عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 100 من أصل 34,822

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية == Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

اسم المؤلف: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
اسم المشرف: اخلاص مشرف عیدان | علي حسین ادحیة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

توصيف جزيئي للخلايا الجذعية المتحفزة لتكوين خلايا عصبية == Molecular Characterization of Stem Cells that Induce Neurogenesis

اسم المؤلف: مائده حسين محمد
اسم المشرف: ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The in vitro isolation, identification, differentiation, and neurogenesis characterization (with molecular studies by conventional and real time - PCR) of stem cells source were investigated to produce two type of stem cells. This two types including neural cells and neural stem cells in culture which use it as a successful sources for further treatments. And finally chosen the best medium formula for maintenance the produced neural stem cells, also to prove their stemness state in culture. The mouse bone marrow mesenchymal stem cells was used as the source of stem cells in this study. Two type of neural differentiation formula was used to induced neural cells and then neural stem cells. The first formula was butylated hydroxyanisole, and the second formula was β - mercaptoethanol reagents. Also three type of different neural stages markers were used; nestin as immaturation stage marker, neurofilament light - chain as early neural marker, and microtubule association protein as maturation marker. These markers were represented the different neurogenesis stages started from mesenchymal stem cells (as undifferentiated cells), neural stem cells production stages, and towards neuron cells (as differentiated cells).The results of immunocytochemistry and real time - PCR of butylated hydroxyanisole differentiation method showed that in contrast to mesenchymal stem cells (as control group), neural differentiated cells showed neural progenitor pattern, by showing stable increased in nestin gene expression significantly through differentiation process for different exposure time, with increased of protein expression significantly compared with control. While, neurofilament light - chain gene and protein expression started to increase significantly, but not - IIreplacedthe nestin expression completely even when its expression passed nestin levels compared with control group. In contrast to the maturation marker microtubule association protein which showed a very low expression during the duration of differentiation period in protein and gene expression (with significant effect) compared with control. This results proved that the cells were still progenitors and do not passed the maturation stage, therefore there was a difficult to define the exactly time of neural stem cells production stage from this formula and as a good formula to produce neuron cells in culture. In other side, the results of immunocytochemistry and real time - PCR of β - mercaptoethanol (as another differentiation formula) were showed that this formula was successful to produce both neural stem cells as well as neuron cells from this formula. This occur through increasing and over expressing of nestin protein and gene significantly within the early hours exposure time reaching to the highest expression levels. Compared with decreased and lower expressed in neurofilament light - chain protein and gene expression levels compared with control; therefore from this stage (exposure time) we can produce neural stem cells in culture. And then decreased and lower expressed of both protein and gene expression of nestin significantly compared with increasing the expression of neurofilament light - chain protein and gene levels throw the late exposure times compared with control, this results indicated that this stage was starting of maturation stage toward neuron cells. Also the proving of this results was lower expression levels of almost all exposure times of microtubule association protein for their protein and gene (with significant effect).The results of gene expression analysis of using four different media formulas to proved the stemness state and maintained the neural stem cells in culture showed that 6 h exposure to β - mercaptoethanol was enough to create - IIIneuralstem cells which maintained using MEM media with 5% FBS, with b - FGF, or with b - FGF &EGF. This study confirms that the molecular characterization study of stem cells in culture will assist to studying and clarifying the neurogenesis pathway through neural differentiation process, by clarified the mechanisms of neural genes through the in vitro differentiation of stem cells, and therefore ability to produced both neuron cells and neural stem cells by using the molecular studies.

امكانية تحفيز بعض الطحالب المعزولة محليا لانتاج الوقود الحيوي == Possibility of stimulation of some locally isolated algae for production of biofeul

اسم المؤلف: ثائر محمد ابراهيم العكيلي
اسم المشرف: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الاحياء المائية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: In the current study, samples of algae have been collecting from( Springs , Streams and Rivulets)including in northern of Iraq (the area on the Iraqi - Iranian and Turkish borders, and from the middle in the areas of (Tarmiya and Alabegi) several races of used algae in biofuels such as : Scendesmus spp , S . quadricouda , S . Dimorphus,Chroococcus sp. ,Chlorococcum humicola , Microcystsp. , Asterococcus sp. ,Chlorella sp , Oscillotoriasp. , Anabena sp , Nostoc. sp. , Ankistrodesmus falcatus.diagnosed , were isolated and prepared pure cultures of Asterococcus sp. , S dimorphus, C.humicola and were selected three culture medium (BG11, Chu13, Chu10)for culturing and development of these algae under controlling conditions (2 ± 25 ° C, intensity of illumination 3000 Lux and 8 : 16 light : darkness system).Experiments include three axes, the first representing the study of the influence of media - type and installed in curves and growth rates (K) and doubling time(G) and estimate the biomass of the tested algae, in addition to monitoring the effectiveness of the quality of the medium in the chemical content of algae and of (total of lipids, proteins, carbohydrates content and fatty acids). A second include the treatment are (remove nitrogen from the media, addition NaCl with 2 g.l - 1, addition of vitamins mixture (B1, B6, B12) in the following concentrations (0. 1, 0.1, 0. 01) mg .l - 1, respectively and change the current speed (as a mixing factor) of 400 and 850 l. h - 1). Third axis include the efficiency of the Photobioreactor system test (Tubular Photobioreactor named( I.TH.1) designed by a researchers for the purpose of comparison between culturing in bottles and the possibility of the application of expandingproduction in the reactor system of 120 liters, for testing C. humicola in Chu13media.The results showed that the highest growth rate recorded in BG11 for Asterococcus sp, was 0.343 cells . day - 1 depending on the absorbance values at of 650 nm wavelength, while the highest rate depending on the number of cells scored in Chu13 after the addition of vitamins mixture for C.humicola was 1.16 cells .day - 1, while the lowest growth rate(K) scored in Asterococcus sp, In Chu10 after the removal of nitrogen and reached 0.04 cells . day - 1, as less doubled time(G) scored when Chu13 after the addition of NaCl to Asterococcus sp, and reached 1.12 day depending on the absorbance values, while less doubling time(G) was relying on the number of cells in C.humicola in Chu13 after the addition of vitamins and amounted to 0.257day.The highest doubled time(G)13.7 and 15.05 day was scored in BG11 after removing N2 form culture medium of Asterococcus sp, depending on the absorbance values and the number of cells respectively. The highest biomass value recorded at Asterococcus sp with current speed 400 l.h - 1 and amounted to 0.724 mg .g - 1 dry weight,while the less biomass0.203 mg.g - 1 dry weight at the same algal after the addition of NaCl to Chu10 .The highest value of total lipids recorded at removing nitrogen from the Chu13 inS.dimorphus amounted 320.8 mg . g - 1 (dry weight) while it was less than at the C.humicola in control. As Chu10 recorded the highest percentage of total lipids was registered at S.dimorphus in BG11 after removing nitrogen and stood at 81.48%. The lowest percentage was registered with C.humicola in Chu10 amounted to 32.49%.The highest amount of total proteins , when Asterococcus sp developed at current speed of 400 l . h - 1 in Chu13 amounted to 299.7 mg . g - 1 (dry weight), while the least value was registered at S.dimorphus amounted to 8.9 mg . g - 1 in BG11 - free of nitrogen. While recorded the highest percentage of total proteins when Asterococcus sp, after the addition of NaCl to BG11media and amounted to 51.17%, while the lowest percentage was registered to the same alga after removing nitrogen from the BG11 and amounted to 5.7%.Results prepared that the highest amount of total carbohydrates, was recorded in the S.dimorphus when the velocity of 400 l . h - 1 and amounted to 63.09 mg . g - 1 (dry weight), and the least amount was registered in Asterococcus sp in Chu10 after the addition of vitamins. While the highest percentage recorded for carbohydrates in S.dimorphus in control BG11 reached 41.67%,and the lowest percentage was in Asterococcus sp at Chu10 after the addition of a mixture of vitamins and stood at 4.65% .When the follow - up impact of the transactions used in the experiments in quality and quantity of fatty acid (Luric, Palmetic, Stearic, Lionoleic, α - liolenic, Oleic, Archidic, DHA), we find that the the final concentrations have varied significantly, recorded acids Luric, Palmetic, Stearic higher concentrations when Asterococcus sp. In Chu13 after the addition of NaCl first and, second and was 46.7, 381.27 mg . l - 1, respectively, while the acid Stearic amounted to 117.0 mg . l - 1 after removing nitrogen from BG11. While α - linoleic, Linoleic asid recorded the highest amount it reached 188.3, 22.7mg.l - 1 when Chu10 after the addition of vitamins and at the speed of 400 l . h - 1, respectively, for Asterococcus sp, As Oleic, Archidic, DHA acids recorded the highest amount in C.humicola amounted to 125.08, 131.8,175.65 mg .l - 1 , at the current speed of 400 l . h - 1 in the first and second acides, when BG11 after removing nitrogen, DHA acid,as in terms of percentages acids, we find that the current study showed the highest percentage of Linoleic, Luric amounted to 39.69, 84.9% at the control Chu10 and Chu13 after treatment with vitamins respectively in Asterococcus sp.While DHA Oleic, α - linoleic, Stearic acids recorded highest percentage reached to 43.39, 44.25, 46.71, 46.85%, respectively, in S.dimorphus in BG11control , after treatment with vitamins to Chu10and after the addition NaCl toBG11respectively . As Archidic, Palmetic acids recorded the highest percentage in C.humicola amounted to 28.42, 62.6%, respectively, in BG11control and the speed 850 l . h - 1.the highest amount of saturated fatty acids S.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 951.7 mg . l - 1 after the addition NaCl to Chu13 .The highest percentage was registered at the same alga 92.5% in Chu13control. Current studie also recorded the highest amount of unsaturated fatty acid U.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 488.2 mg .l - 1 when adding vitamins to Chu10, while the highest percentage recorded in S.dimorphus amounted to 91.79% when adding NaCl to BG11.I n applying the experience of the test reactor, the photobioreactor of 120 liters and choosing alga C.humicola inChu13 and 400 l .h - 1, we find that the system I.TH.1 has given the results and the differences were not significant in terms of impact on growth rates and the doubling time of replication when compared with the first and second controls(Chu13 represent first control sized 150 ml and the process to shake once a day and the second control mixing factor 400 l . h - 1 in 3 - liter size). In terms of the impact of I.TH.1 on the biomass it has increased significantly when the first control while non - significant differences were recorded for the second control at the level of probability (P≤ 0.05) either when the effect in the chemical content of the total of studied alga, we find it recorded 199.6, 200.5, 198.2 mg . g - 1 of total lipids and 218.5, 214.3, 185.9 mg . g - 1 of total proteins and 147.7, 165.1, 143.2 mg . g - 1 of total carbohydrates in the first , second control, I.TH.1respectively. These results show no significant differences between the results of I.TH.1 and education in bottles laboratory. either at the level of the quantity and quality of fatty acids, we find that there is variation in the results as recorded all the fatty acid was significantly higher for the first control except Luric acid which disappeared from the second control and I.TH.1 , while there was a significant decrease in α - Liolenic, Olice, Archidic acids. While I.TH.I recorded an increase in Palmetic, Linolic, DHA acids compared with the second control, with the advent of acidic Myrestic and Stiric in the system and the disappearance in two controls, That shows the importance of the use of these bioreactors in the biofuel production studys.

تعدد الاشكال للنيوكليوتيدة المفردة لبعض الحركيات الخلوية في مرض المعي الالتهابي لدى مرضى عراقيين == Single Nucleotide Polymorphisms of some Cytokines in Inflammatory Bowel Disease of Iraqi Patients

اسم المؤلف: ابتسام بداي حسان الكناني
اسم المشرف: بتول علي شهاب | علي حسين ادحية
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Inflammatory bowel disease (IBD) is a world healthcare problem that involves two major forms : Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Immunogenetic predisposition is one of the risk factors for the disease, and cytokines are among these factors. Therefore, the association between 13 SNPs (single nucleotide polymorphisms) of cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IFNG, TNF and TGFB1) and IBD was determined in samples of Iraqi Arab patients (34 CD and 66 UC). The patients were referred to the Gastrointestinal Tract Unit at Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Yarmouk Teaching Hospital and Al - Zuafrania General Hospital in Baghdad for diagnosis and treatment during the period August 2013 - October 2014. A control sample of 43 individuals was also included.The following results were reached by the study : 1. Interleukin - 1 alpha gene (IL1A - 889) : frequencies of CC genotype and C allele were significantly increased in CD (58.8 and 73.5%, respectively) and UC (54.6 and 71.2%, respectively) patients compared to controls (25.5 and 40.7%, respectively). In contrast, TT genotype and T allele frequencies were significantly decreased in CD (11.8 and 26.5%, respectively) and UC (12.1 and 28.8%, respectively) patients compared to controls (44.2 and 59.3%, respectively).2. Interleukin - 1 beta gene (IL1B - 511) : Frequency of TC genotype was significantly increased in UC patients compared to controls (63.6 vs. 39.5%; P = 0.018), while CC genotype frequency was decreased (6.1 vs. 32.2%; P = 0.061). No variation was observed in CD patients.3. Interleukin 1 receptor type 1 gene (IL1R1pstl 1970) : Frequencies of TT genotype and T allele (47.1 and 67.7%, respectively) were significantly increased (P = 0.026 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients compared to controls (20.9 and 34.97%, respectively). In contrast, CC genotype (11.8 vs. 51.2%) and allele C (32.4 vs. 65.1%) frequencies were significantly decreased (P = 2.8*10 - 4 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients. For UC, the patients demonstratedgnificant increased frequencies of TC genotype (48.5 vs. 27.9%; P = 0.045) and T allele (63.6 vs. 34.9%; P = 5.1*10 - 5) compared to controls. As in CD, UC patients also demonstrated significant decreased frequencies of CC genotype (12.1 vs. 51.2%; P = 1.7*10 - 5) and C allele (36.4 vs. 65.1%; P = 8.6*10 - 5).4. Interleukin 2 gene (IL2+166) : Among CD patients, frequencies of TT genotype (41.2 vs. 6.9%) and T allele (64.7 vs. 43.0%) were significantly increased in patients compared to controls (P = 0.001 and 0.009, respectively). In contrast, TG genotype (47.1 vs. 72.1%; P = 0.035) and G allele (35.3 vs. 56.9%; P = 0.009) frequencies were significantly decreased. Almost, similar observations were made in UC patients.5. Interleukin 4 gene (IL4 - 590) : it was observed that frequencies of TT genotype (52.9 vs. 11.6%; P = 1.2*10 - 4) and T allele (70.6 vs. 24.4%; P = 1.6*10 - 8) were significantly increased in CD patients compared to controls. In contrast, CC genotype (11.8 vs. 62.8%, P = 5.6*10 - 6) and C allele (29.4 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased. In the case of UC, frequencies of TC genotype (69.7 vs. 25.6%; P = 1.1*10 - 5) and T allele (62.1 vs. 24.4%; P = 4.6*10 - 8) were significantly increased in patients, while CC genotype (3.0 vs. 62.8%; P = 2.5*10 - 12) and C allele (37.9 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased in patients.6. Interleukin 4 receptor gene (IL4R+1902) : frequencies of GG genotype (47.1 vs.11.6%) and G allele (55.9 vs. 37.2%) were significantly increased in CD patients compared to controls (P = 0.001 and 0.023, respectively). In contrast, GA genotype (17.7 vs. 51.1%; P = 0.004) and A allele (44.1 vs. 62.8%; P = 0.023) frequencies were significantly decreased. In UC patients, frequencies of GG genotype (57.6 vs. 11.6%) and G allele (75.8 vs. 37.2%) were significantly increased (P = 1.0*10 - 6 and 1.9*10 - 8, respectively); while frequencies of AA genotype (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5) and A allele (24.2 vs. 62.8%; P = 1.9*10 - 8) were significantly decreased.7. Interleukin 6 gene (IL6+565) : Comparing patients to controls revealed that GG genotype frequency was significantly increased in CD (70.6 vs. 13.9%; P = 1.5*10 - 8) and UC (69.7 vs. 13.9%; P = 4.4*10 - 7) patients, and a similar increased frequency of G allele was observed. In contrast, the GC genotype frequency was significantly decreased in CD (23.5 vs. 76.7%; P = 3.7*10 - 6) and UC (24.2 vs. 76.7%; P = 7.0*10 - 6) patients.8. Interleukin 12B gene (IL12B - 1188) : Frequency of A allele was significantly increased in CD patients compared to controls (67.7 vs. 47.7%; P = 0.015), while C allele was significantly decreased (32.4 vs. 52.3%; P = 0.015). For UC, the heterozygous genotype AC showed a significant increased frequency in patients compared to controls (66.7 vs. 30.2%; P = 3.6*10 - 4), while CC genotype frequency was significantly decreased (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5). 9. Interferon gamma gene (IFNG+874) : The AT genotype showed a significant increased frequency in CD patients compared to controls (58.8 vs. 30.2; P = 0.020), while TT genotype frequency was significantly decreased (11.8 vs.39.5%; P = 0.009). For UC, AA genotype (54.6 vs. 30.2%; P = 0.018) and A allele (74.2 vs. 45.4; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly increased in patients. In contrast, TT genotype (6.1 vs. 39.5%; P = 2.8*10 - 5) and T allele (25.8 vs. 54.7%; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly decreased. 10. Tumor necrosis factor alpha gene (TNF - 308) : Comparing CD patients to controls revealed no significant variation, while UC patients demonstrated a significantly (P = 0.006) increased frequency of G allele (71.2 vs. 52.3%) and a decreased frequency of A allele (28.8 vs. 47.7%). 11. Interleukin 1 receptor antagonist (IL1RNmaspl 11100), interleukin 10 gene (IL10 - 1082) and Transforming growth factor beta (TGFB1codon 25) genes : Comparing patients to controls revealed no significant variations in genotype or allele frequencies.The presented results of the 13 cytokine SNPs in CD and UC patients are the first report in Iraqi patients, and their findings highlighted the role of these SNPs in etiopathogenesis of both groups of IBD, and paved the way for further investigations to determine the role cytokine gene polymorphisms in susceptibility to IBD or their protective effects.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا صباح جواد
اسم المشرف: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

اسم المؤلف: وســـد لطيف علوان
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

اسم المؤلف: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
اسم المشرف: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

اسم المؤلف: هونر عثمان اسماعيل
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق == Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

اسم المؤلف: زينة نبيل نصيف العزاوي
اسم المشرف: صباح فرج عبد الاحد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - اللافقريات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

اسم المؤلف: هناء كريم مايخان محمد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

اسم المؤلف: هديل مكي حبيب المؤمن
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

اسم المؤلف: هبة شاكر احمد
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: هادي حسين عباس القريشي
اسم المشرف: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

اسم المؤلف: نهاد خلاوي تكتوك
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

اسم المؤلف: ميس عماد احمد
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية == Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

اسم المؤلف: نشميل علي حسن الهواسي
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن == Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

اسم المؤلف: محمـد فضـل سالم الميسـري
اسم المشرف: حسين حسن عمر خانقاه | رياض عبد الحسين دلول
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية == Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

اسم المؤلف: لمياء علي حسين
اسم المشرف: وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

اسم المؤلف: لمى يوسف مهدي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

اسم المؤلف: لمى قاسم علي الطائي
اسم المشرف: نوري محمد لعيبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة مناعية ومايكروبايولوجية لمرضى الربو == IMMUNOLOGICAL AND MICROBIOLOGICAL STUDY FOR ASTHMATIC PATIENTS

اسم المؤلف: كريم شحل جياد الطائي
اسم المشرف: كريم شحل جياد الطائي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2003
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد الربو اضطرابا التهابيا مزمنا في المسالك الهوائية وانه مرض متعدد الاسباب تلعب المحفزات غير الارجية اضافة للعوامل الارجية دورا فيه . ان الدراسة الحالية تمحورت بشكل اساسي حول الربو الارجي (Allergic asthma) والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1 - من اجل البحث في العلاقة بين الابواغ الفطرية المحمولة في الهواء والمظاهر السريرية لمرضى الربو العراقيين فقد اجريت دراسة كمية ونوعية للفطريات داخل وخارج المنازل (Indoor and Outdoor) باستخدام طريقة الاطباق المفتوحة وذلك خلال الفترة من كانون الثاني 2001 لغاية كانون الاول 2002. اظهرت النتائج ان كثافة الابواغ الفطرية تتباين تبعا للمواسم والظروف المناخية وان شيوع هذه الفطريات كان داخل وخارج المنازل وفق التسلسل التالي : Aspergillus nigar , Penicillium , Aspergillus flavous , Caldosporium Alternaria . اجريت تقيما لدور هذه الفطريات في حث امراض الارجية لدى 116 من مرضى الربو 50 من الاناث و66 من الذكور تراوحت اعمارهم بين 70 - 5 سنة وكذلك 45 فردا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة وذلك باستخدام اختبار وخز الجلد (Skin prick test) ، وقد ابدى غالبية المرضى فعالية جلدية لخلاصة خليط الفطريات MM1 وMM2 وMM3 وMM4 وMM5 كما لوحظت علاقة ايجابية بين وجود هذه الفطريات داخل وخارج منازل مرضى الربو وبين مدى استجابتهم اليها . تبين من خلال قياس مستوى الضد IgE النوعي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) ان اضداد الفطريات Penicillium ، Aspergillus ، Alternaria كانت الاكثر تكرارا 2 - من اجل الغاء المزيد من الضوء حول دور الاخماج البكتيرية والتي من شانها ان تفاقم نوبات الربو ، فقد اجريت عملية زرع القشع لـ 68 مريضا من مرضى الربو تم خلالها عزل 6 انواع من البكتريا كانت Strepto pneumoniae اكثرها تكرارا (%35.2) تليها بكتريا Staph aureus بنسبة (%30.9) وبكتريا H. influenza بنسبة (%7.3) واخيرا بكتريا Strepto pyogenes وStaph epidermidis وN. cattarrhalis وبنسبة (%4.4) لكل منهما. عزلت (9) عزلات من خميرة C. albicans من اولئك المرضى والذين ابدوا تفاعلات جلدية موجبة باستخدام خلاصات هذه الخميرة . ومن خلال اجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية للعزلات ابدت غالبية تلك العزلات حساسية عالية لمضادات Ciprofloxacin وAugmentin وCefatoxime كما ابدت العديد منها مقاومة لمضادات Ampicillin وCloxacillin وTetracycline وErythromycin .3 - ولالقاء الضوء على الحالة المناعية لمرضى الربو تم تحديد مستويات الاضداد IgA وIgG وIgM واجزاء المتمم C3 وC4 في امصالهم باستخدام طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (Single Radial Immunodiffusion=SRID) ومستويات الضد IgE الكلي بتقنية ELISA تبين من خلالها ، بان متوسط مستويات الضد IgG والضد IgA قد انخفضت معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة مع مجموعة السيطرة وان متوسط مستوى جزء المتمم C3 قد ارتفع معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة بمستواه لدى افراد السيطرة في الوقت الذي لم يحصل تغير جوهري في مستويات الضد IgM والجزء C4 من مكونات المتمم من جراء الاصابة بالربو. فيما يتعلق بتقدير مستويات الضد IgE الكلي فقد اظهرت النتائج ان هنالك ارتفاعا معنويا في مستويات هذا الضد لدى مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة وان هنالك اختلافا معنويا في مستوياته بين كلا الجنسين من مرضى الربو. اوضحت الدراسة كذلك ان هنالك فروقا في تفاعل التلازن الخاص بالبروتين الفعال - C والذي كان اكثر ايجابية لدى مرضى الربو وعلى الاخص منهم اولئك الذين يرافق اصابتهم بالربو الخمج البكتيري ومنها Strepto. pneumoniae بشكل خاص . تبين من خلال العد التفريقي لخلايا الدم البيض ان هنالك ارتفاعا معنويا في اعداد خلايا الدم الحمضة في مرضى الربو بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . ومن ناحية اخرى فقد لوحظت علاقة معنوية بين الارتفاع في اعداد هذه الخلايا ولارتفاع في مستويات الضد IgE وكذلك مع فعالية الجلد التي يبديها مرضى الربو. تم تقدير الفعالية الحجمية لانزيم (ADA) في امصال مرضى الربو باستخدام الطريقة الانزيمية ، لوحظ من خلالها ارتفاعا معنويا في فعاليته لدى هؤلاء المرضى وعلى الاخص لدى الاناث مقارنة بالذكور .4 - باستخدام تقنية الامتصاص الذري اللهبي لتحديد مستويات العناصر Fe وZn وCu وتقنية الامتصاص الذري اللالهبي لتحديد مستويات Se وMg هذا وقد لوحظت ان هنالك انخفاضا في مستويات العناصر Fe وCu وMg وSe وارتفاعا معنويا في مستوى عنصر Zn في امصال مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة | Asthma is a chronic inflammatory disorder of the airways. Its aetiology is multifactorial , in which non - allergic triggers and allergic factors have role to play. The present study is concerned mainly with allergic asthma, and the results can be summarized as the following : 1 - To investigate the relationship between air spora and the clinical expression of asthma in Iraqi patients, a quantitative and qualitative study of indoor and outdoor airborn fungi was carried out during the period January 2001 - December 2002 . The results revealed that the spore density depends on seasonal and climatic changes. The common observed genera, arranged according to their density, were/Aspergillus nigar, Penicillium, Aspergillus flavous, Alternaria, and Cladosporium . The role of the majority of such fungi in induction of allergy was evaluated in 116 asthmatic patients (66 males and 50 females) with an age range 5 - 70 years, in addition to 45 apparently healthy individuals as a control group, by using skin prick test. The highest proportion of those patients (89.7%) showed skin reactivity to the allergen HDM , followed by MMI (75.0%), HD (63.8%), MM2 (48.3%), MM3 (19.8%) and MM5 (16.8%) . Also a positive correlation was observed between the occurrence of these fungi (inside and outside the houses of those patients) and their responsiveness . Measuring serum specific IgE using ELISA technique revealed that the most frequent specific IgE was for Penicillium , Aspergillus and Alternaria. 2 - To provide further insight about the role of bacterial infection that deteriorate asthma attack, sputum cultures were done for 68 patients with asthma . Six bacterial species were isolated, in which Strepto. pneumoniae showed the highest percentage (35.2%), followed by Staph. aureus (30.9%), H. influenza (7.3%), Strepto. pyogenes, staph. epidermidis and N. cattarnhalis (4.4%) for each. Also, nine isolates of Candida albicans were isolated from those patients, to which a skin test response was highly positive among them. Antibiotic sensitivity was done for the bacterial isolates. The majority of those isolates revealed high sensitivity to the antibiotics ciprofloxacin, augmentin and cefatoxime, while, they were resistant to ampicillin, cloxacillin, tetracycline, and erythromycin. 3 - To shed some light on the immune status of patients with asthma the total level of serum immunoglobulins (IgA, IgG, and IgM) and complement components (C3 and C4) were evaluated by using single Radial Immunodiffusion assay (SRID). Serum level of total IgE was also evaluated, but by ELISA technique. The results showed that the mean serum levels of IgG and IgA were significantly decreased in patients with asthma as compared to controls while C3 level showed a significant increase. However, the mean serum level of IgM and C4 showed no much deviation due to asthma. With ranged to the evaluation of total IgE level, the result revealed a significant elevation in the level of this immunoglobulin in sera of patients in comparison to healthy individually. Additionally a significant difference in the levels of total IgE was augmented between both sexes of patients. There was some differences in the degree of positive its of agglutination reaction for the factor C.R.P., such reaction was more positive in patients with asthma, especially those with bacterial infections with special regard to Strepto. pneumonia. Differential count of while blood cells illustrated that eosinophils were significantly higher in patients with asthma compared to the control group . On the other hand a significant correlation was noted between the elevation of eosinophil count and the elevated level of IgE antibody and skin reactivity of asthmatic patients. Volume activity of adenosine deaminase enzyme in serum of asthmatic patients revealed a significant increased activity in the patients especially the females compared to males.4 - Trace elements (Fe, Cu, and Zn) assessment was carried out by flame atomic absorption and the more sensitive flameless atomic absorption (Se and Mg) . A significant decrease in Fe, Cu, Se ad Mg, and a significant increase in Zn were clearly observed in asthmatic patients as compared with control group.

التغيرات النسجية والنسجية الشكليائية القياسية لعقار الليفيتراسيتام في بعض اعضاء الجهاز التكاثري في الفئران البيض == Histological and Histomorphological Changes of Levetiracetam Drug in Some Reproductive Organs in White Mice

اسم المؤلف: فائزة جبار جودة الربيعي
اسم المشرف: نهلة عبد الرضا البكري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الانسجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was conducted to study the effects of Levetircetam (LEV) drug at concentration of 350 mg/kg/day body weight on selected organs of male and female reproductive system in albino mice, Mus muculus (Swiss mice). The animals divided into three treated groups, the first group treated once a day for 14 days, the second group treated once a day for 30 day and the third group treated once a day for 45 days, in addition to 3 control groups one for each treated group.The results of the present study declare the following : • Selected organs of male reproductive system (testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis).The results revealed significant degrease (P<0.05) in the percentages of the weight of testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis in treated animals for 14, 30, 45 days respectively in comparison with control group. The results also showed significant decrease (P<0.05) in percentages spermatogonia of the treated animals, when compare with control group. The percentages of the primary spermatocyte, secondary spermatocyte and spermatid increased significantly (P<0.05) in all three treated groups when compare with control groups and significant decrease (P<0.05) in percentage of spermatozoa, number of Sertoli cells, Leydig cells and diameter of Leydig cells nuclei. The mean diameter and thickness of somniferous tubules and height of epit helial cells and thickness of the tubules in the caput (head) and cauda (tail) epididymis in treated animal when compare with control group.The results of present study also showed that treatment with drug lead to histopathological changes in testes of animals treated with drug when compared with control groups such as degeneration, necrosis of spermatogenic cell and vacuolated of some seminiferous tubules, hypotrophy of interstitial and accumulation of spermatid at different stages of spermatogenic cells in lumen of tubules and degeneration of some of Leydig and separation of Sertoli cells from the basement membrane. Also results of percent study revealed some histopathological changes in caput (head) and cauda (tail) epididymis of treated animals with drug when compared with control groups, these change represented by degeneration some of epithelial cells and detachment of basement embrane and appearance of phagocytes in lumen of tubules and degeneration of epithelial cells and appearance of vacuoles between epithelial cells in addition to the damage of tubules. • Selected organs of female reproductive system significant increase (P<0.05), mean weight of ovary, oviducts and uterus of treated animals with drug for 14, 30, 45 days in comparison compared with control groups.Significant decrease (P<0.05) number of primary follicles and significant increase (P<0.05) in number of secondary follicles and significant increase (P<0.05) number of mature follicles of treated animals with drug about 14, 30, 45 days when compared with control group, significant increase (P<0.05) in number follicular cysts and corpus lutues of treated animals with drug when compared with the control groups, and significant decrease (P<0.05) diameter of growth follicles and corpus luteus and significantlyincrease (P<0.05) in diameters follicular cysts of treated animals with drug when compared with control groups. The results revealed some histopathological changes in ovary of treated animals with drug for when compared with the control groups, these changes represented by hypertrophy of cortex, degeneration of granular layer and accumulated some of cells in the middle of follicular lumen, degeneration in ovum and situated at the central position with increasing in the number of follicular cysts, separated of ovum from columns ovum, appearance of some abnormal ovum in some of follicles of ovaries.Significant decrease (P<0.05) in height and numbers of mucus folds in ampula and isthmus regions in oviduct of treated animals with drug when compared with control groups in addition to replacement of the ciliated columnar cells by cuboidal cell with the degreasing in the density of the cilia and the height of the secretory cells in addition hemorrhage, necrosis, hypoplasia and death of the columnar epithelial cells of the mucus folds, with the appearance of vacuoles, phagocytes in the center of the lumen,hypertrophy and hyperplasia in the tunica muscularis. Results also showed significant decrease (P<0.05) in numbers of endometrial glands of treated animals with drug when compared with control and significant increase (P<0.05) number of blood of treated animals with drugs when compared with control group and appearance significant increase (P<0.05) in high of epithelial cells of endometrium and thickness of lamina propria of three treated animals with drugs when compared with control group.The results revealed a histopathological changes in endometrium of treated animals with drug when compared with control such as hyperplasia and hypertrophy the epithelial layer and lamina propria and atrophy of endometrial glands and hyperplasia in epithelial of endometrial gland and detached basement membrane in some of them

دراسة بعض الجوانب المناعية والجزيئية في المرضى المصابين بداء المقوسات العيني == Study of some Immunological and Molecular Aspects in Ocular Toxoplasmosis Patients

اسم المؤلف: علي نزار ياسين
اسم المشرف: اسراء قاسم العبيدي | وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study was conducted on 179 patients who attended the Retina Unit in Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital in Baghdad from the beginning of March to the end of September 2014. The patients were divided a according to the clinical diagnosis to 3 roups; the first included 50 patients infected with ocular toxoplasmosis(OT) while 45 patients with uveitis ; In addition a control group was of 84 apparently healthy individuals (they don’t have any infection in their eyes.) was included. The sera patients were initially diagnosed by immune Latex test. The results showed that all the ocular toxoplasmosis patients (100%) were positive while none of the uveitis patients gave positive result, In control group,30 cases were infected with toxoplasmosis(35.7%) with a significant differences between the three groups (p<0.01). ELISA test results for specific T. gondii IgG and IgM antibodies for were 84% positive to ocular toxoplasmosis as 42 patients versus 16% as 8 cases with negative test, while the positive rate in uveitis patients was 31.1% and considered as positive uveitis group, versus 31 negative case with rate 68.9%.The control group was reevaluated showed 35 positive case from 84 and formed a group called Asymptomatic toxoplasmosis. The levels of specific IgG and IgM were measured by international unit / ml.for all groups. The IgG level was 1.661 ± 0.187 IU/ml. in O.T. group followed by positive uveitis group 1.596 ± 0.157 and Asymptomatic toxoplasmosis group 1.501± 0.257 while negative uveitis group and control were recorded 0.389± 0.190 and 0.350 ± 0.167 respectively.IgM levels were increase in O.T. group 1.922 ±0.510 followed by positive uveitis group 1.867 ± 0.061 then asymptomatic toxoplasmosis came 1.744 ± 0.070. Finally the negative uveitis and control groups were registered 0.632 ± 0.166 and 0.618 ± 0.236 respectively.The study of some properties, coupled with ocular toxoplasmosis, including the sex and age for positive IgG antibody groups as it reflected the probability of female to male rate of 74.28% and 25.72%, respectively for OT group, while positive uveitis 58.33% and 41.67% respectively. Asymptomatic toxoplasmosis group has recorded 53.33% and 46.67%, respectively, with no significant differences between the three groups. The age variable has the results of the current study showed no significant differences between positive IgG antibody groups, as OT group focused within the age range 40 - 49 years and 60 - 70 years and similar rate of 22.88%, while positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis groups focused within at the age range 20 - 29 years and 33.33% and 30% respectively. As for positive IgM antibody groups and sex differences, with no significant differences recorded as OT group of males 71.43% and females 28.57%, while asymptomatic toxoplasmosis group 60% for males and 40% for females recorded. The positive uveitisgroup was limited to females only 100%. As well as not significant differences between positive IgM antibody groups were recorded for variable of age as it was OT group within the age range 30 - 39 years and 50 - 59 years with a similar rate 28.57% and 40 - 49 years by 42.86%. As positive uveitis group was within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate 50%, while asymptomatic toxoplasmosis group within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate of 40% and 40 - 49 years by 20%.Investigation of a specific part of B1 gene in size 469 base pair for positive cases to ELISA test was done by conventional PCR test. O.T. group recorded 10 positive results from 42 patients in 23.8% percent, while positive uveitis group that has 14 patients in which only 3 positive cases in 21.4 percent. Three positive cases was recorded also in asymptomatic toxoplasmosis group in 8.6% percent. No significant differences for this test between studied groups in probability (p.0.05). Real - time PCR was applied also on a positive studied groups to ELISA test also.O.T. group recorded 14 positive case in 33.3% percent, positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis registered only 7 case in rate 50% and 20% respectively, No significant differences for real - time PCR in probability (p.0.05) between the three groups.The present study included als o that contain measuring changes in thelevels of some cytokines that estimated by pg. /ml. for all studied groups.The level of IL - 4 in positive uveitis group reached to 28.22 ± 7.74 followed by asymptomatic toxoplasmosis group 26.72 ± 3.72.then O.T.group 21.39 ± 5.03 while negative uveitis group reached a concentration 16.17 ± 5.66,control group came finally and reached lowest concentration 5.08 ± 2.8.High level of IL - 6 was in O.T. group 33.09 ± 19.57 and positive uveitis group 22.26 ± 9.74 then asymptomatic toxoplasmosis 16.83± 6.06, negative uveitis registered 15.94 ± 6.11,control group came to record the lowest concentration 11.70 ± 5.44. An increase in IL - 10 was record in O.T.gruop 24.24 ± 6.27 followed by negative uveitis group 21.35 ±7.64 then asymptomatic toxoplasmosis group 19.15± 3.95 while positive uveitis showed a level 17.65 ± 2.75,the lowest level was in control group 14.28 ± 2.79. High level of Interferon - gamma Inducible Protein - 10 ( IP - 10 ) was got in O.T. group in a concentration 22.66 ± 3.48followed by positive uveitis group 17.09 ± 1.97, then negative uveitis group 16.91± 3.02. Asymptomatic toxoplasmosis group reached 16.89 ± 2.46 and lowest concentration in control group 14.78 ± 2.26.Granulocytes - macrophages colonies stimulating ( GM - CSF) registered a highest level in positive uveitis 47.44 ± 15.04 followed by O.T. group 45.14 ±10.05 the negative uveitis group 43.12± 9.35 and Asymptomatic toxoplasmosis record 39.26± 12.03 while control group the lowest concentration 29.44± 5.29.There were no significant differences between the studied groups (p.0.05). in the levels of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF).

بيئة وحياتية سمكتي الكارب الكرسين Carassius carassius (L.1758) والخشني Liza abu (Heckel,1843) في ذراع الثرثار - دجلة ونهر دجلة == Ecology & Biology to Crucian Carp Carassius carassius L. and Khishni Liza abu (Heckel,1843) in Tharthar arm & Tigris River

اسم المؤلف: علي عودة شاوردي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي | عامر علي الشماع
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية اختيار اربع محطات اثنتين منها على ذراع الثرثار واثنتي على نهر دجلة لاجراء مقارنة عدد من العوامل البيئية مثل درجة الحرارة والاوكسجين الذائب وتركيز الاس الهيدروجيني والملوحة والشفافية واجراء مقارنة اخرى لكمية الهائمات النباتية والحيوانية واحياء القاع. فضلا عن دراسة حياتية نوعين من الاسماك هما سمكة الكارب الكرسين Carassius carassius L. والخشني Liza abu (Heckel,1843) والمتمثلة بدراسة العمر والنمو والتغذية والتكاثر في بيئتين مختلفتين هما ذراع الثرثار ونهر دجلة مع تشخيص لانواع الاسماك المتوافرة في نهر دجلة ضمن حدود مدينة بغداد.جمعت العينات ابتداء من شهر اذار 2004 وحتى كانون الثاني 2005 بالنسبة لدراسة العوامل البيئية وحياتية النوعين اعلاه وبواقع نموذج واحد لكل شهرين. تراوحت درجة حرارة المياه في منطقتي الدراسة بين 10م كادنى قيمة خلال شهر كانون الثاني و28م كاعلى قيمة لها خلال شهر تموز على الذراع واتخذت نمطا متشابها لها في الموقعين المدروسين وتراوحت قراءات قرص ساكي بين 28سم في خلال شهر ايلول في نهر دجلة و242سم خلال كانون الثاني على الذراع. كما تراوحت تراكيز الاوكسجين الذائب في الماء بين 6 ملغم/لتر خلال شهر تشرين الثاني على الذراع و10.8ملغم/لتر كحد اعلى في المحطة نفسها خلال ايار على الذراع ايضا. كما سجلت اعلى قيم الملوحة في الذراع) خلال اذار 2004 اذ بلغت قيمتها 1.422 غم /لتر. بينما سجلت ادنى مستوى لها على نهر دجلة خلال شهر تشرين الثاني اذ بلغت 0.480غم /لتر. وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني pH بين 6.6 في المحطة (4) على نهر دجلة خلال شهر كانون الثاني، و8.4 خلال شهر تشرين الثاني على ذراع الثرثار .واوضحت الدراسة ان التواجد السنوي للهائمات النباتية في ذراع الثرثار اقل منه في نهر دجلة، وسجلت الدايتومات Bacillariophyceae تواجدا عاليا مقارنة بصنوف الهائمات النباتية الاخرى مسجلة النسب 92.56%، 92.01%، 96.35% ، 95.45% في محطات الدراسة الاربع على التوالي. جاءت بعدها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. وسجلت الهائمات الحيوانية اعلى نسب تواجد لها في نهر دجلة مقارنة بالذراع وجاءت الدولابيات في المرتبة الاولى 91.65%، 86.65% في الذراع 91.87%، 89.42% في نهر دجلة تلتها مجدافية الاقدام. وسجلت احياء القاع اعلى تواجد لها في الذراع 336 فرد/م2 ، 286 فرد/م2 بينما سجلت 126 فرد/م2 ، و178 فرد/م2 في محطتي نهر دجلة على التوالي. تراوحت الاطوال الكلية لسمكة الكارب الكرسين على الذراع بين 7.0 - 27.5 سم واوزانها بين 5 - 300غم وفي نهر دجلة بين 7.5 - 23.25سم و65 - 210.5غم للاطوال والاوزان على التوالي. كما بينت الدراسة ان نمو سمكة الكارب الكرسين ليس قياسيا. وان نموها في الذراع ونهر دجلة كان لصالح الوزن ، اذ بلغت قيمة (b) في اسماك الذراع (3.62) و(3.40) لاسماك الذراع ونهر دجلة. اما سمكة الخشني فتراوحت اطوالها بين 8.0 - 17.9سم واوزانها بين 7.0 - 95.0غم في الذراع وبين 9.0 - 15.5 سم و8.5 - 55.5غم في نهر دجلة للطول والوزن الكلي على التوالي. وبينت الدراسة زيادة في نمو الاسماك باتجاه الزيادة في مكعب الطول على حساب الوزن. وان معدل نموها النسبي في ذراع الثرثار افضل حالا منه في نهر دجلة اذ كانت قيمة (b) لاسماك الخشني المصيدة في الذراع (2.90) وفي نهر دجلة (2.80). تراوحت شدة التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 10.83 و23.33 درجة/سمكة. ولسمكة الخشني بين 9.75 و25.71 درجة /سمكة. بينما تراوح نشاط التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 33.33% و100% ولسمكة الخشني 81.81% و100%، وان سمكة الكارب الكرسين قارتةOmnivorous وتميل بشكل كبير الى الغذاء النباتي الاصل وقد شكل الفتات العضوي الجزء الاكبر من غذائها في كلا الموقعين المدروسين تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة، ولم تختلف مفردات غذائها المتناول في كلا المسطحين المدروسين. كما بينت الدراسة ان سمكة الخشني هي قارتة ايضا Omnivorous تعتمد في غذائها على المصادر ذات الاصل النباتي وان الفتات العضوي هو المكون الرئيس في غذائها الذي حل بالمرتبة الاولى تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. ولم يحصل اختلاف في نوع غذاء هذه السمكة في موقعي الدراسة. وتبين الدراسة ان كلتا السمكتين المدروستين تتناولان غذاءهما من القاع او قريبا منه. اوضحت الدراسة ان نسبة الجنس لسمكة الكارب الكرسين في ذراع الثرثار2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 1.8 : 1 وان لهذا النوع قمة اطلاق واحدة تمتد من منتصف ايار ولغاية تموز وان التبويض فيها حصصي. وان خصوبة هذا النوع عالية وان البيئتين ملائمتان لتكاثر هذا النوع اما عن تكاثر سمكة الخشني فقد بلغت نسبة الجنس في الذراع 2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 2.11 : 1 وان لهذا النوع دورة تكاثرية متتابعة تستمر عاما كاملا ولها قمة اطلاق واحدة تمتد من شهر شباط ولغاية شهر اذار وان التبويض فيها حصصي وقد تصل الى ثلاث دفعات . وتمتاز بخصوبة عالية.

بعض الجوانب المرضية للمصابين بالحمى غير معروفة الاسباب == CERTAIN PATHOLOGICAL ASPECTS ON FEVER OF UNKNOWN ORIGIN PATIENTS

اسم المؤلف: علي جبار عليوي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة على ثلاث مجاميع مختلفة، كانت المجموعة الاولى بعدد 59 مريض بالحمى غير محددة الاسباب (FUO) والمجموعة الثانية بعدد 20 مريض بحمى مشخصة (febrile) والتي اعتبرت لمعاملات سيطرة للمجموعة الاولى، اما المجموعة الثالثة بعدد 20 شخص، كانوا اصحاء ظاهريا وتمثل مجموعة السيطرة للدراسة.تمت المتابعة واخذ العينات من المرضى والعمل عليها في مستشفى الكاظمية التعليمي، بغداد.لقد عانى مرضى FUO من اعراض مالوفة مثل الحمى المستمرة والمتقطعة، الصداع، الم الصدر، الم المفاصل، نقصان الوزن وضعف عام وفقدان الشهية وغيرها، وعلامات مرضية منها الم في الضغط على البطن، وتضخم الطحال، واليرقان، وتورم الساق وتقرحات اللسان والجلد. ان مجموعة مرضى FUO اشتركوا كون جميعهم يعانون من الحمى التي تراوحت مدتها من شهر الى ستة اشهر.تم التعرف على الاعراض السريرية من قبل الاختصاصي الموجود واجريت فحوصات المختبرية لجميع المرضى الراقدين والمشمولين بالدراسة اضافة الى فحوصات من مراكز بحثية اخرى ذات صلة بالموضوع.ان البيانات المتحصل عليها اخضعت للتحليل الاحصائي المناسب وبمختلف الطرق.اظهرت الدراسة بان مرضى FUO بسبب الاصابات المرضية المعدية يشكلون (n = 43)% 72.8) من العدد الكلي لهم (59) ثم قسموا بعد التشخيص النهائي بحسب المرض المعدي الى مرضى الحمى المعوية Enteric fever بواقع (n= 14)% 23.7 ومرضى ذات الرئة والتهاب القصبات بنسبة (n= 11) 18.6%، اما نسبة (n=6) 10.1% من المرضى فقد كانت متساوية لكل من مرضى التدرن الرئوي Tuberculosis(TB)، والتهاب المجاري البولية Urinary tract infection(UTI) ومجموعة اصابات مرضية اخرى Other infections. ومن خلال الدراسة ايضا ظهرت نسبة من المرضى (n=16) 27.12 بسبب امراض اخرى وبنسب مختلفة كما في امراض النسيج الوعائي Collagen vascular diseases (n= 4) 6.7%، ومرض التهاب بطانة القلب Endocarditis (n= 3) 5%، ومرضى الامراض الخبيثة Malignancies (n= 2) 3.3% واخيرا نسبة (n= 7) 11.8% من مرضى FUO هم المرضى غير المشخصين. ان مناقشة اربع من الثوابت الرئيسة المدروسة لها اهمية في التفريق بين مختلف حالات FUO وهذه الثوابت هي : 1 - الثوابت الدمية Haematological parameters.2 - الثوابت الكيموحيوية Biochemical parameters.3 - الثوابت المناعية Immunological parameters.4 - الثوابت الجرثومية Microbiological parameters.1 - اهمية الثوابت الدمية : كانت اعلى قيمة لنتائج فحص معدل ترسيب كريات الدم الحمراء Erythrocyte sedimentation rote (EsR) عند مرضى المناعة الذاتية، وذات معنوية قليلة لهذا الثابت عند مختلف حالات FUO الاخرى.2 - اهمية الثوابت الكيموحيوية : لقد اظهرت البيانات بان مصل مرضى FUO له اهمية كبيرة في تقسيمهم من خلال تقدير اليوريا، والكرياتينين، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي، والبيليروبين الكلى، والالبومين، وتسبق الالبومين الى الكلوبيولين، في مصل هؤلاء المرضى.كما ان الترحيل الكهربائي لمصل مرضى FUO اظهر ارتفاعا في قيم α - 2 globulin, α - 1 globulin، مابين مصل مرضى FUO كما في مصل مجموعة الامراض الخبيثة، في حين هنالك ارتفاعا في قيمة β - globulin في مصل مرضى التهاب المجاري البولية، وارتفاعا في قيمة gammaglobulin بدليل زيادة اضداد IgM، وIgG في مصل مرضى المناعة الذاتية مقارنة مع مرضى FUO الاخرين.3 - اهمية الثوابت المناعية : اظهر فحص مصول مرضى FUO اعلى القيم لمختلف الاضداد ومنها Antistreptolysin O titer، وAntiproteinase antibodies، وAntimyeloperoxidase antibodies، وC - reactive protein، وRheumatiod factor وحسب المرض المشخص.ان مصل مرضى حمى التايفوئيد اظهر ارتفاعا في تركيز IL - 1α (72.2 pgm/ml) مقارنة مع مرضى FUO للاخرين، وكذلك ظهرت وزيادة في قيم كل من (CD25) IL - 2 receptor، وIL - 2 (153.2 pgm/ml، 8.6 pgm/ml على التوالي). في حين وجد اقل تركيزيين لـ(IL - 1α، IL - 2) في مصل مرضى الامراض الخبيثة.4 - اهمية الثوابت الجرثومية : اظهر الفحص الجرثومي تشخيص عزلات بكتريا بنسبة 40% Gram positive diplococci، وبنسبة 20% لكل من Gram negative bacilli، وGram positive cocci. ان نتائج زرع الدم لمرضى FUO اظهرت عزلات بكتريا بنسبة 33.3% لكل من Salmonella spp.، وStaphylococcus aureus، وEnterobacter spp. والمسؤولة عن امراض Salmonellosis، وEndocarditis وامراض بكتيرية اخرى.كما تم عزل كل من بكتريا Enterobacter spp.، وPseudomonas aeruginosa، وpneumoiae Streptococcus من عينات السائل الخلبي Pleural fliud وعلى ما يبدو فانهم العاملين المسببين لمرض ذات الرئة Pneumonitis ومرض التهاب الخلب Pleuritis بنسبة 33.3% من الزرع الكلى الموجب لعينات السائل الخلبي للمرض.اما بشان نتائج زرع الادرار الموجب فقد تم عزل وتشخيص كل من بكتريا Staphylococcus aureus، وE. coli، وKlebsiella spp. والتي تمثل نسبة 33.3% من الزرع الكلى لادرار المرضى والمسببة لمرض التهاب المجاري البولية (UTI).وعند زرع المسحات المختلفة (مسحات الجروح والقرح) تم تشخيص عزلات كل من بكتريا E. coli، وPseudomonas aeruginosa وهما العاملين المسببين الرئيسيين لمرض التهاب النسيج الخلوي Cellulitis.اظهرت نتائج اختبار حساسية العزلات للمضادات الحيوية بان المضاد الحيوي Amikacin يمتلك اعلى فعالية وبنسبة 88.9% ويليه المضاد الحيوي Ciprofloxacin بنسبة 58.3% تجاه العزلات المدروسة، في حين المضادين الحيويين Gentamycin، وCefotaxim كانا اقل فعالية تجاه العزلات وبنسبة 20% و12.5% على التوالي. | The importance of microbiological parameters : Bacterial isolates of sputum sample phowed that there was a 40% graw positive diplococci, gram positive cocci and gram negative bacilli showed a percentage of 20% of each.Blood culture for FUO patients demonstrated a 33.3% for each isolate of sacmorella spp., staphylococcus aurens, and Enterobacter spp., which they may be responsible for salmonellosis, endocaraditis and other bacterial infection diseases.Entarobater spp., Psendomonas aeruginosa as well as streptococcus pneumocial were isalated from a pleural fluid sample and it seems to be camsative agent for pneumonitis and pheuritis, this cause repersnet 33.3% out of the total preural fluid culture results.Urine culture results showed a positive culture result of Staphylococcus aureus, E. coli and Klebsiclla spp., and is considered as a causative agent for Urinary tract infection. This positive result represent about 33.3% of the total urine culture result wound and ulcer swabs showed a detection of E. coli and psendamamas areaginosa isolate which are the main causative agent for cellulites. Arihibiotic sensitive result showed that amikacim has the highest antibiotic activity 88.9% followed by ciprofloxacin 58.3%, while Gentamycin and cefotaxime revealed a 20% and 12.5% respectively

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

اسم المؤلف: عقيل محمود علي اللامي
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة وراثية مناعية للمصابات بداء انتباذ بطانة الرحم == Immunogenetic Study in Endometriosis Patients

اسم المؤلف: ضياء جواد كاظم القاضي
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول | علي حسين ادحية
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية الى تقييم الخلفية المناعية والوراثية - المناعبة لمرض انتباذ بطانة الرحم في عينة من المريضات العراقيات. تمثلت معايير التقييم بمايلي : مجاميع الدم ABO ومستضدات خلايا الدم البيض البشرية من الصنف الاول (A وB وC) والثاني (DR وDQ) وواسمات الخلايا اللمفية المحيطية (CD3 وCD4 وCD8 وCD56) والمستوى المصلي للحركيات الخلوية (IL - 4 وIL - 6 وIL - 10 وIFN - γ) والمستوى المصلي الكلي للغلوبيولينات المناعية (IgA وIgG وIgM) وبروتينات المتمم (C3 وC4) والبلعمة والمستوى المصلي لهرمون الحليب (Prolactin) والهرمونين الجنسيين FSH وLH.شملت الدراسة 54 امراة من المصابات بمرض انتباذ بطانة الرحم واللاتي كن مراجعات لمستشفى العلوية للنسائية والتوليد (بغداد) خلال الفترة اذار 2005 - كانون الثاني 2006. وكان معدل العمر لهن ± الخطا القياسي عند التشخيص 27.3 ± 5.4 سنة. شملت الدراسة ايضا عدد مماثل من النساء غير المريضات (عينة سيطرة) والمطابقات للمريضات من ناحية العمر (25.1 ± 6.7 سنة) والعرق (عراقيات عربيات).توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت مجموعة الدم A تكرارا مرتفع معنويا (Pc = 0.016) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (48.1 مقابل 22.2%)، في حين اظهرت مجموعة الدم O تكرارا منخفض معنويا (Pc = 4 x 10 - 4) في المريضات (5.6 مقابل 35.2%).2. اظهرت ثمانية من مستضدات خلايا الدم البيض البشرية تكرارا مرتفع معنويا في المريضات، وهي A28 (59.3 مقابل 14.8%) وB7 (66.7 مقابل 9.3%) وB12 (68.5 مقابل 16.7%) وB27 (46.3 مقابل 7.4%) وCw6 (44.4 مقابل 1.9%) وCw7 (68.5 مقابل 20.4%) وDR1 (59.3 مقابل 24.0%) وDR11 (27.8 مقابل 5.6%)، في حين اظهر مستضدان اخران تكرارا منخفض معنويا في المريضات وهما A19 (14.8 مقابل 44.5%) وB5 (5.6 مقابل 44.5%). وعند تقدير النمط الفرداني (HLA - halpotype) اتضح بان Cw7 هو اكثر المستضدات تكرارا في الانماط الفردانية المقدرة (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. اظهرت الخلايا اللمفية الموجبة للواسم CD3 (30.6 مقابل 60.5%) والواسم CD4 (13.4 مقابل 30.9%) تكرارا منخفض معنويا في المريضات، في حين لم تظهر الخلايا الموجبة للواسم CD8 فرقا معنويا ولكن كانت النسبة CD4/CD8 هي الاخرى منخفضة معنويا في المريضات (0.65 مقابل 1.6). اما الخلايا الموجبة للواسم CD56 فقد كان تكرارها في المريضات مرتفع معنويا عند المقارنة مع السيطرة (18.1 مقابل 10.6%).4. ارتفع المستوى المصلي معنويا (P ≤ 0.001) للحركي الخلوي IFN - γ في مريضات انتباذ بطانة الرحم عند المقارنة مع السيطرة (47.69 مقابل 21.26 بيكوغرام/مل)، وقد لوحظ ذلك ايضا للحركيات الخلوية IL - 4 (13.49 مقابل 10.47 بيكوغرام/مل) وIL - 6 (37.05 مقابل 22.11 بيكوغرام/مل) وIL - 10 (36.66 مقابل 20.74 بيكوغرام/مل) ولكن بمستوى اقل من المعنوية (0.05 و0.01 و0.01، على التوالي). ولمزيد من الفهم لدور الحركيات الخلوية في مرض انتباذ بطانة الرحم، فقد حسبت النسبة مابين IFN - γ وكل من IL - 4 وIL - 6و IL - 10 وكذلك مابين IL - 6 وكل من IL - 4 وIL - 10. اظهرت النسب الخمسة المحسوبة ارتفاعا في المرضى، ماعدا النسبة IL - 6/IL - 10 فقد كانت متقاربة في المريضات ونساء السيطرة,5. اظهرت الغلوبيولينات المناعي الثلاث (IgA : 172.7 مقابل 124.6 ملغم/د.لتر؛ IgG : 1437.9 مقابل 1126.3 ملغم/د.لتر؛ IgM : 159.3 مقابل 113.4 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي مرتفع معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.6. اظهر بروتيني المتمم (C3 : 72.3 مقابل 152.1 ملغم/د.لتر؛ C4 : 16.7 مقابل 32.3 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي منخفض معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.7. اظهر معامل البلعمة انخفاضا معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (17.37 مقابل 49.68%)، وكذلك الحال بالنسبة لمعامل NBT فقد انخفض هو الاخر معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات (21.18 مقابل 65.80%).8. لم يظهر المستوى المصلي لهرمون الحليب او هرمون LH فرقا معنويا مابين المريضات والسيطرة، وعلى العكس من ذلك فقد ارتفع معنويا (P ≤ 0.05) المستوى المصلي لهرمون FSH في المريضات مقارنة بنساء السيطرة (11.85 مقابل 6.06 ملي وحدة دولية/مل). | The present study aimed to evaluate immunological and immunogenetic backgrounds of endometriosis in a sample of Iraqi patients. The parameters of evaluation were ABO blood groups, HLA - class I (A, B and C) and - class II polymorphisms, peripheral lymphocyte markers (CD3, CD4, CD8 and CD56), serum level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IFN - γ), total serum level of immunoglobulins (IgA, IgG and IgM) and complement components C3 and C4, phagocytosis and serum level of prolactin and sex hormones (FSH and LH).Fifty four female patients with endometriosis were investigated. The patients were referred to the Al - Alwayia Hospital for Gynecology and Obstetrics (Baghdad) during the period March 2005 - January 2006. Their age's main ± standard error at the time of diagnosis was 27.3 ± 5.4 year. A similar number of healthy females (control sample) was included in the study, and they matched patients for age (25.1 ± 6.7 year) and ethnicity (Iraqi Arabs).The Study reached the following results : 1. Blood group A showed a significant (Pc = 0.016) increased frequency in patients as compared to controls (48.1vs. 22.2%), while blood group O showed a significant (Pc = 4 x 10 - 4) decreased frequency (5.6 vs. 35.2%). 2. Eight HLA antigens showed a significant increased frequency in patients. They were A28 (59.3 vs. 14.8%), B7 (66.7 vs. 9.3%), B12 (68.5 vs. 16.7%), B27 (46.3 vs. 7.4%), Cw6 (44.4 vs. 1.9), Cw7 (68.5 vs. 20.4), DR1 (59.3 vs. 24.0%) and DR11 (27.8 vs. 5.6%). Two further antigens showed a significant decreased frequency in the patients, and they were A19 (14.8 vs. 44.5%) and B5 (5.6 vs. 44.5%). HLA - halpotype estimation revealed that Cw7 occurred most frequently in most of the estimated haplotypes (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. Peripheral lymphocytes positive for CD3 (30.6 vs. 60.5%) and CD4 (13.4 vs. 30.9%) showed a significant decreased frequency in patients, while CD8+ lymphocytes showed no significant difference. The CD4/CD8 ratio also showed a significant decrease (0.65 vs. 1.6). The only cells that showed a significant increased frequency were CD56+ cells (18.1 vs. 10.6%). 4. Interferon - γ showed a significant (P ≤ 0.001) increased serum level in endometriosis patients as compared to controls (47.69 vs. 21.26 pg/ml). The same increase was observed for IL - 4 (13.49 vs. 10.47 pg/ml), IL - 6 (37.05 vs. 22.11 pg/ml) and IL - 10 (36.66 vs. 20.74 pg/ml), but with a lower level of significance (P ≤ 0.05, 0.01 and 0.01, respectively). For a further understanding of cytokines in endometriosis, the ratio of IFN - γ to IL - 4, IL - 6 and IL - 10, as well as, the ratio of IL - 6 to IL - 4 and IL - 10 were assessed. The five assessed ratios were increased in the patients as compared to controls, with the exception of IL - 6/IL - 10 ratio, which came approximated in patients and controls. 5. The three immunoglobulins (IgA : 172.7 vs. 124.6 mg/dL; IgG : 1437.9 vs. 1126.3 mg/dL; IgM : 159.3 vs. 113.4 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) increased serum levels in patients as compared with controls. 6. Both complement components (C3 : 72.3 vs. 152.1 mg/dL; C4 : 16.7 vs. 32.3 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) decreased serum levels in patients as compared with controls. 7. The phagocytic index was significantly (P ≤ 0.001) decreased in the patients as compared with controls (17.37 vs. 49.68 %). Similarly, the NBT index was also significantly (P ≤ 0.001) decreased (21.18 vs. 65.8 %) in the patients. 8. Serum level of prolactin and luteinizing hormone (LH) hormones showed no significant difference between patients and controls. In contrast, the follicle stimulating hormone (FSH) showed a significant (P ≤ 0.05) increased serum level in endometriosis patients as compared with controls (11.85 vs. 6.06 mIU/ml).

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

اسم المؤلف: علاء سالم حمزة
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة التنوع الوراثي لضروب مختلفة من الفلفل الحلو Capsicum annuum L. لعينات من الاسواق المحلية باستعمال بعض التقانات الوراثية الجزيئية == Genetic diversity study for different varieties of sweet pepper Capsicum annuum L. for samples from local markets by using some molecular genetic techniques

اسم المؤلف: شيماء صباح مهدي
اسم المشرف: احسان عرفان حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: درس التباين الوراثي في 22 عينة محلية ومستوردة من ثمار الفلفل الحلو Capsicum annuum L. التي جمعت من الاسواق المحلية العراقية باستعمال بعض المعلمات الجزيئية ، فضلا عن تعيين تركيز مادة الكاروتينات Carotenoids في ثمار الفلفل الحلو باستعمال تقانة الكروماتوغرافيا السائلة عالية ا لاداءHigh - performance liquid chromatography (HPLC)، كما كشف عن ثلاثة من الجينات المسؤولة عن انتاج هذه المادة وهي Lycopene β - cyclase (Lcyb)، β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) وCapsanthin - capsorubin synthase (Ccs) مع اجراء التسلسل التتابعي للدنا DNA sequencing لهم.درس التباين الوراثي باستعمال تقانة عديد التكوين ذات القطعة الطولية المضخمةAmplified fragment length polymorphism (AFLP) ولثلاثة توافقات بين البوادئ المستعملة في جميع العينات. انتج التوافق الاول EACG/MAGG اربعة حزم في عينات الفلفل المدروسة وبعدد ثلاثة حزم احادية الشكل Monomorphic bands في كل عينة، ما عدا عينتي الفلفل الاردني البرتقالي والاحمر التي انتجت اربع حزم في كل عينة كانت واحدة منها متعددة الاشكال Polymorphic bands وبنسبة مئوية 25% وكانت كفاءة التوافقPrimer efficiency 21.43% مع قوة فعالية تميزية Discriminatory power بنسبة 100%. انتج التوافق الثاني EAAG/MAAT اربعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 28.57% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%، بينما انتج التوافق الثالث EACA/MCTG سبعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل، ماعدا عينة الفلفل الاخضر العراقي/بلد قد انتج ثلاثة حزم وكانت ايضا احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 50% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي وتوزعت العينات ضمن التحليل العنقودي في ثلاثة مجاميع رئيسة. المجموعة الاولى ضمت ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي، بينما المجموعة الثانية فقد ضمت الفلفل العراقي/بلد الاخضر والمجموعة الثالثة فتكونت من عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. لقد اوضح هذا المخطط وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي مع عينات الفلفل الاخرى ما عدا الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبنسبة 0.94 وهي اعلى قيمة تشابه, بينما كانت قيمة التشابه مع عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر بنسبة 0.68. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي وعينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبقيمة 2.236. استعملت في دراسة تقانة تكرار التسلسل البسيط Simple Sequence Repeat (SSR - PCR) ستة بوادئ، وان هذه البوادئ قد انتجت 33 حزمة كان منها 24 حزمة متعددة الاشكالPolymorphic bands، بينما كان تسعة حزم منها احادية الشكل Monomorphic bands. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي، وبينت النتائج بان العينات قد توزعت ضمن التحليل العنقودي في عشرة مجاميع رئيسة. لقد اوضحت النتائج وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد واليوسفية الاخضر وبنسبة 1 وهي اعلى قيمة تشابه بالمقارنة مع اقل قيمة تشابه لعينة الفلفل الاسباني الطويل الاخضر وبقيمة 0.35. نسبة التشابه العالية قد ظهرت ايضا بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر والاحمر وبقيمة 0.98 وكذلك بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/صويرة الاخضر وثمار الفلفل الحلو الايطالي الاخضر وبقيمة 0.94. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد الاخضر والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر وعينة الفلفل الايراني البرتقالي وبقيمة 5.656، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاخضر والاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. استعملت في تقانة الدنا متعدد الاشكال المضخم عشوائياRandom amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) خمس بادئات عشوائية، وكانت نسبة التعدد الشكلي لجميع البوادئ 100% مع ظهور حزمة متميزة واحدة وبحجم جزيئي 1800 زوج قاعدة عندما استعمل البادئ C52، بينما لم تنتج البادئات الاخرى اية حزم متميزة. نتائج شجرة القرابة الوراثية التي رسمت بالاعتماد على معامل Jaccard للتشابه الوراثي قد وزعت العينات ضمن التحليل العنقودي الى ثمان مجاميع رئيسة. اظهرت شجرة القرابة وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/اليوسفية الاخضر وثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر بنسبة 0.84 وهي اعلى قيمة تشابه، بالمقارنة مع تشابه وبقيمة صفر بين ثمار الفلفل الحلو الايراني الاصفر وبين عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. اظهرت قيم البعد الوراثي بين عينات ثمار الفلفل الحلو المدروسة اعلى قيمة كانت بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الصيني الاصفر والايراني الاخضر وبقمة 5.0، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاسباني الاخضر والايطالي الاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. قدر اعلى تركيز للبيتا - كاروتين في عينة الفلفل الايطالي الاصفر وبقيمة 1415.73 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع اقل قيمة التي هي 94.32 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني الاخضر. كانت اعلى قيمة في الفلفل الاصفر في العينة الايطالية واقل قيمة للون نفسه كان في عينة الفلفل الايراني الاصفر وبقيمة 710.89 مايكروغرام/مليلتر، اما اعلى تركيز للبيتا - كاروتين للفلفل البرتقالي فكان في العينة الايطالية وبقيمة 898.5 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع 574.33 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني البرتقالي. الفلفل الاحمر قد سجل اقل قيمة لتركيز البيتا - كاروتين وهي 245.27 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل الاردني الاحمر، بينما سجل الفلفل الاسباني الاحمر اعلى قيمة وهي 435.41 مايكروغرام/مليلتر. الفلفل الاخضر قد سجل اعلى قيمة في عينة الفلفل الايطالي وبقيمة 232.43 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع قيمة 98.86 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر. كشف عن بعض الجينات التي لها علاقة بتصنيع البيتا - كاروتين باستعمال تقانة Polymerase chain reaction (PCR)، وباستعمال الترحيل الكهربائي لهلام الاكاروز بتركيز 2%. وجد الجين Lcyb في 11 عينة فلفل مدروسة عند الكشف عنه باستعمال البوادئ الخارجية External primers، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 19 عينة فلفل حلو مدروسة وبحجم 360 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية Internal primers. وجد الجين Crtz باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 3 عينات هي الفلفل الاردني البرتقالي، والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر والفلفل الايراني الاخضر وبحجم 760 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. وجد الجين Ccs باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر والفلفل الايطالي البرتقالي وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 7 عينات اخرى من ثمار الفلفل الحلو وبحجم 490 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Lcyb في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في عينات الفلفل الحلو المدروسة بين عينة الفلفل العراقي/الصويرة الاخضر وبين عينة الفلفل الايراني الاخضر وبقيمة 0.903، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل الاردني الاصفر وعينة الفلفل الصيني الاصفر وبقيمة 0.539. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطع الجين Crtz وجود نوعين من التغيرات الجينية هي الحذف Deletion والاستبدال Substitution في الفلفل الاردني البرتقالي. لقد كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية الكوانين G بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 846 و850، واستبدال القاعدة النايتروجينية الثايمين T بالقاعدة النايتروجينية السايتوسين C في المواقع 852، 860 و861، كذلك كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الادنين A في الموقعين 856 و862 واستبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 864 و870. طفرات الحذف ايضا كانت موجودة، اذ حذفت القواعد النايتروجينية ATA من قطعة الجين Crtz في عينة الفلفل الاردني البرتقالي بالمقارنة مع التسلسل التتابعي القياسي Refseq. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Ccs في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة، كما ان هناك بعض طفرات الاستبدال قد حدثت. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في قطع الجين Ccs بين عينة الفلفل الايطالي البرتقالي وبين عينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.966، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وعينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.611. | Genetic variation was studied in 22 local and imported samples of bell pepper fruits Capsicum annuum L., which collected from local Iraqi market by using some molecular markers. Estimation of carotenoids by using high - performance liquid chromatography (HPLC) was done in all samples. Detection of three genes; Lycopene β - cyclase (Lcyb), β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) and Capsanthin - capsorubin synthase (Ccs), were also studied and the DNA sequencing was done for these genes.Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was studied for three selective amplification primers in all samples. The first selective amplification primer (EACG/MAGG) produced 4 bands for the studied bell pepper fruits with 3 monomorphic bands in each sample, except the orange and yellow Jordanian bell pepper samples, which produced 4 bands one of them polymorphic band with 25% ratio and 21.43% primer efficiency with 100% discriminatory power. The second selective amplification primer (EAAG/MAAT) produced 4 monomorphic bands in each sample with no polymorphic bands with 28.57% primer efficiency and 0% discriminatory power, whereas the third selective amplification primer (EACA/MCTG) produced 7 monomorphic bands in each sample, except the Iraqi/Balad green bell pepper, which produced 3 monomorphic bands with no polymorphic bands and the primer efficiency is 50% with 0% discriminatory power. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 3 main groups. The first group was included the red and orange Jordanian bell pepper fruits samples, whereas the second group included the Iraqi/Balad green bell pepper and the third group included the rest samples. The results of this distribution revealed a high similarity between red and orange Jordanian bell pepper and the other bell pepper samples, except Iraqi/Balad green bell pepper with 0.94 values. This value is the higher, whereas the similarity with the Iraqi/Balad green bell pepper is 0.68 values. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between red and orange Jordanian bell pepper and the Iraqi/Balad green bell pepper with 2.236 values. Six primers were used with single sequence repeat (SSR - PCR) technique. These primers produced 33 bands. The number of polymorphic bands is 24, whereas the number of monomorphic bands is 9. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 10 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Balad green bell pepper and Iraqi/Yousifia green bell pepper with 1 value. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.35), which are found in Spanish long green. There are another high values were revealed between Jordanian yellow and red bell pepper with 0.98 value. Also, other high similarity values revealed between and Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian green bell pepper with 0.94 values. The genetic distance between the studied samples revealed the highest values between Iraqi/Balad and Yousifia green bell pepper with Iranian orange bell pepper with 5.656 values, in comparison with the lowest genetic distance between Jordanian green and yellow bell pepper with 1.0 value. The random amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) was used five randomly primers. The percentage of polymorphic bands is 100%, with one distinguished band which is produced by using C52 primer with 1800 base pair. The other primers did not produce any distinguished band. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 8 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Yousifia green bell pepper and Jordanian yellow bell pepper with 0.84 values. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.0) which are found between Iranian yellow bell pepper and the other samples. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between Chinese yellow bell pepper and Iranian green bell pepper with 5.0 values, in comparison with the lowest genetic distance between Spanish green bell pepper and Italian yellow bell pepper with 1.0 value. The higher value of β - carotene concentration was found in Italian yellow bell pepper sample with 1415.73 µg /ml, in comparison with 94.32 µg /ml, which is estimated in Iranian green bell pepper. The highest concentration values of β - carotene in yellow bell pepper was found in Italian sample, in comparison with the lowest value for the same color, which found in Iranian yellow bell pepper with 710.89 µg /ml. The highest concentration value of β - carotene in orange bell pepper was found in Italian sample with 898.5 µg/ml, in comparison with 574.33 µg/ml in Iranian orang bell pepper sample. The red bell pepper was estimated lowest concentration of β - carotene with 245.27 µg/ml in Jordanian red bell pepper, in comparison with highest value in Spanish red bell pepper with 435.41 µg/ml. The green bell pepper was estimated highest concentration of β - carotene in Italian green bell pepper with 232.43 µg/ml, in comparison with lowest value with 98.86 µg/ml in Iraqi/Souwyera green bell pepper sample. Some of genes which related with β - carotene production were detected in all samples by using Polymerase chain reaction (PCR), and the products produced by this approach were resolved on 2% agarose gels. The Lcyb gene was detected in 11 bell pepper samples by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 360 base pair in 19 bell pepper samples when internal primer was used. The Crtz gene was detected in Iraqi/ Souwyera green bell pepper sample with amplified band more than 1500 base pair by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 760 base pair in 3 bell pepper samples; Jordanian orange bell pepper, Iraqi/ Yousifia green bell pepper and Iranian green bell pepper when internal primer was used. The Ccs gene was detected by using the external primers in Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian orange bell pepper with amplified band more than 1500 base pair, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 490 base pair in 7 bell pepper samples when internal primer was used. The DNA sequences results for the Lcyb gene in some green bell pepper samples revealed high similarity between its nucleotides and Refseq for the same gene, with some differences in nucleotide sequences for some bell pepper samples. The highest similarity between nucleotide sequences was found between Iraqi/Souwyera green bell pepper sample and Iranian green bell pepper sample with 0.903 value, whereas the lowest similarity was found in Jordanian yellow bell pepper and Chinese yellow with 0.539 value. The nucleotide sequences results for the Crtz gene revealed two types of genetic changes, such as deletion and substitution in Jordanian orange bell pepper. The results found substitution in the guanine (G) nucleotide base with thymine (T) nucleotide base in 846 and 850 positions. Also, substitute the thymine nucleotide base with the cytosine (C) nucleotide base in the 852, 860 and 861 positions. Substitution also found in the cytosine nucleotide base with adenine (A) nucleotide base in the 856, 862 position, and substitute the cytosine nucleotide base with the thymine nucleotide base in the 864 and 870 positions. Deletions of nucleotide bases was also found like ATA sequence in the Crtz gene of Jordanian orange bell pepper in comparison with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene. The nucleotide sequences results for the Ccs gene in some bell pepper samples revealed high similarity with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene with some differences in some nucleotide bases of the studied samples, like substitution. The highest similarity between nucleotide sequences for the Ccs gene was found between Italian yellow and green bell pepper samples with 0.966 values, whereas the lowest similarity was found in Iraqi/Balad green bell pepper with 0.611 values.

الكشف عن انواع الجنس Fusarium المنتج للفيومنسين ب1 على حبوب الذرة الصفراء باستخدام الطرائق الجزيئية ودراسة تاثيراته المرضية النسيجية على الفئران البيض == Detection of Fusarium Species Producing Fumonisin B1 on Maize Using Molecular Methods and Study Its Histopathological Effects on Albino Mice

اسم المؤلف: سيناء وليد محمد سعيد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب | سالم رشيد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص انواع الجنس Fusarium المرافقة للذرة وقابليتها على انتاج السم FB1 باستخدام الطرق التقليدية والجزيئية. كما تم دراسة الظروف المثلى لانتاجه فضلا عن تاثيره على انسجة الكبد والكلية والطحال وقياس انزيمات الكبد والطحال في ذكور الفئران المجرعه فمويا بالسم.تم جمع ثمانية وثمانين عينة ذرة للفترة ما بين تشرين الثاني 2013 واذار 2014 من الاسواق المحلية ومخازن الحبوب في بغداد (35 عينة ذرة من مخازن الحبوب و53 عينة من الاسواق المحلية) كما وتم الكشف عن الفطرين المنتجين للفيومينيسين وهما Fusarium verticillioides وF. proliferatum باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة (PCR) وتقنية فصل الصفائح الرقيقة (TLC) وتقنية الاليزا.(ELISA) وكانت النتائج كما ياتي : 1. الاجناس الفطرية المعزولة من الذرة هي : الفطر Aspergillus وكان الاكثر سيادة (58.6%) تليه الفطرياتFusarium (17.5%) ثم Rhizopus (6.7%), Alternaria (6.1%), Mucor وPenicillum (3.9%), Bipolaris (1.9%) وTrichthecium (1.2%).2. النوع الاكثر سيادة ضمن جنس Fusarium كان F. verticillioides (70.64%) 3. اظهرت النتائج باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة المتسلسلة (species specific PCR) ان من بين سبعة وسبعين عزلة, فقط ثلاثة عشر عزلة تعود للجنس F. verticillioides ومن بين تسع عزلات فقط عزلة واحدة تعود للجنس F. proliferatum.4. تمتلك جميع عزلات F. verticillioides الثلاثة عشر الجين fum1 وبذلك يعد المنتج الرئيسي للسم FB1 مقارنة مع عزلة F. proliferatum التي لم تمتلك الجين.5. من بين العزلاتF. verticillioides الثلاثة عشر, كانت العزلة FV1 هي الاكفا في انتاج FB1 (175.39 جزء في البليون) على وسط فطيرة الذرة بينما تراوح تركيز السم FB1 لبقية العزلات يتراوح بين (21.31 - 170.51 جزء في البليون).6. كانت نتائج الظروف المثلى لانتاج السم FB1 هي وسط فطيرة الذرة وفترة حضانة 21 يوم ودرجة حرارة مثلى 20ºم.7. حددت الجرعة القاتلة المتوسطة (LD50) للسم FB1 لذكور الفئران وهي 1800 جزء في البليون.8. لوحظت زيادة في تركيز انزيمات الكبد والكلى للفئران بعد تجريعها فمويا بالسم FB1 عند التركيزين 800 و1200 جزء في البليون مقارنة مع مجموعة السيطرة.9. كشفت النتائج ان التغيرات في انسجة الكبد والكلى والطحال للفئران المجرعه فمويا بالسم FB1بالتركيزين 800 و1200 جزء في البليون، ظهرت زيادة التغيرات 10. التنكسية والموت المبرمج للخلايا مقارنه مع مجموعة السيطرة. | The study aimed to identify Fusarium species associated with maize grains and their ability to produce Fumonisin B1 using traditional and molecular methods. The optimal conditions of FB1 production were assayed. The effect of FB1 on liver, kidney and spleen tissues of albino mice were studied and measured its effects on enzymes in affected liver and kidney.Eighty - eight maize samples were collected between November 2013 and March 2014 from local markets and silos of Baghdad province (thirty - five from silos and fifty - three from markets). Fusarium verticillioides and F. proliferatum were investigated and their ability to produce Fumonisin B1 was detected using : Polymerase chain reactions (PCR), Thin layer chromatography (TLC) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) techniques. The following results were obtained from the current study : 1. The fungal genera isolated from maize were : Aspergillus (58.6 % ) followed by Fusarium (17.5% ), Rhizopus (6.8 %), Alternaria (6.1 %), Mucor and Penicillium (3.9 %), Bipolaris (1.9 %), and Trichothecium (1.2%).2. The predominant species among Fusarium was F. verticillioides (70.64%).3. The use of species specific PCR reactions for Fusarium species revealed that out of seventy seven isolates, thirteen isolates only belong to F. verticillioides and out of nine isolates, one isolate only belong to F. proliferatum.4. All the thirteen F. verticillioides isolates were shown to possess fum1 gene (FB1 producer), whereas the F. proliferatum isolate was shown not to possess this gene. 5. Among the thirteen isolates of F. verticillioides, FV1was the most efficient one in production of FB1(175.39 ppb) on patty maize medium, while the concentration of FB1 for other isolates ranged between (21.31 - 170.51) ppb. 6. The optimum culture conditions for FB1 production using solid state fermentation included : patty maize medium with incubation period 21 days at 20ºC. 7. The median lethal dose 50 (LD 50) of FB1for male mice was 1800ppb.8. liver enzymes (AST, ALT, ALP) and kidney functions (Creatinine and Blood urea) were increased in male mice which were orally gavaged FB1 at 800 and 1200ppb concentrations comparing with control group.9. The histopathological changes in the liver, kidney and spleen of orally gavaged mice by FB1 at 800 and 1200 ppb, showed a significant increase degenerative changes and apoptotic cells in comparison with control group

دراسة عن كبسولة بكتريا Acinetobacter baumannii وتاثيرها على الاستجابة المناعية == Study on capsule of Acinetobacter baumannii and its effect on Immune Response

اسم المؤلف: سيناء مهدي شاكر الخفاجي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • عزلت 34 عزلة بكتيرية تعود للنوع Acinetobacter baumannii من بين 424 عينة شملت عينات ( جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) وبنسبة 8.01% جمعت من المرضى الراقدين في مستشفى بغداد التعليمي / مدينة الطب ، وقد شخصت من خلال الصفات الزرعية (المستعمرات) والمجهرية ( البكتريا) والاختبارات الكيميائية الحياتية وباستخدام نظام Api 20 E ، وقد كانت معدلات الاصابة ببكتريا Acinetobacter baumannii في العينات المشخصة (جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) هي (15 ، 11، 6 ، 2) % على التوالي .• التحري عن عزلة كفوءة منتجة للكبسولة ، اذ امكن الحصول على عزلة كفوءة منتجة للكبسولة عند تنمية العزلات في وسط اغار نقيع القلب والدماغ المضاف اليه 5% كلوكوز وبفترة حضن 5ايام ودرجة حرارة 30 م.• التحري عن حساسية عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii تجاه 19 مضادا للحياة ، وقد اظهرت العزلات البكتيرية حساسية بنسبة 100% للمضاد Imipenem ومقاومة بنسبة 100% لمضادات الحياة (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin , Cephalothin , Tetracyclin , Aztreonam , Ciprofloxacin ) • حددت التراكيز المثبطة الدنيا لـ 8 مضادات للحياة Ciprofloxacin وGentamicin وAmikacin وTobramycin وCefotaxime وPipracillin وPiracillin +Tazobactum وCefepime واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في الـMIC لهذه المضادات ،اذ تراو حت قيم الـMIC لهذه المضادات (4 - 512 ، 8 - 1024< ،4 - 256 ، 4 - 1024< ، 16 - 1024< ، 8 - 256 ، 8 - 512) مكغم /مل على التوالي .• التحري عن قابلية عزلات Acinetobacter على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات ، اذ اظهرت العزلات البكتيرية قابليتها على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات نوع الدوز Aldose وتغييره الى لون بني .• التحري عن قابلية 18 عزلة بكتيرية منتخبة بصورة عشوائية تعود للنوع Acinetobacter baumannii على تلزين كريات الدم الحمر للانسان وباصنافه الاربعة A , B, AB, O في اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates ، وقد بينت النتائج قابلية العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للاصناف A , B AB, فيما اخفقت العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للصنف O .ثانيا - الجانب المناعي : استهدف هذا الجانب استخلاص الكبسولة من العزلة الكفوءة ودراسة تاثير تراكيز مختلـفة (25 ، 50 ، 100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على الخلايا المناعية باختيار المعايير الاتية : عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، التشكل الزهري التائي والبائي ، عملية البلعمة ، اختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم ، معامل انقسام خلايا نخاع العظم في الفئران والتحري عن الاضداد المتخصصة بمستخلص الكبسولة باجراء اختبار اخترلوني . ومنها تم الحصول على النتائج الاتية : • عدم تاثير التراكيز (25 ، 50 ، 100) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، فيما اظهرت التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل تاثيرا على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية .فقد سببت انخفاضا في عيوشية هذه الخلايا .• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التائية المكونة للتشكل الزهري الفعال والكلي نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل على الخلايا التائية.• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية البائية المكونة للتشكل الزهري نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل.• اظهرت النتائج زيادة في عملية البلعمة عند استخدام التركيز 100 مكغم /مل من مستخلص الكبسولة فيما انخفضت عملية البلعمة عند استخدام التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في النسب المئوية للخلايا المكونة للفورمازان باستخدام التراكيز (100 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في معامل الانقسام الخيطي لخلايا نخاع العظم في الفئران باستـــخدام التركيزيـــن (100 ، 250) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• تكون خطوط ترسيب بين مستخلص الكبسولة ومصول الارانب الممنعة به باستخدام المصل بدون تخفيف وعند تخفيفه بنسبة 1 : 10 ، فيما لم تظهر اي خطوط ترسيب عند استخدام التخفيفين 1 : 100 و1 : 1000 او عند استخدام المصل قبل التمنيع .ثالثا - الالتصاق البكتيري وتثبيط الالتصاق البكتيري : تضمن هذا الاختبار مقارنة التصاق عزلات مكونة للكبسولة وغير مكونة للكبسولة على البولستايرين ومقارنة التصاق عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار الانسان لمعرفة دور الكبسولة في الالتصاق ، فضلا عن تثبيط الالتصاق البكتيري باستخدام : ا - اضداد مستخلص الكبسولة Capsular antibodies ،اذ تم الحصول على مضاد الكبسولة بعد تمنيع الارانب بمستخلص الكبسولة ومفاعلة المصل المضاد للكبسولة مع عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة لبكتريا Acinetobacter baumannii ومن ثم اجراء اختبار الالتصاق البكتيري لمعرفة دور اضداد الكبسولة في تثبيط الالتصاق .ب‌ - ماتحت التركيز المثبط الادنى subMIC من خلال تنمية العزلة المكونة للكبسولة في وسط نقيع القلب والدماغ السائل BHIB الحاوي على تركيز الـ subMIC لبعض المضادات البكتيرية ، واجري اختبار الالتصاق البكتيري ومقارنة ذلك بمعدل نفس العزلة المنماة في نفس الوسط الخالي من الـ subMIC لمعرفة تاثير الـsubMIC في عملية تخليق الكبسولة وعملية الالتصاق البكتيري .• اظهرت نتائج اختبار الالتصاق على البولستايرين قابلية العزلتين المكونتين للكبسولة على البقاء ملتصقة على البولستايرين فيما اخفقت العزلتين غير المكونتين للكبسولة بالبقاء ملتصقتين على البولستايرين .• بلغ معدل التصاق البكتريا المكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية للانسان (35.62) وبذلك هو اعلى من معدل التصاق البكتريا غير المكونة للكبسولة (19.68) .• اظهرت الاضداد المتخصصة للكبسولة تاثيرا مثبطا لالتصاق العزلة المكونة للكبسولة ، فيما لم تؤثر في التصاق العزلة غير المكونة للكبسولة .• ادى ما تحت التركيز المثبط الادنــــى subMIC للمضاديــــن Ciprofloxacin 64 مكغم/مل وPiracillin + Tazobactum 16 مكغم /مل الى تثبيط الالتصاق البكتيري ، اما في حالة المضادين Cefotaxime 1024 مكغم /مل وGentamicin 4 مكغم /مل فلم يكن هنالك تاثيرا في عملية الالتصاق اذ كان الالتصاق طبيعيا اي انه لم يكن له تاثير ايضا في عملية تخليق الكبسولة .رابعا - الدراسة النسيجية : درست التغييرات النسيجية المختلفة في الفئران المحقونة بالعالق البكتيري Acinetobacter baumannii ومستخلص الكبسولة في الاعضاء ( الكبد ، الطحال ، الكلية ، الرئة ، الامعاء ) ، اذ ظهر تاثير للعالق البكتيري ومستخلص الكبسولة في كل الاعضاء وقد لوحظ تاثير العالق البكتيري في الكبد بوجود خثارات كثيرة داخل الكبد مع وجود تغير دهني ووجود قطيرات دهنية داخل نسيج الكبد ، والطحال ظهر فيه تضخم باللب الابيض في منطقة الخلايا البائية ومنطقة الخلايا التائية ، اما الرئة فقد وجد فيها احتقان مع انخماس ، وظهر في الكلية توسع بسيط في محفظة بومان مع وجود قطيرات دهنية او تغير دهني داخل الكبيبات ووجود تنكس استسقائي في بعض النبيبات ، وفي الامعاء ظهر تضخم في لطخ باير وتنكس مخاطيني . اما تاثير مستخلص الكبسولة فقد ظهر في الكبد بوجود خثرة داخل اوردة الكبد مع توسع في الجيبانيات ، وفي الرئة ظهر ارتشاح خلايا التهابية حول الاوعية الدموية ووجود خلايا التهابية حول القصبات ، اما في الكلية يلاحظ تغيير دهني في الكبيبات ، وظهر في الطحال تكوين دم خارج النخاع مع وجود فرط تنسج في اللب الابيض ، وظهر في الامعاء تضخم لطخ باير مع وجود تنكس مخاطيني . | Acinetobacter baumannii was isolated from 424 samples from wound , urine , sputum , and blood , which were collected from Baghdad hospital / Medical city, 34 isolates (8.01 %) of Acinetobacter baumannii was identified depending on the morphological , cultural ,and biochemical characteristics , by Api 20 E system. The infection rate by Acinetobacter baumannii identified samples (wound , urine , sputum , and blood ) were (15 , 11, 6, 2) % respectively .Detection the efficiency of isolate to produce a large capsular polysaccharide . Under incubation period 5 days at 30 C º and cultural media (Brain heart infusion agar + 5 % glucose) for production of a large amount of capsular polysaccharide . The susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates to 19 antibiotics were performed . All isolates were susceptible 100% to imipeneme and resistant 100% to (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin, Tetracycline , Aztreonam , Ciprofloxacin , Cephalothin Minimum inhibitory concentration ( MIC) of 8 antibiotics (Ciprofloxacin , Gentamicin , Tobramycin , Amikacin , Cefotaxime , Pipracillin , Pipracillin + Tazobactum , Cefipeme ) were determined , which they were ( 4 - 512 , 8 - >1024 , 4 - >1024 , 4 - 256 , 16 - >1024 , 8 - 256 , 8 - 512) μg /ml respectively . The ability of Acinetobacter isolates to discolored blood agar that containing sugars was detected .All isolates showed their ability to discolored blood agar that containing sugars only from type aldose. Ability of isolates that chosen randomly to agglutinate red blood cells of human A,B,AB,O blood groups in micro titration plates was done . Results showed the ability of the isolates to agglutinate red blood cells groups A,B,AB only but not blood group O . Second : Immunological aspect : Extraction of capsular polysaccharide from the efficient isolate number (26) had been done . Then the effect of different concentrations( 52, 50 ,100, 150 , 250 , 500) μg/ml of capsular extract on immune cells were studied according to following parameters : Viability of polymorph nuclear leukocytes and lymphocytes , T&B lymphocytes rosette formation , phagocytosis in vitro, reduction of nitroblutetrazolium , mitotic index test for bone marrow cells in mice , and investigation about specific capsular antibodies by ochterlony test. All these immunological tests were done , the following Results were : No effect was found of concentrations (25,50,100) μg/ml of capsule extract on viability of polymorph nuclear cells & lymphocytes , while concentrations (150, 250 , 500) μg/ml decreased it .The concentrations (100,150,250,500) μg/ml of capsular extract decreased the percentage of T&B rosette formation . Hundred μg/ml of capsular extract increase phagocytic index , while (150, 250, 500) μg/ml inhibited it . Capsular extract concentrations (100, 250, 500) μg/ml decreased number of cells producing Formosan , and (100, 250) μg/ml of capsular extract decreased mitotic index in mice. Precipitation lines were found between capsular extract and serum of immunized rabbits without dilution and with the dilution 1 : 10 .Third : Bacterial adherence and inhibition bacterial adherence : Comparison the adherence between encapsulated isolates and non encapsulated isolates on polystyrene and comparison the adherence between capsulated isolate and non encapsulated isolate on epithelial cells which took from urine to know the capsular role in adherence , and inhibit the bacterial adherence by using : 1 - capsular antibodies which were obtained after immunized the rabbits with capsular extract ,then reaction of the serum with encapsulated and non encapsulated isolates and after that the adherence test was done .2 - sub minimum inhibitory concentration (SubMIC) after growing encapsulated isolate in brain heart infusion broth containing subMIC of some antibiotics and the test of bacterial adherence was done and comparison between the same isolate growing in brain heart infusion broth with subMIC and without subMIC to find the role of subMIC in capsule production process . Results of adherence test on polystyrene showed the ability of encapsulated isolates to adhere on polystyrene while non encapsulated isolates washedout . The rate of encapsulated isolate adhere on human epithelial cells was 35.62 , and that was higher than the rate of non encapsulated isolate which was 19.68. Specific capsular antibodies inhibit adherence of encapsulated isolate, while it had no effect on non encapsulated isolate adherence . SubMIC of the antibiotics ciprofloxacin and piracillin+tazobactum had an inhibitory effect on encapsulated isolate adherence , while their was no effect when subMIC of antibiotic cefotaxime and gentamicin was used. Fourth : Histological aspect : Different histological changes in mice after injected with bacterial suspension and capsular extract were studied in organs (liver , spleen, kidney, lung, intestine) . The effect of bacterial suspension and capsular extract was noticed in all the studied organs . The effect of bacterial suspension in liver was noticed by many clotting inside the liver with fatty changes in the liver tissue , in spleen increased in white pulp size in the region of T&B cells , in lung congestion , in kidney enlargement in bowman capsule with fatty changes inside tubules with hydrobic degeneration in many tubules , in intestine enlargement in payers patches and mucosal degeneration . The effect of capsular extract was noticed in liver by the appearance of clot inside liver’s veins with enlargement in sinuses , in lung infiltration of inflammatory cells around the blood vessels with inflammatory cells around tracheas , in kidney fatty changes in glomerulus . in spleen , blood formation out of the marrow with reactive hyperplasia , in intestine enlargement in payer patches with mucosal degeneration

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

اسم المؤلف: سوسن محمد كريم
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates

دراسة مقارنة لبعض انواع النحل من فوق عائلة Apoidea الملقحة لنبات الجت Alfalfa Medicago sativa في محافظة بابل == Comparative study for some insect pollinators Apoidea that pollinated Alfalfa Medicago sativa in Babylon

اسم المؤلف: سهاد حميد حسن
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي | علي شعلان معيلف الاعرجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم في هذه الدراسة اختيار 13 حقلا من حقول الجت Medicago sativa من مناطق معينة من محافظة بابل لدراسة عملية التلقيح الحيوي لهذا المحصول خلال مدة التزهير للفترة ما بين مايس الى تشرين الاول لعام 2004، حيث استخدمت خلال هذه المدة شبكة صيد الحشرات القياسية لاخذ العينات التي بلغ عددها الكلي 185 عينة ، وقد تم تشخيص (47) نوعا تعود الى(18) جنسا تحت ست عوائل تابعة الى فوق عائلة النحل Apoidea وهي Megachilidae ,Halictidae , Anthophoridae , Andernidae , Ctenoplectridae , Apidae.قورنت عوائل النحل التابعة الى فوق عائلة Apoidea تبعا لعدد الانواع والاجناس والكثافة الكلية لكل منها، وقد وجد ان عائلتي Halictidae وMegachilidae كانتا الاكثر وفرة في عدد الانواع والاجناس وكثافة الافراد مقارنة مع العوائل الاخرى وقد شكلتا نسبة 61.1 % و72.3 % و88.5 % من العدد الكلي للاجناس والانواع والنماذج المجموعة على الترتيب. كما لوحظ وجود تذبذب في عدد العوائل والاجناس والانواع والكثافات باختلاف شهور الدراسة. وقد تبين ان شهر تموز هو الشهر الاعلى كثافة (عدد الافراد/50 كنسة) اذ بلغت الكثافة فيه 22.7 فرد/50 كنسة بينما كان شهر مايس هو الاقل عددا وبلغ 4.34 فرد/50 كنسة.تم دراسة التواجد الشهري لعوائل النحل في حقول الجت من حيث الكثافة وعدد الانواع وتبين ان العوائل اختلفت في عدد الانواع التي تمثلها وكذلك كثافاتها باختلاف شهور الدراسة.اختيرت عشرة انواع من ملقحات محصول الجت التابعة الى فوق عائلة Apoidea على اساس كثافاتها ، ثباتها وتكرار تواجدها في العينات خلال مدة الدراسة بالاضافة الى سهولة تشخيصها بالعين المجردة لغرض الدراسات اللاحقة ، وهذه الانواع هي : Megachile rotundata , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus, Megachile sp.2 (near to M.latimanus) , Nomia melanderi , Apis mellifera , Megachile sp.4, (near to M. texana), Nomia sp.2(near to N. nortoni) , Homalictus sp.1 (near to H. rowlandi) , Nomioides variegata . تم مقارنة الانواع العشرة المنتخبة من حيث معدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها ، نسب حبوب لقاح الجت ضمن الحمولة ، وزن الجسم/ملغم ، طول الخرطوم/ملم، مدة البقاء على الزهرة مقاسا بالثانية وعدد الانتقالات بالدقيقة.واظهرت النتائج ان الاناث قد تفوقت على الذكور في جمع اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح وللانواع العشرة. بينت النتائج ان هنالك ستة انواع من النحل قد تفوقت في معظم نواحي الكفاءة المنتخبة وهي : Megachile rotundata وMegachile sp.2 وsp.4 Megachile تعود لعائلة Megachilidae كذلك الانواع Nomia melanderi وNomia sp.2 (Halictidae) وApis mellifera ( Apidae) وتميزت اناث النوع M. rotundata معنويا بانها الاكثر كفاءة في حمل اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح خلال الدراسة بلغ 49750 حبة لقاح تلته اناث الانواع Megachile sp.2 وsp.4 Megachile وN. melanderi بلغ عدد ما حمل كل منهم على الترتيب (34300 , 32600 , 31550).اما ذكور النحل فقد تميزت بحمل اعداد لا باس بها من حبوب اللقاح فقد حملت ذكور rotundata . M22125 حبة لقاح تلته ذكور N. melanderi فقد حملت 16725 حبة لقاح مما يدل ان لها دورا في عملية تلقيح ازهار الجت. اختلفت معدلات اعداد حبوب التي تحملها الملقحات اختلافا معنويا باختلاف شهور الدراسة،فقد كان معدل عدد حبوب اللقاح المحمولة في شهري تموز واب اعلى مقارنة مع الشهور الاخرى وكانت اعداد حبوب اللقاح المجموعة من قبل اناث النوع M. rotundata اعلى معنويا مقارنة بالانواع الاخرى بلغت 52000 و50875 حبة لقاح خلال شهري تموز واب على الترتيب.من ناحية اخرى بلغ اعلى معدل لنسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح 91.5 % بواسطة اناث النوع M. rotundata تلته اناث النوع N. melanderi اما اقل نسبة فقد بلغت 62.6 % بواسطة النوع Nomia sp.2 .تفاوتت معدلات النسب المئوية لحبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبصورة معنوية بين شهور الدراسة ،وقد تميز كل من شهري تموز واب مقارنة بالشهور الاخرى بارتفاع معدلات نسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبلغت هذه النسبة 100% في شهر تموز بواسطة النوع M. rotundata وN.melanderi ، اما في اب فقد بلغت(100،94.1%)على الترتيب للنوعين المذكورين. وعليه فانه يبدو ان الانواع الستة هي ملقحات متخصصة لمحصول الجت.تم في هذه الدراسة ايضا قياس معدل اوزان الملقحات (ملغم) ذكورا واناثا وبينت النتائج وجود فروق معنوية واضحة بين اوزان الانواع المدروسة,وبناء عليه فقد قسمت الانواع حسب الوزن الى ثلاث مجموعات كبيرة ومتوسطة وصغيرة،كما اشارت النتائج الى وجود علاقة ارتباطية موجبة بين وزن الجسم ومعدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها هذه الملقحات. اظهرت النتائج ان ازهار الجت تزار بمجموعتين من النحل حسب طول الخرطوم(اللسين) هما مجموعة النحل طويل اللسين ،بلغت النسبة المئوية لعدد الانواع التابعة لهذه المجموعة 49% اما المجموعة الثانية فهي مجموعة النحل قصير اللسين بنسبة51% من المجموع الكلي للانواع. وبلغ اكبر معدل لطول اللسين 4.34 ملم لنحل العسل mellifera A. في حين ان اقل معدل بلغ 1.55 ملم للنوع Nomia sp.2 . واوضحت النتائج ان الملقحات المنتخبة قد اختلفت اختلافا معنويا في مدد بقائها على ازهار الجت .اقل مدة بقاء سجلت للنوع M. rotundata على ازهار محصول الجت بلغت 2.22 ثانية تلاه النوع N. melanderi 3.01 ثا ونلاحظ ان عدد الانتقالات قد ارتبط عكسيا مع مدة بقائها فقد سجل النوع M. rotundata اكبر عدد لانتقالاته على محصول الجت بلغت 22.2 انتقالة/د واقل عدد للانتقالات بلغ 11 انتقالة/د للنوع Nomia sp.2 . | Thirteen fields of Alfalfa Medicago sativa were selected from certain region in Babylon governorate to study its pollination biology during flowering period , May to October 2004, the standard insect net was used to collect (185) samples.During study the period, about (47) species were collected from the Alfalfa fields belong to (18) genus under (6) families of the super family Apoidea, these families were Megachilidae, Halictidae, Anthophoridae, Andernidae, Ctenoplectridae, Apidae.The families of Apoidea that have been collected were compared according to the number of species, number of genera and density of individual of each taxonomic group.It was found that the families Halictidae and Megachilidae were the highest in the number of species , genera and density of individual compared with other families , However, these two families represented 61.1% , 72.3% , 88.5% of total number of the genera , species and their densities respectively .The monthly variations in the number of families , genera, species and density of Apoidea were discussed . It was found that the month of July was highest in the density (number of individual/ 50 beat) reached to 22.7, while the lowest number reached to 4.34 on May.The monthly occurrence of different families of Apoidea in Alfalfa fields was investigated according to the rate of densities and the rate of number of species , However, It was appeared that the families varied in number of species and densities of each month for the study period.The alfalfa pollinators species were selected according to their densities , consistence, occurrence during the study period and easily recognized by necked eye for further study. these were included : Nomia sp2.(near to N. nortoni) , Nomia melanderi , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus , Nomioides vareigata , Homalictus sp.1(near to H. rowlandi) (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2(near to M.latimanus) , Megachile sp.4 (near to M. texana)(Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae).The ten selected pollinators were compared according to the average of pollen load, the percentage of Alfalfa pollen grain in the pollen load , body size , length of proboscis, visit duration/s , visit frequency/m ,and the result showed that the females were usually collect more pollen grain than the males of same species in all the ten selected species .It was found that six species pollinators within the ten selected species of Apoidea were significantly more active in most of the efficiency factors , these were Nomia sp2. , Nomia melanderi , (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 (Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae). The females of M.rotundata was significantly more efficient in pollen grain collection , the average number of pollen grain reached to (49750) followed by females of , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 , Nomia melanderi (34300 , 32600, 31550) pollen grain respectively . While 22125 pollen grain was collected by M. rotundata males followed by males of Nomia melanderi (16725). which seems they were importance in the pollination of Alfalfa flowers .The selected pollinators varied in average number of pollen grain in various months . However, it was found that the pollen load of each species was high during July and August compared with other month, the pollen load of females M.rotundata was (52000, 50875) pollen grain in July and August respectively.On the other hand, the highest average percentage of Alfalfa pollen grains was reached to 91.5% by females of M.rotundata followed by Nomia melanderi reached to be 85.7% , while the lowest percentage was 62.6% by Nomia sp2.The average percentage of Alfalfa pollen grain within pollen load was different significantly in each month of the study period. However, it was found that the percentage of Alfalfa pollen grain was high during July and August compared with the other months . The highest percentage of Alfalfa pollen grain was reached to (100 %) in July by M.rotundata and Nomia melanderi and was reached to (100 , 94.1%) in August also by the two species respectively . thereupon, it seems clearly that these six species of Apoidea were appeared to be specialization for Alfalfa crop pollination.The average of body size of pollinators species for males and females were measured .The results illustrated that there was significant variation in body size of selected species. Thereupon , the selected species were grouped into three groups : big, medium and small. It was found that there was positive correlation relationship between the body size and pollen load of pollinators .The results showed that the flowers of Alfalfa crop were visited by two grouped of bees , which were long-tongued bees with the percentage of 49% , and short- tongued bees with the percentage of 51% of the total number of species . The highest average of proboscis length was reached to 4.34 mm for A.mellifera , while the lowest average was reached to 1.55 mm for Nomia sp2 .The results appeared that the selected pollinators were significantly differences in the visit duration to the flowers (second) , the lowest average of the visiting duration of the pollinators was reached to 2.22 second for M.rotundata followed by Nomia melanderi which was reached to 3.01second . It was found that the visiting duration of pollinators was correlated negatively with visit frequency per minute . However , the M.rotundata has highest visiting frequency reached to 22.2 visit/ minute while the lowest visiting frequency was reached to 11 visit / minute by Nomia sp2

الكشف عن البارفوفايروس B19 بوساطة التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي في مرضى اورام الدرقية == Detection of Parvovirus B19 by Immunohistochemistry in Patients with Thyroid Tumors

اسم المؤلف: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | علي حسین محمد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Thyroid cancer is the most common neoplasm of endocrine system. In Iraq thyroid cancer ranks the eighth among ten cancers in females.Therefore, it is a growing health problem.The present study was conducted to evaluate whether or not parvovirus B19 play a role in thyroid tumors and the correlation between the existence of virus and activation of NF - κB p65. Also this study extended to determine relevant cytokines (IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α) in the microenvironment of thyroid tumors by using immunohistochemical technique.This study designed as a retrospective study. A total number of 94 formalin - fixed paraffine - embeded thyroid tumors tissue collected from archive of Histopathology Department of the Teaching Laboratories, Medical/ City, Al - Shaheed Ghazi Hospital Lab, Al - Kindy Hospital Lab, Alkarama Hospital Lab and Central Public Health Lab during the period July 2013 - November 2013. All samples are referred to the period between 2010 - 2013. Tissue blocks were divided into three groups. First group included 53 tissue block of malignant thyroid whereas second group included 41 tissue blocks of benign thyroid tumors and third group included 21 tissue blocks as control group were selected from the same benign cases which have normal tissue. From each block, seven sections of 4μm thickness were taken, one section was stained with Hematoxylin and Eosin (H&E) and the other six sections were immunohistochemically stained for human parvovirus B19, NF - κB p65, IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with malignant thyroid tumors ranged from 20 - 70 year with mean age 40±11.63 year while in benign tumors, the mean age was 37.6±11.19 year, ranged from (16 - 59) year.The papillary thyroid carcinoma was the most common type among malignant histopathological types 61%. In benign tumors the most common was follicular adenoma 29.3%.Human parvovirus B19 expression was higher in malignant tumors than in benign with no significant difference P=0.09 while it was significantly higher in malignant 66% and benign tumors 48.8% compared with their counterparts of control group 4.8%, p˂0.001.NF - κB p65 was positively expressed in all cases of malignant tumors 100% and 97.6% in cases of benign tumors compared with control group 23.8% with significant difference p˂0.001.IL - 6 expression was higher in benign than in malignant tumors with no significant difference p=0.22 while it was significantly higher in benign 90.2% and malignant tumors 81.1% compared with control group 52.4%, p=0.01 and p=0.03 respectively.Immunostaining reaction for IL - 8 was significantly higher in malignant tumors than that in benign 69.8% versus 31.7%, p˂0.001, while positive reaction was not detected in any tissue of control group.IL - 10 was expressed in 83% of malignant tumors, in 95.1% of benign tumors and 71.4% control group. The percentage of IFN - α positive was 83% in malignant tumors compared with 63% in benign tumors and normal tissue 52%. The difference was significant between malignant and benign tumors p=0.04 and between malignant and control group p=0.007.There was a significant correlation between human parvovirus B19 score category and IFN - α score r=0.296, p=0.031. But no significant correlation was noticed between B19 and the other cytokines.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة للمرضى المحبطين مناعيا ودراسة للاستجابة المناعية ضد المبيضات البيضاء == Isolation and identification of fungi associated with and study immunocompromised patients of the immune response against Candida albicans

اسم المؤلف: سعاد يوسف لفتة
اسم المشرف: سجال عبد الوهاب الركابي | هيثم عزت باقر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: خلال فترة الدراسة التي امتدت من تشرين الثاني/2003 ولغاية نيسان/2005 فقد تم اخضاع 300 مريضا يعانون من مختلف الامراض الخبيثة الى فحص داء الفطريات واظهر 17 مريضا من المجموع الكلي ان نتائج زرع الدم كانت ايجابية وان خميرة مبيضة المبيضات Candida albicans كانت المسؤولة عن معظم الاصابات بالفطريات ومن بين الحالات السبعة عشر التي تم عزلها فان تسعة منها (53% من مجموع الحالات) كانت من نوع C. albicans وان الاصابات بفطريات اخرى سواها والتي تم عزلها بلغ عددها اربعة (23% من مجموع الحالات) كانت من Aspergillus spp التي تم عزلها من حالة فردية من حالاات Cryptococcus spp وحالة ثانية من حالات زرع Trichosporone spp . ولقد اتبع اسلوب API (API candida and API 20 C AUX) كطريقة مرجعية لتشخيص ماتم عزله. وبالمقارنة مع الاساليب التي قدمت مؤخرا وهي انظمة (ID32 C) و(VITEK YBC) فان نظام API 20 CAUX وID32 كانامطابقين لمستوى السلالتين وبدون حاجة الى مزيد من الفحوصات الاضافية لتشخيص 13 حالة من الحالات الخمسة عشر التي تم عزلها اي 86.6% وان اهم ما تم التوصل اليه ثبوت ان نظام VITEK YBC يصلح جدا للمقارنة مع API 20 CAUX. ومن بين المرضى الثلاثمائة الذين تم زراعة دمهم تم فحص 71 منهم للتاكد من وجود او عدم وجود اصابة فطرية دون اجراء فحوصات على اعضاء الجسم الاخرى غير المصابة وكانت عينات الادرار هي الاكثر شيوعا من بين العينات الاخرى ومع ذلك فان عينتين فقط من مجموع 35 عينة اتفق على انها موجبة الزرع.و من بين المرضىالسبعة عشر الذين اثبت الزرع وجود فطريات لديهم فان ثمانية منهم كونوا مستعمرات من نفس الانواع الموجودة في النماذج الاخرى وان اكثر المواقع شيوعا لتكوين المستعمرات مع نفس الاحياء المجهرية كانت المجاري التنفسية والمجاري البولية - التناسلية. وكان متوسط العدلات (Neutrophils) في عينات دم موجبة الزرع 1136 خلية/ملم3 مع انحراف معياري مقداره ±1637 خلية/ملم3 في حين كان المتوسط لحالات الزرع السالبة 2701 مع انحراف معياري مقداره ±1667 . وباستعمال فحص ELISA لمضادات الجسيمات BioRad) (المتوفر تجاريا فان 25 مريضافقط من مجموع المرضى الثلاثمئة الذين اجروا الفحص اظهروا نتائج ايجابية. وان تسعة من بين هؤلاء الخمسة والعشرين اظهروا نتائج موجبة لزرع الدم ايضا في حين اظهر الستة عشر الاخرون نتائج زرع سالبة. ولم يظهر اي من افراد فريق السيطرة الاصحاء نتائج موجبة. وكانت قراءة نماذج الدم موجبة الزرع 1.11 مع انحراف معياري مقداره 0.68 في حين ان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لحالات الزرع السالب لاعضاء فريق السطرة الاصحاء كانت 0.43 مع انحراف معياري مقداره ±23 وان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لاعضاء فريق السيطرة الاصحاء كان 0.38 مع انحراف معياري مقداره 0.123. وقد اظهرت تراكيز interleukins التي تم فحصها بهذه الطريقة اختلافات كبيرة بين مجموعات الدراسة المختلفة وكذلك اختلافات بين افراد المجموعة الواحدة وان التركيز المتوسط ل IL - 1α في نماذج زرع الدم الموجبة بلغ 30.94 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±80.33 في حين ان التركيز المضبوط لحالات الزرع السالب بلغ 16.08 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 3.26 وكان التركيز المضبوط ل IL - 8 في نماذج الدم موجبة الزرع 389.2 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±383.15 في حين ان متوسط التركيز كان 163.0 بيكوغرام \مل مع انحراف معياري مقداره ± 289.9 وكان متوسط التركيز لدى مجموعة السيطرة المؤلفة من الاصحاء 5.02 بيكوغرام \مل م مع انحراف معياري مقداره ±1.81 . وكان تركيز GM - CSF في نماذج الدم 12.90 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±31.79 في حين ان متوسط تركيز حالات الزرع الموجبة كان 2.68 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 10.19. وان متوسط تركيز افراد مجموعة السيطرة الاصحاء بلغ 0.85 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 0,45. ولم يظهر مستوى الغلوبيولين المناعي اية متغيرات ملموسة بين مجموعات الدراسة سواء اكان الفحص IgG او IgM او IgA ولقد اظهر مستوىالعنصر التكميلي ل C3 اختلافات بارزة بين مجموعات الدراسة لكونه اوطا في مجموعة الزرع الموجب. وعلى كل حال لم تلاحظ اختلافات كبيرة في المجموعات بالنسبة الى C4 . وكان مستوى C Reactive Protein في المجموعات الدراسية المختلفة قد كشف عن اختلافات بارزة p=0.001 وعلاوه على ذلك فان الاختلافات كانت واضحة بين الافراد الذين هم ضمن نفس المجموعة. وكان المتوسط التقريبي لمستوى CRP في نماذج زرع الدم الموجبة 261,9 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±384.4 وفي نماذج زرع الدم السالبة بلغ 178,8 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±364.2 وفي مجموعة السيطرة التي افراده من الاصحاء بلغ 1.7 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±7.7 . وكان مستوى CRP في 58,8 من الحالات في مجموعة الزرع الموجب قد تجاوز 96 ملغ\لتر في حين ان 37.4% فقط من مجموعة الزرع الموجب تجاوزت هذا الرقم. ولم يكن يوجد بين افراد فريق السيطرة الاصحاء من تجاوز هذا الرقم.و كانت جميع الحالات التي تم عزلها بعد الفحص تستجيب الى الامفوتيريسين B مع (MIC =<1 مايكروغرام\مل) باستثناء C. krusei المنفرد الذي تم عزله والذي كان اقل استجابة من اي نوع اخر مع MIC مقداره 2 مايكروغرام\مل وMIC 50 المزدوج. وكانت نسبة سلسلة MIC الى الامفوتيريسن B تتراوح بين 0.125 الى 2 مايكروغرام\مل وبصوره عامة فان Non - albicans Candida اظهرت MIC اعلى من C. albicans التي تم عزلها وان 84.6% من الCandida التي تم عزلها كانت تستجيب الى الامفوتريسين والباقي اي 1.4% كانت حساسيتها حسب مقدار الجرعة. وان نسبة سلسلة MICs الى الفلوكونازول تراوحت بين (0.25 - 64) مايكروغرام\مل وكان جميع ما تم عزله ذا حساسية عالية تجاه الفلوكونازول باستثناء C. krusei التي اظهرت MIC عال حيث بلغ 32 واما MIC 50 وMIC 90 فقد كانت 16 مايكروغرام\مل و32 مايكروغرام\مل على التوالي. وان جميع ال Candida التي تم عزلها ونسبتها 84.6% استجابت الى الفوكونازول في حين ان نسبة 15.4% كانت حساسيتها حسب الجرعة.ان سلسلة الMIC تجاه الاتراكونازول كانت تتراوح بين (0.015 - 1) مايكروغرام\مل وكانت جميع C. albicans التي تم عزلها حساسة تجاه الاتراكونازول واظهرت خمائر الCandida الاخرى non - albicans Candida استجابة اقل نسبيا مع الحاجة الى تراكيز دوائية اعلى من اجل التوصل الى MIC وان 96.2 % من الCandida التي تم عزلها استجابت الى الاتراكونازول وان الباقي اي 30.8% كانت تستجيب حسب الجرعة. | Through the period of this study which extended from November 2003 to April 2004, 300 patients with different types of malignancies were tested for fungemia. Out of those, 17 patients showed positive blood culture results. Candida albicans accounted for the majority of fungal infections. Out of the 17 fungal isolates, 9 (53%) were C. albicans, others non C. albicans came next in frequency constituting 4 isolates (23.5%). Two isolates of Aspergillus spp. could be detected while a single isolate of Cryptococcus spp and another of Trichosporon spp. isolate were cultured API system (API Candida and API 20C AUX) was used as a reference method for the identification of isolates. Compared with the other newly introduced techniques (ID 32C systems and VITEK YBC). ), the API 20C and the ID 32 system were in agreement with the species level, without additional tests, for the identification of 13 of the 15 (86.6%) isolates.Overall, the updated Vitek YBC compares favorably with the API 20C in the identification of common yeasts. Among the 300 patients whose blood were cultured, 71 of them were screened for fungal infection from other parts of the body. Urine was the commonest sample obtained. However, two samples only out of the total (35 samples) were accepted to be culture positive. Among the 17 patients whose blood cultures proof the existence of fungi, 8 were colonized with the same species in other specimens. The most frequent sites of colonization with the same organism were the respiratory tract and urogenital tract.The mean of neutrophils count of the blood culture positive samples was 1136/c.mm with a standard deviation (SD) of 1637, whereas the mean count of culture negative cases was 2701 with a SD of 1923. Mean count of healthy control group was 5027 with a SD of 1667. Statistical analysis showed significant differences between the study groups. Using commercially available Candida - specific antibody test (Bio - Rad), 25 patients showed positive results out of the 300 patients tested. Nine of them showed positive blood culture as well, whereas the rest (16) gave negative culture results. None of the healthy control group showed positive results. Mean OD readings of the blood culture positive samples was 1.11 with a SD of 0.68, whereas the mean OD readings of the culture negative cases was 0.43 with a SD of 0.23. Mean OD readings of healthy control group was 0.38 with a SD of 0.123. Interleukins (ILs) concentration tested in this study showed significant variations among the different groups of the study as well as within the same group. Mean concentration of IL - 1α in the blood culture positive samples was 30.94 pg/ml with a SD of 80.33, whereas the mean concentration of the culture negative cases was 16.08 pg/ml with a SD of 28.75. Mean concentration of healthy control group was 7.92 pg/ml with a SD of 3.26. Mean concentration of IL - 8 in the blood culture positive samples was 389.2 pg/ml with a SD of 383.l5, whereas the mean concentration of culture negative cases was 163.0 pg/ml with a SD of 289.9. Mean concentration of healthy control group was 5.02 pg/ml with a SD of 1.81. Mean concentration of Granulocyte Macrophage - Colony Stimulating Factor (GM - CSF) in the blood culture positive samples was 12.90 pg/ml with a SD of 31.79, whereas the mean concentration of culture negative cases was 2.68 pg/ml with a SD of 10.19. The mean concentration of healthy control group was 0.85 pg/ml with a SD of 0.45. Serum immunoglobulins level showed no significant differences among the groups of the study whether IgG, IgM or IgA were tested. Mean level of C3 complement component showed significant differences between the groups of the study, being lower in culture positive group, and followed by culture negative group. However, no significant differences were noted in the groups in regard to C4. Level of CRP in different groups of the study shows significant variations (p=0.001). Moreover, variations are clear between individuals within the group itself. Approximate mean of CRP level in blood culture positive samples was 261.9 mg/L with a SD of 384.4 and, in blood culture negative samples was 178.8 mg/L with a SD of 346.2 and in healthy control group was 1.7 mg/L with SD of 7.7. CRP level in 58.8% of cases in culture positive group exceeded 96 mg/L. while only 37.4% of cases in culture negative group exceeded this value. Non in the control group exceeded this figure. All the tested isolates were susceptible to amphotericin B, with MICs ≤ 1ug/ml with the exception of a single isolate of C. krusei which was less susceptible than any other spp with MIC of 2 ug/ml and MIC50 of 2. The range of MICs to amphotericin B was from 0.125 to 2 ug/ml. In general, non - albicans Candida showed higher MIC than C. albicans isolates. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to amphotericin while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to fluconazole was from 0.25 to 64 ug/ml. All isolates were highly sensitive to fluconazole with the exception of C. krusei which showed a high MIC (32) and MIC50 and MIC90 of 16 and 32 ug/ml respectively. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to fluconazole while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to itraconazole was from 0.015 to 1.0 ug/ml. Most C. albicans isolates were sensitive to itraconazole. Non - albicans Candida showed relatively lower susceptibility with the need for higher drug concentrations to attain the MIC. 69.2% of Candida isolates were susceptible to itraconazole while the rest (30.8%) were susceptible in a dose - dependant way.

دراسة مقارنة لازالة سمية الافلاتوكسين B1 وM1 باستخدام بعض الطرائق البايولوجية والفيزيائية == Comparative Study for Detoxification of Aflatoxins (B1 and M1) by Using Some Biological and Physical Methods

اسم المؤلف: سجى يحيى عبد الجليل ابراهيم
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي | لبيب احمد الزبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الانبار
اللغة: العربية
مكان الجامعة: الانبار
الصفحات الاولى:
المستخلص: بعد تلوث الاغذية والاعلاف بالافلاتوكسين(AFB1) B1 احد اسباب المشاكل الاقتصادية والصحية الخطيرة . ووجدت الافلاتوكسين (AFM1) M1 في منتجات الالبان عندما تستهلك الحيوانات المرضعة علفا ملوثا بالافلاتوكسين B1 . تهدف الدراسة الحالية الى الكشف عن مستوى AFB1 في عينات اعلاف الحيوانات اللبنية ومستوى AFM1 في عينات منتجات الالبان في الاسواق المحلية باستخدام تقنيات مختلفة (استشراب الطبقة الرقيقة TLC، الاستشراب السائل عالي الاداء HPLC والممتز المناعي المرتبط بالانزيم ELISA). ودراسة الكفاءة الفيزياوية (تطبيق البلازما غير الحرارية)، فضلا عن الازالة السمية الحيوية (biodetoxification) لـسموم الافلاتوكسنات AFB1 وAFM1 من عينات الاعلاف والحليب على التوالي. وشملت الدراسة 275 عينة من اعلاف الحيوانات اللبنية والبان غذائية من مختلف مناطق بغداد خلال الفترة اذار 2014 - مايس 2015. تضمنت عينات اعلاف الحيوانات اللبنية 145 عينة موزعة على 55 عينة مستوردة و90 عينة محلية ، شملت كل منهما الذرة والقمح والشعيرو فول الصويا واعلاف الحيوانات اللبنية الكاملة والقش، بينما تكونت عينات منتجات الالبان من 130 عينة موزعة على 65 عينة مستوردة ومحلية لكل منهما وشملت الحليب السائل ، الحليب المجفف ، الجبن الابيض والناعم ، فضلا عن اللبن. بينت النتائج عدم وجود فرق معنوي (p≤0.05) بين تقنيتي HPLC وELISA %44.8) و41.3% على التوالي( لكشف AFB1 في عينات اعلاف الحيوانات اللبنية وAFM1 ) 50% و53.8% على التوالي) في عينات منتجات الالبان، التي قد تشير الى حساسيتهما وخصوصيتهما. في حين ان هنالك فرق معنوي (p≤0.05) بالمقارنة مع تقنية TLC (%37.9 عن AFB1 و38.5% عن AFM1). اظهرت تقنية ELISA مستوى اعلى اداء من HPLC في النتائج اذ تمكنت من الكشف عن اوطا تركيز 0.001 نانوغرام/غرام من AFB1 في القمح المحلي في حين HPLC تمكنت من الكشف عن اعلى تركيز 817.9 نانوغرام/غرام للــ AFB1 في القش المحلي ، فضلا عن قدرة ELISA في الكشف عن اوطا واعلى تركيز من AFM1 في الجبن المحلي عند (0.3 و939.67) نانوغرام / لتر على التوالي كانت اعلاف الحيوانات اللبنية الكاملة المستوردة ملوثة جميعها بــ AFB1 وبنسبة تلوث اكثر من المحلية. في حين كانت الذرة والقمح والقش المحلية اكثر تلوثا بــ AFB1 من المستوردة، بينما فول الصويا المحلي والشعير اوطا تلوثا. ان اعلى مستوى من التلوث بــ AFM1 في اللبن والحليب والجبن المحلي والمستورد يمكن ان تشكل خطرا على الصحة العامة. اظهرت الازالة السمية الفيزيائية بتطبيق البلازما غير الحرارية بان 10 ثانية كان افضل وقت تعرض لازالة سموم AFB1 وAFM1 من عينات اعلاف الحيوانات اللبنية والحليب الملوث على التوالي، عندما كان زمن التعرض عند (5 و10 و15) ثانية وحدها. تضمنت الازالة السمية الحيوية المعالجة بعترة الخميرة (Saccharomyces cerevisiae) وعترة البكتيريا (Streptococcus salivarius) في تراكيز متسلسل (1.5 × 104 - 1.5 × 108) خلية / مل، واظهرت النتائج ان افضل تركيز للعترتين البكتيرية والخميرة كان 1.5 × 108 خلية / مل لازالة سمية AFB1 وAFM1 من عينات الاعلاف والحليب على التوالي. | Contamination of feed and food by Aflatoxin B1(AFB1) is a cause of serious economic and health problems. Aflatoxin M1(AFM1) is found in dairy products when lactating animals consume feed contaminated with AFB1.The current study aimed to detection of AFB1 level in dairy animal's feed samples and AFM1 level in dairy food samples at the local markets using different techniques : (Thin Layer Chromatography (TLC), High Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Enzyme Linked Immune Sorbent Assay (ELISA), also study the efficiency of physical (non - thermal plasma application) , in addition to biodetoxification of AFB1 and AFM1 from feed and milk samples respectively .The study included collection of 275 dairy animal's feed and dairy food sample from different regions of Baghdad during March 2014 - June 2015. The dairy animal's feed samples consists of 145 sample distributed into 55 imported sample and 90 locale sample , each of them included corn, wheat, barley, soybeans, complete dairy animal's feed and straw ,While the dairy food samples consists of 130 sample distributed into 65 imported and local sample, each one of them included liquid milk, powder milks, white and soft cheeses, in addition to yoghurt . There was no significant (p≤0.05) difference in the result between HPLC and ELISA techniques in detection of AFB1 (44.8% and 41.3%, respectively) from dairy animal's feed samples and AFM1 (50% and 53.8%, respectively) from dairy food samples, that may refer to their sensitivity and specificity. While have significance (p≤0.05) difference when compared it with TLC technique (37.9% of AFB1 and 38.5% of AFM1). The ELISA technique has highest performance than HPLC , that can detect lowest concentration of AFB1 at 0.001 ng/g in the local wheat ,but HPLC can detect highest concentration of AFB1 in the local straw at 817.9 ng/g., in addition to ability of ELISA to detect lowest and highest concentration of AFM1 in the local cheese at (0.3 and 939.67) ng/L respectively . All the imported complete dairy animal's feed samples were contaminated with AFB1 more than locally samples . While the local corn, wheat and straw were more contaminated with AFB1 than imported; while local soybean and Barley were less contaminated. The highest level of AFM1 contamination was obsorved in the local and imported yogurt , milk and cheese which could be a serious risk for the public health .The physical detoxification using non - thermal plasma application showed that 10 seconds was the best exposure time for detoxification of AFB1 and AFM1 from contaminated dairy animal's feed and milk samples respectively , when exposure time was at (5, 10 and 15) seconds alone. The biodetoxification include treatment with yeast strain (Saccaromyces cerevisiae) and bacterial strain (Streptococcus salivarius) at alone in serial concentrations (1.5 x 104 - 1.5 x 108) cfu/ml, the results showed that the best concentration of bacterial and yeast strains was 1.5 x 108 cfu/ml for detoxification of AFB1 and AFM1 from feed and milk respectively.

تقييـم كفاءة وحـدة المعالجـة فـي شركـة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتريا في الازالة الحيوية لعنصري النحاس والرصاص == Evaluating the Efficiency of Treatment Unit in Diyala Electrical Industries Company and Use of Bacteria in the Vital Element for the Removal of Copper and Lead

اسم المؤلف: ساهرة حسين حسن الخالدي
اسم المشرف: فكرت مجيد حسن | عدنان نعمة عبد الرضا
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت هذه الدراسة تقييم كفاءة محطة معالجة مياه الصرف الصناعي والمنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتيريا المعزولة من المحطة للمعالجة البيولوجية. اخذت العينات شهريا من المحطة قبل المعالجة وبعدها للمدة من تشرين الثاني 2014 الى اذار .2015 وتم قياس بعض العوامل الفيزيائية مثل : درجة الحرارة والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) والتوصيل الكهربائي(EC) والملوحة. كما تم قياس تراكيز خمسة معادن ثقيلة وهي الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك .اظهرت النتائج وجود فرق معنوي قبل المعالجة وبعدها لدرجة الحرارة في كانون الاول عام 2014 فقط ، وقد تراوحت قيمها بين17.7م° في شباط 2015 الى 29.1مº في كانون الاول 2014 قبل المعالجة و16.6 ºم الى 26.01 مº في شباط 2015 وتشرين الثاني 2014، على التوالي. في حين لم يسجل قيم الاس الهيدروجيني فروق معنوية في جميع مرحل الدراسة قبل وبعد عملية المعالجة، اذ تراوحت القيم على النحو الاتي : 7.4 - 6.8 ( قبل ) في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي,) 7.01 - 7.8 بعد( في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي.سجلت النتائج ارتفاع تركيز الاوكسجين المذاب في وحدة المعالجة في مراحل الدراسة كلها، الا في شباط 2015، وتراوحت تراكيز الاكسجين المذاب 5.5 - 2.8جزء بالمليون في اذار 2015 وشباط 2015 و7.8 - 3.95جزء بالمليون في شباط 2015 وكانون الاول 2014 قبل المعالجة وبعدها على التوالي. كما لحظ انخفاض المتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) بعد المعالجة فتراوحت تراكيزهما 144 - 13) ) جزء بالمليون بالنسبة لقيم COD و(39.9 - 0) جزء بالمليون لقيم BOD . سجلت النتائج انخفاضا في قيم التوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰) في كانون الاول 2014 وشباط 2015 فقط، وتراوحت قيم التوصيلية الكهربائية على النحو التالي(1547 - 209) مايكروسمنز/سم قبل المعالجة و(448 - 1218) مايكروسمنز/سم بعد المعالجة. اما بالنسبة لقيم الملوحة فتراوحت بين ( 0.12 - 0.96) جزء بالالف قبل المعالجة و(0.27 - 0.75) جزء بالالف بعد المعالجة. لم يسجل فرق معنوي كبيرلتراكيزالعناصر الثقيلة المدروسة, اذ سجلت اعلى تراكيز لها ( 0.53و 0.99 و0.68و 0.7و(0.25 جزء بالمليون لمعادن الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك قبل المعالجة. في حين كانت تراكيزها بعد المعالجة ( 0.45و 0.41 و0.7 و0.7 و0.36) جزء بالمليون للرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك.تم عزل 60 عزلة بكتيرية من محطة المعالجة واستعملت ثلاثة انواع من البكتريا المعزولة وهي Pseudomonas aeruginosaوEscherichia coli وSulfate Reducing Bacteria. واستعملت في المختبر كعامل امتزاز , كما استعملت تراكيز مختلفة من الرصاص والنحاس100)و 150 و200) جزء بالمليون لاختباركفاءة امتزاز البكتريا المعزولة. فضلا عن ذلك تم اختبار تاثير ثلاثة عوامل مؤثر في امتزاز الرصاص والنحاس وهي الحرارة 25) و30و 37) مº ومستويات مختلفة من الاس الهيدروجيني (3و4.5 )، فضلا عن مدة التماس استخدمت مدتين ( 2 و24 ) ساعة .تم الحصول على نسب عالية لامتزازالرصاص وكما ياتي 95% و95.3% و99.7% للبكتريا E.coli , P. aeruginosaو SRBعند37مᵒ على التوالي. بينما كانت نسب امتزاز النحاس 40.63% و% 50.51و %80.57 للبكتريا E.coli , P. aeruginosa وSRB. عند درجة حرارة 37مº, على التوالي. اظهرت E.coli نسبا مختلفة من الامتزاز للمعادن تراوحت من 6.4% الى 95% في تركيز الرصاص من100 و200 جزء بالمليون وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 لكل من فترات التماس 2 و24 ساعة على التوالي . في حين تراوح امتزاز النحاس من3.5% الى %40.63 في 100 و200 جزء في المليون عند اس هيدروجيني 4.5 وخلال مدة تماس 2 و24 ساعة , على التوالي .حققت P. aeruginosa امتزازا على النحو الاتي : تراوح امتزاز الرصاص من 1.39٪ في التتركيز150 جزء في المليون الى 97.9٪ في200 جزء في المليون عند قيمة الاس الهيدروجيني3 وبفترات تماس 2 و24 ساعه على التوالي. اظهرت SRB فعالية امتزاز اكبر من الانواع البكتيرية الاخرى المستخدمة في الدراسة, وقد تراوح امتزاز الرصاص من 14.97% بتركيز 100 جزء من المليون وقيمة الاس الهيدروجيني ولفترة تماس 24 ساعة الى 99.32% في تركيز الرصاص200 جزء في المليون وقيمة الاس الهيدروجيني 3 وبفترة تماس 2 ساعة. سجلت النتائج وجود فروق معنوية في درجات الحرارة عند استخدام بكتيريا SRB في امتزاز النحاس الرصاص.واظهرت النتائج اعلى نسبة امتزاز عند 200 جزء بالمليون للعناصر كلها كما اظهرت ان هذا النوع من البكتريا قادرة على امتزاز الرصاص بمعدلات اعلى من النحاس . وفضلا عن ذلك، تم تسجيل زيادة امتزاز المعادن في درجة حرارة 37مᵒ وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 وعند مدة تماس 2 ساعة لانواع البكتريا التي شملتها الدراسة. وسجلت انواع البكتريا لمعزولة تباينا في كفاءة الامتزاز للعناصر , اذ كانت كفاءة امتزاز Sulfat Reducing Bacteria اعلى من P.aeruginosa وE.coli ، بينما كانت كفاءة امتزاز P.aeruginosa اعلى من E.coli.كشفت الدراسة ان محطة المعالجة ليست فعالة لازالة المعادن الثقيلة من مياه الصرف الصناعية والاستخدام المنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية لذا تحتاج المعالجة البايولوجية اضافة انواع من البكتريا قيد الدراسة والتي اثبتت كفاءتها في ازالة المعادن الثقيلة اذا تبين من الدراسة ان SRB هو البكتيريا الاكثر فعالية لازالة عنصري النحاس والرصاص من محاليلها المائية تليها بكتريا P.aeruginosa. | This study is conducted to evaluate the efficiency of plant treatment of the industrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries, and to use the isolated bacteria from the treatment plant for bioremediation. Sampling were taken monthly from pre and post - processing treatment during the period from November, 2014 to March, 2015. Some physicochemical factors were taken such as : temperature, pH, dissolved oxygen, Biological oxygen demand (BOD), chemical oxygen demand (COD), electrical conductivity, and salinity. In addition, the concentration of five heavy metals was determined such as : lead (Pb), cadmium (Cd), iron (Fe), Copper (Cu) and Zinc (Zn). Temperature of wastewater in treatment plant showed only a significant difference between temperature before and after treatment in December, 2014, it's values were ranged between 17.7°C in February 2015 to 29.1°C in December 2104 before the treatment, and 16.6°C to 26.01°C in February 2015 and November 2014, after treatment. Whereas, pH was not significant in all study periods before and after treatment process. Its values were ranged as follows : 6.8 - 7.4 (before) in December 2014 and March 015, respectively and 7.01 - 7.8 (after) in December 2014 and March 2015, respectively. Dissolved oxygen concentration was raised after treatment process during all the study periods, except in February2015, the concentrations of dissolved oxygen were ranged 2.8 - 5.5ppm in March 2015 and Februray 2015 and 3.95 - 7.89ppm in February2015 and December 2014 before and after treatment process, respectively. Biochemical oxygen demand (BOD) and Chemical Oxygen demand (COD) concentrations were decreased after treatment, their concentrations were ranged from 13ppm to 144ppm (COD) and 0 - 39.9ppm (BOD), the lowest values refer to after and the highest values were before treatment process. Electrical conductivity (EC) and salinity (S‰) values were decreased only in December 2104 and February 2015, they were ranged as follows : 209 - 1547 ϻS/cm (before the treatment), 448 - 1218 ϻS/cm (after the treatment) for EC, 0.12 - 0.96 ϻS/cm (before the treatment), and 0.27 - 0.75 ϻS/cm (after the treatment) for S‰, spectively. All heavy metals concentrations were not effected scientifically by the treatment. Maximum concentrations (ppm) of these metals were 0.53, 0.99, 0.68, 0.7, 0.25 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn before the treatment. While their concentrations (ppm) after the treatment were 0.45, 0.41, 0.7, 0.7 and 0.36 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn. Sixty isolates of bacteria were isolated from the treatment plant. Three isolated bacteria (Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Sulfate Reducing Bacteria) were used in the laboratory as an adsorbed factor. Different concentrations of Lead and Copper (100, 150 and 200 ppm) were used to investigate the potential adsorption of these isolated bacteria. In addition, three factors affecting lead and copper adsorption were studied. Different temperatures (25, 30, 37 °C), different levels of pH (3 and 4.5), and two contact time (2 and 24 hrs) were used in these experiments. Maximum adsorption of Lead were obtained for about 95%, 95.3% and 99.07% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. While Copper adsorption were 40.63%, 50.51% and 80.57% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. E. coli has attained different percent of metals adsorption. The adsorption was varied from 6.4% to 95% in lead concentration of 100 and 200 ppm at pH 4.5 for both values for 24hrs and 2hrs, respectively. While the Copper adsorption ranged from 3.5% to 40.63 in 100 and 200ppm at pH4.5 for 24hrs and 2hrs, respectively. P. aeruginosa has achieved the adsorption as follows : Lead adsorption was ranged from 1.39% (in lead concentration 150ppm) to 97.9% (in 200ppm) at pH3 for 24hrs and 2hrs contact time, respectively. SRB has more action in adsorption than other bacteria in this study. The adsorption of lead was ranged from 14.97% in 100ppm of its concentration at pH3 for 24hrs contact time to 99.32% in 200ppm of Lead concentration at pH3 for 2hrs contact time. The results recorded significant differences in temperature when sulfur bacteria was used in the adsorption of lead and recorded significant difference in the adsorption of copper. For heavy metals concentration, the results recorded the highest percentage adsorption at 200ppm concentration for both elements, also results showed that the type of bacteria were able to adsorb lead at higher rates than copper. Moreover, increased adsorption of metals was recorded at high temperature and pH4.5 for a 2hr contact time by the studied bacteria. The three isolated bacteria were varied in their abilities to adsorbed elements, the results recorded the adsorption efficiency of sulfat reducing bacteria was higher than P. aeruginosa and E. coli, while the adsorption efficiency of P. aeruginosa was higher than E.coli. This study revealed that the treatment plant are not efficient to remove the heavy metals from the indistrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries and it needs to add the efficiency bacteria to the plant wich removal heavy metals. The study concluded that SRB and P.aeruginosa are the most efficient bacteria to remove the Pb and Cu from their solution.

استخلاص وتنقية جزئية للكتينات بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات مرضية

اسم المؤلف: زينب نوري حامد محمد العاني
اسم المشرف: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع (50) مسحة تعود لمرضى ومراجعين لثلاث مستشفيات عامة في بغداد وذلك للتحري عن عزلات الـ Pseudomonas aeruginosa اخذت من حالات مرضية متعددة شملت الحروق والجروح والتهابات الاذن. وبعد ان اجريت على العزلات التي تم الحصول عليها الاختبارات الكيموحيوية اللازمة لتشخيصها ومنها القابلية على تحليل الدم على وسط الـ Blood agar ، امكن انتقاء (25) عزلة اظهرت قدرتها على انتاج انزيم الـ hemolysinase وتحليل وسط الدم بشكل كامل. اخضعت العزلات بعدها لاختبار القابلية على النمو على وسط السترمايد الانتقائي والقدرة على النمو في 42 م ، اذ انتخبت (18) عزلة منها. ثم تبع ذلك اختبار قابلية العزلات على انتاج اللكتينات من خلال عملية التلازن مع كريات الدم الحمر للانسان بفصائلها (O, B, A) ودم بعض الحيوانات _الماعز ، الدجاج ، الفئران والارانب) حيث تم انتقاء العزلات التي اعطت اعلى عيارية. زرعت العزلات على وسطي الانتاج (GE) Grelets mediumوالمرق المغذي (Nutrient broth) للتحري عن قابليتها على انتاج اللكتينات، ودلت النتائج على انتاجها لنوعين من اللكتينات هما PA - I والـ PA - II ، اذ يتميز الاول بتخصصه تجاه سكر الكالكتوز، فيما يتخصص الثاني بالمانوز. بعد انتهاء فترة التنمية تم استخلاص اللكتينات من اوساط الانتاج لتجري عليها عملية التنقية باستخدام كبريتات الامونيوم ثم التكسير بالموجات فوق الصوتية ، ليتم بعدها انزال الراشح باستخدام طريقة الفصل بكرموتوغرافي عمود الفصل يمكن تلخيص اهم النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : 1 - اظهرت مستخلصات اللكتينات تباينا في الفاعلية التلازنية تجاه كريات الدم الحمر للانسان والحيوان سواء اكانت معاملة بانزيم التربسين ام لم تعامل به، كما تباينت العزلات في انتاجها لانزيم الهيمولايسين وصبغة البايوسين الزرقاء. 2 - تم تحديد درجة الحرارة المثلى لنمو عزلات بكتريا الـ aeruginosa P. وانتاجها للكتينات ب37م عندما بلغ تركيز اللكتين PA - I 95 مايكروغرام / سم3 ، في حين كان تركيزه عند الحرارة 35 م مايكروغرام/ سم3. اما اللكتين PA - II فبلغ تركيزه 40 مايكروغرام / سم3 عند الحرارة 35 م . 3 - وكان لاختلاف الاس الهيدروجيني دور في التاثير على تركيز ونقاوة اللكيتنات المستخلصة. اذ لم يتجاوز تركيز اللكتين PA - II المستخلص من العزلة (Z1) الـ30 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 5.0 في حين بلغ التركيز 105 مايكروغرام / سم3 لنفس اللكتين عند الاس الهيدروجيني الامثل (7.0) . اما اللكتينPA - I فقد انخفض تركيزه من 85 مايكروغرام/ سم3 في الاس الهيدروجيني الامثل ليصل الى35 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 8.0. 4 - تمت تنقية اللكتينات المستخلصة بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام متعدد الاكريلامايد بظروف ماسخة ، من خلال تمرير اربعة نماذج مستخلصة (اضافة الى نموذج البروتينات القياسي). 5 - لدى اختبار حساسية العزلات المعزولة من التهابات الاذن لمضادات الحياة ، اظهرت تباين في مقاومتها للمضادات، وكانت جميع العزلات مقاومة لكل من الامبسلين والاموكسيسيلين، فيما كانت حساسة للمضادات توبرومايسين والجنتامايسين والارثرومايسين. 6 - لاختبار قابلية اللكتينات المستخلصة على الارتباط بالسكريات الموجودة في حليب الام وحليب البقر والحليب المصنع، دلت النتائج بانه اضافة عالق الدم صنف O الى اللكتين مع سكريات الحليب تاركا كريات الدم الحمر حرة. 7 - اثبتت تجربة استخدام المرهم الطبي المضافة له بعض السكريات البسيطة كفاءتها، بعد ان تبين قدرة هذه السكريات على تثبيط تلازن اللكتينات مع كريات الدم الحمر للانسان خارج الجسم.8 - بعد ان حقنت فئران التجارب باللكتينات (PAI,PA - II,PAII) المستخلصة من العزلات (Z4,Z1,Z1) ، كان المحتوى الكاربوهيدراتي فيها (95،48، 30) مايكروغرام/سم3 وتركيز البروتينات (1350،860، 590) مايكروغرام / سم3 على التوالي. كما ولوحظ ظهور حالات غريبة على الفئران الثلاثة في المجموعة الاولى والتي حقنت باللكتينات اعلاه وتركت بدون علاج لمدة ساعة، ما بعد قتلها فقد حدث تحلل دم كامل في الفار الاول ومتوسط في الثاني، في حين لم يحدث اي تحلل للدم في الفار الثالث. وبعد استخدام العلاج في فئران المجموعة الثانية، لم يحدث تحلل دم للفار الاول والثالث وكان التحلل ضعيفا في الثاني. اما فئران المجموعة الثالثة والتي حقنت وتركت لمدة ساعتين بدون علاج، فقد نفق الفار الاول وحدث تحلل ضعيف في دم الفار الثاني وتحلل كامل في الفار الثالث. لم يسبب اعطاء العلاج لفئران المجموعة الرابعة وتركهم لمدة ساعتين اي تحلل لدم الفار الاول والثالث فيما كان ضعيفا في الثاني. اما افراد المجموعة الثانية فقدتركت بعد الحقن ثلاث ساعات بدون علاج، وكان تحلل الدم كاملا في الفار الاول ومتوسطا في الثاني والثالث، في حين لم يحدث تحلل للدم بعد اخذ العلاج. | Fifty samples were collected from several pathogenic cases including burns, wounds and ears belonging to patients and individuals referred to three general hospitals in Baghdad. Samples were subjected to the microbiological tests for detecting Pseudomonas aeruginosa, isolales. Among those tests was the ability of blood analysis on blood agar base medium. A total of (25) isolates were selected which showed the ability to produce the hemololysins. Some suspected isolates were also subjected to grow on ctramide agar, and with stand growth at 42c. Out of (25) only (18) isolate selected due to their ability to grow at 42c. The (18) selected isolates were tested for their ability to produce lectins via the heamagglutination with the human red blood cell groups (A, B, O). Isolates showed higher titers were chosen, when ability to produce lectins, two types (PA - I and PA - II) lectins were detected. Lectin PA - ICharacterized by it’s specify toward galactose, while PA - II was specific to mannose. After lectins were extracted from the production media, they were purfeyed by using ammonium sulphate and fractioned by the ultrasonic waves, followed by descending the filtrate by separation, through the chromatographic column.Results obtained could be described briefly as : 1. Obtained lectins showed were differed in their haemagglutination activity toweras human and animals red blood cells whether they were treated by the trypsin enzyme or not. However, isolates were not similar in producing the hemolysin enzyme and pyocine pigment.2. Optimum temperature for growth of P. aeruginosa isolate, and lectins production was 37c when concentration of lectin PA - I reached 95.0 µg/ml, while at 35c was 35 µg/ml - Regarding PA - II reached 40 µg/ml at 35c.3. Variation of pH played a significant effect on the. concentration and purity of the extracted lectins. At pH5.0 lectin PA - II concentration did in exceed 30, µg/ml while at optimum pH (7.0) it reached 105 µg/ml in the optimum pH to only 35 µg/ml at pH 8.0.4. Extracted lectins purified by gel electrophoresis when four extract in addition to the standard proteins sample were passed through it. The molecular weight of the PA - I was lectin from Z1 was 14.000 Dalton, while PA_II was 12.000 Dalton from the same sample.5. When P. aeruginosa isolates of ear infection were tested for their susceptibility to some antibiotics, they differed in their pattern of resistance. However, all isolates were resistant to Ampicilin and Amoxocilin, but sensitive to Tobramycin, Erythromycin and Gentamycin.6. In order to test the ability of the extracted lectin against some sugar which present in the human milk, raw milk and powder milk, red blood cell group were added to the lectin with the milk samples. Results showed that sugars inhibited haemagglutination with the red blood cells. 7. Experiments and application of the prepared ointment containing simple sugar proved its efficiency when sugar were able to prevent lectin agglutination with human red blood cells (invitro).8. After injecting mouse with the lectins (PAI, PAII, PAII) at (Z1, Z1, Z4) isolates, concentration of CHOs were (30, 48, 95) µg/ml and protein were (135, 860, 590) µg/ml respectively. Abnormal cases were also appeared on the three mice at the first group which was injected by the lectin when they were left without treatment for one hour, after they were killed, the first one was showed complete analysis at red blood cells, while it was not complete in the second and no analysis was showed in the third one, after treatment, no analysis of red blood cells was showed in the first and the third one, but it was not complete in the second one.The third group which injected by the same lectins when they were left without treatment for two hours the first mouse was dead, and the hemolysis was not completed in the second one, but completely in the third one, after treatment no hemolysis was showed in the first and the third one, but weakly in the second one. The fourth group, which injected by the lectins when they were left without treatment for three hours, the first mouse, was showed complete hemolysis, but not complete in the second and third one, after treatment, no hemolysis of red blood cells was showed.

تقييم وبائي ومختبري لمرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط C (HCV) لحالات الثلاسيميا == Evaluation of HCV infection in Thalassemic patients Epidemiological, Virological, Immunological, Clinical and Biochemical

اسم المؤلف: زينب ناصر حسين الطرفي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يتميز التهاب الكبد الفايروسي بقابليته الوبائية على اصابة العديد من الافراد ويطلق مصطلح التهاب الكبد الفايروسي على عدد من الفايروسات المصيبة للكبد التي تم تسميتها حسب اكتشافها الى A,B,C,D,E,F,G ويعتبر التهاب الكبد الفايروسي C وBمشكلة كبيرة وذلك لعدم امكانية تشخيص الاصابة الفايروسية منذ البداية لكون اغلب الاصابات تكون بدون اعراض مرضية او باعراض خفيفة.المواد وطرائق العمل : شملت الدراسة الوبائية 1159عينة لمرضى الثلاسيميا الذين يراجعون مركز الثلاسيميا في الرصافة، والمجموعة الثانية 140915 عينة اخذت لمتبرعي الدم في المركز الوطني لنقل الدم اعتمدت من السجلات. وتم اجراء الفحوص الفايروسية (HCV,HBV,HIV) لهذه المجاميع، واجريت الفحوص الفايروسية التشخيصية الاخرى على مرضى الثلاسيميا، فضلا عن اجراء الفحوص المناعية، فحوص الدم، والفحوص الكيميوحيوية.النتائج : افرزت نتائج مرضى الثلاسيميا عن نسبة 24.76% (70عدد الذكور و110 عدد الاناث) موجبة لفحص anti - HCV، ونسبة 0.77% (7 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لفحص HBsAg، وبنسبة 0.34% (2 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لكلا الفحصين (علما ان جميع المرضى بدون علاج الانترفيرون) مقارنة مع متبرعي الدم بنسبة 0.4% لـanti - HCV و0.97% لـHBsAg،علما ان جميع نتائج فحص HIV كانت سالبة لمرضى الثلاسيميا ومتبرعي الدم، هذا بالنسبة للدراسة الوبائية. اظهرت الدراسة التحليلية المختبرية ان نسبة الاصابة بفايروس التهاب الكبد HCV اعلى في الذكور بنسبة 27.48% مقارنة مع الاناث بنسبة 21.35% بوجود فرق ذو دلالة احصائية معنوية لارتفاع نسبة الذكور عن الاناث، فيما لوحظ ان النسبة هي ذاتها 0.3% لذكور واناث مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ولوحظ ارتفاع الاصابة مع ازدياد العمر فاعلى نسبة للاصابة بـ HCV 41.5% هي للاعمار ما بين 21 - 30سنة وللمصابين بـHBV بنسبة 1.7% للاعمار ما بين 1 - 11سنة. ولوحظ ارتفاع نسبة الاصابة بـ HCV بين الاكراد بنسبة 85.7%. اما بالنسبة الى HBV فقد لوحظ ان النسبة هي 5.7% بين الاكراد، اما في العرق العربي فقد لوحظت نسبة HCV 22.83%، وHBV 0.63% وفي الكلدان لوحظ ان نسبة الاصابة بـHCV 20%. اجري فحصPCR على بعض مرضى الثلاسيميا واظهرت الدراسة ان 50% من النتائج موجبة، وباجراء الكشف عن النوع الجيني لفايروس HCV بطريقة RFLP تم الحصول على انماط جينية مختلفة تضمنت 3b,4,6,3a,2b,1b واجريت دراسة مناعية على المرضى الموجبين لفحص PCR، وكشفت النتائج ان 18% من اولئك المرضى قد ابدوا تفاعلات موجبة لاضداد النواة واضداد العضلات الملساء في حين لم يظهر اي نتيجة موجبة لاضداد الدنا، اضداد الميتوكوندريا واضداد الشحوم المفسفرة. اجري الترحيل الكهربائي لبروتينات المصل وتبين وجود ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لبروتين الكلوبيولين مقارنة بالالبومين، بارتفاع معدل بروتين كاما وانخفاض معدل بروتين الالبومين لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص HCV - PCR.اجري على بعض مرضى الثلاسيميا فحوصات عمل الكبد ولوحظ ارتفاع معدل TSB في مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فضلا عن ارتفاع معدل ALTفي المرضى الموجبين لفحص HBsAg عن المرضى الموجبين لفحص anti - HCV، كذلك لوحظ ارتفاع معدل AST لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فيما لوحظ ان معدل انزيم الفوسفاتيز القاعدي هو ضمن الحد الطبيعي لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg، وتم اختيار مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين بـ HCV,HBV واجريت عليهم عدد من الفحوص الكيميوحيوية لمستوى (البروتين الكلي، الالبومين، الكلوبيولين، اليوريا، الكرياتنين، حامض اليورك، البوتاسيوم، الفسفور غير العضوي، الكالسيوم، النحاس، الكلسترول والسكر) في الدم، ولم يلاحظ اي دلالة احصائية معنوية لهذه الاختبارات، عدا اختبار الكولسترول حيث لوحظ انخفاض معدل الكولسترول في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV الى 112.7mmol/L، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـHBV بمعدل mmol\L93.69 كما لوحظ وجود انخفاض ذو دلالة احصائية معنوية بين مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV,HBV مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV، كذلك لوحظ وجود دلالة احصائية معنوية لانخفاض معدل حامض اليورك لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV,HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا غير المصابين، ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى النحاس في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين مقارنة مع المصابين بـHBV. ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى السكر في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة بمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV وتبين وجود فرق معنوي لارتفاع معدل الفسفور غير العضوي لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين بـHCV,HBV مقارنة بالمصابين بـHBV. اجريت الفحوص المناعية على مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين وتضمنت الدراسة المناعية الكشف عن مستويات الكلوبيولينات المناعية في الدم ومكونات المتممة C3,C4فضلا عن الكشف عن اضداد الذات، ولوحظ ارتفاع نسب اضداد الذات لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غيرهم من مجاميعمرضى الثلاسيميا وتبين ارتفاع نسبة اضداد المايتوكوندريا (43.4%)، اضداد الهستون (40.9%)، اضداد العضلات الملساء (17%)، الاضداد النووية (17%)،اضداد شحم القلب (11.6%)، اضداد الشحوم المفسفرة (17%)، اضداد الدنا المزدوج الشريط (31.8%)، اضداد بروتينات النواة A - Jo - 1 (2.27%)، SS - B (4.5%)، A - Scl (3.4%) في حين ان اضداد الذات من نوع A - RNP/Sm,SS - A,A - Sm,AC - B لم يلاحظ اي نتيجة موجبة لها. اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد تم الحصول على نسبة (15.38%) لكل من اضداد الهستون، اضداد شحم القلب، اضداد الشحوم المفسفرة فيما كانت نسبة اضداد الميتوكوندريا (38.46%). كما لوحظ ارتفاع نسبة المصابين بالعامل الرثوي والبروتين الفعال في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بنسبة 46%، 68% على التوالي مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV بنسبة 38.4% لكل من RF,CRP. وتبين وجود فرق معنوي ذو دلالة احصائية لارتفاع الاصابة باضداد الذات ضد الهستون في الاناث مقارنة مع الذكور وارتفاع الذكور عن الاناث في اضداد المايتوكوندريا في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV. كذلك لوحظ ارتفاع بعض الكلوبيولينات المناعية في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بمستوى 1789 mg/dl للـIgG، ولوحظ مستوى 305.8 mg/dl للـ IgA فيما كان المستوى 203.3 mg/dl للـIgM، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV لوحظ ارتفاع مستوى IgG الى mg/dl1823.6، اما مستوى IgM وIgA فقد كان بمستوى 229.6 mg/dl، 278.8mg/dl بالتعاقب، وفي بروتينات المتممة C3,C4 لوحظ انخفاض مستوى C3 الى 82.6mg/dl فيما كان مستوى C4 23.7mg/dl وهو ضمن الحد الطبيعي الادنى في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV، اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد لوحظ ان مستوى بروتينات المتممة C3 اقل من المستوى الطبيعي 78.1 mg/dl فيما كان المستوى 20.3mg/dl الى C4.في اختبارات امراض الدم تم الحصول على دلالة احصائية معنوية لارتفاع معدل PT لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غير المصابين ومرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV، كما لوحظ انخفاض معدل تعداد كريات الدم العدلة لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. ولوحظ انخفاض معدل تعداد الصفائح الدموية لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. | Viral Hepatitis characterized by its epidemic ability to infect many people. Viral hepatitis called to many hepatic viral infection that had been classified into A,B,C,D,E,F,G. Hepatitis C infection considered a big problem related to the inability to diagnose the viral infection from the beginning because of mild or no symptoms. Material & Methods : - The epidemic study contains two groups, first group 1159 sample of thalassemic patients in Al - Rusafa Center For Thalassemic Patients. Second group 140915 samples taken from blood donors in the national blood bank from the records.Viral tests had been done for these groups (HCV,HBV,HIV). Diagnostic tests done on thalassemic patients like immunological, hematological, biochemical tests.Results : - For the epidemic study the result shows a 24.76% for thalassemic patients infected with HCV , 0.77% for thalassemic patients infected with HBV, & 0.34% for thalassemic patients infected with both HCV,HBV. 74.89% for non infected thalassemic patients compared with blood donors of 0.4% for HCV infection, and 0.97% for HBV infection.Studies for investigating laboratory tests done on thalassemic patients after confirming HCV,HBV infections through doing diagnostic viral tests.HCV Viral results shows higher percentage of male to female by 27.48% for male, 21.35% for female respectively and it was seen that the same rate of 0.3% for male and female infected with HBV. Higher infection rate with age increasing of 41.5% for age group 21 - 30 years of HCV thalassemic patients, and 1.7% for age group 1 - 11 years for HBV thalassemic patients. Higher HCV infection rate noticed for Kurdish people 85.7% , Christians 20%, and in Al - Sabeaa 40%.while the percentage of HBV in Kurdish people 5.7%, and no one infected with HBV infection in Christian and Al - Sabeaa people. For Arabic patients the percentage of HCV infection is 22.83% and 0.63% for HBV infection.HCV - PCR Thalassemic patient results show that 50% of results are positive and 50% are negative (11 out of 22 patients), doing genotyping of HCV by RFLP test shows different subtypes of HCV (3b, 2b, 1b, 3a, 4, 6).Immunological study done on PCR positive patients’ shows antibodies percentage of 18% to ASMA, ANA and 0% for each of AMA, ADNA, APL. Electroforeces done for protein of these patients show significant statistical increasing values of protein globulin in comparison to albumin decreasing.For liver function tests, applied on thalassemic patients it had been noticed that there is a significant statistical increasing values in the thalassemic patients infected with HCV as compared to other thalassemic patients not infected with HCV. Increasing the level of ALT in HBV patients compression with HCV patients, increasing the level of AST of HBV, HCV thalassemic patients where the level of alkaline phosphates in the upper limit of normal value of HCV, HBV thalassemic patients.No significant statistical values where noticed for the biochemical tests applied on some thalassemic patients infected with HCV, HBV infection except cholesterol where it had been noticed a decrease of level 112.7 mmol/L in thalassemic patients infected with HCV. 93.69 mmol/L in HBV infection patients, a significant statistical decrease value between HBV , HCV thalassemic patients in comparison with non infected patients.There is a decrease level of uric acid for the thalassemic patients infected with HCV compared with non infected patients, significant increase of copper level in the blood of HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients and not infected thalassemic patients.Significant statistical value increment for the random blood sugar in HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients.Regarding immunological study, it had been noticed that there is an increasing in autoantibody with significant statistical value for thalassemic patients infected with HCV compared with other thalassemic groups. It had been seen that there is an increasing in the mitochondrial antibodies (AMA - M2) 43.4%, antihiston antibodies (AHA)40.9%, antismooth muscle antibodies (ASMA)17%, antinuclear antibodies (ANA)17%, anticardiolipin antibody antibodies (ACL)11.6%, antiphosphotidel serin antibodies (APL - S)17%, antidouble stranded DNA antibodies (A - ds - DNA) 31.8%, other antinuclear proteins like A - Jo1 2.27%, SS - B 4.5%, A - ScL 3.4%, where the other auto antibodies A - RNP/Sn, SS - A, A - Sm, anticentromer B antibodies (A - C - B) show zero percent for each one of them while in the HBV thalassemic patients a 15.38% was obtained for each APL - S , ACL & AHA.. A 38.46% for AMA - M2.There is an increase in rheumatoid factor (RF), CRP in thalassemic patients infected with HCV compared with non infected thalassemic patients with a ratio of 46%, 68% respectively. In HBV thalassemic patients 38.4% for each RF and CRP. Significant statistical difference for increasing incidence with auto antibodies in the females compared with males of autoantibodies type AHA, AMA - M2 in thalassemic patients infected with HCV noticed.We noticed an increasing in the immunoglobulines IgG 1789 mg/dl, 305.8mg/dl for IgA in thalassemic patients infected with HCV while IgM in the upper normal range 302.3 mg/dl, complimentary portions C3, C4 shows a decrease level in C3 82.6 mg/dl, and the level of C4 is 23.4mg/dl, which is regard as the lower normal limit. While in the HBV thalassemic patients we obtain a level 1515.3mg/dl for IgG, 204.8 mg/dl for IgM and for IgA 233.3mg/dl.In the hematological tests of thalassemic patients infected with HCV shows significant increment in the level of PT test was obtained as compared with other groups of thalassemic patients. Percentage decrement in neutrophil of WBC cells in HCV thalassemic patients as compared with HBV and non infected thalassemic patients. There is a decrement in platelets count in HBV thalassemic patients compared with HCV and non infected thalassemic patients.

استخلاص ، تنقية وتوصيف انزيم اللكنين بيروكسيديز المنتج من العزلة الفطرية المحلية Aspergillus terreus == Extraction, purification and characterization of lignin peroxidase enzyme produced from local fungal isolate Aspergillus terreus

اسم المؤلف: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
اسم المشرف: ندى صباح رزوقي | غازي منعم عزيز
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 18 عزلة فطرية محلية من 75 عينة روث خيول جمعت من نادي الجادرية ونادي العامرية للفروسية في بغداد خلال 8 اشهر للفترة من تموز 2013 الى اذار 2014 . سجلت العزلة A. niger اعلى نسبة ظهور بين العزلات واعلى تكرار % 80 %9.8, على التوالي تبعتها العزلة A.fumigatus (%9.8 , % 48) ثم العزلة A.terreus (% 8.2 , % 46.66) ، بينما سجلت العزلة Absidia cerymbifera اقل ظهور واقل تكرار(%3.28 , % 5.33) تبعتها العزلة Syncephalstrum racemosum ( % 2.67 و( %1.64 على التوالي. اختيرت العزلة A.terreus SG777 كافضل عزلة لانتاج هذه الانزيمات اذ سجلت اعلى فاعلية نوعية لانتاج الانزيمات المحللة للكنين ( لكنين بيروكسيديز 11.828 ، منغنيز بيروكسيديز1.131 واللاكيز 0.527) وحدة /ملغم . ثبتت الظروف المثلى لانتاج الانزيمات المحللة لللكنين من العزلة الفطرية A. terreus SG 777 باستخدام تخمرات الحالة الصلبة ( سيقان الموز كمادة اساس ، فترة الحضن 8 ايام ،حجم اللقاح1 × 105 بوغ / مل ، برقم هيدروجيني 4.5 وبدرجة حرارة 35م°). رسب انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع %80 ثم ازيل الملح من الانزيم المنتج من عفن777 Aspergillus terreus SG باستخدام طريقة النضح الغشائيDialysis تجاه المحلول الدارئ (Tris buffer) ونقي جزئيا بواسطة كروماتوغرافيا التبادل الايونيIon exchange chromatography باستخدام المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدد مرات للتنقية بلغ 5.4 مرة وبحصيلة انزيمية مقدارها %13.7اظهر الانزيم اعلى فغالية وثباتية عند الرقم الهيدروجيني 3.0 ,في حين اقصى فاعلية للانزيم ظهرت عند درجة حرارة 40 م° مع احتفاظ الانزيم بفاعليته عند درجات حرارة تراوحت بين 25) - 35 ) م°. درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة عدة صبغات واظهرت النتائج اعلى نسبة ازالة ( 83.61 %) للانزيم تجاه صبغة الكونغو الحمراء باستخدام 65.51 وحدة / مل منه وبفترة حضن 4 ساعات وتبعتها صبغة المثيلين الزرقاء بنسية تحطيم %58.6 ثم صبغة المثيل الحمراء بنسبة ازالة بلغت % 49.9.بينما سجلت الصبغات الملاكايت الخضراء ، الالورا الحمراء والتارترازين % 24.87 ,% 28.8 , %26 على التوالي كادنى نسبة تحطيم بوساطة الانزيم قيد الدراسة . درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة المركبات الحلقية المتعددة التي تم الكشف عنها وذلك لمقارنة فاعلية الانزيم مع نتائج المعالجات في مصفى الدورة والتي تضمنت (المعالجة الميكانيكية، المعالجة الكيميوفيزيائية والمعالجة البايولوجية ) . اظهرت النتائج ازالة 97.54 % للمركب Di benzo (a ,h) anthrancene باستخدام 65.51 وحدة / مل من الانزيم قيد الدراسة وبفترة حضن 4 ساعات وبدرجة حرارة 40 م° في حين بلغت نسبة الازالة بوساطة معالجات المصفى % 54.37 كما بلغت نسبة الازالة لكل من Floureneو anthrancene قد بلغت % 95.98 و% 83.51 على التوالي مقارنة بنسبة الازالة %84.51 , % 46.83 بوساطة معالجات المصفى . قيد انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام %2 وزن / حجم من الجينات الصوديوم و200 ملي مولار و50 من مل كلوريد الكالسيوم . بينت النتائج ان % 99 من فاعلية الانزيم الحر تم تقييدها .اجريت عملية خزن انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر لمدة اربعة اسابيع عند درجة حرارة 4 م° لمعرفة مدى احتفاظ الانزيم المقيد بفاعليته الانزيمية مقارنة بالانزيم الحر، اذ لوحظ ان الانزيم المقيد قد احتفظ % 88.29 من فاعليته الاصلية بينما احتفظ الانزيم الحر حوالي 66. 02 % من فاعليته الاصلية. استخدم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر في تحطيم صبغة المثيلين الزرقاء ، اذ اظهرت النتائج ان نسبة التحطيم بالانزيم المقيد بلغت حوالي % 40.1 لفترة حضن 4 ساعات بينما بلغت نسبة تحطيم الصبغة حوالي % 25.79 باستخدام الانزيم الحر وبنفس فترة الحضن .حطم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد حوالي% 57.89 من صبغة الكونغو الحمراء عند استخدامه لاول مرة ، وانخفضت قابلية الانزيم المقيد على تحطيم الصبغة الى 16.11% عند استعماله للمرة الرابعة. | Eighteen local isolates were collected from seventy five horse manure samples taken from horses in the Equestrian Club in Jadriya and Al - Amrya / Baghdad that were investigated during the 8 months; the period isolation was started from July 2013 to march 2014. Aspergillus niger was the highest occurrence and frequency (80% and 9.8 %) respectively, followed by A . fumigatus (48 % and 9.8 %) and A. terreus (46.66 % and 8.2 % ) occurrence and frequency respectively , whereas Syncephalstrum racemosum (2.67 % and 1.64%) respectively . The isolate A. terreus had the higher specific activity of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase 11.828, manganese peroxidase 1.13 and laccase 0.53) U/mg. The optimum conditions of ligninolytic enzymes produced from A. terreus SG777 were estimated using solid state fermentation : banana stalks as a substrate, period incubation 8 days, moisture level 1 : 5 w/v inoculum size 1x105 spores /ml, pH 4.5 and temperature 35 °C. Lignin peroxidase produced from A. terreus SG777 precipitated with 80% ammonium sulfate saturation then desalting by dialysis against Tris buffer solution and partially purified by ion exchange chromatography using DEAE - cellulose. The specific activity reached 56.67U/mg with purification fold was 5.4 times and 13.7% recovery. The optimum pH for activity and stability was 3. The maximum activity was observed at 40°C and the enzyme maintained the activity when it was incubated at 25 - 35˚C. Lignin peroxidase removal the dyes during 4hr. Congo red was decolorized to the maximum extent of 83.61% in 4 hr by 65. 51 U/ml of the pure lignin peroxidase, methylene blue decolorized 58.6% and methyl red azo dye was decolorized to the extent of 49.9% ,while Malachite green triarylmethane dye, allura red and tartarazine showed minimum extent decolorized 26, 28.8 and 24.87% respectively. Degradation of poly aromatic hydrocarbons when incubated with 65.51 U/ml lignin peroxidase at 40 °C for 4 hr compared with the Refinery treatment . Results showed (97.54%) removal efficiency of Di benzo (a ,h) anthrancene by lignin peroxidase, while only 54.37% was treated by Refinery treatment. Flourene and anthrancene degradation 95.98% and 83.51% respectively, while the flourene and anthrancene degradation treated by Refinery treatment only 84.51% and 46.83% respectively. Lignin peroxidase immobilization by 2% (w/v) sodium alginate and 200 mM of calcium chloride. Results showed that 99 % from free lignin peroxidase was immobilized. The stability of immobilized and free Lip enzyme was studied during four weeks; remaining activity for immobilized Lip was 88.29 % from its original activity 76 U/ml during four weeks while free Lip remaining activity was 66. 02 % from its original activity (76.04 U/ml). Methylene blue dye degraded about 40.1% by immobilized Lip during four hr compared with free Lip which has removal only 25.79% from dye concentration. The immobilization lignin peroxidase removal 57.89 % from congo red in first use and then the immobilized lignin peroxidase ability reduced to 16.11% dye removal after four uses.

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع عائلة قفازات الاوراق من رتبة نصفية الاجنحة من بعض Hemiptera : Cicadellidae مناطق العراق == Taxonomic and Morphological Study of Some Species of Family : Cicadellidae (Order : Hemiptera) From Some Regions of Iraq

اسم المؤلف: رواء جعفر حميد
اسم المشرف: حسن سعيد جاسم الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الحشرات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study included taxonomic and morphological studies of fifteen species of leafhoppers belong to twelve genera of three subfamilies which are : Agalliinae, Deltocephalinae and Typhlocybinae of the Family : Cicadellidae, Order : Hemiptera.The studied species were collected from different regions of Iraq and thesewere species as follow : SubFamily : Agalliinae*1 - Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898**2 - Assuita megacephala SubFamily : Delatocephalinae**1 - Balclutha cytoptera*2 - Balclutha rubrostriata Melichar, 1903**3 - Balclutha xanthous**4 - Cicadulina laterostriata**5 - Circulifer wilsoni**6 - Eucelidius irakensis**7 - Exitianus transversus*8 - Neoalitarus argillaceus Mityaev, 1975**9 - Neoalitarus nigrosus**10 - Opsianus bronopunctatus*11 - Opsius cypriacus Lindberg, 1958*12 - Orosius albicinctus Distant, 1918 SubFamily : Typhlocybinae**Emposca phosphoviridisThe species marked by one star were regarded as new record species to the Iraqi fauna of Cicadellidae while those marked by two stars were regarded as new to science.Species Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898 regarded as sample of the family.

انتاج وتوصيف Protease من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من بعض الحالات السريرية وعلاقته ببعض المضادات الحيوية == Production and Characterization of Protease from Pseudomonas aeruginosa Isolated from Some Clinical Cases and its Relation with some Antibiotic Agent

اسم المؤلف: رنا مجاهد عبد الله الشويخ
اسم المشرف: سمير فتح الله سمعان | سعود رشيد العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (170) عينة من حالات مرضية مختلفة التي تضمنت (35) مسحة من الجروح و(47) مسحة من الحروق و(25) مسحة من حالات التهابات الاذن الوسطى فضلا عن عينات الادرار التي تضمنت (63) عينة وجمعت العينات من مستشفى الكاظمية التعليمي للمدة من 1 - 5 - 2005 ولغاية 1 - 8 - 2005 .  تم تشخيص (50) عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اذ زرعت على اوساط اغنائية وتفريقية لغرض العزل الاولي ثم اخضعت المزارع البكتيرية للفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها ، ثم استخدمت عدة الفحصapi20E للتشخيص النهائي لهذه العزلات ، اذ تضمنت (8)عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa (16%) من حالات التهاب الجروح ، (16) عزلة (32%) من التهابات الحروق ، (20) عزلة (40%) من حالات التهاب المجاري البولية و(6) عزلات (12%) من حالات التهاب الاذن الوسطى .  اختبرت حساسية بكتريا Pseudomonas aeruginosa ضد (20) مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية . اذ اظهرت بكتريا Pseudomonas aeruginosa نسبة المقاومة(100%) تجاه مضادات الامبسلين ، الاموكسسلين ، الاموكسسلين / حامض كلافيولونك ،الكلوكساسلين والسيفازولين . بينما بلغت نسبة المقاومة لمضادات السيفاكسيم ، الكاربنسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم (98%) ، (84%) ، (80%) و(78%) على التوالي. وبلغت نسبة المقاومة لمضادات الجنتاميسين ، التوبرامايسين ، الببراسيلين ، النورفلوكساسين ، الاميكاسين والسبروفلوكساسين (52%)، (26%) ، (24%) ،(14%) ،(6%) و(4% )على التوالي . في حين اظهرت جميع العزلات لبكتريا Pseudomonas aeruginosa حساسية عالية (100%) تجاه مضادات الازترونام ، امبينيم والسيفابيم البيفلوكساسين والافلوكساسين .  قدرت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs ) للمضادات الحيوية وكانت اعلى نسبة مقاومة لمضادات الاموكسسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم . اما نسبة المقاومة لمضادات الامينوكلايكوسايد فكانت تتراوح (4 - 128) مايكرو غرام / مل للتوبرامايسين ، (4 - 256) مايكرو غرام / مل للجنتاميسين اما لمضاد الاميكاسين فكانت (4 - 128) مايكرو غرام / مل. في حين اظهرت قيم MIC حساسية عالية (100%) لمضادي السبروفلوكساسين والسيفابيم.  اظهرت نتائج خلط مضادات السبروفلوكساسين مع كل من الجنتاميسين والسيفتازديم والببراسيلين نتائج مهمة في تخفيف التراكيز المثبطة الدنيا لكلا المضادين المستخدمين لوحدهما ضد هذه البكتريا . كذلك اظهرت نتائج خلط مضادي التوبرامايسين مع السيفتازديم فعالية عالية عند خلطهما معا واستعمالهما ضد بكتريا Pseudomonas aeruginosa . اظهرت (86%) من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa قابليتها على انتاج انزيم البروتييز . اظهرت النتائج تاثر انزيم البروتييز الخام ببعض المضادات الحيوية التي ادت الى انخفاض في فعالية الانزيم عند زيادة تركيز هذه المضادات .  كانت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتييز عند استخدام وسط لوريا عند رقم هيدروجيني(8) ولمدة(48) ساعة من الحضن بدرجة حرارة(35) م º . نقي انزيم البروتييز من العزلة Pseudomonas aeruginosa PsaW2 باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الايوني DEAE - celluloseوكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100. قدر الوزن الجزيئي للانزيم المنقى بطريقة الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100 وكان (21379 ) دالتون ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية البروتييز (35) م º والرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم كانت (8) . اوضحت نتائج تاثير بعض المثبطات والعوامل المختزلة والكلابية في فعالية الانزيم ، ان فعالية الانزيم قد ازدادت عند معاملته بايونات Ca++ وZn ++ مما يدل انها تلعب دورا في تحفيز وثبات الانزيم ، ولم تثبط فاعلية الانزيم بوجود العوامل المختزلة مثل السستين ، بينما تثبط فعالية الانزيم بوجود العوامل الكلابية EDTA .  اظهر انزيم البروتييز المنقى من بكتريا Pseudomonas aeruginosa فعالية عالية عند خلطه مع مضادي الفانكومايسين والسيفازولين في علاج التهابات العيون في الارانب والمتسبب عنها بكتريا Staphylococcus aureus . |  One - hundred and seventy swab samples were collected from different cases including (35) wound and (47) burn infection , (25) otitis media and (63) samples from urinary tract infections from Al - Kadhymia Teaching Hospital in Baghdad city . The study period was from 1 - 5 - 2005 to 1 - 8 - 2005 .  Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified using different microscopical , cultural characteristics and biochemical tests . Final identification of bacteria were performed by using api20E system. The isolates were 8(16%) from burn infections , 20(40%) isolates from urinary tract infections , 16(32%) isolates from burn infections and 6(12%) isolates from otitis media . The sensitivity of Pseudomonas aeruginosa isolates was been tested against (20) antibiotics showed isolates version resistance with different percentage against antibiotics .Pseudomonas aeruginosa exhibited (100%) resistance to Ampicillin , Amoxycillin , Amoxycillin / clavulanic acid, cloxacillin and cefazolin .While percentages of resistance to cefixime , carbencillin, cefotaxime and ceftazidime were (98%) ,(84%) ,(80%) and ( 78%) respectively .Resistance percentages to Gentamicin ,Tobramycin , Piperacillin , Norfloxacillin , Amikacin and Ciprofloxacine were (52%),(26%),(24%),(16%),(14%)and(4%) respectively. All isolates of Pseudomonas aeruginosa were highly sensitive (100%) to Aztronam , imipenem , cefepime , P - ofloxacin and ofloxacin .  Minimum inhibitory concentrations of Amoxycillin , cefotaxime , ceftazidime and piperacillin showed higher percentage of resistance . While resistance to aminoglycoside antibiotics including Tobramycin was (4 - 128) μ g / ml , Gentamicin was (4 - 256) μ g / ml and Amikacin was (4 - 128) μ g / ml . On the other hand , all bacterial isolates were susceptible (100%) to Ciprofloxacine and Cefepime .  Combinations of Ciprofloxacine with Gentamicin , ceftazidime and piperacillin gave interesting results against the local bacterial isolates in reducing their MIC values . Tobramycin and ceftazidime gave an obvious decrease in MIC values after combination of these drugs and used against Pseudomonas aeruginosa . A (86%) of the isolates of Pseudomonas aeruginosa have ability to produce protease enzyme . Enzyme activity was affected by some antibiotics . This activity was reduced with increasing the concentrations of these antibiotics . The optimum conditions for protease production were in LB medium with a pH (8) after (48) hrs of incubation at (35) C .  Purification of the protease was done using ion exchange chromatography DEAE - cellulose and gel filtration with sephadex G - 100 .  Molecular weight of the purified protease was measured by sephadex G - 100 and it was found to be around (21379 ) Dalton . The optimum temperature of enzyme activity was (35) C . However , the pH (8) was for activity and stability of this enzyme .  Zn++ and Ca++ ions may play a role in the enhancement and stability of the enzyme . Enzyme activity was not inhibited in the presence of reducing agent such as Cysteine , but it was inhibited in the presence of EDTA .  Pseudomonas aeruginosa purified enzyme shows a high activity when combined with Vancomycin and cefazoline and used for the treatment of the eye infection in rabbits caused by Staphylococcus aureus .

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

اسم المؤلف: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
اسم المشرف: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

اسم المؤلف: زاكروس كمال احمد البرزنجي
اسم المشرف: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

اسم المؤلف: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
اسم المشرف: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: خولة جبر خلف المحمداوي
اسم المشرف: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

التنوع والانتشار الجغرافي لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى، العراق == Diversity and geographical distribution of freshwater Gastropods in Diyala river basin , Iraq

اسم المؤلف: خنساء سلمان فرمان
اسم المشرف: عماد الدين عبد الهادي المختار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء الدراسة الحالية للتعرف على التنوع الاحيائي والتباين المظهري لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى في العراق ولهذا الغرض تم اختيار 10 مواقع موزعة على قطاعين : القطاع الشمالي ويتمثل منطقة شمال سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة دربنديخان Dar , موقع مدينة كلار Kal , موقع رافد الوند في مدينة خانقين Wan وموقع مدينة جلولاء Jal . القطاع الجنوبي ويتمثل بجنوب سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة حمرين Him, موقع ناظم الصدور Sud , موقع جدول مهروت Mah في مدينة المقداديه , موقع مشروع الخالص الاروائيKha , موقع جدول السارية Sar وموقع مدينة بعقوبة Baq . ناولت الدراسة التعرف على العوامل الفيزيائية والكيميائية والتي شملت : درجة الحرارة , الاس الهيدروجيني , تركيز الاوكسجين المذاب , التوصيلية الكهربائية , سرعة التيار , تركيز الكالسيوم , نسبة المواد العضوية ونسجة القاع لمواقع الدراسة . جمعت عينات شهرية لبطنية القواقع المائية عن طريق اسطوانة جمع العينات من المواقع للفترة من نيسان 2013 - كانون الثاني 2014 عدا الموقعين دربنديخان وكلار حيث جمعت العينات فقط خلال شهري ايلول وتشرين الاول 2013 . وتم تشخيص العينات بالاعتماد على النماذج المحفوظة في متحف التاريخ الطبيعي البريطاني . تم حساب الكثافة والوفرة النسبية والتردد لكل نوع خلال فترة الدراسة كما شملت قياس التباين المظهري للانواع المشتركة بين القطاعين . والارتباط بين العوامل البيئية والانواع وبين الانواع بالاضافة الى قياس التماثل بين الجماعات السكانية للمواقع . تراوحت قيم درجة الحرارة للمياه المسجله للمواقع خلال فترة الدراسة ( 10 - 33 )º م واظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في حين سجلت ظهور فرق معنوي بين الاشهر كما تراوحت قيم الاس الهيدروجيني ( 6.6 - 8.1 ) مع انها تميل الى ان تكون قاعدية في اغلب المواقع كما اظهرت عدم تسجيل فرق معنوي بين القطاعين . ظهر من قيم الاوكسجين الذائب الذي تراوح بين ( 6.1 - 10.7) ملغم /لتر ان المواقع ذات تهوية جيده وبين التحليل الاحصائي عدم وجود فرق معنوي بين القطاعين في حين سجل وجود فرق معنوي بين القطاعين في قيم التوصيلية الكهربائية التي تراوحت بين ( 1530 - 450) مايكروسيمنز /سم , كما اظهرت النتائج وجود فرق معنوي في سرعة الجريان بين المواقع حيث تراوحت بين اعلى قيمة سجلت في موقع كلار 1.3 م/ثا الى اوطئ قيمة سجلت في الصدور والتي تقدر 0.08م/ثا الا انها لم تسجل فرق معنوي بين القطاعين في اغلب اشهر البحث . كما تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل مختبريا منها تركيز الكالسيوم في المياه حيث سجلت تراكيز عاليه في الموقعين الوند وبعقوبه مقارنة بالمواقع الاخرى حيث بلغت 210 ملغم /لتر في حين بلغت سجلت اقل تركيز في الصدور 41 ملغم / لتر وسجلت وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في اغلب الاشهر , كما تراوحت نسب المادة العضوية في رواسب القاع بين ( 0.6 - 4.1) % مع تسجيل فرق معنوي بين القطاعين , تباينت نسجة القاع بين مواقع الدراسة مزيجيه طينية رمليه للمواقع دربنديخان والوند وجلولاء وعرينيه طينية في كلار ومزيجيه رملية في حمرين في حين كانت طينية في الموقعين الخالص والسارية ومزيجيه في مهروت وبعقوبه . تم خلال فترة الدراسة تشخيص 12 نوع تنتمي الى 8 عوائل وشملت : عائلة Neritidae تضمنت نوعين Theodoxus jordani وNeritina mesopotamica , عائلة Valvatidae شخص Valvata saulcyi وعائلة Viviparidae تم تشخيص Bellamya bengalensis وكما تم تشخيص الانوع Melanopsis costata , M.nodosa , M. subtingitana وM. preamorsa التي تنتمي الى عائلة Melanopsidae وMelanoides tuberculata من عائلة Thiaridae وLymanaea natalensis من عائلىة Lymnaedae وPhysa acuta من عائلة Physidae وPlanorbis gibbonsi من عائلة Planorbidae . وقد بينت النتائج ظهور Physa acuta في جميع المواقع في كما سجل الموقع Dar اعلى كثافة لمجموع الافراد والموقع Jal. اقلها في حين سجلت T.jourdani هي اكثر الانواع كثافة مقارنة مع الانواع المدروسة الاخرى . كما اظهرت النتائج ان اعلى كثافة للانواع تكون في اشهر الخريف والربيع ولكنها تنخفض في اشهر الصيف والشتاء كما اظهر تحليل الارتباط بين الانواع والعوامل البيئية بان كثافة الانواع لا تتاثر بتركيز الكالسيوم في حين هناك تباين في استجابة الانواع لبقية العوامل التي تمت دراستها تم دراسة التباين المظهري للغلاف باستخدام تقنية المقياس المظهري الهندسي . حيث اجريت المقارنة بين الانواع المشتركة بين القطاعين الشمالي والجنوبي لقياس الاختلاف في الحجم لمركزي والتماثل لحجم وشكل الغلاف للانواع المشتركة Theodoxus jordani , Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis , Physa acuta وPlanorbis gibbonsi واظهرت النتائج وجود فرق معنوي في الحجم المركزي للانواع T. jordani ، P.acuta ، M.preamorsa وLymnaea natalensis كما سجلت نتائج التماثل الشكلي وجود تباين معنوي في التماثل لحجم الغلاف للنوع P. acuta. | The present work was conducted to study the biodiversity and the shell’s morphological variation of the Freshwater Gastropods in Diyala River basin northeast Iraq. For this purpose 10 sites were selected within two sectors of the River basin. A northern sector, represented the area north of Himreen’s dam and lake, including : Darbandikhan lake site (Dar); Kalar town site (Kal); Alwand tributary site in Khanaqin (Wan); Jalula city site (Jal). The Southern sector represented the area below Himreen’s dam and lake : Himreen lake site (Him); Al Sudor regulatory Dam site (Sud); Mahroot stream site at Moqdadia city (Mah); Al Khalis irrigation canal site (Kha); Al saria stream site (Sar); and Baqubah city site (Baq). Physical and chemical properties at the study sites were measured. These included : water temperature, pH, Dissolved Oxygen Concentration, Electrical Conductivity, Current Velocity, Calcium Concentration, sediment organic matter content and bottom Sediment particle size. Gastropods samples were collected monthly by a cylinder sampler from all sites for the period April 2013 through January 2014, with a small exception regarding Darbandikhan and Kalar sites. Gastropods species identification was aided by consulting preserved material at the British Natural History Museum (NHMUK). Occurrence, population density and relative abundance of each species were calculated. The morphological variation of the gastropod shells collected from different area sectors within the River basin were also determined. Correlation between gastropod species and the environmental factors were also recorded, in addition to investigating similarities between the studied sites in environmental factors and species density. Values of water temperature ranged between (10 - 33) ºC. No significant difference between sites nor between sectors, but only between months was detected. Values of the pH ranged between (6.6 - 8.1), tending to be alkaline at most sites. These values showed significant difference between the two sectors. The dissolved oxygen values ranged between (6.1 - 10.7) mg /l indicating good oxygenation with no significant difference between sites of the two sectors. However, electrical conductivity EC values ranged between(450 - 1530) µs/cm. A significant difference was revealed between the values of the two sectors, highest value of Current velocity was recorded at Kalar (1.3 m/sec.) and the lowest value was recorded at Al Sudor(0.08 m/sec.), but these records showed no significant difference between the two sectors in most months. Calcium concentration in the water showed presence of high concentrations (210 mg/l) at sites Al wand and Baqubah. While the lowest concentration (41 mg / L) was recorded at Al sudor, but no significant difference between sites or between sectors was evident in most months.Sediment content of organic matter ranged (0.6 - 4.1)% showing significant difference between the northern and southern sectors. Bottom sediment particle size and texture varied from sandy - clay - loam at sites Darbandikhan, Al wand and Jalula, to silt - clay at Kalar, sandy - loam at Himreen, clay at Khalis and Alsaria, and loamy at Mahroot and Baqubah. A total of twelve species of gastropods belonging to eight families were identified. Family Neritidae included two species Theodoxus jordani and Neritina mesopotamica; family Valvatidae included Valvata saulcyi; family Viviparidae included Bellamya bengalensis; family Melanopsidae included Melanopsis costata, M.nodosa, M. subtingitana and M .preamorsa; family Thiaridae included Melanoides tuberculata; family Lymnaedae included Lymanaea natalensis; family Physidae included Physa acuta; and family Planorbidae included Planorbis gibbonsi. Results showed that Physa acuta was present at all sites. while Theodoxus jordani was the highest density recorded. The highest density of the total individuals was recorded at Darbandikhan and the lowest was at Jalula site. The results showed that highest density of Gastropods population was recorded in Spring and Autumn months and decline in Winter and Summer months The correlation analysis between species and environmental factors showed that population density of species was not affected by the concentration of calcium while there was evident variation in the response of species to most other environmental factor. The variation in shell morphological features was investigated using Geometric Morphometric technique. Specimens from northern and southern sectors were compared to detect differences in the centroid size, symmetry of shell shape and size for shells of the most common species : Theodoxus jordani, Melanopsis preamorsa, Lymnaea natalensis, Physa acuta and Planorbis gibbonsi. Results showed variation existed in centroid size for Teodoxus jordani ,Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis and Physa acuta , but the analysis of symmetry in shell size and shape for the recorded species showed significant variance in the shell size of P.acuta only.

دراسة تصنيفية حياتية لانواع معينة من الجنس Astragalus L. من العائلة البقولية Leguminosae في العراق == Biosystematic study of certain species of the genus Astragalus L. from the family Leguminosae in Iraq

اسم المؤلف: خنساء رشيد مجيد
اسم المشرف: خليل ابراهيم الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالیة الى تصنیف انواع من الجنس Astragalus L. من خلال دراسة الصفات المظهریة والتشریحیة والكیمیائیة والوراثية والتوزيع الجغرافي والتصنيف العددي لستة قطاعات متكاملة والحاوية عشرة انواع جمعت من مقاطعات وسط وشمال وجنوب العراق، والقطاعات والانواع التي درست هي : Sec. Aulacolobus : A. guttatus Banks & Sol. ; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus Fisch. & Mey. and A. hamosus L.; Sec. Harpilobus : A. corrugatus Bertol. and A. hauarensis Boiss.; Sec. Hololeuce : A. alyssoides Lam.; Sec. Malacothrix : A. mollis M. Bieb. , A. pulchellus Boiss. and A. sarae Eig.; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis Stev. تضمنت الدراسة التعرف على الصفات المظهریة للجذور والسیقان والاوراق والنورات الزهریة والازهار والثمار والبذو، اما في الجانب التشریحي فتم دراسة التغايرات بین الانواع المدروسة على مستوى السیقان والاوراق والسويق) البشرة والقشرة، عددها وسمكها واعداد الحزم الوعائیة وترتیبها واشكالها ( والمعقدات الثغریة ونمط التعرق اذ كان من نوع Brochidodromous في جميع الانواع المدروسة، كم درست اشكال حبوب اللقاح وبینت نتائج الدراسة الحالیة ان هناك امكانیة للفصل بین الانواع المدروسة باستعمال بعض الصفات المظهریة الدقیقة لحبوب اللقاح اذ كانت حبوب اللقاح من الطراز ثلاثي الاخادید المثقبة Tricolporate في جمیع الانواع المدروسة، تضمنت الدراسة كذلك التعرف ولاول مرة باستعمال تقنیة كروموتوكرافيا الطور السائل عالي الاداء HPLC (High performance liquid chromatography) على محتوى الاوراق من الفلافونویدات لانواع الجنس المدروسة، اذ تم تشخیص ثمانية مركبات فلافونویدیة وهي : myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin مع تحديد تراكيزها، فضلا عن ذلك شملت الدراسة الجانب البیئي، وقد وزعت الانواع جغرافيا على مناطق انتشارها وفي بیئاتها المختلفة ورسمت خرائط توزیع الانواع على المقاطعات الجغرافية في المناطق الجنوبية والوسطى والشمالیة. | The present study aimed to consider the morphological, anatomical, chemical and genetic characters and geographical distripution of six sections and ten species belong to the genus Astragalus L. In the central, northern and south part of Iraq, the sections and species were : Sec. Aulacolobus : A. guttatus; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus and A. hamosus; Sec. Harpilobus : A. corrugatus and A. hauarensis; Sec. Hololeuce : A. alyssoides; Sec. Malacothrix : A. mollis, A. pulchellus and A. sarae; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis. The research includes study of morphological characteristics of the roots, stems, leaves, flowers inflorescences, fruits and seeds, In addition anatomical study that consider variations between the species studied at the stem, leaves and petiole level (epidermis and cortx the thickness, the nature and arrangement of tissues and the number of vascular bundles, their arrangment and forms), epidermis stomatal complexes, venation patterns which they were Brochidodromous in all species in this study and the form of pollen grain which has been Tricolporate in all species in this study. The study also identified for the first time using a technique chromotochraph liquid phase HPLC on the content of the leaves of the flavonoids of the plants studied were diagnosed ten flavonoad compound in the leaves of the plants such as myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin as well as the study included a study of the environmental side, has distributed species geographically "on areas of in environments different and mapped the distribution of species on geographical districts in the central and northern and south regions. Maps of geographical distribution were prepared for all species studied. The study shown that the species were distributed in the north, east and west area of Iraq.

الخصائص الحيوية والجزيئية والفعالية ضد الميكروبية للنايسين المنتج من قبل بكتريا subsp. lactis Lactococcus lactis المعزولة من الحليب الخام == Biological, Molecular characteristics and antimicrobial activity of Nisin produced by Lactococcus lactis subsp. lactis Isolated from Raw Milk

اسم المؤلف: خالد اسماعيل عزيز
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | زيرك فقى احمد عبد الرحمن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمت جمع مائة وخمسة واربعون نموذجا من الحليب الخام خلال فترة ما بين تموز الى التشرين الثانى لعام 2013 فى مزارع تربية المواشي لمحافظة اربيل ودهوك .اسفرت النتائج عن الحصول على 45 عزلة من بكتريا L. lactis subsp. lactis تمت تشخيص هذه العزلات باستخدام الصفات المجهرية , المظهرية , البايوكيميائية ,API 20E SYSTEM بالاضافة الى تقنية الـ PCR . اختبرت فعالية العزلات لبكتريا L. lactis subsp. lactis تجاه ثلاثه عشر نوعا من المضادات الحيويه وتباينت العزلات فيما بينهما من حيث استجابتها لاختبار الحساسية وعدد منها مقاومة كالاتي : Cephalothin, Ampicillin, Amoxicillin/ Clavulanic acid, Sulfamethoxazole/Trimethoprim, Cefotaxime, Clindamycin, Ceftriaxone, Nitrofurantoin, Gentamycin, Vancomycin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, and Imipenem.، ونسبة المقاومة كالاتي : 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55, 24.44%, 2.22%. على التوالي.اظهرت نتائج جميع العزلات فعالية عالية ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية وهى : E. coli, B. subtilis, P. aeruginosa, C. perfringes and S. aureus باستعمال تقنية طريقة الانتشار بالحفر. اظهرت العزلة 41 و15 فعالية عظمى (16mm) (20mm) ضد بكتريا S. aureus وB. subtilis بينما اظهرت العزلة 20 فعالية كبيرة (13mm) ضد بكتريا aeruginosa P.. عموما فان البكتريوسين لجميع العزلات المذكورة كانت فعالة ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة كرام .ايضا تم استخدام النايسين النقي ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية واظهرت النتائج بان مناطق التثبيط كانت 18، 22، 14، 13 و15 ملم ضد كل من S. aureus، B. subtilis، C. perfringens، E. coli وP. aeruginosa على التوالي.درست تاثير الاس الهايدروجينى،الحرارة والاشعة الفوق بنفسجية على فعالية نايسين للعزلات 10، 26 و42. اظهرت النتائج بان مستخلص نايسين لعزلة L42 كانت اكثر فعالية عند الاس الهايدروجينى 2.5 والحرارة - 4 م ضد البكتريا المرضية. لم يظهر مستخلص النايسين اى فعالية ضد البكتريا المرضية عند تعريضه للاشعة الفوق بنفسجية مبينا التاثير السلبى لهذه الاشعة على فعالية البكتريوسين.تم اختيار العزلة اكثر مقاومة للمضادات الحيوية (L42) لاجراء عملية التحول وذلك لتحديد مواقع الجينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية باستخدام عملية التحول الوراثي باستعمال بكتريا coli DH5 - α E. الخالية من البلازميدات مع البلازميد المنقى من العزلة L42. تم اجراء عملية التحول بنجاح واظهرت النتائج بان جينات : Chloramphenicol, Nitrofurantoin, Cefotaxime, and Vancomycin كانت واقعة على البلازميد بينما البقية كانت واقعة على الكروموسوم. تم تحديد التركيز المثبط الادنى للنايسين واظهرت النتائج بان MIC للنايسين بالنسبة لبكتريا aureus S. كانت 400µg/ml بينما لبكتريا coli E. كانت 500µg/ml. استخدمت MIC للنايسين كعامل تحييد للسيطرة على جينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية لنوعين من البكتريا المرضية وهى aureus S. وcoli E.. كشفت النتائج بان الجينات منحت المقاومة لـ AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AK, CFM, تم تحييدها بنسبة 61.5% بينما فى بكتريا coli E. تم تحييد الجينات لـLEV, MEL, NOR, and SXTبنسبة 31%. تم دعم النتائج عمليتي التحول والتحييد باستخدام تقنية الترحيل الكهربائى للهلام. | In this study a total of one hundred forty five raw milk samples were collected during the period of (July to November, 2013) from different fields in Erbil and Duhok province. Screening revealed that 45 out of 145 samples of raw cow milk (31%) were L. lactis subsp. lactis. Characterization of these selected isolates were carried out using morphological, microscopical, biochemical characteristics, API 20 system and further confirmation were achieved by PCR assay.Antibiotic sensitivity test performed for L. lactis subsp. lactis against thirteen antibiotics which include Ampicillin (AMP), Amoxicillin/ Clavulanic acid (AMC), Imipenem (IMP), Gentamycin (GM), Sulfamethoxazole/Trimethoprim (SXT), Cephalothin (CEP), Clindamycin (CLIN), Nitrofurantoin (F), Ciprofloxacin (CIP), Ceftriaxone (CRO), Chloramphenicol (C), Cefotaxime (CTX), and Vancomycin (VAN). The isolates appeared to be varied in their resistance, the number and resistance percent for antibiotics used CEP, AMP, AMC, SXT, CTX, CLIN, CRO, F, GM, VAN, CIP, C, and IMP were as follow 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55%, 24.44%, and 2.22% respectively.All supernatants were isolates exhibited marked activity against five pathogenic bacteria includes S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, P. aeruginosa, and E. coli using agar well diffusion method. Isolate 15 and 41 exert maximum activity (20 mm) and (16 mm) against B. subtilis and S. aureus. Whereas isolate 20 showed highest activity (13 mm) against P. aeroginosa. Generally, all aforementioned isolates were active against gram positive and Gram negative bacteria. In addition, the effect of pH, temperature and UV light were studied on nisin activities of L10, L26 and L42 against some pathogenic bacteria. The results showed that nisin extract of L42 displayed highest activity at pH 2.5 and temperature at - 4 °C against pathogenic bacteria under study. Under UV light wavelength all nisin showed low or no activity against different pathogenic bacteria selected in this study.Also a pure nisin was used against five pathogenic bacteria and the results shows that the inhibition zones were 18, 22, 14, 13 and 15 mm against each of S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, E. coli and P. aeruginosa respectively.One highly resistance isolate was chosen (L42) for transformation test to determine the location of the antibiotic resistance genes by genetic transformation process using the laboratory strain E. coli DH5 - α with plasmid DNA purified from this isolates. The transformation process conducted successfully and the results showed that the resistance genes for F, C, CTX, and VAN were located on plasmid DNA. While for others were located on chromosomal DNA.Minimum inhibitory concentrations were tested for nisin and the results revealed the MIC of nisin for S. aureus was 400 µg/ml while for E. coli was 500 µg /ml. MIC of nisin was used as curing against to control the antibiotic resistance genes in two pathogenic bacteria represented by E. coli and S. aureus. The results showed that the genes encoding resistance to AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AM, and CFM were cured and the percentage of curing was 61.5%. Whereas for E. coli the gene of LEV, MEL, NOR, and SXT were cured with 31%. The above results of both transformation and curing process were supported with gel electrophoresis.

دراسة حالات العقم عند الذكور والتاثيرات البكتيرية والمناعية على معالم السائل المنوي

اسم المؤلف: حياة كاظم سلمان الموسوي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | انتصار محمود جمعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 450 عينة مني ومصل دم من الذكور المصابين بالعقم (اولي _ ثانوي) من مركز العقم واطفال الانابيب (مستشفى كمال السامرائي ). قسمت عينات المني الى قسمين اجري على القسم الاول منها الفحوص العيانية والمجهرية ، فيما تم زرع القسم الاخر على اوساط زرعية مناسبة ( اكار الدم،اكار الماكونكي، اكار الجوكليت) .تم عزل 284 عزلة بكتيرية من مجموع عينات المني 450 عينة : - 173 عزلة بنسبة (38.4%) منها تعود الى Staphylococcus aureus و58 عزلة بنسبة (12.9%) تعود الى بكترياEscherichia coli و31 عزلة (6.9% ) منها تعود الى بكتريا Neisseria gonorrhoeae ،اما نتيجة الزرع للبكتريا المختلطة &S.aureus E.coliفكانت 22حالة (4.9%) وذلك باستخدام نظام API system. اختبرت حساسية البكتريا لـ(11) مضادا حيويا شملت : - الامبسلين والفانكومايسين وامبسلين/ سلبكتام وسيفترياكسون ومينوسايكلين وسيفاكلور وسيفوروكسيم وسيفوتاكسيم والاميكاسين والافلوكساسين والسبروفلوكساسين . اظهرت النتائج وجود مقاومة عالية من قبل العزلات البكتيرية للمضاد الحيوي الامبسلين 100% في حين كان المضاد الحيوي سيفترياكسون اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية والبكتريا التابعة للعائلة المعوية اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له وكان المضاد السبروفلوكساسين الاكثر تاثيرا على العزلات البكترية (N.gonorrhoea). تضمن البحث ايضا دراسة تاثير اضداد النطاف على معالم السائل المنوي اذ وجد ان 284 عينة اي بنسبة (63.1%) (من بين450 عينة ) كانت موجبة لاضداد النطاف في البلازما المنوية وان 270عينة اي بنسبة (60%) من مصل الدم كانت موجبة لاضـداد النطاف وذلك باستخدام فحص التراص بالصفيحة agglutination test Tray . كذلك تم التعرف على عيارية هذه الاضداد اذ ان اعلى عيارية للاضداد في البلازما المنوية كانت (128 : 1) في الوقت الذي بلغت اعلى عيارية للاضداد في مصل الدم (1024 : 1). استخدمت تقنية (ELISA ) Enzyme Linked Immumosorbent Assay للتحري عن اضداد النطاف واصنافها وبينت نتائج الدراسة ان اكثر الاصناف تكرارا في البلازما المنوية هو الضد IgA اذ وجد في 271 عينة بنسبة (95.4%) من بين 284 عينة موجبة لاضداد النطاف اما اصناف الاضداد في مصل الدم فالضد IgG كان اكثرها وجودا (225 ) عينة بنسبة 83.3% .من مجموع العينات الموجبة لاضداد النطاف والبالغة 270 عينة . كما تم التعرف على كيفية حدوث التراص نتيجة وجود الاضداد وتبين ان التراص بالرؤوس هو الاكثر حدوثا في (170 ) عينة بنسبة 39.9% مقارنة مع التراص ذنب بالذنب (37) عينة بنسبة 13% . بينت الدراسة وجود علاقة ذات دلالة احصائية معنوية 0.001>P بين وجود الخلايا القيحية في السائل المنوي ووجود اضداد النطاف في البلازما المنوية اذ بلغت النسبة (98.2%) من مجموع 279 عينة فيما بلغ مجموع المرضى العقيمين الذين ابدوا نتائج موجبة لاضداد النطاف بدون خمج (5)عينات 1.7 % كذلك تبين وجود علاقة معنوية 0.001>P بين الاصابة ببعض الامراض مثل القيلة الدوالية Varicoceleواصابة وضمور الخصيةTesticular trouma & atrophy والنكاف Mumps واختزاع الخصيةTesticular biopsy وبين وجود اضداد النطاف في البلازما المنوية . كذلك اظهرت الدراسة ان 393 مريضا ( 87.3%) من مجموع 450 عقيما اظهروا تركيزا سويا لهرمون (FSH) Follicle Stimulating Hormone. في مصل الدم مقابل )57) مريضا بنسبة 12.7% اظهروا تركيزا اعلى من القيمة الطبيعية العليا . كما اظهرت النتائج ان 380 مريضا بنسبة 84.4% كان لديهم تركيز سوي لهرمون (LH) Leutinizing Hormone ، مقابل 70 بنسبة (15.6%) كان لديهم تركيز اعلى من القيمة الطبيعية العليا في مصل الدم . اما بالنسبة لهرمون التيستوستيرون Testosterone فان 334 بنسبة 74.2% اظهروا تركيزا سويا مقابل 116 (25.8%) ممن كان لديهم تركيز اقل من القيمة الدنيا للتركيز السوي . | Four hundred fifteen samples of seminal fluid from infertile men (primary & secondary) from Infertility and Tube Babies Center (Kamal AL - Sammara'ee Hospital). Each semen sample was divided into two parts : The first part underwent Macroscopic& Microscopic examination, while the other part was culture on suitable culture media (Blood agar, Macconkey agar and chocolate agar). 284 bacterial isolates from 450 sample ; 173 sample of seminal fluid show to Staphylococci aureus (38.4%) and (58) from Escherichia coli (12.8%) , 31 show Nesseria gonorrhea (9.6%) while the result of mixed bacteria (E. coli & S. aureus) it was 22 sample (4.9%) by using (Api E - 20) system. Bacterial sensitivity to (11) antibiotic, included Ampcillin, Vancomycin, Ampicillin/Sulbactam, Ceftriaxone, Minocycline, Cefaclor, Cefuroxine, Cefotaxime, Amikacin, Ofloxacin, and Ciprofloxacin the results show high resistance to Ampcillin antibiotic (100%) while ''Ceftrtaxone '' show best action against (E. coli & S. aureus) . Ciprofloxacin was having the highly effect on the Nesseria gonorrhea . The research was included the study of antisperm antibody It was found that 284 sample (63.1%) from 450 sample were positive against antisperm antibody in seminal plasma and 270 sample (60%) from blood serum samples were found to be positive using '' Tray agglutinant test''. The highest molarity of seminal plasma was found to be (1 : 128) whereas the highest of blood serum was (1 : 1024).The ’ELISA’’ method was used to detect anti sperm antibody. The study showed that the most frequent in seminal plasma is Immunoglobuine ( IgA) , where 271 samples (95.4%) were found to be positive . ( IgG) was found to be the most existing one in blood serum; 225 samples ( 83.3% ) .Identification of how aggulation occurred as a result of contraries existence had been executed. It was approved that head to head is the most occurring one; 170 samples (39.9%) compared with tail to tail 37 ( 13%).There was a significant statistical correlation between the presesnce of pus cells in seminal fluid and antisperm antibodies in seminal plasma where the pus cells were found in (98.2%) 279 of the sample. While the infertile patients showed positive results or antibody without infection as being (5) specimens (1.7%) . In addition, there was a correlation between some diseases such as varicocele, Trauma & Atrophy , Mumps and testisculer biopsy and the existence of antisperm antibody (P< 0.001) in seminal plasma .The results showed that 393 patients ( 87.3% ) from 450 infertilities had normal hormone FsH (Follicle stimulating hormone) who had high level in blood serum against 57 patients (12.7%).The result also showed that 380 patients ( 84.4% ) had normal levels of (LH) in comparisn to 70 with ( 15.6%) high levels of LH in the blood serum. "Testosterone hormone" level was found to be normal in 334 patients ( 77.2%) and 116 patients ( 25.8%) showed high levels .

دراسة بكتيرية ومناعية لعوامل الضراوة المستخلصة من بكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات القناة التنفسية == Bacteriological and Immunological Study of Virulence factors extracted from Moraxella catarrhalis Isolated from Respiratory Tract Infections

اسم المؤلف: حوراء عبد الامير علي الدهان
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي | نجاح رايش هادي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 60عزلة من بكتريا Moraxella catarrhalis من 344 عينة مرضية وبنسبة 17.4% موزعة كالاتي (6.7 , 11.7 , 12.5 , 27.6 , 30) % لكل من مسحات الاذن ومسحات الانف وعينات القشع ومسحات البلعوم ومسحات اللوزتين على التوالي من المرضى المراجعين الى العيادة الاستشارية للانف والاذن والحنجرة والعيادة الاستشارية الصدرية في مستشفى الحكيم العام في محافظة النجف ومن مختلف الاعمار ولكلا الجنسين وللفترة من حزيران 2004 وحتى كانون الاول 2004م. اعتمدت الصفات الزرعية (للمستعمرات) والشكلية (للبكتريا)والاختبارات الكيماحيوية لتشخيص العزلات، فضلا عن اعتماد نظام API - NH . كانت النسبة المئوية لعزل البكتريا من الاناث (18.8%)اكثر مما هو عليه في الذكور (16.3%) فيما سادت الفئة العمرية 1ـ10 سنة حيث بلغت نسبة عزل المسبب المرضي فيها 20.4%. لغرض التحري عن طبيعة مقاومة العزلات قيد الدراسة للمضادات الحيوية المختلفة ،فقد اخضعت جميع العزلات لاختبار حساسيتها لـ 12 نوعا من المضادات الحيوية التي تستعمل في علاج الاخماج البكتيرية ،اذ اظهرت العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيويةAmpicillin وAmoxycillin وTetracyclin وبنسبة 100% لكل مضاد ، في حين اظهرت العزلات مقاومة معتدلة وبنسب (73.3 ، 71.7 ، 66.7 ، 61.7 ، 60 ، 58.3 ) % لكل من المضادات الحيوية Cefotaxime،Ciprofloxacin ،Nitrofurantoin ،Nalidixic acid ، Cephalothin وGentamycinعلى الترتيب ،لكنها كانت مقاومة وبدرجة منخفظة تجاه Chloramphenicol ,Cephalexin , Pipracillin اذ بلغت نسب المقاومة لها(30 , 36.7 , 38.3)% على الترتيب .واظهرت معظم العزلات مقاومة مشتركة لعدد من المضادات الحيوية قيد الدراسة ، كما واظهرت 91.7% من العزلات قدرتها على انتاج انظيم البيتالاكتاميز . في محاولة للتحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستعمار اظهرت العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الاول (CFA/I) والثالث (CFA/III) وبنسب (93.3 ،96.7 )% على التوالي ، في حين لم تظهر ايا من العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الثاني (CFA/II) .اظهرت 22 عزلة من بكتريا M.catarrhalis (36.7%) قدرتها على انتاج انظيم البروتيز الخارج خلوي في حين لم تظهر ايا من العزلات قابليتها على انتاج انظيم الهيمولايسين والسايدروفورات , فضلا عن عدم قدرتها على تكوين المحفظة . ولمعرفة قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الشعيرات (Fimbriae) اجري فحص تكوين الغشاء الرقيق حيث تمكنت 80 % من هذه العزلات من تكوين هذا الغشاء عند نموها في الوسط الزرعي السائل في الوقت الذي استطاعت فيه 85%من العزلات من تلزين كريات الدم الحمراء للانسان صنف O+ وذلك للتحري عن امتلاك البكتريا للواصق التي تمكنها من الالتصاق بمستقبلات خاصة مؤلفة من مواد كاربوهيدراتية تعرف باسم (Gal α1 - 4Gal ß )موجودة على سطح كريات الدم الحمراء للانسان ، كما واستخدمت العزلة (6¬MO¬)المشعرة والملزنة والعزلة (MO1)غير المشعرة والملزنة لمقارنة معدل التصاقها بالخلايا الطلائية للانسان والمرسبة من الادرار مع معدل التصاق العزلة (MPn6)غير المشعرة وغير الملزنة ,اذ بلغ معدل التصاق العزلة (6¬MO¬) 54.1 خلية بكتيرية /خلية طلائية اعلى من معدل التصاق العزلة MO1 والعزلة MPn6 التي بلغ معدل التصاقها (9.6 , 23.9 ) خلية بكتيرية / خلية طلائية على الترتيب . وفي محاولة للتعرف على انماط التلازن الدموي للعزلات البكتيرية قيد الدراسة ,اجري فحص التلازن الدموي لجميع العزلات البكتيرية (60 عزلة) باستخدام دم الانسان والابقار والدجاج وخنازير غينيا على الترتيب وقد ظهر النمط(RRRN) بكونه الاكثر سيادة حيث بلغت نسبته حوالي 33.3% من العزلات قيد الدراسة . تم اختيار احد العزلات (MO6) باعتبارها عزلة كفوءة ومشعرة لثبوتية صفاتها المستضدية واعطائها للنتائج القياسية المعروفة في التفاعلات الكيماحيوية لاستخدامها في التجارب اللاحقة المتمثلة باستخلاص مستضدات عوامل الالتصاق ( الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي وعديد السكريد الشحمي ).المحور الثاني : استخلاص وتنقية المستضدات - تم استخلاص مستضد الشعيرات (Fimbriae) للعزلة المنتجة (MO6)باستخدام تقنية النبذ المركزي فائق السرعة لفصل الشعيرات وكذلك استخدام كبريتات الامونيوم بنسب تشبع مختلفة لغرض ترسيب البروتينات المستخلصة ، ومن ثم قدرت كمية البروتين في هذا المستخلص وكانت 0.525 ملغم /مل . - تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) للعزلة MO6 باستخدام الانظيمات (RNase وDNase ) والمنظف N - Lauroyl - Sarcosinate كما وقدر تركيز البروتين في مستخلص OMPs النقي اذ بلغ 0.6 ملغم /مل ، اما متعدد السكريد الشحمي (LOS ) فقد تم استخلاصه بتكسير الخلايا بالانظيمات والاستخلاص بالفينول المائي الساخن ، وبعد فصل كل من الطورين المائي والفينولي تمت ازالة سمية LOS في كل من الطورين باستخدام مادة Hydrazine اللامائية .وكما تم تقدير كمية الكاربوهيدرات الكلية في الطورين المائي والفينولي كليهما ,حيث بلغت (300 , 190)مكغم/مل على التوالي ,فضلا عن قياس النسبة المئوية للبروتين المرتبط مع LOS في الطورين والتي بلغت (13.3 , 11.8) % على الترتيب. المحور الثالث : الدراسة المناعية شمل هذا المحور دراسة تاثير مستضد الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) المنقاة جزئيا ومتعدد السكريد الشحمي (LOS) المزالة سميته والمستخلصة من العزلة الكفوءة (MO6)لبكتريا M.catarrhalis على الاستجابة المناعية ومعرفة دور هذه المستضدات الثلاثة في تنشيط او تثبيط فعالية بعض الخلايا المناعية ,ولغرض تحقيق ذلك اجريت الاختبارات المناعية الاتية في الزجاج (In vitro )والمتمثلة بعيوشية الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية والتشكل الزهري التائي والبائي وهجرة الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى (PMNs), فضلا عن عملية البلعمة للخميرة Candida albicans المقتولة بالحرارة.ادى استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات (25 , 50 , 100 )مكغم/مل وتراكيزمن مستضد OMPs (50 , 100 , 200) مكغم/مل وتراكيز من مستضد LOS(200,100,50) مكغم /مل الى انخفاض معنوي (0.05 P <)في النسبة المئوية لعيوشية خلايا PMNs والخلايا اللمفاوية مقارنة بالسيطرة ,كما ادى استخدام التراكيز اعلاه ولكل المستضدات الثلاثة الى خفض معنوي في قطر منطقة الهجرة لخلايا PMNs . حيث كانت لجميع هذه التراكيز وللمستضدات الثلاثة تاثيرا مثبطا لهجرة خلايا PMNs وان تدرج التثبيط يزداد بصورة معنوية بزيادة تركيز المستضدات . اما فيما يخص عملية البلعمة التي استخدم فيها مستضد الشعيرات وOMPs وبالتراكيز (25 , 50 , 100 مكغم/مل) و(50 , 100 , 200 مكغم/مل) على التوالي , فقد لوحظ ازدياد معدل معامل البلعمة تدريجيا مع الزمن وبشكل معنوي (0.05 < P) حتى وصل اقصاه عند الوقت 90 دقيقة ، ثم انخفض بعد ذلك خلال الوقت 120 دقيقة ولجميع التراكيز المستعملة ولكلا المستضدين ، اما بالنسبة لمستضد LOS فقد لوحظ ان معدل معامل البلعمة يزداد وبصورة طفيفة وتدريجية واصبح بشكل معنوي عند الوقت 90 دقيقة من المعاملة ولجميع التراكيز المستعملة (200,100,50 ) مكغم /مل ,الا انه لم تظهر هنالك فروقات معنوية ( 0.05 P>) بين التركيزين (100 و200)مكغم /مل عند الاوقات (120,60,30) دقيقة ، كما وازدادت النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية المكونة للتشكل الزهري التائي الفعال والكلي وكذلك التشكل الزهري البائي وبتاثير معنوي (< 0.05 P) للمستضدات الثلاثة (الشعيرات , OMPs ,LOS)عند التراكيز نفسها مقارنة مع معامل السيطرة . اوضحت نتائج تجربة تمنيع الحيوانات المختبرية (الارانب )بمستضد الشعيرات وOMPs وLOS والمعدل المناعي (Immunoferon) امكانية الحصول على اجسام مضادة للمستضدات المستخدمة والتي استدل على وجودها باستخدام اختبار الترسيب في الانابيب ,حيث ظهرت حلقة ترسيب في الانابيب الحاوية على مصل الارنب الممنع بهذه المستضدات والمعدل المناعي عند التراكيز( 140,50,200,100) مكغم/مل على الترتيب ، في حين لم يظهر اختبار الانتشار المناعي المزدوج في هلام الاكروز (اختبارOuchterlony) اي نتيجة موجبة عند استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات وLOS وImmunoferon عدا مستضد OMPs حيث ظهر خط ترسيبي مفرد عند التركيز 200 مكغم /مل .وان هذه النتائج تشير الى امكانية استخدام هذه المستضدات كمعدلات مناعية لقابليتها على تحفيز الخلايا اللمفاوية البائية على تكوين | Sixteen isolate of Moraxella catarrhalis was diagnostic from a total of 344 pathogenic specimens , Moraxella catarrhalis was isolated and identified in a percentage of 17.4% .Isolates of M.catarrhalis were distributed amony source of the pathogenic specimens to (30,27.6,12.5,11.7,6.7) % for swabs from ear, nose, sputum specimens, pharynex, and tonsiles, respectively. Specimens were collected from male and female patients of different age groups referred to the Ear Nose & Throat and Chest consultants clinics in Al - Hakim general hospital in Najaf Governorate from the period of June, 2004 to December, 2004.Cultural, microscopical, and biochemical characteristics were considered for diagnosis of this bacteria, in addition to use of API - NH system.Higher incidence of bacteria was detected in women (18.8 %) compared to men (16.3%).Age group of (1 - 10) year was the dominant infected group (20.4%) among others .To investigate the nature of resistant to various antibiotics ,the isolates were subjected to the sensitivity test of 12 antibiotics which are routinely used in treatment of infections caused by this organism.All isolates were exhibited complete resistance (100 %) to Ampicillin, Amoxycillin, and Ttetracycline, moderatly resistant in a percentages of (73.3 ,71.7,66.7,61.7,60,58.3)% for each Cefotaxime, Ciprofloxaciy, Nitrofurantoin, Nalidixic acid, Cephalothin, Gentamycin, respectively. While, sensitive to Chloramphenicol ,Cephalexin ,Pipracillin when their resistance reached only ( 38.3 , 36.7 ,30)% ,respectively. All isolates exhibited multiple resistance for many antibiotic used in this study ,and 91.7% of isolates presented the ability to produce β - Lactamase enzyme .To investigate the pathogenicity factors for M. catarrhalis such as adhesion and colonization factors, all isolates showed the ability to produce CFA/I and CFA/III in apercentage of 93.3,96.7 %, respectively. Whereas, non of the isolates showed no ability to produce CFA/II .Twenty two (36.7 %) of M.catarrhalis isolates only were able to produce extracellular protease, but all isolates were unable to produce hemolycin, sidrophores, and capsule. To detect the ability of isolates to produce fimbriae ,pellicle formation test was done, and it was found that 80 % of isolates were formed this pellicle when it was grown in the broth culture media .At the same time ,85% of isolates were found to be able to cause agglutination of human blood type O+ “ in order to detect the precence of adhesion in the bacteria which make it able to attach into carbohydrate specific receptors named (Galα - 4Galβ)which presented on the surface of human blood erythrocyte” .The fimbriated –hemagglutinated isolate (MO6) and non fimbriated - hemagglutinated isolate(MO1) were used to compared the bacterial adherenc rate on human uroepithelial cells with non fimbriated –non hemagglutinated isolate(MPn6) .The adherence rate of (MO6) isolate was 54.1 bacterial cells / epithelial cell Morethan that of (MO1) and(MPn6) isolates which presented in 23.9 , 9.6 bacterial cells /epithelial cell,respectively . Hemagglutination patterns for all isolates were done by using human ,bovine ,chicken and guinea pig ,respectively in Hemagglutination test. RRRN patterns the highere incidence pattern presented in 33.3% from all isolates . One isolate (MO6) was selected to be used in the following experiment as it is considered efficient and fimbriated with consistent antigenic properties and its typical biochemical characteristics such as extraction of adherence factors antigens (fimbriae ,outer membrane proteins and lipooligosaccharide).Second Aspect : Extraction and Purification of Antigens. - Fimbria antigen was extracted from MO6 producted isolate by using ultracentrifugation and ammonium sulfate in a different saturation percentages for fimbriae separation and extracted protein precipitation ,respectively .The protein concentration in this antigen was estimated which was 0.525 mg/ml. - RNase ,DNase (enzymes)and N - lauroyl sarcosinate(Detergent) were used to extract OMPs ,from selected isolate (MO6).Protein concentration of the purified extracted OMPs was estimated and found to be 0.6 mg/ml. Lipooligosacchoride (LOS) was extracted after cells were broken by the above enzymes .The extraction was performed by hot - phenol .After the aqueous and phenolic phases were separated, it was detoxified for each phases by using anhydrous hydrazine, and total carbohydrate quantities were estimated for each phase which were 300,190µg/ml , respectively . Morever,LOS bounded protein quantity in each phase was also estimated. The percentages of the protein bounded to LOS for aqueous and phenolic phases were 13.3 , 11.8 %,respectively .Third Aspect : Immunological StudiesThis aspect was investigated the effect of fimbriae ,OMPs which are partially purified, and detoxified LOS antigens isolated from M. catarrhalis (MO6) on immunoresponse and showed the role of this three antigens in activation or inhibition of some immunocellular activity. The following (In vitro)immunological tests were performed; Viability of PMNs and lymphocyte, B and T rosette forming assay ,migration of PMNs, and phagocytosis of Candida albicans . The concentration of fimbriae (25,50,100) µg/ml , OMPs (50,100,200) µg/ml and LOS(50,100,200) µg/ml decreased the viability percentage of PMNs and lymphocyte with significant differences (P<0.05) in comparison to the control treatment ,while, these concentration for each antigens inhibited the migration of PMNs cells in asignificant differences and the gradual inhibition decreased significantly with increase of antigens concentration . The concentration of fimbriae ( 25 , 50 , 100) µg/ml and OMPs (50, 100 , 200 ) µg/ml increased the phagocytic index (PI) Significantly and gradually with time untile it reach the maximum at time 90 min. Then PI decrease at the time 120 minutes . For all concentration of each antigens LOS antigen increase the PI significantly at 90 min. for all concentration but its non significant (P>0.05) at times (30,60,120)minutes between (100,200) µg/ml concentration .All concentration used for these antigens (fimbriae ,OMPs ,LOS) increased the percentage of T and B rosette assay with high signfacant differences in comparison to control . The study showed that rabbit immunized by fimbriae ,OMPs,LOS, and Immunoferon produced antibodies against these antigens which were detected by Ouchterlony double diffusion test which showed no precipitin line between any antigens and serum of immunized rabbit except OMPs showed single precipitin line at concentration 200 μg/ml ,While there was clear ring of precipitin was formed in the second method (tube precipitation test) .These results showed the ability of these antigens to act as immunomodulators due to their ability to stimulate β - lymphocyte to produce antibodies similar to immunoferon

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

اسم المؤلف: حنان طارق صبحي
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة (Crustacea : Copepoda) Cyclopoida لمنطقة الفرات الاوسط /العراق == Taxonomic Morphological Study on Some Species of Order Cyclopoida (Crustacea : Copepoda) in Middle Euphrates Region / Iraq

اسم المؤلف: حنان زوير مخلف حسين الدعمي
اسم المشرف: حسن سعيد جاسم الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - اللافقريات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمن البحث دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة Cyclopoida جمعت من بعض مناطق محافظات منطقة الفرات الاوسط وهي : كربلاء المقدسة وبابل والنجف الاشرف والقادسية. تم وصف اثنا عشر نوعا لعائلة Cyclopidae تابعة لستة اجناس تعود لعويلتين هما : Cyclopinae وEucyclopinae. اوضحت الدراسة ان انواع عويلة Cyclopinae اكثر انتشارا ، وتميز جنس Mesocyclops بكثرة انواعه بين الاجناس الاخرى حيث تم تسجيل خمسة انواع تعود لهذا الجنس ،علما انه تم الاعتماد ووصف الذكور لبعض الانواع ولاول مرة خلال هذه الدراسة. وهذه الانواع هي : Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) اعتمد على النوع Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) كنموذج للعائلةFamily Type. صيغت مفاتيح تصنيفية لعزل العويلات والاجناس والانواع. كما تم تدوين معلومات عن مناطق الجمع وتواريخها ووقتها وعدد الانواع بالاضافة الى تدوين درجات الحرارة والاس الهيدروجيني.*تسجيل جديد اول للمجموعة الحيوانية العراقية )صنف القشريات(. | The Present study included taxonomic morphological study on some species of order Cyclopoida that collected from some regions of Euphrates governorates : (Holy Karbala, AL - Najaf ALAshraf, Babylon, AL - Qadisyah). Six genera and twelve Species were recorded belong to family Cyclopidae which including two subfamily : Cyclopinae and Eucyclopinae. Also in this study the males have been used firstly to some specieses in the taxonomic as procedure .Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) has been studied here in more details particularly in morphological characters. Taxonomic keys were formulated to isolate subfamilies, genera and species. Information about sites collection , dates and times as well as number of species, in addition information about temperatures and pH. were recorded*New First record to Iraqi Animalia Group (Class : Crustacea)

دراسة بكتيرية ومناعية للانظيم الحال للبروتين نوع - ا - المستخلص من بكتيريا Proteus mirabilis المعزولة من خمج السبل البولية == Bacteriological and Immunological Study of IgA - Protease Enzyme Extracted from Proteus mirabilis Isolated from Urinary tract infection

اسم المؤلف: حسن علي حسين السعدي
اسم المشرف: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة اربعة محاور : 1 - العزل والتشخيص : تم عزل وتشخيص (40 ) عزلة من بكتيريا Proteus spp. من مجموع ( 200 ) عزلة بكتيرية من عينات اخماج مرضى السبل البولية في مستشفيي مدينة الطب والكندي للفترة بين 1/3/2004 لغاية 30/10/2004.اظهرت الفحوصات الكيميائية الحيوية ان 40 عزلة بكتيرية (20% ) من العزلات البكتيرية كانت تنتمي الى جنس Proteus والتي اشتملت على ( 37 ) عزلة تعود الى بكتيريا)P. mirabilis18.5%) ثلاث عزلات من بكتيريا Proteus vulgaris. عشر عزلات من بكتيريا P. mirabilis كانت منتجة للانظيم الحال للبروتين (IgA Protease)، بينما كانت عزلات بكتيريا Proteus vulgaris غير منتجة للانظيم المذكور ،واختيرت العزلة (Pm5)P.mirabilis كعزلة منتجة للانظيم.2 - تنقية وتوصيف الانظيم : اختير الوسط مرق ( Cysteine lactose electrolyte deficient ) كافضل وسط زرعي لانتاج الانظيم من بكتيريا Proteus mirabilis وتم تنمية العــــزلة البكتيريـــة( Pm5) في درجة حرارة( 37 )م باستخدام الحاضنة الهزازة وثم نقي الانظيم باستخدام الترسيب ملح كبريتات الامونيوم بتشبع(60%) وديلزته واستخدام هلام السيفادكس G - 100 Sephadex وكذلك المبادل الايوني DEAE - Cellulose، قيست الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين للانظيم في كل مرحلة من مراحل التنقية ظهر منحني تنقية الانظيم باستخدام هلام السيفادكس وجود اربعة قمم بروتينية منها قمة واحدة للانظيم الحال للبروتين بينما اظهرت طريقة استخدام المبادل الايوني قمة واحدة فقط، تم حساب الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين والفعالية النوعية والفعالية الكلية وعدد مرات التنقية والحصيلة الانظيمية فكانت على التوالي : (28.7)وحدة/مل،(0.15)ملغم/مل، (191.3)وحدة/ملغم، (258.3)، (5.5)،(9.9%) عند التنقية باستخدام المبادل الايوني وحسب الوزن الجزيئي للانظيم اذ كان (50)كيلودالتون باستخدام طريقة الترشيح الهلامي وكانت الفعالية المثلى للانظيم عند الاس الهيدروجيني 8 ودرجة الحرارة المثلى لانتاج الانظيم هي (37)م ودرجة الحرارة الملائمة لخزن الانظيم هي (4)م مقدارها وكان للايون (Ca+2) تاثير واضح في زيادة فعالية الانظيم بينما كان للـEDTA تاثير مثبط على فعالية الانظيم. 3 - الدراسة المناعية : - استعملت ثلاث مجاميع من الارانب لغرض التمنيع (ارنبين لكل مجموعة) حقنت داخل العضلة باستعمال تراكيز مختلفة من الانظيم(0.2،0.5،1)ملغم/مل فضلا عن ارنبين ضمن مجموعة السيطرة. اتبعت طريقتين (الاوكترلوني والترسيب باستعمال الانابيب) لغرض التحري عن الاضداد المتخصصة للانضيم الحال للبروتين في مصل الارنب، اظهرت النتائج عدم تكون الخط الترسيبي عند استعمال طريقة الاوكترلوني بينما تكونت حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب. تم فصل امينوكلوبيولينات الارنب باستعمال المبادل الايوني DEAE - Cellulose بعد عملية الفصل ظهرت ثلاث قمم بروتينية على الطول الموجي 280 نانوميتر تم اختبار فعالية الانظيم في كل قمة مقارنة بالقمم المؤشرة في الادبيات، اظهرت القمة الثالثة حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب بينما لم تظهر خط ترسيبي باستعمال اختبار الاوكترلوني وهذا قد يدلل على وجود تحت الانواع IgG المقاومة لفعالية الانظيم الحال للبروتين ضمن هذه القمة. تم دراسة تاثير التراكيز المختلفة للانظيم الحال للبروتين (0.2، 0.5، 1)ملغم/مل على بعض الخلايا المناعية وفق المعايير التالية : اذ ادى تركيز الانظيم(0.2)ملغم/مل الى زيادة في عيوشية الخلايا اللمفاوية وخلايا متعددة النوى (PMNs) وعلى التشكل الزهري التائي والبائي وعملية التهام الخميرة المقتولة في الزجاج واختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم (NBT) ومعامل الانقسام الخيطي في الفئران. 4 - الدراسة النسجية : - درست التغيرات النسجية المختلفة في الارانب الممنعة بالانظيم الحال للبروتين بتركيز((0.2 ملغم/مل فكان له تاثيرا واضحا على انسجة الكبد، الرئة، الكلية والطحال،اذ لوحظ وجود مناطق تنكس استسقائي شديد في هيولي خلايا الكبد مع احتقان الوريد المركزي في نسيج الكبد، كمالوحظ وجود خلايا التهابية في جدران الاسناخ وضمور تجويف الاسناخ في الرئة، بينما توسعت محفظة بومان مع ارتشاح بعض الخلايا الالتهابية وخاصة حول الكبيبات في الكلية، اما في الطحال ازداد عدد الخلايا التائية حول الشرين المركزي كذلك الخلايا البائية في باقي اللب الابيض في الطحال نتيجة لتكاثرها وفرط نموها. | This study was included four aspects : - 1 - Isolation and ldentifcation : Forty isolates of Proteus spp were isolated and identified among (200) bacterial isolates from patients samples with urinary tracts infection in two hospitals (Baghdad and Al - Kindy). Biochemical tests were showed (20 %) from bacterial isolates were belonged for genus Proteus (37) isolates replied to Proteus mirabilis with (18.5 %) and (3) isolates were for Proteus vulgaris. Ten isolates from Proteus mirabilis were producing for IgA protease while P.vulgaris isolates were non - producing for this enzyme. Proteus mirabilis (Pm5 ) was selected among isolates efficient producing isolate(Pm5). 2 - Purification and characterization of the enzyme : Cysteine lactose electrolyte deficient medium was selected as the best medium for culturing for production the enzyme by P. mirabilis. Bacterial isolate (Pm5) to produce protease, then protease was purified by application Ammonium sulfate with (60 %) saturated, dialysis, Sephadex G - 100 filtration, and Ion exchange with DEAE. Cellulose. The enzymatic activity and protein concentration were measured in every stage of purification. Four peaks were appeared one of them belong to IgA - protease activity, while by using Ionic exchange method was appeared only one peak. Enzymatic activity, protein concentration, specific activity, total activity, no. of purification, and enzymatic yield were determined in Ionic exchange technique were : ( 28.7) U/ml,(0.15)mg/ml,(191.3)U/ml,(258.3),(5.5),(9.9%) respectively, molecular weight of the enzyme was performed by using gel filtration was (50)Kd. The optimum activity was at pH (8), the optimum temperature with the enzymatic activity was at (37) ˚C, the suitable temperature for storage with enzymatic activity was at (4) ˚C, the (Ca+2) Ion has on effect on increasing the enzymatic activity, while the EDTA was suppressed activity. 3 - Immunological study : Three groups of rabbits were used for immunization (two rabbits for each group in addition to control were injected intramuscular by different enzyme concentrations (0.2, 0.5, 1) mg/ml. Two methods (Ouchterlony and tube precipitation are used for checking up specific protease antibody in rabbit serum. Results showed no precipitin line between enzyme as antigen and serum in (Ouchterlony) while there was clear ring of precipitin was formed in the second method. Rabbit immunoglobulines were separated by using DEAE - Cellulose results showed three peaks protein at (280) nm wave length absorbency, enzyme activity of each peak was tested. In comparing these peaks with standard rabbit immunoglobulines. The third peak was tested against IgA - protease by using tube precipitation test result showed precipitation ring. This result indicated that this peak may include IgG subclasses which are resist protease activity while other peaks were opsonized by the enzyme. The effects of the IgA protease concentration (0.2, 0.5,1) mg/ml on immune cells were studied according the following parameters : the effect of the enzyme on immune and (PMNs) cells, T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice, (0.2) mg/ml of the enzyme has an effect on induction activity of T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice. 4 - Histological aspect : Different pathological changes were shown on rabbit’s tissues (liver, lung, kidney and spleen) which were immunized with IgA protease (0.2)mg/ml. In liver great hydropic degeneration was noticed in the cytoplasm in addition to present an with congestion of central venule, inflammatory cells in the alveolar walls and alveolar cavity atrophy in lung, enlargement of Bouman s capsule with infiltration of phagocytes around glomerulus was shown in kidney, while in spleen T cells around central arteriole as well as B cells in other white pulp were increased as a result of proliferation .

دراسة انتشار الهائمات النباتية والفطريات المائية في المياه الجارية ضمن محافظة بغداد وتاثير العوامل البيئية عليها == A Study of the Distribution of Phytoplankton and Aquatic Fungi in the Lotic Water in Baghdad District and the Effect of Environmental Factors

اسم المؤلف: تريفة كمال جلال فرخه
اسم المشرف: سجال عبد الوهاب الركابي | علي عبد الزهرة اللامي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى مقارنة تواجد الهائمات النباتية والفطريات المائية في اربعة انظمة مياه جارية ضمن مدينة بغداد وعلاقة ذلك بالظروف البيئية المختلفة ، اختيرت اربعة محطات تمثل النظم الجارية وهي : ذراع الثرثار ونهر دجلة وقناة الجيش ونهر ديالى وتم دراسة تواجد بعض الفطريات المائية Aquatic fungi والهائمات النباتية Phytoplankton والعلاقة بين تواجدهما وبين العوامل الفيزيائية والكيميائية ، وجمعت النماذج شهريا ولمدة خمسة عشر شهرا ابتداء من شهر نيسان 2004 ولغاية حزيران 2005. شملت الدراسة الخصائص الفيزيائية والكيميائية وتمثلت في درجة حرارة المياه وسرعة التيار ودرجة الاس الهيدروجيني والتوصيلية الكهربائية والاملاح الذائبة الكلية والكدرة والاوكسجين الذائب والنسبة المئوية للاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية والمغذيات النباتية (النترات والنتريت والفوسفات). تم تشخيص الهائمات النباتية ودراسة التكوين النوعي لها وكثافتها كذلك عزل وتشخيص بعض الفطريات المائية السابرولكنيسية Saprolegniaceae الموجودة في محطات الدراسة. اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه متاثرة بدرجة حرارة الهواء المحيط وتراوحت بين (10 - 29)م في ذراع الثرثار وبين (10 - 27)م في نهر دجلة و(11 - 29.5)م في قناة الجيش اما في نهر ديالى فكانت (11 - 30.6)م. تميزت المياه في المحطات الاربعة بقاعدية خفيفة حيث تراوحت قيم الاس الهيدروجيني بين (6.1 - 8.0) ، وكانت التوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والمواد الصلبة الكلية في نهر ديالى اعلى نسبة الى بقية المحطات حيث بلغت 2710 مايكروسيمنز/سم و1.73 و1.35 غم/لتر على التوالي ، وكانت المياه ذات تهوية جيدة في كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة نسبة الى قناة الجيش ونهر ديالى وسجلت قيم عالية للعسرة حيث ان اعلى قيمة للعسرة بلغت 1250 ملغم/لتر في قناة الجيش وتلتها في نهر ديالى حيث بلغت 1230 ملغم/لتر. اما بالنسبة الى تركيز النترات فتراوح بين 0.06 - 10.0 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.02 - 6.30 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 9.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.11 - 9.60 ملغم/لتر في نهر ديالى. اما النتريت فتراوحت تراكيزه بين 0.01 - 1.10 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.004 - 1.20 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 1.20 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.07 - 1.60 ملغم/لتر في نهر ديالى ، وتواجد الفسفور في ذراع الثرثار بمعدل 0.17 ملغم/لتر و0.071 ملغم/لتر في نهر دجلة و4.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و2.67 ملغم/لتر في نهر ديالى. واظهرت نتائج التحليلات الاحصائية وجود فروقات معنوية بين محطات الدراسة للعديد من الخصائص الفيزيائية والكيميائية وبالذات فيما يتعلق بالتوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والاملاح الذائبة الكلية والاوكسجين الذائب ونسبة الاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية مما يعزى الى تعرض بعض المواقع الى التلوث وانخفاض في منسوب المياه. شخصت خلال هذه الدراسة 166 وحدة تصنيفية للهائمات النباتية تضمنت 107 من الدايتومات و28 من الطحالب الخضر و22 وحدة تصنيفية تعود الى الطحالب الخضر المزرقة وتوزعت البقية بين صفوف الطحالب اليوغلينية والدوارة (البروات) والكربتات والصفر الذهبية وكان اعلى عدد للوحدات المشخصة في نهر دجلة تلاه نهر ديالى ، وظهرت عدة اجناس تمثلت باكبر عدد من الانواع ضمن الهائمات النباتية (Nitzschia وNavicula وCymbella وCyclotella وGomphonema). وتميزت الدايتومات بكثافة عالية في ذراع الثرثار ونهر دجلة ونهر ديالى والفت النسب المئوية (87.4% ، 91.4% و69.6%) على التوالي اما قناة الجيش فبلغت 16.9%. وكانت رتبة الدايتومات الريشية Pennales اكثر كثافة من رتبة الدايتومات المركزية Centrales ضمن الهائمات النباتية المشخصة. اما بالنسبة للفطريات المائية فقد تم عزل 21 نوعا 19 منها تعود الى العائلة السابرولكنيسية التي شملت الاجناس Saprolegnia وتمثلت بستة انواع والجنس Achlya وتمثل بـ 11 نوع والجنس Dictyuchus بنوعين ونوع واحد للعائلة Leptomitaceae واخر Pythiaceae ، تم تسجيل 168 عزلة في نهر دجلة و146 عزلة في ذراع الثرثار و50 عزلة في قناة الجيش و86 عزلة في نهر ديالى من المجموع الكلي للعزلات التي بلغت 450 عزلة ، ولوحظ تشابه كبير في عدد انواع الفطريات بين كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة حيث سجل (20 و19) نوع على التوالي اما في قناة الجيش فقد سجلت ثمانية انواع فقط في حين عزلت 15 نوع في نهر ديالى. ومن ضمن الفطريات المائية تميز Saprolegnia ferax باعلى نسبة تواجد حيث بلغ 16.44% وتلاه Pythium sp. ايضا بتواجد عال والفت 12.22% في جميع المحطات واقل نسبة مئوية كانت للفطر Saprolegnia litoralis والذي سجل نوعا نادر التواجد حيث ظهر في شهر واحد ولمرة واحدة فقط في ذراع الثرثار. لوحظ بان نسبة تواجد الفطريات المائية كانت مرتبطة عكسيا في معظم اوقات السنة وفي جميع المناطق بتواجد الهائمات حيث انها ازدادت بعد الانخفاض في منحنى النمو للهائمات ويعود ذلك لكونها (اي الفطريات) كائنات رمية التغذية غالبا فتنمو على البقايا العضوية للهائمات وتقوم بتحليلها وتحويلها الى مغذيات جاهزة تنمو عليها الهائمات ويزداد تواجدها ، كذلك فان الظروف البيئية الملائمة تكون متماثلة لكليهما في بعض الاوقات وتختلف في احيان اخرى. | The aim of this work was to study the occurrence of Phytoplankton and aquatic fungi (Oomycetes) in four lotic aquatic systems within Baghdad city (Tharthar Arm, Tigris River, Al - Jaish Canal and Diayla River) during 15 months, the following physico - chemical parameters were also measured : water temperature, pH, electrical conductivity, salinity, total dissolved solids, turbidity, dissolved oxygen, percentage saturation oxygen, total hardness and the nutrients. The effect of the different environmental factors on both Phytoplankton and fungi was investigated. The study included the biological aspects such as species composition and densities of Phytoplankton, isolation and identification of Oomycetes especially Saprolegniaceae for fungi. The results showed that the water temperature was affected by surrounding air temperature, it ranged from 10 - 29C in the Tharthar Arm and from 10 - 27C in Tigris River, 11 - 29.5C in Al - Jaish Canal and 11 - 30.6C in Diayla River. The water of all stations was slightly alkaline with pH values ranging from 6.1 - 8.0, the electrical conductivity, salinity and T.D.S are higher in Diayla River than the other stations. Waters were more aerated in Tharthar Arm and Tigris River than the water of Al - Jaish Canal and Diayla River, the water classified as very hard at all stations, the highest value of total hardness obtained at Al - Jaish Canal it reached 1250 mg/L followed by Diayla River 1230 mg/L. The Nitrate and Phosphate found in highest mean concentration 3.48, 4.67 mg/l respectively in Al - Jaish Canal followed by 2.09, 2.67 mg/l in Diayla River. A significant difference was found between the four stations concerning physico - chemical characters especially the electrical conductivity, salinity, TDS, dissolved oxygen, percentage of saturated oxygen and total hardness. 166 taxa of Phytoplanktons throughout the four stations were identified, diatoms was dominated (107) followed by the Chlorophyceae (28) Cyanophyceae (22) and the remaining belongs to Pyrrophyceae, Cryptophyceae and Xanthophyceae, more taxa were identified in Tigris River followed by Al - Jaish Canal. Some genera of Phytoplanktons were represented by higher numbers of the species such as Nitzschia, Navicula, Cymbella, Cyclotella and Gomphonema. Among the diatoms Pennales were dominated up on centrales, the Phytoplankton density was higher in the Tigris River 22942.6  103 ind./l followed by Al - Jaish Canal 18944.1  103 ind./l, 10106.2  103 ind./l in Diayla River and 8025.1  103 ind./l in Tharthar Arm. The diatoms comprised 91.4% in Tigris River and 87.4% in Tharthar Arm and 69.8% in Diayla River and 16.9% in Al - Jaish Canal. Out of 600 isolates of fungi carried out, 450 reached reproductive maturity so that it was possible to identify it to the level of species. 21 species belongs to 5 genera were identified in the present study, all these species have been described in detail. Most genera (isolates) were obtained through Winter which was the best season for its growth, among the 21 species 19 belongs to the family Saprolegniaceae, 5 species belonged to the genus Saprolegnia, 11 species belongs to the genus Achlya, 2 species belong to the genus Dictyuchus and 1 species to the family Leptomitaceae and the others to Pythiaceae. Out of 450 isolates, 168 isolates identified in Tigris, 146 isolates from Tharthar Arm, 50 isolates from Al - Jaish Canal and 86 isolates from Diayla River. Among the Oomycetes Saprolegnia ferax comprise 16.44% follwed by Pythium sp. 12.22% and less percentage obtained for Saprolegnia litorlis which consider as a rare species in rare occurrence. There was a reversal correlation between Phytoplankton and fungi, both were affected by the same environmental factors in some times and responsed differently at other occasitions

دراسة بعض الفعاليات البايولوجية والتنميط لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة حالات مرضية == Study on Some Biological Activity and Biotyping of Proteus mirabilis Isolated from Clinical Samples

اسم المؤلف: برجين امين خفاف
اسم المشرف: فاروق حسن العكيدي | رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للفترة من تشرين الاول 2004 ولنهاية تشرين الاول 2005 ، تم خلالها عزل بكتريا بروتيوس من 500 عينة مرضية ومن ثلاث مستشفيات رئيسية في مدينة بغداد. تضمنت النماذج المرضية، 310 عينة ادرار و104 مسحات جروح و64 مسحات حروق و22 مسحة اذن ، والتي تم من خلال زرعها على وسطي الدم وماكونكي عزل بكتريا البروتيوس بواقع 100 عزلة من النوع Proteus mirabilis و17 عزلة من النوع Proteus vulgaris وعزلتين من النوع Proteus penneri. اخضعت عزلات النوع Proteus mirabilis (100 عزلة) والمعزولة من عينات الادرار (50 عزلة) ومسحات الجروح (30 عزلة) ومسحات الحروق (15 عزلة) ومسحات الاذن الوسطى (5 عزلة) للفحوصات الاتية : 1. فحص الحساسية لمضادات الحياة : بطريقة الاقراص اظهرت جميع العزلات مقاومة بنسبة 100% لكل من المضادات كلورامفنيكول وارثرومايسين وتتراسايكلين ، 81% لمضاد الكوتراي موكساسول و77% لحامض النالدكس، و71% للنايتروفيورانتين، و40% للريفامبسين، و39% للجنتامايسين، و32% للامكاسين ، بينما كانت 25% من العزلات مقاومة للمضاد سبروفلوكساسين.2. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لاربع مضادات هي الجنتامايسين والسبروفلوكسين والكلورامفنيكول والاميكاسين تجاه 11 عزلة مقاومة لمضادات الحياة بدرجة عالية وظهر ان التركيز المثبط الادنى لكل من المضادات سالفة الذكر هو 2 - 512، 0.5 - 16، 1 - 512، 0 - 8 مايكروغرام/مل وحسب التعاقب.3. تراوح زمن انتاج انزيم اليوريز لعزلات الدراسة من 2.5 - 6 ساعة ، عدا عزلتي ادرار استغرقتا 24 ساعة لحين ظهور النتيجة.4. ظهر ان وسط الحليب هو المفضل على وسطي الكازائين والجيلاتين في التحري عن نشاط انزيم البروتيز وبواقع 90% و78% و76% وعلى التعاقب.5. وجد ان الدم البشري من الصنف O ودم الدجاج هما الافضل استعمالا للتحري عن نشاط انزيم الهيمولايسين وبواقع 59% ، 100% لكل منهما.6. درس النشاط الهيمولايسيني بظروف بيئية مختلفة وكانت درجة الحضانة 44م ودرجة الحامضية pH - 7 واستخدام الوسط الزرعي مولير - هنتون كقاعدة للدم هي الافضل لتحديد النشاط الهيمولايسيني للعزلات.7. ضعف نشاط انزيم الهيمولايسين بعد اضافة مضادات الحياة (كلورامفنيكول وجنتامايسين والاميكاسين والسبروفلوكساسين) الى مزارع البكتريا.8. تراوحت انماط التحلل الهيمولاسيني من الاحادي الى التسعي، وكان افضل تجمع للعزلات في الانماط V وIV وVII وبواقع 33% و19% و16% على التوالي.9. ظهر ان افضل الظروف البيئية لظاهرة دنيس هي استخدام درجة حرارة حضانة 37م وpH - 7 ووسط الاكار المغذي كقاعدة للدم.10. اعطت عملية التنميط باستخدام النشاط الهيمولايسيني اعلى تجمعا للعزلات (33%) ، وكانت نتائجها مفضلة على نتائج استخدام التنميط بظاهرة دنيس (22.1%). | of October 2005, through which Proteus bacteria could be isolated from different clinical specimens (500) and from three major hospitals of Baghdad City (Al - Yarmok, Al - Kindy, Al - Karama).The specimens included 310 urine samples; 104 wound swabs; 64 burn swabs and 22 ear swabs.The specimens were cultured on blood and MacConkey’s agar it yielded a 100 isolates of Proteus mirabilis; 17 isolates of Proteus vulgaris and 2 isolates of Proteus penneri. Proteus mirabilis were isolated from urine (50 isolates); wounds (30); burns (15) and ears (5), these isolates were subjected to the following tests : 1. Antibiotics sensitivity test : all the isolates were resistant 100% towards, Chloramphenicol, Erythromycin, Tetracycline, while 81% to Co - trimoxazole, 77% to Nalidixic acid, 71% to Nitrofurantoin, 40% to Rifampicin, 39% to Gentamicin, 32% to Amikacin and 25% of the isolates were resistant to Ciprofloxacin.2. The minimum inhibition concentrations of four antibiotics (Gentamicin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, Amikacin) towards 11 isolates which were highly resistant to antibiotics revealed an MICs for the tested antibiotics ranged between 2 - 512; 0.5 - 16; 1 - 521; 0 - 8 /ml respectively.3. Except two isolates from urine that required 24 hrs for urease activity, all other isolates needed a time range between 2 - 5 to 6 hrs for the activity of this enzyme. 4. Compared to caseine and gelatin medium, milk agar medium was preferable for the detection of protease activity.5. Human blood group O and chickens blood were the most convenient to detect the haemolysin activity with the ratios 59% and 100% in accordance.6. The most favorable pH and temperature for haemolysin activity were 8 and 44C respectively, using Mueller - Hinton medium as blood agar base.7. Haemolysin activity was reduced after the addition of antibiotics (Chloranphenicol, Gentamicin, Amikacin, Ciprofloxacin) were applied in the broth culture.8. The patterns of haemolysis were ranged from type I to type IX, and the more accumulation of strains were in the types V (33%), IV (19%) and VII (16%).9. The most favorable environmental conditions for Dienese phenomena were incubation temperature at 37C, pH - 7 and using of nutrient agar as blood agar base.10. Identical strains was noticed by using haemolysin activity (33%), while using Dienese phenomena it was 22.1%.

التداخل البكتيري مع عوامل ضراوة خميرة الكانديدا المسببة لحالات التهاب الفرج والمهبل == Bacterial Interference In The Virulence Factors Of The Yeast Candida Causing Vulvovaginal Candidiasis

اسم المؤلف: ايمان ناطق ناجي البياتي
اسم المشرف: احسان شفيق توفيق دميرداغ | سناء مسلم الصفار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2004
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 200 عينة من اعالي المهبل ( H.V.S ) High Vaginal Swab من نساء متزوجات توزعت بين 130 امراة غير حامل ( Non Pregnant Women ) ( NPW ) منهـن 90 كن مصابات بالتهاب الفرج والمهبل Vaginitis و( 40 ) منهن كن سليمات لغرض السيطرة (H ) Healthy Control والباقــي ( 70 ) عينة من نساءحوامل ( P.W. ) Pregnant Women ، منهـن( 40 ) امراة مصابة بالتهاب الفرج والمهبل و( 30 ) اخرى سليمـة سيطرة . استمرت فترة جمع العينات من 1/6/2002 الى 1/2/2003 تحت اشراف الكادر الطبي المتخصص في قسم النسائية والتوليد في مستشفى النعمان العام في الا عظمية / بغداد . كما تم تخصيص استمارة استبيان لكل مريضة دون فيها كل ما يخص المريضة من اعراض سريريه ونتائج التشخيص والفحص المختبري والملاحظات العامة .اعتمادا على الاعراض المرضية والفحوصات المختبرية التشخيصية تم تحديد ثلاث انواع من الالتهابات المهبلية وهي : ا - التهاب الفرج والمهبل اللانوعيBacterial Vaginosis (BV.) ..ظهرت الحالة في (23) مريضة من مجموع (70) امراة حامل [ فيهن (40) مريضة و( 30) اخرى سليمة ] بنسبة (33%) من الحوامل ، كما ظهرت في ( 25) امراة غير حامل من مجموع ( 130) امراة [فيهـن ( 90 ) مريضة ] بنسبة ( 19% ) من النساء غير الحوامل .ب - التهاب الفرج والمهبل الكانديدي Volvavagianal Candidiasis (VVC) .. ظـهرت الحالة في ( 13) مريضة من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة ( 18%) [فيهن ( 30) امراة سليمة و( 40) اخرى مريضة ] كما ظهرت في ( 43) مريضة من مجموع ( 130) امراة غير حامل بنسبة (33%) [فيهن ( 40) امراة سليمة و(90) اخرى مريضة جـ - التهاب ناتج من اصابة مختلطة Mixed Infection (MI) ظهرت الحالة في ( 4) مريضات من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة (6% ) [ فيهن ( 30) امراة سليمة و(40) اخرى مريضة] كما ظهرت في (22) مريضة من مجموع (130) امراة غير حامل بنسبة ( 17) [ فيهن (30) امراة سليمة و(40) امراة اخرى مريضة] . وقد تم عزل 74 عزلة من خميرة الكانديدا عزلت ( 38 ) عزلة منهـن( 43 ) امراة مصابة بالكانديـدا ( VVC ) عزلت ( 16 ) عزلة من (22) مريضة مصابة باصابة مختلطة (M.I ) وعـزلت ( 5 ) عزلات من مجمـوعة السيطرة من النساء غير الحبلى ومن جانب اخـر عزلت ( 11 ) عزلة من ( 13 ) امراة مصابة بالكانديدا ( VVC ) و( 3 ) عزلات من 4 نساء مصابات اصابة مختلطة ( M.I ) وعزلة واحدة من مجموعة السيطرة للنساء الحوامل. وهذه النتائج تدل على سيادة خميرة الكانديدا في التهاب الفرج والمهبل لدى مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل.و تم تشخيص الانواع التالية من خميرة الكانديدا وهي : Candida albicans ( 37 عزلة ) ، C. tropicalis ( 20 عزلة ) C. glabrata ( 7 عزلات) C.dubliniensis ( 7 عزلات ) وC.parapsilosis عزلة واحدة وC. krusei عزلتين. امكن الحصول على 588 عزلة بكتيرية من مجموع عدد الحالات الموجبة للزرع البكتيريولوجي لمجموعتي المرضى والسيطرة البالغ عددهم ( 140 ) امراة شخصت فيها سبعة اجناس من البكتيريا اللاهوائية والانواع التابعة لها وهي : Peptostreptococcus spp, Peptococcus spp, Prevotella spp , Streptococcus spp, Bacceroides spp, Propionibacterium spp, Lactobacillus spp, كما تم تشخيص انواع من البكتريا المتحملة لوجود كميات قليلة من الاوكسجين وهي : Strept . mitis , Entero , faecalis , Gardnerella vaginalis اضافة الى اربع اجناس وبعض انواعها من البكتريا الهوائية وهي Proteus spp , Staphylococcus spp , Escherichia spp, Pseudomonas spp .ولقـد كان النوعان G.vaginalis , Bacteroides fragilis من اكثر الانواع عزلا في مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل المصابات بالتهاب الفرج والمهـبل اللانوعي B.V . وفيما يخص عوامل الضراوة لخميرة الكانديدا والانواع التابعـــة لها وجد ان 28 عزلة ( 76 % ) منتجة للانزيم الحال للشحوم المفسفرة Phospholipase و6 عزلات ( 16 % ) ضعـيفة الانتاجية لهـذا الانـزيم و( 3 ) عزلات ( 8 % ) غير منتجة من اصل ( 37 ) عزلة للنوع C. albicans اماعزلات C. tropicalis فكانت 15 عزلة ( 75 % ) منتجة للانزيم و3 عزلات ( 15 % ) ضـعيفة الانتاجية وعزلتان ( 10 % ) غير منتجة من اصل 20 عزلة . اما عزلات النوع C.dubliniensis فكانت منـها ( 5 ) عزلات ( 71% ) منتجة من اصل (7) عزلات فى حين انتجت عزلة واحدة للنوع C.glabrata هذا الانزيم .وعند دراسة انتاج الانزيم الهاضم للبروتينات Proteinases كعامل اخر من عوامل الضراوة فقد تباينت قدرة الانزيمات المنتجة مـن عزلات الكانديدا على هظم البروتيــن بين ( 175 - 30 ) مكغم / مل وتفاوتت العزلات في قابليتها على انتاج الانزيم فكانت هناك 29 عزلة منتجة من اصل 74 عزلة كانديدا وكانت ( 7 ) منـها مـن النوعC.albicans و( 8 ) منها للنـوع C. tropicalis , وثلاث منها للنوع C. dubliniesis وعـزلة واحـدة للنـوع C. glabrata ولم تتمكن عزلات النوعين الاخرين من انتاج الانزيم وهما C.parapsilsosis وC. krusei . ومن حيث عامل الضراوة الثالث وهو قدرة الخميرة على الالتصاق بالخلايا الطلائية فقد تفاوتت ايضا عزلات الخميــرة فـــي اظهار هـــذه القدرة وكان النوعان C. albicansوC. dubliniensis هما الاكثر كفاءة في الالتصاق من بين الانواع الاخرى وكانت نسبة خلايا الخميرة الملتصقة بالخلايا الطلائية في درجة الحرارة 25 م اعلى من التي حصلت عند درجة 37 م للعزلة نفسها ولكن التحليل الاحصائي لم يظهر فروقا معنوية عالية .كانت جميع عزلات خميرة الكانديدا مقاومة لمادة النستاتين وبتراكيز عالية جدا بلغت 256 مكغم / مل في حين كان المستحضر Clotrimazole هـو الافضل مـن بين مشتقات الازول الاخرى اذ كانت جميع العزلات حساسة له فقـد تراوحت قيـم (MIC ) بيـن ( 2 - 125, 0) مكغم / مل للنوعين C.albicans , C.tropicalis و( 0.5 - 0,125) للنوعين C.dubliniensis وC.glabrata وكانت قيم MFC اكبر او تساوي 4 مكغم / مل . بينـما تفاوتت حساسية عزلات الخميرة اتجاه مشتقات الازول الاخرى اذا اظهرت ثلاثة انواع من الخميرة مقاومة لمضاد Ketoconazule وهي C. albicans , C.dubliniensis , C. glabrata اذ تراوحت قيم MIC ( 0.5 - 32 )،( 0.25 - 16 ) , 160.25 - - مكغم / مل على التوالي بينما كانت الانواع الثلاثة الاخرى حساسة له . وكانت قيم MFC على العموم اكبر ويساوي 32 مكغم / مل . وكانت جميع العزلات حساسـة لمضاد Miconazole اذ تراوحت قيم ( MIC ) مـن ( 4 - 8 ) مكغم / مـل ضد النوع C. albicans واقلها هـــي للنوع C.dubliniensis وهي (0.125 - 1.0) مكغم / مـل بينما كانت قيمة MFC تتراوح بين اكبر او يساوي 4 الى اكبر او تساوي 16 حسب نوع العزلة . وكانت قيم MIC للمضاد Fluconazole مرتفعة لكنها لم تتجاوز 32 مكغم / مل ولذا اعتبرت العزلات حساسة ولكن بتراكيز عالية بينما كان MFC له اكبر او يساوي 64 .كانت قيم MIC لمضاد Amphotericin B هــي الافضل اذا بلغت (0,125 - 0,5 ) مكغم / مل اما MFC فكان يساوي 1 مكغم / مل لقد اظهرت النتائج ان طريقة التخافيق باستعمال الوسط الزرعي السائل لتحديد MIC هي الافضل مقارنة باستعمال الوسط الزرعي الصلب اذ كانت قيم MIC مرتفعة مقارنة بقيم MIC بالطريقة الاولى .ولدراسة الفعالية التضادية لبعض انواع البكتريا المعزولة من اعالي المهبل على عوامل الضراوة وحيوية خميرة الكانديدا ، انتخبت 32 عزلة بكتيرية تابعة لاجناس مختلفة على اساس ما اظهرته من تاثير تضادي في التجارب الاولية على عوامل الضراوة او الحيوية او كلاهما وهذه العزلات هي ثلاث عزلات تابعة للنوع Peptostreptococcus prevotii ، ثلاث عزلات تابعة للنوع propianibacterium granulosum، وست عزلات تابعة للنوع Lactobacillus acidophilus وخمس عزلات تابعة للنوع L. gensenii وثلاث عزلات لكل من النوعين Streptococcus mitis وEnterococcus faecalis كما وانتخبت عزلات الخميرة الاكثر كفاءة في التجارب قيد الدراسة واعتمادا على نتائج الجزء السابق .بعد ان نميت العزلات البكتيرية السابقة الذكر في اوساط زرعية مناسبة لكل منها تم الحصول على رواشح مزارعها السائلة وتم تركيز الرواشح الــى نصف الحجم ( رم 1) والى ربع الحجم ( رم 2 ) مع الاحتفاظ بجزء من الراشح غير المركز . لم تظهر الرواشح غير المركزة تاثيرا على هذه العوامل ولقد بدا واضحا تاثير الراشح المركز لمرة واحدة او لمرتين وبدرجات متفاوته وذلك لاختلاف الاجناس البكتيريا والانواع التابعة لها . كانت اكـثر الـرواشح تاثيرا هـي الـرواشح المركزة م1 وم 2 لكـل مـن العزلات Sm3 , Ef3 , Lj5 , La5 , La6 على فعالية الخميرة في انتاج الانزيمات الهاضمة للبروتين والانزيمات الحالة للشحوم المفسفره وكان النوع C. albicans اكثر حساسية اتجاه المعاملة بهذه الرواشح مقارنة مع الانواع الاخرى ، كما اثرت هذه الرواشح على خفض نسبة الانبات في المصل وبفرو قات معنوية كبيـرة وصلت الى >0.001 P . واظهر ( رم1 ) ( رم2 ) للعزلة La 6 تاثيرا في خفض حيوية الخميرة مقدرة بوحدة مستعمرة لكل مل ( CFU/ml ) وتبين ان لحموضة هذه الرواشح تاثيرا في عملية التثبيط ولكن لا يعزى له التاثير الكلي. فعند مقارنة تاثير الحموضة فقط فـــي اوساط زرعيه سائلة ذات pH محدد ومماثل الى pH الرواشح مما يشير الى ان هذه الرواشح تحتوي مركبات ذات تاثير مثبط ، كما لم تظهر رواشح العزلات الاخرى تاثيرا واضحا او كان بعضها غير مؤثر . ولمحاولة فهم طبيعة تاثير خلايا العزلات البكتيرية السابقة على عملية التصاق خميرة الكانديدا بسطوح الخلايا الطلائية وجدنا ان العزلات Lj5 , La5 , Pp3 , Pg3 , Sm3 , Ef3 , La6 هي الاكثر تاثيرا في خفض نسبة الالتصاق وعلى التوالي وقد اظهرت العزلات طرقا مختلفة في طبيعة منع الالتصاق اما باحاطة خلايا الخميرة بغلاف من خلايا البكتريا او باحاطة الخلية الطلائية بغلاف من خلايا البكتريا او كلاهما مما يمنع التصاق الخميرة بسطح الخلية الطلائية وذلك من خلال غلق المستقبلات على سطوح الخلايا. | 200 high vaginal swabs were taken from 200 married women, 130 of them were non - pregnant (N.P) and 70 were pregnant (P.) women. Of the 130 N.P : 90 were suffering from vaginitis and 40 were healthy controls. Of the pregnant group 40 were suffering from vaginitis and the rest 30 were healthy controls. Thus there were a total of 130 infected and 70 healthy. Sample were taken during the period of first of June 2002 till the end of Feb. 2003, under the supervision of specialized gynecologist in the general No’man hospital in Adhamia , Baghdad . A special questionnaire was prepared for each individual. As result of cultural and microbiological examinations of the sample and depending on the clinical and microbiological features of the 130 infected pregnant (90) and non - pregnant (40) women their vaginitis were devided into three groups, namely : (a) : Bacterial vagnosis (B.V) : Appeared in (23) out of (70) pregnant women [ including (30) healthy and (40) infected i.e. 33% ]B.V. also appeared in 25 non - pregnant women out of 130 [ including (40) healthy and (90) infected i.e. 19% ](B) : Volavaginal condidiasis (V.V.C).Appeared in 13 women out of (70) pregnant women ( 18%) [including 30 healthy and (40) sick] it V.V.C also appeared in (43) infected non - pregnant women out of 130 ( 33%)[ including (40) healthy and (90) sick](C ) : Volvavaginosis due to mixed bacterial and fungal infection. I.e. mixed infection (M.I) : Appeared in (4) patient out of (70) pregnant women (6%) [including 30 healthy and (40) sick women ] . It also appeared in (22) patients out of (130) non - present women [including (40) healthy and (90) sick pregnant women] A total of (74) isolates of candida SPP were isolate from non pregnant and pregnant women of this number 38 isolates from (43) VVC non pregnant cases, (16) isolates from 22 MI non pregnant cases, 5 isolates from 40 healthy non pregnant group, 11 isolates from 13 VVC pregnant women, 3 isolates from 4 MI pregnant women, and one isolates from 30 healthy.The following species of Candida were identified : C. albicans 37 isolates , C. tropicalis 20 isolates , C. glabrata 7 isolates , C. dubliniensis 7 isolates , C. parapsilosis one isolate , and C. kursei 2 isolates .Bacteriologically 588 isolates of bacteria were obtianed form 140 women positive for bacterial cultural ; these include several species of 7 anaerobic bacterial genera ; peptostreptococcus, peptococcus , Streptococcu spp, prevotella spp, Bacteroides spp, lactobacillus spp and propionibacterium spp. Similarly the following microaerophilliic bacteria were isolated; Gardnnerella vaginalis, Enterococuus faecalis , and Streptococcus mitis . The following aerophilic were also isolated, staphyllococcus spp, proteus spp Escherichia spp and pseudomonas spp. the most frequently isolated species a mong infected women group with ( B.V) were Bacteriodes fragilis and G. vaginals . Concerned the virulence factors of the yeast candida spp like production of phospholipases and proteinasas, besides the adherence on epithelial cells ( from human mouth ) and drug tolerance. Phpspholipase was produced by 28 isolates (76 %) out of 37 of C. albicans whereas the rest 6 isolates (16 %) were weak producers and 3 isolates (8 %) did not produce this enzyme. On the other hand out of 20 isolates of C. tropicalis 15 (75 %) were weak producer and 2 isolates (10 %) were not producers of the enzyme . Of The 7 isolates of C. dubliniesis 5 (71% ) could produce the phospholipase also one ( 14 % ) of the 7 isolated of C.glabrata could produce theis enzyme . The enzyme proteinase was produced by 29 out of 74 (39 %) isolated of candida spp out these 17 were C.albicans 8 were C. tropicalis , 3 were C. dubliniesis , one was C. glabrata the other species did not produce the enzyme. Ability of the isolates for attachment onto the surface of epithelial cells varied according to the species. Both C.albicans , C. dubliniesis were more efficient than other species . The percentage of epithelial cells attached by yeast cells were higher at 25C than at 37 C for the same isolate of the yeast, though this difference was not significant. As the resistance to antifungals concerned, we found that all isolates of candida were resistant to nystatin . The measured minimum inhibitory concentration (MIC) reached 256 g/ml . On the other hand , all isolates of candida were much more susceptible to clotrimazole with MIC ranging ( 0,125 - 2 ) g/ml for C.albicans and C. tropicalis and about ( 0,5 - 0.125 ) g / ml for C.dubliniesis and C.glabrata . The minimum fungicidal concentration (MFC) was 4 ug/ml or more for these Candida spp .The (MIC) for ketocanazole against C. albicans , C.dubliniesis , C.glabrata ranges were [0.5 - 32, 0.25 - 16 and 0.25 - 16] g / ml respectively, whereas the other species of candida were more sensitive to ketaconzole , and the ( MFC ) generally was equal to or higher than 32 ug / ml .The (MFC) for Miconzole was (4 - 8) g / ml against C. albicans an (1 - 0.125) g / ml agianst C.dubliniesis , the ( MFC ) ranged between equal to or higher than 4 and 16 g / ml . Fluconzole was less effctive than the others as the (MIC) values agianst all species were 32 g / ml or les. While the (MFC) was equal to or higher than 64 g / ml. Amphoterricin B was the most effective as the (MIC) values against all isolates of candida were (0.125 - 0.5) g / ml and MFC was 1 g/ ml.For the determination of (MIC) we found that using serial dilution of liquid cultures was better than using solid agar media. The recorded (MIC) result using agar media were higher than those obtained in liquid media.We studied the antagonistic effect against virulence factors of Candida spp by (23) isolates of bacteria isolated from healthy vagina. The selection of the candida and the bacterial isolates based on preliminary tests. So three isolates of peptostreptococuus prevotii, three isolates of propionibacteriume granulosum, six isolates of lactobacillus acidophilus , five isolates of lactobacillus jensenii , three isolates of each of streptococcus mitis , and Enterococcus feacalis were used in such tests as culture filtrates and / or as bacterial cells.The cultural filtrates were concentrated to the half or to the quarter volume of the original, as the non - concentrated culture filtrates did not show any effect. Different filtrates showed different levels of effect, the more effective were the double or quadruple concentrates of the culture filtrates of L.acidophilus isolates no 5 and 6, L.jensenii isolates No. 5, Enter.faecalis isolates No. 3 and strep.mitis isolates No. 3 . These filtrates adversely affected the phospholipase and proteinase enzymes, C.albicans being more affected than other species. Also these filtrates reduced significantly (P < 0.001) the percentage of germ forming cells of C.albicans . The culture filtrate (conc. to half or to quarter volume) of isolate No. 6 of L.acidophilus greatly reduced the viability (CFU /ml) of C.albicans and other species. This effect was not totally due to the acidity (low pH) since similar pH values in control tests did not reduce viability to the same level and did not effect the yeast cells. We found that adhesion of candida cells to epithelial cells was reduced in the presence of bacterial cells. The following bacteria were effective and they are listed below starting from the most to the less effective in reducing the number of adhering yeast cells (the number refers to the isolate number L.acidophilus 6, Enter. feacalis 3, Strep. mitis 3, P.granulosum3 peptost. prevotii 3 , L.acidophilus 5 and L.jensenii 5 .Some species of bacteria prevented adhesion by surrounding the yeast cells while other species surrounded the epithelial cells some did both

المؤشرات الحيوية في اللعاب والدم في النساء المصابات بسرطان الثدي == Biomarkers in Saliva and Blood of Breast Cancer in Women

اسم المؤلف: ايدن كامل محمد
اسم المشرف: خالد مهدي صالح | ماهرة نوري احمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يشكل سرطان الثدي المرتبة الاولى من بين اكثر السرطانات شيوعا في العراق، وقد اصبح يشكل اكبر تهديدا لصحة النساء العراقيات. يمتاز سرطان الثدي بكونه مرض شديد التغاير بسبب تنوع خصائصه المظهرية، نتائجه السريرية، وتباين استجابته للعلاجات المختلفة. لذلك فان الدراسة الحالية تحاول ان تضع تصنيف شامل لسرطان الثدي عند النساء العراقيات من خلال تحديد قوة عوامل الخطورة الاكثر شيوعا ، ومستويات بعض الدوال الحيوية قبل وبعد عملية الازالة الجراحية وفيما اذا يمكن الكشف عنها في اللعاب كسائل جسمي تشخيصي بديلا عن الدم.تم تصميم هذه الدراسة لتشمل 181 امراة عراقية من مراكز ومستشفيات الكشف المبكر عن السرطان والامراض النسائية خلال الفترة من تموز 2013 ولغاية تشرين الثاني 2014 . كان عدد النساء السليمة من امراض الثدي 50 امراة ، و131 امراة تعاني من امراض الثدي (111 منهن لديهن سرطان الثدي الخبيث ، والـ 20 المتبقية منهن يعانين من امراض الثدي الحميدة) ، حيث تم تاكيد التشخيص السريري باستخدام تقنية الرشف بالابرة الدقيقة من قبل المتخصصين في هذه المراكز.باستخدام استمارات الاستبيان ، تم الحصول على بيانات التاريخ الطبي لكل النساء المشمولات بالدراسة لتحديد عوامل الخطورة المرافقة لسرطان الثدي كالعمر ، والتاريخ العائلي للمرض ، والعمر عند اول دورة طمثية ، والعمر عند بدا سن الياس ، واستخدام موانع الحمل الفموية ، والحالة الزوجية ، والاجهاض ، والرضاعة ، والتعرض السابق لامراض الثدي والاشعاع ، بالاضافة الى التدخين. كما تم الحصول على بعض المقاييس البدنية كالطول ووزن الجسم ومحيط الخصر والورك لتحديد حالة البدانة لدى كل النساء المشمولة بالدراسة.تم جمع عينات الدم واللعاب من كل النساء لتحديد صنف الدم حسب نظام ABO ونظام لويس وحالة الافراز وكذلك لتقدير مستويات الدوال الحيوية فيهما والتي تضمنت الاسترادايول والبروجيسترون والـCancer Antigen 15 - 3 وCarcinoemberyonic Antigen والبروتين الكلي. اما عينات الخزعة فقد استحصل عليها فقط من النساء المصابات بسرطان الثدي بعد عملية الاستئصال الجراحي واخضعت للفحص الامراضي النسجي والجزيئي لغرض تصنيف السرطان الى انواعه الرئيسية وانماطه الثانوية باستخدام تقنية الكيمياء المناعية النسجية. لقد بينت الدراسة الحالية العديد من النتائج والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1. هناك اربعة عوامل خطورة فقط والتي يمكن الوقاية منها (البدانة وامراض الثدي السابقة واستخدام موانع الحمل والاسقاط) هي التي رافقت بشكل معنوي سرطان الثدي ، في حين سجلت معظم عوامل الخطورة التي لا يمكن الوقاية منها كتاريخ المرض العائلي وحالة اللاافراز وطمث مبكر وسن ياس متاخر زيادة معنوية من خطورة اصابة النساء بسرطان الثدي. ان التاثير التراكمي لعوامل الخطورة هذه اوضح بان 99.1% من النساء المصابات بسرطان الثدي لديهن واحد او اكثر من عوامل الخطورة سواءا تلك التي يمكن الوقاية منها او التي لا يمكن الوقاية منها وبتوشيجات مختلفة بالمقارنة مع 68% من النساء السليمات و75% من النساء المصابات بامراض الثدي الحميدة.2. ان تراكيز جميع الدوال الحيوية المستخدمة في هذه الدراسة قد ارتفعت في دم النساء المصابات بسرطان الثدي عن الحد الاعلى لمدياتها الطبيعية وعن تلك المسجلة عند النساء الطبيعيات والمصابات بامراض الثدي الحميدة ما عدا البروجيسترون الذي بقي تركيزه ضمن الحدود الطبيعية في كل المجاميع. كما تبين بان جميع الدوال الحيوية امكن العثور عليها في عيينات اللعاب وان معامل الجزء اللعابي خاصة للدالتين CA 15 - 3 والبروتين الكلي سجل ارتفاعا معنويا لدى النساء المصابات بسرطان الثدي (14.51% و9.86% على التوالي) بالمقارنة مع (10.65% و2.08% على التوالي) عند النساء السليمات و(12.28% و2.41% على التوالي) للنساء المصابات بامراض الثدي الحميدة .3. بينت الدراسة ان اكثر انواع سرطان الثدي شيوعا عند النساء العراقيات طبقا لتصنيف الامراض النسجية هو السرطان الاجتياحي حيث شكل 92.8% من المجموع الكلي لحالات سرطان الثدي في هذه الدراسة ، والنسبة المتبقية (7.2%) تعود للسرطان الموقعي. في حين اظهر التصنيف الجزيئي بان اكثر الانماط الثانوية شيوعا من السرطانات الاجتياحية هو النمط luminal - like حيث شكل (80.6%) ، واما النسبة المتبقية فشكلت (9.7%) لكل من النمطين HER2 - enriched وbasal - like. وان معظم حالات النمط basal - like كانت من الدرجة الثالثة (90%) بالمقارنة مع 21.7% في حالات النمط luminal - like و10% في النمط HER2 - enriched.4. ان عوامل الخطورة التي لايمكن الوقاية منها هي وحدها التي سجلت ترددات عالية بين حالات النمط basal - like بحيث ان 90% من نساء هذا النمط كن في عمر ما قبل سن الياس ، و70% منهن كان لديهن دورة طمثية غير طبيعية ، و40% منهن لديهن تاريخ عائلي للمرض في اقارب الدرجة الاولى ، و100% من نساء هذا النمط لا يمتلكن صفة الافراز الوراثية. 5. بغض النظر عن البروجيسترون ، فان تراكيز جميع الدوال الحيوية انخفضت بشكل معنوي في عينات الدم واللعاب ولجميع الانماط الثانوية بعد عملية الازالة الجراحية للورم عما كانت عليه قبل الازالة الجراحية ، غير ان حالات النمط basal - like بقيت تراكيز الدوال فيها اعلى وبشكل معنوي عن تلك الموجودة في النمطين الاخرين. 6. على الرغم من ان معامل الجزء اللعابي لكل من الاسترادايول والبروجيسترون والـ CA 15 - 3 لم تتغير قيمته بعد عملية الازالة الجراحية للورم عن تلك المسجلة قبل الازالة الا ان قيمته بالنسبة للدالة CEA (قبل وبعد العملية) ولدالة البروتين الكلي (بعد العملية) قد ازدادت بشكل معنوي في حالات النمط basal - like بالمقارنة مع تلك الموجودة في النمطين الاخرين . يمكن ان نستنتج بان صفة الافراز الوراثية تعد كعامل خطورة قوي لسرطان الثدي خاصة اذراافقتها عوامل خطورة اخرى ، كما ان اللعاب يعد كسائل جسمي تشخيصي يمكن استخدامه للتحري عن العديد من الدوال الحيوية المتعلقة بسرطان الثدي على الاقل للتفريق بين سرطان الثدي وبقية امراض الثدي الحميدة وكذلك بين الانماط المختلفة لسرطان الثدي الاجتياحي. | In Iraq, breast cancer ranks the first among the commonest malignancies, which became one of the major threats to Iraqi female health. Breast cancer is a highly heterogeneous disease due to its diverse morphological features, clinical outcome and response to different therapeutic options. Therefore, the current study attempt to establish a comprehensive classification of breast cancer in Iraqi women via determining the strength of most common risk factors, levels of some biomarkers pre - and post - surgical operation, and whether they are detectable in saliva as an alternative diagnostic fluid as well as of blood. This study has been designed upon 181 Iraqi women in different sites and hospitals for early detection of breast cancer and gynecology Hospital during the period from July 2013 to October 2014. Women involved in this study include 50 healthy, and 131 breast diseased (111 from them are with malignant breast cancer and 20 with benign - breast disease), the diagnosis was confirmed according to the fine needle aspiration (FNA) technique carried out by specialists. By using questionnaire list, clinical history of all women was obtained to determine risk factors associated with breast cancer such as age, family history, age at menarche and menopause, oral contraceptive use, marital status, pregnancy, abortion, breast feeding, previous exposure to breast disease and radiation, as well as smoking. Physical measurements were obtained from all women including height, body weight, waist and hip circumference to determine their obesity status.Blood and saliva samples were collected from all women to determine ABO and Lewis blood groups, secretory status, as well as biomarkers levels including estradiol, progesterone, CA 15 - 3, CEA, and total protein. However, tumor biopsies were obtained only from breast cancer women postoperatively and subjected to histopathological and molecular investigation to classify the major types and subtypes of breast cancer by using immunohistochemistry technique.The present study revealed several results which can be summarized as follows : 1. Only four preventable risk factors (obesity, previous breast disease, oral contraceptive use, and abortion) were significantly (P < 0.05) associated with breast cancer, while most of the non - preventable risk factors including positive family history, non - secretors, early age at menarche and late age at menopause were significantly (P < 0.05) increased the risk in women for getting breast cancer. Furthermore, the accumulative effect of all these risk factors showed that 99.1% of Malignant breast cancer women have combination of one or more risk factors whether they are preventable or non - preventable which are present in different combination in comparison with 68% of normal breast and 75% of benign breast - diseased women.2. The concentrations of all biomarkers investigated in this study were elevated in the blood of malignant - breast women and become higher than those in normal and benign breast diseased women as well as higher than upper limits of their normal range except progesterone which remained within its normal range. Furthermore, all biomarkers were detectable in the saliva samples and the salivary fraction index (Sf %) particularly of CA 15 - 3 and TP were significantly higher in Malignant breast cancer women (14.51%, 9.86% respectively) than those in normal breast (10.65%, 2.08% respectively) and benign breast (12.28%, 2.41% respectively). 3. The most common type of breast cancer among Iraqi women according to histopathological classification was invasive carcinoma (92.8%), while the rest belong to in situ ductal carcinoma (7.2%). Whereas molecular classification showed that the most frequent subtypes of invasive carcinoma among Iraqi women was Luminal - like carcinoma (80.6%), while the rest (9.7%) were recorded for each HER2 - enriched and basal - like. The majority of basal - like cases were found at the 3rd grade (90%) when compared with 21.7% in luminal and 10% in HER2. 4. Non - preventable risk factors recorded high frequency among basal - like cases; 90% of them are at premenopausal status, 70% have abnormal menarche, 40% having first - related women getting breast cancer, and 100% of them are non - secretors.5. In spite of progesterone, concentrations of all other biomarkers were significantly decreased postoperatively in blood and saliva of all subtypes when compared with their concentrations preoperatively, but cases with basal - like carcinoma still have higher concentrations than those in luminal and HER2 whether pre - or postoperatively. 6. Although the salivary fraction of estradiol, progesterone, and CA 15 - 3 didn’t change after surgical removal of tumor from that of preoperatively, its values for CEA (pre - and postoperatively) and total protein (only postoperatively) were significantly increased in basal - like cases in comparison with those in luminal and HER2 subtypes.It can be concluded that secretor status should be considered as a strong risk factor for getting breast cancer particularly when combined with other risk factors, also saliva as diagnostic body fluid is a promised sample to search for several biomarkers related with breast cancer at least to differentiate between breast cancer and other benign breast diseases as well as between the different subtypes of invasive breast carcinoma.

دراسة تشريحية مقارنة لتراكم الصابونيات وتقديرها في نبات Yucca gloriosa Variegata L. الكامل ومزارعه النسيجية

اسم المؤلف: انسام غازي عبد الحليم علي
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش | كاظم محمد ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد نبات الخنجر الاسباني Yucca gloriosa Variegata L. نبات زينة وطبي مهم, ينمو في المناطق الجافة وشبه الجافة حول العالم. يعد التكاثر الخضري التقليدي للنبات عن طريق العقل والخلفات وسيلة غير كافية نظرا الى الاعداد المحدودة التي يستطيع انتاجها، وعليه توفر تقنية زراعة الانسجة النباتية طريقة بديلة للانتاج التجاري لهذا النبات. ازداد الاهتمام بنبات Y. gloriosa لان جميع اجزاء النبات غنية بالمركبات الستيرويدية التي لها قيمة علاجية واسعة. اجريت الدراسة بهدف اكثار هذا النبات نسيجيا واختبار انتاج الانسجة من الصابونيات الستيرويدية في انسجة الزروعات ومقارنتها مع محتوى هذه المركبات في النبات الكامل باستعمال التحليلات الكروماتوغرافية والمجهر الفلوريسيني والذي يعتبر طريقة جديدة فعالة لتقدير مستوى تراكم المركبات الثانوية واختبار المنتجات النباتية الطبيعية التي تستعمل كعقاقير طبية. لدراسة الاخلاف خارج الجسم الحي اضيفت تراكيز مختلفة من منظمات النمو البنزل ادنين BA)) وحامض النفثالين NAA)) وتداخلهما الى الوسط الغذائي موراشيج وسكوج(MS) لاستحثاث الكالس من الاوراق والبراعم. سجلت النسبة المئوية لاستحثاث الكالس والوزن الطري ولون وبنية الكالس بعد 1.5 و6.0 اشهر من الزراعة. استحث الكالس من اجزاء الاوراق في وسط MS مجهز ﺑ 6 ملغم/لتر NAA. اظهرالتداخل بين 0.2 ملغم/لتر BA و1.5 ملغم/لتر NAA تاثير ملحوظ في نشوء الكالس من البراعم. تم اختبار تاثير اضافة منظم النمو الثايدايازورون (TDZ) ﺑتراكيز مختلفة (0.0, 0.1, 0.5 او (1.0 ملغم/لتر الى وسط MS مجهز ﺑ BAو NAAفي استحثاث الكالس. سجل اسرع نمو واكثر انتاجية للكالس من البراعم في الوسط المجهز ﺑ 0.1 ملغم/لتر BA مع 1.5 ملغم/لتر NAA و1.0 ملغم/لتر TDZ. اظهر TDZ تاثيرا ايجابيا في ٳستحثاث الكالس من البراعم مقارنة مع BA او NAA, واعطت بعض التداخلات تكوين مباشر للافرع الخضرية. تميز الكالس الناتج من البراعم بلونه الٲبيض المائل الى الكريمي وبكونه متراص, بينما كان كالس الاوراق اخضر اللون ومفصص. تم اختبار تاثير عدة تداخلات من BA 3)، 6، 7، 8 او 9 ملغم / لتر) و0.05) NAA، 0.1 او 0.2 ملغم / لتر) في تكوين النبيتات على وسط MS في غضون 12 اسبوعا، كان اعلى تكوين للنبيتات بوجود 9) ملغم / لتر) BA و0.1) ملغم / لتر) NAA . حدد تاثير اندول حمض البيوتريك (IBA) بتراكيز مختلفة في تكوين الجذور. ان افضل تجذيرللنبيتات كان في وسط MS بقوة ½ المجهز ﺑ 1.0 ملغم / لتر IBA. استخلصت وشخصت الصابونيات الستيرودية التايكوجينين والجيتوجينين من اجزاء النبات الكامل (اوراق، جذور وقمم نامية) ومزارعه النسيجية (الكالس، الاجزاء الخضرية التي تم اخلافها بطريقة مباشرة وغير مباشرة، الجذور) من النبات. جرى الكشف الاولي للصابونيات الستيرويدية باستعمال الطبقة الرقيقة الكروماتوغرافية (TLC). كما قدرت الصابونيات الستيرويدية (التايكوجينين والجيتوجينين) باستعمال الكروماتوغرافي عالي الاداء (HPLC). اظهرت مستخلصات الكحول البيوتانولي وجود التايكوجينين والجيتوجينين في كل جزء من النبات ومزارعه النسيجية بمدى يتراوح من 128.29الى409.75 ومن51.04 الى236.62 مايكروغرام/غرام على التوالي. سجلت اعلى قيمة للسابوجينينات sapogenins في اوراق النبيتات المعاد اخلافها بطريقة غير مباشرة. ان كمية هذه المركبات كانت جديرة بالاعتبار في انسجة الكالس المعامل مع TDZ اعتمادا على فترة نشوء الكالس القصيرة (ثلاثة اسابيع). نفذت دراسة تشريحية لملاحظة تراكم الصابونينات في اجزاء النبات الكامل ومزارعه النسيجية باستعمال المجهر الفلوريسيني وتبين بان اعلى تراكم قد ظهر في انسجة اوراق النبيتات التي تم اخلافها بطريقة غير مباشرة وفي انسجة الكالس المستحث نشوءه بمنظم النمو .TDZ سجل تغير في محتوى الصابونيات خلال فترات نمو الكالس المختلفة. | Yucca gloriosa Variegata L. is an important ornamental and medicinal plant, grows in arid and semi - arid regions around the world. Traditional vegetative propagation of the plant by cuttings and offsets is not adequate due to the limited numbers that can be produced. Plant tissue culture technique provides an alternative method for commercial propagation of this plant. The interest in Y. gloriosa increased because all parts of this plant are rich in steroidal compounds that have vast therapeutic values. This study was performed to propagate this plant in vitro and investigate the yield of steroidal saponins in the plant tissue cultures. Comparison of the saponins yield in intact plant and tissues or organs derived from it using chromatographic analysis and fluorescence microscopy was carried out. To search the potential of in vitro rapid regeneration of this plant, different concentrations of 6 - Benzyladenine (BA), 1 - naphthaleneacetic acid (NAA) and combinations of both were assessed for callus induction on leaf and bud explants using Murashige and Skoog (MS) medium. Callus response initiation percentage, fresh weight, texture and color of the callus were evaluated after 1.5 and 6.0 months in culture. The appropriate medium for callus initiation on leaf explants was MS medium supplemented with 6.0 mg/l NAA. A combination of 0.2 mg/l BA and 1.5 mg/l NAA also exhibited a remarkable callus induction on bud explants. Addition of thidiazuron (TDZ), BA and NAA at various concentrations (0.0, 0.1, 0.5 or 1.0 mg/l) were examined for callus initiation. Faster growth and more proliferation of callus on bud explants were observed on MS medium supplemented with 0.1 mg/l BA + 1.5 mg/l NAA + 1 mg/l TDZ. Results showed that TDZ was more efficient for inducing callus than BA or NAA however some combinations gave direct shoot regeneration. Calli derived from bud explants were whitish to creamy and compact, while calli derived from leaf explants were greenish. The influence of different combinations of BA (3, 6, 7, 8 or 9 mg/l) and NAA (0.05, 0.1 or 0.2 mg/l) on shoot proliferation on MS medium were tested. Within 12 weeks, the highest shoot formation was in the presence of BA (9 mg/l) and NAA (0.1 mg/l). The effect of indole - 3 - butyric acid (IBA) at different concentrations on root proliferation was determined. The best rooting of plant microshoots was found in MS medium provided with 1.0 mg/l IBA. The extraction and identification of steroidal sapogenin tigogenin and gitogenin from both intact plant parts (leaves, rhizomes and shoot apices) and tissue cultures (calli, direct and indirect regenerated shoots, rhizomes) of Y. gloriosa Variegata L. were performed. Preliminary identification of steroidal sapogenin was done using thin layer chromatography (TLC). Qualitative and quantitative assessment of steroidal saponins (tigogenin and gitogenin) was also performed by using high performance liquid chromatography (HPLC). The butanolic extracts showed the existence of tigogenin and gitogenin in all plant parts and their tissue cultures ranging from 128.29 to 409.75 and 51.04 to 236.62 μg/g respectively. Maximum sapogenins value was recorded in indirect regenerated shoots. The amount of these sapogenins in callus treated with TDZ was considerable since callus initiated rapidly within 3 weeks. Anatomical study investigating saponins accumulation in both intact plant parts and their tissue cultures were performed using fluorescence microscopy under ultraviolet (UV) to determine the site of saponin accumulation. Histological analysis using fluorescence microscope showed that saponins primarily accumulated in indirect regenerated leaf tissues and in callus treated with TDZ. Saponins levels changed during different periods of callus growth

دراسة تجريبية على زراعة الخلايا الجذعية الجنينية للبائن في الاوساط الزرعية == EXPERIMENTAL STUDY ON CULTURE OF MAMMALIAN EMBRYONIC STEM CELLS

اسم المؤلف: انتصار نعمان وحيد العزاوي
اسم المشرف: محمود حياوي حماش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2003
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم في هذه الدراسة انجاز طريقة ناجحة لزراعة الخلايا الجذعية الجنينية (Embryonic stem cells) بالاعتماد على موارد محدودة ومتوفرة وباستعمال تقنية زرع بسيطة. طريقتنا هذه تجيز باشتقاق الخلايا الجذعية الجنينية من كتلة الخلايا الداخلية (Inner cell mass) لاريمة (Blastocyst ) الفار من سلالة (Balb - C)المزروعة خارج الجسم الحي وذلك بدون الحاجة الى استئصال المبيض، او استخدام الجراحة المناعية لكتلة الخلايا الداخلية ، او استخدام الوسط الزرعي المكيف، او اضافة العامل المثبط للتمايز (العامل المثبط للوكيميا) ، لكن تمت فقط زراعة واستنبات الاريمة بوجود الطبقة المغذية(Feeder layer) المثبطة الانقسام ( الخلايا الجنينية الليفية المعاملة بمادة ميتومايسين (C) (10 مايكروغرام/ امل ( 2 ساعة) لتثبيط انقسام الخلايا المغذية وتوقف توالدها ).و الطبقة المغذية اساسية وضرورية لدعم نمو وديمومة استمرار حالة عدم التمايز في الخلايا الجذعية الجنينية، حيث في حالة نمو هذه الخلايا بدون وجود الطبقة المغذية يحدث التمايز مباشرة في الخلايا الملتصقة بالركيزة. ان وجود هذه الطبقات المغذية مع الدقة في عملية الزرع وبوجود وسط زرعي عالي النقاوة مع مصل يؤثر على ادامة النمط الظاهري الجنيني للخلايا المزروعة، بصورة خاصة في المحافظة على قابلية تمايز عالية.تبقى هذه الخلايا الجذعية الجنينية محافظة على حالة عدم التمايز خلال عمليات الزرع الثانوية المتواصلة ولعدة اشهر ، مع استمرارية اظهارها للمواد السطحية المعلمة للخلية ( الفوسفاتاز القاعدي ). تكون الخلايا الجذعية الجنينية التي لها القدرة على تكوين اي خلية او نسيج من الجسم ، صغيرة الحجم لها نواة كبيرة وسايتوبلازم قليل، والنواة حاوية على واحد او اكثر من التراكيب النوية الغامقة والواضحة، وتتجمع هذه الخلايا خلال المراحل المبكرة من عمليات الزرع الثانوي وتلتصق مع بعضها باحكام مكونة مجاميع صغيرة ، حيث من الصعوبة تمييز المكونات المفردة للخلايا ، في حين تكون في المراحل المتاخرة من عمليات الزرع الثانوي على شكل مستعمرات منبسطة ومنتشرة ، لكن الخلايا لا تزال ملتصقة مع بعضها البعض ، مما يتعذر رؤية وتميز الخلايا المفردة . هذا النمط من النمو هو صفة مميزة للخلايا الجذعية بالرغم من ان المستعمرات قد تظهر بشكل قليل الانتظام. ان زرع الخلايا الجذعية الجنينية لا بد ان يكون بكثافة عالية نسبيا وذلك لضمان الحصول على معدل نمو عالي ولاجل الحد من حدوث التمايز التلقائي للخلايا. ان ابناء مثل هذه الخلايا المفيدة التي لها صفتان مميزتان اساسيتان ، الاولى : - هي التغلب على الالية الداخلية التي تحد من مضاعفة ( استنساخ) الخلايا. الثانية : - تبقى قابلية هذه الخلايا ولمختلف مراحل عمليات الزرع الثانوية على اظهار النمط الظاهري لمجاميع خلايا الاسلاف التي انحدرت او انشقت منها مستقرة ، هذا يعني امتلاك القدرة التي تسبب التمايز الى انواع الخلايا المنحدرة من الطبقات الجرثومية الاولية للجنين، (الادمة الباطنةendoderm ، الطبقة المتوسطة mesoderm، والادمة الخارجيةectoderm ) كل هذا يجعل الخلايا الجذعية الجنينية فريدة النوع وهذه القابلية تعرف بالامكانية المتعددة ( pluripotency).تكون انواع الخلايا التي تظهر بعد استنبات الاريمة لمدة طويلة بوجود الطبقة المغذية وبدون زرع ثانوي كما ياتي : - - خلايا الارومة الاغتذائية - الخلايا الليفية - خلايا الادمة الباطنة - تراكيب شبيهة بالانبوبية - وخلايا شبيهة بالعصبية. تم استخدام المجهر الاليكتروني الماسح والمجهر المقلوب لدراسة الاحداث المورفوجينية التي تحدث خلال نمو اريمة الفار وتطور نمو المرحلة المبكرة لاسطوانة البيضة خارج الجسم الحي . فبعد تحرر الاريمة من الطبقة الشفافةZona pellucida والتصاقها بالركيزة التي تغطي سطح وعاء الزرع، فان جوف الاريمة يبدا بالانكماش اثناء انتشار وهجرة الارومة الاغتذائية الجدارية الى الخارج. في هذه المرحلة تكون كتلة الخلايا الداخلية مغطاة بخلايا الادمة الباطنة من جهة جوف الاريمة ، وبخلايا الارومة الاغتذائية القطبية من الجانب الوسطي. تكون كتلة الخلايا الداخلية عند نموها خارج الجسم الحي محاطة كليا بخلايا الادمة الباطنة بينما عند نموها داخل الجسم الحي فان خلايا الادمة الباطنة تكون فقط في الجانب المعرض لسائل جوف الاريمة . وبسبب تكاثر خلايا الارومة الباطنة التي تغطي كتلة الخلايا الداخلة، وبوجود الركيزة وقلة الحيز بسبب جوف الاريمة المنكمش فان كتلة الخلايا الداخلية طبيعيا يحد من الامتداد نحو الاسفل ، لذا فهي تهاجر وتبرز الى الاعلى الى الوسط الزرعي من خلال شق يحدث بين الارومة الاغتذائية الجدارية والقطبية. تستمر خلايا الارومة الاغتذائية القطبية المواجهة لقاعدة اسطوانة البيضةegg - cylinder في تكاثرها مكونة المخروط المشيمي الخارجيectoplacental cone . وحتى هذه المرحلة فان اسطوانة البيضة التي ينقصها حاجز الارومة الاغتذائية تقوم بعكس نمط نموها من اتجاه سطح وعاء الزرع الى موقع اعلى وبارز. ان نمو اسطوانة البيضة خارج الجسم الحي من كتلة الخلايا الداخلية وخلايا الارومة الاغتذائية القطبية مطابق كليا لما يحدث عند النمو داخل الجسم الحي . وقد حصل في هذه الدراسة نمو لتوام الزيجة خارج الجسم الحي من اريمة الفار ، قبل الالتصاق بسطح وعاء الزرع . حيث تبدا كتلة الخلايا الداخلية داخل غشاء الطبقة الشفافة بالتكاثر في جزئين وبعدها تنقسم الى قسمين ، وكل قسم من هذه الاقسام يكون حاويا خلايا ذات الفعالية الكامنة . بعد تحرر والتصاق الاريمة على الركيزة ينتج تكون اسطوانتي بيضة يتشاركان بمخروط مشيمي خارجي واحد. بصورة عامة عند تكون اسطوانات البيضة، يجد انها تشتمل على الادمة الخارجية في الداخل والادمة الباطنة في الخارج . ان الادمة الخارجية تلعب دورا مهم في النمو اللاحق للجنين داخل الجسم الحي ، حيث هذه الطبقة، هي سلف للطبقات الجنينية الاولية،( الادمة الباطنة، الطبقة المتوسطة، الادمة الخارجية ) وهذه الطبقات جميعها تكون مصدر لكل انسجة الجسم البالغ . ان زرع الخلايا الجذعية الجنينية التي تم الحصول عليها في هذه الدراسة هو مشتق من كتلة الخلايا الداخلية بعد سبعة ايام من الزرع ، وكذلك من كتلتي الخلايا الداخلية لاريمة تؤام الزيجة . ان قدرة الخلايا الجذعية الجنينية على تحوير نموها وتمايزها لتكوين مختلف خلايا وانسجة الجسم البالغ تتضح من قابليتها على التمايز التلقائي خارج الجسم الحي بواسطة تكتلها او تجمعها، وذلك من خلال 2 - 3 يوم من الزرع المعلق لهذه الخلايا، والتي تكون الاجسام الجنينية والتي تشتمل على الادمة الباطنة والصفيحة القاعدية والادمة الخارجية، ان هذه الاجسام مشابهة للاجنة في مرحلة اسطوانة البيضة. وبعد خمسة ايام من الزرع المعلق يظهر في بعض الاجسام الجنينية الكبيرة وجود الهيموكلوبين الجنيني في مجاميع الخلايا الدموية المحاطة بطبقتين في الادمة الباطنة بما يشبه الكيس المحي الحشوي لجنين ما بعد الغرس. استحوذ موضوع الحصول على خلايا جذعية جنينية متعددة الفعالية وكاملة الامكانية، من المراحل المبكرة لاجنة اللبائن على اهتمام مختلف الاوساط ووسائل الاعلام وذلك للاسباب التالية : - 1) الاستنبات الناجح للخلايا الجذعية الجنينية خارج الجسم الحي، امكانيتها غير محدودة على التكاثر غير المتمايز خارج الجسم الحي. 2) الامكانية الطبية باستخدام هذه الخلايا في معالجة تعويض الانسجة ، وقد تم هنا استخدام الخلايا الجذعية الجنينية المشتقة من الفئران كنموذج حيواني مناسب | A successful method of culturing embryonic stem (ES) cells have been achieved in this study depending on the limited available resources and by a simple culture technique .This method permits ES cells culture to be derived in vitro from the inner cell mass ( ICM) of explanted mouse blastocysts of strain : Balb - C without the use of ovariectomy; immunosurgery of the ICM, conditioned medium and differentiation inhibitory factor (DIF)\Leukaemia inhibitory factor (LIF), but only cultivation of blastocysts in the presence of mitotically inactivated feeder layer [ embryonic fibroblast cells treated with mitomycin - C, 10 g\ ml (2hr) for inactivated feeder cells and arrest their proliferation]. The feeder layer are necessary and essential to support the growth and maintenance of undifferentiated state of ES cells, when these cells are grown without feeder layer, immediate differentiation takes place in the substrate attached cells. These feeder layers together with careful culture in high quality medium and serum acts to prolong the embryonic phenotype of the cell culture, specifically in terms of maintaining a high differentiation ability.These ES cells remains both undifferentiated in continuos passage for several months and expresses the cell surface marker ( Alkaline phosphatase) for different passages . Pluripotential ES cells are typically small, have a large nucleus and minimal cytoplasm, and the nuclei contain one or more prominent dark nucleoli structures. The cells in early passages pack tightly together in small nests in which it is difficult to discren the individual component cells, while in latter passages these ES cells colony are spread and flattened and the constituent cells also adhere tightly to one another, making it difficult to see individual cells. This growth pattern is characteristic of stem cells, although colonies may appear less regularly shaped. The ES cell culture should be maintained a relatively high densities to ensure maximal growth rate in order to minimize spontaneous differentiation. Establishment of such useful cells has two basic characteristics. First, the endogenous machinery that limits cell replication is overcomed. Second, these cells for different passage is stable express the phenotype of the population of progenitors from which it was derived, that’s mean, the ability to give rise to differentiated cell types that are derived from all primary germ layers of the embryo, endoderm , mesoderm, and ectoderm - is what make ES cell unique, and this ability is known as a "pluripotency".Differentiated cell types which appeared after prolonged cultivation of blastocyst on feeder layer without passage are trophoblast cells, fibroblast cells; endodermal cells; tubular - like structures; neuron - like cells.Correlative scanning electron, and inverted microscopy were utilized to study the morphogenic events occurring during mouse blastocyst outgrowth and early –egg - cylinders development in vitro. After hatching from Zona pellucida ( Z.P.) and attachment of blastocysts on the substrate coated plate surface, the blastocoelics cavity collapses as the mural trophoblasts spread and migrate outward . The inner cell mass is covered with a differentiated endoderm on the blastocoelic cavity side and by the polar trophoblasts on the medium side at this stage . The inner cell mass in vitro becomes completely surrounded with endodermal cells while the endoderm develops in vivo only on the side exposed to blastocoelic fluid . As the endoderm covered inner cell mass proliferates , being physically restricted from further downward expansion by the substrate and by the lack of space in the collapsed blastocoelic cavity , it migrates upward and protrudes into the culture medium in a break between the polar and mural trophoblast cells . Polar trophoblast cells apposed to the base of the egg cylinder continue to proliferate forming the ectoplacental cone. Thus , the early egg cylinder lacking a trophoblast barrier beings inverting its growth pattern from towards the culture plate surface to amore upright position. Egg - cylinder development in vitro from the inner cell mass and polar trophoblast cells closely paralleled in vivo. Monozygotic twins developed in vitro from (murine) mouse blastocysts, before attachment to culture plate surface. The inner cell mass became proliferated into two parts and then subdivided in side the Z.P., and each subdivision apparently incorporated totipotent cells. After hatching and attachment of this blastocyst on the substrate, resulting in the formation of two egg - cylinders sharing the same ectoplancental cone. In general, as the egg - cylindars was formed, it was found to compose of ectoderm to the inside and endoderm on the outside. In vivo the primitive ectoderm plays a pivotal role in the further development of the embryo, since that it is the progenital of three primary embryonic layers, the ectoderm, mesoderm and endoderm, which collectively are the source of all tissue of the adult body. Our ES cell culture was derived from the ICM of seven days culture and from the two ICMs of the blastocyst - derived monozygotic twin. The pluripotency of ES cells demonstrate their ability to spontaneously differentiate in vitro via aggregation, that from 2 - 3 day of suspension culture in non - adhesive dish the cells form embryoid bodies (EBs) with endoderm, basal lamina and ectoderm. They are morphologically similar to embryos of the egg - cylinder stage. From 5 days of culture some of EBs expand into large cystic structures containing embryonic haemoglobin’s of blood islend cells surrounded by two endothelial layers, this result suggest the identification of cystic EB as visceral yolk sac, of the postimplantation embryo. Pluripotent ES cells are derived from totipotent cells of early mammalian embryo are currently in the news for three reasons : the successful cultivation of ES cells in vitro; their capability of unlimited, undifferentiated proliferation in vitro and the potential medical use of these cells for tissue replacement therapy, in this work ,mice ES cells were used as suitable animal model.Self - renewing, totipotent - pluripotent ES cells may provide a virtually unlimited donor source for transplantation. A protocol that permits the in vitro generation of neural precursors from ES cells was devised. This study described conditions to induce differentiation of ES cells reliably and at high efficiency into neural pathway. A prerequisite is to treat early developing ES cell derived aggregates and simple EBs with mouse embryonic brain extract for a precise period of time. Embryonic brain extract here circumvent the need of growth factors. In vitro, treatment with brain extract resulted in the subsequent appearance of neural - like cells after subcultured treated cells. In vivo after dissociation of these cells into a single cell suspension they were stereotaxically transplanted into the brain of recipient adult mice. Results show that ES cell derived neural precursors interact with host tissue and migrated for variable distances of different region of the brain after replace damaged cells at the site of transplantation. Thus, brain extract serves here as a crude source of neurotrophic factors for the induction of ES cells to neuronal pathway, in which ES cells can serve as a valuable source of cell type - specific somatic precursors for neural transplantation.HRP - histochemical marker was introduced into culture medium for marking ES cells in vitro and in vivo to allowed for precise determination of the fate of the transplanted ES cells and their proliferation, migration and differentiation in side the brain. Evaluation of long - term experiments showed viable grafts with a stable HRP - marker expression and proved no signs of tumour growth or non - neural tissue in the transplant recipients

التغيرات الفسلجية المرضية للجهاز المناعي في مرضى سرطان الثدي عند النساء == Physiological changes In immune system in female breast cancer

اسم المؤلف: امين احمد احمد ثابت
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي | هيثم عزت باقر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2004
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هذه الدراسة تبحث في تغيرات الفسلجة المرضية للجهاز المناعي عند الاناث المصابات بسرطان الثدي الخبيث اللاتي شخص حديثا بهن المرض ولم يتعاطين العلاج بعد اللائي ترددن على مستشفى السرطان والطب النووي في بغداد ومختبرات الصحة العامة المركزي . وقد تضمنت هذه الدراسة عدد (80) امراة , حيث كانت هناك ( 4 ) حالات فقط في المرحلة الاولى من المرضى , (32) حالة في المرحلة الثانية , (31) حالة في المرحلة الثالثة , (13) حالة كانت في المرحلة الرابعة من مرض سرطان الثدي .مستويات الواسمات الورمية المختلفة كانت قد قدرت, الواسم CA15 - 3 كان قد حددت قيمته , واظهر حساسية تقدر بـ ( 5ر27%) وتخصيصية تقدر با (8ر95%) في سرطان الثدي المعرف وكذلك في المراحل المختلفة من المرض , النتائج لهذه الدراسة كشفت عدم وجود اختلافات معنوية في مستوى CA15 - 3 في مصل المصابات بحالات ورم الثدي الحميد مقارنة بالنساء المصابات بسرطان الثدي - المرحلة الاولى ( 0.164 <P ) بينما مستوى CA15 - 3 من مصل المريضات بسرطان الثدي من المرحلتين الثالثة والرابعة كانتا اكثر ارتفاعا , وهناك ظهرت الاختلافات المعنوية القائمة بالمقارنة مع المصابين بسرطان الثدي من الدرجة الاولى والثانية ( 0.001<P) .المستضد الورمي الجنيني CEA كان اقل قدرة ادائية حيث كان ذات حساسية تقدر بـ20% وتخصصية 7ر93% من ناحية ثانية , عبر ضم هذين الواسمين خلق مدى افضل للاداء او الانجاز .مولدات مضادات الورمية اخرى اختبرت وكان لها اجمالي الدقة accuracy over all منخفضة والذي جعل استخدامها محدود في عملية تشخيص سرطان الثدي .مستويات Beta 2 microglobulin اظهرت اختلاف معنوي بين مجموعة السيطرة الاصحاء والمرضى بسرطان الثدي في المراحل المختلفة ( 0.001 >P) فوق ذلك , كانت هناك اختلافات معنوية ( 0.001 >P) بين مجموعة السيطرة الاصحاء واولئك من كانوا في المرحلة الاولى من المرضى , عبر ضم هذه الواسمات قد لوحظ تحسين افضل في الكشف عن سرطان الثدي .مستوى Ceruloplamin هو واحد من Acute phase reactant proteins , اظهر عدم وجود فروقات معنوية بين النساء السليمات وتلك المصابات بسرطان الثدي حتى المرحلة الثالثة ( P=0.269) الاختلاف كان معنوي فقط بعد الاخذ في الاعتبار المرحلة الرابعة من المرضى ( 0.002 >P) وهو المؤشر للزيادة الرئيسية الظاهرة في مستوى Ceruloplasminعند المرضى الذين كانوا في مرحلة متاخرة من الورم الخبيث .كما وقد لاحظنا ان عدد CD+ 4 cells يتناقص مع تقدم المرض ليصل الى اقل قيمة عند المرحلة الرابعة من المرض .من ناحية اخرى , التحليل الاحصائي اظهر اختلافات معنوية بين المراحل المدروسة من المرضى ( P=0.718 - 0.065 ) حيث لم تكن هناك فروقات معنوية حتى الوصول الى المرحلة الرابعة ( P=0.013) مشيرا الى ان اقصى درجة التدمير لهذه الخلايا كانت واضحة في هذه المرحلة . من جانب اخر CD8 cells اتخذت كليا التفاعل العكسي , تبدا الاقل انخفاضا عند المراحل المبكرة من المرض حتى تصل الى اعلى مستوى عند المرحلة الرابعة .مستويات Interleukines المعتمدة, كان متوسط IL - 1α في مصل مجموعة السيطرة الاصحاء اقل من الحد المعرف به في الـ Kit . خلال التحليل الاحصائي ظهرت علامة اختلاف معنوي بين المرضى في المراحل المختلفة من المرض ( P=0.032 ) . معظم القراءات كانت في اطار المستويات غير الحد المعرف به والمستوى المرتفع المفاجيء كان عند عدد قليل من المرضى نتجت في هذه الاختلافات .من جانب اخر , اظهر التحليل الاحصائي زيادة معنوية في مستويات IL - 4 بين النساء السليمات والمصابات بسرطان الثدي عند المراحل المختلفة من المرض ( 0.001>P) .تركيز IL - 6 في المصل كان ذات ارتفاع معنوي عند المصابات بسرطان الثدي مقارنة بالنساء السليمات (0.001>P) . متوسط مستويات IL - 6 المصلي كان يقارب الثلاثة اضعاف ارتفاعا عما هو عند مرضى سرطان الثدي المنتقل metastatic breast cancer ( المرحلة الرابعة ) كما قورن مع اولئك الذين كانوا في المرحلة المبكرة من المرض ( المرحلة الاولى ) , والمقدرة على التوالي بـ ( 24.02 pg/ml versus 8.45pg/ml) .كما وقد كان هناك تقدما في الزيادة المعلمة في متوسط مستوى IL - 8 في اطار المراحل المختلفة من المرض ( P=0.025) , مع ذلك العامل المنكرر في كل نتيجة على حدة متمثلا في ارتفاع مستوى القراءات , بما فيها المرحلة الرابعة من المرض .بالمثل لمستويات Immunoglobulins في المصل , كانت هناك زيادة طفيفة في مستويات المصل عند المصابات بالسرطان , والتي قد ظهرت متجاوزة قليلا عنها مما هي عند السليمات , ولكن في هذه الزيادة لم تكن هناك فروقات معنوية مميزة في كل اختبارات ذات الانماط المتساوية . | This study investigated some physiological changes of the immune system in females with malignant breast cancer that were newly diagnosed and untreated, attending The Oncology and Nuclear Medicine Hospital in Baghdad and the Central Public Health Laboratories. Of the 80 females included, only four were in stage I of the disease, 32 in stage II, 31 in stage III, and 13 in stage IV. Different tumor markers levels were evaluated in those patients. CA 15 - 3 was assessed. It showed a sensitivity of 27.5% and a specificty of 95.8% in detecting breast cancer and at different stages of the disease. The results of the study revealed no statistically significant difference in the level of CA 15 - 3 in serum of patients with benign breast conditions compared with patients with a breast cancer of stage I (p>0.164). However, serum CA 15 - 3 level in patients with a breast cancer of stages III and IV, was considerably higher and there was a significant difference as compared with patients with a breast cancer of grades I and II (p < 0.001). Carcinoembryonic antigen had lesser performance capabilites. It had a sensitivity of 20% and a specificty of 93.7%. However, by combining these two parameters better performance indices were achieved.Other tumor markers tested had low over all accuracy that limited their use in breast cancer diagnosis.Beta 2 microglobulin levels showed significant difference among the healthy control group and patients with breast cancer at different stages (P<0.001). Moreover, there was a significant difference (P<0.001) between healthy control and stage I of the disease. By combing this parameter, further improvement in detecting breast cancer could be noticed.Ceruloplasmin level, one of the acute phase reactant proteins, showed no statistically significant changes among healthy control persons and patients with breast cancer up to stage III (P=0.269). The difference was only significant after considering stage IV of the disease (P<0.002), indicating that the major increase in ceruloplasmin level occurs in patients who are at advanced stage of malignancy.We observed that the number of CD4 cells decreases with the progress of the disease reaching its lowest value at stage IV patients. However, statistical analysis showed that the differences between the studied stages (P=0.718 - 0.065) were of no statistical significance till reaching stage IV (P=0.013) indicating that the maximum reduction was in this stage. On the other hand CD8 cells follow totally opposite reaction, being lowest at early stages of the disease reaching its highest level at stage IV. Concerning interleukines levels, mean serum level of IL - 1alpha in the healthy control group was below the detection limit of the kit. Though statistical analysis showed significant difference between patients in different stages of the disease (P=0.032), most of the readings were within the undetectable levels and the occasional high level in few patients resulted in these differences.On the other hand, Statistical analysis shows significant increase in the levels of IL - 4 in patints with breast cancer at different stages of the disease in compare with healthy control group (p<0.0001).Serum IL - 6 concentration was significantly higher in patients with breast cancer compared with healthy controls (P < 0.0001). Mean IL - 6 serum levels were nearly 3 times higher in patients with metastatic breast cancer (stage IV) as compared with those with early disease (stage I) (24.02 pg/mL versus 8.45 pg/mL, respectively).There is progressive significant increase in the mean of IL - 8 level within the stages of the disease (P=0.025), though the main contributory factor in sucha result is the high level within stage IV.As for serum levels of immunoglobulins, a slight increase in the serum levels in patients with cancer appeared exceeding a little those of the healthy control but this increase was not significant in all isotypes tested.

دراسة بيئية وامراضية على جرثومة كليبسيلا في عينات سريرية ونهر دجلة في بغداد == Environmental and Pathogenic Study on Klebsiella Spp. in Samples Collected from Patients and Tigris River at Baghdad

اسم المؤلف: افراح فهد عبد الكريم
اسم المشرف: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | كفاح احمد جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تفرعت الدراسه الحاليه خطين رئيسيين.تضمن الخط الاول تقييم نهر دجله ضمن محافظة بغداد من خلال دراسة العوامل الفيزيائيه والكيميائيه والبايولوجيه والتي لها تاثير على نوعية مياه نهر دجله بينما تضمن الخط الثاني دراسه جزيئيه لبعض عوامل الضراوه، المقاومه للمضادات الحيويه وانتاج الغشاء الحيوي لبكتريا K. pneumoniae والمعزوله من مصادر سريريه وبيئيه. محطات الدراسه تضمنت ثلاثة مواقع على نهر دجله ضمن مدينة بغداد، الموقع الاول يقع شمال مدينة بغداد والتي تقع شمال منطقة الكريعات بالقرب من جسر المثنى، والموقع الثاني يقع قرب مدينة بغداد الطبيه قرب جسر باب المعظم بينما يقع الموقع الثالث الى الجنوب بالقرب من جسر الجادريه. جمعت عينات شهريه من المواقع المذكوره انفا والواقعه على نهر دجله ابتداءا من تشرين الثاني/2013 ولغاية تشرين الاول/2014 . فضلا عن ذلك جمعت عينات سريريه من عدة مستشفيات في بغداد وباستخدام حاويات معقمه. اظهرت النتائج ان قيم درجات الحراره لمياه نهر دجله تراوحت بين (9 - 31 م◦) وهذا من صفات جو العراق والذي يتميز بتقلبات موسميه بدرجات الحراره من جهه وبتغيرات يوميه من جهه اخرى، كانت دالة الحامضيه لمياه النهر تميل للقاعديه الخفيفه وتراوحت بين (6.1 - 8.7) مع ظهور حامضيه خفيفه في الموقع الثاني وقد يعود السبب في ذلك الى مخلفات مدينة الطب والتي تدل على وجود تلوث. تراوح تركيز الاوكسجين المذاب بين (6.6 - 9.9 ملغم/لتر) وهذا يظهر ان مياه نهر دجله جيدة التهويه وكذالك اظهرت النتائج ان المتطلب الحيوي للاوكسجين كان ضمن الحدود المسموح بها دوليا ومحليا حيث تراوحت قيمته بين (0.8 - 3.5 ملغم/لتر). العكوره تظهر مدى شفافية المياه وقد تراوحت قيم العكوره لمياه النهر مابين (16 - 102 نفلوميتر) وسجلت الدراسه ارتفاع ملحوظ في قيم التوصيليه الكهربائيه (651 - 1170 ملغم/لتر). كذلك وجد ان قيم المواد الصلبه الذائبه تراوحت بين (406 - 751 ملغم/لتر) وكان لتاثير الفصول عليها اكثر من تاثير المواقع. بينما سجلت الملوحه تركيز (0.72 - 0.39ملغم/لتر). سجلت النتائج لتركيز المعادن الثقيله ما بين (0.001 - 0.6 ملغم/لتر)،(0.00 - 0.25 ملغم/لتر) لكل من الحديد والزنك على التوالي، معدل التراكيز لهذه المعادن اظهر تغايرا شهريا خلال مدة الدراسه حيث كانت معدلات الحديد متجاوزه الحدود المسموح بها دوليا بينما معدلات الزنك ضمن الحدود المسموح بها. تراوحت قيم الفوسفات لنهر دجله مابين (0.11 - 0.37). من جهه اخرى كانت نتائج الدراسه البكتريولوجيه قد سجلت معدلات مرتفعه لكل من العدد الكلي الحي للبكتريا واعداد بكتريا القولون الكليه واعداد بكتريا القولون البرازيه والتي تجاوزت الحدود المسموح بها دوليا ومحليا والتي كانت دليل على وجود تلوث احيائي وقد سجلت القيم ما بين (195 - 8200CFU/ml ) ، (3625 - 160000 cell/100ml ) ، (24000 - 142500 cell/100ml ) على التوالي. جمعت 75 عزله بكتيريه تابعه للجنس Klebsiella spp. وتوزعت مابين 40 عزله بيئيه و35 عزله مرضيه، شخصت العزلات بانها : K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7), K. ornitholytica (5) اعتمادا على الخواص الزرعيه، المجهريه والكيموحيويه وقد تم تاكيد التشخيص باستخدام نظام API - 20E وVITEC2 systemقد تم عد البكتريا باستخدام طريقة الترشيح الغشائي وباستخدام وسط انتقائي.تم تحديد حساسية العزلات تجاه (23) مضاد حيوي واظهرت النتائج بصوره عامه مقاومه العزلات لاغلب المضادات المستخدمه كما اظهر التحليل الجزيئي ان عزلات K. pneumoniae كانت حامله لجين CTX - M gene والذي له علاقه بمقاومة مضادات البيتالاكتام حيث اظهر تفاعل تضخيم السلسله PCR حزمه واضحه وبحجم (551 bp) فضلا عن ذلك تم دراسة جين aac(3) - II والذي يتعلق بمقاومة مضادات الامينوكلايكوسايد وباستخدام PCR حيث ظهرت حزمه واضحه بحجم (877 bp) . درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي باستخدام ثلاثه طرق مختلفه وقد اظهرت النتائج ايجابيه الفحص وكذلك تم تضخيم جين mrkD والذي يعتبر تحت الوحدة المسؤله عن الاتصاق للنوع الثالث من الاهداب واظهر PCR حزمه بحجم (966 bp). عوامل ضراوه اخرى درست جزيئيا لهذه البكتريا وذلك باستخدام تفاعل تضخيم السلسله تضمنت rmpA , magA وkfu وهي جينات مسؤله عن تكوين الكبسوله وحوامل الحديد وكذلك تم تضخيم جين 16SrRNA وذلك باستخدام conventional and real time PCR وذلك من اجل تشخيصها جزيئيا واظهرت النتائج حزم واضحه بحجم (535 bp) لجين rmpA، (797bp) لجين kfu و(160 bp)عند استخدام برايمر متخصص لجين 16SrRNA بينما لم تظهر اي حزمه عند تضخيم جين magA. | The present work was branched into two line first line aim to study Tigris River within Baghdad City to assess Physical, chemical and biological characteristics of water river that influence water quality of the Tigris River. The second line conducted to study molecular characterization of virulence factor, antibiotic resistance genes and biofilm formation of K. pneumoniae isolated from clinical and environmental sources. The study area included three stations on Tigris River Within Baghdad city, the first was located at North of Baghdad in the northern area of Ghera'att City, and the second at middle part in the area Baghdad medical city, whereas the third station located at South part in the area near Al - Jadiriah Bridge. Monthly samples were collected from three station located on Tigris river, from November 2013 to October 2014. In addition Samples were collected from different Hospital’s Environment and patients by using sterile containers.Results obtained showed that temperature value of Tigris water has ranged between (9 - 31 Cº) the climate of Iraq recognized with seasonal fluctuation from one side and day and night fluctuation from other side. The degree of pH in Tigris River tend to be light alkalinity as it ranged between (6.1 - 8.7) with slightly acidic at station2 and this may be due to the effect of medical city discharge that indicate presences of pollution. The concentration of dissolved oxygen was ranged between (6.6 - 9.9) mg/l and it seems that the water of Tigris is ventilated well. The results showed that values of BOD5 ranged between (0.8 - 3.5 mg/l.) which is within the International allowable levels. The Turbidity reflects the transparency in water, the Turbidity's values ranged between (16 - 102) NTU. The results showed that there is a noticeable raise in value the electrical conductivity that recorded between (651 - 1170) mg/l. It is found that the total dissolved solids values were affected by its seasons more than by its locations, It was recorded higher and lower values of (TDS) (406 - 751) mg/l. whereas the salinity recorded (0.72 - 0.39 ppm) .The results showed that concentrations of heavy metals iron and zinc were varied between 0.001 - 0.6 mg/l and 0.00 - 0.25 mg/l respectively. Mean concentrations of these metals in Tigris River showed monthly variations during the study period and the Fe values exceeded the International allowable levels while Zn within permissible limit for Iraqi and WHO standards for river system maintains. Phosphate values ranged between (0.37 - 0.11). On the other side, The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (195 - 8200 C.F.U/ml), While the total coliform and faecal coliform counts exceeding acceptable limits are indicative of pollution that recorded (3625 - 160000 cell/100ml ) and (2400 - 142500 cell/100ml) respectively.A total of 75 klebsiella spp. isolates had been collected and distributed between 40 environmental isolates and 35 clinical isolates. Isolates were identified as K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7) and K. ornitholytica (5) depending on cultural, microscopical, biochemical characteristics, API 20E and VITEK 2 system. Enumeration of klebsiella sp from water samples had been made by using membrane filtration technique with selective media. The results of Antibiotic susceptibility of K. pneumoniae isolates against (23) antibiotic declared that, generally, the isolates were resistant to the most antibiotics used and molecular analysis showed that all isolates were carrying CTX - M gene concern β - lactam group with PCR product band of molecular size 551 bp and aac(3) - II gene which concern with aminoglycosids group resulting in PCR product with band of molecular size 877 bp.Biofilm formation assay was determined through three different methods and the results showed the ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm, also mrkD gene which is adhesive subunit of type3 fimbriae that play important role and mediated biofilm formation had been amplified and results PCR product with band of molecular size 966 bp. Another virulence factor of K. pneumoniae isolates was studied molecularly by using (PCR), magA, rmpA, kfu and for further diagnosed molecularly 16S rRNA genes were amplified using conventional and real time PCR, the results showed that the isolates of K. pneumoniae gave a clear band with a molecular size 535bp for rmpA, 797bp for kfu and160 bp when PCR was performed with the primer that target the 16S rRNA.while no bind had been obtained for magA

دراسة كيمونسجية مناعية وعلاجية في الفئران الممنعة والمصابة بالاكياس العدرية == Immunohistochemical and Therapeutic Study in Immunized and Infected Mice With Hydatid Cyst

اسم المؤلف: افراح عبد الامير صادق العامري
اسم المشرف: وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت الدراسة الحالية جوانب اساسية للاصابة بالاكياس العدرية الثانوية لـ 120 فارا من ذكور الفئران البيض Mus musculusسلالة Balb/c، شمل الجانب الاول تحديد دور التمنيع في الجوانب الدموية كالعد التفريقي لخلايا الدم البيض والجوانب المناعية كفرط الحساسية الاجلة ومعامل البلعمة. اوضحت نتائج العد التفريقي ارتفاعا ملحوظا في اعداد الخلايا اللمفاوية بنسبة 64.75% مع حدوث تباين في اعداد الخلايا احادية النواة والحمضة وانخفاضا في اعداد الخلايا العدلة ليصل 32% في مجموعة الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة. وفيما يتعلق بالاستجابة المناعية الخلوية المتخصصة المتمثلة بقياس فرط الحساسية الاجلة في وسادة القدم اليسرى، اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول ارتفاع في معدل سمك وسادة القدم في الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة ، مع ارتفاع في معامل البلعمة بنسبة 74% مقارنة بفئران السيطرة السالبة، فضلا عن التغيرات العيانية لتلك المجموعة ومن ثم انعكس ايجابيا على المظهر الخارجي وحركة الفئران ووزنها وقابليتها على التغذية وعليه اصيبت تلك الفئران تجريبيا بداء الاكياس العدرية الثانوية من خلال الحقن داخل الخلب (البريتون) بـ 2000 رؤيس اولي من اكباد ورئات اغنام مصابة طبيعيا بالاكياس العدرية. اما الجانب الثاني من الدراسة تمثل بمعالجة الفئران المصابة بثلاثة عقاقير من مشتقات البنزيميدازول والايزوكوينولين هي الالبندازول ((ABZ والاوكسفيندازول (OFZ) والبرازكوينتل (PZQ) ومتابعة بعض الجوانب الدموية والمناعية في الفئران بعد الاصابة والتمنيع والمعالجة، وشملت العد التفريقي لخلايا الدم البيض، اختبار فرط الحساسية الاجلة، معدل معامل البلعمة، اختبار النوى الصغيرة واختبار الانتشار المناعي في الهلام. سجلت مجموعة الفئران المعاملة بعقارOFZ وOFZ+PZQ ارتفاع النسب المئوية للعدلات وانخفاض الخلايا اللمفاوية مقارنة مع فئران مجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة في سمك وسادة القدم اليسرى بعد 24 ساعة مقارنة بالمجاميع الاخرى ومقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة معنوية في معدل معامل البلعمة في مجموعة الفئران المعاملة OFZ (53.17%) ومجموعة الفئران المعاملة OFZ+PZQ (71.5%) وانخفاضا معنويا في معدل النوى الصغيرة (28% و29.1%، على التوالي) مقارنة مع الفئران المعاملة بـOFZ+ABZ وABZ+PZQ، مما يدل على كفاءة المعالجة بعقار OFZ بشكل مفرد او متحد. اما الجانب الثالث فتمثل بدراسة تاثير الاصابة بالاكياس العدرية والعلاجات الكيميائية المختلفة في وظائف الكبد اذ اظهرت الدراسة ان انزيمات الكبد وهي AST وALT وALP فضلا عن مستوى البيليروبين الكلي والمباشر في مصل الفئران المعاملة بـ OFZ وبـ OFZ+PZQ كانت نتائجها اقرب الى السيطرة السالبة مقارنة مع المجموعتين OFZ+ABZ وABZ+PZQ.اما الجانب الرابع فشمل دراسة الجوانب الحياتية المتعلقة بوزن الفئران الممنعة والمعاملة بعقار OFZ بشكل مفرد او مختلط مع البرازكوينتل OFZ+PZQحيث ظهر ارتفاعا طفيفا بمعدل وزنها بنسبة 11.13% و12.10% على التوالي مقارنة بفئران السيطرة السالبة مقارنة بالفئران المعاملة بـ OFZ+ABZ وABZ+PZQ التي سجلت زيادة معنوية ((p≤0.001 قدرها 13.50% و14.87% على التوالي. وسجلت مجموعة الفئران المعاملة انخفاضا في معدل وزن الكبد ومعدل تضخهما اذ اختلفت معنويا عن مجموعة السيطرة الموجبة عند مستوى احتمالية p≤0.001. لذا فحصت الاكياس العدرية الثانوية بعد اربعة اشهر من الاصابة وتم قياس وزن وقطروعدد الاكياس العدرية وحساب الكفاءة النسبية للعلاج, اظهرت الدراسة ان عقارOFZ+PZQ اعلى كفاءة علاجية (96.70%) لكونه تسبب باختفاء الاكياس من الطحال وتلته المعاملة بعقار OFZ) 93.75%)، وسجلت المجاميع المعاملة بعقارOFZ+ABZ وABZ+PZQ كفاءة علاجية نسبية بلغت 82.5% و77.5%, على التوالي. شملت الدراسة التغيرات النسجية المرضية في طحال وكبد الفئران بعد اربعة اشهر من الاصابة والمعاملة. بينت النتائج حصول تغيرات نسجية معتدلة مقارنة مع فئران السيطرة الموجبة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية عن طريق الكيمونسجية المناعية ( IHC) اظهرت النتائج زيادة مستوى الحركيات الخلوية المفرزة من قبل الخلايا التائية المساعدة - النوع الاول (Th1) متمثلة بانترلوكين - 2، انترفيرون - كاما وعامل تنخر الورم اظهرت النتائج ارتفاعا معنويا ((P≤0.001 في مستوى تعبير بروتينIL - 2 في مجموعة الفئران المعاملة بـ OFZ+PZQ التي بلغت في الطحال 65.1% والكبد 54.1% مقارنة بالمجاميع الاخرى ومجموعة السيطرة السالبة والموجبة، وزيادة تعبير بروتين IFN - γفي المجاميع المعاملة مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة. وبينت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية عالية ذات دلالة احصائيةp≤0.001 في مستوى تعبير بروتينات TNF - α مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. اما بالنسبة الى الحركيات المفرزة من قبل خلايا Th2 فقد سجلت نقصانا في انترلوكين - 10 وعامل تحويل النمو بيتا لدى الفئران المعاملة بالمجاميع العلاجية الاربعة لاسيما المجموعة المعالجة بـ OFZ+PZQ فقد اظهرIL - 10 تعبير بروتينيا واطئا في الطحال بلغ 29.7% وفي الكبد 8.2% مقارنة بالمجاميع المعاملة الاخرى ومجموعة السيطرة، كما اظهرت الفئران الممنعة والمعاملة مستوى تعبير بروتينات TGF - β فروقا معنوية عند مستوى احتماليةp≤0.001 للمجاميع مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. بشكل عام لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الحركيات الخلوية المنتجة من قبل Th1 وTh2وبشكل متوازن لدى الفئران الممنعة والمعاملة. | The current research in deals with fundamental aspects of the infection of 120 white mice Mus musculus strain Balb/c with secondary hydatid cysts, comprising first aspect the role of immunization in the haematological aspects such as the differential count of white blood cells and the immunological aspects such as the delayed type hypersensitivity and phagocytosis. The results of differential white blood cell count showed marked increase in the numbers of lymphocyte percentage (64.75%) with a variation in the numbers of monocytes and eosinophils and a decrease in neutrophil numbers which reached 32% in mice immunized and orally administered with antioxidants. In connection with delayed type hypersensitivity in the foot pad the results showed a rise in the rate of foot pad thickness in mice immunized and orally administered with antioxidants as the highest thickness reached 0.82 mm at 24 hours after the injection of antigen and phagocytosis index in mice immunized and orally administered with antioxidants showed an increase of 74% compared with negative and positive control mice in addition to the gross changes of this group which was positively reflected on their appearance, movement, weight and feeding. So this group was experimentally infected with secondary hydatid cyst through their intra peritoneal injection with 2000 protoscolices. The second aspect of the study was to evaluate the therapeutic efficacy of three drugs which belong to Benzimedazole and Isoquinoline viz albendazole (ABZ), oxfendazole (OFZ) and praziquental (PZQ) as well as to follow - up some aspects of the haematological and immunological parameters in mice after their infection, immunization and treatment which included differential white blood cell count, delayed type hypersensitivity test, phagocytosis, micronucleus test and agar gel immune diffusion test.Regarding changes in differential white blood cell count, mice treated with OFZ and OFZ + PZQ showed an increase in neutrophils and decline in lymphocytes compared with positive control group. Also, an increase in foot pad thickness after 24hrs compared with other treated groups and positive control group. An increase in the phagocytosis was noticed in OFZ treated group (53.17%) and OFZ+PZQ treated group (71.5%) and a significant decline in the micronucleus test of 28% and 29.1%, respectively compared with mice treatment with OFZ + ABZ and ABZ+ PZQ which indicates the efficiency of OFZ drug treated alone or in a combination form.The third aspect of the study was to evaluate the effect of infection with hydatid cyst and different chemical treatments on liver functions where the study showed that liver enzymes such as AST, ALT and ALP, as well as the total and direct bilirubin serum level in mice treated with OFZ alone and OFZ + PZQ were closer to those of the negative group compared with the groups treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ.The fourth aspect of the study was to evaluate the biological aspects related to weight of the mice treated with OFZ alone or combination with praziquental OFZ+PZQ where a slight increase in the average weight of 11.13% and 12.10%, respectively was occurred in compared with the negative control due to the low number of cyst and cyst fibrosis which occurred in comparison with those existed in mice treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ which showed a significant increase(p<0.001) which reached 13.50% and 14.87%, respectively.The treated group showed a reduction in liver weight and enlargement rate which was significantly different from that of the positive control group at the level of probability of P< 0.001, as OFZ+PZQ caused the disappearance of the cysts from the spleen(96.70%), followed by group treated with OFZ (93.75%) and then by group treated with OFZ+ABZ and ABZ+ PZQ which showed a treatment efficacy of 82.5% and 77.5%, respectively. The study also included the evaluation of the pathological changes of liver and spleen of mice after four months of the infection and treatment. The result showed satisfactory histopathological changes in comparison with positive control group. When investigating the role of some cellular interleukins in the immune response against Echinococcus granulosus through the immunohistochemical (IHC)test, the results showed an increase in the level of cytokines secreted byTh1 such as IFN - γ andTNF - α as well as IL - 2. The results showed higher level of protein expression IL - 2 in mice group treated with OFZ+PZQ which amounted 65.1% in spleen and 54.1% in liver compared with other treated and negative and positive control groups. Also, an increase in protein expression of IFN - γ was occurred in the treated groups compared with the negative and positive controls except in the group which was treated with OFZ+PZQ where no significant differences were appear in the negative control. The statistical analysis showed the presence of high significant differences (p<0.001) in the level of expression proteins TNF - α compared with negative and positive control groups. Reduction level of cytokines secretion from Th2 (IL - 10 and TGF - β) in mice treated with the four treated group particularly the group which was treated with OFZ+PZQ showed that IL - 10 protein expression in spleen was low and reached 29.7% and 8.2% in liver compared with the other treated and control groups. The level of expression of proteins of TGF - β in the immunized and treated mice showed significant differences at the level of the probability of p<0.001 of the group compared with negative and positive control group. Generally, a high significant level of cytokines produced byTh1andTh2 in immunized and treated mice

تاثير الرش الورقي ببيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في نمو وحاصل صنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) المزروعة في المنطقة الديمية == Effect of foliar application of hydrogen peroxide and vitamin C on growth and yield of two cultivars of(Hordeum vulgare L.) planted in the dry farming land

اسم المؤلف: اسو لطيف عزيز الاركوازي
اسم المشرف: وفاق امجد القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت التجربة الحقلية خلال موسم النمو 2015 - 2014في احد حقول ناحية قوره تو - قضاء خانقين - محافظة ديالى بهدف تحديد التاثير المتداخل لكل من بيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في بعض الصفات المظهرية والفسلجية وكذلك بعض مكونات الحاصل لصنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) هما الابيض المحلي والاسود المحلي ، نفذت التجربة وفق تصميم القطاعات كاملة التعشيةRandomized Complete Block Design RCBD وبثلاثة مكررات وتضمنت التجربة الحقلية 72 وحدة تجريبية عبارة عن التداخل بين ثلاثة تراكيزمن بيروكسيد الهيدروجين هي 10،5،0% واربعة تراكيز من فيتامين C هي 0،50،100،150 ملغم.لتر - 1 . بينت نتائج التجربة ان تاثير بيروكسيد الهيدروجين ادى الى انخفاض معنوي في جميع الصفات المدروسة ولاسيما عند التركيز 10% حيث انخفض طـول الجذرملم بنسبة 20.76% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 43.87% , الوزن الجاف للمجموع الجذري غم بنسبة 034.8% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 33.45% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 9.28% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 26.08% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 35.52% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 20.90% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 28.83% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 53.93% و53.755 و47.07% و48.82% و9.48% و42.26% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 101.70% و45.80% و47.45% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 18.23% و22.86% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من الجزء المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنـسبة 24.0% و29.53% و42.74% على التتابع، نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العلـم وفـي الحـبوب % بنسبة 32.47% و32.87% و33.71% على التتابع ، البرولين مايكروغرام.غم وزن طري - 1 بنسبة 13.41% ، فـيتامـين Cملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 40.37% ، انـزيم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.23% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.75% ، وطول السنبلة مع السفا سم بنسبة 12.92% , طول السنبلة سم بنسبة 19.39% , وزن السنبلة غم بنسبة 22.82% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 21.59% , عـدد السنـيـبلات لكل سنبلة سنـيبلة.سنـبلة - 1 بـنسبة 16.54% , وزن الحبـوب فـي السنابل غم بنسبة 18.03% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 23.41% , وزن1000 حبة غـم بـنسبة19.80% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 23.95% , الحاصل الاقـتـصادي كغم . هـ - 1 بنسبة 18.02% .كذلك اوضحت نتائج التجربة ان تاثير فيتامين C ادى الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المدروسة لاسيما عند التركيز 100 ملغم.لتر - 1 حيث ازداد طـول الجذرملم بنسبة 125.00% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 341.88% , الوزن الجاف للمجمـوع الجذري غم بنسبة 177.77% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 159.43% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 21.96% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 84.88% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 108.57% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 76.81% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 122.59% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 352.38% و395.19% و251.55% و274.56% 343.37% و209.66% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 286.77% و296.95% و107.46% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 46.91% و39.81% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنسبة 63.68% و100.00% و96.71% على التتابع , نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العــلـم وفـي الـحـبـوب % بنسبة 124.07% و107.50% و111.92% على التتابع ، البـروليـن مايكروغرام .غم وزن طري - 1 بنسبة 42.03% ، فـيتامـين C ملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 202.06% ، انـزيـم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 105.83% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 142.70% ، طول السنبلة مع السفا سم بنسبة 41.85% , طول السنبلة سم بنسبة 61.61% , وزن السنبلة غم بنسبة 75.58% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 77.62% , عدد السنيبلات لكل سنبلة سنيبلة.سنبلة - 1 بنسبة 59.09% , وزن الحبوب في السنابل غم بنسبة 79.41% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 82.35% , وزن1000 حبة غـم بنسبة 95.58% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 86.52%, الحاصل الاقتصادي كغم.هـ - 1 بنسبة 79.41% .بينت نتائج التجربة ماياتي : - - 1 ان زيادة تركيز بيروكسـيد الهـيدروجـين H2O2 من صفر الى 10% ادى الى حدوث انخـفاض معـنوي في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 2ادى زيادة تركيز فيتامين C من صفر الى 100 ملغم.لتر - 1 الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 3اظهرت النتائج ان التركيز 100 ملغم.لتر - 1 فيتامين C هو الافضل في اعطائه افضل القيم للصفات المدروسة وبغض النظر عن تركيز بيروكسيد الهيدروجين H2O2 مقارنة بالتراكيز الاخرى المرشوشة. - 4اظهرت النتائج تفوق صنف الشعير الابيض المحلي في جميع الصفات المدروسة عدا صفة طول السنبلة مقارنة مع صنف الشعير الاسود المحلي.5 - اظهرت نتائج التداخل الثنائي والثلاثي بين عوامل الدراسة تفوق صنف الشعير الابيض معنويا في اغلب الصفات مقارنة بالصنف الاسود المحلي وتحت جميع التراكيز لكل من فيتامين C وبيروكسيد الهيدروجين H2O2. نستنتج من هذه الدراسة : - الدورالمهم لفيتامين C في حماية العمليات الايضية المختلفة في النبات لكونه من مضادات الاكسده غير الانزيمية من تاثير العوامل المجهدة والمتمثلة ببيروكسيد الهيدروجين. | Field experimental was conducted during the growing season of 2014 - 2015 in one of the fields Quratu sub district/ Khanaqin/ Diala province , aiming to determine the influence of the interaction between both hydrogen peroxide and vitamin c in some morphological and physiological characteristics, also some yield components of two types of Barley (Hordeum vulgare L.) local white and local black. This experiment was carried out by randomized complete block design (RCBD) with three replications; the field experiment included 72 experimental unit of interaction between three concentrations of Hydrogen peroxide 0,5,10 % and four concentrations of vitamin C 0, 50,100,150 mg.l - 1 The results of the experiment showed that hydrogen peroxide effect pulling down significantly decreased in all studied characteristic especially in 10% concentration decreased root length 20.76%, root volume 43.87%, root dry weight 34.80%, root diameter 33.45%, Plant height 9.28%, shoot dry weight 26.08%, leaf area 35.52%, flag leaf dry weight 20.90%, leaf area of flag leaf 28.83%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 53.93%, 53.75%, 47.07%, 48.82%, 9.48%, 42.26%, 101.70%, 45.80%,47.45%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 18.23%, 22.86%, soluble carbohydrate percentage in shoot 24.0%, flag leaf 29.53% and seeds 42.74%, protein percentage in shoot 32.47%, flag leaf 32.87%, and seeds 33.71%, Proline 13.41%, vitamin c 40.37%, catalase 34.23%, peroxidase 34.75%, Spike length with awn 12.92%, spike length 24.05%, weight of spike 22.82%, weight of spike in experimental unit 21.59%, number of spikelet's 16.54%, weight of seed in spikes 18.03%, weight of seeds 23.41%, weight of 1000 seeds 19.80%, biological yield 23.95%, grain yield 18.02%.The results of the experiment showed significantly increased in all studied characteristics especially with 100 mg.l - 1 concentration of vitamin c increased root length 125.00 %, root volume 341.88%, root dry weight 177.77%, root diameter 159.43% , plant height 21.96%, shoot dry weight 84.88, leaf area 108.57%, flag leaf dry weight 76.81%, leaf area of flag leaf 122.59%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 352.38%,395.19%,251.55%, 274.56%, 343.37%, 209.66%, 286.77%, 296.95%,107.46%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 46.91%, 39.81%, soluble carbohydrate percentage in shoot 63.68%, flag leaf 100.00% and seeds 96.71%, protein percentage in shoot 124.07%, flag leaf 107.50%, and seeds 111.92%, proline 42.03%, vitamin c 202.06%, catalase 105.83%, peroxidase 142.70%, Spike length with awn 41.85%, spike length 61.61%, weight of spike 75.58%, weight of spike in experimental unit 77.62%, number of spikelet's 59.09%, weight of seed in spikes 79.41%, weight of seeds 82.35%, weight of 1000 seeds 95.58%, biological yield 86.52%, grain yield 79.41%.The results of experiment showed : - 1 - The increased of hydrogen peroxide concentration from zero to 10% caused significantly decreased in all morphological, physiological and yield to both varieties.2 - The increased of vitamin c concentration from zero to 100 mg.l - 1 caused significantly increased in all morphological, physiological and yield to both varieties.3 - The results showed the concentrations of vitamin c 100 mg.l - 1 are the best to give the best value to all characteristic regardless of hydrogen peroxide concentration compared with other concentrations.4 - The results showed the local white barley superiority in all characteristics except the length of spike compared with local black barley. 5 - Results showed double and triple interaction between studied factors the local white barley superiority significantly in all characteristic compared with local black barley under all concentration for both vitamin c and hydrogen peroxide.We conclude of this study : - The important role of vitamin c in the metabolic various processes in the plant for being non - enzymatic antioxidants from the impact of stress full hydrogen peroxide

دور هرمون الانتي - موليرين وبعض الانزيمات التكاثريه في نوعية السائل المنوي في المرضى غير الخصبين == The Role of Anti - Mullerian hormone )AMH), and some reproductive enzymes on Semen Quality in Infertile Male Patients

اسم المؤلف: اسمهان عدنان عباس النقيب
اسم المشرف: صباح عبد الرضا العبيدي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يحتوي كل من مصل الدم والسائل المنوي على مجموعة متنوعة وكبيرة من الهرمونات والانزيمات والتي لم يعرف موقع انتاجها بشكل واضح. حيث تعد مستويات الانزيمات في السائل المنوي مهمة جدا لعملية التمثيل الغذائي فضلا عن دورها في وظائف الحيوانات المنويه ,نذكر منها الهرمون المضاد لقناه مولر) (Anti - Mullerian Hormone وانزيم الاروماتيز ( (Aromataseاو السايتوكروم 450 (Cytochrome450) وانزيم الكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) واخيرا الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases). لذلك كان الهدف من الدراسه هو التقصي عن مستوى ودور كل من الهرمون المضاد لقناه مولر (Anti - MullerianHormone) وانزيم الاروماتيز(Aromatase) اوالسايتوكروم 450(Cytochrome450) وبعض الانزيمات الاخرى وعلاقتها بمعايير السائل المنوي ، ومستوى بعض الهرمونات والانزيمات الجنسيه وحالة الخصوبة للرجال الخصبين وغير الخصبين. شملت الدراسة مائه رجل باعمار تتراوح بين 20 - 94 سنة , راجعوا المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة\ جامعة النهرين, خلال الفترة اذار 2014 الى كانون اول 2014 , حيث تم جمع وفحص عينات السائل المنوي وفق معايير منظمة الصحة العالمية (WHO)لسنة (2010) ,ثم تم وضع عينات السائل المنوي في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2600 دورة\ دقيقة ولمدة ربع ساعة لغرض الحصول على البلازما المنوية ثم تم وضعها بدرجة - 20 م° ليتم قياس الانزيمات لاحقا. كما تم سحب خمسة ملليلتر من الدم الوريدي المحيطي من جميع الذكور. وضعت عينات الدم في انابيب زجاجيه ، والسماح لها لتتجلط ثم وضعت في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2500 دورة \ الدقيقة لمدة 10 دقائق . وتم تصنيف العينات الى 7 مجاميع على وفق نتائج تحليل السائل المنوي. وقد تم تحديد تراكيز الانتي مولين MullerianHormone)) والاروماتيز(Aromatase) باستخدام طريقة الELISA والكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) والكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases) باستخدام الطريقة الانزيمية في كل من مصل الدم وبلازما السائل المنوي.كما تم تحليل النتائج احصائيا.اظهرت هذه الدراسة النتائج الاتية : 1 - مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر AMH)) في كل من مصل الدم والسائل المنوي. تم ملاحظة وجود انخفاض معنوي0.05)≥(P في مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر في كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia والمجموعة التي تعاني في قلة اعداد النطف وبطء في الحركة التقدمية وتشوهات في اشكال النطف Oligoasthenoteratozoospermiaعند مقارنتها بمجاميع العقم الاخرى .كما شوهد ارتفاعا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون لمجموعة العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدميهAsthenozoospermia والمجموعة التي تعاني من تشوهات في اشكال النطفTeratozoospermia بالمقارنة مع مجماميع الذكور طبيعية النطفNormozoospermia,ومجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermiaوالمجموعة التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia وفي كل من مجموعة العقم التي تعاني من قلة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaومجموعة الذكور اللانطفية Azoospermia.من جانب اخر لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P للهرمون المضاد لقناه مولر في السائل المنوي في مجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى .بينما اظهرت مجاميع العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaارتفاعا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل ا لمنوي عند مقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى, ايضا اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia والمجموعة اللانطفية Azoospermia انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل المنوي بالمقارنة بمستواه في مجاميع العقم الاخرى.2 - مستوى السايتوكروم450 (CYP450) او الاروماتيز) (Aromataseفي كل من مصل الدم واالسائل المنوي اظهرت مجموعة الذكور طبيعية االنطف Normozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الاروماتيز في مصل الدم بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى , كما شوهدت زيادة معنوية0.05)≥(P في مجموعة العقم التي تعاني منقلة في الحركة التقدميه وتشوه في الشكل Asthenoteratozoospermia في مستوى الانزيم في مصل الدم بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى. بينما لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور اللانطفيه Azoospermia بالمقارنة بمستوى هذا الانزيم في مجاميع العقم الاخرى , وانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia بالمقارنة مع مستواه في السائل المنوي في مجاميع العقم الاخرى .3 - مستوى الكرياتين كاينيز(CPK) في كل ن مصل الدم وا السائل المنوي . لوحظ وجود ارتفاعا معنويا بمستوى0.05)≥(P في مستوى انزيم الكريايتن كاينيز في مصل الدم في مجموعة الذكور طبيعيه النطف Normozoospermiaوالمجموعة اللانطفيهAzoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى كما ظهر انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaبمقارنة مستواه في مصل الدم مع مجاميع العقم الاخرى. اظهرت مجموعة العقم التي تعاني من قلة في العدد Oligozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من قلة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaزيادة معنوية0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى, كما اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم اللانطفيهAzoospermia انخفاظا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الكرياتين كاينيز بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى في بلازما السائل المنوي4 - مستوى الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز (GGT) في كل ن مصل الدم السائل المنوي. اظهرت مجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هرمون GGTفي مصل الدم عند مقارنة مستواه بمجاميع العقم الاخرى .كما انه كانت هناك زيادة معنوية 0.05)≥ (Pفي مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من بطء في الحركة التقدميةومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia بالمقارنة مع مستواه في المصل لمجاميع العقم الاخرى. كما اظهرت الذكور التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في مصل الدم بمقارنة مستواه مع مجاميع العقم الاخرى, اما مجاميع العقم التي تعاني من قلة العدد وبطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلOligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من بطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلAsthenoteratozoospermia فقد اظهرت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في بلازما السائل المنوي بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى.وقد لوحظ ايضا انخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في في مجموعة العقم التي تعاني من قلة العددOligozoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى | A great assortment of hormones and enzymes are current in blood and seminal plasma, but in many cases the gland in charged for their production has not been well - known. The enzyme levels of seminal plasma are very important for sperm metabolism as well as sperm function; these enzymes are Anti - Mullerian Hormone (AMH), Cytochrome 450, Creatine Phospho Kinase( CPK) and Gamma - Glutamyl Transfrrase (GGT). Therefore, this study was aimed to investigate the role of AMH and aromatase activity (cytochrome 450) in relation to semen parameters, level of some reproductive hormones, enzymes and the fertility status for fertile and infertile men. This study involved one hundred men within 20 - 49 years old who attended to High Institute of Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technology / AL - Nahrain University, during the period from March, 2014 to December, 2014. Semen samples were collected and seminal fluid analysis was done in accordance with WHO (2010). Then samples of seminal fluid were centrifuged for 15 minutes at 2600 rpm. The supernatant as seminal plasma was rapidly and cautiously improved and put to freeze at - 20° C for later measurements. Also, five milliliters of peripheral venous blood was aspirated from each male. Blood samples were collected in plain tubes, allowed clotting and then centrifuged at 2500 rpm for 10 minutes. The samples were assorted into 7 groups in accordance with the results of semen analysis. For serea and seminal plasma concentrations of AMH, Cytochrome 450, CPK, GGT were determined in the stored blood serum and semen. AMH and Cytochrome 450 were determined using the ELISA sandwich method. CPK and GGT were determined by using enzymatic method. The crude data were statistically analyzed. 1 - The level of Anti - Mullerian hormone (AMH) in serum and seminal plasma. A significant decrement (P≤0.05) was observed in the serum AMH for males with oligozoospermia and oligoasthenoteratospermia as compared to the other groups of male infertility factors. There was significant elevation (P≤0.05) for males complaining from asthenozoospermiaand teratozoospermia as compared to normozoospermia, oligoasthenoteratozoospermia,oligozoospermia, asthenoteratozoospermia and azoospermia. Similarly, significant elevation (P≤0.05) in seminal AMH for males suffering from oligozoospermia as compared to other groups of male factor infertility. Meanwhile, males with teratozoospermia showed significant increment (p≤0.05) as compared to other groups infertility. Also, males with asthenoteratozoospermia and azoospermia revealed significant reduction (p≤0.05) in the level of seminal AMH as compared to other male infertility. 2 - The level of cytochrome 450 or aromatas enzyme in serum and seminal plasma. The males with normozoospermia revealed significant reduction (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to the other male infertility groups. Also, males complaining from Asthenoteratozoospermia presented significant elevation (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to other groups of infertility. While, there was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for azoospermic males as compared to the other groups of male infertility, and significant decrement (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for males complaining of normozoospermia as compared to the other groups of male infertility.3 - The level of creatine phosphokinase (cpk) in serum and seminal plasma. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of CPK for males with normozoospermia and Azoospermia when compared to other groups of male infertility in contrast, and the level of CPK showed significant reduction (P≤0.05) for teratozoospermia as compared to other groups of male infertility. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for oligozoospermia and Aasthenoteratospermia when compared to other groups of infertility factors, also, males suffering from oligoasthenoteratospermia and azoospermia showed significant decrement (P≤0.05) when compared to other groups of infertility factors. 4 - The level of gamma - glutamyl transpeptidase (GGT) in serum and seminal plasma. Males with normozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors, and there was significant increment (P≤0.05) for males complaining from asthenoteratozoospermia as compared to the others. Males suffering from teratozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors. Males with oligoasthenoteratozoospermia, and asthenozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of semen GGT when compared to the other groups of infertility factors, males suffering oligozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) when compared to the other groups of infertility facto

التكوين الجنيني والتنسج للدماغ والحبل الشوكي في طائر السلوى Quail Coturnix coturnix (Linnaeus,1758) == Embryonic Development and Histogenesis of Brain and Spinal Cord in Quail Coturinx coturinx (Linnaeus, 1758)

اسم المؤلف: اسماء بشير عبد
اسم المشرف: نهلة عبد الرضا البكري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الاجنة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التعرف على تكوين الدماغ والحبل الشوكي من مرحلة العصيبة حتى مرحلة الفقس لطائر السلوى Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758) ودراسة التركيب النسجي لهما في الطائر البالغ. حصل على اجنة تراوحت اعمارها ما بين (12) ساعة حضانة الى مرحلة الفقس (17) يوما وكذلك على البالغ واجريت عليها خطوات التحميل الكامل والمجهر الالكتروني الماسح وتحضير الشرائح النسجية بطريقة شمع البرافين، وتم ايضا تحليل الاحماض الامينية للادمغة للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16و 17) يوما والبالغ من طائر السلوى.اظهرت نتائج الدراسة الجنينية للدماغ والحبل الشوكي ان بداءة ظهورهما في جنين طائر السلوى عمر (18) ساعة حضانة اذ حدث تثخنا لطبقة الاديم الظاهر لتكوين الصفيحة العصبية التي تتالف من نسيج ظهاري عمودي مطبق كاذب , وظهرت الطيتان العصبيتان ملتحمتان في عمر (24) ساعة حضانة لتكوين الانبوب العصبي وبعد تمايزه الى حوصلة الدماغ والحبل الشوكي، يتمايز الدماغ على ثلاث حويصلات (الدماغ الامامي ، الدماغ المتوسط , الدماغ المؤخر) في عمر (33) ساعة حضانة، وتالف جدار الدماغ من طبقة البطانة العصبية تليها الطبقة الغطائية.تمايز الدماغ في جنين عمر (40) ساعة حضانة على خمس حويصلات هي (الدماغ الانتهائي والدماغ البيني ، والدماغ المتوسط والدماغ البعدي والدماع النخاعيني) وظهر التركيب النسجي لجداره مكون من ثلاث طبقات هي (البطانة العصبية والغطائية والحافية). وظهر التركيب النسجي لجدار الحبل الشوكي مؤلفا من طبقة البطانة العصبية تحيطها الطبقة الغطائية.وفي جنين عمر (48) ساعة حضانة اتضح الانحناء القحفي اذ يصبح الدماغ المتوسط في المقدمة وكذلك ظهرت حوصلتا الدماغ الانتهائي، واصبح جدار الحبل الشوكي مؤلفا من ثلاث طبقات (البطانة العصبية والغطائية والحافية) في هذا العمر. ظهرت الانحناءات (العنقية والظهرية والذنبية) التي تؤدي الى تقوس الجنين، في عمر (72) ساعة حضانة.تمايز الدماغ البيني في جنين عمر (96) ساعة حضانة على ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد وقد ظهرت في هذا العمر الطبقة البصرية وهي اول طبقات السقف البصري الذي يمثل سقف الدماغ المتوسط وظهر الحبل الشوكي ايضا مكونا من المادة السنجابية التي تمثل الجزء الداخلي من جداره والمادة البيضاء التي تمثل الجزء الخارجي من جداره مع تمايز المادة السنجابية الى القرون الظهرية والقرون البطنية.يتسع تجويف الدماغ الانتهائي ويزداد سمكه في جنين عمر (5) ايام حضانة مع ظهور نوى التكوين الشبكي في قاع الدماغ البعدي وفي عمر (6) ايام حضانة بدات الطبقة السنجابية الليفية السطحية بالتمايز وهي الطبقة الثانية من طبقات السقف البصري، كما تمايزت الطبقة الغطائية في الجدار الجانبي للدماغ البعدي على منطقتين ثانويتين الاولى هي الطبقة الغطائية الداخلية تكون مجاورة لطبقة البطانة العصبية اما الثانية فهي الطبقة الغطائية الخارجية ، وظهرت ايضا الحزمة الطولية الناصفة في قاع الدماغ النخاعيني. وفي جنين عمر (7) ايام لاتختلف جدران الدماغ عن المراحل السابقة ولكن تصبح اكثر سمكا.اما في جنين عمر (8) ايام حضانة وجد الدماغ والحبل الشوكي مشابها لحالة البالغ، يمثل الدماغ الانتهائي المخ الذي يتالف من نصفي كرة المخ ويسمى تجويفها البطين الجانبي (الايسر 1st، والايمن 2nd)، ويتالف نسجيا من منطقتين لحاء الدماغ وتحت لحاء الدماغ ، ويمثل البطين الثالث 3rd تجويف الدماغ البيني، ويتالف الدماغ البيني من ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد.اما الدماغ المتوسط فقد تمايز سقفه على ست طبقات (البصرية ، السنجابية الليفية السطحية ، السنجابية المركزية ، الالبومية المركزية ، السنجابية حول البطنية، والالبومية حول البطنية) اما جزاه القاعي فيتمايز الى السقيفة, وتمايز الدماغ البعدي على جزاين (المخيخ والجسر)، ويتمايز الدماغ النخاعيني ليكون النخاع المستطيل ويمثل البطين الرابع 4th تجويف الدماغ المؤخر, اما الحبل الشوكي فيكون مشابها لحالة البالغ اذ وجدت المادة البيضاء في جزئه الخارجي بينما المادة السنجابية مرتبة على شكل X تمثل جزئه الداخلي وتدعى المنطقة الظهرية منها القرون الظهرية Dorsal horns اما المنطقة البطنية فتدعى بالقرون البطنية وتمثل القناة المركزية تجويفه.وشملت الدراسة الحالية ايضا تحليل الاحماض الامينية في ادمغة اجنة طائر السلوى للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16) يوما حضانة ومرحلة الفقس (17) يوما والبالغ ، ووجد (16) حمضا امينيا هي الاسبارتك (13)، الكلوتامين (13)، السيرين)البالغ) ، الهستدين (13)، الثيروتين (13)، الكلايسين (16)، الارجنين )البالغ) ، الالنين (13)، التايروسين )البالغ)، السستين (13)، الفالين (13)، الميثونين (11)، الايزوليوسين (13)، اليوسين (13)، الفينلالنين)البالغ) ، اللايسين (13) على التوالي , اما اقل تركيز للاحماض الامينية في الاعمار الاسبارتك (14)، الكلوتامين (12)، السيرين)10) ، الهستدين (10)، الثيروتين (12)، الكلايسين (10)، الارجنين )10) ، الالنين (10)، التايروسين )10)، السستين (14)، الفالين (12)، الميثونين (12)، الايزوليوسين (15)، اليوسين (10)، الفينلالنين)14) ، اللايسين (10) على التوالي | The present study aimed to study the development of brain and spinal cord starting from neurula stage till hatching stage (17th day) and adult in quail Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758), using the whole mount, scanning electron microscopeand paraffin wax method were used for preparing histological slides. Amino acids of brains were determinated during different ages (10, 11, 12, 13, 15, 15, 16 and 17 days) in addition to the adult .The embryonic study revealed the first appearance of the brain and spinal cord in Coturnix coturnix was at (18) hrs incubation. The first appearance represented as ectodermal thickening to form the neural plate, which is histologically formed from pseudostratified columnar epithelium. The neural folds fused at age of (24) hrs of incubation to form the neural tube and then differentiated to form the brain vesicle and spinal cord. The brain was differentiated into three vesicles represented by (prosencephalon, mesencephalon and rhombencephalon) at age of (33) hrs incubation. The wall of the brain consist of ependymal and mantle layers. The brain in embryo of (40) hrs incubation differentiate into five vesicles represented by telencephalon, diencephalon, mesencephalon, metencephalon and myelencephalon. The histological study of brain wall decleared that it formed from three layers which were ependymal, mantle and marginal layer. The histological structure of spinal cord wall at the same age showed that it consist of two layer represented by Ependymal layer which surrounded by mantle layer.In embryo at age of (48) hrs incubation, the cranial flexure appeared and the two vesicles of telencephalon were also became clear and the spinal cord wall consist of three layers represented by ependymal, mantle and marginal layers.The cervical, dorsal and caudal flexures appeared at (72) hrs incubation, which lead to curved the embryo.Diencephalon at age (96) differentiated into three regions age which are represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus, at this age the stratum opticum also appeared, which represented the first layer of optic tectum and represented the roof of mid - brain. The spinal cord appeared formed from the gray and white matter, at the same time the gray matter differentiated into dorsal and ventral horns.At age of (5) days incubation the telencephalon cavity enlarge and its thickness increase and reticular formation nuclei appeared at the base of metencephalon. At age of (6) days incubation, the stratum griseumfibrosum superficial which represent the 2nd layer of optic tectum started to differentiate and the mantle layer also differentiated from the lateral wall of Metencephalon into two secondary layers represented by the inner mantle layer which observed besides the epindymal layer and the outer mantle layer, The medial longitudinalfascicule appeared at the base of mylencephalon. At age of (7) days incubation the walls of brain become more thickned. At age of (8) days incubation both brain and spinal cord appeared as in the adult stage. The telencephalon appeared represent from hemispherical cerebrum and their cavity called lateral ventricles (right the 1st and left the 2nd). Histologically formed from two region represented by pallium and subpallium the 3rd ventricle represented the cavity of diencephalon which formed from three regions represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus. The mesencephalon roof differentiated to optic tectum with six layers of opticum, griseumet fibrosum superficiale, griseum centrale, album centrale, griseum periventriculare and album periventriculare. At the same time, the base of mesencephalon differentiated to tegmentum. Metencephalon differentiated into two parts represented by cerebellum and pons, while the mylencephalon appeared differentiated to from medulla oblongata and 4th ventricle represented the cavity of rhombencephalon.On the other hand the spinal cord also appeared as in the adult in appearance, the white matter in its external part and gray matter arranged as X - shape and represented the internal part, the dorsal region of this part represented the dorsal horns while the ventral horns represented the ventral region and the central canal represented its cavity.The present study also include the amino acids analysis for the brain of the bird under investigation in different stage of development (10, 11, 12, 13, 14, 15and 16, days incubation) in addition to the hatching stage (17th day) and the adult. The results revealed that there are 16 amino acid: Aspartic acid , Glutamine , Serine , Histidine , Thronine , Glycine , Arginine , Alanine , Tyrosine , Cysteine , Valinine , Methionine , Isoleucine , Phenylalanine , Lysine , and the highest concentration of amino acid at age of (13,13, adult, 13, 13, 16, adult, 13, adult, 13, 13, 11, 13, 13, adult, 13) respectively and the low concentration at age of (14, 12, 10, 10,12,10,10,10,10, 14, 12, 12, 15, 10, 14, 10,) respectively.

عزل طفيلي Blastocystis hominis ، تنميط HLA للمصابين والتثبيط بالمعزز Saccharomyces boulardii == Isolation of Blastocystis hominis , HLA typing of patients and the inhibition by the probiotic Saccharomyces boulardii

اسم المؤلف: اسراء محمد عبد الخالق الحسن
اسم المشرف: سبا طاهر محمد | بتول مطر مهدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية (5892) عينة براز، والتي جمعت من مرضى باعمار مختلفة (1 - 70 سنة) لكلا الجنسين ،كانوا يعانون من الم البطن، مغص حاد ، تطبل البطن واسهال. جمعت العينات خلال الفترة الواقعة من ايلول (2013) ولغاية ايلول (2014)، من اربع مستشفيات في بغداد (مستشفى مدينة الطب التعليمي ،مستشفى الامام علي ،مستشفى الكرامة ومستشفى اليرموك التعليمي ) . للتحري عن نسبة الاصابة بطفيلي hominis Blastocystis ، اظهرت نتائج الدراسة الوبائية ان العدد الكلي المصاب بالطفيلي كان (1420) عينة موجبة وبنسبة (24.10%) ، اما نسب الاصابة بالطفيلي في المستشفيات الاربعة (مستشفى مدينة الطب التعليمي ،مستشفى الامام علي ،مستشفى الكرامة ومستشفى اليرموك التعليمي) كانت (51.41 % ، 18.66%،17.61% و12.32% ) على التوالي . واظهر الذكور اعلى عدد ونسبة للاصابة ، حيث بلغت (750) حالة وبنسبة (52.82%) ، اما الاناث فقد بلغت حالات الاصابة (670) حالة وبنسبة (47.18%) وبدون وجود فروق معنوية . وقد كانت اعلى نسبة للاصابة ضمن الفئة العمرية ( 30 - 21 سنة) بنسبة (29.58%) ، بينما كانت اقل نسبة للاصابة ضمن الفئة العمرية (10 - 1 سنة) بنسبة (3.52%). اظهرت الدراسة ان عينات البرازالتي تحتوي على الطفيلي تمتاز بقوام سائل اوشبه سائل ، وتمت دراسة علاقة الطفيلي مع الاصابة بالطفيليات المعوية الاخرى وجاءت النتائج كالاتي (1110) حالة اصابة مفردة لطفيلي Blastocystis hominis وبنسبة ((78.17%، و(310) 21.83%)) حالة اصابة مشتركة مع (6) اجناس مختلفة من الطفيليات المعوية، حيث كانت اجناس الطفيليات كالاتي ( Entamoeba histolytica ،تليها Giardia lamblia ،تليها Cryptosporidium ،تليها Enterobius vermicularis ،تليها Taenia spp.، واخيرا Ascaris lumbricoides ) وبنسبة ( 18.38% ، 2.68%، 0.35 % ،0.21%، %0.14 ،% 0.07) على التوالي. ان الدراسة الحالية سلطت الضوء على تحديد افضل طريقة تصبيغ لتشخيص الطفيلي بالبراز. واظهرت الدراسة ان افضل طريقة تصبيغ هي صبغة السفرانين تليها صبغة الكمزا والايرون هيماتوكسيلين. اما بالنسبة لزراعة الطفيلي لتشخيصه ، فقد كان وسط جونس المحورهو الوسط المناسب مع اجراء بعض التحوير بطريقة الزرع وهو استبدال مصل الحصان بمصل انسان مثبط ،و حضن الطفيلي هوائيا بدرجة ( 37 مئوية). اظهرت النتائج ان اعلى نسبة نموحصلت بعد (24 ساعة) اذ بلغت اعداد الطفيلي (777.75 خلية/ مل)، و(495.62 خلية / مل) بعد (48 ساعة) ، وقد كان الشكل الفجوي هو الشكل الاكثر تواجدا في الوسط . وقد شملت الدراسة الحالية عمل تنميط مستضدات كرية الدم البيضاء البشرية الى (30) شخص عربي عراقي مسلم مشخصين بوجود متلازمة تهيج القولون العصبي ، جميعهم مصابين بطفيلي Bastocystis hominis ، وقد كان (24) منهم ذكور، و(6) اناث ، وباعمار تراوحت بين (53 - 20 سنة) ،هذا بالاضافة الى (30) شخص سليم عربي عراقي مسلم تم اعتبارهم كمجموعة سيطرة ، تكونت من (25) ذكور، و(5) اناث ، وباعمار تراوحت بين ( 55 - 18 سنة) ، وقد وجد ان هناك ميل واستعداد للاصابة بالطفيلي يتطلب اكتساب الاليل HLA - DR B1*03 ،بالاضافة الى اكتساب الاليل HLA - DRB1*14. تم دراسة تاثيرفعالية خميرة Saccharomyces boulardiiكمعززات حيوية على الطفيلي في الفئران المختبرية ومقارنتها مع دواء mitronidazole الذي يستخدم عادة في علاج الطفيليات المعوية ومن ضمنها طفيلي ال hominis Blastocystis. وقد لوحظ هناك انخفاض تدريجي لاعداد الطفيلي في براز الفئران ومنذ اليوم الاول للمعالجة (حيث اختفى الطفيلي عند اليوم الثاني عشر بعد العلاج بخميرة Saccharomyces ، وعند اليوم الثالث عشر بعد العلاج بدواء metronidazole)، وعند حساب الكفاءة العلاجية للخميرة والميترونيدازول ،وجد بان الخميرة كانت ذات كفاءة علاجية عالية اذ بلغت (87.45%) في حين بلغت الكفاءة العلاجية للميترونيدازول (81.36%) . اظهر الفحص المجهري للمقاطع النسيجية الماخوذة من امعاء الفئران المصابة بالطفيلي لمنطقتي الاعور والقولون قدرة الطفيلي على حدوث تغيرات نسيجية تضمنت وجود ترشح خلوي التهابي شديد وحدوث اضرار للغشاء المخاطي. واظهرت خميرة Saccharomyces boulardii فعالية عالية في اصلاح وشفاء الانسجة المتضررة مقارنة بالميترونيدازول الذي اظهر كفاءة اقل في اصلاح وعودة النسيج الى هيكله الطبيعي. | The present study included (5892) stool sample , which were collected from patients at different ages (1 - 70 year) of both sexes, complained with abdominal pain, cramp, flatulence and diarrhea. Samples were collected during the period from September (2013) till September (2014), included four hospitals in Baghdad (Baghdad Medical City , AL - Imam Ali Hospital, AL - Karaama Hospital and AL - Yarmouk Teaching Hospital ) . To detect of the infection prevalence of Blastocystis hominis , the results of epidemiological study showed that the total number infected with this parasite was (1420) positive sample with percentage of (24.10%) , Percentages of infected cases with parasite in the four hospitals (Baghdad medical city, AL - Imam Ali Hospital , AL - Karaama Hospital and AL - Yarmouk Teaching Hospital), were (51.41%,18.66%,17.61%,and 12.32%) respectively . Males showed higher number and percentage of infection, (750 ) case with percentage of (52.82%), while females were (670) case with percentage of (47.18%) , no statistical significant differences was detected. The highest percentage of infection occurred among age group (21 - 30 year ) with percentage of (29.58%), while the lowest percentage of infection occurred among age group (1 - 10 years) with percentage (3.52%) . This study showed that stool samples which contain the parasite have a liquid or semi liquid . The presence of other intestinal parasites was detected, and the results were (1110) single infection with Blastocystis hominis ,with percentage (78.17%) , and (310) (21.83%) co - infection with (6) different genus of intestinal parasites, which were (Entamoeba histolytica, Giardia lamblia , Cryptosporidium , Enterobius vermicularis , Taenia spp., and Ascaris lumbricoides) with percentage (18.38%, 2.68%, 0.35%, 0.21%,0.14%, and 0.07%) respectively. The current study focused on determining the best way of staining to detect parasite in the stool. This study showed that safranin is the best stain ,then giemsa and iron haematoxylin. According to diagnosis by culture in modified Jones medium was the suitable medium with some modification with replacing horse serum with inactivated human serum, the parasite incubated aerobic at (37ºC). The results showed that the higher growth rate occurred after (24 hr) , the numbers of the parasite were ( 777.75 cell /ml), and ( 495.62 cell/ml ) after (48 hr) , the vacuolar form of the parasite was the main form founded in the culture. The present study included making HLA typing to (30) diagnosed Iraqi Arab Muslim patients with irritable bowel syndrome ,all of them infected with Blastocystis hominis, (24) of them were males , and (6) females ,with age ranged between (20 - 53 year) , control group consist of (30) healthy Iraqi Arab Muslims individuals, where (25) was males , and (5) females, with age ranged between (18 - 55 year), the results revealed that there was a genetic predisposition factor for the infection with Bastocystis hominis by acquiring the allele HLA - DR B1*03,and allele HLA - DRB1*14. The effectiveness of Saccharomyces boulardii yeast as vital probiotic on this parasite was studied in the laboratory animals (mice ) and compared with metronidazole which is used usually in the treatment of intestinal parasites including Blastocystis hominis . A gradually decreasing in the numbers of parasite in feces of mice was noticed since the first day of treatment parasite disappeared on the day (12th ) of treatment with Saccharomyces yeast, and disappeared on the day (13th ) of treatment with metronidazole.The efficacy of treatment was estimated for both of S. boulardii and metronidazole ,and the result proved that this yeast have a higher efficacy for treatment (87.45%) , compared with mitronidazole efficacy which was (81.36%). The microscopic examination to histological sections of the infected mice in cecum and colon regions showed the ability of the parasite to make histological changes included intense inflammatory - cell infiltration, and mucosal damage. The yeast of Saccharomyces boulardii showed higher ability in the healing and recover damaged tissues compared with metronidazole

دراسة وراثية خلوية وجزيئية بين عينة من المرضى المصابين بالهوجكنزلمفوما == Cytogenetic and molecular study among Hodgkin’s lymphoma patients

اسم المؤلف: اسراء حسين حمزة
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي | عبد الحسين مويت الفيصل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة لفحص وتحديد نسبة انتشار التناقل الكروموسومي لكروموسومي (14و18) الذي يحدث بين جين bcl2و JH في بعض المرضى العراقين المصابين بسرطان الهوجكن لمفوما وايضا تم التحرى عن جين (BNRF1)الخاص بفايروس (EBV)كذلك تم التحرى عن التشوهات الكروموسومية بواسطة استخدام تقنية التهجين الموضعي . تضمنت الدراسة 75 عينة من المرضى المصابين (25 عينة من الدم و50 عين من الخزع النسيجية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين) مع عشر عينات من الخزع النسيجية التابعة لمرضى الاورام الحميدة .تم جمع الدم من وحدة امراض الدم في مستشفى بغداد في مدينة الطب ببغداد. اما الخزع النسيجية فقد جمعت من مختبرات الامراض النسيجية في مختلف المستشفيات خلال الفترة من شهر ايلول لعام 2013 لغاية شهر اذار لعام 2014. ان تحديد وفحص التناقل الكرموسومي )14;18) تضمن المناطق المتغايرة بالجين الورمي bcl2 وهي منطقة الانكسار الرئيسية MBR التي تقع بالجزء الغير مشفر بالنهاية 3ʹومنطقة الانكسار الثانوية MCR ولتحديد علاقة هذه المناطق بالتناقل الكروموسومي فقد تم استخدام تسعة بوادى امامية من الجين الورمي bcl2 وبادئ واحد عكسي من جين JH بالاضافة الى السيطرة الموجبة لكل منطقة انكسار والذي تم تصنيعه في المختبر باستخدام تقنية الربط وبناء القطع والذي يعتبر اول دراسة في هذا المجال في العراق والشرق الاوسط. .تم تضخيم الحامض النووي دنا(DNA ) لكل عينات المرضى المصابة بسرطان الهوجكنز لمفوما وعينات المستخدمة للسيطرة بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل PCR والتتابع المباشر والتي تضمنت استخدام ثلاث مجاميع من البوادئ لتغطية المناطق الانكسار المراد فحصها على الجين الورميbcl2 على كروموسوم 18. وقد تم تصميم هذه البوادئ باستعمال برامج NCBI (Primer plus 3) حيث تم تصميم بوادئ امامية لكل من (MBR(MBR1,MBR2) و3MBR(3MBR1, 3MBR2, 3MBR3, 3MBR4) وMCR(MCR1,MCR2, 5MCR)) وتم تصميم بادئ عكسي من جينJH لكل هذه البوادئ الامامية وتم استخدامهم لكل العينات المراد فحصها للانتقال الكروموسومي (14و18) كل على انفراد وباستخدام سيطرة موجبة للفحص والذي تم تصنيعه بالمختبر باستخدام تقنية التضخيم المتداخل والتضخيم متعدد الارسال. وقد تم ضبط ظروف التضخيم وحسب البوادئ المستخدمة وفحص الناتج بواسطة الترحيل الكهربائي لتحديد العينات الموجبة للتناقل ثم تحديد موقع التناقل بواسطة طريقة التتابع المباشر ومقارنتها مع التتابع المباشر للسيطرة الموجبة. كما تم استخدام الدنا المستخلص سابقا لتحديد وجود جين BNRF1 الخاص بفايرس EBVبواسطة استخدام تقنية التضخيم العددي ((qRT - PCR واستخدام تتابع نيوكليوتيدي (بادئ) ومجس خاص . بالاضافة الى استخدام تقنية التهجين الموضعي لتحديد التشوهات الكرموسومية في بعض من عينات الخزع النسيجية المثبتة على سلايدات التهجين الخاصة بذلك .وقد اظهرت الدراسة النتائج التالية : هناك فروق معنوية عالية (p<0.01) بين العوامل المتغيرة في التجربة كما اوضحت النتائج ان نسبة انتشار المرض كان بالاعمار البالغين بين (60 - 70) سنة بنسبة (25.33%) وبالنسبة للجنس فقد حقق جنس الذكور نسبة حدوث اكثر من الاناث وبنسبة (58.67%) اما بالنسبة الى نوع المرض فقد سجل نوع Mixed cellularity اعلى نسبة حدوث بالنسبة للانواع الاخرى من المرض (53.33%)اما بالنسبة الى موقع العقد اللمفاوية المصابة بالورم فكانت اكثر الاماكن اصابة وحدوث الورم هي العقد اللمفاوية العنقية (53.33%) . واظهرت نتائج الدراسة ان نسبة انتشار الانحراف الكروموسومي للجين الورمي في المرضى المصابين بورم الهوجكن ظهر في 26(35%) عينة موجبة وكان 5(19.2%) منهم بمنطقة الانكسار MBR1 و4(15.38%)في منطقة الانكسار MBR2 و3(11.5%) في منطقة 3MBR1 و2(8%) في منطقة 3MBR2 و7(27%) في منطقة 3MBR4 ولم تظهر اي نتيجة موجبة في المنطقة 3MBR3 اما بالنسبة الى مناطق الانكسار الثانوية فقد سجلت 4(15.38) في منطقة الانكسارMCR1 و1(4%) في منطقة MCR2 و2(8%) في منطقة الانكسار 5MCR ولم تسجل اي نتيجة موجبة بالنسبة للعينات الاورام الحميدة المستخدمة للسيطرة . وبهذا فقد بينت النتائج ان نسبة انتشار الانحراف كانت في مناطق الانكسار الرئيسية اكثر من مناطق الانكسار الثانوية. وبالنسبة الى العمر فان نسبة الانتشار كانت باعمار البالغين والاكثر عند الذكور وبفروق معنوية عالية ايضا. بعد تحليل النتائج بواسطة طريقة التتابع المباشرة ومقارنتها بنتائج الموقع العالمي للمعلومات الجينية (NCBI) ومقارنتها كذلك مع تتابع السيطرة الموجبة . تم تقديم العينات ذات الحجم المساوي الى bp200 او اكثر الى بنك الجينات في المواقع العالمية لتسجيل التتابعات الجينية حيث تم تسجيلها في الموقع الامريكي ال(Gene Bank) وتم تسيجلها في الموقع الاوربي (EMBL) كذلك تم التمكن من تسجيلها في الموقع الياباني لبنك الجينات (DDBJ) وتم الموافقة ونشرت تحت عنوان : (Homo sapiens DNA, IGH/BCL2 transition region, isolate : hodgkins - bcl2 - t (14 - 18) mbr - p.)واعطيت ارقام تعليم خاصة بها في بنك الجينات تبدا من (LC041134 - LC041142) واعتبرت كمصدر عن معلومات العراقيين الجينية والتي تعتبر قليلة ضمن بنك الجينات العالمي. كما اظهرت النتائج وجود 40(53.33%) حالة موجبة وبفروق معنوية عالية لجين الابشتاين بار فايروس لمرضى الاورام اللمفية الهوجكن مقارنة بالاورام الحميدة التي لم تظهر اي نتيجة موجبة . اضافة الى ذلك اظهرت النتائج ان اكثر المرضى المصابين بالفايروس كانوا من جنس الذكور ومن نوع Mixed cellularity HL . في مايتعلق باختبار التهجين الموضعي فقد اظهرت النتائج وجود عينة واحدة موجبة للفحص من اصل 6 عينات. نستنتج من هذه الدراسة ان تحديد الانتقال الكروموسومي (14;18) في مرضى الاورام اللمفية الهوجكن يمكن تحديدها باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وباستخدام عدة بوادئ لكل مناطق الانكسار الرئيسية والثانوية .اضافة الى استنتاج دقة اختبار التضخيم الكمي في تقيم وتحديد الفايرس ومن الممكن اعتبارها كوسيلة لتشخيص الاورام اللمفية واي نوع من السرطان ذات العلاقة بالفايرس والذي يعتبر كمؤشر للورم.اما بالنسبة لتقنية التهجين الموضعي فقد تبين انها ادق من تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وذلك بسبب كبر حجم المجس الضوئي المستخدم للفحص . | The study was design to investigate and to determine the frequency of chromosomal translocation involve the bcl2 and JH genes t (14, 18) (q32; q21) in some of Hodgkin’s lymphoma Iraqi patients. The study also aimed to detect the BNRF1 gene of EBV in patients and using FISH technique for other chromosomal aberrations in the same patients. The study include 75 Iraqi patients with Hodgkin’s lymphoma (25 samples as blood and 50 samples as formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue blocks) and 10 samples as reactive hyperplasia blocks for control. The blood samples were collected from hematology unit in Baghdad hospital in medical city but paraffin blocks tissue were collected from histopathological laboratories in different hospitals during the period from September 2013 till March 2014. The detection of t (14; 18) translocation involved the hot spots regions of the bcl2 gene which included the major breakpoints region (MBR located in the 3ʹ untranslated region of bcl2 exon 3) and the minor cluster region (MCR located in the 3ʹ region of bcl2 exon 3). To detect the involvement of these regions in the t (14; 18), nine forward primers were used for bcl2 regions and one reverse primer for JH gene as well as to positive controls for each breakpoints which were prepared by synthesized artificial chromosomal translocation in laboratory by using splicing technique and construct fragments of genes and considered the first work in this field not just in Iraq or middle east but in all world. The DNA for all samples was submitted for PCR (Polymerase Chain Reaction) amplification which performed using three set of primers (multiple primers) defined multiplex PCR to detect MBR, 3ʹMBR and MCR regions on bcl2 gene on 18 chromosome, the three set primers which designed by using NCBI programs (Primer plus 3 program) as forward primer [forward MBR (MBR1,MBR2), 3MBR( 3MBR1, 3MBR2, 3MBR3, 3MBR4), MCR (MCR1, MCR2, 5MCR) and reverse primers (reverse JH used ) in which case each of primer sets forward were used to evaluate the transposition of t (14;18) separately for the same samples with positive control for each breakpoint that was synthesized in lab by nested and multiple primers defined multiplex PCR. The PCR conditions were optimized according to suitable sets of primers used for reproducing the replacement. By gel electrophoresis for the products to identify the fragments with juxtaposed bcl2 and IGH JH enhancer positive and subjected for genotype analysis [these artificial breakpoints (positive control) and each positive samples for t(14, 18) assay] by using Sanger method with Agencourt® CleanSEQ® dye - terminator Removal Kit for direct sequence analysis. The DNA which was extracted before was also used to detect the existence of BNRF1 gene specific for EBV loaded in patients samples by using real time quantitation PCR (qRT - PCR) with specific primer and probe. In addition to use FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) technique to detect abnormal chromosome in tissue samples with the PathVysion Kit applied on tissue section fixed on positive charge slides (thermo fisher scientific). The unstained 3 µm sections of six samples were tested for t (14; 18) using a dual color - dual fusion translocation probes set (Vysis LSI IgH/ BCL2; Abbott Molecular). A total of 200 interphase nuclei were enumerated and scored for the presence of two fusion signals per nuclei. The results in this study showed high significant (P<0.01) between parameters. The results reported that the age of HL patients in the current study ranged between 10 - 80 years and more incidences in old adult with the age range (60 - 70) years (25.33%). There were males predominance among HL patients 44(58.67%) than females 31(41.33%) with high significant (P<0.01). The highest subtype HL number was recorded in mixed cellularity (MC) (53.33%). The cervical lymph node was recorded the highest infected site and included tumor 53.33% than other sites of lymph node and according to stage of disease , most cases in the current study were stage II (72%). Regard to the t (14;18) chromosomal translocation the results noticed a total of 26(35%) positive cases showed IGH/BCL2 gene rearrangement with high significant compared with control. 5 (19.2%) for major breakpoint MBR1, 4(15.38%) for MBR2 and (3(11.5%);2(8%);7(27%)) for 3ʹMBR1, 3ʹMBR2 and 3ʹMBR4 respectively but no cases positive for 3ʹMBR3 while (MCR1, MCR2, 5ʹMCR) were recorded in (4(15.38%); 1(4%); 2(8%)) respectively. And (0%) in reactive hyperplasia for control. The results indicate higher frequency of breakpoints in the MBR regions than MCR cluster region, and the incidence of t (14; 18) translocation was increased in adult’s age depending on age while depending on gander the incidence among males was high. After the sequence analysis for all breakpoints sequence and compared with NCBI by (http : //blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) and compared with construct fragment sequence (positive control). The breakpoints sequence that its product size equal 200 bp or more that were submitted to the NCBI (National Center for Biotechnology Information) site for registration in the Gene Bank database, (DNA Data Bank of Japan) (DDBJ) and in the EMBL (European Molecular Biology Laboratory) and accepted in these three international sites for bioinformatics, thus published under title (Homo sapiens DNA, IGH/BCL2 transition region, isolate : hodgkins - bcl2 - t(14 - 18) mbr - p.) with special ID number (Accession number) specific for these breakpoints sequence which is begin from (LC041134 to LC041142) in gene bank database and considered as a document reference about Iraq people data which is little in gene bank database. The EBV DNA genome encoding the non - glycosylated membrane protein (BNRF1) was detected in 40(53.33%) positive cases of 75 Hodgkin’s lymphoma samples and no cases positive for EBV in reactive hyperplasia with high significant . The majority of positive patients were males 33(82.5%) than females. In addition to the EBV was more frequently detected in mixed cellularity subtype of HL 27(67.5%). According to the FISH assay, the results showed that just one sample from six was positive for t (14; 18) translocation and this case was recorded negative results in PCR assay. In conclusion, the detection of t (14; 18) in HL patients can be achieved by PCR technique by including multiple primers for all three breakpoint regions which are MBR, 3ʹMBR, MCR and performing multiplex amplification. And the positive fragments can also be used as an indicator of minimal residual disease following treatment. The qPCR assay allows precise quantification of EBV load and can be used as a tool for diagnosis and management of EBV related lymphoma patients and for any cancers that EBV DNA may be considered as tumor biomarker. The FISH technique considered more sensitive than PCR for detection t (14, 18) because of large size of FISH probes which used in technology, the IGH probe labeled in green is about 1.5 Mb and includes nearly the entire IgH locus and 300 kb beyond the 3ʹ end and the locus - specific bcl2 probe labeled in orange about 750 kb to include the entire bcl2 gene sequence and additional sequence extending about 250 kb distal and proximal to the ge

دراسة تصنيفية مقارنة لمراتب من العائلة السوسنية Iridaceae النامية بريا في العراق == Comparative Systematic Study For The some Taxa of the Family Iridaceae wild growing in Iraq

اسم المؤلف: اريج عبد الستار فرمان الراوي
اسم المشرف: مازن نواف عبود العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - التصنيف
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study covered 14 taxa of the family Ireidaceae wiled growth in Iraq ,as it has a comparative systematic study of all morphological characters , pollengrains , anatomy , molecular , environmental and geographical distribution in detail , as well as the taxonomical treatment have been down for all taxa with keys for all taxa was done.Survey for must districts of Iraq was done to determined the distribution of taxa , therefor many collection were obtained , new location of taxa distribution were fixed and all the specimens collected including those from herbaria were identified.The comparative study of all the morphological characters of plant parts were recorded down in tables , as well as photo for deferent purposes. Priority taxonomic important were notice to subterranean stems (bulb , rhizome and corm) such as dimension , shape and outer cover of the bulbs and corms especially in genus Iris and Gladiolus.Stems showed very important in isolation and diagnosis , however varied among them , some have normal stems (Gynandriris , Gladiolus and some Iris species) , others have flowering stems (scape) in genus Crocus and some of Iris species.Leaves showed large variation among taxa in shape , dimensions and having sheath , as well as some taxa having stem leaves (Gladiolus and some species of Iris) , others have basal leaves (Gynandriris , Crocus and some Iris species). The variation in bracts and bracteoles in type , dimension and shape were used to identify taxa especially for species belonging to the genus Iris , Gladiolus and Gynandriris .The inflorecences variation were used for isolation and diagnoses especially to Iris species , as well as the variation in floral parts for all taxa, also used for diagnosis such as color , shape and accessory parts showed very important value for taxonomic purpose specially in Iris . Also fruits variations such as dimension , shape and having beak or not showed a great value in identification to Iris sp. , but seed variation have a good taxonomic value which used to identify taxa. The study of Light microscope ( L.M.) and Scanninig electron microscope (S.E.M.) to pollen grains specially in type was shown grate value of taxonomic mattresses , inaperturate pollen grains in some Iris species and monosulcate in taxa of Gladiolus , Gynandriris , Crocus and some species of Iris , as well as the differences in pollen shape , dimensions , sculpturing and germination apertures . The anatomical study for the vertical section of leaves and cross section of stems showed many differentiations of the shapes and tissues among taxa. All taxa shown Anomocytic type of stomatal complex.Molecular study results using Random amplified polymorphic DNA( RAPDPCR) technique appeared great importance among taxa . It was revealed the genetic relationships among 12 taxa belong to genus Iris and Gladiolus , separation of these taxa depending on the presence or absence of bands , and the number of these bands in the gel after electrophoreses , so this is evidence of a genetic diversity or polymorphism among the taxa , as well as obtaining a number of unique bands that give genetic DNA fingerprint for the definition of each taxon . The taxa of the family Iridaceae distributed to their growth sites after collection from the Iraqi distracts , as well as the environmental study to the sites of the plant growth , also the taxa will be distributed on the maps to their geographical distracts , so recorded many of new spreading areas . As a result of this study two species Iris madonna Dykes. and Gladiolus anatolicus Boiss. were identified as new record for Iraq and added to flora of Iraq.

الجوانب المناعية والفسلجية خلال صيام رمضان == IMMUNOLOGICAL and PHYSIOLOGICAL ASPECTS DURING RAMADAN FASTING

اسم المؤلف: احمد فرحان شلال
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | كاظم عبد الامير محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: الحيوان - المناعة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف الدراسة الحالية لتقييم تاثير صيام شهر رمضان على بعض المعاير المناعية والفسلجية,اذ شملت الفحوصات المناعية قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية Immunoglobulin G , Immunoglobulin A Immunoglobulin M, (IgM,IgG,IgA) والحركيات الخلويةTumor Necrosis factor - alpha (TNF - α), Interferon - Gamma(IFN - γ) , Interleukin - 4(IL - 4), Interleukin - 17A (IL - 17A), Transforming growth factor - β (TGF - β) في مصل الدم. اما الفحوصات الفسلجية فقد شملت قياس مستوى بعض الهرمونات الجنسية Luteinizing hormone ,Follicle - stimulating hormone(FSH) (LH) , Testosteroneوانزيمات الكبد ,Aspartate Transaminase (AST) Alanine(ALT) ,Transaminase , Alkaline phosphatase (ALP) بالاضافة الى تاثير الصيام على ضغط الدم ووزن الجسم Body weight and Blood pressure.اجريت الاختبارات على اربعين شخصا حيث كان جميعهم ذكور, غيرمتزوجين,غير مدخنين,اصحاء ظاهريا واعمارهم مابين ((30 - 20 سنة.استخدم فحص Single Radial Immuno Diffusion (SRID)) ) لقياس مستويات الكلوبيولينات المناعية قبل الصيام كمجموعة ضابطة وبعد (14) و(28) يوم من الصيام . استخدمت تقنية (ELISA) لقياس مستوى الحركيات الخلوية قبل وخلال الصيام فيما تم قياس تراكيز الهرمونات باستخدام جهاز (TOSOH) بالاضافة الى قياس فعالية الانزيمات وضغط الدم ووزن الجسم . اظهرت نتائج الدراسة بان هناك انخفاضا معنويا في مستوى IgA)) عند مستوى احتمالية(P<0.05) حيث كان متوسط مستوياته قبل الصيام ( (189.693mg/dlوانخفض الى (107.260mg/dl) ثم الى (67.668mg/dl) خلال (14 ) و(28) يوم من الصيام على التوالي. لوحظ انخفاضا غير معنوي في تركيز (IgG). حيث كانت نتائج (14) و(28) يوما (1792. 15 mg/dl) ، (1501.08mg/dl) على التوالي مقارنة مع القيمة قبل الصيام (1878.63mg/dl). واظهرت الدراسة انه ليس للصيام تاثيرا على تركيز (IgM) حيث كانت قيمة متوسطة خلال (14) يوم 258.150mg/dl)) وفي (28) يوم من الصيام كانت (263.425mg/dl) بالمقارنة مع القيمة قبل الصيام (255.705mg/dl). بينت نتائج الدراسة بان الصيام يؤدي الى تغيير في المؤشرات الالتهابية(TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β) , ففي الوقت الذي كان متوسط تركيز (TNF - α) قبل الصيام (12.288pg/dl)انخفض معنويا(P<0.05) للفترة (14) و(28) يوم من الصيام الى (9.978pg/dl) ، (7.698pg/dl) على التوالي . بينت الدراسة كذلك حدوث انخفاضا معنويا(P<0.05) في تركيز (IFN - γ) بعد (14) يوم (38.880pg/dl) وبعد (28) يوم الى (28.668pg/dl) بعد ان كان قبل الصيام (48.223pg/dl). واوضحت الدراسة بان الصيام كان له تاثير في حصول زيادة معنوية(P<0.05) في تركيز (IL - 4) حيث كانت قيمة متوسطة الفترة (14) يوم من الصيام (18.808 pg/dl) اما بعد (28) فكانت ( 24.100 pg/dl) مقارنة بالقيمة قبل الصيام التي كانت (13.323 pg/dl) . ومن نتائج الدراسة ايضا العلاقة بين الصيام والانخفاض في تركيز ( IL - 17A ) ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا حيث كانت متوسط تركيزة قبل الصيام (37.52 pg/dl) فيما كانت قيم متوسطات للفترة (14) و(28) يوم من الصيام (31.69 pg/dl ) ، (28.99 pg/dl ) على التوالي . فيما اظهرت النتائج حدوث زيادة معنوية(P<0.05) في تركيز (TGF - β ) حيث بلغت قيم المتوسطات للفترة (14) و(28) يوما من الصيام (pg/dl 54.70 ) ، (pg/dl 62.15) على التوالي مقارنة مع القيمة قبل الصيام حيث كانت (48.80 pg/dl). اما بشان الهرمونات الجنسية فقد بينت النتائج حدوث زيادة غير معنوية في تركيز (FSH) حيث كانت قبل الصيام (mIU/mL 9.810) وبعد (14) ، (28) يوما من الصيام (mIU/mL 10.715) ، (mIU/mL 12.028) على التوالي . فيما اظهرت انخفاضا في تركيز (LH) ولكن لم يكن معنويا, ففي الوقت الذي كان متوسط مستواه قبل الصيام (mIU/mL 6.628) انخفضت في الايام (14)، (28) الى (mIU/mL 5.988) ، (mIU/mL 5.393) على التوالي . كما اظهرت حدوث انخفاضا غير معنوي في تركيز(Testosterone) ، اذ كانت قيمته قبل الصيام (ng/dl 430.85)اما وخلال الايام (14) و(28)فكانت (398.59 ng/dl) ، (ng/dl 381.30) على التوالي . كان للصيام تاثيرا في مستويات انزيمات الكبد فبالنسبة للانزيم (AST) كانت قيمة قبل الصيام (U/L 11.545) مقارنة مع قيم المتوسطات في الفترة (14) ، (28) حيث كانت القيم (10.020 U/L ) ، (U/L 8.963) على التوالي ، وعند مقارنة قيم المتوسطات فكانت معنوية(P<0.05) ما بين فترة قبل الصيام وخلال الصيام. كما امتد تاثير الصيام على انزيم (ALT) فقد انخفضت مستوياته كذلك ولم يكن معنويا اذ بلغت قيم المتوسطات قبل وخلال (14) و(28) حيث كانت القيم (U/L 12.448) ، (U/L 11.353) ، (10.798 U/L) على التوالي . وكذلك لوحظ انخفاضا طفيفا غير معنوي في نشاط انزيم (ALP) فكانت على التوالي وللفترات قبل الصيام بعد 14،28 يوما هي(U/L 52.86) (U/L 50.72) ، (U/L 48.18). واظهرت نتائج الدراسة حدوث انخفاضا معنويا(P<0.05) في ضغط الدم الشرياني الانقباضي والانبساطي Systolic and Diastolic pressure اذ كانت قيمة متوسط ضغط الدم الانقباضي خلال (14) و(28) (mmHg 11.550) ، (mmHg 10.800) على التوالي بعد ان كان قبل الصيام (mmHg 12.375). اما بالنسبة للضغط الانبساطي Diastolic Pressure كانت النتيجة حدوث انخفاضا معنويا (P<0.05)حيث كانت قيم المتوسطات للفترة قبل الصيام و(14) و(28) (8.150 mmHg) ، (mmHg 7.375) ،( mmHg 7.075) على التوالي. اظهرت الدراسة كذلك حصول انخفاضا غير معنويا في وزن الجسم حيث كانت قيم المتوسطات (S.E Kg± M 67.575) ، (Kg S.E ±65.808 M ) ، (64.300 M ±S.E Kg) للفترات (قبل الصيام وبعد 14 و28 يوما ) على التوالي. | The objective of the present study is to assess the effect of Ramadan fasting on some immunological and physiological parameters. Immunological studies included measurement of immunoglobulins (Igs) : Immunoglobulin A , Immunoglobulin G and Immunoglobulin M (IgA,IgG,IgM),cytokines : Tumor Necrosis factor - alpha , Interferon - gamma , Interleukin - 4 , Interleukin - 17A and Transforming growth factor - beta (TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β). Physiological studies involved serum levels of some sex hormones : Follicle - stimulating hormone, Luteinizing hormone and Testosterone (FSH, LH), Liver enzymes : Aspartate Transaminase, Alanine Transaminase and Alkaline phosphatase (AST, ALT, ALP) in addition to the body weight and arterial Blood pressure. These tests were done on sample of forty apparently healthy males who were single; non - smoker and their age range were 20 - 30 years. Single Radial Immuno Diffusion (SRID) was used to measure immunoglobulin levels before fasting (as a control group) and after (14, 28) days of fasting. Enzyme - linked Immune Sorbent Assay (ELISA) technique was used to measure cytokines levels before and during fasting while concentration of hormones were measured by using (TOSOH) system, in addition to measuring activity of enzymes, body weight and arterial blood pressure. The results showed that, there was a significant decrease (P<0.05) in the serum IgA level. The mean value of pre - fasting was 189.693 mg/dl and decreased to 107.2 mg/dl, and then to 67.6 mg/dl during 14, 28 days of fasting respectively. In addition a decrease in IgG level during fasting but statistically was not significant. The results for 14 and 28 days were 1792.1 mg/dl, 1501.0 mg/dl respectively in comparison to its value at the pre - fasting days of Ramadan which was 1878.6 mg/dl. The study showed that, IgM level was not affected by fasting. The mean value during the 14th day of fasting was 258.1 mg/dl and in the 28th day was 263.4 mg/dl in comparison to its value at the pre - fasting 255.7 mg/dl.The study demonstrated that fasting lead to change in inflammatory markers(TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β). Mean concentration of TNF - α for pre - fasting days was 12.288 pg/dl and decrease statistically (P<0.05) during period of the 14th and 28th days of fasting to 9.978 pg/dl, 7.698 pg/dl respectively. The study proved as well a significant decrease (P<0.05) in concentration of IFN - γ after 14 days of fasting to 38.880 pg/dl and after 28 days to 28.668 pg/dl after it was at the pre - fasting 48.223pg/dl. The study showed that fasting causes a significantly an increase (P<0.05) in concentration of IL - 4. The mean value of the 14th day was 18.808 pg/dl and after 28 days it was 24.100 pg/dl in comparison to its value at the pre - fasting days which was 13.323 pg/dl. From the results of this study also, the fasting caused decrease in concentration of IL - 17A, but the decreasing was not significant. The mean concentration of IL - 17A for pre - fasting days was 37.52 pg/dl and mean values of the 14 and 28 days of fasting were 31.69 pg/dl, 28.99 pg/dl, respectively. The results showed that fasting caused a significant increase (P<0.05) in concentration of TGF - β. The means values for 14 and 28 days of fasting were 54.70 pg/dl and 62.15 pg/dl respectively in comparison to its value at the pre - fasting days of Ramadan which was 48.80 g/dl. A non - significant increase in the serum level of FSH also recorded. The mean value of pre - fasting was 9.810 mIU/mL, and after 14, 28 days of fasting were 10.715 mIU/mL and 12.028 mIU/mL respectively. The study showed a decrease in LH concentration but it does not reach to be significant. Mean level of pre - fasting days was 6.628 mIU/mL and decreased in 14 and 28 days of fasting to 5.988mIU/mL and 5.393mIU/mL respectively. The study showed as well a decrease in concentration of Testosterone even it was not significant. Its value of pre - fasting day was 430.85 ng/dl and during the 14th and 28th days were 398.59ng/dl and 381.30ng/dl respectively. Fasting also affects the levels of liver enzymes. The mean value of AST for pre - fasting days was 11.545U/L compared with the means values after 14 and 28 days of fasting which were 10.020 U/L and 8.963U/L, respectively. These values were significantly (P<0.05) differ between pre - fasting and the two fasting periods. ALT enzyme also underwent some changes under the effect of fasting. ALT decreased in its levels but not significantly.The means values of pre - fasting, (14), (28) days of fasting were 12.448U/L, 11.353U/L and 10.798 U/L, respectively. Also a slight decreasing in enzyme activity of (ALP) had been noticed. The mean values of (ALP) for the pre - fasting, 14th, 28th days of fasting were 52.86U/L, 50.72U/L and 48.18 U/L, respectively. The study showed a significant decrease (P<0.05) in systolic and diastolic pressure. The means value of systolic pressure after 14 and 28 days of fasting were 11.550 mmHg and 10.800 mmHg respectively after it was at the pre - fasting 12.375 mmHg. The means values of diastolic blood pressure for the pre - fasting, 14 and 28 days of fasting were 8.150 mmHg, 7.375mmHg and 7.075 mmHg respectively. The study showed as well a decrease in body weight but non - significant. The means values of body weights were 67.575 M ±S.E /Kg, 65.808 M ±S.E /Kg and 64.300M ±S.E /Kg for periods (pre - fasting, 14 and 28 days), respectively

دراسة وبائية بكتريا المكورات المعوية ENTEROCOCCI المقاومة للعديد من المضادات الميكروبية والمسببة للاصابات في بيئة المستشفيات == Epidemiological study of Multi - Antimicrobial resistant Enterococci that causes Nonsocomial Infections

اسم المؤلف: محمد حسن يونس محمد
اسم المشرف: مروان صالح محمد | خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: في هذه الدراسة جمعت ( 637 ) عينة من مصادر مختلفة ( سريريه , سطوح بيئية , اجهزة طبية , مياه ) للفترة من تموز 2005 الى كانون الثاني 2006 وقد تم اخذ العينات من وحدة الديلزة في مستشفى بغداد ومن وحدة الناظور في مستشفى اليرموك ومن ردهة الاطفال في مستشفى ابن البلدي .استخدم نوعين من الاوساط الزرعية للعزل الاولي لبكتريا المكورات المعوية المقاومة للعديد من المضادات الحياتية وهما Bile aesculin azide agar وVancomycin resistant - enterococci agar .اعتمادا على الصفات المورفولوجية , المجهرية ,والفحص المصلي ( فحص التلازن بالشريحة ) , وفحص الكاتاليز , تم الحصول على 18 عزلة تمثل بكتريا المكورات المعوية المقاومة للعديد من المضادات الحياتية. واعتمادا على التشخيص بنظام ( Api - 20 Strept. Strip ) , اظهرت النتائج ان 13 عزلة من مجموع 18 عزلة ( 72% ) تعود الى النوع E.faecium و5 عزلات من مجموع 18 عزلة ( %28 ) تعود الى النوع E.feacalis .فحص الحساسية بطريقة الانتشار من الاقراص تجاه 10 انواع من المضادات الحياتية ( بنسيلين ج , الجنتامايسين , السايبروفلوكساسين , الكلورامفينيكول , تتراسايكلين , النايتروفيورانتون , الباستراسين ,اميبيم , اميكاسين ,حامض نالدكسك ) اظهرت العزلات مقاومة عالية ( 100% ) لخمسة من المضادات الحياتية (اميكاسين , نالدسك اسد, تتراسايكلين , الباستراسين , الجنتامايسين ) وبالتالي فهي مكورات معوية مقاومة للعديد من المضادات الحياتية .فحص الحساسية بطريقة المرق لتحديد التركيز المثبط الادنى تجاه 9 انواع من المضادات الحياتية ( الجنتامايسين , السايبروفلوكساسين , الكلورامفينيكول , النايتروفيورانتون , فانكومايسين , سيفالوثين , سيفتازديم , سيفيبيم , بنسيلين ج ) , اظهرت النتائج مقاومة عالية ( 100% ) لكل من سيفالوثين وبنسيلين ج ( ug/ml 32 < = MIC50 ) و(16 ug/ml < = MIC50 ) على التوالي . بينما اظهرت حساسية عالية لكل من النايتروفيورانتون والفانكومايسين ( ug/ml 128 < = MIC50 ) و(16 ug/ml < = MIC50 ) على التوالي .تم استخلاص البلازميدات بطريقة التحلل القاعدي المحورة لستة عزلات من مصادر مختلفة ومن نفس الردهة وبعد الكشف عنها بوساطة الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروزاظهرت النتائج تشابه الحزم في الموقع والحجم ولكل العزلات .تم تحديد نقاوة الدنا البلازميدي بوساطة المطياف الضوئي حيث كان تركيزا لدنا لحاصل القسمة عند الطول الموجي 260 و280 هو ( 1.95 ) مما يدل على نقاوة الاستخلاص للدنا البلازميدي.دراسة امكانية استعمال ناتج عملية التضاعف لجين (vanA ) و( van B ) المشفرة لجين مقاومة الفانكومايسين وجين ( ddI ) المشفر لجين D - alanine - D - alanine ligase المشخص للنوع E.faecium بوساطة فحص تفاعل بوليميرازالسلسلي للدنا وبعد الترحيل لناتج التضاعف لثلاث جينات لوحظ ظهور حزمة مع الجين ddI عن الجين الخاص بتشخيص النوع E.faecium فقط | This work was done on 704 samples that were collected from many sources included patients, medical instruments, ecological surfaces and water samples from three hospitals in Baghdad .For primary isolation of Multi - Drug Resistant Enterococci , two media were used ( Bile aesculin azide agar,Vancomycin - resistant enterococci ).The isolates were exposed to microscopical, morphological, biochemical test ( especially PYR test,catalase test ), serological test ( slidex Strepto - D - Kit) which proved 18 samples as Multi - Drug Resistant Enterococci .Diagnosis by ( Api - 20 Strept.strip ) we determined 13 isolates from 18 isolates ( 72% ) are belonged to E.faecium,and 5 isolates from 18 isolates ( 28%) are belonged to E.Feacalis .the antibiotic susceptibility test by using disk diffusion method as well as the determination of minimal inhibitory concentration of several antibiotics carried upon these samples . the results showed that all samples were resistant to five antibiotics . the minimum inhibitory concentration ( MIC50) of cephalosporin, penicillin G , ciprofloxacin,cefepim, and ceftazidime was > 64 µg / ml.nitrofurantoin and vancomycin had MIC50 of 128 and 16 µg / ml respectively.Pure plasmid DNA was extracted from vancomycin resistant enterococci by the evidence of UV - spectrophotometer study .Agarose gel electrophoresis of plasmid isolated from vancomycin resistant related to different sources showed slight differences in the bands mobilization and gave negative results by Pulsed Field Gel Electrophoresis ( PFGE). Determined the genes of vancomycin resistant (vanA and vanB) in isolates by PCR , the results showed that all isolates gave negative results. The best culture medium used for isolate Multi - drug resistant enterococci is Bile aesculin azide agar . in clinical samples all isolates are E.faecium ,in environmental samples all isolates are E.Feacalis .High resistant to Cephalosporines and low resistant to nitrofurantoin .vanA and vanB genes were not detected in isolates by PCR. In this study were collected ( 637) samples from different sources ( clinical , ecological surfaces , medical instruments , water ) from July in 2005 to January in 2006 . samples taken from ( Dialysis unit in Baghdad hospital , Proctoscopy unit in ALyarmok hospital , Pediatric ward in Ibn - albaldi hospital).Used two types of culture media for primary isolation of Multi - drug resistant enterococci ( Bile aesculin azide agar , Vancomycin resistant enterococci agar).dependent on morphological , microscopical, serological test ( slide Strepto - D - Kit) and (PYR) test and catalase test , we obtained 18 isolates as Multi - drug resistant enterococci. dependent on diagnosis by ( API - 20 Strept.Strip ) . the results showed that 13 isolates from 18 isolates ( 72% ) are belonged to E.faecium, and 5 isolates from 18 isolates ( 28%) are belonged to E.fecalis .The susceptibility test by using disk diffusion method against 10 types of antibiotics(Penicilin G, Gentamicin , Chloramphenicol , Nitrofurantoin , Tetracyclin , Bacitracin , Amikacin , Imepem , Nalidix acid and Ciprofloxacin) .The isolate showed highly resistant (100%) to 5 antibiotics ( Gentamicin , Tetracyclin , , Bacitracin , Amikacin, Nalidix acid) and then the isolates are resistant to Multi - antibiotics.The susceptibility test by using broth dilution method to determine MIC against 9 types of antibiotics (Gentamicin , Penicilin G, Ciprofloxacin, Nitrofurantoin, Chloramphenicol,Cephalothin,Ceftazidime , Cefepime ,Vancomycin),The isolate showed highly resistant (100%) to Cephalothin and Penicillin G ( MIC50 = >32 ug/ml )and ( MIC50 = >16 ug/ml) sequencely The isolate showed low resistant to Nitrofurantoin and Vancomycin ( MIC50 = > 128 ug/ml) and (MIC50 = > 16 ug/ml)sequencely. Plasmid extraction by modified Alkaline analysis method for 6 isolates from different sources in same ward and after detected by agarose gel electrophoresis, the results showed the same plasmid bands in size and place for all isolates. We determined the purity of plasmid DNA by UV - Spectrophotometer which concentration of DNA for divided obtained at wave length 260 and 280 nm was ( 1.95) which indicate the purity of extraction of DNA. Study of using the product of amplication of( vanA) and (vanB) gene coded for vancomycin resistant gene and( ddI) gene coded for D - alanine - D - alanine ligase gene specific for E.faecium by Polymerase Chain Reaction for DNA and after detected the product of amplification of 3 genes, the results showed that isolates gave positive result for just (ddI) gene and negative for( vanA) and( vanB) gene.

دور بروتين A المستخلص من جدران خلايا Staphylococcus aureus في امراضية البكتريا == Role of Staphylococcus aureus cell wall protein A in the pathogenesis of the bacteria

اسم المؤلف: سمير عبد الامير عبد علي علـش
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | علي عبد الرحمن طه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ا عتمد في اجراء هذه الدراسة على 20 عزلة مرضية من بكتريا Staphylococcus aureus ا خذت من مختبر الصحة المركزي مشخصة باستعمال نظام ابي للعنقوديات (API - Staph . Ident . System) . ا عيد تشخيص جميع العزلات عن طريق استخدام الاختبارات الكيموحيويه من اجل التثبت بشكل دقيق من هويتها ، وقد جاءت العزلات جميعها متوافقة مع تشخيص مختبر الصحة المركزي . ا ستخدم اختبار التلازن الدموي ( (Haemagglutination test في التحري عن وجود بروتين A في عزلات S . aureus المشخصة جميعا ، وقد اظهر هذا الاختبار تباينا ملحوظا في نسبة امتلاك هذه العزلات لبروتين A . فقد برزت العزلات ذوات الارقام 1 ، و5 ، و6 ، و7 ، و9 بوصفها عزلات ذات محتوى عال من بروتين A . اما العزلات ذوات الارقام 8 ، و10 ، و11، و12، و13، و14 ، و15، و17، و18، و19 ، و20 ظهرت انها ذات محتوى متوسط من بروتين A . فقط العزلة ذات الرقم 16 ظهرت انها فقيرة المحتوى من بروتين A . بينما كشف ووفق الاختبار المستعمل عدم امتلاك العزلات 2، و3 ، و4 اي محتوى من بروتين A . ا نتخبت العزلة رقم ( 1 ) كعزلة مثالية من اجل انجاز هذه الدراسة لكونها تميزت بمحتوى عال من بروتين A فضلا عن انها تقدمت على بقية العزلات في اعطاء النتيجة الموجبة لاختبار انتاج انزيم Coagulase ، وكذلك في اظهار تحللا كاملا وشديدا في اختبار انتاج حالة الدم Hemolysin . ا ستخلص بروتين A الخام (Crude protein A) على مرحلتين . كانت المرحلة الاولى باتباع طريقة (Lind , (1974 ( طريقة التعليق بالصوديوم ازايد ) بوصفها طريقة سهلة وغير مكلفة في الحصول على مستخلص بروتين A المرتبط بجدار الخلية العنقودية للعزلة رقم ( 1 ) (Cell - bound protein A) بشكل كامل مع الحفاظ وبدرجة عالية على وحدة التركيب البنائي لبروتين A من اية تشوهات . اما المرحلة الثانية كانت باتباع طريقة ( Seki et al .,( 1985 طريقة مكملة للطريقة الاولى وذلك بترسيب بروتين A الطافي بكبريتات الامونيوم ( 85 % اشباع ) مع بقاء بروتين A المترسب محتفظا بفعاليته . ا دخل مستخلص بروتين A الخام عملية التنقية ( Purification) وهي كذلك كانت على مرحلتين . المرحله الاولى استخدمت فيها طريقة كروماتوغرافيا التبادل الايوني (Ion - exchange chromatography) بعمود ( DEAE - Cellulose ). اما المرحلة الاخرى فقد تضمنت استخدام طريقة كروماتوغرافيا الترشيح بالهلام (Gel - filtration chromatography) بعمود Sepharose CL - 6B) ) . انتهى استخدام الطريقتين في الحصول على مستخلص بروتين A منقى ( Purified protein A ) .ومن اجل التحري عن احتفاظ مستخلص بروتين A الخام والمنقى بفعاليته استخدم اختبار الانتشار المناعي الثنائي في الهلام الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون الخطوط الترسيبية التي نتجت من تفاعل مستخلص بروتين A الخام والمنقى مع IgG لمصل دم خنزير غينيا .قدر تركيز مستخلصات بروتين A ( الخام والمنقى جزئيا والمنقى ) باتباع طريقةBradford, ( 1976 ) . حيث بلغت التراكيز 63 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A الخام ، و42 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى جزئيا ، و36 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى .تم استخدام الفئران البيض من نوع ( Balb C ) من اجل الوصول الى التاثيرات المرضية لمستخلص بروتين A المنقى . حيث حقن المستخلص بطريقة الحقن داخل البريتون Intraperitonial injection)) بعدد سبع حقنات ، وبمعدل 0.1 مليلتر لكل حقنة ( ذو التركيز 36 مايكروغرام / مليلتر ) ، يفصل بين حقنة واخرى يوم واحد . اظهرت مجموعة فئران البحث المحقونة ببروتين A المنقى على المستوى السريري خمولا عاما بدا واضحا بعد الحقنة السادسة . لم تظهر اية تغيرات مظهرية جلدية في مناطق الحقن كما لم تحدث وفيات . بعد قتل الفئران وتشريحها جميعا ا ستاصلت اعضاء القلب ، والطحال ، والكبد ، والكليتين ، والامعاء ، والمعدة ، واخيرا الرئة . وبالموازنة مع اعضاء فئران السيطرة لوحظ حدوث تضخم كبير في الطحال . كما اظهر الكبد تضخما ملحوظا وهذا سجل في الفئران المحقونة ببروتين A المنقى . لم يسجل حدوث تغيرات على المستوى المظهري في اعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة ولكن لوحظ وجود بقع سوداء اللون على السطح الخارجي لنسيج الكبد ، والكليتين ، وهو ايضا سجل في فئران الدراسة اجمع .اهم ما برز في هذه الدراسة هو حجم التاثير المرضي الذي اصاب عضو الرئة حيث ظهر بشكل غريب فقد بدا النسيج يميل الى السواد ببهوت وهو ما كان واضحا في سبعة من فئران الحقن ، اما الثلاثة الباقية شوهدت الرئة فيها خلال التشريح وهي مغطاة بعض من اجزائها بالدم .كشف الفحص النسيجي لاعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة عدم وجود اية تاثيرات مرضية ناتجة من حقن بروتين A المنقى . اما الطحال فقد شهد حدوث توسع كبير في منطقة اللب الابيض White Pulp)) مع احتقان دموي بارز وانتشار للخلايا المولدة للصفيحات الدموية (Megacaryocytes) . اما الكبد فقد برز فيه حدوث تلف بسيط (Mild degenerative change) في خلايا الكبد مع ارتشاح خلايا احادية النواة (Monocytes) خصوصا في المنطقة البوابية التي بدت متوسعة نوعا ما . كما لوحظ زيادة في خلايا كبفر ((Kupffer cells في عموم نسيج الكبد . الكليتين شهدت بروز زيادة في الخلايا المكونة للكبيبة الكلوية ( Glomeruli) والتي يطلق عليها ( Mesengial cells ) .عضو الرئة تضمن الفحص النسيجي له تاثيرات عدة وهي كما يلي : 1 - احتقانات دموية كبيرة ( Bloody congestions ) .2 - وذمة ( Oedema ) .3 - ارتشاح خلايا التهابية ( Inflammatory cells infiltration) .4 - توسع في الفسح القصبية ( Alveolar spaces) مكونا ما يسمى بظاهرة Emphysema)) اي انتفاخ حويصلات الرئة . بدت الرئة للفئران المحقونة جميعا ببروتين A المنقى اكثر الاعضاء التي اظهرت تضررا نسيجيا كبيرا موازنة بالضرر في بقية الاعضاء .تم اجراء اختبار التحري عن السمية الخلوية لبروتين A المنقى باستخدام تقنية مزرعة الخطوط الخلوية الطبيعية ( Normal cell lines - culture ) حيث اعطى الاختبار نتيجة سالبة اي عدم امتلاك بروتين A المنقى تاثيرا سميا (Toxic effect) في الخلايا النامية . | This study dealt with ( 20 ) diagnosed isolates of Staphylococcus aureus by "API - Staph . Ident . System". which were taken from the central health laboratory . The diagnosis was repeated so as to confirm the identity of those isolates by using biochemical tests whose results were the same as those of the central health laboratory .The haemagglutination test was used to investigate the presence of protein ( A ) in all S . aureus isolates . The results markedly showed differences in content concerning the ratio of this protein , thus isolates numbered 1 , 5 , 6 , 7 and 9 gave high content of protein ( A ) , but the isolates numbered 8 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 17 , 18 , 19 and 20 gave medium content of protein ( A ) . Isolate numbered 16 was the only isolate that has low content of protein ( A ) . On the other hand , isolates numbered 2 , 3 and 4 gave no content of protein ( A) .The isolate number ( 1 )has been chosen as an optimal isolate to accomplish this study , Because of its high content of protein ( A ) , furthermore it was the best isolate in getting positive result concerning the test of coagulase production , and in giving a complete and intensive result concerning the test of hemolysin production . Crude protein ( A ) was extracted by two steps : Lind method ( Lind , 1974 . ) "Suspending in sodium azide" was followed at the first step as an easy and a cheap method in getting a thorough cell - bound protein ( A ) extracted from the isolate number ( 1 ) with high preservation of the structural unit without any deformation .The Seki et al .,( 1985 ) method was followed in the second step as a completion method to the first one , by the precipitate of the supernatant protein ( A ) using ammonium sulfate ( 85 % saturation ) . The function of precipitated protein ( A ) was perfect . In order to get a purified protein ( A ) extract from crude protein A , purification was accomplished by two steps : Ion - exchange chromatography by DEAE - cellulose column was used in the first step , While Gel - filtration chromatography by Sepharose CL - 6B column was used in the second step . Double immunodiffusion in gel was used to investigate the preservation of the crude and purified protein ( A ) with its full function . This test gave a positive result by forming the precipitate lines as a result of the interaction between protein ( A ) ( Crude and Purified ) and IgG of guinea pig sera .Bradford method was used to estimate protein ( A ) extracts concentration ( Crude , Partial purified , Purified ) . The estimation was 63 microgram / ml for crude extract , 42 microgram / ml for partial purified extract and 36 microgram / ml for purified extract .white mice ( Balb C ) were used to investigate the pathogenic effects of purified protein ( A ) . Intraperitonial injection method was used to inject 0.1 ml of 36 microgram / ml of purified protein ( A ) for 7 times with a one - day separating period . The injected mice with purified protein ( A ) showed general weakness which was very clear after the sixth injection . there were no phenotypic dermal change in the injection area , and no dead mice as well .After killing and dissecting of all the mice , the organs of heart , spleen , liver , kidney , intestine , stomach and lung were eradicated . There were a great enlargement in spleen and a little in liver in all injected mice in comparison with the control mice . No phenotypic changes appeared in heart , intestine and stomach , but black spots were shown on the outer surface of kidney and liver tissue which were presented in all the injected mice . The most important results in this study is the great size of pathogenic effects in lung . The shape of its tissue seemed strange and tended to be faint black with which was obvious in seven mice . The lung of the three others ( some parts ) showed during anatomy covered by blood .The histological check for heart , intestine and stomach showed no pathogenic effects resulted from protein ( A ) injection . In the spleen , there was a huge expanding in the white pulp region , with blood congestion while the spreading of megacaryocytes has increased . The liver showed mild degenerative change in liver cells with monocytes infiltration especially in the entrance region which appeared expanded . Also there was an increase in kupffer cells in all liver tissue .Kidney showed increase in mesengial cells which are concedered the forming units of glomeruli .The histological check of lung included the following : 1 - Bloody congestions .2 - Oedema .3 - Inflammatory cells infiltration .4 - Alveolar spaces expanding forming '' Emphysema '' .The lung was the most effected organ that showed tissue injury among other all organs . The normal cell lines - culture technique was followed to investigate cellular toxicity of the purified protein ( A ) which gave a negative result , that means , there was no toxic effect of purified protein ( A ) on the growth cells .

التاثيرات النسجية والكيمياء الحيوية في الاناث الحوامل المصابة بالشنج النفاسي : دور بروتين Leptin == Histological and Biochemical Effects of Pre eclampsia on the Placenta of Pregnant Women : Role of Protein Leptin

اسم المؤلف: خةبات انور علي خضر
اسم المشرف: قصي عبد القادر مصطفى الجلبي | حمد جنداري جمعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: الموصل
الكلمات الدلالية:
  • pre eclampsia
  • Leptin
  • Pregnant Women
  • Hypertenion
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة معرفة التغيرات النسجية والكيموحيوية عند فرط الضغط للنساء الحوامل ذات الشنج النفاسي. تم جمع 120 عينة مصل من النساء ذات الشنج النفاسي يصاحبها 120 عينة مصل من النساء الحوامل الطبيعيات اللاتي عدن كمجموعة سيطرة. ايضا اهتمت هذه الدراسة بمعرفة تركيز هرمون اللبتين Leptin في مراحل الحمل المختلفة، المشتملة في ثلاثة اشهر الاولى والثانية والثالثة وشملت 90 عينة مصل،30 عينة لكل مرحلة من مراحل الحمل و30 عينة عند الولادة. وتضمنت الدراسة ايضا تقديرا لبعض التغيرات الهرمونية والكيموحيوية مع الحصول على 30 سخد وحبل سرى لتوضيح التغيرات النسجية في الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الطبيعيات. اجريت هذه الدراسة في مستشفى الولادة بمحافظة اربيل. وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : 1 - بصورة عامة شوهدت في دراستنا الحالية زيادة معنوية بمستوى P<0.01 لتراكيز الهرمونات Pro, E2, LEP في الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الاصحاء مع التقدم في فترات الحمل. بينما لوحظ انخفاض معنوي P<0.01 لتراكيز الهرمونات عند الولادة.2 - سجلت قمة ارتفاع مستويات اللبتينLEP بمستوى P<0.01 في فترة الثلاثة اشهر الثانية P2 وتراجعت عند الولادة في النساء الحوامل الاصحاء لمجاميع السيطرة بينما تم تسجيل زيادة خطية في مستويات LEP مع التقدم في فترات الحمل للنساء الحوامل ذات الشنج النفاسي، وتراجعت عند الولادة.3 - وجود معامل ارتباط معنوي P<0.01 بين LEP وهرمونات التكاثر (Pro, E2) في الحوامل ذات الشنج النفاسي.4 - مستويات مصل الـ HDL تاثرت معنويا P<0.01 بالحمل والتي ترتبط سلبيا واحتوائيا مع مستويات LDL, VLDL وTG والكوليسترول، هذه المستويات عالية في مجاميع النساء ذات الشنج النفاسي مقارنة بمجاميع السيطرة بالاضافة الى تراجعها بعد الولادة.5 - وجود معامل ارتباط معنوي P<0.01 بين LEP والقياسات الدهنية في الحوامل ذات الشنج النفاسي. 6 - وجد ان التحليل الانحداري المتعدد لمصل هرمونات التكاثر ومحتويات القياسات الدهنية المتضمنة في دراستنا له علاقة معنوية قوية بمصل LEP.7 - بعض المحتويات الكيميائية الحياتية مثل اليوريا والبروتين والالبومين والكرياتين ازدادت معنويا P<0.01 في النساء الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الاصحاء. وهذه القياسات تقل مع التقدم في فترات الحمل ماعدا مستوى الكرياتين الذي يزداد مع التقدم في فترات الحمل ويقل عند الولادة.8 - معامل الارتباط ضعيف نسبيا P<0.01 بين LEP واليوريا والبروتين والبومين والكرياتين لدى الحوامل ذات الشنج النفاسي.9 - وجد ان معامل الارتباط قوي P<0.01 بين LEP والعمر في الحوامل ذات الشنج النفاسي.10 - الشنج النفاسي خلال الحمل يقلل معنويا P<0.01 من اوزان كل من المشيمة والحبل السري وحديثي الولادة.11 - معامل الارتباط موجب P<0.01 بين مستويات LEP الحبل السري مع اوزان المشيمة والحبل السري وحديثي الولادة.12 - التغيرات العينية المرضية النسجية في النساء ذات الشنج النفاسي : ا - اظهرت السخد التغيرات المشتملة على : * ضمور الزغابات المشيمية.* تليف مع تضييق للشرايين الامية للخلايا الخلوية الغادية المحيطة للزغابات.* نزف ونخر في الساقط.* تكلس مع ترسب لليفين في الساقط الامي.* تثخن نتيجة لتكاثر الالياف الكولاجينية في متن الزغابات الساقط الامي والشرايين الامية.* ارتشاح دهني في الزغابات.ب - الحبل السري اظهر تغيرات اشتملت على : * احتقان وتضيق في التجويف نتيجة لتثخن الجدار خاصة البطانة الداخلية (الغلالة الداخلية).* تواجد الخثرة في التجويف الشرياني فضلا عن وجود التنكس الليفين في البطانة.*وجود الفجوات الدهنية في جدار الشرياني للحبل السري. | This study was conducted the histological and biochemical changes in 120 samples of pre - eclamptic pregnant women, concomitant with 120 samples of normotensive pregnant women.Also, this study deals with estimation of leptin concentration in different periods of pregnancy, which include 120 serum samples for each state and 30 samples for different periods.Histological study conducted by obtaining 30 placenta and umbilical cord for evaluating the vascular tissues injury in PE pregnancy compare with 30 normal control, which admitted to Maternity Hospital in Erbil governorate.The following results were investigates : 1 - Generally longitudinal data significantly increased at P<0.01 means of hormones LEP, E2 and Pro in pre - eclamptic pregnant women were more than that in healthy pregnancy with advancing gestational periods. While they significantly decreased at P<0.01 means of hormones with delivery.2 - A significant increase at P<0.01 of LEP levels was recorded in 2nd trimesters (P2) and declined with delivery in healthy control, while a linear increased of LEP levels was recorded in PE Pregnancy with advancing gestational periods, where it is declined with delivery. 3 - There were significant P<0.01 correlation coefficients between LEP and productive hormones (E2 and Pro) in PE pregnancy.4 - Serum lipid profile of pre - eclamptic women revealed a significant increase at P<0.01, which was HDL levels consistently and negatively correlated with VLDL, LDL, TG and cholesterol levels; these levels were higher in group of women who had PE as compared with normal control, as well as, being declined after delivery.5 - There were positive correlation coefficients between LEP and lipid profile in PE pregnancy at P<0.01. 6 - The multiple regression analysis demonstrated that the serum reproductive hormones and lipid profile contents in our study were strongly significant depending on serum LEP.7 - Some biochemical contents of urea, protein, albumin and creatinine were raised significantly at P<0.01 in hypertensive pregnant women when compared with the normotensive pregnant women, and these parameters well be decreased with advanced gestation periods except creatinine levels which were increased and fallen down with delivery.8 - There were correlation coefficients between LEP and the biochemical contents of urea, protein, albumen and creatinine in PE pregnancy.9 - In correlation coefficient, results indicated that there were strong relationship between LEP and age in pregnancy at P<0.01. 10 - During pregnancy, PE significantly decreased P<0.01 the mean weights of placentae, umbilical cord and babies were delivered at term.11 - There were positive P<0.01 correlation coefficients between LEP cord blood levels and weights of placentae, umbilical cord and the babies delivered.12 - The cross histopathological changes includes : a - PE placentae revealed the following changes : • Atrophy villi. • Fibrosis with stenosis of maternal arteries.• Discontinuation of syncytial border of villi.• Haemorrhage and necrosis in the deciduas.• Calcification with fibrinoid deposits were present in maternal deciduas. • Thickening due to proliferation of collagen fibers surrounded the villous stroma, maternal deciduas and maternal arteries.• Fatty infiltration in placental villi. b - Umbilical cords revealed the following : • Congestion and stenosis of the lumen due to thickening of their walls which was observed mainly in tunica media. This finding is in association with PE pregnancy. • Thrombus in the lumen of arteries and areas of fibrinoid necrosis was observed in the tunica intima of the artery and vein in PE pregnancies. • Lipid vacuoles were observed in the walls of umbilical cord arteries in PE pregnancies.

دراسة نسيجية وكيموحيوية لبعض الديدان الشريطية في مضائف فقرية مختلفة == Histological and Biochemical Studies for some Cestode Tapworm in different Hosts

اسم المؤلف: منى طاهر محمد النفطجي
اسم المشرف: حسين اسماعيل ارتين الخان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: العربية
مكان الجامعة: الموصل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية البحث عن الديدان الشريطية البالغة في اربعة انواع من المضائف الفقرية بعد تشريحها باعداد بلغت ( 235 ) سمكة من عائلة الشبوطيات Cyprinidae ومن نوع الحمري Barbus luteus و( 15 ) افعى من عائلة Hydrophiidia ونوع Microcephalophis gracilis و( 25 ) من طائر النورس من عائلة Loridae ونوع Laurus canus وكان عدد الاغنام ( 95 ) من عائلة Ruminant ونوع Ovis ovis .تم الكشف عن الجهاز العصبي لاربعة انواع من الديدان الشريطية باستخدام الطريقة الانزيمية وبتقنية ( AchI ) اذ بينت النتائج ان هناك اختلافا في الاجهزة العصبية المركزية Central nervous system (CNS) والاجهزة العصبية المحيطية Peripheral nervous system وفيما يلي وصف لجهاز العصبي لكل نوع من هذه الديدان : Bothriocephalus sp. : يتكون الجهاز العصبي المركزي من زوجين من العقد الدماغية احداهما كبيرة تقع في منطقة التعقر الممصي ترتبط مع بعضها بحلقة دماغية Cerebral ring والاخرى صغيرة تقع في مقدمة الرؤيس وعند القرص القمي وترتبط مع بعضها بحلقة قمية Apical ring ، وترتبط كل من الحلقتين الدماغية والقمية برابط عصبي حلقي Ring nerve commissure وتنشا من العقد الدماغية الكبيرة والعقد الصغيرة عدد من الاعصاب لتزود التقعر الممصي ومقدمة الرؤيس . اما الجهاز العصبي المحيطي فيتكون من جذع عصبي رئيس ينشا من العقد الدماغية الكبيرة ثم يتفرع الى زوج من الجذوع الجانبية السميكة في كل جانب من جسم الدودة ، كما وينشا من العقد الدماغية القمية خمسة ازواج من الحبال العصبية الجانبية Lateral nerve cords تقع الى الخارج من الجذوع العصبية السميكة وعشرون عصبا وسطيا ينشا من العقد الدماغية الكبيرة . ترتبط الجذوع الجانبية السميكة والحبال العصبية الجانبية والاعصاب الوسطية بعدد من الروابط المستعرضة . كما تميزت هذه الدودة بظهور شبكة عصبية في كل قطعة وامتدادها الى الحافات الخارجية لجسم الدودة .Ophiotaenia europaea : من زوج من العقد الدماغية Cerebral ganglia تقع في منطقة المحاجم والتي ترتبط مع زوج اخر من العقد القمية اصغر منها تقع في منطقة العضو القمي ، وترتبط العقد القمية مع العقد الدماغية بوساطة رابط حلقي . وينشا من كل عقدة عدد من الاعصاب الصغيرة والنحيفة لتعصيب حافة الرؤيس والمحاجم والعضو القمي .ينشا من العقد العصبية الدماغية زوجين من الجذوع العصبية الجانبية السميكة ، كما وينشا من العقد القمية اربعة ازواج من الحبال العصبية الجانبية وقد لوحظ عدد من الروابط العصبية تتراوح ما بين ( 6 - 8 ) في كل قطعة جسمية كما لوحظ وجود رابط عصبي سميك يفصل كل قطعة جسمية عن الاخرى .انفردت الدودة الحالية بتوزيع العقد العصبية الجانبية الخلفية على الجذوع العصبية الجانبية والحبال والاعصاب الوسطية .Raillietina echinobothrida : يتكون الجهاز العصبي من عقدتين دماغيتين كبيرتين Cerebral ganglia ترتبطان برابط عصبي دائري وتنشا منهما ( 4 - 6 ) من الاعصاب الامامية الصغيرة لتزود المحاجم وعضلات الخطم وينشا من هذه العقد زوجين من الجذوع العصبية الجانبية السميكة جدا Thick lateral nerve trunck وكذلك اربعة ازواج من الحبال العصبية الوسطية Medial nerve cords . ترتبط الجذوع العصبية السميكة والحبال العصبية الوسطية بعدد من الروابط المستعرضة تتراوح بين ( 6 - 8 ) من الروابط العصبية السلمية وقد شوهد رابط عصبي مستعرض سميك يفصل القطع الجسمية بعضها عن البعض الاخر . كما شوهد اضمحلال العصب في منطقة القطع الحبلى .Moniezia expansa : يتكون ال جهاز العصبي المركزي من زوج من العقد الدماغية كثيرة الاجزاء تدعى بمعقد الدماغ ترتبط مع بعضها بحلقة دماغية Cerebral ring يخرج منها عددا من الاعصاب الامامية النحيفة لتزود المحاجم والخطم والحافات الخارجية للرؤيس مكونة شبكة عصبية للرؤيس . كما يخرج من هذه العقد العصبية زوج من الجذوع الجانبية السميكة وزوجين من الحبال العصبية والتي تتميز بسمك اقل من الجذوع الجانبية وقد شوهد ان الحبال العصبية الوسطية تمتد لعدة قطع جسمية ثم تضمحل عند بدء القطع غير الناضجة لتصبح بشكل اعصاب نحيفة وسطية وتتشابك مع الروابط مكونة الشبكة العصبية والتي تنتهي بعقيدات عصبية . كما شوهدت غدد ما بين القطع الجسمية Interproglottid glands واقعة على الرابط المستعرض السميك الذي يفصل القطع الجسمية بعضها عن البعض الاخر وان اعلى فعالية لانزيم الاستيل كولين استريز ( AchE ) توجد في الغدد ما بين القطع .اظهر الفحص بالمجهر الالكتروني النافذ لانسجة الديدان الشريطية قيد الدراسة بان الجليد فيها يتكون من طبقتين رئيستين خارجية وداخلية تفصل بينهما طبقة العضلات ويغطى الجليد ببروزات سايتوبلازمية تدعى بالشعيرات الدقيقة Microtriches تبين انها على ثلاثة انواع خيطية ومخروطية واصبعية وقد ظهرت الاشكال المخروطية والاصبعية بصورة واضحة في الدودة الشريطية المسببة لخمج الاغنام Moniezia expansa كما ظهر الغشاء القاعدي Basement membrane بصورة واضحة .كما تطرقت الدراسة الى عدد من المتغيرات الكيموحيوية منها قياس تركيز البروتين الكلية ، الاحماض النووية ( DNA ، RNA ) ، الكاربوهيدرات ، الدهون ، الكوليسترول ، وفعالية انزيم الكلوكوز - 6 فوسفيت ديهادروجينيز ( Glucos - 6 - phosphate dehydrogenase (G - 6 - PDH) ) ، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي (Alkaline phosphatase (AIP) ) والحامضي (Acid phosphatase, (AcP) ) وانزيم الكلوتاميت ترانس امينيز (Glutamat pyruvate transaminase (GPT) ) وكلوتاميت اوكزالواستيت ترانس امينيز (Glutamate oxaloacetate transaminase (GOT) ) فضلا عن انزيم الاستيل كولين استريز (Acetylcholinesterase (AchE) ) .اظهرت النتائج وجود اختلافات معنوية في تركيز البروتين ، DNA ، RNA ، الكاربوهيدات ، الدهون الكلية ، الكولسترول والانزيمات في هذه الدراسة وخاصة في الديدان الشريطية المسببة لخمج الطيور . وتبين ان هناك ارتفاعا في تركيز البروتين الكلي في الدودة الشريطية Moniezia expansa المسببة لخمج اللبائن اذ بلغ ( 248.667  3.2146 ) مايكروغرام / سم3 ، وانخفض الى ادنى مستوى في شريطية الطيورRaillietina echinbothrida اذ بلغ ( 97.000  1.000 ) مايكروغرام / سم3 في حين كان تركيز البروتين ( 151.667  2.0817 ) مايكروغرام/سم3 و( 195.000  13.2288 ) مايكروغرام/سم3 في دودة Ophiotaenia europaea وBothriocephalus sp. ، على التوالي ، في كل من الزواحف والاسماك ، وكذلك اظهرت النتائج ان تركيز الـ DNA كان اقل قيمة في دودة Raillietina echinbothrida ( 11.000  1.000 ) مايكروغرام/سم3 وارتفعت في الدودة Ophiotaenia europaea الى ( 12.333  0.5774 ) مايكروغرام/سم3 بينما كان تركيز الـ DNA ( 14.3667  0.5508 ) و( 24.333  2.0817 ) مايكروغرام/سم3 في دودة Bothriocephalus sp. وMoniezia expansa . اما تركيز الـ RNA في الدودة الشريطية Moniezia expansa فكان اعلى من بقية الشريطيات اذ بلغت ( 88.6667  3.214 ) مايكروغرام/ سم3 بينما بلغت ( 67.7133  1.353 ) و( 47.333  3.0551 ) و( 23.333  .2.0817 ) مايكروغرام/ سم3 في دودة Bothriocephalus sp. ، Ophiotaenia europaea وRaillietina echinbothrida على التوالي .في حين كانت كمية الكاربوهيدرات في الديدان المسببة لخمج الزواحف قليلة اما قيمتها في الديدان المسببة لخمج الاغنام فكانت اعلى مما هي عليه في بقية الطفيليات اذ بلغت ( 204.5796  2.0801 ) مايكروغرام/ سم3 ، ( 186.6000  9.8989 ) مايكروغرام/ سم3 ، ( 291.1267  1.9688 ) مايكروغرام/ سم3 ، ( 328.000  8.7178 ) مايكروغرام/ سم3 على التوالي في الديدان المسببة لخمج الاسماك ، الافاعي ، الطيور ، الاغنام .اما قيمة الكوليسترول فكانت قليلة في الديدان المسببة لخمج الطيور والافاعي اذ بلغت ( 32.1967  1.3550 ) ملغم/ديسيليتر ، ( 34.6833  2.2548 ) ملغم/ديسيليتر على التوالي . وقد تباينت قيم الدهون الكلية بصورة معنوية وكانت اعلى نسبة في دودة Moniezia expansa اذ بلغت ( 229.427  0.6839 ) ملغم/ ديسيلتر و( 169.0590  1.2694 ) ، ( 146.2080  0.7736 ) و( 114.4253  0.551 ) ملغم/ ديسيلتر في كل من Botheriocephalus sp. ، Ophiotaenia europaea وRaillietinia echinobothrida على التوالي .وتبين نتائج دراسة فعالية الانزيمات : (G - 6 - PDH), (AcP), (AIP), (GOT), (GPT), (AchE) .ان الدودة الشريطية Moniezia expansa تمتلك فعالية عالية للانزيمات ( G - 6 - PDH ) ، (AcP) ، (GOT) ، في حين كانت فعالية الـ (AIP) في الـ Bothriocephalus sp. اعلى من بقية الديدان وتلتها في الفعالية Moniezia expansa بينما في بقية الديدان كانت الفعالية منخفضة في المقارنة مع Bothriocephalus sp. والـ Moniezia expansa ، بينما كانت فعالية انزيم GPT متقاربة نوعا ما في جميع الديدان المدروسة ، اما فعالية انزيم Acetylcholinesterase ( AchE) فقد اظهر اعلى فعالية في الدودة الشريطية Raillietinia echinobothrida وتليها في الفعالية Moniezia expansa بينما كانت الفعالية في الـ Ophiotaenia europaea والـ Bothriocephalus sp. منخفضة مقارنة مع النوعين السابقين .وبينت دراسة الترحيل الكهربائي وجود حزم متباينة في العدد والسمك اذ بلغت اربع حزم في الدودة الشريطية المسببة لخمج الاسماك Bothriocephalus sp والدودة الشريطية للبائن Moniezia expansa وثلاث حزم في الدودة الشريطية للافعى Ophiotaenia europaea وخمس حزم في الدودة الشريطية للطيور Raillietina echinobothrida . | The current research studies cestode tapeworms in four kinds of host vertebrates after dissecting them, including 235 cyprinidae and Barbus Lutus fishes, (15) Hydrophlidia and Microcephalopis gracilis snakes, (25) Loridae and Larus canus seagulls and (95) Ruminant and Ovis ovis .Four system of four kinds of cestde tapeworms were examined using the enzymic method with (AchI) technology. Result show that there is a difference between the central nervous system and the peripheral nervous system. The description for the nervous system for each of these cestode tapworm is : The central nervous system of the Bothriocephalus sp. consist of two pairs of cerebral ganglia; the one large located in the bothria joined other by a cerebral ring, and the other is located in the front part of the scolex at the apical disc, and they are also joined to each other by an apical ring. Both the cerebral ring and the apical ring are linked by a ring nerve commissure. From the large cerebral ganglion and the small ones arise a number of nervous which provide bothria and the front part of scolex.The peripheral nervous system, consist of a main nervous trunk which arise from the big cerebral ganglion, then divides into two pairs of thick lateral trank in each side of the body of the worm, and five lateral nerve cords arise from the apical cerebral ganglion located to the side of the thick nervous trunk, and twenty (20) arises from the big cerebral ganglion. The thick medial nerve cords lateral trunk and the lateral nerve cords with the medial nerve cords are linked by many teraservers commissures. This worm is distinguished by the appearance of a nerve network in every piece of it and expanding toward the exterior edges of the worm body.The central nerve system of the Ophiotaenia europaea consist of a pair of cerebral ganglion located in the area of the suckers which linked with another pairs of apical ganglia smaller than the first pairs located in the apical organ. The apical ganglion and the cerebral ganglia are linked by a ring commissure, and from every ganglia a number of small and thin nerve come out to supply the edge of the scolex, the sucker and the apical organ with nerves.From the cerebral ganglion arise two pairs of the thick lateral nervous suckers, also four pairs of lateral nerve cords raise from the apical ganglion it is noted that there are some nerve commissures between (6 - 8) in every body piece and the existence of thick proglottid from another. This worm is distinguished by the distribution of back lateral nerve ganglion the lateral nerve trunks and on the medial merve cords.The central nervous system of the Raillietina echinobothrida consist of two large cerebral ganglia linked by a circular nerve commissure, and (4 - 6) of small front nerves arise from them to supply the suckers and rostellar muscles. Also from these ganglia two pairs of thick main lateral nerve trunk and four pairs of medial nerve cords arise too. The thick lateral trunk and the medial nerve cords are linked by a number of transvers commissures (6 - 8) ladder nerve commissure, and a thick nerve transverse commissure is noted separating the proglottids from one another, and a nerve degeneration in the area of mature proglottid is also noted.The central nervous system of the Moniezia expansa consist of a pair of cerebral ganglia with many parts called the brain complex linked with each other by a cerebral ring from which a number of thin front of nerves come out to supply the suckers, rostellars and the outer edges of the scolex forming nervous network for the scolex. Also a pair of thick lateral nerve trunks and two pairs of nerve cords, which is characterized decreasing thickness of its lateral trunks.It is noted that the medial nerve cords expand to many proglottids then degenerates when the unripe proglottids starts to conform medial thin nerves and reticulate with the commissures forming a nervous network which ends with ganglion. Interproglottid glands located on the thick transverse commissure which separates the prolottids from one another are also noted, and greatest activity of the acetylcholinestrase enzyme exists in the interproglottid glands.The electronic microscope examination show that the tequment consist of two main layers; external and internal, separated by a layer of muscles, and covered with cytoplasmic projections called microtriches, found to be of three types : filar, conical and figure like, the conical and figure forms appear clearly in (Moneizia expansa), and the basement membrane appear clearly too.The research also include a number of biochemical concentration measuring the total amount of the of the protein, DNA, RNA, carbohydrate, total lipid, cholesterol and enzyme's such as glucose 6 phosphate dehydrogenase activity, Alkaline phosphatase (AIP), Acid phosphatase (AcP), Glutamate pyruvate transaminase (GPT), Glutamate oxaloacetate transaminase (GOT) and Acetylcholinesterase (AchE).The results showed significant differences in the concentration of protein, DNA, RNA, carbohydrate total lipid, cholesterol and enzymes especially in cestode tapeworms that cause bird infection. And also there is a high concentration in total protein that exists in the (Monizia expansa) which causes mammals' infection. It reached to (3.2146  248.667) microgram/cm3. and downed to its lowest levels in birds Raillietina echinobithrida; it reached to (97.000  1.000) microgram to cubicle cm. while the concentration of protein in Ophiotaenia europaea (151.667  2.0817) and (195.000 13.2288) microgram/cm3 in Bothriocephalus sp respectively. Also results shoed the concentration of the DNA was less in Raillietina echinobothrida : (1.000  11.000) microgram/cm3; while it increased to (12.3330.5774) in Ophiotaenia europaea. At the same time the concentration of DNA became in Bothriocephalus sp. and Moniezia expanza (14.3667 0.5508), (24.3332.0817)microgram/cm3. The concentration of the RNA in Moniezia expansa was higher than other types of cestode tapeworms; it reached to (88.6667  3.2146) microgram/cm3. while it reached in Bothriocephalus sp. (67.7133  1.3536), Ophiotaenia europaea (3.055147.333) and Raillietina echinobothrida (23.3332.0817) microgram/cm3.The value of carbohydrate in the cestode tapeworms that cause infection in reptiles was low, while it was higher in those causing sheep infection than other parasites, it reached to (204.5796  2.0801), (186.60009.8989),(291.12671.9688),(329.0008.7178)microgram/cm3 in cestode tapeworms that cause infections in fish, snakes, birds and sheep respectively.The value of total lipids diverged significantly; it was the highest in Moniezia expansa, it reached (229.4270.6839) mg/dl, and (169.05951.2694), (146.20800.7736), and (114.45230.5518) mg/dl in Bothriocephalus sp., Ophiotaenia europea and Raillietina echinobthrida respectively.The study revealed the activity of the enzymes as follows : 1. The Moniezia expansa has a very high activity toward the enzymes : G - 6PHD, AcP, GOT.2. The Bothriocephalus sp. has a higher activity toward the AIP enzymes than other cestode tapeworms, then comes Moniezia expansa in the degree of the activity.3. As for the enzyme GPT the activity was somehow approximate in all the cestode tapeworms.4. The enzyme AchE showed it highest activity in Raillietina echinobothrida then comes Moniezia expansa, while it was low in Ophiotaenia europaea and Bothriocephalus sp in comparison with the two form types.The study of electrophoresis showed different bands in number and thickness; it reached four bands in each type : the one that causes fish infection (Bothriocephalus sp.), and that in mammals (Moniezia expansa) then three bands in Ophiotania europaea, and five bands in Raillietina echinobothrida.

دراسات حول متلازمة المبيض المتعدد الاكياس وتاثير بعض العقاقير المنشطة للخصوبة في مبايض اناث الجرذان == Studies On the Polycystic Ovary Syndrome and Effects Of some Fertility activating Drugs Of Female Rats

اسم المؤلف: لقاء حسين علي محمد الدليمي
اسم المشرف: منى حسين علي جانكير | جنان حسيب عبد الفتاح الحيالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: العربية
مكان الجامعة: الموصل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية التي امتدت من شهر كانون الثاني (2006) لغاية شهر ايار (2008) للتقصي عن انتشار الاصابة بمتلازمة المبيض المتعدد الاكياس لعدد من نساء محافظة نينوى واللاتي بلغ عددهن (92) مصابة، واظهرت الدراسة ان اعلى نسبة للاصابة بحسب الحالات السريرية المرافقة للمتلازمة كانت (51.08 %) في النساء اللاتي يعانين من العقم الاولي وتلتها نسبة الاصابة بالعقم الثانوي (42.39 %) في حين بلغت نسبة الاصابة في النساء الملتحيات (6.52 %). وبينت الدراسة ارتفاع معنوي في تركيز الهورمون المحفز للجريبات ((FSH والهورمون المحفز للجسم الاصفر (LH) مقارنة مع النساء الاصحاء.كما تم تحديد نسبة الاصابة ببعض الامراض التي تعد من المخاطر الصحية في النساء المصابات بالمتلازمة اذ بلغت نسبة الاصابة بارتفاع ضغط الدم (19.56%) في حين كانت نسبة الاصابة بداء السكر(28.26%). اما الاصابة بداء السكر مع ارتفاع ضغط الدم بلغت (5.43%) في النساء المصابات بمتلازمة المبيض المتعدد الاكياس. كما تضمنت الدراسة الحالية متابعة وتشخيص التغيرات النسجية في المبيض المتعدد الاكياس لاناث الجرذان البيضاء البالغة المعرضة للاضاءة المستمرة بشدة (350) لوكس(لمدة 14 اسبوعا) وتمثلت هذه التغيرات بملاحظة مجموعة من التراكيب الكيسية المختلفة الاحجام مع انعدام وجود الجسم الاصفر في المبيض فضلا عن احتقان الاوعية الدموية وازدياد خلوية المبيض. كما شملت الدراسة الحالية متابعة تاثير بعض العقاقير المنشطة للخصوبة المتمثلة بعقاري سترات الكلوميفين بمقدار جرعة (1.6 ) ملغم/ كغم من وزن الجسم لكل دورة شبقية واخرى والميتفورمين بمقدار جرعة (300) ملغم/ كغم من وزن الجسم يوميا كلا على حده وسترات الكلوميفين والميتفورمين معا ولفترات زمنية مختلفة تتراوح بين (4 ، 8 ، 12) اسبوعا من المعاملة بهذه العقاقير ولوحظ ان اعلى زيادة في شدة التغيرات النسجية في مبيض اناث الجرذان عند دمج كل من عقاري سترات الكلوميفين مع الميتفورمين في حين لم تلاحظ تغيرات نسيجية مهمة عند المعاملة بعقار الميتفورمين لوحده ولكن استخدام الكلوميفين لوحده ادى الى حدوث تغيرات نسجية ولكن بشدة متوسطة واقل من دمج العقارين معا وان اهم التغيرات النسجية تمثلت بالتليف وتكيس الجريبات المبيضية مع ازدياد خلوية قشرة ولب المبيض فضلا عن احتقان الاوعية الدموية وزيادة تواجد الاجسام الصفر وهي في مراحل اوبية مختلفة.وشملت الدراسة تقدير تركيز المالوندايالديهايد والكلوتاثايون في نسيج المبيض المتعدد الاكياس لاناث الجرذان البالغة المعرضة للاضاءة المستمرة اذ وجد ان هناك ارتفاعا معنويا في تركيز المالوندايالديهايد مع انخفاض معنوي في تركيز الكلوتاثايون.كما تم دراسة تاثير عقاري سترات الكلوميفين والميتفورمين كلا على حده، وسترات الكلوميفين والميتفورمين معا في تقدير تركيز المالوندايالديهايد والكلوتاثايون في نسيج مبيض اناث الجرذان البالغة ولوحظ ارتفاعا معنويا كبيرا في مستوى تركيز المالوندايالديهايد مع انخفاض معنوي في مستوى تركيز الكلوتاثايون عند دمج العقارين معا. كما لوحظ ارتفاع معنوي ايضا في تركيز المالوندايالديهايد وانخفاض معنوي في تركيز الكلوتاثايون في جميع المعاملات بالعقاقير وازديادها بحسب الفترات الزمنية ما عدا المجاميع المعاملة بعقار الميتفورمين. | The current study, extended from (January 2006 - May 2008) has investigated the infection that spread upon 92 infected women in - Nineveh Province - suffering from polycytic syndrome (PCOS) was conducted. The study showed that the highest rate of infection - according to the associated clinical cases of the syndrome was (51.08%) for women who suffer from primary infertility. Meanwhile, infection percentage for the bearded women was (6.52%). The study also showed a significant increase in the concentrations of Follicle Stimulating Hormone (FSH) and Luteinizing Hormone (LH) compared to those in healthy women. Some health problems were also detected in (PCOS). The hypertension percentage was (19.56%), diabetes (28.26%), while diabetes with hypertension cases were (5.43%) for women who have (PCOS). The present study also involved monitoring and diagnosis of tissue changes in polycytic ovary among white adult female rats, which were exposed to continuous light with an intensity of 350 lux (for 14 weeks). Those changes were represented by identifying a number of cystic structures of various sizes, the absence of corpus luteum, congestion of blood vessels and ovarian hyperplasia. The study also investigated the influence of fertility - activating drugs, like clomiphene citrate (each dose is 1.6 mg/ kg of body weight for one dose estrus stage), metformin (each dose is 300 mg/ kg of body weight daily). Each of the drugs was used alone and clomiphene citrate was associated with metformin were given for different periods (4, 8, and 12) weeks. The highest change in the ovary tissues of female rats was found when using clomiphene citrate with metformin drugs. While no significant tissue changes were observed when using metformine alone. But the treatment by using clomiphene citrate alone resulted in medium tissue changes, and were less when combining the two drugs together. The most important changes are fibriosis ovarian follicle cysts, hyperplasia in the cortex and the ovary mudella as well as the congestion of blood vessels in addition to an increase in the number of corpus luteum when they are in different aterisa stages. The study also included the estimation of the concentration of malondialdehyde and glutathion in the polycystic ovary tissue of adult female rats exposed to continuous light. Its was found that there was a significant increase in the concentration of malondialdehyde and a significant decrease in the concentration of glutathion. In addition to that, the influence of clomiphene citrate of metformin drugs separately, or together, to estimate the concentrations of malondialdehyde and glutathion in adult female ovary tissues was also investigated. Malondialdehyde concentration was high, while glutathion concentration was low when combining the two drugs. Also, a higher significant increase was found in the malonaldehyde concentration and a significant decrease in glutathaion concentration in all drug treatments and their increase over different periods of time, except for the groups, which were treated with metformin.

التلوث الفطري لمنتجات الالبان والمشروبات الغازية في بعض معامل مدينة الموصل بضوء مواصفات المياه المستخدمة والمطروحة == FUNGAL CONTAMINATION OF DAIRY AND SOFT DRINKS PRODUCTS IN SOME FACTORIES OF MOSUL GOVERNORATE WITH CONCERN TO USED AND DISPOSED WATER SPECIFICATIONS

اسم المؤلف: مازن نزار فضل محمد السنجري
اسم المشرف: صالح عيسى محمد الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: العربية
مكان الجامعة: الموصل
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة التلوث بالفطريات وسمومها في معملين للالبان (ا ، ب) ومعملين للمشروبات الغازية (ج ، د) في مدينة الموصل وقد تم عزل وتشخيص خمسة انواع من الاعفان الملوثة لمعامل الالبان ومنتجاتها وهي : Aspergillus spp, Cladosporium sp, Geotrichum sp, Penicillium spp, Rhizopus sp, وثلاثة انواع من الخمائر واشباهها وهي Aurobasidium sp, Candida spp., Rhodoturela sp. ملوثة لمعامل الالبان . بلغت درجة التلوث بالاعفان في منتوج الجبن وكذلك الخمائر في منتوج اللبن (7 × 310) مستعمرة/مل في المعمل(*) (ا) اما في المصنع(**) (ب) فقد ظهر اعلى تلوث بالاعفان والخمائر في منتوج الجبن وبلغ (4 × 310) مستعمرة/مل و(1×310) مستعمرة/مل على التوالي ، وبلغت نسبة التلوث بالعفن Penicillium spp. 100% وشبه الخميرة من جنس Candida spp. بنسبة 100% في كلا المعملين،وشخصت اعفان Fusarium sp. وStemphylum sp. ملوثة لمعامل المشروبات الغازية بالاضافة الى الاعفان والخمائر واشباهها الملوثة لمعامل الالبان ومنتجاتها والمذكورة اعلاه ، وقد تم تسجيل تلوث منتوج الميرندا للمعمل (ج) بالعفن Penicillium verrucosum وبنسبة 100% اما اعلى مستوى للتلوث بالخمائر واشباهها فكان شبه الخميرة Candida tropicalis بنسبة 100% بعدد (5 × 310) مستعمرة/مل في منتوج البيبسي .ولقد بينت النتائج الاولية للمعمل (ج) ان سبب التلوث هو الماء الداخل في التصنيع وبعد تطوير وحدة المعاملة تم التخلص من مشكلة تلوث منتجات المعمل . ولم يظهر اي تلوث بالاعفان والخمائر في منتجات المصنع (د) ، وبصورة عامة كان العفن Penicillium spp. وشبه الخميرة Candida spp. هما السائدان في تلوث منتجات معامل الالبان والمشروبات الغازية . بينت نتائج التحري عن سموم الافلاتوكسين في عينات الالبان والمشروبات الغازية ان اعلى تلوث بسموم الافلاتوكسين B1 وM1 كان في منتوج الجبن لكلا المعملين حيث بلغ 105 نانوغرام/كغم و220 نانوغرام/كغم على التوالي لمنتجات المعمل (ا) و85 نانوغرام/كغم و165 نانوغرام/غم على التوالي في منتجات المصنع (ب) ، وان نسبة التلوث بالافلاتوكسين B1 وM1 في جبن المعمل (ا) اعلى من جبن المصنع (ب) ، وتلوث منتوجي القشطة واللبن في المصنع (ب) كان اعلى من التلوث في منتجات المعمل (ا) ، وعلى اية حال فان مقدار التلوث بالافلاتوكسين B1 وM1 في منتجات الالبان تجاوز الحدود المسموح بها والمثبتة من قبل منظمة الصحة العالمية والبالغة 20 ppb ، في حين لم يظهر اي تلوث بالافلاتوكسينات في عينات المشروبات الغازية .اظهرت نتائج اختبار تاثير مدة الخزن ودرجة حرارة التخزين على تلوث هذه المنتجات زيادة في التلوث مع طول فترة الخزن في كلا الدرجتين الحراريتين 7م و19م ، وان نسبة التلوث في العينات المحفوظة في 19م اعلى من العينات المحفوظة في درجة 7م ، كما بينت النتائج زيادة التلوث مع طول فترة الخزن ، وعند اختبار عينات مستوردة من الالبان والمشروبات الغازية بعد مرور 60 يوم من تاريخ صنعها لم يتبين فيها اي تلوث بالاعفان والخمائر . اما فيما يخص نوعية المياه المستخدمة في هذه الصناعة فقد بينت نتائج التحاليل ان الماء المستخدم في التخفيف هو ضمن الحدود المسموح بها للمياه المستخدمة في الصناعات الغذائية ومياه الشرب وان عملية تنقية المياه في المعمل (ج) بعد تعديل وحدة التنقية والمصنع (د) للمشروبات الغازية كانت كفوءة في ازالة التلوث المايكروبي ، اما في ماء الطرح النهائي فكانت قيم الاس الهيدروجيني والنترات والكبريتات غير متجاوزة للحدود المسموح بها بالنسبة للمياه المطروحة الى النهر ، وعلى العكس من ذلك فان قيم المتطلب الحيوي للاوكسجين والفوسفات والمواد الصلبة الكلية كانت متجاوزة للحدود المسموح بها بالنسبة لمياه الفضلات المطروحة الى الانهار وحسب محددات حماية البيئة وصيانة الانهار من التلوث . | This study was focused on the contamination of two dairy factories (A , B) and two factories of soft drinks (C,D) in Mosul city by fungi and it is toxins, five species of molds isolated from dairy factories were Aspergillus spp., Cladosporium sp., Geotrichum sp., Penicillium spp. and Rhizopus sp. Also three species of yeasts had been isolated Aurobasidium sp., Candida spp., Rhodotorula sp. The contamination of cheese by molds and contamination of yoghurt by yeast amounted to (7× 103) col/ml, in factory (A), While in factory (B) the maximum contamination of yoghurt by molds and yeasts were (4× 103) col/ml, and (1× 103) col /ml respectively . The rate of contamination by Penicillium spp. and Candida spp. were reached 100% in both factories, Some molds such as Fusarium sp. and Stemphylium sp. Were isolated from soft drinks factories in addition to the same molds and yeast which had been isolated from dairy factories, Mirinda beverage had been contaminated in factory (C) by P. verrucosum (100%), The maximum contamination level by yeast and yeast - like was by C. tropicalis (100%) with total number (5× 103) col/ml. Concerning with pepsi cola beverage the primary results in factory (C) showed that the causal agent of contamination was the input water in the process , After improving the water processing unit, Contamination problem had been limited , Factory (D) didn’t show any contamination by molds or yeasts. Generally Penicillium spp. and Candida spp. were the dominant agents of contamination in both dairy and soft drinks products. Screening of aflatoxins in dairy and soft drink products showed that the maximum contamination by aflatoxins B1 and M1 was in cheese product of both factories with concentrations 105 ng/kg , 220 ng/kg respectively in factory (A) products, and 85 ng /kg , 165 ng/kg respectively in factory (B) products, Also cheese contamination by AFB1 and AFM1 in factory (A) was more than factory (B) while , Contamination of cream and yoghurt in factory (B) was more than that occurred in factory (A). Besides, The contaminated dairy products by AFB1 and AFM1 were exceeded the limits certified by WHO not exceed 20 ppb, Investigations showed that there is no any aflatoxins contamination in the soft drink products.Contamination was effected by storage period and temperature on the contamination of this products showed an increase of the contamination with long period of storage at the two temperatures degrees 7C and 19C ,The contamination of samples conserved at 19c was more than that samples conserved at 7C,The results showed an increase of the contamination with the storage period.Imported products of dairy and soft drinks showed no contamination even after 60 day of production.The results of analysis of water used in processing and dilution was within the limits of standards characteristics of the used water in food technology and drinking water, Also the water processing in factory (C) after improving the processing unit and in the factory (D) were very efficient in removing the fungal contamination, In addition the analyses of effluent water showed that values of pH, nitrate and sulfate were within the accepted limits, On the other hand the values of BOD5 , Phosphates and total solids materials were exceeded the allowance limits in concern to the waste waters discharged to the rivers according to the limits of the ecosystem protection and rivers maintenance.

دراسات حياتية وبيئية لحشرة من القطن Aphis gossypii Glover (Homoptera : Aphididae) == Bio - ecology of cotton aphid, Aphis gossypii Glover (Homoptera : Aphididae

اسم المؤلف: سهيلة داوود سلمان الجنابي
اسم المشرف: ابراهيم قدوري قدو
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت دراسات حياتية وبيئية لحشرة من القطن Aphis gossypii Glover ( Homoptera : Aphididae ) التي تعد من الافات الاقتصادية عالمية الانتشار، والتي تصيب العديد من النباتات منها اشجارو محاصيل الخضر بانواعها فضلا عن نباتات الزينة والنباتات البرية . شملت الدراسة ما يا تي : اولا : الدراسات المختبرية ا - تناسبت مدة الاطوار الحورية عكسيا مع درجات الحرارة اذ كانت اقصر مدة للطور الحوري الاول ( 1.25 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° ، واطول مدة لهذا الطور كانت في حرارة ( 15 ) م° ( 4.4 ) يوم . تراوحت مدة الطور الحوري الثاني بين ( 4.1 - 1.2 ) يوم في درجتي الحرارة ( 15 , 30 ) م° . اما مدة الطور الحوري الثالث فكانت متدرجة بين ( 3.5 - 1.1 ) يوما في الحرارة ( 15 , 30 ) م° ، اما مدة الطور الحوري الرابع فكانت اقل مدة في حرارة ( 30 ) م° اذ بلغت ( 1.05 ) يوم واطول مدة كانت ( 3.4 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° . كانت اطول مدة للدور الحوري ( 15.4 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصرها ( 4.6 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° . بلغ اعلى انتاجية للانثى العذرية ( 54.1 ) حورية في حرارة ( 25 ) م° ، واقل انتاجية كان في ( 15 م°) . كما وجد ان طول مدة قبل التكاثر تتاثر ايضا بدرجات الحرارة اذ اطول مدة كانت ( 3.2 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصر مدة كانت ( 0.9 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° . كما ان مدة التكاثر تتاثر ايضا بدرجات الحرارة اذ وجد ان اطول مدة كانت ( 11.2 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقل مدة ( 6.2 ) يوما في حرارة ( 30 ) م° . بلغ معدل انتاج الانثى حورية الواحدة في اليوم الواحد اعلاه ( 6.88 ) حورية / انثى / يوم في حرارة ( 25 ) مº ، واقلها ( 1.61 )حورية / انثى / يوم في ( 15 ) مº . ان طول عمر الانثى يتناقص بارتفاع درجة الحرارة اذ كان اطول عمرا ( 41.3 ) يوم في حرارة ( 15 ) مº ، واقل عمرا ( 19.9 ) يوم في حرارة ( 30 ) مº . وجد ان مدة الجيل كانت تتناسب عكسيا مع درجات الحرارة ، وكانت اطول مدة ( 18.6) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصر مدة كانت ( 5.5 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° .ازدادت النسبة المئوية للهلاك براتفاع الحرارة من 20م° الى ان وصلت اقصاها 100 % في حرارة 35م°. ب - ان لدرجة الحرارة ونوع المضيف النباتي تاثيرا واضحا في مختلف الجوانب الحياتية للحشرة فلوحظ التاثير كان كبيرا في مدة الدور الحوري والانتاجية وطول العمر ومدة الجيل والنسبة المئوية للهلاكات على المضائف النباتية المختلفة . ثانيا : الدراسات الميدانيةا ــ المضائف النباتية : وجد من المسح الميداني للمضائف النباتية التي تصيبها حشرة من القطن في حقول الجادرية انها تصيب اكثر من 40 نوعا من 11 عائلة نباتية اغلبها من العائلات : القثائية ، والمركبة ، والباذنجانية ، والخبازية . ب ــ الكثافة العددية : تختلف باختلاف المضائف النباتية اذ وجد ان اكثر النباتات اصابة هي البطيخ ،و خيارماء ثم الباميا في خريف 2005 . اما في سنة 2006 وجد ايضا ان الكثافة مختلفة باختلاف المضائف ، وان اعلى كثافة على البطيخ والخيارو القطن ثم الباميا ، كما انها تختلف من اسبوع لاخر باختلاف درجات الحرارة والرطوبة النسبية ج ــ تفضيل الحشرة لسطحي الورقة : ان اعلى كثافة لحوريات من القطن كانت على السطح السفلي ( 370.4 ، 195.2 ، 464.5 ) لورقة نبات خيار الماء ، والباذنجان ، والباميا على التوالي واقلها على السطح العلوي ( 132.7 ، 54.0 ، 60.1 ) على التوالي وان اعلى نسبة مجنحات على السطح السفلي على النباتات الثلاث . د ـ توزيع الحشرة على مستويات النبات الثلاث : وجد ان اعلى نسبة للافراد غير المجنحة على المستوى الوسطي ثم القاعدي ثم القمي على نباتات خيار ماء ، وباذنجان ، وباميا على التوالي . اما بالنسبة للمجنحات فكانت مختلفة باختلاف النباتات على السطح العلوي للورقة . اما على السطح السفلي فوجد ان اعلى معدل للافرا د غير المجنحة كان على المستوى الوسطي ثم القاعدي ثم القمي للنباتات الثلاث ، على التوالي في حين انتشار الافراد المجنحة يختلف باختلاف النباتات . هـ - ان توزيع الحوريات غير المجنحة على نصل الورقة كان اعلاه على المساحات الخضر مابين العروق ، واقلها على العرق الوسطي للسطح السفلي لورقة المضيف النباتي . | The cotton aphid , Aphis gossypii Glover ( Homoptera : Aphididae ) is an important economic cosmopolitan polyphagous pests Which attacks numerous hosts such as trees , field crops , ornamental and wild plants . The biology of this insect has not been adequately studied in Iraq .Hence ,this investigation was designed to study the local strain of the pest under controlled and field condition .These investigation covers the following aspects : First : Laboratory studies : 1 - The nymphal stadia decrease with increasing temperatures . The first stadium reneged from 1.25 days at 30 C° to 4.4 days at 15 C° . Second stadium ranged between 4.1 - 1.2 days at 15 - 30 C°, The third stadium was from 3.5 to 1.1 days at 15 - 30 C°, whereas the fourth stadium was 1.05 - 3.4 days at 30 C°, 15C°. Temperature 35 C° is considered a lethal degree of most nymphal instars .The total period of nymphal stage was 15.4 days at 15 C° and 4.6 days at 30 C°.fecundity value The highest of apterae was 54.1 nymphs at 25 C° and the lowest at 15 C° .The maximum daily reproductive rate of a viviparous female was 6.88 nymphs / female /day at 25 C° and the minimum was 1.61 nymphs / female /day at 15C° . Prereproductive and , reproductive period was also affected with temperature .Generation period from birth to birth ranged between 20.9 days at 15 C° to 7.3 days at 30 C°. The maximum longevity was 41.3 days at 15C° and the minimum was 19.9 days at 30 C° . 2 - The laboratory studies have generally revealed that the degree of temperature and host plants have significant effects on the bionomics of cotton aphid . Second : Field studies Cotton aphid has a wide range of host plants . The field survey shows that more than 40 species of host plants belong to the families : Compositae , Malvaceae , Cucurbitaceae and Solanaceae in Jadriyah fields Population density varies on different host plants . The aphid prefers melon , cucumber , okra and cotton and its population varies depending on temperature , relative humidity and natural enemies . The field studies have revealed that both alatae and apterae of cotton aphid prefer the lower surface of different host plant leaves . The highest distribution of them was on the middle leaves of plant and high percentage ratio of apterous on the green area while the lesser one was on the midrib of leaves

تاثيرات بعض المركبات الحلقية غير المتجانسة المصنعة على نمو وايض امامية السوط لطفيليات اللشمانيا الجلدية Leishmania tropica == Effects of Some Synthesized Heterocyclic Compounds on Growth and Metabolism of Leishmania tropica Promastigotes

اسم المؤلف: مروة هاشم داؤد حموشي
اسم المشرف: قصي عبد القادر مصطفى الجلبي | عبد الوهاب جعفر الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: الموصل
الكلمات الدلالية:
  • Heterocyclic Compounds
  • Leishmania tropica
  • Metabolism
  • Energy
  • Fatty Acid
الصفحات الاولى:
المستخلص: عني البحث باستخدام خمسة جالكونات مصنعة ( 1،3 - ثنائي الاريل - 2 - بروبين - 1 - ون ) كمواد بادئة لتصنيع مختلف المركبات الحلقية غير المتجانسة. اختبرت بعدها الفعالية الحيوية للمركبات المصنعةالمذكورة ضد امامية السوط promastigotes لطفيلي اللشمانيا الاستوائية Leishmania tropica. في الزجاج .in vitroكثفت الجالكونات الخمسة المصنعة مع مركبات ذات هيدروجين حامضية Acidic Hydrogen compounds مثل الهايدرازينات Hydrazines واليوريا Ureas ، والثايوريا Thioureas لانتاج خمسة من المركبات النهائية. اثنين من تلك المركبات احتوت حلقة بايرازولين وهي : 5,1 - ثنائي فنيل - 3 - (اورثوكلوروروفينيل) - 2Δ - بايرازولين (P1) و3 - (ميتانيتروفنيل) - 5,1 - (باراكلوروفنيل) - 2Δ - بايرازولين (P5), المركبات الثلاثة الاخرى احتوت حلقة بيرميدينون وهي : 4,3 - ثنائي الهيدروجين - 4 - (بارانايتروفينيل) - 6 - فينيل بيرميدين - 2(H1) - ون(P2) و4,1 - ثنائي الهيدروجين - 3 - اثيل - 4 - (2 - مستيلينيل) - 6 - (اورثوكلوروفينيل) بيرميدين - 2(H1) - ون (P4) و2،4 - ثنائي الهيدروجين - 4 - (باراميثوكسي فينيل) - 6 - (اورثوكلوروفينيل) بيرميدين - 2 - (H1) - ثايون (P3) ، والحاوي على حلقة بيرميدين ثايون . وشخصت المركبات المحضرة باستخدام الطرق الطيفية . اختبرت فعالية الحلقات الخمسة متباينة ضد امامية السوط لطفيليات اللشمانيا الاستوائية في الزجاج In vitro. تبين ان المواد الخمسة المختبرة كان لها تاثير تثبيطي على نمو امامية السوط، وازداد هذا التاثير مع زيادة تركيز المادة قيد الاختبار.عندما قورن تركيز عقار البنتوستام Pentostam المثبط لخمسين بالمئة (IC50) من امامية السوط (20مايكروغرام/ملليلتر ) مع IC50 للمواد قيد الدراسة، وجد ان كل المواد المجربة سببت تثبيطا جيدا(نسبيا) في نمو الطفيلي؛ وان اكثر المواد سمية" كان المركب P4 حيث ان IC50 له كانت (0.6 مايكروغرام/ملليتر) ,بينما امتلك المركب P3 IC50 مماثل لعقار البنتوستام (20 مايكروغرام/ملليلتر) اما المركب P5 فقد امتلك IC50 اعلى بقليل من البنتوستام ( 25مايكرو غرام/ملليلتر) . وكانت IC50 للمركب P1 (30مايكروغرام/ملليلتر). بينما كانت IC50 للمركب P2 (60مايكروغرام/ملليلتر) وهو الاقل سمية" على امامية السوط من بين المركبات الخمسة.درس تاثير المركبات الخمسة على ايض الطاقة في امامي السوط للشمانيا الاستوائية من حيث التاثير على محتوى الاحماض الدهنية وعلى بعض انزيمات السلسلة التنفسية المعلوم تواجدها في امامي السوط.حللت الاحماض الدهنية في امامي السوط للشمانيا الاستوائية بالاعتماد على تقنية كروماتوغرافيا الغاز السائل (Gas liquid chromatography) وتبين وجود ستة انواع من الاحماض الدهنية في امامي السوط وهي على التوالي : Caproic acidو Myristic acidو Palmatic acidو Stearic acidوOleic acid وLinoleic acid.اعطى IC50 للمواد الخمسة (P5 - - - P1) تاثيرات كمية ونوعية متباينة على محتوى امامية السوط من الاحماض الدهنية، فقد اعطى IC50 للمركب P3 اقوى تاثير على محتوى الاحماض الدهنية حيث سبب اختفاء اغلب انواع الاحماض الدهنية ،مع زيادة ملحوظة في نسبة تركيز Caproic acid (35%) ، كما تسبب IC50 للمركب P4 في اختفاء Oleic acid لامامية السوط المعاملة، مع نقص ملحوظ في نسبة تركيز Linoleic acid. وعند معاملة امامية السوط ب IC50 للمركب P5 حصل نقص كبير في نسبة تركيز oleic acid وLinoleic acid. على ما يبدو، فان Linoleic acid وOleic acid هما اكثر الاحماض الدهنية تاثرا، حيث انهما فقدا كليا عند معاملة امامي السوط بـ IC50 للمركبات P3و P4وP5.اختبر تاثير IC50 للمركبات (P5 - - - P1) على فعالية انزيمي فيوماريت ردكتنيز ((FRD وسكسينت ديهيدروجينيز ((SDH. وتبين ان اربعة من المركبات المصنعة وهي P2 - - - P5 امتلكت تاثيرا انتقائيا على السلسلة التنفسية لامامية السوط، حيث اثرت المواد انفة الذكر على فعالية FRD اكثر من تاثيرها على فعالية SDH. وكان تاثير المركب P2 على فعالية FRD اكثر بنسبة 34% من تاثيره على فعالية SDH، في حين كان تاثير المركب P3 على فعالية FRD اكثر ب54% من تاثيره على فعالية SDH. وكذلك الحال بالنسبة للمركب P5 الذي ثبط فعالية FRD بنسبة 43% اكثر من تثبيطه لفعالية انزيم SDH. تشير هذه البيانات الى ان انزيم FRD للطفيلي يمكن ان يكون الموقع المستهدف (الهدف الخاص) الذي يعكس فعالية المركبات الثلاثة P2و P3 وP5 المضادة لامامية السوط للشمانيا الاستوائية. بينت الدراسة الحالية ان المركبات P5 - - - P1 تسببت باختزال المحتوى الكلي للبروتينات والاحماض النووية وكذلك اثرت على فعالية بعض الانزيمات المتعلقة بايض هذه الجزيئات وهما انزيمي دايهايدروفوليت ردكتيز (DHFR) وثايميدين فوسفوريليز (TP). اظهر IC50 للمركب P5 اقصى اختزال في المحتوى البروتيني لامامية السوط (35%) وتسبب كل من IC50 للمركبات P1و P3وP4 باختزال في المحتوى البروتيني لامامية السوط بدرجات اقل : (27%، 24%، 19%على التوالي)، اما IC50 للمركب P2 فقد كان الاقل تاثيرا على محتوى البروتين حيث ادى الى اختزال 9% فقط من محتوى البروتين الكلي. اما من حيث التاثير على محتوى الاحماض النووية لامامية السوط المعاملة؛ فقد سبب P5 اقصى اختزال في كمية الاحماض النووية الكلية (42%). كما تسبب P2و P3و P4 باختزال محتوى الاحماض النووية لامامية السوط بنسب متقاربة (35%،36%،37%على التوالي )، في حين سبب P1 اقل اختزال بمحتوى الاحماض النووية(16%). بينما اعطى P5 اعلى اختزال في كمية الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين ( DNA )(50%) في حين ان P1 سبب اقل اختزال في كميةDNA (12%) . واما ما يخص محتوى امامية السوط من الحامض النووي الرايبوزي (RNA )، فقد اختزل المركب P4 41% من RNA الكلية لامامية السوط المعاملة واختزل IC50 للمركب P5 39% من RNA لامامية السوط المعاملة. وسجل اقل اختزال في محتوىRNA عند معاملة امامية السوط ب IC50 للمركب P1 (17%). تبين ان المركبات قيد الدراسة اثرت على كل من مساري البناء الحيوي de novo والانقاذ salvage لبناء dTMP. حيث ان هذه المواد (P5 - - - P1 - ) اثرت معنويا في فعالية انزيم TP . فالمركبات P2و P3و P4و P5 اختزلت الفعالية النوعية لانزيم TP في امامية السوط، من ناحية اخرى فان جميع المركبات قيد الدراسة تسببت في اختزال الفعالية النوعية لانزيم DHFR باستثناء المركب P1 الذي تسبب في زيادة الفعالية النوعية لانزيم DHFR الى 106%. وان اقصى اختزال في فعالية DHFR سببه المركب P3 (34%).يجدر بالذكر ان IC50 للمواد قيد الدراسة كان لها تاثيرا ملحوظا في شكل وابعاد الطفيلي. حيث تسبب IC50 للمركب P5 بظهور فجوات كبيرة في السايتوبلازم، اما المركب P2 فقد تسبب في ظهور تحبب في السايتوبلازم مع نواة غير منتظمة الشكل. سببت معاملة امامي السوط ب IC50 للمركب P3 ظهور تجمع من الفجوات السايتوبلازمية الصغيرة، من ناحية اخرى ظهرت فجوة منفردة كبيرة في سايتوبلازم الطفيليات المعاملة بالمركب P4، مع نواة غير منتظمة الشكل. لوحظ اقصى انتفاخ في امامية السوط المعاملة بـ IC50 للمركب P4 وبدرجات اقل لتلك المعاملة بـ اولية IC50 للمركبات P1و P2 وP5 على التوالي.بينت نتائج البحث الحالي ان موقع ونوع المجاميع التعويضية على الحلقات المصنعة في المركبات قيد الدراسة، كانت ذا تاثير حرج في الفعالية المضادة للشمانيا لهذه المركبات. | The present investigation is concerned with the use of five synthesized chalcones (1,3 - diaryl - 2 - propen - 1 - one) as a chief starting materials to synthesize different heterocyclic compounds. The produced heterocycles tested then for their biological activity against Leishmania tropica promastigotes in vitro.The five synthesized chalcones were condensed with different acidic hydrogen compounds such as hydrazines, ureas and thioureas to produce five heterocyclic compounds. Two of them contain pyrazoline ring : 1,5 - Diphenyl - 3 - (o - chlorophenyl) - ∆2 - pyrazoline (P1) and 3 - (m - Nitropheny - 5 - (p - chlorophenyl) - ∆2 - pyrazoline (P5), the other three compounds contain pyrimidinone ring : 3,4 - Dihydro - 4 - (p - nitro phenyl) - 6 - phenyl pyrimidine - 2(1H) - one (P2), 1,4 - Dihydro - 3 - ethyl - 4 - (2 - mesitylenyl) - 6 - (o - chlorophenyl) pyrimidine - 2(1H) - one(P4),and,4 - Dihydro - 4 - (p - methoxyphenyl) - 6 - (o - chlorophenyl) pyrimidine - 2 - (1H) - thione (P3), which contain pyrimidine thione ring. The resultant products were identified in the light of spectroscopic methods, as well as the melting points. The five heterocyclic compounds were tested for their antileishmanial activity against Leishmania tropica promastigotes in vitro. All tested compounds caused concentration - dependent inhibition of the in vitro growth of Leishmania promastigotes. When compared with inhibitory concentration 50 ( IC50 ) of pentostam (20μg/ml), all the tested compounds appeared to have relatively good inhibitory effects. The IC50 values of the tested compounds P1,P2,P3,P4 and P5 were 30 μg/ml, 60 μg/ml, 20 μg/ml, 0.6 μg/ml and 25 μg/ml respectively.Effects of the five synthesized compound were also tested on energy metabolism (on fatty acids content and some selective enzymes in respiratory chain) of Leishmania promastigotes. The gas liquid chromatographic analysis of untreated Leishmania tropica promastigotes revealed the presence of six types of fatty acids : caproic, myristic, palmatic, stearic, oleic, and linoleic acids respectively. The IC50 of the tested products (P1 - - - P5) showed different effects, qualitative and quantitative on the fatty acids content of promastigotes. IC50 of P3 displayed the maximum effect on promastigotes fatty acids content, in which most types of fatty acids disappeared, with considerable increase in concentration percentage of caproic acid (35%). IC50 of P4 was caused oleic acid of the treated promastigotes to disappear, with remarkable decrease in percentage concentration of linoleic acid. When promastigotes treated with IC50 of P5, there was a high decrease in percentage concentration of oleic acid and linoleic acid respectively. Oleic acid and linoleic acid seemed to be the most affected fatty acids, since they were missed in the promastigotes when treated with P3, P4. and P5. Fumarate reductase (FRD) and succinate dehydrogenase (SDH) were investigated for its sensitivity toward the five compounds under study (P1 - - - P5). IC50S of four experimented compounds (P2 - - - P5) was observed to have selective inhibitory effects on the parasite respiratory chain, since these compounds proved to have higher inhibitory effects against FRD activity than that against SDH activity. However, the inhibitory effect of P2 on the activity of FRD was approximately 34% higher than that on SDH, while the inhibitory effect of P3 on the activity of FRD was 54% higher than that on SDH, and the inhibitory effect of P5 on the activity of FRD was approximately 43% higher than that on SDH i.e. FRD is more sensitive to P2, P3 and P5 than SDH. The data indicate that the parasite FRD might be the specific target for the action of P2, P3 and P5.IC50 of P1 - - - P5 appeared to have variant inhibitory effects on the total protein, total nucleic acids content and some related enzymes (dihydrofolate reductase (DHFR) and thymidine phosphorelase (TP)). P5 caused the maximum decrease in protein content (35%); P3, P4 and P2 reduced protein total content of promastigotes for less extent (27%, 24%, and 19% respectively); P2 resulted in the less reduction in total protein content (9%). As for nucleic acids content of treated Leishmania promastigotes, the maximum reduction of nucleic acids content caused by P5 (42%), P2, P3, P4 caused approximate reduction percentage in total nucleic acids (35%, 36%, 37% respectively), while P1 resulted in the less inhibition of nucleic acids content (16%). The maximal inhibition in Deoxyribonucleic acid (DNA) content caused by P5 (50%), whereas P1 caused the minimal inhibition (12%). However, Ribonucleic acid (RNA) content was reduced 41% when Leishmania promastigotes treated with P4, and 39% when treated with P5. The less reduction in RNA content was caused by P1 (17%). The experimented compounds appeared to affect both salvage and de novo pathways of Deoxy Thymidinemonophosphate (dTMP) synthesis. However all these compounds (P1 - - - P5) resulted in significant changes in the activity of promastigotes TP. P2, P3, P4 and P5 reduced the specific activity of promastigotes Thymidine phosphorelase (TP). On the other hand, all tested products had inhibitory effects against DHFR activity, except P1, which increases the activity of promastigotes Dihydrofolate reductase (DHFR) to 106%. P3 has the highest inhibitory effect on promastigotes DHFR - activity, since it reduced DHFR activity to 34%. Inhibitory concentration 50 ( IC50 ) of the experimented compounds made remarkable changes in the morphology and dimensions of the parasite. Large vacuoles in the cytoplasm were observed in the parasites, which were treated with IC50 of P1. Cytoplasmic granulation and amorphous nuclei were observed in the parasites, which were treated with IC50 of P2. Assemblage of small vacuoles was observed in the parasites that were treated with IC50 of P3. On the other hand, parasites that were treated with IC50 of P4 appeared to contain single large vacuole that occupies large space of the cytoplasm, with amorphous nuclei. Maximum swell was observed in the promastigotes that were treated with IC50 of P4 and at lower extent with those treated with IC50 of P1, P5, and P2 respectively. The results of the present research showed that the position and type of the substituent on the synthesized rings of the tested products seemed to be critical for their antileishmanial activity.

دراسة كيموحيوية وجزيئية لانزيم Hyaluronidase المنتج من عزلات محلية لبكتريا Pseudomonas spp. == Biochemical and Molecular Study of Hyaluronidase Produced by Local Isolates of Pseudomonas spp

اسم المؤلف: ابية صباح صديق الدملوجي
اسم المشرف: لينة عبد الكريم الامير | غازي منعم عزيز
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 140 عينة من مصادر مختلفة تضمنت الادرار، والخمج، والجروح، والبراز، والقشع، والتهاب الاذن، والدم، وسائل من الرئة ، وللمدة من حزيران ولغاية ايلول 2005 وتم الحصول على 55 عزلة لبكتريا Pseudomonas spp. بنسبه عزل 39.3%, وكانت اعلى نسبة عزل من الخمج والجروح اذ بلغت 38.2%.2 - اختبرت حساسية العزلات المحلية لبكتريا Pseudomonas spp .اتجاه اثنا عشر مضادا للحيوية وقد ابدت العزلات مقاومة مختلفة ومتعددة للمضادات اذ كانت العزلات جميعها مقاومة لثلاثة مضادات هي : Ampicillin ، وAugmentin ، وRifampin . وكانت 82% من العزلات مقاومة ﻟ 6 - 9 مضادات ، بينما كانت 14.5% من العزلات مقاومة ﻟ 1 - 5 مضادات و3.7% من العزلات المحلية مقاومة ﻟ 10 - 12 مضادا. كما لوحظ ان اغلب العزلات كانت حساسة لمضاد Amikacin ثم Ciprofloxacin ثم Gentamycin وتباينت مقاومة العزلات ا تجاه بقية مضادات الحيوية المستعملة.3 - تم التحري عن انتاج عوامل الضراوة المختلفة للعزلات قيد الدراسة مثل : الهيمولايسين ، والايلاستيز، واليورييز ووجد ان نسبة انتاج الهيمولايسين كانت بحدود 78.1% متوزعة بشكل اساسي في نماذج الخمج والجروح ثم الادرار ، كما اتصفت العزلات المحلية بانتاجها لانزيم الايلاستيز وبنسبة 85.4% تمركزت عند عينات الخمج والجروح ثم الاذن والادرار اما نسبة انتاج اليورييز فكانت 80% للعزلات قيد الدراسة وكانت اغلبها عائدة لعينات الادرار والبراز ثم الخمج والجروح.4 - تم التحري عن انتاج انزيم الهيالورونيديز باستعمال وسط نقيع القلب والدماغ الحاوي على حامض الهيالورونك ، واتضح ان 72.7% من العزلات المحلية تمتلك القابلية على انتاج الانزيم توزعت بشكل اساسي في عينات الادرار ثم عينات الخمج والجروح والاذن.5 - درست العلاقة بين انتاج انزيم الهيالورونيديز مع عوامل الضراوة قيد الدراسة (الهيمولايسين ، والايلاستيز ، واليورييز) . واتضح ان 43.6% من العزلات الكلية كانت منتجة لهذه العوامل مع انزيم الهيالورونيديز بينما كانت 18.18% من العزلات الكلية منتجة لعاملي ضراوة وانزيم الهيالورونيديز وتميزت ست عزلات محلية بكونها منتجة لعامل ضراوة واحد مع انزيم الهيالورونيديز ، كذلك لوحظ ازدياد عدد المجموعات الخاصة بنسق توزيع عوامل الضراوة من 7 عند ربط ثلاثة عوامل فقط الى 11 عند اضافة عامل الهيالورونيديز اليها.6 - غربلت العزلات المحلية على وسط نقيع القلب والدماغ الصلب وانتخبت خمس عزلات لاعطاءها نسب تحلل عالية لحامض الهيالورونك. 7 - لوحظ عند دراسة النسق البلازميدي لخمسة عزلات محلية (P52, P2, P10, P27 ,P30) لبكتريا Pseudomonas spp. المنتجه لانزيم الهيالورونيديز باحتوائها على حزمة بلازميدية واحدة.8 - عند محاولة تحييد البلازميدات باستعمال صبغة بروميد الايثيديوم ، لوحظ اختفاء البلازمد من العزلة P2 باستعمال تركيز 2000 مايكروغرام/مليلتر من الصبغة ، وتم اختبار قدرة العزلة المحيدة في انتاج الهيالورونيديز واظهرت هذه العزلة قدرتها في انتاج الانزيم.9 - اختبرت العزلات المحلية (التي اعطت نسب تحلل عالية على الوسط الصلب) في الوسط السائل، وتم تقدير الفعالية النوعية لها بالاعتماد على طريقة Turbidimetric assay ، واختيرت العزلة المحلية P27 Pseudomonas spp. كونها الاغزر انتاجا اذ بلغت الفعالية النوعية لها 2.7 وحدة /ملغم بروتين واستعملت في التجارب اللاحقة.10 - حددت الظروف المثلى لانتاج الهيالورونيديز باستعمال وسط مرق نقيع القلب والدماغ المدعم ﺒ 0.5% مستخلص الخميرة و0.25 ملغم/مليلتر من مادة التفاعل (حامض الهيالورونك) برقم هيدروجيني 6 والملقح بعدد خلايا 1×106 خلية/مليلتر ، والحضن بالمزارع الهزازة بسرعة 50 دورة /دقيقة لمدة 18 ساعة.11 - نقي الهيالورونيديز المنتج من العزلة المنتخبة بخطوات تضمنت الترسيب باستعمال كبريتات الامونيوم بنسبة تشبع 50% ثم استخدام تقنيتي كروماتوغرافي التبادل الايوني باستخدام المبادل DEAE - Cellulose ثم الترشيح الهلامي بعمود Sephacryl S - 300 ، وتم الحصول على عدد مرات تنقية مقدارها 10.8 وبحصيلة انزيمية 20.4%.12 - درست بعض العوامل المؤثرة في فعالية وثباتية الانزيم المنقى اذ كان الرقم الهيدروجيني الامثل للفعالية 6 وثبات الانزيم 6 - 7 وظهرت اقصى فعالية للانزيم عند درجة حراره 40 م واحتفظ الانزيم بحدود 85 - 100% من فعاليته في درجات الحرارة (30 - 45) م ، واحتفظ الانزيم ﺒ 12% فقط من فعاليته عند حضنه بدرجة حراره 50 م لمدة 30 دقيقة. كما درس تاثير بعض الايونات الفلزية في فعالية الهيالورونيديز ، وجد ان لايونات الصوديوم بتركيزي 5 و10 ملي مولار فعلا تنشيطيا للانزيم اذ احتفظ الانزيم ﺒ 107% و102% من فعاليته على التوالي. بينما ثبطت فعالية الانزيم بصورة واضحة عند معاملته بايونات الحديديك Fe+3 ، اذ احتفظ الانزيم ﺒ 50% و15% من فعاليته عند معاملته ﺒ عند معاملته 5 و10 ملي مولار على التوالي ، فضلا عن ذلك لوحظ ان تاثير كل من : ايونات الحديدوز Fe+2 ، والنحاس Cu+2 ، والخارصين Zn+2 ، والزئبق Hg+2 كان اقل من الايونات السابقة، اذ احتفظ الانزيم ﺒ 60% , و53% , و74% , و66% من فعاليته عند معاملته بتركيز 10 ملي مولار لكل من الايونات على التوالي. كذلك احتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند معاملته بمادتي EDTA وازايد الصوديوم بتركيز 5 ملي مولار ، بينما احتفظ الانزيم ﺒ 95% و76% من فعاليته عند معاملته ﺒ 5 ملي مولار من المركب Phenyl methane sulphonyl fluoride والسيستايين. | 1 - A total of 140 Samples including urine infections wounds, burns, sputum, blood, stool and lung fluid samples were collected from different hospitals and medical centers in Baghdad city, during the period June _September 2005. Fifty five isolates belonged to Pseudomonas spp.(40.7%) of which 38.2% belonged to infections and wound samples.2 - Sensitivity of local Isolates was examined against 12 antibiotics, Results showed different and multi resistance patterns to antibiotics. All isolates were resistant to Ampicillin , Augmentin and Rifampin. 82% of which were resistant to 6 - 9 antibiotics, while 14.5% of the isolates were resistant to 1 - 5 antibiotics and only 3.7% were resistant to 10 - 12 antibiotics. Amikacin, Ciprofloxacin and Gentamycin were found to be the most effective agents against most of the isolates.3 - Detection of some virulence factors (hemolysin, elastase and urease) by the local isolates was studied. Results showed that 78.1% of the isolates produced hemolysin (mainly infection and wound isolates, then urine isolates). 85.4% of were mainly elastase producers (wound and infection, ear and urine). Results also showed that 80% of isolates were able to produce urease mostly belonged to urine, stool and infection and wound isolates.4 - Detection of the ability of Pseudomonas spp.local isolates to produce hyaluronidase enzyme by using Brain heart infusion (BHI) agar that contains hyaluronic acid was studied. 72.7% of the isolates were able to produce the enzyme.5 - The relation between hyaluronidase production and other virulence factors (hemolysin, elastase and urease) was studied. The results showed that 43.6% of the isolates produced the three studied virulence factors with hyaluronidase, while 18.18% of the isolates produced two of the virulence factors with hyaluronidase, and onlysix isolates produced one virulence factor and hyaloronidase. The results also showed that the groups concerning virulence factors increased from 7 to 11 when the hyaluronidase was added as a forth virulence factor.6 - Five isolates (P27, P30 , P10 , P2, P52) of Pseudomonas spp.producing hyaloronidase were selected to carry out studies on the plasmid profile. Results showed that all five isolates contained one plasmid.7 - The results of plasmid curing by using ethidium bromide showed that the plasmid of the local isolates P2 was curried by treatment with 2000μg/ml ethidium bromide, the curried isolate kept the ability to produce hyaluronidase. 8 - Five local isolates that gave large inhibition zones on (BHI) agar were chosen for specific activity determination by using submerged cultures. The local isolate P27 was chosen to be the most producing one, it’s specific activity was 2.7 unit/mg protein.9 - The optimum conditions for hyaloronidase production determined by using submerged cultures. Results showed that the optimum media for hyaluronidase production was (BHI) broth containing 0.5% yeast extract and 0.25 mg/ml hyaluronic acid with an inoculum of 1×106 cell/ml at an optimum pH 6, after 18 hours incubation in a shaker incubator 50 cycle/min.10 - Hyaloronidase was purified from selected local isolate by using several steps including concentration by ammonium sulphate in saturation percentage of 50%, this step was followed by DEAE - Cellulose ion exchange chromatography technique and gel filtration technique using sephacryl S - 300 colum. Purification fold and recovery were 10.8 and 20.4% respectively.11 - The optimum pH for enzyme activity and stability was 6 and 6 - 7 respectively. Maximum enzyme activity was obtained at 40C º and the enzyme retained 85 - 100% and 12% of it’s initial activity at (30 - 45) Cº and 50 C º respectively.12 - The effect of some metal ions on hyaluronidase activity was studied, 5 and 10 mμ of Na+2 increased enzyme activity to 107% and 102% respectively, while the enzyme kept only 50% and 15% of it’s initial activity when treated with 5 and 10 mμ of Fe+3 respectively. The enzyme also retained 60%, 53%, 74% and 66% of it’s activity when treated with 10mμ of Fe+2, Cu+2, Zn+2 and Hg+2 respectively. EDTA and sodium azide showed no effect on hyaluronidase activity, while retained only 95% and 76% of it’s initial activity when treated with 5 mμ of PMSF and cysteine respectively.

دراسة السمية الوراثية لحبوب منع الحمل على الانسان والفئران البيض == Study the genotoxicity for oral contraceptive pills on human and white mice

اسم المؤلف: اسراء ايوب علوان منصور القره غولي
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي | سعد محمد الندا
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الهدف من الدراسة الحالية هو تسليط الضوء على التاثيرات الوراثية الخلوية لحبوب منع الحمل الفموية المركبة على عينات دم ماخوذة من نساء اعتمدن هذا العقار كمانع حمل وفي الحيوانات المختبرية (الفار الابيض) بوصفه نظاما اختباريا ، وتم الاعتماد على بعض التحليلات الوراثية الخلوية شملت الانحرافات الكروموسومية في خلايا نقي العظم والطحال ، الانوية الصغيرة ومعامل الانقسام بالاضافة الى تشوهات الهيكل العظمي للاجنة في الفار الابيض، والانحرافات الكروموسومية ، الانوية الصغيرة ومعامل الانقسام في عينات دم الانسان . درست التاثيرات الوراثية لمجموعة من النساء بفئتين عمرية مختلفة بين )25 - 34) و(35 - 45) سنة والتي قسمت الى اربع مجاميع ، اظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي باحتمالية (P<0.05) في النسبة المئوية للانحرافات الكروموسومية الكلية لمجموعة من النساء اللواتي ياخذن حبوب منع الحمل المركبة (COCPs) ذوات الفئة العمرية )25 - 34) سنة ، بينما اظهرت وجود فرقا معنويا في النسبة المئوية للانحرافات الكروموسومية للنساء ذوات الفئة العمرية (35 - 45) سنة . كذلك لوحظ وجود فرق معنوي باحتمالية (P<0.05) في اعداد الانوية الصغيرة (MN) لمجموعة من نساء ياخذن (COCPs) في كلا الفئتين العمريتين. في التجربة الاخرى درست التحليلات الوراثية الخلوية (الانحرافات الكروموسومية) للمانع (COCPs) على الفئران، التي قسمت الى خمس مجاميع شملت مجموعة السيطرة السالبة التي تمثل الحيوانات المجرعة بدارئ (PBS) ومجموعة السيطرة الموجبة المعاملة بعقار السايكلوفوسفومايد (CP) وثلاث مجاميع معاملة بالمانع (COCPs) بالتراكيز(2.44), (1.25) (0.60) , ملغم / كغم ، اشارت النتائج ان التركيزين (2.44), (1.25) ملغم / كغم سجلا فروقا معنوية باحتمالية (P<0.05) في نسبة الانحرافات الكروموسومية بينما لم تسجل المجموعة ذات التركيز (0.60) ملغم / كغم فرقا معنويا في نسبة الانحرافات الكروموسومية لخلايا نقي العظم والطحال . واظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروقا معنوية باحتمالية (P<0.05) للجرع المختلفة للمانع (COCPs) على اعداد الانوية الصغيرة اذ كانت معدلات اعداد الانوية الصغيرة هي (1.26) , (2.50) , (3.53) للجرع ذات التراكيز (2.44) ،(1.25) ، (0.60) ملغم /كغم على التوالي. وكذلك اظهرت النتائج ان هناك فروقا معنويا باحتمالية (P<0.05) في معدل اوزان اجنة فئران المجاميع المدروسة ، فقد اظهرت مجموعة السيطرة السالبة اعلى معدل وزن للاجنة بلغ (1.55) غم، في حين سجلت معاملة السيطرة الموجبة اقل معدل وزن بلغ (0.56) غم. بينما كانت معدلات اوزان الاجنة للمجاميع المجرعة بالمانع ((COCPs ذات التراكيز (0.60) , (1.25) , (2.44) ملغم /كغم هي (1.34) , (1.32) (1.40),غم على التوالي . اما بالنسبة لحساب عدد هلاكات الاجنة فلم يوجد اي تاثير ملحوظ لحبوب منع الحمل المركبة (COCPs) على هلاكات الاجنة في حين ظهرت الهلاكات بنسبة عالية جدا في السيطرة الموجبة ، لكن عند دراسة تاثير حبوب منع الحمل المركبة على الهيكل العظمي للاجنة لم نلحظ اي تشوهات بالهياكل العظمية لجميع اجنة الفئران للمجاميع الثلاث المعاملة بحبوب منع الحمل المركبة . | Our work aimed to study the cytogenetic effects of Combined oral contraceptive pills (COCPs) on blood samples obtained from women utilized this contraceptive and lab animals (mice) treated with (COCPs). Several cytogenetic analyses (Chromosome aberrations of bone marrow and spleen , Micronuclei , Mitotic index and skeleton abnormal of embryos) in mice and (CA , MN , MI) in blood samples of human were used in this study . Studied the genetic effect for women in two age groups rang between (25 - 34) , (35 - 45) years in four groups. Result show non significant difference (P<0.05) in percentage of total chromosome aberration in women taking (COCPs) of age group rang between (25 - 34) years. While show significant differences (P<0.05) in percentage of (CA) in women of age group rang between (35 - 45) years. Also it was noticed significant differences (P<0.05) in Micronuclei (MN) of women taking oral contraceptive pills of two age groups. In other experiment studied the cytogenetic analysis for (COCPs) on mice that were divided into five groups as follows : Negative control group that animals orally treated with PBS buffer, Positive control group was treated with (CP) and three groups treated with (COCPs) with concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg and the result show was concentration (2.44) , (1.25) mg/kg recorded significant differences (P<0.05) while group with concentration (0.60) mg/kg non significant difference. also it was noticed Significant differences (P<0.05) in three groups treated with (COCPs) in Micronuclei rate and were the rates (3.53%) , (2.50%) , (1.26%) of concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg. Also result show statistically significant differences (P<0.05) in body weight of mice embryo of studied groups, Negative control group recorded rate highly in embryo body weight was (1.55) gm. While recorded Positive control group rate less in weight was (0.56) gm while were rates in embryo body weight of orally treated groups with (COCPs) with concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg were (1.40) , (1.32) , (1.34) gm . but non show any influences to (COCPs) in embryo number .while show died embryos in positive control group. also the results show non any abnormality in skeleton of embryos for three groups that treated with oral contraceptive pills.

العلاقة بين مرض قصور الدرقية ومقاومة الانسولين بدلالة بعض المؤشرات الالتهابية == The relationship between hypothyroidism and insulin resistance through some inflammatory markers

اسم المؤلف: شيماء رزاق ابراهيم
اسم المشرف: صباح ناصر العلوجي | خالد ابراهيم اللهيبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمتاز مرض قصور الدرقية بانخفاض مستوى هرمونات T3 وT4 الضرورية لعمليات انتاج الطاقة وحيوية الجسم ؛ لذلك ترافق هذه الحالة اضطرابات في عمليات الايض المختلفة في الجسم . اجريت الدراسة في المركز التخصصي للغدد الصم والسكري في بغداد ، وشملت 70 مريضا من مرضى قصور الدرقية ، تم تشخيص الحالة لديهم عن طريق قياس مستويات الهرمونات (TSH,T4,T3) . كما وشملت 60 شخصا اختيروا بشكل عشوائي من غير مرضى الغدة ، وقد تم التاكد من سلامة الغدة وعدم وجود قصور في وظيفتها لديهم. تضمنت الدراسة الكشف عن نسبة حدوث مقاومة الانسولين لدى مرضى الغدة ومقارنتها مع نسبة حدوثها لدى الافراد الاصحاء الغدة. وقد تم تشخيص مقاومة الانسولين باستخدام اختبارات (الببتيد الرابط C - peptide واختبار تحمل الكلوكوز الفموي Oral glucose tolerance test (OGTT) ، اذ ان ارتفاع مستوىCP والتحمل الضعيف للكلوكوز Impaired glucose tolerance (IGT) يشيران الى مقاومة مؤكدة للانسولين Definite insulin resistance (DIR) ، في حين وجود اضطراب في نتيجة احدهما يشير الى مقاومة ممكنة للانسولين Possible insulin resistance (PIR) . تشير نتائج الدراسة الحالية الى ان كلتا الحالتين المرضيتين (القصور الدرقي ومقاومة الانسولين) مترافقتان وشائعتان لدى النساء وكبار السن وكذلك لدى الافراد من فئة المفرطي الوزن (BMI=25 - 29.9 kg/m2) والبدناء(BMI>30 kg/m2) ، فقد وجد ان اغلب مرضى قصور الدرقية المؤكدي المقاومة للانسولين هم من الفئات العمرية 40 - 21 سنة و60 - 41 سنة وقد شكلوا نسبة %38.5 لكل فئة وكان اغلبهم من النساء ، وشكلوا نسبة %84.6 بالمقارنة مع نسبة %15.4 للذكور . اما المرضى الممكني المقاومة للانسولين فكان اغلبهم من الفئة العمرية 60 - 41 سنة وشكلوا نسبة %66.7 واغلبهم من النساء ايضا وشكلوا نسبة %77.8 بالمقارنة مع نسبة %22.2 للذكور . كذلك يلاحظ ان اغلب المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين هم من فئة البدناء وشكلوا نسبة %53.8 واغلب المرضى الممكني المقاومة للانسولين هم من فئة المفرطي الوزن وشكلوا نسبة %51.9 . وجد من نتائج البحث ارتفاع نسبة حدوث مقاومة الانسولين لدى مرضى قصور الدرقية ، فقد وجد ان %18.6 منهم لديه مقاومة مؤكدة للانسولين ، في حين كانت النسبة اقل بلغت %3.3 لدى الافراد الاصحاء الغدة . وبلغت نسبة المرضى الذين لديهم مقاومة ممكنة للانسولين %38.6 بالمقارنة مع نسبة %25 للافراد الاصحاء . وهي نسبة مرتفعة تؤكد دور قصور وظيفة الغدة الدرقية في نشوء مقاومة الانسولين. تضمنت الدراسة كذلك قياس مستويات بعض المؤشرات البايوكيميائية والمناعية لدى مرضى قصور الدرقية المؤكدي او الممكني المقاومة للانسولين ومقارنتها مع مستوياتها لدى افراد السيطرة الاصحاء. وشملت هذه المؤشرات قياس مستوى الكلوكوز في حالة الصيام ، وCP ، وانواع الدهون ، واختبار OGTT ، وHbA1c ، وTNF - α ، وIL - 6 ، وCRP ، والنسبة المئوية لذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي . اظهر مرضى قصور الدرقية الذين لديهم مقاومة مؤكدة للانسولين تحملا ضعيفا للكلوكوز Impaired glucose tolerance (IGT) وذلك من نتائج اختبار OGTT ، وكذلك ارتفاعا في مستوى الكلوكوز في حالة الصيام بلغ 1.24±5.77 مليمول/ لتر ، وارتفاع مستوى CP بلغ 1.71 ±5.39 نانوغرام/ مليلتر ، وارتفاع معنوي في مستوى HbA1c والبالغ 0.84± %5.86 ، وقد كان مستوى هذه المؤشرات لدى هذه المجموعة اعلى من مستوياتها لدى المجموعتين الاخريين (NIR,PIR) وبالمقارنة مع السيطرة . شملت مجموعة مرضى قصور الدرقية الممكنة المقاومة للانسولين %10 لديهم مستوى مرتفع لـ CP و%28.6 لديهم تحمل للكلوكوز ضعيف (IGT) ، وبشكل عام اظهرت هذه المجموعة ارتفاعا معنويا عاليا في مستوى الكلوكوز في حالة الصيام بلغ 1.97±5.63 مليمول/ لتر وارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى CP ، اذ بلغ 2.82±3.83 نانوغرام/ مليلتر ، وارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى HbA1c والبالغ 1.62±%6.21 . اما بالنسبة لاختبار ذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي ، فقد لوحظ ارتفاع معنوي عال في نسبتها لدى مجاميع المرضى المقاومة للانسولين مؤكدة او ممكنة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اوضحت دراسة المؤشرات المناعية وجود نمط التهابي تحت سريري لدى مرضى قصور الدرقية المؤكدي المقاومة للانسولين ، وذلك من الارتفاع المعنوي العالي(P<0.01) لمستويات كل من TNF - α وIL - 6 التي بلغت 1.02± 6.46 بيكوغرام / مليلتر و2.14 ±50.6 بيكوغرام / مليلتر على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اما مستوى البروتين الفعال سي C - reactive protein (CRP) فقد لوحظ ارتفاع مستوياته لدى مرضى قصور الدرقية جميعا سواء كانوا من المقاومين ام غير المقاومين للانسولين ، مما يشير الى كونه عاملا التهابيا غير نوعي له ارتباط بمرض قصور الدرقية ولكن ليس له دور في التفريق بين الحالات المقاومة وغير المقاومة للانسولين . اظهرت دراسة العلاقات الترابطية بين المؤشرات البايوكيميائية والمناعية التي تم قياسها لدى مجاميع الدراسة وجود علاقة ترابطية سالبة معنوية (P<0.05) بين CP وكل من HbA1c وT.Ch وHDL - C وF.G (P<0.01) . كذلك وجدت علاقة ارتباطية ايجابية معنوية عالية (P<0.01) بين TNF - α وكل من T.Ch وLDL - C ، وعلاقة ارتباط سالبة معنوية عالية (P<0.01) بين TNF - αو TSH لدى مجموعة المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين . وفي مجموعة المرضى الممكني المقاومة للانسولين لوحظ وجود علاقة ارتباطية ايجابية معنوية (P<0.05) بين مستوى IL - 6 وBMI وF.G و(P<0.01) HbA1c . اما بالنسبة للبروتين الفعال سي فقد لوحظ وجود علاقة ارتباطية سالبة معنوية (P<0.05) بين مستواه ومستوى T.Ch وعلاقة ارتباطية ايجابية معنوية (P<0.05) بين CRP وكل من F.G وCP لدى مجموعة المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين و(P<0.01) TNF - α لدى مجموعة المرضى الممكني المقاومة للانسولين. اظهرت الدراسة ارتفاع العامل الالتهابي IL - 6 لدى المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين ونظرا لدوره المهم في العمليات الايضية المختلفة في الجسم ؛ لذلك وجد انه من الضروري دراسة تاثيره في وظيفة الغدة الدرقية وفعاليات اخرى ومقارنته مع تاثير عقار الكاربيمازول . وقد تم ذلك عن طريق حقن ثلاث مجاميع من الجرذان ، الاولى بالانترلوكين - 6 ، والثانية بعقار الكاربيمازول ، والثالثة بالمحلول الملحي الفسيولوجي بوصفها سيطرة. بينت هذه التجربة ان كل من الانترلوكين - 6 والكاربيمازول يسببان انخفاض مستويات هرمونات الدرقية (T4,T3) عند حقنها في الحيوانات ، كما ويسببان انخفاضا معنويا في وزن الجسم في حين لم يكن لهما تاثير في وزن الكبد. لوحظ انخفاض مستوى الكلوكوز في الدم لدى الحيوانات المحقونة بعقار الكاربيمازول ، بينما لم يحدث تغير في مستواه بتاثير الانترلوكين - 6 . اما بالنسبة لانواع الدهون فقد لوحظ ارتفاع معنوي لمستوى كل من T.G وVLDL - C لدى الحيوانات المعاملة بالانترلوكين - 6 ، في حين لم تتاثر مستويات الدهون في الحيوانات المعاملة بالكاربيمازول. واخيرا ادى حقن الحيوانات بالانترلوكين - 6 والكاربيمازول الى زيادة ذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي . | Hypothyroidism is a condition in which thyroid hormones levels decreased in the blood. These hormones are necessary for energy production and body viability. In many occasions this condition is accompanied or followed by different metabolic disorders. The current study is conducted in the "Specialized center for endocrinology and diabetes" and carried on 70 hypothyroid patients and 60 randomly chosen individuals with normal thyroid function .Both groups were submitted to laboratory tests to evaluate thyroid function (T3,T4.TSH). The study involved evaluation of the relationship between hypothyroidism and insulin resistance (IR) . Health problem related to many diseases , became common lately. Insulin resistance diagnosed through two important tests : C - peptide (CP) and oral glucose tolerance test (OGTT). Patients are considered to have definite insulin resistance (DIR), if they have impaired glucose tolerance (IGT) and high level of CP. If one of the tests is abnormal, the patients have possible insulin resistance (PIR). The current study show that both conditions (hypothyroidism and insulin resistance) are associated and common in women, old and overweight individuals. The results show that most hypothyroid patients with DIR are at age between 21 - 40 and 41 - 60 year, which constitute about 38.5% for each. Most of them are women constituting 84.6% compared with 15.4% for men. Most hypothyroid patients with PIR are in the ages between 41 - 60 year, constituting 66.7%. The women constitute about 77.8% compared with less percentage for men 22.2%. Also we should notice that most definite insulin resistant hypothyroid patients are obese , and constitute about 53.8% , and most possible insulin resistant hypothyroid patients are overweight, and constitute about 51.9% Insulin resistance incidence is increased in hypothyroid patients, the results show that 18.6% of hypothyroid patients have DIR compared with less percentage 3.3% in healthy individuals , and about 38.6% hypothyroid patients have PIR compared with 2.5% in healthy individuals This study also considered some biochemical and immunological parameters which include : Fasting blood glucose, (FBG), CP, Lipid profile, OGTT, HbA1c, TNF - α, IL - 6, CRP and percentage of lymphocytes apoptosis in peripheral blood. The levels of these parameters are compared between the study groups. Hypothyroid patients with DIR show impaired glucose tolerance (IGT) and high level of fasting glucose reaching 5.77±1.24 mM/l , high level of CP reaching 5.39±1.71 ng/ml and high level of HbA1c reaching 5.86% ±0.84 .The values of these parameters in this group are higher when compared with other groups and control. About 10% of hypothyroid patients with PIR have high level of CP and 28.6% have IGT. In general, PIR hypothyroid patients show a significant (P<0.01) increase in F.G reaching 5.63±1.97 mM/l , significant (P<0.01) increase in CP level reaching 3.83 ±2.82 ng/ml , and significant increase in HbA1c reaching 6.21% ±1.62. The results of peripheral lymphocytes apoptosis test show significant (P<0.01) increase in hypothyroid patients (DIR or PIR) compared to control group. The results show a significant (P<0.01) increase in levels of TNF - α reaching 6.46±1.02 pg/ml and 50.6±2.14 pg/ml respectively , in hypothyroid patients with DIR compared to control and the high levels of these parameters refer to subclinical inflammation . The non - specific inflammatory marker CRP , which refers to systemic inflammation , also increases in all hypothyroid patients (Insulin resistant or none) The current study also includes the study of correlations between. biochemical and immunological parameters in the study groups. The results show that there was a negative significant correlation between CP and each of : HbA1c, T.G, HDL - C (P<0.05) and F.G (P<0.01). There was a positive significant correlation between TNF - α and each of T.Ch, LDL - C (P<0.01) and negative significant correlation between TNF - α and TSH (P<0.01) in DIR hypothyroid patients. Patients with PIR show positive significant correlation between levels of IL - 6 and each of : BMI, F.G (P<0.05) and HbA1c (P<0.01). In DIR hypothyroid patients, the CRP correlates negatively and significantly with T.Ch (P<0.05) and correlate positively and significantly with F.G and CP (P<0.05). In PIR hypothyroid patients, the CRP correlate positively and significantly with TNF - α (P<0.01). Since the inflammatory marker (IL - 6) increased in insulin resistant cases and known by its critical role in different metabolic reactions in the body, therefore, this study involves a design for an experiment to detect the thyroid gland function and compare its effects with the effect of Carbimazole : An antithyroid drug. The experiment include three groups of rats, each injected with different material : Recombinant human interleukin - 6 (rhIL - 6), Carbimazole , Normal saline (N.S) as control . The results of the experiment show that both IL - 6 and carbimazole cause a decrease in the levels of thyroid hormones (T3,T4) in animal blood , and cause a significant decrease in animal body weight , but there is no effect on the liver weight . There was a significant decrease in glucose level in the animals injected with carbimazole, while in the IL - 6 treated animals there was no change in glucose level. There was a significant increase in the Triglyceride (T.G) and very low density lipoprotein cholesterol (VLDL - C) in the animals treated with IL - 6 , while in the animals treated with carbimazole , there was no change . Finally, injection of the animals with IL - 6 or carbimazole causes significant increase in lymphocyte apoptosis in peripheral blood.

تاثير فيتامين E في تنشيط معالم النطف في الزجاج لمرضى العقم المصابين بقلة النطف ووهنها == Effect of Vitamin E on in Vitro Sperm Activation of Oligospermic and Asthenospermic Infertile Patients

اسم المؤلف: ضرغام فالح حسن الشمرتي
اسم المشرف: صباح ناصر العلوجي | يحيى كاظم السلطاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة على 217 عينة من عينات السائل المنوي التي تعود الى 207 من المرضى الذين يعانون من قلة النطف Oligospermia ، ووهن النطف Asthenospermia ، وابيضاض المني Leukospermia من مراجعي المختبر الاستشاري لكلية الطب في جامعة الكوفة ، للمدة مابين تشرين الاول 2007 وايار 2008. وتم في هذه الدراسة تنشيط النطف البشرية لاولئك المرضى في الزجاج in vitro باستعمال تقنيتين مختلفتين هما : تقنية السباحة للاعلى وتقنية الخلط technique Mixing ولمدة تحضين مقدارها ثلاثين دقيقة في المستنبت ايرل للمرة الاولى ومستنبت ايرل + فيتامين E للمرة الثانية ، ومن ثم بيان تاثير فيتامين E في معالم النطف ، وكذلك بيان تاثير الالتهابات في معالم النطف قبل العلاج وبعده. اظهرت نتائج علاج المرضى الذين يعانون من ابيضاض المني حصول انخفاض معنوي (0.05 >P) في تركيز خلايا الدم البيض والخلايا البلعمية ، في حين كان الانخفاض غير معنوي (0.05 <P) في زمن الاماعة قياسا بقيمتها قبل العلاج فضلا عن حصول تحسن معنوي (0.05 >P) في تركيز النطف ، والنسبة المئوية للنطف المتحركة ، ومعامل حركة النطف ، ودرجة نشاط النطف قياسا بقيمتها قبل العلاج وكذلك عند اجراء عملية التنشيط قبل العلاج وبعده. اشارت نتائج تنشيط نطف المرضى الذين يعانون من قلة النطف (الحاد والمعتدل) ووهن النطف (الحاد والمعتدل) باستعمال تقنية السباحة للاعلى وتقنية الخلط (مستنبت ايرل لوحده ومستنبت ايرل+ فيتامين E) حصول تحسن معنوي (0.05 >P) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف ومعامل حركة النطف عند المقارنة بقيمتها قبل التنشيط. اشارت نتائج تنشيط نطف المرضى الذين يعانون من قلة النطف (الحاد والمعتدل) ووهن النطف (الحاد والمعتدل) باستعمال تقنية السباحة للاعلى (مستنبت ايرل لوحده ومستنبت ايرل+ فيتامين E) حصول انخفاض معنوي (0.05 >P) في تركيز النطف وتركيزخلايا الدم البيض عند المقارنة بقيمتها قبل التنشيط ، في حين لم تكن هناك فروقات معنوية في المعلمين المذكورين عند استعمال تقنية الخلط . اشارت نتائج تنشيط نطف المرضى الذين يعانون من قلة النطف (الحاد والمعتدل) ووهن النطف (الحاد والمعتدل) باستعمال تقنية السباحة للاعلى (مستنبت ايرل لوحده ومستنبت ايرل+ فيتامين E) حصول تحسن معنوي (0.05 >P) في النسبة المئوية للنطف السوية المقارنة بقيمتها قبل التنشيط ، في حين لم تكن الفروق معنوية في النسبة المذكورة عند استعمال تقنية الخلط . كما لوحظ حدوث تحسن معنوي (0.05 >P) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ، ودرجة نشاط النطف ، ومعامل حركة النطف في عملية التنشيط في تقنيتي السباحة للاعلى والخلط عند استعمال مستنبت ايرل ممزوجا مع فيتامين E عند مقارنتها بتلك التي استعمال فيها مستنبت ايرل لوحده ، في حين كان هناك تحسن معنوي (0.05 >P) في تركيز النطف في تقنية السباحة للاعلى عند استعمال مستنبت ايرل مع فيتامين E عند مقارنتها بتركيز النطف عند استعمال مستنبت ايرل لوحده. يستنتج من هذه الدراسة ان العمل على تنشيط النطف البشرية بعد علاج الالتهابات يعطي نتائج افضل بكثير من التنشيط قبل العلاج ، لما لخلايا الدم البيض والخلايا البلعمية من تاثير مهم في معالم النطف . كذلك فان اضافة فيتامين E الى مستنبت ايرل اثبت من الدراسة كفاءة عالية في الحصول على قيم جيدة لمعالم النطف سواء عند تنشيط نطف مرضى العقم المصابين بقلة النطف (الحاد والمعتدل) او نطف المصابين بوهن النطف (الحاد والمعتدل). | This Study was performed on 217 seminal fluid samples belongs to 207 patients suffering from Oligospermia , Asthenospermia and Leukospermia at the consulting Laboratory of College of Medicine Kufa University during the period between October, 2007 and May, 2008. The objective of the persent study is to activation patient sperms quality in vitro by using two different techniques which are the swim - up technique and mixing technique for 30 minute of incubation in Earl’s medium and Earl’s medium + vitamin E to findout the effect of vitamin E on the sperms parameter. Althow, also the effects of infection on the sperm parameter before and after treatment ware evaluated also. . The results showed that the treatment of patient suffering from leukospermia showed revealed significant decrease (P<0.05) in the leukocyte and phagocyte concentration. However, the decrease was insignificant at the time of liquification in comparison with thar used befor treatment . Also a significant improvement (P<0.05) was found in sperm concentration, sperm motility percent, sperm motility index and sperm grade activity in comparison to that resulted befor treatment, as well as that done at the process of activation before and after the treatment. . The sperm activation of patients suffering from Oligospermia (severe and moderate) and Asthenospermia(severe and moderate) by using the swim - up technique and mixing technique (Earl’s media and Earl’s media + vitamin E) showed that there was a significant improvement (P<0.05) in the sperm motility percent, sperm grade activity, sperm motility index in comparison to its result befor activation. The result of sperm patients suffering from Oligospermia (severe and moderate) and Ashenospermia (severe and moderate) by using the swim - up technique (Earl’s media and Earl’s media + vitamin E) showed that there was a significant decrease (P<0.05) in sperm concentration and leukocyte concentration in comparison to that used before activation. However, the results were not significant in both mentioned parameter when mixing technique was used. The result of sperm activation of patients suffering from Oligospermia (severe and moderate) and Asthenospermia(severe and moderate) by using the swim - up technique (Earl’s media and Earl’s media + vitamin E) showed that there was a significant improvement (P<0.05) in the normal sperm morphology percent in comparison to its result befor activation. However, the sperm percent was not significant when mixing technique was used. Also, a significant improvement was noticed(P<0.05) in the sperm motility percent, sperm grade activity and sperm motility index by using ng both techniques swim - up and mixing when Earl’s media was mixed with vitamin E in comparison to the process of activation in both techniques when only Earl’s media was used. However, there was a significant improvement (P<0.05) in sperm concentration swim - up technique by using Earl’s media and vitamin E when compared to that in which only Earl’s media was used . It was concluded that using a human sperm activation after the treatment of infection and inflammations can give a better results than that when used before the treatment as the presence of leukocytes and phagocytes considered important in sperm parameters . Also, it was found that the addition of vitamin E to Earl’s media improve the sperm parameters and their activation in infertile patients suffering from Oligospermia (severe and moderate) and Asthenospermia (severe and moderate)

التاثيرات المرضية للذيفان الخلوي المستخلص من بكتريا Campylobacter jejuni المعزولة محليا == Pathological Effects of the Cytotoxin Extracted from a Locally Isolated Campylobacter jejuni

اسم المؤلف: سيناء محمد علي السباهي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was done to investigate the presence of Campylobacter jejuni in bloody diarrheal stool collected from hospitalized children with gastroenteritis. Campylobacter was isolated from only 4 specimens of a total number of 186; upon identification three isolates were identified as C. jejuni while the fourth isolate was found to be C. coli.Isolation of campylobacters was done using a locally prepared modified, blood - free, charcoal selective medium. It was the first time in which such medium was used for cultivating Campylobacter locally. The efficacy of this medium was very clear in comparison with the ordinarily used blood containing medium for inhibiting almost all fecal flora.Biochemical and physiological tests were used to identify and differentiate C. jejuni from the other Campylobacter species. The antibiotic sensitivity test showed that all isolates were sensitive to erythromycin, chloramphenicol, amikacin and ciprofloxacin, while resistance was found for cephalothin, ceftriaxone cefotaxime, ampicillin and trimethoprim.Tissue culture technique was used to determine C. jejuni of high cytotoxin productivity using continuous cell lines (HeLa and Vero cell lines); this isolate was used for further investigations in the study.In this study, the cytotoxin of the highest cytotoxin producing C. jejuni isolate was extracted locally for the first time and purified, using gel filtration chromatography with Sephadex G100.The purified cytotoxin revealed a single band which was observed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) under the denaturing conditions. The molecular weight of the purified cytotoxin was approximately equal to 43 KDa as determined by PAGE.Using newly hatched chicks (as an animal model),the ID50 value was 3.71x10 4 cfu /ml. The ID50 decreased from 3.71x10 4 to 1.66 x 10 3 cfu/ml when 50 μg of cytotoxin was mixed with the bacterial suspension, this result reflects the role of cytotoxin on the pathogenesis of C. jejuni infection.In the present study, oral inoculation of newly hatched chicks with the C. jejuni isolate resulted in clinical and histopathological damages leading to bloody diarrhea similar to that observed in humans infected with C. jejuni.The post - mortal examination of chicks' viscera showed an accumulation of fluid in chick intestines which were distended with watery fluid; also there was obvious hepatomegaly with yellow spots, and swelling of the gall bladder. The associated infection with the C. jejuni cells and their cytotoxin induced more progressive tissue damage represented by a more severe intestinal distension and congestion.The histopathological examination of the small and large intestine of chicks infected with Campylobacter cells, showed mucosal sloughing, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells in the mucosal and submucosal layers, and accumulation of edematous fluid in the mucosal layer. The examination of chicks infected with Campylobacter cells and the cytotoxin revealed the presence of the same lesion, but more severely with the presence of hemorrhage in the lumen. These results could be important evidence of the role of cytotoxin as a virulence factor on the pathogenicity of C. jejuni

دراسة بعض الجوانب المناعية لبكتريا Listeria monocytogenes المعزولة محليا == Some Immunological study 0n Listeria monocytogenes isolated Locally

اسم المؤلف: ميادة فرحان درويش
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية التحري عن بكتريا Listeria monocytogenes في (148) عينه سريريه تضمنت( 123) عينة من مسحات مهبل عليا (High Vaginal Swab)، و25 عينة مشيمه (Placenta) من النساء المجهضات، وتم الحصول على اربعة عزلات من مسحات المهبل العليا بنسبة ( 2.70) % في حين لم تعزل من عينات المشيمه ، وتم تشخيص العزلات كيموحيويا وزرعت على الاوساط الانتقالية والتفريقية واختبرت حساسيتها للمضادات الحيوية المختلفة. اذ ظهر ان العزلات حساسه جميعها لمضادات الامبسلين والجنتاميسين ومقاومه لمضادات حامض النالدكسيك واللنكومايسين ، ودرست قدرة العزلات البكتيرية على استحثاث الجهاز المناعي في الفئران المختبرية المحقونة باحد العزلات من خلال اجراء عدد من الاختبارات المناعية ومنها الفعالية البلعمية، وقابلية التحول اللمفاوي، وفرط الحساسية الاني والاجل، اظهرت النتائج ان العزلة التي اعطيت الرمز M4 - Lis هي الاكفا بين العزلات . حضرت اللقاحات من بكترياListeria monocytogenes العزله Lis - M4 بطريقة التضعيف (Live attenuated listeria) ولاول مرة محليا ، وكذلك حضرت بطريقة القتل بالحرارة ( listeria Heat killed) . تم حساب قيمة الجرعة القاتلة النصفية للفئران المحقونة بالعالق البكتيري العزله Lis - M4 والجرعه القاتله النصفيه اللقاح الحي المضعف واللقاح المقتول بالحراره المحضرين منها على النحوالاتـي (107×2.12 , 107×3.3 , 104×2.6) وحدة مكونه للمستعمرات / 1مليلتروعلى التوالي. وتم اختيار التركيز 107و 106 , 108 لغرض تقويم التركيزالاكفا في تعزيز الاستجابة المناعية .قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في الفئران باستخدام الفحوصات الاتية فحص التحول اللمفاوي ، اختبار البلعمة ، واختبار فرط الحساسية الاني والاجل ، كما تم قياس الفعالية النوعية لانزيم الادينوسين دي امينيزAdenosin deaminase (ADA) وباستخدام تراكيز ثلاث CFU 108 , 107 , 106 في 1 مليلتر من اللقاحين والعالق البكتيري وبواقع ثلاث فئران لكل معاملة مع وجود مجموعة سيطرة حقنت بماء الملح الوظيفي . اظهرت النتائج ان اللقاح الحي المضعف هوالاكفاء وباستخدام جرعة منشطة واحدة بعد ثمان ايام من التلقيح حيث ظهر اعلى معدل لنسب الخلايا البلعمية الملتهمة واعلى نسب للخلايا اللمفاوية المتحولة واعلى معدل في تفاعل فرط الحساسية المتاخر والاني ، واعلى معدل للفعالية النوعية لانزيم ADA ، وان زيادة عدد جرع اللقاح المقتول بالحرارة ولحد الجرعة الثالثة يزيد من الاستجابة المناعية لهذا اللقاح . كذلك قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في النساء المجهضات نتيجة الاصابة ببكتريا الليستريا والمجهضات لاسباب اخرى ، اظهرت النتائج وبوضوح ارتفاع معدل كلا من γINF - ( 10.97 vs 6.25) وIL - 12 ( 289.19 vs 159.54) وبفارق عالي المعنوية (p<0.00) عند المقارنة بين مجموعة السيطرة والمجهضات بسبب الاصابة بالليستريا وكذلك ارتفاع قيم IgG , IgM , IgA وارتفاع كلا من C3 , C4 نتيجة الاصابة ببكتريا Listeria monocytogenes ، اكدت النتائج قدرة الليستريا على تحفيز الجهاز المناعي بصورة جيدة من خلال تحفيزها للحركيات الخلوية ، اعطت هذه الحقيقة دعما لامكانية استخدام لقاح الليستريا في دراسات اخرى بوصفه علاجا مناعيا ضد العديد من الامراض . | The present study was achieved to investigate the Listeria monocytogenes in clinical samples such as high vaginal swabs and placenta from women with repeated abortion beside samples of blood . Listeria monocytogenes was isolated in percentage of (2.7%) from high vaginal swabs (123) samples but not isolated from placenta 25samples,and the isolates diagnosed dependent on the biochemical test and growth characteristic on selective and differential culter media. The susceptabibility of isolates to different antimicrobial agent was studied , It appeared that all isolates were totally sensitive to Gentamycine and Ampicillin but they were totally resistant to Lincomycine and Nalidaxic acid . The activity of isolates to stimulate immune response in mouse injected by one of these isolates througe number of immune testing which it : phagocytosis , lymphocyte transformation assay , immediate and delayed hypersensitivity reaction ,The result show the Lis - M4 is the best between them . The vaccine prepared from listeria monocytogenes in tow ways , live attenuated listeria is first prepared from bacterium listeria monocytogenes in our country ; also heat killed listeria was prepared . Calculated LD50 in injected mice by Lis - M4 listeria and mice injected by live attenuated vaccine and heat killed listeria vaccine ,So the result as following ( 2.6 ×104 ;3.3 ×107 ; 2.12 ×107 ) in 0.1 ml respectively , and chose the 106 ,107,108 to evalute the best concentration the in stimulate immune response. Immune response in mice evaluated by using the following assay : lymphocyte transformation assay , phagocytosis , immediate and delated hypersensitivity , also Adenosine deaminase specific activity was studied , by use three concentration 106 , 107 , 108 in 0.1ml from tow vaccines and bacterial suspention in 3 mice to each test in addition to control group injected by phosphate buffer saline . The results of this study confirmed that , live attenuated vaccine in boosting dose after 8 days from vaccination is the best efficient and gave highest mean in phagocytosis , lymphocyte transformation assay and significant increase in delayed hypersensitivity and arthus reaction , and highest mean in specific activity in adenosine deaminase enzyme , also show increase vaccine dose stimulate immune response for this vaccine. The immune response in abortion women which infected by Listeria monocytogenes compared with abortion women as aresult different causes , the result observed increase mean in INF - γ (10.97 vs 6.25) and IL - 12 (289.19 vs 159.54 ) by compared with control group , also highest mean in IgG , IgA , IgM , and C3 , C4 as a result Listeria infection . This result amphesis the ability of Listeria to premote immune response through out stimulate cytokines and demonstrate used this vaccine as immunotherapy in several disease

التعبير السايتوبلازمي للانزيمات المحللة للبروتين MMP - 2, - 9 ومثبطاتها في النسيج TIMP - 1, - 2 وتعبير مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي Fas ligand في سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة البولية == Cytoplasmic expression of matrixmetalloproteinases (MMPs) Vs Tissue inhibitor of metalloproteinases (TIMP - 1, - 2) and expression of death receptor (Fas) , and it's specific ligand (FasL)in Transitional cell Carcinoma of the urinary bladder

اسم المؤلف: مي خليل اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة باستخدام 36 نموذجا نسيجيا مطمورا بشمع البرافين ماخوذا من مرضى مصابين بسرطان الخلايا الانتقالية في المثانةTransitional cell carcinoma (TCC ) بالاضافة الى 10 نماذج نسيجية طبيعية ماخوذة من معهد الطب العدلي . النماذج جميعها خضعت لتقنية التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي Immunohistochemistry للتحري عن التعبير السايتوبلازمي لانزيمات MMP - 2 وMMP - 9 ومثبطاتها النسيجية TIMP - 1 وTIMP - 2 فضلا عن التحري عن التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول mRNA لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL باستخدام تقنية التهجين الموضعي In situ hybridization .اظهرت نتائج هذه الدراسة ان نسبة اصابة الذكور الى الاناث بـTCC هي 1 : 3 وان معدل اعمار المصابين كان 60 سنة . واعتمادا على نتائج التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي اظهرت النتائج وجود زيادة معنوية في التعبير السايتوبلازمي عن MMP - 2(P<0.05) يقابلها انخفاض معنوي في التعبير عن TIMP - 2 في الانسجة السرطانية مقارنة بالانسجة الطبيعية (P<0.05) . وعندما صنفت النماذج السرطانية اعتمادا على التغيرات النسيجية المرضية وجد ان كلا من انزيمي MMP - 2 وMMP - 9 يملكان علاقة ايجابية بتطور درجات الورم Tumor grades اذ يزداد التعبير السايتوبلازمي عن هذين الانزيمين كلما ازدادت درجة الورم (p<0.05) ، (p<0.05) بالتتابع . الا انه لم تظهر اية فروقات معنوية في التعبير عن هذه الانزيمات ومثبطاتها بتطور مرحلة الورم Tumor stages (p>0.05) .اما نتائج التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL فقد اظهرت زيادة معنوية في التعبير عنهما في الانسجة السرطانية عندما قورنت بالانسجة الطبيعية (P<0.05) و(P<0.05) بالتتابع كما لوحظ ان تعبير الخلايا السرطانية الانتقالية عن FasL يتناسب طرديا مع تقدم كل من درجة الورم ومرحلته Tumor grade and stage فهناك فرق معنوي في التعبير عن FasL بين الدرجة الاولى والثالثة (P<0.05) وبين المرحلة T1 وT2(p<0.05 ) .اما تعبير هذه الخلايا عن المستقبل Fas فقد لوحظ انه يتناسب عكسيا مع تطور درجات الورم ومراحله فهناك فرق معنوي في تعبير هذه الخلايا عن Fas بين درجة واخرى (p<0.05) وبين مرحلة واخرى (p<0.05) . في الوقت الذي لم يظهر فيه تعبير الخلايا اللمفاوية عن Fas وFasL اختلافا مع تطور درجات الورم ومراحله(P>0.05) و(P>0.05) بالتتابع .وعندما قورنت المعلمات الثمانية احصائيا مع درجات تطور الورم ومراحله ظهرت علاقة طردية معنوية بين MMP - 2 ودرجة الورم (P<0.05) وبين MMP - 9 ودرجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(p<0.05) على التوالي . كما لوحظت علاقة طردية عالية المعنوية في تعبير الخلايا السرطانية عن FasL مع تقدم درجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(P<0.01) على التوالي .من هذه الدراسة نستنتج ان فرط التعبير عن كل من MMP - 2وMMP - 9 وFasL له علاقة بتقدم اورام TCC واجتياحها. | This study was designed by using 36 paraffin embedded tumor tissues obtained from TCC patients , and 10 normal bladder tissues obtained from forensic medicine institute . All specimens undergone to Immunohistochemistry technique to investigate the cytoplasmic expression of MMP - 2, MMP - 9 and their tissue inhibitors TIMP - 1 and TIMP - 2 ; in addition to the in situ mRNA expression of each death receptor (Fas) and its specific Ligand (FasL ) by using in situ hybridization technique. This study showed that male to female infection ratio was 3 : 1 and the mean age of patients was 60 years . Regarding immunohistochemical staining ; MMP - 2 cytoplasmic expression showed significant increase (P<0.05) with significant TIMP - 2 dicrease in tumor tissues compared with normal tissues (P<0.05).According to the histopathological criteria of malignant tissues ; MMP - 2 and MMP - 9 showed a positive relation with tumor grade progression ; so cytoplasmic expression of there enzymes was increased with tumor grade increase (p<0.05) , (p<0.05) respectively ; but there was no significant difference in there enzymes and their inhibitors expression with tumor stage progression (p>0.05).Rgarding in situ mRNA expression of Fas and Fas L ;results of this study reveled that a high significant expression in malignant tissues compaired with normal tissues (p< 0.05 ), (P > 0.05) respectively .Moreover ,FasL expression on transitional malignant cells has a linear increase with tumor grade and stage progression ; there was a significant difference in FasL expression between grade I and grade III(P < 0.05) and between stage T1 and T2 (P < 0.05) . while we found an inverse relation between Fas expression on these cells and tumor grades and stages progression ; there was a significant difference among grades and among stages (P < 0.05) , (P < 0.05) respectively. while there was no significant differences in Fas /FasL expression on lymphocytes and tumor grade and stage progression (P>0.05), (P>0.05) respectively. When we statistically compare the eight markers with tumor grades and stage ; we showed a significant linear relation between MMP - 2 and tumor grade (p<0.05) ; also between MMP - 9 and tumor grade and stage (p<0.01), (p<0.05) respectively. On the other hand , a highly significant liner relation was showed between Fas L expression on transitional malignant cells tumor grade and stage progression (p<0.01) , (p<0.01) respectively .From this study we conclude that overexpression of MMP - 2 , MMP - 9 and FasL are correlated with TCC invasion and progression

تنشيط النطف خارج الجسم باستخدام الاوكسيتوسين في مرضى العقم == In Vitro Sperm Activation by Oxytocin in the Infertile Patients

اسم المؤلف: مكارم قاسم داود اللامي
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي | فريال عبد المناف المهداوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على ١٨۰ مريضا يعانون من وهن النطف اثناء مراجعتهم لمعهد ابحاث الاجنة وعلاج العقم / جامعة النهرين. كان الهدف الرئيس لهذه الدراسة هو استقصاء تاثير اضافة الاوكسيتوسين الى السائل المنوي للمرضى لغرض التحقق من تحسين خصائص الحركة العائدة الى النطف، وكان التركيز على هذا الهرمون بوصفه مادة طبيعية ينتجها الجسم وله وظائف معروفة غير التي هدفت اليها هذه الدراسة. اما الهدف الثانوي فهو دراسة علاقة الترابط بين قيم بعض المعايير الكيمياحياتية للمني ومستوى الهرمونات التكاثرية للمصل من جهة واختبارات وظيفة النطف من جهة اخرى.تم تحليل السائل المنوي للمرضى قبل تنشيط النطف، ومن ثم تم تقسيم المرضى الى ثلاث مجاميع رئيسة متساوية. جمعت عينات الدم من مرضى المجموعة الاخيرة لغرض تعيين مستوى الهرمونات التكاثرية الاربعة في المصل وهى : التيستوستيرون، البرولاكتين، الهرمون اللوتيني، والهرمون المحفز للجريب. كذلك تم قياس مستوى بعض المعايير الكيمياحياتية للسائل المنوي لمرضى هذه المجموعة والتي تضمنت : البروتين الكلي، الكوليستيرول، الكالسيوم، انزيم الكرياتين كاينيز، والفركتوز.استخدمت طريقتان لتنشيط النطف خارج الجسم in vitro وهما : الطريقة المباشرة (باستخدام مزيج الاوكسيتوسين ووسط تحضير النطف) والطريقة غير المباشرة (باستخدام التقنية الطباقية البسيطة) وبتطبيق ثلاثة تراكيز من الاوكسيتوسين وهي : ۲،٤، و٦ وحدة دولية/مل لاختيار التركيز الاكثر تاثيرا على اختبارات وظيفة النطف. اظهرت نتائج الطريقة غير المباشرة حدوث تحسن معنوي ملحوظ (P<0.001) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف عند التركيز۲ وحدة دولية/مل مقارنة مع عينات السيطرة. وقد كان هناك ميلا الى تناقص درجة نشاط النطف مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. اما نتائج الطريقة المباشرة فقد اظهرت حدوث زيادة معنوية (P<0.05) في درجة نشاط النطف وقد كان هناك ايضا ميلا الى تناقص معيار الحركة هذا مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. بناء على هذه النتائج، تم استعمال التركيز۲ وحدة دولية/مل للاوكسيتوسين مع تطبيق الطريقتين المباشرة وغير المباشرة وذلك في حالتين هما وجود وسط تحضير النطف وعدم وجوده. اظهرت حصيلة الطريقة غير المباشرة لتنشيط النطف وعند وجود وسط تحضير النطف زيادة معنوية ملحوظة (P<0.001) في خصائص الحركة (النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف) في كلا المجموعتين (المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة) مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط. اما مقارنة المجموعتين معا فقد اظهرت بان افضل تحسن معنوي ملحوظ ((P<0.001 في خصائص الحركة كان في المجموعة المعاملة. عند غياب وسط تحضير النطف كان هنالك تحسنا معنويا (P<0.05) في خصائص الحركة في المجموعة المعاملة فقط مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط . عند تطبيق الطريقة المباشرة كانت النتائج مماثلة لما حدث عند تطبيق الطريقة غير المباشرة في حالة وجود وسط تحضير النطف. اما عند غياب وسط تحضير النطف لم يحدث اي تغيير معنوي (P>0.05) في تلك المعايير بعد فترة الحضانة. واظهرت النتائج ايضا بان هناك استجابات محفزة بالاوكسيتوسين (رغم انها غير معنوية) في تلك المعايير مقارنة مع مجموعة السيطرة. تشير جميع هذه النتائج الى التاثير المحفز للاوكسيتوسين عند التركيز۲ وحدة دولية/مل على خصائص حركة النطف، كذلك فان استعمال وسط تحضير النطف ادى الى دعم ذلك التاثير.تم تقييم علاقة الترابط بين المعايير الكيمياحياتية لبلازما المني ومعايير المني، وقد اشارت النتائج الى وجود ترابط موجب وبشكل معنوي (r = +0.29, P<0.05) بين مستوى الكوليستيرول وتركيز النطف، وبين مستوى الكالسيوم وكل من النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = +0.27, P<0.05) ودرجة نشاط النطف(r = +0.37, P<0.05) . بينما كان هناك ترابط سالب وبشكل معنوي بين مستوى الفركتوز من جهة وكل من تركيز النطف - 0.41, P<0.001) (r =، النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = - 0.28, P<0.05) ، ودرجة نشاط النطف (r = - 0.32, P<0.05) من جهة اخرى.عند مقارنة مستوى هذه المعايير الكيمياحياتية بين المجموعة المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة، كان واضحا بان الاوكسيتوسين ربما يكون سببا في فقدان الكوليستيرول من الغشاء البلازمي للنطف وبالتالي زيادة مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. كذلك فان الاوكسيتوسين ربما ادى الى تحوير نقل الكالسيوم عبر الغشاء البلازمي وبالنتيجة زيادة تركيز الكالسيوم داخل الخلية وانخفاض مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. بالاضافة الى الانخفاض المعنوي الملحوظ ((P<0.001 في مستوى الفركتوز في الوسط الخارجي والذي يشير الى استخدامه المتزايد من قبل النطف بسبب تنشيط الحركة.اظهرت نتائج فحوصات الهرمونات التكاثرية ارتفاعا معنويا ملحوظا ((P<0.001 في مستوىالبرولاكتين وانخفاضا معنويا (P<0.05)في مستوى الهرمون اللوتيني في الحالات المدروسة عند المقارنة مع القيم الطبيعية. وجدت علاقة ترابط سالبة وبشكل معنوي (r = - 0.29, P<0.05) بين مستوى برولاكتين المصل وتركيز النطف، وقد وجدت علاقة مشابهة ايضا (r = - 0.28, P<0.05) بين مستوى الهرمون المحفز للجريب في المصل وتركيز النطف.

تقييم لقاح الحصبة لدى الاطفال والبالغين باستخدام طرق مصلية مختلفة == Evaluation of Measles Vaccine in Children and Adults Using Various Serological Methods

اسم المؤلف: كريم مؤمن ليلو الساعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: بالرغم من نسبه التغطيه (العاليه ) من التلقيح في العراق الا ان وباء الحصبه مستمر في الحدوث وازدياد نسبة المعرضين للاصابه بمرورالزمن الى مستوى ينتشر فيه المرض بسهوله. ان السيطره على هذا مرض في بلدنا عمليه صعبه لسهولة انتقال الفيروس بين الملامسين بالاضافه الى عدم تطور البنيه التحتيه لانجاز عملية التلقيح ومراقبة الاصابات للحد من انتشار المرض . شمل البحث دراسة الاستجابه المناعيه ضد فايروس الحصبه لنمادج من المصل لاشخاص عراقيين من بغداد ولاطفال من زامبيا مدينة لوساكا .فيما يخص نماذج العراقيين تم اخذ 165 نموذج دم لاطفال وبالغين بواقع 95 ملقحين و70 مصابين من بينهم 34 مصاب بالحصبه على الرغم من التلقيح ضد المرض باعمار تتراوح بين ( 8 شهر - 30 سنه) وللمده ( من شباط / 2007 الى حزيران / 2007 ) , قسمت النماذج الى ستة مجاميع اعتمادا على المدى العمري . شخصت الاصابات التي وقعت عام 2007 سريريا في المراكز الصحيه ومن ثم تاكيدها مختبريا في مختبر الصحه العامه المركزي في بغداد , تم تقييم الاستجابه المناعيه المتخصصه ضد فايروس الحصبه باستخدام ثلاثة طرق مصليه مختلفه وهي : التعادل المصلي الدقيق وقياس الكلوبيولين المناعي صنف G وطريقة تثبيط التلازن الدموي اجريت هذه التجارب في مختبر تقييم اللقاحات الفايروسيه والزراعه النسيجبه في المركز الوطني للرقابه والبحوث الدوائيه . اظهرت نتائج طريقة التعادل المصلي ان جميع المشاركين بالدراسه يمتلكون الاجسام المضاده ( وهم الذين يمتلكون عياريه مساويه او اعلى من ( 128 ) المتخصصه ضد فيروس الحصبه ولكن بمستويات مختلفه , حيث كان مستوى الحمايه المصليه بنسبة 79% للملقحين و94,2% للمصابين وهذا يؤكد على بقاء الاجسام المضادة هذه لفتره طويله بعد حصول الاصابه والتلقيح . وكان معدل الانتشار المصلي لمختلف اعمار الملقحين : 923± 258 , 714± 336 , 705 ± 384 , 268 ± 289 , 278 ± 214 للاعمار (6 - 10 ),(11 - 15) , (16 - 20) ,(21 - 25) , (26 - 30) سنه بالتعاقب , اذ تبين عدم وجود مؤشر احصائي معنوي (P>0.05)عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه مع المصابين حديثا باعمار اقل من 6 سنوات, اما الملقحين بعمر (11 - 15) سنه قد اظهر وجود مؤشر احصائي مختلف (P<0.01) عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه , اما الفئات العمريه (16 - 20) , (26 - 30) سنه من الملقحين فقد اظهرت مؤشرات احصائيه مختلفه (P<0.01)بالمقارنه مع نفس الفئات العمريه من المصابين ولم تظهر الفئه العمريه (21 - 25) سنه من الملقحين مؤشر احصائي مختلف مع المقارنه لنفس الفئه من المصابين . اظهرت النتائج نسبه 97 - 100% للحمايه المصليه لفئة الملقحين في المدى العمري (6 - 10) سنه بعد ذلك تبدا بالانخفاض بتقدم العمر , وكانت نسبة الحمايه المصليه 95 - 100% للمصابين بالمرض من مختلف الفئات العمريه المشاركه في الدراسه . اجريت دراسه ايضا بقياس الحمايه المصليه بالاعتماد على عدد جرع اللقاح المعطاة باستخدام طريقة التعادل المصلي وكانت النتائج (1 : 838 ± 403) , ( (1 : 938± 244) للاشخاص الذين اعطوا 5 و6 جرع على التوالي واظهرت اختلاف احصائي(P<0.01) عن الذين اعطو (1 - 2)جرعه من لقاح الحصبه .تمت دراسة فترة بقاء الاجسام المضادة المتخصصة ضد فايروس الحصبه للملقحين والمصابين اذ وجدت بنسبة عاليه قبل مرور فترة 3 سنوات من اعطاء اخر جرعه من اللقاح حيث اظهرت مؤشر احصائي مختلف من الذين امضوا اكثر من 3 سنوات باستلامهم اخر جرعه , بينما لا توجد مؤشرات احصائيه مختلفه من اعطاء اخر جرعه لفترة (3 - 10)سنه واكثر من 10 سنوات , وهذا يعطي دليل بانخفاض مستوى الاجسام المضاده مع مرور الوقت سواء بعد التلقيح او الاصابه الطبيعيه . اظهرت نتائج قياس IgG بطريقة ELISA ان الحمايه المصليه تمثل 89% ضد الاصابه بفايروس الحصبه وتمثل نسبة 7.7% حمايه مصليه غير ثابته ونسبة 3.3% دون حمايه مصليه .وكانت اعلى نسبه من الحمايه المصليو 94,7% في الاعمار الصغيره (6 - 10) سنه من المشاركين في البحث واقل نسبه من الحمايه المصلية 75% للاعمار الكبيره (25 - 30) سنه . وبصوره عامه فان معدل عيارية الاجسام المضاده المتخصصه ضد فايروس الحصبه صنف IgG هي 2080 ±1837 لجميع الملقحين قيد الدراسة وبدون اختلاف احصائي معنوي بالمقارنه مع المصابين والتي كانت 1949 ±1838 , وان التلقيح بالجرعات التعزيزيه الاضافيه للفئات العمريه المناسبة تلعب دور كبير في تمنيع المجتمع للحد من حدوث الاوبئه وانتشارها . اما باستخدام طريقة تثبيط التلازن الدموي وجد 60 مشاركا من اعمار مختلفه يمتلك اجسام مضاده متخصصه مثبطه للتلازن الدموي , وعند الاخذ بنظر الاعتبارعيارية 1/8 كمؤشر للتعرض للاصابه وجد الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي 53,6 % , 73,6% للملقحين والمصابين بالتتابع , كما وجد انخفاض واضح لمستوى هذه الاجسام المضاده بتقدم العمر , وكما كانت النتائج التي حصل عليها هذا البحث باستخدام تقنية التعادل والاليزا يمكن الاستنتاج ايضا ان مقدارتركيز الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي ذو علاقه مباشره وطرديه مع نسبة الحمايه المصليه ضد النوع البري للاعمار ما بين (6 - 15) سنه , وكانت نتائج معظم افراد الفئه العمريه (16 - 30) سنه ذو نسبه واطئه من الحمايه المصليه وهذه النتائج ربما تعود ان المشاركين في الدراسه للفئه العمريه الكبيره كانت ولادتهم قبل الشروع ببرنامج التلقيح الموسع اوكونهم عاشو خلال فترة كانت فيها نسبه واطئه من التغطيه في التلقيح مما يؤدي الى انخفاض ونقص في الانتشار المصلي . اما نتائج دراسة المقارنه باستخدام الطرق المناعيه الثلاث في قياس الاستجابه المناعيه ضد الحصبه وجد هناك علاقه جبده ومباشره بين طريقتي التعادل وتثبيط التلازن الدموي ( r =0.87 , P<0.01 كما بينت النتائج ان طريقة تثبيط التلازن الدموي اقل حساسيه من طريقة التعادل , اما المقارنه مع طريقة قياس الكلوبيولين المناعي صنف الكلوبيولين المناعي IgGتعتبرمقياس دقيق وذات علاقه جيده ومباشره مع طريقة التعادل (r = 93 , P< 0.05) واخيرا يمكن الاستنتاج ان طرق التعادل هي الطريقه المثلى في قياس الاجسام المضاده ضد فايروس الحصبه وتعتبر الطريقه المناسبه لقياس مستوى الحمايه ضد المرض . اما بخصوص نماذخ المصول العائده للاطفال من زامبيا , شملت الدراسه (50) نموذجا , يعضها كان قبل التلقيح والبعض الاخر بعد (1 - 3 اشهر ) من تلقيح الاطفال بلقاح الحصبه المنفرد بعمر 9 اشهر , تم قياس الاجسام المضادة المتخصصه ضد فايروس الحصبه بتقنية التعادل المصلي في الاكار وباستخدام النوع البري لفايروس الحصبه المعزول من حالات مصابه بالحصبه واجري الاختبار باصابة خلايا كلية القرد الاخضر الحامله للمستلم CD150 واجري الاختبار بالتزامن مع المصل القياسي العالمي لغرض المقارنه ولغرض تحويل العياريه للنتائج الى الوحدات العالميه , تم اجراء الاختبارات في مختبر الاستاذه كرفن في جامعة جون هوبكنز الامريكيه.اما نتائج هذه الاخيبارات فقد كان قياس الاجسام المضاده للاطفال الزامبيين بعمر 9 اشهر قبل اخذ اللقاح 0.079 وحده عالميه وبنفس الوقت هي تمثل ما تبقى من الاجسام المضاده المكتسبه وهي اقل من مسوى الحمايه ضد المرض التي هي 0.120 وحده عالميه عند استخدام تقنية التعادل المصلي في الاكار , اما بعد الفتراة الزمنيه شهر واحد وثلاثة اشهر من التطعيم كان قياس الاجسام المضاده 0.606 , 0.493 وحده عالميه وبمؤشر احصائي P< 0.05 ,P<0.01 , على التوالي بالمقارنه بنتائج قبل التطعيم وهو اعلى من مستوى الحمايه ضد المرض , بينما كان قياس الاجسام المضاده بعد الاصابه الطبيعيه للاطفال بعمر 76 شهر 3.303 وبمؤشر احصائي P<0.005 وحده عالميه وهذه النتيجه تؤكد النتائج السابقه بان الاستجابه المناعيه بعد الاصابه الطبيعيه اعلى من نسبتها بعد التطعيم .وهذه النتائج تتفق مع نتائج الاستجابه المناعيه للاطفال العراقيين دون سن 6 سنواة فيما يخص مستوى الحمايه ضد المرض . | In this study, the potency of the live measles vaccine ( Rouvax / Sanofi pasture production) has been determined by an in vitro microtitration assay ,the results were considered comply and meet with the WHO requirement .The estimation of the prevalence measles antibody among serum samples from Iraqi and Zambian population after measles vaccination and natural infection. Regarding the Iraqi blood samples were collected from Iraqi children and adults with documentation of vaccinated or exposure to natural infection with an average age of (8 months - 30 years) .Samples were divided into six groups based on the age of participants .The individuals were infected during 2007 outbreak identified in the health center of their area and confirmed serologically in Center Public Health Laboratory (CPHL) in Baghdad; Serological assays were performed at the National Center for Drug control and Research ( NCDCR) to detect measles antibody . All 156 participants had detectable neutralizing antibodies, while the prevalence of protective level of neutralizing antibody titer (≥ 1 : 128), was found in 79% of vaccinated group and 94.2 % for participants with a history of measles cases suggesting that the rate of antibody persist longer when expressed exposure to circulating wild virus. When groups distribution of the Geometric Mean Titer (GMT) values was determined according to the age groups, revealed that the measles neutralizing antibody titers after vaccination were 923± 44.2 , 714 ± 68.7 , 705 ± 99.2 , 268 ± 91.4 and 278 ± 87.7 for groups 6 - 10 ,11 - 15 ,16 - 20, 21 - 25 and 26 - 30 years respectively . There was no significant statistical difference (p>0.05) for age group 6 - 10 when comparing with infected children (<6 years), 11 - 15 years group showed statistical significancet when compared with infected children (>6 years) ( P < 0.01) , 16 - 20 and 26 - 30 of vaccinated groups also showed to be statistically significant when comparing with similar age of infected individuals (P< 0.01 ) ; But there is no statistical significance for age groups 21 - 25 years when comparing with similar age of infected individuals ,(p> 0.05) The percentage of neutralizing protective level was 97 - 100% for (>6 - 10) years of vaccinated group and then decreased with increasing ages, while persistent (95 - 100%) for the different age groups infected with measles. Neutralizing antibody titers after five and six vaccine doses was a (1 : 838 (SEM) 100) and (1 : 938 (SEM) 93) respectively this is showing statistically significance when compared with individuals previously had received one and two doses (p < 0.001 and p < 0.01) respectively . In the study of persistence of neutralizing antibody after vaccination and natural infection the prevalence of measles antibody was very high before 3 years of the last dose and show significant differences when compared with group of individuals who had received the last dose after more than 3 years ( P<0.05) and there was no significant statistical differences between groups with the period 3 - 10 and >10 years after the last dose. therfore, no evidence was found of neutralizing antibody against measles which decreased to nonprotective levels from neutralizing result after both vaccination and natural infection. In the second assay, sera were tested for measles specific IgG by ELISA result showed that 89% of all individuals who participated in the research were seropositive against measles, 7.7% equivocal and 3.3% had shown seronegative. The highest seroposivity was ( 94.7% ) among individuals with the lowest age group (6 - 10 years), and the lowest seroposivity (75 %) was among the oldest age group (26 - 30 years). In general all individuals participated in this study have shown IgG level 2080± 197.5 mIU/ml of the vaccinated groups. when compared with participants previously exposed to measles natural infection that was found (1949 ± 262.5mIU/ml) with no statistically significant . When individuals grouped according to the increased age , a marked decline in IgG levels were observed, resulting in different levels of protection against measles and suggested that supplementary vaccination might play a role in vaccinating population before measles outbreaks . In the third assay the prevalence of measles antibody by hemagglutination inhibition has been found that 60 participants of different age groups have detectable hemagglutination inhibition antibody titer using the titer(<1 : 8) as indicator of susceptibility .It was found that 53.6% and 73.6% of hemagglutination inhibition seroprevalence among vaccinated and those with previous to natural infection respectively . Hence again a marked decline in hemagglutination inhibition antibody titers was observed with the increasing age of participants in this study. Regarding neutralizing and IgG - ELISA antibody, the results of hemagglutination inhibition suggest that the seroconvesion after vaccination correlated with the protective levels against wild type among age group (6 - 15) years and most of the participants with (16 - 30) years age group have a low percentage of hemagglutination inhibition antibody titers, and these results may be due to the fact that individuals were born before the implementation of routine immunization against measles in 1985 and lived in the time of low vaccination coverage resulting in waning of antibody or lack of initial seroconversion. In comparison of different methods that have been used in this study to evaluate specific measles immune response, it was found that a good correlation between hemagglutination inhibition and neutralization test ( r=0.87 , P<0.01).With measles virus , hemagglutination inhibition was considered less sensitive than neutralization test . Also was found a good correlation between IgG - ELISA and neutralization assays ( r=0.93 , P<0.05). It has been concluded that the neutralization assay is considered the gold standard in measuring antibodies properly and most important in clinical protection. About the Zambian children were used in order to know the level of immunity required for measles elimination after administration with different measles virus vaccine strain .Fivity serum samples were available from Zambia children in prevaccination , 1 - 3 months after vaccination at 9 months of age ,and infected children with ages (76 ± 65 months ) . A modified plaque reduction neutralization assay was conducted to measure measles antibodies ,using wild type of Measles virus strain to infect veroSLAM cells , Plasma samples were tested in parallel with the International World Health Organization (WHO) Serum Standard and results were transformed into mIU/ml .The tests were conducted in Prof. Griffin lab. of the molecular microbiology and immunology department in John Hopkins School of public health. In the present study,Zambia infants vaccinated at 9 months of age have had passive antibody (79 mIU/ml) lower than the protective level (≥ 120 mIU/ml) and the presence of passive antibody at the time of vaccination continued to have high titers of antibody after one month ( 493 mIU/ml ) (P> 0.01) and three months (606 mIU/ml ) ( P<0.05) of measles vaccination above the protective level against measles infection ,while the antibody levels have reached to (3303 mIU/ml) ( P > 0.005) in children with natural infection, these results showed in agreement with the results of Iraqi children under 6 years of ages regarding the level of protection against the disease .

عزل وتشخيص البكتريا العصوية (Bacillus) المنتجة لانزيمات التحلل المائي (الحلمهه) (Hydrolases) المتحملة للحرارة == Isolation and identification of Bacillus producing thermotolerant hydrolases

اسم المؤلف: عدنان حنون عباس
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 97 عزلة من البكتريا العصوية ( Bacillus ) من جمع 200 عينة تربة ومياه في الفترة مابين تموز/تشرين اول 2008 من مواقع مختلفة من العراق بعد التشخيص الاولي ( صبغة كرام, تكوين السبورات, انتاج الكاتاليز ) وتلقيح العينات على وسط ال Thermus agar وتنميتها على درجة 50°C لفترة 24 ساعة. اظهــــرت نتائج الاخــــــتبارات الكيمــوحيــــويـــــة ان 56 عزلة تربـــــــة صنفت على انها B. laterosporus 35.71% , B. circulans 16.07% , B. stearoyhermophilus 14.28%, B. polymyxa 12.5% , B. macroides 7.14%, B. mycoides 7.14% , B. lentus 3.57% , B. popilliae 1.78% , B. chitinosporus 1.78 , بينـــما صنفت 41 عـــــــــزلة مياه عــــلى انها B. laterosporus 26.82% , B. circulans 26.82% , B. stearothermophilus 4.87% , B. polymyxa 4.87% , B. macroides 9.75% , B. mycoides 2.43% , B. lentus 7.31% , B. popilliae 4.87% , B. filicolonicus 4.87% , B. brevis 2.43% , B. larvae 2.43% , B. pumilus 2.43% . اظهرت عزلات ال ( Bacillus ) المعزولة من التربة والمياه ايجابيتها في انتاج الانزيمات المتحملة للحرارة بعد اختبارها على وسـط الاكار الصـلب, كالبروتييــز ( 73.17% ) ( 89.28% ) , الاميـــــــــليز ( 51.21% ) ( 55.35% ) , اللايبيــــــــــــز ( 95.12% ) ( 91.07% ) , السيليليز( 60.97% ) ( 85.71% ) , والكايتينيز( 92.68% ) ( 85.71% ) , على التوالي, في فترات حضانـــة مختلفة ودرجة حرارة 50°C . من جهة اخرى, قيست قابلية عزلات ال ( Bacillus ) والبالغة نسبتها ( 41.23% ) على انتاج انزيمات التحلل المائي كالبروتييـــز والاميليــز واللايبيـــز والسيليليـــز والكايتينيــز, باجمعها, حيث اظهرت النتائج بان سلالات ال B. polymyxa كانت الافضل في انتاج البروتييز والاميليــز والسيليليــز, بينما سلالات ال B. lentus كانت الافضل في انتاج الكايتينيـــز, اما اللايبيـــزفقد تم انتاجــــــــه من قبل سلالات ال B. circulans , B. stearothermophilus , B. polymyxa , B. mycoides وB. lentus , على اوساط زرعية وفترات حضانة مختلفة ودرجة حرارة 50°C. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج الاميليز من العزلة B. polymyxa AS 4/5 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج والمحضر مختبريا متكون من 2% نشا, 1% تربتون, 0.05% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.02% كلوريد الكالسيوم , برقم هيدروجيني 7, وبدرجة حرارة 50°C لفترة 48 ساعة. تم استخلاص الاميليــز من الوسط الزرعي وتركيزه بواسطة السكروز, وقد اظهرت النتائج الحصول على الاميليز بفاعلية نوعية 2.36U/mg protein, في المــرحلة الاولى تمت تنقية الاميليز بطريقة كروماتوغرافيا الوجبة Batch Chromatography واعقبت هذه المرحلة استخدام عمود التبادل الايوني Ion exchange chromatography باستخدام المبادل DEAE - Cellulose column . وقد اظهرت النتائج الحصـــول على الاميلــــيز بفاعلية نوعية 6.76U/mg protein وبعدد مرات تنقية بلغ 2.86 وبحصيلة نهائية 18.65% . تمت ايضا دراسة توصيف الانزيم, واظهرت النتائج بان الفعالية الانزيمية تزداد بزيادة درجة الحرارة الى 90°C بينما اظهر الاميليزثباتييتـــه في درجات الحرارة 40°C, 50°C, 60°C , في حضانة لمدة 30 دقيقـــة, اما الفاعلية المثلى للانزيم بالرقم الهيدروجيني pH 5, اما ثباتية الانزيم فتكون في الارقام الهيدروجينية مابينpH 4 - 10 في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة, وبفاعلية متبقيــة قصوى 78.57% في .pH 5 اما النتائج المتعلقة بتاثير الايونات الفلزية على الانزيم, تبين ان لكلوريد الزئبق تاثير عالي على الانزيم بفاعلية متبقية 46.47% و40.84% بتركيز 5mM و10mM , على التوالي, اما كلوريد المنغنيز له تاثير قليل على الانزيم بفاعلية متبقية 79.81% و81.69% بتركيز 5mM و10mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة. تعمل المواد الكلابية مثل EDTA والمواد المختزلة mercaptoethanol على تثبيط الفاعلية الانزيمية, حيث تؤثر المواد الكلابية ( EDTA ) على الانزيم بفاعلية متبقية 57.74% و52.58% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, اما المــــواد المختزلـــــــــة ( mercaptoethanol ) يكون تاثيرها بفاعلية متبقية 51.17% و40.37% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقـــــــــة. | Ninety - seven isolates of Bacillus were obtained from 200 soil and water samples, collected between July to October / 2008, from different local sites of Iraq, by primary identification ( gram stain, endospore - forming and catalase production ) after incubation at 50°C for 24h on thermus agar. Biochemical test showed that fifty - six soil isolates were classified as B. laterosporus 35.71%, B.circulans 16.07%, B.stearothermophilus 14.28%, B.polymyxa 12.5%, B.macroides 7.14%, B.mycoides 7.14%, B.lentus 3.57%, B. popilliae 1.78% and B.chitinosporus 1.78%, whereas forty - one water isolates were classified as B.laterosporus 26.82%, B.circulans 26.82%, B.stearothermophilus 4.87%, B.polymyxa 4.87%, B.macroides 9.75%, B.mycoides 2.43%, B.lentus 7.31%, B. popilliae 4.87%, B.filicolonicus 4.87%, B.larvae 2.43%, B.brevis 2.43% and B. pumilus 2.43%. Thermotolerant enzymes were produced from soil and water Bacillus species as, protease ( 89.28% ) ( 73.17% ), amylase ( 55.35% ) ( 51.21% ), lipase ( 91.07% ) ( 95.12% ), cellulase ( 85.71% ) ( 60.97% ) and chitinase ( 85.71% ) ( 92.68% ) , respectively, after culturing on solid agar media with different incubation period, at 50°C. So, 41.23% of soil and water Bacillus isolates were detected for hydrolases production as ( protease, amylase, lipase, cellulase and chitinase ) together, and showed that B. polymyxa strains were the best bacteria in protease, amylase and cellulase production, whereas B. lentus strains was a good chitinase producer. Lipase was produced by several Bacillus strains as B. circulans, B. stearothermophilus, B. polymyxa, B. mycoides and B. lentus, after culturing on different media and incubation period, at 50°C. Thermotolerant amylase production conditions by B. polymyxa AS 4/5 were studied, the highest amylase production was observed when the bacteriaSummary IIwas cultured in medium containing 2% starch, 1% tryptone, 0.05% MgSO4, 0.05% NaCl and 0.02% CaCl2 with pH 7 and incubated at 50°C for 48h. Amylase was extracted from production medium and concentrated with sucrose, the specific activity of amylase was 2.36U/mg protein. Purification of amylase was performed by ion exchange chromatography Cellux - Carboxymethyl ( batch chromatography ), followed by second step of purification by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose column, the results showed that the specific activity was 6.76U/mg protein with 2.86 purification folds and 18.65% yield. Thermotolerant amylase displayed a wide temperature range of activity at 40 - 90°C with highest activity at 90°C and enzyme was stable at 40 - 60°C for 30min. The optimum pH for amylase activity was pH 5, the enzyme was stable at pH 4 - 10 for 30min at 50°C with maximum remaining activity 78.57% at pH 5. Treatment of thermotolerant amylase with metal ions showed that HgCl2 reduced amylase activity, the remaining activity was 46.47% and 40.84% at concentration 5mM and 10mM of HgCl2, respectively. Whereas MnCl2 had lower effect on amylase activity, the remaining activity was 79.81% and 81.69% at concentration 5mM and 10mM of MnCl2, respectively, after 30min at 50°C. Bacillus polymyxa amylase was treated with 2mM and 5mM of EDTA and mercaptoethanol, the two compounds had inhibitory effect on the enzyme, the remaining activity of EDTA treated enzyme was 57.74% and 52.58% at 2mM and 5mM, respectively, while the remaining activity of enzyme treated with 2mM and 5mM mercaptoethanol was 51.17% and 40.37%, respectively, after 30min at 50°C.

دراسات وراثية خلوية ومناعية لمرضى التهاب القولون التقرحي == Cytogenetical and Immunological Studies of Ulcerative Colitis

اسم المؤلف: زينب محمد طاهر جعفر الملا حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحصول على عينات الدم المحيطي والخزع النسيجية الماخوذة من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن والمرضى المصابين بسرطان القولون، ومن الجنسين كليهما، ومن مختلف الاعمار. تم سحب حوالي 10 مل من دم المرضى وقسمت العينة على ثلاثة اقسام، القسم الاول استعمل لاجراء الدراسات الوراثية الخلوية. والقسم الثاني لاجراء دراسات البيولوجيا الجزيئية. والقسم الثالث لاجراء الدراسات المناعية. اجريت الدراسات الوراثية الخلوية من اجل التعرف على التغييرات التي قد تطرا على المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بقياس معامل الارومةBlastogenic index ، ومعامل الانقسام Mitotic index، ومعامل التضاعفReplicative index ، واختبار التبادل الكروماتيدي الشقيقي Sister chromatid exchange، واختبار تردد الطفرة Mutation Frequency. وقد تم ذلك من زرع خلايا الدم المحيطي في الوسط الزرعي الحاوي على المادة المعلمة (Brdu - 5) والمادة المشطرةA) PH). اوضحت النتائج وجود انخفاض في المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بمعامل الارومة، ومعامل الانقسام، ومعامل التضاعف. بينما لوحظ ارتفاع في المعدلات التلقائية في التبادل الكروماتيدي الشقيقي لمرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء. كما ولوحظ هذا الارتفاع في معدلات التبادل الكروماتيدي الشقيقي عند المعاملة بالعقار الميثوتركسيت، اذ لوحظ وجود خلايا نامية في تراكيز واطئة من عقار الميثوتركسيت.اما عن ا لجانب البايولوجي الجزيئي فقد تم قياس تراكيز الحوامض النووية المتمثلة بما يلي : الحامض النووي الرايبوزي (RNA) والحامض النووي المزدوج الشريط ) (dsDNAوالحامض النووي الاحادي الشريط (ssDNA) وذلك بتنميتها في الوسط الزرعي في اوقات حضانة مختلفة (الزمن صفر، ثم بعد24 ساعة ، ثم بعد48 ساعة ، ثم بعد 72 ساعة من الحضانة ). اوضحت النتائج وجود اضطراب في نمو الخلايا الماخوذة من مرضى التهاب القولون التقرحي عند القياس بالاصحاء . كذلك تم قياس تراكيز الحوامض النووية المذكورة اعلاه في الخلايا المنماة في تراكيز عالية من عقار الميثوتركسيت والمتمثلة بتركيز 1 مايكروغم / مليلتر و2 مايكروغم / مليلتر لكل من المرضى والاصحاء بعد تنميتها لمدة حضانة 72 ساعة. اذ لوحظ عدم وجود فروقات معنوية لهذين التركيزين بين الاصحاء والمرضى. اما فيما يتعلق بنتائج التهجين في الموقع in situ hybridiza¬tion لغرض الكشف عن التعبير الجيني للجين الكابح للورم P53 والجين المثبط للموت المبرمج Bcl - 2 ، اذ تم اخذ الخزع النسيجية من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن وسرطان القولون وقياسها بالاصحاء. اوضحت النتائج وجود علاقة بين المورثين في مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون عند قياسهما بالاصحاء، اذ اعطى الجين الكابح للورم نسبة 66 % في الانسجة المصابة بالتهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون وهذا يوضح حصول طفرات تراكمية في الجين الكابح للورم P53 والذي يعطي مؤشر على التقدم نحو التسرطن ، وكذلك الحال مع الجين Bcl - 2 الذي اوضح زيادة بالتعبير الجيني لهذا الجين في النماذج النسيجية لمرضى التهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون والاصحاء. ان التحري عن جين P53 يعطي مؤشرا عن الطفرات التراكمية او الشذوذ في فعالياته ويمكن الاستفادة منه في اعتباره قيمة تشخيصية وانذارية. اما بالنسبة للجانب المناعي فقد استخدمت فحوص مناعية عدة متمثلة بقياس الكلوبيولينات المناعية (IgG , IgA , IgM)، والعامل المتمم (C3 & C4) وفحص الاضداد الذاتية لسايتوبلازم الخلايا العدلة (ANCA) Anti neutrophile cytoplasmic antibodies والذي يشمل c - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة من مجموع العينات، وفحص p - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة، وفحص الاجسام المضادة الذاتية للمتقدرات (AMA) الذي اعطى حوالي 48% نتيجة موجبة وفحص الاضداد المناعية الذاتية للشريط المزدوج للحامض النووي منقوص الاوكسجين dsDNA)) الذي اعطى 43% نتيجة موجبة، وفحص اضداد شحم القلب (Anticardiolipin ) الذي اعطى 40% نتيجة موجبة من مجموع العينات.اوضحت نتائج الفحوصات المناعية ارتفاع نسب الكلوبيولينات المناعية والعامل المتمم في مصل مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء وعلى مستوى احتمالية (P ≤ 0.01). ان نتائج الفحوصات المناعية المستعملة في هذه الدراسة تفسر وجود اضداد ذاتية في مصل مجاميع المرضى المصابين تحت الدراسة. وهذا يوضح كون المرض يمكن ان يعزى في جانب منها الى اسباب مناعية ذاتية. | The investigation has been done on the peripheral blood and biopsy samples which drawn from patients suffered from ulcerative colitis & colon cancer , the samples were taken from female and male of different ages . The collected blood samples were about 10 ml &each sample was divided into 3 parts , the first part used for cytogenetic studies,the second part used for molecular studies & the last part used for immunological studies . The cytogenetic studies has been done in order to define the damaging effect of the disease and the effect of the drug (methotrexate ) on the peripheral blood lymphocytes . these damages were manifested through the significant reduction in the blastogenic index (BI ) , mitotic index ( MI ) , & replication index ( RI ) . This accompanied by significant increase in the sister chromatid exchange ( SCEs ) . In addition to investigate the mutation fraction in the cells cultured in selective medium containing different concentration of the drug . The results also showed presence of mutant cells that can grow in increasing concentrations of methotrexate . The molecular studies include measuring the concentrations of different types of nucleic acids ( dsDNA , ssDNA , RNA ) done by culturing the peripheral blood cells in different incubation times which include T 0 , T1 ( 24 hrs ) , T2 (48hrs ) , T3 (48 hrs ) & T4 (72 hrs ) . The results indicate disturbance in cell cycle comparing with healthy individuals . There was no significant differences in types of nucleic acids between patients & controls , when culturing the resistant cells of blood lymphocytes in high concentrations of the MTX drug ( 1 μg/ ml , 2 μg / ml ) . On the levels of in situ hybridization , the colonic biopsies which collected from patients of ulcerative colitis and colon cancer were examined for gene expression of P53 gene and Bcl - 2 gene . The results indicated accumulated mutations in P53 gene in the inflammed colonic biopsies , this result give an indication for progression of carcinogenesis .While on the level on Bcl - 2 , the results showed increasing in the activity of the gene , resulting in increase in gene expression of Bcl - 2 gene . The gene expression of Bcl - 2 in inflamed colonic tissues were approximately similar to gene expression in tissues of colon cancer . this indicate that the chronic inflammation of UC may ultimately infected with colon cancer . The detection of P53 gene and Bcl - 2 gene in chronic ulcerative colitis give early detection for diagnostic & therapeutic and monitering purposes . The immunological studies conducted to insight into immunological disturbance associated with clinical expression of ulcerative colitis of Iraqi patients and to provide a locally made easy diagnostic tests that can be used in routine work and to study the recent serological markers , that may help in the diagnosis of IBD . The immunological profiles of the patients of UC were studied using different parameters . To assess the importance of antineutrophile cytoplasmic antibodies ( ANCA ) were found in enzyme linked immunoassay ( ELISA ) , for anti - myeloperoxidase (anti - MPO ) antibodies as (P - ANCA) and anti - propteinase - 3 (anti - PR - 3 ) antibodies for ( C - ANCA ) . The C - ANCA test give 50 % positive results , while the P - ANCA test give 55% positive results . The anti - mitochondrial M - 2 antibody was estimated in sera of UC patients and gives 48% positive results . The other serological marker used was the double strand DNA antibody and give 43 % positive results . Also the anticardiolipin antibody was examined and the test give 40 % positive results and this result indicate presence IgM / IgG concentrations in the sera of patients . The levels of immunoglobulins that include ( IgG , IgM , IgA ) as well as some of complement components ( C3 , C4 ) were used in estimation in the sera of the studied groups . The results showed an increase in the levels of immunoglobulins and the complement concentrations at levels of P ≤ 0.01 . The results of immunological markers in this study explained presence of auto antibodies and emphasized by increasing levels of immunoglobulins in the sera of the patients

دور بعض المتغيرات المناعية والاصابات الفيروسية في احداث الاجهاضات العفوية المفردة والمتكررة == The role of some immunological changes and some viral infection in single and recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا سعدي عبود كاظم
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لغرض تسليط الضوء على بعض المتغيرات المناعية والهرمونية وتشخيص بعض انواع الفيروسات المرافقة لحالات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر ، تمت دراسة (90) امراة تعرضن لحدوث اجهاضات عفوية مفردة ومتكررة غير مشخصة السبب ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (10) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، (40) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، اجريت المقارنة مع (30) امراة ، (15) امراة ذات حمل طبيعي و(15) امراة غير حوامل وبالفئات العمرية نفسها ، وعدت مجموعة السيطرة.بينت الدراسة الحالية النتائج الاتية : 1 - ارتفاع مستويات الاضداد الذاتية لدى النساء ذوات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر اذ سجل لديهن : ا - ارتفاع مستويات اضداد شحم القلب Anticardiolipin antibodies (ACA) وبصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ). ب - لوحظ هنالك ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgM) β2 - GP1 - IgM عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل ومجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).ج - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgG) β2 - GP1 - IgG عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة ومجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل). ء - ارتفاع مستويات اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).هـ - ابدت (14) امراة من المجموع الكلي للنساء المجهضات (15.6)% تفاعلا موجبا للاضداد النووية (ANA) بالقياس مع نساء السيطرة اللاتي كن جميعهن سالبات لهذين الاختبارين.2 - ارتفاع مستويات كل من : (IL - 2 , IFN - γ , TNF - α) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).3 - لوحظ هنالك انخفاض معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من : (IL - 10)، و(IL - 4) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).4 - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من الغلوبيولينات المناعية (IgM,IgA,IgG) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).5 - لوحظ هنالك ارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى جزء المتمم الثالث والرابع (C4 , C3) لدى النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).6 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات Anti - Toxoplasma Ab الصنف (IgM) في 18 حالة (20)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود (32) حالة %(35.6) من المجموع الكلي للنساء المجهضات يمتلكن اضداد نوعية لداء المقوسات صنف (IgG) . 7 - بلغت نسبة انتشار اضداد فيروس مضخم الخلايا (CMV) الصنف ((IgG في (12) حالة (13.3)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل ، في حين لوحظ وجود اضداد فيروس مضخم الخلايا صنف (IgM) في (25) حالة %(27.8) من المجموع الكلي للنساء المجهضات. 8 - وجود الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس الحميراء (Rubella virus) في (10) حالات (11.1)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود اضداد فيروس الحميراء صنف (IgG) في 21 حالة %(23.3) من المجموع الكلي للنساء المجهضات.9 - بلغت نسبة انتشار الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس القوباء البسيط (HSV 1 and 2) في 4 حالات (4.4)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل .10 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في مستوى الهرمون المحفز للجسم الاصفر(LH hormone) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).11 - ارتفاع مستوى هرمون البرولاكتين (Prolactin hormone) بصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).12 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين اضداد شحم القلب (ACA) وكل من الحركيات الخلوية (IL - 2 , IL - 4 , IL - 10, IFN - γ ,TNF - α) وكذلك ما بين اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) ،والحركيات الخلوية قيد الدراسة.13 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين هرمون الـ (LH) والحركيات الخلوية قيد الدراسة ,وكذلك ما بين هرمون البرولاكتين وكل من (TNF - α وIFN - γ وIL - 2 و(IL - 10، في حين لوحظ وجود علاقة ترابطية ذات قيمة معنوية (P<0.05) ما بين هرمون البرولاكتين و(IL - 4) .14 - لوحظ وجود اصابات مشتركة ما بين اضداد شحم القلب (ACA) والاصابات الفيروسية، وكذلك وجود اصابات مشتركة ما بين الانواع المختلفة للعوامل الخمجية في هذه الدراسة.س | To shed light on some immunological ,hormonal changes and identification of some viruses that are accompanied to single and recurrent abortion . The study were done on (90) undiagnosed aborted women at different stage of pregnancy. (20) had single abortion during first trimester of pregnancy , (10) had single abortion during second trimester of pregnancy , (40) had recurrent abortion during first trimester of pregnancy , and (20) had recurrent abortion during second trimester of pregnancy . The comparisons were done with (30) women , (15) had normal pregnancy and (15) unpregnant women at the same ages and considered as control groups .The results of this study showed : 1. Increased autoantibodies levels in women that had spontaneous abortion which is : A. Highly significant increased (P<0.01) in anticardiolipin antibodies (ACA) levels in the serum of aborted women at different stages of pregnancy , compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).B. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgM) (β2 - GP 1 - IgM) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).C. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgG) (β2 - GP 1 - IgG) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).D. Highly significant increased (P<0.01) in the level of anti - double stranded DNA (anti - dsDNA) in all groups of aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).E. (14) (15.6)% from total test of aborted women showed positive reaction to antinuclear antibodies (ANA) compared with control groups which were negative to this test. 2. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of (TNF - α , INF - δ , IL - 2) in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).3. Highly significant decreased (P<0.01) in the levels of (IL - 10, IL - 4) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).4. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of immunoglobulins (IgG,IgA,IgM) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).5. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of complement component (C3,C4) in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).6. Antitoxoplasma antibodies (IgM) were found in (18) (20)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while found in (32) (35.6)% from total aborted women have antitoxoplasma antibodies (IgG). 7. Anti CMV antibodies type (IgM) were found in (12) (13.3)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while anti CMV antibodies type (IgG) were found in (25) (27.8) % from total aborted women .8. AntiRubella antibodies type (IgM) were found in (10) (11.1)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while antiRubella antibodies type (IgG) were found in (21) (23.3)% from total aborted women .9. Anti (HSV 1,2) antibodies type (IgM) found in (4) (4.4)% from total aborted women at dofferent stages of pregnancy.10. Significant increased (P<0.05) in the levels of LH hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).11. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of prolactin hormone in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).12. There was a correlation between (ACA) and each of cytokines (TNF - α , INF - δ , IL - 8 , IL - 10 , IL - 4) but this correlation was non significant (P>0.05) and also between anti - dsDNA and all cytokines tested.13. There was non significant correlation (P> 0.05) between LH hormone and all cytokines tested and also between prolactin hormone and each of (TNF - α , INF - δ , IL - 2 , IL - 10) , while there was significant correlation (P<0.05) between prolactin hormone and (IL - 4). 14. There was Co - infection between (ACA) and infectious agents and also between different types of infectious agents in this study.

دراسة مرضية وجزيئية لبكتريا Helicobacter pylori المعزولة من المرضى المصابين بالقرح المعدية والمعوية == Pathological and Molecular study on Helicobacter pylori isolated from patients with gastric and duodenal ulcers

اسم المؤلف: رباب قاسم محمد الصكر
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت80 خزعة نسيجية من المرضى المصابين بامراض القرح المعدية والمعوية، اظهرت نتائج الاختبارات النسيجية المرضية هيمنة التهاب المعدة المزمن بنسبة %35 واتت قرحة المعدة ثانية بنسبة %22.5.اظهرت الدراسة كفاءة اختبار اليوريزالسريع في التحري عن هذه الجرثومة اذ استطاع ان يثبت وجود هذه الجرثومة في 62 خزعة نسيجية واتت الاختبارات النسيجية المرضية ثانية حيث ظهرت جرثومة H.pylori في 47 خزعة نسيجية في حين تمكن الاستنبات البكتيري من الحصول على 42 عزلة بكتيرية.اثبت فحص الحساسية الدوائية تجاه عشر مضادات حيوية كفاءة المضادين الحيويين السيفوتاكسيم والريفامبسين في القضاء على هذه الجرثومة فقد كانت نسبة المقاومة لهما %10 واتى المضادان الحيويان التتراسايكلين والدوكسي سايكلين ثانية بنسبة مقاومة %20،%30 كانت نسبة المقاومة للارثرومايسين والكلارثرومايسين، فيما كانت نسبة المقاومة للاموكسيسلين %100 ونسبة المقاومة %80 لكل من المترونيدازول والسبروفلوكساسين اما الجنتامايسن فكانت نسبة المقاومة له %50.تم نمطت العزلات وراثيا باستعمال بوادىء متخصصة بالكشف عن قطعة الدنا التي تمثل المورث ure AB والمساوية الى 492زوج قاعدة لوحظ احتواء ثمان عزلات على هذا المورث فيما خلت العازلتان HP7 وHP9 من هذا المورث باستعمال تقنية الـ PCR.اظهرت نتائج النسق البلازميدي ان %50 من عزلات H.pylori تحوي بلازميدات، فقد احتوت العزلات (HP3, HP4, HP6, HP8) على بلازميدات صغيرة وامتلكت العزلتان (HP4,HP6) بلازميدا كبيرا فضلا عن بلازميدها الصغير فيما خلت العزلات الباقية من البلازميدات.اظهرت نتائج التحييد البلازميدي باستعمال صبغة بروميد الاثيديوم بوصفها مادة محيدة وبتركيز 3000 مايكوغرام/ مليليتر فقدان العزلة HP4 بلازميدها الكبير والصغير نتج عن ذلك فقدان تلك العزلة HP4صفة انتاج انزيم اليوريز وكذلك فقدانها المقاومة للمضادين الحيويين المترونيدازول Metronidazole والسروفلوكساسلين Ciprofloxacillin.اظهر التحول الوراثي Gentic transformation بين الدنا المستخلص من العزلة HP4 وبين العزلة HP1 التي عدت خلية كفوءة اكتساب الاخيرة صفة المقاومة للمترونيدازول اذ استطاعت ان تنمو على اوساط انتخابية تحوي 32 مايكوغرام/ مليلترمن هذا المضاد.اجريالتحول الوراثي ثانية بين دنا العزلة Hp4 وبكتريا تابعة لجنس اخر هي بكتريا Escherichia coli MM294 اظهرت نتائج هذه التجربة اكتساب بكتريا E.coli صفة انتاج انزيم اليوريزو المقاومة للمترونيدازول والسبروفلوكساسين من بكتريا H.pylori. | A 80 biopsies were collected from gastric & duodenal ulcers, showed dominance of chronic gastritis and gastric ulcers in aratio of %35 and %22.5, respectively.Rapid urease test, histopathological examination and cultural for detection of Helicobacter pylori, Showed the presence of this bacterium in 62 biopsies for urease test, in 47 biopsies for his topathological examination and in 42 biopsies in culture examination.Antibiotic susceptibility tests againt 10 isolates of H.pylori, Showed %10 resistance for cefotaxim & Rifampin, %20 resistance for Tetracyclin & Doxycyclin, %100 resistance for Amoxycillin, %80 resistance for Meteronidazole & ciprofloxacin and %50 resistance for Gentamicin.Genotyping by specific primer in PCR reaction for ureAB gene, Showed that 8 isolates were positive for this gene, where 2 isolates were negative.Plasmid profile for H.pylori isolatez Showed small single plasmid in each of HP3, HP4, HP6 and HP8 isolates and single small and larg plasmids for HP4 and HP6 isolates whereas other isolates were free of plasmids.Curing experiment for HP4 isolate by using ethidium bromide as acuring agent in aconcentration 3000 Mg/ ml, Showed the cured derivation lost their Urease production trait and resistance to meteronidazole & ciprofloxacin.Transformants resulted from transformation experiment between HP4 total DNA & HP1 as acompotent cell, Showed acquired ability to grow on selectve medium containing 32 Mg/ ml of metrronidazole.Another transformants, resulted from transformation experimeat between HP4 total DNA and Escherichia coli MM294 as acompetent cell, Showed acquired ability for Urease production & ciprofloxacin & Meteronidazole resistance.

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: دنيا فريد سلوم
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

في نماذج عنق (HPV) التنميط الجيني للفيروسي الحليمي البشري الرحم لنساءعراقيات باستخدام تقنيتي الوقت الحقيقي - سلسلة تفاعل البلمرة والصفوف الجينية == Genotyping of Human Papillomavirus in a sample of Iraqi women with cervical abnormalities by using Real - Time PCR and Macroarray

اسم المؤلف: حلى يونس فاضل السعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التحري عن العلاقة بين اصابة الفيروس الحليمي البشري (HPV) وحالات الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم في النساء العراقيات. تضمنت الدراسة 122امراة لديهن اعراض سريرية لاصابة عنق الرحم, 110 امراة منهن تميزت بنمو الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم او السرطانية, حيث كان 40.9 % من تلك النساء كان لديهن اصابة بالفيروس الحليمي البشري, اما 12(16.7%) امراة المتبقية تميزت بنمو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم بالرغم من وجود التهاب مزمن والتي جمعت خلال عام 2010. تضمنت مجموعة السيطرة 10 نساء والتي تميزت بغياب كل من التغيرات الخلوية, العلامات السريرية والاصابة بالفيروس الحليمي البشري. اظهرت نتائج مسحات عنق الرحم وجود نوعين من خلايا عنق الرحم غير الطبيعية هي : اصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية قليلة الخطورة (LSIL) التي شملت 70% من حالات الاصابة بالفيروس, واصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية عالية الخطورة (HSIL) التي شملت 26% من حالات الاصابة الايجابية. بينما 4% من مجموع الاصابة الكلية تمثلت بالنساء ذو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والالتهاب المزمن . هي الصفة المميزة للاصابة بالفيروس. تلك الصفة ترافقت مع 100% بوجودKoilocytosisالثاليل التناسلية الظاهرة للعيان و16.7% ترافقت مع الثاليل المستوية (غير الظاهرة). تشير دراسة الدنا الفيروسي باستعمال تجربتي سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي(PCR Real­Time) والصفوف الجينية(MacroArrays) التي طبقت لاول مرة في العراق الى وجود الفيروس الحليمي البشري بنسبة 35.6% في كل المجاميع المدروسة. تشير النتائج الى وجود 17 نمط جيني مختلف للفيروس الحليمي البشري بين 47 امراة مصابة باستعمال تقنية الصفوف الجينية, اربعة عشر من هذه الانماط الجينية كانت من الانماط عالية الخطر والتي شكلت 82.35% من مجموع الانماط والانماط الجينية المتبقية كانت من الانماط قليلة الخطر والتي شكلت 17.56% من مجموع الانماط. دى النتائج المهمة للدراسة الحالية تشير الى وجود 10 انماط جينية مختلفة ربما سجلت للمرة الاولى في النساء العراقيات ( 31 - , 45 - , 51 - , 52 - , 53 - , 58 - , 59 - , 66 - , 68 - , 44 - HPV ). لنمط الجيني 16 - HPV هو السائد على الانماط الجينية السبعة عشر, شكل هذا النمط مع الانماط الجينية (59 - , 39 - , 66 - , 6 - HPV) الانماط الخمس الاكثر شيوعا في العينات الموجبة. كما اظهرت الدراسة بان النساء ذوات الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والمصابة بالفيروس تحمل الانماط الجينية 16 - HPV و59 - HPV. كما شخصت سبعة انماط جينية مختلفة في عينات الثاليل التناسلية الظاهرة وهي (16 - , 6 - , 11 - , 39 - , 59 - , 66 - , 44 - HPV ). اشارت النتائج الى ان 32 (68.09%) من بين 47 امراة مصابة كانت لديهن الانماط عالية الخطر فقط, سواء كانت الاصابة بانماط مفردة او متعددة, بينما ثمان نساء (17.2%) كان لديهن الانماط عالية وقليلة الخطر سوية, وسبع نساء (14.89%) كان لديهن الانماط قليلة الخطر فقط. استعمل المجهر الالكتروني النافذ للتحري عن الجزيئات الفيروسية في عشر عينات موجبة للدنا الفيروسي وذو تغيرات خلوية مختلفة, حيث اظهرت النتائج وجود الجزيئات الفيروسية في ست عينات بمستويات مختلفة من المرضى واربع عينات لم تظهر جزيئات فيروسية. استخدمت تجربة التحول اللمفاوي لتقييم الحالة المناعية للمصابين. حيث وجدت نسبة التحول عالية في النساء ذوات الخلايا الطبيعية في عنق الرحم والمصابة بالفيروس (اصابة كامنة), بينما انخفضت نسبة التحول اللمفاوي في النساء ذوات الخلايا غير الطبيعية في عنق الرحم . امتلكت 40% تقريبا من حالات الثاليل التناسلية معدل عالي للتحفيز التكاثري للخلايا التائية عند مقارنتها بمجموعة السيطرة. اضافة الى ذلك كان التحفيز التكاثري للخلايا التائية مستقلا احصائية عن كل من نوع الاصابة, المحتوى الفيروسي والمجاميع العمرية. استخدمت تجربة تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي للكشف عن الفيروس وكميته لثلاثة عشر نمط جيني الاكثر ترددا بين المستويات المختلفة للنمو غير الطبيعي للخلايا الطلائية لعنق الرحم في الحالات : قبل الاورام, الاورام والسيطرة الاصحاء(132 عينة). اظهرت نتائج فحص سلسلة البلمرة بان 35 حالة موجبة من 47 حالة اصابة فيروسية التي شملت 74.5% من مجموع الاصابات الكلية. بينما الحالات المتبقية (12 حالة ) التي مثلت 25.5% من مجمو الاصابات الكلية لم يكشف عنها بهذه التقنية. لذلك قدر عدد نسخ الدنا الفيروسي لاغلب الانواع الفيروسية عالية الخطرفي 33 عينة موجبة بمستويات مختلفة من التغيرات الخلوية وعينتين موجبتين ذوات خلايا طبيعية لعنق الرحم . توزع المحتوي الفيروسي ل 33 عينة اعلاه من 1×10 الى 9.4×106 نسخة /مل بمعدل (4.17×104 نسخة /مل). اما العينتين المتبقيتين كانتا خارج قيم المنحى القياسي لذا قدرت ب 5× 107 و1×109 نسخة /مل تقريبا. صنف المحتوى الفايروسي لل35 عينة اعلاه كالاتي : 46% من العينات كمحتوى فيروسي عالي, 34% كمحتوى فيروسي منخفض و20% كمحتوي فيروسي متوسط. استخدم اختبار الصفوف الجينية لفحص 68 عينة, 36 عينة منها كانت موجبة و32 عينة كانت سالبة باختبار سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي. حيث وجدت الانماط الجينية عالية الخطر باستعمال هذه التقنية في (36/35) 97% من العينات الموجبة, بينما العينة المتبقية كانت سالبة لفحص الصفوف الجينية. كما وجدت الانماط الجينية قليلة الخطر وعالية الخطر المحتمل في تلك 35 عينة الموجبة والتي لم يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي فهي الانماط (6 - , 11 - , 53 - , 66 - HPV). اما فيما يخص العينات السالبة في فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي حيث فحصت باستعمال اختبار الصفوف الجينية ووجدت الانماط الجينية في 12 عينة منها, الانماط هي : (44 - , 66 - , 53 - , 11 - , 6 - , 58 - , 39 - HPV). تبين مما تقدم بان فحص الصفوف الجينية يتحرى عن 8 انماط جينية لا يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي, تلك الانماط شكلت 32.84% من تردد الانماط و33.33% من الحالات الموجبة التي تمتلك عدة انماط وهذا يعكس العامل المهم الذي يفضل فحص الصفوف الجينية في التحري عن الفيروس. لذا يبدو اختبار الصفوف الجينية طريقة دقيقة واكثر حساسية لكشف وتنميط اصابات الفيروس الحليمي البشري مقارنة مع فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي. | The present study was conducted to investigate the relationship between Human papillomavirus (HPV) infection and cervical cytological abnormalities in Iraqi women. One hundred twenty two women were included in this study with a cervical infection. A sample of 110 women with abnormal cytology cervical dysplasia / cancer, 45 of which 40.9% had HPV infection and 12 (16.7%) women had chronic infection with normal cytology during 2010. A control group with 10 women of normal cytology and no HPV infection was included in study for comparison. Pap smear test results showed two types of cervical cytological abnormalities, low squamous intraepithelial lesion (LSIL) which comprised of 70% of HPV positive cases, and high squamous intraepithelial lesion (HSIL) which comprised of 26% of HPV positive cases. Whereas 4 % out of the total risk group was represented in women with normal cytology. Koilocytosis is pathognonomic for HPV infection. Furthermore, Koilocytosis was accompanied with 100% with genital wart presence and 16.7% was accompanied with flat wart presence. HPV - DNA studied using Real - Time PCR and MacroArray assay (GenoArray) which applied for the first time in Iraq indicates the presence of HPV - DNA in 35.6% of all tested groups. Results indicate the presence of 17 different HPV genotypes among 47 infected women by using macroarray technique. Fourteen of these HPV genotypes which comprised of 82.35% were high risk (HR - type) and 17.56% (3/17) were low risk (LR - type).One of the important results in the present study indicates the presence of ten different genotypes which may be recorded for first time in Iraqi women (HPV - 31, - 44, - 45, - 51, - 52, - 53, - 58, - 59, - 66 and - 68 types). Out of 17 genotypes HPV - 16 was the predominant one, this genotype together with genotypes 59, 6, 39 and 66 comprised of the five most common types detected in HPV positive cases. Moreover, percentage of HPV - 16, and - 59 were extended to involve women with normal cytology. Seven different genotypes - 6, - 11, 16, 59, - 39, - 66 and - 44 have been identified in genital wart specimens. Results indicated that 32 (68.09%) out of 47 infected women had HR type alone, whether single or multiple types, while eight women (17.02%) had HR types in association with LR types and seven women (14.89%) had LR type only. Transmission electron microscope (TEM) was used for viral particles detection from ten HPV DNA positive samples with different cytological changes. Results indicated the presence of viral particles in six samples with different grades of disease and four samples showed no viral particles. To evaluate the immune status of patients lymphocyte transformation assay was applied. Results indicated that transformed lymphocyte were found to be high in women with normal cytology which may have HPV as a latent infection, while they were decreased in women with abnormal cytology. Approximately 40% of genital wart cases have higher mean of proliferative T cell response when they were compared with control group. However, proliferative T cell responses were statistically independent on HPV infection type, viral load and aging group. Real - time PCR assay was employed for HPV detection and quantitation (viral load estimation) from the range of HR - HPV DNA 13 genotypes most frequently found in different grades of cervical intraepithelial neoplasia, cervical tumors and health controls from (132 samples). Results showed that out of 47 positive cases 35 cases can be detected by real - time PCR which comprised of 74.5%. Failures in detection by this technique included 12 cases which comprised of 25.5% of the positive samples. Therefore, viral DNA copies number for the most HR - HPV types in cervical samples was determined from 35 sample with low and high - grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN I, II, III and Squamous Cell Carcinoma), and with normal cytology. However, the viral load of the 33 samples spread over a wide range from 1×10 to 9.4×106 copies/ml (mean 4.17×104 copies/ml). In addition, two samples were around the standard curve values as : approximately 5×107 and 1×109 copies/ml considered. Viral load was estimated approximately 46% constituted as high viral load, 34% as low viral load and 20% as slightly high viral load. Macroarray was applied in 68 samples, 36 of which were positive and 32 were negative by the real - time PCR test. High - risk genotypes were found in 35/36 (97%) real - time PCR positive samples, whereas remaining two samples were negative for HPV DNA (false - positive) by macroarray assay. The low - risk and probable high - risk (PHR) HPV genotypes were detected in the 35 HPV - positive samples which are not detected by real - time PCR included genotypes : HPV - 6 (in three samples), - 11, - 53 and - 66 (in two samples for each). HR, PHR and LR HPV genotypes were detected by macroarray in the 11/31 HPV - negative samples in real - time PCR which comprised of genotypes : - 39, - 58, - 66, - 11, - 6 and - 44. The GenoArray (GA) is capable of detecting 21 HPV multiple genotypes, including 8 types not detecting in real - time PCR. These types represented 32.84% of HPV types frequency and 33.33% of HPV positive cases had multiple types, this may reflect the important factor potentially favoring the GA for HPV detection. Therefore, the GA genotyping assay appears to be more accurate and sensitive technique for the detection and genotyping of HPV infections than real - time PCR one.

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

اسم المؤلف: ايمان جواد كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.

انتاج وتنقية وتوصيف البلانتريسين من سلالات محلية لبكتريا Lactobacillus plantarum == Production, Purification and Characterization of Plantaricin from Local Strains of Lactobacillus plantarum

اسم المؤلف: ولاء شوكت علي
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 118 عزلة تعود لجنس عصيات الحليب Lactobacillus من الخضر المتخمرة والعجائن الحامضية، واخضعت جميع هذه العزلات للفحوصات الزرعية والمجهرية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية بغية تشخيصها حتى النوع واظهرت النتائج ان 73 عزلة منها تعود للنوع Lactobacillus plantarum ، منها 48 عزلة من الخضر المتخمرة و25 عزلة من العجائن الحامضية، وكانت هذه البكتريا سائدة في الخضر المتخمرة اذ بلغت نسبة عزلها 73.85% بينما بلغت نسبتها في العجائن الحامضية 47.17% . تم التحري عن قابلية عزلات بكترياLb.plantarum على انتاج البلانتريسين باستخدام 3 طرائق هي : الاشرطة المتقاطعة(flip - streak method) والتنقيط (spot on the lawn method) والانتشار بالحفر(well diffusion method) ضد 12 نوعا من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام والمتضمنة : Staphylococcus aureus وStaphylococcus epidermidis وListeria monocytogenes وEnterococcus feacalis وLactobacillus acidophilusو Bacillus spp. وPseudomonas aeruginosa وPseudomonas fluorescens وSerratia marcescens وSalmonella typhi و. Klebsiella sppو Escherichia coli. واظهرت النتائج ان 8 عزلات كانت منتجة للبلانتريسين بطريقة flip - streak و7 عزلات كانت منتجة له بطريقة spot on the lawn بينما استطاعت 12 عزلة من انتاجه بطريقة الانتشار بالحفر،مما يدل على ان انتاج البلانتريسين في الاوساط السائلة كان افضل من انتاجه في الاوساط الصلبة،وعدت طريقة الانتشار بالحفر هي الافضل في التحري عن انتاج البلانتريسين. اظهرت البلانتريسينات المنتجة من عزلات Lb.plantarum فعالية عالية ضد P. aeruginosa عندما ابدت 83.3% من هذه العزلات فعاليتها التثبيطية ضد هذه البكتريا بينما اظهرت 16.7% فقط من هذه العزلات تاثيرها التثبيطي ضد بكتريا Lb. acidophilus ولم تبد اية عزلة من عزلات Lb.plantarum اية فعالية تثبيطية ضد بكتريا Bacillus spp. ، هذا وكانت العزلة Lb.plantarumVGW8 هي الافضل في انتاج البلانتريسين اذ تمكنت من انتاجه في الاوساط الصلبة والسائلة بالطرائق الثلاثة اعلاه، فضلا عن فعاليتها التثبيطية العالية تجاه 10 انواع من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج البلانتريسين من العزلة VGW8 Lb.plantarum واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان الوسط المحضر مختبريا في هذه الدراسة والذي اطلق عليه وسط الانتاج السائل ورمز له (PLM) المتكون من 2% كلوكوز و2% ببتون و1.5% مستخلص الخميرة و1.5% مستخلص اللحم و0.25% من ملح K2HPO4 و0.5% من مادة tween 80 ،برقم هيدروجيني(pH) 5 وبدرجة حرارة30 م وبحجم لقاح 2% من المزروع البكتيري الذي يحتوي على 1×109 خلية /مل ولمدة حضانة 12 ساعة في ظروف لاهوائية. تمت في هذه الدراسة ايضا تنقية البلانتريسين اذ سخن المستخلص الخام للبلانتريسين بدرجة 80 م لمدة 10 دقائق قبل البدء بالتنقية والتي تضمنت خطوتين الاولى هي الاستخلاص بالمذيب العضوي (البيوتانول) والثانية الفصل بطريقة كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود (Sepharose 6B). وقد اظهرت النتائج الحصول على البلانتريسين بفعالية نوعية 10666.67 وحدة/ملغم بروتين وبعدد مرات تنقية بلغ 13.067 وبحصيلة نهائية 12%.اطلق على البلانتريسين النقي اسم بلانتريسين VGW8 نسبة الى العزلة المنتجة Lb.plantarumVGW8 .كذلك فقد تم توصيف البلانتريسين المنقى VGW8 واظهرت النتائج ان وزنه الجزيئي كان 14400 دالتون بطريقة الترحيل الكهربائي بوجود المادة الماسخةsodium dodecyl sulfate(SDS) . واظهرت فعالية البلانتريسين النقي ثباتية عالية في قيم من الرقم الهيدروجيني(pH) تراوحت ما بين 3 الى 9 ،اذ احتفظ بكامل فعاليته عند تلك القيم لكنه فقد نصف فعاليته في pH( 2 و10) وكامل فعاليته في pH القاعدي (11 و12).كما اظهرالبلانتريسين ثباتية عالية تجاه المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 100) م لمدد زمنية مختلفة شملت (10 و30 و60) دقيقة ويلاحظ من النتائج انه في الوقت الذي تمكن فيه البلانتريسين من الاحتفاظ بكامل فعاليته عند المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 80 ) م للمدد الزمنية اعلاه، لم يتمكن من استرداد سوى نصف الفعالية عند تعرضه لدرجة حرارة 100 م لمدة 60 دقيقة او عند تعرضه لدرجة حرارة المؤصدة (121 م) لمدة 15 دقيقة. كما بينت النتائج طبيعة البلانتريسين البروتينية عندما فقد كامل فعاليته بعد معاملته بالانزيمات الحالة للبروتين ( ببسين وتربسين وبابين) في حين لم تتاثر فعاليته عند معاملته بالانزيمات (لايبيز والفا - اميليز ولايسوزايم).كذلك فقد اظهر البلانتريسين ثباتية عالية بعد معاملته بالمذيبات العضوية(كلوروفورم واسيتونايترل وداياثيل ايثر وايثانول وميثانول وايزوبروبانول وتولوين واثيل اسيتيت)، والمنظفات (توين80 وتوين20 وترايتون اكس100و EDTA ويورياو SDS) ، وبعض الايونات الفلزية (الصوديوم والبوتاسيوم والكاليسيوم والباريوم والزنك والحديد) حيث استعاد كامل فعاليته بعد معاملته بها لكن فعاليته انخفضت الى النصف بوجود ايوني المغنيسيوم والمنغنيز.تمت ايضا دراسة فعالية البلانتريسين VGW8 ضد P.aeruginosa وS.aureus واظهرت النتائج ان البلانتريسين يمتلك الفعالية القاتلة للبكتريا عندما انخفضت اعداد البكتريا مع زيادة تركيز البلانتريسين الى 320 وحدة /مل، فقد اظهرت النتائج ان هذا التركيز كان كافيا لقتل بكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين من التعرض للبلانتريسين ولقتل بكتريا S.aureus بعد اربع ساعات من التعرض له. ايضا فقد تمت دراسة الفعالية التحللية للبلانتريسين VGW8 واوضحت النتائج انه يمتلك الفعالية الحالة للغشاء الخلوي عندما انخفضت الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 600 نانوميترمن 0.59 الى 0.17 لبكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين فقط من التعرض للبلانتريسين وبتركيز 320 وحدة/مل ، ومن 0.51 الى 0.20 لبكتريا S.aureus بعد 4 ساعات من التعرض للبلانتريسين وبالتركيز نفسه(320 وحدة/مل).وتمت ايضا دراسة تاثير البلانتريسين VGW8 على نفاذية الخلية وبينت النتائج ان الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 260 نانوميتر قد سجلت زيادة من 0.5213 الى 2.9112 لبكتريا P.aeruginosa ومن0.4614 الى 2.6405 لبكتريا S.aureusدليلا على خروج الحامض النووي (DNA) من الخلايا نتيجة لتحللها.يتضح من هذه النتائج ان هدف البلانتريسين VGW8 هو الغشاء الخلوي. | A total of 118 isolates of Lactobacillus were obtained from fermented vegetables and sourdoughs. All the isolates were subjected to the cultural, microscopical and biochemical examinations for the identification of species. The results showed that 73 isolates belongs to Lactobacillus plantarum, 48 isolates from fermented vegetables and 25 isolates from sourdoughs. Lb. plantarum was dominate in fermented vegetables with 73.85% percentage of isolation while in sourdoughs the percentage of isolation was 47.17%.Three methods (flip - streak, spot on the lawn and agar well diffusion methods) were used to detect of plantaricin production by Lb. plantarum isolates against 12 species of Gram positive and Gram negative bacteria which included, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Enterococcus feacalis, Lactobacillus acidophilus, Bacillus spp., Escherichia coli, Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens and Klebsiella spp. The results showed that 8 isolates produced plantaricin by flip - streak method, 7 isolates produced it by spot on the lawn method, while by the agar well diffusion method ,12 isolates were able to produce plantaricin, suggesting that the production of plantaricin was best in the broth medium than in the solid medium. The agar well diffusion method was considered the best one for detection of plantaricin production. Plantaricins of Lb. plantarum isolates exhibited high activity against P. aeruginosa when 83.3% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against this bacterium, whereas the lowest activity was against Lb. acidophilus when 16.7% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against it. No activity against Bacillus spp. was observed.Lb. plantarum VGW8, was the best isolate for plantaricin production. It produced it in both broth and solid media by all detection methods used in this study, this plantaricin exhibited a broad spectrum of activity against 10 species of both Gram positive and Gram negative bacteria. The optimum conditions for plantaricin production by Lb. plantarum VGW8 were determined and the results showed that the best production medium was production liquid medium (PLM) that prepared in this study, it composed of 2% glucose, 2% peptone, 1.5% yeast extract, 1.5% beef extract, 0.25% K2HPO4 and 0.5% tween 80,with pH 5, temperature 30°C for 12 hours under anaerobic conditions and inoculum size of 2% of cells number 1×109cell/ml.Purification of plantaricinVGW8 was made by heating crude plantaricin at 80ºC/10min and then purified by two steps method including extraction with n - butanol followed by gel filtration chromatography on Sepharose 6B column, the results showed that the specific activity was 10666.67AU/mg protein with 13.067purification folds and 12% recovery yield. The purified plantaricin was called plantaricin VGW8 according to the producer isolate Lb. plantarum VGW8.Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of plantaricin VGW8 was 14400 Dalton by sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Plantaricin VGW8 activity was stable at pH values (3 - 9) but 50% of its activity was lost at (2 and 10) pH values, and whole activity was lost at extreme alkali pH values(11 and 12).Also, plantaricin VGW8 showed high thermostability at different temperatures (20 - 100)°C for (10,30 and 60)min, it remained active after being treated with (20 - 80)°C for the periods above, but it retained only 50% of its activity after treatment at 100°C for one hour and autoclaving treatment (121°C/ 15 min).The results showed that the activity of plantaricin VGW8 disappeared when it treated with proteolytic enzymes (pepsin, trypsin and papain), whereas it retained whole activity when treated with lipase, lysozyme and α - amylase, indicating pure proteinaceous nature of purified plantaricin.As well as, treatment of plantaricin VGW8 with organic solvents (chloroform, acetonitrile, diethyl ether, ethanol, methanol, isopropanol, toluene and ethyl acetate), surfactants (tween 80, tween 20, triton X - 100, SDS, EDTA and urea) and the metal ions : Na, K, Ca, Ba, Zn and Fe, showed no effect of these treatments on the activity of plantaricin VGW8.While treatment with Mn and Mg reduced its activity to the half.The antibacterial activity of plantaricin VGW8 was studied against P. aeruginosa and S.aureus. It was observed that plantaricin VGW8 has bactericidal effect when the numbers of cells were decreased with increasing of plantaricin VGW8 concentration to 320 AU/ml. The results showed that the complete killing of P. aeruginosa was observed after 2 hours of incubation with 320 AU/ml of plantaricin VGW8, while the same effect was observed after 4 hours on S.aureus. Also, the lytic activity of plantaricin VGW8 was studied, and the results showed that exposure P. aeruginosa and S.aureus to 320 AU/ml of plantaricin VGW8 led to decrease absorbance at 600nm from 0.59 to 0.17 for P. aeruginosa within 2 hours and from 0.51 to 0.20 for S.aureus within 4 hours. Moreover, the effect of plantaricin VGW8 on the cell permeability was studied and the results showed that absorbance at 260nm increased from 0.5213 to 2.9112 for P. aeruginosa and from 0.4614 to 2.6405 for S.aureus, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis. This means that the cell membrane is the target of plantaricin VGW8.

تاثير الذيفانات المعوية للبكتريا ETEC Escherichia coli في الخلايا السرطانية والخطوط الخلوية وفي حيونات التجارب == Effect of ETEC Escherichia coli enterotoxins on cancer cells, cell lines and laboratory animals

اسم المؤلف: الهام سعيد عبد الكريم بنو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study aimed investigating the cytotoxic effect of crude enterotoxins on normal and cancer cells both invitro and invivo. the present study included isolation and identification of Pathogenic Escherichia coli, From Children (under 3 - years for both sexes) infected with severe diarrhea, from March to June 2005, and as follows : *Sixtysix Islates (60%) were obtained from 110 samples. These Isolates were Identified according to morphological and biochemical tests, and for confirmation by Api - 20E System. *Serological identification for these Isolates( 66 isoleates )showed that only 12 (18%) isolates were belonged to Enteropathogenic group of E. coli.(EPEC).* The results of using Suckling Mouse Assay(SMA) showed that only 13 (19.6%) out of 66 Isolates were capable of producing heat - stable (ST) enterotoxin, therefore these isolates belonged to Enerotoxigenic group of E.coli ( ETEC).Whereas the EPEC isolates were all negative for this test. According to the toxin activily that was evaluated by (SMA) the Isolate No. 99 determined as the most efficient Isolate in producing the (ST). The same Isolate (99) of E. coli showed its ability to produce heat Labile enterotoxin (LT), by using Rabbit lileal Loops.The Isolate (99) revealed for sensitivity to Ampicillin, Gentamicin, Nalidixic acid and Nitrofurantoin antibiotics, but resistance to Amoxicillin , Cefixime, Cephallothin, Ciprofloxacin and trimethoprim.This Isolate also showed its ability to adhere by using the special media that contain the congo red stain, and by using hemagglutination test because it posseses the colonization factors antigen (CFA/1) and CFA /III However it failed in producing hemolysin enzyme that hemolyze red blood cells The toxin reserved Its activity at temperatures (20,40,60 and 80)c0 , but loss some of its effect at 100 c0 and kept its activity at 4 c0 for (24 - 48) hrs, It was found that the highly toxic activity reduced in the PH 5,9.5. The time ofmice response to enterotoxin was determined. At 90 minutes, as the maximum of response and 180 minutes as the optimum time of response. Enterotoxin was purified partially by using sepharose CL - 6B, and the molecular weight for (ST) was 17378 dalton. LD50 of both bacterial Suspension and crude enterotoxin in mice was 2.13 × 108 cell/ mice, and 48.75 mg/ mice respectively. The crude enterotoxin showed more severe effect than the bacterial suspension in spleen, Intestine, and Lung, while the effect of bacteria suspension was more severe in Liver.The therapeutic dose of crude enterotoxin was determined according to LD50 in mice it was revealed that the concentration of 390 mg/kg have the activity in reducing the tumor volume when injected directly in tumor, with an inhibition ratio between(83 - 89)% beginning at 8th day of the 25th injecting days. While when the toxin was injected intraperitonealy, the inhibition ratio of tumor was Less than the injection in tumor it self. The dose 97.5 mg/kg that given daily for 25 days showed more efficiectly in reducing the tumor in percent of 73.3. The Comparitive study between the relative volume of tumor in treated group and the relative volume of tumor in control group revealed that there was significant difference statistically important all over the treatment time.. The necrosis and fibrosis were the most important characteristics in treated groups after histopathological examination which appearantly with the progress of treatment associated with volume decrease of tumor, so it was found that the last stage of treatment showed the cancer cells presented like small Land Surrounded by dense fibrous tissue. The treatment by using all toxin concentration in both ways of injections on murine bone marrow cells, showed significant increase in blast Index (BI) and mitotic Index (MI) when compared with control.The toxic effect of crude extraction was studied in tumor cell lines (in vitro), Hep - 2 and AMN - 3 and the normal cell line REF, the study showed that the toxic effect depend on the type of cells, the dose and the time of exposure. This study revealed that the AMN - 3 Cells were more Susceptible from that of Hep - 2 Cells and the high concentration caused inhibition to the growth of the tumor cells, Specially the concentration of 60000 Mg/ml, Also growth and multiplication of REF cells. Whereas the concentrations of 1875and 3750 Mg/ml were found as an inhibitor to REF Cells. Partially purified enterotoxin (ST) showed that it's effect was found to in hibit Hep - 2, AMN - 3 and REF cells at 72 hrs of exposure and has an inducer effect to growth of cells at 24 hrs of exposure in all concentrations,but the effect was differ in the time of exposure at 48hrs,that the three concentrations (1.986,3.965and 7.95) Mg/ml showed inducing effect ,while the three hight concentrations(15.86,158.6 and1586) Mg/ml showed inhibition effect to AMN - 3 cells.Also the hight concentrations(30000 and 60000) Mg/ml werefound as inhibitor to REF cells at( 48,72)hrs,but they were inducer of growth at 24hrs of exposure. The toxicity effects of crude enterotoxin were studied in human Lymphocyte multiplication (in vitro) , and the higher concencentration showed decline in Mitotic index (MI), but It was induced cells to transform in present of mitogen, so there was inverse in blast index (BI) when compare with the control.

دراسة نسيجية فسيولوجية وبايوكيميائية للمعايير ذات العلاقة بامراض الغدة الدرقية == Histophysiological And Biochemical Study of parameters related with thyroid disease

اسم المؤلف: ريم عبد الرحيم السعد
اسم المشرف: كريم حميد رشيد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد امراض الغده الدرقية من الامراض شائعة الحدوث لاسباب مختلفة وتشمل امراض الغدة الدرقية كل من فرط الدرقية (Hyperthyroidism) (وقصور الدرقية ((Hypothyroidism اذ يحدث تضخم الغده الدرقية في الحالتين . يزداد انتاج هرمونات الغدة في مرضى فرط الدرقية بالرغم من انخفاض تركيز الهرمون المحفز للدرقية ( Follicle stimulating hormone )في حين يقل انتاج هرمونات الدرقية في مرضى قصور الدرقية بالرغم من زياده انتاج الهرمون المحفز للدرقية.هنالك علاقة بين هرمونات الغدة الدرقية والايض من خلال تاثير هذه الهرمونات على ايض الكربوهيدرات , الدهون والبروتينات وبالتالي تنتج الطاقة من تحلل هذه المركبات ولقد اجريت هذه الدراسة للتعرف على التاثيرات المختلفة لمعايير الفسلجية والنسيجية والكيموحيوية والجزيئية في مرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية لمجموعتين عمريتين هما اقل من 45 سنه واكثر من 45 سنه للذكور والاناث.اظهرت نتائج الدراسة اختلافات معنوية بين كل من الهرمون المحفز للدرقية وهرمون الدرقية الثلاثي وهرمون الدرقية الثايروكسين وهرمون الايرسين ومستويات مستقبلات الانترليوكين ومستويات الكلكوز بالمصل ومستويات معدل كتلة الجسم ومستويات الكالسيوم بالمصل ومستويات قابليه مضادات الاكسدة بالمصل ومستويات الصوديوم بالمصل في مرضى قصور الدرقية ومرضى فرط الدرقية مقارنه مع مجموعه السيطرة في حين وجدت اختلافات غير معنوية بين انزيم البيروكسيدايزعند مرضى فرط الدرقية في كلا الجنسين ,مستقبل بروتين الثلاثي (FCRL3)والثايروكلوبيولين عند مرضى قصور الدرقية في كلا الجنسين ومستقبل الهرمون المحفز للدرقية في مرضى قصور الدرقية في الذكور والاناث في المرضى الاقل من 45 سنه فقط مقارنه بمجموعة السيطرة ,كما اظهرت الدراسة النسيجية وجود اختلافات في التركيب النسيجي للحويصلات الدرقية بين مرضى الغدة الدرقية بنوعيها (فرط الدرقية وقصور الدرقية) مقارنة مع السيطرة استخدم في هذه الدراسة جين MAPKinaes gene للكشف عن اورام الغدة الدرقية , وقد اظهر استخدام كيمياء المناعة النسيجية وجود ورم سرطاني من النوع الحلمي Papillary Carcinoma في احدى العينات المستحصلة لهذا الغرض .بينت نتائج الارتباط بين المعايير المختلفة لمرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية وجود ارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين الهرمون المحفز للدرقية معدل كتلة الجسم وارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين مستقبل الانترليوكين وهرمون الدرقية الثلاثي وارتباط موجبة معنوي p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون الدرقية الثلاثي وعلاقة ايجابية معنوية p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون المحفز للدرقية | The thyroid disease is a common disease of occurrence for different causes which include thyroid hyperthyroidism and hypothyroidism . Goiter occurs in both cases and the production of thyroid hormones increases despite the decline in the concentration of the thyroid stimulating hormone (TSH), while the production of thyroid hormones decreases in hypothyroidism despite the increase in the production of thyroid stimulating hormone. In view of the relationship between thyroid hormones and metabolism and the metabolic rate through the influence of these hormones on the metabolism of carbohydrates, fats and proteins and thus energy produced from the hydrolysis of these compounds This study was conducted to investigate the different effects on different physiological ,histological biochemical and molecular criteria in 58 patients with hyperthyroidism and hypothyroidism for two age groups , they were collected from the Teaching Laboratories in Al - Hilla teaching hospital and from private laboratories (Babylon) , during the period from November 2015 to march 2016, the aim of this study was the detection of the best possible diagnostic parameter for the detection of the dysfunction of thyroid gland by using various biological markers in this study. The results of this study showed that a significant differences in thyroid stimulating hormone (TSH), irisin, thyroxin (T4), triiodothyronine (T3), triglycerides (TG), body mass index (BMI), glucose, Interlukin - 2 Receptor (CD25), total antioxidant capacity (TAC), Potassium (K), Sodium (Na), high density lipoprotein (HDL), calcium (Ca) in hypothyroidism ,hyperthyroidism patients compared with the control group, while the differences were Non - signifecant in the thyroid Peroxidase ( TPO) in patients with hyperthyroidism in both sexes Fc - receptor - like - protein3 (FCRL3), thyroglobulin (Tg) in patients with hypothyroidism in both sexes and thyroid Stimulating Hormone Receptor (TSHR) in patients with hypothyroidism in both sexes only in younger old patients as compared to the control group. Histological study revealed that there were differences in the histological structure of the thyroid vesicles in patients with hyperthyroidism and hypothyroidism compared with the control group. MAP Kinase gene was used for the detection of tumors of the thyroid gland by using immunohistochemistry technique, the result in tissue Papillary Carcinoma was identified in one of the samples obtained for this purpose. The results of the correlation between the different criteria for patients with hyperthyroidism, and hypothyroidism have shown a negative correlation between the thyroid stimulating hormone (TSH) and body mass index (BMI) and interlukin - 2receptor (CD25) and triiodothyronine (T3),while there positive correlation was a between irisin and triiodothyronine (T3) and a positive relationship between both irisin and High Density Lipoprotein (HDL), as well as positive correlation between irisin and thyroid stimulating hormone (TSH).

دراسة جزيئية ومناعية كيميائية لانسجة عنق الرحم المصابه بفايروس الورم الحليمي البشري == Molecular and Immunohistochemical Study of Uterine Cervical Tissues Infected with Human Papilloma Virus

اسم المؤلف: الهام جواد كاظم بلال
اسم المشرف: ازهار عمران لطيف الذهب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: Human papillomavirus (HPV) is a DNA virus. It is the main etiological factor for progress of cervical precancerous and cancerous lesions. In order to develop a cancer from dysplasia to invasive carcinoma, a series of cellular changes should occur. As genital HPV carries oncogenes involving in these critical changes, currently HPV has been considered the most important risk factor of cervical cancer.This study was designed as case control study. In the retrospective part of these study a total number of (56) formalin - fixed, paraffin embedded cervical tissues was involved were submitted to ISH and IHC technique 27 with Cervical Carcinoma (CC) and 16 with benign cervical tumors. Thirteen (13) apparently healthy cervical tissues were used as a control group .The age of this individuals (patients and control groups) was ranged between 23 and 73 years. Samples collected from the pathological archives of different general hospital as well as many private laboratories. Specimens belong to the period from January 2009 to September 2015. After sectioning of these cervical biopsies and staining by hematoxyline and eosin, a final definitive histopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist.In the cross - section part of this study seventy two female patients taken from different general hospitals. Cytological examinations were performed for their Pap - smeared and a final definitive cytopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist. According to their main cytological finding cervical cellular scrapes were divided into three cytological groups : cervicitis with squamous intraepithelial lesions, cervicitis without squamous intraepithelial lesions and healthy group. The DNA isolated from a representative cytological specimen was investigated by real - tim PCR analysis for the detection and genotyping of high/risk HPV DNA.The obtained results are summarized as follows : - The age range distribution mostly in age group (23 - 73 years), the most affected age group in malignant and benign cervical tumor was (52 - 67) , (36 - 51) years which constituted 55.6%(15 out of 27 cases), 50% (8 out of 16 cases) with mean age (54 ± 11.22), (38.8 ± 9.85) respectively, while (20 - 35 years) is the most affected age group in control cases were constituting 53.8% (7 out of 13 cases) with mean age (35.5 ± 8.64 ) . - The most common histopathological type among all studied archived cervical tissues was squamous cell carcinoma (66.6%), followed by the adenocarcinoma (33.3%). - The well differentiated grade of CC constituted 52%, whereas those with moderately and poorly differentiated grades CC constituted 37%and 11% respectively. - The percentage of HrHPV31/33 DNA was detected as follows : in 55.6 % of tissues from cervical cancers, 43.7% in the tissues from benign cervical tumors, while, no HrHPV31/33 positive - ISH reaction was detected in healthy cervical tissues of the control group. - The percentage of LrHPV6/11 DNA was detected as follows : in 33.3 % of tissues from cervical cancers, 31.3% in the tissues from benign cervical tumors, while, the percentage of LrHPV6/11 show negative - ISH reaction in healthy control group of cervical tissues. - The highest positive result for ISH of HPV31/33 found in squamous cell carcinoma 72.2% and in adenocarcinoma was 22.2% while the percentage of HPV6/11detection according to cancer type was 50% found in squamous cell carcinoma while 0.0% in the type of adinocarcinoma. - The highest percentage of HPV31/33 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 70% (7 out of 10 cases) show in moderately differentiated, followed by 57.1% (8 out of 14 cases ) in well differentiated , and none of poorly differentiated showpositive signal . - The highest percentage of HPV6/11 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 42,9 % (6 out of 14 cases) show in well differentiated, followed by 30% (3 out of 10 cases ) in moderately differentiated , and none of poorly differentiated show positive signal . - The highest percentage of co - infection with High risk HPV31/33 and Low risk of HPV6/11 types was (22.2%) in malignant cervical tumor group. While in benign cervical tumor and healthy control was 18.8% and 0.0% respectively. - The highest percentage of HPV DNA detection by Rt - PCR was 80% (16 out of 20 cases) within group of cervicitis with SIL, 16.7% (5 out of 30 cases) in group of cervicitis without SIL, while none of control group shoes positive result. - Phylogenetic tree analysis image, results that local HPV amplicon(S1, 3, 5, 7, 9, 12, 14, 15, 16, 17, 18, 20) show closed related to NCBI - Blast HPV type 16 (KMO58666.1), the local HPV isolates (S2, 4, 6, 11 and 19) show closed related to NCBI - Blast HPV type 18 (KC470225.1), whereas the local HPV isolates (S10 and 13) show closed related to NCBI - blast HPV type 33 (EU918766.1), the local HPV isolates (S8) show closed related to NCBI - Blast HPV type 45 (KC470260.1). - Retinoblastoma protein overexpression was detected by IHC test in 59.3% of malignant cervical tumors, 43.8% of benign cervical tumors but no signal was reported in the tissues of control group. In the malignant cervical tumors group, 43.6% has strong score (score III), whereas 37.5% and 18.8% has moderate score (score II) and low score (score I) respectively. While, in benign cervical tumor group, 57.1% were found tohave moderate score (score II) , 28.6% and 14.3% have strong score (score III) and low score (score I) respectively. - P16 protein overexpression was detected by IHC test in 63% of malignant cervical tumors, 56.3% of benign cervical tumors while none of positive result was reported in the tissues of control group. - The highest positive result for IHC of Rb and P16 according to cancer type was found in squamous cell carcinoma 61.1% and 72.2%, respectively, while there percentage in adenocarcinoma was 55.6% and 44.5%, respectively. - The highest percentage of Rb protein expression was found within poorly differentiated that have 100% (3 out of 3 cases) .Followed by 70% (7 out of 10 cases) and 42.9 % (6 out of 14 cases) within moderately and well differentiated respectively. - The highest percentage was 100 % (3 out of 3 cases), 64.3%(9 out of 14 cases), 50% (5 out of 10 cases) of cervical cancer tissues that showed IHC reaction for P16 protein have poorly, well and moderately differentiated respectively. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 100% and 77.3% have additional impact by P16 and Rb protein expression respectively. - Immunohistochemical examination of cervical tumor tissues for CD8+,CD16+ and CD20+ cell surface markers, revealed that CD8+cells the percentage of detection was 66.7% in cervical cancer group, 62.5% in benign cervical tumor group and 23.1% in control group. Also, CD16+ was detected in 29.6% of cervical cancer group, 31.3% of benign cervical tumor group and in 15.4% of control group. The CD20+ cells were detected in 44.4 % of cancer group, 43.8% of benign tumor group, and in 15.4 % of control group. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 77.3% have additional impact by CD8+ protein expression. Whereas 45.5%, 54.5% have additional impact of CD16+, CD20+ protein expression respectively
1 ... 198 199 200 201 202 ... 349