عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 100 من أصل 49,308

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

اسم المؤلف: هديل مكي حبيب المؤمن
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش محمد عبد الهادي غالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

تاثير حامض الجبرلين والبراسينولايد في بعض صفات النمو والحاصل لصنفين من نبات الشبنت Anethum graveolens L. Effect of GA3 and Brassinolide on Some growth and Yield Parameters for two Cultivars of Plant Anethum graveolens L

اسم المؤلف: وائل شاكر حميد الجبوري
اسم المشرف: ماهر زكي فيصل الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت تجربة حقلية في الحديقة النباتية العائدة لقسم علوم الحياة، كلية التربية للعلوم الصرفة - ابن الهيثم - جامعة بغداد، في الموسم النمو 2015 - 2016 لدراسة تاثير تركيز حامض الجبرلين والبراسينولايد وتداخلهما في بعض الصفات المظهرية والكيميائية والمركبات الفعالة طبيا والحاصل ومكوناته في صنفين نبات الشبنت هما الصنف المحلي والصنف الهولندي. نفذت التجربة باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة Randomized Complete Block Design (RCBD) وبثلاثة مكررات اذ تضمنت الدراسة صنفين نبات الشبنت واضافة خمسة تراكيز من البراسينولايد هي (0 و0.5 و1 و2 و3) ملغم.لتر - 1 ورش حامض الجبرلين على المجموع الخضري بتركيز 50ملغم.لتر - 1 وبدون رشه. وبهذا تكون التجربة عاملية (2 × 2 × 5 ×3) اذ تضمنت 60 وحدة تجريبية، وسمدت الوحدات التجريبية وفق معاملاتها. ويمكن ايجاز النتائج التي تم الحصول عليها كما ياتي : 1. اختلاف صنفي نبات الشبنت (المحلي والهولندي) عن بعضهما في الصفات المدروسة، فقد تفوق الصنف المحلي على الصنف الهولندي في صفة ارتفاع النبات ووطول الحامل الزهري وتركيز الفسفور ونسبة الكاربوهيدرات في المجموع الخضري ونسبة الكاربوهيدرات في الثمار ووزن 1000ثمرة. فيما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي في صفة طول الجذر وحجم الجذر وقطر الساق والوزن الرطب والوزن الجاف ومعدل النمو المطلق واستدامة الكتلة الحيوية وعدد النورات الزهرية وحاصل الثمار في النبات الواحد وحاصل الثمار في الوحدة التجريبية الواحدة وحاصل الثمار الكلي وتركيز النتروجين في المجموع الخضري وتركيز الكالسيوم وتركيز البوتاسيوم وتركيز المغنيسيوم ونسبة البروتين في المجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي في الاوراق وتركيز النتروجين في الثمار، نسبة البروتين في الثمار ونسبة الزيت والوزن النوعي.2. اظهرت الدراسة ان المعاملة بحامض الجبرلين والبراسينولايد والتداخل بينهما ادى الى زيادة معنوية في الصفات المدروسة ، عند رش 50 ملغم.لتر - 1 من حامض الجبرلين وتركيز 2 ملغم.لتر - 1 في معظم الصفات والبعض منها عند التركيز 1 ملغم. لتر - 1 من البراسينولايد على المعاملات الاخرى. 3. اظهرت نتائج الفحص والتشخيص الكروماتوغرافي باستعمال تقنية HPLC تشخيص ستة مركبات فعالة في الزيت الطيار لبذور صنفي نبات الشبنت هي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole وP - anisaldehyde وLinalool). وقـد تـفوق الصنـف المحــلي على الصنـــف الهـولـندي باعطائــه اعــــلى تركـيــز لكل مــن المركبات الفــــعالـــة هـــما P - anisaldehyde) وLinalool)، عند رش حامض الجبرلين بتركيز 50 ملغم . لتر - 1 والبراسينولايد بتركيز1 ملغم. لتر - 1 ، بينما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي باعطائـه اعلى تركيز للمركبات الفعالة وهي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole) عند رش 50 ملغم. لتر - 1 الجبرلين و2 ملغم. لتر - 1 البراسينولايد. | A Field study was conducted at the farm of Biology Department, College of Education (Ibn AL - Haitham) for pure science, University of Baghdad during the growth season 2015 - 2016, on study the effect of Gibberellic acid concentration and brassinolide and their intraction on both morphological and chemical characteristics, the components of yield, determining the medically active compoands in two varieties of Dill plant, local and Holand varieties.The experiment was designed as Randomzied Complete Block Design (R C B D) with three replications. which two varieties of Dill plant and spray of Gibberellic acid (50) mg.liter - 1 and non spray and five concentration of brassinolide (0, 0.5 , 1,2 and 3) mg.liter - 1 The experiment was as designed factorial experiment (2x2x5x3) included sixty experimental units The plants were managed fertilized recommaded.Can be summarized the results that were obtained as follows : 1.different the variety of dill plant (local and holand) from each other in the traits, the local variety surpassed the holand variety in the plant height, the length of the pregnant syphilis, Concentration of phosphate, the percentage of carbohydrates in the shoot, the percentage of carbohydrates in the fruits, weight of a thousand fruits. As outweigh the holand variety at the local variety in the character of the root length, root size, stem diameter, wet weight, dry weight, the absolute growth rate, the sustainability of biomass, the number of inflorescences, holds fruits per plant, holds the fruits in a single experimental unit, holds overall fruits, Concentration nitrogen in the shoot, calcium Concentration, potassium Concentration, the percentage of protein in the shoot, the total chlorophyll content in the leaves, the Concentration of nitrogen in the fruits, the percentage Albroonin in fruits, oil content, specific weight.2. The study showed that treatment with acid and Gibberellin and brassinolide and overlap between them led to a significant increase in the traits, at a spray 50 mg.L - 1 Gibberellin acid and concentration of 2 mg.L - 1 in most qualities and some of them at a concentration of 1 mg.L - 1 brassinolide the rest of the transactions.3. Screening and diagnosis chromatographic results showed the use of HPLC technique diagnosed six compounds in the volatile oil fruit plant varieties Dill are : (Anethol , Limonene , Carvone , Dillapiole , P - anisaldehyde and Linalool). Local variety was higher than the holand variety by giving it the highest concentration of the two active compounds are P - anisaldehyde and Linalool), especially when the spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid and 1 mg. L - 1 of brassinolide, while the superiority of the holand breed Local product by giving it the highest concentration of other active compounds which four : (Anethol , Limonene , Carvone and Dillapiole), especially at a spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid. and 2 mg. L - 1 of brassinolide.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

اسم المؤلف: هبة شاكر احمد
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين علي حسين ادحيه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة الهياة الكروموسومية لنوع من اسماك المياه العذبة العراقية سمكة ابو الزمير العميق Mystus pelusius Karyotyping Study of one Species of Iraqi Freshwater Fish ( Mystus pelusius )

اسم المؤلف: هبة حسين رسن
اسم المشرف: اسماء سامي ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The fish has a great economic and environmental importance, however the cytogenetic studies on them still few, especially the chromosomal studies of local fish, therefore current study aimed to identify the karyotype (Chromosomal type and number) and the sex determination system to a species of Iraqi freshwater fish, which is Mystus pelusius (Solander in Russell, 1794) fish in Iraq, as (20) fish (10) male and (10) female were hunted from Tigris river in Al - Kraat area of Bagdad city.The current study was done to investigate the karyotype, where the chromosomal preparations has been preparing from kidney cells according to (air - drying technique).The results of the males and females kidney cells metaphase chromosomes study showed that the diploid chromosome number was 2n=32, which represents less chromosomal number recorded so far in the studied Iraqi fish, also the results showed that the males chromosomal types included 2n=(6m+13sm+7st+6t) and fundamental number FN=51, the females chromosomal type was 2n=(6m+12sm+8st+6t) and FN=50, also it observed that the first sub metacentric pair was the largest within the biarmed chromosomes.The results revealed that the male (heterogamety) and the female (homogamety), accordingly it follows the sex determination system (XX/XY), as the (X) chromosome represented by medium sized submetacentric (sm) chromosome and (Y) chromosome by small sized subtelocentric (st) chromosome.The results of Giemsa - banding technique (G - banding) showed that the rich regions with Guanine (G) and Cytosine (C) nitrogen bases called (G - light) bands and the rich regions with adenine (A) and thymine (T) called (G - dark) bands, thus it determined more accurately the sister chromosomes in Mystus pelusius males and females, more over thistechnique described sex chromosomes better, it has been observed that most chromosomes in both sexes have (G - light) bands, as all (uniarmed) (telocentric, subtelocentric) autosomes pairs entirely contain (G - light) bands, while in the (biarmed) (metacentric, submetacentric) autosomes chromosomes the light bands concentrated in their telomeres, while the rest regions of these biarmed chromosomes have dark bands. Results of (G - banding) technique confirmed which was shown by the traditional pigmentation method (Giemsa staining technique) about the sex chromosomes discrimination, where this technique showed more accurately and better that the male was heterogamety through a observation of medium sized submetacentric (X) chromosome with (G - light) bands in telomric position of (short arm), while the subtelocentric (Y) chromosome was the larger within the uniarmed chromosomes and it was marked by being entirely dark and lack of (G - light) bands, while it was observed in females a medium sized submetacentric (sm) pairs with (G - light) bands in the telomeric of long and short arms which represents (XX) sex chromosomes, and according to this the females considered to be homogamety and the males heterogamety, and proved that the sex determination system in Mystus pelusius fish was a simple sex determination system of (XX/XY) type

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

اسم المؤلف: نور ماجد عبد الله الدليمي
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم عباس عبد المعيد مصطفى
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

دراسة كيمياوية وبايولوجية لبعض مركبات الايض الثانوي المستخلص من اوراق نبات البشملة L. Eroibotrya japonica المستزرع في العراق Chemical and Biological Study of Some Secondary Metabolism Compounds Extracted from Bashmala Eriobotrya Japonica L. leaves Cultivated in Iraq

اسم المؤلف: نعم حيدر جواد سعيد الجوهري
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study containes the extraction and detection some of active compounds in the leaves of Eriobotrya japonica L. and testing the activity of crude extract as an antibacterial and food preservation. Methnol was used in crude extraction and also CC , TLC ,HPLC techniques were used in qultitive and quantative amount of some flavonoid ,terprnoid and phenolic compound .The well in agar to study the effect of crude on Staphylococcus aurus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria in 200 ,100, 50 and 25 mg /ml concentrations , In addition to study of effect of the extraction on meat at 200 mg /ml concentration . The ruselts show that Alcholic crude extract contains flavonoid ,terprnoid and phenolic compounds and the chlororform was the best solvent in separating those compounds . Through the use TLC and HPLC , it was possible to separate terpenoids (Oleanolic acid , ursolic acid , maslinic acid) , flavonoids (Qurcetin, Kaempferol ,Rutine ) and phenolic compounds (Benzoic acid ,caffeic acid ,chlorogenic acid). The results show the high activity of leaves crude extract of Eriobotrya japonica L . in 200 mg /ml concentrationthat is used as a food preservation in minced beef meat. The results also show significant differences at (P<0.05) in Thiobarbutric acid ,Total violate nitrogen measurement ,total bacterial account , and psychrotrophic bacteria account ,AS for the value of PH was governor compared with standard control. The concentrations of cruds extract showed an Antibacterial activity where Staphylococcus aureus where 15 and 26 mm by using 100 and 200 mg/ ml concetrations respectively .furthermore,The crude extractshowed an efficiency as antibacterial agains Escherichia coli with 13and 15mm inhabition zone ; and also Salmonella typhmurium with 14 and 19mm inhabition zone by using 100 and 200 mg / ml concentration , respectively compared with standard control . The ruselts show that minimum inhibitory concentration of the cruds extract agains Staphylococcus aureus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria was 100 mg / ml compared with standard control .

مستويات الرصاص في الدم لسكان بغداد والعوامل المؤثرة على ذلك Levels of Blood Lead in Baghdad Inhabitants and Factors Affecting Them

اسم المؤلف: نضال ياس يعقوب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد الرصاص عنصرا" طبيعيا" يتواجد في القشرة الارضية ويستعمل على نطاق واسع في الطلاء والكازولين والبطاريات والعلب المعدنية وبعض الاواني الخزفية. ويتعرض الناس الى الرصاص عن طريق الغبار الملوث ورقائق الطلاء والاطعمة الملوثة..شملت الدراسة 80 شخصا من العاملين في الشركة العامة للبطاريات في الوزيرية والذين يتعرضون للرصاص اضافة الى 10 اشخاص غير متعرضين ( مجموعة السيطرة). تم تحديد مستوى الرصاص في دم الاشخاص المذكورين كما درست معايير الدم لديهم اذ شملت فحوصات الدم : مستوى خضاب الدم (Hb)،حجم الدم المضغوط(pcv)،عدد كريات الدم الحمر(RBCs)،متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا(MCHC) ومتوسط حجم الخلايا(MCV). تم اختيار عينة مؤلفة من (38) شخصا من المتعرضين الذين كان مستوى الرصاص لديهم عالي حيث يبلغ (41.4 مكغم/100 مل) مع انخفاض ملحوظ في مؤشرات الدم الاخرى فكان معدل تركيز هيموكلوبين الدم (12.75 غم / 100 مل) اما مدى النسبة المئوية لحجم الدم المضغوط فقد كان (39.4 غم/100 مل) ومعدل عدد كريات الدم الحمر (5 مليون / مم3) ومعدل متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا بلغ (30.9 غم/100 مل) ومعدل متوسط حجم الخلايا بلغ (77.1 فمتولتر) . تمت دراسة تاثير الرصاص على هذه المجموعة من خلال تدوين المعلومات الخاصة في الاستمارة الاستبيانية وكانت اهم هذة التاثيرات على جهاز الخصوبة في الذكور وتاثيرات على الجهاز البولي وظهور عدد من حالات فقر الدم وحالات من السعال والصداع والاجهاض لدى السيدات والم في المفاصل .و من جانب اخر فقد تم تقسيم عينة المتعرضين الى عدة مجاميع حسب : - 1) الجنس : اذ تم تقسيم العينة الى مجموعتي الذكور والاناث اذ كان معدل تركيز الرصاص في دم الذكور اعلى اذ بلغ(35.2 مكغم/100 مل) اما الاناث فقد بلغ (32.2 مكغم/100 مل) . وظهرت معدلات اقل بالنسبة لمؤشرات الدم الاخرى .2) حالة التدخين : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتي المدخنين وعددهم (36) شخصا والثانية غير المدخنين وعددهم (44) شخصا وكان هناك تقارب في نتائج مستوى الرصاص في الدم للمجموعتين.3) للفئات العمرية : فقد تم تقسيم العينة الى اربع مجاميع فقد ظهر اعلى مستوى لتركيز الرصاص للفئة العمرية (41 - 50) سنة مع انخفاض في مؤشرات الدم الاخرى.4) حسب المهنة : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتين وهما العاملين من داخل الشركة العامة للبطاريات (بابل 1، بابل 2) في الوزيرية والعاملين في المعامل الاهلية المنتشرة في مدينة بغداد .و من الملاحظ وجود علاقة عكسية بين تراكيز الرصاص ومعايير الدم مثل مستويات خضاب الدم والنسبة المئوية لحجم الدم المضغوط وعدد كريات الدم الحمر ومتوسط تركيزهيموكلوبين الخلايا ومتوسط حجم الخلايا. | Lead is one of the natural elements exist in the crust of the earth, and widely used in the coating , gasoline, batteries, tin cans and some ceramics. Usually people are exposed to lead through the polluted dust, coating pieces and polluted food.In 1987 using lead in gasoline has been denied in developed countries but it is still used in the developing countries. One of the causes of the mental retard in children and being behind their colleagues in behave and learn is sedimentation of lead in brain tissues because the children have more ability to absorb lead than adults.Also women and pregnant face increased hazard as a result of lead exposure which negatively affect the fetus and may lead to infertility. Lead absorption also results in many diseases and effects in human body such as : sever anemia, sever and chronic lung inflammation, increase kidney failure among children and adults, and immunity system breakdown. If the lead level was over (75 μg/dl) these people would have a failure in the reproductive system as a result of having atrophy in the testis with inability to product sperms.A study have been performed to estimate the lead level in the blood of Baghdad inhabitations in order to know its effect on the workers' health who exist in polluted places, and exposure effects on the hematological indications such as : total hemoglobin, percentage of Packed Cell Volume (PCV%), Red Blood Cell count, Mean Cell Hemoglobin Concentration (MCHC), and Mean Cell Volume (MCV). 80 workers who are exposed to lead working in the General Company for Battery in Al - Wazeria in addition to other workers from private companies in Baghdad and other 10 persons who are not exposed to lead as the control group, all have been chosen as samples for the study. a sample of 38 exposed persons have been chosen who have high lead level in their blood which was about (41.4 g/100ml) with a significant decrease in the other hematological indications; the Blood Hemoglobin Concentration average was (12.75 gm/100ml), the percentage of Packed Cell Volume average was (39.4%), the Red blood cell count average was (5 million/mml3), and the mean cell hemoglobin concentration average was (30.9 gm/100ml), mean cell volume average was (77.1 FL).Lead effects on this group had been studied through recording the data in questionnaire forms, and the most important effect was on the male fertility system, effects on urinary system, anemia, coughing, headache, miscarriage, and ache in the joints. In the other hand the sample of the exposed persons had been classified into groups according to : - 1 - Gender : - the sample had been classified into 2 groups : male and female, where the lead concentration was higher in the male blood which was about (35.2 mg/100ml) and about (32.2 mg/100ml) in the female blood, in addition to less hematological indications.2 - Smoking case : - the sample had been classified into 2 groups : smokers about (36)persons and nonsmokers about (44)person, the study showed similarity in the results on lead level in the blood of both groups.3 - Age : - the sample had been classified into 4 groups, the higher lead level appeared in age group (41 - 50), with decrease in the other hematological indications of the rest. It is clear that there is a slight relation between lead concentrations and hematological indications such as blood hemoglobin, mean packed cell volume, red blood cell count, mean cell hemoglobin volume and mean cell volume.

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

اسم المؤلف: ميس عماد احمد
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

اسم المؤلف: نشميل علي حسن الهواسي
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض ابيضاض الدم النخاعي الحاد لمرضى عراقيين Association of Glutathione - S - Transferas (GSTP1) gene polymorphism with Acute Myeloid leukemia in Iraqi patients

اسم المؤلف: ميادة خالد ابراهيم
اسم المشرف: بتول علي شهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was carried out to investigate the relationships between acute myeloid leukemia (AML) patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1 class (GSTP1) by using Polymerase Chain Reaction (PCR) - Restriction Fragment Length Polymorphism (REFLP) and measurement of some clinical parameters of patients and control.This study included 120 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with AML were diagnosed by the consultant of The National Center of Hematology medical City, Center for Hematology AL - Mustanseria University, hematology clinic of Baghdad Hospital and Alkadhymian medical city teaching hospital during the period from October 2014 to May 2015. Those AML cases then have been diagnosed by a specialized hematologists depending on bone marrow aspiration, biopsies reports and other diagnostic criteria for AML according to the International Staging System (ISS).Sixty individuals healthy also included as control group, their age range were between 15 - 70 years. Blood were used as samples to found the correlation between genotyping of GSTP1 and all studied parameters.Molecular studies involved DNA extraction and PCR - RFLP was carried to detect the genetic polymorphism of GSTP1 for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department / College of Sciences for women. The results showed that in the age for patients and control group were no significant difference in group less than 30 years old, while showed significant difference (P˂0.05) between other groups 30 - 50 years and 50 - 70 years, were (30%) (38.30%) (33.3%) and (23.0%) respectively.The results showed that there were significant different between patients (10.40±2.97) and controls (6.25±0.37) in the mean of white blood cells count (WBCc) (P˂0.48), the mean of hemoglobin (Hb) in patients was (8.11±0.37) and in control was (12.81±1.31) and the different was highly significant between them.The results of genetics polymorphism of the GSTP1 showed the significant difference (P˂0.05) between patients were (56.67%) and controls were (65.00%) in wild genotype AA, while the heterozygous genotype AG and homozygous mutant genotype GG were in AML patients and in controls were no significant different.Distribution of GSTP1 polymorphism and age of patients groups showed that there were significant difference between all age groups and all types of gene polymorphism, were (38.24%), (32.35%), (29.41%) in AA genotype, in AG were (26.32%), (21.05%), (52.63%) and in GG were (57.14%), (42.86%) and (0.00%) respectively.The results of relationship between the sex and AML patients showed that mutant genotype GG genotype was more in male (85.71%) than female (14.29%) with highly significant increase and the risk of male to be effect was more 1,5 than female. The mutant allele G is more frequent in male (0.38) than female (0.17). The data also showed no significant difference between the GSTP1 polymorphism and the mean value of WBC, but the mean value of Hb was shown significant different (P˂0.05), the heterozygous genotype AG showed the highest value (11.35± 0.73).Distribution of GSTP1 polymorphism between control groups according to non - smoking and smoking in the genotype AA+AG, (93.33%), (90.00%) respectively, showed significant difference (P<0.05), while in genotype AG+GG (26.67%), (43.33%) showed high significant difference (P<0.01) and the mutant allele G was more frequency in smoker control (0.27) but in non - smoker was (0.17).Results of this study suggest that GSTP1 gene polymorphisms was not associated with AML disease and GSTP1 has no active role in the pathogenesis of AML, while the age and sex may have a risk factor for progression AML

دراسة بعض المؤشرات المناعية لجروح ما بعد الحرق Study of Some Immunological Aspects of Post Burn Injuries

اسم المؤلف: مـــنى شكري محمود جواد
اسم المشرف: زينب ثامر شويت الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الحيوان - المناعة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التحري عن مستويات الحركيات الخلوية (IL - 10, IL - 17A, IFN - γ , MCP - 1,(TNF - α في مصل المصابين بجروح مابعد الحرق , كذلك تم تسليط الضوء على العلاقة بين المساحة السطحية الكلية للحرق مع تعداد خلايا Tregs ومستوى الحركيات الخلوية. شملت عينة الدراسة71 مصابا بجروح ما بعد الحرق, اذ تم سحب الدم الوريدي منهم بعد اليوم الاول واليوم الخامس من الاصابة بالحرق لغرض تقدير مستوى الحركيات الخلوية باستعمال تقنية الاليزا (ELISA) وحساب تعداد خلايا Tregs باستعمال تقنية التدفق الخلوي Flow Cytometry, كما شملت عينة الدراسة 60 شخصا من الاصحاء ليمثلوا مجموعة السيطرة. اظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي في مستويات كل من IL - 10, MCP - 1, TNF - α في مصل المصابين بالحروق مقارنة مع مستوياتها في مجموعة السيطرة , بينما كان هنالك ارتفاعا معنويا في مستوى IL - 17A في مصل المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق (28.70± 0.75, 0.86±27.28) بيكوغرام/مل مقارنة مع مستواه في مجموعة السيطرة (0.66±23.85) بيكوغرام/مل. كما بينت النتائج عدم وجود فرق معنوي في مستوى IFN - γ مابين المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق ومجموعة السيطرة (0.21±14.31, 0.17±13.97, (0.19±13.96 بيكوغرام/مل على التوالي, كما اظهرت نتائج الدراسة وجود انخفاض معنوي بعد اليوم الاول من الحرق في مستوى γ - IFN في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق %(70 - 46) و%(100 - 71)اذ بلغت مستوياته (0.41±13.03, (0.30±13.57 بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصل انخفاض معنوي في مستوى TNF - α في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق100 - 71) )% مقارنة مع المساحات الاقل اذ بلغ مستواه في هذه المجموعـــة 0.57±11.61)) بيكوغرام/مل، بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي بين فئات نسب الحرق المختلفة. كما بينت النتائج وجود ارتفاع معنوي في مستوى TNF - α بعد اليوم الخامس من الحرق مع زيادة المساحة السطحية للحرق اذ بلغ مستواه في الفئات %(45 - 31), %(70 - 46), %(100 - 71) 2.51±21.51), 4.20±29.59, (1.45±23.36بيكوغرام/مل على التوالي مقارنة مع مستواه ضمن مساحة سطحية للحرق%(30 - 10) (0.87±19.54) بيكوغرام/مل بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي مع زيادة مساحة الحرق. وقد حصل ارتفاع معنوي في مستوى كل من IL - 10, IL - 17A في مصل المصابين الذكور مقارنة بالاناث اذ بلغت مستوياتهما في الذكور (30.48±0.85, 29.36±0.83) بيكوغرام/مل على التــوالي في حين بلغت مستوياتهما في الاناث (0.65±28.38, 0.76±26.98) بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصــل ارتفاع في مستـــوى TNF - α 0.97±18.35) ) بيكوغرام/مل في مصل الاناث المصابات بجروح مابعد الحرق مقارنة بالذكور (15.11±0.70) بيكوغرام/مل, كما حصل ارتفاع معنوي في مستوى IL - 10 (34.25±1.77) بيكوغرام/مل في مصل المصابين بجروح الحرق الناتجة من التعرض الى الانفجار مقارنة مع المصابين بالحرق بوساطة مصادر اخرى. اما نتائج تعداد خلايا Tregs فقد حصل ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في الدم المحيطي للمصابين بنسب حرق اقل من %45 واكثر من %45 مقارنة مع اعدادها في الدم المحيطي للاشخاص الاصحاء وذلك بعد اليوم الاول وكذلك بعد اليوم الخامس من الاصابة بالحرق وكان اعلى ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في دم المصابين بنسبة حرق اكثر من %45 بعد اليوم الاول والخامس من الحرق حيث بلغت %(63.58) و57.95))% على التوالي. | The aim of this study was to investigate the levels of cytokines (IL - 10, IL - 17A , IFN - γ , MCP - 1,TNF - α ) in the serum of patients with post burn injuries and to evaluate the status of patients, and also to shed light on the relationship of the surface area of burn with the count of Tregs and levels of cytokines. Seventy one patients with post burn injuries were included in this research, the Venous blood was collected from the first day and fifth day after burn to evaluate cytokines levels by ELISA technique and to count Tregs by Flow Cytometry; the study also included 60 healthy persons represented control group. The results showed a significant decrease in the levels of IL - 10, MCP - 1 and TNF - α in the serum of patients comparing with control, while there is a significant increase in the level of IL - 17A in the serum of patients after first and fifth day of burn (28.70±0.75, 27.28±0.86) pg/ml comparing with control(23.85± 0.66) pg/ml; and there is no significant differences in the level of IFN - γ between patients and control (14.31±0.21, 13.97±0.17, 13.96±0.19) pg/ml respectively. moreover The results showed significant decrease in the level of IFN - γ in the first day after burn in patients with surface area of burn (46 - 70)% and (71 - 100)% and the levels were (13.03±0.41, 13.57±0.30) pg/ml respectively, while there was significant decrease in the level of TNF - α the in patients with surface area of burn (71 - 100)% comparing with less areas of burn, the levels of it in this group was (11.61±0.57) pg/ml and there is no significant differences were seen between other cytokines among different surface areas of burn. The results showed also significant increase in the level of TNF - α in the fifth day after burn in the higher surface areas of burn (31 - 45)%, (46 - 70)% and (71 - 100)% (21.51±2.51, 29.59±4.20, 23.36±1.45) pg/ml respectively comparing with its level in surface area (10 - 30)% (19.54±0.87) pg/ml and there is no significant differences between other cytokines. The results Revealed showed a significant elevation in the level of IL - 10 and IL - 17A in the serum of male patients comparing with female, and the levels in the serum of male were (30.48±0.85, 29.36±0.83) pg/ml respectively while the levels in female patients were (28.38±0.65 , 26.98±0.76) pg/ml respectively, and there was elevation in the level of TNF - α (18.35±0.97) pg/ml in the female patients comparing with male (15.11±0.70) pg/ml. There Additionally, was significant elevation in IL - 10 levels in the patients with post burn injuries by explosion comparing with another sources of burn. There was significant increase in the percentage of Tregs in the peripheral blood of patient with surface area less than 45% and more than 45% comparing with control group , in both first and fifth day after burn with the higher increase in the percentage of its count was in the patients with surface area more than 45% in the first and fifth day after burn (63.58% , 57.95%) respectively

الممرضات الداخلية المسببة لحالات الاسهال لدى الاعمار من 1 - 15 سنة في مدينة بغداد

اسم المؤلف: مروة محمد نصري التميمي
اسم المشرف: سلوى صبر محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The diarrhea is Enteropathy characterized liquidity abnormal,because of the increases by the movement of colon in the general way, may be represent a good sign to the Enteropathy like the Entamoeba histolytica disease, viruses Enteropathogen and bacteria,The diarrhea and associated of droughts state remains the major problem to the job of medial health in the medial east especially in the age under 5 years old.This study design to study the reason of the diarrhea and diagnosis and the effect result of it in the children under 15 years old, theirs patient from (learn hospital of alemamenalkadoman) in the city of Baghdad from 25/4/2014 to 1/10/2014 period of time, the study represent 103 sample of Stool and blood from children between (>1 - 15)years wasSufferers from diarrhea state, this state diagnose with infection of parasite (E.histolytica, G.lamblia, and others), Rotaviruses and bacteria E.coli.It use the general stool examination direct (by eyes) and in direct (by microscope) to diagnose the antigen of rotaviruses in stool, Either the blood sample store in two tube one of it contain EDTA use to CBC, Pcv, Hb, w.b.c, ABO group measure, and the second one is empty from the EDTA use to ayanlsys serum to measure (CRP) and Interleukin in the patient diarrhea.From summation of 103 found that 50 (48.54%) infected by intestinal protozoa, 41 (39.80%) infected by Rotaviruses, 9 (8.73%) infected by mixed (Parasite + Rotavirus), 3 (2.91%) infected by bacteria E.coli.50 sample infected by intestinal protozoa (42 sample is infected with one Species of parasite and 8 sample of stool continue two type of the parasite), the highest ration of infection was E.histolytica 50%, G.lamblia 38.10%, Blastocystis hominis 7.14%, and the lowestBalantidium coli 4.76%, the study recode the highest ration of mixed infected (Parasite + Rotavirus) was between G.lamblia + Rotavirus 33.33%.In This study present we found highest deference between male and female in the infection of parasite and rotavirus, male record (62 - 60)% and female (38 - 40)% on series, mixed infected (parasite + Rotavirus) Reached to the female 55.56% and this is the highest ration infection from the male 44.44%, notice that there is high Significant difference in the ratio of infection between the Age groups of the groups studied at the probability of p<0.01, where recording rotavirus infection IIhigher ratio infection in the Age groups (1 - 5) year 66,67% and less ratio 11,11% where age groups less than year, but the parasite infection only was more age group infected liable (more than 5) year with ratio 56% and smallest ratio for age group (less than year) 18%. And in the result media use (L.E) to culture E.histolytica and discover from the study , this media don’t provide good environment to maintain the parasite and resolve it for a limited period without multiplication or increase in number is it, in the case of trophzoite stage culture it stay with out - increases in the number is for one day only and after bass 24 hour transfer to the cyst stage and remain bass 3 day only and despair in the fourth day, while in culture of cyst stage Found that Noway to transform to the trophzoite stage like it happen in the human body but stay in the case of cyst stage on states. With condition E.histolytica that the Stool samples continue blood and mucous only to contain a lot off mass from the trophzoite stage and this stage only can be increases causes increase in number.Noted that this culture never dedicated only to the cultivation E.histolytica but noted the trophzoite stage exist for parasite B.coli in this stage and when culture sample from Stool contain B.coli and remain this stage Governor of the trophozoite stage for a period of two days.Either for the blood type test has been shown by the study, the highest percentage recorded rotaviruses injury in people living with antigen type A 39.59%, 39% and 44.44% for parasitic and rotavirus infections and joint respectively.And gave a hemoglobin level of Hb and size precipitation of red blood cells PCV lowest level at co - infection (parasit + rotavirus), followed by rotaviral and parasitic infection compared with control group P <0.05. Showed parasitic infection and joint significant difference in the total number of white blood cells when the probability of P <0.05, either rotaviral infection did not give a significant difference with the control group.The results of the present study about differential count of white blood cells, showed no significant difference comparing with study groups, but showed significant difference within the three groups with control group that remain the value of the Moral difference p<0.05 When all of the (Neutrophil ،Basophile ،Eosenophil)However, it did not register significant difference when cells Lymphocyte.When statistical analysis when studying some immunological changes associated with injuries intestinal regarding the number of days that lasted the case of diarrhea, and by which they can determine if the injury was severe diarrhea or chronic, and that gave significant difference (1 - 2) day P <0.01 when (3 - 4) day and (more than 4) on the value of the differences P <0.05.log CRP level of rotavirus infections 31.70%, 0.52% for infections with parasite, 88.89% of the common injuries (parasitic + viral) gave at P <0.01 probability asignificant differences.The results of the study of some of the dynamics of cellular aggregates of the study and its relationship to the immune response. Observed statistically significant at the use of IL - 10 three of its study groups recorded a significant P <0.05 was higher at 1.22% viral infection compared to the control group. Parasitic infection and did not record any significant difference.And log IL - 17A highest percentage increase at the joint injury, and there is no significant difference between the incidence of parasitic and viral infection.For IL - 33 infection joint highest recorded percentage of injury followed by a parasitic infection and finally viral. and IL - 4 infection shared the highest rate, followed by injury viral recorded and finally parasitic and gave moral difference P <0.05 and finally INF - gama, which did not record any significant differences when comparing the groups study together but gave at P <0.01probability moral differences with group of control when compared recorded the highest common injury is also high.

دراسة التنوع الاحيائي للطحالب الملتصقة على نبات القصب والطين في نهر دجلة - الدورة, ضمن مدينة بغداد/العراق Biodiversity Study of Epiphytic on Phragmites australis and Epipelic Algae in Tigris

اسم المؤلف: مروة ثامر خالد هندي
اسم المشرف: جنان شاوي الحساني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الفصلية للطحالب الملتصقة على نبات القصب Phragmites australis ولطحالب الطين في نهر دجلة ضمن منطقة الدورة / بغداد, عدت كمحطة دراسة واحدة ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 لغاية شهر حزيران 2015. تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل البيئية الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ضمن الموقع المذكور مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء)، التوصيلية الكهربائية (E.C.), الملوحة, نفاذية الضوء (L.P)، الاس الهيدروجيني (pH)، المواد الذائبة الكلية (TDS)، المواد الصلبة العالقة الكلية (TSS)، القاعدية الكلية (TA)، الاوكسجين المذاب (DO)، الكدرة (Turbidity), العسرة الكلية (TH), الكالسيوم (Ca), المغنيسيوم (Mg), سرعة الجريان (W.F), الكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا , النتروجين الكلي (TN), الفسفور الكلي (TP) والسيليكا الفعالة (SiO3). تم حساب اربعة ادلة بيولوجية (دليل الغنى ودليل التنوع ودليل جاكارد للتشابه ودليل التكافؤ). تراوحت درجة حرارة الماء والهواء بين (10.5 - 27) م و(11 - 32) م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني (7.1 - 7.9) وقيمة الاس الهيدروجيني للرواسب (7.7 - 8.1). بينما كانت قابلية التوصيل الكهربائي بين (597.0 - 821.67) مايكروسمنز/سم. في حين سجلت قيم الملوحة (0.38 - 0.50) جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية بين (298.0 - 410.0) ملغم /لتر، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن (38.87 - 15.75) ملغم /لتر، والكدرة (24.63 - 42.03)NTU ، ونفاذية الضوء (5.17 - 20.5) سم، وسرعة الجريان (0.06 - 0.67) م/ثا والاوكسجـين المذاب بين ((11.5 - 10.15 ملغم/لتر، وقيم المتطلب الحيوي بين (5.33 - 3.03) ملغم \لتر، واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت بين (133.33 - 200.53) ملغمCaCO3/لتر, العسرة الكلية (413.33 - 636.67)ملغمCaCO3/لتر، الكالسيوم (111.14 - 196.0) ملغم/لتر، المغنسيوم (33.2 - 78.5) ملغم/لتر، النتروجين الكلي (4.54 - 6.99 ) مايكروغرام /لتر، في حين تراوح الفسفور الكلي (12.88 - 15.64) مايكروغرام/لتر والسيليكا الفعالة (371.14 - 506.10) مايكروغرام/لتر. سجلت في هذه الدراسة اعلى قيمة للكلوروفيل للطحالب الملتصقة على نبات القصبPhragmites australis في الخريف (19.71) مايكروغرام/سم2واقل قيمة في الربيع (13.35) مايكروغرام/سم2, اما بالنسبة للكلوروفيل الخاص بطحالب الطين فقد سجل اعلى نسبة في الصيف (5.84) مايكروغرام/سم2, واقل نسبة في الخريف (2.17) مايكروغرام/سم2, سجلت قيم الفيوفايتين في الدراسة الحالية,ففي الطحالب الملتصقة على نبات القصب سجلت اعلى قيمة في الصيف (6.57) مايكروغرام/سم2, واقل قيمة في الربيع (1.02) مايكروغرام/سم2 وقيم الفيوفايتين الخاصة بطحالب الطين سجلت اعلى قيمة لها في الربيع (1.00) مايكروغرام/سم2 واقل قيمة كانت في فصل الخريف (0.37) مايكروغرام/سم2. تم تشخيص (253)نوعا من الطحالب الملتصقة على كلا السطحين (القصب والطين) اذ بلغ عدد الانواع المشخصة على نبات القصب Phragmites australis في الدراسة 183 نوعا( 57 جنسا), وكان منها 115 نوعا (26 جنسا) تعود الى الطحالب العصوية (الدايتومات) Bacillariophyceae 37 نوعا (11 جنسا) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae, و25 نوعا (15 جنس) تعود الى الطحالب الخضر Chlorophyceae وقد شخص نوعان من الطحالب اليوغلينية Euglenophyceae ونوع واحد للطحالب البرواتية Dinophyceae ونوع واحد من الطحالب الكارية Charyophyceae ونوع واحد من الطحالب الحمرRhodophyceae ونوع واحد من الطحالب الصفر Xanthophyceae . وبلغ عدد الطحالب المشخصة على الطين 154 نوعا 38) جنسا), كان منها 130 نوعا(24 جنسا)تعود للطحالب العصوية (الدايتومات) و15 نوعا (سبعة اجناس) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae وثمانية انواع (ستة اجناس) تعود للطحالب الخضر ونوع واحد يعود للطحالب اليوغلينية Euglenophyceae.بينت نتائج الدراسة الحالية وجود تغايرات فصلية في العدد الكلي للطحالب الملتصقة على القصب وعلى الطين اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الشتاء اذ بلغ 772.05 x 104خلية/غم وزن رطب48.1) %) من المجموع الكلي لاعداد الطحالب المشخصة في هذه الدراسة , وقد سجل اقل عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الصيف x 161.13 104خلية/غم وزن رطب (10.04% ), اما في فصلي الربيع الخريف فكانت نتائج اعداد الطحالب المشخصة متقاربة فكانت x337.92 104خلية/غم وزن رطب ( 21.06% ) في الربيع وx 333.17 104 خلية/غم وزن رطب (20.07%) في الخريف. اما بالنسبة للاعداد الكلية الخاصة بطحالب الطين فبلغ اعلى تسجيل في الشتاء 104x20.07 خلية/ سم2 35.01)%) من المجموع الكلي للطحالب المشخصة, واقل عدد كلي سجل في الصيف 104 x6.53خلية/ سم(2 11.39 %) . اما في الخريف والربيع فكان العدد الكلي 104x15.53و 104x15.18 خلية/ سم2( 27.08% و26.48 %) على التوالي . اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان اعلى قيمة لدليل الغنى (8.3) في الشتاء واقل قيمة (3.09) في الصيف للطحالب الملتصقة على نبات القصب في حين سجلت اعلى قيمة لدليل الغنى (4.3) في الشتاء واقل قيمة (2.6) في الصيف لطحالب الطين . ان اعلى قيمة لدليل التنوع (4.02) في الشتاء واقل قيمة في الصيف (2.94) للطحالب الملتصقة على نبات القصب, وتراوحت قيم دليل التنوع لطحالب الطين بين ( 3.02و (4.03 في الصيف والشتاءعلى التوالي. وتراوحت قيم دليل التكافؤ للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين (0.57 - 0.6) في فصلي الصيف والربيع على التوالي, اما بالنسبة لطحالب الطين فكانت قيم دليل التكافؤ تتراوح بين (1.61 - 1.31) في فصلي الصيف والربيع على التوالي. بينت النتائج ان اعلى نسبة تشابه بين الفصول بالنسبة للطحالب الملتصقة على نبات القصب كانت بين الصيف الربيع وبلغت (0.404), اما اقل نسبة فكانت بين الخريف والربيع اذ بلغت (0.195) وكانت نسبة التشابه بين الفصول لطحالب الطين قد سجلت اعلاها بين الربيع والخريف اذ بلغت (0.369), واوطا قيمة سجلت بين فصلي الربيع والصيف اذ بلغت (0.216), اما درجة تشابه الطحالب بين سطحي الالتصاق فقد كانت 45.728%. | A seasonal study was conducted in order to cover the epiphytic Algae on Reed (Phragmites australis) and epipelic algae in Tigris River in Al - Dora site in Baghdad province from November 2014 to June 2015. Some Physiochemical parameters such as Air and water temperature, light penetration, pH, Total dissolved solids (TDS), Total Suspended Solids (TSS), Dissolved Oxygen (DO), Biological Oxygen Demand (B.O.D5), Turbidity (TU), Total hardness, Total Alkalinity (TA), Calcium (Ca), Magnesium (Mg), Water flow, Chlorophyll - a and Pheophytin - a, Total Nitrogen (TN), Total Phosphorous (TP), Active Silicate (SiO3) were collected during the study. In addition, four biological indices [Richness, Diversity (Shannon - Winer), Similarity (Jaccard), and Evenness index] were tested.The studied parameters values ranged as follows : (10.5 - 27) C°, (11 - 32) C° for water and air temperature, respectively. Water pH )7.1 - 7.9( and the sediment pH (7.7 - 8.1), EC (597.0 - 821.67) µS/cm, S‰ (0.38 - 0.50), TDS (298.0 - 410.0) mg/l ,TSS (38.87 - 15.75) mg/l, The turbidity and light penetration, water flow (24.63 - 42.03) NTU, ( 5.17 - 20.5) cm, (0.06 - 0.67) m/min, respectively. While TA (133.33 - 200.53) mg/l, TH (413.33 - 636.67) mg/l, Ca (111.14 - 196.0) mg/l, Mg (33.2 - 78.5) mg/l, DO. concentration ranged 10.15 - 11.5mg/l. B.O.D5 concentration ranged (3.03 - 5.33)mg/l, Nutrients concentration in the study sites ranged as follows : (4.54 - 6.99)µg/l, (12.88 - 15.64)µg/l, (371.14 - 506.10) µg/l for TN, TP and SiO3 - 2. Chlorophyll - a concentration recorded (13.35 - 19.71) µg/cm2 in winter and autumn for epiphytic algae, and (2.17 - 5.84) µg/ cm2 in autumn and summer for epipelic algae. Pheophytin - a concentration varied between epiphytic and epipelic algae, and recorded (1.02 - 6.57) µg/cm2 in spring and summer, (0.37 - 1.02) µg/ cm2 for autumn and spring, respectively for epiphytic and epipelic algae.Total of 183 epiphytic algal species belong to 57 genera as the following : 115 species (26 genera) of Bacillariophyceae; 37 species (11genera) of Cyanophyceae; 25 species (15 genera) of Chlorophyceae; two species of Euglenophyceae; one species to each Dinophyceae, Charyophyceae, Rhodophyceae, and Xanthophyceae were recorded. Regarding the epipelic algal species, total of 154 species (38 genera) as the following : 130 species (24 generra) of Bacillariophyceae, 15 species (seven genera) of Cyanophyceae, eight species (six genera) of Chlorophyceae, and one species of Euglenophyceae were recorded. Moreover, 90 species were shared between the identified epiphytic and epipelic algae at the study site.The seasonal variations of the epiphytic and epipelic algae were notified. According to the epiphytic, the highest count was recorded during winter 2015 and reached 772.05 x 104 cell/g. (48.1%) from the total number of the identified species. The lowest count was noticed in summer and reached 161.13 x 104 cell/g (10.4%) from the total number of the identified species. It is worth mentioning that the total count of epiphytic in autumn and spring was convergent. In autumn the count reached 333.17 x 104 cell/g. (20.07%) from the total number of the identified species; while the count reached 337.92 x 104 cell/g. (21.06%) in Spring, While for epipelic algae the highest count was recorded during winter 2015 and reached 20.07 x 104 cell/ cm² (35.01%) from the total number of the identified species. In summer, the lowest count was noticed and reached 6.53x 104 cell/ cm² (11.39%) from the total number of the identified species. In addition, the autumn count reached 15.53x 104 cell/ cm² (27.08%) from the total number of the identified species; while the spring 15.18x 104 cell/ cm² (26.48%).The biodiversity indices values for epiphytic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (2.94 - 4.02) in summer and winter; Evenness index (0.57 - 0.6) in summer and spring; Jaccard index (0.195 - 0.404) between autumn and spring and between spring and summer. The biodiversity indices values for epipelic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (3.02 - 4.03) in summer and winter; Evenness index) 1.31 - 1.61 (in spring and summer; Jaccard index (0.369 - 0.216) between autumn and spring and between spring and summer

التاثير الوقائي لمستخلص بذور نبات البلنكو Lallemantia royleana في حماية الكبد من سمية عقار الريفادين في ذكور الفار الابيض Hepatoprotective Effect of Lallemantia royleana Seeds Extract Against Rifadin Toxicity in Male Albino Mice

اسم المؤلف: محمد فاضل عبد الحسين
اسم المشرف: زينب فاضل شويت الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الانسجة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to focus on the hepatoprotective effect of Lallemantia royleana seeds extract against rifadin hepatotoxicity in experimental mice.The study was conducted on swiss albino male mice (40), there age ranged from 5 - 8 weeks with weight of 25 - 30 gm that divided into four animals groups : • First group orally administered with (0.1 ml) normal saline (0.9%) for 28 days as control group. • Second group orally administered with ( 0.1 ml) rifadin (1.5 mg/kg/day) for 28 days.• Third group orally administered with (0.1 ml) alcoholic extract of Lallemantia royleana seeds (1%) for 28 days . • Forth group was also orally administered with seeds extract alone for 5 days and with (0.1 ml) seeds extract and rifadin for 28 days, so the total period of this group is 33 days. Blood samples ware collected from experimental animals to measured liver function enzymes (ALT,AST,ALP) levels, liver samples were also collected for histopathological and immunohistochemical studies.Results showed there was animals activity changes in groups especially in drug administered group compared with other groups, which represented by lethargy, introversion,the tendency to sleep, hyperventilation, in addition to change the faeces color and urine color, and these behavioral changes noted after 15 days from experiment began.The statistical analysis of the data showed significant increase (P<0.05) in AST, ALT,ALP levels in blood serum of animal group administered with rifadin (662.04±8.26, 131.575±3.45, 197.00±6.58) respectively compared withcontrol group ( 25.2 ± 21.562 , 445..2±2522, 2.543±6524 ) significant decrease (P<0.05) was also noticed in AST,ALT level in seeds extract group( 2..563±.54., 47.480±1.93) and seeds extract - drug group ( ...531±.5.1, 85.033±2.33) compared with drug group, while significant increase (P<0.05) in ALP enzyme level in animals group administered with seeds extract alone (4..5..±.533 ) compared with drug group.The histopathological changes in liver tissue of experimental grups, was represented by loss of normal architecture of liver tissue and radial organization of hepatic cords in centrilobular region and peripheral regions in animals administered with drug, vaculation and death of hepatic cells, congestion (moderate/ severe) in central veins, and few infiltration of mononuclear leukocyte in centrilobular region. In animals administered with seeds extract - drug group was preserved the hepatic cords radial organization especially surrounding the central vein, congestion (mild/ moderate) in central veins, alarge numbers of balone - shape cells with vaculated hepatic cells, and the histological structure in animals administered with seeds extract was approached to control group, that was no dissociation in liver tissue and hepatic cords radially organized around central vein, and mononuclear leukocyte infiltration in centrilobular region and the adjacent region of portal traid.The immunohistochemical test result revealed significant increase (P<0.05) in apoptotic index and in the cells with Bax protein that stimulating the process of apoptosis possitive reaction in drug administered animals group )%665.22±2542( compared with other experimental groups, also the results revealed significant decrease (P<0.05) in apoptotic index and the cells with Bax protein possitive reaction in animals administered with seeds extract and seeds extract - drug compared with drug group, ( 251.2±2521, 25422±2522) % respectively.

دراسة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل sativus Raphanus ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في الارانب A Study the Protective Effect of Alcoholic Extract of Plant Raphanus Sativus (Radish) Seeds against the Oxidative Stress Induced by Sodium Nitrite on Liver and Kidney of Rabbits

اسم المؤلف: لينا احمد عبد العزيز
اسم المشرف: عالية حسين علي مختار خميس محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية الى معرفة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم NaNO2على كبد وكلى ذكور الارانب. باستخدام كحول 70% لاستخلاص المركبات الفعالة من البذور. استخدمت في الدراسة الحالية 25 ارنب ذكر قسمت الى 5 مجاميع تضمنت كل مجموعة 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوم. المجموعةT1 : جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم, المجموعة : T2 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 50 ملغم/كغم, المجموعة : T3 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 100 ملغم/كغم, المجموعة : T4 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل وبجرعة 200 ملغم/كغم, بالاضافة الى المجموعة : C مجموعة السيطرة جرعت فمويا بجرعة من الماء المقطر مساوية لحجم الجرعة المعطاة لمجاميع المعالجة. اوضحت نتائج الدراسة الحالية في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم حصول ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد (AST, ALT ,(ALP,مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين, ناتج اكسدة الدهون) وانخفاض في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم والمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل 200,100,50 ملغم/كغم لوحظ حصول انخفاض في مستوى انزيمات الكبد (,AST, ALT ,(ALP مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين وناتج اكسدة الدهون) وحصول ارتفاع في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم فقط. بينت نتائج الفحص النسجي لكبد المجموعة المعاملة بنتريت الصوديوم توسع الجيبانيات الدموية, احتقان الاوعية الدموية, ارتشاح الخلايا الالتهابية, تنكس دهني ومائي, تنخر, زيادة اعداد الخلايا الكبدية ثنائية النواة, واظهرت النتائج النسجية لكلى المجموعة المعاملة بمادة نتريت الصوديوم انكماش الكبيبة, احتقان, ارتشاح الخلايا الالتهابية , نزف , تنكس , وذمة, تضخم. بينت نتائج الفحص النسجي لانسجة الكبد والكلى للمجموعة المعاملة بمستخلص البذور وجود حالة اصلاح لهذه الاعضاء. اعتمادا على نتائج الدراسة الحالية نستنتج ان المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة (50 و100 و200 ملغم/كغم) يمتلك فعالية مضادة للاجهاد التاكسدي المستحدث بمادة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في ذكور الارانب. | The aim of this study is to investigate the protective effect of Radish (Raphanus sativus) seeds alcoholic extract against oxidative stress induced by sodium nitrite NaNO2 on liver and kidney in male rabbits. By using 70% alcohol to extract active compound from seeds of R.S. Twenty five adult male rabbits were divided into five groups (five rabbits in each group) and treated daily for 30 days. Group T1 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 , Group T2 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 50 mg/kg of alcoholic extract, Group T3 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 100 mg/kg of alcoholic extract, Group T4 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 200 mg/kg of alcoholic extract from Raphanus sativus seeds as well as Group C : control intubated orally distilled water. Founded in rabbits intubated with NaNO2, that there was increasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), and oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and a decrease in the level of glutathione (GSH) comparing with control . In rabbits intubated with NaNO2 + 50,100,200 mg/kg of alcoholic extract found that there was decreasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and increasing in the level of GSH in comparison with rabbits intubated with NaNO2 only. The histological sections of liver which was treated with S.N. revealed dilation of blood sinusoids, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells, fatty and hydropic degeneration, necrosis and increase number of binucleated hepatocyte. Histological sections of kidney which was treated with S.N. presence of glomerular shrinkage, congestion, infiltration of inflammatory cells, haemorrhage, degeneration, edema, hypertrophy. Histological examination of liver and kidney tissue which was treated with seeds extract, revealed healing of these organs. In conclusion according to results obtained from this study that alcoholic extract of Raphanus sativus seeds in dose (50,100,200 mg/kg) have protective effect against oxidative stress induction by sodium nitrite on liver and kidney in male rabbits.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

اسم المؤلف: لمياء علي حسين
اسم المشرف: وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

اسم المؤلف: لمى يوسف مهدي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي سعد صباح فخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

دراسة تشريحية مقارنة لمراتب من عائلة عرف الديك Amaranthaceae في العراق Comparative Anatomical Study of Taxa From The Family Amaranthaceae in Iraq

اسم المؤلف: فريال خالد خلف
اسم المشرف: عذية ناهي سلمان المشهداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - التشريح
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نبذة تاريخية عن علم تشريح النباتنبذة تاريخية عن علم تشريح النباتالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لمراتب عائلة عرف الديك قيد الد راسةالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لكل نوعتشفيف الاوراق الخضرية والكاسية| طريقة التقطيع اليدويالمنظر السطحي لبشرة السيقان |نظام التعرق في الاوراق الكاسية

التغيرات النسجية والنسجية الشكليائية القياسية لعقار الليفيتراسيتام في بعض اعضاء الجهاز التكاثري في الفئران البيض Histological and Histomorphological Changes of Levetiracetam Drug in Some Reproductive Organs in White Mice

اسم المؤلف: فائزة جبار جودة الربيعي
اسم المشرف: نهلة عبد الرضا البكري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الانسجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was conducted to study the effects of Levetircetam (LEV) drug at concentration of 350 mg/kg/day body weight on selected organs of male and female reproductive system in albino mice, Mus muculus (Swiss mice). The animals divided into three treated groups, the first group treated once a day for 14 days, the second group treated once a day for 30 day and the third group treated once a day for 45 days, in addition to 3 control groups one for each treated group.The results of the present study declare the following : • Selected organs of male reproductive system (testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis).The results revealed significant degrease (P<0.05) in the percentages of the weight of testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis in treated animals for 14, 30, 45 days respectively in comparison with control group. The results also showed significant decrease (P<0.05) in percentages spermatogonia of the treated animals, when compare with control group. The percentages of the primary spermatocyte, secondary spermatocyte and spermatid increased significantly (P<0.05) in all three treated groups when compare with control groups and significant decrease (P<0.05) in percentage of spermatozoa, number of Sertoli cells, Leydig cells and diameter of Leydig cells nuclei. The mean diameter and thickness of somniferous tubules and height of epit helial cells and thickness of the tubules in the caput (head) and cauda (tail) epididymis in treated animal when compare with control group.The results of present study also showed that treatment with drug lead to histopathological changes in testes of animals treated with drug when compared with control groups such as degeneration, necrosis of spermatogenic cell and vacuolated of some seminiferous tubules, hypotrophy of interstitial and accumulation of spermatid at different stages of spermatogenic cells in lumen of tubules and degeneration of some of Leydig and separation of Sertoli cells from the basement membrane. Also results of percent study revealed some histopathological changes in caput (head) and cauda (tail) epididymis of treated animals with drug when compared with control groups, these change represented by degeneration some of epithelial cells and detachment of basement embrane and appearance of phagocytes in lumen of tubules and degeneration of epithelial cells and appearance of vacuoles between epithelial cells in addition to the damage of tubules. • Selected organs of female reproductive system significant increase (P<0.05), mean weight of ovary, oviducts and uterus of treated animals with drug for 14, 30, 45 days in comparison compared with control groups.Significant decrease (P<0.05) number of primary follicles and significant increase (P<0.05) in number of secondary follicles and significant increase (P<0.05) number of mature follicles of treated animals with drug about 14, 30, 45 days when compared with control group, significant increase (P<0.05) in number follicular cysts and corpus lutues of treated animals with drug when compared with the control groups, and significant decrease (P<0.05) diameter of growth follicles and corpus luteus and significantlyincrease (P<0.05) in diameters follicular cysts of treated animals with drug when compared with control groups. The results revealed some histopathological changes in ovary of treated animals with drug for when compared with the control groups, these changes represented by hypertrophy of cortex, degeneration of granular layer and accumulated some of cells in the middle of follicular lumen, degeneration in ovum and situated at the central position with increasing in the number of follicular cysts, separated of ovum from columns ovum, appearance of some abnormal ovum in some of follicles of ovaries.Significant decrease (P<0.05) in height and numbers of mucus folds in ampula and isthmus regions in oviduct of treated animals with drug when compared with control groups in addition to replacement of the ciliated columnar cells by cuboidal cell with the degreasing in the density of the cilia and the height of the secretory cells in addition hemorrhage, necrosis, hypoplasia and death of the columnar epithelial cells of the mucus folds, with the appearance of vacuoles, phagocytes in the center of the lumen,hypertrophy and hyperplasia in the tunica muscularis. Results also showed significant decrease (P<0.05) in numbers of endometrial glands of treated animals with drug when compared with control and significant increase (P<0.05) number of blood of treated animals with drugs when compared with control group and appearance significant increase (P<0.05) in high of epithelial cells of endometrium and thickness of lamina propria of three treated animals with drugs when compared with control group.The results revealed a histopathological changes in endometrium of treated animals with drug when compared with control such as hyperplasia and hypertrophy the epithelial layer and lamina propria and atrophy of endometrial glands and hyperplasia in epithelial of endometrial gland and detached basement membrane in some of them

انتشار ودراسة التضاد لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من فتحتي المنخرمن طلاب المدارس في محافظة ميسان Prevalence and Study the Antagonism of Staphylococcus aureus Isolated from Nares of School Children s in Maysan Governorate

اسم المؤلف: فاطمة يوسف موسى المحمداوي
اسم المشرف: امال عباس محمد الفخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الدراسة الحالية تضمنت جمع 500 مسحة جمعت من انوف طلاب المدارس الابتدائية في محافظة ميسان للفترة ( من تشرين الاول لسنة 2014 الى ايار لسنة2015 للفئة للعمرية 6 - س11 سنة ) للتحري عن حاملي المكورات العنقودية الذهبية اخذت العينات من 8 مدارس ابتدائية (4 مدارس من المناطق الريفية و4 مدارس من المناطق الحضرية). شملت العينات الماخوذة 230 عينة من الذكور و270 عينة من الاناث . وكذلك تم التحري عن البكتريا والاعفان التي قد تكون موجودة في الانف والتي قد تقلل من نسبة تواجد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية في الانف. وقد استخدمت الطرق المختبرية القياسية في تشخيص هذه البكتريا وتم التاكيد باستخدام نظام API 20 .Vitick 2Compact system, وقد اظهرت النتائج ان 140 (28%) عزلة من العينات المدروسة ( 5841.43%)) عزلة اناث و82 ) (58.57عزلة ذكور) هي من النوع المكورات العنقودية الذهبية الموجبة لانزيم التجلط Coagulase Positive Staphylococcus aureus (CoPS).ولمعرفة ما اذا كانت الظروف المعيشية(الريف والمدينة) تؤثر على معدل حمل S.aureus في مناطق الريف والمدينة في محافظة ميسان تم استخدام اختبار مربع كاي حيث عكست نتائج التحليل ان هناك فروق معنوية جدا وصلت الى X2 = 34.747 تحت احتمالية (P ≤ 0.01) بين حاملين ال S.aureus ضمن مناطق الريف والمدينة مما يعكس ان الظروف المعيشة مرتبطة بنسبة حمل هذه البكتريا.كما كانت نسبة الانواع البكترية الموجبة لصبغة غرام الاخرى هي : Staphylococcus epidermidis 226 (45.2 %) Streptococcus spp 176 (35%), Staphylococcus saprophyticus 9(1.8), Aerococcus viridians 4 (0.8)% , Staphylococcus haemolyticus 2(0.4). هذا وقد خضعت العينات الموجبة لانزيم التجلط الى اختبار الحساسية الدوائية بواسطة طريقة الانتشار بالاقراص وقد استعمل 18مضاد حيوي حسب المعاييرالمختبرية العالمية لعام 2012 حيث كانت نتائج الحساسية الدوائية كالاتي : (Methicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%),Amoxyllcin(63.5%), Cefixime (61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28%), Erythromycin(30%),Azithromycin (28.57%),Ciprofloxacin (17.85%) .Clarthromycin (12.17%), Tobramycin (9.28%) , Doxycyclin (7.10%), Vancomycin (5%), Amikacin (2.85%) ,Gentamicin (1.42%), Clindamycin (1.42 %), Levoflaxacin (0.0%), وقد اظهرت النتائج ان المضاد الحيوي Levoflaxacin هوالمضاد الاكثر فعالية بين المضادات المستخدمة فقد وصلت حساسية جميع العزلات الى( 100 %) بينما اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة عالية لمضادات Beta - lactams . اجري الاختبارالتركيز المثبط الادنى Minimum Inhibitory Concentration (MIC) للعينات المعزولة بواسطة نظام الVitek 2 . بينت النتائج ان 8 ( 5.7%) عزلة هي من النوع الكورارات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin resist Staphylococcus aureus MRSA) ) حيث قاومت التركيز 0.5mg للمضادالحيوي Oxacillin . بالاظافة الى ذلك دلت نتائج فحص الحساسية بواسطة الفايتك احتواء هذه العينات المقاومة على البروتين المرتبط بالنسلين المحور 2 PBP واحتوائها على جين ال mecA . تناولت الدراسة ايضا عزل الاعفان الموجودة في الانف حيث تم دراسة 50مسحة وتم الحصول على الانواع الفطرية التالية ( Pencillium Spp, A niger. . A. terrus , Cladosporium Spp, Alternia Spp)) .كما وتم دراسة الفعل الثبيطي لرواشح هذه الاعفان على بكترياS. aureus اوضحت النتائج ان عفن ال Alternaria له القابيلة على تثبيط نمو بكتريا الS. aureus حيث بلغ معدل قطر التثبيط ( 24.67) ملم على التوالي , بالاظافة الى ذلك درس التاثير الثبيطي للبكتريا المتواجدة كنبيت طبيعي في الانف على بكتريا S.aureus حيث اختيرت بكتريا المكورات العنقودية البشرويةS.epidermidis حيث استخدمت طريقة الانتشار بواسطة الحفر well diffusion method لمعرفة تاثير الخلية البكتريا الكاملة وكراشح لهذه البكتريا ضد S.aureus لوحظ ان بكتريا S. epidermdis لم تبدي اي تاثير تثبيطي اتجاه الS.aureus سواء كخلية بكترية كاملة او كراشح لهذه البكتريا. بينما الكشف عن تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا S.aureus بواسطة epidermdis . S بواسطة استخدام جهاز Spectrophotometer اظهرت النتائج ان الامتصاصية بطول موجي 630 نانومتر فقد لوحظ انخفاض الامتصاصية من 0,022 لعالق بكتريا ال S.aureus مع سكر الكلوكوز بتركيز %0,25 المحضون لمدة 73 ساعة بدرجةحرارة 37 سيليزية الى 0,009 عند اظافة البكتريا المضادة S. epidermdis لعالق ال S aureus مع الكلوكو | The current study includes comprises 500 Nasal swab collected from the primary school students in the Maysan Governanat to investigate Staphylococcus aureus carriers for the period from (October to May 2014 - 2015 in the age group 6 - 11 years).The samples were taken from eight primary schools (4 schools from rural areas and 4 schools in urban areas),The samples taken include 230 sample from males and 270 sample from females, also to investigate for bacteria and fungi that may be present in the nose, which may reduce the percentage of the presence of the bacteria Staphylococcus aureus in the nose. The standard laboratory methods were used in the diagnosis of these bacteria and confirmed diagnosis using the API 20 system and the Viteck - 2 Compact System. The results showed that 140 (28%) isolates of the studied samples (58 isolated from females and 82 isolated from males) were Coagulase Positive Staphylococci(CoPS).To know whether that the living conditions (live in rural and urban districts) effect the rate of S. aureus carriers statistical analyses using chi square test for carriers in urban and rural districts revealed highly significant difference X2=34.747 (P≤0.01)which indicated that the living conditions and the rate of carriers are related.The proportion another gram positive bacteria were Staphylococcus epidermidis226(45.2%),Streptococcus spp176(35%),Staphylococcus saprophyticus 9(1.8%) Aerococcus viridians 4(0.8%) and Staphylococcus haemolyticus2(0.4).CoPS isolated were submitted to sensitivity test by kirpy - Bauer Disk diffusion method according to CLSI, 2012,18antibiotic has been used and the resistance rates ethicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%)Amoxycllin(63.5%),Cefixime(61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28),Erythromycin(30%),Azithromycin(28.57%),Ciprofloxacin(17.85%)Tobramycin (9.28%),Doxycyclin(7.10%),Vancomycin(5%)Amikacin(2.85%),Gentamicin 1.42%, Clindamycin (1.42 %), and Levoflaxacin (0.0%).The results showed that the antibiotic Levoflaxacin was the most effective antibiotic among them all isolates were a sensitive and reached to (100%) while most the isolates showed high resistance to Beta - lactame antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) was used by Vitek 2 system showed that 8 isolates of (5.7%) samples were Methecillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA)were they resisted to the minimum inhibitory concentration 0.5 for the antibiotic Oxacillin as well as the results of the examination sensitivity shown by Vitek 2 - System.These resistance isolates associated contain pencillin binding protein 2 PBP and contain the mecA gene.The study also included the isolation of Fungi from the nose, were the study showed 50 swabs got the following types (Pencillium spp, Aspergillus . niger, Aspergillus . terrus, Cladosporium spp, Alternaria spp).The inhibitory effect of the filtrates of these Fungi against S. aureus was studied, were results showed that the mold Alternaria spp only has the ability to inhibit the growth of S. aureus where average of inhibition zone reach to(24.67) mm in addition the present study include the control of S.aureus by the other bacteria which considered normal flora in the nose, Staphylococcus epidermidis selected for this purpose.Well diffusion method was used as Whole bacteria and filtrate for this purpose and results show that there are no inhibitory effect of S.epidermidis on S.aureus by this method. While biofilm formation of S.aureus was inhibited by S. epidermidis by detected using Spectrophotometer (360nm) results of the absorbency was decrease from 0.022 for suspension of S.aureus with glucose 0.25% incubated for 73 hour at 37 °C to 0.009 for suspension of antagonistic bacteria S. epidermidis added to the suspension of S. aureus and glucose 0.25% under the same condition and this indicate that the biofilm was inhibited by S.epidermidis

الاصابات الطفيلية في بعض اسماك نهر دجلة، منطقة الكريعات في محافظة بغداد, العراق parasitic infections in some fishes from Tigris River, Al - Graiat location in Baghdad Province, Iraq

اسم المؤلف: فاطمة خلف عطوان
اسم المشرف: فاطمة خلف عطوان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت خلال الدراسة الحالية 578 سمكة من منطقة الكريعات الواقعة على نهر دجلة في محافظة بغداد اثناء المدة من شهر تموز 2015 ولغاية نهاية شهر اذار 2016. تضمنت هذه الاسماك، التي تعود الى 19 نوعا : 140 سمكة بلعوط ملوكي، 118 سمكة خشني، 66 سمكة بنيني كبير الفم، 46 سمكة حمري، 42 سمكة كارب اعتيادي، 38 سمكة بلطي احمر البطن، 21 سمكة بلطي ازرق، 14 سمكة قطان، 12 سمكة شبوط، 12 سمكة بني، 12 سمكة بنيني صغير الفم، 11 سمكة ذهبية، 11 سمكة شلك، 7 اسماك عراض، 7 اسماك سمنان، 6 اسماك ابو الزمير، 5 اسماك ابو براطم، 5 اسماك جري لاسع و5 اسماك مرمريج. فحصت الاسماك خارجيا وداخليا لتشخيص طفيلياتها. بينت النتائج وجود 77 نوعا من الطفيليات تضمنت : 14 نوعا من حاملات الاهداب، 17 نوعا من البوغيات المخاطية، 41 نوعا من الطفيليات احادية المنشا، اربعة انواع من المخرمات ونوعا واحدا من الديدان شوكية الراس. تم في هذه الدراسة تسجيل 22 نوعا من الطفيليات لاول مرة في العراق، تضمنت اربعة انواع من حاملات الاهداب هي : Trichodina centrostrigeata، T. intermedia، T. urinaria وTripartiella rhombi، عشرة انواع من البوغيات المخاطية هي : Myxobilatus baicalensis،Myxobolus bizerti ،M. branchialis ، M. chuatsi،M. dermatobius ، M. exiguus،M. kubanicum ،M. niei ، M. sphaerocapsularis وM. squamae، ثمانية انــــــواع مــــــن الطــــــفـــيـليات احادية المــــــنشا هــــي : Cichlidogyrus sclerosus، C. tilapiae، Dactylogyrus lenkoranoides،Gyrodactylus comephori، G. ibragimovi، G. macronychus، G. masu وParadiplozoon megalobramae. كما عد 50 نوعا من الاسماك مضيفات جديدة في العراق لـ 30 نوعا من الطفيليات.اظهرت انواع الطفيليات المسجلة في هذه الدراسة اختلافا في مواقع تطفلها في او على اجسام مضيفاتها، كما تباينت في نسب وشدد اصابتها للمضيفات المختلفة من الاسماك، كما بينت الدراسة الحالية وجود تباين في انواع واعداد الطفيليات التي تصيب انواع الاسماك، اذ كانت اسماك الكارب الاعتيادي والخشني مصابة باكبر عدد من انواع الطفيليات (21)، يليها كل من الشبوط والحمري (13)، وسمكة القطان (12)، وكل من البلعوط الملوكي وابو براطم والبنيني كبير الفم (11)، والبلطي احمر البطن (عشرة)، والسمكة الذهبية (خمسة)، وكل من البني والعراض (ثلاثة)، والشلك (اثنين)، وكل من البنيني صغير الفم والبلطي الازرق وابو الزمير والمرمريج والسمنان مصابة بنوع واحدا من الطفيليات، في حين لم تسجل اصابة باي نوع من الطفيليات في الجري اللاسع. | During the present investigation, a total of 578 fishes were collected from Al - Graiat location on the Tigris river at Baghdad province during the period from July 2015 until the end of March 2016. These fishes, which belonged to 19 species, included : 140 Chondrostoma regium, 118 Planiliza abu, 66 Cyprinion macrostomum, 46 Carasobarbus luteus, 42 Cyprinus carpio, 38 Coptodon zillii, 21 Oreochromis aureus, 14 Luciobarbus xanthopterus, 12 Arabibarbus grypus, 12 Mesopotamichthys sharpeyi, 12 Cyprinion kais, 11 Carassius auratus, 11 Leuciscus vorax, seven Acanthobrama marmid, seven Alburnus mossulensis, six Mystus pelusius, five Heteropneustes fossilis, five Barbus barbulus and five Mastacembelus mastacembelus. These fishes were externally and internally examined to identify their parasites. The results showed the presence of 77 species of parasites which included : 14 species of Ciliophora, 17 species of Myxozoa, 41 species of Monogenea, four species of Trematoda and one species of Acanthocephala. Among these parasites, 22 species were recorded for the first time in Iraq. These included : four species of Ciliophora (Trichodina centrostrigeata, T. intermedia, T. urinaria and Tripartiella rhombi), ten species of Myxozoa (Myxobilatus baicalensis, Myxobolus bizerti, M. branchialis, M. chuatsi, M. dermatobius, M. exiguus, M. kubanicum, M. niei, M. macrocapsularis and M. squamae), eight species of Monogenea (Cichlidogyrus sclerosus, C. tilapiae, Dactylogyrus lenkoranoides, Gyrodactylus comephori, G. ibragimovi, G. macronychus, G. masu and Paradiplozoon megalobramae). Also, 50 species of fishes were regarded as new hosts for 30 species of these studied parasites. The present study appeared a difference according to the site of infection on or in their hosts as well as in their prevalence and intensity of infections to their fish hosts, and showed verified in number and species of parasites that infected fishes. Among the infected fishes cyprinus carpio and Planiliza abu harbored the highest number of parasites species (21), followed by Arabibarbus grypus and Carasobarbus luteus (13), Luciobarbus xanthopterus (12), Chondrostoma regium and Barbus barbulus and Cyprinion macrostomum (11), Coptodon zillii (10), Carassius auratus (5), both of Acanthobrama marmid and Mesopotamichthys sharpeyi (3), Leuciscus vorax (2), both of Alburnus mossulensis and Cyprinion kais and Mastacembelus mastacembelus and Mystus pelusius and Oreochromis aureus (1), but there is no infection appeared with parasites in Heteropneustes fossilis.

دراسة الميكروبية والتداخل البكتيري للفطريات المصاحبة لالتهابات الانف والاذن لمرضى السكري وابيضاض الدم Microbial Study and Bacterial Interaction with Mycosis Associated with Nose and Ear Inflammatory of Diabetes and Leukemia Patients

اسم المؤلف: علیاء فخري خلف البیاتي
اسم المشرف: امال عباس محمد الفخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and ten clinical samples were collected from hospitalized patients in hematology - oncology department in Baghdad Teaching Hospital and Al - Kindy Teaching Hospital, during the period from November 2014 to June 2015.The samples included 48 female and 62 male patients who are suffering from diabetes mellitus (DM) and leukemia. The ages of patients ranged between 13 - 82 years. The swab samples taken from the nose and ear of patients were (67 with diabetes mellitus and 43 with leukemia). The results of fungal culturing revealed that 50 samples of DM patients (74.63%) and 31 samples of leukemia (72.09%) were diagnosed as positive ones.From the collected clinical samples that gave positive results; it was found that Candida spp. was the most common fungi isolated from ear swabs (50%) followed by Aspergillus spp. (42.86%) and Penicillum spp. (7.14%).The results of fungal (molds) species isolated from the nose of DM patients revealed highly significant differences between fungal rates, Aspergillus spp. were isolated with highest levels (48.15%), followed by Penicillum spp. (37.04%); however, Rhizopus spp. was isolated with low levels (14.81%). On the other hand, it was found that Candida spp. and Rhodotorula spp. were the most yeasts isolated from the nose of DM patients. They were isolated with rates as (45.83%) and (41.67%) respectively. Nevertheless, the genus Cryptococcus spp. was isolated with low levels (12.50%). The results also revealed that males were more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungal are more prevalent in ages over fifty and ages between thirty one and fifty years compared with younger ages between ten and thirty years old. From the collected clinical samples of leukemia patients, highly significant differences were found between the rates of fungal infection. The level of Aspergillus spp. was (90.91%) and Rhizopus spp. (9.09%), while the levels of yeasts were (88.24%) and (11.76%) for Cryptococcus spp. and Candida spp. respectively.The frequent species of Aspergillus identified included A. niger (37.78%), followed by A. flavus (35.56%), A. fumigatus (17.77%) and A. terreus with lowest levels (8.89%). The results also revealed that males are more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungi are more prevalent in ages 31 - 50, followed by younger ages (10 - 30) compared to old ages, over fifty years old.All fungal isolates were identified according to macroscopic and microscopic characteristics in addition to biochemical tests for yeast identification. Vitek 2 system is another confirmatory test which was carried out for further characterization for the yeast species. The results of Vitek 2 system revealed that Candida spp. were isolated with the highest level (41.67%), followed by Cryptococcus spp. (37.5%) however, Rhodotorula spp. was isolated with a low level (20.83%). A confirmatory test for the selected isolates of A. fumigatus using polymerase chain reaction (PCR) analysis technique was also conducted. This test has been done by using primers specific for hemolysin gene (aspHS). The results of the molecular method were closely related to those obtained from cultural methods with exception of one isolate which was positive by PCR method nevertheless, it was negative by culture method. The results of PCR analysis technique, revealed that 6 isolates out of total 8 (75%) were positive for the presence of aspHS gene compared to culture methods which showed 5 isolates out of total 8 (62.5%) had the ability to induce hemolysis when grown on blood agar .The inhibitory effect of Bacillus subtilis against Aspergillus spp. was also conducted, the results indicated that B. subtilis isolate has antimicrobial activity against Aspergillus spp; the diameter of inhibition fungal growth were 39.3 ± 01.5, 48.6 ± 02.2, 40.5 ± 02.8 and 43.5 ± 01.7 mm for A. fumigates, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with the diameter of controls which were 80.0 ± 05.3, 78.0 ± 03.9, 43.5 ± 01.7 and 72. ± 02.6 mm respectively. The radial inhibition growth of Aspergillus spp. treated with B. subtilis were 51%, 38%, 47% and 44% for A. fumigatus, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with treatment of control.

دراسة بعض الجوانب المناعية والجزيئية في المرضى المصابين بداء المقوسات العيني Study of some Immunological and Molecular Aspects in Ocular Toxoplasmosis Patients

اسم المؤلف: علي نزار ياسين
اسم المشرف: اسراء قاسم العبيدي وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study was conducted on 179 patients who attended the Retina Unit in Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital in Baghdad from the beginning of March to the end of September 2014. The patients were divided a according to the clinical diagnosis to 3 roups; the first included 50 patients infected with ocular toxoplasmosis(OT) while 45 patients with uveitis ; In addition a control group was of 84 apparently healthy individuals (they don’t have any infection in their eyes.) was included. The sera patients were initially diagnosed by immune Latex test. The results showed that all the ocular toxoplasmosis patients (100%) were positive while none of the uveitis patients gave positive result, In control group,30 cases were infected with toxoplasmosis(35.7%) with a significant differences between the three groups (p<0.01). ELISA test results for specific T. gondii IgG and IgM antibodies for were 84% positive to ocular toxoplasmosis as 42 patients versus 16% as 8 cases with negative test, while the positive rate in uveitis patients was 31.1% and considered as positive uveitis group, versus 31 negative case with rate 68.9%.The control group was reevaluated showed 35 positive case from 84 and formed a group called Asymptomatic toxoplasmosis. The levels of specific IgG and IgM were measured by international unit / ml.for all groups. The IgG level was 1.661 ± 0.187 IU/ml. in O.T. group followed by positive uveitis group 1.596 ± 0.157 and Asymptomatic toxoplasmosis group 1.501± 0.257 while negative uveitis group and control were recorded 0.389± 0.190 and 0.350 ± 0.167 respectively.IgM levels were increase in O.T. group 1.922 ±0.510 followed by positive uveitis group 1.867 ± 0.061 then asymptomatic toxoplasmosis came 1.744 ± 0.070. Finally the negative uveitis and control groups were registered 0.632 ± 0.166 and 0.618 ± 0.236 respectively.The study of some properties, coupled with ocular toxoplasmosis, including the sex and age for positive IgG antibody groups as it reflected the probability of female to male rate of 74.28% and 25.72%, respectively for OT group, while positive uveitis 58.33% and 41.67% respectively. Asymptomatic toxoplasmosis group has recorded 53.33% and 46.67%, respectively, with no significant differences between the three groups. The age variable has the results of the current study showed no significant differences between positive IgG antibody groups, as OT group focused within the age range 40 - 49 years and 60 - 70 years and similar rate of 22.88%, while positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis groups focused within at the age range 20 - 29 years and 33.33% and 30% respectively. As for positive IgM antibody groups and sex differences, with no significant differences recorded as OT group of males 71.43% and females 28.57%, while asymptomatic toxoplasmosis group 60% for males and 40% for females recorded. The positive uveitisgroup was limited to females only 100%. As well as not significant differences between positive IgM antibody groups were recorded for variable of age as it was OT group within the age range 30 - 39 years and 50 - 59 years with a similar rate 28.57% and 40 - 49 years by 42.86%. As positive uveitis group was within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate 50%, while asymptomatic toxoplasmosis group within the age range 20 - 29 years and 30 - 39 years, with a similar rate of 40% and 40 - 49 years by 20%.Investigation of a specific part of B1 gene in size 469 base pair for positive cases to ELISA test was done by conventional PCR test. O.T. group recorded 10 positive results from 42 patients in 23.8% percent, while positive uveitis group that has 14 patients in which only 3 positive cases in 21.4 percent. Three positive cases was recorded also in asymptomatic toxoplasmosis group in 8.6% percent. No significant differences for this test between studied groups in probability (p.0.05). Real - time PCR was applied also on a positive studied groups to ELISA test also.O.T. group recorded 14 positive case in 33.3% percent, positive uveitis and asymptomatic toxoplasmosis registered only 7 case in rate 50% and 20% respectively, No significant differences for real - time PCR in probability (p.0.05) between the three groups.The present study included als o that contain measuring changes in thelevels of some cytokines that estimated by pg. /ml. for all studied groups.The level of IL - 4 in positive uveitis group reached to 28.22 ± 7.74 followed by asymptomatic toxoplasmosis group 26.72 ± 3.72.then O.T.group 21.39 ± 5.03 while negative uveitis group reached a concentration 16.17 ± 5.66,control group came finally and reached lowest concentration 5.08 ± 2.8.High level of IL - 6 was in O.T. group 33.09 ± 19.57 and positive uveitis group 22.26 ± 9.74 then asymptomatic toxoplasmosis 16.83± 6.06, negative uveitis registered 15.94 ± 6.11,control group came to record the lowest concentration 11.70 ± 5.44. An increase in IL - 10 was record in O.T.gruop 24.24 ± 6.27 followed by negative uveitis group 21.35 ±7.64 then asymptomatic toxoplasmosis group 19.15± 3.95 while positive uveitis showed a level 17.65 ± 2.75,the lowest level was in control group 14.28 ± 2.79. High level of Interferon - gamma Inducible Protein - 10 ( IP - 10 ) was got in O.T. group in a concentration 22.66 ± 3.48followed by positive uveitis group 17.09 ± 1.97, then negative uveitis group 16.91± 3.02. Asymptomatic toxoplasmosis group reached 16.89 ± 2.46 and lowest concentration in control group 14.78 ± 2.26.Granulocytes - macrophages colonies stimulating ( GM - CSF) registered a highest level in positive uveitis 47.44 ± 15.04 followed by O.T. group 45.14 ±10.05 the negative uveitis group 43.12± 9.35 and Asymptomatic toxoplasmosis record 39.26± 12.03 while control group the lowest concentration 29.44± 5.29.There were no significant differences between the studied groups (p.0.05). in the levels of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF).

تلازم بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض الذبحة الصدرية غير المستقرة

اسم المؤلف: علي مرتضى حسن
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمت دراسة 150 انموذجا لمرضى الذبحة الصدرية Unstable angina و100 انموذج للاصحاء ظاهريا والمضاهين الجنس والاعمار مع المرضى , واهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم ABO وLewis ومجموعة الدم MNS , فقد سجلت النتائج ان تردد المجموعة B كان 33.3% في المرضى, و29% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, اما تردد المجموعة A فلم يعط فرقا بين المرضى والاصحاء, في حين قل تردد المجموعة O في المرضى عنه في الاصحاء, فقد بلغ في المرضى24.7% , و31% في الاصحاء وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, في حين كان تردد مجموعة الدم AB في المرضى 12.0 % وفي الاصحاء بلغ 10% ايضا كان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05 .لقد برز دور المجموعة (Le (a‾ b‾ في القابلية للمرض Susceptibility , وقد سجل هذا النمط ترددا بلغ 30.7% في المرضى و18% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي مشيرا الى معنوية هذا الفرق (P< 0.05), اما المجموعة Le(a+ b - ) فقد سجلت ترددا بلغ في المرضى 15.5% وفي الاصحاء 26% والمجموعة Le(a - b+) كان ترددها 55% في المرضى و18% في الاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.ان مجموعة الدم MNS اعطت مؤشرا الى دورها في المرض وخصوصا دور المجموعة NN اذ بلغ ترددها 19.2% للمرضى مقارنة بتردد 11% للاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.وقد درست الاستجابة المناعية للانماط الدموية التي تحت الدراسة وبينت النتائج ان هنالك ارتباطا بين بعض المجاميع وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر في مصول المرضى مقارنة بالاصحاء.كان النمطان A وB اكثر الانماط اظهارا للعياريات فقد بلغت 43.6 ± 46.6 و61.9 ± 148.9 للمرضى على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 5.6± 5.4 و15.3 ±25.7 للاصحاء وكانت هذه الفروقات ذات اهمية معنوية ((P< 0.05.اقترن ارتفاع عيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر بالمجموعة Le(a - b - ) فقد بلغت العيارية في المرضى 59.5± 67.2 و6.2 ± 5.8 في الاصحاء P<0.01) ). اما عيارية النمط Le(a+ b - ) فقد بلغت 57.6 ± 75.9 في المرضى و7.7± 7.7 في الاصحاء (P< 0.01) في حين كانت العيارية للنمط Le(a - b+) 43.7 ± 117.9 للمرضى, و108.3 ± 559.7 للاصحاء.درس دور مورث الافراز وعلاقته بالاستجابة المناعية فقد سجل المرضى الفارزين عيارية 72.6 ± 77.02 مقارنة بغير الفارزين المسجلين لعيارية بلغت 54.3 ± 63.5 (P< 0.01) في حين كان الاصحاء الفارزين ذوي عياريه 6.0 ± 7.02 مقارنة بغير الفارزين اذ بلغت 6.4 ±5.3 (P< 0.01) .اما العيارية المرتفعة للنمط NN والبالغة 38.4 ± 47.02 فقد اختلفت عن مثيلتها في الاصحاء 8.7 ± 9.4 (P<0.01).كانت الانماط AB وB اكثر خطورة نسبية للمرض, فقد بلغت خطورتها النسبية 1.2 و1.1 على التوالي .وقد نوقشت النتائج في ضوء المعلومات العلمية المتوافرة للموضوع. | A total of 150 unstable angina patients and 100 age and gender comparable healthy controls were investigated. The study dealt with finding the frequency distribution of ABO, Lewis and MNS blood groups .The findings indicated that there was an increase in the frequency of B blood groups (patients 33.3% versus 29% in control, P<0.05). On the other hand however, A gave no significant difference in the patients compared to control. O blood group frequency gave a decreased frequency in patients compared to controls,(24.7% in patients vs. 31% in healthy controls , P<0.05).A noticeable increase in the frequency of Le(a - b - ) was seen in patients (30.7% in patients vs. 18% in controls, P<0.05), However, Le(a - b+) demonstrated a relatively decreased frequency in patients compared to controls, While Le(a+b - ) showed no differences in frequency.In MNS blood groups, NN frequency gave a statistically significant difference ,with a frequency of 19.2% in patients vs 11% in healthy controls.The immunological status in patients and controls was studied, based on a newly developed quantitative criterion (Anti - bovine antibody titers among patients and controls). It was seen that A and B blood groups were among the ones that gave an increased anti - bovine antibody titers giving a mean titers of (43.6 ± 46.6 and 61.9 ± 148.9) in patients vs. (5.6 ± 5.4 and 15.3 ± 25.7) in healthy controls respectively.The increased anti - bovine antibody titers were associated with Le(a - b - ) blood group, That was (59.5 ± 67.2) in patients vs. (6.2 ± 5.8) in healthy control, (P< 0.01).On the other hand however, anti - bovine antibody titers in Le(a+b - ) was (57.6 ± 75.9) in patients vs. (7.7 ± 7.7) in healthy controls, (P< 0,01), While Le(a - b+) gave an opposite titer of (43.7 ± 117.9) in patients vs (108.3 ± 559.7) in healthy control,(P<0.01).The role of secretory gene in the anti - bovine antibody titers distribution was studied among patients . Secretors gave a mean titer of (72.6 ± 77.02) compared to (54.3 ± 63.5) in non secretors.The healthy secretors gave a mean titer of (6.0 ± 7.02) compared to a mean titer of (6.4 ± 5.3) in healthy controls, (P <0.01).NN blood groups gave an anti - bovine antibody mean titer of (38.4 ± 47.02)in patients in respect to a mean titer of (8.7 ± 9.4)in healthy controls, (P <0.01).A relatively high risk was demonstrated among some blood groups.The novel results were discussed based on gathered available immunological data in the subject of atherosclerosis and unstable angina .

دراسة جزيئية لعدد من عوامل الالتصاق البكتيرية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من عينات الادرار من الاطفال دون الخامسة Molecular study of a number of bacterial adhesion of the bacteria Escherichia coli isolated of urine samples of children under five

اسم المؤلف: علـي فاضل احمد
اسم المشرف: الهام سعيد عبد الكريم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة عزل بكتريا Escherichia coli من عينات سريرية لاطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية ، وقد تم الحصول على ( 72 ) عزلة من بكتريا E. coliمن اطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية الذين اعمارهم دون ( 5 ) سنوات ومن كلا الجنسين من مستشفى ( ابن البلدي للاطفال ، والامامين الكاظمين ( ع ) التعليمي ومستشفى العلوية للاطفال ) وللمدة من 1/11/2014 لغاية 28 / 2 / 2015 . اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات المجهرية والزرعية والفحوصات الكيموحيوية والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات بوساطة استعمال الفحص بنظام ( API 20 E ) . بينت نتائج الدراسة ان نسبة اخماج المسالك البولية في الاناث هي ( 54.2 % ) 39 عزلة ، وفي الذكور ( 45.8%) 33 عزلة.واختبرت حساسية جميع العزلات للمضادات الحيوية وفق طريقة ( Kerby Bauer ) اذ اظهرت جميع العزلات مقاومة 100% لمضادي Ampicillinو Ceftazidime في حين، كانت نسب المقاومة للمضاد Trimethoprim ،Amikacin ، Aztreoname، Tobramycin، gentamycin ، Pipracillin83.3 % ،81.9% ، 72.22% ، 70.8% ، 68.5% ، 65.5 على التوالي ، وكانت نسبة الحساسية 100% لمضادي ، Impenem ، Meropenem .اظهرت عزلات بكتريا E. coli قابليتها على التعبير عن عامل الضراوة الهيمولايسين (نوع بيتا β) اذ كانت 59.7% من العزلات منتجة لهذا العامل . اظهرت عزلات بكتريا E. coli احتواءها على نوعي عاملي الالتصاق CFA/I ، CFA/III اذ كانا بنسبة ( 91.6% ) و( 62.5%) على التوالي ، واظهرت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان ( 100%) ، كما اظهرت جميع العزلات قدرتها على انتاج الغشاء الحياتيBiofilm وبنسبة ( 100%) .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق Fim وPap Gباستخلاص الـ DNA البكتيري بوساطة ( Geneaid Kit ) ومن ثم اخضاع الـ DNA لاختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي ( PCR) . استعملت طريقة تفاعل البوليمر لسلسة الدنا PCR للكشف عن نوعين من عوامل الضراوة الجينية التي تمتلكها بكتريا الـ E.coli بوصفها المسبب الاكثر اهمية لالتهابات المسالك البولية وباستعمال بادئات متخصصة لكل جين ، اذ اظهرت النتائج وجود جين Fim (H) بنسبة 100% ، في حين كان وجود pap G ( I) بنسبة 19.4% ، وكان pap ( III) بنسبة 38.8% في حين كانت نتائج الفحص سالبة للجين pap G (II) . | The Present study included 72 Isolates of Escherichia coli from clinical sample were taken from children with urinary tract infection, whom they were under the age of five year , male and female, taken from ( Ibn Al - balady Hospital for Children), ( Al - Imamayn Al - Khademayn Teaching Hospital) and (Al - A’lwayya Hospital for Children), in the period from 1/11/2014 to 28/2/2015. The bacterial diagnosis depended on microscopic and Cultural specifications, Using the biochemical examinations and the final exact examination of the isolated bacteria by using (ApI 20E) examination system. The study results showed that the infection in the urinary tract of females were 54.2% of 39 isolated bacteria and that of males were 45.8% of 33 isolated bacteria.The Antibiotic susceptibility of .isolated bacteriad one according to Kirby Bauer testing , showed a high degree of , resistance100% to the ceftazidime and ampicillin , while resistance to trimethoprim, amikacin, aztreoname, tobramycin , gentamycin and Pipracillin were 83.3,81.9%, 72.22%,70.8% , 68.5%,65.5respectively.All isolates showed susceptibility 0% to the impenem and meropenem antibiotics .The result of virulence factors of E.coli isolates show indicate the ability 59.7% of isolates produce hemolysin .The isolated bacteria of E.coli showed containing two types of adherence factors CFA/I and CFA/III, and the two ratios were 91.6% and 62.5% respectively. All the isolated bacteria showed that the ability of adherence to epithelial cells of the urinary tract was 100%.All the isolated bacteria showed that the ability to produced Biofilm were 100%.The molecular examination of the genes for adherence factors was made by taking out the bacterial DNA by (Geneaid Kit) and then, the DNA was put to the test of polymerase chain reaction (PCR). Polymerase chain reaction (PCR) was used to find out two types of adhesion factors, Fim (H)and Pap G genes, as they were the cause of the most common urinary tract infections by using specialist primers for each gene. The results showed the existence of Fim (H) gene was 100%,while were Pap G(I) gene 19.4%, Pap(III) gene38.8%, and the results of the test of Pap G(II) gene were negative to all isolates .

دراسة بكتيريولوجية وجزيئية للنوع Proteus mirabilis المعزولة من مصادر سريرية وحيوانية Bacteriological and molecular study of Proteus mirabilis isolated from clinical and animal sources

اسم المؤلف: علي سعد كاظم حسين
اسم المشرف: محمود ابراهيم اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الجانب الاول : شمل هذا الجانب عزل وتشخيص البكتيريا Proteus mirabilis من 801 عينة تضمنت 179 عينة سريرية مختلفة (البول، الاذن والجروح) و622 عينة حيوانية مختلفة (براز الدجاج، مستقيم الابقار، مستقيم القطط ومستقيم الكلاب) جمعت من محافظة بغداد للمدة من 26/10/2015 الى 29/3/2016. بعدها درست الحساسية للمضادات الحيوية وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : .1 88 عزلة بكتيرية تعود للنوع P. mirabilis تضمنت 51 (28.49%) عزلة من العينات السريرية و37 (5.95%) عزلة من العينات الحيوانية وشخصت باستعمال طرق التشخيص التقليدية وعدة الفايتك كما تم تاكيد تشخيصها باستخدام البادئ النوعي للجين 16SrRNA للكشف عنه في جينوم البكتيريا بتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل اذ اظهرت نتائج التشخيص الجزيئي ان جميع العزلات البكتيرية امتلكت الجين .16SrRNA 2. بينت نتائج فحص حساسية عزلات P. mirabilis (88 عزلة) للمضادات الحيوية بطريقة انتشار القرص انها امتلكت المقاومة المتعدة لـ )2 - 8( من المضادات الحيوية المختبرة. كما وجد ان اقل معدل مقاومة لعزلات P. mirabilis السريرية كان لمضادات ciprofloxacin (3.9%) وnorfloxacin (7.8%) وimipenem (9.8%) بينما اقل معدل مقاومة للعزلات الحيوانية كان لمضادات cefoxitin (0%) وamikacin (2.7%) وciprofloxacin (5.4%) وcefepime وimipenem وlevofloxacin (8.1%) لكل منها. الجانب الثاني : شمل الكشف عن بعض عوامل الضراوة ظاهريا والكشف الجزيئي عن ثلاثة جينات مرتبطة بعوامل الضراوة وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : 1. بينت نتائج فحص انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف لبكتيريا P. mirabilis بطريقة القرص التازري المزدوج ان 52.49% (27/51) و48.65% (18/37) من العزلات السريرية والعزلات الحيوانية على الترتيب كانت موجبة للفحص.2. بينت نتائج فحص الفعالية الانحلالية للهيمولايسين لعزلات P. mirabilis على اطباق اكار دم الانسان واطباق المعايرة الدقيقة لدم الانسان والارنب ان 66/88 (75%) عزلة منها كانت محللة للدم من نوع الفا وبيتا على اطباق اكار الدم كما انها اعطت معيارا انحلاليا للدم تراوح بين (16 - 256)، كما وجد ان 22/88 (25%) عزلة لا تمتلك فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر على اطباق اكار الدم ولا على اطباق المعايرة الدقيقة. اظهرت نتائج الكشف الجزيئي عن الجين hpmA (الذي يشفر الى انتاج الهيمولايسين) ان جميع العزلات التي اعطت فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر امتلكت الجين hpmA بينما 19/22 من هذه العزلات التي لم تعط فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر كانت لا تمتلك جين الهيمولايسين gene) .(hpmA3. بينت نتائج فحص تكوين الغشاء الحيوي لبكتيريا P. mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة وعند الطول الموجي 630 نانوميتر ان جميع العزلات (88/88) كانت مكونة له. اذ ان 53.41% (47/88) من العزلات كانت مكونة للغشاء الحيوي بدرجة قوية و25% (22/88) بدرجة متوسطة و21.59% (19/88) بدرجة ضعيفة.4. بينت نتائج فحص انتاج انزيم البروتيز لبكتيريا P. mirabilis على اطباق اكار الحليب الفرز والكشف الجزيئي عن الجين zapA (الذ يشفر الى انتاج البروتيز) ان 82/88 (93.18%) عزلة منها كانت منتجة لانزيم البروتيز على اطباق اكار الحليب الفرز وتمتلك الجين zapA بينما 6/88 (6.82%) عزلات كانت غير منتجة لانزيم البروتيز ولا تمتلك الجين zapA، اي يوجد تطابق مابين الكشف الظاهري والكشف الجزيئي عن الجين zapA.5. بينت نتائج الكشف الجزيئي عن عامل الضراوة الجين ucaA (الذي يشفر الى الهدب UCA) ان جميع عزلات P. mirabilis (88/88) كانت تمتلك هذا الجين.6. بينت نتائج فحص انزيم اليوريز لبكتيريا P. mirabilis على وسط اكار اليوريا ان جميع العزلات (88/88) كانت منتجة له وبسرعات مختلفة. | A. Part One included isolation and identification of Proteus mirabilis from 801 samples, including 179 clinical various samples (urine, ear and wounds) and 622 animal (chicken faeces, cows rectal, cats rectal and dogs rectal) various samples were collected from Baghdad province during the period from 26 - 10 - 2015 to 29 - 3 - 2016. Then, their antibiotic sensitivity was studied. This part concluded the following results : 1. 88 bacterial isolates belong to P. mirabilis species included 51(28.49%) isolates from clinical sources and 37 (5.95%) isolates from animal sources were identified by conventional method, Vitek - 2 compact system and confirmed by using specific primer to detect 16SrRNA gene in bacterial genome by polymerase chain reaction technique. Results of molecular identification showed that all these bacterial isolates were possessed this gene (16SrRNA). 2. The results of sensitivity test by disc diffusion method showed that P. mirabilis isolates were multidrug resistant to (2 - 8) from antibiotics tested. The lowest resistance rates for clinical P. mirabilis isolates were (3.9%) for ciprofloxacin, (7.8%) for norfloxacin and (9.8%) for imipenem while animal isolates showed lowest resistance rates : (0%) for cefoxitin, (2.7%) for amikacin, (5.4%) for ciprofloxacin, (8.1%) for each one of cefepime, imipenem and levofloxacin.B. Part Two consisted of a study of some phenotypic virulence factors and molecular detection of 3 genes associated with virulence factors. This part concluded the following results : 1. The results of extended spectrum - β lactamases test by double disk synergy test revealed that 52.49% (27/51) and 48.65% (18/37) of clinical and animal P. mirabilis isolates were respectively positive for the test. 2. The results of hemolytic activity tests of P. mirabilis isolates on human blood agar plates and hemolytic microtiter plates showed that 66/88 (75%) isolates were alpha - and beta - hemolytic on human blood agar plates and they were giving measurable hemolytic titer between (16 - 256), and 22/88 (25%) isolates did not give hemolytic activity. Results of molecular detection of hpmA gene showed that all isolates were giving hemolytic activity possessed the hpmA gene while 19/22 of these isolates did not give hemolytic activity and did not possess the hemolysin gene (hpmA gene).3. The results of biofilm formation test of P. mirabilis by microtiter plates at wave length 630 nm showed that all isolates (88/88) were positive for the test, results showed a strong biofilm formed was 53.41% (47/88), moderate biofilm was 25% (22/88) and weak biofilm was 21.59% (19/88).4. The results of protease production test of P. mirabilis isolates on skim milk agar and results of molecular detection of zapA gene (protease gene) revealed that 82/88 (93.18%) isolates of P. mirabilis were positive for protease test and they were possessed the protease gene. While 6/88 (6.82%) isolates were negative for protease test and did not possess protease gene, there is congruence between phenotypic and molecular detection of zapA gene.5. The results of molecular detection of virulence factor ucaA gene showed that all of the P. mirabilis isolates (88/88) were possessed this gene.6. The results of urease test of P. mirabilis isolates on urea agar plates showed that all of the isolates (88/88) were positive for the test.

دراسة تاثير بعض المطهرات والمعقمات والمنظفات على نمو بعض الفطريات المعزولة من بعض المستشفيات في بغداد Study the effect of some disinfectants, sterilizers and detergents on growth of some fungi isolated from Baghdad hospitals

اسم المؤلف: صادق رحيم محمد علي
اسم المشرف: منى حمودي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to detect the fungal contamination of hospitals in orderto be controlled and limited.A total of 511 environmental swaps were collected from Al - Karamateaching hospital, Al - Sader general hospital, Al - Yarmouk teachinghospital, Baghdad teaching hospital and Imam Ali general hospital inBaghdad city from the period 28,October,2013 to 31,March,2014. Thesamples were collected to isolate and identify the caused and contaminatedfungi in addition to test their sensitivity against certain antiseptic anddisinfectants that are used in hospitals; also their virulence factors forhigher frequency and occurrence genus.These isolates were collected from main sources, the hospitalsenvironment and most of the items used for hospital work in order to detectthe nosocomial pathogens persistent in the hospital ecosystem, whichincludes : sink surfaces, tools and equipments, walls, indwelling medicaldevices, premature incubators, beds, medical trashes, floors and others.Results revealed that fungal contamination in five hospitals was in thepercentage 69.89%, 64.52%, 62.40%, 51.58% and 41.90% respectively. Inaddition, the most contaminated places were the hospitals wards 80%,while it was 77.77% in endoscopy units and 76.92% in the Respiratory careunits. The lowest contaminated places were the emergency units 25.0%then burns units 33.33% and cardiac care unit which was 41.66%. Inrespect with the percentage of occurrence and frequency for the isolatedfungi, it was found out that Aspergillus flavus formed the highest ratio offrequency and occurrence 21.29% and 15.46% respectively, followed byAspergillus niger 18.33% and 13.31% then Penecillium spp. which was10.78% and 7.83%. Regarding other fungi, their frequency and occurrence were different. All fungal isolates were identified depending on themorphological and microscopic examinations as well as biochemical tests.The results on the effect of temperature and pH on fungal growthshowed that the best growth was at 25 - 30 OC, and the best growth wasfound at the pH range 5.0 - 6.0.Results of the test of fungal sensitivity against eight antiseptics andsterilizers used in the hospital showed that the ratio of inhibition of thesecompounds agnaist fungi were different according to types andconcentration of antiseptics as well as genus and species of fungi. Use ofthese compounds in 100%, 50%, 40%, 30% and 20% concentration is veryhigher effective, while more effective if they were used in 10% or 7.5%concentration than in 5% and 2.5%, but not effective in 1.25%concentration.The results showed that Setol (Chloroxylenol) has significantly the mosteffective compound on fungi, followed by Formalin (Formaldehyde), thenCarmal (Tension, active surfactants, non - ionic) and Alwazir (Sodiumhipochlorite).Testing some of virulence factors aflatoxin production, lipaseproduction , protease production and haemolysis test, it was found that A.flavus has higher lipase production and protease production than otherfungi. A. flavus and A. niger were capable of blood hemolysis in 3 daysonly, but in different diameters of lysis zone, 1.8mm and 1.6mmrespectively. Some isolates of A. flavus are capable to aflatoxin production.Depending on all results, hospitals contain different fungal species andgenus, antiseptics and disinfectants have an effect on fungal growth if theyare used in a correctly.

دراسة كيميائية وبايولوجية لمركبي Stigmasterol و? - sitosterol كمكونات فعالة متواجدة في نبات البنفسج العطري (العائلة : البنفسجية) المزروع في العراق Phytochemical and Biological Study of Stigmasterol and ? - sitosterol as Active Constituents Present in Viola odorata L.Plant (Family : Violaceae) Cultivated in Iraq

اسم المؤلف: شيماء فخري جاسم السالم
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد هذه الدراسة مسح لبعض المكونات الفعاله لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. وعزل هذه المركبات الفعالة (Stigmasterol and β - sitosterol)، كما تم اجراء دراسه بايولوجيه لتحديد فاعليتها كمركبات مضادة للاكسدة وكمضادات بكتيرية حيث تضمنت الدراسه مايلي : - • تم استخلاص هذه المركبات كمستخلص خام من كل جزء من اجزاء النبتة الجذور،الاوراق, الازهار والبذور باستخدام الميثانول والبتروليوم ايثر واجراءالتقدير الكمي والنوعي للمركبين Stigmasterol) و( β - sitosterolفي كل جزء باستخدام تقنيات TLC, HPLC,CC• تم استخلاص وعزل وتشخيص المركبين (Stigmasterol and β - sitosterol) وذلك باستخدام طرق استخلاص وتجزئه وعزل مختلفه• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. والمركبات الستيرويدية Stigmasterol) و( β - sitosterol كمضادات للاكسدة على المركب 1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) الفعال لاحتوائه على الجذور الحرة وتحويله الى مركب 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine باستخدام التراكيز 25, 50, 100, 200 و400 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata Lو المركبات الستيرويديه( Stigmasterol و( β - sitosterol كمضادات بكتيرية فاعلة ضد بكتيريا staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa وبتراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع المضاد الحيوي Gentamicin كمعاملة قياسية• اظهرت النتائج وجود كميات كبيرة من المركبات الستيرويدية(Stigmasterol and β - sitosterol )في كل اجزاء نبتة البنفسج العطري Viola odorata L. اذ كانت تراكيز مركب Stigmasterol في الاوراق 2 ملغم/100مليلتر وللازهار 7.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 4.5 ملغم/100مليلتر وللبذور 2.4 ملغم/100مليلتر, فيما كانت تراكيز المركب β - sitosterol في الاوراق 3.2 ملغم/100مليلتر وللازهار 5.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 9.2 ملغم/100مليلتر وللبذور 3 ملغم/100مليلتر, اذ كان اعلى تركيز للمركب Stigmasterol في مستخلص الازهار 7.3 ملغم/100مليلتر واعلى تركيز للمركب β - sitosterol في الجذر 9.2 ملغم/100مليلتر.• اظهرت النتائج الفاعلية الكبيرة للمستخلص الخام لنبات Viola odorata L. بالتركيز 400 مايكروغرام/مليلتر كمضاد للاكسدة بنسبة 94% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 72, 80, 84 و92% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية, اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية P≤ 0.05 ما بين التراكيز للمستخلص الخام, فيما اظهر التركيز 400 مايكروغرام/مليلتر لخليط المركبات( stigmasterol وβ - sitosterol) كفاءة كبيرة كمضادات للاكسدة وبنسبة 74% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 59, 63, 66 و70% على التوالي مقارنة بالمعاملة القياسية وبفروق معنوية P≤0.05 ما بين التراكيز.• اظهرت تراكيز المستخلص الخام للنبتة فاعلية كمضاد للبكتيريا اذ كان مدى تثبيط بكتيريا Staphylococcus aureus على الوسط المغذي الصلب 0, 5, 15, 18, 20, 22 و25 مليمتر باستخدام التراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر على التوالي, واظهر خليط الستيرويدات مدى تثبيط 0, 0, 0, 14, 16, 19 و21 مليمتر لنفس التراكيز على التوالي ومقارنة بالمعاملة القياسية, كذلك اظهر المستخلص الخام كفاءة كمضاد بكتيري ضد بكتيريا Pseudomonas aeruginosa بمدى تثبيط 0, 5, 12, 15, 17, 19 و22 مليمتر ولخليط الستيرويدات بمدى تثبيط 0, 0, 0, 11, 13, 17 و18 مليمتر مقارنة بالمعاملة القياسية, وبينت النتائج ان التركيز الادنى المثبط للمستخلص الخام للنبتة ضد بكتيريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaهو 5 مايكروغرام/مليلتر ولخليط الستيرويدات هو 20 مايكروغرام/مليلتر. | This study is considered as a survey of the some secondary metabolits present in Viola odorata L., collected from plant nursery in Baghdad between April and July, followed by the fractionation and isolation of Stigmasterol and β - sitosterol.The biological study demonstrated the effect of the Stigmasterol and β - sitosterol found in Viola odorata L. as antioxidant and antibacterial. This study involved the following : - • Extraction of Stigmasterol and β - sitosterol as a crude extract from each part of the plant roots, leaves, flowers and seeds using (Petrolium ether and Methanol) to qualitative and quantitative estimation of Stigmasterol and β - sitosterol in each part of the plant by using TLC, HPLC and CC. • Fractionation and Isolation of sterols compounds (Stigmasterol and β - sitosterol) present in Viola odorata L., by using different methods . • Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been studies in experimental work to determination the antioxidant activity against1,1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) which is considered as stable free radical and convert it into 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine ,by using different concentrations (25,50,100,200 and 400µg/ml). Compare ascorbic acid.• Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been used to determination the antibacterial activity using different concentrations (2, 5, 10,20,30,40 and 50µg/ml) against staphylococcus aureus and pseudomonas aeruginosa by using agar well diffusion method compare with Gentamicin as a standard control. • The phytochemical results showed that all the plant parts contain high amount of sterols, the quantitative data revealed that the total content of Stigmasterol in roots(4.5mg/100g) ,in leaves(2mg/100g),in flowers(7.3mg/100g) and in seeds(2.4mg/100g).The content of β - sitosterol in roots(9.2mg/100g),in leaves(3.2mg/100g),in flowers(5.3mg/100g) and in seeds(3mg/100g), highest amount of stigmasterol founded in flowers (7.30mg/100g) ,the maximum amount of β - sitosterol in roots (9.2 mg/100g) .• The results showed that crude extract of Viola odorata in concentration of 400µg/ml have a higher antioxidant effect by 94%, and concentrations of 25, 50, 100 and 200 µg/ml by 72, 80, 84 and 92% respectively which are comparing with standard control Ascorbic acid, the results showed there are significant difference at (P≤ 0.05) between the concentrations in the same crude extract, while the stigmasterol and β - sitosterol of Viola odorata also showed higher antioxidant effect in concentration of 400µg/ml by 74% and concentrations of 25, 50, 100 and 200µg/ml by 59, 63, 66 and 70% respectively comparing with standard control Ascorbic acid with significant difference at (P≤0.05) between them ,and with significant difference at (P≤0.05)between the concentrations in the same fraction.• Antibacterial results of crude extract showed Staphylococcus aureus growth inhibition zone by 0, 5, 15, 18, 20, 22 and 25 mm with 5 µg/ml as MIC, while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 14, 16, 19 and 21 mm with 20 µg/ml as MIC comparing with Gentamicine standard control. Furthermore inhibition zone in pseudomonas aeruginosa culture when using crude extract by 0, 5, 12, 15, 17, 19 and 22 mm with 5 µg/ml as minimum inhibitory concentrations (MIC), while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 11, 13, 17 and 18 mm with 20 µg/ml as Minimum inhibitory concentration (MIC) compar with Gentamicin standard control .Stigmasterol and β - sitosterol compound showed inhibition zone by 0,0,0,11,13,17 and 18 mm with 20 µg/ml MICcompared with Gentamicine standard control.

دراسة التنوع الوراثي لضروب مختلفة من الفلفل الحلو Capsicum annuum L. لعينات من الاسواق المحلية باستعمال بعض التقانات الوراثية الجزيئية Genetic diversity study for different varieties of sweet pepper Capsicum annuum L. for samples from local markets by using some molecular genetic techniques

اسم المؤلف: شيماء صباح مهدي
اسم المشرف: احسان عرفان حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: درس التباين الوراثي في 22 عينة محلية ومستوردة من ثمار الفلفل الحلو Capsicum annuum L. التي جمعت من الاسواق المحلية العراقية باستعمال بعض المعلمات الجزيئية ، فضلا عن تعيين تركيز مادة الكاروتينات Carotenoids في ثمار الفلفل الحلو باستعمال تقانة الكروماتوغرافيا السائلة عالية ا لاداءHigh - performance liquid chromatography (HPLC)، كما كشف عن ثلاثة من الجينات المسؤولة عن انتاج هذه المادة وهي Lycopene β - cyclase (Lcyb)، β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) وCapsanthin - capsorubin synthase (Ccs) مع اجراء التسلسل التتابعي للدنا DNA sequencing لهم.درس التباين الوراثي باستعمال تقانة عديد التكوين ذات القطعة الطولية المضخمةAmplified fragment length polymorphism (AFLP) ولثلاثة توافقات بين البوادئ المستعملة في جميع العينات. انتج التوافق الاول EACG/MAGG اربعة حزم في عينات الفلفل المدروسة وبعدد ثلاثة حزم احادية الشكل Monomorphic bands في كل عينة، ما عدا عينتي الفلفل الاردني البرتقالي والاحمر التي انتجت اربع حزم في كل عينة كانت واحدة منها متعددة الاشكال Polymorphic bands وبنسبة مئوية 25% وكانت كفاءة التوافقPrimer efficiency 21.43% مع قوة فعالية تميزية Discriminatory power بنسبة 100%. انتج التوافق الثاني EAAG/MAAT اربعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 28.57% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%، بينما انتج التوافق الثالث EACA/MCTG سبعة حزم في كل عينة كانت جميعها احادية الشكل، ماعدا عينة الفلفل الاخضر العراقي/بلد قد انتج ثلاثة حزم وكانت ايضا احادية الشكل ولم تظهر اية حزمة متعددة الاشكال وكانت كفاءة التوافق 50% مع قوة فعالية تميزية بنسبة 0%. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي وتوزعت العينات ضمن التحليل العنقودي في ثلاثة مجاميع رئيسة. المجموعة الاولى ضمت ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي، بينما المجموعة الثانية فقد ضمت الفلفل العراقي/بلد الاخضر والمجموعة الثالثة فتكونت من عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. لقد اوضح هذا المخطط وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي مع عينات الفلفل الاخرى ما عدا الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبنسبة 0.94 وهي اعلى قيمة تشابه, بينما كانت قيمة التشابه مع عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر بنسبة 0.68. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاحمر والبرتقالي وعينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وبقيمة 2.236. استعملت في دراسة تقانة تكرار التسلسل البسيط Simple Sequence Repeat (SSR - PCR) ستة بوادئ، وان هذه البوادئ قد انتجت 33 حزمة كان منها 24 حزمة متعددة الاشكالPolymorphic bands، بينما كان تسعة حزم منها احادية الشكل Monomorphic bands. رسمت شجرة القرابة الوراثية باستعمال معامل Jaccard للتشابه الوراثي، وبينت النتائج بان العينات قد توزعت ضمن التحليل العنقودي في عشرة مجاميع رئيسة. لقد اوضحت النتائج وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد واليوسفية الاخضر وبنسبة 1 وهي اعلى قيمة تشابه بالمقارنة مع اقل قيمة تشابه لعينة الفلفل الاسباني الطويل الاخضر وبقيمة 0.35. نسبة التشابه العالية قد ظهرت ايضا بين ثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر والاحمر وبقيمة 0.98 وكذلك بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/صويرة الاخضر وثمار الفلفل الحلو الايطالي الاخضر وبقيمة 0.94. اظهرت النتائج ايضا بان اعلى قيمة بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد الاخضر والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر وعينة الفلفل الايراني البرتقالي وبقيمة 5.656، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاردني الاخضر والاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. استعملت في تقانة الدنا متعدد الاشكال المضخم عشوائياRandom amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) خمس بادئات عشوائية، وكانت نسبة التعدد الشكلي لجميع البوادئ 100% مع ظهور حزمة متميزة واحدة وبحجم جزيئي 1800 زوج قاعدة عندما استعمل البادئ C52، بينما لم تنتج البادئات الاخرى اية حزم متميزة. نتائج شجرة القرابة الوراثية التي رسمت بالاعتماد على معامل Jaccard للتشابه الوراثي قد وزعت العينات ضمن التحليل العنقودي الى ثمان مجاميع رئيسة. اظهرت شجرة القرابة وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/اليوسفية الاخضر وثمار الفلفل الحلو الاردني الاصفر بنسبة 0.84 وهي اعلى قيمة تشابه، بالمقارنة مع تشابه وبقيمة صفر بين ثمار الفلفل الحلو الايراني الاصفر وبين عينات ثمار الفلفل الحلو الاخرى. اظهرت قيم البعد الوراثي بين عينات ثمار الفلفل الحلو المدروسة اعلى قيمة كانت بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الصيني الاصفر والايراني الاخضر وبقمة 5.0، بينما كان اقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الاسباني الاخضر والايطالي الاصفر، اذ كانت القيمة مساوية الى 1.0. قدر اعلى تركيز للبيتا - كاروتين في عينة الفلفل الايطالي الاصفر وبقيمة 1415.73 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع اقل قيمة التي هي 94.32 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني الاخضر. كانت اعلى قيمة في الفلفل الاصفر في العينة الايطالية واقل قيمة للون نفسه كان في عينة الفلفل الايراني الاصفر وبقيمة 710.89 مايكروغرام/مليلتر، اما اعلى تركيز للبيتا - كاروتين للفلفل البرتقالي فكان في العينة الايطالية وبقيمة 898.5 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع 574.33 مايكروغرام/مليلتر في الفلفل الايراني البرتقالي. الفلفل الاحمر قد سجل اقل قيمة لتركيز البيتا - كاروتين وهي 245.27 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل الاردني الاحمر، بينما سجل الفلفل الاسباني الاحمر اعلى قيمة وهي 435.41 مايكروغرام/مليلتر. الفلفل الاخضر قد سجل اعلى قيمة في عينة الفلفل الايطالي وبقيمة 232.43 مايكروغرام/مليلتر بالمقارنة مع قيمة 98.86 مايكروغرام/مليلتر في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر. كشف عن بعض الجينات التي لها علاقة بتصنيع البيتا - كاروتين باستعمال تقانة Polymerase chain reaction (PCR)، وباستعمال الترحيل الكهربائي لهلام الاكاروز بتركيز 2%. وجد الجين Lcyb في 11 عينة فلفل مدروسة عند الكشف عنه باستعمال البوادئ الخارجية External primers، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 19 عينة فلفل حلو مدروسة وبحجم 360 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية Internal primers. وجد الجين Crtz باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 3 عينات هي الفلفل الاردني البرتقالي، والفلفل العراقي/يوسفية الاخضر والفلفل الايراني الاخضر وبحجم 760 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. وجد الجين Ccs باستعمال البوادئ الخارجية في عينة الفلفل العراقي/صويرة الاخضر والفلفل الايطالي البرتقالي وبحجم جزيئي اكبر من 1500 زوج قاعدة، بينما اظهر الترحيل الكهربائي قطعة مضخمة في 7 عينات اخرى من ثمار الفلفل الحلو وبحجم 490 زوج قاعدة عندما استعملت البوادئ الداخلية. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Lcyb في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في عينات الفلفل الحلو المدروسة بين عينة الفلفل العراقي/الصويرة الاخضر وبين عينة الفلفل الايراني الاخضر وبقيمة 0.903، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل الاردني الاصفر وعينة الفلفل الصيني الاصفر وبقيمة 0.539. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطع الجين Crtz وجود نوعين من التغيرات الجينية هي الحذف Deletion والاستبدال Substitution في الفلفل الاردني البرتقالي. لقد كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية الكوانين G بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 846 و850، واستبدال القاعدة النايتروجينية الثايمين T بالقاعدة النايتروجينية السايتوسين C في المواقع 852، 860 و861، كذلك كان هناك استبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الادنين A في الموقعين 856 و862 واستبدال القاعدة النايتروجينية السايتوسين C بالقاعدة النايتروجينية الثايمين T في الموقعين 864 و870. طفرات الحذف ايضا كانت موجودة، اذ حذفت القواعد النايتروجينية ATA من قطعة الجين Crtz في عينة الفلفل الاردني البرتقالي بالمقارنة مع التسلسل التتابعي القياسي Refseq. بينت نتائج التسلسل التتابعي لقطعة من الجين Ccs في بعض من عينات الفلفل الحلو الاخضر الى وجود تشابه كبير بين التسلسلات التتابعية لقطعة الجين المدروسة والتسلسل التتابعي القياسي Refseq للجين نفسه، مع وجود بعض الاختلافات لبعض القواعد النايتروجينية بين العينات المدروسة، كما ان هناك بعض طفرات الاستبدال قد حدثت. وجدت اعلى قيمة تشابه بين التسلسلات التتابعية في قطع الجين Ccs بين عينة الفلفل الايطالي البرتقالي وبين عينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.966، بينما اقل قيمة تشابه فقد وجدت بين عينة الفلفل العراقي/بلد الاخضر وعينة الفلفل الايطالي الاخضر وبقيمة 0.611. | Genetic variation was studied in 22 local and imported samples of bell pepper fruits Capsicum annuum L., which collected from local Iraqi market by using some molecular markers. Estimation of carotenoids by using high - performance liquid chromatography (HPLC) was done in all samples. Detection of three genes; Lycopene β - cyclase (Lcyb), β - carotene hydroxylase (Crtz - 2) and Capsanthin - capsorubin synthase (Ccs), were also studied and the DNA sequencing was done for these genes.Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was studied for three selective amplification primers in all samples. The first selective amplification primer (EACG/MAGG) produced 4 bands for the studied bell pepper fruits with 3 monomorphic bands in each sample, except the orange and yellow Jordanian bell pepper samples, which produced 4 bands one of them polymorphic band with 25% ratio and 21.43% primer efficiency with 100% discriminatory power. The second selective amplification primer (EAAG/MAAT) produced 4 monomorphic bands in each sample with no polymorphic bands with 28.57% primer efficiency and 0% discriminatory power, whereas the third selective amplification primer (EACA/MCTG) produced 7 monomorphic bands in each sample, except the Iraqi/Balad green bell pepper, which produced 3 monomorphic bands with no polymorphic bands and the primer efficiency is 50% with 0% discriminatory power. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 3 main groups. The first group was included the red and orange Jordanian bell pepper fruits samples, whereas the second group included the Iraqi/Balad green bell pepper and the third group included the rest samples. The results of this distribution revealed a high similarity between red and orange Jordanian bell pepper and the other bell pepper samples, except Iraqi/Balad green bell pepper with 0.94 values. This value is the higher, whereas the similarity with the Iraqi/Balad green bell pepper is 0.68 values. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between red and orange Jordanian bell pepper and the Iraqi/Balad green bell pepper with 2.236 values. Six primers were used with single sequence repeat (SSR - PCR) technique. These primers produced 33 bands. The number of polymorphic bands is 24, whereas the number of monomorphic bands is 9. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 10 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Balad green bell pepper and Iraqi/Yousifia green bell pepper with 1 value. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.35), which are found in Spanish long green. There are another high values were revealed between Jordanian yellow and red bell pepper with 0.98 value. Also, other high similarity values revealed between and Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian green bell pepper with 0.94 values. The genetic distance between the studied samples revealed the highest values between Iraqi/Balad and Yousifia green bell pepper with Iranian orange bell pepper with 5.656 values, in comparison with the lowest genetic distance between Jordanian green and yellow bell pepper with 1.0 value. The random amplified polymorphic DNA (RAPD - PCR) was used five randomly primers. The percentage of polymorphic bands is 100%, with one distinguished band which is produced by using C52 primer with 1800 base pair. The other primers did not produce any distinguished band. The results of Dendrogram of the studied samples by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 8 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Yousifia green bell pepper and Jordanian yellow bell pepper with 0.84 values. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.0) which are found between Iranian yellow bell pepper and the other samples. The genetic distance between studied samples revealed the highest values between Chinese yellow bell pepper and Iranian green bell pepper with 5.0 values, in comparison with the lowest genetic distance between Spanish green bell pepper and Italian yellow bell pepper with 1.0 value. The higher value of β - carotene concentration was found in Italian yellow bell pepper sample with 1415.73 µg /ml, in comparison with 94.32 µg /ml, which is estimated in Iranian green bell pepper. The highest concentration values of β - carotene in yellow bell pepper was found in Italian sample, in comparison with the lowest value for the same color, which found in Iranian yellow bell pepper with 710.89 µg /ml. The highest concentration value of β - carotene in orange bell pepper was found in Italian sample with 898.5 µg/ml, in comparison with 574.33 µg/ml in Iranian orang bell pepper sample. The red bell pepper was estimated lowest concentration of β - carotene with 245.27 µg/ml in Jordanian red bell pepper, in comparison with highest value in Spanish red bell pepper with 435.41 µg/ml. The green bell pepper was estimated highest concentration of β - carotene in Italian green bell pepper with 232.43 µg/ml, in comparison with lowest value with 98.86 µg/ml in Iraqi/Souwyera green bell pepper sample. Some of genes which related with β - carotene production were detected in all samples by using Polymerase chain reaction (PCR), and the products produced by this approach were resolved on 2% agarose gels. The Lcyb gene was detected in 11 bell pepper samples by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 360 base pair in 19 bell pepper samples when internal primer was used. The Crtz gene was detected in Iraqi/ Souwyera green bell pepper sample with amplified band more than 1500 base pair by using the external primers, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 760 base pair in 3 bell pepper samples; Jordanian orange bell pepper, Iraqi/ Yousifia green bell pepper and Iranian green bell pepper when internal primer was used. The Ccs gene was detected by using the external primers in Iraqi/ Souwyera green bell pepper and Italian orange bell pepper with amplified band more than 1500 base pair, whereas the gel electrophoresis for this gene revealed amplified band with 490 base pair in 7 bell pepper samples when internal primer was used. The DNA sequences results for the Lcyb gene in some green bell pepper samples revealed high similarity between its nucleotides and Refseq for the same gene, with some differences in nucleotide sequences for some bell pepper samples. The highest similarity between nucleotide sequences was found between Iraqi/Souwyera green bell pepper sample and Iranian green bell pepper sample with 0.903 value, whereas the lowest similarity was found in Jordanian yellow bell pepper and Chinese yellow with 0.539 value. The nucleotide sequences results for the Crtz gene revealed two types of genetic changes, such as deletion and substitution in Jordanian orange bell pepper. The results found substitution in the guanine (G) nucleotide base with thymine (T) nucleotide base in 846 and 850 positions. Also, substitute the thymine nucleotide base with the cytosine (C) nucleotide base in the 852, 860 and 861 positions. Substitution also found in the cytosine nucleotide base with adenine (A) nucleotide base in the 856, 862 position, and substitute the cytosine nucleotide base with the thymine nucleotide base in the 864 and 870 positions. Deletions of nucleotide bases was also found like ATA sequence in the Crtz gene of Jordanian orange bell pepper in comparison with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene. The nucleotide sequences results for the Ccs gene in some bell pepper samples revealed high similarity with the standard nucleotide sequence (Refseq) for the same gene with some differences in some nucleotide bases of the studied samples, like substitution. The highest similarity between nucleotide sequences for the Ccs gene was found between Italian yellow and green bell pepper samples with 0.966 values, whereas the lowest similarity was found in Iraqi/Balad green bell pepper with 0.611 values.

تقييم المعادن الثقيلة لنهر دجلة ضمن مدينة بغداد باستخدام دلائل التلوث Heavy Metals Assessment of Tigris River within Baghdad City by Pollution Indices

اسم المؤلف: شهد رياض زكي الربيعي
اسم المشرف: عادل حسين طالب الزاملي عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للفترة من شهر تشرين الثاني 2013 ولغاية شهر حزيران 2014, اذ تم جمع عينات الدراسة (ماء، رواسب، نباتات) خلال كل شهرين في ثلاثة مواقع في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد. تضمنت الدراسة تقدير تراكيز (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والزنك) في الماء (الذائب والكلي) وفي الرواسب (الكلي والمتوافر احيائيا) لنهر دجلة، وتم قياس نفس المعادن على انواع مختلفة من النباتات التي تم جمعها من مواقع الدراسة.اما الخصائص الفيزيائية والكيميائية لمياه النهر والمتمثلة في درجة حرارة الهواء والماء, الاس الهيدروجيني, الكدرة , الاوكسجين الذائب والتوصيلية الكهربائية فقد سجلت قيما ترواحت ما بين : ١٧٫٩ - ٤١ م°، ١١٫٧ - ٢٥٫٥ م°، ٧٫٨ - ٨٫٧، ٦٫٦ - ٣٧٫٢ NTU ، ٧٫٧ - ١١٫٣ ملغم/لتر و٨۰٦ - ١٩٤۰ مايكروسيمنز/ سم على التوالي .اظهرت نتائج الدراسة ان معدل التراكيز للمعادن الثقيلة الذائبة (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين) كانت ١٫٥١ ، ٣۰١٫١، ١٨٫١٨، ٢٩٫۰٣ ، ١٧١٫٤ و٤٣٫۰٣ ميكروغرام / لتر على التوالي. وكانت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار باستثناء الكروم والرصاص.بينما كان المعدل الاجمالي للمعادن الثقيلة في مياه نهر دجلة ٥٫٣۰ ،٤٦١٫٦۰، ٣٢٫۰٣، ٧٩٫٩٩ ،٢٢١٫٤٦ و١٢٦٫٦٣ميكروغرام / لتر على التوالي . والتي اعتبرت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار، باستثناء الكادميوم، الكروم والرصاص.في الرواسب ، كان معدل الاجمالي للمعادن الثقيلة ٧٫٣٨، ١٦٤٫٩٤،٣٩٫٤١، ٨٤٫٨٩ ٧١٫٥٢ و١٢٨٫٧٣ ملغم/كغم على التوالي. في حين يتراوح التوافر البيولوجي للكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين في رواسب نهر دجلة بين (قيم غير محسوسة - ۰٫٣٢) ، (۰٫٣٩ - ٣٫٤٢) ، (۰٫٨٩ - ٣٫١٩) ، (۰٫٤٢ - ٢٫٨٤) ، (۰٫٧٨ - ٥٫۰٤) و(۰٫٨٦ - ١٧٫١٨) ملغم/كغم على التوالي.تم تقييم شدة تلوث مياه النهر بالمعادن الثقيلة باستخدام مؤشر التلوث (PI) والتي اظهرت ان درجة تلوث المعادن الثقيلة في عينات المياه كانت متوسطة للمواقع حسب الترتيب التالي : ٣>٢>١.كما قيمت شدة تلوث الرواسب النهرية بالمعادن الثقيلة المدروسة بواسطة استخدام دلائل تلوث الرواسب وهي كل من مؤشر التراكم الارضي (I - geo - Index) ، مؤشر حمل التلوث (PLI - Index) ، مؤشر عامل التلوث (CF - Index) ، درجة التلوث (Cd - Index) ومؤشر عامل الاغناء EF - Index)).فيما يتعلق بتقييم تلوث الرواسب باستخدام المؤشرات البيئية فقد بينت نتائج مؤشر التراكم الارضي (I - geo) المحسوب للعناصر المدروسة ان المواقع المدروسة غير ملوثة بعنصري النحاس والزنك ولكنها قوية التلوث للغاية بعنصر الكادميوم في حين اظهرت قيم مؤشر التراكم الارضي للرصاص بانها درجة تلوث معتدلة وغير ملوثة الى متوسطة التلوث لعنصري الكروم والنيكل. كما اظهرت قيم مؤشر حمل التلوث(PLI) بان كل المواقع كانت ملوثة بمجموع المعادن المدروسة.اوضحت نتائج عامل التلوث(CF) بان المواقع جميعها سجلت تلوث عاليا جدا بعنصر الكادميوم ، ولكنها واطئة التلوث بعنصر الزنك في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل تلوث معتدلا بهذا العنصر، بينما سجل تلوث معتدلا بعنصر الكروم ،النحاس والنيكل في جميع المواقع .بينما سجلت الرواسب تلوثا عاليا بعنصر الرصاص في جميع المواقع المدروسة.وفقا لنتائج مؤشر درجة التلوث (Cd) فقد اعتبرت جميع المواقع على درجة عالية جدا من التلوث بالمعادن المدروسة.فضلا عن ذلك بينت نتائج عامل الاغناء EF - Index)) بان كل المواقع تصنف على انها عالية للغاية مع الكادميوم ومعتدلة الاغناء بعناصر الكروم، النحاس والنيكل واغناء مهم بعنصر الرصاص وحد ادنى من الاغناء بعنصر الخارصين في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل اغناء معتدل.اظهرت نتائج قيم BCF& BSF في جميع النباتات بانها اكثر من 1 مما يشير الى ان النباتات مؤشر احيائي جيد لكافة العناصر المدروسة في منطقة الدراسة وكذلك اوضحت نتائج معامل التركيز الاحيائي((BCF لجميع المعادن المدروسة في عينات النباتات انها اعلى من قيم معامل الترسيب الاحيائي ((BSF مما يدل ان مصدر التراكم لهذه العناصر في النباتات كان من الماء. | This study was carried out from November 2013 to June 2014; the samples were collected every two months in three sites in the Tigris River within Baghdad city. It included estimate concentration of (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) in dissolved and total water and sediments (total& bio - available) of Tigris River. The same metals were measured in different types of plants collected from study sites.Physical and chemical properties of river water had values ranged between 17.9 - 41.0 C˚, 11.7 - 25.5 C˚, 7.8 - 8.7, 6.6 - 37.2 NTU, 7.7 - 11.3 mg/l and 806 - 1940 µs/cm for air and water temperature, pH, turbidity, dissolve oxygen and electrical conductivity, respectively.Study results showed that mean of heavy metals concentrations (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) were 1.51 µg/L, 301.10 µg/L, 18.18 µg/L, 29.03 µg/L, 171.40 µg/L and 43.03 µg/L, respectively in dissolved water and they were within permissible limits for Iraqi standard specifications exceptions of Cr and Pb. While the total of heavy metals in Tigris River water average was 5.30 µg/L, 461.60 µg/L, 32.03 µg/L, 79.99 µg/L, 221.46 µg/L and 126.63 µg/L, respectively and they were within permissible limit for Iraqi standard specifications exceptions of Cd, Cr and Pb.In sediment samples, mean of heavy metals concentrations were 7.38 mg/kg, 164.94 mg/kg, 39.41 mg/kg, 84.89 mg/kg, 71.52 mg/kg and 128.73 mg/kg, respectively. While the ranges of bioavailability for Cd, Cr, Cu, Ni, Pb and Zn in sediments of Tigris River are (ND - 0.32), (0.39 - 3.42), (0.89 - 3.19), (0.42.2.84), (0.78 - 5.04) and (0.86 - 17.18) mg/kg, respectively.Severity of river water pollution with studied heavy metals were assessed by using Pollution Index (PI) which showed that the degree of pollution by heavy metals in the water samples moderates contamination for the sites in the following order : 3>2>1.Also, pollution of river sediments in the studied heavy metals were assessed by using sediment pollution indices such as geo - accumulation index (I - geo), pollution load index (PLI), contamination factor (CF), contamination degree (Cd) and enrichment factor (EF).Related with the assessment of sediments pollution by using the ecological indices, the results of geo - accumulation index (I - geo) for studied heavy metals cleared that the studied sites unpolluted with Cu and Zn, while strongly to extremely pollute with Cd while the Igeo values of Pb show moderately polluted degree and unpolluted to moderately polluted degree with Cr and Ni. The values of pollution load index (PLI) showed that all sites are polluted with total studied metals (PLI value of > 1).Results of contamination factor (CF) observed that all the sites recorded very high contamination with Cd , while low contamination with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate contamination with it, and recorded moderate contamination with Cr, Cu and Ni in all sites, while the sediments recorded considerable contamination with Pb in all studied sites. According to the result (Cd) indicates that all studied sites showed very high degree of pollution with studied metals. As well as, the enrichment factor results (EF) showed that all sites can be classified as extremely high enrichment with Cd, moderate enrichment with Cr, Cu and Ni, significant enrichment for Pb and minimal enrichment with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate enrichment.The results showed that BCF &BSF values in all plants were more than 1 and this can be considered that plants can be a good bio - indicator for all the heavy metals studied in study area, also BCF values for all elements were more than (BSF) values in all plants samples which lead to plant samples bioaccumulation source with these metals was from water.

الكشف الجزيئي عن انواع البكتريا وفايروس التهاب الكبد المرتبطين مع بيتا - ثلاسيميا Molecular Detection of Bacterial and Hepatitis Virus Types Associated with ? - Thalassemia

اسم المؤلف: شـهـد رعـد مزعـل
اسم المشرف: اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة التحري عن انواع الاصابات البكتيرية والالتهاب الكبد الفايروسي المرتبط بمرض الثلاسيميا نوع الكبير ومقارنتها مع الاشخاص المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير.لغرض التشخيص انواع البكتيريا جمعت نوعين من عينات من مرضى الذين راجعوا مستشفى ابن بلدي.عينات الادرار تضمنت (41عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و18من المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير) وعينات الدم تضمنت (25عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و25عينة من المرضى غيرمصابين بثلاسيميا نوع الكبير). اعتمادا على تحديد الصفات الزرعية للمستعمرات والصفات المورفولوجية للخلايا البكتيرية ومن ثم الصفات الكميوحيوية كما امكن تشخيص العينات باستخدام .VEKIK2systemاظهرت النتائج التشخيص في عينات الادرار في المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير ان بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 25% بينما انواع اخرى من بكتيريا ظهرت بنسبة 6% ,5% ,3% ,3% ,2% ,2% ,2% ,2%, 1.3% لبكتيريا klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia على التوالي. بينما من جانب اخر كانت نتائج التشخيص عينات الادرار لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير حيث كانت بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 28% بينما ظهرت نتائج الانواع بكتيريا الاخرى بنسبة 12% ,7% ,5% ,3% ,4% ,4% ,4% ,4% ,4% على التوالي لبكترياklibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp ..اظهرت نتائج تشخيص عينات الدم ان بكتيريا الاكثر تواجدا في المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير والمرضى غيرمصابين بثلاسيمميا النوع الكبير كانتEscherichia coli 24% ,15% على التوالي. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 6% ,3% ,5%, 5%,5% ,3% ,2% ,2%, 2% على التوالي لبكتيريا streptococcus pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 7%, 5%, 3.2% ,3.2% ,3.2%3.2%, 3.2%, 3.2%,3.2% على التوالي لبكتريا sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca,proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea.spp. اما بالنسبة لتاثير بعض المضادات الحيوية على بكتيريا Escherichia coli فقد اظهرت النتائج اختبار الحساسية لمضادات باستخدام VITKE 2 systemمقاومة هذه العزلات امبسلين (98%) وسيفاتريكسون (95%) السبروفلوكساسين (46%) السيفوتازيديم (44 (%والاموكسيسيلين (43% (والسيفوتاكزيم (40%) وليفووكساسين) 78%) والنالدكسك اسد (50%) ميثوبريم (27%) سيفابيم (40%) اكستابنيم (20%).استعملت طريقة التحليل الجزيئي PCR analysis للكشف عن عوامل الفوعة الجينية والمقاومة والتقارب الوراثي التي تمتلكها بكتيريا Escherichiacolii ، وباستخدام بادئات متخصصة لكل من الجين الخاص بالاهداب من النوع الاول (fimH) والجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII). وجين خاص بتحلل الدم (hly) وجين خاص بالالتصاق (eae) وجين خاص ب لمقاومه مضاد حيوي ((bla - cmy2 كانت النتائج ان جين (fimH) بنسبة (58%) ، فيما كانت نسبة الجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII) (58%) بينما جين خاص بالالتصاق (eae) كانت نسبة (20%). ونسبة جين خاص بتحلل الدم (hly) (28%), ونسبة الجين خاص بمقاومة المضاد الحيوي ((bla - cmy2 كانت (83%) بينما كانت نسبة ظهور كل جينات) 5.7%), وكانت نتائج الجين الخاص بتقارب الوراثي (Box) (58%).ولغرض دراسة الاصابات الفايروسية مرتبطة بمرض ثلاسيميا النوع الكبير وباستخدام تقنية ELSLA جمعت عينات الدم (88 من المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير و62 من مرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير) تم جمع العينات من مركز الوطني لنقل الدم لتحري عن وجود الالتهاب الكبد الفايروسي نوع ( CوB) حيث كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (B) لدى المرضى مصابين مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (17%) بينما كانت نسبة لدى المرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (16%).بينما كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (C) (82.9 %) ,(8 ,83%) لدى مرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبيرو غير مصابين بثلاسيمياالنوع الكبير على التوالي . | This study was carried out to detect the types of bacterial and viral infections which associated with β thalassemia major comparison to non thalassemic patients group.For Bacterial types identification two different kinds of samples were collected from Ibin ALBalady hospital. Urine samples which included (41from thalassemic patients and 18 from non thalassemic patients) and blood sample which included (25 from thalassemic patients and 25 from non thalassemic patients) depending on their cultural, morphological as well as biochemical characterization. The result identification that in urine sample showed that was most prevalent kind was Escherichia coli with percentage 25%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 6%, 5%, 3%, 3%, 2%, 2%, 2%, 2%, and 1.3%. Klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia respectively. While, on other hand, in non thalassemic patients the result identification that in urine sample the most prevalent kind was Escherichiacoli with percentage 28%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 12%, 7%, 5%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4% for klibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively. The result for blood sample identification also showed that the Escherichia coli was most common in thalassemic and non thalassemic patients it with a percentage 15%, 24% respectively, and other types bacteria were also obtain with a percentage 6%, 3%, 5%, 5%, 5.3%, 2%, 2%, 2% for , sterptococcus pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively from thalassemic patients and other types bacteria were obtain from non thalassemic with a percentage 7%, 5%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3% for sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp receptivity, and the results confirmed by identification VITEK 2 system kit. The VITEK 2 SYSTEM Antibiotics sensitivity test kits results revealed that Escherichiacoli were resistance to following antibioses Ampcilin (98%), Cefatriaxone (95%), Ciprofloxacin (46%), Cefipime (74%) Liovfaxacin (78%), Tetracylin (70%), Cefotaxim (40%), Aomxcilin (43%), Nalidexic acid (50%), Extapenem (20%), ceftazidime (44%). Moreover, low percentage of resistance was shown to, extapenem (20%) Trimethoprim (27%). PCR Methods used of molecular diagnosis of virulence genes, resistance, genotyping genes of E. coli by using specific primers to type 1 fimbria gene (fimH) and capsule gene (kpsMTII), hemolysin (hly), intimin (eae), ceftriaxone (bla - cmy2). PCR results the presence fimH (58%) and kpsMTII (40%) while hly (28%), eae 25%, (bla - cmy2) (83%). While the prevalence of all genes together with a percentage (7.5%) The results of box - PCR genotyping was 80%. To study the viral infection which associated with β thalassemia major by used ELSLA technique sample (88 from thalassemic and 62 from non thalassemic patients) were collected from Iraq National blood bank. For detection of HBS and HCV the result showed that HBS17% in thalassemic patients while in non thalassemic patients was16% while HCV were (82.95%), (83.87%) is percentage thalassemic patients receptivity

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

اسم المؤلف: شذى فارس طارق
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

الكشف عن انواع الجنس Fusarium المنتج للفيومنسين ب1 على حبوب الذرة الصفراء باستخدام الطرائق الجزيئية ودراسة تاثيراته المرضية النسيجية على الفئران البيض Detection of Fusarium Species Producing Fumonisin B1 on Maize Using Molecular Methods and Study Its Histopathological Effects on Albino Mice

اسم المؤلف: سيناء وليد محمد سعيد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب سالم رشيد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص انواع الجنس Fusarium المرافقة للذرة وقابليتها على انتاج السم FB1 باستخدام الطرق التقليدية والجزيئية. كما تم دراسة الظروف المثلى لانتاجه فضلا عن تاثيره على انسجة الكبد والكلية والطحال وقياس انزيمات الكبد والطحال في ذكور الفئران المجرعه فمويا بالسم.تم جمع ثمانية وثمانين عينة ذرة للفترة ما بين تشرين الثاني 2013 واذار 2014 من الاسواق المحلية ومخازن الحبوب في بغداد (35 عينة ذرة من مخازن الحبوب و53 عينة من الاسواق المحلية) كما وتم الكشف عن الفطرين المنتجين للفيومينيسين وهما Fusarium verticillioides وF. proliferatum باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة (PCR) وتقنية فصل الصفائح الرقيقة (TLC) وتقنية الاليزا.(ELISA) وكانت النتائج كما ياتي : 1. الاجناس الفطرية المعزولة من الذرة هي : الفطر Aspergillus وكان الاكثر سيادة (58.6%) تليه الفطرياتFusarium (17.5%) ثم Rhizopus (6.7%), Alternaria (6.1%), Mucor وPenicillum (3.9%), Bipolaris (1.9%) وTrichthecium (1.2%).2. النوع الاكثر سيادة ضمن جنس Fusarium كان F. verticillioides (70.64%) 3. اظهرت النتائج باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة المتسلسلة (species specific PCR) ان من بين سبعة وسبعين عزلة, فقط ثلاثة عشر عزلة تعود للجنس F. verticillioides ومن بين تسع عزلات فقط عزلة واحدة تعود للجنس F. proliferatum.4. تمتلك جميع عزلات F. verticillioides الثلاثة عشر الجين fum1 وبذلك يعد المنتج الرئيسي للسم FB1 مقارنة مع عزلة F. proliferatum التي لم تمتلك الجين.5. من بين العزلاتF. verticillioides الثلاثة عشر, كانت العزلة FV1 هي الاكفا في انتاج FB1 (175.39 جزء في البليون) على وسط فطيرة الذرة بينما تراوح تركيز السم FB1 لبقية العزلات يتراوح بين (21.31 - 170.51 جزء في البليون).6. كانت نتائج الظروف المثلى لانتاج السم FB1 هي وسط فطيرة الذرة وفترة حضانة 21 يوم ودرجة حرارة مثلى 20ºم.7. حددت الجرعة القاتلة المتوسطة (LD50) للسم FB1 لذكور الفئران وهي 1800 جزء في البليون.8. لوحظت زيادة في تركيز انزيمات الكبد والكلى للفئران بعد تجريعها فمويا بالسم FB1 عند التركيزين 800 و1200 جزء في البليون مقارنة مع مجموعة السيطرة.9. كشفت النتائج ان التغيرات في انسجة الكبد والكلى والطحال للفئران المجرعه فمويا بالسم FB1بالتركيزين 800 و1200 جزء في البليون، ظهرت زيادة التغيرات 10. التنكسية والموت المبرمج للخلايا مقارنه مع مجموعة السيطرة. | The study aimed to identify Fusarium species associated with maize grains and their ability to produce Fumonisin B1 using traditional and molecular methods. The optimal conditions of FB1 production were assayed. The effect of FB1 on liver, kidney and spleen tissues of albino mice were studied and measured its effects on enzymes in affected liver and kidney.Eighty - eight maize samples were collected between November 2013 and March 2014 from local markets and silos of Baghdad province (thirty - five from silos and fifty - three from markets). Fusarium verticillioides and F. proliferatum were investigated and their ability to produce Fumonisin B1 was detected using : Polymerase chain reactions (PCR), Thin layer chromatography (TLC) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) techniques. The following results were obtained from the current study : 1. The fungal genera isolated from maize were : Aspergillus (58.6 % ) followed by Fusarium (17.5% ), Rhizopus (6.8 %), Alternaria (6.1 %), Mucor and Penicillium (3.9 %), Bipolaris (1.9 %), and Trichothecium (1.2%).2. The predominant species among Fusarium was F. verticillioides (70.64%).3. The use of species specific PCR reactions for Fusarium species revealed that out of seventy seven isolates, thirteen isolates only belong to F. verticillioides and out of nine isolates, one isolate only belong to F. proliferatum.4. All the thirteen F. verticillioides isolates were shown to possess fum1 gene (FB1 producer), whereas the F. proliferatum isolate was shown not to possess this gene. 5. Among the thirteen isolates of F. verticillioides, FV1was the most efficient one in production of FB1(175.39 ppb) on patty maize medium, while the concentration of FB1 for other isolates ranged between (21.31 - 170.51) ppb. 6. The optimum culture conditions for FB1 production using solid state fermentation included : patty maize medium with incubation period 21 days at 20ºC. 7. The median lethal dose 50 (LD 50) of FB1for male mice was 1800ppb.8. liver enzymes (AST, ALT, ALP) and kidney functions (Creatinine and Blood urea) were increased in male mice which were orally gavaged FB1 at 800 and 1200ppb concentrations comparing with control group.9. The histopathological changes in the liver, kidney and spleen of orally gavaged mice by FB1 at 800 and 1200 ppb, showed a significant increase degenerative changes and apoptotic cells in comparison with control group

الكشف عن السمية الوراثية لمستخلصات نبات الحرمل Peganum harmala L . باستعمال بعض المؤشرات الخلوية والجزيئية Detection of genetoxic effect of Peganum harmala L. extracts by using some molecular and cytogenetic markers

اسم المؤلف: سيف محمد ابراهيم
اسم المشرف: نضال نعمة حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Evaluation of genetoxicity of the aqueous and alcoholic extracts of Peganum harmala L. seeds was assayed in onion roots Allium cepa as a biological system. Onion roots were subjected to different concentrations of aqueous and alcohol extracts (10,25,50,100,200%) V/ W for different periods( 24,48,72) hrs in order to study the effects of these extracts on onion′s root growth and some cytological properties included, (Mitotic index, phase index, proportion and types of chromosomal aberrations), as well as to assess the effect of these extracts on the DNA of onion roots using Random amplification polymorphic DNA (RAPD) technology.The results revealed that all harmala seeds extracts the aqueous and alcoholic caused a significant reduction of onion root growth, the reduction was positively proportional with the increasing concentrations of the extracts. The half maximal effective Concentration (EC50) against onion′s root growth was 50% in the case of using the aqueous extract while it reached 25% in the case of alcoholic extract. This result indicate the efficiency of the alcoholic extract over the aqueous extract on onion′s root growth.Results also showed that both harmala seeds extracts resulted in significant reduction of the mitotic index (MI) of onion′s roots tips compared with the control treatment .The reduction of the MI was also positively proportional with the increasing concentrations of the extracts .Although MI was not affected by the increase in duration of exposure .Therefore ,since the concentration 100% and 25% of the aqueous and alcoholic extracts respectively lowered the MI to nearly 50% compared to the control, they were considered sub lethal, whereas the concentration 200% of both extracts which caused a reduction of the MI to nearly 22% compared to control treatment was considered as lethal concentrations. The results showed a significant reduction prophase and significant increase of metaphase in onion′s root cells due to the treatments with both extracts. Moreover high percentages of chromosomal aberrations were alsodetected, and these aberrations were also positively associated with the increasing concentration and exposure periods. to The most frequent abnormalities were (Chromosomes stickiness, Chromosomal bridges , Chromosome disturbance and C - mitosis) .Moreover some other infrequent chromosomal abnormalities were also appeared such as ( Lagging chromosome ,Star anaphase, Shifting of poles, Polyploidy).The effect of both harmala seeds extracts was tested on DNA of onion′s roots using a random amplification polymorphic DNA (RAPD). Out of ten random primers used, seven were gave multiple bands for all studied, samples with molecular weights ranged between (90 - 1400) base pair .The results of random amplification showed that all harmala extract concentrations tested caused damage to DNA which mutations revealed as loss of a single or more band, or appearing of new bands. Additionally the total lost and gained band in samples treated with alcoholic extract reached 43 bands compared to the samples treated with the aqueous extract which revealed 35 bands , This result indicate the effectiveness of the alcoholic extract over the aqueous in it′s effect on DNA of onions roots. Furthermore, The results showed that the total number of the gained bands was more than that of the lost ones for both extracts with most primers used . The total numbers of the new bands in the samples treated with the aqueous extract were 27 bands whereas 32 bands , with alcoholic extract. However ,the total number of lost bands in samples treated with aqueous extract were 8 bands compared to 11 bands with alcoholic extract.The percentage of the genomic template stability (GTS% ) was lowered initially from the concentration 10% for both extracts ,this reduction was negatively associated with the increasing concentrations of the extracts, indicating the existence of great damage to the DNA with the increasing concentrations of the extract. The decrease of GTS in samples treated with alcoholic extract was more than that with the aqueous extract. A highest reduction 78.56% was detected at concentration 25 and 200 % in samplestreated with the aqueous extract, whereas a higher reduction 69.03% was recorded lower at concentration 50% in samples treated with alcoholic extract.Genetic dendrogram of samples treated with exposed to harmala seeds extracts in addition to the control using Jaccard coefficient of genetic variation and based on RAPD results showed segregation of onion samples treated with aqueous extract from samples treated with aqueous extract from samples treated with alcoholic extract, as well as segregation of the control treatment in a single group, this result confirms the great damages of onions root DNA when treated with harmala seed extracts..

انتاج الليفان من البكتريا المعزولة من تربة الجذور وتقييم العوامل المؤثرة على انتاجه Levan Production by Bacteria Isolated from Rhizosphere Soil and Evaluation of Factors Affecting its Production

اسم المؤلف: سناء بشير كاظم
اسم المشرف: صفاء الدين احمد شنتر القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر منطقة التربة المحيطة بالجذور مصدرا مهما للعديد من الاحياء المجهرية مثل الفطريات والبكتريا والبكتريا الخيطية. في الدراسة الحالية، تم عزل البكتريا المنتجة لليفان من التربة المحيطة بالجذور. حيث تم الحصول على 15 عينة من التربة المحيطة بجذور البقوليات ( الباقلاء واللوبيا ) خلال الفترة بين تشرين الاول 2014 الى كانون الثاني 2015، من ثلاث مزارع للبقوليات في ناحية كنعان، محافظة ديالى. تم عزل 52 عزله من بكتريا الجذور (الرايزوسفير) واختبرت لمعرفة قابليتها لانتاج الليفان وذلك بالاعتماد على نمو المستعمرات المخاطية عند تنمية هذه البكتريا على وسط الاكار المغذي الحاوي على السكروز. وقد اظهرت النتائج مقدرة 36 عزلة بكتيرية جذرية على انتاج الليفان من المجموع الكلي للعزلات. شخصت العزلات الاربع الاكثر كفاءة لانتاج الليفان ووصفت بواسطة الفحوصات المظهرية والبايوكيميائية القياسية والاختبارات على المستوى الجزيئي. تم اجراء التشخيص الجزيئي لهذه العزلات الاربعة باستخدام 16S rDNA والتي اظهرت ان طول تسلسل المنطقة كان (946، 1056، 1064و1154) زوجا قاعديا للعزلات (2، 3، 23 و33) على التوالي. ان محاذات التسلسل في بنك الجينات اظهر ان العزلات الاكثر كفاءة كان لديها نسبة عالية من التشابه (98، 96، 98 و99) % على التوالي وتبعا لاقرب جار تطوري لهذه العزلات, تم التعرف عليها تبعا لتتابع جين (16S rRNA) وتبعا للفحوصات الشكلية والكيموحيوية , وشخصت على انها (Brachybacterium phenoliresistens، Elizabethkingia anophelis، Arthrobacter globiformis، Pseudomonas brassicacearum) على التوالي. تم تشخيص الليفان المنتج من هذه العزلات الاربعة باستخدام تقنية TLC والتي اظهرت تكون الليفان من نوع واحد من السكريات الا وهو الفركتوز. وقد تم تشخيص الليفان المنتج بواسطة بكتريا B. phenoliresistens باستخدام تقنيتي FTIR وتقنية الرنين المغناطيسي النووي NMR. تحليل الليفان بواسطة هاتين التقنيتين اثبتت انتاج الليفان بواسطة هذه العزلة. تم دراسة تاثير العوامل الغذائية والفيزيائية على انتاج الليفان بواسطة العزلات الاكفا. كان مصدر الكاربون الامثل لانتاج الليفان بواسطة هذه العزلات هو السكروز، حيث كان انتاج هذه العزلات هو 7.88، 7.94، 7.8 و7.77 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis، A. globiformis ، P. brassicacearum على التوالي. تم استخدام اربع مصادر مختلفة للنايتروجين لمعرفة افضل مصدر نيتروجيني لانتاج الليفان. حيث كان الكازائين هو افضل مصادر النيتروجين لانتاج الليفان حيث كان انتاج هذه العزلات 8.12، 8.2، 8.24 و8.56 غم/لتر للعينات الاربعة على التوالي. تم استخدام تراكيز مختلفة للسكروز لانتاج الليفان حيث كان اعلى انتاج لجميع العزلات عند التركيز 300غم/لتر وكان الانتاج بواسطة هذه العزلات 7.97، 7.94، 8.06 و7.95 غم/لتر على التوالي. تم استخدام قيم pH مختلفة لمعرفة افضل اس هيدروجيني لانتاج الليفان حيث كان افضل اس هيدروجيني هو 7.8 لكل العزلات، وكان الانتاج 7.88، 7.94، 7.8، 7.77 غم/لتر على التوالي. فضلا عن ذلك، تم اختبار عدة ظروف مثل فترة الحضن المثلى، درجة الحرارة، معدل الرج. كانت فترة الحضن المثلى للعزلة E. anophelis 48 ساعة حيث انتجت 8.46غم/لتر، في حين كانت 72 ساعة لباقي العزلات حيث انتجت 8.58، 8.53 و8.7 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens ، A. globiformis وP. brassicacearumعلى التوالي. درجة الحرارة المثلى لانتاج الليفان بواسطة العزلة B. phenoliresistens كانت عند 30 درجة مئوية حيث انتجت 7.87 غم/لتر، وكانت درجة الحرارة المثلى هي 33 درجة مئوية للعزلتين E. anophelis وA. globiformisحيث انتجت عندها 8.04 و8.6 غم/لتر على التوالي. في حين كانت درجة الحرارة المثلى للعزلة P. brassicacearum 40 درجة مئوية وكان انتاجها 8.24 غم/لتر. استخدمت ثلاث معدلات رج لمعرفة افضل معدل رج لانتاج الليفان. تم الحصول على اعلى انتاج لليفان عند معدل رج 150 هزه/دقيقه، حيث كان الانتاج للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis وA. globiformis هو 8.12، 8.54 و8.27 غم/لتر على التوالي. | The Rhizosphere zone is a narrow volume of soil which surrounds the plants roots and influenced by the activity and growth of the root. In the present study, Levan producing bacteria were isolated from rhizosphere soil, fifteen rhizosphere soil samples were obtained from the legumes roots cowpea and broad bean (Vinga unguiculata L. and Vicia faba) during the period from October 2014 to January 2015, which were collected from three legumes farms in Kana’an Village, Diyala Governorate. A total of 52 Rhizobacterial colonies were isolated, purified and screened for their ability to produce levan, depending on growing of mucoid colonies on sucrose nutrient agar. The results showed that thirty six isolates out of the total number of the isolates were identified as levan producers. The most efficient four isolates were identified and characterized according to standard biochemical and Molecular tests. The Molecular identification of these four isolates was carried out by using 16S rDNA, which resulted in sequenced region of 946, 1056, 1064 and 1154 base pair in length respectively. The sequence alignment in the gene bank indicated that the most efficient isolates (2, 3, 23 and 33) have high percentage of similarity (98, 96, 98 and 99 % respectively), in comparison with the retrieved consensus sequences. The closest phylogenetic neighbor for these isolates is predicted according to the 16S rRNA gene sequence, morphological and biochemical tests. These isolates were identified as (Brachybacterium phenoliresistens, Elizabethkingia anophelis, Arthrobacter globiformis and Pseudomonas brassicacearum) respectively. Levan production by these four isolates were characterized by using Thin Layer chromatography (TLC) technique, which revealed that levan is composed of only one sugar which is fructose. Levan produced by B. phenoliresistens was characterized by Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy techniques. The instrumental analysis indicated that Levan was produced by the selected isolate. The effect of some nutritional and physical factors were investigated on levan production by the highest four isolates. Sucrose was the best carbon source for levan production in all isolates that gave (7.88, 7.94, 7.8 and 7.77) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively. In addition, four nitrogen sources were used to identify the best nitrogen source for levan production. Casein was the best nitrogen source for all isolates that gave (8.12, 8.20, 8.24 and 8.56) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively,. Moreover, different sucrose concentrations were used to assess the best concentration for levan production. The highest levan yield by all isolates was at the sucrose concentration of 300 g/l, which gave (7.97, 7.94, 8.06 and 7.95) g/l respectively. Different pH values were also used to determine the best pH value for the levan production. The four isolates gave their highest levan production (7.88, 7.94, 7.80 and 7.77) g/l at pH 7.8. Further, conditions were examined like optimal incubation period, temperature and agitation rate. The optimal incubation period was 48 hs for E. anophelis that gave 8.46 g/l and 72 hs for B. phenoliresistens, A. globiformis and P. brassicacearum which gave (8.58, 8.53 and 8.7) g/l respectively. Whereas, the optimal temperature was 30ºC for B. phenoliresistens that produced 7.87 g/l , 33 ºC for E. anophelis and A. globiformis which gave (8.04 and 8.6) g/l, and 40 ºC for P. brassicacearum that gave 8.24 g/l. Three agitation rates were used to identify the best agitation rate for levan production. The highest levan production yield was obtained at 150 rpm by the isolates B. phenoliresistens, E. anophelis and A. globiformis which gave (8.12, 8.54 and 8.27) g/l respectively.

مقارنة تشخيصية جزيئية وبكتريولوجسة لبكتريا الزائفة الزنجارية المعزولة من مرضى السكري النوع الثاني وامراض اخرى Comparison the Molecular and Conventional Identification of Pseudomonas aeruginosa isolated from Diabetes Type II and other Diseases

اسم المؤلف: سناء محمد حبيب الشمري
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Fifty clinical samples suspected as Pseudomonas aeruginosa were collected from patients with different diseases, diabetic foot ulcers, U.T.I., wounds, burns, keratitis, external otitis from September 2015, till February 2016, from hospitalized patients in four different Baghdad hospitals (Al - Kindi General Teaching Hospital, Al - Yarmuk General Teaching Hospital, Alkadhmiya General Teaching Hospital, and AL - Shiakh Zaied Hospital).The study population targeted both gender from different ages groups.The collected samples were cultured on different selective and differential media and tested biochemically in order to identify P.aeruginosa, then the identification was ensured by using two molecular methods which are conventional PCR in the detection of ecfx gene and 16SrDNA gene and real time PCR with commercial kit from sacace (qualitative detection of P.aeruginosa) and with gyrB gene using specific primers to each gene.Sensitivity for each test was measured then compared with other tests to determine the test efficiency. The results showed that the sensitivity for API20NE test was (80%), the sensitivity for molecular tests as flows : ecfx test was (92%), 16SrDNA test was (96%), the commercial kit test was (98%) and for gyrB test was (92%).The present study shows that using more than one target gene is reducing the probability of misidentification of P.aeruginosa that may be caused by variation in primer or probe targets.According to the type of infection the comparison was done. The results of P.aeruginosa detection for diabetic foot isolates were compared with other isolates. The results showed that there is a remarkabledifference in the API20NE test; as well as, with the oxidase test (according to the time that oxidase test need it to give the dark purple color as a positive result), for the mucoid strains of this bacterium. The results of detection isolates by using gyrB gene were differed too.Then a comparison in simplicity, cost, accuracy and time of P.aeruginosa identification between molecular methods and API20NE test (biochemical test) and between molecular tests themselves were performed. The results of these comparisons show that the molecular methods are better than API test in all aspects of the comparison. Real time PCR is better than conventional PCR in simplicity, accuracy and time but not in cost.All isolates were tested for antibiotic sensitivity using nine antibiotics. The results showed that most isolates were sensitive to Levofloxacin (94%), Ticarcillin - clavulanic acid (Timinim) (88%), Gentamicin (82%) and (80%) to both Pipracillin and Imipenem, while the isolates appeared resistant to another antimicrobials represented by (72%) to Augmentin, (34%) to Ceftazidime, (38%) to Colistin, and (28%) to Ciprofloxacin. In the present study, Levofloxacin represents the most effective antibiotic against P. aeruginosa isolates with the all types of infection.The present study improves the importance of the rapid and accurate detection of the bacterial types and thus giving the right antibiotics to patients to obtain rapid recovery and prevent any complications that may lead to death.

تحفيز انتاج الاحماض الدهنية من الطحالب المعزولة محليا والمستخدمة للوقود الحيوي Stimulation of the Production of Important Fatty Acid from Locally Isolated Algae Used for Biodiesel

اسم المؤلف: سمارة سعد فرج حمادي
اسم المشرف: فكرت مجيد حسن ناظم حسن حيدر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل عشرة عزلات(Chrococcus disperses, Chrococcus minor, Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) من الاحواض ومن نهر دجلة في العراق . اختبرت العزلات من حيث نموها وانتاجها للدهون. اظهرت العزلات ) C.dispersus, A,augstumalis and C.vulgaris) اعلى نمو وانتاج للدهون ، لذا تم اختيارها لغرض انتاج الدهون الحيوية . حفزت العزلات المختارة بدراسة تاثير الرقم الهيدروجيني والملوحة في النمو وانتاج الدهون. بينت النتائج بان اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.dispersus بلغ 2.68 غم / لتر عند الرقم الهيدروجيني 9 ، بالمقارنة الى تركيز واطئ للدهون ( 1.78 غم/لتر) عند الرقم الهيدروجيني 5 . في حين تم الحصول الى اعلى سرعة نمو (k) واقل فترة تضاعف (G) للعزلة عند الرقم الهيدروجيني 5 . اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.vulgaris بلغ (3.45 غم/لتر) حصل عند الرقم الهيدروجيني الواطئ (pH6) ، بينما اعلى انتاج للدهون كان عند الرقم الهيدروجيني 8 . في حين اعلى نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. بالمقارنة ، حفز انتاج الدهون من قبل A.augstumalis وبلغ (2.75 غم/ لتر) عند الرقم الهيدروجيني العالي 11. اما اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون من قبل العزلة C.dispersus، حفزت بخفض تركيز الملوحة وبلغ (2.94 غم/ لتر) عند التركيز 0.4 غم/ لتر من NaCl . بالمقارنة الى اعلى نمو واقل فترة تضاعف للطحلب حصلت عند التركيز العالي للملوحة (1.5 غم/ لتر). واظهرت النتائج ايضا بان العزلة C.vulgaris قادرة الى تحمل تراكيز عالية من الملوحة اكثر من(1.5 غم/لتر)، واعلى انتاج للدهون بلغ 1.72 غم/ لتر تم الحصول عليه عند تركيز الملوحة (1 غم/لتر ). في حين اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة حصلا عند التركيز 0.8 و0.4 غم/ لتر من الملوحة على التوالي . اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون حفز من قبل A.augstumalisعند الرقم الهيدروجيني المتدني وبلغ 2.5 غم/ لتر عند التركيز 0.4 غم/ لتر من الملوحة ، بالمقارنة مع اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف حصلت عند التركيز الواطئ من الملوحة (0.021غم/ لتر). درس التاثير المشترك للرقم الهيدروجيني والملوحة في انتاج الدهون والسكر والبروتين في داخل الاحواض الزجاجية ذات سعة 5 لتر. اعلى انتاج للدهون والسكر والبروتين من قبل العزلة C.dispersusتم الحصول عليها عند الرقم الهيدروجيني ( pH9، الملوحة 0.4 غم/ لتر) وبلغ 8.4 و0.525 و0.018 غم / لتر على التوالي. في حين اقل انتاج للدهون والسكر والبروتين تم الحصول عليها عند ( pH7، والملوحة 0.075 غم /لتر ). اما في حالة C.vulgaris ، اعلى انتاج للدهون والبروتين تم الحصول عليه عند (pH6، والملوحة 0.075غم/ لتر) . في حين انتاج الدهون من قبل A.augstumalisفضل الظروف القاعدية ، واعلى انتاج للدهون حصل عند (pH11، والملوحة 0.075غم/ لتر).وبلغ 4.42غم/ لتر. اظهرت النتائج ايضا ، بان اعلى محتوى للدهون(%) للعزلة C.vulgarisبلغ 33.2% ( 0.33 غم دهن /غم من الوزن الجاف للطحلب) عند (pH7، والملوحة75 0.0 غم/لتر) ، بالمقارنة مع اقل محتوى للدهون تم الحصول عليه من قبل العزلتين C.dispersus, A.augstumalis وبلغ 16 و13.8% عندما حفزت العزلتان عند (pH11، والملوحة 0.075 غم/ لتر) و(pH9، والملوحة 0.4 غم/ لتر بالتتالي). اظهرت نتائج نتائج تحليل الدهون بجهاز GC، بان مكونات الدهون للعزلة C.dispersus عند (pH7، والملوحة 0.075غم/ لتر) تحتوي حامض الستياريك (1.09غم/ لتر)، في حين لم تظهر الدهون عندما حفز الطحلب عند (pH9 ، الملوحة 0.4غم/لتر). اما في حالة C.vulgaris تم الحصول فقط الى حامض الستياريك (9.78غم/ لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075غم/ لتر)، بينما تم الحصول الى حامض الاوليك (1.15غم/ لتر) وحامض الستيارك (1.26غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.126غم/لتر) عند المعاملة (pH6 والملوحة 0.075غم/ لتر). بالمقارنة مع مكونات الدهون المنتجة من قبل A.augstumalisاحتوت حامض الاوليك (1.12غم / لتر) وحامض الستياريك (0.17 غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.082غم/لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075 غم/ لتر). بينما احتوت الدهون فقط حامض الستياريك (3.96 غم/ لتر ) عندما حفز الطحلب عند المعاملة (pH11 والملوحة 0.075غم/ لتر). | Ten microalgae isolates (Chrococcus dispersus, Chrococcus minor ,Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) were isolated from ponds and Tigris river in Iraq. The isolates were screened for growth and lipid production, the isolates C.dispersus, A.augstumalis and C.vulgaris exhibited higher growth rate and lipid production. Therefore, these isolates were selected for the purpose of algae biodiesel production. The selected isolates were stimulated by studying the effect of different levels of pH and salinity on growth and lipid production. The results showed higher lipid production by C.dispersus which reached (2.68g/l) at pH value of 9, in comparison to lower lipid concentration of (1.78g/l) at pH5. While higher growth rate (K) and shorter doubling time (G) were observed at pH5. The lipid production by C.vulgaris reached maximum of (3.45g/l) at lower pH 6, while, minimum lipid production was observed at pH8. Also, higher growth rate and shorter doubling time were recorded at pH5. In comparison, lipid production was stimulated by A.augstumalis and reached (2.75g/l) which was obtained at pH value of 11. However, higher growth rate and shorter doubling time were observed at pH5. Results also had showed that lipid production by C.dispersus was stimulated by decreasing salinity concentration and reached maximum of (2.94g/l) at 0.4 g/l of NaCl. In comparison higher growth rate and shorter doubling time of algae were observed at higher salinity concentration of 1.5g/l. The results also showed that the isolate C.vulgaris was able to tolerate salt concentration up to 1.5 g/l, maximum lipid production was obtained (1.72 g/l) at salt concentration of 1g/l. While, higher growth rate and shorter doubling time were observed at (0.8 and 0.4 g/l) of salinity, respectively. The results also exhibited that lipid production was stimulated by A.augstumalis at lower salinity level and reached maximum of (2.5 g/l) at 0.4 g/l of salinity, in comparison to higher growth rate and shorter doubling time recorded at lower salinity concentration of 0.2g/l. The combined effect of pH and salinity together on lipid, carbohydrate and protein production were studied, the experiments were carried out in 7.5 liter glass pools. Maximum lipid, carbohydrate and protein concentration of C.dispersus were observed at (pH9 and salt 0.4g/l) and reached (8.43, 0.525 and 0.018g/l), respectively. While, minimum concentration of lipid, carbohydrate and protein production was observed at (pH7 and salt 0.075g/l).In case of C.vulgaris, higher total lipid production and protein was obtained at (pH6and salt0.075g/l).While, lipid production in microalgae A.augstumalis was favored by alkaline condition and maximum lipid production was observed at (pH11 and salt 0.075g/l) and reached 4.42 g/l. The results also reevaluated that the higher oil content was observed in A.augstumalis reached 16% (0.16 g of oil/ g of dry algal biomass) at (pH11 salt 0.075g/l), in comparison to lower oil content (%) observed with C.dispersus and C.vulgaris which reached (13.8 and 11.21%) when stimulated with (pH9 salt 0.4g/l) and (pH6 salt 0.075g/l), respectively. Analysis of lipid content by GC instrument, had shown that the lipid content of algae C.dispersus at (pH7 salt 0.075g/l), contained only stearic acid (1.09g/l) while, no lipid was detected when algae were stimulated at (pH9 salt 0.4g/l). In case of C.vulgaris only stearic acid (9.78g/l) was found at treatment (pH7 salt 0.075g/l) while, oleic acid (1.15 g/l), stearic acid (1.26 g/l) and palmitic acid (0.126 g/l) were observed. At treatment (pH6, salt 0.075g/l).In comparison, lipid content produced by A.augstumalis included, oleic acid (1.12 g/l), stearic acid (0.17 g/l) and palmitic acid (0.08 g/l) found in treatment (pH7 salt 0.075 g/l). While, lipid content was only Stearic acid (3.96g/l) when the algae were stimulated at (pH11 salt 0.075 g/l.

تقييـم كفاءة وحـدة المعالجـة فـي شركـة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتريا في الازالة الحيوية لعنصري النحاس والرصاص Evaluating the Efficiency of Treatment Unit in Diyala Electrical Industries Company and Use of Bacteria in the Vital Element for the Removal of Copper and Lead

اسم المؤلف: ساهرة حسين حسن الخالدي
اسم المشرف: فكرت مجيد حسن عدنان نعمة عبد الرضا
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت هذه الدراسة تقييم كفاءة محطة معالجة مياه الصرف الصناعي والمنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية واستخدام البكتيريا المعزولة من المحطة للمعالجة البيولوجية. اخذت العينات شهريا من المحطة قبل المعالجة وبعدها للمدة من تشرين الثاني 2014 الى اذار .2015 وتم قياس بعض العوامل الفيزيائية مثل : درجة الحرارة والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) والتوصيل الكهربائي(EC) والملوحة. كما تم قياس تراكيز خمسة معادن ثقيلة وهي الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك .اظهرت النتائج وجود فرق معنوي قبل المعالجة وبعدها لدرجة الحرارة في كانون الاول عام 2014 فقط ، وقد تراوحت قيمها بين17.7م° في شباط 2015 الى 29.1مº في كانون الاول 2014 قبل المعالجة و16.6 ºم الى 26.01 مº في شباط 2015 وتشرين الثاني 2014، على التوالي. في حين لم يسجل قيم الاس الهيدروجيني فروق معنوية في جميع مرحل الدراسة قبل وبعد عملية المعالجة، اذ تراوحت القيم على النحو الاتي : 7.4 - 6.8 ( قبل ) في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي,) 7.01 - 7.8 بعد( في كانون الاول 2014 واذار 2015 على التوالي.سجلت النتائج ارتفاع تركيز الاوكسجين المذاب في وحدة المعالجة في مراحل الدراسة كلها، الا في شباط 2015، وتراوحت تراكيز الاكسجين المذاب 5.5 - 2.8جزء بالمليون في اذار 2015 وشباط 2015 و7.8 - 3.95جزء بالمليون في شباط 2015 وكانون الاول 2014 قبل المعالجة وبعدها على التوالي. كما لحظ انخفاض المتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD) والمتطلب الكيميائي للاوكسجين (COD) بعد المعالجة فتراوحت تراكيزهما 144 - 13) ) جزء بالمليون بالنسبة لقيم COD و(39.9 - 0) جزء بالمليون لقيم BOD . سجلت النتائج انخفاضا في قيم التوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰) في كانون الاول 2014 وشباط 2015 فقط، وتراوحت قيم التوصيلية الكهربائية على النحو التالي(1547 - 209) مايكروسمنز/سم قبل المعالجة و(448 - 1218) مايكروسمنز/سم بعد المعالجة. اما بالنسبة لقيم الملوحة فتراوحت بين ( 0.12 - 0.96) جزء بالالف قبل المعالجة و(0.27 - 0.75) جزء بالالف بعد المعالجة. لم يسجل فرق معنوي كبيرلتراكيزالعناصر الثقيلة المدروسة, اذ سجلت اعلى تراكيز لها ( 0.53و 0.99 و0.68و 0.7و(0.25 جزء بالمليون لمعادن الرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك قبل المعالجة. في حين كانت تراكيزها بعد المعالجة ( 0.45و 0.41 و0.7 و0.7 و0.36) جزء بالمليون للرصاص والكادميوم والحديد والنحاس والزنك.تم عزل 60 عزلة بكتيرية من محطة المعالجة واستعملت ثلاثة انواع من البكتريا المعزولة وهي Pseudomonas aeruginosaوEscherichia coli وSulfate Reducing Bacteria. واستعملت في المختبر كعامل امتزاز , كما استعملت تراكيز مختلفة من الرصاص والنحاس100)و 150 و200) جزء بالمليون لاختباركفاءة امتزاز البكتريا المعزولة. فضلا عن ذلك تم اختبار تاثير ثلاثة عوامل مؤثر في امتزاز الرصاص والنحاس وهي الحرارة 25) و30و 37) مº ومستويات مختلفة من الاس الهيدروجيني (3و4.5 )، فضلا عن مدة التماس استخدمت مدتين ( 2 و24 ) ساعة .تم الحصول على نسب عالية لامتزازالرصاص وكما ياتي 95% و95.3% و99.7% للبكتريا E.coli , P. aeruginosaو SRBعند37مᵒ على التوالي. بينما كانت نسب امتزاز النحاس 40.63% و% 50.51و %80.57 للبكتريا E.coli , P. aeruginosa وSRB. عند درجة حرارة 37مº, على التوالي. اظهرت E.coli نسبا مختلفة من الامتزاز للمعادن تراوحت من 6.4% الى 95% في تركيز الرصاص من100 و200 جزء بالمليون وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 لكل من فترات التماس 2 و24 ساعة على التوالي . في حين تراوح امتزاز النحاس من3.5% الى %40.63 في 100 و200 جزء في المليون عند اس هيدروجيني 4.5 وخلال مدة تماس 2 و24 ساعة , على التوالي .حققت P. aeruginosa امتزازا على النحو الاتي : تراوح امتزاز الرصاص من 1.39٪ في التتركيز150 جزء في المليون الى 97.9٪ في200 جزء في المليون عند قيمة الاس الهيدروجيني3 وبفترات تماس 2 و24 ساعه على التوالي. اظهرت SRB فعالية امتزاز اكبر من الانواع البكتيرية الاخرى المستخدمة في الدراسة, وقد تراوح امتزاز الرصاص من 14.97% بتركيز 100 جزء من المليون وقيمة الاس الهيدروجيني ولفترة تماس 24 ساعة الى 99.32% في تركيز الرصاص200 جزء في المليون وقيمة الاس الهيدروجيني 3 وبفترة تماس 2 ساعة. سجلت النتائج وجود فروق معنوية في درجات الحرارة عند استخدام بكتيريا SRB في امتزاز النحاس الرصاص.واظهرت النتائج اعلى نسبة امتزاز عند 200 جزء بالمليون للعناصر كلها كما اظهرت ان هذا النوع من البكتريا قادرة على امتزاز الرصاص بمعدلات اعلى من النحاس . وفضلا عن ذلك، تم تسجيل زيادة امتزاز المعادن في درجة حرارة 37مᵒ وقيمة الاس الهيدروجيني 4.5 وعند مدة تماس 2 ساعة لانواع البكتريا التي شملتها الدراسة. وسجلت انواع البكتريا لمعزولة تباينا في كفاءة الامتزاز للعناصر , اذ كانت كفاءة امتزاز Sulfat Reducing Bacteria اعلى من P.aeruginosa وE.coli ، بينما كانت كفاءة امتزاز P.aeruginosa اعلى من E.coli.كشفت الدراسة ان محطة المعالجة ليست فعالة لازالة المعادن الثقيلة من مياه الصرف الصناعية والاستخدام المنزلي في شركة ديالى للصناعات الكهربائية لذا تحتاج المعالجة البايولوجية اضافة انواع من البكتريا قيد الدراسة والتي اثبتت كفاءتها في ازالة المعادن الثقيلة اذا تبين من الدراسة ان SRB هو البكتيريا الاكثر فعالية لازالة عنصري النحاس والرصاص من محاليلها المائية تليها بكتريا P.aeruginosa. | This study is conducted to evaluate the efficiency of plant treatment of the industrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries, and to use the isolated bacteria from the treatment plant for bioremediation. Sampling were taken monthly from pre and post - processing treatment during the period from November, 2014 to March, 2015. Some physicochemical factors were taken such as : temperature, pH, dissolved oxygen, Biological oxygen demand (BOD), chemical oxygen demand (COD), electrical conductivity, and salinity. In addition, the concentration of five heavy metals was determined such as : lead (Pb), cadmium (Cd), iron (Fe), Copper (Cu) and Zinc (Zn). Temperature of wastewater in treatment plant showed only a significant difference between temperature before and after treatment in December, 2014, it's values were ranged between 17.7°C in February 2015 to 29.1°C in December 2104 before the treatment, and 16.6°C to 26.01°C in February 2015 and November 2014, after treatment. Whereas, pH was not significant in all study periods before and after treatment process. Its values were ranged as follows : 6.8 - 7.4 (before) in December 2014 and March 015, respectively and 7.01 - 7.8 (after) in December 2014 and March 2015, respectively. Dissolved oxygen concentration was raised after treatment process during all the study periods, except in February2015, the concentrations of dissolved oxygen were ranged 2.8 - 5.5ppm in March 2015 and Februray 2015 and 3.95 - 7.89ppm in February2015 and December 2014 before and after treatment process, respectively. Biochemical oxygen demand (BOD) and Chemical Oxygen demand (COD) concentrations were decreased after treatment, their concentrations were ranged from 13ppm to 144ppm (COD) and 0 - 39.9ppm (BOD), the lowest values refer to after and the highest values were before treatment process. Electrical conductivity (EC) and salinity (S‰) values were decreased only in December 2104 and February 2015, they were ranged as follows : 209 - 1547 ϻS/cm (before the treatment), 448 - 1218 ϻS/cm (after the treatment) for EC, 0.12 - 0.96 ϻS/cm (before the treatment), and 0.27 - 0.75 ϻS/cm (after the treatment) for S‰, spectively. All heavy metals concentrations were not effected scientifically by the treatment. Maximum concentrations (ppm) of these metals were 0.53, 0.99, 0.68, 0.7, 0.25 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn before the treatment. While their concentrations (ppm) after the treatment were 0.45, 0.41, 0.7, 0.7 and 0.36 for Pb, Cd, Fe, Cu and Zn. Sixty isolates of bacteria were isolated from the treatment plant. Three isolated bacteria (Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Sulfate Reducing Bacteria) were used in the laboratory as an adsorbed factor. Different concentrations of Lead and Copper (100, 150 and 200 ppm) were used to investigate the potential adsorption of these isolated bacteria. In addition, three factors affecting lead and copper adsorption were studied. Different temperatures (25, 30, 37 °C), different levels of pH (3 and 4.5), and two contact time (2 and 24 hrs) were used in these experiments. Maximum adsorption of Lead were obtained for about 95%, 95.3% and 99.07% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. While Copper adsorption were 40.63%, 50.51% and 80.57% by E. Coli, Pseudomonas aeruginosa and SRB at 37°C, respectively. E. coli has attained different percent of metals adsorption. The adsorption was varied from 6.4% to 95% in lead concentration of 100 and 200 ppm at pH 4.5 for both values for 24hrs and 2hrs, respectively. While the Copper adsorption ranged from 3.5% to 40.63 in 100 and 200ppm at pH4.5 for 24hrs and 2hrs, respectively. P. aeruginosa has achieved the adsorption as follows : Lead adsorption was ranged from 1.39% (in lead concentration 150ppm) to 97.9% (in 200ppm) at pH3 for 24hrs and 2hrs contact time, respectively. SRB has more action in adsorption than other bacteria in this study. The adsorption of lead was ranged from 14.97% in 100ppm of its concentration at pH3 for 24hrs contact time to 99.32% in 200ppm of Lead concentration at pH3 for 2hrs contact time. The results recorded significant differences in temperature when sulfur bacteria was used in the adsorption of lead and recorded significant difference in the adsorption of copper. For heavy metals concentration, the results recorded the highest percentage adsorption at 200ppm concentration for both elements, also results showed that the type of bacteria were able to adsorb lead at higher rates than copper. Moreover, increased adsorption of metals was recorded at high temperature and pH4.5 for a 2hr contact time by the studied bacteria. The three isolated bacteria were varied in their abilities to adsorbed elements, the results recorded the adsorption efficiency of sulfat reducing bacteria was higher than P. aeruginosa and E. coli, while the adsorption efficiency of P. aeruginosa was higher than E.coli. This study revealed that the treatment plant are not efficient to remove the heavy metals from the indistrial and household wastewater of Diyala company for Electrical Industries and it needs to add the efficiency bacteria to the plant wich removal heavy metals. The study concluded that SRB and P.aeruginosa are the most efficient bacteria to remove the Pb and Cu from their solution.

دراسة فسلجية وجزيئية للبكتريا Lactobacillus reuteri ATCC 23272 وتاثيرها التثبيطي على البكتريا المسببة لالتهاب المهبل Physiological and Molecular Study of Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and its Inhibitory Effect on the Bacterial Vaginosis

اسم المؤلف: سارة هيثم صديق النعيمي
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Bacterial vaginosis which is a common infection affecting the female genital tract, can be treated with different methods. One of these methods is the use of probiotic Lactic acid bacteria. The aim of this study was to evaluate the effects of two physiological factors (temperature and pH) on the growth and inhibitory action of probiotic Lactobacilli against the pathogenic Streptococcus agalactiae involved in bacterial vaginosis.A total of one hundred and six vaginal swabs were collected from Iraqi women patients affected with bacterial vaginosis, who attend Gynecological Department of Kamal Al - Samarraiy Hospital, Al - Qanat health care center, and private specialized clinics from October 2014 till March 2015, in order to obtain one hundred Streptococcus species. These swab samples were examined directly at the first. Isolated microorganisms were identified through microscopical, morphological, biochemical tests, and Vitek 2 compact system.The results showed that out of 243 bacterial isolates, 146 (60.08%) were detected as Gram - positive bacteria, whereas 97 (39.91%) were detected as Gram - negative bacteria. A hundred (68.49%) isolates of the Gram - positive bacteria were catalase - negative, while the rest 46 (31.51%) were catalase - positive.For all Gram positive, catalase negative bacteria, the results of the biochemical test and Vitek 2 compact system showed that the most frequent isolated microorganism was Streptococcus agalactiae 57 (57%), followed by Streptococcus faecalis 19(19%), Streptococcus sanguinis 13 (13%),Streptococcus salivarius 6 (6%), Streptococcus ovis 4 (4%), and Streptococcus suis 1(1%).The molecular method using the PCR technique was performed on the most prevalent species Streptococcus agalactiae to detect its virulence factors in order to prove its pathogenicity, the results revealed that, the HylB gene which is responsible for the production of hyaluronate lyase, appeared in 56 out of 57 isolates of S. agalactiae and the CylE gene which is responsible for the hemolysis of the red blood cells, appeared in 53 out of 57 isolates. These virulent isolates were involved in the physiological study.Lactobacillus reuteri ATCC 23272 was used in this study to investigate its effect as probiotic bacteria on the pathogenic bacteria (S. agalactiae). It was cultivated in MRS broth, adjusted to specific initial pH (3.5, 5, 6.5, 8), and at different temperatures of incubation (25°C, 30°C, 37°C, 44°C).The results revealed that the temperature of incubation and the initial pH of the culture medium effected significantly on both the growth rate and the antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272. The temperature 30 °C with the pH 5 were recorded as the best conditions for the antibacterial activity in which the zone of inhibition was (18.2 mm), while the temperature 25 °C with the pH 3.5 resulted in the lowest inhibition zone (0.05mm).The maximum growth rate with an O.D. 1.9297 nm of the L. reuteri ATCC 23272 was obtained at temperature. 30°C and pH 6.5, and the minimum growth rate with an O.D. 0.0002 nm were obtained at temperature 25 °C and pH 3.5.There was a positive correlation between the growth rate of the Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and the zone of inhibition.The optimal growth conditions were recorded in MRS broth, with an initial pH of 5 and a temperature of 30°C and this condition also had parallel effect on the maximum antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272 against S. agalactiae associated with bacterial vaginosis.

تاثير بعض ملوثات الهواء المنبعثة من بيئة المطابع ومكاتب الاستنساخ على صحة العاملين في مدينة بغداد - العراق Effect of some Air Pollutants emitted from Printing Units and Copy Centers environment on workers’ health in Baghdad City - Iraq

اسم المؤلف: زينب نصر عبد اللطيف
اسم المشرف: عادل حسين طالب الزاملي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تشكل المواد الدقائقية والدقائق الورقية المتناهية الصغر المنبعثة اثناء عملية تشغيل مكائن الطباعة والطابعات الليزرية فضلا عن استخدام الاحبار والمذيبات العضوية خطرا على صحة الانسان لاسيما اولئك الذين يتعرضون لها لاوقات طويلة في بيئات عمل مغلقة . هدفت الدراسة الحالية لتقييم نوعية الهواء في بيئة عمل المطابع ومكاتب الاستنساخ وتشخيص الاثار المحتملة لبعض الانبعاثات المهنية وتاثيراتها في صحة العاملين ، اذ توصلت الدراسة للنتائج الاتية : اثبتت الدراسة ان هنالك مشكلة تلوث هواء في ما يتعلق بتراكيز الرصاص والزنك في جميع مواقع الدراسة وبنسب تفوق الحدود المسموح بها عالميا اذ بلغ اعلى تركيز للرصاص في هواء المطابع (5.1) ميكروغرام/م3 ، فيما بلغ اقل تركيز للرصاص (1.3) ميكروغرام/م3 . بلغ اعلى تركيز للزنك في هواء المطابع (100.8) ميكروغرام/م3 ، فيما بلغ اقل تركيز للزنك (31.2) ميكروغرام/م3 . اما قيم النحاس في هواء مواقع الدراسة فكانت ضمن الحدود المسموح بها عالميا عدا مكاتب الاستنساخ التي سجلت ارتفاعا ملحوظا بتركيز النحاس بلغ (0.647) ميكروغرام/م3 عند مستوى احتمالية (P<0.05) . تفاوتت تراكيز المواد الدقائقية PM2.5 وPM10بين مواقع الدراسة ، اذ ان المواد الدقائقية PM2.5 لم تتجاوز المحددات العالمية المسموح بها في اغلب مواقع الدراسة خلال شهر شباط مقارنة بشهر نيسان بينما سجل اعلى تركيز تراكيز للمواد الدقائقية 5PM2. في مطبعة الدار الجامعية (55.33) ميكروغرام/م3 في شهر نيسان. في حين تجاوز كلا من المواد الدقائقية PM10 والدقائق العالقة الكلية TSP المحددات العالمية في جميع مواقع الدراسة وسجل اعلى تركيز لهما (667.33) و(917.67) ميكروغرام/م3 على التوالي في مطبعة الدار الجامعية خلال شهر نيسان . لم تتجاوز تراكيز الغازات المقاسة (CO وNO2 وSO2 و(VOCS المحددات العالمية في جميع مواقع الدراسة اذ كانت تراكيزها اقل من الحدود المسموح بها. اذ سجل اعلى تركيز لغازCO ppm (8) في مطبعة النهرين/قسم التصحيف. اما غاز NO2 فقد سجل اعلى تركيز له ppm (2.0) في مكاتب الاستنساخ . بينما VOCs سجلت اعلى تركيز لها في مطبعة النهرين/قرب مكائن التيل ppm (28.0) . اما غاز SO2 فكانت تراكيزه اقل من تحسس الجهاز في جميع مواقع الدراسة. اظهرت نتائج فحص كفاءة الرئة اختلافا نوعيا في عمل الجهاز التنفسي تمثل في نقص سعة الرئة FVC ووجود ضيق في مجرى التنفس((FEV1 لدى مجموعة الطباعين فضلا عن حدوث قصور في وظيفة الجهاز التنفسي لدى مجاميع التعرض المهني والبيئي . وبينت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية بين معايير كفاءة الرئة ومدة التعرض التراكمي للعاملين لملوثات بيئة العمل، في حين لم تتوصل الدراسة الى ايجاد علاقة معنوية بين معايير كفاءة الرئة وحالة تدخين السكائر باختلاف طبيعة العمل . سجلت قيم الرصاص والزنك ارتفاعا في دم عمال المطابع مقارنة بالمجاميع الاخرى، فكانت تراكيزها (26.96) ميكروغرام/100مل و(93.44( ميكروغرام/100مل على التوالي .فيما سجلت قيم النحاس ارتفاعا في دم عمال الاستنساخ مقارنة بالمجاميع الاخرى اذ بلغ تركيزه (.22138( ميكروغرام/100مل . وبينت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية مرتفعة بين تراكيز العناصر الثقيلة في الدم ومدة التعرض التراكمي الا ان الدراسة لم تتوصل الى ايجاد فروقات معنوية بين معدلات قيم العناصر الثقيلة ومجاميع الدم من جهة وحالة تدخين السكائر من جهة اخرى . بينت نتائج اختبارات الدم وجود انخفاضا معنويا لدى مجموعة الاستنساخ في العدد الكلي لخلايا الدم البيض) 7.81×103 (خلية/ملم3 ،بينما سجلت خلايا الدم البيض الحمضة ارتفاعا معنويا لديهم (2.81)% مقارنة بالمجاميع الاخرى . مجموعة الطباعين سجلت انخفاضا معنويا في خلايا الدم البيض الوحيدة (5.78) % مقارنة بالمجاميع الاخرى .اما مجموعة التعرض البيئي/ التصحيف فقد سجلت انخفاضا معنويا في كلا من هيموغلوبين الدم (11.76) غم/100مل وحجم الدم المضغوط (36.28) % وكريات الدم الحمر(4.47 ×106 (خلية/ملم3 مقارنة بالمجاميع الاخرى. | Particulate matter and Nano papers particulate that emitted through printing machines and laser printers operation as well as inks and organic solvents constitute threat on human health especially who exposed for a long time in a closed work environments. The purpose of the current study is to evaluate air quality in the printing presses and copy centers, and diagnosed potential effects of some occupationally emissions and their effects on human health. The study has reached the following results : The study proved that there was air pollution problem concerning lead and zinc contents in all of the study sites in percentages exceed the permitted globally limits ,The highest concentration of lead was recorded in printing presses air (5.1) µg/m3 and the less concentration of lead was recorded (1.3)µg/m3, Highest concentration of zinc was recorded (100.8)µg/m3 in printing presses air and the less concentration of zinc was recorded (31.2) µg/m3, While copper values in air of study sites was within the permitted globally limits except copier offices that recorded a significant increase for copper concentration (0.674) µg/m3 at (P≤0.05). Particulate matters concentrations PM2.5 , PM10 varied in the study sites, most of PM2.5 didn’t exceeded the permitted globally limits in most of study sites during February compared to April, While the highest concentration of PM2.5 was recorded (55.33) µg/m3 in University house printing press during April. Whereas both of PM10 and TSP exceeded the globally limits in all of study sites and recorded their highest concentration (667.33) and (917.67) µg/m3 respectively in University house printing press during April. Gases concentrations) NO2,VOCS,SO2,CO) did not exceed the permitted globally limits in all study sites ,The highest concentrations of CO was recorded (8) ppm in Al - Nahrain printing press, NO2 gas was recorded its highest concentration (2.0) ppm in copy centers ,While VOCs were recorded the highest concentration (28.0)ppm in Al - Nahrain printing press,SO2 gas concentration was less a sensory device at all study sites. The results of lung efficiency showed qualitative difference in the work of the respiratory system represented in a restriction of lung capacity FVC and presence narrowing of the airway FEV1 at the printers group as well as a shortage in respiratory function for occupational and environmental groups , the results of the study showed a significant differences found between lung function parameters and accumulated exposure for environmental work pollutants. Whereas, the results of the study didn’t find a significant relationship between lung efficiency parameters and the status of cigarette smoking, according to the different of working nature. Lead and Zinc contents recorded increased in printing presses workers blood compared with other groups .Lead and Zinc concentrations were recorded 26.96)) µg/100ml and ((93.44µg/100ml respectively, while copper concentrations was recorded increased in copier workers blood compared with other groups, its concentration was recorded (138.22)µg/100ml, the study results has showed significant differences between heavy metals concentrations in blood and accumulative exposure period .Whereas, the study did not find significant differences between heavy metals rates and blood groups on the one hand and the status of cigarette smoking on the other hand. Complete blood count showed significant decreased in copy centers group in total WBCs (7.81×103) cell/ml3 ,While eosinophil was recorded significant increase (2.81)% compared to other groups .Printers group was recorded significant decrease in monocytes (5.78)% compared to other groups .While environmental group was showed significant decrease in both hemoglobin (11.76)g/100ml , hematocrit (36.28)% and red blood cells (4.47×106) cell/ml3 compared to other groups.

التاثير المزمن لمبيد الفايديت في نسجية الغلاصم والكبد والكلى لاناث سمكة البعوض (S.F. Baird &Girard ; 1853) Gambusia affinis Chronic effect of Vydate on gill , liver and kidneys of female mosquito fish Gambusia affinis (S.F. Baird &Girard ; 1853 )

اسم المؤلف: زينب مؤيد صابر حميد
اسم المشرف: مختار خميس حبه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الفايديت لمبيدMedian lethal concentration في الدراسة الحالية بلغت قيمة التركيز المميت الوسطي واستخدمت الصفة الفسلجية التي Gambusia affinis خلال (96) ساعة (2.4) ملغم / لتر في سمكة البعوض فضلا عن التغيرات المرضية النسجية للتعرف على سمية Bioindicator كدليل حيوي Behaviour بالسلوكمبيد الفايديت وقد وجد بان سمية مبيد الفايديت تزداد مع زيادة كل من التركيـز ومدة التعرض . جمعت 48 سمكة انثى من الاسواق المحلية ومن الجدول المحيط بجامعة بغداد في الجادرية ، قسمت الاسماك الى (4) مجاميع شملت كل مجموعة 12 سمكة عرضت اسماك المجموعة 1 : ( لتركيز 0.12 ملغم / لتر )، المجموعة 2 : (عرضت لتركيز 0.24 ملغم / لتر ) ، المجموعة 3 : (عرضت لتركيز 1.2 ملغم / لتر ) بمبيد الفايديت ، فضلا عن مجموعة السيطرة وبواقع مكررين لكل مجموعة ، ثم شرحت الاسماك بعد كل ( 2، 4، 6 ، 8) اسابيع من التعرض . تم تثبيت العينات بمحلول بوين وحضرت الشرائح المجهرية واستعملت صبغة الهيماتوكسيلين والايوسين . وملاحقة بعضها Erratic swimming اثرمبيد الفايديت في سلوك السمكة من خلال سرعة السباحة العشوائية البعض وزيادة العدائية وسرعة حركة غطاء الغلاصم واستقرار السمكة عند قعر الحوض او بالقرب من سطــــح الماء عند زيادة التركيز . من جانب اخر اثر مبيد الفايديت تصاعديا وبحسب التراكيز المستخدمــــــــة في الدراسة الحالية في بعض اعضاء الجسم مثل : الغلاصم والكبد والكلى . اذ لوحظ حدوث عدة اصابات في الغلاصــم بسبب مبيد الفايديت تمثلت بحصول تضخم الخلايا الكلورية Hypertrophy of chloride cellsو احتقان الاوعية الدموية congestion of blood vessels وانعدام الترتيب الصفائحي Lamellar disarrayو انفصال الخلايا الظهارية عن الغشاء القاعدي Lifting of epithelial cells (Slouphing ) وفرط التنسج للخلايا الكلورية Hyperplasia of chloride cells والتحام الصفائح الثانوية المتجاورة Fusion of adjacent Secondary lamella وتمدد الاوعية الدموية Aneurysm . واحتقان الوريد المركزي والجيبانيات Swelling of hepatocytes سبب مبيد الفايديت انتفاخ الخلايا الكبدية وانعدام الترتيب Haemorrhageو نزفا دمويا Congestion of central vein and sinusoids الدموية وInfiltration of lymphocytes وارتشاح الخلايا اللمفية Loose of radial arrangement الشعاعيو ضمور الخلايا الكبديـــــــــــة Caseous necrosis of hepatocytes حدوث التنخر التجبني للخلايا الكبديةAtrophy of hepatocytes والتليف (التشمع) الكبدي Liver cirrhosis . عانت الكلى ايضا من تاثير مبيد الفايديت من خلال حدوث عدة اصابات فيها مثل تضخم الكبيبات البولية Shrikage of renal tubule lumens,و تضييق تجاويف النبيبات الكلوية Hypertrophy of glomerulusواحتقان الاوعية الدموية واختزال النسيج المولد للدم Reduction of haematopoietic tissue . | In the current study the average value of median lethal concentration was 2.4 mg / L in Gambusia affinis , and we used the physiological characteristic that represented by behavior as a bioindicator , as well as as well as pathological and histological changes to learn about the toxicity of vydate pesticide and found that the toxicity of vydate increased when both concentration and duration of exposure increased . (48) female fishes were collected from local markets and also from the stream that surround Baghdad university campus at Al - jadyria, fishes divided into (4) groups and each group consists of 12 fish : Group1 (exposed to 0.12 mg / L) , Group2 (exposed to 0.24 mg / L) and Group 3 (exposed to 1.2 mg / L) of vydate pesticide. As well as a group for control . Fishes were dissected for for histological preparations after fixation with Bouin’s fluid after each (2,4,6,8) weeks of exposure time. Histological sections were stained with Hematoxylin and eosin . .Vydate pesticide impact on the behavior of G. affinis swimming through random erratic swimming , prosecute each other , increase hostility , increased the opercular movement and the stability of fish was at the bottom of aquarium or at the surface of water when the concentration of pesticide increased . On the other hand vydate impact according to the concentration that used in the current study on some organs of G. affinis such as : gills, liver and kidneys. Where it was noted that a number of histopathological changes in gills due to vydate pesticide such as hypertrophy of chloride cells, congestion of blood vessels, lamellar disarray, lifting of epithelial cells (slouphing), hyperplasia of chloride cells , fusion of adjacent secondary gill lamella and Aneurysm. Vydate pesticide also caused swelling of hepatocytes , congestion of central vein and sinusoids , haemorrhage , loos of radial arrangement infiltration of lymphocytes , caceous necrosis of hepatocytes , atrophy of hepatocytes and liver cirrhosis. Also kidneys suffered from vydate pesticide through several alternative changes such as hypertrophy of glomerulus , shrinkage of renal tubule lumens congestion of blood vessels and reduction of hematopoietic tissue .

تاثير المعززات الحيوية على الفئران المثبطة مناعيا بالبردنيزولون Effect of Probiotics on Prednisolone Immunosuppressed Mice

اسم المؤلف: زينب كاظم عبد
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لمعرفة دور FOXP3 في الفئران المثبطة مناعيا بالردنيزولون اضافة الى دور المعززات الحيوية في الجهاز المناعي للفئران البيضاء. البردنيزولون هو عقار مثبط مناعيا يستخدم لعلاج حالات الحساسية وامراض المناعة الذاتية. المعززات الحيوية هي كائنات حية تستعمل لتعديل الجهاز المناعي في الانسان والفئران. FOXP3 هو دليل للخلية التائية المنظمة وله دور في الاستجابة المناعية.لذلك استخدمنا في التجربة 30 فار مختبري ابيض ذكر قسمت الى 6 مجاميع كل مجموعة تضم 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 14 يوم : المجموعة 1 : جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالخميرة فقط. المجموعه 2 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام مجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعة 3 : جرعت فمويا ب0.4مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط. المجموعه 4 : جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالبكتريا فقط. المجموعه 5 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعه 6 : جرعت فمويا ب0.6مل من بكتريا Ss والتي تحوي (108×1) خلية\مل وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ارتفاع معنوي في العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء(10000.0 ± 275.4) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(7000 ± 145.07), واظهر العد التفريقي لها انخفاض معنوي في الخلايا اللمفية(23.0 ± 1.51) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((30.0 ± 1.65 وارتفاع معنوي في الخلايا العدلة(75.00 ± 3.59)مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (65.00 ± 2.31) وانخفاض معنوي في الخلايا الوحيدة(( 1.0 ± 0.06مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ±0.06) 3.0) وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة , حصل انخفاض معنوي في عملية البلعمه(15.0 ± 0.82) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(20.0 ± 1.4), وارتفاع غير معنوي في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة(40.0 ± 2.03) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (36.0 ± 1.1), وزيادة غير معنوية في تركيز خضاب الدم(13.3 ± 0.76) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((11.6 ± (0.54 وكذلك زيادة غير معنوية في الوزن الكلي للحيوانات المعامله بالعقار فقط (31.0 ± 1.2) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(30.0 ± 1.1) .واظهرت نتائج التجريع بالمعززات الحيوية (الخميرة والبكتريا) ارتفاع العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء ,واظهر العد التفريقي لها ارتفاع الخلايا اللمفية والوحيدة وانخفاض الخلايا العدلة وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة ,كذلك حصل ارتفاع في عملية البلعمة وارتفاع بسيط في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة . بينت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية في المجموعه المعاملة بالعقار فقط حصول فقدان بالشكل العام للعضو وعدم ظهور الحويصلات اللمفاوية وحصول تنخر في الطحال .واوضحت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجموعه المعامله بالمعززات الحيوية احتفاظ العضو بالشكل العام وحصول ارتشاح للخلايا اللمفية وتحفيز الحويصلات المفاوية داخل العضو.كما اظهرت نتائج التجريع الفموي للمعززات الحيوية بعد وقبل ومع حقن الدواء حدوث حالة تحسسن بالمؤشرات المناعية وكذلك حدوث حالة تحسن وتنشيط مناعي للحويصلات اللمفاوية للطحال والعقدة اللمفاوية. واظهرت نتائج الفحص النسيجي الكيميائي المناعي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجاميع المجرعه بالمعززات الحيوية والعقار ان لها نفس التعبير لل.FOXP3 اعتمادا على نتائج التجربة الحالية نستنتج ان المعززات الحيوية (الخميرة والبكتيريا) تمتلك قابلية على تعديل وتحسين تاثيرات العقار الجانبية على الاعظاء والمؤشرات المناعية وكذلك لها نفس التعبير لل.FOXP3 | Study have been done to see the role of FOXP3 in immunosuppressed mice using prednisolone in addition to the role of probiotic on immune system of albino mice. Prednisolone is immunosuppressive drug used to treat several allergic and autoimmune conditions. Probiotic is a live microorganisms used to modulate human and mice immune system.FOXP3 is Treg marker and have a role in immune system responses. Therefore we took 30 male albino mice were divided into 6 groups (five mice in each group) and treated daily for 14 days : Group 1 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days then injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 14 days. Group 2 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14days. Group 3 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days.Group 4 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days then injected intraperitoneally with(0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 14 days. Group 5 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days. Group 6 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days. Mice treated with prednisolone drug showed a significant increase in total leukocytes count (10000±275.4)cells\1ml.blood as compared with negative control (7000±45.07)cells\1ml.blood, and differential count of leukocytes showed non - significant decrease in lymphocytes(23.0±1.51)cells\1ml.blood as compared with negative control (30.0 ±1.65)cells\1ml.blood, a significant increase in neutrophils(75.00±3.59) as compared with negative control(65.00 ± 2.31), a significant decrease in monocytes (1.0±0.06)cells\1ml.blood as compared with negative control(3.0 ± 0.06)cells\1ml.blood and have no effect on basophils and eosinphils, a significant decreased in phagocytosis(15.0 ± 0.82) as compared with negative control (20.0 ±1.4) , no significant increased Pcv (40.0±2.03) as compared with negative control (36.0±1.1) ,no significant increased Hb (13.3±0.76) as compared with negative control(11.6 ± 0.54) , and no significant increase in total body weight (31.0 ± 1.2)g as compared with negative control (30.0 ±1.1)g. The result of group treated with probiotic show a significant increase in total leukocytes, lymphocytes count, phagocytosis and Hb & Pcv as compared with control group administrated by normal saline only. The histological sections of spleen and lymph node which was treated with prednisolone drug revealed lose the architecture, no lymphoid follicles and necrosis. While the section of spleen and lymph node treated with probiotic showed preservation architecture which contain lymphoid follicles and hyperplasia of lymphocytes. The result of groups treated with probiotic pre, post, together with prednisolone drug showed normalized the immunological and histological parameters to the normal condition as compared with group treated with prednisolone only. The immunohistochemical section for spleen and lymph node show the same expression of FOXP3 in mice treated with probiotic (yeast & bacteria) and prednisolone drug. According to the results obtained from this study it is concluded that probiotic (yeast and bacteria) have immunomodulatory effect against prednisolone in immune system of male albino mice and have the same expression of FOXP3

استخلاص وتنقية وتشخيص زيت نبات الرازقي المستزرع في العراق L. Jasminum sambac ودراسة تاثيره كعامل مضاد للاكسدة Extraction, Purification and Identification of Jasmine oil in Jasminum sambac L. Cultivated in Iraq and It's effect as antioxidant activity

اسم المؤلف: زينب عمران سلمان الربيعي
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى استخلاص زيت الياسمين من ازهار واوراق وسيقان وجذور نبات الرازقي المستزرع في العراق Jasminumsambac L., والكشف عن المركبات الموجودة فيه, كما تم اجراء مقارنة بين الزيت الطيار والمستخلص الكحولي الخام للنبات كمركبات مضادة للاكسدة باستعمال الجذرالحر(1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazyle) ((DPPH وذلك باستعمال التراكيز (100,80,60,40,20)l/mlµ والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية. استخلص الزيت الطيار باستعمال طريقة التقطير بالبخار والاستخلاص بالكحول بواسطة جهاز الكلافنجرClavenger apparatus) ), كما تم التعرف على مكونات الزيت الطيار بتقنية كرموتوغرافيا الغاز السائل - مطياف الكتلة. اجريت عملية الاستخلاص الكحولي (الخام) للمركبات الفعالة من النبات بجهاز(Soxhlet), وتم الكشف النوعي عن المركبات الفعالة بواسطة عدد من الكواشف, وبينت النتائج ان المستخلص الكحولي لكلا الجزئين احتوى على مركبات فعالة (القلويدات, الفلافونيدات, التربينات, الصابونيات, التانينات). اشارت النتائج الى ان استخلاص 100غم من نبات الرازقي لكل من الازهار والاوراق انتجت زيتا طيارا 5%, 1.5 % على التوالي, اما السيقان فكانت كمية الزيت الطيار فيها قليلة جدا بحيث كان من الصعب جمعها. اما بالنسبة لجذور النبات فلم يظهر وجود للزيت الطيار فيها. اثبتت الدراسة ان الزيت الطيار للازهار يحتوي على (30 مركبا ) وكان اعلى تركيز لمركب Benzyl acetate حيث بلغت نسبته المئوية 59.37%, يليه مركب Benzyl alcohol بتركيز 14.96%, ثم مركب Benzyl propanoate بتركيز 5.25%. اما زيت الاوراق فاظهرت النتائج انه يحتوي على 43 مركبا وان مركب Benzyl acetate كان الاعلى تركيزا وبنسبة 34.07% , يليه مركب N - carbobenzooxy arginine بتركيز 15.28% , ثم مركب benzyl propanoate بتركيز7.79%.كما اظهرت النتائج الفعالية العالية للزيت الطيار لكل من الازهار والاوراق بالتركيز 100 l/mlµ كمضادا للاكسدة وبنسبة 96.10%, 82.30% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية (حامض الاسكوربك), اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية مابين تراكيز الزيت الطيار لكل من الازهار والاوراق. اما فيما يخص نتائج المقارنة بين الزيت الطيار والمستخلص الخام للنبات فقد تبين ان الفعالية المضادة للاكسدة للزيت الطيار والمستخلص الكحولي لللازهار عند تركيز 100 l/mlµ للزيت الطيار وg/mlµ للمستخلص الخام كانت 96.10% , 33.87% على التوالي, اما بالنسبة للزيت الطيار والمستخلص الكحولي للاوراق عند نفس التركيز فكانت النسبة المئوية المضادة للاكسدة 82.30%, 22.08% على التوالي وبفروق معنوية مابين تراكيز الزيت الطيار والمستخلص الكحولي. | This study aimed was designes to extract Jasmine oil from flowers, leaves, stems, and roots using Jasminum sambac L. which cultivated in Iraq, and detecting the existing compounds. A comparison was conducted between volatile oil and alcoholic extract ( as a crude) of the plant as antioxidant by using the compound 1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazyle (DPPH) as a free radical at the concentrations 20,40,60,80,100 Microliter/ milliliter then compared with ascorbic as a standard treatment. The volatile oil was extracted by using the steam distillation and alcohol extract using Clevenger apparatus. volatile oils were detected by using the chromatography of the liquid gas. In addition, alcoholic crude extract was done by using Soxhlet. The qualitative detection was conducted searching for active compounds through the use of a number of detections reagents.The results of the qualitative detection showed that the alcoholic extract in both plant parts contains the active compounds alkaloids, flavonoids, terpenoids, saponins, tannins. The results showed that 100 g of flowers and leaves has produced a volatile oil estimated by 5% and 1. 5% respectively. While the amount of the volatile oil in the stems was very little to be extracted and thus it was difficult to collect. No volatile oil was detected in plant roots. The study has shown that volatile oil of flowers contains 30compounds and the highest was Benzyl acetate, reaching 59.37%, followed by Benzyl alcohol (14.96%), then Benzyl propanoate which recorded 5.25%. The study showed that volatile oil in leaves contains 43compounds and Benzyl acetateeas represented the highest (34.07%), followed by N - carbobenzooxy arginine (15.28%), then benzyl propanoate (17.79%). The results also showed high volatile oil antioxidant activity in both flowers and leaves at the concentration 100Microliter / ml reached 96.10% and 82.30% respectively compared with Ascorbic Acid. the results also indicate significant differences between the volatile oil concentrations in both flowers and leaves. It has been proved that the maximum antioxidants activity for volatile oils and alcoholic extract of flowers was at a concentration of 100Microliter / ml was reached 96.10%, 33.87% respectively, while for volatile oil and alcoholic extract of the leaves, the percentages were 82.30% and 22.08% respectively, with significant differences between volatile oil and alcoholic extract concentrations.

استخلاص ، تنقية وتوصيف انزيم اللكنين بيروكسيديز المنتج من العزلة الفطرية المحلية Aspergillus terreus Extraction, purification and characterization of lignin peroxidase enzyme produced from local fungal isolate Aspergillus terreus

اسم المؤلف: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
اسم المشرف: ندى صباح رزوقي غازي منعم عزيز
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 18 عزلة فطرية محلية من 75 عينة روث خيول جمعت من نادي الجادرية ونادي العامرية للفروسية في بغداد خلال 8 اشهر للفترة من تموز 2013 الى اذار 2014 . سجلت العزلة A. niger اعلى نسبة ظهور بين العزلات واعلى تكرار % 80 %9.8, على التوالي تبعتها العزلة A.fumigatus (%9.8 , % 48) ثم العزلة A.terreus (% 8.2 , % 46.66) ، بينما سجلت العزلة Absidia cerymbifera اقل ظهور واقل تكرار(%3.28 , % 5.33) تبعتها العزلة Syncephalstrum racemosum ( % 2.67 و( %1.64 على التوالي. اختيرت العزلة A.terreus SG777 كافضل عزلة لانتاج هذه الانزيمات اذ سجلت اعلى فاعلية نوعية لانتاج الانزيمات المحللة للكنين ( لكنين بيروكسيديز 11.828 ، منغنيز بيروكسيديز1.131 واللاكيز 0.527) وحدة /ملغم . ثبتت الظروف المثلى لانتاج الانزيمات المحللة لللكنين من العزلة الفطرية A. terreus SG 777 باستخدام تخمرات الحالة الصلبة ( سيقان الموز كمادة اساس ، فترة الحضن 8 ايام ،حجم اللقاح1 × 105 بوغ / مل ، برقم هيدروجيني 4.5 وبدرجة حرارة 35م°). رسب انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع %80 ثم ازيل الملح من الانزيم المنتج من عفن777 Aspergillus terreus SG باستخدام طريقة النضح الغشائيDialysis تجاه المحلول الدارئ (Tris buffer) ونقي جزئيا بواسطة كروماتوغرافيا التبادل الايونيIon exchange chromatography باستخدام المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدد مرات للتنقية بلغ 5.4 مرة وبحصيلة انزيمية مقدارها %13.7اظهر الانزيم اعلى فغالية وثباتية عند الرقم الهيدروجيني 3.0 ,في حين اقصى فاعلية للانزيم ظهرت عند درجة حرارة 40 م° مع احتفاظ الانزيم بفاعليته عند درجات حرارة تراوحت بين 25) - 35 ) م°. درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة عدة صبغات واظهرت النتائج اعلى نسبة ازالة ( 83.61 %) للانزيم تجاه صبغة الكونغو الحمراء باستخدام 65.51 وحدة / مل منه وبفترة حضن 4 ساعات وتبعتها صبغة المثيلين الزرقاء بنسية تحطيم %58.6 ثم صبغة المثيل الحمراء بنسبة ازالة بلغت % 49.9.بينما سجلت الصبغات الملاكايت الخضراء ، الالورا الحمراء والتارترازين % 24.87 ,% 28.8 , %26 على التوالي كادنى نسبة تحطيم بوساطة الانزيم قيد الدراسة . درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة المركبات الحلقية المتعددة التي تم الكشف عنها وذلك لمقارنة فاعلية الانزيم مع نتائج المعالجات في مصفى الدورة والتي تضمنت (المعالجة الميكانيكية، المعالجة الكيميوفيزيائية والمعالجة البايولوجية ) . اظهرت النتائج ازالة 97.54 % للمركب Di benzo (a ,h) anthrancene باستخدام 65.51 وحدة / مل من الانزيم قيد الدراسة وبفترة حضن 4 ساعات وبدرجة حرارة 40 م° في حين بلغت نسبة الازالة بوساطة معالجات المصفى % 54.37 كما بلغت نسبة الازالة لكل من Floureneو anthrancene قد بلغت % 95.98 و% 83.51 على التوالي مقارنة بنسبة الازالة %84.51 , % 46.83 بوساطة معالجات المصفى . قيد انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام %2 وزن / حجم من الجينات الصوديوم و200 ملي مولار و50 من مل كلوريد الكالسيوم . بينت النتائج ان % 99 من فاعلية الانزيم الحر تم تقييدها .اجريت عملية خزن انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر لمدة اربعة اسابيع عند درجة حرارة 4 م° لمعرفة مدى احتفاظ الانزيم المقيد بفاعليته الانزيمية مقارنة بالانزيم الحر، اذ لوحظ ان الانزيم المقيد قد احتفظ % 88.29 من فاعليته الاصلية بينما احتفظ الانزيم الحر حوالي 66. 02 % من فاعليته الاصلية. استخدم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر في تحطيم صبغة المثيلين الزرقاء ، اذ اظهرت النتائج ان نسبة التحطيم بالانزيم المقيد بلغت حوالي % 40.1 لفترة حضن 4 ساعات بينما بلغت نسبة تحطيم الصبغة حوالي % 25.79 باستخدام الانزيم الحر وبنفس فترة الحضن .حطم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد حوالي% 57.89 من صبغة الكونغو الحمراء عند استخدامه لاول مرة ، وانخفضت قابلية الانزيم المقيد على تحطيم الصبغة الى 16.11% عند استعماله للمرة الرابعة. | Eighteen local isolates were collected from seventy five horse manure samples taken from horses in the Equestrian Club in Jadriya and Al - Amrya / Baghdad that were investigated during the 8 months; the period isolation was started from July 2013 to march 2014. Aspergillus niger was the highest occurrence and frequency (80% and 9.8 %) respectively, followed by A . fumigatus (48 % and 9.8 %) and A. terreus (46.66 % and 8.2 % ) occurrence and frequency respectively , whereas Syncephalstrum racemosum (2.67 % and 1.64%) respectively . The isolate A. terreus had the higher specific activity of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase 11.828, manganese peroxidase 1.13 and laccase 0.53) U/mg. The optimum conditions of ligninolytic enzymes produced from A. terreus SG777 were estimated using solid state fermentation : banana stalks as a substrate, period incubation 8 days, moisture level 1 : 5 w/v inoculum size 1x105 spores /ml, pH 4.5 and temperature 35 °C. Lignin peroxidase produced from A. terreus SG777 precipitated with 80% ammonium sulfate saturation then desalting by dialysis against Tris buffer solution and partially purified by ion exchange chromatography using DEAE - cellulose. The specific activity reached 56.67U/mg with purification fold was 5.4 times and 13.7% recovery. The optimum pH for activity and stability was 3. The maximum activity was observed at 40°C and the enzyme maintained the activity when it was incubated at 25 - 35˚C. Lignin peroxidase removal the dyes during 4hr. Congo red was decolorized to the maximum extent of 83.61% in 4 hr by 65. 51 U/ml of the pure lignin peroxidase, methylene blue decolorized 58.6% and methyl red azo dye was decolorized to the extent of 49.9% ,while Malachite green triarylmethane dye, allura red and tartarazine showed minimum extent decolorized 26, 28.8 and 24.87% respectively. Degradation of poly aromatic hydrocarbons when incubated with 65.51 U/ml lignin peroxidase at 40 °C for 4 hr compared with the Refinery treatment . Results showed (97.54%) removal efficiency of Di benzo (a ,h) anthrancene by lignin peroxidase, while only 54.37% was treated by Refinery treatment. Flourene and anthrancene degradation 95.98% and 83.51% respectively, while the flourene and anthrancene degradation treated by Refinery treatment only 84.51% and 46.83% respectively. Lignin peroxidase immobilization by 2% (w/v) sodium alginate and 200 mM of calcium chloride. Results showed that 99 % from free lignin peroxidase was immobilized. The stability of immobilized and free Lip enzyme was studied during four weeks; remaining activity for immobilized Lip was 88.29 % from its original activity 76 U/ml during four weeks while free Lip remaining activity was 66. 02 % from its original activity (76.04 U/ml). Methylene blue dye degraded about 40.1% by immobilized Lip during four hr compared with free Lip which has removal only 25.79% from dye concentration. The immobilization lignin peroxidase removal 57.89 % from congo red in first use and then the immobilized lignin peroxidase ability reduced to 16.11% dye removal after four uses.

دراسة تاثير بكترياLactobacillus species على نمو وحيوية الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica المعزولة من عينات براز المرضى Study the Effect of Bacteria Lactobacillus species on the Growth and Vitality of Entamoeba histolytica Isolated from Stool Samples of Patients Thesis Summitted

اسم المؤلف: زينب فاروق شفيق الريس
اسم المشرف: ندى صباح رزوقي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study 60 stool specimens were collected from patients suffering from E. histolytica a who attended at AL - Mahmudiya General Hospital , and Hospital ( Medical City ) from November 2014 until March 2015. These samples of males and femals belong to both ages( 2year - 52 years) . Entamoeba specimens were diagnosed by using two methods : the first one is the wet preparation as a General Stool Examination(GSE) after macroscopic examination for specimen and classifying them according to their consistency (solid ,semisolid and liquid ) and color ( brown and yellow ) and presence of blood and mucous in addition to diagnosing them microscopically to detect the presence of pus cells and both phases trophozoite and cyst for E. histolytica . Special diagnosis tool was used for first time in Iraq to complete the steps for diagnosis of Entanoeba spp. , E. histolytica was isolated and cultivated in vitro on Lock - Egg Medium to which sheep serum added . The aim of this study sheds light on the effect of suspension of Lactobacillus spp. cells and filtrates on growth and viability of E.histolytica( in vitro) by studying the effect of adding different concentrations (1.5 ×10P s/ml from filtrates and suspension of bacterial cells , and examined after (24, 48 and 72) hours of incubation , and note over the ability of various concentrations to inhibition growth of E. histolytica , as well as note the variations of parasite morphological which it suffered during the treatment period . The study reached the following results : 1 - The highest percentage of infection was recorded in the age group (2 - 12 years) by 35%, and the results showed that the incidence in females were higher than males, reaching 60% of the total.2 - During investigation of the antagonist action of lactic acid bacterial isolates against E. histolytica results revealed that suspension of bacterial cells of ( L. fermentum , L. delbruekii ) and L. acidophilus given the high inhibitory effect reached to 97.68% , 99.37%respectively. in concentration ( 1.5 × 10P P) cells/ml after incubation period 72hour compared to metronidazole drug which the inhibitory effect , reaching 67.77% for the same of incubation period . The results also showed that the concentration factor of lactic acid bacteria cells and the time factor have a clear anti - growth of trophozoite phases of the parasite , which is appropriate numbers average of trophozoite phases inversely proportional with increased concentration of lactic acid bacterial cells.3 - The results of filtrate lactic acid bacteria in concentration of (1.5 × 10P8P ) cell/ ml showed inhibitory effect less than suspension in same concentration which the percentage of ( L. fermentum, L. delbruekii ) inhibitory effect reached to 35.92% , while the percentage of L. acidophilus 38.32 % after incubation period 72hour , with significant differences in the value of LSD at a level (P <0.05) for the different concentrations and different times.4 - The results of treatment showed a morphological changes in the trophozoite phases of E. histolytica at different concentrations and different times, including discoloration of eccentric bad by blue dye trypan blue, as well as the decomposition of the plasma membrane and the decomposition of the wall of cyst phase , prejudice of some biological events, including stops the intracellular digestion process , and the small size of the trophozoite phases compara to natural state

المكافحة الاحيائية لبعض ادوار الذبابة المعدنية Chrysomya albiceps (Wiedemann,1819) (Diptera : Calliphoridae) باستخدام الفطر Metarhizium anisopliae (Metschnikoff) Sorokin والبكتريا Bacillus thuringiensis Berliner مختبريا Biological Control of some stages of Chrysomya albiceps (Wiedemann, 1819) (Diptera : Calliphoridae) Using Metarhizium anisopliae (Metschnikoff) Sorokin and Bacillus thuringiensis Berliner Under Laboratory Conditions

اسم المؤلف: زهراء سعد نوشي
اسم المشرف: نوال صادق مهدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الحشرات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The work involved studying effects of serial concentrations of Metarhizium anisopliae on the life stages of blow fly Chrysomya albiceps (Wiedemann,1819) (larvae, pupae, adults) were conducted under laboratory conditions.The results showed that all insects stages were sensitive to the fungus. Treating of larval food and direct spraying larvae by the concentrations 2.8×106, 2.8×107, 2.8×108 conidia/ml led to increasing accumulated mortalities percentages depending on the concentration and time. Various malformations were depected.Examination of some serial histopathological sections for some dead infected larvae under compound microscope showed adhesion of fungal conidia on insects body wall and fungal hyphae invated insects internal muscles and hemocoel.Treating of blow fly pupae by direct spraying with fungal suspension concentration mentioned above led to mortalities about 13.33, 26.67, 33.33 % respectively so that adult emergency percentages were about 86.67 - 66.67% while in the control treatment was 96.67%.Adult stage showed high sensitivity when they were directly sprayed with the above concentrations which led to mortalities of about 46.67, 56.67, 70% respectively after a week of treatment.The study also conducted to evaluate serial concentrations of commercial formulation suspension (Antrol) of Bacillus thuringiensis israelensis. As a microbial control agent against Chrysomya albiceps (blow fly) larvae and adults under laboratory conditions. The results revealed that percentages of accumulated mortalities of second instar larvae were 30 - 63.33% for the doses 100 - 2000 ppm respectively , Mortalities rate increased with increased of time, treating larval food with 1000 ppm ofbacterial suspension caused mortality rate reached 30% after two days, later reached 72.96% after 12 days. The bio assays results of treating adults food showed that mortalities percentage were 33.33 - 73.33 when their food was treated by 100 - 2000 ppm of bacterial suspension. The results indicated that B thuringiensis has a potential to be a bio control agent for Ch. albiceps.Results of treatment of food of larvae by combination of mixed concentrations of fungal suspension (2.8×106 or 2.8×107 conidia / ml) and bacterial suspension (100 or 200 ppm) and direct spraying the larvae with fungal suspension led to high and rapid mortalities more than using fungus or bacterial suspension alone .Treatment of the second instar larvae with the combination A(100 ppm + 2.8×106 conidia / ml , bacterium + fungus respectively) led to accumulated mortality percentage about 30 % after one day of treatment , this percentage raised up to 66.67 % . Combination B which was consists of concentration (200 ppm + 2.8×106 conidia / ml bacterium + fungal suspension respectively) caused larval mortality percentage about 86.67 % and the adult percentage emergency was 13.33 % , while in control treatment was 96.67 % . The combinations of fungal and bacterial suspension have a synergistic effect as indicated by the results .

تطبيقات دلائل نوعية المياه في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق Application of Water Quality Indices for Tigris River within Baghdad city - Iraq

اسم المؤلف: زهراء زهراو فرحان الجنابي
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية ابتداءا من شهر شباط 2010 ولغاية شهر كانون الاول 2010, اذ تم جمع النماذج خلال كل شهرين في ثلاث محطات في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد، وتضمنت الدراسة تقييم نوعية مياه نهر دجلة لاغراض الشرب ومعيشة الاحياء المائية والـــــري باستخدام دليــــل نوعيـــة المياه المعتمـــد علـــى الموديل الكنــدي Canadian Council of Ministers of Environment Water Quality Index (CCME WQI) ودليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتيــــــــة Phytoplankton - Index of Biological Integrity (P - IBI). تم قياس العديد من العوامل الفيزيائية والكيميائية مثل درجة حرارة الماء والاس الهيدروجيني, التوصيلية الكهربائية, الملوحة, الكدرة, المواد الصلبة الذائبة, الاوكسجين الذائب, القاعدية الكلية, الكاربونات, البيكاربونات, الكالسيوم, المغنيسيوم, الكلورايد, العسرة الكلية, الصوديوم والبوتاسيوم, الفوسفات الفعال, النترات, النتريت, الامونيا, وقد تراوحت قيم العوامل بين 31.2 - 10.1° و7.1 - 8.4، و- 5901340 مايكروسيمنز/ سم، و0.83 - 0.36 جزء بالالف، و41.03 - 13.15 NTU، و866 - 367 ملغم /لتر، و8.2 - 6.3 ملغم/لتر، و211.0 - 129.2 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر، وقيم غير المحسوسة، و28.8 - 6.45 ملغم HCO3/ لتر، و142.6 - 55.04 ملغم/لتر، و35.96 - 20.09 ملغم/لتر، و134.9 - 24.9 ملغم / لتر، و484 - 232 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر، و63.2 - 17.7 ملغم /لتر، و31.7 - 1.6 ملغم /لتر، وقيم غير محسوسة - 0.3 ملغم/ لتر، و33.2 - 2.21 ملغم/ لتر، على التوالي.و تم قياس بعض العناصر الثقيلة مثل الكادميوم, الكروم, النحاس, الحديد, الرصاص, المنغنيز, النيكل, الزنك, وقد تراوحت قيمها بين قيم غير المحسوسة - 0.039 ملغم/لتر، وقيم غير المحسوسة - 1.3 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة، و0.438 - 0.001 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة - 0.077 ملغم/لتر، وقيم غير محسوسة - 0.778 ملغم/لتر، و0.36 - 0.011 ملغم/ لتر، و0.08 - 0.011 ملغم/لتر، وقيم غير محسوسة - 0.1985 ملغم / لتر، وقيم غير محسوسة - 0.0416 ملغم/لتر، على التوالي.وتم حساب نسبة امتصاص الصوديوم SARو النسبة المئوية للصوديوم الذائب SSP وكاربونات الصوديوم المتبقية RSC، و1.29 - 0.49، و22.1 - 11.2%، واقل من الصفر, على التوالي. تم تشخيص 232 نوع من الهائمات النباتية، تعود الى 88 جنسا، وقد تغلبت مجموعة الدايتومات Bacillariophyceae على بقية المجاميع اذ ضمت 143 نوع تنتمي الى36 جنسا شكلت نسبة 64.12% من العدد الكلي، وسجل 46 نوعا عائدة الى 28 جنسا من الطحالب الخضر Chlorophyceae وبنسبة 20.62 % و24 نوعا (15 جنسا) تعود الى الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae وكانت نسبتها 10.76%. ووجدت كل من الطحالب اليوغلينية Euglenophyceae باربعة انواع عائدة لثلاثة اجناس والطحالب البروات Pyrrhophyceae بنوعين. وتمثلت الصفوف الاخرى بالطحالب الحمر Rhodophyceae والطحالب الكارية Charophyeae والطحالب الصفراءXanthophyceae والطحالب الذهبية Chrysophyceae بنوع واحد لكل منهما.وكانت الانـواع السائدة خلال الدراسة Aulacoseira granulate وSyndra ulna وCyclotella meneghiniana وC. striata وCymbella affinis وNitzschia palea .تراوح العدد الكلي للهائمات النباتية خلال مدة الدراسـة بين952 - 7666 فرد / مللتر، اذ سجلت زيادة واضحة في العدد الكلي للهائمات النباتية خلال فصلي الربيع والصيف، وقد لوحظ في هذه الدراسة سيادة الدايتومات في جميع المحطات وقد وصلت نسبتها الى 99% من العدد الكلي للهائمات النباتية، وقد اظهر النوع Cyclotella ocellata وفرة نسبية عالية وصلت الى45.7% من العدد الكلي للهائمات النباتية.وقد تم حساب دليل نوعية المياه لغرض الشرب باستخدام 20 عاملا : المواد الصلبة الذائبة، والعسرة، والكالسيوم، والمغنيسيوم، والكلورايد، والقاعدية الكلية، والصوديوم، والرصاص، والحديد، والزنك، والنحاس، والكادميوم، والنيكل، والمنغنيز، والكروم، والاس الهيدروجيني، والعكورة، والامونيا، والنترات، والنتريت. اما دليل نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء المائية فقد استخدم 17عاملا في حسابه وهم : المواد الصلبة الذائبة، والكلورايد، والفوسفات، والاوكسجين الذائب، والرصاص، والحديد، والزنك، والنحاس، والكادميوم، والنيكل، والمنغنيز، والاس الهيدروجيني، والكدرة، ودرجة الحرارة، والامونيا، والنترات، والنتريت. واستخدم 15 عاملا لحساب دليل نوعية المياه لاغراض الري وهي : التوصيلية الكهربائية ونسبة امتصاص الصوديوم SAR ونسبة الصوديوم الذائب SSP وكاربونات الصوديوم المتبقية RSC والاس الهيدروجيني والبيكاربونات والكلورايد ووالرصاص والحديد والزنك والنحاس والكادميوم والنيكل والمنغنيز والكروم.اما دليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتية Phytoplankton - Index of Biological Integrity (P - IBI) فقد اختيرت 8 وحدات في حسابه وهي : كثافة الهائمات النباتية (فرد /ملليتر) والوفرة النسبية للطحالب الخضراء المزرقة والوفرة النسبية للطحالب الخضراء والوفرة النسبية للدايتومات المركزية والوفرة النسبية للدايتومات الريشية والوفرة النسبية للطحالب الصفراء والوفرة النسبية للطحالب البروات ودليل الغنى.واشارت نتائج الدراسة ان مياه نهر دجلة جيدة التهوية وعسرة وتميل للقاعدية وملوثة بالمعادن الثقيلة, وكانت قيم المعادن الثقيلة متذبذبة خلال مدة الدراسة باستثناء الرصاص اذ كانت تراكيزه عالية وتجاوزت الحدود المسموح بها للاستخدامات كافة، وكانت المحطة الثالثة اكثر تلوثا من المحطات الاخرى.اظهرت النتائج ان نوعية مياه نهر دجلة لغرض الشرب قد حصلت على تقدير رديء الى حافي، اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 45.7 - 58.4 وفي المحطة الثانية بين 41.8 - 55 وفي المحطة الثالثة 40.3 - 49.5، اذ سجلت اعلى قيمة للدليل في المحطة الاولى في شهر اب. في حين سجلت اوطا قيمة في شهر شباط في المحطة الثالثة، وبذلك تكون مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد غير صالحة للشرب. ان نوعية مياه نهر دجلة لاغراض معيشة الاحياء المائية قد حصلت على تقدير معتدل - حافي اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 71 - 48 وفي المحطة الثانية بين 71.8 - 47 وفي المحطة الثالثة 67.5 - 47.2، اذ سجلت اعلى قيمة خلال شهر شباط في المحطة الثانية، واوطا قيمة في المحطة الثانية ايضا خلال شهر تشرين الاول. لقد حصلت نوعية مياه نهر دجلة لغرض الري على تقدير جيدة - حافية اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 93.9 - 56.4 وفي المحطة الثانية بين 89 - 53.8 وفي المحطة الثالثة 82.7 - 53.8 اذ سجلت اعلى قيمة 93.9 في شهر كانون الاول في المحطة الاولى، بينما سجلت اوطا القيم 53.8 في شهر شباط في المحطتين الثانية والثالثة، ويمكن القول ان مياه نهر دجلة بشكل عام صالحة للاستعمال الزراعي. اما عن دليل التكامل الاحيائي للهائمات النباتية فقد حصل على تقدير جيد - مقبول اذ تراوحت قيمة الدليل في المحطة الاولى بين 72 - 58.7 وفي المحطة الثانية بين 72 - 55 وفي المحطة الثالثة 70 - 52.5 اذ سجلت اعلى قيمة للدليل في المحطة الاولى والثانية خلال شهر شباط، في حين سجلت اوطا قيمة للدليل في المحطة الثالثة خلال شهر حزيران وعند مقارنة قيم دليل التكامل الاحيائي بدليل نوعية المياه لغرض معيشة الاحياء نجد ان قيم كلا الدليلين لم ينخفضا الى الرديء ولم يصلا الى الممتاز، وقد تقاربت قيم الدليلين في اكثر الاحيان مع فارق التقدير. | This study was conducted from February 2010 to December 2010, the samples were collected every two months in three stations in Baghdad city. The study involved the assessment water quality of Tigris River for drinking, aquatic organisms life and for Irrigation by using water quality index. The indices were calculated according to Canadian water index (CCME WQI) and Phytoplankton Index of Biological Integrity (P - IBI).Many parameter were measured such as : temperature, pH, electrical conductivity, salinity, turbidity, total dissolved solids, dissolve oxygen, total alkalinity, carbonate, bicarbonate, calcium, magnesium, chloride, total hardness, sodium, potassium, reactive dissolved phosphate, nitrate, nitrite and ammonia. The results ranged between 10.1°, 8.4 - 7.1, 1340 - 590 µs/cm, 0.83 - 0.36 ‰, 41.03 - 13.15NTU, 367 - 866mg/l, 8.2 - 6.3 mg/l, 211.0 - 129.2 mg/l, carbonate undetectable, 28.8 - 6.45 mgHCO3/l, 142.6 - 55.04 mg/l, 35.96 - 20.09 mg/l, 34.9 - 24.9mg/l, 484 - 232 mg/l, 63.2 - 17.7 mg/l, 31.7 - 1.6 mg/l, undetectable - 0.30 mg/l, 33.2 - 2.21 mg/l, undetectable - 0.039 mg/l respectively. Some heavy metals were measured such as : chromium, cadmium, copper, iron, lead, manganese, nickel and zinc. There values ranged between undetectable to 1.3 mg/l, undetectable, 0.438 - 0.001 mg/l, undetectable - 0.077 mg/l, undetectable - 0.778 mg/l, 0.36 - 0.011mg/l, 0.08 - 0.011mg/l, undetectable - 0.1985 mg/l, undetectable - 0.0416 mg/l respectively. Sodium adsorption ratio(SAR), soluble sodium percentage (SSP), residual sodium carbonate(RSC) were calculated. There values ranged between 1.29 - 0.49, 22.1 - 11.2% and less than zero respectively.223 species of Phytoplankton were recorded belong to 88 genera. The Bacillariophyceae was the dominant group which included 143 species belong to 36 genera consist 64.12% from the total number of phytoplankton. 46 species belong to 28 genera of Chlorophyceae with 20.62 %. 24 species (15 genera) belong to Cyanophyceae which consist 10.76%. Four species (three genera) belong to Euglenophyceae and two species belong to Pyrrhophyceae was found. And the other groups Rhodophyceae, Charophyeae, Xanthophyceae and Chrysophyceae represented by one species for each one.The dominant species were : Aulacoseira granulate وSyndra ulna وCyclotella meneghiniana وC. striata وCymbella affinis وNitzschia palea .The total number of Phytoplankton were ranged between 952 - 7666 cell/ml. In this study diatoms observed in all stations, which was comprised 99% from the total number of phytoplankton composition.Water quality index for drinking calculated by using twenty factors, they were : total dissolved solid, hardness, calcium, magnesium, chloride, total alkalinity, sodium, lead, zinc, iron, copper, cadmium, nickel, manganese, chromium, pH, turbidity, ammonium, nitrite, and nitrate. Seventeen factors have been used to assess water quality index for aquatic organisms life : total dissolved solid, chloride, phosphate, dissolved oxygen, lead, iron, zinc, copper, cadmium, nickel, manganese, pH, turbidity, water temperature, ammonium, nitrite and nitrate. Fifteen factor have been used to assess water quality index for irrigation : electrical conductivity, sodium absorption ratio (SAR), dissolved sodium percentage, residual sodium carbonate, pH, bicarbonate, chloride, cadmium, chromium, copper, iron, lead, manganese, nickel and zinc. The study also was involved the assessment of water quality for Tigris River by using Phytoplankton Index of Biological Integrity (P - IBI) which was calculated by using eight metrices : Phytoplankton Density, relative abundance for blue green algae, green algae, central diatom, pennales, yellow green algae, pyrrophyte algae and species richness index.The results showed that water of Tigris River was well aeration, hard water, alkaline and polluted with heavy metals. The concentration of heavy metals fluctuated during the study period, except lead which have high concentrations and exceeded the limits for all uses. The station 3 was more polluted than other station.Water quality index of Tigris River for drinking was obtained bad - marginal (45.7 - 58.4) in station 1, (41.8 - 55) in station 2 and (40.3 - 49.5) in station 3. The highest index value was recorded in station 1 during august while the lowest value was recorded during February in station 3. so, water quality of Tigris River through Baghdad was unsuitable for drinking. Water quality index of Tigris River for aquatic organisms life was obtained moderate to marginal (48 - 71) in station 1, (47 - 71.8) in station 2, and (47.2 - 67.5) in station 3. The highest value was recorded in station 2 through February, and lowest value was recorded in station 2 through December. Water Quality Index of Tigris River for Irrigation ranged between good to marginal, (56.4 - 93.3) in station 1, (53.8 - 89) in station 2 and (53.8 - 82.7) in station 3. The highest value was recorded in station 1 through December and the lowest value was recorded in station 2 and 3 through February. Generally, we can say that water quality of Tigris River is suitable for irrigation. Phytoplankton Index of Biotic Integrity (P - IBI) was obtained good - acceptable, where the values ranged between (58.7 - 72) in station 1 (55 - 72), in station 2 and (52 - 70) in station 3. The highest value recorded in stations1 and 2 through February, and the lowest value observed in station 3 through Jun. When we compared between the two indices (P - 1B1 and WQI for aquatic organisms life) we found that both indices values don’t declined to bad and don’t reached excellent values, their values were closed up together in most times

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع عائلة قفازات الاوراق من رتبة نصفية الاجنحة من بعض Hemiptera : Cicadellidae مناطق العراق Taxonomic and Morphological Study of Some Species of Family : Cicadellidae (Order : Hemiptera) From Some Regions of Iraq

اسم المؤلف: رواء جعفر حميد
اسم المشرف: حسن سعيد جاسم الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الحشرات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study included taxonomic and morphological studies of fifteen species of leafhoppers belong to twelve genera of three subfamilies which are : Agalliinae, Deltocephalinae and Typhlocybinae of the Family : Cicadellidae, Order : Hemiptera.The studied species were collected from different regions of Iraq and thesewere species as follow : SubFamily : Agalliinae*1 - Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898**2 - Assuita megacephala SubFamily : Delatocephalinae**1 - Balclutha cytoptera*2 - Balclutha rubrostriata Melichar, 1903**3 - Balclutha xanthous**4 - Cicadulina laterostriata**5 - Circulifer wilsoni**6 - Eucelidius irakensis**7 - Exitianus transversus*8 - Neoalitarus argillaceus Mityaev, 1975**9 - Neoalitarus nigrosus**10 - Opsianus bronopunctatus*11 - Opsius cypriacus Lindberg, 1958*12 - Orosius albicinctus Distant, 1918 SubFamily : Typhlocybinae**Emposca phosphoviridisThe species marked by one star were regarded as new record species to the Iraqi fauna of Cicadellidae while those marked by two stars were regarded as new to science.Species Agallia gillettel Osboron and Ball, 1898 regarded as sample of the family.

دراسة مقارنة سمية مبيدي الاعشاب 2,4 - D والراوند اب الترا في سمكة البعوض Gambusia affinis Comparative Study of The HerbicidesToxicity 2,4 - D and Roundup Ultra in Mosquito Fish Gambusia affinis

اسم المؤلف: رنا عبد الفتاح كمال
اسم المشرف: عادل حسين طالب الزاملي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية التاثيرات السمية الحادة ,والمزمنة لمبيدي الاعشاب 2,4 - dichlorophenoxy acetic acide وRoundupultra في سمكة البعوض Gambusia affinis ,واستعملت لمبيد 2,4 - D تراكيز 10و15و20و25و30و35و40و45و50و55 ملغم/لترولمبيد راوند اب الترا التركيز 5و8و11و14و17و20و23و26و29و32 ملغم/لترولمدة 72 ساعة واستعمل كل من التركيز الوسطي القاتل LC50 والتغييرات السلوكية معيارا للتاثيرات السمية الحادة. اما في دراسة التاثيرات السمية المزمنة فقد استعمل تركيزين للمبيد2,4 - D هما 3.25 و6.5ملغم/لتر ومبيد الراوند اب الترا 1.78و3.56 ملغم/لترولمدة 60يوم واستعملت كل من التغييرات السلوكية والتغييرات في النمو والتغييرات النسجية معيارا لملاحظة التاثيرات المزمنة . اظهرت النتائج ان التركيز الوسطي القاتل LC50 32.5 ملغم/لترلمبيد 2,4 - D بينما بلغت قيمة التركيزالوسطي القاتل LC50 17.82ملغم/لترللمبيد راواند اب الترا لسمكة البعوض .كما اظهرت النتائج بان التغييرات السلوكية المتمثلة بالسباحة غيرالمنتظمة والهيجان وفقدان التوازن وزيادة حركة الغطاء الغلصمي وملامسة جدارن الحوض وافراز المخاط تزداد بزيادة التراكيز. اظهرت نتائج التغييرات في النمو انخفاضا معنويا تحت مستوى الدلالة (P< 0.05)في اوزان واطوال اسماك البعوض المتعرضة للمبيد راوند اب الترا اعلى بالمقارنة مع اوزان واطوال الاسماك المتعرضة للمبيد 2,4 - D واسماك مجموعة السيطرة. اظهر الفحص المجهري لنسج كل من غلاصم وكبد وكلى سمكة البعوض بعد تعرضها المزمن لمبيد الاعشاب الراوند اب الترا لمدة 60يوم تشوهات نسجية شديدة في الغلاصم في التركيز 1.78و3.56ملغم/لتروترتمثلت في فرط تنسج الصفائح الغلصمية الثانويه وضمور الصفائح الغلصمية الاولى وحدوث الانوريسما وحصول الشكل الهراوي واندماج الصفائح الغلصمية الثانوية ,اما التشوهات النسجية في الكبد فادت الى تفجي خلايا الكبد في التركيز1.78ملغم/لتر والتنكس الدهني الشديد في التركيز3.56 ملغم /لتر. اما التشوهات النسجية في الكلى فتمثلت في تنخر النبيبات الكلوية وانكماش الكبيبات الدمويه وانكماش النبيبات الكلوية. بينما التشوهات النسجية المرضية في اسماك البعوض المتعرضة لمبيد الاعشاب 2,4 - Dلمدة 60 يوم في التركيزين3.25 و6.5ملغم/لتراذ اظهرت الغلاصم فرط تنسج الصفائح الغلصمية الاولية وتضخم خلايا الصفائح الغلصمية الاولية والثانوية وتضخم الخلايا الكلوريدية وانفصال الخلايا الظهارية . اما في الكبد التغييرات النسجية المرضية ادت الى التنخر وتضخم خلايا الكبد في التركيز 3.25ملغم /لتر وكذلك حصول التغلظ النووي في التركيز6.5 ملغم/لتر. اما التغييرات النسجية المرضية في الكلية كانت خلومحفظة بومان من الكبيبة وانكماش الكبيبات الدموية. | This study included acute and chronic effects of 2,4 - D dichlorophenoxy asetic acid and RoundupUltra herbicides in mosquito fish Gambusia affinis using concentrations for studying acute effects for2,4 - D herbicide (10,15,20,25,30,35,40,45,50and55) mg/l and the concentrations for Round up ultra herbicide were(5,8,11,14,17,20,23,26,29and32) mg/l for 72 hours ,to determine the median lethal concentration ( LC50)and the behavioral changes were used as a standard of those effects .Whereas in the study of chronic effects two concentrations (3.25 , 6.5) mg/l for2,4 - D herbicides and (1.78 ,3.56) mg/l for Round up ultra herbicide were used for 60 days .The behavioral , histological, and growth changes were used as a standard to observe the chronic effects . The value of LC50 for 2,4 - D herbicide was (32.5) mg/l and (17.82) mg/l for Round up ultra herbicide for mosquito fish . The results show that behavioral changes as erratic swimming, hyperactivity, loss of equilibrium, increased in gills operculum and touching aquarium walls, they were increased with increasing concentrations.The results in growth changes showed reduction significantly in weights &tallness of mosquito fish that exposure to Round up ultra herbicide more than weights &tallness fishes exposuring 2,4 - D herbicide according to (P< 0.05) .The microscopic examination of the gills ,liver and kidney tissues of the mosquito fish after 60 days exposure to the herbicide Round up ultra showed sever pathological histological changes in gills in the concentration1.78and 3.56 mg/L like hyperplasia , lifting of the secondary Lamella, Anuerysm and congestion of secondary lamella, Atrophy of primary lamella ,Fusion of secondary lamella and the Club shape. In the liver, pathological changes were seen, leading to Vacuolation of the Hepatocytes in concentration1.78 mg/L and sever hepatocellular fatty degeneration in concentration3.56 mg/L., shrinkage of the renal tubules, necrosis in renal tubules and shrinkage of glomerulus where the pathological alterations in the kidney. While The pathological histological changes in mosquito fish after 60 days exposure to the herbicide 2,4 - D in gills were in the concentrations 3.25 and 6.5 mg/L hyperplasiaof primary lamella ,hypertrophy of primary and secondary lamella ,hypertrophy of chloride cells and Lifting of Epithelial cells. In the liver, pathological changes were seen, leading to Necrosis ,hypertrophy of hepatocells in concentration 3.25 mg/L also the pyknotic in concentration 6.5 mg/L . the pathological alterations in the kidney were vacancy of Bowman capsule and Shirnkage of Glomerulus.

الكشف عن بعض الحركيات الخموية والاخماج البكتيرية في مرضى الفشل الكموي Detection of some cytokines and bacterial infections in patients with renal failure

اسم المؤلف: رغد ناجي شهاب احمد
اسم المشرف: صدام حسين جبر الحيدري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Urine and blood samples was Collected 245 from patients who were resident of the industrial renal unit of Al - kadhamyiah (p) Teaching Hospital and Al - kindy Teaching Hospital from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 05/11/2014 - 13/1/2015 .The samples were cultured in a suitable culture media for isolation bacteria. Diagnosed bacteria isolation on agar medium accuracy and privacy (Chromagar Orientation medium) as dependent as a result of the diagnosis on the color interaction between the enzymes of different bacterial isolates and the components of the center, specialist this confirmed diagnosis using API 20E and API Staph system results showed that the percentages of the bacterial isolates were as follows The results showed that 140 samples were positive for bacterial growth, It included 66 urine samples, has been negative bacterial 61/66 (92.42%) the isolation of prevailing compared bacterial positive grams for gram - stain and number 5/66 isolates, which accounted for (7.58%) of urine, while the number of bacterial isolates negative for tinted grams 26/74 (43.51%) compared to the isolation positive for gram - stain and number of 48/74 (64.86%) bacterial isolates . results show that the bacteria E .coli was the most sought after the generation of patients with kidney failure as it was isolated 57.57 percent, and by 18.92% isolated from the blood of patients with kidney failure. K.pneumoniae bacteria, followed by 25.75%, then the bacteria S.aureus by 7.57% and were S. aureus bacteria are prevalent in the blood as isolated 45.59%, then all of P. mirabilis and P. aeruginosa bacteria 4.54% P.aeruginosa isolates ratio was one of the blood 13.51%. Isolated the bacteria E.cloacae and Enterococcus spp 2.70% - 18.92% of the blood samples .The results showed that the age groups most affected renal failure were in the age group (50 - 70 years) as showing that the disease affects males and females, the study showed that there is an increase significantly in some measures of patients, male and female , and these standards is protein acute phase, the low increase significantly in the level of IGg and molecules complement C3,C4 in the serum of patients. results showed significant decrease in response to IL - 4 in patients level average of 297.4 pg \ ml compared with the levels in the control group, which recorded 410.1 rate pg \ ml and was a significant decrease in the level P< 0.05. Results show the high level of IL - 17A ,but not significant in patients with Group 79.2 pg \ ml compared with the levels in the control group, average of 76.6 pg \ ml.Results showed a high level of IP - 10 concentration in patients, amounting to an average of 0.318 pg \ ml compared with a total of 0.282 pg control \ ml at the level P< 0.05. results recorded a high level of response for MCP - 1 in patients, amounting to an average of 186.1 pg \ ml compared with normal levels in 116.2 when the total control pg \ ml moral worth at the level P< 0.05. The results of the study slight rises in cytokine rate significant difference was not a statistically significant in all cytokine between males and females have the current study signals are consistent with another study that sex is not at the level of cytokine in the serum of patient.

تعدد الاشكال الوراثية لبعض انظمة مجاميع الدم في مرضى ابيضاض الدم النيقياني Genetic Polymorphism of Some Blood Group Systems in Myelogenous Leukemic Patients

اسم المؤلف: رشا حسن صدام السوداني
اسم المشرف: نصر فرحان عبد الله
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Assay has been made for ABO, Rh, Lewis, MNS and Duffy blood groups in a sample consisted of 80 affected individuals with chronic myelogenous leukemia (CML) and other sample consisted of 65 individuals affected with acute myelogenous leukemia (AML). Comparison have been made between each of the Leukemia sample with the control samples which consisted of 100 Healthy individuals.The results of the various comparisons were as follows : 1 - There is insignificant difference in frequency of ABO blood group in chronic and acute leukemia as compared with the control sample.2 - There are significant differences for Rh system patterns due to diminish of CcDee and ccDEe phenotypic patterns in both chronic and acute myelogenous leukemia, Moreover, there is an increase in CCDee pattern in CML and also an increase in CcDEe pattern in AML.3 - There are significant differences (P <0.001) for Lewis group blood in CML as compared with the control samples, also there is significant difference (P <0.05) in AML due to decrease in Le (a - b +) phenotype which resistant to the disease, and an increase in Le (a - b - ) phenotype.4 - There are significant differences (P <0.001) for MN blood group in both types of the disease (CML and AML), due to an increase in M + N + phenotype and decrease in M + N - phenotype. Also there is significant difference for Ss blood group in (AML), because of the increase in S + s + phenotype and decrease in S - s+ phenotype.5 - There is significant difference for Duffy group blood in CML, since the Fy (a + b - ) phenotype was decreased and the Fy (a - b +) was increased. But there is no significant difference in (AML).6 - There is no existence of disturbance or deviation in Hardy - Weinberg equilibrium for ABO, Rh and Lewis.7 - There is disturbance in Hardy - Weinberg equilibrium apparently existing for the MN blood group in both types of Leukemia as compared with the control sample . There is an increase in frequency of (N) allele in the patients and a decrease in frequency of (M) allele. There is also deviation (P <0.001) for Ss blood group in AML since allele S was increased ,but allele s was decreased in the patients as compared with the control sample .Moreover , there is deviation from this equilibrium for Duffy group blood in the overall Leukemia sample. The higher frequency of Fy ͣ allele was found in AML, while the higher frequency of Fyb and Fy alleles were found in CML . Such deviations from Hardy - Weinberg equilibrium in hematological malignancies and not deviated in the control sample may give attention about the etiology of the disease concerned.

تعدد النمط الوراثي لجين اصلاح الضرر للـ (DNA) OGG1) لعراقيين مصابين بمرض ابيضاض الدم النقياني الحاد Genetic polymorphism of (DNA)repair gene (OGG1) in Iraqi acute Myeloid Leukemia patients

اسم المؤلف: رشا عبد الكاظم طعمة
اسم المشرف: بتول علي شهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لمعرفة توزيع الانماط الوراثية للجين (Oxoguanine glycosylase - OGG1) في المجتمع العراقي وعلاقته بمرض ابيضاض الدم النقياني الحاد (Acute Myeloid Leukemia - AML) ، اذ شملت الدراسة (68) مريضا مصابين بمرض (AML) مع (60) شخصا من الاصحاء (مجموعة السيطرة) . واخذت عينات الدم من مستشفى بغداد التعليمي (شعبة امراض الدم) والجامعة المستنصرية / ( المركز الوطني لبحــوث وعلاج امراض الـــدم ) وللمدة من تشرين الثاني 2014 ولغاية شباط 2015 . كما تم تقسيم مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة الى اربع مجموعات فرعية بحسب التدخين والجنس فقد صنفت الى ذكر، انثى ، مدخن ، غير مدخن ، وقد اخذت لهم نتائج المؤشرات الخاصة بصورة تحليل الدم الكامل Complete Blood picture) ).اما الكشف عن تعدد النمط الوراثي للجين OGG1)) فقد اجري في مختبر البيولوجي الجزيئي/ كلية العلوم للبنات باستخدام تقنية تفاعل البوليميرز المتسلسل(Polymerase Chain Reaction - PCR) وكذلك استخدمت تقنية تحديد تعدد الاشكال لطول القطعة (Restriction Fragment Length Polymorphism - RFLP) واستخدام الانزيم القاطع Fun4H1)) . اظهرت نتائج الدراسة ان هناك فروقا معنوية بين المرضى والاصحاء في جميع المؤشرات السريرية، وفيما يخص علاقة هذه المؤشرات مع الفئات العمرية للمرضى فقد اظهرت المؤشرات(White blood cells Count - WBCC) و(Red blood cells Count - RBCC) و(Hemoglobin - Hb Concentration) فروقا معنوية فيما بينها في حين لم تظهر اي فروقا فيما بينها فيما يتعلق بالجنس. كما اوضحت نتائج دراسة تعدد النمط الوراثي ان هناك فروقا معنوية بين المرضى، اذ كانت النسبة 30.88, 67.65, 1.47% لكل من الانماط (GG , CG , CC) على التوالي وبفرق معنوي عالي (P<0.01) . اما في السيطرة فقد كانت 38.33 , 60.00 , 1.67% لكل من الانماط الوراثية GG , CG , CC)) وعلى التوالي وبفرق معنوي عالي (P<0.01). في حين لم تكن الفروق بين هذه الانماط وبين المرضى والاصحاء معنوية الا في النمط الوراثي ((CC اذ كانت 30.88 , 38.33% لكل من المرضى والاصحاء على التوالي. اظهرت النتائج ان توزيع تعدد النمط الوراثي في مجموعة السيطرة بحسب الجنس ان نسبة الافراد الذين يحملون النمط الوراثي الحاوي على الاليل المطفر(G) في الذكور 40.52% وفي الاناث كانت النسبة 42.86% ، اما في مجموعة المرضى كانت النسبة الاكبر في الذكور اذ بلغت 69.44% وفي الاناث 65.63% .اما توزيع الانماط الوراثية بحسب التدخين فقد اظهر ان هناك فرقا معنويا بين تعدد الانماط للمرضى اذ كان للمدخنين 1.47 , 62.07 , 34.48% وغير المدخنين 0.00, 71.79 , 28.21% لكل من CC , CG , GG)) وعلى التوالي اذ كان هناك اختلاف معنوي بين المرضى المدخنين وغير المدخنين في النمط الوراثي (CG) . اما مجموعة السيطرة فقد كانت نسبة المدخنين هي 2.94, 41.18 , 55.88% ولغير المدخنين 0.00, 42.31 ,57.69% لكل من GG), CG،CC) على التوالي. فقد اختلفت الانماط الوراثية معنويا فيما بينها ولم تكن الفروق معنوية بين المدخنين وغير المدخنين.واظهرت نتائج توزيع الانماط الوراثية بحسب الفئة العمرية بان اكثر المرضى كانوا في الفئة العمرية (30 - 50 سنة) وكان المجموع (32) مريضا. وقد بينت النتائج ان في الفئة الاقل من30 سنة كانت نسبة الانماط ) 0.00%, 76.47% , 23.53% ) ، وفي الفئة )30 - 50) كانت (3.13%, 68.75 %, 28.13%) اما في فئة الاكثر من (50) سنة فقد كانت (0.00%, 57.89% , 42.11% ) لكل من الانماط (CC , CG , GG) وعلى التوالي. اذ كانت الفروق معنوية بين الانماط في كل فئة من الفئات (P<0.01) وكذلك بين الفئات لكل من النمطين CC) وCG) فقط (P<0.01). اما توزيع الانماط الوراثية بحسب السجل العائلي اظهر ان (25) فردا من مجموع (68) لم يكن لديهم سجل عائلي للمرض و( 19) فردا من الذين لديهم اقارب من الدرجة الاولى مصابين بالمرض و(24) فردا من الذين لديهم اقارب من الدرجة الثانية، اختلفت الانماط الوراثية فيما يتعلق بدرجة القرابة وكذلك بين درجات القرابة لكل من النمطين ((CC , CG فحسب.توصلت نتائج هذه الدراسة الى ان اكثر الانماط الوراثية انتشارا في المجتمع العراقي (كاصحاء ومرضى) هو النمط الوراثي (CG) للجين ((OGG1 وان الجنس والتدخين والسجل العائلي لاتعد من عوامل الخطورة في حين من الممكن عد العمر عامل من عوامل خطورة للاصابة بـ(AML) . | This study was conducted to determine the distribution of the genetic patterns of gene Oxoguanine glycosylase also known as (OGG1) in Iraqi population and its relationship with (Acute Myeloid Leukemia - AML) disease.The study was included (68) AML patients with (60) healthy people. Blood samples were taken from the Baghdad Teaching Hospital (Department of Hematology) and from Al Mustansiriya University / (The National Center for research and treatment of blood diseases), for the period from November (2014) until February (2015). Genotyping of (OGG1) was carried out by (Polymerase Chain Reaction - PCR) - (Restriction Fragment Length Polymorphism - RFLP) using enzyme restriction (Fun4H1).The study results showed that there were significant differences between patients and healthy controls, in Blood picture parameters, As well, the relationship between Blood picture with the age groups for patients group, (Hemoglobin - Hb g/dl concentration), (Red blood cells Count - RBCC) and (White blood cells count - WBCC) have shown significant differences between Patients and Healthy, while did not show any differences among them according to Gender.The genotyping results showed that there were significant difference between all genotype polymorphism of (OGG1) in both patients and controls. It was (30.88 ، 67.65 ، 1.47%) in patients and was ( 38.33 60.00 ، ، 1.67% ) in controls for each of the (CC, CG and GG) respectively (P<0.01) .The difference between patients and controls was significant only in (CC) genotype, It was (30.88 and 38.33%) for both patients and controls respectively.The distribution of the polymorphism genotype according to Gender in the control group, shown that the number of individuals who carry the genotype containing the allele mutagenic (G), equal in the both males and females, as were (13) individual, and the patients had the largest number is in the male reaching (26), and in females (21).The distribution of genotypes in according with smoking, showed that there was a significant difference between the polymorphism of patterns for smokers patients (34.48, 62.07, 1.47%) and non - smokers (28.21, 71.79, 0 : 00%) for each of the CC, CG and GG respectively . There is only significant difference between patients smokers and non - smokers in genotype (CG).In control , the proportion of healthy smokers was (55.88, 41.18, 2.94%) and non - smokers was (57.69, 42.31, 0.00%) for each of the (CC, CG and GG), respectively. Genetic patterns varied significantly among them were not significant differences between smokers and non - smokers.Results of distribution of genotypes in accordance to the age group showed that most patients were in the age group between (30 - 50 years) and it was total (32) patients. The results showed that in the category of least 30 years the proportion of genetic patterns were (23.53, 76.47, 0.00%) and in category (30 - 50) were (28.13, 68.75, 3.13%) but in the class of more than (50) years were (42.11, 57.89, 0.00%) for each of the patterns (CC, CG, GG) respectively.There were significant differences between the patterns in each of the categories (P<0.01), as well as between the groups for each of the types (CC) and (CG) only (P<0.01).The distribution of genotypes according to the family record has showed that (25) person of the total (68) did not have a family history of the disease and (19) individuals who have first - degree relatives with the disease, and (24) individuals who have relatives from the second - degree, Genetic patterns differed among themselves in relation with the degree of kinship, as well as degrees of kinship between both types (CC, CG) only.The results of this study found that the most prevalent genetic patterns in Iraqi population (Healthy and patients) represents the genotype of (CG) the gene (OGG1) and Gender, smoking, and family record do not represent the risk factors but age could be considered a risk factor for the old injury to (AML).

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض السكري النوع الثاني لمرضى عراقيين The Association of Glutathione - S - Transferase (GSTP1) Genetic Polymorphism in Iraqi Patients with Diabetes MellitusType2

اسم المؤلف: رغد حميد رشيد
اسم المشرف: بتول علي شهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة لمعرفة ارتباط جينات ازالة السمية لمتعدد النمط الوراثي GSTP1في ظهور مرض السكري النوع الثاني. شملت الدراسة 110 عينة دم لافراد عراقيين. 60 فرد اشخاص مصابين بداء السكري النوع الثاني مشخصين حسب المركز الامريكي للسكري وتراوحت اعمارهم بين (32 - 83 ) سنه اختيروا من مركز السكري التابع للجامعة المستنصرية المعالجين من ارتفاع سكر الدم.50 فرد اصحاء اختيروا كمجموعة سيطرة. خذت عينات من البلازما والدم. عينات البلازما شملت قياس المؤشرات السريرية للمرضى والسيطرة تضمنت مستوى الكلوكوز بالدم , الكوليسترول الكلي ,الدهون الثلاثية , مستوى اليوريا, الدهون ذات الكثافة العالية , الدهون ذات الكثافة الواطئة , الدهون ذات الكثافة الواطئة جدا ,بالاضافة الى كتلة الجسم وضغط الدم. اضافه الى تقييم ارتباط هذه العوامل مع تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1. الدراسة الجزيئيـة شملت استخلاصDNA واستخدام التضاعـــف التسلسـلي (polymerase chain reaction)و تباين اطوال قطع الدنا المقيدة (Restriction Fragment Length Polymorphism) للتحري عن التعدد الوراثي لجينات GSTP1 لجميع افراد هذه الدراسة.الدراسة الجزيئية تمت في مختبر البيولوجي الجزيئي /قسم علوم الحياة/ كلية العلوم للبنات. ظهرت النتائج ان المؤشرات السريرية (العمرAge, الجنسSex , كتلة الجسم body mass index, نسبة اليوريا في الدمblood urea , ضغط الدم الانبساطيdiastolic blood pressure والانقباضي systolic blood pressure والبروتينات الدهنية عالية الكثافة High Density Lipoproteins ) في كلا من المرضى والسيطرة لم تختلف معنويا بينما كان مستوى الكلوكوز بالدم fasting blood sugar في المرضى (184.36±7.64) mg/dl تتراوح ما بين ((341 - 100 اما في مجموعة السيطرة فقد كانت (96.06± 3.72 )mg/dl وتراوحت ما بين ((115 - 83 وكان الفرق معنويا .p< 0.00 اظهرت النتائج ان كلا من مستوى الكوليسترول الكلي((Total Cholesterol ومستوى الدهون الثلاثية (Triglyceride) في المرضى كانت ,184.56±68.66) mg/dl (161.95 ± 10.28 على التوالي واما في مجموعة السيطرة فقد كانت 98.41±9.00) mg/dl, 118.16 ± 7.11) على التوالي وكان الفرق معنويا.p<0.00 وكذلك اظهرت النتائج ان كلا من مستوى البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (Low Density Lipoproteins) ومستوى البروتينات الدهنية ذات الكثافة الواطئة جدا في المرضى كانت,106.00 ± 5.01) mg/dl, 31.58 ± 2.10 ) على التوالي واما مجموعة السيطرة فقد كانت 91. ± 4.90), (22.86 ± 1.25وكان الفرق معنويا p<0.000. نتائج التحري عن تعدد النمط الوراثي لجينات GSTP1 وتوزيعه ضمن مجموعات الدراسة اظهرت ان النمط الوراثي البري Ile/Ile والنمط الوراثي الهجين Ile/Val كانا مختلفين معنويا في مجموعة المرضى (60%, 36.67%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (68%, 32%) وكان الفرق معنوياp<0.000 . النمط الوراثي المطفرVal/Val ظهر في المرضى فقط وكان بمعدل (3.33%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0.00%) وكان الفرق معنويا p<0.000. استنادا الى النتائج المذكورة سابقا فان GSTP1 من الممكن ان يكون له دور مهم في امراضيه السكري النوع الثاني بينما لم يظهر تاثيره على مؤشرات الدهون. | This study was carried out to investigate the relationships between the T2DM patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1, and measurement of some clinical parameters of patients and controls. The study included 110 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with Type2 diabetes were diagnosed according to the American Diabetes Association criteria (American Diabetes Association, 2007); their age range were between (32 - 83) years selected from those attending the National - Diabetes Center/ AL - Mustansiriya - University for treatment with history of hyperlipidemia and hypertension. Fifty individuals healthy also included as control group. Sera and blood were used as samples. The measured parameters in serum included (biochemical testes) : Fasting Blood Sugar (FBS), Total Cholesterol (TC), Triglycerides (T.G), Blood Urea (BU), High Density Lipoprotein (HDL), Low Density Lipoprotein (LDL) and Very Low Density Lipoprotein (VLDL). Additionally, body mass index (BMI) and blood pressure (BP) were determined. Moreover, the correlation between genotyping of Glutathione S - Transferase P1 and all studied parameters was carried out. Molecular studies involved DNA extraction and PCR (Polymerase Chain Reaction) - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) was carried to detect the genetic polymorphism of glutathione - S transferase gene Pi class for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department Sciences/ College for women. The results showed that (age, sex, body mass index, blood urea diastolic blood pressure, systolic blood pressure, high density lipoproteins) for patients and control group were not significant while for the level of fasting blood sugar was (184.36±7.64) mg/dl, ranging from (100 - 341) in patients while in the control group it was (96.06±3.72) mg/dl and ranged between (83 - 115) and it was a significantly difference (P < 0.000).The results showed that total cholesterol and Triglycerides in patients (184.56±68.66 mg/dl, 161.95 ± 10.28 mg/dl) respectively were higher significantly than in controls (98.41±9.00, 118.16 ± 7.11) mg/dl (P <0.001). The data also showed that both of Low density lipoproteins and Very low density lipoproteins in patients were (106.00 ± 5.01 mg/dl, 31.58 ± 2.10 mg/dl) respectively and highly significantly difference (P < 0.001) than in controls (91.27 ± 4.90 mg/dl, 22.86 ± 1.25 mg/dl)(P <0.001) respectively. The results of genetic polymorphism of GSTP1 distribution among the studies groups showed that wild type Ile/Ile and heterozygous Ile/Val were higher significantly between patients (60 %, 36.67 %) and in controls (68 %, 32 %) respectively. The homozygous mutant Val/Val genotype was elevated in the DM patients only and it was (3.33%) compared to controls (0.00%). According to data mentioned above showed that GSTP1 genotype polymorphisms may play an important role in the pathogeneses of type2 diabetes mellitus while its effect on all lipid profile indicators did not show any significant difference.

المعالجة النباتية لعنصري الرصاص والنحاس باستعمال نبات عصا الراعي Polygonum sp.مختبريا Phytoremediation of lead and copper elements a by polygonum sp. Plant in Laboratory

اسم المؤلف: رواء حسان محمد عبد الله
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للتعرف على دور نبات عصا الراعيPolygonum sp. في ازالة بعض العناصر الثقيلة من المياه ، وقد استعملت تراكيز مختلفة من عنصري النحاس والرصاص بصورة منفردة وهي ( 10 ، 20 ، 30 ) ppm ، ولمدة تسعة ايام لكل تركيز, وقدرت كفاءة النبات في ازالة العناصر الثقيلة من المياه كنسب مئوية للازالة في الساق والاوراق. بينت النتائج ان النبات له القابلية على تراكم عنصري الرصاص والنحاس في الساق والاوراق بكميات كبيرة. وكان للاوراق القابلية على تراكم العناصر الثقيلة اكثر مما هي عليه في الساق حيث ان الورقة هي المكان الاخير الذي تنتقل اليه العناصر . وجدت فروق معنوية لكل من الاوراق والساق لكلا العنصرين عند مستوى احتمالية P≤0.05، فقد وجدت فروق معنوية بين العنصرين في اغلب التراكيز المدروسة خلال مدة التجربة. اظهر النبات نسب ازالة مئوية مرتفعة لعنصر النحاس وكانت بين (32.02 - 87.01) % وهي كالاتي : - 49.35) ،80.97،87.01)% للتراكيز المدروسة بعد مرور تسعة ايام على التجربة على التوالي ، بينما تراوحت نسب ازالة عنصر الرصاص بين 71.41)%97.85 - ) % وهي كالاتي : (97.85 ، 96.71 ، 92.93 ) % للتراكيز المدروسة على التوالي بعد مرور تسعة ايام من التجربة ، وتم قياس نسبة تركيز العناصر بعد (6 - 3 و9) ايام من التجربة . بينت النتائج ان النسبة المئوية لازالة عنصر الرصاص اعلى من النسبة المئوية لازالة عنصر النحاس ،لكن عنصر النحاس تاثيراته المظهرية على النبات اسرع من عنصر الرصاص، اذ بدات الاوراق بالذبول عند المعاملة بعنصر النحاس اسرع مما هو عليه عند المعاملة بالرصاص . | The present study was carried out to determine the ability of Polygonum SP. for removing of heavy element from water. Different concentrations of Copper and Lead (10, 20 and30) ppm were used for nine days to each concentration. The plant efficiency in removing heavy element from water was estimated as percentage removal ratios in stem and leaves. Results were showed that the plant can accumulate copper and lead in stem and leaves in large amounts. leaves ability to accumulate heavy element was more than stem. Significant differences were found between stem and leaves for both elements in probability level P≤0.05, as well as between both elements for almost concentrations during experiments. Polygonum sp. showed high removal percent ratio of Copper which were ranged between 32.02 - 87.01% as follows : 49.35 , 80.97 and 87.01 for the studied concentrations, respectively, after nine days. While the removal ratios of Lead were ranged between 97.85 - 71.41 as follows : 97.85, 96.71, and 92.93 for studied concentrations after (3,6,9) day. Results were showed the percentage removal to Lead more than Copper,but Copper was more affect on morphology for plant than Lead, the leaves start shriveling when they were treated with Copper and faster than those treated with Lead.

طفيليات بعض من اسماك نهر دجلة في منطقة الشواكة في محافظة بغداد / العراق Parasites of Some Fishes of Tigris River in Al - Shawwaka Region Baghdad City - Iraq

اسم المؤلف: رباب عبد الرحيم رشيد
اسم المشرف: عبد علي جنزيل جبارة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: During the period from September 2015 till April a total of 498 fishes belonging to 14 species namely : 23 Alburnus caeruleus, 9 Arabibarbus grypus, 35 Carasobarbus luteus, 56 Chondrostoma regium, 42 Ctenopharyngodon idella, one Cyprinion kais, 48 Cyprinionmacrostomum, 61 Cyprinus carpio, 50 Leuciscus vorax, 6 Luciobarbus esocinus, 36 Luciobarbus xanthopterus, 4 Mesopotamichthys sharpeyi,(from family Cyprinindae), 68 Captodon zillii (from family Cichlidae), 59 Planiliza abuc (from family Mugilidae). Were collected from Tigris River at Al - Shawwaka region.As the result of external and internal examination for fish paras these fishes were infected with 67 species belong to different groups included eight species Ciliophora from genus Trichodina, six species of Myxobolus, 47 species of Monogennea two species of Cichlidogyrus, 25 species Dactylogyrus, 18 species of Gyrodactylus, one species of Eudiplozoon, one species of Microcotyle sp., two species of Neoechinorhynchus (N.), one species of Nematoda (Procamallanus), and three species of Crustacae (two species of Ergasulus, one species of Lamproglena).14 parasites species were recorded for the first in Iraq in the present study. These included two species of Ciliopora (T. inversa, T. truttae), one species of Myxoblus (M. problematicus), one species of Dactylogyrus (D. nanoides), 10 species of Gyrodactylus (G. branchicus, G. cotti, G. dzhalilovi, G. kearni, G.magnus, G. matovi, G. mikailovi, G. prostate, G. rarus, G. seravshani).Also in this present study 32 species of fishes were recorded as anew host for different species of parasites for the first time in Iraq. As well as the prevalence and mean intensity of infection with parasites. Isolated the parasites from the gills and intesten of fishes in fection and verified in different number and different species of parasites. Among the inspected fishes cyprinus carpro harbored the highest number of parasites species (23), followed by Captodon zillii (14), Chondrostoma regium, Carasobarbus luteus and Cyprinion macrostomum (11), Planiliza abu (10), Ctenopharyngodon idella (nine),Leuciscus vorax, (five), Alburnus caeruleus and Luciobarbus xanthopterus (for), and Mesopotamichthys sharpeyi, Cyprinion kais, Arabibarbus grypus and Luciobarbus esocinus (one).

التحري عن بعض جينات عوامل الضراوة لبكتريا Cronobacter sakazakii المعزولة من حليب الاطفال الرضع المجفف وعينات سريرية Detection of some virulence factors genes of Cronobacter sakazakii isolated from Powder infant formula and clinical samples

اسم المؤلف: ذاريات عبد الرحمن مطلك الجبوري
اسم المشرف: لمى عبد الهادي زوين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لعزل وتشخيص بكتريا Cronobacter sakazakii من حليب الاطفال المجفف ومن الحالات السريرية لاطفال دون عمر السنتين . اذ جمعت230) ) عينة، شملت (30) عينة حليب اطفال لاعمار مختلفة دون عمــــــــــر السنتين من الاسواق المحلية في بغداد, و(200) عينة سريرية، تضمنت 50 عينة من كل من (سائل النخاع الشوكي ودم وخروج وبول) من مستشــــــــفى مدينة الطب (حماية الاطفال ) ومستشفى الطفل المركزي، للمدة من الاول من ايلول 2015الـــــى الاول من كانون الثاني 2016م. زرعت العينات على اوساط زرعية خاصة، اذ زرعــــــــــت عينات (الحليب) على وسط Violet red bile glucose agar وزرعت العينات (السريرية) على وســــــــــــــــــــــــــــط MacConkey agar، وزرعت جميع العينات (الحليب والسريرية ) علــــــــــــــــــى وسط Tryptone soy agar ، ثم زرعت على وسط Biriiltent Enterobacter sakazakii agar. شخصت العزلات بالفحوصات المجهرية والمزرعية والكيموحيوية ، فضلا عن التشخيص باستعمال جهاز Vitek - 2 اذ امكن الحصول على 19 عزلة، وكانت جميعها تعود لبكتيريا Cronobacter sakazakii، وتضمنت 6 عزلات بنسبة تلوث 9.09 % (اذا كانت عزلة واحدة من عينات حليب Novolac Allernova وعزلتين من عينات حليب Novolac AD وثلاث عزلات من عينات حليــــب Dialak1) و13 عزلة بنسبة تلوث 6.5 % (موزعة بواقع 6 (%12) عزلات من عينات سائل النخاع الشوكي و7 ( %14) عزلات من عينات الدم) ولم يتم الحصول على البكتريا من عينات الخروج والبول. بينت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة مظهريا بان جميع العزلات البكتيرية كانت قادرة على احداث حركة Swimming بقطر يتراوح بين ( 9 - 1ملم ) وSwariming بقطر يتراوح بين 40 - 1)ملم) , وقدرتها ايضا على تكوين الغشاء الحيوي Biofilm باستخدام ثلاث طرائــــــــــق، اذ بينت النتائـــج قدرة العزلات البكتيرية علـــــــى تكويــــــــن الغشاء الحيوي بطريقــــــــــــــة التخطيط على وسط احمر الكونغو الصلب Congo red agar اذ ان 16 عزلة من اصل 19 عزلة تعود لبكتريا C.sakazakii بنسبة 84.21% قادرة على تكوين الغشاء الحيوي على وسط احمر الكونغو الصلب التي هي 4 عزلات بكتيرية بنسبة 21.05% كانت منتجة للغشاء الحيوي وبشكل قوي 10 عزلات بكتيرية بنسبة 52.63% كانت منتجة للغشاء الحيوي وبشكل متوسط وعزلتين بكتيريتين بنسبة 10.52% كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل ضعيف، في حين كانت 3 عزلات بكتيرية بنسبة 15.79% غير قادرة على تكوين الغشاء الحيوي ، اما طريقة Tubes method كانت جميع العزلات قادرة على تكوين الغشاء الحيوي، فقد وجد ان 4 عزلات بكتيرية بنسبة %21.05 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل قوي، و13 عزلة بكتيرية بنسبة 68.42 % كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل متوسط ، وعزلتين بكتيرية بنسبة 10.53 % كانت منتجة للغش اء الحي وي بشكل ضعيف ، وطريقة Microtiter plate method اذ ان 9 عزلات بكتيرية بنسبة %47.37 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل قوي و8 عزلات بكتيرية بنسبة 42.11 % كانت منتجة للغشاء الحيـــــــــوي بشكل متوسط وعزلتين بكتيرية بنسبة %10.53 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل ضعيف . اظهرت نتائج فحص الحساسية باستعمال جهاز Vitek - 2 كونه اكثر كفاءة مقارنـــــــــــــــة بالطريقة التقليدية اتجاه 18 مضــــ ادا حيويــــ ا لتحديد التركـــــ يز المثبـــــــــــــــــط الادنـــ ـى( MICs) Minimum Inhibitory Concentration, وبينت النتائج ان جميع العزلات البكتيرية كانت حساسة Sensitive بنسبة 100% لعدد من المضادات الحيوية المستعملة في الـــدراسة وهـــــــــــي Ampicillin - Sulbactam وCefotaxim وCefpodoxime وCeftazidime وCiprofloxacim وGentamicin وImipenumو Levofloxacin وMeropenem وTazobactam - Piperacillin وTrimethoprim - Sulfamethoxaole وTigecyclin. بينما اختلفت العزلات البكتيرية فكانت مقاومة Resistance او متوسطة المقاومة، اذ كانت نسبة المقاومة اتجاه المضاد الحيوي Cefuroxim وCefuroxim Axetil بنسبة 5.26 % على التوالي، في حين كانت متوسطة الحساسية اتجاه المضاد الحيوي Ampicillin بنسبة %5.26 وللمضاد Cefuroxim بنسبة %15.79, وللمضاد Cefuroxim Axetilبنسبة 52.63% وللمضاد Nitrofurontion بنسبة %15.79 . تم التحري عن بعض جينات الضراوة لبكترياC.sakazakii وتضمنت هذه الجينات كلا من ompA( الذي يشفر عن بروتين A للـ Outer membrane ) وzpx (الذي يشفر عن انزيم Proteases) وfliD ( الذي يشفر عن (Flagella (D)واظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة 100% في جميع العزلات. | This study was conducted to isolate and identification of Cronobacter sakazakii from children milk powder and clinical cases of children under two years . It collected (230) samples , included (30) sample children's milk for various ages under two years from the local markets in Baghdad, and (200) from clinical cases , which included (50) samples from each of the (Cerebrospinal Fluid and blood and stool and urine) of the Medical City Hospital ( the protection of children) from Central Children Hospital and Children's Protection Educational Hospital during the period between 1/9/2015 to 1/1/2016. Specimens planted among agricultural private, as planted specimens (milk) to the center of Violet red bile glucose Agar and planted specimens (clinical) at the center of MacConkey agar and planted all samples (milk and clinical) on the central Tryptone soy agar, then planted on the central Biriiltent Enterobacter sakazakii agar. Diagnosed isolates tests microscopic farm and biochemical, as well as diagnostics using Vitek - 2 device as possible to get 19 in isolation, they were all returned to the Cronobacter sakazakii, included (6 (9.09%) isolates included isolation of one isolate from Novolac Allernova and two isolate from Novolac AD and three isolates from Dialak1 ) and 13 isolated (6.5%) included ( 6 (12%) isolates from CSF and 7 (14%) isolates from blood) don't found in stool and urine samples. The results of the investigation of some virulence factors shoewd that all bacteria isolates were able to Swimming motility with a diameter ranging (9 - 1 mm) and Swariming motility with a diameter ranging (40 - 1 mm) and so their ability form biofilm by using three methods. The results show the ability of isolates to form biofilm by using Congo red media methods where it 16 out of 19 isolated bacteria belonging to C.sakazakii increased by (84.21%) able to form biofilm on the central Congo red steel which is 4 (21.05%) were strong production biofilm , 10 (52.63%) were intermediate production biofilm and 2 (10.52% ) were weak biofilm formation , while the 3 (15.79%) unable to form biofilm, The tubes method were all isolates were able to form biofilm, it were found that 4 (21.05%) isolates strong, and 13 (68.42%) intermediate and 2( 10.53%) weak biofilm formation , Microtiter plate method gave 9 (47.37%) isolates strong and 8 (42.11%) intermediate and 2 (10.53%)weak biofilm formation. The susceptibility measured by Vitek - 2 was its more efficient than the traditional methods towards the direction of 18 antibiotic to determine the Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) Minimum. The results showed that all bacterial isolates were sensitive 100% for a number of antibiotics used in the study, a Ampicillin - Sulbactam and Cefotaxim and Cefpodoxime and Ceftazidime and Ciprofloxacim and Gentamicin and Imipenum and Levofloxacin and Meropenem and Tazobactam - Piperacillin and Trimethoprim - Sulfamethoxaole and Tigecyclin. While different bacterial isolates were resistant Resistance or medium resistance, as the proportion of the resistance counter direction vital Cefuroxim and Cefuroxim Axetil was (5.26%) respectively. Whereas , the isolates show intermidate sensitivity towards the Ampicillin with ratio ( 5.26%) Cefuroxim (15.79%), Cefuroxim Axetil (52.63%) and Nitrofurontion (15.79%). Has been investigating some of the genes of pathogenic bacterium C.sakazakii These included genes both ompA (which encodes for Outer membrane protein A) and zpx (which encodes for an enzyme Proteases) and fliD which encodes for (Flagella (D) and the results showed the presence of these genes by 100% in all isolates.

جينات تحسس الزحام وعلاقتها مع بعض عوامل الضراوه في بكتريا الزوائف الزنجاريه Correlation of Quorum Sensing Genes with Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: دعاء كاظم منصورالموسوي
اسم المشرف: منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 60 عزله من البكتريا السالبه لصبغه كرام مشخصه مبدئيا بانها بكتريا الزوائف الزنجاريه من عده مستشفيات في بغداد ومنها مستشفى ابن البلدي ومستشفى الحروق ومستشفى بغداد التعليمي وكذلك من المختبرات التعليميه في مدينه الطب خلال الفتره من بدايه شهر ايلول لغايه نهايه شهر كانون الاول لسنه 2013 تضمنت هذه العزلات22 عزله من خمجات الحروق و18 عزله من خمجات الجروح و9عزلات من عينات القشع لمرضى مصابين باصابات الجهاز التنفسي و6 عزلات من الدم وعزلتين من خمجات المجاري البوليه و3عزلات من مسحات الاذن. شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسط الماكونكي الصلب ووسط الدم الصلب وكذلك وسط السيدوموناس الصلب بعد ذلك تم اجراء بعض الفحوصات البايوكيميائيه مثل فحص الكاتليز والاوكسيديز تبع ذلك تشخيص العزلات جينيا باستخدام تفاعل البلمره التسلسلي باعتماد جين .rpsL اكدت النتائج ان جميع العزلات قيد الدراسه هي بكتريا الزوائف الزنجاريه . خضعت 60 عزله عائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه لاختبارفحص الحساسيه تجاه 12 مضادا حيويا بطريقه الانتشار واظهرت النتائج وجود مقاومه عاليه بين عزلات الدراسه لـــمضادات Tetracycline (100%) ,Ceftazidime (100%) ,Cefoxitin (100%) , Ceftriaxone (85 %) , Cefepeme (83.3%), Amoxillin/Clavulanic acid (81.6 %),Chloramphenicol (78.3 %) وانها كانت ذات مقاومه متوسطه لمضاد51.6%) Pipracillin ) وذات مقاومه واطئه لمضادات Tobramycin(33.3%), Norfloxacin (31.6%), Azithromycin (31.6%),Ciprofloxacin (28.3%). اختبرت قابليه العزلات على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام طريقه احمر - الكونغو وطريقه اطباق المعايره الدقيقه وتم قياس قيم الكثافه الضوئيه باستخدام قارىء منظومة الاليزا, اظهرت النتائج ان طريقه اطباق المعايره الدقيقه اكثر كفاءه وحساسيه من طريقه احمر الكونغو للكشف عن الغشاء الحيوي اذ اظهرت نتائجها ان 4 عزلات فقط غير منتجه للغشاء الحيوي اما العزلات الاخرى فقد كانت منتجه بدرجات متفاوته . اظهرت نتائج التحري عن جينات تحسس الزحام باستخدام تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي المتعدد وباستخدام بادئات خاصه بتسلسلات معينه لجينات الكوارم اظهرت النتائج ان 81,6% من هذه العزلات تمتلك واحد او اكثر من هذه الجينات بينما كانت 18.4% من هذه العزلات لا تمتلك الجينات اعلاه . تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي استخدمت في التحري عن خمس من جينات عوامل الضراوه العائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه وهي ((exoU,proteaseIV,exoS,pilB,plcH, اظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة (0% , 21.6 % ,26.6 % , 46.6% ,53.3% ) تباعا وكانت هذه العزلات تمتلك exoU وبعظها exoS وعلى اساسها صنفت العزلات على انها اما سامه او ضاريه . بينت الدراسة ان هناك بعض الطفرات قد حدثت في تسلسل القواعد النتروجينية للعزلات قيد الدراسة وكانت من نوع طفرات الاستبدال والادخال, كذلك تبين من مطابقة تسلسل القواعد النتروجينية المترجم مع تسلسل الاحماض الامينية الاصلي للجين لم يكن للطفرات تاثير على ناتج الترجمة . | A total of (60) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Pseudomonas aeruginosa were obtained from different teaching hospitals in Baghdad ; Ibn - El Balady , Baghdad teaching hospital , Burn hospital and Teaching laboratory in Medical city. During the period between July 2013 till December 2013. The source of these isolates were as follows : (22) isolates collected from burn infections ,(18) isolates from wound infections, (9) isolates from sputum taken from patients suffering from respiratory tract infection,(6) isolates from blood,(2) isolates from urinary tract infections(UTI), and the last (3) isolates from ear swab. The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar,Blood agar, Pseudomonas agar then diagnosed by performing some biochemical tests (catalase and oxidase) followed by Genotypic diagnoses by PCR Which was performed by housekeeping gene (rpsL gene). The results confirm that all the 60 isolates were P.aeruginosa. Sixty P.aeruginosa isolates were tested for 12 antibiotics by using agar diffusion method , the results showed high resistance against Tetracycline 100%, Ceftazidime100%,Cefoxitin100%,Ceftriaxone85%,Cefepime,83.3%,Amoxicillin/Clavulanic acid 81.6%, and Chloramphinicol 78.3% moderate resistance against ,Pipracillin 51.6% , and low resistance against Tobramycin 33.3% , Norfloxacin 31.6%,Azithromycin 31.6% and Ciprofloxacin 28.3%. The ability of the isolates to produce biofilm were tested using congo red plate method and Tissue culture plate method(TCP). Results showed that TCP method is a more quantitative and reliable method for the detection of biofilm this method show that 6.6% isolates were not biofilm producers while other isolates produce it in different degrees . Multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique was performed using specific primers targeting the specific sequences of Quorum sensing genes (lasR,lasI , rhlR,rhlI) .The results showed that 81.6% positive for one or more QS genes while only 18.3% were negative for all these genes. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to screened five virulence factors (exoU,proteaseIV,exoS, PilB , PlcH) results showed percentage were (53.3% , 46.6% , 26,6 % , 21,6 % , 0% ,) positive isolates respectively and these isolates contain either exoU or exoS and according to this have been classified into cytotoxic and invasive. Determination of nucleotides sequence for QS genes was revealed there was some mutations occurred which included substitution and insertion. From the other side results of identities of translated - nucleotides sequence with original sequence of amino acids revealed that there were no effect of mutations on translation product.

تاثير سلالات محلية مختارة لبكتريا Bacillus thuringiensis في الاداء الحياتي لبعوض Culex pipiens pipiens (Diptera : Culicidae) Effects of Selected local strains of Bacillus thuringiensis on biological aspects of Culex pipiens pipiens (Diptera : Culicidae)

اسم المؤلف: دعاء حقي اسماعيل الحوراني
اسم المشرف: عماد احمد محمود حسام الدين عبد الله محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في كلية العلوم للبنات - جامعة بغداد وللفترة من 1/11/2013 لغاية 1/4/ 2015 لبيان تاثير بكتريا Bacillus thuringiensis المعزولة محليا من ترب العراق على الادوار المختلفة لبعوض Culex pipiens pipiens وبواقع ثلاث تراكيز لكل عزلة . اختبرت عزلة محافظة الانبار BtAN بالتراكيز ( 101x7.35 , 102x7.35 , 105x7.35 ) ml/CFU وعزلة محافظة السليمانية بالتراكيز BtSU (101x5.6 , 102x5.6 , 105x5.6) ml/CFU وعزلة محافظة بغداد BtBAبالتراكيز (101x3.56, 102x3.56 , (105x3.56 ml/CFU ومقارنتها بالعزلة القياسية العالمية Bacillus thuringiensis israelensis وبثلاث تراكيز ايضا ( 101x4.85 , 102x4.85, 105x4.85) ml/CFU .1 - اظهرت نتائج تجربة هذ العزل وبالتراكيز المختارة عدم وجود فروق معنوية في نسبة فقس البيض بكتريا.2 - اظهرت نتائج تاثير هذه العزل البكتيرية وبالتراكيز المشار اليها في اعلاه على الدور اليرقي لبعوض C.pipiens pipiens تفوقت العزلة القياسية العالمية Bti التي اعطت نسب هلاك 100% مقارنة بالعزلات المحلية والتي اظهرت النتائج تفوق عزلة الانبارBtAN بنسبة هلاك 65% بتركيز 105x7.35 ml/CFU تليها عزلة السليمانية BtSUبنسبة هلاك 50% بتركيز 105x5.6 ml/CFU بينما لم تعطي عزلة بغداد BtBAاي نسبة هلاك .3 - اظهرت نتائج تجربة تاثير بكتريا Bt على الدور العذري فاوضحت ان العزلة القياسية العالمية Bti اعطت نسبة هلاك 80% بتركيز 105x4.85 ml/CFU مقارنة بالعزلة المحلية السليمانية BtSU التي اعطت نسبة هلاك 45 % بتركيز 105x5.6 ml/CFU بينما بلغت نسبة الهلاك في عزلة الانبار BtAN 30% بتركيز 105x7.35 ml/CFU .4 - اخيرا اوضحت نتائج تجربة تاثير هذه العزلات البكتيرية على بالغات بعوض C.pipiens pipiens ان نسب الهلاك كانت ضئيلة جدا حيث بلغت في العزلة القياسية Bti 13.3 % بتركيز 105x4.85 ml/CFU للاناث وبلغت في الذكور 6.66% لنفس التركيز , بينما بلغت نسبة الهلاك في الاناث لعزلة الانبار BtAN 10% بتركيز105x7.35 ml/CFU وبلغت نسبة الهلاك في الذكور 6.66% لنفس التركيز ,بينما بلغت نسبة الهلاك 10% للاناث و3.33% للذكور بتركيز 105x5.6 ml/CFU لعزلة السليمانية . | This study was acheived at the University of Baghdad, College of science for women, from 1/11/2013 to 1/3/2015, the effect of selected locally isolated Bacillus thuringiensis bacteria from Iraqi soil on some biological aspects of Culex pipiens pipiens. The study included different phases of Culex pipines pipines mosquito and in three concentrations for each isolate. The isolate of Al - Anbar province BtAN was tested using the concentrations (101x7.35 , 102x7.35 , 105x7.35)ml/CFU,while for Al - Sulaymaniyah isolate BtSU in the concentrations (101x5.6 , 102x5.6 , 105x5.6)ml/CFU and Baghdad isolate BtBA was in the concentrations (101x3.56, 102x3.56,105x3.56,)ml/CFU, and all were compared with three concentrations of the universal standard isolate Bacillus thuringiensis israelensis (Bti) ) 101x4.85 , 102x4.85, 105x4.85) ML/CFU .The experimental results have shown that there were no differences in the rate of egg hatching for all the isolates of Bt bacteria.The results also showed that the effect of Bt bacteria on the defferent larval phases on C.pipiens.pipiens mosquito, resulted in the the superiority of mortality rate of the universal standard isolate Bti to give 100% . As compared with the local ones, this showed that rate of mortality of BtAN isolate was 65% in concentration 7.35x105 ml/CFU , then BtSU isolate 50% in concentration 5.6x105 ml/CFU, whereas Baghdad isolate did not show any mortality rate.The results of the effect of the Bt bacteria on the pupal phases of the C.pipiens.pipiens mosquito, have shown that the rate of mortality of using the universal standard isolate Bti was 80% in concentration 4.85x105 ml/CFU. As compared with the local ones,where the results was 45% rate of mortality for Al - Sulaymaniyah isolate in concentration 5.6x105 ml/CFU and 30% for Al - Anbar isolate in concentration 7.35x105 ml/CFU.The experimental results of the effect of the Bt bacteria on the adults of C.pipiens.pipiens mosquito, have shown the mortality rates were so low the rate of the universal standard isolate Bti was 13.3% for the females and 6.66% for the males in concentration 4.85x105 ml/CFU, whereas the mortality rate of Al - Anbar isolate was 10% for the females and 6.66% for the males in concentration 7.35x105, and as for the mortality rate of Al - Sulaymaniyah isolate, it was 10% for the females and 3.33% for the males in concentration 5.6x105 ml/CFU

التنوع والانتشار الجغرافي لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى، العراق Diversity and geographical distribution of freshwater Gastropods in Diyala river basin , Iraq

اسم المؤلف: خنساء سلمان فرمان
اسم المشرف: عماد الدين عبد الهادي المختار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء الدراسة الحالية للتعرف على التنوع الاحيائي والتباين المظهري لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى في العراق ولهذا الغرض تم اختيار 10 مواقع موزعة على قطاعين : القطاع الشمالي ويتمثل منطقة شمال سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة دربنديخان Dar , موقع مدينة كلار Kal , موقع رافد الوند في مدينة خانقين Wan وموقع مدينة جلولاء Jal . القطاع الجنوبي ويتمثل بجنوب سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة حمرين Him, موقع ناظم الصدور Sud , موقع جدول مهروت Mah في مدينة المقداديه , موقع مشروع الخالص الاروائيKha , موقع جدول السارية Sar وموقع مدينة بعقوبة Baq . ناولت الدراسة التعرف على العوامل الفيزيائية والكيميائية والتي شملت : درجة الحرارة , الاس الهيدروجيني , تركيز الاوكسجين المذاب , التوصيلية الكهربائية , سرعة التيار , تركيز الكالسيوم , نسبة المواد العضوية ونسجة القاع لمواقع الدراسة . جمعت عينات شهرية لبطنية القواقع المائية عن طريق اسطوانة جمع العينات من المواقع للفترة من نيسان 2013 - كانون الثاني 2014 عدا الموقعين دربنديخان وكلار حيث جمعت العينات فقط خلال شهري ايلول وتشرين الاول 2013 . وتم تشخيص العينات بالاعتماد على النماذج المحفوظة في متحف التاريخ الطبيعي البريطاني . تم حساب الكثافة والوفرة النسبية والتردد لكل نوع خلال فترة الدراسة كما شملت قياس التباين المظهري للانواع المشتركة بين القطاعين . والارتباط بين العوامل البيئية والانواع وبين الانواع بالاضافة الى قياس التماثل بين الجماعات السكانية للمواقع . تراوحت قيم درجة الحرارة للمياه المسجله للمواقع خلال فترة الدراسة ( 10 - 33 )º م واظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في حين سجلت ظهور فرق معنوي بين الاشهر كما تراوحت قيم الاس الهيدروجيني ( 6.6 - 8.1 ) مع انها تميل الى ان تكون قاعدية في اغلب المواقع كما اظهرت عدم تسجيل فرق معنوي بين القطاعين . ظهر من قيم الاوكسجين الذائب الذي تراوح بين ( 6.1 - 10.7) ملغم /لتر ان المواقع ذات تهوية جيده وبين التحليل الاحصائي عدم وجود فرق معنوي بين القطاعين في حين سجل وجود فرق معنوي بين القطاعين في قيم التوصيلية الكهربائية التي تراوحت بين ( 1530 - 450) مايكروسيمنز /سم , كما اظهرت النتائج وجود فرق معنوي في سرعة الجريان بين المواقع حيث تراوحت بين اعلى قيمة سجلت في موقع كلار 1.3 م/ثا الى اوطئ قيمة سجلت في الصدور والتي تقدر 0.08م/ثا الا انها لم تسجل فرق معنوي بين القطاعين في اغلب اشهر البحث . كما تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل مختبريا منها تركيز الكالسيوم في المياه حيث سجلت تراكيز عاليه في الموقعين الوند وبعقوبه مقارنة بالمواقع الاخرى حيث بلغت 210 ملغم /لتر في حين بلغت سجلت اقل تركيز في الصدور 41 ملغم / لتر وسجلت وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في اغلب الاشهر , كما تراوحت نسب المادة العضوية في رواسب القاع بين ( 0.6 - 4.1) % مع تسجيل فرق معنوي بين القطاعين , تباينت نسجة القاع بين مواقع الدراسة مزيجيه طينية رمليه للمواقع دربنديخان والوند وجلولاء وعرينيه طينية في كلار ومزيجيه رملية في حمرين في حين كانت طينية في الموقعين الخالص والسارية ومزيجيه في مهروت وبعقوبه . تم خلال فترة الدراسة تشخيص 12 نوع تنتمي الى 8 عوائل وشملت : عائلة Neritidae تضمنت نوعين Theodoxus jordani وNeritina mesopotamica , عائلة Valvatidae شخص Valvata saulcyi وعائلة Viviparidae تم تشخيص Bellamya bengalensis وكما تم تشخيص الانوع Melanopsis costata , M.nodosa , M. subtingitana وM. preamorsa التي تنتمي الى عائلة Melanopsidae وMelanoides tuberculata من عائلة Thiaridae وLymanaea natalensis من عائلىة Lymnaedae وPhysa acuta من عائلة Physidae وPlanorbis gibbonsi من عائلة Planorbidae . وقد بينت النتائج ظهور Physa acuta في جميع المواقع في كما سجل الموقع Dar اعلى كثافة لمجموع الافراد والموقع Jal. اقلها في حين سجلت T.jourdani هي اكثر الانواع كثافة مقارنة مع الانواع المدروسة الاخرى . كما اظهرت النتائج ان اعلى كثافة للانواع تكون في اشهر الخريف والربيع ولكنها تنخفض في اشهر الصيف والشتاء كما اظهر تحليل الارتباط بين الانواع والعوامل البيئية بان كثافة الانواع لا تتاثر بتركيز الكالسيوم في حين هناك تباين في استجابة الانواع لبقية العوامل التي تمت دراستها تم دراسة التباين المظهري للغلاف باستخدام تقنية المقياس المظهري الهندسي . حيث اجريت المقارنة بين الانواع المشتركة بين القطاعين الشمالي والجنوبي لقياس الاختلاف في الحجم لمركزي والتماثل لحجم وشكل الغلاف للانواع المشتركة Theodoxus jordani , Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis , Physa acuta وPlanorbis gibbonsi واظهرت النتائج وجود فرق معنوي في الحجم المركزي للانواع T. jordani ، P.acuta ، M.preamorsa وLymnaea natalensis كما سجلت نتائج التماثل الشكلي وجود تباين معنوي في التماثل لحجم الغلاف للنوع P. acuta. | The present work was conducted to study the biodiversity and the shell’s morphological variation of the Freshwater Gastropods in Diyala River basin northeast Iraq. For this purpose 10 sites were selected within two sectors of the River basin. A northern sector, represented the area north of Himreen’s dam and lake, including : Darbandikhan lake site (Dar); Kalar town site (Kal); Alwand tributary site in Khanaqin (Wan); Jalula city site (Jal). The Southern sector represented the area below Himreen’s dam and lake : Himreen lake site (Him); Al Sudor regulatory Dam site (Sud); Mahroot stream site at Moqdadia city (Mah); Al Khalis irrigation canal site (Kha); Al saria stream site (Sar); and Baqubah city site (Baq). Physical and chemical properties at the study sites were measured. These included : water temperature, pH, Dissolved Oxygen Concentration, Electrical Conductivity, Current Velocity, Calcium Concentration, sediment organic matter content and bottom Sediment particle size. Gastropods samples were collected monthly by a cylinder sampler from all sites for the period April 2013 through January 2014, with a small exception regarding Darbandikhan and Kalar sites. Gastropods species identification was aided by consulting preserved material at the British Natural History Museum (NHMUK). Occurrence, population density and relative abundance of each species were calculated. The morphological variation of the gastropod shells collected from different area sectors within the River basin were also determined. Correlation between gastropod species and the environmental factors were also recorded, in addition to investigating similarities between the studied sites in environmental factors and species density. Values of water temperature ranged between (10 - 33) ºC. No significant difference between sites nor between sectors, but only between months was detected. Values of the pH ranged between (6.6 - 8.1), tending to be alkaline at most sites. These values showed significant difference between the two sectors. The dissolved oxygen values ranged between (6.1 - 10.7) mg /l indicating good oxygenation with no significant difference between sites of the two sectors. However, electrical conductivity EC values ranged between(450 - 1530) µs/cm. A significant difference was revealed between the values of the two sectors, highest value of Current velocity was recorded at Kalar (1.3 m/sec.) and the lowest value was recorded at Al Sudor(0.08 m/sec.), but these records showed no significant difference between the two sectors in most months. Calcium concentration in the water showed presence of high concentrations (210 mg/l) at sites Al wand and Baqubah. While the lowest concentration (41 mg / L) was recorded at Al sudor, but no significant difference between sites or between sectors was evident in most months.Sediment content of organic matter ranged (0.6 - 4.1)% showing significant difference between the northern and southern sectors. Bottom sediment particle size and texture varied from sandy - clay - loam at sites Darbandikhan, Al wand and Jalula, to silt - clay at Kalar, sandy - loam at Himreen, clay at Khalis and Alsaria, and loamy at Mahroot and Baqubah. A total of twelve species of gastropods belonging to eight families were identified. Family Neritidae included two species Theodoxus jordani and Neritina mesopotamica; family Valvatidae included Valvata saulcyi; family Viviparidae included Bellamya bengalensis; family Melanopsidae included Melanopsis costata, M.nodosa, M. subtingitana and M .preamorsa; family Thiaridae included Melanoides tuberculata; family Lymnaedae included Lymanaea natalensis; family Physidae included Physa acuta; and family Planorbidae included Planorbis gibbonsi. Results showed that Physa acuta was present at all sites. while Theodoxus jordani was the highest density recorded. The highest density of the total individuals was recorded at Darbandikhan and the lowest was at Jalula site. The results showed that highest density of Gastropods population was recorded in Spring and Autumn months and decline in Winter and Summer months The correlation analysis between species and environmental factors showed that population density of species was not affected by the concentration of calcium while there was evident variation in the response of species to most other environmental factor. The variation in shell morphological features was investigated using Geometric Morphometric technique. Specimens from northern and southern sectors were compared to detect differences in the centroid size, symmetry of shell shape and size for shells of the most common species : Theodoxus jordani, Melanopsis preamorsa, Lymnaea natalensis, Physa acuta and Planorbis gibbonsi. Results showed variation existed in centroid size for Teodoxus jordani ,Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis and Physa acuta , but the analysis of symmetry in shell size and shape for the recorded species showed significant variance in the shell size of P.acuta only.

دراسة تصنيفية حياتية لانواع معينة من الجنس Astragalus L. من العائلة البقولية Leguminosae في العراق Biosystematic study of certain species of the genus Astragalus L. from the family Leguminosae in Iraq

اسم المؤلف: خنساء رشيد مجيد
اسم المشرف: خليل ابراهيم الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالیة الى تصنیف انواع من الجنس Astragalus L. من خلال دراسة الصفات المظهریة والتشریحیة والكیمیائیة والوراثية والتوزيع الجغرافي والتصنيف العددي لستة قطاعات متكاملة والحاوية عشرة انواع جمعت من مقاطعات وسط وشمال وجنوب العراق، والقطاعات والانواع التي درست هي : Sec. Aulacolobus : A. guttatus Banks & Sol. ; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus Fisch. & Mey. and A. hamosus L.; Sec. Harpilobus : A. corrugatus Bertol. and A. hauarensis Boiss.; Sec. Hololeuce : A. alyssoides Lam.; Sec. Malacothrix : A. mollis M. Bieb. , A. pulchellus Boiss. and A. sarae Eig.; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis Stev. تضمنت الدراسة التعرف على الصفات المظهریة للجذور والسیقان والاوراق والنورات الزهریة والازهار والثمار والبذو، اما في الجانب التشریحي فتم دراسة التغايرات بین الانواع المدروسة على مستوى السیقان والاوراق والسويق) البشرة والقشرة، عددها وسمكها واعداد الحزم الوعائیة وترتیبها واشكالها ( والمعقدات الثغریة ونمط التعرق اذ كان من نوع Brochidodromous في جميع الانواع المدروسة، كم درست اشكال حبوب اللقاح وبینت نتائج الدراسة الحالیة ان هناك امكانیة للفصل بین الانواع المدروسة باستعمال بعض الصفات المظهریة الدقیقة لحبوب اللقاح اذ كانت حبوب اللقاح من الطراز ثلاثي الاخادید المثقبة Tricolporate في جمیع الانواع المدروسة، تضمنت الدراسة كذلك التعرف ولاول مرة باستعمال تقنیة كروموتوكرافيا الطور السائل عالي الاداء HPLC (High performance liquid chromatography) على محتوى الاوراق من الفلافونویدات لانواع الجنس المدروسة، اذ تم تشخیص ثمانية مركبات فلافونویدیة وهي : myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin مع تحديد تراكيزها، فضلا عن ذلك شملت الدراسة الجانب البیئي، وقد وزعت الانواع جغرافيا على مناطق انتشارها وفي بیئاتها المختلفة ورسمت خرائط توزیع الانواع على المقاطعات الجغرافية في المناطق الجنوبية والوسطى والشمالیة. | The present study aimed to consider the morphological, anatomical, chemical and genetic characters and geographical distripution of six sections and ten species belong to the genus Astragalus L. In the central, northern and south part of Iraq, the sections and species were : Sec. Aulacolobus : A. guttatus; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus and A. hamosus; Sec. Harpilobus : A. corrugatus and A. hauarensis; Sec. Hololeuce : A. alyssoides; Sec. Malacothrix : A. mollis, A. pulchellus and A. sarae; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis. The research includes study of morphological characteristics of the roots, stems, leaves, flowers inflorescences, fruits and seeds, In addition anatomical study that consider variations between the species studied at the stem, leaves and petiole level (epidermis and cortx the thickness, the nature and arrangement of tissues and the number of vascular bundles, their arrangment and forms), epidermis stomatal complexes, venation patterns which they were Brochidodromous in all species in this study and the form of pollen grain which has been Tricolporate in all species in this study. The study also identified for the first time using a technique chromotochraph liquid phase HPLC on the content of the leaves of the flavonoids of the plants studied were diagnosed ten flavonoad compound in the leaves of the plants such as myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin as well as the study included a study of the environmental side, has distributed species geographically "on areas of in environments different and mapped the distribution of species on geographical districts in the central and northern and south regions. Maps of geographical distribution were prepared for all species studied. The study shown that the species were distributed in the north, east and west area of Iraq.

الوصف التشكليائي والتركيب النسجي للبنكرياس المعثكلة في الخفاش الكحلي (Kuhl, 1817) Pipistrellus kuhlii Morphological Description and Histological Structure of the Pancreas in Al - Kuhlii Bat Pipistrellus kuhlii (Kuhl, 1817)

اسم المؤلف: خالدة محمد عليوي العوادي
اسم المشرف: بيداء حسين مطلك
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الانسجة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was designed to investigate the morphological description and histological structure of the pancreas gland in Bat Pipistrellus kuhlii.A total number of (20) ,10 male and 10 female bats were used in this study after taking out the pancreas gland it was fixed with fixative solutions their the sequent steps of preparing histological slides were done after that they were stained by using routine and special stains. These stains were represented by (Heamtoxylin - Eosin, Periodic acid Schiff, Chrom alum heamtoxylin, Modified aldehyde Fuchsin and Masson’s trichrome).The morphological study showed that the pancreas gland in Kuhli's bat is represented by a compact type of pancreatic tissue it is white to yellowish color divided into three divisions head, body and tail. The pancreatic tissue lies in the abdominal cavity near the mass of intestine at the mesentery network which is connected with the coiled region of the duodenum from one side and the extended mesenteries between the dorsal part of stomach and the ventral part of spleen from the other side. The pancreas gland has only one duct that originated from the pancreatic body which is opened in the upper part of the duodenum.The pancreas gland is surrounded by loose connective tissue it extend trabeculae that divides the gland into many lobules that differs in size and shape. The pancreatic tissue is characterized into two portions, the exocrine portion and endocrine portion, the exocrine portion is represented by a compound tubule - acinar gland which consists of a large number of acini and the ductal system, each acini represented by a serous secretory unit which consists of many pyramidal cells that surround a small lumen,the apics of narrow cells are headed towards the acinar lumen while their bases are wide and based on the basement membrane. The acinar sizes are variable some acini are large others are small. The acinr cells number range from (6 to 9) cells. The ductal system which eliminate the products of secretory units to the duodenum it is initiate with centroacinar cells, these cells are connected with intercalary ducts which connected with intralobular duct, these ducts lead to the interlobular duct, which their diameter is larger than the diameter of intralobular ducts. The inter lobular ducts eliminate their secretory contents in the main duct which opened in the upper part of the duodenum.The endocrine portion is represented by clusters of cells known as islets of Langerhans which appeared as masses of cells diffused among the exocrine portion units, they're separated from each other by a thin layer of connective tissue.The islets are randomly distributed within the pancreatic tissue, it is obvious that these islets are massively concentrated in the body part of pancreas inside the lobules and around the ducts as in the pancreas head. The study also revealed that there were difference in the diameters and numbers of the islets, the mean diameters of the islets was reached (1.86) micrometer with range (1 - 2.75) micrometer whereas the mean number of islets was (1.6) islet per millimeter with rang of (1 - 3) islet.Each islet consists of three types of cells arranged as irregular clusters, they are separated from each other with blood capillary network. They were differentiated by using routine and special stains, these cells are Alpha cells they have rounded shape with oval nucleus they lies at the peripheral part of the islet. Beta cells they’re oval shaped with spherical nucleus they lies at the center of the islet, while delta cells are irregular shaped, with pale color lies between Alpha and Beta cells they’re less in number and they may appear as single cell or as small clusters and mostly lies at the peripheral part of the islet.The islet stained with faint blue in routine stains (Heamtoxylin and Eosin), and they were stained with faint blue when using special stains (Chrome alum phloxine) while the nucleus of Alpha cells stained with dark red and the Beta cells nucleus stained blue whereas Delta cells nucleus appeared in pink to pale red color. When using modified aldehyde Fuchsin the islets stained with greenish blue, alpha cells stained with orang, beta cells were blueish green and delta cells stained with green

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة (Crustacea : Copepoda) Cyclopoida لمنطقة الفرات الاوسط /العراق Taxonomic Morphological Study on Some Species of Order Cyclopoida (Crustacea : Copepoda) in Middle Euphrates Region / Iraq

اسم المؤلف: حنان زوير مخلف حسين الدعمي
اسم المشرف: حسن سعيد جاسم الاسدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - اللافقريات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمن البحث دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة Cyclopoida جمعت من بعض مناطق محافظات منطقة الفرات الاوسط وهي : كربلاء المقدسة وبابل والنجف الاشرف والقادسية. تم وصف اثنا عشر نوعا لعائلة Cyclopidae تابعة لستة اجناس تعود لعويلتين هما : Cyclopinae وEucyclopinae. اوضحت الدراسة ان انواع عويلة Cyclopinae اكثر انتشارا ، وتميز جنس Mesocyclops بكثرة انواعه بين الاجناس الاخرى حيث تم تسجيل خمسة انواع تعود لهذا الجنس ،علما انه تم الاعتماد ووصف الذكور لبعض الانواع ولاول مرة خلال هذه الدراسة. وهذه الانواع هي : Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) اعتمد على النوع Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) كنموذج للعائلةFamily Type. صيغت مفاتيح تصنيفية لعزل العويلات والاجناس والانواع. كما تم تدوين معلومات عن مناطق الجمع وتواريخها ووقتها وعدد الانواع بالاضافة الى تدوين درجات الحرارة والاس الهيدروجيني.*تسجيل جديد اول للمجموعة الحيوانية العراقية )صنف القشريات(. | The Present study included taxonomic morphological study on some species of order Cyclopoida that collected from some regions of Euphrates governorates : (Holy Karbala, AL - Najaf ALAshraf, Babylon, AL - Qadisyah). Six genera and twelve Species were recorded belong to family Cyclopidae which including two subfamily : Cyclopinae and Eucyclopinae. Also in this study the males have been used firstly to some specieses in the taxonomic as procedure .Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) has been studied here in more details particularly in morphological characters. Taxonomic keys were formulated to isolate subfamilies, genera and species. Information about sites collection , dates and times as well as number of species, in addition information about temperatures and pH. were recorded*New First record to Iraqi Animalia Group (Class : Crustacea)

دراسة مقارنة للمحتوى البلازميدي للبكتريا المخمرة لسكر اللاكتوز للعائلة المعوية والمعزولة من عينات بيئية وسريرية Comparative Study of Plasmid Content of Lactose Ferment Enterobacteriaceae Isolated From Environmental and Clinical Samples

اسم المؤلف: تقي عبد الكريم حميد
اسم المشرف: اسراء عبد الجبار ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: 183 bacterial isolate from clinical and environmental samples are collected during the 5 months from 1/9/2014 to 1/2/2015.Which 98 clinical bacterial isolates were isolated from patients (urine, blood, sputum and swabs) from different hospitals in Baghdad city, and also 85 environmental bacterial isolates were isolated from Tigris river water samples which are collected from Al - Shawaka area , soil samples of eastern Baghdad collected from Jadied Shat area , and poultry feces which are collected from poultry farm in Al - Sadar city.All clinical and environmental bacterial isolates were identified on the basis of morphology and biochemical tests.Further Confirmative tests were used to confirm the identification of bacterial isolates by using Vitek - 2 compact system and specific primer to detect 16S rRNA gene. Results of bacteria identification showed the following species : Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella.oxytoca Enterobacter aerogenes, Citrobacter freundii, Serratia marcescens, Raoultella planticola, Chryseomonas luteola, Burkholderia cepacia, Aeromonas, Hydrophis , Streptococcus feacalisThe antibiotic resistance patterns showed that all bacterial species were multidrug resistant.Most clinical E.coli (45isolates) revealed high levels resistance against most antibiotics : (100%) amikacin and ampicillin, (97%) cefepime and ceftazidime, (95%) cetriaxone,(86%) tobramycin, (82%) amoxicillin, (77%) gentamicin, (73%) aztreonam. Also environmental E. coli (28isolates) showed high levels resistance, (100%) ampicillin, ceftazidime, cefepime and tobramycine, (96%) nitrofurantion, (92%) Ceftriaxone, (89%) amoxicillin, (82%) amikacin, (60%) levofloxacin and impenem. All K.pneumoniae showed high levels resistance against most antibiotics, ampicillin, amoxicillin, cefepime and ceftazidime (100%).While 30% resistance in ciprofloxacinAbstractfor clinical K.pneumoniae isolates and 8% resistance was shown in each meropenem and levofloxacin.Results of molecular identification of E.coli isolates by using the specific primer for 16S rRNA gene showed that all isolates of Lactose fermenter contained this gene (100%). Also the same 16S rRNA gene was found in the bacteria Citrobacter freundii, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Raoultella planticola with the same molecular weight (544 base pair) that found in E. coli isolates. While K.pneumoniae isolates showed two bands for the same 16S rRNA gene with molecular weight of 544 and > 1500 bp.The plasmid DNA analysis by using alkaline lysis method showed that 35/48 (75%) clinical and environmental bacterial isolates contained multiple plasmids their size 1oooo bp, and 15/48 (31.25 %) isolates contained plasmids with molecular weight more than 10000 bp.The leaf extracts of medical plants, Eucalyptus incrassate, Olea eurepea, and Trigonella foenum - graecum L. used as agents to cure the plasmid via adding the plant extract to the culture media or with mixing it with the plasmid DNA. Results showed that both two methods give clear effect

تاثير المستخلصات التربينية والقلوانية والفلافونويدية الخام لاوراق نبات البمبر Cordia myxaفي بعض جوانب الاداء الحياتي لثاقبة الحبوب الصغرى Rhyzopertha dominica (F.) (Coleoptera : Bostrichidae) Effect of crude Terpenoid, Alkaloid and Flavonoid Extracts of Cordia myxa leaves on some biological aspects of lesser grain borer Rhyzopertha dominica(F.) (Coleoptera : Bostrichidae)

اسم المؤلف: تبارك علي حسن الجبوري
اسم المشرف: تبارك علي حسن الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: An experimental study was conducted to evaluate the effect of AL - coholic extracts which includes terpenoids ,alkalines and flavonoides of Cordia myxa leaves on some biological aspect of lesser grain borer Rhyzopertha dominica ;including Eggs , fourth larval stage, pupal stage of 24 h age . and effect high concentration 8% of Alcoholic extract(Terpenoid,alkaloid and flavonoid) extracts on capability mating for treatment adults at 24 and 120 h ages. Also study the effect of Alcoholic extracts on the percentage of repellent ,and attraction by using Chemotropometer . Finally the effect of Alcholic extraction of percentage rice seed germination ( AL - Yasemean variety) has been evaluated. The resulted indicated; using 8% terpenoids extracts causing an increasing mortality in eggs to 93.33%, 86.66% in fourth larval stage and 63.33% in pupal stage of 24 h age, On the other hand 8% of extract has influencig on the rate of eggs production and hatch percentage of adult, So in 24 hrs ages, not production of eggs, has been observed ,by mating of treated male and female ,and also mating un treated male with treated female a lowest percentage of egg hatch 33.33% has been obtained in mating of treated male with un treated female in 24 and 120 hrs ages respectively, while, no eggs laying in case of mating un treated male with treated female.Using alkaline extracts of 8% , the study has been shown clear effect of failed in eggs hatching, and increased in mortality rate for fourth larval stage 93.3% ,while the effect of pupal stage to 66.66% for 24h age.White the effect of extract at 8% concentration for treatment adults ,no eggs laying when mating occur between treated male with treated female , and mating between un treated male with female of 24ages. A lower percentage of 25% hatching was recorded in mating treated male with un treated female .In 120hrs age, the rate of eggs production was zero when mating, treated male with treated female . as well as , a lowest percentage of eggs hatching was zero% showing , when mating between un treated male and treated female.In the same maner the study has been indicated clear effect for flavonoids extracts in life aspect of insect, therefore the higher percentage 86.6% of mortality in eggs in concentration 8%, in the same concentration gave 56.66% mortality of treated fourth larval stage ,also percentage mortality for pupal stage 43.3% at age 24h. Adult treatment with higher concentration 8% has influence effect one rate of eggs and their hatching in case of mating un treated male with treated female in two ages (24 - 120 hrs), this rate leads to decrease the average of age for male and female and the average number of egg that laying by treatment female was 0%. The results were showed that effect of AL - coholic extracts of the Cordia myxa in repellent and attraction , so the attract was 0% for all extracts and concentration. The higher percentage of repellent was 40% recorded by using terpenoids extracts in concentration of 8%, followed by alkaline extracts at the same concentration reach to 20% , in other hand there was no any percentage of repellent for flavonoids extract. Finally terpenoids ,flavonoids and alkalines extraction in concentration 4% ,6% has no effect on rice seed germination.

تاثير المستخلص المائي الحار لبذور واوراق نبات الحلبة (Trigonella foenum - graecum) في مبايض وارحام الفئران البيض السويسرية واجنتها Effect of The Hot Aqueous Extract of Fenugreek Seeds and Leaves (Trigonella foenum - graecum )on Ovaries , Uterus of Swiss Albino Mice and their Embryos

اسم المؤلف: تارا اسو طاهر عزيز
اسم المشرف: محمد عبد الهادي غالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للتعرف على مدى تاثير المستخلص المائي الحار لبذور واوراق نبات الحلبة Trigonella foenum - graecum)) على الفئران الحوامل المجرعة فمويا وبالتراكيز (100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم وذلك بعد مدد ( 4 , 8 , 12 ) يوم من بدء الحمل . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلص المائي الحار لاوراق نبات الحلبة وبالتراكيز (100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم لم تظهر تاثيرا على الفئران الحوامل اذ ان الفئران المجرعة ولدت ولادات طبيعية ولم يحدث لها اجهاض في اثناء مدة الحمل , فضلا عن عدم وجود فروق معنوية في معدل اوزان واطوال الاجنة عند مستوى ( P < 0.05 ) بعد مقارنتها مع مجموعة السيطرة . في حين اظهر المستخلص المائي الحار لبذور الحلبة وبالتراكيز ( 100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم تاثيرا على الفئران الحوامل من خلال تسببه في اجهاض الفئران الحوامل بعد مدد ( 4 , 8 , 12 ) يوم من بدء الحمل, كما سجل حدوث انخفاض معنوي في معدل اوزان واطوال الاجنة عند مستوى ( P < 0.05 ) مقارنة بافراد مجموعة السيطرة وسجلت النتائج وجود انخفاض معنوي عند مستوى ( P < 0.05 ) في اعداد واقطار الجسم الاصفر بعد المعاملة بالمستخلص المائي الحار لبذور نبات الحلبة للتراكيز ( 100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم وبعد مدد ( 4 , 8 , 12 ) يوم من بدء الحمل, في حين لم يلحظ وجود اي فرق معنوي عند مستوى ( P < 0.05 ) في اعداد الجريبات المبيضية ( الجريبات الاولية - الجريبات الثانوية - جريبة كراف ) وكانت الجريبات المبيضية سليمة من الناحية النسجية بعد معاملة الفئران الحوامل بالمستخلص المائي الحار لبذور الحلبة عند جميع التراكيزالسابقة وبعد مدد ( 4 , 8 , 12 ) يوم من بدء الحمل. اظهرت الدراسة عدم ظهور تشوهات مظهرية في الاجنة المجرعة امهاتها بالمستخلص المائي الحار لبذور او اوراق نبات الحلبة وبالتراكيز ( 100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم اذ بدت جميع الاجنة طبيعية من الناحية المظهرية . شارت النتائج الى وجود تغيرات نسجية غير طبيعية في المبايض وارحام الفئران الحوامل المجرعة بالمستخلص المائي الحار لبذور الحلبة وبالتراكيز ( 100 , 200 , 300 ) ملغم / كغم وبعد مدد ( 4 , 8 , 12 ) يوم من بدء الحمل تضمنت توسع واحتقان وتمزق ونزف في الاوعية الدموية بالاضافة الى حدوث تنخر وو ذمة . وهذه النتائج توضح عدم وجود خطورة على الاجنة المتناولة امهاتها اوراق الحلبة ضمن التراكيز والمدد المشار اليها في حين تشكل البذور وبنفس التراكيز خطورة على بقاء الاجنة . | This study was designed to investigate the effect of hot aqueous extract of the seeds and fenugreek leaves of (Trigonella foenum - graecum) on pregnant mice by orally administered at doses (100 , 200 , 300) mg / kg and after periods (4 , 8 ,12 ) days from the beginning of pregnancy. This study shows that the hot aqueous extract leaves of fenugreek show no effect in the pregnant mice and born natural embryo and abortion did not happen to them during the periods of pregnancy. also the results of the study show that there was no significant differences in the weights and embryos lengths at the rate of ( P <0.05) compared with the control group. The study also show that the hot aqueous extract fenugreek seeds of doeses (100 , 200, 300) mg /kg influence at the pregnant mice by causing abortion to the pregnant mice after the periods (4 , 8 , 12) days from the beginning of pregnancy . The average of weight and length of embryo showed a significant decrease at the rate of ( P <0.05) compared with the control group. The results also show a significant decrease at (P <0.05) in the average of numbers and diameters of corpus luteum after treatment with hot aqueous extract fenugreek seeds by the doses (100 , 200 , 300 ) mg / kg after the periods ( 4 , 8, 12 ) days from the beginning of pregnancy . The study show that there was no significant difference in the average numbers of ovarian follicles ( Primary follicles - Secondary follicles - Graffian follicles ) at (P <0.05) after treatment with hot aqueous extract fenugreek seeds . After treating the pregnant mice with the doses (100 , 200 , 300) mg / kg after the periods ( 4 , 8, 12 ) days from the beginning of pregnancy there was no histopathology change in the ovarian follicles. The study show no malformation appearance of embryos when treating pregnant mice with the hot aqueous extract of the seeds and fenugreek leaves in different doses (100 , 200 , 300) mg / kg , during the period ( 4 , 8 , 12) days from the beginning of pregnancy. There are also histopathological changes in the ovary , uterus by the doses (100 , 200 , 300 ) mg / kg after period of pregnancy ( 4, 8 , 12 ) days from the beginning of pregnancy , included vasodilatation , congestion and rupture in blood vessels that caused hemorrhage , necrosis , odema at using doses of hot aqueous extract fenugreek seeds . The results of this study indicate that the use of fenugreek leaves is safe and does not cause abortion of pregnant mothers. The fenugreek seeds are harmful to pregnant mothers because they caused abortion to the fetuses.

دراسة لمجتمع الطحالب (الدايتومات) في نهر دجلة بين بغداد ومنطقة الدجيل Study the community of Algae (Diatoms) in river Tigris between Baghdad and Al - Dujail

اسم المؤلف: بثينة عبد العزيز حسن المكدمي
اسم المشرف: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الاحياء المائية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current the study included and analysis of Diatoms community in the sector of the Tigris River and in the area between Dejail spend in Salahuddin province to the Muthanna Bridge area before entering the river to the city of Baghdad. Six sites have been Chosen along the river to collect samples of water per month for the duration of January until December 2014, physical and chemical factors of water were measurement, also included a study of the quality and quantity of phytoplanktonic diatome epipelic and epiphytic on (Phragmites australis Trin ex Stand ) Diatoms, also addressed the evaluation of the Tigris River water quality in the study area for the purpose of living aquatic - based Canadian Model (Canadian Council of Ministers of Environmental Water Quality Index), in addition to measurement of total concentrations of some heavy metals in water samples and applied pollution - index to evaluated the level of pollution. The results showed the presence of spatial and temporal heterogeneity in rates of physiochemical characteristics of the region studied values , as factors rates ranged as follows : Temperature of the air and water between 11.54 - 38.41c °, 13.43 - 30.36 c°, the depth, light transmittance and turbidity rates were fluctuated in different stations and seasons, as it ranged between 4.25 - 6.83 meters, 38.33 - 76.66 cm 13.03 - 136.76 NUT the flow velocity ranged between 0.50 - 3.37 m/s respectively, as for values of conductivity (EC) , Sodium chloride NaCl , TDS, and salinity increased trend of Muthanna Bridge area , with rates 711 - 1592 ms/cm, 1.5 - 3.5 % , 380.66 - 898.33 mg /L and 0.43 - 0.99 per thousand respectively. Characterized sector water as neutral or alkaline mild in terms of pH , as it ranged between 7.07 - 7.65 , also recorded an increase in dissolved oxygen, DO and bio - oxygen demand, BOD in the winter, and fall gradually in the spring and autumn values , the lower values recorded in the summer and were 2.20 - 9.13 and 0.41 - 3.90 mg / l ,Also the water of study aria Characterized with highly concentrations for Ca compared with Mg and ranged 54.66 - 164.66 and 23.66 - 39.66 mg / L, respectively, while values of Cl and Fl were between 31 - 99 and 0.08 - 0.39mg/L. Water sector characterized as very hardness , amounting to total hardness between 241.66 - 556.66 mg/L, either alkalinity rates ranged values was 86 - 142 mg /L. the result of study prevailed that the values of NO2,NO3,PO4 Affected by various additions to the river hyphen as a remnants of human activity or rainfall , as values ranged between 0.002 - 0.006 mg/L , 0.37 - 1.13 mg/L and 0.19 - 2.51 mg/L, respectively. Also the silicate, SiO3 and Sulphate SO4 recorded high values in all and some stations and ranged 2.84 - 4.74 and 85 - 554 mg/L respectively. The Chlorophyll (a, b and c) of planktonic diatoms recorded clearly fluctuated values in the current study, and arrangement for both (0.02 - 0.30, 0.07 - 1.10 and 0.03 - 3.46 mg/L. also appeared that the chlorophyll values of epipelic diatoms were higher than in planktonic , when recorded for ( a , b , c) 0.35 - 3.85, 0.08 - 1.53 and 0.10 - 3.07 mg /L respectively. In the current study 515 taxa of diatoms were diagnosed, they were distributed among the planktonic, epipelic and epiphytic on (Phragmites australis). Diatoms belonging to 21 families and 55 genus , Including 16 families and 47 genus of pennales and 5 families and 8 genera of centrales. The study was also able to record 29 new species as a new record for Iraqi flora, belong to pennales diatoms, and distributed as a flowing : 7 species (Bacillaria Paradoxa var.tumidula.Grun, Campylodiscus bicostatus W.Smith, Cymbella brehmii Hust, C. hebridica Gregory C. norvegica Grun, Diatoma vulgare var. constricta.Grun,. D. vulgare var. fromes astries abnormale,) planktonic, 4 species Gomphonema intricatum var.vibrio(Ehr.Cl) , Navicula incerta (Nach.Grunow),N. punctata var.punctata W.Smith , Surirrila suecice Grunow) Epipelic, 5 species (Achnanthes exigua var.heterovalva Krasske, Gomphonema subtile, G. tenellum Kutz , Synedra cyclopum Brutschy, S. incisa A.Boyer.) epiphytic on (Phragmites australis), Achnanthes plonensis Hust.4 species Anomoeoneis serians var.apiulata, Denticula thermalis Kutz., Navicula subrhyncocephala Hust., associate between epiphytic and epipelic diatoms, 6 species ,Achnanthes grimmei Krasske., Anomoeoneis vitera Grun., Gomphocymbella ancyli (Cleve)Hust., Navicula capitatoradiata nomen novum., Nitzschia incospicua Grun, distributed among the three environments, 2 species Cocconeis scutellum Ehr. and Navicula rhyncocephala var.germaini, as planktonic and epipelic, and one species Nitzchia obtusa var.multistriata Hohn, associate between planktonic and epipelic diatoms. The qualitative study has shown that 377 taxa of planktonic diatoms belonging to 20 families and 49 genus, which pennales were, dominate by 90.45 % (341species and 42 genus), while the centrales recorded 4.55% with ( 36 species and 7 genus) from the total of planktonic diatoms. The total number of species of planktonic diatoms wandering variation depending on the seasons and the stations, as the St4, recorded the highest number of species (65) in the winter, while the lowest number (17) species was at St1, in the summer. Also Observed heterogeneity in rates of total of individuals of plankton diatoms in different seasons and stations study, as it scored the highest average number 216.36 × 104 cells / L at St4, in the winter , and the lowest 33.62 × 104 cells /L at St2, in autumn. 298 taxa of epipelic diatoms have been diagnosed in this study, belonged to18 families and 45 genus, dominated by pennales with 94.93% (40 genus, 281 species). While the centrals recorded 5.74% (5 genus , 17 species), clearer variations observed in total of numbers for species in different seasons and stations, as recorded the highest numbers 70 species at St5, in winter, so for the St6 and St2, recorded the lowest 18 species in summer and autumn, also the numbers of individuals differenced ,as recorded the highest 91.48 x103celle/cm2 at St3 in autumn, and the lowest 6x 103 cells/cm2 at St6 in summer. The total numbers of species of epiphytic diatoms on P.australis plant reached 333, belonged to 19 families and 45 genus, the pennales recorded the highest percentage, 94.29% (39 genus and 314 species), so for the centrales get 5.71% and (19 species, 6 genus), a variation in numbers of species in different seasons and stations of study observed, as found to outweigh the 3rd St, in number of species in autumn and scored 75 species, while the St2, recorded the lowest number 38 species during the summer. Also appeared variation in the total number of individuals depending on the seasons and stations, as it scored the highest rate of cells 209.4 × 104 cells / g wet weight in the St4, in autumn, and the lowest number 25.41 × 104 cells / g wet weight at St6, during the summer. In this study Adopted four ecological indexes ( richness , diversity, the similarities and differences ) as the results showed that evidence richness and diversity of planktonic diatoms wandering values ranged between 13.58 - 3.93 and 4.05 - 2.67 , The highest value of the similarity 0.261, and the lowest value 0.103, the highest value of the difference 0.957 and the lowest value 0.586. As evidence of the richness and diversity of epipelic diatoms ranged between 19.45 - 6.61, and 3.89 - 2.05, respectively, Also recorded the highest value of the similarity 0.313 and the lowest value 0.086 , so for found the highest value of the difference 0.826, and the lowest value 0.524. While evidence richness and diversity of epiphytic diatoms recorded values ranged 16.89 - 10.44 , and 3.95 - 3.12 , respectively. While the highest value for the similarities 0.420 and the lowest value 0.173 .The highest value of difference 0.742 and the lowest was 0.408 ,when calculating the indices of water quality for the purpose of living aquatic organisms by using 15 factors ( water temperature , turbidity TDS, pH, DO, chloride, NO2 , NO3 , PO4, Fe , Cd, Cu, Pb, Ni and Zn) , the results showed that the quality of water of Tigris River for living aquaculture in area studied area got a (conservative estimate) , as evidence of the highest value 79.64 at St4, in winter and the lowest 65.95 at St1, in summer. The study also included a measurement of the total concentration of some heavy metals in water samples such as iron , cadmium , copper, lead , nickel, zinc , and their values ranged between 0.24 - 1.27 , ND - 0.038 , 0.033 - 0.383, 0.0178 - 0.469, ND - 0.323, 0.020 - 0.231 mg / L, respectively. From results we can concluded that the waters of Tigris River in the study area is contaminated with heavy metals more than the rest of the studied factors , especially regarding cadmium , copper, lead and zinc , and the two stations St3 and St6 were most polluted than the others. When applying heavy metal pollution index , we find evidence that the highest value (100) for the element Cd in all stations while recorded the lowest value ( 0.33 ) for the element Ni.

دراسة مناعية ووراثية لداء السكري النوع الاول في عينة من المرضى العراقيين Immunological and genetic study of type I diabetes mellitus in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: انور عبد ناصر
اسم المشرف: احسان عرفان حسين حازمة موسى خميل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة على 50 عينة دم ماخوذة من اطفال تراوح متوسط اعمارهم من 7 - 12 سنة, كان منها 35 (18 ذكور, 17 اناث) عينة دم لاطفال مصابين بداء السكري - النوع الاول Type 1 Diabetes Mellitus (T1D), وعلى 15 (9 ذكور, 6 اناث) عينة دم لاطفال اصحاء التي عدت كعينة قياسية. قدر تركيز بعض الحركيات الخلوية بادئة الالتهاب في مصل العينات المدروسة التي شملت IFN - γ وIL - 17, وبعض الحركيات الخلوية مضادة للالتهاب وشملت IL - 4، IL - 10 وTGF - β1, وباستعمال تقانة الاليزا ELISA. اظهرت النتائج تراكيز عالية من الحركي الخلوي IFN - γ في مصل المصابين بداء السكري - النوع الاول، اذ بلغ تركيزه 1.575 بيكوغرام/مليلتر بالمقارنة مع 0.921 بيكوغرام/مليلتر لدى العينة القياسية. اظهرت نتائج التحليل الاحصائي باستعمال اختبار Mann - Whitney U وجود فروق معنوية في هذا الحركي الخلوي بين الاطفال المصابين والعينة القياسية وتحت مستوى احتمالية P<0.05. اظهرت النتائج ايضا انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 17A في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ التركيز في مصل دم المصابين 0.010 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.029 بيكوغرام/مليلتر. اظهرت النتائج انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 4 في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ التركيز في مصل دم المصابين 0.015 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.021 بيكوغرام/مليلتر, كما اظهرت النتائج انخفاضا في تركيز الحركي الخلوي IL - 10 في مصل دم المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ متوسط التركيز في مصل دم المصابين 0.068 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.111 بيكوغرام/مليلتر. بينت النتائج ارتفاعا ملحوظا في تركيز الحركي الخلوي TGF - β1 في مصل المصابين بالمقارنة مع العينة القياسية, اذ بلغ متوسط التركيز في مصل دم المصابين 1.659 بيكوغرام/مليلتر، بينما كان تركيزه في العينة القياسية 0.444 بيكوغرام/مليلتر. اظهره نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية في تركيز TGF - β1 بين كلا العينتين وتحت مستوى احتمالية P<0.05. اشارت نتائج قيم معامل الارتباط باستعمال تحليل Pearson Correlation بين الحركيات الخلوية المدروسة الى وجود فروق معنوية في بعض الحركيات الخلوية, بينما لم تظهر وجود اية فروق معنوية في الحركيات الخلوية الاخرى. اظهر التعدد الشكلي لجين IFN - γ T/A +874 المتضخم باستعمال تقانة نظام الممانعة للتضخيم Amplification refractory mutation system (ARMS - PCR) نسبة اعلى من تكرار الاليل t في عينة المصابين بالمقارنة مع تكرار الاليل a، بينما سجل الاليل t نسبة اعلى من الاليل a في العينة القياسية. ظهر الاليل a كاليل مسبب Etiological faction (EF) بلغت قيمته 0.451, ومرتبط مع المرض في عينة المصابين، بينما ظهر الاليل t كاليل وقائي من المرض Preventive faction (PF) وبلغت قيمته 0.299. اظهرت نتائج التحليل الاحصائي للنمط الوراثي TT نسبة اعلى لدى العينة القياسية بالمقارنة مع عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول, وظهر هذا النمط كنمط وراثي وقائي من خطر الاصابة بداء السكري, وظهر النمطان الوراثيان TA وAA كنمطين وراثيين مرتبطين مع خطر الاصابة بداء السكري. اظهرت نتائج الترحيل الكهربائي وجود الجينين IL - 17A وIL - 17 - F في عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول والعينات القياسية, ولعدم توفر الانزيمات القاطعة والوقت الكافي لم تتم دراسة التعدد الشكلي لهذه الجينات. اظهر التعدد الشكلي لجين IL - 4 - 590 (C˃T) المتضخم باستعمال تقانة ARMS - PCR نسبة اعلى من الاليل c في عينة المصابين بالمقارنة مع الاليل t وظهر الاليل c كاليل مسبب مرتبط مع خطر الاصابة بالمرض، بينما سجل الاليل t نسبة اعلى من الاليل c في العينة القياسية، وظهر الاليل t كاليل وقائي من المرض. اظهر النمطان الوراثيان TT وTC كنمطين مرتبطين مع الجزء الوقائي من خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول وظهر النمط الوراثي CC كنمط وراثي مرتبط مع خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول. كشف عن محث الجين 10IL - في الموقعين - 592 و- 1082 في عينة المصابين بداء السكري - النوع الاول والعينة القياسية، واظهرت النتائج وجود هذين الموقعين في محث الجين IL - 10 في جميع العينات المدروسة. اظهرت نتائج التعدد الشكلي للجين TGF - β1 في الموقع Codon 10 : +869*C/T بان الاليل t كاليل مسبب ومرتبط مع المرض, بينما اظهر الاليل c كاليل وقائي من خطر الاصابة بالمرض. وظهر النمطان الوراثيان TT وCC كانماط وراثية مسببة ومرتبطة مع خطر الاصابة بداء السكري, بينما ظهر النمط الوراثي CT كنمط وراثي مرتبط مع الجزء الوقائي من المرض. بينت نتائج التعدد الشكلي للجين TGF - β1 في الموقع Codon 25 : +915*G/C بان الاليل g ظهر كاليل مسبب ومرتبط مع خطر الاصابة, بينما ظهر الاليل c كاليل وقائي من المرض. ظهر النمط GG كنمط وراثي مرتبط مع خطر الاصابة بداء السكري - النوع الاول, بينما لم يظهر النمطان الوراثيان GC وCC اي ارتباط معنوي مع المصابين بداء السكري - النوع الاول, وكان نمطان مرتبطين مع الجزء الوقائي من خطر الاصابة بالمرض. نتائج التسلسل التتابعي لمحث الجين IL - 10 في الموقعين الطافرين - 592 و- 1082 قد سجلت العديد من الطفرات الجينية من نوع الاضافة، الحذف والاستبدال مع نسبة عالية من النوع الاخير من الطفرات الجينية في جميع العينات المدروسة ولكلا الموقعين. | This study was included 50 blood serum samples were collected from children with age ranged between 7 - 12 years. Thirty five samples collected from children with Type 1 Diabetes Mellitus (T1D), and 15 blood serum samples collected from healthy children as a control sample. The concentrations of some pro - inflammatory interleukins like IFN - γ and IL - 17 were detected. Anti - inflammatory interleukins like IL - 4, IL - 10 and TGF - β were also detected by using Elisa instrument. The results revealed high concentrations of IFN - γ in T1D patient’s blood serum with 1.575 Pg/ml in comparison with 0.921 Pg/ml in control sample. The statistically results by using Mann - Whitney U test revealed significant differences between T1D patients and control samples. The results also revealed decreasing in IL - 17 concentrations in T1D patient’s blood serum with 0.010 Pg/ml in comparison with the control sample with 0.029 Pg/ml. No significant differences were detected in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the same statistical test. The results showed increasing in TGF - β concentration in T1D patient’s blood serum in comparison with the control sample. The concentration was 1.659 Pg/ml in patients, whereas the concentration of TGF - β in control sample was 0.444 Pg/ml. The results of Mann - Whitney U test showed significant differences in TGF - β concentrations between both samples. The results revealed decreasing in IL - 4 concentration in blood serum of T1D patients in comparison with the control sample. The concentration was 0.015 Pg/ml in patients, whereas the concentration of IL - 4 in control sample was 0.021 Pg/ml. No significant differences were found in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the same statistical test. The results also revealed decreasing in IL - 10 concentration in T1D patient’s blood serum in comparison with the control sample, with 0.068 Pg/ml in patient sample and 0.111 Pg/ml in control sample. No significant differences were found in concentration of this interleukin between the studied samples when they analyzed with the Mann - Whitney U test. The results of correlation coefficients by using Person Correlation test between the studied interleukins showed significant differences among some interleukins, but no significant differences were detected with the other interleukins. The polymorphism of IFN - γ T/A +874 gene, which amplified by using amplification refractory mutation system (ARMS - PCR) was showed increasing in T allele frequency of T1D patients in comparison with the A allele frequency, whereas the T allele frequency was higher from the A allele frequency in control sample. The A allele revealed as Etiological faction (EF) and correlated with the disease in T1D patients sample, whereas the T allele revealed as Preventive faction (PF). The TT genotype showed higher percentage in control sample in comparison with T1D patients sample when Hardy - Weinberg equilibrium was used, and this genotype revealed as preventive faction from infection by this disease. The TA and AA genotypes revealed as etiological faction with risk by having this disease. The gel electrophoresis of IL - 17A and IL - 17F genes revealed the presence of both genes in all studied samples. The polymorphism of IL - 4 - 592 (C>T) gene which amplified by ARMS - PCR technique was showed high C allele frequency in T1D patients sample in comparison with T allele frequency, and the C allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the T allele showed high frequency from the C allele frequency in control sample, and the T allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The TT and TC genotypes revealed as preventive faction from infection by this disease, whereas the CC genotype revealed as etiological faction with risk by having this disease. The promoter of IL - 10 gene in - 592 and - 1082 positions were detected in both of the studied samples. The results of polymorphism of TGF - β1 gene in Codon 10 : +869*C/T position showed that the T allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the C allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The TT and CC genotypes revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the CT genotype revealed as preventive faction from infection by this disease. The results of polymorphism of TGF - β1 gene in Codon 25 : +915*G/C position showed that the G allele revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the C allele revealed as preventive faction from infection by this disease. The GG genotype revealed as etiological faction with risk by having this disease, whereas the GC and CC genotypes showed no significant correlation with the T1D disease, and these genotypes revealed as preventive faction from infection by this disease. The DNA sequences of the IL - 10 gene promoter were recorded many gene mutations with addition, deletion and substitution types, with high percentage of the last type of gene mutations in all of the studied samples and for both - 592 and - 1082 positions.

دراسة تشريحية مقارنة لتراكم الصابونيات وتقديرها في نبات Yucca gloriosa Variegata L. الكامل ومزارعه النسيجية

اسم المؤلف: انسام غازي عبد الحليم علي
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش كاظم محمد ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد نبات الخنجر الاسباني Yucca gloriosa Variegata L. نبات زينة وطبي مهم, ينمو في المناطق الجافة وشبه الجافة حول العالم. يعد التكاثر الخضري التقليدي للنبات عن طريق العقل والخلفات وسيلة غير كافية نظرا الى الاعداد المحدودة التي يستطيع انتاجها، وعليه توفر تقنية زراعة الانسجة النباتية طريقة بديلة للانتاج التجاري لهذا النبات. ازداد الاهتمام بنبات Y. gloriosa لان جميع اجزاء النبات غنية بالمركبات الستيرويدية التي لها قيمة علاجية واسعة. اجريت الدراسة بهدف اكثار هذا النبات نسيجيا واختبار انتاج الانسجة من الصابونيات الستيرويدية في انسجة الزروعات ومقارنتها مع محتوى هذه المركبات في النبات الكامل باستعمال التحليلات الكروماتوغرافية والمجهر الفلوريسيني والذي يعتبر طريقة جديدة فعالة لتقدير مستوى تراكم المركبات الثانوية واختبار المنتجات النباتية الطبيعية التي تستعمل كعقاقير طبية. لدراسة الاخلاف خارج الجسم الحي اضيفت تراكيز مختلفة من منظمات النمو البنزل ادنين BA)) وحامض النفثالين NAA)) وتداخلهما الى الوسط الغذائي موراشيج وسكوج(MS) لاستحثاث الكالس من الاوراق والبراعم. سجلت النسبة المئوية لاستحثاث الكالس والوزن الطري ولون وبنية الكالس بعد 1.5 و6.0 اشهر من الزراعة. استحث الكالس من اجزاء الاوراق في وسط MS مجهز ﺑ 6 ملغم/لتر NAA. اظهرالتداخل بين 0.2 ملغم/لتر BA و1.5 ملغم/لتر NAA تاثير ملحوظ في نشوء الكالس من البراعم. تم اختبار تاثير اضافة منظم النمو الثايدايازورون (TDZ) ﺑتراكيز مختلفة (0.0, 0.1, 0.5 او (1.0 ملغم/لتر الى وسط MS مجهز ﺑ BAو NAAفي استحثاث الكالس. سجل اسرع نمو واكثر انتاجية للكالس من البراعم في الوسط المجهز ﺑ 0.1 ملغم/لتر BA مع 1.5 ملغم/لتر NAA و1.0 ملغم/لتر TDZ. اظهر TDZ تاثيرا ايجابيا في ٳستحثاث الكالس من البراعم مقارنة مع BA او NAA, واعطت بعض التداخلات تكوين مباشر للافرع الخضرية. تميز الكالس الناتج من البراعم بلونه الٲبيض المائل الى الكريمي وبكونه متراص, بينما كان كالس الاوراق اخضر اللون ومفصص. تم اختبار تاثير عدة تداخلات من BA 3)، 6، 7، 8 او 9 ملغم / لتر) و0.05) NAA، 0.1 او 0.2 ملغم / لتر) في تكوين النبيتات على وسط MS في غضون 12 اسبوعا، كان اعلى تكوين للنبيتات بوجود 9) ملغم / لتر) BA و0.1) ملغم / لتر) NAA . حدد تاثير اندول حمض البيوتريك (IBA) بتراكيز مختلفة في تكوين الجذور. ان افضل تجذيرللنبيتات كان في وسط MS بقوة ½ المجهز ﺑ 1.0 ملغم / لتر IBA. استخلصت وشخصت الصابونيات الستيرودية التايكوجينين والجيتوجينين من اجزاء النبات الكامل (اوراق، جذور وقمم نامية) ومزارعه النسيجية (الكالس، الاجزاء الخضرية التي تم اخلافها بطريقة مباشرة وغير مباشرة، الجذور) من النبات. جرى الكشف الاولي للصابونيات الستيرويدية باستعمال الطبقة الرقيقة الكروماتوغرافية (TLC). كما قدرت الصابونيات الستيرويدية (التايكوجينين والجيتوجينين) باستعمال الكروماتوغرافي عالي الاداء (HPLC). اظهرت مستخلصات الكحول البيوتانولي وجود التايكوجينين والجيتوجينين في كل جزء من النبات ومزارعه النسيجية بمدى يتراوح من 128.29الى409.75 ومن51.04 الى236.62 مايكروغرام/غرام على التوالي. سجلت اعلى قيمة للسابوجينينات sapogenins في اوراق النبيتات المعاد اخلافها بطريقة غير مباشرة. ان كمية هذه المركبات كانت جديرة بالاعتبار في انسجة الكالس المعامل مع TDZ اعتمادا على فترة نشوء الكالس القصيرة (ثلاثة اسابيع). نفذت دراسة تشريحية لملاحظة تراكم الصابونينات في اجزاء النبات الكامل ومزارعه النسيجية باستعمال المجهر الفلوريسيني وتبين بان اعلى تراكم قد ظهر في انسجة اوراق النبيتات التي تم اخلافها بطريقة غير مباشرة وفي انسجة الكالس المستحث نشوءه بمنظم النمو .TDZ سجل تغير في محتوى الصابونيات خلال فترات نمو الكالس المختلفة. | Yucca gloriosa Variegata L. is an important ornamental and medicinal plant, grows in arid and semi - arid regions around the world. Traditional vegetative propagation of the plant by cuttings and offsets is not adequate due to the limited numbers that can be produced. Plant tissue culture technique provides an alternative method for commercial propagation of this plant. The interest in Y. gloriosa increased because all parts of this plant are rich in steroidal compounds that have vast therapeutic values. This study was performed to propagate this plant in vitro and investigate the yield of steroidal saponins in the plant tissue cultures. Comparison of the saponins yield in intact plant and tissues or organs derived from it using chromatographic analysis and fluorescence microscopy was carried out. To search the potential of in vitro rapid regeneration of this plant, different concentrations of 6 - Benzyladenine (BA), 1 - naphthaleneacetic acid (NAA) and combinations of both were assessed for callus induction on leaf and bud explants using Murashige and Skoog (MS) medium. Callus response initiation percentage, fresh weight, texture and color of the callus were evaluated after 1.5 and 6.0 months in culture. The appropriate medium for callus initiation on leaf explants was MS medium supplemented with 6.0 mg/l NAA. A combination of 0.2 mg/l BA and 1.5 mg/l NAA also exhibited a remarkable callus induction on bud explants. Addition of thidiazuron (TDZ), BA and NAA at various concentrations (0.0, 0.1, 0.5 or 1.0 mg/l) were examined for callus initiation. Faster growth and more proliferation of callus on bud explants were observed on MS medium supplemented with 0.1 mg/l BA + 1.5 mg/l NAA + 1 mg/l TDZ. Results showed that TDZ was more efficient for inducing callus than BA or NAA however some combinations gave direct shoot regeneration. Calli derived from bud explants were whitish to creamy and compact, while calli derived from leaf explants were greenish. The influence of different combinations of BA (3, 6, 7, 8 or 9 mg/l) and NAA (0.05, 0.1 or 0.2 mg/l) on shoot proliferation on MS medium were tested. Within 12 weeks, the highest shoot formation was in the presence of BA (9 mg/l) and NAA (0.1 mg/l). The effect of indole - 3 - butyric acid (IBA) at different concentrations on root proliferation was determined. The best rooting of plant microshoots was found in MS medium provided with 1.0 mg/l IBA. The extraction and identification of steroidal sapogenin tigogenin and gitogenin from both intact plant parts (leaves, rhizomes and shoot apices) and tissue cultures (calli, direct and indirect regenerated shoots, rhizomes) of Y. gloriosa Variegata L. were performed. Preliminary identification of steroidal sapogenin was done using thin layer chromatography (TLC). Qualitative and quantitative assessment of steroidal saponins (tigogenin and gitogenin) was also performed by using high performance liquid chromatography (HPLC). The butanolic extracts showed the existence of tigogenin and gitogenin in all plant parts and their tissue cultures ranging from 128.29 to 409.75 and 51.04 to 236.62 μg/g respectively. Maximum sapogenins value was recorded in indirect regenerated shoots. The amount of these sapogenins in callus treated with TDZ was considerable since callus initiated rapidly within 3 weeks. Anatomical study investigating saponins accumulation in both intact plant parts and their tissue cultures were performed using fluorescence microscopy under ultraviolet (UV) to determine the site of saponin accumulation. Histological analysis using fluorescence microscope showed that saponins primarily accumulated in indirect regenerated leaf tissues and in callus treated with TDZ. Saponins levels changed during different periods of callus growth

قابلية بعض النباتات المائية على الازالة الحيوية لعنصر الرصاص من الماء الملوث : دراسة مقارنة Phytoremediation Ability of Some Aquatic Plants of Lead from Polluted Water : A comparative study

اسم المؤلف: انسام صباح عباس
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة المقارنة لاول مرة في العراق لتوضيح كفاءة النباتات المائية عشبة النيل(Mart.) Solms. Eichhorina crassipes والهايدريلا Hydrilla verticillata (L.F) والشمبلان Ceratophyllum demersum L. على ازالة عنصر الرصاص عند وجودها في حوض ماء واحد مجتمعة ، وقد استخدمت تراكيز مختلفة من عنصر الرصاص (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر وبواقع ثلاث مكررات لكل تركيز.جمعت النباتات بعد مرور (4، 7، 14، 21، 28) يوما من احواض التجربة المختبرية وقيست النسبة المئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه وكذلك كمية العنصر المتراكم في كل نبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي لكل نبات وقدرت كفاءة النباتات في ازالة عنصر الرصاص كنسبة مئوية للازالة في النباتات.واشارت نتائج التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية (P<0.05) بين التراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر والايام (4، 7، 14، 21، 28) في مستوى امتصاص الرصاص من النباتات وكذلك وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية (P<0.05) بين التراكيز والايام في نسبة الازالة ولوحظ ان تراكم عنصر الرصاص في النباتات يزداد بزيادة التركيز وكذلك بمرور مدة التعريض.اظهرت النتائج ان نبات عشبة النيل كان اكثر كفاءة في امتصاص ومراكمة عنصر الرصاص داخل انسجته ، اذ بلغت تراكيز عنصر الرصاص في نبات عشبة النيل وبوجود نباتي الشمبلان والهايدريلا بعد مرور ثمانية وعشرين يوما (5.35، 6.38، 8.01 ، 10.02، 8.02) ملغم/كغم للتراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر .في حين كانت تراكيز عنصر الرصاص في نبات الهايدريلا وبوجود نباتي عشبة النيل والشمبلان بعد مرور ثمانية وعشرين يوما (4.20، 5.22، 6.25، 7.25، 0.97) ملغم/كغم للتراكيز المدروسة ، ولوحظ ان نبات الشمبلان كان اقل كفاءة في مراكمة عنصر الرصاص عند وجوده مع نباتي الهايدريلا وعشبة النيل، اذ كانت تراكيز عنصر الرصاص (0.30، 0.42، 3.35، 5.32، 6.25، 0.28) ملغم/كغم بعد مرور ثمانية وعشرين يوما للتراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر على التوالي.بينت النتائج انه يمكن استخدام نباتي الهايدريلا وعشبة النيل في المعالجة الاحيائية للمياه الملوثة بعنصر الرصاص، اذ اظهر النباتين نسبة ازالة مرتفعة لعنصر الرصاص عند وجودهما معا في حوض ماء واحد، وكانت النسب المئوية للازالة (99.40، 97.86، 90.50، 67.60، 19.62)% عند التراكيز (10، 15، 20، 30، 50) ملغم/لتر بعد مرور ثمانية وعشرين يوما على التوالي وهي نسب مرتفعة مقارنة بما سجل عند استخدام نباتي الشمبلان والهايدريلا وكذلك اعلى من نباتي عشبة النيل والشمبلان، وهذا يدل على ان لنباتي الهايدريلا وعشبة النيل القابلية على ازالة عنصر الرصاص بكفاءة عالية.بينت النتائج ان النسبة المئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه في جميع التجارب تزداد بزيادة التركيز وتنخفض بمرور مدة التعريض ، اذ سجلت اعلى نسبة مئوية لعنصر الرصاص المتبقي في المياه عند استخدام ثلاث نباتات مائية عشبة النيل والهايدريلا والشمبلان (90.80)% عند التركيز 50 ملغم/لتر وبعد مرور اربعة ايام في حين بلغت ادناه (0.30)% عند التركيز 10 ملغم/لتر وبعد مرور ثمانية وعشرين يوما من التعريض. بلغت اعلى قيمة لمعامل التركيز الحيوي ((BCF عنصر الرصاص (178.33) ملغم/كغم في نبات عشبة النيل بوجود نباتي الهايدريلا والشمبلان و(140) ملغم/كغم في نبات الهايدريلا وبوجود نباتي الشمبلان وزهرة النيل ، في حين كانت اقل قيمة لمعامل التركيز الحيوي (0.67) ملغم/كغم في نبات الشمبلان وبوجود نباتي الهايدريلا وزهرة النيل ، ولوحظ ان معامل التركيز الحيوي يزداد بمرور مدة التعريض وينخفض بزيادة التركيز مما يدل على ان كفاءة النباتات تتاثر بالتراكيز العالية.

استعمال الهائمات النباتية ادلة احيائية لتقييم تاثير الانشطة البشرية على نوعية مياه نهر بيت زوينة محافظة ديالى Use of Phytoplankton as Biological Indicator to Evaluate the Anthropogenic Impact on Water Quality of Beat - Zwana River - Diyala

اسم المؤلف: انتصار كريم عبد الحسن الدراجي
اسم المشرف: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات - الاحياء المائية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study was conducted in five selected positions variety of human activities along the agricultural project named (Beat zwana River) located in Jadedat - alshat, within the province of Diyala, for the period from October 2013 until June 2014, the study included measurement of twenty - two physiochemical factors of river water environment, as well as to study the quality and quantity of community phytoplankton, has also been applied in the study a number of environmental indexes.The range of studied properties were : 10.83 - 38.75°C and 9.17 - 28.5°C for air and water temperature, water depth (16.50 - 284.33 cm), light penetration (14.50 - 152cm) , turbidity (0.27 - 106.98) NTU, electrical conductivity, EC,(514.83 - 1027.5) μS/cm , salinity (1.15 - 4.88 part per thousand), total dissolved solids, TDS (287.83 - 861.6) mg/l and total suspended solids TSS (2 - 49.87) mg/l, pH (6.25 - 7.98), dissolved oxygen, DO (3.65 - 11.25)mg/l and Biological Oxygen Demand. BOD5 (1.07 - 4.35) mg /l, total alkalinity, TA (115.33 - 178.5 ) mg /l, total hardness, TH ( 221.83 - 338.83) mg/l, Calcium, Ca (52.08 - 101.36) mg CaCO3/l, and Magnesium ,Mg (74.62 - 177.89) mg CaCO3 /l, Nitrate NO3(1.55 - 6.55) mg /l, effective phosphate PO4 (0.02 - 4.16) mg/l, Sulfate, SO4 (131.5 - 283) mg/l ,effective Silicate (4 - 2.10) mg/l, , Chlorophyll - a, ( 0.12 - 28.02) and Phaeophytin - a, (0.85 - 25.93). mg/l, respectively.Results of the present study showed that most of the studied characteristics and private (Salinity, EC, TH, PO4, BOD5, Turbidity, TDS , Ca and Mg) were of an influential or higher rates when comparing the permissible limits environmentally overall used properties of water for irrigation or aquaculture or for human consumption, according to recommendations of WHO, FAO Organization, as well as the Iraqi specifications for the river water, which shows that human activities in the region significant effect on water and environment of project.The number of phytoplankton algae that have been diagnosed in this study reached 200 species belong to 72 genera, within nine classes of the following basic algae Bacillariophyceae, Chlorophyceae, Cyanophyceae, Euglenophyceae, Raphidophyceae, Dinophyceae, Chrysophyceae, Xanthophyceae, and Cryptophyceae. The diatoms algae formed the largest percentage, as record them 131 species belong to 28 genus, and consisting 65.5%, followed by chlorophyceae 30 species belonging to 22 genus and 15%, then Cyanophyceae,22 species, to 10 genus and 11%, followed by algae Euglenophyceae 8 species belonging to 3 genus and 4%, then Cryptophyceae 3species ,to 3 genus and 1.5%, while all of the Xanthophyceae and Dinophyceae recorded 2species belonging to 2 genus and 1%, and finally the Chrysophyceae and Raphidophyceae, found them 1 species belong to 1 genus and 0.5%. Also the results showed that the distribution and biodiversity of diagnosed phytoplankton at the level of the sites, It was found that there is different for each classes from the ranks of the algae, as recorded presence in the first site 90 species belonging to 43 genus, and at the site - 2, 50 and 35 genus, and in site - 3, 68 species and 38 genus, 66 species belonging to 38 genus in site - 4, while presence 127 species belonging to 45 genus at site - 5.The quantitative study of phytoplankton in the lower and the higher ranges at the five sites ( S1, S2, S3,S4 and S5) of the study area respectively recorded the following values, (1780 - 7246 , 300 - 8180 , 220 - 2950, 560 - 3020 and 540 - 6860 cells /ml, and rates generally each site respectively, as well as 2923.6, 2027.0, 871.1, 1344.4 and 2324.6 cells/ml. when comparing the amount of algae that have been counted, we find that the highest 2923.6 rate cells/ml scored St - 1 and less than the rate of 871.1 cells/ml record in S3.In the current study we were able to record six new genus and species after checking with (Checklist of algal flora in Iraq, 2014) and consisted of these algae to : Westella linearis G. M. Smith, Navicula goppertiama Bourrelly .1981, Oedogonium minus (Wittr.) Witrock 1875. Gonyostomum seme Geitler,Gomphoniuma capitum. Bourrelly .1981, Phcus tourus (lemm.) skvortzow 1928.Also in the current study, many ecological indices were used and represented as follows : Richens index (Marglef index (1968), Similarity index (Sorenson index - 1942), Difference index (Bray and Curtis index, 1957), Presence index depended on (Chandler, 1970) and Shannon Weaver index for diversity, To evaluate the relationship between the sites and the quantity and quality of algae studied and water quality. The highest value for richness 16.246, recorded ta S5 and the highest value of the similarity 0.849 was between S1 and S5, the highest value of the difference 0.491 recorded among of S4 and S5, the highest amount of the presence of his record genus Navicula spp from pennales diatoms, feather at the level of individuals in the sample, as recorded following him to the species N. goppertiana and N. cryptocephala 3200 and 2356 cell/ml in October and November in 2013, while the highest value of diversity 1.878, by Shannon Weaver index recorded in S4. This gives an indication of the variation in the quality of water and nutrients and a physiochemical factors that lead to growth provides supportive conditions andthe spread of some species and a specific one for some of phytoplankton during the months of the year and different locations.On the basis of diversity index values, that was between 1.03 - 1.878 as less and higher, can be considered waters of the five sites between light pollution to medium pollution, and classified all within the second water category according (Wilhm guide - 1975). And this gives a conclusion no matter what the view that the water agricultural project environment (Beat - Zwana River) may be directly affected by human activities practiced by the population as well as other environmental impacts experienced by the entire region from various external and internal factors pollutants.

التباين الوراثي لجين E - selectin المصاحب للاصابه بمرض السكري من النوع الثاني في عينه من الذكور العراقيين العرب

اسم المؤلف: امال يوسف جبار احمد
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Diabetes - Type II (Diabetes Mellitus type 2) is a group of metabolic diseases resulting from high blood sugar because of a defect in insulin secretion, insulin action, or both, and tissue resistance to insulin. This study was conducted to evaluate the serum level of factor E - selectin in patients with diabetes and its relationship to the polymorphisms genetic Jene E - selectin A561C at the site and assess the relationship between classical factor E - selectin factors.The study included 100 male appointed to the Iraqis. The first group (80) patients with diabetes type II and second group (20) of healthy as control samples. The study was conducted at Yarmouk Teaching Hospital / Central Laboratories and Hospital of city Alkazemian, and health center in the Saidiya. For the period from November 2015 until February 2016.We have been identified patients with diabetes type II and control in terms of age, gender, family history of the disease and the duration of diseases and weight (kg) and height (cm) and waist central obesity (cm) And we have been calculate the body mass index calculation. The serum for both groups ,we calculate the level of sugar in the blood and hemoglobin A1c and cholesterol and triglycerides and high - density fat and fat and a low - density and fat and very low - lying density index of atherogenic index.Blood sugar and hemoglobin A1c showed significant differences between patients and control while the cholesterol and fat of all kinds showed no significant differences, except for fat, high - density non - significant differences compared to control patients.It was calculate by the concentration of the adhesion molecule E - selectin in the patients' blood serum (66) and compared to control a person (20) individual using the ELISA device and results showed significant differences in patients than controls.When divided the patients into three groups totals for minor according to the level of the hemoglobin A1c in the blood serum. The first group was less than 6.5, and the second group was between (6.5 to 9.3), the third set was more than 9.3. Control group was divided into two subsections, according to the level of hemoglobin A1c , the first group was less than 6.5, and the second group was between (6.5 to 9.3).SummaryAppeared to increase most of the variables in the third set when the level hemoglobin A1c of more than 9.3.When you link current study results have shown that the sugar in the blood record significant correlation with the body mass index (0.20). The hemoglobin A1c and creatine and cholesterol and low - density lipids significant correlation with central obesity respectively coefficient (0.20) (0.22) (0.23) (0.21) and E - selectin factor (0.21).The molecular study included 74 individual patients and (20) of individual control. It included PCR - RFLP technique. Electric deportation results for Jene E - selectin at the site A561C showed the presence of alleles are A, C and the presence of three genotypes are (AA, AC, CC). Allele A is a higher proportion of allele C in patients and control, and that repeating models genetic (AA, AC , CC) with no significant differences in the patient group than controls. Showed allele A difference no significant in control compared to patients using the test Fisher and relying on the Confidence Intervals (CI) and showed a preventive fraction (PF) of the disease, and that the allele C showed a no significant difference in patients than controls using test Fisher depending on the Confidence Intervals (CI) and showed that the allele C was Etiological fraction (EF). Repeat genotype AA difference is no significant in control compared to patients style of preventive fraction (PF) of disease, showed a repeat genotype AC difference is no significant in patients than controls and appeared style of Etiological fraction (EF) of disease, showed a repeat genotype CC no significant difference in patients than controls and Etiological fraction (EF) of disease. and can be used as indicators of readiness of members of Iraqi society of the male to the disease ..From the study of the genotype to Jene E - selectin at the site A561C a number of the details in the totals for the study, found that there were significant differences between patients and control genotype structures the three (AA, AC, CC) with sugar and E - selectin and hemoglobin A1c , and that there is differences were not significant with the body mass index.

دراسة شكليائية ونسجية للجهاز التكاثري الانثوي لسمكة الشبوط Barbus grypus Heckel,1843 في بغداد Morphological and histological study of the female reproductive system in the fish Barbus grypus Heckel,1843 in Baghdad

اسم المؤلف: افين رمضان محسن العاني
اسم المشرف: عبد الحكيم احمد الراوي نهلة عبد الرضا البكري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية دراسة مظهرية ونسجية للجهاز التكاثري الانثوي لسمكة الشبوط Barbus grypus, Heckel 1843 وتحديد موسم السرء لها في نهر دجلة . جمعت لهذا الغرض خمس عشرة سمكة شبوط انثى بالغة بمختلف الاطوال والاوزان , قيس الطول الكلي والوزن الكلي لكل سمكة , وقيس وزن وابعاد المبايض , ثم ثبتت المبايض والاجزاء الاخرى للجهاز التكاثري الانثوي بوساطة ثلاثة انواع من المثبتات , وقد بينت الدراسة الحالية الاتي : - 1 - موسم السرء لاناث اسماك الشبوط في نهر دجلة يكون خلال شهري مايس وحزيران .2 - امكانية التمييز بين اغلب اناث وذكور الشبوط البالغة مظهريا خلال موسم السرء دون اللجوء الى التشريح الداخلي , اذ اكتسبت اغلبية الذكور البالغة لوناﱟ بنياﱟ اغمق من الاناث عند المنطقة الظهرية ( الاختلافات اللونية) . وان اناث الشبوط تنضج جنسيا في السنة الرابعة من العمر .3 - صنفت مراحل نضج المبايض على ست مراحل وهي : - (ما قبل النضج الجنسي - الراحة - تقدم النضج - ما قبل السرء - السرء - مابعد السرء ) .4 - امتلاك اناث اسماك الشبوط زوجا من المبايض من النوع الكيسي , واستمرار التجويف المبيضي الى الخلف مع تجويف قناة البيض التابعة لكل مبيض واللتان تتحدان على شكل قناة بيض مشتركة تفتح الى الخارج عن طريق الفتحة التناسلية التي تقع خلف الفتحة المخرجية وامام الفتحة البولية . تكون قناة البيض جانبية الموقع للمبيض ومبطنة بنسيج ظهاري حرشفي بسيط , وتجويف قناة البيض المشتركة هو امتداد لتجويف قناة البيض . 5 - يحاط المبيض بالجدار المبيضي المؤلف من الظهارة السطحية التي تكون صباغية من ناحية المبيض الظهرية وتدعى بالظهارة السطحية الصباغية , والغلالة البيضاء يليه سدى المبيض الحاوي على الخلايا الجنسية الانثوية بمختلف مراحلها , ويبطن التجويف المبيضي بظهارة انتاشية التي هي منشا سليفات البيوض بالمبيض البالغ .6 - يصنف المبيضان على اساس نمط نمو وتكون الخلايا البيضية فيه الى مبيض ذا المجاميع المزامنة .7 - قسمت مراحل تكوين الخلايا البيضية الى تسع مراحل وهي : - (مرحلة سليفات البيوض - مرحلة النويات المحيطية المبكرة - مرحلة النويات المحيطية المتقدمة - مرحلة الاسناخ القشرية - مرحلة المح الابتدائي - مرحلة المح الثانوي - مرحلة المح الثالثي - مرحلة النواة المهاجرة - مرحلة الاماهة ) .8 - وجود نوعين من المشتقات الجريبية : - ا - الجريبات الرتقية التي تظهر على مدار السنة بنسبة قليلة وفي مرحلة مابعد السرء بنسبة كبيرة. ب - جريبات ما بعد الاباضة التي تظهر في مرحلة السرء نتيجة لحدوث عملية الاباضة .9 - اظهرت نتائج الفحص بالمجهر الالكتروني النافذ ماياتي : - ا - ان المنطقة الشعاعية (الغلاف المحي) ذات تركيب متعدد الصفائح ( صفائح كثيرة الكثافة الكترونيا متبادلة مع صفائح اقل كثافة الكترونيا ) , تتخللها قنيات (قنوات) الثقوب التي تخترقهزاغيبات الخلية البيضية وزغيبات الخلايا الحبيبية اذ تكون الاخيرة اسمك من السابقة , ولهذه الزغيبات اهمية كبيرة في زيادة سطح التبادل الايضي مابين خلية البيضة والخلايا الحبيبية . ب - الاسناخ القشرية تظهر بعضها بوصفها حويصلات غشائية متجانسة ذات تحبب دقيق والبعض الاخر يحوي حويصلة غشائية كثيفة الكترونيا داخل حويصلة غشائية متجانسة ذات تحبب دقيق . ج - المح يظهر بشكل صفيحات محية ذات احجام مختلفة , الكبيرة منها تحوي على جسم رئيس ذي محتوى بلوري من المح . د - الحويصلات المطلية تندمج لتكون اجسام متعددة الحويصلات التي تزداد بالحجم لتصبح اجساماﱟ محية والتي تزداد بالحجم لتصبح صفيحات محية . | The present study includes study of morphological and histological structure of the female reproductive system in the adult Shabout Barbus grypus ,Heckel 1843 and specification of the spawning season for this species in Tigris River .Fifteen of the adult female Shabout of different lengths and weights were collected as sample . Their total length and weights are measured . also the weight and dimensions of each ovary were recorded , samples from each ovary and some parts of the female reproductive system are fixed with three different fixatives .The present study shows the following : - 1 - The spawning season for the female Shabout is in May and June in Tigris river .2 - The ability of distinguishing between most of the Shabout males and females externally at the spawning season , the majority of the adult male has darker brown color at the dorsal side than the females (dichromatism ) , At the age of four , female Shabout attain sexual maturity .3 - The ovarian maturity stages are classified into six : - ( Immature , Resting , Maturing , Pre spawning , Spawning , Post spawning ) .4 - The adult female Shabout has a pair of ovaries of Cystovarian condition . the ovarian cavity continuous posteriorly with the oviduct cavity, and the tow oviducts merges in to one common oviduct which opens externally through the genital pore ( in front of urinary pore and behind anus ) . The oviduct laterally lies with the ovary which is lined with the simple squamous epithelial tissue . The tow oviducts merges to form the Common oviduct which its cavity is a continuous to the oviduct cavity .5 - The ovary is surrounded by the ovarian wall that consist of Surface epithelium which is Pigmented on the dorsal side of the ovary knowen as Pigmented Surface Epithelium and Tunica Albugenia and by the Ovarian Stroma were different stages of female germ cells can found .6 - The tow ovaries are classified as group - Synchronous based on oocyte development .7 - The oocyte developmental stages divided in to nine stages : - ( Oogonia stage , Early Perinucleolar Stage , Advanced Perinucleolar Stage , Cortical Alveoli Stage , Primary Yolk Stage , Secondary Yolk Stage , Tertiary Yolk Stage , Migratory Nucleus Stage , Hydration Stage ) .8 - Tow types of follicular derivatives were found : - a - Atretic follicles that appear in small percentage through the whole year, and in a large percentage on post - spawning stage . b - Post ovulatory follicles which appears in spawning stage because of ovulation . 9 - The Transmission Electron Microscope results shows the following : - a - Zona Radiata ( Vitelline Envelope ) has a multi - lamellar structure ( electron dense lamellae alternating with lower electron density lamellae ) with Pore canaliculi( Canals) that intervening it oocyte microvilli and Granulosa microvilli which are thicker than the previous , these microvilli important to increase the metabolic exchange surface between oocyte and granuolsa cells . b - Some of the Cortical Alveoli appear as homogenous vesicles with fine granulation , the other appear to contain electron dense vesicular inside homogenous vesicles with fine granulation . c - The Yolk appear as Yolk platelets with different sizes , the bigger ones contain Main Body of crystalline yolk . d - The Coated vesicles merges in the form of multi - vesicular bodies which increase in size to become yolk bodies which also increase in size to become Yolk Platelets .

دراسة كيمونسجية مناعية وعلاجية في الفئران الممنعة والمصابة بالاكياس العدرية Immunohistochemical and Therapeutic Study in Immunized and Infected Mice With Hydatid Cyst

اسم المؤلف: افراح عبد الامير صادق العامري
اسم المشرف: وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت الدراسة الحالية جوانب اساسية للاصابة بالاكياس العدرية الثانوية لـ 120 فارا من ذكور الفئران البيض Mus musculusسلالة Balb/c، شمل الجانب الاول تحديد دور التمنيع في الجوانب الدموية كالعد التفريقي لخلايا الدم البيض والجوانب المناعية كفرط الحساسية الاجلة ومعامل البلعمة. اوضحت نتائج العد التفريقي ارتفاعا ملحوظا في اعداد الخلايا اللمفاوية بنسبة 64.75% مع حدوث تباين في اعداد الخلايا احادية النواة والحمضة وانخفاضا في اعداد الخلايا العدلة ليصل 32% في مجموعة الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة. وفيما يتعلق بالاستجابة المناعية الخلوية المتخصصة المتمثلة بقياس فرط الحساسية الاجلة في وسادة القدم اليسرى، اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول ارتفاع في معدل سمك وسادة القدم في الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة ، مع ارتفاع في معامل البلعمة بنسبة 74% مقارنة بفئران السيطرة السالبة، فضلا عن التغيرات العيانية لتلك المجموعة ومن ثم انعكس ايجابيا على المظهر الخارجي وحركة الفئران ووزنها وقابليتها على التغذية وعليه اصيبت تلك الفئران تجريبيا بداء الاكياس العدرية الثانوية من خلال الحقن داخل الخلب (البريتون) بـ 2000 رؤيس اولي من اكباد ورئات اغنام مصابة طبيعيا بالاكياس العدرية. اما الجانب الثاني من الدراسة تمثل بمعالجة الفئران المصابة بثلاثة عقاقير من مشتقات البنزيميدازول والايزوكوينولين هي الالبندازول ((ABZ والاوكسفيندازول (OFZ) والبرازكوينتل (PZQ) ومتابعة بعض الجوانب الدموية والمناعية في الفئران بعد الاصابة والتمنيع والمعالجة، وشملت العد التفريقي لخلايا الدم البيض، اختبار فرط الحساسية الاجلة، معدل معامل البلعمة، اختبار النوى الصغيرة واختبار الانتشار المناعي في الهلام. سجلت مجموعة الفئران المعاملة بعقارOFZ وOFZ+PZQ ارتفاع النسب المئوية للعدلات وانخفاض الخلايا اللمفاوية مقارنة مع فئران مجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة في سمك وسادة القدم اليسرى بعد 24 ساعة مقارنة بالمجاميع الاخرى ومقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة معنوية في معدل معامل البلعمة في مجموعة الفئران المعاملة OFZ (53.17%) ومجموعة الفئران المعاملة OFZ+PZQ (71.5%) وانخفاضا معنويا في معدل النوى الصغيرة (28% و29.1%، على التوالي) مقارنة مع الفئران المعاملة بـOFZ+ABZ وABZ+PZQ، مما يدل على كفاءة المعالجة بعقار OFZ بشكل مفرد او متحد. اما الجانب الثالث فتمثل بدراسة تاثير الاصابة بالاكياس العدرية والعلاجات الكيميائية المختلفة في وظائف الكبد اذ اظهرت الدراسة ان انزيمات الكبد وهي AST وALT وALP فضلا عن مستوى البيليروبين الكلي والمباشر في مصل الفئران المعاملة بـ OFZ وبـ OFZ+PZQ كانت نتائجها اقرب الى السيطرة السالبة مقارنة مع المجموعتين OFZ+ABZ وABZ+PZQ.اما الجانب الرابع فشمل دراسة الجوانب الحياتية المتعلقة بوزن الفئران الممنعة والمعاملة بعقار OFZ بشكل مفرد او مختلط مع البرازكوينتل OFZ+PZQحيث ظهر ارتفاعا طفيفا بمعدل وزنها بنسبة 11.13% و12.10% على التوالي مقارنة بفئران السيطرة السالبة مقارنة بالفئران المعاملة بـ OFZ+ABZ وABZ+PZQ التي سجلت زيادة معنوية ((p≤0.001 قدرها 13.50% و14.87% على التوالي. وسجلت مجموعة الفئران المعاملة انخفاضا في معدل وزن الكبد ومعدل تضخهما اذ اختلفت معنويا عن مجموعة السيطرة الموجبة عند مستوى احتمالية p≤0.001. لذا فحصت الاكياس العدرية الثانوية بعد اربعة اشهر من الاصابة وتم قياس وزن وقطروعدد الاكياس العدرية وحساب الكفاءة النسبية للعلاج, اظهرت الدراسة ان عقارOFZ+PZQ اعلى كفاءة علاجية (96.70%) لكونه تسبب باختفاء الاكياس من الطحال وتلته المعاملة بعقار OFZ) 93.75%)، وسجلت المجاميع المعاملة بعقارOFZ+ABZ وABZ+PZQ كفاءة علاجية نسبية بلغت 82.5% و77.5%, على التوالي. شملت الدراسة التغيرات النسجية المرضية في طحال وكبد الفئران بعد اربعة اشهر من الاصابة والمعاملة. بينت النتائج حصول تغيرات نسجية معتدلة مقارنة مع فئران السيطرة الموجبة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية عن طريق الكيمونسجية المناعية ( IHC) اظهرت النتائج زيادة مستوى الحركيات الخلوية المفرزة من قبل الخلايا التائية المساعدة - النوع الاول (Th1) متمثلة بانترلوكين - 2، انترفيرون - كاما وعامل تنخر الورم اظهرت النتائج ارتفاعا معنويا ((P≤0.001 في مستوى تعبير بروتينIL - 2 في مجموعة الفئران المعاملة بـ OFZ+PZQ التي بلغت في الطحال 65.1% والكبد 54.1% مقارنة بالمجاميع الاخرى ومجموعة السيطرة السالبة والموجبة، وزيادة تعبير بروتين IFN - γفي المجاميع المعاملة مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة. وبينت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية عالية ذات دلالة احصائيةp≤0.001 في مستوى تعبير بروتينات TNF - α مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. اما بالنسبة الى الحركيات المفرزة من قبل خلايا Th2 فقد سجلت نقصانا في انترلوكين - 10 وعامل تحويل النمو بيتا لدى الفئران المعاملة بالمجاميع العلاجية الاربعة لاسيما المجموعة المعالجة بـ OFZ+PZQ فقد اظهرIL - 10 تعبير بروتينيا واطئا في الطحال بلغ 29.7% وفي الكبد 8.2% مقارنة بالمجاميع المعاملة الاخرى ومجموعة السيطرة، كما اظهرت الفئران الممنعة والمعاملة مستوى تعبير بروتينات TGF - β فروقا معنوية عند مستوى احتماليةp≤0.001 للمجاميع مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. بشكل عام لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الحركيات الخلوية المنتجة من قبل Th1 وTh2وبشكل متوازن لدى الفئران الممنعة والمعاملة. | The current research in deals with fundamental aspects of the infection of 120 white mice Mus musculus strain Balb/c with secondary hydatid cysts, comprising first aspect the role of immunization in the haematological aspects such as the differential count of white blood cells and the immunological aspects such as the delayed type hypersensitivity and phagocytosis. The results of differential white blood cell count showed marked increase in the numbers of lymphocyte percentage (64.75%) with a variation in the numbers of monocytes and eosinophils and a decrease in neutrophil numbers which reached 32% in mice immunized and orally administered with antioxidants. In connection with delayed type hypersensitivity in the foot pad the results showed a rise in the rate of foot pad thickness in mice immunized and orally administered with antioxidants as the highest thickness reached 0.82 mm at 24 hours after the injection of antigen and phagocytosis index in mice immunized and orally administered with antioxidants showed an increase of 74% compared with negative and positive control mice in addition to the gross changes of this group which was positively reflected on their appearance, movement, weight and feeding. So this group was experimentally infected with secondary hydatid cyst through their intra peritoneal injection with 2000 protoscolices. The second aspect of the study was to evaluate the therapeutic efficacy of three drugs which belong to Benzimedazole and Isoquinoline viz albendazole (ABZ), oxfendazole (OFZ) and praziquental (PZQ) as well as to follow - up some aspects of the haematological and immunological parameters in mice after their infection, immunization and treatment which included differential white blood cell count, delayed type hypersensitivity test, phagocytosis, micronucleus test and agar gel immune diffusion test.Regarding changes in differential white blood cell count, mice treated with OFZ and OFZ + PZQ showed an increase in neutrophils and decline in lymphocytes compared with positive control group. Also, an increase in foot pad thickness after 24hrs compared with other treated groups and positive control group. An increase in the phagocytosis was noticed in OFZ treated group (53.17%) and OFZ+PZQ treated group (71.5%) and a significant decline in the micronucleus test of 28% and 29.1%, respectively compared with mice treatment with OFZ + ABZ and ABZ+ PZQ which indicates the efficiency of OFZ drug treated alone or in a combination form.The third aspect of the study was to evaluate the effect of infection with hydatid cyst and different chemical treatments on liver functions where the study showed that liver enzymes such as AST, ALT and ALP, as well as the total and direct bilirubin serum level in mice treated with OFZ alone and OFZ + PZQ were closer to those of the negative group compared with the groups treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ.The fourth aspect of the study was to evaluate the biological aspects related to weight of the mice treated with OFZ alone or combination with praziquental OFZ+PZQ where a slight increase in the average weight of 11.13% and 12.10%, respectively was occurred in compared with the negative control due to the low number of cyst and cyst fibrosis which occurred in comparison with those existed in mice treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ which showed a significant increase(p<0.001) which reached 13.50% and 14.87%, respectively.The treated group showed a reduction in liver weight and enlargement rate which was significantly different from that of the positive control group at the level of probability of P< 0.001, as OFZ+PZQ caused the disappearance of the cysts from the spleen(96.70%), followed by group treated with OFZ (93.75%) and then by group treated with OFZ+ABZ and ABZ+ PZQ which showed a treatment efficacy of 82.5% and 77.5%, respectively. The study also included the evaluation of the pathological changes of liver and spleen of mice after four months of the infection and treatment. The result showed satisfactory histopathological changes in comparison with positive control group. When investigating the role of some cellular interleukins in the immune response against Echinococcus granulosus through the immunohistochemical (IHC)test, the results showed an increase in the level of cytokines secreted byTh1 such as IFN - γ andTNF - α as well as IL - 2. The results showed higher level of protein expression IL - 2 in mice group treated with OFZ+PZQ which amounted 65.1% in spleen and 54.1% in liver compared with other treated and negative and positive control groups. Also, an increase in protein expression of IFN - γ was occurred in the treated groups compared with the negative and positive controls except in the group which was treated with OFZ+PZQ where no significant differences were appear in the negative control. The statistical analysis showed the presence of high significant differences (p<0.001) in the level of expression proteins TNF - α compared with negative and positive control groups. Reduction level of cytokines secretion from Th2 (IL - 10 and TGF - β) in mice treated with the four treated group particularly the group which was treated with OFZ+PZQ showed that IL - 10 protein expression in spleen was low and reached 29.7% and 8.2% in liver compared with the other treated and control groups. The level of expression of proteins of TGF - β in the immunized and treated mice showed significant differences at the level of the probability of p<0.001 of the group compared with negative and positive control group. Generally, a high significant level of cytokines produced byTh1andTh2 in immunized and treated mice

تاثير الرش الورقي ببيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في نمو وحاصل صنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) المزروعة في المنطقة الديمية Effect of foliar application of hydrogen peroxide and vitamin C on growth and yield of two cultivars of(Hordeum vulgare L.) planted in the dry farming land

اسم المؤلف: اسو لطيف عزيز الاركوازي
اسم المشرف: وفاق امجد القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت التجربة الحقلية خلال موسم النمو 2015 - 2014في احد حقول ناحية قوره تو - قضاء خانقين - محافظة ديالى بهدف تحديد التاثير المتداخل لكل من بيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في بعض الصفات المظهرية والفسلجية وكذلك بعض مكونات الحاصل لصنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) هما الابيض المحلي والاسود المحلي ، نفذت التجربة وفق تصميم القطاعات كاملة التعشيةRandomized Complete Block Design RCBD وبثلاثة مكررات وتضمنت التجربة الحقلية 72 وحدة تجريبية عبارة عن التداخل بين ثلاثة تراكيزمن بيروكسيد الهيدروجين هي 10،5،0% واربعة تراكيز من فيتامين C هي 0،50،100،150 ملغم.لتر - 1 . بينت نتائج التجربة ان تاثير بيروكسيد الهيدروجين ادى الى انخفاض معنوي في جميع الصفات المدروسة ولاسيما عند التركيز 10% حيث انخفض طـول الجذرملم بنسبة 20.76% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 43.87% , الوزن الجاف للمجموع الجذري غم بنسبة 034.8% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 33.45% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 9.28% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 26.08% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 35.52% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 20.90% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 28.83% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 53.93% و53.755 و47.07% و48.82% و9.48% و42.26% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 101.70% و45.80% و47.45% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 18.23% و22.86% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من الجزء المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنـسبة 24.0% و29.53% و42.74% على التتابع، نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العلـم وفـي الحـبوب % بنسبة 32.47% و32.87% و33.71% على التتابع ، البرولين مايكروغرام.غم وزن طري - 1 بنسبة 13.41% ، فـيتامـين Cملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 40.37% ، انـزيم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.23% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.75% ، وطول السنبلة مع السفا سم بنسبة 12.92% , طول السنبلة سم بنسبة 19.39% , وزن السنبلة غم بنسبة 22.82% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 21.59% , عـدد السنـيـبلات لكل سنبلة سنـيبلة.سنـبلة - 1 بـنسبة 16.54% , وزن الحبـوب فـي السنابل غم بنسبة 18.03% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 23.41% , وزن1000 حبة غـم بـنسبة19.80% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 23.95% , الحاصل الاقـتـصادي كغم . هـ - 1 بنسبة 18.02% .كذلك اوضحت نتائج التجربة ان تاثير فيتامين C ادى الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المدروسة لاسيما عند التركيز 100 ملغم.لتر - 1 حيث ازداد طـول الجذرملم بنسبة 125.00% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 341.88% , الوزن الجاف للمجمـوع الجذري غم بنسبة 177.77% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 159.43% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 21.96% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 84.88% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 108.57% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 76.81% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 122.59% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 352.38% و395.19% و251.55% و274.56% 343.37% و209.66% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 286.77% و296.95% و107.46% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 46.91% و39.81% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنسبة 63.68% و100.00% و96.71% على التتابع , نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العــلـم وفـي الـحـبـوب % بنسبة 124.07% و107.50% و111.92% على التتابع ، البـروليـن مايكروغرام .غم وزن طري - 1 بنسبة 42.03% ، فـيتامـين C ملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 202.06% ، انـزيـم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 105.83% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 142.70% ، طول السنبلة مع السفا سم بنسبة 41.85% , طول السنبلة سم بنسبة 61.61% , وزن السنبلة غم بنسبة 75.58% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 77.62% , عدد السنيبلات لكل سنبلة سنيبلة.سنبلة - 1 بنسبة 59.09% , وزن الحبوب في السنابل غم بنسبة 79.41% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 82.35% , وزن1000 حبة غـم بنسبة 95.58% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 86.52%, الحاصل الاقتصادي كغم.هـ - 1 بنسبة 79.41% .بينت نتائج التجربة ماياتي : - - 1 ان زيادة تركيز بيروكسـيد الهـيدروجـين H2O2 من صفر الى 10% ادى الى حدوث انخـفاض معـنوي في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 2ادى زيادة تركيز فيتامين C من صفر الى 100 ملغم.لتر - 1 الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 3اظهرت النتائج ان التركيز 100 ملغم.لتر - 1 فيتامين C هو الافضل في اعطائه افضل القيم للصفات المدروسة وبغض النظر عن تركيز بيروكسيد الهيدروجين H2O2 مقارنة بالتراكيز الاخرى المرشوشة. - 4اظهرت النتائج تفوق صنف الشعير الابيض المحلي في جميع الصفات المدروسة عدا صفة طول السنبلة مقارنة مع صنف الشعير الاسود المحلي.5 - اظهرت نتائج التداخل الثنائي والثلاثي بين عوامل الدراسة تفوق صنف الشعير الابيض معنويا في اغلب الصفات مقارنة بالصنف الاسود المحلي وتحت جميع التراكيز لكل من فيتامين C وبيروكسيد الهيدروجين H2O2. نستنتج من هذه الدراسة : - الدورالمهم لفيتامين C في حماية العمليات الايضية المختلفة في النبات لكونه من مضادات الاكسده غير الانزيمية من تاثير العوامل المجهدة والمتمثلة ببيروكسيد الهيدروجين. | Field experimental was conducted during the growing season of 2014 - 2015 in one of the fields Quratu sub district/ Khanaqin/ Diala province , aiming to determine the influence of the interaction between both hydrogen peroxide and vitamin c in some morphological and physiological characteristics, also some yield components of two types of Barley (Hordeum vulgare L.) local white and local black. This experiment was carried out by randomized complete block design (RCBD) with three replications; the field experiment included 72 experimental unit of interaction between three concentrations of Hydrogen peroxide 0,5,10 % and four concentrations of vitamin C 0, 50,100,150 mg.l - 1 The results of the experiment showed that hydrogen peroxide effect pulling down significantly decreased in all studied characteristic especially in 10% concentration decreased root length 20.76%, root volume 43.87%, root dry weight 34.80%, root diameter 33.45%, Plant height 9.28%, shoot dry weight 26.08%, leaf area 35.52%, flag leaf dry weight 20.90%, leaf area of flag leaf 28.83%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 53.93%, 53.75%, 47.07%, 48.82%, 9.48%, 42.26%, 101.70%, 45.80%,47.45%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 18.23%, 22.86%, soluble carbohydrate percentage in shoot 24.0%, flag leaf 29.53% and seeds 42.74%, protein percentage in shoot 32.47%, flag leaf 32.87%, and seeds 33.71%, Proline 13.41%, vitamin c 40.37%, catalase 34.23%, peroxidase 34.75%, Spike length with awn 12.92%, spike length 24.05%, weight of spike 22.82%, weight of spike in experimental unit 21.59%, number of spikelet's 16.54%, weight of seed in spikes 18.03%, weight of seeds 23.41%, weight of 1000 seeds 19.80%, biological yield 23.95%, grain yield 18.02%.The results of the experiment showed significantly increased in all studied characteristics especially with 100 mg.l - 1 concentration of vitamin c increased root length 125.00 %, root volume 341.88%, root dry weight 177.77%, root diameter 159.43% , plant height 21.96%, shoot dry weight 84.88, leaf area 108.57%, flag leaf dry weight 76.81%, leaf area of flag leaf 122.59%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 352.38%,395.19%,251.55%, 274.56%, 343.37%, 209.66%, 286.77%, 296.95%,107.46%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 46.91%, 39.81%, soluble carbohydrate percentage in shoot 63.68%, flag leaf 100.00% and seeds 96.71%, protein percentage in shoot 124.07%, flag leaf 107.50%, and seeds 111.92%, proline 42.03%, vitamin c 202.06%, catalase 105.83%, peroxidase 142.70%, Spike length with awn 41.85%, spike length 61.61%, weight of spike 75.58%, weight of spike in experimental unit 77.62%, number of spikelet's 59.09%, weight of seed in spikes 79.41%, weight of seeds 82.35%, weight of 1000 seeds 95.58%, biological yield 86.52%, grain yield 79.41%.The results of experiment showed : - 1 - The increased of hydrogen peroxide concentration from zero to 10% caused significantly decreased in all morphological, physiological and yield to both varieties.2 - The increased of vitamin c concentration from zero to 100 mg.l - 1 caused significantly increased in all morphological, physiological and yield to both varieties.3 - The results showed the concentrations of vitamin c 100 mg.l - 1 are the best to give the best value to all characteristic regardless of hydrogen peroxide concentration compared with other concentrations.4 - The results showed the local white barley superiority in all characteristics except the length of spike compared with local black barley. 5 - Results showed double and triple interaction between studied factors the local white barley superiority significantly in all characteristic compared with local black barley under all concentration for both vitamin c and hydrogen peroxide.We conclude of this study : - The important role of vitamin c in the metabolic various processes in the plant for being non - enzymatic antioxidants from the impact of stress full hydrogen peroxide

دور هرمون الانتي - موليرين وبعض الانزيمات التكاثريه في نوعية السائل المنوي في المرضى غير الخصبين The Role of Anti - Mullerian hormone )AMH), and some reproductive enzymes on Semen Quality in Infertile Male Patients

اسم المؤلف: اسمهان عدنان عباس النقيب
اسم المشرف: صباح عبد الرضا العبيدي محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يحتوي كل من مصل الدم والسائل المنوي على مجموعة متنوعة وكبيرة من الهرمونات والانزيمات والتي لم يعرف موقع انتاجها بشكل واضح. حيث تعد مستويات الانزيمات في السائل المنوي مهمة جدا لعملية التمثيل الغذائي فضلا عن دورها في وظائف الحيوانات المنويه ,نذكر منها الهرمون المضاد لقناه مولر) (Anti - Mullerian Hormone وانزيم الاروماتيز ( (Aromataseاو السايتوكروم 450 (Cytochrome450) وانزيم الكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) واخيرا الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases). لذلك كان الهدف من الدراسه هو التقصي عن مستوى ودور كل من الهرمون المضاد لقناه مولر (Anti - MullerianHormone) وانزيم الاروماتيز(Aromatase) اوالسايتوكروم 450(Cytochrome450) وبعض الانزيمات الاخرى وعلاقتها بمعايير السائل المنوي ، ومستوى بعض الهرمونات والانزيمات الجنسيه وحالة الخصوبة للرجال الخصبين وغير الخصبين. شملت الدراسة مائه رجل باعمار تتراوح بين 20 - 94 سنة , راجعوا المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة\ جامعة النهرين, خلال الفترة اذار 2014 الى كانون اول 2014 , حيث تم جمع وفحص عينات السائل المنوي وفق معايير منظمة الصحة العالمية (WHO)لسنة (2010) ,ثم تم وضع عينات السائل المنوي في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2600 دورة\ دقيقة ولمدة ربع ساعة لغرض الحصول على البلازما المنوية ثم تم وضعها بدرجة - 20 م° ليتم قياس الانزيمات لاحقا. كما تم سحب خمسة ملليلتر من الدم الوريدي المحيطي من جميع الذكور. وضعت عينات الدم في انابيب زجاجيه ، والسماح لها لتتجلط ثم وضعت في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2500 دورة \ الدقيقة لمدة 10 دقائق . وتم تصنيف العينات الى 7 مجاميع على وفق نتائج تحليل السائل المنوي. وقد تم تحديد تراكيز الانتي مولين MullerianHormone)) والاروماتيز(Aromatase) باستخدام طريقة الELISA والكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) والكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases) باستخدام الطريقة الانزيمية في كل من مصل الدم وبلازما السائل المنوي.كما تم تحليل النتائج احصائيا.اظهرت هذه الدراسة النتائج الاتية : 1 - مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر AMH)) في كل من مصل الدم والسائل المنوي. تم ملاحظة وجود انخفاض معنوي0.05)≥(P في مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر في كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia والمجموعة التي تعاني في قلة اعداد النطف وبطء في الحركة التقدمية وتشوهات في اشكال النطف Oligoasthenoteratozoospermiaعند مقارنتها بمجاميع العقم الاخرى .كما شوهد ارتفاعا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون لمجموعة العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدميهAsthenozoospermia والمجموعة التي تعاني من تشوهات في اشكال النطفTeratozoospermia بالمقارنة مع مجماميع الذكور طبيعية النطفNormozoospermia,ومجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermiaوالمجموعة التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia وفي كل من مجموعة العقم التي تعاني من قلة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaومجموعة الذكور اللانطفية Azoospermia.من جانب اخر لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P للهرمون المضاد لقناه مولر في السائل المنوي في مجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى .بينما اظهرت مجاميع العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaارتفاعا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل ا لمنوي عند مقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى, ايضا اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia والمجموعة اللانطفية Azoospermia انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل المنوي بالمقارنة بمستواه في مجاميع العقم الاخرى.2 - مستوى السايتوكروم450 (CYP450) او الاروماتيز) (Aromataseفي كل من مصل الدم واالسائل المنوي اظهرت مجموعة الذكور طبيعية االنطف Normozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الاروماتيز في مصل الدم بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى , كما شوهدت زيادة معنوية0.05)≥(P في مجموعة العقم التي تعاني منقلة في الحركة التقدميه وتشوه في الشكل Asthenoteratozoospermia في مستوى الانزيم في مصل الدم بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى. بينما لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور اللانطفيه Azoospermia بالمقارنة بمستوى هذا الانزيم في مجاميع العقم الاخرى , وانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia بالمقارنة مع مستواه في السائل المنوي في مجاميع العقم الاخرى .3 - مستوى الكرياتين كاينيز(CPK) في كل ن مصل الدم وا السائل المنوي . لوحظ وجود ارتفاعا معنويا بمستوى0.05)≥(P في مستوى انزيم الكريايتن كاينيز في مصل الدم في مجموعة الذكور طبيعيه النطف Normozoospermiaوالمجموعة اللانطفيهAzoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى كما ظهر انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaبمقارنة مستواه في مصل الدم مع مجاميع العقم الاخرى. اظهرت مجموعة العقم التي تعاني من قلة في العدد Oligozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من قلة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaزيادة معنوية0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى, كما اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم اللانطفيهAzoospermia انخفاظا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الكرياتين كاينيز بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى في بلازما السائل المنوي4 - مستوى الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز (GGT) في كل ن مصل الدم السائل المنوي. اظهرت مجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هرمون GGTفي مصل الدم عند مقارنة مستواه بمجاميع العقم الاخرى .كما انه كانت هناك زيادة معنوية 0.05)≥ (Pفي مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من بطء في الحركة التقدميةومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia بالمقارنة مع مستواه في المصل لمجاميع العقم الاخرى. كما اظهرت الذكور التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في مصل الدم بمقارنة مستواه مع مجاميع العقم الاخرى, اما مجاميع العقم التي تعاني من قلة العدد وبطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلOligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من بطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلAsthenoteratozoospermia فقد اظهرت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في بلازما السائل المنوي بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى.وقد لوحظ ايضا انخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في في مجموعة العقم التي تعاني من قلة العددOligozoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى | A great assortment of hormones and enzymes are current in blood and seminal plasma, but in many cases the gland in charged for their production has not been well - known. The enzyme levels of seminal plasma are very important for sperm metabolism as well as sperm function; these enzymes are Anti - Mullerian Hormone (AMH), Cytochrome 450, Creatine Phospho Kinase( CPK) and Gamma - Glutamyl Transfrrase (GGT). Therefore, this study was aimed to investigate the role of AMH and aromatase activity (cytochrome 450) in relation to semen parameters, level of some reproductive hormones, enzymes and the fertility status for fertile and infertile men. This study involved one hundred men within 20 - 49 years old who attended to High Institute of Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technology / AL - Nahrain University, during the period from March, 2014 to December, 2014. Semen samples were collected and seminal fluid analysis was done in accordance with WHO (2010). Then samples of seminal fluid were centrifuged for 15 minutes at 2600 rpm. The supernatant as seminal plasma was rapidly and cautiously improved and put to freeze at - 20° C for later measurements. Also, five milliliters of peripheral venous blood was aspirated from each male. Blood samples were collected in plain tubes, allowed clotting and then centrifuged at 2500 rpm for 10 minutes. The samples were assorted into 7 groups in accordance with the results of semen analysis. For serea and seminal plasma concentrations of AMH, Cytochrome 450, CPK, GGT were determined in the stored blood serum and semen. AMH and Cytochrome 450 were determined using the ELISA sandwich method. CPK and GGT were determined by using enzymatic method. The crude data were statistically analyzed. 1 - The level of Anti - Mullerian hormone (AMH) in serum and seminal plasma. A significant decrement (P≤0.05) was observed in the serum AMH for males with oligozoospermia and oligoasthenoteratospermia as compared to the other groups of male infertility factors. There was significant elevation (P≤0.05) for males complaining from asthenozoospermiaand teratozoospermia as compared to normozoospermia, oligoasthenoteratozoospermia,oligozoospermia, asthenoteratozoospermia and azoospermia. Similarly, significant elevation (P≤0.05) in seminal AMH for males suffering from oligozoospermia as compared to other groups of male factor infertility. Meanwhile, males with teratozoospermia showed significant increment (p≤0.05) as compared to other groups infertility. Also, males with asthenoteratozoospermia and azoospermia revealed significant reduction (p≤0.05) in the level of seminal AMH as compared to other male infertility. 2 - The level of cytochrome 450 or aromatas enzyme in serum and seminal plasma. The males with normozoospermia revealed significant reduction (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to the other male infertility groups. Also, males complaining from Asthenoteratozoospermia presented significant elevation (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to other groups of infertility. While, there was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for azoospermic males as compared to the other groups of male infertility, and significant decrement (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for males complaining of normozoospermia as compared to the other groups of male infertility.3 - The level of creatine phosphokinase (cpk) in serum and seminal plasma. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of CPK for males with normozoospermia and Azoospermia when compared to other groups of male infertility in contrast, and the level of CPK showed significant reduction (P≤0.05) for teratozoospermia as compared to other groups of male infertility. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for oligozoospermia and Aasthenoteratospermia when compared to other groups of infertility factors, also, males suffering from oligoasthenoteratospermia and azoospermia showed significant decrement (P≤0.05) when compared to other groups of infertility factors. 4 - The level of gamma - glutamyl transpeptidase (GGT) in serum and seminal plasma. Males with normozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors, and there was significant increment (P≤0.05) for males complaining from asthenoteratozoospermia as compared to the others. Males suffering from teratozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors. Males with oligoasthenoteratozoospermia, and asthenozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of semen GGT when compared to the other groups of infertility factors, males suffering oligozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) when compared to the other groups of infertility facto

التكوين الجنيني والتنسج للدماغ والحبل الشوكي في طائر السلوى Quail Coturnix coturnix (Linnaeus,1758) Embryonic Development and Histogenesis of Brain and Spinal Cord in Quail Coturinx coturinx (Linnaeus, 1758)

اسم المؤلف: اسماء بشير عبد
اسم المشرف: نهلة عبد الرضا البكري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الاجنة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التعرف على تكوين الدماغ والحبل الشوكي من مرحلة العصيبة حتى مرحلة الفقس لطائر السلوى Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758) ودراسة التركيب النسجي لهما في الطائر البالغ. حصل على اجنة تراوحت اعمارها ما بين (12) ساعة حضانة الى مرحلة الفقس (17) يوما وكذلك على البالغ واجريت عليها خطوات التحميل الكامل والمجهر الالكتروني الماسح وتحضير الشرائح النسجية بطريقة شمع البرافين، وتم ايضا تحليل الاحماض الامينية للادمغة للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16و 17) يوما والبالغ من طائر السلوى.اظهرت نتائج الدراسة الجنينية للدماغ والحبل الشوكي ان بداءة ظهورهما في جنين طائر السلوى عمر (18) ساعة حضانة اذ حدث تثخنا لطبقة الاديم الظاهر لتكوين الصفيحة العصبية التي تتالف من نسيج ظهاري عمودي مطبق كاذب , وظهرت الطيتان العصبيتان ملتحمتان في عمر (24) ساعة حضانة لتكوين الانبوب العصبي وبعد تمايزه الى حوصلة الدماغ والحبل الشوكي، يتمايز الدماغ على ثلاث حويصلات (الدماغ الامامي ، الدماغ المتوسط , الدماغ المؤخر) في عمر (33) ساعة حضانة، وتالف جدار الدماغ من طبقة البطانة العصبية تليها الطبقة الغطائية.تمايز الدماغ في جنين عمر (40) ساعة حضانة على خمس حويصلات هي (الدماغ الانتهائي والدماغ البيني ، والدماغ المتوسط والدماغ البعدي والدماع النخاعيني) وظهر التركيب النسجي لجداره مكون من ثلاث طبقات هي (البطانة العصبية والغطائية والحافية). وظهر التركيب النسجي لجدار الحبل الشوكي مؤلفا من طبقة البطانة العصبية تحيطها الطبقة الغطائية.وفي جنين عمر (48) ساعة حضانة اتضح الانحناء القحفي اذ يصبح الدماغ المتوسط في المقدمة وكذلك ظهرت حوصلتا الدماغ الانتهائي، واصبح جدار الحبل الشوكي مؤلفا من ثلاث طبقات (البطانة العصبية والغطائية والحافية) في هذا العمر. ظهرت الانحناءات (العنقية والظهرية والذنبية) التي تؤدي الى تقوس الجنين، في عمر (72) ساعة حضانة.تمايز الدماغ البيني في جنين عمر (96) ساعة حضانة على ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد وقد ظهرت في هذا العمر الطبقة البصرية وهي اول طبقات السقف البصري الذي يمثل سقف الدماغ المتوسط وظهر الحبل الشوكي ايضا مكونا من المادة السنجابية التي تمثل الجزء الداخلي من جداره والمادة البيضاء التي تمثل الجزء الخارجي من جداره مع تمايز المادة السنجابية الى القرون الظهرية والقرون البطنية.يتسع تجويف الدماغ الانتهائي ويزداد سمكه في جنين عمر (5) ايام حضانة مع ظهور نوى التكوين الشبكي في قاع الدماغ البعدي وفي عمر (6) ايام حضانة بدات الطبقة السنجابية الليفية السطحية بالتمايز وهي الطبقة الثانية من طبقات السقف البصري، كما تمايزت الطبقة الغطائية في الجدار الجانبي للدماغ البعدي على منطقتين ثانويتين الاولى هي الطبقة الغطائية الداخلية تكون مجاورة لطبقة البطانة العصبية اما الثانية فهي الطبقة الغطائية الخارجية ، وظهرت ايضا الحزمة الطولية الناصفة في قاع الدماغ النخاعيني. وفي جنين عمر (7) ايام لاتختلف جدران الدماغ عن المراحل السابقة ولكن تصبح اكثر سمكا.اما في جنين عمر (8) ايام حضانة وجد الدماغ والحبل الشوكي مشابها لحالة البالغ، يمثل الدماغ الانتهائي المخ الذي يتالف من نصفي كرة المخ ويسمى تجويفها البطين الجانبي (الايسر 1st، والايمن 2nd)، ويتالف نسجيا من منطقتين لحاء الدماغ وتحت لحاء الدماغ ، ويمثل البطين الثالث 3rd تجويف الدماغ البيني، ويتالف الدماغ البيني من ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد.اما الدماغ المتوسط فقد تمايز سقفه على ست طبقات (البصرية ، السنجابية الليفية السطحية ، السنجابية المركزية ، الالبومية المركزية ، السنجابية حول البطنية، والالبومية حول البطنية) اما جزاه القاعي فيتمايز الى السقيفة, وتمايز الدماغ البعدي على جزاين (المخيخ والجسر)، ويتمايز الدماغ النخاعيني ليكون النخاع المستطيل ويمثل البطين الرابع 4th تجويف الدماغ المؤخر, اما الحبل الشوكي فيكون مشابها لحالة البالغ اذ وجدت المادة البيضاء في جزئه الخارجي بينما المادة السنجابية مرتبة على شكل X تمثل جزئه الداخلي وتدعى المنطقة الظهرية منها القرون الظهرية Dorsal horns اما المنطقة البطنية فتدعى بالقرون البطنية وتمثل القناة المركزية تجويفه.وشملت الدراسة الحالية ايضا تحليل الاحماض الامينية في ادمغة اجنة طائر السلوى للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16) يوما حضانة ومرحلة الفقس (17) يوما والبالغ ، ووجد (16) حمضا امينيا هي الاسبارتك (13)، الكلوتامين (13)، السيرين)البالغ) ، الهستدين (13)، الثيروتين (13)، الكلايسين (16)، الارجنين )البالغ) ، الالنين (13)، التايروسين )البالغ)، السستين (13)، الفالين (13)، الميثونين (11)، الايزوليوسين (13)، اليوسين (13)، الفينلالنين)البالغ) ، اللايسين (13) على التوالي , اما اقل تركيز للاحماض الامينية في الاعمار الاسبارتك (14)، الكلوتامين (12)، السيرين)10) ، الهستدين (10)، الثيروتين (12)، الكلايسين (10)، الارجنين )10) ، الالنين (10)، التايروسين )10)، السستين (14)، الفالين (12)، الميثونين (12)، الايزوليوسين (15)، اليوسين (10)، الفينلالنين)14) ، اللايسين (10) على التوالي | The present study aimed to study the development of brain and spinal cord starting from neurula stage till hatching stage (17th day) and adult in quail Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758), using the whole mount, scanning electron microscopeand paraffin wax method were used for preparing histological slides. Amino acids of brains were determinated during different ages (10, 11, 12, 13, 15, 15, 16 and 17 days) in addition to the adult .The embryonic study revealed the first appearance of the brain and spinal cord in Coturnix coturnix was at (18) hrs incubation. The first appearance represented as ectodermal thickening to form the neural plate, which is histologically formed from pseudostratified columnar epithelium. The neural folds fused at age of (24) hrs of incubation to form the neural tube and then differentiated to form the brain vesicle and spinal cord. The brain was differentiated into three vesicles represented by (prosencephalon, mesencephalon and rhombencephalon) at age of (33) hrs incubation. The wall of the brain consist of ependymal and mantle layers. The brain in embryo of (40) hrs incubation differentiate into five vesicles represented by telencephalon, diencephalon, mesencephalon, metencephalon and myelencephalon. The histological study of brain wall decleared that it formed from three layers which were ependymal, mantle and marginal layer. The histological structure of spinal cord wall at the same age showed that it consist of two layer represented by Ependymal layer which surrounded by mantle layer.In embryo at age of (48) hrs incubation, the cranial flexure appeared and the two vesicles of telencephalon were also became clear and the spinal cord wall consist of three layers represented by ependymal, mantle and marginal layers.The cervical, dorsal and caudal flexures appeared at (72) hrs incubation, which lead to curved the embryo.Diencephalon at age (96) differentiated into three regions age which are represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus, at this age the stratum opticum also appeared, which represented the first layer of optic tectum and represented the roof of mid - brain. The spinal cord appeared formed from the gray and white matter, at the same time the gray matter differentiated into dorsal and ventral horns.At age of (5) days incubation the telencephalon cavity enlarge and its thickness increase and reticular formation nuclei appeared at the base of metencephalon. At age of (6) days incubation, the stratum griseumfibrosum superficial which represent the 2nd layer of optic tectum started to differentiate and the mantle layer also differentiated from the lateral wall of Metencephalon into two secondary layers represented by the inner mantle layer which observed besides the epindymal layer and the outer mantle layer, The medial longitudinalfascicule appeared at the base of mylencephalon. At age of (7) days incubation the walls of brain become more thickned. At age of (8) days incubation both brain and spinal cord appeared as in the adult stage. The telencephalon appeared represent from hemispherical cerebrum and their cavity called lateral ventricles (right the 1st and left the 2nd). Histologically formed from two region represented by pallium and subpallium the 3rd ventricle represented the cavity of diencephalon which formed from three regions represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus. The mesencephalon roof differentiated to optic tectum with six layers of opticum, griseumet fibrosum superficiale, griseum centrale, album centrale, griseum periventriculare and album periventriculare. At the same time, the base of mesencephalon differentiated to tegmentum. Metencephalon differentiated into two parts represented by cerebellum and pons, while the mylencephalon appeared differentiated to from medulla oblongata and 4th ventricle represented the cavity of rhombencephalon.On the other hand the spinal cord also appeared as in the adult in appearance, the white matter in its external part and gray matter arranged as X - shape and represented the internal part, the dorsal region of this part represented the dorsal horns while the ventral horns represented the ventral region and the central canal represented its cavity.The present study also include the amino acids analysis for the brain of the bird under investigation in different stage of development (10, 11, 12, 13, 14, 15and 16, days incubation) in addition to the hatching stage (17th day) and the adult. The results revealed that there are 16 amino acid: Aspartic acid , Glutamine , Serine , Histidine , Thronine , Glycine , Arginine , Alanine , Tyrosine , Cysteine , Valinine , Methionine , Isoleucine , Phenylalanine , Lysine , and the highest concentration of amino acid at age of (13,13, adult, 13, 13, 16, adult, 13, adult, 13, 13, 11, 13, 13, adult, 13) respectively and the low concentration at age of (14, 12, 10, 10,12,10,10,10,10, 14, 12, 12, 15, 10, 14, 10,) respectively.

دراسة شكليائية ونسجية للمرئ في نوعين من الطيور العراقية الدراج الاسود العراقي (Linnaeus,1766 (Francolinus francolinus والسماك ابيض الصدر Linnaeus,1758 (Halcyon smyrnensis Morphological and Histological Study of the Oesophagus in Two Species of Iraqi Birds Iraqi Black Partridge Francolinus francolinus (Linnaeus,1766) and White Breasted kingfisher Halcyon smyrnensis (Linnaeus,1758)

اسم المؤلف: اسراء عبد الكریم هادي امین البرزنجي
اسم المشرف: ايمان سامي احمد الجميلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study aimed to investigate the , morphological description and histological structure of oesophagus in Iraq black partridge (Francolinus francolinus ) and white breasted kingfisher (Halcyon smyrnensis) ,the results revealed the following : - Morphological Description• In both birds the oesophagus was long muscular tube, thin - walled and distensible tube , it was situated between the oropharynx cavity and Proventriculus .• The oesophagus in Iraq black partridge (Ibp) divided into the three regions represented by anterior part (Cervical), median part (Crop) and posterior part (thoracic),while in white breasted kingfisher (Wbk) divided in two regions , anterior part (Cervical) and posterior part (thoracic), because the crop was absent in this bird so that we suggested to regard the median part instead the crop which is found in Iraqi block partridge.• In both birds , the anterior part ( Cervical ) of oesophagus was located in the midline , dorsally to the larynx and trachea , which was fixed byconnective tissue . In the median part of neck , the oesophagus location was changed where it was situated at the right side of the midline , among trachea laterally and Jugular vein , the vagus nerve and thymus dorsally . In (Wbk) , the oesophagus was curved littleness on the right side of midline in contrast to the (Ibp).• In (Ibp) , immediately in the thoracic entrance , the oesophagus returns to the midline and it expanded ventrally pouch , (the crop) which located between clavicle and breast muscles . The internal and external surface of the crop presented irregular folds.• In (Ibp), the anterior part of oesophagus ( Cervical) taken an (S) shaped due to it was longer than its neck region.• In both , the posterior part of oesophagus (thoracic) entered thoracic region and then located dorsally to the trachea , syrinx and heart, ventrally to the lung. Finally, the posterior part of oesophagus(thoracic) opened in to the Proventriculus .• In both birds , the anterior part of oesophagus ( cervical) was longer than posterior part ( thoracic). The internal surface of the oesophagus demarcated longitudinal folds .Histological Study : • The results of the present study showed that the oesophagus wall in (Ibp) consisted of four tunica represented by mucosa, sub mucosa, Muscularis and adventitia or serosa while in (Wbk) composed of three tunica because due to lack the sub mucosa.• Tunica mucosa in (Ibp) oesophagus consisted of three layers represented by lining epithelium , lamina propria and Muscularis mucosa , but in the (Wbk) the layer of Muscularis mucosa was absent.• The lining epithelium of (Ibp) composed of keratinized stratified squamous epithelium , while it consisted of non keratinized stratified squamous epithelium in the (Wbk).• The lamina propria of (Ibp) consisted of loose connective tissue , while in the (Wbk) it consisted of fibrous connective tissue .• The esophageal glands of (Ibp) were situated in the lamina propria , these glands were simple branched alveolar type, while the esophageal glands of (Wbk) were observed within lining epithelium layer and these glands were simple tubular type.• The oesophageal glands in (Ibp) were less developed in the posterior part (thoracic) in comparison to anterior part ( cervical), while theseglands were absent in crop but it arranged along oesophagus in (Wbk).• Tunica Muscularis consisted of two layers thicker, inner circular and thinner outer longitudinal in (Ibp) ,these layers separated by loose connective tissue, whereas inner thin longitudinal and outer thick circular in (Wbk) ,these layers separated by fibrous connective tissue• In both birds the tunica adventitia and serosa consisted of loose connective tissue with blood vessels and nerves but in serosa surrounded by mesothelium .Statistical Study : Iraqi block partridge and Whitebreasted kingfisher : • Results showed that the mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in anterior part (cervical) oesophagus of (Ibp) as compared to (Wbk), while the mean thickness of both tunica muscularis and adventitia were significantly greater in (Wbk) as compared to (Ibp) (p<0,05).• The main thickness of tunica mucosa was significantly greater in median part ( crop) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk) (p<0.05).• The mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in posterior part ( thoracic) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk)(p <0.05).

دراسة تصنيفية مقارنة لمراتب من العائلة السوسنية Iridaceae النامية بريا في العراق Comparative Systematic Study For The some Taxa of the Family Iridaceae wild growing in Iraq

اسم المؤلف: اريج عبد الستار فرمان الراوي
اسم المشرف: مازن نواف عبود العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - التصنيف
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study covered 14 taxa of the family Ireidaceae wiled growth in Iraq ,as it has a comparative systematic study of all morphological characters , pollengrains , anatomy , molecular , environmental and geographical distribution in detail , as well as the taxonomical treatment have been down for all taxa with keys for all taxa was done.Survey for must districts of Iraq was done to determined the distribution of taxa , therefor many collection were obtained , new location of taxa distribution were fixed and all the specimens collected including those from herbaria were identified.The comparative study of all the morphological characters of plant parts were recorded down in tables , as well as photo for deferent purposes. Priority taxonomic important were notice to subterranean stems (bulb , rhizome and corm) such as dimension , shape and outer cover of the bulbs and corms especially in genus Iris and Gladiolus.Stems showed very important in isolation and diagnosis , however varied among them , some have normal stems (Gynandriris , Gladiolus and some Iris species) , others have flowering stems (scape) in genus Crocus and some of Iris species.Leaves showed large variation among taxa in shape , dimensions and having sheath , as well as some taxa having stem leaves (Gladiolus and some species of Iris) , others have basal leaves (Gynandriris , Crocus and some Iris species). The variation in bracts and bracteoles in type , dimension and shape were used to identify taxa especially for species belonging to the genus Iris , Gladiolus and Gynandriris .The inflorecences variation were used for isolation and diagnoses especially to Iris species , as well as the variation in floral parts for all taxa, also used for diagnosis such as color , shape and accessory parts showed very important value for taxonomic purpose specially in Iris . Also fruits variations such as dimension , shape and having beak or not showed a great value in identification to Iris sp. , but seed variation have a good taxonomic value which used to identify taxa. The study of Light microscope ( L.M.) and Scanninig electron microscope (S.E.M.) to pollen grains specially in type was shown grate value of taxonomic mattresses , inaperturate pollen grains in some Iris species and monosulcate in taxa of Gladiolus , Gynandriris , Crocus and some species of Iris , as well as the differences in pollen shape , dimensions , sculpturing and germination apertures . The anatomical study for the vertical section of leaves and cross section of stems showed many differentiations of the shapes and tissues among taxa. All taxa shown Anomocytic type of stomatal complex.Molecular study results using Random amplified polymorphic DNA( RAPDPCR) technique appeared great importance among taxa . It was revealed the genetic relationships among 12 taxa belong to genus Iris and Gladiolus , separation of these taxa depending on the presence or absence of bands , and the number of these bands in the gel after electrophoreses , so this is evidence of a genetic diversity or polymorphism among the taxa , as well as obtaining a number of unique bands that give genetic DNA fingerprint for the definition of each taxon . The taxa of the family Iridaceae distributed to their growth sites after collection from the Iraqi distracts , as well as the environmental study to the sites of the plant growth , also the taxa will be distributed on the maps to their geographical distracts , so recorded many of new spreading areas . As a result of this study two species Iris madonna Dykes. and Gladiolus anatolicus Boiss. were identified as new record for Iraq and added to flora of Iraq.

دراسة لمؤشرات مناعية وحيوية في مرضى تصلب الاعصاب المنتشر Study of Certain Immuno and Biomarkers in Multiple Sclerosis Patients

اسم المؤلف: سماح خليل يحيى
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تصلب الاعصاب المنتشر مرض التهابي مزمن مجهول السبب، يتصف بفقدان الميالين (النخاعين) مع الميل الى اصابة محور الليف العصبي، ويصيب الاشخاص في الاعمار المتوسطة من حياتهم مع ارجحية اصابة النساء اكثر من الرجال.جاءت هذه الدراسة بصورة رئيسية لبحث العلاقة بين تصلب الاعصاب المتعدد وتركيز كل من البين الابيضاضي - 2 و- 10 وعامل التنخر الورمي - الفا وكذلك المؤشرات الحيوية كمستوى الدهون في الدم (الكولسترول, لشحوم الثلاثية والشحوم عالية الكثافة) , حمض اليوريك وظائف الغدة الدرقية (ثالث يود الثيرونين , الثايروكسين وهرمون تنشيط الغدة الدرقية). الى جانب ذللك , قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض. كما تناولت العلاقة بين تركيز هذة الحركيات الخلوية والمؤشرات الحيوية وعلاقتها بالجنس ومراحل تقدم المرض.اجريت هذه الدراسة على 60 مريض عراقي شخصوا بتصلب الاعصاب المتعدد وفق لمعايرMcDonald criteria وتم تصنيف المرضى المختارين الى مجموعتين : 1. المجموعة الاولى : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15اناث) تتراوحت اعمرهم من (56 - 18) سنة وهم في المرحلة الاولى من التشخيص (اي حدث لهم انتكاسة) ولم ياخذوا اي علاج.2. المجموعة الثانية : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15 اناث) تراوحت اعمرهم من (53 - 18) سنة وهم مشخصين مندو فتره ومعالجين بانترفيرون بيتا مع مثل ابردزولون الى3 ايام او 5 ايام.الى جانب ذلك‚ مجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 20 فردا (10 اناث و10 ذكور) تراوحت اعمارهم من (50 - 20) اصحاء ظاهريا والذين راجعوا الى (مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب / عيادة للكشف المبكر عن تصلب الاعصاب المتعدد) في بغداد خلال الفترة من تشرين الثاني/ 2013 الى نهاية نيسان/ 2014 للتشخيص والعلاج. تم سحب عينة (8 - 6) ملليتر من الدم الوريدي من 80 من الحالات المتضمنة في الدراسة (المرضى والسيطرة) لغرض استخدامها في الدراسة المناعية والتي تشمل قياس الحركيات الخلوية المذكورة بواسطة استعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) والمؤشرات الحيوية باستخدام جهاز ابت لقياس (مستوى الدهون في الدم وحمض اليوريك) ويستخدم جهاز توسوا لقياس (وظائف الغدة الدرقية). فضلا عن حساب العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض باستخدام جهاز روبي. توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى تصلب الاعصاب هو (34.43) سنة وان الفئة العمرية (39 - 30) سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2. اظهر معدل المستوى المصلي للبين الابيضاضي - 10 فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 بين مجموعات مرضى التصلب المتعدد (قبل وبعد المعالجة) ومجموعة السيطرة (46.64 , 44.70 و50.95) بيكو غرام/مل , على التوالي.3. اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 ما بين مرضى بعد المعالجة (17.04) بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى قبل العلاج ومجموعة السيطرة (14.81 و14.28) بيكو غرام/ مل , على التوالي .4. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من الكولسترول , الشحوم الثلاثية, الشحوم قليلة الكثافة والشحوم قليلة الكثافة جدا عند مستوى P<0.05 في المرضى غير المعالجين والمعالجين مقارنة بمجموعة السيطرة .5. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من ثالث يود الثيرونين وهرمون الثايروكسين عند مستوى P<0.05 في المرضى الغير معالجين ) 1.08) نانوغرام / مل و(7.99) ميكروغرام / ديسيلتر، على التوالي والمرضى المعالجين (1.27) نانوغرام / مل و(8.68) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة (0.898) نانوغرام / مل و(6.95) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي. 6. اظهره نقصان معنوية في معدل الخلايا الحمضة في مجاميع المرضى (قبل وبعد المعالجة) مع انترفيرون - بيتا - 1ب مقارنة مع مجموعة السيطرة.7. لم تظهر اي علاقة بين معدل كريات الدم والمستويات المصلية من كل البين الابيضاضي - 2 ,هرمون تنشيط الغدة الدرقية , حمض اليوريك والشحوم عالية الكثافة والامراضية من تصلب الاعصاب المنتشر.8. ظهر تاثير الجنس في كلا من الشحوم الثلاثية وحمض اليوريك حيث وجود زيادة وبفارق معنوي في الذكور مقارنة بالاناث, بينما كانت هنالك زيادة معنويه في الشحوم عالية الكثافة في الاناث مقارنة بالذكور. | Multiple Sclerosis (MS) is an idiopathic chronic inflammatory disease characterized by demyelination that can be associated with axonal degeneration and is the leading cause of a non - traumatic neurological disability in young adults, with female affection more than male.This study is designated mainly to investigate the relationship between the MS patients and certain cytokines serum concentrations of Interleukin - 2 (IL - 2), interleukin - 10 (IL - 10), Tumor necrosis factor - alpha (TNF - α) and biomarkers; lipid profile (TC, TG, LDL, VLDL and HDL), Uric Acid (UA) and thyroid function (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the blood. Also it is trying to find out the relation between concentrations of these cytokines and biomarkers with the gender and disease course of Iraqi MS patients. The study involved 60 Iraqi who were diagnosed as MS patients. the selected patients were classified into two groups :  Pre - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 56) years at the stage of the early diagnosis (RRMS).  Post - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 53) years with treatment Interferon - β 1b (INF - β - 1b) intravenous immunoglobulin (Ig) pulse Methyl - Prednisolone MP (in acute relapses) for 3 days or 5 days. Besides, 20 healthy volunteers 10 males and 10 females matched the patients with age and gender were used as control subjects with age range between (20 - 50) years. They have attended to (Baghdad Teaching Hospital in the Medical City / Clinic for early detection of MS) in Baghdad during the period from November / 2013 to the end of April / 2014 for the diagnosis and treatment. The blood samples (6 - 8) ml were drown from all of studied cases in order to be used for immunological study by measuring their serum level of cytokines using Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) and biomarkers; using Architect c4000 System (Abbott) for (TC, TG, LDL, VLDL, HDL and UA) and AIA - 360 system for (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the 2 ml of blood at using Cell - Dyn Ruby System.The Study has Reached the following Results : 1. The results showed that the average age in patients with MS is (34.43) years and age group (30 - 39) years are more susceptible to affected. 2. The study has showed the average serum level of IL - 10 were significant differences at the level of probability P<0.05 between the (pre - and post - treated) patients and the healthy control (35.54, 35.86 and 52.68) pg/ml, respectively. 3. The study furthermore, has showed the average serum level of TNF - α were significant differences at the level of probability P<0.05 between the post - treated patients (17.04) pg/ml and two group the pre - treated patients and the healthy control (14.81 and 14. 28) pg/ml, respectively.4. The result observed significant an increase in the concentration of serum level of TC, TG, LDL and VLDL at the level of probability P<0.05 in the pre - and post - treated patients as compared to the healthy control. 5. The result observed significant increase in the concentration of serum level of T3 and T4 at the level of probability P<0.05 in the pre - treated patients (1.08) ng/ml and (7.99) μg/dl, respectively and the post - treated patients (1.27) ng/ml and (8.68) μg/dl, respectively as compared to the healthy control (0.898) ng/ml and (6.95) μg/dl, respectively. 6. The study has showed a significant decrease in mean of the eosinophil for the pre - and post - treated patients (1.28 and 1.99) respectively as compared with the healthy controls (2.79).7. There is no relationship between the differential count of WBC and serum levels of (IL - 2, HDL, UA and TSH) and the pathogenicity of MS. 8. The research show significant increase in levels of TG and UA in male as compared with female, while level of HDL was significant increase in female as compared with male.

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

اسم المؤلف: ابرار جاسم حسن
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

اسم المؤلف: نرمين نصر الدين فتحي
اسم المشرف: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.

دراسة العلاقة بين بعض المؤشرات المناعية وشدة المرض عند المصابين بالربو الارجي Study of the relationship between some immunological markers and disease severity in allergic asthma patients

اسم المؤلف: یاسر باسم عبد الوهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was conducted to support the investigations of probable immunological changes in asthmatic patients and to study the relationship between some immunological markers and the clinically estimated asthma severity in order to find the more correlated immunological marker with asthma severity. This study involved 61 patients of both genders ( ٤٦ female and 15 male) of age varied between 13 to 53 years from recently diagnosed cases that arrived to the allergy institute of Baghdad or from steroids and other antiinflammatory therapy ceased patients and for a period that allow to carry out study tests without effecting the results, In addition to control group which consisted of 23 apparently healthy individuals.Skin test analysis of ten allergens showed a significant differences between asthma patients and healthy controls in rate of positive reactivity for at least one tested molds or grass allergens where they attained 43.1 % and 35.3% in patients’ group respectively, results also revealed that there was a significant differences in rate of reactivity for M4 allergen only with difference in asthma severity.Total and specific serum IgE were assessed by the Enzyme Linked Immunosorbent assay (ELISA). The geometric mean of serum total IgE was significantly higher in asthmatics than healthy controls, Another Significant elevation was revealed in asthmatics as compared to control in the rate of 100 IU/ml overlapped serum total IgE individuals, this rate also showed significant difference among the different categories of asthma severity. 83 IU/ml was suggested as a typical cut off value that differentiates asthmatic patients from healthy individuals.From other side, estimation of serum specific IgE for 10 allergens demonstrated significant differences in I203 allergen specific IgE levels in addition to specific IgE for food allergens (F25, F27, F33, F35 and F81) between asthmatics and healthy controls. Its ought to mention that specific IgE for food allergens (F25, F27 and F33) also recorded significant differences by difference in asthma severity which may refer actual effect for some food allergens in asthma pathogenesis .The results didn’t document any significant difference in levels of other immunoglobulins IgM, IgG, and IgA and complement component C4 in serum between asthmatic patients and control group, Whereas a significant elevation was documented in serum C3 level of asthmatics as compared to healthy controls which supports the studies that refered some complement component role in asthma pathogenesis. From other side, this study didn’t observe any significant differences in the levels of those immunoglobulins with difference in asthma severity. Total and differential white blood cells were estimated during the study, the results showed a significant elevation in mean of total white blood cells, eosinophils and neutrophils numbers in asthmatics’ blood as compared to control, while there were no significant differences in association with remaining white blood cells. The relationship between asthma severity and white blood cells was also assessed, the results showed a significant difference in geometric mean of total white blood cells and also lymphocytes numbers in asthmatics’ blood and asthma severity.The data demonstrated that there was a significant elevation in level of eosinophil cationic protein (ECP) in asthmatics’ serum (median = 40 ng/ml) as compared with control group (median = 15.5 ng/ml) , it was also observed that elevation in serum ECP level proportionate significantly increasing of asthma severity. This study suggested that 29 ng/ml of serum ECP as a typical cut off value of statistically significant denotation for differentiation between asthmatic patients and healthy individuals. The ratio of serum eosinophil cationic protein to blood eosinophils was calculated in this study, Despite not attaining the significance level between patients’ group and controls as regards this ratio, results showed a significant elevation in ECP/Eo associated with increasing ofasthma severity among different categories. During the study of correlation among some immunological markers that adapted in many allergy centers as preliminary diagnostic tests for asthmatic patients especially the determination of total serum IgE level and blood eosinophils number, there was no significant correlation between total serum IgE level and asthma severity, correlation between blood eosinophils and asthma severity was also not significant too (r = 0.16 and 0.01 respectively). Contrary to the previous results, Statistical analysis showed a significant positive linear correlation between ECP level and also ECP/Eo ratio and clinically estimated asthma severity (r = 0.41 and 0.43 respectively, P<0.01).According to results the ratio 0.38 Pg/Cell suggested as a typical cut off value for diagnosing severe persistent asthma and 137.5 ng/ml of serum ECP concentration also suggested as a typical cut off value for differentiating severe persistent asthma cases from other less severe categories. According to the results, Determination of serum ECP can be considered as a diagnostic tool for differentiating asthma cases from not, besides it reflects asthma severity significantly, whereas calculation of ECP/Eo ratio may be an effective marker in reflecting asthma severity which may be useful in monitoring asthma cases and in determining the recovery of disease severity during therapy stages but it has no benefit for diagnosing asthma cases where no significant differences were recorded between asthmatics and healthy controls

دراسة التاثيرات الوراثية لمتعدد السكريد خارج خلوي لبكتريا Enterococcus faecium في الخلايا السرطانية Study of the Genetic Effects of Exopolysaccharide (EPS) from Enterococcus faecium in the Cancer Cells

اسم المؤلف: هويدة كريم عبد الجنابي
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على ثلاث عزلات لبكتريا Enterococcus faecium من 120 عينة منتجات الالبان المحلية والمستوردة، وقد شخصت هذه العزلات باستخدام الفحوصات البكتريولوجية والكيموحيوية، استخلص متعدد السكريد خارج خلوي Exopoly Saccharide من العزلة رقم (1) لبكتريا E. faecium وذلك لكون هذه العزلة اعطت اعلى معدل انتاجية من المستخلص وبلغ 300 ملغرام/لتر من الوزن الجاف.درس التاثير السمي الخلوي لمستخلص EPS في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما AMN - 3 وHeLa، واظهر المستخلص فعالية تثبيطية في الخلايا السرطانية اعتمادا على التركيز المستخدم ومدة التعريض خصوصا عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر حيث وصلت نسب التثبيط الى 59.3% و86.2% على التوالي في خلايا AMN - 3، ثم بدات هذه النسب بالانخفاض مع تقليل التركيز المستخدم الى 1250 مايكروغرام/مللتر لتصل الى (8.3)% بينما استمرت الخلايا بالنمو والتضاعف خلال مدد التعريض الثلاث 24 ، 48 و72 ساعة عند التركيز 625 مايكروغرام/مللتر وكانت النسبة المئوية لتضاعفها (157.1%) مقارنة بعينة السيطرة (100%).اما تاثير المستخلص في خلايا HeLa فقد اظهر تاثيرا تثبيطيا على هذه الخلايا ازدادت نسبته مع زيادة التركيز ومدة التعريض وان نسب التثبيط في خلايا HeLa كانت اقل بفارق معنوي عن نسب التثبيط في خلايا AMN - 3 حيث بلغت نسب التثبيط في خلايا HeLa عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر 28.0% و31.1% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة واستمر انخفاض الفعالية التثبيطية للمستخلص في خلايا HeLa في التراكيز الواطئة 625 و1250 مايكروغرام/ مللتر حيث بلغت 10.7% و14.4% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة مقارنة بعينة السيطرة.درس تاثير مستخلص (EPS) وراثيا في الخلايا اللمفاوية للانسان من خلال حساب معامل التحول الارومي Blast index (BI) ومعامل الانقسام الخيطي (MI) Mitotic index وفحصت التغايرات الكروموسومية والفعالية التحفيزية لانقسام الخلايا. وجد ان هذا المستخلص قد سبب انخفاضا معنويا في معدلات معامل الانقسام ومعامل التحول الارومي يتناسب مع زيادة التركيز المستعمل ومدة التعريض لكنه لم يحدث اية تاثيرات سمية وراثية في كروموسومات الخلايا اللمفاوية المعاملة. | Three isolates of Enterococcus faecium were obtained from 120 of dairy products. These isolates were identified using bacteriological and biochemical assays.Exopolysarccharide (EPS) was extracted by (TCA 10%) method from isolate E. faecium no.1 for high production. One gram of dry weight produced 300 mg/ml of EPS.Cytotoxicity effect of EPS on cancer cell lines AMN - 3 and HeLa. An inhibitory activity of EPS against cancer cells was noticed, it was depended on EPS concentration and time exposure. Both concentrations 2500 and 5000 µg/ml were inhibited cells of AMN - 3; the percentage of inhibition was 59.3 and 86.2% respectively. Whereas, the percentage of inhibition was reduced when EPS concentration was low, 1250 µg/ml of EPS was showed 8.3% of inhibition rate. Notable, the low concentration (625µg/ml) of EPS was induced proliferation of AMN - 3 cancer cells of AMN - 3 for proliferation; the viability rate of cancer cells was 157.1% in comparison with untreated cells (control). In addition, the cytotoxic activity of EPS on cancer cell line HeLa was also studied. Significantly, inhibition rate on HeLa cells was less than that against AMN - 3 cells. The inhibition rate of HeLa cells at 2500 and 5000 µg/ml of EPS after 72 hr. was 28.06 and 31.1 % respectively. While the inhibitory activity of EPS at low concentrations (625 and 1250 µg/ml) on HeLa cells were 10.7% and 14.4% respectively.Genetically, the effect of EPS on normal human lymphocytes using different parameters such as mitotic index (MI), blastogenic index (BI), rearrangement of chromosomes, and mitogenic activity was examined. The results showed that EPS was significantly reduced MI and BI. Moreover, no genotoxic effect on chromosomes of healthy human lymphocytes was noticed

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

اسم المؤلف: همسة نافع محمد علي الرحو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.

مقارنة التاثيرات المرضية للببتيدوكلايكان المستخلص من Staphylococcus xylosus وعديد السكريد الشحمي للـ E. Coli Comparative Pathogenicity of Peptidoglycan Extracted from Staphylococcus xylosus and Lipopolysaccharide Extracted E. coli

اسم المؤلف: هبة خليل توفيق
اسم المشرف: مي طالب فليح حارث جبار فهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: من مجموع 150 عينة ادرار تم الحصول على 61 عزلة عائدة للجنس Staphylococcus , جمعت من مرضى مصابين بخمج المجاري البولية من مستشفيات الزعفرانية واليرموك للمدة من الاول من ايلول 2005 - الاول من كانون الثاني 2005 . تم التاكد من عائدية 10 عزلات للنوع S. xylosus وبنسبة عزل 16.3% من مجموع العنقوديات ، وقد تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية وتبين ان 8 عزلات كانت مقاومة للمضاد Erythromycin ، والعزلات جميعها حساسة للمضاد Ciprofloxacin . تم استخلاص الجدار الخلوي باستخدام طريقة التكسير بالحبيبات الزجاجية (Glass beads) وتم اجراء تنقية جزئية للببتيدوكلايكان من الجدار باستعمال مواد كيميائية مثل : SDS , EDTA , LiCL2 , CaCL2 والهضم بالانزيمات DNase , RNase , Trypsin , Pronase . ولغرض التاكد من جودة طريقة التنقية تم اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة فقد انخفض عدد الحزم البروتينية من 6 حزم في الجدار الخلوي الخام الى 4 حزم بعد التنقية . لقد اظهرت الدراسة الحالية التاثيرات الكيموحيوية السريرية للببتيدوكلايكان في مصل الارانب المحقونة عن طريق الزيادة الحاصلة في انزيمات الكبد والكلية ؛ اذ لوحظ زيادة معتدلة في كل من انزيمات : GoT وGpT وAlkaline phosphatase وكذلك Bilirubin ، والـ Urea ، والـ Creatinine ؛ مما يدل على حدوث خلل وظيفي في الكبد والكلية . تم دراسة امراضية مستخلص الببتيدوكلايكان للعزلة S.xylosus S24 (المقاومة لاكثر عدد من مضادات الحياة قيد الدراسة ) في الجهاز البولي للفئران البيض السويسرية الاناث اذ حقنت خمس مجاميع من الفئران بواقع ثلاثة مكررات لكل مجموعة عبر الاحليل باستخدام القثطرة بالتراكيز 1000000 ، 2000000 ، 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، وحقنت خمس مجاميع اخرى بمستخلص قياسي للـ LPS من بكتريا E.coli بالتراكيز 10, 25, 50, 75, 100 نانوغرام/مليليتر ، وبعد مرور يومين من الحقن تم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلية) تغييرات نسيجية تمثلت : بانكماش الكبيبة الكلوية ، واحتقان الاوعية الدموية ، وارتشاح الخلايا الالتهابية وفي المثانة فقدان طبقة الكيراتين وحدوث التنكس الاستسقائي لخلايا الطبقة الظهارية في كلا المستخلصين ومن خلال موازنة هذه التغييرات المرضية النسيجية لكل من مستخلص الببتيدوكلايكان وعديد السكريد الشحمي اتضح ان مستخلص عديد السكريد الشحمي اكثر شدة وامراضية اذ بدات التاثيرات بتراكيز (50, 75, 100) نانوغرام/مليليتر اقل من تراكيز مستخلص الببتيدوكلايكان 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، فضلا عن وجود تغييرات نسيجية اخرى حدثت في مستخلص عديد السكريد الشحمي وغير موجودة في مستخلص الببتيدوكلايكان. | Our of 150 urine specimens collected from patients presented with urinary tract infections attending Alza’farania and Alyarmoouk hospitals in Baghdad for the period of September , 1st 2005 to December, 1st 2005 , 61 staphylococci were obtained. Ten isolates (16 , 3%) were confirmed to be Staphylococcus xylosus identified by using of biochemical tests. Antibiotic susceptibility tests . however , 8 of them were resistant to erythromycin while all of them were sensitive to ciprofloxacin.The Crude cell wall was extracted by mechanical disintegration using glass beads and a partial purification was done to the peptidoglycan by means of chemicals such as SDS , EDTA , LiCl2 and CaCl2 in addition to enzymes like DNase , RNase , trypsin and pronase.In order to prove the efficiency of the purification method , polyacrylamide gel electrophoresis was achieved under undenaturing conditions as the proteins bands number was reduced from 8 in the crude extract to 4 bands at the final stage.The present study showed clinical biochemical effects of the peptidoglycan in sera of injected rabbits through the increase resulted in liver enzymes ad renal function tests represented by GOT , GPT , alkaline phosphatase , total serum bilirubin , urea and creatinin , an indication to a malfunction of liver and kidney.The pathogenicity of peptidoglycan extracted from S. xulosus S24 (the isolate that resist highest number of studied antibiotics) was studied in urinary tract of female Swiss mice by injecting five animal groups , as triplicates catheter at concentrations reached 1000000 , 2000000 , 3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml , plus another five groups with 10 , 25 , 50 , 75 and 100 ng / ml of E. coli LPS. Two days later , animals were killed ; kidneys and urinary bladder were taken for histopathological study as they showed different pathological changes included shrinkage of glomerulus , congestion of blood vessels and infiltration of inflammatory cells in kidney , whereas dekeratinization and edematous dehydration of the epithelium were seen in urinary bladder.Passing through a comparison between these pathological changes in both extracts , LPS developed the highest severity and pathogenecity since the effects started with concentration (50 , 75 and 100 ng / ml) less than those was withpeptidoglycan (3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml) in addition to the presence of some changes developed by LPS rather than peptidoglycan

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

اسم المؤلف: هبة علي هلال الجبوري
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.

التاثيرات السمية الوراثية الخلوية للازورين المنقى جزئيا من بكتريا Pseudomonas aeruginosa في الخلايا السرطانية والطبيعية Cytogenotoxic Effects of Partial purified Azurin from Pseudomonas aerugi

اسم المؤلف: نهاد طه محمد جدوع
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى الكشف عن قابلية الازورين المستخلص من بكتريا Pseudomanas aeruginosa في تثبيط الخلايا السرطانية ومدى تاثيره في الخلايا الطبيعية ولذا تم جمع 66 عزلة من بكتريا P.aeruginosa من مجموع 145 عينة سريرية( ادرار، ومسحات من الجروح والحروق ، ومسحات من الاذن ، والقشع ، والبراز). وقد شخصت البكتريا بالاعتماد على الفحوصات المجهرية والزرعية والكيموحيوية ، وتم التاكد من التشخيص باستخدام عدة Api 20 E. استخلص الازورين من العزلة Ps21 المعزولة من الادرار ثم قيس تركيزه باستخدام الطريقة المطلقة Absolute method وكان 916.33 مايكروغرام / مل ، بعد ذلك نقي الازورين جزئيا بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام هلام Sephadex G - 100 اذ امتدت قمة الازورين من الجزء رقم ( 24 - 33 ) ، وبلغ تركيزه بعد التنقية 550 مايكروغرام / مل. درس التاثير الوراثي الخلوي لمستخلص الازورين المنقى جزئيا في الخلايا اللمفاوية للانسان بدلالة معامل التحول الارومي BI والانقسام الخيطي MI وفحصت كروموسومات الخلايا المعامله به ، ولوحظ ان المستخلص بتراكيزه العالية سبب انخفاضا معنويا بقيمة BI وMI بينما التراكيز الواطئة لم تحدث فروق معنوية احصائيا عند المقارنة مع معاملة السيطرة ، كما انه لم يحدث اي تغير في تركيب وعدد الكروموسومات للخلايا اللمفاوية المعامله به. كما درس التاثير التثبيطي للمستخلص المنقى جزئيا في بعض الخطوط الخلوية السرطانية مثل خط خلايا سرطان الحنجرة البشريHep - 2 وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري AMN - 3 فقد اظهر المستخلص فعالية تثبيطية عالية عند التراكيز العالية (125 ، 250 ) مايكروغرام / مل حسب هذه الدراسة ولاوقات التعريض جميعا ، في حين قل التاثير التثبيطي تدريجيا مع انخفاض التركيز المستعمل ، فقد اسهمت التراكيز الواطئة في تحفيز الخلايا على التضاعف والانقسام في هذين الخطين الخلوين وبنسب مختلفة قياسا بالسيطرة (100 % ) ، فخلايا ال Hep - 2 زادت حيويتها خلال مدة ال 24 ساعة الاولى من التعريض فقط في حين ان خلايا الAMN - 3 تمكنت من النمو والتكاثر في اوقات التعريض جميعها ( 24 ، 48 ، 72 ) ساعة. كما ونجح المستخلص في تجزئة دنا الخلايا السرطانية المستخدمة في هذه الدراسة اذ لوحظ ارتفاع معنوي في نسبة التجزئة وتناسب هذا الارتفاع طرديا مع زيادة التركيز ولكلا الخطين. | This study was amied to detection the ability of azurin, produced from Pseudomonas aeruginosa , as inihibtor of cancer cells and show the effect of azurin to the human lymphocyte. Therfore, out of 145 specimens collected from urin, burn andwound swabs, ear swab, sputum and stool. 66 isolates of P. aeruginosa were obtained. These isolates were identified according to microscopical, cultural, biochemical assays. In addition Api 20 E assay was used to confirm the diagnosis. Azurin was extacted from Ps21, isolate from urin, and concentration was measured by absolute method , it was 916.33µg/ml. Therfore, it was purified by using gel filtration,Sephadex G - 100. The peak was ranged from 24 to 33.The concentration. Azurin was performed 550µg/ml. The genetic effects of partial purified of azurin in human lymphocyte was studied by using several parameters such as Blastindex (BI), Mitotic index (MI) and Chromosomal aberration (CA). The high concentration of azurin, caused a significantreduction effect when compared with control. In addition, no chromosomal aberratios was seen. The inhibion effect of partial purified of azurin in some cancer cell lines (Hep - 2, AMN - 3) was studied. The extract at high Concentration ( 125 , 250 ) µg/ml. was exhibited apotent inhibiory for all exposure time against cancer cell lines. WhileThe inhibitory activity was gradually reduced with decreasing of Concentration;the low concentration was activated of cell to proliferation in both cell lines at different ratio in coparasion with the control ( 100 % ). The viability of Hep - 2 cells was increased only during the first 24 h from exposure while the AMN - 3 cell was able to grow and proliferate in all exposture time (24 , 48 , 72) hr. In addition the extract was succeeded to fragmentation DNA of cancer cell which used in these Studied, the azurin caused significant increas of fragmentation ratio, which increased with increase the concentration of azurin for both cell lines

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

اسم المؤلف: ميسم محمد رشيد الشيباني
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA

انتاج انزيم chitinase من بكترياSerratia marcescens باستخدام حالة التخمرات السائلة والصلبة ودوره في المعالجة الحيوية

اسم المؤلف: ميس عماد احمد محمود
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: درست قابلية (15)عزلة من بكتيريا Serratia marcescenase على انتاج الكايتنيز, واظهرت نتائج الغربلة الكميه وشبه الكمية ان العزلةSerratia marcescenaseA1S هي الاغزر انتاجا للانزيم . زرعت البكتيريا في اوساط تخمر صلبة وسائلة مختلفة استعملت مواد نباتية مختلفة ( مضافا اليها الكايتين وبدونه ) لتحضير الاوساط الصلبة ، اما الاوساط السائلة فقد احتوت على الكايتين مع مواد نيتروجينية مختلفة . بينت النتائج الماخوذه من قياس فعالية الانزيم على اساس تقدير السكريات المختزلة والسكر ان استيل كلوكوز امين ان البكتيريا تنتج انزيمات الكايتينيز الداخلي chitobiosidase) ) الذي يحرر سلاسل من السكريات المختزلة والكايتنيز الخارجي chitobioase ) ) التي تحرر وحدات السكر الامينيN - acetyl D - glucosamine )) ، وكانت فعالية الكايتنيز الخارجي اعلى من الداخلي عموما ، وتبين ان الاوساط السائله تعطي انتاجية اعلى من اوساط التخمر الصلبة. نميت البكتيريا في الوسط السائل بظروف مختلفة ، ووجد ان الظروف الافضل لانتاج الانزيم هي اضافة البكتريا بعدد خلايا 104 × 2.2 خلية / مل الى الوسط الحاوي على الببتون بوصفه مصدرا للنتروجين 2 % من الكايتين الغروي وحضنها بدرجة 30 م عند الرقم الهيدروجيني ( 7 ) لمدة 4 ايام في الحاضنة الهزازة بسرعة 150 دورة / دقيقة ،وبلغت الانتاجية 9.5 وحدة/ملغم بروتين. رسب الكايتنيز في وسط الانتاج بعد تنمية العزلةmarcescenas A1S Serratia باضافة كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 75% ، وكانت الفعالية النوعية 9وحدة/ ملغم بروتين , وقد حققت هذه الخطوه تنقية جزئيه للانزيم وكان عدد مرات التنقيه5.6 بحصيله انزيميه مقدارها%80 . درست بعض العوامل المؤثره في فعالية وثبات الانزيم ، ولوحظ ان الرقم الهيدروجيني 7 هو الافضل للفعالية ، وتراوحت الارقام المفضلة لثباته بين 6 - 9 , وكانت اقصى فعالية للانزيم عند درجة 30 م . احتفظ الانزيم بنسبة 65 - 100 % عند حضنه بدرجات حرارة تراوح من 30 - 60 م لمدة 30 دقيقة ، وبقى محتفظا بـ 57 % من فعالية عند درجة 80 م. درس تاثيربعض المواد والمثبطات في فعالية الكايتنيز ولوحظ عدم تاثر الانزيم بـ EDTA وازايد الصوديوم والـPMSF بتركيز5 و10 ملي مولار . درس تاثير بعض الايونات الفلزية في فعالية الكايتنيز ولوحظت زيادة فعالية الانزيم عند حضنه مع ايونات الصوديوم Na+2 اذ وصلت الى 150 % . لم يتاثر الانزيم بايونات Mn +2 ، وFe+2 ،و Ca +2 ،و 2+ K وثبطت فعالية الانزيم عند معاملته بايونات Cu +² Zn +2, , Hg+2 بتركيز 5 ملي مولار اذ انخفضت الفعالية الى 31 , 50 , 55 % على التوالي وانخفضت الفعالية الى 25 ، 43 ، 50 % بتركيز 10 ملي مولار على التوالي عند المعاملة بهذه الايونات . قيست الفعالية المضادة للانزيم اتجاه انواع مختلفة من الكائنات الحية ، وبينت النتائج ان للانزيم فعالية مثبطة واضحة ضد خميرة الـ Candida albicans , حيث ظهرت مناطق عدم نمو واضحه للخميرة المعاملة بالانزيم ، وعند معاملةالقواقع البحرية Achatina fulica بالكايتنيز ظهرت تغيرات مظهرية عليها اذ لوحظ تنخر في اصدافها وفقدان فعاليتها. بينت النتائج ان تعريض يرقات حشرة خنفساء الطحين المتشابه Tribolium confusum للكايتنيز له تاثير قاتل للحشرة حيث فقدت حيويتها ، وظهر تحلل كامل في طبقة الكايتين التي تغلف سطح جسم اليرقة. يتضح من هذه النتائج ان الكايتنيز المنتج منmarcescenis A1S Serratia له فعالية مضادة لانواع مختلفة من الكائنات ، ويمكن استعماله بديلا للمواد الكميائية في القضاء على مثل هذه الاحياء | Fifteen Serratia isolatesd were obtained from different sources the ability of chitinase production from thes isolates was studied .Semi quantative and quantative screening appeared that Serratia marcescensA1S was the highest chitinase producer . The bacteria was cultured in different liquid and solid state fermentation media(SSF) , different plant sbstanaes were used for (SSF) with or without chitin , while liquid media containet chitin with different nitrogen source By measurements of reducing sugars and N - acetylD - glucosamine it was show this Serratia marcescensA1S produces endochitinase & exochitinase . the activity of exochitinase was higer than that of endochitinase the liquid media gaive higer chitinase production than the (SSF) Serratia marcescensA1S was grow in liquid media under tdifferent condiations and chitinase production was different favorable condtion for chitinase production were inoculation with 2.2 ×104 cell/ ml of bacteria in media containing 2 % chitin with peptone as nitrogen source , at pH 7, and incubated at 30 Cº in shakeing incubater with 150 rpm for 4 days Chitinase production reachet 9.7 unit/mg protein in these condation , Chitinase was precipitated from production media by 75 % saturation of ammonium sulphat with 9 unit/mg protein specific activity , the enzyme obtained from this step was partially purifed with 5.6 fold of purifaction and 80 % recovery . The effect of some facter on enzyme activity and stability were studied ,the optimum PH enzyme activity was 7and the favorites pH for enzyme stability ranged between 6 - 9 , the maximum activity was at 30 Cº, 100 - 65 % of enzyme activity mentained at 30 - 60 C º for 30 min and 57% at 80 Cº. EDTA ,Sodium azide and phenylmethane sulfonyl fluoride (PMSF) have no effect on chitinase activity with 5,10mM . The enzyme was treated with different metal ions , Na+2 increase enzyme activity , since it reached to150 % Mn2+ ,Fe +² ,Ca+2 , K+2, have no effect , while Cu2+, Zn+2, and Hg+2 at 5 Mm decreaced enzyme activity to 31 , 50 , 55 % respectivily and to 25 ، 43 ، 50% when it was treated with 10mM of these ions respectivily . The antibiotic activity of the chitinase against different organisms was determined , the enzyme inhibited Candida albicans growth, aclear zon appeared in the medium cultured with the yeast (treated with enzyme). Many chang appeared on sea snail Achatina fulica treated with enzyme, there was many pores on the shells , and the animal lost its viability . Flour beetle Tribolium confusum died when it was sprayed with chitinase, the chitin layer covered the Insecte body degredated after the treatment . From the above results it can be concluded that chitinase produced from Serratia marcescensA1S has antibiotic activity for different organismes , and it can be used as biocidal compound instead of chemical compounds for destroying or killing the harmful organisms

التحري الجزيئي عن جين الضراوة rmp لبكتيريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة محليا من المرضى البالغين Molecular Detection of Virulance rmp Gene in Neisseria gonorrhoeae Isolated from Adult patients

اسم المؤلف: مهـند كـريم عنيد الساعدي
اسم المشرف: نورية عبد الحسين علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, the Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories for the time period from November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on media cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25 %) women and 63 (78.75 %) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75 %) samples were positive : 35(43.75 %) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer - Martin media; while 9 (11.25 %) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3 (3.75 %) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25 %) of the direct smears and 75 (93.75 %) of the urine samples were positive. Results of the Nitrogen bases sequence of the PCR technology of the samples in this study revealed consistency reaching up to 99 % with the Nitrogen bases sequence of the rmp gene present in the N. gonorrhoeae strain of the WHO. This study presented high specificity and sensitivity for the diagnosis of gonorrhoea using the PCR technology which is cheaper and faster than the conventional methods currently used in the hospitals and laboratories.

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

اسم المؤلف: منال سلمان محمد كسار
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

اسم المؤلف: مريم باسم انيس
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

تكون الغشاء الحيوي بوساطة Klebsiella pneumoniae الملوثة للمثبتات الخارجية ومقاومته لمضادات الحياة Biofilm Formation by The External Fixators Contaminating Klebsiella pneumoniae and Its Antibiotic Resistance

اسم المؤلف: مروى حميد مطشر الخفاجي
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شخصت 98 عزلة بكتيرية منماة بظروف هوائية من مجموع 100 عينة سريرية ماخوذه من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية المستعملة في جراحة العظام والكسور. شكلت البكتريا السالبة لملون غرام اعلى نسبة 51% (50 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات، في حين شكلت البكتريا الموجبة لملون غرام 49% (48 عزلة) منها ، وكانت بكتريا Klebsiella pneumoniae هي المسبب الاكثر شيوعا لهذه الاخماج اذ عزلت بنسبة 74% (37 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات السالبة لملون غرام . اجري اختبار حساسية عزلات K. pneumoniae لمضادات الحياة ، وتبين ان العزلات جميعها كانت حساسة لمضاد Amikacin (100%) ، ومقاومة للمضادات : Ampicillin ، وCefalexine ، وCefalothin ، وCefotaxime ، وCiprofloxacin ، وRifampin بنسبة 100% ، وقد كانت نسبة مقاومتها لمضادات Ceftazidime ، وStreptomycin ، وTobramycin ، وGentamycin ، وNeomycin ، وNitrofurantoin ، وNorfloxacin ، وTetracycline ، وNalidixic acid 94.5% و86.5% و86.5% و67.5% و59.5% و37.8% و35.1% و32.5% و24.3% وعلى التوالي . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات بكتريا K. pneumoniae لمضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin فبلغت 1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K13 ، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر، و4 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51 . كما تم تحديد التراكيز القاتلة الدنيا لهذه المضادات وتراوحت مابين اكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، على التوالي للعزلة K13 ، واكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و256 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، و8 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51. تم التحري عن قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الطبقة اللزجة ، واظهرت نتائج طريقة الفحص بالانابيب ان 83.8% (31عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة ، في حين اظهرت طريقة احمر الكونغو ان 97.3% (36عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة . تم التحري عن فوعة عزلات K. pneumoniae المعزولة من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية وذلك باختبار قابليتها لربط البنفسج البلوري وكانت العزلات جميعها فائعة (Virulent) . اختبرت قدرة عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة فاظهرت النتائج ان العزلات جميعها كانت منتجة للغشاء الحيوي لكن بدرجات سمك متفاوتة ، وتراوحت قيم الامتصاصية مابين (0.111 - 2.899)، وكانت العزلة K13 هي العزلة الاكثر فعالية في انتاج الغشاء الحيوي حيث سجلت اعلى قيمة امتصاصية 2.899 . اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا من مضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin في الاغشية الحيوية المتكونة بفعل العزلتين K13وK51 في اطباق المعايرة الدقيقة باعمار مختلفة 24 ساعة و48 ساعة ، واظهرت النتائج ان هذه التراكيز ثبطت التصاق البكتريا على سطح البولي ستيرين مما ادى الى انفصال الغشاء الحيوي ، كما تبين ان الاغشية الحيوية الاقدم اكثر مقاومة للعوامل ضد الميكروبية . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للغشاء الحيوي واظهرت النتائج انها اكبر بثلاث او اربع مرات من التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات K. pneumoniae العالقة في الوسط الزرعي | Out of 100 clinical samples taken from infected external fixation devices used in orthopedic surgery 98 bacterial isolates grown in aerobic conditions had been diagnosed. The higher ratio 51% (50 isolates) of the total number of the isolates occupied by gram negative bacteria while gram positive bacteria represented the rest 49% (48 isolate) , Klebsiella pneumoniae was the most common aetiological agent of these infections which accounted 74% (37 isolates) of the total number of gram negative bacterial isolates. The sensitivity test against different antibiotics was done. It was found that all K. pneumoniae isolates (100%) were sensitive to Amikacin and resistant to Ampicillin, Cefalexine, Cefalothin, Cefotaxime, Ciprofloxacin, and Rifampin . While their resistance percetage to the antibiotics Ceftazidime, Streptomycin, Tobramycin, Gentamycin, Neomycin, Nitrofurantoin, Norfloxacin, Tetracycline, and Nalidixic acid were 94.5% , 86.5% , 86.5% , 67.5% , 59.5% , 37.8% , 35.1% , 32.5% , 24.3% respectively. Minimum inhibitory concentrations to K. pneumoniae isolates had been determined for the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , they were 1024 Mcg/ml , 128 Mcg/ml , 64 Mcg/ml , and 16 Mcg/ml respectively for the isolate K13 , and they were 1024 Mcg/ml , 64 Mcg/ml, 16 Mcg/ml, and 4 Mcg/ml respectively for the isolate K51. Minimum bactericidal concentrations for the same antibiotics had been estimated and they were higher than 1024 Mcg/ml, 1024 Mcg/ml, 128 Mcg/ml, and 32 Mcg/ml respectively for K13 isolate, and higher than 1024 Mcg/ml, 256 Mcg/ml, 32 Mcg/ml, and 8 Mcg/ml respectively for the isolate K51. The ability of K.pneumoniae isolates to produce slime layer was detected , the results revealed that 83.3% (31 isolates) were slime layer producers by tube method, while 97.3% (36 isolates) were slime producers by congo red method. The virulence of K.pneumoniae isolates isolated from external fixators infections had been detected via detection the crystal violet binding ability of these isolates, all the isolates were virulent. The ability of K.pneumoniae isolates to produce the biofilm had been tested by using microtiter plates , results revealed that all the isolates were biofilm producers with different thickness degrees, absorbance values rendered between (0.111 - 2.899) , K13 was the best biofilm producer isolate, it,s absorbance value was 2.899 . The effect of subinhibitory concentrations of the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , on biofilms formed by K13 and K51 isolates in microtiterplates in different ages , 24 hr and 48 hr had been tested , results revealed that these concentrations inhibited bacterial adhesion on polysteren surface and consequently causes biofilm detachment , also it was demonstrated that aged biofilms are more resistant to antimicrobial agents . Minimum inhibitory concentrations for the biofilm had been estimated, and the results revealed that these concentrations were three to four times higher than minimum inhibitory concentrations for the planktonic K.pneumoniae isolates.

دراسـة الاستجابة المناعيـة للاشخاص بعد تلقيحهم بلقاح الحصبـة الالمانية Immune - status of Individuals after Immunization with Rubella vaccine

اسم المؤلف: ليلى فؤاد علي
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: بدا برنامج التلقيح الموسعExpanded programme on immunization(EPI) في العراق عام 1985وبتوجيه من منظمة الصحة العالمية وبضمنه لقاح الحصبة الالمانية في برنامج التلقيح الاعتيادي للاطفال وبعمر 15شهر بهدف القضاء على مرض متلازمة الحصبة الالمانية الولادية نظرا لما يسببه هذا المرض من اضرار كبيرة في الجنين حيث قد يولد الطفل المصاب مشوه وقد تؤدي الاصابة بحياته الى الموت (Laura & Susan,2002). شملت الدراسة (116) عينة دم ماخوذة من اشخاص اصحاء ،كان منها 30 عينة دم لاطفال اصحاء بعد اسبوعين من تلقيحهم بلقاح الحصبة الالمانية حسب الجدول التلقيحي المتبع في القطر وقد تراوحت اعمارهم مابين (18 - 20) شـهر ، و20 عينة دم لاناث تراوحت اعمارهن مابين(12 - 15) سنة بعد اسبوعين من تلقيحهن بلقاح الحصبة الالمانية . اما مجموعة السيطرة فتضمنت 12 عينات دم لاطفال و10 عينات لاناث بعمر (12 - 15) سنة لم يتلقوا لقاح الحصبة الالمانية . هذه العينات اجريت لها الاختبارات المناعية لتقييم الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية للقاح الحصبة الالمانية.كما تضمنت الدراسة 44 عينة دم لاشخاص ملقحين منها 22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها موجبة و22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها سالبة ، تم اختبار هاتين المجموعتين باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) لمعرفة العلاقة بين الفحصين والحساسية والنوعية لفحص (ELISA)نسبة الى فحص تثبيط التلازن الدموي . في هذه الدراسة تم قياس الاستجابة المناعية الخلطية وذلك بقياس تركيز الاضداد النوعية للحصبة الالمانية ، بالاضافة الى تقدير التركيز الكلي للكلوبيولينات المناعية صنفA وM وG.كما تضمنت الدراسة قياس الاستجابـة لمناعية الخلوية وذلك بقياس قابلية الخلايا البلعمية على البلعمة ،وقياس قابلية الخلايا اللمفاوية التي تم تحفيزها بالملزن النباتي (PHA) على التحول والانقسام . من خلال هذه الدراسة تم الحصول على النتائج التالية : - 1 - اظهرت مصول الاطفال نسبة 96.7 % ،واظهرت مصول الاناث نسبة 95 % تراكيز فعالة من الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية اعلى من 11وحدة عالمية \مليلتر باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم ELISA بعد عملية التلقيح .2 - اظهرت مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين انخفاض في اجمالي الكلوبيولين المناعي صنف GوAوبفروق معنوية (p<0.05) ( p>0.05 ) مع ارتفاع في الكلوبيولين المناعي صنف Mوبفروق معنوية عالية(p<0.01) مقارنة بمجموعتي السيطرة .3 - وجد من خلال فحص النسبة المئوية لعملية البلعمة ان كل من الاطفال والاناث الملقحين اظهروا ارتفاعا في النشاط الالتهامي للخلايا البلعمية وبفروق معنوية (p<0.05) مقارنة بمجموعتي السيطرة .4 - اظهرت نتائج فحص التحول والانقسام اللمفاوي ان هناك انخفاض غير معنوي ( p>0.05 )في مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين مقابلة بمجموعتي السيطرة . 5 - لا توجد فروق معنوية في الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية بين مجموعة الاطفال الملقحين ومجموعة الاناث الملقحات ( p>0.05 ) .6 - وجد ان فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم هو اكثر حساسية من فحص تثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية ،وعليه فهو الافضل في تقييم الاستجابة المناعية للقاح الحصبة الالمانية .7 - وجد ان هناك علاقة ايجابية قوية بين فحصي الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم وتثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية حيث كانت قيمة ( r = 0.585 ) . | The Expanded Programme on Immunization (EPI) began in Iraq in 1985, including Rubella vaccine. MMR vaccine is represent one of combined vaccines of rubella ,measles and mumps that given for children at age of 12 - 15 months. Vaccination with rubella vaccine is the best way to eradicate Congenital Rubella Syndrome which have severe complications for women in their first trimester of pregnancy These complications include severe birth defects or death of the fetus. In this study, (116) blood samples were taken from healthy individuals after 2 - 4 weeks after vaccination with rubella vaccine .(30) from children of age (12 - 18) and (20) from females at age of (12 - 15) years old . Control group included (12) healthy children and (10) healthy females ,both did not have rubella vaccine through their life .These samples were tested to evaluate the immune - states of individuals after immunization . the study include (44) blood samples tested by HItest and ELISA test . In this study specific haemagglutination antibodies & IgM antibodies were measured ,total Immunoglobulines IgM ,IgG ,IgA also determined .Lymphocyte transformation and ability of phagocyte cell to phagocytosis were measured. The following results were obtained in this study : 1. The percentage of children whom observed levels of specific antibodies ≥ 11AU/ml was 96.7% and 95% by ELISA test for children and females groups respectively after vaccination .2. The decreasing total of IgG and IgA with the increasing of IgM in both groups of children and females with significant differences (p>0.05) (p>0.05) (p<0.01) receptively comparison with control group.3. The increasing percentage of phagocytic cell to phagocytosis in both groups of children and females in significant differences (p<0.05) comparison with control group .4. The decreasing percentage of lymphocyte transformation in both children and females groups in non significant differences (p>0.05) comparison with control group .5. The non significant differences in humoral and cellular immune Response between child and female groups .6. The higher sensitivity of ELISA test to HI test in determination of rubella specific antibodies , so it is better than HI test in measuring the immune - status of individuals vaccinated with rubella vaccine .7. A positive relationship between ELISA test and HI test (r= 0.585) .

الاستخلاص والتنقية الجزئية للخملة من بكتريا Proteus mirabilis ودراسة دورها في الالتصاق على الخلايا الطلائية البولية Extraction and Partial Purification for Fimbriae from Proteus mirabilis and Study Their Role in Adhesion to Uroepithlial Cells

اسم المؤلف: عامر سعيد علي الكعبي
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص البكتريا السالبة لملون كرام من ادرار المرضى المراجعين لمستشفى الكاظمية التعليمي ومستشفى اليرموك في بغداد واللذين شخصت اصابتهم بخمج المسالك البولية سريريا . عزلت البكتريا السالبة لملون كرام من 61 عينة ادرار وبنسبة عزل 28.9% من اصل 211 عينة ادرار , كانت نسبة عزل بكتريا Escherichia coli 70.49% , اما بكتريا Klebsiella pneumoniae , وPseudomonas aeruginosa فكانت نسبـة عزلهما 8.19% و6.55% وعلى التوالي . اظهرت بكتريا Proteus spp. نسبة عزل 14.75% وبلغت نسبة عزل P.mirabilis 11.47% اما نسبة عزل P.vulgaris فكانت 3.27% . تم التحري عن قدرة سللات بكتريا P.mirabilis للتعبير عن خمل لاصق الخلايا الطلائية البولية (Uroepithelial Cell Adhesin)(UCA) , بالاعتماد على اعلى معدل التصاق للبكتريا بالخلايا الطلائية البولية للانسان , اذ تم اختبار العزلة P.mirabilis U7 التي كان معدل التصاقها 30.2% عند تنميتها على وسط مرق اللوريا وفترة حضن 24 ساعة بدرجة حرارة 37 م , وعند تنميتها على وسط اكار اللوريا كان معدل التصاقها 20.3% مقارنة بالعزلة P.mirabilis U4 التي ابدت معدل التصاق واطيء عند تنميتها على وسط مرق اللوريا واكار اللوريا اذ بلغ معدل الالتصاق 4.7% و1.65% وعلى التوالي . اظهرت العزلة P.mirabilis U7 قدرة للتعبير عن الخمل المقاوم للمانوز شبية البروتيس (MR ∕P) والخمل المقاوم للمانوز شبية الكلبسيلا (MR ∕K) , اذ لازنت هذه العزلة كريات الدم الحمر للانسان نوع O+ وخنازير غينيا والخراف وبوجود سكر المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕P , كما لازنت كريات الدم الحمر المدبغة للابقار وبوجود المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕K عند تنمية هذه العزلة على وسط مرق اللوريا وفترة حضانة 48 ساعة وبدرجة حرارة 37 م , كما اختزل التعبير عن الخمل MR ∕Pو MR ∕K عند تنمية P.mirabilis U7 على الاوساط الزرعية الصلبة . تم عزل خمل UCA وتنقيته جزئيا باستخدام اليوريا بتركيز 2 مولر والصدمة الحرارية وكبريتات الامونيوم وبنسبة تشبع 50% وDeoxycholate , كان تركيز بروتين UCA هو 1.65 مايكروغرام/مليلتر وبحجم نهائي 1.5 مليلتر ناتج من استخدام 3 لتر من مرق اللوريا . اظهر الترحيل الكهربائي وبوجود المادة الماسخة SDS حزمتين بروتينية لبروتين UCA المنقى جزئيا والذي بلغ وزنه الجزيئي 17.782 دالتون . تم حقن الـ UCA المنقى جزيئا في الارانب للحصول على المصل المضاد اذ وجد ان تركيز المصل المضاد هو 128 كما تم الاستدلال على وجود الاضداد النوعية لمستضد خمل UCA . ثبطت اضداد خمل UCA المحضرة في الارانب والمخففة بتراكيز 1 : 50 و1 : 100 , 1 : 200 التصاق العزلة P.mirabilis U7 بالخلايا الطلائية البولية (معدل البكتريا الملتصقة كان 5.6 و11.75 و21.05 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) , اظهرت هذه الاضداد اختلافا معنويا (P≤0.05) في معدل الالتصاق عند مقارنتها بمصل السيطرة والمستعمل بنفس التراكيز (معدل عدد البكتريا الملتصقة كان 29.8 و30 و31.6 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) ,كما اظهرت النتائج وجود اختلاف معنوي (P≤0.05) بين تراكيز المصل المضاد المستخدمة في تثبيط الالتصاق . تم اختبار قدرة خمل UCA المنقى جزئيا على التمنيع وحماية اناث الفئران من الاصابة بخمج المسالك البولية , تم اصابة الفئران الممنعة وغير الممنعة ببكتريا P.mirabilis U7 بتركيز (5×105) وحدة مكونة لمستعمرة/ مليلتر عن طريق الاحليل وبعد مرور اسبوع على الاصابة وجد ان اعداد الخلايا البكترية الحية في كلية الفئران الممنعة انخفض الى (2.6 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر مقارنة بـ(3.7 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر لكلية الفئران غير الممنعة ,اما مثانة الفئران الممنعة فقد اختفت الاصابة وبشكل كامل مقارنة بمثانة الفئران غير الممنعة (3.3 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر .

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

اسم المؤلف: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

دراسة بعض الخصائص الفيزيائية والكيميائية لانزيم Staphylolysin المنتج من بكتريا Pseudomonas aeruginosa Study of Some Physical and Chemical properties of Staphylolysin produced by Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: شيماء سهيل نجم
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت (50) عزلة عائدة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من 120 عينة سريرية جمعت من مصادر مختلفة تضمنت (الادرار،والقشع ،والبراز ،ومسحات الاذن ، والجروح،والحروق).تم التحري عن انتاج بعض من عوامل الضراوة للعزلات قيد الدراسة مثل : الهيمولايسين، والايلاستيز ، والبروتيز ، ووجد ان نسبة انتاج الهيمولايسين والايلاستيز كانت 76% ، فيما كانت نسبة انتاج البروتيز 72% في العزلات المحلية قيد الدراسة.اختبرت قابلية العزلات المحلية على انتاج انزيم الستافيلولايسين ، وبينت نتائج الغربلة شبه الكمية ان 18 عزلة (36%) من العزلات لها القابلية على انتاج الانزيم وبنسب متفاوتة،اذ تراوحت اقطار الهالة الشفافة من(5 - 22)ملم ، وتميزت خمس عزلات منها باعطاءها اوسع مناطق تحلل على وسط ] ترتبك صويا الصلب + 0.2% (وزن/حجم) من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة المقتولة بالحرارة بدرجة 100م [تراوحت من (16 - 22)ملم ، وتم انتخاب العزلة 16P لاستخلاص الستافيلولايسين A (LasA) ، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (8.59)وحدة / ملغم بروتين ، والعزلة 5P لاستخلاص الستافيلولايسين D (LasD)، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (0.66)وحدة / ملغم بروتين ،لكونهما الاغزر انتاجا للانزيم عند اجراء الغربلة الكمية.استخلص انزيم الستافيلولايسين بالنبذ المركزي المبرد وتمت تنقيته جزئيا بترسيبه بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 80% ثم بكروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل DEAE - Cellulose ، بينت النتائج ان الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات (Staphylolytic activity) لانزيم الستافيلولايسين A ظهرت في القمة الاولى، وبلغت عدد مرات التنقية 10.74 مرة وبحصيلة انزيمية 14.2%،فيما اظهرت القمة الثانية الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات لانزيم الستافيلولايسين D بعدد مرات تنقية 9.1 مرة وبحصيلة انزيمية 18.14%.درست بعض خصائص الانزيمين فكان الوزن الجزيئي 20.417 كيلو دالتون و23.988 كيلو دالتون للستافيلولايسين D,A على التوالي عند تقديرهما بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE. لوحظ ان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين A هو 8 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 150 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 7.5 - 8.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، فيما كان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين D هو 9.5 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 16 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 8.5 - 9.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، وظهرت اقصى فعالية للانزيمين عند درجة حرارة 40م اذ بلغت الفعالية النوعية للستافيلولايسين A 140 وحدة /مل وللستافيلولايسين D 16.4 وحدة/ مل ، واحتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما تقريبا عند حضنهما بدرجة حرارة 25 - 40م لمدة ساعة.عند دراسة تاثير بعض المواد في الفعالية الانزيمية للستافيلولايسين D,A كان لكلوريد الصوديوم وكلوريد البوتاسيوم بتركيز 1 و5 ملي مولار تاثير منشط للفعالية الانزيمية قياسا بالسيطرة اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ105% و108% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد الصوديوم ، واحتفظ بـ 102% و104% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد البوتاسيوم، في حين ثبطت الفعالية الانزيمية عند معاملتهما بكلوريدات الحديد والزئبق والخارصين وبنسب متفاوتة ،اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ 73% و7% من فعاليته على التوالي عند معاملته بـ5ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و9% فقط من فعاليته عند معاملته بـ 0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين ، فيما احتفظ انزيم الستافيلولايسين D بـ45% و13% من فعاليته فقط عند معاملته بـ5 ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و23% فقط من فعاليته عند معاملته بـ0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين، بينما احتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما عند المعاملة بمادة EDTA بتركيز 10 ملي مولار ،وفنيل مثيل سلفونيل فلورايد (PMSF) بتركيز 0.4 ملي مولار. | Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were obtained from 120 various clinical samples included (urine, sputum, stool, ear, wound & burn swabs). Detection of the production of some virulence factors (hemolysin, elastase and protease) by the local isolates was studied. Results showed that the hemolysin and elastase production ratio were 76%, while the protease production ratio was about 72% by the local isolates.Detection of the ability of local isolates to produce staphylolysin enzyme was studied, the semi quantity screening results showed that 18 (36%) of the isolates have the ability to produce this enzyme in variable ratios , the diameters of lysis Zone ranged from(5 - 22)mm, and five isolates were characterized by giving the highest lysis zone on (Tryptic soya agar + 0.2% (wt./vol.) of heat killed Staphylococcus. aureus at temperature 100oC ) medium which were ranged from(16 - 22)mm, then the isolate P16 was chosen to extract staphylolysin A (LasA) and it's specific activity reaches 8.59 unit /mg protein, whi1e chosen the isolate P5 to extract staphylolysin D (LasD) where it's specific activity reaches 0.66 unit /mg protein since the two isolates were the most production of enzyme by quantity screening . Staphylolysin enzyme was extracted by cooling centrifugation and partially purified by ammonium sulphate precipitation in saturation percentage of 80%, this step was followed by Ion exchange chromatography technique by using DEAE - cellulose column, results showed that the enzymatic activity (Staphylolytic activity) of the staphylolysin A appeared in first peak with purification folds and recovery of 10.74 fold and 14.2% respectively, while the second peak appeared the activity for staphylolysin D with purification folds and recovery of 9.1 fold and 18.14% respectively.Some of the characters of the two enzymes were studied, so the molecular weights were 20.417 kilo dalton & 23.988 kilo dalton for staphylolysin A&D respectively were estimated by SDS - polyacryl amide gel e1ectrophoresis. The optimum pH for staphylolysin A activity was found to be 8 which gives higher activity reaches 150 unit/ml, and for enzyme stability was 7.5 - 8.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity, while there were for staphylolysin D 9.5 that gives higher activity of 16 unit/ml.& 8.5 - 9.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity respectively, Maximum activity of two enzymes was obtained at 40 C in which the specific activity were for staphylolysin A and D 140 and 16.4 unit/ml , and the activity for two enzymes at 25 - 40 C remained approximately without change for one hour. When the effects of some materials on staphylolysin A & D activity were studied, the results showed that both sodium chloride & potassium chloride at 1 & 5 mM had the activator effect on enzymatic activity compared with its control where the staphylolysin A and D retained 105% ,108% and 102%, 104% of their activity, respectively when treated with sodium chloride, while they retained 110%, 114% and 133%, 118% of their activity, respectivity when treated with potassium chloride, while ferric, mercury & zinc chlorides inhibited the activity in variable ratios in which the staphylolysin A and D kept only 73%, 7% and 45%, 13% respectively of their initial activity when treated with 5mM of ferric and meracury chloride and 9%, 23% respectively of their initial activity when treated with 0.1mM zinc chlorid & enzymatic activity for both enzymes were not affected when treated with EDTA at 10mM & phenyl methyl sulphonyl fluoride (PMSF) at 0.4mM.

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

اسم المؤلف: شمم ناصرراضي
اسم المشرف: شذى سلمان حسن سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

اسم المؤلف: سعاد علي احمد
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

اسم المؤلف: سحـر ظاهر عبد عسل
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.
1 ... 211 212 213 214 215 ... 494