Share
التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics
Author name:
نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name:
امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic:
Biology
Specific topic:
Microbiology
Degree:
Master
University:
University of Baghdad - College Of Science For Girls
Language:
English
University location:
Baghdad
First pages:
24T3449 - p.pdf
Abstract:
ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.
