Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 100 out of 16,123

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن == Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

Author name: محمـد فضـل سالم الميسـري
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من نماذج الانسان باستخدام تقنية تفاعل البوليمرز المتسلسل (PCR) والنشاط المضاد لمستخلصات قشور البصل == Isolation and Identification dermatophytes from human Samples By using polymerase chain reaction (PCR) Technique and Antidermatophytic activity of onion peel extracts

Author name: محمد عبد الكريم الخفاجي
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الفطريات الجلدية هي واحدة من مجموعة من الفطريات ذات الصلة وثيقة والتي لديها القدرة على غزو الانسجة المتقرنة (الجلد والشعر) في الانسان والحيوانات لاحداث الاصابة الجلدي دعى Dermatophytosis والمعروفة لنا على انها التهابات حلقة الدودة. لعزل وتحديد الفطريات الجلدية من العينات السريرية ودراسة النشاط المضاد للفطريات antidermatophytic للمستخلصات قشور البصل (Allim cepa) . جمعت 60 عينة من مستشفى ابو قاطع ابي غريب، 22 عينات من مستشفى اليرموك و18 عينة من تلاميذ المدارس الابتدائية في ابو غريب على التوالي. وقد اجريت الدراسة خلال الفترة الممتدة من اكتوبر 2014 الى اذار 2015. باستخدام الفحص المجهري والزرع تشخيصت وجود فطريات جلدية لدى (90) مريض من اصل (100) مريضاﱟ فقط اي بنسبة (90%) ، وقد تبين ان 59 (59%)من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري والزرع . في حين عدد الحالات السالبة في الفحص الزرعي فكان 31 اي بنسبة (31%) حيث كانت انواع مختلفة ل Candida spp، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 10 (10%) حيث كانت اجناس فطرية اخرى مثال على ذلك Penicillium sp, Aspergillus niger . اظهرت الفحوصات المختبرية تباين الانواع الفطرية الجلدية المعزولة اذ ان اكثر الانواع الفطرية الجلدية المعزولة كان الفطر Trichophyton.mentoagrophytes ظهر في 27 عينة (45.7%) ,يليه الفطر Microsporum.canis ظهرفي 18 عينة (30.6%) , والفطر Trichophyton.rubrum كان في 9 عينات (15.25%) وبينما كان الفطر Trichophyton.verrucosum اقل الانواع الفطرية المعزولة وظهر في 5 عينات فقط وبنسبة (8.4%) . واظهرت النتائج تباين في نسبة الاصابة بين الذكور والاناث ، حيث سجلت اعداد ونسب المصابين بالامراض الفطرية تبعا للجنس. اذ سجل عدد الذكور 39 اصابة اي (66.1%) اما عدد الاناث فقد بلغ 20 اصابة اي (33.9%).تبين من خلال هذه نتائج هذه الدراسة ان الاصابات بالامراض الفطرية كانت اكثر تكرارا خلال الاشهر المعتدلة درجة الحرارة حيث لوحظ زيادة نسبة الاصابة في فصل الربيع والذي سجلت فيه اعلى نسبة للاصابة خلال شهر اذار (35%) ،شهر شباط (25%) ، شهر كانون الثاني (18%) ، شهر كانون الاول (12%) ، شهر تشرين الثاني (10%) على التوالي .هرت النتائج وجود علاقة ما بين الاصابة ومناطق سكن المرضى حيث بلغت نسبتها في المناطق الريفية (84%) مقارنة مع المناطق الحضرية التي بلغت (16%) ، كما اظهرت ان الفطريات الجلدية التي تنتقل عن طريق ملامسة الحيوانات اكثر تكرارا (84.4 %) من كانت الملامسة البشرو التي كانت اقل تكرارا (15.6 %).شخصت الفطريات الجلدية المعزولة بطريقة تفاعل سلسلة انزيم البلمرة PCR ،واظهرت النتائج تماثل في الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة وحيث قورن مواقع هذه الحزم مع موقع الحزم ذات الاوزان الجزيئية المعروفة العائدة للدليل الحجمي, حيث جاءت النتائج متماثلة للحجم المتوقع وهو 500bp (زوج قاعدة) كناتج لعملية تضاعف البادىء primerالمتخصص بالفطريات الجلدية لكل M. canis , mentogrophyt T. , T. vrrucosum . وقد تمت دراسة التاثير التثبيطي لكل من المستخلص المائي والكحولي (الحار والبارد ) لقشور ثمرة البصل ، كل على حدة في النمو القطري لمستعمرات الفطريات الجلدية والاكثر تكرارا حيث شملت الفطرين M. canis ,. mentogrophyt T . واظهرت نتائج استخدام المستخلصات النباتية لقشور ثمرة البصل ان ادنى التركيز المثبط للنمو من المستخلص المائي الحار هو (0.78)ملغم/مل للفطر T.mentogrphytes اما الادنى التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل، اما الفطر M .canis فان الادنى التركيز المثبط للنمو هو (0.78)ملغم/مل اما التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل . وللمستخلص المائي البارد فان ادنى التركيز المثبط للنمو هو (1.56)ملغم /مل للفطرT.mentogrphytes واما ادنى التركيز القاتل فقد كان (25) ملغم/مل. واما فطر M .canis فادنى التركيز المثبط للنمو هو (3.125) ملغم /مل والتركيز القاتل فقد كان (12.5) ملغم/مل. كما تبين ان لادنى التركيز المثبط من المستخلص الكحولي الحار والكحولي البارد لقشور البصل هو (0.78) ملغم/مل على النوعين الفطريات ، اما ادنى التركيز القاتل للمستخلص الكحولي الحار والبارد فهو(50) ملغم/مل بالنسبة للفطر M. canis ,. mentogrophyt T . | Dermatophytes are one a group of closely related fungi that have the capacity to invade the keratinized tiusse (skin and hair) of human and other animals to produce cutaneus infection called Dermatophytosis commouly referred to as ring worm infections . To isolate and identify the dermatophytes from clinical samples and to study the antidermatophytic activity of onion (Allim cepa ) extracts . 60 sample from Abu Graib Hospital , 22 samples from Yarmook Hospital and 18 sample from elementany school pupils Abu Graib regian were Collected respectively . The study was conducted during the period extended from oct , 2014 to Mary ,2015 . by microscopial examination and cultivation have been diagnosed with the presence of Dermatophyte at (90) patients only at a rate (90%), has been shown that 59 (59%) of the cases were positive Result by microscopic examination and cultivation. As the number of negative cases in the examination cultivation was 31 ( 31%), where the different genus for Candida sp, either the number of negative microscopic examination and cultivation is 10 cases (10%), where anther genus of fungi for example Penicillium, Aspergillus niger. When you identify the types of fungi, laboratory tests showed fungal species isolated skin variation، The most common fungi isolated were T.mentoagrophyt where the sample was 27 (45.7%), followed by M.canis where the 18 samples (30.6%) , was T.rubrum 9 samples (15.25%), and while The T.verrucosum was less fungal species isolated where , the number of isolated samples only 5 (8.4%).There were significant differences in Infection rate between males and females, were recorded prepare ratios infected with fungal diseases Accordingly sex, and as it was recorded that the number of males 39 (66.1%) The number of females has reached to 20 (33.9%) .It has been shown through this study that fungal diseases Infection were more frequent during of moderate temperature months of year ,observed increase in Infection of the during spring, which recorded the highest rate of infection during the month of March (35%), followed by injuries recorded in the month of February (25% ) then the month of January (18%) and the month of December (12%) and then the November (10%) respectively.about the relationship between infected with Housing areas, showing High incidence was recorded in rural regions (84%) in comparison with urban regions(16%). the study demonstrated a significant shift in the skin fungus that causes the disease towards animal species (84.4% ), while the human species less frequent (15.6%). Diagnosed skin fungi by (PCR) manner enzyme polymerase chain reaction, The results showed similar in molecular weight of packages multiplying and these sites packages as compared to with site with molecular weights known as belonging to the manual volumetric packages ,where the results were similar to the size of the expected site, a 500bp (pair base) as a product of the process started it doubled primer M. canis, T. mentogrophyt, T. vrrucosum.Has been studied the inhibitory effect of each of the aqueous and alcoholic extract (hot and cold) to peel the onion, Separately in growth of the colonies skin fungi isolated from injuries skin diseases, and the most frequent during this study, which included fungi Micrsporum canis , mentoagrophyt Trichophyton.And it showed the results of the use of plant extracts to peel onions that minimum inhibitory concentration(MIC) of the growth of the aqueous extract is (0.78) mg / ml for T.mentogrphytes The minimum Focus concentration (MFC) is 25 mg / ml, either MIC for M .canis is (0.78) mg / ml The MFC 25 mg / ml . To the water cold extract, MIC is (1.56) mg / ml of T.mentogrphytes MFC is 25 mg / ml. The M .canis MIC is (3.125) mg / ml MFC is (12.5) mg / ml.And the MIC of the hot alcoholic and cold alcoholic extract of onion peel is (0.78) mg / ml and the MFC is 50 mg / ml for both M. canis, T. mentogrophyt .

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية Dermatophytes ومقاومتها ببعض المستخلصات النباتية == Isolation and Identification of some Dermatophytes and its control by the plants extracts

Author name: محسن محمد فرج
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لغرض عزل وتشخيص الفطريات الجلدية المسببة لمرض داء السعفة التي تصيب الانسان ودراسة حساسيتها بواسطة المستخلصات النباتية للاغصان الفتية لنبات التين والحليب النباتيlatex,اذ تم جمع 100 نموذجا (قشطات جلدية ،شعر، اظافر) ماخوذة من مناطق مختلفة من الجسم ذكور واناث بفئات عمرية مختلفة من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية التابعة لمستشفى الامام علي() الذين شخصوا من قبل الطبيب المختص كحالات اصابة سريرية بالفطريات الجلدية للمدة ما بين تشرين الاول 2013 ولغاية حزيران 2014.تم فحص النماذج مختبريا بالفحص المجهري المباشر باستعمال هيدروكسيد البوتاسيوم KOH (%10) ثم زرعت النماذج على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ اظهر الفحص المجهري المباشر والزرع 52 مريض بنسبة (52%) من المجموع الكلي للاصابات من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري المباشر والزرع ، في حين كان عدد الحالات الموجبة بالفحص المجهري المباشر وسالبة بالزرع هو 41 مريض بنسبة (41%) ، وكان عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر وموجبة بالزرع هو 0 اصابه بنسبة (0%) ، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 7 اصابات وبنسبة (7%).اظهرت نتائج العزل والتشخيص ستة انواع من الفطريات الجلدية اذ سجل اعلى نسبة الفطر Trichophyton rubrum 33.33% ثم يليه في نفس المرتبة كل من Trichophyton schoenleinii وMicrosporum canis بنسبة20%)) لكل منهما ويليه Trichophyton tunsouransبنسبة 13.33%وكذالك احتلت كل من Trichophyton mentagrophytesو Trichophyton vercosum 6.66% . وبلغت اصابات الذكور46.67% اما اصابات الاناث فكانت 53.33% . واكثر فئة عمرية متاثرة بالاصابات الفطرية الجلدية هي سن العشر سنين اذ بلغت نسبة الاصابة 20% . وحول موسم انتشار هذه الاصابات الجلدية اذ تبين ان الاصابة اكثر تكرارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه النسبة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة خلال شهر نيسان وبنسبة (27 %) ، وادنى نسبة اصابة خلال شهر تشرين الاول وبنسبة (2%) . وفيما يخص مصادر الاصابة بالفطريات الجلدية وجد ان تربية الحيوانات المنزلية والحقلية هي الغالبة وبنسبة (% 33) ، يليه استعمال ادوات الاخرين بنسبة (% 23) وباقي الاصابات لم يوجد لديهم تماس مع الحيوانات ولا لبس الملابس المستعملة .ان المستخلص المائي البارد والكحولي البارد اعطى اعلى فعالية تثبيطية مقارنة بالمستخلص الكحولي الحار والمائي الحار .كما اظهرت الفطريات الجلدية فيما بينها فروق معنوية اذ اظهر الفطر M.canis حساسية اعلى للمستخلصات المختلفة يليه الفطر T.mentagrophytes. ثم الفطر T.rubrum. وقد اظهر المستخلص المائي البارد فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وان معـــدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز75mg/ml)) اما عند تركيز50mg/ml كانت نسبة التثبيط(,18 64.16 12.5,)% على التوالي لكل من الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها 12) , 3.3 4.1 ,) % على التوالي عند التركيز5mg/ml وعند التركيز 0.5mg/ml)) نسبة تثبيط, 0.8) 27.9 , % ( 3.3 .اما المستخلص الكحولي البارد فقد اظهر فاعلية تثبيطية للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وبمعدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز 75mg/ml)) وبنسبة تثبيط مقدارها(56.7,78.9,58)% على التوالي عند التركيز 30mg/ml,اما عند التركيز( 3mg/ml) فقد فكانت نسبة التثبيط (65.6,68.4,50) % على التوالي , ووصلت النسبة المئوية للتثبيط ,46.6) 52.6 , 57.4 ) % للتركيز 0.3mg/ml . اما المستخلص المائي الحار فكان اقل كفاءة ضد الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها( 22 , 2.6 , 30.3)% على التوالي عند التركيز (75mg/ml) ,اما عند التركيز 7.5mg/ml)) فقد بلغت نسبة التثبيط مقدارها3.22,0,3.1) )% على التوالي في حين بلغت بنسبة تثبيط مقدارها (12.2 , 0 , 19.3 ) % لجميع الفطريات عند التركيز. (0.75mg/ml )اما المستخلص الكحولي الحار فقد اظهر فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum عند التركيزmg/ml) 40) بلغت نسبة التثبيط (62.5,53,28) % على التوالي , وعند التركيز ml) (4mg/بلغت نسبة المئوية للتثبيط(24.6 , 51 , 44 )% وعند تركيز 0.4mg/ml) ) بلغت نسبة التثبيط (22.6 , 32.6 (43.4 ,%. وكذلك تم استعمال حليب التين كمستخلص للفطريات قيد الدراسة T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum بتركيز1.5mg/ml)) واثر هذا التركيز على نمو المستعمرات الفطرية وبنسبة تثبيط بلغت (28 , 29.16 , 12.5)% .اذ درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقاري الفلوكونازول وايتريكونازول في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrumوعلى التوالي وبتركيز (7.5mg/ml)للمضاد الفطري fluconazol وكانت بنسبة التثبيط (59.6 , 33.3 , 80.5)% بينما بلغت نسبة التثبيط لنفس المضاد بتركيز 15mg/ml)) (70 , 100 % (88.7, واستخدم ايضا المضاد Itraconazol بتركيز 5mg/ml)) للفطريات قيد الدراسة فبلغت بنسبة التثبيط للمستعمرات الفطرية (28.3 , 22.2 , 53)%. واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلصين المائي والكحولي الباردين لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر T.mentgrophytesفي الارانب. | This study was carried out to Isolate and Identify the Dermatophytes which infect human and control plants (Ficus carica) by using the extracts of the young branches of Fig . One hundred specimens (scale ,nail and hairs) have been taken from everybody were collected from outpatient visiting the Dermatology in Al - amamm ali alyehi Alsalam , which diagnosed as dermatophycosis infection during the period extended from November 2013 through September 2014 . On direct microscopically examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty two fungal isolates.(52%) were positive by direct microscopically examination and culture ,(41%) were positive by direct microscopically examination and negative in culture and (7%) were negative by culture and microscopical examination . The most common fungi isolated were Trichophyton rubrum(33.33 %) followed by Trichophyton schoenleini (20%)M.canis (20%) Trichophyton tunsourans 13.33% Trichophyton mentagrophytesو T.vercosum 6.66% There was recorded among male (46.67%) than female (54.43%) ,the higher percentage for fungal infection was recorded in the age ten years with percentage (20%). Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (27 % ) while the lowest rate was in February (2%). concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (33%) and using others instruments (23%).Young branch extract of the Fig plants ( Ficus carica ) were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and Fluconazol,Itraconazol were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Fig cold water and ethanol extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Microsporum canis was the highest sensitive compared to the other tested fungi.Cold aqueous extract showed of different inhibitory effect according to concentration and fungal test Tricophyton.rubrum,M.canis,Tricophyton.mentgrophytes with average diameters zero and 100% inhibition at concentration (75mg/ml).while concentration(50mg/ml)the inhibitory effect (33.2,64.16,12.5)% respectively for each fungi T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes with inhibition percentage(12,3.3,4.1)% respectively at concentration (5mg/ml),while inhibitory effect at(0.5mg/ml) concentration was (0.8,27.9,3.3)% Cold alcohol extract showed inhibitory effect of fungi T.rubrum,T.mentgrophytes,M.canis,and the average diameters of fungal colonies (zero)and(100)% inhibitory at (75mg/ml) concentration ,respectively at (30mg/ml) concentration ,as well as (3mg/ml) concentration appear inhibitory effect (50,68.4,65.6)% respectively ,and the percentage of inhibitory reach (45.6,52.6,57.4)% at(0.3mg/ml) concentration .Hot aqueous extract showed lowest efficiency against T.rubrum,M.canis. T.mentgrophytes, with in hibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (75mg/ml)concentration the inhibitory effect (3.1,0.1.2)% respectively ,as well as the inhibitory effect (12.2,0,19.3)% of all fungi at (0.75mg/ml)concentration.Hot alcohol extract showed lowest efficiency against (T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes),with inhibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (40mg/ml)concentration the inhibitory effect (62.5 ,53.6, 28)% respectively ,as well as the inhibitory effect (44, 51, 24.6)% of all fungi at (4mg/ml)concentration and the inhibitory effect (43.4,32.6,22.6)of all fungi at (0.4 mg/ml) According to these results the cold aqueous extracts of Fig plants have been diagnosed to examine their effectiveness (In vivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes infection in rabbets

دراسة اصطباغ المادة الوراثية للنطف وعلاقتها بعقم الرجال العراقيين == Study of Chromatin Staining of Sperms among Infertile Iraqi Men

Author name: ماجد حميد جعفر الدباغ
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف الدراسة الحالية الى تقييم سلامة المادة الوراثية للنطف لكل من الرجال السليمين والعقيمين وذلك من خلال استعمال الفحصين Acridine orange (AO.) وAniline blue (AB.) ، ومن ثم تقييم العلاقة بين متغيرات السائل المنوي مع كل من الفحصين السابقين اعلاه.تم فحص السائل المنوي ل (39) من الذكور السليمين ومتوسط اعمارهم (33.61± 5.23 ) سنة في حين كان عدد الذكور العقيمين الذين تم اجراء فحص السائل المنوي لهم هو(111 ) وكان متوسط اعمارهم ( 44.121 ± 6.708 ) سنة. كذلك اجري فحص (AO test ) لكل من الذكور السليمين والعقيمين من اجل معرفة سلامة المادة الوراثية للنطف. فيما بعد اجري فحص (AB test ) لكل من الرجال السليمين والعقيمين لقياس مدى تكثيف المادة الوراثية (Chromatin condensation ) التي تحصل اثناء تكوين الحيامن في الخصى والمهمة في المحافظة على سلامة المادة الوراثية. تم تقسيم المرضى العقيمين الى سبع مجاميع ، تتضمن مرضى قليلي النطف(oligozoospermia;O.) عددهم 12 ومرضى ذوي نطف قليلة العدد وشاذة(oligoteratozoospermia; OT.) عددهم 10 ومرضى يعانون من قلة عدد النطف وبطيئة الحركة وشاذة (oligoasthenoteratozoospermia; OAT.)عددهم 18 ومرضى يعانون من بطئ في حركة النطف(asthenozoospermia; A.) عددهم 6 ومرضى لديهم النطف بطيئة الحركة وشكل شاذ (asthenoteratozoospermia; AT.)عددهم 17 ومرضى نطفهم فقط شاذة الشكل(teratozoospermia; T.) عددهم 22 واخيرا مجموعة مرضى العقم غيرالمشخص وعددهم 26 . اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود فرق معنوي ( P< 0.05 ) بين الضرر في (DNA ) في نطف المرضى العقيمين مقارنة بالذكور السليمين باستعمال فحص (AO test )،في حين لم يسجل اي فرق معنوي بين مجموعتي الذكورالخصبين والعقيمين باستعمال فحص (AB test ). كذلك اظهرت نتائج الدراسة علاقة سالبة(r = - 0.575 ; P= 0.050), بين (AO test ) ومستويات الاس الهيدروجيني pH للسائل المنوي في مجموعة المرضى قليلي النطف(O) ، وكذلك ( r = - 0.500 ; P = 0.034) في مجموعة المرضى الذين يملكون نطف قليلة وبطيئة الحركة وشاذة المظهر(OAT). كذلك اظهرت مجموعة المرضى قليلي النطف علاقة سالبة ( r = - 0.634 ; P = 0.027)بين فحص (AO test) وكل من نشاط النطف (sperm activity) الصنف (A) وكذلك ظهرت علاقة سالبة ( r = - 0.684 ; P = 0.014) مع وقت التميع للسائل المنوي (semen liquefaction time). بالمقابل ظهرت علاقة سالبة قوية بين فحص ( AB test ) والنسبة المئوية لعدد النطف (r = - 0.840 ; P = 0.037) وكذلك مع النسبة المئوية للشكل المظهري الطبيعي للنطف( r = - 0.875 ; P = 0.022) في مجموعة المرضى ذوي نطف بطيئة الحركة . من ناحية اخرى النتائج اظهرت ان نسبة الضررفي المادة الوراثية لفحص (AO test ) كانت اكبر من نسبة فحص (AB test ). وبينما لوحظت علاقة موجبة بين الفحصين ( AO ,AB ) لاغلب مجاميع العقم السابقة فانه لم يسجل وجود فروق معنوية بين الفحصين (AO , AB ) لجميع مجاميع العقم. من النتائج التي ظهرت في هذه الدراسة نجد ان فحص السائل المنوي كان غير كافيا لتحديد خصوبة الرجل من عدمها بمعزل عن فحص المادة الوراثية والتي اظهرت كفاءتها في تحديد سلامة DNA النطف ، واخيرا فان الدراسة الحالية اظهرت ان فحص ( ( AO هو اكثر دقة من فحص (AB ) في التعرف على الضررالحاصل للمادة الوراثية. | The aim of this study was to evaluate the sperm DNA integrity for fertile men and infertile patients by using acridine orange (AO) test and aniline blue (AB) test, then to assess correlation between semen parameters with both AO test and AB test. Also to study the correlation between results of AO test and of AB test.Seminal fluid analysis was performed for thirty nine fertile men with average age (33.61 ± 5.23) years, and one hundred eleven infertile patients with average age (40.121 ± 6.708) years. The AO test was performed also for fertile and infertile men, then the chromatin condensation was measured by using AB test for fertile and infertile men. Infertile patients were divided into seven groups included Oligozoospermia (O.)=12, Oligoteratozoospermia (OT.)=10, Oligoasthenoteratozoospermia (OAT.)=18, Athenozoospermia (A.)=6, Asthenoteratozoospermia (AT.)=17, Teratozoospermia (T.)=22 and Unexplained infertility group=26. The results of the present study showed a significant (P< 0.05) difference in DNA fragmentation percent between fertile and infertile men by using AO test, but no significant difference (P>0.05) assessed by using AB test between both fertile and infertile men. Also a negative correlation was recorded between AO test and pH in oligozoospermia group (r = - 0.575; P= 0.050), and oligoasthenoteratozoospermia group ( r = - 0.500 ; P = 0.034). There was a good negative correlation assessed between AO test and grade (A) for sperm activity ( r = - 0.634 ; P = 0.027) , and liquefaction time ( r = - 0.684 ; P = 0.014) in oligozoospermia group. On the other hand, a strong negative correlation was noticed between AB test and sperm concentration (r = - 0.840 ; P = 0.037), and sperm morphology percentage ( r = - 0.875 ; P = 0.022) in asthenozoospermia group. Furthermore, results of DNA fragmentation percentage using AO test was higher than those using AB test with no significant difference. While there was a positive correlation between AO test and AB test in most of infertility groups, but no significant difference was assessed between the percentage of AO test and AB test in all infertility groups. From the results of this study, it was concluded that the seminal fluid analysis was not enough to obtain the fertility potential, and the sperm DNA integrity test was essential to detect DNA fragmentation in fertility clinics and laboratories. Both AO and AB test were easy and not expensive to perform for integrity test. Finally, AO test was more accurate test to detect abnormality of sperm DNA than AB test.

دراسة مناعية لمستضدات الدم وعلاقتها بسرطان الثدي القنوي في عينة من النساء العراقيات == Immunological study on blood antigens and their relationship with ductal breast cancer in a sample of Iraqi women.

Author name: ليث باسم علي الحسيني
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تكمن اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع الامراض السرطانية وقد اكدت الدراسات المتعلقة بسرطان الثدي على دور مجموعتي ABO وMNS ، اضافة الى ان مجموعة الدم Lewis تلعب دورا اساسيا كجزيئات مرتبطة بالسرطان Cancer associated molecules جمعت 100 عينة دم من مريضات سرطان الثدي القنوي Ductal breast carcinoma ومثلها لنساء صحيحات مقاربة بالعمر للمقارنة.اهتمت الدراسة في ايجاد تردد مجاميع الدم ABOو Lewis وMNS وLutheran للمريضات والصحيحات ،اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية وتكوين المعقدات المناعية في مريضات السرطان وعلاقة ذلك بمجاميع الدم المختلفة. نمطت مجاميع الدم المختلفة باستعمال كشف التلازن الدموي Hemagglutination test كما استعمل فحص انخفاض العيارية للمصل كمعيار لتكوين المعقدات المناعية اضافة لاستعمال تثبيط تكوين المعقدات المناعية بالمستضد الحر كدليل على انفتاح المعقدات المناعية. واستعمال كشف تثبيط التلازن لدراسة نوعية الاضداد المعنية في هذه الدراسة. اظهرت نتائج العينة المدروسة عدم وجود فروق معنوية لصنفي الدم O وA في المريضات مقارنة بالصحيحات, بينما كانت نسبة صنف الدمB منخفضة في المريضات حيث بلغت 10% مقارنة بنسبة 24% للصحيحات وكانت النتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.001) ، في حين ابدت مجموعة دم Lewis في المريضات ترددا مغايرا عن تلك التي في الصحيحات, فقد بلغ تردد مجموعة دم Le( a - b+) %40 عند المريضات مقارنة بنسبة تردد %55 في الصحيحات وكان التحليل الاحصائي مشير الى معنوية هذا الفرق p<0.05)) ،اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b - )فلم تعطي فرقا معنويا فكانت %29 في المريضات مقارنة بنسبة %31 للصحيحات ، كما اظهرت مجموعة دم Le (a - b - ) نسبة بلغت %23 في المريضات مقارنة بنسبة %10عند الصحيحات اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b+) فكانت 8%و4% في المريضات والصحيحات على التوالي وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.005). فيما يتعلق بدور المجموعة MNS فقد اتضح من الدراسة ان المجموعة MN كانت الاكثر ازديادا اذ بلغت نسبة ترددها في المريضات %77 مقارنة مع %57 في الصحيحات(p<0.001). اما نسبة تردد النمط الوراثي Lu(a - b - )لمجموعة الدمLutheran فقد كانت عالية اذ بلغت 31% في المريضات, و7% في الصحيحات(p<0.001), بينما كانت نسبة تردد النمط الوراثي Lu (a - b+) منخفضة في المريضات اذ كانت 65% بينما كانت 82% في الصحيحات(p<0.001).اظهرت نتائج العينة المدروسة استجابة مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSوLutheran حيث كانت مجموعتي الدم AوO اكثر المجاميع اعطائا لعيارية ضادة لمستضد او مستضدات كريات دم البقر فقد بلغت 2.9 ± 8.9 و0.9 ± 7.4 للمريضات على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 0.9 ±5.0 و0.7±6.5 لمجموعتي الدم AوO للصحيحات على التوالي .(P<0.05) اما مجموعة الدم Lewis فقد لوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Le(a - b+) كانت الاعلى اذ بلغت 8.5 ± 2.0 في المريضات و5.7 ± 0.7 في الصحيحات (P<0.05). وقد بلغ معدل عيارية النمط الوراثي MM 7.3±1.8 للمريضات مقارنة بعيارية 5.1±1.3 للصحيحات ( (P<0.05وكان الاعلى بين العيارية الموجبة للانماط الوراثية الاخرى لمجموعة الدم MNS. ولوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Lu(a - b+) الاعلى حيث بلغ 7.4 ± 1.2 في المريضات وكان معدل تلك العيارية 5.8 ± 0.7 في الصحيحات ( (P<0.01. سجلت نتائج العينة المدروسة تكون المعقدات المناعية Immune complexes في مصول مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSو Lutheran من خلال انخفاض في معايير الاضداد الضادة لكريات دم الابقار بعد تكوين المعقدات المناعية. ابدى 54 نموذجا للمريضات و37 نموذجا للصحيحات انخفاض في معايير الاضداد بعد تكوين المعقدات المناعية فقد كانت النسبة المئوية للمريضات المكونة للمعقدات 83.0% وكانت العيارية 7.1 ± 0.8 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات % 63.0بمعدل عيارية 5.5 ± 0.6 قبل تكوين المعقدات المناعية ((P<0.01، اما بعد تكوين المعقدات المناعية اصبحت النسبة المئوية للمريضات 65.1% بمعدل عيارية 2.9 ± 0.4 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات 58.7% بمعدل عيارية 3.0 ± 0.5 واشارت نتائج التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية بين النسبتين.تشير نتائج الدراسة الحالية الى ان هنالك ترابط بين وجود الجزيئات المسؤولة عن مجاميع الدم ووجود سرطان الثدي القنوي اذ حدد هذا الترابط اعتمادا على تلازم المرض مع المجموعة واختلافه في الصحيحات.اشارت نتائج الدراسة الحالية الى القابلية الكبيرة لمريضات سرطان الثدي القنوي على تكوين المعقدات المناعية وحددت بعض معالم نوعية الاضداد الداخلة في تلك المعقدات. سجلت هذه الدراسة ظاهرة انقلاب الصنف (من مجموعة الدم B الى AB) لاول مرة.تمت مناقشة نتائج الدراسة في ضوء النتائج المتوافرة في الابحاث العلمية ذات الصلة . | Blood groups antigens are important molecules their phenotypic expression are associated with various type of diseases as well as cancer, especially, Blood groups ABO, Lewis, MNS and Lutheran. The present study dealt with the frequency distribution of these molecules patients of ducted breast cancer and matched healthy Iraqi women. In addition the immune response toward red blood corpuscles antigen(s) and immune complexes formation were investigated.Different type of blood groups were typed by using direct hemagglutination tests, tube and Anti - human globulin test. The occurrence of immune complexes were detected using a lowered hemagglutinin titers befor and after incubating sera at room temperature and 4C. in addition, The specificity of immune complexed immunoglobulin was analyzed using free saliva antigens and hemagglutination inhibition.The results showed the followings.There no significant differences in the frequency distribution of A and O and blood groups in patient and healthy control, However Blood group B frequency was 10% in patient vs. 24% in controls (p<0,001) .On the other hand however Lea - b+ blood group approach a frequency of 40 % in patients vs 55% in controls (p<0.05).The difference of frequency of Lea+b - in patients and controls was not significant . Lea - b - Lewis blood group gave a frequency distribution of 23% in patients compared to 10% in controls (p<0.05) .In the MNSs blood group, The phenotype MN gave a highly significant frequency distribution 77% in patients vs 57% in controls (p<0.001) .In Lutheran blood group Lu a - b - showed a 31% frequency distribution in patients vs 7% in controls ( p<0.001). Various blood groups type patients demonstrated an elevated anti - bovine antibody immune response,Blood group A and O patient showed elevated mean titers .The titers in patients more 8.9±2.9 and 7.4±0.9 respectively compared to a controls mean atiters of 5±0.9 and 6.5 ±0.7 respectively . Among lewis blood groups ,the mean titer of Lea - b+ was the highest. It was8.5±2.0 in patients vs 5.7±0.7 in healthy controls (p<0.05). Likewise ,MM blood type gave a mean titer of 7.3±1.8 vs 5.1 ±1.3 in the controls (p<0.05) . The study provide the information of immune complexes (Ics) in patient and control sera . The percentage of sera giving immune complexes was 83% in patients vs 63% in controls. The respective titers after immune complexes formation were 7.1±0.8 in patients vs 5.5±0.6 in controls before (Ics) formation that rendered the titer to 2.9±0.4 in patients and 0.3±0.5 in controls after Ics formation . This study revealed a status of blood group B conversion to AB. In conclusion, the present study indicated that there were association between blood groups molecule and ductal breast cancer . The result are discussed bared on the available data on ductal breast cancer as related to blood groups molecule

تاثير مبيدي القوارض فوسفايد الزنك والراكومين في افراج الدجاج العراقي المحلي Gallus domesticus == The effects of Rodenticides Znic Phosphide and Racumin in a young Iraqi local chickens Gallus domesticus

Author name: لؤي عبد الامير ناجي العامري
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | حسين عبد المنعم داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة التعرف على تاثير مبيدي القوارضRodenticides فوسفايد الزنك Zinc Phosphide والراكومين Racumin في افراخ الدجاج العراقي المحليGallus domesticus بعد تعريضهم تجريبيا للمبيدين المذكورين ولعدم وجود دراسة مشابهة اخرى تتناول هذا الموضوع الحيوي، فقد درست اهم الجوانب التي تتعلق بتاثير هذين المبيدين على الافراخ، وشملت الدراسة المعايير التالية : 1. قياس الجرعة المميتة الوسطية Median Lethal Dose (LD50) بلغت قيمة الجرعة المميتة الوسطية (19.3) ملغم/كغم بالنسبة لمبيد فوسفايد الزنك مما يوضح السمية العالية لهذا المبيد، في حين بلغت قيمتها (309) ملغم/كغم بالنسبة لمبيد الراكومين وهذا يوضح السمية المعتدلة لهذا المبيد.2. التغيرات السلوكية Behavioural Changes لوحظ على الافراخ الخاضعة للتجربة تغيرات سلوكية ازدادت شدتها بزيادة فترة التعرض لمبيد فوسفايد الزنك وتمثلت باعراض الاعتلال العصبي والخمول Depression وانخفاض الشهيةAnorexia وانتفاخ الحوصلة فضلا عن الاسهال الاخضر اللونGreen diarrhea، في حين كانت اعراض التعرض المزمن لمبيد الراكومين هي نزف خارجي وداخلي رافقه اورام دموية Haematomus نتج عنها عرج Lameness او كبر حجم الراس او انتفاخ احد العينين وازرقاق Cyanosis المنطقة المحيطة بها واختلاجات عصبية Convulsions فضلا عن الاسهال الابيض اللون White diarrhea. 3. التغيرات المرضية العيانية Gross Pathological Changes تمثلت التغيرات المرضية العيانية بعد التعرض المزمن لمبيد فوسفايد الزنك في كل من الكبد والكلية باحتقان Congestion ونزف Hemorrhage وتغير لوني مع شحوب واضح في الحواف وزيادة نسبية في الحجم وانخفاض وزني ازداد معنويا بزيادة فترة التعرض فضلا عن انخفاض وزن الجسم العام، اما التعرض المزمن لمبيد الراكومين فاظهر ضمور Atrophy واصفرار Yellowish وانخفاض وزني معنوي شديد في كل من الكبد والكلية فضلا عن انخفاض وزن الجسم العام.4. الدراسة النسجية والنسجية المرضية Histological and Histopathological Study اوضح التعرض المزمن لمبيد فوسفايد الزنك في كل من الكبد والكلية حصول احتقان ونزف وزيادة سمك المحفظة وارتشاح وانتشار عدة بؤر للخلايا الالتهابية Infiltration and foci of inflammatory cells ترافق هذا مع تغيرات تنكسية Degeneration changes وتكاثر القنوات الصفراوية Proliferation of bile duct (بالنسبة للكبد) وبداية تليف Fibrosis ووجود واضح لحبيبات الهيموسدرين Hemosiderin granules فضلا عن انسلاخ Separation او اختفاء Disappearance جزئي او كامل للخلايا الظهارية المبطنة للنبيبات الكلوية وانكماش العديد من الكبيبات Shrinkage of glomeruli مسببة توسع الحيز المحفظي Enalrgement of capsular space، اما التعرض المزمن لمبيد الراكومين فاظهر حالة نقص الاوكسجين Hypoxia في كل من الكبد والكلية مسببة موت وتدمير واسع للخلايا مع فقدان البنية الخلوية Loss of cytoarchitecture (بالنسبة للكبد) فضلا عن اختفاء الخلايا الظهارية المبطنة للعديد من النبيبات مع غشائها القاعدي احيانا او وجودها بشكل ركام تالف ضمن تجويف نبيب الكلية وانكماش العديد من الكبيبات او اختفائها التام وبالتالي توسع الحيز المحفظي. | The present study aimed to examine the effects of two rodenticides; highly toxic Zinc Phosphide and moderately toxic Racumin in young Iraqi local chickens Gallus domesticus. Therefore the study was involved the following parameters with their results : I. Median Lethal Dose (LD50) The (LD50) value for Zinc Phosphide was (19.3) mg/kg, whereas for Racumin was (309) mg/kg. The results revealed that Zinc Phosphide was highly toxic rodenticide while the Racumin was moderately toxic rodenticide.II. Behavioural Changes The behavioural changes mainfested by young chickens were treated with Zinc Phosphide for two successive periods (45 & 75) days indicated that the intensity of abnormal behaviour increases with the progressive time. The symptoms were nerves breakdown, depression, anorexia, crop swelling, in addition to a green diarrhea. The symptoms of prolong exposure (35) day to Racumin were characterized by hemorrhage, haematomus that result in lameness or head enlargement or swelling of one of the eyes with cyanosis in the area around. Moreover there was some periodical convulsions with white diarrhea.III. Gross Pathological Changes The gross pathological changes after prolonged exposure to Zinc Phosphide in young chickens represented by congestion, hemorrhage, color changes with margins pale and increasing of the size of both the liver and kidney. The weight of two organs was reduced beside to decrease the total body weight. While the gross pathological changes after prolonged exposure to Racumin were characterized by atrophy, yellowish beside to decrease the weight of liver, kidney and total body weight.IV. Histological and Histopathological Study The histological study revealed some histopathological changes in the liver and kidney. These were represented by congestion, hemorrhage, increasing in the thickness of capsule, infiltration and spreading of many foci of inflammatory cells, degeneration changes, proliferation of bile ducts (to liver), fibrosis, appearance hemosiderin granules beside to separation or partial disappearance of lining epithelial cells of the renal tubules and shrinkage of many glomeruli cause to increase the capsular space. Regarding the prolong exposure of young chickens to Racumin resulted in a hypoxia of both the liver and kidney cause to death and destruction of many cells, loss of cytoarchitecture (to liver), disappearance of the lining epithelial cells of the renal tubules sometimes with basement membrane and shrinkage of many glomeruli or disappearance it cause to increase the capsular space.

تقييم بعض المؤشرات الفسلجية والوراثية عند النساء العراقيات المصابات بمتلازمة تكيس المبايض == Assessment of physiological and genetic markers in some Iraqi women with polycystic ovarian syndrome

Author name: لـنا نزار عبد الرزاق
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | رياض محمد المشاط
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تدرج متلازمة تكيس المبايض ضمن اضطرابات الغدد الصماء المعقدة والاكثر شيوعا التي تؤثر على النساء في سن الانجاب والتي تتميز بالعقم ,الشعرانية, ونمو الحويصلات الغير طبيعي ,وزيادة انتاج الاندروجين من المبيض.اشتملت الدراسة على جزاين .ضم الجزء الاول دراسة الخصائص السريرية والهرمونية والبايوكيمائية في حين ضم الجزء الثاني دراسة التغايرات الوراثية للجينات ذات الصلة بمتلازمة تكيس المبايض .تم جمع عينات الدم من 50 امراة عراقية مشخصة بمتلازمة تكيس المبايض (تراوحت اعمارهن 18 - 40سنة) و25 امراة سليمة من مستشفى كمال السامرائي / بغداد للفترة المحصورة بين شهر ايلول ولغاية كانون الاول - 2013. قسمت النساء المشخصات كمرضى بمتلازمة تكيس المبايض الى مجموعتين وفقا للانماط الظاهرية المختلفة من متلازمة تكيس المبايض على النحو التالي : 1. 25 نمط ظاهري شديد2. 25 نمط ظاهري معتدلواظهرت النتائج وجود فروق معنوية في الاعراض السريرية للنمط الظاهري الشديد لمتلازمة تكيس المبايض مقارنة مع النمط الظاهري المعتدل وعينات السيطرة، كاضطراب الدورة الشهرية ( قلة الطمث 24% وندرة الطمث (76%، وكانت الشعرانية موجودة بنسبة84 ٪ والسمنة المفرطة حيث كانت قيمة مؤشر كتلة الجسم (BMI ≥ 35kg/m2) 36٪, في حين لم تكن هناك فروق ذات دلالة احصائية (P> 0.05) لكل من حب الشباب، الشواك الاسود وزواج الاقارب.كما واظهرت النتائج وجود ارتفاع ملحوظ في مستويات الهرمون المحرض للاباضة LH، نسبة الهرمون المحرض للاباضة/ الهرمون المحفز للحويصلات LH / FSH والهرمون الذكري (Testesterone) ايضا في النمط الظاهري الشديد من متلازمة تكيس المبايض اعلى بكثير مقارنة مع النمط الظاهري المعتدل والنساء السليمات في حين كان الارتفاع بنسب اقل لمستوى الهرمونات في النمط الظاهري المعتدل من متلازمة تكيس المبايض مقارنة بمجموعة النساء السليمات, في حين لم تظهر فروق معنوية لمستويات كل من الهرمون المحفز للحويصلات FSH وهرمون الحليب PRL والهرمون المحفز للغدة الدرقية TSH بين مجموعتي المرضى ومجموعة السيطرة.اظهر قياس مستويات الكولسترول ,الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة (LDL) والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا (VLDL) في النمط الظاهري الشديد والمعتدل من متلازمة تكيس المبايض ارتفاعا معنويا مقارنة بالنساء السليمات، في حين كانت نسب البروتين الدهني عالي الكثافة (HDL) مرتفعة في النساء السليمات مقارنة مع النمطين الظاهريين المختلفين من متلازمة تكيس المبايض.في الجزء الثاني من الدراسة، تم استخدام PCR - RFLP وتحليل التتابع المباشر للكشف عن العلاقة بين اثنين من الجينات التي يعتقد لها صلة بمتلازمة تكيس المبايضLHR) وCYP3A5 على التوالي) فقد تم دراسة احدى الطفرات الجديدة(rs6199631) والتي تقع في الاكسون الاخير من جين LHRباستخدام تقنية PCR - RFLP واظهرت النتائج عدم وجود اختلافات ذات فوارق معنوية بين مجموعة المرضى والنساء السليمات حيث ساد النمط الوراثي الخالي من الطفرة وهذا قد يؤكد ثبات هذا التتابع لدى النساء في المجتمع العراقي, في حين اظهرت نتائج تحليل التتابع المباشر وجود طفرة جديدة في الموقع 12084ضمن الانترون الثالث من الجينCYP3A5 وبتردد عالي (%53.3) في النمط الظاهري الشديد في حين كانت ذات تردد منخفض في النمط الظاهري المعتدل (8.3%) ولم يكشف عن وجودها في النساء السليمات.واخيرا بينت الدراسة ان النساء المشخصات بمتلازمة تكيس المبايض تقترن باضطراب هرموني وخلل في استقلاب الدهون كما ويكون للعوامل الجينية تاثير على الاصابة بالمرض. | Polycystic ovary syndrome (PCOS) is the most common, complex, endocrine disorder affecting women in their reproductive years, and is characterized by infertility, hirsutism, abnormal follicular development, and increased ovarian androgen production. The present study was carried out in two parts. The first part comprises clinical, hormonal, and biochemical characteristics and the second part is based on molecular genetic alterations associated with those PCOS.Blood samples of 50 Iraqi women with polycystic ovary syndrome (age ranged 18 - 40 years) and 25 healthy women were collected from Kamal Al - Samarrai Hospital/ Baghdad. Samples were collected from September 2013to December, 2013. Then, the women who have PCOS were divided into 2 groups according to the different phenotypes of polycystic ovary syndrome as follows : 1.25 Severe phenotype.2.25 Mild phenotype.The results showed big differences of the clinical features in severe phenotype of PCOS compared to the mild phenotype and control, such as menstrual cycle problems (oligomenorrhea and amenorrhea) were seen in 24% and 76% respectively , hirsutism was present in 84% and severe obesity (BMI ≥35kg/m2) was found in 36%. There was no significant differences (P>0.05) in two different phenotypes of PCOS (severe and mild) compared to control women for acne, acanthosis nigricans and inter - family marriages.The mean serum LH levels, LH/FSH ratio and also testosterone in severe phenotype of PCOS were significantly higher when compared to mild phenotype and control women. Slightly rising of that hormones levels were noticed to be in mild phenotype of PCOS than that of control group. No significant differences have been noticed in the mean level of FSH, PRL and TSH among the two patient groups and the controls. Cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein (LDL) and very low density lipoprotein (VLDL) levels in severe and mild phenotype of PCOS women were higher when compared to control women, while high density lipoprotein (HDL) in control women were high compared to two different phenotypes of PCOS. In second part of the study, polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and direct sequencing were used to detect the relationship of the two gene candidate (luteinizing hormone receptor (LHR) and CYP3A5 respectively) and PCOS risk. The new SNP rs61996318 on LHR shows no significant differences between patients and control group, which indicate the highly conservative sequence in Iraqi women. A new SNP locate at 12084 within the third intron of the CYP3A5 gene was detected in high frequency (53.3%) in severe phenotype PCOS whereas it found in low frequency in mild phenotype (8.3%) and absent in control group. Finally, the results demonstrate hormonal disorder, lipid disturbance and genetic defect in polycystic ovarian syndrome (PCOS) female.

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

Author name: لمى قاسم علي الطائي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة تاثير مستخلصات نباتي البربين Portulaca oleracea والاشنان Seidlitzia rosmarinus على بكتريا Escherichia coli ، Staphylococcus aureus وخميرة Candida albicans المعزولة من المصابين باخماج المجاري البولية == Study the effect of Portulaca oleracea and Seidlitzia rosmarinus extracts on Escherichia coli ,Staphylococcus aureus and Candida albicans that isolated from urinary tract infection patients

Author name: لقاء جميل ابراهيم الجنابي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي البربينportulaca oleracea والاشنان Seidlitzia rosmarinus في نمو البكتريا Staphylococcus aureus وEsherichia coli وخميرة Candida albicans المعزولة من المصابين باخماج المجاري البولية،وذلك باستخدام طريقة الحفر بالاكار لاختبار فعالية المستخلصات ضد البكتريا والخميرة ، ولقد اختلفت نتائج دراسة الفعالية التثبيطية للمستخلصات باختلاف نوع المستخلص نفسه وتركيزه ، ونوع الكائن المجهري. وكانت بكتريا Staph. aureus الموجبة لصبغة كرام اكثرها تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع E. coli السالبة لصبغة كرام ومع خميرة C. albicans . تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل المستخلصات ، وقد بينت نتائج الكشوفات الكيميائية لها ان المستخلص المائي الحار والبارد لنبات البربين يحتوي على قلويدات,تربينات , تانينات , فلافونات وصابونيات. بينما احتوى المستخلص الكحولي البارد والحارعلى قلويدات، تربينات ، تانينات، فلافونات، راتنجات، صابونيات وكومارينات وبلاضافة الى ذلك يحتوي المستخلص الكحولي الحار على الزيوت الطيارة. اظهرت النتائج احتواء المستخلص المائي البارد والحار لنبات الاشنان على القلويدات , فينولات, كلايكوسيدات, تانينات, فلافونات وصابونيات ويحتوي المستخلص المائي البارد بالاضافة الى ما ذكر على التربينات والراتنجات. اما المستخلص الكحولي البارد والحار لنبات الاشنان فيحتوي على فينولات , كلايكوسيدات , تانينات , فلافونات , راتنجات، كومارينات والزيوت الطيارة، ويحتوي المستخلص الكحولي البارد بالاضافة الى ما ذكر على الصابونيات ، والكحولي الحار على القلويدات. وقد قيس pH المستخلصات جميعها وكانت النتائج كالاتي : لنبات البربين المائي الحار 6.6 ، المائي البارد 6.8 ، الكحولي الحار 4.8 والكحولي البارد 5.1. اما لنبات الاشنان فكانت المائي الحار 6.1 ، المائي البارد 6.1 ، الكحولي الحار 4.4 والكحولي البارد 5.4 . بالنسبة الى مستخلصات نبات البربين فقد كان المستخلص الكحولي الحار هو الافضل معنويا بتاثيره في البكتريا والخميرة مقارنة بالمستخلص الكحولي البارد والمستخلص المائي البارد والحار عندما بلغ قطر منطقة التثبيط (17.33)ملم عند عند التركيز 1000ملغم/مل مقارنة ب (13.44 ، 5.44 ، 16.11) للمستخلص المائي البارد والحار والمستخلص الكحولي البارد على التوالي عند التركيز نفسه. وعند مقارنة تاثير التراكيز المختلفة لمستخلص نبات البربين في Staph. aureus اتضح عدم وجود فروق معنوية عند مستوى احتمالية(0.05) للتراكيز (100,800,600) ملغم/مل في تاثيرها على العزلات،فكان التركيز600 ملغم/مل هو اعلى تركيز مثبط للعزلات المختبرة.اما E.coli, C. albicans كان التركيز 1000 ملغم/مل اعلى تركيز مثبط لهما، وكانت بكتريا Staph.aureus الاكثر حساسية لفعل جميع مستخلصات نبات البربين وفي جميع التراكيز المدروسة. اما بالنسبة الى مستخلصات نبات الاشنان فقد كان المستخلص الكحولي الحار هو ايضا الاكثر تاثيرا معنويا في البكتريا والخميرة مقارنة بالمستخلصات الاخرى وفي التراكيز المدروسة جميعها اذ سجل 12.66 ملم في التركيز1000 ملغم/مل. وعند مقارنة تاثير التراكيز المختلفة لمستخلصات نبات الاشنان في albicans ,E.coli , Staph.aureus. C تبين ان التركيز 1000 ملغم/مل لايفرق معنويا عن التركيز 800 ملغم/مل فبذلك يكون التركيز 800ملغم/مل هو اعلى تركيز مثبط للعزلات المختبرة،وكانت بكتريا Staph.aureus الاكثر حساسية لفعل جميع مستخلصات نبات الاشنان وفي جميع التراكيز المدروسة. عند اجراء مقارنة احصائية بين نتائج نباتي البربين والاشنان وجد ان نبات البربين هو الاكثر فعالية في تثبيط العزلات المدروسة،وبينت النتائج ان المستخلص المائي الحار والكحولي الحار لايفرقان معنويا عن بعض للنباتين،وكذلك معدلات اقطار التثبيط للتركيز 200 ملغم/مل لايوجد بينهما فروق معنوية للنباتين،وفعالية النباتين في تثبيط خميرة albicans C. كانت غير معنوية. | This study was done to find the effect of water and alcoholic extracts of Portulaca oleracea and Seidlitza rosmarinus on the growth of Staphylococcus aureus , E. coli and Candida albicans , which isolated from patients suffering from Urinary Tract Infections , by using .well diffusion method. To examin the effect of the plant extracts against bacteria and yeast.The results were different according to type , concentration of plant extracts and type of microorganism.The gram positive Staph.aureus was the most sensitive bacteria for plant extracts in comparison with E.coli and C.albicans.The results of chemical test of the active compounds showed that the hot and cold water extracts of P.oleracea contained , alkaloides , terpens, tannins , flavonoids and saponins , while the hot and cold alcoholic extract contain , alkaloids , terpens , tannins , flavonoids , resins, saponins and coumarins with volatile oils in hot alcoholic extracts.The results of cold and hot water extracts of S.rosmarinus showed the extract contained , alkaloida , glycosides , tannins , flavonides , saponins and phenols. In addition to that the cold water extract contained terpens and resins. The cold and hot alcoholic extracts of S.rosmarinus contained , phenols , glycosides , tannins , flavonoides , resins , coumarins and volatile oils , in addition the cold alcoholic extract contained saponins; while the hot alcoholic contained alkaloids. The pH of the all extracts were measured and the results were as followed : - The hot water extract of P.oleracea 6.6 , cold water extract 6.8 , hot alcoholic extract was 4.8 and cold alcoholic extract was 5.1 . The cold water extract of S.rosmarinus was 6.6 , cold water extract was 6.1 ,hot alcoholic extract 4.4 and cold alcoholic 5.4 . Antimicrobial effect of hot alcoholic extract of P.oleracea was more effective against bacteria and yeast than cold and hot water extracts and cold alcoholic extracts . When the inhibition zone diameter reached 17.33 mm at concentration 1000 mg /ml of hot alcoholic extract , while the inhibition zone diameter was (13.44 , 5.44 , and 16.11 ) mm for cold and hot water extract and cold alcoholic extract respectively at the same concentration . In the comparison with the effect of different concentrations for P.oleracea extract against S. aureus there is no significant difference at (p< 0.05) for the concentrations (600 , 800 , 1000) mg/ml on it’s effect of the tested microorganisms . The 600 mg/ml concentration was the highest one in its inhibition of tested microorganisms . The 1000 mg/ml concentration was the highest inhibitor for C.albicans and E.coli . S.aureus was the most sensetive microorganism for all extracts effects of S.rosmarinus in different concentrations.On the other hand the hot alcoholic extract of S.rosmarinus was the most significant effects in bacteria and yeast . In comparison with the other extracts in all studied concentrations , which have been recorded 12.66 mm in the 1000 mg/ml.In the study of the effect of different concentrations of S.rosmarinus extract , S.aureus , E.coli and C.albicans , it seemed that there is no significant difference between 1000 mg/ml and 800 mg/ml . So the 800 mg/ml concentration was the highest inhibitor for tested microorganisms . S.aureus was the most sensitive for all S.rosmarinus extractions in all studied concentrations.Statistical comparison were done between the results of P.oleracea and S.rosmarinus showed that P.oleracea was the highest effect of inhibition of studied microorganisms , and the results showed non significant difference between hot water and hot alcoholic extracts for the tow plants , also there is no significant difference between these plants on the inhibition zone diameter 200 mg/ml.And the inhibition effect of the two plants not significant on C.albicans

دراسة مناعية ومايكروبايولوجية لمرضى الربو == IMMUNOLOGICAL AND MICROBIOLOGICAL STUDY FOR ASTHMATIC PATIENTS

Author name: كريم شحل جياد الطائي
Supervisor name: كريم شحل جياد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الربو اضطرابا التهابيا مزمنا في المسالك الهوائية وانه مرض متعدد الاسباب تلعب المحفزات غير الارجية اضافة للعوامل الارجية دورا فيه . ان الدراسة الحالية تمحورت بشكل اساسي حول الربو الارجي (Allergic asthma) والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1 - من اجل البحث في العلاقة بين الابواغ الفطرية المحمولة في الهواء والمظاهر السريرية لمرضى الربو العراقيين فقد اجريت دراسة كمية ونوعية للفطريات داخل وخارج المنازل (Indoor and Outdoor) باستخدام طريقة الاطباق المفتوحة وذلك خلال الفترة من كانون الثاني 2001 لغاية كانون الاول 2002. اظهرت النتائج ان كثافة الابواغ الفطرية تتباين تبعا للمواسم والظروف المناخية وان شيوع هذه الفطريات كان داخل وخارج المنازل وفق التسلسل التالي : Aspergillus nigar , Penicillium , Aspergillus flavous , Caldosporium Alternaria . اجريت تقيما لدور هذه الفطريات في حث امراض الارجية لدى 116 من مرضى الربو 50 من الاناث و66 من الذكور تراوحت اعمارهم بين 70 - 5 سنة وكذلك 45 فردا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة وذلك باستخدام اختبار وخز الجلد (Skin prick test) ، وقد ابدى غالبية المرضى فعالية جلدية لخلاصة خليط الفطريات MM1 وMM2 وMM3 وMM4 وMM5 كما لوحظت علاقة ايجابية بين وجود هذه الفطريات داخل وخارج منازل مرضى الربو وبين مدى استجابتهم اليها . تبين من خلال قياس مستوى الضد IgE النوعي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) ان اضداد الفطريات Penicillium ، Aspergillus ، Alternaria كانت الاكثر تكرارا 2 - من اجل الغاء المزيد من الضوء حول دور الاخماج البكتيرية والتي من شانها ان تفاقم نوبات الربو ، فقد اجريت عملية زرع القشع لـ 68 مريضا من مرضى الربو تم خلالها عزل 6 انواع من البكتريا كانت Strepto pneumoniae اكثرها تكرارا (%35.2) تليها بكتريا Staph aureus بنسبة (%30.9) وبكتريا H. influenza بنسبة (%7.3) واخيرا بكتريا Strepto pyogenes وStaph epidermidis وN. cattarrhalis وبنسبة (%4.4) لكل منهما. عزلت (9) عزلات من خميرة C. albicans من اولئك المرضى والذين ابدوا تفاعلات جلدية موجبة باستخدام خلاصات هذه الخميرة . ومن خلال اجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية للعزلات ابدت غالبية تلك العزلات حساسية عالية لمضادات Ciprofloxacin وAugmentin وCefatoxime كما ابدت العديد منها مقاومة لمضادات Ampicillin وCloxacillin وTetracycline وErythromycin .3 - ولالقاء الضوء على الحالة المناعية لمرضى الربو تم تحديد مستويات الاضداد IgA وIgG وIgM واجزاء المتمم C3 وC4 في امصالهم باستخدام طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (Single Radial Immunodiffusion=SRID) ومستويات الضد IgE الكلي بتقنية ELISA تبين من خلالها ، بان متوسط مستويات الضد IgG والضد IgA قد انخفضت معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة مع مجموعة السيطرة وان متوسط مستوى جزء المتمم C3 قد ارتفع معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة بمستواه لدى افراد السيطرة في الوقت الذي لم يحصل تغير جوهري في مستويات الضد IgM والجزء C4 من مكونات المتمم من جراء الاصابة بالربو. فيما يتعلق بتقدير مستويات الضد IgE الكلي فقد اظهرت النتائج ان هنالك ارتفاعا معنويا في مستويات هذا الضد لدى مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة وان هنالك اختلافا معنويا في مستوياته بين كلا الجنسين من مرضى الربو. اوضحت الدراسة كذلك ان هنالك فروقا في تفاعل التلازن الخاص بالبروتين الفعال - C والذي كان اكثر ايجابية لدى مرضى الربو وعلى الاخص منهم اولئك الذين يرافق اصابتهم بالربو الخمج البكتيري ومنها Strepto. pneumoniae بشكل خاص . تبين من خلال العد التفريقي لخلايا الدم البيض ان هنالك ارتفاعا معنويا في اعداد خلايا الدم الحمضة في مرضى الربو بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . ومن ناحية اخرى فقد لوحظت علاقة معنوية بين الارتفاع في اعداد هذه الخلايا ولارتفاع في مستويات الضد IgE وكذلك مع فعالية الجلد التي يبديها مرضى الربو. تم تقدير الفعالية الحجمية لانزيم (ADA) في امصال مرضى الربو باستخدام الطريقة الانزيمية ، لوحظ من خلالها ارتفاعا معنويا في فعاليته لدى هؤلاء المرضى وعلى الاخص لدى الاناث مقارنة بالذكور .4 - باستخدام تقنية الامتصاص الذري اللهبي لتحديد مستويات العناصر Fe وZn وCu وتقنية الامتصاص الذري اللالهبي لتحديد مستويات Se وMg هذا وقد لوحظت ان هنالك انخفاضا في مستويات العناصر Fe وCu وMg وSe وارتفاعا معنويا في مستوى عنصر Zn في امصال مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة | Asthma is a chronic inflammatory disorder of the airways. Its aetiology is multifactorial , in which non - allergic triggers and allergic factors have role to play. The present study is concerned mainly with allergic asthma, and the results can be summarized as the following : 1 - To investigate the relationship between air spora and the clinical expression of asthma in Iraqi patients, a quantitative and qualitative study of indoor and outdoor airborn fungi was carried out during the period January 2001 - December 2002 . The results revealed that the spore density depends on seasonal and climatic changes. The common observed genera, arranged according to their density, were/Aspergillus nigar, Penicillium, Aspergillus flavous, Alternaria, and Cladosporium . The role of the majority of such fungi in induction of allergy was evaluated in 116 asthmatic patients (66 males and 50 females) with an age range 5 - 70 years, in addition to 45 apparently healthy individuals as a control group, by using skin prick test. The highest proportion of those patients (89.7%) showed skin reactivity to the allergen HDM , followed by MMI (75.0%), HD (63.8%), MM2 (48.3%), MM3 (19.8%) and MM5 (16.8%) . Also a positive correlation was observed between the occurrence of these fungi (inside and outside the houses of those patients) and their responsiveness . Measuring serum specific IgE using ELISA technique revealed that the most frequent specific IgE was for Penicillium , Aspergillus and Alternaria. 2 - To provide further insight about the role of bacterial infection that deteriorate asthma attack, sputum cultures were done for 68 patients with asthma . Six bacterial species were isolated, in which Strepto. pneumoniae showed the highest percentage (35.2%), followed by Staph. aureus (30.9%), H. influenza (7.3%), Strepto. pyogenes, staph. epidermidis and N. cattarnhalis (4.4%) for each. Also, nine isolates of Candida albicans were isolated from those patients, to which a skin test response was highly positive among them. Antibiotic sensitivity was done for the bacterial isolates. The majority of those isolates revealed high sensitivity to the antibiotics ciprofloxacin, augmentin and cefatoxime, while, they were resistant to ampicillin, cloxacillin, tetracycline, and erythromycin. 3 - To shed some light on the immune status of patients with asthma the total level of serum immunoglobulins (IgA, IgG, and IgM) and complement components (C3 and C4) were evaluated by using single Radial Immunodiffusion assay (SRID). Serum level of total IgE was also evaluated, but by ELISA technique. The results showed that the mean serum levels of IgG and IgA were significantly decreased in patients with asthma as compared to controls while C3 level showed a significant increase. However, the mean serum level of IgM and C4 showed no much deviation due to asthma. With ranged to the evaluation of total IgE level, the result revealed a significant elevation in the level of this immunoglobulin in sera of patients in comparison to healthy individually. Additionally a significant difference in the levels of total IgE was augmented between both sexes of patients. There was some differences in the degree of positive its of agglutination reaction for the factor C.R.P., such reaction was more positive in patients with asthma, especially those with bacterial infections with special regard to Strepto. pneumonia. Differential count of while blood cells illustrated that eosinophils were significantly higher in patients with asthma compared to the control group . On the other hand a significant correlation was noted between the elevation of eosinophil count and the elevated level of IgE antibody and skin reactivity of asthmatic patients. Volume activity of adenosine deaminase enzyme in serum of asthmatic patients revealed a significant increased activity in the patients especially the females compared to males.4 - Trace elements (Fe, Cu, and Zn) assessment was carried out by flame atomic absorption and the more sensitive flameless atomic absorption (Se and Mg) . A significant decrease in Fe, Cu, Se ad Mg, and a significant increase in Zn were clearly observed in asthmatic patients as compared with control group.

دراسة مناعية وبكتريولوجية لمرض روماتزم المفاصل الرثياني لدى النساء الكرديات == Immunological and Bacteriological Study of Rheumatoid Arthritis in Kurdish Women

Author name: فيان محمد صالح
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية اذ اكدت الدراسات على دور مجموعتي الدم ABO وLewis في هذه الامراض ، وبما ان مجموعة الدم Lewis تلعب دورا اساسيا في الالتصاق الخلوي Cell adhesion فقد ركزت الدراسة الحالية في جانب تنميط مجاميع الدم على مدى تكرار هذه المجاميع في مريضات التهاب المفاصل الرثياني مقارنة بالسليمات ، اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في المريضات وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع الدم المختلفة . كانت عينات المريضات 50 عينة ومثلها للسليمات للمقارنة ،تم تقصي انماط مجموعة الدم ABO وانماط مجموعة الدم Lewis. اظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي في نسب مجموعة الدم ABO في المريضات مقارنة بالسليمات اذ كانت النتائج غير معنوية ، في حين ابدت مجموعة دم Lewis في المريضات تكرارا مغايرا مقارنة بالسليمات فقد ازداد تكرار مجموعة دم Le( a+ b - ) عند المريضات حيث بلغ (%56) مقارنة بنسبة تكرار (%14) في السليمات (X2=38.77,P=4.77×10 - 10)،في حين كانت مجموعة دم Le (a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها الى (%8) في المريضات مقارنة بنسبة تكرار السليمات (%70) (X2=80.8,P=2.5×10 - 19)، ان الارتفاع في نسب مجموعتي الدم Le (a+ b - ) وLe (a+b+)كان له علاقة بحالة الافراز وعدمها لدى المريضات.اما ما يخص الدراسات المصلية فقد كانت نتائج فحص تلازن اللاتكس RF وبروتين سي الفعال ومعدل ترسيب كريات الدم الحمركلها ايجابية مع الاختلاف في النسب بين المريضات ، اما الفحوصات المناعية فقد اشارت النتائج بالنسبة لاختبار التحري عن وجود المستضد (H) في لعاب المريضات والسليمات ذوات صنف دم لويس Le.a الى وجود هذا المستضد في صنف الدم هذا حيث كانت نسبة امتلاك هذا المستضد عند المريضات 58% والسليمات 50% , وايضا اجري اختبار لتحديد مستوى المستضد (H) في لعاب المريضات والسليمات من صنف دم لويس Le.b وLe.a+b+ اذ بينت النتائج الى قلة منسوب النتاج الجينيﻟ (Se.gene) لديهن وكانت النتائج كالاتي : معدل العيارية للمريضات لصنف دم Le.b (44±57.5) وللسليمات (86.85±40.11) اما المريضات ذوات صنف Le.a+b+ فقد سجلوا عيارية (5.7±11.7) والسليمات (32±0.00) هذه النتائج تدل على معنوية الفروق بين المريضات والسليمات من صنف Le.a+b+ . اكد اختبار تقدير عيارية الاضداد الضادة لكريات الدم الحمر لدى المريضات والسليمات الى ان مصول مريضات التهاب المفاصل الرثياني ابدت استجابة مناعية تجاه مستضدات كريات دم الصنف OLe. للانسان. استخدم كشف الاقتران المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) في تقدير الاضداد الضادة للعابين(الميوسين) نمط (Le.a,Le.b,Le,a - b - ) في مصول المريضات والسليمات(تخفيف المصل 1 : 128 ) حيث ابدت استجابة مناعيه ضد اللعابين وسجلت قراءات عالية المعنوية بين المريضات والسليمات. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | The importance of antigen of blood groups emerged as molecules associated with autoimmune diseases, where studies have confirmed the role of the two sets of blood ABO and Lewis in these diseases, and as the blood group Lewis plays an essential role in the adhesion has focused the present study on the side of the standardization of blood groups on how frequently these totals in rheumatoid arthritis patients compared to control, either side of the immune system study has touched on the presence of the immune response in the patients and the relationship of those responding totals different blood.Samples of the patients were 50 samples and the same for probable comparison. The results showed a lack of significant difference in the proportions set of ABO blood in the patients compared to control because the results were insignificant, while expressed blood group Lewis in the patients again different from those in healthy. An increased frequency of blood group Le (a + b - ) in patients was (56%) compared with (14%)frequency in healthy(control), while the blood group Le (a - b+) group resistant to the disease its frequency was (8%) in patients compared with healthy control (70%).The results indicate for the screening test for the presence of antigen (H) in the saliva of the patients and control of( Le.a) was(58%) in patients and (50%) in control. The result of serological tests(RF,CRP and ESR) were all positive.The level of antigen (H) in the saliva of the patients and control class of blood Lewis ( Le.b) and (Le.a + b +) was : Le.b patients (44 ± 57.5) compared to control (86.85 ± 40.11) patients of ( Le.a + b +) has registered titer (5.7 ± 11.7) and (32 ± 0.00) in control Anti - OLe.a blood group titer antibodies demonstrated insignificant rise of titers in patients sera compared to control. The results of anti - mucin titer to mucin pattern (Le.a, Le.b, Le. a - b - ) in the sera of patients and control were very significant.The abnormal frequency distribution of Lewis blood groups molecules in patients compared to healthy control,the low level of H - gene productin patients versus controls and the highly significant rise in anti - salivary mucin autoantibodies first time reported here indicate the probable important anociation of these multifactorial factors in the etiopathogenesis of Rheumatoid Arthritis.

دراسة لبعض الهرمونات الجنسية لدى الاشخاص المصابين بداء المقوسات الكوندية المراجعين لبعض مستشفيات بغداد == Study of some sexual hormones in infected humans with Toxoplasmosis attenuated in some Baghdad hospitals

Author name: فرح محمود شتيب ابراهيم الوائلي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد داء المقوسات احد الامراض الوبائية الذي ينتشر على نطاق واسع جدا في جميع انحاء العالم. سببه هو الاصابة بطفيلي التوكسوبلازما Toxoplasma gondiiويساعد في انتشاره الظروف المناخية والجغرافية والعادات الاجتماعية والثقافية والغذائية. وقد اجريت هذه الدراسة على 130 امراة (حوامل ومجهضات) مصابات بداء المقوسات واللاتي يعانين من حالات الاجهاض او بدونه. وقد وجد ان 90 مريضة من اللواتي تم احالتهن من قبل الاخصائي لمستشفى فاطمة الزهراء (عليها السلام) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة ضد داء المقوسات, و90 رجل مصاب بداء المقوسات من المركز الوطني لنقل الدم وقد تراوحت اعمارالاشخاص بين 15 - 45 سنة في الفترة من ديسمبر 2014 الى مارس 2015 وبالتوازي مع ذلك، تم اختيار 60 امراة و30 رجل سليمين كمجموعة سيطرة. وقداظهرت النتائج ان نسبة الاصابة بهذا الطفيلي للنساء والرجال كانت 69.23% و66.67% على التوالي باستخدام طريقة فحص التلازن test Agglutination وطريقة الاليزا ELISA . ودلت النتائج على ان مجموعة الخطر الكبيرة من النساء الحوامل المصابات بداء المقوسات تتراوح اعمارهن بين 21 - 30 سنة اذ شكلت (61.54٪) من الحالات. واظهرت النتائج ان نسبة الاجهاض وفقا لعدد مرات الاسقاطات للنساء الحوامل قيد الدراسة بلغت (61.54٪) من عدد النساء الحوامل اللاتي اجهضن مرة واحدة او اثنتين. وقد كان تركيز الضد المناعي IgG مرتفع معنويا (0.05 >P), حيث كان بمتوسط (4.02 ± 0.39) عند الرجال و(8.50 ± 0.41) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة الصحية حيث كانت عند الرجال (0.343 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.418 ± 0.03)، في حين تراكيز الضد المناعي IgM سجلت ارتفاعا غير مهم وكانت بمستوى (0.603 ± 0.07) عند الرجال و(0.540 ± 0.08 ) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة حيث كان عند الرجال (0.151 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.325 ± 0.03). وتمت دراسة تراكيز العديد من الهرمونات في مصل مثل (testosterone, Estradiol, Progesterone, Prolactin, Follicle Stimulating Hormone and Luteinizing Hormone). وكانت نتائج هذه التجارب تكشفت عن وجود فرق معنوي (0.05 >P) في مستوى الاستراديول في النساء المصابات (المجهضات والحوامل) (43.62 ± 7.12 نانوغرام / مل) ( 682.11 ± 12.23نانو غرام/مل)، وفرق غير معنوي في الرجال المصابين (501.32 ± 82.09 نانوغرام / مل) وانخفاض معنوي (0.05 >P) في مستوى هرمون البروجسترون في النساء المصابات المجهضات والحوامل (3.12 ± 2.33 نانوغرام / مل) (7.81 ± 1.52 نانو غرام/ مل) و(5.51 ± 1.25 نانوغرام / مل) في الرجال المصابين بالمقارنة مع السيطرة للنساء (3.81± 3.22 نانو غرام/ مل) (10.72±2.23 نانو غرام/ مل) وللرجال (4.01 ± 0.02). ومع ذلك، فقد لوحظ عدم وجود فروق معنوية كبيرة في مستوى البرولاكتين حيث سجلت انخفاضا كبيرا في المرضى المصابين من النساء والرجال مقارنة بالمجموعة الضابطة. واظهرت النتائج ان مستويات هرمون تستوستيرون ليست ذات دلالة احصائية مسجلة بين مجموعتي النساء والرجال. واظهرت النتائج عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية في تركيز مستويات هرمون FSH للنساء والرجال المصابين. وكذلك في مستوى هرمون LH في النساء المصابات والرجال المصابين. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widely all over the world. The cause of it is the infection by the parasite Toxoplasma gondii. Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition. The present study was conducted on 130 women infected with toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 90 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite. And 90 men infected by toxoplasmosis from National Blood Transfusion Center ranging in ages between 15 - 45 years for the period from December 2014 to March 2015. Parallel to that, 60 healthy women and 30 healthy men were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infections by the parasite for women and men were 69.23% and 66.67% respectively using Agglutination and ELISA methods. The results indicated the great risk group of pregnant women with toxoplasmosis at the age between 21 - 30 year was (61.54%) of cases. The results showed that the rate of abortion, according to the projection of the number of times women were pregnant as a percentage (61.54%) of those who aborted once or twice. The concentrations of IgG were significantly elevated (P<0.05), the levels were (4.02 ± 0.39 IU /ml) in men and (8.50 ± 0.41 IU /ml) in woman, compared to a healthy control group where it was in men (0.343 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.418 ± 0.03 IU /ml), while the concentrations of IgM registered no significant elevated the levels were (0.603 ± 0.07 IU /ml) in men and (0.540 ± 0.08 IU /ml) in women, comparison to a healthy control group where it was in men (0.151 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.325 ± 0.03 IU /ml). The serum concentrations of several hormones were studied such as (Testosterone, Estradiol, progesterone, Prolactin, Follicle stimulating hormone and Luteinizing hormone). The results of these trials revealed a significant (p<0.05) increase in level of Estradiol hormone in women (aborted and women) (43.62±7.12 ng/ml) (682.11±12.23 ng/ml) and non - significant for infected men (501.32 ± 82.09 ng/ml) and a significant (p< 0.05) decline in progesterone level in infected women aborted and pregnant (3.12 ± 2.33ng/ml) (7.81±1.52 ng/ml) and (5.51 ± 1.25 ng/ml) for infected men when compared with control for women (3.81± 3.22 ng/ ml) (10.72±2.23 ng/ ml) and for men (4.01± 0.02 ng/ml). However, no significant differences were noticed in the level of prolactin where it registered significant decrease in infected patients in women and men comparison to control subjects. And the results showed that testosterone levels have no statistical significance registered between the two group's women and men. The results showed the absence of significant differences in the concentration of FSH hormone level among infected women and infected men. As well as in the level of LH hormone in infected women and infected men

دراسة مقاومة بكتريا Enterococcus faecalis المسببة لالتهابات المجاري البولية لبعض المضادات الحيوية وانتاجها لانزيمات ? - Lactamase == Study The Resistance of Enterococcus Faecalis that caused Urinary Tract Infection to some Antibiotics & its Production for ? - Lactamase Enzymes"

Author name: فاطمة صبيح علي السعدي
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم التحري عن وجود بكتريا Enterococcus faecalis في (389) عينة ادرار جمعت من مرضى مصابين باخماج القناة البولية ، ومن مختلف الفئات العمرية ، وللمدة ما بين (اب2005 - ) الى (كانون الثاني2006 - ) ، اذ اعتمدت الصفات الزرعية للمستعمرات والمجهرية لخلايا البكتريا ، والاختبارات الكيموحيوية (Biochemical tests) ، والتشخيص المصلي بطريقة لانسفيلد ، والتشخيص بعدة (API - 20 strep) ، وامكن تشخيص (27) عزلة تابعة لهذا النوع و(3) عزلات من النوعfaecium Enterococcus. اجري فحص الحساسية لعزلات E.faecalis المدروسة باستخدام (24) مضادا حيويا، وقد اظهرت العزلات مقاومة متعددة تجاه المضادات الحيوية ما بين (18 - 15) مضادا حيويا, وكانت جميع العزلات مقاومة وبنسبة (%100) لاربعة عشر مضادا حيويا، في حين كانت حساسة بنسبة (%100) تجاه البعض الاخر،كما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعشرة مضادات حيوية ، واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في قيمها. تم اختبار قابلية العزلات المدروسة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز بطريقة اليود القياسية السريعة وطريقة النايتروسفين ، واظهرت النتائج عدم مقدرة هذه العزلات على انتاج انزيم البيتالاكتاميز . تم الكشف عن قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز (Protease) وانزيم اللايبيز (Lipase) والبكتريوسين ((Bacteriocin وقدرتها على التلازن الدموي (Haemagglutination) ، واظهرت النتائج ان (26 عزلة) وبنسبة (% 96.3) كانت منتجة للبروتييز ، و(7عـزلات) (% 26.0)للانواع المنتجة لللايبيز ، و(23عزلة) (% 85.2) للانواع المنتجة للبكتريوسين ، فيما لم تظهر اي عزلة من العزلات المدروسة القدرة على التلازن الدموي . اظهرت العزلات المدروسة قابلية على الالتصاق بالخلايا الطلائية للمجاري البولية للانسان، وقد تباينت العزلات في قيم معدلات الالتصاق ما بين (78.0 - 22.10) بكتريا/خلية ، كما اجري اختبار تثبيط الالتصاق البكتيري في (4) عزلات منتخبة ذات معدل التصاق (52.6 و56.4 و77.5 و78.0 ) بكتريا/خلية باستخدام التركيز تحت المثبط الادنى وما تحته لاربعة مضادات حيوية بعد تنمية العزلات في وسط حاوي على تلك التراكيز ومقارنة ذلك بمعدل التصاق نفس العزلات المنماة في نفس الوسط الخالي من اي تركيز للمضادات الحيوية المستخدمة في الاختبار ، وقد اظهرت نتائج التحليل الاحصائي فرقا معنويا بين معدلات الالتصاق للعزلات المدروسة بوجود وعدم وجود تلك التراكيز من المضادات الحيوية المستعملة . اظهرت النتائج قابلية عزلتين وبنسبة (%7.4) على انتاج انزيم الهيمولايسن وكان التحلل من نوع بيتا (β - haemolysis)، كما اظهرت هاتين العزلتين القابلية على انتاج السايتولايسين والذي هو عبارة عن (هيمولايسين - بيتا/البكتريوسين) ، كما تم دراسة تاثير تركيز تحت المثبط الادنى لمضادي Nitrofurantoin وCiprofloxacin على انتاج الهيمولايسين الخام للعزلتين المنتجة (7و14) ، عن طريق حساب الفعالية النوعية للهيمولايسين الخام قبل وبعد التعرض لتلك التراكيز، اذ بلغت الفعالية النوعية للهيمولايسين الخام قبل التعرض للمضاد الحيوي للعزلتين (7و14) حوالي (1.6 و8.3) وحدة تحلل/مكغم على التوالي ، واظهرت النتائج ان هنالك تاثيرا مثبطا كبيرا لتلك التراكيز المستخدمة من المضادات الحيوية على انتاج الهيمولايسين الخام . | To detection Enterococcus faecalis in (389) urine samples were collected from urinary tract infection patients from all the ages during the period of (August 2005) till (January 2006) . Detection depending on cultural & microscobial characteristics of bacterial cell & Biochemical tests & Serological diagnosis by Lancefield method & Diagnosis by (Api - 20 strept ) was done to find (27) isolates of this species & (3) isolates of the species Enterococcus faecium. The antibiotic sensitivity test was done by using (24) antibiotics, the isolates showed multiresistant against (15 - 18) antibiotics. All the isolates were resistant by (100 %) against (14) antibiotics , while the isolates were sensitive by (100 %) against other antibiotics, also the minimum inhibitory concentration for ten antibiotics was studied, & the results showed an obvious different between their values . The ability of the isolates for βeta - Lactamase enzymes production was studied by standard rapid iodometric method & by nitrocefin method .The results showed the disability of these isolates for βeta - Lactamase enzymes production. To detection of the isolates ability of production of protease enzyme ,lipase enzyme ,bacteriocin, the ability of haemagglutination .The results showed that (26 isolate) (96.3 %) were protease producer , & (7 isolates) (26.0 %) were lipase producer, & (23 isolate) (85.2 %) were bacteriocin producer , while none of isolates under the study showed the ability of haemagglutination.The isolates showed the ability of adherence to the uroepithelial cells of humans urinary tracts .The isolates showed different adherence rates between (22.10 - 78.0) bacteria/cell .The inhibition of bacterial adherence was studied for four selected isolates which were their adherence rates were (52.6,56.4,77.5,78.0) bacteria/cell by using the minimum inhibition concentration & below it for four antibiotics after the isolates were cultured in a medium containing these concentration & comparing this with the adherence rates of the same isolates in the same medium but empity of any of antibiotics concentration that were used in the test. The Statistical analysis showed a significant difference between the adherence rates for the studied isolates in the presence & absence of these concentrations of the antibiotics in this study. The results showed the ability of two isolates (7.4 %) of enzyme hemolysin production & the hemolysis was from the Beta type (β - hemolysis) & those two isolates showed the ability of cytolysin production which is (hemolysin - βeta/bacteriocin). The effect of the below minimum inhibition concentration of Nitrofurantoin & Ciprofloxacin on the production of crude hemolysin of the two producer isolates (7 & 14) by calculating the specific activity for crude hemolysin before & after exposure to these concentrations. The specific activity for crude hemolysin before exposure to the antibiotics for the two isolates (7 & 14) about (1.6 & 8.3) hemolytic unit/mg respectively .The results showed that there was inhibitory effect of the used concentrations of antibiotics on production of cr

تاثير المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين Ficus carica domestica وقشرة الرمان Punica granatum على بعض الاحياء المجهرية المعزولة من الجروح والحروق == THE EFFECT OF HOT WATER & COLD ALCOHOL EXTRACTS OF FIG FRUITS Ficus carica domestica & PERICARP OF POMEGRANATES FRUITS Punica granatum ON SOME MICRO ORGANISM ISOLATED FROM WOUNDS & BURNS

Author name: عمر موفق انور العلي
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف هذه الدراسة هو الاختبار التجريبي لتاثيرات المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين وغلاف ثمرة الرمان على نمو ثلاثة انواع من البكتيريا المصاحبة للحروق والجروح الجلدية . خمسون من المسحات جمعت من مرضى مستشفى الواسطي التعليمي الذين تعرضوا لحوادث الحروق والجروح وللمدة من 20 كانون الاول 2005 ولغاية 18\3\2006 اتبعت الطرائق التصنيفية لتحديد اهم الانواع المتواجدة . جمعت النماذج النباتية لثمرة التين وقشرة ثمرة الرمان من السوق واجريت عليها طرائق الاستخلاص بالماء الحار والكحول البارد للحصول على مادة مركزة والذي خفف الى تراكيز (250,200,150,100,50) ملغم\مل . وبموجب الطرائق المذكورة انفا وباستعمال طريقة الاقراص الورقية تم الحصول على النتائج الاتية : - اولا : - اظهرت طرائق التشخيص للنماذج ان البكتيريا الموجبة لصبغة غرام Staphylococcus aureus كانت البكتيريا اكثر تواجدا في النماذج ( %50) تبعتها النوعان الاخران Pseudomonas aeruginosa , Escherichia coli واللذان يمثلان نسبة (%30) من النماذج . ثانيا : - اجري الكشف على المركبات الموجودة في النماذج النباتية المستخدمة وبين الكشف احتواء المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين على الكلايكوسيدات فقط بينما مستخلصات قشرة ثمرة الرمان احتوت على عدد من النواتج الثانوية هي القلويدات والكلايكوسيدات والفلافونويدات والفينولات ولا تحتوي على التربينات والستيرويدات والصابونيات .ثالثا : - كانت التاثيرات التي اظهرتها مستخلصات الماء الحار والكحول البارد لغلاف ثمرة الرمان على تثبيط نمو اقطار الانواع البكتيرية الثلاث واضحــــــــــة . اذ ان اختزال اقطار النمو كانت بمدى ( 11 - 13 ) ملم عند التركيز 50ملغم\مل ازدادت الى (16 - 18) ملم عند التركيز 250ملغم \مل بالنسبة الى النوعين Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa بينما الاختزال في اقطار نمو Escherichia coli كان حوالي (%60) مقارنة مع النوعين الاخرين . اختزال النمو بالنسبة الى الانواع البكتيرية الثلاث التي كانت تحت تاثير تراكيز مختلفة من المستخلصات المائية الحارة والكحولية الباردة لثمرة التين كان معدوما او ضعيفا كما في معاملة الاستخلاص الكحولي التي طبقت على ( S.aureus وP.aeruginosa) حيث بلغ ( 1 ) ملم عند التركيز 50 ملغم\مل وازدادت الى ( 2 ) ملم عند التركيز 250 ملغم\مل . واخيرا اظهرت نتائج الاختزال باستعمال المستخلصين ( المائي الحار والكحولي البارد) بالنسبه لنباتي ( التين والرمان ) عدم وجود فروق معنوية مؤثرة على (Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa). | The aim of this study was to investigate experimentaly the effects of hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit and pericarp of Pomegranate on growth of three skin and burn wound pathogenic bacteria . Fifty swab samples were collected from patients exposed to accidental wounds and burn from hospital for a period extending between 20 th December 2005 to 18 th March 2006 .Bacterial identification methods are followed to determine most common ones . Also plant samples ( Fig fruit and pericarp of Pomegranate) were collected from local market . The hot water and cold alcohol extraction were obtained as a stock solution then diluted into a range of conc.( 50,100,150,200,250) mg/ml .According to the above mentioned methodology and by using disc paper method it was possible to obtain the following results : - First : - Identification methods showed that gram - positive bacteria Staphylococcus aureus was the most present bacteria in the samples (50%) followed by the other two common bacetira Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli which represent about one - third of the bacetira present in the samples .Second : - The hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit contain only glycosides . While extracts of Pomegranate contain a number of secondary metabolites such as : ( alkaloids, glycosides, flavonoids, phenols but no terpens , steroids, saponins and resins were detected .Third : - The effects of hot water and cold alcohol of pericarp of pomegranate fruit extraction on growth inhibition of the three bacetira under investigation were obvious. Growth diameters reductions were ranging between (11 - 13) mm at conc. (50) mg/ml and increased to the range of ( 16 - 18 ) mm at conc. (250) mg/ml for both Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa .While diameter reduction of Escherichia coli growth was about (60%)comparing with the other two species of bacteria .Growth diameter reductions of the three bacterial species exposed to different concentrations of hot water and cold alcohol extracts of Fig fruit showed a nil or weak results except for alcohol exract treatment applied to Staphylococcus aureus and Pseudomonas aerugionsa which were both exhibited a weak results of reduction (1)mm at (50) mg/ml concentration increased to (2)mm at (250) mg/ml . Finaly , the results of growth reduction by the two methods extraction (hot water and cold alcohol ) of the two plants ( Fig and Pomegranate) exhibited non - significant differences on (Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa).

تاثير جسيمات ثاني اوكسيد التيتانيوم 2TiO النانوية والميكروية على انبات ونمو بذور نباتي الحنطة والرز ومركباتها == Effect of titanium dioxide TiO2 nano and bulk particles on seeds germination and growth of wheat (Triticum aestivum L.) and rice (Oryza sativa L.)

Author name: علياء محسن يوسف
Supervisor name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

بيئة وحياتية سمكتي الكارب الكرسين Carassius carassius (L.1758) والخشني Liza abu (Heckel,1843) في ذراع الثرثار - دجلة ونهر دجلة == Ecology & Biology to Crucian Carp Carassius carassius L. and Khishni Liza abu (Heckel,1843) in Tharthar arm & Tigris River

Author name: علي عودة شاوردي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | عامر علي الشماع
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية اختيار اربع محطات اثنتين منها على ذراع الثرثار واثنتي على نهر دجلة لاجراء مقارنة عدد من العوامل البيئية مثل درجة الحرارة والاوكسجين الذائب وتركيز الاس الهيدروجيني والملوحة والشفافية واجراء مقارنة اخرى لكمية الهائمات النباتية والحيوانية واحياء القاع. فضلا عن دراسة حياتية نوعين من الاسماك هما سمكة الكارب الكرسين Carassius carassius L. والخشني Liza abu (Heckel,1843) والمتمثلة بدراسة العمر والنمو والتغذية والتكاثر في بيئتين مختلفتين هما ذراع الثرثار ونهر دجلة مع تشخيص لانواع الاسماك المتوافرة في نهر دجلة ضمن حدود مدينة بغداد.جمعت العينات ابتداء من شهر اذار 2004 وحتى كانون الثاني 2005 بالنسبة لدراسة العوامل البيئية وحياتية النوعين اعلاه وبواقع نموذج واحد لكل شهرين. تراوحت درجة حرارة المياه في منطقتي الدراسة بين 10م كادنى قيمة خلال شهر كانون الثاني و28م كاعلى قيمة لها خلال شهر تموز على الذراع واتخذت نمطا متشابها لها في الموقعين المدروسين وتراوحت قراءات قرص ساكي بين 28سم في خلال شهر ايلول في نهر دجلة و242سم خلال كانون الثاني على الذراع. كما تراوحت تراكيز الاوكسجين الذائب في الماء بين 6 ملغم/لتر خلال شهر تشرين الثاني على الذراع و10.8ملغم/لتر كحد اعلى في المحطة نفسها خلال ايار على الذراع ايضا. كما سجلت اعلى قيم الملوحة في الذراع) خلال اذار 2004 اذ بلغت قيمتها 1.422 غم /لتر. بينما سجلت ادنى مستوى لها على نهر دجلة خلال شهر تشرين الثاني اذ بلغت 0.480غم /لتر. وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني pH بين 6.6 في المحطة (4) على نهر دجلة خلال شهر كانون الثاني، و8.4 خلال شهر تشرين الثاني على ذراع الثرثار .واوضحت الدراسة ان التواجد السنوي للهائمات النباتية في ذراع الثرثار اقل منه في نهر دجلة، وسجلت الدايتومات Bacillariophyceae تواجدا عاليا مقارنة بصنوف الهائمات النباتية الاخرى مسجلة النسب 92.56%، 92.01%، 96.35% ، 95.45% في محطات الدراسة الاربع على التوالي. جاءت بعدها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. وسجلت الهائمات الحيوانية اعلى نسب تواجد لها في نهر دجلة مقارنة بالذراع وجاءت الدولابيات في المرتبة الاولى 91.65%، 86.65% في الذراع 91.87%، 89.42% في نهر دجلة تلتها مجدافية الاقدام. وسجلت احياء القاع اعلى تواجد لها في الذراع 336 فرد/م2 ، 286 فرد/م2 بينما سجلت 126 فرد/م2 ، و178 فرد/م2 في محطتي نهر دجلة على التوالي. تراوحت الاطوال الكلية لسمكة الكارب الكرسين على الذراع بين 7.0 - 27.5 سم واوزانها بين 5 - 300غم وفي نهر دجلة بين 7.5 - 23.25سم و65 - 210.5غم للاطوال والاوزان على التوالي. كما بينت الدراسة ان نمو سمكة الكارب الكرسين ليس قياسيا. وان نموها في الذراع ونهر دجلة كان لصالح الوزن ، اذ بلغت قيمة (b) في اسماك الذراع (3.62) و(3.40) لاسماك الذراع ونهر دجلة. اما سمكة الخشني فتراوحت اطوالها بين 8.0 - 17.9سم واوزانها بين 7.0 - 95.0غم في الذراع وبين 9.0 - 15.5 سم و8.5 - 55.5غم في نهر دجلة للطول والوزن الكلي على التوالي. وبينت الدراسة زيادة في نمو الاسماك باتجاه الزيادة في مكعب الطول على حساب الوزن. وان معدل نموها النسبي في ذراع الثرثار افضل حالا منه في نهر دجلة اذ كانت قيمة (b) لاسماك الخشني المصيدة في الذراع (2.90) وفي نهر دجلة (2.80). تراوحت شدة التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 10.83 و23.33 درجة/سمكة. ولسمكة الخشني بين 9.75 و25.71 درجة /سمكة. بينما تراوح نشاط التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 33.33% و100% ولسمكة الخشني 81.81% و100%، وان سمكة الكارب الكرسين قارتةOmnivorous وتميل بشكل كبير الى الغذاء النباتي الاصل وقد شكل الفتات العضوي الجزء الاكبر من غذائها في كلا الموقعين المدروسين تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة، ولم تختلف مفردات غذائها المتناول في كلا المسطحين المدروسين. كما بينت الدراسة ان سمكة الخشني هي قارتة ايضا Omnivorous تعتمد في غذائها على المصادر ذات الاصل النباتي وان الفتات العضوي هو المكون الرئيس في غذائها الذي حل بالمرتبة الاولى تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. ولم يحصل اختلاف في نوع غذاء هذه السمكة في موقعي الدراسة. وتبين الدراسة ان كلتا السمكتين المدروستين تتناولان غذاءهما من القاع او قريبا منه. اوضحت الدراسة ان نسبة الجنس لسمكة الكارب الكرسين في ذراع الثرثار2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 1.8 : 1 وان لهذا النوع قمة اطلاق واحدة تمتد من منتصف ايار ولغاية تموز وان التبويض فيها حصصي. وان خصوبة هذا النوع عالية وان البيئتين ملائمتان لتكاثر هذا النوع اما عن تكاثر سمكة الخشني فقد بلغت نسبة الجنس في الذراع 2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 2.11 : 1 وان لهذا النوع دورة تكاثرية متتابعة تستمر عاما كاملا ولها قمة اطلاق واحدة تمتد من شهر شباط ولغاية شهر اذار وان التبويض فيها حصصي وقد تصل الى ثلاث دفعات . وتمتاز بخصوبة عالية.

تاثير الكليبوسين المنقى جزئيا من البكتريا المعزولة محليا Klebsiella pneumoniae على بعض البكتريا المعوية وعلى بعض الخلايا المناعية == Effect of Klebocin partialy purified from bacteria Klebsiella pneumoniae Local Isolated on some enteric bacteria &on some immune cells

Author name: علي رزاق لفتة
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | عصام فاضل علوان الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 210 عينة سريرية توزعت الى 60 عينة ادرار و50 عينة قشع و50 عينة من التهابات الاذن الوسطى و50 عينة من اصابات الجروح ومن خلال نتائج الزرع البكتريولوجي على اوساط الماكونكي واكار الدم ووسط Eosin Methylen Blue , والتشخيص المظهري والكيموحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام Api20 تم الحصول على 42 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella توزعت الى 23 عزلة بنسبة 54.76% تعود للنوع K.pneumoniae و11 عزلة وبنسبة 26.19% للنوع K.oxytica و8 عزلات وبنسبة 19.05% تعود للنوع K.planticola ، لقد تم التحري عن العزلات المنتجة للكليبوسين ومن خلال تم التوصل الى ان 8 عزلات فقط كانت منتجة للكليبوسين من اصل 23 عزلة هذا وبنسبة 34.78% ، وكان وسط Tryptic soy broth المضاف اليه خلاصة الخميرة بنسبة1% افضل وسط لانتاج الكليبوسين وتعد طريقة اقراص الاكار ملائمة للتحري عن العزلات المنتجة للكيبوسين وطريقة التخطيط المتقاطع كفوءة للتحري عن العزلات الدالة . اختيرت العزلة المنتجة K. pneumoniae 8 كافضل عزلة منتجة للكليبوسين والعزلة K. pneumoniae 2 كافصل عزلة دالة ، تلاها استخلاص الكليبوسين من العزلة المنتجة بعد ان تم حث العزلة بالمايتوماسين سي فكانت فعالية 80 وحدة/مليلتر والفعالية النوعية 800 وحده/مليغرام بروتين . نقـي الكليبوسين المنتج من العزلة المنتخبة بخطوات عدة تضمنت التركيز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسب اشباع 70% وكحول البيوتانول بنسبة 1 : 1 فكان الترسيب بالبيوتانول افضل من الكبريتات الامونيوم اذ بلغت الفعالية 640 وحدة/مليلتر وبفعالية نوعية 2560 وحدة/مليغرام بروتين ثـم تقنيتي كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستعمال المبادل DEAE - Cellulosو الترشيح الهلامي علـى عمـود السيفاكريلS - 200 . وكانت عدد مرات التنقية للكليبوسين بمقدار 10 والحصيلة للكليبوسين المنقى 6%.تم دراسة تاثير الكليبوسين المنقى على بعض انواع البكتريا المعوية المقاومة للمضادات الحياتية والتي شملت : Enterobacter sakazaki Shigella flexneri, E.coli, Citrobacter koseri, , Enterobacter cloacae K.oxytoca, Proteus mirabilis Serratia marcescens, , Enterococcus fecalis Salmonella typhi واظهرت النتائج ان Enterococcus fecalis وCitrobacter koseri, وProteus mirabilis كانت مقاومة لتاثير الكليبوسين المنقى في حين بقية الانواع تاثرت وكان تركيز 100مايكروغرام/مليلتر اكثرفعالية من بقية التراكيز حيث بلغ قطرالتثبيط 20ملم تجاه النوع K.oxytoca تلاها E.coli بقطر 17ملم ثم Shigella flexneri بقطر 15ملم ثم Enterobacter sakazaki بقطر 15 ثم Salmonella typhi بقطر 14 ملم ثم Enterobacter cloacae بقطر 12ملم ثم Serratia marcescens بقطر 12ملم . استعملت تراكيز التالية 10 ، 30 ، 50 مايكروغرام/مليلتر في دراسة التاثير السمي للكليبوسين على بعض الخلايا المناعية من خلال ملاحظة عيوشية تلك الخلايا وقد تم توصل الى عدم وجود تاثير للكليبوسين بتركيز 10 مايكروغرام/مليلتر على شكل وحجم الخلايا PMNs وقدرتها على بلعمة خميرة الكانديدا المقتولة اذ اظهر التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية (0.05< P) مقارنة مع معامل السيطرة . بينما حفز التركيز نفسه قدرة PMNs على قتل الخميرة الحية في الزجاج ، مما يدل على ان الكليبوسين المنقى من K. pneumoniae 8 يعمل على تحفيز الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية . اما التراكيز العالية للكليبوسين المنقى من العزلة المحلية K. pneumoniae 8 فانها سببت تثبيطا ملحوظا لفعاليات الخلايا PMNs واللمفاوية التي اختيرت في هذه الدراسة. | The study has included collecting (210) clinical samples distributed into (60) urine samples, (50) sputum samples, (50) otitis media samples, and (50) wounds infections samples. Through results obtained from bacteriological culture on McConkey, blood, and eosin methylene blue agars in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20E system. Fourty tow Klebsiella isolates distributed into (23) K. pneumonia isolates that represent (54.76%), (11) K. oxytoca isolates that represent (26.19%), and (8) K. planticola isolates that represent (19.05%). Then, the klebocin - producing isolates have been detected and through which it is clear that only (8) isolates produce klebocin in (23) isolates, of percentage (34.78%). Tryptica soy broth medium with yeast extract additive in percentage of (1%) was the best medium for production of klebocin, agar discs method was the best method for klebocin - producing isolates detection, and cross - streaking method was the best method for indicating isolates detection. The producing isolate, K. pneumonia 8, and the indicating isolate, K. pneumonia 2, were chosen as the best producing and indicating isolates respectively. Next, the klebocin has extracted from the producing isolate after isolate induction by Mitomycin C; consequently, the activity was (80) unit/ml and the specific activity was (800) unit/mg of protein. The produced klebocin has been purified from selected isolates via several methods including precipitation utilizing ammonium sulfate in saturation percentage of (70%) and butanol alcohol; as a result, the butanol precipitation was better than that in ammonium sulfate so that the activity reached (640) unit/ml with specific activity of (2560) unit/mg of protein. Then, the second method was purification by ion exchange chromatography using exchanger (DEAE - Cellulose) and the third one was gel filtration over sefacryl S - 200 column. The times of purification of klebocin were (10) and the gain of purified klebocin was (6%). The purified klebocin effect has been studied on group of enterobacteria resisting for antibiotics including Acinetobacter, Escherichia coli, Shigella flexneri, Enterobacter sakazaki, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter cloacae, Citrobacter koseri, Salmonella typhi, Enterococcus faecalis, and Serratia marcescens. The results show that Enterococcus faecalis, Citrobacter koseri and Poteus mirabilis were resistant to the effect of the purified klebocin; however, all the remaining isolates affected. The concentration of (100) µg/ml has more activity than the remaining concentrations so that the inhibition diameter reached (20) mm in the species K. oxytoca, followed by E. coli with diameter of (17) mm, then Shigella flexneri with diameter (15) mm, then Enterobacter sakazaki with diameter (15) mm, followed by Salmonella typhi with diameter (14) mm, then Enterobacter cloacae with diameter (12) mm, followed by Serratia marcescens with diameter (12) mm. Of concentrations of (10, 30, 50) µg/ml, the toxic effect of klebocin on immune cells has been studied through viability of these cells; the study achieved that the klebocin in concentration of (10) µg/ml did not affect on the shape and size of phagocytic cells and its ability of phagocytosis of killed Candida yeast; so that, statistical analysis showed that there is no significant differences (P>0.05) comparing with control factor. However, the same concentration stimulate the macrophages ability of killing living yeast in vivo, which indicate that the purified klebocin from K. pneumonia 8 works on stimulating humeral and cellular immune response. Nevertheless, the high concentrations of purified klebocin from the local isolate, K. pneumonia 8, caused noticed inhibition to activities of macrophages and lymphocytes selected in this study.

بعض الجوانب المرضية للمصابين بالحمى غير معروفة الاسباب == CERTAIN PATHOLOGICAL ASPECTS ON FEVER OF UNKNOWN ORIGIN PATIENTS

Author name: علي جبار عليوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على ثلاث مجاميع مختلفة، كانت المجموعة الاولى بعدد 59 مريض بالحمى غير محددة الاسباب (FUO) والمجموعة الثانية بعدد 20 مريض بحمى مشخصة (febrile) والتي اعتبرت لمعاملات سيطرة للمجموعة الاولى، اما المجموعة الثالثة بعدد 20 شخص، كانوا اصحاء ظاهريا وتمثل مجموعة السيطرة للدراسة.تمت المتابعة واخذ العينات من المرضى والعمل عليها في مستشفى الكاظمية التعليمي، بغداد.لقد عانى مرضى FUO من اعراض مالوفة مثل الحمى المستمرة والمتقطعة، الصداع، الم الصدر، الم المفاصل، نقصان الوزن وضعف عام وفقدان الشهية وغيرها، وعلامات مرضية منها الم في الضغط على البطن، وتضخم الطحال، واليرقان، وتورم الساق وتقرحات اللسان والجلد. ان مجموعة مرضى FUO اشتركوا كون جميعهم يعانون من الحمى التي تراوحت مدتها من شهر الى ستة اشهر.تم التعرف على الاعراض السريرية من قبل الاختصاصي الموجود واجريت فحوصات المختبرية لجميع المرضى الراقدين والمشمولين بالدراسة اضافة الى فحوصات من مراكز بحثية اخرى ذات صلة بالموضوع.ان البيانات المتحصل عليها اخضعت للتحليل الاحصائي المناسب وبمختلف الطرق.اظهرت الدراسة بان مرضى FUO بسبب الاصابات المرضية المعدية يشكلون (n = 43)% 72.8) من العدد الكلي لهم (59) ثم قسموا بعد التشخيص النهائي بحسب المرض المعدي الى مرضى الحمى المعوية Enteric fever بواقع (n= 14)% 23.7 ومرضى ذات الرئة والتهاب القصبات بنسبة (n= 11) 18.6%، اما نسبة (n=6) 10.1% من المرضى فقد كانت متساوية لكل من مرضى التدرن الرئوي Tuberculosis(TB)، والتهاب المجاري البولية Urinary tract infection(UTI) ومجموعة اصابات مرضية اخرى Other infections. ومن خلال الدراسة ايضا ظهرت نسبة من المرضى (n=16) 27.12 بسبب امراض اخرى وبنسب مختلفة كما في امراض النسيج الوعائي Collagen vascular diseases (n= 4) 6.7%، ومرض التهاب بطانة القلب Endocarditis (n= 3) 5%، ومرضى الامراض الخبيثة Malignancies (n= 2) 3.3% واخيرا نسبة (n= 7) 11.8% من مرضى FUO هم المرضى غير المشخصين. ان مناقشة اربع من الثوابت الرئيسة المدروسة لها اهمية في التفريق بين مختلف حالات FUO وهذه الثوابت هي : 1 - الثوابت الدمية Haematological parameters.2 - الثوابت الكيموحيوية Biochemical parameters.3 - الثوابت المناعية Immunological parameters.4 - الثوابت الجرثومية Microbiological parameters.1 - اهمية الثوابت الدمية : كانت اعلى قيمة لنتائج فحص معدل ترسيب كريات الدم الحمراء Erythrocyte sedimentation rote (EsR) عند مرضى المناعة الذاتية، وذات معنوية قليلة لهذا الثابت عند مختلف حالات FUO الاخرى.2 - اهمية الثوابت الكيموحيوية : لقد اظهرت البيانات بان مصل مرضى FUO له اهمية كبيرة في تقسيمهم من خلال تقدير اليوريا، والكرياتينين، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي، والبيليروبين الكلى، والالبومين، وتسبق الالبومين الى الكلوبيولين، في مصل هؤلاء المرضى.كما ان الترحيل الكهربائي لمصل مرضى FUO اظهر ارتفاعا في قيم α - 2 globulin, α - 1 globulin، مابين مصل مرضى FUO كما في مصل مجموعة الامراض الخبيثة، في حين هنالك ارتفاعا في قيمة β - globulin في مصل مرضى التهاب المجاري البولية، وارتفاعا في قيمة gammaglobulin بدليل زيادة اضداد IgM، وIgG في مصل مرضى المناعة الذاتية مقارنة مع مرضى FUO الاخرين.3 - اهمية الثوابت المناعية : اظهر فحص مصول مرضى FUO اعلى القيم لمختلف الاضداد ومنها Antistreptolysin O titer، وAntiproteinase antibodies، وAntimyeloperoxidase antibodies، وC - reactive protein، وRheumatiod factor وحسب المرض المشخص.ان مصل مرضى حمى التايفوئيد اظهر ارتفاعا في تركيز IL - 1α (72.2 pgm/ml) مقارنة مع مرضى FUO للاخرين، وكذلك ظهرت وزيادة في قيم كل من (CD25) IL - 2 receptor، وIL - 2 (153.2 pgm/ml، 8.6 pgm/ml على التوالي). في حين وجد اقل تركيزيين لـ(IL - 1α، IL - 2) في مصل مرضى الامراض الخبيثة.4 - اهمية الثوابت الجرثومية : اظهر الفحص الجرثومي تشخيص عزلات بكتريا بنسبة 40% Gram positive diplococci، وبنسبة 20% لكل من Gram negative bacilli، وGram positive cocci. ان نتائج زرع الدم لمرضى FUO اظهرت عزلات بكتريا بنسبة 33.3% لكل من Salmonella spp.، وStaphylococcus aureus، وEnterobacter spp. والمسؤولة عن امراض Salmonellosis، وEndocarditis وامراض بكتيرية اخرى.كما تم عزل كل من بكتريا Enterobacter spp.، وPseudomonas aeruginosa، وpneumoiae Streptococcus من عينات السائل الخلبي Pleural fliud وعلى ما يبدو فانهم العاملين المسببين لمرض ذات الرئة Pneumonitis ومرض التهاب الخلب Pleuritis بنسبة 33.3% من الزرع الكلى الموجب لعينات السائل الخلبي للمرض.اما بشان نتائج زرع الادرار الموجب فقد تم عزل وتشخيص كل من بكتريا Staphylococcus aureus، وE. coli، وKlebsiella spp. والتي تمثل نسبة 33.3% من الزرع الكلى لادرار المرضى والمسببة لمرض التهاب المجاري البولية (UTI).وعند زرع المسحات المختلفة (مسحات الجروح والقرح) تم تشخيص عزلات كل من بكتريا E. coli، وPseudomonas aeruginosa وهما العاملين المسببين الرئيسيين لمرض التهاب النسيج الخلوي Cellulitis.اظهرت نتائج اختبار حساسية العزلات للمضادات الحيوية بان المضاد الحيوي Amikacin يمتلك اعلى فعالية وبنسبة 88.9% ويليه المضاد الحيوي Ciprofloxacin بنسبة 58.3% تجاه العزلات المدروسة، في حين المضادين الحيويين Gentamycin، وCefotaxim كانا اقل فعالية تجاه العزلات وبنسبة 20% و12.5% على التوالي. | The importance of microbiological parameters : Bacterial isolates of sputum sample phowed that there was a 40% graw positive diplococci, gram positive cocci and gram negative bacilli showed a percentage of 20% of each.Blood culture for FUO patients demonstrated a 33.3% for each isolate of sacmorella spp., staphylococcus aurens, and Enterobacter spp., which they may be responsible for salmonellosis, endocaraditis and other bacterial infection diseases.Entarobater spp., Psendomonas aeruginosa as well as streptococcus pneumocial were isalated from a pleural fluid sample and it seems to be camsative agent for pneumonitis and pheuritis, this cause repersnet 33.3% out of the total preural fluid culture results.Urine culture results showed a positive culture result of Staphylococcus aureus, E. coli and Klebsiclla spp., and is considered as a causative agent for Urinary tract infection. This positive result represent about 33.3% of the total urine culture result wound and ulcer swabs showed a detection of E. coli and psendamamas areaginosa isolate which are the main causative agent for cellulites. Arihibiotic sensitive result showed that amikacim has the highest antibiotic activity 88.9% followed by ciprofloxacin 58.3%, while Gentamycin and cefotaxime revealed a 20% and 12.5% respectively

تاثير تجريع الفئران الحوامل بعقار اللاموترجين على التغييرات النسيجية لخصى الذرية == THE EFFECT OF LAMOTRIGINE ADMINISTERED TO PREGNANT MICE ON HISTOLOGICAL CHANGES OF OFFSPRING TESTES

Author name: علي ابراهيم محمد السماوي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الخلفية العلمية : يعد عقار اللاموترجين ( Lamotrigine ) من اكثر العقاقير الحديثة المستخدمة على نطاق واسع في الوقت الحالي لعلاج مرضى الصرع ولعلاج الاكتئاب ثنائي القطب , ويعد هذا العقار ملائما للاستعمال لدى البالغين والاطفال على حد سواء , اما بالنسبة للنساء الحوامل فتضعه منظمة الغذاء والدواء العالمية ضمن فئة ( سي ) حيث لا توجد لغاية الان دراسات كافية تؤكد سلامة هذا العلاج على الجنين وفيما اذا كان الخطر على الجنين يفوق المنفعة العلاجية بالاضافة الى منع استخدامه اثناء الرضاعة وذلك لان العلاج يفرز في حليب الام المرضع.الهدف من الدراسة : تهدف هذه الدراسة لبيان مدى التاثير السلبي لمتعاطي هذا العقار اثناء فترة الحمل بالنسبة الى الام الحامل والاجنة . وكذلك تهدف الى دراسة التغيرات الشكلية والنسيجية لخصى الاجنة اثناء استخدام الام الحامل هذا العقار .طرائق العمل : ان الحيوانات المختبرية المستخدمة في هذه الدراسة هي الفئران السويسرية البيض ( Swiss - webster ) اذ استخدم مائة وثمان واربعين انثى حبلى بعمر ( 15 - 16 اسبوع) وقد قسمت الاناث الحوامل الى اربعة مجاميع , المجموعة الضابطة اعطي لها محلول فسلجي ملحي والمجاميع الثلاث الاخرى اعطي لها عقار اللاموترجين بواقع (5 , 10 ,20 ) ملغرام لكل كيلوغرام من وزن الجسم حيث كانت طريقة اعطاء العقار عن طريق الفم . تم تقسيم الفئران المختبرية الى مجموعتين رئيسيتين ,الاولى تم البدء بالتجريع من اليوم الاول من الحمل وتم جمع العينات (الاجنة ) في اليومين الرابع عشر او العشرين من الحمل . اما المجموعة الثانية فقد تم التجريع من اليوم السادس من الحمل الى اليوم الرابع عشر او اليوم العشرين على التوالي حيث تم جمع العينات (الاجنة) والبدء باجراء التحضيرات للفحص النسيجي .النتائج : تم تسجيل اوزان الاجنة باعمار (14 و20 ) يوم من الحمل وقد اظهرت النتائج انخفاض كبير في اوزان الاجنة في المجاميع المجرعة , حيث ظهرت هنالك فروق معنوية (P<0.05) بين هذه المجاميع والمجموعة الضابطة حيث وجد ان هنالك تناسب عكسي بين مقدار الجرعة المعطاة وبين اوزان الاجنة المختلفة. ومن خلال الفحص النسيجي للاجنة ,تم قراءة التغيرات النسيجية تحت المجهر الضوئي بعد ان تم تصبيغها بواسطة صبغة الهيماتوكسلين والايوسين ., كذلك بينت النتائج وجود تغيرات نسيجية واضحة بخصى الاجنة حيث ادى العقار الى التقليل من عدد واقطار النبيبات المنوية وكذلك تاثيرها على الخلايا الجنسية البدائية وعلى الخلايا الجرثومية للاجنة مقارنة مع الاجنة المعزولة من المجموعة الضابطة.الاستنتاجات : يستنتج في ضوء ما تقدم ان عقار اللاموترجين له العديد من التاثيرات الجانبية السلبية على الاجنة وبالتحديد على الجهاز التناسلي الذكري للاجنة في الفترة الجنينية وما قبل الولادة بالاضافة الى ملاحظة العديد من التشوهات الجنينية عند استخدام الجرعة عالية التركيز من العقار. | Scientific background : Lamotrigine (LTG) is one of the most modern drugs used widely at present days for treatment of patients with epilepsy and for the treatment of bipolar depression and it is suitable for use for both adults and children. The Food and Drug Administration (FDA) established lamotrigine within the category ( C ), where until now no sufficient studies confirm the safety of this treatment on the fetus and whether the risk for fetus is much higher than the beneficial therapeutic. Lamotrigine also, not recommended for use during lactation because the treatment is secreted in mother breast milk . Aims of the study : This study aims to demonstrate the extent of the negative impact of administration this drug during pregnancy on the mother and its fetuses. Also aims to study the morphological and histological changes induced by lamotrigine in the testis fetal mice .Materiales and method : One hundred forty eight healthy female mothered Swiss albino mice (Mus. musculus) (age : 15 - 16 weeks) and seventy four male albino mice (age : 15 - 17 weeks) were used in this study. In the first study include seventy nine pregnant mice, the drug administration started from ( day 1 ) ( next day of seeing the vaginal plug), and continue drug administration until fetal collection either at (day 14) or at ( day 20 ) of the gestation period. The pregnant mice were divided into four groups including, the control group was given a physiological saline solution and other groups were given lamotrigine doses ( 5,10 and 20 mg/kg ) orally. The second study include sixty nine pregnant mice, the administration started from ( day 6 ). As same as the first study, the administration continue until fetal collection either at ( day 14 ) or at ( day 20 ) of the gestation period and then the preparation for histological examination started .Results : After collection of fetuses at gestation periods (14 or 20 day) the weights of fetuses were recorded and the results showed significant difference (P<0.05) between each treated group in the body weight of fetuses (low, medium and high dose). Certainly, high dose group provides the higher reduction in the body weight among all treated group. Moreover, the histological examination of the fetuses were examined under light microscope after being staining with haematoxyline and eosin. The current study revealed significant reduction (P<0.05) in all testicular parameters of the fetus including for all treated groups as compared to the control group(number of spermatogoni cell /tubules, tubular radius, number of seminiferous tubules / fetus, spermatogonial cell height and germ cell height).Conclusions : This study concluded that Lamotrrigine has many teratogenic effects in dose - dependent manner on fetuses during in utero development on the testicular parameters.

تقييم بعض المؤشرات المناعية للنساء الحوامل المصابات بداء المقوسات == Evaluation of some immunological parameter in pregnant women infect with toxoplasmosis

Author name: علا هوال جاسم هذال التميمي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد داء المقوسات الكونيدية مرضا معديا مستوطنا واسع الانتشارفي كل انحاء العالم سببه الاصابة بطفيلي المقوسات الكوندية. ويعتمد انتشاره على العادات الغذائية للشعوب ,الظروف البيئية والموقع الجغرافي. اجريت الدراسة الحالية على 197 مريضة مشكوك باصابتهن بداء المقوسات واللاتي عانن من حالات الاجهاض او بدونه . اذ وجد ان 70 مريضة من اللواتي تمت احالتهن من قبل الاخصائية الى مستشفى فاطمة الزهراء)ع) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة لطفيلي المقوسات والتي تراوحت اعمارهن من 45 - 18 سنة للمدة من شهر تشرين الاول للعام 2013 ولغاية شهرشباط من عام 2014 . فضلا عن ذلك اختيرت 20 امراة من الاصحاء ولايمتلكن اجساما مضادة لطفيلي المقوسات واعتمدت كعينة سيطرة. اظهرت النتائج ان نسبة الخمج بالمقوسات 35.53 % باستخدام طريقة الاليزا(الامتزازالمناعي المقترن بالانزيم) وطريقة فحص التلازن اذ كانت نسبة الضد المناعي IgG 97.14 % ونسبة الضد المناعي IgM مع الضد IgG 4.29% , في حين ان نسبة الضد المناعي IgM 2.68% .ان مستوى الضدالمناعي IgG اعلى من مستوى الضد المناعي IgMفي مجموع النساء المصابات قيدالدراسة حيث اوضحت النتائج ارتفاعا معنوي(p< 0.05 ) في مستوى الضدIgG (5.461 ± 0.39 IU /ml) مقارنة مع السيطرة(0.159 ± 0.018 IU /ml) وارتفاعا معنوي(p< 0.05 )في مستوى الضدIgM( 0.420 ± 0.035 IU /ml)مقارنة مع السيطرة(0.161 ± 0.019 IU /ml).في حين لم يسجل فرق معنوي في معدل تركيز C3و C 4في كل من مجاميع المصابات والسيطرة. تضمنت الدراسة معرفة الحالة المناعية للنساء المصابات بداء المقوسات من خلال التحري عن مستوى البين ابيضاضي 5 و18 , اذ اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي (p< 0.05 ) في مستوى البين ابيضاضي 5 عند المصابات 805.70 ± 122.30 pg/ml) ) مقارنة مع السيطرة (126.62 ± 35.96 pg/ml) . في حين لم يسجل فرق معنوي في مستوى البين ابيضاضي 18 بين المصابات والسيطرة. وكذلك تم دراسة الخمج بداءالمقوسات وكل من العمرالحملي للجنين وعمر المصابات. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widly all over the world.The cause of it is the infection by parasite Toxoplasma gondii .Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition . The present study was conducted on 197 pregnant women infected by toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 70 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite .Their ages ranged between 18 - 45 years for the period from October 2013 to February 2014 Parallel to that ,20 healthy women were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infection by the parasite was 35.53% using ELISA and Agglutination methods .The perecentage of immunoglobulin G, immunoglobulin M with immunoglobulin G ,and immunoglobulin M antibody was 97.14%, 4.29% ,and 2.68% ,respectivel immunoglobulin G antibody titer was frequently higher than immunoglobulin M titer in the total studied sample., There was asignificant increase in mean concentration of immunoglobulin G (5.461 ± 0.39 IU /ml) during the infection compared to that in control group (0.159 ± 0.018 IU /ml), and significant increase in mean concentration of immunoglobulin M (0.420 ± 0.035 IU /ml) during the infection compared to that in control group (0.161 ± 0.019 IU /ml) also there were no significant differences in the mean concentration of C3 and C4 component of complement in both patients and control groups. The immunity of the patients was also studied by means of detection of the cytokines (interleukin - 5 and interleukin - 18) levels.These results showed a significant (p<0.05) difference in interleukin - 5 level between patients (805.70 ± 122.30pg/ml) and control group (126.62 ± 35.96pg/ml), the seroprevalence of T. gondii infection and gestational age of the fetus age and the age of the patients was also studied

تاثير ليزر ثاني اوكسيد الكاربون 10600 نانوميتر على حيوية وعوامل ضراوة بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية == Effect of CO2 Laser (10600) nm on Viability and Virulence Factors of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus

Author name: عقيلة عبد الزهرة علي
Supervisor name: ايمان ناطق ناجي البياتي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 60 مسحة من مرضى مصابين باخماج جروح العمليات وجروح الحروق وقرحة الفراش للفترة من شهرايلول ولغاية شهرتشرين الثاني لسنة2013 من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد تشمل : مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري للجراحات التخصصية ومستشفى الحروق التخصصي وقسم المختبرات التعليمية في مدينة الطب. زرعت المسحات على وسطي اكار الدم والماكونكي وشخصت باستخدام المعايير البكتريولوجية القياسية. تم تشخيص 40 عينة من مجموع 60 عينة على انها : 20عزلة تعود للنوع البكتيري Staphylococcus aureus و20عزلة تعود للنوع البكتيري Pseudomonas aeruginosa اعتمادا على طرق التشخيص المظهرية والمجهرية والكيموحيوية , واكد التشخيص باستخدام نظامي API Staphو .API 20 E تم اجراء اختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية باستخدام طريقة نشر القرص لجميع العزلات قيد الدراسة ضد 12 مضاد مختلف واظهرت النتائج ان نسبة مقاومة عزلات بكتريا Staphylococcus aureus للمضادات الحياتية كانت كالاتي : 100% لمضادات Methicillin, Piperacillin, Ceftriaxone وCeftazidim و80% لمضاد Tetracyclin و40% لمضادي Gentamycin وNorfloxacin و35%لمضاد Tobramycin و30% لمضاد Ciprofloxacin و15% لمضادAmikacin و0% لمضادي VancomycinوChloramphenicol اما نسبة مقاومة عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa للمضادات الحياتية كانت كالاتي : 100% لمضادات Carbencillin Cefepime,وCeftriaxone و70%لمضاد Amikacin و65% لمضادات Cftazidime,Tobramycinو Gentamycin و55% لمضادي Ciprofloxacin وNorfloxacin و50% لمضادي Piperacillin وImipenm و%30 لمضاد Aztreonam . تم اختبار بعض عوامل ضراوة العزلات البكتيرية والقابلية على تكوين الاغشية الحيوية واظهرت النتائج ان جميع عزلات بكتريا Staphylococcus aureus كانت منتجة لانزيم مخثر البلازما بينما 95% من العزلات كانت منتجة لانزيمات الهيمولايسين)الانزيم الحال للدم) والبروتيز(الانزيم الحال للبروتين) واللايبيز (الانزيم الحال للدهون) ولها القدرة على تكوين الاغشية الحيوية, من جهه اخرى فان جميع عزلات بكتيريا Pseudomonas aeruginosa كانت منتجة لانزيمات الهيمولايسين والبروتيز واللايبيز والصبغات خارج الخلوية بينما 95% من العزلات اظهرت القدرة على تكوين الاغشية الحيوية. اختيرت 12 عزلة للتشعيع بCO2 ليزر ,ست عزلات من بكتريا Staphylococcus aureus وست عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اعتمادا على نتائج اختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية وعوامل الضراوة عند كثافة الطاقة 20003000,2500, واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 60 و90 ثانية.اظهرت نتائج التشعيع ان CO2 ليزرادى الى تناقص في عدد CFU/ml عزلات بكتريا Staphylococcus aureus وبكترياPseudomonas aeruginosa واوضحت نتائج التحليل الاحصائي باستخدام تحليل التباين واقل فرق معنوي ان هناك فروقات معنوية P.value˂0.001في قيمةCFU/ml بين كثافة الطاقة 20003000,2500, واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 60 و90 ثانية خاصة عند كثافة الطاقة 3000واط/سنتمترمربع وزمن تعرض 90 ثانية. بعد التشعيع تم اجراء فحص الحساسية للمضادات الحياتية وعوامل الضراوة للعزلات المشععة. تم الاستنتاج ان CO2 ليزر له تاثير قاتل على بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa دون التاثير على حساسيتهما للمضادات الحياتية وعوامل ضراوتهما الاخرى . | In this study sixty swabs were collected from patients suffering from surgical wound infections, burn infections and bedsore infections during the period from )September 2013 to November 2013( at many hospitals of Baghdad governorate including : Baghdad Teaching Hospital, Al - Shahid Ghazi Al - Harery Hospital for specialist surgeries, Burns Specialist Hospital and Teaching Laboratories Department in Medical City. All swabs were cultured initially on blood agar and MacConkey agar and diagnosed by standard bacteriological procedures. Forty samples out of sixty were identified as 20 isolates of Staphylococcus aureus and 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa using morphological, physiological and biochemical diagnosis and confirmed by API staph kit and API 20E respectively. The antibiotic susceptibility test was performed for Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates using disc diffusion test against 12 different antibiotics for both genera. The results illustrate that the resistance rates of Staphylococcus aureus isolates were : 100%(20/20) for methicillin, piperacillin ,ceftriaxone and ceftazidim; 80%(16/20) for tetracyclin; 40%(8/20) for norfloxacin and gentamycin; 35%(7/20) for tobramycin; 30%(6/20) for ciprofloxacin; 15%(3/20) for amikacin and 0%(20/20) for vancomycin and chloramphenicol antibiotics.While the resistance rates of Pseudomonas aeruginosa isolates were : 100% (20\20) for ceftriaxone, cefepime and carbencillin ; 70% (14/20) for amikacin; 65%(13/20) for tobramycin, ceftazidim and gentamycin ; 55%(11/20) for ciprofloxacin and norfloxacin; 50%(10/20) for Piperacillin and Imipenem; 30%(6/20) for aztreonam. All Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates were investigated for detection of some virulence factors and biofilm formation. The results revealed that all Staphylococcus aureus isolates (100%) were coagulase enzymes producer, while (95%) of the isolates were haemolysin, protease, lipase enzymes and biofilm producer. All Pseudomonas aeruginosa isolates (100%) were haemolysin, protease, lipase enzymes and extracellular pigments producer while (95%) of the isolates were biofilm producer. Twelve bacterial isolates, six isolates of Staphylococcus aureus and six isolates of Pseudomonas aeruginosa were selected for CO2 laser irradiation according to the results of antibiotic susceptibility test and virulence factors using output power from 4 - 6W corresponding to power densities (2000, 2500, 3000) W/cm2 with exposure time (60 and 90) second. The results of CO2 laser irradiation illustrated that CO2 laser irradiation lead to a reduction in the mean value of the viable number CFUs/ml of all bacterial isolates and the results of the statistical analysis, by using analysis of variance (ANOVA) one way and least significant differences - LSD, showed that there were high statistical significant differences reached to P ˂0.001 in the mean value of the viable number CFUs/ml between power densities)2000, 2500, 3000(W/cm2 and exposure time 60 and 90 second for all the bacterial isolates that were used in the current study especially at power density 3000 W/cm2 at exposure time 90 second. After irradiation, antibiotic susceptibility test and virulence factors were performed. The current study concludes that CO2 laser has bactericidal effect on Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolates without any effect on their antibiotic susceptibility and virulence factors

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

Author name: عقيل محمود علي اللامي
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة العلاقة بين انتاج البروتسين وحركة بكتيريا Proteus spp المعزولة من المرضى وبعض صفاتها الحيوية == Study the relationship between proticine production and motion of Proteus spp isolates from patients and some biological characters

Author name: عقيل محمد مجيد حبيب العزي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على عشرين عزلة من بكتريا Proteus من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية عن طريق زرع احدى واربعين عينة ادرار, ومن مرضى مصابين بالتهابات الاذن الوسطى عن طريق زرع احدى وستين مسحة . زرعت عينات الادرار ومسحات الاذن على الوسطين الزرعيين وسط اكار الدم ووسط الماكونكي ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيميائية الحيوية لغرض تشخيص بكتيريا اﻠ Proteus , وتم تاكيد التشخيص باستخدام عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية API 20 E فقد تم تشخيص تسعة عشرة عزلة من البكتريا Proteus mirabiIis ( اربع منهاعزلت من عينات الادرار وخمسة عشرة عزلة من مسحات الاذن ) , وعزلة واحدة من بكتيريا Proteus vuIgaris من مسحات الاذن . فقد اخضعت العزلات البكترية الى اختبار الحساسية للمضادات الحيوية باستخدام المضادات الاتية : ,Pipracillin ,Amikacin ,Azithromycin Oxytetrayclin Gentamycin , , Naldixic acid , Azteroname , Cefotaxime , Ciprofloxacin , Imipneme , واظهرت النتائج تباينا واضحا في مقاومة العزلات المستخدمة اذ كان مضاد Imipneme من اكثر المضادات الفعالة تجاه تلك العزلات البكتيريةوبنسبة100%. تلاه مضاد Ciprofloxacinوبنسبة ( 95 % ) , بينما كانت البكتريا مقاومة بنسبة 100% لكل من المضادين Azithromycin , Oxytetracyclin .و اظهرت جميع العزلات مقاومةلاكثر من مضاد حيوي ( 2 - 8 مضادات). فقد اظهر قسم من العزلات , القابلية على انتاج البروتسين اذكانت سبعة عزلات منتجة للبروتسين بنسبة 35 % بطريقة التخطيط المتقاطع , وستة عشر عزلة منتجة للبروتسين بنسبة 80 %بطريقة الحفر , وكانت طريقة التخطيط المتقاطع اسهل طريقة للتحري عن فعالية البروتسين الخام في العزلات المنتجة. وقد اختبر ت قابلية عزلات بكتريا البروتيس على انتاج البروتسين تجاه بعض انواع من العائلة المعوية مثل E.coli , Acinetobacter baumannii , Klebsiella spp وكذلك Pseudomonas aeroginosa , ولم يظهر اي تاثير تثبيطي لعزلات البروتيس العشرين تجاه اي من عزلات الاختبار المذكورة في اعلاه , فيما اظهرت ثمانية عشرة عزلة من النوع Proteus mirabiIis وعزلة واحدة من النوع Proteus vulgaris (منتجة للبروتسين) تاثيرا تثبيطيا واضحا تجاه بعض عزلات الاختبار الموجبة لصبغة الكرام aureus Staphylococcus , Streptococcus pyogens , وكذلك خميرة Candida albicansوبنسبة 95 % . بينت النتائج وجود علاقة ايجابية بين مقاومة المضادات الحيوية وصفة انتاج البروتسين , فقد كانت عشرة عزلات من اصل 16 عزلة (5 . 62 % ) منتجة للبروتسين ومقاومة للمضادات الحيوية مما يؤكد العلاقة بينهما . واظهر اختبار دينس وجود تشابه كبير بين العزلات (3, 13) و( 9, 19 ) وتشابه في مقاومتها لمضادات Pipracillin , Gentamycin , Amikacin . حيث اوضحت النتائج وجود علاقة بين انتاج البروتسين والحركة التموجية لبكتيريا Proteus فقد كانت نسبة البكتيريا غير المتحركة بحركة تموجية ومنتجة للبروتسين (60%) فيما كانت نسبة المنتجة للبروتسين والمتحركة(20%) وغير المنتجة وغير المتحركة(20%) وغير المنتجة والمتحركة(0%) . | This study was carried out for Bacterial Isolation from different clinical sources. Twenty isolates of bacteria Proteus was isolaled from culturing 41 urine sample of urinary tract infection and 61 ear swabs from otitis media infection. Urine samples and ear swabs were cultured on blood agar medium and MacConkeys medium . The isolated bacteria were diagnosed according to their morphological shapes and by using biochemical tests , Then the diagnosis was confirmed by using Api 20 E , which revealed that 19 Proteus mirabilis isolates (four isolates from urin and 15 isolates from ear swabs) and one isolate of Proteus vulgaris (from ear swab). Antibiotics sensitivity test was carried for all the Proteus bacteria by using the following antibiotics, Pipracillin ; Azithromycin ; Amikacin ; Oxytetracycline ; Gentamicin ; Nalidixic acid ; Azteroname ; Cefotaxime ; Ciprofloxacin and Imipnem the results showed that the antibiotic Imipnem was the most effective antibiotic (100%) , followed by Ciprofloxacin (95%) , while the bacteria were resistant (100%) for Azithromycin and Oxytetracyclin. Most of the isolates were resistant to 2 - 8 antibiotics . The ability of Proteus bacteria to produce proticine was detected in seven isolates (35%) by using cross streaking procedure and 80% by using well method. The proticine activity was detected against Escherichia coli ; Acinetobacter baummannii ; Klebsiella spp . and Pseudomonas aeruginosa , the result showed no effect , while the proticine of 18 isolates of Proteus mirabilis and one isolate of Proteus vulgaris were effective (95%) against some Gram positive bacteria (Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes) and Candida albicans, the results showed that there was a relationship between the production of proticine and antibiotics resistant , since 62.5% of the protecin producing bacteria were resistant to antibiotics. Denes test reveald that some strains (3,13) ; (9,19) were highly identical and also in their resistance to the antibiotics Pipracillin. Gentamycin and Amikacin . The results indicated that there were relationship between the proticine production and the swarming motion of Proteus bacteria , since the isolates with no swarming motion were 60% producer for proticine , while the producer of proticine with swarming were 20% and the no producer of proticine and no swarming 20% while the no producer of proticine and motile were 0.0% .

دراسة الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية في مرضى السكري النمط - 1 والاصحاء == Anti - salivary mucins antibodies in Patients of Type - 1diabetes&healthy controls

Author name: عذراء نجم عبد محمد
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية وعلى دور مجموعة الدم لويس في هذه الامراض . فقد ركزت الدراسة الحالية في جانبها على تنميط مجاميع الدم ومدى تكرار هذه المجاميع في مرضى داء السكري النمط - 1 مقارنة بالاصحاء , اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في مرضى داء السكري النمط 1 - وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع دم لويس ومستضداتها اللعابية . تمت دراسة (59) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث و(50) عينة دم ولعاب وخروج من الذكور ومقارنة ذلك للاصحاء ب(25) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث والذكور .تم تنميط مجاميع دم لويس باستعمال طريقة الشريحة الزجاجية وملاحظة التلازن الدموي تحت تكبير 40x.ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض حيث بلغت نسبتها عند المريضات (33%) مقارنة بالسليمات (12%) (P=3.77×10 - 4**)، في حين كانت مجموعة دمLe(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفظت نسبتها الى (23%) في المريضات مقارنة بنسبة (64%) للسليمات 10 - 9)×4.98=P) ، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+)عند المريضات (17%) مقارنة بالسليمات (16%) (0.462 P=)، في حين كانت مجموعة دم(Le(a - b - في المريضات (23%) مقارنة بنسبة(%8) (10 - 3×1.20 P=) للسليمات . ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) مجموعة مقاومة للمرض اذ بلغت نسبتها في المرضى الذكور (%20) مقارنة بنسبة(24%) للاصحاء (0.239 =P)، في حين كانت مجموعة دم Le(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها في المرضى(32%) مقارنة بالاصحاء(40%)(0.313 P=)، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+) في المرضى (10%) مقارنة بنسبة(16%) للاصحاء(p=0.462) . وكانت مجموعةدم Le(a - b - ) في المرضى(28%)مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (P=0.185).وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 ذات صنفLe(a) . ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة (50%) في المريضات مقارنة بنسبة(33.3%) للسليمات (P=0.015 ) ،اما تردد مجموعة غير الفارزين حيث بلغت نسبتها(50%) مقارنة بنسبة (66.6 %) للسليمات(0.022 P=) ، وفي الذكور كان تردد الفارزين بنسبة(12.5%) في لمرضى مقارنة بنسبة(40%) للاصحاء (10 - 6×6.37 P=)، اما تردد مجموعة الغير فارزين حيث بلغت نستها (87.5%) مقارنة بنسبة(60%) .(10 - 5×1.52 P=) ، كما تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط - 1 ذات صنف Le(a - b - ) ، ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة(%62.5)، اما السليمات فلم توجد نسبة لتحديدها لقله عدد النماذج .اما تردد مجموعة غير الفارزين اذ بلغت نسبتها(%37.5) للمريضات مقارنة بنسة (100%) للسليمات (10 - 22×8.80 P=) ،اما في الذكور كان تردد الفارزين بنسبة (16.6%) للمرضى مقارنة بنسة(8%) بالاصحاء (0.082 P=) ، اما مجموعة تردد الغير فارزين حيث بلغت نسبتها (83.3%) مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (10 - 19×4.94 p=)، اظهرت تجارب كشف الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية وباستعمال كشف الايلازا غير المباشر(مستوى الاضداد مقاس بمعدل الكثافة الضوئية ± الانحراف القياسي)، فلمجموعة Le.a للمريضات كان معدل الاضداد0.0 )±0.085) مقارنة بمعدل0.0127)±0.1495) للسليمات(10 - 8**×8.48=P)، مجموعة Le.b للمريضات كان معدل الاضداد0.011)±0.089) مقارنة بمعدل0.0127)±0.151) للسليمات (10 - 12**×P=6.37) ،مجموعة Le.a+b+ للمريضات كان معدل 0.007)±0.099) مقارنة بمعدل0.0138)±0.288) للسليمات (10 - 13***×9.09=P) ،مجموعة Le.a - b - كان للمريضات بمعدل الاضداد0.003)±0.073) مقارنة بمعدل 0.0076)±0.1207) للسليمات (10 - 13***×9.09=P). تم دراسة تثبيط الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية بالمستضدات اللعابية OL e.a وOLe.b الحرة وكانت النتائج كالاتي : كان معدلات الكثافة الضوئية ±الانحراف القياسي للمعاملات كالاتي : مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.025±0.145) (P=0.490) ،مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.03±0.1) (P=0.142) ،مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط (0.094±0.201) ( P=0.667) ،مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط (0.029±0.103) (10 - 4×P=4.76)، مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.b كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.01±0.118) (10 - 8×2.33=P)، مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OL.b كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.016±0.088)(10 - 3×P=1.29). مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط(0.077±0.189) ( P=0.971)، مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط(0.02±0.097) (10 - 4×P=1.70)..اما في الجانب البكتيري فقد تم تشخيص عزلات بكتريا Staphylococcus aureusو Pseudomonas aeruginosa .وكالاتي : عزل بكتريا Pseudomonas aeruginosa شخصت 5 عزلات aeruginos .P من اصل ( 25) عيبة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراصي (20%) وفي حين بلغت نسبة الزرع للسليمات (0%) من اصل 25)) عينة خروج , وايضا شخصت 4))من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عز ل الاصحاء (%0).عزل بكتريا Staphylococcus aureus شخصت 5 عزلات S. aureus من اصل (25) عينة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراضي الموجب(20%) وفي حين بلغت نسبته للسليمات 0)% )من اصل 25 عينة خروج , وايضا شخصت 4)) عزلات من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عزل الاصحاء (%0).استنتج ان داء السكري النمط - 1 له علاقة بمجاميع الدم ABO ,ومجموعة دم لويس اذ دراستنا هذه اجريت سابقا بنفس الموضوع في قسم علوم الحياة . اشرت الدراسة ان هنالك اضداد ضادة لميوسين اللعاب مسجلة لاول مرة، وهي ملازمة بعيارية عالية (استعمل المصل المخفف 1 : 100) تكثر في المرضى مقارنة بالاصحاء .هنالك زيادة في تكرار عزل البكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus . فيما يدل ذلك وجود تلازم بين نوعي البكتريا والمرض الى ان ذلك يحتاج الى دراسات معمقة . ممكن ان تكون الفروقات بين الذكور والاناث في توزيع مجاميع دم لويس اساسها هرمونات ستيرويدية. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين في مرضى السكري والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | Blood group antigen, are associated with autoimmune diseases . studies emphasized on lewis blood groups. The present study concentrated on finding the frequency distribution of ABO - Lewis blood groups association in type - 1 Diabetes compared to the distribution in healthy controls.The immunological part of this study investigated the immune response in the disease and its relation ship with salivary mucins Lewis molecules. Fiftynine diabetic female samples(blood، saliva،stools) as well as 50 male diabetic sample(blood، saliva،stools) were used in addition to 25sample (blood، saliva،stools )of female and males healthy controls . Typing of blood groups Lewis using the glass slide Not blood agglutination and under magnification 40x.The findings indicated that Lea+b - molecule has arole in disease susceptibility. Ites percentage approach 33% in female patients compared to 12% in healthy controls (p=7.33 x 10 - 4)، On the other hand however, Lea - b+ group gave 23% in diabetic females compared to 64% in healthy females (p= 4.98 x10 - 9). Lea+b+ groups gave 17% in diabetic females and 16% in healthy females (p=0.46).Interestingly however, Lea - b - groups was represented at 23% in diabetic females versus 8% in healthy females (p=1.2x 10 - 3) In males the results of the frequenecies could be summarized as follows : Lea + b - 20% in diabetics vs 24% in controls. p=(0.239).Lea - b+ : 33% in diabetics vs 40% in controls. P=(= 0.31).Lea+b+ : 10% in diabetics vs 16% in controls. P= (0.462).Lea - b - : 28% in diabetics vs 20% in controls. P=(0.185).The role of secretion (se gene role) in diabetes was investigated also, particularly in Lea group and the findings were as follows : secretors female : 50% in diabetics vs 33.3% in controls.(p=0.015).None secretors : 12.5% in diabetics vs 40% incontrols (p=6.37x10 - 6).In addition to that the role of secretion was seen in Lea - b - group as well. Secretor diabetics female, showed 62.5% . There was no available samples in controls.A Statistically siqnificant frequency differences was seen in non secretors diabtic, females compared to controls (37.5% in diabetics vs 100% in controls p=8.8 x 10 - 22).In Males the results of secretions reported a significant difference in non secretors83.3%. In diabetics vs 20% controls ( p= 4.94 x 10 - 3)The other part of the study experiments oriented to uncovering the presence of anti - salivary mucins antibody .Using Lewis types, salivary mucin as coating antigen، and indirect ELISA, we could demonstrate the occurrence of anti - mucin antibodies in patients sera that was from controls.In this respect the level of anti - mucin antibody measured as ELISA mean o.D±SD seen below and as following : In Lea diabetic females group was 0.085+0.02 vs 0.1495±0.0127 in control (p= 8.48 x10 - 8)،In Leb diabetic females group 0.089±0.011 vs 0.151±0.0127 in control group( p= 6.37 x10 - 12)،In lea+b+ diabetic females group 0.099+0.007 vs control groups 0.288+0.0138 in control p=( 9.09 x10 - 13) ،In Lea - b - diabetic females group 0.07+0.003 vs control group 0.1207+0.0076( p=9.09 x 10 - 13)In specificity experiment, using free olea and oleb free saliva as inhibitor for anti - mucin antibody, it was demaonstrated that in female patients group Lea : no inhibition by free Lea was seen (0.6 ± 0.01) vs 0.145±0.02 for treatments before and after inhibition respectively (p=0.49)، similarly there was no inhibitin by the free antigens، similarity there this no inhibition by the free antigens towards antibodies in group Leb.Significnt inhibition of anti - mucin antibody by free Lewis was seen in group : (0.2±0.060) vs (0.103±0.029) before and after inhibitim respectiuly(p=476 x 10 - 4) and similar results was seen in Lea - b - group.The bacteriological study on The isolation of P.aeroginosa from stool samples revealed an isolation frequency of 20% in diabetic vs 0% in control.In addition S.aureus isolation from stool gave a frequency of 20% in patients vs 0% in control.It is concluded that there is areltionship among Lewis blood groups – secretion of there molecules and anti - mucin، immune response directed to aspecific targt and initiating autoimmunity in this particular disease.

التغيرات في مستويات انترليوكين - 33 في مرضى الربو والتهاب الانف التحسسي تحت تاثير العلاج المناعي == Changes of IL - 33 Levels in Asthmatic and Allergic Rhinitis Patients under the Effect of Immunotherapy

Author name: عذراء خلف فلحي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة لتقصي التغيرات في مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 في امصال المرضى المصابين بالربو التحسسي والتهاب الانف التحسسي اضافة الى دراسة اثر العلاج المناعي على هذه المؤثرات المناعية. تم اختبار مئتين وخمسه وتسعين مريض (120ربو, 75 التهاب الانف التحسسي, 100 خاضعين للعلاج المناعي) اعمارهم تتراوح بين 20 - 60 سنة (160 ذكور , 135 اناث), من بين المراجعين للمركز التخصصي للحساسية في بغداد/ الرصافة للفترة من اكتوبر 2014 الى فبراير 2015. تم خلال الدراسة قياس مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 بتقنية الاليزا وبالامكان تلخيص النتائج لهذه الدراسة بالاتي : 1 - تبين من خلال اجراء فحص وخز الجلد باستخدام 15 نوع من المستارجات الاكثر شيوعا ان مستويات التفاعلات الايجابية ترتب كالتالي : 8.7%D. pteronyssinus (D1) , 7.6% D. farina (D2), 7.6% Chenopodium (CH) و7.1% Bermuda grass (G2) في المرضى الذين يعانون من الربو و8.2% D. pteronyssinus (D1), 7.6% D. farina (D2), 7.6% Bermuda grass (G2) و6.6% Chenopodium (CH) في المرضى الذين يعانون من التهاب الانف التحسسي.2 - تبين من النتائج ارتفاع معنوي عالي عند مستوى معنوية (P<0.001) في مستويات الضد IgE سواء عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 33.07 ± 328.78( او التهاب الانف التحسسي (pg/ml 36.09 ± 379.76( بالمقارنة بمستوياته التي انخفضت بشكل معنوي عند مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي (pg/ml 22.75 ± 210.23(. فيما ضلت مستوياته ضمن حدودها الطبيعية عند مجموعة الاصحاء (pg/ml 8.04 ± 81.19).3 - موازيا لذلك فان مستويات انترلوكين - 33 قد سجلت ارتفاعات معنوية عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 13.75 ± 128.07( والتهاب الانف التحسسي ( pg/ml12.78 ± 144.62) فيما انخفضت عن ذلك في مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي لتصل (pg/ml 11.32± 110.79( اما مجموعة السيطرة فكانت (pg/ml 9.06 ± 59.04).4 - وقد وجد ان هنالك علاقة موجبة ذات دلاله معنوية بين مستوى انتولوكين - 33 ومستويات IgE الكلية حيث ان معامل الارتباط في الربو (r = 0.42**), التهاب الانف التحسسي (r = 0.31*), والمرضى الخاضعين للعلاج المناعي (r = 0.41**) على مستوى احتمال (P <0.01**) و. (P <0.05*) | The present study was undertaken to investigate the changes in levels of total IgE and interleukin - 33 in sera of patients with allergic asthma and allergic rhinitis. In addition, the effect of immunotherapy on such immune parameters were investigated. Two hundred and ninety five of allergic patients (120 asthmatics, 75 allergic rhinitis, and 100 receiving immunotherapy) their ages ranged between 20 - 60 years (160 males and 135 females), among those who attended the allergy specialized center in Baghdad /Al - Russafa during the period from October 2014 to February 2015. The control group was included 50 apparently healthy individuals. Levels of interleukin - 33, Total IgE, were estimated using ELISA technique, the results of the study can be summarized as follow : 1 - By doing skin prick test using 15 types of most common allergens for both groups of patients, the recorded results showed to be positive respectively as so : Dermatophagoides pteronyssinus (D1) 8.7%, Dermatophagoides farinae (D2) 7.6%, Chenopodium (CH) 7.6% and Bermuda grass (G2) 7.1% in asthmatic patients and D. pteronyssinus (D1) 8.2%, D. farinae (D2) 7.6%, Bermuda grass (G2) 7.6% and Chenopodium (CH) 6.6% in allergic rhinitis patients.2 - The results showed high significant (P < 0.001) increase in the level of total serum IgE in asthmatic patients (328.78 ± 33.07 IU/ml) and in allergic rhinitis patients (379.76 ± 36.09 IU/ml) compared with its level, which were decreased (210.23 ± 22.75 IU/ml), in those patients who received immunotherapy and compared to level in healthy individuals, which were stayed within normal range (81.19 ± 8.04 IU/ml).3 - In parallel IL - 33 also recorded a significant elevation in both groups of patients (128.07 ± 13.75 pg/ml) in allergic asthma, and (144.62 ± 12.78 pg/ml) in allergic rhinitis. It decreased in group of immunotherapy patients to reach (110.79 ± 11.32 pg/ml), while it was (59.04 ±9.06 pg/ml) in the sera of healthy individuals.4 - A significant positive correlation was found between serum level of IL - 33 and the total IgE as the correlation coefficient in asthma was (r = 0.42**), rhinitis (r = 0.31*), immunotherapy (r = 0.41**) at the level of probability (P <0.01**) and (P <0.05*).

تاثير المستحلب الحيوي المنتج من بكتريا Leuconostoc mesenteroides ssp. cremoris المعزولة محليا في البكتريا المرضية المعزولة من ادوات القسطرة واصابات المجاري البولية == Effect of Biosurfactant Produced by Locally Leuconostoc mesenteroides ssp. cremoris in Pathogenic Bacteria Isolated from Catheters and Urinary Tract Infections

Author name: عدنان ياس خضير عباس
Supervisor name: جيهان عبد الستار سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

الازالة الحيوية لعنصر الرصاص مختبريا باستخدام نبات الشمبلان Ceratophyllum demersum L == Bioremediation of Lead Labrotary by Ceratophyllum demersum L.

Author name: عبد الجبار جاسم الجريان
Supervisor name: عبد الجبار جاسم الجريان | عدنان حسن عفچ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لتقييم ثلاثة انواع من النباتات المائية هي الشمبلان demersum L . Cratophyllum واللزيج Nagaus armata L. والخويصةVallisneria spiralis L. , كعوامل للازالة الحيوية لعنصر الرصاص Bioremediation من البيئة المائية لبحيرة الزوراء المجهزة من نهر دجلة ,وتحديد اثر عنصر الرصاص في بعض معاييرالنمو لنبات الشمبلان C. demersum . اظهرت النتائج ان محتوى الرصاص في نبات الشمبلان C. demersum بلغ ((0 - 14 جزء بالميلون وهو اعلى من محتوى نباتي N. armata وV. Spiralis اللذين سجلا( 0 . 12) و( 0 .13) ,جزء بالمليون على التوالي ,وهذا ماانعكس على تركيز الرصاص في مياه نبات الشمبلان C. demersum الذي سجل ( ppm ( 0.25 مقارنة بتركيز الرصاص في المحتوى المائي لنباتي N.armata وV.spiralis واللذين سجلا0.50) ( 0.52 )) جزء بالمليون وعلى التوالي .كما اظهرت نتائج التجربة المختبرية ان الازالة الحيوية لعنصر الرصاص من ثلاث بيئات مائية ملوثة بثلاث مستويات منه 6,4,2 ppm نامي فيها نبات الشمبلان C.demersum كانت كفائته على الازالة الحيوية لهذا العنصر قد بلغت 100% عند نهاية الاسبوع الثالث وبداية الاسبوع الرابع للتجربة وفي المعاملة المغذاة بـ 6 جزء بالمليون من عنصر الرصاص.اما الازالة الحيوية لعنصر الرصاص في المعاملة المخهزة بتركيز ((4 ppm فقد بلغت 100% عند نهاية الاسبوع السادس من التجربة . اما الازالة الحيوية لعنصر الرصاص في المعاملة المجهزه بـ ((2 ppm وكذلك معاملة السيطرة Control والتي تحتوي مياهها على (0.5 ppm) من عنصر الرصاص , قد بلغت %100 عند نهاية الاسبوع الثامن من التجربة.كما اثبتت الدراسة التاثير الضار لعنصر الرصاص المتجمع في انسجة نبات الشمبلان C.demersum في النمو الظاهري للنبات , والمتمثل بعدد الفروع وعدد الاوراق السوارية ووريقاتها , فقد ظهر جليا العلاقة العكسية بين نسبة الازالة الحيوية وانخفاض النمو الظاهري . ويعزى السبب في هذه العلاقة الى تاثير الرصاص المتجمع في انسجة النبات على اهم عملية فسيولوجية فيه الا وهي عملية البناء الضوئيphotosynthesis , التي بدورها سيكون لها التاثير السلبي الكبير على النمو الظاهري للنبات والمتمثل بعدد وفروع , عدد الاوراق السوارية ووريقاتها والسبب الرئيسي في ذلك قد يعود الى تناقص الكلوروفيل الكلي في النبات مع زيادة تراكيز الرصاص في مياه احواض التجربة , وخلال الفترات الزمنية للقياس . | This study was carried out to evaluate the efficiency of three aquatic plants : Ceratophyllum demersum , Najaus armata and Vallisneria spiralis as bioremediation agents for Lead aquatic environment of AL - Zawraa park feeded from Tiger rever,and determination of Lead toxic effect on some growth parameters C.demersum. The results revealed that lead content of C. demesum plant was the highest (0.14) ppm as compared to other tested plant N.armata and V.spiralis which recorded (0.12) and( 0.13) ppm respeetivaly ,this result reflected on the lead concentration in aquatic environment of C.demersum plant which recorded (0.25 )ppm copared with lead concentration in aquatic environment of N.armata and V.spilis plants which recorded (0.25 and 0.50) ppm respeetively. The results of labrotary exprements for remediation of lead for three diffirent concentration of lead contaminated aquatic environment (2,4,6)ppm showed the high efficiency of C.demersum plant in bioremediation of lead from aquatic environment up to (100%) at the end of the third week and beginning of the fourth week in 6 ppm lead treatment ,while in 4 ppm lead treatment it achieved (100%) at the end of the sixth week .the bioremediation of the lead from aquatic invironment in 2 ppm lead treatment and control 0.5 ppm lead achieved (100%) at the end of eighth week. The results also showed hrumfull effect of accumulated lead in C.demersum plant tissue on some parameters(number of branches,number of leaves and leaflets) as manifested by the negative relationship between the bioremediation and tested plant growth parameters. The causal agent of this negative relationship may refer to the influence on photosynthesis efficiency which lead to severe reduction in plant growth parameters (number of branches,number of leaves and leaflets) and this suggestion confirmed by the significant reduction of total chlorophyll content in all lead treatments.

دراسة بكتريولوجية وخلوية لنماذج القشع لمرضى التهاب الجهاز التنفسي السفلي لدى المصابين وغير المصابين بسرطان الرئة == Bacteriological and Cytological Study for Sputum from Lower Respiratory Tract Infection in Both Lung Cancer and Non Lung Cancer Patients

Author name: عاصفة علي حسين الجنابي
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | علاء غني حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (260 )نموذجا للقشع من المرضى البالغين المراجعين للعيادات الاستشارية والراقدين في كل من المستشفى الجامعي لكلية صدام الطبية ومعهد ومستشفى الطب والاشعاع النووي للفترة من ايلول 2001 ولغاية نيسان 2002 . وقد صنفت النماذج الى مجموعتين ، المجموعة (1) وتضم (210)مريضا مصابا بالتهابات القناة التنفسية السفلى من غير المصابين بسرطان الرئة ،تراوحت اعمارهم (14 - 85 ) سنة ، من بينهم (124)ذكورا ، و(68)اناثا. اما المجموعة (2) فتضم (50)مريضا مصابا بالتهابات القناة التنفسية السفلى من المشخصين بالاصابة بسرطان الرئة ،وقد تراوحت اعمارهم (40 - 80) سنة ،من بينهم (39)ذكورا ،(11) اناثا . 1 - اظهرت النتائج ارتفاع نسبة الاصابة لدى الذكور مقارنة بالاناث في كلتا المجموعتين (1) و(2) اذ بلغت (58.5%)،(76%)على التوالي ،في حين كانت الفئات العمرية المتقدمة اكثر عرضة للاصابة بهذه الالتهابات وفي كلتا المجموعتين .كما وجد ان نسبة المدخنين تفوق نسبة غير المدخنين في المجموعتين اذ بلغت (58.5%) في المجموعة (1)في حين بلغت (80 %)في المجموعة (2). 2 - عزلت البكتريا الهوائية واللاهوائية الاختيارية من نماذج القشع ، كما اجري الفحص المباشر لها باستخدام صبغة كرام والصبغة المقاومة للحامض A FB للتحري عن عصيات التدرن (T.B.).3 - تم تشخيص (129) نموذجا موجبا للزرع البكتريولوجي توزعت (95)نموذجا (2 .45% )في المجموعة (1)،و34 نموذجا (68 %) في المجموعة (2) ، في حين بلغ عدد النماذج التي لم تعزل فيها البكتريا المرضية (131)نموذجا ،توزعت (115 )نموذجا (54.7%) في المجموعة (1) ،16 نموذجا (32 %)في المجموعة (2) .بينما ظهر نمو مختلط في (13)نموذجا (13.6 %)في المجموعة (1) في حين بلغت 4 عينات (11.7 %) في المجموعة (2) .4 - اوضحت نتائج التشخيص البكتريولوجي للبكتريا المرضية المعزولة في المجموعة (1)،ان بكتريا S.pneumoniae كانت المسبب الاكثر شيوعا وبنسبة (51.4 %) تلتها بعض افراد العائلة المعوية (41.9 %)من بينها S. marcescens, E.cloacae ,K .pneumoniae وبنسبة عزل (7.4 %) ،(4.6 %) ، (2.8 %) على التوالي تلتها P. aeruginosa (13 %) تلتها S. aureus (11.2 %)، في حين تساوت نسبة عزل كل من M.catarrhalis , H.influenzae (4.6 %) لكل منهما .5 - اما البكتريا المرضية المعزولة في المجموعة (2) فكانت النسبة الاكبر لبكتريا S.pneumoniae 30 %تلتها بعض افراد العائلة المعوية 20 % من بينها S.marcescens ,E. cloacae ,K .pneumoniae وبنسب 12.5 % ،5 %،2.5 %على التوالي ، تلتها S.aureus 15 % تلتها نسب متساوية من P.aeruginosa, M.catarrhalis 12.5 % لكل منهما واخيرا H.influenzae 10%.6 - اما فيما يخص M.tuberculosis فقد اعتمد في تشخيصها على الفحص المجهري دون الزرع البكتريولوجي وكانت نسبة الفحص الموجب لمسحة القشع 11.6 % في المجموعة رقم (1) في حين لم تشخص اي نتيجة موجبة لتلك المسحة في المجموعة (2) .7 - اجري فحص الحساسية للعزلات البكتيرية المرضية تجاه 15 مضادا حيويا وهي (Ampicillin, Penicillin G, Cloxacillin, Co - Trimoxazole, Erthromycin , Tetracycline , Cephalexine, Ciprofloxacin, Cefotaxime, Lincomycin , Gentamicin, Pipracillin, Tobramycin, Ceftazidime, Amikacin) واظهرت النتائج وجود تباين واضح وبنسب مختلفة في مقاومة هذه العزلات للمضادات المستخدمة وللمجموعتين (1)،(2) .كما اظهرت العزلات البكتيرية في المجموعة (2) المصابين بسرطان الرئة مقاومة اعلى مقارنة بالعزلات البكتيرية في المجموعة (1) وقد اظهرت كل من S. pneumoniae ، S. aureus ، M. catarrhalis ، H. influenzae اعلى نسبة مقاومة تجاه الكلوكساسيلن والامبسيلين والبنسلين (ج) والتي بلغت 69.1% ، 64.8% ، 52.1% على التوالي في حين اقل نسبة مقاومة لهذه العزلات تجاه السبروفلوكساسين والسيفاتاكسين 4.2% و12.7% على التوالي ، اما P.aeruginosa ، K. pneumoniae ، E. cloacae ، S. marcescens فقد اظهرت اعلى نسبة مقاومة تجاه الامبسيلين والسيفالكسين ، والكوترايموكزازول 100% ، 90.7% ، 88.3% على التوالي بينما بلغت اقل نسبة مقاومة للمضادات الاميكاسين والسبروفلوكساسين والسيفاتاكسيم 14% ، 20.9% ، 37.2% على التوالي .8 - تم تحديد قيم التراكيز المثبطة الدنيا MIC لبعض العزلات البكتيرية تجاه ثمانية مضادات (الامبسلين ، السيفاتاكسيم ،السيفتازديم ،البنسلين ،الببراسلين ،السبروفلوكساسين ،الارثرومايسين ،الجنتاميسين) وقد تباينت قيم MIC لهذه المضادات تجاه العزلات البكتيرية، اذ ابدت كل من M.catarrhalis ,S.aureus, S. pneumoniae اعلى مدى للمقاومة تجاه مضادات الامبسلين ،البنسلين ،السيفاتاكسيم ،اما البكتريا العصوية السالبة لكرام P.aeruginosa ,S.marcescens, E.cloacae ,K.pneumoniae فكان اعلى مدى للمقاومة تجاه الببراسلين والجنتاميسين في حين كان اقل مدى للمقاومة للعزلات البكتيرية كافة لمضاد السبروفلوكساسين .9 - اختبرت العزلات البكتيرية المقاومة لمجموعة البيتالاكتام ومنها (الامبسلين ،الببراسلين ،السيفتازديم) وقد حددت قيم MIC لها بوجود مثبطات انزيمات البيتالاكتاميز ومنها مثبط حامض الكلافيولنك وبطريقة النسبة الثابتة 2 : 1 لخليط المثبط /المضاد على التوالي ،كما استخدام مثبط التازوباكتم مع الببراسلين المحضر تجاريا بنسبة 8 : 1 على التوالي . وقد اظهرت النتائج ان استخدام مثل هذه المثبطات اعطى فعالية عالية واسترجع المضاد لكفاءته للقسم الاكبر من العزلات المقاومة.وقد ابدى خليط التازوباكتم / الببراسلين افضل تاثير تازري اذ بلغت نسبة حساسية الخليط 76.9 %، كما وجد ان بان هذا الخليط ذو فعالية تفوق خليط حامض الكلافيولنك /الببراسلين .10 - بينت الدراسة الخلوية لكافة النماذج قيد الدراسة وجود الخلايا الالتهابية (الحادة غالبا ) كما لوحظ وجود التغيرات الخلوية السابقة لحدوث السرطان (خلايا التنسج الحرشفي والحثل النموي بمختلف درجاته )في كلتا المجموعتين فضلا عن وجود الخلايا السرطانية في مجموعة المصابين بسرطان الرئة . وقد بلغت نسبة خلايا التنسج الحرشفي في المجموعة (1)و(2) 37.1 %، 34 % على التوالي في حين نسبة وجود خلايا التنسج الحرشفي والحثل النموي للمجموعتين (1)و(2) قد بلغت 10.5 % ،26 % على التوالي . كما وجد ان نسبة التغيرات الخلوية اعلى في الفئات العمرية المتقدمة لاسيما لدى المدخنين اذ بلغت 74.3 %، 90.9 % للمجموعتين (1) ،(2) على التوالي .11 - كما اظهرت نتائج الفحص الخلوي لقشع المرضى المشخصين بالاصابة بسرطان الرئة سيادة لنوع السرطان الحرشفي من بين انواع السرطان الرئوي وبنسبة 50 % تلتها السرطان الغدي 14 % ثم السرطان ذو الخلايا الصغيرة 10 % وان نسبة 26 % كانت للنماذج التي لم يشخص فيها نوع السرطان الرئوي بالفحص الخلوي . | This study included collection of 260 sputum samples from adult patients referred to the outpatient clinic and admitted to both Saddam College of Medicine University Hospital and Institute of Nuclear Medicine from the period September 2001 till April 2002.The samples were classified into two groups : The first group included 210 patients , ranged (14 - 85) years old : 124 males and 86 females , with lower respiratory tract infections with no history of lung cancer and the second group include 50 patients having lower resporatory tract infections who are known cases of lung cancer, their age range from (40 - 80) years; 39 males and 11 females.1 - The results reveal higher incidence of lower respiratory tract infection in males than in females in both groups since it was 85.5%, 76% in the two groups respectively. There were a high incidence of lower respiratory tract infection with increasing age in the two groups of patients. Also it was found that incidence of smokers was higher than non - smoker in the 2 groups studied since it was 58.5% in the first groups and 80% in the 2nd group.2 - Isolated aerobic and faculative anaerobic bacteria and they were stained by Gram stain and acid - fast stain (AFB) examined . 3 - There was 129 positive sample for bacteriology culture divided into 95 sample 45.2% in the first group, 34 sample 68% in the 2nd group whereas 13 sample were negative for pathogenic bacterial growth, divided into 115 sample 54.7% in the 1st group 16 sample 32% in the 2nd group. Mixed bacterial growth was noticed in 31 sample 13.6% in the first group while 4 samples 11.7 in the 2nd group.4 - Results of bacterial diagnosis reveal species and percentage of bacteria isolated from first group that S.pneumoniae was the major and the commonest cause of LRT1 51.4% followed by some enteric group 41.9% including : K.pneumoniae, E.cloacae, S.marceseens with percentage of isolates : 7.4%, 4.6%, 2.8% respectively, followed by P.aeruginosa which constitute 13%; than S. aureus 11.2% while equal percentage of isolates from both H influenzae and M. catarrhalis 4.6% for each.5 - For the lung cancer patients groups the predominant bacterial growth was for S.pneumoniae 30% followed by some entric group 20% including K.pnumoniae, E. cloacae, S.marcescens with percentage of isolates 12.5%, 5%, 2.5% respectively. Bacteria S. aureus comes next 15% of isolate, followed by P. aeruginosa and M. caqtarrhalis 12.5% for each and H. influenzae comes at the end of the list 10%.6 - For the dinguses of M. tuberculosis we depended on microscopical examination without bacteriological culture , the positive percentage of sputum smear was 11.6% in group (1) while we can not diagnosis any positive result in group (2). 7 - Antibiotic sensitivity test was doing for all the pathogenic bacterial isolates to 15 antibiotic that were Ampicillin, Penicillin G, Cloxacillin, Co - Trimoxazole, Erthromycin , Tetracycline , Cephalexine, Ciprofloxacin, Cefotaxime, Lincomycin , Gentamicin, Pipracillin, Tobramycin, Ceftazidime, Amikacin the results reveal a clear variation in antibiotic sensitivity among different bacterial isolates for both groups. Also the bacterial isolates for the lung cancer group have shown higher antibiotic resistance than the isolates for the first group in general . S. pneumoniae , S. aureus , M. catarrhalis , H. influenzea show highest resistance percentage toward cloxacillin, ampicillin, pencillin G , 69.1%, 64.8%, 52.1% respectively while the lowest resistant percentage for this isolate for ciprofloxacin , cefetoxime 4.2% , 12.7% respectively . While P. aeruginosa, K. pneumoniae , E. cloacae , S. marcescens it show highest resistant percentage for ampicillin, cephalexine , co - trimoxazole 100%, 90.7% , 88.3% respectively . While the lowest resistance percentage for the antibiotic amikacin, ciprofloxacin , cefotaxime 14%, 20.9%, 37.2% respectively .8 - Results of MIC were determined for some bacterial isolates towards eight antibiotic (Ampicillin, cefotaxime, cefazidime, penicillin, pipracillin, ciprofloxacin, erythromycin, gentamicin). And reveal a marke of variation among MIC values for different regard, S. pneumoniae, S. aureus and M. catarrhalis have shown the highest range of resistance towards Ampicillin , penicillin, cefotaxime while the Gram negative bacillius (K. pneumoniae, E. cloacae, S. marcescens, P. aeoginisa) have shown a high range of resistance towards pipracillin , gentamicin. Most of bacteria isolates showed little resistance toward ciprofloxacin.9 - Bacterial isolates that revaled resistance to betalactm group (Ampicillin, pipracillin, ceftazidine) were tested for MIC values in the presence of beta lactamases inhibitors including clavulanic acid in a ratio of 2 : 1 for antibiotic inhibitor respectively. Also tazobactam inhibitor was mixed with pipercillin prepared commercially with 8 : 1 respectively. And the results revealed that the use of such inhibitors gives higher activity and made the antibiotic retain its effectiveness for a large portion of resistance bacterial isolates. The Tazobactam / piperacillin mixture have shown the best synergestic effect since its sensitivity reach 76.9%. Also found that this mixture was of activity that exceed calvulanic acid/ piperacillin mixture.10 - Cytological study of sputum samples explain in both groups have revealed the presence of inflammatory cells (predominantly acute). Also it reveals the presence of precancer cytological changes including squamous metaplasia and different graded of dysplasia cellular a typical in both group studied. Also it reveals presence of cancer cell in lung cancer group.Squamous metaplsia changes occur in the non lung cancer group 37% and 34% in the lung cancer group. Combined squamous metaplsia and dysplasia was seen in 10.5% in the 1st group and 26% in the 2nd group. Also the incidence of precancers cellular changes (including squamous metaplasia and dysplasia) were noticed with advanced age especially among smokers 74.3%. 90.9% for the 1st and 2nd group respectively.11 - Also sputum cytology examination for lung cancer patients revealed predominant of squamous cell carcinoma variety 50% followed by adenocarcinoma group, the small cell carcinoma group 10% and 26% of cases the exact cancer subtype was not determined by sputum cytological examination.

دراسة علاقة الكورتيزول ومقاومة الانسولين في رجال قصور الغدة الدرقية غير المصابين بالسكري == Study the relationship of cortisol and insulin resistance in non - diabetic hypothyroidism men

Author name: ظلال عبد الخالق جمعة
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية للتحري عن مستويات الكورتيزول ومقاومة الانسولين بالعلاقة مع زيادة مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية ((TSH في مرضى قصور الغدة الدرقية من الذكوروالتي اجريت على 48 شخصا من المراجعين الى المركز التخصصي للغدد الصم ومرضى السكري في بغداد للفترة من 10/10/2014 ولغاية 14/2/2015. شملت مجموعة قصورالغدة الدرقية 24 رجلا تراوحت اعمارهم بين 20 - 60 سنة ومجموعة السيطرة 24 رجل تراوحت اعمارهم بين 20 - 56 سنة. ارتفع مستوى Mu/lTSHمعنويا (P˂0.01)في مجموعة قصورالغدة الدرقية (41.74±3.61) قارنة بمجموعة السيطرة(1.97±0.264). اظهرت مستويات هرمون الثايروكسين T4nmol/Lفي مجموعة قصورالغدة الدرقية (48.59±0.98) انخفاضا معنويا P˂0.01)) مقارنة بالسيطرة .(80.12±3.09) اظهرت مستويات T3nmol/lعدم وجود فروقات معنوية (p≥0.05) بين المجموعتين (1.31±0.14)؛ (1.52±0.083) على التوالي. ارتفعت مستويات الكورتيزول ng/ml(274.08±9.3) في مجموعة المرضى معنويا(P<0.01) مقارنة بمجموعة السيطرة (174.33±13.55).ازداد مستوى الانسولين(15.13±1.14) µIU/ml في المرضى مقارنة بالسيطرة (8.28 ± 0.76) معنويا (P<0.01).لم تكن الفروقات معنوية p≥0.05)) في مستويات كلوكوز الدم(4.84±0.15) ؛ mmol/l(4.98±0.11)بين المجموعتين .لم تكن الفروقات معنويةp≥0.05)) في مستويات HbA1c%بين المجموعتين (5.50±0.18;5.50±0.18) على التوالي. ازدادت مستويات مقاومة الانسولين معنويا (P<0.01)في مجموعة المرضى (3.39±0.29) مقارنة بمجموعة السيطرة (1.81±0.16) . ارتفع معامل كتلة الجسم BMI(kg/m2)معنويا (P<0.01) في مجموعة المرضى (25.81±0.39) مقارنة بالسيطرة (23.72±0.49). لم يكن ضغط الدم الشرياني العالي (11.58 ± 0.37) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05)) عند مقارنته مع مجموعة السيطرة (11.46 0.22). لم يكن ضغط الدم الشرياني الواطئ(9.04±0.40) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05))عند المقارنة مع مجموعة السيطرة(8.46±0.23) .. كان معدل العمر (39.00±1.92; 35.54±2.29) بين المجموعتين. اظهر TSH وCortisolارتباطا موجبا (0.65)ومعنويا (P<0.01).اظهر الكورتيزول وT4علاقة سالبة ( - 0.32) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكورتيزول علاقة سالبة ( - 0.18) غير معنويةp≥0.05) ) مع T3. اظهر الانسولين وكلوكوزالدم علاقة موجبة (0.09) غيرمعنوية (p≥0.05). اظهراالانسولين والHbA1c% علاقة سالبة ( - 0.09) غير معنوية p≥0.05)).كانت العلاقة موجبة (0.42) ومعنوية (P<0.01) بين الانسولين والكورتيزول. اظهرالانسولين وTSHعلاقة موجبة (0.36) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكلوكوز وTSHعلاقة سالبة ( - 0.16) وغير معنوية p≥0.05)). اظهرTSHو HbA1c%علاقة موجبة (0.05) غير معنوية ( - 0.08)كانت مقاومة الانسولين والكلوكوز علاقة موجبة (0.32) ومعنوية(p≤0.05).وجدت علاقة سالبة( - 0.08) بين مقاومة الانسولين وHbA1c%غير معنوية p≥0.05)).اظهرت مقاومة الانسولين ومعامل كتلة الجسم BMI علاقة موجبة(0.33) ومعنوية (p≤0.05). كذلك اظهرBMI وTSH علاقة موجبة (0.39)ومعنوية(P<0.01) . اظهر BMI وT4علاقة سالبة ( - 0.36) ومعنوية (P<0.01). بين BMI وT3علاقة موجبة (0.002) غير معنوية(p≥0.05) . اظهر BMIوالعمرعلاقة سالبة( - 0.001) غير معنوية p≥0.05)). استنتجنا من هذه الدراسة بان ارتفاع مستوى الTSH يؤدي الى ارتفاع مستوى الكورتيزول في مرضى قصور الغدة الدرقية مع زيادة مستويات الانسولين والمصاحبة لزيادة مقاومة الانسولين وزيادة معامل كتلة الجسم BMI. | The present study aimed to investigate the cortisol levels and insulin resistance and their relationship with increasing level of Thyroid stimulating hormone (TSH) in the hypothyroid male patients. The study was carried on 48 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Baghdad province. The study began on10/10/2014to 14/2/2015.The subjects were divided into 2groups (control and hypothyroid).Each group included 24 males, their ages ranged between 20 - 60; 20 - 56years respectively. The results showed a highly significant (P˂ 0.01) increase in the level of TSH in overt hypothyroid patients (41.74± 3.61mu/l) in comparison with control (1.97± 0.264mu/l). Levels of T4nmol/L (48.59 ± 0.98) showed a significant (p˂0.01) decrease in comparison with control (80.12±3.09). T3nmol/L levels were not significantly (p≥0.05) between two groups (1.31±0.14); (1.52±0.083) respectively. Cortisol levels (274.08±9.37) ng/ml increased significantly (P<0.01)in the patients group in comparsion with control group (174.33±13.55). Insulin (15.13±1.14)µIU/ml increased significantly (P<0.01) in the patients group in comparison with control. (8.28 ± 0.76(Glucose levels mmol/l in patients (4.84±0.15) and control group (4.98±0.11) were not significant (p≥0.05). HbA1c (%) levels in the study groups (5.50±0.18; 5.50±0.18) were not significant (p≥0.05). Insulin resistance (%) increased significantly (P<0.01) in patients group(3.39 ±0.29)when compared with control group (1.81±0.16). Body mass index (kg/m2) increased significantly (P<0.01) in patients group (25.81±0.39) in comparison with control group (23.72± 0.49). High arterial blood pressure in patients group (11.58 ± 0.37) was not significant (P≥0.05) in comparison with control group (11.46± 0.22). Low arterial blood pressure in patients group (9.04±0.40) was not significant (P≥0,05) in comparison with control group(8.46±0.23). Mean of age was (39.00±1.92;35.54±2.29) in both groups. There is a positive correlation (0.65) between cortisol and TSH at (P<0.01) level in patient group; while cortisol showed negative correlation ( - 0.32) between cortisol and T4 at (p<0.05). Cortisol showed non - significant (p≥0.05) negative correlation ( - 0.18) with T3. Insulin and glucose showed positive (0.09) non - significant correlation (p≥0.05).Insulin and HbA1C% showed ( - 0.09) non - significant correlation (0.42).TSH & Insulin in patients group showed positive (0.36) significant correlation (P<0.01). TSH & Glucose in patients group showed negative( - 0.16) non - significant (p≥0.05) correlation. TSH & HbA1C% in patients group showed positive (0.05) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and glucose correlation was positive (0.32) significantly (p≤0.05) in patients group. Insulin resistance & HbA1C% in patients group showed negative ( - 0.08) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and BMI showed positive (0.33) significantly (p≤0.05).BMI and TSH showed significant (P<0.01) positive (0.39) correlation. BMI & T4 showed significant (P<0.01) negative ( - 0.36) Correlation in patients groups. BMI & T3 showed positive (0.002) non - significant (p≥0.05) correlation. BMI & Age showed negative ( - 0.001) non - significant (p≥0.05). We concluded from this study that increasing levels of TSH causing an elevation of cortisol levels among hypothyroid patients with increasing insulin levels accompanied by increased insulin resistance and BMI index.

استخدام بعض المثيرات اللاحياتية في زيادة بعض مركبات الايض الثانوي لنبات السبحبــــــح Melia azedarach L. بزراعة الانسجة == In vitro use of some abiotic elicitors to increase secondary metabolites production of Melia azedarach L

Author name: طه علاوي احمد
Supervisor name: سعدية حسن محمود | الاء جبار طه
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية, قسم علوم الحياة, كلية العلوم, الجامعة المستنصرية بهدف زيادة انتاج بعض مركبات الايض الثانوي في المزارع النسيجية لنبات السبحبحMelia azedarach L. ومقارنة انتاجيتها مع انتاجية النبات الكامل. تم تعقيم الاجزاء النباتية (بذور , اوراق) باستخدام مادة هايبوكلورات الصوديوم بتركيز 1% لمدة 5 دقائق , 2% لمدة 10 دقائق للاوراق والبذور على التوالي. استبعدت البذور لعدم استجابتها للانبات ولاستحثاث الكالس. استحث الكالس من زراعة الاوراق الفتية المفصولة من النبات على الوسط الغذائي MS بوجود تراكيز مختلفة من منظمي النمو Benzyl adenine (BA) و2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) بالتراكيز 0.0, 0.5., 1.0, 1.5 او 2.0 ملغم/لتر, كما استخدم الوسط الغذائي MS بوجود تراكيز مختلفة من منظمي النمو IBA) Indolebutyric acid) بتركيز (3.0,2.0,1.0 او 4.0) ملغم/لتر وBA بتركيز (0.5 او 1.0) ملغم/لتر. اظهرت النتائج ان 2,4 - D بتركيز 1ملغم/لتر قد اعطى اعلى معدل للنسبة المئوية لاستحثاث الكالس بلغت 90% واعلى معدل للوزن الطري بلغ 618.4 ملغم, وقد استعملت التوليفة اعلاه لادامة الكالس المستحث, وكان الحضن في الظلام افضل. اما الوسط الحاوي على IBA, BA فلم يكن فعالا في استحثاث الكالس. قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهازHigh Performance Liquid Chromatography ((HPLC لعينات المستخلص الميثانولي للاوراق والمزارع النسيجية للكالس. تميز المستخلص الميثانولي للكالس بارتفاع محتواه من بعض تراكيز المركبات الثانوية مقارنة بمستخلص الاوراق. وبغية زيادة انتاج المركبات الثانوية وظفت مثيرات كيميائية وفيزيائية تضمنت حامض الساليساليك (Salicylic acid) بالتراكيز 50, 100, 150 او 200 ملغم /لتر, ونترات الفضة Silver nitrate)) بالتراكيز 0.1, 0.2, 0.3 او 0.4 ملي مولر, والضوء (Light) لفترات التعرض لـ 24 ساعة ظلام, 12 ساعة ضوء, 16 ساعة ضوء, 24 ساعة ضوء والاشعة فوق البنفسجية ((Ultraviolet كانت مدة التعريض 10 او 20 دقيقة. استنتج من تاثير العوامل الكيميائية والفيزيائية ان الاشعة فوق البنفسجية كانت الافضل في زيادة الوزن الطري والجاف للكالس. وان الضوء كان الاكثر تاثيرا في زيادة تراكيز المركبات الثانوية في المزارع النسيجية لكالس نبات السبحبح اذ بلغــــت لمركـــــب (p - hydroxy benzoic acid ) 00.0805, ولمركــــــــب (p - cinamoylmelianolone) 0.1461, ولمركب ((Azadirachtin 0.6234, ولمركــــب (1 - cinnamoyl - 3,11 - dihydroxymeliacarpin) 0.1983, ولمركب (Salanin) 0.1846 ملغم/غم. واوضحت النتائج ان جميع المعاملات سواء الفيزيائية والكيميائية ادت الى زيادة تركيز مركب الازادرختين Azadirachtin مقارنة بمعاملة السيطرة, وبلغ اعلى تركيز له 0.7262 ملغم/غم عند استخدام نترات الفضة بتركيز 0.3 ملي مولر. | This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biology Department, College of Science, Al - Mustansiriyah University. The major objective of this study was to elicitation of some secondary metabolites using abiotic elicitors added to the tissue culture medium of Melia azedarach L. plants. The productivity was compared with those produced by the intact plants. Plant parts (seeds and leaves) were disinfected by NaOCl at 1% for 5 min and 2% for 10 min respectively. Callus was initiated on leaves explants grown on MS medium supplemented with Benzyl adenine (BA) and 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) at concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l and another medium supplemented with Indole butyric acid (IBA) at concentrations 1.0, 2.0, 3.0 or 4.0 mg/l and Benzyl adenine (BA) at concentrations 0.5 or 1.0 mg/l. Results showed that 2, 4 - D at 1.0 mg/l was the most effective for increasing the percentage of callus induction reached 90% and the mean highest fresh weight reached 618.4 mg. The same combination was used for callus maintenance. The quality and quantity of phytochemicals were investigated using methanol extracts of leaves and Callus tissues were analyzed using High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Results also showed an increase of secondary metabolites concentration in methanol extracts of callus cultures. Callus cultures were treated with chemical and physical elicitors, namely : salicylic acid (SA) at the concentrations 50, 100, 150 or 200 mg/l, silver nitrate (AgNO3) at the concentrations 0.1, 0.2, 0.3 or 0.4 mM, and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the UV exposure time was 10 or 20 minutes. Results showed significant differences between the various treatments. UV increased callus fresh and dry weight. The highest concentration of secondary metabolites in callus cultures of Melia azedarach L. were obtain by light treatment, (p - hydroxy benzoic acid) 0.08050, (p - cinamoylmelianolone) 0.1461, (Azadirachtin) 0.6234, (1 - cinnamoyl - 3,11 - dihydroxymeliacarpin) 0.1983, (Salanin) 0.1846 mg\g. Results also showed that all chemicals and physical treatment led to increase concentration of Azadirachtin compared to control treatment and the highest concentration reached to 0.7262 mg\g when using silver nitrate at 0.3 mM.

دراسة وراثية مناعية للمصابات بداء انتباذ بطانة الرحم == Immunogenetic Study in Endometriosis Patients

Author name: ضياء جواد كاظم القاضي
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | علي حسين ادحية
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى تقييم الخلفية المناعية والوراثية - المناعبة لمرض انتباذ بطانة الرحم في عينة من المريضات العراقيات. تمثلت معايير التقييم بمايلي : مجاميع الدم ABO ومستضدات خلايا الدم البيض البشرية من الصنف الاول (A وB وC) والثاني (DR وDQ) وواسمات الخلايا اللمفية المحيطية (CD3 وCD4 وCD8 وCD56) والمستوى المصلي للحركيات الخلوية (IL - 4 وIL - 6 وIL - 10 وIFN - γ) والمستوى المصلي الكلي للغلوبيولينات المناعية (IgA وIgG وIgM) وبروتينات المتمم (C3 وC4) والبلعمة والمستوى المصلي لهرمون الحليب (Prolactin) والهرمونين الجنسيين FSH وLH.شملت الدراسة 54 امراة من المصابات بمرض انتباذ بطانة الرحم واللاتي كن مراجعات لمستشفى العلوية للنسائية والتوليد (بغداد) خلال الفترة اذار 2005 - كانون الثاني 2006. وكان معدل العمر لهن ± الخطا القياسي عند التشخيص 27.3 ± 5.4 سنة. شملت الدراسة ايضا عدد مماثل من النساء غير المريضات (عينة سيطرة) والمطابقات للمريضات من ناحية العمر (25.1 ± 6.7 سنة) والعرق (عراقيات عربيات).توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت مجموعة الدم A تكرارا مرتفع معنويا (Pc = 0.016) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (48.1 مقابل 22.2%)، في حين اظهرت مجموعة الدم O تكرارا منخفض معنويا (Pc = 4 x 10 - 4) في المريضات (5.6 مقابل 35.2%).2. اظهرت ثمانية من مستضدات خلايا الدم البيض البشرية تكرارا مرتفع معنويا في المريضات، وهي A28 (59.3 مقابل 14.8%) وB7 (66.7 مقابل 9.3%) وB12 (68.5 مقابل 16.7%) وB27 (46.3 مقابل 7.4%) وCw6 (44.4 مقابل 1.9%) وCw7 (68.5 مقابل 20.4%) وDR1 (59.3 مقابل 24.0%) وDR11 (27.8 مقابل 5.6%)، في حين اظهر مستضدان اخران تكرارا منخفض معنويا في المريضات وهما A19 (14.8 مقابل 44.5%) وB5 (5.6 مقابل 44.5%). وعند تقدير النمط الفرداني (HLA - halpotype) اتضح بان Cw7 هو اكثر المستضدات تكرارا في الانماط الفردانية المقدرة (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. اظهرت الخلايا اللمفية الموجبة للواسم CD3 (30.6 مقابل 60.5%) والواسم CD4 (13.4 مقابل 30.9%) تكرارا منخفض معنويا في المريضات، في حين لم تظهر الخلايا الموجبة للواسم CD8 فرقا معنويا ولكن كانت النسبة CD4/CD8 هي الاخرى منخفضة معنويا في المريضات (0.65 مقابل 1.6). اما الخلايا الموجبة للواسم CD56 فقد كان تكرارها في المريضات مرتفع معنويا عند المقارنة مع السيطرة (18.1 مقابل 10.6%).4. ارتفع المستوى المصلي معنويا (P ≤ 0.001) للحركي الخلوي IFN - γ في مريضات انتباذ بطانة الرحم عند المقارنة مع السيطرة (47.69 مقابل 21.26 بيكوغرام/مل)، وقد لوحظ ذلك ايضا للحركيات الخلوية IL - 4 (13.49 مقابل 10.47 بيكوغرام/مل) وIL - 6 (37.05 مقابل 22.11 بيكوغرام/مل) وIL - 10 (36.66 مقابل 20.74 بيكوغرام/مل) ولكن بمستوى اقل من المعنوية (0.05 و0.01 و0.01، على التوالي). ولمزيد من الفهم لدور الحركيات الخلوية في مرض انتباذ بطانة الرحم، فقد حسبت النسبة مابين IFN - γ وكل من IL - 4 وIL - 6و IL - 10 وكذلك مابين IL - 6 وكل من IL - 4 وIL - 10. اظهرت النسب الخمسة المحسوبة ارتفاعا في المرضى، ماعدا النسبة IL - 6/IL - 10 فقد كانت متقاربة في المريضات ونساء السيطرة,5. اظهرت الغلوبيولينات المناعي الثلاث (IgA : 172.7 مقابل 124.6 ملغم/د.لتر؛ IgG : 1437.9 مقابل 1126.3 ملغم/د.لتر؛ IgM : 159.3 مقابل 113.4 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي مرتفع معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.6. اظهر بروتيني المتمم (C3 : 72.3 مقابل 152.1 ملغم/د.لتر؛ C4 : 16.7 مقابل 32.3 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي منخفض معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.7. اظهر معامل البلعمة انخفاضا معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (17.37 مقابل 49.68%)، وكذلك الحال بالنسبة لمعامل NBT فقد انخفض هو الاخر معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات (21.18 مقابل 65.80%).8. لم يظهر المستوى المصلي لهرمون الحليب او هرمون LH فرقا معنويا مابين المريضات والسيطرة، وعلى العكس من ذلك فقد ارتفع معنويا (P ≤ 0.05) المستوى المصلي لهرمون FSH في المريضات مقارنة بنساء السيطرة (11.85 مقابل 6.06 ملي وحدة دولية/مل). | The present study aimed to evaluate immunological and immunogenetic backgrounds of endometriosis in a sample of Iraqi patients. The parameters of evaluation were ABO blood groups, HLA - class I (A, B and C) and - class II polymorphisms, peripheral lymphocyte markers (CD3, CD4, CD8 and CD56), serum level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IFN - γ), total serum level of immunoglobulins (IgA, IgG and IgM) and complement components C3 and C4, phagocytosis and serum level of prolactin and sex hormones (FSH and LH).Fifty four female patients with endometriosis were investigated. The patients were referred to the Al - Alwayia Hospital for Gynecology and Obstetrics (Baghdad) during the period March 2005 - January 2006. Their age's main ± standard error at the time of diagnosis was 27.3 ± 5.4 year. A similar number of healthy females (control sample) was included in the study, and they matched patients for age (25.1 ± 6.7 year) and ethnicity (Iraqi Arabs).The Study reached the following results : 1. Blood group A showed a significant (Pc = 0.016) increased frequency in patients as compared to controls (48.1vs. 22.2%), while blood group O showed a significant (Pc = 4 x 10 - 4) decreased frequency (5.6 vs. 35.2%). 2. Eight HLA antigens showed a significant increased frequency in patients. They were A28 (59.3 vs. 14.8%), B7 (66.7 vs. 9.3%), B12 (68.5 vs. 16.7%), B27 (46.3 vs. 7.4%), Cw6 (44.4 vs. 1.9), Cw7 (68.5 vs. 20.4), DR1 (59.3 vs. 24.0%) and DR11 (27.8 vs. 5.6%). Two further antigens showed a significant decreased frequency in the patients, and they were A19 (14.8 vs. 44.5%) and B5 (5.6 vs. 44.5%). HLA - halpotype estimation revealed that Cw7 occurred most frequently in most of the estimated haplotypes (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. Peripheral lymphocytes positive for CD3 (30.6 vs. 60.5%) and CD4 (13.4 vs. 30.9%) showed a significant decreased frequency in patients, while CD8+ lymphocytes showed no significant difference. The CD4/CD8 ratio also showed a significant decrease (0.65 vs. 1.6). The only cells that showed a significant increased frequency were CD56+ cells (18.1 vs. 10.6%). 4. Interferon - γ showed a significant (P ≤ 0.001) increased serum level in endometriosis patients as compared to controls (47.69 vs. 21.26 pg/ml). The same increase was observed for IL - 4 (13.49 vs. 10.47 pg/ml), IL - 6 (37.05 vs. 22.11 pg/ml) and IL - 10 (36.66 vs. 20.74 pg/ml), but with a lower level of significance (P ≤ 0.05, 0.01 and 0.01, respectively). For a further understanding of cytokines in endometriosis, the ratio of IFN - γ to IL - 4, IL - 6 and IL - 10, as well as, the ratio of IL - 6 to IL - 4 and IL - 10 were assessed. The five assessed ratios were increased in the patients as compared to controls, with the exception of IL - 6/IL - 10 ratio, which came approximated in patients and controls. 5. The three immunoglobulins (IgA : 172.7 vs. 124.6 mg/dL; IgG : 1437.9 vs. 1126.3 mg/dL; IgM : 159.3 vs. 113.4 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) increased serum levels in patients as compared with controls. 6. Both complement components (C3 : 72.3 vs. 152.1 mg/dL; C4 : 16.7 vs. 32.3 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) decreased serum levels in patients as compared with controls. 7. The phagocytic index was significantly (P ≤ 0.001) decreased in the patients as compared with controls (17.37 vs. 49.68 %). Similarly, the NBT index was also significantly (P ≤ 0.001) decreased (21.18 vs. 65.8 %) in the patients. 8. Serum level of prolactin and luteinizing hormone (LH) hormones showed no significant difference between patients and controls. In contrast, the follicle stimulating hormone (FSH) showed a significant (P ≤ 0.05) increased serum level in endometriosis patients as compared with controls (11.85 vs. 6.06 mIU/ml).

دراسة وراثية وجزيئية لعزلات محلية مرضية من بكتريا Klebsiella المقاومة للمعادن الثقيلة والمنتجة لانزيم B - Lactamase == A Genetic and Molecular Study of Local Pathological Isolates from Klebsiella Resistant to Heavy Metal and Productive of ? - Lactamase Enzymes

Author name: صلاح مهدي حسن السعدون
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (536) عينة ادرار من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من اربعة مستشفيات في بغداد للفترة الواقعة من 22/12/2004 - 27/5/2005.2 - من خلال نتائج الزرع البكتريولوجي الاولي استطاعت (286) عزلة (63.8%) من النمو باستخدام وسطي اكار الماكونكي واكار الدم وقد كان من بينها (85) عزلة مخاطية وبنسبة (29.7%)، فيما اظهرت نتائج التشخيص المورفولوجي والكيموحيوي للعزلات المخاطية ومن خلال نتائج استخدام نظام Api 20E عائدية (36) عزلة الى جنس الكلبسيلا، توزعت مابين (18) عزلة للنوع K.planticola K.pneumoniae و(7) و(6) عزلات للنوع عزلات للنوع K.terrigena و(4) عزلات للنوع K.oxytoca و(1) عزلة للنوع K.ornithinolytica. 3 - تم التحري عن عدد من عوامل الضراوة لانواع الكلبسيلا، اذ اظهرت نتائج الفحص المجهري باستعمال طريقة التصبيغ السالب ان العزلات جميعها (100%) محاطة بمحفظة، كما بينت جميع العزلات (100%) عدم قدرتها على انتاج الهيمولايسين، بينما اظهرت (61.1%) من العزلات قدرتها على انتاج السايدروفورات بنموها في الوسط الحاوي 2 - 2 ثنائي بايريديل (M9)، واظهرت جميع العزلات ايضا (100%) قابلية الالتصاق بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار اناث صحيحات، فيما كان (66.6%) من العزلات منتجة للبكتريوسين.4 - اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز باستخدام الطريقة اليود القياسية السريعة، اذ اظهرت (23) عزلة (63.8%) قدرتها على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز بهذه الطريقة، بفترات تراوحت مابين اقل من دقيقة الى (5) دقائق.5 - اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف باستخدام الطريقة الثلاثية الابعاد (غير المباشرة)، واظهرت النتائج بان 18 عزلة من مجموع 36 (33.3%) لها القدرة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف توزعت مابين 5 عزلات من مجموع 18 (27.7%) للنوع K.planticola و3 عزلات من مجموع 6 (50%) للنوع K.pneumoniae وعزلتان من مجموع 7 (28.5%) للنوع K.terrigena وعزلة واحدة من مجموع 4 (25%) للنوع K.oxytoca وعزلة واحدة فقط من مجموع 1 (100%) للنوع K.ornithinolytica.6 - اجري اختبار الحساسية للمضادات لجميع العزلات تجاه (24) مضادا للحياة، لقد اظهرت جميع العزلات نمط المقاومة المتعددة، اذ كانت (100%) من العزلات مقاومة للامبسلين والكاربنسلين والببراسلين والسيفالوكسين، بينما كانت العزلات جميعها حساسة للاميكاسين والسفيبيم والاميبينيم والنورفلوكساسين، فيما تفاوتت نسب المقاومة لباقي المضادات.7 - حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من البنسلينات والسيفالوسبورينات ومجموعة الامينوكلايكوسيدات والكينولونات وغيرها من المضادات، واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في قيم الـMIC بين الانواع البكتيرية المختلفة سيما المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف، فقد استطاعت اغلب العزلات مقاومة تراكيز عالية من الامبسلين، والكاربنسلين والببراسلين والسسيفالكسين غير انه لم تستطع سوى عزلات قليلة وبضمنها المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف من النمو في تراكيز عالية من الاميكاسين (AK)، والسيفيبيم (PEF)، والامبينيم (IMP)، والنورفلكساسين (NX)، والسيروفلكساسين (CF).8 - درست قابلية العزلات على تحمل تراكيز مختلفة من المعادن الثقيلة وذلك بانمائها على اوساط ضمت تراكيز مختلفة من تلك المعادن. وقد اظهرت النتائج انخفاضا في مستوى تحمل البكتريا للمعادن الثقيلة، وكان هنالك اختلافا واضحا من بين تلك العزلات لتحمل معدن النحاس، الكروم، الكوبلت، الزنك، الكادميوم، الزئبق، الرصاص، الفضة. 9 - تمت دراسة محتوى الدنا البلازميدي لمجموعة من العزلات والتي اظهرت مديات عالية من المقاومة لمضادات الحياة والمعادن الثقيلة، وبينت النتائج احتواء معظم العزلات على اكثر من حزمة بلازميدية واحدة، بينما خلت بعض العزل من اي حزم وبذلك تصبح مقاومة للمضادات والمعادن الثقيلة فضلا عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز صفة الكروموسومية.10 - اجري فحص الاقتران البكتيري مابين عزلات منتقاة من انواع بكتريا الكلبسيلا اتسمت بمقاومتها العالية الى اكثر من مضاد وتحملها للمعادن الثقيلة فضلا عن انتاجها لانزيمات البيتالاكتاميز وبين السلالة القياسية E.coli MM294، وقد استطاعت 9 عزلات من مجموع 14 عزلة تحقيق عملية الاقتران بنجاح (وبنسبة 64.2%) فيما اخفقت 5 عزلات، واستطاعت الخلايا الاقترانية الناتجة من التزاوج من النمو على اوساط الاختبار الحاوية على مضادي الامبسلين والريفامبسين معا. 11 - تم التحري عن المحتوى البلازميدي للخلايا الاقترانية ووجد ان اغلب البلازميدات كانت قد انتقلت من السلالة الواهبة متمثلة بالعزلات قيد الدراسة الى السلالة القياسية، اذ استطاعت 7 عزلات اقترانية من مجموع 9 وبنسبة (77.7%) من اعطاء فحص انزيم البيتالاكتاميز موجب ونسبة (77.7%) لفحص التحري عن ESBLs. فضلا عن ذلك فقد انتقلت مقاومة مشتركة لاكثر من مضاد حيوي ومعدن ثقيل للخلايا الاقترانية مما يدل على ان هذه الصفات محمولة بلازميديا. | 1 - This study included the collection of 536 urine samples from patients suffering urinary tract infection from four hospitals located in Baghdad to the period between 22/12/2004 - 27/5/2005. 2 - Using MacConkey blood agar in primary bacterialogical culture, 286 isolates (63.84) were grown, among them 85 isolate (29.71) were mucoid. Result of morphological & Biochemical diagnosis besid using Api 20E showed there were 36 isolates related to genus Klebsiella. These comrised as K.planticola (18 isolates), K.terrigena (7 isolets) and K.pneumonia (6 isolates) & K.oxytoca (4 isolates) and one isolates of K.ornithinolytica. 3 - Some virulence factors of Klebsiella species were detected. Microscopic examination using negative stain revealed that all the isolates (100%) were capsulated, besid they were unable to produce heamolysine. While (16.1%) of the isolate were siderophore producer when they showed their ability to grow in 2 - 2 dipyridyl media (9M media). All the isolates (100%) showed adherence ability to epithelial cell isolated from urine of healthy women, whereas 66.6% of the isolates were bacteriocin producer. 4 - The rapid standard iodometric method was used for the dection of B - lactamase production. Results showed that 23 isolate (63.84) were B - lactamase producer and the time of positive results ranged from less than (1 - 5)mins. 5 - The indirect three - dimentional method was performed to detect the Extended - spectrum B - lacatamase (ESBLs). Results revealed that only 18 isolates (33.3%) were ESBLs producer. These comprised 5 isolated from 18 (27.7) to K.planticola, 3 isolates from 6 (50%) to K.pneumonia, 2 isolates from 7 (28.5%) to K.terrigena, one isolates from 4 (28%) to K.oxytoca & one isolate (100%) to K.ornithinolytica. 6 - Antibiotic sensitivity test was performed using 24 different antibiotic. All isolates showed multidrug resistance. Results showed that all the isolate (100%) were able to resist Ampicillin, Carbencillin, Piperacillin, Cephalexin, while they were sensitive towards Amikacin, Cefepime, Imepinem and Norflaxacin. Resistance rate to other antibiotic were variant. 7 - The minimal inhibitory concentration (MIC) for Penicillins & Cephalosporins, Aminoglycoside group, Qinolones & other antibiotics were determined. Considerable differences observed between the MIC for ESBLs producer isolates and the non - producer - both groups were able to resist high concentration of Ampicillin, Carbenicillin, Piperacillin & Cephalexin while only the ESBLs producer outcome of non - producer isolates were able to grow in considerable concentration of Amikacin, Cefepime, Imepinem, Norflaxacin & Ceprofloxacin. 8 - The ability to tolerate different concentration of heavy metals were studied by growing them in media containing different concentration of these metals. There were great differences & decreas & in the level of bacterial tolerance to heavy metals including (Cu, Cr, Co, Zn, Cd, Hg, Pb, Ag) while many isolates could not tolerate low concentration of copper nor chrome. 9 - Plasmid profile of some isolated specially these showed high antibiotic & heavy metal resistance were determined. Result showed that most of the isolates examined harboured more than one plasmid band. While some isolates were plasmidless, A condition implying that B - lactamase production, antibiotic & heavy metal resistance are under chromosomal control. 10 - Bacterial conjugation was performed between selected isolates of Klebsiella specially those with high antibiotic resistance, heavy metal tolerance, besid B - lactamase production and the standard strain E.coli MM294. There were (9) successful conjugation from 14 (64.2%). The transconjugant cells were able to grow of selective media containing both of Ampicillin & Rifampicin. 11 - Studying plasmid profile of transconjugated cells showed that most the plasmid were transferred from the donore (represented by bacterial isolated) to recipient (the stander stranted). Out of 9, 7 transconjugant cells (77.7%) gave positive result to B - lactamase production & ESBLs. In addition multidrug resistance & heavy metal tolerance were transferred to the transconjugant cells, a condition implying that they are plasmid mediated.

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

Author name: علاء سالم حمزة
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة وراثية للبكتريوسين المنتج من بكتريا Klebsiella spp. المعزولة من مصادر سريرية مختلفة

Author name: علاء سالم حمزة حبيب
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع (200) عينة سريرية توزعت الى (50) عينة ادرار و(50) عينة قشع و(50) عينة من التهابات الاذن الوسطى و(50) عينة من اصابات الجروح والحروق، ومن خلال نتائج الزرع البكتريولوجي على اوساط اكار الماكونكي واكار الدم ووسط Eosin Methylen Blue , والتشخيص المظهري والكيموحيوي، وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API20E ، تم الحصول على( 40 ) عزلة تعود لبكتريا Klebsiella. توزعت الى 20 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و(11) عزلة للنوع K.oxytoca و(9) عزلات تعود للنوع K.planticola . تم الكشف عن مدى قابلية العزلات على انتاج البكتريوسين بثلاث طرائق تضمنت : طريقة الحفر (wells)، وطريقة اقراص الاكار cup assay))، وطريقة التخطيط المتقاطع ( (cross - streaking assay. وتم الحصول على سبع عزلات منتجة للبكتريوسين . تم استخلاص البكتريوسين بنوعيه المرتبط بالجدار وغير المرتبط بالجدار , واظهر البكتريوسين الخام المرتبط بالجدار فعالية عالية مقارنة بالبكتريوسين غير المرتبط بالجدار , وكانت فعالية البكتريوسين المرتبط بالجدار (5120) وحدة/مل، وكان تركيز البروتين (4000) مكغم/مل وقطر منطقة التثبيط (20) ملم , بينما كانت الفعالية للبكتريوسين غير المرتبط (320) وحدة/مل وتركيز البروتين (500 )مكغم/مل وقطر منطقة التثبيط (15) ملم . اظهر البكتريوسين الخام المرتبط بالجدار تاثيرا على مجموعة من البكتريا المرضية تضمنت Enterobacter sakazaki ، Shigella flexneri، E. coli، Acinetobacter baumannii ، Enterobacter aerugenes ، K.planticola Proteus mirabilis ، Serratia marcescens، Enterococcus fecalis ، Staphylococcus aureus . ولم يظهر البكتريوسين فعالية على Enterococcus faecalis ، Serratia marcescens ، Proteus mirabilis ، Pseudomonas aeruginosa تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحيوية للعزلات البكتيرية المنتجة للبكتريوسين، فقد تم استخدام (13) مضادا حيويا شملت كل من ( Cefotaxim وGentamycin وNorfloxacinو Nitrofurantoinو Amikacinو Ampicillin وTrimethoprimو Pipracillinو AztreonamوImipenem وCiprofloxacin وAugmentin وCephalexin ) وتم اختيار العزلات الاكثر مقاومة لهذه المضادات لاكمال الجانب الوراثي . تمت دراسة المحتوى البلازميدي للعزلات الاربعة (K2, K4, K20,K38) التي كانت اكثر مقاومة لمضادات الحيوية , وبينت النتائج احتواء العزلة(K4 )على حزمتين بلازميديتين، اما العزلات الاخرى فقد احتوت على حزمة بلازمية واحدة , ثم اجريت عملية تحييد الدنا البلازميدي باستخدام مادتي SDS ومادة Acridin orange , لم تنجح مادة SDS في تحييد الحزم البلازميدية , بينما نجحت مادة Acridin orange في تحييد الحزم البلازميدية عند تركيز (512) مايكروغرام/مل .تم التحري عن قابلية العزلات المحيدة على انتاج البكتريوسين والمقاومة لبعض مضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة واظهرت النتائج فقدان العزلات (K2, K4, K38) لصفة انتاج البكتريوسين، واحتفاظ العزلة ((K20 بصفة انتاج البكتريوسين. بالنسبة لمضادات الحيوية , احتفظت العزلات بمقاومتها لمضادات Ciprofloxacin وNorfloxacin وTrimethoprim , اما بقية المضادات والتي شملت كل من Pipracillin وAztreonamو Ampicillin وCefotaximو Gentamycinو Nitrofurantionو Amikacinو Cephlexin وAugmentin، فقد اصبحت العزلات حساسه لها.اجري فحص الاقتران البكتيري بين العزلات (K2, K4, K20,K38) والعزلة القياسية E.coliMM294, وقد نجحت العزلتان ( K2, K4) في تحقيق عملية الاقتران بينما فشلت العزلتان (K20,K38) في تحقيق عملية الاقتران , وقد اكتسبت العزلة القياسية صفة انتاج البكتريوسين والمقاومة لمضادات الحيوية قيد الدراسة . | The study included (200) clinical sample, (50) urine,(50) sputum , (50) sample of otitis media and (50) sample with injuries and burns. Morphological and biochemical tests were employed to diagnose bacterial species and the results showed they were (40) isolates.They were (20) K.pneumoniae ,(11) isolates of K.oxytoca and(9) isolates of K.planticola. The ability of isolates to produce bacterocin were detected by three methods included the methods of wells, cup assay method, and cross - streaking assay. Results revealed that(7) isolates were able to produce bacteriocin.The wall - degraded bacteriocin was (5120) unit\ml, and protein concentration was (4000) μg/ml and the diameter of inhibition area was 20mm, while non wall - degraded was (320)unit\ml and the protein concentration (500) µ\ml and the inhibition area (15) mm. The effect of crude bacteriocin on some clinical isolates including Enterobacter sakazakii,S.auereus, K.oxytoca , Shigella flexneri, E. coli, Acinetobacter baumannii, K. planticola and Enterobacter aerogenes was studied. The results showed thier was effect on the above isolates, while the isolates of Proteus mirabilis, Serratia marcescens, Enterococcus fecales and Ps.aeruginosa were resistant to bacteriocin. Sensitivity of isolates that produced the bacteriocin was tested against (13) antimicrobial agents included (Cefotaxime, Gentamycin, Norfloxacin, Nitrofurantoin, Amikacin, Ampicillin, Trimethoprim, Pipracillin, Aztreonam, Ciprofloxacin, Imipenem ,Augmentin and Cephalexin). Results revealed that four isolates were resistant to the antibiotics. The plasmid content of the four isolates (K38, K20, K4, K2) which were the most resistant to the abovementioned antibiotics was studied ,The results showed That these isolates contain plasmids of different molecular weight. Curing was conducted by the use of SDS and Acridin orange. The isolates lost the plasmids at concentration 512µg/ml of Acridin orange. The production of bacteriocin and the resistance of the four selected isolates to the antibiotics were studied. The results showed that three of the examined isolates were unable to produce bacteriocin, they were (K38, K4, K2).The fourth isolate(K20) was able to produce bacteriocin.The four isolates appeared to resist the antibiotics Trimethoprim, Ciprofloxacin and Norfloxacin, while they were sensitive to the other antibiotics. The bacterial conjugation between (K38, K20, K4, K2) isolates and the standard strain E.coli MM294 was studied. The results showed That (2) isolates (K4, K2) were successful in transferring plasmids , while the other two (K20, K38) failed. The transconjugants were able to produce bacteriocin and resist Antibiotics.

تقدير مستوى انترلوكين - 1 - بيتا وانترلوكين - 6 في مصول وادرار اطفال مصابين بالتهاب الحويض والكليه الحاد == Estimation of IL - 1? and IL - 6 in Sera and Urine of Acute Pyelonephritis Patients

Author name: علاء لعيبي عبد الله الصرخي
Supervisor name: انتصار ناظـم خلخال
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد التهاب الحويض والكلية الحاد من الامراض المعدية الشائعة في الاطفال وقد يؤدي الى تلف الكلى الدائم.صممت هذه الدراسة لغرض قياس مستويات اثنين من الانترلوكينات المهمة خلال الاصابة البكتيرية هما IL - 6 او IL - 1β، لدى الاطفال المصابين بالتهاب الحويض والكلية الحاد ولتحقيق هذا الهدف فقد جمعت (95) عينه ادرار ودم من اطفال باعمار تتراوح من (2شهر - 12عام) يعانون من حمى,حرقة عند التبول, وكثرة التبول (زيادة عدد مرات التبول) في مستشفى ابن البلدي للاطفال ومستشفى حميات للاطفال (بغداد) لمدة خمسة اشهر فضلا عن (20) عينه ادرار ودم لاطفال اصحاء من نفس الفئة العمرية عدت كمجموعة سيطرة. شخص 26 من الاطفال المصابين بالتهاب الحويض والكلية الحاد بواسطة الاعراض السريرية المميزة (حمى,غثيان,قيء, الم في الخاصرة , مع عسر وكثرة التبول) من قبل الاخصائي بالامراض البولية كما تم تاكيد التشخيص بالفحوصات المختبرية المتوفرة فضلا عن اجهزة الكشف بالموجات فوق الصوتية. كانت نتائج النسب المئوية للمظاهر السريرية للمصابين (الحمى,كثرة التبول,الم خاصرة، عسر التبول,والغثيان او القيء (88,4%, 83,3%, 61,5 %, 53,8%, 34,6%) على التوالي.اما نسب الحالات الاخرى (المعقدة) فكانت : 34,4% مع ارتداد مثاني, 23% مع hydronephros،19,2%يعانون من فشل كلوي حاد, 7,6% حصى الكلية 3,6% مع ارتفاع ضغط الدم.اظهرت النتائج ان النسبة المئوية للاطفال المصابين من الذكور (65,38%) اعلى من الاناث (34,62) كما ظهرت فروقات معنوية واضحة بين المصابين من الفئات العمرية المختلفة مقارنة مع بعضها وكذلك مع السيطرة,كذلك ظهرت فروقات معنوية مهمة في اعداد الخلايا القيحية والبكتريا البولية فضلا عن تراكيز البروتين البولي عند مقارنتها بين الفئات العمريه ولدى الجنسين كذلك مع السيطرة.شخصت العوامل المسببة للاصابة باستخدام نظام(Vitek2) وتم تاكيد التشخيص عند زرع الادرار على وسط اكار عالي الدقة والخصوصية باصابات المسالك البولية (HiCrome) تعتمد نتيجة التشخيص على التفاعل اللوني بين انزيمات العزلات البكتيرية المختلفة ومكونات الوسط الزرعي المتخصص هذا. واظهرت النتائج ان النسب المئوية للعزلات البكتيرية كانت كالاتي : (50%, 15,38% ,7,6%, 23,09%) لبكترياEnter.fecalis ,S.aureus ,E.coli, اصابة مختلطة باكثر من جنس بكتيري , فضلا عن الخميرة Candida albecans (3,85%)، كما ازدادت اعداد خلايا الدم البيض لاسيما الخلايا العدلة وعلى مستوى (p<0.05) , وبمستوى (p<0.01) عن بروتين CRPلدى الاطفال المصابين مقارنة مع مجموعة السيطرة، بينما لم تظهر اي فروقات معنوية في مستويات اليوريا والكرياتنين في الدم بين المرضى والسيطرة.قيسـت تراكـيز IL - 1β في الادرار والمصل للاطفال المصابين وكانت معدلاتها (1060,09, 571,84) جزء من الغرام/ مل على التوالي واظهرت فروقا معنوية مهمة عند مقارنتها مع معدلاتها في ادرار ومصول اطفال السيطرة ( 34,5, 45,29) جزء من الغرام/ مل عند مستوى معنوية (p < 0.05).لوحظت فروقات معنوية واضحة عند مقارنة معدلات IL - 6 في الادرار والمصل والتي بلغت ( 109,42, 28,86) جزء من الغرام/ مل مع معدلاتها لدى السيطرة (12,59, 6,93) جزء من الغرام/ مل عند مستوى معنوية ((p< 0.05. | Acute pyelonephritis (APN) is a common infectious disease in children may result in permanent renal damage. This study has been designed for measuring the level of IL - 1β and IL - 6 in pediatric APN during bacterial infection .A total of (95) urine &blood sample have been collected from children 2month - 12 years suffering from fever, dysurea, frequency from Dec.2013 - Apr.2014 at Ibn Al - Blady hospital and Welfare Teaching Hospital/ Medical city in Baghdad. Twenty Sample from healthy individuals of the same age range as control group. Twenty - sex patients of APN were included in the present study, those patients have been diagnosed by urologist, the diagnosis have been confirmed by available investigation methods; laboratory tests and ultrasound. Results of clinical features (fever, frequency, loin pain, dysuria and nausea or vomiting) were 88.4%, 83.3%, 61.5%, 53.8%, 34.6% respectively, Others were presented as complicated cases 34.6% with vesicoureteral reflux, 23.0% with hydronephros, 19.2% with acute renal failure, 7.6% with stone and 2.6% with hypertension. The percentage of infected males 65.38% was higher than females 34.62% and clear significant differences (p < 0.01) were noted between patients of different ages groups .Also important differences (p < 0.01) have been appeared in pyuria nembers and bacteruria as well as in proteinuria concentrations when compared between patients of two genders in different age groups to control group. Vitek 2 system has been used for suspected the identification of APN causative agents , diagnosis that was supported by culturing urine samples on high specialized and accurate medium; HiCrome medium which is specific for UTIs, Identification result depend on coloured reaction between microorganism enzymes and some reagents in that culture medium.Results were as following : 50.0% of E. coli , 15.38% of Staphylococcus. aureus , 7.6% of Enterococcus.faecalis ,and 23.09% of mixed infection (more than one bacterial genus), finally the yeast Candida albicans is 3.85%.No significant differences in urea and creatinine levels in patients sera compared to control while white blood cells specially neutrophiles (p < 0.05) as well as C - Reactive protein (p < 0.01) were significantly higher in patients than control. Level of IL - 1β has been measured in urine and serum of patients, the means 1060.09, 571.84 pg/ml respectively , have been clarified important significant differences p < 0.05 in comparison with their levels in controls 34.05, 45.29 pg/ml . Apparent significant differences p < 0.05 have been showed between IL - 6 concentration in urine and serum of patients ,means were; 109.24, 28.86 pg/ml comparing to control 12.59, 6.93 pg/ml .

دور عصيات حامض اللبنيك كنبيت طبيعي للتاثير على البكتيريا المرافقة المعزولة من الجهاز التناسلي الانثوي == The role of Lactobacilli as a normal microflora in preventing vaginal infection

Author name: صبا عبد الهادي مهدي شبع
Supervisor name: اكرام امين خاكي | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت خمسين عزلة لعصيات حامض اللبنيك من اعالي المهبل من نساء متزوجات مصابات بطريقة المسحة High Vaginal Swab(HVS) تراوحت اعمارهن بين 16 - 45 سنة واخضعت جميع العزلات للفحوصات المجهرية والزرعية الى جانب الفحوصات الكيموحياتية.اختبرت قدرة عزلات عصيات حامض اللبنيك على اعطاء افضل فعالية تضادية على وسط MRS الصلب بطريقة الاقراص Cup Assay Methodضد بعض المجاميع المرضية ومن ثم حضرت رواشح للعزلات الفعالة ودرست قابليتها على التثبيط في وسط MRSالسائل استنادا الى طريقة الانتشار في الحفر .Well Diffusion Assay Method اختبر تاثير pH في الفعالية التثبيطية لهذه الرواشح باستخدام قيم مختلفة للاس الهيدروجيني واجري فحص اختبار الحساسية لعصيات حامض اللبنيك. لوحظ مقاومة عصيات حامض اللبنيك لمعظم المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وان فاعلية الرواشح البكتيرية ضد الممرضات المهبلية كانت افضل مقارنة بفاعلية العزلات.عند اجراء التحليل الاحصائي لمقارنة نتائج تقدير الفعالية التضادية لوحظ وجود فروق معنوية بين انواع عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لخميرةCandida على الوسط الصلب وقد امتلك النوع L.jensenii اعلى فاعلية تثبيطية لها كما تباينت رواشح عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لعزلات الاختبار اذ اظهرت هذه الرواشح اعلى تاثيرا ضد خميرة Candida وامتازت بكتريا E.coli بامتلاكها ادنى مستوى تاثر بهذه الرواشح. اعطت رواشح عزلات عصيات حامض اللبنيك افضل فعالية تثبيطية في pH (4) مقارنة بفعاليتها التثبيطية في pH (5,6) على التوالي في حين لم تظهر اي فعالية تثبيطية للرواشح ضد عزلات الاختبار في pH (7) وقد ظهر ذلك واضحا عند اجراء التحليل الاحصائي وقد وجد ان الاس الهيدروجيني المنخفض (4)يملك تاثيرا تثبيطيا ضد البكترية والخمائر المهبلية الممرضة اكثر من الاس الهيدروجيني الاعلى. | Fifty isolates of lactobacillus ssp. were taken from infected married women vagina by high vaginal swab. The age of the women ranged between (16 - 45) years. The isolated lactobacilli were identified by microscopical, cultural and biochemical tests. The effect of these isolates against pathogenic microorganism were tested on MRS agar medium by using cup assay method where as supernatant from active isolates were tested using the well diffusion assay. The effect of pH of the medium on the inhibitory effect of lactobacilli were also tested by using different values of pH. It has been observed that lactobacillus were resistant to most commonly used antipiotics which where used in this staday and the antimicrobial activity of lactobacillus supernatant were best compore with the antimicrobial activity of lactobacillus isolates against vaginal pathogens When the statistical analysis were done to compare the results of antimicrobial activity significant differences were observed between the lactobacilli species in their antimicrobial activity on Candida on solid MRS agar medium and L.casei have the highest antimicrobial activity, also supernatants of lactobacilli species were different in their antimicrobial activity thus these supernatants had highest effect on Candida while E. coli had lower value of effect by these supernatants, also these supernatants showed best antimicrobial activity at pH (4) compard with their antimicrobial activity at pH (5,6) and did not show any antimicrobial activity at pH (7) and that was clear when the statistical analysis were done. It has been found that low pH is more effective on the inhibitory activity of lactobacilli against vaginal pathogenic bacteria and Candida than at higher pH values

دراسة بكتريولوجية وبيئية لمياه نهر دجلة وثلاث محطات تصفية في محافظة بغداد == Bacteriological and Ecological Studies on Tigris River and three Purification Stations in Baghdad province

Author name: صبا حسين محمد النعيمي
Supervisor name: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | خالد خورشيد كاظم البياتي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمن هذا البحث دراسة بعض العوامل الخاصة بمياه الشرب المؤثرة في صحة الانسان في مدينة بغداد . العامل الاول : هو العامل البايولوجي والفيزيائي والكيميائي الذي يؤثر في جودة مياه نهر دجلة . والعامل الثاني يتضمن دراسة كفاءة تعقيم المياه في ثلاثة محطات تصفية منشاة على طول نهر دجلة . اما العامل الثالث فقد تضمن تقييم مياه الشرب في منطقة الشعلة التي تزود بالمياه من احدى محطات التصفية ( محطة الكرامة ). فضلا عما سبق ,فقد تضمنت الدراسة مقارنة بين تلوث الماء من الناحية البكتريولوجية وحالات الاسهال في الاطفال تحت عمر السنتين, الذين قد راجعوا العيادة الخارجية لمستشفى الشهيد باقر الحكيم في منطقة الشعلة . تضمنت الدراسة ايضا تعيين جودة المياه في ثلاث محطات رئيسة للتصفية , وهي محطة شرق دجلة الواقعة شمال دجلة ومحطة الكرامة الواقعة في وسط دجلة فضلا عن محطة القادسية الواقعة جنوب نهر دجلة في مدينة بغداد , اخذت عينات الماء بواقع مكررين شهريا قبل وبعد عملية التصفية من المحطات المذكورة انفا ابتداءا من كانون الاول - 2009 ولغاية ايلول - 2010 . اما التحاليل البكتريولوجية للماء فقد تضمنت تقدير العدد الحي الكلي للبكتريا والعدد الحي الكلي للبكتريا المعوية والعدد الكلي لبكتريا E.coliوبكتريا Pseudomonas aeruginosa. فضلا عن وجود بعض البكتريا المعوية المرضية مثل Vibrio cholera وspp. Salmonella. حيث جمعت 60عينة من مياه النهر و60 من داخل مشاريع التصفية . وقد استخدمت لتشخيص هذه الانواع من البكتريا الطرائق الاعتيادية المعروفة للتشخيص فضلاعن عدة .API20E بينما تضمنت التحاليل الفيزيائية والكيميائية للماء قبل وبعد عمليات التصفية تعيين المعايير الاتية, الحرارة وتركيز ايون الهيدروجين والكدرة والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الذائبة الكلية والملوحة والاوكسجين الذائب والمتطلب الحيوي للاوكسجين , فضلا عن درجات حرارة الهواء في محطات التصفية الثلاثة. وقد اخذت العينات بواقع مكررين وجمعت 60عينة مياه لقياس الاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين و60عينة اخرى لبقية الفحوصات الفيزيائية والكيميائية . كمااخذت اربعين عينة من ماء الحنفية من المنازل في منطقة الشعلة خلال اشهر الصيف وهي حزيران وتموز واب وايلول من عام 2010. وفي الوقت نفسه, وفي الفترات نفسها السابقة , اخذت عينات مماثلة (اربعون عينة ) من براز الاطفال تحت عمرالسنتين المصابين بالاسهال واربعون عينة مماثلة من براز اطفال اصحاء بالعمرنفسه للمقارنة ولتعيين انواع واعداد البكتريا الحية الكلية المرضية في هذه العينات . ولقد اشارت نتائج هذه الدراسات الى ان درجة حرارة الهواء اثرت بدرجات حرارة البيئة المحيطة وتراوحت بين (15 - 41 م), وكانت درجة حرارة مياه دجلة ما بين ( 13 - 32 م ) , بينما كانت درجة حرارة المياه بعد عمليات التصفية في المحطات الثلاثة بين ( 15 - 33 م) . كان تركيز ايون الهيدروجين للماء ( 7. 48 - 8.08 ) وبعد التصفية كان ( 7.31 - 7.89) اما كدرة مياه دجلة فقد تراوحت بين ( NTU156 - 26 ) ولمياه المحطات الثلاثة بين ( NTU 4 - 1 )كما بينت نتائج الدراسات الحالية الى ان التوصيلية الكهربائية لمياه دجلة كانت اقل منها في مياه المشاريع الثلاثة ( 606 - 776 مايكروسيمنز/سم ) و( 608 - 793 مايكروسيمنز/ سم ) على التوالي . والمواد الصلبة الذائبة الكلية لمياه المحطات ( 425 - 555 ملغرام / لتر ) ولمياه النهر كانت ( 429 - 554 ملغرام / لتر ) . بينما لم تتجاوز الملوحة في كل من مياه النهر والمحطات عن 0.49 ملغرام / لتر. كما كان تركيز الاوكسجين الذائب في مياه نهر دجلة بحدود 7.4ملغرام / لتر بينما اعلى تركيز للاوكسجين الذائب كان 10 ملغرام / لتر. اما المتطلب الحيوي للاوكسجين لمياه النهر فقد كان بحدود ( 1.2 - 4.4 مغرام / لتر ) وهذه النسبة هي ضمن الحدود المسموح بها دوليا .و من جهة اخرى اشارت الدراسات البكتريولوجية الى وجود نسبة عالية من اعداد البكتريا الحية الكلية في مياه المحطات الثلاثة وكانت بحدود ( 1 - C.F.U 64 ), وهذه الاعداد تشير الى عدم كفاءة عمليات التصفية والتعقيم الجارية في المحطات الثلاثة . وخاصة محطة الكرامة , بينما اعداد البكتريا الحية الكلية لمياه نهر دجلة كانت بحدود ( 468 - C.F.U 9100) . اما اعداد بكتريا القولون الكلية وبكتريا E.coli فقد تراوح بين ( 1.1 - 7.1 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة وهذه الاعداد هي اكثر من الحدود المسموح بها دوليا . وقد تجاوزت اعداد بكتريا القولون الكلية في نهر دجلة عن ( 1795 - 63000 خلية / 100مل) ,بينما اعداد بكتريا E.coli فقد كانت بحدود ( 335 - 39000 خلية / 100مل ) .ا ما بالنسبة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa فقد كان عددها ( 2.2 - 23 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة واعلى تركيز في اعدادها كان قد سجل في اشهر الصيف , بينما كانت اعدادها في نهر دجلة بحدود( 580 - 160000 خلية / 100مل ) .ا ما نتائج اعداد البكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coliالمعزولة من مياه الحنفيات في منازل الشعلة فقد سجلت اعلى القيم للبكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coli 16)و9.2خلية/100مل)على التوالي, اما اقل القيم فكانت 1.1)و0.0خلية/100مل)على التوالي. كما اشارت الدراسة الى احتواء عينات البراز الماخوذة من الاطفال المصابين بالاسهال ,ا نواع البكتريا الاتية : - Citrobacter freundii 15% , Klebsiella pneumonia 21% , E.coli 45 % , Pseudomonas aeruginosa 11%,Serratia plymuthica 4% , Serratia ficaria 2% , Pseudomonas fluoresens 2%. وهذه الانواع هي في الواقع متوافقة مع الانواع نفسها من البكتريا المعزولة من ماء الحنفيات من المنازل في الشعلة وهي : - Klebsiella pneumonia 30% , E.coli 27% , Pseudomonas aeruginosa 23% Citrobacter freundii 14%, Serratia playmuthia 3% , Pseudomonas fluoresens 3% . لقد عزلت انواع من البكتريا غير السائدة مثل Sphingomonas paucimobilis, Pantoea spp. من مياه النهر ومياه المشاريع اذ تعود Pantoea spp.الى العائلة المعوية Enterobacteriaceae وتسبب بعض انواعها اعراضا مرضية خطيرة للانسان, وكثيراما تكون ملوثة للادوات الطبية اضافة الى ان بعض الاجناس ممكن ان تصيب مدى واسعا من المحاصيل الزراعية المهمة اقتصاديا ,وانواع من اشجار الغابات حول العالم كما توجد بشكل مجتمعات بكتيرية تلوث خزانات وقود الطائرات النفاثة اماالنوع Sphingomonas paucimobilisفيعود لعائلة Sphingomonasaceae الذي يوجد في البيئات المختلفة بضمنها المائية (مياه البحر والمياه العذبة) وبعض انواعها وخصوصاS.paucimobilis فقد توجد في الاجهزة الطبية في المستشفيات وانواع مختلفة من النماذج السريرية وبالرغم من ان الاصابة بها خطيرة ونادرة فقد تعالج باستخدام المضادات الحيوية . واخيرا اشارت نتائج هذه الدراسة الى ان استهلاك مياه الحنفيات من قبل عموم الناس قد يكون السبب الرئيس لحالات الاسهال التي تصيب الاطفال وغيرهم لاحتوائها على اعداد كبيرة من المسببات المرضية المختلفة. | The present work aimed to study different parameters of the drinking water that affect the health of people of Baghdad city .To perform this target three factors were studied. Firstly ,The Biological ,Physical and Chemical factors that influence water quality of the Tigris river .secondly, evaluation of the efficiency of water purification of three purification stations constructed along the river of Tigris ,and thirdly ,evaluation of drinking water of AL - Shulla region in Baghdad city that is provided with water from one of these purification stations (AL - Karama station). In addition to above ,the study also included the comparison between water pollution with respect to bacteriological point of view and diarrhea cases suffering children under two years of age ,attended the hospital of Baqir AL - Hakkem out - clinic in AL - Shula. The study included determination of the water quality from three main purification station, these stations were located to the Northern (Sharq - Diglla) ,middle (AL - Karama)and southern (AL - Qadisia)parts of Tigris river in Baghdad city.Duplicate water samples were taken on monthly basis before and after purification from December, 2009 to September 2010.Microbial analyses of the water included estimation of the number of total viable microbial counts ,total viable coliforms ,total viable E.coli and Pseudomonas aeruginosa .In addition to the presence of some pathogenic enteric microorganisms e.g. Salmonella spp. , Vibrio cholerae etc. using conventional bacteriological methods and API20E Technique for the identification of these bacteria, while Physical and chemical analyses of water before and after purification included determination of the following parameters ,temperature, pH, turbidity ,electrical conductivity ,total dissolved solids ,salinity ,dissolved oxygen and Biological oxygen demand along with the air temperatures at the three purification stations. . . On the other hand ,forty tape water samples were collected from the houses in AL - Shulla region during summer months June , July ,August and September ,2010.At the same time ,and during the same periods ,forty faecal samples from children under age of two years suffering from diarrhea and forty feacal samples from healthy children of the same age also were collected to determine the total pathogenic microorganisms in these samples .The results of these studies were indicated that the water temperature was influenced by the surrounding temperatures (15 - 41 °C)and the Tigris river temperature was between (13 - 32°C ),whereas the temperature of the water after purification in the three stations were around (15 - 33°C). . The pH of the water was (7.85 - 7.97) and after purification was around (7.31 - 7.87).The Turbidity of the river water was(156 - 26)NTU and of the stations were between (1 - 4NTU) The results of the present study also revealed that the electrical conductivity of the Tigris river water was less than that of the three stations, that is (606 - 776Ms/cm) and (608 - 793Ms /cm) respectively. and the total dissolved solids (T.D.S)were between (425 - 555mg/l)for stations water and were between (429 - 554mg/l) for river water. whereas the salinity of both river and stations water did not exceed 0.49mg/l. The dissolved oxygen concentration was 7.4mg/l in Tigris river, which indicate a good aeration condition while the highest concentration for river water recorded to be 10mg/l. The biological oxygen demand for river was between (1.2 - 4.4mg/l) which is within the International allowable levels. On the other hand ,The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (1 - 64C.F.U/ml), and these numbers indicate a non - efficient purification procedures in all station studied and was exceeding the International allowable levels especially in the AL - Krama station . while total viable bacterial counts of the Tigris river was between (468 - 9100C.F.U/ml).Total coliform counts and pathogenic E.coli counts were both between(1.1 - 7.1cell/100ml )in all the three stations studied ,again,these numbers exceeded the International allowable levels. In Tigris river water ,on the other hand ,the total coliform counts was exceeded the (1795 - 63000cell/100ml )while the pathogenic E.coli count was between (335 - 39000cell/100ml) .Pseudomonas aeruginosa counts was about (2.2 - 23cell/100ml) in the three station and the highest level recorded was in summer seasons ,whereas its counts was in between (580 - 160000cell/100ml) in Tigris river. The highest number for total coliform and pathogenic E.coli were recorded to be (16 and 9.2cell/100ml) respectively. whereas the lower range were (1.1 and 0.0 cell/100ml) respectively. . The results of the present study also revealed that the faecal samples of the diarrhea cases of children contain the following bacteria ,E.coli 45%,Klebsiella pneumonia 21%.while the numbers of other bacteria ,Citrobacter freundii, Pseudomonas aeruginosa , Serratia ficaria ,Serratia plymuthica and Pseudomonas fluorescens were 15%,11%,2%,4% and 2% respectively. . These proportions are in accordance with the same bacterial species isolated from AL - Shulla houses while were 27%for E.coli ,30%for Klebsiella pneumonia and 14%for Citrobacter freundii 23%for Pseudomonas aeruginosa ,3%for pseudomonas fluoresens and 3% for Serratia plymuthica . Finally ,these results clearly indicate that the tape water consumption by the general public might be the main causative factors for diarrhea cases affecting the people due to its high content on other hand ,will reflect the poor purification procedures employed in these different purification stations at least in Baghdad city

التوصيف المظهري والوراثي للانزيمات المحورة لمضادات الامينوكلايكوسيدية المنتجة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين == Phenotypic and genotypic characterization of aminoglycoside modifying enzymes produced by methecillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: شيــماء عدنان جبر العبيــــدي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 150عزلة سريرية من المكورات العنقودية من مستشفيي الحبيبية والنعمان في مدينة بغداد خلال الفترة من شهر كانون الثاني وحتى شهر نيسان لعام 2011 من اصابات سريرية متنوعة. توزعت العينات ما بين 30 عزلة من الادرار, 84 من خمجات جروح و36 عزلة من مسحات الاذن . • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم, تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص الشكلية والكيموحيوية, ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة نظامي api staph وMast staph kit .لقد تم الحصول على 87 عزلة (58%) على انها Staphylococcus .aureus مقابل 63 عزلة (42%) للانواع الاخرى من هذا الجنس. • بينت نتائج الفحص المسحي المظهري الاولي لمقاومة مضاد المثسلين باستخدام طريقة الانتشاربالاكار ان هنالك 84 عزلة من اصل 87 (%96.5) قد اظهرت مقاومتها لمضاد المثسلين لتكون من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين((MRSA مقابل 3عزلات فقط (3.5%) مستجيبة للمثسلين (MSSA).• اجري اختبارفحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشارالاقراص لجميع عزلات MRSA( ,(84 واستخدم لهذا الغرض ستة مضادات حيوية تعود للمجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجوداختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري للعزلات قيد الدراسة اذا اظهرت هذه العزلات مستوى عال من المقاومة لهذه المجموعة مع نسبة وصلت الى ( 19٪ ( للستربتوميسين, 38)٪ (للاميكاسين, ( 52٪ ( للجنتاميسين ، 62٪) للكاناميسين ،و (69٪) لكل من مضادي ا لنيومايسين والتوبراميسين. • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى(MIC) لعزلات ال MRSA) (لعدد من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لعزلات ال MRSA، اذا اظهرت 16 عزلة مقاومتها للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين (16 - 1024 ميكروغرام / مل ) , و32 عزلة مقاومة للاميكاسين (64 - 128 ميكروغرام/مل ) ، و44 عزلة للجنتاميسين ( 16 - 64 ميكروغرام/مل ) و38 لو 52عزلة للكانامايسين ( 64 - 128مايكروغرام/ مل) , ، و58 للنيوميسين (16 - 1024 ميكروغرام/مل ). ان هذه النتائج تدل على انتشار صفة مقاومة مضادات المجموعة الامينوكلايكوسايدية بين عزلات المكورات العنقودية المقاومة للمثسيلين .• اعتمدت طريقتان لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهما : طريقة الغليان وطريقة المستعمرة المباشر. اظهرت النتيجة ان طريقة المستعمرة المباشرة كان افضل في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.• اختيرت خمسة وعشرون عزلة من بكتريا MRSA التي اعطت نتائج ايجابية في مجال الكشف المظهري لنمط المقاومة لمضاد المثسلين ولمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية للكشف عن الجين mecA المشفرلمقاومة المثيسلين بوساطة تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) . اظهرت نتائج احتواء جميع العزلات (100٪) على جين mecA ,وبلغ حجم القطعة المكثرة 314 زوج قاعدة بمقارنتها بدلائل الدنا الحجمية .• اجري الفحص الوراثي بتقنية ال PCR للكشف عن ثلاث جينات مشفرة للانزيمات المحورة لمضادات المجـــموعة الامــينوكلايكوسيـــدية في عــزلات ال MRSA وشـمـــلت aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa.بينت النتائج ان جين ) ′aac(6’) - Ie+aph(2’ هو الاكثر انتشارا وبنسبة 84٪ (21/25) تلاه جين ant(4’) - Iaو aph(3’) - IIIa بنسبة 76.3٪ (19/25) و44٪ (11/25) على التوالي.• بلغ معدل تواجد aac(6’) - Ie+aph(2’) مع ant(4’) - Ia, مقدار 64٪ (16 / 25) ويمثل اعلى نسبة تواجد في العزلات قيد الدراسة, فيما بلغت نسبة تواجد جيني ant(4’) - Ia وaph(3’) - IIIaمعا 40٪ (10/25) لتحل نسبة تواجد كلا من aac(6’) - Ie+aph(2’) مع aph(3’) - IIIa ثالثا وبمعدل 32٪ (8/25).اما نسبة تواجد هذه الجينات الثلاث معا فقد بلغ 28%(7/21(. • لوحظ ان هنالك ترابط بين الصفة المظهرية لمقاومة المضادرات مع الصفة الوراثية , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين aac(6’) - Ie+aph(2’) ذات مقاومة عالية لمضاد الجنتامايسين وايضا مقاومة لاغلب انواع المضادات الامينوكلايكوسيدية الاخرى.بينما كانت العزلات الحاملة للجين ant(4’) - Ia هي عزلات ذات مقاومة عالية لمضادي التوبرامايسين والنيومايسين ,ومن ناحية اخرى كانت العزلات الحاملة للجين aph(3’) - IIIa اظهرت مقاومتها العالية للمضادين الكانامايسين والاميكاسين.• في هذه الدراسة كانتالاربع وعشرين 24 عزلة الحاملة لجين mecA من اصل 25) 96%( كانت على الاقل مترابطة مع احد جينات الانزيمات المحورة AME او اثنان منها او جميعا ,ويعد هذا مؤشرا لوجود ترابط كبير بين مقاومة العزلات لمضادات الامينو كلايكوسايدية وبين مقاومتها للمثسلين في العزلات المحلية .في الوقت نفسة ظهرت ضمن النتائج عزلة MRSA واحدة اتسمت بمقاومتها المظهرية لمضادات هذه المجموعة غير انها خلت من اي جين في الفحص الوراثي مما يدل على امتلاكها نمط اخر من المقاومة تجاه هذة المجموعة . | • A total of 150 Clinical isolates of Staphylococcus species were collected from two hospitals : Al - habibia and Noaman hospitals in Baghdad city during the period from January to April 2011. Types and the numbers of these clinical samples were distributed as (30) isolates from urine, (84) isolates from wound infections and (36) isolates from ear swabs. • The isolates were initially diagnosed by culturing on MacConkey agar and blood agar followed by performing some morphological and biochemical tests . A confirmatory test as final diagnoses were done using api 20 and MAST staph kits. The results have showed that Staphylococcus aureus comprised 87(58%) isolates while other Staphylococcus species represented 63 isolates (42%) .• Results of primary screening test for methicillin resistance using disk diffusion method have revealed that 84 isolates(96.5%) were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus(MRSA), while only 3 isolates (3.5%)were methicillin sensetive Staphylococcus aureus (MSSA).• Antibiotic susceptibility test for all the 84 MRSA isolates was performed against 6 antibiotic of aminoglycosides group using disc diffusion method. The result have demonstrated clear differences in the phenotypic resistance among isolates of the current study . They showed high - level of resistance to aminoglycosides group, and the percentage of isolates reached to(19%) for streptomycin, (38% ) for amikacin ,(52% ) for gentamicin, (62%) for kanamycin and ( 69%) for each of neomycin and tobramycin . • Two fold was serial dilution agar used to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) for the MRSA isolates against aminoglycosides group. The results have showed that there were differences in the MIC values among MRSA isolates when 16 isolates were resistance streptomycin (MIC ranged 16 - 1024 µg/ ml) , 32 isolates resistance amikacin (64 - 128 µg/ ml), 44 isolates to gentamicin (16 - 64 µg/ ml) , 52 isolates to kanamycin (64 - 128µg /ml), and 58 isolates to neomycin (16 - 1024 µg/ ml). The results indicate the prevalence of aminoglycosides resistance pattern in all the MRSA isolates. • The two different methods boiling method and the direct colony method were used to prepare template DNA in order to be used in the polymerase chain reaction test. The results revealed that the direct colony methode was better in demonstrating the result as comparied with the boiling method . • Twenty five isolates which gave positive results in phenotypic detection for methicillin and aminoglycoside group resistance , were selected to detect mecA gene encoding methicillin resistance using PCR technique.The results showed that all the isolates (100%) harbored merA gene with amplified size 314 bp as compared with DAN ladder . • Genotypic detection was performed to detect three genes encoding aminoglycoside modifying enzymes in MRSA isolates. They were aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa genes.The results showed that aac(6') - Ie - aph(2") gene was the most prevalent Aminoglycoside modifying enzymes (AME) gene when the rate was 84% (21/25) of the resistant isolates followed by ant(4') - Ia and aph(3') - IIIa when the rates were 76.3% (19/25) and 44% (11/25) of these isolates respectively.• The coexistence rate of aac(6') - Ie - aph(2") with ant(4') - Ia was 68% (16/25) which it represents the most predominant rate in the isolates of the current study followed by the coexistence between of ant(4') - Ia with aph(3') - IIIa which was 40% (10/25) and the third rate for aac(6') - Ie - aph(2") with aph(3') - IIIa by 32% (8/25). The coexistence rate of the three genes in all the isolates was 28% (7/25).• The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern.The isolates harboring aac(6’) - Ie+aph(2’) gene are considered to be high resistant to gentamicin and even to all aminoglycosides ,while the isolates harboring this gene were highly resistant to tobramycin and neomycin and the isolates carrying aph(3′) - IIIa gene showed the high resistance to amikacin and kanamycin in MRSA. • In this study, the 24 isolates harboring mecA gene out of 25 ( 96%) were carried either one or more than one aminoglycoside modifying gene and this represents an indicator for high correlation between aminoglycoside and methicillin resistance in our local isolates .From the other hand the results showed that there was a MRSA isolates which confer phenotypic resistance to aminoglycoside group but it not encode for any of AME gene ,this may indicate that such isolates confer another type of resistance toward this group

دراسة مرضية نسيجية ومناعية كيميائية نسيجية للخلايا اللمفاوية المرتشحة في العقد اللمفاوية المشمولة في سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي == Histopathological and Immunohistochemical study on Lymphocytic Infiltrate in Lymph nodes involved by in Colorectal cancer and Breast carcinoma

Author name: شيماء عبد الرضا ناجي الربيعي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سالم رشيد حمودي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة كبحث رجعي ، اذ اجريت على (85) حالة مرضية لانسجة مطمورة بشمع البارافين واخذت العينات من المرضى المصابين بالاورام الحميدة والخبيثة للقولون والمستقيم والثدي والتي تعود للفترة من 2006 - 2008 .جمعت العينات من مستشفى مدينة الطب/ المختبرات التعليمية ومستشفى امراض الجهاز الهضمي للفترة من تشرين الاول 2008 ولغاية حزيران 2009 . قسمت هذه العينات الى ثلاثة مجاميع : 1 - المجموعة الاولى تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان القولون والمستقيم والحاوية على العقد اللمفاوية.2 - المجموعة الثانية تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان الثدي والحاوية على العقد اللمفاوية.3 - المجموعة الثالثة (35) عينة من بلوك شمع البارافين منها (15) عينة تحتوي على التنسج اللمفاوي للعقد و(20) عينة طبيعية تعتبر كمجاميع سيطرة.تم تحليل هذه العينات من العقد اللمفاوية في المجاميع الثلاثة احصائيا حسب العمر , الجنس , وجود او عدم وجود السرطان المنتشر وعلاقته بارتشاح الخلايا اللمفاوية ، درجة التمايز ومرحلة الانتشار للسرطان.ولغرض التشخيص النسيجي قطعت العينات بجهاز المايكروتوم بسمك 4 مايكرومتر وصبغت بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين.امتدت الدراسة لتشمل تحديد التنميط المظهري للخلايا اللمفاوية المرتشحة والتي تشمل الواسمات CD8+, CD3+ بطريقة التصبيغ النسيجي المناعي . وقد خلصت الدراسة الى النتائج التالية : 1 - في الوقت الذي تراوح العمر لمرضى سرطان القولون والمستقيم بين (23 - 70) سنة وبمعدل (43,2) سنة ، فان النسبة الاكبر قد شخصت في عمر يتراوح بين (61 - 70) سنة.2 - اغلب حالات سرطان القولون والمستقيم كانت وسطية التمايز وكانت موجبة بنسبة (75%) للواسم CD3+ وبنسبة (25%) للواسم CD8+ للخلايا اللمفاوية المرتشحة.3 - ان النسبة من 75 - 80% من حالات سرطان القولون والمستقيم كانت في مرحلة C.4 - اظهرت الخلايا اللمفاوية الحاملة للواسم CD8+ فروقات معنوية بين سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي عند مستوى احتمالية (P<0.05). | This study was designed as retrospective study. A total number of cases were eighty five (85) formalin - fixed paraffin embedded tissue blocks of colorectal and breast cancer, in addition to benign lesions that related to the period between 2006 - 2008 . The samples were collected from Teaching Laboratories / Medical City and Gastrointestinal Teaching Hospital/ Medical City during the period extended from October 2008 till June 2009. These paraffin blocks were divided into (3) groups : 1. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of colorectal carcinoma (CRC) with their lymph node drainage.2. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of breast carcinoma with their L.N drainage.3. In addition thirty five (35) tissue blocks, including (15) blocks lymph node follicular hyperplasia and (20) blocks of normal lymph node were examined as control groups.All these tissues were analyzed according to age, gender, presence or absence of tumor metastasis with infiltration of lymphocyte, histological grading, and staging.For definitive histological diagnosis the samples were made by microtome at 4μm thickness and stained by hematoxylin and eosin stain.This study was extended to determine the phenotype of cell surface antigen markers, namely CD3+ and CD8+ markers of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal antibodies to these markers.The results of this study can be described as follows : 1 - The age of patients with CRC ranged from (23 - 70) year with mean of (43.2) year. The highest percentage was diagnosed in the age (61 - 70) year.2 - Most of the cases of the CRC were moderately differentiated grade, (75%) were CD3+ positive results, while (25%) of them were CD8+ positive results.3 - From 75 - 80% of the CRC cases were in stage C.4 - In respect to CD8+ infiltrated lymphocytes, there were significant differences (P <0.05) between CRC and breast carcinoma, 20%, 56% respectively.

تاثير Lactobacillus fermentum وLactobacillus gasseri في طفيلي الابواغ الخبيئة داخل الجسم الحي == Effect of Lactobacillus fermentum and Lactobacillus gasseri on Cryptosporidium parvum invivo

Author name: شيماء داود سلمان
Supervisor name: سبا طاهر محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to study the effect of some bacterial probiotics on the parasite Cryptosporidium parvum invivo, 60 of feces samples were collected from fetal in calves farm belong to College of Veterinary \ Baghdad University, their aged from one to two weeks and suffer from a severe watery diarrhea. Samples were examined to detect the presence of the parasite oocysts by using Modified Cold Zeinl Neelson Stain method.Oocysts of parasite were isolated from positive feces samples by using saturated salt solution method and used to induce infection in mice .The study of laboratory animals shown that the perpant period of the parasite ranged between 3 - 4 days and did not notice any clear clinical signs neither infected mice nor treated ones.The study included nine groups; five treatment groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells,supernatant of L.fermentum,suspension of L.gasseri cells,supernatant of L.gasseri and the drug spiramycin, two preventive groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells and suspension of L.gasseri cells befor and after infected , and two groups that used as positive control (infected mice)and negative control (healthy mice).The results showed that all treatment groups suffered from a gradual decrease in rates of oocysts shedding and the groups treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day and eighth, respectively, and efficiency treatment was 81.44%, 81.72% , respectively while groups that treated with supernatant of bacteria was stopped oocysts shedding on the tenth day, and efficiency treatment 76.33%, 75.28% , respectively.On the other hand treated groups with spiramycin drug did not stop shedding of parasite oocysts to the eleventh day after treatment and recorded less efficiency treatment reaching to 65.14% compared with the positive control group, which continued shedding oocycts to the end of experiment.Also, the results showed that the preventive groups that treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day after the treatment, and for both types of bacteria,the highest treatment efficiency reached to 85.91%and 86.55%, respectively. The statistical analysis showed significant differences between the control group and the treated groups in level of probability (P≥0.05).According to the results of histological study, the changes occurred in the small intestine before and after treatment, showed that in the tissue sections of the positive control group animals the parasite adhesion clearly on brush border of the epithelial intestine tissue.The treated groups with two types of bacteria and their supernatants showed disappearance of the parasite from the intestinal tissue with simple changes included hydropic degeneration and increase in the number of goblet cells when compared to a group of spiramycin which led to the occurrence of damage in the mucous layer and the shorten in lengths of the villi , dehydration and infiltration in lymphocytes with destruction in tissue (necrosis).

دراسة جزيئية لعوامل الالتصاق في بكتريا Escherichia coli الممرضة للمسالك البولية وعلاقتها بمقاومة Fluoroquinolones == Molecular Study of Adherence Factors in Uropathogenic Escherichia coli Related to Fluoroquinolones Resistance

Author name: شيماء خضر عباس العلاق
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 150عينة ادرار من مرضى خمج المسالك البولية ومن مختلف الاعمار للفترة من تموزالى تشرين الثاني 2011 .اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات الزرعية والمجهرية والفحوصات الكيموحيوية , والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات في وقت مبكر للكشف عن الانواع بواسطة استخدام فحص Api20E .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق وجين مقاومة الفلوروكوينولونات باستخلاص الدنا البكتيري بطريقة الغليان ومن ثم اخضع الى اختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) . تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية , فضلا عن تقدير التركيز المثبط الادنى (MIC) لاربع مضادات من الفلوروكوينولونات . اظهرت النتائج ان توزيع اصابات اخماج المسالك البولية في الاناث (99(66%) بينما بلغت في الذكور 51(34%)) وسجلت اعلى نسبة من الاصابة في النساء البالغات المتزوجات 67(44.7%) .اظهرت النتائج ان بكتريا E.coli كانت الاكثر شيوعا في مرضى خمج المسالك البولية 65 عزلة (43.3%). بينت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان (100%) , اذ اظهرت نسب مختلفة من الالتصاق تراوحت بين 8 الى 63 خلية بكتيرية / خلية طلائية .اظهرت عزلات E.coli احتوائها على ثلاثة انواع من عوامل الالتصاق (CAF) وبنسب مختلفة . النوع الاول (CAFl) ووجد في 58 عزلة (89%) , النوع الثاني (CAFΠ) ووجد في 35 عزلة (54%) والثالث (CAFШ) وجد في 36 عزلة (55%) . عند اختبار حساسية العزلات تجاه 12 مضاد جرثومي , اظهرت عزلات E.coli مقاومة تامة (100%) لمضاد Augmentin(Amoxicillin/Clavulanic acid) (99%) بينما كانت اقل مقاومة للمضادات Pefloxacin , Norfloxacin, Nitrofurantoin وبنسبة(34, 35, 22)% على التوالي .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة من المقاومة المضاعفة المشتركة (42%) كانت في العزلات التي قاومت خمسة الى ثمانية مضادات . فيما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لاربعة مضادات من الفلوروكوينولونات ,فاظهرت النتائج ان هناك اختلافا واضحا في قيمتها . تم اختيار 28 عزلة E.coli من عزلاتنا المحلية بالاعتماد على درجة مقاومتها العالية للمضادات ,اظهر كشف البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) المفرد (Uniplex PCR) والمشترك (Multiplex PCR) عن وجود جينات الالتصاق الضارية والمتضمنة P (papC), type 1 fambria fimH ,adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ) حيث تم الكشف عن(22 isolates (79%),20(71%), 6(21%),4(14%)) على التوالي . تم الكشف عن جين مقاومة الكوينولونات gyrA في كل العزلات 28 (100%). في هذه الدراسة تم اعتماد gyrAبديلا عن استخدام 16s rRNA في تشخيص السلالات البكتيرية.اذ اعطت جميع العزلات حزم عند الحجم الجزيئي (518 bp) دلالة على وجود الجين باستخدام تقنية (PCR) .واخيرا .اظهرت النتائج ان عزلات E.coli الممرضة للقناة البولية (UPEC) والمقاومة للكوينولونات تبدي انخفاضا في عوامل ضراوتها عن العزلات الحساسة للكوينولونات ,اظهرت نتائجنا اعلى نسبة لعوامل الضراوة في العزلات التي قاومت ثمانية مضادات اعطت نسبة 18% منها تمتلك عامل الالتصاق الاول (CAFl) , 14%تمتلك (CAFΠ) و12% من هذه العزلات تمتلك (CAFШ) وذلك يشير الى ارتباط مباشر لمقاومة الكوينولونات مع انخفاض وجود جينات الضراوة (تراجع جيني).و اظهرت النتائج ايضا انه جينات الضراوة اقل انتشارا (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) في العزلات التي قاومت كل مضادات الفلوروكوينولونات .هذه العلاقة ربما تتاثر بواسطة التراجع الجيني . | One hundred fifty urine samples were collected from urinary tract infection patients from different ages during the period of July 2011 to November 2011. The bacterial diagnosis on cultural and microscopical characteristics of bacterial cell and biochemical tests. The final and accurate diagnoses of the isolates as the early mentioned species were done using the API 20E system. Molecular identification for adhesion factors and fluoroquinolone resistant gene was done by DNA extraction by boiling method, then subjected to conventional PCR .The antibiotic sensitivity test was done, also the minimum inhibitory concentration (MIC) for four Fluoroquinolone antimicrobial agents was studied. The results showed that the distribution of UTI in female were 99(66%), while in male were 51 (34%). However, the high percentages of UTI were observed within the adult married women 67(44.7%). The results showed that E.coli was the most common microorganisms in UTI patients, 65 isolates (43.3%). All the isolates showeded ability of adherence to uroepithelial cells of human's urinary tract (100%) of the isolates presented adherence that mean number of bacteria adhered to uroepithelial cells ranged from 8 to 63. E.coli isolates exhibited the presence of three types of colony adhesion factors (CAF) at different rate. Type one (CAFl) observed in 58 isolates (89%), while type two (CAFΠ) in 35 isolates (54%), and (CAFШ) in 36 isolates (55%). Sensitivity of E.coli local isolates toward 12 antimicrobial agents showed complete resistance (100%) to Augmentin (Amoxicillin/Clavulanic acid), while they were less resistance to Pefloxacin, Norfloxacin, Nitrofurantoin at (34, 35, 22)% respectively. The results showed that the highest rate of multidrug resistance (42%) was observed in isolates were able to resist 5 to 8 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentrations for four Fluoroquinolone antimicrobial agents showed an obvious different between their values.The local isolates of E. coli selection 28 isolates depending upon high degree of multi antibiotic resistance. The PCR assay (Uniplex PCR and Multiplex PCR) showed prevalence of virulent adhesion genes P (papC), type 1 fambria fim H, adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ), were detected (22 isolates (79%), 20(71%), 6(21%), 4(14%)) respectively. The quinolone resistance gene gyrA detected in all isolates 28 (100%). In the present study depended upon gyrA gene (housekeeping gene) as alternative to 16s rRNA for the identification bacterial strains. All the isolates give bands at the molecular size (518 bp) an indication of a gene by using PCR technique. Finally ,the results have shown that Fluoroquinolone resistant uropathogenic E.coli (UPEC) isolates express fewer virulence factors than Fluoroquinolone susceptible isolates .The persent results showed the highest rates of virulence factors in isolates that resisted eight antibiotics which was obtained to 18% of these isolates have(CAF l ), 14% have(CAFΠ ) and 12% of the isolates have (CAFШ). This finding suggests that fluoroquinolone could be directly associated with decreased prevalence of virulent genes (genetic back) .Also the results showed that all 4 virulent genes under the study were lower prevalent (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) in the isolates resistance for all fluoroquinolone and quinolone antimicrobial agents. that the relationship may be influenced by the genetic background.

استجابة تراكيب وراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتحمل تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم خلال مراحل مختلفة من النمو == Response of barley genotypes Hordeum vulgare L. for tolerance different concentrations of Sodium Chloride through different growth stage

Author name: شروق محمود وسين
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2008 - 2009 بهدف التعرف على مدى تحمل بعض التراكيب الوراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم في مراحل مختلفة من النمو . تضمنت الدراسة تجربتين : التجربة الاولى هي دراسة تاثير تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم (0 ، 50 ، 100 ، 150 و200) مليمول/لتر على ستة تراكيب وراثية من الشعير هي بركة، بيكسون، فوريست ، بركة × بيكسون، بركة × فوريست وبيكسون × فوريست في بعض المؤشرات المظهرية كنسبة وسرعة انبات البذور وطول الجذير والرويشة والمساحة الورقية . نفذت التجربة في مختبر الدراسات العليا ، قسم علوم الحياة / كلية العلوم / الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية وقد استعمل محلول مغذي nutrient solution كوسط لزراعة البذور .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في المؤشرات المدروسة كما اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية للشعير في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهر التركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح فقد اعطى القيم 93.00% عن نسبة الانبات و7.36 بذرة/يوم عن سرعة الانبات، 6.72 سم عن طول الجذير و8.30 سم عن طول الرويشة. اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع لقسم علوم الحياة ، كلية التربية / ابن الهيثم / جامعة بغداد من خلال زراعة بذور التراكيب الوراثية بركة وبيكسون وبركة × فوريست بعد معرفة تحملها للملوحة (التجربة الاولى) في اصص بلاستيكية لدراسة تاثير تراكيز كلوريد الصوديوم السابقة المذكورة اعلاه على بعض المؤشرات المظهرية والفسلجية كاطوال الجذور واحجامها واوزانها الجافة وارتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري والمساحة الورقية ومحتوى بعض العناصر الغذائية في الجزء الخضري (كالنتروجين والفسفور والبوتاسيوم والصوديوم والكلور) ونسبة البروتين ومحتوى الكلوروفيل ومحتوى البرولين ونسبة الدهون والمحتوى النسبي للرطوبة في الاوراق بالاضافة الى بعض مكونات الحاصل وهي الحاصل البايولوجي ، طول السنبلة ، وزن السنبلة/نبات ، عدد الحبوب/سنبلة، وزن الحبوب/سنبلة، وزن 1000 حبة ووزن الحبوب/اصيص . كما تمت دراسة (محتوى البوتاسيوم والصوديوم والكلور) والجهد الازموزي لتربة التجربة بعد الزراعة . وقد استخدم التصميم العشوائي الكامل CRD)) وبتجارب عاملية لتنفيذ التجربتين وبثلاثة مكررات في التجربة الاولى، واربعة مكررات في التجربة الثانية، وقد تم تحليل النتائج احصائيا وقورنت المتوسطات باستعمال اقل فرق معنوي (L.S.D.)على مستوى احتمال 0.05 .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في معظم المؤشرات المدروسة. وزيادة معنوية في محتوى الحامض الاميني البرولين ومحتوى الصوديوم والكلور في الانسجة المختلفة للتراكيب الوراثية المدروسة ، كما زاد معدل الجهد الازموزي ومحتوى الصوديوم والكلور وانخفض محتوى البوتاسيوم في ترب التراكيب الوراثية مقارنة بها قبل الزراعة . كذلك اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهرالتركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح، فقد اعطى قيما عليا في معظم المؤشرات المدروسة كالوزن الجاف للجذور 1.01 غم/نبات، وارتفاع النبات بعد مرور شهر من التعرض للملح 54.00 سم، وارتفاع النبات بعد مرور ثلاثة اشهر من التعرض للملح 63.90 سم، والوزن الجاف للجزء الخضري 0.35 غم/نبات، والمساحة الورقية 53.51 سم2، ومحتوى النتروجين 10.83 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى البوتاسيوم 8.22 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى الكلور 7.45 ملغم/غم وزن جاف، ونسبة البروتين 18.70%، ومحتوى الكلوروفيل 33.20 مايكروغرام/سم2، ومحتوى البرولين 14.01 ملغم/لتر، ونسبة الدهون 5.27%، وبعض مكونات الحاصل مثل الحاصل البايولوجي 11.01 غم/اصيص وطول السنبلة 5.84 سم، وعدد الحبوب/سنبلة 25.39 حبة/سنبلة، ووزن الحبوب/سنبلة، 0.81 غم/سنبلة، ووزن 1000 حبة 28.93 غم، ووزن الحبوب /اصيص 4.22 غم/اصيص، يليه التركيب الوراثي بيكسون ثم بركة × فوريست . كما اظهرت النتائج وجود تباين بين ترب التراكيب الوراثية للشعير في محتوى بعض العناصر، اذ اعطت تربة بركة اقل معدل لمحتوى عنصر البوتاسيوم بلغ 231.70جزء بالمليون، واعلى محتوى للكلور بلغ 2.74 ملي مكافئ/لتر . | This study has been performed during the agricultural season of 2008 - 2009 in the aim to recognize how some genotypes of barley Hordeum vulgare L. tolerate different concentrations of NaCl in different growth stages . Two sets of experiment has been done : The first was to determine the effect of different concentrations of NaCl (0,50,100,150 and 200) mM/l on some morphological parameters (% and rapidness of seeds germination, radical and plumule length and leaf area). Of six genotypes of barley cultivars Baraka, Bekson, Forest, Baraka × Bekson, Baraka × Forest and Bekson × Forest . The experiment was done in the Labrotary of higher studies, Department of Biologey, college of science, AL - Mustansiriyah University, by using petri dishes supplied with nutrient solution. The result showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to asignificant decrease in the studied parameters. Also the result revealed adifference among the genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype showed agood tolerating capacity against high saline concentration so it gave values 93% for percentage of germination, 7.36 seed/day of rapidness of germination, 6.72 cm of radical length and 8.30 cm of plumule length. The second set was carried out in the green house of the Department of Biologey, college of Education (Ibn AL - Haitham), Baghdad university via planting seeds of Baraka, Bekson and Baraka×Forest genotypes after determination of their salinity tolerance (set No.1) in plastic pots in order to study the effect of the above mentioned NaCl concentrations on some of their morphological and physiological parameters such as root length and size, shoot and root dry weights , content of some nutrient elements in the shoot (such as N, K, Na and Cl), protein %, chlorophyll content, proline content, lipid proportion and leaf relative humidity, beside some yield components : biological yield, spike length, weight of spike/plant, number of grains/spike, weight of grains/spike, weight of 1000 grains and weight of grains /pot Additionally, determination of (K, Na and Cl content)and osmotic potential in experiment soil after planting. The completely RandomiZed Design (CRD) with Factorial experiments was applied with three replicates for the first experiment and four replicates for the second experiment, Data were statistically analyzed to find out the least significant differences between treatment at 0.05 level. The results showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to a significant decrease in studied parameters and a significant increase in content of proline acid, Sodium and Chloride in the different tissue of the studied genotypes. Also increased the average of osmotic potential, content of Sodium, Chloride and decrease of potassium content in soil of the genotypes as compared with it befor planting. Moreover, the result revealed a difference among genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype exhibited a good tolerating capacity against high saline concentration so it provides higher values in most of the studied parameters as root dry weight 1.01 gm/plant, shoot length after one month of salt treated 54.00Cm,shoot length after three months of salt treated 63.90 Cm, shoot dry weight 0.35 gm/plant, leaf area 53.51Cm2, Nitrogen content 10.83 mg/gm dry weight, Potassium content 8.22 mg/gm dry weight, Chloride content 7.45 mg/gm dry weight, % protein 18.70 %, chlorophyll content 33.20 mg/cm2, proline content 14.01 mg/L, % lipid 5.27%, biological yield 11.01 gm/pot , spike length 5.84Cm, number of grains /spike 25.39 grain/spike, weight of grains /spike 0.81 gm/spike, weight of 1000 grains 28.93mg and weight of grains/ pot 4.22 gm/pot; then, Bekson genotype and Baraka × Forest. The result showed that there is a variation among soil of the genotypes of barley in content of some elements when soil Baraka gave least avarege of Potassium content as (231.70 ppm) and higher Chloride content as (2.74 m.q/L)

دراسة العلاقة بين مجاميع الدم واضداد النطف في الرجال قليلي الخصوبة == A study on relation between blood groups and Anti - sperm antibodies in infertile men

Author name: شروق ابراهيم محمود عزيز اغا
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم استخدام 92 عينة دم وسائل منوي لذكور قليلي الخصوبة وكذلك نفس العدد من ذكور خصبين , حيث تم الحصول عليها للفترة المحصورة من تشرين الثاني 2006 ولغاية حزيران 2007 . اجري فحص الدم على جميع العينات لتحديد مجاميع الدم طبقا لنظام ABO ونظام لويس , بينما تم التحري عن اضداد النطف باستخدام فحص ELISA النوعي وكما تم تحديد عيارية هذه الاضداد في العينات الموجبة باستخدام Tray - agglutination test (TAT). اظهرت نتائج هذه الدراسة علاقة معنوية (p≤0.01) مابين نوع مجاميع دم لويس وحالة الخصوبة حيث سجل صنف دم Lea 4.4% وصنف Leb 14.1% وصنف Lea - b - 81.5% في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع 20.7 % , 15.2 % ,64.1% على التوالي في الذكور الخصبين . بينما اظهر فحص ELISA نتيجة موجبة لوجود اضداد النطف بنسبة 5.4% , 32.0% في كل من البلازما المنوية ومصل الدم على التوالي في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع الذكور الخصبين حيث لم تسجل اي نسبة وجود للاضداد في مصل الدم . من جهة اخرى فقد اظهرت النتائج علاقة معنوية ( (P≤0.01 ما بين وجود اضداد النطف في مصل دم الذكور قليلي الخصوبة ومجاميع الدم نظام ABO , حيث سجل صنف الدم O , اعلى نسبة للاضداد بلغت 55.0% بالمقارنة مع 45.0% لجميع اصناف الدم الاخرى . كما اظهرت النتائج وجود نفس العلاقة المعنوية( (≤0.05 ما بين مجاميع دم لويس ونسبة اضداد النطف حيث سجل صنف دم لويس Lea - b - اعلى نسبة اضداد بلغت 69.0% بالمقارنة مع 31.0% لكلا الصنفين Lea , Leb كذلك اظهرت النتائج عدم وجود علاقة معنوية ما بين اضداد النطف وعدد النطف في الذكور قليلي الخصوبة ذوي مجاميع الدم ABO ومجاميع دم لويس .واخيرا فقد اظهرت النتائج وجود تراكيز طبيعية لجميع الهرمونات الجنسية في عينات مصل الدم لجميع الذكور قليلي الخصوبة سواء حسب نظام ABO او نظام لويس. | Ninety two samples of blood and seminal fluid of low fertility males and equal number of the same samples from fertile males ,were obtained from November 2006 till June 2007 . The grouping was carried out according to ABO and Lewis system , While antibodies of sperms were detected by using specific ELISA test , and the titer in the positive samples was determined by Tray - agglutination test (TAT) . The results of this study revealed a significant correlation (P≤ 0.01) between the phenotype of Lewis blood groups and the fertility state , in which 4.4% Lea, 14.1% Leb and 81.5% Lea - b - phenotypes were recorded in the low fertility males , in comparison to 20.7% ,15.2% and 64.1% respectively in those fertile males . However the ELLISA screening test in low fertility males showed positive results 5.4% and 32.0% in seminal plasma and serum samples respectively , in comparison to 0% in serum of fertile males . On the other hand , the results demonstrated a significant correlation (P≤ 0.001) between the presence of anti - sperm antibodies in the serum of infertile and the ABO blood groups , Whereas ,the group O recorded a highest presence of anti - sperm antibodies 55.0% in comparison to that recorded by the remaining groups 45.0% . Also the same significant correlation (P≤ 0.05) has been obtained between the Lewis blood groups and the presence of anti - sperm antibodies, in which Lewisa - b - phenotype recorded the highest percentage 69.0% comparison to 31.0% for those of Lea and Leb together . Further more the results also showed that in low fertility males, who had ABO and Lewis blood groups, there were non significant correlation between anti - sperm antibodies and number of sperms .Finally the results showed normal concentration of all sex hormones in the serum of all infertile males in spite of their ABO and Lewis blood groups

دراسة عن كبسولة بكتريا Acinetobacter baumannii وتاثيرها على الاستجابة المناعية == Study on capsule of Acinetobacter baumannii and its effect on Immune Response

Author name: سيناء مهدي شاكر الخفاجي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • عزلت 34 عزلة بكتيرية تعود للنوع Acinetobacter baumannii من بين 424 عينة شملت عينات ( جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) وبنسبة 8.01% جمعت من المرضى الراقدين في مستشفى بغداد التعليمي / مدينة الطب ، وقد شخصت من خلال الصفات الزرعية (المستعمرات) والمجهرية ( البكتريا) والاختبارات الكيميائية الحياتية وباستخدام نظام Api 20 E ، وقد كانت معدلات الاصابة ببكتريا Acinetobacter baumannii في العينات المشخصة (جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) هي (15 ، 11، 6 ، 2) % على التوالي .• التحري عن عزلة كفوءة منتجة للكبسولة ، اذ امكن الحصول على عزلة كفوءة منتجة للكبسولة عند تنمية العزلات في وسط اغار نقيع القلب والدماغ المضاف اليه 5% كلوكوز وبفترة حضن 5ايام ودرجة حرارة 30 م.• التحري عن حساسية عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii تجاه 19 مضادا للحياة ، وقد اظهرت العزلات البكتيرية حساسية بنسبة 100% للمضاد Imipenem ومقاومة بنسبة 100% لمضادات الحياة (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin , Cephalothin , Tetracyclin , Aztreonam , Ciprofloxacin ) • حددت التراكيز المثبطة الدنيا لـ 8 مضادات للحياة Ciprofloxacin وGentamicin وAmikacin وTobramycin وCefotaxime وPipracillin وPiracillin +Tazobactum وCefepime واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في الـMIC لهذه المضادات ،اذ تراو حت قيم الـMIC لهذه المضادات (4 - 512 ، 8 - 1024< ،4 - 256 ، 4 - 1024< ، 16 - 1024< ، 8 - 256 ، 8 - 512) مكغم /مل على التوالي .• التحري عن قابلية عزلات Acinetobacter على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات ، اذ اظهرت العزلات البكتيرية قابليتها على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات نوع الدوز Aldose وتغييره الى لون بني .• التحري عن قابلية 18 عزلة بكتيرية منتخبة بصورة عشوائية تعود للنوع Acinetobacter baumannii على تلزين كريات الدم الحمر للانسان وباصنافه الاربعة A , B, AB, O في اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates ، وقد بينت النتائج قابلية العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للاصناف A , B AB, فيما اخفقت العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للصنف O .ثانيا - الجانب المناعي : استهدف هذا الجانب استخلاص الكبسولة من العزلة الكفوءة ودراسة تاثير تراكيز مختلـفة (25 ، 50 ، 100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على الخلايا المناعية باختيار المعايير الاتية : عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، التشكل الزهري التائي والبائي ، عملية البلعمة ، اختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم ، معامل انقسام خلايا نخاع العظم في الفئران والتحري عن الاضداد المتخصصة بمستخلص الكبسولة باجراء اختبار اخترلوني . ومنها تم الحصول على النتائج الاتية : • عدم تاثير التراكيز (25 ، 50 ، 100) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، فيما اظهرت التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل تاثيرا على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية .فقد سببت انخفاضا في عيوشية هذه الخلايا .• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التائية المكونة للتشكل الزهري الفعال والكلي نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل على الخلايا التائية.• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية البائية المكونة للتشكل الزهري نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل.• اظهرت النتائج زيادة في عملية البلعمة عند استخدام التركيز 100 مكغم /مل من مستخلص الكبسولة فيما انخفضت عملية البلعمة عند استخدام التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في النسب المئوية للخلايا المكونة للفورمازان باستخدام التراكيز (100 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في معامل الانقسام الخيطي لخلايا نخاع العظم في الفئران باستـــخدام التركيزيـــن (100 ، 250) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• تكون خطوط ترسيب بين مستخلص الكبسولة ومصول الارانب الممنعة به باستخدام المصل بدون تخفيف وعند تخفيفه بنسبة 1 : 10 ، فيما لم تظهر اي خطوط ترسيب عند استخدام التخفيفين 1 : 100 و1 : 1000 او عند استخدام المصل قبل التمنيع .ثالثا - الالتصاق البكتيري وتثبيط الالتصاق البكتيري : تضمن هذا الاختبار مقارنة التصاق عزلات مكونة للكبسولة وغير مكونة للكبسولة على البولستايرين ومقارنة التصاق عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار الانسان لمعرفة دور الكبسولة في الالتصاق ، فضلا عن تثبيط الالتصاق البكتيري باستخدام : ا - اضداد مستخلص الكبسولة Capsular antibodies ،اذ تم الحصول على مضاد الكبسولة بعد تمنيع الارانب بمستخلص الكبسولة ومفاعلة المصل المضاد للكبسولة مع عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة لبكتريا Acinetobacter baumannii ومن ثم اجراء اختبار الالتصاق البكتيري لمعرفة دور اضداد الكبسولة في تثبيط الالتصاق .ب‌ - ماتحت التركيز المثبط الادنى subMIC من خلال تنمية العزلة المكونة للكبسولة في وسط نقيع القلب والدماغ السائل BHIB الحاوي على تركيز الـ subMIC لبعض المضادات البكتيرية ، واجري اختبار الالتصاق البكتيري ومقارنة ذلك بمعدل نفس العزلة المنماة في نفس الوسط الخالي من الـ subMIC لمعرفة تاثير الـsubMIC في عملية تخليق الكبسولة وعملية الالتصاق البكتيري .• اظهرت نتائج اختبار الالتصاق على البولستايرين قابلية العزلتين المكونتين للكبسولة على البقاء ملتصقة على البولستايرين فيما اخفقت العزلتين غير المكونتين للكبسولة بالبقاء ملتصقتين على البولستايرين .• بلغ معدل التصاق البكتريا المكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية للانسان (35.62) وبذلك هو اعلى من معدل التصاق البكتريا غير المكونة للكبسولة (19.68) .• اظهرت الاضداد المتخصصة للكبسولة تاثيرا مثبطا لالتصاق العزلة المكونة للكبسولة ، فيما لم تؤثر في التصاق العزلة غير المكونة للكبسولة .• ادى ما تحت التركيز المثبط الادنــــى subMIC للمضاديــــن Ciprofloxacin 64 مكغم/مل وPiracillin + Tazobactum 16 مكغم /مل الى تثبيط الالتصاق البكتيري ، اما في حالة المضادين Cefotaxime 1024 مكغم /مل وGentamicin 4 مكغم /مل فلم يكن هنالك تاثيرا في عملية الالتصاق اذ كان الالتصاق طبيعيا اي انه لم يكن له تاثير ايضا في عملية تخليق الكبسولة .رابعا - الدراسة النسيجية : درست التغييرات النسيجية المختلفة في الفئران المحقونة بالعالق البكتيري Acinetobacter baumannii ومستخلص الكبسولة في الاعضاء ( الكبد ، الطحال ، الكلية ، الرئة ، الامعاء ) ، اذ ظهر تاثير للعالق البكتيري ومستخلص الكبسولة في كل الاعضاء وقد لوحظ تاثير العالق البكتيري في الكبد بوجود خثارات كثيرة داخل الكبد مع وجود تغير دهني ووجود قطيرات دهنية داخل نسيج الكبد ، والطحال ظهر فيه تضخم باللب الابيض في منطقة الخلايا البائية ومنطقة الخلايا التائية ، اما الرئة فقد وجد فيها احتقان مع انخماس ، وظهر في الكلية توسع بسيط في محفظة بومان مع وجود قطيرات دهنية او تغير دهني داخل الكبيبات ووجود تنكس استسقائي في بعض النبيبات ، وفي الامعاء ظهر تضخم في لطخ باير وتنكس مخاطيني . اما تاثير مستخلص الكبسولة فقد ظهر في الكبد بوجود خثرة داخل اوردة الكبد مع توسع في الجيبانيات ، وفي الرئة ظهر ارتشاح خلايا التهابية حول الاوعية الدموية ووجود خلايا التهابية حول القصبات ، اما في الكلية يلاحظ تغيير دهني في الكبيبات ، وظهر في الطحال تكوين دم خارج النخاع مع وجود فرط تنسج في اللب الابيض ، وظهر في الامعاء تضخم لطخ باير مع وجود تنكس مخاطيني . | Acinetobacter baumannii was isolated from 424 samples from wound , urine , sputum , and blood , which were collected from Baghdad hospital / Medical city, 34 isolates (8.01 %) of Acinetobacter baumannii was identified depending on the morphological , cultural ,and biochemical characteristics , by Api 20 E system. The infection rate by Acinetobacter baumannii identified samples (wound , urine , sputum , and blood ) were (15 , 11, 6, 2) % respectively .Detection the efficiency of isolate to produce a large capsular polysaccharide . Under incubation period 5 days at 30 C º and cultural media (Brain heart infusion agar + 5 % glucose) for production of a large amount of capsular polysaccharide . The susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates to 19 antibiotics were performed . All isolates were susceptible 100% to imipeneme and resistant 100% to (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin, Tetracycline , Aztreonam , Ciprofloxacin , Cephalothin Minimum inhibitory concentration ( MIC) of 8 antibiotics (Ciprofloxacin , Gentamicin , Tobramycin , Amikacin , Cefotaxime , Pipracillin , Pipracillin + Tazobactum , Cefipeme ) were determined , which they were ( 4 - 512 , 8 - >1024 , 4 - >1024 , 4 - 256 , 16 - >1024 , 8 - 256 , 8 - 512) μg /ml respectively . The ability of Acinetobacter isolates to discolored blood agar that containing sugars was detected .All isolates showed their ability to discolored blood agar that containing sugars only from type aldose. Ability of isolates that chosen randomly to agglutinate red blood cells of human A,B,AB,O blood groups in micro titration plates was done . Results showed the ability of the isolates to agglutinate red blood cells groups A,B,AB only but not blood group O . Second : Immunological aspect : Extraction of capsular polysaccharide from the efficient isolate number (26) had been done . Then the effect of different concentrations( 52, 50 ,100, 150 , 250 , 500) μg/ml of capsular extract on immune cells were studied according to following parameters : Viability of polymorph nuclear leukocytes and lymphocytes , T&B lymphocytes rosette formation , phagocytosis in vitro, reduction of nitroblutetrazolium , mitotic index test for bone marrow cells in mice , and investigation about specific capsular antibodies by ochterlony test. All these immunological tests were done , the following Results were : No effect was found of concentrations (25,50,100) μg/ml of capsule extract on viability of polymorph nuclear cells & lymphocytes , while concentrations (150, 250 , 500) μg/ml decreased it .The concentrations (100,150,250,500) μg/ml of capsular extract decreased the percentage of T&B rosette formation . Hundred μg/ml of capsular extract increase phagocytic index , while (150, 250, 500) μg/ml inhibited it . Capsular extract concentrations (100, 250, 500) μg/ml decreased number of cells producing Formosan , and (100, 250) μg/ml of capsular extract decreased mitotic index in mice. Precipitation lines were found between capsular extract and serum of immunized rabbits without dilution and with the dilution 1 : 10 .Third : Bacterial adherence and inhibition bacterial adherence : Comparison the adherence between encapsulated isolates and non encapsulated isolates on polystyrene and comparison the adherence between capsulated isolate and non encapsulated isolate on epithelial cells which took from urine to know the capsular role in adherence , and inhibit the bacterial adherence by using : 1 - capsular antibodies which were obtained after immunized the rabbits with capsular extract ,then reaction of the serum with encapsulated and non encapsulated isolates and after that the adherence test was done .2 - sub minimum inhibitory concentration (SubMIC) after growing encapsulated isolate in brain heart infusion broth containing subMIC of some antibiotics and the test of bacterial adherence was done and comparison between the same isolate growing in brain heart infusion broth with subMIC and without subMIC to find the role of subMIC in capsule production process . Results of adherence test on polystyrene showed the ability of encapsulated isolates to adhere on polystyrene while non encapsulated isolates washedout . The rate of encapsulated isolate adhere on human epithelial cells was 35.62 , and that was higher than the rate of non encapsulated isolate which was 19.68. Specific capsular antibodies inhibit adherence of encapsulated isolate, while it had no effect on non encapsulated isolate adherence . SubMIC of the antibiotics ciprofloxacin and piracillin+tazobactum had an inhibitory effect on encapsulated isolate adherence , while their was no effect when subMIC of antibiotic cefotaxime and gentamicin was used. Fourth : Histological aspect : Different histological changes in mice after injected with bacterial suspension and capsular extract were studied in organs (liver , spleen, kidney, lung, intestine) . The effect of bacterial suspension and capsular extract was noticed in all the studied organs . The effect of bacterial suspension in liver was noticed by many clotting inside the liver with fatty changes in the liver tissue , in spleen increased in white pulp size in the region of T&B cells , in lung congestion , in kidney enlargement in bowman capsule with fatty changes inside tubules with hydrobic degeneration in many tubules , in intestine enlargement in payers patches and mucosal degeneration . The effect of capsular extract was noticed in liver by the appearance of clot inside liver’s veins with enlargement in sinuses , in lung infiltration of inflammatory cells around the blood vessels with inflammatory cells around tracheas , in kidney fatty changes in glomerulus . in spleen , blood formation out of the marrow with reactive hyperplasia , in intestine enlargement in payer patches with mucosal degeneration

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

Author name: سوسن محمد كريم
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates

دراسة مناعية لمرضى القرحة المعدية المصابين ببكتريا Helicobacter pylori == Immunological Study of Gastric - Ulcer Patients Infected with Helicobacter pylori

Author name: سهى طالب يحيى الجميلي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | محمد عيسى محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة جمع خزع نسيجية (Biopsy) وعينات دم من 92 مريض يعاني من عسر الهضم، التهاب وقرحة المعدة، قرحة الاثني عشري وسرطان المعدة. وكانت اعمار المرضى تتراوح بين 17 - 76 سنة . جمعت العينات في الفترة ما بين كانون الاول 2011 ونيسان 2012 في مستشفى الكاظمية التعليمي في بغداد. وشملت الدراسة 20 شخص سليم كمجموعة سيطرة. اخضعت مجموعة المرضى فقط للتنظير المعدي العفجي لاستاصال الخزع النسيجية لاجراء الاختبارات البكتريولوجية بينما جمعت عينات الدم من مجموعة المرضى وايضا من مجموعة السيطرة لاجراء الاختبارات المناعية. للتحري عن وجود بكتريا Helicobacter pylori استخدمت عدة اختبارات شملت اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية، الزرع البكتيري، اختبار الانتشار المناعي وايضا الاختبارات المصلية التي شملت اختبار التحري عن الاجسام المضادة ((IgM IgG, IgA والمتمم (C4, C3) واختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) (ELISA)، للتحري عن مستوى الانترفيرون كاما Interferon gamma (IFN - γ) الانترلوكين - 8 Interleukin - 8 (IL - 8). تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي لبكتريا H. pyloriباستخدام طريقة Murphy وقدرت كمية البروتين باستخدام جهاز المطياف الضوئي والتي كانت (2.76028 مغم/مل) وايضا تم تقدير الوزن الجزيئي للبروتينات المستخلصة باستخدام جهاز الترحيل الكهربائي.و خلصت هذه الدراسة كالاتي : 1. انتشار بكتريا H. pylori بلغ (44.56%) بين 92 مريض.2. لا يوجد ارتباط معنوي احصائيا بين عامل العمر والاصابة ببكتريا H. Pylori. بينما وجد احصائيا تاثير عامل الجنس على الاصابة ببكنريا H. pylori.3. نتيجة الزرع البكتيري اعطت (7.31%) من (41) مصاب، بينما اعطى اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية واختبار الضد لبكتريا H. pyloriالسريع النسب (44.56% و64.13%) على التوالي من 92 مريض.4. اظهرت نتائج الترحيل وجود عشرة حزم بروتينية ذات اوزان جزيئية تتراوح بين (16.914 - 340.476) كيلو دالتون مقارنة مع حزم البروتينات القياسية.5. استخدم مستخلص بروتينات الغشاء الخارجي للبكتريا كمستضد للتحري عن وجود الاجسام المضادة للبكتريا باستخدام اختبار الانتشار المناعي الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون خطوط ترسيب بين المستخلص ومصل المريض.6. اختبار التحري عن الاجسام المضادة والمتمم اعطى عيارية عالية للمستضدين IgG, IgA والمتمم C3 بينما عيارية كل من الجسم المضاد IgM والمتمم C4 بقيت طبيعية مقارنة بمجموصة السيطرة.7. اختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم(ELISA) اعطى فروقات معنوية عند مستوى P0.05 لكل من الانترفيرون كاما (IFN - γ)و الانترلوكين - 8 (IL - 8) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | This study includes collection of biopsy and blood specimens from patients with age ranged between 17 - 76 years that suffering from dyspepsia, gastritis, duodenal ulcer, and gastric cancer during the period between December 2011 to April 2012 at AL - Kadhymia teaching hospital . This study also involved twenty healthy persons as a control group. Patients group were subjected to gastroduodenal endoscopy, gastric biopsy were taken from them for bacteriological investigations. Blood samples were also collected for immunological tests, while only blood samples were collected from control group. The Detection of Helicobacter pylori was performed using several laboratory investigations such as biopsy urease test, bacterial culture, precipitation test, and serological test which include immunoglobulins and complement quantitation and enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Interferon gamma (IFN - γ) and Interleukin - 8 (IL - 8) detection. Outer membrane proteins were extracted from these bacteria using Murphy method and the concentration of proteins were calculated by using spectrophotometer, then proteins detected and the molecular weight of proteins were evaluated by using electrophoresis.The results of this study revealed the following : 1. Prevalence of H. pylori in (44.56%) from 92 patients.2. No significant relation between age factor and distribution of H. pylori, but there is a significant relation between gender factor and distribution of H. pylori 3. The result of biopsy culture was (7.31%) from (41) infected patients, while biopsy urease test and Rapid anti H. pylori test gave (44.56% and 64.13%) respectively from 92 patients.4. Electrophoresis results revealed ten bands which renged between (16.914 - 340.476) KDa with protein concentration of (2.76028) mg/ml.5. Outer membrane proteins were extracted from H. pylori isolates and used as antigen to detect specific H. pylori antibodies using precipitation test in which the formation of precipitating line considered as a positive result.6. High titer of IgG, IgA and C3 appeared in patients group, while a normal titers of IgM and C4, as a result of immunoglobulins and complement quantitation.7. Enzyme - Linked Immunosorbent Assay technic for detection of IFN - γ and IL - 8 revealed statistically significant high level in compared with control group.

دراسة فعالية بعض المستخلصات لطحلب Cladophora glomerata == Study the activity of some extracts of alga Cladophora glomerata

Author name: سهام نعمة لفتة
Supervisor name: احمد ساهي دويش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية عزل جنس من الطحالب الكبيرة من بيئة مائية وتشخيصها , اذ تم عزل طحلب Cladophora glomerata من بحر النجف من محافظة النجف الاشرف. تضمنت الدراسة ايضا قياس بعض الصفات الفيزيوكيميائية لمياه بحر النجف والمعزول منه طحلب Cladophora glomerata , اذ شملت القياسات كل من درجة حرارة الهواء والماء , الدالة الحامضية , التوصيلية الكهربائية,المواد الصلبة الذائبة ,الملوحة,وتركيز بعض الايونات السالبة والموجبة للاملاح الموجودة في ماء البحر .بينت النتائج ان درجة حرارة الهواء كانت ( 24)م˚ في حين كانت درجة حرارة الماء (18) م˚ ,فيما كانت قيمة الدالة الحامضية (7.89) وقيمه التوصيلية الكهربائية (20500) ميكروسيمنز / سم وكانت قيمة الملوحة (1.62) 0/00 . في حين كانت نتائج قياس بعض الايونات الموجبة والسالبة للاملاح هي كالاتي : الكالسيوم والمغنسيوم والصوديوم والبوتاسيوم والكلوريدات والكبريتات (3085 و1376 و3815 و6.8 و2988 و3694 ) ملغم/ مل على التوالي .استخلص طحلب Cladophora glomerata باستخدام ثلاث انواع من المذيبات وتمثلت بـ (الكحول الاثيلي وخلات الاثيل والكلوروفورم ) ومن ثم تم اختبار فعالية هذه المستخلصات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus وProteus mirabilis وEscherichia coli .كانت محصلة الاستخلاص ( الحار - البارد ) لطحلب Cladophora glomerata باستخدام المذيبات المختلفة الكحول الاثيلي %(128 - ) وخلات الاثيل %(84 - ) الكلوروفورم %(54,8 - 13,2). استعملت تراكيز مختلفة من مستخلصات الطحلب الكبيرCladophora glomerata (256,128,64,32) ملغم /مل لدراسة تاثيرها على البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق باستعمال اطباق بتري وذلك عن طريق قياس قطر منطقة التثبيط.بالنسبة الى المستخلص الاثيلي لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , وقد بلغت من معدلات اقطار مناطق التثبيط , 9 , 15, 20) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis.، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه والتي كانت (10 ,10 ,11 ,17) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص خلات الاثيل لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص البارد اكفا في تاثيره في البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ كانت معدلات اقطار مناطق التثبيط (10 , 10 , 12 , 15) ملم لكل من بكتريا : S. aureus وPs. aeruginosa وPr.mirabilis. وE.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الحار وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9.8) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 13 , 13 , 17 , 20 ) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. ، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9) ملم وعلى التوالي.كان مستخلص الكلوروفورم الحار لطحلب Cladophora glomerata معنويا اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى لجميع المذيبات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق, لذا استعمل هذا المستخلص انموذجا للتجارب اللاحقة .اظهرت نتائج الكشف عن المركبات الفعالة باستعمال التفاعلات الكيميائية احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلبCladophora glomerata على كل من التانينات والصابونينات والفلافونويدات والقلويدات والكلايكوسيدات والتربينات والفينولات والراتنجات.واظهرت نتائج التحري عن المحتوى الكيميائي من المواد الفعالة باستعمال تقنية الـGC - Mass Spectrophotometer احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata الذي اظهر كفاءة عالية في تثبيط نمو الاحياء المجهرية المعزولة من خمجات الجروح والحروق لاحتوائهما على العديد من المركبات ذات التاثيرات البايولوجية ضد المايكروبية. | The present study includes isolation and identification of Macro - alga from water body. Macro - algae was isolated ,Cladophora glomerata from Baher Al - Najaf region in Holy Najaf city . This experiment includes the measurement of some chemical and physical characteristics of Baher AL - Najef water which Cladophora glomerata was isolated from it . Temperature, electric conductivity (EC),PH, hardness and concentration of ions : Chloride, Sulphates and Carbonates. The Results were showed that the measurements of : air temperature was (24)˚C while water temperature was (18) ˚C, EC (20500) µS/cm; PH (7.8 ) ; and salinity (1.62)0/00.The concentration of positive and negative ions such as Ca, Mg, Na, K, Cl and SO4 were (3085,1376,3815,3815,6.8,2988 and 3694) mg/ml respectively Three types (Ethanol, Ethyl acetate and Chloroform) were used to extract Cladophora glomerata in order to evaluate their antibacterial activity against some bacterial isolates which isolated from wound and burn infection includes ( Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Proteus mirabilis Escherichia coli,) .The percentage yields of extracts of ( hot - cold ) for Cladophora glomerata were Ethanol ( 8 - 12 ) % , Ethyl acetate ( 4 - 8 ) % and Chloroform (13.2 - 54.8) %. Different concentrations of these algal extracts had prepared which were (32, 64, 128 and 256) mg/ml and the antagonistic activity against the isolated bacteria from wound and burn infection were evaluated by measured the diameter of inhibition zone. The effect of hot Ethanol extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 15 , 9 , 11 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with cold Ethanol extract which were ( 17 , 11 , 10 , 10) mm , respectively. The effect of cold Ethyl acetate extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15 , 12 , 10 , 10 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with hot Ethyl acetate extract which were ( 9.8 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. The effect of hot Chloroform extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 17 , 13 , 13 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli respectively , when compared with cold Chloroform extract which were ( 9 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. Because hot Chloroform extract of Cladophora glomerata was more efficiency effective than the other extracts , only the hot Chloroform extract of Cladophora glomerata will used in the next experiments. Results indicated that the active chemical compounds in hot Chloroform extract of Cladophora glomerata were Tannins, Saponins , Flavonoids, Resins , Glycosides , Terpenes, Alkaloid and Phenols. Results indicated that hot Chloroform extract of Cladophora glomerata has a lot of active chemical compounds against micro - organisms by using the GC - Mass Spectrometry technology

دراسة مقارنة لبعض انواع النحل من فوق عائلة Apoidea الملقحة لنبات الجت Alfalfa Medicago sativa في محافظة بابل == Comparative study for some insect pollinators Apoidea that pollinated Alfalfa Medicago sativa in Babylon

Author name: سهاد حميد حسن
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي شعلان معيلف الاعرجي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة اختيار 13 حقلا من حقول الجت Medicago sativa من مناطق معينة من محافظة بابل لدراسة عملية التلقيح الحيوي لهذا المحصول خلال مدة التزهير للفترة ما بين مايس الى تشرين الاول لعام 2004، حيث استخدمت خلال هذه المدة شبكة صيد الحشرات القياسية لاخذ العينات التي بلغ عددها الكلي 185 عينة ، وقد تم تشخيص (47) نوعا تعود الى(18) جنسا تحت ست عوائل تابعة الى فوق عائلة النحل Apoidea وهي Megachilidae ,Halictidae , Anthophoridae , Andernidae , Ctenoplectridae , Apidae.قورنت عوائل النحل التابعة الى فوق عائلة Apoidea تبعا لعدد الانواع والاجناس والكثافة الكلية لكل منها، وقد وجد ان عائلتي Halictidae وMegachilidae كانتا الاكثر وفرة في عدد الانواع والاجناس وكثافة الافراد مقارنة مع العوائل الاخرى وقد شكلتا نسبة 61.1 % و72.3 % و88.5 % من العدد الكلي للاجناس والانواع والنماذج المجموعة على الترتيب. كما لوحظ وجود تذبذب في عدد العوائل والاجناس والانواع والكثافات باختلاف شهور الدراسة. وقد تبين ان شهر تموز هو الشهر الاعلى كثافة (عدد الافراد/50 كنسة) اذ بلغت الكثافة فيه 22.7 فرد/50 كنسة بينما كان شهر مايس هو الاقل عددا وبلغ 4.34 فرد/50 كنسة.تم دراسة التواجد الشهري لعوائل النحل في حقول الجت من حيث الكثافة وعدد الانواع وتبين ان العوائل اختلفت في عدد الانواع التي تمثلها وكذلك كثافاتها باختلاف شهور الدراسة.اختيرت عشرة انواع من ملقحات محصول الجت التابعة الى فوق عائلة Apoidea على اساس كثافاتها ، ثباتها وتكرار تواجدها في العينات خلال مدة الدراسة بالاضافة الى سهولة تشخيصها بالعين المجردة لغرض الدراسات اللاحقة ، وهذه الانواع هي : Megachile rotundata , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus, Megachile sp.2 (near to M.latimanus) , Nomia melanderi , Apis mellifera , Megachile sp.4, (near to M. texana), Nomia sp.2(near to N. nortoni) , Homalictus sp.1 (near to H. rowlandi) , Nomioides variegata . تم مقارنة الانواع العشرة المنتخبة من حيث معدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها ، نسب حبوب لقاح الجت ضمن الحمولة ، وزن الجسم/ملغم ، طول الخرطوم/ملم، مدة البقاء على الزهرة مقاسا بالثانية وعدد الانتقالات بالدقيقة.واظهرت النتائج ان الاناث قد تفوقت على الذكور في جمع اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح وللانواع العشرة. بينت النتائج ان هنالك ستة انواع من النحل قد تفوقت في معظم نواحي الكفاءة المنتخبة وهي : Megachile rotundata وMegachile sp.2 وsp.4 Megachile تعود لعائلة Megachilidae كذلك الانواع Nomia melanderi وNomia sp.2 (Halictidae) وApis mellifera ( Apidae) وتميزت اناث النوع M. rotundata معنويا بانها الاكثر كفاءة في حمل اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح خلال الدراسة بلغ 49750 حبة لقاح تلته اناث الانواع Megachile sp.2 وsp.4 Megachile وN. melanderi بلغ عدد ما حمل كل منهم على الترتيب (34300 , 32600 , 31550).اما ذكور النحل فقد تميزت بحمل اعداد لا باس بها من حبوب اللقاح فقد حملت ذكور rotundata . M22125 حبة لقاح تلته ذكور N. melanderi فقد حملت 16725 حبة لقاح مما يدل ان لها دورا في عملية تلقيح ازهار الجت. اختلفت معدلات اعداد حبوب التي تحملها الملقحات اختلافا معنويا باختلاف شهور الدراسة،فقد كان معدل عدد حبوب اللقاح المحمولة في شهري تموز واب اعلى مقارنة مع الشهور الاخرى وكانت اعداد حبوب اللقاح المجموعة من قبل اناث النوع M. rotundata اعلى معنويا مقارنة بالانواع الاخرى بلغت 52000 و50875 حبة لقاح خلال شهري تموز واب على الترتيب.من ناحية اخرى بلغ اعلى معدل لنسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح 91.5 % بواسطة اناث النوع M. rotundata تلته اناث النوع N. melanderi اما اقل نسبة فقد بلغت 62.6 % بواسطة النوع Nomia sp.2 .تفاوتت معدلات النسب المئوية لحبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبصورة معنوية بين شهور الدراسة ،وقد تميز كل من شهري تموز واب مقارنة بالشهور الاخرى بارتفاع معدلات نسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبلغت هذه النسبة 100% في شهر تموز بواسطة النوع M. rotundata وN.melanderi ، اما في اب فقد بلغت(100،94.1%)على الترتيب للنوعين المذكورين. وعليه فانه يبدو ان الانواع الستة هي ملقحات متخصصة لمحصول الجت.تم في هذه الدراسة ايضا قياس معدل اوزان الملقحات (ملغم) ذكورا واناثا وبينت النتائج وجود فروق معنوية واضحة بين اوزان الانواع المدروسة,وبناء عليه فقد قسمت الانواع حسب الوزن الى ثلاث مجموعات كبيرة ومتوسطة وصغيرة،كما اشارت النتائج الى وجود علاقة ارتباطية موجبة بين وزن الجسم ومعدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها هذه الملقحات. اظهرت النتائج ان ازهار الجت تزار بمجموعتين من النحل حسب طول الخرطوم(اللسين) هما مجموعة النحل طويل اللسين ،بلغت النسبة المئوية لعدد الانواع التابعة لهذه المجموعة 49% اما المجموعة الثانية فهي مجموعة النحل قصير اللسين بنسبة51% من المجموع الكلي للانواع. وبلغ اكبر معدل لطول اللسين 4.34 ملم لنحل العسل mellifera A. في حين ان اقل معدل بلغ 1.55 ملم للنوع Nomia sp.2 . واوضحت النتائج ان الملقحات المنتخبة قد اختلفت اختلافا معنويا في مدد بقائها على ازهار الجت .اقل مدة بقاء سجلت للنوع M. rotundata على ازهار محصول الجت بلغت 2.22 ثانية تلاه النوع N. melanderi 3.01 ثا ونلاحظ ان عدد الانتقالات قد ارتبط عكسيا مع مدة بقائها فقد سجل النوع M. rotundata اكبر عدد لانتقالاته على محصول الجت بلغت 22.2 انتقالة/د واقل عدد للانتقالات بلغ 11 انتقالة/د للنوع Nomia sp.2 . | Thirteen fields of Alfalfa Medicago sativa were selected from certain region in Babylon governorate to study its pollination biology during flowering period , May to October 2004, the standard insect net was used to collect (185) samples.During study the period, about (47) species were collected from the Alfalfa fields belong to (18) genus under (6) families of the super family Apoidea, these families were Megachilidae, Halictidae, Anthophoridae, Andernidae, Ctenoplectridae, Apidae.The families of Apoidea that have been collected were compared according to the number of species, number of genera and density of individual of each taxonomic group.It was found that the families Halictidae and Megachilidae were the highest in the number of species , genera and density of individual compared with other families , However, these two families represented 61.1% , 72.3% , 88.5% of total number of the genera , species and their densities respectively .The monthly variations in the number of families , genera, species and density of Apoidea were discussed . It was found that the month of July was highest in the density (number of individual/ 50 beat) reached to 22.7, while the lowest number reached to 4.34 on May.The monthly occurrence of different families of Apoidea in Alfalfa fields was investigated according to the rate of densities and the rate of number of species , However, It was appeared that the families varied in number of species and densities of each month for the study period.The alfalfa pollinators species were selected according to their densities , consistence, occurrence during the study period and easily recognized by necked eye for further study. these were included : Nomia sp2.(near to N. nortoni) , Nomia melanderi , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus , Nomioides vareigata , Homalictus sp.1(near to H. rowlandi) (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2(near to M.latimanus) , Megachile sp.4 (near to M. texana)(Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae).The ten selected pollinators were compared according to the average of pollen load, the percentage of Alfalfa pollen grain in the pollen load , body size , length of proboscis, visit duration/s , visit frequency/m ,and the result showed that the females were usually collect more pollen grain than the males of same species in all the ten selected species .It was found that six species pollinators within the ten selected species of Apoidea were significantly more active in most of the efficiency factors , these were Nomia sp2. , Nomia melanderi , (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 (Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae). The females of M.rotundata was significantly more efficient in pollen grain collection , the average number of pollen grain reached to (49750) followed by females of , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 , Nomia melanderi (34300 , 32600, 31550) pollen grain respectively . While 22125 pollen grain was collected by M. rotundata males followed by males of Nomia melanderi (16725). which seems they were importance in the pollination of Alfalfa flowers .The selected pollinators varied in average number of pollen grain in various months . However, it was found that the pollen load of each species was high during July and August compared with other month, the pollen load of females M.rotundata was (52000, 50875) pollen grain in July and August respectively.On the other hand, the highest average percentage of Alfalfa pollen grains was reached to 91.5% by females of M.rotundata followed by Nomia melanderi reached to be 85.7% , while the lowest percentage was 62.6% by Nomia sp2.The average percentage of Alfalfa pollen grain within pollen load was different significantly in each month of the study period. However, it was found that the percentage of Alfalfa pollen grain was high during July and August compared with the other months . The highest percentage of Alfalfa pollen grain was reached to (100 %) in July by M.rotundata and Nomia melanderi and was reached to (100 , 94.1%) in August also by the two species respectively . thereupon, it seems clearly that these six species of Apoidea were appeared to be specialization for Alfalfa crop pollination.The average of body size of pollinators species for males and females were measured .The results illustrated that there was significant variation in body size of selected species. Thereupon , the selected species were grouped into three groups : big, medium and small. It was found that there was positive correlation relationship between the body size and pollen load of pollinators .The results showed that the flowers of Alfalfa crop were visited by two grouped of bees , which were long-tongued bees with the percentage of 49% , and short- tongued bees with the percentage of 51% of the total number of species . The highest average of proboscis length was reached to 4.34 mm for A.mellifera , while the lowest average was reached to 1.55 mm for Nomia sp2 .The results appeared that the selected pollinators were significantly differences in the visit duration to the flowers (second) , the lowest average of the visiting duration of the pollinators was reached to 2.22 second for M.rotundata followed by Nomia melanderi which was reached to 3.01second . It was found that the visiting duration of pollinators was correlated negatively with visit frequency per minute . However , the M.rotundata has highest visiting frequency reached to 22.2 visit/ minute while the lowest visiting frequency was reached to 11 visit / minute by Nomia sp2

الكشف عن البارفوفايروس B19 بوساطة التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي في مرضى اورام الدرقية == Detection of Parvovirus B19 by Immunohistochemistry in Patients with Thyroid Tumors

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | علي حسین محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Thyroid cancer is the most common neoplasm of endocrine system. In Iraq thyroid cancer ranks the eighth among ten cancers in females.Therefore, it is a growing health problem.The present study was conducted to evaluate whether or not parvovirus B19 play a role in thyroid tumors and the correlation between the existence of virus and activation of NF - κB p65. Also this study extended to determine relevant cytokines (IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α) in the microenvironment of thyroid tumors by using immunohistochemical technique.This study designed as a retrospective study. A total number of 94 formalin - fixed paraffine - embeded thyroid tumors tissue collected from archive of Histopathology Department of the Teaching Laboratories, Medical/ City, Al - Shaheed Ghazi Hospital Lab, Al - Kindy Hospital Lab, Alkarama Hospital Lab and Central Public Health Lab during the period July 2013 - November 2013. All samples are referred to the period between 2010 - 2013. Tissue blocks were divided into three groups. First group included 53 tissue block of malignant thyroid whereas second group included 41 tissue blocks of benign thyroid tumors and third group included 21 tissue blocks as control group were selected from the same benign cases which have normal tissue. From each block, seven sections of 4μm thickness were taken, one section was stained with Hematoxylin and Eosin (H&E) and the other six sections were immunohistochemically stained for human parvovirus B19, NF - κB p65, IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with malignant thyroid tumors ranged from 20 - 70 year with mean age 40±11.63 year while in benign tumors, the mean age was 37.6±11.19 year, ranged from (16 - 59) year.The papillary thyroid carcinoma was the most common type among malignant histopathological types 61%. In benign tumors the most common was follicular adenoma 29.3%.Human parvovirus B19 expression was higher in malignant tumors than in benign with no significant difference P=0.09 while it was significantly higher in malignant 66% and benign tumors 48.8% compared with their counterparts of control group 4.8%, p˂0.001.NF - κB p65 was positively expressed in all cases of malignant tumors 100% and 97.6% in cases of benign tumors compared with control group 23.8% with significant difference p˂0.001.IL - 6 expression was higher in benign than in malignant tumors with no significant difference p=0.22 while it was significantly higher in benign 90.2% and malignant tumors 81.1% compared with control group 52.4%, p=0.01 and p=0.03 respectively.Immunostaining reaction for IL - 8 was significantly higher in malignant tumors than that in benign 69.8% versus 31.7%, p˂0.001, while positive reaction was not detected in any tissue of control group.IL - 10 was expressed in 83% of malignant tumors, in 95.1% of benign tumors and 71.4% control group. The percentage of IFN - α positive was 83% in malignant tumors compared with 63% in benign tumors and normal tissue 52%. The difference was significant between malignant and benign tumors p=0.04 and between malignant and control group p=0.007.There was a significant correlation between human parvovirus B19 score category and IFN - α score r=0.296, p=0.031. But no significant correlation was noticed between B19 and the other cytokines.

تقييم بعض العوامل المسببة للاجهاض التلقائي للنساء في محافظة بغداد : دراسة مصلية ونسيجية == Evaluation of Some Spontaneous Abortion - Causative Factors for women in Baghdad Province A Serological And Histological Study

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | سالم رشيد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الاجهاض التلقائي احدى المشاكل السريرية المهمة التي تؤثر على النساء الحوامل خلال (20 - 22) اسبوع الاولى من الحمل مسببة خطر على الام وجنينها.وبهدف القاء الضوء على بعض مسببات الاجهاض وموت الاجنة داخل الرحم. تم اختيار (70) امراة من النساء المجهضة ، قسمت النساء الى مجموعتين ، الاولى هي المجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل (52) والثانية مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الثانية من الحمل (18) . اجريت المقارنة مع(20) من النساء ذوات حمل طبيعي انتهى حملهن بولادة طبيعية.جمعت نماذج الدم والمشايم خلال الفترة من تشرين الثاني 2008 ولغاية نيسان 2009 في مستشفيات بغداد. اجريت الفحوصات المختبرية لتحديد مستويات هرمون البروجسترون والاستراديول واضداد داء المقوسات IgM, IgG الانترلوكين - 6 وسكر الدم والبروتين الكلي والتغيرات النسجية في مشايم النساء المجهضة باستخدام صبغة الايوسين - هيماتوكسلين وصبغة الكمزا. بنيت الدراسة الحالية النتائج الاتية : - 1 - لوحظ وجود انخفاض معنوي (P< 0.01 ) في مستوى هرمون البرجسترون والاستراديول لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل المختلفة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 2 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات IgG في (%41.43) من المجموع الكلي للنساء المجهضة, بينما لوحظ وجود اضداد داء المقوسات IgM في (%5.6 ) من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل.3 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستوى 1L - 6 بين النساء المجهضات ومجموعة السيطرة. 4 - لوحظ ارتفاع معنوي (P< 0.01 ) و(P< 0.05 ) في مستوى البروتين الكلي في مصل النساء المجهضة خلال مرحلة الحمل الاولى والثانية على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 5 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستويات الكلوكوز بين مجموعة النساء المجهضة ومجموعة السيطرة . 6 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقات ترابطية في المرحلة الاولى من الاجهاض التي كانت علاقة موجبة بين ( IgM,IgG) داء المقوسات (P< 0.01 ) وعلاقة معنوية موجبة بين البروحسترون والاستراديول مع مستوى السكر بالـدم (P< 0.05 ) وعلاقة معنوية موجبة بين IgG داء المقوسات والعمر.7 - وجود علاقات ترابطية قوية بين هرمون البروجسترون و1L - 6 (P< 0.05 ) و(P< 0.01 ) المرحلة الاولى والثانيةعلى التوالي من الحمل وهرمون البروجستون والاستراديول (P< 0.05 ) في المرحلة الثانية من الاجهاض . 8 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية ظهور الحالات المرضية في المشايم المجهضة والتي شملت الاستسقاء المائي Hydropic Degeneration التليف Fibrosis وتجمع الهايلين Hyalinization وحالة الذوى Ischemia والتفاعل المناعي Immunological reaction وعدم وجود الطفيلي نسيج المشيمة باستخدام صيغة كمزا . | The spontaneous abortion is considered as one of the important clinical problems that is may effects pregnant women during the 1st 20 - 22 weeks of pregnancy causing dangers to the mother and her fetus.The present study was designed to focus on some spontaneous abortion causes and fetal death and fetal death in the uterus. (70) Women were selected to represented the samples of spontaneous aborted women.The women were classified into two groups , the first represented aborted women during the first trimester of pregnancy (52) , the second trimester of pregnancy (18) , in comparison with result of (20) normally delivered pregnancies. The samples (sera and placenta) were collected during the period from November 2008 to April 2009 in Baghdad.Laboratory tests were performed to determine serum levels of difficult parameters which include progesterone ,estradiol , Toxoplasma IgG,IgM , IL - 6 , blood sugar, total protein .Histopathological changes of aborted placenta was performed using haematoxylin - eosin , giemsa stain to differentiate nuclear and cytoplasmic morphology of parasite.Results 1 - Significant decrease (p<0.01) in the level of progesterone and estradiol hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy compared with control.2 - Anti - Toxoplasma IgG, IgM were positive in (41.43%), (5.6%) of total aborted women, respectively.3 - There was no significant difference (p>0.05) in level of IL - 6 between aborted women and control. 4 - There was a significant increase in the level of total protein in the serum of women with abortion in first and second trimester of pregnancy compared to control (p< 0.01, p< 0.05).5 - There was no significant difference in the levels of blood sugar between women with abortion and control.6 - The results of present study revealed correlations between the parameter in first trimester that was positive correlation between IgG with IgM toxoplasmosis (p<0.01), significant positive correlation between blood sugar with progesterone,estradiol hormone,(p<0.05) and significant positive correlation between age with IgG toxoplasmosis (p<0.05). 7 - There was a correlation (positive) between progesterone with IL - 6 in first and second trimester (p<0.05, p<0.01), respectively. And progesterone with estradiol (p<0.05) in second trimester. 8 - The histological study shows hydropic degeneration fibroids with hyalinization of fibrinosis changes, immunologic reaction, ischemia and negative histological parasite with Giemsa.

اكثار نبات الخلة البلدي Ammi visnaga نسيجيا وتقدير بعض مركبات الايض الثانوي فيه == Micro propagation and Estimation of some Secondary metabolite in Ammi visnaga plant A thesis

Author name: سعدة عبد الفتاح سعيد
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عبد الجاسم محيسن جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري هذا البحث في مختبرات مركز بحوث التقنيات الاحيائية / جامعة النهرين بهدف زيادة انتاج الخلين في المزارع النسيجية لنبات الخلة البلدي Ammi visnaga وتقديره بالتحليل الكمي والنوعي بجهاز HPLC ثم مقارنته مع مستخلص الاوراق والبذور الجافة من النبات الكامل In vivo. تم انبات البذور في ظروف معقمة على وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 1, 0.5 ملغم / لتر على التوالي والحصول على بادرات دون الكالس .اظهرت النتائج بان وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 3.5و1 ملغم / لتر على التوالي كان فعالا في استحداث الكالس فتفوقت السويقة الجنينة السفلى باعطاء معدل نسبة مئوية 100% بالضوء على كالس الاوراق الذي كانت نسبته 83.3 % وكذلك تفوق نفس الوسط بالوزن الطري والجاف للسويقة الجنينية السفلى مقارنة مع كالس الاوراق للضوء والظلام . فقد بلغ الوزن الطري لكالس السويقة الجنينية السفلى من الضوء 1005.6 ملغم وفي الظلام 916.5 ملغم . بينما بلغ الوزن الجاف في الضوء لكل من كالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية 48.5و39.9 ملغم على التوالي وفي الظلام 45.5 و41.1ملغم .تباينت طبيعة ولون الكالس تبعا للجزء النباتي وظروف الحضن تميز كالس السويقة الجنينية السفلى بطبيعة هشة ولون اخضر في الضوء وازداد هشاشة ولون ابيض مائل للاخضرار في الظلام . بينما اختلف الكالس المستحدث من الاوراق الفتية واتصف بتماسكه ولونه الاخضر في الضوء مقارنة بالكالس المستحدث في الظلام اذ كان اقل تماسكا وذو لون ابيض .تم الحصول على كالس ذو وزن عالي وبكميات كبيرة عند اعادة زراعته Subculture على نفس وسط الاستحداث ثلاث مرات .اعطت مستخلصات الاجزاء النباتية البذور الجافة والاوراق للنبات المزروعة في الحقل In vivo منحنيات عالية لمركب الخلين مع انعدامه بمنحنيات مزارع الكالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية بخلاف مركب الكومارين اذ تميزت مستخلصات مزارع كالس بانتاجه، وارتفع منحناه بمستخلص كالس الاوراق الفتية في الضوء.لقد تم بنجاح الحصول على نبيتات كاملة لكالس نبات الخلة البلدي عند زراعته على وسط MS حيث مزود ﺒ NAA 0.5 ملغم / لتر وBA 1 ملغم / لتر تم نقلها على نفس الوسط بدون NAA . | this study was conducted in The laboratories of Biological technology center / university of Al - Nahrain, during 2007 - 2008.The aim of this study was to increase the production of Khellin from Ammi visnaga In vitro and its determination by the quantitative and qualitative Analysis by HPLC and comparing it with the extracts of plant part In vivo. Seeds have been germinated under sterilized conditions on MS medium supplied with NAA at0.5 mg/L and BA at1mg/L and It has achieved to plantlets without any production of callus .Results showed that MS medium supplied with NAA 3.5 mg/L and BA 1.0 mg/L was that most effective on callus induction. Thus, the calli of hypocotyls incubated in light were significantly superior(100% induction) in comparison with young leaves calli which gave 83.3%.Results also showed that the same medium produced more fresh and dry weights of hypocotyls callus has and young leaves ones exposed or not to light .Accordingly the fresh weight of the hypocotyls calli and young leaves achieved 1005.66, 916.5 mg in light. respectively and 800.8,702.5 in dark successively. As for the dry weight hypocotyls calli reached 48.5 mg in light and 45.5mg in dark while young leaves calli gave 41.11mg in dark and 39.9mg in light .The difference in nature and color of the calli depends on the type of explant and incubation conditions. Calli of hypocotyls was fragile nature with green color in light, the fragility increased in darkness and the color was white and greenish. Calli of young leaves were compact and green color in light while less coherent and white at dark .In order to obtain larg quantities of calli, subculture on the above mentioned medium is recommended for at least three times.The highest level of khellin was obtained in vivo by using extracts of different parts (dry seeds and leaves) in comparison with callus that production in in vitro (calli).Regeneration was successfully achieved from calli cultured firstly on MS medium supplemented with NAA0.5mg/L and BA1.0mg/L then transfersed to the same medium with out NAA.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة للمرضى المحبطين مناعيا ودراسة للاستجابة المناعية ضد المبيضات البيضاء == Isolation and identification of fungi associated with and study immunocompromised patients of the immune response against Candida albicans

Author name: سعاد يوسف لفتة
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: خلال فترة الدراسة التي امتدت من تشرين الثاني/2003 ولغاية نيسان/2005 فقد تم اخضاع 300 مريضا يعانون من مختلف الامراض الخبيثة الى فحص داء الفطريات واظهر 17 مريضا من المجموع الكلي ان نتائج زرع الدم كانت ايجابية وان خميرة مبيضة المبيضات Candida albicans كانت المسؤولة عن معظم الاصابات بالفطريات ومن بين الحالات السبعة عشر التي تم عزلها فان تسعة منها (53% من مجموع الحالات) كانت من نوع C. albicans وان الاصابات بفطريات اخرى سواها والتي تم عزلها بلغ عددها اربعة (23% من مجموع الحالات) كانت من Aspergillus spp التي تم عزلها من حالة فردية من حالاات Cryptococcus spp وحالة ثانية من حالات زرع Trichosporone spp . ولقد اتبع اسلوب API (API candida and API 20 C AUX) كطريقة مرجعية لتشخيص ماتم عزله. وبالمقارنة مع الاساليب التي قدمت مؤخرا وهي انظمة (ID32 C) و(VITEK YBC) فان نظام API 20 CAUX وID32 كانامطابقين لمستوى السلالتين وبدون حاجة الى مزيد من الفحوصات الاضافية لتشخيص 13 حالة من الحالات الخمسة عشر التي تم عزلها اي 86.6% وان اهم ما تم التوصل اليه ثبوت ان نظام VITEK YBC يصلح جدا للمقارنة مع API 20 CAUX. ومن بين المرضى الثلاثمائة الذين تم زراعة دمهم تم فحص 71 منهم للتاكد من وجود او عدم وجود اصابة فطرية دون اجراء فحوصات على اعضاء الجسم الاخرى غير المصابة وكانت عينات الادرار هي الاكثر شيوعا من بين العينات الاخرى ومع ذلك فان عينتين فقط من مجموع 35 عينة اتفق على انها موجبة الزرع.و من بين المرضىالسبعة عشر الذين اثبت الزرع وجود فطريات لديهم فان ثمانية منهم كونوا مستعمرات من نفس الانواع الموجودة في النماذج الاخرى وان اكثر المواقع شيوعا لتكوين المستعمرات مع نفس الاحياء المجهرية كانت المجاري التنفسية والمجاري البولية - التناسلية. وكان متوسط العدلات (Neutrophils) في عينات دم موجبة الزرع 1136 خلية/ملم3 مع انحراف معياري مقداره ±1637 خلية/ملم3 في حين كان المتوسط لحالات الزرع السالبة 2701 مع انحراف معياري مقداره ±1667 . وباستعمال فحص ELISA لمضادات الجسيمات BioRad) (المتوفر تجاريا فان 25 مريضافقط من مجموع المرضى الثلاثمئة الذين اجروا الفحص اظهروا نتائج ايجابية. وان تسعة من بين هؤلاء الخمسة والعشرين اظهروا نتائج موجبة لزرع الدم ايضا في حين اظهر الستة عشر الاخرون نتائج زرع سالبة. ولم يظهر اي من افراد فريق السيطرة الاصحاء نتائج موجبة. وكانت قراءة نماذج الدم موجبة الزرع 1.11 مع انحراف معياري مقداره 0.68 في حين ان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لحالات الزرع السالب لاعضاء فريق السطرة الاصحاء كانت 0.43 مع انحراف معياري مقداره ±23 وان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لاعضاء فريق السيطرة الاصحاء كان 0.38 مع انحراف معياري مقداره 0.123. وقد اظهرت تراكيز interleukins التي تم فحصها بهذه الطريقة اختلافات كبيرة بين مجموعات الدراسة المختلفة وكذلك اختلافات بين افراد المجموعة الواحدة وان التركيز المتوسط ل IL - 1α في نماذج زرع الدم الموجبة بلغ 30.94 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±80.33 في حين ان التركيز المضبوط لحالات الزرع السالب بلغ 16.08 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 3.26 وكان التركيز المضبوط ل IL - 8 في نماذج الدم موجبة الزرع 389.2 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±383.15 في حين ان متوسط التركيز كان 163.0 بيكوغرام \مل مع انحراف معياري مقداره ± 289.9 وكان متوسط التركيز لدى مجموعة السيطرة المؤلفة من الاصحاء 5.02 بيكوغرام \مل م مع انحراف معياري مقداره ±1.81 . وكان تركيز GM - CSF في نماذج الدم 12.90 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±31.79 في حين ان متوسط تركيز حالات الزرع الموجبة كان 2.68 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 10.19. وان متوسط تركيز افراد مجموعة السيطرة الاصحاء بلغ 0.85 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 0,45. ولم يظهر مستوى الغلوبيولين المناعي اية متغيرات ملموسة بين مجموعات الدراسة سواء اكان الفحص IgG او IgM او IgA ولقد اظهر مستوىالعنصر التكميلي ل C3 اختلافات بارزة بين مجموعات الدراسة لكونه اوطا في مجموعة الزرع الموجب. وعلى كل حال لم تلاحظ اختلافات كبيرة في المجموعات بالنسبة الى C4 . وكان مستوى C Reactive Protein في المجموعات الدراسية المختلفة قد كشف عن اختلافات بارزة p=0.001 وعلاوه على ذلك فان الاختلافات كانت واضحة بين الافراد الذين هم ضمن نفس المجموعة. وكان المتوسط التقريبي لمستوى CRP في نماذج زرع الدم الموجبة 261,9 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±384.4 وفي نماذج زرع الدم السالبة بلغ 178,8 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±364.2 وفي مجموعة السيطرة التي افراده من الاصحاء بلغ 1.7 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±7.7 . وكان مستوى CRP في 58,8 من الحالات في مجموعة الزرع الموجب قد تجاوز 96 ملغ\لتر في حين ان 37.4% فقط من مجموعة الزرع الموجب تجاوزت هذا الرقم. ولم يكن يوجد بين افراد فريق السيطرة الاصحاء من تجاوز هذا الرقم.و كانت جميع الحالات التي تم عزلها بعد الفحص تستجيب الى الامفوتيريسين B مع (MIC =<1 مايكروغرام\مل) باستثناء C. krusei المنفرد الذي تم عزله والذي كان اقل استجابة من اي نوع اخر مع MIC مقداره 2 مايكروغرام\مل وMIC 50 المزدوج. وكانت نسبة سلسلة MIC الى الامفوتيريسن B تتراوح بين 0.125 الى 2 مايكروغرام\مل وبصوره عامة فان Non - albicans Candida اظهرت MIC اعلى من C. albicans التي تم عزلها وان 84.6% من الCandida التي تم عزلها كانت تستجيب الى الامفوتريسين والباقي اي 1.4% كانت حساسيتها حسب مقدار الجرعة. وان نسبة سلسلة MICs الى الفلوكونازول تراوحت بين (0.25 - 64) مايكروغرام\مل وكان جميع ما تم عزله ذا حساسية عالية تجاه الفلوكونازول باستثناء C. krusei التي اظهرت MIC عال حيث بلغ 32 واما MIC 50 وMIC 90 فقد كانت 16 مايكروغرام\مل و32 مايكروغرام\مل على التوالي. وان جميع ال Candida التي تم عزلها ونسبتها 84.6% استجابت الى الفوكونازول في حين ان نسبة 15.4% كانت حساسيتها حسب الجرعة.ان سلسلة الMIC تجاه الاتراكونازول كانت تتراوح بين (0.015 - 1) مايكروغرام\مل وكانت جميع C. albicans التي تم عزلها حساسة تجاه الاتراكونازول واظهرت خمائر الCandida الاخرى non - albicans Candida استجابة اقل نسبيا مع الحاجة الى تراكيز دوائية اعلى من اجل التوصل الى MIC وان 96.2 % من الCandida التي تم عزلها استجابت الى الاتراكونازول وان الباقي اي 30.8% كانت تستجيب حسب الجرعة. | Through the period of this study which extended from November 2003 to April 2004, 300 patients with different types of malignancies were tested for fungemia. Out of those, 17 patients showed positive blood culture results. Candida albicans accounted for the majority of fungal infections. Out of the 17 fungal isolates, 9 (53%) were C. albicans, others non C. albicans came next in frequency constituting 4 isolates (23.5%). Two isolates of Aspergillus spp. could be detected while a single isolate of Cryptococcus spp and another of Trichosporon spp. isolate were cultured API system (API Candida and API 20C AUX) was used as a reference method for the identification of isolates. Compared with the other newly introduced techniques (ID 32C systems and VITEK YBC). ), the API 20C and the ID 32 system were in agreement with the species level, without additional tests, for the identification of 13 of the 15 (86.6%) isolates.Overall, the updated Vitek YBC compares favorably with the API 20C in the identification of common yeasts. Among the 300 patients whose blood were cultured, 71 of them were screened for fungal infection from other parts of the body. Urine was the commonest sample obtained. However, two samples only out of the total (35 samples) were accepted to be culture positive. Among the 17 patients whose blood cultures proof the existence of fungi, 8 were colonized with the same species in other specimens. The most frequent sites of colonization with the same organism were the respiratory tract and urogenital tract.The mean of neutrophils count of the blood culture positive samples was 1136/c.mm with a standard deviation (SD) of 1637, whereas the mean count of culture negative cases was 2701 with a SD of 1923. Mean count of healthy control group was 5027 with a SD of 1667. Statistical analysis showed significant differences between the study groups. Using commercially available Candida - specific antibody test (Bio - Rad), 25 patients showed positive results out of the 300 patients tested. Nine of them showed positive blood culture as well, whereas the rest (16) gave negative culture results. None of the healthy control group showed positive results. Mean OD readings of the blood culture positive samples was 1.11 with a SD of 0.68, whereas the mean OD readings of the culture negative cases was 0.43 with a SD of 0.23. Mean OD readings of healthy control group was 0.38 with a SD of 0.123. Interleukins (ILs) concentration tested in this study showed significant variations among the different groups of the study as well as within the same group. Mean concentration of IL - 1α in the blood culture positive samples was 30.94 pg/ml with a SD of 80.33, whereas the mean concentration of the culture negative cases was 16.08 pg/ml with a SD of 28.75. Mean concentration of healthy control group was 7.92 pg/ml with a SD of 3.26. Mean concentration of IL - 8 in the blood culture positive samples was 389.2 pg/ml with a SD of 383.l5, whereas the mean concentration of culture negative cases was 163.0 pg/ml with a SD of 289.9. Mean concentration of healthy control group was 5.02 pg/ml with a SD of 1.81. Mean concentration of Granulocyte Macrophage - Colony Stimulating Factor (GM - CSF) in the blood culture positive samples was 12.90 pg/ml with a SD of 31.79, whereas the mean concentration of culture negative cases was 2.68 pg/ml with a SD of 10.19. The mean concentration of healthy control group was 0.85 pg/ml with a SD of 0.45. Serum immunoglobulins level showed no significant differences among the groups of the study whether IgG, IgM or IgA were tested. Mean level of C3 complement component showed significant differences between the groups of the study, being lower in culture positive group, and followed by culture negative group. However, no significant differences were noted in the groups in regard to C4. Level of CRP in different groups of the study shows significant variations (p=0.001). Moreover, variations are clear between individuals within the group itself. Approximate mean of CRP level in blood culture positive samples was 261.9 mg/L with a SD of 384.4 and, in blood culture negative samples was 178.8 mg/L with a SD of 346.2 and in healthy control group was 1.7 mg/L with SD of 7.7. CRP level in 58.8% of cases in culture positive group exceeded 96 mg/L. while only 37.4% of cases in culture negative group exceeded this value. Non in the control group exceeded this figure. All the tested isolates were susceptible to amphotericin B, with MICs ≤ 1ug/ml with the exception of a single isolate of C. krusei which was less susceptible than any other spp with MIC of 2 ug/ml and MIC50 of 2. The range of MICs to amphotericin B was from 0.125 to 2 ug/ml. In general, non - albicans Candida showed higher MIC than C. albicans isolates. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to amphotericin while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to fluconazole was from 0.25 to 64 ug/ml. All isolates were highly sensitive to fluconazole with the exception of C. krusei which showed a high MIC (32) and MIC50 and MIC90 of 16 and 32 ug/ml respectively. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to fluconazole while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to itraconazole was from 0.015 to 1.0 ug/ml. Most C. albicans isolates were sensitive to itraconazole. Non - albicans Candida showed relatively lower susceptibility with the need for higher drug concentrations to attain the MIC. 69.2% of Candida isolates were susceptible to itraconazole while the rest (30.8%) were susceptible in a dose - dependant way.

نزعات مقاومة مكروليد في العقدية المقيحة والرئوية المعزولة من الاطفال العراقيين المصابين بامراض الحلق المعدية == Macrolide Resistance Trends in Streptococcus pyogenes and Streptococcus pneumoniae Isolated from Iraqi children with throat infections

Author name: سعاد عبد الجبار عبد الزهرة الساعدي
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على مرضى مراجعي العيادة الاستشارية في مستشفى ابن البلدي في مدينة بغداد (العراق) للفترة من تشرين الثاني 2007 الى شباط 2008 . تم تعين المرضى بشكل عشوائي اذ تم اختيار 108 حالة (60 انثى و48 ذكر) تراوحت اعمارهم بين 18 شهر الى 12 سنة والذين يعانون من التهاب الحنجرة والبلعوم .تم جمع مسحات البلعوم من كل مريض بهدف عزل وتشخيص البكتريا . اعتمد كل من فحص D - test وOptochin كفحص اساسي لتميز بكتريا Streptococcus pyogenes المقاومة للمضادات الميكروليدية . اظهرت النتائج ان 94 حالة ظهرت عليهم العلامات السريرية واعراض التهاب اللوزتين والبلعوم ، 7 حالات ظهرت عليهم اعراض الحمى القرمزية (Scarlet fever)، و14 مريض اعتبروا حاملين للمرض .تم تشخيص بكتريا S. pyogenes في 65 عزلة من اصل 73 وكانت 16 منها مقاومة لمضادات الحياة الميكروليدية ، وتم تشخيص 8 عزلات من Streptococcus pneumoniae .توزعت المجاميع المقاومة للمضادات الحياة الميكروليدية الى : مجموعة بكتريا مقاومة من نوع iMLSB بواقع 3 عزلات ، ومن نوع cMLSB بواقع 8 عزلات ومن نوع M - phenotype بواقع 5 عزلات ، واظهرت عزلتين من نوع معكوس D - Shape (Inverted D - Shape) .كانت التراكيز المثبطة الدنيا باستخدام تقنية التخفبف الدقيق Micro - dilution لـ17 مضاد حيوي متفاوتة بالنسبة الى العزلات (حساسة او مقاومة للمضادات الميكروليدية واشكالها المظهرية) . اظهرت بكتريا S. pyogenes الحساسة للـerythromycin والـclindamycin تركيز مثبطا ادنى عند 0.25 مايكروغرام/مليليتر لكل من الـCo - amoxicillin + clavulanic acid وceftriaxone .بكتريا S. pyogenes التي قاومت كل من erythromycin وclindamycin كانت حساسة عند التركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر للـampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وceftriaxone وciprofloxacin وgatifloxacin .كانت عزلات S. pyogenes من نوع M - phenotype حساسة للتركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر من azithromycin وlincomycin وampicillin وCo - ampicillin cloxacillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وcephalothin وcefotaxime . ادنى تركيز مثبط لعزلات S. pyogenes من نوع D - Shape موجب كان 0.25 مايكروغرام/مليليتر لمضادات ampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin . كانت عزلات S. pneumoniae حساسة لكل مضادات الحيوية التي تم دراستها وبتراكيز مثبطة ادنى تراوحت بين (1 - 0.25) مايكروغرام/مليليتر .تم تحديد 3 عزلات من S. pyogenes متحملة للبنسلين . يستنتج من ذلك ان عزلات الـS. pyogenes المقاومة لمضادات الميكروليدية كانت تحتل نسبة عالية ، واكثر الاشكال المظهرية شيوعا كان من نوع cMLSB .كل من العزلات المقاومة للـfluoroquinolone والمتحملة للبنسلين penicillin tolerant كانت متواجدة في العزلات المقاومة والحساسة لمضادات الميكروليدية .حساسية عزلات S. pyogenes لمضادات الحيوية كانت متفاوتة بالنسبة الى حساسيتها او مقاومتها لمضادات الحيوية الميكروليدية وكذلك بالنسبة الى التنويع المظهري للعزلات المقاومة . | This study was conducted on patients attending the consultant clinic at Ibn - Al - Balady Hospital in Baghdad, Iraq from November 2007 to February 2008. The patients were allocated randomly, after they examined thoroughly by pediatrician, to be admit in this study. A total number of 108 (60 girls and 48 boys), their ages ranged from 18 months to 12 years, with provisional diagnosis of tonsillo - pharyngitis were enrolled in this study. Throat swab was obtained from each patient for isolation and identification of microorganisms. Double - disk test (D - test) and optochin test, fundamental for discrimination macrolide resistant Streptococcus pyogenes were done. The results showed that 94 patients had clinical signs and symptoms of tonsillo - pharyngitis, 7 patients were diagnosed as scarlet fever and 14 patients were considered as carriers. S. pyogenes was identified in 65 out of 73 isolates; sixteen of them were macrolide - resistant strain, and (8 isolates) of Streptococcus pneumoniae were identified. The phenotypes of macrolide resistant S. pyogenes were distributed as iMLSB (3 isolates), cMLSB (8 isolates) and M phenotype (5 isolates). Two isolates showed inverted D - Shape patterns. The minimum inhibitory concentration (MIC), using microdilution technique, of seventeen antimicrobials were varied with respect to the isolates whether susceptible or resistant to macrolide in addition to their phenotypes. The lowest MIC for susceptible isolates to erythromycin and clindamycin, was 0.25 µg/mL of Co - amoxicillin + clavulanic acid and ceftriaxone. S. pyogenes which resisted to both erythromycin and clindamycin were susceptible to 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, ceftriaxone, ceftazidime, ciprofloxacin and gatifloxacin. M - phenotype of S. pyogenes isolates were susceptible to 0.25 µg/mL of azithromycin, lincomycin, ampicillin, Co - ampicillin - cloxacillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, cephalothin and cefotaxime. The lowest MIC for S. pyogenes characterized by positive D - shape test was 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid and gentamicin . S. pneumoniae isolates were susceptible to all tested antimicrobials with MIC range of 0.25 - 1 µg/mL. Penicillin - tolerant S. pyogenes was detected in 3 isolates. It concludes that Macrolide resistant S. pyogenes was found in high percent, and the commonest phenotype was cMLSB. Both fluoroquinolone resistant isolates and penicillin tolerant isolates were detected in both Macrolide resistant and susceptible isolates. The susceptibility of S. pyogenes isolates to antimicrobials was varied in respect to their susceptibility or resistance to macrolide as well as to the phenotypes of resistant isolates.

بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية في تعقيدات الحـمـل == SOME IMMUNOLOGICAL AND BIOCHEMICAL CHANGES IN PREGNANCY COMPLICATIONS

Author name: سعاد الماس براخاس
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية المرافقة لتعقيدات الحمل. تم جمع (120) انموذجا من دم لنساء حوامل، قسمت على اربع مجاميع تتضمن (30) نموذج لنساء ذوات مقدمة الارتعاج و(30) نموذجا لنساء ذوات سكري الحمل و(40 ) نموذجا لنساء ذوات فقر الدم و(20) نموذجا لنساء حوامل اصحاء ظاهريا، وقد اعتمدت المجاميع الثانية والثالثة والرابعة بمثابة مجاميع السيطرة للحالة المرضية الرئيسية مقدمة الارتعاج.وقد خلصت الدراسة المناعية الى النتائج الاتية : - 1 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgM معنويا (P<0.001) في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 173.7 mg /dl ± 43.5 مقارنة بمعدل مستوياتها لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم والبالغ 118.4 mg/dl±43.5 و131.1 mg/dl±43.7 على التوالي ،في حين لم يكن هناك فرقا معنويا بالمقارنة مع ذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن 181.7 mg/dl± 55.6.2 - ارتفعت قليلا مستويات الكلوبيولين المناعي IgG في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها mg/dl 1285± 377.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى مجاميع السيطرة الثلاثة والبالغ 1145mg/dl ±374.1 و1117.2 mg/dl± 378.3 و280.4± 1233.9 mg/dl على التوالي ولم يكن هذا الارتفاع معنويا.3 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgA معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فكان معدلها 279.9 mg/dl± 94.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء الاصحاء والبالغ 177.1 mg/dl ±70.2 في حين لم يكن الارتفاع ذي دلالة معنوية مقارنة بمعدل مستواه عند ذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 94.37±210.4 mg/dl و261.3 mg/dl± 85.7 على التوالي.4 - ارتفاع في مستويات جزئي المتمم C3 وC4 معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغت معدلاتها 188.3 mg/dl±40.1 و47.1± 14.6 مقارنة بمعدلاتها مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم108.9 mg/dl ±44.2 و139.9 mg/dl± 40.8 و29.9 mg/dl± 12.5 و34 mg/dl± 11.8 على التوالي ، في حين لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 157.1 mg/dl ±55.4 و37.6 mg/dl ±11.5 .5 - ارتفعت مستويات البروتين الجنيني الالفي معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها 63.2 ng/ml ±34.6 مقارنة بمعدل مستواه عند النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 27.6 ng/ml ± 12.4و 30.4 ng/ml± 12.8و18 ng/ml ± 10.4على التوالي.6 - ارتفاع في مستويات البروتين الفعال - C في امصال 36.6% من النسوة ذوات مقدمة الارتعاج مقارنة بارتفاعه لدى 10% من ذوات فقر الدم و20% من ذوات سكري الحمل ، في حين لم تبدي اي من النساء الحوامل الاصحاء تفاعلا موجبا لهذا الفحص.فيما اشارت نتائج الفحوصات الكيموحيوية الى ماياتي : - 1 - ارتفع مستوى الكلوكوز في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.7±103.4 mg/dl مقارنة بمعدل مستواه لدى مجموعة النساء ذوات فقر الدم والبالغ g/dl 76±11.9 وكان الارتفاع ذا دلالة احصائية ( P<0.001)، بينما لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 86.3 mg/dl±10.4 ، غير ان مستواه يقل وبشكل معنوي ( P<0.001) مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 163.4 mg/dl± 19.9.2 - ارتفع مستوى الكولسترول الكلي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 217.5 mg/dl 41.8 ± مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات فقر الدم والبالغ 187.2 mg/dl±30.5 وكان الارتفاع ذ ا دلالة احصائية (P<0.001) بينما لم يكن الارتفاع ذا دلالة احصائية مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 195.5 mg/dl± 19.5، في حين كان يقل وبشكل غير معنوي مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 221.5 mg/dl ±41.3 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى اليوريا في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.6 ± 35.6 mg/dlمقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن22.2 mg/dl± 4.9 و23.9 mg/dl±6.4 و24 mg/dl± 5.7 على التوالي.4 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى الكرياتنين في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 1.1 mg/dl± 0.4 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 0.6 mg/dl ± 0.2 و0.6 mg/dl ± 0.2 و0.2 ± 0.7 mg/dl على التوالي.5 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى حامض اليوريك في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 7.4 mg/dl± 2.5 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 3.7 mg/dl± 1 و4.1 mg/dl± 1.2 و4.6 mg/dl±1.1 على التوالي.6 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GOT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط Median)) U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 6 U/L و7 U/L و5 U/L على التوالي.7 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GPT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 8 U/L و8 U/L و6 U/L على التوالي.8 - لم يكن هناك فرق معنوي في مستوى انزيم الفوسفاتيزالقاعدي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 27 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحــــمل والـبالغ 34 U/L و25 U/L و28 U/L على التوالي.اما نتائج الفحوصات الدمية فاشارت الى ما ياتي : - - 1ظلت مستويات الهيموكلوبين ضمن حدودها الطبيعية عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء مقارنة بمستواه لدى النساء ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 1 ± 9.2 g/dl .2 - ظلت مستويات مكداس الدم متقاربة وضمن حدودها الطبيعية لدى النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء فيما انخفض مستوياته لدى ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 2.8 ± 28.2 %.3 - ارتفعت اعداد خلايا الدم البيض معنويا (P<0.001) عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 3.7 ± 12.2 ×109 /L مقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن9.1×109/L ± 1.9 و109/L 8.8 × 2.1± و109/L 8.8 × ± 2.6 على التوالي .4 - لم تكن هناك فروقات معنوية في اعداد الصفيحات الدموية بين النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وظلت ضمن حدودها الطبيعية. | The present study was designed to focus on some immunological and biochemical changes accompanied pregnancy complications. 120 pregnant women were selected to represent the samples, the women were classified into 4 groups, the first group (30 samples) represented preeclamptic women, the second group (30 samples) represented gestational diabetic women, the third group (40 samples) represented anemic women, and the fourth group (20 samples) represented healthy pregnant women. The 2nd, 3rd, and 4th groups considered as a control groups for the main group, preeclamptic women.The results of immunological study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001) in the levels of immunoglobulin IgM in the sera of preeclamptic women (43±173.7mg/dl) in comparison with healthy women and anemic women 43±118.4 mg/dl , 43.5±131.1 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.6±181.7 mg/dl.2 - There was some elevation (non - significant) in the level of immunoglobulin IgG in the serum of preeclamptic women in comparison with the three control groups.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of immunoglobulin IgA of preeclamptic women (94.5±279.9mg/dl) ,in comparison with healthy women 70.2±177.1 mg/dl , while there were no significant differences in comparison with anemic women and gestational diabetic women 4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of complement components C3 and C4 of preeclamptic women 40.1±188.3 mg/dl, 14.6±47.1mg/dl respectively comparison with healthy women and anemic women 44.2±108.9 mg/dl, 40.8±139.9 mg/dl and 12.5 ±29.9 mg/dl,11.8±34 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.4±157.1 mg/dl and 11.5 ±37.6 mg/dl.5 - A significant increase (P<0.001) in the levels of Alpha - fetoprotein in the sera of preeclamptic women 34.6 ±63.2 ng/ml in comparison with healthy women 11.5±27.6 ng/ml , anemic women 12.4±30.4 ng/dl , and gestational diabetic women 10.4±18 ng/dl .6 - The serum levels of C - reactive protein recorded to be increased in 36.6% of preeclamptic women in comparison with 10% of anemic women and 27% of gestational diabetic women, while all the healthy women showed negative result to this test.The biochemical study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of glucose of preeclamptic women 13.7±103.4 mg/dl in comparison with anemic women 11.9 ±76 mg/dl, but not significant with healthy women 10.4±86.3 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 19.9±163.4 mg/dl .2 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of total cholesterol of preeclamptic women 41.8 ±217.5mg/dl in comparison with anemic women 30.5 ±187.2 mg/dl, but not significantly with healthy women 19.5±195.5 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 41±221.9 mg/dl.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of urea of preeclamptic women 13.6 ±35.6 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 4.9±22.2 mg/dl , 6.4± 23.9 mg/dl and 5.7±24 mg/dl respectively.4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of creatinine of preeclamptic women (0.4 ±1.1 mg/dl) in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.2 ±0.6 mg/dl , 0.2 ± 0.6 mg/dl and 0.2±0.7 mg/dl respectively.5 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of uric acid of preeclamptic women 2.5 ±7.4 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.9 ±3.7mg/dl , 1.2 ± 4.1 mg/dl and 1.1±4.6 mg/dl respectively.6 - There was no significant difference in the levels of GOT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.7 - There was no significant difference in the levels of GPT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.8 - There was no significant difference in the levels of alkaline phosphates enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.The hematological study showed following features : - 1 - The hemoglobin's level remain within its normal range in preeclamptic women , and gestational diabetic women , as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who showed a significant decrease (P<0.001) the mean was 0.9± 9.2 g/dl. 2 - The hematocrit level remain within its normal range in preeclamptic women, and gestational diabetic women, as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who revealed a significant decrease (P<0.001) the mean was 2.8 ± 28.2 % .3 - A significant increase (P<0.001) in the counts of white blood cells in preeclamptic women 3.7 ±12.2 × 109 /L. in comparison with healthy women , anemic women and gestational diabetic women, 1.9 ±9.1×109/ L , 2.1 ± 8.8×109 / L and 2.6 ±8.8×109 / L respectively.4 - There was no significant difference in the platelets counts in preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.

دراسة تاثير الغشاء الحيوي المنتج بواسطة Klebsiella pneumonia المعزولة سريريا على بعض جوانب الجهاز المناعي == Study the Effects of Biofilm of Klebsiella pneumoniae Isolated Clinically on Some Immune System Aspects

Author name: سرى مؤيد عباس العبيدي
Supervisor name: علي حسين علوان العامري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد بكترياKlebsiella pneumoniae من الممرضات الخطرة التي بامكانها ان تسبب اصابات حادة, شملت الدراسة عزل 50 عزلة من البكتريا من مصادر سريرية مختلفة من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد (مستشفى ابن البلدي, مستشفى الكندي التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب) لغرض دراستها من محاور عدة بعد ان شخصت البكتريا اعتمادا على الطرق التقليدية بالتشخيص من حيث صفاتها الزرعية والكيموحيوية فضلا عن استعمل جهاز vitek2 compact system لتاكيد التشخيص, اظهرت نتائجنا ان عدد ونسبة عزلات بكترياKlebsiella pneumoniae التي تم الحصول عليها وفقا للمصادرالسريرية (الادرار,الدم ,القشع، حروق, مسحة الاذن ، القيح, الجروح والخروج) كانت 22 (44٪)، 11 (22٪)، 4 (8٪),4 (8٪), (3) (6٪)، 3 (6٪)، 2 (4٪) و1 (2٪) على التوالي. المحور الاول ركز على دراسة المقاومة للمضادات المختلفة وتحديد التركيز الادنى للمضادات الحيوية لتثبيط نمو البكتريا, استعملت المضادات الاتية (,amikicin, azteronam cefepime ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin (trimethoprim/ sulfamethoxazole and لوحظ ان المضادات amikicin, impenem meropenem and اكثر فاعلية ضد هذه البكتريا. من جهة اخرى اظهرت العزلات قدرة مختلفة على انتاج الغشاء الحيوي، حيث استخدمت في هذه الدراسة طريقتان لمعرفة قدرة العزلات لتشكيل الغشاء الحيوي، وكالتالي كانت النسبة في طريقة Congo - Red Agar (CRA) 72 % مكونة للغشاء و20 % غير منتجة و8 % غير محددة الانتاجية, في حين طريقة اطباق المعايرة الدقيقة 80 % مكونة و20 % غير قادرة على تكوين الغشاء. العزلات الاقوى لانتاج الغشاء الحيوي اختيرت لمعرفة مقاومتها للمضادين Ciprofloxacin and Meropenem لاجراء مقارنة المضادات بين الخلايا المفردة والخلايا المكونة للغشاء الحيوي, حيث اظهرت النتائج ان المقاومة للمضادات تصبح اكثر بحوالي 10 مرات بالنسبة للخلايا المكونة للغشاء الحيوي مقارنة مع الخلايا المفردة. المحور الثاني تضمن اجراء التجارب المناعية وشملت عملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة وعملية البلعمة, اجريت هذه التجارب على اكفا عزلتين من كل مصدر من ناحية تكوين الغشاء الحيوي والاكثر مقاومة للمضادات الحيوية, من ناحية اخرى عرضت هذه العزلات لمصدر الاشعة فوق البنفسجية بطول موجي 240 نانوميتر ولمدة نصف ساعة وذلك لاجراء مقارنة بين العزلات نفسها قبل وبعد التعرض وتاثير ذلك على استجابة الجهاز المناعي داخل وخارج الجسم الحي. حيث اظهرت التحليلات الاحصائية وجود فروق عند مستوى معنوية (0.001) لعملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة (داخل الجسم الحي) والبلعمة (خارج الجسم الحي) عند المقارنة مابين العزلات قبل وبعد التشعيع ومابين البكتريا في حالة كونها خلايا مفردة وفي حالة تكوينها الغشاء الحيوي, يدلل ذلك ان الجهاز المناعي اكثر فاعلية ضد الخلايا المفردة من الخلايا المكونة للغشاء الحيوي وللعزلات نفسها قبل وبعد التشعيع.اخيرا اجريت دراسة للتحري عن نسبة وجود الجينات التي يعتقد انها مسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي بواساطة جهاز تفاعل البلمرة التسلسلي وكانت النسبة للجين mrkA 92% وللجين mrkD 50% في العزلات الغير مشععة واصبحت النسبة 53% MrkA و23% MrkD للعزلات بعد التشعيع. كخلاصة هذه النتائج تؤيد ان الاستجابة المناعية ضد البكتريا المكونة للاغشية الحيوية هي اقل كفاءة والتي تضمنت في الدراسة عنها للخلايا المفردة ومما يعني نحن بحاجة لاجراء دراسات اخرى تشمل للجوانب المناعية الاخرى المتخصصة في استجابة الجهاز المناعي. | Klebsiella pneumoniae is a dangerous pathogens that can cause severe diseases. This study included the isolation of 50 isolates of bacteria from different clinical sources from different hospitals in Baghdad city (Ibn - albalady hospital, Teaching Al - Kindy hospitals and Teaching laboratory in medical city hospitals through August 2014 to December 2014) for the purpose of examination of several axes after confirmation the diagnosis of bacteria depending on traditional methods of diagnosis in terms of relying on cultural and biochemical characteristics then used vitek2 a compact system. These results showed that the number and percentage of isolate according to the sources (urine, blood, sputum, burns, ear swabs, pus, wounds and stool ) were 22(44%), 11(22%), 4(8%), 4(8%), 3(6%), 3(6%), 2(4%) and 1(2%) respectively. The first axis of this studies focused on the isolates resistance to different antibiotics and determination the minimum inhibitory concentration of antibiotics ( amikicin, azteronam, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin, trimethoprim/ sulfamethoxazole) that inhibits the growth of bacteria, the obtained results showed that the antibiotics amikicin, impenem and meropenem more effective against the isolates. On other hand the isolates showed different ability to produce biofilms, to examine this ability two methods were used (Congo - red agar methods and Tissue culture plate methods), the percentage of isolates formed biofilms in method (CRA) 72% produce biofilm and 20% non productive and 8% non - specific in CRA, while in TCP method 80% composed and 20% are not able to form the membrane. Higher production of biofilms isolates were exposed to Ciprofloxacin and Meropenem to make a comparison the antibiotic resistance between planktonic and biofilms producers isolates, the results showed that resistance to antibiotics became 10 times higher than planktonic. The second axis was the immunological experiment which included opsonization, bactericidal activity and phagosytosis. The strongest isolates that were chosen from each sources depended on biofilms formation, and antibiotic resistance, the same isolates were exposured to radiation by UV light wave length 240nm for 30min to compare between the same isolates after and before radiation to determine the immune response. Statistical analysis showed a significant differences P (0.001) to all immunogical experiments opsonization and bactericidal (preformed in vivo for wild and mutant type) activity phagocytosis (preformed in vitro for bacteria in planktonic and biofilm form). The immune system response was more effective against planktonic than biofilms formation bacteria to phagocytosis and between isolates for bactericidal assay and opsonization after and before radiation. Finally the genetic study used serial polymerase chain reaction to determine the proportion of the presence of genes that are believed to be responsible of biofilm production ratio was mrkA 92% and mrkD 50% of wild isolates that became at ratio 53.8% mrkA and 23% mrkD in isolates after radaiation, as a conclusion these findings support that immune response to bacteria vital constituent of membranes differ from the response in the case of single cells and there is need to make other immunological studies include specialized aspects of the immune system response.

تحضير الدقائق النانوية لاوكسيد واوكزالات النحاس ودراسة فعاليتها ضد بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المعزولة من اصابات الحروق والجروح == Preparation of Copper Oxide and Oxalate Nanoparticles and Their Effects Against P.aeruginosa and Methicillin - Resistant S.aureus from Burn and Wound Infections

Author name: سرمد فاروق هادي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ست وثمانون عينة سريرية (57 من الجروح و29 من الحروق) من مرضى مصابين بانواع مختلفة من الجروح والحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد وهي : مستشفى اليرموك التعليمي ومستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الحروق في مدينة الطب خلال الفترة من ايلول الى كانون الاول 2014. العينات المجموعة فحصت باستخدام ملون كرام ثم زرعت على اوساط اكار الدم واكارالماكونكي بالاضافة الى الاوساط التفريقية الانتقائية (وسط اكار السيدوموناس لعزل Pseudomonas aeruginosa ووسط المانيتول الملحي لعزل (Staphylococcus aureusكما اجريت الاختبارات الكيموحيوية التالية : الكاتاليز والاوكسديز والكواوكيوليز واختبار API 20 NE لغرض تشخيص الـ P.aeruginosa بالاضافة الى ذلك، وبالاعتماد على نظام VITEK2 compact تم اجراء الاختبار التاكيدي لتشخيص P.aeruginosa وS.aureus كشف الزرع البكتيري لـ 86 عينة الماخوذة من الجروح والحروق، ان 75 عينة )%87.2 ( وجد فيها نمو بكتيري هوائي (عينات ايجابية)، بينما العينات السلبية كانت (11) ونسبتها 12.8 %. اظهر زرع عينات الحروق والجروح نسبة عالية %)45.3 ( ,34 عزلة من P.aeruginosa وبالتالي اقترح ان يكون هو المسبب المرضي الاكثر شيوعا، بينما S. aureus كانت نسبتها 28.0 % (21 عزلة). تم زرع جميع عزلات S. aureusعلى وسط agar CHROM حيث سجلت 66.6 %منها كانت مقاومة للمثسيلين اي Methicillin Resist Staphylococcus aureus (MRSA) و33.3 % حساسة للمثسيلين ايMethicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) ، نفس النتائج اعلاه تم الحصول عليها باستعمال طريقة Cefoxitin disc diffusion. خضعت 34عزلة عائدة لبكتيريا P.aeruginosa لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية قيد الدراسة، واظهرت النتائج ان كل العزلات %100.0كانت مقاومة للمضادات Carbenicillin وDoxycycline في حين اظهرت مقاومة عالية نسبيا للمضادات الاتية Amoxicillin /Clavulanic acid % 85.3% Cefipime , , 82.4 Netilmicin 76.5% واخيرا Azetreonam 61.8% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Gentamicin ,35.3% Tobramycin 32.4% واخيرا Ciprofloxacin ,29.4 % بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لمضاد% Imipenem 14.7 . من جهة اخرى, خضعت 21 عزلة عائدة لبكتريا S.aureus لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية واظهرت مقاومة عالية نسبيا لكل من Azithromycin ; 76.2% Cefoxitin Clathromycin; 66.7% 62.0% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Chloramphenicol ,%47.6 42.9% Ciprofloxacin Doxycycline, 38.0% بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لكل من Gentamycin , 19.0% Tobramycin Vancomycin , 14.3% 9.5% واخيرا Clindamycin . 9.5% تم تحضير دقائق نانوية لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس بنجاح بطريقة كيمياوية مرنة مستندة على التفكك الحراري لمواد اولية من حامض الاوكزاليك. تم تشخيصها باستعمال الطرق التالية : التحليل النمطي من انحراف الاشعة السينية (XRD) ، والمجهر الالكتروني الماسح (SEM) والتحويل الرباعية لامتصاص الاشعة تحت الحمراء(FT - IR) . تم قياس الفعالية المضادة للبكتيريا لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس النانوية المحضرة لكل من P.aeruginosa وMRSA باستعمال طريقة الانتشار في الحفر وطريقة تخفيف المرق. بينت النتائج بان كلا النوعين من الدقائق النانوية لها القدرة على منع نمو عزلات البكتيريا تحت الدراسة. كما تم تحديد التركيز المثبط الادنى MIC والتركيز القاتل الادنى MBC لكلا النوعين من الدقائق النانوية حيث كانت قيم MIC وMBC لاوكسيد النحاس ضد P.aeruginosa في التراكيز 1600 و3200 مايكروغرام/مل على التوالي، في حين كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/ مل على التوالي. اما بالنسبة لـ MRSA فان قيم MIC وMBC للدقائق النانوية لاوكسيد النحاس كانت في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/مل على التوالي، بينما كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس النانوية في التراكيز 200 و400 مايكروغرام/مل على التوالي. | Eighty six clinical samples (57 wounds and 29 burns swabs) were collected from patients with different types of wounds and burns from hospitals in Baghdad City : Al - Yarmuk Teaching Hospital, Baghdad Teaching Hospital and Burn Hospital in Medical City at a period between September to December 2014. The collected samples were examined by Gram stain then cultured on Blood agar and MacConkey agar media, as well as differential selective media including Pseudomonas agar for isolation of Pseudomonas aeruginosa and Mannitol salt agar for isolation of Staphylococcus aureus bacteria. The following biochemical tests were performed : catalase, oxidase, coagulase tests, and API 20 NE in order To diagnose P.aeruginosa. Additional, Confirmatory test was performed by using VITEK2 compact system in order To identify P.aeruginosa and S.aureus. The results of bacterial cultures revealed that out of 86 samples obtained from burns and wounds, 75 samples forming 87.2 % were observed to have an aerobic bacterial growth (positive samples), while negative samples, (11) represented 12.8%. The results of bacterial culture from burn and wound samples revealed high percentage of 45.3% of P.aeruginosa (34 isolates). Hence, it was suggested to be the most common pathogen, while S.aureus represent 28.0% (21 isolates). All isolates of S.aureus were cultured on CHROM agar medium which revealed that 66.6 % of them were Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and 33.3% Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), the same results were obtained by using Cefoxitin Disc Diffusion method. The Antibiotic sensitivity test on thirty four isolates of P.aeruginosa showed that all isolates 100.0% were resistant to Carbenicillin and Doxycycline; relatively high resistance to Amoxicillin/Clavulanic acid, 85.3 %; Cefipime, 82.4 %; Netilmicin, 76.5 % and Azetreonam, 61.8 %. These isolates have relatively moderate resistance to Gentamicin, 35.3%; Tobramycin, 32.4%; Ciprofloxacin, 29.4%, and relatively low resistance to Imipenem, 14.7 %. On the other hand, (21) isolates of S.aureus were tested for antibiotics sensitivity, indicating relatively high resistance to Azithromycin, 76.2%; Cefoxitin, 66.7% and Clathromycin, 62.0%. They also have relatively moderate resistance to Chloramphenicol, 47.6%; Ciprofloxacin, 42.9%, Doxycycline, 38.0% and relatively low resistance to Gentamycin, 19.0%; Tobramycin, 14.3%; Vancomycin, 9.5 % and Clindamycin, 9.5%.Copper oxide and oxalate nanoparticles were prepared successfully via soft chemistry route based on the thermal decomposition of oxalic precursors. They were obtained with a well - controlled morphology and particle size. These nanoparticles were characterized by using : X - ray diffraction (XRD) pattern analysis, Scanning Electron Microscope (SEM) and Fourier Transform Infra - Red spectroscopy (FT - IR). The antibacterial activity of the obtained copper oxide and oxalate nanoparticles against P.aeruginosa and MRSA were estimated by using Well Diffusion and Broth Dilution methods. The results showed that both types of nanoparticles have the ability to inhibit growth of the bacteria under study. The Minimal Inhibitory Concentration (MIC) and Minimal Bactericidal Concentration (MBC) of copper oxide nanoparticles against P.aeruginosa were found to be 1600 and 3200 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively. For MRSA, the MIC and MBC values of copper oxide nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 200 and 400 µg/mL respectively

التحــري عن سم الباتيولين والفطريات المنتـجــه له في بعض انـواع الفاكــهـه المجـفـفه والسـيـطره عليـه بايولوجيا == Investigation for Patulin toxin producing from some fungi in dried fruits and its biological degradation

Author name: سامي جبار اسماعيل الجدياوي
Supervisor name: شذى علي شفيق | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسه في مختبرات دائرة البحوث الزراعية التابعة لوزارة العلوم والتكنولوجيا للتحري عن تلوث الفواكه المجففه ( المشمش - العنب) المعروضه في اسواق مدينة بغداد ومحافظة كربلاء بسم الباتيولين . اظهرت نتائج التحري عن سم الباتيولين في 21 عينه مختلفه من عينات (المشمش - العنب) المجففه اخذت من مناطق مختلفه من محافظة بغداد اضافة الى عينة من محافظة كربلاء وكانت جميع العينات المفحوصه ملوثه بسم الباتيولين وقد سجلت العينات الماخوذه من مناطق (عنب مجفف)كربلاءK و(مشمش مجفف) الشعلة D وشارع فلسطين C اعلى نسبة تلوث بلغت 30499.5) و2836.3 و1795.3 ) مايكروغرام /غم على الترتيب , في حين سجلت العينات الماخوذه من (مشمش مجفف) الحارثية I ومدينة الصدرS و(عنب مجفف) الحارثية G اقل نسبة تلوث بلغت حوالي (7.8 و11.7 (19.8 مايكروغرام /غم على الترتيب وتباينت درجة تلوث العينات بالفطريات اذ بلغت اعلى نسبة وجود على مستوى الاجناس كانت لجنس Aspergillus spp. حيث كانت نسبة وجوده 100% في عينة(عنب مجفف) الشعب H وبعدها عينات (مشمش مجفف) العطيفية N و(عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف) بغداد الجديدة U و(عنب مجفف) شارع فلسطين A والعلاوي J لنفس الجنس بنسبة (94.12 و94.44 و95.45 و95.56 و96.55)% على الترتيب . وفيما يخص لجنس Penicillium spp. فقد تراوحت نسبة وجوده في العينات من 0.0) - 46.15)% حيث سجلت اقل نسبة وجود في العينه (عنب مجفف) الشعب H 0.0% بينما كانت اعلى نسبة وجود في عينه (مشمش مجفف) كربلاء 46.15%. واظهرت نتائج التحري عن قابلية انتاج سم الباتيولين في 5 عزلات تعود الى A.flavus وA.fumigatus و3 عزلات من فطر P.expansum عزلت من عينات مختلفة هي (عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف)مدينة الصدر S و(عنب مجفف) العطيفية Z حيث ان فطر A.flavus وA.fumigatus لم ينتج سم الباتيولين نهائيا في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة مدينة الصدر والعطيفية انتج سم الباتيولين بعد مرور 5 ايام من تنيمته على الوسط المحفز لانتاج الباتيولين , في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة كربلاء انتج سم الباتيولين بعد مرور 15 يوم وسجلت العزله S اعلى قابليه على الانتاج بلغت 16.5 مايكروغرام/مل في وسط زرعي السائل GCA)) Glugose Czapek,s Apple في حين سجلت العزلة K اوطا قابليه على الانتاج بلغت (13) مايكروغرام / مل تحت نفس الظروف .اما الجانب الثاني من الدراسه فقد اظهرت نتائج ازالة السمية باستخدام المعزز الحيوي العراقي عند تركيز 0.03 ملغرام/مل في الوسط الزرعي السائل GCA الحاوي على الفطر المنتج لسم الباتيولين P.expansum K لمدة 14 يوم الى انخفاض تركيز سم الباتيولين الى 192.18مايكروغرام/مل مقارنة بمعاملة السيطرة ذات تركيز 325.01مايكروغرام/مل من سم الباتيولين , في حين لم يظهراي تركيز لسم الباتيولين عند فحصه بجهاز الـ High Performance liquid Chromatography (HPLC) عند التركيز 0.06ملغرام/مل من المعزز الحيوي العراقي تحت نفس الظروف السابقه. وفيما يخص فعالية استخدام تركيزين من خميرة Saccharomyce boulardii في ازالة سمية الباتيولين في الوسط الزرعي السائل GCA, استخدمت التراكيز( 108 و(1016خميرة/مل وفي كلا التركيزين تم ازالة السمية ولم يظهر اي تركيز لسم الباتيولين . | The results of Mycotoxin Patulin (PAT) detection in 21 samples of dried fruits (grape and apricot) collected from different locations at Baghdad city and one sample from Karbala governorate revealed that all tested samples were contaminated with PAT ,samples K , D and C which collected from Karbala ( dried grape) , Al - shoala (dried apricot) and Palestine Street (dried apricot) showed the highest contamination levels which recorded (30499.5, 2836.3 and 1795.3) µg/ml respectively , while the samples Al - Harthiya (I), Al - Sadr city (S) and Al - Harthiya (G) showed the lowest contamination levels which recorded (7.8 , 11.7 and 19.8) µg/ml respectively. The results also showed that Aspergillus spp. recorded the high percentage of occurrence 100% in sample H collected from Al - Shaab and in samples (N , K , U , A , J) collected from Al - Utaifiyya , Karbala , Baghdad al - jadeeda , Palestine Street and Al - Alawi , the percentage of occurrence is (94.12 , 94.44 , 95.45 , 95.56 , 96.55)% respectively. Also the percentage of Penicillium spp. occurrence percentage rated from 0.0 to 46.15% , samples dried grape which collected from Al - Shaab (H) recorded the lowest percentage of occurrence 0.0% , while sample apricot from Karbala (M) recorded the highest percentage 46.15% . The results of toxigenic ability of five fungal isolates include A.flavus and A.fumigatus and three isolates of P.expansum from three different samples include (K) Karbala (dried grape) , dried apricot of Al - Sadr city (S) and (Z) grape in Al - Utaifiyya . Regarding A.flavus and A.fumigatus were not produced PAT, while P.expansum isolate from S and Z recorded the ability to produce PAT after five days , while P.expansum isolated from K produced PAT after 15 days. The highest ability to produce PAT recorded in S 16.5 µg/ml, and the lowest ability in K 13 µg/ml. The second aspect of the present study was showed the ability of Iraqi probiotic at concentration 0.03 mg/ml to reduce PAT concentration in the culture medium Glucose - Czapeks Apple broth (GCA) containing of P.expansum K for 14 days which recorded 192.18 µg/ml comparing to control treatment 325.01 µg/ml while at concentration 0.06 mg/ml of Iraqi probiotic destroyed of PAT and there was no PAT appeared when examined in High Performance Liquid Chromatography (HPLC). However the results of test the ability of two concentrations of Saccharomyces boulardii (108 and 1016) yeast/ml in PAT detoxification from broth culture of (GCA) showed completely detoxification of Patulin

التاثير التداخلي للرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير Hordeum vulgare L. في وسط رمل == The Interference of Lead Mineral and Nitrogen on Barley Plant (Hordeum vulgare L.) Cultivated on Sandy Soil Culture

Author name: سارة يحيى المندلاوي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2009 - 2010 بهدف التعرف على تاثير الرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير في مرحلتي الانبات والبادرات كل على حدة فضلا عن التاثير التداخلي لهما.صممت تجارب الدراسة الحالية بتحضير اربعة تراكيز مختلفة من الرصاص (200, 150, 100, 50) جزء من المليون (ج.م.م.) اضافة لمعاملة المقارنة, فضلا عن المعاملة بثلاثة مستويات من السماد النتروجيني (اليوريا) (90, 60, 30) كغم/دونم اضافة لمعاملة المقارنة, والتحري عن تاثير كل من هذه التراكيز والمستويات بتجربة عاملية على عدد من الصفات المظهرية والفسلجية لنبات الشعير Hordeum vulgare L. في مرحلتي الانبات والبادرات فضلا عن التاثير التداخلي لكل من تراكيز الرصاص المحضرة مع مستويات السماد النتروجيني المذكورة سابقا. تم اجراء تجربتين في الدراسة الحالية, التجربة الاولى جرت في مختبر الدراسات العليا في قسم علوم الحياة بكلية العلوم - الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية (زراعة مائية) للفترة من 8 - 16/ تشرين الثاني/,2009 اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع للقسم المذكور نفسه من خلال زراعة بذور نبات الشعير في اصص بلاستيكية حاوية على تربة رملية لمدة خمسة واربعون يوما للفترة من 22/ تشرين الثاني ولغاية 7/ كانون الثاني/2010.اظهرت نتائج الزراعة المائية (مرحلة الانبات) عدم تاثر الصفات المدروسة بالمعاملة بتراكيز الرصاص المحضرة, بينما سجلت المعاملة بالسماد النتروجيني وجود انخفاض في معدلات كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة الانبات بغض النظر عن المعنوية من عدمها, فقد كانت نسب الانخفاض في معدلات الصفات المدروسة معنوية على كل من النسبة المئوية للانبات 35.29%, ومعدل الانبات 43.33%, ومؤشر تحفيز الانبات 37.09% وغير معنوية على قيم سرعة الانبات 34.23%. كما اظهرت نتائج المعاملة بتراكيز الرصاص في الزراعة الرملية (مرحلة البادرات) وجود تاثير معنوي سلبي في قيم كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة البادرات (عدا قيم محتوى الرصاص داخل انسجة النبات حيث كان التاثير معنوي ايجابي) فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي على كل من تركيز الكلوروفيل b والكلوروفيل الكلي.بينما اظهرت معاملة النبات بالسماد النتروجيني وبغض النظر عن تراكيز الرصاص وجود تاثير معنوي سلبي في كل الصفات المدروسة في مرحلة الانبات فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي في محتوى النبات لصبغات الكلوروفيل a وb والكلوروفيل الكلي. في حين سجلت زيادة مستويات السماد النتروجيني ارتفاعا معنويا في معدلات محتوى الرصاص داخل النبات وبنسبة بلغت 64.82%.اظهرت نتائج التداخل بين تاثير معاملتي الرصاص والتسميد النتروجيني وجود فروق معنوية في النسبة المئوية للانبات بالنسبة لمرحلة الانبات (الزراعة المائية), فيما سجلت فروق معنوية في جميع الصفات المدروسة في مرحلة البادرات (الزراعة الرملية) عدا صفة الوزن الطري للجذور ومحتوى الصبغات الكلوروفيلية

استخلاص وتنقية جزئية للكتينات بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات مرضية

Author name: زينب نوري حامد محمد العاني
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع (50) مسحة تعود لمرضى ومراجعين لثلاث مستشفيات عامة في بغداد وذلك للتحري عن عزلات الـ Pseudomonas aeruginosa اخذت من حالات مرضية متعددة شملت الحروق والجروح والتهابات الاذن. وبعد ان اجريت على العزلات التي تم الحصول عليها الاختبارات الكيموحيوية اللازمة لتشخيصها ومنها القابلية على تحليل الدم على وسط الـ Blood agar ، امكن انتقاء (25) عزلة اظهرت قدرتها على انتاج انزيم الـ hemolysinase وتحليل وسط الدم بشكل كامل. اخضعت العزلات بعدها لاختبار القابلية على النمو على وسط السترمايد الانتقائي والقدرة على النمو في 42 م ، اذ انتخبت (18) عزلة منها. ثم تبع ذلك اختبار قابلية العزلات على انتاج اللكتينات من خلال عملية التلازن مع كريات الدم الحمر للانسان بفصائلها (O, B, A) ودم بعض الحيوانات _الماعز ، الدجاج ، الفئران والارانب) حيث تم انتقاء العزلات التي اعطت اعلى عيارية. زرعت العزلات على وسطي الانتاج (GE) Grelets mediumوالمرق المغذي (Nutrient broth) للتحري عن قابليتها على انتاج اللكتينات، ودلت النتائج على انتاجها لنوعين من اللكتينات هما PA - I والـ PA - II ، اذ يتميز الاول بتخصصه تجاه سكر الكالكتوز، فيما يتخصص الثاني بالمانوز. بعد انتهاء فترة التنمية تم استخلاص اللكتينات من اوساط الانتاج لتجري عليها عملية التنقية باستخدام كبريتات الامونيوم ثم التكسير بالموجات فوق الصوتية ، ليتم بعدها انزال الراشح باستخدام طريقة الفصل بكرموتوغرافي عمود الفصل يمكن تلخيص اهم النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : 1 - اظهرت مستخلصات اللكتينات تباينا في الفاعلية التلازنية تجاه كريات الدم الحمر للانسان والحيوان سواء اكانت معاملة بانزيم التربسين ام لم تعامل به، كما تباينت العزلات في انتاجها لانزيم الهيمولايسين وصبغة البايوسين الزرقاء. 2 - تم تحديد درجة الحرارة المثلى لنمو عزلات بكتريا الـ aeruginosa P. وانتاجها للكتينات ب37م عندما بلغ تركيز اللكتين PA - I 95 مايكروغرام / سم3 ، في حين كان تركيزه عند الحرارة 35 م مايكروغرام/ سم3. اما اللكتين PA - II فبلغ تركيزه 40 مايكروغرام / سم3 عند الحرارة 35 م . 3 - وكان لاختلاف الاس الهيدروجيني دور في التاثير على تركيز ونقاوة اللكيتنات المستخلصة. اذ لم يتجاوز تركيز اللكتين PA - II المستخلص من العزلة (Z1) الـ30 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 5.0 في حين بلغ التركيز 105 مايكروغرام / سم3 لنفس اللكتين عند الاس الهيدروجيني الامثل (7.0) . اما اللكتينPA - I فقد انخفض تركيزه من 85 مايكروغرام/ سم3 في الاس الهيدروجيني الامثل ليصل الى35 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 8.0. 4 - تمت تنقية اللكتينات المستخلصة بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام متعدد الاكريلامايد بظروف ماسخة ، من خلال تمرير اربعة نماذج مستخلصة (اضافة الى نموذج البروتينات القياسي). 5 - لدى اختبار حساسية العزلات المعزولة من التهابات الاذن لمضادات الحياة ، اظهرت تباين في مقاومتها للمضادات، وكانت جميع العزلات مقاومة لكل من الامبسلين والاموكسيسيلين، فيما كانت حساسة للمضادات توبرومايسين والجنتامايسين والارثرومايسين. 6 - لاختبار قابلية اللكتينات المستخلصة على الارتباط بالسكريات الموجودة في حليب الام وحليب البقر والحليب المصنع، دلت النتائج بانه اضافة عالق الدم صنف O الى اللكتين مع سكريات الحليب تاركا كريات الدم الحمر حرة. 7 - اثبتت تجربة استخدام المرهم الطبي المضافة له بعض السكريات البسيطة كفاءتها، بعد ان تبين قدرة هذه السكريات على تثبيط تلازن اللكتينات مع كريات الدم الحمر للانسان خارج الجسم.8 - بعد ان حقنت فئران التجارب باللكتينات (PAI,PA - II,PAII) المستخلصة من العزلات (Z4,Z1,Z1) ، كان المحتوى الكاربوهيدراتي فيها (95،48، 30) مايكروغرام/سم3 وتركيز البروتينات (1350،860، 590) مايكروغرام / سم3 على التوالي. كما ولوحظ ظهور حالات غريبة على الفئران الثلاثة في المجموعة الاولى والتي حقنت باللكتينات اعلاه وتركت بدون علاج لمدة ساعة، ما بعد قتلها فقد حدث تحلل دم كامل في الفار الاول ومتوسط في الثاني، في حين لم يحدث اي تحلل للدم في الفار الثالث. وبعد استخدام العلاج في فئران المجموعة الثانية، لم يحدث تحلل دم للفار الاول والثالث وكان التحلل ضعيفا في الثاني. اما فئران المجموعة الثالثة والتي حقنت وتركت لمدة ساعتين بدون علاج، فقد نفق الفار الاول وحدث تحلل ضعيف في دم الفار الثاني وتحلل كامل في الفار الثالث. لم يسبب اعطاء العلاج لفئران المجموعة الرابعة وتركهم لمدة ساعتين اي تحلل لدم الفار الاول والثالث فيما كان ضعيفا في الثاني. اما افراد المجموعة الثانية فقدتركت بعد الحقن ثلاث ساعات بدون علاج، وكان تحلل الدم كاملا في الفار الاول ومتوسطا في الثاني والثالث، في حين لم يحدث تحلل للدم بعد اخذ العلاج. | Fifty samples were collected from several pathogenic cases including burns, wounds and ears belonging to patients and individuals referred to three general hospitals in Baghdad. Samples were subjected to the microbiological tests for detecting Pseudomonas aeruginosa, isolales. Among those tests was the ability of blood analysis on blood agar base medium. A total of (25) isolates were selected which showed the ability to produce the hemololysins. Some suspected isolates were also subjected to grow on ctramide agar, and with stand growth at 42c. Out of (25) only (18) isolate selected due to their ability to grow at 42c. The (18) selected isolates were tested for their ability to produce lectins via the heamagglutination with the human red blood cell groups (A, B, O). Isolates showed higher titers were chosen, when ability to produce lectins, two types (PA - I and PA - II) lectins were detected. Lectin PA - ICharacterized by it’s specify toward galactose, while PA - II was specific to mannose. After lectins were extracted from the production media, they were purfeyed by using ammonium sulphate and fractioned by the ultrasonic waves, followed by descending the filtrate by separation, through the chromatographic column.Results obtained could be described briefly as : 1. Obtained lectins showed were differed in their haemagglutination activity toweras human and animals red blood cells whether they were treated by the trypsin enzyme or not. However, isolates were not similar in producing the hemolysin enzyme and pyocine pigment.2. Optimum temperature for growth of P. aeruginosa isolate, and lectins production was 37c when concentration of lectin PA - I reached 95.0 µg/ml, while at 35c was 35 µg/ml - Regarding PA - II reached 40 µg/ml at 35c.3. Variation of pH played a significant effect on the. concentration and purity of the extracted lectins. At pH5.0 lectin PA - II concentration did in exceed 30, µg/ml while at optimum pH (7.0) it reached 105 µg/ml in the optimum pH to only 35 µg/ml at pH 8.0.4. Extracted lectins purified by gel electrophoresis when four extract in addition to the standard proteins sample were passed through it. The molecular weight of the PA - I was lectin from Z1 was 14.000 Dalton, while PA_II was 12.000 Dalton from the same sample.5. When P. aeruginosa isolates of ear infection were tested for their susceptibility to some antibiotics, they differed in their pattern of resistance. However, all isolates were resistant to Ampicilin and Amoxocilin, but sensitive to Tobramycin, Erythromycin and Gentamycin.6. In order to test the ability of the extracted lectin against some sugar which present in the human milk, raw milk and powder milk, red blood cell group were added to the lectin with the milk samples. Results showed that sugars inhibited haemagglutination with the red blood cells. 7. Experiments and application of the prepared ointment containing simple sugar proved its efficiency when sugar were able to prevent lectin agglutination with human red blood cells (invitro).8. After injecting mouse with the lectins (PAI, PAII, PAII) at (Z1, Z1, Z4) isolates, concentration of CHOs were (30, 48, 95) µg/ml and protein were (135, 860, 590) µg/ml respectively. Abnormal cases were also appeared on the three mice at the first group which was injected by the lectin when they were left without treatment for one hour, after they were killed, the first one was showed complete analysis at red blood cells, while it was not complete in the second and no analysis was showed in the third one, after treatment, no analysis of red blood cells was showed in the first and the third one, but it was not complete in the second one.The third group which injected by the same lectins when they were left without treatment for two hours the first mouse was dead, and the hemolysis was not completed in the second one, but completely in the third one, after treatment no hemolysis was showed in the first and the third one, but weakly in the second one. The fourth group, which injected by the lectins when they were left without treatment for three hours, the first mouse, was showed complete hemolysis, but not complete in the second and third one, after treatment, no hemolysis of red blood cells was showed.

تقييم وبائي ومختبري لمرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط C (HCV) لحالات الثلاسيميا == Evaluation of HCV infection in Thalassemic patients Epidemiological, Virological, Immunological, Clinical and Biochemical

Author name: زينب ناصر حسين الطرفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يتميز التهاب الكبد الفايروسي بقابليته الوبائية على اصابة العديد من الافراد ويطلق مصطلح التهاب الكبد الفايروسي على عدد من الفايروسات المصيبة للكبد التي تم تسميتها حسب اكتشافها الى A,B,C,D,E,F,G ويعتبر التهاب الكبد الفايروسي C وBمشكلة كبيرة وذلك لعدم امكانية تشخيص الاصابة الفايروسية منذ البداية لكون اغلب الاصابات تكون بدون اعراض مرضية او باعراض خفيفة.المواد وطرائق العمل : شملت الدراسة الوبائية 1159عينة لمرضى الثلاسيميا الذين يراجعون مركز الثلاسيميا في الرصافة، والمجموعة الثانية 140915 عينة اخذت لمتبرعي الدم في المركز الوطني لنقل الدم اعتمدت من السجلات. وتم اجراء الفحوص الفايروسية (HCV,HBV,HIV) لهذه المجاميع، واجريت الفحوص الفايروسية التشخيصية الاخرى على مرضى الثلاسيميا، فضلا عن اجراء الفحوص المناعية، فحوص الدم، والفحوص الكيميوحيوية.النتائج : افرزت نتائج مرضى الثلاسيميا عن نسبة 24.76% (70عدد الذكور و110 عدد الاناث) موجبة لفحص anti - HCV، ونسبة 0.77% (7 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لفحص HBsAg، وبنسبة 0.34% (2 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لكلا الفحصين (علما ان جميع المرضى بدون علاج الانترفيرون) مقارنة مع متبرعي الدم بنسبة 0.4% لـanti - HCV و0.97% لـHBsAg،علما ان جميع نتائج فحص HIV كانت سالبة لمرضى الثلاسيميا ومتبرعي الدم، هذا بالنسبة للدراسة الوبائية. اظهرت الدراسة التحليلية المختبرية ان نسبة الاصابة بفايروس التهاب الكبد HCV اعلى في الذكور بنسبة 27.48% مقارنة مع الاناث بنسبة 21.35% بوجود فرق ذو دلالة احصائية معنوية لارتفاع نسبة الذكور عن الاناث، فيما لوحظ ان النسبة هي ذاتها 0.3% لذكور واناث مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ولوحظ ارتفاع الاصابة مع ازدياد العمر فاعلى نسبة للاصابة بـ HCV 41.5% هي للاعمار ما بين 21 - 30سنة وللمصابين بـHBV بنسبة 1.7% للاعمار ما بين 1 - 11سنة. ولوحظ ارتفاع نسبة الاصابة بـ HCV بين الاكراد بنسبة 85.7%. اما بالنسبة الى HBV فقد لوحظ ان النسبة هي 5.7% بين الاكراد، اما في العرق العربي فقد لوحظت نسبة HCV 22.83%، وHBV 0.63% وفي الكلدان لوحظ ان نسبة الاصابة بـHCV 20%. اجري فحصPCR على بعض مرضى الثلاسيميا واظهرت الدراسة ان 50% من النتائج موجبة، وباجراء الكشف عن النوع الجيني لفايروس HCV بطريقة RFLP تم الحصول على انماط جينية مختلفة تضمنت 3b,4,6,3a,2b,1b واجريت دراسة مناعية على المرضى الموجبين لفحص PCR، وكشفت النتائج ان 18% من اولئك المرضى قد ابدوا تفاعلات موجبة لاضداد النواة واضداد العضلات الملساء في حين لم يظهر اي نتيجة موجبة لاضداد الدنا، اضداد الميتوكوندريا واضداد الشحوم المفسفرة. اجري الترحيل الكهربائي لبروتينات المصل وتبين وجود ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لبروتين الكلوبيولين مقارنة بالالبومين، بارتفاع معدل بروتين كاما وانخفاض معدل بروتين الالبومين لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص HCV - PCR.اجري على بعض مرضى الثلاسيميا فحوصات عمل الكبد ولوحظ ارتفاع معدل TSB في مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فضلا عن ارتفاع معدل ALTفي المرضى الموجبين لفحص HBsAg عن المرضى الموجبين لفحص anti - HCV، كذلك لوحظ ارتفاع معدل AST لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فيما لوحظ ان معدل انزيم الفوسفاتيز القاعدي هو ضمن الحد الطبيعي لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg، وتم اختيار مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين بـ HCV,HBV واجريت عليهم عدد من الفحوص الكيميوحيوية لمستوى (البروتين الكلي، الالبومين، الكلوبيولين، اليوريا، الكرياتنين، حامض اليورك، البوتاسيوم، الفسفور غير العضوي، الكالسيوم، النحاس، الكلسترول والسكر) في الدم، ولم يلاحظ اي دلالة احصائية معنوية لهذه الاختبارات، عدا اختبار الكولسترول حيث لوحظ انخفاض معدل الكولسترول في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV الى 112.7mmol/L، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـHBV بمعدل mmol\L93.69 كما لوحظ وجود انخفاض ذو دلالة احصائية معنوية بين مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV,HBV مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV، كذلك لوحظ وجود دلالة احصائية معنوية لانخفاض معدل حامض اليورك لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV,HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا غير المصابين، ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى النحاس في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين مقارنة مع المصابين بـHBV. ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى السكر في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة بمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV وتبين وجود فرق معنوي لارتفاع معدل الفسفور غير العضوي لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين بـHCV,HBV مقارنة بالمصابين بـHBV. اجريت الفحوص المناعية على مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين وتضمنت الدراسة المناعية الكشف عن مستويات الكلوبيولينات المناعية في الدم ومكونات المتممة C3,C4فضلا عن الكشف عن اضداد الذات، ولوحظ ارتفاع نسب اضداد الذات لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غيرهم من مجاميعمرضى الثلاسيميا وتبين ارتفاع نسبة اضداد المايتوكوندريا (43.4%)، اضداد الهستون (40.9%)، اضداد العضلات الملساء (17%)، الاضداد النووية (17%)،اضداد شحم القلب (11.6%)، اضداد الشحوم المفسفرة (17%)، اضداد الدنا المزدوج الشريط (31.8%)، اضداد بروتينات النواة A - Jo - 1 (2.27%)، SS - B (4.5%)، A - Scl (3.4%) في حين ان اضداد الذات من نوع A - RNP/Sm,SS - A,A - Sm,AC - B لم يلاحظ اي نتيجة موجبة لها. اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد تم الحصول على نسبة (15.38%) لكل من اضداد الهستون، اضداد شحم القلب، اضداد الشحوم المفسفرة فيما كانت نسبة اضداد الميتوكوندريا (38.46%). كما لوحظ ارتفاع نسبة المصابين بالعامل الرثوي والبروتين الفعال في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بنسبة 46%، 68% على التوالي مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV بنسبة 38.4% لكل من RF,CRP. وتبين وجود فرق معنوي ذو دلالة احصائية لارتفاع الاصابة باضداد الذات ضد الهستون في الاناث مقارنة مع الذكور وارتفاع الذكور عن الاناث في اضداد المايتوكوندريا في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV. كذلك لوحظ ارتفاع بعض الكلوبيولينات المناعية في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بمستوى 1789 mg/dl للـIgG، ولوحظ مستوى 305.8 mg/dl للـ IgA فيما كان المستوى 203.3 mg/dl للـIgM، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV لوحظ ارتفاع مستوى IgG الى mg/dl1823.6، اما مستوى IgM وIgA فقد كان بمستوى 229.6 mg/dl، 278.8mg/dl بالتعاقب، وفي بروتينات المتممة C3,C4 لوحظ انخفاض مستوى C3 الى 82.6mg/dl فيما كان مستوى C4 23.7mg/dl وهو ضمن الحد الطبيعي الادنى في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV، اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد لوحظ ان مستوى بروتينات المتممة C3 اقل من المستوى الطبيعي 78.1 mg/dl فيما كان المستوى 20.3mg/dl الى C4.في اختبارات امراض الدم تم الحصول على دلالة احصائية معنوية لارتفاع معدل PT لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غير المصابين ومرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV، كما لوحظ انخفاض معدل تعداد كريات الدم العدلة لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. ولوحظ انخفاض معدل تعداد الصفائح الدموية لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. | Viral Hepatitis characterized by its epidemic ability to infect many people. Viral hepatitis called to many hepatic viral infection that had been classified into A,B,C,D,E,F,G. Hepatitis C infection considered a big problem related to the inability to diagnose the viral infection from the beginning because of mild or no symptoms. Material & Methods : - The epidemic study contains two groups, first group 1159 sample of thalassemic patients in Al - Rusafa Center For Thalassemic Patients. Second group 140915 samples taken from blood donors in the national blood bank from the records.Viral tests had been done for these groups (HCV,HBV,HIV). Diagnostic tests done on thalassemic patients like immunological, hematological, biochemical tests.Results : - For the epidemic study the result shows a 24.76% for thalassemic patients infected with HCV , 0.77% for thalassemic patients infected with HBV, & 0.34% for thalassemic patients infected with both HCV,HBV. 74.89% for non infected thalassemic patients compared with blood donors of 0.4% for HCV infection, and 0.97% for HBV infection.Studies for investigating laboratory tests done on thalassemic patients after confirming HCV,HBV infections through doing diagnostic viral tests.HCV Viral results shows higher percentage of male to female by 27.48% for male, 21.35% for female respectively and it was seen that the same rate of 0.3% for male and female infected with HBV. Higher infection rate with age increasing of 41.5% for age group 21 - 30 years of HCV thalassemic patients, and 1.7% for age group 1 - 11 years for HBV thalassemic patients. Higher HCV infection rate noticed for Kurdish people 85.7% , Christians 20%, and in Al - Sabeaa 40%.while the percentage of HBV in Kurdish people 5.7%, and no one infected with HBV infection in Christian and Al - Sabeaa people. For Arabic patients the percentage of HCV infection is 22.83% and 0.63% for HBV infection.HCV - PCR Thalassemic patient results show that 50% of results are positive and 50% are negative (11 out of 22 patients), doing genotyping of HCV by RFLP test shows different subtypes of HCV (3b, 2b, 1b, 3a, 4, 6).Immunological study done on PCR positive patients’ shows antibodies percentage of 18% to ASMA, ANA and 0% for each of AMA, ADNA, APL. Electroforeces done for protein of these patients show significant statistical increasing values of protein globulin in comparison to albumin decreasing.For liver function tests, applied on thalassemic patients it had been noticed that there is a significant statistical increasing values in the thalassemic patients infected with HCV as compared to other thalassemic patients not infected with HCV. Increasing the level of ALT in HBV patients compression with HCV patients, increasing the level of AST of HBV, HCV thalassemic patients where the level of alkaline phosphates in the upper limit of normal value of HCV, HBV thalassemic patients.No significant statistical values where noticed for the biochemical tests applied on some thalassemic patients infected with HCV, HBV infection except cholesterol where it had been noticed a decrease of level 112.7 mmol/L in thalassemic patients infected with HCV. 93.69 mmol/L in HBV infection patients, a significant statistical decrease value between HBV , HCV thalassemic patients in comparison with non infected patients.There is a decrease level of uric acid for the thalassemic patients infected with HCV compared with non infected patients, significant increase of copper level in the blood of HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients and not infected thalassemic patients.Significant statistical value increment for the random blood sugar in HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients.Regarding immunological study, it had been noticed that there is an increasing in autoantibody with significant statistical value for thalassemic patients infected with HCV compared with other thalassemic groups. It had been seen that there is an increasing in the mitochondrial antibodies (AMA - M2) 43.4%, antihiston antibodies (AHA)40.9%, antismooth muscle antibodies (ASMA)17%, antinuclear antibodies (ANA)17%, anticardiolipin antibody antibodies (ACL)11.6%, antiphosphotidel serin antibodies (APL - S)17%, antidouble stranded DNA antibodies (A - ds - DNA) 31.8%, other antinuclear proteins like A - Jo1 2.27%, SS - B 4.5%, A - ScL 3.4%, where the other auto antibodies A - RNP/Sn, SS - A, A - Sm, anticentromer B antibodies (A - C - B) show zero percent for each one of them while in the HBV thalassemic patients a 15.38% was obtained for each APL - S , ACL & AHA.. A 38.46% for AMA - M2.There is an increase in rheumatoid factor (RF), CRP in thalassemic patients infected with HCV compared with non infected thalassemic patients with a ratio of 46%, 68% respectively. In HBV thalassemic patients 38.4% for each RF and CRP. Significant statistical difference for increasing incidence with auto antibodies in the females compared with males of autoantibodies type AHA, AMA - M2 in thalassemic patients infected with HCV noticed.We noticed an increasing in the immunoglobulines IgG 1789 mg/dl, 305.8mg/dl for IgA in thalassemic patients infected with HCV while IgM in the upper normal range 302.3 mg/dl, complimentary portions C3, C4 shows a decrease level in C3 82.6 mg/dl, and the level of C4 is 23.4mg/dl, which is regard as the lower normal limit. While in the HBV thalassemic patients we obtain a level 1515.3mg/dl for IgG, 204.8 mg/dl for IgM and for IgA 233.3mg/dl.In the hematological tests of thalassemic patients infected with HCV shows significant increment in the level of PT test was obtained as compared with other groups of thalassemic patients. Percentage decrement in neutrophil of WBC cells in HCV thalassemic patients as compared with HBV and non infected thalassemic patients. There is a decrement in platelets count in HBV thalassemic patients compared with HCV and non infected thalassemic patients.

دراسة التغيرات المرضية والكيميائية الحياتية والصورة الدموية لتاثير مبيد Thiamethoxam في الفئران == The study of Pathological changes ,Biochemical and Hematological picture for effect of “Thiamethoxam in mice

Author name: سحر عبد الهادي محمد جواد الشرقي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ليلـــى جبار محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية تقييم تاثيرات المبيد الحشري الـ Thiamethoxam في الفئران البيض ، وقـــد اعتمد فــي تحديد قـــيم الجرع علـــى قيمة الحد المسموح تناوله يوميا ( ADI ) Acceptable daily intake والذي بلغ 0.004 ملغم/ كغم من وزن الجسم . تمت دراسة التاثيرات الحادة والمزمنة بعد 28,14 يوم من التجريع بالجرع 0.12,0.08,0.04 ملغم/ كغم من وزن الجسم اضافة الى جرعة ADI من خلال المعايير الاتية : التغيرات السريرية والتغيرات في اوزان الاعضاء الكبد والكلية والطحال وعد الكريات الحمر Erythrocytes count وقياس كمية خضاب الدم Haemoglobin estimation والنسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص Percentage of Packed Cell Volume ( PCV ) والعد التفريقي للكريات البيض Differential Leukocytic count وقياس مستوى انزيمات الكبد ALP , GPT , GOT ) ) وقياس مستوى الكرياتنيين Creatinine واليوريا Urea في مصل الدم للكلية ودراسة نسيجية لكل من الكبد والكلية والطحال . وقد ادت هذه الدراسة الى النتائج الاتية : لوحظ على الحيوانات قلة في الحركة والنشاط وتناول العليقة وقلة في كمية الادرار ازدادت بزيادة الجرعة وفترة التجريع . اما معدل وزن الكبد فقد سجل اعلى ارتفاع عند P<0.05 للجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 14 يوم بعد التجريع ، وقد بلغ معدل وزن الكبد 0.16±1.72 غم ، اما لفترة 28 يوم بعد التجريع فقد سجل معدل وزن الكبد انخفاضا الاانه لم يكن معنويا عند مقارنته مع معدل وزن الكبد لحيوانات السيطرة .بينما اظهر معدل اوزان الكلى ارتفاعا لـــــم يكــــن معنويا من الناحية الاحصائية لفترة 14 يوم بعد التجريع عند مقارنته مع معدل اوزان الكلى لحيوانات السيطرة ، اما فترة 28 يوم بعد التجريع فقد اظهرت النتائج انخفاضا معنويا عند P<0.05 اذ كان اقل انخفاض عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم اذ بلغ 0.01±0.18 غم ، بينما كان معدل وزن الطحال منخفضا خلال فترتي التجريع وكان اقل انخفاض عند P<0.005 لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم الذي بلغ معدل وزن الطحال له 0.01±0.06 غم . ان التعرض الحاد والمزمن للمبيد للفترتين 28,14 يوم بعد التجريع سبب ارتفاع في معدل عدد الكريات الحمر ومعدل مستوى خضاب الدم ومعدل النسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص، ولوحظ ان مبيد الـ Thiamethoxam عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم قد سجل اعلى ارتفاعا معنويا P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع لتلك القياسات الدموية حيث بلغت معدلاتها ( 0.17±9.84 كرية / ملم3 ، 0.54±50.60 % ،0.87±16.58 غم / 100 مل ) على التوالي . اما معدل العد التفريقي للكريات البيض فقد سجل اعلى ارتفاع معنوي P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لمعدل الخلايا اللمفاوية حيث بلغ 0.85±80.80 % ، بينما سجل انخفاضا معنويا لمعدل الخلايا العدلة وقد وصل اقل انخفاض P<0.005 عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم مــــن وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع اذ بلغ 0.98±10.00 % ، اما معدل عدد الخلايا وحيدة النواة فقد سجل انخفاضا معنويا P<0.05 وكان اقل معدل عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع الذي بلغ 0.44±5.20 % . كانت التغيرات المرضية النسيجية قد تدرجت شدتها حسب الجرعة والفترة الزمنية ، حيث لوحظ تكفيف خلوي لمفي حول الاوعية الدموية واحتقان وتنخر الخلايا الكبدية مع وجود خلايا تعاني من الموت المبرمج فضلا عن وجود الاورام الحبيبية ، وقد لوحظ اعادة بناء الخلايا الكبدية التي تميزت بفرط تنسج تلك الخلايا وانشطار انويتها بشكل واضح مما يشير الى دور هذا المبيد في احداث الاصابة بالسرطان Cancer ، كذلك لوحظت تغيرات تنكسية في الخلايا المبطنة للنبيبات الكلوية فضلا عن تشتت اللب الابيض في الطحال في المراحل الاولى من اعطاء الجرع تحولت الى فرط تنسج اللب الابيض في مراحل لاحقة . ان النتائج السابقة الذكر ممكن ان تعطي انطباعا وافيا حول التاثير السمي للمبيد الحشري الـThiamethoxam من خلال تاثيراته الواضحة في انسجة الاعضاء وبخاصة نسيج الكبد اضافة الى التغيرات الدموية. | The present study investigates the assessments of the effects of insecticide “ Thiamethoxam “ in white mice the doses given were according to the allowable limits of Acceptable Daily Intake ( ADI ) , which amount to 0.004 mg/ kg b. w. . The acute and chronic effects have been examined after 14 , 28 days of ( 0.04 , 0.08 , 0.12 ) mg/ kg b. w. in addition to the doses of ADI through the following criteria : Behavioral changes , the changes on the weight of the liver , kidney , and spleen , erythrocytes count , haemoglobin estimation , percentages of packed cell volume ( PCV ) , differential leukocytic count , estimation of the level of liver enzymes ( GOT , GPT , ALP ) , estimation of the level of creatinine and urea in blood serum of kidney , and histological examination of the liver , kidney , and spleen .The study reached the following results : It has been observed that there was a reduction in the animals’ movement and activity and having a pellete , the reduction in the amount of urine increased by the increase of the dose and dose duration . The average of liver weight has shown the highest increase at P< 0.05 per dose was at 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days of the dosage time , the average of the liver weight was 0.16±1.72 g but after 28 days of the dosage time , the liver weight decrease though it was not significant in comparison with the average of the liver weight of the control animals’while the averages of kidney weights show an increase , though statistically insignificant , for 14 days of the dosage time in comparisn with average of kidney weight of the control animals’. After 28 days of the dosage , the results show some decrease at P< 0.05 and the least decrease at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.18 g . The average of spleen weight was decrease during the two dosage duration . The least decrease at P< 0.05 for 28 days after the dosage of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.06 g . The acute and chronic exposure to the pesticide for 14 , 28 days of dosage was the cause for the increase of the average of the Erythrocytes count , the average of the Haemoglobin , in the average of the percentage of the Packed Cell Volume ( PCV ) . It was also observed that the “Thiamethoxam” pesticide at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. registered the highest level of P< 0.05 . When it was chronically exposed for 28 days of dosage and the blood measurements were ( 9.84±0.17 cell / mm3 , 50.60±0.54 % , and 16.58±0.87 g / 100 ml ) respectively .The differential Leukocytic count has shown the highest significant level P< 0.005 at the chornic exposure for 28 days after the dosage at 0.12 mg/ kg b. w. of Lymphocyte average of 80.80±0.85 % . Significant decrease of the Neutrophile average has shown a significant decrease and the least decrease was P< 0.005 at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after the dosage . Then showns 10.00±0.98 % . The average of Monocyte has shown a decrease of P< 0.005 and the least average at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after dosage which comes to 5.20±0.44 % .The severe histopathological changes was leveled according to the dosage and the duration , it has observed lymphocytic aggregation a round blood vessels , congestion and necosis of hepatic cells with the existence of cells which suffer from apoptosis as well as the existence of granuloma and it has observed a rebuild of hepatic cells which is characterized by hyperplasia of these cells and the division of its nucleus obviously which refers to the role of this pesticide which causes cancer . In addition degeneration changes have been observed in the renal tubular epithelium besides the depletion in spleen in the first stages of giving dosage and has turned to hyperplasia of white pulp in the following stages .The previously mentioned results can give a sufficient impression about toxicity effect of the insecticide “ Thiamethoxam “ through its obvious effects in the tissue of the organs especially the liver tissue in addition to the hematological changes.

دراسة انتاجية بعض مركبات الايض الثانوية من المزارع النسيجيه لنبات الثوم . Allium sativum L == Study of the yield of some secondary metabolite in tissue culture of Allium sativum L

Author name: زينب سالم حسين
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية, قسم علوم الحياة, كلية العلوم, الجامعة المستنصريه, بهدف زيادة انتاج بعض مركبات الايض الثانوي في المزارع النسيجية لنبات الثوم .Allium sativumL . قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهاز كروماتوكرافيا السائل ذو الاداء الفائقHPLC وقورنت مع مستخلص فص الثوم . حفز الكالس على النشوء باخذ اجزاء من فصوص نبات الثوم بعد زراعتها على الوسط الغذائي (MS) Murashige and Skoog, (1962) الحاوي على تراكيز مختلفة من منظمات النمو شملت Dichlorophenoxy acetic acid ( (2,4 - Dبالتراكيز 0 ,1 ,2 ,3 ,4) ) ملغم/لتر وBenzyl adenine (BA) بتركيز1ملغم /لتر وNaphthalene acetic acid (NAA) بتركيز 0.5 ملغم/لتربالنسبه للوسط الاول اما الوسط الثاني فقد استعملت منظمات نمو شملت 2,4 - D بتركيز, .0.5 ,1 ,1.5 ,2, 2.5) 0) ملغم /لتر وKinetin بتركيز 0.5 ملغم /لتر. واظهرت النتائج ان الوسط الحاوي على 2 ملغم/لتر 2,4 - D وBA بتركيز 1ملغم/لتر وNAAبتركيز0.5 ملغم /لتر قد اعطت اعلى معدل للنسبة المئوية لاستحثاث الكالس بلغت %60 واعلى معدل وزن طري بلغ 839ملغم بالنسبه للوسط الاول وقد استعملت التوليفه اعلاه في ادامة الكالس المستحث. واعطى الوسط الثاني الحاوي على 1.5))ملغم/لتر2,4 - D وKinetin بتركيز0.5))ملغم /لتراعلى نسبه مئويه لاستحثاث الكالس بلغ %50 وقد اعطى الوسط الحاوي على 1.5 , 2ملغم/لتر(2,4 - D) وkinetinبتركيز0.5 ملغم /لتراعلى معدل وزن طري بلغ 748.6,750.0 ملغم/لتر. وبغية زيادة انتاج المركبات الثانوية وظفت عوامل تحفيز فيزيائية وكيميائية تضمنت الاشعة فوق البنفسجية (Ultraviolet) وحامض الساليساليك , وحامض الفنل النين بالتراكيز200,150,100,50,0ملغم/لتر لـحامض السالسيلك (Salicylic acid) وحامض الفنل النين Phenyl alanineبالتراكيز40,30,20,10,0 ملغم/لتراما الاشعة فوق البنفسجية نوع B فقد كانت مدة التعريض 30,20,10,0دقيقة . واظهرت النتائج ان حامض الساليسلك كان افضل محفز لزيادة مركبات الايض الثانويه اذ اعطى حامض الساليسليك افضل تركيز للتحفيز وزيادة الانتاج بتركيز 100 , 150ملغم/لتروقد اعطى التركيز 100ملغم /لتر اعلى معدل وزن طري بلغ 743 ملغم /لتر.اما حامض الفنل النين فقد اعطى التركيز 20 ملغم/لتر زياده معنوية في مركب الallicine اذ بلغ المعدل 52.2 ملغم اما بقية التراكيز فلم تكن الزيادة معنوية.اما بالنسبة للاشعة فوق البنفسجية فقد سببت المده 10دقيقه زيادة معنوية لمركب الagoene اذ بلغ المعدل 37.6 ملغم اما بقية المعاملات فقد اعطت زيادة ولكنها غير معنوية في تركيز المركبات.

تاثير الفعالية التثبيطية لمستخلصات نبات الكبار Capparis spinosa L. في بعض الاحياء المجهرية ذات الاهمية الطبية

Author name: سراء نصيف مسلم
Supervisor name: رضا ابراهيم حسين البياتي | نزار ادورناصر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحـــولية لجذر واوراق وثمار نبات الكبار Capparis spinosa في نمو البكتريا Escherichia coliو Klebsiella spp. Staphylcoccus aureus وPseudomonas aeruginosa والفطــــــــــــــــــــــــــــريات Candida albicans المعزولة من الاصابات الجلـــدية وذلك باستخدام طريقة الحفر بالاكار لاختبار فعالية المستخلصات ضد البكتيريا والخميرة، ولقد اختلفت نتائج دراسة الفعاليــة التثبيطية للمستخلصات باختلاف نوع المستخلص نفسه, وتنوع الكائن المجهري. وكانت بكتريا S. aureus الموجبة لصبغة كرام اكثرها تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا .Klebsiella spp اكثرها مقاومة لفعل المستخلصات النباتية. وتم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل المستخلصات , وقد بينت نتائج الكشوفات الكيميائية لها بان المستخلص المائي يحتوي على المركبات الاتية : كلايكوسيدات وقلويــــــــدات وصابونيات وتانينات والفلافونات والفينولات . وان هذه المركبات لها القابلية عـــــــلى الذوبان في الماء ، اما المستخلص الكحولي لنبات الكبار فانه يحتوي فضلا عما ذكـــــر على مركبات راتنجية ,وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية . بالنسبة الـــــى مستخلصات الجــــذر فقد كان المستخلص المائي افضل في تاثيره على البكتريا والخميرة بتركــــــيز 500 ملغم/ مل , اذ كانت معـــــدلات اقطار مناطق تثبيــــــــط St. aureus وE. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa . 22 ) و13.1 و12 و21.3 ) ملـــــم وعلى التوالــي مقارنة مع معـدلات اقطار مناطـــق التثبيــط للمستخلص الكحـــولي وللتراكيز نفسها ( 4.2و6.8 و3.2 و10.4) ملم وعلى التــــوالي . اما بالنسبة الى مستخلصات الاوراق فقد كان المستخلص المائي افضل من المستخلص الكحــولي في تاثيره في الانواع البكترية St. aureusو E. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa والخمــــــــيرة C.albicans بتركيز 500ملغم/ مل وبمعــــدلات اقطار تثبيــــــط (22 و10.9 و21.5 و21.3 و5.5 ) ملم وعلى التوالي مقارنة مـــع المستخلص الكحـــــــولي وبمعــــدلات اقطار( 21.9 و0 و0 و8.4 و3.2) ملم على التوالي. كما وجد ان المستخلص الكحولي لثمار نبات الكبار ذمو تاثير افضل من المستخلص المائي على البكتريا والخميرة قيد الدراسة وبتركيز 500 ملم /مل. وعند المزج بين مستخلصات الاجزاء الهوائية (الاوراق والثمار) والجزء الارضي (الجذر) بنسبة 1 : 1 ودراسة تاثيرها على البكتريا والخميرة قيد الدراسة , تبين ان خلط المستخلصين له تاثير اقل مقارنة من تاثيرهل منفردا. | The present study dealt with the effects of watery and alcoholic extracts of root, leaves and fruits of Capparis spinosa on the growth of Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella spp. , Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans isolated from patients suffering from skin infection . Agar - well diffusion method was used for this purpose.With respect to inhibitory effects of the plant extracts on the studied microorganisms, the results indicated that there were clear variation. These were depended on the types of the extracts and the kinds of microorganisms. chemical analysis were done on the plant for identification of active compounds. The results have illustrated that watery extract contained the following compounds : Alkaloids, Glycosides, Tanins, Saponins,Phenoles and Flavones. These compounds were all soluble in water. Alcoholic extract of this plant contained, in addition to as mentioned above, rasins compound. These alcoholic extracts were soluble in organic solrents, but not water soluble .Watery and alcoholic extracts of root were applied to study their effect on the microorganism of the present study. The results demonstrated that watery extracts were more efficient, as bacterial and yeast inhibitors , at an extract concentration of 500 mg/ml . These extracts have gave average inhibition zone diameters to Staphylococcus aureus , Escherichia coli, Klebsilla spp., Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans of ( 22 , 13.1 , 12 , 21.3 , 11) mm respectively . while alcoholic extracts which gave average inhibition zone diameters for the same bacteria and yeast of ( 4.2 , 6.8 , 3.2 , 10.4 , 13.4 ) mm respectively.The resutts of this wack also showed that watery extracts of leaves were more efficient, hence they gave, at aconcentration of 500 mg/ml, average inhibition zone diameters to S.aureus , E.coli,Klebsilla spp., P. aeruginosa and C. albicans of (22 , 10.9 , 21.5 , 21.3 , 5.5 ) mm respectively compared to alcoholic extracts that were showed, at the same extract concentration, relatively, lower average inhibition zone diameters, for the same microorganisms of (21.9 , 0 , 0, 8.4 , 3.2) mm respectivelyMoreover, alcoholic extract of C. spinosa fruit, at aconcentration of 500 mg/ml , were efficient, as microbial inhibitor, than watery extracts.Among different currently studied microorganism, Gram positive Staphylococcus aureus was the most sensitive isolates to inhibitory action of the extracts. In contrast, Gram negative Klebsilla spp. Was the most resistant type to the action of these extracts.Few inhibitory response were noticed upon mixing, at rate 1 : 1, of aerial and terrestrial extract of C. spinosa.

دراسة مختبرية للسيطرة على الاعمار اليرقية المحتلفة لبعوضDiptera : Culicidae Culex pipiens Say باستخدام منظم النمو Dimilin والمبيد الاحيائي Bacillus thuringiensis Israelensis == Laboratory Stuty on the Control of Culex pipiens Say (Diptera : Culicidae) Different Larval Instar Using Dimilin Growth Regulater and Bio.pesticide Bacillus thuringiensis Israelensis

Author name: زينب عباس عودة
Supervisor name: معن عبد العزيز شفيق
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر بحوث الحيوان / البيت الحيواني /كلية العلوم /الجامعة المستنصرية لتقيم كفاءة منظم النمو Dimilin المثبط لتصنيع الكايتين بواقع ثلاث تراكيز مختلفة (0.5 ، 1.0 ، 1.5 ) جزء بالمليون وكفاءة عالق البكتريا Bacillus thuringiensis israelensis بالتراكيز الاتية (6.25×108، 6.25×1010 و6.25×1012 ) بوغ / مل على الاعمار اليرقية المختلفة لبعوض Culex pipiens.وبلغت اعلى نسبة قتل 100% لمنظم النمو بالتركيز 1.5 جزء بالمليون للفترة 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للفترة 12 ساعة للتركيز 0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الاول، اما اعلى نسبة قتل بلغت %86.67 لمنظم النمو بالتركيز1.5 جزء بالمليون خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 20% خلال 12 ساعة للتركيز0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الثاني. واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 73.33% خلال 48 ساعة للتركيز1.5 جزء بالمليون واقل نسبة قتل بلغت 33.33% للتركيز 1.0 جزء بالمليون خلال 12 ساعة للعمر اليرقي الثالث على التوالي. واعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الرابع بلغت 80% خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للتركيزين 0.5 و1.0 جزء بالمليون لمنظم النمو . واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل للمبيد الاحيائي B.thuringiensis israelensis بلغت 100% للعمر اليرقي الاول بالتركيز 6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 40% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة. وكانت اعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الثاني 100% بالتركيزين 6.25× 1010 و6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 53.33% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة واعلى نسبة قتل بلغت للعمر اليرقي الثالث والرابع 100% على التوالي خلال 48 ساعة للتركيز 6.25×1012 بوغ/مل واقل نسبتي قتل للتركيز 6.25×108 بوغ/مل بلغت 40% و33. 33% للعمرين نفسيهما على التوالي خلال 12 ساعة. كما ودرس تاثير المبيد الحيوي التجاري Antrol للبكتريا B.thuringiensis israelensis في التركيز 0.0105 غم /مل للاعمار اليرقية المختلفة وبينت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 100% خلال الفترتين 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 80% للفترة 12 ساعة للعمر اليرقي الاول . واعلى نسبة قتل بلغت 100% للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع على التوالي خلال 48 ساعة، واقل نسب قتل للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع بلغت 66.67، 53.33 و40% على التوالي خلال 12 ساعة . | This study was conducted at the Researches Laboratory / Animal House / College of Science / Mustansiriyah University to evaluate the efficiency of the growth regulator Dimilin Chitin synthesis inhibitor using three different concentrations of 0.5, 1.0 and 1.5 ppm and the efficiency suspension of bacteria Bacillus thuringiensis israelensis at there concentrations 6.25 × 108, 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml to different larval instars of mosquito Culex pipiens in composion The highest mortality 100% of the growth regulator reached at the concentration1.5 ppm for a period of 48 hours and lowest mortality was 26.67 % for the period of 12 hours for the concentration of 0.5 ppm for the first larval instar, respectively. The highest mortality was86.67 % for the growth regulator at concentration1.5 ppm 48 hours and lowest mortality was 20 % during the 12hours at concentration of 0.5 ppm for the second larval instar, respectively. The results also showed that the highest mortality was73.33 % during the 48hours at concentration of 1.5 ppm and lowest mortality was33.33 % for the concentration of 1.0 ppm during the 12 hours for the third larval instar, respectively. The highest mortality of the fourth larval instar reached 80 % in 48 hours and lowest mortality was 26.67 % at the other two concentrations (0.5 and 1.0 ppm) for Dimilin. The results also showed that the highest mortality of bio - pesticide Bacillus thuringiensis israelensis was100% for the first larval instar at concentration of 6.25 × 1012 spores / ml within 24 to 48 hours and lowest mortality was 40% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours. The highest mortality for second larval instar was 100% at two concentrations 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml within 24 and 48 hours, respectively, and the lowest mortality was 53.33% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours and the highest mortality reached 100% for the third and fourth larval instars respectively, during the 48 hours at concentration of 6.25 × 1012 spore /ml, The lowest mortalities at concentration at 6.25 × 108 spore / ml were 40 and 33. 33% for the same two instars, respectively, within 12 hours. The impact of biocide Antrol at concentration of 0.0105 mg / ml in the first larval instar was 100% in both 24 and 48 hours, and the lowest mortality was 80% for the exposure period of 12 hours. The highest mortality was 100% for second, third and fourth larval instars, respectively, within 48 hours, and lowest mortality for second, third and fourth larval instars were 66.67, 53.33 and 40%, respectively, within the 12 hours exposure period. Finally the results showed that the mortality of the chemical pesticide Temephose was100% for all larval instars within 12 hours.

استخلاص وتنقية انزيم اللايبيز من عفن Aspergillus niger 11414 (ATCC) واستخدامه في تحسين نوعية الدهن الحر == Extraction and purification of Lipase from Aspergillus niger 11414 ( ATCC) to improve the butter oil

Author name: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الد راسة عزل وتنقية انزيم اللايبيز من العزلة القياسية Aspergillus niger 11414 ( ATCC) ثم تطبيقه عمليا في مجال الصناعات الغذائية . • تم تــنمية العزلة وتنشـــيطها على وسط اجار البطاطا والدكستروز Potato dextrose Agar PDA . • تم التحري الاولي عن انتاج انزيم اللايبيز من العزلة A. niger 11414 بطريقة الاطباق باستخدام وسط ( Tween 80 ) ، وظهرت النتيجة موجبة بشكل هالة معتمة تحيط المستعمرة الفطـرية . استخدم وسط Tween 80 واضيف زيت الزيــــتون بـــدل الـ (Tween 80) الى وسط التحري وكانت النتيجة موجبة اذ ظهرت الهالة المعتمة حول المستعمرة لكن بمساحة اكبر مما سبق . • درست عدة معايير ( تركيز زيت الزيتون ، مدة التخمر ، الاس الهيدروجيني الابتدائي ، حجم اللقاح ، درجة الحرارة ) لايجاد الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايـــبيز وكانــــت افضل الظروف لانتاج الانزيم هي ( تركيز زيت الزيتون 1 % ، مدة التخمر 168 ساعة ، واس هــــيدروجيني ابـــتدائي 6 وحجم لقاح 10 × 1 ( بوغ / مل ) ودرجة حرارة 30 م ، اذ سجلت عند هذه الظروف اعلى فعالية للانزيم المنتج . • اظهر الانزيم الخام بعد حضنه باسس هيدروجينية مختلفة لمدة 30 دقيقة ثباتا عند قيم الاسس الهيدروجينية بين ( 5.0 - 4.0 ) ، فيــــما اظهر الانـــــزيم الخام بعد حضنه في درجات حرارة مختلفة لمدة 60 دقيقة ثباتا حراريا عند ( 40 - 50 ) م , احتفظ الانزيم بكامل فعاليته.• استخدمـــت خطوات متسلسلة لغرض تنقية انزيم اللايبيز شـملت اولا التركيز بكبريتات الامونيوم وكان افضلها 30 % حين بلغت اعلى فعالية نوعية عندها بمقدار 3.8 وحدة / ملغم برويتن ، استخدمت خطوة الديلزة للتخلص من الاملاح . لقد اظهرت النتائج ارتفاع الفعالية والفعالية النوعية للانزيم اذ اصبحت 8.64 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 8.73 . بعدها مرر الانزيم المنقى جزئيا على عمود هلام Sephadex G - 75 مرتين وجمعت الاجزاء التي اظهرت فعالية انزيمية ، مرر بعدها خلال عمود هلام Sephadex G - 100 ازدادت خلالها نقاوة الانزيم اذ ارتفــعت الفعالية النوعية الى 142.8 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 143.19 وبحصيلة انزيمية 87.5 % .• درست بعض الخصائص المهمة للانزيم المنقى جزئيا اذ اظهر الانزيم المنقى جزئيا ثباتا تجاه قيم من الاس الهيدروجيني بين ( 5 - 6 ) ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل 5.6 واحتفظ الانزيم المنقى جزئيا بـكامل فعاليته عند درجتي حرارة 30 و40 م على التوالي ولمدة 30 دقيقة وفقد 95 % من فعاليته عند درجة حرارة 80 م وللمدة نفسها ، اما درجة الحرارة المثلى فكانت 35 م . • استعمل اللايبيز المنقى جزئيا في تحسين نكهة الدهن الحر الذي تم معاملته بالانزيم ، اما السيطرة Control فتمثلت باضافة محلول دارىء فوسفات السترات ذي الاس الهيدروجيني 6.0 فقط الى الدهن الحر . اجري تقييس الفعالية على المعاملتين واظهرت النتائج ان هناك تغيرا محسوسا في الدهن المعامل بالانزيم في حين بقيت السيطرة دون تغيير . • استـخدم الدهن الحر المعامل بالانــــزيم والسيطرة Control في صنــع بعض انـــواع الحلويات ( البرمة ). عمل تقييم حسي للمنتوج من خلال 31 عينة للصــــفات ( اللون ، النسجة ، الرطوبة ، الرائحة ، النكهة " الطعم " ) . حللت النتائج احصائيا ووجد فرق معنوي ملحوظ بين الدهن الحر المعامل بالانزيم والسيطرة ، عدا صفة اللون فكان الفرق غير معنوي لكلتا المعاملتين . | In this study the extraction and purification of Lipase from isolated A. niger was studied. The ability of A. niger to produce Lipase was tested on Tween 80 media , indicate the positive result. Better result was obtained by added olive oil instead of Tween 80 media Several culture conditions were studied to determine the optimum conditions for Lipase producing , and the optimum conditions were : Concentration of Olive oil 1 % , period of fermentation 168 hour, initial pH 6 , inoculums size 1×10⁵ ( Spore / ml ) and the temperature 30 ℃ higher activity of produced enzyme was recorded in this conditions. The crude enzyme was stable after incubation at different pH (4 - 5 ) for 30 min., the enzyme was stable after incubation at different temperature (40 - 50) ℃ for 60 min., the enzyme retained all activity . Sequent steps used to purify Lipase. These included the concentration in ammonium sulfate the optimum saturation rate was 30 % , while the enzyme specific activity was 3.8 Unit / mg protein . Dialysis of enzyme resulted in increase of specific activity, which became 8.64 Unit / mg protein. Partially purified enzyme to the gel column sephadex G - 75 twice, the parts which show enzyme activity collected and added to the gel column sephadex G - 100, this increased the enzyme purification and a specific activity increased to 141.76 Unit / mg protein , while the number of purification was 193.19 and 82.46 % yield. Properties of the partially purified Lipase were investigated. Its showed stability against the values of pH (5.0 - 6.0) and the optimum pH was ( 5.6 ). The partially purified Lipase retained all activity 1n the temperature ( 30,40 )℃, for ( 30 ) minutes , and lost 95 % of its original activity at ( 80) ℃ , for the same time , while the optimum temperature was 35 The partially purified enzyme is used for improvement the flavor of butter oil which was treated with the enzyme , while the control was treated by addition phosphate citrate buffer solution ( pH = 6.0) only to the butter oil , the results showed that was sensible changes in the butter oil treated with enzyme while the control remain without any changes. The animal fat which treated with enzyme and the control was used in some kinds of sweets ( Al - Burma ) , making sensible evaluating for the product by (31) samples for characterization (color, texture, moisture, odor and flavor " tastes "). The results were analyzed statistically , and the noticed incorporeal comparison was found between the butter oil treated with enzyme and control , except the properties of color , it was non incorporeal comparison for both samples

دراسة تشخيصية وفسلجية لبعض الفطريات المائية == Diagnostics and physiological study on some aquatic fungi

Author name: سرمد سالم شنيشل
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | سوسن ساجد الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 48 عينة ماء من نهر دجلة من منطقة الشواكة (قرب جسر الشهداء) للفترة بين اب - كانون الاول2002 . اظهرت نتائج الفحوصات المختبرية وجود هايفات غير مقسمة تعود للبيضات في 4 عينات بنسبة 8.33 من مجموع الـ 48 عينة ماء . تم قطع نهايات الخيوط الفطرية ونقلها لوسط اكار مسحوق الذرة (CMA) ، الحاوي على الكلورمفينكول، ولغرض الحصول على مزارع نقية اخذت قطعا من اطراف المستعمرات الفطرية النامية على اكار الذرة بوساطة ثاقبة فلين ، ونقلت لمزارع مائية من اطباق بتري حاوية على ماء مقطر وبذور سمسم نوع Sesamum indicum كطعوم ، وحضنت بدرجة حرارة 20م،فحصت كل 24 ساعة لمدة اسبوع.ووفقا للتشخيص النهائي تم الحصول على نوعين من الفطريات البيضية هما Saprolegnia turfosa وAchlya sp. وعند دراسة اصابة الفطرين المذكورين بينت النتائج ان الفطرين لهما المقدرة على اصابة بيض سمك الكارب نوع Cyprinus carpio بدرجة حرارة 20م . كما بينت نتائج دراسة تاثير اربع درجات حرارية مختلفة 15 , 20, 25, 30 م على الامراضية ان درجة حرارة 15م و20م كانت الدرجات المثلى لحصول الامراضية ، اذ استغرقت الاصابة 20 ساعة للفطر Saprolegnia turfosa و24 ساعة للفطر Achlya spp. ، في حين طالت فترة حصول الاصابة عند ارتفاع الحرارة عند درجة 25م لتصل الى 26 و30 ساعة للفطرين على التوالي ، كما استغرقت فترة الاصابة 48 ساعة للفطرين عند درجة 30م.اوضحت نتائج مقارنة بذور السمسم وبيض سمك الكارب (غير طازج) كطعوم ان البيض كان اكثر كفاءة في جذب السبورات السابحة في المزارع المائية اذ استغرق ظهور النمو 72 ساعة على بذور السمسم في حين استغرقت العملية ذاتها 24 ساعة على بيض سمك الكارب وتم ذلك عند درجة حرارة 20م.نمت الفطريات بصورة جيدة على اوساط اكار الذرة،اكار السمسم واكار بيض الكارب.وتميز الفطر Achlya sp. بنموه بشكل جيد على وسط اكار بيض الكارب اذ ظهر فرق معنوي بالمقارنة مع وسط اكار الذرة. درست قابلية الفطرين على انتاج الانزيم المحلل للدهون Lipase على وسط Tween80 agar والانزيم المحلل لليسيثين Lecithinase،وذلك على وسط Lecithovitelline agar،والانزيم المحلل للنشا amylase على وسط Starch agar وانزيم proteinase المحلل للبروتين على وسط Milk agar ، فضلا عن الانزيم المحلل للجيلاتين Gelatinase على وسـط Gelatine agar ، والانزيم المـحلل للـكايتين Chitinase على وسط Chitin agar , وبينت النتائج مقدرة الفطرين على انتاج الانزيمات اعلاه باستثناء الانزيم Gelatinase وذلك بدرجة حرارة 20م وتعد هذه الدراسة الاولى في التطرق لقدرة هذه الفطريات على انتاج الانزيم المحلل لليسيثين. | Fourty eight water samples were collected from Tigris river - AL - Shauaka area (near AL - Shuhadaa bridge) during the period from (August - December - 2002) only four samples of the (48) showed the occurance of Oomycetes, and Hyphal tips were cut and transferred onto corrn meal agar (CMA)containing Cloromphenicol, for purification a disc of CMA containing hyphal tips was cut by corck borer transferred to a petridishes (aquatic culture) containing Sesamum indicum( sesame seeds) as baits, incubated at 20ºC, examined each 24hr. for one week . Saprolegnia turfosa and Achlya spp. were identified , those two fungi were found to be pathogenic to carp fish eggs at 20º.Studying the effects of four different degrees 15ºC, 20ºC, 25ºC, 30ºC on infection showed at 15ºC and 20ºC Saprolegnia turfosa and Achlya sp. Infected carp fish eggs within 20,24 hr. respectively while they were 26,30 hr . at 25ºC and 48,48 hr. at 30 ºC for both fungi respectively.The comparison between the sesame seeds and non fresh carp eggs as a baits results that the eggs of carp fish was more competent in attraction of zoospores in the aquatic culture, it took only (24 hr.) of the infection of carp fish eggs while the growth on sesame seeds observed took (72 hr.) at (20ºC). Both fungi were good growing on a corn meal agar - sesame agar - carp fish eggs agar and especially Achlya spp. Growth was significant different on carp fish eggs agar .Studying the ability for both fungi to produce the enzymes lipase on (Tween 80 agar), lecithinase on (LV agar), Amylase on (starch agar) as well as protienase on (milk agar) and chitinase on (chitin agar). The results showed that both fungi were able to produce all the above enzymes except for Gelatinase. This study considered the first report about ability of these fungi to produce Lecithinase

الكشف الجزيئي والبكتريولوجي لبكتريا Group B Streptococci (GBS) المحلية في بعض النساء العراقيات الحوامل

Author name: زينب عدي حامد
Supervisor name: نهاية حكمت زكي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • تم جمع مائة وتسعة وثمانين مسحة مهبلية من النساء الحوامل من مستشفى ابن البلدي ومختبر الصحة المركزي ومستشفى كمال السامرائي. حيث تم الحصول على ستة واربعين عزلة من بكتريا Streptococcus agalactiae خلال الفترة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر شباط 2014.• كانت الفئة العمرية للنساء المصابة ببكتريا S. agalactiae تتراوح بين (35 - 37) سنة حيث كانت نسبة الاصابة تصل الى 76.08%.• تم تشخيص جميع العينات مبدئيا بواسطة الطرق المظهرية من خلال الاوساط الزرعية blood agar وchromogenic agar واجري تاكيد التشخيص بواسطة VITEK SYSTEM 2 Identification وكذلك تم تشخيصها بالطريقة الجزيئية PCR للكشف عن جين 16S rRNA.• اجريت دراسة تحليلية مقارنة بين الطرق الثلاثة المظهرية والطريقة الجزيئية المستخدمة في الكشف عن البكتريا، وكانت طريقة التفاعل التضاعفي) (PCR افضل وسيلة للكشف عن S. agalactiae حيث تم تشخيص 46 عينة بواسطته بينما تم الكشف عن 30، 36، 37 عينة من قبل blood agar وchromogenic agar وsystem 2 VITEK على التوالي.• اجري فحص VITEK Antibiotic Sensitivity Test للكشف عن حساسية البكتريا للمضادات الحيوية المختلفة لجميع العزلات المشخصة، وكان اعلى معدل انتشار مقاومة لمضاد tetracycline بنسبة 65.2% وتليها 58.6% و45.6% لمضاداتerythromycin وclindamycin على التوالي.• تم فحص ثلاثة من الجينات التي تشفر لعوامل الفوعمة (sip، scpB، cfb) في جميع العزلات المشخصة، وكانت نسبة 97.8% من اجمالي العزلات تحتوي على الجينات الثلاثة المذكورة.• تم الكشف عن خمسة جينات لمقاومة مضادات Macrolide وكان معدل المقاومة 69.5% من اجمالي العزلات.• تم التحري عن جينات مقاومة لمثيلة الرايبوسوم (ermB، ermA\TR، ermC) في جميع العزلات المشخصة وكان جين ermB الاكثر وفرة بين العزلات بنسبة 64.04% ثم يليه جين ermA\TR بنسبة 23.09% وعلى الرغم من تغيير الظروف المستخدمة في تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز PCR)) لكن هذه الدراسة فشلت في تحديد جين مثيلة الرايبوسوم (ermC) • بينت نتائج التحري عن اثنين من الجينات المشفرة لنظام الدفق efflux pumps وهي (mefA، mreA) ان معدل انتشار الجينين بين العزلات هو 8.69% و69.5% على التوالي.• اظهرت نتائج الدراسة ان 14(% 30.4) من اجمالي العزلات لا يمتلك اي جين من جينات مقاومة الاريثرومايسين الخمسة.• بينت نتائج الدراسة ان عزلة واحدة من بكتريا S. agalactiae رقم) (V12 حاملة لاربعة انواع من جينات مقاومة الاريثرومايسين عدا الجين (ermC). | • One hundred and eighty nine vaginal swabs were collected from Ibn - Albalady Hospital, Central health Laboratory and Kammal Alsamaraie Hospital. Forty - six Streptococcus agalactiae isolates were obtained during October 2013 to February 2014.• The isolates were initially identified phenotypically by blood agar culture media and chromogenic culture media and further identification was performed by Vitek and by molecular methods by 16srRNA - based PCR. • A comparative analysis were performed between three phenotypic detection methods and molecular method by PCR were best tool for S. agalactiae detection which 46 isolates were identified while 37, 36, 30 isolates were detected by Vitek system, chromogenic agar and blood agar respectively.• Vitek Antibiotic susceptibility for different antibiotics were performed to all detected isolates, the highest prevalence of resistance was 65.2% toward tetracycline and followed by 58.6% and 45.6% for erythromycin and clindamycin respectively.• Three virulence - encoding genes (sip, scpB and cfb) were screened in all detected isolates, 97.8% of total isolates were contain the three mentioned genes.• Five macrolide resistance genes were screened and the resistant rate in total isolates was 69.5%.• Three ribosome methylation genes (ermB, ermA/TR, ermC) were screened in all examined isolates; the most prevalence gene was ermB with 63.04%, whereas 23.9% was the prevalence of ermA\TR gene and ermC not detected in any of examined isolates.• Two efflux pump genes (mefA and mreA) were screened and the prevalence rate was 8.69% and 69.5% respectively

تاثير العسل والغذاء الملكي وخليطهما على الخطوط الخلوية السرطانية == Effect of Honey, Royal jelly & their mixture on cancer Cell lines

Author name: زينب غازي حسين السلطان
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | شلال مراد العتابي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة تقييم تاثير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما في بعض خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية خارج الجسم الحي Invitro، فضلا عن دراسة قابلية تاثير العسل والغذاء الملكي على انقسام الخلايا اللمفاوية البشرية . كما تم تحضير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما باذابتهم في وسط زرعي خال من المصل SFM (serum free media) ، واختبرت الفعالية السمية لهذه التراكيز في الخطوط الخلوية السرطانية منها AMN - 3، RD وخط الخلايا المتحول وراثيا Vero وخط الخلايا الطبيعي REF بثلاثة تراكيز( 1000 - 10.00 - 100.00 ) ميكروغرام/مل ، وضمن مدد تعريض مختلفة (24 - 48 - 72) ساعة ، و72 ساعة منها فقط عند الخط الخلوي الطبيعي REF . كانت النتيجة لتلك التراكيز تاثيرا سميا واضحا وبمعنوية عالية على نمو الخلايا السرطانية وخلال المدد الثلاث من التعريض ، في حين لم يكن هنالك تاثيرا واضح للتراكيز نفسها على نمو الخلايا الطبيعية (REF) . وان اكثر التراكيز التي لها تاثير سمي هي خليط من العسل والغذاء الملكي سواء كان ( متساوي او غير متساوي ) ، ثم تراكيز الغذاء الملكي ، واخيرا العسل . اما اكثر الخطوط تاثرا بهذه التراكيزRD اذ بلغت نسبة التثبيط عند التركيز 100.000 ميكروغرام/مل لمدة 72ساعه 92% (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم AMN - 3 وان نسبة التثبيط 92%عند 48 ساعه (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم Vero اذ بلغت نسبة التثبيط 90%عند (مزيج العسل والغذاء الملكي) خلال 48 ساعه .واعتمدت على تراكيز المستخدم ،اذ ان التراكيز العالية (10.000100.00 - ميكروغرام/مل) هي الاشد تاثيرا اي الاكثر تثبيطا . ومن ثم عمدنا الى دراسة العسل والغذاء الملكي عند انقسام الخلايا اللمفاوية بواسطة مقارنة المحتوى البروتيني قبل وبعد اضافة العامل المشطر PHA وضمن مدة تعريضية قدرها 72 ساعة. ولوحظت زيادة بتراكيز المحتوى البروتيني بعد اضافة العامل المشطرPHA بالنسبة للعسل والغذاء الملكي مقارنة مع السيطرة السالبة والموجبة بمستوى احتماليه (P<0.005)وسبب هذه الزيادة تعود للتاثير التازري لتراكيز العسل والغذاء الملكي مع المادة المشطرةPHA | The evaluation of variety concentrations of honey, the royal jelly and their mixtures effect was carried out on the normal and some cancer cell lines (Invitro) in this study, in addition of studying Honey and Royal jelly effect abilities on the human lymphocyte division. Different honey , royal jelly and their mixture concentrations were prepared by melting them in a culture media, purified from serum (SFM). The toxicity activity of these concentrations was tested in the cancer cell lines AMN - 3, RD, Vero, and normal cells line with three concentrations (100.000 - 10.000 - 1000)µg/ml and with different exposure periods (24 - 48 - 72) hours , only 72 hours for the normal cells line REF. The results of toxicity effect was obvious with high significance for those concentrations for growing the cancer cells line during the three periods of the exposure , while there wasn’t any obvious effect on the same concentrations in growing the normal cells (REF). The most effective concentration that has toxicity effect is the concentration of the mixture of royal jelly and honey, whether it is (equal or not), then after, the royal jelly concentration, and the honey. The most affected cell lines by these concentrations are RD ,as the inhibition rate was up to 92% at the concentration 100.000 µg/ml within 72 hours ( the honey and RJ mixtures) , then AMN - 3 ,92% within 48 hours ( the honey and RJ mixtures). For Vero, the inhibition rate was 90% within 48 hours (for the honey and RJ mixtures) These rates depended on the used concentrations , as the high concentrations was(100.000 - 10.000) µg/ml ,were the most affecting i.e. the most inhibiting .Then it was intended to study Honey and Royal jelly for the lymphocyte division by total protein comparison before and after adding the mitogen factor PHA and within 72 hours exposure time. An increase in the protein concentration were remarker after PHA addition for the honey and R.J in comparative with the negative and positive control with estimation range (P<0.005).The reason of that increase was the synergistic effect of the honey and the royal jelly concentration with the mitogen PHA

تاثير الصبغات الحيوية في مكونات الجدران الخلوية للبكتيريا المعزولة من المرضى المصابين بالاكزما الجلدية

Author name: زينب عويد شاطي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 100 مسحة جلدية خلال الفترة من تشرين الاول 2013 لغاية اذار 2014 من المرضى الذين يعانون من الاكزما الجلدية من مستشفى الامام علي ومستشفى الشهيد الصدر في العاصمة بغداد والذين كانت تتراوح اعمارهم بين (5اشهر - 70 سنة) ,من مجموعهم كانت (72 %) موجبة الزرع البكتيري ,و( 38%) سالبة للنمو . وقد اظهرت النتائج التالي : • ان كلا الجنسين يتاثر بالاكزما ,مع ارتفاع النسبة لدى الاناث 57% على الذكور 43% ضمن الانواع المختلفة للاكزما .• ان اعلى ارتفاع للاكزما كان ضمن الفئة العمرية 5اشهر - 9 سنوات ( 45 %) ,متبوعة بالفئة العمرية 30 - 39سنة كانت( 14 %) بينما اقل نسبة (5%) كانت ضمن الفئة العمرية 20 - 29 سنة .• الاكزما التلامسية كانت اعلى نسبة للانتشار(57 %) , يليها الاكزما الولادية بنسبة ( 35 %) والاكزما القرصية( 5%) بينما الاكزما العصبية كانت (3%).• من مجموع 100 مريض يعاني من الاكزما في جميع مجاميع الدراسة ,ظهرت Staphylococcus aureusباعلى نسبة 20عزلة (57.14%) ,تليهاStaphylococcus haemolyticus بسبع عزلات ( 20%)Pseudomonas, fluorescens, خمس عزلات (14.28 %) ,وعزلتان لبكتريا Enterobacter aerogenes ( 5.7%) وعزلة واحدة لبكتريا Staphylococcus warneri (2.8%) .• اختبرت العزلات البكتيرية للمضادات الحيوية.• P. fluorescens كانت مقاومة 18 مضاد حيوي وحساسية لمضادي ( neomycin ,(nitrofurantoin, حيث اظهرت العزلات مقاومة 100 % لمضادات (lactams,erythromycin ,azithromycin ,oxacillin ,trimethoprimβ) ومقاومة 50 % لمضادات (levofloxacin ,rifampicin ,norfloxacin )• E. aerogenes قاومت مضادات البيتالاكتام بنسبة 100 % ,وكانت حساسة بنسبة 100 % لمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية ((Amikacin ,gentamicin ,بينما اعطت مقاومة متوسطة لمضاد neomycin .• S.aureus قاومت 11 نوع من المضادات الحيوية وحساسة لثمانية انواع من المضادات ,بينما S.haemolyticus مقاومة 15 نوع من المضادات وحساسة لاربع انواع ومتوسطة لمضاد levofloxacin. وذلك يختلف عن S.warneri الحساسة 14 نوع من المضادات ومقاومة لخمسة انواع ومتوسطة لمضاد Oxacillin .• اختبرت قابلية البكتريا على النمو بوجود تراكيز مختلفة من الصبغات الحيوية (الصبغات الحيوية التي استخدمت الكرستال البنفسجية والمثيل الحمراء والمثيلين الزرقاء) مما سمح بتحديد التركيز المثبط الادنى للصبىغات ,فكان التركيز المثبط الادنى للمثيلين الزرقاء على S. haemolyticus , P.fluorescens بلغ 1ملغ\مل بينما على S .warneri , S .aureus 10 ملغ\مل ,بينما التركيز المثبط الادني للمثيل الحمراء كان 1 ملغ \مل لكل الانواع البكتيرية , التركيز المثبط الادنى للكرستال البنفسجية كان 0.1 ملغ\مل لكل الانواع ماعدا S.warneri التي كان التركيز المثبط لها 1ملغ\مل .• اظهرت البكتيريا السالبة لكرام اقل مقاومة للصبغات من البكتيريا الموجبة لكرام والصبغة المتعادلة ابدت تاثير اكثر من الصبغة الحامضية والقاعدية عند نفس التركيز , وسمحت الصبغة القاعدية بنمو البكتريا الموجبة لكرام بينما ثبطت السالبة لكرام .• اظهرت دراسة تاثير الصبغات على عوامل الضراوة للعزلات البكتيرية عدم تاثرانتاج الكبسولة ولكن تم تثبيط عوامل الالتصاق للعزلات البكتيرية بواسطة الصبغات , بينما استطاعت المعاملة بالصبغات اختزال قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الغشاء الحيوي ,كذلك تناقصت القابلية العالية للعزلات البكتيرية على التلازن مع اللاكتين المستخلص من الخلايا الطلائية بعد المعاملة بالصبغات الحيوية .• استخدمت طريقة المطياف الضوئي لدراسة تاثير الصبغات على نفاذية غشاء الخلية فكانت الزيادة في امتصاص الاشعة فوق البنفسجية لعينات الخلايا دليل على تحلل الخلايا بتاثير الصبغات الحيوية.اذ كشفت النتائج ان الموقع الهدف لتاثيرالصبغات الحيوية هو غشاء الخلية .• استخلص عديد السكريد الدهني من بكتريا P.fluorescens ,وهو احد مكونات الجدار الخلوي ,وتمت دراسة تاثير الصبغة الحيوية على كمية الدهن والسكريد في عديد السكريد الدهني .اذ اظهرت النتائج مستوى عالي للدهن في النموذج غير المعامل بالصبغة 79.33 % ملغ\مل , بينما تناقص مستوى الدهن الى 45.8% ملغ\مل بعد المعاملة بالصبغة , اما كمية السكريد في عديد السكريد الدهني في النموذج غير المعامل بصبغة المثيل الحمراء كانت 123.4% ملغ\مل والتي انخفضت الى 74.2 % ملغ\مل في نموذج عديد السكريد الدهني المعامل بالصبغة . | • One hundred Skin swabs samples were collected during the period from November 2013 to March 2014 from patients suffering from eczema at Al - Sadder hospital and Al - Imam Ali hospital in Baghdad Province . A total of (72%) gave positive cultures ,while (28%) showed negative cultures and the results showed the following : • Both genders were suffering from eczema , with dominance in females (57%) comparable to males (43%) within variable type of eczema.• The highest incidence of eczema was found in age group five months to 9 years (45%) ,followed in the age group (30 - 39) years (14%) , while the lowest percentage (5%) is in age group (20 - 29) years .• Contact dermatitis is the highest percentage of incidence (57%) followed by Atopic dermatitis (35%) and Discoid dermatitis (5%) ,while the lowest percentage is for Neuro dermatitis (3%) .• Out of the one hundred patients with eczema in all study groups , results showed that Staphylococcus aureus isolated at a highest percentage 20 (57.14%), followed by Staphylococcus haemolyticus seven (20%), and Pseudomonas fluorescens five (14.28%) and two isolates of Enterobacter aerogenes (5.7%) ,and one isolate of Staphylococcus warneri(2.8%).• Pseudomonas fluorescens were resistance for 18 antibiotic ,and sensitive to only two antibiotics (Neomycin and Nitrofurantoin ) .The isolates were resistant 100% to β lactams antibiotics ,augmentin ,erythromycin, azithromycin ,oxacillin ,while resistance 50% to levofloxacin ,rifampicin, norfloxacin ,and ciprofloxacin .• Enterobacter aerogenes isolates were resistant to βLactam antibiotics (100%) and appeared sensitivite to Aminoglycosides Antibiotic (amikacin ,gentamicin) in 100% percentage ,but gave intermediate resistance to neomycin .• Staphylococcus aureus isolates were resistant to 11 type of antibiotics and sensitive for eight . While Staphylococcus haemolyticus isolates were resistant to 15 type of antibiotics and sensitive to four and intermediate to Levofloxacin .And that differ from Staphylococcus warneri isolates which sensitive to 14 type of Antibiotics ,while resistant to only five antibiotics ,and intermediate to only Oxacillin. • Testing ability of Bacterial isolates to growth in presence different concentration of biostains (the biostains used are Crystal violet , Methylene blue and Methyl red ) allowed to detecting the sub MIC. the MIC of the methylene blue against S. haemolyticus and P.fluorescens were (1) mg/ml, while against S .warneri and S.aureus were (10) mg/ml ,and the MIC of the methyl red was (1) mg/ml against all type of these isolates , while the MIC of crystal violet against all these isolates were (0.1) mg/ml except against S. warneri was (1) mg/ml .• Studying the effect of biostains on virulence factors for bacterial isolates appeared their were&#39;nt any effect for these biostains on capsule production in these isolates ,and inhibition of adherence factor for these isolates by the stains ,while the treating of bacterial isolates with biostains could reduce the ability of these isolates for forming biofilm ,and the highly ability of these isolates which isolated from eczema patients to agglutinated with the lectin extracted from epithelial cells. But the percentage of agglutination decrased due to the treatment with biostains . • Spectrophotometric method is used to investigate the effect of biostains on cell permeability ,the results revealed that the target of biostains is the cell membrane.• Extracting lipopolysaccharide from Pseudomonas fluorescens which is one of the component of cell wall ,and studying the effect of biostain on the quantity of lipid and sugar, The results showed high level of lipid 79.33mg/ml in sample which not treated with biostain , while the lipid level decreases to 45.8 mg/ml when treated bacteria with the stain, as well as the quantity of sugar in lipopolysaccharide was high in sample not treated to biostain 123.4 mg/ml but decreased to 74.2 mg/ml when sample treated with methyl red stain.

تاثير بعض المواد الكيميائية في انتاجية وفعالية ذيفان الفا - هيمولايسين المنتج من المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Effect of some chemical materials on productivity and activity of ? - hemolysin which produced from Staphylococcus aureus Isolated from clinical samples

Author name: زينب فرحان علي الزهيري
Supervisor name: خولة جبر خلف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة عزل بكتيريا المكورات العنقودية من بعض مستشفيات بغداد، والتي شملت : مستشفى بغداد التعليمي، ومستشفى ابن البلدي، والمختبرات التعليمية،و مستشفى حماية الطفولة التعليمي، ومستشفى الكندي حيث امكن الحصول على (110) عزلة، توزعت بواقع (15) عزلة من عينات التهاب المجاري البولية، و(20) عزلة من الحروق، و(46) عزلة من الجروح ،و (17)عزلة من عينات الدم، و(12) عزلة من مسحات الاذن والفم والعيون.شخصت الدراسة (77) عزلة بكتيرية على انها مكورات عنقودية ذهبية من خلال اعطائها نتائج ايجابية في فحص الكاتليز وفحص انزيم مخثر البلازما ، وبقية الفحوص البايوكيمياوية مثل تخمير المانيتول في وسط ملحي تحت ظروف هوائية وقابلية العزلات على تحلل الدم وكانت عزلات Staphylococcus aureus قد توزعت على النحو الاتي (9) عزلات من عينات الدم، و(36) عزلة من الجروح، و(13) عزلة من الحروق، و(9) عزلات من مسحات الاذن والفم والعيون، و(10) عزلات من التهابات المجاري البولية.وقد اظهرت العزلات قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي(Biofilm) اذا استطاعت (35) عزلة (45.45)% من اصل 77 عزلة ان تكون الغشاء الحيوي فيما لم تستطع (42) عزلة (54.54)% المتبقية من تكوين الغشاء الحيوي.اظهرت النتائج ان نسبة العزلات المنتجة لذيفان الفا - هيمولايسين كانت (32) عزلة (41.55)% اما العزلات غير المنتجة للذيفان ، فقد كانت (45)عزلة.اختبرت حساسية العزلات تجاه المضادات الحيوية، وقد كانت نسبة مقاومة العزلات تجاه مضاد Oxacillin هي 100%، اما مضاد Methicillin وCloxacillin ، فقد كانت نسبة المقاومة 98.7 % و97.4 % على التوالي. وكانت نسبة مقاومة مضاد Cephalexin وCefixim هي 93.5 % و76.6 % على التوالي، اما مضاد Rifampicin وVancomcin فقد كانت نسبة مقاومتها 67.5 % فيما كانت نسبة مقاومة Azithromycin وLevofloxacin وBacitracin هي 49.3%، 70.1 %، 93.5 % على التوالي.اختيرت العزلة الكفؤة رقم (19)، وحدد التركيز المثبط الادنىminimum inhibitory concentration (MIC) لمضاد المثيسلين والذي كان تركيزه (32) مايكروغرام / مل.اختبر تاثير مادة CD - Cholesterol، وCholesterol ، وCD ، وMethicillin ، وPbs في فعالية ذيفان الهيمولايسين وكان معيار التحلل Hemolytic Titer هو : 8، 32.768، 65.536، 140.737.488.355.32، E+254.961408 على التوالي.واختبر تاثير المواد نفسها في انتاجية ذيفان الهيمولايسين وكانت النتائج على الاتي : 67.108.864، 549.755.813.888، 274.877.906.944، 576.460.752.303.360، 3.96140812E+25 على التوالي.وقد نقي الذيفان جزئيا بطريقة الترسيب باستخدام كبريتات الامونيوم، واختبرت فعالية الذيفان في حل كريات الدم الحمراء بطريقة الانتشار في الحفر.واختبرت التجربة فعالية الذيفان المنقى جزئيا داخل الجسم الحي في قرنية عين الارانب المختبرية اذ تكونت مناطق تاكل في القرنية بقطر 7.70 ملم بعد 8 ساعات من الحقن وثبطت فعالية هذا الذيفان داخل الجسم الحي باستخدام مادة CD - Cholesterol مع الذيفان حيث اصبح قطر تاكل القرنية 3.95 ملم.استخدمت مادة CD - Cholesterol بوصفها مادة علاجية من خلال استخدامها على هياة قطرات اضيفت الى العين المصابة بالذيفان وادت الى تناقص منطقة التاكل في القرنية من 7.70 الى 3.95.ويستنتج من الدراسة الحالية : اهمية استخدام CD - Cholesterol في تثبيط ذيفان الفا - هيمولايسين في داخل وخارج الجسم الحي وما لهذه المادة من اهمية في المجالات التطبيقية وفي الوقاية من تاثيرات الذيفان وقدرته التحللية للخلايا | In this study, one hundred and ten clinical samples were obtained from hospitals patient at many hospitals of Baghdad governorate : Baghdad teaching hospital, , Ibn - EL Balady hospital, educational laboratories, Protect child teaching hospital, Al - kendi hospital . The types and the numbers of clinical samples were distributed as (15) samples from urinary tract infect , (20) samples from burns infection , (46) samples from wounds, (17) samples from blood, (12) samples from ear, mouth and eyes infections . In this study (77) isolates were diagnosed as cocci cluster gold by giving positive result for catalase test and coagulase enzyme test and the other biochemical tests such as fermentation of mannitol under aerobic conditions and the ability of some isolates to hemolysis blood . S. aureus isolates distributed as follows : (9) isolates from blood samples, (36) isolated from wounds, (13) isolates from burns, (9) isolates from ear, mouth and eyes infection, (10) isolates from urinary tract infections.The isolates showed the ability to form biofilm (35) isolates (45.45%) out of 77 isolates and the other isolates could not form biofilm were : (42) isolation (54.54%),. The results showed that the proportion of isolates producing α - hemolysin was (32) (41.55%) isolates were either non - producing toxin : (45) isolates. The isolates were tested sensitivity to antibiotics and showed proportion of resistant toward Oxacillin which was 100% , Methicillin and Cloxacillin resistance ratio was 98.7% and 97.4%, respectively.The proportion of resistant to Cephalexin and Cefixim were 93.5% and 76.6%, respectively, while the Rifampicin and Vancomcin resistance ratio were 67.5%, while the proportion of resistant to Azithromycin and Levofloxacin and Bacitracin were 49.3%, 70.1%, 93.5%, respectively. The chosen isolate was ( number 19), select the minimum inhibitory concentration (MIC) of methicillin which were (32) micrograms \ ml. Tested the effect of CD - Cholesterol ,Cholesterol ,CD ,Methicillin and Pbs on the activity of toxin α - hemolysin and the hemolytic Titer is : 8 ( line A, well 3), 32.768 (line B, well 4), 65.536 (line B, well 5), 140.737.488.355.32 (line D, well 12) , 4.961408E + 25 (line G, well 12) respectively. It also has been testing the effect of the same material on the productivity of toxin α - hemolysin and the results were respectively : 67.108.864 (line : C well : 3), 549.755.813.888 (line : D ,well : 4), 274.877.906.944 (line : D, well : 3) , 576.460.752.303.360 (line : E, well : 12) , 3.96140812E + 25(line : H, well : 12) respectively.The toxin α - hemolysin was purified by using ammonium sulfate precipitation, and tested the effectiveness of the toxin on the red blood cells by using wells diffusion method . purified toxin was injected inside the living body in the cornea of rabbits eye, and the erosion of cornea where formed with diameter : 7.70 mm after 8 hours of injection but the other eye that injected with CD - Cholesterol that mix with toxin where the erosion diameter was3.95mm.CD - Cholesterol was used in treatment as a drops which added to the affected eye and led to a decrease in corneal erosion area from7.70 mm to3.95.mm We follows from the present study : The importance of using CD - Cholesterol in the inhibition of alpha - toxin inside and outside the living body and the importance of this study in applied medical fields and in the prevention the effects of the toxin on the cells.

دراسة تاثير التدخين على بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى السكري من النوع الثاني == Study the effect of smoking on some haematological and biochemical changes in type 2 diabetic patients

Author name: زينب رشيد حميد
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (105) مريضا" بالسكري النوع الثاني ,شملت المجموعة الاولى (45) مدخنا" والمجموعة الثانية (60) مريضا" من غير المدخنين من الوافدين الى مركز الغدد الصم والسكري التابع لوزارة صحة بغداد ,الرصافة ,مجاور مستشفى الكندي التعليمي. راوحت اعمار المجموعة الاولى (29 - 68 سنة) وبمعدل (48.53) سنة والمجموعة الثانية(24 - 75 سنة ) وبمعدل (52.21) سنة, تم سحب الدم الوريدي بمقدار (10 ملم۳) ,استخدم (2 ملم۳) منها لاجراء الفحوصات الدموية والتي شملت فحص هيموكلوبين الدم,الهيوكلوبين المسكر HbA1c%,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة(PCV%),معدل ترسيب كريات الدم الحمر(ESR),مع قياس ضغط الدم (الانقباضي والانبساطي) واستخدم (8 ملم۳) من الدم لاجراء الفحوصات الكيموحيوية والتي شملت قياس مستويات الكلوكوز الصياميF.B.G) ) , وصورة الدهون الكولستيرول,الكليسريدات الثلاثية(TGs),البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (LDL), الواطئة الكثافة جدا"(VLDL) والعالية الكثافة (HDL), وتم كذلك ايجاد معامل كتلة الجسم BMI. اظهرت النتائج في المجموعة الاولى من مرضى السكري النوع الثاني من المدخنين ارتفاعا"معنويا"(P≤0.05)في مستويات الهيموكلوبين (14.60gm/dl),حجم كريات الدم الحمر المضغوطة PCV% (46.05) ومعدل ضغط الدم(mmHg) الانقباضي (14.24) والانبساطي (8.64), الهيموكلوبين المسكر (%6.14) وانخفاضا" معنويا"(P≥0.05) في ESR(16.6 mm/h) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (12.91gm/dl) ,PCV% (40.68), ومعدل ضغط الدم (mmHg) الانقباضي (13.65) والانبساطي ((7.93 وانخفاضا" في HbA1c% (%5.32) وارتفاعا" معنويا"في ESR(30.45mm/h) واظهرت نتائج الفحوصات الكيموحيوية في المجموعة الاولى ارتفاعا"معنويا" في مستويات الكولستيرول (4.83±0.17mmol/L) ,الكليسريدات الثلاثية (2.48mmol/L), البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (1.56 mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين في الكولستيرول (4.20mmol/L), الكليسريدات الثلاثية (1.61mmol/L),البروتينات الدهنية واطئة الكثافة جدا (0.82mmol/L) انخفض مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة معنويا" (P≤0.05) في المجموعة الاولى (1.30mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (2.25mmol/L). لم تكن الفروقات معنوية في مستويات البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (LDL) بين المجموعتين وكذلك في مستويات سكر الدم الصيامي ومعامل كتلة الجسم BMI. نستنتج من هذه الدراسة الى ان التدخين قد ادى الى ارتفاع في مستويات الهيموكلوبين (Hb gm/dl) ,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة (PCV%), الهيموكلوبين المسكر(%HbA1c), مستوى الكلوكوز الصيامي(F.B.G) وكذلك في مستويات الدهون (Chol.,TGs,VLDL) في المجموعة الاولى مع انخفاض كل من (HDL - c,ESR) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية, على الرغم من عدم وجود فروقات معنوية بين المجموعتين في مستوى الكلوكوز الصيامي (F.B.G), الا ان القيم كانت مرتفعة في المجموعة الاولى مقارنة مع القيم الطبيعية (3.3 - 6.1 mmol/L) وهذا يعود الى عدم تحمل الكلوكوز ((Glucose intolerance بسبب التدخين فضلا عن العلاقة الايجابية بين ارتفاع الهيموكلوبين المسكر (HbA1c%) والكلوكوز الصيامي (F.B.G) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية. | The present study was conducted on 105 diabetic patients type2 . the first group included (45) smokers. The 2nd group (60)non smokers who visited the Diabetic and Endocrine center, near AL - Kindey hospital , the average age for first group was (29 - 68 year), and (48.53), and (24 - 75year) , (52.21) for the 2nd group. 10ml of blood was drawing by veinpuncture,2ml out of 10ml was used for hematological tests (Hb gm/dl, Glycated Hb(HbA1c%),PCV%,ESR) Blood pressure (systolic and Diastolic) was estimated, 8ml of blood was used to estimate the Biochemical tests that included fasting blood sugar (F.B.S) ,lipid profile (cholesterol, Triglycerides, LDL,VLDL and HDL - c) and BMI was calculated for both groups. The results showed in 1st group a significant increase (P˂0.05 ) in Hb level (14.60gm/dl) ,PCV% (46.05), Systolic blood pressure (mmHg) (14.24), Diastolic blood pressure (8.64) ,HbA1c (6.14%) with significant reduce (P≥0.05) in ESR (16.6 mm/h) in compassion with the 2nd non smoker group (12.91gm/dl). PCV% (40.63), Diastolic blood pressure (7.93 mmHg) , with reducing HbA1c (5.32%) and increasing ESR (30.45mm/h). The results of biochemical test revealed in 1st group a significant (p˂0.05) increase In the levels of cholesterol (4.83 mmol/L), TGs (2.48 mmol/L) , VLDL (1.56 mmol/L) in comparison with 2nd group non smoker. Cholesterol (4.20mmol/L), TGs (1.61),VLDL (0.82 mmol/L) . The HDL - c in 1st group was reduced significantly (p˂0.05)(1.30 mmol/L) in comparison with 2nd group (2.25 mmol/L). The differences in levels of LDL, F.B.G and BMI were not significant between the two groups. We concluded from this study that the smoking causing an increase in the levels of Hb gm/dl ,PCV% ,HbA1c% F.B.G and lipid profile (chol., TGs, and VLDL ) in the first group in comparison with 2nd group. Although there was no significant differences in the level of F.B.G between two groups , but the values were highly elevated in comparison to the normal values of F.B.S (3.3 - 6.1 mmol/L) in both groups This may be related to Glucose intolerance due to cigarettes smoking in addition to positive relationship between elevation of HbA1c and F.B.G in 1st group in comparison with 2nd group.

استخلاص وتنقية وتوصيف انزيم بيتا - كالاكتوسيديز من كبد الاغنام == Isolated, Purification and Characterization of Beta - Galactosidase from Sheep Liver

Author name: زهراء عدنان جاسم
Supervisor name: اياد نافع يحيى | سند باقر محمد
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة اختيار افضل طريقة لاستخلاص انزيم البيتاكالاكتوسايديز من كبد الاغنام المحلية, من بين ثمان طرائق, وكان استخدام دارئ الفوسفات (0.2 مولاري وبدالة حموضة 5) هو الافضل في استخلاص الانزيم بفعالية كلية بلغت (78898.5) وحدة. تم ترسيب المحتوى البروتيني باستخدام كبريتات الامونيوم (60)%من بين خمس طرائق للتركيز (التنقية الجزئية), واكملت مراحل التنقية باستخدام التبادل الايوني بعمود DEAE - Sephadex A100 , ومن ثم استخدام الترشيح الهلامي بعمود السيفاكريل S - 300 ( Sephacryl S - 300) اذ بلغت الفعالية النوعية ( 3328.8 ) وحدة / ملغم بروتين والحصيلة الانزيمية مقدارها (41.84)% وعدد مرات التنقية (8.57) مرة. وتم التاكد من نقاوة الانزيم باجراء عملية الترحيل الكهربائي بغياب المواد الماسخة للبروتين اذ ظهرت حزمة بروتينية واحدة في هلام متعدد اكريل امايد, ثم تم توصيف الانزيم واشارت النتائج الى ما ياتي : 1. كان الوزن الجزيئي هو (180) كيلودالتون مقدرا بطريقة الترشيح الهلامي.2. بلغت نقطة التعادل الكهربائي pI للانزيم (4.4).3. اظهرت الدراسة ان الانزيم من البروتينات السكرية وان نسبة الجزء الكربوهيدراتي تشكل (23)% عند تقديرها بطريقة الفينول - حامض الكبريتيك.4. وجد ان الدالة الحمضية الامثل لفعالية الانزيم (5), واظهر الانزيم ثباتا في مدى من قيم دالة الحموضة تراوحت بين (4.5 - 6.5).5. اظهرت النتائج ان درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم كانت (50) م°, عند دالة الحموضة الامثل لفعالية الانزيم, وان درجة الثبات الحراري لهذا الانزيم بين (25 - 60) م°.6. احتفظ الانزيم بكامل فعاليته الانزيمية عند حضنه بدرجة حرارة (50) م° لمدة (50) دقيقة وفقد (7)% من فعاليته في الدقيقة (60) وفقد (23)% من فعاليته بعد (120) دقيقة.7. بلغت قيمة طاقة التنشيط لتحويل المادة الاساس الى ناتج (8.32) كيلو سعرة / مول, بينما بلغت قيمة طاقة التنشيط لمسخ الانزيم (53.84) كيلو سعرة / مول.8. اظهرت دراسة الثوابت الحركية ان معدلات قيم ثابت ميكالس منتن ( Km ) لتفاعل الانزيم تجاه ONPG كانت ( 0.502) ملغم/مل , بينما بلغت قيمة السرعة القصوى ( Vmax ) للتفاعل الانزيمي (1.106) وحدة/مل.9. اظهرت الايونات الموجبة للمنغنيز والمغنيسيوم تاثيرا منشطا, بينما اظهرت ايونات الكوبلت والزنك والكالسيوم والنحاس تاثيرا مثبطا, فيما لم تؤثر ايونات الباريوم في فعالية الانزيم. 10. وجد ان جميع المثبطات المعدنية المستخدمة في الدراسة سببت تثبيطا بدرجة واضحة مما يعطي دليلا على اشتراك المعادن في تفاعل الانزيم.11. وجد ان المستخلص الانزيمي النقي , له القدرة على تحليل سكر اللاكتوز بكفاءة عالية , اذ ارتفعت نسبة اللاكتوز المتحلل من (25.11)% بعد مرور ساعة من الحضن الى (88.3)% بعد مرور 4 ساعات. | The study included the selection of the best methods to extract the enzyme among eight methods. It appeared that phosphate buffer ( 0.2 M, pH : 5) have given the highest activity of the crude enzyme ( total activity = 78898.5 unit). The protein content was concentrated and precipitated by ammonium sulfate (60) %, among other five methods of concentration (partial purification). The purification stages were achieved by using ion exchange column chromatography ( DEAE - Sephadex A 100 column ). Followed by gel filtration chromatography using Sephacryl S - 300. This method extract pure enzyme at a yield of (41.48) %, (8.57) times of purification and specific activity of (3328.8) unit / mg. The purity of enzyme was certified by poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing condition, the enzyme was characterized by the following : - 1 - Its molecular weight was (180) KD as estimated by gel filtration.2 - Its Iso electric point was at (4.4).3 - The result showed that it was a glycoprotein with a carbohydrate content of (23) % as determined by phenol - sulfuric acid method.4 - Its optimum activity pH was (5). The enzyme was stable at pH range between (4.5 - 6.5).5 - The optimum temperature for enzyme activity was (50) C°at the Optimum pH. The enzyme stability temperature range between (25 - 60) C°. 6 - The enzyme keep full effectiveness when incubated in (50) C° for 50 minutes, and lost (7) % of its effectiveness after (60) minutes, and lost 23% of its effectiveness after (120) minutes.7 - The activation energy to convert the substrate to product was (8.32) kilo calorie / mole. The inactivation energy for the denatured enzyme was (53.84) kilo calorie / mole.8 - The average Michael’s constant ( Km ) for the enzyme reactions towards ONPG were (0.502) mg/ml. and its Vmax was (1.106) unite / minutes 9 - The positive ions such as Mg and Mn have shown activating effect of β - galactosidase, While the Co, Zn, Ca and Cu have on inhibitory effect on the enzyme.10 - Metal inhibitors in habited β - galactosidase clearly meaning that it is metallic protein enzyme.11 - The analytical results have indicated that lactose solution analyzed by enzyme. The hydrolysis rate is increased from (25.11) % after one hour to (88.3) % after (4) hours.

دراسة نوعية مياه نهري ديالى ودجلة في الجزء الجنوبي لمدينة بغداد وتاثير بعض العناصر الثقيلة على الفطريات البيضية المعزولة == Study on the quality of water in Diyala and Tigris rivers southern Baghdad and the effect of heavy metals on the isolated aquatic fungi(Oomycetes)

Author name: ريم عمران عيسى الحسوني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله | عبد الرضا طه سرحان
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في الدراسة الحالية اختيار خمس محطات جنوب بغداد ثلاث منها على نهر ديالى الاولى قبل محطة الرستمية والثانية قرب مصبات الرستمية اما المحطة الثالثة فكانت بالقرب من نقطة التقاء نهر ديالى بنهر دجلة . اما المحطتان الاخريان فهما على نهر دجلة واحدة تقع على نهر دجلة قبل التقائه برافده ديالى والاخرى على نهر دجلة بعد نهر ديالى لمعرفة تاثيرنهر ديالى على نهر دجلة . اخذت النماذج من محطات الدراسة كل شهرين لمدة سنة كاملة ابتداء من شهر شباط ولغاية كانون الاول2009 . وقد تم عزل وتشخيص ( 14 ) نوعا فطريا عائدا الى ستة اجناس عائدة الى صنف الفطريات البيضية( Oomycetes ) وهي : Achlya Klebsiana A . americana , A . prolifroides , Achlya sp Saprolegnia ferax , S . anisospora , S . diclina , Saprolegnia sp , Dictyuchus sterile , D . carpophorus , D . polysporus , Pythium . ultimum , Pythiopsis cymosa , Leptomitus lacteus واظهرت النتائج ٲن اعلى عدد للعزلات ( 46 ) عزلةكانت في محطة رقم ( 5 ) في نهر دجلة اما اقل المواقع وجود للفطريات فكانت المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 16 )عزلة وكان الجنس Saprolegnia اكثر الاجناس تواجدا واقل الاجناس وجودا هو الجنس Pythopsis . وبينت النتائج انه يمكن اعتبار الانواع التالية ادلة حياتية على تلوث المياه . A . prolifroides , S . ferax , S . anisospora , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus وسجل النوعين لاول مرة D . polysporus وP. cymosa في العراق ، وقد اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه تراوحت ( 10.5 - 29.5 )م خلال مدة الدراسة ، كما وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني في محطات الدراسة ( 8.3 - 6.8 ) . وقيم التوصيلية والملوحة تراوحت على التوالي (9.8 - 4.9)مايكروسمينز|سم و((3.08 - 0.61غم|لتر للملوحة, اما قيم الاحتياج الكيميائي والحيوي للاوكسجين ( 18.2 - 3.2 ) ملغم|لتر و( 7.3 - 2.2 )ملغم|لتر اما نهر ديالى فكانت قيمة عالية مقارنة بنهر دجلة ,اما الكدرة فتراوحت ( 42 - 14.4 ) (NTU)وكانت قيمها اعلى في نهر ديالى من نهر دجلة وكذلك العسرة تراوحت ( 1617 - 210 ) ملغم|لتر واعلى القيم سجلت في محطة ( 3 ). اما الايونات الموجبة بالنسبة للكالسيوم والمغنسيوم سجلت زيادة في نهر ديالى اعلى من نهر دجلة اما نهر دجلة فقد سجلت المحطة ( 5 ) قيما اعلى من محطة ( 1 ) وذلك لتاثير نهر ديالى في بيئية نهر دجلة . ( ( 872.11 - 65 ملغم /لتر،اما الصوديوم فقد سجل اعلى قيم الايونات الموجبة تراوحت مابين ( 870 - 45 ) ملغم/لتر واقلها البوتاسيوم حيث تراوحت مابين( 18.12 - 1.7 ) ملغم/لتر, اما العناصر الثقيلة فقد كان الزنك اكثر العناصر وجودا في كل المحطات واقلها الكروم وبينت نتائج التحليل بان نهر ديالى ملوث بهذه العناصر ( الزنك ، الرصاص ، الكادميوم ، النحاس ، الحديد ، الكروم ) رغم انها لم تاخذ نمطا معينا خلال السنة . اما في نهر دجلة فكانت مدياتها ضمن الحدود المسموح بها . اما الفوسفات فتراوحت تراكيزه في المواقع المدروسة( 3.8 - 0.1 ) ملغم/لتر وكانت تراكيزه في نهر ديالى كما هو متوقع اعلى من نهر دجلة . اما الكلوريدات فقد سجلت قيم بمدى ( 775.63 - 54.55 ) ملغم/لتر واعلى التراكيز في نهر ديالى المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 775.63 - 199.96 ) ملغم/لتر. وتمت دراسة تاثير بعض العناصر ( الكاديميوم والزنك والحديد والكالسيوم والمغنسيوم والبوتاسيوم والصوديوم ) مختبريا على النمو الخضري والتكاثر الجنسي واللاجنسي وتكوين الجمات لكل من الفطريات الاتية والمعزولة من محطات الدراسة اثناء مدة الدراسةS. anisospora, A . prolifroides , L . lacteusوكانت نتائج التجارب المختبرية كالاتي : 1 - الكادميوم : اخذ بتراكيز ( 2 , 1 , 0.75 , 0.5 , 0.25 ) ملغم / لتر ا - اظهر الفطران L . lacteus وA . prolifroides تحملا لتراكيز الكاديميوم العالية اكثر من الفطر S . anisospora في النمو القطري بشكل معنوي. ب - عملت التراكيز العالية على تثبيط التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات الثلاثة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية عالية اكثر من باقي الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للكاديميوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة .2 - الزنك : اخذ بتراكيز ( 20 , 15 , 10 , 5 , 1 ) ملغم / لتر ا - عملت التراكيز العالية للزنك على تثبيط اقطار المستعمرات للفطريات الثلاثة .ب - عمل التركيز (1)ملغم|لتر على تشجيع التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات المدروسة مقارنة بمعاملة السيطرة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية تجاه تراكيز الزنك اكثر من الفطرين L . lacteus وS . anisospora . اما الفطر S . anisospora يمكن عده مؤشر لتلوث المياه بالزنك لكونه اكثر الفطريات تحملا للتراكيز المرتفعة لهذا العنصر .جـ - التراكيز المختلفة للزنك قللت معنويا اعداد الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides والتراكيز العالية للزنك عملت على زيادة اعداد الجمات للفطر L . lacteus معنويا.3 - الحديد : اخذ بتراكيز ( 5 , 2 , 1.5 , 1 , 0.5 ) ملغم / لتر ا - لم تؤثر التراكيز الواطئة للحديد معنويا على النمو القطري للفطريات المدروسة .ب - التراكيز المختلفة للحديداثرت على تكوين وظهور واعداد الحافظات البوغية والبيضية للفطر A . prolifroides مما يجعل امكانية استخدامه كدليل حياتي لتلوث المياه بهذا العنصر . وكذلك بالنسبةالفطر L . lacteus اما الفطر S . anisospora فانه لم يتاثر بشكل ملحوظ .جـ - اثرت التراكيز المختلفة على الفطران S . anisospora وA . prolifroides بزيادة اعداد الجمات فيه . لكن عمل الحديد على تقليل اعداد الجمات في الفطر L . lacteus .4 - الكالسيوم : اخذ التراكيز ( 150 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - ازدادت اقطار المستعمرات الفطرية بوجود الكالسيوم لكل من L . lacteus وS . anisospora لكن ثبطت اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides . ب - عملت التراكيز( 100 , 80 , 60 ) ملغم / لتر على تحفيز التكاثر اللاجنسي للفطريات اما التركيز (150)ملغم/ لتر ثبط الحافظات البوغية ،وشجعت التراكيز المنخفضة تكوين الحافظات البيضية وزيادة اعدادها للفطر A . prolifroides ،اما الفطر S . anisospora فان تراكيز الكالسيوم المختلفة عملت على تشجيع ظهور الحافظات البيضية وزيادة اعدادها, اما في الفطر L . lacteus فان تراكيز معينة عملت على تشجيع ظهورها وزيادة اعدادها . جـ - شجع الكالسيوم على تكوين الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides ولكنه ثبط اعدادها في الفطر L . lacteus بشكل معنوي.5 - المغنسيوم : اخذ بتراكيز ( 120 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - حفزت التراكيز المختلفة للمغنسيوم على زيادة اقطار المستعمرات لكل من الفطرين L . lacteus , A . prolifroides لكن الفطر S . anisospora عمل المغنسيوم على تثبيط اقطار مستعمراته .ب - اخر المغنسيوم ظهور الحافظات البوغية لكل الفطريات المدروسة وكذلك قلل اعدادها . اما الحافظات البيضية للفطريات المدروسة فقد اظهر المغنسيوم تاثيرا متباينا على الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للمغنسيوم اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , S . anisospora اما فان التركيزين ( 100 , 80 ) ملغم / لتر عملت على زيادة اعداد الجمات في الفطر A . prolifroides.6 - البوتاسيوم : اخذ التراكيز التالية ( 15 , 10 , 75 , 5 , 2.5 ) ملغم / لترا - حفز البوتاسيوم زيادة اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides لكنه ثبط اقطار الفطرين L . lacteus , S . anisospora معنويا مقارنة بمعاملة السيطرة.ب - شجعت التراكيز المنخفضة للبوتاسيوم على تكوين الحافظات البوغية والبيضية للفطر S . anisospora اما التراكيز العالية عملت على تثبيط اعدادها . اما في الفطر A . prolifroides فقد اثر بشكل مختلف ومتباين على تكوين حافظاته البوغية والبيضية .وفي الفطر L . lacteus عملت التراكيز ( 10 , 7.5 , 5 ) على زيادة اعداد حافظاته ج - عمل البوتاسيوم على زيادة اعداد الجمات للفطر A . prolifroides ،وعمل التركيز ( 5 ) ملغم / لتر فقط عمل على زيادة اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , .anisospora S . 7 - الصوديوم : اخذت التراكيز التالية ( 250 , 200 , 150 , 100 , 50 ) ملغم / لتر ا - ثبط الصوديوم اقطار الفطر S . anisospora اما الفطر A . prolifroides فان التراكيز المنخفضة زيدت اقطار مستعمراته اما التراكيز العالية ثبطت اقطار مستعمراته وكذلك الفطر L . lacteus .ب - الفطر A . prolifroides كان اكثر الفطريات حساسية تجاه التراكيز المختلفة للصوديوم خصوصا لتكاثره الجنسي واللاجنسي . اما الفطر L . lacteus فقد شجع الصوديوم تكوين حافظاته البوغية والبيضية . اما الفطر S . anisospora فان التراكيز المختلفة اثرت على تقليل اعداد الحافظات البوغية , وكذلك الحافظات البيضية .جـ - زيدت التراكيز المختلفة للصوديوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة S . anisospora ,A . prolifroides L . lacteus باستثناء التركيز (50)ملغم / لتر الذي عمل على تقليل اعدادها في الفطر الاخير. | In the present study five stations were chosen in the South of Baghdad . three stations on the Diyala river . the first before Al - Rustumia station , the second near the confluences of Al - Rustumia station and the third station was near the point that Diyala river meeting Tigris river . the last two stations , one of them located on Tigris river before it meet's Diyala river and the other after their meeting to limit the ecological effect of Diyala river on Tigris river . The samples were taken from studied stations every two months from February to December 2009. Fourteen species were isolated belong to six genus related to the class Oomycetes .These are : - Achlya klebsiana , A . amricana , A . prolifroides , Achlya .sp , S. ferax , S . anisospora , S .diclina,Saprolegnia.sp,Dictyuchus sterile,D.carpophorus, D . Polysporus , Pythium ultimum , Pythopsis cymosa , Leptomitus . lacteus . The results showed that higher number of isolates was in station ( 5 ) in the Tigris river while the lower number of isolates was in station ( 3 ) near the confluences of AL - Rustumia (16 )isolates. The study showed that Saprolagnia was the most frequent in the peroid of studying and Pythopsis was showed the lower freqency. The result showed that we can consider each of these Speicies : S . anisospora , S . ferax , A . prolifriodes , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus . as indictor of water Pollution . D . polysporus and Pythopsis cymosa were not recorded in Iraq . The ecological studying showed that temperature variability was between (10.5 - 29.5)C˚ in the peirod of studying , and Hydrogen contcentration ( 6.8 - 8.3 ) in the station s of studying . Electeral ions conductivity and salinity was ( 985 - 4920 )µs\Cm ,( 0.61 - 3.08 ) G\l in sequence . Biological Oxygen Demmend and Chemical Oxygen Demmend (3.2 - 18.2 )mg\l , ( 2.2 - 7.3 ) mg\l river was higher as compared with Tigris river the turbidiy valves was ( 14. 4 - 42 )NTU and it was higher in Diyala river then inTigris river so that Hardness range was ( 210 - 1617 ) mg\l . The Cataions consider ( Calisum and Magnesium) recorded increase in Diyala river than Tigris river because of effect of Diyala river on ecological situation of Tigris river ( 65 - 862.11 ) mg\l , ( 13.76 - 545.4 ) mg\l . The Sodium concentration recorded higher values in cataions Concentration ( 45 - 870 ) mg\l and the Polassium was the lowest concentration ( 1.7 - 18.12 ) mg\l. The heavy metal , the Zinc was the only elements present while the Chromum was recorded the lowest concentration . The results also showed that Diyala river Polluted with the elements ( Zinc , Lead , Cadmium , Copper , Iron , Chromum ) . in spite of that it wasn't take regular style .However In the Tigris river it was at the acceptable limitis ,The phosphate , concentrations in the studied stations were between ( 0.1 - 3.8) mg\l and concentration in Diyala river as were higher than Tigris river . The chloride was recorded in range ( 199.96 - 775.63 ) mg\l and higher concentration in Diyala river in Station ( 3 ) near the confluence of AL - Rustumia. All of ecological studies recorded decreased in the second halfe of the year ( 2009 ) compative to first half of that Year because of the level of water increased . Effect of the elements ( Cadmium , Zinc , Iron , Calsium , Magnesium , Potassium , Sodium ) on the radical growth , A sexual and sexual reprodudtion and gemma formation of the following isolated species fungi : S . anisospora , A.prolifroides . L . lacteus . were studied in the laboratory The results were as follows : 1. Effect of Cadmium : was used at the concentration (0.25, 0.5, 0.75, 1,) (mg\l) .a - A . prolifroides and L . lacteus showed more tolerance to the higher concentrations of Cadmium more than S . anisospora of radical growth .b - Higher concentration reduced both the Asexual and Sexual reproduction to the three fungi and the fungus A . prolifroides showed high sensitivity as compared with the other two fungi . Cadmium expanded the period of oogonia formation .c - Cadmium reduced number of gemmae in three fungi.2. Effect of Zinc : was used at the concentration ( 1,5,10,15,20 ) ( mg \l) a - Higher conc. of Zinc reduced the diameters of colonies of all the three fungi , while the low conc. had no effect.b - ( 1ppm ) conc. stimulated asexual and sexual reproduction of the studied fungi and the fungus A . prolifroides was more sensitive to all concs. of Zinc than S . anisospora , L . lacteus while the fungus S . anisospora was tolerant and can consider as bioindicator for water pollution with Zinc because it was the best fungus tolereate to higher conc. of this element.c - Different conc. of Zinc decreased the number of gemme of the S . anisospora and A. prolifroides, but higher conc. of Zinc increased the number of gemmae of L . lacteus 3. Effect of Iron : was used at the concs. ( 0.5 , 1 , 1.5 , 2.5 ) ( mg \l ) a - lower conc. of Iron has no effect on redical growth of fungi while the conc. ( 2,5 ) mg / L reduced the colonies diameter. b - Different concs. of Iron stimulated the formation and number of sporangia of the fungi A . prolifroides , L . lacteus that makes the first one as indicator for water pollution of this element. while the fungus S . anisospore was not affected c - Different concs. of Iron stimulated and increased the number of gemmae to fungi A.prolifriodes , L.lacteus but decrease the gemmae in S.anisospora 4. Effect of Calsium : was used at the concentration ( 40, 60, 80, 100, 150 ) mg \la - Calcium induced an increased of colonies diameters of S . anisospora and L . lacteus , while it redued redical growth of A . prolifroides .b - The concs . ( 60 , 80 , 100 ) mg \l work on stimulation of the asexual reproduction the fungi , while ( 150 ) mg \l redued the sporangia formation . Low conc . induced formation and number of Oogonia in A . prolifroides , while the different conc. Of Calsium stimulated Oogoina formation and number in S . anisospora .in the fungus L . lacteus specific conc . encourage the formation and number of Oogonia .c - Calsium increase the number of gemmae in A . prolifroides and S . anisospora , while reduced it in L . lacteus5. Effect of Magnesium : was used at the conc. (40, 60, 80,100,120) mg \la - Different concs. Of Magnesium stimulated the radial growth of both of fungi A . prolifroides and L . lacteus , while the Magnesium reduced the radial growth of S . anisospora .b - Period of sporangia formation of the there fungi was expanded , and the number of sporangia was reduced of fungi . Oogonia of all fungi showed different effect in different concs. of Magnesium. c - Different concs. of Magnesium reduced the number of gemmae of fungi , except ( 60 ) mg/L for the fungus S . anisospora and ( 40 ) mg\l for the fungus L . lacteus , while ( 80 , 100 ) mg\l stimulated the number of gemmae in A . prolifroides 6. Effect of Potassium : was used at the concs. (2.5, 5,7.5, 10,15) mg\l a - Potassium reduced the radial growth of both fungi S . anisospora and L . lacteus , while increased the Colonies diameter of the fungus A . prolifroides. b - Low conc. of Potassium stimulated the formation and number of sporingia and Oogonia , while higher conc. reduced it. However ,the concs. ( 5 , 7.5 , 10 ) mg\l stimulated the number of sporangia and Oogonia of the fungus A . prolifroides S.anisospora showed irregular style in the formation of sporangia and Oogonia so the fungus L . lacteus . c - Potassium concs. stimulated the number. of gemmae in A . prolifroides , while only ( 5 ) mg\l stimulated the number of gemmae of S . anisospora and L . lacteus. 7. Effect of Sodium : was used at the conc. (50,100,150, 200, 250 ) mg\l a - Sodium reduced the colonies diameters of the fungus S . anisospora , while low conc. increased the radial growth but high conc. reduced the radial growth of A . prolifroides and L . lacteus b - A . prolifroides was high sensitive to different conc. of Sodium specialy the asexual and sexual reproduction . Sodium stimulated the formation of sporangia and Oogonia in L . lacteus , while and reduced it in the fungus S . anisospora .c - Sodium was stimulated and increased of gemmae formation in S . anisospora and , A . prolifroides at different concs. of , while in fungus L . lacteus only ( 150 ) mg / L reduced the number of gemmae and the other concs. stimulated their number .

دراسة تاثير بعض الطرائق الفيزيائية في تحطيم سم الافلاتوكسين B1 المنتج من الفطر Aspergillus flavus في حبوب الذرة الصفراء المخزونة == Study the effect of some physical methods to destroy the toxin aflatoxin B1 product from the fungi Aspergillus flavus on maize stored grains

Author name: ريام حسن طعمة الدراجي
Supervisor name: امنة محمد علي | حليمة زغير حسين
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The study inculded in the plant protection department / College of Agriculture / University of Baghdad evaluate the efficiency of physical agents (ozone, ultraviolet radiation, microwave oven) for inhibiting Aspergillus flavus growth and destroying the mycotoxin that produced in corn seeds . An isolate af A.flavus producing Aflatoxin B1 was obtained from plant protection dept. college of Agric. University of Baghdad . the results showed that hight significant reduction in A. flavus growth between treated and non - treated cultures for all the agents used was observed . The exposition of A. flavus culture to ozone at 2 and 4 g/min . 5, 10 , 20 mins. induced inhibition percentayes of fungal growth 82.16 , 83.30 , 79.96 % and 78.47 , 81.60 , 78.83 % respectively, compared 0 % in control treatment . It was found that the more efficient concentration is 2 g / min for to mins . The inhibition percentages of A.flavus growth were found to be 84.73 , 88.50 , 92.53 % and 81.46 , 94.40 , 87.37 % when the fungal culture exposed to Ulttraviolet radiation at wave length 240 and 365 nm for 30 , 60 , 120 mins . compared with 0 % in control treatment. The best time escposition was found to be 120 mins. and 240 nm and 60 mins. at 365 nm. The biomass weights of A.flavus growth were estimated to be 0.12 ,0.30, 0.42 g and 0.21, 0.38 , 0.44 g when a fungal culture exposed to microwave for 5 , 10 , 20 seconds at 80 Co and 100 Co respectively, compared with 0.26 g in control treatment . The best treatment of each agents was chosen for storage experiment to evaluate the ability of these agents to destroy Aflatoxin B1 produced by A. flavus in contaminated corn seeds . The concentration of the mycotoxin were determined by ELISA test protocol . Results showed destroy toxin IFLA B1 (reduction ratio) the effect of radiation microwave in the center of Japex degree 80 and 100 Co 57.14% and 85.71%, respectively, and for 20 sec ,compared to the treatment comparison 0 % as found significant differences were apparent between transactions and the treatment of comparison, as and the presence of a significant difference to the treatment beam microwave notes degree 100 Co, amounting reduction ratio 85.71%, showed the effect of radiation microwave to break toxin IFLA B1 raw results (percentage reduction) by two notches 80 and 100 Co, 5, 10, 20 times a second and there were no significant differences between the treatments and treatment comparison as well as the existence of clear differences of treatment degree 80 and 100 Co and time of 20 sec and rates reduced 95.09% and 91.18%, respectively, showed the results of destroy toxin IFLA B1 (reduction ratios) contaminated corn and the presence of significant differences apparent between the comparative treatment and the rest of the transactions when it was noted the lack of significant differences between transactions ozone and ultraviolet (240,365 nm) and microwave two - tone effect temperature (80 and 100 Co ) and rates reduced 89.52% and 89.52% and 69.52% and 94.29% and 89.52%, respectively, and was the best treatment is radiation microwave degree 80 Co and by the reduction of 94.29%, and the results showed that there were significant differences apparent between the comparison treatment (non - polluting) and the rest of the transactions and observed significant differences were apparent between transactions (microwave and ozone and ultraviolet radiation) led by microwave treatment of two - tone effect 80 and 100 Co and by the reduction of 100% for both degrees .

التغيرات في بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى قصور الغدة الدرقية == Changes in some haematological indices and biochemical parameters in patients with hypothyroidism

Author name: رويدة يونس لفتة
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (80) شخصا بشكل مجموعتين ، تضمنت المجموعة الاولى مرضى قصور الغدة الدرقية 60 مريضا (40 انثى، 20 ذكر) الذين تراوحت اعمارهم بين (25 - 63 ) سنة وبمعدل 44.23±1.38) ) ومن المراجعين الى مركز الغدد الصم والسكري / التابع لمستشفى الكندي / الرصافة ، شملت مجموعة السيطرة 20 شخصا (15 انثى ، 5 ذكور) تراوحت اعمارهم بين (25 - 60 ) سنة وبمعدل ( 37.00±6.49 ). اظهرت النتائج ارتفاعا (P<0.01) في مستويات هرمون TSH في مجموعة المرضى وبمعدل (5.60±0.78 mU/L) مقارنة بالسيطرة (1.62±0.17 mU/L)، لم تكن الفروقات معنوية (P>0.05) في مستويات T4 (79.82±2.32 nmol/L )، (74.90±2.11 nmol/L) وT3 (1.35±0.05 nmol/L) ،(1.54±0.06 nmol/L) في مجموعتي المرضى والسيطرة على التوالي . كان معامل الارتباط سالبا (P<0.01) في مجموعة المرضى بين TSH وT3 (0.31 - ) وكذلك بين TSH وT4 (0.53 - ) بينما كان الارتباط موجبا (P<0.01) بين T4و T3 (0.54) . انخفض مستوى هيموكلوبين الدم (P<0.01) (<13gm/dL) في الذكور ، (<12 gm/dL) في الاناث وبمعدل (9.47±0.13 gm/dL ) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (12.91±0.30 gm/dL) . بلغت نسبة حصول فقر الدم (38.33%) وعند مستوى معنوية (P<0.01) في مجموعة المرضى وبمعدل مستوى الهيموكلوبين (9.47±0.13 gm/dL) مقارنة ﺒ (20 %) وبمعدل هيموكلوبين الدم (10.82±1.3 gm/dL) في مجموعة السيطرة . كان نوع فقر الدم في مجموعة المرضى وبحسب حجم كريات الدم الحمر الكريي (MCV <80 Ft ) في 8 حالات وبنسبة (34.78 %) وتحت مستوى معنوية ( P<0.01) من نوع صغيرة الحجم (Microcytic anemia) وفي 15 حالة وبنسبة (62.21 %) وعند مستوى معنوية (P<0.01) من نوع طبيعية الحجم (Normocytic anemia) اما حالات عدم وجود فقردم فلقد بلغت 37 حالة وبنسبة (61.67 %) وعند مستوى معنوية (P<0.05) . انخفض مستوى حديد مصل الدم (P<0.05) في مجموعة المرضى في 10 حالات وبنسبة (16.67 %) وبمقدار (10.08±0.5 µmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0 %) وبمعدل (19.83±0.69 µmol/L) . انخفض فريتين مصل الدم (P<0.01 ) وبمعدل (11.21±0.13 µg/L) وبنسبة (36.67 %) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (20 %) وبمعدل ( 6.14±0.12 µg/L) . ارتفع مستوى TIBC ((P<0.01 في 7 حالات وبنسبة (11.67 %) وبمعدل (67.02±0.12 µmol/L ) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (51.23±0.87 µmol/L) ،انخفض مستوى TIBC (P<0.01) في 51 حالة من المرضى وبنسبة (85 %) وبمعدل (29.78±0.32 µmol/L) مقارنة مع السيطرة(51.23±0.87 µmol/L) لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (123.17±1.35 mm.Hg) والانبساطي (mm.Hg 79.27±0.82) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة ((120.20±2.50 mm.Hg ،((78.95±0.18 mm.Hg على التوالي . لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى معامل كتلة الجسم (BMI) في مجموعة المرضى (28.37±0.72) مقارنة مع السيطرة (26.71±1.07) . ارتفع مستوى RDW (P<0.01 ) (17.2±0.12%) وانخفض مستوى MCV (62±0.2 Ft) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة RDW (15±0.22%) وMCV (66.3±0.13 Ft)، انخفض مستوى صوديوم مصل الدم (<135 mmol/L) في 26 حالة وبنسبة (43.33 %) وعند مستوى معنوية ((P<0.01 مقارنة بالسيطرة (0%) بلغت مستويات البوتاسيوم (4.62±0.08 mmol/L) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (4.59±0.07 mmol/L) الا ان هذا الارتفاع لم يكن معنويا ((P>0.05 . نستنتج من هذه الدراسة الى ان قصور الغدة الدرقية في مجموعة المرضى كان من نوع تحت السريري وذلك من خلال ارتفاع مستوى هرمون TSH والمستويات الطبيعية لهرموني T4 وT3 . وكان فقر الدم من نوع صغيرة الحجم ، وطبيعية الحجم مع انخفاض مستوى الصوديوم في مصل الدم. | The present study was conducted on 80 subjects , divided into two groups. The hypothyroid patients group (Ist group) Included 60 subjects (40 females,20 males),their ages ranged between (25 - 63) year by mean (44.23±1.38) ,that visited the center of endocrine and diabetes at AL Kindy Hospital, Rusafa region .The control group was included 20 subjects (15 females,5 males). Their ages ranged between 25 - 60 year by mean (37.00±6.49) The results showed a significant (p<0.01) increase in the level of TSH in patients group (5.60±0.78 mU/L) in comparison (1.62±0.17 mU/L) in the control group . The differences were not significant (P>0.05)in the level of T4 (79.82±2.32 nmol/L) ;(79.90±2.11 nmol/L) and T3 (1.35±0.05 nmol/L) ; (1.54±0.06 nmol/L) in the patient and control groups respectively. There was negative correlation(P<0.01) between TSH and T3 (0.31 - ) ,and also between TSH and T4 (0.53 - ) .while there was a positive correlation (0.54) significant at (p<0.01) between T4 and T3 in the patients group . The level of haemoglobin decreased significantly (P<0.01) in males (<13 gm/dL) and females (<12 gm/dL) with mean (9.47±0.13 gm/dL) in patienst group in comparison with control group (12.91±0.30 gm/dL). The rate of anemia was (38.33%) at the level (P<0.01) in the patients group in comparison with control group (20%) by mean(10.82±1.3 gm/dL) . The type of anemia according to MCV (<80 Ft) was microcytic in 8 cases (34.78%) at level (P<0.01) and it was normocytic in 15 cases (62.21%) in the patienst group at (p<0.01) . The non anemic cases were 37 (61.67%) at level (P<0.05) . The level of serum Iron reduced (P<0.05) in the patients group in 10 cases (16.67%) with mean (10.08±0.5 µmol/L) in comparison (0%) with mean (19.83±0.69 µmol/L) in the control group. The level of Ferritin reduced (P<0.01) by mean (11.21±0.13 µg/L) at rate (36.67%) in comparison (20%) with mean (6.14±0.12 µg/L) in the control group. TIBC was Increased (P<0.01) in 7 cases (11.67%) with mean (67.02±0.12 µmol/L) in the patients group in comparison with the control group (51.23±0.87 µmol/L) . The level of TIBC was decreased (P<0.01) in 51 cases (85%) with mean (29.78±0.32 µmol/L) in the patients group in comparison with control (51.23±0.87 µmol/L) . There was no significant differences (p>0.05) in the level of systolic blood pressure (123.17±1.35 mm.Hg) and diastolic blood pressure (79.27±0.82 mm.Hg) in the patients group in comparison with control (120.20±2.50 mm.Hg) ;(78.95 ±0.18 mm.Hg) respectively . BMI value was not significant (p>0.05) in the patients group (28.37±0.72) in comparison with the control group (26.71±1.07) . The level of RDW increased(P<0.01)(17.2±0.12%) while MCV (Ft) decreased (62±0.2 Ft) in patients group in comparison with control group; the RDW was (15±0.22 %) and MCV (66.2±0.13 Ft) . The level of serum sodium (<135 mmol/L) reduced (P<0.01) in the 26 cases (43.33%) in comparison with control group(0%) . The level of potassium was Increased (P>0.05) (4.62±0.08 mmol/L) in the patients group in comparison (4.59±0.07 mmol/L) in the control group. We concluded from this study that the hypothyroidism in the patients group was subclinical (SCH) ,due to increasing TSH levels but the T4 and T3 levels were normal .The anemia in this group was microcytic and normocytic and reduction in the serum sodium level .

انتاج وتوصيف Protease من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من بعض الحالات السريرية وعلاقته ببعض المضادات الحيوية == Production and Characterization of Protease from Pseudomonas aeruginosa Isolated from Some Clinical Cases and its Relation with some Antibiotic Agent

Author name: رنا مجاهد عبد الله الشويخ
Supervisor name: سمير فتح الله سمعان | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (170) عينة من حالات مرضية مختلفة التي تضمنت (35) مسحة من الجروح و(47) مسحة من الحروق و(25) مسحة من حالات التهابات الاذن الوسطى فضلا عن عينات الادرار التي تضمنت (63) عينة وجمعت العينات من مستشفى الكاظمية التعليمي للمدة من 1 - 5 - 2005 ولغاية 1 - 8 - 2005 .  تم تشخيص (50) عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اذ زرعت على اوساط اغنائية وتفريقية لغرض العزل الاولي ثم اخضعت المزارع البكتيرية للفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها ، ثم استخدمت عدة الفحصapi20E للتشخيص النهائي لهذه العزلات ، اذ تضمنت (8)عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa (16%) من حالات التهاب الجروح ، (16) عزلة (32%) من التهابات الحروق ، (20) عزلة (40%) من حالات التهاب المجاري البولية و(6) عزلات (12%) من حالات التهاب الاذن الوسطى .  اختبرت حساسية بكتريا Pseudomonas aeruginosa ضد (20) مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية . اذ اظهرت بكتريا Pseudomonas aeruginosa نسبة المقاومة(100%) تجاه مضادات الامبسلين ، الاموكسسلين ، الاموكسسلين / حامض كلافيولونك ،الكلوكساسلين والسيفازولين . بينما بلغت نسبة المقاومة لمضادات السيفاكسيم ، الكاربنسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم (98%) ، (84%) ، (80%) و(78%) على التوالي. وبلغت نسبة المقاومة لمضادات الجنتاميسين ، التوبرامايسين ، الببراسيلين ، النورفلوكساسين ، الاميكاسين والسبروفلوكساسين (52%)، (26%) ، (24%) ،(14%) ،(6%) و(4% )على التوالي . في حين اظهرت جميع العزلات لبكتريا Pseudomonas aeruginosa حساسية عالية (100%) تجاه مضادات الازترونام ، امبينيم والسيفابيم البيفلوكساسين والافلوكساسين .  قدرت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs ) للمضادات الحيوية وكانت اعلى نسبة مقاومة لمضادات الاموكسسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم . اما نسبة المقاومة لمضادات الامينوكلايكوسايد فكانت تتراوح (4 - 128) مايكرو غرام / مل للتوبرامايسين ، (4 - 256) مايكرو غرام / مل للجنتاميسين اما لمضاد الاميكاسين فكانت (4 - 128) مايكرو غرام / مل. في حين اظهرت قيم MIC حساسية عالية (100%) لمضادي السبروفلوكساسين والسيفابيم.  اظهرت نتائج خلط مضادات السبروفلوكساسين مع كل من الجنتاميسين والسيفتازديم والببراسيلين نتائج مهمة في تخفيف التراكيز المثبطة الدنيا لكلا المضادين المستخدمين لوحدهما ضد هذه البكتريا . كذلك اظهرت نتائج خلط مضادي التوبرامايسين مع السيفتازديم فعالية عالية عند خلطهما معا واستعمالهما ضد بكتريا Pseudomonas aeruginosa . اظهرت (86%) من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa قابليتها على انتاج انزيم البروتييز . اظهرت النتائج تاثر انزيم البروتييز الخام ببعض المضادات الحيوية التي ادت الى انخفاض في فعالية الانزيم عند زيادة تركيز هذه المضادات .  كانت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتييز عند استخدام وسط لوريا عند رقم هيدروجيني(8) ولمدة(48) ساعة من الحضن بدرجة حرارة(35) م º . نقي انزيم البروتييز من العزلة Pseudomonas aeruginosa PsaW2 باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الايوني DEAE - celluloseوكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100. قدر الوزن الجزيئي للانزيم المنقى بطريقة الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100 وكان (21379 ) دالتون ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية البروتييز (35) م º والرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم كانت (8) . اوضحت نتائج تاثير بعض المثبطات والعوامل المختزلة والكلابية في فعالية الانزيم ، ان فعالية الانزيم قد ازدادت عند معاملته بايونات Ca++ وZn ++ مما يدل انها تلعب دورا في تحفيز وثبات الانزيم ، ولم تثبط فاعلية الانزيم بوجود العوامل المختزلة مثل السستين ، بينما تثبط فعالية الانزيم بوجود العوامل الكلابية EDTA .  اظهر انزيم البروتييز المنقى من بكتريا Pseudomonas aeruginosa فعالية عالية عند خلطه مع مضادي الفانكومايسين والسيفازولين في علاج التهابات العيون في الارانب والمتسبب عنها بكتريا Staphylococcus aureus . |  One - hundred and seventy swab samples were collected from different cases including (35) wound and (47) burn infection , (25) otitis media and (63) samples from urinary tract infections from Al - Kadhymia Teaching Hospital in Baghdad city . The study period was from 1 - 5 - 2005 to 1 - 8 - 2005 .  Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified using different microscopical , cultural characteristics and biochemical tests . Final identification of bacteria were performed by using api20E system. The isolates were 8(16%) from burn infections , 20(40%) isolates from urinary tract infections , 16(32%) isolates from burn infections and 6(12%) isolates from otitis media . The sensitivity of Pseudomonas aeruginosa isolates was been tested against (20) antibiotics showed isolates version resistance with different percentage against antibiotics .Pseudomonas aeruginosa exhibited (100%) resistance to Ampicillin , Amoxycillin , Amoxycillin / clavulanic acid, cloxacillin and cefazolin .While percentages of resistance to cefixime , carbencillin, cefotaxime and ceftazidime were (98%) ,(84%) ,(80%) and ( 78%) respectively .Resistance percentages to Gentamicin ,Tobramycin , Piperacillin , Norfloxacillin , Amikacin and Ciprofloxacine were (52%),(26%),(24%),(16%),(14%)and(4%) respectively. All isolates of Pseudomonas aeruginosa were highly sensitive (100%) to Aztronam , imipenem , cefepime , P - ofloxacin and ofloxacin .  Minimum inhibitory concentrations of Amoxycillin , cefotaxime , ceftazidime and piperacillin showed higher percentage of resistance . While resistance to aminoglycoside antibiotics including Tobramycin was (4 - 128) μ g / ml , Gentamicin was (4 - 256) μ g / ml and Amikacin was (4 - 128) μ g / ml . On the other hand , all bacterial isolates were susceptible (100%) to Ciprofloxacine and Cefepime .  Combinations of Ciprofloxacine with Gentamicin , ceftazidime and piperacillin gave interesting results against the local bacterial isolates in reducing their MIC values . Tobramycin and ceftazidime gave an obvious decrease in MIC values after combination of these drugs and used against Pseudomonas aeruginosa . A (86%) of the isolates of Pseudomonas aeruginosa have ability to produce protease enzyme . Enzyme activity was affected by some antibiotics . This activity was reduced with increasing the concentrations of these antibiotics . The optimum conditions for protease production were in LB medium with a pH (8) after (48) hrs of incubation at (35) C .  Purification of the protease was done using ion exchange chromatography DEAE - cellulose and gel filtration with sephadex G - 100 .  Molecular weight of the purified protease was measured by sephadex G - 100 and it was found to be around (21379 ) Dalton . The optimum temperature of enzyme activity was (35) C . However , the pH (8) was for activity and stability of this enzyme .  Zn++ and Ca++ ions may play a role in the enhancement and stability of the enzyme . Enzyme activity was not inhibited in the presence of reducing agent such as Cysteine , but it was inhibited in the presence of EDTA .  Pseudomonas aeruginosa purified enzyme shows a high activity when combined with Vancomycin and cefazoline and used for the treatment of the eye infection in rabbits caused by Staphylococcus aureus .

دراسة تاثير بعض الاحماض الدهنية على فعالية انزيمات المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من حالات الحروق == Study the effect of some fatty acids on the enzymes activity of Staphylococcus aureus isolated from burns

Author name: رنا عبد الكريم رشيد
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 157 عينة مسحة من المرضى المصابين بالحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد للفترة من شهر تشرين الثاني 2006 ولغاية اذار 2007 . زرعت هذه المسحات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . • اظهرت النتائج ايجابية 144 مسحة لتلوثها بالبكتريا ، وبنسبة 91.7% ، فيما كانت 13 مسحة منها سالبة ، وبنسبة 8.3% .• عزلت 50 عزلة من بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus بنسبة عزل 31.8% ، وشخصت باستخدام الاختبارات المظهرية والكيميائية الحياتية الخاصة بها .• قاومت جميع العزلات (50 عزلة) مضاد الاوكساسلين ، فضلا عن قدرتها على النمو في وسط اكار الاوكساسلين (Oxacillin agar) ، وبذلك كانت مقاومة للمثسلين (Methicillin resistant Staphylococcus aureus) (MRSA) وبنسبة 100% .• تم التحري عن حساسية العزلات تجاه 21 مضادا حيويا ضمن مجاميع مختلفة ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عالية للعزلات البكتيرية لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسة ، في حين كان المضاد الجرثومي الفانكومايسين اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين ، اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له ، وكانت العزلتان R120 وR148 الاكثر مقاومة ، اذ قاومتا عشرين مضادا ، فيما كانتا حساستين للفانكومايسين فقط .• اوضح اختبار Minimum inhibitory concentration (MIC) للاحماض الدهنية ضد العزلتين R120 وR148 ان حامض اللاورك هو الاكفا في تثبيط نمو البكتريا ، اذ بلغت قيمة MIC 0.4 ملغم / مل ، في حين بلغت قيم MIC لكل من حامض المايرستك واللينوليك والبالمتك والاوليك ( 1.6، 1.6، 6.4، 25.6) ملغم/ مل على التوالي .• اختبرت قابلية العزلتين R120 وR148 على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط غراء كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز ، واعتمادا على ظهور هالة شفافة حول المستعمرات كانت نسبة التحلل للعزلتين المدروستين 2.5 ، 2.7 وعلى التوالي . ولذا فقد انتخبت العزلة R148 لاختبار تاثير الحامض الدهني في فعالية انزيم البروتييز فيها . • حضرت تراكيز متعددة من حامض اللاورك (0.0125 ، 0.025 ، 0.05 ، 0.1 ، 0.2 ، 0.4 ، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، واختبر تاثيرها على فعالية انزيم البروتييز ولوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ،اذ بلغت الفعالية معدل 2.36 وحدة / مللتر وبنسبة مئوية تبلغ 79.73% عند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض لتنخفض الى معدل 0.69 وحدة/ مللتر ، ونسبة 23.31% عند تركيز 1.6 ملغم / مل من الحامض .• اختبر تاثير التراكيز المختلفة من حامض اللاورك على وقت تكون الخثرة بوساطة انزيم مخثر البلازما (Coagulase) ، اذ تاخر تكون الخثرة الى الساعة الثانية من اجراء الاختبار عند التركيز 0.05 ملغم/ مل ، في حين كان التاثير الاكبر عند التراكيز ( 0.4، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، اذ تكونت الخثرة بعد مرور 18 ساعة من اجراء التجربة .• تم تقييم تاثير التراكيز المختلفة لحامض اللاورك على فعالية انزيم الهيمولايسين ، اذ لوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ، فعند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض وتخفيف 1/2 بلغت النسبة المئوية للفعالية 52.9% ، لتنخفض هذه النسبة عند تركيز 0.2 ملغم/مل من الحامض ، وتخفيف 1/2 الى 5.9%. | A total of 157 samples of burn swabs were collected from three hospitals in Baghdad during November 2006 to March 2007. Culturing of the samples was done on suitable media to isolate the bacteria.• The results showed that 144 swabs were positive for bacterial contamination (91.7%), while 13 swabs were negative ( 8.3%).• Fifty isolates of Staphylococcus aureus were isolated (31.8 %), the identification was accomplished using morphological and biochemical tests.• All isolates (50 isolates) were resistant to oxacillin and could grow on oxacillin agar , thus they were resistant to methicillin (Methicillin resistant Staphylococcus aureus ) (MRSA) at 100%.• The sensitivity of the isolates against (21) antibiotics was investigated using different groups of antibiotics , the results showed high resistance of isolates to many antibiotics which have been used in the study , while they were sensitive to vancomycin and the two selected isolates - R120, R148 were sensitive to vancomycin only and resistant to all 20 antibiotics .• The minimum inhibitory concentration (MIC) test for fatty acids to the two isolates R120, R148 showed that lauric acid was the best fatty acid in inhibiting bacterial growth when the MIC reached 0.4 mg/ ml while the other fatty acids (Myristic, Linoleic, Palmitic and Oleic ) MIC reached to (1.6, 1.6, 6.4, 25.6) mg/ml respectively .• The ability of the two isolates (R120, R148 ) to produce protease was detected on solid media ( Skim milk Columbia agar) and depending on the development of clear zone the lysis ratio was 2.5 , 2.7 respectively , therefore the R148 isolate was chosen to detect the fatty acid effect on its protease activity .• Multiple concentrations of lauric acid have been prepared (0.0125, 0.025 , 0.05 , 0.1 , 0.2 , 0.4 , 0.8 , 1.6 ) mg/ml and tested for its effect on protease activity . The obtained results showed that the activity decreased at the concentrations studied. The activity reached an average of 2.36 unit/ ml and a percentage of 79.73% at the concentration 0.0125 mg/ ml of the acid , and then reached an average of 0.69 unit/ ml and a percentage of 23.31% at the concentration 1.6 mg/ ml of the acid.• The effect of different concentrations of lauric acid on the time of clot formation by coagulase have been tested . The clot was formed at the 2nd hour of the test at the concentration 0.05 mg/ml while the highest effect was at the concentrations (0.4 ,0.8 ,1.6) mg/ml as the clot was formed after 18 hours from the beginning of the test .• The effect of the different concentrations of lauric acid on the activity of haemolysin was evaluated . A decrease in activity at the concentrations studied was noticed. The activity reached to 52.9% at the concentration 0.0125 mg /ml of acid and the dilution 1/2 then the activity decreased to 5.9% at the concentration 0.2 mg/ml and dilution 1/2

بعض الجوانب الحياتية ونوع الغذاء وتاثير الاشعة الفوق بنفسجية على ادوار عثة الرز الانجومواSitotroga cerealella Lepidoptera : Gelechiidae) ) == Some biological aspects and effect at food type and Ulitraviolet ray on the (Angoumois ) Sitotroga cerealella (Lepidoptera : Gelechiidae

Author name: رشا سطام حميد الخزرجي
Supervisor name: اياد احمد رضا الطويل | ليلى جبار محمد البهادلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Grain moth Sitotroga cerealella(Olivier) is considered as one of the world wide - spread pest that causing damage to the grain and its products either in the field or in the warehouses . . The sensitivity of Sitotroga cerealella egg is carried out to UV rays at genetic control Department l integrated pest management center / Agricultural Research Directorate / Ministry of Scinence and Technology. The study showed that semi cooked wheat media gave the highest rate of adults emergenc ( 82.00%) from hatched eggs . This media considered as the best medium for rearing the mentioned insect for successive generation .The effect of different tempreture degrees were also studied on the insect biology , the best degree to rear this pest was 30CO because recording the highest average of egg laying which was .5% . +80 of relative humidity 106.6 at The study also showed that the continuing usage of the UV rays has caused consumption of the tube .This explains the differences in the results compared with other researchers results for using the same wave length . . The study also showed that the eggs at age two days is more sensitive to the UV than the other age old of the insect . Besides this there was an effect of the UV rays on the egg hatch where exposure 7.5 min . The the at the time of % .3330the least was UV rays also effected the rate of the emergence of adult males & females ( 0.00% ) at the time of exposure 5 minAs for the UV rays effect on the male & female age lifespan , there was a little effect on the males and showed low decreases , While on the females , There was an increases in the lifespan with average (9.0 days) at exposure time of 2.5 min . While there was decreases in the female lifespan with average 4.5% at exposure time 3 min .The results also showed that the UV rays with wave length of 312 nm has more effect on the biological parametes of the grain moth from the wave length of 365 nm for this pest. The effect of the wave length 312 nm on the different mating ofthe adults emerged from irradiated eggs at 48 hr old were conducted .The results showed that 2 min exposure caused complet sterility to males while 1.5 min caused complet sterility to femaleAlso the study showed that sex ratio was divated for males upen the emergence of femal in same case of the adulte mating. Resulte from irradiated egg at 312 . The appereance of male after mating ( normal female * irradiated male ) ( irradiated female * normal male ) ( irradiated male & female) were ( 100.0 , 80.0 , 72.5 ) respectively at radiation time ( 1.5 mn ) from the other hand . There were clear decrease in femal population as compared with the abov ratio after tadiate the same time and wave length femal were ratio ( 27.5 , 20.0 , 00.0 % ) respectively .

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca والسذاب Ruta chalepensis على الفطريات المعزولة من فروة الراس Tinea capitis

Author name: زينب حكمت عبود الاسدي
Supervisor name: مناهل نجيب بحو | جاسم محمد كرحوت
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 71 نموذج (قشور وشعر) ماخوذ من منطقة الراس من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الكندي التعليمي الذين شخصوا كحالات اصابة سريرية بسعفة الراس في المدة ما بين تشرين الاول 2006 ولغاية ايلول . 2007 فحصت النماذج مختبريا بوساطة الفحص المجهري المباشر باستخدام هيدروكسيد البوتاسيوم (% 10) KOH وصبغة اللاكتوفينول الزرقاء وكذلك بوساطة الزرع على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ ظهر في الفحص المجهري المباشر والزرع نتائج ايجابية في 66 حالة (% 92.95) بينما تم تشخيص 55 عزلة فطرية . عند التعرف على انواع الفطر كان الفطر Trichophyton mentagrophytes هو الغالب (% 36. 61) ، يليه الفطر Trichophyton verrucosum (% 18.30) ، وجاء الفطر Trichophyton rubrum بالمرتبة الثالثة (% 14.08) ، ثم الفطر Trichophyton violaceum (% 5.63) ، والفطر Trichophyton soudanense (% 2.81) .سجلت اعلى نسبة اصابة لدى الذكور قياسا بالاناث اذ بلغ عدد الذكور 37 (% 52.2) بينما عدد الاناث (34) (% 47.8) ، اما بخصوص اعمار المصابين فتراوحت اعمارهم ما بين (14 - 2) سنة ، وتبين عدم وجود فروق معنوية بين نسبة الاصابة واعمار المصابين ، اذ كان المرض اكثر تكرارا لدى المصابين الذين تراوحت اعمارهم (10 - 6) سنة (% 52.1) بينما كان المرض اقل تكرارا لدى المصابين الذين كانت اعمارهم (15) سنة فما فوق (% 2.8). تبين ان الاصابة كانت اكثر انتشارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه الاصابة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة في شهر نيسان بنسبة (% 22.5) ، وادنى نسبة اصابة في شهري اب وايلول (% 1.4) ، اما عن علاقة الاصابة بمناطق سكن المصابين فتبين ان اعلى نسبة اصابة سجلت لدى المصابين من المناطق الريفية (% 81.7) مقارنة بسكان المناطق الحضرية (% 18.3). كان النوع الملتهب هو الغالب بنسبة (60.6%) على النوع المتقشر بنسبة (39.4%) بالنسبة للانواع السريرية لسعفة الراس ، وفيما يخص مصادر الاصابة بسعفة الراس فوجد ان تربية الحيوانات المنزلية او الحقلية هي الغالبة بنسبة (% 56.36) ، يليه وجود اصابات فطرية لدى افراد العائلة بنسبة (% 30.90) ثم استخدام ادوات الاخرين بنسبة (% 12.7). حضرت مستخلصات اوراق نباتي السذاب Ruta chalepensis واليوكالبتوس Eucalyptus camaldulensis باستخدام الماء والكحول الحار والبارد ، كما درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقار الكرزيوفولفين في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية المعزولة من اصابات سعفة الراس والاكثر تكرارا خلال هذه الدراسة والتي شملت الفطر Trichophyton mentagrophytes وTrichophyton verrucosum وTrichophyton rubrum. اظهرت النتائج ان التاثير التثبيطي للمستخلصات المدروسة اعتمد على نوع المستخلص وتركيزه ونوع الفطر المختبر ، اذ اظهر المستخص المائي البارد لاوراق السذاب والمستخلص المائي البارد لاوراق اليوكالبتوس اعلى فعالية تثبيطية لنمو الفطريات المدروسة، وان هذا التاثير يزداد بزيادة تركيز المستخلص ومن جهة اخرى اظــهر الفطـــــر Trichophyton verrucosum اعلى حساسية للمستخلصات المختبرة مقارنة ببقية الفطريات المدروسة.واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلص المائي البارد لاوراق نبات السذاب Ruta chalepensis والمستخلص المائي البارد لاوراق نبات اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In Vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر Trichophyton mentargophytes var mentagrophytes في الارانب. | Seventy one specimens (scale and hairs) have been taken from scalp region were collected from out patient visiting the Dermatology Unit of Baghdad Taching Hospital , and Al - Kindy Teaching Hospitals , which diagnoised as Tinea capitis infection during the period extended from November 2006 through September 2007. On direct microscopical examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty five fungal isolates. The most common fungi isolated were Trichophyton mentagrophytes (36.6 %) followed by Trichophyton verrucosum (18.3 %) Trichophyton rubrum (14.08 %) Trichophyton violaceum (5.63 %) Trichophyton soudanense (2.81 %). There was recorded among male (52.2%) than female (47.8%) , also there was no significant different recorded among patient with (6 - 10) years age groups followed by (14) years age group. Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (22.5 % ) while the lowest rate was in Augest and September (1.4%). High rate was recorded in rural region (81.7 %) in comparison with urban regions (18.3 %). The inflamed (kerion) type (60 - 6%) was most poplur than the scaly type (39.4%) concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (56.36%) followed by infection of the family members (30.9%) and using others instrumeuts (12.7%). Leaves extract of Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and griseofulvin were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca cold water extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Trichophyton verrucosum was the highest sensitive cpmpared to the other tested fungi. According to these results the cold water extracts of Ruta chalepensis and eucalyptus microtheca have been diagnosed to examine their effectiveness (Invivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes var. mentagrophytes infection in rabbets.

علاقة بعض المعايير الكيموحيوية في مصول مرضى الفشل الكلوي بعوامل الامراضية في عزلات لبكتريا Enterobacter وProvidencia == Study of some biomarkers in patients with kidney failure and it’s relation with virulence factors in Enterobacter and Providencia

Author name: رشا حاتم شايع العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 182 عينة من ادرار ودم المرضى المصابين بالفشل الكلوي والراقدين في ردهات الكلية الصناعية لمستشفى بعقوبة التعليمي ومستشفى مدينة الطب والبالغ عددهم 130 مريضا لمختلف الاعمار ومن كلا الجنسين للمدة من 5/11/2012 - 13/1/2013 . زرعت العينات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . اذ اظهرت النتائج ايجابية 74 عينة 40.7% للنمو البكتيري والذي تضمن 40 عينة دم 54.05% و34 عينة ادرار 45.95% . فيما كانت 108 عينة سالبة للنمو 59.3%.• تم تشخيص 17عزلة تعود لبكتريا (Enterobacter cloacae) وعزلتان تعودان لبكتريا (Providencia rettgeri) من المرضى المصابين بالفشل الكلوي، وبنسبة 9.34% و1.09%على التوالي ، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع للفشل الكلوي هو بكتريا Escherechia coli وبنسبة24.3%، اضافة الى بكتيريتي Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis بنفس النسبة 4.1%، ثم بكتريا Pseudomonas aeruginosa 1.4%7.• عند التحري عن عوامل الامراضية لبكتريا P.rettgeriو E.cloacaeوالمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت جميع العزلات والتي تعود لكلا الجنسين امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثالث فيما لم تملكا عامل الاستعمار الثاني. كما اظهرت عزلات E.cloacae وP.rettgeri قدرتهما على التلازن مع مجاميع الدم للانسان بنسب متفاوتة .• اظهرت عزلة واحدة فقط تعود لكلا من E.cloacae وP.rettgeri قابليتها على انتاج الانزيم المحلل للبروتين الخارج خلوي(extracellular protease) في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين كما اظهرت جميع العزلات من كلا الجنسين قابليتها على انتاج السايدروفورات وقدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة قدرة عزلتا بكتريا P.rettgeri على انتاج انزيم اليورييز في حين لم تظهر عزلات بكتريا E.cloacae قدرتها على انتاج انزيم اليورييز.• كذلك اظهرت 12عزلة من مجموع 17من عزلات بكتريا E.cloacae وعزلتا P.rettgeri قدرتها على انتاج البكتريوسين ، وتم قياس فعالية البكتريوسين وتحديد الفعالية النوعية له لكلا من نوعي البكتريا . وبلغت فعاليته وفعاليته النوعية لبكترياE.cloacae 22.8 وحدة / مل و0.542 وحدة / مكغم وعلى التوالي ولبكتريا P.rettgeri 23وحدة / مل و0.286 وحدة / مكغم ، وعلى التوالي . من ذلك لوحظ زيادة تركيز البروتين في البكتريوسين المنتج من قبل P.rettgeri 80.4 مكغم/مل مقارنة بتركيزة في E.cloacae 42مكغم /مل ومنه زيادة فعاليتة في P.rettgeri عن E.cloacae.• اظهرت النتائج قدرة 15عزلة من E.cloacae 88.2% وعزلتا P.rettgeri 100%على انتاج انزيم β - lactamase ، كما اظهرت جميع العزلات ولكلا نوعي البكتريا القدرة على تكوين الغشاء الحيوي (Biofilm) .• اظهرت جميع عزلات E.cloacaeمقاومة تامة لمضاد amoxicillin/ clavulanic acid 100%. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية ceftriaxone cefoxitine ،82.4 ceftazidime % ثم تليها مضادات cefotaxime ، trimethoprim 70.6% ثم تليها piperacillin،nalidixic acid ،aztreonam ، )azithromycin58.8,53,53,53)% على التوالي ، ثم يليها مضاد gentamycin 41.2 % ثم تليها باقل مقاومة مضاداتneomicin ،nitrofurantoin، ciprofloxacin (29.4, 29.4(23.5, % على التوالي .اما بكتريا P.rettgeri فقد اظهرت مقاومة تامة لكل من مضادات ceftriaxone ،cefoxitine ، ceftazidime ، amoxicillin /clavulanicacid ، gentamicin ،neomicin ، trimethoprim، Azithromycin بنسبة 100% ، في حين كانت المقاومة اقل لكل من مضادات nitrofurantoin، cefotaxime50%.• اظهرت النتائج ان الفئات العمرية الاكثر اصابة بالفشل الكلوي كانت ضمن الفئة العمرية (61 - 70) سنة . فيما تبين ان المرض يصيب الذكور والاناث ، مع ارتفاع نسبة اصابة الذكور 56.2% على الاناث 43.8% . كما اظهرت معايير مصول المرضى ارتفاع مستويات اليوريا والكرياتنين في مصل الدم ليبلغ معدل (11.6 - 50)ملي مول/لتر و(45 - 1000) مايكرومول/لتر وعلى التوالي .• تم الكشف عن وجود علاقة بين الانزيم المؤكسد لحامض اللاكتيك LDH)) ومرض الفشل الكلوي وكذلك علاقتة الانزيم بعوامل الامراضية لبكتريا E.cloacae وP.rettgeri،حيث وجد في هذه الدراسة ان انزيم LDH)) يكون مرتفع عن القيمة الطبيعية في حالة مرض الفشل الكلوي (قبل الديلزة الدموية) مقارنة بالاشخاص الطبيعين .حيث بلغ مستوى الانزيم عند وجود بكتريا E.cloacae 213.50 وحدة / لتر وبكتريا P.rettgeri 214.52وحدة / لتر . ومقارنة بالاشخاص الطبيعيين 153.63 وحدة /لتر | One hundred eighty two urine samples were isolated from patients who were resident of the industrial kidney unit of Baquba Teaching Hospital and Medical City Hospital suffering from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 5/11/2012 - 31/1/2013. The samples were cultured in a suitable culture media for isolation the bacteria. The results showed that 74 samples (40.7%) were positive for bacterial growth, It included 40 blood samples (54.05%) and 34 urine samples (45.95%).While the rest samples (i.e. 108) were negative for bacterial growth (59.3%). • The results also showed that 17 isolates have been diagnosed as E .cloacae and two have been diagnosed as P.rettgeri with a percentage of 9.34% and 1.09% respectively. Other genus were also isolated, The results showed that common cause is bacteria Escherechia coli with a percentage of 24.3% , Klebsiella pneumonia , Proteus spp. with a percentage of 4.1% and Pseudomonas aeruginosa 1.4%. • P.rettgeri and E.cloacae showed a possession of the first and third colonization factors with a percentage of 100% and both genera showed the ability to agglutinate human blood group with a variable proportions. • One isolate only of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce of extracellular protease while none of the isolates had the ability to produce hemolysin, and all of the isolates showed the ability to produce sydrophorat and capsule formation. • The results of this study showed that the genus P.rettgeri has the ability to produce the enzyme urease while the genus E.cloacae hasn’t had the ability to produce urease. • 12 out of 17 isolate of E.cloacae and the two isolate of P.rettgeri ability to produce bacteriocin. the activity of bacteriocin was measured and the qualitative activity was measured for both the two species,its activity and qualitative activity for E.cloacae were 22.8 unit/ml and 0.542 unit /µgm respectively and for P rettgeri 23 unit/ml and 0.286 unit /µgm respectively .From that we can notice that the increase in protein concentration produced by P.rettgeri 80.4 µgm/ml compared with the concentration in E. cloacae 42 µgm/ml and therefore increasing its efficiency in P.rettgeri compared with cloacae. • The results showed that 15 isolates of E.cloacae 88.2% and the two isolates of P.rettgeri 100% have the ability to produce the enzyme β - lactamase; all the isolates of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce biofilm. • All E.cloacae isolates revealed a resistance to the antibiotic amoxicillin/ clavulanic acid with a percentage of 100%, ceftriaxone cefoxitine and ceftazidime 82.4, cefotaxime and trimethoprim 70.6, and piperacillin, nalidixic acid aztreonam and azithromycin with a percentage of (58.8,53,53,53)% respectively Followed by the antibiotic gentamycin 41.2 Followed by the least resistance to neomicin, nitrofurantoin and ciprofloxacin (29.4,29.4 and 23.5)% respectively.The genus P.rettgeri showed resistance against the antibiotics ceftriaxone, cefoxitine, ceftazidime, amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, neomicin, trimethoprim and azithromycin 100% while this genus showed less resistance against nitrofurantoin and cefotaxime 50%. • The results showed that the most age group infected with kidney failure is between (61 - 70) years. The disease affects women and men alike with a higher proportion of males infection 56.2% over females 43.8%. Patients sera standards showed high levels of urea and creatinine levels in blood serum to rate (11.6 - 50)m mol/L,(45 - 1000)M mol/L respectively. • It was revealed the existence of a relationship between lactic acid oxidative enzyme and kidney failure disease also the relation between the enzyme and virulence factors of P.rettgeri and E.cloacae , It was found in this study that the enzyme (LDH) have higher values in the case of natural situation of kidney failure patient (before dialyziz) compared with normal peoples where the level of the enzyme in the presence of E.cloacae (213.5)unit/L and (214.52) unit/L compared with normal peoples (153.63). • A study of the impact and effectiveness of the enzyme lysozyme in the analysis of the cell wall of the bacteria E.cloacae and P.rettgeri was done, the results showed that the highest effectiveness of the bacterial enzyme reached (0.388 and0.329) unit/L at concentrations (100,200) mg/ml respectively. The enzyme inhibited the growth of both types of bacteria to reach the highest areas of growth inhibition of both E.cloacae and P.rettgeri (25,20) mm at concentrations of the enzyme (100, 200) mg/ml respectively. The statistical analysis showed significant differences at the level (p>0.05).

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

Author name: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
Supervisor name: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

Author name: زاكروس كمال احمد البرزنجي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو بعض البكتريا المعزولة من اخماج الحروق == The Effect of Watery & Alcoholic Plant Extracts of Citrullus colocynthis & Solanum nigrum On Growth of Some Bacteria Isolated from burn Infections

Author name: زيد شاكر ناجي محمود الربيعي
Supervisor name: ياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لثمار نباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli .تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل مستخلص ولكلا النباتين , اذ تبين نتائج الكشوفات الكيميائية لمستخلص الحنظل ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات . وان هذه المركبات لها القابلية على الذوبان في الماء , اما المستخلص الكحولي لثمار الحنظل فيحتوي ( بالاضافة الى ما ذكر ) على مركبات راتنجية وكومارينات وزيوت طيارة , وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية.و بالنسبة الى مستخلصات ثمار عنب الذيب فقد اظهرت نتائج الكشوفات الكيميائية ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , فينولات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات , واما المستخلص الكحولي فانه يحتوي على المركبات الفعالة نفسها الموجودة في المستخلص المائي بالاضافة الى الراتنجات .لدراسة تاثير المستخلصات النباتية لثمار نبات الحنظل وثمار نبات عنب الذيب في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق , تم تحضير نوعين من المستخلصات ولكلا النباتين وهما : المستخلصات المائية والمستخلصات الكحولية .بالنسبة الى مستخلصات نبات الحنظل كان المستخلص المائي اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 480 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الكحولي وللتركيز نفسه ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11 ) ملم وعلى التوالي.اما بالنسبة الى مستخلصات نبات عنب الذيب كان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي على الانواع البكتيرية بتركيز ( 480 ملغم/ مل ) وبمعدلات اقطار تثبيط ( 16.33 , 20.66 , 18 , 16.33 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , وبمعدلات تثبيط ( 16.33 , 20 , 15.33 , 15.33 ) ملم على التوالي عند التركيز نفسه .كانت البكتريا St. aureus ( الموجبة لصبغة كرام ) اكثر الانواع البكتيرية تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا Klebsilla spp. اكثر الانواع البكتيرية مقاومة لفعل المستخلصات النباتية .وبما ان المستخلص المائي هو اكفا من المستخلص الكحولي لنبات الحنظل, وان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , فقد تم المزج بين المستخلصين بنسبة 1 : 1 ودرس تاثير المزيج على البكتريا قيد الدراسة , وقد تبين ان خلط المستخلصين معا لم يعط اي تاثير ضد البكتريا . | This study was done to determine the effect of watery and alcoholic extracts of two plants : Fruits of Citrullus colocynthis and Berries of Solanum nigrum on growth of bacteria isolated from infected burns which are : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli .Evaluation of active ingredients found in each extract for both plants determined.The biochemical analysis revealed that watery extract of Citrullus colocynthis contains : Alkaloids, Glycosides, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones , while the alcoholic extract contains : (in addition to the above mentioned compounds ) Coumarines, Resins and Volatile oils.The biochemical analysis of the watery extract of Solanum nigrum showed that it contains : Alkaloids, Glycosides, Phenols, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones, while the alcoholic extract contains the same active materials in addition to Resins.The effect of watery extract of Citrullus colocynthis on the bacterial growth revealed that at a concentration of 480 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) mm for Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli respectively , when compared with alcoholic extract which were ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11) mm respectively.The study also showed that staphylococcus aureus ( gram positive ) bacteria is most sensitive to plant extract's than the gram negative bacteria , while Klebsilla spp. were most resistant to plant extracts than the others.Because water extracts of Citrullus colocynthis were more effective than the alcoholic extracts , while alcoholic extracts of Solanum nigrum were more effective than watery extracts.A mixture of both extracts was prepared in a proportion of 1 : 1 wt : wt and used to test it's effect on the studied bacteria. No effect have been detected therefore it's useless to use the above mentioned mixture in treatment.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية == Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

Author name: رؤى عبد السادة جبار
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

مسح لمسببات التلوث البكتيري في وحدة الكلية الصناعية وحساسيتها للمضادات الحيوية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Survey of Bacterial contamination in Dialysis Unit and antibiotics susceptibility in some hospitals in Baghdad

Author name: زياد طارق نعمان شهاب
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـم في هذه الدراسة جمع (204) عينة من مستشفيات مدينة بغداد ، وهي كـل مـن ( مستشفى بغداد التعليمــي/ وحدة الكلية الصناعية. ومستشـفى الكرامة التعليمـي / وحدة الكلية الصـناعية ) ، للفـترة مـن كانون الاول 2009 لغاية منتصف اذار 2010 .شملت العينات مسحات من بيئة وحدة الكلية الصناعية التي تضمنت 12 موقـعا وهي كـل من ( الاسرة والمفروشات والارضـية والجـدران والسـطح الخارجي لجـهاز الديـلـزة وجلد المرضى الراقـدين والادوات الطـبية ذات الاسـتخدام الــيدوي وملابـس الكادر الطـبـي وانابيـب دخول وخـروج الماء داخـل جـهاز الديـلزة وفتحات جـهاز الـتبريد والــتدفئـة وادوات الطـعام والاثاث الخشبي والمغاسـل فضلا عن عـينات من هـواء الصالـة وتم الحصول على النتائج الاتية : 1 - كان عدد المسحات والعينات الموجبة (95) عينة من ( 204 ) عينة وبنسبة (%46.56) واحتوت بعـض المسحات على اكثر من عزلة بكتيرية واحدة .2 - تم الحصول على (139) عزلة اجمالية من مجـموع العـينات الموجـبة كان مـنها (122) عزلة بكتيرية نقية مشخصة . شملت هذه العزلات كل من بكتريا Staphylococcus spp. وAcinetobacter spp. وPseudomonas spp. وKlebsiella spp. وCitrobacter freundii وEscherichia coli وEnterobacter spp. وAlcaligens spp. وStenotrophomonas maltophilia وBordettella spp. وOchrobacter anthropi وProteus spp. وShigella spp. وFlavomonas oryzihabitans وPasturella pneumotropica وChrysemonas lutula وBacillus spp. وNocardia spp. وEnterococcus spp. . فقد تم تشخيص هذه الـعزلات عن طريق الصـفات المظهرية والمزرعـية للمستعمرات وكـذلك عن طريـق الفحص المجهري للخلايا وباستخدام الفحوصات الكيموحياتية فضلا عن استخدام فحص API test لغرض التشخيص الدقيق للعزلات .3 - اظهرت العينات الماخوذة من هـواء الصالة والمغاسل نسبة عالية من الثلوث فقد كانت نسبة التلوث لكل منهما (%81.8) بعـدها جاءت الارضية والجـدران تلـيها الاسرة والمفروشات وبنسبة تلوث للعينات الماخوذة بلغت (%58) و(%53) على التوالي .4 - كانت بكتريا المكورات العنقودية الاكثر انتشارا في بيئة وحدة الكـلية الصناعية حيث تم الحصول على (47) عـزلة منها وبنسبة (%38.5) من اجمالي العزلات والتي كانت (122) عـزلة مشخصة . 5 - كانت بكتريا Acinetobacter spp. الاكثر انتشارا من بين العصيات السالبة لصـبغة كرام بعدد عزلات بلغ (15) عزلة من اصـل (65) عزلة سالبة لصبغة كرام وبنسـبة مئوية بلغت (%23.07) من مجموع العـزلات السالبة لصبغة كـرام ونسبة (%12.2) من مجموع العزلات الكلية، تليها كل من بكتريا Pseudomonas spp. وKlebsiella spp. وبنسب مئـوية بلغت (%10.6) و(%4.9) على التوالي من مجموع العزلات الكلية6 - تم التحري عن حساسية (70) عزلة بكتيرية مختلفة لاثني عشر مضادﴽ حيويا وهي كـل Amikacin وAmoxicillin / clavulanic acid وCiprofloxacin وCefotaxim وCefexime وChloramphenicol وGentamycin وPiperacillin وTrimethoprime وOfloxacin وVancomycin وNalidixic acid .7 - اظهرت بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية جدا تجاه المضاد الحيوي Cefexime فقد بلغت نسبة مقاومة هذا المضاد (%100) ، كما اظهرت العزلات مقاومة مرتفعة تجاه كل من المضادات الحيوية Cefotaxime وGentamycin وNalidixic acid حيث بلغت نسبة المقاومة لهذه المضادات (%60) . في حـين اظهـرت هذه العـزلات مقاومة منخفـضة تجاه كـل مـن المضادات Chloramphenicol وCiprofloxacin وOfloxacin وبنسبة مئوية بلغت (%10) لكل مضاد. 8 - اظهرت بكتريا Staphylococcus epidermidis مقاومة بنسبة (%100) للمضاد الحيوي Cefexime ، في حـين كانت نسـبة مقاومة البـكتريا للمـضاد الحـيوي Cefotaxime هـي (%58) كـما كانت نسـبة مقاومتها للمـضادات الحـيوية Nalidixic acid وTrimethoprime (%50) لكـل مـن هذه المـضادات. 9 - كانت بكتريا المكورات العنقودية جميعها حساسة بنسبة (%100) للمـضاد الحيوي Amikacin .10 - اظهرت بكتريا Pseudomonas spp. مقاومة عالية تجاه المضادين Cefotaxime وNalidixic acid وبنسبة مقاومة بلغت (%66) كما كانت نسـبة مقاومة كـل من المضادين Trimethoprim وVancomycin (%55.5) و(%44.4) على التوالـي في حين لم تظهر مقاومة للبكتريا تجاه المضاد الحيوي Amikacin وPiperacillin وOfloxacin وAmoxicillin/ Clavulanic acid .11 - كانت عزلات بكتريا Klebsiella spp. مقاومة بنسبة (%100) لكل من المضادات الحيوية Cefixime وTrimethoprim وVancomycin ، كما اظهرت البكتريا نسـبة مقاومة للمضادات الحـيوية Cefotaxime وPiperacillin وAmoxicillin/Clavulanic acid بلـغت (%66.6) ، يلـيها المضاد الحـيوي entamycin بنسبة مقاومة بلغت (%50) . وكانت بكتريا Klebsiella spp. البكتريا الوحيدة التي اظهرت نسبة مقاومة للمـضاد الحيوي Amikacin بلـغت (%16.6) .12 - تم اجراء فحص MICs لخمسة من المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وهي Amikacin وAmoxicillin / Clavulanic acid وCefotaxime وGentamycin وCiprofloxacin . على البكتريا الاكثر حساسية او الاكثر مقاومة واظهرت العزلات جميعها التي اجري لها الاختـبار نسبة MICs واطـئة تجاه المضاد الحيوي Amikacin حيث تراوحت بين (8 - 1) مايكروغرام/مليلتر حيث كانت العزلات حساسة بشكل كبير للمضاد الحيوي المذكور.13 - اظهرت العزلات قيم MICs مرتفعة للمضاد الحيوي Cefotaxime حيث تراوحت القيم ما بين (128 - 2) مايكروغـرام/ مليلتر بالنـسبة لبكـتريا S. aureus في حين تراوحت القيم مابين (512 - 8) مايكروغرام/مليلتر بالنسبة لباقي المكورات العنقودية السالبة لفحص Coagulase ، اما بالنسبة لعزلات كل من بكتريا Klebsiella spp. وAcinetobacter spp. فـقد كانت قـيم MICs لها للمضاد المذكور تتراوح مابين (512 - 2) مايكروكرام / مليلتر . في حين اظـهرت عزلات بكتريا Pseudomonas spp. قيمMICs منخفضة للمضاد نفسـه حيث تراوحت القيم بين (2.0 - 0.25) مايكروكرام / مليلتر . | In this study has collected (204) samples from the hospitals of Baghdad, these are (Baghdad teaching hospital/Dialysis unit & AL karama teaching hospital/ Dialysis unit), for the period of December 2009 to March 2010.The samples included swabs ofartificial kidney unit environment that has 12 positions these are (beds, furniture, ground, walls, external surface of dialysis, skin of asleep patients, medical instruments - use manual, clothes of medical stuff, tubes of enter and out water inside of dialysis, slots cooling and heating device, Eating utensils, wooden furniture &sinks as well as samples of hall air and it has obtained the following results : 1 - The number of swabs & positive samples was (95) sample from (204) sample in the rate of (46.56%) some of swabs contain more than one bacterial isolate.2 - It has obtained (139) total isolate from the positive samples amount (122) of that were bacterial pure diagnostic isolates all of these isolates included the following kinds of bacteria : Staphylococcus spp., Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Klebsiella spp., Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter spp., Alcaligens spp., Stenotrophomonas maltophilia, Bordettella spp., Ochrobacter anthropi, Proteus spp., Bacillus spp., Chrysemonas lutula, Pasturella pneumotropica, Nocardia spp. and Enterococcus spp. They have diagnosed these isolates by Phenotypic & farming characteristics of colonies & by Microscopic examination for cells by using bio - chemical tests as well as using API test for the purpose of accurate diagnosisfor isolates.3 - The samples taken from the hall air and sinks showed a high rate of pollution that were (81.8%) for every sample after that they were ground followed by beds, furniture, And by contamination of the samples taken at (58%) and (53%) respectively.4 - Staph bacteria were most prevalent in the environment of artificial kidney unit was obtained (47) isolate of them at (38.5%) of the total isolates, which was (122) diagnosed isolate.5 - Acinetobacter spp. were most prevalent among the negative bacilli of gram stain in the number of isolates was 15 out of 65 negative isolate of gram stain and a percentage amounted to 23.07% of the total isolate Followed by Pseudomonas spp. & Klebsiella spp. at (10.6%) & (4.9%) of the total isolates respectively.6 - It was investigated for sensitivity (70) bacterial isolates of twelve different antibiotics and are all of the : Amikacin, Amoxicillin /clavulanic acid, Ciprofloxacin, Cefotaxim, Cefexime, Chloramphenicol, Gentamycin, Piperacillin, Trimthoprime, Ofloxacin, Vancomycin and Nalidixic acid.7 - Staphylococcus aureus showed very high resistance to the antibiotic Cefaxime The ratio of this counter - resistance (100%), isolates also showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime, Gentamycin & nalidixic acid Where the percentage of resistance to these antibiotics (60%).While these isolates showed low resistance to both antibiotics Chloramphenicol, Ciprofloxacin & Ofloxacin at (10%) to both antibiotic.8 - Staphylococcus epidermidis showed resistance by (100%) to antibiotic Cefexime, while the ratio of bacteria resistance to antibiotic Cefotaxime is (58%) also it was the resistance ratio to the antibiotics Nalidixic acid & Trimethoprime (50%) to both of these antibiotics.9 - Staphylococcus bacteria were all sensitive (100%) for antibiotic Amikacin.10 - Pseudomonas spp. Showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime & Nalidixic acid by resistance reached (66%) it was also the resistance ratio of both antibiotics Trimethoprim & Vancomycin (55.5%) & (44.4%) respectively While did not show resistance to the bacteria to the antibiotic Amikacin, piperacillin, Ofloxacin & Amoxicillin/Clavulanic acid.11 - Bacteria isolates Klebsiella spp. Were resistant to every antibiotics Cefixime, Trimethoprim & Vancomycin by (100%), bacteria also showed resistant ratio for antibiotics Cefotaxime, Piperacillin & Amoxicillin/Clavulanic reached (66.6%), followed by antibiotic Gentamycin by resistant reached (50%). Klebsiella spp. Were the only bacteria that showed resistant ratio for antibiotic Amikacin reached (16.6%).12 - It has measured MICs test for five antibiotics that used in in the study these are : Amikacin & Clavulanic acid/ Cefotaxime, Amoxicillin, Gentamycin & Ciprofloxacin. on the bacteria most sensitive or most resistant and all isolates that tested showed low MICs ratio to antibiotic Amikacin where ranged between (1 - 8) microgram/milliliter where the isolates were sensitive to mentioned antibiotic geatly.13 - The isolates showed MICs values increased to antibiotic Cefotaxime where the values ranged between (2 - 128)microgram/milliliter to S. aureus while the values ranged between (8 - 512) microgram/milliliter to the remain negative Staphylococcus bacteria of Coagulase test, as for isolates of Klebsiella spp. & Acinetobacter spp. The values of their MICs for the mentioned antibiotic ranged between (2 - 512) microgram/milliliter. While the bacteria isolates Pseudomonas spp. MICs values were low for the same antibiotic where values ranged between (0.25 - 2.0)microgram/milliliter.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لاوراق نباتي العفص Thuja orientalis L. واذان الصخلة Plantago lanceolata L. على بعض البكتيريا المسببة لالتهابات جروح الجلد == Effect of alcoholic extracts for leaves of Thuja orientalis L. and Plantago lanceolata L. on bacteria causes wounds skin infection

Author name: زيد رعد عباس
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة تاثير المستخلصات النباتية لاذان الصخلة Plantago lanceolata L. والعفص . Thuja orientalis Lعلى العزلات البكتيرية المتضمنة S. aureus وPse. aeruginosa وcoli, K. spp. E. . شخصت العزلات مظهريا وزرعيا وحسب الاختبارات الكيموحيوية . ابدت معظم العزلات تحسسا لمضادات Imipenean ,Aztreonam , Gentamycin وبنسبة 100% ومقاومة لمضادي Cephalothin , Carbencillin بنسبة 100% . اظهرت الدراسة ان للمستخلص المائي البارد لنبات اذان الصخلة تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم / مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli وباقطار تثبيط 9.0 ,9.66 , 6.0 ملم وعلى التوالي , فيما ازداد تاثير المستخلص بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك بينت النتائج فروقا معنوية لتاثير المستخلص الكحولي وعند التراكيز120 , 480 ملغم/ مل ضد جميع العزلات البكتيرية . اظهرت النتائج ان للمستخلص المائي البارد لنبات العفص تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم/مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli, فيما ازداد تاثير المستخلص معنويا بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك وضحت النتائج فروقا معنوية مشابهة لتاثير المستخلص الكحولي على البكتيريا المعزولة وعند التراكيز 120 , 480 ملغم/ مل . يمكن ان يعود تاثير المستخلصات النباتية على البكتيريا المعزولة الى احتواء المستخلصات المدروسة على معظم المركبات الفعالة التي تم الكشف عنها . | The study included the effect of plant extract for Plantago lanceolata L. and Thuja orientalis L. on bacterial isolates which included : S.aureus , Ps. aeruginosa , K. spp. and E.coli. The isolated bacteria were identified a ccording to cultural , morphological and biochemical testes . The majority of isolates were sensitive to Aztreonam , Gentamycin and Imipenean 100% , but they were resistant to Cephalothin and Carbencillin 100% . The study revealed asignificant effect of Plantago lanceolata L. cold water extract at the concentration 120 mg/ ml against each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli with inhibition zone 9.0 , 9.99 , 6.0 mm respectively , whil the effect increased when the concentration increased to 480 mg / ml . Also the results showed a significant effect of alcoholic extract at the concentration 120 and 480 mg /ml aganist isolated bacteria . The result revealed a significant effect of Thuja orientalis L. cold water extract at the concentration 120 mg /ml aganist each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli , while the effect were increased significantly when the concentration increased to 480 mg /ml .Also the result showed a significant effect for alcoholic extract on the isolated bacteria at the concentration 120 , 480 mg /ml . The action of plant extract on bacterial isolates may be due to the presence of active compounds in the studies extract whic were explored .

تاثير السستانون وزيت السمسم على بعض الجوانب الفسلجية والنسجية المرضية في ذكور الجرذان == Effect of the sustanon and sesame oil on some physiological and histopathological aspects in male rats

Author name: رشا عبد الامير عبد اللطيف
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تقوم الدراسة الحالية الى معرفة تاثير حقن السستانون وهو من المركبات الستيرويدية البنائية وكذلك زيت السمسم على بعض الوظائف الفسيولوجية في كبد ، كلية ، خصى الجرذان والتي شملت قياس مستويات انزيمات الكبد ( SGOT , SGPT , ALP ) ، الكرياتنين , يوريا الدم والتستوستيرون والتغيرات النسجية الامراضية التي يحدثها السستانون وزيت السمسم في كل من الكبد ، الكلية ، الخصى وجلد الجرذان . تضمنت حيوانات التجربة 50 جرذا ذكرا من نوع Rattus norvegicus قسمت الى مجموعتين بالتساوي وتم تقسيم حيوانات كل مجموعة الى خمسة مجاميع فرعية ( Subgroups ) . ضمت مجاميع التجربة الاولى مجموعة السيطرة السالبة ( علفا وماء ) ، المجموعة الثانية سيطرة موجبة ( 1 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الثالثة سيطرة موجبة ( 2 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الرابعة سستانون ( 10 ملغم /كغم من وزن الجسم) ، المجموعة الخامسة سستانون ( 20 ملغم / كغم من وزن الجسم) .حقنت مجاميع حيوانات التجربة الاولى لمدة 6 اسابيع مرة واحدة اسبوعيا بالسستانون وزيت السمسم وتم سحب الدم منها ثم قتلت في نهاية الاسبوع السادس ، اما مجموعة حيوانات التجربة الثانية فقد عوملت لمدة 6 اسابيع ثم قتلت بعد اسبوعين من نهاية المعاملة بالسستانون وزيت السمسم اي في نهاية الاسبوع الثامن من التجربة . اظهرت نتائج حيوانات التجربة الاولى ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستويات انزيمات الكبد (SGOT , SGPT,ALP) في المجاميع المحقونة بالسستانون ( 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) .بينما اظهرت مجموعتي السيطرة الموجبة الثانية والثالثة ( زيت السمسم ) انخفاضا غير معنوي في مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT ) وانخفاضا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم ALP . ارتفعت مستويات الكرياتنين ويوريا الدم بصورة معنوية ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة بالسيطرة السالبة ، بينما انخفضت قيم هذه المعايير بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة (زيت السمسم ) .ارتفعت مستويات هرمون التستوستيرون معنويا ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة مقارنة مع السيطرة السالبة ومجموعتي السيطرة الموجبة بينما ارتفع مستوى التستوستيرون في مجموعتي السيطرة الموجبة بصورة غير معنوية. بينت نتائج حيوانات التجربة الثانية والمقتولة بعد اسبوعين من نهاية المعاملة ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم الكبد ( SGOT) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون ) مقارنة بالمجموعتين الثانية والثالثة . كذلك ارتفع مستوى انزيم ALP وSGPT معنويا ( P<0.05 ) في المجموعة الخامسة ( 20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة مع بقية المجاميع .انخفضت مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT,ALP) بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة والمحقونة بزيت السمسم .بينما لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الكرياتنين في كافة مجاميع حيوانات التجربة الثانية ، ازداد مستوى يوريا الدم معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 48.2±3.16 ملغم/ 100مل من الدم ) مقارنة بالمجموعة الثانية ( 42.4±0.93 ملغم/ 100مل من الدم) الا انه لم تلاحظ فروقات معنوية في بقية المجاميع . ارتفع مستوى التستوستيرون ( 5.14±0.35 نانوغرام / مل ) في المجموعة الرابعة (سستانون ) معنويا ( P<0.05) مقارنة ببقية المجاميع . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في مستوى الهرمون في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة بالمجموعة الثالثة (زيت السمسم) ( 1.65±0.48 نانوغرام / مل) .لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الهرمون في المجموعتين الثانية والثالثة مقارنة بالسيطرة السالبة . لوحظ استمرار ارتفاع مستويات انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT) معنويا ( P<0.05) في حيوانات التجربة الثانية المقتولة في نهاية الاسبوع الثامن مقارنة بتلك المقتولة بنهاية الاسبوع السادس في المجموعة المعاملة بهرمون السستانون . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في انزيم ALP في حيوانات التجربة الثانية مقارنة بحيوانات التجربة الاولى ، اظهرت المجموعة الثانية (زيت السمسم) ارتفاعا غير معنوي في مستوى الكرياتنين ، الا انه ارتفع معنويا ( P<0.05) في المجموعة الثالثة ( زيت السمسم) وانخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة وغير معنوي في المجموعة الرابعة وكذلك لم تظهر يوريا الدم فروقات معنوية بين المجموعتين . انخفض مستوى هرمون التستوستيرون بصورة غير معنوية في مجاميع السيطرة الموجبة ( الثانية والثالثة سمسم ) وارتفع بصورة غير معنوية في المجموعة الرابعة ، الا انه انخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة ببقية المجاميع. تميزت التغيرات النسجية المرضية في كلى ، اكباد ، خصى وجلود جرذان التجربة الاولى والثانية بما يلي : اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كلى الجرذان المعاملة بـ 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم سستانون والمقتولة في نهاية الاسبوع السادس ( تجربة اولى ) والمقتولة في نهاية الاسبوع الثامن ( تجربة ثانية ) . احتقان دموي في الكبيبات وبين النبيبات مع تنكس وتنخر الخلايا المبطنة الكلوية . اظهرت تلك المعاملة بزيت السمسم في حيوانات التجربتين الاولى والثانية الشكل الطبيعي والمتكون من الكبيبات والنبيبات الدانية والقاصية . بينت المقاطع النسجية في كبد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بالجرعتين 10 و20 ملغم / كغم سستانون تنخر وتنكس مع تلف الخلايا الكبدية ، احتقان دموي مع ارتشاح الخلايا الالتهاية قرب المنطقة البوابية . اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كبد الجرذان ( التجربة الاولى والثانية ) والمعاملة بالسمسم (1مل/كغم من وزن الجسم) شكل الكبد القريب الى الطبيعي المتكون من اشرطة الخلايا الكبدية والوريد الوسطي بينما بينت بعض الخلايا الكبدية في جرذان التجربة الاولى والمعاملة بالسمسم الانقسام الخيطي ( Mitosis) مما يشير الى وجود تحفيز للخلايا الكبدية على الانقسام بوساطة زيت السمسم . اظهرت خصى الجرذان المعاملة بـ10 ملغم/كغم سستانون ( التجربة الاولى ) وجود تنخر داخل النبيبات المنوية مع وجود اعداد قليلة من الحيامن وعدم وجودها في بعض تجاويف النبيبات مقارنة بالسيطرة السالبة مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن ( Spermatogonia) اظهرت جرعة 20 ملغم/كغم سستانون ( تجربة ثانية ) تثخن جدران النبيبات الخصوية مع استمرار التنكس فيها ( تنكس زجاجي ) مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن . تميزت المقاطع النسجية والمعاملة بزيت السمسم في مجموعتي جرذان التجربة الاولى والثانية بالشكل الطبيعي لنسيج الخصى وباحتواء اكثر تجاويف النبيبات المنوية على اعداد كثيرة من الحيامن . بينت المقاطع النسجية المرضية في جلد جرذان التجربة الاولى ( 10 و20 ملغم /كغم سستانون ) زيادة في الغدد الدهنية في الادمة مع عدم وجود بصيلات الشعر ممايدل على تساقط الشعر مع زيادة في الغدد الدهنية تحت الادمة ووجود بصيلات فارغة وتساقط الشعر في جرذان التجربة الثانية ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون مقارنة بالجلد الطبيعي ( السيطرة السالبة ) الذي تميز بوجود بصيلات الشعر والنسيج الضام . اظهرت المقاطع النسجية في جلد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (1مل/كغم من وزن الجسم ) بالشكل القريب الى الطبيعي مع احتوائه على بصيلات الشعر في منطقة الادمة باعداد لا باس بها . مع وجود اعداد كثيرة من بصيلات الشعر في منطقة الادمة في جرذان التجربة الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (2مل/كغم من وزن الجسم) .نستنتج من هذه الدراسة الى ان حقن السستانون بجرعتي (10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) في حيوانات التجربة الاولى قد ادى الى ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT ALP) في حين لوحظ في حيوانات التجربة الثانية ارتفاع انزيمي الـSGOT وSGPT وانخفاض في انزيمALP نتيجة جرح الكبد مع جرح الكلية والذي تميز بارتفاع الكرياتنين ويوريا مصل الدم .ارتفاع هرمون التستوستيرون بالجرعتين اعلاه في حيوانات التجربة الاولى في حين انخفض في حيوانات التجربة الثانية بجرعة 20 ملغم /كغم من وزن الجسم . تميزت الحيوانات المحقونة بزيت السمسم انخفاضا في مستوى هذه الانزيمات مع ارتفاع في مستوى التستوستيرون في كلا حيوانات التجربة . الامر الذي انعكس على انسجة الكبد والكلية والخصية والجلد الذي تميز بغياب بصيلات الشعر في الحيوانات المعاملة بالسستانون . | The present study was aimed to investigate the effect of sustanon (Anabolic Androgenic steroids )and sesame oil on some physiological functions of Liver , Kidney , Testes of rats , that included estimation of Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP (, creatinine , blood urea and testosterone levels.The histopathological study included changes caused by sustanon and sesame oil on Liver , Kidney ,testes and skin . The experimental animals included 50 males Rattus norvegicus rats divided equally into2 groups , 1st and 2nd experimental animal groups , that divided also into 5 subgroups (negative control )( ration and water ) , second group (positive control 1 ml/kg B.W Sesame oil) ; third group ( positive control 2 ml/kg B.W Sesame oil) . Fourth group ( 10 mg/kg B.W sustanon), Fifth group ( 20 mg/kg B.W sustanon) The 1stexp.groups were injected with sustanon , sesame oil weekly for six weeks and were Killed at the end of sixth week . The animals of 2ndexp.were injected the same as in first group but were Killed at eight week. Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP) in the 1stexp increased significantly (P<0.05) . The 2nd and third (sesame oil ) groups showed non significant decrease in SGOT and SGPT enzymes Levels but showed significant decrease (P<0.05) in ALP enzyme level . Creatinine and blood urea increased significantly ( P<0.05) in the 4th and 5th group in comparison with negative control group .The level of creatinine and Blood urea in second and third group decreased non significantly in comparison with negative control . Testosterone level increased significantly (p<0.05) in 4th and 5th group in comparison with negative control and two groups of positive control ,while increased non significantly in both two positive control groups ( sesame oil ). SGOT increased significantly (P<0.05) in the 4th and 5th groups of 2nd exp. animals in comparison two positive sesame control groups. The SGPT and ALP increased significantly (P<0.05) in the fifth group when compared with other groups. SGPT , SGOT and ALP decreased non significantly in the 2nd and 3rd sesame group . creatinine did not show any significant differences in all groups . at 2ndexp animals . Blood urea increased significantly (P<0.05) in 5th group ( 48.2±3.16 mg/100ml blood) in comparison with 2nd sesame group (42.4±0.93 mg/100ml blood) . The other groups showed no significancy.Testosterone level increased (5.14±0.35 ng/ml) significantly (P<0.05) in 4th group (sustanon ) in comparison with other groups . Fifth group showed significant (P<0.05) decrease in the level of Testosterone ( 0.51±0.09 ng/ml) in comparison with 3rd group ( 1.65±0.48 ng/ml) .The 2nd and 3rd groups ( sesame oil ) showed non significancy in testosterone in comparison with negative control . Rats of 2ndexp (The killed at the end of the eighth week) . showed an increase ( P<0.05) of SGOT and SGPT in comparison with Rats of 1st exp( The killed at the end of the sixth week) , while ALP showed significant decrease ( P>0.05). The 2nd group (sesame ) showed non significant increase in the level of creatinine but increased significantly (P<0.05) in the 3rd group (sesame oil ). creatinine decreased significantly (P<0.05) in the 5th group and non significantly in 4th group . Blood urea showed no significant differeneces between two exp.groups. Testosterone level decreased not significantly in 2nd and 3rd groups and increased not significantly in the 4th group.But it showed a significant decreased (P<0.05) in the 5th group (0.51±0.09 ng/ml) in comparison with other groups.Histopathological changes : The histopathological changes in the Kidneys , livers , testes and skins of Rats in experimental one and two were characterized by the following : - The renal sections in rats treated with (10 and 20 mg/kg B.W sustanon), 1st group which killed at the end of six week , and the 2nd group which killed at the end of eight week showed bloody congestion in the glomeruli and btween renal tubules ; with regenerative necrosis of endothelial cells. Sections in 2nd Exp. treated with sesame oil revealed the normal architecture of the kidney composed from glomeruli , proximal and distal tubules . Hepatic sections in two experiments ( 10 and 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed necrosis with regenerative changes and damaged of hepatocytes ; bloody congestion with inflammatory infiltration near the portal area. Liver sections in 1st and 2ndexp .treated with sesame oil (1ml/kg B.w) showed normal Liver shape composed of hepatocytes cords and central vein , the sections in sesame oil (2ml/kg B.W) showed hepatocytes mitosis that refered to the role of sesame oil in cellular (hepatocytes) division stimulation .Testes sections in rats treated with 10 and 20 mg/kg B.W sustanon (1stExp ) showed necrosis intra testicular tubules with presence of few number of sperms ; and absence of others in luminal seminiferous tubules in comparison with control ., with spermatogonial necrosis . The dose 10 mg/kg B.W sustanon (2ndexp , showed testicular tubular necrosis , and azosperma inside the lumen in comparison with control . The dose 20 mg /kg B.W sustanon revealed thickening of the testicular tubules with continuously hyaline degeneration with spermatogonial necrosis ; the testicular sections in 2ndexp , sesame oil showed normal testicular tissue and most testicular tubules contained sperms in high numbers.The skin sections in 1stexp ( 10 , 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed an increase in the sebaceous glands in dermis with abscent of hair follicles that refered to hair fallen with increasing sebaceous glands in hypodermis , presence of empty hair follicles and abscent of hair in 2ndexp . (10 and 20 mg/kg B.W sustanon) in comparison with normal control skin . In the 1st and 2ndexp . sesame oil (1ml/kg B.W) the skin sections revealed shape near normal and contained hair follicles in dermis that can't be neglected with high number of hair follicles in dermis of 1st and 2nd group treated with sesame oil (2ml/kg B.W) .We concluded from this study that the sustanon injection at two doses ( 10 and 20 mg/kg B.W) lead to an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT and ALP) in the 1st group and an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT ) and decrease in the ALP in the 2nd group due to liver injury with kidney injury that characterized by increase in the level of creatinine and serum blood urea . Testosterone was increase in the 1st group at two doses while decrease in the second group at dose 20 mg/kg B.W . The injected two groups with sesame oil showed decrease in the liver enzymes levels with testosterone increase in both experimental groups ,that reflected on the liver ; kidney; testes and skin that characterized by abscense of hair follicles in the animals treated with sustanon

دراسة بعض عوامل الضراوة للبكتيريا المعزولة من ردهات الاطفال الخدج ومقاومتها لمضادات الحياة والمطهرات == Study of Some Virulence Factors of Bacteria Isolated From Instrument Used in Neonatal Intensive Care Units and It is Resistance to Antibiotics and Disinfectants

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني | اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
Key words:
  • Staphylococcus aureus
  • Proteus mirabilis
  • Escherichia coli
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 800 مسحة مختلفة من بيئة ردهات الاطفال الخدج ومن مصادر مختلفة شملت اجهزة سحب السوائل (Suckers) وحاضنات الاطفال الخدج واجهزة انعاش الطفل والميزان وقناع الاوكسجين وادوات قص الحبل السري والارضية والجدران بالاضافة الى ايدي العاملين والكادر الطبي خلال الفترة بين ايلول 2004 الى مايس 2005 .• زرعت العينات (المسحات) مباشرة على وسطي الدم والمكونكي لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري . اخضعت العينات للاختبارات الكيموحيوية والفحص باستخدام انظمة api اذ تم استخدام api 20E للعصيات السالبة وapi staph للمكورات العنقودية وشخصت على هذا الاساس 88 عينة تعود للبكتيريا الموجبة لملون كرام شملت Staphylococcus aureus وبواقع 62 عزلة وStaphylococcus epidermidis وبواقع 26 عزلة وكذلك تم عزل 170 عزلة تعود للبكتيريا السالبة لملون كرام شملت 51 عزلة للنوع Escherichia coli و35 عزلة للنوع Proteus mirabilis و20 عزلة للنوع Pseudomonas aeruginosa و15 للنوع Klebsiella sPP. و8 عزلات للنوع Citrobacter sPP. و7 عزلات للنوع Serratia sPP. و10 عزلات للنوع Enterobacter sPP. و24 عزلة للنوع Acinetobacter sPP. .• اختبرت حساسية العزلات تجاه 15 نوعا من مضادات الحياة شائعة الاستعمال . وبينت النتائج ان معظم انواع البكتيريا المعزولة مقاومة للعديد من مضادات الحياة من مجموعة مضادات البيتالاكتام اذ كانت نسبة العزلات المقاومة للمضاد Augmentin 95.9% تلاه مضاد Carbencillin (93.4%) ثم Amoxicillin (78.2%) . فيما كان مضاد Amikacin وCefotaxime وNorfloxacin اكثر فعالية تجاه العزلات قيد الدراسة وبنسبة مقاومة 4% و15.9% و18.5% على التوالي .• حددت التراكيز المثبطة الدنيا لبعض المضادات المستخدمة في العلاج وشملت المضاد Gentamicin اذ تراوحت قيم MICs ما بين 8 - 1024 مايكروغرام/مل ، والمضاد Cefotaxime 8 - 1024 مايكروغرام/مل وCiprofloxacin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وChloramphenicol 16 - 1024 مايكروغرام/مل وCephazolin 8 - >1024 مايكروغرام/مل وAmikacin 8 - 128 مايكروغرام/مل وTrimethoprim 16 - 1024 مايكروغرام/مل وClavulanic acid+ Amoxicillin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وNorfloxacin 16 - 1024 مايكروغرام/مل وOfloxacin 4 - 512 مايكروغرام/مل وAmoxicillin 4 - >1024 مايكروغرام/مل .• درست بعض عوامل الضراوة للعزلات ومنها قابليتها على انتاج الانزيم الحال للبروتين Protenase اذ اظهرت 40 عزلة (40%) من مجموع عزلات الدراسة القدرة على انتاج هذا الانزيم تضمنت 16 عزلة تابعة لبكتيريا Staph.aureus و15 عزلة لبكتيريا E.coli و9 عزلات لبكتيريا P. mirabilis .• درست قابلية العزلات على انتاج انزيم الهيمولايسين فقد كانت منتجة وبنسبة 42% عند استخدام الدم البشري صنف A وبنسبة 37% عند استخدام الدم البشري صنف B وبنسبة 46% عند استخدام الدم البشري صنف AB وبنسبة 34% عند استخدام الدم البشري صنف O ، ومن هنا يظهر ان صنف الدم AB هو افضل الانواع لمعرفة نوع التحلل .• تم الكشف عن قابلية البكتيريا على انتاج انزيم اليوريز اذ كانت 64.2% من عزلات Staph.aureus منتجة لهذا الانزيم اما P.mirabilis فقد كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% .• اما بخصوص انتاج انزيم البيتالاكتاميز فقد اعطت كل من Staph.aureus وE.coli وP.mirabilis نسب انتاج 57.1% و52.6% 55% على التوالي .• تم تحديد التركيز المثبط الادنى لبعض المطهرات المستخدمة في المستشفيات وتبين ان المطهر Skinsept بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات اذ تراوحت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا مابين 4 - 128 مايكروغرام/مل ، بينما كان مطهر Minudus هو الاقل كفاءة اذ بلغت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا 512 - 4000 مايكروغرام/مل .• تم تحديد قيم التراكيز القاتلة للمطهرات المستخدمة في المستشفيات اذ تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Skinsept ما بين 2 - 256 مايكروغرام/مل وهو الافضل من باقي المطهرات . بينما تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Minudus مابين 1024 - 4500 مايكروغرام/مل .• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا . اذ كان زمن القتل لمطهر Skinsept 5 دقيقة ولمطهر Hibitane ما بين 5 - 10 دقيقة ومطهر Bleach ما بين5 - 20 دقيقة ولمطهر Sekeucid - N ما بين 25 - 30 دقيقة واخيرا مطهر Minudus ما بين 20 - 30 دقيقة . | • In this study , 800 different swabs were taken from neonatal intensive care unit and from many sources , including , suckers system , neonatal incubators , baby mobilization systems , balance , Oxygen mask , imbirical cutting tools , the floor and walls , in addition to the laborers hands and the medical staff , during the period of September 2004 to may 2005.• The swabs were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria. The colonies were tested biochemically by using API system , the API 20E was used for the Gram negative bacteria and API staph. used for staphylococci , though , 88 sample were identificated , these samples were belonged to the G + bacteria , including 62 isolates of Staphylococcus aureus and 26 isolates of Staphylococcus epidermidis were found. Also 170 isolates were belonged to Gram negative bacteria , including 51 isolates of Escherichia coli , 35 isolates of Proteus mirabilis , 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa , 15 isolates of Klebsiella spp. , 8 isolates of Cirtrobacter spp. , 7 isolates of Serratia spp. , 10 isolates of Enterobacter spp. and 24 isolates of Acinetobacter spp.• The susceptibility of the isolates toward 15 types of common antibiotics , was tested , the results showed that several types of isolated bacteria were resistant to many types of antibiotics that belonged to the Betalactam group . The percentage of resistance to Augmentin was 95.9% , Carbenicillin was 93% , then Amoxicillin was 78.2% while Amikacin, Cefotaxime and Norfloxacin were more active against the isolates , with percentage resistance 4% , 15.9% and 18.5% respectively .• The minimal inhibitory - concentrations of some antibiotics were determined. For Gentamicin , the MICs values ranged between 8 - 1024 mg/ml , Cefotaxime , 8 - 1024mg/ml , Ciprofloxacin 4 - 1024 mg/ml, Chloramphenicol 16 - 1024 mg/ml , Cephazolin 8 - 1024 mg/ml, Amikacin 8 - 128 mg/ml, Trimethoprim 16 - 1024 mg/ml, Amoxicillin + Clavulanic acid 4 - 1024 mg/ml , Norfloxacin 16 - 1024 mg/ml , Ofloxacin 4 - 512 mg/ml and Amoxicillin 4 - 1024 mg/ml .• Some of the virulence factors of the isolates were studied , such as the ability of protease production , 40 isolates (40%) were able to produce this enzyme, including 16 isolates of Staphylococcus aureus , 15 isolates of E.coli and 9 isolates of P.mirabilis .• The ability of the isolates for production of Haemolysin enzyme was studied too . 42% of isolates were producing Haemolysin by using Human blood group A, 37% with group B , 46% with group AB and 34% with group O , it appears that AB blood group is the best type to detect hamolysin activities . • The ability of bacteria to produce urease enzyme was detected, 64.2% of S.aureus isolates were producing this enzyme, while P.mirabilis isolates, were 100% producers.• The production of  - lactamase from each of S.aureus , E.coli and P.mirabilis was 57.1% , 52.6% and 55% respectively . • The minimum inhibiting - concentration of some antiseptics used in hospitals were determine. The results showed that the antiseptic Skinsept with its low concentrations was the most active comparing with the other antiseptics , though , the MICS values ranged between 4 - 128 mg/ml while the Minudus was the less active and its MICS values ranged between 512 - 4000 mg/ml .• The values of bactericidal concentration of antiseptics were also determined , the minimal bactericidal concentrations of Skinsept ranged between 2 - 256 mg/ml and it was the best one , while the minimal bactericidal concentrations of Minudus ranged between 1024 - 4000 mg/ml .• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal concentrations of antiseptic was determined , it was 5 minutes for Skinsept , 5 - 10 minutes for Hibitane , 5 - 20 minutes for Bleach , 25 - 30 minutes for Sekeucid - N and finally , 20 - 30 minutes for Minudus .

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

Author name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.

انتاج وتنقية اللكتين من بكتريا Acinetobacter baumannii المعزولة من القشع وتاثيره في بعض الاحياء المجهرية خارج الجسم الحي

Author name: رونق مهدي هاشم
Supervisor name: ساهرة نصيف مسلم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to isolate Acinetobacter baumannii , 104 samples of sputum were collected from patients infected with respiratory tract infections, from Teaching Baghdad Hospital / Medical City, General Teaching Al - Kindi hospital and Al - Imam Ali Hospital . Depending on microscopic , cultural and biochemical tests ,23 isolates belonge to it were obtained.The ability of A.baumannii isolates to produce lectin was detected by using glass slide and microtiteration plates methods and the results showed that all the isolates were able to produce lectin , A.baumannii S12 was the best isolate for produce it and the blood group O was the best for detection the titration of agglutination activity.The optimum conditions for lectin production were determined and the results showed that the cultivation of A.baumannii S12 in Colonization Factor Antigen medium with pH value of 7.2 at 37 ºC for 24 hours in shaker incubator at 100 rpm / min. were the best to produce it. The lectin was extracted from cilia of A.baumannii S12 isolate by using six different breaking methods at different times , the glass beads method for 50 minutes was the best to extract it, the agglutination activity reached to 512 AU / ml with specific activity 174.14 AU / mg protein in comparison with other breaking methods. Lectin was purified by three steps, included ; precipitation by 35% saturation ammonium sulfate , ion exchange chromatography by DEAE - cellulose, then gel filtration chromatography by Sephadex G - 150. The final lectin recovery was 36.92% with 20.63 folds of purification and 3592 U / mg protein of specific activity .The purified lectin was also partially characterized and the results showed that the optimal activity of the lectin was at 30 ºC and its thermostability was between (10 and 30) ºC ,the optimum pH for lectin activity was 7.2 while the pH value for its stability was between 7 and 7.2 . Lectin retained whole activity when treated with sucrose, raffinose, maltose, mannitol, fructose, lactose, arabinose, ribose and rhamminose, while it lost whole activity when treated with glucose , mannose and galactose. Also, lectin retained whole activity when treated with EDTA - NaN3 and trypsin , whereas its agglutination activity was reduced to the half when treated with pepsin , and to 12.5% and 0.39% when treated with 2 - mercaptoethanol and formalin, respectively. In addition, the effect of some substances on lectin stability was studied and the results showed that the mixture of 2% glycerol and physiological normal saline followed by 20% ammonium sulfate were the best for its stability for 20 and 10 days, respectively. while the solutions of the rest materials(Tween - 80, mannitol, sucrose, lactose and SDS) showed inhibitory effect on lectin activity.Also, the antimicrobial activity of purified lectin against 12 bacterial and fungal isolates was studied and the results showed that the lectin had antibacterial activity against Klebsiella pneumonia , Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis with (50 , 38.88 and 36.84 )% of inhibition, respectively, and antifungal activity against Penicillium spp. , Cladosporium spp. and Fusarium spp. with (33 , 18.75 and 17.39 )% of inhibition, respectively. whereas ,it had no antimicrobial activity against the bacteria; Escherichia coli , Enterobacter cloacae ,and Staphylococcus aureus ,and the fungi ; Aspergilus niger, Aspergilus terius , and Candida albicans.

تاثير عديد سكرايد بعض الضروب المصلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa على خلايا السائل البريتوني للفار الابيض == Effect of polysaccharide of some serotypes of Pseudomonas aeruginosa on peritoneal exudates cells of white mouse

Author name: رواء عبد الامير عبد الجبار
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اظهرت تاثيرات عديد سكرايد الزائفة الزنجارية Pseudomonas aeruginosa تاثيرا متباينا على الخلايا المناعية لجوف الفار السويسري. استخلص عديد السكرايد من ضروب مصلية مختلفة للزائفة الزنجارية وتم حقنه داخل الجوف البطني للفئران بجرع مختلفة وبفترات مختلفة. فقد كان تاثير الضرب المصلي O3 واضحا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة Large Lymphocytes اعتمادا على الجرعة والوقت ، وكان هذا الضرب متميزا في تحفيزه للخلايا الرغوية Foam cell ايضا ابتداءا من اليوم الثاني للتحفيز .كان الضرب O6 غير قادرا على تحفيز الخلايا الرغوية Foam cells ، الا انه تميز في حثه للخلايا البدينة Mast cells . اما الضرب O9 فقد كان محفزا جيدا للخلايا اللمفاوية الكبيرة ومتماثلا مع الضرب O6 في عدم تحفيزه للخلايا الرغوية ، في حين كان الضرب O11 قويا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة والخلايا الرغوية ومعتمدا على الجرعة والوقت ، اذ بلغ معدل اعداد اللمفاويات الكبيرة بجرعة 50 مايكروغرام/ مل ( 41.867 ±4.277) مقارنة بالسيطرة (11.867±0.611).تميز الضرب O16 في تحفيزه الكبير للخلايا البدينة فقد كانت اعدادها النسبية في اليوم الاول وبجرعة 20مايكروغرام/ مل وبجرعة 50 مايكروغرام /مل فقد بلغت (20.067±051.4) ، (320.53±70.75) على التوالي مقارنة بالسيطرة (001.4±60.34) ، وفي اليوم الثالث بلغت الاعداد نسبة عالية اذ بلغ تحفيز الجرعة 50 مايكروغرام/ مل من عديد سكرايد هذا الضرب (23.267±1.102) مقارنة بالسيطرة (71.66±0.643). استطاعت البكتريا المقتولة من تحفيز خلايا الجوف المناعية التي تباينت ضروبها المصلية في ذلك. نوقشت النتائج في ضوء المعلومات المتوفرة التي تتعلق بتاثير عديد سكرايد هذه البكتريا على الخلايا المناعية البطنية لجوف الفار واهمية عديد السكرايد هذا كمحددة بكتيرية مهمة في الاستجابة المناعية وامراضية هذه البكتريا.

تحضير وتوصيف الجسيمات الدهنية النانوية وربطها مع مستضد طفيلي Leishmania donovani == Preparation and characterization of nanoliposome and entrapment of Leishmania donovani antigens

Author name: روعة نجم عبد الله الخميسي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي عبد الرحمن الشيخلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعتبر استخدام الجزيئات النانوية التي تحمل المستضد صناعيا والقابلة للتحلل الحيوي كجزيئة مساعدة من المواضيع المهمة في تحضير اللقاح ومن الخطوات المهمة في السيطرة على تحرر المستضد لتحسين الاستجابة المناعية . تتكون الجسيمات الدهنية النانوية من مركبات طبيعية والتي تشجع بدورها الباحثين على استخدامها كمساعدات نانوية طبيعية . في هذه الدراسة , استخدمت الجسيمات الدهنية النانوية كمساعدات لقنص المستضدات الذائبة المستخلصة من طفيلي اللشمانيا الاحشائية كخطوة اولى باتجاه تحضير لقاح ضد اللشمانيا . تم تنشيط الطفيلي من خلال تنميت طور الطفيلي ) 104 promastigote / ml ) في الوسط الزرعي ( RPMI ) في درجة تحضين 23 م0 ولمدة اربعة ايام . اعتمدت اللقيحة بعمر 4 ايام وبنسبة 104 خلية في المليلترالواحد في تلقيح وسط (SNB9 ) لانتاج الكتلة الحيوية والتي تستخدم لاستخلاص المستضد . تم استخلاص المستضدات الذائبة من خلايا الطفيلي بعد اربعة تمريرات في نفس الوسط الزرعي ليتم بعدها قنصها في الجسيمات الدهنية النانوية والمحضرة انيا . حضرت الجسيمات الدهنية النانوية من ( mM Phosphatidylcholine 4 ) ) 2.2 mM Cholesterol ) و(mM Phosphatidylethanolamine 0.55) وبنسبة 1 : 2 : 7 ضمن جميع طرق التحضير المختلفة وتم دراسة توصيفها الفيزياوي والكيمياوي باستخدام (SEM ) و(AFM ) و( FTIR) و(Zeta Potential ) لتقدير حجم وشكل وشحنة الجسيمات وتحديد المجاميع الكيمياوية المتكونة .من النتائج لوحظ ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تحمل شحنة سالبة ولاتظهر تكتل بعد عملية التحضير ولا تزيد اقطار الجسيمات الناتجة عن 75 نانوميتر وتحمل مجاميع كيمياوية (PO2 ) و(CH2) و(CH3 ) . تم احتساب كفاءة قنص (EE) الجسيمات الدهنية النانوية للمستضدات الذائبة وكانت النسبة المئوية لكفاءة القنص هي 62% و50% و27.5 % للجسيمات المحضرة بطريقة الكلوروفورم والسيفادكس G25و السيفادكس G75 على التوالي . من جانب اخر , تم دراسة الثباتية للجسيمات الدهنية النانوية القانصة للمستضدات بدرجتي حرارة تخزين 4 و37 م0 واظهرت النتائج ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تمتلك درجة ثباتية كان مقدارها 32% في درجة حرارة 4 م0 و16% في درجة حرارة 37 م0 خلال فترة تخزين 12 يوم | The use of biodegradable nanoparticles as vaccine adjuvant with entrapped antigens represents an exciting approach for controlling the release of vaccine antigens and optimizing the desired immune response . Because of the natural components of nanoliposomes , we investigated the ability of prepared nanoliposomes , as a nanoadjuvant , to entrap soluble Leismania donovani antigens (SLAs) . The study was include preparation of SLA by parasite reactivation was carried out when inoculated into Rosewell park memorial institute media (RPMI) and incubated at 23 ̊ C for 4 days . Inoculum (104 promastigote / ml) of 4 days was used to inoculate modified medium of Saline - Neopeptone and Blood agar ( SNB) to produce promastigote mass . SLAs were extracted from the promastigotes ghost membrane after fourth passages of subculturing in SNB9 .The extracted SLAs then entrapped in nanoliposomes prepared freshly .Lipids mixture of 4mMPhosphatidylcholine, 2.2mM Cholesterol and 0.55mM Phosphatidylethanolamine in a ratio of 7 : 2 : 1 was depended in two nanoliposome preparation methods ; Chloroform injection and size exclusion chromatography . Physio - chemical characterizations of prepared nanoliposomes was performed by using Scanning Electron Microscope (SEM) , Atomic Force Microscope (AFM) ,Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Zeta Potential assays to determine the size , morphology , chemical active group and charge . Nanoliposomes prepared by chloroform injection method revealed non aggregate of negative nano vesicles with diameter of less than 75nm and PO2, CH2 and CH3 groups. The nanoliposomes entrapment efficiency (EE) to entrap SLAs was determined. The percentage of EE was 62, 50 and 27.5of SLAs entrapped nanoliposomes prepared by chloroform injection, Sephadex G25 and SephadexG75 , respectively .Moreover, stability of SLAs entrapped nanoliposomes was examined at 4 and 37 ̊ C storage temperature. SLAs entrapped nanoliposomes , prepared by chloroform injection method ,shown higher value of EE( 32 % ) at 4 ̊ C and(16%) at 37 ̊ C after 12 days of storage .

دراسة تاثير هرمون النمو على بعض المظاهر الفسيولوجية لقصار القامة في العراق

Author name: راوية محمود يوسف السلامي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء علي عبد الجبار
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يمثل نقص الافراز الداخلي لهرمون النمو السبب الاكثر شيوعا في احداث قصر القامة في الاطفال ومرتبطا" بالعديد من التبعات المرضية الفسلجية. ان المفاهيم الاساسية لاثر النقص الهرموني تتاتى من الدراسات السريرية, المناعية البايوكيمياوية, والوراثية والتي تشير الى اهمية دراسة العوامل المناعية والبايوكمياوية في تفسير هذا الاثر ,اضافة الى ان نقص هرمون النمو لا يرتبط بتبعات طبية جدية فحسب وانما يؤثر نفسيا واجتماعيا في مثل هؤلاء الاطفال وعوائلهم, مما يتطلب ايضا ايضاح الدور العلاجي في الحد من الاستجابات الفسلجية المفرطة التي تلعب دورا محوريا في تراجع نمو هؤلاء الاطفال. ولندرة الدراسات العراقية في هذا المجال وبهدف تطوير استراتجيات الادارة العلاجية الناجحة والذي يسهل من خلال فهم الجوانب المناعية والايضية لنقص هذا الهرمون.لقد كانت الواسمات الورمية (مستضد المسرطن الجنيني CEA, البروتين الحميلي نوع الفا AFP, مستضد الكاربوهيدرات CA - 125), هرمون الانسولين, فايبرنوجين البلازما, اضافة" الى نسبة الدهون والكالسيوم في المصل, الطول,الوزن المرشحة لمثل هذه الدراسة علاوة على ذالك اهتمت الدراسة ايضا" بتقييم الاستجابة التحفيزية لهرمون النمو بواسطة الكلوندين. اجريت هذه الدراسة المستقبلية في المستشفيات التعليمية/ حماية الاطفال - بغداد على 49 مريضا" عراقيا" مصابا" بقصر القامة (37 ذكر, 12 انثى), قورنوا مع 20فردا"من الاطفال الاصحاء كمجموعة ضابطة, للفترة من تشرين الاول 2007 ولغاية اب 2008. اجري فحص مقايسة الماز المناعي للانزيم المرتبط ELISA لتقييم الجوانب المناعية الفسلجية(هرمون النمو, الواسمات الورمية,هرمون الانسولين, الفحص الالي اليدوي للفايبرنوجين , الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير مستويات الدهون{الكوليسترول T - C ,ال_xFFFF_لسريد الثلاثي TG ,البروتينات الشحمية (عالية الكثافة (HDL , (واطئة الكثافة (LDL, (واطئة الكثافة جدا (VLDL (اضافة لنسبة HDL T - C/} والكلسيوم في المصل) وحساب الطول نسبة" للعمر معبرا عنه بالوحدة ,Z كذالك الوزن عبر عنه بحساب معدل كتلة وزن الجسم BMIZ لجميع افراد مجموعتي الدراسة.اظهر الروز الكمي لوسيط تركيز هرمون النمو(GH) مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل ان مستوى هذا الهرمون في الاطفال قصار القامة (1.4) في السيطرة (3.7), اما بعد التحفيز فقد كان في المرضى (5.1)و في السيطرة (10.9). وكانت هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين كل من مجموعتي المرضى ومجموعة الاصحاء سواء" قبل او بعد التحفيز. اظهر الكلوندين فعالية ممتازة في التفريق بين المرضى والاصحاء من جهة وفي التقييم الاولي لنقص هرمون النمو في الاطفال قصار القامة من جهة اخرى.ظهر الوسيط الحسابي لتركيز CEA مقدر" بال مايكرو غرام لكل مل من المصل ان مستواه لدى المرضى (1.4) اعلى مما عليه في الاصحاء (0.9) هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين ومن الممكن ان تعد مؤشرا مناعيا التهابيا متعلقا بجوانب مرضية لنقص الدور الايضي للهرمون . بعد فترة 9 اشهر من العلاج بدا هذا المستوى المرتفع يميل بعض الشيء نحو الانخفاض (1.38) وان كان على نحو ضئيل لكنه معنوي مقارنة بالمرضى انفسهم قبل العلاج, على الرغم من ذالك بقت الفر وقات معنويا عالية بين المجموعتين. فيما يخص المتوسط الحسابي لتركيز CA - 125 (مقدر" وحدة لكل لتر) اعلى قليلا" لدى المرضى (10.8) من السيطرة (9.2), وبدا هذا الارتفاع البسيط يميل للانخفاض بعد العلاج (9.7), بالرغم من ذالك الاختلافات لم تكن ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين. اما المتوسط الحسابي لتركيز AFP مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل لم يؤشر اي فرق معنوي بين المرضى سواء قبل العلاج (1.4) او بعد العلاج (1.3) بالمقارنة بافراد المجموعة الضابطة (1.3) .التاثير المعاكس للانسولين تحقق من خلال التقدير الكمي لتركيز الانسولين (مايكرو وحدة دولية لكل لتر) عند الصيام حيث اظهر المتوسط الحسابي للبيانات قبل العلاج عدم وجود فرو قات معنوية بين المرضى(8.1) والمجموعة الضابطة (8.3), اثناء المتابعة لفترة العلاج ارتفع مستوى تركيز الانسولين معنويا (17.4) مقارنة بافراد المجموعة الضابطة من جهة وبين الحالة قبل العلاج من جهة اخرى.اوضحت النتائج الاحصائية لوسط تركيز الفايبرنوجين مقدرا" بوحدة الملغرام لكل لتر من البلازما بواسطة الطريقة الالية اليدوية ارتفاعا" معنويا" لدى المرضى قبل العلاج (282.9) مقارنة" بالسيطرة (265.4), ظهر ان تركيزه ازداد اكثر بعد العلاج (361.1) وبدت الفر وقات معنوية" اكثر مما كانت عليه مقارنة بالسيطرة من ناحية وبالمرضى انفسهم قبل العلاج من ناحية" اخرى.جانب اخر مهم يوضح الدور الفسلجى الايضي لهرمون النمو باستخدام الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير تركيز مستوى الدهون والكالسيوم (بوحدة الملي مول لكل لتر من المصل) وكانت البيانات موضحة لاثر النقص الهرموني لدى هؤلاء المرضى. حيث ان الفرو قات كانت معنويا" عالية بين المجموعتين في مستوى دهون المصل كما اظهر المتوسط الحسابي لعينة المرضى {T - C=4.1 , TG=1.5 ,LDL=2.5 , VLDL=0.7 , الوسيط الحسابي TC/HDL=4.22 اما HDL فقد كان معنويا منخفض = 1 { مقارنة بالسيطرة {T - C=9.3 , TG=1 ,LDL=1.8 , VLDL=0.5 , اما HDL فقد كان = 1.6, المتوسط الحسابي TC/HDL=2.35 { طرا بعد العلاج الهرموني تحسنا" معنويا" عاليا" مقارنة بما كانت عليه الحالة قبل العلاج كالاتي {T - C=3.6, TG=1.2, LDL=1.6, VLDL=0.5, اما 1.5=HDL, والمتوسط الحسابي TC/HDL=2.31}.اظهر التحليل الاحصائي ان البيانات الاولية لوسيط مستوى كالسيوم المصل تشير لانخفاض طفيف لدى المرضى(2.2) قبل العلاج, مقارنة" مع السيطرة (2.3). في حين ظهرت الفرو قات ذات اهمية معنوية اثر العلاج الهرموني حيث انخفض متوسط تركيزه الى (2). العلاج الهرموني ساهم معنويا (P<0.001) في تحسين {HAZ= - 2.9 و{BMIZ=0.7 لدى قصار القامة, مقارنة بما كانوا عليه قبل العلاج {HAZ= - 3.7 و{BMIZ= - 1.1, لكن عموما لازالت الفرو قات ذات اهمية معنوية في تفريقهم عن مجموعة السيطرة {HAZ= 0.2 . {BMIZ=0.3 بينت تحليلات الحسابات الاحصائية ان قيم القطع المثلى من الممكن ان تكون ذات اهمية في تفريق المرضى قصار القامة بسبب نقص هرمون النمو عن الاصحاء, وفي ذات السياق من الممكن ايضا" ان تساعد في توقع النقص الهرموني لديهم, ان كانت قيم القطع المثلى للمتغيرات المختبرة كالاتي {تركيز GH بعد التحفيز بالكلوندين اقل من 10.6 , CEA اعلى او مساوي ل 0.95 , وان كان مستوى الدهون في المصل اعلى من 3.04 ل TC/HDL , 2.1 LDL , 1.2 TG , 0.4 VLDL واقل من 1.4 HDL , واقل من 0.72 BMIZ }.نستنتج من هذه الدراسة ان العديد من الاستجابات المرضية والاختلال الايضيي يبدو بوضوح متعلقا" بنقص هرمون النمو وان العلاج الهرموني يساهم في تحسين الوضع المناعي والفسلجي لهؤلاء الاطفال. بشكل عام استخدام هرمون النمو امن نسبيا", بالرغم من ذالك GH يمتلك اثار جانبية محتملة قوية , لذا مثل هؤلاء المرضى لابد ان يراقبوا عن كثب وبصورة" دورية اثناء العلاج.بعض المتغيرات المدروسة مثل CEA ومستوى الدهون والفايبرنوجين اضافة الى BMIZ يمكن ان تساهم في التقييم الاولي والى حد معين من الممكن ان تساهم في دعم تشخيص نقص هرمون النمو .علاوة" على ذالك من المهم الانتباه الى الناحية الغذائية ودعم نمو مثل هؤلاء الاطفال بالكالسيوم اثناء العلاج اضافة للعناصر المغذية الاخرى الضرورية لنموهم. | Growth hormone deficiency (GHD) is the commonest endocrine disorder presenting with short stature (SS) in children, it is associated with several pathophysiological consequences, which has not yet elucidated. The important clues have come from clinical, immunobiochemical and genetic studies of GHD which have suggested an importance for the immunobiochemical factors in the etiology of this pathological consequences, and showed that GH - replacement therapy (GHRT) is recommended for the determination of the exaggerated physiological responses that play a crucial role in children growth retardation, and because of GHD not only has very serious medical consequences but also has a major psychological and social impact on children and their families, in addition to that a little is known about GHD pathological features, therefore; the development of successful therapeutical management strategies to such children are facilitated by the understanding of the GHD pathological influences.Tumor markers antigens (Carcinoembryonic antigen CEA, Alpha fetoprotein AFP, Carbohydrate antigen 125 CA - 125), insulin hormone, plasma fibrinogen, are primary candidates for this study, in addition, lipid profile, serum calcium (Ca), height and weight expressed as Z score {height for age (HAZ), body mass index (BMIZ)}, the study was also concerned with the evaluation of GH stimulation by using clonidine. This prospective study was carried out in 49 Iraqi, children, SS patient groups (37 male, 12 female) they were regularly attending the Welfare Teaching Hospital / children protective/ Baghdad were studied. The diagnosis has been well - established, based on clinical, immune - biochemical, and genetic criteria. An ethnically matched, apparently healthy control group (n=20) aged 13.5±3.3 years (mean ±SD) was also involved through Oct. 2007 to Aug 2008. ELISA tests for GH, CEA, CA - 125, AFP, insulin, and manual automated test of plasma FI and enzymatic colorimetric assay for serum lipid profile and Ca were carried out on all studied groups.Concerning the GH quantitative assay for serum median concentration (ng/ml) of baseline and after clonidine stimuli test revealed significant (p<0.001) differences between the study groups, baseline value was significantly lowered(1.4) in SS GHD cases compared to controls (3.7), after stimulation GH value was also lowered among SS GHD cases (5.1), than in controls (10.9). Clonidine test showed an excellent discriminating ability, between the two groups, and in initial assessment of GHD in SS children.A serological tumor markers quantitative immune assays, for serum median CEA concentration (µg/L), revealed that; baseline value was significantly (p<0.006) higher among GHD cases (1.4) than in controls (0.9), this elevated value tends to slightly decreased after treatment, although, still significantly higher among GHD cases (1.38) compared to controls, this result may be indicatives of the inflammatorycondition associated with GHD. CA - 125 baseline mean value (U/L) was slightly higher among GHD patients (10.8) than controls (9.2), a slight insignificant reduction occurred after treatment (9.7) compared to baseline value.AFP serum mean value (ng/ml) revealed no significant differences at baseline among GHD cases (1.4) compared to controls (1.3), after GHRT there were also no significant differences in GHD cases (1.3) compared to controls and baseline values.The contra insulin effect of GH achieved by quantitative determination of fasting serum insulin, baseline data observed in mean concentration (µIU/L) showed no significant differences among GHD cases (8.1) in comparison with controls (8.3). After treatment duration(9months) fasting serum insulin was significantly(p<0.001) elevated among GHD cases (17.4) compared to controls and to its baseline values. Manual automated quantitative assay for plasma FI mean concentrations (mg/dl) revealed that; baseline FI was significantly (p<0.049) higher among GHD patients (282.9) than in controls (265.4), this elevated value was fatherly increased after treatment (361.1) (p<0.001) in GHD patients. Another important aspect of GHD pathophysiological consequences on metabolism observed by the enzyme colorimetric method, for serum lipid profile mean value (mmol/l) , the data shown to be relevant to GHD in SS children; baseline lipid profile was significantly (p<0.001) higher among GHD cases {(T - C=4.1), (TG=1.5), (LDL - C=2.5), (VLDL - C=0.7) and median value of (T - C/HDL - C=4.22), whereas mean value of serum (HDL - C was significantly lowered =1)} than in controls {(T - C=3.9), (TG=1), (LDL - C=1.8), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.35) and (HDL - C=1.6)}. A significant (p<0.001) improvement observed through out GHRT duration in GHD cases {(T - C=3.6), (TG=1.2), (LDL - C=1.6), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.31) and (HDL - C=1.5)} compared to baseline values.Ca is an essential mineral for bones building, and several other biological functions, baseline data concentration (mmol/l) expressed as median value reveled that; baseline serum Ca was a slightly lowered in GHD cases (2.2) than controls (2.3), this slightly lowered value was further and significantly (p<0.001) decreased among GHD cases (2) compared to controls and to its baseline values.GHRT significantly (p<0.001) improved HAZ and BMIZ in GHD cases respectively {( - 2.9), ( - 0.7)} than it was pretreatment {( - 3.7), ( - 1.1)}, which were significantly (p<0.001) lowered than normal controls values {(0.2), (0.3)}, although, this improvement GHD short stature cases are still significantly different than in controls. The ROC analysis was shown newly reported, interesting evaluating roles that may - be possibly have an important assistant as discriminating and predicting tool of GHD in SS children, for probably most study parameters considering GHD as an important etiology of SS at baseline, the typical cutoff values when used to classify subjects and separator SS cases with GHD the results of this study indicated that SS patients may possibly be predicted to have GHD if they have concentrations as followed, the typical cutoff values were(< 10.6 for GH after stimulation by clonidine), while were (≥ 0.95 for CEA), {(lipid profile optimal cut off value were (≥ 3.8 for T - C), (1.2 for TG), (2.1 for LDL - C), (0.4 for VLDL - C), (3.04 for T - C/HDL - C) and was for (HDL - C < 1.4)},and for BMIZ was< 0.72). In conclusion, several pathological responses and metabolic disorders seem to be associated with GHD, and GHRT aid in improving GHD children immuno physiological state, the evaluation of immune metabolic parameters proves to be a useful indicator of GHD in The use of GH generally safe, although GH has potential side effects, children receiving GH must be monitored closely during treatment. Importantly, CEA, serum Ca, and lipid profile prove to be useful tools for the evaluation of auxological parameters during GHRT, and to some extent may aid in prediction GHD in SS children and possibly support the diagnosis.Further attention should be paid to the nutritional status of such patients, and supporting their growth by calcium and other important minerals supplements.

تحديد قابلية بعض النباتات المحلية على مقاومة وازالة النفط الخام من التربة == Determination the Ability some of Local Plants on Resistance and Removal the Crude Oil from S

Author name: داوود سالم عيدان عبد النبي الطائي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: زرعت خمس بذور كلا من النباتات التالية : جت Medicago sativa، شعير Hordeum vulgatis، ذرة Zea mays، ماش Vigna radiata، خيار Cucumis sativa، برسيم Trifolium astivum ولوبيا Vigna sinensis وشوفان Avena sativa وريحان Osmium basilicum في البيت الزجاجي في اصص معامــلة بتـــراكيز (0 ،22.5 ،45 , 80) غم نفط خام/ كغم تربة جافة, وبعد 34 يوم من بدء الزراعة تم اجراء عدة اختبارات : حساب نسبة الانبات, اطوال النباتات , الحجم العلوي للنبات , سرعة الانبات ومؤشر تحفيز الانبات, حيث اظهرت النتائج مقاومة النبات لتراكيز النفط ضمن درجات متفاوتة وبالترتيب من الاكثر مقاومة ( اقل حساسية) الى الاقل مقاومة (الاكثر حساسية) : الجت، الشعير, ذرة, ماش, خيار,برسيم, لوبيا واظهرت ان الشوفان والريحان على الترتيب اكثر حساسية لتراكيز النفط المستعملة, كما تم قياس كمية CO2 المتحررة من جذور الشعير وجذور الريحان بعد اسبوع من بدء التجربة للجذور الماخوذة من اصص غير ملوثة ومن اصص تركيز النفط فيها 22.5 غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف بعد 34 يوم من بدء الزراعة لكل منهما, تبين ان كميةCO2 المتحررة خلال جميع الايام السبعة وللمعاملتين لنبات الشعير اعلى من كمية CO2 المتحررة لنبات الريحان. ولمعرفة قابلية النباتات المقاومة النامية سابقا في تحسين التربة تم زراعة 5 بذور من بذور النباتين الحساسين كلا على حدا بعد 34 يوم من بدء الزراعة في اصص مزروعة سابقا بنباتات المقاومة لتراكيز النفط المختلفة , اظهرت النتائج بعد اجراء اختبارات نسبة الانبات وحجم النبات على نباتي الشوفان والريحان اظهرت ازدياد في نسبة الانبات حيث كان الانبات الاولي للشوفان وللريحان على الترتيب في المرة الاولى( اصص غير مزروعة سابقا ) ضمن تركيزي (22.5،45 ) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف ( 29%, 19% ), (25 % , 17.1% ) على الترتيب, في حين في الزراعة الثانية ( اصص مزروعة سابقا ) كانت نسب الانبات لهما على الترتيب وضمن تركيزي (22.5، 45) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف (72 %, 70 %), (74 %, 69 %) وهذا التحسن كان في حجم الجزء الخضري لهما ايضا. | Phytodegredation of crude oil in artificially contaminated soil, I used 4 concentration of crude oil in the following plants : alfalfa, barely, clover, Basil in the different concentration, after 34 days of starting the plants we measured length of plant and promoter indicator and speed of germination we showed from these tolerant plant and sensitive plant, after that we measured CO2 liberated from root soil exactly from Barely and Basil after that we planted the soil that was previously planted in the farmer plant we showed from that improvement in the growth of plant and anther criteria that was refer to improve in the soil.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli == Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

Author name: داليا سـلمان عــبد ســبع
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

Author name: خولة جبر خلف المحمداوي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

دراسة اولية لتقدير فعالية مواد (نباتية ، كيمياوية ، مستضدية) في خمجية طفيلي الاكياس المائية في محاولة لاستخدامها علاجيا == Primitive study to determine material efficiency) plant , chemical , antigen ( in Echinococcus granulosus infection as an a tempt to curing application

Author name: خلود ناجي رشيد التكريتي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ندى محمد طه البشير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة علاج مرض الاكياس المائية Hydatidosis المتسبب عن الطور اليرقي للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus اذ تضمنت محورين : - الاول : علاج المـــرض كـــدواء وشمـــل جانبيـــن : .1 استخــدام مســـتخلصين نباتييـــن مائييــن ( اوراق الاس Myrtus communis وبــذور الحبـــة الســـوداء Nigella sativa ) ..2 استـــخــــدام مستحضـــر كيمياوي ( عقار S2 - Complex) . فقـد درس تاثير المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في حيوية الرؤيسات الاولية Protoscolices لطفيلي E. granulosus خارج الجسم in vitro وبواقع خمسة تراكيـز لكل منهم تراوحت ما بيـن (30 ، 35 ، 40 ، 45 ، 50) ملغم/مل للمستخلصيـن النباتييـــن و(2.3 ، 3.3 ، 4.3 ، 5.3 ، 6.3) ملغم/مل للعقار ، كما درسـت فعالية وقدرة المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في السيطرة على خمجية الطفيلي داخـل الجسـم in vivo وبواقـع تركيزين لكـل منهـم تراوحت ما بيـن } (12,6) ، (25,12) ، (0.36,0.18) { ملغم/مل من مستخلص اوراق الاس وبذور الحبة السوداء والعقار S - 2 على التوالي .الثاني : علاج المـــرض كلقاح : حيث تـم استخلاص مستضدين من الطور اليرقي للطفيلي موضوع البحث ، هما مستضد سائـل الكيـس المائـي Hydatid cyst fluid antigen ومستضـد طبقات جدار الكيـس المائـي Hydatid cyst wall layers antigen فـي محاولـة لتمنيــع الفئــران المختبرية ضد الخمج بالاكياس المائية . وتم تقييم حدة الخمج بدلالة بعض المقاييس الحياتية مثـل : معـدل عـدد وقطـر الاكياس المائيـة الثانويـة والنسبـة المئويـة لاختزالها وقياس مؤشـر تضخـم الطحال والكبـد وقياس معـدل الفعاليـة الانزيميـة لانزيمي (ADA) Adenosine deaminase و(ALP) Alkaline phosphatase كمؤشرين كيميائيين حياتيين لحالة الخمج ولفترات زمنية معينة وكذلك الفحص النسيجي للكبد والطحال والكليـة والرئـة . وقـــد اظهـرت نتائج الدراسة خارج الجسـم in vitro ان المستخلص المائـي لاوراق الاس كان الاكثر فعالية في ايقاف حيوية الرؤيسات الاولية يليه المستخلص المائي لبـذور الحبـة السـوداء ثـم العقار S - 2 عنـد استخـدام التراكيـز المختلفـة لكـل منهــم مقارنــة بحالـة السيطـرة ، فــي حيـن اظهـرت نتائج الدراسة داخل الجسم in vivo قـدرة العقار S2 - Complex فـي الحـد مـن انتشار الاكياس المائية الثانوية من خلال تثبيط اعدادها واحجامها في الكبد والاحشاء الداخليـة ، يليـه المستخلص المائي لاوراق الاس ثم المستخلص المائـي لبـذور الحبـة السـوداء من حيث القدرة التثبيطية للخمج مقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة . اما نتائج استخدام المستضدين المستخلصين مــن الطـور اليرقـي فقـد اظهرت كفاءة مستضد سائل الكيس المائي HF في رفع القوة التمنيعية من خلال قدرة الفئران على توجيه مقاومة فعالة ضد الخمج فكانت النسبة المئوية لاختزال عدد الاكياس المائية (100)% اي انه اعطى مناعة تامـة ضد الخمج ، في حين ان مستضد طبقات جدار الكيس المائي HCL اعطى نسبة اختزال (94.37)% ، وقد جرى استخدام معدلين مناعيين لاغراض السيطرة : هما لقاح الســل البقــري (BCG) Bacilli Calmette Guerin ومادة النشا Starch ، فقـد اظهر لقاح BCG نسبة اختزال لاعداد الاكياس المائية الثانوية بلغت (53.83)% في حين اظهـرت مادة النشا نسبــة اختـزال بلغت (21.29)% قياسا لمجموعة السيطرة الموجبة . وبشكل عام فالنتائــج المستحصلــة تشيــر الــى القــدرة العالية للعقار S2 - Complex فـي تثبيـط تطـور الاكياس المائيـة الثانويـة ، كما تظهـر الفعالية الكبيـرة لمستضـد سائـل الكيـس المائي وكفاءته العالية في تحفيز مناعة تامـة ضد الخمج ، مما يوحي بامكانية استخدامها مستقبلا في الوقاية ضد مرض الاكياس المائية اذا ما تبعت هذه الدراسة بدراسات تطبيقيـة اخرى فـي مضائـف اخـرى . | This study aimed treat the Hydatidosis disease caused by larval stage of the Echinococcus granulosus. It included two axes : First : treatment of the disease using medicine which involved two aspects : A) Using water extracts of two plants (leaves of Myrtus communis,seeds of Nigella sativa).B) Using chemical substance (S2 - Complex drug) .The effect of those two extracts and the drug had been studied on the protoscolices viability for E. granulosus in vitro using five concentrations for each of them ranging between (30,35,40,45,50) mg/ml for the two plants extracts and (2.3,3.3,4.3,5.3,6.3) mg/ml for the substance . The effectiveness and ability of the two extracts and substance were studied in order to control the infection in vivo using two concentrations for each ranging between[(12,6),(25,12),(0.36,0.18)] mg/ml for the leave extracts of M. communis , seed extracts of N. sativa and the drug S - 2 receptively .Second : treatment of the disease using vaccine : Two antigens were extracted from the larval stage of the parasite under study. Those are hydatid cyst fluid antigen (antigen HF)and hydatid cyst wall layers antigen (antigen HCL) this was in an attempt to immunize laboratory mice against infection with Hydatidosis This study evaluated the infection intensity by using some biological standards as : The average number and diameter of hydatid cysts and its reduction percentage ratio ; measuring the indicator of liver and spleen hypertrophy ; measuring the average of the enzyme activity for Adenosine Deaminase (ADA) and Alkaline Phosphatase (ALP) as biochemical indicators for the infection state , during a period of time, in addition to tissue investigated for liver, spleen, kidney and lung .The conclusion of this study represented that the extract of M. communis was the most effective to stop the protoscolices viability ; followed by the extract of the N. sativa and finally the drug S - 2 when different concentrations were used for each of them compared with the control state. Whereas the results in vivo presented the ability of S2 - Complex drug to limit the distribution of hydatid cysts by inhibition their numbers and volumes in the liver and the visceral organs followed by water extracts of M.communis and water extracts of N. sativa according to the inhibition ability for infection compared to the positive control group. However the results of uses antigen extracted from the larval stage showed efficiency of antigen HF to increase immunization strength through mice capability having an active resistant against infection . The percentage of reducing the number of hydatid cysts was (100)% . It means that this antigen give absolute immunization against infection . However the antigen HCL gave a reduction ration (94.37)% . Then we used two immunomodulators as a control, They are BCG vaccine and Starch, The BCG vaccine present a reduction ratio for the hydatid cysts numbers reached (53.83)% while Starch represent a reduction ratio reached (21.29)% compared with the positive control group .Generally the results indicated to the S2 - Complex high capacity in frustrating the development of the hydatid cysts. Also it showed the large activity of antigen HF and its high capability for catalysis absolute immunity against infection. This can be used in prevention against the Hydatidosis disease if this study followed by another application studies in other fields .

دراسة بكتيرية ومصلية لمسببات ذات الرئة المكتسب من المجتمع لدى المصابين بالانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological and serological study for causes of community acquired pneumonia in COPD patients

Author name: خديجة شعبان المزوري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة (100) مريض من المصابين بالانسداد الرئوي المزمن والذين يعانون من التهاب ذات الرئة والمشخصين سريريا وشعاعيا في مستشفى بغداد التعليمي من قبل اطباء اختصاص بالاعتماد على العلامات والاعراض السريرية, الفحص الشعاعي وفحص وظائف الرئة. خلال المدة الزمنية 15/9/2001 - 15/4/2002.تم جمع (83) عينة قشع من هؤلاء المرضى, ثم تم قبول (76) عينة لانها كانت ضمن المواصفات المطلوبة والمتضمنة عدد الخلايا القيحية وعدد الخلايا الظهارية, ورفضت (7) عينات لانها لم تكن ضمن المواصفات المطلوبة.تم جمع عينات المصل من جميع المرضى لغرض الكشف عن الاستجابة النوعية للاجسام المضادة نوع IgM, كما شملت الدراسة (50) عينة دم سحبت من اشخاص اصحاء لا يعانون من اصابات تنفسية.تم زرع عينات القشع على اوساط زرعية مختلفة لغرض عزل وتشخيص البكتريا, في حين استخدم نظام API للتشخيص النهائي للبكتريا المعزولة وقد اظهرت نتائج التشخيص ان بكتريا Moraxella catarrhalis كانت باعلى بنسبة اذ بلغت (%13.8), ثم تلتها بكتريا Klebsiella pneumoniae (%12.1) وبكتريا Pseudomonas aeroginosae (%10.3). في حين بلغت نسبة الاصابة ببكتريا Streptococcus pneumoniae (%6.9) وبكتريا (%5.2) Haemophilus influenzae وعند اجراء التشخيص المصلي باستخدام الالايزا (ELISA), اظهرت النتائج ان بكتريا Chlamydia pneumoniae شخصت بنسبة (%31) ثم تلتها بكتريا Mycoplasma pneumoniae التي بلغت نسبتها (%17.2).وفي محاولة للتفريق بين ذات الرئة النمطي وغير النمطي تم استخدام بعض المقاييس مثل ( معدل ترسيب كريات الدم الحمر, العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, بروتين التفاعل, قياس الاستجابة المناعية الموضعية).اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود تاثير معنوي فقط عند استخدام العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, وقياس الاستجابة المناعية الموضعية. ولدراسة عوامل الخطورة الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل العمر, الجنس, وبعض الظروف الملازمة للاصابة. دلت النتائج على وجود زيادة في نسبة اصابة الذكور عما هي عليه في الاناث, اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 2.وكان للعمر تاثير مختلف على المسببات البكتيرية, فقد ارتفعت نسبة الاصابة ببكتريا C. pneumoniae وبكتريا M. catarrhalis مع الزيادة بالعمر, في حين انخفضت نسبة الاصابة ببكتريا M. pneumoniae مع تقدم المريض بالعمر.كما دلت النتائج الى وجود علاقة ذات اثر معنوي بين الاصابة ببعض المسببات البكتيرية وبعض الظروف الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل (التدخين, داء السكر, اصابات رئوية سالبة, القصور الكلوي المزمن). | This study enrolled (100) patient with clinical and radiological evidence of Pneumonia through the period extending from 15/9/2001 - 15/4/2002, who were admitted to Baghdad Teaching hospital, with chronic obstructive pulmonary disease diagnosed by a physician based on clinical, radiological and pulmonary function test.Sputum sample were collected from (83) patient, (76) were processed after fitting criteria for selection which included number of pus cells, number of epithelial cell and Gram stain for primary bacterial identification. Seven samples were rejected for not fitting criteria of selection.Serum sample for detection specific antibody response, were taken for the whole patients.More over 50 serum sample were taken as a control for immunological tests.Proper sputum samples were cultured for the isolation of bacteria, API system was used for the identification of bacteria.From the bacteria isolated M. catarrhalis was the most commonly diagnosed bacteria which is found to be (13.8%) of the total bacteria. Followed by Gram negative bacilli K. pneumoniae being (12.1%) and P. aeroginosae (10.3%) Streptococcus pneumoniae (6.9%), H. influenzae (5.2%).As for immunological diagnosis, C. pneumoniae was diagnosed for (31%) of the cases, followed by M. pneumoniae (17.2%). In an attempt to evaluate parameters that might be useful to differentiate Typical from Atypical pneumonia, ESR, CRP, total WBC count and IgA local immune response were evaluated.Significant difference was detected only in total WBC count and IgA local immune response.Finally to detect possible effect of comorbid condition on bacteria previous age, sex, and other comorbid illness were studied. Males were affected more than female, age show variable effect on different bacterial infection.Smoking, diabetes mellitus, old pulmonary diseases, chronic renal disease, were among the most common and significant factor that affect community acquired pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease

مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus المعزولة من اخماج الحروق والجروح للمضادات الحيوية وبعض المطهرات == Resistance of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus isolated from Burns & Wounds infections to Antibiotics and some Disinfecta

Author name: ختام علي عبيد الخزعلي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 235 مسحة من مرضى مصابين باخماج الجروح والحروق في مستشفيات مختلفة في بغداد للفترة من تشرين الثاني لسنة 2007 ولغاية شهر ايار لسنة 2008 .• شخصت المستعمرات النامية بالاعتماد على عدد من الاختبارات الكيموحيوية, اذ امكن تشخيص 100 عزلة سريرية ( 67 عزلة حروق و33 عزلة جروح ) من المجموع الكلي للعزلات ، توزعت بواقع 64 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ( 50 عزلة حروق 14 عزلة جروح ) و36 عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus ( 17 عزلة حروق و19 عزلة جروح ) واكد التشخيص باستخدام نظام API 20 NE وAPI Staph .• شملت الدراسة فحص الحساسية باستخدام الاقراص تجاه 18مضاداحيويا لكل منهما.• اظهرت عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa مقاومة عالية لمضادات Azetreoname وPipracillin وCarbencillin وCefepime وCefixime وCephalexin وCeftriaxone وCefotixime وCeftazidime وTrimethoprime وCo - trimoxazole اذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة لمضادات Gentamicin وTobramycin وCiprofloxacin وNorfloxacin وImipenem بلغت نسبها (89 ، 79.68 ، 60.9، 81.25، 42.1) % على التوالي ، في حين اظهرت عزلتين فقط من البكتريا المعزولة من اخماج الحروق مقاومة لمضاد Colistin ، وبنسبة 3.2% .• اظهرت عزلات بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية لمضادي Methicillin وAmpicillinاذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة للمضادات Ceftriaxone وAugmentin وErythromycin وGentamicin وTobramycin وTetracyclin وTrimethoprim وCo - trimoxazole بنسبة (72.2 ، 86.1 ، 52.77 ، 41.66 ، 36.1 ، 50 ، 33.3 ، 30.5) % على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة اقل تجاه المضادات (Imipenem ، Rifampicin ،Ciprofloxacin ،Cefotaxime) بنسبة (22.2، 27.7، 13.88، 16.66) % على التوالي . اظهرت العزلات مقاومة متكافئة لمضادات Norfloxacin وOfloxacin وEnoxacin بنسبة % 19.4 . جميع العزلات كانت حساسة لمضاد Vancomycin. • حددت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs) لبعض المضادات المستخدمة في الدراسة وشملت ، مضاد Imipenem اذ تراوحت قيم MICs ما بين (512 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Ciprofloxacin (128 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Norfloxacin (1024 - 8) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Cefotaxime (4 - 1024< ) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Gentamicin (4 - 1024<) ميكروغرام/مليلتر.• اجري اختبار الفعالية المضادة للبكتريا لخمسة من السيفالوسبورينات بعد اجراء تفاعل اعادة الترتيب من خلال تصعيدها في المحاليل المائية الحامضية القوية . انتج تفاعل اعادة الترتيب هيكل حلقة من 5,2 داي اوكسو ببرازين وهي ذات فاعلية واطئة كمضادات بكتيرية وعلى الرغم من ذلك فان هذه النواتج هي مرشحات قوية كادوية مضادة للسرطان.• تبين ان 90% من العزلات كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز.• حددت التراكيز المثبطة الدنيا Minimal Inhibitory Concentrations (MICs) لثلاثة من المطهرات الكيميائية الشائعة الاستخدام في المستشفيات لعشر عزلات بكتيرية لكل من النوعين والتي شملت مطهر الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(256 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (512 - 64) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (512 - 4) مايكروغرام/مليلتر. اذ تبين ان مطهر الهبتين بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات، في حين مطهر بيروكسيد الهيدروجين هو الاقل كفاءة.• حددت التراكيز القاتلة الدنيا Minimal Bactericidal Concentrations (MBCs) للمطهرات الثلاثة للعزلات البكتيرية الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(512 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (1024 - 128) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (1024 - 4) مايكروغرام/مليلتر.• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا (MBCs) اذ تراوح مابين 15 - 10)) دقيقة لمطهر الهبتين,و(40 - 20) دقيقة لبيروكسيد الهيدروجين,(20 - 10) دقيقة لمطهر السكنسبت. | • The study includes the collection of 235, burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2007 to May 2008 .• The isolated colonies were identified depending on biochemical tests, The identification revealed of 100 isolates (67 burns & 33 wounds) from the total number of isolates , 64 isolates of Pseugomonas aeruginosa (50 burns & 14 wounds) and 36 isolates of Staphylococcus aureus (17 burns & 19 wounds) Then the identification of these species was confirmed by using API 20 NE and API Staph. • The study includes sensitivity test by using Disk diffusion method . towards 18 antibiotics,for each species. • The Pesudomonas aeruginosa isolates showed height resistance to Azetreoname, Pipracillin, Carbencillin, Cefepime, Cefixime, Cephalexin, Ceftriaxone, Cefotixime, Ceftazidime, Trimethoprime, and Co - trimoxazole with percentage 100 %, and to Gentamicin, Tobramycin, Ciprofloxacin, Norfloxacin and Imipenem with percentage (89, 79.68, 60.9, 81.25, 42.1) % respectively . While two of burns isolates showed resistance to Colisitin with percentage 3.2 % . • The isolates of Staphylococcus aureus showed high resistance to Methicillin and Ampicillin with Percentage 100 %, and to Cefriaxone , Augmentin, Erythromycin, Gentamicin, Tobramycin, Tetracyclin, Trimethprim, Co - trimoxazole with percentage (72.2, 86.1, 52.77, 41.66, 36.1, 50, 33.3, 30.5 ) % respectively, and less resistance to Imipenem, Rifampicin, Ciprofloxacin, Cefotaxime with percentage (22.2, 27.7, 13.88, 16.66) % respectively. The isolates showed the same resistance towards Norfloxacin, Ofloxacin and Enoxacin with percentage 19.4 % . All strains were sensitive to Vancomycin . • The minimal inhibitory concentrations of some antibiotics were determined . for Imipenem, the MICs values ranged between (2 - 512) µg/mL, Ciprofloxacin, (2 - 128) µg/mL. Norfloxacin, (8 - 1024) µg/mL, Cefotaxime,( 4 - >1024) µg/mL, Gentamicin,( 4 - >1024) µg/mL• The antibacterial activity of five of cephalosporins after chemical re arrangement by reflux in strong acid solution was examined. The re arrangement reaction produce new ring skeleton of 2,5 dioxopiprazine , of lower antibacterial activity. However there product are candidates drug with expected anticancer activity. • (90 %) of the isolates have ability to produce beta lactamase enzymes.• Minimal Inhibitory Concentration, (MICs) for three of the Common Chemical disinfectants in the hospital were determined, for 10 bacterial isolates for each species. The MICs were range between (4 - 256) µg/mL for Hibitane, (64 - 512) µg/mL for Hydrogen peroxide and (4 - 512) µg/mL for skinsept . Hibitane with its low concentration was the most active comparing with the other antiseptics. while the Hydrogen peroxide was the less . • Minimal Bactericidal Concentration (MBCs) for three of the common chemical disinfectants were determined, the MBCs for Hibitane, (4 - 512) µg/mL, Hydrogen peroxide(128 - 1024) µg/mL,and Skinsept (4 - 1024) µg/mL for each species.• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal Concentrations of antiseptic was determined,it was (10 - 15)min for Hibitane, (20 - 40) min for Hydrogen peroxide and(10 - 20)min for Skinsept
1 ... 91 92 93 94 95 ... 162