عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 75 من أصل 6,681

مسار التحول الاقتصادي في العراق اشكالياته ومستقبله في ضوء تجارب مختارة == The Paths of Economic Transformation in Iraq : Problems and Future

اسم المؤلف: علي جابر عبد الحسين محسن المعالي
اسم المشرف: مازن عيسى الشيخ راضي
الموضوع العام: الادارة والاقتصاد
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاقتصاد
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

اثـر التدريس بالمنظمات التخطيطية وبابعاد التــعلم في تحصيل مادة علم الاحياء وعادات العقل عند طلاب الصف الرابع العلمي == The Effect of teaching by Graph Organizers and Dimensional learning in the Achievement of Biology and Habits of mind among Fourth Class Science Student male

اسم المؤلف: قصي قاسم جايد فليح الركابي
اسم المشرف: نادية حسين يونس | اسماعيل ابراهيم علي
الموضوع العام: العلوم التربوية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: طرائق تدريس علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

الشيخ اسحاق الفياض واراؤه الفقهية

اسم المؤلف: علي رجب علي محمد علي
اسم المشرف: عبد الامير كاظم زاهد
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الشريعة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

فهم النص القراني بين القدامى والحداثيين : دراسة نقدية

اسم المؤلف: حميد مهدي محمد صالح
اسم المشرف: كريم شاتي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الشريعة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الاسرائيليات في مصنفات التفسير بالماثور == The Israeliyat in The Books of Interpretation by Transmitted Word

اسم المؤلف: هــــدى تكــــليف مجيد السلامي
اسم المشرف: صباح عباس عنوز
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

النقد التفسيري في مقدمات التفاسير : دراسة تحليلية == Analytical Criticism in the Explanation Introduction

اسم المؤلف: علي محسن جبر
اسم المشرف: عدي جواد علي الحجار
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحديث
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الفكر العقائدي للديانات الاخرى في القران الكريم : دراسة تفسيرية == Other Religions Doctrinal Thought in the Holy Qur'an Explanative study

اسم المؤلف: دعاء شكر عباس
اسم المشرف: وليد عبد الحميد خلف فرج الله الاسدي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الشهرة مبانيها واسس الخلاف فيها بين الفقهاء والمحدثين

اسم المؤلف: محمد عبد الهادي شاكر العامري
اسم المشرف: حسين سامي عبد الصاحب شير علي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: العلوم الاسلامية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الظاهرة الحسية في القران الكريم لمفهومي الترغيب والترهيب == Sensory Phenomenon in Holy Quran of the Cajole and Intimidation Concept

اسم المؤلف: محسن عبد الكاظم هادي
اسم المشرف: حكمت عبيد الخفاجي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

شبهة القران الكريم دعوة نصرانية : دراسة موضوعية نقدية == The Holy Qur’an Suspicion of Christianity An Objective Critical Study

اسم المؤلف: علي كاظم سميسم
اسم المشرف: جنان غالب ظاهر
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

القراءات القرانية المنسوبة لائمة اهل البيت عليهم السلام واثارها == The Quranic Readings Attributed to the Prophet's Household Imams (p.u.t) and their Effects

اسم المؤلف: مؤمل جواد كاظم خليفه
اسم المشرف: حكمت عبيد الخفاجي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

اثر اختلاف المصاديق في تفسير القران الكريم == The Impact of Corroborates' Difference on Holy Quran Interpretation

اسم المؤلف: فاطمة محمد جواد حبيب
اسم المشرف: محمد كاظم البكاء
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: التفسير
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الافعال الانجازية في النص القراني : دراسة تفسيرية == Speech Acts in the Qur`anic Text An Explanative Study

اسم المؤلف: علي خضر محمد الشكري
اسم المشرف: علي كاظم جواد سميسم
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: التفسير
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

النقـد التفسيــري عند العلامـــة الطباطبائي == Interpretative Criticism for the Scholar Al - Tabatabaei

اسم المؤلف: سهيركريم برهان الجنابي
اسم المشرف: صباح عباس عنــوز
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: التفسير
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

الاخر في فكر اهل البيت (عليهم السلام) == The other in notion of Ahlul - Bait “peace be upon them

اسم المؤلف: اقبال يحيى حسين
اسم المشرف: رؤوف احمد محمد الشمري
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: العقائد
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

اثر التفسير الخاطئ للحديث الشريف في الفتوى المعاصرة

اسم المؤلف: مصطفى صالح مهدي الجعيفري
اسم المشرف: حسين سامي شير علي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

رواية الحديث بالمعنى حجيتها واثرها عند العلماء == Narration by Meaning; its Judgment and Validity

اسم المؤلف: عبد الامير جبر جياد العابدي
اسم المشرف: علي خضير حجي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

العلاقة بين المسلمين واتباع الاديان الاخر : دراسة فقهية التعامل المدني انموذجا == Muslims relationship with followers of other faiths Doctrinal study compared Dealing a model of civil

اسم المؤلف: فاضل عاشور عبد الكريم عبد زيد التغلبي
اسم المشرف: عبد الامير كاظم زاهد
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: العلوم الاسلامية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

حقيقة القران من القران == The Qur`an Truthiness in the Qur`an

اسم المؤلف: هدى علي عباس الخالدي
اسم المشرف: محمد كاظم البكاء
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: التفسير
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

مسالة الافهام الى ايات الاحكام : دراسة تفسيرية

اسم المؤلف: حوراء حاكم صاحب
اسم المشرف: عبد الامير كاظم زاهد
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الشريعة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

المباني الاصولية عند المحقق العراقي : دراسة فيما اشتهر به == Buildings when fundamentalism Iraqi investigator

اسم المؤلف: حيدر عيسى حيدر
اسم المشرف: هادي حسين الكرعاوي
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم القران
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

تعدد النمط الوراثي للجين GSTT1,GSTM1 في الاطفال العراقيين المصابين بمرض السكري النوع الاول == Genetic Polymorphism of (GSTM1, GSTT1) Gene in A sample of Diabetes Mellitus type1 in Iraqi children

اسم المؤلف: سهام مجيد محمد
اسم المشرف: بتول علي شهاب | رافد علاء جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Type1 diabetes mellitus uncommon problem in Iraq which increase incidence of effected young age groups ,and its regards one of the multifactorial disorders with genetics and environmental factors playing important role in its cause and pathogenesis ,complication, prognosis.In diabetes, the defects in cellular metabolism especially hyperglycemia results in increasing free radicals. These radicals react with other vital cellular molecules which are responsible in diabetes side effects. Human glutathione S - transferees (GST) are a family of enzymes that catalysis conjugation of electrophilic substances with glutathione. In this research the deletion and expression of two of the most important genes of this family; GSTT1 and GSTM1 genes was investigated as the risk factor for type1 DM and control of the disease glycated hemoglobin (HbA1c), body mass index (BMI) as ( indicators of diabetic control), in relationship to the age , gender , age of the onset, duration of the disease, and also study of 10 parents of type1 DM to demonstrate the genetic role of GSTs genes in the disease.Forty four type1 DM patients were enrolled (23M & 21 F) and compared with 42 non diabetic counterparts matching with age and gender as regards as control group.Deletion of GSTM1 and GSTT1 genes was observed in (3) diabetics’ patients as compared with control group 3/44 (6.8%), 0/42 (0%) respectively . Also this percentage was increased, 8/11 (72.73) 1/11 (9.09) in the poor control type1 DM (HbA1c < 10), while in the underweight 5/10 (50%), 6/10 (60%) are Significant Correlation between GSTM1 null / GSTT1 present genotype, also study showed more incidence in the male than female patients.There are increase incidence of the expression and deletion of GST genes with aging, chronicity of disease, glycemic control, family GST gene states , and BMI.The type1 DM had effect on the GST states according to the gender, age , age of onset and duration of the disease .

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية == Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

اسم المؤلف: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
اسم المشرف: اخلاص مشرف عیدان | علي حسین ادحیة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

توصيف جزيئي للخلايا الجذعية المتحفزة لتكوين خلايا عصبية == Molecular Characterization of Stem Cells that Induce Neurogenesis

اسم المؤلف: مائده حسين محمد
اسم المشرف: ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The in vitro isolation, identification, differentiation, and neurogenesis characterization (with molecular studies by conventional and real time - PCR) of stem cells source were investigated to produce two type of stem cells. This two types including neural cells and neural stem cells in culture which use it as a successful sources for further treatments. And finally chosen the best medium formula for maintenance the produced neural stem cells, also to prove their stemness state in culture. The mouse bone marrow mesenchymal stem cells was used as the source of stem cells in this study. Two type of neural differentiation formula was used to induced neural cells and then neural stem cells. The first formula was butylated hydroxyanisole, and the second formula was β - mercaptoethanol reagents. Also three type of different neural stages markers were used; nestin as immaturation stage marker, neurofilament light - chain as early neural marker, and microtubule association protein as maturation marker. These markers were represented the different neurogenesis stages started from mesenchymal stem cells (as undifferentiated cells), neural stem cells production stages, and towards neuron cells (as differentiated cells).The results of immunocytochemistry and real time - PCR of butylated hydroxyanisole differentiation method showed that in contrast to mesenchymal stem cells (as control group), neural differentiated cells showed neural progenitor pattern, by showing stable increased in nestin gene expression significantly through differentiation process for different exposure time, with increased of protein expression significantly compared with control. While, neurofilament light - chain gene and protein expression started to increase significantly, but not - IIreplacedthe nestin expression completely even when its expression passed nestin levels compared with control group. In contrast to the maturation marker microtubule association protein which showed a very low expression during the duration of differentiation period in protein and gene expression (with significant effect) compared with control. This results proved that the cells were still progenitors and do not passed the maturation stage, therefore there was a difficult to define the exactly time of neural stem cells production stage from this formula and as a good formula to produce neuron cells in culture. In other side, the results of immunocytochemistry and real time - PCR of β - mercaptoethanol (as another differentiation formula) were showed that this formula was successful to produce both neural stem cells as well as neuron cells from this formula. This occur through increasing and over expressing of nestin protein and gene significantly within the early hours exposure time reaching to the highest expression levels. Compared with decreased and lower expressed in neurofilament light - chain protein and gene expression levels compared with control; therefore from this stage (exposure time) we can produce neural stem cells in culture. And then decreased and lower expressed of both protein and gene expression of nestin significantly compared with increasing the expression of neurofilament light - chain protein and gene levels throw the late exposure times compared with control, this results indicated that this stage was starting of maturation stage toward neuron cells. Also the proving of this results was lower expression levels of almost all exposure times of microtubule association protein for their protein and gene (with significant effect).The results of gene expression analysis of using four different media formulas to proved the stemness state and maintained the neural stem cells in culture showed that 6 h exposure to β - mercaptoethanol was enough to create - IIIneuralstem cells which maintained using MEM media with 5% FBS, with b - FGF, or with b - FGF &EGF. This study confirms that the molecular characterization study of stem cells in culture will assist to studying and clarifying the neurogenesis pathway through neural differentiation process, by clarified the mechanisms of neural genes through the in vitro differentiation of stem cells, and therefore ability to produced both neuron cells and neural stem cells by using the molecular studies.

تعدد الاشكال للنيوكليوتيدة المفردة لبعض الحركيات الخلوية في مرض المعي الالتهابي لدى مرضى عراقيين == Single Nucleotide Polymorphisms of some Cytokines in Inflammatory Bowel Disease of Iraqi Patients

اسم المؤلف: ابتسام بداي حسان الكناني
اسم المشرف: بتول علي شهاب | علي حسين ادحية
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Inflammatory bowel disease (IBD) is a world healthcare problem that involves two major forms : Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Immunogenetic predisposition is one of the risk factors for the disease, and cytokines are among these factors. Therefore, the association between 13 SNPs (single nucleotide polymorphisms) of cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IFNG, TNF and TGFB1) and IBD was determined in samples of Iraqi Arab patients (34 CD and 66 UC). The patients were referred to the Gastrointestinal Tract Unit at Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Yarmouk Teaching Hospital and Al - Zuafrania General Hospital in Baghdad for diagnosis and treatment during the period August 2013 - October 2014. A control sample of 43 individuals was also included.The following results were reached by the study : 1. Interleukin - 1 alpha gene (IL1A - 889) : frequencies of CC genotype and C allele were significantly increased in CD (58.8 and 73.5%, respectively) and UC (54.6 and 71.2%, respectively) patients compared to controls (25.5 and 40.7%, respectively). In contrast, TT genotype and T allele frequencies were significantly decreased in CD (11.8 and 26.5%, respectively) and UC (12.1 and 28.8%, respectively) patients compared to controls (44.2 and 59.3%, respectively).2. Interleukin - 1 beta gene (IL1B - 511) : Frequency of TC genotype was significantly increased in UC patients compared to controls (63.6 vs. 39.5%; P = 0.018), while CC genotype frequency was decreased (6.1 vs. 32.2%; P = 0.061). No variation was observed in CD patients.3. Interleukin 1 receptor type 1 gene (IL1R1pstl 1970) : Frequencies of TT genotype and T allele (47.1 and 67.7%, respectively) were significantly increased (P = 0.026 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients compared to controls (20.9 and 34.97%, respectively). In contrast, CC genotype (11.8 vs. 51.2%) and allele C (32.4 vs. 65.1%) frequencies were significantly decreased (P = 2.8*10 - 4 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients. For UC, the patients demonstratedgnificant increased frequencies of TC genotype (48.5 vs. 27.9%; P = 0.045) and T allele (63.6 vs. 34.9%; P = 5.1*10 - 5) compared to controls. As in CD, UC patients also demonstrated significant decreased frequencies of CC genotype (12.1 vs. 51.2%; P = 1.7*10 - 5) and C allele (36.4 vs. 65.1%; P = 8.6*10 - 5).4. Interleukin 2 gene (IL2+166) : Among CD patients, frequencies of TT genotype (41.2 vs. 6.9%) and T allele (64.7 vs. 43.0%) were significantly increased in patients compared to controls (P = 0.001 and 0.009, respectively). In contrast, TG genotype (47.1 vs. 72.1%; P = 0.035) and G allele (35.3 vs. 56.9%; P = 0.009) frequencies were significantly decreased. Almost, similar observations were made in UC patients.5. Interleukin 4 gene (IL4 - 590) : it was observed that frequencies of TT genotype (52.9 vs. 11.6%; P = 1.2*10 - 4) and T allele (70.6 vs. 24.4%; P = 1.6*10 - 8) were significantly increased in CD patients compared to controls. In contrast, CC genotype (11.8 vs. 62.8%, P = 5.6*10 - 6) and C allele (29.4 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased. In the case of UC, frequencies of TC genotype (69.7 vs. 25.6%; P = 1.1*10 - 5) and T allele (62.1 vs. 24.4%; P = 4.6*10 - 8) were significantly increased in patients, while CC genotype (3.0 vs. 62.8%; P = 2.5*10 - 12) and C allele (37.9 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased in patients.6. Interleukin 4 receptor gene (IL4R+1902) : frequencies of GG genotype (47.1 vs.11.6%) and G allele (55.9 vs. 37.2%) were significantly increased in CD patients compared to controls (P = 0.001 and 0.023, respectively). In contrast, GA genotype (17.7 vs. 51.1%; P = 0.004) and A allele (44.1 vs. 62.8%; P = 0.023) frequencies were significantly decreased. In UC patients, frequencies of GG genotype (57.6 vs. 11.6%) and G allele (75.8 vs. 37.2%) were significantly increased (P = 1.0*10 - 6 and 1.9*10 - 8, respectively); while frequencies of AA genotype (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5) and A allele (24.2 vs. 62.8%; P = 1.9*10 - 8) were significantly decreased.7. Interleukin 6 gene (IL6+565) : Comparing patients to controls revealed that GG genotype frequency was significantly increased in CD (70.6 vs. 13.9%; P = 1.5*10 - 8) and UC (69.7 vs. 13.9%; P = 4.4*10 - 7) patients, and a similar increased frequency of G allele was observed. In contrast, the GC genotype frequency was significantly decreased in CD (23.5 vs. 76.7%; P = 3.7*10 - 6) and UC (24.2 vs. 76.7%; P = 7.0*10 - 6) patients.8. Interleukin 12B gene (IL12B - 1188) : Frequency of A allele was significantly increased in CD patients compared to controls (67.7 vs. 47.7%; P = 0.015), while C allele was significantly decreased (32.4 vs. 52.3%; P = 0.015). For UC, the heterozygous genotype AC showed a significant increased frequency in patients compared to controls (66.7 vs. 30.2%; P = 3.6*10 - 4), while CC genotype frequency was significantly decreased (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5). 9. Interferon gamma gene (IFNG+874) : The AT genotype showed a significant increased frequency in CD patients compared to controls (58.8 vs. 30.2; P = 0.020), while TT genotype frequency was significantly decreased (11.8 vs.39.5%; P = 0.009). For UC, AA genotype (54.6 vs. 30.2%; P = 0.018) and A allele (74.2 vs. 45.4; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly increased in patients. In contrast, TT genotype (6.1 vs. 39.5%; P = 2.8*10 - 5) and T allele (25.8 vs. 54.7%; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly decreased. 10. Tumor necrosis factor alpha gene (TNF - 308) : Comparing CD patients to controls revealed no significant variation, while UC patients demonstrated a significantly (P = 0.006) increased frequency of G allele (71.2 vs. 52.3%) and a decreased frequency of A allele (28.8 vs. 47.7%). 11. Interleukin 1 receptor antagonist (IL1RNmaspl 11100), interleukin 10 gene (IL10 - 1082) and Transforming growth factor beta (TGFB1codon 25) genes : Comparing patients to controls revealed no significant variations in genotype or allele frequencies.The presented results of the 13 cytokine SNPs in CD and UC patients are the first report in Iraqi patients, and their findings highlighted the role of these SNPs in etiopathogenesis of both groups of IBD, and paved the way for further investigations to determine the role cytokine gene polymorphisms in susceptibility to IBD or their protective effects.

العلاقة بين مستوى الكلوكوز في الدم مع بعض المعايير الكيموحيوية في متلازمة تكيس المبيض == The Relation Between Blood Glucose level and Some Biochemical Parameters in Polycystic Ovarian Syndrome

اسم المؤلف: ياسمين سرمد حسن الصائغ
اسم المشرف: عالية حسين علي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد متلازمة تكيس المبيض المتعدد ((PCOS من الاكثر شيوعا بين اضطرابات الغدد الصماء والتي تصيب النساء في عمر الانجاب. ماتزال امراضية هذه المتلازمة غير معروفة ولكن الكثير من الباحثين يعزونها الى عوامل وراثية واضطرابات ايضية والسمنة وفرط الاندروجين ومقاومة الانسولين، فضلا عن فرط الانسولين. هدفت هذه الدراسة الى ايجاد العلاقة بين مستوى الكلوكوز مع اختبارات اليوريا والكرياتنين، فضلا عن البروتين المتفاعل C في عينة من النساء العراقيات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد، اذ اجريت الدراسة الحالية على (51) امراة يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد و(10) نساء سليمات كمجموعة سيطرة في المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة على الانجاب/جامعة النهرين للفترة من شباط الى اب للعام 2014. تم تشخيص النساء الخاضعات للدراسة باستخدام جهاز الامواج فوق الصوتية (السونار) لفحص الرحم والمبيض واسندت بالاستبيان ان كن يعانين من ندرة الطمث (oligomenorrhea)، انقطاع الطمث الثانوي (secondary amenorrhea) او دورة حيضية منتظمة، فضلا عن الفحوصات الهرمونية والتي تضمنت الهرمون المحفز للحويصلات المبيضية ((FSH، الهرمون اللوتيني (LH)، هرمون الحليب (PRL)، هرمون الايستروجين (E2) وهرمون التيستوستيرون ((Testosterone. اذ جمع (5) مل من الدم الوريدي من كل امراة صائمة صباحا، واذيب 75 غرام من الكلوكوز بـ 300 - 500 مل من الماء واعطي لكل النساء الخاضعات لهذه الدراسة. تم جمع المعلومات والتي شملت العمر ومؤشر كتلة الجسم ( (BMIو فترة العقم من كل امراة خاضعة للدراسة، ثم تم اجراء اختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار فقط) واختبار اليوريا في الدم واختبار كرياتنين المصل واختبار الهوموسيستين واختبار البروتين الفعال C لكل النساء في هذه الدراسة. كما وتم اجراء اختبار اليوريا والكرياتنين فضلا عن اختبار البروتين المتفاعل C مع منتصف الاختبار لتحمل الكلوكوز الفموي لكل النساء الخاضعات في هذه الدراسة لغرض ايجاد العلاقة المحتملة بين السكر وهذه الاختبارات. قسمت المريضات الى عدة مجاميع وفقا لاختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار) ونوع العقم وحالات الاجهاض ومؤشر كتلة الجسم وفترات العقم ووفقا للفئات العمرية. وبعد ذلك تم تحليل البيانات احصائيا. اظهرت نتائج الدراسة عدم وجود فروق معنوية(P>0.05) بين مجاميع المريضات (PCOS) مقارنة بمجموعة السيطرة فيما يخص عامل العمر،و لكن وفقا للفئات العمرية، لوحظ زيادة تكرار هذه المتلازمة للنساء ضمن الفئة العمرية التي تتراوح بين 21 - 30 سنة. كما واظهرت هذه الدراسة ان اغلب المريضات يعانين من الوزن الزائد والسمنة المفرطة، وارتفاع السكر في الدم. اما فيما يخص حالة العقم فقد قسمت المريضات لمجموعتين، مجموعة تعاني من عقم اولي 52.95%) ) والمجموعة الثانية تعاني من عقم ثانوي ((47.05% . اضافة الى ذلك، حوالي (29.42%)من المريضات يعانين من حالات الاجهاض، ولم تلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في فترات العقم بين المريضات اللواتي يعانين من الاجهاض مقارنة باللواتي لا يعانين من الاجهاض، وايضا بين المريضات اللواتي لديهن عقم اولي مقارنة باللواتي لديهن عقم ثانوي. اما بالنسبة للتحليل الهرموني، فقد لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) بهرمون الحليب لدى المريضات اللواتي يعانين من زيادة الوزن والسمنة المفرطة. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية (P>0.05)في تركيز الهرمون المحفز للحويصلات والهرمون اللوتيني وهرمون الايستروجين والهرمون الذكري التيستوستيرون بين المريضات ومجموعة السيطرة. ايضا اظهرت النتائج حصول ارتفاع معنوي(P<0.05) في تركيز الهوموسيستين في المريضات اللواتي يعانين من فترة عقم 9 سنوات فما فوق. لوحظ ايضا وجود علاقة ايجابية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز مع تركيز كل من اليوريا والكرياتنين في الدم، بينما لوحظت علاقة عكسية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز وتركيز البروتين المتفاعل C في الدم. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في مستويات اليوريا والكرياتنين والبروتين المتفاعل C بين مجاميع المريضات ومجموعة السيطرة الصائمات.نستنتج من نتائج الدراسة الحالية ان متلازمة تكيس المبيض مرتبطة بالسمنة، ومقاومة الانسولين، فضلا عن اضطرابات الطمث. وان ارتفاع الهوموسيستين مرتبط بمقاومة الانسولين والسمنة. المريضات اللواتي لديهن فرط الانسولين قد يتطور لديهن مرض السكري. كما وان ارتفاع هرمون الحليب مرتبط بالسمنة المفرطة والوزن الزائد في المريضات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبيض المتعدد (PCOS). | Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder which affect women at reproductive age. The pathophysiology of this syndrome still unclear, but many researchers were attributed this syndrome to genetics, metabolic disorders, obesity, hyperandrogenism, insulin resistance and hyperinsulinemia. This study was aimed to identify the correlation of glucose level with blood urea, serum creatinine and C - reactive protein test in some Iraqi women suffering from polycystic ovarian syndrome. The present study was carried out for (51) PCOS women and (10) healthy women as control with age between (17 - 49) years at High Institute for Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technologies / AL - Nahrain University, from February to August, 2014. The females were diagnosed by ultrasound scan for ovarian and uterine features and supported by a questionnaire if they have oligomenorrhea, secondary amenorrhea or regular menstrual cycle, as well as reproductive hormonal assay performed for all women involved; FSH, LH , prolactin, E2 and testosterone. Blood samples (about 5 mL) were collected from each fasting woman in the morning, and 75 gm of glucose loaded in 300 - 500 ml of water and given to the subjects. The information included; age, BMI and duration of infertility were recorded for all subjects. Oral glucose tolerance test (Mid - test only), blood urea test, serum creatinine test, homocysteine test and C - reactive protein test were performed for all subjects. Blood urea, serum creatinine and C - reactive protein tests were performed with mid - test OGTT for all subjects provided the correlation between blood glucose levels and these parameters. PCOS women divided into groups according to mid - test OGTT, type of infertility, abortion cases, BMI values, duration of infertility and according to age groups. Crude data were statistically analyzed. As for the age, no significant differences (P>0.05) were observed among PCOS groups and controls. According to age group, higher prevalence of PCOS women was observed in age group with age range 21 - 30 years . The most of PCOS women were overweight and obese, and they had higher glucose levels. As for the infertility, infertile PCOS women were divided into two groups, PCOS women suffering from primary infertility (52.95%) and secondary infertility (47.05%). About 29.42% of PCOS women had abortion. Non significant differences (P>0.05) in duration of infertility between PCOS aborted vs. non aborted ones, and between primary and secondary. Higher prolactin level (P<0.05) was recorded in obese and overweight women, while non significantly differences (P>0.05) were recorded in FSH, LH, E2, and testosterone level among PCOS groups and controls. Higher homocysteine level (P<0.05) was observed in PCOS group with duration of infertility (≥9 years). Weak positive correlation was demonstrated between glucose with blood urea and glucose with serum creatinine. While negative weak correlation of glucose level with C - reactive protein level was recorded. Moreover, non significant differences (P>0.05) in urea, creatinine and C - reactive protein levels among fasting PCOS groups and control.In conclusion, the present study supported the association of PCOS cases with obesity, insulin resistance, and menstrual disturbances. Elevation of homocysteine levels related to insulin resistance and obesity in PCOS women. Hyperinsulinimic PCOS women had higher prevalence risk to develop type 2 diabetes mellitus. An elevation of prolactin level associated with obesity and overweight in PCOS patients

زيادة بعض مركبات الايض الثانوية لنبات الزيتون Olea europaea L باستخدام نترات الفضة النانوية والبولي اثيلين كلايكول خارج الجسم الحي == Increasing of some secondary metabolites of Olea europaea L. Using silver nitrate nano particle and polyethylene glycol elicitor In Vitro

اسم المؤلف: وسن محمد موسى السويدي
اسم المشرف: هاشم كاظم محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in callus induce from leave and shoot tips of Olea europaea L. in vitro.Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant.Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that ms medium containing 1 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 50 % under light conditions, the highest callus fresh and dry weight were recorded 630,43.0mg at concentrations 1,2 mg/l 2,4 - D respectively.Shoot tips and Stigma cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulatorsincluding Benzyl Adenine BA at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of shoot tips reached 80 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2534,552 mg at concentration 3mg/l BA respectively. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of Stigma reached 40 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2070,404 mg at the concentration 4mg/l BA respectively.In order to increase theproduction of secondary metabolites, some elicitors were used including Poly Ethylene Glycol (PEG) at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 %, and silver nano particles AgNO3 NPs at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l.Results showed that 1.5mg/l concentration of AgNO3NPs caused highly significant production in most of the secondary metabolites (Glycosides compound) of callus for Olea europaea L while 2mg/l concentrations of AgNO3 NPs caused highly significant production in some of the secondary metabolites (Glycosides compound) of shoot tips for Olea europaea L. Results showed that 2% concentration of PEG caused highly significant production of the secondary metabolites (Fenolic compound) of callus for Olea europaea L. while 1.5% concentrations of PEG caused highly significant production b in most of the secondary metabolites (phenolic compound) of shoot tips for Olea europaea L.

التوزيع الزماني للفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة وبعض طرائق السيطرة عليها == Temporal Distribution of Dermatophytic Fungi the Causative of Tinea Diseases and Some Control Methods

اسم المؤلف: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي
اسم المشرف: حمزية علي عجة الدليمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

اسم المؤلف: هيبت ماهر عباس التميمي
اسم المشرف: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

اسم المؤلف: هند يوسف خلف
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

اسم المؤلف: هند مجيد كانوص الموسوي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض المعالم المناعية لمرضى التصلب المتعدد العراقيين == Study of Some Immunological Parameters in Iraqi Patients with Multiple Scler

اسم المؤلف: هند قصي اسماعیل الفرضي
اسم المشرف: حازمة موسى خلیل العباسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - المناعة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory condition that affects central nervous system (CNS) causing neurological dysfunction. The current study aim was the evaluation of the role of Methylprednisolone (MP), Interferon Beta (IFN - β) as disease treatments, and to investigate their influence on CD25+ FoxP3 T regulatory cells (it was counted by flow cytometry technique), IL - 8, IL - 17 (pro - inflammatory cytokines), IL - 12 (inflammatory cytokine (T cells differentiation Factor)), IL - 10, TGF - β (anti - Inflammatory cytokines) it estimated by ELISA technique, also the total and differential WBC count, ESR, CRP (inflammatory indicators), patient characteristics, clinical manifestation and life style characteristics. Forty - five Iraqi MS patients (15 untreated as early onset patients, 15 MP treated patients and 15 IFN - β treated patients), in addition to 15 apparently healthy individuals as control. For patients treated with MP, samples collected after treatment period, while patients treated with IFN - β samples were collected in remission status.The study revealed the following results : 1. Patient general characteristics showed that according to gender distribution female : male ratio was 2 : 1 (66.67% : 33.33%), according to the age of onset, (< 30 years) group of patients were the highest frequency in study sample (37.9%), 57 years was the maximum age of onset and 13 years was the minimum, with mean (34.93), Baghdad was the highest governorate in MS onset (73.33%). 2. Total WBC count showed that patients treated with MP (10.38*103μl) increases significantly (P≤0.002), (P≤0.001) as compared with both patients treated with IFN - β (7.45*103μl) and control (7.33*103μl) respectively. Lymphocytes were decrease significantly (P≤0.013), (P≤0.030) patients treated with MP and INF - β respectively (1.82), (1.92) as compared to control (2.58) and there were a significant decrease (P≤0.03) in patients treated with MP (1.82*103μl) as compared to untreated patients (2.47*103μl).Neutrophils was increase significantly (P≤0.016) and (P≤0.000) in patients treated with MP and untreated patients respectively (7.81), (5.99) as compared to control (3.82), there were also a significant increase in patients treated with MP (P≤0.04), (P≤0.001) ascompared with untreated patients (5.99*103μl) and patients treated with IFN - β (4.73*103μl) respectively. Basophils decrease significantly (P≤0.001), (P≤0.014) in both patients treated with MP and INF - β respectively (0.05), (0.06) as compared to control (0.08).3. CD25+ FoxP3+ Tregs counting showed a significant increase (P≤0.002) in untreated patients (28.01%) as compared to control 14.06%), while there were a significant decrease (P≤0.016), (P≤0.007) in both patients treated with MP and IFN - β respectively(3.70%), (2.44%) as compared to control, also there were a significant increase (P≤0.000), (P≤0.000) in untreated patients (28.01%) as compared with patients treated with MP (3.70%) and patients treated with IFN - β (2.44%) respectively.4. Serum cytokines estimation showed that IL - 8 decreased significantly (P≤0.026) in untreated patients (0.003pg/ml) as compared to control (0.016), while IL - 10, IL - 12, IL - 17 showed no significances and TGF - β increased significantly (P≤0.028) inpatients treated with MP (700.27) as compared to control (392.13), while there were a significant increasing (P≤0.001), (P≤0.001) in patients treated with MP (700.27pg/ml) as compared with untreated patients (235pg/ml) and patients treated with IFN - β (484.67pg/ml) respectively. Saliva cytokines estimation showed that IL - 8 was increased significantly (P≤0.023) in patients treated with IFN - β (0.578) as compared to control (0.223), IL - 10 increased significantly (P≤0.017) in patients treated with MP (0.023) as compared to control(0.00), IL - 12 decreased significantly (P≤0.003) in patients treated with IFN - β (4.93) as compared to control (24.07), IL - 17 increased significantly (P≤0.018) in patients treated with MP (19.17) as compared to control (0.00).

التحري عن بعض المعايير المناعية وتعدد الطرز الوراثية لجين IL - 13 في مرضى الربو في محافظة ذي قار == Investigation of some Immunological parameters and polymorphism of IL - 13 gene in patients of asthma in Thi - Qar province

اسم المؤلف: هند حسين صالح الطائي
اسم المشرف: علي نعيم سلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - المناعة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Asthma is a chronic inflammatory disease of the airways in which many cells and cellular elements play a role. Causes recurrent episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness, and coughing. These episodes cause airflow obstruction, often reversible either spontaneously or with treatment. The current study was conducted at the Labs of college of Education for pure science and Al - Hussein Teaching Hospital in Thi - Qar province, during the period from October 2014 to May 2015. The study aimed to investigate role of polymorphism of IL - 13 gene in patients with asthma and to evaluate their immune status by measuring the levels of some immunological parameter immunoglobulins ( IgE) by enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) and (IgG, IgM ) by single redial immune diffusion (SRID) and measure the levels of interleukins (IL - 6, IL - 17) in the serum using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), the study included test phagocytic cells on phagocytosis (coefficient of phagocytosis) and the total and differential count of white blood cells .A total of 100 patients with bronchial asthma (68 females) and (32 males) whose age lies between 17 - 62 years have enrolled in this study. DNA was extracted and RFLP - PCR was performed by using primers specific for the gene IL - 13, the results showed the presence of mutations in a48 sample out of 100 patients with asthma at site 1112C/T after using restriction enzyme BstUI. the statistical analysis showed correlation between the occurrence of the disease and the emergence of mutation (C / T) in the promoter region of IL - 13 gene when compared with the healthy control in population of Thi - Qar province .When it was compared the patient group with healthy control group there was a high significant increase (P ≤ 0.001) in serum IgE, IgG of patients with asthma compared with healthy control group. And no significant difference in serum IgM of patients with asthma compared with healthy control group. Decrease coefficientphagocytosis was significantly (P ≤ 0.001) in all patients with asthma compared with healthy control group. Levels of interleukin (IL - 6, IL - 17) measured in serum of 60 a sample of patients with asthma, and in the serum of 20 samples from healthy control group. The results showed a significant increase (P ≤ 0.001) in the levels of these interleukins in the serum of patients with asthma compared to the control group.Also there was increased in the rate of counting the total of WBCs and differential cell lymphocytes, eosinophil, neutrophil, basophil, and monocyte (P ≤ 0.001) in patients with asthma compared with the healthy people in the control group.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

اسم المؤلف: هبة شاكر احمد
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة جزيئية ونسيجية مناعية للنساء المصابات بمرض سرطان الثدي في محافظة ذي قار,العراق == Molecular and Immunohistochemical Study in Women with Breast Cancer in Thi - Qar Province

اسم المؤلف: هبة لفتة عبد الغالبي
اسم المشرف: منال بادي صالح | مها شاكر حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Breast cancer is a complex and multifactorial disease resulting in abnormal cell growth that leads to malignant tumor formation.In this study we focus on mutations of breast cancer susceptibility genes 1 and 2 (BRCA1 and BRCA2), immunohistochemical evaluation of estrogen, progesterone, HER - 2 receptors, ABO blood groups , white blood cells and clinicopathological parameter ( age, breast feeding, family history and tumor site) .Eighty five blood samples were taken from patients who attended Al - Hussain teaching hospital and oncology unit in Al - Habboby hospital during the period (from August /2014 to April /2015) , fifty blood samples were collected from healthy women as a control group who attended Al - Hussain teaching hospital and divided into groups according to age, family history, age at first brith, breast feeding. For histopathological and immunohistochemical analysis fifty tissue samples were collected from patients with breast cancer who were undergoing surgical resection (mastectomy). Blood samples were obtained by venepuncture , using a 5 ml disposable syringe , and they were divided into three aliquots, which were 1 ml, 2 ml and 2ml, for collect serum, genetic studies and hematological parameters (leucocycte count and ABO blood groups) study. The tissue samples were collected from the 50 patients with breast cancer for histopathological diagnosis and for Immunohistochemical analysis (estrogen receptor, progesterone receptor and here2/nue) The total patients were divided according to their age in to five groups (30 - 39), (40 - 49), (50 - 59), (60 - 69) and (≥70 years). results of present study revealed that a highest incidence of breast cancer (41%) occur in the age oup between 40 - 49 years, there is a significant difference among patients groups (P ≤ 0.01).The results of our study showed that (77) of patients lactating and from those according to period of lactation we found that the highest percentage of patients (37.6%) were lactating for period between (18 - 22months) and the lowest percentage (10.38%) lactating for period between (1 - 6 month). Family history of breast cancer indicates a strong association with risk of developing breast cancer. The result of the present study revealed that the family history positive in 31 cases (36.47%), and 54 cases (63.52%) had negative family history of breast cancer.The results of present study showed that (41.5%) had first birth at age (20 - 29years), (23.37%) had their first birth in age group (15 - 19 years) and (30 - 39 years), and (9.09%) had first birth at age (≥40 years).Regarding the tumor site, we found that most of patients (50.5%) the tumor mass was located in the right side and (38.8%) cases the tumor mass were located in the left side.The DNA was extracted from blood samples by using Accupower® genomic DNA extraction kit. Each concentration and purity of all DNA samples have been measured by Nanodrop. Samples with a purity ranged from 1.2 to 1.8 have been enrolled in this study for the molecular detection of BRCA1/2 gene mutation in patients and control groups. Detection of BRCA1/2 gene mutation by multiplex PCR revealed that (185 del AG mutation in BRCA1 gene) was detected in 6 patients (7.05%) out of 85 cases with breast cancer, and (5382 ins C) mutation in the same gene was detected in 2 patients (2.35%). Regarding (6174 del T) mutation in BRCA2 gene was detected in 3 patients (3.52%). While this mutation was not detected in the control groups.Histopathologically, carcinoma was divided into 44 cases (88%) ductal carcinoma {from which 42 cases (84%) were invasive ductal carcinoma, and 2 cases (4%) were comedocarcinoma}, and 6 cases (12%) cases invasive lobular carcinoma. Results revealed that 2 cases (4%) were stage I, 13 cases (26%) were stage II, 24 cases (48%) were stage III and 11 cases (22%) were stage IV, also our results showed that the 2 cases (4%) were grade I, 23 cases (46%) were grade II and 25 cases (50%) were grade III. The results of immunohistochemical analysis for breast cancer samples showed that Estrogen receptors were present in 36 cases (72%), and 14 cases (28%) were negative, while Progesterone receptors detected in 27 cases (54%), and 23 cases (46%) were negative, on the other hand the expression of HER - 2/neu showed positive results in 28 cases (56%), and 22 cases (44%) were negative.Regarding the ABO blood groups, we found that most of the cases carry blood group A (40 cases, 47.05 %), and the lowest frequency was for blood group AB (7 cases, 8.23%).The results of the present study showed that leukocytes count, lymphocytes count, monocytes count, neutrophils count and basophiles count were lower in patients than the control group, with a significant difference (p value ≤ o.o1). While the eosinophils count was significantly higher in patients than the controls (p value ≤ o.o1).

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: هادي حسين عباس القريشي
اسم المشرف: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

اسم المؤلف: نور ماجد عبد الله الدليمي
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

اسم المؤلف: نور شكيب محمد
اسم المشرف: ضمياء محمود ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

اسم المؤلف: نهاد خلاوي تكتوك
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التحري الجزيئي والتعبير الجيني لمضخات الدفق في بكتريا Pseudomonas aerugionsa متعددة المقاومة للمضادات الحيوية == The Role of Efflux Pumps in Multidrug - Resistance in Colistin - resistant Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: نبراس رضا محمد العبيدي
اسم المشرف: محمد فرج شذر المرجاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 120 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa للمدة من /15 2014/9 لغاية /11/15 2014, من مصادر سريرية مختلفة شملت : (33عزلة ) من الادرار , و(25عزلة) من الحروق , و(25عزلة ) من القشع , و(17عزلة) من الجروح , و(12عزلة ) من الدم, و( 5عزلات ) من الاذن , و(3 عزلات) من ادوات قثطرة المجاري البولية. اختبرت حساسية العزلات قيد الدراسة تجاه مضاد الكولستين باستعمال طريقة الاقراص واظهرت النتائج وجود 27) ) عزلة مقاومة للكولستين وبنسبة (%22.5) , ثم اختبرت مقاومة60 عزلة (منها 27 عزلة مقاومة للكولستين ) تجاه اثناعشر مضادا من مجاميع مختلفة وتم تحديد حساسية العزلات ومقاومتها للمضادات المايكروبية باعتماد قياس قطر منطقة التثبيط بالمليمتر حول اقراص المضادات المستعملة , واظهرت النتائج ان جميع العزلات المختبرة كانت مقاومة بشكل تام لمضادات Amoxicillin وCarbencillin بينما ابدت العزلات مقاومة لمضاداتGentamycin بنسبة (%70) و(%56.6) Tobramycin وLomefloxacin (%58.3)وكانت المقاومة اقل لمضادات Aztreonam (%18.3) وPolymyxin B بنسبة (%18.3) وتليها المقاومة لمضادNorfloxacin (%13.3)و Levofloxacin (%11.6) وتجاه Ciprofloxacin الاقل مقاومة بنسبة (%8.3) .اختبرت قابلية (60) عزلة اعلاه على انتاج انزيم البروتييز وتكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج قابلية % 88.3 من العزلات 53) عزلة )على انتاج انزيم البروتييز, وكانت جميع العزلات المقاومة للكولستين منتجة لانزيم البروتييز وبنسبة %100 , من جانب اخر كانت 43 عزلة (%71.7) منتجة طبقة لزجة قوية محددة بوساطة تكوين مستعمرات سوداء دلالة على تكوينها الغشاء الحيوي .تم الكشف عن وجود مضخات الدفق بين 60 عزلة من عزلات الدراسة ( منها 27 عزلة مقاومة لمضاد كولستين و33 عزلة حساسة له) باعتماد طريقة العجلة الخشبية Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) باعتماد صبغة الاثيديوم برومايد كمؤشر للكشف عن مضخات الدفق , واظهرت النتائج ان 46 عزلة (76.7%) من العزلات المختارة اعطت نتيجة موجبة للفحص اعلاه , ومن جانب اخر كانت جميع العزلات المقاومة للكولستين موجبة للفحص مما يدل على امتلاكها لمضخات الدفق , اما بالنسبة للعزلات الحساسة للكولستين فكانت %33.3منها تملك مضخات دفق بالكشف المظهري . اخضعت 32 عزلة (27 منها كانت مقاومة للكولستين) للكشف الجيني عن مضخات الدفق باستعمال تقنية Conventional PCRللكشف عن مضخة الدفق MexAB - OprM (بالكشف عن جينات oprMو (mexAومضخة الدفق MexXY (بالكشف عن جين mexY) اظهرت النتائج ان20 عزلة (62.5%) تمتلك الجينoprM , وان 22عزلة (68.8%) تمتلك الجين mexA , و24 عزلة (75%) تمتلك الجينmexY , وبينت النتائج ايضا بخصوص الكشف الجيني عن مضخات الدفق لعزلات الدراسة ان جميع العزلات الموجبة لاختبار امتلاك الجين mexYهي مقاومة للكولستين وقد شكلت نسبة %88.9 من العزلات الكلية المقاومة للكولستين . وتم الكشف عن التعبير الجيني لمضخة الدفق OprM - MexAB (بدراسة الجين (mexB ومضخة الدفق MexXY ( بدراسة الجين mexX) في 9 من عزلات الدراسة والتي كانت مقاومة لمضاد الكولستين باستعمال تقنية q RT - PCR من خلال استخلاص RNA البكتيري , ومن ثم تحويله الى cDNA , واظهرت نتائج الكشف عن التعبير الجيني للجين mexB والجين mexXان العزلات كانت متباينة في قيم ct , وبحسب معادلة Livak تم استخراج قيم ct ومعرفة التعبير الجيني لمضخات الدفق , ولوحظ ان التعبير الجيني لمضخة الدفق MexXY اكثر من التعبير الجيني لمضخة الدفق MexAB - OprM . | A total of (120) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were collected from different sources , During the period between 15/9/2014 till 15/11/2014 . The source of these isolates were as follows : (33) isolates from urine , (25) isolates from Burns , (25) isolates from sputum , (17) isolates from Wounds , (12) isolates from Blood , (5) isolates from ears ,and the last (3) isolates from Catheters . All isolates were identified through morphological , cultural and some biochemical tests and using Vitek2 GN . The antibiotic susceptibility test Towrd Colistin was done using the agar diffusion method ; Results showed that 27 isolates (%22.5) were resistance to Colistin ,then Sixty isolates ( Ones 27 isolates resistance to Colistin ) were tested against twelve antibiotic by measuring inhibition zone around disk antibiotic , Result showed that All isolates were complete resistance to Amoxicillin and Carbencillin , While resistance to other antibiotic were Gentamycin (70%) , Tobramycin (56.6%) , Lomefloxacin (58.3%) , and less resistance was showed for Aztreonam(18.3%) , Polymyxin B (18.3%), Norfloxacin(13.3%) , Levofloxacin(11.6%) and Ciprofloxacin (8.3%) ,The most effective antibiotic against Colistin resistance isolates were Levofloxacin and Ciprofloxacin . Sixty of isolates were choosen to detect for ability to protease production and biofilm formation , The Results showed 53 isolates (%88.3) were protease production , and results showed all Colistin resistant isolates were protease production and 43 isolates (%71.7) were able to biofilm formation . Sixity isolates (Ones 27 Colistin resistance isolates ) were choosen for detect efflux pumps by using Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) , which include ethedium bromide dye as marker to detect efflux pumps , the result showed that 46 isolates (%76.7) give positive result . Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the mexA , mexY, oprM gene , The results showed that oprM found in 20 isolates (%62.5) , mexA found in 22 isolates (%68.8) , mexY found in 24 isolates (%75) , The results also showed that 88.9 % from Colistin resistant isolates had mexY gene . Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction of Colistin resistant isolates and c DNA synthesis , The results showed that gene expression were high in efflux pumps especially to MexXY efflux pumps , and the gene expression to MexXY efflux pumps higher than MexAB - OprM efflux pums

تقييم كفاءة بعض المرشحات كبدائل في معالجة مياه الصرف الصحي واعادة استخدامها في ري نبات الذره الصفرا ء Zea mays L == Evaluation Efficiency For Some Alternatives Filters in Sewage Treatment and Reusing in Irrigation Plant Zea mays L

اسم المؤلف: منى محمد نجیب
اسم المشرف: حسين يوسف خلف الركابي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: recently Iraq where suffer from several crisis including diminished quantity and deteriorated quality of water resources, specially in southern provinces. This study was designed to show the extent of using non - traditional water resources such as sewage after its treatment with local alternative chemicals and using the resulting water in agriculture sector. Samples were collected from the terminal tank of waste water station in Al Nasiriyah ( Alhindia station) according to the criteria of United States Environment Protection Agency (USEPA, 1977) regarding the sewage properties including pH, EC, total dissolved solid(TDS), total suspended solids( TSS), CO2, Mg+2, Ca+2, Na+, CaCO3, Cl - , PO4 - , NO3 - , chemical oxygen demand ( COD), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, we easured three trace elements ( Pb, Ni, Cd) as well as sodium adsorption ratio( SAR) and biological properties and bacterial contamination with fecal coliform bacteria. Physicochemical analysis of both sewage and tab water was performed. It was found that pH values were 7.37 and 8 for sewage and tab water , respectively. While the electrical conductivity for tab water was 8.01 ds / m compared with that of sewage water which was only 1.76 ds / m . TDS, TSS and CO2 for both sewage and tab water were (3780, 723) and ( 800 , 320) and (5.41, 1.23) mg/ L respectively. Results also showed that sewage water contain high concentrations of cations and anions as compared to tab water. Magnesium concentration was 469.42mg/L in sewage water and 100.1mg/L in tab water while calcium was 581.2mg/L in tab water and 60.8 in sewage water. Sodium concentration was 662.86 mg/L in sewage water and 186.3mg/L in tab water. On the other hand, water hardness and alkalinity were (3300 , 280) mg/L for sewage water and ( 2.40, 66.49) mg/L for tab water respectively .Results of this study also showed an increase in the concentrations of some ions in crude sewage water with respect to tab water. Concentrations ofchloride,phosphate,sulphate and nitrate in sewage water sample were 2496.31 Mg/ L,1.6 Mg / L , 1976 Mg / L ,3.67 Mg / L and for tab water were 226.8,0.7,108.48,0.6 Mg/L, respectively. Fecal coliform number was 2600 cell/100 ml in sewage sample and only 6 cell/ 100 ml in tab water. BOD5 andCOD values were 18, 167 Mg/ L for sewage water and 2.0, 6.0 Mg/L for tab water respectively Heavy elements also found to be elevated in sewage with respect to tab water , where the concentrations of Pb,Ni& Cd in sewage sample were 2.8, 0.8 & 0.004 Mg / L , while they were 0.09, 0.001 &undetected in tab water, respectively. On the other hand, sodium adsorption ratio SAR in sewage samples was 7 and in tab water was only 0.48.Laboratory experiments dealt with the following : 1 - It was used sand filters as a primary processing for waste water to remove pollutants prior to pass it through used filter upon incubating it for 14 days . 2 - in this study , it was selected four types of filters to remove contaminants and improve the quality of water is (water plant Ceratophyllum demersum, wood sawyer , , coal and Cladophora glomerta ). As it was used as filters either aprimary step in processing waste water through passing these waters as aby - pass step these waters on sand filter was used in this studay .3 - chemical , physical and biological characteristics of waste waters were studied upon passing it on the under - studying filters and also estimated the efficiency of removal Removal efficiency (%) of the components. 4 - Used of Some international Standerds and Iraqi specifications to evaluate the quality of water befor and after to pass it on filters for irrigation purposes. Some of criteria Such as (Kloke, 1980; WHO, 1995; US EPA, 1996; European Society, 1996 and Awasthi, 2000. ) were used to in the evaluation of soil contamination with heavy metals.This study reached to the following results : .The study concluded accrediting wooden sawyer + sand and water plant in recycling and reforming waste water and its capacity to remove pollutants, evaluation of quality of waste water and the treated water after passing through the filters under studay results indicated that all types of water inclusive the class (C4S1 ) which means high salinity water with afew of sodium element according to the classification of Laboratory US salinity. and water to cause toxicity problem in the study, and showed It results that candidates contributed to the removal of pathogenic bacteria from the treated water, and irrigation with waters passed through ceratophyllum dermersum L and sand filter leading treatment gave the highest dry to plant maize and two shoot and root weight, Result of statistical analysis showed that soils characteristics had a significant effect on of dry weight, concentration and quantity absorbed heavy elements in sections shoot and root to plant maize, was not for irrigation with treated wastewater impact on soil pollution with heavy metals and the results showed that the soils environmentally safe after relying on the Organization standards (WHO) and the American Environmental Protection Agency (US EPA).

فصــل وتنقية وتوصيف انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي == Isolated, Purification and Characterization of Lipoxygenase from Local Chickens Meat

اسم المؤلف: منى محمد زيدان
اسم المشرف: اياد نافع يحيى
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة اختيار افضل طريقة لاستخلاص انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي, من بين ثمان طرائق, وكان كلوريد الصوديوم (10)% هو الافضل في استخلاص الانزيم بفعالية كلية بلغت (918810) وحدة, ركز المحتوى البروتيني باستخدام كبريتات الامونيوم (60)%من بين خمس طرائق للتركيز (التنقية الجزئية), واكملت مراحل التنقية باستخدام التبادل الايوني والترشيح الهلامي بعمود DEAE - Sephadex - A50 , ومن ثم استخدام الترشيح الهلامي بعمود السيفاكريل ( Sephacryl S - 300) اذ بلغت الفعالية النوعية (17.10) وحدة / مل والفعالية الكلية (393) وحدة والحصيلة الانزيمية مقدارها (42.9)% وعدد مرات التنقية (7.50) مرة. وثم التاكد من نقاوة الانزيم باجراء عملية الترحيل الكهربائي بغياب المواد الماسخة للبروتين اذ ظهرت حزمة بروتينية واحدة في هلام متعدد اكريل امايد, ثم تم توصيف الانزيم واشارت النتائج الى ما ياتي : 1. كان الوزن الجزيئي هو (85) كيلودالتون مقدرا بطريقة الترشيح الهلامي.2. بلغت نقطة التعادل الكهربائي pI للانزيم (6.2).3. اظهرت الدراسة ان الانزيم من البروتينات السكرية وان نسبة الجزء الكربوهيدراتي تشكل (9.42)% عند تقديرها بطريقة الفينول - حامض الكبريتيك.4. وجد ان الدالة الحمضية الامثل لفعالية الانزيم (7), واظهر الانزيم ثباتا في مدى من قيم دالة الحموضة تراوحت بين (5 - 9).5. اظهرت النتائج ان درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم كانت (40) م°, عند دالة الحموضة الامثل لفعالية الانزيم, وان درجة الثبات الحراري لهذا الانزيم بين (10 - 40) م°.6. احتفظ الانزيم بكامل فعاليته الانزيمية عند حضنه بدرجة حرارة (40) م° لمدة (40) دقيقة وفقد (6)% من فعاليته في الدقيقة (50) وفقد (10)% من فعاليته بعد (60) دقيقة.7. بلغت قيمة طاقة التنشيط لتحويل المادة الاساس الى ناتج (8.836) كيلو سعرة / مول, بينما بلغت قيمة طاقة التنشيط لمسخ الانزيم (18.239) كيلو سعرة / مول.8. اظهرت دراسة الثوابت الحركية ان معدلات قيم ثابت ميكالس منتن ( Km ) لتفاعل الانزيم تجاه حامض اللينولييك كانت ( 0.296) ملغم/مل , في حين بلغت قيمة السرعة القصوى ( Vmax ) للتفاعل الانزيمي (1.50) وحدة/مل.9. اظهرت الايونات الموجبة للكالسيوم والمنغنيز والمغنيسيوم والنيكل تاثيرا منشطا, بينما اظهرت ايونات النحاس والحديد والخارصين تاثيرا مثبطا.10. وجد ان جميع المثبطات المعدنية المستخدمة في الدراسة سببت تثبيطا بدرجة واضحة مما يعطي دليلا على اشتراك المعادن في تفاعل الانزيم, اي ان هذا الانزيم من الانزيمات المعدنية. 11. وجد ان المستخلص الانزيمي النقي , له القدرة على تبييض دقيق القمح الاسمر كذلك تحسن الصفات الحسية للخبز المصنوع من الدقيق الاسمر بعد اضافة انزيم الليبوكسيجينيز المستخلص من لحم الدجاج المحلي له. | The study included the selection of the best methods to extract the enzyme among eight methods. It appeared that have given the highest activity of the crude enzyme (total activity = 918810 unit). The protein content was concentrated and precipitated by ammonium sulfate (60) %, among other five methods of concentration (partial purification). The purification stages were achieved by using ion exchange column chromatography (DEAE - Sephadex A - 50 column). Followed by gel filtration chromatography using Sephacryl S - 300. This method extract pure enzyme at a yield of (42.9) %, (7.50) times of purification and specific activity of (17.1) unit / ml. The purity of enzyme was certified by poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing condition, the enzyme was characterized by the following : - 1 - Its molecular weight was (85) KD as estimated by gel filtration.2 - Its Iso electric point was at (6.2).3 - The result showed that it was a glycoprotein with a carbohydrate content of (9.42) % as determined by phenol - sulfuric acid method.4 - Its optimum activity pH was (7). The enzyme was stable at pH range between (5 - 9).5 - The optimum temperature for enzyme activity was (40) C°at the Optimum pH. The enzyme stability temperature range between (10 - 40) C°. 6 - The enzyme keep full effectiveness when his lap (40)C° for (40) minutes, and lost (6) % of its effectiveness after (50) minutes, and lost (10)% of its effectiveness after (60) minutes.7 - The activation energy to convert the substrate to product was (8.836) kilo calorie / mole. The inactivation energy for the denatured enzyme was (18.239) kilo calorie / mole.8 - The average Michael’s constant ( Km ) for the enzyme reactions towards linoleic acid were (0.296) mg/ml. and its Vmax was (1.50) unite / minutes. 9 - The positive ions such as Ca, Mn, Mg and Ni have shown activating effect of Lipoxygenase, while the Cu, Fe and Zn have on inhibitory effect on the enzyme.10 - Metal inhibitors in habited Lipoxygenase clearly meaning that it is metallic protein enzyme.11 - Purified enzyme was clearly bleached the tan color of flour, leading to improvement of properties quality of the produced loaf.

تاثير نبات Carica papaya على طفيلي Giardia lamblia في الفئران وبعض التغيرات البايوكيميائية والنسيجية == Effect of Carica papaya on Giardia lamblia in mice, some biochemical and histological changes

اسم المؤلف: مصطفى كاظم ملاخ عزيز
اسم المشرف: شذى خضير
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة لمستخلص بذور نبات Carica papaya على 100 من الفئران السويدية التي تتراوح اعمارهم (6 - 10) اسابيع ومعدل اوزانهم (8 - 23) غم المصابة بطفيلي الجيارديا ثم ومعرفة بعض التغيرات المناعية والفسيولوجية المرضية والنسيجية والكيميائية الحياتية الحاصلة في تلك الفئران بعد استخدام مستخلص البذور كعلاج لتلك القئران من الجيارديا ثم مقارنتها مع الفلاجيل.بينت نتائج الدراسة المعطيات التالية : هناك انخفاض في مستوى البروتين الكلي في مصل مجموعة الفئران المصابة بطفيلي الجيارديا والمجموعة التي تم معالجتها بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2٪ و5٪ (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) في حين ارتفع مستواه في مجموعة الفئران التي تم معالجتها من قبل فلاجيل (4.35 ± 0.06) مقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة (4.10 ± 0.06).انخفض مستوى الكلكوز انخفاض طفيفا في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا (7.70 ± 0.04). في حين ارتفع مستوى الكلكوز في مصل الدم في المجموعة المعالجة بالفلاجيل وكذلك المجموعتين المصابة بالجيارديا والمعالجة بمستخلص بذور نبات ال Papaya 2% و5% (10.90 ± 0.04) (10.60 ± 0.05) (10.64 ± 0.07) على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (8.10 ± 0.06).مستوى انزيمات الكبد (GOT, GPT) ارتفعت في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة. انخفض مستوى الكوليسترول في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا وفي مجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 5% (1.50 ± 0.04) (1.64 ± 0.05) على التوالي, بينما ارتفع لدى مجموعة الفئران المعالجة بالفلاجيل (2.65 ± 0.03) ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 2% (2.65 ± 0.08) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (2.50 ± 0.00).ارتفع مستوى الكرياتين في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى البروتينات (A, C, D, E) انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري المغنيسيوم والصوديوم انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري الكالسيوم والبوتاسيوم انخفض في مجموعة الفئران المصابة بلجيارديا بينما ارتفع مستواه في مجموعة الفئران المعالجة بلفلاجيل ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2% و5% مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.اظهرت النتائج تغيرات فسلجية مرضية متنوعة في امعاء وكبد وكلية الحيوانات المصابة بطفيلي الجيارديا شملت قصر في الزغابات المعوية, ارتشاح خلوي التهابي, تنسج مع وجود التنخر واحتقان دموي مع تجمع للدهونافضل النتائج كانت بلنسبة للفلاجيل ومن ثم يليها المستخلص المائي لبذور بنات Carica papaya بتركيز 2%. | This study was conducted to determine the effect of different concentrations of seeds extract of Carica papaya plant on 100 Swedish mice aged (6 - 10) weeks and the rate of their weight (8 - 23) g infected with parasite of Giardia and then knowing some pathological physiological, histological and Biochemical changes that occurred in those mice after using the seed extract as a treatment for those mice from Giardia and then compare it with Flagyl. There is a decrease in the total protein level in serum of the group infected mice with Giardia, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) g/L respectivily while its level increased in the group which treated by Flagyl (4.35 ± 0.06 g/L) compared to the negative control group (4.10 ± 0.06 g/L). Level of glucose low slightly in serum in the group of infected mice with Giardia (7.70 ± 0.04 mmol/L), while its level high in the serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (10.90 ± 0.04, 10.60 ± 0.05, 10.64 ± 0.07) mmol/L respectively compared to the negative control group (8.10 ± 0.06 mmol/L). The level of the enzyme (GOT) and (GPT) high in all groups compared with a negative control. The cholesterol level in serum of the group infected mice with Giardia and the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 5% (1.50 ± 0.04 and 1.64 ± 0.05) mg/dl respectively, while its level high in the serum of the group that dosage with flagyl and the group that dosage with seeds extract of Carica Papaya concentration of 2% (2.65 ± 0.03, 2.65 ± 0.08) mg/dl respectively compared to the negative control group (2.50 ± 0.00 mg/dl). The level of Creatinine in the serum high in all groups compared to the negative control group. The level of vitamin A, C, D and E became low in the serum of all groups compared with negative control group. The level of Mg+2 and Na+ low in a serum of all groups compared with the negative control group. The level of Ca+2 and K+ low in a serum of the group of infected mice with Giardia while its level rise in a serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% compared to the negative control group. Results showed diverse histopathological changes in the intestines, liver and kidney of infected animals with Giardia included Palace in intestinal villi, inflammatory cellular infiltration, hyperplasia, necrosis, bloody vessels congestion and accumulation the fats. The best results were for Flagyl, and then for aqueous extract of Carica papaya in a concentration 2%.

التحطم الحيوي لسم فطر Fusarium graminearum داخل جسم الكائن الحي

اسم المؤلف: مشتاق طالب كريم
اسم المشرف: شذى علي شفيق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية بيان التاثيرات النسيجية والبايوكيميائية في نسيجي الكبد والكلى لذكور الفئران البيض تحت تاثير سم الزيرالينون المستخلص من عزلة فطرية منتجة لسم الزيرالينون Fusarium graminearum وبتركيز(2)ملغم/كغم بجرعة احادية وجرعات متكررة من السم وتجريعها فمويا , تقسيم الفئران الى ثلاث مجاميع (5 فئران لكل مجموعة) مع الاخذ بنظر الاعتبار وزن الجسم الحي واوزان الكبد والكلى,مجموعة عوملت بجرعة احادية من السم وتركت لمدة يومين (T1) ومجموعة اخرى عوملت بجرعتين اسبوعيا لمدة اسبوع (T2) ومجموعة عوملت بجرعـــتين كل اسبوع لمدة اســـبوعين (T3),وقد تم اخـــذ مجموعة السيطرة لكل معاملة وعـــوملت بالمحلول الذي اذيب فيه السم الفطري (1% ثنائي مثيل الكبريت) DMSO Dimethyl Suphxide.لقد لــــوحظ في نتائج هذه الدراسة تغيــــيرات نسيجية في الكـــبد عند المعاملتين T2وT3 تمـــثلت باحتقان في الاوعية الدموية مع تنخر وتنكس في الخلايا الكـــبدية وقلة حبيـــبات الكلايكوبروتين , بينما تضمنت التغيرات النسيجية في نسيج الكلى باحـــتقان دموي في الاوعية الدموية مع وجود تنكسات في الخلايا المبطنة الدانية والقاصـــية في المعاملــتين T2وT3 ولم تــظهر المــعاملة T1 اي تغيرات نسيجية في الكبد والكلى مقارنة مع معاملة السيطرة .اما نتائج الاختبارت البايوكيــــميائية لانزيـــمات الكبد والــــكلى فقد اظــهرت نتائج التحليل الاحصائي عـــــدم وجـــــود فروقات معـــــنوية فــــي قـــيــم انزيــــمي AST Aspartate Aminotransferase) ) وALT(Alanine Aminotransferase) عند المعاملتين T1وT2 , بينما اظهرت المعاملة T3 انخفاضا معنويا فــــي قيم كلا الانزيــمين وقد انـــخفضت الى (12.33,14.00) وحــدة دولية لكل لتر مقارنة مع معاملة السيطرة (22.00,20.00) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب , اما انــزيم (Alkaline Phosphatase) ALP اظــهرت المعاملتين T2وT3 ارتفاعا معنويا بلغت (23.00,18.66) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة(13.33)وحدة دولية لكل لتر, ولم تظهر المعاملة T1 اي اختلاف معنوي في قيم الانزيم ALP . اما تركيز اليوريا في مجانس نسيج الكلى فــــقد اظهر انخفاضا معنويا في المعاملتين T2وT3 اذ بلغت قيمته (23.66,24.83) ملغم / لتــــر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة (27.16) ملغم/لتر,اما المعامـــــلة T1 لم تظهر اي فروقات معنوية في قيم تركيز اليوريا، كما لم تظهر فروقات معنوية ولكافة المعاملات في تركيز الكرياتنين.تضمن الجزء الثاني من هذه الدراسة التحطيم الاحيائي لسم الزيرالينون بواسطة المعزز الحيوي العراقي بتركيز (2%) وزن/حجم وراشح خميرة Saccaromyces boulardii واللذان كان لهما الاثر الفــــعال والمعـــنوي , اذ لوحــــظ تحسن واضح في خلايا نسيج الكبد والكلى لمجموعة الفئران التي تم تغذيتـــها عــــــلى العـــليقة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح الخميرة مقارنة مع ما احــدثته السيطرة الموجبة والمتمثلة بمجموعة الفئران التي تغذت على العليقة الملوثة بفـــطر F.graminearum المنتج لسم الزيرالينون من تغيرات نسيجية في نسيجي الكبد والكلى.كما اظهرت نتائج التحليل الاحصائي لانزيمات الكبد في معاملة السيطرة الموجبة فروقات معنوية واضحة عند مستوى احتمالية (P˂0.01) بلغت قيــــم ا لانزيمات ASTو ALTوALP (25.66,14.66,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة السالبة (مجموعة الفئران التي تغذت على عليـــــقة غير ملوثة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لـــسم الزيرالينون ) اذ بلغت قيــــم الانزيمات الثلاثة (13.33,22.00,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب,و بينت نتائج تداخل تغذية ذكور الفئران لعـــليقة ملوثة بفطر F.graminearum المنتجة لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح خميرة S.boulardii زيادة معنوية في قيم الفـــعالية النوعية لانـــزيمات الكبد الثلاثة في مجانس نسيج الكبد وقـــــيمة تركـــيز اليــوريا في مجانس نسيج الكلى مقارنة مع معاملة السيطرة الموجبة. | The present study was conducted to evaluate the histological and biochemical toxic effects of Zearalenone on liver and kidney tissues of males white mice that extracted from fungal isolate Fusarium graminearum produced Zearalenone at concentration (2 mg / kg body weight) given single and repeated doses of toxin via oral administration. Mice were divided into three groups (five mice for each group), taking into consideration body weight, liver and kidney weights. T1 : receiving the toxin once and sacrificed after two days. T2 : given the toxin twice for one week. T3 : given the toxin twice a week for two weeks. Each treated group has its corresponding control which received 1% Dimethyl Sulphoxide (DMSO). The results showed the histological changes in liver tissue in T2 and T3 groups which represented by congestion vascular with necrosis and degeneration in hepatic cells in addition to reduction in glycoprotein granules. While, the histological changes in kidney tissue included congestion vascular and degeneration in distal and proximal tubules. No obvious histological changes were noticed in liver and kidney tissues in T1 group.The results of biochemical tests for kidney and liver enzymes AST (Aspartate Aminotransferase) , ALT (Alanine Aminotransferase) were shown no significant differences in means of the specific activity of these enzymes , AST and ALT in T1 and T2 groups .In contrast T3 group showed significant decreasing in values for both enzymes AST and ALT (14.00 , 12.33) IU/ L respectively . ALP (Alkaline Phosphatase) enzyme was increased significantly in T2 and T3 groups (23.00, 18.00) IU/L respectively compared with T1 and control groups . The results of Creatinine concentration in kidney tissue revealed no significant differences in all groups. In regard to Urea concentration in kidney tissue was decreased significantly in T2 and T3 groups (24.83,23.66) mg / L respectively compared with the rest of groups. The other part of the present study was to investigate the biological degradation of Zearalenone using by Iraqi probiotic 2% (w/v) and yeast filtrate of Saccharomyces boulardii which had an active influence . As observed a clear improvement in liver and kidney tissues for group of mice that fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate compared with positive control ( group of mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ) that caused the histological changes in liver and kidney tissues .The results of liver enzymes showed significant differences in positive group for three enzymes ALS , ALT and ALP reached ( 15.66, 14.66, 25.66 ) IU/ L respectively , compared with negative control (group of mice did not fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ). However , the results of the interaction between mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate were shown significant increasing for ALS , ALT , ALP enzymes in addition to urea concentrations in kidney tissue compared with positive control

توصيف جرثومة Enterobacter sakazakii المعزولة من مصادر مختلفة في محافظة ذي قار == Characterization of Enterobacter sakazakii Isolated from various sources at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: مروى حسن نصير الصافي
اسم المشرف: يحيى عبد الرضا عباس | راجي طعمة ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى الكشف عن بكتريا Enterobacter sakazakii في بيئات مختلفة شملت عينات غذائية وبيئية وسريرية . اذ جمعت 310 عينة خلال الفترة من ايلول 2012 ولغاية تموز 2013.اظهرت نتائج الزرع الاولي على وسطVRBAواكار الماكونكي بعد التشخيص بالاعتماد على الصفات الزرعية والكيموحيوية وتوكيد التشخيص باستعمال العدة API 20E. ان 22 (7.09%) من اصل 310 عينة اعطت نموا لبكتريا Enterobacter كالاتي 9/80(11.2%) من بيئة المستشفيات ,12/180(6.6%) حليب اطفال,1/50(2%)من حالات الاسهال . توزعت العزلات بعد التشخيص المختبري على الانواع التالية (15/22) 68.1% Enterobacter cloacae,(4/22)18.1% Enterobacter sakazakii و3/22))13.6% للنوع Enterobacter aminogenus. اختبرت مقاومة عزلات Enterobacter sakazakii الاربع ضد 20 مضادا من اصناف مختلفة وقد اظهرت النتائج ا ن جميع العزلات كانت مقاومة على الاقل لست من المضادات قيد الاختبار.اختبرت قدرة بكتريا Enterobacter sakazakii على انتاج انزيمات البيتا لاكتيميز واسعة الطيف واظهرت العزلات عدم قدرتها على الانتاج واستخدمت طريقة القرص المصاحب لمعرفة قابلية العزلات على انتاج انزيمات الميتالو بيتا لاكتاميز.درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج ان 2/4(50%) من العزلات لها قدرة على انتاج الغشاء الحيوي.كما د رست قدرة البكتريا على مقاومة التاثير القاتل للمصل وظهرت العزلات كلها موجبة بينما درست قدرة البكتريا على تلازن كريات الدم الحمراء لوحظت تحت المجهر واظهرت النتائج ان 3/4(75%)من العزلات كانت موجبة.اختبرت قدرة البكتريا على انتاج السموم المعوية باستخدام الفئران الرضيعة وظهرت كل العزلات منتجة له وقد ظهرت على الفئران الرضيعة بالسموم المعوية اعراض سريريه حادة مثل انخفاض النشاط والحركة البطيئة وعلامات ضعف مع تغيرات في المعدة وخسارة التركيب النسيجي للغشاء المخاطي والغدد وظهور بؤر للخلايا المتحللة وزيادة في سمك الجدار مع تقرحات في النسيج اما التغيرات المرضية في الامعاء فهي تغيرات غير مخصصة تمثلت بتقطعات في النسيج الطلائي وتقرحه وفقدان لشكل النسيج والغدد. | This study was aimed for detection occurrence of Enterobacter sakazakii in stool specimens, infant formula and hospitals environments. A total of 310 samples (180 infant formula, 50 stool samples and 80 hospital environment swabs ), during the period from September 2012 to July 2013 were collected. Growth on Violet redbile agar and MacConkey agar was identified by cultural and biochemical tests and confermated by API 20 E system which revealed that : Only 22/310(7.09%)gave positive growth for Enterobacter spp. as following : 9/80 (11.2%) environmental swabs , 12/180(6.6%) infant formula and 1/50 (2%) stool samples. Diagnosis of the isolates appeared that E. cloacae was (15 ⁄ 22) while E . sakazakii (4 ⁄ 22) and E. aminogenus (3/22). Four E. sakazakii isolates were screened for their antibiotic resistance against 20 antibiotics of different classes using Kirby - Bauer disk diffusion method. The results showed that all the tested isolates were resistant to at least 6 antibiotics of which they were tested . In the present study four E. sakazakii isolates where screened for potential ESBLs production, they showed 3 (75%) isolates were potential ESBLs production ,but conformation of ESBLs production was detected by double disk synergism test and appeared that all the isolates were unproductive . Combined disk diffusion method was used for detection of metallo - β - lactamase - producing isolates, they were emplace each of imipenem and ceftazidame antibiotics with and without EDTA on Mueller - Hinton agar, because EDTA working to inhibit of metallo - β - lactamase. The results showed that the presence of EDTA does not affect the diameter of inhibition zone for the four isolates. Biofilm production was detected by spectrophotometric method .The four isolates were tested and appeared that 2(50%) were produced biofilm. The resistance of bacterial isolates to serum bactericidal activity was tested by the turbidmetric assay . All isolates were appeared able to resist to serum bactericidal activity, while Agglutination of erythrocytes was tested under the microscope and showed 3/4(75%) were positive. In the present study E. sakazakii were evaluated enterotoxin production. All the isolates showed positive for enterotoxin production. Results of treating suckling mice with enterotoxin showed acute clinical signs appeared depression, slow movement and signs of weakness. Significant macroscopic finding showed in mice treated with enterotoxin the stomach was distended and enlarged with thick corrugated mucosa but no significant changes in intestine. Pathological changes in the stomach appeared as loss of normal architecture of mucosa and glands, multiple foci of degenerative cells, reactive epithelial surface with thickening wall, pseudo - metaplasic changes and superficial epithelial injury. The intestinal changes showed nonspecific pattern of damage to surface of epithelium .Complete loss of architecture of glands and mucosal epithelial , superficial epithelial discontinuity , ulcer and non - specific reactive epithelial surface.

الممرضات الداخلية المسببة لحالات الاسهال لدى الاعمار من 1 - 15 سنة في مدينة بغداد

اسم المؤلف: مروة محمد نصري التميمي
اسم المشرف: سلوى صبر محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The diarrhea is Enteropathy characterized liquidity abnormal,because of the increases by the movement of colon in the general way, may be represent a good sign to the Enteropathy like the Entamoeba histolytica disease, viruses Enteropathogen and bacteria,The diarrhea and associated of droughts state remains the major problem to the job of medial health in the medial east especially in the age under 5 years old.This study design to study the reason of the diarrhea and diagnosis and the effect result of it in the children under 15 years old, theirs patient from (learn hospital of alemamenalkadoman) in the city of Baghdad from 25/4/2014 to 1/10/2014 period of time, the study represent 103 sample of Stool and blood from children between (>1 - 15)years wasSufferers from diarrhea state, this state diagnose with infection of parasite (E.histolytica, G.lamblia, and others), Rotaviruses and bacteria E.coli.It use the general stool examination direct (by eyes) and in direct (by microscope) to diagnose the antigen of rotaviruses in stool, Either the blood sample store in two tube one of it contain EDTA use to CBC, Pcv, Hb, w.b.c, ABO group measure, and the second one is empty from the EDTA use to ayanlsys serum to measure (CRP) and Interleukin in the patient diarrhea.From summation of 103 found that 50 (48.54%) infected by intestinal protozoa, 41 (39.80%) infected by Rotaviruses, 9 (8.73%) infected by mixed (Parasite + Rotavirus), 3 (2.91%) infected by bacteria E.coli.50 sample infected by intestinal protozoa (42 sample is infected with one Species of parasite and 8 sample of stool continue two type of the parasite), the highest ration of infection was E.histolytica 50%, G.lamblia 38.10%, Blastocystis hominis 7.14%, and the lowestBalantidium coli 4.76%, the study recode the highest ration of mixed infected (Parasite + Rotavirus) was between G.lamblia + Rotavirus 33.33%.In This study present we found highest deference between male and female in the infection of parasite and rotavirus, male record (62 - 60)% and female (38 - 40)% on series, mixed infected (parasite + Rotavirus) Reached to the female 55.56% and this is the highest ration infection from the male 44.44%, notice that there is high Significant difference in the ratio of infection between the Age groups of the groups studied at the probability of p<0.01, where recording rotavirus infection IIhigher ratio infection in the Age groups (1 - 5) year 66,67% and less ratio 11,11% where age groups less than year, but the parasite infection only was more age group infected liable (more than 5) year with ratio 56% and smallest ratio for age group (less than year) 18%. And in the result media use (L.E) to culture E.histolytica and discover from the study , this media don’t provide good environment to maintain the parasite and resolve it for a limited period without multiplication or increase in number is it, in the case of trophzoite stage culture it stay with out - increases in the number is for one day only and after bass 24 hour transfer to the cyst stage and remain bass 3 day only and despair in the fourth day, while in culture of cyst stage Found that Noway to transform to the trophzoite stage like it happen in the human body but stay in the case of cyst stage on states. With condition E.histolytica that the Stool samples continue blood and mucous only to contain a lot off mass from the trophzoite stage and this stage only can be increases causes increase in number.Noted that this culture never dedicated only to the cultivation E.histolytica but noted the trophzoite stage exist for parasite B.coli in this stage and when culture sample from Stool contain B.coli and remain this stage Governor of the trophozoite stage for a period of two days.Either for the blood type test has been shown by the study, the highest percentage recorded rotaviruses injury in people living with antigen type A 39.59%, 39% and 44.44% for parasitic and rotavirus infections and joint respectively.And gave a hemoglobin level of Hb and size precipitation of red blood cells PCV lowest level at co - infection (parasit + rotavirus), followed by rotaviral and parasitic infection compared with control group P <0.05. Showed parasitic infection and joint significant difference in the total number of white blood cells when the probability of P <0.05, either rotaviral infection did not give a significant difference with the control group.The results of the present study about differential count of white blood cells, showed no significant difference comparing with study groups, but showed significant difference within the three groups with control group that remain the value of the Moral difference p<0.05 When all of the (Neutrophil ،Basophile ،Eosenophil)However, it did not register significant difference when cells Lymphocyte.When statistical analysis when studying some immunological changes associated with injuries intestinal regarding the number of days that lasted the case of diarrhea, and by which they can determine if the injury was severe diarrhea or chronic, and that gave significant difference (1 - 2) day P <0.01 when (3 - 4) day and (more than 4) on the value of the differences P <0.05.log CRP level of rotavirus infections 31.70%, 0.52% for infections with parasite, 88.89% of the common injuries (parasitic + viral) gave at P <0.01 probability asignificant differences.The results of the study of some of the dynamics of cellular aggregates of the study and its relationship to the immune response. Observed statistically significant at the use of IL - 10 three of its study groups recorded a significant P <0.05 was higher at 1.22% viral infection compared to the control group. Parasitic infection and did not record any significant difference.And log IL - 17A highest percentage increase at the joint injury, and there is no significant difference between the incidence of parasitic and viral infection.For IL - 33 infection joint highest recorded percentage of injury followed by a parasitic infection and finally viral. and IL - 4 infection shared the highest rate, followed by injury viral recorded and finally parasitic and gave moral difference P <0.05 and finally INF - gama, which did not record any significant differences when comparing the groups study together but gave at P <0.01probability moral differences with group of control when compared recorded the highest common injury is also high.

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من نماذج الانسان باستخدام تقنية تفاعل البوليمرز المتسلسل (PCR) والنشاط المضاد لمستخلصات قشور البصل == Isolation and Identification dermatophytes from human Samples By using polymerase chain reaction (PCR) Technique and Antidermatophytic activity of onion peel extracts

اسم المؤلف: محمد عبد الكريم الخفاجي
اسم المشرف: عبد العزيز مجيد نخيلان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الفطريات الجلدية هي واحدة من مجموعة من الفطريات ذات الصلة وثيقة والتي لديها القدرة على غزو الانسجة المتقرنة (الجلد والشعر) في الانسان والحيوانات لاحداث الاصابة الجلدي دعى Dermatophytosis والمعروفة لنا على انها التهابات حلقة الدودة. لعزل وتحديد الفطريات الجلدية من العينات السريرية ودراسة النشاط المضاد للفطريات antidermatophytic للمستخلصات قشور البصل (Allim cepa) . جمعت 60 عينة من مستشفى ابو قاطع ابي غريب، 22 عينات من مستشفى اليرموك و18 عينة من تلاميذ المدارس الابتدائية في ابو غريب على التوالي. وقد اجريت الدراسة خلال الفترة الممتدة من اكتوبر 2014 الى اذار 2015. باستخدام الفحص المجهري والزرع تشخيصت وجود فطريات جلدية لدى (90) مريض من اصل (100) مريضاﱟ فقط اي بنسبة (90%) ، وقد تبين ان 59 (59%)من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري والزرع . في حين عدد الحالات السالبة في الفحص الزرعي فكان 31 اي بنسبة (31%) حيث كانت انواع مختلفة ل Candida spp، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 10 (10%) حيث كانت اجناس فطرية اخرى مثال على ذلك Penicillium sp, Aspergillus niger . اظهرت الفحوصات المختبرية تباين الانواع الفطرية الجلدية المعزولة اذ ان اكثر الانواع الفطرية الجلدية المعزولة كان الفطر Trichophyton.mentoagrophytes ظهر في 27 عينة (45.7%) ,يليه الفطر Microsporum.canis ظهرفي 18 عينة (30.6%) , والفطر Trichophyton.rubrum كان في 9 عينات (15.25%) وبينما كان الفطر Trichophyton.verrucosum اقل الانواع الفطرية المعزولة وظهر في 5 عينات فقط وبنسبة (8.4%) . واظهرت النتائج تباين في نسبة الاصابة بين الذكور والاناث ، حيث سجلت اعداد ونسب المصابين بالامراض الفطرية تبعا للجنس. اذ سجل عدد الذكور 39 اصابة اي (66.1%) اما عدد الاناث فقد بلغ 20 اصابة اي (33.9%).تبين من خلال هذه نتائج هذه الدراسة ان الاصابات بالامراض الفطرية كانت اكثر تكرارا خلال الاشهر المعتدلة درجة الحرارة حيث لوحظ زيادة نسبة الاصابة في فصل الربيع والذي سجلت فيه اعلى نسبة للاصابة خلال شهر اذار (35%) ،شهر شباط (25%) ، شهر كانون الثاني (18%) ، شهر كانون الاول (12%) ، شهر تشرين الثاني (10%) على التوالي .هرت النتائج وجود علاقة ما بين الاصابة ومناطق سكن المرضى حيث بلغت نسبتها في المناطق الريفية (84%) مقارنة مع المناطق الحضرية التي بلغت (16%) ، كما اظهرت ان الفطريات الجلدية التي تنتقل عن طريق ملامسة الحيوانات اكثر تكرارا (84.4 %) من كانت الملامسة البشرو التي كانت اقل تكرارا (15.6 %).شخصت الفطريات الجلدية المعزولة بطريقة تفاعل سلسلة انزيم البلمرة PCR ،واظهرت النتائج تماثل في الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة وحيث قورن مواقع هذه الحزم مع موقع الحزم ذات الاوزان الجزيئية المعروفة العائدة للدليل الحجمي, حيث جاءت النتائج متماثلة للحجم المتوقع وهو 500bp (زوج قاعدة) كناتج لعملية تضاعف البادىء primerالمتخصص بالفطريات الجلدية لكل M. canis , mentogrophyt T. , T. vrrucosum . وقد تمت دراسة التاثير التثبيطي لكل من المستخلص المائي والكحولي (الحار والبارد ) لقشور ثمرة البصل ، كل على حدة في النمو القطري لمستعمرات الفطريات الجلدية والاكثر تكرارا حيث شملت الفطرين M. canis ,. mentogrophyt T . واظهرت نتائج استخدام المستخلصات النباتية لقشور ثمرة البصل ان ادنى التركيز المثبط للنمو من المستخلص المائي الحار هو (0.78)ملغم/مل للفطر T.mentogrphytes اما الادنى التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل، اما الفطر M .canis فان الادنى التركيز المثبط للنمو هو (0.78)ملغم/مل اما التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل . وللمستخلص المائي البارد فان ادنى التركيز المثبط للنمو هو (1.56)ملغم /مل للفطرT.mentogrphytes واما ادنى التركيز القاتل فقد كان (25) ملغم/مل. واما فطر M .canis فادنى التركيز المثبط للنمو هو (3.125) ملغم /مل والتركيز القاتل فقد كان (12.5) ملغم/مل. كما تبين ان لادنى التركيز المثبط من المستخلص الكحولي الحار والكحولي البارد لقشور البصل هو (0.78) ملغم/مل على النوعين الفطريات ، اما ادنى التركيز القاتل للمستخلص الكحولي الحار والبارد فهو(50) ملغم/مل بالنسبة للفطر M. canis ,. mentogrophyt T . | Dermatophytes are one a group of closely related fungi that have the capacity to invade the keratinized tiusse (skin and hair) of human and other animals to produce cutaneus infection called Dermatophytosis commouly referred to as ring worm infections . To isolate and identify the dermatophytes from clinical samples and to study the antidermatophytic activity of onion (Allim cepa ) extracts . 60 sample from Abu Graib Hospital , 22 samples from Yarmook Hospital and 18 sample from elementany school pupils Abu Graib regian were Collected respectively . The study was conducted during the period extended from oct , 2014 to Mary ,2015 . by microscopial examination and cultivation have been diagnosed with the presence of Dermatophyte at (90) patients only at a rate (90%), has been shown that 59 (59%) of the cases were positive Result by microscopic examination and cultivation. As the number of negative cases in the examination cultivation was 31 ( 31%), where the different genus for Candida sp, either the number of negative microscopic examination and cultivation is 10 cases (10%), where anther genus of fungi for example Penicillium, Aspergillus niger. When you identify the types of fungi, laboratory tests showed fungal species isolated skin variation، The most common fungi isolated were T.mentoagrophyt where the sample was 27 (45.7%), followed by M.canis where the 18 samples (30.6%) , was T.rubrum 9 samples (15.25%), and while The T.verrucosum was less fungal species isolated where , the number of isolated samples only 5 (8.4%).There were significant differences in Infection rate between males and females, were recorded prepare ratios infected with fungal diseases Accordingly sex, and as it was recorded that the number of males 39 (66.1%) The number of females has reached to 20 (33.9%) .It has been shown through this study that fungal diseases Infection were more frequent during of moderate temperature months of year ,observed increase in Infection of the during spring, which recorded the highest rate of infection during the month of March (35%), followed by injuries recorded in the month of February (25% ) then the month of January (18%) and the month of December (12%) and then the November (10%) respectively.about the relationship between infected with Housing areas, showing High incidence was recorded in rural regions (84%) in comparison with urban regions(16%). the study demonstrated a significant shift in the skin fungus that causes the disease towards animal species (84.4% ), while the human species less frequent (15.6%). Diagnosed skin fungi by (PCR) manner enzyme polymerase chain reaction, The results showed similar in molecular weight of packages multiplying and these sites packages as compared to with site with molecular weights known as belonging to the manual volumetric packages ,where the results were similar to the size of the expected site, a 500bp (pair base) as a product of the process started it doubled primer M. canis, T. mentogrophyt, T. vrrucosum.Has been studied the inhibitory effect of each of the aqueous and alcoholic extract (hot and cold) to peel the onion, Separately in growth of the colonies skin fungi isolated from injuries skin diseases, and the most frequent during this study, which included fungi Micrsporum canis , mentoagrophyt Trichophyton.And it showed the results of the use of plant extracts to peel onions that minimum inhibitory concentration(MIC) of the growth of the aqueous extract is (0.78) mg / ml for T.mentogrphytes The minimum Focus concentration (MFC) is 25 mg / ml, either MIC for M .canis is (0.78) mg / ml The MFC 25 mg / ml . To the water cold extract, MIC is (1.56) mg / ml of T.mentogrphytes MFC is 25 mg / ml. The M .canis MIC is (3.125) mg / ml MFC is (12.5) mg / ml.And the MIC of the hot alcoholic and cold alcoholic extract of onion peel is (0.78) mg / ml and the MFC is 50 mg / ml for both M. canis, T. mentogrophyt .

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية Dermatophytes ومقاومتها ببعض المستخلصات النباتية == Isolation and Identification of some Dermatophytes and its control by the plants extracts

اسم المؤلف: محسن محمد فرج
اسم المشرف: عبد العزيز مجيد نخيلان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لغرض عزل وتشخيص الفطريات الجلدية المسببة لمرض داء السعفة التي تصيب الانسان ودراسة حساسيتها بواسطة المستخلصات النباتية للاغصان الفتية لنبات التين والحليب النباتيlatex,اذ تم جمع 100 نموذجا (قشطات جلدية ،شعر، اظافر) ماخوذة من مناطق مختلفة من الجسم ذكور واناث بفئات عمرية مختلفة من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية التابعة لمستشفى الامام علي() الذين شخصوا من قبل الطبيب المختص كحالات اصابة سريرية بالفطريات الجلدية للمدة ما بين تشرين الاول 2013 ولغاية حزيران 2014.تم فحص النماذج مختبريا بالفحص المجهري المباشر باستعمال هيدروكسيد البوتاسيوم KOH (%10) ثم زرعت النماذج على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ اظهر الفحص المجهري المباشر والزرع 52 مريض بنسبة (52%) من المجموع الكلي للاصابات من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري المباشر والزرع ، في حين كان عدد الحالات الموجبة بالفحص المجهري المباشر وسالبة بالزرع هو 41 مريض بنسبة (41%) ، وكان عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر وموجبة بالزرع هو 0 اصابه بنسبة (0%) ، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 7 اصابات وبنسبة (7%).اظهرت نتائج العزل والتشخيص ستة انواع من الفطريات الجلدية اذ سجل اعلى نسبة الفطر Trichophyton rubrum 33.33% ثم يليه في نفس المرتبة كل من Trichophyton schoenleinii وMicrosporum canis بنسبة20%)) لكل منهما ويليه Trichophyton tunsouransبنسبة 13.33%وكذالك احتلت كل من Trichophyton mentagrophytesو Trichophyton vercosum 6.66% . وبلغت اصابات الذكور46.67% اما اصابات الاناث فكانت 53.33% . واكثر فئة عمرية متاثرة بالاصابات الفطرية الجلدية هي سن العشر سنين اذ بلغت نسبة الاصابة 20% . وحول موسم انتشار هذه الاصابات الجلدية اذ تبين ان الاصابة اكثر تكرارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه النسبة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة خلال شهر نيسان وبنسبة (27 %) ، وادنى نسبة اصابة خلال شهر تشرين الاول وبنسبة (2%) . وفيما يخص مصادر الاصابة بالفطريات الجلدية وجد ان تربية الحيوانات المنزلية والحقلية هي الغالبة وبنسبة (% 33) ، يليه استعمال ادوات الاخرين بنسبة (% 23) وباقي الاصابات لم يوجد لديهم تماس مع الحيوانات ولا لبس الملابس المستعملة .ان المستخلص المائي البارد والكحولي البارد اعطى اعلى فعالية تثبيطية مقارنة بالمستخلص الكحولي الحار والمائي الحار .كما اظهرت الفطريات الجلدية فيما بينها فروق معنوية اذ اظهر الفطر M.canis حساسية اعلى للمستخلصات المختلفة يليه الفطر T.mentagrophytes. ثم الفطر T.rubrum. وقد اظهر المستخلص المائي البارد فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وان معـــدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز75mg/ml)) اما عند تركيز50mg/ml كانت نسبة التثبيط(,18 64.16 12.5,)% على التوالي لكل من الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها 12) , 3.3 4.1 ,) % على التوالي عند التركيز5mg/ml وعند التركيز 0.5mg/ml)) نسبة تثبيط, 0.8) 27.9 , % ( 3.3 .اما المستخلص الكحولي البارد فقد اظهر فاعلية تثبيطية للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وبمعدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز 75mg/ml)) وبنسبة تثبيط مقدارها(56.7,78.9,58)% على التوالي عند التركيز 30mg/ml,اما عند التركيز( 3mg/ml) فقد فكانت نسبة التثبيط (65.6,68.4,50) % على التوالي , ووصلت النسبة المئوية للتثبيط ,46.6) 52.6 , 57.4 ) % للتركيز 0.3mg/ml . اما المستخلص المائي الحار فكان اقل كفاءة ضد الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها( 22 , 2.6 , 30.3)% على التوالي عند التركيز (75mg/ml) ,اما عند التركيز 7.5mg/ml)) فقد بلغت نسبة التثبيط مقدارها3.22,0,3.1) )% على التوالي في حين بلغت بنسبة تثبيط مقدارها (12.2 , 0 , 19.3 ) % لجميع الفطريات عند التركيز. (0.75mg/ml )اما المستخلص الكحولي الحار فقد اظهر فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum عند التركيزmg/ml) 40) بلغت نسبة التثبيط (62.5,53,28) % على التوالي , وعند التركيز ml) (4mg/بلغت نسبة المئوية للتثبيط(24.6 , 51 , 44 )% وعند تركيز 0.4mg/ml) ) بلغت نسبة التثبيط (22.6 , 32.6 (43.4 ,%. وكذلك تم استعمال حليب التين كمستخلص للفطريات قيد الدراسة T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum بتركيز1.5mg/ml)) واثر هذا التركيز على نمو المستعمرات الفطرية وبنسبة تثبيط بلغت (28 , 29.16 , 12.5)% .اذ درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقاري الفلوكونازول وايتريكونازول في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrumوعلى التوالي وبتركيز (7.5mg/ml)للمضاد الفطري fluconazol وكانت بنسبة التثبيط (59.6 , 33.3 , 80.5)% بينما بلغت نسبة التثبيط لنفس المضاد بتركيز 15mg/ml)) (70 , 100 % (88.7, واستخدم ايضا المضاد Itraconazol بتركيز 5mg/ml)) للفطريات قيد الدراسة فبلغت بنسبة التثبيط للمستعمرات الفطرية (28.3 , 22.2 , 53)%. واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلصين المائي والكحولي الباردين لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر T.mentgrophytesفي الارانب. | This study was carried out to Isolate and Identify the Dermatophytes which infect human and control plants (Ficus carica) by using the extracts of the young branches of Fig . One hundred specimens (scale ,nail and hairs) have been taken from everybody were collected from outpatient visiting the Dermatology in Al - amamm ali alyehi Alsalam , which diagnosed as dermatophycosis infection during the period extended from November 2013 through September 2014 . On direct microscopically examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty two fungal isolates.(52%) were positive by direct microscopically examination and culture ,(41%) were positive by direct microscopically examination and negative in culture and (7%) were negative by culture and microscopical examination . The most common fungi isolated were Trichophyton rubrum(33.33 %) followed by Trichophyton schoenleini (20%)M.canis (20%) Trichophyton tunsourans 13.33% Trichophyton mentagrophytesو T.vercosum 6.66% There was recorded among male (46.67%) than female (54.43%) ,the higher percentage for fungal infection was recorded in the age ten years with percentage (20%). Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (27 % ) while the lowest rate was in February (2%). concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (33%) and using others instruments (23%).Young branch extract of the Fig plants ( Ficus carica ) were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and Fluconazol,Itraconazol were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Fig cold water and ethanol extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Microsporum canis was the highest sensitive compared to the other tested fungi.Cold aqueous extract showed of different inhibitory effect according to concentration and fungal test Tricophyton.rubrum,M.canis,Tricophyton.mentgrophytes with average diameters zero and 100% inhibition at concentration (75mg/ml).while concentration(50mg/ml)the inhibitory effect (33.2,64.16,12.5)% respectively for each fungi T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes with inhibition percentage(12,3.3,4.1)% respectively at concentration (5mg/ml),while inhibitory effect at(0.5mg/ml) concentration was (0.8,27.9,3.3)% Cold alcohol extract showed inhibitory effect of fungi T.rubrum,T.mentgrophytes,M.canis,and the average diameters of fungal colonies (zero)and(100)% inhibitory at (75mg/ml) concentration ,respectively at (30mg/ml) concentration ,as well as (3mg/ml) concentration appear inhibitory effect (50,68.4,65.6)% respectively ,and the percentage of inhibitory reach (45.6,52.6,57.4)% at(0.3mg/ml) concentration .Hot aqueous extract showed lowest efficiency against T.rubrum,M.canis. T.mentgrophytes, with in hibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (75mg/ml)concentration the inhibitory effect (3.1,0.1.2)% respectively ,as well as the inhibitory effect (12.2,0,19.3)% of all fungi at (0.75mg/ml)concentration.Hot alcohol extract showed lowest efficiency against (T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes),with inhibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (40mg/ml)concentration the inhibitory effect (62.5 ,53.6, 28)% respectively ,as well as the inhibitory effect (44, 51, 24.6)% of all fungi at (4mg/ml)concentration and the inhibitory effect (43.4,32.6,22.6)of all fungi at (0.4 mg/ml) According to these results the cold aqueous extracts of Fig plants have been diagnosed to examine their effectiveness (In vivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes infection in rabbets

دراسة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل sativus Raphanus ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في الارانب == A Study the Protective Effect of Alcoholic Extract of Plant Raphanus Sativus (Radish) Seeds against the Oxidative Stress Induced by Sodium Nitrite on Liver and Kidney of Rabbits

اسم المؤلف: لينا احمد عبد العزيز
اسم المشرف: عالية حسين علي | مختار خميس محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية الى معرفة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم NaNO2على كبد وكلى ذكور الارانب. باستخدام كحول 70% لاستخلاص المركبات الفعالة من البذور. استخدمت في الدراسة الحالية 25 ارنب ذكر قسمت الى 5 مجاميع تضمنت كل مجموعة 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوم. المجموعةT1 : جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم, المجموعة : T2 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 50 ملغم/كغم, المجموعة : T3 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 100 ملغم/كغم, المجموعة : T4 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل وبجرعة 200 ملغم/كغم, بالاضافة الى المجموعة : C مجموعة السيطرة جرعت فمويا بجرعة من الماء المقطر مساوية لحجم الجرعة المعطاة لمجاميع المعالجة. اوضحت نتائج الدراسة الحالية في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم حصول ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد (AST, ALT ,(ALP,مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين, ناتج اكسدة الدهون) وانخفاض في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم والمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل 200,100,50 ملغم/كغم لوحظ حصول انخفاض في مستوى انزيمات الكبد (,AST, ALT ,(ALP مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين وناتج اكسدة الدهون) وحصول ارتفاع في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم فقط. بينت نتائج الفحص النسجي لكبد المجموعة المعاملة بنتريت الصوديوم توسع الجيبانيات الدموية, احتقان الاوعية الدموية, ارتشاح الخلايا الالتهابية, تنكس دهني ومائي, تنخر, زيادة اعداد الخلايا الكبدية ثنائية النواة, واظهرت النتائج النسجية لكلى المجموعة المعاملة بمادة نتريت الصوديوم انكماش الكبيبة, احتقان, ارتشاح الخلايا الالتهابية , نزف , تنكس , وذمة, تضخم. بينت نتائج الفحص النسجي لانسجة الكبد والكلى للمجموعة المعاملة بمستخلص البذور وجود حالة اصلاح لهذه الاعضاء. اعتمادا على نتائج الدراسة الحالية نستنتج ان المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة (50 و100 و200 ملغم/كغم) يمتلك فعالية مضادة للاجهاد التاكسدي المستحدث بمادة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في ذكور الارانب. | The aim of this study is to investigate the protective effect of Radish (Raphanus sativus) seeds alcoholic extract against oxidative stress induced by sodium nitrite NaNO2 on liver and kidney in male rabbits. By using 70% alcohol to extract active compound from seeds of R.S. Twenty five adult male rabbits were divided into five groups (five rabbits in each group) and treated daily for 30 days. Group T1 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 , Group T2 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 50 mg/kg of alcoholic extract, Group T3 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 100 mg/kg of alcoholic extract, Group T4 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 200 mg/kg of alcoholic extract from Raphanus sativus seeds as well as Group C : control intubated orally distilled water. Founded in rabbits intubated with NaNO2, that there was increasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), and oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and a decrease in the level of glutathione (GSH) comparing with control . In rabbits intubated with NaNO2 + 50,100,200 mg/kg of alcoholic extract found that there was decreasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and increasing in the level of GSH in comparison with rabbits intubated with NaNO2 only. The histological sections of liver which was treated with S.N. revealed dilation of blood sinusoids, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells, fatty and hydropic degeneration, necrosis and increase number of binucleated hepatocyte. Histological sections of kidney which was treated with S.N. presence of glomerular shrinkage, congestion, infiltration of inflammatory cells, haemorrhage, degeneration, edema, hypertrophy. Histological examination of liver and kidney tissue which was treated with seeds extract, revealed healing of these organs. In conclusion according to results obtained from this study that alcoholic extract of Raphanus sativus seeds in dose (50,100,200 mg/kg) have protective effect against oxidative stress induction by sodium nitrite on liver and kidney in male rabbits.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

اسم المؤلف: لمى يوسف مهدي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

اسم المؤلف: لمى قاسم علي الطائي
اسم المشرف: نوري محمد لعيبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة لبعض الهرمونات الجنسية لدى الاشخاص المصابين بداء المقوسات الكوندية المراجعين لبعض مستشفيات بغداد == Study of some sexual hormones in infected humans with Toxoplasmosis attenuated in some Baghdad hospitals

اسم المؤلف: فرح محمود شتيب ابراهيم الوائلي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد داء المقوسات احد الامراض الوبائية الذي ينتشر على نطاق واسع جدا في جميع انحاء العالم. سببه هو الاصابة بطفيلي التوكسوبلازما Toxoplasma gondiiويساعد في انتشاره الظروف المناخية والجغرافية والعادات الاجتماعية والثقافية والغذائية. وقد اجريت هذه الدراسة على 130 امراة (حوامل ومجهضات) مصابات بداء المقوسات واللاتي يعانين من حالات الاجهاض او بدونه. وقد وجد ان 90 مريضة من اللواتي تم احالتهن من قبل الاخصائي لمستشفى فاطمة الزهراء (عليها السلام) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة ضد داء المقوسات, و90 رجل مصاب بداء المقوسات من المركز الوطني لنقل الدم وقد تراوحت اعمارالاشخاص بين 15 - 45 سنة في الفترة من ديسمبر 2014 الى مارس 2015 وبالتوازي مع ذلك، تم اختيار 60 امراة و30 رجل سليمين كمجموعة سيطرة. وقداظهرت النتائج ان نسبة الاصابة بهذا الطفيلي للنساء والرجال كانت 69.23% و66.67% على التوالي باستخدام طريقة فحص التلازن test Agglutination وطريقة الاليزا ELISA . ودلت النتائج على ان مجموعة الخطر الكبيرة من النساء الحوامل المصابات بداء المقوسات تتراوح اعمارهن بين 21 - 30 سنة اذ شكلت (61.54٪) من الحالات. واظهرت النتائج ان نسبة الاجهاض وفقا لعدد مرات الاسقاطات للنساء الحوامل قيد الدراسة بلغت (61.54٪) من عدد النساء الحوامل اللاتي اجهضن مرة واحدة او اثنتين. وقد كان تركيز الضد المناعي IgG مرتفع معنويا (0.05 >P), حيث كان بمتوسط (4.02 ± 0.39) عند الرجال و(8.50 ± 0.41) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة الصحية حيث كانت عند الرجال (0.343 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.418 ± 0.03)، في حين تراكيز الضد المناعي IgM سجلت ارتفاعا غير مهم وكانت بمستوى (0.603 ± 0.07) عند الرجال و(0.540 ± 0.08 ) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة حيث كان عند الرجال (0.151 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.325 ± 0.03). وتمت دراسة تراكيز العديد من الهرمونات في مصل مثل (testosterone, Estradiol, Progesterone, Prolactin, Follicle Stimulating Hormone and Luteinizing Hormone). وكانت نتائج هذه التجارب تكشفت عن وجود فرق معنوي (0.05 >P) في مستوى الاستراديول في النساء المصابات (المجهضات والحوامل) (43.62 ± 7.12 نانوغرام / مل) ( 682.11 ± 12.23نانو غرام/مل)، وفرق غير معنوي في الرجال المصابين (501.32 ± 82.09 نانوغرام / مل) وانخفاض معنوي (0.05 >P) في مستوى هرمون البروجسترون في النساء المصابات المجهضات والحوامل (3.12 ± 2.33 نانوغرام / مل) (7.81 ± 1.52 نانو غرام/ مل) و(5.51 ± 1.25 نانوغرام / مل) في الرجال المصابين بالمقارنة مع السيطرة للنساء (3.81± 3.22 نانو غرام/ مل) (10.72±2.23 نانو غرام/ مل) وللرجال (4.01 ± 0.02). ومع ذلك، فقد لوحظ عدم وجود فروق معنوية كبيرة في مستوى البرولاكتين حيث سجلت انخفاضا كبيرا في المرضى المصابين من النساء والرجال مقارنة بالمجموعة الضابطة. واظهرت النتائج ان مستويات هرمون تستوستيرون ليست ذات دلالة احصائية مسجلة بين مجموعتي النساء والرجال. واظهرت النتائج عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية في تركيز مستويات هرمون FSH للنساء والرجال المصابين. وكذلك في مستوى هرمون LH في النساء المصابات والرجال المصابين. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widely all over the world. The cause of it is the infection by the parasite Toxoplasma gondii. Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition. The present study was conducted on 130 women infected with toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 90 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite. And 90 men infected by toxoplasmosis from National Blood Transfusion Center ranging in ages between 15 - 45 years for the period from December 2014 to March 2015. Parallel to that, 60 healthy women and 30 healthy men were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infections by the parasite for women and men were 69.23% and 66.67% respectively using Agglutination and ELISA methods. The results indicated the great risk group of pregnant women with toxoplasmosis at the age between 21 - 30 year was (61.54%) of cases. The results showed that the rate of abortion, according to the projection of the number of times women were pregnant as a percentage (61.54%) of those who aborted once or twice. The concentrations of IgG were significantly elevated (P<0.05), the levels were (4.02 ± 0.39 IU /ml) in men and (8.50 ± 0.41 IU /ml) in woman, compared to a healthy control group where it was in men (0.343 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.418 ± 0.03 IU /ml), while the concentrations of IgM registered no significant elevated the levels were (0.603 ± 0.07 IU /ml) in men and (0.540 ± 0.08 IU /ml) in women, comparison to a healthy control group where it was in men (0.151 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.325 ± 0.03 IU /ml). The serum concentrations of several hormones were studied such as (Testosterone, Estradiol, progesterone, Prolactin, Follicle stimulating hormone and Luteinizing hormone). The results of these trials revealed a significant (p<0.05) increase in level of Estradiol hormone in women (aborted and women) (43.62±7.12 ng/ml) (682.11±12.23 ng/ml) and non - significant for infected men (501.32 ± 82.09 ng/ml) and a significant (p< 0.05) decline in progesterone level in infected women aborted and pregnant (3.12 ± 2.33ng/ml) (7.81±1.52 ng/ml) and (5.51 ± 1.25 ng/ml) for infected men when compared with control for women (3.81± 3.22 ng/ ml) (10.72±2.23 ng/ ml) and for men (4.01± 0.02 ng/ml). However, no significant differences were noticed in the level of prolactin where it registered significant decrease in infected patients in women and men comparison to control subjects. And the results showed that testosterone levels have no statistical significance registered between the two group's women and men. The results showed the absence of significant differences in the concentration of FSH hormone level among infected women and infected men. As well as in the level of LH hormone in infected women and infected men

تاثير جسيمات ثاني اوكسيد التيتانيوم 2TiO النانوية والميكروية على انبات ونمو بذور نباتي الحنطة والرز ومركباتها == Effect of titanium dioxide TiO2 nano and bulk particles on seeds germination and growth of wheat (Triticum aestivum L.) and rice (Oryza sativa L.)

اسم المؤلف: علياء محسن يوسف
اسم المشرف: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

اسم المؤلف: عقيل محمود علي اللامي
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية في مرضى السكري النمط - 1 والاصحاء == Anti - salivary mucins antibodies in Patients of Type - 1diabetes&healthy controls

اسم المؤلف: عذراء نجم عبد محمد
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية وعلى دور مجموعة الدم لويس في هذه الامراض . فقد ركزت الدراسة الحالية في جانبها على تنميط مجاميع الدم ومدى تكرار هذه المجاميع في مرضى داء السكري النمط - 1 مقارنة بالاصحاء , اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في مرضى داء السكري النمط 1 - وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع دم لويس ومستضداتها اللعابية . تمت دراسة (59) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث و(50) عينة دم ولعاب وخروج من الذكور ومقارنة ذلك للاصحاء ب(25) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث والذكور .تم تنميط مجاميع دم لويس باستعمال طريقة الشريحة الزجاجية وملاحظة التلازن الدموي تحت تكبير 40x.ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض حيث بلغت نسبتها عند المريضات (33%) مقارنة بالسليمات (12%) (P=3.77×10 - 4**)، في حين كانت مجموعة دمLe(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفظت نسبتها الى (23%) في المريضات مقارنة بنسبة (64%) للسليمات 10 - 9)×4.98=P) ، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+)عند المريضات (17%) مقارنة بالسليمات (16%) (0.462 P=)، في حين كانت مجموعة دم(Le(a - b - في المريضات (23%) مقارنة بنسبة(%8) (10 - 3×1.20 P=) للسليمات . ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) مجموعة مقاومة للمرض اذ بلغت نسبتها في المرضى الذكور (%20) مقارنة بنسبة(24%) للاصحاء (0.239 =P)، في حين كانت مجموعة دم Le(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها في المرضى(32%) مقارنة بالاصحاء(40%)(0.313 P=)، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+) في المرضى (10%) مقارنة بنسبة(16%) للاصحاء(p=0.462) . وكانت مجموعةدم Le(a - b - ) في المرضى(28%)مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (P=0.185).وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 ذات صنفLe(a) . ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة (50%) في المريضات مقارنة بنسبة(33.3%) للسليمات (P=0.015 ) ،اما تردد مجموعة غير الفارزين حيث بلغت نسبتها(50%) مقارنة بنسبة (66.6 %) للسليمات(0.022 P=) ، وفي الذكور كان تردد الفارزين بنسبة(12.5%) في لمرضى مقارنة بنسبة(40%) للاصحاء (10 - 6×6.37 P=)، اما تردد مجموعة الغير فارزين حيث بلغت نستها (87.5%) مقارنة بنسبة(60%) .(10 - 5×1.52 P=) ، كما تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط - 1 ذات صنف Le(a - b - ) ، ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة(%62.5)، اما السليمات فلم توجد نسبة لتحديدها لقله عدد النماذج .اما تردد مجموعة غير الفارزين اذ بلغت نسبتها(%37.5) للمريضات مقارنة بنسة (100%) للسليمات (10 - 22×8.80 P=) ،اما في الذكور كان تردد الفارزين بنسبة (16.6%) للمرضى مقارنة بنسة(8%) بالاصحاء (0.082 P=) ، اما مجموعة تردد الغير فارزين حيث بلغت نسبتها (83.3%) مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (10 - 19×4.94 p=)، اظهرت تجارب كشف الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية وباستعمال كشف الايلازا غير المباشر(مستوى الاضداد مقاس بمعدل الكثافة الضوئية ± الانحراف القياسي)، فلمجموعة Le.a للمريضات كان معدل الاضداد0.0 )±0.085) مقارنة بمعدل0.0127)±0.1495) للسليمات(10 - 8**×8.48=P)، مجموعة Le.b للمريضات كان معدل الاضداد0.011)±0.089) مقارنة بمعدل0.0127)±0.151) للسليمات (10 - 12**×P=6.37) ،مجموعة Le.a+b+ للمريضات كان معدل 0.007)±0.099) مقارنة بمعدل0.0138)±0.288) للسليمات (10 - 13***×9.09=P) ،مجموعة Le.a - b - كان للمريضات بمعدل الاضداد0.003)±0.073) مقارنة بمعدل 0.0076)±0.1207) للسليمات (10 - 13***×9.09=P). تم دراسة تثبيط الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية بالمستضدات اللعابية OL e.a وOLe.b الحرة وكانت النتائج كالاتي : كان معدلات الكثافة الضوئية ±الانحراف القياسي للمعاملات كالاتي : مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.025±0.145) (P=0.490) ،مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.03±0.1) (P=0.142) ،مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط (0.094±0.201) ( P=0.667) ،مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط (0.029±0.103) (10 - 4×P=4.76)، مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.b كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.01±0.118) (10 - 8×2.33=P)، مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OL.b كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.016±0.088)(10 - 3×P=1.29). مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط(0.077±0.189) ( P=0.971)، مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط(0.02±0.097) (10 - 4×P=1.70)..اما في الجانب البكتيري فقد تم تشخيص عزلات بكتريا Staphylococcus aureusو Pseudomonas aeruginosa .وكالاتي : عزل بكتريا Pseudomonas aeruginosa شخصت 5 عزلات aeruginos .P من اصل ( 25) عيبة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراصي (20%) وفي حين بلغت نسبة الزرع للسليمات (0%) من اصل 25)) عينة خروج , وايضا شخصت 4))من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عز ل الاصحاء (%0).عزل بكتريا Staphylococcus aureus شخصت 5 عزلات S. aureus من اصل (25) عينة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراضي الموجب(20%) وفي حين بلغت نسبته للسليمات 0)% )من اصل 25 عينة خروج , وايضا شخصت 4)) عزلات من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عزل الاصحاء (%0).استنتج ان داء السكري النمط - 1 له علاقة بمجاميع الدم ABO ,ومجموعة دم لويس اذ دراستنا هذه اجريت سابقا بنفس الموضوع في قسم علوم الحياة . اشرت الدراسة ان هنالك اضداد ضادة لميوسين اللعاب مسجلة لاول مرة، وهي ملازمة بعيارية عالية (استعمل المصل المخفف 1 : 100) تكثر في المرضى مقارنة بالاصحاء .هنالك زيادة في تكرار عزل البكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus . فيما يدل ذلك وجود تلازم بين نوعي البكتريا والمرض الى ان ذلك يحتاج الى دراسات معمقة . ممكن ان تكون الفروقات بين الذكور والاناث في توزيع مجاميع دم لويس اساسها هرمونات ستيرويدية. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين في مرضى السكري والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | Blood group antigen, are associated with autoimmune diseases . studies emphasized on lewis blood groups. The present study concentrated on finding the frequency distribution of ABO - Lewis blood groups association in type - 1 Diabetes compared to the distribution in healthy controls.The immunological part of this study investigated the immune response in the disease and its relation ship with salivary mucins Lewis molecules. Fiftynine diabetic female samples(blood، saliva،stools) as well as 50 male diabetic sample(blood، saliva،stools) were used in addition to 25sample (blood، saliva،stools )of female and males healthy controls . Typing of blood groups Lewis using the glass slide Not blood agglutination and under magnification 40x.The findings indicated that Lea+b - molecule has arole in disease susceptibility. Ites percentage approach 33% in female patients compared to 12% in healthy controls (p=7.33 x 10 - 4)، On the other hand however, Lea - b+ group gave 23% in diabetic females compared to 64% in healthy females (p= 4.98 x10 - 9). Lea+b+ groups gave 17% in diabetic females and 16% in healthy females (p=0.46).Interestingly however, Lea - b - groups was represented at 23% in diabetic females versus 8% in healthy females (p=1.2x 10 - 3) In males the results of the frequenecies could be summarized as follows : Lea + b - 20% in diabetics vs 24% in controls. p=(0.239).Lea - b+ : 33% in diabetics vs 40% in controls. P=(= 0.31).Lea+b+ : 10% in diabetics vs 16% in controls. P= (0.462).Lea - b - : 28% in diabetics vs 20% in controls. P=(0.185).The role of secretion (se gene role) in diabetes was investigated also, particularly in Lea group and the findings were as follows : secretors female : 50% in diabetics vs 33.3% in controls.(p=0.015).None secretors : 12.5% in diabetics vs 40% incontrols (p=6.37x10 - 6).In addition to that the role of secretion was seen in Lea - b - group as well. Secretor diabetics female, showed 62.5% . There was no available samples in controls.A Statistically siqnificant frequency differences was seen in non secretors diabtic, females compared to controls (37.5% in diabetics vs 100% in controls p=8.8 x 10 - 22).In Males the results of secretions reported a significant difference in non secretors83.3%. In diabetics vs 20% controls ( p= 4.94 x 10 - 3)The other part of the study experiments oriented to uncovering the presence of anti - salivary mucins antibody .Using Lewis types, salivary mucin as coating antigen، and indirect ELISA, we could demonstrate the occurrence of anti - mucin antibodies in patients sera that was from controls.In this respect the level of anti - mucin antibody measured as ELISA mean o.D±SD seen below and as following : In Lea diabetic females group was 0.085+0.02 vs 0.1495±0.0127 in control (p= 8.48 x10 - 8)،In Leb diabetic females group 0.089±0.011 vs 0.151±0.0127 in control group( p= 6.37 x10 - 12)،In lea+b+ diabetic females group 0.099+0.007 vs control groups 0.288+0.0138 in control p=( 9.09 x10 - 13) ،In Lea - b - diabetic females group 0.07+0.003 vs control group 0.1207+0.0076( p=9.09 x 10 - 13)In specificity experiment, using free olea and oleb free saliva as inhibitor for anti - mucin antibody, it was demaonstrated that in female patients group Lea : no inhibition by free Lea was seen (0.6 ± 0.01) vs 0.145±0.02 for treatments before and after inhibition respectively (p=0.49)، similarly there was no inhibitin by the free antigens، similarity there this no inhibition by the free antigens towards antibodies in group Leb.Significnt inhibition of anti - mucin antibody by free Lewis was seen in group : (0.2±0.060) vs (0.103±0.029) before and after inhibitim respectiuly(p=476 x 10 - 4) and similar results was seen in Lea - b - group.The bacteriological study on The isolation of P.aeroginosa from stool samples revealed an isolation frequency of 20% in diabetic vs 0% in control.In addition S.aureus isolation from stool gave a frequency of 20% in patients vs 0% in control.It is concluded that there is areltionship among Lewis blood groups – secretion of there molecules and anti - mucin، immune response directed to aspecific targt and initiating autoimmunity in this particular disease.

التغيرات في مستويات انترليوكين - 33 في مرضى الربو والتهاب الانف التحسسي تحت تاثير العلاج المناعي == Changes of IL - 33 Levels in Asthmatic and Allergic Rhinitis Patients under the Effect of Immunotherapy

اسم المؤلف: عذراء خلف فلحي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتقصي التغيرات في مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 في امصال المرضى المصابين بالربو التحسسي والتهاب الانف التحسسي اضافة الى دراسة اثر العلاج المناعي على هذه المؤثرات المناعية. تم اختبار مئتين وخمسه وتسعين مريض (120ربو, 75 التهاب الانف التحسسي, 100 خاضعين للعلاج المناعي) اعمارهم تتراوح بين 20 - 60 سنة (160 ذكور , 135 اناث), من بين المراجعين للمركز التخصصي للحساسية في بغداد/ الرصافة للفترة من اكتوبر 2014 الى فبراير 2015. تم خلال الدراسة قياس مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 بتقنية الاليزا وبالامكان تلخيص النتائج لهذه الدراسة بالاتي : 1 - تبين من خلال اجراء فحص وخز الجلد باستخدام 15 نوع من المستارجات الاكثر شيوعا ان مستويات التفاعلات الايجابية ترتب كالتالي : 8.7%D. pteronyssinus (D1) , 7.6% D. farina (D2), 7.6% Chenopodium (CH) و7.1% Bermuda grass (G2) في المرضى الذين يعانون من الربو و8.2% D. pteronyssinus (D1), 7.6% D. farina (D2), 7.6% Bermuda grass (G2) و6.6% Chenopodium (CH) في المرضى الذين يعانون من التهاب الانف التحسسي.2 - تبين من النتائج ارتفاع معنوي عالي عند مستوى معنوية (P<0.001) في مستويات الضد IgE سواء عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 33.07 ± 328.78( او التهاب الانف التحسسي (pg/ml 36.09 ± 379.76( بالمقارنة بمستوياته التي انخفضت بشكل معنوي عند مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي (pg/ml 22.75 ± 210.23(. فيما ضلت مستوياته ضمن حدودها الطبيعية عند مجموعة الاصحاء (pg/ml 8.04 ± 81.19).3 - موازيا لذلك فان مستويات انترلوكين - 33 قد سجلت ارتفاعات معنوية عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 13.75 ± 128.07( والتهاب الانف التحسسي ( pg/ml12.78 ± 144.62) فيما انخفضت عن ذلك في مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي لتصل (pg/ml 11.32± 110.79( اما مجموعة السيطرة فكانت (pg/ml 9.06 ± 59.04).4 - وقد وجد ان هنالك علاقة موجبة ذات دلاله معنوية بين مستوى انتولوكين - 33 ومستويات IgE الكلية حيث ان معامل الارتباط في الربو (r = 0.42**), التهاب الانف التحسسي (r = 0.31*), والمرضى الخاضعين للعلاج المناعي (r = 0.41**) على مستوى احتمال (P <0.01**) و. (P <0.05*) | The present study was undertaken to investigate the changes in levels of total IgE and interleukin - 33 in sera of patients with allergic asthma and allergic rhinitis. In addition, the effect of immunotherapy on such immune parameters were investigated. Two hundred and ninety five of allergic patients (120 asthmatics, 75 allergic rhinitis, and 100 receiving immunotherapy) their ages ranged between 20 - 60 years (160 males and 135 females), among those who attended the allergy specialized center in Baghdad /Al - Russafa during the period from October 2014 to February 2015. The control group was included 50 apparently healthy individuals. Levels of interleukin - 33, Total IgE, were estimated using ELISA technique, the results of the study can be summarized as follow : 1 - By doing skin prick test using 15 types of most common allergens for both groups of patients, the recorded results showed to be positive respectively as so : Dermatophagoides pteronyssinus (D1) 8.7%, Dermatophagoides farinae (D2) 7.6%, Chenopodium (CH) 7.6% and Bermuda grass (G2) 7.1% in asthmatic patients and D. pteronyssinus (D1) 8.2%, D. farinae (D2) 7.6%, Bermuda grass (G2) 7.6% and Chenopodium (CH) 6.6% in allergic rhinitis patients.2 - The results showed high significant (P < 0.001) increase in the level of total serum IgE in asthmatic patients (328.78 ± 33.07 IU/ml) and in allergic rhinitis patients (379.76 ± 36.09 IU/ml) compared with its level, which were decreased (210.23 ± 22.75 IU/ml), in those patients who received immunotherapy and compared to level in healthy individuals, which were stayed within normal range (81.19 ± 8.04 IU/ml).3 - In parallel IL - 33 also recorded a significant elevation in both groups of patients (128.07 ± 13.75 pg/ml) in allergic asthma, and (144.62 ± 12.78 pg/ml) in allergic rhinitis. It decreased in group of immunotherapy patients to reach (110.79 ± 11.32 pg/ml), while it was (59.04 ±9.06 pg/ml) in the sera of healthy individuals.4 - A significant positive correlation was found between serum level of IL - 33 and the total IgE as the correlation coefficient in asthma was (r = 0.42**), rhinitis (r = 0.31*), immunotherapy (r = 0.41**) at the level of probability (P <0.01**) and (P <0.05*).

دراسة علاقة الكورتيزول ومقاومة الانسولين في رجال قصور الغدة الدرقية غير المصابين بالسكري == Study the relationship of cortisol and insulin resistance in non - diabetic hypothyroidism men

اسم المؤلف: ظلال عبد الخالق جمعة
اسم المشرف: علي شلش سلطان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية للتحري عن مستويات الكورتيزول ومقاومة الانسولين بالعلاقة مع زيادة مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية ((TSH في مرضى قصور الغدة الدرقية من الذكوروالتي اجريت على 48 شخصا من المراجعين الى المركز التخصصي للغدد الصم ومرضى السكري في بغداد للفترة من 10/10/2014 ولغاية 14/2/2015. شملت مجموعة قصورالغدة الدرقية 24 رجلا تراوحت اعمارهم بين 20 - 60 سنة ومجموعة السيطرة 24 رجل تراوحت اعمارهم بين 20 - 56 سنة. ارتفع مستوى Mu/lTSHمعنويا (P˂0.01)في مجموعة قصورالغدة الدرقية (41.74±3.61) قارنة بمجموعة السيطرة(1.97±0.264). اظهرت مستويات هرمون الثايروكسين T4nmol/Lفي مجموعة قصورالغدة الدرقية (48.59±0.98) انخفاضا معنويا P˂0.01)) مقارنة بالسيطرة .(80.12±3.09) اظهرت مستويات T3nmol/lعدم وجود فروقات معنوية (p≥0.05) بين المجموعتين (1.31±0.14)؛ (1.52±0.083) على التوالي. ارتفعت مستويات الكورتيزول ng/ml(274.08±9.3) في مجموعة المرضى معنويا(P<0.01) مقارنة بمجموعة السيطرة (174.33±13.55).ازداد مستوى الانسولين(15.13±1.14) µIU/ml في المرضى مقارنة بالسيطرة (8.28 ± 0.76) معنويا (P<0.01).لم تكن الفروقات معنوية p≥0.05)) في مستويات كلوكوز الدم(4.84±0.15) ؛ mmol/l(4.98±0.11)بين المجموعتين .لم تكن الفروقات معنويةp≥0.05)) في مستويات HbA1c%بين المجموعتين (5.50±0.18;5.50±0.18) على التوالي. ازدادت مستويات مقاومة الانسولين معنويا (P<0.01)في مجموعة المرضى (3.39±0.29) مقارنة بمجموعة السيطرة (1.81±0.16) . ارتفع معامل كتلة الجسم BMI(kg/m2)معنويا (P<0.01) في مجموعة المرضى (25.81±0.39) مقارنة بالسيطرة (23.72±0.49). لم يكن ضغط الدم الشرياني العالي (11.58 ± 0.37) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05)) عند مقارنته مع مجموعة السيطرة (11.46 0.22). لم يكن ضغط الدم الشرياني الواطئ(9.04±0.40) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05))عند المقارنة مع مجموعة السيطرة(8.46±0.23) .. كان معدل العمر (39.00±1.92; 35.54±2.29) بين المجموعتين. اظهر TSH وCortisolارتباطا موجبا (0.65)ومعنويا (P<0.01).اظهر الكورتيزول وT4علاقة سالبة ( - 0.32) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكورتيزول علاقة سالبة ( - 0.18) غير معنويةp≥0.05) ) مع T3. اظهر الانسولين وكلوكوزالدم علاقة موجبة (0.09) غيرمعنوية (p≥0.05). اظهراالانسولين والHbA1c% علاقة سالبة ( - 0.09) غير معنوية p≥0.05)).كانت العلاقة موجبة (0.42) ومعنوية (P<0.01) بين الانسولين والكورتيزول. اظهرالانسولين وTSHعلاقة موجبة (0.36) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكلوكوز وTSHعلاقة سالبة ( - 0.16) وغير معنوية p≥0.05)). اظهرTSHو HbA1c%علاقة موجبة (0.05) غير معنوية ( - 0.08)كانت مقاومة الانسولين والكلوكوز علاقة موجبة (0.32) ومعنوية(p≤0.05).وجدت علاقة سالبة( - 0.08) بين مقاومة الانسولين وHbA1c%غير معنوية p≥0.05)).اظهرت مقاومة الانسولين ومعامل كتلة الجسم BMI علاقة موجبة(0.33) ومعنوية (p≤0.05). كذلك اظهرBMI وTSH علاقة موجبة (0.39)ومعنوية(P<0.01) . اظهر BMI وT4علاقة سالبة ( - 0.36) ومعنوية (P<0.01). بين BMI وT3علاقة موجبة (0.002) غير معنوية(p≥0.05) . اظهر BMIوالعمرعلاقة سالبة( - 0.001) غير معنوية p≥0.05)). استنتجنا من هذه الدراسة بان ارتفاع مستوى الTSH يؤدي الى ارتفاع مستوى الكورتيزول في مرضى قصور الغدة الدرقية مع زيادة مستويات الانسولين والمصاحبة لزيادة مقاومة الانسولين وزيادة معامل كتلة الجسم BMI. | The present study aimed to investigate the cortisol levels and insulin resistance and their relationship with increasing level of Thyroid stimulating hormone (TSH) in the hypothyroid male patients. The study was carried on 48 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Baghdad province. The study began on10/10/2014to 14/2/2015.The subjects were divided into 2groups (control and hypothyroid).Each group included 24 males, their ages ranged between 20 - 60; 20 - 56years respectively. The results showed a highly significant (P˂ 0.01) increase in the level of TSH in overt hypothyroid patients (41.74± 3.61mu/l) in comparison with control (1.97± 0.264mu/l). Levels of T4nmol/L (48.59 ± 0.98) showed a significant (p˂0.01) decrease in comparison with control (80.12±3.09). T3nmol/L levels were not significantly (p≥0.05) between two groups (1.31±0.14); (1.52±0.083) respectively. Cortisol levels (274.08±9.37) ng/ml increased significantly (P<0.01)in the patients group in comparsion with control group (174.33±13.55). Insulin (15.13±1.14)µIU/ml increased significantly (P<0.01) in the patients group in comparison with control. (8.28 ± 0.76(Glucose levels mmol/l in patients (4.84±0.15) and control group (4.98±0.11) were not significant (p≥0.05). HbA1c (%) levels in the study groups (5.50±0.18; 5.50±0.18) were not significant (p≥0.05). Insulin resistance (%) increased significantly (P<0.01) in patients group(3.39 ±0.29)when compared with control group (1.81±0.16). Body mass index (kg/m2) increased significantly (P<0.01) in patients group (25.81±0.39) in comparison with control group (23.72± 0.49). High arterial blood pressure in patients group (11.58 ± 0.37) was not significant (P≥0.05) in comparison with control group (11.46± 0.22). Low arterial blood pressure in patients group (9.04±0.40) was not significant (P≥0,05) in comparison with control group(8.46±0.23). Mean of age was (39.00±1.92;35.54±2.29) in both groups. There is a positive correlation (0.65) between cortisol and TSH at (P<0.01) level in patient group; while cortisol showed negative correlation ( - 0.32) between cortisol and T4 at (p<0.05). Cortisol showed non - significant (p≥0.05) negative correlation ( - 0.18) with T3. Insulin and glucose showed positive (0.09) non - significant correlation (p≥0.05).Insulin and HbA1C% showed ( - 0.09) non - significant correlation (0.42).TSH & Insulin in patients group showed positive (0.36) significant correlation (P<0.01). TSH & Glucose in patients group showed negative( - 0.16) non - significant (p≥0.05) correlation. TSH & HbA1C% in patients group showed positive (0.05) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and glucose correlation was positive (0.32) significantly (p≤0.05) in patients group. Insulin resistance & HbA1C% in patients group showed negative ( - 0.08) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and BMI showed positive (0.33) significantly (p≤0.05).BMI and TSH showed significant (P<0.01) positive (0.39) correlation. BMI & T4 showed significant (P<0.01) negative ( - 0.36) Correlation in patients groups. BMI & T3 showed positive (0.002) non - significant (p≥0.05) correlation. BMI & Age showed negative ( - 0.001) non - significant (p≥0.05). We concluded from this study that increasing levels of TSH causing an elevation of cortisol levels among hypothyroid patients with increasing insulin levels accompanied by increased insulin resistance and BMI index.

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

اسم المؤلف: علاء سالم حمزة
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة تاثير بعض المطهرات والمعقمات والمنظفات على نمو بعض الفطريات المعزولة من بعض المستشفيات في بغداد == Study the effect of some disinfectants, sterilizers and detergents on growth of some fungi isolated from Baghdad hospitals

اسم المؤلف: صادق رحيم محمد علي
اسم المشرف: منى حمودي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to detect the fungal contamination of hospitals in orderto be controlled and limited.A total of 511 environmental swaps were collected from Al - Karamateaching hospital, Al - Sader general hospital, Al - Yarmouk teachinghospital, Baghdad teaching hospital and Imam Ali general hospital inBaghdad city from the period 28,October,2013 to 31,March,2014. Thesamples were collected to isolate and identify the caused and contaminatedfungi in addition to test their sensitivity against certain antiseptic anddisinfectants that are used in hospitals; also their virulence factors forhigher frequency and occurrence genus.These isolates were collected from main sources, the hospitalsenvironment and most of the items used for hospital work in order to detectthe nosocomial pathogens persistent in the hospital ecosystem, whichincludes : sink surfaces, tools and equipments, walls, indwelling medicaldevices, premature incubators, beds, medical trashes, floors and others.Results revealed that fungal contamination in five hospitals was in thepercentage 69.89%, 64.52%, 62.40%, 51.58% and 41.90% respectively. Inaddition, the most contaminated places were the hospitals wards 80%,while it was 77.77% in endoscopy units and 76.92% in the Respiratory careunits. The lowest contaminated places were the emergency units 25.0%then burns units 33.33% and cardiac care unit which was 41.66%. Inrespect with the percentage of occurrence and frequency for the isolatedfungi, it was found out that Aspergillus flavus formed the highest ratio offrequency and occurrence 21.29% and 15.46% respectively, followed byAspergillus niger 18.33% and 13.31% then Penecillium spp. which was10.78% and 7.83%. Regarding other fungi, their frequency and occurrence were different. All fungal isolates were identified depending on themorphological and microscopic examinations as well as biochemical tests.The results on the effect of temperature and pH on fungal growthshowed that the best growth was at 25 - 30 OC, and the best growth wasfound at the pH range 5.0 - 6.0.Results of the test of fungal sensitivity against eight antiseptics andsterilizers used in the hospital showed that the ratio of inhibition of thesecompounds agnaist fungi were different according to types andconcentration of antiseptics as well as genus and species of fungi. Use ofthese compounds in 100%, 50%, 40%, 30% and 20% concentration is veryhigher effective, while more effective if they were used in 10% or 7.5%concentration than in 5% and 2.5%, but not effective in 1.25%concentration.The results showed that Setol (Chloroxylenol) has significantly the mosteffective compound on fungi, followed by Formalin (Formaldehyde), thenCarmal (Tension, active surfactants, non - ionic) and Alwazir (Sodiumhipochlorite).Testing some of virulence factors aflatoxin production, lipaseproduction , protease production and haemolysis test, it was found that A.flavus has higher lipase production and protease production than otherfungi. A. flavus and A. niger were capable of blood hemolysis in 3 daysonly, but in different diameters of lysis zone, 1.8mm and 1.6mmrespectively. Some isolates of A. flavus are capable to aflatoxin production.Depending on all results, hospitals contain different fungal species andgenus, antiseptics and disinfectants have an effect on fungal growth if theyare used in a correctly.

دراسة كيميائية وبايولوجية لمركبي Stigmasterol و? - sitosterol كمكونات فعالة متواجدة في نبات البنفسج العطري (العائلة : البنفسجية) المزروع في العراق == Phytochemical and Biological Study of Stigmasterol and ? - sitosterol as Active Constituents Present in Viola odorata L.Plant (Family : Violaceae) Cultivated in Iraq

اسم المؤلف: شيماء فخري جاسم السالم
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد هذه الدراسة مسح لبعض المكونات الفعاله لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. وعزل هذه المركبات الفعالة (Stigmasterol and β - sitosterol)، كما تم اجراء دراسه بايولوجيه لتحديد فاعليتها كمركبات مضادة للاكسدة وكمضادات بكتيرية حيث تضمنت الدراسه مايلي : - • تم استخلاص هذه المركبات كمستخلص خام من كل جزء من اجزاء النبتة الجذور،الاوراق, الازهار والبذور باستخدام الميثانول والبتروليوم ايثر واجراءالتقدير الكمي والنوعي للمركبين Stigmasterol) و( β - sitosterolفي كل جزء باستخدام تقنيات TLC, HPLC,CC• تم استخلاص وعزل وتشخيص المركبين (Stigmasterol and β - sitosterol) وذلك باستخدام طرق استخلاص وتجزئه وعزل مختلفه• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. والمركبات الستيرويدية Stigmasterol) و( β - sitosterol كمضادات للاكسدة على المركب 1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) الفعال لاحتوائه على الجذور الحرة وتحويله الى مركب 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine باستخدام التراكيز 25, 50, 100, 200 و400 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata Lو المركبات الستيرويديه( Stigmasterol و( β - sitosterol كمضادات بكتيرية فاعلة ضد بكتيريا staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa وبتراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع المضاد الحيوي Gentamicin كمعاملة قياسية• اظهرت النتائج وجود كميات كبيرة من المركبات الستيرويدية(Stigmasterol and β - sitosterol )في كل اجزاء نبتة البنفسج العطري Viola odorata L. اذ كانت تراكيز مركب Stigmasterol في الاوراق 2 ملغم/100مليلتر وللازهار 7.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 4.5 ملغم/100مليلتر وللبذور 2.4 ملغم/100مليلتر, فيما كانت تراكيز المركب β - sitosterol في الاوراق 3.2 ملغم/100مليلتر وللازهار 5.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 9.2 ملغم/100مليلتر وللبذور 3 ملغم/100مليلتر, اذ كان اعلى تركيز للمركب Stigmasterol في مستخلص الازهار 7.3 ملغم/100مليلتر واعلى تركيز للمركب β - sitosterol في الجذر 9.2 ملغم/100مليلتر.• اظهرت النتائج الفاعلية الكبيرة للمستخلص الخام لنبات Viola odorata L. بالتركيز 400 مايكروغرام/مليلتر كمضاد للاكسدة بنسبة 94% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 72, 80, 84 و92% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية, اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية P≤ 0.05 ما بين التراكيز للمستخلص الخام, فيما اظهر التركيز 400 مايكروغرام/مليلتر لخليط المركبات( stigmasterol وβ - sitosterol) كفاءة كبيرة كمضادات للاكسدة وبنسبة 74% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 59, 63, 66 و70% على التوالي مقارنة بالمعاملة القياسية وبفروق معنوية P≤0.05 ما بين التراكيز.• اظهرت تراكيز المستخلص الخام للنبتة فاعلية كمضاد للبكتيريا اذ كان مدى تثبيط بكتيريا Staphylococcus aureus على الوسط المغذي الصلب 0, 5, 15, 18, 20, 22 و25 مليمتر باستخدام التراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر على التوالي, واظهر خليط الستيرويدات مدى تثبيط 0, 0, 0, 14, 16, 19 و21 مليمتر لنفس التراكيز على التوالي ومقارنة بالمعاملة القياسية, كذلك اظهر المستخلص الخام كفاءة كمضاد بكتيري ضد بكتيريا Pseudomonas aeruginosa بمدى تثبيط 0, 5, 12, 15, 17, 19 و22 مليمتر ولخليط الستيرويدات بمدى تثبيط 0, 0, 0, 11, 13, 17 و18 مليمتر مقارنة بالمعاملة القياسية, وبينت النتائج ان التركيز الادنى المثبط للمستخلص الخام للنبتة ضد بكتيريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaهو 5 مايكروغرام/مليلتر ولخليط الستيرويدات هو 20 مايكروغرام/مليلتر. | This study is considered as a survey of the some secondary metabolits present in Viola odorata L., collected from plant nursery in Baghdad between April and July, followed by the fractionation and isolation of Stigmasterol and β - sitosterol.The biological study demonstrated the effect of the Stigmasterol and β - sitosterol found in Viola odorata L. as antioxidant and antibacterial. This study involved the following : - • Extraction of Stigmasterol and β - sitosterol as a crude extract from each part of the plant roots, leaves, flowers and seeds using (Petrolium ether and Methanol) to qualitative and quantitative estimation of Stigmasterol and β - sitosterol in each part of the plant by using TLC, HPLC and CC. • Fractionation and Isolation of sterols compounds (Stigmasterol and β - sitosterol) present in Viola odorata L., by using different methods . • Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been studies in experimental work to determination the antioxidant activity against1,1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) which is considered as stable free radical and convert it into 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine ,by using different concentrations (25,50,100,200 and 400µg/ml). Compare ascorbic acid.• Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been used to determination the antibacterial activity using different concentrations (2, 5, 10,20,30,40 and 50µg/ml) against staphylococcus aureus and pseudomonas aeruginosa by using agar well diffusion method compare with Gentamicin as a standard control. • The phytochemical results showed that all the plant parts contain high amount of sterols, the quantitative data revealed that the total content of Stigmasterol in roots(4.5mg/100g) ,in leaves(2mg/100g),in flowers(7.3mg/100g) and in seeds(2.4mg/100g).The content of β - sitosterol in roots(9.2mg/100g),in leaves(3.2mg/100g),in flowers(5.3mg/100g) and in seeds(3mg/100g), highest amount of stigmasterol founded in flowers (7.30mg/100g) ,the maximum amount of β - sitosterol in roots (9.2 mg/100g) .• The results showed that crude extract of Viola odorata in concentration of 400µg/ml have a higher antioxidant effect by 94%, and concentrations of 25, 50, 100 and 200 µg/ml by 72, 80, 84 and 92% respectively which are comparing with standard control Ascorbic acid, the results showed there are significant difference at (P≤ 0.05) between the concentrations in the same crude extract, while the stigmasterol and β - sitosterol of Viola odorata also showed higher antioxidant effect in concentration of 400µg/ml by 74% and concentrations of 25, 50, 100 and 200µg/ml by 59, 63, 66 and 70% respectively comparing with standard control Ascorbic acid with significant difference at (P≤0.05) between them ,and with significant difference at (P≤0.05)between the concentrations in the same fraction.• Antibacterial results of crude extract showed Staphylococcus aureus growth inhibition zone by 0, 5, 15, 18, 20, 22 and 25 mm with 5 µg/ml as MIC, while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 14, 16, 19 and 21 mm with 20 µg/ml as MIC comparing with Gentamicine standard control. Furthermore inhibition zone in pseudomonas aeruginosa culture when using crude extract by 0, 5, 12, 15, 17, 19 and 22 mm with 5 µg/ml as minimum inhibitory concentrations (MIC), while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 11, 13, 17 and 18 mm with 20 µg/ml as Minimum inhibitory concentration (MIC) compar with Gentamicin standard control .Stigmasterol and β - sitosterol compound showed inhibition zone by 0,0,0,11,13,17 and 18 mm with 20 µg/ml MICcompared with Gentamicine standard control.

تاثير Lactobacillus fermentum وLactobacillus gasseri في طفيلي الابواغ الخبيئة داخل الجسم الحي == Effect of Lactobacillus fermentum and Lactobacillus gasseri on Cryptosporidium parvum invivo

اسم المؤلف: شيماء داود سلمان
اسم المشرف: سبا طاهر محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: In order to study the effect of some bacterial probiotics on the parasite Cryptosporidium parvum invivo, 60 of feces samples were collected from fetal in calves farm belong to College of Veterinary \ Baghdad University, their aged from one to two weeks and suffer from a severe watery diarrhea. Samples were examined to detect the presence of the parasite oocysts by using Modified Cold Zeinl Neelson Stain method.Oocysts of parasite were isolated from positive feces samples by using saturated salt solution method and used to induce infection in mice .The study of laboratory animals shown that the perpant period of the parasite ranged between 3 - 4 days and did not notice any clear clinical signs neither infected mice nor treated ones.The study included nine groups; five treatment groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells,supernatant of L.fermentum,suspension of L.gasseri cells,supernatant of L.gasseri and the drug spiramycin, two preventive groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells and suspension of L.gasseri cells befor and after infected , and two groups that used as positive control (infected mice)and negative control (healthy mice).The results showed that all treatment groups suffered from a gradual decrease in rates of oocysts shedding and the groups treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day and eighth, respectively, and efficiency treatment was 81.44%, 81.72% , respectively while groups that treated with supernatant of bacteria was stopped oocysts shedding on the tenth day, and efficiency treatment 76.33%, 75.28% , respectively.On the other hand treated groups with spiramycin drug did not stop shedding of parasite oocysts to the eleventh day after treatment and recorded less efficiency treatment reaching to 65.14% compared with the positive control group, which continued shedding oocycts to the end of experiment.Also, the results showed that the preventive groups that treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day after the treatment, and for both types of bacteria,the highest treatment efficiency reached to 85.91%and 86.55%, respectively. The statistical analysis showed significant differences between the control group and the treated groups in level of probability (P≥0.05).According to the results of histological study, the changes occurred in the small intestine before and after treatment, showed that in the tissue sections of the positive control group animals the parasite adhesion clearly on brush border of the epithelial intestine tissue.The treated groups with two types of bacteria and their supernatants showed disappearance of the parasite from the intestinal tissue with simple changes included hydropic degeneration and increase in the number of goblet cells when compared to a group of spiramycin which led to the occurrence of damage in the mucous layer and the shorten in lengths of the villi , dehydration and infiltration in lymphocytes with destruction in tissue (necrosis).

تقييم المعادن الثقيلة لنهر دجلة ضمن مدينة بغداد باستخدام دلائل التلوث == Heavy Metals Assessment of Tigris River within Baghdad City by Pollution Indices

اسم المؤلف: شهد رياض زكي الربيعي
اسم المشرف: عادل حسين طالب الزاملي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للفترة من شهر تشرين الثاني 2013 ولغاية شهر حزيران 2014, اذ تم جمع عينات الدراسة (ماء، رواسب، نباتات) خلال كل شهرين في ثلاثة مواقع في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد. تضمنت الدراسة تقدير تراكيز (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والزنك) في الماء (الذائب والكلي) وفي الرواسب (الكلي والمتوافر احيائيا) لنهر دجلة، وتم قياس نفس المعادن على انواع مختلفة من النباتات التي تم جمعها من مواقع الدراسة.اما الخصائص الفيزيائية والكيميائية لمياه النهر والمتمثلة في درجة حرارة الهواء والماء, الاس الهيدروجيني, الكدرة , الاوكسجين الذائب والتوصيلية الكهربائية فقد سجلت قيما ترواحت ما بين : ١٧٫٩ - ٤١ م°، ١١٫٧ - ٢٥٫٥ م°، ٧٫٨ - ٨٫٧، ٦٫٦ - ٣٧٫٢ NTU ، ٧٫٧ - ١١٫٣ ملغم/لتر و٨۰٦ - ١٩٤۰ مايكروسيمنز/ سم على التوالي .اظهرت نتائج الدراسة ان معدل التراكيز للمعادن الثقيلة الذائبة (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين) كانت ١٫٥١ ، ٣۰١٫١، ١٨٫١٨، ٢٩٫۰٣ ، ١٧١٫٤ و٤٣٫۰٣ ميكروغرام / لتر على التوالي. وكانت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار باستثناء الكروم والرصاص.بينما كان المعدل الاجمالي للمعادن الثقيلة في مياه نهر دجلة ٥٫٣۰ ،٤٦١٫٦۰، ٣٢٫۰٣، ٧٩٫٩٩ ،٢٢١٫٤٦ و١٢٦٫٦٣ميكروغرام / لتر على التوالي . والتي اعتبرت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار، باستثناء الكادميوم، الكروم والرصاص.في الرواسب ، كان معدل الاجمالي للمعادن الثقيلة ٧٫٣٨، ١٦٤٫٩٤،٣٩٫٤١، ٨٤٫٨٩ ٧١٫٥٢ و١٢٨٫٧٣ ملغم/كغم على التوالي. في حين يتراوح التوافر البيولوجي للكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين في رواسب نهر دجلة بين (قيم غير محسوسة - ۰٫٣٢) ، (۰٫٣٩ - ٣٫٤٢) ، (۰٫٨٩ - ٣٫١٩) ، (۰٫٤٢ - ٢٫٨٤) ، (۰٫٧٨ - ٥٫۰٤) و(۰٫٨٦ - ١٧٫١٨) ملغم/كغم على التوالي.تم تقييم شدة تلوث مياه النهر بالمعادن الثقيلة باستخدام مؤشر التلوث (PI) والتي اظهرت ان درجة تلوث المعادن الثقيلة في عينات المياه كانت متوسطة للمواقع حسب الترتيب التالي : ٣>٢>١.كما قيمت شدة تلوث الرواسب النهرية بالمعادن الثقيلة المدروسة بواسطة استخدام دلائل تلوث الرواسب وهي كل من مؤشر التراكم الارضي (I - geo - Index) ، مؤشر حمل التلوث (PLI - Index) ، مؤشر عامل التلوث (CF - Index) ، درجة التلوث (Cd - Index) ومؤشر عامل الاغناء EF - Index)).فيما يتعلق بتقييم تلوث الرواسب باستخدام المؤشرات البيئية فقد بينت نتائج مؤشر التراكم الارضي (I - geo) المحسوب للعناصر المدروسة ان المواقع المدروسة غير ملوثة بعنصري النحاس والزنك ولكنها قوية التلوث للغاية بعنصر الكادميوم في حين اظهرت قيم مؤشر التراكم الارضي للرصاص بانها درجة تلوث معتدلة وغير ملوثة الى متوسطة التلوث لعنصري الكروم والنيكل. كما اظهرت قيم مؤشر حمل التلوث(PLI) بان كل المواقع كانت ملوثة بمجموع المعادن المدروسة.اوضحت نتائج عامل التلوث(CF) بان المواقع جميعها سجلت تلوث عاليا جدا بعنصر الكادميوم ، ولكنها واطئة التلوث بعنصر الزنك في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل تلوث معتدلا بهذا العنصر، بينما سجل تلوث معتدلا بعنصر الكروم ،النحاس والنيكل في جميع المواقع .بينما سجلت الرواسب تلوثا عاليا بعنصر الرصاص في جميع المواقع المدروسة.وفقا لنتائج مؤشر درجة التلوث (Cd) فقد اعتبرت جميع المواقع على درجة عالية جدا من التلوث بالمعادن المدروسة.فضلا عن ذلك بينت نتائج عامل الاغناء EF - Index)) بان كل المواقع تصنف على انها عالية للغاية مع الكادميوم ومعتدلة الاغناء بعناصر الكروم، النحاس والنيكل واغناء مهم بعنصر الرصاص وحد ادنى من الاغناء بعنصر الخارصين في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل اغناء معتدل.اظهرت نتائج قيم BCF& BSF في جميع النباتات بانها اكثر من 1 مما يشير الى ان النباتات مؤشر احيائي جيد لكافة العناصر المدروسة في منطقة الدراسة وكذلك اوضحت نتائج معامل التركيز الاحيائي((BCF لجميع المعادن المدروسة في عينات النباتات انها اعلى من قيم معامل الترسيب الاحيائي ((BSF مما يدل ان مصدر التراكم لهذه العناصر في النباتات كان من الماء. | This study was carried out from November 2013 to June 2014; the samples were collected every two months in three sites in the Tigris River within Baghdad city. It included estimate concentration of (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) in dissolved and total water and sediments (total& bio - available) of Tigris River. The same metals were measured in different types of plants collected from study sites.Physical and chemical properties of river water had values ranged between 17.9 - 41.0 C˚, 11.7 - 25.5 C˚, 7.8 - 8.7, 6.6 - 37.2 NTU, 7.7 - 11.3 mg/l and 806 - 1940 µs/cm for air and water temperature, pH, turbidity, dissolve oxygen and electrical conductivity, respectively.Study results showed that mean of heavy metals concentrations (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) were 1.51 µg/L, 301.10 µg/L, 18.18 µg/L, 29.03 µg/L, 171.40 µg/L and 43.03 µg/L, respectively in dissolved water and they were within permissible limits for Iraqi standard specifications exceptions of Cr and Pb. While the total of heavy metals in Tigris River water average was 5.30 µg/L, 461.60 µg/L, 32.03 µg/L, 79.99 µg/L, 221.46 µg/L and 126.63 µg/L, respectively and they were within permissible limit for Iraqi standard specifications exceptions of Cd, Cr and Pb.In sediment samples, mean of heavy metals concentrations were 7.38 mg/kg, 164.94 mg/kg, 39.41 mg/kg, 84.89 mg/kg, 71.52 mg/kg and 128.73 mg/kg, respectively. While the ranges of bioavailability for Cd, Cr, Cu, Ni, Pb and Zn in sediments of Tigris River are (ND - 0.32), (0.39 - 3.42), (0.89 - 3.19), (0.42.2.84), (0.78 - 5.04) and (0.86 - 17.18) mg/kg, respectively.Severity of river water pollution with studied heavy metals were assessed by using Pollution Index (PI) which showed that the degree of pollution by heavy metals in the water samples moderates contamination for the sites in the following order : 3>2>1.Also, pollution of river sediments in the studied heavy metals were assessed by using sediment pollution indices such as geo - accumulation index (I - geo), pollution load index (PLI), contamination factor (CF), contamination degree (Cd) and enrichment factor (EF).Related with the assessment of sediments pollution by using the ecological indices, the results of geo - accumulation index (I - geo) for studied heavy metals cleared that the studied sites unpolluted with Cu and Zn, while strongly to extremely pollute with Cd while the Igeo values of Pb show moderately polluted degree and unpolluted to moderately polluted degree with Cr and Ni. The values of pollution load index (PLI) showed that all sites are polluted with total studied metals (PLI value of > 1).Results of contamination factor (CF) observed that all the sites recorded very high contamination with Cd , while low contamination with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate contamination with it, and recorded moderate contamination with Cr, Cu and Ni in all sites, while the sediments recorded considerable contamination with Pb in all studied sites. According to the result (Cd) indicates that all studied sites showed very high degree of pollution with studied metals. As well as, the enrichment factor results (EF) showed that all sites can be classified as extremely high enrichment with Cd, moderate enrichment with Cr, Cu and Ni, significant enrichment for Pb and minimal enrichment with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate enrichment.The results showed that BCF &BSF values in all plants were more than 1 and this can be considered that plants can be a good bio - indicator for all the heavy metals studied in study area, also BCF values for all elements were more than (BSF) values in all plants samples which lead to plant samples bioaccumulation source with these metals was from water.

الكشف الجزيئي عن انواع البكتريا وفايروس التهاب الكبد المرتبطين مع بيتا - ثلاسيميا == Molecular Detection of Bacterial and Hepatitis Virus Types Associated with ? - Thalassemia

اسم المؤلف: شـهـد رعـد مزعـل
اسم المشرف: اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة التحري عن انواع الاصابات البكتيرية والالتهاب الكبد الفايروسي المرتبط بمرض الثلاسيميا نوع الكبير ومقارنتها مع الاشخاص المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير.لغرض التشخيص انواع البكتيريا جمعت نوعين من عينات من مرضى الذين راجعوا مستشفى ابن بلدي.عينات الادرار تضمنت (41عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و18من المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير) وعينات الدم تضمنت (25عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و25عينة من المرضى غيرمصابين بثلاسيميا نوع الكبير). اعتمادا على تحديد الصفات الزرعية للمستعمرات والصفات المورفولوجية للخلايا البكتيرية ومن ثم الصفات الكميوحيوية كما امكن تشخيص العينات باستخدام .VEKIK2systemاظهرت النتائج التشخيص في عينات الادرار في المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير ان بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 25% بينما انواع اخرى من بكتيريا ظهرت بنسبة 6% ,5% ,3% ,3% ,2% ,2% ,2% ,2%, 1.3% لبكتيريا klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia على التوالي. بينما من جانب اخر كانت نتائج التشخيص عينات الادرار لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير حيث كانت بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 28% بينما ظهرت نتائج الانواع بكتيريا الاخرى بنسبة 12% ,7% ,5% ,3% ,4% ,4% ,4% ,4% ,4% على التوالي لبكترياklibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp ..اظهرت نتائج تشخيص عينات الدم ان بكتيريا الاكثر تواجدا في المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير والمرضى غيرمصابين بثلاسيمميا النوع الكبير كانتEscherichia coli 24% ,15% على التوالي. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 6% ,3% ,5%, 5%,5% ,3% ,2% ,2%, 2% على التوالي لبكتيريا streptococcus pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 7%, 5%, 3.2% ,3.2% ,3.2%3.2%, 3.2%, 3.2%,3.2% على التوالي لبكتريا sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca,proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea.spp. اما بالنسبة لتاثير بعض المضادات الحيوية على بكتيريا Escherichia coli فقد اظهرت النتائج اختبار الحساسية لمضادات باستخدام VITKE 2 systemمقاومة هذه العزلات امبسلين (98%) وسيفاتريكسون (95%) السبروفلوكساسين (46%) السيفوتازيديم (44 (%والاموكسيسيلين (43% (والسيفوتاكزيم (40%) وليفووكساسين) 78%) والنالدكسك اسد (50%) ميثوبريم (27%) سيفابيم (40%) اكستابنيم (20%).استعملت طريقة التحليل الجزيئي PCR analysis للكشف عن عوامل الفوعة الجينية والمقاومة والتقارب الوراثي التي تمتلكها بكتيريا Escherichiacolii ، وباستخدام بادئات متخصصة لكل من الجين الخاص بالاهداب من النوع الاول (fimH) والجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII). وجين خاص بتحلل الدم (hly) وجين خاص بالالتصاق (eae) وجين خاص ب لمقاومه مضاد حيوي ((bla - cmy2 كانت النتائج ان جين (fimH) بنسبة (58%) ، فيما كانت نسبة الجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII) (58%) بينما جين خاص بالالتصاق (eae) كانت نسبة (20%). ونسبة جين خاص بتحلل الدم (hly) (28%), ونسبة الجين خاص بمقاومة المضاد الحيوي ((bla - cmy2 كانت (83%) بينما كانت نسبة ظهور كل جينات) 5.7%), وكانت نتائج الجين الخاص بتقارب الوراثي (Box) (58%).ولغرض دراسة الاصابات الفايروسية مرتبطة بمرض ثلاسيميا النوع الكبير وباستخدام تقنية ELSLA جمعت عينات الدم (88 من المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير و62 من مرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير) تم جمع العينات من مركز الوطني لنقل الدم لتحري عن وجود الالتهاب الكبد الفايروسي نوع ( CوB) حيث كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (B) لدى المرضى مصابين مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (17%) بينما كانت نسبة لدى المرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (16%).بينما كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (C) (82.9 %) ,(8 ,83%) لدى مرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبيرو غير مصابين بثلاسيمياالنوع الكبير على التوالي . | This study was carried out to detect the types of bacterial and viral infections which associated with β thalassemia major comparison to non thalassemic patients group.For Bacterial types identification two different kinds of samples were collected from Ibin ALBalady hospital. Urine samples which included (41from thalassemic patients and 18 from non thalassemic patients) and blood sample which included (25 from thalassemic patients and 25 from non thalassemic patients) depending on their cultural, morphological as well as biochemical characterization. The result identification that in urine sample showed that was most prevalent kind was Escherichia coli with percentage 25%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 6%, 5%, 3%, 3%, 2%, 2%, 2%, 2%, and 1.3%. Klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia respectively. While, on other hand, in non thalassemic patients the result identification that in urine sample the most prevalent kind was Escherichiacoli with percentage 28%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 12%, 7%, 5%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4% for klibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively. The result for blood sample identification also showed that the Escherichia coli was most common in thalassemic and non thalassemic patients it with a percentage 15%, 24% respectively, and other types bacteria were also obtain with a percentage 6%, 3%, 5%, 5%, 5.3%, 2%, 2%, 2% for , sterptococcus pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively from thalassemic patients and other types bacteria were obtain from non thalassemic with a percentage 7%, 5%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3% for sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp receptivity, and the results confirmed by identification VITEK 2 system kit. The VITEK 2 SYSTEM Antibiotics sensitivity test kits results revealed that Escherichiacoli were resistance to following antibioses Ampcilin (98%), Cefatriaxone (95%), Ciprofloxacin (46%), Cefipime (74%) Liovfaxacin (78%), Tetracylin (70%), Cefotaxim (40%), Aomxcilin (43%), Nalidexic acid (50%), Extapenem (20%), ceftazidime (44%). Moreover, low percentage of resistance was shown to, extapenem (20%) Trimethoprim (27%). PCR Methods used of molecular diagnosis of virulence genes, resistance, genotyping genes of E. coli by using specific primers to type 1 fimbria gene (fimH) and capsule gene (kpsMTII), hemolysin (hly), intimin (eae), ceftriaxone (bla - cmy2). PCR results the presence fimH (58%) and kpsMTII (40%) while hly (28%), eae 25%, (bla - cmy2) (83%). While the prevalence of all genes together with a percentage (7.5%) The results of box - PCR genotyping was 80%. To study the viral infection which associated with β thalassemia major by used ELSLA technique sample (88 from thalassemic and 62 from non thalassemic patients) were collected from Iraq National blood bank. For detection of HBS and HCV the result showed that HBS17% in thalassemic patients while in non thalassemic patients was16% while HCV were (82.95%), (83.87%) is percentage thalassemic patients receptivity

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين == Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

اسم المؤلف: شذى فارس طارق
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

الكشف عن انواع الجنس Fusarium المنتج للفيومنسين ب1 على حبوب الذرة الصفراء باستخدام الطرائق الجزيئية ودراسة تاثيراته المرضية النسيجية على الفئران البيض == Detection of Fusarium Species Producing Fumonisin B1 on Maize Using Molecular Methods and Study Its Histopathological Effects on Albino Mice

اسم المؤلف: سيناء وليد محمد سعيد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب | سالم رشيد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص انواع الجنس Fusarium المرافقة للذرة وقابليتها على انتاج السم FB1 باستخدام الطرق التقليدية والجزيئية. كما تم دراسة الظروف المثلى لانتاجه فضلا عن تاثيره على انسجة الكبد والكلية والطحال وقياس انزيمات الكبد والطحال في ذكور الفئران المجرعه فمويا بالسم.تم جمع ثمانية وثمانين عينة ذرة للفترة ما بين تشرين الثاني 2013 واذار 2014 من الاسواق المحلية ومخازن الحبوب في بغداد (35 عينة ذرة من مخازن الحبوب و53 عينة من الاسواق المحلية) كما وتم الكشف عن الفطرين المنتجين للفيومينيسين وهما Fusarium verticillioides وF. proliferatum باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة (PCR) وتقنية فصل الصفائح الرقيقة (TLC) وتقنية الاليزا.(ELISA) وكانت النتائج كما ياتي : 1. الاجناس الفطرية المعزولة من الذرة هي : الفطر Aspergillus وكان الاكثر سيادة (58.6%) تليه الفطرياتFusarium (17.5%) ثم Rhizopus (6.7%), Alternaria (6.1%), Mucor وPenicillum (3.9%), Bipolaris (1.9%) وTrichthecium (1.2%).2. النوع الاكثر سيادة ضمن جنس Fusarium كان F. verticillioides (70.64%) 3. اظهرت النتائج باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة المتسلسلة (species specific PCR) ان من بين سبعة وسبعين عزلة, فقط ثلاثة عشر عزلة تعود للجنس F. verticillioides ومن بين تسع عزلات فقط عزلة واحدة تعود للجنس F. proliferatum.4. تمتلك جميع عزلات F. verticillioides الثلاثة عشر الجين fum1 وبذلك يعد المنتج الرئيسي للسم FB1 مقارنة مع عزلة F. proliferatum التي لم تمتلك الجين.5. من بين العزلاتF. verticillioides الثلاثة عشر, كانت العزلة FV1 هي الاكفا في انتاج FB1 (175.39 جزء في البليون) على وسط فطيرة الذرة بينما تراوح تركيز السم FB1 لبقية العزلات يتراوح بين (21.31 - 170.51 جزء في البليون).6. كانت نتائج الظروف المثلى لانتاج السم FB1 هي وسط فطيرة الذرة وفترة حضانة 21 يوم ودرجة حرارة مثلى 20ºم.7. حددت الجرعة القاتلة المتوسطة (LD50) للسم FB1 لذكور الفئران وهي 1800 جزء في البليون.8. لوحظت زيادة في تركيز انزيمات الكبد والكلى للفئران بعد تجريعها فمويا بالسم FB1 عند التركيزين 800 و1200 جزء في البليون مقارنة مع مجموعة السيطرة.9. كشفت النتائج ان التغيرات في انسجة الكبد والكلى والطحال للفئران المجرعه فمويا بالسم FB1بالتركيزين 800 و1200 جزء في البليون، ظهرت زيادة التغيرات 10. التنكسية والموت المبرمج للخلايا مقارنه مع مجموعة السيطرة. | The study aimed to identify Fusarium species associated with maize grains and their ability to produce Fumonisin B1 using traditional and molecular methods. The optimal conditions of FB1 production were assayed. The effect of FB1 on liver, kidney and spleen tissues of albino mice were studied and measured its effects on enzymes in affected liver and kidney.Eighty - eight maize samples were collected between November 2013 and March 2014 from local markets and silos of Baghdad province (thirty - five from silos and fifty - three from markets). Fusarium verticillioides and F. proliferatum were investigated and their ability to produce Fumonisin B1 was detected using : Polymerase chain reactions (PCR), Thin layer chromatography (TLC) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) techniques. The following results were obtained from the current study : 1. The fungal genera isolated from maize were : Aspergillus (58.6 % ) followed by Fusarium (17.5% ), Rhizopus (6.8 %), Alternaria (6.1 %), Mucor and Penicillium (3.9 %), Bipolaris (1.9 %), and Trichothecium (1.2%).2. The predominant species among Fusarium was F. verticillioides (70.64%).3. The use of species specific PCR reactions for Fusarium species revealed that out of seventy seven isolates, thirteen isolates only belong to F. verticillioides and out of nine isolates, one isolate only belong to F. proliferatum.4. All the thirteen F. verticillioides isolates were shown to possess fum1 gene (FB1 producer), whereas the F. proliferatum isolate was shown not to possess this gene. 5. Among the thirteen isolates of F. verticillioides, FV1was the most efficient one in production of FB1(175.39 ppb) on patty maize medium, while the concentration of FB1 for other isolates ranged between (21.31 - 170.51) ppb. 6. The optimum culture conditions for FB1 production using solid state fermentation included : patty maize medium with incubation period 21 days at 20ºC. 7. The median lethal dose 50 (LD 50) of FB1for male mice was 1800ppb.8. liver enzymes (AST, ALT, ALP) and kidney functions (Creatinine and Blood urea) were increased in male mice which were orally gavaged FB1 at 800 and 1200ppb concentrations comparing with control group.9. The histopathological changes in the liver, kidney and spleen of orally gavaged mice by FB1 at 800 and 1200 ppb, showed a significant increase degenerative changes and apoptotic cells in comparison with control group

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

اسم المؤلف: سوسن محمد كريم
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates
1 ... 33 34 35 36 37 ... 90