Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 50 out of 11,481

انتاج انزيم chitinase من بكترياSerratia marcescens باستخدام حالة التخمرات السائلة والصلبة ودوره في المعالجة الحيوية

Author name: ميس عماد احمد محمود
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: درست قابلية (15)عزلة من بكتيريا Serratia marcescenase على انتاج الكايتنيز, واظهرت نتائج الغربلة الكميه وشبه الكمية ان العزلةSerratia marcescenaseA1S هي الاغزر انتاجا للانزيم . زرعت البكتيريا في اوساط تخمر صلبة وسائلة مختلفة استعملت مواد نباتية مختلفة ( مضافا اليها الكايتين وبدونه ) لتحضير الاوساط الصلبة ، اما الاوساط السائلة فقد احتوت على الكايتين مع مواد نيتروجينية مختلفة . بينت النتائج الماخوذه من قياس فعالية الانزيم على اساس تقدير السكريات المختزلة والسكر ان استيل كلوكوز امين ان البكتيريا تنتج انزيمات الكايتينيز الداخلي chitobiosidase) ) الذي يحرر سلاسل من السكريات المختزلة والكايتنيز الخارجي chitobioase ) ) التي تحرر وحدات السكر الامينيN - acetyl D - glucosamine )) ، وكانت فعالية الكايتنيز الخارجي اعلى من الداخلي عموما ، وتبين ان الاوساط السائله تعطي انتاجية اعلى من اوساط التخمر الصلبة. نميت البكتيريا في الوسط السائل بظروف مختلفة ، ووجد ان الظروف الافضل لانتاج الانزيم هي اضافة البكتريا بعدد خلايا 104 × 2.2 خلية / مل الى الوسط الحاوي على الببتون بوصفه مصدرا للنتروجين 2 % من الكايتين الغروي وحضنها بدرجة 30 م عند الرقم الهيدروجيني ( 7 ) لمدة 4 ايام في الحاضنة الهزازة بسرعة 150 دورة / دقيقة ،وبلغت الانتاجية 9.5 وحدة/ملغم بروتين. رسب الكايتنيز في وسط الانتاج بعد تنمية العزلةmarcescenas A1S Serratia باضافة كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 75% ، وكانت الفعالية النوعية 9وحدة/ ملغم بروتين , وقد حققت هذه الخطوه تنقية جزئيه للانزيم وكان عدد مرات التنقيه5.6 بحصيله انزيميه مقدارها%80 . درست بعض العوامل المؤثره في فعالية وثبات الانزيم ، ولوحظ ان الرقم الهيدروجيني 7 هو الافضل للفعالية ، وتراوحت الارقام المفضلة لثباته بين 6 - 9 , وكانت اقصى فعالية للانزيم عند درجة 30 م . احتفظ الانزيم بنسبة 65 - 100 % عند حضنه بدرجات حرارة تراوح من 30 - 60 م لمدة 30 دقيقة ، وبقى محتفظا بـ 57 % من فعالية عند درجة 80 م. درس تاثيربعض المواد والمثبطات في فعالية الكايتنيز ولوحظ عدم تاثر الانزيم بـ EDTA وازايد الصوديوم والـPMSF بتركيز5 و10 ملي مولار . درس تاثير بعض الايونات الفلزية في فعالية الكايتنيز ولوحظت زيادة فعالية الانزيم عند حضنه مع ايونات الصوديوم Na+2 اذ وصلت الى 150 % . لم يتاثر الانزيم بايونات Mn +2 ، وFe+2 ،و Ca +2 ،و 2+ K وثبطت فعالية الانزيم عند معاملته بايونات Cu +² Zn +2, , Hg+2 بتركيز 5 ملي مولار اذ انخفضت الفعالية الى 31 , 50 , 55 % على التوالي وانخفضت الفعالية الى 25 ، 43 ، 50 % بتركيز 10 ملي مولار على التوالي عند المعاملة بهذه الايونات . قيست الفعالية المضادة للانزيم اتجاه انواع مختلفة من الكائنات الحية ، وبينت النتائج ان للانزيم فعالية مثبطة واضحة ضد خميرة الـ Candida albicans , حيث ظهرت مناطق عدم نمو واضحه للخميرة المعاملة بالانزيم ، وعند معاملةالقواقع البحرية Achatina fulica بالكايتنيز ظهرت تغيرات مظهرية عليها اذ لوحظ تنخر في اصدافها وفقدان فعاليتها. بينت النتائج ان تعريض يرقات حشرة خنفساء الطحين المتشابه Tribolium confusum للكايتنيز له تاثير قاتل للحشرة حيث فقدت حيويتها ، وظهر تحلل كامل في طبقة الكايتين التي تغلف سطح جسم اليرقة. يتضح من هذه النتائج ان الكايتنيز المنتج منmarcescenis A1S Serratia له فعالية مضادة لانواع مختلفة من الكائنات ، ويمكن استعماله بديلا للمواد الكميائية في القضاء على مثل هذه الاحياء | Fifteen Serratia isolatesd were obtained from different sources the ability of chitinase production from thes isolates was studied .Semi quantative and quantative screening appeared that Serratia marcescensA1S was the highest chitinase producer . The bacteria was cultured in different liquid and solid state fermentation media(SSF) , different plant sbstanaes were used for (SSF) with or without chitin , while liquid media containet chitin with different nitrogen source By measurements of reducing sugars and N - acetylD - glucosamine it was show this Serratia marcescensA1S produces endochitinase & exochitinase . the activity of exochitinase was higer than that of endochitinase the liquid media gaive higer chitinase production than the (SSF) Serratia marcescensA1S was grow in liquid media under tdifferent condiations and chitinase production was different favorable condtion for chitinase production were inoculation with 2.2 ×104 cell/ ml of bacteria in media containing 2 % chitin with peptone as nitrogen source , at pH 7, and incubated at 30 Cº in shakeing incubater with 150 rpm for 4 days Chitinase production reachet 9.7 unit/mg protein in these condation , Chitinase was precipitated from production media by 75 % saturation of ammonium sulphat with 9 unit/mg protein specific activity , the enzyme obtained from this step was partially purifed with 5.6 fold of purifaction and 80 % recovery . The effect of some facter on enzyme activity and stability were studied ,the optimum PH enzyme activity was 7and the favorites pH for enzyme stability ranged between 6 - 9 , the maximum activity was at 30 Cº, 100 - 65 % of enzyme activity mentained at 30 - 60 C º for 30 min and 57% at 80 Cº. EDTA ,Sodium azide and phenylmethane sulfonyl fluoride (PMSF) have no effect on chitinase activity with 5,10mM . The enzyme was treated with different metal ions , Na+2 increase enzyme activity , since it reached to150 % Mn2+ ,Fe +² ,Ca+2 , K+2, have no effect , while Cu2+, Zn+2, and Hg+2 at 5 Mm decreaced enzyme activity to 31 , 50 , 55 % respectivily and to 25 ، 43 ، 50% when it was treated with 10mM of these ions respectivily . The antibiotic activity of the chitinase against different organisms was determined , the enzyme inhibited Candida albicans growth, aclear zon appeared in the medium cultured with the yeast (treated with enzyme). Many chang appeared on sea snail Achatina fulica treated with enzyme, there was many pores on the shells , and the animal lost its viability . Flour beetle Tribolium confusum died when it was sprayed with chitinase, the chitin layer covered the Insecte body degredated after the treatment . From the above results it can be concluded that chitinase produced from Serratia marcescensA1S has antibiotic activity for different organismes , and it can be used as biocidal compound instead of chemical compounds for destroying or killing the harmful organisms

التحري الجزيئي عن جين الضراوة rmp لبكتيريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة محليا من المرضى البالغين == Molecular Detection of Virulance rmp Gene in Neisseria gonorrhoeae Isolated from Adult patients

Author name: مهـند كـريم عنيد الساعدي
Supervisor name: نورية عبد الحسين علي
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, the Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories for the time period from November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on media cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25 %) women and 63 (78.75 %) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75 %) samples were positive : 35(43.75 %) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer - Martin media; while 9 (11.25 %) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3 (3.75 %) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25 %) of the direct smears and 75 (93.75 %) of the urine samples were positive. Results of the Nitrogen bases sequence of the PCR technology of the samples in this study revealed consistency reaching up to 99 % with the Nitrogen bases sequence of the rmp gene present in the N. gonorrhoeae strain of the WHO. This study presented high specificity and sensitivity for the diagnosis of gonorrhoea using the PCR technology which is cheaper and faster than the conventional methods currently used in the hospitals and laboratories.

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة == Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

Author name: منال سلمان محمد كسار
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز == Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

Author name: مريم باسم انيس
Supervisor name: سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

تكون الغشاء الحيوي بوساطة Klebsiella pneumoniae الملوثة للمثبتات الخارجية ومقاومته لمضادات الحياة == Biofilm Formation by The External Fixators Contaminating Klebsiella pneumoniae and Its Antibiotic Resistance

Author name: مروى حميد مطشر الخفاجي
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شخصت 98 عزلة بكتيرية منماة بظروف هوائية من مجموع 100 عينة سريرية ماخوذه من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية المستعملة في جراحة العظام والكسور. شكلت البكتريا السالبة لملون غرام اعلى نسبة 51% (50 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات، في حين شكلت البكتريا الموجبة لملون غرام 49% (48 عزلة) منها ، وكانت بكتريا Klebsiella pneumoniae هي المسبب الاكثر شيوعا لهذه الاخماج اذ عزلت بنسبة 74% (37 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات السالبة لملون غرام . اجري اختبار حساسية عزلات K. pneumoniae لمضادات الحياة ، وتبين ان العزلات جميعها كانت حساسة لمضاد Amikacin (100%) ، ومقاومة للمضادات : Ampicillin ، وCefalexine ، وCefalothin ، وCefotaxime ، وCiprofloxacin ، وRifampin بنسبة 100% ، وقد كانت نسبة مقاومتها لمضادات Ceftazidime ، وStreptomycin ، وTobramycin ، وGentamycin ، وNeomycin ، وNitrofurantoin ، وNorfloxacin ، وTetracycline ، وNalidixic acid 94.5% و86.5% و86.5% و67.5% و59.5% و37.8% و35.1% و32.5% و24.3% وعلى التوالي . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات بكتريا K. pneumoniae لمضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin فبلغت 1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K13 ، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر، و4 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51 . كما تم تحديد التراكيز القاتلة الدنيا لهذه المضادات وتراوحت مابين اكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، على التوالي للعزلة K13 ، واكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و256 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، و8 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51. تم التحري عن قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الطبقة اللزجة ، واظهرت نتائج طريقة الفحص بالانابيب ان 83.8% (31عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة ، في حين اظهرت طريقة احمر الكونغو ان 97.3% (36عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة . تم التحري عن فوعة عزلات K. pneumoniae المعزولة من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية وذلك باختبار قابليتها لربط البنفسج البلوري وكانت العزلات جميعها فائعة (Virulent) . اختبرت قدرة عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة فاظهرت النتائج ان العزلات جميعها كانت منتجة للغشاء الحيوي لكن بدرجات سمك متفاوتة ، وتراوحت قيم الامتصاصية مابين (0.111 - 2.899)، وكانت العزلة K13 هي العزلة الاكثر فعالية في انتاج الغشاء الحيوي حيث سجلت اعلى قيمة امتصاصية 2.899 . اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا من مضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin في الاغشية الحيوية المتكونة بفعل العزلتين K13وK51 في اطباق المعايرة الدقيقة باعمار مختلفة 24 ساعة و48 ساعة ، واظهرت النتائج ان هذه التراكيز ثبطت التصاق البكتريا على سطح البولي ستيرين مما ادى الى انفصال الغشاء الحيوي ، كما تبين ان الاغشية الحيوية الاقدم اكثر مقاومة للعوامل ضد الميكروبية . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للغشاء الحيوي واظهرت النتائج انها اكبر بثلاث او اربع مرات من التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات K. pneumoniae العالقة في الوسط الزرعي | Out of 100 clinical samples taken from infected external fixation devices used in orthopedic surgery 98 bacterial isolates grown in aerobic conditions had been diagnosed. The higher ratio 51% (50 isolates) of the total number of the isolates occupied by gram negative bacteria while gram positive bacteria represented the rest 49% (48 isolate) , Klebsiella pneumoniae was the most common aetiological agent of these infections which accounted 74% (37 isolates) of the total number of gram negative bacterial isolates. The sensitivity test against different antibiotics was done. It was found that all K. pneumoniae isolates (100%) were sensitive to Amikacin and resistant to Ampicillin, Cefalexine, Cefalothin, Cefotaxime, Ciprofloxacin, and Rifampin . While their resistance percetage to the antibiotics Ceftazidime, Streptomycin, Tobramycin, Gentamycin, Neomycin, Nitrofurantoin, Norfloxacin, Tetracycline, and Nalidixic acid were 94.5% , 86.5% , 86.5% , 67.5% , 59.5% , 37.8% , 35.1% , 32.5% , 24.3% respectively. Minimum inhibitory concentrations to K. pneumoniae isolates had been determined for the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , they were 1024 Mcg/ml , 128 Mcg/ml , 64 Mcg/ml , and 16 Mcg/ml respectively for the isolate K13 , and they were 1024 Mcg/ml , 64 Mcg/ml, 16 Mcg/ml, and 4 Mcg/ml respectively for the isolate K51. Minimum bactericidal concentrations for the same antibiotics had been estimated and they were higher than 1024 Mcg/ml, 1024 Mcg/ml, 128 Mcg/ml, and 32 Mcg/ml respectively for K13 isolate, and higher than 1024 Mcg/ml, 256 Mcg/ml, 32 Mcg/ml, and 8 Mcg/ml respectively for the isolate K51. The ability of K.pneumoniae isolates to produce slime layer was detected , the results revealed that 83.3% (31 isolates) were slime layer producers by tube method, while 97.3% (36 isolates) were slime producers by congo red method. The virulence of K.pneumoniae isolates isolated from external fixators infections had been detected via detection the crystal violet binding ability of these isolates, all the isolates were virulent. The ability of K.pneumoniae isolates to produce the biofilm had been tested by using microtiter plates , results revealed that all the isolates were biofilm producers with different thickness degrees, absorbance values rendered between (0.111 - 2.899) , K13 was the best biofilm producer isolate, it,s absorbance value was 2.899 . The effect of subinhibitory concentrations of the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , on biofilms formed by K13 and K51 isolates in microtiterplates in different ages , 24 hr and 48 hr had been tested , results revealed that these concentrations inhibited bacterial adhesion on polysteren surface and consequently causes biofilm detachment , also it was demonstrated that aged biofilms are more resistant to antimicrobial agents . Minimum inhibitory concentrations for the biofilm had been estimated, and the results revealed that these concentrations were three to four times higher than minimum inhibitory concentrations for the planktonic K.pneumoniae isolates.

استخلاص بكتريوسين من العنقوديات الذهبية لعينات سريرية واختبار قدرته العلاجية وتاثيره في الخلايا السرطانية والطبيعية == Extract bacteriocin from Staphylococcus.aureus of clinical samples and test it´s curing ability and effects in cancerous and normal cells

Author name: اسما سميع افرام كرومي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | علي صالح حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: Tikrit University - Faculty Of Education
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة لغرض تقييم القدرة العلاجية للبكتريوسينات المنتجة بواسطة عزلات سريرية من بكتريا المكورات العنقودية الذهبيةStapylococus aureus ضد الاورام السرطانية للغدة اللبنية المغروسة في اناث الفئران البيضاء ودراسة تاثيراتها في الخلايا اللمفاوية لمزارع الدم الكامل للانسان وخمس من خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية المعاملة في الزجاج.اشتملت الدراسة على ما ياتي : - عزل وتشخيص افراد النوع Stapylococus aureus من عينات سريرية لاصابات جرثومية معظمها من جروح(33عينة) وحروق(13عينة) ودمامل(33) من مرضى راقدين في مستشفيات السلام, الخنساء, ابن الاثير, ابن سينا والمستشفى الجمهوري في محافظة نينوى للمدة من الاول من شباط ولغاية الاول من اب للعام 2007 , عزل وتوصيف السلالات المنتجة للبكتريوسينات, استخلاص البكتريوسينات المنتجة بواسطة السلالات الكفوءة, تنقية وتوصيف البكتريوسينات المستخلصة, تقييم القدرة العلاجية للبكتريوسينات المستخلصة ضد الاورام السرطانية للغدة اللبنية المغروسة في اناث الفئران البيضاء, تقدير تاثير البكتريوسين المستخلص في الخلايا اللمفاوية لمزارع الدم الكامل للانسان المعاملة في الزجاج, وتقدير تاثير البكتريوسين المستخلص في خمس من خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية.تم التقييم باستعمال الطرق الاتية : - تقدير الشذوذ الكروموسومي في خلايا نقي العظم, تقدير الشذوذ الكروموسومي في الخلايا المولدة للنطف, تقدير التشوهات المظهرية في النطف الناضجة, تقدير التلف الوراثي في الخلايا الكبدية بواسطة تقنية Comet assay, تقدير التلف الوراثي في الخلايا اللمفاوية للانسان بواسطة اختبار النواة الصغرى واختبار تبادلات الكروماتيدات الشقيقة, تقدير التاثير التثبيطي في نمو الخلايا السرطانية والطبيعية الناتج عن المعاملة مع تركيزات مختلفة من البكتريوسين ولفترات زمنية مختلفة.تم الحصول على (163) عزلة نقية لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية من اصل (250) عينة سريريه جمعت من اصابات الجروح والحروق والدمامل. كانت 14\ 163 عزلة منتجة كفوءة وقد ظهر ان عزلتين منها كانت احداها ذات فعل محلل للدنا ومحطمة للغشاء السايتوبلازمي اما الثانية فكانت ذات فعل محلل للدنا وليس لها تاثير على الغشاء الخلوي, وهما العزلتين التي تم استخدامهما في انتاج البكتريوسينات التي تم اختبار تاثيراتها في هذه الدراسة. اظهرت العزلات المستخدمة في الدراسة مقاومة متباينة لخمسة عشر نوعا من المضادات الحيوية.تم استخلاص البكتريوسين وكان من النوع الحر غير المرتبط, وقد اظهر ثباتية عند الخزن بدرجة 4ﹾ م. رسب البكتريوسين بواسطة كبريتات الامونيوم واجري الفصل بواسطة عمود السيفادكس 100G, ثم جفدت المادة وتم وزن المسحوق واستخدامه في تحديد الجرعة المميتة النصفية وكانت قيمتها210,215mg/kg.bw. والجرعات المستخدمة في المعاملات العلاجية ودراسة السمية الوراثية وهي 2 /1 و10 /1 قيمة LD50 . واستخدمت الجرعة100 /1 من قيمة LD50 وسلسة التخفيفات النصفية لها في معاملة الخلايا اللمفاوية لمزارع الدم الكامل للانسان وخطوط الخلايا السرطانية والطبيعية. ترافقت انواع الشذوذ الكروموسومي مع ازدياد حجم الورم المغروس في الفئران وكانت على نوعين, شذوذ تركيبي بشكل كسر كروموسومية وسلسلة رباعية, اما بالنسبة للشذوذ العددي فكان من نوع الوهن السنتروميري والانقسام الميتوزي الداخلي. كما اظهرت المعاملة داخل الجسم مع البكتريوسين انواع من الشذوذ الكروموسومي في كل من خلايا نقي العظم والخلايا الابتدائية المولدة للنطف, حيث لوحظت السلسلة الرباعية واحاديات X - Y والاحاديات الجسميةو التعدد المجموعي الكروموسومي. اما بالنسبة للتشوهات في الشكل الظاهري للنطفة الناضجة فقد لحظ الراس غير المنتظم, الراس فاقد النتوء , الراس الصغير, الراس الكبير والراس الشبيه بالموز, كما لحظ الذيل الملتف. تسببت المعاملة العلاجية مع كل من المستخلصينB6 وB11 الى تحسن الفعالية الميتوزية وخفض حدوث انواع الشذوذ الكروموسومي التركيبي والعددي, حيث كان متوسط مجموع احداث الشذوذ الكروموسومي 8.4±0.25 بعد نمو الورم المغروس واصبح بعد المعاملة العلاجية 4.5±0.22 مع المستخلصB6, 2.0±0.005 مع المستخلصB11 بالمقارنة مع 1.8±0.009 في مجموعة السيطرة السالبة, وهذا يشير الى فروق معنوية عند مستوى p<0.05. كما تبين ان لطول فترة المعاملة بعد الغرس مع كلا الجرعتين العلاجيتين تاثيرا في نسبة خفض احداث الشذوذ الكروموسومي, حيث انخفضت متوسطاتها من 8.8±0.28 الى 4.0±0.02 بعد ثلاث اسابيع والى 5.0±0.02 بعد ستة اسابيع مع1\ 10 من قيمةLD50 و5.0±0.02بعد ثلاث اسابيع و4.0±0.01 مع1\2 قيمة LD50 وهذا يشير الى ان الجرعة الاولى تفقد تاثيرها مع ازدياد فترة المعاملة في حين ان الجرعة الثانية تكون اكثر تاثيرا مع ازدياد فترة المعاملة.تسببت المعاملة داخل الجسم لذكور الفئران مع الجرعتين العلاجية 1\ 10 و1\ 2 من قيمة LD50 في حث انواع الشذوذ الكروموسومي حيث كان متوسط مجموع انواع الشذوذ التركيبي 4.0±0.17, 4.1±0.13 مع1/10و 1/2قيمة LD50 على التوالي من B6 و5.1±0.31, 5.1±0.14 معB11 وهي فروق معنوية عند مستوى p<0.05 بالمقارنة مع قيم السيطرة السالبة 2.1±0.1. اما بالنسبة لانواع الشذوذ العددي فقد كانت متوسطات مجموعها 8.0±0,3, 8.o±0,2 مع 1\ 10 و1\ 2 قيمة LD50 على التوالي بالنسبة للبكتريوسينB6, 7.6±0.1 و8.1±0.17 وهي فروق معنوية عند مستوىp< 0.05 بالمقارنة مع قيم السيطرة السالبة التي بلغت 1.8±0.009. كما تسببت المعاملة في خفض الفعالية الميتوزية MI, فقد ظهرت فروق معنوية عند مستوىp<0.05 بالمقارنة مع السيطرة السالبة 75.6±0.9 حيث بلغت 46.6±1.5, 43.0±0.3 مع البكتريوسينB6 و38.9±0.2, 37.2±0.3 مع البكتريوسينB11. وقد تسببت المعاملة لذكور الفئران البيضاء في حث انواع الشذوذ الكروموسومي في الخلايا الابتدائية المولدة للنطف حيث ظهرت فروق معنوية عند مستوىp<0.05 في متوسط مجموع الشذوذ التركيبي بالمقارنة مع السيطرة السالبة 1.8±0.17 في حين بلغت 3.4±0.6 و4.1±0.6 بالنسبة لB6, 7.9±2.6 و8.2±2.5 بالنسبة لB11. اما انواع الشذوذ العددي فقد ظهرت فروق معنوية عند مستوىp<0.05 في متوسط المجموع الكلي حيث بلغ 6.6±1.01 في السيطرة السالبة, 11.0±2.01 بعد ستة اسابيع من المعاملة مع المستخلصB11. وقد حثت تشوهات في الشكل الظاهري للنطف الناضجة بالمعاملة مع البكتريوسين, فقد ظهرت فروق معنوية عند مستوىp<0.05 في متوسط مجموع التشوهات حيث بلغت 19.8±0.73 في السيطرة في حين وصلت 23.0±1.0 مع B6, 26.8±1.15 معB11. تسببت المعاملة العلاجية بالبكتريوسين في خفض مستوى التلف في دنا الخلايا الكبدية للفئران الحاملة للاورام المغروسة, حيث لحظت فروق معنوية عند مستوىp<0.05 في قيم OTM والتي بلغت 0.19±0.03 في السيطرة السالبة, 3.73±0.69 في الفئران المغروسة وانخفضت بعد المعاملة العلاجية الى2.16±0.59, 0.998±0.32 بعد ثلاثة وسته اسابيع على التوالي مع B6. وبلغت2.72±0.576, 1.216±0.387 بعد ثلاثة وسته اسابيع على التوالي مع B11. كما تسببت المعاملة العلاجية في خفض معنوي عند مستوىp<0.05 للنسبة المئوية للخلايا الحاوية على الدنا المتضرر, حيث كانت نسبتها في السيطرة السالبة 98.5±9.0 وانخفضت الى87±0.78, 58.7±5.88 بعد ثلاث وست اسابيع على التوالي مع B6, اما مع B11 فقد بلغت 92±8.25, 64.8±7.21 بعد ثلاثة اسابيع وست اسابيع على التوالي. اما عند معاملة الخلايا اللمفاوية لمزارع الدم الكامل للانسان بتراكيز مختلفة من البكتريوسين فقد تم حث تكوين النوى الصغرى باسلوب معتمد على الجرعة حيث بلغ عددها في السيطرة السالبة 17 مع الواهب الاول و13 مع الواهب الثاني في حين تسببت التراكيز العالية في فروق معنوية عند مستوى p<0.05 وp<0.01 حيث بلغت 33 و35 مع التركيزين 100, 500 µg/ml على التوالي بالنسبة للواهب الاول. كما نتجت زيادة معنوية في متوسط مجموعSCEs مع التركيز500µg/ml بلغت 8.10±0.41 بالنسبة للواهب الاول ولم تلحظ زيادة معنوية بالنسبة للواهب الثاني مع B6, في حين حدثت زيادة معنوية عند مستوىp<0.05 وp<0.01, حيث بلغت 9.54±0.35 و9.54±0.33 مع التركيزين100, 500 µg/ml على التوالي مقارنة مع 7.14±0.35 بالنسبة للسيطرة السالبة مع الواهب الاول, وبلغت 9.74±0.50, 10.68±0.45 مع التركيزين نفسهما بالنسبة للواهب الثاني. اما عند معاملة خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية فقد وجد تباينا في تاثير المستخلصين B6 وB11 اعتمادا على نوع الخلايا ومدة المعاملة. كما وجد تماثلا في الفعل القاتل الذي يوجهه المستخلصين مع بعض الاختلافات. بالنسبة للخط الخلوي AMN - 3 وجدت فروق معنوية عند مستوى p<0.05 في متوسط اعداد الخلايا الحية بعد 24 و48 ساعة من المعاملة مع التراكيز الواطئة ومع التركيز الاعلى بعد72 ساعة من المعاملة مع المستخلصين B6 وB11, اي ان الخلايا تزداد مقاومة مع طول مدة المعاملة. واختلف نمط التاثير بالنسبة للخط الخلوي RD اذ وجدت فروق معنوية عند مستوى p<0.05 في متوسط اعداد الخلايا الحية بعد المعاملة مع التراكيز العالية لمدة 24 ساعة واختفى التاثير عند المعاملة مع المستخلصين لمدة 48 ساعة ليعود فيظهر مع التراكيز الواطئة مما يشير الى احتمالية احداث تغيرات في المادة الوراثية للخلايا. وتماثل تاثير كل من المستخلصين في خلايا الخط الخلوي السرطاني Hela اذ لم توجد فروق معنوية بين السيطرة والمعاملة بعد 24 و48 ساعة بينما وجدت فروق معنوية عند مستوى p<0.05 في متوسط اعداد الخلايا الحية بعد المعاملة لمدة 72 ساعة ويشير هذا الى ازدياد التاثير في الخلايا مع طول مدة المعاملة وبالنسبة للخط الخلوي AMG وجدت فروق معنوية عند مستوى p<0.05في متوسط اعداد الخلايا الحية بعد 24, 48 ساعة من المعاملة مع التراكيز الواطئة واقتصر التاثير على التركيز الاعلى من المستخلصB6 والمستخلص B11 بعد 72 ساعة من المعاملة واما بالنسبة للخط الخلوي الطبيعي المتحول L20B, فقد تباين تاثير كل من المستخلصين B6 وB11 اذ وجدت فروق معنوية في متوسط اعداد الخلايا الحية بعد 24 ساعة من المعاملة مع ادنى تركيز من المستخلص B6 والتركيزين الاعلى والاوسط من المستخلصB11 وتماثل سلوك خلايا هذا الخط مع خلايا الخط السرطاني RD اذ انعدمت الاستجابة بعد 48 ساعة من المعاملة مع كل من المستخلصين لكنها اختلفت بعد72 ساعة من المعاملة اذ ازدادت مقاومة الخلايا. | The study was designed to test effect of bacteriocin extracted from Staphylococcus aureus isolated in cancer and normal cells in vitro and in vivo. clinical The study includes : - Isolation and identification of Staphylococcus aureus from clinical samples of wounds(33)20% , burns(13)8% and fasterrs(33)20%,cases in Al - Salaam, Al - Khansah, Abn - Atheer, Ibn Sena, Al - gamhoory hosphtalofMosul city.The study started from Feb.(2007) to Oug(2007). Isolation and identification of bacteriocin producing strains, extraction of produced bacteriocin by competent strains, purification and charachterization of extracted bacteriocin, evaluation of therapeutic ability of extracted bacteriocin against transplanted mammary tumor in white mice females, determination of bacteriocin effect 0n human lymphocytes of whole blood culture and determination .of bacteriocin effect in five of cancer and normal cell lines. The evaluation conducted by : - Determination of chromosome aberration in bone marrow cells, Determination of chromosome aberration in primary spermatocytes, determination of morphological abnormalities in mature sperms, determination of genetic damage in hepatic cells by comet assay, determination of genetic damage in human lymphocytes by micronucleus test and SCEs test, determination of inhibition effect in cancer and normal cells growth result from treatment with different concentrations of bacteriocin for different times. 163 S aureus isolates from 250 samples of wounds , burns and fasterrs ,14/163 has been detected as competent producing isolates, 2/14 isolate showed DNase and plasma membrane damage effect. These two isolates used to produced bacteriocin which used for testing its effects in this study. Free extracted bacteriocin showed stability in storing at 4ºC. Ammonium sulfate used to precipitate the bacteriocin. Separation was conducted by 100G sephadex column. Lypholization and weighing of powder in order to using in LD50 determination and therapeutic treatment and genotoxicity study with 1/2, 1/10 LD50 and dose of 1/100 LD50 and its half dilutions in treatment of cancer and normal cell lines.Chromosome aberrations associate with growth of transplanted tumor in mice females which of two type, structural aberration as chromosome breakage, chain IV and numeric aberration as chromosome attenuation and endomitoses.In vivo treatment with bacteriocin showed chromosome aberration types in bone marrow cells and primary spermatocytes.Chain IV, X - Y univalents and autosomal univalents was observed, polyploidy was observed too.Sperm morphological abnormalities was observed as amorphous head, with out hook, small and big head and banana shape, coiled tail was noticed too.Therapeutic treatment with B6 and B11 bacteriocine caused enhancement of mitotic activity MI and reducing of structural and numerical aberrations. Its total average was 8.4±0.25 after growth of transplanted tumor, after therapeutic treatment was 4.5±0,22 with B6, 2.0±0.005 withB11 compared with 1.8 ±0.009 of negative control, this refer to significant differences at p<0.05. Treatment with the two used doses in decreasing percentage of chromosome aberration its averages decreased from 8.8±0.28 to4.0±0,02 after 3 weeks and to 5.0±0.02 after 6 weeks with 1/10 LD50 and to 5.0±0.02 after 3 weeks, 4.0 ±0.01 after 6 weeks with 1/2 LD50.In vivo treatment of male white mice with the two therapeutic doses 1/10, 1/2 LD50 cause induction of CAs types. Average of total structural aberrations 4.0±0.17, 4.1±0.13 with 1/10 and 1/2 of LD50 respectively with B6, 5.1±0.31 and 5.1±014 with B11 which is significant differences when compared with negative control 2.1±0.1. Average of total numerical aberrations was 8.0±0.3, 8.0±0.2 with 1/10 and 1/2 LD50 respectively of B6, 7.6±0.1 and 8.1±0.17 with 1/10 and 1/2 LD50 respectively of B11 which show significant differences when compared with negative control 1.8±0.009. Treatment caused decrease of mitotic activity (M!), there were significant differences at p<0.05 when compared with negative control 75.6±0.9. It reached 46.6±1.5, 43.0±0.3 with B6 and 38.9±0.2, 37.2±0.3 with B11. Treatment of male white mice induce chromosome aberration types in primary spermatocytes which showed significant differences at p<0.05 of total average of CAs when compared with negative control 1.8±0.17 while it reached 3.4±0.6 and 4.1±0.6 with B6 and 8.2±2.5 with B11.Sperm morphological abnormalities induced by treatment with bacteriocin, it showed significant differences at p<0.05 in total average abnormalities which reached 19.8±0.73 for control while reached 23.0±1.0, 26.8±1.19 for B6 and B11 respectively. Therapeutic treatment caused decrease in level of damage in hypatocytes DNA of tumor carrier mice. Significant differences was observed at p<0.05 in OTM which reached 0.19±0.03 in negative control, 3.73±0.69 in transplanted mice and decreased to 2.16±0.59, 0.998±0.32 after treatment for 3 and 6 weeks respectively with B6. It reached 2.72±0.576, 1.216±0.387 after 3 and 6 weeks respectively with B11. Therapeutic treatment cause significant decrease at p<0.05 in percentage of cells with damaged DNA. Percentage in negative control was 98.5±9.0 and decreased to 87.0±0.78, 58.7±5.88 after 3 and 6 weeks respectively with B6 and with B11 reached to 92.0±8.25 and 64.8±7.21 after 3 and 6 weeks respectively. Treatment of human lymphocytes in whole blood cultures with different concentrations of bacteriocin induce micronucleus formation in dose dependent manner. Its number reached 17 and 13 in 1st and 2nd donors respectively in negative control cultures. High concentrations of bacteriocin caused significant differences at p<0.05 and p<0.01, which reached 33and 35 with 100 and 500µg/ml respectively for 1st donor. Significant increase at p<0.05 resulted in total average of SCEs with 500µg/ml which reached 8.10±0.41 for 1st donor. No significant increase was observed for 2nd donor with B6, while significant increase at p<0.05 and p<0.01 resulted , which reached 9.94±0.35 and 9.54 ±0.33 with 100 and 500µg/ml respectively when compared with 7.14±0.35 for negative control cultures of 1st donor, and 10.68±4.5, 9.74±0.50 with the same concentrations for 2nd donor.When Cancer and normal cell lines treated, Different effect was existed by either of B6 and B11 extract and this depend ed on kind of cells and time of treatment. Similar killing effect of the two extracts was existed with some difference. For the cancer cell line AMN - 3 significant differences at the level P<0.05 in mean of viable cells numbers after 24 and 48 h of treatment with lower concentrations and with the highest concentration after 72 of treatment with the two extracts B6 and B11, that means increased cell resistance with the time of treatment. The mode of effect was different for cancer cell line RD, there were significant differences at P<0.05hn mean of viable cell number after treatment with the higher concentrations for 24 h , the effect disappeared with the treatment of 48 h which returned with the lowest concentrations with treatment of 72 h that refer to the possibility of occurred changes in cells genetic material. The effect of the two extracts in the cancer cell lines Hela which showed no significant differences Between the control and treatment after 24 and 48 h but significant differences at P<0.05 was excited in mean of cell numbers after treatment for 72 h which refer to increased effect in the cells with the durance of treatment, for the cancer cell line AMG - 5 significant differences was excited at P<0.05 in the mean of cell numbers after 24 and 48 the lowest concentrations and with the highest concentration of the extracts B6 and B11 after 72 h of treatment. While for the transformed normal cell line L20B the effect of either of the two extract B6 and B11 was variant which showed significant differences in mean of viable cell numbers after 24 h of treatment with the lowest concentration of the extract B6 and the highest and median concentrations of the extract B11, their the behaviour of this cells was similar with the cells of cancer cell line RD which showed no response after 48 h of treatment with the two extracts which disappeared but it different after 72 h of treat men which refer to increased cells resistance.

دراسـة الاستجابة المناعيـة للاشخاص بعد تلقيحهم بلقاح الحصبـة الالمانية == Immune - status of Individuals after Immunization with Rubella vaccine

Author name: ليلى فؤاد علي
Supervisor name: غنيمة صادق محمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: بدا برنامج التلقيح الموسعExpanded programme on immunization(EPI) في العراق عام 1985وبتوجيه من منظمة الصحة العالمية وبضمنه لقاح الحصبة الالمانية في برنامج التلقيح الاعتيادي للاطفال وبعمر 15شهر بهدف القضاء على مرض متلازمة الحصبة الالمانية الولادية نظرا لما يسببه هذا المرض من اضرار كبيرة في الجنين حيث قد يولد الطفل المصاب مشوه وقد تؤدي الاصابة بحياته الى الموت (Laura & Susan,2002). شملت الدراسة (116) عينة دم ماخوذة من اشخاص اصحاء ،كان منها 30 عينة دم لاطفال اصحاء بعد اسبوعين من تلقيحهم بلقاح الحصبة الالمانية حسب الجدول التلقيحي المتبع في القطر وقد تراوحت اعمارهم مابين (18 - 20) شـهر ، و20 عينة دم لاناث تراوحت اعمارهن مابين(12 - 15) سنة بعد اسبوعين من تلقيحهن بلقاح الحصبة الالمانية . اما مجموعة السيطرة فتضمنت 12 عينات دم لاطفال و10 عينات لاناث بعمر (12 - 15) سنة لم يتلقوا لقاح الحصبة الالمانية . هذه العينات اجريت لها الاختبارات المناعية لتقييم الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية للقاح الحصبة الالمانية.كما تضمنت الدراسة 44 عينة دم لاشخاص ملقحين منها 22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها موجبة و22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها سالبة ، تم اختبار هاتين المجموعتين باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) لمعرفة العلاقة بين الفحصين والحساسية والنوعية لفحص (ELISA)نسبة الى فحص تثبيط التلازن الدموي . في هذه الدراسة تم قياس الاستجابة المناعية الخلطية وذلك بقياس تركيز الاضداد النوعية للحصبة الالمانية ، بالاضافة الى تقدير التركيز الكلي للكلوبيولينات المناعية صنفA وM وG.كما تضمنت الدراسة قياس الاستجابـة لمناعية الخلوية وذلك بقياس قابلية الخلايا البلعمية على البلعمة ،وقياس قابلية الخلايا اللمفاوية التي تم تحفيزها بالملزن النباتي (PHA) على التحول والانقسام . من خلال هذه الدراسة تم الحصول على النتائج التالية : - 1 - اظهرت مصول الاطفال نسبة 96.7 % ،واظهرت مصول الاناث نسبة 95 % تراكيز فعالة من الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية اعلى من 11وحدة عالمية \مليلتر باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم ELISA بعد عملية التلقيح .2 - اظهرت مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين انخفاض في اجمالي الكلوبيولين المناعي صنف GوAوبفروق معنوية (p<0.05) ( p>0.05 ) مع ارتفاع في الكلوبيولين المناعي صنف Mوبفروق معنوية عالية(p<0.01) مقارنة بمجموعتي السيطرة .3 - وجد من خلال فحص النسبة المئوية لعملية البلعمة ان كل من الاطفال والاناث الملقحين اظهروا ارتفاعا في النشاط الالتهامي للخلايا البلعمية وبفروق معنوية (p<0.05) مقارنة بمجموعتي السيطرة .4 - اظهرت نتائج فحص التحول والانقسام اللمفاوي ان هناك انخفاض غير معنوي ( p>0.05 )في مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين مقابلة بمجموعتي السيطرة . 5 - لا توجد فروق معنوية في الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية بين مجموعة الاطفال الملقحين ومجموعة الاناث الملقحات ( p>0.05 ) .6 - وجد ان فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم هو اكثر حساسية من فحص تثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية ،وعليه فهو الافضل في تقييم الاستجابة المناعية للقاح الحصبة الالمانية .7 - وجد ان هناك علاقة ايجابية قوية بين فحصي الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم وتثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية حيث كانت قيمة ( r = 0.585 ) . | The Expanded Programme on Immunization (EPI) began in Iraq in 1985, including Rubella vaccine. MMR vaccine is represent one of combined vaccines of rubella ,measles and mumps that given for children at age of 12 - 15 months. Vaccination with rubella vaccine is the best way to eradicate Congenital Rubella Syndrome which have severe complications for women in their first trimester of pregnancy These complications include severe birth defects or death of the fetus. In this study, (116) blood samples were taken from healthy individuals after 2 - 4 weeks after vaccination with rubella vaccine .(30) from children of age (12 - 18) and (20) from females at age of (12 - 15) years old . Control group included (12) healthy children and (10) healthy females ,both did not have rubella vaccine through their life .These samples were tested to evaluate the immune - states of individuals after immunization . the study include (44) blood samples tested by HItest and ELISA test . In this study specific haemagglutination antibodies & IgM antibodies were measured ,total Immunoglobulines IgM ,IgG ,IgA also determined .Lymphocyte transformation and ability of phagocyte cell to phagocytosis were measured. The following results were obtained in this study : 1. The percentage of children whom observed levels of specific antibodies ≥ 11AU/ml was 96.7% and 95% by ELISA test for children and females groups respectively after vaccination .2. The decreasing total of IgG and IgA with the increasing of IgM in both groups of children and females with significant differences (p>0.05) (p>0.05) (p<0.01) receptively comparison with control group.3. The increasing percentage of phagocytic cell to phagocytosis in both groups of children and females in significant differences (p<0.05) comparison with control group .4. The decreasing percentage of lymphocyte transformation in both children and females groups in non significant differences (p>0.05) comparison with control group .5. The non significant differences in humoral and cellular immune Response between child and female groups .6. The higher sensitivity of ELISA test to HI test in determination of rubella specific antibodies , so it is better than HI test in measuring the immune - status of individuals vaccinated with rubella vaccine .7. A positive relationship between ELISA test and HI test (r= 0.585) .

الاستخلاص والتنقية الجزئية للخملة من بكتريا Proteus mirabilis ودراسة دورها في الالتصاق على الخلايا الطلائية البولية == Extraction and Partial Purification for Fimbriae from Proteus mirabilis and Study Their Role in Adhesion to Uroepithlial Cells

Author name: عامر سعيد علي الكعبي
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص البكتريا السالبة لملون كرام من ادرار المرضى المراجعين لمستشفى الكاظمية التعليمي ومستشفى اليرموك في بغداد واللذين شخصت اصابتهم بخمج المسالك البولية سريريا . عزلت البكتريا السالبة لملون كرام من 61 عينة ادرار وبنسبة عزل 28.9% من اصل 211 عينة ادرار , كانت نسبة عزل بكتريا Escherichia coli 70.49% , اما بكتريا Klebsiella pneumoniae , وPseudomonas aeruginosa فكانت نسبـة عزلهما 8.19% و6.55% وعلى التوالي . اظهرت بكتريا Proteus spp. نسبة عزل 14.75% وبلغت نسبة عزل P.mirabilis 11.47% اما نسبة عزل P.vulgaris فكانت 3.27% . تم التحري عن قدرة سللات بكتريا P.mirabilis للتعبير عن خمل لاصق الخلايا الطلائية البولية (Uroepithelial Cell Adhesin)(UCA) , بالاعتماد على اعلى معدل التصاق للبكتريا بالخلايا الطلائية البولية للانسان , اذ تم اختبار العزلة P.mirabilis U7 التي كان معدل التصاقها 30.2% عند تنميتها على وسط مرق اللوريا وفترة حضن 24 ساعة بدرجة حرارة 37 م , وعند تنميتها على وسط اكار اللوريا كان معدل التصاقها 20.3% مقارنة بالعزلة P.mirabilis U4 التي ابدت معدل التصاق واطيء عند تنميتها على وسط مرق اللوريا واكار اللوريا اذ بلغ معدل الالتصاق 4.7% و1.65% وعلى التوالي . اظهرت العزلة P.mirabilis U7 قدرة للتعبير عن الخمل المقاوم للمانوز شبية البروتيس (MR ∕P) والخمل المقاوم للمانوز شبية الكلبسيلا (MR ∕K) , اذ لازنت هذه العزلة كريات الدم الحمر للانسان نوع O+ وخنازير غينيا والخراف وبوجود سكر المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕P , كما لازنت كريات الدم الحمر المدبغة للابقار وبوجود المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕K عند تنمية هذه العزلة على وسط مرق اللوريا وفترة حضانة 48 ساعة وبدرجة حرارة 37 م , كما اختزل التعبير عن الخمل MR ∕Pو MR ∕K عند تنمية P.mirabilis U7 على الاوساط الزرعية الصلبة . تم عزل خمل UCA وتنقيته جزئيا باستخدام اليوريا بتركيز 2 مولر والصدمة الحرارية وكبريتات الامونيوم وبنسبة تشبع 50% وDeoxycholate , كان تركيز بروتين UCA هو 1.65 مايكروغرام/مليلتر وبحجم نهائي 1.5 مليلتر ناتج من استخدام 3 لتر من مرق اللوريا . اظهر الترحيل الكهربائي وبوجود المادة الماسخة SDS حزمتين بروتينية لبروتين UCA المنقى جزئيا والذي بلغ وزنه الجزيئي 17.782 دالتون . تم حقن الـ UCA المنقى جزيئا في الارانب للحصول على المصل المضاد اذ وجد ان تركيز المصل المضاد هو 128 كما تم الاستدلال على وجود الاضداد النوعية لمستضد خمل UCA . ثبطت اضداد خمل UCA المحضرة في الارانب والمخففة بتراكيز 1 : 50 و1 : 100 , 1 : 200 التصاق العزلة P.mirabilis U7 بالخلايا الطلائية البولية (معدل البكتريا الملتصقة كان 5.6 و11.75 و21.05 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) , اظهرت هذه الاضداد اختلافا معنويا (P≤0.05) في معدل الالتصاق عند مقارنتها بمصل السيطرة والمستعمل بنفس التراكيز (معدل عدد البكتريا الملتصقة كان 29.8 و30 و31.6 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) ,كما اظهرت النتائج وجود اختلاف معنوي (P≤0.05) بين تراكيز المصل المضاد المستخدمة في تثبيط الالتصاق . تم اختبار قدرة خمل UCA المنقى جزئيا على التمنيع وحماية اناث الفئران من الاصابة بخمج المسالك البولية , تم اصابة الفئران الممنعة وغير الممنعة ببكتريا P.mirabilis U7 بتركيز (5×105) وحدة مكونة لمستعمرة/ مليلتر عن طريق الاحليل وبعد مرور اسبوع على الاصابة وجد ان اعداد الخلايا البكترية الحية في كلية الفئران الممنعة انخفض الى (2.6 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر مقارنة بـ(3.7 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر لكلية الفئران غير الممنعة ,اما مثانة الفئران الممنعة فقد اختفت الاصابة وبشكل كامل مقارنة بمثانة الفئران غير الممنعة (3.3 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر .

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

Author name: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
Supervisor name: حارث جبار فهد المذخوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

دراسة بعض الخصائص الفيزيائية والكيميائية لانزيم Staphylolysin المنتج من بكتريا Pseudomonas aeruginosa == Study of Some Physical and Chemical properties of Staphylolysin produced by Pseudomonas aeruginosa

Author name: شيماء سهيل نجم
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: عزلت (50) عزلة عائدة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من 120 عينة سريرية جمعت من مصادر مختلفة تضمنت (الادرار،والقشع ،والبراز ،ومسحات الاذن ، والجروح،والحروق).تم التحري عن انتاج بعض من عوامل الضراوة للعزلات قيد الدراسة مثل : الهيمولايسين، والايلاستيز ، والبروتيز ، ووجد ان نسبة انتاج الهيمولايسين والايلاستيز كانت 76% ، فيما كانت نسبة انتاج البروتيز 72% في العزلات المحلية قيد الدراسة.اختبرت قابلية العزلات المحلية على انتاج انزيم الستافيلولايسين ، وبينت نتائج الغربلة شبه الكمية ان 18 عزلة (36%) من العزلات لها القابلية على انتاج الانزيم وبنسب متفاوتة،اذ تراوحت اقطار الهالة الشفافة من(5 - 22)ملم ، وتميزت خمس عزلات منها باعطاءها اوسع مناطق تحلل على وسط ] ترتبك صويا الصلب + 0.2% (وزن/حجم) من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة المقتولة بالحرارة بدرجة 100م [تراوحت من (16 - 22)ملم ، وتم انتخاب العزلة 16P لاستخلاص الستافيلولايسين A (LasA) ، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (8.59)وحدة / ملغم بروتين ، والعزلة 5P لاستخلاص الستافيلولايسين D (LasD)، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (0.66)وحدة / ملغم بروتين ،لكونهما الاغزر انتاجا للانزيم عند اجراء الغربلة الكمية.استخلص انزيم الستافيلولايسين بالنبذ المركزي المبرد وتمت تنقيته جزئيا بترسيبه بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 80% ثم بكروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل DEAE - Cellulose ، بينت النتائج ان الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات (Staphylolytic activity) لانزيم الستافيلولايسين A ظهرت في القمة الاولى، وبلغت عدد مرات التنقية 10.74 مرة وبحصيلة انزيمية 14.2%،فيما اظهرت القمة الثانية الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات لانزيم الستافيلولايسين D بعدد مرات تنقية 9.1 مرة وبحصيلة انزيمية 18.14%.درست بعض خصائص الانزيمين فكان الوزن الجزيئي 20.417 كيلو دالتون و23.988 كيلو دالتون للستافيلولايسين D,A على التوالي عند تقديرهما بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE. لوحظ ان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين A هو 8 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 150 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 7.5 - 8.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، فيما كان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين D هو 9.5 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 16 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 8.5 - 9.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، وظهرت اقصى فعالية للانزيمين عند درجة حرارة 40م اذ بلغت الفعالية النوعية للستافيلولايسين A 140 وحدة /مل وللستافيلولايسين D 16.4 وحدة/ مل ، واحتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما تقريبا عند حضنهما بدرجة حرارة 25 - 40م لمدة ساعة.عند دراسة تاثير بعض المواد في الفعالية الانزيمية للستافيلولايسين D,A كان لكلوريد الصوديوم وكلوريد البوتاسيوم بتركيز 1 و5 ملي مولار تاثير منشط للفعالية الانزيمية قياسا بالسيطرة اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ105% و108% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد الصوديوم ، واحتفظ بـ 102% و104% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد البوتاسيوم، في حين ثبطت الفعالية الانزيمية عند معاملتهما بكلوريدات الحديد والزئبق والخارصين وبنسب متفاوتة ،اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ 73% و7% من فعاليته على التوالي عند معاملته بـ5ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و9% فقط من فعاليته عند معاملته بـ 0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين ، فيما احتفظ انزيم الستافيلولايسين D بـ45% و13% من فعاليته فقط عند معاملته بـ5 ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و23% فقط من فعاليته عند معاملته بـ0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين، بينما احتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما عند المعاملة بمادة EDTA بتركيز 10 ملي مولار ،وفنيل مثيل سلفونيل فلورايد (PMSF) بتركيز 0.4 ملي مولار. | Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were obtained from 120 various clinical samples included (urine, sputum, stool, ear, wound & burn swabs). Detection of the production of some virulence factors (hemolysin, elastase and protease) by the local isolates was studied. Results showed that the hemolysin and elastase production ratio were 76%, while the protease production ratio was about 72% by the local isolates.Detection of the ability of local isolates to produce staphylolysin enzyme was studied, the semi quantity screening results showed that 18 (36%) of the isolates have the ability to produce this enzyme in variable ratios , the diameters of lysis Zone ranged from(5 - 22)mm, and five isolates were characterized by giving the highest lysis zone on (Tryptic soya agar + 0.2% (wt./vol.) of heat killed Staphylococcus. aureus at temperature 100oC ) medium which were ranged from(16 - 22)mm, then the isolate P16 was chosen to extract staphylolysin A (LasA) and it's specific activity reaches 8.59 unit /mg protein, whi1e chosen the isolate P5 to extract staphylolysin D (LasD) where it's specific activity reaches 0.66 unit /mg protein since the two isolates were the most production of enzyme by quantity screening . Staphylolysin enzyme was extracted by cooling centrifugation and partially purified by ammonium sulphate precipitation in saturation percentage of 80%, this step was followed by Ion exchange chromatography technique by using DEAE - cellulose column, results showed that the enzymatic activity (Staphylolytic activity) of the staphylolysin A appeared in first peak with purification folds and recovery of 10.74 fold and 14.2% respectively, while the second peak appeared the activity for staphylolysin D with purification folds and recovery of 9.1 fold and 18.14% respectively.Some of the characters of the two enzymes were studied, so the molecular weights were 20.417 kilo dalton & 23.988 kilo dalton for staphylolysin A&D respectively were estimated by SDS - polyacryl amide gel e1ectrophoresis. The optimum pH for staphylolysin A activity was found to be 8 which gives higher activity reaches 150 unit/ml, and for enzyme stability was 7.5 - 8.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity, while there were for staphylolysin D 9.5 that gives higher activity of 16 unit/ml.& 8.5 - 9.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity respectively, Maximum activity of two enzymes was obtained at 40 C in which the specific activity were for staphylolysin A and D 140 and 16.4 unit/ml , and the activity for two enzymes at 25 - 40 C remained approximately without change for one hour. When the effects of some materials on staphylolysin A & D activity were studied, the results showed that both sodium chloride & potassium chloride at 1 & 5 mM had the activator effect on enzymatic activity compared with its control where the staphylolysin A and D retained 105% ,108% and 102%, 104% of their activity, respectively when treated with sodium chloride, while they retained 110%, 114% and 133%, 118% of their activity, respectivity when treated with potassium chloride, while ferric, mercury & zinc chlorides inhibited the activity in variable ratios in which the staphylolysin A and D kept only 73%, 7% and 45%, 13% respectively of their initial activity when treated with 5mM of ferric and meracury chloride and 9%, 23% respectively of their initial activity when treated with 0.1mM zinc chlorid & enzymatic activity for both enzymes were not affected when treated with EDTA at 10mM & phenyl methyl sulphonyl fluoride (PMSF) at 0.4mM.

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

Author name: شمم ناصرراضي
Supervisor name: شذى سلمان حسن | سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum == Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

Author name: سعاد علي احمد
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae == A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

Author name: سحـر ظاهر عبد عسل
Supervisor name: حارث جبار فهد المذخوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه == Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

Author name: زهراء عباس جبر العيساوي
Supervisor name: رسمية عبد ابو ريشة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

عزل وتشخيص فيروس شلل الاطفال من الاطفال الملقحين بلقاح شلل الاطفال ومقارنته مع الفيروس الضاري == Isolation &Identification of Poliovirus from Vaccinated Children with Oral poliovirus vaccine and Comparison With Wild Type Virus

Author name: زهراء جعفر جميل عبد الكريم
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | عبد اللطيف محمد احمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد فيروس السنجابيةPoliovirus(PV) العامل المرضي الرئيس المسبب لشلل الاطفال Poliomyelitis . ويعتبر هذا المرض من الامراض الخطرة في العالم والتشخيص المختبري له ضروريا لغرض مراقبة وترصد حالات شلل الاطفال ومدى فعالية عملية التلقيح، وكذلك للتميز بين الشلل المتسبب من فيروس السنجابية (PV) والعوامل الاخرى ، والعناية المثالية للمريض هي تجنب الحركة والركض والركون الى الراحة والعلاج الطبيعي . تطوير علاج المرض باستعمال مضادات الفيروس لاصابات شلل الاطفال ممكن ان يضيف في المستقبل القريب حافزا اضافيا للتشخيص المختبري له . تضمنت الدراسة جمع مئة وثمانين عينة خروج من الاطفال (اعمارهم اقل من خمس سنوات) الذين اعطوا لقاح شلل الاطفال الفموي Poliovirus vaccine Oral في مركز الرعاية الاولية الصحية في بغداد لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) ، وكذلك تم اختيار خمسة عشر طفلا من المجموع الكلي للاطفال واستمرار متابعة مدى طرح فيروس السنجابية (PV) في الخروج لمدة عشرة ايام بعد التلقيح بلقاح شلل الاطفال الفموي (OPV) .لعزل فيروس السنجابية (PV) : حقنت نماذج الخروج في خطوط خلوية مختلفة (L20B, RD,Hep - 2C, CEF) ، ويتبع ذلك تشخيص نوع فيروس السنجابية (PV) من النماذج الموجبة التي اظهرت تاثيرات مرضية Cytopathic Effect بوساطة اختبار التعادل الدقيق Microneutralization Test ثم اجراء الترحيل الكهربائي SDS - PAGE Electrophoresis لبعض العينات التي شخصت وعينة اللقاح وعينات برية تم الحصول عليها من مختبر الصحة المركزي، وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : - • اظهرت الدراسة ان 114 عينة اعطت نتيجة موجبة لعزل فيروس السنجابية(PV)من اصل 180 عينة اي بنسبة (63%) .• لا توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV) من الذكور والاناث اذ ان نسبة الذكور الى الاناث في عزل (PV) هي 1 : 1 .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV ) خلال فصول السنة حيث وجد ان اعلى النسب كانت 74.6% في فصل الصيف .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) من عينات خروج اطفال باعمار مختلفة وجد ان اعلى نسبة لعزل (PV) 83.3% من عينات الاطفال بعمر 8 - 10 اشهر .• عند مقارنة معدل النتائج الموجبة على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطى افضل المعدلات (93%) يليها خلايا (RD) لمعدل (88%) ثم خلايا (Hep - 2C) بمعدل (84%) ،وعلى النقيض خلايا (CEF) لم تعط اية نتيجة موجبة .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في سرعة ظهور فيروس السنجابية (PV) على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان خلايا(L20B) اسرع الخطوط الخلوية في اعطاء النتائج، وكذلك توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) بين الخلايا (L20B) و(RD) في اليوم الثالث وكذلك توجد فروق معنوية بين (RD) و(Hep - 2C) ( P<0.05 ) في اليوم الخامس، بينما توجد فروق معنوية عالية ( P<0.05 ) في التحري عن فيروس السنجابية (PV) بين خلايا (L20B) و(Hep - 2C) وجد في اليوم الخامس .• في اختبار التعادل N.T : اظهرت النتائج ان النمط الاول (PV1) هو الشائع وقد كان بنسبة 60% ، ثم النمط الثالث (PV3) بنسبة 27% . لكن في هذه الدراسة لم يتم عزل النمط الثاني (PV2) ، وقد ظهرت فيروسات معوية (EVs) اخرى بنسبة 13% .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) مع باقي الفيروسات المعوية (EVs) خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطي افضل المعدلات (100%) لعزل فيروس السنجابية (PV)، ولم تعزل فيروسات معوية (EVs) ، اما خلايا (RD) بمعدل (90%) اما خلايا(Hep - 2C) بمعدل (71%) لعزل فيروس السنجابية (PV) ، وقد عزلت (EVs) بمعدل (29%) .• في اختبار الترحيل الكهربائي (Electrophoresis (SDS - PAGE في هذه الدراسة تم تمييز اربعة حزم للسلاسل الببتيدية لفيروس السنجابية (PV) لكن هذه النتائج : لم تظهر اي فروقات تميز بين انماط فيروس السنجابية (PV) الثلاثة ، وكذلك لا توجد فروقات تميز بين فيروس السنجابية (PV) المعزولة من عينات الخروج (المشتقة من اللقاح) والعينات البرية (تم الحصول عليها من مختبر الصحة العام المركزي)او عينات اللقاح .نستنتج من الدراسة ان تقنية الزرع النسيجي في الكشف عن فيروس السنجابية (PV) في نماذج الخروج ان الخلايا (L20B) تعد خط الخلايا الامثل والافضل لعزل فيروس السنجابية (PV) بدون عزل فيروسات معوية (EVs) اخرى من نماذج الخروج ، وهذا يوفر لناالوقت والجهد والمواد المبذولة لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) من عينات الخروج خلال وجود ومراقبة حالات الشلل الرخو الحاد (AFP )والمراقبة البيئية ضمن مبادرة استئصال شلل الاطفال وكذلك نستنتج ان النمط الاول(PV1)هو الاكثر شيوعا في هذه الدراسة . | Poliovirus (PV) is the etiologic agents of poliomyelitis , This Disease was one of the dangerous diseases in the world. Laboratory diagnosis is still required for detection of poliomyelitis cases and surveillance, to qualification of Immunization and other potentially treatable conditions; development of antiviral agent for the treatment of (PV) infection may provide added impetus for laboratory diagnosis in the near future. In this study collection one hundred and eighty stool specimens from children (less than 5 years old) who administered Oral Poliovirusvaccine (OPV) in preliminary health protection centers in Baghdad and Select fifteen children from the total children and following shedding (PV) in stool for 10 days after immunization with (OPV). Isolation of (PV) was conducted using stool specimens of the vaccination children and inoculated in (L20B) cells, human rhabdomyosarcoma (RD) , human epidermoid carcinoma (Hep - 2C) and check embryo fibroblast (CEF). Followed by identification of (PV) type from positive case which appear cytopathic effect (CFE). By microneutralization test, SDS - PAGE Electrophoresis was done to some specimens which identified as (PV1) ,(PV3),vaccine and wild type. The following results were obtained in this study : - • This study found (114) specimens were positive out of (180) specimens (63%).• No significant difference in isolation of (PV) taken from males and females ,The male to female ratio in (PV) isolation was 1 : 1 .• In comparison, the recovery rate of (PV) due to age of children was found to be the greater proportion and was 83.3%for children within age 8 - 10 month.• Significant difference in isolated (PV) due to during seasons ,the greater percentage was 74.6% during summer .• In Comparison, the recovery rate of (PV) in different cell lines revealed that L20B cell provided the best recovery rate (93%) from fecal samples , differing significantly from the other cell lines (P< 0.05) .• Significant difference in speed recovery of PV in different cell lines , recovery of L20B cell provided the faster recovery rate , significant difference (p > 0.05) of detecting PV between L20B and RD cell at day 3 and between RD and Hep - 2C cell (p > 0.05) at day 5;whereas more significant difference (p > 0.05) in the detection of PV between L20B and Hep - 2C found at day 5.• In neutralization test,it was found the poliovirus type (PV1)was more frequent (60%) than (PV3) (27%)but in this study can’t isolated (PV2), in this study found other (ENs) (13%). • In comparison, the recovered (PV) and other (EVs) in different cell lines ,showed that L20B cell was the best in the recovery rate (100%) for the isolation of (PV) while did not isolation of (EVs),RD in rate (90%) for (PV) while Hep - 2C isolation (PV) in rate (71%),and (ENs) in rate (29%).• In SDS - PAGE Electrophoresis, in this study distinguish 4 bands for polypeptide of (PV), but this result didn't show any difference between strains of (PV) which isolation from stool specimens and wild type. In conclusion the T.C. technique used for detection of ( PV) from stool specimens , the L20B cell was superior to isolation of (PV) without isolation of (EVs) and therefore established a first line of clinical diagnostic test for the detection of (PV) from stool specimens during AFP surveillance and Environmental surveillance in the initiation of eradication of Poliomyelitis. and in conclusion that the (PV1) was widespread in Environment .

دراسة وبائية بكتريا المكورات المعوية ENTEROCOCCI المقاومة للعديد من المضادات الميكروبية والمسببة للاصابات في بيئة المستشفيات == Epidemiological study of Multi - Antimicrobial resistant Enterococci that causes Nonsocomial Infections

Author name: محمد حسن يونس محمد
Supervisor name: مروان صالح محمد | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: Mustansiriyah University - College Of Science
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: في هذه الدراسة جمعت ( 637 ) عينة من مصادر مختلفة ( سريريه , سطوح بيئية , اجهزة طبية , مياه ) للفترة من تموز 2005 الى كانون الثاني 2006 وقد تم اخذ العينات من وحدة الديلزة في مستشفى بغداد ومن وحدة الناظور في مستشفى اليرموك ومن ردهة الاطفال في مستشفى ابن البلدي .استخدم نوعين من الاوساط الزرعية للعزل الاولي لبكتريا المكورات المعوية المقاومة للعديد من المضادات الحياتية وهما Bile aesculin azide agar وVancomycin resistant - enterococci agar .اعتمادا على الصفات المورفولوجية , المجهرية ,والفحص المصلي ( فحص التلازن بالشريحة ) , وفحص الكاتاليز , تم الحصول على 18 عزلة تمثل بكتريا المكورات المعوية المقاومة للعديد من المضادات الحياتية. واعتمادا على التشخيص بنظام ( Api - 20 Strept. Strip ) , اظهرت النتائج ان 13 عزلة من مجموع 18 عزلة ( 72% ) تعود الى النوع E.faecium و5 عزلات من مجموع 18 عزلة ( %28 ) تعود الى النوع E.feacalis .فحص الحساسية بطريقة الانتشار من الاقراص تجاه 10 انواع من المضادات الحياتية ( بنسيلين ج , الجنتامايسين , السايبروفلوكساسين , الكلورامفينيكول , تتراسايكلين , النايتروفيورانتون , الباستراسين ,اميبيم , اميكاسين ,حامض نالدكسك ) اظهرت العزلات مقاومة عالية ( 100% ) لخمسة من المضادات الحياتية (اميكاسين , نالدسك اسد, تتراسايكلين , الباستراسين , الجنتامايسين ) وبالتالي فهي مكورات معوية مقاومة للعديد من المضادات الحياتية .فحص الحساسية بطريقة المرق لتحديد التركيز المثبط الادنى تجاه 9 انواع من المضادات الحياتية ( الجنتامايسين , السايبروفلوكساسين , الكلورامفينيكول , النايتروفيورانتون , فانكومايسين , سيفالوثين , سيفتازديم , سيفيبيم , بنسيلين ج ) , اظهرت النتائج مقاومة عالية ( 100% ) لكل من سيفالوثين وبنسيلين ج ( ug/ml 32 < = MIC50 ) و(16 ug/ml < = MIC50 ) على التوالي . بينما اظهرت حساسية عالية لكل من النايتروفيورانتون والفانكومايسين ( ug/ml 128 < = MIC50 ) و(16 ug/ml < = MIC50 ) على التوالي .تم استخلاص البلازميدات بطريقة التحلل القاعدي المحورة لستة عزلات من مصادر مختلفة ومن نفس الردهة وبعد الكشف عنها بوساطة الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروزاظهرت النتائج تشابه الحزم في الموقع والحجم ولكل العزلات .تم تحديد نقاوة الدنا البلازميدي بوساطة المطياف الضوئي حيث كان تركيزا لدنا لحاصل القسمة عند الطول الموجي 260 و280 هو ( 1.95 ) مما يدل على نقاوة الاستخلاص للدنا البلازميدي.دراسة امكانية استعمال ناتج عملية التضاعف لجين (vanA ) و( van B ) المشفرة لجين مقاومة الفانكومايسين وجين ( ddI ) المشفر لجين D - alanine - D - alanine ligase المشخص للنوع E.faecium بوساطة فحص تفاعل بوليميرازالسلسلي للدنا وبعد الترحيل لناتج التضاعف لثلاث جينات لوحظ ظهور حزمة مع الجين ddI عن الجين الخاص بتشخيص النوع E.faecium فقط | This work was done on 704 samples that were collected from many sources included patients, medical instruments, ecological surfaces and water samples from three hospitals in Baghdad .For primary isolation of Multi - Drug Resistant Enterococci , two media were used ( Bile aesculin azide agar,Vancomycin - resistant enterococci ).The isolates were exposed to microscopical, morphological, biochemical test ( especially PYR test,catalase test ), serological test ( slidex Strepto - D - Kit) which proved 18 samples as Multi - Drug Resistant Enterococci .Diagnosis by ( Api - 20 Strept.strip ) we determined 13 isolates from 18 isolates ( 72% ) are belonged to E.faecium,and 5 isolates from 18 isolates ( 28%) are belonged to E.Feacalis .the antibiotic susceptibility test by using disk diffusion method as well as the determination of minimal inhibitory concentration of several antibiotics carried upon these samples . the results showed that all samples were resistant to five antibiotics . the minimum inhibitory concentration ( MIC50) of cephalosporin, penicillin G , ciprofloxacin,cefepim, and ceftazidime was > 64 µg / ml.nitrofurantoin and vancomycin had MIC50 of 128 and 16 µg / ml respectively.Pure plasmid DNA was extracted from vancomycin resistant enterococci by the evidence of UV - spectrophotometer study .Agarose gel electrophoresis of plasmid isolated from vancomycin resistant related to different sources showed slight differences in the bands mobilization and gave negative results by Pulsed Field Gel Electrophoresis ( PFGE). Determined the genes of vancomycin resistant (vanA and vanB) in isolates by PCR , the results showed that all isolates gave negative results. The best culture medium used for isolate Multi - drug resistant enterococci is Bile aesculin azide agar . in clinical samples all isolates are E.faecium ,in environmental samples all isolates are E.Feacalis .High resistant to Cephalosporines and low resistant to nitrofurantoin .vanA and vanB genes were not detected in isolates by PCR. In this study were collected ( 637) samples from different sources ( clinical , ecological surfaces , medical instruments , water ) from July in 2005 to January in 2006 . samples taken from ( Dialysis unit in Baghdad hospital , Proctoscopy unit in ALyarmok hospital , Pediatric ward in Ibn - albaldi hospital).Used two types of culture media for primary isolation of Multi - drug resistant enterococci ( Bile aesculin azide agar , Vancomycin resistant enterococci agar).dependent on morphological , microscopical, serological test ( slide Strepto - D - Kit) and (PYR) test and catalase test , we obtained 18 isolates as Multi - drug resistant enterococci. dependent on diagnosis by ( API - 20 Strept.Strip ) . the results showed that 13 isolates from 18 isolates ( 72% ) are belonged to E.faecium, and 5 isolates from 18 isolates ( 28%) are belonged to E.fecalis .The susceptibility test by using disk diffusion method against 10 types of antibiotics(Penicilin G, Gentamicin , Chloramphenicol , Nitrofurantoin , Tetracyclin , Bacitracin , Amikacin , Imepem , Nalidix acid and Ciprofloxacin) .The isolate showed highly resistant (100%) to 5 antibiotics ( Gentamicin , Tetracyclin , , Bacitracin , Amikacin, Nalidix acid) and then the isolates are resistant to Multi - antibiotics.The susceptibility test by using broth dilution method to determine MIC against 9 types of antibiotics (Gentamicin , Penicilin G, Ciprofloxacin, Nitrofurantoin, Chloramphenicol,Cephalothin,Ceftazidime , Cefepime ,Vancomycin),The isolate showed highly resistant (100%) to Cephalothin and Penicillin G ( MIC50 = >32 ug/ml )and ( MIC50 = >16 ug/ml) sequencely The isolate showed low resistant to Nitrofurantoin and Vancomycin ( MIC50 = > 128 ug/ml) and (MIC50 = > 16 ug/ml)sequencely. Plasmid extraction by modified Alkaline analysis method for 6 isolates from different sources in same ward and after detected by agarose gel electrophoresis, the results showed the same plasmid bands in size and place for all isolates. We determined the purity of plasmid DNA by UV - Spectrophotometer which concentration of DNA for divided obtained at wave length 260 and 280 nm was ( 1.95) which indicate the purity of extraction of DNA. Study of using the product of amplication of( vanA) and (vanB) gene coded for vancomycin resistant gene and( ddI) gene coded for D - alanine - D - alanine ligase gene specific for E.faecium by Polymerase Chain Reaction for DNA and after detected the product of amplification of 3 genes, the results showed that isolates gave positive result for just (ddI) gene and negative for( vanA) and( vanB) gene.

تقييم صلاحية مياه نهر الغراف - جنوب العراق للاستخدامات المختلفة باستخدام دليل نوعية المياه (النموذج الكندي) == Evaluation of the validity of The AL - Gharraf - River Water Southern of Iraq for various uses by using the Water Quality Index (Canadian Model)

Author name: مها مثنى حسن التميمي
Supervisor name: حسين يوسف خلف الركابي
General topic: Biology
Specific topic: Aquatic Environment
Degree: Master
University: University of Thi-Qar - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على نهر الغراف في محافظة ذي قار(جنوب العراق) فصليا ابتداء من فصل الصيف 2014 ولغاية فصل الربيع 2015 باستعمال دليل نوعية المياه (النموذج الكندي ) في هذه الدراسة بوصفه اداة فعالة في تقييم نوعية مياه نهر الغراف ولاول مرة في منطقة الدراسة لتحديد صلاحيته لاغراض مختلفة منها الشرب ومعيشة الاحياء والري للوقوف على حال المياه ونوعيتها في هذا النهر . اختيرت اربع محطات على طول النهر لجمع عينات المياه تمثلت المحطة الاولى عند مدينة الحي في محافظة واسط قبل دخول النهر محافظة ذي قار واحداثياتها 32°08'29.4"N ; 46°02'38.3"E))، اما المحطة الثانية تقع بعد خروج النهر من قضاء الرفاعي وتبعد عن المحطة الاولى بمسافة 50 كم تقريبا واحداثياتها (31°41'21.6"N ; 46°06'53.9"E) ،تقع المحطة الثالثة بعد خروج النهر من قضاء الشطرة وتبعد عن المحطة الثانية بمسافة 40 كم تقريبا واحداثياتها (31°22'50.8"N; 46°10'51.0"E)، والمحطة الرابعة والاخيرة تقع عند مدينة الاصلاح وتبعد عن المحطة الثالثة 72كم تقريبا واحداثياتها( 31°09'55.0"N; 46°36'36.6"E). جمعت عينات المياه من محطات الدراسة فصليا ابتداء من فصل الصيف2014 ولغاية فصل الربيع 2015 .اختير26 متغيرا من المتغيرات ذات التاثير الاكبر في نوعية المياه وصلاحية استخدامها لتجهيز مياه الشرب ولاغراض معيشة الاحياء ولاغراض الري في ايجاد قيم الدليل وهي درجة حرارة الهواء والماء وسرعة الجريان والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين والمتطلب الكيميائي للاوكسجين والتوصيلية الكهربائية والملوحة والعكارة والمواد الصلبة الذائبة الكلية والعسرة الكلية والكاربونات والبيكاربونات والقاعدية الكلية والكالسيوم والمغنيسيوم وايون الكلورايد وايون الصوديوم وايون البوتاسيوم ونسبة امتزاز الصوديوم والفوسفات الفعالة والنترات الفعالة والكبريتات والعناصر النزرة (الكادميوم والرصاص) وبكتيريا القولون البرازية . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ان درجة حرارة الهواء تراوحت بين(10 - 44) ○م ،اما درجة حرارة الماء فكانت بين (7.3 - 28.5) ○م ، وسرعة الجريان بين(0.07 - 0.25)م/ ثا ،اما قيم الاس الهيدروجيني سجلت بين(5.92 - 8.5)،كما سجلت الدراسة الحالية تراكيز للاوكسجين الذائب بين(1.06 - 8.4)ملغم/لتر ،اما المتطلب الحيوي للاوكسجين فكان ضمن المدى(22. 1 - 3.24)ملغم/لتر، بينما قيم المتطلب الكيميائي للاوكسجين بين (6.2 - 35.4) ملغم/لتر، في حين تراوحت قيم التوصيلية الكهربائية بين(674 - 1622) مايكروسمنز/سم، كما تراوح تركيز الملوحة بين (0.43 - 1.04) غم/لتر والعكارة بينNTU 6.7 - 3.11))،كما سجل تركيز المواد الذائبة الكلية بين(336 - 902) ملغم/لتر، والعسرة الكلية بين (367 - 833) ملغم CaCO3/لتر وكانت قيم الكاربونات غير محسوسة والبيكاربونات بين و(294 - 605) ملغم CaCO3/لتر، كما سجلت الدراسة الحالية تراكيز القاعدية الكلية بين(152 - 301) ملغم CaCO3/لتر، وكانت قيم الكالسيوم بين (52.3 - 197) ملغم/لتر والمغنسيوم بين (35.6 - 134)ملغم/لتر، والكلورايد بين (118 - 312)ملغم/لتر، كما سجلت مديات ايونات الصوديوم بين (93 - 201)ملغم/لتر والبوتاسيوم(3.2 - 13.37)ملغم/لتر ،اما نسبة امتزاز الصوديوم فكانت بين (0.63 - 3.98)ملي مكافئ/لتر،واما الفوسفات فيقع بين (0.03 - 0.44)ملغم/لتر.، بينما قيم النترات تقع بين (1.35 - 4.1)ملغم/لتر، في حين تروحت الكبريتات بين (202 - 399)ملغم/لتر. كما اظهرت الدراسة الحالية ان قيم العناصر النزرة كانت في الطور العالق ، اعلى من الطور الذائب اذ سجل عنصر الرصاص في الطور الذائب ما بين (1.72 - 47.81)مايكغم/لتر بينما في الطور العالق بين(5.78 - 135.1) مايكغم /غم وزن جاف. اما قيم عنصر الكادميوم في الطور الذائب بين (1.46 - 10.08)مايكغم وفي الطور العالق بين(2.16 - 110.72) مايكغم /غم وزن جاف. كما سجلت مياه المحطات المدروسة اعدادا لبكتريا القولون البرازية بين(50 - 333)خلية/100مل تراوحت نتائج الدراسة الحالية لقيم دليل نوعية المياه لتجهيز مياه الشرب(PWSI) بين (19.87 - 26.98) لكافة المحطات طوال مدة الدراسة وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة 44 - 0)) الفقيرة (Poor) على مقياس الدليل, اذ سجلت اعلى قيمة للدليل(26.98) (Poor) في المحطة الثانية خلال فصل الشتاء وادنى قيمة للدليل(19.87) (poor) في المحطة الرابعة لنفس الفصل. اما قيم دليل نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء (WQIAL) فكانت بين(4.37 - 12.06) وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة ايضا 44 - 0))الفقيرة(Poor) لجميع المحطات طوال مدة الدراسة ,اذ سجلت اعلى قيمة للدليل (12.6 ) (poor) في المحطة الثالثة خلال فصل الشتاء وادنى قيمة (4.37) (poor) في المحطة الرابعة خلال فصل الصيف. في حين وجدت قيم دليل نوعية مياه الري (IWQI) ما بين (16.11 - 43.32) وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة 44 - 0))(Poor) على مقياس الدليل, لجميع المحطات طوال مدة الدراسة ,اذ سجلت اعلى القيم للدليل في المحطة الاولى ( 43.32) (poor) خلال فصل الشتاء وادنى قيمة(16.11)(poor) في المحطة الرابعة خلال فصل الصيف. اظهرت نتائج تحليل المكونات الاساسيPrincipal Component Analysis (PCA) ان الكادميوم والبوتاسيوم والنترات والفوسفات والكلورايد والمتطلب الكيميائي للاوكسجين وبكتريا القولون البرازية والمغنيسيوم اهم المتغيرات المسؤولة عن التغاير في نوعية مياه الشرب وبالتالي اكثرها تحديدا لمدى صلاحية نهر الغراف لتجهيز مياه الشرب, تلاها الصوديوم والعسرة الكلية والكبريتات والعكارة والاوكسجين المذاب والرصاص والقاعدية الكلية والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الكلية والكالسيوم والاس الهيدروجيني والمتطلب الحيوي للاوكسجين .في حين اهم المتغيرات المسؤولة عن التغاير في نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء ،درجة الحرارة والمتطلب الكيميائي للاوكسجين وبكتريا القولون البرازية والبوتاسيوم والفوسفات والكلورايد والكادميوم تلتها المتطلب الحيوي للاوكسجين والعكارة والاس الهيدروجيني والرصاص والمواد الصلبة الذائبة الكلية والاوكسجين المذاب والعسرة الكلية . في حين كان الاس الهيدروجيني والبيكاربونات والرصاص والتوصيلية الكهربائية هي المتغيرات الاكثر مسؤولية في التاثير على نوعية مياه الري ،تلاها الكادميوم ونسبة امتزاز الصوديوم والكلورايد. | The current study was conducted on Al - Gharraf River in Thi - Qar governorate(southern of Iraq) for the period from Summer 2014 to Spring 2015 using water quality index(Canadian model) in this study as an effective tool in the assessment of Gharraf River water for the first time in the study area to determine suitability for drinking, irrigation and aquatic organisms life. Four stations were determined along the river to collect samples AL - Hay city to the completion in the marshes .The first station was located in the district city and away from the second station of 50 kilometers (32 ° 08'29.4 "N; 46 ° 02'38.3" E), The second station was located after the departure of the river to spend AL - Rifai and its coordinates (31 ° 41'21.6 "N; 46 ° 06'53.9" E), The third station was located after the departure of the river AL - Shatra and away from the second station of approximately 40 km (31 ° 22'50.8 "N; 46 ° 10'51.0" E) The fourth station was located at the AL - Esllah city and away from the third station about 72km (31 ° 09'55.0 "N; 46 ° 36'36.6" E). Water samples were collected seasonally from a quarterly of study stations (and by four samples in the chapter) during every two months, starting from summer 2014 until spring 2015. twenty even variables were compiled the greatest impact on the water quality of the river and the validity of the Garraf which have using for the processing of drinking ,for the purposes of living requirements and irrigation purposes in the directory to find the WQI. These variables were air temperature, water temperature, the water current velocity, pH ,dissolved oxygen ,biological oxygen demand, chemical oxygen demand and electrical conductivity, salinity, turbidity ,total dissolved solids ,total hardness, carbonate ,bicarbonates ,total alkalinity, calcium ,magnesium, ion chloride ,sodium ion and potassium ion, reactive phosphate, reactive nitrate, sulfate sodium adsorption ratio ,trace elements (cadmium and lead) and fecal coliform bacteria. The current results showed that the air temperature ranged between (10 - 44) Cº, while the temperature of the water ranged between (7 - 28) Cº, the water current velocity ranged from (0.25 - 0.7) m / sec, pH between (5.92 - 8.5), The current study also recorded the concentrations of dissolved oxygen between (1.06 - 8.4 mg / L). The concentration of biological oxygen demand within the range (1.22 - 3.24) mg / L . The chemical oxygen demand of between (6.2 - 35.4)mg / L, Electrical conductivity values ranged between (674 - 1622) μs / m, .Salinity concentration ranged between (0.43 - 1.04) mg / L .Turbidity of water ranged from (3.11 - 6.7)NTU. Total dissolved solids ranged between (336 - 902) mg / L. Total hardness ranged between (367 - 833) mg CaCO3 /L. Carbonate values was non - palpable and bicarbonate and ranged between (294 - 605) mg CaCO3 /L. The total alkalinity concentration between (152 - 301) mg CaCO3 /L, Calcium ranged between (52.3 - 197 )mg / L. Magnesium ranged between (35.6 - 134) mg / L. Chloride ranged between (118 - 312) mg / L. Sodium ions were recorded between (93 - 201) mg / L. potassium (3.2 - 13.37) mg / L. The proportion of sodium adsorption ranged between (0.63 - 3.98) mequ/L. Phosphate ranged between (0.03 - 0.44) mg / L. Nitrates ranged between (1.35 - 4.1) mg / L. Sulfates ranged between (202 - 399) mg / L. The finding showed that the values of trace elements in the airborne phase was higher than the dissolved phase range the lead element of the dissolved phase between the values (1.72 - 47. 81) μg/L, while in the suspended phase ranged between(5.78 - 135.1) μg /gm dry weight. In the case cadmium of values of soluble part in the water range was (1.46 - 10.08) μg/L, either in the suspended phase of the water was (2.16 - 110.72) μg /gm dry weight. Studied water stations also recorded Numbers of fecal coliform ranged from (50 - 333) cells / 100 ml. Was also recorded in the studied stations . The values of potable water supply index (PWQI) ranged between (19.87 - 26.98) for all stations accordingly it is categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor). The highest value was (26.98) (Poor) in the second stations through the winter and the lowest value of the index (19.87) (poor) in the fourth station of the same season. Water quality index for aquatic organisms life (WQIAL) ranged between (4.37 - 12.06) for all stations there for it is evidently categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor) , As it recorded the highest value of index 12.6 (poor) in the third stations during the winter and the lowest value of index was( 4.37) (poor) in the fourth stations during the summer. The values for irrigation water quality index (IWQI)ranged between (16.11 - 43.32) for all stations accordingly it is categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor) , As it the highest values of the index in the first station 43.32 (poor) during the winter and the lowest value of index was (16.11) (poor) in the fourth station during the summer. The results of Principal Component Analysis (PCA) showed that cadmium, potassium, reactive nitrates, phosphates, chloride ,chemical oxygen demand ,fecal coliform and magnesium were the most effective variables on the changes in water quality index for drinking water , followed by sodium, sulfates, total hardness ,turbidity ,dissolved oxygen, lead , total alkalinity ,electric conductivity ,total solids, calcium, pH and biological oxygen demand. While the most important variables responsible for the variation in water quality for quality organisms life,were water temperature ,chemical oxygen demand ,fecal coliform, potassium, phosphate, chloride , cadmium, followed by biological oxygen demand ,turbidity, pH, lead, total solids, dissolved oxygen and total hardness. While the pH ,bicarbonates, lead and electrical conductivity were the most influents effective on the determination of irrigation water quality, followed by cadmium, sodium adsorption ratio and chlorine .

دراسة بعض الجوانب الوبائية والمناعية للخمج بداء المقوسات في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار == Study of some epidemiological and immunological aspects of toxoplasmosis in Fallujah city - Al - Anbar province

Author name: محمد سليم اسماعيل ثامر العيساوي
Supervisor name: ابراهيم شعبان داوود | عبد الوهاب بديوي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: Tikrit University - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع عينات دم من النساء المجهضات تراوحت اعمارهن بين (16 - 45) سنة المراجعات لمستشفى الفلوجة العام لمعرفة مدى انتشار طفيلي المقوسة الكوندية Toxoplasma gondii في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار بطريقتي تلازن اللاتكس Latex agglutination واختبار الخميرة للادمصاص المناعي (الاليزا) Enzyme linked immunosorbent assay, كذلك قياس مستوى الاضداد IgA , IgE , IgM , IgG والمتممين C4 , C3 وبعض المظاهر المناعية للخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) وبعض التاثيرات المناعية في الفئران البيض والقطط . ظهرت النتائج ان نسبة الخمج الكلية وحسب الفئات العمرية قيد الدراسة (16 - 25) , (26 - 35) , (36 - 45) سنة بطريقة تلازن اللاتكس كانت 43.75% , ( 40.90% , 46.15% , 42.11% ) وبطريقة الاليزا 32.50% (31.82% , 35.90 , 26.31% ) , ونسبة الاخماج الكلية الحادة والمزمنة بطريقة ELISA - IgG , ELISA - IgM وحسب الفئات العمرية كانت 10% (13.64% , 12.82% , 0% ) , 22.50% (18.18% , 23.08% , 26.31 ) على التوالي. قياس مستوى الاضداد IgG , IgM النوعية ضد المقوسة الكوندية وIgE الكمي بطريقة اختبار الاليزا (ELISA ) , وقياس مستوى الضد IgA الكمي والمتممين( Complements) C4 , C3 بطريقة اختبار الانتشار المناعي الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion test اظهرت ارتفاع معنوي في معدل مستوى الاضداد IgG , IgM النوعيين ضد المقوسة الكوندية وعدم وجود فروق معنوية لمعدل مستوى الاضداد IgE , IgA الكميين والمتممين C3 , C4 للنساء المخمجات مقارنة بالسيطرة. اظهر التحليل الاحصائي ان للخمج بطفيلي المقوسة الكوندية T. gondii وجود فرق معنوي على زيادة نشاط الخلايا متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) في بلعمة خميرة الكانديداCandida yeast واختزال صبغةNitroblue tetrazolium reduction وتاثيراﱟ منخفضاﱟ لمعدل عيوشية الخلايا (PMNs ) وهجرة طبيعية للخلايا PMNs)) المعزولة من النساء المخمجات ولكل الفئات العمرية مقارنة بالسيطرة. اظهرت النتائج ان حقن اكياس البيض المضعفة بالاشعة فوق البنفسجية Ultraviolet والمكسرة Ultra - Sonication اعطت تفاعلات واضحة عند اجراء اختبار فرط الحساسية المتاخرDelayed Type Hypersensitivity اذ بلغ اعلى معدل سمك القدم (2.32 , 2.79) ملم وقطر المنطقة المتهيجة (7.79 , 8.78) ملم بعد (24) ساعة في الفئران المحقونة على التوالي ، ان تمنيع الفئران بمحلول اكياس البيض المضعفة واعطائها جرعة تحدي تاثير على انخفاض معامل الكبد والطحال مقارنة بالسيطرة ، وان حقن مستضدات الطفيلي ( اكياس البيض المضعفة ) في الفئران ثم اعطائها للقطط اخر وقلل نسبة اكياس البيض المطروحة من قبل القطط وبلغت نسبة الوقاية الكلية 22.29% مقارنة بالسيطرة الموجبة. | The study included collection of blood samples from aborted women, aged between 16 - 54 years attended the general Fallujah Hospital for the prevalence of the infection with Toxoplasma gondii in Fallujah city - AL - Anbar province by two methods : latex agglutination , Enzyme linked immunosorbent assay , measurement of antibodies concentration of IgM, IgG, IgE, IgA, Complements C3, C4, and some immunological features of cells and some immunological effect in white mice and cats. The results showed that the percentage of total infection and according to age groups in the study (16 - 25), (26 - 35), (36 - 45) by LAT were 43.75% , 40.90% , 46.15% 42.11% respectively and with ELISA test 32.50% , 31.82% , 35.90% , 32.50% respectively , the percentage of total acute infection by ELISA - IgM in accordance with age groups were 10% , 13.64% , 12.82% , 0% whereas total , chronic infection by ELISA - IgG were 22.50% , 18.18% , 23.08% , 26.31% respectively. The measurement of antibodies levels of IgG, IgM, IgE by ELISA, IgA and complements C3, C4 by single radial immunodiffusion showed a significant increase in the average antibodies levels of specific IgM, IgG against T. gondii whereas no significant increase in the average antibody level of IgE, IgA and complement C3 , C4 in the infection women in comparison to control. The infection with T. gondii showed significant difference in the activity of Polymorphonuclear neutrophils (PMNs) in the phagocytosis of candida yeast and reduction of Nitroblue tetrazolium, whereas little effect on viability of PMNs and natural migration of neutrophils isolated from infection women of all age groups in comparison to control. The results of the immunological effects of inoculation of Oocysts attenuated by ultra - violet rays or ultra - sonication into white mice showed, the clear reaction in delayed type hypersensitivity test, the average of highest thickness of mice - foot were 2.79, 2.32 mm. and diameter of the inflamed regions were 8.78, 7.79 mm. 24h. after inoculation, the immunization of mice with attenuated oocysts followed by a challenge dose reshowed a decrease in the factor of liver and spleen in comparison to control. Cats fed mice that fedded by which was inoculated by Oocysts attenuated by ultra - violet rays showed a delay and a decrease in the Oocysts discharge in the feces by 22.29% in comparison to control.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ والقريص على بعض عوامل الضراوة والدنا البلازميدي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == The Effect of aqueous and alcoholic extracts of Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens (L.) in some virulence factors and plasmid DNA in local isolates of Pseudomonas aeruginosa

Author name: ديمة نزار فرج باصات
Supervisor name: لينة عبد الكريم الامير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (50) عزلة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من (110) عزلة من مصادر عزل مختلفة (الجروح ، والحروق ، والاذن ، والادرار ، والدم) لمرضى في مستشفيات اليرموك ، والكندي والعلوية للاطفال ، وقد تبين ان (44 %) من العزلات كان مصدرها الجروح و(20 %) لكل من الادرار ، والاذن و(12%) للحروق ، و(4 %) لعينات الدم.وعند التحري عن المقاومة لمضادات الحياة وجد ان (68 %) من العزلات اظهرت مقاومة متعددة لـ (6 - 9) مضادات و(26 %) من العزلات كانت مقاومة لـ (1 - 5) مضادات و(6 %) من العزلات مقاومة لـ (10 - 12) مضادا وتوزعت العزلات المقاومة ضمن (33) نمط مقاومة لمضادات الحياة.وعند التحري عن انتاج بعض عوامل الضراوة لبكتريا P. aeruginosa تبين ان (82 %) من العزلات منتجة لانزيم الهيمولايسين و(74 %) منتجة لانزيم الايلاستيز و(66 %) منتجة لانزيم اليوريز ، وكانت المجموعة السائدة هي المنتجة للعوامل الثلاثة معا ، مما يدل على اهمية هذه العوامل في ضراوة البكتريا كما تبين ان هناك ارتباطا بين انتاج انزيم الايلاستيز والهيمولايسين.اختيرت عزلتان احداهما مقاومة لاحد عشر مضادا من اصل 12 مضادا منتجة لعوامل الضراوة الهيمولايسين ، والايلاستيز ، واليورييز (PD1) والاخرى حساسة (مقاومة لاربعة مضادات من اصل 12 مضادا) ومنتجة للايلاستيز والهيمولايسين وغير منتجة لليوريز (PD2).وعند التحري عن وجود البلازميدات وجد ان العزلة المقاومة (PD1) تمتلك بلازميدا واحدا والعزلة الحساسة (PD2) لا تمتلك بلازميدا.حدد التركيز المثبط الادنى للمستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ Withania somnifera L. Dun. ، والقريص Urtica urensi L. تجاه بكتريا P. aeruginosa (للعزلتين (PD1,PD2وكان التركيز المثبط الادنى لمستخلص سم الفراخ المائي (175) ملغم / مللتر ، والكحولي (5) ملغم / مللتر ، والتركيز المثبط الادنى لمستخلص القريص الكحولي (25) ملغم / مللتر ، اما المستخلص المائي للقريص فلم يكن له اي تاثير تثبيطي في نمو البكتريا حتى التركيز (175) ملغم / مللتر.درس تاثير المستخلصات في التراكيز تحت التركيز المثبط الادنى تجاه تثبيط بعض عوامل الضراوة للبكتريا وكان مستخلص سم الفراخ المائي والمستخلص الكحولي مثبطا لانزيم الهيمولايسين ومضعفا للايلاستيز ولم يكن لهما تاثير في انتاج اليوريز عند التراكيز (100 ، 125 ، 150) ملغم / مللترللمستخلص المائي والتراكيز (2 ، 3 ، 4) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي ، اما مستخلص القريص المائي والمستخلص الكحولي فكان لهما تاثير مثبط للايلاستيز ومضعف للهيمولايسين ولم يؤثرا في انتاج اليوريز عند التراكيز (125 ، 150 ، 175) ملغم / مللتر للمستخلص المائي وعند التراكيز (10 ، 15 ، 20) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي.لم يكن لاي مستخلص نباتي من المستخلصات المستعملة تاثير في تحييد البلازميد للعزلة PD1 عند التراكيز تحت المثبطة ، لكن عند تحليل الدنا البلازميدي باستخدام الاشعة تحت الحمراء وجد ان مستخلصي سم الفراخ المائي عند التركيز (150) ملغم / مل والكحولي عند التركيز (4) ملغم / مللتر احدثا تغييرا في مواقع جذر NH+3 ولايون C=O عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 ، والحزمة 1649 سم - 1 على التوالي. اما مستخلص القريص المائي عند التركيز (175) ملغم / مللتر والكحولي عند (20) ملغم / مللتر فقد احدث تغييرا في موقع جذر NH3+ عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 وايون C=O عند 1649 سم - 1 واحدثت تغييرا في شدة الحزمة عند 1022 سم - 1 والتي تعود الى مجموعة PO2 - ويمتاز المستخلص المائي بانه احدث تغييرا في دنا البلازميد البكتيري بظهور حزمة جديدة عند 810 - 690 سم - 1 وتعود لمجموعة PO2 - ايضا. وهذا يشير ايضا الى احتمال تاثير تلك المستخلصات النباتية على الوضعية العامة لجزيئة الـ DNA من ناحية التركيب الثانوي وبالتالي على بعض ادواره الوظيفية الحيوية. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from various clinical specimens including : wound , burn , ear , urine and blood , collected from patients hospitalized in Yarmouk , Al - Kindy and Al - Elweia for children hospital,A total of (50) (out of 110) isolates were obtained of which (44 %) were isolated from wounds , (20 %) from urine and ear infections , (12 %) from burns and (4 %) from blood specimen.Antibiotic resistant tests have indicated that (68 %) of P. aeruginosa isolates were multiresistant to (6 - 9) antibiotics and (26 %) were resistant to (1 - 5) antibiotics and (6 %) were resistant to (10 - 12) antibiotics , P. aeruginosa isolates exhibited (33) antibiogram patterns.Detection of some virulence factors production by these isolates indicated that (82 %) were producers of hemolysin, (74 %) were elastase producers and (66 %) were urease producers. The group producing all three virulence factors was dominant.Two isolates were selected , the first isolate (PD1) was resistant to (11) antibiotics , and produced hemolysin , elastase and urease , the second isolate (PD2) was resistant to (4) antibiotics only (out of 12) and produced hemolysin , elastase but not urease.Screening for plasmid DNA indicated that the resistant isolate (PD1) had a single plasmid , while the sensitive isolate (PD2) had no plasmid.Minimum inhibitory concentration (MICs) of the aqueous and ethanolic extracts of both (whole) plants Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens L., were determined towards P. aeruginosa (PD1,PD2), Results obtained showed that MIC of ethanolic extract of W. somnifera was (5) mg / ml and of aqueous extract was (175) mg / ml. The MIC for the ethanolic extract of U. urens was (25) mg / ml , while the aqueous extract had no inhibitory effect towards P. aeruginosa up to (175) mg / ml.The effect of Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extracts of both plants on the production of hemolysin , elastase and urease was investigated. Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extract of W. somnifera had an inhibitory effect on hemolysin production and a suppressing effect on elastase but no effect on urease production at 100 , 125 , 150 mg / ml for the aqueous extract and 2 , 3 , 4 mg / ml for the ethanolic extract.Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extract of U. urens had an inhibitory effect on elastase production and a suppressing effect on hemolysin , but no effect on urease production at 125 , 150 , 175 for the aqueous extract and 10 , 15 , 20 mg / ml for the ethanolic extract.The electrophoresis of plasmid DNA isolated from bacterial cell treated with plant extracts indicated that neither W. somnifera nor U. urens extracts had a curing effect on the plasmid at sub - MIC concentrations for PD1.Vising infrared spectroscopy spectrum showed that the sub MICs of ethanolic and aqueous extracts of . W. somnifera (4 mg / ml , 150 mg / ml) made an alteration in NH+3 groups at wave band (2000 - 3100) cm - 1 and C=O group at 1649 cm - 1 , while the Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extracts of U. urens (20 mg / ml , 175 mg / ml) made changes in NH+3 , C=O and PO2 - groups at the wave bands (2000 - 3100) , 1649 , 690 - 810 cm - 1 respectively. These results indicate the possible effect of plant extracts on the conformation of the DNA molecules affecting some of its biological functions.

دراسة مقارنة بين الشكلين الحلزوني والمكور في بكتريا Helicobacter pylori المعزولة من مرضى مصابين بقرحة الاثنى عشر

Author name: حلا مؤيد رديف
Supervisor name: ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى عزل بكتريا Helicobacter pylori من المرضى المصابين بقرحة الاثنى عشر ودراسة ظاهرة تحول الخلايا من الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة والعوامل المؤثرة ، وقد بينت النتائج ان مكونات الوسط الزرعي والضوء والاوكسجين من اهم العوامل التي تساعد على عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة لجرثومة H. pylori . خلال مدة الحضن والخزن , فقد لوحظ عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب ، ووسط اغار الدم الاساسي المضاف اليهما دم بشري متحلل بنسبة ( %5) ، واضافات النمو يتم الحصول على الاشكال المكورة بنسبة اقل مما لو استخدمت الاوساط الزرعية ذاتها لكن بدون اضافة الدم واضافات النمو. وللمحافظة على حيوية جراثيم الهيليكوبكتر وعلى شكلها الحلزوني لمدة زمنية اطول قد تصل الى (30 - 20) يوما عند خزنها بدرجة حرارة (4)مo , يجب عدم تعريض الاوساط الزرعية الى الضوء والاوكسجين بنسبة اعلى من ( %6 ) ، كذلك مراعاة ان تكون باءهاءpH)) الوسط .( 8 - 6.9 ) سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب، ووسط المولرهنتون، ووسط مرق البروسيلا، ووسط اغار الحليب، ووسط اغار الـﭼوكليت ،ووسط اغار الماكونكي ، ووسط التربتون سوي بروث( Trypton Soy Broth ) . اذ اضيف الى قسم من الاوساط المستخدمة ( %5 ) دم بشري متحلل واضافات النمو ، كذلك سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الفئران واستخدام خنازير غينيا ( Guinea - pigs ) بشكل افضل من استخدام الاوساط الزرعية الصلبة والسائلة مع مراعاة اعطاء الحيوان جرعة لقاح بحجم ( 0.1 ) ملليلتر , ولوحظ ضرر نسيجي عند دراسة المقاطع النسيجية للمعدة ، اذ اشارت الدراسات السابقة الى عدم قدرة تحول الاشكال المكورة الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الحيوانات المختبرية. اوضحت النتائج ان المحتوى الكيميائي للاشكال المكورة في بكتريا H. pylori يختلف عن المحتوى الكيميائي للاشكال الحلزونية للبكتريا نفسها بعد معاملتها بحامض الكبريتيك المركز وهيدروكسيد البوتاسيوم ، الشيء الذي يعكس حدوث تغيرات في الجدار الخلوي خلال عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة . كما بينت النتائج ان الاشكال المكورة اقل كثافة من الاشكال الحلزونية ، بسبب قلة نسبة الببتيدوكلايكان ، واضمحلال المكونات الخلوية وفقدانها نتيجة حدوث تغيرات في الجدار الخلوي وتلف الغشاء الهيولي Cytoplasmic membrane) ) . اظهرت الدراسة ان محتوى الاشكال المكورة العائدة الى H. pylori من الحامض النووي الديوكسي رايبوز DNA ) Deoxyribo nucleic acid ) ، والحامض النووي الرايبوزي RNA ) Ribonucleic acid ) اقل مما هو موجود في الاشكال الحلزونية للجرثومة نفسها . عند دراسة انظيم اللايسوزايم Lysozyme ومادة EDTA كلا على حدة ، وكذلك انظيم اللايسوزايم ومادة EDTA معا في الاشكال الحلزونية العائدة الى جرثومة H. pylori , كان التاثير اكثر بكثير قياسا مع الاشكال المكورة للجرثومة نفسها ، وذلك لقلة نسبة الببتيدوكلايكان في جدران الاشكال المكورة ، او لفقدان مواقع في الببتيدوكلايكان حساسة الى انظيم اللايسوزايم . وقد لوحظ ان المنظفات الايونية مثل مادة SDS والمنظفات اللاايونية مثل مادة Triton X - 100 تسببان تحلل عزلة H. pylori بشكليها الحلزوني والمكور , الا ان التراكيز الواطئة من مادة SDS تكون اكثر فعالية من التراكيز العالية من مادة Triton X - 100 في تحلل الجرثومة بشكليها الحلزوني والمكور. شوهدت الاشكال الحلزونية والاشكال المكورة لجرثومة H. pylori والاشكال التي تظهر خلال تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة عند استخدام المجهر الالكتروني الناقل , وقد لوحظت اشكال مختلفة من الاشكال المكورة تملك سوطا واحدا او سوطين . وسجل لاول مرة امتلاك الاشكال المكورة العديد من الاسواط ، وذلك عند تصوير العزلات بالمجهر الالكتروني الناقل. في حين اشارت الدراسات السابقة الى امتلاك الاشكال المكورة سوطا واحدا او سوطين فقط . وقد بينت نتائج دراسة التركيب الدقيق باستخدام المجهر الالكتروني ظهور الاشكال المتعددة للجرثومة ( العصوي ، والعصوي المنحني ، والملتوي ) فضلا عن ملاحظة النهاية المستديرة للجرثومة والتوزيع المتجانس للمكونات السايتوبلازمية والصباغية ( Chromatic Contents ) في داخل الخلية الجرثومية والسطح الناعم للجرثومة ، كما تم مشاهدة السياط المميزة لهذه الجرثومة التي تميزت بكونها مغمدة ( Sheathed ) وحاوية على انتفاخ ( تثخن ) في نهاية السوط الذي يشبه الهراوة . | The study aimed to isolate the Helicobacter pylori bacteria from patients who have duodenum ulcer and study the phenomenon of cell transformation from spiral shapes to cocci shapes and the influencing factors. The results showed that the component of the agricultural environment, light, and oxygen are the most important factors that help in the process of transformation from the spiral shapes to cocci bacterial shapes of H. pylori during the incubation and the storage period. It had been noticed that when using Brain - Hart infusion agar and Blood - Base agar with the addition of decomposed human blood by a percentage of (5%) with growth supplements, we get cocci shapes with a percentage less than that when we use the same agricultural media without adding the blood and the growth supplements. To maintain the activity of the H. pylori and its spiral shape for a longer period of time which can go up to (20 - 30) days when stored at 4 Co , we must not exposure the agricultural media to light and oxygen with a percentage higher than 6% and also thepH must be (6.9 - 8). For the first time, it had been recorded that some cocci shapes can transform to spiral shapes when using Brain - Hart infusion agar, Muller - Hinton agar, Brucella agar, Milk agar, Choclate agar, Maconcky agar, and Trypton Soy Broth, if we add to some of the used media (5%) of decomposed human blood and growth supplements. While, the previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using cultural media. Also, it had been recorded for the first time that some of the cocci shapes can transform to spiral shapes when using mice and Guinea - Pigs, in a better way than using the solid and liquid cultural media taking into consideration giving the animal a dosage of vaccine of size (0.1) ml. Tissue damage had been noted when studying the tissue sections for stomach, while previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using laboratory animals. The results show that the chemical content of the cocci shapes in the H.pylori bacteria is different from the chemical content of the spiral shapes of the same type of bacteria after treating it by concentrated sulfuric acid and potassium hydroxide, which reflect that changes had took place in the cell wall during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes. The results also showed that the cocci shapes are less density from the spiral shapes due to shortage of Peptidoglycan and the vanishing of the cellular components and the loss of these cellular components due to the changes that took place in the cell wall and the damage of the Cytoplasmic membrane. The study showed that the contents of the cocci shapes of the H.pylori from the Deoxyribo Nucleic Acid (DNA) and from the RiboNucleic Acid (RNA) is less than that of the spiral shapes of the same bacteria. When the Lysozyme and EDTA had been studied separately and also the Lysozyme and the DETA together in the spiral shapes of the H. pylori bacteria, the effect was much more when compared with the cocci shapes of the same bacteria, and that is due to the shortage of Peptidoglycan in the walls of the cocci shapes or due to the loss of Peptidoglycan positions sensitive to the Lysozyme. It had been noted that the ionic detergents such as the SDS and the non - ionic detergents such as Triton X - 100 are causing the analysis of the H. pylori isolation in both the cocci and spiral shapes, but the low concentrations of SDS is more efficient than the high concentration of the Triton X - 100 in the analysis of the bacteria in both of its cocci and spiral shapes. The spiral shapes and the cocci shapes of the H. pylori bacteria and the shapes that appears during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes had been observed when using the Transmission Electronic Microscope (TEM) , also different cocci shapes had been observed that have one and two flagellum. It had been recorded for the first time that the cocci shapes have more than one flagellum and that was during the photography of the isolations by the TEM, while previous studies mentioned that the cocci shapes have one or two flagellum only. The fine composition study using electronic microscope showed that many shapes of the bacteria appears ( rods, curved rods, and the spiral ) in addition to noticing the round end of the bacteria and the homogenous distribution of the Cytoplasmic and Chromatic contents inside the bacteria cell and the smooth surface of the bacteria, and also the flagellum that distinguish this bacteria had been observed that are distinguished by being sheathed and have inflation ( thickness ) in the end of the flagellum which looks like cudgel.

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين == Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

Author name: هالة محمد حسين الحسني
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

Author name: حسام صباح اوهيم
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا == Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

Author name: جوان صباح باجلان
Supervisor name: سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة مصلية وجزيئية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من بعض الاغذية الحيوانية ومن حالات سريرية في محافظة بابل == Molecular and serological study of the bacteria Escherichia coli isolated from some animal foods and clinical cases in Babylon province

Author name: محمد حسن عبد الكاظم الكعبي
Supervisor name: الهام سعيد عبد الكريم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study isolation and Identification of Esherichia coli in Babylon province. Atotal of 206 samples were obtamel which Include 86 stool sample from patients with diarrhea for both sexy and different ages in AL - kasem and AL - Hashimia hospitals from 2 - 2 - 2015 to 30 - 3 - 2015.60 samples of ground beef meat and 60 samples of Localy raw cheeses were obtamil from Hlla , Kasem, Hashimia and Hamza states form the period from 4 - 2 - 2015 to 17 - 4 - 2015 .2. 145 Isolates characterrizd as E.coli depending on the characteristics of the colonies phenotypic and microscopic when grown in diffrerential selective media as well as biochemical test to diagnose Isolates .Then the Identification of these species were confirmal by using Api20E system . 77(89.53 %) E.coli Isolates were obtamel from stoolsamples ,33(22.75%) from ground beef meat , samples 35(24.14%) from Localy raw cheeses samples.3. Serological Identification for 145 E.coli Isolates showed that 31 Isolates (21.8%) were belonged to O157 : H7 ,also results showed 69 E.coli Isolates (47.58%)were belonged to polyvalent II (O111,O119,O26,O55,O126) ,22(15.17%) belonged to polyvalent III (O86,O114,O123,O127,O128),11(7.59%) Isolates belonged to polyvalent IV (O112,O124,O142), 2 Isolstes .belonged to O128 Monovalent serotype from stooland cheese samples and 2Isolates belonged to O159 Monovalent from stool samples .4. Results of Virulence factors of E.coli Isolates showed the ability of 66(45.51%)Producing hemolysin (α,β),E.coli Isolates showed containing tow types of adherence CFA/1 and CFA/III , and tow ratios were 104(71.72%) and 77(53.10%)Respectively ,109(75.7%) Isolates shwed ability to produce Biofilm and 122(84.15%) Isolates showed ability to produce β - Lactamase .5. The Antibiot snsceptibility to all E.coli O157 : H7 Isolate .were performed according to Kirby Bauer testing ,showed ahigh degree of resistance 100% to Ampicillin and Mmeropenem, All Isolates showed Susceptibility 0% to Impenem and Amikacin ,Norfloxcin 96.77% and Gentamycin 90.32%.while resistance to Ceftazidine, Pipracillin ,Ofloxacine and Trimethoprime 77.41%, 70.96 %70 .96%67 74% respectively .6. The molecular Investigation of the genes stx1,stx2 hlyA and flic : H7 was made by taking out the bacterial DNA of all E.coliO157 : H7.Isolates using polymerase chain reaction PCR techniques , results showed 26(83.87%)Isolates gene positive result for stx1 at (180 bp) ,9(29.03%) gave positive result for stx2 at(255bp),all Isolates 100% gave hlyA at (534bp),23(74.19%) gave positive result for flic : H7 at (625bp).

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة == Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

Author name: بشار قصي كاظم
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli

دراسة الاستجابة المناعية للنساء الحوامل وعلاقتها بالمسببات الجرثومية للالتهاب المجاري البولية == Study of Immune Response of Pregnant Women and it's Relation with Causative Pathogenes of Urinary Tract Infection

Author name: امال عزيز كريم السعدي
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
Abstract: تناولت هذه الدراسة التعرف على المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا لاصابة النساء الحوامل بالتهاب المجاري البولية وتقييم الاستجابة المناعية بنوعيها الخلطية (Humoral) والخلوية (Cellular).جمع 124 نموذج دم وادرار موزعة على النحو الاتي : (50) نموذجا من نساء حوامل مصابات وعينات السيطرة من (50) نموذجا من نساء حوامل غير مصابات و(10) نماذج من نساء غير حوامل مصابات، و(14) نموذجا من نساء غير حوامل وغير مصابات.وقد اظهرت النتائج ان المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا باصابتها للنساء الحوامل كانت بكتيريا Escherichia coli وبنسبة (%18.6)، تليها بالمرتبة الثانية بكتيريا Staphylococcus saprophyticus وبنسبة (%18.3).اختلفت انواع البكتيريا التي تمكن عزلها باختلاف مراحل الحمل الثلاث Trimester. وسجلت اعلى نسبة اصابة في المرحلة الثانية من الحمل تليها المرحلة الاولى ثم المرحلة الثالثة من الحمل وكانت النسبة %47) و%20 و%17) على التوالي.اظهرت نتائج الاستجابة المناعية غير المتخصصة (Non - specific) وجود زيادة بنتائج فحص النشاط البلعمي (Phagocytosis) في الدم المحيطي للنساء الحوامل المصابات وبزيادة معنوية (0.05 > P) في قابلية الخلايا البلعمية على الالتهام وفي مراحل الحمل الثلاث مقارنة مع عينات السيطرة.كما لوحظ وجود زيادة معنوية (0.05 > P) في تركيز العامل المتمم الثالث C3 في مصول النساء الحوامل المصابات.اما الاستجابة المناعية المتخصصة (Specific) فقد اظهرت انخفاضا معنويا (0.05>P) في قابلية الخلايا اللمفاوية على التحول والانقسام في الدم المحيطي وفي مراحل الحمل الثلاث وباستخدام المشطر (PHA) لتحفيز الخلايا اللمفاوية على الانقسام، مقارنة مع عينات السيطرة.اما نتائج قياس تركيز الغلوبيولينات المناعية (Immunoglobulines) في مصول مجاميع الدراسة. فقد اظهرت النتائج عدم وجود فروق معنوية في تركيز كل من الغلوبيولينات المناعية نوع A وG مع انخفاض معنوي في تركيز الغلوبيولين المناعي نوع M في مصول الحوامل المصابات مقارنة مع عينة السيطرة من النساء غير الحوامل غير المصابات | In this study, we attempted to identify the most common bacteria which causes urinary tract infection in pregnant women, and also to evaluate both cell - medicated and humoral immune responses in those women.Samples of 124 blood and urine were collected as follows : 50 blood and urine samples were taken from infected pregnant women.50 blood and urine samples were taken from non - infected pregnant women.10 blood and urine samples were taken from non - pregnant, but infected women.14 blood and urine samples were taken from non - pregnant, infected women.The results showed that E. coli was the most common causative agent of UTI in pregnant infected women (18.6%) followed by Staphylococcus saprophyticus (18.3%).In this work, different types of bacteria were isolated during the three trimesters of pregnancy. The highest percentage of infection was in the second trimester (47%), followed by the first and third trimesters (20% and 17%) respectively.Results of non - specific immune response demonstrated that there was a significant phagocytic activity increase in the peripheral blood of the pregnant, infected women during the three trimester of pregnancy when compared with the control group (P > 0.05). There was also a significant increase in the concentration of the complement component C3 in the blood of the infected pregnant women (P>0.05).While the results of specific immune response showed a significant decrease in the ability of lymphocytes to change and divide in the peripheral blood during the three trimesters of pregnancy. After using (PHA) as a stimulating agent in comparison with the control samples (P < 0.05).Results of estimation of immunoglobulin concentrations in the sera of studied groups, showed no significant differences in the concentrations of IgG and IgA, while there was a significant decrease in the concentration of IgM in the sera of infected pregnant women when compared with its concentration in the sera of the control groups i.e. non - infected and non - pregnant women

دراسة مقارنة بين العزلات المحلية لبكترياStaphylococcus epidermidis المقاومة والحساسة للمثيسلين == Comparative Study between Local Isolates of Methicillin Sensitive and Resistance of Staphylococcus epidermidis

Author name: استبرق نبيل عبد اللطيف
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 60 عزلة من المكورات العنقودية من 140 عينة سريريه (ادرار، مسحات اذن، مسحات انفية، جروح، عينات الدم). اثنان وثلاثون عزلة (53.3%) من العدد الكلي للمكورات العنقودية شخصت على انها عنقوديات غير مخثرة لذيفان مخثر بلازما الدمCONS)). تسعة عشر عزلة (59.38%) من CONS شملتStaphylococcus .epidermidis تم فحص الحساسية للعزلات المحلية من S. epidermid لمضاد المثيسلين, النتائج اظهرت 3عزلات من S. epidermidis حساسة للمثيسلين و16عزلة من S. epidermidis كانت مقاومة للمثيسلين، طبقا لهذه النتائج صنفت العزلات الى مجموعتين : - S. epidermidis مقاومة للمثيسلين MRSE)) وS. epidermidisحساسة للمثيسلين .(MSSE) اجري اختبار الحساسية لهاتين المجموعتين من S. epidermidis لاحد عشر مضادا حيويا، اظهرت النتائج مقاومة عالية ومتعددة ل MRSE لهذه المضادات بينما MSSE كانت عالية الحساسية، حيث اظهرت الMRSE حساسية 100% لمضاد vancomycinفقط. وتراوحت نسبة مقاومتها للمضادات penicillin G100% وclindamycin75% وamoxicillin 68.7% وamoxicillin clavulinic acid 68.7% وtetracyclin56.2% وrifampin 56.2% وcephalexin56.2% وerythromycin50% وciprofloxacin50% وgentamicin 43.7%. بينما اظهرتMSSE حساسية 100% لمضاد gentimicinو rifampin وclindamycin وciprofloxacin وvancomycinونسب مختلفة من المقاومة للمضادات الاخرى، اذ كانت نسبة مقاومة MSSE لمضاد amoxicillin وamoxicillin clavulinic acid وcephalexinو erythromycinو penicillin G و.%33 tetracyclin تم التحري عن انتاجية MSSEو MRSE لبعض عوامل الفوعة شملت الهيمولايسين والبروتييزواللايبيزواليورييزوالجيلاتينييزوانزيم المحلل للحامض النوويDNA اظهرت النتائج انMRSE تمتلك نسبة انتاجية لهذه عوامل الفوعة اعلى منMSSE . حيث ان نسبة انتاجية هيمولايسين، البروتييز، اللايبيز، اليورييز، الجيلاتينييز وانزيم المحلل للحامض النووي DNA فيMRSE كانت80%، 100%، 80%، 100%، 60%، و30% على التوالي، بينما كانت نسبة الانتاجية لهذه العوامل في MSSE 67%، 100%، 67%، 100%، 33% و33% على التوالي. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات penicillinو .tetracyclin اذ كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للعزلة 32S هي 60 وحدة للبنسلين و25مايكروغرام/مل للتتراسايكلين، 40 وحدة للبنسيلين للعزلة .40S تم دراسة امراضية MRSE وMSSE باختبار سميتها باستخدام ذكور الفئران البيض السويسرية، وكانت الاعداد البكتيرية المستخدمة هي (108،109، 1010 ،1011 ،1012) cfu/ml والتي تم حقنها داخل بريتون الفئران. لم تسجل اي نسبة قتل بكل التراكيز المستخدمة ل MSSE بينما بلغت نسبة القتل 33% بالتراكيز1010 و11 10 cfu/ml لMRSE. درست التغيرات النسيجية في انسجة الكبد، الطحال، الكلى، الرئة والقلب لذكور الفئران المحقونة ب MSSE و.MRSE لوحظ ان التاثيرات النسيجية التي سببتها MRSE كانت اعلى من تلك التي سببتهاMSSE . اكثر الاعضاء تاثرا نتيجة حقنMSSE وMRSE هما الرئة والكلى واللتان سبتتا نسبة عالية من النخر بهذين العضوين وكان التاثير اقل في الطحال والكبد من الرئة والكلى، ولم يظهر اي تاثير في قلب الفار المحقون بMSSE لكن هناك بعض التاثيرات في قلب الفار المحقون بMRSE. اظهرت نتائج الترحيل الكهربائي لعزلتيMSSE ( 51S و(5Sبانها لا تمتلك اي بلازميد بينما عزلتانMRSE تمتلك بلازميدات، كما لوحظ وجود بلازميدان في عزلة 40S احداهما بلازميد كبير والاخر صغير في حين ان العزلة الاخرى من MRSE 32S تمتلك 3 بلازميدات واحد منها كبير واثنان صغيران. اظهرت نتائج تحييد البلازميد باستخدام SDSو Rifampin ان بلازميدات العزلتين 32S)، (40S قد حييدت عند المعاملة ب100مايكروغرام/مل، 230مايكروغرام/مل من SDSعلى التوالي، 150مايكروغرام/مل، 200مايكروغرام/مل من Rifampinعلى التوالي. اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 40S حساسية للبنسيلين وبقاء المقاومة للمثيسلين كما اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 32S حساسبة للبنسلين وتتراسايكلين واحتفاظ البكتريا بمقاومتها للمثيسلين. | Sixty isolates of Staphylococcus were obtained from one hundred forty clinical specimens (urine, ear swabs, nasal swab, wound, and blood). Thirty two isolates (53.3%) of total number of Staphylococcus were identified as coagulase - negative staphylococci (CONS), nineteen isolates(59.38%) of CONS were included Staphylococcus epidermidis. Sensitivity of local isolates of S. epidermidis was examined against methicillin, the results showed 3 isolates from S. epidermidis were sensitive to methicillin and 16 isolates from S. epidermidis were resistance to methicillin, according to these results the isolates were splits to two groups : - methicillin resistance S. epidermidis (MRSE) and methicillin sensitive S. epiderimidis (MSSE). The sensitivity test of these two groups against 11 different antibiotics was done, the results showed MRSE were highly resistance and multi resistance patterns to these antibiotics, while MSSE showed highly sensitive. In MSSE showed 100% sensitivity to gentimicin, rifampin, clindamycin, ciprofloxacin and vancomycin, and different percentage of resistance to other antibiotics. The resistance percentage of MRSE to pencillin G 100%, clindamycin 75%, amoxicillin 68.7%, amoxicillin clavulinic acid 68.7%, cephalexin 56.2%, rifampin 56.2%, tetracyclin 56.2%, erythromycin 50%, ciprofloxacin 50%, gentamicin 43.7%. the resistance percentage of MSSE to amoxicillin, amoxicillin clavulinic acid, cephalexin, erythromycin, penicillin G and tetracyclin were 33%. While in MRSE showed 100% sensitivity to vancomycin only. Some virulence factors of MRSE and MSSE were detected including the hemolysin, protease, lipase, urease, gelatinase and DNase the results showed MRSE have higher percentage to produce these virulence factors than MSSE. The production percentage of hemolysin, protases, lipase, urease, gelatinase and DNase in MRSE was 80%, 100%, 80%, 100%, 60% and 60% respectively, while in MSSE 67%, 100%, 67%, 100%, 33% and 33% respectively. The minimum inhibitory concentration of antibiotics (penicillin and tetracyclin) to S. epidermidis isolate had been determined. they were 60U and 25µg/ml respectively for the isolate 32S, they were 40U of penicillin for the isolate 40S. The pathogenicity of MRSE and MSSE was studied by testing its lethality by using white Swiss male mice, the bacterial numbers was used that is (108,109,1010,1011,1012) cfu/ml and was injected in mice. Died of injected mice was not recorded with any used concentration in MSSE but in MRSE 33.3% of injected mice was killed in concentration 1010 and 1011 CFU/ml. Histological changes in liver, spleen, kidney, lung and heart tissues of male mice which were injected with MRSE and MSSE were studied. The histological effect were produced by MRSE was higher than those produced by MSSE. The most effective of MRSE and MSSE in lung, kidney because appeared of high necrosis in these organs but in spleen, liver of mouse were less effected from lung and kidney, in heart of mouse injected with MSSE no effect was recorded while in MRSE some effect have been seen. Results from agarose gel electrophoresis showed two isolates of MSSE 5S and 51S don't have any plasmid while other two isolates of MRSE have plasmids, two plasmids found in S. epidermidis isolate (40S), one of them was large plasmid and the other was small plasmid and in S. epidermidis isolate (32S) contained three plasmids, one from these was large plasmid and the other two plasmids were small plasmids. The results of plasmid curing by using sodium dodecyl sulphate (SDS) and rifampin showed that the plasmids of the local isolates 32S and 40S was curred by treatment with 100μg/ml, 230μg/ml respectively from SDS and 150μg/ml, 200μg/ml respectively from rifampin. Cured cells from 40S isolate (MRSE) were sensitive to penicillin and still resistance to methicillin and the cured cells from 32S isolate were sensitive to penicillin, tetracycline and still resistance to methicillin

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

Author name: حسام محمود حسن العماري
Supervisor name: هيفاء هادي حساني | عدوية عبد الله السعدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.

التغيرات النسجية لتاثير اشعة الهاتف النقال في بعض اعضاء طائر السمان الياباني (Coturnix coturnix japonica) == The histological changes to the effects of mobile phone radiation in some organs of ( Coturnix coturnix japonica )

Author name: احسان فرج عبد الصاحب الحسناوي
Supervisor name: ستار عبود فارس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
University: University of Thi-Qar - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية استـعمال (48) طـيـرا مـن ذكـور واناث طائر الســمان الـيابانــي Coturnix coturnix japonica، التي كانت بعمر ( 60 الى 70 ) يوما , تم الحصول على الطيور من الاسواق المحلية لمدينة سوق الشيوخ / محافظة ذي قار / العراق ، وبعد فحصها من قبل الاطباء البيطريين والتاكد من كونها سليمة وضعت الطيور معا لمدة (30 يوما) لغرض التكيف ومن ثم قسمت الطيور الى اربع مجاميع ووضعت في اقفاص خشبية بابعاد (50 × 50 سم3 ) وبواقع (12 طيرا) في كل مجموعة (6 ذكور و6 اناث) , وضعت الاقفاص في ظروف مناسبة من حيث التهوية والاضاءة ودرجة الحرارة التي بلغت من (23 - 25 مº) ، عرضت المجموعة الاولى لاشعاع الهاتف المحمول لمدة (7 ايام) , وعرضت المجموعة الثانية لمدة (30 يوم) , والمجموعة الثالثة لمدة (60 يوم) , اما المجموعة الرابعة فهي مجموعة السيطرة , وبعد انتهاء فترة التعرض شرحت الـطـيـور واسـتخـرجـت الاعـضاء الـمـراد دراسـتـها (الـخـصى ، الـمـبايـض ، الـكـبـد ، الـكـلى) . اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول انخفاض معنوي ( P≤0.05) في معدل اقطار النبيبات المنوية وكذلك حصول انخفاض معنوي في معدل سمك طبقة الخلايا الجرثومية في الخصى وكذلك حصول انخفاض معنوي في معدل وزن الخصى في ذكور المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف المحمول مقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول تغييرات نسجية في خصى ذكور المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال تمثلت هذه التغيرات بحصول نقصان في اعداد الحيوانات المنوية وقلة في اعداد الخلايا المكونة للنطف ونقص في كثافة النسيج الضام الذي يفصل بين النبيبات المنوية وكذلك تحلل degeneration في النسيج الضام بين النبيبات المنوية بالاضافة الى تحلل في جدار النبيب المنوي وكذلك حصول تنخر في الظهارة النبيبية وحصول نزف دموي بين النبيبات المنوية ، واظهرت نتائج الدراسة الحالية للمبيض حصول انخفاض معنوي في معدل وزن المبيض في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال مقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت الدراسة للمبيض في اناث المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال لمدة (30 و60 يوم) حصول تحلل في جدار المبيض وقلة في اعداد الحويصلات المبيضية وكذلك احتقان في الاوعية الدموية ونزف دموي بالاضافة الى ارتشاح الخلايا الالتهابية , كما اظهرت نتائج الدراسة للكبد في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال حصول توسع expansion في الجيبانيات الكبدية واحتقان congestion وتوسع في الوريد البابي المركزي وكذلك حصول تفجي vaculation في سايتوبلازم الخلايا الكبدية بالاضافة الى ارتشاح الخلايا الالتهابية وحصول نزف دموي ، كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان تعرض طيور السمان الياباني لاشعاع الهاتف النقال يؤدي الى حصول انخفاض معنوي في معدل قطر الكبيبة الكلوية وارتفاع معنوي في معدل الحيز بين الكبيبة ومحفظة بومان وارتفاع معنوي في معدل قطر النبيب الكلوي عند المقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية للكلى في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال حصول ارتشاح infiltration للخلايا الالتهابية ونزف دموي hemorrhage وانكماش shrinkage في الكبيبات الكلوية بالاضافة الى حصول تحلل degeneration في النبيبات الكلوية . | The current study includes use (48) birds from both sexes (males , females) from Coturnix coturnix japonica . These birds were brought from the local market of Suq Al - shuyukh city / Thi - Qar province / Iraq , and then checked by veterinarians and make sure they are healthy we put them together for (30) days for adaptation and then divided the birds into four groups and put in wooden cages with dimensions 50 × 50 cm3 for 12 birds in each group (6 males and 6 females) , the cages put at organization and controlled whence ventilation , lighting and temperature ranged between (23 - 25 Cº) , the first group was exposed of mobile phone radiation for (7) days , and exposed a second group for (30) days , and the third group for (60) days , while the fourth group a control group , and after the end exposure period vivisection the birds and we extracted the organs we want study (testes , ovaries , liver , kidneys). The results of the current study showed a reduction in the rate of the seminiferous tubule diameters as well as a reduction in the rate of germ cells layer thickness in testes males mobile phone radiation - exposed aggregates compared with control group , the results of the current study also showed histological changes in testis males groups mobile phone radiation - exposed these changes were decrease in sperm counts and lack of number of cells of sperm and a decrease in density connective tissue which separates between seminiferous tubules and degenerating in connective tissue between seminiferous tubules addition to smashed in the wall of seminiferous tubule as well as epithelium necrosis and hemorrhage between seminiferous tubules , also showed the results of the current study of the ovary in females mobile phone radiation - exposed groups for (30 and 60) days smashed into the wall of the ovary and lack in numbers ovarian follicles and vascular congestion and hemorrhage in addition to infiltration of inflammatory cells , also showed the results of the current study of the liver in groups mobile phone radiation - exposed expansion in sinusoids, congestion, expansion in central vein and vaculation in hepatocytes in addition to infiltration of inflammatory cells and hemorrhage , as the results of the current study showed that exposure to radiation Japanese quail mobile phone leads to a reduction in renal glomerulus diameter rate and high rate of spread between the glomerulus and Bowman's capsule and high renal tubule diameter rate when compared to the control group and the results of the current study showed that the kidneys in mobile phone radiation - exposed aggregates infiltration of inflammatory cells, and hemorrhage shrinkage in renal glomerulus in addition to getting degenerate renal tubules .

النمط المناعي للاشخاص المعرضين للحروق والمصابين ببكتريا الزوائف الزنجارية (Pseudomonas aeruginosa) وتوصيفها الجزيئي لمقاومة المضادات الحياتية == Immunological profile of burned patients infected with Pseudomonas aeruginosa and Molecular characterization of It's Antibiotic Resistance

Author name: ضواء محمد صلاح الخطيب
Supervisor name: وفاء صادق الوزني | ياسمين خضير الغانمي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: University of Kerbala - College Of Science
Language: Arabic
University location: Karbala
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى بيان نسبة تردد بكتريا الزوائف الزنجارية Pseudomonas aeruginosa بين مرضى الحروق في محافظة كربلاء. مع بيان بعض التغايرات المناعية المرافقة لاصابات الحروق في جسم المصاب وبعض الصفات الوراثية لبكتريا المعزولة التي تجعلها مقاومة للعديد من المضادات الحيوية الشئ الذي يزيد من زيادة نسبة حالات الانتان الدموي والموت بين هؤلاء المرضى . قد تم في الفترة من شهر شباط2014 الى شهر اب 2014 جمع مسحات جلدية وعينات دم من 64 عزلة من مرضى الحروق الراقدين في مستشفى الحسين مع جمع 30 مسحة بيئية من ردهات الحروق نفسها في تلك المستشفى ،اذ ظهر ان 45 % من مسحات الحروق كانت تعود لبكتريا الزوائف الزنجارية في حين 26.1% فقط كانت نسبة عزل هذه البكتريا من المسحات البيئية ولبيان العلاقة بين عمر المريض ودرجة الحرق ونوعه تبين ان نسبة الحروق 60.9) %) في الاعمار دون 15 سنة كانت اعلى من نسبتها 39.11)%) في الاعمار فوق 15 سنة . في حين كانت الحروق الناتجة عن السوائل الحارة لدى المصابين دون 15سنة اعلى معدلات الحرق بينما حروق اللهب شكلت النسبة الاكبر (29.7%) في الاعمار فوق 15سنة بالاضافة الى ان الاناث كانت الاكثر عرضة للحرق ونسبته (56.3%) مقارنة بالرجال (%43.8). كانت بكتريا P.aeruginosa المعزولة عالية المقاومة لاغلب المضادات الحيوية حيث كانت مقاومة لكل من )Cefatotaxime 88.6%) , Ceftazidime (85.7%), Oxacillin (71.4)و Meropenin(85.7%) في حين وصلت مقاومتها الى (%77.1) للمضاد الحيوي Gentamycin . اذ كانت اغلب العزلات مقاومة لاكثر من مضاد حيوي واحد لبيان سبب هذه المقاومة العالية تم الكشف وراثيا عن جينات البيتالاكتميز مثل per - 1 وoxa - 10باستخدام تقنية تفاعل تضخيم الدنا (PCR) حيث اظهرت نتائج البلمرة بحجم 760bp بالنسبة لجين المسؤول عن انزيم oxa - 10 وناتج بلمرة بحجم 927bp للجين المسؤول عن انزيم per - 1 ، وكانت نسبة تواجد جين oxa - 10 بنسبة 85% من مجموع العزلات الكلي اما الجين per - 1 فقد تواجد بنسبة 50% من العزلات المحصلة عليها.اما نتائج الدراسة المناعية الخاصة لبيان تاثير الحروق بانواعها على فعالية الجهاز المناعي للمريض فقد ظهر جليا ارتفاع واضح لكريات الدم البيض عند المصابين والذي يتناسب طرديا مع شدة الحرق فقد وصلت اعداد الخلايا mm3) / 103) 10.44 , 13.222 و15.955 لكل من مجموعة مرضى الحروق البسيط والمتوسطة والشديدة على التوالي حيث كان الارتفاع بصورة خاصة لكريات الدم البيض العدلة مقارنة ببقية الانواع الخلوية .اما المناعة الخلطية المتمثلة بتراكيز كل من بروتين الطور الحاد والمتمم فقد لوحظ ارتفاع معنوي في قيم بروتيات الطور الحاد والذي يتزايد طرديا مع شدة الحرق ليصل الى 63.4 ملغم/لتر في الحروق البسيطة في حين وصل الى) 95.2 و121.8 ) ملغم/لتر لكل من الحروق المتوسطة والشديدة على التوالي .اما تراكيز بروتين المتمم C3 فقد ظهرت التحليلات الاحصائية ارتفاع غير معنوي بمستوى المتمم الثالث لكل درجات الحروق البسيطة وبنسبة 125.45 ملغم/ديسيلتر,المتوسطة137.5 ملغم/ديسيلتر والشديدة 140.15 ملغم/ديسيلتر مقارنة مع الاشخاص الاصحاء 122.32 ملغم/ديسيلتر. في حين كان الارتفاع معنويا ( p≤0.05) في قيم الحركي الخلوي IL - 6 ليصل الى 118 بيكوغرام /مل, 86 بيكوغرام /مل و33 بيكوغرام /مل كل من مرضى الحروق البسيطة والمتوسطة والشديدة على التوالي .على العكس من ذلك فقد سجلت عامل التنخر الورمي TNF اعلى ارتفاع في مرضى الحروق الشديدة اذ بلغ 600.45 بيكوغرام/مل مقارنة بالاشخاص الاصحاء 175.15 بيكوغرام/مل. | This study aimed to a statement the ratio Pseudomonas.aeruginosa between burns patients in the Al - Hussein Hosppital in Kerbala city and as well as some variations of immune system that associated with injuries or burns in the body patient in addition explain some genetic characters of isolated bacteria that make them resistant to different types of antibiotics, which increases sepsis & death among these patients. Skin swabs and blood samples were collected from 64 burn patients admitted to the hospital in period febrwary 2014 to agust 2014 in addition 30 swabs from environmental hospital also collected . Pseudomonas aeruginosa was isolated from burns swabs (45% ) while only 26.1% were isolated from environmental swabs. Relationship statement between the patient's age and the degree, type of the burn showed that the percentage of burns ( 60.9%) in the ages under 15 years higher than the rate of (39.11%) in ages over 15 years .The burns rates caused by hot liquids in patients under 15 years than flame higher burn while burns flame formed the most (29.7%) in the ages over 15 years . That females were most likely to burn rate (56.3%) compared to men (43.8%) P.aeruginosa were isolated high resistance to most antibiotics used where the resistance of each Cefatotaxime (88.6%), Ceftazidime (85.7%),Oxaciilin(71.4) and Meropenin (85.7%) while resistant to (77.1%) for Gentamycin. The cause of multidurg resistance was detected genetically by determined B - lactamase genes of per - 1and oxa - 10 using a technique amplified DNA reaction (PCR). The results showed polymerization Size 760bp for the gene responsible for oxa - 10 and the result Size polymerization 927bp gene responsible for an enzyme per - 1the presence of oxa - 10 (85%) in the total isolates either per - 1gene has presence by (50% )in the isolates collected them.The immunological results showed clearly increased white blood cells that directly proportional to the severity of the burn has reached the preparation of cells (10.44, 13.222, 15.955 ) 103/mm3 of the patients with simple and moderate to severe burns group respectively, where the rise, in particular, to neutrophil white blood cells compared to other types of cells.The immune humoral concentrations of both protein acute phase and complement were noted a significant rise in acute phase protein values and which are increasingly proportional to severity of the burn to arrives 63.4 mglL in simple burns while arrived( 95.2 and 121.8) ) mglL for each of degrees burns moderate and severe on respectively.It was found significant increase in the acute phase protein values and which increased directly according to the severity of the burn for up to 63.4mg/ml in simple burns while reached( 95.2 and 121.8)mg/ml each of the moderate and severe burns respectively.Statistical analyzes of complement protein C3 appeared insignificant rise in the levels of the complement for each degree of burns simple 125.45, medium (137.5 mgldL)and severe (140.15 mgldL) compared with healthy people (122.32 mgldL).While the rise significant at the level of probability (p ≤0.05) in the kinetic values cellular IL - 6 to reach( 118 pg / ml), (86 pg / ml), (33 pg / ml) each of the patients simple burns and moderate to severe respectively. On the opposite it values of kinetic cellular TNF were recorded the highest rise in patients with severe burns, reaching 600.45 (pg / ml) compared to control

مقارنة تاثير انواع وتراكيز المستخلصات النباتية مع عدد من المضادات الحياتية على البكتريا المسببة لالتهاب اللثة == Comparison the effect of the types and concentrations of plant extracts with some antibiotics on bacteria that cause gingivitis

Author name: اسامة غازي اسماعيل الزهيري
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في محافظة ديالى للفترة من1/10/2014 الى 1/04/ 2015 ، جمعت العينات البكتيرية باستخدام مسحات قطنية معقمة من الاشخاص الذين يعانون من مرض التهاب اللثة في المراكز التخصصية للاسنان في مدينة بعقوبة , ثم نقلت العينات الى مختبر الاحياء المجهرية/مستشفى بعقوبة التعليمي. تم تشخيص هذه العزلات البكتيرية من قبل العاملين في المختبر وهي : Staphylococcus aureusو Escherichia coliو Proteus sppو Streptococcus pyogene تضمنت الدراسة اختبار حساسية العزلات البكتيرية قيد الدراسة تجاه ستة انواع من المضادات الحيوية وهي (Tetracyclin وAmoxicillin وAugmentin وTrimethoprim وGentamicin وAmikacin). اذ بينت نتائج فحص الحساسية للعزلات البكتيريا ان بكتريا E.coli وProteus spp اظهرتا حساسيتهما تجاه المضادات الحيوية Amoxicillin وAugmentin وTrimethoprim وGentamicin وAmikacin في حين اظهرتا مقاومتهما تجاه Tetracyclin , اما بالنسبة الى بكتريا S. aureus وS. pyogens فقد اظهرتا حساسيتهما تجاه مضادات Amikacin وGentamicin وAugmentin وTrimethoprim في حين اظهرتا مقاومتهما لمضادات Tetracyclin وAmoxicillin. كما تضمنت الدراسة الكشف النوعي والتقدير الكمي للمركبات الفعالة الموجودة في نباتات القرنفل والكجرات والسواك فضلا عن دراسة تاثير المستخلص الكحولي ومستخلص الماء الحار ومستخلص الماء البارد للنبات قيد الدراسة وبثلاثة تراكيز 50 و100 و200ملغم.مل - 1. بينت نتائج الكشف النوعي ان النباتات المستعملة في الدراسة تحتوي على العديد من المركبات الفعالة وهي القلويدات والصابونينات والفلافونات والتانينات والكلايكوسيدات والزيوت الطيارة والراتنجات . اما بالنسبة الى التقدير الكمي فبينت النتائج ان المواد الفعالة ظهرت بنسب مئوية عالية في المستخلص الكحولي يليه المستخلص المائي الحار ثم المستخلص المائي البارد , وان الكجرات اكثر النباتات الذي يحتوي على نسبة عالية من المواد الفعالة يليه السواك والقرنفل . اظهرت المستخلصات النباتية فاعلية تثبيطيه تجاه العزلات البكتيرية قيد الدراسة ، اذ ان هذه العزلات كانت حساسة بالدرجة الاولى للمستخلص الكحولي ثم المستخلص المائي الحار يليه المستخلص المائي البارد. بينت الدراسة ايضا ان مستخلصات نبات الكجرات كان اكثر الانواع النباتية تثبيطا تجاه البكتريا يليه مستخلصات السواك ثم مستخلصات القرنفل , وان الفعالية التثبيطية للمستخلص النباتي ازدادت بزيادة تركيزه , اذ اعطى التركيز 200ملغم.مل - 1 اعلى فعالية تثبيطيه تجاه الانواع البكتيرية. | This study was conducted in Diyala province for the period from 01/10/2014 to 01/04/2015, bacterial samples were collected using sterile cotton swabs from people who suffer from gum inflammation disease in specialized centers of the teeth in the city of Baquba, and then the samples were transferred to biology lab microstructure / Baquba Teaching Hospital. It has been diagnosed with this bacterial isolates by those working in the laboratory which is : Staphylococcus aureus and Escherichia coli and Proteus spp and streptococcus pyogenes. The study tested the sensitivity of bacterial isolates under study toward six kinds of antibiotics which (Tetracyclin and Amoxicillin and Augmentin and Trimethoprim and Gentamicin and Amikacin). As the results of the examination of the sensitivity of the isolates of the bacteria showed that the bacteria E - coli and Proteus spp have shown resistance toward antibiotics Amoxicillin and Augmentin and Trimethoprim and Gentamicin and Amikacin while demonstrated their resistance toward Tetracyclin, As for the bacteria, S. aureus and S. pyogens has demonstrated sensitivity toward anti - Gentamicin and Amikacin and Augmentin and Trimethoprim while demonstrated their resistance to antibiotics Tetracyclin and Amoxicillin. The study also included qualitative detection and quantification of the active compounds in plants Eugenia caryophyllus Hibiscus sabdariffa and Salvadora persica as well as the study of the influence of alcoholic extract and extract hot water and cold water extract of the plant under study and three concentrations of 50, 100 and 200 mg.ml - 1. Results showed that the qualitative detection used in the study of plants contain many active compounds which alkaloids and saponins and tannins and Filavonat and Alkleikosadat and volatile oils and resins. As for the quantification of the results it stated that the active substances showed high percentages in the alcoholic extract, followed by warm water and then extracted aqueous extract cold, and Hibiscus sabdariffa more plants that contains a high concentration of active substances, followed by Salvadora persica and Eugenia caryophyllus. Plant extracts showed inhibitory effective against bacterial isolates under study, since these isolates were sensitive primarily to extract alcohol and aqueous extract hot water extract, followed by cold. The study also showed that the plant extracts Hibiscus sabdariffa was more plant species toward inhibition of bacteria, followed by Salvadora persica and then extracts Eugenia caryophyllus extracts, and that the effectiveness of inhibitory plant extract increased by increasing its focus, as it gave focus 200 mg.ml - 1. higher effective inhibitory toward bacterial species

دراسة بكتريولوجية لبعض مسببات الاسهال لدى الاطفال == Bacteriological study of the some causes of diarrhea in children

Author name: ريا خليل ابراهيم القيسي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | هادي رحمن رشيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: This study included The investigation of the existence some type of Enterobacteriaceae bacterial Causes Diarrhea in (215) samples for patients sufferers symptoms indicate that their infection Diarrhea. period from 1\10\2014 to 30\1\2015, and used MacConkey agar and blood agar for the cultivation of these samples.The results refer that 65 isolates are belonging to bacteria of Enterobacteriaceae 13 (20 %) Proteus mirabilis and 3(4.6%)Morganella morganii 2(3.1%) Salmonella spp by using diagnostic phenotypic ,biochemical tests and confirm the diagnosis by using system Vitek2.The results of the investigation of some virulence factors showed the isolates of Proteus mirabilis produce of haemolysin (92.3%) ,while Salmonella spp and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme. The results showed that all isolates of Proteus mirabilis and Salmonella spp and Morganella morganii were produced urease by (100%) (0%) (100%) respectively.The results showed that all isolates of Salmonella spp and Morganella morganii were produced protease by (100%)(50%) while Proteus mirabilis have not ability to produce this enzyme.The results showed that isolates of Proteus mirabilis were produced bacteriocin by (69.2%) while Salmonella spp by (50%) and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme The results showed a variance as far as their resistance to these antibiotics. Isolates of Proteus mirabilis showed highest resistance rate (76.9%) for Ampicillin e while isolates of Salmonella spp highest resistance rate (100%) for Cephalothin, Cefotaxime and Ampicillin , while isolates of Morganella morganii showed highest resistance rate %100 for Trimethoprime , Ampicillin , Cephalothin , Nalidixic acid , Piperacilli.The results showed (15) isolates rate (83.33%) have multiple resistance pattern for antibiotic and divided into two groups , first group included (5) isolates which were resistant to ( 2 - 5 ) antibiotics , while second group included (10) isolates were resistant to (6 - 10) antibiotics . Results indicated that the second group was dominant. The results showed that the Resistance prevailing coordinated to isolates Proteus mirabilis is (4) antibiotic (Ap - TM - CTX - NA) and to isolates Morganella morganii is (6)antibiotic (AP - TN - PRL - NA - KF - FOX) and to isolates Salmonella spp is (3) antibiotic (AP - CTX - KF).Results showed content plasmid for Proteus mirabilis and Morganella morganii they do not contain plasmids packages While shown Salmonella spp content on plasmids one package .The results of bacterial conjugation In the liquid medium The success of the process of bacterial conjugation for Salmonella spp That have one package of plasmids before and after of bacterial conjugation .The results of transmission of prescription antibiotics (TM - AP - KF - CTX)

متلازمة الابنية المريضة بين الحضر والريف : دراسة مقارنة == Sick buildings syndrome between the Urban and Rural areas : A comparative study

Author name: ســرمـد قاسـم مـحمــد الـتميمي
Supervisor name: عدنان نعمة عبد الرضا العزاوي | عامر محمد ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة الميدانية في محافظة ديالى للفترة الواقعة بين 1/تشرين الاول/2014 ولغاية 1/اذار/ 2015 وشملت مناطق حضرية ومناطق ريفية واخرى وسطية في طور التحول ،بهدف التعرف على الاثار الصحية للملوثات البيئية(الكيميائية والفيزيائية والحيوية) في الاماكن المغلقة مع بيان الفرق في نسب تلك الملوثات بين مناطق الدراسة. تضمنت الدراسة توزيع 150 استمارة استبيان تحتوي على الجنس ،مجموعة من الظروف البيئية ومجموعة من الاعراض المرضية والتي تشير الى وجود بيئة مريضة ، بواقع 50 استمارة لكل منطقة .وتم قياس تركيز الغازات اول اوكسيد الكاربون (CO)، وثاني اوكسيد الكاربون (( CO2 ،وثاني اوكسيد النتروجين(NO2) في داخل المبنى وفي خارجه باستعمال جهاز تحليل الغازات Portable Gas Analyzer وكذلك قياس درجة الحرارة والرطوبة النسبية في داخل المبنى. كما تم جمع 150 مسحة بكتيرية بواقع 50 مسحة لكل منطقة وذلك من مصادر بيئية مختلفة شملت المطابخ، الصحيات وغرف النوم وتم تشخصيها مختبريا،اضافة الى اجراء فحص الحساسية الدوائية تجاه مجموعة من مضادات الحياة للعزلات المشخصة . بينت نتائج الدراسة الحالية ان اعراض متلازمة المباني المريضة Sick Building Syndrome (SBS) مثل العصبية ،الصداع ، ضيق التنفس ، جفاف العين وجفاف الجلد كانت اكثر ظهورا لدى سكان المناطق الحضرية اذ بلغت نسبتها32.5%، 32.4%،24.4%، 20.5%، 17.1 % على التوالي، في حين كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية وكانت قليلة جدا لدى سكان المنطقة الريفية وكانت الاعراض الدوران، تشتت الانتباه ، تهيج الانف، وتهيج العين، اكثر ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية اذ بلغت نسبتها 27% ،24.8%،23.3%، 12.2% على التوالي،وايضا كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الريفية. وكانت الاعراض الصداع، جفاف العين ،تهيج العين وجفاف الجلد اكثر ظهورا على الاناث من الذكور، في حين ان الاعراض العصبية والانزعاج والدوران كانت اكثر ظهورا على الذكور. وبينت النتائج ان عوامل الخطر البيئية المساعدة على حدوث الاعراض مثل التعرض الى سوء التهوية ، الروائح الكريهة وضعف الاضاءة الطبيعية كانت متوافرة في البيئة الحضرية بصورة اكثر وبنسب 28.6%،22.4%،20.4% على التوالي ، في حين ان التعرض الى الغبار والهواء الجاف كان بنسب اعلى لدى سكان المنطقة الوسطية وبنسب27.1%،23.2% على التوالي. وكانت الظروف البيئية بنسب اقل لدى سكان المنطقة الريفية. اما نتائج قياس تركيز الغازات CO، CO2،NO2 فقد كانت اعلى تركيزا في المناطق الحضرية وبنسب 2.62 جزء بالمليون ، 0.13 جزء بالمليون ،0.20 جزء بالمليون على التوالي ، في حين كانت الاقل تركيزا في المناطق الريفية والتي بلغت 0.10 جزء بالمليون، 0.006 جزء بالمليون، 0.06 جزء بالمليون على التوالي. لم تكن هناك فروق معنوية بالنسبة لقياس درجات الحرارة والرطوبة،اذ بلغ معدل درجة الحرارة في المنطقة الوسطية 23.9م تلتها المنطقة الحضرية 21.8م ، وسجلت في المنطقة الريفية اقل درجة 21.6م .اما بالنسبة للرطوبة النسبية تفوقت المنطقة الريفية باعلى نسبة للرطوبة فبلغت 58.9%، وتلتها المنطقة الحضرية55%، وتمثلت المنطقة الوسطية باقل نسبة للرطوبة 54.8% اما بالنسبة لنتائج العزل البكتيري فقد المنطقة الريفية اعلى نسبة للنمو الايجابي اذ بلغت 46 من اصل50 عينة وبنسبة (92%)،تلتها المنطقة الوسطية 35 من اصل 50 عينة وبنسبة (70%) ، وجاءت المنطقة الحضرية باقل نسبة 24 من اصل 50 عينة وبنسبة(48%)، في المنطقة الريفية كانت البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة اذ شكلت بكتريا Staphylococcus aureus اعلى نسبة (43.4 %) وEscherichia coli (19.5%) اما الاجناس pseudomonas aeruginos وpneumoniae Streptococcus فقد بلغ كل منهما (10.8%) وبلغت pneumonia klebsiella (4.3%). وفي المنطقة الوسطية كانت ايضا البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة فقد شكلت S. aureus (42.8%) تلتها E.coli (20%) وP. aeruginosa (17.1%) وpneumoniae S . (8.5%) واحتلت K. pneumonia المرتبة الاخيرة (2.8%) . اما في المنطقة الحضرية فقد كانت البكتريا السالبة لصبغة كرام هي السائدة فبلغت نسبة P. aeruginosa وS. aureus (33.3%) وبلغت نسبة الاجناس E.coliو pneumoniaeK. ،و pneumoniae S.، (12.5%) ،(8.3%) ، (4.1%) على التوالي . وبينت نتائج فحص الحساسية تجاه المضادات اوجمنتين (Augmentin)، والامبسلين Ampicillin)) ،والتوبرومايسين Tobramycin) )،والامبينيم ( Imipenem) ان معظم الاجناس كانت متحسسة وبنسب متفاوتة،الا ان بعض الاجناس ابدت مقاومة تجاه انواع معينة منها. | This field study was conducted in Diyala province for the period between 1/10/2014 until 1/3/2015 included urban areas and rural areas and other centrist in transition, with a view to identifying the health effects of environmental contaminants (chemical, physical and biological) in enclosed spaces with the difference in the proportions of those pollutants between the study areas. It includes the distribution of 150 a questionnaire containing, sex set of environmental conditions and a set of symptoms that indicate the presence of sick environment, by 50 for each form region and concentration measurement of gases (CO, CO2, NO2) inside the building and outside by using Portable Gas Analyzer as well as temperature and relative humidity In inside the building. He also collected 150 bacterial swab 50 swab for each area,from different environmental sources included kitchens, bedrooms and Health facilities and laboratory - diagnosed, as well as a test of sensitivity to a range from antibiotic of the isolates diagnosed. The results showed that Sick Buildin Syndrome symptoms such as nervousness, headaches, shortness of breath, eyes dry and skin dryness were at ahigher rate in urban areas as the average 32.5%,32.4%, 24.4%, 20.5% 17.1% respectively, while less visible in the middle of the region and were very few the rural of the region, symptoms were Rotation, Attention Deficit, irritation of the nose, eye irritation, more common the middle of the region as the average of 27%, 24.8%, 23.3% , 12.2%, respectively, and Less amonge to the population of the rural area. symptoms as headache, eye dry, eye irritation, dryness of the skin were more amonge females than males, while the symptoms as neurological , discomfort, and the rotation was more pronounced on males. The results showed that environmental risk factors help symptoms occur, such as vulnerability to poor ventilation, odors and poor natural light available in a more urban environment as the average 28.6%, 22.4% , 20.4% respectively, whereas exposure to dust and dry air was higher among residents of the middle region as the average of 27.1%, 23.2% respectively and environmental conditions were lower in the rural area. The results concentration of measurment gases (CO, CO2, NO2) were higher in the urban areas, as average ( 2.62 ppm, 0.13 ppm, 0.20 ppm) respectively, while the less concentrated in rural areas, which reached (0.10 ppm, 0.006 ppm, 0.06 ppm) respectively, There was no significal differences for measurement of temperature and humidity, with an average temperature in the middle region ( 23.9)m followed by the urban area of (21.8) m, recorded in rural lower (21.6 )m .for relative humidity overtook the rural area with the highest percentage of humidity, reaching 58.9%, followed by urban area 55%, and middle area was the lowest 54.8%. The results of bacterial isolation region showed the highest Percentage in the rural isolation 46 sample (92%), followed by the middle region 35 sample (70%)and urban area with less than 24 sample (48%). the rural area showed the positive it for bacteria gram stain were most common , accounting Staphylococcus aureus bacteria highest percentage (43.4%) , Escherichia coli (19.5),the races, pseudomonas aeruginosa and Streptococcus pneumoniae were each (10.8%) and klebsiella pneumonia (4.3%). In the middle area the positive it for bacteria gram stain were most common accounting S. aureus might formed (42.8%) Followed by E. coli (20%) , P. aeruginosa (17.1%) , S. pneumonia (8.5%)and K. pneumonia ranked last (2.8%) In the urban area negative it for bacteria gram stain were most common accounting P. aurgenosa and S. aureus was (33.3%) and the result of species E. coli, K. pneumonia and S. pneumonia were (12.5%) (8.3%) (4.1%) respectively. the results of sensitivity to antibiotics Augmentin, Ampicillin, Tobramycin, Imipenem ,that most strain were resistance in varying percentage, some strain have expressed resistance towards certain types

دراسة مناعية وتقييم انتشار الاجسام المضادة الخاصة ضد اللولبية الشاحبة بين العراقيين المتبرعين بالدم

Author name: انس وسام مالك
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | محمد عبد الدايم صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: English
University location: Diyala
First pages:
Abstract: السفلس هو مرض ينتقل جنسيا بوساطة بكتريا اللولبية الشاحبة Treponema pallidum ويصنف اما مكتسب او ولادي .اجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لنقل الدم في بغداد خلال جزء عملي اشتمل على المرضى المراجعين للمركز للمدة من 1 اب الى 31 كانون الاول 2014 . تضمنت الدراسة 70 مريضا و10 اصحاء ظاهريا من كلا الجنسين بمعدل عمر من 24 الى 57 سنة.جمعت عينات المرضى من وحدة الفايروسات بوساطة متخصصين الذين شخصوا الحالات المرضية .تضمنت المعلومات الديمغرافية العمر,الجنس والعنوان. اظهرت نتائج الدراسة الحالية معدل العمر ± الانحراف المعياري7.14±41)) سنة في المرضى(من 24 - 57 سنة) كما اظهرت النتائج ان(2.9%) من المرضى كانوا ضمن الفئة العمرية (21 - 30 سنة) ,وكانت نسبة الفئة العمرية (31 - 40 سنة ) هي (40%),و نسبة الفئة العمرية (41 - 50 سنة ) هي(44.3%)والفئة العمرية (51 - 60 سنة ) هي (. (12.8%علاوة على ذلك ان ما مجموعه ((74610 من متبرعي الدم العراقيين تتراوح اعمارهم من 18 - 60 سنة عرضوا لاكتشاف الاصابة بمرض السفلس ,وان ما مجموعه(769) من المصابين بالمرضوكان عدد المصابين من الذكور( (753بنسبة(97.9%) وكان عدد الاناث هو16 بنسبة(2.1%) .من ناحية اخرى تم اختيار 70 مصاب من المجموع الكلي للمصابين (769) وتم فحصهم ضمن بعض المؤشرات المناعية واظهرت النتائج ازدياد مستوى IL - 2 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وكانت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±64.9941.92 pg/ml و39.69 ±52.94pg/ml على التواليولم يلاحظ وجود فروق معنية احصائية بين كلا المجموعتين. فضلا عن ذلك ازداد مستوى IL - 10 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وبلغت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±559.101804.20pg/ml و±377.47252.36pg/ml على التوالى.بينما كان مستوى IFN - γ اقل في المرضى وكان المعدل ± الانحراف المعياري 239.35 ±201.38pg/ml عن المستوي في مجموعة السيطرة الذي بلغ 248.51±291.49pg/ml .فضلا عن ذلك كان مستوى IgG في كلا المجموعتين (المرضى والسيطرة ) عاليا , بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمجموعة المرضى825.66±287.18pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 638.28±242.41pg/ml لذلك لا يوجد فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين = P value)0.166( كذلك بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى IgM في مجموعة المرضى 121.01±70.57pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 50.96±21.61453pg/ml مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين(P value=0.031). بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى C3 في مجموعة المرضى±112.22pg/ml 26.34 بينما كانت ±147.7617.41pg/ml لمجموعة السيطرة. وهذا يعني وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.004). اخيرا وصلت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى 4Cفيمجموعة المرضى ± 22.7622.76pg/ml بينما كانت في مجموعة السيطرة±34.412.15pg/ml .مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.005). | Syphilis is a sexually transmitted disease (STD) created by the Treponema pallidumand characterized as acquired or congenital.This study was conducted in National Blood Transfusion Center in Baghdad as crosswise over area study incorporating patients going to in the period from 1 August to 31 December 2014. The study included 70 patients and 10 apparently healthy individuals from both sex withage range from 24 to 57 years oldas control group.The specimens of patients were gathered in virology unit by virologists who conclusion the cases. The demographic data incorporates age, sex and location. The results of present study showed thatmean of age ±SD of patients was 41±7.14 years (from 24 - 57 years ) , also theresults showed (2.9%) of patients were from (21 - 30 years), (40%) of patients were from (31 - 40 years), (44.3%) of patients were from (41 - 50 years), (12.8%) of patients were from (51 - 60 years).Furthermore,a total of 74610 Iraqi blood donors, aged from 18 - 60 years were discovered to have been screened for syphilis, a total of 769 Infected syphilis there were the number of males were753 (97.9%) and females were16 (2.1%).On another hand 70 syphilis patients were selected from total infected patients ( 769) and was examined to some immunological parameters and the results showed that the level of IL - 2 higher in patients group than that of control group.Themean ±SD was 64.99±41.92pg/mland 52.94±39.69 pg/ml respectively withoutnoticing any significant statistical difference was between both groups. Additionallythe level of IL10 was higher in patients group than that of control group,the mean ±SD were559.10±1804.20 pg/ml while in control were 377.47±252.36 pg/ml.Whereas, the level of IFN - γ was lowerin patients, the mean ±SD were201.38 ±239.35pg/ml than thatin controlWhich were 291.49 ±248.51pg/ml. Furthermore, the level of IgG in both patients and controlwas almost more thanthe mean ±SDfor patients were 825.66±287.18 mg/dl and in controls they were 638.28±242.41 mg/dl. Therefore, there was no significant statistical difference between both groups (P value =0.166). Also , themean ±SD for the level of IgM in patients, were121.01±70.57mg/dl whereas in controls theywere 50.96±21.61453mg/dl.This means that there is a significant statistical difference between both groups (P value =0.031).For the level of C3 in patients ,the mean ±SDwere112.22±26.34mg/dl while in controls they were 147.76±17.41mg/dl. This indicates that there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.004).Finally, the mean ±SD the for level of C4 in patients were 22.76± 8.44mg/dl while in control they were 34.4±12.15mg/dl. Therefore there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.005).

مقارنة وراثية وبكتريولوجية بين Staphylococcus spp. وStreptococcus spp. المقاومة لمضادات الــ Macrolide والمعزولة من اصابات سريرية مختلفة == Genetic and Bacteriological Comparative between Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. resistance to Macrolide , isolated from different clinical infections

Author name: سيف علي محمد الحيالي
Supervisor name: هادي رحمن رشيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: جمعت 200 عينة من مصادرمتنوعة شملت ( الادرار، والدم ، ومسحات الاذن الوسطى ، والقشع ، والجروح ، والبلعوم ، ومسحات مهبلية ) من مستشفيات ( بعقوبة العام ، البتول للولادة ، وبلدروز العام ) بالاضافة الى بعض المراكز الصحية وذلك للفتره من 1/ 9 / 2013 لغاية 1 /1 /2014 ، حيث اظهرت 75 عينة وبنسبة (37.5%) نموا سالبا للزرع البكتيري و125 عينة (62.5%) نموا موجبا للزرع البكتيري . تم الحصول على 40 عزلة تعود للجنسين Staphylococcus spp. وStreptococcus spp . اذ شخصت العزلات باستخدام الاختبارات الزرعية , والمجهرية , والكيموحياتية فضلا عن الفحص التاكيدي للعزلات باستخدام نظام api 20 staph and strep . وصلت نسبة Staphylococcus المعزولة من الدم الى 33.3% ومن الادرار 12.6% ومن البلعوم 36% ، ومن الاذن الوسطى 13.8% ، ومن الجروح 18.7% ، اما نسبة Streptococcus المعزولة من البلعوم فكانت نسبتها 30.7% ، ومن القشع 11.7% ، ومن الجروح 6.2% . تم اختبار حساسية جميع العزلات لبعض مضادات الـــ Macrolide الشائعة الاستخدام بالاضافة الى مضاد الكلندامايسين العائد لعائلة الــ Lincosamides ، اظهرت النتائج ان مقاومة S. aureus للارثرومايسين وصلت الى نسبة 50% ، وللازيثرومايسين بنسبة 45% ، وللكلندمايسين بنسبة 25% . اما S. epidermidis فقد كانت النسب كالتالي 66.6% للارثرومايسين و44.4% للازيثرومايسين ، و11.11% للكلندامايسين . اما بالنسبة للجنس S.pyogenes فكانت نسب المقاومة كالتالي 25.5% للارثرومايسين ، و25.5% للازيثرومايسين ، و14.5% للكلندامايسين . تم تحديد التركيز المثبط الادنى لمضاد الارثرومايسين للعزلات قيد الدراسة والتي اظهرت مقاومة تجاه هذا المضاد في فحص الحساسية بطريقة الاقراص (المقاومة) حيث تراوحت قيم MIC للعزلات بين (<64 - 32) مايكروغرام / مل . تم التحري عن قابلية عزلات Staphylococcus spp . و. Streptococcus spp على انتاج بعض عوامل الضراوة وقد اظهرت النتائج ان تلك العزلات كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والذيفانات التي تسهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، واللايبيز ، واليوريز، والانزيم المحلل للدنا ، والستافيلوكاينيز ، والستربتوكاينيز وكذلك اظهرت هذه العزلات قدرتها على انتاج اربعة انواع من الهيمولايسين (الفا ، بيتا ، كاما ، ودلتا). كما وتم التحري عن قابلية العزلات على انتاج الطبقة اللزجة Slime layer باستخدام طريقة اكار احمر الكونغـو وقد بينت النتائج ان كلا الجنسين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة فقد اظهرت النتائج ان (65% ) من عزلات بكتريا S. aureus منتجة للطبقة اللزجة بينما كانت جميع عزلات S.epidermidis وبنسبة %100 منتجة للطبقة اللزجة ، بينما اظهرت 75% من عزلات S.pyogens قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة . اجريت عملية استخلاص للدنا الكلي البكتيري لـ ( 12 ) عزلة ثم اجري تفاعل البلمرة المتسلسل PCR لعزلات Staphylococcus spp. وStreptococcuss spp. المقاومة للـ Mcrolide وذات MIC اكثر من64 مايكروغرام/ مل والموجبة النمو على الوسط المعلم بالارثرومايسين من خلال استعمال البوادىء المتخصصة التي تستهدف التسلسل النوعي للجين erm A وmef A ، رحلت نواتج التضاعف على هلام الاكاروز بتركيز 1% ولوحظ ظهور حزمة واحدة في جميع المسارات في الهلام بالمستوى نفسه بالنسبة للجينين . اظهرت النتائج ان نسبة وجود الجين erm A في عزلات S. aureus وصل الى 80% وفي عزلات S.epidermidis 30% ، وفي عزلات S.pyogens وصلت النسبة الى 50% ، اما بالنسبة للجين mef A فكانت نسبة توافره في عزلات S. aureus 20% ، وفي عزلات S.epidermidis 40% ، وفي عزلات S.pyogens 50% . | Collected 200 samples from different clinical sources included (Urine , blood , middle ear , sputum, throat , wounds , and vaginal swabs) from hospitals (Baquba teaching hospital , AL - Batool hospital and Balad Ruz teaching hospital) in addition to some health centers for the period from 1 / 9 / 2013 until 01 / 01 / 2014. As demonstrated 75 samples 37.5% were negative growth for bacterial culture and 125 62.5% positive growth of bacterial culture . 40 isolates belonging were obtained to both genus Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. These isolated were diagnosed by using cultural tests , microscopic, and biochemical characteristics as well as a confirmatory test for the isolates using the api 20 staph & strep system . The percentage of Staphylococcus isolated from the blood is 33.3% the urine 12.6% the throat 36% , middle ear 13.8% , and the wounds 18.7%, while the percentage of Streptococcus isolated from the throat was represented 30.7% , the sputum 11.7% , and the wonds 6.2%. Antibiotic susceptibility testing was performed on all isolates against some of the commonly used Macrolide members in addition to the clindamycin return to the lincosamides family using the disk diffusion method , the results showed that the resistance of S. aureus to erythromycin reached to 50% , for azithromycin 45% , and for clindamycin is 25% . The S. epidermidis ratios were as follows 66.6% for erythromycin 44.4% for azithromycin , and 11.11% of the clindamycin ، while the resistant of S.pyogens were as follows 12.5% of erythromycin , 12.5% of the azithromycin , and 14.5% of the clindamycin . The minimum inhibitory concentration MIC for erythomycin of isolates under study which showed resistance to the antibiotic sensitivity test in a Disk diffusion method where ranged between <33 - 64 µg / mL . investigated the ability of Staphylococcus spp. and Streptococcus spp on the production of some of the virulence factors . The results showed that these isolates were productive for several types of enzymes and toxins that contribute usually in pathogenicity. One of these enzymes , protease enzyme , lipase enzyme , urease enzyme , Dnase enzyme , Staphylokinase enzyme , and Streptokinase enzyme and also showed these isolates ability to produce Four types of Heamolysin (alpha , beta , gamma , and Delta) . It also has been investigating the susceptibility of isolates to produce a Slime layer using the Congo red agar ( CRA) ، The results showed that both genus have the ability to produce slime layer and Biofilm formation , the results showed that 65% of the S. aureus producing Slime layer while all S.epidermidis isolates produced the slime layer , while showed 75% of the isolates S.pyogens ability to produce Slime layer. Conducted the process of total DNA extraction to 12 isolates under study that resist Macrolide members . polymerase chain reaction (PCR) was done for isolates of the bacterium Staphylococcus and S.pyogens resistance of Mcrolide and with MIC more than 64 micrograms / ml by using specialized primers targeting sequence specific gene erm A and mef A , deported outputs doubling the agarose gel concentration 1% and observed the emergence of a single package in all the tracks in the gel at the same level for the genes . The results showed that the percent of the presence of erm A gene in isolates of S. aureus arrived 80% and in isolates S.epidermidis 30% , and in isolates S.pyogens got to 50% , while for mef A gene the presence in isolates of S. aureus was 20% , in isolates S.epidermidis 40% , and in isolates S.pyogens 50% .

تقدير البعد الوراثي لبعض اصناف نخيل التمر Phoenix dactylifera L. المزروعة في العراق باستعمال تقانة RAPD == Estimation of the Genetic Distance for Some Date Palm Varieties ( Phoenix dactylifera L.) Grown in Iraq using a RAPD Technique

Author name: مهند رشيد حسين الزيدي
Supervisor name: شذى عايد يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: This study was conducted at Molecular Biology lab, Genetic Engineering Department, Agricultural Research Directorate, Ministry of Science & Technology to estimate fingerprint and genetic relationship among 9 Iraqi varieties of date palm Phoenix dactylifera L. namely Asabee AL - aroose, Zahdi, Sukari, Saada, Ashrasy, Barben, Shetwi, Khistawi and Nhair Al Saly. 20 primers were used to PCR amplify characteristic Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) marker fragments. Total genomic DNA was isolated from varieties fresh leaves, the average yields of DNA were in the range of 100 - 522.5 ng/ul with purity ranged between 1.66 to 1.92. Polymerase Chain Reaction (PCR) experiments were performed to detect DNA polymorphisms amplified fragments in each cultivar (their numbers and molecular weight sizes) on agarose gel electrophoresis stained by ethidium bromide. Results of RAPD experiments revealed differences in band numbers and molecular weight sizes, all tested primers yielded 157 polymorphic bands and the lowest polymorphic band numbers (5 bands) were with primers OPA - 01 and OPA - 20 while the largest number of polymorphic (12 bands) were with primers OPA - 08 and OPH - 09. RAPD analysis showed that many primers gave unique band in all samples made possible fingerprint identification of each cultivar, Ashrasy variety gave highest 6 unique polymorphic bands with primers OPA - 08, OPC - 04, OPF - 05 and OPF - 12, while Zahdy variety gave 1 unique polymorphic band (385 pb) with primer OPB - 05. Data was analyzed by using statistical program SPSS to find similarity and genetic relationship among cultivars, similarity index ranged between 0.291 and 0.511 and the biggest percentage of similarity was between Saada and Shetwi. Dendogram analysis has separated varieties into two main groups, the first main group consists of three sub - cluster or sub - group, the first sub - cluster contained Saada and Shetwi varieties while the second sub - cluster included Zahdi, Ashrasy and Nhair Al Saly and the third sub - cluster consisted Asabee Aroose cultivar. The second main group was divided into two sub - group, the first sub - group consisted of Berben and Khistawi while the second sub - group included Sukary.

تاثير الرش بالبرولين والارجنين في نمو وحاصل الباذنجان في الزراعة المحمية == Effect of Spraying Proline and Arginine in the Growth and Yield of Egg Plant in Protected culture

Author name: زينب نبيل ابراهيم
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:

تاثير مواعيد الزراعة والاصناف في نمو وحاصل زهرة الشمس (Helianthus annuus L.) == The effect of difference genotype and planting date in growth and production of (Helianthus annuus L .

Author name: هديل احمد مهدي الساعدي
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: نفذت التجربة في مشتل مديرية زراعة ديالى - بلدروز في الموسم الربيعي لعام ( 2014 ) لدراسة تاثير اربعة مواعيد زراعة 1/2 و15/2 و1/3 و15/3 على صفات النمو والحاصل ومكوناته والصفات النوعية لثلاثة اصناف من نبات زهرة الشمس الصنف فلامي , يوروفلور , زهرة العراق . تم استعمال القطع المنشقة Split Plot بتصميم القطاعات العشوائية الكاملة R.C.B.D بثلاثة مكررات حيث تضمنت مواعيد الزراعة المعاملات الرئيسية الاصناف المعاملات الثانوية ويمكن تلخيص النتائج كالاتي : - 1 - اظهرت مواعيد الزراعة تاثيرات معنوية في صفات النمو والحاصل والنوعية . اذ تفوق الموعدين الثاني والثالث في جميع صفات النمو كما تفوق الموعد الثاني في جميع مكونات الحاصل ونسبة الزيت وحاصله.2 - اظهرت الاصناف اختلافات معنوية فيما بينها في بعض صفات النمو ومكونات الحاصل والنوعية . اذ تفوق الصنف زهرة العراق فــــي المساحة الورقية وعدد الاوراق / نبات . وتفوق الصنفين زهرة العراق يوروفلور في النسبة المئوية للاخصاب ، وتفوق الصنفين يوروفلور وفلامي في قطر الساق تفوق الصنفين زهرة العراق ويوروفلور في نسبة الاخصاب المئوية وتفوق الصنفين يوروفلور وفلامي في وزن 1000 بذرة وحاصل النبات ونسبة وحاصل الزيت .3 - كان تاثير تداخل مواعيد الزراعة والاصناف معنويا في بعض صفات النمو والحاصل والنوعية ، حيث اعطى الصنف زهرة العراق في الموعد الثاني اعلى متوسط في ارتفاع النبات . واعطى اعلى متوسط في ارتفاع النبات والمساحة الورقية ودليل الكلوروفيل . واعطى الصنف يوروفلور اعلى متوسط في الوزن الرطب والجاف في القرص الزهري وقطر الساق وقطر القرص والنسبة المئوية للاخصاب وعدد البذور ووزن 1000 بذرة وحاصل النبات وحاصل البذور والنسبة المئوية للزيت وحاصل الزيت | This experiment was conducted in Baladrus plant nursery in spring (2014) to stady effect of four sowing dates ( 1/2 , 15/2 , 1/3 and 15/3 ) on plant yield and its component and the second factor was sunflower varieties ( Flamy , Eourflor , sun flower ) in a split plot desing in R.C.B.D with three repilication the sawing date have the main plots varieties in the sub - plots and the result summarized in : 1 - the sowing date show a signifieaht effects in some of growth yied and quality characters . the second and third date exceeded the others in plant height leaves number in plant but the second dates exceeded others in fertilization percentage and leaves seed number in disc .2 - varieties show significant differences in growth yield and its components and quality sun flower exceeded others in leave area . but Eourflor and Flamy gave increase in stem diameter . sunflower and Eourflor gave in higer fertilization percentage Eourflor and sunflower exceeded others in 1000 seed weight plant yield and Oil yield .3 - Interaction between sowing dates with varieties gave signnificantly result in growth yield and yield quality sunflower gave high means in the second and third dates in plant height and leave area and chrorophyll index in the second date Flamy gave the highest means in leave area in the third date Eourflor gave the highest means in stem diameret wet and dry weight for the flower disc in the second date Eouroflor and Flamy exceeded others in all of yield components yield and Oil percentage in the second date .

دور بروتين A المستخلص من جدران خلايا Staphylococcus aureus في امراضية البكتريا == Role of Staphylococcus aureus cell wall protein A in the pathogenesis of the bacteria

Author name: سمير عبد الامير عبد علي علـش
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح | علي عبد الرحمن طه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ا عتمد في اجراء هذه الدراسة على 20 عزلة مرضية من بكتريا Staphylococcus aureus ا خذت من مختبر الصحة المركزي مشخصة باستعمال نظام ابي للعنقوديات (API - Staph . Ident . System) . ا عيد تشخيص جميع العزلات عن طريق استخدام الاختبارات الكيموحيويه من اجل التثبت بشكل دقيق من هويتها ، وقد جاءت العزلات جميعها متوافقة مع تشخيص مختبر الصحة المركزي . ا ستخدم اختبار التلازن الدموي ( (Haemagglutination test في التحري عن وجود بروتين A في عزلات S . aureus المشخصة جميعا ، وقد اظهر هذا الاختبار تباينا ملحوظا في نسبة امتلاك هذه العزلات لبروتين A . فقد برزت العزلات ذوات الارقام 1 ، و5 ، و6 ، و7 ، و9 بوصفها عزلات ذات محتوى عال من بروتين A . اما العزلات ذوات الارقام 8 ، و10 ، و11، و12، و13، و14 ، و15، و17، و18، و19 ، و20 ظهرت انها ذات محتوى متوسط من بروتين A . فقط العزلة ذات الرقم 16 ظهرت انها فقيرة المحتوى من بروتين A . بينما كشف ووفق الاختبار المستعمل عدم امتلاك العزلات 2، و3 ، و4 اي محتوى من بروتين A . ا نتخبت العزلة رقم ( 1 ) كعزلة مثالية من اجل انجاز هذه الدراسة لكونها تميزت بمحتوى عال من بروتين A فضلا عن انها تقدمت على بقية العزلات في اعطاء النتيجة الموجبة لاختبار انتاج انزيم Coagulase ، وكذلك في اظهار تحللا كاملا وشديدا في اختبار انتاج حالة الدم Hemolysin . ا ستخلص بروتين A الخام (Crude protein A) على مرحلتين . كانت المرحلة الاولى باتباع طريقة (Lind , (1974 ( طريقة التعليق بالصوديوم ازايد ) بوصفها طريقة سهلة وغير مكلفة في الحصول على مستخلص بروتين A المرتبط بجدار الخلية العنقودية للعزلة رقم ( 1 ) (Cell - bound protein A) بشكل كامل مع الحفاظ وبدرجة عالية على وحدة التركيب البنائي لبروتين A من اية تشوهات . اما المرحلة الثانية كانت باتباع طريقة ( Seki et al .,( 1985 طريقة مكملة للطريقة الاولى وذلك بترسيب بروتين A الطافي بكبريتات الامونيوم ( 85 % اشباع ) مع بقاء بروتين A المترسب محتفظا بفعاليته . ا دخل مستخلص بروتين A الخام عملية التنقية ( Purification) وهي كذلك كانت على مرحلتين . المرحله الاولى استخدمت فيها طريقة كروماتوغرافيا التبادل الايوني (Ion - exchange chromatography) بعمود ( DEAE - Cellulose ). اما المرحلة الاخرى فقد تضمنت استخدام طريقة كروماتوغرافيا الترشيح بالهلام (Gel - filtration chromatography) بعمود Sepharose CL - 6B) ) . انتهى استخدام الطريقتين في الحصول على مستخلص بروتين A منقى ( Purified protein A ) .ومن اجل التحري عن احتفاظ مستخلص بروتين A الخام والمنقى بفعاليته استخدم اختبار الانتشار المناعي الثنائي في الهلام الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون الخطوط الترسيبية التي نتجت من تفاعل مستخلص بروتين A الخام والمنقى مع IgG لمصل دم خنزير غينيا .قدر تركيز مستخلصات بروتين A ( الخام والمنقى جزئيا والمنقى ) باتباع طريقةBradford, ( 1976 ) . حيث بلغت التراكيز 63 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A الخام ، و42 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى جزئيا ، و36 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى .تم استخدام الفئران البيض من نوع ( Balb C ) من اجل الوصول الى التاثيرات المرضية لمستخلص بروتين A المنقى . حيث حقن المستخلص بطريقة الحقن داخل البريتون Intraperitonial injection)) بعدد سبع حقنات ، وبمعدل 0.1 مليلتر لكل حقنة ( ذو التركيز 36 مايكروغرام / مليلتر ) ، يفصل بين حقنة واخرى يوم واحد . اظهرت مجموعة فئران البحث المحقونة ببروتين A المنقى على المستوى السريري خمولا عاما بدا واضحا بعد الحقنة السادسة . لم تظهر اية تغيرات مظهرية جلدية في مناطق الحقن كما لم تحدث وفيات . بعد قتل الفئران وتشريحها جميعا ا ستاصلت اعضاء القلب ، والطحال ، والكبد ، والكليتين ، والامعاء ، والمعدة ، واخيرا الرئة . وبالموازنة مع اعضاء فئران السيطرة لوحظ حدوث تضخم كبير في الطحال . كما اظهر الكبد تضخما ملحوظا وهذا سجل في الفئران المحقونة ببروتين A المنقى . لم يسجل حدوث تغيرات على المستوى المظهري في اعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة ولكن لوحظ وجود بقع سوداء اللون على السطح الخارجي لنسيج الكبد ، والكليتين ، وهو ايضا سجل في فئران الدراسة اجمع .اهم ما برز في هذه الدراسة هو حجم التاثير المرضي الذي اصاب عضو الرئة حيث ظهر بشكل غريب فقد بدا النسيج يميل الى السواد ببهوت وهو ما كان واضحا في سبعة من فئران الحقن ، اما الثلاثة الباقية شوهدت الرئة فيها خلال التشريح وهي مغطاة بعض من اجزائها بالدم .كشف الفحص النسيجي لاعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة عدم وجود اية تاثيرات مرضية ناتجة من حقن بروتين A المنقى . اما الطحال فقد شهد حدوث توسع كبير في منطقة اللب الابيض White Pulp)) مع احتقان دموي بارز وانتشار للخلايا المولدة للصفيحات الدموية (Megacaryocytes) . اما الكبد فقد برز فيه حدوث تلف بسيط (Mild degenerative change) في خلايا الكبد مع ارتشاح خلايا احادية النواة (Monocytes) خصوصا في المنطقة البوابية التي بدت متوسعة نوعا ما . كما لوحظ زيادة في خلايا كبفر ((Kupffer cells في عموم نسيج الكبد . الكليتين شهدت بروز زيادة في الخلايا المكونة للكبيبة الكلوية ( Glomeruli) والتي يطلق عليها ( Mesengial cells ) .عضو الرئة تضمن الفحص النسيجي له تاثيرات عدة وهي كما يلي : 1 - احتقانات دموية كبيرة ( Bloody congestions ) .2 - وذمة ( Oedema ) .3 - ارتشاح خلايا التهابية ( Inflammatory cells infiltration) .4 - توسع في الفسح القصبية ( Alveolar spaces) مكونا ما يسمى بظاهرة Emphysema)) اي انتفاخ حويصلات الرئة . بدت الرئة للفئران المحقونة جميعا ببروتين A المنقى اكثر الاعضاء التي اظهرت تضررا نسيجيا كبيرا موازنة بالضرر في بقية الاعضاء .تم اجراء اختبار التحري عن السمية الخلوية لبروتين A المنقى باستخدام تقنية مزرعة الخطوط الخلوية الطبيعية ( Normal cell lines - culture ) حيث اعطى الاختبار نتيجة سالبة اي عدم امتلاك بروتين A المنقى تاثيرا سميا (Toxic effect) في الخلايا النامية . | This study dealt with ( 20 ) diagnosed isolates of Staphylococcus aureus by "API - Staph . Ident . System". which were taken from the central health laboratory . The diagnosis was repeated so as to confirm the identity of those isolates by using biochemical tests whose results were the same as those of the central health laboratory .The haemagglutination test was used to investigate the presence of protein ( A ) in all S . aureus isolates . The results markedly showed differences in content concerning the ratio of this protein , thus isolates numbered 1 , 5 , 6 , 7 and 9 gave high content of protein ( A ) , but the isolates numbered 8 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 17 , 18 , 19 and 20 gave medium content of protein ( A ) . Isolate numbered 16 was the only isolate that has low content of protein ( A ) . On the other hand , isolates numbered 2 , 3 and 4 gave no content of protein ( A) .The isolate number ( 1 )has been chosen as an optimal isolate to accomplish this study , Because of its high content of protein ( A ) , furthermore it was the best isolate in getting positive result concerning the test of coagulase production , and in giving a complete and intensive result concerning the test of hemolysin production . Crude protein ( A ) was extracted by two steps : Lind method ( Lind , 1974 . ) "Suspending in sodium azide" was followed at the first step as an easy and a cheap method in getting a thorough cell - bound protein ( A ) extracted from the isolate number ( 1 ) with high preservation of the structural unit without any deformation .The Seki et al .,( 1985 ) method was followed in the second step as a completion method to the first one , by the precipitate of the supernatant protein ( A ) using ammonium sulfate ( 85 % saturation ) . The function of precipitated protein ( A ) was perfect . In order to get a purified protein ( A ) extract from crude protein A , purification was accomplished by two steps : Ion - exchange chromatography by DEAE - cellulose column was used in the first step , While Gel - filtration chromatography by Sepharose CL - 6B column was used in the second step . Double immunodiffusion in gel was used to investigate the preservation of the crude and purified protein ( A ) with its full function . This test gave a positive result by forming the precipitate lines as a result of the interaction between protein ( A ) ( Crude and Purified ) and IgG of guinea pig sera .Bradford method was used to estimate protein ( A ) extracts concentration ( Crude , Partial purified , Purified ) . The estimation was 63 microgram / ml for crude extract , 42 microgram / ml for partial purified extract and 36 microgram / ml for purified extract .white mice ( Balb C ) were used to investigate the pathogenic effects of purified protein ( A ) . Intraperitonial injection method was used to inject 0.1 ml of 36 microgram / ml of purified protein ( A ) for 7 times with a one - day separating period . The injected mice with purified protein ( A ) showed general weakness which was very clear after the sixth injection . there were no phenotypic dermal change in the injection area , and no dead mice as well .After killing and dissecting of all the mice , the organs of heart , spleen , liver , kidney , intestine , stomach and lung were eradicated . There were a great enlargement in spleen and a little in liver in all injected mice in comparison with the control mice . No phenotypic changes appeared in heart , intestine and stomach , but black spots were shown on the outer surface of kidney and liver tissue which were presented in all the injected mice . The most important results in this study is the great size of pathogenic effects in lung . The shape of its tissue seemed strange and tended to be faint black with which was obvious in seven mice . The lung of the three others ( some parts ) showed during anatomy covered by blood .The histological check for heart , intestine and stomach showed no pathogenic effects resulted from protein ( A ) injection . In the spleen , there was a huge expanding in the white pulp region , with blood congestion while the spreading of megacaryocytes has increased . The liver showed mild degenerative change in liver cells with monocytes infiltration especially in the entrance region which appeared expanded . Also there was an increase in kupffer cells in all liver tissue .Kidney showed increase in mesengial cells which are concedered the forming units of glomeruli .The histological check of lung included the following : 1 - Bloody congestions .2 - Oedema .3 - Inflammatory cells infiltration .4 - Alveolar spaces expanding forming '' Emphysema '' .The lung was the most effected organ that showed tissue injury among other all organs . The normal cell lines - culture technique was followed to investigate cellular toxicity of the purified protein ( A ) which gave a negative result , that means , there was no toxic effect of purified protein ( A ) on the growth cells .

التاثير الاليلوباثي لنباتي الفلفل والباذنجان ومستويات الرطوبة في نمو نوعين من الحنطة == Allelopathic effect of pepper, eggplant and moisture levels on growth for two wheat species

Author name: ايمان طه ياسين سلطان السبيع
Supervisor name: صلاح محمد سعيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Al Mosul - College Of Science
Language: Arabic
University location: Mosul
Key words:
  • الجهد الاليلوباثي,
  • مستويات الرطوبة
  • الحنطة
  • الفلفل
  • الباذنجان
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية للمجموع الخضري لنباتي الفلفل pepper(Capsicum frutescens L) والباذنجانEggplant(Solanum melongena L.) وبالتراكيز %(9,6,3,0) في انبات ونمو نوعين من الحنطة (اباء - 99) و(ام الربيع)؛ فضلا عن دراسة مستخلصات الترب تحت نباتي الفلفل والباذنجان .اظهرت النتائج المختبرية بان المستخلصات المائية للمجموع الخضري سببت اختزال معنوي في النسبة المئوية لانبات البذور, حيث كلمزااد التركيز انخفضت نسبة الانبات اذ بلغت اقل نسبة انبات بتاثير المستخلص المائي للمجموع الخضري لنبات الباذنجان 75.68)%) قياسا بمعاملة المقارنة (الماء المقطر), وتفوق النوع اباء - 99 تفوقا معنويا على النوع ام الربيع.اما في نمو البادرات المتمثل بطول الرويشة والجذير ووزنهما الجاف؛ فقد لوحظ من النتائج حصول تثبيط لتاثير المستخلصات المائية للمجموع الخضري والترب قياسا بمعاملة المقارنة مع ملاحظة انه كلمزااد التركيز للمستخلصات المائية ازداد التثبيط, وان مستخلص نبات الباذنجان كان اكثر تاثيرا في اغلب المعاملات, اذ حصلت اعلى نسبة اختزال في طول الرويشة وطول الجذير والوزن الجاف لهما عند التركيز 9% من المستخلص المائي للمجموع الخضري لنبات الباذنجان .اما تاثير مستخلصات الترب؛ فقد حصل تثبيط قياسا بمعاملة المقارنة(مستخلص التربة غير المزروعة) في اغلب الصفات المدروسة. اما تجربة البيت الزجاجي؛ فقد كانت تجربة عامليه بالتصميم العشوائي الكامل (R.C.B.D.) وبواقع (48) معاملة وفي اربعة مكررات, واستخدم المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان وبالنسب %(9,6,3,0) وزن : وزن وتحت ثلاثة مستويات من السعة الحقلية %(100,75,50) لمعرفة تاثيرها في الانبات وبعض صفات النمو والحاصل ومكوناته للنوعين من الحنطة؛ فضلا عن تاثيرها في تركيز العناصر الغذائية, واجريت تجربة اخرى لمعرفة تاثير الترب تحت نباتي الفلفل والباذنجان وبثلاث مستويات من الرطوبة%(100,75,50) وبواقع (18) معاملة وفي اربعة مكررات,وتم التوصل الى النتائج التالية : 1. صفات النمو : اظهرت النتائج انه في حالة اضافة المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان وبالتراكيز%(9,6,3) كان له تاثير تثبيطي اذ تفوقت معاملة المقارنة (تربة بدون مخلفات) في صفة نسبة الانبات, ارتفاع النبات, مساحة ورقة العلم ومحتوى الكلوروفيل الكلي للاوراق في حين تفوق المستوى الرطوبي 100% في صفة ارتفاع النبات, مساحة ورقة العلم ومحتوى الكلوروفيل الكلي قياسا الى مستوى الرطوبة %(75,50), وعن تاثير انواع الترب المزروعة؛ فقد تفوقت معاملة المقارنة على بقية المعاملات في اغلب الصفات المدروسة.2. الحاصل ومكوناته : اذ حصل اختزال في الحاصل ومكوناته (طول السنبلة, حاصل الحبوب والحاصل البايولوجي) نتيجة اضافة المجموع الخضري للنباتات قياسا بمعاملة المقارنة. اما بالنسبة لتاثير الترب المزروعة؛ فقد حصل فيها تثبيط قياسا بمعاملة المقارنة.3. تركيز العناصر : ان اضافة المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان الى التربة وتحت الثلاث مستويات من الرطوبة كان له تاثيرا سلبيا على تركيز بعض العناصر في المجموع الخضري لنباتات الحنطة, فقد كانت اعلى نسبة تثبيط لعنصري الفسفور والبوتاسيوم عند التركيز 9%ومستوى رطوبة50%؛ اما بالنسبة لعنصر النتروجين؛ فنلاحظ حصول انخفاض مع زيادة مستويات رطوبة التربة .4. نوع الحنطة : اظهر نوع الحنطة اباء - 99 تفوقا معنويا على النوع ام الربيع في اغلب الصفات المدروسة. | The current study was conducted to investigate the effect of aqueous extract of pepper (Capsicum frutescens L.)and eggplant (Solanum melongena L.(shoots with concentration of (9,6,3,0)% on the growth of two types of wheat, (Iba - 99) and (Om Al - Rabee'), and to investigate soil extracts beneath the pepper and eggplants.Results of the current study showed that aqueous extracts of shoots caused a significant decrease in the seed percentage; where in the growth rate decreased with higher concentrations. It was shown that the lowest percentage effect by aqueous extracts of eggplants shoot amounted to (75.68%) compared with the control tretment, with Iba - 99 being significantly higher than Om Al - Rabee'.As for growth of roots and dry weight, an inhibition in the effect of the aqueous extracts of shoots and soil as compared with the control treatment was noticed. It was also shown that inhibition increased with the increase of concentration of the aqueous extracts, with eggplants having the most effect in most treatments, as well as inducing higher rate of inhibition in leaf length, root length and dry weight at concentration of 9%.Soil extract incurred an inhibition as compared with the control treatment (unplanted soil extracts)in most studied characteristics.Complete Random Design (R. C.B.D.) was used in the Glasshouse experiment, with (48) treatments and four r replications. Pepper and eggplant shoots were used with percentages of (9,6,3,0%) weight : weight under three levels of field capacity (50, 75, 100%) to determine the effect on germination, several growth characteristics and product characteristics for both wheat types. During the course of the study,and other experiment was conducted to know the effect of pepper and eggplant soil under three levels of moisture with four replications ((18) treatments combination) the following results were reached : 1 - Growth Characteristics : results show that when adding plant shoots with concentration of (9,6,3) an inhibitory effect occurred, with the control treatment (non - waste soil) being dominant in germination percentage, plant height, leaf area, and total chlorophyll content of leaves, while humidity level 100% had the most effect on plant height, leaf area, and total chlorophyll content of leaves as compared with humidity rate of (50, 75%). As for effect of planted soils, the control treatment had the dominant effect over other treatments.2 - yield components : an inhibition in the yield quantity occurred (spike length, seed yielde and biologicalyield) as a result to adding plant shoots, while inhibitory effect occurred in planted soils as compared with the control treatment.3 - Concentration of Elements : Addition of plant shoots and level of humidity significantly affected concentration of elements in the soil. Phosphorus and potassium had the highest inhibition at concentration of 9% and humidity level of 50%. Nitrogen concentration decreased with the rise of soil humidity.4 - Wheat Type : Wheat type Iba - 99 was significantly dominant over wheat type Om Al - Rabee' in most studied characters.

المستارجات الشائعة المسببة للارجية في مدينة بعقوبة ودورها في الحماية من الاصابة بالطفيليات المعوية == The common allergen causing allergy in Baquba city and its protective role against intestinal parasites infections

Author name: اميرة فاضل احمد النعيمـــي
Supervisor name: نبيل عبد القادر مولود | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Diyala - Faculty Of Education
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية بهدف الكشف عن المستارجات الاكثر اثارة للارجية في محافظة ديالى، وعن الدور الذي قد يوفره الضد I g E الكلي وخلايا الدم الحمضة في الوقاية من الاصابات الطفيلية عند مرضى الارجية. شملت الدراسة، 106 فردا من مرضى الارجية ( 62 مريضا بالربو الارجي و44 مريضا بالتهاب الانف الارجي ) ومن كلا الجنسين ، فضلا عن 64 فردا من الاصحاء ظاهريا اعتمدوا كمجموعة سيطرة، وقد تراوحت الاعمار بين 5 - 50 سنة ± 7.24 . اظهرت نتائج اختبار وخز الجلد باستخدام 19 نوعا من الخلاصات ان اعلى النسب في تفاعلات الجلد الموجبة كانت تجاه المستارجات HDM = Hous dust mite بنسبة 33.92 % ومستارجات Bermuda وM1 ( Alternaria ) وT1 ( Fagaceae ) بنسبة 19.64 % لكل منها عند مرضى الربو، والمستارجات Bermuda وHDM بالنسب 39.39 % و30.30 % من مرضى التهاب الانف الارجي وعلى الترتيب. فيما يتعلق بالعمر والجنس لمرضى الارجية فقد ظهر ان الفئة العمرية 21 - 30 سنة هم الاكثر نسبة في حدوث المرض لكلا المجموعتين اذ سجلت نسبة 27.41% لمرضى الربو و36.36% لمرضى التهاب الانف الارجي، فيما كانت نسبة الذكور 27.77% هم الاعلى في مجموعة الربو الارجي بينما كانت الاناث 37.03% هم الاعلى في مجموعة التهاب الانف الارجي. اظهرت نتائج قياس تركيز I g E الكلي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم ( ELISA ) ان هناك فروقا معنوية ( P< 0.05 ) في مستويات هذا الضد في امصال مرضى الربو الارجي مقارنة بافراد السيطرة ، اذ بلغ المتوسط الحسابي لديهم 429.98± 279.62 وحدة عالمية / مليلتر ومرضى التهاب الانف الارجي 342.60± 242.88 وحدة عالمية / مليلتر مقارنة الاصحاء 104.02± 82.94 وحدة عالمية / مليلتر . اما بشان نسب الخلايا الحمضة فقد وجد ان هناك فروقا معنوية ( P < 0.05 ) بين متوسط نسب هذه الخلايا عند مرضى الارجية ومستوياتها في دماء الاصحاء ، اذ بلغ المتوسط الحسابي لهذه النسب في دماء مرضى الربو الارجي ومرضى التهاب الانف الارجـي 5.15 % ± 3.23 و4.97 % ± 2.73 على التوالي مقارنة بمستوياتها عند الاصحاء 1.93 % ± 1.35. ولالقاء الضوء على دور الضد I g E والخلايا الحمضة في توفير الوقاية ضد الاصابة الطفيلية عند مرضى الارجية ، فقد تم اجراء اختبار للطفيليات المعوية في مجموعتي المرضى والسيطرة، وجد من خلالها ان نسبة الذين كانت لديهم مثل هذه الاصابات من بين مرضى الارجية 1.98 % فقط مقارنة بنسبتها البالغة 25.92 % عند غير المصابين بالارجية في عينة الدراسة . وقد توزعت نسبة هذه الاصابات لدى هؤلاء المرضى على النحو الاتي 0.99 % لكل منova Enterobius vermicularis وegg Ascaris lumbricoides فيما كانت النسب عند غير المصابين بالارجية 11.11 % و5.55 % و3.70 % و1.85 % وللطفيليات trophozoite ova , Entamoeba histolytica E. vermicularisA. lumbricoides egg وAncylostoma duodenale egg , trophozoite Giardia lamblia وبالترتيب . | The current study was conducted in the Dermatology and Allergy unit in the outpatient clinic of Baquba General Hospital for the period from 2006 to 2008 . The aim of the study is to determine the most common allergens in Diyala province and to explare the protective role of total IgE antibody and eosinophile against intestinal parasitic infection .The study include 106 atopic patients; 62 patients with bronchial asthma and 44 patients with allergic rhinitis , of both sexes with mean age 5 - 50 ±7.24years. Additionally ,64 apparently individual were included as control group with mean age 5 - 50 ±7.24 years. Determination of causative allergen was carried out by skin prick test utilizing 19 type of allergen extracts . Assessment of total IgE was done using ELISA technique .Estimation of eosinophil counts and percentage was done through stained blood film . The results reveated that in asthmatic patients the highest skin positivity rate was due to HDM ( 33.9%) followed by Bermuda , Alternaria (M1) and Fagaceae (T1)(19.6%). Whereas in allergic rhinitis patients , the highest skin positivity rate was due to Bermuda and HDM(39.3% and 30.3 %) respectively . The results showed a significant increase in the total IgE concentration in asthmatic patients compared to that of control (429.9 IU/ml vs104 IU/ml); (p= 0.04).Similarly , the total IgE concentration in allergic rhinitis patients was significantly high compared to control ( 342.6 IU/ml Vs 140IU/ml) (P= 0.04 ). Estimation of blood eosinophile revealed that the percentage of these cells was significantly higher in asthmatic and allergic rhinitis patient compared to control (5.1%and 4.9% Vs 1.9%) , the P value were (P=0.03) and (P=0.04) respectively . The results also revealed that the infection rate by intestinal parasites among allergic patients was 1.98%compared to 25.9% in the control group . Among patients , Enterobius vermicularis and Ascaris lumbricoides were detected in 0.99%. However , among healthy individuals , Ascaris lumbricoides , E.vermicularis ova, Entamoeba histolytica trophozoites , Ancylostoma duodenale and Giardia lambilia were detected in 11.1%, 5.5 % , 3.7%, 1.8%respectively .

حدوث الاصابات الفطرية الجلدية بين السكان في مدينة بعقوبة وضواحيها == Occurrence of Cutaneous Mycoses Among The People In Baquba City And Vicinity

Author name: ميساء تقي عبد الحسن الخزعلي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | عبد الرزاق شفيق حسن الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - Faculty Of Education
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: جمـعت نماذج القشطات الجلدية ، الشعر ، والاظافر من (320) مريضا كانوا يظهرون علامات يشتبه سريريا ارتباطها بالفطريات للمدة بين الاول من كانون الاول 2003 ولغاية الحادي والثلاثين من اب 2004 ، وفحصت مختبريا بوساطة الفحص المجهري المباشر باستخدام محلول هيدروكسيد البوتاسيوم (10%) وبواسطة الزرع على وسط اكار السابرويد دكستروز ، لتاكيد الاصابات الفطرية ولتحديد انواع الفطريات المسؤولة عنها.اظهر الفحص المختبري نتائج ايجابية للاصابات الفطرية لدى (248) مريضا ، واعتمادا على المسبب المرضي قسمت تلك الاصابات الفطرية الى ثلاثة مجموعات وتبين ان مجموعة الفطارات الجلدية (Dermatophytoses) هي السائدة (52.4%) وتلتها النخالية المبرقشة (Pityriasis Versicolor) بنسبة (25.8%) ، ثم الاصابات الجلدية بالمبيضات (Cutaneous Candidiasis) بنسبة (21.8%). صنفت الفطارات الجلدية سريريا الى ستة اشكال وتبين ان سعفة الجسم (44.6%) هو الشكل السائد ويليه سعفة الراس (39.2%) ، سعـفة الوجه (10.8%) ، سعفة القدم (2.3%)، ثم سعفة الفخذ (1.5%) ، وسعفة اليد (1.5%) ولـم تكن هناك فروقات معنوية في نسب الاصابات بالفطارات الجلدية بمختلف اشكالها بين الذكور والاناث ، اما بخصوص اعمار المصابين فقد لوحظت زيادة معنوية في نسب الاصابات بالفطريات الجلدية خاصة في سعفة الجسم وسعفة الراس ، لدى فئة الاعمار (1 - 11) سنة مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين من الاعمار الاكبر سنا ، وحول علاقة الاصابة مع مناطق سكن المصابين تبين ان اعـلى نسب الفطارات الجلدية خاصة في سعفة الجسم وسعفة الراس ، سجلت لدى المصابين من المناطق الريفية ( 68.5% ) مـقارنة باولئك من المناطق الحضرية ( 31.5 % ) . اظهرت الفحوص الزرعية للنماذج التي جمعت من الفطارات الجلدية ، ان النمو الفطري في وسط اكار السابرويد دكستروز كان ايجابيا في 107 (82.3%) عينة ولدى التعرف على انواع الفطريات في اوساط الزرع تبين ان الفطر Trichophyton mentagrophytes كان السائد بنسبة (33.6%) ويليه الفطر Trichophyton rubrum (21.5%) ، Trichophyton verrucosum (16.8%) ، Trichophyton tonsurans (11.2%) ، ثم Trichophyton soudanense (9.3%) ، وTrichophyton violaceum (7.5%). كما تبين ان الفطر Trichophyton soudanense قد تم عزله في الدراسة الحالية لاول مرة في العراق . كانت نسبة كبيرة من المصابين بالفطر T.mentagrophytes (22.4%) والفطر T.verrucosum (11.2%) يربون الحيوانات داخل منازلهم ، بينما سجلت اعلى نسب الفطريات الاتية : T.rubrum (14.9%) ، T.tonsurans (9.3%) ، T.soudanense (7.5%) ، وT.violaceum (7.5%) لدى المصابين الذين اعطوا تاريخا عائليا لوجود اصابات فطرية جلدية. درست النخالية المبرقشة تبعا لمواقع الاصابة في الجسم فتبين ان اصابة الرقبة كانت الاكثر شيوعا لدى (40.6%) من المصابين وقد وجد ان الاصابة البيضاء كانت اكثر الاصابات تكرارا (67.2%) مقارنة بالاصابات الغامقة اللون ، وسجلت اعلى نسب الاصابة لدى الذكور (73.4%) مقارنة بالاناث (26.5%) ، اما بخصوص اعمار المصابين فقد لوحظت زيادة معنوية في نسبة الاصابة لدى فئة الاعمار (12 - 31) سنة حيث بلغت (76.6%) مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين من الاعمار الاصغر والاكبر من هذه الفئة . وحول العلاقة بين الاصابة ومناطق سكن المصابين فلم تظهر فروقات معنوية في نسب الاصابة بين المصابين من المناطق الحضرية (48.4%) واولئك من المناطق الريفية (51.6%). بينت نتائج الفحص المجهري المباشر عن وجود الفطر Malassezia furfur في جميع حالات النخالية المبرقشة . سجلت الاصابات الجلدية بالمبيضات تبعا لمواقع الاصابة في اجسام المصابين فتبين ان اصابة الطيات الجلدية (62.9%) خاصة ما بين اصابع القدم (29.6%) وما بين اصابع اليد (20.4%) هي الاكثر شيوعا . وقد لوحظت زيادة معنوية في نسبة الاصابة لدى الاناث (72.2%) مقارنة بالذكور (27.8%) ، واما بخصوص اعمار المصابين فقد سجلت اعلى نسب الاصابة لدى فئة الاعمار (12 - 31) سنة حيث كانت (62.9%) مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين الاصغر والاكبر سنا من هذه الفئة . حول العلاقة بين الاصابة ومناطق سكن المصابين فلم تظهر اية فروقات معنوية في نسب الاصابة بين المصابين من المناطق الحضرية (55.5%) واولئك من المناطق الريفية (44.4%) .كشفت نتائج الفحص الزرعي للنماذج التي جمعت من حالات الاصابات الجلدية بالمبيضات عن نتائج ايجابية في جميع الحالات ولدى التعرف على انواع المبيضات المعزولة تبين وجود نوعين منها ، وكان الفطر Candida albicans هو السائد (88.9%) ويليه Candida tropicalis (11.1%). | Skin scrappings , nail, and hairs specimens were collected from 320 patients with clinically suspected to be infected with cutaneous mycoses during the peroid from 1st / December 2003 to 31th / August 2004 . These specimens were examined by direct mount with KOH(10%) and culture on Sabouraud’s - Dextrose agar plates for isolation and identification of causative fungi.The results showed that 248 (77.5%) were positive for fungi. Thereafter, according to the causative agent, the patients were divided into 3 groups; Those patients with dermatophytes were common (52.4%), followed by patients with pityriasis versicolor (25.8%) and finally those with cutaneous candidiasis (21.8%). The results also showed that these dermatophytoses were belong to the following clinical intities; Tinea corporis was the common (44.6%) followed by Tinea capitis (39.2%), Tinea facialis (10.8%), Tinea pedis (2.3%), Tinea cruris (1.5%) and Tinea palmaris (1.5%). There was insignificant difference among clinical pictures of dermatophytoses between male and female. Concerning the age groups, the results revealed a significantly higher infection rate among the age group (1 - 11) years, particulary Tinea corporis and Tinea capitis. Furthermore, higher rate of dermatophytes particulary Tinea corporis and Tinea capitis among rurals compared to urbans. Culture of specimens on Sabouraud - Dextrose agar were positive in 107 (82.3%) case. Trichophyton mentagrophytes were the predominent type of fungi isolated (33.6%), followed by T.rubrum (21.5%), T.verrucosum (16.8%), T. tonsurans (11.2%), T.soudanense (9.3%), and T.violaceum (7.5%). For the best of our knowledge, the species T. soudanense was isolated for the fiest time in Iraq in this study.Higher infection rate with T.mentagrophytes (22.4%) and T.verrucosum (11.2%) were found among patients who breed domestic animals inside their houses. However, Higher infection rate with T.rubrum (14.9%), T.tonsurans (9.3%) , T.soudanense (7.5%) , T.violaceum (7.5%) were found among patient who gave positive past family history of dermatophytoses.The most common site of clinical pityriasis versicolor was the neck (40.6%), and the white patches were the predominent (67.2%). Higher infection rate with P. versicolor was found among males (73.4%) compared to females (26.5%). The infection rate was significantly higher (76.6%) among the age group (12 - 31) years. However, there was insignificant difference between urbans (48.4%) compared to rurals (51.6%). The results of direct microscopical examination with 10% KOH revealed the presence of Malassezia furfur in all specimens of pityriasis versicolor cases. Cutaneous candidiasis was mostly affected skin folds (62.9%) especially the interdigital space (29.6%) and among the fingers (20.4%). Significantly higher infection rate was revealed among females (72.2%) compared to males (27.8%). The age group (12 - 31) years was the hardly infected (62.9%). However, there was insignificant difference concerning the residence of the patients, the infection rate among urbans was (55.5%) and that among rural was (44.4%). All culture of specimens taken from cases of cutaneous candidiasis were all positive, and the Candida albicans was the predominent isolates (88.9%) followed by C.tropicalis (11.1%).

توزيع عيارية الاضداد النوعية للسالمونيلا في محافظة ديالى وتاثير بعض العوامل عليها == Distribution of anti - Salmonella antibody titer in Diyala province and the effect of certain factors

Author name: عدوية فاضل عباس الزبيدي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | عبد الرزاق شفيق حسن الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة للمدة من الاول من تشرين الاول 2003 الى الثلاثين من كانون الاول 2004 في مختبر الصحة العامة، ومختبر مستشفى عام بعقوبة. استهدفت الدراسة قياس عيارية الاجسام المناعية للمستضد الجسدي والسوطي لسالمونيلا التايفي والباراتايفي A,B,C بطريقة فحص الويدال ودراسة حساسية العزلات الجرثومية لبعض المضادات الحيوية بطريقتي الانتشار من الاقراص وطريقة التخفيف في الانابيب لمعرفة التركيز المثبط الادنى.شملت الدراسة مجموعتين : مجموعة السيطرة التي تضمنت 123 شخصا من الاصحاء ظاهريا انتخبوا من بين متبرعي الدم ممن لم يطعموا بلقاح التيفؤيد ولم يصابوا بحمى التيفؤيد او الباراتيفؤئيد لثلاث سنوات سابقة. تكونت هذه المجموعة من 65(52.8%) اناث و58(47.2%) ذكور، وكان غالبيتهم يقطنون المناطق الريفية 88(71.5%)، كانت الاعمار تتراوح بين 15 - 50 سنة، اما الوسط الحسابي لاعمار المشاركين فهو (6.9 + 24.7) سنة. مجموعة المرضى ضمت 127 مريضا بحمى التيفؤيد او الباراتيفؤيد ممن كانوا يحالون من العيادة الاستشارية لمستشفى عام بعقوبة وبقية مستشفيات المحافظة اعتمادا على العلامات السريرية. تكونت المجموعة من 85(66.9%) اناث، و42(33.1%) ذكور، وكانت نسبة الذين يقطنون المناطق الريفية 69(54.3%)، كانت الاعمار تتراوح بين 3 - 70 سنة، اما الوسط الحسابي لاعمار المرضى فكان(13.5 + 31.7) سنة. من خلال فحص الويدال الذي اجري بطريقة التخفيف الثنائي للامصال فقد تبين ان عيارية الاجسام المناعية الاساسية(Baseline anti Salmonella - O - antibody) للمستضد الجسدي لسالمونيلا التايفي والباراتايفي A,B في مجموعة الاصحاء فقد كانت 160/1 اما للسالمونيلا باراتايفي C فقد كانت 80/ 1 . اما عيارية الاجسام المناعية الاساسية للمستضد السوطي (Baseline anti - Salmonella - H - antibody) فهي للسالمونيلا تايفي والسالمونيلا باراتايفي A كانت 640/1 وللسالمونيلا باراتايفي B فكانت 320/1 وللسالمونيلا باراتايفي C فكانت 80/1 اما عيارية الاجسام المناعية للمستضد الجسدي للمصابين بالسالمونيلا تايفي والباراتايفي A,B فكانت ( 320 /1) ، والسالمونيلا باراتايفي C فكانت (160/1) . عيارية الاجسام المناعية للمستضد السوطي للمصابين بالسالمونيلا تايفي والباراتايفي B فكانت (640/1)، والسالمونيلا باراتايفي A فكانت (320/1) والسالمونيلا باراتايفي C كانت (160/1). المعدل والوسيط الحسابي لعيارية الاجسام المناعية للمستضد الجسدي والسوطي للسالمونيلا تايفي والباراتايفي لكل من مجموعة السيطرة والمرضى فقد ظهرت فروقات معنوية (P< 0.001) للمستضد الجسدي للسالمونيلا تايفي والبارتايفي AO, BO . في حين لم يكن هناك فرق معنوي (P=0.42 ) للسالمونيلا باراتايفي CO . وكذلك ظهرت فروقات معنوية للمعدل والوسيط الحسابي لعيارية الاجسام المناعية للمستضد السوطي للسالمونيلا تايفي والباراتايفي AH ، BH اذا كانت قيم P ( P<0.001, P=0.001 , P=0.002 ) على التوالي في حين لم يكن هناك فرق معنوي للسالمونيلا باراتايفي CH اذ كانت قيمة P (P=0.94). لم تظهر النتائج تاثيرا معنويا لعوامل السكن، والعمر، والجنس، وحدوث اصابات سابقة على عيارية الاجسام المناعية للمستضدين الجسدي والسوطي لسالمونيلا التايفي والباراتايفي (A,B) في كل من مجموعة المرضى والاشخاص الاصحاء ظاهريا فكانت قيمة P لعامل السكن للاصحاء تتراوح بين (0.94 - 0.17 ) وللمرضى كانت قيمة P تتراوح بين (0.19 - 0.96)، ولعامل الجنس قيمة P للاصحاء (0.07 - 0.93) وللمرضى تراوحت بين (0.93 - 0.29 ) اما تاثير عامل العمر فكانت قيمةP للاصحاء تتراوح بين (0.05 - 0.93 ) وللمرضى تراوحت بين (0.05 - 0.93 ) ولتاثير الاصابات السابقة كانت قيمةP لمجموعة المرضى تراوحت بين (0.2 الى 0.97). خلال مدة الدراسة تم عزل 19 عزلة جرثومية بواقع 7 عزلات للسالمونيلا تايفي و8 عزلات للسالمونيلا باراتايفي B و4 عزلات للسالمونيلا باراتايفي A . استخدمت العزلات الجرثومية لدراسة الحساسية الدوائية لاثني عشر مضادا حيويا بطريقة الانتشار من الاقراص، فظهرت 18(%94.7) منها حساسة للسبروفلوكساسين و11 (%57.9 ) للجنتامايسين والستربتومايسين 10(%52.6) وحامض النالدكسك 8( 42.1%) والكوترايمكسازول 7( 36.8%)، والكلورامفينكول والتتراسيكلين والسيفو تاكسيم فكانت 6(31.6 %) والامبسيلين 4(21.1%) والبنسلين 3(15.8%) والارثرومايسين 1(5.3%). ولم تظهر اي عزلة حساسة للفانكومايسين . وقد اظهر الاختبار الاحصائي (Cochran test) فرقا معنويا عند مقارنة العزلات الحساسة للمضادات الحيوية اذ كانت قيمة (p <0.001). اختيرت اربعة مضادات حيوية متداولة في علاج حمى التيفؤئيد، والتي اظهرت حساسيتها الدوائية بطريقة الانتشار من الاقراص لحساب التركيز المثبط الادنى (MIC ) بطريقة التخفيف في الانابيب باستخدام المرق (broth dillution) فكانت الحساسية الدوائية للعزلات لكل من السبروفلوكساسين 19(100%) ولحامض النالدكس 17(89.5%) وللكلورامفينكول 10(52.6 %) وقيمة MIC لهذه المضادات الثلاث 50 مكروغرام/مللتر.اما الجنتامايسين فكانت الحساسية الدوائية14(73.7 %) وقيمة MIC له كانت 25 مكروغرام/مليلتر وقد ظهرت فروقات معنوية للحساسية للعزلات الجرثومية اتجاه المضادات الحيوية فكانت (P=0.004 ). | This study was conducted in Public Health Laboratory and Baquba General Hospital for the period from 1st. October/2003 to 30th /December/2004. The study aimed to determine the baseline titer of anti - salmonella (O) and (H) antibodies for salmonella typhi (S.typhi) and salmonella paratyphi (S.paratyphi) A,B and C among normal population and typhoid fever patients and to investigate the impact of certain epidemiological factors. Additionally, the antibiotic susceptibility patterns of salmonella isolates were tested by disc diffusion and tube dilution method to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) of certain commonly used antibiotics. Two groups were included in this study; the control group consist of 123 normal healthy individuals. They were randomly chosen from blood donors who were neither received typhoid vaccine nor infected by typhoid or paratyphoid ever for three years ago. 65(52.8%) were females and 58(47.2%) were males, most of them 88 (71.5%) were from rural areas. The age range was 15 - 50years, while the mean age was (24.7+ 6.9) years. The patient group consists of 127 patients who were referred from outpatient clinic of Baquba general hospital and other hospitals in Diyala province for their clinical signs suspected typhoid or paratyphoid fever. This group was consist of 85 (66.9%) females and 42(33.1%) males, 69(54.3) were from rural areas. The age range was 3 - 70 years, while the mean age was (31.7 + 13.5). The Widal test which was carried out by serial 8 fold dilution tube method showed that the baseline anti - salmonella (O) antibody titer for S.typhi and S.paratyphi A and B among healthy individuals was 1/160, and for S.paratyphi C was 1/80. The anti - salmonella (H) antibody titer for S.typhi and S.paratyphi A was 1/ 640, and for S.aratyphi B was 1/320, and for S.paratyphi C was 1/80. Among the patient group, the anti - salmonella (O) antibody titer for S.typhi and S. paratyphi A and B were 1/320, while for S.paratyphi C was 1/160. Concerning the anti - salmonella (H) antibody titer for S.typhi and S.paratyphi B were 1/640, and for S.paratyphi A was 1/320, and for S.paratyphi C was 1/160. The statistical analyses revealed a significant difference in the median of anti - salmonella (O) antibody titers of S.typhi and S,paratyphi A and B in patients compared to controls (P<0.001). However, there was insignificant difference (P=0.42) concerning anti - salmonella (O) antibody titers for S.paratyphi C between the study groups. Similarly, there was significant difference in the median of anti - salmonella (H) antibody titers for S.typhi and S.paratyphi A and B in patients compared to controls (P < 0.002, P=0.001, P<0.001) respectively. While there was insignificant difference concerning anti - salmonella (H) antibody titer for S.paratyphi C between the study groups (P=0.94). The results also revealed that there was insignificant effect of age, sex, residence and previous history of infection on the anti - salmonella (O) and (H) antibody titers for S.typhi and S.paratyphi A,B and C in both patients and control groups. The P values in the control group ranged between (0.17 to 0.94), whereas in the patient group, the P values ranged between (0.16 to 0.96). Throughout the study period, blood culture yielded 19 isolates : 7 for S.typhi, 8 for S.paratyphi B, and 4 for S.paratyphi A. These isolates were used to study the antibiotic susceptibility patterns against 12 available antibiotics using disc diffusion method. The results showed that 18(94.7%) were sensitive to ciprofloxacin, 11(57.9%) were sensitive to gentamycin, 10(52.6%) were sensitive to streptomycin, 8(42.1%) were sensitive to nalidexic acid, 7(36.8%) were sensitive to cotrimethaxazole , 6(31.6%) were sensitive to each of chloramphenicol, cefotaxim and tetracycline, 4(21.1%) were sensitive to ampicillin, 3(15.8%) were sensitive to penicillin, and 1(5.3%) was sensitive for erythromycin. All isolates were resistant to vancomycin. Cochran statistical analyses revealed significant difference in the sensitivity of different isolates to antibiotics (P < 0.001). Broth dilution technique was used to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) of four antibiotics against salmonella isolates. The results showed that 19(100%), 17(89.5%) and 10(52.6%) of the isolates were sensitive to ciprofloxacin, Nalidexic acid and chloramphenicol respectively, and the MIC for these antibiotics was 50 μg/ml. Furthermore, 14(73.7%) of the isolates were sensitive to gentamycin, and the MIC was 25 μg/ml. The statistical analyses showed significant difference in the sensitivity of isolates against these antibiotics (P= 0.004). The results also revealed that 9(47.3%) of the isolates were resistant to chloramphenicol, 5(26.3%) were resistant to gentamycin, and 2(10.5%)were resistant to nalidexic acid. All isolates were resistant to more than one antibiotics

تاثير تقدم العمر على الايلاستين والكولاجين وبعض المتغيرات الكيموحيوية والفسلجية في رئات ذكور الارانب البيض == Influence of Ageing on Elastin and Collagen and some Biochemical and Physiological Parameters in White Male Rabbit Lungs

Author name: غزوة خليل علي الطائي
Supervisor name: سراب داؤد سليمان الشماع
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Al Mosul - College Of Science
Language: Arabic
University location: Mosul
First pages:
Abstract: شملت الدراسة الحالية بيان تاثير تقدم العمر على الصفات المظهرية، النسجية، والكيموحيوية في رئات ذكور الارانب البيض، حيث تم استخدام واحد وعشرون ارنبا ذكرا نوع Albino تراوحت اعمارهم بين شهر واحد - ثلاث سنوات ونصف، صنفت الى سبع مجاميع تتضمن ثلاث ارانب لكل مجموعة.شملت التغييرات المظهرية بتقدم العمر ما ياتي : 1 - اتساع في الحجم، وفقدان في الطبيعة المرنة والتناسق غير المنتظم لفصيصات رئات الارانب باعمار مختلفة.2 - زيادة وزن الجسم ووزن الرئات بتقدم العمر حيث تراوحت بين 450 - 2250 غم و1.4 - 7.3 غم على التوالي فضلا عن زيادة نسبة وزن الرئة/وزن الجسم ووزن الرئة/حجم الرئة حيث تراوحت بين 0.311 - 0.324 و0.325 - 0.663، كما اوضحت الدراسة الحالية تغيرات نسجية لرئات ذكور الارانب البيض بتقدم العمر، مثل : تثخن الحواجز السنخية وجدران القصيبات الهوائية وتضيق المجال الهوائي. اما التغيرات الكيموحيوية لتقدم العمر فقد شملت ما ياتي : 1 - زيادة كمية كل من الكولاجين والايلاستين في مستخلصات رئات ذكور الارانب البيض حيث تراوحت بين 0.012 - 0.079 غم للكولاجين و0.214 - 0.957 غم للايلاستين، في حين اظهرت نسبة وزن الكولاجين / وزن الرئة الجاف زيادة في مجموعة الارانب بعمر سنة ونصف حيث كانت 0.094 مقارنة مع مجموعة الارانب بعمر شهر واحد 0.062 ثم عادت الى الانخفاض في مجموعة الارانب بعمر ثلاث سنوات ونصف 0.062 مقارنة بمجموعة الارانب بعمر سنة ونصف، واظهرت نسبة وزن الايلاستين/وزن الرئة الجاف ايضا زيادة في مجموعة الارانب بعمر سنة ونصف 0.879 مقارنة مع مجموعة الارانب بعمر شهر واحد 0.632 ثم عادت للانخفاض في مجموعة الارانب بعمر ثلاث سنوات ونصف 0.749 مقارنة بمجموعة الارانب بعمر سنة ونصف.2 - زيادة وزن الدهون الكلية ونسبة وزن الدهون/وزن الرئة حيث ترواحت بين 0.038 - 1.679غم و0.383 - 2.412.3 - زيادة البروتينات والكربوهيدرات الكلية في راشح مستخلصات رئات ذكور الارانب البيض حيث تراوحت بين 105 - 570 مايكروغرام/سم3 و12 - 60 مايكروغرام/سم3 على التوالي.4 - اوضحت هذه الدراسة زيادة مستوى كل من العناصر Cu, Mn, Fe, Ca ونقصان في مستوى Zn في راشح المستخلصات الرئوية.5 - كما بينت الدراسة ايضا وجود تغيرات تركيبية في كل من الكولاجين والايلاستين اللذان تم تنقيتهما من المستخلصات الرئوية بتقدم العمر، فقد ازدادت نسبة الكربوهيدرات المرتبطة مع الكولاجين وقلت شدة الامتصاصية الفلورنسية والتي تم قياسها باستخدام تقنية قياس الشدة الفلورنسية Fluorescence Spectrometry بتقدم العمر في حين لم نلاحظ اختلافا واضحا في المجاميع الكيميائية للكولاجين باستخدام تقنية IR infra - red technique بتقدم العمر ولكن هذه التقنية اوضحت بان الكولاجين المستخلص من انسجة رئات ذكور الارانب البيض ذات بصمة اصبع مماثلة للكولاجين نوع I، اما التغيرات التركيبية في الايلاستين المستخلص من رئات ذكور الارانب البيض باعمار مختلفة فشملت زيادة نسبة وزن الكاربون/ وزن الايلاستين بتقدم العمر، بينما انخفضت شدة الامتصاصية الفلورنسية للايلاستين بتقدم العمر.6 - فضلا عن انخفاض في مستوى هرموني النمو والتيستوستيرون في مصل دم ذكور الارانب البيض المتقدمة في العمر مقارنة بالارانب الاقل عمرا. | This study involved the elucidation of aging effects on the morphometrical, histological, and biochemical characters of white male rabbit's lungs. Twenty - one albino rabbits aged between 1 month - 3.5 years classified into 7 groups (with 3 rabbit in each). Morphometrical changes include : 1) Enlargement of rabbits' lung volume, loss of elasticity, and irregular arrangement of its lobs.2) Increased body weight and lung weight which ranged between 450 - 2250g and 1.4 - 7.3g respectively in addition to the increased percentage of lung weight/body weight and lung weight/lung volume that ranged between 0.311 - 0.324 and 0.325 - 0.663 respectively.Histological changes also revealed thickening of alveolar septa and brounchoelli walls narrowing air space. Our results also showed biochemical changes which include : 1) Increasing of collagen and elastin content in white male rabbit's lung extract that ranged between 0.012 - 0.079g for Collagen 0.214 - 0.957g for elastin respectively while the percentage of total collagen dry weight/lung weight increased in the group 1.5 years 0.094 compared with 1 month group 0.062 then return to decrease in 3.5 years group 0.062 compared to the 1.5 years group, like collagen elastin percentage of total dry weight/lung dry weight which was increased in 1.5 year 0.879 compared to 1 month 0.632 then decreased again in 3.5 years group 0.749 compared with 1.5 year.2) Total fat weight and the percentage of fat weight/lung had been increased with aging and ranged between 0.338 - 1.679g and 0.038 - 2.412 respectively.3) Increasing of total proteins and carbohydrates in the supernatant of lung extract that ranged between 105 - 570μg/ml 12 - 60 μg/ml respectively had been obtained also with aging.4) This study also revealed an increase in the levels of metals in the supernatant lung extract such as Ca, Fe, Cu, Mn, and a decrease in the level of Zn only.5) Structural changes of purified collagen and elastin with aging had been also shown, purified collagen showed an increase of carbohydrates content and a decrease in fluorescents absorbance intensity, While IR - technique didn't give us any differences in the important groups of collagen with aging, but it gave us a finger print similar to that of collagen type I, elastin structural changes had also been elucidated which includes increased percentage of carbon weight/purified elastin while the fluorescent absorbance intensity of purified elastin decreased with aging. 6) Decreased levels of both growth hormone and testosterone had been reveled also in the serum of aged rabbits compared with younger ones.

دراسة تاثير عسل النحل على البكتريا التي تلوث الحروق وامكانية استخدامه في العلاج == A study the Effect of Bee Honey on Bacteria that Contaminate Burns and the Possibility of it’s Usage in the Treatment

Author name: سندس عادل ناجي العزاوي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Diyala - College Of Science
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة خلال المدة من 15/11/2003 الى 15/7/2004 وشملت 70 مريضا راقدا في ردهة الحروق / مستشفى عام بعقوبة خلال مدة الدراسة الذين يعانون من حروق ذي درجات مختلفة وذلك لعزل البكتريا المسببة لاخماج الحروق وتشخيصها ودراسة بعض عوامل الضراوة لها وتحديد حساسيتها لبعض مضادات الحياة واختبار تراكيز مختلفة من العسل وحساب التركيز المثبط الادنى فضلا عن دراسة تاثير استخدام العسل مرهما (Ointment) في علاج الحروق.تكونت مجموعة المرضى من (38) انثى و(32 )ذكرا كما تراوحت اعمار المرضى بين (10 - 70) سنة جمعت خلال مدة الدراسة (126) مسحة من الحروق زرعت تلك المسحات على وسطي اغار الدم والماكونكي فضلا عن اجراء زرع (126) عينة دم للمرضى على مرق نقيع الدماغ والقلب. شخصت العزلات البكتيرية بالاعتماد على الصفات المظهرية والفحوص الكيموحيوية .اختبرت قابلية 6 عزلات بكتيرية من كل نوع معزول على انتاج الانزيم الحال للدم وتلازن كريات الدم الحمراء وقابليتها على الالتصاق بالخلايا الطلائية كما اختبرت قابلية البكتريا السالبة لصبغة كرام على انتاج انزيم البيتالاكتميز .اجري فحص الحساسية الدوائية للعزلات كافة لاثنتي عشرة من مضادات الحياة فضلا عن اختبار تاثير تراكيز مختلفة من العسل (بطريقة الانتشار في الاغار) ضد 18 عزلة عائدة الى الاجناس البكتيرية قيد الدراسة اما حساب التركيز المثبط الادنى للعسل فقد اجري للعزلات كافة.اختبرت فعالية العسل في علاج حروق 7 مرضى تراوحت اعمارهم من (2ـ25)سنة وبنسبة حرق اقل من 30% ثم قورنت مدة الشفاء بين المجموعة المعالجة بالعسل والمجموعة المعالجة باستخدام مرهم povidone - iodine المكونة من 7 مرضى تراوحت اعمارهم من (2ـ28) سنة وبنسبة حرق اقل من 30% مصابين بالحروق كما تم تقدير كلفة العلاج الكلية لكتا المجموعتين .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة للمصابين بالحروق (58.57%) كانت في ضمن الفئة العمرية (اقل من 10سنة) من كلا الجنسين ، بينما ظهرت اقل نسبة (1.42%) في ضمن الفئة العمرية (70) سنة تراوحت نسبة الحرق بين (10 - 100)% اذ تراوحت نسبة الحروق لدى العدد الاكبر من المصابين (31.43%) بين(10 - 15)% في حين كان ثلاثة مصابين بنسبة حرق(70 - 85)% وكانت اسباب الحروق في الحالات كافة هي السوائل الساخنة واللهب والكهرباء اذ بلغت نسبة الوفيات بين المصابين (22.85%) .اظهرت نتائج الفحوص الزرعية نتائج ايجابية في (101)(80.16%) في حين كانت (25)(19.84%) سالبة. كانت نتائج التشخيص البكتيري ونسبها كالاتي Enterobacter spp. (35)(%34.66), Pseudomonas aeruginosa (24)(%23.76) , Staphlococcus aureus (21)(%20.79) , Escherichia coli (8)(%7.92) , Klebsiella spp. 8(%7.92) , Proteus mirabilis (5)(%4.95).فيما يتعلق بزرع عينات الدم كانت النتائج ايجابية في (13)(18.57%) في حين كانت سلبية في (57)(81.43%) واظهر التشخيص البكتيري للعزلات وجود Enterobacter spp. بنسبة (61.54%) وPs.aeruginosa بنسبة (38.56%) .بينت نتائج الدراسة الحالية ان (33.33%,16.66%) من بكتريا E.coli , Enterobacter spp على التتالي امتلكت القدرة على انتاج انزيم البيتالاكتميز بينما لم تظهر العزلات الاخرى هذه القدرة كما اظهرت (83.33%,66.67% ,66.67%, 50%) من بكتريا Ps.aeruginosa ,Staph aureus, Pr.mirabilis ,E.coli على التتالي قدرتها على انتاج الانزيم الحال للدم ، في حين لم تظهر عزلات Klebsiella spp. ,Enterobacter spp. قدرة على انتاج هذا الانزيم.كما اظهرت النتائج ايضا ان (83.33%, 66.67% ,66.67% ,50% ,33.33%) من عزلات Ps.aeruginosa ,Enterobacter spp. ,Klebsiella spp ,E.coli ,Pr.mirabilis على التتالي قدرتها على تلازن كريات الدم الحمراء ولم تظهر عزلات Staph. aureusقدرتها على ذلك ومن جانب اخر اظهرت جميع عزلات Ps.aeruginosa قدرتها على الالتصاق بالخلايا الطلائية اما عزلات Enterobacter spp., Staph aureus ,Klebsiella spp. , E.coli ,Pr.mirabilis فقد كانت نسبة الالتصاق لها (66.67% ,66.67% ,66.67% ,50% ,33.33%) على التتالي.اما فيما يخص نتائج فحص الحساسية الدوائية فقد اظهرت العزلاات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها لمضادات الحياة المستعملة فقد كانت مقاومة جميع العزلات لـPenicillin (%100), ampicillin (%98.2), strephomycin (%97.9) , chloramphenicol (%86.2), ciprofloxacine (%84.1) , tetracycline (%76.9), tobramycin (%59.4) , cefotaxime (%54.5), gentamicin (%50.6), amikacin (%43.2) , cephotaxime( 90.5%) , norflaxin(%85.1) .اظهرت نتائج اختبار فعالية العسل ضد (18) عزلة بكتيرية عائدة للاجناس Ps.aeruginosa ,Enterobacter spp., Klebsiella spp.,Staph aureus, E.coli وPr.mirabilis عند التراكيز (100,80,60,40,20)%على التتالي وقد اظهرت النتائج ان معدلات اقطار مناطق التثبيط على الوسط الزرعي للعزلات البكتيرية كانت (0,0 ,6,4 ,9) ملم، (10,7,4,3,0) ملم ،(15,6,5,4,0) ملم ،(20,11,9,5,0) ملم،(25,20,10,0,0) ملم،(25,22,20,6,0) ملم على التتالي. كما اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى(MIC) للعسل لعزلات Enterobacter spp. ,Ps.aeruginosa ,Staph. aureus ,E.coli كان (40%) بيمنا كانت قيمة (MIC) للعسل لعزلات Klebsiella spp. ,Pr.mirabilis (25,30)% على التتالي. اظهرت نتائج استخدام العسل في علاج الحروق ان الحروق الملوثة ببكتريا Enterobacter spp. وبكتريا Staph. aureus بنسبة (57.14 ,28.57)% على التتالي اصبحت خالية من التلوث البكتيري بعد مرور (6) ايام على استخدام العسل في العلاج. كما اظهرت نتائج الدراسة ان متوسط مدة الشفاء في المجموعة المعالجة بالعسل ( 6.5) ايام في حين بلغ متوسط مدة الشفاء في المجموعة المعالجة بمرهم povidone - iodine (9.2) ايام اما كلفة العلاج باستخدام العسل فقد كانت اقل من كلفة العلاج باستخدام مرهم povidone - iodine | This study was conducted through the period from 15/11/2003 to /15/7/2004. It included (70) patients from burns unit in Baquba general hospital, who were suffering from different degree of burns. This study aimed to isolate and identifiy the bacterial causative agent for burns infection, study some of certain virulence factors, determinate their susceptibility pattern against certain available antibiotics and to different concentration of honey with the determination of minimum inhibitory concentration as well study the effect of use of honey in burns treatment. The patient group consist of (38) females and (32) males. Through the study period; (126) burns swabs were collected, These swabs were streaked as soon as possible on blood agar and MacConky agar plates. Furthermore blood culture for (70) samples of patients using brain - heart Infusion broth bottles. Identification of bacterial isolates were based on colony morphology and biochemical test. The ability of (6) isolates were tested for production of hemolysin , agglutination of red blood cells and then ability to adhere to epithelial cells besides the ability of gram’s negative becteria isolates for production of β - Lactamase were tested. The antibiotic susceptibility patterns of bacterial isolates against (12 ) antibiotics in addition to different concentration of honey were tested against 18 isolates from bacterial genera in this study (by diffusion in agar ) where as , the determination of (MIC) for honey was done for all isolates . The effect of honey was tested in treatment of burns for (7) patients as well as compaired the healing period between the groub treated with hony and the groub treated with povidone - iodine as well as account the total coast for each groub . The result showed that the highest percentage of patient (58.57%) were belong to the age group (>10) years old of both sexes, While the lowest percentage (1.42%) was among the age group (70) years. The degree of burns ranged between (10 - 100)% (BSA) . Most of the patient (31.43 %)had (10 - 15)% of (BSA), and only three patients had (70 - 85)%of (BSA)Generally , the cases of burns were boiling liquids , flames and electicity . the mortality rate was (22.85%). The culture tests showed that 101(80.16%) of the burns swabs yielded bacterial growth while 25 (19.84%) was negative the number and percentage of bacterial isolates were as follows : Enterobacter spp. 35(34.66%) Pseudomonas aeruginosa 24 (23.76%), Staphylococcus aureus 21 (20.79%) , Escherichia coli 8(7.92%) , Klebsiella spp. 8(7.92%) , proteus mirabilis 5(4.95%). Concerning blood culture 13 (18.57%) samples were positive and 57(81.43%) were negative for bacterial growth. Bacterial identification showed the presence of Enterobacter spp. in (61.54), Ps. aeruginose in (38.56%). Data of the present study found that (33.3, 20)%isolates of E. coli and Enterobacter spp . respectively were able to produceβ - lactamase while the other strain did not have this ability . Furthermore (83.33, 66.67, 66.67, 50)% isolates of Ps aeruginosa, Staph. aureus , pr . mirabilis , E.coli respectively were able to produce haemolysin while Klebsiella spp . , Enterobacter spp . lack this ability. The result also showed that ( 83.33, 66.67 , 50, 33.33 )%of Ps. aeruginosa , Enterobacter spp. , Klebsiella spp ., E. coli and Pr. mirabilis isolates respectively were able to agglutiniated red blood cells . While the isolates of Staph . aureus didn’t have this ability . On the other hand all Ps. aeruginosa isolates showed their ability to adhere on epithilial cells in apercentage of for each where as the isolates of Enterobacter spp ., Staph aures , KIlebsiella spp ., E.coli and Pr . mirabilis had an adherent ability in (66.67 , 66.67 , 66.67 , 50, 33.33)%respectively . The antibiotic susceptibility tests showed marked viability in the resistance of bacterial isolates to utilized antibiotic so the rate of resistance to Penicillin was (100%), Ampicilln( 98.2%) , Streptomycin (97.9%), Chloramphenicol (86.2%), Ciprofloxacin (84.1%), Tetracycline (76.9%), Tobramycin (59.4%) , Cefotaxime (54.5%), Gentamicin (50.6%), Amikacin (43.2%), Cephataxime (90.5 %)and Norflaxin (85.1%) The inhibitory ability of honey against (18) bacterial isolates belong to Ps. aeruginosa , Enterobacter spp ., klebsiella spp., Staph .aureus , E.coli and Pr . mirabilis at aconcentration (20,40,60,80,100)%. The result showed that the diameter of inhibition zone on agar was (0,0,4,6,9) mm, (0,3,4,7,10) mm, (0,4,5,6,15) mm, (0,5,9,11,20) mm, (0,0,10,20,25) mm and (0,6,20,22,25) mm respectively. Whereas the (MIC) of honey for Enterobacter spp., PS. aeruginosa,Staph. aureus , E. coli was (40%) while the (MIC ) for klebsiella spp., pr. mirabilis was (30,25)% respectively . The results of use of honey in treatment of burns showed that burns infected with Enterobacter spp., Staph. aureus with rate (57.12,28.57)% respectively become steriled after( 6) days on use of honey in treatment The results also found that the mean period of hospital stay for those patients treatment with honey was( 6.5) days compared with (9.2) days for those treated with povidone - iodine ointment , and the treatment coast was less with honey than with povidone - iodine ointment.

دراسة وراثية عن الطوافر البكتيرية المفككة للمركبات الفينولية

Author name: دانية منعم حامد الجادر
Supervisor name: صبحي دواد حمزة | ميساء جاسب
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
University: University of Baghdad - College Of Science - Department Of Biotechnology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: During this study (30) bacterial isolates from (55) soil samples and (10) water samples previously contaminated with petroleum oils were isolated and then screened for their capability for degrading phenol and analine . only (5) isolates were selected which show higher growth and degradation activity on the two substrates and identified Pseudomonas aeruginosa A13 and A5 , Escherichia coli A2 and A11 ، Enterobacter cloacae A8. Adaptation of isolates (A13, A11, A8, A5, A2) in higher concentrations of phenol (500 - 3000) µg/ml and analine (5003500) µg/ml were done . As much as (70,75and 80)% of (2000 µg/ml) phenol and (70,75 and 85)% of (2500 µg/ml) analine were degraded after 3 days of incubation. Number of mutants were generated by using 500 µg/ml of Nitrosoguanidine at incubations time (0.5,1.0and 2.0) hr .It was found that period of 1hr enough to induce mutation in the bacterial isolates in this study . and increased degradation activity as much as (90,90and 97)% of (2000 µg/ml) phenol and (90,97 and 100)% of (2500 µg/ml) analine were degraded by isolates (A13M2, A11M4and A8M12)respectively . Genetic analysis by electrophoretic agarose gel show that (A13, A8 and A8M12) isolates contain three plasmid bands However isolates (A11, A11M4 and A13M2) contain only two . Curing of plasmid frome the three isolates,« A11M4, A13M2 and A8M12»,were done by using acridine orange , ethidum bromide and SDS . It was found that 2200 µg/ml SDS and200 µg/ml acridine orange were capable of curing plasmids frome A11M4, A13M2 . All attempts for curing plasmid of isolates A8M12 was failed , however transformation of plasmid DNA of isolates A11M4, A13M2 and A8M12 in to E. coli MM294 was achieved . Results of the experiments indicate that these plasmids were responsible for degradation ability in the transformed isolates.

عزل وتشخيص بعض انواع الجراثيم المحللة للمركبات الهيدروكاربونية من ترب محافظة نينوى == Isolation and Identification of some Hydrocarbon Degrading Bacteria from Soil in Nenavha Governorate

Author name: ايمان محمد طاهر عزيز
Supervisor name: اديبة يونس شريف حمو النعمان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Al Mosul - College Of Science
Language: Arabic
University location: Mosul
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع (100) عينة تربة من مناطق مختلفة من محافظة نينوى والاقضية التابعة لها بعضها مناطق ملوثة كمصفى الكسك وقرية العلولية وقرية البوير ومنطقة الشيخان بهدف عزل وتشخيص الانواع الجرثومية للتربة ودراسة قابلية بعض الجراثيم المعزولة على تحليل النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام. اظهرت نتائج العزل الحصول على 137 عزلة جرثومية من الانواع الموجبة والسالبة لصبغة كرام. وبنسبة 74.45% للانواع الموجبة لصبغة كرام و25.55% للانواع السالبة لصبغة كرام، شكل الجنس Bacillus نسبة 69.6% من الجراثيم الموجبة لصبغة كرام وان اكثر الانواع عزلا كان النوع B.circulans وبنسبة 26.47% من مجموع الجراثيم الموجبة وشكلت Proteus mirabilis اكثر الانواع عزلا من الجراثيم السالبة لصبغة كرام وبنسبة 28.57% من مجموع الجراثيم السالبة لصبغة كرام. وعند التحري عن قابلية عدد من انواع الجراثيم المعزولة من الترب المحلية لتحليل المركبات الهيدروكاربونية والتي شملت انواع من جنس Bacillus وهي B.cereus وB.subtilis وB.mycoides وB.megaterium وB.circulans، وانواع من جنس Micrococcus وهي M.roseus وM.luteus وM.varians وذلك باستخدام وسط الاملاح المعدنية الحاوي على المصادر الهيدروكاربونية وبنسبة 1%. اظهرت نتائج الدراسة زيادة في معدلات نمو معظم عزلات M.roseus وM.luteus وM.varians اذ كانت معدل اعدادها عند بداية التجربة 109×42 و109×31 و109×24 و107×25 و109×30.4 و109×25.3 للنوعين M.roseus وM.luteus على المصادر الهيدروكاربونية النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام على التوالي ووصلت الى 106×36 و108×36 و109×31.2 و106×30 و107×28.5 و106×22.5 لهذين النوعين من الجراثيم على التوالي وعلى المصادر الهيدروكاربونية نفسها في حين لم تتمكن احدى عزلات M.luteus من النمو في الوسط الحاوي على النفط الابيض زيت الغاز والنفط الخام واحدى عزلات M.varians وعزلتي M.roseus على النفط الابيض والنفط الخام.اما الانواع التابعة لجنس Bacillus والنامية على النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام فقد اظهر نموا جيدا وباعداد اعلى 105×30 لمعظم انواعها ما عدا B.circulans التي لم تتمكن من النمو على النفط الابيض واحدى عزلات B.megaterium وB.subtilis وB.cereus على النفط الخام وسجلت زيادة في الامتصاصية الضوئية خلال اوقات التجربة وبتناسق مع الزيادة في الاعداد الحية للبكتريا للانواع التابعة لجنس Micrococcus وBacillus النامية على النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام.كما سجل انخفاض في الدالة الحامضية لجميع العزلات التي اظهرت نموا جيدا على المصادر الهيدروكاربونية المختلفة في الدراسة والتي عدت دليلا على قدرتها لتحليلها. فيما بقيت الدالة الحامضية عند 7.0 pH للعزلتين M.roseus النامية على النفط الابيض واحدى عزلات M.luteus وعزلتين لـ M.roseus واحدى عزلات M.luteus النامية على النفط الخام وكان الانخفاض في الاس الهيدروجيني قليلا اذ وصل الى 6.5 للعزلتين M.luteus وM.varians النامية على النفط الابيض والنفط الخام واحدى عزلات M.roseus النامية على زيت الغاز والنوع B.circulans النامية على النفط الابيض وB.cereus وB.subtilis وB.megaterium النامية على النفط الخام وان هذا الانخفاض ظهر في العزلات التي توقف نموها في اليوم الرابع للتجربة وعد استحلاب الوسط واختفاء الطبقة الزيتية من على سطحه دليلا على قدرة الجراثيم لاستهلاكه. اذ اظهرت معظم الانواع والعزلات المحللة استحلابا كاملا. كما تم اعتماد تقنيتي Gas - Chromatography GC وInfra - IR اذ لوحظ اختفاء اعداد كبيرة من الحزم العائدة للنفط الابيض وزيت الغاز المعامل بالعزلات الجرثومية المستخدمة في الدراسة مقارنة مع عينة النفط الابيض وزيت الغاز غير المعامل. ولوحظ كذلك اختفاء عدد من الاواصر عند استخدام تقنية IR اذ ظهرت اواصر الحامض الكاربوكسيلي والامايد والاستر في العينات المعاملة بالعزلات الجرثومية المحللة. ومن النتائج لوحظ ان الانواع المعزولة من مناطق ملوثة اظهرت قابلية جيدة لتحليل المركبات الهيدروكاربونية. | The study include the collection of 100 soil sample from Nenavah and it's vicinity, some of them were pollutant areas from Al - Kassic, Alalolia, Al - bwer Village, and Al Shikhan to isolated and identify and study the ability of some bacteria to degrade kerosene, diesel and crud oil. The results showed that the isolation of (137) bacterial isolates of both gram negative and positive bacteria, (74.45)% represent gram positive bacteria and (25.55)% were of the gram negative. Bacillus formed (69.6)% of the gram positive isolates, B.circulans was (26.47)% the most frequent isolate while Proteus mirabilis form (28.57)% of all gram negative bacteria. The ability of some isolated bacteria to degrade hydrocarbons including kerosene, diesel, crude oil was studied for Bacillus and Micrococcus which includes, B.circulans, B.cereus, B.mycoids, B.subtilis, B.megaterium, B.circulans, M.luteus, M.roseus and M.varians in mineral salts medium containing (1)% of hydrocarbon sources. The results showed an increase in the growth rates for most strain of M.roesus, M.luteus and M.varians as the mean count were 42×109, 31×109, 24×109, 25×107, 30.4×109 and 25.3×109 for M.roseus and M.luteus grown on kerosene, diesel and crude oil respectively, at the beginning and reached 36×106, 36×108, 31.2×109, 30×106, 28.5×107, 22.5×106 for mentioned species respectively on the same hydrocarbonic source at the end, whereas one strain of M.luteus didn't grow in the media containing kerosene diesel, and crude oil, and one strain of M.varians and two strain of M.roseus didn't grow in the media containing kerosene and crude oil all Bacillus species growing on kerosene, diesel and crude oil showed a good growth with colony count more than 30x105 for all strains except B.circulans which didn't grow on kerosene and of the strains of B.megaterium, B.subtilis and B. cereus which didn't grow on crude oil. An increase in photo absorption was recorded during the experimental period which were corresponding with increased viable counts of bacteria belonging to the genera of Micrococcus and Bacillus on kerosene, diesel, and crude oil. A decrease in pH was also recorded for all strain which showed a good growth on the different hydrocarbon sources used in the study which was considered as an indicator of their ability for degradation. While pH remained at (7.0) for two strains of M.roseus on kerosene one strain of M. luteus on diesel and two strains of M.roseus and one strain of M. luteus on crude oil. The decrease in pH was few as it reased (6.5) for two strains of M. luteus and M. varians growing on kerosene and crude oil one strain of M. roseus on diesel, B.circulans on kerosene and B. cereus, B. subtilis, B. megaterium on crude oil, this little decrease appeared in the strains which stopped growth at day four of the experiment Emulsification of media and disappeared of oil later of the surface was regarded as indicator for the ability of bacteria to consume hydrocarbon sources as most of hydrolytic strains showed complete emulsification.Gas chromatography (GC) and Infrared - IR techniques were used as indicators as disappearance of number of bands kerosene and diesel treated with the bacterial isolates used in the study compared with untreated sample of kerosene and diesel. And the disappearance of number of bonds was observed using IR technique, the carboxylic acid, amid and ester bonds appeared in bacterial treated sample. The bacteria isolated from polluted area have a good ability in the their hydrolytic activity.

دور حامض الفولك في تقليل تاثير احد ادوية الصرع على تشوهات الجهاز العصبي المركزي لاجنة الفئران المهقاء == Folic Acid Role in Reducing the Effect of One of Epilepsy Drugs on Central Nervous System s Malformations of Mice Albino Embryos

Author name: فاتن ذنون عبد الرحمن الطائي
Supervisor name: جنان حسيب عبد الفتاح مصطفى الحيالي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Al Mosul - College Of Science
Language: Arabic
University location: Mosul
Key words:
  • Topiramate
  • Malformation
  • pregencey
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية للتعرف على التاثيرات الظاهرية والنسجية المرضية التي يحدثها عقار Topiramate في الجهاز العصبي المركزي (الدماغ والحبل الشوكي) في اجنة الفار الابيض السويسري Mus musculus . ودور حامض الفولك في امكانية تقليل هذه التشوهات من خلال تجريع الاناث الحوامل بالعقار بجرعة 8.4 ملغم / كغم من وزن الجسم وحامض الفولك بجرعتين 0.42 و0.84 ملغم / كغم من وزن الجسم من اليوم الاول الى اليوم الثامن عشر من الحمل حيث شرحت في هذا اليوم. وقد احدث هذا العقار تشوهات ظاهرية لكل من الدماغ والحبل الشوكي للاجنة المعاملة وبلغت نسبتها 4.39 % و3.29 % على التوالي . تمثلت تشوهات الدماغ ببروز الدماغ الى الخارج ، وجود انخفاض في المنطقة القحفية وظهور الدماغ بشكل غير نام ، وانعدام الراس بالكامل . اما تشوهات الحبل الظهري فتمثلت بتشوه الجذع واحتوائه على حدبة ظهرية وتشوهات العنق . وهذه التشوهات في الحبل الظهري تعد جميعها تشوهات جديدة لم نلحظ ذكرها في بحوث سابقة . اما الفحص النسجي فقد اظهر تشوهات في نسيج الدماغ بنسبة 21.97% تمثلت بدماغ خارجي وتنخر الخلايا العصبية ، وحالة التنكس في الخلايا والدماغ كبير الحجم والتفجي وتنخر الخلايا العصبية . اما الحبل الشوكي فقد عانى من تشوهات نسجية ايضا بنسبة 10.98% ابرزها تمايز الحبل الشوكي لاول مرة في موقع مختلف عن الحالة الطبيعية وتفجي الخلايا العصبية واتقان دموي للوعاء اعلى الحبل العصبي . اما عند استخدام العقار بجرعة 8.4 ملغم /كغم من وزن الجسم مع حامض الفولك بجرعة 0.42 ملغم/كغم فقد اصبحت 0.0% اما تشوهات الدماغ النسجية فكانت بنسبة 14.28% متمثلة بالدماغ كبير الحجم متضخم بشكل اربعة اجزاء ، ووجود اضرار نسجية مثل التنخر وكثافة الخلايا الدبقية ، واختلاف في حجم نصفي كرتي المخ . اما تشوهات الحبل العصبي النسجية فبلغت نسبتها 4.76 % تمثلت بالحبل العصبي المستطيل الشكل ، واختلاف موقعه عن السيطرة مع حالات التفجي والتنخر وحبل عصبي كبير جدا وتفجي في الخلايا العصبية . اما عند استخدام العقار بجرعة 8.4 ملغم/كغم من وزن الجسم مع عقار حامض الفولك بجرعة 0.84 ملغم/كغم من وزن الجسم ، فقد اختزلت التشوهات الظاهرية للدماغ والحبل الشوكي الى 0.0% اما تشوهات الدماغ النسجية فكانت نسبتها 6.66% تمثلت بكبر حجم الدماغ ووجود مادة غروية في قشرة المخ وتفجي الخلايا العصبية ودماغ كبير متضخم, اما تشوهات الحبل الشوكي النسجية فبلغت نسبتها 2.5% وتمثلت بوجود احتقان في الوعاء الدموي اعلى الحبل العصبي مع وجود تنخر في بعض الخلايا العصبية وخلايا متنخر غير طبيعية ، ووجود حالة الاحتقان الدموي | The study was conducted to determine the external and histo - pathological effects , caused by the drug Topiramate , on the Central Nervous System (CNS) brain and Spinal cord in the mouse Mus musculus Embryos. And Folic acid role in reducing the Malformations was administered to pregrant mice Topiramate dose (8.4 mg/kg) of body weight and folic acid two doses (0.42 , 0.84) mg/kg B.W. for 18 days. The results showed that using Topiramate alone caused various malformation of the brain (4.39%) & the Spinal cord (3.29%) .the external Malformations Brain defects were exencephaly , depression of the skull with atrophy of the brian, the loss of the whole head ;While spinal cord defects were trunk and neck abnormalities these abnormalities were not reported in the published research . before . Histological examination of the CNS tissues showed 21.97 abnormalities of the brain as exencephally , necrosis of neurons , Degeneration . the brain which has amedian dorsal depression cotained large size brain , Vacculation and necrosis neurons . The spinal cord showed 10.98% histological defects such as abnormal position ,which was not reported before , Vacculation of neurons , congestion dorsal blood Vessel wall at the upper part of the spinal cord . Using Topiramate 8.4 mg/kg B.W. with 0.24 mg/kg B.W. folic asid , showed complete reduction of the external malformation of brain and spinal cord (0.0%). While brain histological defects were (14.28%) large 4 - lobed brain , necrosis , in creasing density of neuroglia and adifference in the size of the Cerebral hemispheres . the results revealed that the cross section of the spinal cord was rectangular in shape with Vacculation , necrosis , large size spinal cord and Vacculation of neurone . Using Topiramate 8.4 mg/kg B.W with double the dose of folic acid showed complete reduction of external malformation of brain and spinal cord (0.0%) . While brain histological defects were 6.66% large size brain , found colloids in the brain cortex and Vacculation of neurons and large lobed brain . Spinal cord histological defects were 2.5% as necrosis of the dorsal blood Vessel abnormal at the upper part of the spinal cord , necrosis of some neurons , and congertion with thinning of blood V.wall

دراسة تاثير مزيج من بعض المستخلصات لبذور الحرمل ومخاريط السرو في حيوية الرؤيسات الاولية للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus خارج وداخل الجسم الحي == Study the effect of plant extracts mixture from seeds of Peganum harmala & cones of Cupressus sempervirens on viability of protoscolices of Echinococcus granulosus in vitro and in vivo

Author name: نور نهاد باقر وزان
Supervisor name: فوزية احمد الشنوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة استخدام المستخلصات المائية لبذور الحرمل بالتراكيز 10، 20، 30 مليغرام/مليليتر، ومخاريط السرو بالتراكيز50 ،100، 200مليغرام/مليليتر. اما المستخلصات الكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السروكانت التراكيز1،2 ،3 مليغرام/مليليتر و50، 100، 200 مليغرام/مليليتر على التوالي بينما الخليط المائي لبذور الحرمل ومخاريط السروكانت التراكيز(10+50)، (20+100) و(30+200) مليغرام/مليليتر، اما تراكيز الخلط الكحولي للنباتين(1+50)،(2+100) و(3+200) مليغرام/مليليتر؛ وذلك لدراسة تاثيرها في حيوية الرؤيسات الاولية لطفيلي المشوكات الحبيبية Echinococcus granulosus في الزجاجIn vitro من اجل الوصول الى التركيزالفعال في قتل الرؤيسات خلال اقصرمدة زمنية ممكنة لحقنه داخل التجويف البريتوني للفئران البيض سلالة Balb/c في الجسم الحي In vivo انخفضت الحيوية عند استخدام المستخلص المائي لبذور الحرمل ومخاريط السرووالخلط المائي لهما فحصل القتل التام للرؤيسات الاولية عند التراكيز 30، 200 و( 30+200)مليغرام/مليليتر في الزمن 30 دقيقة على التوالي. بينما تميزت المستخلصات الكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السرو والخلط الكحولي لهما بالقتل التام للرؤيسات في الزمن صفر دقيقة عند التراكيز 3، 200 و(3+200) مليغرام/مليليتر على التوالي . وبعد اختيار التراكيز الفعالة تم تجريبها في الفئران البيض المحقونة بالرؤيسات الاولية وقياسها بالسيطرة الموجبة المحقونة بالرؤيسات وغير المعاملة بالمستخلصات النباتية والخلط والبندازول، وبالسيطرة السالبة المحقونة بالمحلول الملحي الطبيعي Normal saline من اجل بيان تاثير المستخلصات النباتية والخلط المائي والكحولي والبندازول داخل الجسم الحي عن طريق دراسة التغيرات الحاصلة في معدل اعداد واوزان واقطار الاكياس العدرية والنسب المئوية لاختزالها في الجسم ؛ اذ تبين حدوث اختزال بنسبة 100% في المجاميع اجمع قياسا بالسيطرة الموجبة غير المعاملة اذ لم يلاحظ وجود الاكياس العدرية الثانوية في المجاميع المعاملة جميعها.وتم دراسة التغيرات الحاصلة في معدلات اوزان الكبد والطحال ومعدلات تضخمهما في المجاميع المعاملة بالمستخلصات النباتية المائية والكحولية والخلط المائي والكحولي والبندازول. وقد لوحظ حدوث تباين في المعدلات اذ كانت منخفضة عن السيطرة الموجبة والافضلية كانت لمجموعة الخلط الكحولي لبذور الحرمل ومخاريط السرو اذ اقتربت من السيطرة السالبة . وشملت هذه الدراسة ايضا معرفة تاثير هذه المستخلصات والبندازول في نسيج الكبد والطحال عن طريق دراسة التغيرات النسيجية لهما اذ حصل في الكبد تغيرات عديدة منها تغيرات في شكل الخلايا الكبدية، وزيادة في اعداد خلايا كفر الدفاعية في الفئران المعاملة التي كانت اقل مما ظهر في فئران السيطرة الموجبة، اما الطحال فاظهر توسعا في اللب الابيض وظهور الخلايا المكونة للصفيحات الدموية (Megakaryocytes) في الفئران المعاملة قياسا بالسيطرة السالبة وكانت هذه التغيرات اقل حدة في الفئران المعاملة بالخلط المائي والكحولي لبذورالحرمل ومخاريط السرو؛ لذلك فان نتائج التغيرات تبين امكانية استخدام الخلط المائي والكحولي للنباتين وبالتراكيز (30+50) و(1+50) مليغرام/مليليترعلى التوالي داخل الجسم الحي بطريقة امنة عن طريق قدرتها على تحفيز الجهاز المناعي وتوهين الرؤيسات الذي ادى الى منع تطورها الى اكياس عدرية ثانوية داخل الجسم الحي دون اثار جانبية سلبية قياسا ببقية العقاقير الكيميائية مما يؤهلها للتقليل من المضاعفات الحاصلة في العمليات الجراحية . كما تم دراسة الجرعة المميتة لهذه المستخلصات والخلط للاستفادة منها عند حقن الحيوانات فكانت الجرعة المميتة لكلا الحيوانات المحقونة بالمستخلص المائي والكحولي لبذور الحرمل 2.5 غرام/كيلوغرام؛ بينما كانت الجرعة المميتة للمستخلص المائي والكحولي لمخاريط السرو 5.18، 3.63 غرام/كيلوغرام على التوالي وكانت قيمة الجرعة المميتة للخلط المائي والكحولي للنباتين 6.7، 3.3 غرام/كيلوغرام على التوالي . وباجراء التحليل الاولي للكشف عن المجاميع الفعالة في المستخلصات المائية والكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السرو تبين احتواء المستخلص المائي والكحولي لبذور الحرمل على القلويدات والكلايكوسيدات والصابونينات والفلافونيدات، بينما احتوى المستخلص الكحولي للنبات على الراتنجات فضلا عن المواد السابقة في المستخلص المائي. اما المستخلص المائي والكحولي لمخاريط السرو احتوى على الفينولات ،والتانينات ، والصابونينات، والفلافونيدات ،والكلايكوسيدات، والزيوت الطيارة، والتربينات، والستيرويدات ولم يحتو على القلويدات، ووجدت الراتنجات في المستخلص الكحولي لمخاريط نبات السرو. | This study included the using of the aquatic extracts for the seeds of Peganum harmala and cones Cupressus sempervirens with the concentration ( 10, 20, 30 )mg/ml and (50,100,200)mg/ml respectively and the aquatic mixture for seeds P. harmala and cones C.sempervirens with concentration {(10+50),(20+100),(30+200)}mg/ml and alcoholic extracts of the seeds P. harmala and cones C.sempervirens with concentration (1,2,3)mg/ml and (50,100,200) mg/ml respectively and alcoholic mixture of them with concentration {(1+50),(2+100),(3+200)} mg/ml .To study of the influence of plant extracts and mixture in the percentage of vitality of the protoscolices of Echinococcus granulosus In vitro for the purpose of arriving to the active concentration in killing of protoscolices during the shortest period of time possible in order to inject it intraperitoneal of the white mice In vivo as the vitality of protoscolices had caused complete death at the time 30 minute when using the aquatic extracts of seeds P. harmala and cones C. sempervirens and aquatic mixture of them at the concentration {30,200,(30+200)}mg/ml respectively . the alcoholic extracts of seeds P. harmala and cones C. sempervirens and alcoholic mixture of them with concentration {3,200,(3+200)}mg/ml these had differ to be distinguished with higher inhibition on the vitality of protoscolices and shown complete killing of protoscolices at the time zero minute . After the suitable concentration selection and then experimentation the active concentration on the mice injected with protoscolices and its comparison with the mice injected with protoscolices and not processed with plant extracts ,mitxure and albendazole (as positive control group ), the mice injected with albendazole and the mice injected with normal saline(as negative control ) to investigate the effect of plant extracts and albendazole in vivo with study the changes occurred in the average of the numbers weights, diameters of the hydatid cyst and the percentage for its reduction in the body as it appeared of getting the reduction of hydatid cyst with percentage 100% in all processed group with plant extracts , mixture and albendazole compared with positive group as its absence of the hydatid cyst in processed group. Also study the change occurred in the averages of the weights of the liver and spleen and the averages of its distension ,as it appeared the occurrence of the variation in the averages of the weights of the liver and spleen and the factors of its distension ,as the lowering significantly of these average occurred in all processed groups with plant extracts, mixture and albendazole about of the positive group and the best result of alcoholic mixture group which was approach to the negative group. This study included tissular changes occurred in the liver and spleen concerning the liver it appeared the occurrence of many tissular changes it most important are the changes of the liver cell and increase in the number of the kupffer cell as a defensive in the processed rates were less than what it appeared in the rate with the positive control, but the spleen ,it appeared the dilation of the whit pulp and the appearance of the cell composing of the hemic platelets(megakaryocyte cells) in the mice processed in comparison with unprocessed negative control group. these tissular changes were of less acuity in each of the group processed with the aquatic and alcoholic mixture of the seeds P. harmala and cones C. sempervirens compared with remaining groups . Thus from the results of this study at appeared the possibility of using the aquatic and alcoholic mixture of the seeds P. harmala and cones C. sempervirens with concentration {(30+50),(3+50)}mg/ml respectively in vivo in successful and safe way in the medical understanding by it a capability of initiating the immunity system which caused to the prohibition of the development of the protoscolices to the secondary hydatid cyst in vivo without causing the side effect in comparison with remaining chemical drug and white it qualifies it to decrease the complications of occurring drug the surgical operation . Also this study included knowing the lethal dose of plants extracts and the aquatic, alcoholic mixture of seeds P. harmala and cones C. sempervirens to purpose utilization its when injected the animal, as the lethal dose of aquatic and alcoholic extract of seeds P. harmala was 2.5gm/kgm while the lethal dose of aquatic and alcoholic extract of cones C. sempervirens was 5.18gm/kgm,3.63gm/kgm respectively. and the dose of aquatic and alcoholic mixture was 6.7gm/kgm,3.3gm/kgm respectively By performing phytochemical analysis the results showed the aquatic and alcoholic extracts of seeds P. harmala contain alkaloids, flavonoids ,glycosides whereas aquatic and alcoholic extracts of cones C. sempervirens contain phenol, tannin, flavonoids ,glycosides ,terpenoids , steroids and volatile oils but only alcohol extract of seeds P. harmala and cones C. sempervirens contain resins

دراسات تجريبية ونسجية حول تاثير بعض العقاقير والمستحضرات النباتية على حيوية الدودة الشريطية القزمة Rodentolepis nan (von Siebold 1852) Spasskii, 1954 == Experimental and histological studies about the effect of some drugs and plant preparations on the viability of dwarf tapeworm Rodentolepis nana (von Siebold 1852) Spasskii, 1954

Author name: خنساء عزيز يونس الطائي
Supervisor name: زهير ابراهيم فتوحي رحيمو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Al Mosul - College Of Science
Language: Arabic
University location: Mosul
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية فحص الشكل العام في النماذج الكاملة whole mounts للدودة الشريطية القزمة والمعزولة من الفار المختبري الابيض Mus musculus من سلالة albino mice وذلك بعد صبغ اجزاء جسم الدودة بخمس صبغات استخدمت لهذا الغرض وهي صبغة الكارمين الخليAceto carmine ، وصبغة الهيماتوكسلينHematoxyline stain، وصبغة الكارمين Carmine، وصبغة البيستكارمين Best's carmine وصبغة المثيل الاخضرMethyl green وكانت كل من صبغة الكارمين الخلي والهيماتوكسلين افضل من الصبغات الاخرى في الكشف عن اهم الاجزاء كالرؤيس والعنق والمحاجم والخطم وحلقة الاشواك وكذلك القطع الجسمية غير الناضجة والناضجة التي تحتوي على تراكيب حويصلية تمثل فصي المبيض والخصى والقناتين الابرازيتين والحبال العصبية الطولية الممتدة على طول الجسم.كما ان هذه الدراسة انصبت على دراسة الدودة نسجيا باستعمال المقاطع الشمعية فتم عمل مقاطع عرضية في جسم الدودة توضحت من خلالها مختلف طبقات الجسم ابتداء من طبقة الجليد cuticle وتحت الجليد subcuticle والزغيبات الجليدية cuticular villi لجدار الجسم، فضلا عن العضلات الدائرية circular والعضلات الطولية longitudinal muscles والعضلات المستعرضة transvers muscles والعضلات المائلة oblique muscles وكذلك اجزاء الاعضاء التناسلية كفصي المبيض ovary اللذين اظهر اختلاف في حجميهما كما ظهر حاجز يقسم فص المبيض الى قسمين والخصى testes والفتحة التناسلية الجانبية العامة lateral common genital pore كما ظهرت فتحتا القناتين الابرازيتين excretory canals الفارغتين في كل طرف من المقطع العرضي وظهر الحبل العصبي الطولي على كلا الجانبين الى خارج القناتين الابرازيتين.وقد تم تتبع تاثير خمسة عقاقير وهي النيكلوساميد Niclosamide والميبندازول Mebendazole والبندازول Al - Bendazole والاكزت Exit واللاكتولاك Lactolac، وتاثير خمسة مستحضرات نباتية وهي زيت الخروع وحب القرع وثمار الحنظل وثمار الخرنوب واوراق الرمرام في الاصابة التجريبية للفئران البيضاء المختبرية، ودراسة تاثير جرع مختلفة منها على انتاج البيوض لهذه الديدان وعلى فاعليتها في طرد الديدان او قتلها داخل معى المضيف. اظهر عقار النيكلوساميد فاعلية عالية في خفض اعداد البيوض وفي خفض اعداد الديدان بنسبة مئوية 100%، اما بقية العقاقير الاخرى وهي الميبندازول والبندازول والاكزت واللاكتولاك فقد اعطت نتائج متذبذبة في خفض انتاج البيوض خلال ايام (2، 4، 6، 8) بعد التجريع المذكور وكانت فاعليتها في خفض اعداد الديدان اكبر من خفض اعداد البيوض مما يدل على ان تاثيرها كان اكبر في الطور البالغ منه على انتاج البيض.اما تاثير النباتات الطبية فقد اظهر زيت الخروع وبتركيز 0.4 مل فاعلية في خفض اعداد البيوض واعداد الديدان بعد التشريح خلال الايام(2، 4، 6، 8)ايام بعد التجريع. وبصورة عامة كانت النباتات الطبية ذات تاثير متذبذب في خفض اعداد البيوض مما يدل على ان جميع هذه الجرع لم تكن مؤثرة بما فيه الكفاية لظهور فروقات معنوية بعد التحليل الاحصائي. | The present study include the examination of general morphology of the dwarf tapeworm in whole mounts isolated from the laboratory white mouse, Mus musculus (albino Balb / C) after staining different parts of the body with five stains. Acetocarmine, Hematoxyline, Carmine, Best's carmine and Methyl green. It has been found that Acetocarmine and Hematoxyline are the best stains when compared with other stains to reveal some important parts of the worm such as Scolex, neck, suckers, rostelum and ring of hooks, immature and mature proglottids which possess vesicular structures such as two lobes of ovary, the two excretory canals, and the Longtudinal nerve cords which extend through out the body. This study include histological study using paraffin sections, both cross and Longitudinal which shows different layers of body. From external cuticle layer, sub cutile, cuticular villi of bodys wall, circular muscles, longitudinal muscles, transvers muscles, oblique muscles in addition to parts of reproductive organs such as the two lobes of ovary which are different in size with adistinct partions, testes, lateral common genital pore and the empity excretory canals in each side of transverse section and the longitudinal nerve cord in each side which is located outer to the excretory canals. So as tracing the effect of five drugs namely Niclosamide, Mebendazole, Al - Bendazole, Exit, Lactolac, and five plant preperation namely Ricinus Cucurbita, communis pepo L., Citrullus colocynthis, Prosopis farcta and Chenopodium album. On the experimental infection of white mice and testing the effects of different doses of written substans of plants on egg production of this worm and their efficacy in expulsion or killing of the worms in the host. After using Niclosamide a reduction in adult helminthes in ratio100 % while other drugs such as Mebendazole, Al - Bendazole, Exit, and Lactolac gave fluculating results in reducing the number of eggs during (2,4,6,8) days afer administration and while their activities on reducing the number of helminthes were higher than reducing the number of eggs which means that their effects on the adult stage were more than their effect on the egg production.As concern the effect of medical plants Cucurbita pepo in concentration of 0.4 ml has more effect on reducing the number of eggs, and helminths after dissection during (2,4,6,8) days after administration. Generally, the medical plants used have fluculating effect in reducing the number of eggs which means that possibly all these doses were not enough to show significant differences after statistical analysis
1 ... 147 148 149 150 151 ... 230