عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 50 من أصل 11,746

التاثيرات المرضية للذيفان الخلوي المستخلص من بكتريا Campylobacter jejuni المعزولة محليا == Pathological Effects of the Cytotoxin Extracted from a Locally Isolated Campylobacter jejuni

اسم المؤلف: سيناء محمد علي السباهي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was done to investigate the presence of Campylobacter jejuni in bloody diarrheal stool collected from hospitalized children with gastroenteritis. Campylobacter was isolated from only 4 specimens of a total number of 186; upon identification three isolates were identified as C. jejuni while the fourth isolate was found to be C. coli.Isolation of campylobacters was done using a locally prepared modified, blood - free, charcoal selective medium. It was the first time in which such medium was used for cultivating Campylobacter locally. The efficacy of this medium was very clear in comparison with the ordinarily used blood containing medium for inhibiting almost all fecal flora.Biochemical and physiological tests were used to identify and differentiate C. jejuni from the other Campylobacter species. The antibiotic sensitivity test showed that all isolates were sensitive to erythromycin, chloramphenicol, amikacin and ciprofloxacin, while resistance was found for cephalothin, ceftriaxone cefotaxime, ampicillin and trimethoprim.Tissue culture technique was used to determine C. jejuni of high cytotoxin productivity using continuous cell lines (HeLa and Vero cell lines); this isolate was used for further investigations in the study.In this study, the cytotoxin of the highest cytotoxin producing C. jejuni isolate was extracted locally for the first time and purified, using gel filtration chromatography with Sephadex G100.The purified cytotoxin revealed a single band which was observed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) under the denaturing conditions. The molecular weight of the purified cytotoxin was approximately equal to 43 KDa as determined by PAGE.Using newly hatched chicks (as an animal model),the ID50 value was 3.71x10 4 cfu /ml. The ID50 decreased from 3.71x10 4 to 1.66 x 10 3 cfu/ml when 50 μg of cytotoxin was mixed with the bacterial suspension, this result reflects the role of cytotoxin on the pathogenesis of C. jejuni infection.In the present study, oral inoculation of newly hatched chicks with the C. jejuni isolate resulted in clinical and histopathological damages leading to bloody diarrhea similar to that observed in humans infected with C. jejuni.The post - mortal examination of chicks' viscera showed an accumulation of fluid in chick intestines which were distended with watery fluid; also there was obvious hepatomegaly with yellow spots, and swelling of the gall bladder. The associated infection with the C. jejuni cells and their cytotoxin induced more progressive tissue damage represented by a more severe intestinal distension and congestion.The histopathological examination of the small and large intestine of chicks infected with Campylobacter cells, showed mucosal sloughing, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells in the mucosal and submucosal layers, and accumulation of edematous fluid in the mucosal layer. The examination of chicks infected with Campylobacter cells and the cytotoxin revealed the presence of the same lesion, but more severely with the presence of hemorrhage in the lumen. These results could be important evidence of the role of cytotoxin as a virulence factor on the pathogenicity of C. jejuni

دراسة بعض الجوانب المناعية لبكتريا Listeria monocytogenes المعزولة محليا == Some Immunological study 0n Listeria monocytogenes isolated Locally

اسم المؤلف: ميادة فرحان درويش
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية التحري عن بكتريا Listeria monocytogenes في (148) عينه سريريه تضمنت( 123) عينة من مسحات مهبل عليا (High Vaginal Swab)، و25 عينة مشيمه (Placenta) من النساء المجهضات، وتم الحصول على اربعة عزلات من مسحات المهبل العليا بنسبة ( 2.70) % في حين لم تعزل من عينات المشيمه ، وتم تشخيص العزلات كيموحيويا وزرعت على الاوساط الانتقالية والتفريقية واختبرت حساسيتها للمضادات الحيوية المختلفة. اذ ظهر ان العزلات حساسه جميعها لمضادات الامبسلين والجنتاميسين ومقاومه لمضادات حامض النالدكسيك واللنكومايسين ، ودرست قدرة العزلات البكتيرية على استحثاث الجهاز المناعي في الفئران المختبرية المحقونة باحد العزلات من خلال اجراء عدد من الاختبارات المناعية ومنها الفعالية البلعمية، وقابلية التحول اللمفاوي، وفرط الحساسية الاني والاجل، اظهرت النتائج ان العزلة التي اعطيت الرمز M4 - Lis هي الاكفا بين العزلات . حضرت اللقاحات من بكترياListeria monocytogenes العزله Lis - M4 بطريقة التضعيف (Live attenuated listeria) ولاول مرة محليا ، وكذلك حضرت بطريقة القتل بالحرارة ( listeria Heat killed) . تم حساب قيمة الجرعة القاتلة النصفية للفئران المحقونة بالعالق البكتيري العزله Lis - M4 والجرعه القاتله النصفيه اللقاح الحي المضعف واللقاح المقتول بالحراره المحضرين منها على النحوالاتـي (107×2.12 , 107×3.3 , 104×2.6) وحدة مكونه للمستعمرات / 1مليلتروعلى التوالي. وتم اختيار التركيز 107و 106 , 108 لغرض تقويم التركيزالاكفا في تعزيز الاستجابة المناعية .قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في الفئران باستخدام الفحوصات الاتية فحص التحول اللمفاوي ، اختبار البلعمة ، واختبار فرط الحساسية الاني والاجل ، كما تم قياس الفعالية النوعية لانزيم الادينوسين دي امينيزAdenosin deaminase (ADA) وباستخدام تراكيز ثلاث CFU 108 , 107 , 106 في 1 مليلتر من اللقاحين والعالق البكتيري وبواقع ثلاث فئران لكل معاملة مع وجود مجموعة سيطرة حقنت بماء الملح الوظيفي . اظهرت النتائج ان اللقاح الحي المضعف هوالاكفاء وباستخدام جرعة منشطة واحدة بعد ثمان ايام من التلقيح حيث ظهر اعلى معدل لنسب الخلايا البلعمية الملتهمة واعلى نسب للخلايا اللمفاوية المتحولة واعلى معدل في تفاعل فرط الحساسية المتاخر والاني ، واعلى معدل للفعالية النوعية لانزيم ADA ، وان زيادة عدد جرع اللقاح المقتول بالحرارة ولحد الجرعة الثالثة يزيد من الاستجابة المناعية لهذا اللقاح . كذلك قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في النساء المجهضات نتيجة الاصابة ببكتريا الليستريا والمجهضات لاسباب اخرى ، اظهرت النتائج وبوضوح ارتفاع معدل كلا من γINF - ( 10.97 vs 6.25) وIL - 12 ( 289.19 vs 159.54) وبفارق عالي المعنوية (p<0.00) عند المقارنة بين مجموعة السيطرة والمجهضات بسبب الاصابة بالليستريا وكذلك ارتفاع قيم IgG , IgM , IgA وارتفاع كلا من C3 , C4 نتيجة الاصابة ببكتريا Listeria monocytogenes ، اكدت النتائج قدرة الليستريا على تحفيز الجهاز المناعي بصورة جيدة من خلال تحفيزها للحركيات الخلوية ، اعطت هذه الحقيقة دعما لامكانية استخدام لقاح الليستريا في دراسات اخرى بوصفه علاجا مناعيا ضد العديد من الامراض . | The present study was achieved to investigate the Listeria monocytogenes in clinical samples such as high vaginal swabs and placenta from women with repeated abortion beside samples of blood . Listeria monocytogenes was isolated in percentage of (2.7%) from high vaginal swabs (123) samples but not isolated from placenta 25samples,and the isolates diagnosed dependent on the biochemical test and growth characteristic on selective and differential culter media. The susceptabibility of isolates to different antimicrobial agent was studied , It appeared that all isolates were totally sensitive to Gentamycine and Ampicillin but they were totally resistant to Lincomycine and Nalidaxic acid . The activity of isolates to stimulate immune response in mouse injected by one of these isolates througe number of immune testing which it : phagocytosis , lymphocyte transformation assay , immediate and delayed hypersensitivity reaction ,The result show the Lis - M4 is the best between them . The vaccine prepared from listeria monocytogenes in tow ways , live attenuated listeria is first prepared from bacterium listeria monocytogenes in our country ; also heat killed listeria was prepared . Calculated LD50 in injected mice by Lis - M4 listeria and mice injected by live attenuated vaccine and heat killed listeria vaccine ,So the result as following ( 2.6 ×104 ;3.3 ×107 ; 2.12 ×107 ) in 0.1 ml respectively , and chose the 106 ,107,108 to evalute the best concentration the in stimulate immune response. Immune response in mice evaluated by using the following assay : lymphocyte transformation assay , phagocytosis , immediate and delated hypersensitivity , also Adenosine deaminase specific activity was studied , by use three concentration 106 , 107 , 108 in 0.1ml from tow vaccines and bacterial suspention in 3 mice to each test in addition to control group injected by phosphate buffer saline . The results of this study confirmed that , live attenuated vaccine in boosting dose after 8 days from vaccination is the best efficient and gave highest mean in phagocytosis , lymphocyte transformation assay and significant increase in delayed hypersensitivity and arthus reaction , and highest mean in specific activity in adenosine deaminase enzyme , also show increase vaccine dose stimulate immune response for this vaccine. The immune response in abortion women which infected by Listeria monocytogenes compared with abortion women as aresult different causes , the result observed increase mean in INF - γ (10.97 vs 6.25) and IL - 12 (289.19 vs 159.54 ) by compared with control group , also highest mean in IgG , IgA , IgM , and C3 , C4 as a result Listeria infection . This result amphesis the ability of Listeria to premote immune response through out stimulate cytokines and demonstrate used this vaccine as immunotherapy in several disease

التعبير السايتوبلازمي للانزيمات المحللة للبروتين MMP - 2, - 9 ومثبطاتها في النسيج TIMP - 1, - 2 وتعبير مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي Fas ligand في سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة البولية == Cytoplasmic expression of matrixmetalloproteinases (MMPs) Vs Tissue inhibitor of metalloproteinases (TIMP - 1, - 2) and expression of death receptor (Fas) , and it's specific ligand (FasL)in Transitional cell Carcinoma of the urinary bladder

اسم المؤلف: مي خليل اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة باستخدام 36 نموذجا نسيجيا مطمورا بشمع البرافين ماخوذا من مرضى مصابين بسرطان الخلايا الانتقالية في المثانةTransitional cell carcinoma (TCC ) بالاضافة الى 10 نماذج نسيجية طبيعية ماخوذة من معهد الطب العدلي . النماذج جميعها خضعت لتقنية التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي Immunohistochemistry للتحري عن التعبير السايتوبلازمي لانزيمات MMP - 2 وMMP - 9 ومثبطاتها النسيجية TIMP - 1 وTIMP - 2 فضلا عن التحري عن التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول mRNA لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL باستخدام تقنية التهجين الموضعي In situ hybridization .اظهرت نتائج هذه الدراسة ان نسبة اصابة الذكور الى الاناث بـTCC هي 1 : 3 وان معدل اعمار المصابين كان 60 سنة . واعتمادا على نتائج التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي اظهرت النتائج وجود زيادة معنوية في التعبير السايتوبلازمي عن MMP - 2(P<0.05) يقابلها انخفاض معنوي في التعبير عن TIMP - 2 في الانسجة السرطانية مقارنة بالانسجة الطبيعية (P<0.05) . وعندما صنفت النماذج السرطانية اعتمادا على التغيرات النسيجية المرضية وجد ان كلا من انزيمي MMP - 2 وMMP - 9 يملكان علاقة ايجابية بتطور درجات الورم Tumor grades اذ يزداد التعبير السايتوبلازمي عن هذين الانزيمين كلما ازدادت درجة الورم (p<0.05) ، (p<0.05) بالتتابع . الا انه لم تظهر اية فروقات معنوية في التعبير عن هذه الانزيمات ومثبطاتها بتطور مرحلة الورم Tumor stages (p>0.05) .اما نتائج التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL فقد اظهرت زيادة معنوية في التعبير عنهما في الانسجة السرطانية عندما قورنت بالانسجة الطبيعية (P<0.05) و(P<0.05) بالتتابع كما لوحظ ان تعبير الخلايا السرطانية الانتقالية عن FasL يتناسب طرديا مع تقدم كل من درجة الورم ومرحلته Tumor grade and stage فهناك فرق معنوي في التعبير عن FasL بين الدرجة الاولى والثالثة (P<0.05) وبين المرحلة T1 وT2(p<0.05 ) .اما تعبير هذه الخلايا عن المستقبل Fas فقد لوحظ انه يتناسب عكسيا مع تطور درجات الورم ومراحله فهناك فرق معنوي في تعبير هذه الخلايا عن Fas بين درجة واخرى (p<0.05) وبين مرحلة واخرى (p<0.05) . في الوقت الذي لم يظهر فيه تعبير الخلايا اللمفاوية عن Fas وFasL اختلافا مع تطور درجات الورم ومراحله(P>0.05) و(P>0.05) بالتتابع .وعندما قورنت المعلمات الثمانية احصائيا مع درجات تطور الورم ومراحله ظهرت علاقة طردية معنوية بين MMP - 2 ودرجة الورم (P<0.05) وبين MMP - 9 ودرجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(p<0.05) على التوالي . كما لوحظت علاقة طردية عالية المعنوية في تعبير الخلايا السرطانية عن FasL مع تقدم درجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(P<0.01) على التوالي .من هذه الدراسة نستنتج ان فرط التعبير عن كل من MMP - 2وMMP - 9 وFasL له علاقة بتقدم اورام TCC واجتياحها. | This study was designed by using 36 paraffin embedded tumor tissues obtained from TCC patients , and 10 normal bladder tissues obtained from forensic medicine institute . All specimens undergone to Immunohistochemistry technique to investigate the cytoplasmic expression of MMP - 2, MMP - 9 and their tissue inhibitors TIMP - 1 and TIMP - 2 ; in addition to the in situ mRNA expression of each death receptor (Fas) and its specific Ligand (FasL ) by using in situ hybridization technique. This study showed that male to female infection ratio was 3 : 1 and the mean age of patients was 60 years . Regarding immunohistochemical staining ; MMP - 2 cytoplasmic expression showed significant increase (P<0.05) with significant TIMP - 2 dicrease in tumor tissues compared with normal tissues (P<0.05).According to the histopathological criteria of malignant tissues ; MMP - 2 and MMP - 9 showed a positive relation with tumor grade progression ; so cytoplasmic expression of there enzymes was increased with tumor grade increase (p<0.05) , (p<0.05) respectively ; but there was no significant difference in there enzymes and their inhibitors expression with tumor stage progression (p>0.05).Rgarding in situ mRNA expression of Fas and Fas L ;results of this study reveled that a high significant expression in malignant tissues compaired with normal tissues (p< 0.05 ), (P > 0.05) respectively .Moreover ,FasL expression on transitional malignant cells has a linear increase with tumor grade and stage progression ; there was a significant difference in FasL expression between grade I and grade III(P < 0.05) and between stage T1 and T2 (P < 0.05) . while we found an inverse relation between Fas expression on these cells and tumor grades and stages progression ; there was a significant difference among grades and among stages (P < 0.05) , (P < 0.05) respectively. while there was no significant differences in Fas /FasL expression on lymphocytes and tumor grade and stage progression (P>0.05), (P>0.05) respectively. When we statistically compare the eight markers with tumor grades and stage ; we showed a significant linear relation between MMP - 2 and tumor grade (p<0.05) ; also between MMP - 9 and tumor grade and stage (p<0.01), (p<0.05) respectively. On the other hand , a highly significant liner relation was showed between Fas L expression on transitional malignant cells tumor grade and stage progression (p<0.01) , (p<0.01) respectively .From this study we conclude that overexpression of MMP - 2 , MMP - 9 and FasL are correlated with TCC invasion and progression

تنشيط النطف خارج الجسم باستخدام الاوكسيتوسين في مرضى العقم == In Vitro Sperm Activation by Oxytocin in the Infertile Patients

اسم المؤلف: مكارم قاسم داود اللامي
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي | فريال عبد المناف المهداوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على ١٨۰ مريضا يعانون من وهن النطف اثناء مراجعتهم لمعهد ابحاث الاجنة وعلاج العقم / جامعة النهرين. كان الهدف الرئيس لهذه الدراسة هو استقصاء تاثير اضافة الاوكسيتوسين الى السائل المنوي للمرضى لغرض التحقق من تحسين خصائص الحركة العائدة الى النطف، وكان التركيز على هذا الهرمون بوصفه مادة طبيعية ينتجها الجسم وله وظائف معروفة غير التي هدفت اليها هذه الدراسة. اما الهدف الثانوي فهو دراسة علاقة الترابط بين قيم بعض المعايير الكيمياحياتية للمني ومستوى الهرمونات التكاثرية للمصل من جهة واختبارات وظيفة النطف من جهة اخرى.تم تحليل السائل المنوي للمرضى قبل تنشيط النطف، ومن ثم تم تقسيم المرضى الى ثلاث مجاميع رئيسة متساوية. جمعت عينات الدم من مرضى المجموعة الاخيرة لغرض تعيين مستوى الهرمونات التكاثرية الاربعة في المصل وهى : التيستوستيرون، البرولاكتين، الهرمون اللوتيني، والهرمون المحفز للجريب. كذلك تم قياس مستوى بعض المعايير الكيمياحياتية للسائل المنوي لمرضى هذه المجموعة والتي تضمنت : البروتين الكلي، الكوليستيرول، الكالسيوم، انزيم الكرياتين كاينيز، والفركتوز.استخدمت طريقتان لتنشيط النطف خارج الجسم in vitro وهما : الطريقة المباشرة (باستخدام مزيج الاوكسيتوسين ووسط تحضير النطف) والطريقة غير المباشرة (باستخدام التقنية الطباقية البسيطة) وبتطبيق ثلاثة تراكيز من الاوكسيتوسين وهي : ۲،٤، و٦ وحدة دولية/مل لاختيار التركيز الاكثر تاثيرا على اختبارات وظيفة النطف. اظهرت نتائج الطريقة غير المباشرة حدوث تحسن معنوي ملحوظ (P<0.001) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف عند التركيز۲ وحدة دولية/مل مقارنة مع عينات السيطرة. وقد كان هناك ميلا الى تناقص درجة نشاط النطف مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. اما نتائج الطريقة المباشرة فقد اظهرت حدوث زيادة معنوية (P<0.05) في درجة نشاط النطف وقد كان هناك ايضا ميلا الى تناقص معيار الحركة هذا مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. بناء على هذه النتائج، تم استعمال التركيز۲ وحدة دولية/مل للاوكسيتوسين مع تطبيق الطريقتين المباشرة وغير المباشرة وذلك في حالتين هما وجود وسط تحضير النطف وعدم وجوده. اظهرت حصيلة الطريقة غير المباشرة لتنشيط النطف وعند وجود وسط تحضير النطف زيادة معنوية ملحوظة (P<0.001) في خصائص الحركة (النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف) في كلا المجموعتين (المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة) مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط. اما مقارنة المجموعتين معا فقد اظهرت بان افضل تحسن معنوي ملحوظ ((P<0.001 في خصائص الحركة كان في المجموعة المعاملة. عند غياب وسط تحضير النطف كان هنالك تحسنا معنويا (P<0.05) في خصائص الحركة في المجموعة المعاملة فقط مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط . عند تطبيق الطريقة المباشرة كانت النتائج مماثلة لما حدث عند تطبيق الطريقة غير المباشرة في حالة وجود وسط تحضير النطف. اما عند غياب وسط تحضير النطف لم يحدث اي تغيير معنوي (P>0.05) في تلك المعايير بعد فترة الحضانة. واظهرت النتائج ايضا بان هناك استجابات محفزة بالاوكسيتوسين (رغم انها غير معنوية) في تلك المعايير مقارنة مع مجموعة السيطرة. تشير جميع هذه النتائج الى التاثير المحفز للاوكسيتوسين عند التركيز۲ وحدة دولية/مل على خصائص حركة النطف، كذلك فان استعمال وسط تحضير النطف ادى الى دعم ذلك التاثير.تم تقييم علاقة الترابط بين المعايير الكيمياحياتية لبلازما المني ومعايير المني، وقد اشارت النتائج الى وجود ترابط موجب وبشكل معنوي (r = +0.29, P<0.05) بين مستوى الكوليستيرول وتركيز النطف، وبين مستوى الكالسيوم وكل من النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = +0.27, P<0.05) ودرجة نشاط النطف(r = +0.37, P<0.05) . بينما كان هناك ترابط سالب وبشكل معنوي بين مستوى الفركتوز من جهة وكل من تركيز النطف - 0.41, P<0.001) (r =، النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = - 0.28, P<0.05) ، ودرجة نشاط النطف (r = - 0.32, P<0.05) من جهة اخرى.عند مقارنة مستوى هذه المعايير الكيمياحياتية بين المجموعة المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة، كان واضحا بان الاوكسيتوسين ربما يكون سببا في فقدان الكوليستيرول من الغشاء البلازمي للنطف وبالتالي زيادة مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. كذلك فان الاوكسيتوسين ربما ادى الى تحوير نقل الكالسيوم عبر الغشاء البلازمي وبالنتيجة زيادة تركيز الكالسيوم داخل الخلية وانخفاض مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. بالاضافة الى الانخفاض المعنوي الملحوظ ((P<0.001 في مستوى الفركتوز في الوسط الخارجي والذي يشير الى استخدامه المتزايد من قبل النطف بسبب تنشيط الحركة.اظهرت نتائج فحوصات الهرمونات التكاثرية ارتفاعا معنويا ملحوظا ((P<0.001 في مستوىالبرولاكتين وانخفاضا معنويا (P<0.05)في مستوى الهرمون اللوتيني في الحالات المدروسة عند المقارنة مع القيم الطبيعية. وجدت علاقة ترابط سالبة وبشكل معنوي (r = - 0.29, P<0.05) بين مستوى برولاكتين المصل وتركيز النطف، وقد وجدت علاقة مشابهة ايضا (r = - 0.28, P<0.05) بين مستوى الهرمون المحفز للجريب في المصل وتركيز النطف.

تقييم لقاح الحصبة لدى الاطفال والبالغين باستخدام طرق مصلية مختلفة == Evaluation of Measles Vaccine in Children and Adults Using Various Serological Methods

اسم المؤلف: كريم مؤمن ليلو الساعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: بالرغم من نسبه التغطيه (العاليه ) من التلقيح في العراق الا ان وباء الحصبه مستمر في الحدوث وازدياد نسبة المعرضين للاصابه بمرورالزمن الى مستوى ينتشر فيه المرض بسهوله. ان السيطره على هذا مرض في بلدنا عمليه صعبه لسهولة انتقال الفيروس بين الملامسين بالاضافه الى عدم تطور البنيه التحتيه لانجاز عملية التلقيح ومراقبة الاصابات للحد من انتشار المرض . شمل البحث دراسة الاستجابه المناعيه ضد فايروس الحصبه لنمادج من المصل لاشخاص عراقيين من بغداد ولاطفال من زامبيا مدينة لوساكا .فيما يخص نماذج العراقيين تم اخذ 165 نموذج دم لاطفال وبالغين بواقع 95 ملقحين و70 مصابين من بينهم 34 مصاب بالحصبه على الرغم من التلقيح ضد المرض باعمار تتراوح بين ( 8 شهر - 30 سنه) وللمده ( من شباط / 2007 الى حزيران / 2007 ) , قسمت النماذج الى ستة مجاميع اعتمادا على المدى العمري . شخصت الاصابات التي وقعت عام 2007 سريريا في المراكز الصحيه ومن ثم تاكيدها مختبريا في مختبر الصحه العامه المركزي في بغداد , تم تقييم الاستجابه المناعيه المتخصصه ضد فايروس الحصبه باستخدام ثلاثة طرق مصليه مختلفه وهي : التعادل المصلي الدقيق وقياس الكلوبيولين المناعي صنف G وطريقة تثبيط التلازن الدموي اجريت هذه التجارب في مختبر تقييم اللقاحات الفايروسيه والزراعه النسيجبه في المركز الوطني للرقابه والبحوث الدوائيه . اظهرت نتائج طريقة التعادل المصلي ان جميع المشاركين بالدراسه يمتلكون الاجسام المضاده ( وهم الذين يمتلكون عياريه مساويه او اعلى من ( 128 ) المتخصصه ضد فيروس الحصبه ولكن بمستويات مختلفه , حيث كان مستوى الحمايه المصليه بنسبة 79% للملقحين و94,2% للمصابين وهذا يؤكد على بقاء الاجسام المضادة هذه لفتره طويله بعد حصول الاصابه والتلقيح . وكان معدل الانتشار المصلي لمختلف اعمار الملقحين : 923± 258 , 714± 336 , 705 ± 384 , 268 ± 289 , 278 ± 214 للاعمار (6 - 10 ),(11 - 15) , (16 - 20) ,(21 - 25) , (26 - 30) سنه بالتعاقب , اذ تبين عدم وجود مؤشر احصائي معنوي (P>0.05)عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه مع المصابين حديثا باعمار اقل من 6 سنوات, اما الملقحين بعمر (11 - 15) سنه قد اظهر وجود مؤشر احصائي مختلف (P<0.01) عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه , اما الفئات العمريه (16 - 20) , (26 - 30) سنه من الملقحين فقد اظهرت مؤشرات احصائيه مختلفه (P<0.01)بالمقارنه مع نفس الفئات العمريه من المصابين ولم تظهر الفئه العمريه (21 - 25) سنه من الملقحين مؤشر احصائي مختلف مع المقارنه لنفس الفئه من المصابين . اظهرت النتائج نسبه 97 - 100% للحمايه المصليه لفئة الملقحين في المدى العمري (6 - 10) سنه بعد ذلك تبدا بالانخفاض بتقدم العمر , وكانت نسبة الحمايه المصليه 95 - 100% للمصابين بالمرض من مختلف الفئات العمريه المشاركه في الدراسه . اجريت دراسه ايضا بقياس الحمايه المصليه بالاعتماد على عدد جرع اللقاح المعطاة باستخدام طريقة التعادل المصلي وكانت النتائج (1 : 838 ± 403) , ( (1 : 938± 244) للاشخاص الذين اعطوا 5 و6 جرع على التوالي واظهرت اختلاف احصائي(P<0.01) عن الذين اعطو (1 - 2)جرعه من لقاح الحصبه .تمت دراسة فترة بقاء الاجسام المضادة المتخصصة ضد فايروس الحصبه للملقحين والمصابين اذ وجدت بنسبة عاليه قبل مرور فترة 3 سنوات من اعطاء اخر جرعه من اللقاح حيث اظهرت مؤشر احصائي مختلف من الذين امضوا اكثر من 3 سنوات باستلامهم اخر جرعه , بينما لا توجد مؤشرات احصائيه مختلفه من اعطاء اخر جرعه لفترة (3 - 10)سنه واكثر من 10 سنوات , وهذا يعطي دليل بانخفاض مستوى الاجسام المضاده مع مرور الوقت سواء بعد التلقيح او الاصابه الطبيعيه . اظهرت نتائج قياس IgG بطريقة ELISA ان الحمايه المصليه تمثل 89% ضد الاصابه بفايروس الحصبه وتمثل نسبة 7.7% حمايه مصليه غير ثابته ونسبة 3.3% دون حمايه مصليه .وكانت اعلى نسبه من الحمايه المصليو 94,7% في الاعمار الصغيره (6 - 10) سنه من المشاركين في البحث واقل نسبه من الحمايه المصلية 75% للاعمار الكبيره (25 - 30) سنه . وبصوره عامه فان معدل عيارية الاجسام المضاده المتخصصه ضد فايروس الحصبه صنف IgG هي 2080 ±1837 لجميع الملقحين قيد الدراسة وبدون اختلاف احصائي معنوي بالمقارنه مع المصابين والتي كانت 1949 ±1838 , وان التلقيح بالجرعات التعزيزيه الاضافيه للفئات العمريه المناسبة تلعب دور كبير في تمنيع المجتمع للحد من حدوث الاوبئه وانتشارها . اما باستخدام طريقة تثبيط التلازن الدموي وجد 60 مشاركا من اعمار مختلفه يمتلك اجسام مضاده متخصصه مثبطه للتلازن الدموي , وعند الاخذ بنظر الاعتبارعيارية 1/8 كمؤشر للتعرض للاصابه وجد الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي 53,6 % , 73,6% للملقحين والمصابين بالتتابع , كما وجد انخفاض واضح لمستوى هذه الاجسام المضاده بتقدم العمر , وكما كانت النتائج التي حصل عليها هذا البحث باستخدام تقنية التعادل والاليزا يمكن الاستنتاج ايضا ان مقدارتركيز الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي ذو علاقه مباشره وطرديه مع نسبة الحمايه المصليه ضد النوع البري للاعمار ما بين (6 - 15) سنه , وكانت نتائج معظم افراد الفئه العمريه (16 - 30) سنه ذو نسبه واطئه من الحمايه المصليه وهذه النتائج ربما تعود ان المشاركين في الدراسه للفئه العمريه الكبيره كانت ولادتهم قبل الشروع ببرنامج التلقيح الموسع اوكونهم عاشو خلال فترة كانت فيها نسبه واطئه من التغطيه في التلقيح مما يؤدي الى انخفاض ونقص في الانتشار المصلي . اما نتائج دراسة المقارنه باستخدام الطرق المناعيه الثلاث في قياس الاستجابه المناعيه ضد الحصبه وجد هناك علاقه جبده ومباشره بين طريقتي التعادل وتثبيط التلازن الدموي ( r =0.87 , P<0.01 كما بينت النتائج ان طريقة تثبيط التلازن الدموي اقل حساسيه من طريقة التعادل , اما المقارنه مع طريقة قياس الكلوبيولين المناعي صنف الكلوبيولين المناعي IgGتعتبرمقياس دقيق وذات علاقه جيده ومباشره مع طريقة التعادل (r = 93 , P< 0.05) واخيرا يمكن الاستنتاج ان طرق التعادل هي الطريقه المثلى في قياس الاجسام المضاده ضد فايروس الحصبه وتعتبر الطريقه المناسبه لقياس مستوى الحمايه ضد المرض . اما بخصوص نماذخ المصول العائده للاطفال من زامبيا , شملت الدراسه (50) نموذجا , يعضها كان قبل التلقيح والبعض الاخر بعد (1 - 3 اشهر ) من تلقيح الاطفال بلقاح الحصبه المنفرد بعمر 9 اشهر , تم قياس الاجسام المضادة المتخصصه ضد فايروس الحصبه بتقنية التعادل المصلي في الاكار وباستخدام النوع البري لفايروس الحصبه المعزول من حالات مصابه بالحصبه واجري الاختبار باصابة خلايا كلية القرد الاخضر الحامله للمستلم CD150 واجري الاختبار بالتزامن مع المصل القياسي العالمي لغرض المقارنه ولغرض تحويل العياريه للنتائج الى الوحدات العالميه , تم اجراء الاختبارات في مختبر الاستاذه كرفن في جامعة جون هوبكنز الامريكيه.اما نتائج هذه الاخيبارات فقد كان قياس الاجسام المضاده للاطفال الزامبيين بعمر 9 اشهر قبل اخذ اللقاح 0.079 وحده عالميه وبنفس الوقت هي تمثل ما تبقى من الاجسام المضاده المكتسبه وهي اقل من مسوى الحمايه ضد المرض التي هي 0.120 وحده عالميه عند استخدام تقنية التعادل المصلي في الاكار , اما بعد الفتراة الزمنيه شهر واحد وثلاثة اشهر من التطعيم كان قياس الاجسام المضاده 0.606 , 0.493 وحده عالميه وبمؤشر احصائي P< 0.05 ,P<0.01 , على التوالي بالمقارنه بنتائج قبل التطعيم وهو اعلى من مستوى الحمايه ضد المرض , بينما كان قياس الاجسام المضاده بعد الاصابه الطبيعيه للاطفال بعمر 76 شهر 3.303 وبمؤشر احصائي P<0.005 وحده عالميه وهذه النتيجه تؤكد النتائج السابقه بان الاستجابه المناعيه بعد الاصابه الطبيعيه اعلى من نسبتها بعد التطعيم .وهذه النتائج تتفق مع نتائج الاستجابه المناعيه للاطفال العراقيين دون سن 6 سنواة فيما يخص مستوى الحمايه ضد المرض . | In this study, the potency of the live measles vaccine ( Rouvax / Sanofi pasture production) has been determined by an in vitro microtitration assay ,the results were considered comply and meet with the WHO requirement .The estimation of the prevalence measles antibody among serum samples from Iraqi and Zambian population after measles vaccination and natural infection. Regarding the Iraqi blood samples were collected from Iraqi children and adults with documentation of vaccinated or exposure to natural infection with an average age of (8 months - 30 years) .Samples were divided into six groups based on the age of participants .The individuals were infected during 2007 outbreak identified in the health center of their area and confirmed serologically in Center Public Health Laboratory (CPHL) in Baghdad; Serological assays were performed at the National Center for Drug control and Research ( NCDCR) to detect measles antibody . All 156 participants had detectable neutralizing antibodies, while the prevalence of protective level of neutralizing antibody titer (≥ 1 : 128), was found in 79% of vaccinated group and 94.2 % for participants with a history of measles cases suggesting that the rate of antibody persist longer when expressed exposure to circulating wild virus. When groups distribution of the Geometric Mean Titer (GMT) values was determined according to the age groups, revealed that the measles neutralizing antibody titers after vaccination were 923± 44.2 , 714 ± 68.7 , 705 ± 99.2 , 268 ± 91.4 and 278 ± 87.7 for groups 6 - 10 ,11 - 15 ,16 - 20, 21 - 25 and 26 - 30 years respectively . There was no significant statistical difference (p>0.05) for age group 6 - 10 when comparing with infected children (<6 years), 11 - 15 years group showed statistical significancet when compared with infected children (>6 years) ( P < 0.01) , 16 - 20 and 26 - 30 of vaccinated groups also showed to be statistically significant when comparing with similar age of infected individuals (P< 0.01 ) ; But there is no statistical significance for age groups 21 - 25 years when comparing with similar age of infected individuals ,(p> 0.05) The percentage of neutralizing protective level was 97 - 100% for (>6 - 10) years of vaccinated group and then decreased with increasing ages, while persistent (95 - 100%) for the different age groups infected with measles. Neutralizing antibody titers after five and six vaccine doses was a (1 : 838 (SEM) 100) and (1 : 938 (SEM) 93) respectively this is showing statistically significance when compared with individuals previously had received one and two doses (p < 0.001 and p < 0.01) respectively . In the study of persistence of neutralizing antibody after vaccination and natural infection the prevalence of measles antibody was very high before 3 years of the last dose and show significant differences when compared with group of individuals who had received the last dose after more than 3 years ( P<0.05) and there was no significant statistical differences between groups with the period 3 - 10 and >10 years after the last dose. therfore, no evidence was found of neutralizing antibody against measles which decreased to nonprotective levels from neutralizing result after both vaccination and natural infection. In the second assay, sera were tested for measles specific IgG by ELISA result showed that 89% of all individuals who participated in the research were seropositive against measles, 7.7% equivocal and 3.3% had shown seronegative. The highest seroposivity was ( 94.7% ) among individuals with the lowest age group (6 - 10 years), and the lowest seroposivity (75 %) was among the oldest age group (26 - 30 years). In general all individuals participated in this study have shown IgG level 2080± 197.5 mIU/ml of the vaccinated groups. when compared with participants previously exposed to measles natural infection that was found (1949 ± 262.5mIU/ml) with no statistically significant . When individuals grouped according to the increased age , a marked decline in IgG levels were observed, resulting in different levels of protection against measles and suggested that supplementary vaccination might play a role in vaccinating population before measles outbreaks . In the third assay the prevalence of measles antibody by hemagglutination inhibition has been found that 60 participants of different age groups have detectable hemagglutination inhibition antibody titer using the titer(<1 : 8) as indicator of susceptibility .It was found that 53.6% and 73.6% of hemagglutination inhibition seroprevalence among vaccinated and those with previous to natural infection respectively . Hence again a marked decline in hemagglutination inhibition antibody titers was observed with the increasing age of participants in this study. Regarding neutralizing and IgG - ELISA antibody, the results of hemagglutination inhibition suggest that the seroconvesion after vaccination correlated with the protective levels against wild type among age group (6 - 15) years and most of the participants with (16 - 30) years age group have a low percentage of hemagglutination inhibition antibody titers, and these results may be due to the fact that individuals were born before the implementation of routine immunization against measles in 1985 and lived in the time of low vaccination coverage resulting in waning of antibody or lack of initial seroconversion. In comparison of different methods that have been used in this study to evaluate specific measles immune response, it was found that a good correlation between hemagglutination inhibition and neutralization test ( r=0.87 , P<0.01).With measles virus , hemagglutination inhibition was considered less sensitive than neutralization test . Also was found a good correlation between IgG - ELISA and neutralization assays ( r=0.93 , P<0.05). It has been concluded that the neutralization assay is considered the gold standard in measuring antibodies properly and most important in clinical protection. About the Zambian children were used in order to know the level of immunity required for measles elimination after administration with different measles virus vaccine strain .Fivity serum samples were available from Zambia children in prevaccination , 1 - 3 months after vaccination at 9 months of age ,and infected children with ages (76 ± 65 months ) . A modified plaque reduction neutralization assay was conducted to measure measles antibodies ,using wild type of Measles virus strain to infect veroSLAM cells , Plasma samples were tested in parallel with the International World Health Organization (WHO) Serum Standard and results were transformed into mIU/ml .The tests were conducted in Prof. Griffin lab. of the molecular microbiology and immunology department in John Hopkins School of public health. In the present study,Zambia infants vaccinated at 9 months of age have had passive antibody (79 mIU/ml) lower than the protective level (≥ 120 mIU/ml) and the presence of passive antibody at the time of vaccination continued to have high titers of antibody after one month ( 493 mIU/ml ) (P> 0.01) and three months (606 mIU/ml ) ( P<0.05) of measles vaccination above the protective level against measles infection ,while the antibody levels have reached to (3303 mIU/ml) ( P > 0.005) in children with natural infection, these results showed in agreement with the results of Iraqi children under 6 years of ages regarding the level of protection against the disease .

عزل وتشخيص البكتريا العصوية (Bacillus) المنتجة لانزيمات التحلل المائي (الحلمهه) (Hydrolases) المتحملة للحرارة == Isolation and identification of Bacillus producing thermotolerant hydrolases

اسم المؤلف: عدنان حنون عباس
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 97 عزلة من البكتريا العصوية ( Bacillus ) من جمع 200 عينة تربة ومياه في الفترة مابين تموز/تشرين اول 2008 من مواقع مختلفة من العراق بعد التشخيص الاولي ( صبغة كرام, تكوين السبورات, انتاج الكاتاليز ) وتلقيح العينات على وسط ال Thermus agar وتنميتها على درجة 50°C لفترة 24 ساعة. اظهــــرت نتائج الاخــــــتبارات الكيمــوحيــــويـــــة ان 56 عزلة تربـــــــة صنفت على انها B. laterosporus 35.71% , B. circulans 16.07% , B. stearoyhermophilus 14.28%, B. polymyxa 12.5% , B. macroides 7.14%, B. mycoides 7.14% , B. lentus 3.57% , B. popilliae 1.78% , B. chitinosporus 1.78 , بينـــما صنفت 41 عـــــــــزلة مياه عــــلى انها B. laterosporus 26.82% , B. circulans 26.82% , B. stearothermophilus 4.87% , B. polymyxa 4.87% , B. macroides 9.75% , B. mycoides 2.43% , B. lentus 7.31% , B. popilliae 4.87% , B. filicolonicus 4.87% , B. brevis 2.43% , B. larvae 2.43% , B. pumilus 2.43% . اظهرت عزلات ال ( Bacillus ) المعزولة من التربة والمياه ايجابيتها في انتاج الانزيمات المتحملة للحرارة بعد اختبارها على وسـط الاكار الصـلب, كالبروتييــز ( 73.17% ) ( 89.28% ) , الاميـــــــــليز ( 51.21% ) ( 55.35% ) , اللايبيــــــــــــز ( 95.12% ) ( 91.07% ) , السيليليز( 60.97% ) ( 85.71% ) , والكايتينيز( 92.68% ) ( 85.71% ) , على التوالي, في فترات حضانـــة مختلفة ودرجة حرارة 50°C . من جهة اخرى, قيست قابلية عزلات ال ( Bacillus ) والبالغة نسبتها ( 41.23% ) على انتاج انزيمات التحلل المائي كالبروتييـــز والاميليــز واللايبيـــز والسيليليـــز والكايتينيــز, باجمعها, حيث اظهرت النتائج بان سلالات ال B. polymyxa كانت الافضل في انتاج البروتييز والاميليــز والسيليليــز, بينما سلالات ال B. lentus كانت الافضل في انتاج الكايتينيـــز, اما اللايبيـــزفقد تم انتاجــــــــه من قبل سلالات ال B. circulans , B. stearothermophilus , B. polymyxa , B. mycoides وB. lentus , على اوساط زرعية وفترات حضانة مختلفة ودرجة حرارة 50°C. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج الاميليز من العزلة B. polymyxa AS 4/5 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج والمحضر مختبريا متكون من 2% نشا, 1% تربتون, 0.05% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.02% كلوريد الكالسيوم , برقم هيدروجيني 7, وبدرجة حرارة 50°C لفترة 48 ساعة. تم استخلاص الاميليــز من الوسط الزرعي وتركيزه بواسطة السكروز, وقد اظهرت النتائج الحصول على الاميليز بفاعلية نوعية 2.36U/mg protein, في المــرحلة الاولى تمت تنقية الاميليز بطريقة كروماتوغرافيا الوجبة Batch Chromatography واعقبت هذه المرحلة استخدام عمود التبادل الايوني Ion exchange chromatography باستخدام المبادل DEAE - Cellulose column . وقد اظهرت النتائج الحصـــول على الاميلــــيز بفاعلية نوعية 6.76U/mg protein وبعدد مرات تنقية بلغ 2.86 وبحصيلة نهائية 18.65% . تمت ايضا دراسة توصيف الانزيم, واظهرت النتائج بان الفعالية الانزيمية تزداد بزيادة درجة الحرارة الى 90°C بينما اظهر الاميليزثباتييتـــه في درجات الحرارة 40°C, 50°C, 60°C , في حضانة لمدة 30 دقيقـــة, اما الفاعلية المثلى للانزيم بالرقم الهيدروجيني pH 5, اما ثباتية الانزيم فتكون في الارقام الهيدروجينية مابينpH 4 - 10 في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة, وبفاعلية متبقيــة قصوى 78.57% في .pH 5 اما النتائج المتعلقة بتاثير الايونات الفلزية على الانزيم, تبين ان لكلوريد الزئبق تاثير عالي على الانزيم بفاعلية متبقية 46.47% و40.84% بتركيز 5mM و10mM , على التوالي, اما كلوريد المنغنيز له تاثير قليل على الانزيم بفاعلية متبقية 79.81% و81.69% بتركيز 5mM و10mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة. تعمل المواد الكلابية مثل EDTA والمواد المختزلة mercaptoethanol على تثبيط الفاعلية الانزيمية, حيث تؤثر المواد الكلابية ( EDTA ) على الانزيم بفاعلية متبقية 57.74% و52.58% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, اما المــــواد المختزلـــــــــة ( mercaptoethanol ) يكون تاثيرها بفاعلية متبقية 51.17% و40.37% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقـــــــــة. | Ninety - seven isolates of Bacillus were obtained from 200 soil and water samples, collected between July to October / 2008, from different local sites of Iraq, by primary identification ( gram stain, endospore - forming and catalase production ) after incubation at 50°C for 24h on thermus agar. Biochemical test showed that fifty - six soil isolates were classified as B. laterosporus 35.71%, B.circulans 16.07%, B.stearothermophilus 14.28%, B.polymyxa 12.5%, B.macroides 7.14%, B.mycoides 7.14%, B.lentus 3.57%, B. popilliae 1.78% and B.chitinosporus 1.78%, whereas forty - one water isolates were classified as B.laterosporus 26.82%, B.circulans 26.82%, B.stearothermophilus 4.87%, B.polymyxa 4.87%, B.macroides 9.75%, B.mycoides 2.43%, B.lentus 7.31%, B. popilliae 4.87%, B.filicolonicus 4.87%, B.larvae 2.43%, B.brevis 2.43% and B. pumilus 2.43%. Thermotolerant enzymes were produced from soil and water Bacillus species as, protease ( 89.28% ) ( 73.17% ), amylase ( 55.35% ) ( 51.21% ), lipase ( 91.07% ) ( 95.12% ), cellulase ( 85.71% ) ( 60.97% ) and chitinase ( 85.71% ) ( 92.68% ) , respectively, after culturing on solid agar media with different incubation period, at 50°C. So, 41.23% of soil and water Bacillus isolates were detected for hydrolases production as ( protease, amylase, lipase, cellulase and chitinase ) together, and showed that B. polymyxa strains were the best bacteria in protease, amylase and cellulase production, whereas B. lentus strains was a good chitinase producer. Lipase was produced by several Bacillus strains as B. circulans, B. stearothermophilus, B. polymyxa, B. mycoides and B. lentus, after culturing on different media and incubation period, at 50°C. Thermotolerant amylase production conditions by B. polymyxa AS 4/5 were studied, the highest amylase production was observed when the bacteriaSummary IIwas cultured in medium containing 2% starch, 1% tryptone, 0.05% MgSO4, 0.05% NaCl and 0.02% CaCl2 with pH 7 and incubated at 50°C for 48h. Amylase was extracted from production medium and concentrated with sucrose, the specific activity of amylase was 2.36U/mg protein. Purification of amylase was performed by ion exchange chromatography Cellux - Carboxymethyl ( batch chromatography ), followed by second step of purification by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose column, the results showed that the specific activity was 6.76U/mg protein with 2.86 purification folds and 18.65% yield. Thermotolerant amylase displayed a wide temperature range of activity at 40 - 90°C with highest activity at 90°C and enzyme was stable at 40 - 60°C for 30min. The optimum pH for amylase activity was pH 5, the enzyme was stable at pH 4 - 10 for 30min at 50°C with maximum remaining activity 78.57% at pH 5. Treatment of thermotolerant amylase with metal ions showed that HgCl2 reduced amylase activity, the remaining activity was 46.47% and 40.84% at concentration 5mM and 10mM of HgCl2, respectively. Whereas MnCl2 had lower effect on amylase activity, the remaining activity was 79.81% and 81.69% at concentration 5mM and 10mM of MnCl2, respectively, after 30min at 50°C. Bacillus polymyxa amylase was treated with 2mM and 5mM of EDTA and mercaptoethanol, the two compounds had inhibitory effect on the enzyme, the remaining activity of EDTA treated enzyme was 57.74% and 52.58% at 2mM and 5mM, respectively, while the remaining activity of enzyme treated with 2mM and 5mM mercaptoethanol was 51.17% and 40.37%, respectively, after 30min at 50°C.

دراسات وراثية خلوية ومناعية لمرضى التهاب القولون التقرحي == Cytogenetical and Immunological Studies of Ulcerative Colitis

اسم المؤلف: زينب محمد طاهر جعفر الملا حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحصول على عينات الدم المحيطي والخزع النسيجية الماخوذة من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن والمرضى المصابين بسرطان القولون، ومن الجنسين كليهما، ومن مختلف الاعمار. تم سحب حوالي 10 مل من دم المرضى وقسمت العينة على ثلاثة اقسام، القسم الاول استعمل لاجراء الدراسات الوراثية الخلوية. والقسم الثاني لاجراء دراسات البيولوجيا الجزيئية. والقسم الثالث لاجراء الدراسات المناعية. اجريت الدراسات الوراثية الخلوية من اجل التعرف على التغييرات التي قد تطرا على المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بقياس معامل الارومةBlastogenic index ، ومعامل الانقسام Mitotic index، ومعامل التضاعفReplicative index ، واختبار التبادل الكروماتيدي الشقيقي Sister chromatid exchange، واختبار تردد الطفرة Mutation Frequency. وقد تم ذلك من زرع خلايا الدم المحيطي في الوسط الزرعي الحاوي على المادة المعلمة (Brdu - 5) والمادة المشطرةA) PH). اوضحت النتائج وجود انخفاض في المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بمعامل الارومة، ومعامل الانقسام، ومعامل التضاعف. بينما لوحظ ارتفاع في المعدلات التلقائية في التبادل الكروماتيدي الشقيقي لمرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء. كما ولوحظ هذا الارتفاع في معدلات التبادل الكروماتيدي الشقيقي عند المعاملة بالعقار الميثوتركسيت، اذ لوحظ وجود خلايا نامية في تراكيز واطئة من عقار الميثوتركسيت.اما عن ا لجانب البايولوجي الجزيئي فقد تم قياس تراكيز الحوامض النووية المتمثلة بما يلي : الحامض النووي الرايبوزي (RNA) والحامض النووي المزدوج الشريط ) (dsDNAوالحامض النووي الاحادي الشريط (ssDNA) وذلك بتنميتها في الوسط الزرعي في اوقات حضانة مختلفة (الزمن صفر، ثم بعد24 ساعة ، ثم بعد48 ساعة ، ثم بعد 72 ساعة من الحضانة ). اوضحت النتائج وجود اضطراب في نمو الخلايا الماخوذة من مرضى التهاب القولون التقرحي عند القياس بالاصحاء . كذلك تم قياس تراكيز الحوامض النووية المذكورة اعلاه في الخلايا المنماة في تراكيز عالية من عقار الميثوتركسيت والمتمثلة بتركيز 1 مايكروغم / مليلتر و2 مايكروغم / مليلتر لكل من المرضى والاصحاء بعد تنميتها لمدة حضانة 72 ساعة. اذ لوحظ عدم وجود فروقات معنوية لهذين التركيزين بين الاصحاء والمرضى. اما فيما يتعلق بنتائج التهجين في الموقع in situ hybridiza¬tion لغرض الكشف عن التعبير الجيني للجين الكابح للورم P53 والجين المثبط للموت المبرمج Bcl - 2 ، اذ تم اخذ الخزع النسيجية من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن وسرطان القولون وقياسها بالاصحاء. اوضحت النتائج وجود علاقة بين المورثين في مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون عند قياسهما بالاصحاء، اذ اعطى الجين الكابح للورم نسبة 66 % في الانسجة المصابة بالتهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون وهذا يوضح حصول طفرات تراكمية في الجين الكابح للورم P53 والذي يعطي مؤشر على التقدم نحو التسرطن ، وكذلك الحال مع الجين Bcl - 2 الذي اوضح زيادة بالتعبير الجيني لهذا الجين في النماذج النسيجية لمرضى التهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون والاصحاء. ان التحري عن جين P53 يعطي مؤشرا عن الطفرات التراكمية او الشذوذ في فعالياته ويمكن الاستفادة منه في اعتباره قيمة تشخيصية وانذارية. اما بالنسبة للجانب المناعي فقد استخدمت فحوص مناعية عدة متمثلة بقياس الكلوبيولينات المناعية (IgG , IgA , IgM)، والعامل المتمم (C3 & C4) وفحص الاضداد الذاتية لسايتوبلازم الخلايا العدلة (ANCA) Anti neutrophile cytoplasmic antibodies والذي يشمل c - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة من مجموع العينات، وفحص p - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة، وفحص الاجسام المضادة الذاتية للمتقدرات (AMA) الذي اعطى حوالي 48% نتيجة موجبة وفحص الاضداد المناعية الذاتية للشريط المزدوج للحامض النووي منقوص الاوكسجين dsDNA)) الذي اعطى 43% نتيجة موجبة، وفحص اضداد شحم القلب (Anticardiolipin ) الذي اعطى 40% نتيجة موجبة من مجموع العينات.اوضحت نتائج الفحوصات المناعية ارتفاع نسب الكلوبيولينات المناعية والعامل المتمم في مصل مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء وعلى مستوى احتمالية (P ≤ 0.01). ان نتائج الفحوصات المناعية المستعملة في هذه الدراسة تفسر وجود اضداد ذاتية في مصل مجاميع المرضى المصابين تحت الدراسة. وهذا يوضح كون المرض يمكن ان يعزى في جانب منها الى اسباب مناعية ذاتية. | The investigation has been done on the peripheral blood and biopsy samples which drawn from patients suffered from ulcerative colitis & colon cancer , the samples were taken from female and male of different ages . The collected blood samples were about 10 ml &each sample was divided into 3 parts , the first part used for cytogenetic studies,the second part used for molecular studies & the last part used for immunological studies . The cytogenetic studies has been done in order to define the damaging effect of the disease and the effect of the drug (methotrexate ) on the peripheral blood lymphocytes . these damages were manifested through the significant reduction in the blastogenic index (BI ) , mitotic index ( MI ) , & replication index ( RI ) . This accompanied by significant increase in the sister chromatid exchange ( SCEs ) . In addition to investigate the mutation fraction in the cells cultured in selective medium containing different concentration of the drug . The results also showed presence of mutant cells that can grow in increasing concentrations of methotrexate . The molecular studies include measuring the concentrations of different types of nucleic acids ( dsDNA , ssDNA , RNA ) done by culturing the peripheral blood cells in different incubation times which include T 0 , T1 ( 24 hrs ) , T2 (48hrs ) , T3 (48 hrs ) & T4 (72 hrs ) . The results indicate disturbance in cell cycle comparing with healthy individuals . There was no significant differences in types of nucleic acids between patients & controls , when culturing the resistant cells of blood lymphocytes in high concentrations of the MTX drug ( 1 μg/ ml , 2 μg / ml ) . On the levels of in situ hybridization , the colonic biopsies which collected from patients of ulcerative colitis and colon cancer were examined for gene expression of P53 gene and Bcl - 2 gene . The results indicated accumulated mutations in P53 gene in the inflammed colonic biopsies , this result give an indication for progression of carcinogenesis .While on the level on Bcl - 2 , the results showed increasing in the activity of the gene , resulting in increase in gene expression of Bcl - 2 gene . The gene expression of Bcl - 2 in inflamed colonic tissues were approximately similar to gene expression in tissues of colon cancer . this indicate that the chronic inflammation of UC may ultimately infected with colon cancer . The detection of P53 gene and Bcl - 2 gene in chronic ulcerative colitis give early detection for diagnostic & therapeutic and monitering purposes . The immunological studies conducted to insight into immunological disturbance associated with clinical expression of ulcerative colitis of Iraqi patients and to provide a locally made easy diagnostic tests that can be used in routine work and to study the recent serological markers , that may help in the diagnosis of IBD . The immunological profiles of the patients of UC were studied using different parameters . To assess the importance of antineutrophile cytoplasmic antibodies ( ANCA ) were found in enzyme linked immunoassay ( ELISA ) , for anti - myeloperoxidase (anti - MPO ) antibodies as (P - ANCA) and anti - propteinase - 3 (anti - PR - 3 ) antibodies for ( C - ANCA ) . The C - ANCA test give 50 % positive results , while the P - ANCA test give 55% positive results . The anti - mitochondrial M - 2 antibody was estimated in sera of UC patients and gives 48% positive results . The other serological marker used was the double strand DNA antibody and give 43 % positive results . Also the anticardiolipin antibody was examined and the test give 40 % positive results and this result indicate presence IgM / IgG concentrations in the sera of patients . The levels of immunoglobulins that include ( IgG , IgM , IgA ) as well as some of complement components ( C3 , C4 ) were used in estimation in the sera of the studied groups . The results showed an increase in the levels of immunoglobulins and the complement concentrations at levels of P ≤ 0.01 . The results of immunological markers in this study explained presence of auto antibodies and emphasized by increasing levels of immunoglobulins in the sera of the patients

دور بعض المتغيرات المناعية والاصابات الفيروسية في احداث الاجهاضات العفوية المفردة والمتكررة == The role of some immunological changes and some viral infection in single and recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا سعدي عبود كاظم
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لغرض تسليط الضوء على بعض المتغيرات المناعية والهرمونية وتشخيص بعض انواع الفيروسات المرافقة لحالات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر ، تمت دراسة (90) امراة تعرضن لحدوث اجهاضات عفوية مفردة ومتكررة غير مشخصة السبب ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (10) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، (40) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، اجريت المقارنة مع (30) امراة ، (15) امراة ذات حمل طبيعي و(15) امراة غير حوامل وبالفئات العمرية نفسها ، وعدت مجموعة السيطرة.بينت الدراسة الحالية النتائج الاتية : 1 - ارتفاع مستويات الاضداد الذاتية لدى النساء ذوات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر اذ سجل لديهن : ا - ارتفاع مستويات اضداد شحم القلب Anticardiolipin antibodies (ACA) وبصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ). ب - لوحظ هنالك ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgM) β2 - GP1 - IgM عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل ومجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).ج - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgG) β2 - GP1 - IgG عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة ومجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل). ء - ارتفاع مستويات اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).هـ - ابدت (14) امراة من المجموع الكلي للنساء المجهضات (15.6)% تفاعلا موجبا للاضداد النووية (ANA) بالقياس مع نساء السيطرة اللاتي كن جميعهن سالبات لهذين الاختبارين.2 - ارتفاع مستويات كل من : (IL - 2 , IFN - γ , TNF - α) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).3 - لوحظ هنالك انخفاض معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من : (IL - 10)، و(IL - 4) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).4 - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من الغلوبيولينات المناعية (IgM,IgA,IgG) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).5 - لوحظ هنالك ارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى جزء المتمم الثالث والرابع (C4 , C3) لدى النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).6 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات Anti - Toxoplasma Ab الصنف (IgM) في 18 حالة (20)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود (32) حالة %(35.6) من المجموع الكلي للنساء المجهضات يمتلكن اضداد نوعية لداء المقوسات صنف (IgG) . 7 - بلغت نسبة انتشار اضداد فيروس مضخم الخلايا (CMV) الصنف ((IgG في (12) حالة (13.3)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل ، في حين لوحظ وجود اضداد فيروس مضخم الخلايا صنف (IgM) في (25) حالة %(27.8) من المجموع الكلي للنساء المجهضات. 8 - وجود الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس الحميراء (Rubella virus) في (10) حالات (11.1)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود اضداد فيروس الحميراء صنف (IgG) في 21 حالة %(23.3) من المجموع الكلي للنساء المجهضات.9 - بلغت نسبة انتشار الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس القوباء البسيط (HSV 1 and 2) في 4 حالات (4.4)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل .10 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في مستوى الهرمون المحفز للجسم الاصفر(LH hormone) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).11 - ارتفاع مستوى هرمون البرولاكتين (Prolactin hormone) بصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).12 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين اضداد شحم القلب (ACA) وكل من الحركيات الخلوية (IL - 2 , IL - 4 , IL - 10, IFN - γ ,TNF - α) وكذلك ما بين اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) ،والحركيات الخلوية قيد الدراسة.13 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين هرمون الـ (LH) والحركيات الخلوية قيد الدراسة ,وكذلك ما بين هرمون البرولاكتين وكل من (TNF - α وIFN - γ وIL - 2 و(IL - 10، في حين لوحظ وجود علاقة ترابطية ذات قيمة معنوية (P<0.05) ما بين هرمون البرولاكتين و(IL - 4) .14 - لوحظ وجود اصابات مشتركة ما بين اضداد شحم القلب (ACA) والاصابات الفيروسية، وكذلك وجود اصابات مشتركة ما بين الانواع المختلفة للعوامل الخمجية في هذه الدراسة.س | To shed light on some immunological ,hormonal changes and identification of some viruses that are accompanied to single and recurrent abortion . The study were done on (90) undiagnosed aborted women at different stage of pregnancy. (20) had single abortion during first trimester of pregnancy , (10) had single abortion during second trimester of pregnancy , (40) had recurrent abortion during first trimester of pregnancy , and (20) had recurrent abortion during second trimester of pregnancy . The comparisons were done with (30) women , (15) had normal pregnancy and (15) unpregnant women at the same ages and considered as control groups .The results of this study showed : 1. Increased autoantibodies levels in women that had spontaneous abortion which is : A. Highly significant increased (P<0.01) in anticardiolipin antibodies (ACA) levels in the serum of aborted women at different stages of pregnancy , compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).B. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgM) (β2 - GP 1 - IgM) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).C. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgG) (β2 - GP 1 - IgG) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).D. Highly significant increased (P<0.01) in the level of anti - double stranded DNA (anti - dsDNA) in all groups of aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).E. (14) (15.6)% from total test of aborted women showed positive reaction to antinuclear antibodies (ANA) compared with control groups which were negative to this test. 2. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of (TNF - α , INF - δ , IL - 2) in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).3. Highly significant decreased (P<0.01) in the levels of (IL - 10, IL - 4) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).4. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of immunoglobulins (IgG,IgA,IgM) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).5. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of complement component (C3,C4) in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).6. Antitoxoplasma antibodies (IgM) were found in (18) (20)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while found in (32) (35.6)% from total aborted women have antitoxoplasma antibodies (IgG). 7. Anti CMV antibodies type (IgM) were found in (12) (13.3)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while anti CMV antibodies type (IgG) were found in (25) (27.8) % from total aborted women .8. AntiRubella antibodies type (IgM) were found in (10) (11.1)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while antiRubella antibodies type (IgG) were found in (21) (23.3)% from total aborted women .9. Anti (HSV 1,2) antibodies type (IgM) found in (4) (4.4)% from total aborted women at dofferent stages of pregnancy.10. Significant increased (P<0.05) in the levels of LH hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).11. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of prolactin hormone in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).12. There was a correlation between (ACA) and each of cytokines (TNF - α , INF - δ , IL - 8 , IL - 10 , IL - 4) but this correlation was non significant (P>0.05) and also between anti - dsDNA and all cytokines tested.13. There was non significant correlation (P> 0.05) between LH hormone and all cytokines tested and also between prolactin hormone and each of (TNF - α , INF - δ , IL - 2 , IL - 10) , while there was significant correlation (P<0.05) between prolactin hormone and (IL - 4). 14. There was Co - infection between (ACA) and infectious agents and also between different types of infectious agents in this study.

دراسة مرضية وجزيئية لبكتريا Helicobacter pylori المعزولة من المرضى المصابين بالقرح المعدية والمعوية == Pathological and Molecular study on Helicobacter pylori isolated from patients with gastric and duodenal ulcers

اسم المؤلف: رباب قاسم محمد الصكر
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت80 خزعة نسيجية من المرضى المصابين بامراض القرح المعدية والمعوية، اظهرت نتائج الاختبارات النسيجية المرضية هيمنة التهاب المعدة المزمن بنسبة %35 واتت قرحة المعدة ثانية بنسبة %22.5.اظهرت الدراسة كفاءة اختبار اليوريزالسريع في التحري عن هذه الجرثومة اذ استطاع ان يثبت وجود هذه الجرثومة في 62 خزعة نسيجية واتت الاختبارات النسيجية المرضية ثانية حيث ظهرت جرثومة H.pylori في 47 خزعة نسيجية في حين تمكن الاستنبات البكتيري من الحصول على 42 عزلة بكتيرية.اثبت فحص الحساسية الدوائية تجاه عشر مضادات حيوية كفاءة المضادين الحيويين السيفوتاكسيم والريفامبسين في القضاء على هذه الجرثومة فقد كانت نسبة المقاومة لهما %10 واتى المضادان الحيويان التتراسايكلين والدوكسي سايكلين ثانية بنسبة مقاومة %20،%30 كانت نسبة المقاومة للارثرومايسين والكلارثرومايسين، فيما كانت نسبة المقاومة للاموكسيسلين %100 ونسبة المقاومة %80 لكل من المترونيدازول والسبروفلوكساسين اما الجنتامايسن فكانت نسبة المقاومة له %50.تم نمطت العزلات وراثيا باستعمال بوادىء متخصصة بالكشف عن قطعة الدنا التي تمثل المورث ure AB والمساوية الى 492زوج قاعدة لوحظ احتواء ثمان عزلات على هذا المورث فيما خلت العازلتان HP7 وHP9 من هذا المورث باستعمال تقنية الـ PCR.اظهرت نتائج النسق البلازميدي ان %50 من عزلات H.pylori تحوي بلازميدات، فقد احتوت العزلات (HP3, HP4, HP6, HP8) على بلازميدات صغيرة وامتلكت العزلتان (HP4,HP6) بلازميدا كبيرا فضلا عن بلازميدها الصغير فيما خلت العزلات الباقية من البلازميدات.اظهرت نتائج التحييد البلازميدي باستعمال صبغة بروميد الاثيديوم بوصفها مادة محيدة وبتركيز 3000 مايكوغرام/ مليليتر فقدان العزلة HP4 بلازميدها الكبير والصغير نتج عن ذلك فقدان تلك العزلة HP4صفة انتاج انزيم اليوريز وكذلك فقدانها المقاومة للمضادين الحيويين المترونيدازول Metronidazole والسروفلوكساسلين Ciprofloxacillin.اظهر التحول الوراثي Gentic transformation بين الدنا المستخلص من العزلة HP4 وبين العزلة HP1 التي عدت خلية كفوءة اكتساب الاخيرة صفة المقاومة للمترونيدازول اذ استطاعت ان تنمو على اوساط انتخابية تحوي 32 مايكوغرام/ مليلترمن هذا المضاد.اجريالتحول الوراثي ثانية بين دنا العزلة Hp4 وبكتريا تابعة لجنس اخر هي بكتريا Escherichia coli MM294 اظهرت نتائج هذه التجربة اكتساب بكتريا E.coli صفة انتاج انزيم اليوريزو المقاومة للمترونيدازول والسبروفلوكساسين من بكتريا H.pylori. | A 80 biopsies were collected from gastric & duodenal ulcers, showed dominance of chronic gastritis and gastric ulcers in aratio of %35 and %22.5, respectively.Rapid urease test, histopathological examination and cultural for detection of Helicobacter pylori, Showed the presence of this bacterium in 62 biopsies for urease test, in 47 biopsies for his topathological examination and in 42 biopsies in culture examination.Antibiotic susceptibility tests againt 10 isolates of H.pylori, Showed %10 resistance for cefotaxim & Rifampin, %20 resistance for Tetracyclin & Doxycyclin, %100 resistance for Amoxycillin, %80 resistance for Meteronidazole & ciprofloxacin and %50 resistance for Gentamicin.Genotyping by specific primer in PCR reaction for ureAB gene, Showed that 8 isolates were positive for this gene, where 2 isolates were negative.Plasmid profile for H.pylori isolatez Showed small single plasmid in each of HP3, HP4, HP6 and HP8 isolates and single small and larg plasmids for HP4 and HP6 isolates whereas other isolates were free of plasmids.Curing experiment for HP4 isolate by using ethidium bromide as acuring agent in aconcentration 3000 Mg/ ml, Showed the cured derivation lost their Urease production trait and resistance to meteronidazole & ciprofloxacin.Transformants resulted from transformation experiment between HP4 total DNA & HP1 as acompotent cell, Showed acquired ability to grow on selectve medium containing 32 Mg/ ml of metrronidazole.Another transformants, resulted from transformation experimeat between HP4 total DNA and Escherichia coli MM294 as acompetent cell, Showed acquired ability for Urease production & ciprofloxacin & Meteronidazole resistance.

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: دنيا فريد سلوم
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

في نماذج عنق (HPV) التنميط الجيني للفيروسي الحليمي البشري الرحم لنساءعراقيات باستخدام تقنيتي الوقت الحقيقي - سلسلة تفاعل البلمرة والصفوف الجينية == Genotyping of Human Papillomavirus in a sample of Iraqi women with cervical abnormalities by using Real - Time PCR and Macroarray

اسم المؤلف: حلى يونس فاضل السعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التحري عن العلاقة بين اصابة الفيروس الحليمي البشري (HPV) وحالات الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم في النساء العراقيات. تضمنت الدراسة 122امراة لديهن اعراض سريرية لاصابة عنق الرحم, 110 امراة منهن تميزت بنمو الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم او السرطانية, حيث كان 40.9 % من تلك النساء كان لديهن اصابة بالفيروس الحليمي البشري, اما 12(16.7%) امراة المتبقية تميزت بنمو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم بالرغم من وجود التهاب مزمن والتي جمعت خلال عام 2010. تضمنت مجموعة السيطرة 10 نساء والتي تميزت بغياب كل من التغيرات الخلوية, العلامات السريرية والاصابة بالفيروس الحليمي البشري. اظهرت نتائج مسحات عنق الرحم وجود نوعين من خلايا عنق الرحم غير الطبيعية هي : اصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية قليلة الخطورة (LSIL) التي شملت 70% من حالات الاصابة بالفيروس, واصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية عالية الخطورة (HSIL) التي شملت 26% من حالات الاصابة الايجابية. بينما 4% من مجموع الاصابة الكلية تمثلت بالنساء ذو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والالتهاب المزمن . هي الصفة المميزة للاصابة بالفيروس. تلك الصفة ترافقت مع 100% بوجودKoilocytosisالثاليل التناسلية الظاهرة للعيان و16.7% ترافقت مع الثاليل المستوية (غير الظاهرة). تشير دراسة الدنا الفيروسي باستعمال تجربتي سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي(PCR Real­Time) والصفوف الجينية(MacroArrays) التي طبقت لاول مرة في العراق الى وجود الفيروس الحليمي البشري بنسبة 35.6% في كل المجاميع المدروسة. تشير النتائج الى وجود 17 نمط جيني مختلف للفيروس الحليمي البشري بين 47 امراة مصابة باستعمال تقنية الصفوف الجينية, اربعة عشر من هذه الانماط الجينية كانت من الانماط عالية الخطر والتي شكلت 82.35% من مجموع الانماط والانماط الجينية المتبقية كانت من الانماط قليلة الخطر والتي شكلت 17.56% من مجموع الانماط. دى النتائج المهمة للدراسة الحالية تشير الى وجود 10 انماط جينية مختلفة ربما سجلت للمرة الاولى في النساء العراقيات ( 31 - , 45 - , 51 - , 52 - , 53 - , 58 - , 59 - , 66 - , 68 - , 44 - HPV ). لنمط الجيني 16 - HPV هو السائد على الانماط الجينية السبعة عشر, شكل هذا النمط مع الانماط الجينية (59 - , 39 - , 66 - , 6 - HPV) الانماط الخمس الاكثر شيوعا في العينات الموجبة. كما اظهرت الدراسة بان النساء ذوات الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والمصابة بالفيروس تحمل الانماط الجينية 16 - HPV و59 - HPV. كما شخصت سبعة انماط جينية مختلفة في عينات الثاليل التناسلية الظاهرة وهي (16 - , 6 - , 11 - , 39 - , 59 - , 66 - , 44 - HPV ). اشارت النتائج الى ان 32 (68.09%) من بين 47 امراة مصابة كانت لديهن الانماط عالية الخطر فقط, سواء كانت الاصابة بانماط مفردة او متعددة, بينما ثمان نساء (17.2%) كان لديهن الانماط عالية وقليلة الخطر سوية, وسبع نساء (14.89%) كان لديهن الانماط قليلة الخطر فقط. استعمل المجهر الالكتروني النافذ للتحري عن الجزيئات الفيروسية في عشر عينات موجبة للدنا الفيروسي وذو تغيرات خلوية مختلفة, حيث اظهرت النتائج وجود الجزيئات الفيروسية في ست عينات بمستويات مختلفة من المرضى واربع عينات لم تظهر جزيئات فيروسية. استخدمت تجربة التحول اللمفاوي لتقييم الحالة المناعية للمصابين. حيث وجدت نسبة التحول عالية في النساء ذوات الخلايا الطبيعية في عنق الرحم والمصابة بالفيروس (اصابة كامنة), بينما انخفضت نسبة التحول اللمفاوي في النساء ذوات الخلايا غير الطبيعية في عنق الرحم . امتلكت 40% تقريبا من حالات الثاليل التناسلية معدل عالي للتحفيز التكاثري للخلايا التائية عند مقارنتها بمجموعة السيطرة. اضافة الى ذلك كان التحفيز التكاثري للخلايا التائية مستقلا احصائية عن كل من نوع الاصابة, المحتوى الفيروسي والمجاميع العمرية. استخدمت تجربة تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي للكشف عن الفيروس وكميته لثلاثة عشر نمط جيني الاكثر ترددا بين المستويات المختلفة للنمو غير الطبيعي للخلايا الطلائية لعنق الرحم في الحالات : قبل الاورام, الاورام والسيطرة الاصحاء(132 عينة). اظهرت نتائج فحص سلسلة البلمرة بان 35 حالة موجبة من 47 حالة اصابة فيروسية التي شملت 74.5% من مجموع الاصابات الكلية. بينما الحالات المتبقية (12 حالة ) التي مثلت 25.5% من مجمو الاصابات الكلية لم يكشف عنها بهذه التقنية. لذلك قدر عدد نسخ الدنا الفيروسي لاغلب الانواع الفيروسية عالية الخطرفي 33 عينة موجبة بمستويات مختلفة من التغيرات الخلوية وعينتين موجبتين ذوات خلايا طبيعية لعنق الرحم . توزع المحتوي الفيروسي ل 33 عينة اعلاه من 1×10 الى 9.4×106 نسخة /مل بمعدل (4.17×104 نسخة /مل). اما العينتين المتبقيتين كانتا خارج قيم المنحى القياسي لذا قدرت ب 5× 107 و1×109 نسخة /مل تقريبا. صنف المحتوى الفايروسي لل35 عينة اعلاه كالاتي : 46% من العينات كمحتوى فيروسي عالي, 34% كمحتوى فيروسي منخفض و20% كمحتوي فيروسي متوسط. استخدم اختبار الصفوف الجينية لفحص 68 عينة, 36 عينة منها كانت موجبة و32 عينة كانت سالبة باختبار سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي. حيث وجدت الانماط الجينية عالية الخطر باستعمال هذه التقنية في (36/35) 97% من العينات الموجبة, بينما العينة المتبقية كانت سالبة لفحص الصفوف الجينية. كما وجدت الانماط الجينية قليلة الخطر وعالية الخطر المحتمل في تلك 35 عينة الموجبة والتي لم يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي فهي الانماط (6 - , 11 - , 53 - , 66 - HPV). اما فيما يخص العينات السالبة في فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي حيث فحصت باستعمال اختبار الصفوف الجينية ووجدت الانماط الجينية في 12 عينة منها, الانماط هي : (44 - , 66 - , 53 - , 11 - , 6 - , 58 - , 39 - HPV). تبين مما تقدم بان فحص الصفوف الجينية يتحرى عن 8 انماط جينية لا يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي, تلك الانماط شكلت 32.84% من تردد الانماط و33.33% من الحالات الموجبة التي تمتلك عدة انماط وهذا يعكس العامل المهم الذي يفضل فحص الصفوف الجينية في التحري عن الفيروس. لذا يبدو اختبار الصفوف الجينية طريقة دقيقة واكثر حساسية لكشف وتنميط اصابات الفيروس الحليمي البشري مقارنة مع فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي. | The present study was conducted to investigate the relationship between Human papillomavirus (HPV) infection and cervical cytological abnormalities in Iraqi women. One hundred twenty two women were included in this study with a cervical infection. A sample of 110 women with abnormal cytology cervical dysplasia / cancer, 45 of which 40.9% had HPV infection and 12 (16.7%) women had chronic infection with normal cytology during 2010. A control group with 10 women of normal cytology and no HPV infection was included in study for comparison. Pap smear test results showed two types of cervical cytological abnormalities, low squamous intraepithelial lesion (LSIL) which comprised of 70% of HPV positive cases, and high squamous intraepithelial lesion (HSIL) which comprised of 26% of HPV positive cases. Whereas 4 % out of the total risk group was represented in women with normal cytology. Koilocytosis is pathognonomic for HPV infection. Furthermore, Koilocytosis was accompanied with 100% with genital wart presence and 16.7% was accompanied with flat wart presence. HPV - DNA studied using Real - Time PCR and MacroArray assay (GenoArray) which applied for the first time in Iraq indicates the presence of HPV - DNA in 35.6% of all tested groups. Results indicate the presence of 17 different HPV genotypes among 47 infected women by using macroarray technique. Fourteen of these HPV genotypes which comprised of 82.35% were high risk (HR - type) and 17.56% (3/17) were low risk (LR - type).One of the important results in the present study indicates the presence of ten different genotypes which may be recorded for first time in Iraqi women (HPV - 31, - 44, - 45, - 51, - 52, - 53, - 58, - 59, - 66 and - 68 types). Out of 17 genotypes HPV - 16 was the predominant one, this genotype together with genotypes 59, 6, 39 and 66 comprised of the five most common types detected in HPV positive cases. Moreover, percentage of HPV - 16, and - 59 were extended to involve women with normal cytology. Seven different genotypes - 6, - 11, 16, 59, - 39, - 66 and - 44 have been identified in genital wart specimens. Results indicated that 32 (68.09%) out of 47 infected women had HR type alone, whether single or multiple types, while eight women (17.02%) had HR types in association with LR types and seven women (14.89%) had LR type only. Transmission electron microscope (TEM) was used for viral particles detection from ten HPV DNA positive samples with different cytological changes. Results indicated the presence of viral particles in six samples with different grades of disease and four samples showed no viral particles. To evaluate the immune status of patients lymphocyte transformation assay was applied. Results indicated that transformed lymphocyte were found to be high in women with normal cytology which may have HPV as a latent infection, while they were decreased in women with abnormal cytology. Approximately 40% of genital wart cases have higher mean of proliferative T cell response when they were compared with control group. However, proliferative T cell responses were statistically independent on HPV infection type, viral load and aging group. Real - time PCR assay was employed for HPV detection and quantitation (viral load estimation) from the range of HR - HPV DNA 13 genotypes most frequently found in different grades of cervical intraepithelial neoplasia, cervical tumors and health controls from (132 samples). Results showed that out of 47 positive cases 35 cases can be detected by real - time PCR which comprised of 74.5%. Failures in detection by this technique included 12 cases which comprised of 25.5% of the positive samples. Therefore, viral DNA copies number for the most HR - HPV types in cervical samples was determined from 35 sample with low and high - grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN I, II, III and Squamous Cell Carcinoma), and with normal cytology. However, the viral load of the 33 samples spread over a wide range from 1×10 to 9.4×106 copies/ml (mean 4.17×104 copies/ml). In addition, two samples were around the standard curve values as : approximately 5×107 and 1×109 copies/ml considered. Viral load was estimated approximately 46% constituted as high viral load, 34% as low viral load and 20% as slightly high viral load. Macroarray was applied in 68 samples, 36 of which were positive and 32 were negative by the real - time PCR test. High - risk genotypes were found in 35/36 (97%) real - time PCR positive samples, whereas remaining two samples were negative for HPV DNA (false - positive) by macroarray assay. The low - risk and probable high - risk (PHR) HPV genotypes were detected in the 35 HPV - positive samples which are not detected by real - time PCR included genotypes : HPV - 6 (in three samples), - 11, - 53 and - 66 (in two samples for each). HR, PHR and LR HPV genotypes were detected by macroarray in the 11/31 HPV - negative samples in real - time PCR which comprised of genotypes : - 39, - 58, - 66, - 11, - 6 and - 44. The GenoArray (GA) is capable of detecting 21 HPV multiple genotypes, including 8 types not detecting in real - time PCR. These types represented 32.84% of HPV types frequency and 33.33% of HPV positive cases had multiple types, this may reflect the important factor potentially favoring the GA for HPV detection. Therefore, the GA genotyping assay appears to be more accurate and sensitive technique for the detection and genotyping of HPV infections than real - time PCR one.

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

اسم المؤلف: ايمان جواد كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.

انتاج وتنقية وتوصيف البلانتريسين من سلالات محلية لبكتريا Lactobacillus plantarum == Production, Purification and Characterization of Plantaricin from Local Strains of Lactobacillus plantarum

اسم المؤلف: ولاء شوكت علي
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 118 عزلة تعود لجنس عصيات الحليب Lactobacillus من الخضر المتخمرة والعجائن الحامضية، واخضعت جميع هذه العزلات للفحوصات الزرعية والمجهرية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية بغية تشخيصها حتى النوع واظهرت النتائج ان 73 عزلة منها تعود للنوع Lactobacillus plantarum ، منها 48 عزلة من الخضر المتخمرة و25 عزلة من العجائن الحامضية، وكانت هذه البكتريا سائدة في الخضر المتخمرة اذ بلغت نسبة عزلها 73.85% بينما بلغت نسبتها في العجائن الحامضية 47.17% . تم التحري عن قابلية عزلات بكترياLb.plantarum على انتاج البلانتريسين باستخدام 3 طرائق هي : الاشرطة المتقاطعة(flip - streak method) والتنقيط (spot on the lawn method) والانتشار بالحفر(well diffusion method) ضد 12 نوعا من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام والمتضمنة : Staphylococcus aureus وStaphylococcus epidermidis وListeria monocytogenes وEnterococcus feacalis وLactobacillus acidophilusو Bacillus spp. وPseudomonas aeruginosa وPseudomonas fluorescens وSerratia marcescens وSalmonella typhi و. Klebsiella sppو Escherichia coli. واظهرت النتائج ان 8 عزلات كانت منتجة للبلانتريسين بطريقة flip - streak و7 عزلات كانت منتجة له بطريقة spot on the lawn بينما استطاعت 12 عزلة من انتاجه بطريقة الانتشار بالحفر،مما يدل على ان انتاج البلانتريسين في الاوساط السائلة كان افضل من انتاجه في الاوساط الصلبة،وعدت طريقة الانتشار بالحفر هي الافضل في التحري عن انتاج البلانتريسين. اظهرت البلانتريسينات المنتجة من عزلات Lb.plantarum فعالية عالية ضد P. aeruginosa عندما ابدت 83.3% من هذه العزلات فعاليتها التثبيطية ضد هذه البكتريا بينما اظهرت 16.7% فقط من هذه العزلات تاثيرها التثبيطي ضد بكتريا Lb. acidophilus ولم تبد اية عزلة من عزلات Lb.plantarum اية فعالية تثبيطية ضد بكتريا Bacillus spp. ، هذا وكانت العزلة Lb.plantarumVGW8 هي الافضل في انتاج البلانتريسين اذ تمكنت من انتاجه في الاوساط الصلبة والسائلة بالطرائق الثلاثة اعلاه، فضلا عن فعاليتها التثبيطية العالية تجاه 10 انواع من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج البلانتريسين من العزلة VGW8 Lb.plantarum واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان الوسط المحضر مختبريا في هذه الدراسة والذي اطلق عليه وسط الانتاج السائل ورمز له (PLM) المتكون من 2% كلوكوز و2% ببتون و1.5% مستخلص الخميرة و1.5% مستخلص اللحم و0.25% من ملح K2HPO4 و0.5% من مادة tween 80 ،برقم هيدروجيني(pH) 5 وبدرجة حرارة30 م وبحجم لقاح 2% من المزروع البكتيري الذي يحتوي على 1×109 خلية /مل ولمدة حضانة 12 ساعة في ظروف لاهوائية. تمت في هذه الدراسة ايضا تنقية البلانتريسين اذ سخن المستخلص الخام للبلانتريسين بدرجة 80 م لمدة 10 دقائق قبل البدء بالتنقية والتي تضمنت خطوتين الاولى هي الاستخلاص بالمذيب العضوي (البيوتانول) والثانية الفصل بطريقة كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود (Sepharose 6B). وقد اظهرت النتائج الحصول على البلانتريسين بفعالية نوعية 10666.67 وحدة/ملغم بروتين وبعدد مرات تنقية بلغ 13.067 وبحصيلة نهائية 12%.اطلق على البلانتريسين النقي اسم بلانتريسين VGW8 نسبة الى العزلة المنتجة Lb.plantarumVGW8 .كذلك فقد تم توصيف البلانتريسين المنقى VGW8 واظهرت النتائج ان وزنه الجزيئي كان 14400 دالتون بطريقة الترحيل الكهربائي بوجود المادة الماسخةsodium dodecyl sulfate(SDS) . واظهرت فعالية البلانتريسين النقي ثباتية عالية في قيم من الرقم الهيدروجيني(pH) تراوحت ما بين 3 الى 9 ،اذ احتفظ بكامل فعاليته عند تلك القيم لكنه فقد نصف فعاليته في pH( 2 و10) وكامل فعاليته في pH القاعدي (11 و12).كما اظهرالبلانتريسين ثباتية عالية تجاه المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 100) م لمدد زمنية مختلفة شملت (10 و30 و60) دقيقة ويلاحظ من النتائج انه في الوقت الذي تمكن فيه البلانتريسين من الاحتفاظ بكامل فعاليته عند المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 80 ) م للمدد الزمنية اعلاه، لم يتمكن من استرداد سوى نصف الفعالية عند تعرضه لدرجة حرارة 100 م لمدة 60 دقيقة او عند تعرضه لدرجة حرارة المؤصدة (121 م) لمدة 15 دقيقة. كما بينت النتائج طبيعة البلانتريسين البروتينية عندما فقد كامل فعاليته بعد معاملته بالانزيمات الحالة للبروتين ( ببسين وتربسين وبابين) في حين لم تتاثر فعاليته عند معاملته بالانزيمات (لايبيز والفا - اميليز ولايسوزايم).كذلك فقد اظهر البلانتريسين ثباتية عالية بعد معاملته بالمذيبات العضوية(كلوروفورم واسيتونايترل وداياثيل ايثر وايثانول وميثانول وايزوبروبانول وتولوين واثيل اسيتيت)، والمنظفات (توين80 وتوين20 وترايتون اكس100و EDTA ويورياو SDS) ، وبعض الايونات الفلزية (الصوديوم والبوتاسيوم والكاليسيوم والباريوم والزنك والحديد) حيث استعاد كامل فعاليته بعد معاملته بها لكن فعاليته انخفضت الى النصف بوجود ايوني المغنيسيوم والمنغنيز.تمت ايضا دراسة فعالية البلانتريسين VGW8 ضد P.aeruginosa وS.aureus واظهرت النتائج ان البلانتريسين يمتلك الفعالية القاتلة للبكتريا عندما انخفضت اعداد البكتريا مع زيادة تركيز البلانتريسين الى 320 وحدة /مل، فقد اظهرت النتائج ان هذا التركيز كان كافيا لقتل بكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين من التعرض للبلانتريسين ولقتل بكتريا S.aureus بعد اربع ساعات من التعرض له. ايضا فقد تمت دراسة الفعالية التحللية للبلانتريسين VGW8 واوضحت النتائج انه يمتلك الفعالية الحالة للغشاء الخلوي عندما انخفضت الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 600 نانوميترمن 0.59 الى 0.17 لبكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين فقط من التعرض للبلانتريسين وبتركيز 320 وحدة/مل ، ومن 0.51 الى 0.20 لبكتريا S.aureus بعد 4 ساعات من التعرض للبلانتريسين وبالتركيز نفسه(320 وحدة/مل).وتمت ايضا دراسة تاثير البلانتريسين VGW8 على نفاذية الخلية وبينت النتائج ان الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 260 نانوميتر قد سجلت زيادة من 0.5213 الى 2.9112 لبكتريا P.aeruginosa ومن0.4614 الى 2.6405 لبكتريا S.aureusدليلا على خروج الحامض النووي (DNA) من الخلايا نتيجة لتحللها.يتضح من هذه النتائج ان هدف البلانتريسين VGW8 هو الغشاء الخلوي. | A total of 118 isolates of Lactobacillus were obtained from fermented vegetables and sourdoughs. All the isolates were subjected to the cultural, microscopical and biochemical examinations for the identification of species. The results showed that 73 isolates belongs to Lactobacillus plantarum, 48 isolates from fermented vegetables and 25 isolates from sourdoughs. Lb. plantarum was dominate in fermented vegetables with 73.85% percentage of isolation while in sourdoughs the percentage of isolation was 47.17%.Three methods (flip - streak, spot on the lawn and agar well diffusion methods) were used to detect of plantaricin production by Lb. plantarum isolates against 12 species of Gram positive and Gram negative bacteria which included, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Enterococcus feacalis, Lactobacillus acidophilus, Bacillus spp., Escherichia coli, Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens and Klebsiella spp. The results showed that 8 isolates produced plantaricin by flip - streak method, 7 isolates produced it by spot on the lawn method, while by the agar well diffusion method ,12 isolates were able to produce plantaricin, suggesting that the production of plantaricin was best in the broth medium than in the solid medium. The agar well diffusion method was considered the best one for detection of plantaricin production. Plantaricins of Lb. plantarum isolates exhibited high activity against P. aeruginosa when 83.3% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against this bacterium, whereas the lowest activity was against Lb. acidophilus when 16.7% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against it. No activity against Bacillus spp. was observed.Lb. plantarum VGW8, was the best isolate for plantaricin production. It produced it in both broth and solid media by all detection methods used in this study, this plantaricin exhibited a broad spectrum of activity against 10 species of both Gram positive and Gram negative bacteria. The optimum conditions for plantaricin production by Lb. plantarum VGW8 were determined and the results showed that the best production medium was production liquid medium (PLM) that prepared in this study, it composed of 2% glucose, 2% peptone, 1.5% yeast extract, 1.5% beef extract, 0.25% K2HPO4 and 0.5% tween 80,with pH 5, temperature 30°C for 12 hours under anaerobic conditions and inoculum size of 2% of cells number 1×109cell/ml.Purification of plantaricinVGW8 was made by heating crude plantaricin at 80ºC/10min and then purified by two steps method including extraction with n - butanol followed by gel filtration chromatography on Sepharose 6B column, the results showed that the specific activity was 10666.67AU/mg protein with 13.067purification folds and 12% recovery yield. The purified plantaricin was called plantaricin VGW8 according to the producer isolate Lb. plantarum VGW8.Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of plantaricin VGW8 was 14400 Dalton by sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Plantaricin VGW8 activity was stable at pH values (3 - 9) but 50% of its activity was lost at (2 and 10) pH values, and whole activity was lost at extreme alkali pH values(11 and 12).Also, plantaricin VGW8 showed high thermostability at different temperatures (20 - 100)°C for (10,30 and 60)min, it remained active after being treated with (20 - 80)°C for the periods above, but it retained only 50% of its activity after treatment at 100°C for one hour and autoclaving treatment (121°C/ 15 min).The results showed that the activity of plantaricin VGW8 disappeared when it treated with proteolytic enzymes (pepsin, trypsin and papain), whereas it retained whole activity when treated with lipase, lysozyme and α - amylase, indicating pure proteinaceous nature of purified plantaricin.As well as, treatment of plantaricin VGW8 with organic solvents (chloroform, acetonitrile, diethyl ether, ethanol, methanol, isopropanol, toluene and ethyl acetate), surfactants (tween 80, tween 20, triton X - 100, SDS, EDTA and urea) and the metal ions : Na, K, Ca, Ba, Zn and Fe, showed no effect of these treatments on the activity of plantaricin VGW8.While treatment with Mn and Mg reduced its activity to the half.The antibacterial activity of plantaricin VGW8 was studied against P. aeruginosa and S.aureus. It was observed that plantaricin VGW8 has bactericidal effect when the numbers of cells were decreased with increasing of plantaricin VGW8 concentration to 320 AU/ml. The results showed that the complete killing of P. aeruginosa was observed after 2 hours of incubation with 320 AU/ml of plantaricin VGW8, while the same effect was observed after 4 hours on S.aureus. Also, the lytic activity of plantaricin VGW8 was studied, and the results showed that exposure P. aeruginosa and S.aureus to 320 AU/ml of plantaricin VGW8 led to decrease absorbance at 600nm from 0.59 to 0.17 for P. aeruginosa within 2 hours and from 0.51 to 0.20 for S.aureus within 4 hours. Moreover, the effect of plantaricin VGW8 on the cell permeability was studied and the results showed that absorbance at 260nm increased from 0.5213 to 2.9112 for P. aeruginosa and from 0.4614 to 2.6405 for S.aureus, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis. This means that the cell membrane is the target of plantaricin VGW8.

تاثير الذيفانات المعوية للبكتريا ETEC Escherichia coli في الخلايا السرطانية والخطوط الخلوية وفي حيونات التجارب == Effect of ETEC Escherichia coli enterotoxins on cancer cells, cell lines and laboratory animals

اسم المؤلف: الهام سعيد عبد الكريم بنو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study aimed investigating the cytotoxic effect of crude enterotoxins on normal and cancer cells both invitro and invivo. the present study included isolation and identification of Pathogenic Escherichia coli, From Children (under 3 - years for both sexes) infected with severe diarrhea, from March to June 2005, and as follows : *Sixtysix Islates (60%) were obtained from 110 samples. These Isolates were Identified according to morphological and biochemical tests, and for confirmation by Api - 20E System. *Serological identification for these Isolates( 66 isoleates )showed that only 12 (18%) isolates were belonged to Enteropathogenic group of E. coli.(EPEC).* The results of using Suckling Mouse Assay(SMA) showed that only 13 (19.6%) out of 66 Isolates were capable of producing heat - stable (ST) enterotoxin, therefore these isolates belonged to Enerotoxigenic group of E.coli ( ETEC).Whereas the EPEC isolates were all negative for this test. According to the toxin activily that was evaluated by (SMA) the Isolate No. 99 determined as the most efficient Isolate in producing the (ST). The same Isolate (99) of E. coli showed its ability to produce heat Labile enterotoxin (LT), by using Rabbit lileal Loops.The Isolate (99) revealed for sensitivity to Ampicillin, Gentamicin, Nalidixic acid and Nitrofurantoin antibiotics, but resistance to Amoxicillin , Cefixime, Cephallothin, Ciprofloxacin and trimethoprim.This Isolate also showed its ability to adhere by using the special media that contain the congo red stain, and by using hemagglutination test because it posseses the colonization factors antigen (CFA/1) and CFA /III However it failed in producing hemolysin enzyme that hemolyze red blood cells The toxin reserved Its activity at temperatures (20,40,60 and 80)c0 , but loss some of its effect at 100 c0 and kept its activity at 4 c0 for (24 - 48) hrs, It was found that the highly toxic activity reduced in the PH 5,9.5. The time ofmice response to enterotoxin was determined. At 90 minutes, as the maximum of response and 180 minutes as the optimum time of response. Enterotoxin was purified partially by using sepharose CL - 6B, and the molecular weight for (ST) was 17378 dalton. LD50 of both bacterial Suspension and crude enterotoxin in mice was 2.13 × 108 cell/ mice, and 48.75 mg/ mice respectively. The crude enterotoxin showed more severe effect than the bacterial suspension in spleen, Intestine, and Lung, while the effect of bacteria suspension was more severe in Liver.The therapeutic dose of crude enterotoxin was determined according to LD50 in mice it was revealed that the concentration of 390 mg/kg have the activity in reducing the tumor volume when injected directly in tumor, with an inhibition ratio between(83 - 89)% beginning at 8th day of the 25th injecting days. While when the toxin was injected intraperitonealy, the inhibition ratio of tumor was Less than the injection in tumor it self. The dose 97.5 mg/kg that given daily for 25 days showed more efficiectly in reducing the tumor in percent of 73.3. The Comparitive study between the relative volume of tumor in treated group and the relative volume of tumor in control group revealed that there was significant difference statistically important all over the treatment time.. The necrosis and fibrosis were the most important characteristics in treated groups after histopathological examination which appearantly with the progress of treatment associated with volume decrease of tumor, so it was found that the last stage of treatment showed the cancer cells presented like small Land Surrounded by dense fibrous tissue. The treatment by using all toxin concentration in both ways of injections on murine bone marrow cells, showed significant increase in blast Index (BI) and mitotic Index (MI) when compared with control.The toxic effect of crude extraction was studied in tumor cell lines (in vitro), Hep - 2 and AMN - 3 and the normal cell line REF, the study showed that the toxic effect depend on the type of cells, the dose and the time of exposure. This study revealed that the AMN - 3 Cells were more Susceptible from that of Hep - 2 Cells and the high concentration caused inhibition to the growth of the tumor cells, Specially the concentration of 60000 Mg/ml, Also growth and multiplication of REF cells. Whereas the concentrations of 1875and 3750 Mg/ml were found as an inhibitor to REF Cells. Partially purified enterotoxin (ST) showed that it's effect was found to in hibit Hep - 2, AMN - 3 and REF cells at 72 hrs of exposure and has an inducer effect to growth of cells at 24 hrs of exposure in all concentrations,but the effect was differ in the time of exposure at 48hrs,that the three concentrations (1.986,3.965and 7.95) Mg/ml showed inducing effect ,while the three hight concentrations(15.86,158.6 and1586) Mg/ml showed inhibition effect to AMN - 3 cells.Also the hight concentrations(30000 and 60000) Mg/ml werefound as inhibitor to REF cells at( 48,72)hrs,but they were inducer of growth at 24hrs of exposure. The toxicity effects of crude enterotoxin were studied in human Lymphocyte multiplication (in vitro) , and the higher concencentration showed decline in Mitotic index (MI), but It was induced cells to transform in present of mitogen, so there was inverse in blast index (BI) when compare with the control.

دور الببتيدو كلايكان في امراضية بكتريا Staphylococcus saprophyticus == Role of Peptidoglycan in Pathogenicity of Staphylococcus saprophyticus

اسم المؤلف: عذراء صالح فليح الهيتي
اسم المشرف: مي طالب فليح | حارث جبار فهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: من مجموع 300 عينة ادرار تم الحصول على 71 عزلة عائدة لجنس الـ Staphylococcus من مريضات مصابات بخمج المجاري البولية واظهر عائدية 16 عزلة للنوع S. saprophyticus تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية ، كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية ، استخدمت عملية التكسير الميكانيكي (Mechanical disintegration) باستخدام المازج (vortex) والحبيبات الزجاجية ، والتكسير باستخدام جهاز الذبذبات فوق الصوتية لتكسير جدار خلية العزلةS67 saprophyticus S. والحصول على خلايا متكسرة تمثل الجدار الخلوي الخام ومن ثم استخلاص وتنقية جزئية للببتيدوكلايكان بالاعتماد على الهضم الانزيمي بوساطة انزيمات الـ DNase وRNase وPronase وTrypsin فضلا عن استخدام مركب سلفات دودسيل الصوديوم (SDS) ومواد كيميائية اخرى ؛لازالة الاغشية السايتوبلازمية والمحتويات البروتينية الاخرى ؛ وبذلك تم الحصول على ببتيدوكلايكان نقي خال من الشوائب وهذا ما اكده الفحص بالمجهر الضوئي والالكتروني وقد اظهر الببتيدوكلايكان حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة مقارنة بالجدار الخلوي الخام والذي اظهر عدة حزم بروتينية ؛ مما يدل على كفاءة الطريقة المستخدمة في الاستخلاص. تضمن البحث دراسة امراضية بكترياS67 S. saprophyticus المسببة لخمج المجاري البولية في الفئران اذ حقنت مجموعة من الفئران الاناث البيض عبر الاحليل وباستخدام القثطرة بتركيز 109 خلية جرثومية / مليلتر ، وحقنت مجموعة اخرى من الفئران بتركيز 3 ملغم / 0.2 ملليتر من الببتيدوكلايكان المستخلص منS67 S. saprophyticus والمنقى جزئيا وتم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) تغييرات نسيجية ممرضة تمثلت بانكماش الكبيبة الكلوية واحتقان الاوعية الدموية للكلية وارتشاح الخلايا الالتهابية وفقدان طبقة الكيراتين في المثانة سواء اكانت محقونة بالجراثيم ام بالببتيدوكلايكان . حضر المصل المضاد للببتيدوكلايكان في الحيوانات المختبرية (الارانب البيض) وتبين ان الببتيدوكلايكان ممنع جيد عند حقنه في الارانب ، وتم اثبات وجود الاجسام المضادة للببتيدوكلايكان باستخدام اختبار الندف بالانابيب واختبار التلازن الجرثومي (Bacterial agglutination) حيث كون المصل المضاد للببتيدوكلايكان المعزول من جدار بكتريا S.saprophyticusS67 تلازنا مع جراثيم البكتريا نفسها وايضا اعطى تلازنا مع العزلة القياسية ATCC6538 S. aureusمما يشير الى وجود تفاعل تصالبي لهذه الاضداد. تم دراسة التاثيرات السريرية للببتيدوكلايكان في الارانب المحقونة، اذ لوحظ ارتفاع في مستوى اليوريا والكرياتنين وانزيمي GPT وGOT والكلوكوز في الدم وانخفاض مستوى انزيم الفوسفتيز القاعدي( Alkaline phosphatase ) مما قد يدل على وجود خلل وظيفي في عدد من الاعضاء مثل : الكلى ،و الكبد ،و البنكرياس نتيجة تاثرها بالببتيدوكلايكان | Seventy one isolates of Staphylococcus were obtained from 300 urine samples isolated from female patients with urinary tract infection. sixteen of these isolates were identified as S.saprophyticus by biochemical tests , the sensitivity of the isolates to different antibiotics were also studiedMechanical disintegration method using vortex and glass beeds in addition of Ultrasonicator were used for preparing disintegrated cell wall which represent Crude cell wall , Extraction and partial purification of the peptidoglycan were accomplished by enzymatic digestion using DNase ,RNase ,Pronase and Trypsin in addition to SDS and other chemicals to remove the cytoplasm membrane and other protein contents, so we obtained pure peptidoglycan that were confirmed by light and electron microscope, the partial purified peptidoglycan showed one protein band compared with crude cell wall which showed many protein bands when performed in poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing conditions which improved the efficacy of method that employed in extraction of peptidoglycan The pathogenicity of the S.saprophyticus in urinary tract infection of mice was studied, Female mice were injected transurethrally by using catheter with 109 germ cells concentration /ml, other group of mice were injected by 3mg concentration /0.2ml of partial purified peptidoglycan which extracted from S.saprophyticus , The histopathological changes in the organs (Kidney and Bladder) whether it was injected with germ or the peptidoglycan were observed Antiserum of the peptidoglycan was prepared in the laboratory animals (white rabbit) the results revealed that the peptidoglycan was a good immunogen, The presence of antibodies was shown by tube flocculation test and bacterial agglutination test.Thiese antibodies cause agglutination with S.saprophyticus by using microtiter plate and also give cross - reaction with ATCC5538P S.aureusThe clinical effects of the peptidoglycan in the injected rabbit were also studied, The levels of Urea,Creatinine ,GOT, GPT ,Glucose were increased in the blood where the level of Alkine phosphatase was decreased which indicate that the peptidoglycan caused dysfunction of several organs like kidney,liver and bladder

تاثير مستخلصات المركبات الثانوية لنبات الكبوسين الكبير Tropaeolum majus في بعض جوانب الاداء الحياتي للذبابة المنزلية Musca domestica (Diptera : Muscidae) ودورها في نقل الفايروس العجلي Rotavirus == Effect of secondary compounds extracts of Tropaeolum majus on some biological aspects of Musca domestica (Diptera : Muscidae) and role for transfer of The Rotavirus

اسم المؤلف: نور هادي حسن الشمري
اسم المشرف: هادي مزعل خضير الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء سلسلة من التجارب المختبرية في مختبر بيئة الحشرات / كلية العلوم للبنات / جامعة بابل من شهر تشرين الثاني لعام 2015 الى شهر ايلول من عام 2016 , وهدفت الدراسة الحالية الى اختبار فعالية المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير Tropaeolum majus (Brassicales : Tropaeolaceae) في بعض جوانب الاداء الحياتي للذبابة المنزلية Diptera : Muscidae)) Musca domestica, اضافة لدور الحشرة في نقل الفايروس العجليRotavirus , وكذلك دراسة نسجية حول تاثير مستخلص المركبات الثانوية في مبيض والقناة الهضمية للحشرة . وايضا عزل وتشخيص المركبات الفعالة الموجودة في المستخلصات باستخدام تقنية Gas - chromatography Mass Spectrometry. تفوق مستخلص المركبات الفينولية الخام على مستخلصي المركبات التربينية والقلوانية الخام , حيث بلغت معدلات نسب هلاك البيض في مستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام (90 و90 و62.3)% في تركيز (20)ملغم/مل على التوالي مقارنة مع (19.2 و18.4و 13.2)% في معاملات السيطرة . ظهر الطور اليرقي الاول اكثر حساسية للمستخلصات حيث بلغت معدلات نسب الهلاك نتيجة المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام (85.2 و77.8 و67.3)% وبتركيز (20)ملغم/مل على التوالي . اما العذارى فلم تسجل اي نسبة هلاك نتيجة المعاملة بمستخلصات المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية . بلغت معدلات نسب الهلاك التراكمي للادوار غير البالغة نتيجة المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام ( 100و 93 و81)% على التوالي عند تركيز20) )ملغم/مل بالمقارنة مع (20 و18 و15)% في معاملات السيطرة . اما مدة النمو للاطوار غير البالغة فقد بلغت (12.3) يوما عند المعاملة بمستخلص المركبات القلوانية الخام وبتركيز ((20ملغم/مل مقارنة مع ((10.2 يوما في معاملة السيطرة. انخفضت اوزان العذارى والانتاجية ونسبة الفقس البيوض عند المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام من ( 0.30و 0.32 و0.35) غم و(125 و127 و129.2) بيضة/انثى و(93 و92 و(92.5 % في معاملات السيطرة على التوالي الى (0.09 و0.10 و0.13) غم و(0 و74.6 و80) بيضة/انثى و(15 و20 و(25%على التوالي وبتركيز (20)ملغم/مل . ساهمت الذبابة المنزلية في نقل الفايروس العجلي Rotavirus ميكانيكيا وذلك بعد تعرض الذبابة المنزلية الى عينة من الغائط الحاوية على الفايروس ولفترة زمنية قدرها (48) ساعة وكذلك وضعت عينة الغذاء ( معكرونية) داخل القفص ولمدة (48) ساعة ايضا , ومن خلال تقنية RT - PCR تبين وجود الفايروس في الغذاء . تاثر المبيض والقناة الهضمية للحشرة بمستخلص المركبات الفينولية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير , حيث اظهر تركيز (2.5)ملغم/مل من مستخلص المركبات الفينولية الخام تاثيرا في مبيض حشرة الذبابة المنزلية بعد ((72 ساعة من البزوغ ,حيث ظهر تحلل في انسجة الخلية البيضية والحويصلات المبيضية وزيادة في سمك الغمد المبيضي , اما تركيز (1)ملغم/مل لنفس المستخلص اثر في تركيب المعي المتوسط للحشرة وسبب تجمع في الفجوات داخل الخلايا الطلائية وتنخر في العضلات الطولية والدائرية , وكذلك سبب مستخلص المركبات القلوانية الخام عند تركيز (5)ملغم/مل تغيرات في تركيب المعي المتوسط لحشرة الذبابة المنزلية بعد (72) ساعة من البزوغ حيث ظهر في المقطع (A) زيادة في سمك جدار المعي المتوسط وتنخر في العضلات الدائرية والطولية مع وجود للفجوات داخل البطانة الطلائية , اما في المقطع (B) سبب المستخلص اختزال واضمحلال في طبقة العضلات الطولية والدائرية مع تجمع مجموعة من الفجوات داخل طبقة البطانة الطلائية . تم عزل وتشخيص المركبات الفعالة في مستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير باستعمال تقنية غروماتوغرافيا - المزود بطيف الكتلة (GC - MS) حيث تم عزل 12)) مركبا فعالا في مستخلص المركبات الفينولية حيث وجد ان مركب Acetic Acid الذي يمتلك زمن احتجاز (3.097) مولاري نورمالي (م ن) هو اول المركبات انفصالا بينما مركب Tri butyl acetyl citrate الذي يمتلك زمن احتجاز ( (25.710م ن كان اخر المركبات انفصالا , كما تم تحديد (30) مركبا فعالا في مستخلص المركبات التربينية الخام حيث كان مركب 2,4 Dithia pentane الذي يمتلك زمن احتجاز ((2.916 م ن اول المركبات انفصالا بينما مركب Phthalic acid, 2 - ethylhexyl phenyl ester الذي يمتلك زمن احتجاز (31.196) م ن كان اخر المركبات انفصالا , وشخص ايضا ثمانية مركبات فعالة في مستخلص المركبات القلوانية وكان مركب Acetic Acidالذي يمتلك زمن احتجاز ((3.398 م ن اول المركبات انفصالا بينما مركب 6 - Octadecenoicacide , Methyl ester,(Z) - الذي يمتلك زمن احتجاز قدره (23.887) م ن اخر المركبات انفصالا . | A series of labratory experiments were conducted in the labratory of insect ecology / college of science for women Babylon university since 2015 - 2016 , and the present study aimed to test the activity of the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds for Tropaeolum majus ( Brassicales : Tropaeolaceae ) on some biological aspects of house fly Musca domestica ( Diptera : Muscidae) . as well as the role of insect for transmission the Rota virus , and histological study about the effect of secondary compounds on ovary and digestive tract of insect . Isolation and identification of active compounds in these extracts by using Gas - chromatography Mass spectrometry . The extract of crude phenolic compounds was more effective than the extracts of terpenoid and alkaloid compounds , The mortality rates of eggs in the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds ware (90 , 90 , 62.3)% respectively at concentration (20)mg/ml compared with (19.2 , 18.4 , 13.2)% respectively at control transaction . The first larval instar was more sensitive for these extracts , the mortality rates of first larval instar at the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds ware (85.2 , 77.8 , 67.3)% respectively of concentration (20)mg/ml . The pupal stage was not effected from treated with extracts . The mortality rates of immature stages for crude phenolic , alkaloid and terpenoid compounds ware (100, 93 , 81)% respectively of concentration (20)mg/ml , compared with (20 , 18 , 15 )% respectively at control transactions . The developmental period of immature stags was (12.3) days at the extracts of crude alkaloid compounds of concentration (20)mg/ml, compared with (10.2) days at the control transaction . The pupal weight , female productivily and percentage of aggs hatching which were treated with extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds more decreases from (0.35 , 0.32 , 0. 30)gm , (129.2 , 127 , 125)egg/female and (93 , 92 , 92.5)% at control transaction respectively to (0.13 , 0.10 , 0.09)gm , (80 , 74.6 , 0)egg/female and (25 , 20, 15)% respectively at concentration (20)mg/ml . The house fly contributed in transmission of Rota virus when the house fly pensions to faeces sample which was containing the virus at time (48) hours as well as the insect pensions to the food (mekrunet) at time (48) hours from RT - PCR showed that the virus was founded in food . The ovary and digestive tract of insect was effected for the extracts of crude phenolic and alkaloid compounds of Tropaeolum majus , the concentration of (2.5)mg/ml of crude phenolic compounds appeared the effect on ovary of insect after (72) hours from emergence , appeared analysis in tissue of eggs cell , ovarian follicles and increasing in the thickness of oval sheath , while the concentration (1)mg/ml for this extracts effect on the structure of midgut of insect , which caused aggregate the vacules enter epithelial lining and necrosis in longitudinal and circular muscles . also the extracts of crude alkaloid compounds at concentration (5)mg/ml caused variation in the structure of midgut for insect after (72) hours from emergence , appeared in (A) site increasing in thickness of the well of midgut and necrosis in longitudinal and circular muscles and vacules ware founded enter the epithelial lining , while in (B) site the extract caused shorthand and disappearance in layer of longitudinal and circular muscles and aggregated the vacules enter layer of epithelial lining . Isolation and identification of active compounds from crude extracts of phenolic ,terpenoid and alkaloid compounds of Tropaeolum majus by using (GC - MS) . Twelve compound were isolated from crude phenolic compounds which were (acetic acid) was first active compounds isolated at retention time (3.097)mn. while the active compound (Tri butyl acetyl citrate) was later compound isolated of retention time (25.710)mn. Thirty active compounds isolated from the crude terpenoid compounds (2,4Dithia pentane) was first compound isolated at retention time (2.916)mn. while the later active compounds (phthalic acid , 2 - ethyl hexyl phenyl ester) isolated at retention time (31.296)mn. eight active compound identified from crude alkaloid compounds the (acetic acid) was the first active compound isolated at retention time (3.398)mn. while the (6 - Octadecenoic acid , Methyl ester , (Z) - ) was later active compound isolated at retention time (23.887)mn

التنميط الوراثي لمستضدات معقدات التوافق النسيجي (HLA - DR, DQ) والتغيير الوراثي لانترلوكينات IL - 4 , IL - 18 في مرضى المفاصل == HLA - DR,DQ genotyping and IL - 4, IL - 18 gene polymorphism in arthritis patients

اسم المؤلف: علا عباس خضير
اسم المشرف: عبد النبي جويد عبد المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للتحقيق في دور بعض الجوانب المناعية والوراثية التي تتعلق بالتهاب المفاصل. وتشمل الدراسة 100عينة دم جمعت من الناس الذين راجعوا مستشفى مرجان، مع 25 عينة من الذين يبدو عليهم اصحاء وللفترة من تشرين الاول2015 الى اذار 2016. تضمنت الدراسة المناعية تقدير مستويات انترلوكين 18 وانترلوكين 4 في مرضى التهاب المفاصل باستخدام تقنية الاليزا ,لوحظ زيادة مستوى انترلوكين 18في جميع المرضى على النقيض من ذلك مع مجموعة السيطرة بمتوسط 133.93 pg/ml)) في مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي و( pg/ml ( 130.3 لمرضى هشاشه العظام مع مستوى احتمالية (.(P ≤ 0.01 اظهرت النتائج الخاصة بتقدير انترلوكين 4 زيادة في مستوى انترلوكين4 في كلا النوعين لالتهاب المفاصل وبمتوسط على النحو المبين : ( pg/ml45.06 ، pg/ml33) مع التهاب المفاصل الروماتويدي وهشاشة العظام على التوالي مقارنة مع مجموعة السيطرة (pg/ml22.48) بمستوى احتمالية(P≤ 0.01). تضمنت الدراسة الوراثية ( IL - 4 - 590 C/T & IL - 18 - 137 G/C) ذات الصلة مع مرضى التهاب المفاصل ل75 عينة متضمنة عينات مرضى وعينات سيطرة باستخدام تقنية SSP) - (PCR. اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد من( IL - 18 - 137 G/C) : 39 من متباينة الاشكال 21 ,GCمن متماثله الاشكالGGو 15 من متماثلة الاشكال CC. كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة. اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد من (IL - 4 - 590 C/T)ولوحظ انه : 50من متباينة الاشكال CT،9من متماثلة الاشكال CCو16 من متماثلة الاشكالTT.كما اظهر عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين المرضى ومجموعات السيطرة في حاله الاليلات والمورثات.كما تضمنت الدراسة الحالية دراسة علاقة مجموعة اليلات من HLA للموقعينDRB1 وكذلك DQB1 باستخدام تقنية PCR - SSP)) وبينت عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي معالاليلات(DRB1 0301, 0701&DQB1 0201) مقارنة مع السيطرة,اما في مرضى هشاشة العظام بينت وجود اختلافات كبيرة في اليل((DQB1*0201مقارنة مع السيطرة، في حين لم تظهر اختلافات كبيرة اليلاتDRB1 وهؤلاء المرضى. | The current study was conducted to investigate the role of some aspects of immunogenetics that related with arthritis disease . The study includes 100 blood samples were collected from people who attend to Marjan hospital, with 25 samples from apparently ealth people during the period of October 2015 to March 2016 Immunological study involved estimate the levels of IL - 18 , IL - 4 in certain arthritis patients using ELISA technique , the estimation of IL - 18 revealed significantly increased in all patients by contrast with control group with mean value133.93 pg/ml in rheumatoid arthritis( RA) patients and 103 .3pg/ml for osteoarthritis (OA) patients (P <0.01) Estimation of IL - 4 and contrary results showed increasing IL - 4 levels in both types of arthritis with mean value ( 45. 06 pg/ml , 33 pg/ml ) with RA and OA respectively compared with control group (22.48 pg/ml ) with P ≤ 0.01 The genetic study involved screening of IL - 18( - 137 G/C ) and IL - 4 ( - 590 C/T ) related with arthritis patients for 75 samples including patients and control using PCR - SSP technique The SNP of IL - 18 ( - 137 G/C ) showed : GC heterozygous with (39), GG homozygous with (21) and CC homozygous with (15). The allelic and genotypes association appeared no significant differences between patients and control groups. Another SNP of IL - 4 ( - 590 C/T) showed : CT heterozygous with (50), CC homozygous with (9) and TT homozygous with (16). The allelic and genotypes association showed no significant differences between patients and control groups The possibility of detection of histocompatibility antigens HLA( DRB1& DQB1) alleles related genetically with disease by using (PCR - SSP)was performed and showed that no significant differences between RA patients with DRB1 (0301 & 0701) and DQB1 (0201) alleles compared with control , while in osteoarthritis patients showed significant differences between patients with DQB1 (0201) allele compared with control, but no significant differences with DRB1 alleles

دراسة نسيجية فسيولوجية وبايوكيميائية للمعايير ذات العلاقة بامراض الغدة الدرقية == Histophysiological And Biochemical Study of parameters related with thyroid disease

اسم المؤلف: ريم عبد الرحيم السعد
اسم المشرف: كريم حميد رشيد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد امراض الغده الدرقية من الامراض شائعة الحدوث لاسباب مختلفة وتشمل امراض الغدة الدرقية كل من فرط الدرقية (Hyperthyroidism) (وقصور الدرقية ((Hypothyroidism اذ يحدث تضخم الغده الدرقية في الحالتين . يزداد انتاج هرمونات الغدة في مرضى فرط الدرقية بالرغم من انخفاض تركيز الهرمون المحفز للدرقية ( Follicle stimulating hormone )في حين يقل انتاج هرمونات الدرقية في مرضى قصور الدرقية بالرغم من زياده انتاج الهرمون المحفز للدرقية.هنالك علاقة بين هرمونات الغدة الدرقية والايض من خلال تاثير هذه الهرمونات على ايض الكربوهيدرات , الدهون والبروتينات وبالتالي تنتج الطاقة من تحلل هذه المركبات ولقد اجريت هذه الدراسة للتعرف على التاثيرات المختلفة لمعايير الفسلجية والنسيجية والكيموحيوية والجزيئية في مرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية لمجموعتين عمريتين هما اقل من 45 سنه واكثر من 45 سنه للذكور والاناث.اظهرت نتائج الدراسة اختلافات معنوية بين كل من الهرمون المحفز للدرقية وهرمون الدرقية الثلاثي وهرمون الدرقية الثايروكسين وهرمون الايرسين ومستويات مستقبلات الانترليوكين ومستويات الكلكوز بالمصل ومستويات معدل كتلة الجسم ومستويات الكالسيوم بالمصل ومستويات قابليه مضادات الاكسدة بالمصل ومستويات الصوديوم بالمصل في مرضى قصور الدرقية ومرضى فرط الدرقية مقارنه مع مجموعه السيطرة في حين وجدت اختلافات غير معنوية بين انزيم البيروكسيدايزعند مرضى فرط الدرقية في كلا الجنسين ,مستقبل بروتين الثلاثي (FCRL3)والثايروكلوبيولين عند مرضى قصور الدرقية في كلا الجنسين ومستقبل الهرمون المحفز للدرقية في مرضى قصور الدرقية في الذكور والاناث في المرضى الاقل من 45 سنه فقط مقارنه بمجموعة السيطرة ,كما اظهرت الدراسة النسيجية وجود اختلافات في التركيب النسيجي للحويصلات الدرقية بين مرضى الغدة الدرقية بنوعيها (فرط الدرقية وقصور الدرقية) مقارنة مع السيطرة استخدم في هذه الدراسة جين MAPKinaes gene للكشف عن اورام الغدة الدرقية , وقد اظهر استخدام كيمياء المناعة النسيجية وجود ورم سرطاني من النوع الحلمي Papillary Carcinoma في احدى العينات المستحصلة لهذا الغرض .بينت نتائج الارتباط بين المعايير المختلفة لمرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية وجود ارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين الهرمون المحفز للدرقية معدل كتلة الجسم وارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين مستقبل الانترليوكين وهرمون الدرقية الثلاثي وارتباط موجبة معنوي p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون الدرقية الثلاثي وعلاقة ايجابية معنوية p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون المحفز للدرقية | The thyroid disease is a common disease of occurrence for different causes which include thyroid hyperthyroidism and hypothyroidism . Goiter occurs in both cases and the production of thyroid hormones increases despite the decline in the concentration of the thyroid stimulating hormone (TSH), while the production of thyroid hormones decreases in hypothyroidism despite the increase in the production of thyroid stimulating hormone. In view of the relationship between thyroid hormones and metabolism and the metabolic rate through the influence of these hormones on the metabolism of carbohydrates, fats and proteins and thus energy produced from the hydrolysis of these compounds This study was conducted to investigate the different effects on different physiological ,histological biochemical and molecular criteria in 58 patients with hyperthyroidism and hypothyroidism for two age groups , they were collected from the Teaching Laboratories in Al - Hilla teaching hospital and from private laboratories (Babylon) , during the period from November 2015 to march 2016, the aim of this study was the detection of the best possible diagnostic parameter for the detection of the dysfunction of thyroid gland by using various biological markers in this study. The results of this study showed that a significant differences in thyroid stimulating hormone (TSH), irisin, thyroxin (T4), triiodothyronine (T3), triglycerides (TG), body mass index (BMI), glucose, Interlukin - 2 Receptor (CD25), total antioxidant capacity (TAC), Potassium (K), Sodium (Na), high density lipoprotein (HDL), calcium (Ca) in hypothyroidism ,hyperthyroidism patients compared with the control group, while the differences were Non - signifecant in the thyroid Peroxidase ( TPO) in patients with hyperthyroidism in both sexes Fc - receptor - like - protein3 (FCRL3), thyroglobulin (Tg) in patients with hypothyroidism in both sexes and thyroid Stimulating Hormone Receptor (TSHR) in patients with hypothyroidism in both sexes only in younger old patients as compared to the control group. Histological study revealed that there were differences in the histological structure of the thyroid vesicles in patients with hyperthyroidism and hypothyroidism compared with the control group. MAP Kinase gene was used for the detection of tumors of the thyroid gland by using immunohistochemistry technique, the result in tissue Papillary Carcinoma was identified in one of the samples obtained for this purpose. The results of the correlation between the different criteria for patients with hyperthyroidism, and hypothyroidism have shown a negative correlation between the thyroid stimulating hormone (TSH) and body mass index (BMI) and interlukin - 2receptor (CD25) and triiodothyronine (T3),while there positive correlation was a between irisin and triiodothyronine (T3) and a positive relationship between both irisin and High Density Lipoprotein (HDL), as well as positive correlation between irisin and thyroid stimulating hormone (TSH).

دراسة تصنيفية لبعض اجناس العائلة الصليبية Cruciferae في العراق == Taxonomical study of some genera in family Cruciferae in Iraq.

اسم المؤلف: سرى سليم كاظم البيرماني
اسم المشرف: عبد الكريم خضير البيرماني | هدى جاسم التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت الدارسة الحالية دراسة تصنيفه مقارنه لسبعة انواع عائدة لاجناس ضمن العائلة الصليبية Brassicaceae في العراق وهي Biscutella didyma L. وCapsella bursa pastoris (L.) Medik. وLobularia martima (L.) Desv. وNasturtium officinale R.Br. وNesila apiculata Fisch. وSameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. وSchimpera arabica Hochst and Steud.. واجريت الدراسة في مختبر ابحاث تصنيف النبات المتقدم/كلية العلوم للبنات/جامعة بابل للمدة من تشرين الاول/2015 الى اب/2016 . اعتمدت الدراسة على العينات الطرية والجافة التي تم الحصول عليها من السفرات الحقلية والمعاشب النباتية العراقية . اذ تناولت الدراسة العديد من الجوانب المهمة في تصنيف النبات منها الصفات المظهرية والتشريحية وحبوب اللقاح وبعض الجوانب الكيميائية والجزيئية فضلا عن التصنيف العددي. وخلصت الدراسة المظهرية في اظهار الصفات التي كان لها قيمة تشخيصية ساعدت في الفصل بين الانواع، اذ قورنت الخصائص المظهرية لصفات السيقان والاوراق والازهار والاجزاء التكاثرية والثمار والبذور وحددت اهميتها التصنيفية واتضح منها التباين في الاهمية التصنيفية لكل عضو من اعضاء النبات سواء كان على مستوى الاجناس او الانواع.وتمكنت الدراسة من تحديد العديد من الصفات التشريحية لنصل الورقة والساق والسويق وحامل النورة وطبيعة التعرق وطبيعة الكساء السطحي. ودرست مظهرية حبوب اللقاح لجميع الانواع التي هي قيد الدراسة وتبين وجود اهمية تصنيفية جيدة في عزل الانواع عن بعضها، اذ امتازت جميع الانواع بكونها ثلاثية الثقوب والاخاديد وبانها ملساء الا انها اختلفت في الحجم والشكل وسمك جدار حبة اللقاح الخارجي. وتناول البحث الحالي المحتوى الكيميائي باستخدام تقنية كروموتوغرافيا الغاز - الطيف الكتلي Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) للانواع المدروسة، ولوحظ غنى الانواع بالمركبات الكيميائية التي امكن من خلالها عزل الانواع بعضها عن بعض. كما امدت الدراسة الجزيئية بادلة ساعدت على الفصل بين الانواع المتقاربة لاختلاف الحزم الناتجة من التضخيم بين الانواع باستخدام تقانة Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) وذلك باستخدام سبع بادئات، ورسم المخطط الشجيري لمقارنة درجات التقارب والتباعد للتراكيب الوراثية للانواع قيد الدراسة. هذا وقد عوملت الانواع حسابيا استنادا الى عدد من الصفات المختارة لمعرفة مدى التشابه والاختلاف بين الانواع وتم رسم المخطط الشجيري والاشكال متعددة الاضلاع للانواع كافة وحسبت نسبة التشابه بين الانواع،ومن ثم قورنت المخططات الشجيرية الناتجة من الدراسة الجزيئية ودراسة التصنيف العددي ونتج منها مخطط يوضح درجة تقارب وتباعد الانواع بالاعتماد على جميع الصفات والجوانب المدروسة مما اكد العلاقة الوثيقة بين نتائج الدراسة المظهرية والتشريحية والكيميائية وحبوب اللقاح والجزيئية والتصنيف العددي في تحديد علاقات القربى بين الانواع محل الدراسة. | Seven species belonging to the genera within the family Brassicaceae in Iraq have been systematically studied, these are Biscutella didyma L., Capsella bursa pastoris (L.) Medik. , Lobularia martima (L.) Desv. , Nasturtium officinale R.Br. , Nesila apiculata Fisch. , Sameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. and Schimpera arabica Hochst and Steud. The study carried out in the laboratory of Advanced Plant Research / College of Science for women / the university of Babylon from October / 2015 to August / 2016. The study relied on a fresh and dry samples which obtained from field trips and National Herbarium of Iraq. The study covered many important aspects of plant taxonomy, including morphological ,anatomical traits, pollen grains, chemical and molecular aspects as well as a numerical taxonomy study. The current study concluded the characteristics that had diagnostic value helped in the separation of species, and compared to the phenotypic characteristics of the qualities of the stems, leaves, flowers, reproductive parts, fruits and seeds and their taxonomic significance were determined, including variation in important taxonomic for each member of the plant,at the level of species. The study was able to identify some of the anatomical characteristics of the lamina, stem, petiole, pedicel inflorescence , the nature of venation and the nature of the Indumentum the type of trichomes prevailing, intensity consider it as a diagnostic attribute for each species. All species of the family under study were studied Palynologically and show a good taxonomic importance in isolating the species from each other, as it was characterized by being a Tricolporate and Spineless in all species but they varied in size and shape and exaine thickness. Chemical content through the use technique of Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) in all species were studied, the study observed indispensable types of chemical compounds that could be use to isolate the species from each other. Molecular study also supplied evidence helped to separate the species converged to the different bands resulting from amplification between species using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique using seven primers, draw dendrograms to compare the degree of convergence and divergence of combinations of genetic types under study. Species treated mathematically based on a number of selected attributes to identify the similarities and differences between them, and draw the dendrogram and polygonal for all species and calculated the similarity’s ratio between species and then were compared diagrams dendritic resulting from the molecular and numerical taxonomical study and resulting in the plan that shows the degree of convergence and divergence of species depending on the qualities and all the aspects studied, which confirms the close relationship between findings of the study of morphological and anatomical, chemical and Palynological and molecular taxonomy in determining the relationships between the species under study.

تقييم تحديد عينات دم الانسان المخلوطه باستخدام تقنيه PCR == Forensic Molecular Study of Fungemia Using ITS Region

اسم المؤلف: علي حميد مجيد الاسدي
اسم المشرف: محمد جواد الجصاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمكن ان يكون لطريقه تفاعل البلمره المتسلسل دور فعال في المحكمه لابراز الادله الثبوتيه او النافيه خاصه بعد تحديد السلالات الفطريه التي تعطي معلومات عن المنطقه الجغرافيه ومصدر الاصابه سواء كان من مصادر حيوانيه او عمليه ارهابيه تستهدف المجتمع باستخدام عوامل ميكروبيه.اهداف الدراسهاهمية الدراسة الحالية هي لتقييم التحقيق الجزيئي للاصابة الفطرية بستخدام تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل باستخدام البوادئ ITS1 ,ITS4 والتي تساعد في التفريق بين دم الانسان المخلوط ودورها في دور محتمل لتورط الشخص في القضية الجنائية. تحديد مدى الاصابة الفطرية في الحيوانات التي قد يكون لها دور باعتبارها مصدر لتفشي وباء والذي يتطلب اتخاذ اجراءات سريعه للحد من انتشار المرض وطمانه المجتمع بان الوباء تحت السيطره.طريقه العملتم جمع 70 عينه دم في انابيب حاويه على ماده EDTA تتظمن 20 عينة من اشخاص اصحاء لا تظهر عليهم اعراض مرضيه و20 خروف و20 دجاجه و10 اشخاص يعانون من سرطان الدم. تم فحص العينات من ناحيه احتوائها على اصابه فطريه باستخدام الطرق المزرعيه والجزيئيه. بعض عينات الدم تم خلطها لتقييم مدى دور التحري عن الاصابه الفطريه في تحديد وجود الشخص المصاب ضمن مسرح الجريمه.النتائجلم تظهرت اي نتيجه ايجابيه عند زراعة عينات الدم المختلفة على اطباق المزرعة الغنية حتى بعد حضنها لمدة اسبوع . اظهرت نتائج تحليل تفاعل البلمره المتسلسل لمنطقه ITS باستخدام بادئات خاصه بالفطريات, ان الاصابه الفطريه الجهازيه لدى الاشخاص الذين يعانون من سرطان الدم بلغت 70% بسبب ضعف المناعه لديهم بالمقارنه مع الاشخاص الاصحاء الذين بلغت لديهم نسبه الاصابه 30% مما يدل على احتمال حدوث حاله تفشي لمرض فطري من خلال التعامل المباشر مع الحيوانات مثل الدواجن او الخراف الذين ظرت نسبه الصابه بهم 40% و20% على التوالي او من مصادر اخرى خاصه مع زياده نسبه الصابه في العينات البشريه بالمقارنه مع العينات الحيوانيه.تظهر نتائج الترحيل الكهربائي في الهلام لنواتج تفاعل البلمره المتسلسل خليط من العينات الدم الانسان التي نستطيع التفريق بين الاجابية والسلبية , تشير هذه النتائج الى احتمال تورط الشخص مع الدم الملوث في حالة الجريمة يمكن استخدامها كعلامة داعمة في تحقيقات الطب العدلي الاستنتاجان تقنية تفاعل البلمره المتسلسل تعطي نتائج قيمة في التفريق بين عينات دم بشريه مختلطه من خلال الكشف العدوى الفطرية حسب المنطقة تضخيم ITS التي قد تكون بمثابة فكرة اساسية داعمة في تحقيقات الطب الشرعي. اضف الى ذلك، انه يعطي مؤشرا على وجود عدوى حيوانية المصدر و/ او عمل ارهابي محتمل.

دراسة جزيئية ومناعية كيميائية لانسجة عنق الرحم المصابه بفايروس الورم الحليمي البشري == Molecular and Immunohistochemical Study of Uterine Cervical Tissues Infected with Human Papilloma Virus

اسم المؤلف: الهام جواد كاظم بلال
اسم المشرف: ازهار عمران لطيف الذهب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: Human papillomavirus (HPV) is a DNA virus. It is the main etiological factor for progress of cervical precancerous and cancerous lesions. In order to develop a cancer from dysplasia to invasive carcinoma, a series of cellular changes should occur. As genital HPV carries oncogenes involving in these critical changes, currently HPV has been considered the most important risk factor of cervical cancer.This study was designed as case control study. In the retrospective part of these study a total number of (56) formalin - fixed, paraffin embedded cervical tissues was involved were submitted to ISH and IHC technique 27 with Cervical Carcinoma (CC) and 16 with benign cervical tumors. Thirteen (13) apparently healthy cervical tissues were used as a control group .The age of this individuals (patients and control groups) was ranged between 23 and 73 years. Samples collected from the pathological archives of different general hospital as well as many private laboratories. Specimens belong to the period from January 2009 to September 2015. After sectioning of these cervical biopsies and staining by hematoxyline and eosin, a final definitive histopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist.In the cross - section part of this study seventy two female patients taken from different general hospitals. Cytological examinations were performed for their Pap - smeared and a final definitive cytopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist. According to their main cytological finding cervical cellular scrapes were divided into three cytological groups : cervicitis with squamous intraepithelial lesions, cervicitis without squamous intraepithelial lesions and healthy group. The DNA isolated from a representative cytological specimen was investigated by real - tim PCR analysis for the detection and genotyping of high/risk HPV DNA.The obtained results are summarized as follows : - The age range distribution mostly in age group (23 - 73 years), the most affected age group in malignant and benign cervical tumor was (52 - 67) , (36 - 51) years which constituted 55.6%(15 out of 27 cases), 50% (8 out of 16 cases) with mean age (54 ± 11.22), (38.8 ± 9.85) respectively, while (20 - 35 years) is the most affected age group in control cases were constituting 53.8% (7 out of 13 cases) with mean age (35.5 ± 8.64 ) . - The most common histopathological type among all studied archived cervical tissues was squamous cell carcinoma (66.6%), followed by the adenocarcinoma (33.3%). - The well differentiated grade of CC constituted 52%, whereas those with moderately and poorly differentiated grades CC constituted 37%and 11% respectively. - The percentage of HrHPV31/33 DNA was detected as follows : in 55.6 % of tissues from cervical cancers, 43.7% in the tissues from benign cervical tumors, while, no HrHPV31/33 positive - ISH reaction was detected in healthy cervical tissues of the control group. - The percentage of LrHPV6/11 DNA was detected as follows : in 33.3 % of tissues from cervical cancers, 31.3% in the tissues from benign cervical tumors, while, the percentage of LrHPV6/11 show negative - ISH reaction in healthy control group of cervical tissues. - The highest positive result for ISH of HPV31/33 found in squamous cell carcinoma 72.2% and in adenocarcinoma was 22.2% while the percentage of HPV6/11detection according to cancer type was 50% found in squamous cell carcinoma while 0.0% in the type of adinocarcinoma. - The highest percentage of HPV31/33 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 70% (7 out of 10 cases) show in moderately differentiated, followed by 57.1% (8 out of 14 cases ) in well differentiated , and none of poorly differentiated showpositive signal . - The highest percentage of HPV6/11 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 42,9 % (6 out of 14 cases) show in well differentiated, followed by 30% (3 out of 10 cases ) in moderately differentiated , and none of poorly differentiated show positive signal . - The highest percentage of co - infection with High risk HPV31/33 and Low risk of HPV6/11 types was (22.2%) in malignant cervical tumor group. While in benign cervical tumor and healthy control was 18.8% and 0.0% respectively. - The highest percentage of HPV DNA detection by Rt - PCR was 80% (16 out of 20 cases) within group of cervicitis with SIL, 16.7% (5 out of 30 cases) in group of cervicitis without SIL, while none of control group shoes positive result. - Phylogenetic tree analysis image, results that local HPV amplicon(S1, 3, 5, 7, 9, 12, 14, 15, 16, 17, 18, 20) show closed related to NCBI - Blast HPV type 16 (KMO58666.1), the local HPV isolates (S2, 4, 6, 11 and 19) show closed related to NCBI - Blast HPV type 18 (KC470225.1), whereas the local HPV isolates (S10 and 13) show closed related to NCBI - blast HPV type 33 (EU918766.1), the local HPV isolates (S8) show closed related to NCBI - Blast HPV type 45 (KC470260.1). - Retinoblastoma protein overexpression was detected by IHC test in 59.3% of malignant cervical tumors, 43.8% of benign cervical tumors but no signal was reported in the tissues of control group. In the malignant cervical tumors group, 43.6% has strong score (score III), whereas 37.5% and 18.8% has moderate score (score II) and low score (score I) respectively. While, in benign cervical tumor group, 57.1% were found tohave moderate score (score II) , 28.6% and 14.3% have strong score (score III) and low score (score I) respectively. - P16 protein overexpression was detected by IHC test in 63% of malignant cervical tumors, 56.3% of benign cervical tumors while none of positive result was reported in the tissues of control group. - The highest positive result for IHC of Rb and P16 according to cancer type was found in squamous cell carcinoma 61.1% and 72.2%, respectively, while there percentage in adenocarcinoma was 55.6% and 44.5%, respectively. - The highest percentage of Rb protein expression was found within poorly differentiated that have 100% (3 out of 3 cases) .Followed by 70% (7 out of 10 cases) and 42.9 % (6 out of 14 cases) within moderately and well differentiated respectively. - The highest percentage was 100 % (3 out of 3 cases), 64.3%(9 out of 14 cases), 50% (5 out of 10 cases) of cervical cancer tissues that showed IHC reaction for P16 protein have poorly, well and moderately differentiated respectively. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 100% and 77.3% have additional impact by P16 and Rb protein expression respectively. - Immunohistochemical examination of cervical tumor tissues for CD8+,CD16+ and CD20+ cell surface markers, revealed that CD8+cells the percentage of detection was 66.7% in cervical cancer group, 62.5% in benign cervical tumor group and 23.1% in control group. Also, CD16+ was detected in 29.6% of cervical cancer group, 31.3% of benign cervical tumor group and in 15.4% of control group. The CD20+ cells were detected in 44.4 % of cancer group, 43.8% of benign tumor group, and in 15.4 % of control group. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 77.3% have additional impact by CD8+ protein expression. Whereas 45.5%, 54.5% have additional impact of CD16+, CD20+ protein expression respectively

ارتباط التغايرات الوراثية لجينات نظام الدوبامين مع السلوك الاجرامي العنيف للسجناء العراقيين == Association of Dopaminergic System Genes Polymorphisms with Violent Criminal Behavior in Iraqi Prisoners

اسم المؤلف: سهاد رضا متعب الطائي
اسم المشرف: محمد عبد الله جبر جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The violent criminal behavior is emerged from the interaction between several genetics and environmental factors. The present study reflect the role of polymorphisms in dopaminergic system genes (drd2 ,comt ,dat1 ,drd4, and maoa) on violent criminal behavior in Iraqi prisoners.This research was a case - control study , blood samples were collected from 200 prisoners (case group) who convicted with terrorism (150 sample), murder (30 sample) and drug trading (20 sample) Issues selected from Al - Hilla reformist central prison for men and women in Babylon city and from position and deporting division in Karbala .This sample included (160 male and 40 female). Additionally, 100 sample were collected as control group included (54 male and 46 female).DNA was extracted and the polymorphisms analysis achieved by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP - PCR) for drd2 and comt genes ,while the dat1 ,drd4 and maoa polymorphisms was analyzed by Polymerase Chain Reaction (PCR).All polymorphisms (except drd4) were subjected to PCR - sequencing for confirming the presence of polymorphisms .The results showed that the percentage of the case group was 34.5 % with an age ranged between 20 - 39 years ,most of them were male 80% ,72.5% were married ,77.5% were from rural area ,84% were self - employed and 41.5% were illiterate .Genetic analysis of drd2 TaqIA polymorphism demonstrated that a significant increase in the genotype frequency of A1/A1 was observed in case group (p = 0.03; OR= 4.93 ; 95% CI=1.08 - 22.5) and the A1 allele frequency was significantly associated with criminal behavior (p=0.03 ;OR=1.51; 95% CI=1.04 - 2.21).The comt (Val 158 Met) polymorphism revealed that the homo - mutant genotype A/A had significant higher risk of criminal behavior (p= 0.001 ;OR= 3.98 ; 95% CI= 1.7 - 9.3) when compared with control group. and the A allele(met allele) frequency was significantly associated with case group (p=0.003; OR= 1.68; 95%CI= 1.19 - 2.37).On the other hand , the analysis of VNTR polymorphism in dat1 gene showed non - significant difference in 9/9 genotype and 9R allele frequency between the study groups (p>0.05).The VNTR polymorphism analysis for drd4 gene revealed that the criminal individual who carried 7/4 genotype was significant higher than in control group (p=0.03;OR= 2.6, 95%CI= 1.09 - 6.17), and the 7R allele frequency was significantly associated with case group (p=0.04;OR=2.06; 95%CI= 1.04 - 4.1).Finally, the maoa VNTR polymorphism was analyzed in male and female separately due to the gene location on X - chromosome .The results demonstrated that there was non - significant difference observed between all genotypes and alleles frequencies between case and control male (p> 0.05),whereas in female a significant association in 3.5/3.5 and 5.5/4.5 genotypes (p<0.01) ,additionally the 3.5 R alleles was associated with higher risk of violent criminal behavior in female (p= 0.004;OR=2.62; 95%CI=1.36 - 5.05).These results suggested that the drd2 ,comt ,drd4 and maoa in female polymorphism might increase the susceptibility of individual to engage in to crimes in the presence of certain environment risk factors.

الطريقة المثلى لاستخلاص الدنا من عينات الدم البشري == Optimization Method of DNA Extraction From Human Blood Samples

اسم المؤلف: انتصار هادي طالب اليساري
اسم المشرف: ذكرى عبد العالي الكعبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الكلمات الدلالية:
  • History of Forensic DNA
  • Sources of DNA (Evidence)
  • Bone and Teeth
  • Extraction of DNA
  • Other Method for Investigation Human DNA Profile
  • Instruments and Equipment
  • Solutions and Agarose Gel Preparation
  • Detection of β - Globin Gene by PCR Assay
  • I
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study was conducted to create an environment that mimic those samples collected from crime scenes Blood samples were collected from one hundred and twenty persons from Hila city. These samples were used to stimulate the different possible blood samples obtained for forensic medical purpose. The following simulations were created : 20 fresh blood samples, 20 frozen blood samples, 40 dried blood stain samples on carpet (20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours), and 40 samples in the form of dried blood stains on soil(20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours).Extraction of genomic DNA was attempted from the listed forms of blood samples by using four different methods : Promega purification kits, Favorgen purification kits, salting out methods, and two - step lysis assay.These methods were compared for the best extraction of DNA and were confirmed by molecular detection of β - globin gene using polymerase chain reaction (PCR) technique.After extraction of gDNA and electrophoresis by use agarose gel electrophoresis and measuring the concentration and purity of DNA by bio drop spectrophotometer. Purity was then confirmed by PCR. The results indicated that the best methods for genomic DNA isolation were from fresh, frozen ,and dried stains on carpet using Promega purification kits, whereas, from dried blood stain on soil ,none of the four methods was suitable for isolation the genomic DNA.

دراسة جزيئية ومناعية للمستقبلات TLRs المرتبطـــة بداء المــقوسات في محافظة القادسية == Molecular and immunological study of TLRs associated with Toxoplasmosis in Al - Qadisiyah province

اسم المؤلف: هديل شاكرهادي التميمي
اسم المشرف: رائد عباس كاظم | رحيم طعمة عبيس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المقوسة الكوندية طفيليات داخل خلوية تصيب نسبة كبيرة من سكان العالم. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان المستقبلات ((TLR تلعب دور مهم في الامراض الطفيلية المختلفة. وقد اجريت هذه الدراسة لتحديد الجينات TLR7 وTLR9 والسيتوكينات ذات الصلة في 125 امراة مجهضة كمجموعة بالمقارنة مع 15عينة من النساء الاصحاء (غير حوامل) و15عينة من النساء الحوامل كمجموعات سيطرة في مستشفى النسائية والاطفال في محافظة القادسية من كانون الثاني / 2015 وحتى اذار / 2016، وقد تم سحب 5 مل من عينات الدم الوريدي من النساء تحت ظروف معقمة. هناك ثلاثة جوانب في هذه الدراسة , وتضمن الجانب الاول قياس مستويات الاجسام المضادة (العدوى الكامنة والعدوى المكتسبة مؤخرا) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل . الجانب الثاني تضمن تحديد مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وproflin - 1 (PFN - 1) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل. تم الكشف عن مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وPFN - 1 في الدم باستخدام تقنية ELISA . ركز الجانب الثالث على تحديد الجينات TLR7) , (TLR9 واستخلاص الحمض النووي DNA من النساء عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). واظهرت النتائج ان معدل الانتشار المصلي IgM (العدوى الكامنة) وIgG (العدوى المكتسبة مؤخرا) الاجسام المضادة للتوكسوبلازما كانت موجبة في 55/125 حالة بنسبة ((44% و5/125 حالة بنسبة (4%) على التوالي، والانتشار المصلي للاجسام المضادة لل T.gondii في النساء المجهضات .48% ولم تسجل مصليا بشكل مختلط في هذه الدراسة، في حين كانوا النساء الاصحاء بنسبة(0%) لجميع الاجسام المضادة . وجدت علاقة ذات اهمية احصائية (P<0.05) بين الانتشار المصلي للاصابة بداء المقوسات المزمنة والعمر للنساء المجهضات ، الامراض المزمنة ، ووقت الاجهاض ، وقد اظهرت النتائج عدم وجود علاقة ذات اهمية احصائية بين الاصابة بداء المقوسات وقدرة النساء على انجاب الاطفال وتكرار الاجهاض. اكدت النتائج ان النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgG يزداد لديهم تركيز IL - 12 زيادة معنوية بالمقارنة مع مجاميع السيطرة ، في حين انه لاتوجد اي زيادة معنوية في تركيز الاجسام المضادة IgM بالمقارنة مع مجاميع السيطرة في قيمة LSD ((30.28. تركيز IFN - γ كان منخفض في النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgM ، كلا المجموعتين من النساء المجهضات لديهم انخفاض في تركيز IFN - γ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (الحوامل وغير الحوامل) . كما ان النساء المجهضات السالبات للاجسام المضادة IgM لديهم انخفاض هام في بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD (19.33).profilin - 1 البشري كان في مستوى منخفض في النساء المجهضات المصابات للاجسام المضادة IgM وIgG بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD 230.14)). ان الصورة الجينية لجينات TLRs قد اوضح ان TLR7 وTLR9 كانا بنسبة 89.7%)), 84.1%)) على التوالي .كذلك النتائج وضحت وجود بعض التباين الوراثي (TLR7 وTLR9 الجينات) في النساء المجهضات مقارنة مع السيطرة، وهذا يعني وجود طفرات في الجينات للمرضى. | Toxoplasma gondii is an intracellular parasite infected large proportion of the world population. Many of studies have shown the critical part of TLRs in different parasitic diseases. The present study were performed to detect TLRs 7 and TLRs 9 genes and related cytokines in 125 aborted women as case group and 30 healthy women (15 non pregnant and 15 pregnant women) as control groups in the Maternity and children Hospital in the Al - Qadisiyah province from December 2015 till March 2016, Five milliliter of venous blood sample were obtained from each woman under sterile condition. Three aspects were involved in this study; the first aspect included the measurement of sera antibodies (IgG& IgM) in the aborted women and control and study epidemiological aspects for T. gondii infection. The second aspect determined the levels of cytokines (IL - 12 Pg./ml , IFN - γ Pg./ml) and human proflin - 1 (PFN - 1 Pg./ml) in the sera of aborted women and control. The levels of cytokines (IL - 12 , IFN - γ) and PFN - 1 in blood were detected by using ELISA principle. The third aspect focused on detection of TLR7 gene and TLR9 gene in extraction DNA of aborted women and control (non pregnant and pregnant women) by Polymerase Chain Reaction (PCR). The outcomes demonstrated the seroprevalence of IgG (latent infection) and IgM (recently acquired infection) anti - Toxoplasma antibodies were positive in 55/125 cases (44%) and 5/125 cases (4%) respectively, however the Overall Seroprevalence of anti - T.gondii antibodies in aborted women was 48%. Mixed seropositive for IgG and IgM were not recorded in the present study, whereas the control were 0% for all antibodies. Significant relationship (P< 0.05) was found between the seroprevalence of T.gondii as ( chronic infection , age groups of the aborted women, several chronic diseases and abortion time). The results showed no statistically significant association between Toxoplasma infection and the ability of women to have children and frequency of abortions. The results confirmed that the aborted women with positive IgG antibody have significant increase in IL - 12 concentration in comparison with control , while no significant increase in IgM in comparison with control groups at LSD value ( 30.28). The concentrations of IFN - γ were lower in positive IgM aborted women than IgG , both groups of aborted women have significant decreased in comparison with pregnant control. While IgM patients have significant decreased in comparison with pregnant and healthy control group at LSD value (19.33). The human profilin - 1 levels were lowered in infected aborted women with IgG and IgM antibodies in comparison with pregnant and healthy control at LSD value ( 230.14). The genetic profils of genes TLRs have explained that TLR7 and TLR9 were (89.1 %) , (84.7 %), Respectively in aborted women. The results illustrated the presence of some genetic variation (TLR7 and TLR9 gene) in aborted women compared with the control, and this means having mutations in the patients gene.

توصيف المركبات الفعالة في نبات الشويل Cressa cretica L. وتاثيرها في الفطريات المعزولة من التهاب الاذن الخارجية == Characterization of bioactive compounds in Cressa cretica L. and their effect on fungal otomycosis

اسم المؤلف: اسيل محمد عمران الطائي
اسم المشرف: نداء عدنان ابو سراج | ابتهال معز الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to investigate the phytochemical components and antifungal activity of Cressa cretica L. using Gas chromatography - Mass spectrum (GC - MS) and Fourier transform infrared spectrophotometer (FTIR) techniques in addition to the characterization ( morphological and molecular) of fungal ear infection (otomycosis) and evaluate the antifungal activity (in vitro) of the C. cretica bioactive extracts. The secondary metabolites analysis of C.cretica extracts revealed the presence of phenols, alkaloids, terpenes, flavonoids, glycosides and tannins. The results of GC - MS reported 112 chemical compounds (30 in flowers, 34 in leaves, 23 in stems and 25 in roots). The results of the FTIR confirmed the presence of large numbers of functional groups in each part of the plant and these functional groups which varied according to the solvent type. More of these functional groups were alcohols, phenols, alkanes, alkyl halides, aldehydes, carboxylic acids, aromatics, nitro compounds and amines. The results were designed according to factorial experiments with complete randominal designed. Clinical diagnosis of otomycosis fungi revealed that there are 126 positive casesout of 185 cases included the filamentous fungi Aspergillus niger, A. flavus, A. terreuss, Penicilleum digitatium, either yeasts have included Candida parapsilosis, C. albicans, C. glabrata , C. Krusie. The percentage of Candida was 53.63% while the percentage of filamentous fungi was 46.36%, males was more infected than females, the age group 11 - 20 years old appear more affected than other age groups (19.8%), while the age group 31 - 40 years old and those who are older than 61 years were the least affected. Antifungal activity of C. cretica extracts revealed that each species of Candida had been affected by a part more than others, as well as a certain type of solvents, as follow : C. Parapsilosis largely affected by flowers extract when solvent hexane was used (the diameter of inhibition zone was 10.33 mm) at the concentration of 50%, while the C. albicans was most affected by whole plant when used ethyl acetate solvent (the diameter of inhibition zone was 10.92 mm). Stems extract by using hexane solvent was the most inhibitory growth effect on C. glabrata (the diameter of inhibition zone was 10.8 mm), while the roots extract by using methanol solvent showed largest inhibition on C. krusie growth (the diameter of inhibition zone was 8.56 mm). Minimum inhibitory concentration (MIC) reached to 25% on C. glabrata and C. krusie when using hexane stems extract and methanol roots extract respectively, while C. parapsilosis and C. albicans had reached the minimum inhibitory concentration to 30% when using hexane flowers extract and ethyl acetate whole plant extract.The results revealed that the alkaloids extract are the most effect against all species of Candida under study, the inhibition zone for C. parapsilosis was 4 mm diameters and 3.6 mm for C. albicans , 3.2 mm for C.glabrata and 5.2mm for C. krusie, followed by phenols extracts and terpens with the exception of C. albicans since terpenes extract had been more affected than phenols extracted, and this effect was increased with increasing the concentration of extract. When the C. cretica compared with the antifungal (Fluconazole) the results showed that the effect of extracts had greater inhibitory effect against otomycosis fungi, where the greatest impact of fluconazole was 8.23 mm at concentration 50% in the treatment of C. glabrata, and had the little inhibitory effect on the growth of C. krusie where the diameter of inhibition zone was 0.53 mm at the concentration 50%, and that the inhibitory effect increases with increasing concentration, while roots alkaloids gave inhibitory effect reached to 5.2 mm on C. krusie .

التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة == Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city

اسم المؤلف: زهراء محمد وناس
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.

العزل والتشخيص الجزيئي للفطريات المعزولة من التربة المنتجة للمواد الايضية المضادة للميكروبات == Isolation and Molecular Identification of Antimicrobial Metabolites Producing Fungal Isolated from Soil

اسم المؤلف: سرى رحمن نوار المسافر
اسم المشرف: نداء شهاب حمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم للبنات / جامعة بابل للتحري عن الفطريات المنتجة للمركبات الضد ميكروبية في تربة محافظه بابل للمدة من ايلول ,2015 الى ايلول ,2016 . حيث جمعت عينات التربة من مناطق مختلف وشملت الترب الزراعية والترب الغير مزروعة كذلك الترب الملحية وترب الشاطئ والترب الصناعية ,تم تنقية 200 عزله فطرية عشوائيا واختبرت قدرتها التضادية مع عدد من الاحياء المجهرية الممرضة لتحديد قدرتها الانتاجيه .تم اختبار 200 عزلة فطرية بواسطة المسح الاولي لتحديد قابليتها على تثبيط البكتريا الممرضة السالبة والموجبة والفطريات المرضية خارج الوسط الحي .بينت نتائج التضاد ان 72 عزلة كانت قادره على تثبيط 3≤ من الكائنات الممرضة وقد اختبرت هذه العزلات لتحديد انتاجيتها للحوامض حيث وجد ان 13 فقط كانت غير منتجه و59 عزله منتجه بنسب مختلفة .استثنيت العزلات المنتجة للحوامض من الدراسة لان نسبه الحامض ادت الى قتل الاحياء المجهرية الممرضة . اما العزلات غير المنتجة فقد اختيرت منها العزلات الاكثر فعالية في التثبيط وذات مدى تثبيطي واسع . تم تشخيص العينات الفطرية مظهريا باستخدام المجهر الالكتروني واوساط زرعيه تشخيصية مختلفة ,اما التشخيص الجزيئي للعزلات فقد تم باستخدام البادئ العامITS1و ITS4 لتضخيم منطقة Internal transcribed spacer ,حيث بينت نتائج التشخيص المظهري والجزيئي للعزلات بانها تعود للجنسين Aspergillus fumigates وTrichoderma longibrachiatum. اما نتائج فحص الحساسية فقد اوضحت ان العزلتين 104وS4 هما الاقوى في الانتاج على وسط مخلفات البطاطا الصلب بالمقارنه مع الاوساط السائلة وتحت ضروف مثلى من درجة حراره واس هايدروجيني وزمن انتاج .بينت النتائج بان المركبات المعزوله كانت ذات تاثير واسع الطيف ضد مجموعة من البكتريا الموجبه والسالبة لصبغة كرام لذالك تم اختبار فعاليتها ضد مجموعة من الخمائر والاعفان الممرضه للانسان والمعزوله من مختبرات مستشفيات محافظة بابل.عند مقارنه النتائج التي تم الحصول عليها مع نتائج المضادات الصيدلانية وجد ان تاثير المضاد المنتج يفوق تاثير كل من Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, بصورة كبيرة بالاضافة الى تاثيرها على مجموعة من الاعفان الممرضة. اما اعلى قطر تثبيط تم الحصول علية يعود للعزلة S4 ضد البكتريا Bacillus seraus بقطر 43.35mm بعد تنمية الفطر على وسط مخلفات البطاطا الصلب لمدة 9 ايام بدرجه حراره 30 ◦م. وهو اعلى من قطر تثبيط المضاد Meropenem ضد البكتريا المذكوره.تضمنت الدراسة جوانب اخرى وهي استخلاص المركبات الفعالة من وسط التخمر باستخدام خلات الاثيل والماء المقطر ثم تنقيه المركب باستخدام تقنية كروماتوكرافيا الطبقة الرقيقة .كذلك تم تشخيص المركبات الفعالة باستخدام التحاليل الكيميائيه التالية(FTIR,HNMR and CHNS ) لمعرفة المجاميع الفعالة والتركيب الكيميائي للمركبات المستخلصة. | This study is conducted in the laboratories of Science College for Women’s / University of Babylon to investigate the antimicrobial producing fungi in the soil of Babylon province from September 2015 until September 2016 . Soil samples are collected from different regions included agricultural, non - agricultural, salty, sandy and carbonate soil, purified 200 fungal isolates randomly and tested the antagonism with a number of pathogenic microorganisms . The 200 fungal isolates are tested by primary screening method to determine their ability to inhibit in vitro Pathogenic gram positive and negative bacteria and pathogenic fungi. The primary screening illustrate that 72 isolate were able to inhibition 3≤ pathogenic organisms. These isolates were tested to determine the acid productivity which found that only 13 were non - acid production and 59 isolate are product in different concentration. The acids producing isolates are excluded from the study because the rate of acid led to killing of test pathogenic microorganism .The selected isolates are non - acid productive and most effective in the inhibition of test pathogenic microorganism with a wide range. The samples are morphologically identified using the electron microscope and different diagnostic agricultural media (PDA, CYA, MEA), either molecular diagnosis of isolates have been using ITS1 and, ITS4 primer to amplify the Internal transcribed spacer region, the morphological and molecular identification results of the isolates showed that it belongs to Aspergillus fumigatus and Trichoderma longibrachiatum. The sensitivity results illustrate that the isolates 104 and S4 are the strongest in the production on potatoes peals solid media in compared with liquid residues media under the optimal production condition including temperature, hydrogen power and time of production. Results show that the isolated antimicrobial compounds were broad - spectrum against both G+ve and G - ve bacteria so it has been tested its effectiveness against a group of pathogenic yeasts and molds isolated from laboratories of Babylon hospitals.When comparing the results obtained with the results of pharmaceutical antibiotics found that the effect of the product exceeds the effect of Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, in addition to significantly impact on a range of pathogenic molds. The highest inhibition zone is obtained due to the isolation of S4 against the bacteria Bacillus seraus with diameter 43.35mm after the incubation the isolates on the potato peals solid media for 9 days at a temperature of 30 ◦C. These diameter is higher than the inhibition zone of Meropenem antibiotics against the same bacteria.Other aspects of this study include an extracted of the active compounds from the fermentation media using ethyl acetate and distilled water and then purifying the compound using thin layer chromatography(TLC) technique. Also it has been diagnosed the active compounds using the following chemical analysis (FTIR, HNMR and CHNS) to illustrated the type of effective compound.

تقدير السيروتونين, عامل تغذية الدماغ, اللبتين, الكورتيزول والتيستوستيرون عند الرجال البدناء في محافظة بابل == Determination of serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, cortisol and testosterone of obese men in Babylon province

اسم المؤلف: غدير حامد عبد الحســــن
اسم المشرف: نوران جميل ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل السمنة مشكلة صحية عالمية واسعة الانتشار من خلال تاثيراتها على مختلف وظائف الجسم وهذا ما اكدته العديد من الابحاث والدراسات التي تناولت السمنة ومدى تاثيرها على صحة الجسم وتضمنت دراستنا الحالية دراسة السمنة وعلاقتها ببعض النواقل العصبية والهرمونات الايضية وقد كانت الابحاث في هذا المجال الى حد ما قليلة. اجريت الدراسة في كلية العلوم للبنات /جامعة بابل للفترة الممتدة من تشرين الثاني 2015 ولغاية نيسان 2016 حيث تم دراسة بعض النواقل العصبية (السيروتونين 5 - HT وعامل تغذية الدماغBDNF ) وبعض الهورمونات الايضية (اللبتين والكورتيزول والتيستوستيرون ) باستخدام طريقة (ELISA) وكذلك تم تقسيم مجتمع الدراسة حسب المعايير الجسمانية حيث تم حساب وزن وطول الاشخاص ومن ثم مؤشر كتلة الجسم, العمر, ونسبة الدهون في الجسم , وقياس محيط الخصر وفق معادلات خاصة وتوضيح العلاقة بين الهورمونات والمعايير الجسمانية التي بموجبها تم تقسيم مجتمع الدراسة، حيث شملت عينة البحث 98 شخص سليم ظاهريا تتراوح اعمارهم بين 20 - 49 سنة من الرجال وفي ادناه التقسيمات الجسمانية لمجتمع الدراسة : ا - مؤشر كتلة الجسم الى ثلاثة مجاميع، الفئة الاولى شملت 54 شخص بدين و24 شخص وزن زائد و20 شخص وزن مثالي كمجموعة سيطرة. ب‌ - نسبة الدهون في الجسم الى اربعة مجاميع , فئة الرياضيين5 اشخاص، فئة الاشخاص اللذين يمتلكون لياقة بدنية3 اشخاص، فئة الاشخاص بنسبة مقبولة من الدهون 14 شخص, فئة البدينين 76 شخص.ج‌ - حسب الفئات العمرية الى ثلاثة مجاميع ، الفئة الاولى شملت 31 شخص فئة الشباب و29 شخص لفئة متوسطي العمر و38 شخص كبار السن.د‌ - حسب قياس محيط الخصر وضمت مجموعتين، الاولى (84) خصر كبير(اكبر او يساوي 90 سم) والثانية(14) خصر صغير ( اصغر من 90 سم ).واظهرت النتائج ما يلي : 1. انخفاض معنوي في مستوى هرمون السيروتونين (p<0.05) عند مجموعة الاشخاص البدينين اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى. 2. اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي ( p<0.05) في مستوى عامل تغذية الدماغ BDNF)) عند مجموعة الاشخاص البدينين مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة.3. اما اعتمادا على تقسيم الفئات العمرية فنلاحظ وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في مستوى BDNF عند الفئة العمرية لكبار السن مقارنة مع فئة الشباب.4. كما واوضحت النتائج زيادة ملحوظة لمستويات هرمون اللبتين في مصول الاشخاص البدنيين في جميع التقسيمات الجسمانية(مؤشر كتلة الجسم، نسبة الدهون، ومحيط الخصر) عند مقارنتها بمجموعة السيطرة.5. فيما اظهرت نتائج هرموني الكورتيزول والشحمون الخصوي انخفاض معنوي( p<0.05) في الاشخاص البدينين لجميع التقسيمات الجسمانية مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى . 6. اما فيما يخص الفئات العمرية فقد اوضحت النتائج وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في اللبتين وهرمون الكورتيزول في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب ,بينما اظهرت النتائج حصول انخفاض معنوي (p<0.05) في هرمون الشحمون الخصوي في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب. اما قيم السيروتونين فلا توجد فروق معنويه بين الفئات العمرية . في حين اظهرت نتائج تحليل الانحدار الخطي وجود ارتباطات ايجابية وعكسية بين المعايير الجسمانية الاربعة المقاسة (كتلة الجسم ونسبة الدهون ومحيط الخصر بالاضافة الى الفئات العمرية) مع الهورمونات المتضمنة موضوع دراستنا بالاضافة الى وجود علاقات بين الهورمونات مع بعضها البعض عند الاشخاص في المجاميع المختلفة المصنفة حسب مقاييس السمنة المذكورة سابقا. | According to recent studies, obesity have been found to be of prime risk factor for many a worldwide public health problem. However, little works have been done to study the effect of obesity in showing healthy person neuropeptide and metabolic hormone level associated with it in the regulation of important system in human body. This study was carried out in College of Science for Women in Babylon University during the period from November 2015 till April 2016, it was an evaluated study for the assessment of the obesity effect on serotonin, brain derived neurotrophic factor, leptin, cortisol, and testosterone and to investigate any relationship if found between these parameters in studying population according to measures of obesity categories. The study involves following up of 98 men at 20 - 49 years who were divided according to their anthropometric (physical) characteristics : 1 - Subjects whom were obese (54 sample), overweight (24 sample) and normal weight (20 sample) as classified according to BMI categories.2 - Subjects whom were athletes (5 samples), fitness (3 samples), acceptable (14 sample) and obese (76 sample) as classified according to body fat percentage category. 3 - Subjects whom have young - age (31 sample), middle - age (29 sample), others whom have old - age (38 sample) based on age group categories.4 - Subjects whom have waist circumference (WC≥ 90 cm) defined subjects with large WC (84 sample) other subjects have (WC< 90 cm) were considered as small WC (14 sample). The parameters in the present study were included serum neurotransmitter serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, Cortisol, and Testosterone, also the parameters were done in this study included anthropometric measurements such as; body weight, height to calculated (BMI), and WC and percentage of body fat were calculated by a special formula, also subjects age were recorded. The results show in the following : 1 - A significant decrease in the serotonin level (p<0.05) in obese subjects according to categories of obesity measurements compared with other groups.2 - The results showed a significant increase in BDNF level (p<0.05) in obese group according to categories of obesity measurements as compared with other groups of obesity measurements.3 - The study showed that increase level of BDNF in old - age group compared with young - age group.4 - The results of leptin hormone show a significant increase (p<0.05) in all obese groups in regard with categories of obesity measurements.5 - The results showed a significant decrease serum testosterone level in obese subjects in all categories of obesity measurements as comparison with other groups.6 - The results showed that variation in leptin and testosterone levels were associated with age groups difference, while there were no significant differences in serotonin level as related with age - groups difference.7 - The results of cortisol level showed a significant increase (p<0.05) in both of obese groups and normal BMI group. In addition, it was noticed that a significant positive and negative correlation among investigated hormones in subjects based on categories of obesity and between that tested hormones with anthropometric measurements.

دراسة مقارنة مظهرية ونسجية للاعور وعلاقته بالبيئة الغذائية في بعض الحيوانات == Comparative study Morphological and Histological of caecum in relation to feeding ecology in some animals

اسم المؤلف: عطاف طلال شاكر الكرعاوي
اسم المشرف: فاضل فرهود مكي الجبوري | منار محمد حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study included four axis, the aim of which is to reveal the histological and morphological changes in the caecum of birds and mammals in relation to the effect of food on it, The result, showed the following. The 1st axis includes a laboratory study on the (Starnus vulgarus) since it is omnivorous birds and has the ability to change its natural feeding very fast, The aim of the experiment is to show the effect of food on the length of the small intestine and caecum. Thus, 25 birds were dissecting. The experiment lasted 40 days. The results showed that there was moral differences in the sum of body weight, small intestine length, caecum length and thickness, in both herbivorous and carnivorous feeding groups. The average body weight of the herbivorous feeding group was (60.04 ± 11.72)gm as compared with (70.48 ± 6.37)gm for the carnivorous feeding group .There was a moral differences in the length of the small intestine and caecum in both groups of birds. The average length of herbivorous group was (27.56 ± 3.61)cm as compared with (22.90 ± 1.50)cm in the other group. There was moral differences the length of caecum of both groups. The average length in the herbivorous group was (5.91 ± 1.38)cm . compared with(1.27 ± .22)mm in the other group. The amount of vegetable food consumption was much more 73 gm/day than that of the animal food 23 gm/day. The histological studies of the caecum of the Starnus vulgarus revealed that there was amoral differences in the thickness of the lumen of the herbivorous feeding and carnivorous feeding in herbivorous was(83.00 ±3.70) while in carnivorous was(21.5 ± 2.85) .The thickness of the muscular layer in the herbivorous feeder was(2.07 ±27.60 ) compared with(5.20 ± 1.92) in the other group. The 2nd axis includes a histological and morphological studies on the caecum of two different species of birds namely Anas platyrhynchos herbivorous bird and Falcon peregrinus carnivorous bird . It was found that there was amoral differences in small intestine length, caecum length and thickness between the two groups. The rate of small intestine length in duck was(8.14 ± 1.37) cm while that of the hawk measured(25.04 ± 1.35)cm. It was noticed that the length of caecum in the duck was (11.68 ± 1.54)cm as compared with(0.40±0.08)cm in the hawk. The thickness of the caecum in the duck was (0.67 ± 0.14)cm as compared with (0.17 ± 0.04)cm in the hawk. Histologically. There was amoral differences in the lumen thickness and muscular layer. Thus, the thickness of lumen in the duck was(467.50±33.21) while that in the hawk was(141.00±6.754) . The thicken of muscular layer in the duck was (20.20±6.37) while that in the hawk was(6.40±2.07) . The third axis includes a morphological and histological study of appendix of the rabbit to reveal the effect of food on it. It was noticed that the average weight of the body was (1100.05 ± 1.86)gm and the length of the small intestine was (36.51 ± 2.17)cm and the length of the appendix was (8.32 ± 1.27)cm and the thickness of the appendix was(0.61 ± 0.19)mm.the link among the small intestine and appendix length , appendix length and thickness was studied, too. It was that observed appositive correlation among the small intestine and appendix length , among appendix length and thickness, the correlation index among the small intestine and appendix length was(0.4) while that among the appendix length with its thickness was(0.5). Histologically, it was noticed that the appendix of the rabbit made of four layers namely, mucosa, sub mucosa , muscularis and serosa. It was also found that there was aplenty of goblet cell inside the simple columnar epithelial tissue of appendix lumen. It was also noticed that there was some kind of cells called endocrine(entero endo crino cyte), and that there was a massive spread of lymphoid follicles. The fourth axis : It includes a histological comparative study between the normal and infected appendix in human. The normal appendix of the human composed of four layers namely mucosa, sub mucosa, muscular and serosa. It was noticed that there was an intensive spread of goblet cell with in the simple columnar epithelial. It was also noticed that there was a presence of crypts of liberikuhn with in mucosa layer with widely spread to lymphocytes with in mucosa and sub mucosa layer. In the condition of inflamed appendix it was found large deformation in all layers. The information start in the internal lining of the appendix which is the mucosa layer then the information spread later to the other part.

التشخيص الجزيئي, المظهري واختبار حساسية الفطريات والبكتريا المرافقة لقشرة الشعر مختبريا لعوامل التضاد الميكروبي == Molecular, Phenotyping identification and invitro susceptibility testing in Fungi and Bacteria associated with hair dandruff to antimicrobial agents

اسم المؤلف: شيماء محمد علي وتوت
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل قشرة الراس اكثر مرض جلدي شيوعا ورغم انها غير مهلكة للحياة فلم تنل قسطا من الاهتمام والبحث على مستوى العالم ولذلك هدفت الدراسة الحالية الى عزل, تشخيص والتحري عن تاثير المضادات الفطرية على الفطريات والخمائر وكذلك عزل وتشخيص البكتريا المرافقة للقشرة الموجودة في فروة الراس ومن شعر هذه الحالات المرضية. خلال مدة الدراسة ولفترة من تشرين الاول الى حزيران 2016 حيث تم جمع 280 عينة قشرة وشعر ومسح من الحالات الموصوفة انفا واشتملت على 152عينة شعر و74 عينة قشرة و54 مسحة من فروة الراس وكذلك جمعت 30 عينة سيطرة. وكل جهد لم يشار اليه بمصدر فهو من جهد الباحث.زرعت العينات على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسيمايد وبدونه وشخصت عزلات الخمائر اوليا على وسط CHROMagar للتميز بين انواع الخمائر عن طريق الوانها. كذلك تم التحري عن الفطريات الخيطية الجلدية من خلال زراعتها على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسومايد للحصول على عزلات للفطريات الجلدية وكذلك تقييم تواجد الفطريات المترممة مع العينات قيد الدراسة وتقيم عوامل الضراوة لدى الخمائر. تشخيص الفطريات المعزولة على المستوى الجزيئي من خلال تضخيم منطقة ITS باستخدام الزوج الباديئي ITS5/ITS4وITS3/ITS4 واجراء تحليل التتابع DNA sequencing لعينات ممثلة عن المجوعات المتماثلة في اوزانها الجزيئية لمنطقة التضخيم وبعد الحصول على نتائج التضخيم تم اخذ منتج بلمرة لعزلات ممثلة وارسلت الى مختبرMicrogene في امريكا للحصول على التتابع للقواعد النتروجينية ومقارنتها مع تتابع العينات المرجعية في البنك الجيني باستخدام برنامج NCBI )Blast Nucliotide Database). ومطابقة التتابعات لتقييم التماثل والاختلاف ورسم الشجرة التطورية على اساس نتائج تحليل التتابع لتقييم مدى تقارب العزلات ضمن النوع والانواع قيد الدراسة.اظهرت نتائج التشخيص التقليدية والجزيئية باستخدام الازواج البادئية ITS5/ITS4 وITS3/ITS4 كانت اوزان الحزم لكامل منطقة ITS تتراوح بين500 - 800 زوج قاعدي. بينما تراوحت الاوزان لمنطقة ITS2 بين350 - 400زوج قاعدي.واظهرت النتائج ان الطرق الجزيئية المتقدمة هي ادوات قوية لتشخيص الفطريات مقارنة مع الطرق التقليدية. تم تسجيل عزلتين من C. sake و3 عزلة Aurobasidium iranianum وعزلة Issatchenkia orientalis وعزلة من Cryptococcus fonsecae وعزلة واحدة من Cryptococcus diffluens لاول مرة في العراق.اجراء تقييم للفعالية المايكروبية لبعض المستخلصات النباتية المهمة طبيا ومقارنتها مع المضادات الفطرية وتقييم التركيز المثبط الادنى باستخدام شريط E - Test strips .كما تم مسح الانواع البكتيرية المرافقة للعينات قيد الدراسة مجهريا وبايوكيميائيا من خلال زراعتها على الاوساط التفريقية مثل وسط Manitol salt agar ووسط Blood agar base.اظهرت عزلات المبيضات البيضاء موجبة لانتاج الانبوبة الجرثومية, النمو بوجود السايكلوهكسيمايد والنمو في درجة ˚45م. قابلية C.kruzei , C.parapsilosi وC.glabrata على تكوين الغشاء الحيوي . اما اختبار الانزيمات الحالة للدهون المفسفرة فقد كانت موجبة لعزلات C.albicans ,C.parapisilosis وC.kruzei واخيرا اضهر اختبار الانزيمات الحالة للدهون نتيجة موجبة فقط لعزلات C.albicans ,C.tropicalis وC.parapsilosis. كذلك اجريت اختبارات للفطريات الجلدية والتي تضمنت قدرة ال T.rubrum على النمو على وسط SDA with 5% of NaCl وكذلك نمو الفطريات على وسط PDA وانتاج صبغة عكسية.اظهرت النتائج ان لبعض المستخلصات المائية للنباتات تاثير مثبط على نمو الفطريات الجلدية والخمائر وكان المستخلص المائي للقرنفل اكثر فعالية في تثبيط الفطريات الجلدية وبعض الخمائر وال Rhodotorulla وبفرق معنوي ≥ 0.05 يليه الشاي الاخضر والكالبتوز والدارسين والحنة وبتركيز 8 % حيث كان اكثر تاثير من بقية التراكيز.تم اجراء اختبار الحساسية الدوائية لبعض المضادات الفطرية باستخدام E - Test strips للمضادين CAS وFLU حيث اظهرت النتائج مقاومة الفطريات الجلدية والخمائر وال Rhodotorulla للمضادين.تم عزل بكتريا Staph.aurues and Staph.epidermidisوبين اختبار ال Congo red قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي Biofilms)). واستنتجت الدراسة ان قشرة الشعر هي مشكلة الشعر المهمة العديد من الخمائر مع الشعر المتساقط معها قد تقف وراءها مجموعة من الفطريات والبكتيريا المتهمة في احداث مثل هكذا اخماج وان استخدام المستخلصات النباتية كانت مؤثرة بشكل معنوي في اختزال نمو الفطريات التي تم اختبارها تحت تاثير هذه النواتج الطبيعية وبغياب الفعالية الدوائية لافضل المضادات الفطرية مثل الفلوكنزول والكاسبوفنجين. ان التشخيص المظهري للعزلات اعتمادا على شكل الخلية لانواع المبيضات والوانها على وسط الكرومواكار هو غير علمي لنجاح التميز بين انواع المبيضات. لذلك تشخيص الانواع بالاعتماد على منطقة ITS يوفر وقتا (والذي ياخذ وقت من يوم الى يومين ) وهي ملائمة وتطبيقية حتى مع العزل التي تمتلك خصائص مظهرية شاذة. | Hair dandruff is a most commercially demoralized skin disease. Although it is not deadly disease, but not have more attention and research worldwide. This study was aimed for isolation, identification and investigation of antifungal susceptibility of dermatophytes and Candida also isolation and identification of bacteria associated with hairs dandruff. During the period from September to June a total of 280 sample of scalp and hair and smear were collected from Hilla hospital private clinics and primary schools in rural areas in the Province of Babylon (n=152 hair samples, n= 74 dandruff samples, n= 54 smear from head scalp) and samples was also collected as 30 control samples. Every effort not referred to source it from researcher effort. Samples cultured on Sabouroud Dextrose Agar (SDA) medium with or without Cyclohexemide based on stander cultured methods, incubation and identification, Primary identification of Candida has been achieved on CHROMagar medium to differential between Candida spp. based on colors. Also it was investigation about dermatophytes through cultivation on Sabouroud Dextrose Agar containing Cyclohexomide to get isolates of dermatophytes, as well as assess the presence of fungus saprophytic with samples under study.Virulence factors for the yeast were detected. Fungal identification based on amplification internal transcript spacer (ITS) region by using ITS5/ITS4, ITS3/ITS4 primers and subject the PCR product to sequence analysis (DNA sequence) for representative samples groups at Micro gene laboratory in US. Sequence analysis based on alignment with data base of reference strains in the gene bank (Blast Nucliotide Database (NCBI) program). phylogeny tree was construction on the basis of the results of the sequence data.Results showed conventional and molecular diagnosis by used ITS5/ITS4 and ITS3/ITS4 primer was band weight integration to ITS region range between 500 - 800 bp. while range weight for ITS2 region between 350 - 400 bp.The results showed that advanced molecular assays were powerful tools for fungal identification compare with the conventional methods. For the first time in Iraq Two isolates from C.sake and one isolate from Issatchenkia orientalis, also three isolates Aurobasidium iranianum and one isolates from Cryptococcus fonsecae and one isolates from Cryptococcus diffluens were recorded.Evaluating the effectiveness of microbial for some medically important plant extracts and compared with the antifungal and assess the minimum inhibitory concentration by used E - Test strips. As it has been cleared bacterial species accompanying to samples under study microscopically and biochemically during cultured on differential medium like manitol salt agar and blood agar base media.C.albicans isolates positive results for germ tube, growth in the presence of Cyclohexomide and growth in temperature 45C˚. C.kruzei, C.parapsilosis, C.glabrata ability composition of biofilms, while phospholipase assay was positive to C.albicans, C.parapisilosis and C.kruzei. Lipase assay was positive to C.albicans, C.tropicalis, C.parapsilosis. As well as conducted test for dermatophytes which include ability of Trichophyton rubrum on growth on SDA with NaCl of 5 % and dermatophytes growth on PDA and produce inverse dye. The results showed that aqueous extracts were reduced the growth of dermatophytes and Candida. The aqueous extract of Cloves more effective in inhibition of dermatophytes, Candida and Rhodotorulla at ≥ 0.05 followed by green tea and Eucalyptus, Cinnomomum, Henna. Moreover 8% concentration was more effective than other concentrations.Tested antifungal sensitivity for some Fluconazole and Caspofungin antifungal using E - Test strips. Showed that dermatophytes, Candida and Rhodotorulla was reveals resistance action against antifungals.Staph.aureus and Staph.epidermidis showed Congo red test and ability for biofilms formation.The study concluded that the hair dandruff is important hair problem, many yeast with the hair loss together may be behind them groups from fungi and bacteria accused in events such as typhoid and used of plant extracts was effected in signification in fungi growth that test under effect this natural products and the absence pharmaceutical activity to best antibiotic such as Fluconazole and Caspofungin. Morphologically identified isolates based on the cell shapes of Candida spp. and their color on CHROMagar isn’t feasible to successfully differentiate between members of the Candida spp. Therefore, identification of Candida and dermatophytes base on ITS region saves time (it takes 2 to 3 days) and is accurate and applicable even to isolates with atypical morphological features.

التغييرات الفسيولوجية والبايوكيميائية لنبات عين البزون باستخدام حامض الساليسليك خارج الجسم == In Vitro Physiological and Biochemical Changes of Catharanthus roseus Using Salicylic Acid Under Salinity Stresse.

اسم المؤلف: هديل عامر كاظم
اسم المشرف: بشير عبد الحمزة محمد العلواني
الموضوع العام: علوم الحياة
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت التجارب في مختبرات كلية العلوم في جامعة بابل ,خلال الفترة 2015 - 2016 ,لتقدير كمية منتجات الايض الثانوي(المركبات القلويدية : الفنكرستين والفنبلاستين)من اوراق وكالس نبات عين البزون Catharanthus roseus. تضمنت الدراسة تعقيم الاوراق وزراعتها في وسط الـ MSمضافا اليه منظمات النمو النباتية : (1 mg.l - 1) من كل من 2,4 - dichlorophenoxi acetic acid (2,4 - D) وBenzyl adenine (BA) من اجل تحفيز الكالس. بعدها اخذت كمية مماثلة من الكالس وزرعت في وسط الـ MS مع منظمات النمو ومضافا اليه تراكيز مختلفة من ملح الـ, 6, 9, 12 and 15 dS.m - 1 NaClوتراكيز مختلفة من حامض الساليسلك50,100,150 and 200 mg.l - 1,وعمل تداخلات بين الملح والحامض. وقد ارتفعت مضادات الاكسدة الانزيمية SOD,CAT,POX ومضادات الاكسدة الغير انزيمية AsA ,proline ,GSH وكذلك الـ MDAفي الكالس تحت تاثير التراكيز 9,12 and 15 dS.m - 1 من NaCl وكذلك التراكيز 150 and 200 mg.l - 1من الـSA بالمقارنة مع عينة السيطرة وكذلك مع الكالس من التداخلات 6 dS.m - 1 NaCl +50 and 100 mg.l - 1SA ازداد محتوى الفنكرستين في تراكيز الملح 9,12 and 15 dS.m - 1وكذلك في تراكيز حامض الساليسيلك150 and 200 mg.l - 1,وقد كان اعلى تركيز للفنكرستين عند التوليفة 150 mg.l - 1SA+ 12 dS.m - 1NaCl حيث وصل الى129.092 µg/g واعلى تركيز للفنبلاستين عند التركيز 50 mg.l - 1 SA حيث وصل الى16.231µg/g.. | This experiment was conducted in faculty of Science labs, Babylon University, during 2015 - 2016 for extraction, to evaluate the quantity of secondary metabolites which are Alkaloids : (Vincristine &Vinblastine) from the leaves and callus tissue of Catharanthus roseus. This study included sterilized leaves of Catharanthus plant to culture them on MS medium supplemented with plant growth regulators : 1 mg.l - 1 of 2,4 - dichlorophenoxi acetic acid (2,4 - D) and 1 mg.l - 1 of Benzyl adenine (BA) to induced callus. Then, identically callus fresh weight sub - cultured on the same MS medium supplemented with different level of salinity using 6, 9, 12 and 15 dS.m - 1,and different concentration of salicylic acid 50,100,150 and 200 mg.l - 1 and their interactions. The results revealed that antioxidant enzymes activity like Superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT),and peroxidase(POX),and non - enzymatic antioxidants like Glutathione(GSH), proline, Ascorbic acid(AsA),and Malandialdehyde (MDA) were high in callus under 9,12 and 15 dS.m - 1 of NaCl ,and 150 and 200 mg.l - 1 of SA, than in callus control and callus grown in MS media supplemented with 6 dS.m - 1 NaCl and 50 and 100 mg.l - 1SA and their combinations. Vincristine was increased in 9,12 and 15 dS.m - 1 of NaCl ,and 150 and 200 mg.l - 1 of SA, and the higher content was in the combination 150 mg.l - 1SA+ 12 dS.m - 1 NaCl where it was 129.092 µg/g. The higher content of Vinblastine was in the concentration 50 mg.l - 1 SA where it was 16.231µg/g

عزل وتشخيص المضاد الحيوي المنتج بواسطة عزلة Penicillium chrysogenum من البيئات المختلفة في ترب مدينة الناصرية == Isolation and Identification of antibiotic produced by Penicillium chrysogenum isolated from different environments in Nasseriya city soi

اسم المؤلف: ميسم كريم حسن
اسم المشرف: سعد سلمان هميم | محمد حسين مشهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study includes the isolation and identification of some mycoflora from 40 soil samples in six places ( Remnants of fat - born, parks, edges of the river, animal wastes, sewage and rubbish) during October 2015 - January 2016 in Nasseriya City, Iraq. According to different environmental factors, the isolated genera were Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, Cladosporium, Sepedonium chrysospermum, Alternaria chlamydospora, Bipolaris, Chrysosporium, Candida albicans, Rhododendron flavum, Humicola, Geotrichum candidum, Fusarium and Acremonium. Three isolation methods were used. Dilution method, direct plate method, alcohol and heat treatment technique using the cultural media viz. Potato Dextrose Agar ( PDA), Sabouraud Dextrose Agar (SDA) and Potato Carrots Agar (PCA). Aspergillus represented the highest fungal isolates which represent 62 (37.12%). followed by Penicillium with 47 (28.14%), Mucor 22 (13.16%), Rhizopus 15 (8.98%), Cladosporium 6 (3.59%), Sepedonium chrysospermum and Alternaria chlamydospora, 3 (1.80%), Biopolaris, Chrysosporium and Candida albicans with 2 (1.20%), and finally Rhododendron flavum, Humicola, Acremonium, Fusarium and Geotrichum candidum recorded the lowest fungal isolation with one isolate for each (0.60%). The study was aimed to isolation of Penicillium from soil and assay its antibacterial activity. The results showed that dilution method gave a best fungal growth in comparison with direct plate method and alcohol and heat treatment technique in 25 ºC and pH = 6. PDA appeared as an optimum medium for isolation in comparison with other media such as SDA and PCA. The preliminary results showed that Penicillium sp. exerted antibacterial activity against Gram positive and Gram negative bacteria; Therefore, this fungus was used for production of antibiotic on Potato Dextrose Broth (PDB) medium. The optimum conditions were obtained at pH = 6, incubation temperature of 25 ºC and shaking rate of 180 rpm for 7 days to fermentation. Ethyl acetate was a good organic solvent to extraction of antibiotic which produced (3g/L) as white to creamy crystals. The characterization of the antibiotic product after extraction and purified by chemical methods included Thin Layer Chromatography (TLC) test, Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectra and Mass Spectra. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for clinical bacterial species was 1 - 10mg/ml.The PCR method used in this study utilized Internal transcribed spacer (ITS1 - 4) as a primer for identification of isolates. Two PCR products of the targeted gene of Penicillium chrysogenum isolates which locally named as (Penicillium chrysogenum F1 and Penicillium chrysogenum F2) were selected and subjected to partial DNA sequencing for the ITS gene to follow up the possible molecular relationship between these local isolates and what recorded globally in Genbank.

Predictability of the Expression of ER, PR Receptors, HER2 Marker by the Coloration with of IV Collagen Expression and AgNORs in Breast Carcinoma among Iraqi Women in Thi_Qar Providence : Immunohistochemical Study == Predictability of the Expression of ER

اسم المؤلف: نجم الازيرجاوي
اسم المشرف: هيفاء عبد علي الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study is adescriptive exploratory study in Thi - Qar providence for some breast cancer patients . This study aims to assess the relationship between gene expression for each type four of the collagen (IVCollagen) and gene expression positive for both estrogen receptor ER - Eestrogen - receptor and progesterone PR - Progestron receptor and fairs tumor HER2 (Human epidermal growth factor receptor) By using chemistry of dyes immunological technique and the nuclear regulatory regions Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR(. The present study addresses the identification of the type IV collagen content in the basement membrane of epithelial tissue of the breast cancer patients in Thi qar and its relationship to nuclear organization region and maintain its relationship with hormonal receptors and progesterone genetic factor and the extent of their association with the occurrence of breast cancer.Fifty tissue samples are collected from Hussein Teaching Hospital inThi Qar and some private laboratories in the providence each case where data included that the most important factor is age, where he found that the highest percentage of injuries, age (55 - 46 years) increased by 38%. And mixed samples, either partial removal of the tumor or the eradication of whole breast. After collecting samples saved each formalin concentration of 10% for 24 hours at a minimum and then buried with parafin wax and completed the work by histological methods own work.The use of special select number of collagen type IV and determine the type of hormonal receptor positive or negative and also used several positive pathological tissues of the tumor to determine the human epidermal growth factor receptor by using silver nitrate to study the nuclear organization regions. Results of the current study showed that there is a positive relationship between collagen gene expression of type IV and between fairs oncogene(HER2 human epidermal growth factor receptor), as observed the presence of collagen type IV in tissue sections of tumors with HER2 negative gene expression of genetic factor, and with the positive expression for each Estrogen receptor positive ( estrogen positive ) and progesterone receptor positive( Progstrogen positive).Results of this study also showesthe presence of collagen or lack in histological sections of the tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs as well as the non - existence of collagen in the sections taken from tumors with negative expression of estrogen and progesterone receptors. The results of the current study also showed that there is a clear positive relationship between nuclear organization regions and between Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR) Fairs oncogene HER2, as it was noted the presence of many of the nuclear regions of the dye - derived tissue sections of tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs, while nuclear chromosomal regions did not appear in the sections derived from tumors with negative expression of estrogen receptor and progesterone hormone. The results of the current study also showed that there is a lack of positive gene expression of collagen type IV, the presence of a number of chromosome regions nucleuse (Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR)).

تاثير داء السكري وعقار البنتوستام على تطور الاصابة بداء اللشمانيا الاحشائية في ذكور الفئران المختبرية == The Impact of diabetes and Pentostam on development the infected Leishmania donovani parasite in male laboratory mice

اسم المؤلف: افراح علي عبد الامير العزاوي
اسم المشرف: فاضل عباس منشد العبادي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included evaluation of the role of diabetes and Sodium Stibogluconate drug (Pentostam) against infection leishmaniasis parasite in laboratory animals experimentally infected with the parasite, Where we used in this study male white laboratory rats of the strain Mus musculus Balb /c. Aggregates were divided randomly into eight major groups of eight mice, The first group were injected with saline solution at a dosage of 0.2 ml, the group was considered as a negative control, The second group were injected with parasite (1.2 × 10 6 parasites / 0.2 ml) at a dosage of 0.2 ml, The third group was injected with the parasite and alloxan at a dosage of 0.2 ml, while the fourth group were injected only with alloxan, While the fifth group were injected with a Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg, as well as the sixth group were injected with leishmania parasite at a dosage of 0.2 ml and Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg while the seventh group were injected with the parasite and alloxan at a dosage of 0.2 ml and Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg while the eighth group injected with alloxan at a dosage of 0.2 ml and Sodium Stibogluconate drug at a dosage of 20 mg/kg, Where it was dissected first four groups a period of 45 days while the other groups were dissected after 75 days with recorded weights of the body before and after the experiment. Also studied the histological pathological changes and taking weights for each of the liver and spleen, blood samples were taken for the purpose of knowing the effect of which occurred in the blood parameters and the level of glucose in the blood. The results of the statistical analysis of the current study showed in the second set significantly higher (P≤0.05) total weight of the body and the weight of the liver spleen, White blood cells lymph and acidophilus, while there was a significant decrease in the total number of white blood cells, neutrophils and red blood cells there was no significant difference (P≤0.05) inthe blood glucose concentration compared with the first group. The fourth group showed a significant decrease (P≤0.05) in total body weight and red blood corpuscles with (P≤0.05) blood glucose level and neutrophil cells, the groups treated with the drug showed the sixth and seventh group height body weight and white blood cells and lymphocytes and a significant decrease (P≤0.05) red blood cells, neutrophils and acidity. There was no significant difference (P≤0.05) in the concentration of glucose in seventh group. The eighth group showed a significant decrease (P≤0.05) in the total number of white and red blood cells and significant increase (P≤0.05) in lymphocytes and acid, while there was no significant difference (P≤0.05) concentration of blood glucose. The fifth group showed the treatment of the drug loss in the radiology of hepatic cells and degeneration of clear and congestion in the central vein with the infiltration of inflammatory cells within the hepatic tissue, and showed a clear exhaustion in the white pulp and the proliferation of red pulp.we observed in the histological sections of the present study in the sixth group infected with parasite and treated with pentostam, a significant improvement of the liver tissue. The spleen showed a simple propagation of the white heart. The seventh group is experimentally infected with leishmania and the alloxan The development of diabetes and the treatment of pentostam is spread with Kupffer cells and expansion in the blood sinusoids with changes in the spleen. White and the group of nematodes around it with breeding in the red pulp as in the fifth group.

دراسة انتشار ذبابتي الرمل paptasi Phlebotomus و(Diptera : psychodidae) p.sergenti ودورهما في نقل مرض اللشمانيا في محافظة ميسان == Study the Prevalence of sand fly Phlebotomus p.sergenti (Diptera : psychodidae) paptasi and and its role in the spread of Leishmaniasis in Maysan province

اسم المؤلف: عبد الحسين شلويط زغير
اسم المشرف: صادق صاحب علي | بسعاد عقرب العبودي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: during field studies have been done in order to know the spread of sand flies in Maysan province during the beginning of October /2015 until the end of September 2016 through the collecting of samples from five areas that geographically different which included the areas of AL - majer AL - kabber, AL - uzair, AL - musharah , kumait and Mugharbah in the middle of the center of province .1263 insect have been collected by two types of traps light insect traps and manual insect traps. These insects included two species : papatasi and sergenti which belong to the same genus ( phlebotomus ) the number of the first species insects was more than of the second species. The number of the first species reached 85.90% while the number of the second species was 14.04% . The inset had been classified in transmitted diseases center in BaghdadThe insects have been found in the whole areas of the studying except the species sergenti which has been not found in the area of AL - majer AL - kabber . There are two peak spread times of these insects : The first is through out October and the second is the through out may . Concerning the relationship between the spread of these insects and the occurrence of Leishmaniasis positivewhere the infestation by this disease began on September November and December and the peak spread is recorded on January on the country of the inset occurrence where it begins at spring and the beginning of autumn . The spread of these insects was in flounced by the environmental factors such as temperatures and humidity . The flagellated promastigotes of leishmania parasite were not found during the anatomy of a lot of insects.Four chemical insecticides were used to control these insects where the effect of the insecticides (snake) was the strongest for killing these insects.515 infection of Leishamaniasis has been recorded in Maysan province at proportion of 506 cutaneous infestation and 9 visceral infection respectively .The rate of skin infestation was high in age groups between (1 - 10 ) year in comparison with another age groups.Concerning the types of ulcer ,the dry ulcer were dominant and the number of dry ulcers was 873 while wet ulcers were 100 concerning the diameter of the ulcer the higher infections occurred at diameter of 1 Cm which reached 873 infection . The number of patients infected by one ulcer was the highest which reached 301 infestation.The number of dry infestation in the cities was higher than in rural areas on the contrary of wet infestation . concerning the distribution of skin infestation on the body areas the higher ratio of infestation occurred in higher and lower extremities which reached 344 at proportion of 68.57%.The infestation of skin Leishmaniasis has been concentrated in the center of province which reached 334 at proportion of 66.07%.Concerning the months of the year , the majority of skin leishmaniasis was on January which reached 137 at ratio of 27.66%most of visceral leishmaniasis occurred in the patients of blood group type O proportion of 33.33% .The infection of visceral Leishmaniasis in males was higher than of females and the highest than and the highest infection of visceral Leishmaniasis was in age groups between (1 - 3) years and also the number of visceral Leishmaniasis infestation was the highest on January . Kumait areas is characterized by the presence of the highest visceral Leishmaniasis infestation.

دراسة تجريبية وجزيئية للبكتريا المصاحبة لحالات الحروق في محافظة ميسان == Experimental and Molecular Study of the Bacteria associated with burns in Maysan Governorate

اسم المؤلف: حسين علي دنانه البهادلي
اسم المشرف: رحمن لعيبي جلاب | حيدر خميس شنان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Burn injuries are considered as health problems that may sometimes lead to rapid death. Bacteria are considered as the most important causes of microbial infection associated with burns. In present study, 75 clinical samples were collection from patients with burns for the period from October 2015 to June 2016 from the lobby burns in Sadr Teaching Hospital in the Maysan Governorate, these burn swabs revealed 56 bacterial isolates, 41 (73.21%) were Gram - negative bacterial, distributed of (35.71%) Pseudomonas aeruginosa, (28.57%) Klebsella Pneuomonia, (3.57%) Escherichia coli ,Enterobacter (5.35%). On the other hand 6(10.71%)were Gram - positive bacterial. out of 75 burned swabs, 84% revealed a single pathogens and 16% shown a mixed bacteria. On the other hand, Antimicrobial susceptibility for the bacterial burn isolates revealed that P. aeruginosa was resistant to routine tested antibiotics, like Amoxicillin, Gentamycin and Tobramycin in 100%, While was resistance to Ciprofloxacin 85%, while most P. aeruginosa was sensitive to Ceftizmiden in 50%. Results also showed that Staph. aureus was resistant to Gentamycin, Tobramycin, and Levofloxacin in 50% respectively.Depending on the rate of injury burns microbial and resistance to antibiotics used, p.aeruginosa and Staph.aureus isolated from the burnswere chosen and study their role in the events of infection, experimental burns, and for this purpose has been the use Albino mouse male as a model for a pilot study for pathogenesis and progress associated with the infection of the disease bacterial burns. (33) male mice were divided into tow groups, the first group(24) mice were burned (deep dermal second degree) and infection by 0.2X108 cfu kg of elected isolates, the route of infection was subcutaneously and scratching within burned area. In the second group six were infected without burn, which was considered as positive control, while in the thirdgroup three mice were burned and injected by 0.2ml of normal saline and consider as negative control .the first group was subdivided into two subgroups (12) mices for each burn dominant pathogens, then divided into subgroups each of six mices and following up (3,7, days intervals post infection process). P.aeruginosa burned mice group, shown skin infection more progressive and more severity in comporning with group infected by Staph. aureus, In addition, they were significant increases in the body temperature of all infection burned mice group(p.value)compared with those pre - infection process. Reisolation of bacteria from infection mice organs revealed, that high percentages in experimental p.aeruginosa burned model comparison with Staph. aureus.Diagnosed bacterial isolates by API 20and Vitek compact system, in addition to molecular diagnostics using PCR technique for the detection of 16S rRNA gene, All isolates showed a positive result of this gene. The amplified 16S rRNA gene seguence was compared with the seguence in NCBI seguence database.the bacterial strain identified as P.aeruginosa EPSI. This study reflects the usefulness of sequence analysis of the 16S ribosomal RNA gene in identifying bacteria and determining bacterial diversity. Various techniques that are based on utilizing the 16S rRNA gene are discussed. Of critical importance is the use of massively parallel sequencing to study bacterial diversity. Through massively parallel sequencing which is replacing traditional methods of bacterial identification; various bacterial habitats are surveyed to compile their species compositions.

عزل وتشخيص البكتريا المرضية مع ايلاء اهتمام خاص للبكترياStaphylococcus auerus المرافقة ل Cutaneous Leishmaniasis في محافظة ذي قار == Isolation and Identification Pathogenic Bacteri with Special Regard to Staphylococcus auerus Associate with Cutaneous leishmaniasis at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: رضاء الله مرتضى الاعظمي
اسم المشرف: قاسم حسن وداعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study is designed to isolated and identification the pathogenic bacteria associated with Cutaneous leishmaniasis. Cutaneous leishmaniasis (CL) is a parasitic disease characterized by single or numerous ulcerations. This was study performed in Iraqi in Shatra general hospital and Al - hussein teaching hospital in Thi - Qar province 2016 - 2017.Total of 370 samples of suspected patients were taken and after examining them using geimsa stain , the positive were 186 males and 126 females then sterilize the area surrounding for ulcer , all samples were taken to (swab transport media) ,culture to MacConkey agar and blood agar after 24 hr of incubation at 37C ,after diagnosed by biochemical testing then species determined by API system. The positive results on culture media 92/312 , males 62 (67.4%) , female 30 (32.6 %).The total bacteria isolated from the lesions were in males and female staph auerus 52 cases (56.5%), Escherichia coli 8 cases(8.6%) , Bacillus cereus 6 cases(6.5%) , Pseudomonas. aeruginesa 5 cases (5.4% ), Strep. Pyogenes 6 cases(6.5%) ,Strepto.agalactiae 3 cases(3.3%).While other that isolated in males only and did not appear in females were aerobic bacteria ,Listeria moncytogenes 3 cases(3.4%) , Actinobacteria .spp 2 cases(2.2%) ,Klebsiella. Pneumonia 2 cases (2.2%) , Rodococcus .equi 1 cases (1.1%) , and anaeroberia bacteria ,Peptococcus niger 2 cases (2.2%) ,Peptostreptococcus .spp 2 cases (2.2%) .Then find bacteria that more presence more with cutaneous Leishmaniasis ,were it was staph. aureus therefore it were objected study antibiotic resistant .The present study demonstrates that Staph. aureus XIV isolates were resistant to methicillin 50 (96.15%), penicillin 48 (92.30%) , Clindamycin 37 (71.15%), ciprofloxacin 30 (57.69%) , Gentamicin 30 (57.69%),Amoxicalave 29 (55.76%), Azithromycin 25 (48.07%) , Amoxicillin 22 (42.30%), Tetracycline 21 (40.38%), Rifampin 10 (19.23%) and Vancomycin all staph .auerus are sensitive to Vancomycin The all 52 Staph. aureus isolates were further examined using polymerase chain reaction (PCR) for detection of (16SrRNA ,mecA and PVI gene ). 16SrRNA gene which were responsible for diagnosis ,where all isolates were positive to was 52\52 (100%) , mecA gene which were responsible for methicillin resistance this was detected in 52\52 (100%) . of Staph. aureus isolates and a part of virulence factors PVL gene was detected in 46/52(88.46%) of Staph. aureus isolates which are responsible to kill the leukocytes of human and other animals.

التوصيف المظهري والجزيئي للانواع البكتيرية المصاحبة لحالات الحروق في محافظة ذي قار == Phenotypic and Genotypic Charactrization of Bacterial species Assocuated with burn infections in ThiQar province

اسم المؤلف: عبير هادي فرهود الحبيب
اسم المشرف: رحمن لعيبي جلاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية الى تشخيص الانواع البكتيرية المصاحبة لحالات الحروق والكشف الجزيئي عن الموروثه 16SrRNA في الانواع البكتيرية المشخصة واستخدام تقنية DNA Sequencing . تناولت الدراسة الحالية فحص ومعاينة 107 مريضا تم اختيارهم بشكل عشوائي (ذكور واناث) تراوحت اعمارهم بين 1 - 45 سنة من الراقدين في مستشفى الحسين التعليمي للمدة من حزيران - 2015 تشرين الاول 2016 اذ اجري الفحص السريري من قبل الطبيب المختص وتشخيص الاصابة على انها حالة حروق مرضية ناتجة عن اسباب مختلفة. جمعت 107 عينة مسحات قطنية Cotton swabs وزرعت على وسط اكار المكونكي ((MacConkey agar واكار الدم ((Blood agar والاكار المغذي ((Nutrient agar. شخصت العزلات عن طريق الاختبارات المظهرية والبايوكيمائية وعامل التشخيص API20E ونظام الفايتك ( (Vitek 2compactفضلا عن التشخيص الجزيئي باستخدام جين.16S rRNA واظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود 117 عزلة بكتيرية تفوقت فيها العزلات السالبة لصبغة كرام ((Gram negative بنسبة 93.16% على العزلات الموجبة لصبغة كرام (Gram positive)بنسبة 6,83 وكانت نسب توزيع العزلات البكتيرية المشخصة Pseudomonas aeroginosa 32.47% , Klabseilla pneumonia 21.36% واقل نسبــة عزل كانـت لبكتريا Staphylococcus epidermidis بنسبة عزل 1.7% , في حين كانت نسب العزلات البكتيرية التالية Acinetobacter baumannii , Escherishia coli , . Enterobacter claocae ,Staphylococcus aureus , Burkholderia cepacia, Pruteus mirabillis, , Pantoea agglomerans بنسبة عزل. 12.36% , 11.1% , 5.12% , % 5.12 , 3.41% , 2.56 على التوالي.تناولت الدراسة الحالية بعض الجوانب الوبائية للحالات المصابة التي شملت معلومات عن المرضى المصابين بالحروق التي تضمنت الجنس , العمر , موقع السكن ونوع الحرق. وبينت النتائج ان عدد الحالات المشخصة كاصابات حروق للذكور كانت بنسبة 42.9% بينما كانت نسبة اصابة الاناث 57.%, تم تقسم المرضى الى عدد من المجاميع حسب الفئات العمرية. اعلى نسبة اصابة كانت في الفئة العمرية 9 - 1سنة بنسبة 54.2% وهي الفئة الخاصة بالاطفال تليها الفئة العمرية erishi29 - 20 بنسبة 20.56% واقل نسبة اصابة كانت في الفئة العمرية 49 - 40 بنسبة 4.67% وكانت نسب الفئات العمرية الاتية 19 - 10 , 39 - 30 بنسبة 11.21 , 9.34 على التوالي. اشارت النتائج الى ان حالات الاصابات المشخصة توزعت بنسب متفاوتة فيما يتعلق بنوع الحرق اذ كانت اعلى نسبة اصابة بالحروق بواسطة الماء المغلي Boiled water 38% تليها اصابة الحرق بواسطة لهيب الغاز Fire by gas flame بنسبة 28.9% واقل نسبة اصابة كانت لحروق الصدمة الكهربائية بنسبة 4.67%.اما فيما يتعلق بطبيعة ومكان السكن فقد اظهرت الدراسة ان اعلى نسبة اصابة كانت بين الافراد الذين يسكنون المناطق الريفية بنسبة 84.1% في حين كانت اصابات المركز بنسبة 15.88% . وجدت الدراسة الحالية ان نسبة الاصابة بالحوادث غير المقصودة كانت 86.9% في حين كانت الاصابات المقصودة 13% , لوحظ في الدراسة الحالية ان اعلى الاصابات بالحروق كانت تحدث في فصل الشتاء بنسبة 75.7% مقارنة باصابات الحروق في فصل الصيف 24.29% .اما بالنسبة الى اختبار فحص الحساسية فقد بينت نتائج الدراسة الحالية ان اكثر المضادات الحيوية فعالية ضد كل من البكتريا السالبة لصبغة كرامBacteria Gram negative والموجبة لصبغة كرام Gram positive هي Ceftazidin , Ciprofloxacin,Amicacin .واظهرت الدراسة ان اكثر العزلات مقاومة هي بكتريا P.aeruginosa التي اظهرت مقاومة لكل المضادات الحيوية بنسب متفاوتة. اكدت نتائج الدراسة الجزيئية لتضخيم جين 16SrRNA ان كل العزلات اعطت نتيجة موجبة لهذا الجين وان حجم الجين لكل الانواع البكتيرية كان 1500pb كذلك اكدت النتائج ان الحصول على500Pb من DNA Sequencing للجين 16SrRNA كافية لتشخيص الانواع البكتيرية كلا على حدة . ايضا تم مقارنة جميــــع نتائج DNA Sequencing للانواع البكتيرية (Pseudomonas aeruginosa ,Escherishi coli, Enterobacter cloaca , Proteus mirabillis, , Klebsiella pneumonia Staphylococcus.heamolyticus ,) التي اكدت تشابه نسب تتابع القواعد النيتروجينية مع نسب القواعد النيتروجينية المخزونة في البنك الجيني باستخدام برنامج MEGA6 Moleculas Evolutionary Genetics Analysis)) اكدت نتائج الدراسة الحالية على وجود 21 سلاله جديدة قيد التسجيل واعطيت الرمز TQU1 الى TQU12. | The present study addressed the examination and preview the 107 patients. who were randomly selected (males and females) and who ranged in age from 1 - 45 years old and have fallen asleep at the Hussein Teaching Hospital of the, period from Jon 2015 to November 2016. where he conducted clinical examination by a specialist doctor and diagnosed as a case of burns satisfactory result for different reasons. specimens were cultured on appropriated culture MacConkey agar, Blood agar and Nutrient agar, diagnosed isolates by phenotypic tests, Biochemical test, diagnosis factor API20E system Vitek 2 compact, as well as to molecular diagnostics, During this study, In total 117 bacterial isolates.109 isolates were Gram - negative bacilli and 8 were Gram - positive cocci. he distribution of bacterial isolates diagnosed Pseudomonas aeroginosa 32.47%, Klabseilla pneumonia 21.36% and the lowest rate was to isolate the bacteria by isolating Staph.epedermidis 1.7%, while the following bacterial isolates Acinetobacter baumennii, Escherishia coli, Enterobacter claocae, Staphylococcus .aueus, Burkholderia cepesa, Pruteus mirabillsi, Pantoea agglomerans by isolating : 12 : 82% , 11.1% , 5.12% 5.12% 3.41% 2.56 respectively. The present study addressed some of the epidemiological aspect of infected cases burns,which included information on patients with with burns, which included sex, age, residence location (place), burning type. The results showed that (42.9%) isolates were males and (57.%) were female.The most frequent patient were belonged to the 0 - 9 years old (54.2%) which is for children. 29 - 20 followed by isolation of 22 20.56% and less isolating rate was in the 49 - 40 age group. Created results also cases of infections diagnosed were distributed to varying degrees with respect to the type of cremation, where the highest rate of injury burns Boiled water 38%, followed by the burning by flames gas Fire 28.9%,Fire by gasoline flames (19.6%),Hot liquids (8.41%) and Electrical Shock(4.67%). As for the nature and place of residence have study found that the highest proportion of cases were among individuals who live in rural areas increased by 90 injured 84.1% while the injuries the center has reached 17 cases of burn injury by 10.88% ,Frequency of the manners of burning based on intention or accidentally was as follow : (86.95) of patients were burned accidentally and (13%) were intenion. Present results showed that the most frequent burning (75.7%)was occurred during winter. The lowest frequency (24.2%)was belonged to summer .So the most common time of burning of present was during winter. As for the screening test sensitivity was shown the results of the current study that the most effective antibiotics against both Gram - negative bacilli bacteria and Gram - positive cocci were Ceftazidin, Ciprofloxacin, Amicacin while most of isolates showed high resistance to Ticarkcillin, Gentamicin, Impenem. Where the highest proportion of resistant bacteria P.aeruginosa which showed high resistance to all antibiotics in different proportions. It showed the results of the molecular study to amplify the gene 16SrRNA that all isolates gave a positive result and it's within the range 1400pb - 1500 pb. Also it has been compared to the results of all the DNA Squencing bacterial species (P.aeruginosa, E.coli, E.cloaca, A.baumennii, P.mirabili), which confirmed its similarity ratios nitrogenous bases relay with nitrogenous bases ratios stored in the gene bank

التوصيف الجزيئي لبعض الفطريات الانتهازية المعزولة من المرضى الضعاف مناعيا واختبار حساسيتها تجاه مستخلص الثوم == Molecular Identification of Some Opportunistic Fungi Isolated from Immunocompromised Patients and Their Testing Sensitivity Against Extract of Garlic ( Allium sativum)

اسم المؤلف: هند حبيب عبد الامير الفرطوسي
اسم المشرف: ياس خضير عباس | ميثاق ستار عبود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية العزل والتوصيف الجزيئي والمظهري لبعض الفطريات الانتهازية من القناة التنفسية السفلى للمرضى الضعاف مناعيا المراجعين لقسم الاورام في مستشفى الحبوبي والمراجعين للعيادة الاستشارية للامراض الصدرية في محافظة ذي قار (جنوب العراق) حيث تم جمع 130عينة قشع sputum للفترة من 1/10/2015 الى 1/5/ 2016 . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع 85عينة وبنسبة 65.38% , اذ شكل عدد عينات الاناث الموجبة 21 عينة وبنسبة 46.67 % , اما عدد عينات الذكور الموجبة فقد بلغ 64 عينة وبنسبة 75.29% . ظهرت اعلى نسبة عزل عند الفئة العمرية 61 - 70 سنة وبنسبة 32.94 % بعدها الفئة العمرية 31 - 40 سنة وبنسبة 15.25 % . وتم الحصول على 106 عزلة فطرية . باستخدام طرق التشخيص المظهرية والجزيئية, بينت هذه الدراسة ان اعلى نسبة ظهور للفطريات المعزولة تمثلت بجنس spp. Candidaثم جنس Aspergillus spp.تلاه جنس Penicillium spp. بالنسب المئوية 49.41% 38.32 % 21.17 % وبالترتيب . كما ظهرت Candida albicans ثم Aspergillus flavus بالنسب المئوية 36.47 % , 12.94% بالترتيب, كما تم تسجيل 15 عزلة من الفطريات المعزولة في البنك الجيني الدولي . شملت الدراسة استخدام اربعة مذيبات عضوية وهي الايثانول, الاسيتون, الميثانول والماء بحيث كان قد استخدم من المذيبات الثلاثة غير الماء التراكيز 50%, 70% فضلا عن التركيز المطلق للحصول على مستخلص الثوم. اختبرت اربعة تراكيز من كل مذيب ضد 11 نوعا من الفطريات المعزولة, واظهر المستخلص المائي كفاءة جيدة في تثبيط جميع انواع الفطريات المدروسة بالمقارنة مع المذيبات العضوية الاخرى اذ بلغ اعلى معدل تثبيط عند التركيز400 مايكروغرام\مل بحيث ابدى الفطر Penicillium notatum تاثرا كبيرا للمستخلص المائي الذي بلغ اعلى معدل تثبيط له (60 مليمتر) عند التركيز المذكور . حددت الفعالية الحيوية لكل مذيب ضد كل الفطريات المدروسة وتم مقارنة المستخلص مع ثلاثة مضادات فطرية Miconazole وNystatin وAmphtericin B واظهر المضادان الاول والثاني تاثيرات متباينة اما المضاد الثالث فلم يظهر اي تاثير على الفطريات المختبرة . تم تحديد السمية الخلوية للمستخلص المائي الخام باستخدام كريات الدم الحمر ولم يتسبب في اي تحلل دموي. كذلك تضمنت الدراسة الكشف عن المركبات التي يحتويها المستخلص المائي للثوم باستخدام الكشوفات النوعية وتقنية كروماتوغرافيا الغاز GC فكشفت تلك الطرائق وتقنية كروماتوكرافيا الغاز بان المستخلص يحتوي على القلويدات والفينولات والفلافونويدات والتربينويدات والتانينات والكاروتينات بالاضافة الى وجود الاحماض الامينية ومركبات كبريتية اهمها الاليسين allicin واخرى اروماتية | The current study included isolation and molecular and phenotypic identification of some the opportunistic fungi from the lower respiratory tract of the immunocompromised patients in the Department of Oncology and Thoracic Consultant Clinic of Alhaboobi hospital at Thi - Qar Province ( South of Iraq). The specimens of sputum were 130 which collected during 1/ October /2015 until 1/May/2016. The study showed that 85 of the collected specimens appeared as positive results which were 65.38% of the ratio in which the females ones were 21 (46.67%) specimens while 64 (75.29%) for males. In addition that, the highest ratio of the positive results was recorded in the ages of 61 - 70 years, followed by 31 - 40 years which were 32.94% and 15.25%, respectively. Totally, 106 isolates of the isolated opportunistic fungi appeared from the positive specimens. Through using morphological methods and molecular techniques, this study showed the first rank of the isolated fungi was Candida spp followed by Aspergillus spp, and Penicillium spp which possessed ratios of 49.41%, 38.32% and 21.17, respectively. According to the species, the first ratio of the isolation was Candida albicans followed by Aspergillus falvus, as 36.47%, 12.94%, respectively. Fifteen fungal isolates of the present study were recorded in the Gene Bank of NCBI. In this study, the extracts of Allium sativum were separately obtained by using four organic solvents (ethanol, acetone, methanol and water) and three concentrations (50%, 70% and absolute) of each solvents except water. Four concentrations of each extract were tested against 11 species of the isolated fungi in which the water extract gave the best value of the bioactivity including highest inhibitory value (60 mm) against Penicillium notatum by using 400µg\ml compared with the extracts of ethanol, acetone, and methanol. The bioactivity of Allium sativum extracts of each solvent was done against the tested fungi in comparison with Amphotericin B, Nystatin and Miconazole in which two of them produced the different bioactivities while Miconazole had no effect. The blood cytotoxicity of the crude water extract was performed against red blood cells and it did not appear any hemolysis. The chemical tests and Gas Chromatography (GC) revealed that the water extract contains alkaloids, phenols, flavonoids, terpenoids, tannins and carotenes in addition to sulfur formations, such as allicin as well as aromatic compounds.

التحري الجزيئي والوبائي لطفيلي المتحولة Entamoeba Spp. في الاطفال المصابين بالاسهال في محافظة ذي قار == Molecular and Epidemiological investigation of the Parasite Entamoeba Spp. In children with diarrhea in Thi Qar Province

اسم المؤلف: منار كريم كاظم السعيدي
اسم المشرف: فاضل عباس منشد العبادي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية فحص 3909 عينة غائط للاطفال دون سن 12 سنة الذين يعانون من الاسهال ويشكون من الام بطنية والمراجعين لمستشفى بنت الهدى التعليمي ومستشفى الشهيد محمد الموسوي والمراكز الصحية والعيادات الخارجية في محافظة ذي قار خلال المدة من شهر تشرين الاول 2015 لغاية شهر ايلول 2016 تضمنت الدراسة ثلاثة محاور رئيسة . المحور الاول هو تشخيص جنس المتحولة مجهريا باستعمال المسحة المباشرة الرطبة وطريقة التركيز وذلك للكشف عن الاطوار المتغذية والمتكيسه للطفيلي واظهرت اصابة كلية بجنس المتحولة Entamoeba spp. بنسبة 26.86% واختيرت 80 عينة من العينات الموجبة مجهريا لتاكيد التشخيص باستعمال الفحص الجزيئي PCR بواسطة الجين 18S rRNAفسجلت الدراسة اصابة كلية بطفيلي المتحولة بنسبة 35% ، اظهرت نتائج الفحص باستعمال طريقة Nested PCR لتمييز الانواع (Species Specific) اصابة بطفيلي المتحولة الحالة للنسج Entamoeba histolytica بنسبة 39.29% وبطفيلي المتحولة المتغايرة Entamoeba dispar بنسبة 39.29% . فحصت العينات الموجبة (28) للPCR باستعمال Real - Time PCR وبوجود المجسان Probes المجس Histolytica - 96 T الخاص بالمتحولة الحالة للنسج والمجس Dispar - 96 T الخاص بالمتحولة المتغايرة وذلك لتاكيد التشخيص وتمايز الانواع فثبت وجود المتحولة الحالة للنسج باعلى نسبة 53.57% والمتحولة المتغايرة بنسبة 39.29% والانواع الاخرى لجنس المتحولة بنسبة 7.14% وبفارق معنوي بين الطريقتين الجزيئيتين مع وجود تاثير معنوي لنوع الطفيلي في احداث الاصابة . اظهرت الدراسة اصابة مفرد لطفيلي E. histolytica بنسبة 45.50% ولطفيلي E.dispar بنسبة 27.20% فيما سجلت اصابة مختلطة بنسبة 27.30% كما وسجلت وجود كريات الدم الحمر في 80% من العينات الموجبة لوجود E. histolytica وبنسبة 54.55% من العينات الموجبة لوجود E.dispar . تضمن المحور الثاني دراسة انتشار الاصابة بجنس المتحولة من خلال دراسة علاقة الاصابة مع بعض العوامل الوبائية ، منها فصول السنة التي اظهرت وجود فروق معنوية P≤0.05 فكان فصل الصيف اعلى الفصول من حيث نسبة الاصابة 37.06% وادناها في فصل الشتاء بلغت 14.14% ، كذلك لم تبين النتائج وجود فروق معنوية للاصابة فيما يخص الفئات العمرية فكانت النسب اعلاها بين الاطفال دون (3) سنوات فبلغت 30.50% ادناها بين الاطفال في الفئة الاعلى من (10) سنوات بلغت 17.13% ، لم تسجل الدراسة اية فروق معنوية في نسبة الاصابة بالطفيلي بحسب الجنس فسجلت نسبة 26.87% و26.85% للاناث والذكور على التوالي، في حين اظهرت الدراسة وجود فروق معنوية ملحوظة فيما يخص المستوى المعاشي فكانت نسبة الاصابة لدى الاطفال الذين ينتمون للعائلات ذات الدخل المحدود هي الاعلى 37.98% واقلها للذين ينتمون للعائلات ذات الدخل فوق الجيد وبلغت 10.11% كما سجلت النتائج وجود فروق معنوية في نسب الاصابة حسب المستوى التعليمي للابوين فكانت نسبة الاصابة عالية لدى الاطفال الذين المستوى العلمي لذويهم دون الابتدائية مقارنة بذوي الاطفال من حملة الشهادات الجامعية وبلغت النسب 36.85% و8.55% على التوالي فيما يخص عدد افراد العائلة كانت نسبة الاصابة عالية وبفارق معنوي لدى الاطفال الذين ينتمون لعائلات تتكون اكثر من (10) افراد واقلها للذين ينتمون لعائلات التي يبلغ عددها (5 - 3) افراد بنسب بلغت 36.95% و8.54% على التوالي . تضمن المحور الثالث دراسة بعض المعايير الدمية ومعرفة التغير في نسبة هذه المعايير لدى الاطفال المصابين بالطفيلي عند مقارنتها بالمعايير الدمية للاطفال الاصحاء وتم ذلك باستعمال جهاز Coulter Counter . جمعت 150 عينة دم من الاطفال المصابين بطفيلي المتحولة و50 عينة دم من الاطفال الذين يمثلون مجموعة السيطرة الاصحاء وتبين وجود فروق معنوية واضحة في نسبة خضاب الدم 10.16%وحجم كريات الدم الحمر المضغوط 34.7% حيث لوحظ انخفاضهما في مجموعة المصابين مقارنة بالقيم في مجموعة السيطرة التي بلغت 12.34 و39.10 على التوالي. سجلت نتائج العد الكلي لخلايا الدم البيض وجود ارتفاع معنوي في الاطفال المصابين مقارنة بمجموعة الاطفال الاصحاء وبلغت 11.3، 8.37 على التوالي وفيما يخص العد التفريقي لها فقد بينت النتائج وجود ازدياد بفارق معنوي في عدد الخلايا العدلة 6.92 و4.03 والخلايا الحمضة 0.61 و0.17 والخلايا الوحيدة 1.19 و0.93 على التوالي ولوحظ كذلك وجود انخفاضا معنويا في عد الخلايا اللمفاوية في الاطفال المصابين مقارنة بقيمتها لدى اطفال مجموعة السيطرة التي بلغت 2.19 و2.76 على التوالي | The current study included examination of 3909 stool samples from under 12 years old children who visited Bint Al - Huda hospital, Martyr Mohammad Al - Mosawi hospital, medical centres and outpatient clinics in Thiqar governorate during the period from October 2015 until September 2016. All those individuals were suffering from diarrhea and abdominal pain. This study included the microscopic identification of Entamoeba Spp. using direct wet amount and concentration techniques in order to diagnose both Trophozoite and cyst stages of the parasite. The result revealed that 1050 (26.86%) of the collected samples were infected with Entamoeba Spp. Out of these infected samples, 80 were randomly selected for further confirmation by conventional PCR and 18S rRNA. Using this method, 28 (35%) was recorded to have Entamoeba Spp. Positive samples from conventional PCR were further examined by Nested PCR for species specific identification. The result of this method showed the presence of two species, E. histolytica (39.29%) and E. dispar (39.29%).Positive samples for molecular examination (28) were then examined by Real time PCR in order to verify and confirm the molecular results. Two probes were used, Histolytica - 96 Tfor E. histolytica and Dispar - 96 T for E. dispar. A significant difference was observed between two methods. E. histolytica was found to be higher percentage followed by E. dispar and then Entamoeba Spp., 53.57%, 39.29% and 7.14% respectively. The Real time PCR reported mono - infection with E. histolytica in 45.5% and with E. dispar in 27.2%, whereas reported mixed infections by both parasites in 27.3%. Red blood cells (RBCs) were detected in 80% E. histolytica positive samples and in 54.55% E. dispar positive ones.The environmental factors and their correlation with Entamoeba Spp. prevalence were also included in this study. The infection prevalence based on the seasonal variation showed significant differences P≤ 0.05. Summer recorded the highest infection prevalence whereas the lowest was in the winter, 37.06% and 14.14% respectively. Regarding the infection in age groups, the highest percentage (30.5%) was recorded in under 3 years old group and the lowest (17.13%) was found in above 10 years old one. However, no significant difference P≤ 0.05 was observed between these age groups. Furthermore, no significant differences were recorded betweenpatient’s sex. Entamoeba Spp. infection (37.98%) appeared to be higher in children who belong to families with low standard of living compared to those who are from families that earning a higher income (10.11%). A Similar pattern was found in Entamoeba Spp. prevalence based on the number of the patient’s family members. Higher prevalence and significant difference were reported (39.95%) in patients who belong high family member (above 10), compared to those from 3 - 5family member (8.54%).One hundred and fifty blood samples from infected children with Entamoeba Spp. and fifty samples from healthy children as a control were collected during the present study in order to observe the change in blood picture and parameters between two groups. Significant differences were reported in blood hemoglobin (10.16%) and volume of packed RBCs (34.7%) in the infected group compared to 12.34% and 39.10% in the control group. Total leukocyte count was found to be significantly higher in the infected group (11.3) compared to the individuals in the control group (3.37). Differential leukocyte count also showed significant differences in Neutrophils (6.92%, 4.03), eosinophils (0.61, 0.17), monocytes (1.19,0.93) and lymphocytes (2.19, 2.76) in infected and control groups respectively.

تاثير الاصابة التجريبية بطفيلي المقوسة الكوندية Toxoplasma gondii وبعض الادوية على خصوبة الجرذان المختبرية Rattus norvegicus == Effect of experimental Toxoplasma gondii infection and some drugs on fertility rats Rattus norvegicus

اسم المؤلف: زهراء سعدون هادي الغزي
اسم المشرف: فاضل عباس منشد العبادي | علي اسماعيل عبيد السنافي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included 3 stages. In the first stage, Toxoplasma gondii was isolated from aborted women placenta who visited Bent Al - Huda hospital and Al - Shatra hospital after confirmation of the prescence of parasite by impression smear method. Then parasite uspension injected 0.3 ml which contain 100 cyst intraperitoneally (174 rat) to 87 male and 87 female rats, inaddition to control group 30 rat (15 male and 15 female). After 10 days of injection, diagnosed the acute infection by Real - Time Poplymerase Chain Reaction(Real - Time PCR) and showed 97.70% (170 infected rat and 4 noninfected rat) , in male 96.55% (84 infected rat and 3 noninfected) ,in female 98.85% (86 infected rat and 1 noninfected) . After 2months of infection 84 animals (42 males and 42 females)were sacrificed, dissected (brain, testis and ovary ) were isolated to confirm the occurance of chronic infection with the using Real - Time PCR. The incidence of infection was 100% in brain males and ovary females and recorded 71.43% in testis and 90.48% in brain females. So diagnosed infection by impression smear method, identified the amount of DNA of the parasite T. gondii by using Real - Time PCR. The use of the remaining number of animals within the following experiments.The second stage included effect of experimental Toxoplasmosis infection and some drugs on fertility 168 rat (84 male and 84 female). Animals were subdivided into 6 groups for each group included 14 rat : (First group) non infected treated by DMSO, (Second roup) non infected treated by Sulfadiazine, (Third group) non infected treated by Pyrimethamine, (Fourth group) infected treated by DMSO, (Fifth group) infected treated by Sulfadiazine and (Sixth group) infected treated by Pyrimethamine.The current study results revealed prominent effect of T. gondii infection on the hormonal level in both males and females. T. gondii infection induced significant decline in Luteinizing Hormone (LH), Follicle Stimulating Hormone (FSH) and Testosterone levels in nfected male compared with non infected males treated by DMSO. Sulf. and Pyr. treatment significantly elevated the level of these hormones (P <0.01) in infected males compared with fourth group similar to levels its in first group. Toxoplasmosis in female rats significantly decrease FSH, LH, Estrogen and Progesterone levels in compared with first group, while treating of infected females with Sulf. and Pyr. didn,t improve the declined levels of these hormones in infected and noninfected females comparedwith fourth and first group, respectively.The study showed that Toxoplasmosis in male rats induced significant decline in the sperm count in the epididymal cauda, sperm viability and relative weights of male sexual organs with an increase in sperm malformation ratio in infected male compared with first group. Treatment with Sulf. and Pyr. in infected male significanthy elevated the sperm count and viability (P<0.05), compared with fourth group. Sulf. didn,t induced further significant changes, but Pyr. induced further significant increase in sperm malformation ratio in infected (P< 0.01) and non infected (P<0.05) rats. The study also revealed that Toxoplasmosis significantly decrease the relative weight of ovary and uterus compared with first group, while treatment with Sulf. and Pyr. increased the declined relative weight of the ovary and uterus in the infected females.Testicular histological section of Toxoplasmosis infected male rats treatment with DMSO showed vacular degeneration of spermatogonia and spermatocytes. The seminiferous tubules revealed sever degeneration, shrinkal, necrosis, hemorrhage. Seminiferous tubules lumen contained little amount of sperm with appearance of gaint cell, polymorphonuclear leukocytes and exfoliated cellular debris. Metamorphosis and disintegration of the tissue between the seminiferous tubules was also observed compared to the first group that showed complex histologically intact while testes sections of infected rats treatment Pyr. and Sulf. showed improvement by removing histocompatibility damage caused by the parasite infection.The epididymal sections of T. gondii infected rats treatment with DMSO showed infiltration of mononuclear and multinucleated gaint cell. Sections also showed hyperplasia of duct lining and contained tissue cyst of T. gondii. All these changes were improved in infected males treated by Sulf. and Pyr. Ovary sections of the infected females treatment with DMSO compared with first group revealed decreased primary and secondary follicle increased follicle atresia. Histological sections of ovary females showed in the fifth and sixth group to increase the number of primary and secondary follicles and decreased number of follicle atresia compared overian sections for the fourth group. Uterine sections of the infected females treatment with DMSO showed hypertrophy, increase endometrial thickness and myometerium, increase polymorphonuclear cell infiltration, fewer glands and congestion of blood vessels compared with first group. Histological sections for ovary females of the fifth and sixth group showed changes but less severe than is present in the fourth group.In third stage from studying Toxoplasmosis on fertility parameters of male and female rats, 84 rat(42 male and 42 female) which showed the results of the current study, when paired fertilized healthy females by males is infected and infected of T.gondii treatment with Sulf. , Pyr. and DMSO, and inversion, there is the effect of the parasite and used drugs the percentage of getting pregnant and pregnancy size and rate of embryos weight and placental weight and increase the proportion of fetal resorption and the proportion of early loss of embryos in fertilized healthy females by males five groups compared to the first group.Based on that conclude from the study that the infection of parasite T. gondii had negative effects on the fertility of male and female, and that all of thePyr. and Sulf. were not honest is the other of the impact on reproductive functions.

دراسة جزيئية ومناعية لالتهاب الكبد الفيروسي نمط جـ لمرضى الثلاسيميا في محافظة النجف الاشرف - العراق == Molecular and immunological study for Hepatitis C virus in Thalassemia patients in AL - Najaf AL - Ashraf / Iraq

اسم المؤلف: ناديه حبيب سرحان الشيباني
اسم المشرف: موسى نعمة مزهر | جميل جري يوسف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was conducted to detect the infection percentage of Hepatitis C Virus (HCV) in the samples of thalassemic patients in AL - Najaf Governorate.About 130 suspected cases attending AL - Zahra'a hospital for children and delivery in Al - Najaf city during period from 1st of November (2014) to 28thof April (2015).Only 69 samples were carried out in this study .The practical side for this study followes three main paths : 1 - The Molecular identification of the presence of Ribonuclic acid of Hepatitis C virus in Thalassemic patients by using RT - PCR.2 - Using the Enzyme Linkedimmunosorbant assay (ELISA - III)technique to determinate immunological markers anti - HCV IgG and interleukine - 28B (IL - 28B).3 - Using theCYANHemato devicefor the purpose of counting blood cells which is called Coulter - Method to give a Complete blood count(CBC).The overall results obtained in this study were as follows : - Out of 69 samples,25(36%) samples of thalassemic patients were infected with Hepatitis C virus, 16 male and 9 female ,their age range from (4 - 43) years ,while 44(64%) samplesof thalassemic patients were withoutHepatitis C virus infection , 22 male and 22 female, their age range from (3 - 35) years . - The result showed that 25samples seropositive to anti - HCV IgG in all age groups where the age group (10 - 20) years old has thehighest percentage among other age groups. - The result of the examination of HCV - RNA Eleven of (25) HCV seropositive patients were positive to RT - PCR technique. - The result of this study showed that level of Interleukin - 28Bin thalassemic patients with HCV was high (mean or significant) (12733.33) pg/ml as compared with thalassemic patients without HCV (270.0463) pg/ml and control(12.1267)pg/ml. - The result also has revealed that the hematological parameters of white blood cells (WBCs),monocytespercentage (MON) and lymphocytes percentage (LYM) significantly have increased (P<0.05) in Hepatitis C patients compared to those of control group. - Granulocytes(GRA) showed a significant decrease (P<0.05) in percentage in Hepatitis C patients compared to those of control groups.

تنقية جزئية وتوصيف Biosurfactant من بكتريا Bacillus subtilis وتاثيرها على نمو بعض عزلات البكتريا والفطريات

اسم المؤلف: غـفـران فـلـيـح عـبد الـحـسـن عـزيـز الجـبـوري
اسم المشرف: فاطمة عبد الحسين مجبل التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 102عزلة من العزلات البكتيرية من 40 عينة من عينات الترب الملوثة بالنفط من مختلف المناطق ورشة عمل السيارات، محطات وقود السيارات، مصافي النفط ولخمسة مناطق مختلفة في العراق . خضعت كل هذه العزلات الى الفحص المجهري والخصائص الزرعية ووجد ان 80 عزلة منها تنتمي الى جنس Bacillus ، هذه العزلات خضعت ايضا لاختبارات بايوكيميائية وشخصت بناءا على دراسة rDNA 16S من قبل مجموعتين من البرايمرات (andB16SF B16SR) و(1492R and 27 F) اذ وجد ان 51 عزلة منها تعود الى Bacillus subtilis . تم فحص جميع هذه العزلات من حيث قدرتها على انتاج biosurfactant عن طريق فحص النشاط انحلال الدم على وسط دم الاغنام حيث وجد ان جميع العزلات كانت من النوع تحلل الدم بيتا حيث تم فحصها اعتمادا على قياس الشد السطحي بعد زراعتها في Jacques medium اظهرت النتائج ان 46 عزلة من 51 عزلة كانت منتجة biosurfactant , وقد تم اختيار ثمانية منها تميزت بانتاجها لهذا المركب وهي (S1,S2,S3 S4,S5,S6,S7,S8) حيث كانت العزلة B. subtilis S4 هي الاكفا في الانتاج لذلك اختيرت في الدراسات اللاحقة . تم استخلاص Biosurfactant الخام من العزلات المختارة بواسطة وتنقيته جزئيا باستخدام طريقة Ion exchange chromatography باستخدام DEAE - Cellulose تلاها طريقة Gel filtration chromatography باستخدام Sepharose - 6B . تمت دراسة خصائص المركبات المنقاة واظهرت النتائج ان الوزن الجزيئي biosurfactant التي تنتجهاB.subtilis S4 تراوح بين (1036 - 1058دالتون) من خلال جهاز HPLC - TOF - MS . اظهرت النتائج ان الحد الاقصى لانتاج biosurfactant من العزلة تم بطريقة استخدام زيت الزيتون (3٪) وكبريتات الامونيوم (0.3٪) وKH2PO4 (1.5) غم / لتر، وبدرجة حرارة 30 مº والاس الهايدروجيني (7) وفترة الحضانة لمدة 72 ساعة. وقد تحققت اعلى نسبة للـ biosurfactant بعد مكملات الظروف المثلى الى 0.3 غرام / لتر من الوسط الزرعي . تم اختبارالنشاط البكتيري والفطري للعزلات الثمانية ضد بعض الجراثيم المسببة للامراض، وهي Staphylococcus aureus,Streptococcus pneumonia, Pseudomonas aeruginosa ,Escherichia coli ,Proteus mirabilis, Candida albicans , Candida tropicalis , Candida krusei , Rhizopus oryzae , Aspergillus niger وكانت العزلة الاكثر فعالية هي B.subtilis S4 التي اظهرت وجود نشاط ضد كل مسببات الامراض ماعدا S.pneumonia ,P.aeruginosa ,C.krusei . كما بينت النتائج ان مستخلص العزلة B.subtilis S4 اظهر اعلى تثبيط نموعند التركيز 1500 مايكروغرام / مل وصل الى 24 ملم ضد E.coli، 23 ملم ضد K.aerogenes، 21 ملم ضد S.aureus، 15 ملم ضدC.albicans، 14 ملم ضد P.mirabilis، 11 ملم ضد C.tropicalis، وتثبيط نمو الفطريات، حيث وصل معدل النمو الشعاعي الى 31.9 ملم ضد A.niger و9.7 ملم ضد R.oryzae عند التركيز 2 ملغم / مل. كذلك اظهرت النتائج ان سمية المستخلص B.subtilis خارج الجسم الحي على ذكور الجرذان البيض بلغت حوالي 922 ملغم / كغم وتشير اذ ان الاعطاء اليومي biosurfactant لم تظهراي حالة وفاة في اي جرعة ، ولم تلاحظ اي تغييرات غير عادية في السلوك اوتاثيرات سمية خلال فترة 28 يوما من العلاج. واثبت التحاليل انه ليس هناك اي تاثير سلبي على معايير الدم الفسلجية وهذا يؤكد صحة هذه المستحضرات الحيوية للاستخدام . | About 102 bacterial isolates were obtained from 40 oil contaminated soil samples from various automobile work shop ,cars fuel stations ,oil refineries of five different areas in Iraq. Microscopic examination and cultural characteristics for all isolated were investigated , 80 isolates were found to be related to the genus Bacillus , Bacillus isolates were subjected to the biochemical tests and molecular identification based on the 16S rDNA by two sets of primers (B16SF and B16SR) , (27F and 1492R) of these 80 isolates revealed that 51 of the identified isolates belonged to Bacillus subtilis.All these isolates were screened for their ability for biosurfactant production through blood haemolysis activity on sheep blood agar indicated that all isolates were β - hemolysis while screening depended on measuring the lowering surface tension of cell free supernatant after cultivation in jacques medium which referred that 46 of 51 isolates were biosurfactant producers. Eight isolates were selected for the best biosurfactant producer isolatesCrude biosurfactants produced by the selected isolates were extracted by acid precipitation followed by partially purified with dichloromethane followed by purification and characteristics, the results showed that the molecular weight of biosurfactant produced by B.subtilis S4 ranging between 1036 - 1058 Da . Optimum conditions for biosurfactants production from B. subtilis S4 were determined. Results showed that maximum biosurfactant production from this isolate was achieved by using 3% olive oil , 0.3 % ammonium sulfate and 1.5 g / l Potassium dihydrogen phosphate ,at pH7,30 ºC and incubation period for 72 hrs. Maximum biosurfactant production was achieved after the supplementation of the optimum conditions was 0.3 g/l of culture medium .All of the eight isolates were tested for antimicrobial activity against twelve pathogenic microorganisms : Staphylococcus aureus ,Streptococcus pneumonia,Pseudomonas aeruginosa ,Escherichia coli ,Proteus mirabilis Klebsiella aerogenes,Candida albicans,C.tropicalis,C. krusei , Rhizopus oryzae , Aspergillus niger and Penicillium notatum.The most effective isolates were B.subtilis S4 which showed antimicrobial activity against some tested pathogens except S.pneumonia ,P. aeruginosa ,C.krusei and P.notatum.The results indicated that S4 culture extract showed high growth inhibition zone in concentration 1500 µg /ml reached to 24 , 23, 21, 15, 14 and 11 mm against E.coli , K.aerogenes , S.aureus , C.albicans, P.mirabilis,C.tropicalis respectively and high reduction in of radial growth of the fungi reached to 31.9 and 9.7 mm in A.niger and R.oryzae respectively at 2 mg /ml concentration .Study in vivo potential toxicity of B.subtilis lipopeptide biosurfactant towards male rat was evaluated. An LD50 value was determined to be about 922 mg / kg. Results show that daily administration of biosurfactant did not show any death cases at any dose. Also, no unusual changes in behavior and no intoxication were observed during the 28 days period of treatment. Analysis proved that there were no significant adverse effect on hematological parameters and this confirms the validity of those biopharmaceuticals on body of mammals.

دراسة جزيئية ومناعية لفايروس النورو والفايروس الغدي نمط 40 و41 في الاطفال المصابين بالاسهال == Molecular and Immunological Study of Norovirus and Adenovirus types 40 and 41 in Diarrheic Children

اسم المؤلف: رمله احمد محمد حسن العميدي
اسم المشرف: مهدي حسين محيل العمار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن فايروسي النورو والفايروس الغدي نمط 40 / 41 في الاطفال المصابين بالاسهال واجراء تحليل لمعدل الاصابة وطبيعتها ودراسة الطبيعة الجزيئية للفايروسين وكذلك التحري عن قدرة الفايروسين على حث الجهاز المناعي وتحديد بعض الحركيات الخلويه عند الاطفال المصابين بالفايروسين.بالاضافة الى دراسة بعض ملامح الاصابه مثل تغاير الفصول والعمر وتحديد افضل الطرق لتشخيص الفايروسين. اجريت الدراسة الحالية في محافظة النجف الاشرف /مستشفى الزهراء التعليمي للولادة والاطفال خلال الفترة من كانون الثاني2014 الى كانون الاول 2014 والتي تضمنت 314 عينه من البراز والدم من الاطفال المصابين بالاسهال والذين تتراوح اعمارهم بين شهر الى خمسة سنوات.حيث اعتمد التحري في عينات البراز استخدام اختبار الكروماتوغرافيا المناعي السريع للكشف عن المستضدات الفايروسية للفايروسين النورو والغدي نمط 40 / 41.كما تم تاكيد العينات الموجبة بواسطة تقنية PCR Real Time لفايروس النورو تقنية PCR للفايروسالغدي نمط40 / 41،والتي اظهرت فيها النتائج بان معدل الاصابة كان 11.7% لفايروس النوروو8.9% للفايروس الغدينمط 40 / 41.كذلك تم فحص العينات الموجبة بواسطة المجهر الالكتروني والتي بينت مظهر للفايروسين في عينات البراز . وتشير الدراسة الى ان التقنيات الجزيئية المستخدمة في فحص العينات هي الاكثر كفاءة للتشخيص الروتيني للفايروسين مقارنة مع المجهر الالكتروني لتشخيص عينات الاسهال.وطبقا للفئات العمرية ،اظهرت النتائج ان الفئة العمرية 13 - 24 شهر سجلت ارتفاع عالي للاصابة بالفايروسين النورو والغدينمط 40 / 41.الحالات الايجابية كانت بين الاطفال الذين يتغذون على الحليب الجاف الاصطناعي (31 حاله) مقارنة مع الرضاعة الطبيعية من الام (14 حاله).اما نتائج الاعراض السريرية في الاطفال المصابين بالفايروسين فاظهرت ان كل الحالات تبين وجود اسهال من النوع المائي المخاطي وبنسبة 100% يليها الالم البطن بنسبة 94.5% و82.1 %،التقيؤ بنسبة 81 % و78.5 % واخيرا الحمى بنسبة 78.3% و71.1 % لكلا من النورو والغدي نمط 40 / 41 على التوالي. كما كشفت الدراسة الحالية بان معدل الاصابة المرتفع لفايروس النوروكان من شهر كانون الثاني الى اذار والتي كانت بنسبة 81%من الحالات الموجبة ، اما بالنسبة لفايروسالغدينمط 40 / 41كان معدل الاصابة المرتفع من شهر كانون الثاني الى نيسان والتي كانت بنسبة 89.2% من الحالات الموجبة. كما اظهرت النتائج وجود ارتفاع كبيرفيالحركيات الخلويه (السايتوكينات) لمصل الاطفال المصابين مقارنة مع السيطرة. وفقا للفئات العمرية ،اظهرت الفئة( 49 - 60) شهر ارتفاع عالي في مستويات الانترفيرون كاما ، الانترلوكين - 6((IL - 6 والانترلوكين - 12 (12 IL - (حيث كانت للفايروس النورو(90.8, 56.7, 84.3) جزء من الغرام /مل على التوالي،بينما كانت لفايروسالغدي(106.5, 59, 87.5)جزء من الغرام /ملعلى التوالي مقارنة مع مجموعة السيطرة. | Norovirus and adenovirus types (40 and 41) are the important causes of gastroenteritis infections in children worldwide. The present study was designed to determine the incidence and nature of infection of norovirus and adenovirus types (40 and 41) at molecular and immunological levels, as well as some features such as seasonal variation , age distributions and detected the most effective and suitable method for diagnosis of the two viruses . The study was carried out in Al - Najaf province, in AL - Zahra teaching hospital for maternity and children, during the period from January, 2014 to December, 2014. Stool and blood samples were collected from 314 children with diarrhea, their age range (from 1months to 5 years). Immunochromatographic assay for norovirus and adenovirus used to detect their antigens in stool samples, the positive results were confirmed by reverse transcriptase real time PCR technique for norovirus and polymerase chain reaction technique for adenovirus types (40 and 41), which showed incidence of 11.7% and 8.9% for norovirus and adenovirus, respectively. Transmission electron microscopy examination gave clear positive norovirus and adenovirus types (40 and 41) appearance in diarrheal stool samples .The study indicates that molecular methods are most suitable and sufficient tests for routine diagnosis of norovirus and adenovirus types (40 and 41) as compared to transmission electron microscopy analysis for diarrheal samples. According to age groups, the results showed that the majority of infections with norovirus and adenovirus were recorded among age group (13 - 24) months. The positive cases were highly among infants fed with bottle fed (31 cases) compared with infants fed with breast fed (14 cases). Regarding the clinical features of children with viral diarrheal infections , the results showed that all of the cases of both viruses complained of watery or mucosal consistence stool (100%) followed by abdominal pain (94.5%) and (82.1%), vomiting (81%) and (78.5%) , and fever (78.3%) and (71.4%) for norovirus and adenovirus positive children respectively. The present study also revealed that a higher incidence of norovirus was detected from January - March 2014, when it was found in 81% (30/37) of the positive cases, whereas the incidence of adenovirus was higher from January - April 2014, during which it was found in 89.2% (25/28) of the positive cases. The current study for cytokines profile detection showed that significant elevation in patients with norovirus and adenovirus than control. The age groups 49 - 60 months have shown a high level in cytokines Interferon gamma, Interleukin - 6 and Interleukin - 12 with concentration were (84.3, 56.7, 90.8) pg./ml , respectively for norovirus while adenovirus were (87.5, 59, 106.5) pg./ml , respectively as compared with control group . Conclusion of the study shows incidence norovirus genotypeII (GII) and adenovirus types (40 and 41) by rapid chromatographic test from infected children in Al - Najaf province. The study indicates that molecular techniques are most suitable and sufficient tests alternatively for transmission electron microscopy when there is good facility and both can replaced by rapid chromatographic test . Interferon gamma, Interleukin - 6 and Interleukin - 12 were increased in all patients with norovirus and adenovirus infections and showed high level in age group (49 - 60) months

دراســـــة بعض المعايـــــير الجزيئيـــــة والمناعيـــــة لبكتيريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيلين والمعزولة محليا من الاصابات الجلدية المكتسبة مجتمعيا

اسم المؤلف: هدى سعد عزاوي
اسم المشرف: سلمان عزيز | سميرة كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الكلمات الدلالية:
  • المكورات العنقودية الذهبية
  • الخراج ونضح الجروح
  • الاصابات الجلدية
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد البكتيريا العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المكتسبة مجتمعيا من الكائنات المجهرية المرضية التي تسبب طيفا واسعا من الاصابات في مختلف بقاع العالم في اماكن مختلفة من جسم الانسان اذ اقترنت امراضيتها مع اصابات الجلد والانسجة الرخوة . تهدف هذه الدراسة الى التعرف على مدى انتشار هذه البكتيريا في حالات اصابة انسجة الجلد المختلفة ,واجراء تقييم جزيئي لهذه البكتيريا المعزولة من حالات مرضية مختلفة , وتقييم مستوى بعض الحركيات الخلوية في مصول المرضى . وقد اشتملت على 169 عينة اخذت من المرضى المصابين بالتهابات الجلد المختلفة كـ الدمامل والخراج الجلدي والجروح والقدم المصابة بالقرحة لدى مرضى السكري وعدوى الحروق والحصف (القوباء) واخذت من المرضى الذين يراجعون العيادات الخارجية , والمراكز الصحية , وكذلك العيادات الخاصة, لمدة امتدت اكثر من خمسة اشهر , وللفترة من تشرين الاول 2014 م وحتى اذار2015 م. تضمنت الدراسة الحالية اخذ مسحات من الجلد المصاب بالالتهابات المرضية المختلفة وعينات دم ,من بين 169 عينة ,76 عزلة فقط اثبتت عائديتها الى جنس المكورات العنقودية الذهبية وبنسبة 45% من العزلات الماخوذة من حالات مختلفة لاصابة الجلد , وكان معدل العزل العام للعنقوديات الذهبية من القدم المصابة بالقرح لدى مرضى السكري 5 عزلات بنسبة 33% نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين 20% (عزلة واحدة ),اما المصابين بخراج الجلد والدمامل والقوباء الجلدي فكان معدل عزلها كالاتي (69)18 %,(55)21% , (31)9%,نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين (55.6)10% , (61.9)13%, (11.11)1% على التوالي . ان معدل عزل هذه البكتيريا من عدوى الجروح والحروق فكانت كالاتي (32)11%, (44)12% نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين منها (72.7)8%% (16.6)2, على التوالي . ان العزلات البكتيرية من المكورات العنقودية الذهبية المكتسبة مجتمعيا مقاومة لجميع مضادات البيتالاكتام وغير مقاومة للمضادات الحيوية التي لا تنتمي الى هذه المجموعة. اجري الكشف الوراثي باستعمال تقنية سلسلة تفاعلات البلمرة polymerase chain reaction اذ شخصت العزلات الخمسة والثلاثين باستعمال 3 جينات وهم mec Agene وهو الجين الخاص بالمقاومة للمثيسيلين , وكان عدد العزلات الحاملة لهذا الجين 22 عزلة من اصل 35 عزلة وبنسبة 62% . واخضعت العزلات المقاومة للمثيسيلين الى عملية تعريف للقطعة الكروموسومية النوع الرابعSCCmec IV اذ يعد هذا النوع سمة تفريقية للعزلات البكتيرية من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين والمكتسبة في المجتمع ، اذ وجدت بنسبة 100 % . كذلك تم التحري عن امكانية تواجد مورثة الذيفان الخارجي Panton Valatine leukocidine ( pvl ) باستعمال تقنية تفاعلات البلمرة PCR اذ شخص في 19 عزلة بكتيرية بنسبة 54% ، اقترن وجود السم بالاخص مع حالات الاصابة بالدمامل والخراج والجروح . اجريت الفحوصات المناعية عند المصابين بالتهاب انسجة الجلد , وذلك من خلال تقييم مستوى بعض الحركيات الخلوية مثل IL - 8 وLTB - 4 باستعمال طريقة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم Enzyme linked Immune Sorbant assay وقد لوحظ زيادة معنوية في تراكيزها في مصول المرضى مقارنة بعامل السيطرة . | Community acquired methicillin resistant Staphylococcus aureus is one of the pathogenic micro - organism that cause a wide spectrum of infections in different sites of the human body where their pathogenicity is related to skin and soft tissue infection. This study is aimed to explore the role of this bacteria in different cases of skin infections.The genetic structure of these isolated strains of Staphylococcus aureus was also one of this study targets to evaluate immunological response by measurement of concentration of some cytokines as indicator of immune response. One hundred sixty nine patients with different cases of skin infection were enrolled in this study by taking one skin swab from each patient with different skin infection as Furuncle, boil, wound infection, impetigo and burns infection. All these cases were taken from out - patient clinics and private clinic along 5 months period from October 2014 to march 2015 in AL - Najaf Province , From the 169 swab samples only 76 swabs were shown to be positive Staphylococcus aureus with percent 45%.The percent of isolates of S. aureus from different cases of skin infection (5) isolates from diabetic foot with 20% of them are Methicillin resistant (one isolate) and skin abscess, boil, and impetigo were 18(69%),21(55%),9(31%)from which methicillin resistant were 10(55.6%), 13(61%) and 1(11.11%) respectively Percent of isolates from wound &burns infection were 11(32%) and 12(44%) and methicillin resistant isolates were 8 (72.7%) and 2(16.6%) respectively . The process of diagnosis of methicillin - resistant isolates was performed by using sensitivity test for cifoxitin following (CLSI,2014) instruction . Only 35 isolate showed resistant to methicillin when Cefoxitin disk was used then antibiotic sensitive test for other antibiotic disks done., Isolates of CA - MRSA showed resistant to all β - Lactam antibiotics and also to other drugs that are not belonged to this type of antibiotics. Genetic study was evaluated by using PCR technique to diagnosis the following genes in 35 isolates : mecA gene : which is considered responsible for methicillin resistant ,it was found that only 22 from 35 isolates (62%)carrying the gene. SCCmec IV gene which restricted only to Community acquired isolates of Staphylococci were explored in the isolates which considered a diagnostic character for Community acquired Staphylococci and this gene was found in 100% of isolates . Exotoxin panton - valatine toxin also diagnosed in 19 isolates with percent 54% in isolates of S. aureus using PCR technique. This exotoxin was produced in cases of Furuncle, skin abscess, and wound infection . Immunological test was introduced in this study to evaluate the innate immune response by measuring the concentration of Cytokines IL - 8&LTB4 which showed significant elevation in their concentration in comparison with healthy persons.

دراسة لاعتلال الاعصاب المحيطية عند مرضى الداء السكري من النوع الثاني == Study of peripheral neuropathy in patients with diabetes mellitus type II

اسم المؤلف: اسراء ماجد نعمة عبيد العيكاشي
اسم المشرف: سحر محمود جواد الجمالي | عمار جبار حمد الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: Diabetes mellitus is one of the most chronic diseases that is widely spread all over the world and affects all age groups. The disease has a vast potential to affect almost every body organ, especially the peripheral nerves, which causes high mortality rates from disease complications. These complications cause damage in the organs of the body including the nerves located in the limbs that generate an intense heat resulting from the destruction of nerve fibers in addition to the acute pain resulting from the effect of diabetes in those nerves. This study was designed to determine the sensitivity of those nerves by displaying the results of nerve conduction study for patients and compared it with their clinical examination to determine the severity of numbness and assess the level of pain in the upper and lower limbs.The study was conducted at the Diabetes and Endocrinology Center in Al - Sader Medical City in Al - Najaf governorate and it included following up the case of (78) patients with diabetic peripheral neuropathy by nerve conduction study. The study was began from 5/9/2014 until 7/4/2015. It included diabetic men and women, and they were divided into three age groups (35 - 68), and the study excluded the patients with peripheral neuropathy but have foot ulceration because the nerve connect system (SUDOSCAN REPORT ) was used in the current study, cannot perform nerve conduction study for patients with foot ulceration also smoking and the patients who taking treatment for diabetic peripheral neuropathy .During this study the clinical examination for patients was conducted and compared it with the nerve conduction study of them , also recording the information were related with the history of patients ,as while asmeasuring the concentrations of urea and creatinine in serum, in addition the study was recognized the effect of diabetes mellitus on the kidneys by estimating the ratio of albumin to creatinine in the urine, or named (ACR). the study compared the glycosylated hemoglobin levels and body mass index with the nerve conduction study results for all patients.The present study has shown a statistical significant difference (P <0.05) between the clinical tests of the patients who were tested by tuning fork as while as nerves test needle test and between nerve conduction study for both sexes also at all age groups included in the study. The results of the study did not show any a statistical significant (P>0.05). difference when compared the results of nerve conduction study among the different age groups for males. For females however, there was a statistical significant difference (P<0.05) amongst the different age groups.The results of the current study did not show a statistical significant difference (P>0.05) as regards the duration of injury for males, while it revealed a statistical significant difference among females (P <0.05), the results of the current study also observed the presence of a statistical significant increase (P<0.05) in the ratio of albumin to creatinine in patients with diabetic peripheral nervous for males and females.When compared the glycosylated hemoglobin (HbA1c) levels over the past three months, there are no a statistical significant differences (P>0.05) for males and females ,while the study revealed no a statistical significant increase (P> 0.05) in the concentrations of urea in males when compared to their nerve conduction study results, as well as theconcentrations of creatinine which did not show a statistical significant difference( P> 0.05) at them.The study was also revealed the presence of a statistical significant difference (P<0.05) in the concentrations of urea in females with diabetic peripheral neuropathic and did not show a statistical significant difference (P> 0.05) in the concentration of creatinine at them. The results of the current study did not show a statistical significant difference (P>0.05) between the body mass index among males and it showed a statistical significant difference among females (P <0.05)with peripheral diabetic neuropathy.The study reached that diabetes, with long periods of infection, has a crucial role in showing and the advancement of the disease for most of the patients, particularly those who lack the suitable amount of control over the percentage of the Glucose in the blood. The study also deducted that the disease is accompanied with kidney failure for most of the studied patients. It was also revealed that the nominees of some of the patients which appeared during their examination via tuning fork as while as nerves test needle was not the cause of their infection with diabetes, therefore, the study recommended the adoption of the results of the diabetic peripheral neuropathy to diagnose and asses the infection with peripheral nervous surround diabetes.

دراسة بعض العوامل البيئية المؤثرة في بعض انواع القشريات في نهر الكوفة == Study Som of Enviromental factors offecting Some Crustacea species in the Kufa river

اسم المؤلف: ايمان حساني شباط السلامي
اسم المشرف: جاسم حميد رحمة الخزاعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للتعرف على انواع القشريات وانتشارها في نهر الكوفة , وتاثير بعض العوامل البيئية على تواجدها , اذ جمعت عينات الدراسة شهريا للمدة من اب 2014 لغاية تموز 2015 من ثلاث محطات , الاولى : تقع شمال جسر الامام علي (عليه السلام) والثانية قرب مبزل ميسان والمحطة الثالثة قرب جسر الكوفة القديم ( قريبة من دار ضيافة المحافظة ) , اذ قيست العوامل البيئية الفيزياوية والكيمياوية مثل درجة الحرارة والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين والتوصيلية الكهربائية والكدرة , والعسرة الكلية وايون الكالسيوم . تراوحت الحدود الدنيا والعليا لحرارة الهواء 14.3) - 42.6 ) مo وحرارة الماء (13 - 30.4) مo والاس الهيدروجيني 6.8) - 9.6 ) والاوكسجين الذائب 2.9) - 9.1 ) ملغم / لتر والمتطلب الحيوي للاوكسجين 0.7) - 4.7 ) ملغم / لتر والتوصيلية الكهربائية 1162) - 2055 ) مايكروسيمنز/ سم والملوحة 0.7) - 1.31 ) جزء بالالف والكدرة 1.4) - 17.5) نفثالين وحدة كدرة والعسرة الكلية 210) - 930 ) ملغم / لتر وايون الكالسيوم 119 ) - 380 ) ملغم / لتر . تم خلال الدراسة الحالية تسجيل جديد لنوعين من القشريات الكبيرة لاول مرة في نهر الكوفة وهما الروبيان النهري Macrobrachium nipponense والسرطان النهري Potamon magnum اللذان يعودان الى رتبة عشارية الاقدام Decapoda , اذ سجل اعلى كثافة للروبيان النهري 63.58 ) ) فرد / م 3 في المحطة الاولى في شهر تشرين الاول واختفى في محطات الدراسة جميعها في شهر كانون الثاني وشباط , بينما سجل اعلى كثافة للسرطان النهري 32.89) ) فرد / م 3 في المحطة الاولى في شهر نيسان . وتم تشخيص 32 وحدة تصنيفية تعود الى رتبتين من القشريات الصغيرة , وهي رتبة Cladocera ورتبة Copepoda اذ وجد ان رتبة Cladocera هي الاكثر وفرة وغزارة في محطات الدراسة اذ تضم خمسة وعشرون نوعا , بينمراتبة Copepoda تضم سبعة انواع.تم تشخيص ثمانية اجناس من رتبة متفرعة اللوامس Cladocera وهي Bosmina , Daphnia , Ceriodaphnia , Simocephalus , Alona , Chydorus , Macrothrix وMonia , في جميع محطات الدراسة , ومن الاجناس التي سجلت اعلى كثافة هي جنس Bosmina وDaphnia بينما سجل الجنسين Macrothrix وMonia اقل كثافة اذ اختفت في معظم اشهر الدراسة وفي جميع محطات الدراسة. وتم تشخيص اربعة اجناس من رتبة مجذافية الاقدام Copepoda وهي Cyclops , Diaptomus , Microcyclops , Macrocyclops , ومن الاجناس التي سجلت اعلى كثافة هو جنس Cyclops ومن الاجناس التي سجلت اقل كثافة هو جنس Diaptomus . وتم تسجيل جديد لاحدى عشر نوع من القشريات الصغيرة Microcrustacea لاول مرة في نهر الكوفة تعود لرتبتين هما Cladocera وCopepoda وهذه الانواع هي umholtzil Daphnia , Daphnia galeata , Daphnia magna , Daphnia retrocurva , Simocephalus sexpinosus , Alona affinis , Chydorus gibbus , Monia micrura , Cyclops strenuous , Macrocyclops albidus , Microcyclops sp . , اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود علاقة ارتباط بين كثافة القشريات والعوامل الفيزياوية والكيمياوية المقاسة شهريا ولمدة عام , كذلك لوحظ وجود فروق معنوية بين اشهر ومحطات الدراسة بالنسبة لكثافة القشريات والعوامل الفيزياوية والكيمياوية عند مستوى P ≤ 0.05 . | This study was conducted to identify the types of Crustaceans and distribution in Al - Kufa River and the effect of some environmental factors on their presence , Study samples were collected monthly for the period from August 2014 to July 2015 of three stations, the first station is located north bridge Imam Ali , the second near the Missan trocar and the third station near old Kufa bridge . The Environmental factors, were measured ( physical and chemical) such as temperature , pH , dissolved oxygen, , electrical conductivity, salinity , turbidity ,total hardness (T . H) and calcium ion. Lower and upper limits for air temperature ranged from (14.3 - 42.6) Co and water temperature (13 - 30.4) C0 , pH (6.8 - 9.6) , dissolved oxygen (2.9 - 9.1) mg / L , the biological oxygen demand (BOD5) (0.7 - 4.7) mg / L), electrical conductivity (1162 - 2055) µs/ cm and salinity (0.7 - 1.31) ppt , turbidity (1.4 - 17.5) NTU, total hardness (210 - 930) mg / L and calcium ion ( 119 - 380) mg / L. During the current study, a new record of two species of Macrocrustaceans for the first time in AL - Kufa River Macrobrachium nipponense and river crab Potamon magnum which they return to the Order Decapoda, The highest density was recorded for the M. nipponense (63.58) individual / m 3 in the first station in October month and disappeared in the study, all stations at January and February, months , while the highest density of river crab P. magnum record (32.89) individual / m 3 in the first station in April month. in this study diagnosed 32 taxonomic unit return to Microcrustacea : Cladocera and Copepoda orders , also cladocera reverded where found that the most abundant and the abundance of plants in the study are Cladocera rank as comprising twenty - five type, while Copepoda rank of seven . Diagnosed eight genus belong to the Cladocera such as Bosmina, Daphnia, Ceriodaphnia, Simocephalus, Alona, Chydorus, Macrothrix, Monia, in all study stations, The genera Bosmina and Daphnia recorded high density while Macrothrix and Monia recorded low density which disappeared in the most study month in all study stations. Also four genera of the Copepoda were diagnose such as Cyclops, Diaptomus, Microcyclops and Macrocyclops, and genus Cyclops record high density while the genus Diaptomus recorded low density. eleven species of Microcrustacea were recorded for the first time in AL - Kufa River belonging to the Cladocera and Copepoda orders and these species are Daphnia umholtzil, Daphnia galeata, Daphnia magna, Daphnia retrocurva, Simocephalus sexpinosus, Alona affinis, Chydorus gibbus, Monia micrura , Cyclops strenuous, Macrocyclops albidus, and Microcyclops sp. Statistical analysis showed a correlation relationship between the density of Crustaceans and the physical and chemical factors measured per month for one year, also noted that there were significant differences between months and study stations for the intensity of Crustaceans and the physical and chemical factors at P ≤ 0.05

دراسة تاثـير المستخلصات المائيـة لنباتي الليمـون الحامـض والسعـد في ذكور الجرذان البيض السليمة والمصابة تجريبيا بداء السكري == Studying the Effect of Aqueous Extract of Citrus limon and Cyperus rotandus in alloxan induced in Diabetic Male Albino Rats

اسم المؤلف: زهراء كريـم عبد الله حسن الميالي
اسم المشرف: زينب شنيور مهـدي الطرفـي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء السكري هو اضطراب ايضي مزمن يتصف بارتفاع سكر الدم مع اضطراب في ايض الكاربوهيدرات والدهون والبروتين نتيجة لخلل في افراز الانسولين من قبل البنكرياس ، او تاثيره الحيوي اوكليهما، يشكل هذا الداء تهديد خطير ومتزايد على حياة الكثير من الناس ويعد المشكلة الرئيسية التي تودي بحياة الملايين، وما للنباتات الطبية اثر مهم في صحة الانسان كونها مصدرا مهما للعديد من الادوية والمستحضرات الطبية , وتكمن الفائدة الطبية لهذه النباتات في قابليتها على انتاج العديد من المركبات الكيميائية ذات الخصائص الصيدلانية التي تدخل كمادة اولية او عوامل مساعدة في صناعة الادوية ولكثرة استخدام الاعشاب (النباتات الطبية) في الوقت الراهن بوصفها الطب البديل جاءت هذه الدراسة . اجريت هذه الدراسة الحالية في كلية التربية للبنات / جامعة الكوفة للمدة من 2014/10/1 م ولغاية 2015/5/30 م وتضمنت الدراسة تحضير المستخلص المائي الحارلكلا النباتين (بذور الليمون الحامض Citrus limon ودرنات السعد (Cyperus rotundusوقد تضمنت الدراسة متابعة (42) حيوان من ذكور الجرذان البيض ، وتم تقسيمها الى سبعة مجاميع تضمنت كل مجموعة ستة ذكور ، اذ جرعت المجموعة الاولى فمويا بمحلول الملحي الفسيولوجي حسب وزن الجسم واعتبرت كمجموعة سيطرة (سالبة) ، اما المجموعة الثانية فقد حقنت تحت الجلد بالالوكسان (1 مل) واعتبرت كمجموعة سيطرة مصابة (موجبة)، اما المجموعة الثالثة فقد جرعت فمويا بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض بتركيز (500ملغم/كغم) بتركيز (750ملغم/كغم) وحسب وزن الجسم ، والمجموعة الرابعة جرعت فمويا بالمستخلص المائي الحار لدرنات السعد حسب وزن الجسم ، والمجوعة الخامسة فحقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم جرعت فمويا المستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض بتركيز (500ملغم/كغم) وحسب وزن الجسم، والمجموعة السادسة التي حقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم تم تجريعها فمويا المستخلص المائي الحار لدرنات السعد بتركيز (750ملغم/كغم) حسب وزن الجسم ، واخيرا المجموعة السابعة التي حقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم جرعت فمويا بعقار الاميرال (Glimepiride) بتركيز (0.1) ، علما ان التجريع قد استمر لمدة ثلاثين يوما كاملا وبواقع مرة واحدة يوميا .وقد اظهرت نتائج الدراسة ما يلي :  حصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في وزن الجسم واوزان الاعضاء (البنكرياس والكبد والكلية) لدى مجموعة السيطرة الموجبة(المحقونة بالالوكسان) عند مقارنتها بالمجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي، وعلى النقيض من ذلك فقد اظهر وزن الجسم وكذلك اوزان الاعضاء ارتفاعا معنويا (P< 0.05) لدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة.  وجود انخفاض معنوي (P< 0.05) في التعداد الكلي لخلايا الدم البيض وكريات الدم الحمر وتركيز الهيموغلوبين والصفيحات الدموية عند الحيوانات المصابة تجريبيا بداء السكري عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، على العكس من ذلك حصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في مجموعة الحيوانات السليمة لدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . حصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في مستويات الكلوكوز ، الكولسترول الكلي الكليسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية واطئة الكثافة والواطئة الكثافة جدا وحصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وكذلك حصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في المعايير المذكورة اعلاه وارتفاع في البروتينات الدهنية عالية الكثافة في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . وحصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في فعالية الانزيمات الكبدية ALT, AST وALp والبلروبين لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وحصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في فعالية الانزيمات اعلاه في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . حصول انخفاض معنوي (P< 0.05)في مستوى البروتين الكلي والالبومين والكلوبيولين لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وحصول ارتفاع معنوي(P< 0.05) في في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . اشارت نتائج الدراسة النسجية للكبد حصول تغير نسجي للكبد في حالة ارتفاع السكر بالدم تمثل بحصول توسع بسيط بالجيبانيات ،واحتقان دموي مع حدوث تنخر للخلايا الكبدية ونزف فيها ، وظهور مناطق التهابية عدة واستسقاء مائي وبعد معاملة المجموعة المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للخلايا الكبدية . اشارت نتائج الدارسة النسجية للكلية حصول تغير نسيجي فيها في حالة ارتفاع الكلوكوز بالدم والمتمثل بخروج الانوية من الكبيبة الكلوية وتجمعها في اماكن متفرقة خارج الكبيبة وكذلك وجود نزف وتحطم في جدران الكبيبة والاوعية الدموية الموجودة ضمنها وتحطم واضح للقشرة الكلوية وعند معالجة الحيوانات المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للكلية . اشارت نتائج الدارسة النسجية للبنكرياس حصول تغير في التركيب النسيجي للبنكرياس في حالة الاصابة بالسكري نتيجة الحقن بمادة الالوكسان تتمثل بوجود النزف الحاد في جميع مناطقها وحصول توسع وتحطم في الخلايا وعدم انتظام اشكالها وانحلال الانوية وخروجها من اماكنها الصحيحة ولكن عند معالجة الحيوانات المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للبنكرياس.وقد سجلت النتائج جميعا بشكل عام تاثيرا افضل للمستخلص النباتي لبذور الليمون الحامض قياسا بدرنات السعد والدرنات افضل من العقار في تخفيض سكر الدم اضافة الى تحسين الاضطرابات الايضية المتسببة عن داء السكري المستحدث بعقار الالوكسان . | Diabetes Mellitus is a metabolic disorder characterized by hyperglycemia due to a defect in Insulin secretion from the pancreas, insulin action or both, with disturbances in (carbohydrates, lipid and protein) metabolic due to a defect in Insulin secretion, Insulin action or both. This disease is a serious and growing threat to the lives of many people , it isthe main problem which cause death to millions,The medical plants have important impact on human health as an important source of many medicines and medical products. The medical advantage of these plants lies in their ability to produce many of the characteristics that the pharmaceutical intervention have as a primary material or contributing factors in the pharmaceutical industry chemical compounds. The frequent use of herbs (medical plants) at the present time as alternative medicine, as came in this study.This study was conducted at the Faculty of Education /University of Kufa during the period from2/10/ 2014 to 30/5/ 2015. The study included the preparation of aqueous extractsofCitrus lemonseeds and Cyperus rotundus tuber. Also the study includedthe use ofaqueous extractsofCitrus lemon at concentration (500) mg/kg andCyperus rotundus at concentration (750) mg/kgineach dosageaccording to the body weight of the albino rats (Ratus ratus). The study includes (42) white malerats divided into seven groups with six rat in each group and they were injected according to their weight in the following way : the first group was orally dosed with physiological saline and it was considered as a control(negative), the second group was injected with alloxan (1ml.) and were considered as infected control group (positive). The third group were also dosed orally with decocted extract of citrus lemon seeds in (500mg/kg). The fourth group was dosed orally with decocted extract of Cyperus rotundus (750mg/kg) concentration. The fifth group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with decocted extract of citrus lemon seeds in (500mg/kg) concentration. The sixth group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with decocted extract of Cyperus rotundus (750mg/kg) concentration. The seventh group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with Glimepiride with (0.1) concentration. The dosing continued for 30 days.  A significant decrease (P< 0.05) was shown in total body weight and organ weight such as pancreas, liver and kidney in uninfected control(Negative) when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds ad Cyperusrotundus tuber respectively, also,the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, we alsofound a significant increase (P< 0.05) in the above criteria in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with the positive control group.  A significant decrease (P< 0.05) was shown in the total WBC and RBC count , and the hemoglobin concentration platelets in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively, also the group was treat with Amyral and the group that were injected with alloxan and that which was treated with hot aqueous extracts of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, also a significant increase (P< 0.05) was shown in the above criteriain diabeticanimalsgroup compared with healthy control group, we also found a significant increase (P< 0.05) was shown in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with positive control group.  A significant increase (P< 0.05) was clear in the levels of glucose , total cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein , very low density lipoprotein and a significant decrease (P< 0.05) in high density lipoprotein in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively.Also the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds ad Cyperusrotundus tuber, a significant decrease (P< 0.05) was clear in the above criteria and significant increasein high density lipoprotein in diabeticanimalsshown in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with the positive control group.  A significant increase (P< 0.05) the effectiveness of hepatic enzymes(ALT , AST ,ALP, Bilirubin) in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively, also the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, also a significant decrease (P< 0.05) in the effectiveness of hepatic enzymes in diabeticanimals, a significant decrease (P< 0.05). The effectiveness of the above enzymes in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extract when compared with the positive control group.  The presented histological study of the liver refers to the histological changes in the liver in the state of hyperglycemia that is represented by the expansion of sinusoid, blood accumulation, necrosis and bleeding in hepatocyte, presence of many inflammation areas, watery dropsically but when treating diabetic animals by aqueous extract of (Citrus lemon andCyperusrotundus), it wasnoted thatthey returned back to the normal shape of hepatocyte. The histological study of the kidneyrefers to the occurring of the histological changes in the kidney in the state of hyperglycemia that were represented by getting out the nucleus from glomerulous and aggregation in many area out theglomeruli, also, the bleeding or the destruction of glomerulous wall with blood vessels, the present distraction in kidney cortex but when treating diabetic animals with aqueous extract of (Citrus lemon and Cyperusrotundus), it was noted that it returned back to the normal shape of kidney. The histological study of the pancreasrefers to the occurring of the histological changes in infected diabetic animals by (alloxan) which represented an acute bleeding in all regions, destruction and expansion in kidney cells, abnormal shape, nucleus degenerative and leaving the true area but when treating diabetic animals with aqueous extract of (Citrus lemon and Cyperusrotundus), it was noted that it returned back to the normal shape ofpancreas.In conclusion, the results of this study indicate that the Citrus limonseeds and Cyperus rotundus tuberextracts gave good results, even better than the reference drug Amyral for loweringbloodsugar, in addition to improvingmetabolic disorderscaused byalloxan induced-diabetes

دراسة لتكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Escherichia coli وProteus mirabilis المعزلة من اصابات المسالك البولية في محافظة النجف الاشرف == Study of Biofilm formation of Escherichia coli and Proteus mirabilis isolated from urinary tract infection in AL - Najaf Al - Ashraf governorate

اسم المؤلف: رسل عيدان محسن
اسم المشرف: سهام جاسم محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: The aim of this study is to inferring the ability of biofilm production and virulence factors which has helped to form it into two types of bacteria P.mirabilis and E.coli. Two hundred and fifty samples have been collected from patients who are suffering Urinary tract infection (UTI) in Teaching Hospital at Al - Najaf Al - Ashraf during the period ( 1/10/2014 - 1/1/ 2015). The samples have has identified by diagnostic methods : culturing , microscopic , biochemical and using VITEK - 2 compact system more sensitively and specifically method.The results have been showed that the isolation ratio was 30 (37.5%) of E.coli, while P.mirabilis was 14(17.5%) also, a five isolates (6.5%) wereEnterobacter cloacae ssp cloacae and only two isolates (2.5%) were Raoultella ornithinolytica from the total number of specimens. The virulence factors and antibiotic sensitivity test of two bacteria : P.mirabilis and E.coli were determined and the more virulence and multidrug resistance were selected.The hemagglutination properties of P.mirabilis which isolated from clinical samples were determined , the reaction with red blood cells of human group O+ was explored. The ratio of Hemagglutination was reached 42.86%, 50%, 7.14% to MSHA, MRHA and NOHA respectively. However, E.coli has been a different results that was reached 30 % , 26.67% and 43.33% from type MSHA, MRHA and NOHA as well. On the other hand, the thin - film production (pellicle) has been formed by 13 isolates of bacteria P.mirabilis and 21 isolates of bacteria E.coli, when it was growth on the nutrient broth in a temperature 37˚C for 24 - 18 hours. Moreover, it has been shown that there is high affinity for adhesion with the epithelium cell in the urinary tract. In addition, the E.coli has proved the higher efficiency than P.mirabilis in adhesion. It was detected ability of bacteria to biofilm production in three methods. The bacteria E.coli have showed their ability on biofilm production where by the rate was (43.3, 52 and60)% on the different growth ways which was the Congo Red, the tube and the plate respectively.The gel electrophoresis has been done on all isolates which was to analyzed on adhesive factors genetically whereby the bacteria P.mirabilis, E.coli have shown ability to gene expression (fimH and afaB) with a rate of (42.86 and 28.57)% and (30 and 20)%, respectively.Also, it has been clarified that the antibiotics ( Ciprofloxacin, Amikacin and Ceftazidime) have an effect on the most virulent bacteria to prevent the formation of biofilm when it is taken a half of minimum inhibitory concentrations. It was found that the minimum inhibitory concentrations were the most efficient in the prevent a biofilm formation in both types of bacteria.It appears to be found that the minimum inhibitory concentrations of these antibiotics were the most efficient in the prevent the formation of biofilm in both types of bacteria. Ciprofloxacin has the high efficiency to prevent the biofilm formation in E.coli while this concentration has no effective on biofilm production from others. It has been found that there is a clear positive relationship between the presence of adhesion gene (fimH , afaB) and the ability to adhesion on the epithelial .The conjugation process was conducted successfully to transfer the adhesion genes between (E.coli and P.mirabilis) which have been considered a donor strains to transfer the genes to the standard strain E.coli HB101 which have been considered a receipt strains whereby have shown ability to adhesion and biofilm formation.

دراسة علاقة مجاميع الدم ABO مع البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والبين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني == Studying the Association of ABO Blood Groups with IL - 18BPa & IL - 18R beta in the Iraqi Arab Females with Diabetes Mellitus Type 2

اسم المؤلف: زينب فاضل عبد الغفور
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء السكري كمرض التهابي يرتبط مع العديد من العوامل الالتهابية لذلك تهدف الدراسة الحالية لحساب تركيز العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا مع عوامل الخطورة التقليدية والتي تشمل المقاييس الفيزيائية مثل متوسط محيط الخصر ومؤشر كتله الجسم وعوامل البيو كيميائية مثل الانسولين , مقاومة الانسولين , مستوى السكر في الدم في حاله الصيام ,مستوى الهيموغلوبين السكري وملف الدهون وفي الوقت نفسه دراسة ارتباطهم مع نظام الدم ABO في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني ومن اجل معرفة تاثير ذلك مع عوامل اخرى التي تعتبر كمؤشر او مطور لمرض السكري من النوع الثاني . وشملت الدراسة الحالية 340 مريضا من النساء العراقيات العربيات المشخصات حديثا بالسكري من النوع الثاني 200 من النساء الاصحاء اختبرت للتكرار الاليلي والمظهري ,ومن هؤلاء 60 مريضة اختبرت للدراسة المناعية والكيميائية مقارنة مع 28 من النساء الاصحاء .الاختبارات المناعية بواسطة استخدام تقنية الانزيم المرتبط المناعي, اما المقاييس الكيميائية باستخدام الاساليب الانزيمية واللونية, وتم تقسيم المرضى والسيطرة حسب مجاميع الدم الى اربعة مجاميع ثانوية (A , B ,AB ,O) وفقا لنوع فصائل الدم التي كشف عنها بواسطة الاختبارات المصلية القياسية .اظهرت البيانات الحالية : 1 - زيادة معنوية في المصل العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا في المرضى الحاليين ,في حين لم تظهر اختلافات معنوية في مستوى مصل العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .2 - زيادة معنوية في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة, في حين العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتزااد في المجموعة الاقل من 40 سنة وانخفض مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة .بالاظافة الى زيادة كل عوامل الخطورةالاخرى.3 - تركيز كلا العاملين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا يزداد بشكل غير معنوي تدريجيا في كل المرضى مع زيادة مدة المرض ونفس النتيجة لمقاومة الانسولين.4 - اظهرت نسبة الهيموغلوبين السكري اقل من 7.3 % زيادة كبيرة في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وتنخفض تدريجيا مع زيادة نسبة الهيموغلوبين السكري .5 - الافراد الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , الانسولين ومقاومة الانسولين .6 - المرضى الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B والاصحاء الذين يحملون فصيلة الدم A اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .7 - يعتبر العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا كعوامل خطورة مستقلة في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني والتي تدعمها غياب العلاقة المعنوية بين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وجميع عوامل الخطورة التقليدية الاخرى .8 - هنالك علاقة ايجابية بين مستويات العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا وخطورة السكري من النوع الثاني والذي قد يعتبر كمؤشر لحدوث المرض , في حين ان مستويات العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا قد يكون مؤشر لتطور المرض .مزيد من الدراسات اللازمة لفهم العلاقة بين مجاميع الدم , عوامل الالتهابية ومخاطر السكري من النوع الثاني . | DM is considered as inflammatory disease associated with many inflammatory factors. As such the present study aims to investigate the concentration of IL - 18 binding protein alpha (IL - 18BPa) and IL - 18R beta with classical risk factors which include Anthropometric risk factors like Age, Central Obesity (CO) and body mass index (BMI), biochemical factors like Insulin , Insulin Resistance (IR), Fasting Blood Glucose ( FBG), Glycosylated Hemoglobin (HbA1c) and lipid profile. Besides, the study aims to studying their association with ABO blood system in the Iraqi Arab female patients with diabetes mellitus type 2 in order to figure out their effect with other factors as predictor or developer for diabetes mellitus type 2. The present study included 340 Iraqi Arab female patients newly diagnosed with DMT2 and 200 healthy individuals tested for phenotype and allele frequency. From those, 60 patients were tested for the immunological and chemical where compared to 28 healthy individuals. Immunological tests by using ELISA kits. While Chemical parameters using enzymatic and colorimetric methods. The study groups (patients and control) were divided into four sub groups (A, B, AB and O) according to the class of blood groups which were tested by using standard serological procedures. The present data showed : 1 - A significant increase in the serum level of IL - 18BPa in the patients of the present study, while there was no significant difference in the serum level of IL - 18R beta. 2 - A significant increased in mean of IL - 18BPa with increased age in both patients and control groups. While IL - 18R beta showed increase at group less than 40 year and decreased with increasing age in both patients and control group. Besides increased all other risk factors. 3 - The levels of both IL - 18BPa and IL - 18R beta were gradually non significantly increased the level in each patients group with an increased duration of disease and the same for IR. 4 - Patients with HbA1c less than 7.3% showed a significant increase in mean of IL - 18BPa and IL - 18R beta and decreased gradually with the increase of HbA1c. 5 - Patients and control subjects who carried blood group B had the highest mean of IL - 18BPa, Insulin and Insulin resistance. 6 - Patient subjects who carried blood group B and control subjects who carried blood group A showed the highest mean of IL - 18R beta. 7 - IL - 18BPa and IL - 18R beta act as independent risk factors in Iraqi Arab females with DMT2 which supported by the absence of significant correlation among IL - 18BPa, IL - 18R Beta and all others classical risk factors. 8 - A positive relation between levels of IL - 18BPa and risk of DMT2. This may be an indication of inflammation for newly diagnostic diabetic patients, while Serum levels of IL - 18R beta might be a predictor marker of disease progression. Further studies are needed to understanding the relationship between blood groups, inflammatory markers and risk of DMT2 in healthy population.
1 ... 154 155 156 157 158 ... 235