التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة == Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city
Author name:
زهراء محمد وناس
Supervisor name:
زيدان خليف عمران المعموري
General topic:
Biology
Specific topic:
Microbiology
Degree:
Master
University:
University of Babylon - College Of Science For Girls - Department Of Biology
Language:
English
University location:
Babylon
First pages:
24T3049 - p.pdf
Abstract:
المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.
