عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 50 من أصل 41,289

تحضير وتوصيف الجسيمات الدهنية النانوية وربطها مع مستضد طفيلي Leishmania donovani Preparation and characterization of nanoliposome and entrapment of Leishmania donovani antigens

اسم المؤلف: روعة نجم عبد الله الخميسي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي علي عبد الرحمن الشيخلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعتبر استخدام الجزيئات النانوية التي تحمل المستضد صناعيا والقابلة للتحلل الحيوي كجزيئة مساعدة من المواضيع المهمة في تحضير اللقاح ومن الخطوات المهمة في السيطرة على تحرر المستضد لتحسين الاستجابة المناعية . تتكون الجسيمات الدهنية النانوية من مركبات طبيعية والتي تشجع بدورها الباحثين على استخدامها كمساعدات نانوية طبيعية . في هذه الدراسة , استخدمت الجسيمات الدهنية النانوية كمساعدات لقنص المستضدات الذائبة المستخلصة من طفيلي اللشمانيا الاحشائية كخطوة اولى باتجاه تحضير لقاح ضد اللشمانيا . تم تنشيط الطفيلي من خلال تنميت طور الطفيلي ) 104 promastigote / ml ) في الوسط الزرعي ( RPMI ) في درجة تحضين 23 م0 ولمدة اربعة ايام . اعتمدت اللقيحة بعمر 4 ايام وبنسبة 104 خلية في المليلترالواحد في تلقيح وسط (SNB9 ) لانتاج الكتلة الحيوية والتي تستخدم لاستخلاص المستضد . تم استخلاص المستضدات الذائبة من خلايا الطفيلي بعد اربعة تمريرات في نفس الوسط الزرعي ليتم بعدها قنصها في الجسيمات الدهنية النانوية والمحضرة انيا . حضرت الجسيمات الدهنية النانوية من ( mM Phosphatidylcholine 4 ) ) 2.2 mM Cholesterol ) و(mM Phosphatidylethanolamine 0.55) وبنسبة 1 : 2 : 7 ضمن جميع طرق التحضير المختلفة وتم دراسة توصيفها الفيزياوي والكيمياوي باستخدام (SEM ) و(AFM ) و( FTIR) و(Zeta Potential ) لتقدير حجم وشكل وشحنة الجسيمات وتحديد المجاميع الكيمياوية المتكونة .من النتائج لوحظ ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تحمل شحنة سالبة ولاتظهر تكتل بعد عملية التحضير ولا تزيد اقطار الجسيمات الناتجة عن 75 نانوميتر وتحمل مجاميع كيمياوية (PO2 ) و(CH2) و(CH3 ) . تم احتساب كفاءة قنص (EE) الجسيمات الدهنية النانوية للمستضدات الذائبة وكانت النسبة المئوية لكفاءة القنص هي 62% و50% و27.5 % للجسيمات المحضرة بطريقة الكلوروفورم والسيفادكس G25و السيفادكس G75 على التوالي . من جانب اخر , تم دراسة الثباتية للجسيمات الدهنية النانوية القانصة للمستضدات بدرجتي حرارة تخزين 4 و37 م0 واظهرت النتائج ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تمتلك درجة ثباتية كان مقدارها 32% في درجة حرارة 4 م0 و16% في درجة حرارة 37 م0 خلال فترة تخزين 12 يوم | The use of biodegradable nanoparticles as vaccine adjuvant with entrapped antigens represents an exciting approach for controlling the release of vaccine antigens and optimizing the desired immune response . Because of the natural components of nanoliposomes , we investigated the ability of prepared nanoliposomes , as a nanoadjuvant , to entrap soluble Leismania donovani antigens (SLAs) . The study was include preparation of SLA by parasite reactivation was carried out when inoculated into Rosewell park memorial institute media (RPMI) and incubated at 23 ̊ C for 4 days . Inoculum (104 promastigote / ml) of 4 days was used to inoculate modified medium of Saline - Neopeptone and Blood agar ( SNB) to produce promastigote mass . SLAs were extracted from the promastigotes ghost membrane after fourth passages of subculturing in SNB9 .The extracted SLAs then entrapped in nanoliposomes prepared freshly .Lipids mixture of 4mMPhosphatidylcholine, 2.2mM Cholesterol and 0.55mM Phosphatidylethanolamine in a ratio of 7 : 2 : 1 was depended in two nanoliposome preparation methods ; Chloroform injection and size exclusion chromatography . Physio - chemical characterizations of prepared nanoliposomes was performed by using Scanning Electron Microscope (SEM) , Atomic Force Microscope (AFM) ,Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Zeta Potential assays to determine the size , morphology , chemical active group and charge . Nanoliposomes prepared by chloroform injection method revealed non aggregate of negative nano vesicles with diameter of less than 75nm and PO2, CH2 and CH3 groups. The nanoliposomes entrapment efficiency (EE) to entrap SLAs was determined. The percentage of EE was 62, 50 and 27.5of SLAs entrapped nanoliposomes prepared by chloroform injection, Sephadex G25 and SephadexG75 , respectively .Moreover, stability of SLAs entrapped nanoliposomes was examined at 4 and 37 ̊ C storage temperature. SLAs entrapped nanoliposomes , prepared by chloroform injection method ,shown higher value of EE( 32 % ) at 4 ̊ C and(16%) at 37 ̊ C after 12 days of storage .

دراسة تشخيصية ووبائية لطفيلي المقوسة الكوندية لطلبة جامعة ذي قار باستعمال تقنيتي الاليزا Toxoplasma gondii وتفاعل سلسلة البلمرة ذو الوقت الحقيقي Diagnostic and Epidemiological Study of Toxoplasma gondii for Students of Thi - Qar University by ELISA and Real - Time PCR Techniques

اسم المؤلف: رباب علي شناوه الموسوي
اسم المشرف: بسعاد عقرب العبودي منال بادي التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Toxoplasma gondii is a unique intracellular parasite, which infects a large proportion of the world, population, but clinically uncommonly causes significant disease. The present study was performed for the first time in Thi - Qar province to estimate the prevalence of toxoplasmosis among university students. Blood samples were collected from 319 (111 males and 208 females) apparently healthy students, they have ages between (18 - 42) years attended from different colleges of Thi - Qar university (students of morning and evening study), during the period from October 2013 to April 2014.Enzyme linked Immunosorbant Assay (ELISA), was used to evaluate the presence of anti - Toxoplasma IgM and IgG antibodies and detection of B1 gene of T.gondii DNA by Real - Time Polymerase Chain Reaction (RT - PCR).The results indicated that 21.94% of students were exposed to positive for anti - Toxoplasma antibodies, 5.33% of them had IgM, 11.91% had IgG, and 4.70% had both IgM and IgG. Statistically, they were significant difference between them.There were a significant difference between males and females in total rate but not significant of antibodies pattern in them, which recorded 7.52% of males and 14.42% of females were positive for anti - Toxoplasma antibodies.The study demonstrated that no significant difference in infection percentages between colleges where students studied, although the highest seropositivity students was 47.83% in education sports college whereas it did not score any infection with toxoplasmosis in College of Education for Pure Science .The current study also showed that the highest positive percentage with T.gondii of male students was 28.57% in College of Engineering while the highest percentage with T.gondii of female students was 30.43% in College of sports education.The present study revealed that the acute infection of toxoplasmosis which presented IgM and both IgM and IgG was high at small age youngstudents (18 - 22) years while the chronic infection which presented IgG was high at old students (38 - 42) years.The present study demonstrated that seroprevalence of toxoplasmosis was significantly associated with close contact with cats. Although more students in the positive sample group eating undercooked meat but not significant difference between those 36.13% and other students who did not have this habit 13.5% has been discovered.The results showed the highest positive percentage samples at middle socioeconomic level was 24.10% while the lowest percentage at good socioeconomic level was 19.60% .The results showed that the highest positive percentage samples 31.0% at Refaee district whereas the lowest percentage was 19.78% as noticed at Naserya district.The present study demonstrated that seroprevalence of toxoplasmosis was significantly associated with presence of clinical symptoms (fever, headache, malaise, influenza) that may have a relationship with toxoplasmosis of infected students when compared with not presence clinical symptoms of those (p<0.05) they recorded 18.57% and 81.43% respectively.The present study revealed an association between blood group system and Toxoplasma infection with highest prevalence among samples of blood group A+ 30.65% and lowest prevalence in samples of blood group B+ 17.44% .The current study evolutes the rate of some blood parameters, in infected and non infected students, there was no significant difference observed in mean hemoglobin level (Hb), total count of leukocytes (WBCs), neutrophilis, lymphocytes, monocytes and basophilis numbers in both student . While significant differences were observed in mean of eosinophils number of infected students was more than number of non infected students.Moreover, mean of lymphocytes number recorded significant differences between infected and non infected females only.Besides the serological diagnosis of T.gondii, Real - Time PCR (RT - PCR) technique was used to confirm the infection with T.gondii by detection B1 gene of T.gondii DNA in the blood of students. Out of 319 students only 6.26% showed positive for toxoplasmosis among those 2.50% were males and 3.76% were females. The positive result in RT - PCR analysis were distributed on the patterns of the anti - Toxoplasma antibodies by ELISA test , Any positive blood samples with IgM, IgG and both IgM and IgG respectively have not been found whereas 20 positive cases of no anti - Toxoplasma antibodies.Real - Time PCR test in student's blood has advantages in detection of recent or active toxoplasmosis

دراسة تاثير هرمون النمو على بعض المظاهر الفسيولوجية لقصار القامة في العراق

اسم المؤلف: راوية محمود يوسف السلامي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري هناء علي عبد الجبار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمثل نقص الافراز الداخلي لهرمون النمو السبب الاكثر شيوعا في احداث قصر القامة في الاطفال ومرتبطا" بالعديد من التبعات المرضية الفسلجية. ان المفاهيم الاساسية لاثر النقص الهرموني تتاتى من الدراسات السريرية, المناعية البايوكيمياوية, والوراثية والتي تشير الى اهمية دراسة العوامل المناعية والبايوكمياوية في تفسير هذا الاثر ,اضافة الى ان نقص هرمون النمو لا يرتبط بتبعات طبية جدية فحسب وانما يؤثر نفسيا واجتماعيا في مثل هؤلاء الاطفال وعوائلهم, مما يتطلب ايضا ايضاح الدور العلاجي في الحد من الاستجابات الفسلجية المفرطة التي تلعب دورا محوريا في تراجع نمو هؤلاء الاطفال. ولندرة الدراسات العراقية في هذا المجال وبهدف تطوير استراتجيات الادارة العلاجية الناجحة والذي يسهل من خلال فهم الجوانب المناعية والايضية لنقص هذا الهرمون.لقد كانت الواسمات الورمية (مستضد المسرطن الجنيني CEA, البروتين الحميلي نوع الفا AFP, مستضد الكاربوهيدرات CA - 125), هرمون الانسولين, فايبرنوجين البلازما, اضافة" الى نسبة الدهون والكالسيوم في المصل, الطول,الوزن المرشحة لمثل هذه الدراسة علاوة على ذالك اهتمت الدراسة ايضا" بتقييم الاستجابة التحفيزية لهرمون النمو بواسطة الكلوندين. اجريت هذه الدراسة المستقبلية في المستشفيات التعليمية/ حماية الاطفال - بغداد على 49 مريضا" عراقيا" مصابا" بقصر القامة (37 ذكر, 12 انثى), قورنوا مع 20فردا"من الاطفال الاصحاء كمجموعة ضابطة, للفترة من تشرين الاول 2007 ولغاية اب 2008. اجري فحص مقايسة الماز المناعي للانزيم المرتبط ELISA لتقييم الجوانب المناعية الفسلجية(هرمون النمو, الواسمات الورمية,هرمون الانسولين, الفحص الالي اليدوي للفايبرنوجين , الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير مستويات الدهون{الكوليسترول T - C ,ال_xFFFF_لسريد الثلاثي TG ,البروتينات الشحمية (عالية الكثافة (HDL , (واطئة الكثافة (LDL, (واطئة الكثافة جدا (VLDL (اضافة لنسبة HDL T - C/} والكلسيوم في المصل) وحساب الطول نسبة" للعمر معبرا عنه بالوحدة ,Z كذالك الوزن عبر عنه بحساب معدل كتلة وزن الجسم BMIZ لجميع افراد مجموعتي الدراسة.اظهر الروز الكمي لوسيط تركيز هرمون النمو(GH) مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل ان مستوى هذا الهرمون في الاطفال قصار القامة (1.4) في السيطرة (3.7), اما بعد التحفيز فقد كان في المرضى (5.1)و في السيطرة (10.9). وكانت هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين كل من مجموعتي المرضى ومجموعة الاصحاء سواء" قبل او بعد التحفيز. اظهر الكلوندين فعالية ممتازة في التفريق بين المرضى والاصحاء من جهة وفي التقييم الاولي لنقص هرمون النمو في الاطفال قصار القامة من جهة اخرى.ظهر الوسيط الحسابي لتركيز CEA مقدر" بال مايكرو غرام لكل مل من المصل ان مستواه لدى المرضى (1.4) اعلى مما عليه في الاصحاء (0.9) هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين ومن الممكن ان تعد مؤشرا مناعيا التهابيا متعلقا بجوانب مرضية لنقص الدور الايضي للهرمون . بعد فترة 9 اشهر من العلاج بدا هذا المستوى المرتفع يميل بعض الشيء نحو الانخفاض (1.38) وان كان على نحو ضئيل لكنه معنوي مقارنة بالمرضى انفسهم قبل العلاج, على الرغم من ذالك بقت الفر وقات معنويا عالية بين المجموعتين. فيما يخص المتوسط الحسابي لتركيز CA - 125 (مقدر" وحدة لكل لتر) اعلى قليلا" لدى المرضى (10.8) من السيطرة (9.2), وبدا هذا الارتفاع البسيط يميل للانخفاض بعد العلاج (9.7), بالرغم من ذالك الاختلافات لم تكن ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين. اما المتوسط الحسابي لتركيز AFP مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل لم يؤشر اي فرق معنوي بين المرضى سواء قبل العلاج (1.4) او بعد العلاج (1.3) بالمقارنة بافراد المجموعة الضابطة (1.3) .التاثير المعاكس للانسولين تحقق من خلال التقدير الكمي لتركيز الانسولين (مايكرو وحدة دولية لكل لتر) عند الصيام حيث اظهر المتوسط الحسابي للبيانات قبل العلاج عدم وجود فرو قات معنوية بين المرضى(8.1) والمجموعة الضابطة (8.3), اثناء المتابعة لفترة العلاج ارتفع مستوى تركيز الانسولين معنويا (17.4) مقارنة بافراد المجموعة الضابطة من جهة وبين الحالة قبل العلاج من جهة اخرى.اوضحت النتائج الاحصائية لوسط تركيز الفايبرنوجين مقدرا" بوحدة الملغرام لكل لتر من البلازما بواسطة الطريقة الالية اليدوية ارتفاعا" معنويا" لدى المرضى قبل العلاج (282.9) مقارنة" بالسيطرة (265.4), ظهر ان تركيزه ازداد اكثر بعد العلاج (361.1) وبدت الفر وقات معنوية" اكثر مما كانت عليه مقارنة بالسيطرة من ناحية وبالمرضى انفسهم قبل العلاج من ناحية" اخرى.جانب اخر مهم يوضح الدور الفسلجى الايضي لهرمون النمو باستخدام الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير تركيز مستوى الدهون والكالسيوم (بوحدة الملي مول لكل لتر من المصل) وكانت البيانات موضحة لاثر النقص الهرموني لدى هؤلاء المرضى. حيث ان الفرو قات كانت معنويا" عالية بين المجموعتين في مستوى دهون المصل كما اظهر المتوسط الحسابي لعينة المرضى {T - C=4.1 , TG=1.5 ,LDL=2.5 , VLDL=0.7 , الوسيط الحسابي TC/HDL=4.22 اما HDL فقد كان معنويا منخفض = 1 { مقارنة بالسيطرة {T - C=9.3 , TG=1 ,LDL=1.8 , VLDL=0.5 , اما HDL فقد كان = 1.6, المتوسط الحسابي TC/HDL=2.35 { طرا بعد العلاج الهرموني تحسنا" معنويا" عاليا" مقارنة بما كانت عليه الحالة قبل العلاج كالاتي {T - C=3.6, TG=1.2, LDL=1.6, VLDL=0.5, اما 1.5=HDL, والمتوسط الحسابي TC/HDL=2.31}.اظهر التحليل الاحصائي ان البيانات الاولية لوسيط مستوى كالسيوم المصل تشير لانخفاض طفيف لدى المرضى(2.2) قبل العلاج, مقارنة" مع السيطرة (2.3). في حين ظهرت الفرو قات ذات اهمية معنوية اثر العلاج الهرموني حيث انخفض متوسط تركيزه الى (2). العلاج الهرموني ساهم معنويا (P<0.001) في تحسين {HAZ= - 2.9 و{BMIZ=0.7 لدى قصار القامة, مقارنة بما كانوا عليه قبل العلاج {HAZ= - 3.7 و{BMIZ= - 1.1, لكن عموما لازالت الفرو قات ذات اهمية معنوية في تفريقهم عن مجموعة السيطرة {HAZ= 0.2 . {BMIZ=0.3 بينت تحليلات الحسابات الاحصائية ان قيم القطع المثلى من الممكن ان تكون ذات اهمية في تفريق المرضى قصار القامة بسبب نقص هرمون النمو عن الاصحاء, وفي ذات السياق من الممكن ايضا" ان تساعد في توقع النقص الهرموني لديهم, ان كانت قيم القطع المثلى للمتغيرات المختبرة كالاتي {تركيز GH بعد التحفيز بالكلوندين اقل من 10.6 , CEA اعلى او مساوي ل 0.95 , وان كان مستوى الدهون في المصل اعلى من 3.04 ل TC/HDL , 2.1 LDL , 1.2 TG , 0.4 VLDL واقل من 1.4 HDL , واقل من 0.72 BMIZ }.نستنتج من هذه الدراسة ان العديد من الاستجابات المرضية والاختلال الايضيي يبدو بوضوح متعلقا" بنقص هرمون النمو وان العلاج الهرموني يساهم في تحسين الوضع المناعي والفسلجي لهؤلاء الاطفال. بشكل عام استخدام هرمون النمو امن نسبيا", بالرغم من ذالك GH يمتلك اثار جانبية محتملة قوية , لذا مثل هؤلاء المرضى لابد ان يراقبوا عن كثب وبصورة" دورية اثناء العلاج.بعض المتغيرات المدروسة مثل CEA ومستوى الدهون والفايبرنوجين اضافة الى BMIZ يمكن ان تساهم في التقييم الاولي والى حد معين من الممكن ان تساهم في دعم تشخيص نقص هرمون النمو .علاوة" على ذالك من المهم الانتباه الى الناحية الغذائية ودعم نمو مثل هؤلاء الاطفال بالكالسيوم اثناء العلاج اضافة للعناصر المغذية الاخرى الضرورية لنموهم. | Growth hormone deficiency (GHD) is the commonest endocrine disorder presenting with short stature (SS) in children, it is associated with several pathophysiological consequences, which has not yet elucidated. The important clues have come from clinical, immunobiochemical and genetic studies of GHD which have suggested an importance for the immunobiochemical factors in the etiology of this pathological consequences, and showed that GH - replacement therapy (GHRT) is recommended for the determination of the exaggerated physiological responses that play a crucial role in children growth retardation, and because of GHD not only has very serious medical consequences but also has a major psychological and social impact on children and their families, in addition to that a little is known about GHD pathological features, therefore; the development of successful therapeutical management strategies to such children are facilitated by the understanding of the GHD pathological influences.Tumor markers antigens (Carcinoembryonic antigen CEA, Alpha fetoprotein AFP, Carbohydrate antigen 125 CA - 125), insulin hormone, plasma fibrinogen, are primary candidates for this study, in addition, lipid profile, serum calcium (Ca), height and weight expressed as Z score {height for age (HAZ), body mass index (BMIZ)}, the study was also concerned with the evaluation of GH stimulation by using clonidine. This prospective study was carried out in 49 Iraqi, children, SS patient groups (37 male, 12 female) they were regularly attending the Welfare Teaching Hospital / children protective/ Baghdad were studied. The diagnosis has been well - established, based on clinical, immune - biochemical, and genetic criteria. An ethnically matched, apparently healthy control group (n=20) aged 13.5±3.3 years (mean ±SD) was also involved through Oct. 2007 to Aug 2008. ELISA tests for GH, CEA, CA - 125, AFP, insulin, and manual automated test of plasma FI and enzymatic colorimetric assay for serum lipid profile and Ca were carried out on all studied groups.Concerning the GH quantitative assay for serum median concentration (ng/ml) of baseline and after clonidine stimuli test revealed significant (p<0.001) differences between the study groups, baseline value was significantly lowered(1.4) in SS GHD cases compared to controls (3.7), after stimulation GH value was also lowered among SS GHD cases (5.1), than in controls (10.9). Clonidine test showed an excellent discriminating ability, between the two groups, and in initial assessment of GHD in SS children.A serological tumor markers quantitative immune assays, for serum median CEA concentration (µg/L), revealed that; baseline value was significantly (p<0.006) higher among GHD cases (1.4) than in controls (0.9), this elevated value tends to slightly decreased after treatment, although, still significantly higher among GHD cases (1.38) compared to controls, this result may be indicatives of the inflammatorycondition associated with GHD. CA - 125 baseline mean value (U/L) was slightly higher among GHD patients (10.8) than controls (9.2), a slight insignificant reduction occurred after treatment (9.7) compared to baseline value.AFP serum mean value (ng/ml) revealed no significant differences at baseline among GHD cases (1.4) compared to controls (1.3), after GHRT there were also no significant differences in GHD cases (1.3) compared to controls and baseline values.The contra insulin effect of GH achieved by quantitative determination of fasting serum insulin, baseline data observed in mean concentration (µIU/L) showed no significant differences among GHD cases (8.1) in comparison with controls (8.3). After treatment duration(9months) fasting serum insulin was significantly(p<0.001) elevated among GHD cases (17.4) compared to controls and to its baseline values. Manual automated quantitative assay for plasma FI mean concentrations (mg/dl) revealed that; baseline FI was significantly (p<0.049) higher among GHD patients (282.9) than in controls (265.4), this elevated value was fatherly increased after treatment (361.1) (p<0.001) in GHD patients. Another important aspect of GHD pathophysiological consequences on metabolism observed by the enzyme colorimetric method, for serum lipid profile mean value (mmol/l) , the data shown to be relevant to GHD in SS children; baseline lipid profile was significantly (p<0.001) higher among GHD cases {(T - C=4.1), (TG=1.5), (LDL - C=2.5), (VLDL - C=0.7) and median value of (T - C/HDL - C=4.22), whereas mean value of serum (HDL - C was significantly lowered =1)} than in controls {(T - C=3.9), (TG=1), (LDL - C=1.8), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.35) and (HDL - C=1.6)}. A significant (p<0.001) improvement observed through out GHRT duration in GHD cases {(T - C=3.6), (TG=1.2), (LDL - C=1.6), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.31) and (HDL - C=1.5)} compared to baseline values.Ca is an essential mineral for bones building, and several other biological functions, baseline data concentration (mmol/l) expressed as median value reveled that; baseline serum Ca was a slightly lowered in GHD cases (2.2) than controls (2.3), this slightly lowered value was further and significantly (p<0.001) decreased among GHD cases (2) compared to controls and to its baseline values.GHRT significantly (p<0.001) improved HAZ and BMIZ in GHD cases respectively {( - 2.9), ( - 0.7)} than it was pretreatment {( - 3.7), ( - 1.1)}, which were significantly (p<0.001) lowered than normal controls values {(0.2), (0.3)}, although, this improvement GHD short stature cases are still significantly different than in controls. The ROC analysis was shown newly reported, interesting evaluating roles that may - be possibly have an important assistant as discriminating and predicting tool of GHD in SS children, for probably most study parameters considering GHD as an important etiology of SS at baseline, the typical cutoff values when used to classify subjects and separator SS cases with GHD the results of this study indicated that SS patients may possibly be predicted to have GHD if they have concentrations as followed, the typical cutoff values were(< 10.6 for GH after stimulation by clonidine), while were (≥ 0.95 for CEA), {(lipid profile optimal cut off value were (≥ 3.8 for T - C), (1.2 for TG), (2.1 for LDL - C), (0.4 for VLDL - C), (3.04 for T - C/HDL - C) and was for (HDL - C < 1.4)},and for BMIZ was< 0.72). In conclusion, several pathological responses and metabolic disorders seem to be associated with GHD, and GHRT aid in improving GHD children immuno physiological state, the evaluation of immune metabolic parameters proves to be a useful indicator of GHD in The use of GH generally safe, although GH has potential side effects, children receiving GH must be monitored closely during treatment. Importantly, CEA, serum Ca, and lipid profile prove to be useful tools for the evaluation of auxological parameters during GHRT, and to some extent may aid in prediction GHD in SS children and possibly support the diagnosis.Further attention should be paid to the nutritional status of such patients, and supporting their growth by calcium and other important minerals supplements.

جينات تحسس الزحام وعلاقتها مع بعض عوامل الضراوه في بكتريا الزوائف الزنجاريه Correlation of Quorum Sensing Genes with Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: دعاء كاظم منصورالموسوي
اسم المشرف: منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 60 عزله من البكتريا السالبه لصبغه كرام مشخصه مبدئيا بانها بكتريا الزوائف الزنجاريه من عده مستشفيات في بغداد ومنها مستشفى ابن البلدي ومستشفى الحروق ومستشفى بغداد التعليمي وكذلك من المختبرات التعليميه في مدينه الطب خلال الفتره من بدايه شهر ايلول لغايه نهايه شهر كانون الاول لسنه 2013 تضمنت هذه العزلات22 عزله من خمجات الحروق و18 عزله من خمجات الجروح و9عزلات من عينات القشع لمرضى مصابين باصابات الجهاز التنفسي و6 عزلات من الدم وعزلتين من خمجات المجاري البوليه و3عزلات من مسحات الاذن. شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسط الماكونكي الصلب ووسط الدم الصلب وكذلك وسط السيدوموناس الصلب بعد ذلك تم اجراء بعض الفحوصات البايوكيميائيه مثل فحص الكاتليز والاوكسيديز تبع ذلك تشخيص العزلات جينيا باستخدام تفاعل البلمره التسلسلي باعتماد جين .rpsL اكدت النتائج ان جميع العزلات قيد الدراسه هي بكتريا الزوائف الزنجاريه . خضعت 60 عزله عائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه لاختبارفحص الحساسيه تجاه 12 مضادا حيويا بطريقه الانتشار واظهرت النتائج وجود مقاومه عاليه بين عزلات الدراسه لـــمضادات Tetracycline (100%) ,Ceftazidime (100%) ,Cefoxitin (100%) , Ceftriaxone (85 %) , Cefepeme (83.3%), Amoxillin/Clavulanic acid (81.6 %),Chloramphenicol (78.3 %) وانها كانت ذات مقاومه متوسطه لمضاد51.6%) Pipracillin ) وذات مقاومه واطئه لمضادات Tobramycin(33.3%), Norfloxacin (31.6%), Azithromycin (31.6%),Ciprofloxacin (28.3%). اختبرت قابليه العزلات على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام طريقه احمر - الكونغو وطريقه اطباق المعايره الدقيقه وتم قياس قيم الكثافه الضوئيه باستخدام قارىء منظومة الاليزا, اظهرت النتائج ان طريقه اطباق المعايره الدقيقه اكثر كفاءه وحساسيه من طريقه احمر الكونغو للكشف عن الغشاء الحيوي اذ اظهرت نتائجها ان 4 عزلات فقط غير منتجه للغشاء الحيوي اما العزلات الاخرى فقد كانت منتجه بدرجات متفاوته . اظهرت نتائج التحري عن جينات تحسس الزحام باستخدام تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي المتعدد وباستخدام بادئات خاصه بتسلسلات معينه لجينات الكوارم اظهرت النتائج ان 81,6% من هذه العزلات تمتلك واحد او اكثر من هذه الجينات بينما كانت 18.4% من هذه العزلات لا تمتلك الجينات اعلاه . تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي استخدمت في التحري عن خمس من جينات عوامل الضراوه العائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه وهي ((exoU,proteaseIV,exoS,pilB,plcH, اظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة (0% , 21.6 % ,26.6 % , 46.6% ,53.3% ) تباعا وكانت هذه العزلات تمتلك exoU وبعظها exoS وعلى اساسها صنفت العزلات على انها اما سامه او ضاريه . بينت الدراسة ان هناك بعض الطفرات قد حدثت في تسلسل القواعد النتروجينية للعزلات قيد الدراسة وكانت من نوع طفرات الاستبدال والادخال, كذلك تبين من مطابقة تسلسل القواعد النتروجينية المترجم مع تسلسل الاحماض الامينية الاصلي للجين لم يكن للطفرات تاثير على ناتج الترجمة . | A total of (60) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Pseudomonas aeruginosa were obtained from different teaching hospitals in Baghdad ; Ibn - El Balady , Baghdad teaching hospital , Burn hospital and Teaching laboratory in Medical city. During the period between July 2013 till December 2013. The source of these isolates were as follows : (22) isolates collected from burn infections ,(18) isolates from wound infections, (9) isolates from sputum taken from patients suffering from respiratory tract infection,(6) isolates from blood,(2) isolates from urinary tract infections(UTI), and the last (3) isolates from ear swab. The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar,Blood agar, Pseudomonas agar then diagnosed by performing some biochemical tests (catalase and oxidase) followed by Genotypic diagnoses by PCR Which was performed by housekeeping gene (rpsL gene). The results confirm that all the 60 isolates were P.aeruginosa. Sixty P.aeruginosa isolates were tested for 12 antibiotics by using agar diffusion method , the results showed high resistance against Tetracycline 100%, Ceftazidime100%,Cefoxitin100%,Ceftriaxone85%,Cefepime,83.3%,Amoxicillin/Clavulanic acid 81.6%, and Chloramphinicol 78.3% moderate resistance against ,Pipracillin 51.6% , and low resistance against Tobramycin 33.3% , Norfloxacin 31.6%,Azithromycin 31.6% and Ciprofloxacin 28.3%. The ability of the isolates to produce biofilm were tested using congo red plate method and Tissue culture plate method(TCP). Results showed that TCP method is a more quantitative and reliable method for the detection of biofilm this method show that 6.6% isolates were not biofilm producers while other isolates produce it in different degrees . Multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique was performed using specific primers targeting the specific sequences of Quorum sensing genes (lasR,lasI , rhlR,rhlI) .The results showed that 81.6% positive for one or more QS genes while only 18.3% were negative for all these genes. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to screened five virulence factors (exoU,proteaseIV,exoS, PilB , PlcH) results showed percentage were (53.3% , 46.6% , 26,6 % , 21,6 % , 0% ,) positive isolates respectively and these isolates contain either exoU or exoS and according to this have been classified into cytotoxic and invasive. Determination of nucleotides sequence for QS genes was revealed there was some mutations occurred which included substitution and insertion. From the other side results of identities of translated - nucleotides sequence with original sequence of amino acids revealed that there were no effect of mutations on translation product.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

اسم المؤلف: داليا سـلمان عــبد ســبع
اسم المشرف: محمد فخري احمد مروان صالح محمد النمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

التنوع والانتشار الجغرافي لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى، العراق Diversity and geographical distribution of freshwater Gastropods in Diyala river basin , Iraq

اسم المؤلف: خنساء سلمان فرمان
اسم المشرف: عماد الدين عبد الهادي المختار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء الدراسة الحالية للتعرف على التنوع الاحيائي والتباين المظهري لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى في العراق ولهذا الغرض تم اختيار 10 مواقع موزعة على قطاعين : القطاع الشمالي ويتمثل منطقة شمال سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة دربنديخان Dar , موقع مدينة كلار Kal , موقع رافد الوند في مدينة خانقين Wan وموقع مدينة جلولاء Jal . القطاع الجنوبي ويتمثل بجنوب سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة حمرين Him, موقع ناظم الصدور Sud , موقع جدول مهروت Mah في مدينة المقداديه , موقع مشروع الخالص الاروائيKha , موقع جدول السارية Sar وموقع مدينة بعقوبة Baq . ناولت الدراسة التعرف على العوامل الفيزيائية والكيميائية والتي شملت : درجة الحرارة , الاس الهيدروجيني , تركيز الاوكسجين المذاب , التوصيلية الكهربائية , سرعة التيار , تركيز الكالسيوم , نسبة المواد العضوية ونسجة القاع لمواقع الدراسة . جمعت عينات شهرية لبطنية القواقع المائية عن طريق اسطوانة جمع العينات من المواقع للفترة من نيسان 2013 - كانون الثاني 2014 عدا الموقعين دربنديخان وكلار حيث جمعت العينات فقط خلال شهري ايلول وتشرين الاول 2013 . وتم تشخيص العينات بالاعتماد على النماذج المحفوظة في متحف التاريخ الطبيعي البريطاني . تم حساب الكثافة والوفرة النسبية والتردد لكل نوع خلال فترة الدراسة كما شملت قياس التباين المظهري للانواع المشتركة بين القطاعين . والارتباط بين العوامل البيئية والانواع وبين الانواع بالاضافة الى قياس التماثل بين الجماعات السكانية للمواقع . تراوحت قيم درجة الحرارة للمياه المسجله للمواقع خلال فترة الدراسة ( 10 - 33 )º م واظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في حين سجلت ظهور فرق معنوي بين الاشهر كما تراوحت قيم الاس الهيدروجيني ( 6.6 - 8.1 ) مع انها تميل الى ان تكون قاعدية في اغلب المواقع كما اظهرت عدم تسجيل فرق معنوي بين القطاعين . ظهر من قيم الاوكسجين الذائب الذي تراوح بين ( 6.1 - 10.7) ملغم /لتر ان المواقع ذات تهوية جيده وبين التحليل الاحصائي عدم وجود فرق معنوي بين القطاعين في حين سجل وجود فرق معنوي بين القطاعين في قيم التوصيلية الكهربائية التي تراوحت بين ( 1530 - 450) مايكروسيمنز /سم , كما اظهرت النتائج وجود فرق معنوي في سرعة الجريان بين المواقع حيث تراوحت بين اعلى قيمة سجلت في موقع كلار 1.3 م/ثا الى اوطئ قيمة سجلت في الصدور والتي تقدر 0.08م/ثا الا انها لم تسجل فرق معنوي بين القطاعين في اغلب اشهر البحث . كما تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل مختبريا منها تركيز الكالسيوم في المياه حيث سجلت تراكيز عاليه في الموقعين الوند وبعقوبه مقارنة بالمواقع الاخرى حيث بلغت 210 ملغم /لتر في حين بلغت سجلت اقل تركيز في الصدور 41 ملغم / لتر وسجلت وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في اغلب الاشهر , كما تراوحت نسب المادة العضوية في رواسب القاع بين ( 0.6 - 4.1) % مع تسجيل فرق معنوي بين القطاعين , تباينت نسجة القاع بين مواقع الدراسة مزيجيه طينية رمليه للمواقع دربنديخان والوند وجلولاء وعرينيه طينية في كلار ومزيجيه رملية في حمرين في حين كانت طينية في الموقعين الخالص والسارية ومزيجيه في مهروت وبعقوبه . تم خلال فترة الدراسة تشخيص 12 نوع تنتمي الى 8 عوائل وشملت : عائلة Neritidae تضمنت نوعين Theodoxus jordani وNeritina mesopotamica , عائلة Valvatidae شخص Valvata saulcyi وعائلة Viviparidae تم تشخيص Bellamya bengalensis وكما تم تشخيص الانوع Melanopsis costata , M.nodosa , M. subtingitana وM. preamorsa التي تنتمي الى عائلة Melanopsidae وMelanoides tuberculata من عائلة Thiaridae وLymanaea natalensis من عائلىة Lymnaedae وPhysa acuta من عائلة Physidae وPlanorbis gibbonsi من عائلة Planorbidae . وقد بينت النتائج ظهور Physa acuta في جميع المواقع في كما سجل الموقع Dar اعلى كثافة لمجموع الافراد والموقع Jal. اقلها في حين سجلت T.jourdani هي اكثر الانواع كثافة مقارنة مع الانواع المدروسة الاخرى . كما اظهرت النتائج ان اعلى كثافة للانواع تكون في اشهر الخريف والربيع ولكنها تنخفض في اشهر الصيف والشتاء كما اظهر تحليل الارتباط بين الانواع والعوامل البيئية بان كثافة الانواع لا تتاثر بتركيز الكالسيوم في حين هناك تباين في استجابة الانواع لبقية العوامل التي تمت دراستها تم دراسة التباين المظهري للغلاف باستخدام تقنية المقياس المظهري الهندسي . حيث اجريت المقارنة بين الانواع المشتركة بين القطاعين الشمالي والجنوبي لقياس الاختلاف في الحجم لمركزي والتماثل لحجم وشكل الغلاف للانواع المشتركة Theodoxus jordani , Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis , Physa acuta وPlanorbis gibbonsi واظهرت النتائج وجود فرق معنوي في الحجم المركزي للانواع T. jordani ، P.acuta ، M.preamorsa وLymnaea natalensis كما سجلت نتائج التماثل الشكلي وجود تباين معنوي في التماثل لحجم الغلاف للنوع P. acuta. | The present work was conducted to study the biodiversity and the shell’s morphological variation of the Freshwater Gastropods in Diyala River basin northeast Iraq. For this purpose 10 sites were selected within two sectors of the River basin. A northern sector, represented the area north of Himreen’s dam and lake, including : Darbandikhan lake site (Dar); Kalar town site (Kal); Alwand tributary site in Khanaqin (Wan); Jalula city site (Jal). The Southern sector represented the area below Himreen’s dam and lake : Himreen lake site (Him); Al Sudor regulatory Dam site (Sud); Mahroot stream site at Moqdadia city (Mah); Al Khalis irrigation canal site (Kha); Al saria stream site (Sar); and Baqubah city site (Baq). Physical and chemical properties at the study sites were measured. These included : water temperature, pH, Dissolved Oxygen Concentration, Electrical Conductivity, Current Velocity, Calcium Concentration, sediment organic matter content and bottom Sediment particle size. Gastropods samples were collected monthly by a cylinder sampler from all sites for the period April 2013 through January 2014, with a small exception regarding Darbandikhan and Kalar sites. Gastropods species identification was aided by consulting preserved material at the British Natural History Museum (NHMUK). Occurrence, population density and relative abundance of each species were calculated. The morphological variation of the gastropod shells collected from different area sectors within the River basin were also determined. Correlation between gastropod species and the environmental factors were also recorded, in addition to investigating similarities between the studied sites in environmental factors and species density. Values of water temperature ranged between (10 - 33) ºC. No significant difference between sites nor between sectors, but only between months was detected. Values of the pH ranged between (6.6 - 8.1), tending to be alkaline at most sites. These values showed significant difference between the two sectors. The dissolved oxygen values ranged between (6.1 - 10.7) mg /l indicating good oxygenation with no significant difference between sites of the two sectors. However, electrical conductivity EC values ranged between(450 - 1530) µs/cm. A significant difference was revealed between the values of the two sectors, highest value of Current velocity was recorded at Kalar (1.3 m/sec.) and the lowest value was recorded at Al Sudor(0.08 m/sec.), but these records showed no significant difference between the two sectors in most months. Calcium concentration in the water showed presence of high concentrations (210 mg/l) at sites Al wand and Baqubah. While the lowest concentration (41 mg / L) was recorded at Al sudor, but no significant difference between sites or between sectors was evident in most months.Sediment content of organic matter ranged (0.6 - 4.1)% showing significant difference between the northern and southern sectors. Bottom sediment particle size and texture varied from sandy - clay - loam at sites Darbandikhan, Al wand and Jalula, to silt - clay at Kalar, sandy - loam at Himreen, clay at Khalis and Alsaria, and loamy at Mahroot and Baqubah. A total of twelve species of gastropods belonging to eight families were identified. Family Neritidae included two species Theodoxus jordani and Neritina mesopotamica; family Valvatidae included Valvata saulcyi; family Viviparidae included Bellamya bengalensis; family Melanopsidae included Melanopsis costata, M.nodosa, M. subtingitana and M .preamorsa; family Thiaridae included Melanoides tuberculata; family Lymnaedae included Lymanaea natalensis; family Physidae included Physa acuta; and family Planorbidae included Planorbis gibbonsi. Results showed that Physa acuta was present at all sites. while Theodoxus jordani was the highest density recorded. The highest density of the total individuals was recorded at Darbandikhan and the lowest was at Jalula site. The results showed that highest density of Gastropods population was recorded in Spring and Autumn months and decline in Winter and Summer months The correlation analysis between species and environmental factors showed that population density of species was not affected by the concentration of calcium while there was evident variation in the response of species to most other environmental factor. The variation in shell morphological features was investigated using Geometric Morphometric technique. Specimens from northern and southern sectors were compared to detect differences in the centroid size, symmetry of shell shape and size for shells of the most common species : Theodoxus jordani, Melanopsis preamorsa, Lymnaea natalensis, Physa acuta and Planorbis gibbonsi. Results showed variation existed in centroid size for Teodoxus jordani ,Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis and Physa acuta , but the analysis of symmetry in shell size and shape for the recorded species showed significant variance in the shell size of P.acuta only.

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

اسم المؤلف: حنان طارق صبحي
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

اسم المؤلف: حسين ظاهر عليوي التميمي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

تحديد مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين والابيشتاين بار فايروس في امصال المرضى العراقيين المصابين باللاهودجكن اللمفاوي Detection of interleukin 10 , Adiponectin and Epstein Bar Virus in sera of Iraqi patients with Non - Hodgkin's lymphoma

اسم المؤلف: حسنين سمير الهاشمي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري زياد احمد شبيب الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد مرض اللاهودجكن اللمفاوي مجموعة من سرطانات الخلايا اللمفاوية والذي تتطورفيه الخلايا المفاوية بطريقة خاطئه مؤدية الى اضطرابات مناعية .تم خلال الدراسة الحالية تقييم بعض المؤشرات المناعية في امصال (46) عراقيا من مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ومقارنتها مع (46) فردا مضاهيا من الاصحاء ظاهريا .اجريت الدراسة في المركز الوطني لبحوث وعلاج امراض الدم وفي قسم علوم الحياة في الجامعة المستنصريه منذ كانون الثاني الى حزيران من العام 2013. هدفت الدراسة لتقييم مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين واضداد (EBV) في امصال مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ودراسة اثر هذه المتغيرات في الامراضية والتنبؤ بسير المرض وكيف يؤثر بعضها في البعض .كان 31 (67%) مريضا (≥ 50) سنة و15 (33%) منهم باعمار(<50) سنة . وكان متوسط اعمار المرضى (52.74متوسط± 2.18) اذ تراوحت اعمارهم بين (17 - 80) سنة وقد بينت نتائج الدراسة ان الذكور هم اكثر عرضه للاصابة بالمرض مقارنة بالاناث وبنسبة 1 : 1.7 . كما تبين من الدراسة هنالك فروقات معنوية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين (50≤ و50≥) فضلا عن الفروقات كانت معنويه(0.05 > p) بينهما في مستويات الاضداد (EBV IgM) في الوقت الذي لم تكن الفروق معنويه (0.05 < p) لاضداد (EBV IgG) . تبين كذلك ان هنالك فروقات في مستويات الاديبونكتين المصلية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين في ما لم تكن الفروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الانترليوكين 10 بين المجوعتين العمريتين . عند تقسيم المرضى تبعا للجنس 29 ذكر و17 انثى , بينت النتائج ان هناك فروقات معنوية في اعداد خلايا الدم البيض بين الجنسين (17.32*109/لتر ± 6.87 ذكور , 5.80*109/لتر± 0,85 اناث) (0.05 > p).وبشان مستويات اضداد EBV (IgM,IgG) لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) بين كلا الجنسين , كما لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الاديبونكتين . فيما كانت الفروقات ذات دلاله معنويه في مستويات الانترليوكين 10 (23.77 بيكو غرام / مل ±6.58ذكور , 12.06 بيكوغرام/مل ±3.77 اناث ) (0.05 > وبمقارنة المرضى بالاصحاء كانت هناك فروقات معنوية (0.05 > p) في اعداد كريات الدم البيضاء فما لم تكن الفروقات معنوية (0.05 < p) بالنسبة EBV (IgM,IgG) .اما مستويات الاديبونكتين المصلية فقد انخفضت معنويا في امصال مرضى اللاهودجكن المفاوية (وان بقيت مستوياتها ضمن الحدود الطبيعيه ) بالمقارنة مع الاحصاء (0.05 > p).سجلت النتائج ارتفاعا معنويا (0.05 > p) في مستويات الانترليوكين 10 (18.67بيكو غرام/مل ±4.12 )بالمقارنة مع مستوياته (3.4بيكوغرام /غرام ±0.73) عند مجموعة الاصحاء , كما لوحظ ان هنالك ارتفاعا معنويا (0.05 > p) اخر في امصال اللاهودجكن ذوي المراحل المتقدمة (33.1 بيكو غرام /مل ± 4.5) عند مقارنتهم بالمرضى في المراحل المبكرة (13.4 بيكو غرام /مل ± 2.7) (0.05 > p)وعلى العكس من ذلك انخفضت مستويات الاديبونكتين معنويا (0.05 > p)في المراحل المتقدمة من المرض (4.53مايكروغرام /مل ±1.4 ) مقارنة بالمراحل المبكرة (6.79مايكرو غرام /مل ±1.1). بينت نتائج التحليل الاحصائي انه ليس هنالك ثمة علاقة معنويه (0.05 < p)بين الانترليوكين 10 والاديبونكتين عند مرضى اللاهودجكن اللمفاوي في جميع مراحلة . خلصت الدراسة بالاستنتاج ان حالات اللاهودجكن المدروسة اكثر حدوثا في فئات عمرية فوق الخمسين سنة بالمقارنة مع من هم تحت ال 50 سنة وترافقهزايادة في مستويات الانترليوكين 10 مع تقدم عمر المريض وارتباطها كذلك مع شدة المرض مما قد يعكس القيمة التنبؤية لهذا السياتوكين . فيما ارتبط انخفاض مستويات الاديبونكتين مع ارتفاع خطورة الاصابة بالمرض ومع اشتداد المرض . يرتبط الانخفاض في مستويات الاديبونكتين عكسيا مع مؤشر كتلة الجسم (BMI). سجل خلال الدراسة انخفاض مستويات (EBV IgM) في المرضى باستخدام تقنية الايلايزا يعكس الحاجة لاستخدام تقنيات اخرى للكشف عن الفايروس المختبىئ . | Non hodgkin's lymphoma (NHL) is a group of cancers of the lymphocytes. In NHL, the lymphocytes develop in a wrong way led to immune disorder. The present study was carried out to evaluate some immunological parameters in the sera of (46) NHL Iraqi patients , In addition to control group involving (46) matched apparently healthy subjects. This study was done in the National center of hematology & Department of biology at AL - Mustansiyria University since January to June 2013.The aim of this study is to estimate the levels of Interleukin 10, Adiponectin and EBV infection in sera of patients with NHL and to study the impact of these parameters on the pathogenesis and predictive of the disease and how they correlated.There were 31 out of 46 (67%) patients with age group ≥50 years and 15 out of 46(33%) patients with age group <50 years. The mean age of NHL patients was (52.74) years ranging from 17 to 80 years. The patients were divided into two groups according to the age(≥50years and <50 years)patients .There was statistically significant difference (p<0.05) in White blood cells count between age groups . The mean of adiponectin serum level was significantly differ (p<0.05) between the two age groups.The mean of IL - 10 serum levels did not show a significant difference between the two age groups (p>0.05).The mean of adiponectin serum level in NHL patients wasn't significantly (P>0.50) differ between male and female while the IL - 10 level in serum was significantly different (23.77pg/ml ± 6.58 male, 12.06 pg/ml ± 3.77 female) (P<0.05).When the patients of NHL compared with control, the mean of white blood cell count was significantly different ( p<0.05) also there was non - significant differences(P>0.05) in mean of EBV - IgG & IgM among NHL patients and control group. The mean level of adiponectin serum was a statistically decreased in patients of NHL as compared with control subjects(p<0.05), but still these levels are within normal range, furthermore The levels of interleukin 10 were significantly increased in patients with NHL compared with healthy subjects (18.67 ± 4.12 pg/ml vs. 3.4 ± 0.73pg/ml) (p<0.05). Higher increasing of IL - 10 levels in the advanced stage patients of NHL was noticed compared with early stages (33.1 ± 4.5 pg/ml vs. 13.4 ± 2.7 pg/ml) (P<0.05). Otherwise the serum levels of adiponectin in aggressive stage of NHL patients was decreased compared to the early stages of that disease (4.53 ± 1.4 µg/ml vs. 6.79 ± 1.1 µg/ml ) (P<0.05). There was no significant negative correlation between IL - 10 and adiponectin in all NHL patients (p>0.05) also there was no significant correlation between IL - 10 and adiponectin in patients with advanced stage (p>0.05). In conclusion, NHL was noticed in the highest ages and it might indicates the increasing rates of NHL among older population. in addition increasing level of IL10 is associated with increasing age range and also correlated positively with aggressive NHL cases that might indicates the predictive pivotal role of this cytokine . Moreover, Lower adiponectin levels are associated with an increased risk of NHL. Adiponectin is inversely correlated with Body mass index and also it was decreased in aggressive cases compared to early stages. The low percentage of EBV IgM in NHL patients by using Elisa technique might indicates the Necessity for using other advanced technique to detect EBV infection either an action or silent form

الكشف عن انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف المنتجة من بكتريا Klebsiella pneumoniae Detection of extended spectrum ? - Lactmases producing Klebsiella pneumoniae

اسم المؤلف: بيداء مجبل علي حسن الخفاجي
اسم المشرف: خليل مصطفى خماس سعد لعيبي حامد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت 46 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella pneumoniaeمن عدة مستشفيات في مدينة بغداد للفترة مابين شهري تشرين الثاني 2012 وتموز 2013. تم الحصول على العزلات من مصادر سريرية مختلفة شملت : (23) عزلة من الدم و(19) عزلة من الادرار وعزلتان من الجروح وعزلة واحدة من كل من مسحة الاذن والقشع. تم اجراء فحص حساسية العزلات تجاه 15 مضاد جرثومي باستخدام جهاز Vitek 2 , وكان نمط مقاومة العزلات تجاه المضادات الجرثومية على النحو التالي : 100٪ للاموكسيسيلين، 82.6٪ للسيفازولين، 80.43٪ للسيفوتاكسيم، 78.26٪ لكل من للالسيفتازيديم وسيفيبيم، 73٪ للكوتريموكسازول، 45.65٪ للجنتاميسين، 30٪ لل نايتروفيورانتين، 17٪ لكل من للاموكسيسيلين / كلافيولانك اسد وبيبراسيلين / تازوبكتام، وسيبروفلوكساسين، 8.69٪ للسيفوكسيتين، و4.34٪ لكل من الاميبينيم والميروبينيم والاميكاسين. فضلا عن ان بعض العزلات قد اظهرت مقاومة متوسطة ضد المضادات الجرثومية المدروسة. اظهرت نتائج فحص الحساسية ان هناك نسبة عالية من المقاومة تجاه المضادات الجرثومية المدروسة, خاصة تجاه مجموعة السيفالوسبورينات والمضاد الجرثومي كو - ترايموكزول , في حين كانت المضادات الجرثومية الاكثر فاعلية هي مجموعة الكاربابنيمات والمضاد الحياتي الاميكاسين. اظهرت نتائج قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف بان 39 عزلة (84.78%) من بين العزلات قد اعطت نتيجة موجبة لهذا الفحص. استعملت تقنيه تفاعل البلمره الببتيدي ((PCR للكشف عن مدى انتشار الجينات blaTEM وblaSHV وblaCTX - M بين العزلات المنتجه لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف المسؤولة عن التشفير لهذه الانزيمات. كشفت نتائج تقنية PCR بان نسب انتشار blaTEM ، blaSHV ، وblaCTX - M كانت : 66.66 ٪ (26 عزله) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 448 زوج قاعدة ، 69.23 ٪ (27عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 231 زوج قاعدة و82.05 ٪ (32 عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 551 زوج قاعدة على الترتيب. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان عدد العزلات الحاملة للجينات الثلاثة blaTEM وblaSHV وblaCTX - M سوية كانت 16 عزلة ( 34.78 ٪ ) ، في حين وجد ان عدد العزلات التي تحمل كلا من الجينين blaTEM وblaCTX - M, blaSHV وblaCTX - M وblaSHVو blaTEM سوية كانت 10 عزلات ( 21.73 ٪ ), 7 عزلات ( 51.21 ٪ ) وعزلتان( 4.34 ٪ ) على الترتيب . بينما كانت نسبة 10.86 ٪ من العزلات المدروسة حاوية على الجين blaSHV لوحده , و6.52٪ من العزلات كانت تمتلك فقط الجين .blaCTX - M لم تظهر النتائج وجود الجين blaTEM لوحده في اي من العزلات قيد الدراسة. اظهرت النتائج المستحصلة من بيانات نتائج تسلسل الناتج المضخم من تقنية PCR وجود نسبة مطابقة تراوحت مابين ( (100 - 99٪ مع الطراز الوراثي blaCTX - M - 15 ونسبة مطابقة تراوحت مابين ( 98 - 100 ) ٪ مع الطراز الوراثي blaSHV - 11. بينت نتائج هذا الاختبار سيادة الطرز الوراثية blaSHV - 11 وblaCTX - M - 15 بين عزلات بكتريا K. pneumoniae المنتجة لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف. | Forty - six Klebsiella pneumoniae isolates were isolated from some hospitals of Baghdad between November 2012 and July 2013. The isolates were obtained from various clinical specimens including : blood (23) isolates, urine (19) isolates, wounds (2)isolates, ear swab(1)isolates, and sputum(1) isolates. Antimicrobial susceptibility test was carried out towards 15 antimicrobials using Vitek 2 compact system, and the pattern of resistance was as follow : 100% for amoxicillin, 82.6% for cefazolin, 80.43% for cefotaxime, 78.26% for ceftazidime and cefepime, 73% for co - trimoxazole, 45.65% for gentamicin, 30% for nitrfurantoin, 17% for amoxicillin/clavulanic acid, pipracilli/tazobactam, and ciprofloxacin, (for each) 8.69% for cefoxitin, and 4.34% for imipenem, meropenem, and amikacin. In addition to some isolates were revealed intermediate resistance against some antimicrobials. Results of antimicrobials susceptibility tests has been revealed high percentage of resistance for antimicrobials studied, especially for cephalosporins and co - trimoxazole, while the most effective antimicrobials were carbapenems and amikacin. The results of capability of isolates to produce extended - spectrum β - lactamases (ESBLs) showed that thirty - nine of isolates (84.78%) were given positive result.ESBLs - producing K. pneumoniae (39) isolates were subjected to polymerase chain reaction (PCR) amplification technique to identify the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M genes that responsible for β - lactame expression. Results revealed the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M were : 26(66.66%) isolates with 448 bp amplified product, 27(69.23%) isolates with 231 bp amplified product, and 32(82.05%) isolates with 551 bp amplified product respectively.The results of present study were showed that presence of three genes - blaTEM,,blaSHV, and blaCTX - M together were in 16 isolates(34.78%), while combinations between blaTEM and blaCTX - M , blaSHV and blaCTX - M , and between blaTEM and blaSHV were found in 10 isolates(21.73%),7 isolates(15.21%), and 2 isolates(4.34%) respectively. While 10.86% of studied isolates contains only blaSHV gene, and 6.52% has only bla CTX - M none of studied isolates were carried blaTEM aloneThe data of the sequencing of PCR products were revealed (99 - 100) % homology with the blaCTX - M - 15 genotype and (98 - 100) % homology with the blaSHV - 11genotype. Results have been shown the dominance of blaSHV - 11 and blaCTX - M - 15 among ESBLs - producing strains.

دراسة بعض الفعاليات البايولوجية والتنميط لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة حالات مرضية Study on Some Biological Activity and Biotyping of Proteus mirabilis Isolated from Clinical Samples

اسم المؤلف: برجين امين خفاف
اسم المشرف: فاروق حسن العكيدي رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للفترة من تشرين الاول 2004 ولنهاية تشرين الاول 2005 ، تم خلالها عزل بكتريا بروتيوس من 500 عينة مرضية ومن ثلاث مستشفيات رئيسية في مدينة بغداد. تضمنت النماذج المرضية، 310 عينة ادرار و104 مسحات جروح و64 مسحات حروق و22 مسحة اذن ، والتي تم من خلال زرعها على وسطي الدم وماكونكي عزل بكتريا البروتيوس بواقع 100 عزلة من النوع Proteus mirabilis و17 عزلة من النوع Proteus vulgaris وعزلتين من النوع Proteus penneri. اخضعت عزلات النوع Proteus mirabilis (100 عزلة) والمعزولة من عينات الادرار (50 عزلة) ومسحات الجروح (30 عزلة) ومسحات الحروق (15 عزلة) ومسحات الاذن الوسطى (5 عزلة) للفحوصات الاتية : 1. فحص الحساسية لمضادات الحياة : بطريقة الاقراص اظهرت جميع العزلات مقاومة بنسبة 100% لكل من المضادات كلورامفنيكول وارثرومايسين وتتراسايكلين ، 81% لمضاد الكوتراي موكساسول و77% لحامض النالدكس، و71% للنايتروفيورانتين، و40% للريفامبسين، و39% للجنتامايسين، و32% للامكاسين ، بينما كانت 25% من العزلات مقاومة للمضاد سبروفلوكساسين.2. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لاربع مضادات هي الجنتامايسين والسبروفلوكسين والكلورامفنيكول والاميكاسين تجاه 11 عزلة مقاومة لمضادات الحياة بدرجة عالية وظهر ان التركيز المثبط الادنى لكل من المضادات سالفة الذكر هو 2 - 512، 0.5 - 16، 1 - 512، 0 - 8 مايكروغرام/مل وحسب التعاقب.3. تراوح زمن انتاج انزيم اليوريز لعزلات الدراسة من 2.5 - 6 ساعة ، عدا عزلتي ادرار استغرقتا 24 ساعة لحين ظهور النتيجة.4. ظهر ان وسط الحليب هو المفضل على وسطي الكازائين والجيلاتين في التحري عن نشاط انزيم البروتيز وبواقع 90% و78% و76% وعلى التعاقب.5. وجد ان الدم البشري من الصنف O ودم الدجاج هما الافضل استعمالا للتحري عن نشاط انزيم الهيمولايسين وبواقع 59% ، 100% لكل منهما.6. درس النشاط الهيمولايسيني بظروف بيئية مختلفة وكانت درجة الحضانة 44م ودرجة الحامضية pH - 7 واستخدام الوسط الزرعي مولير - هنتون كقاعدة للدم هي الافضل لتحديد النشاط الهيمولايسيني للعزلات.7. ضعف نشاط انزيم الهيمولايسين بعد اضافة مضادات الحياة (كلورامفنيكول وجنتامايسين والاميكاسين والسبروفلوكساسين) الى مزارع البكتريا.8. تراوحت انماط التحلل الهيمولاسيني من الاحادي الى التسعي، وكان افضل تجمع للعزلات في الانماط V وIV وVII وبواقع 33% و19% و16% على التوالي.9. ظهر ان افضل الظروف البيئية لظاهرة دنيس هي استخدام درجة حرارة حضانة 37م وpH - 7 ووسط الاكار المغذي كقاعدة للدم.10. اعطت عملية التنميط باستخدام النشاط الهيمولايسيني اعلى تجمعا للعزلات (33%) ، وكانت نتائجها مفضلة على نتائج استخدام التنميط بظاهرة دنيس (22.1%). | of October 2005, through which Proteus bacteria could be isolated from different clinical specimens (500) and from three major hospitals of Baghdad City (Al - Yarmok, Al - Kindy, Al - Karama).The specimens included 310 urine samples; 104 wound swabs; 64 burn swabs and 22 ear swabs.The specimens were cultured on blood and MacConkey’s agar it yielded a 100 isolates of Proteus mirabilis; 17 isolates of Proteus vulgaris and 2 isolates of Proteus penneri. Proteus mirabilis were isolated from urine (50 isolates); wounds (30); burns (15) and ears (5), these isolates were subjected to the following tests : 1. Antibiotics sensitivity test : all the isolates were resistant 100% towards, Chloramphenicol, Erythromycin, Tetracycline, while 81% to Co - trimoxazole, 77% to Nalidixic acid, 71% to Nitrofurantoin, 40% to Rifampicin, 39% to Gentamicin, 32% to Amikacin and 25% of the isolates were resistant to Ciprofloxacin.2. The minimum inhibition concentrations of four antibiotics (Gentamicin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, Amikacin) towards 11 isolates which were highly resistant to antibiotics revealed an MICs for the tested antibiotics ranged between 2 - 512; 0.5 - 16; 1 - 521; 0 - 8 /ml respectively.3. Except two isolates from urine that required 24 hrs for urease activity, all other isolates needed a time range between 2 - 5 to 6 hrs for the activity of this enzyme. 4. Compared to caseine and gelatin medium, milk agar medium was preferable for the detection of protease activity.5. Human blood group O and chickens blood were the most convenient to detect the haemolysin activity with the ratios 59% and 100% in accordance.6. The most favorable pH and temperature for haemolysin activity were 8 and 44C respectively, using Mueller - Hinton medium as blood agar base.7. Haemolysin activity was reduced after the addition of antibiotics (Chloranphenicol, Gentamicin, Amikacin, Ciprofloxacin) were applied in the broth culture.8. The patterns of haemolysis were ranged from type I to type IX, and the more accumulation of strains were in the types V (33%), IV (19%) and VII (16%).9. The most favorable environmental conditions for Dienese phenomena were incubation temperature at 37C, pH - 7 and using of nutrient agar as blood agar base.10. Identical strains was noticed by using haemolysin activity (33%), while using Dienese phenomena it was 22.1%.

تاثير مستخلصات قشور البرتقال على نشاط بكتريا Pseudomonas aeruginosa المقاومة للمضادات الحيوية والمعزولة من التهابات جروح الحروق وجروح ما بعد العمليات في مدينة بغداد Effect of Citrus sinensis peels extracts on the viability of antibiotics resistant Pseudomonas aeruginosa isolated from burn and post - operative wound infections in Baghdad City

اسم المؤلف: بتول عبد الامير باقر الصفار
اسم المشرف: محمد فخري احمد صفاء عبد الكريم عبد الرزاق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • تم جمع 175 مسحة من المرضى الذين يعانون من خمجات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية ,الراقدين في مستشفيات بغداد المختلفة ,والمتضمنة مستشفى الكندي التعليمي, مستشفى الكرخ العام ومستشفى بغداد التعليمي اثناء الفترة من ايلول 2008 الى كانون الثاني 2009. • زرعت المسحات على وسطي غراء الدم والماكونكي وحضنت هوائيا بحرارة 37 م لمدة 24 ساعة وشخصت العزلات منPseudomonas aeruginosa باستخدام التشخيص الكيموحيوي والفسلجي والصفات ﺍ ﻠﻤﻈهرية واكد باستخدام نظام عدة api 20E .• تشير النتائج الى 114عزلة اعطت زرع بكتيرولوجي موجب بمعدل65.14% هذه تضمنت 51 (%60 ) عزلة من 85 مسحة من اصابات جروح مابعد العمليات و63 (%70 ) عزلة من 90 مسحة من اصابات الحروق.• اجري فحص الحساسية على هذه العزلات باستعمال 10 مضادات حيوية شائعة الاستعمال من مجاميع مختلفة ,اظهرت النتائج مقاومة عالية الىCephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime وبنسبة مقاومة (100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78)% على التوالي. بينما اظهرت العزلات حساسية عالية الى المضادات Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem وبنسبة مقاومة ( 28.94, 23.68, 15.78 )% على التوالي. • اربع مستخلصات المائي الحار٬ المائي البارد ٬ الكحولي الحار والكحولي البارد طبقت لاستخلاص قشـــورالبـــرتقال. ووجدت من خلال الكشف النوعي للمستخلصات بان المستخلصات المائية الحارة والباردة لقشور البرتقال احتوت على المركبات التالية : كلايكوسيدات٬ فينولات٬ قلويدات٬ صابونيات وتانينات، بينما احتوت المستخلصات الكحولية الحارة والباردة (اضافة الى ما ذكر) على مركبات : راتنجات٬ تربينات٬ فلافونات٬ كومارينات وزيوت طيارة. • استخدمت المستخلصات لدراســـة تاثيرها على نمــو العــزلات المقاومة فقــط والمعزولة من اصابات الجروح مابعد العمليات الجراحية والحروق بطريقة الانتشار بالحفر. مستخلصات قشورالبرتقال في التراكيز) 25 ,50, 75 ,100, 200 ,300 ,400 و500 )ملغم/مل اظهرت فعالية ضد العزلات البكتيرية. • كشف التحليل الاحصائي وجود اقل فروق معنوية عند مستوى احتمالية P<0.05)) لاربع مستخلصات.• المستخلص الكحولي الحار من قشور البرتقال كان اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى ضد عزلات الجروح مابعد العمليات وجروح الحروق. المستخلص المائي البارد ياتي بالمرتبة الثانية بعد المستخلص الكحولي الحار. معدلات اقطار مناطق التثبيط لهذه المستخلصات ضد P. aeruginosa عند التركيز العالي 500 ملغم/مل كانت 22.78ملم لمستخلص الكحولي الحار، بينما كانت 71.15ملم لمستخلص المائي البارد. اما النتائج كانت متغايرة بالنسبة لتاثير مستخلصي الكحولي البارد والماء الحار وبشكل عام اظهرت تاثيرات منخفضة على العزلات البكتيرية. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل لمستخلص الكحولي الحار معدلات اقطار التثبيط تناقص الى 64.1 ملم. • اختبر تاثير التراكيز المختلفة لمستخلص الكحولي الحار على نشاط انتاج الانزيمات : اليوريز ، جيلاتينيز ، اوكسيديز والكاتاليز، اظهرت النتائج ان المستخلصات الكحولية الحارة في التراكيز (75, 100, 200) ملغم/ مل تاثيرا جدير بالملاحظة على نشاط انتاج اليوريز، يعزى ذلك الى ظهور اللون الاصفر(كنتيجة سالبة) بعد ساعتين من الاختبار. بينما عند تراكيز(25 ,50) ملغم/مل من المستخلص حصول نتيجة سالبة لانتاج اليوريز بعد الساعة الرابعة من الحضن. • المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الجيلاتينيزعند التراكيز( 50 ,75 ,100 ,200) ملغم/ مل بعد الساعة الثانية من فترة الحضن. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل اظهرت النتيجة سالبة للجيلاتينيز بعد الساعة الرابعة حضانة. المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الاوكسيديز والكاتاليز بالتراكيز(25 ,50 ,75, 100 ) ملغم/مل واظهرت نتيجة سالبة بعد الساعة الثانية من الحضن. • اظهرت نتيجة دراسات ميكانيكيات النمو بتركيز 500 ملغم \مل من المستخلص الكحولي الحار قتل كامل لعزلات اصابات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية التي يتطلب وقت حضانة بين الساعة 6 - 8 ساعة. علاوة على ذلك المستخلص بتركيز 400 ملغم/ مل تطلب القتل الكامل للعزلات 8 ساعات حضانة لكل العزلات. بينما عند التركيز( 200 ,300 ) ملغم/ مل اظهر قتل كامل على جميع الخلايا بعد مرور 24 ساعة حضانة. اما التركيز 100 ملغم/ مل اظهر معدل قتل جزئي للعزلات (حتى بعد 24 ساعة حضانة). ﺗﻡ اﯿﻀﺎ ﻤﻨﺎﻗﺷﺔ ﻮﺘﺤﻠﻴﻞ ﻤﻧﺤﺪﺮﺍﺖ اﻠﻴﺔ ﺍﻠﻧﻤﻮ ﻠﻠﺒﻜﺘﺮﻴﺎ. | Hundred and seventy five swab samples were collected from patients suffering from burns and post - operative infections who admitted to different hospitals in Baghdad for medical care, these included : Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Karkh General Hospital and Baghdad Teaching Hospital, during the periods from October 2008 to January 2009. The swabs were cultured on blood agar base and macConky's agar then incubated at 37˚C for 24hrs . Isolates of P. aeruginosa were isolated and identified using morphological, physiological and biochemical diagnosis and confirmed by api 20 E kit . The results indicated that 114 (65.14%) have given positive bacteriological cultures, this included 51(60%) isolates out of 85 swabs of post - operative wound infections, while 63(70%) isolates out of 90 swabs of burns infections. Sensitivity test was performed for these isolates using 10 commonly used antibiotics. The result indicated that a higher resistance to Cephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime whith the percentages of 100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78 % respectively , while the isolates showed a higher sensitivity to Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem with the percentages of resistance of 28.94, 23.68, 15.78 % respectively. Four extraction methods, i.e. hot water, cold water, hot alcoholic and cold alcoholic, were applied for the extraction of Citrus sinensis peels . Hot and cold watery extracts of Citrus sinensis peels contained the following compounds : Glycosides, phenols, alkaloids, saponins, and tannins. While hot and cold alcoholic extracts contained, in addition to above, resins, terpins, flavones, coumarins, and volatile oils. The extracts were used to study their effects on growth of P. aeruginosa resistant isolates of post operative wound and burn isolates by using agar diffusion method. Extracts of Citrus sinensis peels at concentrations of 500, 400, 300, 200, 100, 75, 50, 25mg/ml showed activity against bacterial isolates. The statistical analysis revealed the presence of significant differences (P<0.05) for four extracts. The hot alcoholic extract of Citrus sinensis peels were more efficient than the other extracts against post - operative wounds and burn wounds isolates. Cold water extract came next to hot alcoholic extract. The inhibition zone diameters for these extracts were 22.78mm (for hot alcoholic extract) and 15.71mm (for cold water extract). Variable results were obtained with respect to the effects of cold alcoholic extract and hot watery extract, and generally, of low effects on bacterial isolates. At a concentration of 25mg/ml of hot alcoholic extract, the rate of inhibition zone diameters decreased to 1.64mm. The effect of different concentrations of hot alcoholic extract on the activity of enzymes production of urease, gelatinase, oxidase and catalase have been tested. The results showed that hot alcoholic extracts at concentrations of 75, 100, and 200mg/ml, demonstrated an observable effect on the activity of urease production due to observation of yellow - orange color (i.e. negative result), after 2hrs . While at extract concentrations of 25 and 50mg/ml, negative urease test was obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract has inhibited gelatinase production at a concentration of 50, 75, 100, and 200mg/ml after 2hrs incubation. While at a concentration of 25mg/ml, negative gelatinase result is obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract affects the inhibition of oxidase and catalase production at concentration of 25, 50, 75, and 100mg/ml, which showed negative results after 2hrs incubation. The result of Kinetics of growth studies demonstrated that the concentration of 500mg/ml of hot alcoholic extract was enough for complete killing the isolates from burn and post - operative wound infections. Moreover, this killing required incubation time between 6 - 8 hrs . At extract concentration of 400 mg/ml a complete killing required 8hrs incubation. While for complete killing upon application of 200 and 300mg/ml of the extract required 24hrs incubation. Partial kill occurs after 24hrs when 100 mg/ml of extract was used. Analysis of the slopes of growth kinetics was also discussed.

استخدام بعض المؤثرات الفيزيائية والكيميائية في تحفيز بعض مركبات الايض الثانوي لنباتي الروجة Hypericum triquetrifolium وعنب الذيب Solanum nigrum خارج الجسم الحي Effect of some physical and chemical elicitors on some secondary metabolite induction of Hypericum triquetrifolium and Solanum nigrum In vitro

اسم المؤلف: بان منــعـم عبد الرزاق تويــج
اسم المشرف: سعدية حسن محمود كاظم محمد ابراهيم الصميدعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biotechnology Department, College of Science, Al - Nahrain University. It is aimed to increase the production of some secondary metabolites using physical and chemical elicitors in tissue cultures of Hypericum triquetrifolium L. and Solanum nigrum L. plants. The quality and quantity of phytochemicals were estimated using methanolic extracts of dried leaves and callus were analysed using HPLC. Callus was initiated on leaf discs cultured on Murashig and Skoog (MS) medium supplemented with 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) and Benzyl adinenine (BA) at concentrations of 0,0.1, 0.5, 2.0 or 5.0 mg/l for H.triquetrifolium callus initiation and Naphthalene acetic acid (NAA) at concentrations of 1.0, 2.0, 3.0, 4.0 or 5.0 mg/l and BA at 0.5, 1.0, 1.5, 2.0 or 2.5 mg/l for S.nigrum callus initiation. Results showed that the combination of 2,4 - D at 0.1 mg/l with BA at 0.5 mg/l was the most effective for callus induction percentage reached 90%. The highest mean fresh weight reached 64.33 mg for H.triquetrfolium, and the combination of NAA at 2.0 mg/l with 1.0 mg/l BA was the most effective for callus induction percentage reached 100% and the fresh weight reached 859.1 mg for S.nigrum. The same combination was used for callus maintenance for both plants. Results also showed an increase in the concentration of secondary metabolites in methanol extracts induced on leaves. Callus cultures induced on leaf discs were treated with some physical and chemical stimuli such as light, ultraviolet, jasmonic acid and salicylic acid, (2, 4, 6 or 8 mg/l jasmonic acid), or (50, 100, 150 or 200 mg/l salicylic acid), and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the uv exposure time was 10 or 20 minutes. Result showed that there are significant differences between the various treatmeant, the best concentration of jasmonic acid to stimulate and increase production was 6 mg/l in H.triquetrifolium callus cultures, and 8 mg/l for S.nigrum. Salicylic acid stimulated the production reached 150 mg/l in callus culture of H.triquetrifolium and 100 mg/l in callus culture of S.nigrum. The best light exposure time caused an increase in the production of secondary metabolism was 12 hrs light for calli in both plants. Both exposure time (10 or 20 mint) induced the yield of secondary metabolites in callus cultures of H.triquetrifolium equally. and 20 minutes for S.nigrum. It is concluded from studying the effect of chemical and physical treatments on callus of both plants. that uv increased callus fresh weight and secondary metabolites in callus cultures. The highest concentration of secondary metabolites induced incallus cultures of H.triquetrifolium were catchin (0.14708 mg/g), hypersoid (0.09825 mg/g), hypericin (0.84623 mg/g), pseudohypericin (0.13707 mg/g), hyperforin (0.85525 mg/g) and prenylated phlorglucin (0.11275 mg/g), the highest fresh weight for callus 61.67 mg. S.nigrum callus cultures produced ascorbic acid (0.14721 mg/g), α - solanine (0.2294 mg/g), solasodin (4.3689 mg/g), solanidin (1.4854 mg/g), β - solamargine (5.9896 mg/g), α - solamargin (1.5509 mg/g), solasonine (1.3048 mg/g) and demission (2.031 mg/g). Additionaly, it yielded the highest callus fresh weight reached 849.20 mg.

The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori

اسم المؤلف: ايمان عبد الجبار محمد العاني
اسم المشرف: Nazar E. Naser Abdul Wahab Al - Shaikhly
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتوضيح تاثير الشذوذ المناعي حول الكشف السريري لدى مرضى مصابون بقرحة المعدة والاثني عشري في بغداد, بالاضافة الى تهيئة معالم اوضح لدور الانترلوكين - 8 في الامراضية المناعية عند هؤلاء المرضى والتي سببها بكتريا Helicobacter pylori. كذلك شملت الدراسة استخدام مختلف الفحوصات المناعية والبكتريولوجية في الكشف عن وجود بكتريا H.pylori المسببة لمرض قرحة المعدة والاثنى عشري . تم شمول (48) مريضا (31 من الذكور و17 من الاناث) وباعمار تراوحت ما بين ال30 - 50 سنة مصابين بمرض قرحة المعدة والاثني عشري ومجموعة من الافراد الاصحاء كمجموعة سيطرة ملونة من 62 شخصا منهم( 26 من الذكور و36 من الاناث ) باستخدام طرائق تحري بكتريولوجية شائعة وحديثة , مناعية وتشريح انسجة مرضية للتحري عن وجود الاصابة ببكتريا Helicobacter pylori.اعتمد التشخيص النهائي على ايجابية اي من الاوساط الثلاثة او بمصاحبة فحص اليورييز الايجابي وفحص النسيج المرضي, اذ اثبتت النتائج ان من بين اوساط الزرع الثلاثة المختلفة , كان HP agar هو الوسط الاكفا في عزل البكتريا H.pylori عندما حقق على معدل عزل قياسا بكل من وسطي اكار خلاصة الدماغ / القلب واكار كولومبيا ( 79.2% , 35.4% , 25% على التوالي). اظهر تقدير اداء الاختبارات المصلية في التنبؤ بالاصابة ببكترياH.pylori لدى مرضى قرحة المعدة والاثني عشري وتمييزهم عن مجموعة الاصحاء , ان تحديد وجود H.pylori specific IgG باتباع طرائق حديثة مختلفة قد يحسن من عملية التنبوء بالاصابة بالبكتريا اكثر من علاقتها بمرض قرحة المعدة والاثني عشري نفسه.كما وتضمنت الدراسة اتباع طريقتين لتشخيص وجود مضادات H.pylori specific IgG حيث اظهرت النتائج ان طريقة الاليزا (ELISA) اعطت معدل ايجابية اعلى لدى مجموعة المرضى مقارنة بطريقة miniVidas (95.8% , 89,6% على التوالي). ومن الجدير بالملاحظة ان مجموعة السيطرة H.pylori specific IgG بلغت نسبة ( 42.2% او 46.8% عند القياس بطريقة miniVidas او ELISA على التوالي). لم تظهر فوارق معنوية لمستوى وسط H.pylori specific IgG عند قياسه بالطريقتين , اية فروق معنوية بشكل واضح بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة , في حين ظهرت فروق معنوية بين وجود من عدم وجود H.pylori في مجموعة المرضى باستخدام طريقة miniVidas فقط ) وسط الزرع =3 ng/ ملي لتر و1.15 ng / ملي لتر على التوالي). لم يكن كلا من فحص H.pylori specific IgG واختبارات ال Helicogen ذات كفاءة جيدة في التنبؤ بمرض قرحة المعدة والاثني عشر للتفريق بين مجموعتي المرضى والاصحاء , اذ كان الPPV قريبا جدا من احتمال وجود المرض دون اجراء اي اختبار. ومن جهة اخرى فان اجراء الفحص السيرولوجي في التنبؤ بالاصابة ببكتريا H.pylori لدى المرضى المصابين بقرحة المعدة والاثني عشري اظهر بان طريقة اليزا قد تعتبر فحصا حساسا جدا (درجة الحساسية 100%) في التحري عن وجود H.Pylori التي نتج عنها PPV , NPVتاما لدى 87%. كما وتم الحصول على اعلى محدودية للاختبار الايجابي ( 97.5%) باتباع طريقة miniVidas رغم ان حساسية الاختبار كانت اقل بقليل من طريقة ELISA (97.5%). واستنادا الى النتائج فان H.pylori specific IgG الذي تم تقديره بطريقةminiVidas كان افضل خيار للتميز بين H.pylori السالبة والموجبة حيث اظهر القياس نسبة حساسية عالية وPPV تتجاوز 90.7% والتي كانت مساوية لمعيار النفاذ الذي تم الحصول علية باستخدام الطريقتين. اثبتت الدراسة الحالية وجود فوارق معنوية في المستوى الكلي لمصل IgG بين المجموعات الموجبة والسالبة لدى المصابين ببكتريا H.pylori (المتوسط الحسابي 1531.2 ملي غرام/ملي لتر و917.7 ملي غرام/ملي لتر على التوالي ) في حين لم تظهر فروقات معنوية تتعلق ب IgM, IgA, C3 & C4 بين هاتين المجموعتين. ومن ناحية اخرى تميز IgG وC4 لدى المقارنة بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة (المتوسط الحسابي ل IgG كان مساويا الى 1397 ملي غرام / ملي لتر و1067.4 ملي غرام / ملي لتر والمتوسط الحسابي لC4 كان 49.8 ملي غرام / ملي لتر و29 ملي غرام / ملي لتر على التوالي). تشير البيانات المستخرجة من الدراسة الى ان مستوى IL - 8 في مرض التهاب المعدة لم يكن يعتمد على الاصابة ببكتريا H.pylori ولكن زيادة ال IL - 8 في مستوى المصل بين حالات الاصابة بقرحة المعدة والاثني عشري قد تعزى الى التهاب النسيج الذي يصاحب المرض ما دام هناك فارق معنوي بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة, في حين لم تكن تلاحظ اية فروق معنوية بين المجموعات الموجبة والسالبة لبكتريا H.pylori . وقد تكون لهذه النتائج مضامين هامة للتوصل الى تبصر اعمق في تفهم اليات البكتريا المسببة للمرض فيما يتعلق بالاستجابة المناعية ضد الاصابة ببكتريا H.pylori | This study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of peptic ulcer among Iraqi patients, in addition to provide further insights into the role of some interleukins in immunopathogenesis of patients with peptic ulcer disease induced by Helicobacter pylori. The study also included various immunological and bacteriological investigations in detecting the presence of H. pylori associated with peptic ulcer disease.Forty eight (31 males and 17 females) patients suffering from peptic ulcer, and sixty two (26 males and 36 females) apparently healthy individuals (as control) , were subjected to different recent and common bacteriological, immunological and histopathological evaluations regarding the ages of the patients and healthy individuals included between 30 - 50 years which were done for detecting Helicobacter pylori infection.Final diagnosis was completely established when any of the three culture media showed the evidence or a combination of positive urease test and histological evidence. The results documented that among different types of cultures media, Helicobacter pylori agar was the most superior medium for the recovery of H. pylori 79.2 %, which provided the highest isolation rate compared with Brain Heart Infusion agar and Colombia agar (35.4 %, and 25 % respectively).Assessing the performance of serology in predicting H. pylori infection associating with peptic ulcer patients and / or distinguishing them from healthy controls, demonstrated that determination of H. pylori specific IgG using recent different methods may improve predicting the infection of H. pylori rather than relating to peptic ulcer disease itself.In the present study, two methods were used for detecting presence of H. pylori specific IgG antibodies. The results showed that ELISA method gave a higher cases positivity rate compared to miniVidas method (95.8%, 89.6% ,respectively) .It is worth noting that a good proportion of healthy controls had positive H. pylori specific IgG (45.2 % or 46.8 % measured by miniVidas or ELISA method respectively). The medium level of H.pylori specific IgG measured by both methods did not significantly differ between patients and control groups, while the differences observed for the presence of H. pylori compared with its absence among cases were statistically significant only by using the miniVidas method (Medium = 3 ng/ml, and 1.15 ng/ml respectively). The present study showed that both H. pylori specific IgG antibodies test and Helicogen tests were not so useful in predicting peptic ulcer disease distinguishing them from healthy control since the PPV was nearly close to the prior probability of having the disease without doing any test. On the other hand, assessing the performance of serology in predicting H.pylori infection in patients with peptic ulcer disease demonstrated that ELISA method would be a very sensitive test (sensitivity = 100 %) in detecting the presence of H. pylori, that resulted in a complete NPV and PPV of 87%.The highest specificity of positive test (97.5%) was obtained by using miniVidas method. Its sensitivity, however, was slightly lower than ELISA method (97.5 %). According to the results, H. pylori specific IgG measured by miniVidas method seems to be the best choice to differentiate between positivity and negativity of H. pylori since it offered a high sensitivity and a PPV exceeding 90.7% which was equal to the validity of parameter obtained by using both methods. The present study documented a significant variation in total serum IgG level between positive and negative groups of H. pylori infection,(mean 1531.2 mg/ml and 917.7 mg/ml ,respectively), while no significant variations were reported in IgM, IgA, C3 and C4 between these two groups. On the other hand, only IgG and C4 varied significantly regarding cases and control groups (mean of IgG = 1397 mg/ml and 1067.4 mg/ml, mean of C4= 49.8 mg/ml and 29 mg/ml, respectively). Data from the study indicated that IL - 8 level in gastritis was independent of H. pylori infection, but one would attribute the increase in IL - 8 serum level among cases with peptic ulcer to the tissue inflammation related to the disease since there was a significant variation between cases and controls, while no differences were observed between positive and negative groups of H. pylori infection. These findings might be of important implications for having further insights into understanding the pathogenic mechanisms of bacteria in relation with immunologic response against H. pylori infection.

دراسة جوانب من الاستجابة المناعية لاصابات الكلية عند الاطفال A study of some immunological aspects in children with renal disease

اسم المؤلف: ايمان عباس محسن
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي سيناء مهدي شاكر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نفذت هذه الدراسة بين 17 - 12 - 2008 و25 - 8 - 2009 وشملت 62 طفلا مريضا في المدى العمري (1 - 12) سنة ومن كلا الجنسين : 26 طفلا مصابا بالفشل الكلوي المزمن و36 طفلا مصابا بالمتلازمة الكلائية، وكان المرضى خارجيين وراقدين في وحدة غسل الكلية في كل من مستشفى المنصور التعليمي للاطفال ومستشفى الطفل التعليمي المركزي وشملت المجموعة الضابطة 26 طفلا. جمعت عينات الدم من المرضى والاصحاء واجريت الفحوص المناعية وهي قياس مستويات كلا من انترلوكين - 6 والاريثروبيوتين وفق تقنية مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم ((ELISA. اما الاختبارات الكيميائية الحيوية فقد تضمنت قياس نسبة اليوريا والكرياتنين في المصل لتقييم الوظيفة الكلوية. شملت السمات الدموية قياس حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم للتحري عن وجود فقر الدم. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى انترلوكين - 6 (0.001>P) ونقصانا معنويا في مستوى الاريثروبيوتين(0.001>P) وزيادة معنوية في يوريا وكرياتنين المصل(0.001>P) ونقصانا معنويا في كل من حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم (0.001>P)في كلتا المجموعتين المرضيتين بالمقارنة مع المجموعة الضابطة. جمعت عينات الادرار من مجاميع المرضى والاصحاء واجري لها الفحص العام (بغض النظر عن نوع المرض الكلوي) بعد زرع النماذج على وسطي اغار ماكونكي واغار الدم . اظهرت نتائج الفحص العام للادرار ان وجود القوالب في ادرار المرضى لم يكن معنويا (الاحتمالية=0.056)، بينما كان وجود بروتين الالبومين في ادرار المرضى معنويا (الاحتمالية=0.049). وجدت نتائج زرع الادرار السالبة في 64.5% من كلتا المجموعتين المرضيتين٬ كذلك كانت نتائج زرع الادرار سالبة في المجموعة الضابطة. اما نتائج زرع الادرار الموجبة في المرضى (35.3%) فكانت تشير الى وجود التهاب السبيل البولي مع علاقة معنوية بنوع المرض الكلوي (الاحتمالية= 0.042). لقد اظهر التهاب السبيل البولي علاقة معنوية مع الجنس (الاحتمالية= 0.044). تضمن النمو الجرثومي الانواع التالية : E. coli (54.55%) وPseudomonas aeruginosa (22.73%) وKlebsiella pneumoniae (9.09%) وProteus mirabilis (9.09%) وعزلة واحدة فقط من Morganella morganii (4.55%). اختلفت العزلات البكتيرية في حساسيتها للمضادات الحياتية والتي اشتملت على السفترياكزون والسفتازديم والجنتامايسين وحامض الناليدكسك والتراي ميثوبريم والنايتروفيورانتين. | This study was carried out between December 17, 2008 and August 25, 2009. It included 62 pediatric patients at the age range (1 - 12) years of both genders : 26 with chronic renal failure (CRF) and 36 with nephrotic syndrome (NS), who were outpatients and in - patients in the dialysis unit in both Al - Mansour pediatric teaching hospital and Child's central teaching hospital. The control group consisted of 26 children. Blood samples were collected from patients and controls. Immunological tests of interleukin - 6 (IL - 6) and erythropoietin (Epo) measurement were done by using ELISA technique. Biochemical tests, including blood urea and serum creatinine, were applied to evaluate renal function. Hematological aspects referred to anemia presence or not; by measuring PCV and Hb. The results explained significant increase in serum IL - 6 levels (P<0.001), significant decrease in serum Epo levels (P<0.001), significant increase in both urea and creatinine concentrations (P<0.001) in serum and significant decrease in both PCV and Hb (P<0.001) in NS and CRF patients in comparison with the control group. Urine samples were collected from children with both renal diseases and healthy controls. After culturing the samples on both MacConkey agar medium and blood agar medium, general urine examination (GUE) was applied regardless the type of the renal disease. GUE of both CRF and NS patients showed that casts presence in urine was not significant (p=0.056), while albuminuria was significant (P=0.049). The negative urine cultures were present in 64.5% of both patients' groups. The control group showed no bacteria in urine. The positive cultures in patients (35.5%) were indicating UTIs with a significant relation with the type of renal disease (P=0.042). UTIs seemed to be related with gender (P=0.044). The bacterial growth included the following isolates : E. coli (54.55%), Pseudomonas aeruginosa (22.73%), Klebsiella pneumoniae (9.09%), Proteus mirabilis (9.09%) and Morganella morganii in one case only (4.55%). The bacterial isolates were different in their sensitivity to antibiotics, which included Ceftazidime, Cefteriaxone, Gentamycin, Nalidixic acid, Nitrofurantoin and Trimethoprime).

التحليل لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من مصادر التليف الحوصلي وغير التليف الحوصلي

اسم المؤلف: ايمان ثامر جار الله
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study concerned with illustration the molecular pattern of virulence genes in P. aeruginosa isolated from cystic fibrosis (CF) and compared them with those of none CF isolates (different nosocomial infections). The study involves the following steps : · Twenty - six isolates of P. aeruginosa were obtained from patients submitted to Baghdad hospitals/Iraq during the period between July 2013 until December 2013. These isolates were distributed as 6 isolates from blood, 4 isolates from urinary tract infections andsputum (for each), 3 isolates from wounds and ear infections (for each), 2 isolates from bronchial wash of patients suffering respiratory tract infection beside 4 isolates from cystic fibrosis patients. · The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar and P. aeruginosa agar then diagnosed by performing some morphological and biochemical tests. The second diagnoses was done by api 20NE system followed by Genotypic diagnoses usingpolymerase chain reaction (PCR) depending on a housekeeping gene rpsl gene (amplified size was 201bp). The results revealed that all the 26 isolates were P. aeruginosa.· Genotypic detection of many virulence factors related to P. aeruginosa was performed using conventional PCR. They included : gene coded for exoenzyme S (exoS, 504bp), exotoxin A (toxA, 352bp), two phospholipases C encoded by (plcH, 307bp) and (plcN,466bp), alginate (algD, 1310bp), (lasB, 300bp), putative silidase (Pseudoaminidase, 1500bp) and Neuraminidase (nan1, 1316bp). · The results revealed that the most frequently gene was exoS when it was detected in 21/26 (80.7%) and distributed between 19 in different clinical source and 4 in CF samples. For toxA the rate was 19/26 (73%) and all CF isolates were positive to this gene as with exoS. The percentage of other genes were, plcH 13/26 (50%), plcN 18/26 (69.2%), algD17/26 (65.3%) {All CF isolates were positive}. For lasB gene it was detected in 8/26 (30.7%), sialidase (Pseudoaminidase) in 4/26 (15.38%) isolate, one of source was CF and the others distributed between bronchial wash and ear infections. The last gene was nan1 and only one CF isolate 1/26 (3.8%) harbored this gene.· DNA sequencing and phylogenic analysis for exoS, toxA, plcH, algD, nan1 and sialidase (Pseudoaminidase) genes were done using Pairwise alignment and Tamura - Nei genetic destine model, UPGMA (Un weighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) tree build, respectively. Results of DNA sequencing for exoS and toxA genes revealed that most isolates display different point mutation as compared with the NCBI data. Point mutation type transversion was detected in residue no. 17 base 52 in P. aeruginosa exoSBW1 isolated from bronchial wash causes alteration of Thyamine to Adenine and conversion of Leucine residue to Glutamine. Another point mutation type transition occured in exoSB1, exoSU1 and exoSCyF1 in residue no. 18 base 55 when Guanine converted to Adenine cause conversion of Serine residue to Asparagine. P. aeruginosa exoSB3 and exoS CyF2 isolated from blood and cystic fibrosis, respectively, showed high similarity made them segregate within the same group or clone, while exoSU2 and U3 were within the same clone but neither with exoS U1 nor U4. · Another point mutation was detected in P. aeruginosa toxA CyF2, when nitrogen base Guanine no. 36 residue 12 was changed to Adenine causes conversion of Arginine to Histidin. Also mutation occur in toxA - CyF1, 2, 3, 4, toxA U1, 2, 3, 4 and toxA BI, BW1 whennitrogen base Adenine no. 132 residue 44 was converted to Guanine causes the conversion of Threonine to Alanine. Such difference may explain the diversity of virulence in some isolates.· DNA analysis for plcH was performed to amplified fragment related to CyF3. The identity of Pairwise alignment with the origin gene related to NCBI was 100% and no mutation was detected. · For algD, result revealed that a point mutations were detected in many residuse but the interest finding is that all of these mutations were silent specially in CyF2, since it didn’t change amino acid sequence, while the mutation that was delectated in P. aeruginosa algD Ear1 causes alteration in amino acid sequence when nitrogen base Guanine no. 388 residue 130 was converted to Adenine thus the conversion of Glycine to serine. The percentage of Pairwise identity was 95.4% which represent the percentage of identical residues in the alignment including gap and non gap residues .· For nan1 gene, many mutations were noticed in this amplified fragment but some of them were silent while others were defective cause alteration in frame translation in many residues. · DNA sequence for silidase (Pseudoaminidase) gene related to P. aeruginosa CyF3 and Pairwise alignment for this gene was performed (forward and reverse sequences data). The data was compared with control obtained from NCBI gene bank. The identity was 82% with some gaps occur in identity due to differences in base pair sequence as a result from changing some nitrogen bases. Most of these mutation were silent mutation after translated to amino acid. Others were not.· From all above results, it could be said that some isolates displayed highly virulence pattern specially in CF isolates as compared with non - CF isolates. P. aeruginosa was unique in harboring all the detected virulence genes and most of them were mutant.

دراسة تجريبية على زراعة الخلايا الجذعية الجنينية للبائن في الاوساط الزرعية EXPERIMENTAL STUDY ON CULTURE OF MAMMALIAN EMBRYONIC STEM CELLS

اسم المؤلف: انتصار نعمان وحيد العزاوي
اسم المشرف: محمود حياوي حماش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2003
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم في هذه الدراسة انجاز طريقة ناجحة لزراعة الخلايا الجذعية الجنينية (Embryonic stem cells) بالاعتماد على موارد محدودة ومتوفرة وباستعمال تقنية زرع بسيطة. طريقتنا هذه تجيز باشتقاق الخلايا الجذعية الجنينية من كتلة الخلايا الداخلية (Inner cell mass) لاريمة (Blastocyst ) الفار من سلالة (Balb - C)المزروعة خارج الجسم الحي وذلك بدون الحاجة الى استئصال المبيض، او استخدام الجراحة المناعية لكتلة الخلايا الداخلية ، او استخدام الوسط الزرعي المكيف، او اضافة العامل المثبط للتمايز (العامل المثبط للوكيميا) ، لكن تمت فقط زراعة واستنبات الاريمة بوجود الطبقة المغذية(Feeder layer) المثبطة الانقسام ( الخلايا الجنينية الليفية المعاملة بمادة ميتومايسين (C) (10 مايكروغرام/ امل ( 2 ساعة) لتثبيط انقسام الخلايا المغذية وتوقف توالدها ).و الطبقة المغذية اساسية وضرورية لدعم نمو وديمومة استمرار حالة عدم التمايز في الخلايا الجذعية الجنينية، حيث في حالة نمو هذه الخلايا بدون وجود الطبقة المغذية يحدث التمايز مباشرة في الخلايا الملتصقة بالركيزة. ان وجود هذه الطبقات المغذية مع الدقة في عملية الزرع وبوجود وسط زرعي عالي النقاوة مع مصل يؤثر على ادامة النمط الظاهري الجنيني للخلايا المزروعة، بصورة خاصة في المحافظة على قابلية تمايز عالية.تبقى هذه الخلايا الجذعية الجنينية محافظة على حالة عدم التمايز خلال عمليات الزرع الثانوية المتواصلة ولعدة اشهر ، مع استمرارية اظهارها للمواد السطحية المعلمة للخلية ( الفوسفاتاز القاعدي ). تكون الخلايا الجذعية الجنينية التي لها القدرة على تكوين اي خلية او نسيج من الجسم ، صغيرة الحجم لها نواة كبيرة وسايتوبلازم قليل، والنواة حاوية على واحد او اكثر من التراكيب النوية الغامقة والواضحة، وتتجمع هذه الخلايا خلال المراحل المبكرة من عمليات الزرع الثانوي وتلتصق مع بعضها باحكام مكونة مجاميع صغيرة ، حيث من الصعوبة تمييز المكونات المفردة للخلايا ، في حين تكون في المراحل المتاخرة من عمليات الزرع الثانوي على شكل مستعمرات منبسطة ومنتشرة ، لكن الخلايا لا تزال ملتصقة مع بعضها البعض ، مما يتعذر رؤية وتميز الخلايا المفردة . هذا النمط من النمو هو صفة مميزة للخلايا الجذعية بالرغم من ان المستعمرات قد تظهر بشكل قليل الانتظام. ان زرع الخلايا الجذعية الجنينية لا بد ان يكون بكثافة عالية نسبيا وذلك لضمان الحصول على معدل نمو عالي ولاجل الحد من حدوث التمايز التلقائي للخلايا. ان ابناء مثل هذه الخلايا المفيدة التي لها صفتان مميزتان اساسيتان ، الاولى : - هي التغلب على الالية الداخلية التي تحد من مضاعفة ( استنساخ) الخلايا. الثانية : - تبقى قابلية هذه الخلايا ولمختلف مراحل عمليات الزرع الثانوية على اظهار النمط الظاهري لمجاميع خلايا الاسلاف التي انحدرت او انشقت منها مستقرة ، هذا يعني امتلاك القدرة التي تسبب التمايز الى انواع الخلايا المنحدرة من الطبقات الجرثومية الاولية للجنين، (الادمة الباطنةendoderm ، الطبقة المتوسطة mesoderm، والادمة الخارجيةectoderm ) كل هذا يجعل الخلايا الجذعية الجنينية فريدة النوع وهذه القابلية تعرف بالامكانية المتعددة ( pluripotency).تكون انواع الخلايا التي تظهر بعد استنبات الاريمة لمدة طويلة بوجود الطبقة المغذية وبدون زرع ثانوي كما ياتي : - - خلايا الارومة الاغتذائية - الخلايا الليفية - خلايا الادمة الباطنة - تراكيب شبيهة بالانبوبية - وخلايا شبيهة بالعصبية. تم استخدام المجهر الاليكتروني الماسح والمجهر المقلوب لدراسة الاحداث المورفوجينية التي تحدث خلال نمو اريمة الفار وتطور نمو المرحلة المبكرة لاسطوانة البيضة خارج الجسم الحي . فبعد تحرر الاريمة من الطبقة الشفافةZona pellucida والتصاقها بالركيزة التي تغطي سطح وعاء الزرع، فان جوف الاريمة يبدا بالانكماش اثناء انتشار وهجرة الارومة الاغتذائية الجدارية الى الخارج. في هذه المرحلة تكون كتلة الخلايا الداخلية مغطاة بخلايا الادمة الباطنة من جهة جوف الاريمة ، وبخلايا الارومة الاغتذائية القطبية من الجانب الوسطي. تكون كتلة الخلايا الداخلية عند نموها خارج الجسم الحي محاطة كليا بخلايا الادمة الباطنة بينما عند نموها داخل الجسم الحي فان خلايا الادمة الباطنة تكون فقط في الجانب المعرض لسائل جوف الاريمة . وبسبب تكاثر خلايا الارومة الباطنة التي تغطي كتلة الخلايا الداخلة، وبوجود الركيزة وقلة الحيز بسبب جوف الاريمة المنكمش فان كتلة الخلايا الداخلية طبيعيا يحد من الامتداد نحو الاسفل ، لذا فهي تهاجر وتبرز الى الاعلى الى الوسط الزرعي من خلال شق يحدث بين الارومة الاغتذائية الجدارية والقطبية. تستمر خلايا الارومة الاغتذائية القطبية المواجهة لقاعدة اسطوانة البيضةegg - cylinder في تكاثرها مكونة المخروط المشيمي الخارجيectoplacental cone . وحتى هذه المرحلة فان اسطوانة البيضة التي ينقصها حاجز الارومة الاغتذائية تقوم بعكس نمط نموها من اتجاه سطح وعاء الزرع الى موقع اعلى وبارز. ان نمو اسطوانة البيضة خارج الجسم الحي من كتلة الخلايا الداخلية وخلايا الارومة الاغتذائية القطبية مطابق كليا لما يحدث عند النمو داخل الجسم الحي . وقد حصل في هذه الدراسة نمو لتوام الزيجة خارج الجسم الحي من اريمة الفار ، قبل الالتصاق بسطح وعاء الزرع . حيث تبدا كتلة الخلايا الداخلية داخل غشاء الطبقة الشفافة بالتكاثر في جزئين وبعدها تنقسم الى قسمين ، وكل قسم من هذه الاقسام يكون حاويا خلايا ذات الفعالية الكامنة . بعد تحرر والتصاق الاريمة على الركيزة ينتج تكون اسطوانتي بيضة يتشاركان بمخروط مشيمي خارجي واحد. بصورة عامة عند تكون اسطوانات البيضة، يجد انها تشتمل على الادمة الخارجية في الداخل والادمة الباطنة في الخارج . ان الادمة الخارجية تلعب دورا مهم في النمو اللاحق للجنين داخل الجسم الحي ، حيث هذه الطبقة، هي سلف للطبقات الجنينية الاولية،( الادمة الباطنة، الطبقة المتوسطة، الادمة الخارجية ) وهذه الطبقات جميعها تكون مصدر لكل انسجة الجسم البالغ . ان زرع الخلايا الجذعية الجنينية التي تم الحصول عليها في هذه الدراسة هو مشتق من كتلة الخلايا الداخلية بعد سبعة ايام من الزرع ، وكذلك من كتلتي الخلايا الداخلية لاريمة تؤام الزيجة . ان قدرة الخلايا الجذعية الجنينية على تحوير نموها وتمايزها لتكوين مختلف خلايا وانسجة الجسم البالغ تتضح من قابليتها على التمايز التلقائي خارج الجسم الحي بواسطة تكتلها او تجمعها، وذلك من خلال 2 - 3 يوم من الزرع المعلق لهذه الخلايا، والتي تكون الاجسام الجنينية والتي تشتمل على الادمة الباطنة والصفيحة القاعدية والادمة الخارجية، ان هذه الاجسام مشابهة للاجنة في مرحلة اسطوانة البيضة. وبعد خمسة ايام من الزرع المعلق يظهر في بعض الاجسام الجنينية الكبيرة وجود الهيموكلوبين الجنيني في مجاميع الخلايا الدموية المحاطة بطبقتين في الادمة الباطنة بما يشبه الكيس المحي الحشوي لجنين ما بعد الغرس. استحوذ موضوع الحصول على خلايا جذعية جنينية متعددة الفعالية وكاملة الامكانية، من المراحل المبكرة لاجنة اللبائن على اهتمام مختلف الاوساط ووسائل الاعلام وذلك للاسباب التالية : - 1) الاستنبات الناجح للخلايا الجذعية الجنينية خارج الجسم الحي، امكانيتها غير محدودة على التكاثر غير المتمايز خارج الجسم الحي. 2) الامكانية الطبية باستخدام هذه الخلايا في معالجة تعويض الانسجة ، وقد تم هنا استخدام الخلايا الجذعية الجنينية المشتقة من الفئران كنموذج حيواني مناسب | A successful method of culturing embryonic stem (ES) cells have been achieved in this study depending on the limited available resources and by a simple culture technique .This method permits ES cells culture to be derived in vitro from the inner cell mass ( ICM) of explanted mouse blastocysts of strain : Balb - C without the use of ovariectomy; immunosurgery of the ICM, conditioned medium and differentiation inhibitory factor (DIF)\Leukaemia inhibitory factor (LIF), but only cultivation of blastocysts in the presence of mitotically inactivated feeder layer [ embryonic fibroblast cells treated with mitomycin - C, 10 g\ ml (2hr) for inactivated feeder cells and arrest their proliferation]. The feeder layer are necessary and essential to support the growth and maintenance of undifferentiated state of ES cells, when these cells are grown without feeder layer, immediate differentiation takes place in the substrate attached cells. These feeder layers together with careful culture in high quality medium and serum acts to prolong the embryonic phenotype of the cell culture, specifically in terms of maintaining a high differentiation ability.These ES cells remains both undifferentiated in continuos passage for several months and expresses the cell surface marker ( Alkaline phosphatase) for different passages . Pluripotential ES cells are typically small, have a large nucleus and minimal cytoplasm, and the nuclei contain one or more prominent dark nucleoli structures. The cells in early passages pack tightly together in small nests in which it is difficult to discren the individual component cells, while in latter passages these ES cells colony are spread and flattened and the constituent cells also adhere tightly to one another, making it difficult to see individual cells. This growth pattern is characteristic of stem cells, although colonies may appear less regularly shaped. The ES cell culture should be maintained a relatively high densities to ensure maximal growth rate in order to minimize spontaneous differentiation. Establishment of such useful cells has two basic characteristics. First, the endogenous machinery that limits cell replication is overcomed. Second, these cells for different passage is stable express the phenotype of the population of progenitors from which it was derived, that’s mean, the ability to give rise to differentiated cell types that are derived from all primary germ layers of the embryo, endoderm , mesoderm, and ectoderm - is what make ES cell unique, and this ability is known as a "pluripotency".Differentiated cell types which appeared after prolonged cultivation of blastocyst on feeder layer without passage are trophoblast cells, fibroblast cells; endodermal cells; tubular - like structures; neuron - like cells.Correlative scanning electron, and inverted microscopy were utilized to study the morphogenic events occurring during mouse blastocyst outgrowth and early –egg - cylinders development in vitro. After hatching from Zona pellucida ( Z.P.) and attachment of blastocysts on the substrate coated plate surface, the blastocoelics cavity collapses as the mural trophoblasts spread and migrate outward . The inner cell mass is covered with a differentiated endoderm on the blastocoelic cavity side and by the polar trophoblasts on the medium side at this stage . The inner cell mass in vitro becomes completely surrounded with endodermal cells while the endoderm develops in vivo only on the side exposed to blastocoelic fluid . As the endoderm covered inner cell mass proliferates , being physically restricted from further downward expansion by the substrate and by the lack of space in the collapsed blastocoelic cavity , it migrates upward and protrudes into the culture medium in a break between the polar and mural trophoblast cells . Polar trophoblast cells apposed to the base of the egg cylinder continue to proliferate forming the ectoplacental cone. Thus , the early egg cylinder lacking a trophoblast barrier beings inverting its growth pattern from towards the culture plate surface to amore upright position. Egg - cylinder development in vitro from the inner cell mass and polar trophoblast cells closely paralleled in vivo. Monozygotic twins developed in vitro from (murine) mouse blastocysts, before attachment to culture plate surface. The inner cell mass became proliferated into two parts and then subdivided in side the Z.P., and each subdivision apparently incorporated totipotent cells. After hatching and attachment of this blastocyst on the substrate, resulting in the formation of two egg - cylinders sharing the same ectoplancental cone. In general, as the egg - cylindars was formed, it was found to compose of ectoderm to the inside and endoderm on the outside. In vivo the primitive ectoderm plays a pivotal role in the further development of the embryo, since that it is the progenital of three primary embryonic layers, the ectoderm, mesoderm and endoderm, which collectively are the source of all tissue of the adult body. Our ES cell culture was derived from the ICM of seven days culture and from the two ICMs of the blastocyst - derived monozygotic twin. The pluripotency of ES cells demonstrate their ability to spontaneously differentiate in vitro via aggregation, that from 2 - 3 day of suspension culture in non - adhesive dish the cells form embryoid bodies (EBs) with endoderm, basal lamina and ectoderm. They are morphologically similar to embryos of the egg - cylinder stage. From 5 days of culture some of EBs expand into large cystic structures containing embryonic haemoglobin’s of blood islend cells surrounded by two endothelial layers, this result suggest the identification of cystic EB as visceral yolk sac, of the postimplantation embryo. Pluripotent ES cells are derived from totipotent cells of early mammalian embryo are currently in the news for three reasons : the successful cultivation of ES cells in vitro; their capability of unlimited, undifferentiated proliferation in vitro and the potential medical use of these cells for tissue replacement therapy, in this work ,mice ES cells were used as suitable animal model.Self - renewing, totipotent - pluripotent ES cells may provide a virtually unlimited donor source for transplantation. A protocol that permits the in vitro generation of neural precursors from ES cells was devised. This study described conditions to induce differentiation of ES cells reliably and at high efficiency into neural pathway. A prerequisite is to treat early developing ES cell derived aggregates and simple EBs with mouse embryonic brain extract for a precise period of time. Embryonic brain extract here circumvent the need of growth factors. In vitro, treatment with brain extract resulted in the subsequent appearance of neural - like cells after subcultured treated cells. In vivo after dissociation of these cells into a single cell suspension they were stereotaxically transplanted into the brain of recipient adult mice. Results show that ES cell derived neural precursors interact with host tissue and migrated for variable distances of different region of the brain after replace damaged cells at the site of transplantation. Thus, brain extract serves here as a crude source of neurotrophic factors for the induction of ES cells to neuronal pathway, in which ES cells can serve as a valuable source of cell type - specific somatic precursors for neural transplantation.HRP - histochemical marker was introduced into culture medium for marking ES cells in vitro and in vivo to allowed for precise determination of the fate of the transplanted ES cells and their proliferation, migration and differentiation in side the brain. Evaluation of long - term experiments showed viable grafts with a stable HRP - marker expression and proved no signs of tumour growth or non - neural tissue in the transplant recipients

التغيرات الفسلجية المرضية للجهاز المناعي في مرضى سرطان الثدي عند النساء Physiological changes In immune system in female breast cancer

اسم المؤلف: امين احمد احمد ثابت
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي هيثم عزت باقر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2004
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هذه الدراسة تبحث في تغيرات الفسلجة المرضية للجهاز المناعي عند الاناث المصابات بسرطان الثدي الخبيث اللاتي شخص حديثا بهن المرض ولم يتعاطين العلاج بعد اللائي ترددن على مستشفى السرطان والطب النووي في بغداد ومختبرات الصحة العامة المركزي . وقد تضمنت هذه الدراسة عدد (80) امراة , حيث كانت هناك ( 4 ) حالات فقط في المرحلة الاولى من المرضى , (32) حالة في المرحلة الثانية , (31) حالة في المرحلة الثالثة , (13) حالة كانت في المرحلة الرابعة من مرض سرطان الثدي .مستويات الواسمات الورمية المختلفة كانت قد قدرت, الواسم CA15 - 3 كان قد حددت قيمته , واظهر حساسية تقدر بـ ( 5ر27%) وتخصيصية تقدر با (8ر95%) في سرطان الثدي المعرف وكذلك في المراحل المختلفة من المرض , النتائج لهذه الدراسة كشفت عدم وجود اختلافات معنوية في مستوى CA15 - 3 في مصل المصابات بحالات ورم الثدي الحميد مقارنة بالنساء المصابات بسرطان الثدي - المرحلة الاولى ( 0.164 <P ) بينما مستوى CA15 - 3 من مصل المريضات بسرطان الثدي من المرحلتين الثالثة والرابعة كانتا اكثر ارتفاعا , وهناك ظهرت الاختلافات المعنوية القائمة بالمقارنة مع المصابين بسرطان الثدي من الدرجة الاولى والثانية ( 0.001<P) .المستضد الورمي الجنيني CEA كان اقل قدرة ادائية حيث كان ذات حساسية تقدر بـ20% وتخصصية 7ر93% من ناحية ثانية , عبر ضم هذين الواسمين خلق مدى افضل للاداء او الانجاز .مولدات مضادات الورمية اخرى اختبرت وكان لها اجمالي الدقة accuracy over all منخفضة والذي جعل استخدامها محدود في عملية تشخيص سرطان الثدي .مستويات Beta 2 microglobulin اظهرت اختلاف معنوي بين مجموعة السيطرة الاصحاء والمرضى بسرطان الثدي في المراحل المختلفة ( 0.001 >P) فوق ذلك , كانت هناك اختلافات معنوية ( 0.001 >P) بين مجموعة السيطرة الاصحاء واولئك من كانوا في المرحلة الاولى من المرضى , عبر ضم هذه الواسمات قد لوحظ تحسين افضل في الكشف عن سرطان الثدي .مستوى Ceruloplamin هو واحد من Acute phase reactant proteins , اظهر عدم وجود فروقات معنوية بين النساء السليمات وتلك المصابات بسرطان الثدي حتى المرحلة الثالثة ( P=0.269) الاختلاف كان معنوي فقط بعد الاخذ في الاعتبار المرحلة الرابعة من المرضى ( 0.002 >P) وهو المؤشر للزيادة الرئيسية الظاهرة في مستوى Ceruloplasminعند المرضى الذين كانوا في مرحلة متاخرة من الورم الخبيث .كما وقد لاحظنا ان عدد CD+ 4 cells يتناقص مع تقدم المرض ليصل الى اقل قيمة عند المرحلة الرابعة من المرض .من ناحية اخرى , التحليل الاحصائي اظهر اختلافات معنوية بين المراحل المدروسة من المرضى ( P=0.718 - 0.065 ) حيث لم تكن هناك فروقات معنوية حتى الوصول الى المرحلة الرابعة ( P=0.013) مشيرا الى ان اقصى درجة التدمير لهذه الخلايا كانت واضحة في هذه المرحلة . من جانب اخر CD8 cells اتخذت كليا التفاعل العكسي , تبدا الاقل انخفاضا عند المراحل المبكرة من المرض حتى تصل الى اعلى مستوى عند المرحلة الرابعة .مستويات Interleukines المعتمدة, كان متوسط IL - 1α في مصل مجموعة السيطرة الاصحاء اقل من الحد المعرف به في الـ Kit . خلال التحليل الاحصائي ظهرت علامة اختلاف معنوي بين المرضى في المراحل المختلفة من المرض ( P=0.032 ) . معظم القراءات كانت في اطار المستويات غير الحد المعرف به والمستوى المرتفع المفاجيء كان عند عدد قليل من المرضى نتجت في هذه الاختلافات .من جانب اخر , اظهر التحليل الاحصائي زيادة معنوية في مستويات IL - 4 بين النساء السليمات والمصابات بسرطان الثدي عند المراحل المختلفة من المرض ( 0.001>P) .تركيز IL - 6 في المصل كان ذات ارتفاع معنوي عند المصابات بسرطان الثدي مقارنة بالنساء السليمات (0.001>P) . متوسط مستويات IL - 6 المصلي كان يقارب الثلاثة اضعاف ارتفاعا عما هو عند مرضى سرطان الثدي المنتقل metastatic breast cancer ( المرحلة الرابعة ) كما قورن مع اولئك الذين كانوا في المرحلة المبكرة من المرض ( المرحلة الاولى ) , والمقدرة على التوالي بـ ( 24.02 pg/ml versus 8.45pg/ml) .كما وقد كان هناك تقدما في الزيادة المعلمة في متوسط مستوى IL - 8 في اطار المراحل المختلفة من المرض ( P=0.025) , مع ذلك العامل المنكرر في كل نتيجة على حدة متمثلا في ارتفاع مستوى القراءات , بما فيها المرحلة الرابعة من المرض .بالمثل لمستويات Immunoglobulins في المصل , كانت هناك زيادة طفيفة في مستويات المصل عند المصابات بالسرطان , والتي قد ظهرت متجاوزة قليلا عنها مما هي عند السليمات , ولكن في هذه الزيادة لم تكن هناك فروقات معنوية مميزة في كل اختبارات ذات الانماط المتساوية . | This study investigated some physiological changes of the immune system in females with malignant breast cancer that were newly diagnosed and untreated, attending The Oncology and Nuclear Medicine Hospital in Baghdad and the Central Public Health Laboratories. Of the 80 females included, only four were in stage I of the disease, 32 in stage II, 31 in stage III, and 13 in stage IV. Different tumor markers levels were evaluated in those patients. CA 15 - 3 was assessed. It showed a sensitivity of 27.5% and a specificty of 95.8% in detecting breast cancer and at different stages of the disease. The results of the study revealed no statistically significant difference in the level of CA 15 - 3 in serum of patients with benign breast conditions compared with patients with a breast cancer of stage I (p>0.164). However, serum CA 15 - 3 level in patients with a breast cancer of stages III and IV, was considerably higher and there was a significant difference as compared with patients with a breast cancer of grades I and II (p < 0.001). Carcinoembryonic antigen had lesser performance capabilites. It had a sensitivity of 20% and a specificty of 93.7%. However, by combining these two parameters better performance indices were achieved.Other tumor markers tested had low over all accuracy that limited their use in breast cancer diagnosis.Beta 2 microglobulin levels showed significant difference among the healthy control group and patients with breast cancer at different stages (P<0.001). Moreover, there was a significant difference (P<0.001) between healthy control and stage I of the disease. By combing this parameter, further improvement in detecting breast cancer could be noticed.Ceruloplasmin level, one of the acute phase reactant proteins, showed no statistically significant changes among healthy control persons and patients with breast cancer up to stage III (P=0.269). The difference was only significant after considering stage IV of the disease (P<0.002), indicating that the major increase in ceruloplasmin level occurs in patients who are at advanced stage of malignancy.We observed that the number of CD4 cells decreases with the progress of the disease reaching its lowest value at stage IV patients. However, statistical analysis showed that the differences between the studied stages (P=0.718 - 0.065) were of no statistical significance till reaching stage IV (P=0.013) indicating that the maximum reduction was in this stage. On the other hand CD8 cells follow totally opposite reaction, being lowest at early stages of the disease reaching its highest level at stage IV. Concerning interleukines levels, mean serum level of IL - 1alpha in the healthy control group was below the detection limit of the kit. Though statistical analysis showed significant difference between patients in different stages of the disease (P=0.032), most of the readings were within the undetectable levels and the occasional high level in few patients resulted in these differences.On the other hand, Statistical analysis shows significant increase in the levels of IL - 4 in patints with breast cancer at different stages of the disease in compare with healthy control group (p<0.0001).Serum IL - 6 concentration was significantly higher in patients with breast cancer compared with healthy controls (P < 0.0001). Mean IL - 6 serum levels were nearly 3 times higher in patients with metastatic breast cancer (stage IV) as compared with those with early disease (stage I) (24.02 pg/mL versus 8.45 pg/mL, respectively).There is progressive significant increase in the mean of IL - 8 level within the stages of the disease (P=0.025), though the main contributory factor in sucha result is the high level within stage IV.As for serum levels of immunoglobulins, a slight increase in the serum levels in patients with cancer appeared exceeding a little those of the healthy control but this increase was not significant in all isotypes tested.

دراسة مقارنة بين تشظي DNA النطف والموت الخلوي المبرمج لبيوت الطاقة وعلاقتهما بعوامل العقم الذكري A comparative study between sperm DNA fragmentation and mitochondrial apoptosis correlated to male infertility factors

اسم المؤلف: الاء محمد ياسين
اسم المشرف: عبد الامير ناصر غلوب محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر بيوت الطاقة ((mitochondria والحمض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين (DNA) للنطف عوامل تنبؤ اساسية لحيوية النطفة المسؤولة عن نجاح الحمل سواء كان بالطريقة الطبيعية او عن طريق التقنيات المساعدة للانجابART) ) . لذلك هدفت هذه الدراسة لتقييم الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطفSperm mitochondrial apoptosis) SMA ) وتشظي المادة النووية للنطف SDF((Sperm DNA fragmentation. ثم تحديد العلاقة بينهما وبين عوامل العقم الذكري للسائل المنوي, وايضا ايجاد العلاقة بين نتائج فحص Acridinie orange (AO) وفحص الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطف (SMA). اجري تحليل السائل المنوي ل (85) ذكر, وكان عدد الذكور من ذوي نوع العقم الاولي (52) , ومتوسط اعمارهم (1.42± 32.13) سنة , وعدد الذكور من ذوي العقم الثانوي (33) , وبمعدل عمري قدره (1.85± 35.22) سنة , تم تقسيم الذكور الى عدة مجاميع على اساس عوامل العقم الذكري لسائلهم المنوي حسب معايير منظمة الصحة العالمية لعام (2010) عدا شكل النطف تم حسابه اعتمادا عى معايير منظمة الصحة (WHO) لسنة (1999). ايضا تم اجراء فحص الموت الخلوي المبرمج للمايتوكوندريا (SMA) لجميع الذكور بواسطة عدة تصبيغ المايتوكوندريا , وفحص تشظي المادة الوراثية بواسطة فحص (AO) وفحصت خلايا النطف المصبغة بواسطة (Fluorescent Microscope). اظهرت نتائج هذه الدراسة زيادة معنوية في الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطف (SMA) بطيئة الحركة التقدمية (Asthenozoospermia), وحالات النطف قليلة العدد وبطيئة الحركة التقدمية (Oligozasthenozoospermia), وحالات النطف قليلة العدد بطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل (Oligozasthenoteratozoospermia), بينما اظهر الذكور ذوي السائل المنوي طبيعي النطف والذكور ذوي النطف بطيئة الحركة التقدمية مشوهة الشكل (Asthenoteratozoospermia) والذكور ذوي حالات النطف قليلة العدد مشوهة الشكل زيادة غير معنوية (P>0.05) في نسبة (SMA) بالمقارنة مع المجاميع الاخرى. بالاضافة الى ذلك, اظهرت هذه الدراسة علاقة سلبية معنوية (P<0.05; r= - 0.94) بين الحركة التقدمية الكلية وبين نتائج فحص (SMA) في مجموعة الذكور ذوي النطف المشوهة (Teratozoospermia) , بينما كانت العلاقة سلبية غير معنوية(P>0.05) بين الصفات اعلاه مع تشظي المادة النووية (SDF) . اضافة الى ذلك اظهرت الدراسة الحالية ان الموت الخلوي المبرمج وتشظي المادة النووية كان باعلى النسب في حالات العقم الذكري التي يشترك فيها عامل عقم بطئ الحركة التقدمية. ايضا, تم ملاحظة اختلافات غير معنوية (P>0.05) في تشظي المادة النووية بين مجاميع عوامل العقم الذكري. على اية حال, كان التشظي في اعلى مستوياته عند الذكور ذوي قلة عدد النطف مع بطئ الحركة التقدمية لها, يليها نسبة اقل من (SDF) في الذكور ذوي النطف بطيئة الحركة التقدمية, بينما ظهرت اقل نسبة من (SDF) في الذكور ذوي السائل المنوي الطبيعي (Normozoospermia). استنتجنا من هذه الدراسة ان لفحص الموت الخلوي المبرمج لبيوت الطاقة لخلية النطفة دور مهم في بيان العقم الذكري . اضافة الى ذلك, ان لكلا الفحصين (SMA and SDF ) اهمية تنبا للمرضى ذوي عامل عقم بطئ الحركة التقدمية سواء كان لوحده او مرتبطا مع عوامل العقم الذكري الاخرى. | Sperm mitochondria and sperm DNA considered essential factors to prediction of sperm viability, which is responsible for successful pregnancy in natural way or in assisted reproductive techniques. Therefore, this work aimed to evaluate the sperm mitochondrial apoptosis (SMA) and DNA integrity for infertile patients, then to assess correlation between semen parameters with both SMA and sperm DNA fragmentation (SDF), also to assume the correlation between results of SMA test and acridine orange test. Seminal fluid analysis was performed for (85) male, the number of primary infertile men were (52) with average age (32.13 ± 1.42) year, and number of secondary infertile men were (33) with an average age (35.22 ± 1.85) yearAll patients were classified into several groups according to the male infertility factors according to WHO (2010) criteria with exception for the morphology that assessed according to WHO (1999). Also, the other two tests including SMA and SDF were performed for all infertile patients. SMA was assessed by mito - capture kit assay and the SDF assessed by Acridine Orange (AO) by using of fluorescent Microscope. The results of the present study showed a significant difference (P< 0.05) in SMA assay for asthenozoospermia, oligoasthenozoospermia and oligoasthenoteratozoospermia as compared with teratozoospermia, while normozoospermia, asthenoteratozoospermia, and oligoteratozoospermia had non significant differences (P > 0.05) in SMA (%) as compared with the other groups. Moreover, a significant negative correlation (P<0.05; r= - 0.94) assessed between total progressive motility (TPM) and SMA in Teratozoospermia, while it was negative non significant (P< 0.05) correlation with SDF. Also, this study showed that SMA and SDF were in the higher percentages in males who shares asthenozoospermia male infertility factor. Non significant differences (P>0.05) had been observed among groups of male infertility factors for sperm DNA fragmentation. However, SDF was in the maximum value for male with oligoasthenozoospermia, followed by asthenozoospermia. In contrast, minimum value was assessed in group normozoospermia males. A significant increment has been observed for secondary infertility as compared to primary infertility in sperm concentration, sperm progressive motility (%), sperm normal morphology (%), and total sperm motility (%). Additionally, this study showed that SMA and SDF were in higher values in cases that shares asthenozoospermia. From the results of the present study, it was concluded that the sperm mitochondrial apoptosis assay (SMA) has an important role in investigation of male infertility. Furthermore, both SMA and DFI assays have predictive value for patients with asthenozoospermia either alone or combined with other male infertility factors.

تاثير بعض المحفزات الكيمائية والنانوية في انتاجية بعض مركبات الايض الثانوية من المزارع النسيجية لنبات الاقحوان Calendula officinalis L. Effect of some chemical and nanoparticle elicitors on the production of secondary metabolites of Calendula officinalis L. In Vitro

اسم المؤلف: اسيل صالح محمدامين
اسم المشرف: هاشم كاظم محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجري هذا البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية ، قسم علوم الحياة ، كلية العلوم ، الجامعة المستنصرية ، بهدف زيادة انتاج بعض المركبات الثانوية في نبات الاقحوان Calendula officinalis L. خارج الجسم الحي. قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهاز كوماتكرافيا السائل ذو الاداء الفائق HPLC وقورنت مع مايحتويه النبات الام. استحث الكالس من الاوراق بعد زراعتها على وسط MS مزود بالتراكيز 0, 1, 2, 3 او 4 ملغم\لتر من 2,4 - D . بينت النتائج ان الوسط الحاوي على 2ملغم\لتر من 2,4 - D اعطى اعلى نسبة مئوية لااستحثاث الكالس بلغت 90% عند التحضين بالضوء, واعطى اعلى وزن طري وجاف للكالس هذه المعاملة 612, 33.8 ملغم على التوالي. وبهدف زيادة المركبات الثانوية اضيفت بعض المحفزات السالسيلك اسيد بتراكيز 0, 50 , 100 , 150 او 200 ملغم\لتر, الفنل النين بتراكيز 0, 10 , 20 , 30 او 40 ملغم\لتر ونترات الفضة النانوية AgNO3 بتراكيز 0, 0.3 , 0.6 , 0.9 او 1.2 ملغم\لتر. اظهرت النتائج ان التركيز 200 ملغم\لترمن السالسيلك اسيد وتركيز 20 ملغم\لتر من الفنيل النين اعطى زيادة معنوية في اغلب مركبات الزيوت الطيارة لنبات الاقحوان بينما اعطى تركيز 1.2 ملغم\لتر من نترات الفضة النانوية زيادة معنوية في جميع مركبات الزيوت الطيارة لنبات الاقحوان. | The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in leave of Calendula officinalis L. in vitro. Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant. Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 90 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 612, 33.8 mg respectively. In order to increase the production of secondary metabolites, some elicitors were used including Salicylic acid at the concentrations 0, 50, 100, 150 or 200 mg/l, phenyl alanine at the concentrations 0, 10, 20, 30 or 40 mg/l, and silver nanoparticles AgNO3 at the concentrations 0, 0.3, 0.6, 0.9 or 1.2 mg/l. Results showed that 200 mg/l concentration of Salicylic acid and 20 mg/l concentration of phenyl alanine caused highly significant production in most of the secondary metabolites (essential oils) of C. officinalis L. while 1.2 mg/l of silver nitrate nanoparticles AgNO3 caused

دور هرمون الانتي - موليرين وبعض الانزيمات التكاثريه في نوعية السائل المنوي في المرضى غير الخصبين The Role of Anti - Mullerian hormone )AMH), and some reproductive enzymes on Semen Quality in Infertile Male Patients

اسم المؤلف: اسمهان عدنان عباس النقيب
اسم المشرف: صباح عبد الرضا العبيدي محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يحتوي كل من مصل الدم والسائل المنوي على مجموعة متنوعة وكبيرة من الهرمونات والانزيمات والتي لم يعرف موقع انتاجها بشكل واضح. حيث تعد مستويات الانزيمات في السائل المنوي مهمة جدا لعملية التمثيل الغذائي فضلا عن دورها في وظائف الحيوانات المنويه ,نذكر منها الهرمون المضاد لقناه مولر) (Anti - Mullerian Hormone وانزيم الاروماتيز ( (Aromataseاو السايتوكروم 450 (Cytochrome450) وانزيم الكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) واخيرا الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases). لذلك كان الهدف من الدراسه هو التقصي عن مستوى ودور كل من الهرمون المضاد لقناه مولر (Anti - MullerianHormone) وانزيم الاروماتيز(Aromatase) اوالسايتوكروم 450(Cytochrome450) وبعض الانزيمات الاخرى وعلاقتها بمعايير السائل المنوي ، ومستوى بعض الهرمونات والانزيمات الجنسيه وحالة الخصوبة للرجال الخصبين وغير الخصبين. شملت الدراسة مائه رجل باعمار تتراوح بين 20 - 94 سنة , راجعوا المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة\ جامعة النهرين, خلال الفترة اذار 2014 الى كانون اول 2014 , حيث تم جمع وفحص عينات السائل المنوي وفق معايير منظمة الصحة العالمية (WHO)لسنة (2010) ,ثم تم وضع عينات السائل المنوي في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2600 دورة\ دقيقة ولمدة ربع ساعة لغرض الحصول على البلازما المنوية ثم تم وضعها بدرجة - 20 م° ليتم قياس الانزيمات لاحقا. كما تم سحب خمسة ملليلتر من الدم الوريدي المحيطي من جميع الذكور. وضعت عينات الدم في انابيب زجاجيه ، والسماح لها لتتجلط ثم وضعت في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2500 دورة \ الدقيقة لمدة 10 دقائق . وتم تصنيف العينات الى 7 مجاميع على وفق نتائج تحليل السائل المنوي. وقد تم تحديد تراكيز الانتي مولين MullerianHormone)) والاروماتيز(Aromatase) باستخدام طريقة الELISA والكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) والكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases) باستخدام الطريقة الانزيمية في كل من مصل الدم وبلازما السائل المنوي.كما تم تحليل النتائج احصائيا.اظهرت هذه الدراسة النتائج الاتية : 1 - مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر AMH)) في كل من مصل الدم والسائل المنوي. تم ملاحظة وجود انخفاض معنوي0.05)≥(P في مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر في كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia والمجموعة التي تعاني في قلة اعداد النطف وبطء في الحركة التقدمية وتشوهات في اشكال النطف Oligoasthenoteratozoospermiaعند مقارنتها بمجاميع العقم الاخرى .كما شوهد ارتفاعا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون لمجموعة العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدميهAsthenozoospermia والمجموعة التي تعاني من تشوهات في اشكال النطفTeratozoospermia بالمقارنة مع مجماميع الذكور طبيعية النطفNormozoospermia,ومجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermiaوالمجموعة التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia وفي كل من مجموعة العقم التي تعاني من قلة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaومجموعة الذكور اللانطفية Azoospermia.من جانب اخر لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P للهرمون المضاد لقناه مولر في السائل المنوي في مجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى .بينما اظهرت مجاميع العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaارتفاعا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل ا لمنوي عند مقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى, ايضا اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia والمجموعة اللانطفية Azoospermia انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل المنوي بالمقارنة بمستواه في مجاميع العقم الاخرى.2 - مستوى السايتوكروم450 (CYP450) او الاروماتيز) (Aromataseفي كل من مصل الدم واالسائل المنوي اظهرت مجموعة الذكور طبيعية االنطف Normozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الاروماتيز في مصل الدم بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى , كما شوهدت زيادة معنوية0.05)≥(P في مجموعة العقم التي تعاني منقلة في الحركة التقدميه وتشوه في الشكل Asthenoteratozoospermia في مستوى الانزيم في مصل الدم بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى. بينما لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور اللانطفيه Azoospermia بالمقارنة بمستوى هذا الانزيم في مجاميع العقم الاخرى , وانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia بالمقارنة مع مستواه في السائل المنوي في مجاميع العقم الاخرى .3 - مستوى الكرياتين كاينيز(CPK) في كل ن مصل الدم وا السائل المنوي . لوحظ وجود ارتفاعا معنويا بمستوى0.05)≥(P في مستوى انزيم الكريايتن كاينيز في مصل الدم في مجموعة الذكور طبيعيه النطف Normozoospermiaوالمجموعة اللانطفيهAzoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى كما ظهر انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaبمقارنة مستواه في مصل الدم مع مجاميع العقم الاخرى. اظهرت مجموعة العقم التي تعاني من قلة في العدد Oligozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من قلة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaزيادة معنوية0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى, كما اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم اللانطفيهAzoospermia انخفاظا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الكرياتين كاينيز بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى في بلازما السائل المنوي4 - مستوى الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز (GGT) في كل ن مصل الدم السائل المنوي. اظهرت مجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هرمون GGTفي مصل الدم عند مقارنة مستواه بمجاميع العقم الاخرى .كما انه كانت هناك زيادة معنوية 0.05)≥ (Pفي مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من بطء في الحركة التقدميةومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia بالمقارنة مع مستواه في المصل لمجاميع العقم الاخرى. كما اظهرت الذكور التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في مصل الدم بمقارنة مستواه مع مجاميع العقم الاخرى, اما مجاميع العقم التي تعاني من قلة العدد وبطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلOligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من بطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلAsthenoteratozoospermia فقد اظهرت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في بلازما السائل المنوي بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى.وقد لوحظ ايضا انخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في في مجموعة العقم التي تعاني من قلة العددOligozoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى | A great assortment of hormones and enzymes are current in blood and seminal plasma, but in many cases the gland in charged for their production has not been well - known. The enzyme levels of seminal plasma are very important for sperm metabolism as well as sperm function; these enzymes are Anti - Mullerian Hormone (AMH), Cytochrome 450, Creatine Phospho Kinase( CPK) and Gamma - Glutamyl Transfrrase (GGT). Therefore, this study was aimed to investigate the role of AMH and aromatase activity (cytochrome 450) in relation to semen parameters, level of some reproductive hormones, enzymes and the fertility status for fertile and infertile men. This study involved one hundred men within 20 - 49 years old who attended to High Institute of Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technology / AL - Nahrain University, during the period from March, 2014 to December, 2014. Semen samples were collected and seminal fluid analysis was done in accordance with WHO (2010). Then samples of seminal fluid were centrifuged for 15 minutes at 2600 rpm. The supernatant as seminal plasma was rapidly and cautiously improved and put to freeze at - 20° C for later measurements. Also, five milliliters of peripheral venous blood was aspirated from each male. Blood samples were collected in plain tubes, allowed clotting and then centrifuged at 2500 rpm for 10 minutes. The samples were assorted into 7 groups in accordance with the results of semen analysis. For serea and seminal plasma concentrations of AMH, Cytochrome 450, CPK, GGT were determined in the stored blood serum and semen. AMH and Cytochrome 450 were determined using the ELISA sandwich method. CPK and GGT were determined by using enzymatic method. The crude data were statistically analyzed. 1 - The level of Anti - Mullerian hormone (AMH) in serum and seminal plasma. A significant decrement (P≤0.05) was observed in the serum AMH for males with oligozoospermia and oligoasthenoteratospermia as compared to the other groups of male infertility factors. There was significant elevation (P≤0.05) for males complaining from asthenozoospermiaand teratozoospermia as compared to normozoospermia, oligoasthenoteratozoospermia,oligozoospermia, asthenoteratozoospermia and azoospermia. Similarly, significant elevation (P≤0.05) in seminal AMH for males suffering from oligozoospermia as compared to other groups of male factor infertility. Meanwhile, males with teratozoospermia showed significant increment (p≤0.05) as compared to other groups infertility. Also, males with asthenoteratozoospermia and azoospermia revealed significant reduction (p≤0.05) in the level of seminal AMH as compared to other male infertility. 2 - The level of cytochrome 450 or aromatas enzyme in serum and seminal plasma. The males with normozoospermia revealed significant reduction (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to the other male infertility groups. Also, males complaining from Asthenoteratozoospermia presented significant elevation (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to other groups of infertility. While, there was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for azoospermic males as compared to the other groups of male infertility, and significant decrement (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for males complaining of normozoospermia as compared to the other groups of male infertility.3 - The level of creatine phosphokinase (cpk) in serum and seminal plasma. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of CPK for males with normozoospermia and Azoospermia when compared to other groups of male infertility in contrast, and the level of CPK showed significant reduction (P≤0.05) for teratozoospermia as compared to other groups of male infertility. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for oligozoospermia and Aasthenoteratospermia when compared to other groups of infertility factors, also, males suffering from oligoasthenoteratospermia and azoospermia showed significant decrement (P≤0.05) when compared to other groups of infertility factors. 4 - The level of gamma - glutamyl transpeptidase (GGT) in serum and seminal plasma. Males with normozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors, and there was significant increment (P≤0.05) for males complaining from asthenoteratozoospermia as compared to the others. Males suffering from teratozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors. Males with oligoasthenoteratozoospermia, and asthenozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of semen GGT when compared to the other groups of infertility factors, males suffering oligozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) when compared to the other groups of infertility facto

التحري عن الافلاتوكسين B1 في الذرة والحنطة والرز في بعض مخازن الحبوب في العراق Detection of Aflatoxin B1 in maize (Zea mays), wheat (Triticum aestivum) and rice (Oryza sativa) collected from some silos in Iraq

اسم المؤلف: اسماء عبد الحميد عبد المجيد
اسم المشرف: حسن محمد بدير عادل حسين طالب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Aflatoxins are one of the dangerous mycotoxins, especially aflatoxin B1, causing of cancers disease to humans and animals, also lead to a large Perdition. This toxin is produced from Aspergillus flavus and Aspergillus parasiticus.The current study was conducted to investigate the environmental conditions in the local stores and their impact on pollution with aflatoxin B1, Three Models of economic crops which are corn, wheat and rice samples are collected from the Ministry of Trade and Ministry of Agriculture stores(silos) in the provinces of Baghdad and Wast for six consecutive months started from September 2014 until March 2015, in addition to collection of these crop from the local market to study the relationship between the storage and production of the toxin. Sixty type samples of the three grain crops were collected from the stores, twelve samples of corn and twenty four samples each of wheat and rice, total of samples and three replicates were one hundred eighty planted on the (PDA) medium. Sixty five isolates of A. flavus were obtained from all samples of grains; Preliminary tests for the detection of aflatoxin B1 productivity were done on these isolates, using coconut medium test, ammonia vapor test and Yellow pigment test. The results showed that thirty - six of the isolates were capable of producing aflatoxin B1 while twenty - nine were not produced of producing the toxin. Environmental conditions have affected the growth ratio of the A. flavus in each of the three crops, where corn crop recorded the highest rate of fungal contamination ratio in the six months, it was (80.5%), followed by wheat (32%), and finally by rice (18%). Quantitative and qualitative test for estimation of aflatoxin B1 using ELISA technique was done on grain samples that had positive indicators for the growth of A. flavus. The results showed that the concentration of aflatoxin B1 was at its peak in February compared with other months under study, reached to (46.2, 45.2, 40) ppb, respectively, in each of corn, wheat and rice, while the low concentrations of aflatoxin were recorded in September and October, attained to(19.5,2.2,1.8) ppb in each of corn, wheat and rice respectively. These results are attributed to the rise in humidity rates in February and low temperature off set by low humidity and high temperatures rates in September, which provides environmentally appropriate conditions for the fungus growth and production the toxins. The results also show that corn crop was more affected by the pollution compared with other crops, where the concentration of aflatoxin B1 was 46.2ppb in corn, while in rice crops was concentration of toxin reached to1.8 ppb

عزل طفيلي Blastocystis hominis ، تنميط HLA للمصابين والتثبيط بالمعزز Saccharomyces boulardii Isolation of Blastocystis hominis , HLA typing of patients and the inhibition by the probiotic Saccharomyces boulardii

اسم المؤلف: اسراء محمد عبد الخالق الحسن
اسم المشرف: سبا طاهر محمد بتول مطر مهدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية (5892) عينة براز، والتي جمعت من مرضى باعمار مختلفة (1 - 70 سنة) لكلا الجنسين ،كانوا يعانون من الم البطن، مغص حاد ، تطبل البطن واسهال. جمعت العينات خلال الفترة الواقعة من ايلول (2013) ولغاية ايلول (2014)، من اربع مستشفيات في بغداد (مستشفى مدينة الطب التعليمي ،مستشفى الامام علي ،مستشفى الكرامة ومستشفى اليرموك التعليمي ) . للتحري عن نسبة الاصابة بطفيلي hominis Blastocystis ، اظهرت نتائج الدراسة الوبائية ان العدد الكلي المصاب بالطفيلي كان (1420) عينة موجبة وبنسبة (24.10%) ، اما نسب الاصابة بالطفيلي في المستشفيات الاربعة (مستشفى مدينة الطب التعليمي ،مستشفى الامام علي ،مستشفى الكرامة ومستشفى اليرموك التعليمي) كانت (51.41 % ، 18.66%،17.61% و12.32% ) على التوالي . واظهر الذكور اعلى عدد ونسبة للاصابة ، حيث بلغت (750) حالة وبنسبة (52.82%) ، اما الاناث فقد بلغت حالات الاصابة (670) حالة وبنسبة (47.18%) وبدون وجود فروق معنوية . وقد كانت اعلى نسبة للاصابة ضمن الفئة العمرية ( 30 - 21 سنة) بنسبة (29.58%) ، بينما كانت اقل نسبة للاصابة ضمن الفئة العمرية (10 - 1 سنة) بنسبة (3.52%). اظهرت الدراسة ان عينات البرازالتي تحتوي على الطفيلي تمتاز بقوام سائل اوشبه سائل ، وتمت دراسة علاقة الطفيلي مع الاصابة بالطفيليات المعوية الاخرى وجاءت النتائج كالاتي (1110) حالة اصابة مفردة لطفيلي Blastocystis hominis وبنسبة ((78.17%، و(310) 21.83%)) حالة اصابة مشتركة مع (6) اجناس مختلفة من الطفيليات المعوية، حيث كانت اجناس الطفيليات كالاتي ( Entamoeba histolytica ،تليها Giardia lamblia ،تليها Cryptosporidium ،تليها Enterobius vermicularis ،تليها Taenia spp.، واخيرا Ascaris lumbricoides ) وبنسبة ( 18.38% ، 2.68%، 0.35 % ،0.21%، %0.14 ،% 0.07) على التوالي. ان الدراسة الحالية سلطت الضوء على تحديد افضل طريقة تصبيغ لتشخيص الطفيلي بالبراز. واظهرت الدراسة ان افضل طريقة تصبيغ هي صبغة السفرانين تليها صبغة الكمزا والايرون هيماتوكسيلين. اما بالنسبة لزراعة الطفيلي لتشخيصه ، فقد كان وسط جونس المحورهو الوسط المناسب مع اجراء بعض التحوير بطريقة الزرع وهو استبدال مصل الحصان بمصل انسان مثبط ،و حضن الطفيلي هوائيا بدرجة ( 37 مئوية). اظهرت النتائج ان اعلى نسبة نموحصلت بعد (24 ساعة) اذ بلغت اعداد الطفيلي (777.75 خلية/ مل)، و(495.62 خلية / مل) بعد (48 ساعة) ، وقد كان الشكل الفجوي هو الشكل الاكثر تواجدا في الوسط . وقد شملت الدراسة الحالية عمل تنميط مستضدات كرية الدم البيضاء البشرية الى (30) شخص عربي عراقي مسلم مشخصين بوجود متلازمة تهيج القولون العصبي ، جميعهم مصابين بطفيلي Bastocystis hominis ، وقد كان (24) منهم ذكور، و(6) اناث ، وباعمار تراوحت بين (53 - 20 سنة) ،هذا بالاضافة الى (30) شخص سليم عربي عراقي مسلم تم اعتبارهم كمجموعة سيطرة ، تكونت من (25) ذكور، و(5) اناث ، وباعمار تراوحت بين ( 55 - 18 سنة) ، وقد وجد ان هناك ميل واستعداد للاصابة بالطفيلي يتطلب اكتساب الاليل HLA - DR B1*03 ،بالاضافة الى اكتساب الاليل HLA - DRB1*14. تم دراسة تاثيرفعالية خميرة Saccharomyces boulardiiكمعززات حيوية على الطفيلي في الفئران المختبرية ومقارنتها مع دواء mitronidazole الذي يستخدم عادة في علاج الطفيليات المعوية ومن ضمنها طفيلي ال hominis Blastocystis. وقد لوحظ هناك انخفاض تدريجي لاعداد الطفيلي في براز الفئران ومنذ اليوم الاول للمعالجة (حيث اختفى الطفيلي عند اليوم الثاني عشر بعد العلاج بخميرة Saccharomyces ، وعند اليوم الثالث عشر بعد العلاج بدواء metronidazole)، وعند حساب الكفاءة العلاجية للخميرة والميترونيدازول ،وجد بان الخميرة كانت ذات كفاءة علاجية عالية اذ بلغت (87.45%) في حين بلغت الكفاءة العلاجية للميترونيدازول (81.36%) . اظهر الفحص المجهري للمقاطع النسيجية الماخوذة من امعاء الفئران المصابة بالطفيلي لمنطقتي الاعور والقولون قدرة الطفيلي على حدوث تغيرات نسيجية تضمنت وجود ترشح خلوي التهابي شديد وحدوث اضرار للغشاء المخاطي. واظهرت خميرة Saccharomyces boulardii فعالية عالية في اصلاح وشفاء الانسجة المتضررة مقارنة بالميترونيدازول الذي اظهر كفاءة اقل في اصلاح وعودة النسيج الى هيكله الطبيعي. | The present study included (5892) stool sample , which were collected from patients at different ages (1 - 70 year) of both sexes, complained with abdominal pain, cramp, flatulence and diarrhea. Samples were collected during the period from September (2013) till September (2014), included four hospitals in Baghdad (Baghdad Medical City , AL - Imam Ali Hospital, AL - Karaama Hospital and AL - Yarmouk Teaching Hospital ) . To detect of the infection prevalence of Blastocystis hominis , the results of epidemiological study showed that the total number infected with this parasite was (1420) positive sample with percentage of (24.10%) , Percentages of infected cases with parasite in the four hospitals (Baghdad medical city, AL - Imam Ali Hospital , AL - Karaama Hospital and AL - Yarmouk Teaching Hospital), were (51.41%,18.66%,17.61%,and 12.32%) respectively . Males showed higher number and percentage of infection, (750 ) case with percentage of (52.82%), while females were (670) case with percentage of (47.18%) , no statistical significant differences was detected. The highest percentage of infection occurred among age group (21 - 30 year ) with percentage of (29.58%), while the lowest percentage of infection occurred among age group (1 - 10 years) with percentage (3.52%) . This study showed that stool samples which contain the parasite have a liquid or semi liquid . The presence of other intestinal parasites was detected, and the results were (1110) single infection with Blastocystis hominis ,with percentage (78.17%) , and (310) (21.83%) co - infection with (6) different genus of intestinal parasites, which were (Entamoeba histolytica, Giardia lamblia , Cryptosporidium , Enterobius vermicularis , Taenia spp., and Ascaris lumbricoides) with percentage (18.38%, 2.68%, 0.35%, 0.21%,0.14%, and 0.07%) respectively. The current study focused on determining the best way of staining to detect parasite in the stool. This study showed that safranin is the best stain ,then giemsa and iron haematoxylin. According to diagnosis by culture in modified Jones medium was the suitable medium with some modification with replacing horse serum with inactivated human serum, the parasite incubated aerobic at (37ºC). The results showed that the higher growth rate occurred after (24 hr) , the numbers of the parasite were ( 777.75 cell /ml), and ( 495.62 cell/ml ) after (48 hr) , the vacuolar form of the parasite was the main form founded in the culture. The present study included making HLA typing to (30) diagnosed Iraqi Arab Muslim patients with irritable bowel syndrome ,all of them infected with Blastocystis hominis, (24) of them were males , and (6) females ,with age ranged between (20 - 53 year) , control group consist of (30) healthy Iraqi Arab Muslims individuals, where (25) was males , and (5) females, with age ranged between (18 - 55 year), the results revealed that there was a genetic predisposition factor for the infection with Bastocystis hominis by acquiring the allele HLA - DR B1*03,and allele HLA - DRB1*14. The effectiveness of Saccharomyces boulardii yeast as vital probiotic on this parasite was studied in the laboratory animals (mice ) and compared with metronidazole which is used usually in the treatment of intestinal parasites including Blastocystis hominis . A gradually decreasing in the numbers of parasite in feces of mice was noticed since the first day of treatment parasite disappeared on the day (12th ) of treatment with Saccharomyces yeast, and disappeared on the day (13th ) of treatment with metronidazole.The efficacy of treatment was estimated for both of S. boulardii and metronidazole ,and the result proved that this yeast have a higher efficacy for treatment (87.45%) , compared with mitronidazole efficacy which was (81.36%). The microscopic examination to histological sections of the infected mice in cecum and colon regions showed the ability of the parasite to make histological changes included intense inflammatory - cell infiltration, and mucosal damage. The yeast of Saccharomyces boulardii showed higher ability in the healing and recover damaged tissues compared with metronidazole

التحري عن مقاومة المجموعة الامينوكلايكوسيدية المتواسطة بمثيلة 16S rRNA في بعض انواع البكتريا السالبة لكرام Detection of 16S rRNA Methylation Gene between Two Species of Gram Negative with High Level Resistance to Aminoglycosides

اسم المؤلف: اسراء محمد صفي عبد علي الكاظمي
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت 100 عزلة من البكتريا السالبة لصبغة كرام مشخصة مبدئيا بانها وEscherichia coli Pseudomonas aeruginosa من مرضى باصابات مختلفة في مستشفى الكندي التعليمي ومستشفى الكاظمية التعليمي ومستشفى ابن البلدي ومستشفى الامام علي خلال الفترة مابين تموز الى تشرين الثاني2011. تضمنت 68 عزلة من خمجات المجاري البولية و8 عزلات من عينات القشع و6 من خمجات الحروق و18 عزلة من اصابات تجرثم الدم. • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم. تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص المورفولوجية والكيموحيوية ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة api20E.تبعا لذلك توزعت العزلات المائة بواقع 58 عزلة تعود لبكتريا E. coli اما العزلات ال 42 الباقية فكانت لبكتريا P. aeruginosa.• اجري اختبار فحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشار الاقراص لـ 7 من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجود اختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري لهذه العزلات .فقد بلغت نسبة مقاومة بكتريا E. coli لمضاد الاميكاسين 34.4%)20\58)و53.4%(31\58)للنتلامايسين و67.2%(39\58) للتوبرامايسين و87.9% (51\58 ) لللسيسومايسين , و94.8%(55\58 ) لكلا من مضادي الكانامايسين والستربتومايسين واخيرا بلغت النسبة للجنتامايسين 98.2%(57\58) . كما هو الحال مع بكتريا E. coli , فقد ظهر ان افضل فاعلية ضد بكتريا P.aeruginosa كانت للاميكاسين حين بلغت نسبة المقاومة45.2%(20\42) تلا ذلك مضاد النتلامايسين52.3%(22\4222) وبلغت 57.1%(27\42) و59.5%(25\42) للسيسومايسين والتوبرامايسين على التوالي اما للكانامايسين فقد بلغت 90.4%(38\42) للستربتومايسين 92.8%(39\42) واعلى نسبة مقاومة كانت ضد مضاد الجنتامايسين حيث بلغت 95.2%(40\42). • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى لست من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية. بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لهذه النوعين من العزلات.فمن اصل (58) عزلة من بكتريا E.coli كانت منها 20 مقاومة للاميكاسين(%34.4 ( وبقيم MIC تراوحت ما بين(64 - 128 مايكروغرام\مل), 56 عزلة)87.5%(مقاومة للبارومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين)16 - 1024مايكروغرام\مل) , 57 عزلة) %98.2) مقاومة للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين(16 - 256مايكروغرام\مل), وكانت جميع العزلات (100%) مقاومة لكل من الجنتامايسين والنيومايسين والكانامايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين)128 - 1024مايكروغرام\مل) للجنتامايسين والنيومايسين بينما تراوحت للكانامايسين ما بين(128 - 1024مايكروغرام\مل(. اما بالنسبة لبكتريا P.aeruginosa كانت20 (47.6%) عزلة مقاومة للاميكاسين وبقيم MIC تراوحت ما بين(16 - 1024مايكروغرام\مل) و39 عزلة (92.5%)عزلة مقاومة للكانامايسين والستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين(64 - 1024مايكروغرام\مل)و)16 - 1024مايكروغرام\مل) على التوالي,جميع العزلات وبنسبة (100%) كانت مقاومة للجنتامايسين والنيومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين )16 - 1024مايكروغرام\مل), واخيرا جميع العزلات اظهرت مقاومة تامة للبارومايسين (100%) وبقيم MIC تراوحت ما بين)32 - 1024مايكروغرام\مل).• تم التحري عن انتاج انزيم البتالاكتاميز باستخدام اختبار الاشرطة السريع, وتضمن اربع اختبارات : اختبار المسح الاولي للبتالاكتاميز,اختبار انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف ESβLs التاكيدي وMetallo - β - lactamase وانزيم AmpC. اظهرت النتائج انه 84 عزلة من مجموع 100 (84%) كانت موجبة للمسح الاولي للبيتالاكتميز توزعت مابين50 عزلة(86.2%) لبكتريا E.coli و34عزلة (80.9%) لبكتريا P.aeruginosa. اما بالنسبة للـ ESβLs فكانت نسبة العزلات المنتجة له هي 83% توزعت كالاتي 86.2%(50\58) لبكتريا E.coli و80.9%(34\42) تعود لبكتريا P.aeruginosa اما نتائج MβL فقد كانت اقل نسبيا لتصل الى 75% موزعة مابين %77.5)45\58) لبكتريا E.coli و71.4% (30\42) لبكتريا P.aeruginosa بينما 70% من العزلات كانت منتجة لانزيم AmpC توزعت مابين 56.8%(33\58) لبكتريا E.coli و88.9%(37\42) لبكتريا P.aeruginosa.• تم التحري عن المحتوى البلازميدي لعدد من العزلات المنتخبة والتي اظهرت مستوى مقاومة عالية وذلك باستخدام modified alkaline lysis method. اظهرت النتائج ان معظم العزلات كانت حاملة لاكثر من بلازميد باحجام مختلفة , وبعض منها ت احتوى على بلازميدات كبيرة.• اعتمدت طريقتان مختلفة لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهي : طريقة الغليان وطريقة استخلاص البلازميد. اظهرت النتيجة ان طريقة عزل البلازميد كانت ادق في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.مع ذلك فان الطريقة الاولى هي الاكثر شيوعا في العمل الروتيني .• اختيرت 20 عزلة من كل نوع لغرض الدراسة الجينية اعتمادا على مستوى المقاومة العالية الذي اظهرته هذه العزلات . استخدمت تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) للتحري عن جين blaCTX - M المسؤول عن انتاج ESβLs فضلا عن التحري عن ستة من جينات مثيلة 16S rRNA ArmA )و RmtAو RmtBو RmtCو RmtD وNpmA ) .• بينت نتائج التحري عن جين blaCTX - M في E.coli ان جميع العزلات حاملة لهذا الجين (100%) لتقل النسبة الى 85% (17\20( لبكتريا P.aeruginosa بالاعتماد على وجود القطعة المكثرة بحجم 550 زوج قاعدي بالمقارنة مع دليل الدنا المستخدم بحجم 100 زوج قاعدي المرحل في 1%من هلام الاجاروز .• اوضحت نتائج التحري عن جينات مثيلة 16S rRNA بتقنية الـ (PCR) لعزلات E.coli ان16 عزلة من مجموع20 (80%) كانت حاملة لجين ArmA اعتمادا على وجود القطعة مكثرة بحجم 846 زوج قاعدي بالمقارنة مع دليل الدنا الحجمي (100 زوج قاعدي )بعد الترحيل في هلام الاجاروز 1% فيما اظهرت عزلة واحدة من مجموع20 (5%) امتلاكها لجين المثيلة RmtB بحجم قطعة مكثرة 584 زوج قاعدي , بينما كانت 3 عزلات من مجموع 20(15%)حاملة لجين RmtC بالاعتماد على وجود حزم بحجم 711 زوج قاعدي , وعزلة واحدة فقط (5%) حاملة لجين RmtD بوجود قطعة مكثرة بحجم 500 زوج قاعدي , واخيرا فان جين المثيلة السادس وهو npmA فقد حدد في عزلة واحدة (5%) من اصل 20 عزلة بالاعتماد على وجود حزمة بحجم 641 زوج قاعدي.• اظهرت نتائج التحري عن جينات مثيلة 16S rRNA في بكتريا P.aeruginosa وجود نوع واحد من هذه الجينات وهو ( RmtD) وقد حدد في 3 عزلات من اصل20 (15%)بالمقارنة مع دليل الدنا الحجمي 100 زوج قاعدي.• كلا نوعي البكتريا E.coli وP.aeruginosa لم يظهرا احتوائها على جين RmtA , بينما كان جين ArmA هو الجين السائد في بكتريا E.coli.• اظهرت النتائج ان عزلة واحدة من بكتريا E.coli رقم(37) حاملة لخمسة انواع من جينات مثيلة 16S rRNA فضلا عن جينblaCTX - M ,بينما كانت اربع عزلات من بكتريا E.coli ذات التسلسل(11 و32 و40و42) لاتحتوي على اي جين من جينات المثيلة ماعدا جينblaCTX - M .• اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان هنالك ترابط بين التنميط المظهري لمقاومة المضادات مع التنميط الجيني , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين المثيلة 16S rRNA هي العزلات التي اظهرت مقاومة عالية لكل من المضادات الاميكاسين والجنتامايسين ولكل المجموعة الامينوكلايكوسيدية ماعدا الستربتومايسين لبكتريا E.coli وبكتريا P.aeruginosa فضلا عن مقاومتهما لبقية المضادات ,لكن بكتريا P.aeruginosa اظهرت احتوائها على نوع واحد من جينات المثيلة وهو (RmtD) وقد ظهرت في العزلات رقم (14و28و37) بالاضافة الى جين blaCTX - M بالرغم من مقاومتها العالية لمضادات مجموعة الامينوكلايكوسيدية, وهذا يعزى لاحتوائها على اليات مقاومة اخرى مثل مضخة الدفق وتحوير الانزيمات وتغيير حاجز النفاذية والاكثر شيوعا هو مضخة الدفق للمضاد. • بينت النتائج على الاقل وجود احدى جينات المثيلة مرافقة لجينات مقاومة اخرى مثل جين blaCTX - M المسؤول عن انتاج ESβLs سيما في بكتريا . E.coli | A total of (100) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa were collected from Al - Kindey hospital, Al - Kadhymia teaching hospital, Ibn - Albalady hospital and Alemam - Ali hospital in Baghdad city , during the period between July 2011 to November 2011. They were obtained from mid stream urine from patients suffering from urinary tract infections (68 isolates), sputum samples from patients suffering from respiratory tract infection (8 isolates), wounds infections (6 isolates) and from bacteraemia (18 isolates).• The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar and blood agar then diagnosed by performing some morphological and biochemical tests. A confirmatory test as a final diagnoses was done using api20E system. According to this, the 100 isolates were distributed as 58 isolates of Escherichia coli while the remaining 42 isolates were Pseudomonas aeruginosa.• Antibiotic susceptibility test for 7 aminoglycoside antibiotic was performed using disc diffusion method. The results demonstrated a clear differences in the phenotypic resistance among the isolates. The percentage of highest resistance in E.coli isolates reached 98.2%(57\58) for gentamicin while lower reached 34.4% (20\58) for amikacin. As with E.coli the best activity against P.aeruginosa the highest resistance was against gentamicin when the percentage reached 95.2%, while the lower percentage aganist amikacin when the percentage of resistance was 47.6%(20\42). • Two fold serial dilution agar was used to determine the minimum inhibitory concentrations (MICs) using six aminoglycosides antibiotic. The results showed that there were differences in the MICs values among the two species. Out of (58) E.coli isolates, 20(34.4%) were resisted to amikacin (MIC ranged from 64–128 µg /ml) , and all isolates 58 (100%) were resisted to gentamicin, neomycin and kanamycin when the MICs ranged from (32–1024µg /ml) to gentamicin and neomycin while it was (128–1024 µg /ml) to kanamycin. In P.aeruginosa, 20(47.6%) isolates were resisted amikacin (MIC ranged from 64–128 µg /ml), all isolates(100%) were resistant to gentamicin and neomycin (MIC ranged from 16–1024 µg /ml) and finally all the isolates showed complete resistance towards Paromomycin (100%) with MIC ranged from (32–1024µg /ml).• The detection of β - lactamases production was performed using the easy rapid strip test including four tests : preliminary screening test for β - lactemase, Extended - Spectrum Beta - Lactamases (ESβLs) confirmation, Metallo β lactamases and AmpC enzymes. The results showed that 84 isolates out of 100 (84%) were positive in Preliminary screening of β - lactamases distributed between 58(86.2%) for E.coli and 42(80.9%) for P.aeruginosa . In ESβL, the rate of producer isolates were 83% distributed as (50/58)86.2% of E.coli isolates and (34/42)80.9% for P.aeruginosa. Results of MβL production revealed that the rate of producer isolates reduced to 75% distributed as (45/58)77.5% for E.coli and (30/42)71.4% for P.aeruginosa, while 70%of the isolates were AmpC producers distributed as (33/58)56.8% and (37/42)88.09% for E.coli and P.aeruginosa respectively.• The detection of plasmid content was done for selected isolates which showed very high level of resistance using modified alkaline lysis method. The results showed that most of the isolates were harboring more than one plasmids of different size, and some isolates appeared to have mega plasmid. • Template DNA used for polymerase chain reaction (PCR) reaction was prepared using two different methods : the boiling method and the plasmid DNA. The results revealed that the plasmid DNA was more specific in demonstrating the result as compared with the boiling method however, the first method is more common in routine work. • Twenty isolates from each species were selected according to their high - level resistance for the genotypic study. PCR technique was performed to detect blaCTX - M gene responsible for ESβLs production beside detecting six 16S rRNA methylation genes including (ArmA, RmtA, RmtB, RmtC, RmtD, and NpmA). • The results for detecting blaCTX - M gene in E.coli showed that all of the isolate (100%) were harboring this gene, while the rate decreased to 85%(17/20) for P.aeruginosa based on the presence of an amplified segment with 550bp (as compared with 100bp DNA ladder) in agarose gel (1%) .• The results of detection 16S rRNA methylation by PCR in E.coli isolate showed that 16 isolates out of 20 (80%) were harboring ArmA based on the presence of 846 bp bands (as compared with 100bp DNA ladder) after running in (1%) agarose gel. Only one isolates out of 20(5%) harbored RmtB methylation gene with amplified size 584bp, while 3 isolates out of 20(15%) contains RmtC gene based on the presence of 711bp bands , 1 isolates(5%) harbored RmtD gene and the size of the amplified segment was 500bp, and the final sixth methylation gene was npmA which was detected in only one isolate (5%) out of 20 based on the presence of 641bp bands. • The results of detection 16S rRNA methylation in P.aeruginosa showed that only one methylation gene( RmtD) was found in the isolates and it was detected in 3 isolates out of 20 (15%) as compared with DNA ladder 100bp.• Both of bacteria E.coli and P.aeruginosa didn’t show any positive results to RmtA gene, while ArmA gene was the most predominant in E.coli.• The results showed that there was only one E.coli isolate(no.37) harbored the five 16S rRNA methylation genes beside blaCTX - M gene, while four E.coli isolates (no. 11, 32, 40 and 44) devoid any one of them except blaCTX - M gene. • The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern. The isolates harboring 16S rRNA methylation genes are considered to show high - level resistance to amikacin, gentamicin and even to all aminoglycosides except streptomycin, for E.coli and P.aeruginosa beside resistance to other antibiotic, but in P.aeruginosa only one methylase gene (RmtD) gene appeared in three isolates(no.14, 28,37) in addition to blaCTX - M gene despite the high level of resistance towards aminoglycoside group and this is due to contain other types of resistance such as efflux mechanisms, aminoglycoside modifying enzymes and impermeability of the cell wall may cause reduced susceptibility to aminoglycosides and the most prevalent was efflux mechanisms.• At least one Methylation resistance genes was coupled with other resistance gene such as blaCTX - M gene responsible for ESβLs production

التغيرات الدموية والكيميائية الحياتية في الفئران البيضاء المستحثة بواسطة المبيد الحشري Prothor (Imidacloprid) Hematological and Biochemical changes in the white mice induced by insecticide prothor (Imidacloprid)

اسم المؤلف: اسراء سليم عبد الزهرة الدباغ
اسم المشرف: ليلى جبار محمد البهادلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة للمبيد الحشريImidacloprid (IMD)على 204 ذكور الفئران السويسرية البيض ، تتراوح اعمارهم بين 8 - 12 اسابيع ومعدل اوزانها 20 - 25 غرام ، وتنقسم الى تجربتين رئيسيتين : - التجربة الاولى (التاثيرات شبه المزمنة) : اجريت هذه التجربة لتحديد تاثير التركيز الموصى به (ADI) Acceptable daily intake60.0 ملغم/كغم من وزن الجسم وتركيزين مختلفين ) 0.12،0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم ( واظهرت التراكيز المختلفة تاثيرات مختلفة على الاوزان المختلفة للاعضاء مثل (الكبد ،الكلى والطحال) بالاضافة الى تغييرفي انزيمات الكبد، معايير وظائف الكلى ومعايير الدم للاعضاء سابقة الذكر. تم فحص التاثيرات بعد 14 و28 يوم من التجريع الفموي اليومي، اكدت النتائج وجود انخفاض (p ≤0.05) في اوزان الاعضاء الكبد، الكلى والطحال والتي سجلت اقل وزنا للكبد (0.720±0.04 ) ،الكلى(0.140±0.024) والطحال (0.040±0.005) بعد 14 يوم من التجريع الفموي اليومي بالمبيد (IMD) وبالتركيز 0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم ؛ بينما اكدت النتائج التي اجريت بعد 28 يوم من التجريع الفموي على وجود انخفاض غير معنوي (p ≥0.05) في وزن الكبد، الكلى والطحال وللجرعات 0.06،0.12 و0.18 ملغم/ كغم من وزن الجسم. اظهرت النتائج بعد 14 يوم من التجريع الفموي زيادة معنوية(p ≤0.05) في مستويات انزيم Aspartate aminotransferase (AST) and alkaline phosphatase (ALP)عند الجرعتين 0.12 و0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم AST (27.40±2.34 ؛ 31.10±0.65) وALP (82.84±7. ؛ 49.04±1.07) على التوالي، تمت مقارنة كل قياسات التجربة مع مجموعة السيطرة، في حين سجل مستوى alanine aminotransferase (ALT) انخفاض معنوي (p ≤0.05) عند جرعتي 0.06 و0.18 ملغم من وزن الجسم (13.80±0.45 و12.36±0.51) على التوالي. اظهرت النتائج وجود زيادة معنوية (p ≤0.05) في مستويات انزيمات AST (36.96±5.04)، (24.90±1.52) ALT وALP (62.52±8.10) بعد 28 يوم من التجريع الفموي عند الجرعة 0.18 ملغم من وزن الجسم بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. كما وجدت زيادة معنوية (p ≤0.05) بمستويات معايير وظائف الكلى مصل الكرياتنيين (0.920±0.10) واليوريا (47.20±2.35) بعد 14 يوم من التجريع الفموي وبالجرعة 0.06 ملغم/كغم من وزن الجسم في حين كانت التاثيرات غير معنوية (p ≥0.05) بعد 28 يوم من التجريع الفموي في مصل الكرياتنين واليوريا عند جميع الجرع (0.06،0.12 و0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اظهرت النتائج انخفاض معنوي (p ≤0.05) في مجموع خلايا الدم الحمراء Total red blood cells count (7.62±0.46) (RBCs)، محتوى الهيموغلوبين(11.62±0.53) Hemoglobin content (HB)، حجم رصيص الدم(PCV) Packed cell volume (29.02±1.45) ومستوى الصفيحات الدمويةPlatelets (341.80±67.57)(PLT)بعد 14 يوم من الجريع اليومي وبالجرعة 0.06 ملغم/كغم من وزن الجسم مقارنة مع مجموعة السيطرة. اكدت نتائج الدراسة حصول زيادة معنوية (p ≤0.05) بعد 28 يوم من التجريع الفموي في محتوى HB (26.18±3.48) , PCV (77.72±12.15)وباعدادRBCs (16.52±1.23) عند الجرعة 0.06 ملغم/كغم من وزن الجسم في حين بينت الدراسة ان الزيادة معنوية (p ≤0.05) باعدادPLT (1156.80±74.36) عند الجرعة 0.12 ملغم/كغم من وزن الجسم، كذلك اكدت نتائج الدراسة حصول انخفاض معنوي (p≤0.05) بالعدد الكلي لخلايا الدم البيضاءTotal white blood cells count (WBCs) بعد 14 يوم من التجريع الفموي اليومي ولجميع الجرع (0.06 ،0.12 و0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم (3.83±1.01 و(6.74±1.46, 5.98±0.57 على التوالي. في حين اظهرت النتائج ل (WBCs) بعد 28 يوم من التجريع الفموي اليومي انخفاضا معنويا (p ≤0.05) عند الجرعتين 0.06 و0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم 6.80±1.21) و(7.01±0.96 على التوالي بينما في الجرعة 0.12 ملغم/كغم من وزن الجسم اظهرت النتائج زيادة معنوية (p ≤0.05) (11.26±1.46) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اظهر مستوى الخلايا اللمفاويةLymphocytes cells ( (LYM انخفاضا معنويا (p ≤0.05) في 14 يوم بعد التجريع الفموي ولجميع الجرع 0.06، 0.12 و0.18 ملغم/طغم من وزن الجسم (3.70 ± 0.22، 4.10 ± 0.91 و2.46 ± 0.52) على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة؛ بينما بعد 28 يوم من التجريع الفموي كان التاثير غير معنوي( (p ≥0.05 للجرعتين 0.12 و0.18 ملغم/كغم من وزن الجسم (6.32 ± 0.64 و6.80 ± 1.21) على التوالي مقارنة مع مجموعة السيطرة ، النتائج اظهرت انخفاض غير معنوي ( (p ≥0.05 في جرعة 0.06 ملغم/كغم من وزن الجسم للفترتين 14 و28 يوم من التجريع الفموي. التجربة الثانية (التاثيرات المزمنة) : الهدف من الدراسة هو تحديد الاثار المترتبة على تركيز اقل من ADI هو 0.03 ملغم/كغم من وزن الجسم بعد تناوله عن طريق الفم وملاحظة التاثيرات المختلفة للتركيز المذكور على نفس المعايير السابقة التي درست في التجربة الاولى ، فحصت التاثيرات بعد 45، 60، و90 يوم من التجريع الفموي اليومي، اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p ≤0.05) في اوزن اعضاء الكبد، الكلى والطحال وسجلت اقل انخفاض بوزن الكبد (0.820±0.07) ووزن الكلى (0.160±0.02) بعد 60 يوما من التجريع الفموي بينما سجل الطحال سجل اقل انخفاض بعد 45 يوما (0.120±0.02). اظهرت النتائج زيادة معنوية (p ≤0.05) في مستويات انزيمات الكبد حيث سجلت اعلى ارتفاع بمستوي انزيم 31.60±0.62)AST) وانزيم ALT (23.54±4.69) بعد فترة 90 يوم من التجريع الفموي وللانزيم .64±8.81)ALP 75) بعد 45 يوم من التجريع الفموي ، كذلك حصول زيادة معنوية (p ≤0.05) بمستويات معايير وظائف الكلى مصل الكرياتنين (1.14±0.08) واليوريا (56.40±1.58) بعد 90 يوم من التجريع الفموي. اكدت نتائج الدراسة حصول انخفاض معنوي (p ≤0.05) باعداد كريات الدم الحمراء (RBCs)، محتوى الهيموغلوبين (HB)، حجم رصيص الدم (PCV)ومستوى الصفيحات الدموية (PLT) بنسب متفاوتة ولجميع الفترات الزمنية، كذلك حصول انخفاض معنوي (p ≤0.05) باعداد كريات الدم البيضاء (WBCs) (4.16±0.30) والخلايا اللمفاوية ( 2.50±1.69) (LYM) بعد 45 يوم من التجريع الفموي | This study conducted to determine the effect of different concentrations of the insecticide Imidacloprid (IMD) at 204 male Swiss mice aged 8 - 12 weeks with a body weight ranged between 20 - 25 g, and divided into two main experiments : The first experiment) Subchronic effects) : experiments conducted in order to determine the acceptable daily intake (ADI) 0.06 mg/kg from body weight, with different concentration (0.12, 0.18mg/kg.bw) and showed different effects of different concentration at weight of organs like (liver, kidney and spleen). The results demonstrated many changes in liver enzymes, kidney function parameters and hematological changes for the previous organs. The effects have been examined after 14, 28 fallowing daily oral administration, also results showed a significant decrease (p ≤0.05) in the weight of organs liver, kidney and spleen, which recorded less weight for liver (0.720±0.04), kidney (0.140±0.024) and spleen (0.40±0.005) after 14 days of oral administration with insecticide (IMD) at dose 0.18 mg/kg.bw; while experiment conducted at 28 days of oral administration non - significant (p ≥0.05) decrease in liver, kidney and spleen weight at all doses 0.06, 0.12 and 0.18mg/kg.bw. Results at 14 days fallowing daily oral administration illustrated a significant increase (p ≤0.05) in Aspartate aminotransferase (AST) and alkaline phosphatase (ALP) levels at dose 0.12 and 0.18mg/kg.bw, AST (27.40±2.34 ; 31.10±0.65) and ALP (82.84±7.20 ; 49.04±1.07) respectively, all measurement experiments were compared with control group, while alanine aminotransferase (ALT) level recorded a significant decrease (p ≤0.05) at dose 0.06 and 0.18mg/kg.bw (13.80±0.45 and 12.36±0.51) respectively. The results illustrated a significant increase (p ≤0.05) at level of enzymes AST (36.96±5.04), ALT level (24.90±1.52) and ALP (62.52±8.10) after 28 days of daily oral administration at dose 0.18 mg/kg.bw in comparison with control group. Also found a significant increase (p ≤0.05) at levels of kidney function parameters serum creatinine (0.920±0.10) and urea (47.20±2.35) after 14 days from oral daily administration at dose 0.06 mg/kg.bw; however at 28 days after administration there was non - significant effect (p ≥0.05) in creatinine and urea at all doses (0.06, 0.12 and 0.18 mg/kg.bw) in comparison with control group. The results showed a significant decrease (p ≤0.05) in total red blood cells count (RBCs) (7.62±0.46), Hemoglobin content (HB) (11.62±0.53), packed cell values (PCV) (29.02±1.45) and Platelets (PLT) (341.80±67.57) following 14 days from oral administration at dose 0.06 mg/kg.bw in comparison with control group. While the results of study demonstrate a significant increase (p ≤0.05) after 28 days from oral administration in HB (26.18±3.48), PCV (77.72±12.15) content and numbers of RBCs (16.52±1.23) at dose 0.06 mg/kg.bw however the study show a significant increase (p ≤0.05) in number of PLT(1156.80±74.36) at dose 0.12 mg/kg.bw , as well as the results of study confirmed a significant decrease (p ≤0.05) in number of total white blood cells count (WBCs) after 14 days following daily oral administration at all doses 0.06, 0.12and 0.18mg/kg.bw (6.74±1.46, 5.98±0.57 and 3.83±1.01) respectively; while the results of (WBCs) at 28 days after administration showed a significant decrease (p ≤0.05) at doses 0.06 and 0.18mg/kg.bw(7.01±0.96 and 6.80±1.21) respectively while at 0.12mg/kg.bw the results showed a significant increase (p ≤0.05) (11.26±1.46) in comparison with control group. The level of Lymphocytes cells (LYM) showed a significant decrease (p ≤0.05) at 14 days after administration at all doses 0.06, 0.12 and 0,18 mg/kg.bw(3.70±0.22, 4.10±0.91 and 2.46±0.52) respectively in comparison with control group ; while at 28 days after administration there was non - significant effect (p ≥0.05) at dose 0.12 and 0.18 mg/kg.bw (6.32±0.64 and 6.80±1.21) respectively in comparison with control group and the results showed a non - significant decrease (p ≥0.05) at dose 0.06mg/kg.bw for two periods 14 and 28 days after administration. The second experiment (Chronic effects ) : The aim of this study was to determine the effects of concentration less than ADI which 0.03 mg/kg.bw in oral administration and note the different effects of the obvious concentration at same parameters studying in first experiment , the effects have been examined after 45, 60 and 90 days after oral administration. The results demonstrated a significant decrease (p ≤0.05) in weight organs liver , kidney and spleen , results recorded less weight for liver (0.820±0.07) , kidney (0.160±0.020) after 60 days from oral administration either spleen weight recorded less decline in period 45 days (0.120±0.02), also results showed a significant increase (p ≤0.05) at levels of liver enzymes and recorded a highest increase for AST level (31.60±0.62), ALT level (23.54±4.69) after 90 days from administration , either enzymes ALP (75.64±8.81) after 45 days from administration , also happen a significant increase (p ≤0.05) at levels of kidney function parameters ,serum creatinine (1.14±0.08) and urea (56.40±1.58) after 90 days from administration. The results of study confirmed happen a significant decrease (p ≤0.05) in number of (RBCs), (HB), (PCV) and (PLT) in varying degrees and for all periods, also happen a significant decrease (p ≤0.05) in number of (WBCs) (4.16±0.30) and (LYM) (2.50±1.69) after 90 days from oral daily administration.

دراسة وراثية خلوية وجزيئية بين عينة من المرضى المصابين بالهوجكنزلمفوما Cytogenetic and molecular study among Hodgkin’s lymphoma patients

اسم المؤلف: اسراء حسين حمزة
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي عبد الحسين مويت الفيصل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة لفحص وتحديد نسبة انتشار التناقل الكروموسومي لكروموسومي (14و18) الذي يحدث بين جين bcl2و JH في بعض المرضى العراقين المصابين بسرطان الهوجكن لمفوما وايضا تم التحرى عن جين (BNRF1)الخاص بفايروس (EBV)كذلك تم التحرى عن التشوهات الكروموسومية بواسطة استخدام تقنية التهجين الموضعي . تضمنت الدراسة 75 عينة من المرضى المصابين (25 عينة من الدم و50 عين من الخزع النسيجية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين) مع عشر عينات من الخزع النسيجية التابعة لمرضى الاورام الحميدة .تم جمع الدم من وحدة امراض الدم في مستشفى بغداد في مدينة الطب ببغداد. اما الخزع النسيجية فقد جمعت من مختبرات الامراض النسيجية في مختلف المستشفيات خلال الفترة من شهر ايلول لعام 2013 لغاية شهر اذار لعام 2014. ان تحديد وفحص التناقل الكرموسومي )14;18) تضمن المناطق المتغايرة بالجين الورمي bcl2 وهي منطقة الانكسار الرئيسية MBR التي تقع بالجزء الغير مشفر بالنهاية 3ʹومنطقة الانكسار الثانوية MCR ولتحديد علاقة هذه المناطق بالتناقل الكروموسومي فقد تم استخدام تسعة بوادى امامية من الجين الورمي bcl2 وبادئ واحد عكسي من جين JH بالاضافة الى السيطرة الموجبة لكل منطقة انكسار والذي تم تصنيعه في المختبر باستخدام تقنية الربط وبناء القطع والذي يعتبر اول دراسة في هذا المجال في العراق والشرق الاوسط. .تم تضخيم الحامض النووي دنا(DNA ) لكل عينات المرضى المصابة بسرطان الهوجكنز لمفوما وعينات المستخدمة للسيطرة بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل PCR والتتابع المباشر والتي تضمنت استخدام ثلاث مجاميع من البوادئ لتغطية المناطق الانكسار المراد فحصها على الجين الورميbcl2 على كروموسوم 18. وقد تم تصميم هذه البوادئ باستعمال برامج NCBI (Primer plus 3) حيث تم تصميم بوادئ امامية لكل من (MBR(MBR1,MBR2) و3MBR(3MBR1, 3MBR2, 3MBR3, 3MBR4) وMCR(MCR1,MCR2, 5MCR)) وتم تصميم بادئ عكسي من جينJH لكل هذه البوادئ الامامية وتم استخدامهم لكل العينات المراد فحصها للانتقال الكروموسومي (14و18) كل على انفراد وباستخدام سيطرة موجبة للفحص والذي تم تصنيعه بالمختبر باستخدام تقنية التضخيم المتداخل والتضخيم متعدد الارسال. وقد تم ضبط ظروف التضخيم وحسب البوادئ المستخدمة وفحص الناتج بواسطة الترحيل الكهربائي لتحديد العينات الموجبة للتناقل ثم تحديد موقع التناقل بواسطة طريقة التتابع المباشر ومقارنتها مع التتابع المباشر للسيطرة الموجبة. كما تم استخدام الدنا المستخلص سابقا لتحديد وجود جين BNRF1 الخاص بفايرس EBVبواسطة استخدام تقنية التضخيم العددي ((qRT - PCR واستخدام تتابع نيوكليوتيدي (بادئ) ومجس خاص . بالاضافة الى استخدام تقنية التهجين الموضعي لتحديد التشوهات الكرموسومية في بعض من عينات الخزع النسيجية المثبتة على سلايدات التهجين الخاصة بذلك .وقد اظهرت الدراسة النتائج التالية : هناك فروق معنوية عالية (p<0.01) بين العوامل المتغيرة في التجربة كما اوضحت النتائج ان نسبة انتشار المرض كان بالاعمار البالغين بين (60 - 70) سنة بنسبة (25.33%) وبالنسبة للجنس فقد حقق جنس الذكور نسبة حدوث اكثر من الاناث وبنسبة (58.67%) اما بالنسبة الى نوع المرض فقد سجل نوع Mixed cellularity اعلى نسبة حدوث بالنسبة للانواع الاخرى من المرض (53.33%)اما بالنسبة الى موقع العقد اللمفاوية المصابة بالورم فكانت اكثر الاماكن اصابة وحدوث الورم هي العقد اللمفاوية العنقية (53.33%) . واظهرت نتائج الدراسة ان نسبة انتشار الانحراف الكروموسومي للجين الورمي في المرضى المصابين بورم الهوجكن ظهر في 26(35%) عينة موجبة وكان 5(19.2%) منهم بمنطقة الانكسار MBR1 و4(15.38%)في منطقة الانكسار MBR2 و3(11.5%) في منطقة 3MBR1 و2(8%) في منطقة 3MBR2 و7(27%) في منطقة 3MBR4 ولم تظهر اي نتيجة موجبة في المنطقة 3MBR3 اما بالنسبة الى مناطق الانكسار الثانوية فقد سجلت 4(15.38) في منطقة الانكسارMCR1 و1(4%) في منطقة MCR2 و2(8%) في منطقة الانكسار 5MCR ولم تسجل اي نتيجة موجبة بالنسبة للعينات الاورام الحميدة المستخدمة للسيطرة . وبهذا فقد بينت النتائج ان نسبة انتشار الانحراف كانت في مناطق الانكسار الرئيسية اكثر من مناطق الانكسار الثانوية. وبالنسبة الى العمر فان نسبة الانتشار كانت باعمار البالغين والاكثر عند الذكور وبفروق معنوية عالية ايضا. بعد تحليل النتائج بواسطة طريقة التتابع المباشرة ومقارنتها بنتائج الموقع العالمي للمعلومات الجينية (NCBI) ومقارنتها كذلك مع تتابع السيطرة الموجبة . تم تقديم العينات ذات الحجم المساوي الى bp200 او اكثر الى بنك الجينات في المواقع العالمية لتسجيل التتابعات الجينية حيث تم تسجيلها في الموقع الامريكي ال(Gene Bank) وتم تسيجلها في الموقع الاوربي (EMBL) كذلك تم التمكن من تسجيلها في الموقع الياباني لبنك الجينات (DDBJ) وتم الموافقة ونشرت تحت عنوان : (Homo sapiens DNA, IGH/BCL2 transition region, isolate : hodgkins - bcl2 - t (14 - 18) mbr - p.)واعطيت ارقام تعليم خاصة بها في بنك الجينات تبدا من (LC041134 - LC041142) واعتبرت كمصدر عن معلومات العراقيين الجينية والتي تعتبر قليلة ضمن بنك الجينات العالمي. كما اظهرت النتائج وجود 40(53.33%) حالة موجبة وبفروق معنوية عالية لجين الابشتاين بار فايروس لمرضى الاورام اللمفية الهوجكن مقارنة بالاورام الحميدة التي لم تظهر اي نتيجة موجبة . اضافة الى ذلك اظهرت النتائج ان اكثر المرضى المصابين بالفايروس كانوا من جنس الذكور ومن نوع Mixed cellularity HL . في مايتعلق باختبار التهجين الموضعي فقد اظهرت النتائج وجود عينة واحدة موجبة للفحص من اصل 6 عينات. نستنتج من هذه الدراسة ان تحديد الانتقال الكروموسومي (14;18) في مرضى الاورام اللمفية الهوجكن يمكن تحديدها باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وباستخدام عدة بوادئ لكل مناطق الانكسار الرئيسية والثانوية .اضافة الى استنتاج دقة اختبار التضخيم الكمي في تقيم وتحديد الفايرس ومن الممكن اعتبارها كوسيلة لتشخيص الاورام اللمفية واي نوع من السرطان ذات العلاقة بالفايرس والذي يعتبر كمؤشر للورم.اما بالنسبة لتقنية التهجين الموضعي فقد تبين انها ادق من تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وذلك بسبب كبر حجم المجس الضوئي المستخدم للفحص . | The study was design to investigate and to determine the frequency of chromosomal translocation involve the bcl2 and JH genes t (14, 18) (q32; q21) in some of Hodgkin’s lymphoma Iraqi patients. The study also aimed to detect the BNRF1 gene of EBV in patients and using FISH technique for other chromosomal aberrations in the same patients. The study include 75 Iraqi patients with Hodgkin’s lymphoma (25 samples as blood and 50 samples as formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue blocks) and 10 samples as reactive hyperplasia blocks for control. The blood samples were collected from hematology unit in Baghdad hospital in medical city but paraffin blocks tissue were collected from histopathological laboratories in different hospitals during the period from September 2013 till March 2014. The detection of t (14; 18) translocation involved the hot spots regions of the bcl2 gene which included the major breakpoints region (MBR located in the 3ʹ untranslated region of bcl2 exon 3) and the minor cluster region (MCR located in the 3ʹ region of bcl2 exon 3). To detect the involvement of these regions in the t (14; 18), nine forward primers were used for bcl2 regions and one reverse primer for JH gene as well as to positive controls for each breakpoints which were prepared by synthesized artificial chromosomal translocation in laboratory by using splicing technique and construct fragments of genes and considered the first work in this field not just in Iraq or middle east but in all world. The DNA for all samples was submitted for PCR (Polymerase Chain Reaction) amplification which performed using three set of primers (multiple primers) defined multiplex PCR to detect MBR, 3ʹMBR and MCR regions on bcl2 gene on 18 chromosome, the three set primers which designed by using NCBI programs (Primer plus 3 program) as forward primer [forward MBR (MBR1,MBR2), 3MBR( 3MBR1, 3MBR2, 3MBR3, 3MBR4), MCR (MCR1, MCR2, 5MCR) and reverse primers (reverse JH used ) in which case each of primer sets forward were used to evaluate the transposition of t (14;18) separately for the same samples with positive control for each breakpoint that was synthesized in lab by nested and multiple primers defined multiplex PCR. The PCR conditions were optimized according to suitable sets of primers used for reproducing the replacement. By gel electrophoresis for the products to identify the fragments with juxtaposed bcl2 and IGH JH enhancer positive and subjected for genotype analysis [these artificial breakpoints (positive control) and each positive samples for t(14, 18) assay] by using Sanger method with Agencourt® CleanSEQ® dye - terminator Removal Kit for direct sequence analysis. The DNA which was extracted before was also used to detect the existence of BNRF1 gene specific for EBV loaded in patients samples by using real time quantitation PCR (qRT - PCR) with specific primer and probe. In addition to use FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) technique to detect abnormal chromosome in tissue samples with the PathVysion Kit applied on tissue section fixed on positive charge slides (thermo fisher scientific). The unstained 3 µm sections of six samples were tested for t (14; 18) using a dual color - dual fusion translocation probes set (Vysis LSI IgH/ BCL2; Abbott Molecular). A total of 200 interphase nuclei were enumerated and scored for the presence of two fusion signals per nuclei. The results in this study showed high significant (P<0.01) between parameters. The results reported that the age of HL patients in the current study ranged between 10 - 80 years and more incidences in old adult with the age range (60 - 70) years (25.33%). There were males predominance among HL patients 44(58.67%) than females 31(41.33%) with high significant (P<0.01). The highest subtype HL number was recorded in mixed cellularity (MC) (53.33%). The cervical lymph node was recorded the highest infected site and included tumor 53.33% than other sites of lymph node and according to stage of disease , most cases in the current study were stage II (72%). Regard to the t (14;18) chromosomal translocation the results noticed a total of 26(35%) positive cases showed IGH/BCL2 gene rearrangement with high significant compared with control. 5 (19.2%) for major breakpoint MBR1, 4(15.38%) for MBR2 and (3(11.5%);2(8%);7(27%)) for 3ʹMBR1, 3ʹMBR2 and 3ʹMBR4 respectively but no cases positive for 3ʹMBR3 while (MCR1, MCR2, 5ʹMCR) were recorded in (4(15.38%); 1(4%); 2(8%)) respectively. And (0%) in reactive hyperplasia for control. The results indicate higher frequency of breakpoints in the MBR regions than MCR cluster region, and the incidence of t (14; 18) translocation was increased in adult’s age depending on age while depending on gander the incidence among males was high. After the sequence analysis for all breakpoints sequence and compared with NCBI by (http : //blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) and compared with construct fragment sequence (positive control). The breakpoints sequence that its product size equal 200 bp or more that were submitted to the NCBI (National Center for Biotechnology Information) site for registration in the Gene Bank database, (DNA Data Bank of Japan) (DDBJ) and in the EMBL (European Molecular Biology Laboratory) and accepted in these three international sites for bioinformatics, thus published under title (Homo sapiens DNA, IGH/BCL2 transition region, isolate : hodgkins - bcl2 - t(14 - 18) mbr - p.) with special ID number (Accession number) specific for these breakpoints sequence which is begin from (LC041134 to LC041142) in gene bank database and considered as a document reference about Iraq people data which is little in gene bank database. The EBV DNA genome encoding the non - glycosylated membrane protein (BNRF1) was detected in 40(53.33%) positive cases of 75 Hodgkin’s lymphoma samples and no cases positive for EBV in reactive hyperplasia with high significant . The majority of positive patients were males 33(82.5%) than females. In addition to the EBV was more frequently detected in mixed cellularity subtype of HL 27(67.5%). According to the FISH assay, the results showed that just one sample from six was positive for t (14; 18) translocation and this case was recorded negative results in PCR assay. In conclusion, the detection of t (14; 18) in HL patients can be achieved by PCR technique by including multiple primers for all three breakpoint regions which are MBR, 3ʹMBR, MCR and performing multiplex amplification. And the positive fragments can also be used as an indicator of minimal residual disease following treatment. The qPCR assay allows precise quantification of EBV load and can be used as a tool for diagnosis and management of EBV related lymphoma patients and for any cancers that EBV DNA may be considered as tumor biomarker. The FISH technique considered more sensitive than PCR for detection t (14, 18) because of large size of FISH probes which used in technology, the IGH probe labeled in green is about 1.5 Mb and includes nearly the entire IgH locus and 300 kb beyond the 3ʹ end and the locus - specific bcl2 probe labeled in orange about 750 kb to include the entire bcl2 gene sequence and additional sequence extending about 250 kb distal and proximal to the ge

الجوانب المناعية والفسلجية خلال صيام رمضان IMMUNOLOGICAL and PHYSIOLOGICAL ASPECTS DURING RAMADAN FASTING

اسم المؤلف: احمد فرحان شلال
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري كاظم عبد الامير محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: الحيوان - المناعة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف الدراسة الحالية لتقييم تاثير صيام شهر رمضان على بعض المعاير المناعية والفسلجية,اذ شملت الفحوصات المناعية قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية Immunoglobulin G , Immunoglobulin A Immunoglobulin M, (IgM,IgG,IgA) والحركيات الخلويةTumor Necrosis factor - alpha (TNF - α), Interferon - Gamma(IFN - γ) , Interleukin - 4(IL - 4), Interleukin - 17A (IL - 17A), Transforming growth factor - β (TGF - β) في مصل الدم. اما الفحوصات الفسلجية فقد شملت قياس مستوى بعض الهرمونات الجنسية Luteinizing hormone ,Follicle - stimulating hormone(FSH) (LH) , Testosteroneوانزيمات الكبد ,Aspartate Transaminase (AST) Alanine(ALT) ,Transaminase , Alkaline phosphatase (ALP) بالاضافة الى تاثير الصيام على ضغط الدم ووزن الجسم Body weight and Blood pressure.اجريت الاختبارات على اربعين شخصا حيث كان جميعهم ذكور, غيرمتزوجين,غير مدخنين,اصحاء ظاهريا واعمارهم مابين ((30 - 20 سنة.استخدم فحص Single Radial Immuno Diffusion (SRID)) ) لقياس مستويات الكلوبيولينات المناعية قبل الصيام كمجموعة ضابطة وبعد (14) و(28) يوم من الصيام . استخدمت تقنية (ELISA) لقياس مستوى الحركيات الخلوية قبل وخلال الصيام فيما تم قياس تراكيز الهرمونات باستخدام جهاز (TOSOH) بالاضافة الى قياس فعالية الانزيمات وضغط الدم ووزن الجسم . اظهرت نتائج الدراسة بان هناك انخفاضا معنويا في مستوى IgA)) عند مستوى احتمالية(P<0.05) حيث كان متوسط مستوياته قبل الصيام ( (189.693mg/dlوانخفض الى (107.260mg/dl) ثم الى (67.668mg/dl) خلال (14 ) و(28) يوم من الصيام على التوالي. لوحظ انخفاضا غير معنوي في تركيز (IgG). حيث كانت نتائج (14) و(28) يوما (1792. 15 mg/dl) ، (1501.08mg/dl) على التوالي مقارنة مع القيمة قبل الصيام (1878.63mg/dl). واظهرت الدراسة انه ليس للصيام تاثيرا على تركيز (IgM) حيث كانت قيمة متوسطة خلال (14) يوم 258.150mg/dl)) وفي (28) يوم من الصيام كانت (263.425mg/dl) بالمقارنة مع القيمة قبل الصيام (255.705mg/dl). بينت نتائج الدراسة بان الصيام يؤدي الى تغيير في المؤشرات الالتهابية(TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β) , ففي الوقت الذي كان متوسط تركيز (TNF - α) قبل الصيام (12.288pg/dl)انخفض معنويا(P<0.05) للفترة (14) و(28) يوم من الصيام الى (9.978pg/dl) ، (7.698pg/dl) على التوالي . بينت الدراسة كذلك حدوث انخفاضا معنويا(P<0.05) في تركيز (IFN - γ) بعد (14) يوم (38.880pg/dl) وبعد (28) يوم الى (28.668pg/dl) بعد ان كان قبل الصيام (48.223pg/dl). واوضحت الدراسة بان الصيام كان له تاثير في حصول زيادة معنوية(P<0.05) في تركيز (IL - 4) حيث كانت قيمة متوسطة الفترة (14) يوم من الصيام (18.808 pg/dl) اما بعد (28) فكانت ( 24.100 pg/dl) مقارنة بالقيمة قبل الصيام التي كانت (13.323 pg/dl) . ومن نتائج الدراسة ايضا العلاقة بين الصيام والانخفاض في تركيز ( IL - 17A ) ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا حيث كانت متوسط تركيزة قبل الصيام (37.52 pg/dl) فيما كانت قيم متوسطات للفترة (14) و(28) يوم من الصيام (31.69 pg/dl ) ، (28.99 pg/dl ) على التوالي . فيما اظهرت النتائج حدوث زيادة معنوية(P<0.05) في تركيز (TGF - β ) حيث بلغت قيم المتوسطات للفترة (14) و(28) يوما من الصيام (pg/dl 54.70 ) ، (pg/dl 62.15) على التوالي مقارنة مع القيمة قبل الصيام حيث كانت (48.80 pg/dl). اما بشان الهرمونات الجنسية فقد بينت النتائج حدوث زيادة غير معنوية في تركيز (FSH) حيث كانت قبل الصيام (mIU/mL 9.810) وبعد (14) ، (28) يوما من الصيام (mIU/mL 10.715) ، (mIU/mL 12.028) على التوالي . فيما اظهرت انخفاضا في تركيز (LH) ولكن لم يكن معنويا, ففي الوقت الذي كان متوسط مستواه قبل الصيام (mIU/mL 6.628) انخفضت في الايام (14)، (28) الى (mIU/mL 5.988) ، (mIU/mL 5.393) على التوالي . كما اظهرت حدوث انخفاضا غير معنوي في تركيز(Testosterone) ، اذ كانت قيمته قبل الصيام (ng/dl 430.85)اما وخلال الايام (14) و(28)فكانت (398.59 ng/dl) ، (ng/dl 381.30) على التوالي . كان للصيام تاثيرا في مستويات انزيمات الكبد فبالنسبة للانزيم (AST) كانت قيمة قبل الصيام (U/L 11.545) مقارنة مع قيم المتوسطات في الفترة (14) ، (28) حيث كانت القيم (10.020 U/L ) ، (U/L 8.963) على التوالي ، وعند مقارنة قيم المتوسطات فكانت معنوية(P<0.05) ما بين فترة قبل الصيام وخلال الصيام. كما امتد تاثير الصيام على انزيم (ALT) فقد انخفضت مستوياته كذلك ولم يكن معنويا اذ بلغت قيم المتوسطات قبل وخلال (14) و(28) حيث كانت القيم (U/L 12.448) ، (U/L 11.353) ، (10.798 U/L) على التوالي . وكذلك لوحظ انخفاضا طفيفا غير معنوي في نشاط انزيم (ALP) فكانت على التوالي وللفترات قبل الصيام بعد 14،28 يوما هي(U/L 52.86) (U/L 50.72) ، (U/L 48.18). واظهرت نتائج الدراسة حدوث انخفاضا معنويا(P<0.05) في ضغط الدم الشرياني الانقباضي والانبساطي Systolic and Diastolic pressure اذ كانت قيمة متوسط ضغط الدم الانقباضي خلال (14) و(28) (mmHg 11.550) ، (mmHg 10.800) على التوالي بعد ان كان قبل الصيام (mmHg 12.375). اما بالنسبة للضغط الانبساطي Diastolic Pressure كانت النتيجة حدوث انخفاضا معنويا (P<0.05)حيث كانت قيم المتوسطات للفترة قبل الصيام و(14) و(28) (8.150 mmHg) ، (mmHg 7.375) ،( mmHg 7.075) على التوالي. اظهرت الدراسة كذلك حصول انخفاضا غير معنويا في وزن الجسم حيث كانت قيم المتوسطات (S.E Kg± M 67.575) ، (Kg S.E ±65.808 M ) ، (64.300 M ±S.E Kg) للفترات (قبل الصيام وبعد 14 و28 يوما ) على التوالي. | The objective of the present study is to assess the effect of Ramadan fasting on some immunological and physiological parameters. Immunological studies included measurement of immunoglobulins (Igs) : Immunoglobulin A , Immunoglobulin G and Immunoglobulin M (IgA,IgG,IgM),cytokines : Tumor Necrosis factor - alpha , Interferon - gamma , Interleukin - 4 , Interleukin - 17A and Transforming growth factor - beta (TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β). Physiological studies involved serum levels of some sex hormones : Follicle - stimulating hormone, Luteinizing hormone and Testosterone (FSH, LH), Liver enzymes : Aspartate Transaminase, Alanine Transaminase and Alkaline phosphatase (AST, ALT, ALP) in addition to the body weight and arterial Blood pressure. These tests were done on sample of forty apparently healthy males who were single; non - smoker and their age range were 20 - 30 years. Single Radial Immuno Diffusion (SRID) was used to measure immunoglobulin levels before fasting (as a control group) and after (14, 28) days of fasting. Enzyme - linked Immune Sorbent Assay (ELISA) technique was used to measure cytokines levels before and during fasting while concentration of hormones were measured by using (TOSOH) system, in addition to measuring activity of enzymes, body weight and arterial blood pressure. The results showed that, there was a significant decrease (P<0.05) in the serum IgA level. The mean value of pre - fasting was 189.693 mg/dl and decreased to 107.2 mg/dl, and then to 67.6 mg/dl during 14, 28 days of fasting respectively. In addition a decrease in IgG level during fasting but statistically was not significant. The results for 14 and 28 days were 1792.1 mg/dl, 1501.0 mg/dl respectively in comparison to its value at the pre - fasting days of Ramadan which was 1878.6 mg/dl. The study showed that, IgM level was not affected by fasting. The mean value during the 14th day of fasting was 258.1 mg/dl and in the 28th day was 263.4 mg/dl in comparison to its value at the pre - fasting 255.7 mg/dl.The study demonstrated that fasting lead to change in inflammatory markers(TNF - α, IFN - γ, IL - 4, IL - 17A, TGF - β). Mean concentration of TNF - α for pre - fasting days was 12.288 pg/dl and decrease statistically (P<0.05) during period of the 14th and 28th days of fasting to 9.978 pg/dl, 7.698 pg/dl respectively. The study proved as well a significant decrease (P<0.05) in concentration of IFN - γ after 14 days of fasting to 38.880 pg/dl and after 28 days to 28.668 pg/dl after it was at the pre - fasting 48.223pg/dl. The study showed that fasting causes a significantly an increase (P<0.05) in concentration of IL - 4. The mean value of the 14th day was 18.808 pg/dl and after 28 days it was 24.100 pg/dl in comparison to its value at the pre - fasting days which was 13.323 pg/dl. From the results of this study also, the fasting caused decrease in concentration of IL - 17A, but the decreasing was not significant. The mean concentration of IL - 17A for pre - fasting days was 37.52 pg/dl and mean values of the 14 and 28 days of fasting were 31.69 pg/dl, 28.99 pg/dl, respectively. The results showed that fasting caused a significant increase (P<0.05) in concentration of TGF - β. The means values for 14 and 28 days of fasting were 54.70 pg/dl and 62.15 pg/dl respectively in comparison to its value at the pre - fasting days of Ramadan which was 48.80 g/dl. A non - significant increase in the serum level of FSH also recorded. The mean value of pre - fasting was 9.810 mIU/mL, and after 14, 28 days of fasting were 10.715 mIU/mL and 12.028 mIU/mL respectively. The study showed a decrease in LH concentration but it does not reach to be significant. Mean level of pre - fasting days was 6.628 mIU/mL and decreased in 14 and 28 days of fasting to 5.988mIU/mL and 5.393mIU/mL respectively. The study showed as well a decrease in concentration of Testosterone even it was not significant. Its value of pre - fasting day was 430.85 ng/dl and during the 14th and 28th days were 398.59ng/dl and 381.30ng/dl respectively. Fasting also affects the levels of liver enzymes. The mean value of AST for pre - fasting days was 11.545U/L compared with the means values after 14 and 28 days of fasting which were 10.020 U/L and 8.963U/L, respectively. These values were significantly (P<0.05) differ between pre - fasting and the two fasting periods. ALT enzyme also underwent some changes under the effect of fasting. ALT decreased in its levels but not significantly.The means values of pre - fasting, (14), (28) days of fasting were 12.448U/L, 11.353U/L and 10.798 U/L, respectively. Also a slight decreasing in enzyme activity of (ALP) had been noticed. The mean values of (ALP) for the pre - fasting, 14th, 28th days of fasting were 52.86U/L, 50.72U/L and 48.18 U/L, respectively. The study showed a significant decrease (P<0.05) in systolic and diastolic pressure. The means value of systolic pressure after 14 and 28 days of fasting were 11.550 mmHg and 10.800 mmHg respectively after it was at the pre - fasting 12.375 mmHg. The means values of diastolic blood pressure for the pre - fasting, 14 and 28 days of fasting were 8.150 mmHg, 7.375mmHg and 7.075 mmHg respectively. The study showed as well a decrease in body weight but non - significant. The means values of body weights were 67.575 M ±S.E /Kg, 65.808 M ±S.E /Kg and 64.300M ±S.E /Kg for periods (pre - fasting, 14 and 28 days), respectively

دراسة بكتريولوجية وجزيئية للجين norA في بكتريا Staphylococcus species المقاومة للمثيسيلين Bacteriological and molecular study of norA gene in Methicillin Resistant Staphylococcus species bacteria

اسم المؤلف: احلام خليفة عبد الله التميمي
اسم المشرف: محمد فرج شذر المرجاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred clinical isolates of methecillin resistant Staphylococcus spp. were collected from different sources including : (80,10,5,3,2) isolates from wounds, blood, urine, pus, otitis media respectively from different hospitals in Baghdad during the period from 1/9/2013to 1/1/2014. All isolates were identified through morphological, cultural and some biochemical testes. Coagulase test was performed done by using both tube and slide method The results showed that 75% of isolated were positive for this test which refer to Staphylococcus aureus, and 25% were Coagulase negative Staphylococci (CoNS) .The antibiotic susceptibility test against 10 antimicrobials were determined by the agar diffusion method ; Results showed that all isolates were resistant to ceftriaxone, cloxacillin and aztreonam. The most effective antibiotic aganist isolates were ciprofloxacin and norfloxacin. The Minimum inhibitory concentrations (MICs) for ciprofloxacin and norfloxacin were determined by agar dilution method .The MIC isolates ranged from 4 to 1024 μg/ml for both antibiotics. On the other hand the minimum inhibitory concentrations (MICs) were determined for quartenary ammonium compounds and chloroxylenole . Results revealed that MIC for chloroxylenole were 50 - 500μg/ml and 500μg/ml for quartenary ammonium compounds.Thirty Four of methicillin resistant isolates were choosen for detect efflux pumps by using Ethidium Bromide - Agar Cartweel Methode (EtBrCW), which include ethidium bromide dye as marker to detect efflux pumps, the result showed that 18 isolates(52.9%) give positive result, 3 isolates (8.82%) were intermediate, wherase remaining isolates 13 isolates(38.29%) were give negative result.Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the norA gene, The results showed that norA found in 16 isolates (47%). Nucleotide sequence for norA gene in 9 isolates were determined ,results revealed consistency reaching up to 90 % as compared nitrogen bases sequence of the norA gene present in the Staphylococcus aureus strain in NCBI Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction and cDNA syenthesis , the result showed that gene expression were various among isolates , and the gene expression increase with increasing MIC of ciprofloxacin and norfloxacin.The effect of biosurfactant as efflux inhibitors was tested by detection of MIC for ciprofloxacin alone and mixed with biosurfactant , the result showed ability of biosurfactant in decreasing the MIC to two or four - fold in the presence of inhibitor this refer to biosurfactant effective material against NorA efflux pump.

تثبيـط نمو وتكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa بالبروتينات المنتجة من خـمـيرة cerevisiae Saccharomyces Inhibition of Pseudomonas aeruginosa Biofilm formation and Growth by inhibitory Proteins Produced by Saccharomyces cerevisiae

اسم المؤلف: احسان علي رحيم السوداني
اسم المشرف: نبراس نزار محمود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 207عينة سريرية من بعض مستشفيات بغداد ولفئات عمرية مختلفة ولكلا الجنسين للفترة من 15/10/2013 - 15/1/2014 وعزلتﹸ وشخصتﹸ 68 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومن مصادر مختلفة شملت (28) عينة من الحروق و(21) من اخماج الجروح و(6) اخماج المسالك البولية و(6) من اخماج الاذن الوسطى و(4) من التهاب البلعوم و(3) من القشع. شخصتﹸ العزلات البكتيرية اعتمادا على صفات المستعمرات المظهرية والمجهرية عند تنميتها في الاوساط الزرعية التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام Vitek2 compact كخطوة تكميلية . استعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Agar Method(CRA) وطريقة اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates method (MTP).اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت الاكثر دقة في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي , اذ لوحظ ان (28)عزلة من اصل (68) عزلة كانت مكونة للغشاء الحيوي , في حين كانت (40) عزلة غير مكونة للغشاء الحيوي قياسا بطريقة (CRA) التي كانت عدد العزلات المكونة للغشاء الحيوي فيها (16) عزلة و(52 ) عزلة غير مكونة للغشاء الحيوي .اخضعت العزلات المكونة للغشاء الحيوي لفحص الحساسية تجاه (17) مضادا حيويا بطريقة الاقراص , وقد تبين ان عزلات الدراسة تحمل صفة المقاومة المتعددة للمضادات (Multi drug resistance) اذ اظهرت جميع العزلات السريرية لبكتريا P.aeruginosa مقاومة بنسبة 100% للمضادات Piperacillin , Amoxicillin/Clavulanic acid , Ticarcillin/Clavulanic acid, Ceftazidime, Ceftriaxone , Aztreonam, Cefoxitin , Çefodizime, Trimethoprim/Sulphamethoxazole , Nalidixic Acid , Rifampicin , ثـم تـدرجت مــقاومة البكــتريا لـبقية المــضادات ,فــي حيـــن كانـــت حساسة لمضاد Imipenem بنسبة 100%. قدر التركيز المثبط الادنى (MIC) لعزلات بكتريا P. aeruginosa باستعمال نظام compact Vitek2 وحددت النتائج بوصف البكتريا مقاومة R او حساسة S.استعملت خمائر الخبز الجافة المستوردة من مناشئ مختلفة والمتوفرة في الاسواق المحلية من اجل الحصول على عزلات لخميرة Saccharomyces cerevisiae التي شملت كل من العزلة AY من خميرة Angel الصينية المنشا والعزلة MY من خميرة Magestic الصينية المنشا والعزلة PY من خميرة Packmaya التركية المنشا والعزلة LY من خميرة Altunsa التركية المنشا، وتم التاكد من جنس الخميرة ونوعها باعتماد المفاتيح التشخيصية التي تشمل كل من الصفات المظهرية والزرعية والفحوصات الكيموحيوية.اجريت غربلة لرواشح عزلات الخميرة من اجل انتخاب العزلة الاكفا في انتاج المواد البروتينية المثبطة باستعمال طريقة الانتشار في الحـفر لمعــرفة تاثير هــذه المواد تجاه بكتريا P. aeruginosa المنتــجة للــغشاء الحــيوي قيد الدراسة , لم تظهر الرواشح الخام (غير المركزة) لعزلات خميرة S. cerevisiae اي تاثير تثبيطي ضد العزلات البكتيرية , في حين ادى تركيز راشح خميرة AY S. cerevisiae لمرة واحدة ولمرتين الى اظهار فعاليتها التثبيطية تجاه عزلات بكتريا P. aeruginosa المنــتــجة للغشاء الحيوي وبمعدل اقطار تثبيط بلغ (15.5, 20.4) ملم عـلـى الـتـوالـي . فـي حـين بــلــغ مــعــدل اقـــطارمــنطـــقــة الــتثــبيط لراشح خميرة PY S. cerevisiaeالمركز لمرة واحدة ولمرتين (13.8, 18.2) ملم على التوالي.اظهرالراشح المركز لعزلة AY S.cerevisiae المنماة في وسط Yeast Extract Glucose Peptone Broth (YEGPB) تاثيرا تثبيطيا واضحا تجاه العزلات قياسا براشح العزلة المنماة في وسط (PDB) Potato dextrose broth . عـدت مدة الحضن (24) ساعة افضل مدة زمنية تحتاجها الخميرة لتحفيز انتاج المواد المثبطة.شـملت خــطوة تنــقية البروتينات المثبطة استعمال كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع تراوحـت بــين 30 الــى 70% لتــرســيب الــبروتينات الــموجــودة فـــي وسط النمو للعزلة AY S. cerevisiae , وكان للبروتين المثبط المنقى جزئيا فعلا مضادا لنمو البكتريا . اذ بلغ التركيز المثبط الادنى للبروتين المثبط المنقى جزئيا (64) ملغرام/ملليلتر, ما عدا عزلة واحدة بلغت قيمة (MIC) لها (32) ملغرام/ملليلتر. وتباينت فعالية البروتين المثبط والمنقى جزئيا المضادة لتكوين الغشاء الحيوي على عزلات بكتريا P. aeruginosa , كانت العزلة الاكثر تحسسا للبروتين المنقى جزئيا العزلة Ps33 والاقل تحسسا لها Ps68.

دراسة لمؤشرات مناعية وحيوية في مرضى تصلب الاعصاب المنتشر Study of Certain Immuno and Biomarkers in Multiple Sclerosis Patients

اسم المؤلف: سماح خليل يحيى
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تصلب الاعصاب المنتشر مرض التهابي مزمن مجهول السبب، يتصف بفقدان الميالين (النخاعين) مع الميل الى اصابة محور الليف العصبي، ويصيب الاشخاص في الاعمار المتوسطة من حياتهم مع ارجحية اصابة النساء اكثر من الرجال.جاءت هذه الدراسة بصورة رئيسية لبحث العلاقة بين تصلب الاعصاب المتعدد وتركيز كل من البين الابيضاضي - 2 و- 10 وعامل التنخر الورمي - الفا وكذلك المؤشرات الحيوية كمستوى الدهون في الدم (الكولسترول, لشحوم الثلاثية والشحوم عالية الكثافة) , حمض اليوريك وظائف الغدة الدرقية (ثالث يود الثيرونين , الثايروكسين وهرمون تنشيط الغدة الدرقية). الى جانب ذللك , قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض. كما تناولت العلاقة بين تركيز هذة الحركيات الخلوية والمؤشرات الحيوية وعلاقتها بالجنس ومراحل تقدم المرض.اجريت هذه الدراسة على 60 مريض عراقي شخصوا بتصلب الاعصاب المتعدد وفق لمعايرMcDonald criteria وتم تصنيف المرضى المختارين الى مجموعتين : 1. المجموعة الاولى : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15اناث) تتراوحت اعمرهم من (56 - 18) سنة وهم في المرحلة الاولى من التشخيص (اي حدث لهم انتكاسة) ولم ياخذوا اي علاج.2. المجموعة الثانية : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15 اناث) تراوحت اعمرهم من (53 - 18) سنة وهم مشخصين مندو فتره ومعالجين بانترفيرون بيتا مع مثل ابردزولون الى3 ايام او 5 ايام.الى جانب ذلك‚ مجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 20 فردا (10 اناث و10 ذكور) تراوحت اعمارهم من (50 - 20) اصحاء ظاهريا والذين راجعوا الى (مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب / عيادة للكشف المبكر عن تصلب الاعصاب المتعدد) في بغداد خلال الفترة من تشرين الثاني/ 2013 الى نهاية نيسان/ 2014 للتشخيص والعلاج. تم سحب عينة (8 - 6) ملليتر من الدم الوريدي من 80 من الحالات المتضمنة في الدراسة (المرضى والسيطرة) لغرض استخدامها في الدراسة المناعية والتي تشمل قياس الحركيات الخلوية المذكورة بواسطة استعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) والمؤشرات الحيوية باستخدام جهاز ابت لقياس (مستوى الدهون في الدم وحمض اليوريك) ويستخدم جهاز توسوا لقياس (وظائف الغدة الدرقية). فضلا عن حساب العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض باستخدام جهاز روبي. توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى تصلب الاعصاب هو (34.43) سنة وان الفئة العمرية (39 - 30) سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2. اظهر معدل المستوى المصلي للبين الابيضاضي - 10 فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 بين مجموعات مرضى التصلب المتعدد (قبل وبعد المعالجة) ومجموعة السيطرة (46.64 , 44.70 و50.95) بيكو غرام/مل , على التوالي.3. اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 ما بين مرضى بعد المعالجة (17.04) بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى قبل العلاج ومجموعة السيطرة (14.81 و14.28) بيكو غرام/ مل , على التوالي .4. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من الكولسترول , الشحوم الثلاثية, الشحوم قليلة الكثافة والشحوم قليلة الكثافة جدا عند مستوى P<0.05 في المرضى غير المعالجين والمعالجين مقارنة بمجموعة السيطرة .5. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من ثالث يود الثيرونين وهرمون الثايروكسين عند مستوى P<0.05 في المرضى الغير معالجين ) 1.08) نانوغرام / مل و(7.99) ميكروغرام / ديسيلتر، على التوالي والمرضى المعالجين (1.27) نانوغرام / مل و(8.68) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة (0.898) نانوغرام / مل و(6.95) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي. 6. اظهره نقصان معنوية في معدل الخلايا الحمضة في مجاميع المرضى (قبل وبعد المعالجة) مع انترفيرون - بيتا - 1ب مقارنة مع مجموعة السيطرة.7. لم تظهر اي علاقة بين معدل كريات الدم والمستويات المصلية من كل البين الابيضاضي - 2 ,هرمون تنشيط الغدة الدرقية , حمض اليوريك والشحوم عالية الكثافة والامراضية من تصلب الاعصاب المنتشر.8. ظهر تاثير الجنس في كلا من الشحوم الثلاثية وحمض اليوريك حيث وجود زيادة وبفارق معنوي في الذكور مقارنة بالاناث, بينما كانت هنالك زيادة معنويه في الشحوم عالية الكثافة في الاناث مقارنة بالذكور. | Multiple Sclerosis (MS) is an idiopathic chronic inflammatory disease characterized by demyelination that can be associated with axonal degeneration and is the leading cause of a non - traumatic neurological disability in young adults, with female affection more than male.This study is designated mainly to investigate the relationship between the MS patients and certain cytokines serum concentrations of Interleukin - 2 (IL - 2), interleukin - 10 (IL - 10), Tumor necrosis factor - alpha (TNF - α) and biomarkers; lipid profile (TC, TG, LDL, VLDL and HDL), Uric Acid (UA) and thyroid function (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the blood. Also it is trying to find out the relation between concentrations of these cytokines and biomarkers with the gender and disease course of Iraqi MS patients. The study involved 60 Iraqi who were diagnosed as MS patients. the selected patients were classified into two groups :  Pre - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 56) years at the stage of the early diagnosis (RRMS).  Post - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 53) years with treatment Interferon - β 1b (INF - β - 1b) intravenous immunoglobulin (Ig) pulse Methyl - Prednisolone MP (in acute relapses) for 3 days or 5 days. Besides, 20 healthy volunteers 10 males and 10 females matched the patients with age and gender were used as control subjects with age range between (20 - 50) years. They have attended to (Baghdad Teaching Hospital in the Medical City / Clinic for early detection of MS) in Baghdad during the period from November / 2013 to the end of April / 2014 for the diagnosis and treatment. The blood samples (6 - 8) ml were drown from all of studied cases in order to be used for immunological study by measuring their serum level of cytokines using Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) and biomarkers; using Architect c4000 System (Abbott) for (TC, TG, LDL, VLDL, HDL and UA) and AIA - 360 system for (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the 2 ml of blood at using Cell - Dyn Ruby System.The Study has Reached the following Results : 1. The results showed that the average age in patients with MS is (34.43) years and age group (30 - 39) years are more susceptible to affected. 2. The study has showed the average serum level of IL - 10 were significant differences at the level of probability P<0.05 between the (pre - and post - treated) patients and the healthy control (35.54, 35.86 and 52.68) pg/ml, respectively. 3. The study furthermore, has showed the average serum level of TNF - α were significant differences at the level of probability P<0.05 between the post - treated patients (17.04) pg/ml and two group the pre - treated patients and the healthy control (14.81 and 14. 28) pg/ml, respectively.4. The result observed significant an increase in the concentration of serum level of TC, TG, LDL and VLDL at the level of probability P<0.05 in the pre - and post - treated patients as compared to the healthy control. 5. The result observed significant increase in the concentration of serum level of T3 and T4 at the level of probability P<0.05 in the pre - treated patients (1.08) ng/ml and (7.99) μg/dl, respectively and the post - treated patients (1.27) ng/ml and (8.68) μg/dl, respectively as compared to the healthy control (0.898) ng/ml and (6.95) μg/dl, respectively. 6. The study has showed a significant decrease in mean of the eosinophil for the pre - and post - treated patients (1.28 and 1.99) respectively as compared with the healthy controls (2.79).7. There is no relationship between the differential count of WBC and serum levels of (IL - 2, HDL, UA and TSH) and the pathogenicity of MS. 8. The research show significant increase in levels of TG and UA in male as compared with female, while level of HDL was significant increase in female as compared with male.

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

اسم المؤلف: ابرار جاسم حسن
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة مصلية ومناعية لداء المقوسات في مرضى القلب Serological and Immunological Study of Toxoplasmosis in Heart Disease Patients

اسم المؤلف: حيدر صباح عبد الحسين
اسم المشرف: بسعاد عقرب العبودي احمد حسن محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Toxoplasmosis is the general term for infection and disease in human and animal caused by a parasite called Toxoplasma gondii, this disease is prevalent among different categories of people , Heart disease patients are one of them. Because of the dormancy status of T. gondii, there is ambiguity and variation in the immunity of patients. This study aimed to investigate the immune status of heart disease patients infected with toxoplasmosis, to detect the prospective relationship between heart disease patients and T. gondii, and investigate the relationship between toxoplasmosis and risk factors which included gender, age, blood group, contact with cats, and habitation.One hundred fifty samples of blood had been collected at period from August 2016 till November 2016 from patients with heart disease, they lying or visit Heart Medical Centre in Thi - Qar province. According to gender, the patients divide in to (81 males and 69 females) with age ranging 18 to 82 years. Also one hundred samples of blood had been collected from apparently healthy persons as negative control ,dividing according to gender in to ( 55 males and 45 females) with age ranging 19 to 56 years . All samples of both subjects had been tested by ELISA technique to detect anti - Toxoplasma Abs (IgG & IgM) . While the positive samples with toxoplasmosis were tested to detect the level of interleukins (IL - 10, IL - 12 and IL - 17).The overall of seropositivity of anti - Toxoplasma Abs that scored by ELISA in the current study was 44% in heart disease patients are higher than those in apparently healthy controls 19%, and there was a significant difference between them. There is a significant difference between male and female, in the seropositivity of anti - Toxoplasma Abs that scored in controls, in male was higher than those in female. Presence of antiSummary toxoplasmosis Abs in all types of heart disease patients with significant difference among them, and the highest percentage of anti - toxoplasmosis Abs in Mitral stenosis( MS) was 55.8% , and the lower value was 30.3% in Myocardiopathy.There are significant differences between the age groups and the percentage of anti - Toxoplasma Abs in heart disease patients with highest value was 63.2% at age group of 61 - 75 years, and the lowest one was 26.3% at age group of 15 - 30 years. While no significant differences between the age groups and toxoplasmosis in apparently healthy controls with highest value was 19.5% at age group of 31 - 45 years, and the lowest one was 8.6% at age group of 15 - 30 years.The results demonstrated that seroprevalence of toxoplasmosis was significantly associated with close contact with cats. The percentage of seroprevalence anti - Toxoplasma Abs in heart disease patients and controls inhabited rural area was 52.5% and 32% are higher than those inhabited urban area was 34.3% and 6% respectively. Some blood parameters were estimated of both subjects infected and non - infected with toxoplasmosis. There was high significant difference at p≤0.05 observed in mean ratio of eosinophil’s number between infected and not infected subjects with toxoplasmosis in both subjects. While there was no significant differences in mean ratio of total count of WBCs. Moreover, mean of lymphocytes number recorded significant differences betweeninfected and non - infected heart disease patients only. The blood group phenotypes of the infected heart disease patients and controls highlight the role in toxoplasmosis infection and the AB blood group characterized by the highest significant percentage of infection. The results of interleukins appeared high mean levels of IL - 12 82.85 pg/ml in heart disease patients infected with toxoplasmosis when compared with control 60.97 pg/ml, and there was significant difference between them. While there was no significant difference in IL - 10 and IL - 17 in both patients and controls. The results also showed decreased level of IL - 17 in patients with heart disease. The increased level of IL - 12 in patient with heart disease infected with toxoplasmosis indicate to the activity of cell mediated immunity in those patients and may be lead to provoke an inflammatory status in the heart valves and muscle then worse heart disease to be sever and need complicated treatments

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

اسم المؤلف: نرمين نصر الدين فتحي
اسم المشرف: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.

التشوهات الخلقية في اجنة الفئران السويسرية البيضاء من امهات معاملة بجرع مختلفة من عقار Mus masculus الديكساميثازون Developmental anomalies in swiss albino mice embryos Mus masculus from the mother treated with different doses of Dexamethasone

اسم المؤلف: صدى غالب طاهر الموسوي
اسم المشرف: علي نعيم سلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - الاجنة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The current study was conducted for the period from September 2015 until August 2016 in college of Education for Pure Sciences - University of Thi - Qar, this study aimed to fallow the embryonic lung development and evaluate histological changes in embryos's lung development when pregnant mice treated with different doses of Dexamethasone (Dex) and evaluate Alpha - fetoprotein (AFP) levels were evaluated as an indicator for congenital malformations. Sixty pregnant mice were randomly divided into four groups and each group contain 15 pregnant mice. The members of each group were given specific dose of Dex and at different time periods, while the control group injected with a solution of Normal Saline 0.9%.All animals received doses used by tail intravenous injection until the end of the time periods specified .Blood samples were taken for the purposes of biochemical parameters account as well as the collection of samples for histological study .The treatment of animals under the same conditions were determined with a dose based on body weight, according to what was stated in the pharmaceutical constitutions where's the therapeutic dosage was 0.002 mg \2mg (0.1mg.kg from body weight ). We used another two concentrations from drug ,one less than the therapeutic dosage (0.05mg \kg from body weight) and another more than the therapeutic dosage (0.2mg \kg from body weight ).The results have showed that was a negative effects on mice embryo's body weights and the lengths increase with increasing of number and doses concentrations. The using of different doses of Dex also showed various changes in general external morphological features and congenital malformation in embryos of treated mothers included : Death of embryos ,placenta damage ,neural Tube Defect ,Trunk Torsion ,Headhemorrhage, Brain hypertrophy ,Liver Hypertrophy ,Letter C Shape Embryos, swelling ,Convoluted Tail ,Short nostril and limbs, curved head, Wrinkled skin ,Crooked pave ,Short toes ,Seal legs appearance, Oedema ,absent fingers and eyelids ,Tail congestion and Bulging eyes. Histologically microscopic examination showed histological changes with varied severity and appearing between different sub experimental group compared with the control group.Rapid elongation in lung bud, advancing in lung development, the lung asflower appearance, Loosely lung mesenchyme ,necrosis in lung tissue ,mucus hypersecretion, elongation in epithelial air ways,epithelial Hyperplasia ,mesenchyme looks as butterfly in appearance in some parts ,thinning of alveolar walls ,thinning of the interstitialmesenchymal lung tissue ,elongation of developing alveolar septa ,free alveolar septa. Alfa - fetoprotein (AFP) levels showed different concentrations value in correlation with congenital malformations .when the (AFP) value was high there were neural tube defects and advancing in the lung development while they were low in normal lung development and in brain hypertrophy.

دراسة التاثيرات الوراثية لمتعدد السكريد خارج خلوي لبكتريا Enterococcus faecium في الخلايا السرطانية Study of the Genetic Effects of Exopolysaccharide (EPS) from Enterococcus faecium in the Cancer Cells

اسم المؤلف: هويدة كريم عبد الجنابي
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على ثلاث عزلات لبكتريا Enterococcus faecium من 120 عينة منتجات الالبان المحلية والمستوردة، وقد شخصت هذه العزلات باستخدام الفحوصات البكتريولوجية والكيموحيوية، استخلص متعدد السكريد خارج خلوي Exopoly Saccharide من العزلة رقم (1) لبكتريا E. faecium وذلك لكون هذه العزلة اعطت اعلى معدل انتاجية من المستخلص وبلغ 300 ملغرام/لتر من الوزن الجاف.درس التاثير السمي الخلوي لمستخلص EPS في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما AMN - 3 وHeLa، واظهر المستخلص فعالية تثبيطية في الخلايا السرطانية اعتمادا على التركيز المستخدم ومدة التعريض خصوصا عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر حيث وصلت نسب التثبيط الى 59.3% و86.2% على التوالي في خلايا AMN - 3، ثم بدات هذه النسب بالانخفاض مع تقليل التركيز المستخدم الى 1250 مايكروغرام/مللتر لتصل الى (8.3)% بينما استمرت الخلايا بالنمو والتضاعف خلال مدد التعريض الثلاث 24 ، 48 و72 ساعة عند التركيز 625 مايكروغرام/مللتر وكانت النسبة المئوية لتضاعفها (157.1%) مقارنة بعينة السيطرة (100%).اما تاثير المستخلص في خلايا HeLa فقد اظهر تاثيرا تثبيطيا على هذه الخلايا ازدادت نسبته مع زيادة التركيز ومدة التعريض وان نسب التثبيط في خلايا HeLa كانت اقل بفارق معنوي عن نسب التثبيط في خلايا AMN - 3 حيث بلغت نسب التثبيط في خلايا HeLa عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر 28.0% و31.1% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة واستمر انخفاض الفعالية التثبيطية للمستخلص في خلايا HeLa في التراكيز الواطئة 625 و1250 مايكروغرام/ مللتر حيث بلغت 10.7% و14.4% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة مقارنة بعينة السيطرة.درس تاثير مستخلص (EPS) وراثيا في الخلايا اللمفاوية للانسان من خلال حساب معامل التحول الارومي Blast index (BI) ومعامل الانقسام الخيطي (MI) Mitotic index وفحصت التغايرات الكروموسومية والفعالية التحفيزية لانقسام الخلايا. وجد ان هذا المستخلص قد سبب انخفاضا معنويا في معدلات معامل الانقسام ومعامل التحول الارومي يتناسب مع زيادة التركيز المستعمل ومدة التعريض لكنه لم يحدث اية تاثيرات سمية وراثية في كروموسومات الخلايا اللمفاوية المعاملة. | Three isolates of Enterococcus faecium were obtained from 120 of dairy products. These isolates were identified using bacteriological and biochemical assays.Exopolysarccharide (EPS) was extracted by (TCA 10%) method from isolate E. faecium no.1 for high production. One gram of dry weight produced 300 mg/ml of EPS.Cytotoxicity effect of EPS on cancer cell lines AMN - 3 and HeLa. An inhibitory activity of EPS against cancer cells was noticed, it was depended on EPS concentration and time exposure. Both concentrations 2500 and 5000 µg/ml were inhibited cells of AMN - 3; the percentage of inhibition was 59.3 and 86.2% respectively. Whereas, the percentage of inhibition was reduced when EPS concentration was low, 1250 µg/ml of EPS was showed 8.3% of inhibition rate. Notable, the low concentration (625µg/ml) of EPS was induced proliferation of AMN - 3 cancer cells of AMN - 3 for proliferation; the viability rate of cancer cells was 157.1% in comparison with untreated cells (control). In addition, the cytotoxic activity of EPS on cancer cell line HeLa was also studied. Significantly, inhibition rate on HeLa cells was less than that against AMN - 3 cells. The inhibition rate of HeLa cells at 2500 and 5000 µg/ml of EPS after 72 hr. was 28.06 and 31.1 % respectively. While the inhibitory activity of EPS at low concentrations (625 and 1250 µg/ml) on HeLa cells were 10.7% and 14.4% respectively.Genetically, the effect of EPS on normal human lymphocytes using different parameters such as mitotic index (MI), blastogenic index (BI), rearrangement of chromosomes, and mitogenic activity was examined. The results showed that EPS was significantly reduced MI and BI. Moreover, no genotoxic effect on chromosomes of healthy human lymphocytes was noticed

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

اسم المؤلف: همسة نافع محمد علي الرحو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

اسم المؤلف: هبة علي هلال الجبوري
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

اسم المؤلف: ميسم محمد رشيد الشيباني
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA

التحري الجزيئي عن جين الضراوة rmp لبكتيريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة محليا من المرضى البالغين Molecular Detection of Virulance rmp Gene in Neisseria gonorrhoeae Isolated from Adult patients

اسم المؤلف: مهـند كـريم عنيد الساعدي
اسم المشرف: نورية عبد الحسين علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, the Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories for the time period from November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on media cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25 %) women and 63 (78.75 %) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75 %) samples were positive : 35(43.75 %) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer - Martin media; while 9 (11.25 %) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3 (3.75 %) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25 %) of the direct smears and 75 (93.75 %) of the urine samples were positive. Results of the Nitrogen bases sequence of the PCR technology of the samples in this study revealed consistency reaching up to 99 % with the Nitrogen bases sequence of the rmp gene present in the N. gonorrhoeae strain of the WHO. This study presented high specificity and sensitivity for the diagnosis of gonorrhoea using the PCR technology which is cheaper and faster than the conventional methods currently used in the hospitals and laboratories.

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

اسم المؤلف: منال سلمان محمد كسار
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

اسم المؤلف: مريم باسم انيس
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

اسم المؤلف: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

اسم المؤلف: شمم ناصرراضي
اسم المشرف: شذى سلمان حسن سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

اسم المؤلف: سعاد علي احمد
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

اسم المؤلف: سحـر ظاهر عبد عسل
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

اسم المؤلف: زهراء عباس جبر العيساوي
اسم المشرف: رسمية عبد ابو ريشة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

اسم المؤلف: هالة محمد حسين الحسني
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

اسم المؤلف: حسام صباح اوهيم
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

اسم المؤلف: جوان صباح باجلان
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

اسم المؤلف: بشار قصي كاظم
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli
1 ... 553 554 555 556 557 ... 826