Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 50 out of 2,726

دراسة انتاجية بعض مركبات الايض الثانوية من المزارع النسيجيه لنبات الثوم . Allium sativum L == Study of the yield of some secondary metabolite in tissue culture of Allium sativum L

Author name: زينب سالم حسين
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري البحث الحالي في مختبر زراعة الانسجة النباتية, قسم علوم الحياة, كلية العلوم, الجامعة المستنصريه, بهدف زيادة انتاج بعض مركبات الايض الثانوي في المزارع النسيجية لنبات الثوم .Allium sativumL . قدرت مركبات الايض الثانوي بالتحليل الكمي والنوعي باستعمال جهاز كروماتوكرافيا السائل ذو الاداء الفائقHPLC وقورنت مع مستخلص فص الثوم . حفز الكالس على النشوء باخذ اجزاء من فصوص نبات الثوم بعد زراعتها على الوسط الغذائي (MS) Murashige and Skoog, (1962) الحاوي على تراكيز مختلفة من منظمات النمو شملت Dichlorophenoxy acetic acid ( (2,4 - Dبالتراكيز 0 ,1 ,2 ,3 ,4) ) ملغم/لتر وBenzyl adenine (BA) بتركيز1ملغم /لتر وNaphthalene acetic acid (NAA) بتركيز 0.5 ملغم/لتربالنسبه للوسط الاول اما الوسط الثاني فقد استعملت منظمات نمو شملت 2,4 - D بتركيز, .0.5 ,1 ,1.5 ,2, 2.5) 0) ملغم /لتر وKinetin بتركيز 0.5 ملغم /لتر. واظهرت النتائج ان الوسط الحاوي على 2 ملغم/لتر 2,4 - D وBA بتركيز 1ملغم/لتر وNAAبتركيز0.5 ملغم /لتر قد اعطت اعلى معدل للنسبة المئوية لاستحثاث الكالس بلغت %60 واعلى معدل وزن طري بلغ 839ملغم بالنسبه للوسط الاول وقد استعملت التوليفه اعلاه في ادامة الكالس المستحث. واعطى الوسط الثاني الحاوي على 1.5))ملغم/لتر2,4 - D وKinetin بتركيز0.5))ملغم /لتراعلى نسبه مئويه لاستحثاث الكالس بلغ %50 وقد اعطى الوسط الحاوي على 1.5 , 2ملغم/لتر(2,4 - D) وkinetinبتركيز0.5 ملغم /لتراعلى معدل وزن طري بلغ 748.6,750.0 ملغم/لتر. وبغية زيادة انتاج المركبات الثانوية وظفت عوامل تحفيز فيزيائية وكيميائية تضمنت الاشعة فوق البنفسجية (Ultraviolet) وحامض الساليساليك , وحامض الفنل النين بالتراكيز200,150,100,50,0ملغم/لتر لـحامض السالسيلك (Salicylic acid) وحامض الفنل النين Phenyl alanineبالتراكيز40,30,20,10,0 ملغم/لتراما الاشعة فوق البنفسجية نوع B فقد كانت مدة التعريض 30,20,10,0دقيقة . واظهرت النتائج ان حامض الساليسلك كان افضل محفز لزيادة مركبات الايض الثانويه اذ اعطى حامض الساليسليك افضل تركيز للتحفيز وزيادة الانتاج بتركيز 100 , 150ملغم/لتروقد اعطى التركيز 100ملغم /لتر اعلى معدل وزن طري بلغ 743 ملغم /لتر.اما حامض الفنل النين فقد اعطى التركيز 20 ملغم/لتر زياده معنوية في مركب الallicine اذ بلغ المعدل 52.2 ملغم اما بقية التراكيز فلم تكن الزيادة معنوية.اما بالنسبة للاشعة فوق البنفسجية فقد سببت المده 10دقيقه زيادة معنوية لمركب الagoene اذ بلغ المعدل 37.6 ملغم اما بقية المعاملات فقد اعطت زيادة ولكنها غير معنوية في تركيز المركبات.

تاثير الفعالية التثبيطية لمستخلصات نبات الكبار Capparis spinosa L. في بعض الاحياء المجهرية ذات الاهمية الطبية

Author name: سراء نصيف مسلم
Supervisor name: رضا ابراهيم حسين البياتي | نزار ادورناصر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحـــولية لجذر واوراق وثمار نبات الكبار Capparis spinosa في نمو البكتريا Escherichia coliو Klebsiella spp. Staphylcoccus aureus وPseudomonas aeruginosa والفطــــــــــــــــــــــــــــريات Candida albicans المعزولة من الاصابات الجلـــدية وذلك باستخدام طريقة الحفر بالاكار لاختبار فعالية المستخلصات ضد البكتيريا والخميرة، ولقد اختلفت نتائج دراسة الفعاليــة التثبيطية للمستخلصات باختلاف نوع المستخلص نفسه, وتنوع الكائن المجهري. وكانت بكتريا S. aureus الموجبة لصبغة كرام اكثرها تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا .Klebsiella spp اكثرها مقاومة لفعل المستخلصات النباتية. وتم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل المستخلصات , وقد بينت نتائج الكشوفات الكيميائية لها بان المستخلص المائي يحتوي على المركبات الاتية : كلايكوسيدات وقلويــــــــدات وصابونيات وتانينات والفلافونات والفينولات . وان هذه المركبات لها القابلية عـــــــلى الذوبان في الماء ، اما المستخلص الكحولي لنبات الكبار فانه يحتوي فضلا عما ذكـــــر على مركبات راتنجية ,وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية . بالنسبة الـــــى مستخلصات الجــــذر فقد كان المستخلص المائي افضل في تاثيره على البكتريا والخميرة بتركــــــيز 500 ملغم/ مل , اذ كانت معـــــدلات اقطار مناطق تثبيــــــــط St. aureus وE. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa . 22 ) و13.1 و12 و21.3 ) ملـــــم وعلى التوالــي مقارنة مع معـدلات اقطار مناطـــق التثبيــط للمستخلص الكحـــولي وللتراكيز نفسها ( 4.2و6.8 و3.2 و10.4) ملم وعلى التــــوالي . اما بالنسبة الى مستخلصات الاوراق فقد كان المستخلص المائي افضل من المستخلص الكحــولي في تاثيره في الانواع البكترية St. aureusو E. coli وKlebsiella sppو P. aeruginosa والخمــــــــيرة C.albicans بتركيز 500ملغم/ مل وبمعــــدلات اقطار تثبيــــــط (22 و10.9 و21.5 و21.3 و5.5 ) ملم وعلى التوالي مقارنة مـــع المستخلص الكحـــــــولي وبمعــــدلات اقطار( 21.9 و0 و0 و8.4 و3.2) ملم على التوالي. كما وجد ان المستخلص الكحولي لثمار نبات الكبار ذمو تاثير افضل من المستخلص المائي على البكتريا والخميرة قيد الدراسة وبتركيز 500 ملم /مل. وعند المزج بين مستخلصات الاجزاء الهوائية (الاوراق والثمار) والجزء الارضي (الجذر) بنسبة 1 : 1 ودراسة تاثيرها على البكتريا والخميرة قيد الدراسة , تبين ان خلط المستخلصين له تاثير اقل مقارنة من تاثيرهل منفردا. | The present study dealt with the effects of watery and alcoholic extracts of root, leaves and fruits of Capparis spinosa on the growth of Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella spp. , Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans isolated from patients suffering from skin infection . Agar - well diffusion method was used for this purpose.With respect to inhibitory effects of the plant extracts on the studied microorganisms, the results indicated that there were clear variation. These were depended on the types of the extracts and the kinds of microorganisms. chemical analysis were done on the plant for identification of active compounds. The results have illustrated that watery extract contained the following compounds : Alkaloids, Glycosides, Tanins, Saponins,Phenoles and Flavones. These compounds were all soluble in water. Alcoholic extract of this plant contained, in addition to as mentioned above, rasins compound. These alcoholic extracts were soluble in organic solrents, but not water soluble .Watery and alcoholic extracts of root were applied to study their effect on the microorganism of the present study. The results demonstrated that watery extracts were more efficient, as bacterial and yeast inhibitors , at an extract concentration of 500 mg/ml . These extracts have gave average inhibition zone diameters to Staphylococcus aureus , Escherichia coli, Klebsilla spp., Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans of ( 22 , 13.1 , 12 , 21.3 , 11) mm respectively . while alcoholic extracts which gave average inhibition zone diameters for the same bacteria and yeast of ( 4.2 , 6.8 , 3.2 , 10.4 , 13.4 ) mm respectively.The resutts of this wack also showed that watery extracts of leaves were more efficient, hence they gave, at aconcentration of 500 mg/ml, average inhibition zone diameters to S.aureus , E.coli,Klebsilla spp., P. aeruginosa and C. albicans of (22 , 10.9 , 21.5 , 21.3 , 5.5 ) mm respectively compared to alcoholic extracts that were showed, at the same extract concentration, relatively, lower average inhibition zone diameters, for the same microorganisms of (21.9 , 0 , 0, 8.4 , 3.2) mm respectivelyMoreover, alcoholic extract of C. spinosa fruit, at aconcentration of 500 mg/ml , were efficient, as microbial inhibitor, than watery extracts.Among different currently studied microorganism, Gram positive Staphylococcus aureus was the most sensitive isolates to inhibitory action of the extracts. In contrast, Gram negative Klebsilla spp. Was the most resistant type to the action of these extracts.Few inhibitory response were noticed upon mixing, at rate 1 : 1, of aerial and terrestrial extract of C. spinosa.

دراسة مختبرية للسيطرة على الاعمار اليرقية المحتلفة لبعوضDiptera : Culicidae Culex pipiens Say باستخدام منظم النمو Dimilin والمبيد الاحيائي Bacillus thuringiensis Israelensis == Laboratory Stuty on the Control of Culex pipiens Say (Diptera : Culicidae) Different Larval Instar Using Dimilin Growth Regulater and Bio.pesticide Bacillus thuringiensis Israelensis

Author name: زينب عباس عودة
Supervisor name: معن عبد العزيز شفيق
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر بحوث الحيوان / البيت الحيواني /كلية العلوم /الجامعة المستنصرية لتقيم كفاءة منظم النمو Dimilin المثبط لتصنيع الكايتين بواقع ثلاث تراكيز مختلفة (0.5 ، 1.0 ، 1.5 ) جزء بالمليون وكفاءة عالق البكتريا Bacillus thuringiensis israelensis بالتراكيز الاتية (6.25×108، 6.25×1010 و6.25×1012 ) بوغ / مل على الاعمار اليرقية المختلفة لبعوض Culex pipiens.وبلغت اعلى نسبة قتل 100% لمنظم النمو بالتركيز 1.5 جزء بالمليون للفترة 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للفترة 12 ساعة للتركيز 0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الاول، اما اعلى نسبة قتل بلغت %86.67 لمنظم النمو بالتركيز1.5 جزء بالمليون خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 20% خلال 12 ساعة للتركيز0.5 جزء بالمليون للعمر اليرقي الثاني. واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 73.33% خلال 48 ساعة للتركيز1.5 جزء بالمليون واقل نسبة قتل بلغت 33.33% للتركيز 1.0 جزء بالمليون خلال 12 ساعة للعمر اليرقي الثالث على التوالي. واعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الرابع بلغت 80% خلال 48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 26.67% للتركيزين 0.5 و1.0 جزء بالمليون لمنظم النمو . واظهرت النتائج ان اعلى نسبة قتل للمبيد الاحيائي B.thuringiensis israelensis بلغت 100% للعمر اليرقي الاول بالتركيز 6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة واقل نسبة قتل بلغت 40% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة. وكانت اعلى نسبة قتل للعمر اليرقي الثاني 100% بالتركيزين 6.25× 1010 و6.25×1012 بوغ /مل خلال 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 53.33% للتركيز 6.25×108 بوغ/مل خلال 12 ساعة واعلى نسبة قتل بلغت للعمر اليرقي الثالث والرابع 100% على التوالي خلال 48 ساعة للتركيز 6.25×1012 بوغ/مل واقل نسبتي قتل للتركيز 6.25×108 بوغ/مل بلغت 40% و33. 33% للعمرين نفسيهما على التوالي خلال 12 ساعة. كما ودرس تاثير المبيد الحيوي التجاري Antrol للبكتريا B.thuringiensis israelensis في التركيز 0.0105 غم /مل للاعمار اليرقية المختلفة وبينت النتائج ان اعلى نسبة قتل بلغت 100% خلال الفترتين 24 و48 ساعة على التوالي واقل نسبة قتل بلغت 80% للفترة 12 ساعة للعمر اليرقي الاول . واعلى نسبة قتل بلغت 100% للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع على التوالي خلال 48 ساعة، واقل نسب قتل للاعمار اليرقية الثاني، الثالث والرابع بلغت 66.67، 53.33 و40% على التوالي خلال 12 ساعة . | This study was conducted at the Researches Laboratory / Animal House / College of Science / Mustansiriyah University to evaluate the efficiency of the growth regulator Dimilin Chitin synthesis inhibitor using three different concentrations of 0.5, 1.0 and 1.5 ppm and the efficiency suspension of bacteria Bacillus thuringiensis israelensis at there concentrations 6.25 × 108, 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml to different larval instars of mosquito Culex pipiens in composion The highest mortality 100% of the growth regulator reached at the concentration1.5 ppm for a period of 48 hours and lowest mortality was 26.67 % for the period of 12 hours for the concentration of 0.5 ppm for the first larval instar, respectively. The highest mortality was86.67 % for the growth regulator at concentration1.5 ppm 48 hours and lowest mortality was 20 % during the 12hours at concentration of 0.5 ppm for the second larval instar, respectively. The results also showed that the highest mortality was73.33 % during the 48hours at concentration of 1.5 ppm and lowest mortality was33.33 % for the concentration of 1.0 ppm during the 12 hours for the third larval instar, respectively. The highest mortality of the fourth larval instar reached 80 % in 48 hours and lowest mortality was 26.67 % at the other two concentrations (0.5 and 1.0 ppm) for Dimilin. The results also showed that the highest mortality of bio - pesticide Bacillus thuringiensis israelensis was100% for the first larval instar at concentration of 6.25 × 1012 spores / ml within 24 to 48 hours and lowest mortality was 40% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours. The highest mortality for second larval instar was 100% at two concentrations 6.25 × 1010 and 6.25 × 1012 spores / ml within 24 and 48 hours, respectively, and the lowest mortality was 53.33% at the concentration of 6.25 × 108 spore / ml within 12 hours and the highest mortality reached 100% for the third and fourth larval instars respectively, during the 48 hours at concentration of 6.25 × 1012 spore /ml, The lowest mortalities at concentration at 6.25 × 108 spore / ml were 40 and 33. 33% for the same two instars, respectively, within 12 hours. The impact of biocide Antrol at concentration of 0.0105 mg / ml in the first larval instar was 100% in both 24 and 48 hours, and the lowest mortality was 80% for the exposure period of 12 hours. The highest mortality was 100% for second, third and fourth larval instars, respectively, within 48 hours, and lowest mortality for second, third and fourth larval instars were 66.67, 53.33 and 40%, respectively, within the 12 hours exposure period. Finally the results showed that the mortality of the chemical pesticide Temephose was100% for all larval instars within 12 hours.

استخلاص وتنقية انزيم اللايبيز من عفن Aspergillus niger 11414 (ATCC) واستخدامه في تحسين نوعية الدهن الحر == Extraction and purification of Lipase from Aspergillus niger 11414 ( ATCC) to improve the butter oil

Author name: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الد راسة عزل وتنقية انزيم اللايبيز من العزلة القياسية Aspergillus niger 11414 ( ATCC) ثم تطبيقه عمليا في مجال الصناعات الغذائية . • تم تــنمية العزلة وتنشـــيطها على وسط اجار البطاطا والدكستروز Potato dextrose Agar PDA . • تم التحري الاولي عن انتاج انزيم اللايبيز من العزلة A. niger 11414 بطريقة الاطباق باستخدام وسط ( Tween 80 ) ، وظهرت النتيجة موجبة بشكل هالة معتمة تحيط المستعمرة الفطـرية . استخدم وسط Tween 80 واضيف زيت الزيــــتون بـــدل الـ (Tween 80) الى وسط التحري وكانت النتيجة موجبة اذ ظهرت الهالة المعتمة حول المستعمرة لكن بمساحة اكبر مما سبق . • درست عدة معايير ( تركيز زيت الزيتون ، مدة التخمر ، الاس الهيدروجيني الابتدائي ، حجم اللقاح ، درجة الحرارة ) لايجاد الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايـــبيز وكانــــت افضل الظروف لانتاج الانزيم هي ( تركيز زيت الزيتون 1 % ، مدة التخمر 168 ساعة ، واس هــــيدروجيني ابـــتدائي 6 وحجم لقاح 10 × 1 ( بوغ / مل ) ودرجة حرارة 30 م ، اذ سجلت عند هذه الظروف اعلى فعالية للانزيم المنتج . • اظهر الانزيم الخام بعد حضنه باسس هيدروجينية مختلفة لمدة 30 دقيقة ثباتا عند قيم الاسس الهيدروجينية بين ( 5.0 - 4.0 ) ، فيــــما اظهر الانـــــزيم الخام بعد حضنه في درجات حرارة مختلفة لمدة 60 دقيقة ثباتا حراريا عند ( 40 - 50 ) م , احتفظ الانزيم بكامل فعاليته.• استخدمـــت خطوات متسلسلة لغرض تنقية انزيم اللايبيز شـملت اولا التركيز بكبريتات الامونيوم وكان افضلها 30 % حين بلغت اعلى فعالية نوعية عندها بمقدار 3.8 وحدة / ملغم برويتن ، استخدمت خطوة الديلزة للتخلص من الاملاح . لقد اظهرت النتائج ارتفاع الفعالية والفعالية النوعية للانزيم اذ اصبحت 8.64 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 8.73 . بعدها مرر الانزيم المنقى جزئيا على عمود هلام Sephadex G - 75 مرتين وجمعت الاجزاء التي اظهرت فعالية انزيمية ، مرر بعدها خلال عمود هلام Sephadex G - 100 ازدادت خلالها نقاوة الانزيم اذ ارتفــعت الفعالية النوعية الى 142.8 وحدة / ملغم بروتين وبلغ عدد مرات التنقية 143.19 وبحصيلة انزيمية 87.5 % .• درست بعض الخصائص المهمة للانزيم المنقى جزئيا اذ اظهر الانزيم المنقى جزئيا ثباتا تجاه قيم من الاس الهيدروجيني بين ( 5 - 6 ) ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل 5.6 واحتفظ الانزيم المنقى جزئيا بـكامل فعاليته عند درجتي حرارة 30 و40 م على التوالي ولمدة 30 دقيقة وفقد 95 % من فعاليته عند درجة حرارة 80 م وللمدة نفسها ، اما درجة الحرارة المثلى فكانت 35 م . • استعمل اللايبيز المنقى جزئيا في تحسين نكهة الدهن الحر الذي تم معاملته بالانزيم ، اما السيطرة Control فتمثلت باضافة محلول دارىء فوسفات السترات ذي الاس الهيدروجيني 6.0 فقط الى الدهن الحر . اجري تقييس الفعالية على المعاملتين واظهرت النتائج ان هناك تغيرا محسوسا في الدهن المعامل بالانزيم في حين بقيت السيطرة دون تغيير . • استـخدم الدهن الحر المعامل بالانــــزيم والسيطرة Control في صنــع بعض انـــواع الحلويات ( البرمة ). عمل تقييم حسي للمنتوج من خلال 31 عينة للصــــفات ( اللون ، النسجة ، الرطوبة ، الرائحة ، النكهة " الطعم " ) . حللت النتائج احصائيا ووجد فرق معنوي ملحوظ بين الدهن الحر المعامل بالانزيم والسيطرة ، عدا صفة اللون فكان الفرق غير معنوي لكلتا المعاملتين . | In this study the extraction and purification of Lipase from isolated A. niger was studied. The ability of A. niger to produce Lipase was tested on Tween 80 media , indicate the positive result. Better result was obtained by added olive oil instead of Tween 80 media Several culture conditions were studied to determine the optimum conditions for Lipase producing , and the optimum conditions were : Concentration of Olive oil 1 % , period of fermentation 168 hour, initial pH 6 , inoculums size 1×10⁵ ( Spore / ml ) and the temperature 30 ℃ higher activity of produced enzyme was recorded in this conditions. The crude enzyme was stable after incubation at different pH (4 - 5 ) for 30 min., the enzyme was stable after incubation at different temperature (40 - 50) ℃ for 60 min., the enzyme retained all activity . Sequent steps used to purify Lipase. These included the concentration in ammonium sulfate the optimum saturation rate was 30 % , while the enzyme specific activity was 3.8 Unit / mg protein . Dialysis of enzyme resulted in increase of specific activity, which became 8.64 Unit / mg protein. Partially purified enzyme to the gel column sephadex G - 75 twice, the parts which show enzyme activity collected and added to the gel column sephadex G - 100, this increased the enzyme purification and a specific activity increased to 141.76 Unit / mg protein , while the number of purification was 193.19 and 82.46 % yield. Properties of the partially purified Lipase were investigated. Its showed stability against the values of pH (5.0 - 6.0) and the optimum pH was ( 5.6 ). The partially purified Lipase retained all activity 1n the temperature ( 30,40 )℃, for ( 30 ) minutes , and lost 95 % of its original activity at ( 80) ℃ , for the same time , while the optimum temperature was 35 The partially purified enzyme is used for improvement the flavor of butter oil which was treated with the enzyme , while the control was treated by addition phosphate citrate buffer solution ( pH = 6.0) only to the butter oil , the results showed that was sensible changes in the butter oil treated with enzyme while the control remain without any changes. The animal fat which treated with enzyme and the control was used in some kinds of sweets ( Al - Burma ) , making sensible evaluating for the product by (31) samples for characterization (color, texture, moisture, odor and flavor " tastes "). The results were analyzed statistically , and the noticed incorporeal comparison was found between the butter oil treated with enzyme and control , except the properties of color , it was non incorporeal comparison for both samples

دراسة تشخيصية وفسلجية لبعض الفطريات المائية == Diagnostics and physiological study on some aquatic fungi

Author name: سرمد سالم شنيشل
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | سوسن ساجد الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 48 عينة ماء من نهر دجلة من منطقة الشواكة (قرب جسر الشهداء) للفترة بين اب - كانون الاول2002 . اظهرت نتائج الفحوصات المختبرية وجود هايفات غير مقسمة تعود للبيضات في 4 عينات بنسبة 8.33 من مجموع الـ 48 عينة ماء . تم قطع نهايات الخيوط الفطرية ونقلها لوسط اكار مسحوق الذرة (CMA) ، الحاوي على الكلورمفينكول، ولغرض الحصول على مزارع نقية اخذت قطعا من اطراف المستعمرات الفطرية النامية على اكار الذرة بوساطة ثاقبة فلين ، ونقلت لمزارع مائية من اطباق بتري حاوية على ماء مقطر وبذور سمسم نوع Sesamum indicum كطعوم ، وحضنت بدرجة حرارة 20م،فحصت كل 24 ساعة لمدة اسبوع.ووفقا للتشخيص النهائي تم الحصول على نوعين من الفطريات البيضية هما Saprolegnia turfosa وAchlya sp. وعند دراسة اصابة الفطرين المذكورين بينت النتائج ان الفطرين لهما المقدرة على اصابة بيض سمك الكارب نوع Cyprinus carpio بدرجة حرارة 20م . كما بينت نتائج دراسة تاثير اربع درجات حرارية مختلفة 15 , 20, 25, 30 م على الامراضية ان درجة حرارة 15م و20م كانت الدرجات المثلى لحصول الامراضية ، اذ استغرقت الاصابة 20 ساعة للفطر Saprolegnia turfosa و24 ساعة للفطر Achlya spp. ، في حين طالت فترة حصول الاصابة عند ارتفاع الحرارة عند درجة 25م لتصل الى 26 و30 ساعة للفطرين على التوالي ، كما استغرقت فترة الاصابة 48 ساعة للفطرين عند درجة 30م.اوضحت نتائج مقارنة بذور السمسم وبيض سمك الكارب (غير طازج) كطعوم ان البيض كان اكثر كفاءة في جذب السبورات السابحة في المزارع المائية اذ استغرق ظهور النمو 72 ساعة على بذور السمسم في حين استغرقت العملية ذاتها 24 ساعة على بيض سمك الكارب وتم ذلك عند درجة حرارة 20م.نمت الفطريات بصورة جيدة على اوساط اكار الذرة،اكار السمسم واكار بيض الكارب.وتميز الفطر Achlya sp. بنموه بشكل جيد على وسط اكار بيض الكارب اذ ظهر فرق معنوي بالمقارنة مع وسط اكار الذرة. درست قابلية الفطرين على انتاج الانزيم المحلل للدهون Lipase على وسط Tween80 agar والانزيم المحلل لليسيثين Lecithinase،وذلك على وسط Lecithovitelline agar،والانزيم المحلل للنشا amylase على وسط Starch agar وانزيم proteinase المحلل للبروتين على وسط Milk agar ، فضلا عن الانزيم المحلل للجيلاتين Gelatinase على وسـط Gelatine agar ، والانزيم المـحلل للـكايتين Chitinase على وسط Chitin agar , وبينت النتائج مقدرة الفطرين على انتاج الانزيمات اعلاه باستثناء الانزيم Gelatinase وذلك بدرجة حرارة 20م وتعد هذه الدراسة الاولى في التطرق لقدرة هذه الفطريات على انتاج الانزيم المحلل لليسيثين. | Fourty eight water samples were collected from Tigris river - AL - Shauaka area (near AL - Shuhadaa bridge) during the period from (August - December - 2002) only four samples of the (48) showed the occurance of Oomycetes, and Hyphal tips were cut and transferred onto corrn meal agar (CMA)containing Cloromphenicol, for purification a disc of CMA containing hyphal tips was cut by corck borer transferred to a petridishes (aquatic culture) containing Sesamum indicum( sesame seeds) as baits, incubated at 20ºC, examined each 24hr. for one week . Saprolegnia turfosa and Achlya spp. were identified , those two fungi were found to be pathogenic to carp fish eggs at 20º.Studying the effects of four different degrees 15ºC, 20ºC, 25ºC, 30ºC on infection showed at 15ºC and 20ºC Saprolegnia turfosa and Achlya sp. Infected carp fish eggs within 20,24 hr. respectively while they were 26,30 hr . at 25ºC and 48,48 hr. at 30 ºC for both fungi respectively.The comparison between the sesame seeds and non fresh carp eggs as a baits results that the eggs of carp fish was more competent in attraction of zoospores in the aquatic culture, it took only (24 hr.) of the infection of carp fish eggs while the growth on sesame seeds observed took (72 hr.) at (20ºC). Both fungi were good growing on a corn meal agar - sesame agar - carp fish eggs agar and especially Achlya spp. Growth was significant different on carp fish eggs agar .Studying the ability for both fungi to produce the enzymes lipase on (Tween 80 agar), lecithinase on (LV agar), Amylase on (starch agar) as well as protienase on (milk agar) and chitinase on (chitin agar). The results showed that both fungi were able to produce all the above enzymes except for Gelatinase. This study considered the first report about ability of these fungi to produce Lecithinase

الكشف الجزيئي والبكتريولوجي لبكتريا Group B Streptococci (GBS) المحلية في بعض النساء العراقيات الحوامل

Author name: زينب عدي حامد
Supervisor name: نهاية حكمت زكي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • تم جمع مائة وتسعة وثمانين مسحة مهبلية من النساء الحوامل من مستشفى ابن البلدي ومختبر الصحة المركزي ومستشفى كمال السامرائي. حيث تم الحصول على ستة واربعين عزلة من بكتريا Streptococcus agalactiae خلال الفترة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر شباط 2014.• كانت الفئة العمرية للنساء المصابة ببكتريا S. agalactiae تتراوح بين (35 - 37) سنة حيث كانت نسبة الاصابة تصل الى 76.08%.• تم تشخيص جميع العينات مبدئيا بواسطة الطرق المظهرية من خلال الاوساط الزرعية blood agar وchromogenic agar واجري تاكيد التشخيص بواسطة VITEK SYSTEM 2 Identification وكذلك تم تشخيصها بالطريقة الجزيئية PCR للكشف عن جين 16S rRNA.• اجريت دراسة تحليلية مقارنة بين الطرق الثلاثة المظهرية والطريقة الجزيئية المستخدمة في الكشف عن البكتريا، وكانت طريقة التفاعل التضاعفي) (PCR افضل وسيلة للكشف عن S. agalactiae حيث تم تشخيص 46 عينة بواسطته بينما تم الكشف عن 30، 36، 37 عينة من قبل blood agar وchromogenic agar وsystem 2 VITEK على التوالي.• اجري فحص VITEK Antibiotic Sensitivity Test للكشف عن حساسية البكتريا للمضادات الحيوية المختلفة لجميع العزلات المشخصة، وكان اعلى معدل انتشار مقاومة لمضاد tetracycline بنسبة 65.2% وتليها 58.6% و45.6% لمضاداتerythromycin وclindamycin على التوالي.• تم فحص ثلاثة من الجينات التي تشفر لعوامل الفوعمة (sip، scpB، cfb) في جميع العزلات المشخصة، وكانت نسبة 97.8% من اجمالي العزلات تحتوي على الجينات الثلاثة المذكورة.• تم الكشف عن خمسة جينات لمقاومة مضادات Macrolide وكان معدل المقاومة 69.5% من اجمالي العزلات.• تم التحري عن جينات مقاومة لمثيلة الرايبوسوم (ermB، ermA\TR، ermC) في جميع العزلات المشخصة وكان جين ermB الاكثر وفرة بين العزلات بنسبة 64.04% ثم يليه جين ermA\TR بنسبة 23.09% وعلى الرغم من تغيير الظروف المستخدمة في تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز PCR)) لكن هذه الدراسة فشلت في تحديد جين مثيلة الرايبوسوم (ermC) • بينت نتائج التحري عن اثنين من الجينات المشفرة لنظام الدفق efflux pumps وهي (mefA، mreA) ان معدل انتشار الجينين بين العزلات هو 8.69% و69.5% على التوالي.• اظهرت نتائج الدراسة ان 14(% 30.4) من اجمالي العزلات لا يمتلك اي جين من جينات مقاومة الاريثرومايسين الخمسة.• بينت نتائج الدراسة ان عزلة واحدة من بكتريا S. agalactiae رقم) (V12 حاملة لاربعة انواع من جينات مقاومة الاريثرومايسين عدا الجين (ermC). | • One hundred and eighty nine vaginal swabs were collected from Ibn - Albalady Hospital, Central health Laboratory and Kammal Alsamaraie Hospital. Forty - six Streptococcus agalactiae isolates were obtained during October 2013 to February 2014.• The isolates were initially identified phenotypically by blood agar culture media and chromogenic culture media and further identification was performed by Vitek and by molecular methods by 16srRNA - based PCR. • A comparative analysis were performed between three phenotypic detection methods and molecular method by PCR were best tool for S. agalactiae detection which 46 isolates were identified while 37, 36, 30 isolates were detected by Vitek system, chromogenic agar and blood agar respectively.• Vitek Antibiotic susceptibility for different antibiotics were performed to all detected isolates, the highest prevalence of resistance was 65.2% toward tetracycline and followed by 58.6% and 45.6% for erythromycin and clindamycin respectively.• Three virulence - encoding genes (sip, scpB and cfb) were screened in all detected isolates, 97.8% of total isolates were contain the three mentioned genes.• Five macrolide resistance genes were screened and the resistant rate in total isolates was 69.5%.• Three ribosome methylation genes (ermB, ermA/TR, ermC) were screened in all examined isolates; the most prevalence gene was ermB with 63.04%, whereas 23.9% was the prevalence of ermA\TR gene and ermC not detected in any of examined isolates.• Two efflux pump genes (mefA and mreA) were screened and the prevalence rate was 8.69% and 69.5% respectively

تاثير العسل والغذاء الملكي وخليطهما على الخطوط الخلوية السرطانية == Effect of Honey, Royal jelly & their mixture on cancer Cell lines

Author name: زينب غازي حسين السلطان
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | شلال مراد العتابي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة تقييم تاثير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما في بعض خطوط الخلايا السرطانية والطبيعية خارج الجسم الحي Invitro، فضلا عن دراسة قابلية تاثير العسل والغذاء الملكي على انقسام الخلايا اللمفاوية البشرية . كما تم تحضير تراكيز مختلفة من العسل والغذاء الملكي ومزيجهما باذابتهم في وسط زرعي خال من المصل SFM (serum free media) ، واختبرت الفعالية السمية لهذه التراكيز في الخطوط الخلوية السرطانية منها AMN - 3، RD وخط الخلايا المتحول وراثيا Vero وخط الخلايا الطبيعي REF بثلاثة تراكيز( 1000 - 10.00 - 100.00 ) ميكروغرام/مل ، وضمن مدد تعريض مختلفة (24 - 48 - 72) ساعة ، و72 ساعة منها فقط عند الخط الخلوي الطبيعي REF . كانت النتيجة لتلك التراكيز تاثيرا سميا واضحا وبمعنوية عالية على نمو الخلايا السرطانية وخلال المدد الثلاث من التعريض ، في حين لم يكن هنالك تاثيرا واضح للتراكيز نفسها على نمو الخلايا الطبيعية (REF) . وان اكثر التراكيز التي لها تاثير سمي هي خليط من العسل والغذاء الملكي سواء كان ( متساوي او غير متساوي ) ، ثم تراكيز الغذاء الملكي ، واخيرا العسل . اما اكثر الخطوط تاثرا بهذه التراكيزRD اذ بلغت نسبة التثبيط عند التركيز 100.000 ميكروغرام/مل لمدة 72ساعه 92% (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم AMN - 3 وان نسبة التثبيط 92%عند 48 ساعه (لمزيج العسل والغذاء الملكي) ثم Vero اذ بلغت نسبة التثبيط 90%عند (مزيج العسل والغذاء الملكي) خلال 48 ساعه .واعتمدت على تراكيز المستخدم ،اذ ان التراكيز العالية (10.000100.00 - ميكروغرام/مل) هي الاشد تاثيرا اي الاكثر تثبيطا . ومن ثم عمدنا الى دراسة العسل والغذاء الملكي عند انقسام الخلايا اللمفاوية بواسطة مقارنة المحتوى البروتيني قبل وبعد اضافة العامل المشطر PHA وضمن مدة تعريضية قدرها 72 ساعة. ولوحظت زيادة بتراكيز المحتوى البروتيني بعد اضافة العامل المشطرPHA بالنسبة للعسل والغذاء الملكي مقارنة مع السيطرة السالبة والموجبة بمستوى احتماليه (P<0.005)وسبب هذه الزيادة تعود للتاثير التازري لتراكيز العسل والغذاء الملكي مع المادة المشطرةPHA | The evaluation of variety concentrations of honey, the royal jelly and their mixtures effect was carried out on the normal and some cancer cell lines (Invitro) in this study, in addition of studying Honey and Royal jelly effect abilities on the human lymphocyte division. Different honey , royal jelly and their mixture concentrations were prepared by melting them in a culture media, purified from serum (SFM). The toxicity activity of these concentrations was tested in the cancer cell lines AMN - 3, RD, Vero, and normal cells line with three concentrations (100.000 - 10.000 - 1000)µg/ml and with different exposure periods (24 - 48 - 72) hours , only 72 hours for the normal cells line REF. The results of toxicity effect was obvious with high significance for those concentrations for growing the cancer cells line during the three periods of the exposure , while there wasn’t any obvious effect on the same concentrations in growing the normal cells (REF). The most effective concentration that has toxicity effect is the concentration of the mixture of royal jelly and honey, whether it is (equal or not), then after, the royal jelly concentration, and the honey. The most affected cell lines by these concentrations are RD ,as the inhibition rate was up to 92% at the concentration 100.000 µg/ml within 72 hours ( the honey and RJ mixtures) , then AMN - 3 ,92% within 48 hours ( the honey and RJ mixtures). For Vero, the inhibition rate was 90% within 48 hours (for the honey and RJ mixtures) These rates depended on the used concentrations , as the high concentrations was(100.000 - 10.000) µg/ml ,were the most affecting i.e. the most inhibiting .Then it was intended to study Honey and Royal jelly for the lymphocyte division by total protein comparison before and after adding the mitogen factor PHA and within 72 hours exposure time. An increase in the protein concentration were remarker after PHA addition for the honey and R.J in comparative with the negative and positive control with estimation range (P<0.005).The reason of that increase was the synergistic effect of the honey and the royal jelly concentration with the mitogen PHA

تاثير الصبغات الحيوية في مكونات الجدران الخلوية للبكتيريا المعزولة من المرضى المصابين بالاكزما الجلدية

Author name: زينب عويد شاطي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 100 مسحة جلدية خلال الفترة من تشرين الاول 2013 لغاية اذار 2014 من المرضى الذين يعانون من الاكزما الجلدية من مستشفى الامام علي ومستشفى الشهيد الصدر في العاصمة بغداد والذين كانت تتراوح اعمارهم بين (5اشهر - 70 سنة) ,من مجموعهم كانت (72 %) موجبة الزرع البكتيري ,و( 38%) سالبة للنمو . وقد اظهرت النتائج التالي : • ان كلا الجنسين يتاثر بالاكزما ,مع ارتفاع النسبة لدى الاناث 57% على الذكور 43% ضمن الانواع المختلفة للاكزما .• ان اعلى ارتفاع للاكزما كان ضمن الفئة العمرية 5اشهر - 9 سنوات ( 45 %) ,متبوعة بالفئة العمرية 30 - 39سنة كانت( 14 %) بينما اقل نسبة (5%) كانت ضمن الفئة العمرية 20 - 29 سنة .• الاكزما التلامسية كانت اعلى نسبة للانتشار(57 %) , يليها الاكزما الولادية بنسبة ( 35 %) والاكزما القرصية( 5%) بينما الاكزما العصبية كانت (3%).• من مجموع 100 مريض يعاني من الاكزما في جميع مجاميع الدراسة ,ظهرت Staphylococcus aureusباعلى نسبة 20عزلة (57.14%) ,تليهاStaphylococcus haemolyticus بسبع عزلات ( 20%)Pseudomonas, fluorescens, خمس عزلات (14.28 %) ,وعزلتان لبكتريا Enterobacter aerogenes ( 5.7%) وعزلة واحدة لبكتريا Staphylococcus warneri (2.8%) .• اختبرت العزلات البكتيرية للمضادات الحيوية.• P. fluorescens كانت مقاومة 18 مضاد حيوي وحساسية لمضادي ( neomycin ,(nitrofurantoin, حيث اظهرت العزلات مقاومة 100 % لمضادات (lactams,erythromycin ,azithromycin ,oxacillin ,trimethoprimβ) ومقاومة 50 % لمضادات (levofloxacin ,rifampicin ,norfloxacin )• E. aerogenes قاومت مضادات البيتالاكتام بنسبة 100 % ,وكانت حساسة بنسبة 100 % لمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية ((Amikacin ,gentamicin ,بينما اعطت مقاومة متوسطة لمضاد neomycin .• S.aureus قاومت 11 نوع من المضادات الحيوية وحساسة لثمانية انواع من المضادات ,بينما S.haemolyticus مقاومة 15 نوع من المضادات وحساسة لاربع انواع ومتوسطة لمضاد levofloxacin. وذلك يختلف عن S.warneri الحساسة 14 نوع من المضادات ومقاومة لخمسة انواع ومتوسطة لمضاد Oxacillin .• اختبرت قابلية البكتريا على النمو بوجود تراكيز مختلفة من الصبغات الحيوية (الصبغات الحيوية التي استخدمت الكرستال البنفسجية والمثيل الحمراء والمثيلين الزرقاء) مما سمح بتحديد التركيز المثبط الادنى للصبىغات ,فكان التركيز المثبط الادنى للمثيلين الزرقاء على S. haemolyticus , P.fluorescens بلغ 1ملغ\مل بينما على S .warneri , S .aureus 10 ملغ\مل ,بينما التركيز المثبط الادني للمثيل الحمراء كان 1 ملغ \مل لكل الانواع البكتيرية , التركيز المثبط الادنى للكرستال البنفسجية كان 0.1 ملغ\مل لكل الانواع ماعدا S.warneri التي كان التركيز المثبط لها 1ملغ\مل .• اظهرت البكتيريا السالبة لكرام اقل مقاومة للصبغات من البكتيريا الموجبة لكرام والصبغة المتعادلة ابدت تاثير اكثر من الصبغة الحامضية والقاعدية عند نفس التركيز , وسمحت الصبغة القاعدية بنمو البكتريا الموجبة لكرام بينما ثبطت السالبة لكرام .• اظهرت دراسة تاثير الصبغات على عوامل الضراوة للعزلات البكتيرية عدم تاثرانتاج الكبسولة ولكن تم تثبيط عوامل الالتصاق للعزلات البكتيرية بواسطة الصبغات , بينما استطاعت المعاملة بالصبغات اختزال قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الغشاء الحيوي ,كذلك تناقصت القابلية العالية للعزلات البكتيرية على التلازن مع اللاكتين المستخلص من الخلايا الطلائية بعد المعاملة بالصبغات الحيوية .• استخدمت طريقة المطياف الضوئي لدراسة تاثير الصبغات على نفاذية غشاء الخلية فكانت الزيادة في امتصاص الاشعة فوق البنفسجية لعينات الخلايا دليل على تحلل الخلايا بتاثير الصبغات الحيوية.اذ كشفت النتائج ان الموقع الهدف لتاثيرالصبغات الحيوية هو غشاء الخلية .• استخلص عديد السكريد الدهني من بكتريا P.fluorescens ,وهو احد مكونات الجدار الخلوي ,وتمت دراسة تاثير الصبغة الحيوية على كمية الدهن والسكريد في عديد السكريد الدهني .اذ اظهرت النتائج مستوى عالي للدهن في النموذج غير المعامل بالصبغة 79.33 % ملغ\مل , بينما تناقص مستوى الدهن الى 45.8% ملغ\مل بعد المعاملة بالصبغة , اما كمية السكريد في عديد السكريد الدهني في النموذج غير المعامل بصبغة المثيل الحمراء كانت 123.4% ملغ\مل والتي انخفضت الى 74.2 % ملغ\مل في نموذج عديد السكريد الدهني المعامل بالصبغة . | • One hundred Skin swabs samples were collected during the period from November 2013 to March 2014 from patients suffering from eczema at Al - Sadder hospital and Al - Imam Ali hospital in Baghdad Province . A total of (72%) gave positive cultures ,while (28%) showed negative cultures and the results showed the following : • Both genders were suffering from eczema , with dominance in females (57%) comparable to males (43%) within variable type of eczema.• The highest incidence of eczema was found in age group five months to 9 years (45%) ,followed in the age group (30 - 39) years (14%) , while the lowest percentage (5%) is in age group (20 - 29) years .• Contact dermatitis is the highest percentage of incidence (57%) followed by Atopic dermatitis (35%) and Discoid dermatitis (5%) ,while the lowest percentage is for Neuro dermatitis (3%) .• Out of the one hundred patients with eczema in all study groups , results showed that Staphylococcus aureus isolated at a highest percentage 20 (57.14%), followed by Staphylococcus haemolyticus seven (20%), and Pseudomonas fluorescens five (14.28%) and two isolates of Enterobacter aerogenes (5.7%) ,and one isolate of Staphylococcus warneri(2.8%).• Pseudomonas fluorescens were resistance for 18 antibiotic ,and sensitive to only two antibiotics (Neomycin and Nitrofurantoin ) .The isolates were resistant 100% to β lactams antibiotics ,augmentin ,erythromycin, azithromycin ,oxacillin ,while resistance 50% to levofloxacin ,rifampicin, norfloxacin ,and ciprofloxacin .• Enterobacter aerogenes isolates were resistant to βLactam antibiotics (100%) and appeared sensitivite to Aminoglycosides Antibiotic (amikacin ,gentamicin) in 100% percentage ,but gave intermediate resistance to neomycin .• Staphylococcus aureus isolates were resistant to 11 type of antibiotics and sensitive for eight . While Staphylococcus haemolyticus isolates were resistant to 15 type of antibiotics and sensitive to four and intermediate to Levofloxacin .And that differ from Staphylococcus warneri isolates which sensitive to 14 type of Antibiotics ,while resistant to only five antibiotics ,and intermediate to only Oxacillin. • Testing ability of Bacterial isolates to growth in presence different concentration of biostains (the biostains used are Crystal violet , Methylene blue and Methyl red ) allowed to detecting the sub MIC. the MIC of the methylene blue against S. haemolyticus and P.fluorescens were (1) mg/ml, while against S .warneri and S.aureus were (10) mg/ml ,and the MIC of the methyl red was (1) mg/ml against all type of these isolates , while the MIC of crystal violet against all these isolates were (0.1) mg/ml except against S. warneri was (1) mg/ml .• Studying the effect of biostains on virulence factors for bacterial isolates appeared their were&#39;nt any effect for these biostains on capsule production in these isolates ,and inhibition of adherence factor for these isolates by the stains ,while the treating of bacterial isolates with biostains could reduce the ability of these isolates for forming biofilm ,and the highly ability of these isolates which isolated from eczema patients to agglutinated with the lectin extracted from epithelial cells. But the percentage of agglutination decrased due to the treatment with biostains . • Spectrophotometric method is used to investigate the effect of biostains on cell permeability ,the results revealed that the target of biostains is the cell membrane.• Extracting lipopolysaccharide from Pseudomonas fluorescens which is one of the component of cell wall ,and studying the effect of biostain on the quantity of lipid and sugar, The results showed high level of lipid 79.33mg/ml in sample which not treated with biostain , while the lipid level decreases to 45.8 mg/ml when treated bacteria with the stain, as well as the quantity of sugar in lipopolysaccharide was high in sample not treated to biostain 123.4 mg/ml but decreased to 74.2 mg/ml when sample treated with methyl red stain.

تاثير بعض المواد الكيميائية في انتاجية وفعالية ذيفان الفا - هيمولايسين المنتج من المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Effect of some chemical materials on productivity and activity of ? - hemolysin which produced from Staphylococcus aureus Isolated from clinical samples

Author name: زينب فرحان علي الزهيري
Supervisor name: خولة جبر خلف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة عزل بكتيريا المكورات العنقودية من بعض مستشفيات بغداد، والتي شملت : مستشفى بغداد التعليمي، ومستشفى ابن البلدي، والمختبرات التعليمية،و مستشفى حماية الطفولة التعليمي، ومستشفى الكندي حيث امكن الحصول على (110) عزلة، توزعت بواقع (15) عزلة من عينات التهاب المجاري البولية، و(20) عزلة من الحروق، و(46) عزلة من الجروح ،و (17)عزلة من عينات الدم، و(12) عزلة من مسحات الاذن والفم والعيون.شخصت الدراسة (77) عزلة بكتيرية على انها مكورات عنقودية ذهبية من خلال اعطائها نتائج ايجابية في فحص الكاتليز وفحص انزيم مخثر البلازما ، وبقية الفحوص البايوكيمياوية مثل تخمير المانيتول في وسط ملحي تحت ظروف هوائية وقابلية العزلات على تحلل الدم وكانت عزلات Staphylococcus aureus قد توزعت على النحو الاتي (9) عزلات من عينات الدم، و(36) عزلة من الجروح، و(13) عزلة من الحروق، و(9) عزلات من مسحات الاذن والفم والعيون، و(10) عزلات من التهابات المجاري البولية.وقد اظهرت العزلات قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي(Biofilm) اذا استطاعت (35) عزلة (45.45)% من اصل 77 عزلة ان تكون الغشاء الحيوي فيما لم تستطع (42) عزلة (54.54)% المتبقية من تكوين الغشاء الحيوي.اظهرت النتائج ان نسبة العزلات المنتجة لذيفان الفا - هيمولايسين كانت (32) عزلة (41.55)% اما العزلات غير المنتجة للذيفان ، فقد كانت (45)عزلة.اختبرت حساسية العزلات تجاه المضادات الحيوية، وقد كانت نسبة مقاومة العزلات تجاه مضاد Oxacillin هي 100%، اما مضاد Methicillin وCloxacillin ، فقد كانت نسبة المقاومة 98.7 % و97.4 % على التوالي. وكانت نسبة مقاومة مضاد Cephalexin وCefixim هي 93.5 % و76.6 % على التوالي، اما مضاد Rifampicin وVancomcin فقد كانت نسبة مقاومتها 67.5 % فيما كانت نسبة مقاومة Azithromycin وLevofloxacin وBacitracin هي 49.3%، 70.1 %، 93.5 % على التوالي.اختيرت العزلة الكفؤة رقم (19)، وحدد التركيز المثبط الادنىminimum inhibitory concentration (MIC) لمضاد المثيسلين والذي كان تركيزه (32) مايكروغرام / مل.اختبر تاثير مادة CD - Cholesterol، وCholesterol ، وCD ، وMethicillin ، وPbs في فعالية ذيفان الهيمولايسين وكان معيار التحلل Hemolytic Titer هو : 8، 32.768، 65.536، 140.737.488.355.32، E+254.961408 على التوالي.واختبر تاثير المواد نفسها في انتاجية ذيفان الهيمولايسين وكانت النتائج على الاتي : 67.108.864، 549.755.813.888، 274.877.906.944، 576.460.752.303.360، 3.96140812E+25 على التوالي.وقد نقي الذيفان جزئيا بطريقة الترسيب باستخدام كبريتات الامونيوم، واختبرت فعالية الذيفان في حل كريات الدم الحمراء بطريقة الانتشار في الحفر.واختبرت التجربة فعالية الذيفان المنقى جزئيا داخل الجسم الحي في قرنية عين الارانب المختبرية اذ تكونت مناطق تاكل في القرنية بقطر 7.70 ملم بعد 8 ساعات من الحقن وثبطت فعالية هذا الذيفان داخل الجسم الحي باستخدام مادة CD - Cholesterol مع الذيفان حيث اصبح قطر تاكل القرنية 3.95 ملم.استخدمت مادة CD - Cholesterol بوصفها مادة علاجية من خلال استخدامها على هياة قطرات اضيفت الى العين المصابة بالذيفان وادت الى تناقص منطقة التاكل في القرنية من 7.70 الى 3.95.ويستنتج من الدراسة الحالية : اهمية استخدام CD - Cholesterol في تثبيط ذيفان الفا - هيمولايسين في داخل وخارج الجسم الحي وما لهذه المادة من اهمية في المجالات التطبيقية وفي الوقاية من تاثيرات الذيفان وقدرته التحللية للخلايا | In this study, one hundred and ten clinical samples were obtained from hospitals patient at many hospitals of Baghdad governorate : Baghdad teaching hospital, , Ibn - EL Balady hospital, educational laboratories, Protect child teaching hospital, Al - kendi hospital . The types and the numbers of clinical samples were distributed as (15) samples from urinary tract infect , (20) samples from burns infection , (46) samples from wounds, (17) samples from blood, (12) samples from ear, mouth and eyes infections . In this study (77) isolates were diagnosed as cocci cluster gold by giving positive result for catalase test and coagulase enzyme test and the other biochemical tests such as fermentation of mannitol under aerobic conditions and the ability of some isolates to hemolysis blood . S. aureus isolates distributed as follows : (9) isolates from blood samples, (36) isolated from wounds, (13) isolates from burns, (9) isolates from ear, mouth and eyes infection, (10) isolates from urinary tract infections.The isolates showed the ability to form biofilm (35) isolates (45.45%) out of 77 isolates and the other isolates could not form biofilm were : (42) isolation (54.54%),. The results showed that the proportion of isolates producing α - hemolysin was (32) (41.55%) isolates were either non - producing toxin : (45) isolates. The isolates were tested sensitivity to antibiotics and showed proportion of resistant toward Oxacillin which was 100% , Methicillin and Cloxacillin resistance ratio was 98.7% and 97.4%, respectively.The proportion of resistant to Cephalexin and Cefixim were 93.5% and 76.6%, respectively, while the Rifampicin and Vancomcin resistance ratio were 67.5%, while the proportion of resistant to Azithromycin and Levofloxacin and Bacitracin were 49.3%, 70.1%, 93.5%, respectively. The chosen isolate was ( number 19), select the minimum inhibitory concentration (MIC) of methicillin which were (32) micrograms \ ml. Tested the effect of CD - Cholesterol ,Cholesterol ,CD ,Methicillin and Pbs on the activity of toxin α - hemolysin and the hemolytic Titer is : 8 ( line A, well 3), 32.768 (line B, well 4), 65.536 (line B, well 5), 140.737.488.355.32 (line D, well 12) , 4.961408E + 25 (line G, well 12) respectively. It also has been testing the effect of the same material on the productivity of toxin α - hemolysin and the results were respectively : 67.108.864 (line : C well : 3), 549.755.813.888 (line : D ,well : 4), 274.877.906.944 (line : D, well : 3) , 576.460.752.303.360 (line : E, well : 12) , 3.96140812E + 25(line : H, well : 12) respectively.The toxin α - hemolysin was purified by using ammonium sulfate precipitation, and tested the effectiveness of the toxin on the red blood cells by using wells diffusion method . purified toxin was injected inside the living body in the cornea of rabbits eye, and the erosion of cornea where formed with diameter : 7.70 mm after 8 hours of injection but the other eye that injected with CD - Cholesterol that mix with toxin where the erosion diameter was3.95mm.CD - Cholesterol was used in treatment as a drops which added to the affected eye and led to a decrease in corneal erosion area from7.70 mm to3.95.mm We follows from the present study : The importance of using CD - Cholesterol in the inhibition of alpha - toxin inside and outside the living body and the importance of this study in applied medical fields and in the prevention the effects of the toxin on the cells.

دراسة تاثير التدخين على بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى السكري من النوع الثاني == Study the effect of smoking on some haematological and biochemical changes in type 2 diabetic patients

Author name: زينب رشيد حميد
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (105) مريضا" بالسكري النوع الثاني ,شملت المجموعة الاولى (45) مدخنا" والمجموعة الثانية (60) مريضا" من غير المدخنين من الوافدين الى مركز الغدد الصم والسكري التابع لوزارة صحة بغداد ,الرصافة ,مجاور مستشفى الكندي التعليمي. راوحت اعمار المجموعة الاولى (29 - 68 سنة) وبمعدل (48.53) سنة والمجموعة الثانية(24 - 75 سنة ) وبمعدل (52.21) سنة, تم سحب الدم الوريدي بمقدار (10 ملم۳) ,استخدم (2 ملم۳) منها لاجراء الفحوصات الدموية والتي شملت فحص هيموكلوبين الدم,الهيوكلوبين المسكر HbA1c%,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة(PCV%),معدل ترسيب كريات الدم الحمر(ESR),مع قياس ضغط الدم (الانقباضي والانبساطي) واستخدم (8 ملم۳) من الدم لاجراء الفحوصات الكيموحيوية والتي شملت قياس مستويات الكلوكوز الصياميF.B.G) ) , وصورة الدهون الكولستيرول,الكليسريدات الثلاثية(TGs),البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (LDL), الواطئة الكثافة جدا"(VLDL) والعالية الكثافة (HDL), وتم كذلك ايجاد معامل كتلة الجسم BMI. اظهرت النتائج في المجموعة الاولى من مرضى السكري النوع الثاني من المدخنين ارتفاعا"معنويا"(P≤0.05)في مستويات الهيموكلوبين (14.60gm/dl),حجم كريات الدم الحمر المضغوطة PCV% (46.05) ومعدل ضغط الدم(mmHg) الانقباضي (14.24) والانبساطي (8.64), الهيموكلوبين المسكر (%6.14) وانخفاضا" معنويا"(P≥0.05) في ESR(16.6 mm/h) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (12.91gm/dl) ,PCV% (40.68), ومعدل ضغط الدم (mmHg) الانقباضي (13.65) والانبساطي ((7.93 وانخفاضا" في HbA1c% (%5.32) وارتفاعا" معنويا"في ESR(30.45mm/h) واظهرت نتائج الفحوصات الكيموحيوية في المجموعة الاولى ارتفاعا"معنويا" في مستويات الكولستيرول (4.83±0.17mmol/L) ,الكليسريدات الثلاثية (2.48mmol/L), البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة (1.56 mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين في الكولستيرول (4.20mmol/L), الكليسريدات الثلاثية (1.61mmol/L),البروتينات الدهنية واطئة الكثافة جدا (0.82mmol/L) انخفض مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة معنويا" (P≤0.05) في المجموعة الاولى (1.30mmol/L) مقارنة مع المجموعة الثانية من غير المدخنين (2.25mmol/L). لم تكن الفروقات معنوية في مستويات البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (LDL) بين المجموعتين وكذلك في مستويات سكر الدم الصيامي ومعامل كتلة الجسم BMI. نستنتج من هذه الدراسة الى ان التدخين قد ادى الى ارتفاع في مستويات الهيموكلوبين (Hb gm/dl) ,حجم كريات الدم الحمر المضغوطة (PCV%), الهيموكلوبين المسكر(%HbA1c), مستوى الكلوكوز الصيامي(F.B.G) وكذلك في مستويات الدهون (Chol.,TGs,VLDL) في المجموعة الاولى مع انخفاض كل من (HDL - c,ESR) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية, على الرغم من عدم وجود فروقات معنوية بين المجموعتين في مستوى الكلوكوز الصيامي (F.B.G), الا ان القيم كانت مرتفعة في المجموعة الاولى مقارنة مع القيم الطبيعية (3.3 - 6.1 mmol/L) وهذا يعود الى عدم تحمل الكلوكوز ((Glucose intolerance بسبب التدخين فضلا عن العلاقة الايجابية بين ارتفاع الهيموكلوبين المسكر (HbA1c%) والكلوكوز الصيامي (F.B.G) في المجموعة الاولى مقارنة مع المجموعة الثانية. | The present study was conducted on 105 diabetic patients type2 . the first group included (45) smokers. The 2nd group (60)non smokers who visited the Diabetic and Endocrine center, near AL - Kindey hospital , the average age for first group was (29 - 68 year), and (48.53), and (24 - 75year) , (52.21) for the 2nd group. 10ml of blood was drawing by veinpuncture,2ml out of 10ml was used for hematological tests (Hb gm/dl, Glycated Hb(HbA1c%),PCV%,ESR) Blood pressure (systolic and Diastolic) was estimated, 8ml of blood was used to estimate the Biochemical tests that included fasting blood sugar (F.B.S) ,lipid profile (cholesterol, Triglycerides, LDL,VLDL and HDL - c) and BMI was calculated for both groups. The results showed in 1st group a significant increase (P˂0.05 ) in Hb level (14.60gm/dl) ,PCV% (46.05), Systolic blood pressure (mmHg) (14.24), Diastolic blood pressure (8.64) ,HbA1c (6.14%) with significant reduce (P≥0.05) in ESR (16.6 mm/h) in compassion with the 2nd non smoker group (12.91gm/dl). PCV% (40.63), Diastolic blood pressure (7.93 mmHg) , with reducing HbA1c (5.32%) and increasing ESR (30.45mm/h). The results of biochemical test revealed in 1st group a significant (p˂0.05) increase In the levels of cholesterol (4.83 mmol/L), TGs (2.48 mmol/L) , VLDL (1.56 mmol/L) in comparison with 2nd group non smoker. Cholesterol (4.20mmol/L), TGs (1.61),VLDL (0.82 mmol/L) . The HDL - c in 1st group was reduced significantly (p˂0.05)(1.30 mmol/L) in comparison with 2nd group (2.25 mmol/L). The differences in levels of LDL, F.B.G and BMI were not significant between the two groups. We concluded from this study that the smoking causing an increase in the levels of Hb gm/dl ,PCV% ,HbA1c% F.B.G and lipid profile (chol., TGs, and VLDL ) in the first group in comparison with 2nd group. Although there was no significant differences in the level of F.B.G between two groups , but the values were highly elevated in comparison to the normal values of F.B.S (3.3 - 6.1 mmol/L) in both groups This may be related to Glucose intolerance due to cigarettes smoking in addition to positive relationship between elevation of HbA1c and F.B.G in 1st group in comparison with 2nd group.

دراسة نوعية مياه نهري ديالى ودجلة في الجزء الجنوبي لمدينة بغداد وتاثير بعض العناصر الثقيلة على الفطريات البيضية المعزولة == Study on the quality of water in Diyala and Tigris rivers southern Baghdad and the effect of heavy metals on the isolated aquatic fungi(Oomycetes)

Author name: ريم عمران عيسى الحسوني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله | عبد الرضا طه سرحان
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في الدراسة الحالية اختيار خمس محطات جنوب بغداد ثلاث منها على نهر ديالى الاولى قبل محطة الرستمية والثانية قرب مصبات الرستمية اما المحطة الثالثة فكانت بالقرب من نقطة التقاء نهر ديالى بنهر دجلة . اما المحطتان الاخريان فهما على نهر دجلة واحدة تقع على نهر دجلة قبل التقائه برافده ديالى والاخرى على نهر دجلة بعد نهر ديالى لمعرفة تاثيرنهر ديالى على نهر دجلة . اخذت النماذج من محطات الدراسة كل شهرين لمدة سنة كاملة ابتداء من شهر شباط ولغاية كانون الاول2009 . وقد تم عزل وتشخيص ( 14 ) نوعا فطريا عائدا الى ستة اجناس عائدة الى صنف الفطريات البيضية( Oomycetes ) وهي : Achlya Klebsiana A . americana , A . prolifroides , Achlya sp Saprolegnia ferax , S . anisospora , S . diclina , Saprolegnia sp , Dictyuchus sterile , D . carpophorus , D . polysporus , Pythium . ultimum , Pythiopsis cymosa , Leptomitus lacteus واظهرت النتائج ٲن اعلى عدد للعزلات ( 46 ) عزلةكانت في محطة رقم ( 5 ) في نهر دجلة اما اقل المواقع وجود للفطريات فكانت المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 16 )عزلة وكان الجنس Saprolegnia اكثر الاجناس تواجدا واقل الاجناس وجودا هو الجنس Pythopsis . وبينت النتائج انه يمكن اعتبار الانواع التالية ادلة حياتية على تلوث المياه . A . prolifroides , S . ferax , S . anisospora , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus وسجل النوعين لاول مرة D . polysporus وP. cymosa في العراق ، وقد اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه تراوحت ( 10.5 - 29.5 )م خلال مدة الدراسة ، كما وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني في محطات الدراسة ( 8.3 - 6.8 ) . وقيم التوصيلية والملوحة تراوحت على التوالي (9.8 - 4.9)مايكروسمينز|سم و((3.08 - 0.61غم|لتر للملوحة, اما قيم الاحتياج الكيميائي والحيوي للاوكسجين ( 18.2 - 3.2 ) ملغم|لتر و( 7.3 - 2.2 )ملغم|لتر اما نهر ديالى فكانت قيمة عالية مقارنة بنهر دجلة ,اما الكدرة فتراوحت ( 42 - 14.4 ) (NTU)وكانت قيمها اعلى في نهر ديالى من نهر دجلة وكذلك العسرة تراوحت ( 1617 - 210 ) ملغم|لتر واعلى القيم سجلت في محطة ( 3 ). اما الايونات الموجبة بالنسبة للكالسيوم والمغنسيوم سجلت زيادة في نهر ديالى اعلى من نهر دجلة اما نهر دجلة فقد سجلت المحطة ( 5 ) قيما اعلى من محطة ( 1 ) وذلك لتاثير نهر ديالى في بيئية نهر دجلة . ( ( 872.11 - 65 ملغم /لتر،اما الصوديوم فقد سجل اعلى قيم الايونات الموجبة تراوحت مابين ( 870 - 45 ) ملغم/لتر واقلها البوتاسيوم حيث تراوحت مابين( 18.12 - 1.7 ) ملغم/لتر, اما العناصر الثقيلة فقد كان الزنك اكثر العناصر وجودا في كل المحطات واقلها الكروم وبينت نتائج التحليل بان نهر ديالى ملوث بهذه العناصر ( الزنك ، الرصاص ، الكادميوم ، النحاس ، الحديد ، الكروم ) رغم انها لم تاخذ نمطا معينا خلال السنة . اما في نهر دجلة فكانت مدياتها ضمن الحدود المسموح بها . اما الفوسفات فتراوحت تراكيزه في المواقع المدروسة( 3.8 - 0.1 ) ملغم/لتر وكانت تراكيزه في نهر ديالى كما هو متوقع اعلى من نهر دجلة . اما الكلوريدات فقد سجلت قيم بمدى ( 775.63 - 54.55 ) ملغم/لتر واعلى التراكيز في نهر ديالى المحطة رقم ( 3 ) قرب مصبات الرستمية ( 775.63 - 199.96 ) ملغم/لتر. وتمت دراسة تاثير بعض العناصر ( الكاديميوم والزنك والحديد والكالسيوم والمغنسيوم والبوتاسيوم والصوديوم ) مختبريا على النمو الخضري والتكاثر الجنسي واللاجنسي وتكوين الجمات لكل من الفطريات الاتية والمعزولة من محطات الدراسة اثناء مدة الدراسةS. anisospora, A . prolifroides , L . lacteusوكانت نتائج التجارب المختبرية كالاتي : 1 - الكادميوم : اخذ بتراكيز ( 2 , 1 , 0.75 , 0.5 , 0.25 ) ملغم / لتر ا - اظهر الفطران L . lacteus وA . prolifroides تحملا لتراكيز الكاديميوم العالية اكثر من الفطر S . anisospora في النمو القطري بشكل معنوي. ب - عملت التراكيز العالية على تثبيط التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات الثلاثة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية عالية اكثر من باقي الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للكاديميوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة .2 - الزنك : اخذ بتراكيز ( 20 , 15 , 10 , 5 , 1 ) ملغم / لتر ا - عملت التراكيز العالية للزنك على تثبيط اقطار المستعمرات للفطريات الثلاثة .ب - عمل التركيز (1)ملغم|لتر على تشجيع التكاثر الجنسي واللاجنسي للفطريات المدروسة مقارنة بمعاملة السيطرة واظهر الفطر A . prolifroides حساسية تجاه تراكيز الزنك اكثر من الفطرين L . lacteus وS . anisospora . اما الفطر S . anisospora يمكن عده مؤشر لتلوث المياه بالزنك لكونه اكثر الفطريات تحملا للتراكيز المرتفعة لهذا العنصر .جـ - التراكيز المختلفة للزنك قللت معنويا اعداد الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides والتراكيز العالية للزنك عملت على زيادة اعداد الجمات للفطر L . lacteus معنويا.3 - الحديد : اخذ بتراكيز ( 5 , 2 , 1.5 , 1 , 0.5 ) ملغم / لتر ا - لم تؤثر التراكيز الواطئة للحديد معنويا على النمو القطري للفطريات المدروسة .ب - التراكيز المختلفة للحديداثرت على تكوين وظهور واعداد الحافظات البوغية والبيضية للفطر A . prolifroides مما يجعل امكانية استخدامه كدليل حياتي لتلوث المياه بهذا العنصر . وكذلك بالنسبةالفطر L . lacteus اما الفطر S . anisospora فانه لم يتاثر بشكل ملحوظ .جـ - اثرت التراكيز المختلفة على الفطران S . anisospora وA . prolifroides بزيادة اعداد الجمات فيه . لكن عمل الحديد على تقليل اعداد الجمات في الفطر L . lacteus .4 - الكالسيوم : اخذ التراكيز ( 150 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - ازدادت اقطار المستعمرات الفطرية بوجود الكالسيوم لكل من L . lacteus وS . anisospora لكن ثبطت اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides . ب - عملت التراكيز( 100 , 80 , 60 ) ملغم / لتر على تحفيز التكاثر اللاجنسي للفطريات اما التركيز (150)ملغم/ لتر ثبط الحافظات البوغية ،وشجعت التراكيز المنخفضة تكوين الحافظات البيضية وزيادة اعدادها للفطر A . prolifroides ،اما الفطر S . anisospora فان تراكيز الكالسيوم المختلفة عملت على تشجيع ظهور الحافظات البيضية وزيادة اعدادها, اما في الفطر L . lacteus فان تراكيز معينة عملت على تشجيع ظهورها وزيادة اعدادها . جـ - شجع الكالسيوم على تكوين الجمات للفطرين S . anisospora ,A . prolifroides ولكنه ثبط اعدادها في الفطر L . lacteus بشكل معنوي.5 - المغنسيوم : اخذ بتراكيز ( 120 , 100 , 80 , 60 , 40 ) ملغم / لتر ا - حفزت التراكيز المختلفة للمغنسيوم على زيادة اقطار المستعمرات لكل من الفطرين L . lacteus , A . prolifroides لكن الفطر S . anisospora عمل المغنسيوم على تثبيط اقطار مستعمراته .ب - اخر المغنسيوم ظهور الحافظات البوغية لكل الفطريات المدروسة وكذلك قلل اعدادها . اما الحافظات البيضية للفطريات المدروسة فقد اظهر المغنسيوم تاثيرا متباينا على الفطريات .جـ - ثبطت التراكيز المختلفة للمغنسيوم اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , S . anisospora اما فان التركيزين ( 100 , 80 ) ملغم / لتر عملت على زيادة اعداد الجمات في الفطر A . prolifroides.6 - البوتاسيوم : اخذ التراكيز التالية ( 15 , 10 , 75 , 5 , 2.5 ) ملغم / لترا - حفز البوتاسيوم زيادة اقطار مستعمرات الفطر A . prolifroides لكنه ثبط اقطار الفطرين L . lacteus , S . anisospora معنويا مقارنة بمعاملة السيطرة.ب - شجعت التراكيز المنخفضة للبوتاسيوم على تكوين الحافظات البوغية والبيضية للفطر S . anisospora اما التراكيز العالية عملت على تثبيط اعدادها . اما في الفطر A . prolifroides فقد اثر بشكل مختلف ومتباين على تكوين حافظاته البوغية والبيضية .وفي الفطر L . lacteus عملت التراكيز ( 10 , 7.5 , 5 ) على زيادة اعداد حافظاته ج - عمل البوتاسيوم على زيادة اعداد الجمات للفطر A . prolifroides ،وعمل التركيز ( 5 ) ملغم / لتر فقط عمل على زيادة اعداد الجمات للفطرين L . lacteus , .anisospora S . 7 - الصوديوم : اخذت التراكيز التالية ( 250 , 200 , 150 , 100 , 50 ) ملغم / لتر ا - ثبط الصوديوم اقطار الفطر S . anisospora اما الفطر A . prolifroides فان التراكيز المنخفضة زيدت اقطار مستعمراته اما التراكيز العالية ثبطت اقطار مستعمراته وكذلك الفطر L . lacteus .ب - الفطر A . prolifroides كان اكثر الفطريات حساسية تجاه التراكيز المختلفة للصوديوم خصوصا لتكاثره الجنسي واللاجنسي . اما الفطر L . lacteus فقد شجع الصوديوم تكوين حافظاته البوغية والبيضية . اما الفطر S . anisospora فان التراكيز المختلفة اثرت على تقليل اعداد الحافظات البوغية , وكذلك الحافظات البيضية .جـ - زيدت التراكيز المختلفة للصوديوم اعداد الجمات للفطريات الثلاثة S . anisospora ,A . prolifroides L . lacteus باستثناء التركيز (50)ملغم / لتر الذي عمل على تقليل اعدادها في الفطر الاخير. | In the present study five stations were chosen in the South of Baghdad . three stations on the Diyala river . the first before Al - Rustumia station , the second near the confluences of Al - Rustumia station and the third station was near the point that Diyala river meeting Tigris river . the last two stations , one of them located on Tigris river before it meet's Diyala river and the other after their meeting to limit the ecological effect of Diyala river on Tigris river . The samples were taken from studied stations every two months from February to December 2009. Fourteen species were isolated belong to six genus related to the class Oomycetes .These are : - Achlya klebsiana , A . amricana , A . prolifroides , Achlya .sp , S. ferax , S . anisospora , S .diclina,Saprolegnia.sp,Dictyuchus sterile,D.carpophorus, D . Polysporus , Pythium ultimum , Pythopsis cymosa , Leptomitus . lacteus . The results showed that higher number of isolates was in station ( 5 ) in the Tigris river while the lower number of isolates was in station ( 3 ) near the confluences of AL - Rustumia (16 )isolates. The study showed that Saprolagnia was the most frequent in the peroid of studying and Pythopsis was showed the lower freqency. The result showed that we can consider each of these Speicies : S . anisospora , S . ferax , A . prolifriodes , S . diclina , D . carpophorus , Leptomitus lacteus . as indictor of water Pollution . D . polysporus and Pythopsis cymosa were not recorded in Iraq . The ecological studying showed that temperature variability was between (10.5 - 29.5)C˚ in the peirod of studying , and Hydrogen contcentration ( 6.8 - 8.3 ) in the station s of studying . Electeral ions conductivity and salinity was ( 985 - 4920 )µs\Cm ,( 0.61 - 3.08 ) G\l in sequence . Biological Oxygen Demmend and Chemical Oxygen Demmend (3.2 - 18.2 )mg\l , ( 2.2 - 7.3 ) mg\l river was higher as compared with Tigris river the turbidiy valves was ( 14. 4 - 42 )NTU and it was higher in Diyala river then inTigris river so that Hardness range was ( 210 - 1617 ) mg\l . The Cataions consider ( Calisum and Magnesium) recorded increase in Diyala river than Tigris river because of effect of Diyala river on ecological situation of Tigris river ( 65 - 862.11 ) mg\l , ( 13.76 - 545.4 ) mg\l . The Sodium concentration recorded higher values in cataions Concentration ( 45 - 870 ) mg\l and the Polassium was the lowest concentration ( 1.7 - 18.12 ) mg\l. The heavy metal , the Zinc was the only elements present while the Chromum was recorded the lowest concentration . The results also showed that Diyala river Polluted with the elements ( Zinc , Lead , Cadmium , Copper , Iron , Chromum ) . in spite of that it wasn't take regular style .However In the Tigris river it was at the acceptable limitis ,The phosphate , concentrations in the studied stations were between ( 0.1 - 3.8) mg\l and concentration in Diyala river as were higher than Tigris river . The chloride was recorded in range ( 199.96 - 775.63 ) mg\l and higher concentration in Diyala river in Station ( 3 ) near the confluence of AL - Rustumia. All of ecological studies recorded decreased in the second halfe of the year ( 2009 ) compative to first half of that Year because of the level of water increased . Effect of the elements ( Cadmium , Zinc , Iron , Calsium , Magnesium , Potassium , Sodium ) on the radical growth , A sexual and sexual reprodudtion and gemma formation of the following isolated species fungi : S . anisospora , A.prolifroides . L . lacteus . were studied in the laboratory The results were as follows : 1. Effect of Cadmium : was used at the concentration (0.25, 0.5, 0.75, 1,) (mg\l) .a - A . prolifroides and L . lacteus showed more tolerance to the higher concentrations of Cadmium more than S . anisospora of radical growth .b - Higher concentration reduced both the Asexual and Sexual reproduction to the three fungi and the fungus A . prolifroides showed high sensitivity as compared with the other two fungi . Cadmium expanded the period of oogonia formation .c - Cadmium reduced number of gemmae in three fungi.2. Effect of Zinc : was used at the concentration ( 1,5,10,15,20 ) ( mg \l) a - Higher conc. of Zinc reduced the diameters of colonies of all the three fungi , while the low conc. had no effect.b - ( 1ppm ) conc. stimulated asexual and sexual reproduction of the studied fungi and the fungus A . prolifroides was more sensitive to all concs. of Zinc than S . anisospora , L . lacteus while the fungus S . anisospora was tolerant and can consider as bioindicator for water pollution with Zinc because it was the best fungus tolereate to higher conc. of this element.c - Different conc. of Zinc decreased the number of gemme of the S . anisospora and A. prolifroides, but higher conc. of Zinc increased the number of gemmae of L . lacteus 3. Effect of Iron : was used at the concs. ( 0.5 , 1 , 1.5 , 2.5 ) ( mg \l ) a - lower conc. of Iron has no effect on redical growth of fungi while the conc. ( 2,5 ) mg / L reduced the colonies diameter. b - Different concs. of Iron stimulated the formation and number of sporangia of the fungi A . prolifroides , L . lacteus that makes the first one as indicator for water pollution of this element. while the fungus S . anisospore was not affected c - Different concs. of Iron stimulated and increased the number of gemmae to fungi A.prolifriodes , L.lacteus but decrease the gemmae in S.anisospora 4. Effect of Calsium : was used at the concentration ( 40, 60, 80, 100, 150 ) mg \la - Calcium induced an increased of colonies diameters of S . anisospora and L . lacteus , while it redued redical growth of A . prolifroides .b - The concs . ( 60 , 80 , 100 ) mg \l work on stimulation of the asexual reproduction the fungi , while ( 150 ) mg \l redued the sporangia formation . Low conc . induced formation and number of Oogonia in A . prolifroides , while the different conc. Of Calsium stimulated Oogoina formation and number in S . anisospora .in the fungus L . lacteus specific conc . encourage the formation and number of Oogonia .c - Calsium increase the number of gemmae in A . prolifroides and S . anisospora , while reduced it in L . lacteus5. Effect of Magnesium : was used at the conc. (40, 60, 80,100,120) mg \la - Different concs. Of Magnesium stimulated the radial growth of both of fungi A . prolifroides and L . lacteus , while the Magnesium reduced the radial growth of S . anisospora .b - Period of sporangia formation of the there fungi was expanded , and the number of sporangia was reduced of fungi . Oogonia of all fungi showed different effect in different concs. of Magnesium. c - Different concs. of Magnesium reduced the number of gemmae of fungi , except ( 60 ) mg/L for the fungus S . anisospora and ( 40 ) mg\l for the fungus L . lacteus , while ( 80 , 100 ) mg\l stimulated the number of gemmae in A . prolifroides 6. Effect of Potassium : was used at the concs. (2.5, 5,7.5, 10,15) mg\l a - Potassium reduced the radial growth of both fungi S . anisospora and L . lacteus , while increased the Colonies diameter of the fungus A . prolifroides. b - Low conc. of Potassium stimulated the formation and number of sporingia and Oogonia , while higher conc. reduced it. However ,the concs. ( 5 , 7.5 , 10 ) mg\l stimulated the number of sporangia and Oogonia of the fungus A . prolifroides S.anisospora showed irregular style in the formation of sporangia and Oogonia so the fungus L . lacteus . c - Potassium concs. stimulated the number. of gemmae in A . prolifroides , while only ( 5 ) mg\l stimulated the number of gemmae of S . anisospora and L . lacteus. 7. Effect of Sodium : was used at the conc. (50,100,150, 200, 250 ) mg\l a - Sodium reduced the colonies diameters of the fungus S . anisospora , while low conc. increased the radial growth but high conc. reduced the radial growth of A . prolifroides and L . lacteus b - A . prolifroides was high sensitive to different conc. of Sodium specialy the asexual and sexual reproduction . Sodium stimulated the formation of sporangia and Oogonia in L . lacteus , while and reduced it in the fungus S . anisospora .c - Sodium was stimulated and increased of gemmae formation in S . anisospora and , A . prolifroides at different concs. of , while in fungus L . lacteus only ( 150 ) mg / L reduced the number of gemmae and the other concs. stimulated their number .

التغيرات في بعض المعايير الدموية والكيموحيوية لدى مرضى قصور الغدة الدرقية == Changes in some haematological indices and biochemical parameters in patients with hypothyroidism

Author name: رويدة يونس لفتة
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على (80) شخصا بشكل مجموعتين ، تضمنت المجموعة الاولى مرضى قصور الغدة الدرقية 60 مريضا (40 انثى، 20 ذكر) الذين تراوحت اعمارهم بين (25 - 63 ) سنة وبمعدل 44.23±1.38) ) ومن المراجعين الى مركز الغدد الصم والسكري / التابع لمستشفى الكندي / الرصافة ، شملت مجموعة السيطرة 20 شخصا (15 انثى ، 5 ذكور) تراوحت اعمارهم بين (25 - 60 ) سنة وبمعدل ( 37.00±6.49 ). اظهرت النتائج ارتفاعا (P<0.01) في مستويات هرمون TSH في مجموعة المرضى وبمعدل (5.60±0.78 mU/L) مقارنة بالسيطرة (1.62±0.17 mU/L)، لم تكن الفروقات معنوية (P>0.05) في مستويات T4 (79.82±2.32 nmol/L )، (74.90±2.11 nmol/L) وT3 (1.35±0.05 nmol/L) ،(1.54±0.06 nmol/L) في مجموعتي المرضى والسيطرة على التوالي . كان معامل الارتباط سالبا (P<0.01) في مجموعة المرضى بين TSH وT3 (0.31 - ) وكذلك بين TSH وT4 (0.53 - ) بينما كان الارتباط موجبا (P<0.01) بين T4و T3 (0.54) . انخفض مستوى هيموكلوبين الدم (P<0.01) (<13gm/dL) في الذكور ، (<12 gm/dL) في الاناث وبمعدل (9.47±0.13 gm/dL ) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (12.91±0.30 gm/dL) . بلغت نسبة حصول فقر الدم (38.33%) وعند مستوى معنوية (P<0.01) في مجموعة المرضى وبمعدل مستوى الهيموكلوبين (9.47±0.13 gm/dL) مقارنة ﺒ (20 %) وبمعدل هيموكلوبين الدم (10.82±1.3 gm/dL) في مجموعة السيطرة . كان نوع فقر الدم في مجموعة المرضى وبحسب حجم كريات الدم الحمر الكريي (MCV <80 Ft ) في 8 حالات وبنسبة (34.78 %) وتحت مستوى معنوية ( P<0.01) من نوع صغيرة الحجم (Microcytic anemia) وفي 15 حالة وبنسبة (62.21 %) وعند مستوى معنوية (P<0.01) من نوع طبيعية الحجم (Normocytic anemia) اما حالات عدم وجود فقردم فلقد بلغت 37 حالة وبنسبة (61.67 %) وعند مستوى معنوية (P<0.05) . انخفض مستوى حديد مصل الدم (P<0.05) في مجموعة المرضى في 10 حالات وبنسبة (16.67 %) وبمقدار (10.08±0.5 µmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0 %) وبمعدل (19.83±0.69 µmol/L) . انخفض فريتين مصل الدم (P<0.01 ) وبمعدل (11.21±0.13 µg/L) وبنسبة (36.67 %) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (20 %) وبمعدل ( 6.14±0.12 µg/L) . ارتفع مستوى TIBC ((P<0.01 في 7 حالات وبنسبة (11.67 %) وبمعدل (67.02±0.12 µmol/L ) في مجموعة المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة (51.23±0.87 µmol/L) ،انخفض مستوى TIBC (P<0.01) في 51 حالة من المرضى وبنسبة (85 %) وبمعدل (29.78±0.32 µmol/L) مقارنة مع السيطرة(51.23±0.87 µmol/L) لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (123.17±1.35 mm.Hg) والانبساطي (mm.Hg 79.27±0.82) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة ((120.20±2.50 mm.Hg ،((78.95±0.18 mm.Hg على التوالي . لم تكن الفروقات معنوية (p>0.05) في مستوى معامل كتلة الجسم (BMI) في مجموعة المرضى (28.37±0.72) مقارنة مع السيطرة (26.71±1.07) . ارتفع مستوى RDW (P<0.01 ) (17.2±0.12%) وانخفض مستوى MCV (62±0.2 Ft) في مجموعة المرضى مقارنة مع السيطرة RDW (15±0.22%) وMCV (66.3±0.13 Ft)، انخفض مستوى صوديوم مصل الدم (<135 mmol/L) في 26 حالة وبنسبة (43.33 %) وعند مستوى معنوية ((P<0.01 مقارنة بالسيطرة (0%) بلغت مستويات البوتاسيوم (4.62±0.08 mmol/L) في مجموعة المرضى مقارنة بالسيطرة (4.59±0.07 mmol/L) الا ان هذا الارتفاع لم يكن معنويا ((P>0.05 . نستنتج من هذه الدراسة الى ان قصور الغدة الدرقية في مجموعة المرضى كان من نوع تحت السريري وذلك من خلال ارتفاع مستوى هرمون TSH والمستويات الطبيعية لهرموني T4 وT3 . وكان فقر الدم من نوع صغيرة الحجم ، وطبيعية الحجم مع انخفاض مستوى الصوديوم في مصل الدم. | The present study was conducted on 80 subjects , divided into two groups. The hypothyroid patients group (Ist group) Included 60 subjects (40 females,20 males),their ages ranged between (25 - 63) year by mean (44.23±1.38) ,that visited the center of endocrine and diabetes at AL Kindy Hospital, Rusafa region .The control group was included 20 subjects (15 females,5 males). Their ages ranged between 25 - 60 year by mean (37.00±6.49) The results showed a significant (p<0.01) increase in the level of TSH in patients group (5.60±0.78 mU/L) in comparison (1.62±0.17 mU/L) in the control group . The differences were not significant (P>0.05)in the level of T4 (79.82±2.32 nmol/L) ;(79.90±2.11 nmol/L) and T3 (1.35±0.05 nmol/L) ; (1.54±0.06 nmol/L) in the patient and control groups respectively. There was negative correlation(P<0.01) between TSH and T3 (0.31 - ) ,and also between TSH and T4 (0.53 - ) .while there was a positive correlation (0.54) significant at (p<0.01) between T4 and T3 in the patients group . The level of haemoglobin decreased significantly (P<0.01) in males (<13 gm/dL) and females (<12 gm/dL) with mean (9.47±0.13 gm/dL) in patienst group in comparison with control group (12.91±0.30 gm/dL). The rate of anemia was (38.33%) at the level (P<0.01) in the patients group in comparison with control group (20%) by mean(10.82±1.3 gm/dL) . The type of anemia according to MCV (<80 Ft) was microcytic in 8 cases (34.78%) at level (P<0.01) and it was normocytic in 15 cases (62.21%) in the patienst group at (p<0.01) . The non anemic cases were 37 (61.67%) at level (P<0.05) . The level of serum Iron reduced (P<0.05) in the patients group in 10 cases (16.67%) with mean (10.08±0.5 µmol/L) in comparison (0%) with mean (19.83±0.69 µmol/L) in the control group. The level of Ferritin reduced (P<0.01) by mean (11.21±0.13 µg/L) at rate (36.67%) in comparison (20%) with mean (6.14±0.12 µg/L) in the control group. TIBC was Increased (P<0.01) in 7 cases (11.67%) with mean (67.02±0.12 µmol/L) in the patients group in comparison with the control group (51.23±0.87 µmol/L) . The level of TIBC was decreased (P<0.01) in 51 cases (85%) with mean (29.78±0.32 µmol/L) in the patients group in comparison with control (51.23±0.87 µmol/L) . There was no significant differences (p>0.05) in the level of systolic blood pressure (123.17±1.35 mm.Hg) and diastolic blood pressure (79.27±0.82 mm.Hg) in the patients group in comparison with control (120.20±2.50 mm.Hg) ;(78.95 ±0.18 mm.Hg) respectively . BMI value was not significant (p>0.05) in the patients group (28.37±0.72) in comparison with the control group (26.71±1.07) . The level of RDW increased(P<0.01)(17.2±0.12%) while MCV (Ft) decreased (62±0.2 Ft) in patients group in comparison with control group; the RDW was (15±0.22 %) and MCV (66.2±0.13 Ft) . The level of serum sodium (<135 mmol/L) reduced (P<0.01) in the 26 cases (43.33%) in comparison with control group(0%) . The level of potassium was Increased (P>0.05) (4.62±0.08 mmol/L) in the patients group in comparison (4.59±0.07 mmol/L) in the control group. We concluded from this study that the hypothyroidism in the patients group was subclinical (SCH) ,due to increasing TSH levels but the T4 and T3 levels were normal .The anemia in this group was microcytic and normocytic and reduction in the serum sodium level .

انتاج وتوصيف Protease من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من بعض الحالات السريرية وعلاقته ببعض المضادات الحيوية == Production and Characterization of Protease from Pseudomonas aeruginosa Isolated from Some Clinical Cases and its Relation with some Antibiotic Agent

Author name: رنا مجاهد عبد الله الشويخ
Supervisor name: سمير فتح الله سمعان | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (170) عينة من حالات مرضية مختلفة التي تضمنت (35) مسحة من الجروح و(47) مسحة من الحروق و(25) مسحة من حالات التهابات الاذن الوسطى فضلا عن عينات الادرار التي تضمنت (63) عينة وجمعت العينات من مستشفى الكاظمية التعليمي للمدة من 1 - 5 - 2005 ولغاية 1 - 8 - 2005 .  تم تشخيص (50) عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اذ زرعت على اوساط اغنائية وتفريقية لغرض العزل الاولي ثم اخضعت المزارع البكتيرية للفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها ، ثم استخدمت عدة الفحصapi20E للتشخيص النهائي لهذه العزلات ، اذ تضمنت (8)عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa (16%) من حالات التهاب الجروح ، (16) عزلة (32%) من التهابات الحروق ، (20) عزلة (40%) من حالات التهاب المجاري البولية و(6) عزلات (12%) من حالات التهاب الاذن الوسطى .  اختبرت حساسية بكتريا Pseudomonas aeruginosa ضد (20) مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية . اذ اظهرت بكتريا Pseudomonas aeruginosa نسبة المقاومة(100%) تجاه مضادات الامبسلين ، الاموكسسلين ، الاموكسسلين / حامض كلافيولونك ،الكلوكساسلين والسيفازولين . بينما بلغت نسبة المقاومة لمضادات السيفاكسيم ، الكاربنسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم (98%) ، (84%) ، (80%) و(78%) على التوالي. وبلغت نسبة المقاومة لمضادات الجنتاميسين ، التوبرامايسين ، الببراسيلين ، النورفلوكساسين ، الاميكاسين والسبروفلوكساسين (52%)، (26%) ، (24%) ،(14%) ،(6%) و(4% )على التوالي . في حين اظهرت جميع العزلات لبكتريا Pseudomonas aeruginosa حساسية عالية (100%) تجاه مضادات الازترونام ، امبينيم والسيفابيم البيفلوكساسين والافلوكساسين .  قدرت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs ) للمضادات الحيوية وكانت اعلى نسبة مقاومة لمضادات الاموكسسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم . اما نسبة المقاومة لمضادات الامينوكلايكوسايد فكانت تتراوح (4 - 128) مايكرو غرام / مل للتوبرامايسين ، (4 - 256) مايكرو غرام / مل للجنتاميسين اما لمضاد الاميكاسين فكانت (4 - 128) مايكرو غرام / مل. في حين اظهرت قيم MIC حساسية عالية (100%) لمضادي السبروفلوكساسين والسيفابيم.  اظهرت نتائج خلط مضادات السبروفلوكساسين مع كل من الجنتاميسين والسيفتازديم والببراسيلين نتائج مهمة في تخفيف التراكيز المثبطة الدنيا لكلا المضادين المستخدمين لوحدهما ضد هذه البكتريا . كذلك اظهرت نتائج خلط مضادي التوبرامايسين مع السيفتازديم فعالية عالية عند خلطهما معا واستعمالهما ضد بكتريا Pseudomonas aeruginosa . اظهرت (86%) من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa قابليتها على انتاج انزيم البروتييز . اظهرت النتائج تاثر انزيم البروتييز الخام ببعض المضادات الحيوية التي ادت الى انخفاض في فعالية الانزيم عند زيادة تركيز هذه المضادات .  كانت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتييز عند استخدام وسط لوريا عند رقم هيدروجيني(8) ولمدة(48) ساعة من الحضن بدرجة حرارة(35) م º . نقي انزيم البروتييز من العزلة Pseudomonas aeruginosa PsaW2 باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الايوني DEAE - celluloseوكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100. قدر الوزن الجزيئي للانزيم المنقى بطريقة الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100 وكان (21379 ) دالتون ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية البروتييز (35) م º والرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم كانت (8) . اوضحت نتائج تاثير بعض المثبطات والعوامل المختزلة والكلابية في فعالية الانزيم ، ان فعالية الانزيم قد ازدادت عند معاملته بايونات Ca++ وZn ++ مما يدل انها تلعب دورا في تحفيز وثبات الانزيم ، ولم تثبط فاعلية الانزيم بوجود العوامل المختزلة مثل السستين ، بينما تثبط فعالية الانزيم بوجود العوامل الكلابية EDTA .  اظهر انزيم البروتييز المنقى من بكتريا Pseudomonas aeruginosa فعالية عالية عند خلطه مع مضادي الفانكومايسين والسيفازولين في علاج التهابات العيون في الارانب والمتسبب عنها بكتريا Staphylococcus aureus . |  One - hundred and seventy swab samples were collected from different cases including (35) wound and (47) burn infection , (25) otitis media and (63) samples from urinary tract infections from Al - Kadhymia Teaching Hospital in Baghdad city . The study period was from 1 - 5 - 2005 to 1 - 8 - 2005 .  Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified using different microscopical , cultural characteristics and biochemical tests . Final identification of bacteria were performed by using api20E system. The isolates were 8(16%) from burn infections , 20(40%) isolates from urinary tract infections , 16(32%) isolates from burn infections and 6(12%) isolates from otitis media . The sensitivity of Pseudomonas aeruginosa isolates was been tested against (20) antibiotics showed isolates version resistance with different percentage against antibiotics .Pseudomonas aeruginosa exhibited (100%) resistance to Ampicillin , Amoxycillin , Amoxycillin / clavulanic acid, cloxacillin and cefazolin .While percentages of resistance to cefixime , carbencillin, cefotaxime and ceftazidime were (98%) ,(84%) ,(80%) and ( 78%) respectively .Resistance percentages to Gentamicin ,Tobramycin , Piperacillin , Norfloxacillin , Amikacin and Ciprofloxacine were (52%),(26%),(24%),(16%),(14%)and(4%) respectively. All isolates of Pseudomonas aeruginosa were highly sensitive (100%) to Aztronam , imipenem , cefepime , P - ofloxacin and ofloxacin .  Minimum inhibitory concentrations of Amoxycillin , cefotaxime , ceftazidime and piperacillin showed higher percentage of resistance . While resistance to aminoglycoside antibiotics including Tobramycin was (4 - 128) μ g / ml , Gentamicin was (4 - 256) μ g / ml and Amikacin was (4 - 128) μ g / ml . On the other hand , all bacterial isolates were susceptible (100%) to Ciprofloxacine and Cefepime .  Combinations of Ciprofloxacine with Gentamicin , ceftazidime and piperacillin gave interesting results against the local bacterial isolates in reducing their MIC values . Tobramycin and ceftazidime gave an obvious decrease in MIC values after combination of these drugs and used against Pseudomonas aeruginosa . A (86%) of the isolates of Pseudomonas aeruginosa have ability to produce protease enzyme . Enzyme activity was affected by some antibiotics . This activity was reduced with increasing the concentrations of these antibiotics . The optimum conditions for protease production were in LB medium with a pH (8) after (48) hrs of incubation at (35) C .  Purification of the protease was done using ion exchange chromatography DEAE - cellulose and gel filtration with sephadex G - 100 .  Molecular weight of the purified protease was measured by sephadex G - 100 and it was found to be around (21379 ) Dalton . The optimum temperature of enzyme activity was (35) C . However , the pH (8) was for activity and stability of this enzyme .  Zn++ and Ca++ ions may play a role in the enhancement and stability of the enzyme . Enzyme activity was not inhibited in the presence of reducing agent such as Cysteine , but it was inhibited in the presence of EDTA .  Pseudomonas aeruginosa purified enzyme shows a high activity when combined with Vancomycin and cefazoline and used for the treatment of the eye infection in rabbits caused by Staphylococcus aureus .

دراسة تاثير بعض الاحماض الدهنية على فعالية انزيمات المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من حالات الحروق == Study the effect of some fatty acids on the enzymes activity of Staphylococcus aureus isolated from burns

Author name: رنا عبد الكريم رشيد
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 157 عينة مسحة من المرضى المصابين بالحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد للفترة من شهر تشرين الثاني 2006 ولغاية اذار 2007 . زرعت هذه المسحات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . • اظهرت النتائج ايجابية 144 مسحة لتلوثها بالبكتريا ، وبنسبة 91.7% ، فيما كانت 13 مسحة منها سالبة ، وبنسبة 8.3% .• عزلت 50 عزلة من بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus بنسبة عزل 31.8% ، وشخصت باستخدام الاختبارات المظهرية والكيميائية الحياتية الخاصة بها .• قاومت جميع العزلات (50 عزلة) مضاد الاوكساسلين ، فضلا عن قدرتها على النمو في وسط اكار الاوكساسلين (Oxacillin agar) ، وبذلك كانت مقاومة للمثسلين (Methicillin resistant Staphylococcus aureus) (MRSA) وبنسبة 100% .• تم التحري عن حساسية العزلات تجاه 21 مضادا حيويا ضمن مجاميع مختلفة ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عالية للعزلات البكتيرية لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسة ، في حين كان المضاد الجرثومي الفانكومايسين اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين ، اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له ، وكانت العزلتان R120 وR148 الاكثر مقاومة ، اذ قاومتا عشرين مضادا ، فيما كانتا حساستين للفانكومايسين فقط .• اوضح اختبار Minimum inhibitory concentration (MIC) للاحماض الدهنية ضد العزلتين R120 وR148 ان حامض اللاورك هو الاكفا في تثبيط نمو البكتريا ، اذ بلغت قيمة MIC 0.4 ملغم / مل ، في حين بلغت قيم MIC لكل من حامض المايرستك واللينوليك والبالمتك والاوليك ( 1.6، 1.6، 6.4، 25.6) ملغم/ مل على التوالي .• اختبرت قابلية العزلتين R120 وR148 على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط غراء كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز ، واعتمادا على ظهور هالة شفافة حول المستعمرات كانت نسبة التحلل للعزلتين المدروستين 2.5 ، 2.7 وعلى التوالي . ولذا فقد انتخبت العزلة R148 لاختبار تاثير الحامض الدهني في فعالية انزيم البروتييز فيها . • حضرت تراكيز متعددة من حامض اللاورك (0.0125 ، 0.025 ، 0.05 ، 0.1 ، 0.2 ، 0.4 ، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، واختبر تاثيرها على فعالية انزيم البروتييز ولوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ،اذ بلغت الفعالية معدل 2.36 وحدة / مللتر وبنسبة مئوية تبلغ 79.73% عند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض لتنخفض الى معدل 0.69 وحدة/ مللتر ، ونسبة 23.31% عند تركيز 1.6 ملغم / مل من الحامض .• اختبر تاثير التراكيز المختلفة من حامض اللاورك على وقت تكون الخثرة بوساطة انزيم مخثر البلازما (Coagulase) ، اذ تاخر تكون الخثرة الى الساعة الثانية من اجراء الاختبار عند التركيز 0.05 ملغم/ مل ، في حين كان التاثير الاكبر عند التراكيز ( 0.4، 0.8 ، 1.6) ملغم / مل ، اذ تكونت الخثرة بعد مرور 18 ساعة من اجراء التجربة .• تم تقييم تاثير التراكيز المختلفة لحامض اللاورك على فعالية انزيم الهيمولايسين ، اذ لوحظ انخفاض الفعالية عند التراكيز المدروسة ، فعند تركيز 0.0125 ملغم/ مل من الحامض وتخفيف 1/2 بلغت النسبة المئوية للفعالية 52.9% ، لتنخفض هذه النسبة عند تركيز 0.2 ملغم/مل من الحامض ، وتخفيف 1/2 الى 5.9%. | A total of 157 samples of burn swabs were collected from three hospitals in Baghdad during November 2006 to March 2007. Culturing of the samples was done on suitable media to isolate the bacteria.• The results showed that 144 swabs were positive for bacterial contamination (91.7%), while 13 swabs were negative ( 8.3%).• Fifty isolates of Staphylococcus aureus were isolated (31.8 %), the identification was accomplished using morphological and biochemical tests.• All isolates (50 isolates) were resistant to oxacillin and could grow on oxacillin agar , thus they were resistant to methicillin (Methicillin resistant Staphylococcus aureus ) (MRSA) at 100%.• The sensitivity of the isolates against (21) antibiotics was investigated using different groups of antibiotics , the results showed high resistance of isolates to many antibiotics which have been used in the study , while they were sensitive to vancomycin and the two selected isolates - R120, R148 were sensitive to vancomycin only and resistant to all 20 antibiotics .• The minimum inhibitory concentration (MIC) test for fatty acids to the two isolates R120, R148 showed that lauric acid was the best fatty acid in inhibiting bacterial growth when the MIC reached 0.4 mg/ ml while the other fatty acids (Myristic, Linoleic, Palmitic and Oleic ) MIC reached to (1.6, 1.6, 6.4, 25.6) mg/ml respectively .• The ability of the two isolates (R120, R148 ) to produce protease was detected on solid media ( Skim milk Columbia agar) and depending on the development of clear zone the lysis ratio was 2.5 , 2.7 respectively , therefore the R148 isolate was chosen to detect the fatty acid effect on its protease activity .• Multiple concentrations of lauric acid have been prepared (0.0125, 0.025 , 0.05 , 0.1 , 0.2 , 0.4 , 0.8 , 1.6 ) mg/ml and tested for its effect on protease activity . The obtained results showed that the activity decreased at the concentrations studied. The activity reached an average of 2.36 unit/ ml and a percentage of 79.73% at the concentration 0.0125 mg/ ml of the acid , and then reached an average of 0.69 unit/ ml and a percentage of 23.31% at the concentration 1.6 mg/ ml of the acid.• The effect of different concentrations of lauric acid on the time of clot formation by coagulase have been tested . The clot was formed at the 2nd hour of the test at the concentration 0.05 mg/ml while the highest effect was at the concentrations (0.4 ,0.8 ,1.6) mg/ml as the clot was formed after 18 hours from the beginning of the test .• The effect of the different concentrations of lauric acid on the activity of haemolysin was evaluated . A decrease in activity at the concentrations studied was noticed. The activity reached to 52.9% at the concentration 0.0125 mg /ml of acid and the dilution 1/2 then the activity decreased to 5.9% at the concentration 0.2 mg/ml and dilution 1/2

بعض الجوانب الحياتية ونوع الغذاء وتاثير الاشعة الفوق بنفسجية على ادوار عثة الرز الانجومواSitotroga cerealella Lepidoptera : Gelechiidae) ) == Some biological aspects and effect at food type and Ulitraviolet ray on the (Angoumois ) Sitotroga cerealella (Lepidoptera : Gelechiidae

Author name: رشا سطام حميد الخزرجي
Supervisor name: اياد احمد رضا الطويل | ليلى جبار محمد البهادلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Grain moth Sitotroga cerealella(Olivier) is considered as one of the world wide - spread pest that causing damage to the grain and its products either in the field or in the warehouses . . The sensitivity of Sitotroga cerealella egg is carried out to UV rays at genetic control Department l integrated pest management center / Agricultural Research Directorate / Ministry of Scinence and Technology. The study showed that semi cooked wheat media gave the highest rate of adults emergenc ( 82.00%) from hatched eggs . This media considered as the best medium for rearing the mentioned insect for successive generation .The effect of different tempreture degrees were also studied on the insect biology , the best degree to rear this pest was 30CO because recording the highest average of egg laying which was .5% . +80 of relative humidity 106.6 at The study also showed that the continuing usage of the UV rays has caused consumption of the tube .This explains the differences in the results compared with other researchers results for using the same wave length . . The study also showed that the eggs at age two days is more sensitive to the UV than the other age old of the insect . Besides this there was an effect of the UV rays on the egg hatch where exposure 7.5 min . The the at the time of % .3330the least was UV rays also effected the rate of the emergence of adult males & females ( 0.00% ) at the time of exposure 5 minAs for the UV rays effect on the male & female age lifespan , there was a little effect on the males and showed low decreases , While on the females , There was an increases in the lifespan with average (9.0 days) at exposure time of 2.5 min . While there was decreases in the female lifespan with average 4.5% at exposure time 3 min .The results also showed that the UV rays with wave length of 312 nm has more effect on the biological parametes of the grain moth from the wave length of 365 nm for this pest. The effect of the wave length 312 nm on the different mating ofthe adults emerged from irradiated eggs at 48 hr old were conducted .The results showed that 2 min exposure caused complet sterility to males while 1.5 min caused complet sterility to femaleAlso the study showed that sex ratio was divated for males upen the emergence of femal in same case of the adulte mating. Resulte from irradiated egg at 312 . The appereance of male after mating ( normal female * irradiated male ) ( irradiated female * normal male ) ( irradiated male & female) were ( 100.0 , 80.0 , 72.5 ) respectively at radiation time ( 1.5 mn ) from the other hand . There were clear decrease in femal population as compared with the abov ratio after tadiate the same time and wave length femal were ratio ( 27.5 , 20.0 , 00.0 % ) respectively .

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca والسذاب Ruta chalepensis على الفطريات المعزولة من فروة الراس Tinea capitis

Author name: زينب حكمت عبود الاسدي
Supervisor name: مناهل نجيب بحو | جاسم محمد كرحوت
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 71 نموذج (قشور وشعر) ماخوذ من منطقة الراس من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الكندي التعليمي الذين شخصوا كحالات اصابة سريرية بسعفة الراس في المدة ما بين تشرين الاول 2006 ولغاية ايلول . 2007 فحصت النماذج مختبريا بوساطة الفحص المجهري المباشر باستخدام هيدروكسيد البوتاسيوم (% 10) KOH وصبغة اللاكتوفينول الزرقاء وكذلك بوساطة الزرع على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ ظهر في الفحص المجهري المباشر والزرع نتائج ايجابية في 66 حالة (% 92.95) بينما تم تشخيص 55 عزلة فطرية . عند التعرف على انواع الفطر كان الفطر Trichophyton mentagrophytes هو الغالب (% 36. 61) ، يليه الفطر Trichophyton verrucosum (% 18.30) ، وجاء الفطر Trichophyton rubrum بالمرتبة الثالثة (% 14.08) ، ثم الفطر Trichophyton violaceum (% 5.63) ، والفطر Trichophyton soudanense (% 2.81) .سجلت اعلى نسبة اصابة لدى الذكور قياسا بالاناث اذ بلغ عدد الذكور 37 (% 52.2) بينما عدد الاناث (34) (% 47.8) ، اما بخصوص اعمار المصابين فتراوحت اعمارهم ما بين (14 - 2) سنة ، وتبين عدم وجود فروق معنوية بين نسبة الاصابة واعمار المصابين ، اذ كان المرض اكثر تكرارا لدى المصابين الذين تراوحت اعمارهم (10 - 6) سنة (% 52.1) بينما كان المرض اقل تكرارا لدى المصابين الذين كانت اعمارهم (15) سنة فما فوق (% 2.8). تبين ان الاصابة كانت اكثر انتشارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه الاصابة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة في شهر نيسان بنسبة (% 22.5) ، وادنى نسبة اصابة في شهري اب وايلول (% 1.4) ، اما عن علاقة الاصابة بمناطق سكن المصابين فتبين ان اعلى نسبة اصابة سجلت لدى المصابين من المناطق الريفية (% 81.7) مقارنة بسكان المناطق الحضرية (% 18.3). كان النوع الملتهب هو الغالب بنسبة (60.6%) على النوع المتقشر بنسبة (39.4%) بالنسبة للانواع السريرية لسعفة الراس ، وفيما يخص مصادر الاصابة بسعفة الراس فوجد ان تربية الحيوانات المنزلية او الحقلية هي الغالبة بنسبة (% 56.36) ، يليه وجود اصابات فطرية لدى افراد العائلة بنسبة (% 30.90) ثم استخدام ادوات الاخرين بنسبة (% 12.7). حضرت مستخلصات اوراق نباتي السذاب Ruta chalepensis واليوكالبتوس Eucalyptus camaldulensis باستخدام الماء والكحول الحار والبارد ، كما درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقار الكرزيوفولفين في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية المعزولة من اصابات سعفة الراس والاكثر تكرارا خلال هذه الدراسة والتي شملت الفطر Trichophyton mentagrophytes وTrichophyton verrucosum وTrichophyton rubrum. اظهرت النتائج ان التاثير التثبيطي للمستخلصات المدروسة اعتمد على نوع المستخلص وتركيزه ونوع الفطر المختبر ، اذ اظهر المستخص المائي البارد لاوراق السذاب والمستخلص المائي البارد لاوراق اليوكالبتوس اعلى فعالية تثبيطية لنمو الفطريات المدروسة، وان هذا التاثير يزداد بزيادة تركيز المستخلص ومن جهة اخرى اظــهر الفطـــــر Trichophyton verrucosum اعلى حساسية للمستخلصات المختبرة مقارنة ببقية الفطريات المدروسة.واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلص المائي البارد لاوراق نبات السذاب Ruta chalepensis والمستخلص المائي البارد لاوراق نبات اليوكالبتوس Eucalyptus microtheca لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In Vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر Trichophyton mentargophytes var mentagrophytes في الارانب. | Seventy one specimens (scale and hairs) have been taken from scalp region were collected from out patient visiting the Dermatology Unit of Baghdad Taching Hospital , and Al - Kindy Teaching Hospitals , which diagnoised as Tinea capitis infection during the period extended from November 2006 through September 2007. On direct microscopical examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty five fungal isolates. The most common fungi isolated were Trichophyton mentagrophytes (36.6 %) followed by Trichophyton verrucosum (18.3 %) Trichophyton rubrum (14.08 %) Trichophyton violaceum (5.63 %) Trichophyton soudanense (2.81 %). There was recorded among male (52.2%) than female (47.8%) , also there was no significant different recorded among patient with (6 - 10) years age groups followed by (14) years age group. Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (22.5 % ) while the lowest rate was in Augest and September (1.4%). High rate was recorded in rural region (81.7 %) in comparison with urban regions (18.3 %). The inflamed (kerion) type (60 - 6%) was most poplur than the scaly type (39.4%) concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (56.36%) followed by infection of the family members (30.9%) and using others instrumeuts (12.7%). Leaves extract of Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and griseofulvin were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Ruta chalepensis and Eucalyptus microtheca cold water extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Trichophyton verrucosum was the highest sensitive cpmpared to the other tested fungi. According to these results the cold water extracts of Ruta chalepensis and eucalyptus microtheca have been diagnosed to examine their effectiveness (Invivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes var. mentagrophytes infection in rabbets.

علاقة بعض المعايير الكيموحيوية في مصول مرضى الفشل الكلوي بعوامل الامراضية في عزلات لبكتريا Enterobacter وProvidencia == Study of some biomarkers in patients with kidney failure and it’s relation with virulence factors in Enterobacter and Providencia

Author name: رشا حاتم شايع العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 182 عينة من ادرار ودم المرضى المصابين بالفشل الكلوي والراقدين في ردهات الكلية الصناعية لمستشفى بعقوبة التعليمي ومستشفى مدينة الطب والبالغ عددهم 130 مريضا لمختلف الاعمار ومن كلا الجنسين للمدة من 5/11/2012 - 13/1/2013 . زرعت العينات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . اذ اظهرت النتائج ايجابية 74 عينة 40.7% للنمو البكتيري والذي تضمن 40 عينة دم 54.05% و34 عينة ادرار 45.95% . فيما كانت 108 عينة سالبة للنمو 59.3%.• تم تشخيص 17عزلة تعود لبكتريا (Enterobacter cloacae) وعزلتان تعودان لبكتريا (Providencia rettgeri) من المرضى المصابين بالفشل الكلوي، وبنسبة 9.34% و1.09%على التوالي ، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع للفشل الكلوي هو بكتريا Escherechia coli وبنسبة24.3%، اضافة الى بكتيريتي Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis بنفس النسبة 4.1%، ثم بكتريا Pseudomonas aeruginosa 1.4%7.• عند التحري عن عوامل الامراضية لبكتريا P.rettgeriو E.cloacaeوالمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت جميع العزلات والتي تعود لكلا الجنسين امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثالث فيما لم تملكا عامل الاستعمار الثاني. كما اظهرت عزلات E.cloacae وP.rettgeri قدرتهما على التلازن مع مجاميع الدم للانسان بنسب متفاوتة .• اظهرت عزلة واحدة فقط تعود لكلا من E.cloacae وP.rettgeri قابليتها على انتاج الانزيم المحلل للبروتين الخارج خلوي(extracellular protease) في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين كما اظهرت جميع العزلات من كلا الجنسين قابليتها على انتاج السايدروفورات وقدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة قدرة عزلتا بكتريا P.rettgeri على انتاج انزيم اليورييز في حين لم تظهر عزلات بكتريا E.cloacae قدرتها على انتاج انزيم اليورييز.• كذلك اظهرت 12عزلة من مجموع 17من عزلات بكتريا E.cloacae وعزلتا P.rettgeri قدرتها على انتاج البكتريوسين ، وتم قياس فعالية البكتريوسين وتحديد الفعالية النوعية له لكلا من نوعي البكتريا . وبلغت فعاليته وفعاليته النوعية لبكترياE.cloacae 22.8 وحدة / مل و0.542 وحدة / مكغم وعلى التوالي ولبكتريا P.rettgeri 23وحدة / مل و0.286 وحدة / مكغم ، وعلى التوالي . من ذلك لوحظ زيادة تركيز البروتين في البكتريوسين المنتج من قبل P.rettgeri 80.4 مكغم/مل مقارنة بتركيزة في E.cloacae 42مكغم /مل ومنه زيادة فعاليتة في P.rettgeri عن E.cloacae.• اظهرت النتائج قدرة 15عزلة من E.cloacae 88.2% وعزلتا P.rettgeri 100%على انتاج انزيم β - lactamase ، كما اظهرت جميع العزلات ولكلا نوعي البكتريا القدرة على تكوين الغشاء الحيوي (Biofilm) .• اظهرت جميع عزلات E.cloacaeمقاومة تامة لمضاد amoxicillin/ clavulanic acid 100%. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية ceftriaxone cefoxitine ،82.4 ceftazidime % ثم تليها مضادات cefotaxime ، trimethoprim 70.6% ثم تليها piperacillin،nalidixic acid ،aztreonam ، )azithromycin58.8,53,53,53)% على التوالي ، ثم يليها مضاد gentamycin 41.2 % ثم تليها باقل مقاومة مضاداتneomicin ،nitrofurantoin، ciprofloxacin (29.4, 29.4(23.5, % على التوالي .اما بكتريا P.rettgeri فقد اظهرت مقاومة تامة لكل من مضادات ceftriaxone ،cefoxitine ، ceftazidime ، amoxicillin /clavulanicacid ، gentamicin ،neomicin ، trimethoprim، Azithromycin بنسبة 100% ، في حين كانت المقاومة اقل لكل من مضادات nitrofurantoin، cefotaxime50%.• اظهرت النتائج ان الفئات العمرية الاكثر اصابة بالفشل الكلوي كانت ضمن الفئة العمرية (61 - 70) سنة . فيما تبين ان المرض يصيب الذكور والاناث ، مع ارتفاع نسبة اصابة الذكور 56.2% على الاناث 43.8% . كما اظهرت معايير مصول المرضى ارتفاع مستويات اليوريا والكرياتنين في مصل الدم ليبلغ معدل (11.6 - 50)ملي مول/لتر و(45 - 1000) مايكرومول/لتر وعلى التوالي .• تم الكشف عن وجود علاقة بين الانزيم المؤكسد لحامض اللاكتيك LDH)) ومرض الفشل الكلوي وكذلك علاقتة الانزيم بعوامل الامراضية لبكتريا E.cloacae وP.rettgeri،حيث وجد في هذه الدراسة ان انزيم LDH)) يكون مرتفع عن القيمة الطبيعية في حالة مرض الفشل الكلوي (قبل الديلزة الدموية) مقارنة بالاشخاص الطبيعين .حيث بلغ مستوى الانزيم عند وجود بكتريا E.cloacae 213.50 وحدة / لتر وبكتريا P.rettgeri 214.52وحدة / لتر . ومقارنة بالاشخاص الطبيعيين 153.63 وحدة /لتر | One hundred eighty two urine samples were isolated from patients who were resident of the industrial kidney unit of Baquba Teaching Hospital and Medical City Hospital suffering from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 5/11/2012 - 31/1/2013. The samples were cultured in a suitable culture media for isolation the bacteria. The results showed that 74 samples (40.7%) were positive for bacterial growth, It included 40 blood samples (54.05%) and 34 urine samples (45.95%).While the rest samples (i.e. 108) were negative for bacterial growth (59.3%). • The results also showed that 17 isolates have been diagnosed as E .cloacae and two have been diagnosed as P.rettgeri with a percentage of 9.34% and 1.09% respectively. Other genus were also isolated, The results showed that common cause is bacteria Escherechia coli with a percentage of 24.3% , Klebsiella pneumonia , Proteus spp. with a percentage of 4.1% and Pseudomonas aeruginosa 1.4%. • P.rettgeri and E.cloacae showed a possession of the first and third colonization factors with a percentage of 100% and both genera showed the ability to agglutinate human blood group with a variable proportions. • One isolate only of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce of extracellular protease while none of the isolates had the ability to produce hemolysin, and all of the isolates showed the ability to produce sydrophorat and capsule formation. • The results of this study showed that the genus P.rettgeri has the ability to produce the enzyme urease while the genus E.cloacae hasn’t had the ability to produce urease. • 12 out of 17 isolate of E.cloacae and the two isolate of P.rettgeri ability to produce bacteriocin. the activity of bacteriocin was measured and the qualitative activity was measured for both the two species,its activity and qualitative activity for E.cloacae were 22.8 unit/ml and 0.542 unit /µgm respectively and for P rettgeri 23 unit/ml and 0.286 unit /µgm respectively .From that we can notice that the increase in protein concentration produced by P.rettgeri 80.4 µgm/ml compared with the concentration in E. cloacae 42 µgm/ml and therefore increasing its efficiency in P.rettgeri compared with cloacae. • The results showed that 15 isolates of E.cloacae 88.2% and the two isolates of P.rettgeri 100% have the ability to produce the enzyme β - lactamase; all the isolates of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce biofilm. • All E.cloacae isolates revealed a resistance to the antibiotic amoxicillin/ clavulanic acid with a percentage of 100%, ceftriaxone cefoxitine and ceftazidime 82.4, cefotaxime and trimethoprim 70.6, and piperacillin, nalidixic acid aztreonam and azithromycin with a percentage of (58.8,53,53,53)% respectively Followed by the antibiotic gentamycin 41.2 Followed by the least resistance to neomicin, nitrofurantoin and ciprofloxacin (29.4,29.4 and 23.5)% respectively.The genus P.rettgeri showed resistance against the antibiotics ceftriaxone, cefoxitine, ceftazidime, amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, neomicin, trimethoprim and azithromycin 100% while this genus showed less resistance against nitrofurantoin and cefotaxime 50%. • The results showed that the most age group infected with kidney failure is between (61 - 70) years. The disease affects women and men alike with a higher proportion of males infection 56.2% over females 43.8%. Patients sera standards showed high levels of urea and creatinine levels in blood serum to rate (11.6 - 50)m mol/L,(45 - 1000)M mol/L respectively. • It was revealed the existence of a relationship between lactic acid oxidative enzyme and kidney failure disease also the relation between the enzyme and virulence factors of P.rettgeri and E.cloacae , It was found in this study that the enzyme (LDH) have higher values in the case of natural situation of kidney failure patient (before dialyziz) compared with normal peoples where the level of the enzyme in the presence of E.cloacae (213.5)unit/L and (214.52) unit/L compared with normal peoples (153.63). • A study of the impact and effectiveness of the enzyme lysozyme in the analysis of the cell wall of the bacteria E.cloacae and P.rettgeri was done, the results showed that the highest effectiveness of the bacterial enzyme reached (0.388 and0.329) unit/L at concentrations (100,200) mg/ml respectively. The enzyme inhibited the growth of both types of bacteria to reach the highest areas of growth inhibition of both E.cloacae and P.rettgeri (25,20) mm at concentrations of the enzyme (100, 200) mg/ml respectively. The statistical analysis showed significant differences at the level (p>0.05).

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

Author name: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
Supervisor name: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

Author name: زاكروس كمال احمد البرزنجي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو بعض البكتريا المعزولة من اخماج الحروق == The Effect of Watery & Alcoholic Plant Extracts of Citrullus colocynthis & Solanum nigrum On Growth of Some Bacteria Isolated from burn Infections

Author name: زيد شاكر ناجي محمود الربيعي
Supervisor name: ياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لثمار نباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli .تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل مستخلص ولكلا النباتين , اذ تبين نتائج الكشوفات الكيميائية لمستخلص الحنظل ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات . وان هذه المركبات لها القابلية على الذوبان في الماء , اما المستخلص الكحولي لثمار الحنظل فيحتوي ( بالاضافة الى ما ذكر ) على مركبات راتنجية وكومارينات وزيوت طيارة , وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية.و بالنسبة الى مستخلصات ثمار عنب الذيب فقد اظهرت نتائج الكشوفات الكيميائية ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , فينولات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات , واما المستخلص الكحولي فانه يحتوي على المركبات الفعالة نفسها الموجودة في المستخلص المائي بالاضافة الى الراتنجات .لدراسة تاثير المستخلصات النباتية لثمار نبات الحنظل وثمار نبات عنب الذيب في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق , تم تحضير نوعين من المستخلصات ولكلا النباتين وهما : المستخلصات المائية والمستخلصات الكحولية .بالنسبة الى مستخلصات نبات الحنظل كان المستخلص المائي اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 480 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الكحولي وللتركيز نفسه ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11 ) ملم وعلى التوالي.اما بالنسبة الى مستخلصات نبات عنب الذيب كان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي على الانواع البكتيرية بتركيز ( 480 ملغم/ مل ) وبمعدلات اقطار تثبيط ( 16.33 , 20.66 , 18 , 16.33 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , وبمعدلات تثبيط ( 16.33 , 20 , 15.33 , 15.33 ) ملم على التوالي عند التركيز نفسه .كانت البكتريا St. aureus ( الموجبة لصبغة كرام ) اكثر الانواع البكتيرية تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا Klebsilla spp. اكثر الانواع البكتيرية مقاومة لفعل المستخلصات النباتية .وبما ان المستخلص المائي هو اكفا من المستخلص الكحولي لنبات الحنظل, وان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , فقد تم المزج بين المستخلصين بنسبة 1 : 1 ودرس تاثير المزيج على البكتريا قيد الدراسة , وقد تبين ان خلط المستخلصين معا لم يعط اي تاثير ضد البكتريا . | This study was done to determine the effect of watery and alcoholic extracts of two plants : Fruits of Citrullus colocynthis and Berries of Solanum nigrum on growth of bacteria isolated from infected burns which are : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli .Evaluation of active ingredients found in each extract for both plants determined.The biochemical analysis revealed that watery extract of Citrullus colocynthis contains : Alkaloids, Glycosides, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones , while the alcoholic extract contains : (in addition to the above mentioned compounds ) Coumarines, Resins and Volatile oils.The biochemical analysis of the watery extract of Solanum nigrum showed that it contains : Alkaloids, Glycosides, Phenols, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones, while the alcoholic extract contains the same active materials in addition to Resins.The effect of watery extract of Citrullus colocynthis on the bacterial growth revealed that at a concentration of 480 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) mm for Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli respectively , when compared with alcoholic extract which were ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11) mm respectively.The study also showed that staphylococcus aureus ( gram positive ) bacteria is most sensitive to plant extract's than the gram negative bacteria , while Klebsilla spp. were most resistant to plant extracts than the others.Because water extracts of Citrullus colocynthis were more effective than the alcoholic extracts , while alcoholic extracts of Solanum nigrum were more effective than watery extracts.A mixture of both extracts was prepared in a proportion of 1 : 1 wt : wt and used to test it's effect on the studied bacteria. No effect have been detected therefore it's useless to use the above mentioned mixture in treatment.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية == Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

Author name: رؤى عبد السادة جبار
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

مسح لمسببات التلوث البكتيري في وحدة الكلية الصناعية وحساسيتها للمضادات الحيوية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Survey of Bacterial contamination in Dialysis Unit and antibiotics susceptibility in some hospitals in Baghdad

Author name: زياد طارق نعمان شهاب
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـم في هذه الدراسة جمع (204) عينة من مستشفيات مدينة بغداد ، وهي كـل مـن ( مستشفى بغداد التعليمــي/ وحدة الكلية الصناعية. ومستشـفى الكرامة التعليمـي / وحدة الكلية الصـناعية ) ، للفـترة مـن كانون الاول 2009 لغاية منتصف اذار 2010 .شملت العينات مسحات من بيئة وحدة الكلية الصناعية التي تضمنت 12 موقـعا وهي كـل من ( الاسرة والمفروشات والارضـية والجـدران والسـطح الخارجي لجـهاز الديـلـزة وجلد المرضى الراقـدين والادوات الطـبية ذات الاسـتخدام الــيدوي وملابـس الكادر الطـبـي وانابيـب دخول وخـروج الماء داخـل جـهاز الديـلزة وفتحات جـهاز الـتبريد والــتدفئـة وادوات الطـعام والاثاث الخشبي والمغاسـل فضلا عن عـينات من هـواء الصالـة وتم الحصول على النتائج الاتية : 1 - كان عدد المسحات والعينات الموجبة (95) عينة من ( 204 ) عينة وبنسبة (%46.56) واحتوت بعـض المسحات على اكثر من عزلة بكتيرية واحدة .2 - تم الحصول على (139) عزلة اجمالية من مجـموع العـينات الموجـبة كان مـنها (122) عزلة بكتيرية نقية مشخصة . شملت هذه العزلات كل من بكتريا Staphylococcus spp. وAcinetobacter spp. وPseudomonas spp. وKlebsiella spp. وCitrobacter freundii وEscherichia coli وEnterobacter spp. وAlcaligens spp. وStenotrophomonas maltophilia وBordettella spp. وOchrobacter anthropi وProteus spp. وShigella spp. وFlavomonas oryzihabitans وPasturella pneumotropica وChrysemonas lutula وBacillus spp. وNocardia spp. وEnterococcus spp. . فقد تم تشخيص هذه الـعزلات عن طريق الصـفات المظهرية والمزرعـية للمستعمرات وكـذلك عن طريـق الفحص المجهري للخلايا وباستخدام الفحوصات الكيموحياتية فضلا عن استخدام فحص API test لغرض التشخيص الدقيق للعزلات .3 - اظهرت العينات الماخوذة من هـواء الصالة والمغاسل نسبة عالية من الثلوث فقد كانت نسبة التلوث لكل منهما (%81.8) بعـدها جاءت الارضية والجـدران تلـيها الاسرة والمفروشات وبنسبة تلوث للعينات الماخوذة بلغت (%58) و(%53) على التوالي .4 - كانت بكتريا المكورات العنقودية الاكثر انتشارا في بيئة وحدة الكـلية الصناعية حيث تم الحصول على (47) عـزلة منها وبنسبة (%38.5) من اجمالي العزلات والتي كانت (122) عـزلة مشخصة . 5 - كانت بكتريا Acinetobacter spp. الاكثر انتشارا من بين العصيات السالبة لصـبغة كرام بعدد عزلات بلغ (15) عزلة من اصـل (65) عزلة سالبة لصبغة كرام وبنسـبة مئوية بلغت (%23.07) من مجموع العـزلات السالبة لصبغة كـرام ونسبة (%12.2) من مجموع العزلات الكلية، تليها كل من بكتريا Pseudomonas spp. وKlebsiella spp. وبنسب مئـوية بلغت (%10.6) و(%4.9) على التوالي من مجموع العزلات الكلية6 - تم التحري عن حساسية (70) عزلة بكتيرية مختلفة لاثني عشر مضادﴽ حيويا وهي كـل Amikacin وAmoxicillin / clavulanic acid وCiprofloxacin وCefotaxim وCefexime وChloramphenicol وGentamycin وPiperacillin وTrimethoprime وOfloxacin وVancomycin وNalidixic acid .7 - اظهرت بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية جدا تجاه المضاد الحيوي Cefexime فقد بلغت نسبة مقاومة هذا المضاد (%100) ، كما اظهرت العزلات مقاومة مرتفعة تجاه كل من المضادات الحيوية Cefotaxime وGentamycin وNalidixic acid حيث بلغت نسبة المقاومة لهذه المضادات (%60) . في حـين اظهـرت هذه العـزلات مقاومة منخفـضة تجاه كـل مـن المضادات Chloramphenicol وCiprofloxacin وOfloxacin وبنسبة مئوية بلغت (%10) لكل مضاد. 8 - اظهرت بكتريا Staphylococcus epidermidis مقاومة بنسبة (%100) للمضاد الحيوي Cefexime ، في حـين كانت نسـبة مقاومة البـكتريا للمـضاد الحـيوي Cefotaxime هـي (%58) كـما كانت نسـبة مقاومتها للمـضادات الحـيوية Nalidixic acid وTrimethoprime (%50) لكـل مـن هذه المـضادات. 9 - كانت بكتريا المكورات العنقودية جميعها حساسة بنسبة (%100) للمـضاد الحيوي Amikacin .10 - اظهرت بكتريا Pseudomonas spp. مقاومة عالية تجاه المضادين Cefotaxime وNalidixic acid وبنسبة مقاومة بلغت (%66) كما كانت نسـبة مقاومة كـل من المضادين Trimethoprim وVancomycin (%55.5) و(%44.4) على التوالـي في حين لم تظهر مقاومة للبكتريا تجاه المضاد الحيوي Amikacin وPiperacillin وOfloxacin وAmoxicillin/ Clavulanic acid .11 - كانت عزلات بكتريا Klebsiella spp. مقاومة بنسبة (%100) لكل من المضادات الحيوية Cefixime وTrimethoprim وVancomycin ، كما اظهرت البكتريا نسـبة مقاومة للمضادات الحـيوية Cefotaxime وPiperacillin وAmoxicillin/Clavulanic acid بلـغت (%66.6) ، يلـيها المضاد الحـيوي entamycin بنسبة مقاومة بلغت (%50) . وكانت بكتريا Klebsiella spp. البكتريا الوحيدة التي اظهرت نسبة مقاومة للمـضاد الحيوي Amikacin بلـغت (%16.6) .12 - تم اجراء فحص MICs لخمسة من المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وهي Amikacin وAmoxicillin / Clavulanic acid وCefotaxime وGentamycin وCiprofloxacin . على البكتريا الاكثر حساسية او الاكثر مقاومة واظهرت العزلات جميعها التي اجري لها الاختـبار نسبة MICs واطـئة تجاه المضاد الحيوي Amikacin حيث تراوحت بين (8 - 1) مايكروغرام/مليلتر حيث كانت العزلات حساسة بشكل كبير للمضاد الحيوي المذكور.13 - اظهرت العزلات قيم MICs مرتفعة للمضاد الحيوي Cefotaxime حيث تراوحت القيم ما بين (128 - 2) مايكروغـرام/ مليلتر بالنـسبة لبكـتريا S. aureus في حين تراوحت القيم مابين (512 - 8) مايكروغرام/مليلتر بالنسبة لباقي المكورات العنقودية السالبة لفحص Coagulase ، اما بالنسبة لعزلات كل من بكتريا Klebsiella spp. وAcinetobacter spp. فـقد كانت قـيم MICs لها للمضاد المذكور تتراوح مابين (512 - 2) مايكروكرام / مليلتر . في حين اظـهرت عزلات بكتريا Pseudomonas spp. قيمMICs منخفضة للمضاد نفسـه حيث تراوحت القيم بين (2.0 - 0.25) مايكروكرام / مليلتر . | In this study has collected (204) samples from the hospitals of Baghdad, these are (Baghdad teaching hospital/Dialysis unit & AL karama teaching hospital/ Dialysis unit), for the period of December 2009 to March 2010.The samples included swabs ofartificial kidney unit environment that has 12 positions these are (beds, furniture, ground, walls, external surface of dialysis, skin of asleep patients, medical instruments - use manual, clothes of medical stuff, tubes of enter and out water inside of dialysis, slots cooling and heating device, Eating utensils, wooden furniture &sinks as well as samples of hall air and it has obtained the following results : 1 - The number of swabs & positive samples was (95) sample from (204) sample in the rate of (46.56%) some of swabs contain more than one bacterial isolate.2 - It has obtained (139) total isolate from the positive samples amount (122) of that were bacterial pure diagnostic isolates all of these isolates included the following kinds of bacteria : Staphylococcus spp., Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Klebsiella spp., Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter spp., Alcaligens spp., Stenotrophomonas maltophilia, Bordettella spp., Ochrobacter anthropi, Proteus spp., Bacillus spp., Chrysemonas lutula, Pasturella pneumotropica, Nocardia spp. and Enterococcus spp. They have diagnosed these isolates by Phenotypic & farming characteristics of colonies & by Microscopic examination for cells by using bio - chemical tests as well as using API test for the purpose of accurate diagnosisfor isolates.3 - The samples taken from the hall air and sinks showed a high rate of pollution that were (81.8%) for every sample after that they were ground followed by beds, furniture, And by contamination of the samples taken at (58%) and (53%) respectively.4 - Staph bacteria were most prevalent in the environment of artificial kidney unit was obtained (47) isolate of them at (38.5%) of the total isolates, which was (122) diagnosed isolate.5 - Acinetobacter spp. were most prevalent among the negative bacilli of gram stain in the number of isolates was 15 out of 65 negative isolate of gram stain and a percentage amounted to 23.07% of the total isolate Followed by Pseudomonas spp. & Klebsiella spp. at (10.6%) & (4.9%) of the total isolates respectively.6 - It was investigated for sensitivity (70) bacterial isolates of twelve different antibiotics and are all of the : Amikacin, Amoxicillin /clavulanic acid, Ciprofloxacin, Cefotaxim, Cefexime, Chloramphenicol, Gentamycin, Piperacillin, Trimthoprime, Ofloxacin, Vancomycin and Nalidixic acid.7 - Staphylococcus aureus showed very high resistance to the antibiotic Cefaxime The ratio of this counter - resistance (100%), isolates also showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime, Gentamycin & nalidixic acid Where the percentage of resistance to these antibiotics (60%).While these isolates showed low resistance to both antibiotics Chloramphenicol, Ciprofloxacin & Ofloxacin at (10%) to both antibiotic.8 - Staphylococcus epidermidis showed resistance by (100%) to antibiotic Cefexime, while the ratio of bacteria resistance to antibiotic Cefotaxime is (58%) also it was the resistance ratio to the antibiotics Nalidixic acid & Trimethoprime (50%) to both of these antibiotics.9 - Staphylococcus bacteria were all sensitive (100%) for antibiotic Amikacin.10 - Pseudomonas spp. Showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime & Nalidixic acid by resistance reached (66%) it was also the resistance ratio of both antibiotics Trimethoprim & Vancomycin (55.5%) & (44.4%) respectively While did not show resistance to the bacteria to the antibiotic Amikacin, piperacillin, Ofloxacin & Amoxicillin/Clavulanic acid.11 - Bacteria isolates Klebsiella spp. Were resistant to every antibiotics Cefixime, Trimethoprim & Vancomycin by (100%), bacteria also showed resistant ratio for antibiotics Cefotaxime, Piperacillin & Amoxicillin/Clavulanic reached (66.6%), followed by antibiotic Gentamycin by resistant reached (50%). Klebsiella spp. Were the only bacteria that showed resistant ratio for antibiotic Amikacin reached (16.6%).12 - It has measured MICs test for five antibiotics that used in in the study these are : Amikacin & Clavulanic acid/ Cefotaxime, Amoxicillin, Gentamycin & Ciprofloxacin. on the bacteria most sensitive or most resistant and all isolates that tested showed low MICs ratio to antibiotic Amikacin where ranged between (1 - 8) microgram/milliliter where the isolates were sensitive to mentioned antibiotic geatly.13 - The isolates showed MICs values increased to antibiotic Cefotaxime where the values ranged between (2 - 128)microgram/milliliter to S. aureus while the values ranged between (8 - 512) microgram/milliliter to the remain negative Staphylococcus bacteria of Coagulase test, as for isolates of Klebsiella spp. & Acinetobacter spp. The values of their MICs for the mentioned antibiotic ranged between (2 - 512) microgram/milliliter. While the bacteria isolates Pseudomonas spp. MICs values were low for the same antibiotic where values ranged between (0.25 - 2.0)microgram/milliliter.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لاوراق نباتي العفص Thuja orientalis L. واذان الصخلة Plantago lanceolata L. على بعض البكتيريا المسببة لالتهابات جروح الجلد == Effect of alcoholic extracts for leaves of Thuja orientalis L. and Plantago lanceolata L. on bacteria causes wounds skin infection

Author name: زيد رعد عباس
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة تاثير المستخلصات النباتية لاذان الصخلة Plantago lanceolata L. والعفص . Thuja orientalis Lعلى العزلات البكتيرية المتضمنة S. aureus وPse. aeruginosa وcoli, K. spp. E. . شخصت العزلات مظهريا وزرعيا وحسب الاختبارات الكيموحيوية . ابدت معظم العزلات تحسسا لمضادات Imipenean ,Aztreonam , Gentamycin وبنسبة 100% ومقاومة لمضادي Cephalothin , Carbencillin بنسبة 100% . اظهرت الدراسة ان للمستخلص المائي البارد لنبات اذان الصخلة تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم / مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli وباقطار تثبيط 9.0 ,9.66 , 6.0 ملم وعلى التوالي , فيما ازداد تاثير المستخلص بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك بينت النتائج فروقا معنوية لتاثير المستخلص الكحولي وعند التراكيز120 , 480 ملغم/ مل ضد جميع العزلات البكتيرية . اظهرت النتائج ان للمستخلص المائي البارد لنبات العفص تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم/مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli, فيما ازداد تاثير المستخلص معنويا بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك وضحت النتائج فروقا معنوية مشابهة لتاثير المستخلص الكحولي على البكتيريا المعزولة وعند التراكيز 120 , 480 ملغم/ مل . يمكن ان يعود تاثير المستخلصات النباتية على البكتيريا المعزولة الى احتواء المستخلصات المدروسة على معظم المركبات الفعالة التي تم الكشف عنها . | The study included the effect of plant extract for Plantago lanceolata L. and Thuja orientalis L. on bacterial isolates which included : S.aureus , Ps. aeruginosa , K. spp. and E.coli. The isolated bacteria were identified a ccording to cultural , morphological and biochemical testes . The majority of isolates were sensitive to Aztreonam , Gentamycin and Imipenean 100% , but they were resistant to Cephalothin and Carbencillin 100% . The study revealed asignificant effect of Plantago lanceolata L. cold water extract at the concentration 120 mg/ ml against each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli with inhibition zone 9.0 , 9.99 , 6.0 mm respectively , whil the effect increased when the concentration increased to 480 mg / ml . Also the results showed a significant effect of alcoholic extract at the concentration 120 and 480 mg /ml aganist isolated bacteria . The result revealed a significant effect of Thuja orientalis L. cold water extract at the concentration 120 mg /ml aganist each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli , while the effect were increased significantly when the concentration increased to 480 mg /ml .Also the result showed a significant effect for alcoholic extract on the isolated bacteria at the concentration 120 , 480 mg /ml . The action of plant extract on bacterial isolates may be due to the presence of active compounds in the studies extract whic were explored .

تاثير السستانون وزيت السمسم على بعض الجوانب الفسلجية والنسجية المرضية في ذكور الجرذان == Effect of the sustanon and sesame oil on some physiological and histopathological aspects in male rats

Author name: رشا عبد الامير عبد اللطيف
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تقوم الدراسة الحالية الى معرفة تاثير حقن السستانون وهو من المركبات الستيرويدية البنائية وكذلك زيت السمسم على بعض الوظائف الفسيولوجية في كبد ، كلية ، خصى الجرذان والتي شملت قياس مستويات انزيمات الكبد ( SGOT , SGPT , ALP ) ، الكرياتنين , يوريا الدم والتستوستيرون والتغيرات النسجية الامراضية التي يحدثها السستانون وزيت السمسم في كل من الكبد ، الكلية ، الخصى وجلد الجرذان . تضمنت حيوانات التجربة 50 جرذا ذكرا من نوع Rattus norvegicus قسمت الى مجموعتين بالتساوي وتم تقسيم حيوانات كل مجموعة الى خمسة مجاميع فرعية ( Subgroups ) . ضمت مجاميع التجربة الاولى مجموعة السيطرة السالبة ( علفا وماء ) ، المجموعة الثانية سيطرة موجبة ( 1 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الثالثة سيطرة موجبة ( 2 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الرابعة سستانون ( 10 ملغم /كغم من وزن الجسم) ، المجموعة الخامسة سستانون ( 20 ملغم / كغم من وزن الجسم) .حقنت مجاميع حيوانات التجربة الاولى لمدة 6 اسابيع مرة واحدة اسبوعيا بالسستانون وزيت السمسم وتم سحب الدم منها ثم قتلت في نهاية الاسبوع السادس ، اما مجموعة حيوانات التجربة الثانية فقد عوملت لمدة 6 اسابيع ثم قتلت بعد اسبوعين من نهاية المعاملة بالسستانون وزيت السمسم اي في نهاية الاسبوع الثامن من التجربة . اظهرت نتائج حيوانات التجربة الاولى ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستويات انزيمات الكبد (SGOT , SGPT,ALP) في المجاميع المحقونة بالسستانون ( 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) .بينما اظهرت مجموعتي السيطرة الموجبة الثانية والثالثة ( زيت السمسم ) انخفاضا غير معنوي في مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT ) وانخفاضا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم ALP . ارتفعت مستويات الكرياتنين ويوريا الدم بصورة معنوية ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة بالسيطرة السالبة ، بينما انخفضت قيم هذه المعايير بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة (زيت السمسم ) .ارتفعت مستويات هرمون التستوستيرون معنويا ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة مقارنة مع السيطرة السالبة ومجموعتي السيطرة الموجبة بينما ارتفع مستوى التستوستيرون في مجموعتي السيطرة الموجبة بصورة غير معنوية. بينت نتائج حيوانات التجربة الثانية والمقتولة بعد اسبوعين من نهاية المعاملة ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم الكبد ( SGOT) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون ) مقارنة بالمجموعتين الثانية والثالثة . كذلك ارتفع مستوى انزيم ALP وSGPT معنويا ( P<0.05 ) في المجموعة الخامسة ( 20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة مع بقية المجاميع .انخفضت مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT,ALP) بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة والمحقونة بزيت السمسم .بينما لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الكرياتنين في كافة مجاميع حيوانات التجربة الثانية ، ازداد مستوى يوريا الدم معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 48.2±3.16 ملغم/ 100مل من الدم ) مقارنة بالمجموعة الثانية ( 42.4±0.93 ملغم/ 100مل من الدم) الا انه لم تلاحظ فروقات معنوية في بقية المجاميع . ارتفع مستوى التستوستيرون ( 5.14±0.35 نانوغرام / مل ) في المجموعة الرابعة (سستانون ) معنويا ( P<0.05) مقارنة ببقية المجاميع . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في مستوى الهرمون في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة بالمجموعة الثالثة (زيت السمسم) ( 1.65±0.48 نانوغرام / مل) .لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الهرمون في المجموعتين الثانية والثالثة مقارنة بالسيطرة السالبة . لوحظ استمرار ارتفاع مستويات انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT) معنويا ( P<0.05) في حيوانات التجربة الثانية المقتولة في نهاية الاسبوع الثامن مقارنة بتلك المقتولة بنهاية الاسبوع السادس في المجموعة المعاملة بهرمون السستانون . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في انزيم ALP في حيوانات التجربة الثانية مقارنة بحيوانات التجربة الاولى ، اظهرت المجموعة الثانية (زيت السمسم) ارتفاعا غير معنوي في مستوى الكرياتنين ، الا انه ارتفع معنويا ( P<0.05) في المجموعة الثالثة ( زيت السمسم) وانخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة وغير معنوي في المجموعة الرابعة وكذلك لم تظهر يوريا الدم فروقات معنوية بين المجموعتين . انخفض مستوى هرمون التستوستيرون بصورة غير معنوية في مجاميع السيطرة الموجبة ( الثانية والثالثة سمسم ) وارتفع بصورة غير معنوية في المجموعة الرابعة ، الا انه انخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة ببقية المجاميع. تميزت التغيرات النسجية المرضية في كلى ، اكباد ، خصى وجلود جرذان التجربة الاولى والثانية بما يلي : اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كلى الجرذان المعاملة بـ 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم سستانون والمقتولة في نهاية الاسبوع السادس ( تجربة اولى ) والمقتولة في نهاية الاسبوع الثامن ( تجربة ثانية ) . احتقان دموي في الكبيبات وبين النبيبات مع تنكس وتنخر الخلايا المبطنة الكلوية . اظهرت تلك المعاملة بزيت السمسم في حيوانات التجربتين الاولى والثانية الشكل الطبيعي والمتكون من الكبيبات والنبيبات الدانية والقاصية . بينت المقاطع النسجية في كبد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بالجرعتين 10 و20 ملغم / كغم سستانون تنخر وتنكس مع تلف الخلايا الكبدية ، احتقان دموي مع ارتشاح الخلايا الالتهاية قرب المنطقة البوابية . اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كبد الجرذان ( التجربة الاولى والثانية ) والمعاملة بالسمسم (1مل/كغم من وزن الجسم) شكل الكبد القريب الى الطبيعي المتكون من اشرطة الخلايا الكبدية والوريد الوسطي بينما بينت بعض الخلايا الكبدية في جرذان التجربة الاولى والمعاملة بالسمسم الانقسام الخيطي ( Mitosis) مما يشير الى وجود تحفيز للخلايا الكبدية على الانقسام بوساطة زيت السمسم . اظهرت خصى الجرذان المعاملة بـ10 ملغم/كغم سستانون ( التجربة الاولى ) وجود تنخر داخل النبيبات المنوية مع وجود اعداد قليلة من الحيامن وعدم وجودها في بعض تجاويف النبيبات مقارنة بالسيطرة السالبة مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن ( Spermatogonia) اظهرت جرعة 20 ملغم/كغم سستانون ( تجربة ثانية ) تثخن جدران النبيبات الخصوية مع استمرار التنكس فيها ( تنكس زجاجي ) مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن . تميزت المقاطع النسجية والمعاملة بزيت السمسم في مجموعتي جرذان التجربة الاولى والثانية بالشكل الطبيعي لنسيج الخصى وباحتواء اكثر تجاويف النبيبات المنوية على اعداد كثيرة من الحيامن . بينت المقاطع النسجية المرضية في جلد جرذان التجربة الاولى ( 10 و20 ملغم /كغم سستانون ) زيادة في الغدد الدهنية في الادمة مع عدم وجود بصيلات الشعر ممايدل على تساقط الشعر مع زيادة في الغدد الدهنية تحت الادمة ووجود بصيلات فارغة وتساقط الشعر في جرذان التجربة الثانية ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون مقارنة بالجلد الطبيعي ( السيطرة السالبة ) الذي تميز بوجود بصيلات الشعر والنسيج الضام . اظهرت المقاطع النسجية في جلد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (1مل/كغم من وزن الجسم ) بالشكل القريب الى الطبيعي مع احتوائه على بصيلات الشعر في منطقة الادمة باعداد لا باس بها . مع وجود اعداد كثيرة من بصيلات الشعر في منطقة الادمة في جرذان التجربة الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (2مل/كغم من وزن الجسم) .نستنتج من هذه الدراسة الى ان حقن السستانون بجرعتي (10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) في حيوانات التجربة الاولى قد ادى الى ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT ALP) في حين لوحظ في حيوانات التجربة الثانية ارتفاع انزيمي الـSGOT وSGPT وانخفاض في انزيمALP نتيجة جرح الكبد مع جرح الكلية والذي تميز بارتفاع الكرياتنين ويوريا مصل الدم .ارتفاع هرمون التستوستيرون بالجرعتين اعلاه في حيوانات التجربة الاولى في حين انخفض في حيوانات التجربة الثانية بجرعة 20 ملغم /كغم من وزن الجسم . تميزت الحيوانات المحقونة بزيت السمسم انخفاضا في مستوى هذه الانزيمات مع ارتفاع في مستوى التستوستيرون في كلا حيوانات التجربة . الامر الذي انعكس على انسجة الكبد والكلية والخصية والجلد الذي تميز بغياب بصيلات الشعر في الحيوانات المعاملة بالسستانون . | The present study was aimed to investigate the effect of sustanon (Anabolic Androgenic steroids )and sesame oil on some physiological functions of Liver , Kidney , Testes of rats , that included estimation of Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP (, creatinine , blood urea and testosterone levels.The histopathological study included changes caused by sustanon and sesame oil on Liver , Kidney ,testes and skin . The experimental animals included 50 males Rattus norvegicus rats divided equally into2 groups , 1st and 2nd experimental animal groups , that divided also into 5 subgroups (negative control )( ration and water ) , second group (positive control 1 ml/kg B.W Sesame oil) ; third group ( positive control 2 ml/kg B.W Sesame oil) . Fourth group ( 10 mg/kg B.W sustanon), Fifth group ( 20 mg/kg B.W sustanon) The 1stexp.groups were injected with sustanon , sesame oil weekly for six weeks and were Killed at the end of sixth week . The animals of 2ndexp.were injected the same as in first group but were Killed at eight week. Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP) in the 1stexp increased significantly (P<0.05) . The 2nd and third (sesame oil ) groups showed non significant decrease in SGOT and SGPT enzymes Levels but showed significant decrease (P<0.05) in ALP enzyme level . Creatinine and blood urea increased significantly ( P<0.05) in the 4th and 5th group in comparison with negative control group .The level of creatinine and Blood urea in second and third group decreased non significantly in comparison with negative control . Testosterone level increased significantly (p<0.05) in 4th and 5th group in comparison with negative control and two groups of positive control ,while increased non significantly in both two positive control groups ( sesame oil ). SGOT increased significantly (P<0.05) in the 4th and 5th groups of 2nd exp. animals in comparison two positive sesame control groups. The SGPT and ALP increased significantly (P<0.05) in the fifth group when compared with other groups. SGPT , SGOT and ALP decreased non significantly in the 2nd and 3rd sesame group . creatinine did not show any significant differences in all groups . at 2ndexp animals . Blood urea increased significantly (P<0.05) in 5th group ( 48.2±3.16 mg/100ml blood) in comparison with 2nd sesame group (42.4±0.93 mg/100ml blood) . The other groups showed no significancy.Testosterone level increased (5.14±0.35 ng/ml) significantly (P<0.05) in 4th group (sustanon ) in comparison with other groups . Fifth group showed significant (P<0.05) decrease in the level of Testosterone ( 0.51±0.09 ng/ml) in comparison with 3rd group ( 1.65±0.48 ng/ml) .The 2nd and 3rd groups ( sesame oil ) showed non significancy in testosterone in comparison with negative control . Rats of 2ndexp (The killed at the end of the eighth week) . showed an increase ( P<0.05) of SGOT and SGPT in comparison with Rats of 1st exp( The killed at the end of the sixth week) , while ALP showed significant decrease ( P>0.05). The 2nd group (sesame ) showed non significant increase in the level of creatinine but increased significantly (P<0.05) in the 3rd group (sesame oil ). creatinine decreased significantly (P<0.05) in the 5th group and non significantly in 4th group . Blood urea showed no significant differeneces between two exp.groups. Testosterone level decreased not significantly in 2nd and 3rd groups and increased not significantly in the 4th group.But it showed a significant decreased (P<0.05) in the 5th group (0.51±0.09 ng/ml) in comparison with other groups.Histopathological changes : The histopathological changes in the Kidneys , livers , testes and skins of Rats in experimental one and two were characterized by the following : - The renal sections in rats treated with (10 and 20 mg/kg B.W sustanon), 1st group which killed at the end of six week , and the 2nd group which killed at the end of eight week showed bloody congestion in the glomeruli and btween renal tubules ; with regenerative necrosis of endothelial cells. Sections in 2nd Exp. treated with sesame oil revealed the normal architecture of the kidney composed from glomeruli , proximal and distal tubules . Hepatic sections in two experiments ( 10 and 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed necrosis with regenerative changes and damaged of hepatocytes ; bloody congestion with inflammatory infiltration near the portal area. Liver sections in 1st and 2ndexp .treated with sesame oil (1ml/kg B.w) showed normal Liver shape composed of hepatocytes cords and central vein , the sections in sesame oil (2ml/kg B.W) showed hepatocytes mitosis that refered to the role of sesame oil in cellular (hepatocytes) division stimulation .Testes sections in rats treated with 10 and 20 mg/kg B.W sustanon (1stExp ) showed necrosis intra testicular tubules with presence of few number of sperms ; and absence of others in luminal seminiferous tubules in comparison with control ., with spermatogonial necrosis . The dose 10 mg/kg B.W sustanon (2ndexp , showed testicular tubular necrosis , and azosperma inside the lumen in comparison with control . The dose 20 mg /kg B.W sustanon revealed thickening of the testicular tubules with continuously hyaline degeneration with spermatogonial necrosis ; the testicular sections in 2ndexp , sesame oil showed normal testicular tissue and most testicular tubules contained sperms in high numbers.The skin sections in 1stexp ( 10 , 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed an increase in the sebaceous glands in dermis with abscent of hair follicles that refered to hair fallen with increasing sebaceous glands in hypodermis , presence of empty hair follicles and abscent of hair in 2ndexp . (10 and 20 mg/kg B.W sustanon) in comparison with normal control skin . In the 1st and 2ndexp . sesame oil (1ml/kg B.W) the skin sections revealed shape near normal and contained hair follicles in dermis that can't be neglected with high number of hair follicles in dermis of 1st and 2nd group treated with sesame oil (2ml/kg B.W) .We concluded from this study that the sustanon injection at two doses ( 10 and 20 mg/kg B.W) lead to an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT and ALP) in the 1st group and an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT ) and decrease in the ALP in the 2nd group due to liver injury with kidney injury that characterized by increase in the level of creatinine and serum blood urea . Testosterone was increase in the 1st group at two doses while decrease in the second group at dose 20 mg/kg B.W . The injected two groups with sesame oil showed decrease in the liver enzymes levels with testosterone increase in both experimental groups ,that reflected on the liver ; kidney; testes and skin that characterized by abscense of hair follicles in the animals treated with sustanon

دراسة بعض عوامل الضراوة للبكتيريا المعزولة من ردهات الاطفال الخدج ومقاومتها لمضادات الحياة والمطهرات == Study of Some Virulence Factors of Bacteria Isolated From Instrument Used in Neonatal Intensive Care Units and It is Resistance to Antibiotics and Disinfectants

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني | اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
Key words:
  • Staphylococcus aureus
  • Proteus mirabilis
  • Escherichia coli
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 800 مسحة مختلفة من بيئة ردهات الاطفال الخدج ومن مصادر مختلفة شملت اجهزة سحب السوائل (Suckers) وحاضنات الاطفال الخدج واجهزة انعاش الطفل والميزان وقناع الاوكسجين وادوات قص الحبل السري والارضية والجدران بالاضافة الى ايدي العاملين والكادر الطبي خلال الفترة بين ايلول 2004 الى مايس 2005 .• زرعت العينات (المسحات) مباشرة على وسطي الدم والمكونكي لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري . اخضعت العينات للاختبارات الكيموحيوية والفحص باستخدام انظمة api اذ تم استخدام api 20E للعصيات السالبة وapi staph للمكورات العنقودية وشخصت على هذا الاساس 88 عينة تعود للبكتيريا الموجبة لملون كرام شملت Staphylococcus aureus وبواقع 62 عزلة وStaphylococcus epidermidis وبواقع 26 عزلة وكذلك تم عزل 170 عزلة تعود للبكتيريا السالبة لملون كرام شملت 51 عزلة للنوع Escherichia coli و35 عزلة للنوع Proteus mirabilis و20 عزلة للنوع Pseudomonas aeruginosa و15 للنوع Klebsiella sPP. و8 عزلات للنوع Citrobacter sPP. و7 عزلات للنوع Serratia sPP. و10 عزلات للنوع Enterobacter sPP. و24 عزلة للنوع Acinetobacter sPP. .• اختبرت حساسية العزلات تجاه 15 نوعا من مضادات الحياة شائعة الاستعمال . وبينت النتائج ان معظم انواع البكتيريا المعزولة مقاومة للعديد من مضادات الحياة من مجموعة مضادات البيتالاكتام اذ كانت نسبة العزلات المقاومة للمضاد Augmentin 95.9% تلاه مضاد Carbencillin (93.4%) ثم Amoxicillin (78.2%) . فيما كان مضاد Amikacin وCefotaxime وNorfloxacin اكثر فعالية تجاه العزلات قيد الدراسة وبنسبة مقاومة 4% و15.9% و18.5% على التوالي .• حددت التراكيز المثبطة الدنيا لبعض المضادات المستخدمة في العلاج وشملت المضاد Gentamicin اذ تراوحت قيم MICs ما بين 8 - 1024 مايكروغرام/مل ، والمضاد Cefotaxime 8 - 1024 مايكروغرام/مل وCiprofloxacin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وChloramphenicol 16 - 1024 مايكروغرام/مل وCephazolin 8 - >1024 مايكروغرام/مل وAmikacin 8 - 128 مايكروغرام/مل وTrimethoprim 16 - 1024 مايكروغرام/مل وClavulanic acid+ Amoxicillin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وNorfloxacin 16 - 1024 مايكروغرام/مل وOfloxacin 4 - 512 مايكروغرام/مل وAmoxicillin 4 - >1024 مايكروغرام/مل .• درست بعض عوامل الضراوة للعزلات ومنها قابليتها على انتاج الانزيم الحال للبروتين Protenase اذ اظهرت 40 عزلة (40%) من مجموع عزلات الدراسة القدرة على انتاج هذا الانزيم تضمنت 16 عزلة تابعة لبكتيريا Staph.aureus و15 عزلة لبكتيريا E.coli و9 عزلات لبكتيريا P. mirabilis .• درست قابلية العزلات على انتاج انزيم الهيمولايسين فقد كانت منتجة وبنسبة 42% عند استخدام الدم البشري صنف A وبنسبة 37% عند استخدام الدم البشري صنف B وبنسبة 46% عند استخدام الدم البشري صنف AB وبنسبة 34% عند استخدام الدم البشري صنف O ، ومن هنا يظهر ان صنف الدم AB هو افضل الانواع لمعرفة نوع التحلل .• تم الكشف عن قابلية البكتيريا على انتاج انزيم اليوريز اذ كانت 64.2% من عزلات Staph.aureus منتجة لهذا الانزيم اما P.mirabilis فقد كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% .• اما بخصوص انتاج انزيم البيتالاكتاميز فقد اعطت كل من Staph.aureus وE.coli وP.mirabilis نسب انتاج 57.1% و52.6% 55% على التوالي .• تم تحديد التركيز المثبط الادنى لبعض المطهرات المستخدمة في المستشفيات وتبين ان المطهر Skinsept بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات اذ تراوحت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا مابين 4 - 128 مايكروغرام/مل ، بينما كان مطهر Minudus هو الاقل كفاءة اذ بلغت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا 512 - 4000 مايكروغرام/مل .• تم تحديد قيم التراكيز القاتلة للمطهرات المستخدمة في المستشفيات اذ تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Skinsept ما بين 2 - 256 مايكروغرام/مل وهو الافضل من باقي المطهرات . بينما تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Minudus مابين 1024 - 4500 مايكروغرام/مل .• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا . اذ كان زمن القتل لمطهر Skinsept 5 دقيقة ولمطهر Hibitane ما بين 5 - 10 دقيقة ومطهر Bleach ما بين5 - 20 دقيقة ولمطهر Sekeucid - N ما بين 25 - 30 دقيقة واخيرا مطهر Minudus ما بين 20 - 30 دقيقة . | • In this study , 800 different swabs were taken from neonatal intensive care unit and from many sources , including , suckers system , neonatal incubators , baby mobilization systems , balance , Oxygen mask , imbirical cutting tools , the floor and walls , in addition to the laborers hands and the medical staff , during the period of September 2004 to may 2005.• The swabs were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria. The colonies were tested biochemically by using API system , the API 20E was used for the Gram negative bacteria and API staph. used for staphylococci , though , 88 sample were identificated , these samples were belonged to the G + bacteria , including 62 isolates of Staphylococcus aureus and 26 isolates of Staphylococcus epidermidis were found. Also 170 isolates were belonged to Gram negative bacteria , including 51 isolates of Escherichia coli , 35 isolates of Proteus mirabilis , 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa , 15 isolates of Klebsiella spp. , 8 isolates of Cirtrobacter spp. , 7 isolates of Serratia spp. , 10 isolates of Enterobacter spp. and 24 isolates of Acinetobacter spp.• The susceptibility of the isolates toward 15 types of common antibiotics , was tested , the results showed that several types of isolated bacteria were resistant to many types of antibiotics that belonged to the Betalactam group . The percentage of resistance to Augmentin was 95.9% , Carbenicillin was 93% , then Amoxicillin was 78.2% while Amikacin, Cefotaxime and Norfloxacin were more active against the isolates , with percentage resistance 4% , 15.9% and 18.5% respectively .• The minimal inhibitory - concentrations of some antibiotics were determined. For Gentamicin , the MICs values ranged between 8 - 1024 mg/ml , Cefotaxime , 8 - 1024mg/ml , Ciprofloxacin 4 - 1024 mg/ml, Chloramphenicol 16 - 1024 mg/ml , Cephazolin 8 - 1024 mg/ml, Amikacin 8 - 128 mg/ml, Trimethoprim 16 - 1024 mg/ml, Amoxicillin + Clavulanic acid 4 - 1024 mg/ml , Norfloxacin 16 - 1024 mg/ml , Ofloxacin 4 - 512 mg/ml and Amoxicillin 4 - 1024 mg/ml .• Some of the virulence factors of the isolates were studied , such as the ability of protease production , 40 isolates (40%) were able to produce this enzyme, including 16 isolates of Staphylococcus aureus , 15 isolates of E.coli and 9 isolates of P.mirabilis .• The ability of the isolates for production of Haemolysin enzyme was studied too . 42% of isolates were producing Haemolysin by using Human blood group A, 37% with group B , 46% with group AB and 34% with group O , it appears that AB blood group is the best type to detect hamolysin activities . • The ability of bacteria to produce urease enzyme was detected, 64.2% of S.aureus isolates were producing this enzyme, while P.mirabilis isolates, were 100% producers.• The production of  - lactamase from each of S.aureus , E.coli and P.mirabilis was 57.1% , 52.6% and 55% respectively . • The minimum inhibiting - concentration of some antiseptics used in hospitals were determine. The results showed that the antiseptic Skinsept with its low concentrations was the most active comparing with the other antiseptics , though , the MICS values ranged between 4 - 128 mg/ml while the Minudus was the less active and its MICS values ranged between 512 - 4000 mg/ml .• The values of bactericidal concentration of antiseptics were also determined , the minimal bactericidal concentrations of Skinsept ranged between 2 - 256 mg/ml and it was the best one , while the minimal bactericidal concentrations of Minudus ranged between 1024 - 4000 mg/ml .• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal concentrations of antiseptic was determined , it was 5 minutes for Skinsept , 5 - 10 minutes for Hibitane , 5 - 20 minutes for Bleach , 25 - 30 minutes for Sekeucid - N and finally , 20 - 30 minutes for Minudus .

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

Author name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.

انتاج وتنقية اللكتين من بكتريا Acinetobacter baumannii المعزولة من القشع وتاثيره في بعض الاحياء المجهرية خارج الجسم الحي

Author name: رونق مهدي هاشم
Supervisor name: ساهرة نصيف مسلم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to isolate Acinetobacter baumannii , 104 samples of sputum were collected from patients infected with respiratory tract infections, from Teaching Baghdad Hospital / Medical City, General Teaching Al - Kindi hospital and Al - Imam Ali Hospital . Depending on microscopic , cultural and biochemical tests ,23 isolates belonge to it were obtained.The ability of A.baumannii isolates to produce lectin was detected by using glass slide and microtiteration plates methods and the results showed that all the isolates were able to produce lectin , A.baumannii S12 was the best isolate for produce it and the blood group O was the best for detection the titration of agglutination activity.The optimum conditions for lectin production were determined and the results showed that the cultivation of A.baumannii S12 in Colonization Factor Antigen medium with pH value of 7.2 at 37 ºC for 24 hours in shaker incubator at 100 rpm / min. were the best to produce it. The lectin was extracted from cilia of A.baumannii S12 isolate by using six different breaking methods at different times , the glass beads method for 50 minutes was the best to extract it, the agglutination activity reached to 512 AU / ml with specific activity 174.14 AU / mg protein in comparison with other breaking methods. Lectin was purified by three steps, included ; precipitation by 35% saturation ammonium sulfate , ion exchange chromatography by DEAE - cellulose, then gel filtration chromatography by Sephadex G - 150. The final lectin recovery was 36.92% with 20.63 folds of purification and 3592 U / mg protein of specific activity .The purified lectin was also partially characterized and the results showed that the optimal activity of the lectin was at 30 ºC and its thermostability was between (10 and 30) ºC ,the optimum pH for lectin activity was 7.2 while the pH value for its stability was between 7 and 7.2 . Lectin retained whole activity when treated with sucrose, raffinose, maltose, mannitol, fructose, lactose, arabinose, ribose and rhamminose, while it lost whole activity when treated with glucose , mannose and galactose. Also, lectin retained whole activity when treated with EDTA - NaN3 and trypsin , whereas its agglutination activity was reduced to the half when treated with pepsin , and to 12.5% and 0.39% when treated with 2 - mercaptoethanol and formalin, respectively. In addition, the effect of some substances on lectin stability was studied and the results showed that the mixture of 2% glycerol and physiological normal saline followed by 20% ammonium sulfate were the best for its stability for 20 and 10 days, respectively. while the solutions of the rest materials(Tween - 80, mannitol, sucrose, lactose and SDS) showed inhibitory effect on lectin activity.Also, the antimicrobial activity of purified lectin against 12 bacterial and fungal isolates was studied and the results showed that the lectin had antibacterial activity against Klebsiella pneumonia , Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis with (50 , 38.88 and 36.84 )% of inhibition, respectively, and antifungal activity against Penicillium spp. , Cladosporium spp. and Fusarium spp. with (33 , 18.75 and 17.39 )% of inhibition, respectively. whereas ,it had no antimicrobial activity against the bacteria; Escherichia coli , Enterobacter cloacae ,and Staphylococcus aureus ,and the fungi ; Aspergilus niger, Aspergilus terius , and Candida albicans.

تاثير عديد سكرايد بعض الضروب المصلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa على خلايا السائل البريتوني للفار الابيض == Effect of polysaccharide of some serotypes of Pseudomonas aeruginosa on peritoneal exudates cells of white mouse

Author name: رواء عبد الامير عبد الجبار
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اظهرت تاثيرات عديد سكرايد الزائفة الزنجارية Pseudomonas aeruginosa تاثيرا متباينا على الخلايا المناعية لجوف الفار السويسري. استخلص عديد السكرايد من ضروب مصلية مختلفة للزائفة الزنجارية وتم حقنه داخل الجوف البطني للفئران بجرع مختلفة وبفترات مختلفة. فقد كان تاثير الضرب المصلي O3 واضحا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة Large Lymphocytes اعتمادا على الجرعة والوقت ، وكان هذا الضرب متميزا في تحفيزه للخلايا الرغوية Foam cell ايضا ابتداءا من اليوم الثاني للتحفيز .كان الضرب O6 غير قادرا على تحفيز الخلايا الرغوية Foam cells ، الا انه تميز في حثه للخلايا البدينة Mast cells . اما الضرب O9 فقد كان محفزا جيدا للخلايا اللمفاوية الكبيرة ومتماثلا مع الضرب O6 في عدم تحفيزه للخلايا الرغوية ، في حين كان الضرب O11 قويا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة والخلايا الرغوية ومعتمدا على الجرعة والوقت ، اذ بلغ معدل اعداد اللمفاويات الكبيرة بجرعة 50 مايكروغرام/ مل ( 41.867 ±4.277) مقارنة بالسيطرة (11.867±0.611).تميز الضرب O16 في تحفيزه الكبير للخلايا البدينة فقد كانت اعدادها النسبية في اليوم الاول وبجرعة 20مايكروغرام/ مل وبجرعة 50 مايكروغرام /مل فقد بلغت (20.067±051.4) ، (320.53±70.75) على التوالي مقارنة بالسيطرة (001.4±60.34) ، وفي اليوم الثالث بلغت الاعداد نسبة عالية اذ بلغ تحفيز الجرعة 50 مايكروغرام/ مل من عديد سكرايد هذا الضرب (23.267±1.102) مقارنة بالسيطرة (71.66±0.643). استطاعت البكتريا المقتولة من تحفيز خلايا الجوف المناعية التي تباينت ضروبها المصلية في ذلك. نوقشت النتائج في ضوء المعلومات المتوفرة التي تتعلق بتاثير عديد سكرايد هذه البكتريا على الخلايا المناعية البطنية لجوف الفار واهمية عديد السكرايد هذا كمحددة بكتيرية مهمة في الاستجابة المناعية وامراضية هذه البكتريا.

تحضير وتوصيف الجسيمات الدهنية النانوية وربطها مع مستضد طفيلي Leishmania donovani == Preparation and characterization of nanoliposome and entrapment of Leishmania donovani antigens

Author name: روعة نجم عبد الله الخميسي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي عبد الرحمن الشيخلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعتبر استخدام الجزيئات النانوية التي تحمل المستضد صناعيا والقابلة للتحلل الحيوي كجزيئة مساعدة من المواضيع المهمة في تحضير اللقاح ومن الخطوات المهمة في السيطرة على تحرر المستضد لتحسين الاستجابة المناعية . تتكون الجسيمات الدهنية النانوية من مركبات طبيعية والتي تشجع بدورها الباحثين على استخدامها كمساعدات نانوية طبيعية . في هذه الدراسة , استخدمت الجسيمات الدهنية النانوية كمساعدات لقنص المستضدات الذائبة المستخلصة من طفيلي اللشمانيا الاحشائية كخطوة اولى باتجاه تحضير لقاح ضد اللشمانيا . تم تنشيط الطفيلي من خلال تنميت طور الطفيلي ) 104 promastigote / ml ) في الوسط الزرعي ( RPMI ) في درجة تحضين 23 م0 ولمدة اربعة ايام . اعتمدت اللقيحة بعمر 4 ايام وبنسبة 104 خلية في المليلترالواحد في تلقيح وسط (SNB9 ) لانتاج الكتلة الحيوية والتي تستخدم لاستخلاص المستضد . تم استخلاص المستضدات الذائبة من خلايا الطفيلي بعد اربعة تمريرات في نفس الوسط الزرعي ليتم بعدها قنصها في الجسيمات الدهنية النانوية والمحضرة انيا . حضرت الجسيمات الدهنية النانوية من ( mM Phosphatidylcholine 4 ) ) 2.2 mM Cholesterol ) و(mM Phosphatidylethanolamine 0.55) وبنسبة 1 : 2 : 7 ضمن جميع طرق التحضير المختلفة وتم دراسة توصيفها الفيزياوي والكيمياوي باستخدام (SEM ) و(AFM ) و( FTIR) و(Zeta Potential ) لتقدير حجم وشكل وشحنة الجسيمات وتحديد المجاميع الكيمياوية المتكونة .من النتائج لوحظ ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تحمل شحنة سالبة ولاتظهر تكتل بعد عملية التحضير ولا تزيد اقطار الجسيمات الناتجة عن 75 نانوميتر وتحمل مجاميع كيمياوية (PO2 ) و(CH2) و(CH3 ) . تم احتساب كفاءة قنص (EE) الجسيمات الدهنية النانوية للمستضدات الذائبة وكانت النسبة المئوية لكفاءة القنص هي 62% و50% و27.5 % للجسيمات المحضرة بطريقة الكلوروفورم والسيفادكس G25و السيفادكس G75 على التوالي . من جانب اخر , تم دراسة الثباتية للجسيمات الدهنية النانوية القانصة للمستضدات بدرجتي حرارة تخزين 4 و37 م0 واظهرت النتائج ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تمتلك درجة ثباتية كان مقدارها 32% في درجة حرارة 4 م0 و16% في درجة حرارة 37 م0 خلال فترة تخزين 12 يوم | The use of biodegradable nanoparticles as vaccine adjuvant with entrapped antigens represents an exciting approach for controlling the release of vaccine antigens and optimizing the desired immune response . Because of the natural components of nanoliposomes , we investigated the ability of prepared nanoliposomes , as a nanoadjuvant , to entrap soluble Leismania donovani antigens (SLAs) . The study was include preparation of SLA by parasite reactivation was carried out when inoculated into Rosewell park memorial institute media (RPMI) and incubated at 23 ̊ C for 4 days . Inoculum (104 promastigote / ml) of 4 days was used to inoculate modified medium of Saline - Neopeptone and Blood agar ( SNB) to produce promastigote mass . SLAs were extracted from the promastigotes ghost membrane after fourth passages of subculturing in SNB9 .The extracted SLAs then entrapped in nanoliposomes prepared freshly .Lipids mixture of 4mMPhosphatidylcholine, 2.2mM Cholesterol and 0.55mM Phosphatidylethanolamine in a ratio of 7 : 2 : 1 was depended in two nanoliposome preparation methods ; Chloroform injection and size exclusion chromatography . Physio - chemical characterizations of prepared nanoliposomes was performed by using Scanning Electron Microscope (SEM) , Atomic Force Microscope (AFM) ,Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Zeta Potential assays to determine the size , morphology , chemical active group and charge . Nanoliposomes prepared by chloroform injection method revealed non aggregate of negative nano vesicles with diameter of less than 75nm and PO2, CH2 and CH3 groups. The nanoliposomes entrapment efficiency (EE) to entrap SLAs was determined. The percentage of EE was 62, 50 and 27.5of SLAs entrapped nanoliposomes prepared by chloroform injection, Sephadex G25 and SephadexG75 , respectively .Moreover, stability of SLAs entrapped nanoliposomes was examined at 4 and 37 ̊ C storage temperature. SLAs entrapped nanoliposomes , prepared by chloroform injection method ,shown higher value of EE( 32 % ) at 4 ̊ C and(16%) at 37 ̊ C after 12 days of storage .

دراسة تاثير هرمون النمو على بعض المظاهر الفسيولوجية لقصار القامة في العراق

Author name: راوية محمود يوسف السلامي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء علي عبد الجبار
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يمثل نقص الافراز الداخلي لهرمون النمو السبب الاكثر شيوعا في احداث قصر القامة في الاطفال ومرتبطا" بالعديد من التبعات المرضية الفسلجية. ان المفاهيم الاساسية لاثر النقص الهرموني تتاتى من الدراسات السريرية, المناعية البايوكيمياوية, والوراثية والتي تشير الى اهمية دراسة العوامل المناعية والبايوكمياوية في تفسير هذا الاثر ,اضافة الى ان نقص هرمون النمو لا يرتبط بتبعات طبية جدية فحسب وانما يؤثر نفسيا واجتماعيا في مثل هؤلاء الاطفال وعوائلهم, مما يتطلب ايضا ايضاح الدور العلاجي في الحد من الاستجابات الفسلجية المفرطة التي تلعب دورا محوريا في تراجع نمو هؤلاء الاطفال. ولندرة الدراسات العراقية في هذا المجال وبهدف تطوير استراتجيات الادارة العلاجية الناجحة والذي يسهل من خلال فهم الجوانب المناعية والايضية لنقص هذا الهرمون.لقد كانت الواسمات الورمية (مستضد المسرطن الجنيني CEA, البروتين الحميلي نوع الفا AFP, مستضد الكاربوهيدرات CA - 125), هرمون الانسولين, فايبرنوجين البلازما, اضافة" الى نسبة الدهون والكالسيوم في المصل, الطول,الوزن المرشحة لمثل هذه الدراسة علاوة على ذالك اهتمت الدراسة ايضا" بتقييم الاستجابة التحفيزية لهرمون النمو بواسطة الكلوندين. اجريت هذه الدراسة المستقبلية في المستشفيات التعليمية/ حماية الاطفال - بغداد على 49 مريضا" عراقيا" مصابا" بقصر القامة (37 ذكر, 12 انثى), قورنوا مع 20فردا"من الاطفال الاصحاء كمجموعة ضابطة, للفترة من تشرين الاول 2007 ولغاية اب 2008. اجري فحص مقايسة الماز المناعي للانزيم المرتبط ELISA لتقييم الجوانب المناعية الفسلجية(هرمون النمو, الواسمات الورمية,هرمون الانسولين, الفحص الالي اليدوي للفايبرنوجين , الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير مستويات الدهون{الكوليسترول T - C ,ال_xFFFF_لسريد الثلاثي TG ,البروتينات الشحمية (عالية الكثافة (HDL , (واطئة الكثافة (LDL, (واطئة الكثافة جدا (VLDL (اضافة لنسبة HDL T - C/} والكلسيوم في المصل) وحساب الطول نسبة" للعمر معبرا عنه بالوحدة ,Z كذالك الوزن عبر عنه بحساب معدل كتلة وزن الجسم BMIZ لجميع افراد مجموعتي الدراسة.اظهر الروز الكمي لوسيط تركيز هرمون النمو(GH) مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل ان مستوى هذا الهرمون في الاطفال قصار القامة (1.4) في السيطرة (3.7), اما بعد التحفيز فقد كان في المرضى (5.1)و في السيطرة (10.9). وكانت هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين كل من مجموعتي المرضى ومجموعة الاصحاء سواء" قبل او بعد التحفيز. اظهر الكلوندين فعالية ممتازة في التفريق بين المرضى والاصحاء من جهة وفي التقييم الاولي لنقص هرمون النمو في الاطفال قصار القامة من جهة اخرى.ظهر الوسيط الحسابي لتركيز CEA مقدر" بال مايكرو غرام لكل مل من المصل ان مستواه لدى المرضى (1.4) اعلى مما عليه في الاصحاء (0.9) هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين ومن الممكن ان تعد مؤشرا مناعيا التهابيا متعلقا بجوانب مرضية لنقص الدور الايضي للهرمون . بعد فترة 9 اشهر من العلاج بدا هذا المستوى المرتفع يميل بعض الشيء نحو الانخفاض (1.38) وان كان على نحو ضئيل لكنه معنوي مقارنة بالمرضى انفسهم قبل العلاج, على الرغم من ذالك بقت الفر وقات معنويا عالية بين المجموعتين. فيما يخص المتوسط الحسابي لتركيز CA - 125 (مقدر" وحدة لكل لتر) اعلى قليلا" لدى المرضى (10.8) من السيطرة (9.2), وبدا هذا الارتفاع البسيط يميل للانخفاض بعد العلاج (9.7), بالرغم من ذالك الاختلافات لم تكن ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين. اما المتوسط الحسابي لتركيز AFP مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل لم يؤشر اي فرق معنوي بين المرضى سواء قبل العلاج (1.4) او بعد العلاج (1.3) بالمقارنة بافراد المجموعة الضابطة (1.3) .التاثير المعاكس للانسولين تحقق من خلال التقدير الكمي لتركيز الانسولين (مايكرو وحدة دولية لكل لتر) عند الصيام حيث اظهر المتوسط الحسابي للبيانات قبل العلاج عدم وجود فرو قات معنوية بين المرضى(8.1) والمجموعة الضابطة (8.3), اثناء المتابعة لفترة العلاج ارتفع مستوى تركيز الانسولين معنويا (17.4) مقارنة بافراد المجموعة الضابطة من جهة وبين الحالة قبل العلاج من جهة اخرى.اوضحت النتائج الاحصائية لوسط تركيز الفايبرنوجين مقدرا" بوحدة الملغرام لكل لتر من البلازما بواسطة الطريقة الالية اليدوية ارتفاعا" معنويا" لدى المرضى قبل العلاج (282.9) مقارنة" بالسيطرة (265.4), ظهر ان تركيزه ازداد اكثر بعد العلاج (361.1) وبدت الفر وقات معنوية" اكثر مما كانت عليه مقارنة بالسيطرة من ناحية وبالمرضى انفسهم قبل العلاج من ناحية" اخرى.جانب اخر مهم يوضح الدور الفسلجى الايضي لهرمون النمو باستخدام الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير تركيز مستوى الدهون والكالسيوم (بوحدة الملي مول لكل لتر من المصل) وكانت البيانات موضحة لاثر النقص الهرموني لدى هؤلاء المرضى. حيث ان الفرو قات كانت معنويا" عالية بين المجموعتين في مستوى دهون المصل كما اظهر المتوسط الحسابي لعينة المرضى {T - C=4.1 , TG=1.5 ,LDL=2.5 , VLDL=0.7 , الوسيط الحسابي TC/HDL=4.22 اما HDL فقد كان معنويا منخفض = 1 { مقارنة بالسيطرة {T - C=9.3 , TG=1 ,LDL=1.8 , VLDL=0.5 , اما HDL فقد كان = 1.6, المتوسط الحسابي TC/HDL=2.35 { طرا بعد العلاج الهرموني تحسنا" معنويا" عاليا" مقارنة بما كانت عليه الحالة قبل العلاج كالاتي {T - C=3.6, TG=1.2, LDL=1.6, VLDL=0.5, اما 1.5=HDL, والمتوسط الحسابي TC/HDL=2.31}.اظهر التحليل الاحصائي ان البيانات الاولية لوسيط مستوى كالسيوم المصل تشير لانخفاض طفيف لدى المرضى(2.2) قبل العلاج, مقارنة" مع السيطرة (2.3). في حين ظهرت الفرو قات ذات اهمية معنوية اثر العلاج الهرموني حيث انخفض متوسط تركيزه الى (2). العلاج الهرموني ساهم معنويا (P<0.001) في تحسين {HAZ= - 2.9 و{BMIZ=0.7 لدى قصار القامة, مقارنة بما كانوا عليه قبل العلاج {HAZ= - 3.7 و{BMIZ= - 1.1, لكن عموما لازالت الفرو قات ذات اهمية معنوية في تفريقهم عن مجموعة السيطرة {HAZ= 0.2 . {BMIZ=0.3 بينت تحليلات الحسابات الاحصائية ان قيم القطع المثلى من الممكن ان تكون ذات اهمية في تفريق المرضى قصار القامة بسبب نقص هرمون النمو عن الاصحاء, وفي ذات السياق من الممكن ايضا" ان تساعد في توقع النقص الهرموني لديهم, ان كانت قيم القطع المثلى للمتغيرات المختبرة كالاتي {تركيز GH بعد التحفيز بالكلوندين اقل من 10.6 , CEA اعلى او مساوي ل 0.95 , وان كان مستوى الدهون في المصل اعلى من 3.04 ل TC/HDL , 2.1 LDL , 1.2 TG , 0.4 VLDL واقل من 1.4 HDL , واقل من 0.72 BMIZ }.نستنتج من هذه الدراسة ان العديد من الاستجابات المرضية والاختلال الايضيي يبدو بوضوح متعلقا" بنقص هرمون النمو وان العلاج الهرموني يساهم في تحسين الوضع المناعي والفسلجي لهؤلاء الاطفال. بشكل عام استخدام هرمون النمو امن نسبيا", بالرغم من ذالك GH يمتلك اثار جانبية محتملة قوية , لذا مثل هؤلاء المرضى لابد ان يراقبوا عن كثب وبصورة" دورية اثناء العلاج.بعض المتغيرات المدروسة مثل CEA ومستوى الدهون والفايبرنوجين اضافة الى BMIZ يمكن ان تساهم في التقييم الاولي والى حد معين من الممكن ان تساهم في دعم تشخيص نقص هرمون النمو .علاوة" على ذالك من المهم الانتباه الى الناحية الغذائية ودعم نمو مثل هؤلاء الاطفال بالكالسيوم اثناء العلاج اضافة للعناصر المغذية الاخرى الضرورية لنموهم. | Growth hormone deficiency (GHD) is the commonest endocrine disorder presenting with short stature (SS) in children, it is associated with several pathophysiological consequences, which has not yet elucidated. The important clues have come from clinical, immunobiochemical and genetic studies of GHD which have suggested an importance for the immunobiochemical factors in the etiology of this pathological consequences, and showed that GH - replacement therapy (GHRT) is recommended for the determination of the exaggerated physiological responses that play a crucial role in children growth retardation, and because of GHD not only has very serious medical consequences but also has a major psychological and social impact on children and their families, in addition to that a little is known about GHD pathological features, therefore; the development of successful therapeutical management strategies to such children are facilitated by the understanding of the GHD pathological influences.Tumor markers antigens (Carcinoembryonic antigen CEA, Alpha fetoprotein AFP, Carbohydrate antigen 125 CA - 125), insulin hormone, plasma fibrinogen, are primary candidates for this study, in addition, lipid profile, serum calcium (Ca), height and weight expressed as Z score {height for age (HAZ), body mass index (BMIZ)}, the study was also concerned with the evaluation of GH stimulation by using clonidine. This prospective study was carried out in 49 Iraqi, children, SS patient groups (37 male, 12 female) they were regularly attending the Welfare Teaching Hospital / children protective/ Baghdad were studied. The diagnosis has been well - established, based on clinical, immune - biochemical, and genetic criteria. An ethnically matched, apparently healthy control group (n=20) aged 13.5±3.3 years (mean ±SD) was also involved through Oct. 2007 to Aug 2008. ELISA tests for GH, CEA, CA - 125, AFP, insulin, and manual automated test of plasma FI and enzymatic colorimetric assay for serum lipid profile and Ca were carried out on all studied groups.Concerning the GH quantitative assay for serum median concentration (ng/ml) of baseline and after clonidine stimuli test revealed significant (p<0.001) differences between the study groups, baseline value was significantly lowered(1.4) in SS GHD cases compared to controls (3.7), after stimulation GH value was also lowered among SS GHD cases (5.1), than in controls (10.9). Clonidine test showed an excellent discriminating ability, between the two groups, and in initial assessment of GHD in SS children.A serological tumor markers quantitative immune assays, for serum median CEA concentration (µg/L), revealed that; baseline value was significantly (p<0.006) higher among GHD cases (1.4) than in controls (0.9), this elevated value tends to slightly decreased after treatment, although, still significantly higher among GHD cases (1.38) compared to controls, this result may be indicatives of the inflammatorycondition associated with GHD. CA - 125 baseline mean value (U/L) was slightly higher among GHD patients (10.8) than controls (9.2), a slight insignificant reduction occurred after treatment (9.7) compared to baseline value.AFP serum mean value (ng/ml) revealed no significant differences at baseline among GHD cases (1.4) compared to controls (1.3), after GHRT there were also no significant differences in GHD cases (1.3) compared to controls and baseline values.The contra insulin effect of GH achieved by quantitative determination of fasting serum insulin, baseline data observed in mean concentration (µIU/L) showed no significant differences among GHD cases (8.1) in comparison with controls (8.3). After treatment duration(9months) fasting serum insulin was significantly(p<0.001) elevated among GHD cases (17.4) compared to controls and to its baseline values. Manual automated quantitative assay for plasma FI mean concentrations (mg/dl) revealed that; baseline FI was significantly (p<0.049) higher among GHD patients (282.9) than in controls (265.4), this elevated value was fatherly increased after treatment (361.1) (p<0.001) in GHD patients. Another important aspect of GHD pathophysiological consequences on metabolism observed by the enzyme colorimetric method, for serum lipid profile mean value (mmol/l) , the data shown to be relevant to GHD in SS children; baseline lipid profile was significantly (p<0.001) higher among GHD cases {(T - C=4.1), (TG=1.5), (LDL - C=2.5), (VLDL - C=0.7) and median value of (T - C/HDL - C=4.22), whereas mean value of serum (HDL - C was significantly lowered =1)} than in controls {(T - C=3.9), (TG=1), (LDL - C=1.8), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.35) and (HDL - C=1.6)}. A significant (p<0.001) improvement observed through out GHRT duration in GHD cases {(T - C=3.6), (TG=1.2), (LDL - C=1.6), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.31) and (HDL - C=1.5)} compared to baseline values.Ca is an essential mineral for bones building, and several other biological functions, baseline data concentration (mmol/l) expressed as median value reveled that; baseline serum Ca was a slightly lowered in GHD cases (2.2) than controls (2.3), this slightly lowered value was further and significantly (p<0.001) decreased among GHD cases (2) compared to controls and to its baseline values.GHRT significantly (p<0.001) improved HAZ and BMIZ in GHD cases respectively {( - 2.9), ( - 0.7)} than it was pretreatment {( - 3.7), ( - 1.1)}, which were significantly (p<0.001) lowered than normal controls values {(0.2), (0.3)}, although, this improvement GHD short stature cases are still significantly different than in controls. The ROC analysis was shown newly reported, interesting evaluating roles that may - be possibly have an important assistant as discriminating and predicting tool of GHD in SS children, for probably most study parameters considering GHD as an important etiology of SS at baseline, the typical cutoff values when used to classify subjects and separator SS cases with GHD the results of this study indicated that SS patients may possibly be predicted to have GHD if they have concentrations as followed, the typical cutoff values were(< 10.6 for GH after stimulation by clonidine), while were (≥ 0.95 for CEA), {(lipid profile optimal cut off value were (≥ 3.8 for T - C), (1.2 for TG), (2.1 for LDL - C), (0.4 for VLDL - C), (3.04 for T - C/HDL - C) and was for (HDL - C < 1.4)},and for BMIZ was< 0.72). In conclusion, several pathological responses and metabolic disorders seem to be associated with GHD, and GHRT aid in improving GHD children immuno physiological state, the evaluation of immune metabolic parameters proves to be a useful indicator of GHD in The use of GH generally safe, although GH has potential side effects, children receiving GH must be monitored closely during treatment. Importantly, CEA, serum Ca, and lipid profile prove to be useful tools for the evaluation of auxological parameters during GHRT, and to some extent may aid in prediction GHD in SS children and possibly support the diagnosis.Further attention should be paid to the nutritional status of such patients, and supporting their growth by calcium and other important minerals supplements.

تحديد قابلية بعض النباتات المحلية على مقاومة وازالة النفط الخام من التربة == Determination the Ability some of Local Plants on Resistance and Removal the Crude Oil from S

Author name: داوود سالم عيدان عبد النبي الطائي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: زرعت خمس بذور كلا من النباتات التالية : جت Medicago sativa، شعير Hordeum vulgatis، ذرة Zea mays، ماش Vigna radiata، خيار Cucumis sativa، برسيم Trifolium astivum ولوبيا Vigna sinensis وشوفان Avena sativa وريحان Osmium basilicum في البيت الزجاجي في اصص معامــلة بتـــراكيز (0 ،22.5 ،45 , 80) غم نفط خام/ كغم تربة جافة, وبعد 34 يوم من بدء الزراعة تم اجراء عدة اختبارات : حساب نسبة الانبات, اطوال النباتات , الحجم العلوي للنبات , سرعة الانبات ومؤشر تحفيز الانبات, حيث اظهرت النتائج مقاومة النبات لتراكيز النفط ضمن درجات متفاوتة وبالترتيب من الاكثر مقاومة ( اقل حساسية) الى الاقل مقاومة (الاكثر حساسية) : الجت، الشعير, ذرة, ماش, خيار,برسيم, لوبيا واظهرت ان الشوفان والريحان على الترتيب اكثر حساسية لتراكيز النفط المستعملة, كما تم قياس كمية CO2 المتحررة من جذور الشعير وجذور الريحان بعد اسبوع من بدء التجربة للجذور الماخوذة من اصص غير ملوثة ومن اصص تركيز النفط فيها 22.5 غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف بعد 34 يوم من بدء الزراعة لكل منهما, تبين ان كميةCO2 المتحررة خلال جميع الايام السبعة وللمعاملتين لنبات الشعير اعلى من كمية CO2 المتحررة لنبات الريحان. ولمعرفة قابلية النباتات المقاومة النامية سابقا في تحسين التربة تم زراعة 5 بذور من بذور النباتين الحساسين كلا على حدا بعد 34 يوم من بدء الزراعة في اصص مزروعة سابقا بنباتات المقاومة لتراكيز النفط المختلفة , اظهرت النتائج بعد اجراء اختبارات نسبة الانبات وحجم النبات على نباتي الشوفان والريحان اظهرت ازدياد في نسبة الانبات حيث كان الانبات الاولي للشوفان وللريحان على الترتيب في المرة الاولى( اصص غير مزروعة سابقا ) ضمن تركيزي (22.5،45 ) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف ( 29%, 19% ), (25 % , 17.1% ) على الترتيب, في حين في الزراعة الثانية ( اصص مزروعة سابقا ) كانت نسب الانبات لهما على الترتيب وضمن تركيزي (22.5، 45) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف (72 %, 70 %), (74 %, 69 %) وهذا التحسن كان في حجم الجزء الخضري لهما ايضا. | Phytodegredation of crude oil in artificially contaminated soil, I used 4 concentration of crude oil in the following plants : alfalfa, barely, clover, Basil in the different concentration, after 34 days of starting the plants we measured length of plant and promoter indicator and speed of germination we showed from these tolerant plant and sensitive plant, after that we measured CO2 liberated from root soil exactly from Barely and Basil after that we planted the soil that was previously planted in the farmer plant we showed from that improvement in the growth of plant and anther criteria that was refer to improve in the soil.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli == Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

Author name: داليا سـلمان عــبد ســبع
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

Author name: خولة جبر خلف المحمداوي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

دراسة اولية لتقدير فعالية مواد (نباتية ، كيمياوية ، مستضدية) في خمجية طفيلي الاكياس المائية في محاولة لاستخدامها علاجيا == Primitive study to determine material efficiency) plant , chemical , antigen ( in Echinococcus granulosus infection as an a tempt to curing application

Author name: خلود ناجي رشيد التكريتي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ندى محمد طه البشير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة علاج مرض الاكياس المائية Hydatidosis المتسبب عن الطور اليرقي للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus اذ تضمنت محورين : - الاول : علاج المـــرض كـــدواء وشمـــل جانبيـــن : .1 استخــدام مســـتخلصين نباتييـــن مائييــن ( اوراق الاس Myrtus communis وبــذور الحبـــة الســـوداء Nigella sativa ) ..2 استـــخــــدام مستحضـــر كيمياوي ( عقار S2 - Complex) . فقـد درس تاثير المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في حيوية الرؤيسات الاولية Protoscolices لطفيلي E. granulosus خارج الجسم in vitro وبواقع خمسة تراكيـز لكل منهم تراوحت ما بيـن (30 ، 35 ، 40 ، 45 ، 50) ملغم/مل للمستخلصيـن النباتييـــن و(2.3 ، 3.3 ، 4.3 ، 5.3 ، 6.3) ملغم/مل للعقار ، كما درسـت فعالية وقدرة المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في السيطرة على خمجية الطفيلي داخـل الجسـم in vivo وبواقـع تركيزين لكـل منهـم تراوحت ما بيـن } (12,6) ، (25,12) ، (0.36,0.18) { ملغم/مل من مستخلص اوراق الاس وبذور الحبة السوداء والعقار S - 2 على التوالي .الثاني : علاج المـــرض كلقاح : حيث تـم استخلاص مستضدين من الطور اليرقي للطفيلي موضوع البحث ، هما مستضد سائـل الكيـس المائـي Hydatid cyst fluid antigen ومستضـد طبقات جدار الكيـس المائـي Hydatid cyst wall layers antigen فـي محاولـة لتمنيــع الفئــران المختبرية ضد الخمج بالاكياس المائية . وتم تقييم حدة الخمج بدلالة بعض المقاييس الحياتية مثـل : معـدل عـدد وقطـر الاكياس المائيـة الثانويـة والنسبـة المئويـة لاختزالها وقياس مؤشـر تضخـم الطحال والكبـد وقياس معـدل الفعاليـة الانزيميـة لانزيمي (ADA) Adenosine deaminase و(ALP) Alkaline phosphatase كمؤشرين كيميائيين حياتيين لحالة الخمج ولفترات زمنية معينة وكذلك الفحص النسيجي للكبد والطحال والكليـة والرئـة . وقـــد اظهـرت نتائج الدراسة خارج الجسـم in vitro ان المستخلص المائـي لاوراق الاس كان الاكثر فعالية في ايقاف حيوية الرؤيسات الاولية يليه المستخلص المائي لبـذور الحبـة السـوداء ثـم العقار S - 2 عنـد استخـدام التراكيـز المختلفـة لكـل منهــم مقارنــة بحالـة السيطـرة ، فــي حيـن اظهـرت نتائج الدراسة داخل الجسم in vivo قـدرة العقار S2 - Complex فـي الحـد مـن انتشار الاكياس المائية الثانوية من خلال تثبيط اعدادها واحجامها في الكبد والاحشاء الداخليـة ، يليـه المستخلص المائي لاوراق الاس ثم المستخلص المائـي لبـذور الحبـة السـوداء من حيث القدرة التثبيطية للخمج مقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة . اما نتائج استخدام المستضدين المستخلصين مــن الطـور اليرقـي فقـد اظهرت كفاءة مستضد سائل الكيس المائي HF في رفع القوة التمنيعية من خلال قدرة الفئران على توجيه مقاومة فعالة ضد الخمج فكانت النسبة المئوية لاختزال عدد الاكياس المائية (100)% اي انه اعطى مناعة تامـة ضد الخمج ، في حين ان مستضد طبقات جدار الكيس المائي HCL اعطى نسبة اختزال (94.37)% ، وقد جرى استخدام معدلين مناعيين لاغراض السيطرة : هما لقاح الســل البقــري (BCG) Bacilli Calmette Guerin ومادة النشا Starch ، فقـد اظهر لقاح BCG نسبة اختزال لاعداد الاكياس المائية الثانوية بلغت (53.83)% في حين اظهـرت مادة النشا نسبــة اختـزال بلغت (21.29)% قياسا لمجموعة السيطرة الموجبة . وبشكل عام فالنتائــج المستحصلــة تشيــر الــى القــدرة العالية للعقار S2 - Complex فـي تثبيـط تطـور الاكياس المائيـة الثانويـة ، كما تظهـر الفعالية الكبيـرة لمستضـد سائـل الكيـس المائي وكفاءته العالية في تحفيز مناعة تامـة ضد الخمج ، مما يوحي بامكانية استخدامها مستقبلا في الوقاية ضد مرض الاكياس المائية اذا ما تبعت هذه الدراسة بدراسات تطبيقيـة اخرى فـي مضائـف اخـرى . | This study aimed treat the Hydatidosis disease caused by larval stage of the Echinococcus granulosus. It included two axes : First : treatment of the disease using medicine which involved two aspects : A) Using water extracts of two plants (leaves of Myrtus communis,seeds of Nigella sativa).B) Using chemical substance (S2 - Complex drug) .The effect of those two extracts and the drug had been studied on the protoscolices viability for E. granulosus in vitro using five concentrations for each of them ranging between (30,35,40,45,50) mg/ml for the two plants extracts and (2.3,3.3,4.3,5.3,6.3) mg/ml for the substance . The effectiveness and ability of the two extracts and substance were studied in order to control the infection in vivo using two concentrations for each ranging between[(12,6),(25,12),(0.36,0.18)] mg/ml for the leave extracts of M. communis , seed extracts of N. sativa and the drug S - 2 receptively .Second : treatment of the disease using vaccine : Two antigens were extracted from the larval stage of the parasite under study. Those are hydatid cyst fluid antigen (antigen HF)and hydatid cyst wall layers antigen (antigen HCL) this was in an attempt to immunize laboratory mice against infection with Hydatidosis This study evaluated the infection intensity by using some biological standards as : The average number and diameter of hydatid cysts and its reduction percentage ratio ; measuring the indicator of liver and spleen hypertrophy ; measuring the average of the enzyme activity for Adenosine Deaminase (ADA) and Alkaline Phosphatase (ALP) as biochemical indicators for the infection state , during a period of time, in addition to tissue investigated for liver, spleen, kidney and lung .The conclusion of this study represented that the extract of M. communis was the most effective to stop the protoscolices viability ; followed by the extract of the N. sativa and finally the drug S - 2 when different concentrations were used for each of them compared with the control state. Whereas the results in vivo presented the ability of S2 - Complex drug to limit the distribution of hydatid cysts by inhibition their numbers and volumes in the liver and the visceral organs followed by water extracts of M.communis and water extracts of N. sativa according to the inhibition ability for infection compared to the positive control group. However the results of uses antigen extracted from the larval stage showed efficiency of antigen HF to increase immunization strength through mice capability having an active resistant against infection . The percentage of reducing the number of hydatid cysts was (100)% . It means that this antigen give absolute immunization against infection . However the antigen HCL gave a reduction ration (94.37)% . Then we used two immunomodulators as a control, They are BCG vaccine and Starch, The BCG vaccine present a reduction ratio for the hydatid cysts numbers reached (53.83)% while Starch represent a reduction ratio reached (21.29)% compared with the positive control group .Generally the results indicated to the S2 - Complex high capacity in frustrating the development of the hydatid cysts. Also it showed the large activity of antigen HF and its high capability for catalysis absolute immunity against infection. This can be used in prevention against the Hydatidosis disease if this study followed by another application studies in other fields .

دراسة بكتيرية ومصلية لمسببات ذات الرئة المكتسب من المجتمع لدى المصابين بالانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological and serological study for causes of community acquired pneumonia in COPD patients

Author name: خديجة شعبان المزوري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة (100) مريض من المصابين بالانسداد الرئوي المزمن والذين يعانون من التهاب ذات الرئة والمشخصين سريريا وشعاعيا في مستشفى بغداد التعليمي من قبل اطباء اختصاص بالاعتماد على العلامات والاعراض السريرية, الفحص الشعاعي وفحص وظائف الرئة. خلال المدة الزمنية 15/9/2001 - 15/4/2002.تم جمع (83) عينة قشع من هؤلاء المرضى, ثم تم قبول (76) عينة لانها كانت ضمن المواصفات المطلوبة والمتضمنة عدد الخلايا القيحية وعدد الخلايا الظهارية, ورفضت (7) عينات لانها لم تكن ضمن المواصفات المطلوبة.تم جمع عينات المصل من جميع المرضى لغرض الكشف عن الاستجابة النوعية للاجسام المضادة نوع IgM, كما شملت الدراسة (50) عينة دم سحبت من اشخاص اصحاء لا يعانون من اصابات تنفسية.تم زرع عينات القشع على اوساط زرعية مختلفة لغرض عزل وتشخيص البكتريا, في حين استخدم نظام API للتشخيص النهائي للبكتريا المعزولة وقد اظهرت نتائج التشخيص ان بكتريا Moraxella catarrhalis كانت باعلى بنسبة اذ بلغت (%13.8), ثم تلتها بكتريا Klebsiella pneumoniae (%12.1) وبكتريا Pseudomonas aeroginosae (%10.3). في حين بلغت نسبة الاصابة ببكتريا Streptococcus pneumoniae (%6.9) وبكتريا (%5.2) Haemophilus influenzae وعند اجراء التشخيص المصلي باستخدام الالايزا (ELISA), اظهرت النتائج ان بكتريا Chlamydia pneumoniae شخصت بنسبة (%31) ثم تلتها بكتريا Mycoplasma pneumoniae التي بلغت نسبتها (%17.2).وفي محاولة للتفريق بين ذات الرئة النمطي وغير النمطي تم استخدام بعض المقاييس مثل ( معدل ترسيب كريات الدم الحمر, العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, بروتين التفاعل, قياس الاستجابة المناعية الموضعية).اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود تاثير معنوي فقط عند استخدام العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, وقياس الاستجابة المناعية الموضعية. ولدراسة عوامل الخطورة الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل العمر, الجنس, وبعض الظروف الملازمة للاصابة. دلت النتائج على وجود زيادة في نسبة اصابة الذكور عما هي عليه في الاناث, اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 2.وكان للعمر تاثير مختلف على المسببات البكتيرية, فقد ارتفعت نسبة الاصابة ببكتريا C. pneumoniae وبكتريا M. catarrhalis مع الزيادة بالعمر, في حين انخفضت نسبة الاصابة ببكتريا M. pneumoniae مع تقدم المريض بالعمر.كما دلت النتائج الى وجود علاقة ذات اثر معنوي بين الاصابة ببعض المسببات البكتيرية وبعض الظروف الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل (التدخين, داء السكر, اصابات رئوية سالبة, القصور الكلوي المزمن). | This study enrolled (100) patient with clinical and radiological evidence of Pneumonia through the period extending from 15/9/2001 - 15/4/2002, who were admitted to Baghdad Teaching hospital, with chronic obstructive pulmonary disease diagnosed by a physician based on clinical, radiological and pulmonary function test.Sputum sample were collected from (83) patient, (76) were processed after fitting criteria for selection which included number of pus cells, number of epithelial cell and Gram stain for primary bacterial identification. Seven samples were rejected for not fitting criteria of selection.Serum sample for detection specific antibody response, were taken for the whole patients.More over 50 serum sample were taken as a control for immunological tests.Proper sputum samples were cultured for the isolation of bacteria, API system was used for the identification of bacteria.From the bacteria isolated M. catarrhalis was the most commonly diagnosed bacteria which is found to be (13.8%) of the total bacteria. Followed by Gram negative bacilli K. pneumoniae being (12.1%) and P. aeroginosae (10.3%) Streptococcus pneumoniae (6.9%), H. influenzae (5.2%).As for immunological diagnosis, C. pneumoniae was diagnosed for (31%) of the cases, followed by M. pneumoniae (17.2%). In an attempt to evaluate parameters that might be useful to differentiate Typical from Atypical pneumonia, ESR, CRP, total WBC count and IgA local immune response were evaluated.Significant difference was detected only in total WBC count and IgA local immune response.Finally to detect possible effect of comorbid condition on bacteria previous age, sex, and other comorbid illness were studied. Males were affected more than female, age show variable effect on different bacterial infection.Smoking, diabetes mellitus, old pulmonary diseases, chronic renal disease, were among the most common and significant factor that affect community acquired pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease

مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus المعزولة من اخماج الحروق والجروح للمضادات الحيوية وبعض المطهرات == Resistance of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus isolated from Burns & Wounds infections to Antibiotics and some Disinfecta

Author name: ختام علي عبيد الخزعلي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 235 مسحة من مرضى مصابين باخماج الجروح والحروق في مستشفيات مختلفة في بغداد للفترة من تشرين الثاني لسنة 2007 ولغاية شهر ايار لسنة 2008 .• شخصت المستعمرات النامية بالاعتماد على عدد من الاختبارات الكيموحيوية, اذ امكن تشخيص 100 عزلة سريرية ( 67 عزلة حروق و33 عزلة جروح ) من المجموع الكلي للعزلات ، توزعت بواقع 64 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ( 50 عزلة حروق 14 عزلة جروح ) و36 عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus ( 17 عزلة حروق و19 عزلة جروح ) واكد التشخيص باستخدام نظام API 20 NE وAPI Staph .• شملت الدراسة فحص الحساسية باستخدام الاقراص تجاه 18مضاداحيويا لكل منهما.• اظهرت عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa مقاومة عالية لمضادات Azetreoname وPipracillin وCarbencillin وCefepime وCefixime وCephalexin وCeftriaxone وCefotixime وCeftazidime وTrimethoprime وCo - trimoxazole اذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة لمضادات Gentamicin وTobramycin وCiprofloxacin وNorfloxacin وImipenem بلغت نسبها (89 ، 79.68 ، 60.9، 81.25، 42.1) % على التوالي ، في حين اظهرت عزلتين فقط من البكتريا المعزولة من اخماج الحروق مقاومة لمضاد Colistin ، وبنسبة 3.2% .• اظهرت عزلات بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية لمضادي Methicillin وAmpicillinاذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة للمضادات Ceftriaxone وAugmentin وErythromycin وGentamicin وTobramycin وTetracyclin وTrimethoprim وCo - trimoxazole بنسبة (72.2 ، 86.1 ، 52.77 ، 41.66 ، 36.1 ، 50 ، 33.3 ، 30.5) % على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة اقل تجاه المضادات (Imipenem ، Rifampicin ،Ciprofloxacin ،Cefotaxime) بنسبة (22.2، 27.7، 13.88، 16.66) % على التوالي . اظهرت العزلات مقاومة متكافئة لمضادات Norfloxacin وOfloxacin وEnoxacin بنسبة % 19.4 . جميع العزلات كانت حساسة لمضاد Vancomycin. • حددت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs) لبعض المضادات المستخدمة في الدراسة وشملت ، مضاد Imipenem اذ تراوحت قيم MICs ما بين (512 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Ciprofloxacin (128 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Norfloxacin (1024 - 8) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Cefotaxime (4 - 1024< ) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Gentamicin (4 - 1024<) ميكروغرام/مليلتر.• اجري اختبار الفعالية المضادة للبكتريا لخمسة من السيفالوسبورينات بعد اجراء تفاعل اعادة الترتيب من خلال تصعيدها في المحاليل المائية الحامضية القوية . انتج تفاعل اعادة الترتيب هيكل حلقة من 5,2 داي اوكسو ببرازين وهي ذات فاعلية واطئة كمضادات بكتيرية وعلى الرغم من ذلك فان هذه النواتج هي مرشحات قوية كادوية مضادة للسرطان.• تبين ان 90% من العزلات كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز.• حددت التراكيز المثبطة الدنيا Minimal Inhibitory Concentrations (MICs) لثلاثة من المطهرات الكيميائية الشائعة الاستخدام في المستشفيات لعشر عزلات بكتيرية لكل من النوعين والتي شملت مطهر الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(256 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (512 - 64) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (512 - 4) مايكروغرام/مليلتر. اذ تبين ان مطهر الهبتين بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات، في حين مطهر بيروكسيد الهيدروجين هو الاقل كفاءة.• حددت التراكيز القاتلة الدنيا Minimal Bactericidal Concentrations (MBCs) للمطهرات الثلاثة للعزلات البكتيرية الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(512 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (1024 - 128) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (1024 - 4) مايكروغرام/مليلتر.• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا (MBCs) اذ تراوح مابين 15 - 10)) دقيقة لمطهر الهبتين,و(40 - 20) دقيقة لبيروكسيد الهيدروجين,(20 - 10) دقيقة لمطهر السكنسبت. | • The study includes the collection of 235, burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2007 to May 2008 .• The isolated colonies were identified depending on biochemical tests, The identification revealed of 100 isolates (67 burns & 33 wounds) from the total number of isolates , 64 isolates of Pseugomonas aeruginosa (50 burns & 14 wounds) and 36 isolates of Staphylococcus aureus (17 burns & 19 wounds) Then the identification of these species was confirmed by using API 20 NE and API Staph. • The study includes sensitivity test by using Disk diffusion method . towards 18 antibiotics,for each species. • The Pesudomonas aeruginosa isolates showed height resistance to Azetreoname, Pipracillin, Carbencillin, Cefepime, Cefixime, Cephalexin, Ceftriaxone, Cefotixime, Ceftazidime, Trimethoprime, and Co - trimoxazole with percentage 100 %, and to Gentamicin, Tobramycin, Ciprofloxacin, Norfloxacin and Imipenem with percentage (89, 79.68, 60.9, 81.25, 42.1) % respectively . While two of burns isolates showed resistance to Colisitin with percentage 3.2 % . • The isolates of Staphylococcus aureus showed high resistance to Methicillin and Ampicillin with Percentage 100 %, and to Cefriaxone , Augmentin, Erythromycin, Gentamicin, Tobramycin, Tetracyclin, Trimethprim, Co - trimoxazole with percentage (72.2, 86.1, 52.77, 41.66, 36.1, 50, 33.3, 30.5 ) % respectively, and less resistance to Imipenem, Rifampicin, Ciprofloxacin, Cefotaxime with percentage (22.2, 27.7, 13.88, 16.66) % respectively. The isolates showed the same resistance towards Norfloxacin, Ofloxacin and Enoxacin with percentage 19.4 % . All strains were sensitive to Vancomycin . • The minimal inhibitory concentrations of some antibiotics were determined . for Imipenem, the MICs values ranged between (2 - 512) µg/mL, Ciprofloxacin, (2 - 128) µg/mL. Norfloxacin, (8 - 1024) µg/mL, Cefotaxime,( 4 - >1024) µg/mL, Gentamicin,( 4 - >1024) µg/mL• The antibacterial activity of five of cephalosporins after chemical re arrangement by reflux in strong acid solution was examined. The re arrangement reaction produce new ring skeleton of 2,5 dioxopiprazine , of lower antibacterial activity. However there product are candidates drug with expected anticancer activity. • (90 %) of the isolates have ability to produce beta lactamase enzymes.• Minimal Inhibitory Concentration, (MICs) for three of the Common Chemical disinfectants in the hospital were determined, for 10 bacterial isolates for each species. The MICs were range between (4 - 256) µg/mL for Hibitane, (64 - 512) µg/mL for Hydrogen peroxide and (4 - 512) µg/mL for skinsept . Hibitane with its low concentration was the most active comparing with the other antiseptics. while the Hydrogen peroxide was the less . • Minimal Bactericidal Concentration (MBCs) for three of the common chemical disinfectants were determined, the MBCs for Hibitane, (4 - 512) µg/mL, Hydrogen peroxide(128 - 1024) µg/mL,and Skinsept (4 - 1024) µg/mL for each species.• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal Concentrations of antiseptic was determined,it was (10 - 15)min for Hibitane, (20 - 40) min for Hydrogen peroxide and(10 - 20)min for Skinsept

دراسـة مقاومة انواع من البكتريا المعزولة من المرضى لبعض المضادات الحياتية والمركبات الكيمياوية الجديدة == STUDY THE RESISTANCE OF BACTERIAL SPECIES ISOLATED FROM PATIENTS TO THE SOME ANTIBIOTICS AND NEW CHEMICAL COMPOUNDS

Author name: خانزاد خضر جرجيس
Supervisor name: عادل كمال خضر | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 488 عينة ماخوذة من مختلف انواع الاصابات من مختبر الصحة العامة المركزي ومستشفيات محافظة اربيل . اخذت 100 عينة من اشخاص لهم التهابات المجاري البولية، وجمعت 388 مسـحة من التهاب الجروح، الحروق، الاذن، اللوزتين، ملتحمة العين، المهبل والانف . استنبتت هذه العينات على وسطي اكار الدم وماكونكي اكار للتحري عن وجود البكتريا المسـببة للاصابات المتنوعة وتشخيصها . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع البكتيري 321 (% 65.77)، فيما كان عدد العينات السالبة 167 (% 34.22)، شــخصت العزلات النامية مظهريا وزرعيا وخواصها الكيموحيوية اذ اهملت جميع انواع البكتريا النامية باســـتثناء S. aureus ، S. epidermidis ، P .aeruginosa ، E. coli . اظهرت نتائج التشخيص البايوكيميائي وجود 67 عزلة (% 20.87) منها تعود الى نوع S. aureus من خلال ايجابيتها لفحص الكاتليز وفحص انتاج انزيم مجلط البلازما، وتخمير سـكر المانيتول، اختزال التليورايت وانتاج انزيم محلل الدنا DNase المقاوم للحرارة كما واظهرت نتائج التشـــخيص وجود 59 عزلة (% 18.38) منها تعود الى E. coli اذ تميزت هذه البكتريا عند تنميتها على وسط EMB (Eosin - methylene blue agar) بمستعمراتها ذات بريق معدني اخضر وتنمو على اكار الماكونكي بشكل مستعمرات وردية لكونها مخمرة لسكر لاكتوز اضافة الى اختبار IMVC كانت موجبة لاختبار الاندول واحمر المثيل فيما كانت سالبة لفحص الفوكس بروسكاور ولم تتمكن بكتريا E. coli من اسـتهلاك السترات فقد اعطت فحصا سالبا لليوريز والاوكســيديز وكذلك وجود 50 عزلة (% 15.57) P. aeruginosa الموجبة لفحص الاوكسيديز والكاتليز واختبار استهلاك السترات وسالبة لاختبار انتاج اليوريز.واظهرت وجود 21 عزلة (% 6.54) تعود الى S. epidermidis منتجة لانزيم الكاتليز وغير منتجة لانزيم مجلط البلازما وانزيم تحلل الدنا DNase وغير مخمرة لســكر مانيتول، ، واستعمل نظام ابي API STAPH ، API 20E لدعم هذه النتائج .شملت الدراسة فحص حساسية العزلات تجاه 33 مضادا حياتيا و9 مركبات كيمياوية . اظهرت بكتريا S. aureus مقاومة عالية للمضادات Penicillin ، Ampicillin، Piperacillin ،Carbenicillin ، Augmentin ، Tetracycline اذ بلغت نسبتها (,90, 100 ,90 80 , 6050 ,) %على التوالي واظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضاد Rifampicin اذ بلغت نسبتها 5% واظهرت هذه البكتريا مقاومة منخفضة للمضادات Oxacillin ، Cloxacillin ، Imipenem , Amikacin , Ciprofloxacillin , Pefloxacillin , Sulphamethoxazole Trimethoprim اذ بلغت نســـــبتها % 15 على التوالي في حين حصلت استجابة مختلفة للمضادات الحيوية الاخرى . بينت النتائج ان جميع العزلات S. aureus كانت % 100 حساسة لمضاد Vancomycin ، Novobiocin ، Fusidic acid .اظهرت بكتريا S. epidermidis مقاومة عالية للمضادات Piperacillin, Penicillin G , Doxycycline hydrochloride, Ampicillin Carbenicillin ,Tetracycline, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (50,60,70,70,80,90, 100) .اظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضادات Imipenem Ciprofoxacillin,Rifampicin , ,Pefloxacillin, Fusidic acid , اذ بلغت نســـبتها % (5,10,10,10,10) على التوالي واظهرت جميع عزلات بكتريا S. epidermidis حساسيتها للمضادات Vancomycin , Novobiocin والتي بلغت نســـبتها % 100. اظهرت عزلات P. aeruginosa مقاومة عالية بلغت نسبتها % 100 للمضادات Penicillin G , Ampicillin , Augmentin , Oxacillin , Cloxacillin , Cephalothin , Cephalexin , Cefoxitin , Streptomycin ,Tetracyclin , Doxycycline hydrochloride , Chloramphenicol , Erythromycin , Rifampicin , Nitrofurantoin وSulphamethoxazole Trimethoprim.اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات Amikacin Ciprofloxacillin, Pefloxacillin, Imipenem, Aztreonam,, اذ بلغت نسبتها % (15,20,20,20,25) , بينما اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . اظهرت عزلات E. coli مقاومة عالية للمضادات Penicillin G , Cloxacillin,Oxacillin , Ampicillin Erythromycin, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (90,95,95, 100, 100,100) , اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات ,Gentamicin Ciprofoxacillin , Imipenem Aztreonam , , ,Amikacin,Nitrofurantoin,Pefloxacillin اذ بلغت نسبتها%(5,10,10,10,10,15,15) على التوالي في حين اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . تم دراسة مركبات مشتقة من - 5,5 ثنائي فنيل - 4,2 - ايميدازوليدين دايون (فنتيون) من خلال اجراء تفاعلات قواعد مانيخ مع البارافورمالديهايد والامينات الاولية المعروفة باستخداماتها الدوائية . واختبرت هذه المركبات الكيميائية الجديدة التســعة كمواد مضادة للبكتريا Antibacterial agent باستخدام خمسة تراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06, 0.04 ml) . بينت نتائج التحليل الاحصائي ان افضل طريقة هي طريقة التخفيف بالمرق broth dilution وتليها طريقة تخفيف بالاكار . فقد تم التوصل الى وجود فروقات معنوية (P< 0.05) ، بين طريقة التخفيف بالمرق وكل من الطريقتين انتشار القرص والحفرة .جميع المركبات الكيمياوية المحضرة لها تاثيرات قاتلة على كل من S. aureus وS. epidermidis باســـتثناء V,VII حيث وجد ان لهما تاثيرا مثبطا وليـس قاتلا في التراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06,0.04ml) في حين اظهرت المركبات I، IV، V، VIII،IX تاثيرات قاتلة على بكتريا P. aeruginosa ، كما وجد ان المركبات II،III، VI، VII لهم تاثيرات مثبطة على هذه البكتريا في التراكيز المذكورة نفسها، كانت جميع المركبات الكيمياوية لهم تاثيرات قاتلة على بكتريا E. coli وفي جميع التراكيز المستخدمة .

الخصائص الحيوية والجزيئية والفعالية ضد الميكروبية للنايسين المنتج من قبل بكتريا subsp. lactis Lactococcus lactis المعزولة من الحليب الخام == Biological, Molecular characteristics and antimicrobial activity of Nisin produced by Lactococcus lactis subsp. lactis Isolated from Raw Milk

Author name: خالد اسماعيل عزيز
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | زيرك فقى احمد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت جمع مائة وخمسة واربعون نموذجا من الحليب الخام خلال فترة ما بين تموز الى التشرين الثانى لعام 2013 فى مزارع تربية المواشي لمحافظة اربيل ودهوك .اسفرت النتائج عن الحصول على 45 عزلة من بكتريا L. lactis subsp. lactis تمت تشخيص هذه العزلات باستخدام الصفات المجهرية , المظهرية , البايوكيميائية ,API 20E SYSTEM بالاضافة الى تقنية الـ PCR . اختبرت فعالية العزلات لبكتريا L. lactis subsp. lactis تجاه ثلاثه عشر نوعا من المضادات الحيويه وتباينت العزلات فيما بينهما من حيث استجابتها لاختبار الحساسية وعدد منها مقاومة كالاتي : Cephalothin, Ampicillin, Amoxicillin/ Clavulanic acid, Sulfamethoxazole/Trimethoprim, Cefotaxime, Clindamycin, Ceftriaxone, Nitrofurantoin, Gentamycin, Vancomycin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, and Imipenem.، ونسبة المقاومة كالاتي : 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55, 24.44%, 2.22%. على التوالي.اظهرت نتائج جميع العزلات فعالية عالية ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية وهى : E. coli, B. subtilis, P. aeruginosa, C. perfringes and S. aureus باستعمال تقنية طريقة الانتشار بالحفر. اظهرت العزلة 41 و15 فعالية عظمى (16mm) (20mm) ضد بكتريا S. aureus وB. subtilis بينما اظهرت العزلة 20 فعالية كبيرة (13mm) ضد بكتريا aeruginosa P.. عموما فان البكتريوسين لجميع العزلات المذكورة كانت فعالة ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة كرام .ايضا تم استخدام النايسين النقي ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية واظهرت النتائج بان مناطق التثبيط كانت 18، 22، 14، 13 و15 ملم ضد كل من S. aureus، B. subtilis، C. perfringens، E. coli وP. aeruginosa على التوالي.درست تاثير الاس الهايدروجينى،الحرارة والاشعة الفوق بنفسجية على فعالية نايسين للعزلات 10، 26 و42. اظهرت النتائج بان مستخلص نايسين لعزلة L42 كانت اكثر فعالية عند الاس الهايدروجينى 2.5 والحرارة - 4 م ضد البكتريا المرضية. لم يظهر مستخلص النايسين اى فعالية ضد البكتريا المرضية عند تعريضه للاشعة الفوق بنفسجية مبينا التاثير السلبى لهذه الاشعة على فعالية البكتريوسين.تم اختيار العزلة اكثر مقاومة للمضادات الحيوية (L42) لاجراء عملية التحول وذلك لتحديد مواقع الجينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية باستخدام عملية التحول الوراثي باستعمال بكتريا coli DH5 - α E. الخالية من البلازميدات مع البلازميد المنقى من العزلة L42. تم اجراء عملية التحول بنجاح واظهرت النتائج بان جينات : Chloramphenicol, Nitrofurantoin, Cefotaxime, and Vancomycin كانت واقعة على البلازميد بينما البقية كانت واقعة على الكروموسوم. تم تحديد التركيز المثبط الادنى للنايسين واظهرت النتائج بان MIC للنايسين بالنسبة لبكتريا aureus S. كانت 400µg/ml بينما لبكتريا coli E. كانت 500µg/ml. استخدمت MIC للنايسين كعامل تحييد للسيطرة على جينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية لنوعين من البكتريا المرضية وهى aureus S. وcoli E.. كشفت النتائج بان الجينات منحت المقاومة لـ AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AK, CFM, تم تحييدها بنسبة 61.5% بينما فى بكتريا coli E. تم تحييد الجينات لـLEV, MEL, NOR, and SXTبنسبة 31%. تم دعم النتائج عمليتي التحول والتحييد باستخدام تقنية الترحيل الكهربائى للهلام. | In this study a total of one hundred forty five raw milk samples were collected during the period of (July to November, 2013) from different fields in Erbil and Duhok province. Screening revealed that 45 out of 145 samples of raw cow milk (31%) were L. lactis subsp. lactis. Characterization of these selected isolates were carried out using morphological, microscopical, biochemical characteristics, API 20 system and further confirmation were achieved by PCR assay.Antibiotic sensitivity test performed for L. lactis subsp. lactis against thirteen antibiotics which include Ampicillin (AMP), Amoxicillin/ Clavulanic acid (AMC), Imipenem (IMP), Gentamycin (GM), Sulfamethoxazole/Trimethoprim (SXT), Cephalothin (CEP), Clindamycin (CLIN), Nitrofurantoin (F), Ciprofloxacin (CIP), Ceftriaxone (CRO), Chloramphenicol (C), Cefotaxime (CTX), and Vancomycin (VAN). The isolates appeared to be varied in their resistance, the number and resistance percent for antibiotics used CEP, AMP, AMC, SXT, CTX, CLIN, CRO, F, GM, VAN, CIP, C, and IMP were as follow 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55%, 24.44%, and 2.22% respectively.All supernatants were isolates exhibited marked activity against five pathogenic bacteria includes S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, P. aeruginosa, and E. coli using agar well diffusion method. Isolate 15 and 41 exert maximum activity (20 mm) and (16 mm) against B. subtilis and S. aureus. Whereas isolate 20 showed highest activity (13 mm) against P. aeroginosa. Generally, all aforementioned isolates were active against gram positive and Gram negative bacteria. In addition, the effect of pH, temperature and UV light were studied on nisin activities of L10, L26 and L42 against some pathogenic bacteria. The results showed that nisin extract of L42 displayed highest activity at pH 2.5 and temperature at - 4 °C against pathogenic bacteria under study. Under UV light wavelength all nisin showed low or no activity against different pathogenic bacteria selected in this study.Also a pure nisin was used against five pathogenic bacteria and the results shows that the inhibition zones were 18, 22, 14, 13 and 15 mm against each of S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, E. coli and P. aeruginosa respectively.One highly resistance isolate was chosen (L42) for transformation test to determine the location of the antibiotic resistance genes by genetic transformation process using the laboratory strain E. coli DH5 - α with plasmid DNA purified from this isolates. The transformation process conducted successfully and the results showed that the resistance genes for F, C, CTX, and VAN were located on plasmid DNA. While for others were located on chromosomal DNA.Minimum inhibitory concentrations were tested for nisin and the results revealed the MIC of nisin for S. aureus was 400 µg/ml while for E. coli was 500 µg /ml. MIC of nisin was used as curing against to control the antibiotic resistance genes in two pathogenic bacteria represented by E. coli and S. aureus. The results showed that the genes encoding resistance to AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AM, and CFM were cured and the percentage of curing was 61.5%. Whereas for E. coli the gene of LEV, MEL, NOR, and SXT were cured with 31%. The above results of both transformation and curing process were supported with gel electrophoresis.

دور السيلينيوم والبراسينولايد في النمو والمركبات الفعالة لنبات الكزبرة (Coriandrum sativum L.) المعرض للاجهاد المائي == Role of Selenium and Brassinolide in growth and active compounds for Coriander plant (Coriandrum sativum L.) Exposed to Water Stress

Author name: حيدر ناصر حسين المنتفجي
Supervisor name: عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

Author name: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.

دراسة حالات العقم عند الذكور والتاثيرات البكتيرية والمناعية على معالم السائل المنوي

Author name: حياة كاظم سلمان الموسوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | انتصار محمود جمعة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 450 عينة مني ومصل دم من الذكور المصابين بالعقم (اولي _ ثانوي) من مركز العقم واطفال الانابيب (مستشفى كمال السامرائي ). قسمت عينات المني الى قسمين اجري على القسم الاول منها الفحوص العيانية والمجهرية ، فيما تم زرع القسم الاخر على اوساط زرعية مناسبة ( اكار الدم،اكار الماكونكي، اكار الجوكليت) .تم عزل 284 عزلة بكتيرية من مجموع عينات المني 450 عينة : - 173 عزلة بنسبة (38.4%) منها تعود الى Staphylococcus aureus و58 عزلة بنسبة (12.9%) تعود الى بكترياEscherichia coli و31 عزلة (6.9% ) منها تعود الى بكتريا Neisseria gonorrhoeae ،اما نتيجة الزرع للبكتريا المختلطة &S.aureus E.coliفكانت 22حالة (4.9%) وذلك باستخدام نظام API system. اختبرت حساسية البكتريا لـ(11) مضادا حيويا شملت : - الامبسلين والفانكومايسين وامبسلين/ سلبكتام وسيفترياكسون ومينوسايكلين وسيفاكلور وسيفوروكسيم وسيفوتاكسيم والاميكاسين والافلوكساسين والسبروفلوكساسين . اظهرت النتائج وجود مقاومة عالية من قبل العزلات البكتيرية للمضاد الحيوي الامبسلين 100% في حين كان المضاد الحيوي سيفترياكسون اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية والبكتريا التابعة للعائلة المعوية اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له وكان المضاد السبروفلوكساسين الاكثر تاثيرا على العزلات البكترية (N.gonorrhoea). تضمن البحث ايضا دراسة تاثير اضداد النطاف على معالم السائل المنوي اذ وجد ان 284 عينة اي بنسبة (63.1%) (من بين450 عينة ) كانت موجبة لاضداد النطاف في البلازما المنوية وان 270عينة اي بنسبة (60%) من مصل الدم كانت موجبة لاضـداد النطاف وذلك باستخدام فحص التراص بالصفيحة agglutination test Tray . كذلك تم التعرف على عيارية هذه الاضداد اذ ان اعلى عيارية للاضداد في البلازما المنوية كانت (128 : 1) في الوقت الذي بلغت اعلى عيارية للاضداد في مصل الدم (1024 : 1). استخدمت تقنية (ELISA ) Enzyme Linked Immumosorbent Assay للتحري عن اضداد النطاف واصنافها وبينت نتائج الدراسة ان اكثر الاصناف تكرارا في البلازما المنوية هو الضد IgA اذ وجد في 271 عينة بنسبة (95.4%) من بين 284 عينة موجبة لاضداد النطاف اما اصناف الاضداد في مصل الدم فالضد IgG كان اكثرها وجودا (225 ) عينة بنسبة 83.3% .من مجموع العينات الموجبة لاضداد النطاف والبالغة 270 عينة . كما تم التعرف على كيفية حدوث التراص نتيجة وجود الاضداد وتبين ان التراص بالرؤوس هو الاكثر حدوثا في (170 ) عينة بنسبة 39.9% مقارنة مع التراص ذنب بالذنب (37) عينة بنسبة 13% . بينت الدراسة وجود علاقة ذات دلالة احصائية معنوية 0.001>P بين وجود الخلايا القيحية في السائل المنوي ووجود اضداد النطاف في البلازما المنوية اذ بلغت النسبة (98.2%) من مجموع 279 عينة فيما بلغ مجموع المرضى العقيمين الذين ابدوا نتائج موجبة لاضداد النطاف بدون خمج (5)عينات 1.7 % كذلك تبين وجود علاقة معنوية 0.001>P بين الاصابة ببعض الامراض مثل القيلة الدوالية Varicoceleواصابة وضمور الخصيةTesticular trouma & atrophy والنكاف Mumps واختزاع الخصيةTesticular biopsy وبين وجود اضداد النطاف في البلازما المنوية . كذلك اظهرت الدراسة ان 393 مريضا ( 87.3%) من مجموع 450 عقيما اظهروا تركيزا سويا لهرمون (FSH) Follicle Stimulating Hormone. في مصل الدم مقابل )57) مريضا بنسبة 12.7% اظهروا تركيزا اعلى من القيمة الطبيعية العليا . كما اظهرت النتائج ان 380 مريضا بنسبة 84.4% كان لديهم تركيز سوي لهرمون (LH) Leutinizing Hormone ، مقابل 70 بنسبة (15.6%) كان لديهم تركيز اعلى من القيمة الطبيعية العليا في مصل الدم . اما بالنسبة لهرمون التيستوستيرون Testosterone فان 334 بنسبة 74.2% اظهروا تركيزا سويا مقابل 116 (25.8%) ممن كان لديهم تركيز اقل من القيمة الدنيا للتركيز السوي . | Four hundred fifteen samples of seminal fluid from infertile men (primary & secondary) from Infertility and Tube Babies Center (Kamal AL - Sammara'ee Hospital). Each semen sample was divided into two parts : The first part underwent Macroscopic& Microscopic examination, while the other part was culture on suitable culture media (Blood agar, Macconkey agar and chocolate agar). 284 bacterial isolates from 450 sample ; 173 sample of seminal fluid show to Staphylococci aureus (38.4%) and (58) from Escherichia coli (12.8%) , 31 show Nesseria gonorrhea (9.6%) while the result of mixed bacteria (E. coli & S. aureus) it was 22 sample (4.9%) by using (Api E - 20) system. Bacterial sensitivity to (11) antibiotic, included Ampcillin, Vancomycin, Ampicillin/Sulbactam, Ceftriaxone, Minocycline, Cefaclor, Cefuroxine, Cefotaxime, Amikacin, Ofloxacin, and Ciprofloxacin the results show high resistance to Ampcillin antibiotic (100%) while ''Ceftrtaxone '' show best action against (E. coli & S. aureus) . Ciprofloxacin was having the highly effect on the Nesseria gonorrhea . The research was included the study of antisperm antibody It was found that 284 sample (63.1%) from 450 sample were positive against antisperm antibody in seminal plasma and 270 sample (60%) from blood serum samples were found to be positive using '' Tray agglutinant test''. The highest molarity of seminal plasma was found to be (1 : 128) whereas the highest of blood serum was (1 : 1024).The ’ELISA’’ method was used to detect anti sperm antibody. The study showed that the most frequent in seminal plasma is Immunoglobuine ( IgA) , where 271 samples (95.4%) were found to be positive . ( IgG) was found to be the most existing one in blood serum; 225 samples ( 83.3% ) .Identification of how aggulation occurred as a result of contraries existence had been executed. It was approved that head to head is the most occurring one; 170 samples (39.9%) compared with tail to tail 37 ( 13%).There was a significant statistical correlation between the presesnce of pus cells in seminal fluid and antisperm antibodies in seminal plasma where the pus cells were found in (98.2%) 279 of the sample. While the infertile patients showed positive results or antibody without infection as being (5) specimens (1.7%) . In addition, there was a correlation between some diseases such as varicocele, Trauma & Atrophy , Mumps and testisculer biopsy and the existence of antisperm antibody (P< 0.001) in seminal plasma .The results showed that 393 patients ( 87.3% ) from 450 infertilities had normal hormone FsH (Follicle stimulating hormone) who had high level in blood serum against 57 patients (12.7%).The result also showed that 380 patients ( 84.4% ) had normal levels of (LH) in comparisn to 70 with ( 15.6%) high levels of LH in the blood serum. "Testosterone hormone" level was found to be normal in 334 patients ( 77.2%) and 116 patients ( 25.8%) showed high levels .

دراسة بكتيرية ومناعية لعوامل الضراوة المستخلصة من بكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات القناة التنفسية == Bacteriological and Immunological Study of Virulence factors extracted from Moraxella catarrhalis Isolated from Respiratory Tract Infections

Author name: حوراء عبد الامير علي الدهان
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | نجاح رايش هادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل وتشخيص 60عزلة من بكتريا Moraxella catarrhalis من 344 عينة مرضية وبنسبة 17.4% موزعة كالاتي (6.7 , 11.7 , 12.5 , 27.6 , 30) % لكل من مسحات الاذن ومسحات الانف وعينات القشع ومسحات البلعوم ومسحات اللوزتين على التوالي من المرضى المراجعين الى العيادة الاستشارية للانف والاذن والحنجرة والعيادة الاستشارية الصدرية في مستشفى الحكيم العام في محافظة النجف ومن مختلف الاعمار ولكلا الجنسين وللفترة من حزيران 2004 وحتى كانون الاول 2004م. اعتمدت الصفات الزرعية (للمستعمرات) والشكلية (للبكتريا)والاختبارات الكيماحيوية لتشخيص العزلات، فضلا عن اعتماد نظام API - NH . كانت النسبة المئوية لعزل البكتريا من الاناث (18.8%)اكثر مما هو عليه في الذكور (16.3%) فيما سادت الفئة العمرية 1ـ10 سنة حيث بلغت نسبة عزل المسبب المرضي فيها 20.4%. لغرض التحري عن طبيعة مقاومة العزلات قيد الدراسة للمضادات الحيوية المختلفة ،فقد اخضعت جميع العزلات لاختبار حساسيتها لـ 12 نوعا من المضادات الحيوية التي تستعمل في علاج الاخماج البكتيرية ،اذ اظهرت العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيويةAmpicillin وAmoxycillin وTetracyclin وبنسبة 100% لكل مضاد ، في حين اظهرت العزلات مقاومة معتدلة وبنسب (73.3 ، 71.7 ، 66.7 ، 61.7 ، 60 ، 58.3 ) % لكل من المضادات الحيوية Cefotaxime،Ciprofloxacin ،Nitrofurantoin ،Nalidixic acid ، Cephalothin وGentamycinعلى الترتيب ،لكنها كانت مقاومة وبدرجة منخفظة تجاه Chloramphenicol ,Cephalexin , Pipracillin اذ بلغت نسب المقاومة لها(30 , 36.7 , 38.3)% على الترتيب .واظهرت معظم العزلات مقاومة مشتركة لعدد من المضادات الحيوية قيد الدراسة ، كما واظهرت 91.7% من العزلات قدرتها على انتاج انظيم البيتالاكتاميز . في محاولة للتحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستعمار اظهرت العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الاول (CFA/I) والثالث (CFA/III) وبنسب (93.3 ،96.7 )% على التوالي ، في حين لم تظهر ايا من العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الثاني (CFA/II) .اظهرت 22 عزلة من بكتريا M.catarrhalis (36.7%) قدرتها على انتاج انظيم البروتيز الخارج خلوي في حين لم تظهر ايا من العزلات قابليتها على انتاج انظيم الهيمولايسين والسايدروفورات , فضلا عن عدم قدرتها على تكوين المحفظة . ولمعرفة قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الشعيرات (Fimbriae) اجري فحص تكوين الغشاء الرقيق حيث تمكنت 80 % من هذه العزلات من تكوين هذا الغشاء عند نموها في الوسط الزرعي السائل في الوقت الذي استطاعت فيه 85%من العزلات من تلزين كريات الدم الحمراء للانسان صنف O+ وذلك للتحري عن امتلاك البكتريا للواصق التي تمكنها من الالتصاق بمستقبلات خاصة مؤلفة من مواد كاربوهيدراتية تعرف باسم (Gal α1 - 4Gal ß )موجودة على سطح كريات الدم الحمراء للانسان ، كما واستخدمت العزلة (6¬MO¬)المشعرة والملزنة والعزلة (MO1)غير المشعرة والملزنة لمقارنة معدل التصاقها بالخلايا الطلائية للانسان والمرسبة من الادرار مع معدل التصاق العزلة (MPn6)غير المشعرة وغير الملزنة ,اذ بلغ معدل التصاق العزلة (6¬MO¬) 54.1 خلية بكتيرية /خلية طلائية اعلى من معدل التصاق العزلة MO1 والعزلة MPn6 التي بلغ معدل التصاقها (9.6 , 23.9 ) خلية بكتيرية / خلية طلائية على الترتيب . وفي محاولة للتعرف على انماط التلازن الدموي للعزلات البكتيرية قيد الدراسة ,اجري فحص التلازن الدموي لجميع العزلات البكتيرية (60 عزلة) باستخدام دم الانسان والابقار والدجاج وخنازير غينيا على الترتيب وقد ظهر النمط(RRRN) بكونه الاكثر سيادة حيث بلغت نسبته حوالي 33.3% من العزلات قيد الدراسة . تم اختيار احد العزلات (MO6) باعتبارها عزلة كفوءة ومشعرة لثبوتية صفاتها المستضدية واعطائها للنتائج القياسية المعروفة في التفاعلات الكيماحيوية لاستخدامها في التجارب اللاحقة المتمثلة باستخلاص مستضدات عوامل الالتصاق ( الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي وعديد السكريد الشحمي ).المحور الثاني : استخلاص وتنقية المستضدات - تم استخلاص مستضد الشعيرات (Fimbriae) للعزلة المنتجة (MO6)باستخدام تقنية النبذ المركزي فائق السرعة لفصل الشعيرات وكذلك استخدام كبريتات الامونيوم بنسب تشبع مختلفة لغرض ترسيب البروتينات المستخلصة ، ومن ثم قدرت كمية البروتين في هذا المستخلص وكانت 0.525 ملغم /مل . - تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) للعزلة MO6 باستخدام الانظيمات (RNase وDNase ) والمنظف N - Lauroyl - Sarcosinate كما وقدر تركيز البروتين في مستخلص OMPs النقي اذ بلغ 0.6 ملغم /مل ، اما متعدد السكريد الشحمي (LOS ) فقد تم استخلاصه بتكسير الخلايا بالانظيمات والاستخلاص بالفينول المائي الساخن ، وبعد فصل كل من الطورين المائي والفينولي تمت ازالة سمية LOS في كل من الطورين باستخدام مادة Hydrazine اللامائية .وكما تم تقدير كمية الكاربوهيدرات الكلية في الطورين المائي والفينولي كليهما ,حيث بلغت (300 , 190)مكغم/مل على التوالي ,فضلا عن قياس النسبة المئوية للبروتين المرتبط مع LOS في الطورين والتي بلغت (13.3 , 11.8) % على الترتيب. المحور الثالث : الدراسة المناعية شمل هذا المحور دراسة تاثير مستضد الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) المنقاة جزئيا ومتعدد السكريد الشحمي (LOS) المزالة سميته والمستخلصة من العزلة الكفوءة (MO6)لبكتريا M.catarrhalis على الاستجابة المناعية ومعرفة دور هذه المستضدات الثلاثة في تنشيط او تثبيط فعالية بعض الخلايا المناعية ,ولغرض تحقيق ذلك اجريت الاختبارات المناعية الاتية في الزجاج (In vitro )والمتمثلة بعيوشية الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية والتشكل الزهري التائي والبائي وهجرة الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى (PMNs), فضلا عن عملية البلعمة للخميرة Candida albicans المقتولة بالحرارة.ادى استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات (25 , 50 , 100 )مكغم/مل وتراكيزمن مستضد OMPs (50 , 100 , 200) مكغم/مل وتراكيز من مستضد LOS(200,100,50) مكغم /مل الى انخفاض معنوي (0.05 P <)في النسبة المئوية لعيوشية خلايا PMNs والخلايا اللمفاوية مقارنة بالسيطرة ,كما ادى استخدام التراكيز اعلاه ولكل المستضدات الثلاثة الى خفض معنوي في قطر منطقة الهجرة لخلايا PMNs . حيث كانت لجميع هذه التراكيز وللمستضدات الثلاثة تاثيرا مثبطا لهجرة خلايا PMNs وان تدرج التثبيط يزداد بصورة معنوية بزيادة تركيز المستضدات . اما فيما يخص عملية البلعمة التي استخدم فيها مستضد الشعيرات وOMPs وبالتراكيز (25 , 50 , 100 مكغم/مل) و(50 , 100 , 200 مكغم/مل) على التوالي , فقد لوحظ ازدياد معدل معامل البلعمة تدريجيا مع الزمن وبشكل معنوي (0.05 < P) حتى وصل اقصاه عند الوقت 90 دقيقة ، ثم انخفض بعد ذلك خلال الوقت 120 دقيقة ولجميع التراكيز المستعملة ولكلا المستضدين ، اما بالنسبة لمستضد LOS فقد لوحظ ان معدل معامل البلعمة يزداد وبصورة طفيفة وتدريجية واصبح بشكل معنوي عند الوقت 90 دقيقة من المعاملة ولجميع التراكيز المستعملة (200,100,50 ) مكغم /مل ,الا انه لم تظهر هنالك فروقات معنوية ( 0.05 P>) بين التركيزين (100 و200)مكغم /مل عند الاوقات (120,60,30) دقيقة ، كما وازدادت النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية المكونة للتشكل الزهري التائي الفعال والكلي وكذلك التشكل الزهري البائي وبتاثير معنوي (< 0.05 P) للمستضدات الثلاثة (الشعيرات , OMPs ,LOS)عند التراكيز نفسها مقارنة مع معامل السيطرة . اوضحت نتائج تجربة تمنيع الحيوانات المختبرية (الارانب )بمستضد الشعيرات وOMPs وLOS والمعدل المناعي (Immunoferon) امكانية الحصول على اجسام مضادة للمستضدات المستخدمة والتي استدل على وجودها باستخدام اختبار الترسيب في الانابيب ,حيث ظهرت حلقة ترسيب في الانابيب الحاوية على مصل الارنب الممنع بهذه المستضدات والمعدل المناعي عند التراكيز( 140,50,200,100) مكغم/مل على الترتيب ، في حين لم يظهر اختبار الانتشار المناعي المزدوج في هلام الاكروز (اختبارOuchterlony) اي نتيجة موجبة عند استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات وLOS وImmunoferon عدا مستضد OMPs حيث ظهر خط ترسيبي مفرد عند التركيز 200 مكغم /مل .وان هذه النتائج تشير الى امكانية استخدام هذه المستضدات كمعدلات مناعية لقابليتها على تحفيز الخلايا اللمفاوية البائية على تكوين | Sixteen isolate of Moraxella catarrhalis was diagnostic from a total of 344 pathogenic specimens , Moraxella catarrhalis was isolated and identified in a percentage of 17.4% .Isolates of M.catarrhalis were distributed amony source of the pathogenic specimens to (30,27.6,12.5,11.7,6.7) % for swabs from ear, nose, sputum specimens, pharynex, and tonsiles, respectively. Specimens were collected from male and female patients of different age groups referred to the Ear Nose & Throat and Chest consultants clinics in Al - Hakim general hospital in Najaf Governorate from the period of June, 2004 to December, 2004.Cultural, microscopical, and biochemical characteristics were considered for diagnosis of this bacteria, in addition to use of API - NH system.Higher incidence of bacteria was detected in women (18.8 %) compared to men (16.3%).Age group of (1 - 10) year was the dominant infected group (20.4%) among others .To investigate the nature of resistant to various antibiotics ,the isolates were subjected to the sensitivity test of 12 antibiotics which are routinely used in treatment of infections caused by this organism.All isolates were exhibited complete resistance (100 %) to Ampicillin, Amoxycillin, and Ttetracycline, moderatly resistant in a percentages of (73.3 ,71.7,66.7,61.7,60,58.3)% for each Cefotaxime, Ciprofloxaciy, Nitrofurantoin, Nalidixic acid, Cephalothin, Gentamycin, respectively. While, sensitive to Chloramphenicol ,Cephalexin ,Pipracillin when their resistance reached only ( 38.3 , 36.7 ,30)% ,respectively. All isolates exhibited multiple resistance for many antibiotic used in this study ,and 91.7% of isolates presented the ability to produce β - Lactamase enzyme .To investigate the pathogenicity factors for M. catarrhalis such as adhesion and colonization factors, all isolates showed the ability to produce CFA/I and CFA/III in apercentage of 93.3,96.7 %, respectively. Whereas, non of the isolates showed no ability to produce CFA/II .Twenty two (36.7 %) of M.catarrhalis isolates only were able to produce extracellular protease, but all isolates were unable to produce hemolycin, sidrophores, and capsule. To detect the ability of isolates to produce fimbriae ,pellicle formation test was done, and it was found that 80 % of isolates were formed this pellicle when it was grown in the broth culture media .At the same time ,85% of isolates were found to be able to cause agglutination of human blood type O+ “ in order to detect the precence of adhesion in the bacteria which make it able to attach into carbohydrate specific receptors named (Galα - 4Galβ)which presented on the surface of human blood erythrocyte” .The fimbriated –hemagglutinated isolate (MO6) and non fimbriated - hemagglutinated isolate(MO1) were used to compared the bacterial adherenc rate on human uroepithelial cells with non fimbriated –non hemagglutinated isolate(MPn6) .The adherence rate of (MO6) isolate was 54.1 bacterial cells / epithelial cell Morethan that of (MO1) and(MPn6) isolates which presented in 23.9 , 9.6 bacterial cells /epithelial cell,respectively . Hemagglutination patterns for all isolates were done by using human ,bovine ,chicken and guinea pig ,respectively in Hemagglutination test. RRRN patterns the highere incidence pattern presented in 33.3% from all isolates . One isolate (MO6) was selected to be used in the following experiment as it is considered efficient and fimbriated with consistent antigenic properties and its typical biochemical characteristics such as extraction of adherence factors antigens (fimbriae ,outer membrane proteins and lipooligosaccharide).Second Aspect : Extraction and Purification of Antigens. - Fimbria antigen was extracted from MO6 producted isolate by using ultracentrifugation and ammonium sulfate in a different saturation percentages for fimbriae separation and extracted protein precipitation ,respectively .The protein concentration in this antigen was estimated which was 0.525 mg/ml. - RNase ,DNase (enzymes)and N - lauroyl sarcosinate(Detergent) were used to extract OMPs ,from selected isolate (MO6).Protein concentration of the purified extracted OMPs was estimated and found to be 0.6 mg/ml. Lipooligosacchoride (LOS) was extracted after cells were broken by the above enzymes .The extraction was performed by hot - phenol .After the aqueous and phenolic phases were separated, it was detoxified for each phases by using anhydrous hydrazine, and total carbohydrate quantities were estimated for each phase which were 300,190µg/ml , respectively . Morever,LOS bounded protein quantity in each phase was also estimated. The percentages of the protein bounded to LOS for aqueous and phenolic phases were 13.3 , 11.8 %,respectively .Third Aspect : Immunological StudiesThis aspect was investigated the effect of fimbriae ,OMPs which are partially purified, and detoxified LOS antigens isolated from M. catarrhalis (MO6) on immunoresponse and showed the role of this three antigens in activation or inhibition of some immunocellular activity. The following (In vitro)immunological tests were performed; Viability of PMNs and lymphocyte, B and T rosette forming assay ,migration of PMNs, and phagocytosis of Candida albicans . The concentration of fimbriae (25,50,100) µg/ml , OMPs (50,100,200) µg/ml and LOS(50,100,200) µg/ml decreased the viability percentage of PMNs and lymphocyte with significant differences (P<0.05) in comparison to the control treatment ,while, these concentration for each antigens inhibited the migration of PMNs cells in asignificant differences and the gradual inhibition decreased significantly with increase of antigens concentration . The concentration of fimbriae ( 25 , 50 , 100) µg/ml and OMPs (50, 100 , 200 ) µg/ml increased the phagocytic index (PI) Significantly and gradually with time untile it reach the maximum at time 90 min. Then PI decrease at the time 120 minutes . For all concentration of each antigens LOS antigen increase the PI significantly at 90 min. for all concentration but its non significant (P>0.05) at times (30,60,120)minutes between (100,200) µg/ml concentration .All concentration used for these antigens (fimbriae ,OMPs ,LOS) increased the percentage of T and B rosette assay with high signfacant differences in comparison to control . The study showed that rabbit immunized by fimbriae ,OMPs,LOS, and Immunoferon produced antibodies against these antigens which were detected by Ouchterlony double diffusion test which showed no precipitin line between any antigens and serum of immunized rabbit except OMPs showed single precipitin line at concentration 200 μg/ml ,While there was clear ring of precipitin was formed in the second method (tube precipitation test) .These results showed the ability of these antigens to act as immunomodulators due to their ability to stimulate β - lymphocyte to produce antibodies similar to immunoferon

دراسة تاثير بعض العوامل الخارجية في بقاء والتصاق بكتريا Acinetobacter baumannii على السطوح غير الحية == Study the effect of some external factors on survival and adherance of Acinetobacter baumannii on abiotic surfaces

Author name: حنين اكرم حبيب
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت عزلات من بكتريا Acinetobacter baumannii من سطوح غير حية مختلفة شملت قضبان الاسرة ومقابض الابواب والمغاسل والاغطية والوسائد وملابس العاملين , وقد تم الحصول على (149) عينة من مستشفى الكندي التعليمي , اذ زرعت العينات على اوساط زرعية صلبة (الماكونكي واكارالدم) ,وعلى ضوء التشخيص المجهري والزرعي والكيموحيوي , ومن ثم استخدم نظام Api 2o - E فقد تم الحصول على 16 عزلة من بكتريا A.baumannii وبنسب مئوية للعزل مقدارها (6.25 , 12.5 , 18.75 , 25 , 37.5) % لمسحات قضبان الاسرة , مقابض الابواب , المغاسل , الاغطية والوسائد , وملابس العاملين على التوالي . الخطوة الثانية تضمنت التحري عن العزلات البكتيرية المتحركة من بين 16 عزلة حيث كانت جميع العزلات البكتيرية متحركة حركة ارتعاشية على وسط الحركة شبه الصلب . اختبرت قابلية العزلات على الالتصاق وتكوين الغشاء الحيوي لعزلات بكتريا A.baumannii على السطوح غير الحية المصنعة من مواد مختلفة ( البلاستيك , الفولاذ والمسمى محليا ( Stainless steel) , البورسلين , الخزف , الخشب , الفورميكا , الزجاج , البوليستايرين ) وذلك بوضع كمية محددة من العالق الخلوي على تلك الاسطح ثم حضنها تحت درجات حرارية مختلفة وهي درجة حرارة الثلاجة (4)م درجة حرارة الغرفة - 20)25 (م ودرجة حرارة الحضن )37 (م ولفترات زمنية مختلفة (72,48,24) ساعة ومن ثم عمل مسحة لتلك الاسطح وزرعها على وسطBrain Heart Infusion Agar لمدة 24 ساعة تحت درجة حرارة 37 م لملاحظة مدى حيوية خلايا بكتريا A.baumannii او بعمل سلايد لسطوح الزجاج والبوليستايرين وقد اظهرت هذه النتائج ان هذه البكتريا تلتصق على السطوح غير الحية وبنسب متقاربة ما عدا الخشب فقد اظهرت البكتريا التصاقا قليلا على هذا السطح .

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

Author name: حنان طارق صبحي
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي == Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

Author name: حسين ظاهر عليوي التميمي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

تحديد مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين والابيشتاين بار فايروس في امصال المرضى العراقيين المصابين باللاهودجكن اللمفاوي == Detection of interleukin 10 , Adiponectin and Epstein Bar Virus in sera of Iraqi patients with Non - Hodgkin's lymphoma

Author name: حسنين سمير الهاشمي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | زياد احمد شبيب الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد مرض اللاهودجكن اللمفاوي مجموعة من سرطانات الخلايا اللمفاوية والذي تتطورفيه الخلايا المفاوية بطريقة خاطئه مؤدية الى اضطرابات مناعية .تم خلال الدراسة الحالية تقييم بعض المؤشرات المناعية في امصال (46) عراقيا من مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ومقارنتها مع (46) فردا مضاهيا من الاصحاء ظاهريا .اجريت الدراسة في المركز الوطني لبحوث وعلاج امراض الدم وفي قسم علوم الحياة في الجامعة المستنصريه منذ كانون الثاني الى حزيران من العام 2013. هدفت الدراسة لتقييم مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين واضداد (EBV) في امصال مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ودراسة اثر هذه المتغيرات في الامراضية والتنبؤ بسير المرض وكيف يؤثر بعضها في البعض .كان 31 (67%) مريضا (≥ 50) سنة و15 (33%) منهم باعمار(<50) سنة . وكان متوسط اعمار المرضى (52.74متوسط± 2.18) اذ تراوحت اعمارهم بين (17 - 80) سنة وقد بينت نتائج الدراسة ان الذكور هم اكثر عرضه للاصابة بالمرض مقارنة بالاناث وبنسبة 1 : 1.7 . كما تبين من الدراسة هنالك فروقات معنوية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين (50≤ و50≥) فضلا عن الفروقات كانت معنويه(0.05 > p) بينهما في مستويات الاضداد (EBV IgM) في الوقت الذي لم تكن الفروق معنويه (0.05 < p) لاضداد (EBV IgG) . تبين كذلك ان هنالك فروقات في مستويات الاديبونكتين المصلية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين في ما لم تكن الفروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الانترليوكين 10 بين المجوعتين العمريتين . عند تقسيم المرضى تبعا للجنس 29 ذكر و17 انثى , بينت النتائج ان هناك فروقات معنوية في اعداد خلايا الدم البيض بين الجنسين (17.32*109/لتر ± 6.87 ذكور , 5.80*109/لتر± 0,85 اناث) (0.05 > p).وبشان مستويات اضداد EBV (IgM,IgG) لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) بين كلا الجنسين , كما لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الاديبونكتين . فيما كانت الفروقات ذات دلاله معنويه في مستويات الانترليوكين 10 (23.77 بيكو غرام / مل ±6.58ذكور , 12.06 بيكوغرام/مل ±3.77 اناث ) (0.05 > وبمقارنة المرضى بالاصحاء كانت هناك فروقات معنوية (0.05 > p) في اعداد كريات الدم البيضاء فما لم تكن الفروقات معنوية (0.05 < p) بالنسبة EBV (IgM,IgG) .اما مستويات الاديبونكتين المصلية فقد انخفضت معنويا في امصال مرضى اللاهودجكن المفاوية (وان بقيت مستوياتها ضمن الحدود الطبيعيه ) بالمقارنة مع الاحصاء (0.05 > p).سجلت النتائج ارتفاعا معنويا (0.05 > p) في مستويات الانترليوكين 10 (18.67بيكو غرام/مل ±4.12 )بالمقارنة مع مستوياته (3.4بيكوغرام /غرام ±0.73) عند مجموعة الاصحاء , كما لوحظ ان هنالك ارتفاعا معنويا (0.05 > p) اخر في امصال اللاهودجكن ذوي المراحل المتقدمة (33.1 بيكو غرام /مل ± 4.5) عند مقارنتهم بالمرضى في المراحل المبكرة (13.4 بيكو غرام /مل ± 2.7) (0.05 > p)وعلى العكس من ذلك انخفضت مستويات الاديبونكتين معنويا (0.05 > p)في المراحل المتقدمة من المرض (4.53مايكروغرام /مل ±1.4 ) مقارنة بالمراحل المبكرة (6.79مايكرو غرام /مل ±1.1). بينت نتائج التحليل الاحصائي انه ليس هنالك ثمة علاقة معنويه (0.05 < p)بين الانترليوكين 10 والاديبونكتين عند مرضى اللاهودجكن اللمفاوي في جميع مراحلة . خلصت الدراسة بالاستنتاج ان حالات اللاهودجكن المدروسة اكثر حدوثا في فئات عمرية فوق الخمسين سنة بالمقارنة مع من هم تحت ال 50 سنة وترافقهزايادة في مستويات الانترليوكين 10 مع تقدم عمر المريض وارتباطها كذلك مع شدة المرض مما قد يعكس القيمة التنبؤية لهذا السياتوكين . فيما ارتبط انخفاض مستويات الاديبونكتين مع ارتفاع خطورة الاصابة بالمرض ومع اشتداد المرض . يرتبط الانخفاض في مستويات الاديبونكتين عكسيا مع مؤشر كتلة الجسم (BMI). سجل خلال الدراسة انخفاض مستويات (EBV IgM) في المرضى باستخدام تقنية الايلايزا يعكس الحاجة لاستخدام تقنيات اخرى للكشف عن الفايروس المختبىئ . | Non hodgkin's lymphoma (NHL) is a group of cancers of the lymphocytes. In NHL, the lymphocytes develop in a wrong way led to immune disorder. The present study was carried out to evaluate some immunological parameters in the sera of (46) NHL Iraqi patients , In addition to control group involving (46) matched apparently healthy subjects. This study was done in the National center of hematology & Department of biology at AL - Mustansiyria University since January to June 2013.The aim of this study is to estimate the levels of Interleukin 10, Adiponectin and EBV infection in sera of patients with NHL and to study the impact of these parameters on the pathogenesis and predictive of the disease and how they correlated.There were 31 out of 46 (67%) patients with age group ≥50 years and 15 out of 46(33%) patients with age group <50 years. The mean age of NHL patients was (52.74) years ranging from 17 to 80 years. The patients were divided into two groups according to the age(≥50years and <50 years)patients .There was statistically significant difference (p<0.05) in White blood cells count between age groups . The mean of adiponectin serum level was significantly differ (p<0.05) between the two age groups.The mean of IL - 10 serum levels did not show a significant difference between the two age groups (p>0.05).The mean of adiponectin serum level in NHL patients wasn't significantly (P>0.50) differ between male and female while the IL - 10 level in serum was significantly different (23.77pg/ml ± 6.58 male, 12.06 pg/ml ± 3.77 female) (P<0.05).When the patients of NHL compared with control, the mean of white blood cell count was significantly different ( p<0.05) also there was non - significant differences(P>0.05) in mean of EBV - IgG & IgM among NHL patients and control group. The mean level of adiponectin serum was a statistically decreased in patients of NHL as compared with control subjects(p<0.05), but still these levels are within normal range, furthermore The levels of interleukin 10 were significantly increased in patients with NHL compared with healthy subjects (18.67 ± 4.12 pg/ml vs. 3.4 ± 0.73pg/ml) (p<0.05). Higher increasing of IL - 10 levels in the advanced stage patients of NHL was noticed compared with early stages (33.1 ± 4.5 pg/ml vs. 13.4 ± 2.7 pg/ml) (P<0.05). Otherwise the serum levels of adiponectin in aggressive stage of NHL patients was decreased compared to the early stages of that disease (4.53 ± 1.4 µg/ml vs. 6.79 ± 1.1 µg/ml ) (P<0.05). There was no significant negative correlation between IL - 10 and adiponectin in all NHL patients (p>0.05) also there was no significant correlation between IL - 10 and adiponectin in patients with advanced stage (p>0.05). In conclusion, NHL was noticed in the highest ages and it might indicates the increasing rates of NHL among older population. in addition increasing level of IL10 is associated with increasing age range and also correlated positively with aggressive NHL cases that might indicates the predictive pivotal role of this cytokine . Moreover, Lower adiponectin levels are associated with an increased risk of NHL. Adiponectin is inversely correlated with Body mass index and also it was decreased in aggressive cases compared to early stages. The low percentage of EBV IgM in NHL patients by using Elisa technique might indicates the Necessity for using other advanced technique to detect EBV infection either an action or silent form

دراسة بكتيرية ومناعية للانظيم الحال للبروتين نوع - ا - المستخلص من بكتيريا Proteus mirabilis المعزولة من خمج السبل البولية == Bacteriological and Immunological Study of IgA - Protease Enzyme Extracted from Proteus mirabilis Isolated from Urinary tract infection

Author name: حسن علي حسين السعدي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة اربعة محاور : 1 - العزل والتشخيص : تم عزل وتشخيص (40 ) عزلة من بكتيريا Proteus spp. من مجموع ( 200 ) عزلة بكتيرية من عينات اخماج مرضى السبل البولية في مستشفيي مدينة الطب والكندي للفترة بين 1/3/2004 لغاية 30/10/2004.اظهرت الفحوصات الكيميائية الحيوية ان 40 عزلة بكتيرية (20% ) من العزلات البكتيرية كانت تنتمي الى جنس Proteus والتي اشتملت على ( 37 ) عزلة تعود الى بكتيريا)P. mirabilis18.5%) ثلاث عزلات من بكتيريا Proteus vulgaris. عشر عزلات من بكتيريا P. mirabilis كانت منتجة للانظيم الحال للبروتين (IgA Protease)، بينما كانت عزلات بكتيريا Proteus vulgaris غير منتجة للانظيم المذكور ،واختيرت العزلة (Pm5)P.mirabilis كعزلة منتجة للانظيم.2 - تنقية وتوصيف الانظيم : اختير الوسط مرق ( Cysteine lactose electrolyte deficient ) كافضل وسط زرعي لانتاج الانظيم من بكتيريا Proteus mirabilis وتم تنمية العــــزلة البكتيريـــة( Pm5) في درجة حرارة( 37 )م باستخدام الحاضنة الهزازة وثم نقي الانظيم باستخدام الترسيب ملح كبريتات الامونيوم بتشبع(60%) وديلزته واستخدام هلام السيفادكس G - 100 Sephadex وكذلك المبادل الايوني DEAE - Cellulose، قيست الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين للانظيم في كل مرحلة من مراحل التنقية ظهر منحني تنقية الانظيم باستخدام هلام السيفادكس وجود اربعة قمم بروتينية منها قمة واحدة للانظيم الحال للبروتين بينما اظهرت طريقة استخدام المبادل الايوني قمة واحدة فقط، تم حساب الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين والفعالية النوعية والفعالية الكلية وعدد مرات التنقية والحصيلة الانظيمية فكانت على التوالي : (28.7)وحدة/مل،(0.15)ملغم/مل، (191.3)وحدة/ملغم، (258.3)، (5.5)،(9.9%) عند التنقية باستخدام المبادل الايوني وحسب الوزن الجزيئي للانظيم اذ كان (50)كيلودالتون باستخدام طريقة الترشيح الهلامي وكانت الفعالية المثلى للانظيم عند الاس الهيدروجيني 8 ودرجة الحرارة المثلى لانتاج الانظيم هي (37)م ودرجة الحرارة الملائمة لخزن الانظيم هي (4)م مقدارها وكان للايون (Ca+2) تاثير واضح في زيادة فعالية الانظيم بينما كان للـEDTA تاثير مثبط على فعالية الانظيم. 3 - الدراسة المناعية : - استعملت ثلاث مجاميع من الارانب لغرض التمنيع (ارنبين لكل مجموعة) حقنت داخل العضلة باستعمال تراكيز مختلفة من الانظيم(0.2،0.5،1)ملغم/مل فضلا عن ارنبين ضمن مجموعة السيطرة. اتبعت طريقتين (الاوكترلوني والترسيب باستعمال الانابيب) لغرض التحري عن الاضداد المتخصصة للانضيم الحال للبروتين في مصل الارنب، اظهرت النتائج عدم تكون الخط الترسيبي عند استعمال طريقة الاوكترلوني بينما تكونت حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب. تم فصل امينوكلوبيولينات الارنب باستعمال المبادل الايوني DEAE - Cellulose بعد عملية الفصل ظهرت ثلاث قمم بروتينية على الطول الموجي 280 نانوميتر تم اختبار فعالية الانظيم في كل قمة مقارنة بالقمم المؤشرة في الادبيات، اظهرت القمة الثالثة حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب بينما لم تظهر خط ترسيبي باستعمال اختبار الاوكترلوني وهذا قد يدلل على وجود تحت الانواع IgG المقاومة لفعالية الانظيم الحال للبروتين ضمن هذه القمة. تم دراسة تاثير التراكيز المختلفة للانظيم الحال للبروتين (0.2، 0.5، 1)ملغم/مل على بعض الخلايا المناعية وفق المعايير التالية : اذ ادى تركيز الانظيم(0.2)ملغم/مل الى زيادة في عيوشية الخلايا اللمفاوية وخلايا متعددة النوى (PMNs) وعلى التشكل الزهري التائي والبائي وعملية التهام الخميرة المقتولة في الزجاج واختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم (NBT) ومعامل الانقسام الخيطي في الفئران. 4 - الدراسة النسجية : - درست التغيرات النسجية المختلفة في الارانب الممنعة بالانظيم الحال للبروتين بتركيز((0.2 ملغم/مل فكان له تاثيرا واضحا على انسجة الكبد، الرئة، الكلية والطحال،اذ لوحظ وجود مناطق تنكس استسقائي شديد في هيولي خلايا الكبد مع احتقان الوريد المركزي في نسيج الكبد، كمالوحظ وجود خلايا التهابية في جدران الاسناخ وضمور تجويف الاسناخ في الرئة، بينما توسعت محفظة بومان مع ارتشاح بعض الخلايا الالتهابية وخاصة حول الكبيبات في الكلية، اما في الطحال ازداد عدد الخلايا التائية حول الشرين المركزي كذلك الخلايا البائية في باقي اللب الابيض في الطحال نتيجة لتكاثرها وفرط نموها. | This study was included four aspects : - 1 - Isolation and ldentifcation : Forty isolates of Proteus spp were isolated and identified among (200) bacterial isolates from patients samples with urinary tracts infection in two hospitals (Baghdad and Al - Kindy). Biochemical tests were showed (20 %) from bacterial isolates were belonged for genus Proteus (37) isolates replied to Proteus mirabilis with (18.5 %) and (3) isolates were for Proteus vulgaris. Ten isolates from Proteus mirabilis were producing for IgA protease while P.vulgaris isolates were non - producing for this enzyme. Proteus mirabilis (Pm5 ) was selected among isolates efficient producing isolate(Pm5). 2 - Purification and characterization of the enzyme : Cysteine lactose electrolyte deficient medium was selected as the best medium for culturing for production the enzyme by P. mirabilis. Bacterial isolate (Pm5) to produce protease, then protease was purified by application Ammonium sulfate with (60 %) saturated, dialysis, Sephadex G - 100 filtration, and Ion exchange with DEAE. Cellulose. The enzymatic activity and protein concentration were measured in every stage of purification. Four peaks were appeared one of them belong to IgA - protease activity, while by using Ionic exchange method was appeared only one peak. Enzymatic activity, protein concentration, specific activity, total activity, no. of purification, and enzymatic yield were determined in Ionic exchange technique were : ( 28.7) U/ml,(0.15)mg/ml,(191.3)U/ml,(258.3),(5.5),(9.9%) respectively, molecular weight of the enzyme was performed by using gel filtration was (50)Kd. The optimum activity was at pH (8), the optimum temperature with the enzymatic activity was at (37) ˚C, the suitable temperature for storage with enzymatic activity was at (4) ˚C, the (Ca+2) Ion has on effect on increasing the enzymatic activity, while the EDTA was suppressed activity. 3 - Immunological study : Three groups of rabbits were used for immunization (two rabbits for each group in addition to control were injected intramuscular by different enzyme concentrations (0.2, 0.5, 1) mg/ml. Two methods (Ouchterlony and tube precipitation are used for checking up specific protease antibody in rabbit serum. Results showed no precipitin line between enzyme as antigen and serum in (Ouchterlony) while there was clear ring of precipitin was formed in the second method. Rabbit immunoglobulines were separated by using DEAE - Cellulose results showed three peaks protein at (280) nm wave length absorbency, enzyme activity of each peak was tested. In comparing these peaks with standard rabbit immunoglobulines. The third peak was tested against IgA - protease by using tube precipitation test result showed precipitation ring. This result indicated that this peak may include IgG subclasses which are resist protease activity while other peaks were opsonized by the enzyme. The effects of the IgA protease concentration (0.2, 0.5,1) mg/ml on immune cells were studied according the following parameters : the effect of the enzyme on immune and (PMNs) cells, T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice, (0.2) mg/ml of the enzyme has an effect on induction activity of T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice. 4 - Histological aspect : Different pathological changes were shown on rabbit’s tissues (liver, lung, kidney and spleen) which were immunized with IgA protease (0.2)mg/ml. In liver great hydropic degeneration was noticed in the cytoplasm in addition to present an with congestion of central venule, inflammatory cells in the alveolar walls and alveolar cavity atrophy in lung, enlargement of Bouman s capsule with infiltration of phagocytes around glomerulus was shown in kidney, while in spleen T cells around central arteriole as well as B cells in other white pulp were increased as a result of proliferation .

تاثـيــر فعالية الانتيروسين المنتج من بكتريا faecium Enterococcus على بعض البكتريا المرضية المعزولة من مصادر مختلفة == Activity effect of enterocin produced from Enterococcus faecium on some pathogenic bacteria isolated from different sources

Author name: حسام سامي عويد الشمري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـتـناول هــذه الـــدراســة تاثـيـر الانتيـروســـين المنتــج بــواســطــة بكــتــريا E.faecium ضـــد بــعــض البكتــريا الــمـمـرضــة المـتـواجـــدة بكثرة في الحـليب ومشتقاته. فقد تم لهذا الغـرض جمع 382عينة من اطفال يعانون حالات اسهال والتهاب السبيل البولي والحليب الخام لعـزل بكتريا E.faecium وتم تشخيص العزلات بالفحوصات الكيموحيوية وتاكيد تشخيصها باستعمال منظومة فايتك 2 . فضلا عن ذلك فقـد تم جمع 50 عينة لعـزل بكتريا Listeria monocytogenes و66 عينة لعزل بكتريا Salmonella typhimurium من الحليب الخام ومشتقاته وتم تشخيصهما باتباع الفحوصات الكيموحيوية وتاكيد التشخيص باستعمال Api Listeria وApi - 20Eاضافة الى التنميط المصلي لبكتريا Salmonella typhimurium . تم تقصي انتاج الانتيروسين المنتج بواسطةE. faecium باستعمال طريقتي اقراص الاكار والانتشار في الحفر , ونقي الانتيروسين باستعمال الترسيب بسلفات الامونيوم والفصل بكحول البيوتانول , كما تم الكشف عن حساسية البكتريوسين المنتج لمجموعة واسعة من الانزيمات الحالة للبروتين والدهون وبعض الانزيمات الاخرى .فضلا عن ذلك فقد تمت دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني على البكتريوسين المنتج , وتم اختبار تراكيز مختلفة من المايتومايسين - سي لحث الانتيروسين .اختبرت الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات بكتريا اللستيريا والسالمونيلا والمكورات المعوية باستخدام طريقة كيربي - باور .يمكن تلخيص النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : كانت نسبة عـزل E. faecium 7.59)%) من مجموع 382 عينة , اما نسبـة عـزل Listeria monocytogenes 10)%) من مجموع 50 عينة , اما نـسبـة عـزل Salmonella typhimurium فقد كانت .06)6%) من مجموع 66 عينة . اظهـر الانتيروســين المنتـج بواســطة E. faecium طـيفا واسعا من التاثير ضـد البكتريا الاختبار المـوجبة والسالبة لصبغـة غــرام التي عددها 8 وبضمـنها Listeria monocytogenes وSalmonella typhimurium . اظهر الحث بالمايتومايسين - سي )بتركيزي 1.5 و2 مكغم/ مل( انتاجا عاليا للانتيروسين . ادت تنقية الانتيروسين جزئيا باستعمال الترسيب بنسبة 80 % الى اعطاء اعلى نتيجة عندما بلغت 2.225 وحدة / مكغم بروتين , اما الفصل بكحـول البيوتانول فقد اعطى محصولا وصــل الى 0.57 وحدة / مكغم بروتين . ادت معاملة الانتيروسين بالانزيمات وتلك الحالة للبروتين حساسية الانتيروسين تجاه هذه الانزيمات باستثناء انزيمات Lipase وCatalase وα - amylaseو Lysozyme . اظهـرت تجارب المعاملة بالحرارة مقاومة الانتيروسين للحرارة وحتى عند121ºC لمدة 20 دقيقة , في حين كان مدى الاس الهيدروجيني له 4 - 9 .اظهرت تجارب الحساسية للمضادات الحيوية ان Enterococcus faecium كانت حساسة الى 7 مضادات حيوية . وكانت بكتريا Listeria monocytogenes مقاومة الى 9 مضادات حيوية وبكتريا Salmonella typhimurium مقاومة الى 4 مضادات حيوية .امكن الحصول على النتائج وكما يلي : انتجت عزلات Enterococcus faecium الانتيروسين بكميات واطئه فيما امكن حثه باستعمال المادة الحاثة المايتومايسين - سي , وامكن تنقيتها جزئيا باستعمال مرسبات البروتين . اتصف الانتيروسين المنتج من هذه البكتريا بطيف واسع النطاق من التاثير ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام ولاسيما تلك التي تلوث الحليب ومشتقاته . | This study investigate the effect of bacteriocin by Enterococcus faecium against some pathogenic bacteria frequently found in milk and dairy product. Three hundred eighty two sample collected from patients and raw milk were used for isolation of E.faecium the isolates were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Vitek 2 system . In addition Listeria monocytogenes , Salmonella typhimurium were isolated from milk and dairy products these were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Api Listeria and Api - 20E system in addition to serotyping to bacteria Salmonella typhimurium . Enterocin produced by E.faecium detected using tow methods Cup agar and Well diffusion and partially - purified using ammonium sulfate precipitation and n - butanol partition , the sensitivity of the material was tested against diverse group of proteolytic , lipolytic and some other enzymes. In addition the effect of temperature as well as pH an the bacteriocin were tested . and used different concentration of Mitomycin - C to induce enterocin . Antibiotic sensitivity of Listeria and Salmonella and Enterococcus isolates were tested using Kirby - Bauer method. The results showed the followings : The isolation rate of E . faecium was (7.59%) from 382 sample , L. monocytogenes isolation rate approach (10%) from 50 sample , S.typhimurium isolation rate reached (6.06%) from 66 sample .Enterocin produce by E . faecium demonstrated a broad - spectrum effect against both gram positive and gram negative bacteria including Listeria monocytogenes and Salmonella typhimurium . Mitomycin - C induction was used to induce a high level production of Enterocin the concentration of optimum inducing agent was 1.5 - 2 mg /ml. The enterocin was partially purified eighty percent of Ammonium sulfate give the highest yield reaching 2.225 Unit /mg protein , n - butanol partition yield 0.57 Unit/mg protein. Enzymatic effect on enterocin demonstrated that proteolytic enzymes completely inactivated the bacteriocin , other enzymes including Lipases Catalase demonstrated no effect. α - amylase , Lysozyme ,The Enterocin was heat - resistance at even 121º C for 20 minute , the optimum pH was shown to be 4 - 9 .Enterococcus faecium was highly sensitive to 7 antibiotic used .and Listeria monocytogenes was highly resistance to 9 antibiotic and Salmonella typhimurium was resistance to 4 antibiotic . In results E . faecium produce enterocin at low level which was induced to high level yield using Mitomycin - C , the enterocin could be partially purified using precipitators protein, That enterocin product of this bacteria characterized a broad spectrum against positive and negative gram bacteria including contaminate milk and its products

تقييم العلاج التصليبي للكيس الكلوي البسيط == Diagnosis and Sclerotherapy evaluation of Simple renal cyst

Author name: جميلة عيسى كاظم الموسوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | يعرب ادريس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اعتمدت معالجة الكــيس الكلـــوي البسـيـط (Simple renal cyst) سابقا على اجراء العمليات الجراحية لازالة الكيس واستخدام قثطرة البولي اثيلين (Polyethylene Catheter) في اجراء عملية الارتشاف البسيط (Simple aspiration) فقط او مع تشريب العلاج الصليبي عن طريق الجلد (Percutaneous sclerotherapeutic instillation ) .اما دراستنا والتي استغرقت عاما واحدا ابتداء من ايلول 2001 ولغاية ايلول 2002 بواقع (31) مريضا يعانون من مرض الكيس الكلوي البسيط الذي شخص لديهم اشعاعيا وسريريا, فقد اعتمدت على اختراق الكيس عن طريق الجلد باستخدام الرشف بالابرة الدقيقة(FNA) (Fine needle aspiration ) وتحت سيطرة جهاز التصوير فوق الصوتي(U/S)(Ultrasonography) في علاج هذا النوع من الاكياس باجراء عملية الارتشاف مع تشريب نوعين من العوامل التصليبية (Sclerosing agent ) اذ استخدمنا عقار التتراسايكلين بشكل اساسي ولاول مرة وفي حالتين فقط استخدمنا الكحول الاثيلي ).95%( وتلى ذلك متابعة المرضى وبشكل منتظم بعد العلاج مدة تراوحت بين الشهر الى ثلاثة اشهر .وكذلك اجريت اختبارات تفريقية للسائل المرتشف تضمنت اختبارات بايوكيميائية وخلوية للتوصل الى افضل طريقة لتشخيص انواع الاصابات التكيسية والتي شملت (الاكياس البسيطة والالتهابية والنزفية والسرطانية). واخيرا تم التوصل الى النتائج التالية اذ ظهر ان اجمالي دقة التشخيص المستخدم في هذه الدراسة كان بنسبة(100%) وقد وصلت النسبة المئوية للاستجابة السريعة للعلاج (67.7%) اما النسبة المئوية لعودة الكيس الى الظهور فلم تتجاوز (6.4%). هذا ومن الجدير بالذكر ان في هذه الدراسة لم تحصل اية مضاعفات غير محسوبة. | Traditinally the mangment of simple renal cyst has been based on the proceeding of surgical operations or by using the polyethelen catheter for simple aspiration and/lor with percataneous sclero / therapeutic instillation.Our study which was over one year period, starting from sept. 2001 to sept. 2002, (32) patients with clinical - radiological diagnosis of simple renal cyst underwent percutaneous fine needle aspiration of the kidney underultra sonic guidance and further manged using two type of sclerotherapeutic agents (like tetracycline Amp. which used mainly in most of our cases, and ethylalcohol (95%) which used only two cases) post sclerotherapy eutic in aperiod between (1 - 3) months post aspiration close regular follow up of all patient, for aperiod from (1 - 3) months post aspiration.Full physical, biochemical & cytological laboratory evaluation of the aspiration fluid has been done in all cases to diagnostic, simple, complicated, neoplastic cysts.Finally the overall aecuracy of the diagnostic procedur was (100%) and the percantage of dromatic respons to treatment was (67.7%) while the recurred percentages no more than (6.4%). So in this study no complication was encountered.
1 ... 29 30 31 32 33 ... 55