عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 514

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

اسم المؤلف: لمى يوسف مهدي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

انتشار ودراسة التضاد لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من فتحتي المنخرمن طلاب المدارس في محافظة ميسان == Prevalence and Study the Antagonism of Staphylococcus aureus Isolated from Nares of School Children s in Maysan Governorate

اسم المؤلف: فاطمة يوسف موسى المحمداوي
اسم المشرف: امال عباس محمد الفخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الدراسة الحالية تضمنت جمع 500 مسحة جمعت من انوف طلاب المدارس الابتدائية في محافظة ميسان للفترة ( من تشرين الاول لسنة 2014 الى ايار لسنة2015 للفئة للعمرية 6 - س11 سنة ) للتحري عن حاملي المكورات العنقودية الذهبية اخذت العينات من 8 مدارس ابتدائية (4 مدارس من المناطق الريفية و4 مدارس من المناطق الحضرية). شملت العينات الماخوذة 230 عينة من الذكور و270 عينة من الاناث . وكذلك تم التحري عن البكتريا والاعفان التي قد تكون موجودة في الانف والتي قد تقلل من نسبة تواجد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية في الانف. وقد استخدمت الطرق المختبرية القياسية في تشخيص هذه البكتريا وتم التاكيد باستخدام نظام API 20 .Vitick 2Compact system, وقد اظهرت النتائج ان 140 (28%) عزلة من العينات المدروسة ( 5841.43%)) عزلة اناث و82 ) (58.57عزلة ذكور) هي من النوع المكورات العنقودية الذهبية الموجبة لانزيم التجلط Coagulase Positive Staphylococcus aureus (CoPS).ولمعرفة ما اذا كانت الظروف المعيشية(الريف والمدينة) تؤثر على معدل حمل S.aureus في مناطق الريف والمدينة في محافظة ميسان تم استخدام اختبار مربع كاي حيث عكست نتائج التحليل ان هناك فروق معنوية جدا وصلت الى X2 = 34.747 تحت احتمالية (P ≤ 0.01) بين حاملين ال S.aureus ضمن مناطق الريف والمدينة مما يعكس ان الظروف المعيشة مرتبطة بنسبة حمل هذه البكتريا.كما كانت نسبة الانواع البكترية الموجبة لصبغة غرام الاخرى هي : Staphylococcus epidermidis 226 (45.2 %) Streptococcus spp 176 (35%), Staphylococcus saprophyticus 9(1.8), Aerococcus viridians 4 (0.8)% , Staphylococcus haemolyticus 2(0.4). هذا وقد خضعت العينات الموجبة لانزيم التجلط الى اختبار الحساسية الدوائية بواسطة طريقة الانتشار بالاقراص وقد استعمل 18مضاد حيوي حسب المعاييرالمختبرية العالمية لعام 2012 حيث كانت نتائج الحساسية الدوائية كالاتي : (Methicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%),Amoxyllcin(63.5%), Cefixime (61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28%), Erythromycin(30%),Azithromycin (28.57%),Ciprofloxacin (17.85%) .Clarthromycin (12.17%), Tobramycin (9.28%) , Doxycyclin (7.10%), Vancomycin (5%), Amikacin (2.85%) ,Gentamicin (1.42%), Clindamycin (1.42 %), Levoflaxacin (0.0%), وقد اظهرت النتائج ان المضاد الحيوي Levoflaxacin هوالمضاد الاكثر فعالية بين المضادات المستخدمة فقد وصلت حساسية جميع العزلات الى( 100 %) بينما اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة عالية لمضادات Beta - lactams . اجري الاختبارالتركيز المثبط الادنى Minimum Inhibitory Concentration (MIC) للعينات المعزولة بواسطة نظام الVitek 2 . بينت النتائج ان 8 ( 5.7%) عزلة هي من النوع الكورارات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin resist Staphylococcus aureus MRSA) ) حيث قاومت التركيز 0.5mg للمضادالحيوي Oxacillin . بالاظافة الى ذلك دلت نتائج فحص الحساسية بواسطة الفايتك احتواء هذه العينات المقاومة على البروتين المرتبط بالنسلين المحور 2 PBP واحتوائها على جين ال mecA . تناولت الدراسة ايضا عزل الاعفان الموجودة في الانف حيث تم دراسة 50مسحة وتم الحصول على الانواع الفطرية التالية ( Pencillium Spp, A niger. . A. terrus , Cladosporium Spp, Alternia Spp)) .كما وتم دراسة الفعل الثبيطي لرواشح هذه الاعفان على بكترياS. aureus اوضحت النتائج ان عفن ال Alternaria له القابيلة على تثبيط نمو بكتريا الS. aureus حيث بلغ معدل قطر التثبيط ( 24.67) ملم على التوالي , بالاظافة الى ذلك درس التاثير الثبيطي للبكتريا المتواجدة كنبيت طبيعي في الانف على بكتريا S.aureus حيث اختيرت بكتريا المكورات العنقودية البشرويةS.epidermidis حيث استخدمت طريقة الانتشار بواسطة الحفر well diffusion method لمعرفة تاثير الخلية البكتريا الكاملة وكراشح لهذه البكتريا ضد S.aureus لوحظ ان بكتريا S. epidermdis لم تبدي اي تاثير تثبيطي اتجاه الS.aureus سواء كخلية بكترية كاملة او كراشح لهذه البكتريا. بينما الكشف عن تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا S.aureus بواسطة epidermdis . S بواسطة استخدام جهاز Spectrophotometer اظهرت النتائج ان الامتصاصية بطول موجي 630 نانومتر فقد لوحظ انخفاض الامتصاصية من 0,022 لعالق بكتريا ال S.aureus مع سكر الكلوكوز بتركيز %0,25 المحضون لمدة 73 ساعة بدرجةحرارة 37 سيليزية الى 0,009 عند اظافة البكتريا المضادة S. epidermdis لعالق ال S aureus مع الكلوكو | The current study includes comprises 500 Nasal swab collected from the primary school students in the Maysan Governanat to investigate Staphylococcus aureus carriers for the period from (October to May 2014 - 2015 in the age group 6 - 11 years).The samples were taken from eight primary schools (4 schools from rural areas and 4 schools in urban areas),The samples taken include 230 sample from males and 270 sample from females, also to investigate for bacteria and fungi that may be present in the nose, which may reduce the percentage of the presence of the bacteria Staphylococcus aureus in the nose. The standard laboratory methods were used in the diagnosis of these bacteria and confirmed diagnosis using the API 20 system and the Viteck - 2 Compact System. The results showed that 140 (28%) isolates of the studied samples (58 isolated from females and 82 isolated from males) were Coagulase Positive Staphylococci(CoPS).To know whether that the living conditions (live in rural and urban districts) effect the rate of S. aureus carriers statistical analyses using chi square test for carriers in urban and rural districts revealed highly significant difference X2=34.747 (P≤0.01)which indicated that the living conditions and the rate of carriers are related.The proportion another gram positive bacteria were Staphylococcus epidermidis226(45.2%),Streptococcus spp176(35%),Staphylococcus saprophyticus 9(1.8%) Aerococcus viridians 4(0.8%) and Staphylococcus haemolyticus2(0.4).CoPS isolated were submitted to sensitivity test by kirpy - Bauer Disk diffusion method according to CLSI, 2012,18antibiotic has been used and the resistance rates ethicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%)Amoxycllin(63.5%),Cefixime(61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28),Erythromycin(30%),Azithromycin(28.57%),Ciprofloxacin(17.85%)Tobramycin (9.28%),Doxycyclin(7.10%),Vancomycin(5%)Amikacin(2.85%),Gentamicin 1.42%, Clindamycin (1.42 %), and Levoflaxacin (0.0%).The results showed that the antibiotic Levoflaxacin was the most effective antibiotic among them all isolates were a sensitive and reached to (100%) while most the isolates showed high resistance to Beta - lactame antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) was used by Vitek 2 system showed that 8 isolates of (5.7%) samples were Methecillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA)were they resisted to the minimum inhibitory concentration 0.5 for the antibiotic Oxacillin as well as the results of the examination sensitivity shown by Vitek 2 - System.These resistance isolates associated contain pencillin binding protein 2 PBP and contain the mecA gene.The study also included the isolation of Fungi from the nose, were the study showed 50 swabs got the following types (Pencillium spp, Aspergillus . niger, Aspergillus . terrus, Cladosporium spp, Alternaria spp).The inhibitory effect of the filtrates of these Fungi against S. aureus was studied, were results showed that the mold Alternaria spp only has the ability to inhibit the growth of S. aureus where average of inhibition zone reach to(24.67) mm in addition the present study include the control of S.aureus by the other bacteria which considered normal flora in the nose, Staphylococcus epidermidis selected for this purpose.Well diffusion method was used as Whole bacteria and filtrate for this purpose and results show that there are no inhibitory effect of S.epidermidis on S.aureus by this method. While biofilm formation of S.aureus was inhibited by S. epidermidis by detected using Spectrophotometer (360nm) results of the absorbency was decrease from 0.022 for suspension of S.aureus with glucose 0.25% incubated for 73 hour at 37 °C to 0.009 for suspension of antagonistic bacteria S. epidermidis added to the suspension of S. aureus and glucose 0.25% under the same condition and this indicate that the biofilm was inhibited by S.epidermidis

دراسة الميكروبية والتداخل البكتيري للفطريات المصاحبة لالتهابات الانف والاذن لمرضى السكري وابيضاض الدم == Microbial Study and Bacterial Interaction with Mycosis Associated with Nose and Ear Inflammatory of Diabetes and Leukemia Patients

اسم المؤلف: علیاء فخري خلف البیاتي
اسم المشرف: امال عباس محمد الفخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and ten clinical samples were collected from hospitalized patients in hematology - oncology department in Baghdad Teaching Hospital and Al - Kindy Teaching Hospital, during the period from November 2014 to June 2015.The samples included 48 female and 62 male patients who are suffering from diabetes mellitus (DM) and leukemia. The ages of patients ranged between 13 - 82 years. The swab samples taken from the nose and ear of patients were (67 with diabetes mellitus and 43 with leukemia). The results of fungal culturing revealed that 50 samples of DM patients (74.63%) and 31 samples of leukemia (72.09%) were diagnosed as positive ones.From the collected clinical samples that gave positive results; it was found that Candida spp. was the most common fungi isolated from ear swabs (50%) followed by Aspergillus spp. (42.86%) and Penicillum spp. (7.14%).The results of fungal (molds) species isolated from the nose of DM patients revealed highly significant differences between fungal rates, Aspergillus spp. were isolated with highest levels (48.15%), followed by Penicillum spp. (37.04%); however, Rhizopus spp. was isolated with low levels (14.81%). On the other hand, it was found that Candida spp. and Rhodotorula spp. were the most yeasts isolated from the nose of DM patients. They were isolated with rates as (45.83%) and (41.67%) respectively. Nevertheless, the genus Cryptococcus spp. was isolated with low levels (12.50%). The results also revealed that males were more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungal are more prevalent in ages over fifty and ages between thirty one and fifty years compared with younger ages between ten and thirty years old. From the collected clinical samples of leukemia patients, highly significant differences were found between the rates of fungal infection. The level of Aspergillus spp. was (90.91%) and Rhizopus spp. (9.09%), while the levels of yeasts were (88.24%) and (11.76%) for Cryptococcus spp. and Candida spp. respectively.The frequent species of Aspergillus identified included A. niger (37.78%), followed by A. flavus (35.56%), A. fumigatus (17.77%) and A. terreus with lowest levels (8.89%). The results also revealed that males are more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungi are more prevalent in ages 31 - 50, followed by younger ages (10 - 30) compared to old ages, over fifty years old.All fungal isolates were identified according to macroscopic and microscopic characteristics in addition to biochemical tests for yeast identification. Vitek 2 system is another confirmatory test which was carried out for further characterization for the yeast species. The results of Vitek 2 system revealed that Candida spp. were isolated with the highest level (41.67%), followed by Cryptococcus spp. (37.5%) however, Rhodotorula spp. was isolated with a low level (20.83%). A confirmatory test for the selected isolates of A. fumigatus using polymerase chain reaction (PCR) analysis technique was also conducted. This test has been done by using primers specific for hemolysin gene (aspHS). The results of the molecular method were closely related to those obtained from cultural methods with exception of one isolate which was positive by PCR method nevertheless, it was negative by culture method. The results of PCR analysis technique, revealed that 6 isolates out of total 8 (75%) were positive for the presence of aspHS gene compared to culture methods which showed 5 isolates out of total 8 (62.5%) had the ability to induce hemolysis when grown on blood agar .The inhibitory effect of Bacillus subtilis against Aspergillus spp. was also conducted, the results indicated that B. subtilis isolate has antimicrobial activity against Aspergillus spp; the diameter of inhibition fungal growth were 39.3 ± 01.5, 48.6 ± 02.2, 40.5 ± 02.8 and 43.5 ± 01.7 mm for A. fumigates, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with the diameter of controls which were 80.0 ± 05.3, 78.0 ± 03.9, 43.5 ± 01.7 and 72. ± 02.6 mm respectively. The radial inhibition growth of Aspergillus spp. treated with B. subtilis were 51%, 38%, 47% and 44% for A. fumigatus, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with treatment of control.

تلازم بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض الذبحة الصدرية غير المستقرة

اسم المؤلف: علي مرتضى حسن
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمت دراسة 150 انموذجا لمرضى الذبحة الصدرية Unstable angina و100 انموذج للاصحاء ظاهريا والمضاهين الجنس والاعمار مع المرضى , واهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم ABO وLewis ومجموعة الدم MNS , فقد سجلت النتائج ان تردد المجموعة B كان 33.3% في المرضى, و29% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, اما تردد المجموعة A فلم يعط فرقا بين المرضى والاصحاء, في حين قل تردد المجموعة O في المرضى عنه في الاصحاء, فقد بلغ في المرضى24.7% , و31% في الاصحاء وكان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05, في حين كان تردد مجموعة الدم AB في المرضى 12.0 % وفي الاصحاء بلغ 10% ايضا كان التحليل الاحصائي معنوي ((P< 0.05 .لقد برز دور المجموعة (Le (a‾ b‾ في القابلية للمرض Susceptibility , وقد سجل هذا النمط ترددا بلغ 30.7% في المرضى و18% في الاصحاء, وكان التحليل الاحصائي مشيرا الى معنوية هذا الفرق (P< 0.05), اما المجموعة Le(a+ b - ) فقد سجلت ترددا بلغ في المرضى 15.5% وفي الاصحاء 26% والمجموعة Le(a - b+) كان ترددها 55% في المرضى و18% في الاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.ان مجموعة الدم MNS اعطت مؤشرا الى دورها في المرض وخصوصا دور المجموعة NN اذ بلغ ترددها 19.2% للمرضى مقارنة بتردد 11% للاصحاء وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية ((P< 0.05.وقد درست الاستجابة المناعية للانماط الدموية التي تحت الدراسة وبينت النتائج ان هنالك ارتباطا بين بعض المجاميع وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر في مصول المرضى مقارنة بالاصحاء.كان النمطان A وB اكثر الانماط اظهارا للعياريات فقد بلغت 43.6 ± 46.6 و61.9 ± 148.9 للمرضى على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 5.6± 5.4 و15.3 ±25.7 للاصحاء وكانت هذه الفروقات ذات اهمية معنوية ((P< 0.05.اقترن ارتفاع عيارية الاضداد الضادة لكريات دم البقر بالمجموعة Le(a - b - ) فقد بلغت العيارية في المرضى 59.5± 67.2 و6.2 ± 5.8 في الاصحاء P<0.01) ). اما عيارية النمط Le(a+ b - ) فقد بلغت 57.6 ± 75.9 في المرضى و7.7± 7.7 في الاصحاء (P< 0.01) في حين كانت العيارية للنمط Le(a - b+) 43.7 ± 117.9 للمرضى, و108.3 ± 559.7 للاصحاء.درس دور مورث الافراز وعلاقته بالاستجابة المناعية فقد سجل المرضى الفارزين عيارية 72.6 ± 77.02 مقارنة بغير الفارزين المسجلين لعيارية بلغت 54.3 ± 63.5 (P< 0.01) في حين كان الاصحاء الفارزين ذوي عياريه 6.0 ± 7.02 مقارنة بغير الفارزين اذ بلغت 6.4 ±5.3 (P< 0.01) .اما العيارية المرتفعة للنمط NN والبالغة 38.4 ± 47.02 فقد اختلفت عن مثيلتها في الاصحاء 8.7 ± 9.4 (P<0.01).كانت الانماط AB وB اكثر خطورة نسبية للمرض, فقد بلغت خطورتها النسبية 1.2 و1.1 على التوالي .وقد نوقشت النتائج في ضوء المعلومات العلمية المتوافرة للموضوع. | A total of 150 unstable angina patients and 100 age and gender comparable healthy controls were investigated. The study dealt with finding the frequency distribution of ABO, Lewis and MNS blood groups .The findings indicated that there was an increase in the frequency of B blood groups (patients 33.3% versus 29% in control, P<0.05). On the other hand however, A gave no significant difference in the patients compared to control. O blood group frequency gave a decreased frequency in patients compared to controls,(24.7% in patients vs. 31% in healthy controls , P<0.05).A noticeable increase in the frequency of Le(a - b - ) was seen in patients (30.7% in patients vs. 18% in controls, P<0.05), However, Le(a - b+) demonstrated a relatively decreased frequency in patients compared to controls, While Le(a+b - ) showed no differences in frequency.In MNS blood groups, NN frequency gave a statistically significant difference ,with a frequency of 19.2% in patients vs 11% in healthy controls.The immunological status in patients and controls was studied, based on a newly developed quantitative criterion (Anti - bovine antibody titers among patients and controls). It was seen that A and B blood groups were among the ones that gave an increased anti - bovine antibody titers giving a mean titers of (43.6 ± 46.6 and 61.9 ± 148.9) in patients vs. (5.6 ± 5.4 and 15.3 ± 25.7) in healthy controls respectively.The increased anti - bovine antibody titers were associated with Le(a - b - ) blood group, That was (59.5 ± 67.2) in patients vs. (6.2 ± 5.8) in healthy control, (P< 0.01).On the other hand however, anti - bovine antibody titers in Le(a+b - ) was (57.6 ± 75.9) in patients vs. (7.7 ± 7.7) in healthy controls, (P< 0,01), While Le(a - b+) gave an opposite titer of (43.7 ± 117.9) in patients vs (108.3 ± 559.7) in healthy control,(P<0.01).The role of secretory gene in the anti - bovine antibody titers distribution was studied among patients . Secretors gave a mean titer of (72.6 ± 77.02) compared to (54.3 ± 63.5) in non secretors.The healthy secretors gave a mean titer of (6.0 ± 7.02) compared to a mean titer of (6.4 ± 5.3) in healthy controls, (P <0.01).NN blood groups gave an anti - bovine antibody mean titer of (38.4 ± 47.02)in patients in respect to a mean titer of (8.7 ± 9.4)in healthy controls, (P <0.01).A relatively high risk was demonstrated among some blood groups.The novel results were discussed based on gathered available immunological data in the subject of atherosclerosis and unstable angina .

دراسة جزيئية لعدد من عوامل الالتصاق البكتيرية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من عينات الادرار من الاطفال دون الخامسة == Molecular study of a number of bacterial adhesion of the bacteria Escherichia coli isolated of urine samples of children under five

اسم المؤلف: علـي فاضل احمد
اسم المشرف: الهام سعيد عبد الكريم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة عزل بكتريا Escherichia coli من عينات سريرية لاطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية ، وقد تم الحصول على ( 72 ) عزلة من بكتريا E. coliمن اطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية الذين اعمارهم دون ( 5 ) سنوات ومن كلا الجنسين من مستشفى ( ابن البلدي للاطفال ، والامامين الكاظمين ( ع ) التعليمي ومستشفى العلوية للاطفال ) وللمدة من 1/11/2014 لغاية 28 / 2 / 2015 . اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات المجهرية والزرعية والفحوصات الكيموحيوية والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات بوساطة استعمال الفحص بنظام ( API 20 E ) . بينت نتائج الدراسة ان نسبة اخماج المسالك البولية في الاناث هي ( 54.2 % ) 39 عزلة ، وفي الذكور ( 45.8%) 33 عزلة.واختبرت حساسية جميع العزلات للمضادات الحيوية وفق طريقة ( Kerby Bauer ) اذ اظهرت جميع العزلات مقاومة 100% لمضادي Ampicillinو Ceftazidime في حين، كانت نسب المقاومة للمضاد Trimethoprim ،Amikacin ، Aztreoname، Tobramycin، gentamycin ، Pipracillin83.3 % ،81.9% ، 72.22% ، 70.8% ، 68.5% ، 65.5 على التوالي ، وكانت نسبة الحساسية 100% لمضادي ، Impenem ، Meropenem .اظهرت عزلات بكتريا E. coli قابليتها على التعبير عن عامل الضراوة الهيمولايسين (نوع بيتا β) اذ كانت 59.7% من العزلات منتجة لهذا العامل . اظهرت عزلات بكتريا E. coli احتواءها على نوعي عاملي الالتصاق CFA/I ، CFA/III اذ كانا بنسبة ( 91.6% ) و( 62.5%) على التوالي ، واظهرت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان ( 100%) ، كما اظهرت جميع العزلات قدرتها على انتاج الغشاء الحياتيBiofilm وبنسبة ( 100%) .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق Fim وPap Gباستخلاص الـ DNA البكتيري بوساطة ( Geneaid Kit ) ومن ثم اخضاع الـ DNA لاختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي ( PCR) . استعملت طريقة تفاعل البوليمر لسلسة الدنا PCR للكشف عن نوعين من عوامل الضراوة الجينية التي تمتلكها بكتريا الـ E.coli بوصفها المسبب الاكثر اهمية لالتهابات المسالك البولية وباستعمال بادئات متخصصة لكل جين ، اذ اظهرت النتائج وجود جين Fim (H) بنسبة 100% ، في حين كان وجود pap G ( I) بنسبة 19.4% ، وكان pap ( III) بنسبة 38.8% في حين كانت نتائج الفحص سالبة للجين pap G (II) . | The Present study included 72 Isolates of Escherichia coli from clinical sample were taken from children with urinary tract infection, whom they were under the age of five year , male and female, taken from ( Ibn Al - balady Hospital for Children), ( Al - Imamayn Al - Khademayn Teaching Hospital) and (Al - A’lwayya Hospital for Children), in the period from 1/11/2014 to 28/2/2015. The bacterial diagnosis depended on microscopic and Cultural specifications, Using the biochemical examinations and the final exact examination of the isolated bacteria by using (ApI 20E) examination system. The study results showed that the infection in the urinary tract of females were 54.2% of 39 isolated bacteria and that of males were 45.8% of 33 isolated bacteria.The Antibiotic susceptibility of .isolated bacteriad one according to Kirby Bauer testing , showed a high degree of , resistance100% to the ceftazidime and ampicillin , while resistance to trimethoprim, amikacin, aztreoname, tobramycin , gentamycin and Pipracillin were 83.3,81.9%, 72.22%,70.8% , 68.5%,65.5respectively.All isolates showed susceptibility 0% to the impenem and meropenem antibiotics .The result of virulence factors of E.coli isolates show indicate the ability 59.7% of isolates produce hemolysin .The isolated bacteria of E.coli showed containing two types of adherence factors CFA/I and CFA/III, and the two ratios were 91.6% and 62.5% respectively. All the isolated bacteria showed that the ability of adherence to epithelial cells of the urinary tract was 100%.All the isolated bacteria showed that the ability to produced Biofilm were 100%.The molecular examination of the genes for adherence factors was made by taking out the bacterial DNA by (Geneaid Kit) and then, the DNA was put to the test of polymerase chain reaction (PCR). Polymerase chain reaction (PCR) was used to find out two types of adhesion factors, Fim (H)and Pap G genes, as they were the cause of the most common urinary tract infections by using specialist primers for each gene. The results showed the existence of Fim (H) gene was 100%,while were Pap G(I) gene 19.4%, Pap(III) gene38.8%, and the results of the test of Pap G(II) gene were negative to all isolates .

دراسة بكتيريولوجية وجزيئية للنوع Proteus mirabilis المعزولة من مصادر سريرية وحيوانية == Bacteriological and molecular study of Proteus mirabilis isolated from clinical and animal sources

اسم المؤلف: علي سعد كاظم حسين
اسم المشرف: محمود ابراهيم اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الجانب الاول : شمل هذا الجانب عزل وتشخيص البكتيريا Proteus mirabilis من 801 عينة تضمنت 179 عينة سريرية مختلفة (البول، الاذن والجروح) و622 عينة حيوانية مختلفة (براز الدجاج، مستقيم الابقار، مستقيم القطط ومستقيم الكلاب) جمعت من محافظة بغداد للمدة من 26/10/2015 الى 29/3/2016. بعدها درست الحساسية للمضادات الحيوية وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : .1 88 عزلة بكتيرية تعود للنوع P. mirabilis تضمنت 51 (28.49%) عزلة من العينات السريرية و37 (5.95%) عزلة من العينات الحيوانية وشخصت باستعمال طرق التشخيص التقليدية وعدة الفايتك كما تم تاكيد تشخيصها باستخدام البادئ النوعي للجين 16SrRNA للكشف عنه في جينوم البكتيريا بتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل اذ اظهرت نتائج التشخيص الجزيئي ان جميع العزلات البكتيرية امتلكت الجين .16SrRNA 2. بينت نتائج فحص حساسية عزلات P. mirabilis (88 عزلة) للمضادات الحيوية بطريقة انتشار القرص انها امتلكت المقاومة المتعدة لـ )2 - 8( من المضادات الحيوية المختبرة. كما وجد ان اقل معدل مقاومة لعزلات P. mirabilis السريرية كان لمضادات ciprofloxacin (3.9%) وnorfloxacin (7.8%) وimipenem (9.8%) بينما اقل معدل مقاومة للعزلات الحيوانية كان لمضادات cefoxitin (0%) وamikacin (2.7%) وciprofloxacin (5.4%) وcefepime وimipenem وlevofloxacin (8.1%) لكل منها. الجانب الثاني : شمل الكشف عن بعض عوامل الضراوة ظاهريا والكشف الجزيئي عن ثلاثة جينات مرتبطة بعوامل الضراوة وقد توصلت نتائج هذا الجانب الى ما ياتي : 1. بينت نتائج فحص انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف لبكتيريا P. mirabilis بطريقة القرص التازري المزدوج ان 52.49% (27/51) و48.65% (18/37) من العزلات السريرية والعزلات الحيوانية على الترتيب كانت موجبة للفحص.2. بينت نتائج فحص الفعالية الانحلالية للهيمولايسين لعزلات P. mirabilis على اطباق اكار دم الانسان واطباق المعايرة الدقيقة لدم الانسان والارنب ان 66/88 (75%) عزلة منها كانت محللة للدم من نوع الفا وبيتا على اطباق اكار الدم كما انها اعطت معيارا انحلاليا للدم تراوح بين (16 - 256)، كما وجد ان 22/88 (25%) عزلة لا تمتلك فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر على اطباق اكار الدم ولا على اطباق المعايرة الدقيقة. اظهرت نتائج الكشف الجزيئي عن الجين hpmA (الذي يشفر الى انتاج الهيمولايسين) ان جميع العزلات التي اعطت فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر امتلكت الجين hpmA بينما 19/22 من هذه العزلات التي لم تعط فعالية انحلالية لخلايا الدم الحمر كانت لا تمتلك جين الهيمولايسين gene) .(hpmA3. بينت نتائج فحص تكوين الغشاء الحيوي لبكتيريا P. mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة وعند الطول الموجي 630 نانوميتر ان جميع العزلات (88/88) كانت مكونة له. اذ ان 53.41% (47/88) من العزلات كانت مكونة للغشاء الحيوي بدرجة قوية و25% (22/88) بدرجة متوسطة و21.59% (19/88) بدرجة ضعيفة.4. بينت نتائج فحص انتاج انزيم البروتيز لبكتيريا P. mirabilis على اطباق اكار الحليب الفرز والكشف الجزيئي عن الجين zapA (الذ يشفر الى انتاج البروتيز) ان 82/88 (93.18%) عزلة منها كانت منتجة لانزيم البروتيز على اطباق اكار الحليب الفرز وتمتلك الجين zapA بينما 6/88 (6.82%) عزلات كانت غير منتجة لانزيم البروتيز ولا تمتلك الجين zapA، اي يوجد تطابق مابين الكشف الظاهري والكشف الجزيئي عن الجين zapA.5. بينت نتائج الكشف الجزيئي عن عامل الضراوة الجين ucaA (الذي يشفر الى الهدب UCA) ان جميع عزلات P. mirabilis (88/88) كانت تمتلك هذا الجين.6. بينت نتائج فحص انزيم اليوريز لبكتيريا P. mirabilis على وسط اكار اليوريا ان جميع العزلات (88/88) كانت منتجة له وبسرعات مختلفة. | A. Part One included isolation and identification of Proteus mirabilis from 801 samples, including 179 clinical various samples (urine, ear and wounds) and 622 animal (chicken faeces, cows rectal, cats rectal and dogs rectal) various samples were collected from Baghdad province during the period from 26 - 10 - 2015 to 29 - 3 - 2016. Then, their antibiotic sensitivity was studied. This part concluded the following results : 1. 88 bacterial isolates belong to P. mirabilis species included 51(28.49%) isolates from clinical sources and 37 (5.95%) isolates from animal sources were identified by conventional method, Vitek - 2 compact system and confirmed by using specific primer to detect 16SrRNA gene in bacterial genome by polymerase chain reaction technique. Results of molecular identification showed that all these bacterial isolates were possessed this gene (16SrRNA). 2. The results of sensitivity test by disc diffusion method showed that P. mirabilis isolates were multidrug resistant to (2 - 8) from antibiotics tested. The lowest resistance rates for clinical P. mirabilis isolates were (3.9%) for ciprofloxacin, (7.8%) for norfloxacin and (9.8%) for imipenem while animal isolates showed lowest resistance rates : (0%) for cefoxitin, (2.7%) for amikacin, (5.4%) for ciprofloxacin, (8.1%) for each one of cefepime, imipenem and levofloxacin.B. Part Two consisted of a study of some phenotypic virulence factors and molecular detection of 3 genes associated with virulence factors. This part concluded the following results : 1. The results of extended spectrum - β lactamases test by double disk synergy test revealed that 52.49% (27/51) and 48.65% (18/37) of clinical and animal P. mirabilis isolates were respectively positive for the test. 2. The results of hemolytic activity tests of P. mirabilis isolates on human blood agar plates and hemolytic microtiter plates showed that 66/88 (75%) isolates were alpha - and beta - hemolytic on human blood agar plates and they were giving measurable hemolytic titer between (16 - 256), and 22/88 (25%) isolates did not give hemolytic activity. Results of molecular detection of hpmA gene showed that all isolates were giving hemolytic activity possessed the hpmA gene while 19/22 of these isolates did not give hemolytic activity and did not possess the hemolysin gene (hpmA gene).3. The results of biofilm formation test of P. mirabilis by microtiter plates at wave length 630 nm showed that all isolates (88/88) were positive for the test, results showed a strong biofilm formed was 53.41% (47/88), moderate biofilm was 25% (22/88) and weak biofilm was 21.59% (19/88).4. The results of protease production test of P. mirabilis isolates on skim milk agar and results of molecular detection of zapA gene (protease gene) revealed that 82/88 (93.18%) isolates of P. mirabilis were positive for protease test and they were possessed the protease gene. While 6/88 (6.82%) isolates were negative for protease test and did not possess protease gene, there is congruence between phenotypic and molecular detection of zapA gene.5. The results of molecular detection of virulence factor ucaA gene showed that all of the P. mirabilis isolates (88/88) were possessed this gene.6. The results of urease test of P. mirabilis isolates on urea agar plates showed that all of the isolates (88/88) were positive for the test.

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين == Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

اسم المؤلف: شذى فارس طارق
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

الكشف عن انواع الجنس Fusarium المنتج للفيومنسين ب1 على حبوب الذرة الصفراء باستخدام الطرائق الجزيئية ودراسة تاثيراته المرضية النسيجية على الفئران البيض == Detection of Fusarium Species Producing Fumonisin B1 on Maize Using Molecular Methods and Study Its Histopathological Effects on Albino Mice

اسم المؤلف: سيناء وليد محمد سعيد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب | سالم رشيد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص انواع الجنس Fusarium المرافقة للذرة وقابليتها على انتاج السم FB1 باستخدام الطرق التقليدية والجزيئية. كما تم دراسة الظروف المثلى لانتاجه فضلا عن تاثيره على انسجة الكبد والكلية والطحال وقياس انزيمات الكبد والطحال في ذكور الفئران المجرعه فمويا بالسم.تم جمع ثمانية وثمانين عينة ذرة للفترة ما بين تشرين الثاني 2013 واذار 2014 من الاسواق المحلية ومخازن الحبوب في بغداد (35 عينة ذرة من مخازن الحبوب و53 عينة من الاسواق المحلية) كما وتم الكشف عن الفطرين المنتجين للفيومينيسين وهما Fusarium verticillioides وF. proliferatum باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة (PCR) وتقنية فصل الصفائح الرقيقة (TLC) وتقنية الاليزا.(ELISA) وكانت النتائج كما ياتي : 1. الاجناس الفطرية المعزولة من الذرة هي : الفطر Aspergillus وكان الاكثر سيادة (58.6%) تليه الفطرياتFusarium (17.5%) ثم Rhizopus (6.7%), Alternaria (6.1%), Mucor وPenicillum (3.9%), Bipolaris (1.9%) وTrichthecium (1.2%).2. النوع الاكثر سيادة ضمن جنس Fusarium كان F. verticillioides (70.64%) 3. اظهرت النتائج باستخدام تفاعل تضاعف البلمرة المتسلسلة (species specific PCR) ان من بين سبعة وسبعين عزلة, فقط ثلاثة عشر عزلة تعود للجنس F. verticillioides ومن بين تسع عزلات فقط عزلة واحدة تعود للجنس F. proliferatum.4. تمتلك جميع عزلات F. verticillioides الثلاثة عشر الجين fum1 وبذلك يعد المنتج الرئيسي للسم FB1 مقارنة مع عزلة F. proliferatum التي لم تمتلك الجين.5. من بين العزلاتF. verticillioides الثلاثة عشر, كانت العزلة FV1 هي الاكفا في انتاج FB1 (175.39 جزء في البليون) على وسط فطيرة الذرة بينما تراوح تركيز السم FB1 لبقية العزلات يتراوح بين (21.31 - 170.51 جزء في البليون).6. كانت نتائج الظروف المثلى لانتاج السم FB1 هي وسط فطيرة الذرة وفترة حضانة 21 يوم ودرجة حرارة مثلى 20ºم.7. حددت الجرعة القاتلة المتوسطة (LD50) للسم FB1 لذكور الفئران وهي 1800 جزء في البليون.8. لوحظت زيادة في تركيز انزيمات الكبد والكلى للفئران بعد تجريعها فمويا بالسم FB1 عند التركيزين 800 و1200 جزء في البليون مقارنة مع مجموعة السيطرة.9. كشفت النتائج ان التغيرات في انسجة الكبد والكلى والطحال للفئران المجرعه فمويا بالسم FB1بالتركيزين 800 و1200 جزء في البليون، ظهرت زيادة التغيرات 10. التنكسية والموت المبرمج للخلايا مقارنه مع مجموعة السيطرة. | The study aimed to identify Fusarium species associated with maize grains and their ability to produce Fumonisin B1 using traditional and molecular methods. The optimal conditions of FB1 production were assayed. The effect of FB1 on liver, kidney and spleen tissues of albino mice were studied and measured its effects on enzymes in affected liver and kidney.Eighty - eight maize samples were collected between November 2013 and March 2014 from local markets and silos of Baghdad province (thirty - five from silos and fifty - three from markets). Fusarium verticillioides and F. proliferatum were investigated and their ability to produce Fumonisin B1 was detected using : Polymerase chain reactions (PCR), Thin layer chromatography (TLC) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) techniques. The following results were obtained from the current study : 1. The fungal genera isolated from maize were : Aspergillus (58.6 % ) followed by Fusarium (17.5% ), Rhizopus (6.8 %), Alternaria (6.1 %), Mucor and Penicillium (3.9 %), Bipolaris (1.9 %), and Trichothecium (1.2%).2. The predominant species among Fusarium was F. verticillioides (70.64%).3. The use of species specific PCR reactions for Fusarium species revealed that out of seventy seven isolates, thirteen isolates only belong to F. verticillioides and out of nine isolates, one isolate only belong to F. proliferatum.4. All the thirteen F. verticillioides isolates were shown to possess fum1 gene (FB1 producer), whereas the F. proliferatum isolate was shown not to possess this gene. 5. Among the thirteen isolates of F. verticillioides, FV1was the most efficient one in production of FB1(175.39 ppb) on patty maize medium, while the concentration of FB1 for other isolates ranged between (21.31 - 170.51) ppb. 6. The optimum culture conditions for FB1 production using solid state fermentation included : patty maize medium with incubation period 21 days at 20ºC. 7. The median lethal dose 50 (LD 50) of FB1for male mice was 1800ppb.8. liver enzymes (AST, ALT, ALP) and kidney functions (Creatinine and Blood urea) were increased in male mice which were orally gavaged FB1 at 800 and 1200ppb concentrations comparing with control group.9. The histopathological changes in the liver, kidney and spleen of orally gavaged mice by FB1 at 800 and 1200 ppb, showed a significant increase degenerative changes and apoptotic cells in comparison with control group

انتاج الليفان من البكتريا المعزولة من تربة الجذور وتقييم العوامل المؤثرة على انتاجه == Levan Production by Bacteria Isolated from Rhizosphere Soil and Evaluation of Factors Affecting its Production

اسم المؤلف: سناء بشير كاظم
اسم المشرف: صفاء الدين احمد شنتر القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر منطقة التربة المحيطة بالجذور مصدرا مهما للعديد من الاحياء المجهرية مثل الفطريات والبكتريا والبكتريا الخيطية. في الدراسة الحالية، تم عزل البكتريا المنتجة لليفان من التربة المحيطة بالجذور. حيث تم الحصول على 15 عينة من التربة المحيطة بجذور البقوليات ( الباقلاء واللوبيا ) خلال الفترة بين تشرين الاول 2014 الى كانون الثاني 2015، من ثلاث مزارع للبقوليات في ناحية كنعان، محافظة ديالى. تم عزل 52 عزله من بكتريا الجذور (الرايزوسفير) واختبرت لمعرفة قابليتها لانتاج الليفان وذلك بالاعتماد على نمو المستعمرات المخاطية عند تنمية هذه البكتريا على وسط الاكار المغذي الحاوي على السكروز. وقد اظهرت النتائج مقدرة 36 عزلة بكتيرية جذرية على انتاج الليفان من المجموع الكلي للعزلات. شخصت العزلات الاربع الاكثر كفاءة لانتاج الليفان ووصفت بواسطة الفحوصات المظهرية والبايوكيميائية القياسية والاختبارات على المستوى الجزيئي. تم اجراء التشخيص الجزيئي لهذه العزلات الاربعة باستخدام 16S rDNA والتي اظهرت ان طول تسلسل المنطقة كان (946، 1056، 1064و1154) زوجا قاعديا للعزلات (2، 3، 23 و33) على التوالي. ان محاذات التسلسل في بنك الجينات اظهر ان العزلات الاكثر كفاءة كان لديها نسبة عالية من التشابه (98، 96، 98 و99) % على التوالي وتبعا لاقرب جار تطوري لهذه العزلات, تم التعرف عليها تبعا لتتابع جين (16S rRNA) وتبعا للفحوصات الشكلية والكيموحيوية , وشخصت على انها (Brachybacterium phenoliresistens، Elizabethkingia anophelis، Arthrobacter globiformis، Pseudomonas brassicacearum) على التوالي. تم تشخيص الليفان المنتج من هذه العزلات الاربعة باستخدام تقنية TLC والتي اظهرت تكون الليفان من نوع واحد من السكريات الا وهو الفركتوز. وقد تم تشخيص الليفان المنتج بواسطة بكتريا B. phenoliresistens باستخدام تقنيتي FTIR وتقنية الرنين المغناطيسي النووي NMR. تحليل الليفان بواسطة هاتين التقنيتين اثبتت انتاج الليفان بواسطة هذه العزلة. تم دراسة تاثير العوامل الغذائية والفيزيائية على انتاج الليفان بواسطة العزلات الاكفا. كان مصدر الكاربون الامثل لانتاج الليفان بواسطة هذه العزلات هو السكروز، حيث كان انتاج هذه العزلات هو 7.88، 7.94، 7.8 و7.77 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis، A. globiformis ، P. brassicacearum على التوالي. تم استخدام اربع مصادر مختلفة للنايتروجين لمعرفة افضل مصدر نيتروجيني لانتاج الليفان. حيث كان الكازائين هو افضل مصادر النيتروجين لانتاج الليفان حيث كان انتاج هذه العزلات 8.12، 8.2، 8.24 و8.56 غم/لتر للعينات الاربعة على التوالي. تم استخدام تراكيز مختلفة للسكروز لانتاج الليفان حيث كان اعلى انتاج لجميع العزلات عند التركيز 300غم/لتر وكان الانتاج بواسطة هذه العزلات 7.97، 7.94، 8.06 و7.95 غم/لتر على التوالي. تم استخدام قيم pH مختلفة لمعرفة افضل اس هيدروجيني لانتاج الليفان حيث كان افضل اس هيدروجيني هو 7.8 لكل العزلات، وكان الانتاج 7.88، 7.94، 7.8، 7.77 غم/لتر على التوالي. فضلا عن ذلك، تم اختبار عدة ظروف مثل فترة الحضن المثلى، درجة الحرارة، معدل الرج. كانت فترة الحضن المثلى للعزلة E. anophelis 48 ساعة حيث انتجت 8.46غم/لتر، في حين كانت 72 ساعة لباقي العزلات حيث انتجت 8.58، 8.53 و8.7 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens ، A. globiformis وP. brassicacearumعلى التوالي. درجة الحرارة المثلى لانتاج الليفان بواسطة العزلة B. phenoliresistens كانت عند 30 درجة مئوية حيث انتجت 7.87 غم/لتر، وكانت درجة الحرارة المثلى هي 33 درجة مئوية للعزلتين E. anophelis وA. globiformisحيث انتجت عندها 8.04 و8.6 غم/لتر على التوالي. في حين كانت درجة الحرارة المثلى للعزلة P. brassicacearum 40 درجة مئوية وكان انتاجها 8.24 غم/لتر. استخدمت ثلاث معدلات رج لمعرفة افضل معدل رج لانتاج الليفان. تم الحصول على اعلى انتاج لليفان عند معدل رج 150 هزه/دقيقه، حيث كان الانتاج للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis وA. globiformis هو 8.12، 8.54 و8.27 غم/لتر على التوالي. | The Rhizosphere zone is a narrow volume of soil which surrounds the plants roots and influenced by the activity and growth of the root. In the present study, Levan producing bacteria were isolated from rhizosphere soil, fifteen rhizosphere soil samples were obtained from the legumes roots cowpea and broad bean (Vinga unguiculata L. and Vicia faba) during the period from October 2014 to January 2015, which were collected from three legumes farms in Kana’an Village, Diyala Governorate. A total of 52 Rhizobacterial colonies were isolated, purified and screened for their ability to produce levan, depending on growing of mucoid colonies on sucrose nutrient agar. The results showed that thirty six isolates out of the total number of the isolates were identified as levan producers. The most efficient four isolates were identified and characterized according to standard biochemical and Molecular tests. The Molecular identification of these four isolates was carried out by using 16S rDNA, which resulted in sequenced region of 946, 1056, 1064 and 1154 base pair in length respectively. The sequence alignment in the gene bank indicated that the most efficient isolates (2, 3, 23 and 33) have high percentage of similarity (98, 96, 98 and 99 % respectively), in comparison with the retrieved consensus sequences. The closest phylogenetic neighbor for these isolates is predicted according to the 16S rRNA gene sequence, morphological and biochemical tests. These isolates were identified as (Brachybacterium phenoliresistens, Elizabethkingia anophelis, Arthrobacter globiformis and Pseudomonas brassicacearum) respectively. Levan production by these four isolates were characterized by using Thin Layer chromatography (TLC) technique, which revealed that levan is composed of only one sugar which is fructose. Levan produced by B. phenoliresistens was characterized by Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy techniques. The instrumental analysis indicated that Levan was produced by the selected isolate. The effect of some nutritional and physical factors were investigated on levan production by the highest four isolates. Sucrose was the best carbon source for levan production in all isolates that gave (7.88, 7.94, 7.8 and 7.77) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively. In addition, four nitrogen sources were used to identify the best nitrogen source for levan production. Casein was the best nitrogen source for all isolates that gave (8.12, 8.20, 8.24 and 8.56) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively,. Moreover, different sucrose concentrations were used to assess the best concentration for levan production. The highest levan yield by all isolates was at the sucrose concentration of 300 g/l, which gave (7.97, 7.94, 8.06 and 7.95) g/l respectively. Different pH values were also used to determine the best pH value for the levan production. The four isolates gave their highest levan production (7.88, 7.94, 7.80 and 7.77) g/l at pH 7.8. Further, conditions were examined like optimal incubation period, temperature and agitation rate. The optimal incubation period was 48 hs for E. anophelis that gave 8.46 g/l and 72 hs for B. phenoliresistens, A. globiformis and P. brassicacearum which gave (8.58, 8.53 and 8.7) g/l respectively. Whereas, the optimal temperature was 30ºC for B. phenoliresistens that produced 7.87 g/l , 33 ºC for E. anophelis and A. globiformis which gave (8.04 and 8.6) g/l, and 40 ºC for P. brassicacearum that gave 8.24 g/l. Three agitation rates were used to identify the best agitation rate for levan production. The highest levan production yield was obtained at 150 rpm by the isolates B. phenoliresistens, E. anophelis and A. globiformis which gave (8.12, 8.54 and 8.27) g/l respectively.

تاثير المعززات الحيوية على الفئران المثبطة مناعيا بالبردنيزولون == Effect of Probiotics on Prednisolone Immunosuppressed Mice

اسم المؤلف: زينب كاظم عبد
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لمعرفة دور FOXP3 في الفئران المثبطة مناعيا بالردنيزولون اضافة الى دور المعززات الحيوية في الجهاز المناعي للفئران البيضاء. البردنيزولون هو عقار مثبط مناعيا يستخدم لعلاج حالات الحساسية وامراض المناعة الذاتية. المعززات الحيوية هي كائنات حية تستعمل لتعديل الجهاز المناعي في الانسان والفئران. FOXP3 هو دليل للخلية التائية المنظمة وله دور في الاستجابة المناعية.لذلك استخدمنا في التجربة 30 فار مختبري ابيض ذكر قسمت الى 6 مجاميع كل مجموعة تضم 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 14 يوم : المجموعة 1 : جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالخميرة فقط. المجموعه 2 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام مجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعة 3 : جرعت فمويا ب0.4مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط. المجموعه 4 : جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالبكتريا فقط. المجموعه 5 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعه 6 : جرعت فمويا ب0.6مل من بكتريا Ss والتي تحوي (108×1) خلية\مل وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ارتفاع معنوي في العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء(10000.0 ± 275.4) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(7000 ± 145.07), واظهر العد التفريقي لها انخفاض معنوي في الخلايا اللمفية(23.0 ± 1.51) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((30.0 ± 1.65 وارتفاع معنوي في الخلايا العدلة(75.00 ± 3.59)مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (65.00 ± 2.31) وانخفاض معنوي في الخلايا الوحيدة(( 1.0 ± 0.06مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ±0.06) 3.0) وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة , حصل انخفاض معنوي في عملية البلعمه(15.0 ± 0.82) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(20.0 ± 1.4), وارتفاع غير معنوي في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة(40.0 ± 2.03) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (36.0 ± 1.1), وزيادة غير معنوية في تركيز خضاب الدم(13.3 ± 0.76) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((11.6 ± (0.54 وكذلك زيادة غير معنوية في الوزن الكلي للحيوانات المعامله بالعقار فقط (31.0 ± 1.2) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(30.0 ± 1.1) .واظهرت نتائج التجريع بالمعززات الحيوية (الخميرة والبكتريا) ارتفاع العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء ,واظهر العد التفريقي لها ارتفاع الخلايا اللمفية والوحيدة وانخفاض الخلايا العدلة وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة ,كذلك حصل ارتفاع في عملية البلعمة وارتفاع بسيط في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة . بينت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية في المجموعه المعاملة بالعقار فقط حصول فقدان بالشكل العام للعضو وعدم ظهور الحويصلات اللمفاوية وحصول تنخر في الطحال .واوضحت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجموعه المعامله بالمعززات الحيوية احتفاظ العضو بالشكل العام وحصول ارتشاح للخلايا اللمفية وتحفيز الحويصلات المفاوية داخل العضو.كما اظهرت نتائج التجريع الفموي للمعززات الحيوية بعد وقبل ومع حقن الدواء حدوث حالة تحسسن بالمؤشرات المناعية وكذلك حدوث حالة تحسن وتنشيط مناعي للحويصلات اللمفاوية للطحال والعقدة اللمفاوية. واظهرت نتائج الفحص النسيجي الكيميائي المناعي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجاميع المجرعه بالمعززات الحيوية والعقار ان لها نفس التعبير لل.FOXP3 اعتمادا على نتائج التجربة الحالية نستنتج ان المعززات الحيوية (الخميرة والبكتيريا) تمتلك قابلية على تعديل وتحسين تاثيرات العقار الجانبية على الاعظاء والمؤشرات المناعية وكذلك لها نفس التعبير لل.FOXP3 | Study have been done to see the role of FOXP3 in immunosuppressed mice using prednisolone in addition to the role of probiotic on immune system of albino mice. Prednisolone is immunosuppressive drug used to treat several allergic and autoimmune conditions. Probiotic is a live microorganisms used to modulate human and mice immune system.FOXP3 is Treg marker and have a role in immune system responses. Therefore we took 30 male albino mice were divided into 6 groups (five mice in each group) and treated daily for 14 days : Group 1 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days then injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 14 days. Group 2 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14days. Group 3 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days.Group 4 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days then injected intraperitoneally with(0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 14 days. Group 5 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days. Group 6 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days. Mice treated with prednisolone drug showed a significant increase in total leukocytes count (10000±275.4)cells\1ml.blood as compared with negative control (7000±45.07)cells\1ml.blood, and differential count of leukocytes showed non - significant decrease in lymphocytes(23.0±1.51)cells\1ml.blood as compared with negative control (30.0 ±1.65)cells\1ml.blood, a significant increase in neutrophils(75.00±3.59) as compared with negative control(65.00 ± 2.31), a significant decrease in monocytes (1.0±0.06)cells\1ml.blood as compared with negative control(3.0 ± 0.06)cells\1ml.blood and have no effect on basophils and eosinphils, a significant decreased in phagocytosis(15.0 ± 0.82) as compared with negative control (20.0 ±1.4) , no significant increased Pcv (40.0±2.03) as compared with negative control (36.0±1.1) ,no significant increased Hb (13.3±0.76) as compared with negative control(11.6 ± 0.54) , and no significant increase in total body weight (31.0 ± 1.2)g as compared with negative control (30.0 ±1.1)g. The result of group treated with probiotic show a significant increase in total leukocytes, lymphocytes count, phagocytosis and Hb & Pcv as compared with control group administrated by normal saline only. The histological sections of spleen and lymph node which was treated with prednisolone drug revealed lose the architecture, no lymphoid follicles and necrosis. While the section of spleen and lymph node treated with probiotic showed preservation architecture which contain lymphoid follicles and hyperplasia of lymphocytes. The result of groups treated with probiotic pre, post, together with prednisolone drug showed normalized the immunological and histological parameters to the normal condition as compared with group treated with prednisolone only. The immunohistochemical section for spleen and lymph node show the same expression of FOXP3 in mice treated with probiotic (yeast & bacteria) and prednisolone drug. According to the results obtained from this study it is concluded that probiotic (yeast and bacteria) have immunomodulatory effect against prednisolone in immune system of male albino mice and have the same expression of FOXP3

استخلاص ، تنقية وتوصيف انزيم اللكنين بيروكسيديز المنتج من العزلة الفطرية المحلية Aspergillus terreus == Extraction, purification and characterization of lignin peroxidase enzyme produced from local fungal isolate Aspergillus terreus

اسم المؤلف: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
اسم المشرف: ندى صباح رزوقي | غازي منعم عزيز
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 18 عزلة فطرية محلية من 75 عينة روث خيول جمعت من نادي الجادرية ونادي العامرية للفروسية في بغداد خلال 8 اشهر للفترة من تموز 2013 الى اذار 2014 . سجلت العزلة A. niger اعلى نسبة ظهور بين العزلات واعلى تكرار % 80 %9.8, على التوالي تبعتها العزلة A.fumigatus (%9.8 , % 48) ثم العزلة A.terreus (% 8.2 , % 46.66) ، بينما سجلت العزلة Absidia cerymbifera اقل ظهور واقل تكرار(%3.28 , % 5.33) تبعتها العزلة Syncephalstrum racemosum ( % 2.67 و( %1.64 على التوالي. اختيرت العزلة A.terreus SG777 كافضل عزلة لانتاج هذه الانزيمات اذ سجلت اعلى فاعلية نوعية لانتاج الانزيمات المحللة للكنين ( لكنين بيروكسيديز 11.828 ، منغنيز بيروكسيديز1.131 واللاكيز 0.527) وحدة /ملغم . ثبتت الظروف المثلى لانتاج الانزيمات المحللة لللكنين من العزلة الفطرية A. terreus SG 777 باستخدام تخمرات الحالة الصلبة ( سيقان الموز كمادة اساس ، فترة الحضن 8 ايام ،حجم اللقاح1 × 105 بوغ / مل ، برقم هيدروجيني 4.5 وبدرجة حرارة 35م°). رسب انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع %80 ثم ازيل الملح من الانزيم المنتج من عفن777 Aspergillus terreus SG باستخدام طريقة النضح الغشائيDialysis تجاه المحلول الدارئ (Tris buffer) ونقي جزئيا بواسطة كروماتوغرافيا التبادل الايونيIon exchange chromatography باستخدام المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدد مرات للتنقية بلغ 5.4 مرة وبحصيلة انزيمية مقدارها %13.7اظهر الانزيم اعلى فغالية وثباتية عند الرقم الهيدروجيني 3.0 ,في حين اقصى فاعلية للانزيم ظهرت عند درجة حرارة 40 م° مع احتفاظ الانزيم بفاعليته عند درجات حرارة تراوحت بين 25) - 35 ) م°. درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة عدة صبغات واظهرت النتائج اعلى نسبة ازالة ( 83.61 %) للانزيم تجاه صبغة الكونغو الحمراء باستخدام 65.51 وحدة / مل منه وبفترة حضن 4 ساعات وتبعتها صبغة المثيلين الزرقاء بنسية تحطيم %58.6 ثم صبغة المثيل الحمراء بنسبة ازالة بلغت % 49.9.بينما سجلت الصبغات الملاكايت الخضراء ، الالورا الحمراء والتارترازين % 24.87 ,% 28.8 , %26 على التوالي كادنى نسبة تحطيم بوساطة الانزيم قيد الدراسة . درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة المركبات الحلقية المتعددة التي تم الكشف عنها وذلك لمقارنة فاعلية الانزيم مع نتائج المعالجات في مصفى الدورة والتي تضمنت (المعالجة الميكانيكية، المعالجة الكيميوفيزيائية والمعالجة البايولوجية ) . اظهرت النتائج ازالة 97.54 % للمركب Di benzo (a ,h) anthrancene باستخدام 65.51 وحدة / مل من الانزيم قيد الدراسة وبفترة حضن 4 ساعات وبدرجة حرارة 40 م° في حين بلغت نسبة الازالة بوساطة معالجات المصفى % 54.37 كما بلغت نسبة الازالة لكل من Floureneو anthrancene قد بلغت % 95.98 و% 83.51 على التوالي مقارنة بنسبة الازالة %84.51 , % 46.83 بوساطة معالجات المصفى . قيد انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام %2 وزن / حجم من الجينات الصوديوم و200 ملي مولار و50 من مل كلوريد الكالسيوم . بينت النتائج ان % 99 من فاعلية الانزيم الحر تم تقييدها .اجريت عملية خزن انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر لمدة اربعة اسابيع عند درجة حرارة 4 م° لمعرفة مدى احتفاظ الانزيم المقيد بفاعليته الانزيمية مقارنة بالانزيم الحر، اذ لوحظ ان الانزيم المقيد قد احتفظ % 88.29 من فاعليته الاصلية بينما احتفظ الانزيم الحر حوالي 66. 02 % من فاعليته الاصلية. استخدم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر في تحطيم صبغة المثيلين الزرقاء ، اذ اظهرت النتائج ان نسبة التحطيم بالانزيم المقيد بلغت حوالي % 40.1 لفترة حضن 4 ساعات بينما بلغت نسبة تحطيم الصبغة حوالي % 25.79 باستخدام الانزيم الحر وبنفس فترة الحضن .حطم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد حوالي% 57.89 من صبغة الكونغو الحمراء عند استخدامه لاول مرة ، وانخفضت قابلية الانزيم المقيد على تحطيم الصبغة الى 16.11% عند استعماله للمرة الرابعة. | Eighteen local isolates were collected from seventy five horse manure samples taken from horses in the Equestrian Club in Jadriya and Al - Amrya / Baghdad that were investigated during the 8 months; the period isolation was started from July 2013 to march 2014. Aspergillus niger was the highest occurrence and frequency (80% and 9.8 %) respectively, followed by A . fumigatus (48 % and 9.8 %) and A. terreus (46.66 % and 8.2 % ) occurrence and frequency respectively , whereas Syncephalstrum racemosum (2.67 % and 1.64%) respectively . The isolate A. terreus had the higher specific activity of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase 11.828, manganese peroxidase 1.13 and laccase 0.53) U/mg. The optimum conditions of ligninolytic enzymes produced from A. terreus SG777 were estimated using solid state fermentation : banana stalks as a substrate, period incubation 8 days, moisture level 1 : 5 w/v inoculum size 1x105 spores /ml, pH 4.5 and temperature 35 °C. Lignin peroxidase produced from A. terreus SG777 precipitated with 80% ammonium sulfate saturation then desalting by dialysis against Tris buffer solution and partially purified by ion exchange chromatography using DEAE - cellulose. The specific activity reached 56.67U/mg with purification fold was 5.4 times and 13.7% recovery. The optimum pH for activity and stability was 3. The maximum activity was observed at 40°C and the enzyme maintained the activity when it was incubated at 25 - 35˚C. Lignin peroxidase removal the dyes during 4hr. Congo red was decolorized to the maximum extent of 83.61% in 4 hr by 65. 51 U/ml of the pure lignin peroxidase, methylene blue decolorized 58.6% and methyl red azo dye was decolorized to the extent of 49.9% ,while Malachite green triarylmethane dye, allura red and tartarazine showed minimum extent decolorized 26, 28.8 and 24.87% respectively. Degradation of poly aromatic hydrocarbons when incubated with 65.51 U/ml lignin peroxidase at 40 °C for 4 hr compared with the Refinery treatment . Results showed (97.54%) removal efficiency of Di benzo (a ,h) anthrancene by lignin peroxidase, while only 54.37% was treated by Refinery treatment. Flourene and anthrancene degradation 95.98% and 83.51% respectively, while the flourene and anthrancene degradation treated by Refinery treatment only 84.51% and 46.83% respectively. Lignin peroxidase immobilization by 2% (w/v) sodium alginate and 200 mM of calcium chloride. Results showed that 99 % from free lignin peroxidase was immobilized. The stability of immobilized and free Lip enzyme was studied during four weeks; remaining activity for immobilized Lip was 88.29 % from its original activity 76 U/ml during four weeks while free Lip remaining activity was 66. 02 % from its original activity (76.04 U/ml). Methylene blue dye degraded about 40.1% by immobilized Lip during four hr compared with free Lip which has removal only 25.79% from dye concentration. The immobilization lignin peroxidase removal 57.89 % from congo red in first use and then the immobilized lignin peroxidase ability reduced to 16.11% dye removal after four uses.

التحري عن بعض جينات عوامل الضراوة لبكتريا Cronobacter sakazakii المعزولة من حليب الاطفال الرضع المجفف وعينات سريرية == Detection of some virulence factors genes of Cronobacter sakazakii isolated from Powder infant formula and clinical samples

اسم المؤلف: ذاريات عبد الرحمن مطلك الجبوري
اسم المشرف: لمى عبد الهادي زوين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لعزل وتشخيص بكتريا Cronobacter sakazakii من حليب الاطفال المجفف ومن الحالات السريرية لاطفال دون عمر السنتين . اذ جمعت230) ) عينة، شملت (30) عينة حليب اطفال لاعمار مختلفة دون عمــــــــــر السنتين من الاسواق المحلية في بغداد, و(200) عينة سريرية، تضمنت 50 عينة من كل من (سائل النخاع الشوكي ودم وخروج وبول) من مستشــــــــفى مدينة الطب (حماية الاطفال ) ومستشفى الطفل المركزي، للمدة من الاول من ايلول 2015الـــــى الاول من كانون الثاني 2016م. زرعت العينات على اوساط زرعية خاصة، اذ زرعــــــــــت عينات (الحليب) على وسط Violet red bile glucose agar وزرعت العينات (السريرية) على وســــــــــــــــــــــــــــط MacConkey agar، وزرعت جميع العينات (الحليب والسريرية ) علــــــــــــــــــى وسط Tryptone soy agar ، ثم زرعت على وسط Biriiltent Enterobacter sakazakii agar. شخصت العزلات بالفحوصات المجهرية والمزرعية والكيموحيوية ، فضلا عن التشخيص باستعمال جهاز Vitek - 2 اذ امكن الحصول على 19 عزلة، وكانت جميعها تعود لبكتيريا Cronobacter sakazakii، وتضمنت 6 عزلات بنسبة تلوث 9.09 % (اذا كانت عزلة واحدة من عينات حليب Novolac Allernova وعزلتين من عينات حليب Novolac AD وثلاث عزلات من عينات حليــــب Dialak1) و13 عزلة بنسبة تلوث 6.5 % (موزعة بواقع 6 (%12) عزلات من عينات سائل النخاع الشوكي و7 ( %14) عزلات من عينات الدم) ولم يتم الحصول على البكتريا من عينات الخروج والبول. بينت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة مظهريا بان جميع العزلات البكتيرية كانت قادرة على احداث حركة Swimming بقطر يتراوح بين ( 9 - 1ملم ) وSwariming بقطر يتراوح بين 40 - 1)ملم) , وقدرتها ايضا على تكوين الغشاء الحيوي Biofilm باستخدام ثلاث طرائــــــــــق، اذ بينت النتائـــج قدرة العزلات البكتيرية علـــــــى تكويــــــــن الغشاء الحيوي بطريقــــــــــــــة التخطيط على وسط احمر الكونغو الصلب Congo red agar اذ ان 16 عزلة من اصل 19 عزلة تعود لبكتريا C.sakazakii بنسبة 84.21% قادرة على تكوين الغشاء الحيوي على وسط احمر الكونغو الصلب التي هي 4 عزلات بكتيرية بنسبة 21.05% كانت منتجة للغشاء الحيوي وبشكل قوي 10 عزلات بكتيرية بنسبة 52.63% كانت منتجة للغشاء الحيوي وبشكل متوسط وعزلتين بكتيريتين بنسبة 10.52% كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل ضعيف، في حين كانت 3 عزلات بكتيرية بنسبة 15.79% غير قادرة على تكوين الغشاء الحيوي ، اما طريقة Tubes method كانت جميع العزلات قادرة على تكوين الغشاء الحيوي، فقد وجد ان 4 عزلات بكتيرية بنسبة %21.05 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل قوي، و13 عزلة بكتيرية بنسبة 68.42 % كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل متوسط ، وعزلتين بكتيرية بنسبة 10.53 % كانت منتجة للغش اء الحي وي بشكل ضعيف ، وطريقة Microtiter plate method اذ ان 9 عزلات بكتيرية بنسبة %47.37 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل قوي و8 عزلات بكتيرية بنسبة 42.11 % كانت منتجة للغشاء الحيـــــــــوي بشكل متوسط وعزلتين بكتيرية بنسبة %10.53 كانت منتجة للغشاء الحيوي بشكل ضعيف . اظهرت نتائج فحص الحساسية باستعمال جهاز Vitek - 2 كونه اكثر كفاءة مقارنـــــــــــــــة بالطريقة التقليدية اتجاه 18 مضــــ ادا حيويــــ ا لتحديد التركـــــ يز المثبـــــــــــــــــط الادنـــ ـى( MICs) Minimum Inhibitory Concentration, وبينت النتائج ان جميع العزلات البكتيرية كانت حساسة Sensitive بنسبة 100% لعدد من المضادات الحيوية المستعملة في الـــدراسة وهـــــــــــي Ampicillin - Sulbactam وCefotaxim وCefpodoxime وCeftazidime وCiprofloxacim وGentamicin وImipenumو Levofloxacin وMeropenem وTazobactam - Piperacillin وTrimethoprim - Sulfamethoxaole وTigecyclin. بينما اختلفت العزلات البكتيرية فكانت مقاومة Resistance او متوسطة المقاومة، اذ كانت نسبة المقاومة اتجاه المضاد الحيوي Cefuroxim وCefuroxim Axetil بنسبة 5.26 % على التوالي، في حين كانت متوسطة الحساسية اتجاه المضاد الحيوي Ampicillin بنسبة %5.26 وللمضاد Cefuroxim بنسبة %15.79, وللمضاد Cefuroxim Axetilبنسبة 52.63% وللمضاد Nitrofurontion بنسبة %15.79 . تم التحري عن بعض جينات الضراوة لبكترياC.sakazakii وتضمنت هذه الجينات كلا من ompA( الذي يشفر عن بروتين A للـ Outer membrane ) وzpx (الذي يشفر عن انزيم Proteases) وfliD ( الذي يشفر عن (Flagella (D)واظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة 100% في جميع العزلات. | This study was conducted to isolate and identification of Cronobacter sakazakii from children milk powder and clinical cases of children under two years . It collected (230) samples , included (30) sample children's milk for various ages under two years from the local markets in Baghdad, and (200) from clinical cases , which included (50) samples from each of the (Cerebrospinal Fluid and blood and stool and urine) of the Medical City Hospital ( the protection of children) from Central Children Hospital and Children's Protection Educational Hospital during the period between 1/9/2015 to 1/1/2016. Specimens planted among agricultural private, as planted specimens (milk) to the center of Violet red bile glucose Agar and planted specimens (clinical) at the center of MacConkey agar and planted all samples (milk and clinical) on the central Tryptone soy agar, then planted on the central Biriiltent Enterobacter sakazakii agar. Diagnosed isolates tests microscopic farm and biochemical, as well as diagnostics using Vitek - 2 device as possible to get 19 in isolation, they were all returned to the Cronobacter sakazakii, included (6 (9.09%) isolates included isolation of one isolate from Novolac Allernova and two isolate from Novolac AD and three isolates from Dialak1 ) and 13 isolated (6.5%) included ( 6 (12%) isolates from CSF and 7 (14%) isolates from blood) don't found in stool and urine samples. The results of the investigation of some virulence factors shoewd that all bacteria isolates were able to Swimming motility with a diameter ranging (9 - 1 mm) and Swariming motility with a diameter ranging (40 - 1 mm) and so their ability form biofilm by using three methods. The results show the ability of isolates to form biofilm by using Congo red media methods where it 16 out of 19 isolated bacteria belonging to C.sakazakii increased by (84.21%) able to form biofilm on the central Congo red steel which is 4 (21.05%) were strong production biofilm , 10 (52.63%) were intermediate production biofilm and 2 (10.52% ) were weak biofilm formation , while the 3 (15.79%) unable to form biofilm, The tubes method were all isolates were able to form biofilm, it were found that 4 (21.05%) isolates strong, and 13 (68.42%) intermediate and 2( 10.53%) weak biofilm formation , Microtiter plate method gave 9 (47.37%) isolates strong and 8 (42.11%) intermediate and 2 (10.53%)weak biofilm formation. The susceptibility measured by Vitek - 2 was its more efficient than the traditional methods towards the direction of 18 antibiotic to determine the Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) Minimum. The results showed that all bacterial isolates were sensitive 100% for a number of antibiotics used in the study, a Ampicillin - Sulbactam and Cefotaxim and Cefpodoxime and Ceftazidime and Ciprofloxacim and Gentamicin and Imipenum and Levofloxacin and Meropenem and Tazobactam - Piperacillin and Trimethoprim - Sulfamethoxaole and Tigecyclin. While different bacterial isolates were resistant Resistance or medium resistance, as the proportion of the resistance counter direction vital Cefuroxim and Cefuroxim Axetil was (5.26%) respectively. Whereas , the isolates show intermidate sensitivity towards the Ampicillin with ratio ( 5.26%) Cefuroxim (15.79%), Cefuroxim Axetil (52.63%) and Nitrofurontion (15.79%). Has been investigating some of the genes of pathogenic bacterium C.sakazakii These included genes both ompA (which encodes for Outer membrane protein A) and zpx (which encodes for an enzyme Proteases) and fliD which encodes for (Flagella (D) and the results showed the presence of these genes by 100% in all isolates.

جينات تحسس الزحام وعلاقتها مع بعض عوامل الضراوه في بكتريا الزوائف الزنجاريه == Correlation of Quorum Sensing Genes with Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: دعاء كاظم منصورالموسوي
اسم المشرف: منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 60 عزله من البكتريا السالبه لصبغه كرام مشخصه مبدئيا بانها بكتريا الزوائف الزنجاريه من عده مستشفيات في بغداد ومنها مستشفى ابن البلدي ومستشفى الحروق ومستشفى بغداد التعليمي وكذلك من المختبرات التعليميه في مدينه الطب خلال الفتره من بدايه شهر ايلول لغايه نهايه شهر كانون الاول لسنه 2013 تضمنت هذه العزلات22 عزله من خمجات الحروق و18 عزله من خمجات الجروح و9عزلات من عينات القشع لمرضى مصابين باصابات الجهاز التنفسي و6 عزلات من الدم وعزلتين من خمجات المجاري البوليه و3عزلات من مسحات الاذن. شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسط الماكونكي الصلب ووسط الدم الصلب وكذلك وسط السيدوموناس الصلب بعد ذلك تم اجراء بعض الفحوصات البايوكيميائيه مثل فحص الكاتليز والاوكسيديز تبع ذلك تشخيص العزلات جينيا باستخدام تفاعل البلمره التسلسلي باعتماد جين .rpsL اكدت النتائج ان جميع العزلات قيد الدراسه هي بكتريا الزوائف الزنجاريه . خضعت 60 عزله عائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه لاختبارفحص الحساسيه تجاه 12 مضادا حيويا بطريقه الانتشار واظهرت النتائج وجود مقاومه عاليه بين عزلات الدراسه لـــمضادات Tetracycline (100%) ,Ceftazidime (100%) ,Cefoxitin (100%) , Ceftriaxone (85 %) , Cefepeme (83.3%), Amoxillin/Clavulanic acid (81.6 %),Chloramphenicol (78.3 %) وانها كانت ذات مقاومه متوسطه لمضاد51.6%) Pipracillin ) وذات مقاومه واطئه لمضادات Tobramycin(33.3%), Norfloxacin (31.6%), Azithromycin (31.6%),Ciprofloxacin (28.3%). اختبرت قابليه العزلات على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام طريقه احمر - الكونغو وطريقه اطباق المعايره الدقيقه وتم قياس قيم الكثافه الضوئيه باستخدام قارىء منظومة الاليزا, اظهرت النتائج ان طريقه اطباق المعايره الدقيقه اكثر كفاءه وحساسيه من طريقه احمر الكونغو للكشف عن الغشاء الحيوي اذ اظهرت نتائجها ان 4 عزلات فقط غير منتجه للغشاء الحيوي اما العزلات الاخرى فقد كانت منتجه بدرجات متفاوته . اظهرت نتائج التحري عن جينات تحسس الزحام باستخدام تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي المتعدد وباستخدام بادئات خاصه بتسلسلات معينه لجينات الكوارم اظهرت النتائج ان 81,6% من هذه العزلات تمتلك واحد او اكثر من هذه الجينات بينما كانت 18.4% من هذه العزلات لا تمتلك الجينات اعلاه . تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي استخدمت في التحري عن خمس من جينات عوامل الضراوه العائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه وهي ((exoU,proteaseIV,exoS,pilB,plcH, اظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة (0% , 21.6 % ,26.6 % , 46.6% ,53.3% ) تباعا وكانت هذه العزلات تمتلك exoU وبعظها exoS وعلى اساسها صنفت العزلات على انها اما سامه او ضاريه . بينت الدراسة ان هناك بعض الطفرات قد حدثت في تسلسل القواعد النتروجينية للعزلات قيد الدراسة وكانت من نوع طفرات الاستبدال والادخال, كذلك تبين من مطابقة تسلسل القواعد النتروجينية المترجم مع تسلسل الاحماض الامينية الاصلي للجين لم يكن للطفرات تاثير على ناتج الترجمة . | A total of (60) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Pseudomonas aeruginosa were obtained from different teaching hospitals in Baghdad ; Ibn - El Balady , Baghdad teaching hospital , Burn hospital and Teaching laboratory in Medical city. During the period between July 2013 till December 2013. The source of these isolates were as follows : (22) isolates collected from burn infections ,(18) isolates from wound infections, (9) isolates from sputum taken from patients suffering from respiratory tract infection,(6) isolates from blood,(2) isolates from urinary tract infections(UTI), and the last (3) isolates from ear swab. The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar,Blood agar, Pseudomonas agar then diagnosed by performing some biochemical tests (catalase and oxidase) followed by Genotypic diagnoses by PCR Which was performed by housekeeping gene (rpsL gene). The results confirm that all the 60 isolates were P.aeruginosa. Sixty P.aeruginosa isolates were tested for 12 antibiotics by using agar diffusion method , the results showed high resistance against Tetracycline 100%, Ceftazidime100%,Cefoxitin100%,Ceftriaxone85%,Cefepime,83.3%,Amoxicillin/Clavulanic acid 81.6%, and Chloramphinicol 78.3% moderate resistance against ,Pipracillin 51.6% , and low resistance against Tobramycin 33.3% , Norfloxacin 31.6%,Azithromycin 31.6% and Ciprofloxacin 28.3%. The ability of the isolates to produce biofilm were tested using congo red plate method and Tissue culture plate method(TCP). Results showed that TCP method is a more quantitative and reliable method for the detection of biofilm this method show that 6.6% isolates were not biofilm producers while other isolates produce it in different degrees . Multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique was performed using specific primers targeting the specific sequences of Quorum sensing genes (lasR,lasI , rhlR,rhlI) .The results showed that 81.6% positive for one or more QS genes while only 18.3% were negative for all these genes. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to screened five virulence factors (exoU,proteaseIV,exoS, PilB , PlcH) results showed percentage were (53.3% , 46.6% , 26,6 % , 21,6 % , 0% ,) positive isolates respectively and these isolates contain either exoU or exoS and according to this have been classified into cytotoxic and invasive. Determination of nucleotides sequence for QS genes was revealed there was some mutations occurred which included substitution and insertion. From the other side results of identities of translated - nucleotides sequence with original sequence of amino acids revealed that there were no effect of mutations on translation product.

دراسة مقارنة للمحتوى البلازميدي للبكتريا المخمرة لسكر اللاكتوز للعائلة المعوية والمعزولة من عينات بيئية وسريرية == Comparative Study of Plasmid Content of Lactose Ferment Enterobacteriaceae Isolated From Environmental and Clinical Samples

اسم المؤلف: تقي عبد الكريم حميد
اسم المشرف: اسراء عبد الجبار ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: 183 bacterial isolate from clinical and environmental samples are collected during the 5 months from 1/9/2014 to 1/2/2015.Which 98 clinical bacterial isolates were isolated from patients (urine, blood, sputum and swabs) from different hospitals in Baghdad city, and also 85 environmental bacterial isolates were isolated from Tigris river water samples which are collected from Al - Shawaka area , soil samples of eastern Baghdad collected from Jadied Shat area , and poultry feces which are collected from poultry farm in Al - Sadar city.All clinical and environmental bacterial isolates were identified on the basis of morphology and biochemical tests.Further Confirmative tests were used to confirm the identification of bacterial isolates by using Vitek - 2 compact system and specific primer to detect 16S rRNA gene. Results of bacteria identification showed the following species : Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella.oxytoca Enterobacter aerogenes, Citrobacter freundii, Serratia marcescens, Raoultella planticola, Chryseomonas luteola, Burkholderia cepacia, Aeromonas, Hydrophis , Streptococcus feacalisThe antibiotic resistance patterns showed that all bacterial species were multidrug resistant.Most clinical E.coli (45isolates) revealed high levels resistance against most antibiotics : (100%) amikacin and ampicillin, (97%) cefepime and ceftazidime, (95%) cetriaxone,(86%) tobramycin, (82%) amoxicillin, (77%) gentamicin, (73%) aztreonam. Also environmental E. coli (28isolates) showed high levels resistance, (100%) ampicillin, ceftazidime, cefepime and tobramycine, (96%) nitrofurantion, (92%) Ceftriaxone, (89%) amoxicillin, (82%) amikacin, (60%) levofloxacin and impenem. All K.pneumoniae showed high levels resistance against most antibiotics, ampicillin, amoxicillin, cefepime and ceftazidime (100%).While 30% resistance in ciprofloxacinAbstractfor clinical K.pneumoniae isolates and 8% resistance was shown in each meropenem and levofloxacin.Results of molecular identification of E.coli isolates by using the specific primer for 16S rRNA gene showed that all isolates of Lactose fermenter contained this gene (100%). Also the same 16S rRNA gene was found in the bacteria Citrobacter freundii, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Raoultella planticola with the same molecular weight (544 base pair) that found in E. coli isolates. While K.pneumoniae isolates showed two bands for the same 16S rRNA gene with molecular weight of 544 and > 1500 bp.The plasmid DNA analysis by using alkaline lysis method showed that 35/48 (75%) clinical and environmental bacterial isolates contained multiple plasmids their size 1oooo bp, and 15/48 (31.25 %) isolates contained plasmids with molecular weight more than 10000 bp.The leaf extracts of medical plants, Eucalyptus incrassate, Olea eurepea, and Trigonella foenum - graecum L. used as agents to cure the plasmid via adding the plant extract to the culture media or with mixing it with the plasmid DNA. Results showed that both two methods give clear effect

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية == Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

اسم المؤلف: ابرار جاسم حسن
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية == A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

اسم المؤلف: نرمين نصر الدين فتحي
اسم المشرف: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.

مقارنة التاثيرات المرضية للببتيدوكلايكان المستخلص من Staphylococcus xylosus وعديد السكريد الشحمي للـ E. Coli == Comparative Pathogenicity of Peptidoglycan Extracted from Staphylococcus xylosus and Lipopolysaccharide Extracted E. coli

اسم المؤلف: هبة خليل توفيق
اسم المشرف: مي طالب فليح | حارث جبار فهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: من مجموع 150 عينة ادرار تم الحصول على 61 عزلة عائدة للجنس Staphylococcus , جمعت من مرضى مصابين بخمج المجاري البولية من مستشفيات الزعفرانية واليرموك للمدة من الاول من ايلول 2005 - الاول من كانون الثاني 2005 . تم التاكد من عائدية 10 عزلات للنوع S. xylosus وبنسبة عزل 16.3% من مجموع العنقوديات ، وقد تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية وتبين ان 8 عزلات كانت مقاومة للمضاد Erythromycin ، والعزلات جميعها حساسة للمضاد Ciprofloxacin . تم استخلاص الجدار الخلوي باستخدام طريقة التكسير بالحبيبات الزجاجية (Glass beads) وتم اجراء تنقية جزئية للببتيدوكلايكان من الجدار باستعمال مواد كيميائية مثل : SDS , EDTA , LiCL2 , CaCL2 والهضم بالانزيمات DNase , RNase , Trypsin , Pronase . ولغرض التاكد من جودة طريقة التنقية تم اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة فقد انخفض عدد الحزم البروتينية من 6 حزم في الجدار الخلوي الخام الى 4 حزم بعد التنقية . لقد اظهرت الدراسة الحالية التاثيرات الكيموحيوية السريرية للببتيدوكلايكان في مصل الارانب المحقونة عن طريق الزيادة الحاصلة في انزيمات الكبد والكلية ؛ اذ لوحظ زيادة معتدلة في كل من انزيمات : GoT وGpT وAlkaline phosphatase وكذلك Bilirubin ، والـ Urea ، والـ Creatinine ؛ مما يدل على حدوث خلل وظيفي في الكبد والكلية . تم دراسة امراضية مستخلص الببتيدوكلايكان للعزلة S.xylosus S24 (المقاومة لاكثر عدد من مضادات الحياة قيد الدراسة ) في الجهاز البولي للفئران البيض السويسرية الاناث اذ حقنت خمس مجاميع من الفئران بواقع ثلاثة مكررات لكل مجموعة عبر الاحليل باستخدام القثطرة بالتراكيز 1000000 ، 2000000 ، 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، وحقنت خمس مجاميع اخرى بمستخلص قياسي للـ LPS من بكتريا E.coli بالتراكيز 10, 25, 50, 75, 100 نانوغرام/مليليتر ، وبعد مرور يومين من الحقن تم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلية) تغييرات نسيجية تمثلت : بانكماش الكبيبة الكلوية ، واحتقان الاوعية الدموية ، وارتشاح الخلايا الالتهابية وفي المثانة فقدان طبقة الكيراتين وحدوث التنكس الاستسقائي لخلايا الطبقة الظهارية في كلا المستخلصين ومن خلال موازنة هذه التغييرات المرضية النسيجية لكل من مستخلص الببتيدوكلايكان وعديد السكريد الشحمي اتضح ان مستخلص عديد السكريد الشحمي اكثر شدة وامراضية اذ بدات التاثيرات بتراكيز (50, 75, 100) نانوغرام/مليليتر اقل من تراكيز مستخلص الببتيدوكلايكان 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، فضلا عن وجود تغييرات نسيجية اخرى حدثت في مستخلص عديد السكريد الشحمي وغير موجودة في مستخلص الببتيدوكلايكان. | Our of 150 urine specimens collected from patients presented with urinary tract infections attending Alza’farania and Alyarmoouk hospitals in Baghdad for the period of September , 1st 2005 to December, 1st 2005 , 61 staphylococci were obtained. Ten isolates (16 , 3%) were confirmed to be Staphylococcus xylosus identified by using of biochemical tests. Antibiotic susceptibility tests . however , 8 of them were resistant to erythromycin while all of them were sensitive to ciprofloxacin.The Crude cell wall was extracted by mechanical disintegration using glass beads and a partial purification was done to the peptidoglycan by means of chemicals such as SDS , EDTA , LiCl2 and CaCl2 in addition to enzymes like DNase , RNase , trypsin and pronase.In order to prove the efficiency of the purification method , polyacrylamide gel electrophoresis was achieved under undenaturing conditions as the proteins bands number was reduced from 8 in the crude extract to 4 bands at the final stage.The present study showed clinical biochemical effects of the peptidoglycan in sera of injected rabbits through the increase resulted in liver enzymes ad renal function tests represented by GOT , GPT , alkaline phosphatase , total serum bilirubin , urea and creatinin , an indication to a malfunction of liver and kidney.The pathogenicity of peptidoglycan extracted from S. xulosus S24 (the isolate that resist highest number of studied antibiotics) was studied in urinary tract of female Swiss mice by injecting five animal groups , as triplicates catheter at concentrations reached 1000000 , 2000000 , 3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml , plus another five groups with 10 , 25 , 50 , 75 and 100 ng / ml of E. coli LPS. Two days later , animals were killed ; kidneys and urinary bladder were taken for histopathological study as they showed different pathological changes included shrinkage of glomerulus , congestion of blood vessels and infiltration of inflammatory cells in kidney , whereas dekeratinization and edematous dehydration of the epithelium were seen in urinary bladder.Passing through a comparison between these pathological changes in both extracts , LPS developed the highest severity and pathogenecity since the effects started with concentration (50 , 75 and 100 ng / ml) less than those was withpeptidoglycan (3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml) in addition to the presence of some changes developed by LPS rather than peptidoglycan

تكون الغشاء الحيوي بوساطة Klebsiella pneumoniae الملوثة للمثبتات الخارجية ومقاومته لمضادات الحياة == Biofilm Formation by The External Fixators Contaminating Klebsiella pneumoniae and Its Antibiotic Resistance

اسم المؤلف: مروى حميد مطشر الخفاجي
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شخصت 98 عزلة بكتيرية منماة بظروف هوائية من مجموع 100 عينة سريرية ماخوذه من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية المستعملة في جراحة العظام والكسور. شكلت البكتريا السالبة لملون غرام اعلى نسبة 51% (50 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات، في حين شكلت البكتريا الموجبة لملون غرام 49% (48 عزلة) منها ، وكانت بكتريا Klebsiella pneumoniae هي المسبب الاكثر شيوعا لهذه الاخماج اذ عزلت بنسبة 74% (37 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات السالبة لملون غرام . اجري اختبار حساسية عزلات K. pneumoniae لمضادات الحياة ، وتبين ان العزلات جميعها كانت حساسة لمضاد Amikacin (100%) ، ومقاومة للمضادات : Ampicillin ، وCefalexine ، وCefalothin ، وCefotaxime ، وCiprofloxacin ، وRifampin بنسبة 100% ، وقد كانت نسبة مقاومتها لمضادات Ceftazidime ، وStreptomycin ، وTobramycin ، وGentamycin ، وNeomycin ، وNitrofurantoin ، وNorfloxacin ، وTetracycline ، وNalidixic acid 94.5% و86.5% و86.5% و67.5% و59.5% و37.8% و35.1% و32.5% و24.3% وعلى التوالي . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات بكتريا K. pneumoniae لمضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin فبلغت 1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K13 ، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر، و4 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51 . كما تم تحديد التراكيز القاتلة الدنيا لهذه المضادات وتراوحت مابين اكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، على التوالي للعزلة K13 ، واكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و256 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، و8 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51. تم التحري عن قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الطبقة اللزجة ، واظهرت نتائج طريقة الفحص بالانابيب ان 83.8% (31عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة ، في حين اظهرت طريقة احمر الكونغو ان 97.3% (36عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة . تم التحري عن فوعة عزلات K. pneumoniae المعزولة من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية وذلك باختبار قابليتها لربط البنفسج البلوري وكانت العزلات جميعها فائعة (Virulent) . اختبرت قدرة عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة فاظهرت النتائج ان العزلات جميعها كانت منتجة للغشاء الحيوي لكن بدرجات سمك متفاوتة ، وتراوحت قيم الامتصاصية مابين (0.111 - 2.899)، وكانت العزلة K13 هي العزلة الاكثر فعالية في انتاج الغشاء الحيوي حيث سجلت اعلى قيمة امتصاصية 2.899 . اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا من مضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin في الاغشية الحيوية المتكونة بفعل العزلتين K13وK51 في اطباق المعايرة الدقيقة باعمار مختلفة 24 ساعة و48 ساعة ، واظهرت النتائج ان هذه التراكيز ثبطت التصاق البكتريا على سطح البولي ستيرين مما ادى الى انفصال الغشاء الحيوي ، كما تبين ان الاغشية الحيوية الاقدم اكثر مقاومة للعوامل ضد الميكروبية . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للغشاء الحيوي واظهرت النتائج انها اكبر بثلاث او اربع مرات من التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات K. pneumoniae العالقة في الوسط الزرعي | Out of 100 clinical samples taken from infected external fixation devices used in orthopedic surgery 98 bacterial isolates grown in aerobic conditions had been diagnosed. The higher ratio 51% (50 isolates) of the total number of the isolates occupied by gram negative bacteria while gram positive bacteria represented the rest 49% (48 isolate) , Klebsiella pneumoniae was the most common aetiological agent of these infections which accounted 74% (37 isolates) of the total number of gram negative bacterial isolates. The sensitivity test against different antibiotics was done. It was found that all K. pneumoniae isolates (100%) were sensitive to Amikacin and resistant to Ampicillin, Cefalexine, Cefalothin, Cefotaxime, Ciprofloxacin, and Rifampin . While their resistance percetage to the antibiotics Ceftazidime, Streptomycin, Tobramycin, Gentamycin, Neomycin, Nitrofurantoin, Norfloxacin, Tetracycline, and Nalidixic acid were 94.5% , 86.5% , 86.5% , 67.5% , 59.5% , 37.8% , 35.1% , 32.5% , 24.3% respectively. Minimum inhibitory concentrations to K. pneumoniae isolates had been determined for the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , they were 1024 Mcg/ml , 128 Mcg/ml , 64 Mcg/ml , and 16 Mcg/ml respectively for the isolate K13 , and they were 1024 Mcg/ml , 64 Mcg/ml, 16 Mcg/ml, and 4 Mcg/ml respectively for the isolate K51. Minimum bactericidal concentrations for the same antibiotics had been estimated and they were higher than 1024 Mcg/ml, 1024 Mcg/ml, 128 Mcg/ml, and 32 Mcg/ml respectively for K13 isolate, and higher than 1024 Mcg/ml, 256 Mcg/ml, 32 Mcg/ml, and 8 Mcg/ml respectively for the isolate K51. The ability of K.pneumoniae isolates to produce slime layer was detected , the results revealed that 83.3% (31 isolates) were slime layer producers by tube method, while 97.3% (36 isolates) were slime producers by congo red method. The virulence of K.pneumoniae isolates isolated from external fixators infections had been detected via detection the crystal violet binding ability of these isolates, all the isolates were virulent. The ability of K.pneumoniae isolates to produce the biofilm had been tested by using microtiter plates , results revealed that all the isolates were biofilm producers with different thickness degrees, absorbance values rendered between (0.111 - 2.899) , K13 was the best biofilm producer isolate, it,s absorbance value was 2.899 . The effect of subinhibitory concentrations of the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , on biofilms formed by K13 and K51 isolates in microtiterplates in different ages , 24 hr and 48 hr had been tested , results revealed that these concentrations inhibited bacterial adhesion on polysteren surface and consequently causes biofilm detachment , also it was demonstrated that aged biofilms are more resistant to antimicrobial agents . Minimum inhibitory concentrations for the biofilm had been estimated, and the results revealed that these concentrations were three to four times higher than minimum inhibitory concentrations for the planktonic K.pneumoniae isolates.

دراسـة الاستجابة المناعيـة للاشخاص بعد تلقيحهم بلقاح الحصبـة الالمانية == Immune - status of Individuals after Immunization with Rubella vaccine

اسم المؤلف: ليلى فؤاد علي
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: بدا برنامج التلقيح الموسعExpanded programme on immunization(EPI) في العراق عام 1985وبتوجيه من منظمة الصحة العالمية وبضمنه لقاح الحصبة الالمانية في برنامج التلقيح الاعتيادي للاطفال وبعمر 15شهر بهدف القضاء على مرض متلازمة الحصبة الالمانية الولادية نظرا لما يسببه هذا المرض من اضرار كبيرة في الجنين حيث قد يولد الطفل المصاب مشوه وقد تؤدي الاصابة بحياته الى الموت (Laura & Susan,2002). شملت الدراسة (116) عينة دم ماخوذة من اشخاص اصحاء ،كان منها 30 عينة دم لاطفال اصحاء بعد اسبوعين من تلقيحهم بلقاح الحصبة الالمانية حسب الجدول التلقيحي المتبع في القطر وقد تراوحت اعمارهم مابين (18 - 20) شـهر ، و20 عينة دم لاناث تراوحت اعمارهن مابين(12 - 15) سنة بعد اسبوعين من تلقيحهن بلقاح الحصبة الالمانية . اما مجموعة السيطرة فتضمنت 12 عينات دم لاطفال و10 عينات لاناث بعمر (12 - 15) سنة لم يتلقوا لقاح الحصبة الالمانية . هذه العينات اجريت لها الاختبارات المناعية لتقييم الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية للقاح الحصبة الالمانية.كما تضمنت الدراسة 44 عينة دم لاشخاص ملقحين منها 22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها موجبة و22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها سالبة ، تم اختبار هاتين المجموعتين باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) لمعرفة العلاقة بين الفحصين والحساسية والنوعية لفحص (ELISA)نسبة الى فحص تثبيط التلازن الدموي . في هذه الدراسة تم قياس الاستجابة المناعية الخلطية وذلك بقياس تركيز الاضداد النوعية للحصبة الالمانية ، بالاضافة الى تقدير التركيز الكلي للكلوبيولينات المناعية صنفA وM وG.كما تضمنت الدراسة قياس الاستجابـة لمناعية الخلوية وذلك بقياس قابلية الخلايا البلعمية على البلعمة ،وقياس قابلية الخلايا اللمفاوية التي تم تحفيزها بالملزن النباتي (PHA) على التحول والانقسام . من خلال هذه الدراسة تم الحصول على النتائج التالية : - 1 - اظهرت مصول الاطفال نسبة 96.7 % ،واظهرت مصول الاناث نسبة 95 % تراكيز فعالة من الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية اعلى من 11وحدة عالمية \مليلتر باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم ELISA بعد عملية التلقيح .2 - اظهرت مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين انخفاض في اجمالي الكلوبيولين المناعي صنف GوAوبفروق معنوية (p<0.05) ( p>0.05 ) مع ارتفاع في الكلوبيولين المناعي صنف Mوبفروق معنوية عالية(p<0.01) مقارنة بمجموعتي السيطرة .3 - وجد من خلال فحص النسبة المئوية لعملية البلعمة ان كل من الاطفال والاناث الملقحين اظهروا ارتفاعا في النشاط الالتهامي للخلايا البلعمية وبفروق معنوية (p<0.05) مقارنة بمجموعتي السيطرة .4 - اظهرت نتائج فحص التحول والانقسام اللمفاوي ان هناك انخفاض غير معنوي ( p>0.05 )في مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين مقابلة بمجموعتي السيطرة . 5 - لا توجد فروق معنوية في الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية بين مجموعة الاطفال الملقحين ومجموعة الاناث الملقحات ( p>0.05 ) .6 - وجد ان فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم هو اكثر حساسية من فحص تثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية ،وعليه فهو الافضل في تقييم الاستجابة المناعية للقاح الحصبة الالمانية .7 - وجد ان هناك علاقة ايجابية قوية بين فحصي الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم وتثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية حيث كانت قيمة ( r = 0.585 ) . | The Expanded Programme on Immunization (EPI) began in Iraq in 1985, including Rubella vaccine. MMR vaccine is represent one of combined vaccines of rubella ,measles and mumps that given for children at age of 12 - 15 months. Vaccination with rubella vaccine is the best way to eradicate Congenital Rubella Syndrome which have severe complications for women in their first trimester of pregnancy These complications include severe birth defects or death of the fetus. In this study, (116) blood samples were taken from healthy individuals after 2 - 4 weeks after vaccination with rubella vaccine .(30) from children of age (12 - 18) and (20) from females at age of (12 - 15) years old . Control group included (12) healthy children and (10) healthy females ,both did not have rubella vaccine through their life .These samples were tested to evaluate the immune - states of individuals after immunization . the study include (44) blood samples tested by HItest and ELISA test . In this study specific haemagglutination antibodies & IgM antibodies were measured ,total Immunoglobulines IgM ,IgG ,IgA also determined .Lymphocyte transformation and ability of phagocyte cell to phagocytosis were measured. The following results were obtained in this study : 1. The percentage of children whom observed levels of specific antibodies ≥ 11AU/ml was 96.7% and 95% by ELISA test for children and females groups respectively after vaccination .2. The decreasing total of IgG and IgA with the increasing of IgM in both groups of children and females with significant differences (p>0.05) (p>0.05) (p<0.01) receptively comparison with control group.3. The increasing percentage of phagocytic cell to phagocytosis in both groups of children and females in significant differences (p<0.05) comparison with control group .4. The decreasing percentage of lymphocyte transformation in both children and females groups in non significant differences (p>0.05) comparison with control group .5. The non significant differences in humoral and cellular immune Response between child and female groups .6. The higher sensitivity of ELISA test to HI test in determination of rubella specific antibodies , so it is better than HI test in measuring the immune - status of individuals vaccinated with rubella vaccine .7. A positive relationship between ELISA test and HI test (r= 0.585) .

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

اسم المؤلف: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه == Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

اسم المؤلف: زهراء عباس جبر العيساوي
اسم المشرف: رسمية عبد ابو ريشة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

دور بروتين A المستخلص من جدران خلايا Staphylococcus aureus في امراضية البكتريا == Role of Staphylococcus aureus cell wall protein A in the pathogenesis of the bacteria

اسم المؤلف: سمير عبد الامير عبد علي علـش
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | علي عبد الرحمن طه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ا عتمد في اجراء هذه الدراسة على 20 عزلة مرضية من بكتريا Staphylococcus aureus ا خذت من مختبر الصحة المركزي مشخصة باستعمال نظام ابي للعنقوديات (API - Staph . Ident . System) . ا عيد تشخيص جميع العزلات عن طريق استخدام الاختبارات الكيموحيويه من اجل التثبت بشكل دقيق من هويتها ، وقد جاءت العزلات جميعها متوافقة مع تشخيص مختبر الصحة المركزي . ا ستخدم اختبار التلازن الدموي ( (Haemagglutination test في التحري عن وجود بروتين A في عزلات S . aureus المشخصة جميعا ، وقد اظهر هذا الاختبار تباينا ملحوظا في نسبة امتلاك هذه العزلات لبروتين A . فقد برزت العزلات ذوات الارقام 1 ، و5 ، و6 ، و7 ، و9 بوصفها عزلات ذات محتوى عال من بروتين A . اما العزلات ذوات الارقام 8 ، و10 ، و11، و12، و13، و14 ، و15، و17، و18، و19 ، و20 ظهرت انها ذات محتوى متوسط من بروتين A . فقط العزلة ذات الرقم 16 ظهرت انها فقيرة المحتوى من بروتين A . بينما كشف ووفق الاختبار المستعمل عدم امتلاك العزلات 2، و3 ، و4 اي محتوى من بروتين A . ا نتخبت العزلة رقم ( 1 ) كعزلة مثالية من اجل انجاز هذه الدراسة لكونها تميزت بمحتوى عال من بروتين A فضلا عن انها تقدمت على بقية العزلات في اعطاء النتيجة الموجبة لاختبار انتاج انزيم Coagulase ، وكذلك في اظهار تحللا كاملا وشديدا في اختبار انتاج حالة الدم Hemolysin . ا ستخلص بروتين A الخام (Crude protein A) على مرحلتين . كانت المرحلة الاولى باتباع طريقة (Lind , (1974 ( طريقة التعليق بالصوديوم ازايد ) بوصفها طريقة سهلة وغير مكلفة في الحصول على مستخلص بروتين A المرتبط بجدار الخلية العنقودية للعزلة رقم ( 1 ) (Cell - bound protein A) بشكل كامل مع الحفاظ وبدرجة عالية على وحدة التركيب البنائي لبروتين A من اية تشوهات . اما المرحلة الثانية كانت باتباع طريقة ( Seki et al .,( 1985 طريقة مكملة للطريقة الاولى وذلك بترسيب بروتين A الطافي بكبريتات الامونيوم ( 85 % اشباع ) مع بقاء بروتين A المترسب محتفظا بفعاليته . ا دخل مستخلص بروتين A الخام عملية التنقية ( Purification) وهي كذلك كانت على مرحلتين . المرحله الاولى استخدمت فيها طريقة كروماتوغرافيا التبادل الايوني (Ion - exchange chromatography) بعمود ( DEAE - Cellulose ). اما المرحلة الاخرى فقد تضمنت استخدام طريقة كروماتوغرافيا الترشيح بالهلام (Gel - filtration chromatography) بعمود Sepharose CL - 6B) ) . انتهى استخدام الطريقتين في الحصول على مستخلص بروتين A منقى ( Purified protein A ) .ومن اجل التحري عن احتفاظ مستخلص بروتين A الخام والمنقى بفعاليته استخدم اختبار الانتشار المناعي الثنائي في الهلام الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون الخطوط الترسيبية التي نتجت من تفاعل مستخلص بروتين A الخام والمنقى مع IgG لمصل دم خنزير غينيا .قدر تركيز مستخلصات بروتين A ( الخام والمنقى جزئيا والمنقى ) باتباع طريقةBradford, ( 1976 ) . حيث بلغت التراكيز 63 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A الخام ، و42 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى جزئيا ، و36 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى .تم استخدام الفئران البيض من نوع ( Balb C ) من اجل الوصول الى التاثيرات المرضية لمستخلص بروتين A المنقى . حيث حقن المستخلص بطريقة الحقن داخل البريتون Intraperitonial injection)) بعدد سبع حقنات ، وبمعدل 0.1 مليلتر لكل حقنة ( ذو التركيز 36 مايكروغرام / مليلتر ) ، يفصل بين حقنة واخرى يوم واحد . اظهرت مجموعة فئران البحث المحقونة ببروتين A المنقى على المستوى السريري خمولا عاما بدا واضحا بعد الحقنة السادسة . لم تظهر اية تغيرات مظهرية جلدية في مناطق الحقن كما لم تحدث وفيات . بعد قتل الفئران وتشريحها جميعا ا ستاصلت اعضاء القلب ، والطحال ، والكبد ، والكليتين ، والامعاء ، والمعدة ، واخيرا الرئة . وبالموازنة مع اعضاء فئران السيطرة لوحظ حدوث تضخم كبير في الطحال . كما اظهر الكبد تضخما ملحوظا وهذا سجل في الفئران المحقونة ببروتين A المنقى . لم يسجل حدوث تغيرات على المستوى المظهري في اعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة ولكن لوحظ وجود بقع سوداء اللون على السطح الخارجي لنسيج الكبد ، والكليتين ، وهو ايضا سجل في فئران الدراسة اجمع .اهم ما برز في هذه الدراسة هو حجم التاثير المرضي الذي اصاب عضو الرئة حيث ظهر بشكل غريب فقد بدا النسيج يميل الى السواد ببهوت وهو ما كان واضحا في سبعة من فئران الحقن ، اما الثلاثة الباقية شوهدت الرئة فيها خلال التشريح وهي مغطاة بعض من اجزائها بالدم .كشف الفحص النسيجي لاعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة عدم وجود اية تاثيرات مرضية ناتجة من حقن بروتين A المنقى . اما الطحال فقد شهد حدوث توسع كبير في منطقة اللب الابيض White Pulp)) مع احتقان دموي بارز وانتشار للخلايا المولدة للصفيحات الدموية (Megacaryocytes) . اما الكبد فقد برز فيه حدوث تلف بسيط (Mild degenerative change) في خلايا الكبد مع ارتشاح خلايا احادية النواة (Monocytes) خصوصا في المنطقة البوابية التي بدت متوسعة نوعا ما . كما لوحظ زيادة في خلايا كبفر ((Kupffer cells في عموم نسيج الكبد . الكليتين شهدت بروز زيادة في الخلايا المكونة للكبيبة الكلوية ( Glomeruli) والتي يطلق عليها ( Mesengial cells ) .عضو الرئة تضمن الفحص النسيجي له تاثيرات عدة وهي كما يلي : 1 - احتقانات دموية كبيرة ( Bloody congestions ) .2 - وذمة ( Oedema ) .3 - ارتشاح خلايا التهابية ( Inflammatory cells infiltration) .4 - توسع في الفسح القصبية ( Alveolar spaces) مكونا ما يسمى بظاهرة Emphysema)) اي انتفاخ حويصلات الرئة . بدت الرئة للفئران المحقونة جميعا ببروتين A المنقى اكثر الاعضاء التي اظهرت تضررا نسيجيا كبيرا موازنة بالضرر في بقية الاعضاء .تم اجراء اختبار التحري عن السمية الخلوية لبروتين A المنقى باستخدام تقنية مزرعة الخطوط الخلوية الطبيعية ( Normal cell lines - culture ) حيث اعطى الاختبار نتيجة سالبة اي عدم امتلاك بروتين A المنقى تاثيرا سميا (Toxic effect) في الخلايا النامية . | This study dealt with ( 20 ) diagnosed isolates of Staphylococcus aureus by "API - Staph . Ident . System". which were taken from the central health laboratory . The diagnosis was repeated so as to confirm the identity of those isolates by using biochemical tests whose results were the same as those of the central health laboratory .The haemagglutination test was used to investigate the presence of protein ( A ) in all S . aureus isolates . The results markedly showed differences in content concerning the ratio of this protein , thus isolates numbered 1 , 5 , 6 , 7 and 9 gave high content of protein ( A ) , but the isolates numbered 8 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 17 , 18 , 19 and 20 gave medium content of protein ( A ) . Isolate numbered 16 was the only isolate that has low content of protein ( A ) . On the other hand , isolates numbered 2 , 3 and 4 gave no content of protein ( A) .The isolate number ( 1 )has been chosen as an optimal isolate to accomplish this study , Because of its high content of protein ( A ) , furthermore it was the best isolate in getting positive result concerning the test of coagulase production , and in giving a complete and intensive result concerning the test of hemolysin production . Crude protein ( A ) was extracted by two steps : Lind method ( Lind , 1974 . ) "Suspending in sodium azide" was followed at the first step as an easy and a cheap method in getting a thorough cell - bound protein ( A ) extracted from the isolate number ( 1 ) with high preservation of the structural unit without any deformation .The Seki et al .,( 1985 ) method was followed in the second step as a completion method to the first one , by the precipitate of the supernatant protein ( A ) using ammonium sulfate ( 85 % saturation ) . The function of precipitated protein ( A ) was perfect . In order to get a purified protein ( A ) extract from crude protein A , purification was accomplished by two steps : Ion - exchange chromatography by DEAE - cellulose column was used in the first step , While Gel - filtration chromatography by Sepharose CL - 6B column was used in the second step . Double immunodiffusion in gel was used to investigate the preservation of the crude and purified protein ( A ) with its full function . This test gave a positive result by forming the precipitate lines as a result of the interaction between protein ( A ) ( Crude and Purified ) and IgG of guinea pig sera .Bradford method was used to estimate protein ( A ) extracts concentration ( Crude , Partial purified , Purified ) . The estimation was 63 microgram / ml for crude extract , 42 microgram / ml for partial purified extract and 36 microgram / ml for purified extract .white mice ( Balb C ) were used to investigate the pathogenic effects of purified protein ( A ) . Intraperitonial injection method was used to inject 0.1 ml of 36 microgram / ml of purified protein ( A ) for 7 times with a one - day separating period . The injected mice with purified protein ( A ) showed general weakness which was very clear after the sixth injection . there were no phenotypic dermal change in the injection area , and no dead mice as well .After killing and dissecting of all the mice , the organs of heart , spleen , liver , kidney , intestine , stomach and lung were eradicated . There were a great enlargement in spleen and a little in liver in all injected mice in comparison with the control mice . No phenotypic changes appeared in heart , intestine and stomach , but black spots were shown on the outer surface of kidney and liver tissue which were presented in all the injected mice . The most important results in this study is the great size of pathogenic effects in lung . The shape of its tissue seemed strange and tended to be faint black with which was obvious in seven mice . The lung of the three others ( some parts ) showed during anatomy covered by blood .The histological check for heart , intestine and stomach showed no pathogenic effects resulted from protein ( A ) injection . In the spleen , there was a huge expanding in the white pulp region , with blood congestion while the spreading of megacaryocytes has increased . The liver showed mild degenerative change in liver cells with monocytes infiltration especially in the entrance region which appeared expanded . Also there was an increase in kupffer cells in all liver tissue .Kidney showed increase in mesengial cells which are concedered the forming units of glomeruli .The histological check of lung included the following : 1 - Bloody congestions .2 - Oedema .3 - Inflammatory cells infiltration .4 - Alveolar spaces expanding forming '' Emphysema '' .The lung was the most effected organ that showed tissue injury among other all organs . The normal cell lines - culture technique was followed to investigate cellular toxicity of the purified protein ( A ) which gave a negative result , that means , there was no toxic effect of purified protein ( A ) on the growth cells .

انتاج واستخلاص الكلوكان من خميرة Saccharomyces cerevisiae ودراسة تاثيره في تحفيز الخلايا البلعمية خارج الجسم الحي == Production and extraction of glucan from yeast Saccharomyces cerevisiae and study it's effect in stimulation of phagocytic cells in vitro

اسم المؤلف: علي عبد الواحد عبد الربيعي
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على خمس عزلات من خميرة الخبز Saccharomyces cerevisiae اخذت من نماذج مختلفة من الخمائر الجافة المتوافرة في الاسواق المحلية المستوردة من عدة مناشىء ، تم تشخيصها استنادا الى الاختبارات المظهرية والزرعية والكيموحيوية التي اشارت الى انها تعود الى الخميرة المذكورة . استخدمت ست طرائق مختلفة لاستخلاص الكلوكان من الخميرة وكانت ثلاث من هذه الطرائق مستخدمة في دراسات اخرى وثلاث طرائق تم تحويرها وفق الية عمل جديدة تختلف نوعا ما عن الطرائق الثلاث الاخرى ، اظهرت النتائج ان طريقة التحلل الذاتي وطريقة الموجات الصوتية الفائقة (Ultrasonication) المحورتان كانت اكثر ملائمة في الحصول على مستخلص عالي النقاوة حيث اعطت طريقة التحلل الذاتي مستخلصا بنقاوة 94 % واعطت طريقة الموجات الصوتية الفائقة مستخلصا بنقاوة 91 % وكان وزن المستخلصين 4.8 غرام /100 غرام خلايا لطريقة التحلل الذاتي و5.5 غرام / 100 غرام خلايا لطريقة الموجات الصوتية الفائقة ، وان اعلى كمية من مستخلص الكلوكان قد تم الحصول عليها بطريقة Byron 1 والتي بلغت 6.25 غم /100 غرام خميرة بنسبة نقاوة 71 % ، وكانت هذه الطريقة هي الاقل استهلاكا للوقت وللمواد المستخدمة في الاستخلاص بين الطرائق المستخدمة.تم الكشف عن وجود الكلوكان في المستخلصات النهائية باستخدام تقنية الـFT - IR ، بينت نتائج الفحوصات احتواء جميع النماذج على بيتا (3،1) كلوكان ، ولوحظ ايضا خلو جميع النماذج من اي مركب سكري اخر مثل المانان او الكلايكوجين فضلا عن خلوها من البيتا (6،1) كلوكان ، باستثناء ما اشارت اليه الفحوصات من احتواء احد النماذج ( الانموذج G.1) الذي تم الحصول عليه بطريقة (Sakai 1) على نسبة من الكايتين دون بقية النماذج .تم غربلة عزلات الخميرة بالاعتماد على محتواها من الكلوكان ولوحظ ان العزلة S. cerevisiae Sc3 تحتوى على اعلى نسبة من الكلوكان بلغت 3.827 % (وزن /وزن ) من الوزن الجاف للخلايا ، في حين ان اعلى كتلة حيوية للخلايا تم الحصول عليها من العزلة S. cerevisiae Sc5 والتي بلغت 0.8778 غم /100 مللتر . درس تاثير بعض الظروف في انتاج الكلوكان من خلايا الخميرة ولوحظ ان نسبة الكلوكان في الخلايا تختلف باختلاف ظروف النمو ، واشارت النتائج الى ان درجة الحرارة المثلى لانتاج الكلوكان هي 35 م والرقم الهيدروجيني الامثل 6 والمصدر الكربوني الامثل هو السكروز في حين كانت مدة الحضانة المثلى هي 48 ساعة كما لوحظ ان استخدام الحاضنة الهزازة بسرعة 100 دورة / الدقيقة في حضن المزارع يعطي نسبة اعلى من الكلوكان قياسا مع استخدام الحاضنة الساكنة ، استعملت انواعا من الاوساط الخام الطبيعية في تنمية الخميرة مثل وسط مستخلص التمر ومستخلص النخالة التي يمكن ان تكون ملائمة للاستعمال بنطاق واسع وتحقيق مردود اقتصادي فضلا عن الاوساط المختبرية التقليدية المستعملة في الدراسات والبحوث مثل وسط Yeast extract peptone dextrose (YEPD) وبينت النتائج ان وسط مستخلص التمر كان الافضل في الحصول على اعلى نسبة من الكلوكان والتي بلغت 4.664 % (وزن / وزن ) من الوزن الجاف للخلايا كما ان هذا الوسط قد اعطى ايضا اعلى كتلة حيوية من الخلايا بلغت 0.9864 غم / 100 مللتر . درس تاثير ثلاث نماذج من الكلوكان في عملية التهام خميرة Candida albicans من قبل خلايا الدم البيض متعددة اشكال النوى (Polymorphonuclears) خارج الجسم الحي ، تضمنت الانموذج G.3 الذي تم الحصول عليه بطريقة (Byron 1) والانموذج G.5 الذي تم الحصول عليه بطريقة الموجات الصوتية الفائقة والانموذج G.6 الذي تم الحصول عليه بطريقة التحلل الذاتي ، بينت النتائج ان النماذج الثلاثة كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز نماذج الكلوكان باستثناء التركيز 100 مايكروغرام / مل للانموذج G.3 حيث لم يلاحظ وجود زيادة معنوية في معامل البلعمة قياسا مع معاملة السيطرة ، ولوحظ ان الانموذج G.6 الذي تم الحصول عليه بطريقة التحلل الذاتي وهو الاكثر نقاوة كان هو الافضل في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة قدرتها على الالتهام وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه عند التركيز 500 مايكروغرام / مللتر لهذا الانموذج . | Five isolates of the Saccharomyces cerevisiae were obtained from different samples of commercial dry baker yeasts that imported from different origins which purchased from local markets , they were identified depending on morphological , cultural and biochemical tests . Six different extraction methods have been used to extract glucan from the yeast , three of these methods are well documanted in previous studies and ,while the other three methods have been modified (in this study) using new technique differ from the other methods . The results showed that the autolysis and the ultrasonication methods were the best to obtain highly purified extracts , the autolysis method gave glucan extract with 94% purity and the ultrasonication method gave extract with 91% purity , the weight of extracts was 4.8 g /100 g of yeast by the autolysis method and 5.5 g / 100 g of yeast by the ultrasonication method ; The maximum quantity of glucan extract was obtained by (Byron 1) method which is reached 6.25 g/100g of yeast with 71% purity , this method was the least time and materials consumption among the extraction methods used in this study. The presence of glucan in the final extracts that obtained from these methods have been detected by the FT - IR technique , the results shown that all samples contain beta (1,3) glucan , and all samples did not contain any other carbohydrates such as mannan or glycogen as well as beta (1,6) glucan , with exception of sample (G.1) which extracted by (Sakai 1) method contained a proportion of chitin .The S. cerevisiae isolates have been screened depending on glucan content , S. cerevisiae Sc3 gave the highest glucan content reached to 3.827 % (wt / wt ) of dry weight of cells , while the highest cells biomass have been obtained from the S. cerevisiae Sc5 was 0.8778 g/100 ml.The effect of some cultural conditions on glucan content was studied and showed that glucan contents varies with different growth conditions , the result showed that the favorable conditions for glucan production are culturing the yeast in media containing sucrose (5%) with pH 6 and incubated at 35°C in a shaker incubator with 100 rpm for 48 hrs. Some natural crude materials such as date extract and wheat bran were utilized as media for growing of yeast and production of glucan to achieve the economical advantages , date extract was the favorable medium for glucan production since high content of glucan (4.664 % of dry weight of cells ) and highest cells biomass (0.9864 g/100 ml) was achieved from this medium . The effect of three glucan samples on phagocytic process of Candida albicans cells by the polymorphonuclear (PMNs) leucocytes have been studied in vitro , the samples used were G.3 which extracted by (Byron 1) method and G.5 which extracted by (Ultrasonication) method and G.6 which extracted by (autolysis) method, and the results showed that all samples had clear effect in stimulation of the phagocytic cells and increase its phagocytic activity , the stimulating effect increased with increasing of sample concentration , with exception of the concentration 100 µg / ml of sample G.3 which had no significant increasing in the phagocytic index (PI) , the sample G.6 which was obtained by the autolysis method with highest purity was the best in stimulation of the phagocytic cells , and the maximum phagocytic index was obtained at the concentration 500 µg / ml of this sample .

التعبير السايتوبلازمي للانزيمات المحللة للبروتين MMP - 2, - 9 ومثبطاتها في النسيج TIMP - 1, - 2 وتعبير مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي Fas ligand في سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة البولية == Cytoplasmic expression of matrixmetalloproteinases (MMPs) Vs Tissue inhibitor of metalloproteinases (TIMP - 1, - 2) and expression of death receptor (Fas) , and it's specific ligand (FasL)in Transitional cell Carcinoma of the urinary bladder

اسم المؤلف: مي خليل اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة باستخدام 36 نموذجا نسيجيا مطمورا بشمع البرافين ماخوذا من مرضى مصابين بسرطان الخلايا الانتقالية في المثانةTransitional cell carcinoma (TCC ) بالاضافة الى 10 نماذج نسيجية طبيعية ماخوذة من معهد الطب العدلي . النماذج جميعها خضعت لتقنية التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي Immunohistochemistry للتحري عن التعبير السايتوبلازمي لانزيمات MMP - 2 وMMP - 9 ومثبطاتها النسيجية TIMP - 1 وTIMP - 2 فضلا عن التحري عن التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول mRNA لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL باستخدام تقنية التهجين الموضعي In situ hybridization .اظهرت نتائج هذه الدراسة ان نسبة اصابة الذكور الى الاناث بـTCC هي 1 : 3 وان معدل اعمار المصابين كان 60 سنة . واعتمادا على نتائج التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي اظهرت النتائج وجود زيادة معنوية في التعبير السايتوبلازمي عن MMP - 2(P<0.05) يقابلها انخفاض معنوي في التعبير عن TIMP - 2 في الانسجة السرطانية مقارنة بالانسجة الطبيعية (P<0.05) . وعندما صنفت النماذج السرطانية اعتمادا على التغيرات النسيجية المرضية وجد ان كلا من انزيمي MMP - 2 وMMP - 9 يملكان علاقة ايجابية بتطور درجات الورم Tumor grades اذ يزداد التعبير السايتوبلازمي عن هذين الانزيمين كلما ازدادت درجة الورم (p<0.05) ، (p<0.05) بالتتابع . الا انه لم تظهر اية فروقات معنوية في التعبير عن هذه الانزيمات ومثبطاتها بتطور مرحلة الورم Tumor stages (p>0.05) .اما نتائج التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL فقد اظهرت زيادة معنوية في التعبير عنهما في الانسجة السرطانية عندما قورنت بالانسجة الطبيعية (P<0.05) و(P<0.05) بالتتابع كما لوحظ ان تعبير الخلايا السرطانية الانتقالية عن FasL يتناسب طرديا مع تقدم كل من درجة الورم ومرحلته Tumor grade and stage فهناك فرق معنوي في التعبير عن FasL بين الدرجة الاولى والثالثة (P<0.05) وبين المرحلة T1 وT2(p<0.05 ) .اما تعبير هذه الخلايا عن المستقبل Fas فقد لوحظ انه يتناسب عكسيا مع تطور درجات الورم ومراحله فهناك فرق معنوي في تعبير هذه الخلايا عن Fas بين درجة واخرى (p<0.05) وبين مرحلة واخرى (p<0.05) . في الوقت الذي لم يظهر فيه تعبير الخلايا اللمفاوية عن Fas وFasL اختلافا مع تطور درجات الورم ومراحله(P>0.05) و(P>0.05) بالتتابع .وعندما قورنت المعلمات الثمانية احصائيا مع درجات تطور الورم ومراحله ظهرت علاقة طردية معنوية بين MMP - 2 ودرجة الورم (P<0.05) وبين MMP - 9 ودرجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(p<0.05) على التوالي . كما لوحظت علاقة طردية عالية المعنوية في تعبير الخلايا السرطانية عن FasL مع تقدم درجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(P<0.01) على التوالي .من هذه الدراسة نستنتج ان فرط التعبير عن كل من MMP - 2وMMP - 9 وFasL له علاقة بتقدم اورام TCC واجتياحها. | This study was designed by using 36 paraffin embedded tumor tissues obtained from TCC patients , and 10 normal bladder tissues obtained from forensic medicine institute . All specimens undergone to Immunohistochemistry technique to investigate the cytoplasmic expression of MMP - 2, MMP - 9 and their tissue inhibitors TIMP - 1 and TIMP - 2 ; in addition to the in situ mRNA expression of each death receptor (Fas) and its specific Ligand (FasL ) by using in situ hybridization technique. This study showed that male to female infection ratio was 3 : 1 and the mean age of patients was 60 years . Regarding immunohistochemical staining ; MMP - 2 cytoplasmic expression showed significant increase (P<0.05) with significant TIMP - 2 dicrease in tumor tissues compared with normal tissues (P<0.05).According to the histopathological criteria of malignant tissues ; MMP - 2 and MMP - 9 showed a positive relation with tumor grade progression ; so cytoplasmic expression of there enzymes was increased with tumor grade increase (p<0.05) , (p<0.05) respectively ; but there was no significant difference in there enzymes and their inhibitors expression with tumor stage progression (p>0.05).Rgarding in situ mRNA expression of Fas and Fas L ;results of this study reveled that a high significant expression in malignant tissues compaired with normal tissues (p< 0.05 ), (P > 0.05) respectively .Moreover ,FasL expression on transitional malignant cells has a linear increase with tumor grade and stage progression ; there was a significant difference in FasL expression between grade I and grade III(P < 0.05) and between stage T1 and T2 (P < 0.05) . while we found an inverse relation between Fas expression on these cells and tumor grades and stages progression ; there was a significant difference among grades and among stages (P < 0.05) , (P < 0.05) respectively. while there was no significant differences in Fas /FasL expression on lymphocytes and tumor grade and stage progression (P>0.05), (P>0.05) respectively. When we statistically compare the eight markers with tumor grades and stage ; we showed a significant linear relation between MMP - 2 and tumor grade (p<0.05) ; also between MMP - 9 and tumor grade and stage (p<0.01), (p<0.05) respectively. On the other hand , a highly significant liner relation was showed between Fas L expression on transitional malignant cells tumor grade and stage progression (p<0.01) , (p<0.01) respectively .From this study we conclude that overexpression of MMP - 2 , MMP - 9 and FasL are correlated with TCC invasion and progression

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

اسم المؤلف: ايمان جواد كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.
1 ... 7 8 9 10 11 ... 21