Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي

Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان

Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي

Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي

Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي

General topic: Biology

Specific topic: Life Science

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل

Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

تاثير التلوث بالمواد العالقة بالهواء واثره على البيئة == THE IMPACT OF POLLUTION ON THE SUSPENDED AIR PARTICLES AND THEIR EFFECT ON ENVIROMENT

Author name: يسرى بدري نوري الحسيني

Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تناولت هذه الدراسة عدة مواقع من مدينة بغداد في جانبي الكرخ والرصافة، اذ كان الاختيار على اساس الكثافتين المرورية والسكانية، والتي يتمخض عنهما مخلفات حرق الوقود المضاف اليه رابع اثيلات الرصاص وحرق القمامة الناتجة من الفعاليات البشرية المختلفة، مصدرا للتلوث. لذا اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على العناصر الملوثة (الكادميوم، النيكل، الرصاص، الحديد) كملوثات للمنظومة البيئية (تربة - نبات). من خلال تقدير هذه العناصر كما ونوعا في نباتات وترب الدراسة، مع الاخذ بالحسبان التغيرات الفصلية. جرى اعتماد النباتات المعمرة الدفلة Nerium oleander والزيتون Olea europea والنخيل Phoenix dactylifera والترب المزروعة فيها مادة لهذه الدراسة، اذ قيست تراكيز هذه العناصر في الاوراق النباتية المغسولة وغير المغسولة لفصلي الشتاء والصيف وما بعد المطر ومعرفة اي من هذه الحالات الاكثر امتصاصا، كما قيست الكميات المتجمعة من العوالق على اسطح تلك الاوراق بالمقارنة مع مساحة سطح الورقة ومعرفة اي الانواع الاكثر تجميع هذا من جانب، ومن جانب اخر قيست هذه العناصر المرتبطة بمكونات التربة ذات المساحة السطحية العالية (الطين، المادة العضوية، اكاسيد الحديد، كاربونات الكالسيوم ) بطريقة الاستخلاص المتعاقب ومقارنة قيمها بقيم التواجد البيدوكيميائي الطبيعي له في التربة. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ما ياتي : 1 - ان اوراق نباتات النخيل كانت الاكثر تجميعامن حيث كمية الدقائق العالقة على سطح الورقة، تلى ذلك اوراق نبات الدفلة والزيتون. 2 - كان تركيز عناصر الدراسة في اوراق النباتات المغسولة اقل مما في غير المغسولة اذ سجلت تراكيز العناصر في اوراق النباتات المغسولة الترتيب الاتي بعد المطر > فصل الشتاء > فصل الصيف، ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر سلوكا مختلفا عن بقية العناصر وكما في التسلسل الاتي فصل الصيف > بعد المطر > فصل الشتاء.3 - شكلت تراكيز عناصر الدراسة في اوراق الزيتون غير المغسولة اعلى قيما من بين عناصر الدراسة فيما سجلت اوراق نبات الدفلة القيم الاعلى من تراكيز هذه العناصر في الاوراق المغسولة. 4 - دلت تحريات التربة وتحاليلها على الالفة العالية لجميع عنلصر الدراسة مع مفصول الطين ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر ميلا شديدا للارتباط مع الاكاسيد الحرة ( الحديد والالمنيوم ). 5 - بينت المقارنة البيدوكيميائية لقيم عناصر الدراسة مع القيم الاصلية لها ان عنصري الكادميوم والنيكل لم يتجاوزا الحد المسموح بالتلوث فيما تجاوز ذلك كل من عنصري الرصاص والحديد. | This study deals with many sites in Baghdad, both Karh and Russafa. The choice of theses sites are according to the traffic and residential density, which result wastes from burning the fuel that contains lead Tetra ethelate and the burning of garbage that result from human activities and other pollution resources. This study is made to shed light on the polluted elements (Cadmium, Nickel, Lead and Iron) as causers of pollution to environment (soil - plant), through estimating these elements quantitively and qualitatively in the soils and plants of the study, with taking into consideration the seasonal changes.The long - lived plants are regarded in the study like Nerium Oleander, Olea europea and phoenix dactylifera and the soil of plantation.The concentrations of these elements in washed and non washed plants leaves in winter and summer seasons and after rain falling are measured to know which one is the most absorptional. The quantities of suspended particles on leaves surface are measured to be compared with the leave's area and to know which one is the most precipitated.On the other hand, these elements that are bounded with soil components of specific high surface area (clay, organic matter, Iron oxide) calcium carbonate) are estimated by sequence extraction, and comparing their values with the Bedochemical values in the soil.The study reaches the following results : 1. The leaves of palm - date is the most accumulated of the suspended particles amount on leave surface, then Nerium and olive respectively.2. The concentration of the study elements is on higher level in the washed leaves rather than the non - washed leaves. It is reported that the elements in the washed leaves are as the following sequence post - rain> winter> summer, except for Fe which has different behavior as in this sequence summer> post - rain> winter. 3. Nerium shows the higher concentrations of the elements in the washed leaves, while olive shows the higher concentrations of these elements in non - washed leaves.4. The soil investigation of the study indicates that all elements of the study have high binding with the clay except for Fe which has great tendency to be bounded with free oxides (Iron and Aluminum).5. The Petrochemical comparison of the values of cadmium and nickel do not exceed the boundary of pollution while iron and lead do

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي

Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

دراسة انتاجية البكتريوسين من بكتريا Enterococcus faecium المعزولة من مصادر سريرية == Study of the Bacteriocin production from Enterococcus faecium isolated From clinical sources

Author name: هاله عباس جاسم

Supervisor name: خليل مصطفى خماس | شروق ريس كاظم

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تضمنت الدراسة جمع 290 عينة سريرية من المرضى الراقدين والمراجعين لمستشفيات بغداد وتوزعت هذه العينات الى 177عينة ادرارو113 عينة خروج ، اظهرت نتائج الزرع البكتريولوجي على وسط المكورات المعوية الانتخابي Ej media ووسط المكورات المعوية التاكيدي Bile esculin azide agar والتشخيص المظهري والكيميوحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API 20 strep تشخيص 27عزلة(%9.31) من بكتريا Enterococcus faecium من عدد العينات الكلي ،وكانت 11 عزلة ( 6.21%) منهامن الادرارو16 %14.15)) عزلة من الخروج . اختبرت حساسية عزلات E.faeciumل11 نوع من المضادات الحيوية واظهرت النتائج مقاومة عالية لل Naldixic acid(81%)و (63%) TetracyclineوAmpicilin (52%)بينما كانت المقاومة لل Ciprofloxacin(48%)و(41%) Erythromycin .ومن الناحية الاخرى اظهرت العزلات مقاومة واطئة لل Penicillin (26%) وNitrofurantion (22%)و وVancomycin (18%)وكانت (19%)لل Trimethprim و(15%)Chloramphenicol. كانت (7%)فقط من العزلات مقاومةللGentamycin.اجريت تجارب التحري عن البكتريوسين من بكتريا E.faecium وكانت جميع العزلات منتجة (100%)ولمدى واسع من التاثير على البكتريا الموجبة والسالبة مع اقطار تثبيط (8 - 15 )مليمتر و(9 - 27)مليمتر على العزلات العائدة لنفس النوع . اختيرت العزلة EH(1) كعزلة كفوءة الانتاج مع فعالية نوعية 1.28 وحدة/مايكروكرام بروتين بتركيز بروتين 250 مايكروكرام /مليمتر بعد ان قيست الفعالية في العزلات(EH1,EH6,EH13) التي كانت افضل العزلات انتاجية للبكتريوسين بطريقة الاقراص. ووجد ان وسط Mann Regusa Sharp السائل والصلب هو افضل وسط لانتاج البكتريوسين من بكتريا E.faecium وان هذه البكتريا تنتج البكتريوسين في درجات حرارية بين 16 - 45 م ، واختيرت العزلة E3 والبكتريا Staphylococcus aureus, Staphylococcs epidermidis,Escherichia coli, Sallmonella كعزلات دالة ، استخلص البكتريوسين من العزلةE1 بصورته الخام بعد تنمية هذه العزلة على وسط Mann Regusa sharp السائل وتم الحصول على بكتريوسين ذي فعالية نوعية )1,28 وحدة / مايكرو كرام) بروتين وبتركيز بروتين 250 (مايكروكرام /مليلتر) وهذا البكتريوسين مقاوم للدرجات الحرارية (80,100، 121)م لمدة (15 و30 )دقيقة ، كذلك مقاوم لمدى من الرقم الهيدروجيني (8 - 2) ،ومقاوم للخزن في درجات حرارة (0،4 ،37) م لمدة (يوم ,اسبوع) . اجريت التنقية الجزئية للبكتريوسين الخام المستخلص من العزلة E1 بالترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع ( 40% و75% )واظهرت النتائج ان الترسيب بـ40%كان الافضل الذي بلغت الفعالية النوعيةفيه 44.137 وحدة/مايكروكرام بروتين وبتركيز بروتين 290 مايكروكرام/مليمتر . وكانت فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا ثابتةعند 80م لمدة 30 دقيقة و100 م لمدة (15,5)دقيقة لكن انخفضت فعاليته لتصل الى 0.8 )وحدة /مايكروكرام بروتين( في 30 دقيقة , وفقدت الفعاليةعند121م لمدة 15 دقيقة ، كانت الفاعلية ثابتة عند مدى من الرقم الهيدروجيني (8.5 - 5.5) والخزن عند صفردرجة مئوية لمدة اسبوع. | The study has involved collecting (290) clinical samples collected from admitted and refeard patients of Baghdad hospitals .The samples distributed into (177) urine sample and (113) faeces samples . Results from bacteriological culture on selective Enterococcus medium EJ medium , Enterococcus medium (bile esculin azide agar) in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20 strep system showed that only27 isolates (9.31%) were identified as Enterococcus faecium ,11 (6.21% ) isolate from urine samples and 16isolate (14.15% ) from faeces samples . The Antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecium isolates was tested towards 11 types of antimicrobial agents .The isolate showed a high resistance to Naldixic acid (81%) ,Tetracycline (63%) and ampicilin (52%) ,while (48%) of the isolate were resistant to Ciprofloxocin and (41%)resistant to Erythromycin . From the other hand Enterococcus faecium isolates showed low resistance to otherantimicrobial agent : Pencilin(26%),Nitrofurantion (22%) , Vancomycin (18%) and Trimethprim (19%) and Chloramphenicol (15%). Only(7%) of the isolates were resistant to gentamycin . Bacteriocin detection experments were carried on Enterococcus faecium and the results that all isolates were produce bacteriocin (100%) with wide range effect on gram positive and negative bacteria bacterial growth , with diameter (8 - 15)millimeter and (9 - 27)millimeter on the same isolates species ,EH1 isolate chosen as the best producer isolate bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration(250) microgram/ millimeter after the activity detected in isolates EH1,EH6,EH13 were the best bacteriocin production isolates by using disk method on the Mann Regusa Sharp agar . And founded the solid and broth Man Ragusa sharp medium was the best medium for bacteriocin production from E.faecium and this bacteria produce bacteriocin in tempreture degree between )16 - 45(C, E3isolate and the bacteria Salmonella ,Escherichia coli ,Staphylococcus aureus ,staphylococcus epidermidis chosen as indicating isolates, the bacteriocin extracted from E1in the crude form after growth this isolate on Mann Regusa Sharp broth and obtained on bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration (250) microgram /millimeter and this bacteriocin resistant for tempreture degrees 80,100,121 C for (15 ,30) minute also resistant to PH range (2 - 8) and resistant the storage in tempreture degree 0C,4 Cfor (day ,week). Then partial purification applied for this crude bacteriocin by precipitation with Ammonium sulphate of (40%,75%) saturation percentage .Results showed the precipitation in percentage 40% was the best with a specific activity reached in it to 44,137unit /migrogram protein and protein concentration 290 microgram/millimeter . The partial purified bacteriocin activity was stable at 80C for 30 minutes ,100C for( 5 ,15) minute ,but its activity decrease to reach to 0.8 unit/mg protein in 30 minute and lost activity in 121 C for 15 minute. Its activity was stable in PH (5.5 - 8.5) and storage at 0C for week

دراسة التاثير الخلطي لبعض المضادات الحيوية على فعالية المكونات الخلوية لبكتريا البروسيل == Study the effect of some antibiotics combination on the cell component activity for Brucella Spp

Author name: هادي حسين عباس القريشي

Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تم عزل نوعين من بكتريا البروسيلا وتحديد انماطها الحيوية وهي البروسيلا المجــــــــــهضة (Brucella abortus)والبروسيلا المالطية (Brucella melitensis)المعزولة من الانسان . وتحديد حساسيتها لمضادات الحيوية وتــــــــحديد التركيز المثبط الادنىMIC))لبعض المضادات الحيوية المستخدمة في علاج داء البروسيلوسز Brucellosis)). فضلا عن التحري عن التاثير الخلطي لمضادات الحيوية وعند التراكيز تحت المثبطة الدنيا (sub - MIC)في نموها وعلى المكونات الخلوية المتمثلة بفعاليات انزيماتها, ونفاذية غشائها الخلوي ومكونات عديد السكرايد الشحمي المستخلص منها وعوامل التصاقها (Colony factor), فضلا عن تاثيرها في طور المستعمرات والتصاق خلايا البروسيلا على سطح الخلايا الطلائية . حيث اظهرت النتائج الاتي : • ان النمطين الحيويين السابع من البروسلا المجهضة والثالث من البروسيلا المالطية هما الاكثر انتشارا .• حساسية عزلات البروسيلا المجهضة والمالطية لكل من مضادات,Gentamicin,Kanamycin,Tobramycin,Naldixic acid .فيما قاومت مضادات,Lincomycin Rifampicin , Cephalaxicin ( وعلى التوالي .• بلغ التركيز المثبط الادنى لمضادات Doxycyclin ,Tetracyclin,Streptomycin ,Erythromycin ,Rifampicin (5,10,10,40,40) مكغم/مل وعلى التوالي • وجود تاثير تازري في نمو بكتريا عند خلط كل من مضاديDoxycyclin+Rifampicin,Erythromycin+Doxycyclin ,Erythromycin+Rifampicin,Tetracyclin+Rifampicin ,Tetracyclin+Erythromycin• غير مضاد Doxycyclin طور المستعمرات الملساء للبروسيلا الى طورها المتوسط فيما لم يوثر مضاد Rifampicin في طور المستعمرات فبقيت ملساء, وغير خلط مضاديDoxycyclin+Rifampicin طور المستعمرات الى الطور الخشن الفاقد للامراضية . • ثبط مضاديDoxycyclin+Rifampicin انتاج انزيمات Catalase ,Urease ,Oxidase ,Nitrate reductaseمن قبل البروسيلا المالطية والمجهضة عند استخدامها بصورة مفردة وخلطية • جاء التاثير الخلطي لمضادات Doxycyclin+Rifampicin تازريا في مكونات عديد السكرايد الشحمي عندما خفض نسبة المكونات السكرية والدهنية في مستخلص عديد السكرايد الشحمي بطوره المائي والفينولي لتبلغ المكونات السكرية للمستخلص(147,144) مكغم/مل للبروسيلا المجهضة بطورها المائي والفينولي وعلى التوالي و(145,138)مكغم/مل للبروسيلا المالطية وبطوريها المائي والفينولي . ومقارنة مع معاملة السيطرة(172,189) مكغم/مل بطوريها المائي والفينولي . اما المكونات الدهنية فبلغت لمستخلص البروسيلا المجهضة (60.6,56.5 )مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي ولمستخلص البروسيلا المالطية (44.4,36.3 )مكغم/مل وعلى التوالي لطوريها الفينولي والمائي ومقارنة بمعاملة السيطرة للبروسيلا المجهضة (82.1,77.3) مكغم/مل وللبروسيلا المالطية(92.1,64.6) مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي .• تبين قدرة كل من البروسيلا المالطية والمجهضة على تكوين عوامل الالتصاق بانواعـــــــــــها الثلاثة (CAF/I, CAF/II ,CAF/III), فضلا عن تكوينها لانواع اخرى من عوامل الالتصاق تم الكشف عنها وبطرائق محورة . كما استطاعت المضادات الحيوية المستخدمة خــــــــــلطا (Doxycyclin+Rifampicin )من منع خلايا البروسيلا عن تكوين هذه العوامل كافة.• اثر استخدام مضادي Doxycyclin+Rifampicinخلطا على خفض عدد خلايا البروسيلا الملتصقة بسطوح الخلايا الطلائية مسببا خفض اعدادها لتبغ معدل عدد الخلايا للبروسيلا المجهضة 6, وللبروسيلا المالطية 3 مقارنة بمعاملة السيطرة 51 و55 وعلى التوالي .• تسبب معاملة البروسيلا بمضاديDoxycyclin+Rifampicin خلطا خللا في نفاذية غشائها الخلوي السايتوبلازمي ونضوحا لحامضها النووي عندما بلغ طيف الامتصاص حامضها النووي(2.21,2.33) لكل من البروسيلا المجهضة والمالطية وعلى التوالي ومقارنة بمعاملة السيطرة(0.72,0.73). | Two types of Brucella isolated from human included Br. abortus and Br. melitensis were determine there biotype, Antibiotic sensitivity and MIC for some antibiotic used for brucellosis treatment were applied.mixed affect of antibiotics at concentrations of sub MIC on the growth and on cellular containt of brucella represented by enzymatic activity, cellular membrane permeability lipopolysaccharide contents,colony phase,colony adhesion factor beside adhesion on epithelial cells to brucella.the results showed that biotype 7 from Br.abortus and biotype 3 from Br. melitensis were the dominant isolated. All isolated of Br . abortus , Br. melitensis sensitive completely to gentamycin, kanamycin ,tobramycin, naldixic acid while its resistantto lincomycin ,rifampicin ,cephlothin , doxycyline The MIC to doxycycline,tetracycline,streptomycine,erythromycine,rifampicin were ( 40 , 40 , 10 , 10 ,5 ) g/ml respeactivelly.There was a synergistic effect on bacterial growth when the following antibiotics mixed as follow : ( doxycyline - rifampicin , erythromycin - rifampicin , rifampicin - tetracycline , erthromycin - tetracycline )The doxycycline had changed the colony from smooth phase to intermediate phase while the rifampicin had not affect the smooth phase . The mixed affect of doxycylin _ rifampicin have changed the smooth colonies to rough colonies .Both doxycyline , rifampicine inhibited the activity of catalase , urease , oxidase , nitrate , reductase that produced by Br. abortus and Br.melitensisThe synergistic effect of doxycycline and Rifampicin on the content of lipopolysaccharide.The mixed effect of antibiotic caused a decrase in the polysaccharides in aqueous and phenolic phases .In this case it gave a values (144,147) g/ml for Br. abortus and (138,145) g/ml for Br. melitensis in comparison with contral with read to(172,180.1) g/ml to aqueous and phenolic extraction respeactivelly. While the lipid content showed value of (60.6,56.5) g/ml for Br. abortus and (44.4,36.3) for Br. melitensis in comparison with control that gave a values (82.1,77.3) g/ml for Br. abortus and (92.1,64.6) for Br. melitensis in aqueous and phenolic phases respeactivelly .Both Br.abortus and Br. melitensis had ability to from colony adhesion factor(CAF/I,CAF/II,CAF/III) in addition to another colony factors(i.e CAF/III) that had modified due to presence of tannic acid. The mixed effect of doxycycline - Rfampicin inhibit the formation of these factor.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin causesd a decrase of brucella adhesion on the epithelial cell surface.The average of Br. abortus (6) and Br. mlitensis(3) in comparison with control 51,55 cell/filed respectively.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin caused a defeact in cytoplasmic membrane permeability hance the absorbance of Naldaxic acid a values 2.21,2.33 for Br. abortus and Br.melitensis in comparison with acontrol that showed avalues 0.72,0.73 respectivelly.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي

Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن

Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

ترافق بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض السكري النمط - 1 للانسان == Association of some human blood groups and antibodies with type - 1 diabetes

Author name: نور عبد الاله خليل حسين

Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: شملت الدراسة 126 نموذجا لمرضى السكري النمط ـ1 (T1D) Type - 1 Diabetes قورنت بـ 100 نموذجا لاصحاء مقاربة بالعمر والجنس مع المرضى. اهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم A وB وO وAB وLe(a+b - )وLe(a - b+) وLe(a - b - )و MMوMN وNNوSS وSsوss فضلا عن دراسة عيارية الاضداد للمرضى والاصحاء اذ استعملت طريقة تنميط مجموعة الدم ABO وLewis وMNSs واستعمل فحص تثبيط التراص لتحديد قابلية الافراز للنمط Le(a - b - ). جاءت النتائج لتشير الى زيادة ملحوظة في تردد مجموعة الدم O ، اذ كانت 39.68% في المرضى و28% في الاصحاء (مربع كاي 7.097 وباحتمالية P<0.01 ). فيما صاحب تردد مجموعة الدم A انخفاضا ملحوظا في المرضى فكان 20.63% اما في الاصحاء فكان 37% (مربع كاي 6.159 واحتمالية P<0.05) .اما مجموعة الدم B فظهرت بتردد 28.57% في المرضى و23% في الاصحاء (مربع كاي 3.615 واحتمالية P<0.05). وانخفض تردد مجموعة الدم AB انخفاضا طفيفا في المرضى عنه في الاصحاء ، اذ كان في المرضى 11.11% و12% في الاصحاء وبفرق غير معنوي (مربع كاي 0.804).ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض ، اذ بلغ ترددها في المرضى 30.95% فيما كان في الاصحاء 21% واشار التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية لهذا الفرق (مربع كاي 5.882 واحتمالية P<0.05). واظهرت المجموعة Le(a - b - ) دورا هاما في قابلية الاصابة بالمرض وبتردد بلغ 18.25% في المرضى و11% في الاصحاء (مربع كاي 4.604 واحتمالية P<0.05). في حين اظهرت المجموعة Le(a - b+) دورا مقاوما للمرض.وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 وذلك بارتفاع تردد الفارزين عن غير الفارزين ، فقد كان في المرضى 69.56% على حين كان في الاصحاء 45.45% وبمعنوية عالية (مربع كاي 11.601 واحتمالية P<0.01). اما مجموعة غير الفارزين فاظهرت مقاومة للاصابة بالمرض.لقد برز دور مجموعة الدم MNSs في المرض ، اذ بلغ تـردد المجمـوعة MN في المرضى 55.55% مقارنة بالاصحاء 41% (مربع كاي 6.377 واحتمالية P<0.05). وقد لعبت المجموعة Ss دورا في المرض وبتردد 23.80% في المرضى مقارنة بتردد 11% في الاصحاء (مربع كاي 7.067 واحتمالية P<0.01)، على حين كانت بعض مجاميع دم MNSs مقاومة للمرض. درست عيارية الاضداد للانماط الدموية تحت الدراسة وقد لوحظ من نتائج الدراسة وجود ارتباط بين بعض المجاميع الدموية وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب Anti - rabbit red blood corpuscles antibodies في مصول مرضى السكري النمط ـ1 مقارنة بالاصحاء اذ استعمل اختبار التحري عن عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب. كان النمطين A وAB اكثر الانماط اظهارا لعياريات عالية ، اذ بلغت في المجموعة A 1949.5 ± 938.7 . اما في المجموعة AB قد كانت 1940.6 ± 1331.3 مقارنة بالاصحاء والتي بلغت 1487.6 ± 1237.5 في المجموعة A و714.7 ± 510.4 في المجموعة AB وكان التحليل الاحصائي ذا شان (قيمة T 35.844 واحتمالية P<0.01) و(قيمة T 167.78 وباحتمالية P<0.01) على التوالي.ان المجموعة Le(a - b+) ارتفعت فيها عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب ، اذ بلغت 1852.9 ± 948.7 في المرضى و1387.3 ± 1192.1 في الاصحاء (قيمة T 51.802 واحتمالية P<0.01).اما عيارية النمط Le(a+b - ) اذ بلغت 1824.8 ± 979.6 في المرضى و1091.1 ± 1088.8 في الاصحاء (قيمة T 40.816 وباحتمالية P<0.01).على حين كانت العيارية للنمط Le(a - b - ) هي 1444 ± 1069.6 في المرضى و1198.6 ± 742.6 في الاصحاء (قيمة T 63.470 وباحتمالية P<0.01). درس مورث الافراز Secretory gene بالنسبة الى عيارية الاضداد، قد كان غير الفارزين ذو عيارية ضادة لكريات دم الارنب عالية مقارنة بالفارزين اذ بلغت في المرضى 2052.6 ± 1557.2 مقارنة بالاصحاء البالغة 1386.7 ± 794.9 (قيمة T 172.65 واحتمالية P<0.01).اما ما يخص مجموعة الدم MNSs ، فقد اظهر النمط MN عيارية مرتفعة والبالغة 1815.3 ± 962.9 وقد افترقت عن مثيلاتها في الاصحاء فكانت 1379.9 ± 1142.5 (قيمة T 162.09 واحتمالية P<0.01).كانت المجاميع O وLe(a - b - ) وLe(a+b - ) ومجموعة الفارزين والانماط MN وSsاكثر Relative risk للمرض اذ بلغت خطورتها النسبية 1.4 و1.7 و1.5 و1.5 و1.4 و2.2 على التوالي. | A total of 126 type - 1 diabetics and an age and sex comparable 100 healthy subjects were studied . The study dealt with finding the frequency of ABO , Lewis , MNSs blood groups in these subjects , besides the frequency of secretors and non - secretors were investigated.Further more , the anti - rabbit antibody immune response among diabetic and healthy subjects was investigated .The frequency distribution of ABO showed the followings :  A significant increase in O - blood group distribution was recorded : 39.68% in patients versus 28% in control (Chi2 7.097 , P< 0.01 ) . A significant decrease in patients A - blood group frequency was seen 20.63% in patients versus 37% in control (Chi2 6.159 , P<0.05 ) . A slight increase in B - blood group frequency in patients was observed (28.57%) compared to control (23%) (Chi2 3.615 , P< 0.05 ) . Likewise , AB - blood group showed a frequency of 11.11% in patients compared to 12% in the control .On the other hand , the frequency distribution of Lewis blood group showed : Le ( a+ b - ) Patients frequency was 30.95% versus 21% in control (Chi2 5.88 , P<0.05 ) . while Le ( a - b - ) gave a patients frequency of 18.25% versus 11% in control ( Chi2 4.6 , P<0,05 ) .Le ( a - b+ ) demonstrated a resistant distribution compared to control .The fraction of secretors among Le ( a - b - ) gave 69.56% versus 45.45% in healthy controls ( Chi2 = 11.6 , P<0.01 ) .The frequency distribution of MNSs blood group showed a role of MN , giving a frequency of 55.55% versus 41% in control (Chi2 = 6.37, P<0.05). Likewise , Ss gave a frequency of 23.80% versus 11% in control (Chi2 = 7.06 , P<0.01 ) .Nonetheless , some MNSs genetic types showed a decreased frequency in diabetics compared to controls .The immunological findings showed that there was an association between blood groups and anti - rabbit red blood cell antibody titers . A and AB were among the groups that gave an increase anti - rabbit red blood cell titers . The mean titer in A was 1949.5 ± 938.7 versus 1487.6 ± 1237.5 ( T 35.8 , P<0.01 ) , while the mean titer in AB was 1310.2 ± 646.3 in patients versus 714.7 ± 510.4 in controls (T 167.78 , P < 0.01).A statistically significant increase in anti - rabbit antibody titers was seen in Le ( a+b - ) and Le ( a - b - ) Lewis blood groups compared to controls .MNSs blood groups genetic types gave an increase in mean MN anti - rabbit antibody titers 1815.3 ± 962.9 versus 1379.9 ± 1142.5 ( T = 162.09 , P<0.01 ) .The relative risk in all blood groups was recorded O , Le ( a - b - ) , Le ( a+b - ) , secretors , MN and Ss showed a relatively increase risk giving a relative risks of 1.4 , 1.7 , 1.5 , 1.5 , 1.4 and 2.2 respectively .The novel findings were discussed based on the available data in the subject

تاثير مستخلصات اوراق العنب والخروع والبصل في بعض عوامل استعمار انواع بكتريا التهاب الاذن الوسطى في الانسان == Effect of Grape leaves, Caster bean and Onion extracts in some colonization factors of bacterial species isolated from otitis media in human

Author name: نضال عبد الامير علي

Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت 80 مسحة من المرضى المصابين بالتهابات الاذن الوسطى( Otitis media) المراجعين للعيادة الخارجية في مستشفى الصدر العام في بغداد وللفترة من تشرين الثاني 2007 وحتى كانون الثاني 2008. زرعت المسحات على الاوساط الزرعية (اكار الدم واكار الماكونكي) لعزل البكتريا وتشخيصها باستخدام الاختبارات المجهرية ،و الزرعية واالكيموحيوية . امكن الحصول على 69 عزلة بكتيرية من المجموع الكلي (83) وشخصت بكونها تابعة الى الانواع الاتية : (33) عزلة وبنسبة (39.75 %) Pseudomonas aeruginosa ، (11)عزلة (13.2 % ) aureus Staphylococcus ، و(8) عزلات (9.6 %) epidermidis Staphylococcus و(8) عزلات (9.6 %) Proteus mirabilis و( 5 ) عزلات(6.02 % ) تعود الى Klebsiella pneumoniae و(4) عزلات ( 4.8 %) Escherichia coli، في لم تظهر ( 14) مــسحة بنسبة ( 16.86 %) اي نمو بكتيري . اظهرت النتائج ان الاصابات المفردة هي السائدة عندما بلغت نسبتها( 96.2 %) ،بينما بلغت الاصابات المختلطة ( 3 ) اصابات فقط بنسبة (3.7%). كانت نسبة الاصابات في الاناث (57.2%) اكثر منها في الذكور (42.5 %) فيما سجلت اعلى نسبة للاصابة في الفئة العمرية (اقل من سنة - 10 سنوات) .كما تبين ان الاصابة المزمنة بالتهابات الاذن الوسطى هي اكثر شيوعا من الاصابة الحادة . لدى اختبار حساسية العزلات البكتيرية الى (18) مضادا حيويا ، اظهرت نتائج وجود مقاومة تامة (100%) لبكتريا Ps.aeruginosa ضد كل من Carbenicillin ، Doxycyclin وCeftizoxime في حين كانت حساسة جدا لمضادات Amikacin وImipenem وCiprofloxacin سوى عزلة واحدة ،اما الانواع العائدة للعائلة المعوية فكانت Pr.mirabilis وبكتريا E.coli مقاومة بنسبة (100%) لمضاد Doxycyclin دون غيره وعزلات K.pneumoniae مقاومة وبنسبة (100%) لكل من Doxycyclin وGentamycinو Pipracillin ، وكانت جميع عزلات Staphylococcus spp. مقاومة كليا Methicillin وبنسبة (100%) فيما قاومت مضادات Penicillin وAmpicillin وCloxacillin بنسب اقل . انتخبت العزلات البكتيرية وحسب شدة ضراوتها ومقاومتها للمضادات الحيوية التي شملت Ps.aeruginosa وaureus S.و Pr.mirabilisو K.pneumoniaeو E.coliلدراسة تاثير المستخلصات المائية الباردة لثمار البصل واوراق كل من الخروع والعنب في نمو العزلات ،فقد اظهر مستخلص البصل فعالـية ضد Ps.aeruginosaو aureus . Sو E.coliوعند التراكيز (750 , 1000 ,1250 ,1500 ) ملغم /مل ،عندما بلغ قطر منطقة التثبيط لكل من بكتريا aureus . Sو Ps.aeruginosa وE.coli عند تركيز 750 ملغم /مل (13 , 12 , 11) ملم وعلى التوالي . واظهر مـــستخلص اوراق الــخروع فـعاليــة ضـــد Ps.aeruginosa وaureus S. وE.coli وK.pneumoniae عند التراكيز (250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل حيث بلغت اقطار مناطق التثبيط عند التركيز 1000 ملغم /مل 15.66 , 16.33 , 16.33 , 15.33 ) ) ملم وعلى التوالي . في حين اظهر مستخلص اوراق العنب فعالية ضد جميع الانواع البكتيرية المختبرة وفي التراكيز(250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل ، عندما بلغت اقطار مناطق التثبـــــيط عند التركيز 1000ملغم/مل لكل من بكتريا aureus. S وPr.mirabilisو Ps.aeruginosaو E.coli وK.pneumoniae (32 ,21.3 , 20.6 , 18.6 , 14.3) ملم وعلى التوالي . وكان المستخلص المائي البارد لاوراق العنب هو الاكفا في تاثيره مقارنة بمستخلصات البصل واوراق الخروع . تم اختبار قابلية الانواع البكتيرية المنتخبة على الالتصاق على الخلايا الطلائية قبل وبعد المعاملة بالتركيز تحت المثبط الادنى للمستخلصات النباتية، فقد اظهر التركيز تحت المثبط الادنى للبصل تاثيرا مثبطا للالتصاق الانواع Ps.aeruginosa وaureus . Sو E.coli عندما قلل عدد الخلايا البكتيرية الملتصقة من ( 56.8 , 48.9 , 24.7 ) وعلى التوالي ليصبح (11.6 , 08 21 , 15.3)على التوالي. اظهر مستخلص اوراق العنب تاثيرا مثبطا لالتصاق الانواع المختبرة Ps.aeruginosaو aureus . Sو Pr.mirabilis وK.pneumoniaeوE.coli عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة بعد المعاملة بالمستخلص ( 12.8, 14.8, 8.3 , 16 ,12.8 ) وعلى التوالي ،اما مستخلص اوراق الخروع فقد قلل عدد الخلايا الملتصقة للانواع Ps.aeruginosa وaureus S. وK.pneumoniae وE.coliمن (56.8 , 48.9 ,46.8 ,24.7) لتصبح ( 7 , 13.6 ,4.2 ,4.5) وعلى التوالي ، كان هذا المستخلص الاكفا لتثبيط التصاق الخلايا البكتيرية بالخلايا الطلائية . | Eighty swabs were collected from patients suffering from otitis media who attended Al - sader hospital in Baghdad during November 2007 to January 2008. Swabs were cultured on blood agar and MacConkey agar media to isolate bacteria and to diagnose by microscopic cultural and biochemical testes. Ninety six isolates were isolated and identified to species as follows : (33) isolates (39.75)% were Pseudomonas aeruginosa, (11) were S.aureus with a ratio of (13.2)% and (8) isolates with a ratio of (9.6)% were S.epidermidis .(8) isolates with ratio (19.6)% were Proteus mirabilis, while (5) isolates were Klebsiella pneumoniae with a ratio of ( 6.02) % and (4) isolates with ratio (4.8)% Escherichia coli, However (14) swabs with a ratio of (16.86)% with no growth. Results showed that the infections by a single pathogen were the dominant was reached 96.2%, while the mixed infection was only (3.7)%. The infection in female were 57.2% , while in male were 42.5%. However ,the high percentage of infection were observed within the age range of less than year to ten years . Morever the chronic infection with otitis media were more dominant than the acute infection. Sensitivity of the isolates towards (18) antibiotics were performed. The results showed complete resistance (100%) of Pseudomonas aeruginosa to Carbenicillin, Doxycyclin and Ceftizoxime, while they were sensitive to Amikacin, Imipenem and Ciproflaxcin , except one isolate. Proteus mirabilis and Escherichia coli isolates were (100 )% resistant to Doxycyclin, while Klebsiella pneumoniae isolates were completely resistance (100%) to Doxycyclin , Gentamycin and Pipracillin. All Staphylococcus spp. isolates completely resisted Methicillin (100%) , but resisted Penicillin , Ampicillin , Cloxacillin at less ratios. Bacterial isolates which included Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae ,E.coli were chosen according to their virulence factors and resistant to the antibiotics , to be used for studying the effect of cold - water extracts of Allium cepa (Onion) ,Ricinus communis leaves(Caster bean) and Vitis vinifera leaves(Grape) on bacterial growth ,and adherence to epithelial cells of human . Allium cepa extracts showed activity against Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli at concentration of (750, 1000, 1250, 1500)mg/ml when the diameter of inhibition zones for S.aureus , Ps.aeruginosa, E.coli at (750)mg /ml were (13 ,12 ,11)mm, respectively . The Ricinus communis leaves extracts showed activity against Ps.aeruginosa , S.aureus , E.coli and K.pneumoniae at concentration of ( 250, 500, 750, 1000)mg /ml with diameters of inhibition zones at 1000mg/ml (15.33 ,16.33 ,16.33 ,15.66) mm , respectively. While Vitis vinifera leaves extracts showed activity against all tested bacterial species in concentrations of (250 ,500 ,750 ,1000)mg/ml with inhibition zones at 1000mg/ml concentration for S.aureus, Pr.mirabilis, Ps.aeruginosa, K.pneumoniae, E.coli (32 ,21.3 ,20.6 ,18.6 ,14.3) mm , respectively . Result showed that the cold - water extract of the Vitis vinifera leaves was the most efficient in its effects on bacterial species in comparison with Allium cepa and Ricinus communis extracts . The ability of chosen bacterial isolates for adherence before and after the treatment with sub - minimum inhibition concentration of plant extracts showed the sub - MIC for Allium cepa extract reduced the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli when the adhered bacterial cells decrease from (56.8 ,48.9 ,24.7) to be (11.6 , 21.08 ,15.3) , respectively. Vitis vinifera extract showed inhibition effect on the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae and E.coli when the average of adhered cells after the treatment with the extract were (12.8 , 14.8 , 8.3 , 16 , 12.8) , respectively . Ricinus communis leaves extracts decrease numbers of the adhered cells of Ps.aeruginosa , S.aureus , K.pneumoniae , E.coli to epithelial from ( 56.8 , 48.9 , 46.8 , 24.7) to be ( 7 , 13.6 , 4.2 , 4.5) , respectively

التحري وراثيا عن انتاج بعض انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية من بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Genetics Detection of Metallic and Extended spectrum Beta - Lactamase production from Klebsiella pneumoniae Isolated from different clinical sources

Author name: نبا علي جاسم

Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تضمنت الدراسة جمع 1600 عينة سريرية من مرضى يعانون من التهابات مختلفة ، توزعت ما بين 1500 عينة ادرار و100 عينة قشع, ومن خلال نتائج الفحوصات الزرعية والفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية ، شخصت 53 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella spp تضمنت 44 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و6 عزلات تعود للنوع K.oxytoca و3 عزلات تعود للنوع K.planticola .اختبرت حساسية عزلات بكتريا K.pneumoniae لـ 15 مضادا حيويا شملت على : Aztreonam وAmpicillinو Amikacinو Ceftriaxoneو Cefotaxime وCeftazidime[ Amoxicillin / Clavulanic acidو Meropenemو Imipenemو Ciprofloxacin Kanamycin وPipracillinو Cefepimeو CarbenicillinوStreptomycin,] . تم التحري عن انتاج هذه العزلات لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية ، اذ استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وثلاث طرائق للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية ،وتم الحصول على خمس عزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وعزلة واحدة منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية وكانت العزلات المنتجة لهذه الانزيمات تحمل مقاومة عالية للمضادات الحياتية AztreonamوCeftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وCarbenicillin وPipracillin وAmpicillinبنسبة 100%. تم تحديد التركيز المثبط الادنى(MIC) Minimum Inhibition Concentration باستخدام طريقة تخفيف الاكار القياسية،وقد اظهرت العزلات قيمة MIC عالية اتجاه المضادات قيد الدراسة (Ceftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وImipenem) اذ تراوحت القيم للعزلات المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميزالواســعة الطــيف(K22,K26,K28,K29,K36) من g/mlµ(0.1 - 0.05) لمضاد Imipenem وg/mlµ (256 - 32) لمضاد وg/mlµ (1024 - 256) لمضاد Ceftriaxone وg/mlµ (1024 - 128) لمضاد Cefotaxime. اما العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية K8 فقد كانت قيمة MIC لهg/ml µ ( 64 ,512,1024, ( 512 للمضادات (Imipenem , Ceftazidime , Ceftriaxone , ( Cefotaxime على التوالي.تــمـــت دراســــة المــحتــوى البلازمـيـــدي للــعــزلات الســـتة المنتخبة (K8, K22, K26, K28, K29, K36) واظهرت نتائج الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز امتلاك العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية (K8) حزمة بلازميدية في حين تباينت العزلات الخمسة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ، اذ احتوت العزلتين K22 وK26 على ثلاث حزم بلازميدية ، بينما العزلة K36 على حزمتين بلازميدية في حين احتوت العزلتين K28 وK29 على حزمة واحدة فقط. اظهرت نتائج معاملات الدنا البلازميدي باستخدام مادتي Ethidum Bromide وSDS عدم قدرة مادة SDSعلى تحييد الحزم البلازميدية، في حين كان Ethidum Bromide محيدا كفوءا عند التركيز g/mlµ (512 - 1024 ).تم استخدام تقنية (PCR) Polymerase Chain Reaction للتحري عن امتلاك العزلات قيد الدراسة على الجينات التي تشفرالى انتاج انزيمات ESL وML وباستخدام طريقة الاستخلاص السريعة (الغليان) وطريقة المستعمرة المباشرة كقالب الدنا وباستخدام بادئات متخصصة لاستهداف الجين shv - bla والجين bla imp - 1. اظهرت العزلات المنتجة لانزيمات ESLجميعها امتلاكها للجين shv - bla وبنسبة %100 ولكن العزلة المنتجة لانزيمات IMP اعطت نتيجة سالبة، كما اظهرت طريقة الاستخلاص بواسطة الغليان كفاءة عالية كقالب للدنا، مقارنتا بطريقة المستعمرة المباشرة. | The study included (1600) clinical samples from Patients suffering From different infections distrubated between (1500) urine and (100) sputum. Morphological ، biochemical tests and use Api 20 E system were employed to diagnose bacterial species and the result showed they were (53) isolates of Klebsiella spp.included(44) K. pneumoniae. (6) K. oxytoca and (3) isolates of K. planticola. Antibiotic susceptibility for K. pneumoniae isolate was performed against 15 antibiotic using disk diffusion method. Disc approximation method was used to detect production of ESLs , and three methods used to detect production of MLs.Results indicated that 5 isolates produced ESLs and only one isolate produced MLs, they isolates which produced ESLs were have highly resistant to antibiotic (100)%to [Aztreonam, Ceftriaxone, Cefotaxime, Ceftazidime, Ampicillin, Pipracillin, Carbenicillin]. Agar dilution method was used for the determination of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for the ESLs and MLs producing isolates. The result showed high resistance to Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem and Ceftazidime. The value of MIC of isolates producing ESLs(K22,K26,K28,K29,K36) were (0.05 - 0.1) µg/ml to Imipenem antibiotic, Ceftazidime (32 - 265) µg/ml, Ceftriaxone (256 - 1024) µg/ml and Cefotaxime (128 - 1024) µg/ml, while the isolate producing ML(K8) showed MIC value (64, 512, 1024, 1024) µg/ml respectively. The plasmid content of six isolates (K 8, K 22, K 26, K 28, K 29, K 36) were studies، the result of revealed electrophorsis in agar gel that the isolate K8 have one plasmid, while isolates produce ESLs differs on plasmid content,in our side K22, K26 have three plasmid, K36 have two plasmid and K28, K29 have one plasmid. Curing was conducted by the use of SDS and ethidum bromide ، and the results showed that the isolates lost the plasmids at concentration (512 - 1024) g/mL of ethidum bromide. Polymerase chain reaction technique was performed for the detection ESLs and ML, DNA template that used for PCR reaction was prepared by using boiling method and the Direct colony method, by using SHV to detect ESL and IMP - 1 to detect MLs. The results showed that all isolates were 100% harboring blashv while blaIMP - 1 gave negative result.also the extraction by use boiling method showed high efficiency compare with direct colony method.

تاثير بعض العوامل الفيزيائية والكيميائية في الشكل المظهري والامراضية لخميرة Candida albicans == Effect Of Some Physical And Chemical Factors In Morphology And Pathogenicity Of Candida albicans

Author name: ميس قيس علي

Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | رباب قاسم صقر

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: This study included isolation and identification Candida albicans from different sources ,We obtained (26) isolates of Candida albicans of the total (115) samples which included (60) clinical samples of children who suffer from inflammatory in the Area of diapers in the children Protection Teaching - Hospital in The Medical City hospital and Alalweia hospital in Baghdad ؛(50) soil samples from Nurseries and gardens and corrals , )5) dried milk samples in the period between January2012to April2012 . We obtained (20) isolates C. albicans from the clinical samples; (5) isolates from soil samples and only one isolate from the dried milk samples.All isolates have been cultured on a differential mediums to diagnosis and identify C. albicans from the other species . Biggy agar, Candida medium, Candida BCG ,Corn meal agar involved in the isolation and identification of the C. albicans. Candida diagnosed based on the phenotypic characteristics of the developing colonies.All isolates was involved to microscopic examinations for the purpose of examining the phenotypic characteristics of C. albicans cells as well as to examine the germination tube formation, The diagnosis also includes the use of biochemical methods such as fermentation and assimilation behavior of Candida , API20cAUX System and ability of Candida to produce Proteinase in Skim milk agar and Blood agar.The second axis of the current study included investigating about white - opaque phenotypic switching, (20) clinical isolates (5) soil isolates (1) milk isolate showed ability to transition from white to opaque ,also we found the results of phenotypic transition ratios of the colonies grown on modified Lee’s mediums by adding Glucose or N - acetyl glucosamine in different incubation conditions involved the aerobic condition and presence of CO2, at (25)°c and (37)°c during (1,2,5,and 10) days. the results of transition ratios and the overlap between the factors compared statistically. the study found that the ratio reached a maximum at physiological temperature (37 o C) in the presence of N - acetylglucoseamine and 1% CO2 . in the aerobic condition at (37o)C with presence of N - acetylglucoseamine the results show a significantdifference at the duration between the 1st and 2nd day, and no significant difference on the dried milk isolate . The results of 5th and 10th days do not show significant difference in any isolates which due to the saturation condition when cell do not affect a change in the metabolic activity, so it dispense with N - acetylglucoseamine who induce the swathing only for a short duration.Further study the morphology of C. albicans with transmission electron microscope (TEM) and the virulence of the white and opaque colony of C. albicans. The histopathological study of the liver, the spleen and the kidneys of injected mice (Balb/c) showed several changes in the tissues, two concentration of yeast suspension (1.5 x 108) cells/ml and (3x 108) cells/ml prepared by McFarland method are used, the injection with the white the phenotypic (1.5 x 108) showed necrosis in the renal tubule and mononucleosis filtration in the tissue of the kidney, also simple filtration to the inflammatory cell in liver and a replication and necrosis in the lymphatic tissue of the spleen .The white the phenotypic (3x 108) showed a necrosis in the lymphatic tissue of the spleen and a filtrationto the Megakaryocytes, acute necrosis in liver cells and a filtration to the inflammation near the hepatic portal veins and a acute renal failure combined with mononucleosis filtration in the kidney ,On the other hand the opaque cells injection (3x108) cells/ml has caused a simple necrosis in tissues of the liver, spleen and the kidneys while the opaque cells (1.5 x108) cells/ml has no effective virulence and the tissue diagnosed as a normal.

دراسة بعض التاثيرات البيئية لملوثات الهواء في بغداد

Author name: نادية كامل بشار القريشي

Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تمت دراسة تلوث الهواء بدقائق الغبار ( العواصف الغبارية dust storm والغبار العالق في الهواء Suspended dust والغبار المتصاعد rising dust والغبار المترسب على اوراق نبات الدودونيا Dodonaea viscose L. جمع الغبار على الاوراق في كل شهر من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009 لثلاث مناطق : الكاظمية ، والمنصور ، وشارع فلسطين ، في مدينة بغداد/ العراق، واخذت معلومات عن عدد المرضى الشهري الذين زاروا مستشفى ابن النفيس خلال فترة الدراسة من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009. ربطت العلاقة بين عدد المرضى والظواهر اعلاه .وبينت النتائج ان العواصف الغبارية لم يكن فيها فرق معنوي بين معدلات الفترات الزمنية 1970 - 1980 و1980 - 1990 و1990 - 2000للاشهر الستة اعلاه . بينما يوجد فرق معنوي على مستوى 5% ( P - value = 0.022 ) لشهر اذار بين الفترات الزمنية الثلاث اعلاه . بالنسبة للغبار المتصاعد .المعدل الشهري لمجموع الغبار المترسب على اوراق نبات الدودونياكان معنويا لشهر اذار ( 0.70 غم / سم ²) ومايس (0.38 غم / سم ² ) وحزيران (0.38 غم / سم ²) للمناطق الثلاث تحت الدراسة .معدل عدد المرضى كان 8848.0 ، واقل قيمة هي 6902.00 وكانت في شهر كانون الثاني ، واعلى قيمة12940.0 في شهر حزيران .ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والغبار المترسب (r =0.9679) ، والمعادلة الاتية توضح العلاقة : Y=12684.505e - 86.3442X العلاقة بين عدد المرضى الشهري (Y) والغبار الجوي المتصاعد(X)Rising dust Y=11841.62 - 2211.404+220.69X2 ….. r = 0.8033ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والعواصف الغبارية (r = 0.6763) Y=480.00+20168.42X - 9993.53X2 ….. r=0.6763ولاتوجد علاقة معنوية بين عدد المرضى والغبار المعلق Y=11749.138 - 785.34X+39.21X2 ….. r=0.3772 وقد تبين من نتائج التحاليل الكيمياوية للغبار المترسب ان هناك فرقا معنويا في نسبة الكاربون العضوي للمناطق الثلاثة ونسبة المادة العضوية والكالسيوم والمغنيسيوم وملوحة التربة وتفاعلها ، بينما لا يوجد فرق معنوي بالنسبة لمحتوى الرصاص والكاربونات والبيكاربونات والكلورات .

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لاعلاف الدواجن والتحري عن مستوى التلوث بالافلاتوكسين == Isolation and identification of fungi associated with poultry feeds and detection of aflatoxin contamination level

Author name: هـبـة فـرحان دلــــي

Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبـود

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الى تحديد مدى تلوث بعض اعلاف الدواجن(خليط من بذور بعض المحاصيل) المعروضة في بعض الاسواق المحلية لبعض محافظات العراق بالفطريات ، وتحديد قابلية عزلات الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسينات فضلا عن تقييم كفاءة اربعة ممد صات كيميائية في ٳمدصاص سم الافلاتوكسين B1 من الاوساط السائلة . اظهرت نتائج عزل وتشخيص الفطريات المعزولة من 52 عينة من اعلاف الدواجن من محافظات بغداد ،ديالى ،بابل ،السماوة ،كربلاء ،القادسية وميسان تواجد الانواع الفطرية الاتية في الاعلاف : Alternaria alternaria وAspergillus candidus وAsp.clavatus وAsp.flavipesوAsp.flavus وAsp.fumigatus وAsp.niger وCephalosporium spp. وCladosporium cladosporioids وFusarium graminearum وF.moniliforme وF.oxysporum وGonatosbotrys simplex وMucor sp. وPenicillium citrinum وP.chrysogenum وP.cyclopium وP.expansumوP.griesofulvum وP.oxalicum وUlocladium sp. ومجموعة Mycelia sterila fungi. وفيما يخص نسبة التواجد فقد كان الجنس Aspergillus sp. هو الاعلى في معظم العينات المفحوصة اذ بلغت نسب تواجده 99.15 ،100 ،100 ،94.55 ،100 ،98.58 ،100 و95.24% في العينات B4 ،B11 ،B13 ،B16 ،B17 ،Kh6 ،M1 وM3. وسجل النوع Aspergillus flavus اعلى نسبة مئوية للتواجد بالنسبة لبقية انواع الجنسAspergillus sp. اذ بلغت نسب تواجده 88.03 ،85.71 ،71.43 و% 87.5 في العينات B4 ،B17 ،C2 وC3. في حين ظهر الفطر Cladosporium cladosporioids بشكل متوسط وبنسب مئوية 41.67 ،56.25 ،72.22 ،71.43 و50 % في العينات B¬1 ،B2 ،B6 ،B7 وC1 . اما الفطر Gonatobotrys simplex فقد سجل اقل نسبة مئوية للتواجد بلغت 0.5 % في العينة Di1. وفيما يـخـص تـكـرار العـزل قـد اظهر الجـنـس Aspergillus sp. اعـلـى تكرارات بـلـغت 19 : 18 ،7 : 7 ،3 : 3 ،3 : 3 ،6 : 5 ،6 : 6 و8 : 8 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل،السماوة ، كـربلاء ، القادسيـة ومـيـسان ومـن بـيـن انـواع الجـنـس Aspergillus sp. سجـل النـوع Aspergillus flavus اعـلـى تكرارات عـزل بـلـغت 19 : 15 ،7 : 5 ،3 : 3 و3 : 3 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل ، الســماوة على التوالي . اظهر الفـطـر Cladosporium cladosporioids تـكـرار عــزل بلغت متوسطاته 19 : 8 ،7 : 3،6 : 2 و8 : 4 % في عينات محفظات بـغـداد ، ديالـى ، كربلاء وميسان . اما اقل تكرار عزل فسجله الفطر Gonatobotrys simplex اذ بلغ 7 : 1 % في عينات محافظة ديالى . وبالنسبة لبقية الفطريات فقد اظهرت نسب تواجد وتكرارات عزل متباينة حسب مصدر العينات ومكوناتها . وفيما يخص الحمل الفطري فقد سجلت محافظة كربلاء اعلى معدل للحمل الفطري بلغ 253×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، وسجلت محافظة القادسية معدل حمل فطري متوسط بلغ 140×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، في حين كان اقل معدل حمل فطري لمحافظة السماوة اذ بلغ 3.4×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف . اظهرت نتائج قابلية 37 عزلة من الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسين ان 13 عزلة فقط اظهرت قابلية على انتاج الافلاتوكسين B1، وتفوقت العزلة 6B من محافظة بغداد على بقية العزلات في القابلية على الانتاج اذ سجلت قابلية فائقة في الانتاج (++++) . اظهرت نتائج الكشف بتقانة TLC كفاءة كل من قشور الرمان والفحم المنشط والكايتوسان كعوامل ممدصة ، وكانت قشور الرمان اكفا هذه العوامل اذ اظهرت اكبر مساحة بقعة واشد تالق مقارنة ببقية المعاملات الاخرى، في حين اظهر الفحم المنشط كفاءة جيدة في الامدصاص ولكن بمستوى اقل من الدباغ. اما فيما يخص الكايتوسان قد اظهر كفاءة قليلة كعامل مدمص بينما اظهر الطين عدم كفاءته كعامل مدمص الا انه اظهر كفاءة عالية في التحطيم حيث ادى الى اختفاء السم من الراشح والراسب. | This study was aimed to determine the fungal contamination levels of poultry feeds(grains mixture of agricultural crops) exhibited in local markets of some Iraqi governorates, the aflatoxin toxigenic activity of Aspergillus flavus isolated isolates and evaluation of four materials as detoxification agents. The results of fungal isolation and identification of 52 poultry feed samples collected from Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan governorates revealed presence of the following fungal species : Alternaria alternaria,Aspergillus candidus, Asp.clavatus, Asp.flavipes, Asp.flavus, Asp.fumigatus, Asp.niger, Cephalosporium ssp., Cladosporium cladosporioids, Fusarium graminearum, F.monilforme, F.oxysporum, Gonatobotrys simplex, Mucor sp., Penicillium citrinum, P.chrysogenum, P.cyclopium, P.expansum, P.griesofulvum, P.oxalicum , Ulocladium sp. and Mycelia sterile fungi group. Genus Aspergillus showed the highest percentage of occurence in most tested samples which recorded 99.15 ,100 ,100 ,94.55 ,100 ,98.58 ,100 and 95.24 % in samples B4 ,B11 ,B13 ,B16 ,B17 ,Kh6 ,M1 and M3, respectively. Species Asp.flavus recorded the highest percentage of occurence among other Aspergillus species which recorded 88.03 ,85.71 ,71.43 and 87.5% in samples B4 ,B17 ,C2 and C3, respectively, while the fungus Cladosporium cladosporioids appeared in moderate percentage when recorded 41.67 ,56.25 ,72.22 ,71.43 and 50 % in samples B1 ,B2 ,B6 ,B7 and C1, respectively. Fungus Gonatobotrys simplex showed the lowest percentage of occurence (5.0% in Di1). The genus Aspergillus also recorded highest isolation frequencies (18 : 19 ,7 : 7 ,3 : 3 ,3 : 3 ,5 : 6 ,6 : 6 and 8 : 8 %) in (samples Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan).However, among isolated species, Asp.flavus recorded highest frequencies 15 : 19 ,5 : 7 ,3 : 3 and 3 : 3 % in samples Baghdad, Deila, Babil and Seemawa respectively, while Cladosporium cladosporioids showed moderate isolation frequencies 8 : 19 ,3 : 7 ,2 : 6 and 4 : 8 % in samples Baghdad, Deila, Karbala and Maysan respectively and the Gonatobotrys simplex the lowest (1 : 7 %) in Deila samples. Other fungal isolates showed different percentages of occurence and isolation frequencies according to the source and components of the collected Samples. Karbala governorate recorded highest rate of fungal load (253×106 CFU / gm feed), moderate rate (140×106 CFU / gm feed) recorded by Kadisia samples, while the lowest (3.3×106 CFU / gm feed) by Seemawa samples. The results of toxigenic activity of 37 isolates of Asp.flavus showed that only 13 of them have toxigenic activity, and isolate B6 was the most toxigenic than other isolates. The results of TLC showed the efficiency of Pomegranate pericarp , activated carbon and chitosan as absorption agents. Pomegranate pericarp was the most efficient as manifested by area and severe fluorescence of it's sopt followed by activated carbon and chitosan which recorded the lowest efficiency, while clay had no efficiency as absorption agents but it showed high efficiency in toxin degradation as manifested by the disappearance of the toxin in both filterate and precipitate.

علاقة الحركيات الخلوية بالتهاب المعدة المزمن لدى عينة من المرضى العراقيين == Association of Cytokines with Chronic Gastritis in A sample of Iraqi Patients

Author name: نرجس عبد الرحمن عودة اللامي

Supervisor name: اقبال خضر الجوفي

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: يعد التهاب المعدة المزمن من المشاكل الصحية الكبرى الواسعة الانتشار في العالم وتعتمد الاصابة به على نوع المسبب المرضي ومدى فعاليته اضافة الى قوة الاستجابة الالتهابية والمناعية (الخلوية والخلطية) للمضيف، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف تقييم بعض المعايير المصلية والنسيجية التي يمكن من خلالها تشخيص نوع المرض والاصابة ببكتريا H.pylori، ولتوضيح تاثير بعض العوامل المناعية والالتهابية على الحالة المرضية لدى مرضى التهاب المعدة المزمن. شملت الدراسة (100) مريض عراقي يعانون من اعراض عسر الهضم خضعوا للتنظير المعدي واستئصال الخزعات النسيجية (61 ذكر، 39انثى) تراوحت اعمارهم بين 10 الى 79 سنة، وقسمت مجموعة المرضى وفقا للتشخيص النسيجي الى ثلاثة مجاميع، الاولى تضم 66 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن الفعال Active Chronic Gastritis ، والثانية 21 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن السطحي Superficial Chronic Gastritis، اما الثالثة فشملت 13 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن غير الفعال Inactive Chronic Gastritis، فضلا عن ثلاثين متطوع من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة. اجريت الدراسة في المركز التعليمي لامراض الجهاز الهضمي والكبد في دائرة مدينة الطب في بغداد ومختبرات الصحة المركزية، واستمرت للمدة من تشرين الثاني 2007م الى نيسان 2008م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1 - ان الاصابة بالتهاب المعدة المزمن في الذكور اعلى منها في الاناث؛ اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 1.56 ومتوسط اعمارهم (40.03) سنة، لكن لم يشكل هذا الفرق دلالة معنوية (P> 0.05).2 - اظهرت الفحوصات النسيجية للمعده وجود بكتريا H.pylori بنسبة (66%) من المجموع الكلي لمرضى التهاب المعدة المزمن. 3 - تبين من خلال الفحوصات السيرولوجية للتحري عن اضداد IgG ضد H.pylori اصابة (70%) من مرضى التهاب المعدة المزمن ببكتريا H.pylori مقارنة بالمرضى غير المصابين بالبكتريا (30%) وقد اكتسب هذا الفرق دلالة معنوية جدا(P < 0.01)،كما ارتفع مستوى اضداد IgG ضد بكترياH.pylori لدى مجاميع المرضى الثلاثه ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P < 0.05).4 - اظهرت الاختبارات السيرولوجية لتقييم حالة الطبقة الظهارية لمخاطية المعدة - ارتفاع مستوى الكاسترين - 17 لدى مجاميع المرضى الثلاثة ICG وSCG وACG على التوالي بدلالة معنوية (P < 0.05) مقارنة مع مجموعة السيطرة. - وجد هناك فرق معنوي (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين I لدى مرضى ACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة لكن لا يعد ذلك ارتفاعا في مستوى PGI لكون قيمته كانت ضمن النسب الطبيعية لمستوى PGI في مصل الدم. - لوحظ وجود علاقة معنوية (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين II لدى مرضى ACG فقط مقارنة بمجموعة السيطرة، بينما لم تلاحظ اي فروقات معنوية (P > 0.05) في مستوى نسب PGI/II لدى مجاميع المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة. 5 - الحركيات الخلوية Cytokines - ارتفاع مستوى IL - 4 في مصل مجاميع المرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - اظهرت مجاميع المرضى ICG وSCG وACG على التوالي ارتفاع مستوى IL - 8 في المصل مقارنة بالسيطرة وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك ارتفاع في مستوى IL - 10 في مصل مجاميع المرضى ACG وICG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا لدى مرضى ACG فقط (P < 0.01). - ارتفع مستوى IFN - γ في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل الارتفاع فرقا معنويا (P < 0.05). - اظهرت مجاميع مرضىACG وSCG وICG على التوالي ارتفاع مستوى GM - CSF في المصل مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا ( P < 0.05). 6 - الكلوبيولينات المناعية Immunoglobulines - ارتفع مستوى IgG في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - لوحظ ارتفاع مستوى IgA في مصل مجاميع مرضى ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك اختلاف في مستوى IgM بين مجاميع المرضى والسيطرة وكان الاختلاف معنويا لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة. 7 - مكوني المتمم C3، C4 - ظهر فرق معنوي (P<0.05) في مستوى C3 لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة، فيما كان مستواه لدى مرضى التهاب المعدة المزمن عامة ومرضى SCG وICG مقاربا لمجموعة السيطرة ومن دون فروقات معنوية. - ارتفع مستوى C4 في مصل مجاميع مرضى ICG وSCG وACG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). 8 - اظهر التحليل الاحصائي وجود فروقات معنوية بين المرضى والحالة الاقتصادية والاجتماعية (P < 0.01) وكانت اعلى نسبة للتكرارات لدى المرضى ذوي الحالة الاقتصادية والاجتماعية الواطئة. فيما لوحظ انخفاض المستوى التعليمي لدى مرضى التهاب المعدة المزمن وقد شكل هذا الانخفاض دلالة معنوية (P<0.01). وعند المقارنة الاحصائية بين المرضى والاعراض السريرية وجد ارتفاع تكرارات المرضى لمجموعة من اعراض عسر الهضم واكتسب الارتفاع دلالة معنوية (P<0.01). 9 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقة طردية بين IL - 4 وكل من PGII وIL - 10 وIgG وكانت العلاقة طردية ايضا بين IL - 8 مع IgG وC4 وIgA وG - 17، فيما ارتبط مستوى IL - 10 بعلاقة طردية مع IFN - γ وPGII وC4، وظهر ايضا وجود علاقة طردية بين IFN - γ وكل من IL - 8 وIgA وC4 وIgG، وقد اكتسبت هذه العلاقات دلالة معنوية (P < 0.05). | The chronic gastritis is considered as one of the greatest health problem that is widely distributed throughout the world, and the disease depends on the type and the activity of the causes, furthermore the strength of immune & inflammatory response (cellular & humeral) of the host, The present study was conducted to estimate some of serological & histological parameters in order to diagnose both the type of disease, and infection with H.pylori, in addition to shed light on influence of some immunoinflammatory factors on pathogensis of thechronic gastritis. The study included (100)Iraqi patients (61 male & 39 female) are suffering from dyspepsia , and submitted for gastroendoscopy and biopsy. their age varied between 10 to 80 years. All patient groups were divided according to histological diagnosis into three groups , 66 with Active Chronic Gastritis (ACG), 21 with Superficial Chronic Gastritis (SCG) and 13 with Inactive Chronic Gastritis (ICG), with apparently health 30 individuals volunteers as control group, the study was carried out in the Gastroenterology and Hepatology Teaching Center in Medical City and Health Central Laboratories from November 2007 to April 2008. The study revealed the following results : 1 - The present study showed the frequency of chronic gastritis is higher among males than females; with ratio was 1.56 : 1 respectively; The mean age was (40.03) years, with non significant difference (P<0.05). 2 - Histological examinations revealed the incidence of H.pylori is (66%) among all patients. 3 - Serological examinations showed significance, that increasing number of patients with chronic gastritis infected with H.pylori (70%) compared with non infected (30%) Also highly significant increased (P<0.01) was observed in serum level of IgG antibody anti - H.pylori in the three patient groups : ACG, SCG, ICG respectively as compared with control group. 4 - Estimation of mucas epithelial layer state : - Significant increase (P<0.05) in serum level of Gastrin - 17 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively as compared with control group. - Significant difference (P<0.05) was found in serum level of pepsinogen I in patients groups : ACG, SCG respectively as compared with control group but that is not consider increase in the level of PGI because the values lies among the normal ratio of PGI level in serum. - There is significant relationship (P<0.05) was observed in serum level of pepsinogen II only in patients of ACG compared with control group, wherease non significant differences (P<0.05) was observed in the ratios of PGI / II in the patients groups compared with control group. 5 - Cytokines : - Significant increase (P<0.05) in the serum level of IL - 4 in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - All patients groups ICG, SCG, ACG respectively revealed highly significant increased (P< 0.01) in the serum level of IL - 8 compared with control group. - Highly significant increased (P<0.01) was observed of IL - 10 in all patients groups : ACG, ICG, SCG respectively compared with control group. - Highly level of IFN - γ in serum of all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively, This increament formed significant difference (P<0.05). - All patients groups ACG, SCG, ICG consequently revealed significant increased (P<0.05) in the concentration of GM - SCF as compared with control group. 6 - Immunoglobulines : - Highly significant increased (P<0.01) in the level of serum IgG in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - Highly significant increase was observed in the level of serum IgA in all patients groups : ACG, SCG, ICG consequently compared with control group (P<0.01). - Patients groups revealed difference in the level of serum IgM compared with control group, but this difference was significant only in ACG patients (P<0.05). 7 - Complement components C3 and C4 : - Appearing significant difference (P<0.05) in the serum level of C3 only in ACG patients compared with the control group, but non significant difference when compared general patients of chronic gastritis and SCG, ICG patients with control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the serum level of C4 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively compared with control group. 8 - Statistical analysis appeared significant difference (P<0.01) between patients with low socioeconomic state & educational level and inassociation with severity of clinical diagnosis & increased frequency of patient that’s are suffering from dyspepsia. 9 - The result of present study revealed direct correlation between IL - 4 with (PGII, IL - 10 & IgG), IL - 8 with (IgG, C4, IgA & G - 17), IL - 10 with (IFN - γ, PGII & C4) and IFN - γ with (IL - 8, IgA, C4 & IgG). This correlations request significant evidence (P<0.05).

التحري الجزيئي والتعبير الجيني لمضخات الدفق في بكتريا Pseudomonas aerugionsa متعددة المقاومة للمضادات الحيوية == The Role of Efflux Pumps in Multidrug - Resistance in Colistin - resistant Pseudomonas aeruginosa

Author name: نبراس رضا محمد العبيدي

Supervisor name: محمد فرج شذر المرجاني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت 120 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa للمدة من /15 2014/9 لغاية /11/15 2014, من مصادر سريرية مختلفة شملت : (33عزلة ) من الادرار , و(25عزلة) من الحروق , و(25عزلة ) من القشع , و(17عزلة) من الجروح , و(12عزلة ) من الدم, و( 5عزلات ) من الاذن , و(3 عزلات) من ادوات قثطرة المجاري البولية. اختبرت حساسية العزلات قيد الدراسة تجاه مضاد الكولستين باستعمال طريقة الاقراص واظهرت النتائج وجود 27) ) عزلة مقاومة للكولستين وبنسبة (%22.5) , ثم اختبرت مقاومة60 عزلة (منها 27 عزلة مقاومة للكولستين ) تجاه اثناعشر مضادا من مجاميع مختلفة وتم تحديد حساسية العزلات ومقاومتها للمضادات المايكروبية باعتماد قياس قطر منطقة التثبيط بالمليمتر حول اقراص المضادات المستعملة , واظهرت النتائج ان جميع العزلات المختبرة كانت مقاومة بشكل تام لمضادات Amoxicillin وCarbencillin بينما ابدت العزلات مقاومة لمضاداتGentamycin بنسبة (%70) و(%56.6) Tobramycin وLomefloxacin (%58.3)وكانت المقاومة اقل لمضادات Aztreonam (%18.3) وPolymyxin B بنسبة (%18.3) وتليها المقاومة لمضادNorfloxacin (%13.3)و Levofloxacin (%11.6) وتجاه Ciprofloxacin الاقل مقاومة بنسبة (%8.3) .اختبرت قابلية (60) عزلة اعلاه على انتاج انزيم البروتييز وتكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج قابلية % 88.3 من العزلات 53) عزلة )على انتاج انزيم البروتييز, وكانت جميع العزلات المقاومة للكولستين منتجة لانزيم البروتييز وبنسبة %100 , من جانب اخر كانت 43 عزلة (%71.7) منتجة طبقة لزجة قوية محددة بوساطة تكوين مستعمرات سوداء دلالة على تكوينها الغشاء الحيوي .تم الكشف عن وجود مضخات الدفق بين 60 عزلة من عزلات الدراسة ( منها 27 عزلة مقاومة لمضاد كولستين و33 عزلة حساسة له) باعتماد طريقة العجلة الخشبية Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) باعتماد صبغة الاثيديوم برومايد كمؤشر للكشف عن مضخات الدفق , واظهرت النتائج ان 46 عزلة (76.7%) من العزلات المختارة اعطت نتيجة موجبة للفحص اعلاه , ومن جانب اخر كانت جميع العزلات المقاومة للكولستين موجبة للفحص مما يدل على امتلاكها لمضخات الدفق , اما بالنسبة للعزلات الحساسة للكولستين فكانت %33.3منها تملك مضخات دفق بالكشف المظهري . اخضعت 32 عزلة (27 منها كانت مقاومة للكولستين) للكشف الجيني عن مضخات الدفق باستعمال تقنية Conventional PCRللكشف عن مضخة الدفق MexAB - OprM (بالكشف عن جينات oprMو (mexAومضخة الدفق MexXY (بالكشف عن جين mexY) اظهرت النتائج ان20 عزلة (62.5%) تمتلك الجينoprM , وان 22عزلة (68.8%) تمتلك الجين mexA , و24 عزلة (75%) تمتلك الجينmexY , وبينت النتائج ايضا بخصوص الكشف الجيني عن مضخات الدفق لعزلات الدراسة ان جميع العزلات الموجبة لاختبار امتلاك الجين mexYهي مقاومة للكولستين وقد شكلت نسبة %88.9 من العزلات الكلية المقاومة للكولستين . وتم الكشف عن التعبير الجيني لمضخة الدفق OprM - MexAB (بدراسة الجين (mexB ومضخة الدفق MexXY ( بدراسة الجين mexX) في 9 من عزلات الدراسة والتي كانت مقاومة لمضاد الكولستين باستعمال تقنية q RT - PCR من خلال استخلاص RNA البكتيري , ومن ثم تحويله الى cDNA , واظهرت نتائج الكشف عن التعبير الجيني للجين mexB والجين mexXان العزلات كانت متباينة في قيم ct , وبحسب معادلة Livak تم استخراج قيم ct ومعرفة التعبير الجيني لمضخات الدفق , ولوحظ ان التعبير الجيني لمضخة الدفق MexXY اكثر من التعبير الجيني لمضخة الدفق MexAB - OprM . | A total of (120) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were collected from different sources , During the period between 15/9/2014 till 15/11/2014 . The source of these isolates were as follows : (33) isolates from urine , (25) isolates from Burns , (25) isolates from sputum , (17) isolates from Wounds , (12) isolates from Blood , (5) isolates from ears ,and the last (3) isolates from Catheters . All isolates were identified through morphological , cultural and some biochemical tests and using Vitek2 GN . The antibiotic susceptibility test Towrd Colistin was done using the agar diffusion method ; Results showed that 27 isolates (%22.5) were resistance to Colistin ,then Sixty isolates ( Ones 27 isolates resistance to Colistin ) were tested against twelve antibiotic by measuring inhibition zone around disk antibiotic , Result showed that All isolates were complete resistance to Amoxicillin and Carbencillin , While resistance to other antibiotic were Gentamycin (70%) , Tobramycin (56.6%) , Lomefloxacin (58.3%) , and less resistance was showed for Aztreonam(18.3%) , Polymyxin B (18.3%), Norfloxacin(13.3%) , Levofloxacin(11.6%) and Ciprofloxacin (8.3%) ,The most effective antibiotic against Colistin resistance isolates were Levofloxacin and Ciprofloxacin . Sixty of isolates were choosen to detect for ability to protease production and biofilm formation , The Results showed 53 isolates (%88.3) were protease production , and results showed all Colistin resistant isolates were protease production and 43 isolates (%71.7) were able to biofilm formation . Sixity isolates (Ones 27 Colistin resistance isolates ) were choosen for detect efflux pumps by using Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) , which include ethedium bromide dye as marker to detect efflux pumps , the result showed that 46 isolates (%76.7) give positive result . Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the mexA , mexY, oprM gene , The results showed that oprM found in 20 isolates (%62.5) , mexA found in 22 isolates (%68.8) , mexY found in 24 isolates (%75) , The results also showed that 88.9 % from Colistin resistant isolates had mexY gene . Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction of Colistin resistant isolates and c DNA synthesis , The results showed that gene expression were high in efflux pumps especially to MexXY efflux pumps , and the gene expression to MexXY efflux pumps higher than MexAB - OprM efflux pums

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين == Study of some immunological aspects of Iraqi patients with ATOPIC DERMATITIS

Author name: ميادة نوري اقبال الدوسكي

Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology - Immunology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف الحصول على المزيد من الايضاحات حول تاثير الاضطرابات المناعية على الحالة المرضية عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين ،لقد تم خلال هذه الدراسة اخضاع 124 مريضا من كلا الجنسين (55مريضاﹰمن الذكور و69من الاناث ) تتراوح اعمارهم ما بين(6 - 55 ) سنة من الذين شخصوا كمرضى التهاب جلدي متماحل ،حيث كان بينهم 48 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل البسيط و76 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل الشديد ، اضافةﹰالى(50) شخصاﹰمن الاصحاء ظاهرياﹰ كمجموعة سيطرة ، تم اخضاعهم الى مختلف الاختبارات بضمنها الفحوصات المختبرية المالوفة للحساسيةوقياس المعلمات المناعية حديثة الاكتشاف بالاضافة الى عزل وتشخيص بكتريا الـ Staphylococcus spp. .اظهرت النتائج اختلاف انتشار مرض التهاب الجلدي المتماحل بين مختلف الفئات العمرية وكذلك بين الجنسين حيث كان نسبة انتشار المرض عند الاناث اكثرمن الذكور. من خلال فحص الجلد وباستخدام (13) نوع من المستارجات، تم التوصل الى انه المستارجات داخل المباني indoor allergens اعلى نسبة للتفاعل الموجب لفحص الجلد ضمن كل مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ،ومن بينها كان حلم الغبار المنزل HDM هو اكثر الانواع تكرارا فى الظهور بنسبة =5‚68 في حين كان لثيل البرمودا Bermuda grass وخليط انواع المختلفة النسبة الاعلى بين حبوب اللقاح =7‚ 13 % و1‚ 12 % على التوالي ، وكذلك لخليط الفطريات نوع MMI النسبة الاعلى بين الفطريات =9‚12%. باستخدام اختبار الامتزاز المناعي للانظيم المرتبط ELISA تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي(E) الكلي والنوعي في مصل الدم ، وكانت قيمة المتوسط الحسابي للكلوبيولين المناعي(E) الكلي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد اعلى وذات فرق احصائي معنوي عنها في كل من مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط ومجموعة السيطرة الاصحاء.وكذلك تم احتساب مستوى الكلوبيولين المناعي (E)النوعي في مصل الدم وذلك لـ 19 نوع المستارجات اظهرت نتائج الدراسة ان الكلوبيولين المناعي (E)النوعي الاكثر تكرارا في كل مجاميع الدراسة من المرضى كان للمستارج D2 بنسبة =7‚ 63 % يتبعه للمستارج H2بنسبة = 7‚ 59 % ،ثم للعشب G2 وبنسبة = 9‚ 58 % تبعهم الكلوبيولين النوعي للفطر M1 = 5‚ 57 % ، F29 =8‚ 54 % ، = F23‚ 54 %، W6 =6‚ 51 % ، M4 = 50 % ، G1 = 50 % ، G15 =2‚ 49 % ، W1 =5‚ 43 % ، M6 =8‚ 46 % ، D1 =46 % ، M2 =5‚ 43 % ، بينما كانت نسبة الكلوبيولين (E ) النوعي للـ F73 مساوي لـ T9 = 1‚ 37 % ،و 9‚ 33 % للمستارج W9 . في حين كانت اقل نسب للكلوبيولين النوعي ضد كل من T3 ، T5 وكانت تساوي 4‚ 23 % ،1، 16 % على التوالي .ان نسبة التطابق الاجمالية بين فحص الجلد ومستوى الكلوبيولينات المناعية النوعية لـخمسة من المستارجات كانت بمقدار9‚ 83 % كما كانت حساسية الاختبار بنسبة 100% لاشجار Mediterranean و19% لاعشاب Mugwort في حين كانت نسبة خصوصية الاختبار 98 % مساوية لكل من Plantain ,Betula واعقبتها المستارجات Fagac ,Bermuda =5‚97% ، 7‚96% على التوالي .اما المستارج HD اظهر اقل نسبة خصوصية وكانت2‚74% لم يلاحظ اي اختلاف معنوي في مستوى الكلوبيولينات المناعية (M , A ) واحدى مكونات المتمم C3 في المصل بين المجاميع الثلاثة قيد الدراسة بينما لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الكلوبيولين المناعي G واحدى مكونات المتمم C4 عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاء. وجد ان عدد خلايا اليفة الايوسين في الدم اعلى معنويا عند كل من مجموعتي المرضى بالمقارنة مع الاصحاء. لم تظهر النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي CD3 اي فروقات معنوية ضمن مجاميع الدراسة ،بينما النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي .CDميادة نوري اقبال الدوسكيكانت اعلى معنويا عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عما هو عليه في كل من مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء. المعلم المناعي الـ CD8 اظهر انخفاض معنوي عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاءولوحظ فروقات معنوية في نسبة الخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 ضمن مجاميع الدراسة مما ادى الى ارتفاع نسبة ((CD4/CD8 ارتفاعا ملحوظا ضمن مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومقارنة بالاصحاء وخاصة عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.كذلك لوحظت اضطرابات في الاستجابة المناعية الخلوية تجاه المشطر اللانوعي PHA ومستخلص البروتيني عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.احد النتائج المهمة في هذه الدراسة هي ان متوسط مستوى الانترلوكين نوع IL - 4 يزداد بشكل معنوي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل عن الاصحاء ،ان مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط اظهرت زيادة معنوية مقارنة بمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد والاصحاء (1‚84، 9‚58،4 ‚15 بيكوغرام/مل ) في حين ان مستوى الانترلوكين نوع IL - 5 في المصل كان اعلى في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عن مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء(5‚95، 9‚75، 2 ‚23 بيكوغرام/مل ) ، بالاضافة الى ذلك ظهرت علاقة خطية موجبة بين IL - 5 واعداد خلايا اليفة الايوسين في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اما فيما يتعلق بمجاميع الدم فلم تظهر اية علاقة معنوية موجبة بين مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومجاميع فصائل الدم بالرغم من انتشار مرض الالتهاب الجلدي المتماحل ضمن الاشخاص ذوي فصائل الدم A, B .الجزء الاخير من الدراسة تضمن اخذ مسحات للجلد لكل من المرضى والاصحاء ، تم زرعها بشكل مناسب لعزل وتشخيص بكتريا المتواجدة فيه . لقد اوضحت النتائج ان بكتريا Staphylococcus aureus كانت الاكثر تكرارا لدى مرضى الالتهاب الجلد المتماحل بنسبة 7‚ 76 % وبالاخص مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد بينما Staphylococcus epidermidis كانت نسبتها3‚ 23 % .فيما يخص علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مع مختلف المعلمات المناعية ،فقد لوحظ وجود علاقة خطية موجبة معنوية مع عدد من الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) النوعي ،الى جانب ذلك فقد بينت النتائج وجود علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي مع عدد خلايا اليفة الايوسين عند كل مرضى الالتهاب الجلد المتماحل النسب المئوية للخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 وCD19ونسبة CD4/CD8 وIL - 4 ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اظهرت علاقة موجبة معنوية مع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي ،في حين علاقة الانترلوكين IL - 5 مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي هي علاقة سلبية واظهرت النتائج ايضا وجود الـ Staphylococcus aureus ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل هو مقترن مع زيادة او ارتفاع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مما ادى الى علاقة موجبة .فيما لم تظهر الكلوبيولينات المناعية ( M , A ) علاقة موجبة مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي عدا الكلوبيولين المناعي G حيث اظهر علاقة ضعيفة ،كذلك الحال بالنسبة لعلاقة شدة المرض مع مختلف المعلمات المناعية حيث اظهرت النتائج وجود علاقة موجبة ذات قيمة معنوية احصائيا مع كل من عدد الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) وعدد خلايا اليفة الايوسين ،ونسبة CD4/CD8 ، مستوى الانترلوكين IL - 5 في المصل ، اضافة الى ذلك كانت نسبة انتشار بكتريا Staphylococcus aureus مقترنة مع شدة المرض. | The favor of this work, is first at all, and above all, is all Allah's. I would like to express my profound thanks and sincere gratitude to my supervisor Dr. Rajwa H.AL - Rubai’e for her valuable scientific guidance, encouragement and support that made it possible for me to accomplish this study. I extend my deep gratitude also to my supervisor Dr. Jassem T. AL - Khafaji for his scientific advice, clinical instructions, in addition to his provision of laboratory materials and equipment. I should express my gratitude to the head and all the employees of the Department of Biology in the College of Science, AL - Mustansiriya University.Deepest gratitude goes to consultant center for Allergy and Asthma especially, Dr. Arij AL - Ani and Dr. Omar AL - Janabi for preparing the diagnostic cases and the chemist Mrs. Aysar F.AL - Aumari and Alaa’s father, Hamssa’s mother for their generous help and their kind assistance in presenting the possible facilities in the lab work.Thanks are also dedicated for Fransois Tron for his cooperation in help me to complete our research in laboratories of Rouen University France. My sincere gratitude presented to Dr. Abdul Alkhaliq AL - Naqeb for their efforts and help in statistical analysis.From my deep hearts, I would express my thanks and respect to my colleagues for their encouragement during my study. Finally, I would like to express my deepest and warmest gratitude and indebtedness to my family, for their kind, love and help in one way or another, and to all those who have contributed to the completion and success of this project. Mayada N. AL - DoskiResearcher SummaryA Prospective study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of atopic dermatitis (AD) among Iraqi patients. One hundred twenty four cases of AD (55 males and 69 females), ranging in age between (6 to 55) years, Patients were grouped as mild AD (48) and severe AD (76), according to severity, and (50) apparently healthy individuals used as a control group (24 males and 26 females). They were studied using different allergic, immunological and hematological tests; in addition to that Staphylococcus species were isolated and diagnosed, Atopic Dermatitis occurred in different ages and most frequently in females than males.Skin test analysis of 13 allergens revealed that AD patients had higher proportions of positive skin reactivity to indoor allergens, among them House dust mites HDM was the most frequent = 68.5%, Bermuda grass and grasses mixture had the highest frequency = 13.7%, and 12.1% respectively among pollens, whereas mould mixture I were the most frequent moulds = 12.9%. Enzyme linked immunosorbent assay ELISA was used to measure serum IgE levels. The mean total IgE was significantly higher in severe than in mild AD and healthy control groups. The quantitative of serum specific IgE was carried out for 19 allergens. Among all AD cases, the most frequent specific IgE was found to D2 = 63.7% followed by H2 = 59.7%, G2 = 58 .9%, M1=56.5%, F29= 54.8%, F2= 54.03%, W6= 51.6%, M4= 50%, G1=50%, G15= 49.2%, W1= 43.5%, M6 = 46.8%, D1 = 46%, M2 = 43.5% and F73 and T9 are equal = 37.1% and 33.9 % for W9. However the least rates were to T3 and T5=23.4% and 16.1% respectively, in contrast to that of healthy controls which showed negative results for most allergens with the exception of M1= 24% = followed by W9 = 16% . The relationship of skin test with serum specific IgE level for seven compatible allergens showed an overall agreement of (83.9%) sensitivity for Mediterranean trees=100%, Mugwort=99%, specificity for Plantain equal to Betula = 98%, followed by specificity for Bermuda and Fagac = 97.5%, 96.7% respectively while the least were to HD = 74.2%. No significant differences between all AD patients and healthy controls as well as between two types of AD patients could be detected in IgM, IgA and C3 serum levels, while serum IgG and C4 levels were significantly increased in both types of illness compared to healthy controls. Blood eosinophil counts were significantly higher in all AD patients than healthy controls. No significant differences between all AD patients and healthy subjects in CD3+ lymphocyte percentage while CD19+ lymphocyte percentage was significantly higher in severe AD group than mild and healthy control groups. CD8+ lymphocyte percentage was significantly lower in all AD patients than healthy control group . Statistically significant differences were observed between the study groups in CD4+ lymphocyte percentage, the mean CD4+ / CD8+ ratio was higher in severe AD group compared to mild AD and healthy control. On the other hand a disorder observed in cellular immunity response to PHA and proteins extract among patients with severe AD. One of the important findings of this study, was that the mean serum IL - 4 was significantly increasing among AD patients as compared to healthy controls, also it was significantly higher in mild AD than severe AD and healthy control groups = 84.1, 58.9 and 15.4 pg/ml respectively, whereas serum level of IL - 5 was obviously higher in cases with severe AD group than mild AD and healthy control groups= 95.5, 75.9 and 23.2 pg/ml respectively. More over a significant positive linear correlation was found between IL - 5 and peripheral eosinophil counts in atopic dermatitis. The relationship between AD and ABO system has shown no significant correlation in spite of the highest frequency of A and B blood groups among atopic dermatitis patients. The last part of this study included skin swabs which were taken from AD patients. Samples were cultured on suitable media for isolation then identification bacteria. The results showed that Staphylococcus aureus was the most common organism isolated from AD patients =76.7% while Staphylococcus epidermidis was =23.3%. In severe AD group; the incidence of Staphylococcus aureus was higher than in mild AD group =70 %, 60% respectively. Regarding the association between total serum IgE and different immunological markers, the mean serum total IgE concentration was significantly increased with number of positive skin tests as well as serum specific IgE scored by subjects with AD. Also, the eosinophil counts revealed a statistically significant positive linear correlation with total serum IgE level in all AD group.CD4+ and CD19+ lymphocyte percentage and CD4+/CD8+ ratio among all AD groups showed significant positive linear correlation with total serum IgE concentration.The relationship between total serum IgE levels and IL - 4 concentration gave positive linear correlation; whereas, between IL - 5 and total IgE levels the results showed negative correlation. The results revealed that persistence of Staphylococcus aureus colonization in AD patients was associated with higher levels of total serum IgE leading to positive correlations between serum total IgE and Staphylococcus aureus persistence. There were no significant differences in level concentration of IgM, IgA with the exception of the IgG which showed a weak correlation. In conclusion, the association between AD severity and different immunological markers were assessed. The severity of AD group was associated with higher total serum IgE levels and number of specific IgE scored by subjects, as well as, eosinophil counts, CD4+/CD8+ ratio, level of cytokine in serum (IL - 5), in addition, the persistence of Staphylococcus aureus were associated with severity of AD disease.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لتعفن الفواكه المستوردة وطرق مكافحتها == Isolation and Identification of fungi associated for rotting of imported fruits and methods of their control

Author name: مؤيد صالح حسين

Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان | هادي مهدي عبود

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر الفطريات، قسم علوم الحياة، كلية العلوم - الجامعة المستنصرية ٬ ومختبرات دائرة البحوث الزراعية - وزارة العلوم والتكنولوجيا ؛ للكشف عن الفطريات المرافقة لثلاثة انواع من الفاكهة المستوردة (الليمون حامض ، التفاح والخوخ) . تم جمع (60) عينة عشـوائية (20 لكل نـوع) من اربع اسـواق محلية (باب المعظم ، الكاظمية ، علاوي الحلة، العطيفية ) في مدينة بغداد. للفترة من 15 - 5 ولغاية 15 - 8 لعام 2013 . وبعد تحديد نسبة حدوث المرض،عزلت الفطريات من الفواكه المتعفنة على الوسط الزرعي PDA المدعم ب 100 جزء بالمليون من الكلورامفينيكول. تمت تنقية الفطريات المعزولة٬ وتم حساب تردد كل عزلة لكل الفطريات. اظهرت النتائج عزل 141 عزلة فطرية تنتمي الى اربعة اجناس : Penicillium, Aspergillus ,Rhizopus Alternaria , توزعت على ستة انواع من الفطريات. اكثر الانواع ترددا Aspergillus niger بتردد 37.6% يليه Penicillium expansum بتردد 24.8% ثم Penicillum digitatum ٬ Aspergillusflavus ٬Rhizopus Stolonifer وAlternaria.citri التي سجلت 14.9% ٬ 9.2%٬ 7.8% و5.7% . اظهرت النتائج ايضا ان الفطريات الاكثر عزلا كانت من سوق باب المعظم وبنسبة 49.6% يليه سوق الكاظمية 24.8% ثم سوق العلاوي والعطيفية التي سجلت كل منهما 12.8% . استنادا الى تردد العزلات تم اختيار 36 عزلة لاختبار القدرة الٳمراضية باستخدام ثمار التفاح كعائل نباتي . انتخبت عشر عزلات عالية الضراوة : ٳثنان تعود الى جنس البنسليوم P.expansum, واحدة تعود الى P.digitatum , اربعة تعود الى A.niger عزلة واحدة تعود الى R. stolonifer , وعزلة واحدة تابعة ٳلى Alternaria citri وكذلك عزلة واحدة تنتمي الى A.flavus التي اعطيت الرموز الاتية (1 - 2) (1 - 6)، (1 - 7)، (2 - 1) (2 - 3)، (2 - 4) (2 - 5)، (3 - 1)، (4 - 1)، (5 - 1) على التوالي ٬ والتي استخدمت طوال مدة الدراسة. اظهرت نتائج التاثير السمي لحامض الساليسيلك (SA) في الفطريات ٬ ان (SA) في 400 جزء بالمليون ثبط بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلات (1 - 7) P.digitatum و(3 - 1) R. stolonifer ، في حين ان التركيز نفسه في الوسط السائل ثبط بالكامل الوزن الطري والجاف للكتلة الحية للعزلة (1 - 6) expansum P.. كذلك اظهرت النتائج ان الكايتوسان في 1.6 ملغم / مل ثبطʹ بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلة (3 - 1) R. stolonifer في حين ان التركيز نفسه احدث انخفاضا عاليا في الوزن الطري والجاف من الكتلة الحيوية الفطرية للعزلة (1 - 7) P.digitatum التي سجلت 0.15 غرام و0.01 غرام على التوالي. اظهرت النتائج ان توليفات من حامض السالسيلك والكايتوسان اثرت على النمو القطري، التبوغ والوزن الطري والجاف للعزلات (1 - 2) P.expansum و(2 - 5) A.niger وان التوليفة 75 - 25 % كانت الاكثر فعالية. كما اظهرت نتائج الاختبارات التطبيقية في رش كل من حامض السالسيلك بتركيز 400 جزء بالمليون والكايتوسان بتركيز 1.6 ملغم/مل والتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان بالتركيز 75 - 25 جزء بالمليون - ملغم/مل على ثمار التفاح الملقحة بالعزلة (1 - 2) التي تعود للفطر P.expansum ٬ ان الثمار كانت اكثر مقاومة لظهور العفن في جميع المعاملات قبل 24 ساعة من التلقيح وحتى نهاية اليوم الخامس للاختبار بالمقارنة مع الثمار المعاملة بعد 24 ساعة من التلقيح ٬ حيث وصل النمو ٳلى 2.33 سم2 في الثمار المعاملة بحامض السالسيلك ٬ في حين وصل النمو في الثمار المعاملة بالكايتوسان ٳلى 2.65 سم2 ٬اما الثمار المعاملة بالتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان فقد وصل النمو الى 3.57 سم2 ٬ في حين وصل معدل النمو لثمار السيطرة في اليوم الخامس ايضا الى 10.88 سم2 . واظهرت نتائج قدرة اربع عزلات فطرية هي (1 - 2) Penicillium expansum ٬ (1 - 11) P. digitatum ٬ (2 - 1) A. niger ٬ (2 - 19) A. niger في انتاج انزيمي البكتنيز Pectinase والسليليز Cellulase ان العزلات جميعها لها القابلية على ٳنتاج الانزيمين . وارتبطت الفعالية الانزيمية مباشرة بالقابلية الٳمراضية للعزلات ٬ فوجد ان العزلتين العاليتي الضراوة (1 - 2) (2 - 1) اظهرت فعالية انزيمية عالية بلغت 23.59 ٬ 22.55 و64.83 ٬ 62.36 وحدة/ مل . في حين اظهرت العزلات الواطئة الضراوة (1 - 11) (2 - 19) فعالية انزيمية بلغت 9.44 ٬ 15.87 و43.44 ٬ 47.89 وحدة/مل لانزيم Cellulase وPectinase على التوالي . | This study was conducted in laboratory of fungi , Biology Department , College of Sciences - University of El - Mustansiriya and laboratories of Directorate of agricultural research , Ministry of Science and Technology to detect the fungi associated with three kinds of imported fruit ( lemon , apple , peach). Sixty random samples (20 for each kind ) were collected from four local markets (Bab El muadium, Kadhmia, Alawi alhilla, Eletaphia) at Baghdad city After determination of the percentage of disease incidence , the rotted fruits subjected for fungal isolation on PDA medium supplemented with 100 ppm Chloramphenicol . Isolated fungi were purified then the frequency of each isolate was calculated for all fungi. The results showed the isolation of 141 fungal isolate belonged to four genera : Penicillium, Aspergillus, Rhizopus, Alternaria and distributed among six fungal species . The most frequent isolated species Aspergillus niger 37.6 %, followed by Penicillium expansum 24.8 % and P. digitatum, A.flavus, R. Stolonifer and A.citri which recorded 14.9 % , 9.2% , 7.8% and 5.7 % respectively. The results also showed that the most isolated fungi were from Bab El muadium 49.6 %, followed by Kadhmia 24.8 %, then Alawi alhilla and Eletaphia which each of them recorded 12.8 % . Based on the frequency of isolation 36 isolates were selected for pathogenicity test using apple fruits as host Plant . The high virulent ten isolates were selected : two belonged to Penicillium expansum , one belonged to Penicillium digitatum , four belonged to Aspergillus niger one isolate belonged to Rhizopus stolonifer , one isolate belonging to Alternaria citri and one isolate belonged to Aspergillus flavus which given the following codes (1 - 2) (1 - 6) , ( 1 - 7 ) , (2 - 1 ) (2 3) , ( 2 - 4 ) (2 - 5 ) , (3 - 1 ) , (4 - 1 ) , ( 5 - 1 ), respectively were used throughout the study . The results of Fungitoxic effect of Salicylic acid(SA) revealed that (SA) at 400 ppm completely inhibited the radial growth and sporulation of ( 1 - 7 ) P. digitatum and (3 - 1 ) R. stolonifer isolates , while the same concentration in broth medium completely inhibited fresh and dry weight of biomass for (1 - 6) P. expansum . The results showed that Chitosan at 1.6 mg / ml completely inhibited the radial growth and sporulation of isolate (3 - 1 ) R. stolonifer while the same concentration induced the high reduction in fresh and dry weight of fungal biomass for isolate ( 1 - 7 ) P. digitatum which recorded 0.15 g and 0.01 g respectively. The results of the combination effect of Salicylic acid and Chitosan mixture on radial growth , sporulation , fresh and dry weight of isolate (1 - 2 ) P.expansum and (2 - 5 ) A.niger showed that the 75 - 25 % mixture was the most effective one. The results of the tests applications in spraying of Salicylic acid concentration of 400 ppm and Chitosan concentration of 1.6 ml / mg and combination between Salicylic acid and Chitosan concentration 75 - 25 ppm - ml / mg on the apples vaccinated with isolate (1 - 2) P.expansum showed that fruits were more resistant to the appearance of mold in all Treatments befor 24 hours of vaccination until the end of the fifth day of the test, compared with fruits treatment after 24 hours of vaccination, Reached growth to 2.33 cm 2 in fruits treated with Salicylic acid ٬ while growth reached in fruits treated with Chitosan to 2.65 cm 2 , and the fruits which treated with combination between Salicylic acid and Chitosan the growth has reached to 3.57 cm 2 , while the growth rate of the fruits of control on the fifth day to 10.88 cm 2 . The results of the ability of four isolates (1 - 2) P. expansum, (1 - 11) P. digitatum, (2 - 1) A. niger and (2 - 19) A. niger in production of Cellulase and Pectinase enzymes showed that all tested isolates are capable of production both enzymes , but the ability was positively correlated with the isolate virulence . The virulent isolate (1 - 2 ) , (2 - 1) showed the highest enzymaric activity 23.59 , 22.55 , 64.83 and 62.36 Enzymatic units / ml . While the A virulent isolates ( 1 - 11) (2 - 19 ) showed the lowest enzymatic activity 9.44 , 15.87 and 43.44 , 47.89 unit / ml respectively.

دور بعض العوامل المناعية الالتهابية كعوامل خطورة لدى مرضى القلب == The Role of Some Immunoinflammatory Elements as Risk Factors in Patients with Heart Diseases

Author name: مهدي حيدر حمادي الناجي

Supervisor name: اقبال خضر الجوفي

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: ازداد شيوع امراض القلب خلال القرن الحادي والعشرين كمرض مزمن ومهيمن في العديد من انحاء العالم، ويتوقع ان يصبح السبب الرئيس للعجز والوفاة في العالم، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول تاثير العوامل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory Factors والكيموحيوية في الحالة المرضية لدى مرضى القلب العراقيين، وتوجيه المزيد من الفهم نحو عوامل الخطورة التقليدية والمزيد من العوامل الجديدة التي قد تعد عوامل خطورة يمكن استخدامها كعوامل تكهنية وتشخيصية للمرض. ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة 100 مريض عراقي من المصابين بامراض القلب (80 ذكر، 20 انثى) وقسمت مجموعة المرضى الى اربعة مجاميع، الاولى 17 مريضا مصابا بفشل القلب Heart Failure (H.F)، والثانية 26 مريضا مصابا باحتشاء عضلة القلب Myocardial Infarction (M.I)، والثالثة 12 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية المستقرة Stable Angina Pectoris (SAP)، والرابعة 45 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية غيرالمستقرة Unstable Angina Pectoris (UAP)، فضلا عن الى عشرين متطوعا من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة ، وتراوحت اعمار المرضى بين 20 الى 80 سنة. وقد شخصت مجاميع المرضى من اختصاصي امراض القلب في المركز العراقي لامراض القلب، ومستشفى بغداد التعليمي للمدة من كانون الاول 2006م والى اذار 2007م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : * المظاهر الديموغرافية Demographic featuresبالنسبة للتوزيع الجغرافي كان 77% من بغداد، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 4/1، ومتوسط اعمارهم 36.30 سنة. وكانت نسبة الاصابة في الذكور اعلى معنويا (P<0.05) عما عليه في الاناث. * عوامل الخطورة Risk factors - ارتفاع تكرارات مرضى القلب الذين يمتلكون تاريخا عائليا موجبا لامراض القلب (54.5%) مقارنة مع مرضى القلب الذين لا يمتلكون تاريخا عائليا موجبا (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - اظهرت المجاميع الاربعة للمرضى انخفاضا في تكرارات المرضى المتناولين للمشروبات الكحولية هذا الانخفاض لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المدخنين (54.5%) مقارنة بغير المدخنين (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المصابين ببكتريا Helicobacter pylori (90%)، مقارنة مع مرضى القلب غير المصابين (10%). وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). كما ارتفع مستوى الكلوبيولين المناعي IgG ضد بكتريا H.pylori لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وUA وSA وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب غير المتبعين لنظام غذائي (59.6%) مقارنة مع مرضى القلب المتبعين لنظام غذائي (40.4%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوي (P>0.05). - انخفاض دليل كتلة الجسم لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة (اعلى من 25 كغم/ملم2) عموما مقارنة بالسيطرة، ولكن هذا الانخفاض لم يشكل فرق معنوية (P>0.05). - ان مجموعة الدم O اكثر تكرارا لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وMI وUA وSA على التوالي، فيما كانت مجموعة الدم B اكثر تكرارا لدى مرضى SA وUA فقط مقارنة بالسيطرة وبشكل معنوي جدا (P<0.01)، وعكس ذلك بالنسبة لمجاميع الدم A وAB اذ كانت اقل تكرارا. * الدلائل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory markersتم استخدام ثلاث تقنيات للتحري عن العناصر المناعية الالتهابية، اولا تقنية الـ (EASIA) Enzyme Amplified Sensitivity Immunoassay للتحري عن مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IL - 4 وIL - 6 وIL - 8 وIFN - γ)، وتقنية الـ Enzyme Linked Immunosorbant Assay(ELISA) للتحري عن مستوى البروتين الفعال - C، والبحث عن وجود الاجسام المضادة نوع IgG ضد بكتريا Helicobactor pylori، وتقنية الانتشار الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion لتقدير مستوى مكوني المتمم C3 وC4. - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 4 في مصل مجاميع مرضى القلب HF وUA وMI وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وHF وUA وSA على التوالي ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 6 في المصل مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 8 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة UA وHF وMI وSA على التوالي ارتفاع مستوى الانترفيرون - كاما (IFN - γ) في المصل، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر (ESR) لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وMI وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع مستوى البروتين الفعال - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C3 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وUA وHF وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C4 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وHF وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). * الشحوم والبروتينات الشحمية Lipid & Lipoproteins - ارتفاع مستوى الكوليسترول لدى مرضى فشل القلب ومرضى احتشاء عضلة القلب ومرضى الذبحة الصدرية غير المستقرة، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01) فيما انخفض لدى مرضى الذبحة الصدرية المستقرة مقارنة بالسيطرة. - ارتفاع مستوى الكليسيريد الثلاثي لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة S.A وM.I وUA وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - انخفاض مستوى البروتين الشحمي عالي الكثافة المرتبط بالكوليسترول HDL - C لدى مرضى HF وSA وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05)، بينما كان مرتفعا قليلا لدى مرضى MI ولكن بدون فروقات معنوية. - ارتفاع مستوى البروتين الشحمي واطئ الكثافة المرتبط بالكوليسترول LDL - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة مقارنة بالسيطرة ولكن هذا الارتفاع البسيط لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05).* فحص خضاب الدم Haemoglobin test - انخفض معدل تركيز خضاب الدم (Hb) لدى مرضى U.A فقط مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05) فيما كان معدل تركيزه لدى مرضى HF وMI وSA مقاربا لمجموعة السيطرة وبدون فروقات معنوية.اكدت نتائج الدراسة الحالية ان العناصر المناعية الالتهابية تمثل دورا حيويا كعامل خطورة للاصابة بامراض القلب، وانعكس ذلك بارتفاع واضح في مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IFN - γ,IL - 8, IL - 6, IL - 4) بصورة عامة لدى مرضى القلب جميعهم فضلا عن ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر ESR ومستوى البروتين الفعال C - الذي يؤشر درجة الحالة الالتهابية لمرضى القلب، كما بينت ان نظام المتمم بمكونيه C3 وC4 يمثل دورا مهما في العمليات الالتهابية لامراض القلب من خلال المسلكين التقليدي والبديل، واكدت النتائج ان الاصابة ببكتريا H.pylori تعد عامل خطورة مهما في حدوث امراض القلب وقد تجلى بوضوح الدور الذي تمثله الشحوم والبروتينات الشحمية كعوامل خطورة للاصابة بامراض القلب، فضلا عن ذلك اكدت الدراسة ان مستضدات مجاميع الدم بامكانها ان تمثل دورا مهما في الاصابة بامراض القلب. | Heart Diseases become more common during 21st century as the dominant chronic diseases in many parts of the world and it is predicted to become the main causes of disability and death worldwide.Present study was conducted to obtain more clarification about the impact of immuno - inflammatory and biochemical factors on the clinical expression of heart disease among Iraqi patients, and proved further insights into the classical risk factors, and several new factors that could be consider as risk factors that could be used as predictive and diagnostic factors.In order to reach this purpose the study included 100 Iraqi patients with heart diseases (80male and 20 Female) patients are divided into four groups. 17 with Heart Failure (H.F); 26 with Myocardial Infarction (M.I); 12 with stable Angina Pectoris (SAP) and 45 with unstable Angina Pectoris (UAP), with apparently health 20 individuals are used as control group, the age varied between 20 to 80 years. All patients groups were diagnosed by consultant of heart diseases in Iraqi center for heart diseases and Baghdad Hospital from December 2006 to March 2007. The study revealed the following results : * Demographic featuresAbout the geographical distribution, 77% of patients were from Baghdad; male to female ratio was 4/1; Age mean was 36.30 years, with significant difference in male than female (P<0.05).* Risk Factors - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients with positive family history for heart diseases (54%) compared with patients with negative family history (45.5%). - Non significant decreased (P>0.05) was observed in the frequency of alcohol drinking patients in the four patients groups. - Higher frequency of smokers patients (54.5%) compared with non smokers (45.5%) but this difference is not significant (P>0.05). - High significant increased (P<0.01) in the frequency of infected patients with H.pylori (90%) compared with non infected patients (10%). Also clearly significant (P>0.01) elevated was observed in serum level of anti H.pyolri antibody in the four patients groups : H.F, U.A, S.A, M.I respectively as compared with control group. - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients undergo dietary system (59.6%) as compared with patients who were not undergo dietary system. - Non significant reduction (P>0.05) in the means of body mass index (BMI) in all patients groups (over 25 Kg/m2) compared with control group. - Blood group O was significantly (P<0.01) more frequent in all patients groups : H.F,M.I,U.A,S.A respectively, also highly significant increased in frequency of blood group B was observed only in the patients groups of S.A and U.A heart diseases (P<0.01), on contrast blood groups A & AB had the less frequency.* Immuno - inflammatory markers in this study three techniques were used to measure immuno - inflammatory elements, the first enzyme amplified sensitivity immunoassay (EASIA) technique to measure the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8, IFN - γ) and enzyme linked immunosorbant assay (ELISA) technique to measure the levels of C - RP and anti H.pylori antibody, moreover single radial immunodiffusion technique to measure the level of complement component C3 and C4. - Significant increase in the serum level of IL - 4 in all patients groups : HF, UA, MI, SA respectively compared with control group (P<0.05). - The present study revealed significant increased in the serum level of IL - 6 in all patients groups : MI, HF, UA, SA respectively compared with control group (P<0.05). - Significant increased (P<0.05) in the serum level of IL - 8 in all patients groups : SA,HF,MI,UA respectively compared with control group. - All patients groups UA, HF, MI, SA consequently revealed highly significant increased (P<0.01) in the concentration of IFN - γ compared wit control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the erythrocyte sedimentation rate (E.S.R) in all patients groups : SA, UA, MI, HF consequently compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the mean of C - reactive protein concentration in the serum of all patients groups : SA, HF, MI, UA respectively compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the concentration of serum C3 in all patients groups : MI, UA, HF, SA respectively compared with control group. - Significant increased in the concentration of serum C4 in all patients groups : SA, UA, HF, MI consequently compared with control group (P<0.05). * Lipids and lipoproteins - Significant increased (P<0.05) in the mean of cholesterol level in HF, MI and UA patients groups compared with the control group, on the other hand, decreased in the cholesterol level in SA patient group was observed compared with the control group. - Highly significant elevated (P<0.01) in the means of serum triglyceride level in all patient group; SA, MI, UA, HF respectively compared with control group. - Significant decreased (P<0.05) in the serum HDL - C level in the HF, SA, UA patents groups respectively compared with control group on the other hand, increased in the level of HDL - C in the MI patients group. - The means of serum LDL - C level illustrated no significant differences recorded among patients groups and control group (P>0.05).* Haemoglobin test - Significant decreased (P<0.05) in the mean of haemoglobin concentration in the UA patients group compared with healthy control group, with non significant increased in Hb. Level was observed in HF, MI, SA patients groups compared with healthy control group (P>0.05). Results of the present study showed that immuno - inflammatory elements play a crucial role in the susceptibility of heart diseases this reflected by markedly elevated in the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8 IFN - γ) in all patients of heart diseases in addition elevation of erythrocyte sedimentation rate and the level of C - RP this reflect the degree of the inflammatory status of heart diseases patients, also this revealed that complement component C3 & C4 play important role in inflammatory process of heart diseases through both pathway classical & Alternative, on the other hand, the results proved that infected by H.pylori consider as important microbial risk factor in heart diseases, furthermore, the results revealed that lipid & lipoproteins play important role as risk factor in the occurrency of heart disease, in addition, this study showed that blood groups antigens could play crucial role in the aetiopathogensis of heart diseases.

دراسة جزيئية لبكتريا Enterococcus spp. المقاومة لمضاد الفانكومايسين == Molecular Study of the Vancomycin - Resistant Enterococcus spp

Author name: مها مخلف كاظم الشمري

Supervisor name: محمد فرج شذر المرجاني | كفاح احمد جاسم الكرخي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت (325) عينة شملت (268) عينة سريرية ، توزعت بين (151) عينة ادرار و(101) عينة دم و(16) عينة سائل النخاع الشوكي CSF)) ، من مستشفيات مختلفة من مدينة بغداد ،من جانب اخر جمعت (57)عينة براز من اصحاء وذلك للفترة من بداية تشرين الاول وحتى نهاية كانون الاول لعام 2010. تم الحصول على (33) عزلة تعود لجنس Enterococcus بواقع (30) عزلة من عينات الادرار و(3) عزلات من عينات الدم ، فيما لم يتم الحصول على اية عزلة من عينات سائل النخاع الشوكي، وبلغت عزلات براز الاصحاء (46) عزلة. اما على مستوى النوع فقد تم تشخيص (20) عزلة تعود للنوع E.faecalis ، شملت (17) عزلة من عينات الادرار بنسبة عزل (6.3)% و(3) عزلات من عينات الدم بنسبة عزل (1.11)% ، في حين شخصت (10) عزلات تعود للنوع E.faecium بنسبة عزل (3.73)% وقد عزلت جميعها من عينات الادرار. وفيما يخص عينات براز الاصحاء فقد كانت السيادة تعود للنوع E.faecium اذ شخصت (40) عزلة تعود لهذا النوع وبنسبة عزل (70.1)% في حين شخصت (3) عزلات فقط تعود للنوع E.faecalis بنسبة عزل (5.2)%. اختبرت حساسية العزلات تجاه (11) مضادا حيويا مختلفا باستعمال طريقة الاقراص وقد اظهرت النتائج فعالية كل من Imipeneme وAmpicillin تجاه عزلات بكتريا E.faecalis السريرية ، اما Ofloxacin فقد اظهر فعالية تجاه عزلات الاصحاء بالمقارنة مع العزلات السريرية ، في حين كانت عزلات هذه البكتريا مقاومة بنسبة (100)% Oxacillin وCefepime ، بينما اظهرت العزلات السريرية مقاومة بنسبة (55)% Azlocillin وبلغت نسبة مقاومة عزلات الاصحاء لهذا المضاد (66.7)% ، وكانت نسبة مقاومة عزلاتها من الاصحاء (100)% Erythromycin وRifampicin وTetracycline ، اما بالنسبة لبكتريا E.faecium فقد اظهرت عزلاتها حساسية عالية تجاه Imipeneme وكانت العزلات السريرية اكثر حساسية تجاه Ampicillin مقارنة بعزلات الاصحاء . فضلا عن ان العزلات جميعا كانت مقاومة Oxacillin ، بينما كانت العزلات السريرية مقاومة بنسبة (100)% Azlocillin ، في حين كانت عزلات الاصحاء مقاومة بنسبة (100)% Cefepime ، كما اظهرت عزلات الاصحاء مقاومة اعلى من العزلات السريرية تجاه Erythromycin ، كما كانت جميع العزلات السريرية مقاومة Rifampicin وStreptomycin. اوضحت نتائج الدراسة الحالية ان (25)% من العزلات السريرية و(66.7)% من عزلات الاصحاء لبكتريا E.faecalis كانت مقاومة Vancomycin ، بينما بلغت نسبة العزلات السريرية لبكتريا E.faecium المقاومة لهذا المضاد (40)% ، في حين كانت نسبتها بين عزلات الاصحاء (47.5)% . حددت التراكيز المثبطة الدنيا Vancomycin للعزلات المقاومة لهذا المضاد بطريقة التخفيف بالوسط السائل ، تراوحت قيم MIC للعزلات السريرية لبكتريا E.faecalis بين (4 - 512) مايكروغرام\مل ، بينما كانت عزلتا الاصحاء التابعة لهذه البكتريا ذات MIC (128و64) مايكروغرام\مل ،اما بالنسبة لبكتريا E.faecium فتراوحت قيم MIC لعزلاتها السريريــــة بين (4 - 64) مايكروغــرام\مـــل ولــــعزلاتها من الاصحاء) ≤4) مايكروغرام\مل . بينت نتائج التحري عن الدنا البلازميدي بالترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز لعدد من عزلات بكتريا المكورات المعوية المقاومة Vancomycin Vancomycin - Resistant Enterococcus) (VRE) ) احتواء بعض هذه العزلات على حزم بلازميدية مختلفة الاحجام. اجريت عمليات الاقتران البكتيري خارج الجسم الحي In vitro)) وداخل الجسم الحيvivo) In) ، اظهرت النتائج نجاح عمليات الاقتران اذ لوحظ انتقال صفة مقاومة Vancomycin بين الخلايا مما يدل على احتمال كون جينات هذه الصفة محمولة على بلازميدات اقترانية تسهل انتقالها عبر الانتقال الافقي من خلية لاخرى ضمن النوع نفسه او الانواع الاخرى . كما اظهرت نتائج التشخيص باستعمال تقنيةPCR لعزلات بكتريا المكورات المعوية نجاح ارتباط البوادئ بالتسلسلات المكملة لها ضمن جيناتsod A الموجودة بالدنا القالب لكلا النوعين الذي ادى الى الحصول على نواتج التضاعف وبالتالي التاكد من صحة الفحوصات التشخيصية التي اجريت على العزلات والتي اعتمدت الفحوصات البايوكيميائية ماعدا (4) عزلات لبكتريا E.faecalis و(6) عزلات لبكتريا E.faecium لم تعط اي ناتج . بينت نتائج التحري عن جينات مقاومة Vancomycin في بكترياVRE سواء كانت VRE.faecalis (VREF) او VRE.faecium (VREFm) ان جينات المقاومة vanA هي الاكثر انتشارا بين العزلات المحلية بالمقارنة مع جينات vanB اذ احتوت العزلات جميعها - سواء كانت السريرية او المعزولة من الاصحاء التابعة لكلا النوعين وذات (64)≤ MIC مايكروغرام\مل - على جين vanA عدا عزلتين كانت احداهما عزلة سريرية تعود لبكترياE. faecalis والاخرى عزلة اصحاء تعود لبكتريا E.faecium اللتان لهما MIC (32) مايكروغرام \مل اذ احتوت كل منهما على جين vanB . | This study involved collecting (325) samples distributed as two groups : The first group was including (268) clinical samples distributed as (151) urine, (101) blood and (16) CSF, the second group involved (57) stool specimens from healthy people, from different hospital in Baghdad, since October till December 2010. All (73) isolates had been identified by morphological, cultural and biochemical tests such API - 20 strep and API Rapid ID - 32 strep, as a result of these tests (6.3)% of urin isolates, (1.11)% of blood isolates and (5.2)% of stool isolates were identified as E.faecalis, at the same time (3.73)% of urine isolates and (70.1)% of stool isolates were identified as E.faecium. Blood agar medium used to detect bacterial ability to produce β - hemolysin, (58.82)% and (66.67)% of E.faecalis clinical and stool isolates were able to produce β - hemolysin, (20)% of clinical and (27.5)% of stool E.faecium isolates were able to produce β - hemolysin. The antibiotic susceptibility test to (11) types of antibiotics showed the high susceptibility of E.faecalis isolates to Imipeneme and Ampicillin and the high resistance (100)% to Oxacillin, and Cefepim, all isolates showed resistance to Azlocillin , stool isolates showed high resistance to Tetracyclin and Refampicin, all E.faecium isolates showed high sensitivity to Imipeneme, high sensitivity to Ampicillin (among clinical isolates more than stool isolates), high resistance among stool isolates to Erythromycin, all clinical isolates were resistant to Streptomycin and Rifampicin. The vancomycin susceptibility test for E.faecalis was done results showed that (25)% of clinical isolates and (66.7)% of stool isolates were resistant to this antibiotic. While (40,47.5)% of clinical and stool E.faecium isolates were resistant to vancomycin respectively. Minimum Inhibitory concentrations for vancomycin were determined, VRE.faecalis isolates that had concentrations between (4 - 512) μg/ml, and VRE.faecium clinical isolates had MICS (4 - 64) μg/ml and the MICS for stool isolates were ≥ 4 μg/ml. The detection of plasmid DNA in VRE isolates by gel electrophoresis showed that some of these isolates had plasmid bands with different sizes. The bacterial conjugation expriments between Enterococcus isolates had gained success in transfer of vancomycin resistance between the local isolates by in vitro and in vivo conjugation. Identifiicaion of Enterococcus isolates to the species level by using the sodA gene as a target in the PCR in this method (19) of E.faecalis isolates gave suspected products while (24) of E.faecium isolates gave suspected products. The detection of van genes by PCR showed the high dissemination of vanA gene which encoded to high resistance level to vancomycin between the local VRE isolates especially VREFm in comparison to vanB gene

الدور المحتمل للانترليوكين - 33 (33 - IL) في النساء ذوات مقدمة الارتعاج == The possible Role of IL - 33 in preeclamptic women

Author name: مها محمود شاكر

Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: صممت الدراسة الحالية بهدف تقصي بعض المتغيرات المناعية وبالتحديد interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin IgG and antiphospholipid IgG عند الحوامل المصابات بمقدمة الارتعاج وقد امتدت الدراسة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر كانون الثاني 2014. اشتملت الدراسة على 90 امراة حامل تراوحت اعمارههن (16 - 42) منهن 60 مريضة بمقدمة الارتعاج من المراجعات لمستشفى بغداد التعليمي قسم النسائية والتوليد ومستشفى فاطمة الزهراء التعليمي و30 امراة ذات حمل طبيعي للمقارنة ممن ليس لديهن تاريخ سريري للاصابة بمقدمة الارتعاج, قسمت المريضات الستين وفقا لشدة المرض الى 23 حالة خفيفة و37 حالة شديدة .تضمنت العينات اخذ كل من الدم والادرار اضافة الى مليء استمارة استبيان اعدت بهدف الحصول على تفاصيل الحالة الصحية التي تضمنت العمر بالسنوات وعمر الحمل عدد مرات الولادة عند المشاركات في الدراسة. تم خلال الدراسة قياس مستويات interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid( IgG) بتقنية الاليزا بالاضافة الى قياس كل من Cholesterol and triglyceride وقد تم قياس الطول والوزن لحساب مؤشر كتلة الجسم وتم اخذ اوزان الاطفال لكل من المريضات وذوات الحمل الطبيعي وقد خلصت الدراسة الى نتائج مختلفة يمكن تلخيصها بما يلي : ارتفعت مستويات IL - 33عند مستوى معنوية (P<0.05) لتصلml) (163.78 ± 26.82 pg/ في امصال النساء المصابات بمقدمة الارتعاج وعند كلا من المريضات ذوات الحالة الخفيفة (164.30 ± 28.54 pg/ml) وذوات الحالة الشديدة من المرض (163.45 ±16.71 pg/ml) اذا ما قورنت بمستوياته بنظيراتهن من نساء السيطرة((92.27 ± 11.56 pg/ml يمكن ان تدل هذه التغيرات على دور هذا الانترليوكين في امراضية مقدمة الارتعاج. اما بشان IgE فقد سجل ارتفاعا في مستوياته في مريضات مقدمة الارتعاج ( (275.31 ± 28.89 IU/ml) سواء اكن من ذوات الحالة الخفيفة(30.5.31 ± 48.24 IU/ml) ام الحالات الشديدة( 256.67 ± 36.18 IU/ml) مقارنة بمستوياته التي ضلت ضمن حدودها الطبيعية في امصال النسوة في مجموعة السيطرة (138.26 ±20.17 IU/ml ) .وربما تنذر مثل هذه النتائج بالدور الضار لل IgE في مقدمة الارتعاج. لوحظت علاقة احصائية موجبة بين فرط انتاج IL - 33 مع الزيادة في مستويات IgE عند النساء المريضات. من ناحية اخرى لم تكن هنالك ثمة تغيرات في مستويات اضداد الكارديوليبين واضداد الفوسفوليبد في امصال المريضات بمقدمة الارتعاج(3.54 ± 0.22 pg/ml) ( 3.20 ± 0.19 pg/ml) على التوالي سواء ذوات الحالة المعتدلة(3.73 ± 0.43 pg/ml) ( 2.68 ± 0.28 pg/ml)على التوالي ام الشديدة منها(3.42±0.25 pg/ml) (3.52±0.24 pg/ml) على التوالي والتي ظلت عند مستوياتها الطبيعية(3.34± 0.12 pg/ml) (3.36 ± 0.29 pg/ml) على التوالي عند النساء ذوات الحمل الطبيعي .كما لوحظ ايضا ارتفاعا عند مستوى معنوية في الكولسترول عند المريضات251.4 ± 22 mg/dl),) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (187.3 ± 10.78 mg/dl) كذلك لوحظ مثل هذا الارتفاع في الدهون الثلاثية عند المريضات ذوات مقدمة الارتعاجmg/dl) 251.4 ± 22) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (223.7 ± 29.72 mg/dl وعندما تم احتساب قيمة الدهون منخفضة الكثافة جدا من الدهون الثلاثية فقد وجد انها ترتفع عند مستوى معنوية عند النساء من ذوات مقدمة الارتعاج (49.52 ± 1.12 mg/dl) مقارنة مع نظيراتهن من ذوات الحمل الطبيعي41.82 ± 5.18 mg/dl) ) وكذلك لوحظ ارتفاعا في مؤشر كتلة الجسم عند المريضات 33 ± 0.5 Kg/m2)) مقارنة مع ذوات الحمل الطبيعي (30 ± 0.6 Kg/m2) في حين لم يلاحظ اي اختلاف في معدل اوزان اطفال كل من المريضات بمقدمة الارتعاج او ذوات الحمل الطبيعي ( .(3.52 ± 0.36 Kg , 3.4 ± 0.31Kg | The present study was designed to focus on some immunological changes; namely interleukin - 33, total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) accompanied preeclampsia . The study was extended from October 2013 to February 2014. Ninety women whose ages ranged from 16 - 42 years, were enrolled in the study including 60 preeclamptic women, among those attending the Department of Obstetrics and Gynecology in Baghdad Teaching hospital and in Fatima AL - Zahra Teaching Hospital. In addition to, 30 women whose pregnancies were healthy with no history of preeclampsia. The preeclamptic women were divided according to the severity of the disease into 23 with mild preeclampsia and 37with severe preeclampsia. Samples were taken from the 90 participants including blood and urine, in addition to a questionnaire which was prepared for this purpose including patient age, gestational age, parity , weight, height, history of family. There was a significant (P < 0.05) increase in the mean systolic blood pressure (SBP) and diastolic blood pressure (DBP) in women with mild and severe PE (14.84 ± 0.93, 10.06 ± 0.81 mmHg & 17.36 ± 1.08, 11.29 ± 0.73 mmHg respectively) as compared to those of apparently healthy pregnant (control) group (10.59 ± 0.87, 7.38 ± 0.28 mm - Hg respectively). The elevation of albuminuria in preeclamptic women were recorded to be 3 grades (+1,+2,+3). The highest ratio (41.6 %) of preeclamptic were with grade +2, (30.1%) of them recorded to be with +3, grade while (28.3%) with +1 grade. Statistically there were significantly (p < 0.05) differ compare to their counterparts in those with healthy pregnancy (controls) in whom albuminuria wasn’t been detected Levels of interleukin - 33, Total IgE, anticardiolipin (IgG), and antiphospholipid (IgG) were estimated using ELISA technique while lipid profile were estimated by using enzymatic method, results can be summarized as follows : Interleukin - 33 levels significantly elevated (P < 0.05) to reach (163.78±26.82 pg/ml) in preeclamptic women, including both groups of patients, those with mild (164.30 ± 28.54 pg/ml) and those with severe illness (163.45 ± 16.71 pg/ml) in comparison to their counterparts in control group (92.27 ±11pg/ml). Such changes may indicate the pivotal role of interleukin - 33 in the pathogenesis of preeclampsia. Regarding (IgE) also recorded to be significantly elevate (P<0.05) in preeclamptic patients (275.31 ± 28.89 IU/ml), both in those with mild (305.31 ± 48.24 IU/ml ) and those with severe illness (256.67 ± 36.18 IU/ml), also, which it remain within its normal range in control groups (138.26 ± 20.17 IU/ml). These results can be alarming for the noxious role of total IgE in the pathogenesis of preeclampsia. Statistically, a positive correlation was noticed between the overproduction of serum interleukin - 33 and increased levels of serum total IgE in preeclamptic women. On the other hand there were no significant changes in each of anticardiolipin (IgG) and antiphospholipid (IgG) levels which remain within the limits of their normal range in sera of preeclamptic patients (3.54 ± 0.22 pg/ml and 3.20 ± 0.19 pg/ml) respectively, whether those of mild (3.73 ± 0.43 pg/ml and 2.68 ± 0.28 pg/ml respectively) or sever conditions (3.42 ± 0.25 pg/ml and 3.52 ± 0.24 pg/ml) respectively in compareision to their levels in those women whose pregnancies were with no complications (3.34 ± 0.12 pg/ml and 3.36 ± 0.29 pg/ml) respectively. Cholesterol, triglyceride, and very low density lipoprotein recorded significantly elevated (P < 0.05) in preeclamptic patients (264.1 ± 34.54 mg/dl, 251.4 ± 22 mg/dl, 49.52 ± 1.12 mg/dl) respectively as compared to control group (187.3 ± 10.78 mg/dl, 223.7 ± 29.72 mg/dl, and 41.82 ± 5.18 mg/dl respectively).The body mass index also increased in its mean in preeclamptic patients (33 ± 0.5 Kg/m2) at(P < 0.05) as compared to control group (30 ± 0.6 Kg/m2), while there are no significant (P > 0.05) increase in mean of weight of babies of preeclamptic women (3.4 ± 0.31Kg) as compared to control group (3.52 ± 0.36 Kg).

تاثير نبات Carica papaya على طفيلي Giardia lamblia في الفئران وبعض التغيرات البايوكيميائية والنسيجية == Effect of Carica papaya on Giardia lamblia in mice, some biochemical and histological changes

Author name: مصطفى كاظم ملاخ عزيز

Supervisor name: شذى خضير

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة لمستخلص بذور نبات Carica papaya على 100 من الفئران السويدية التي تتراوح اعمارهم (6 - 10) اسابيع ومعدل اوزانهم (8 - 23) غم المصابة بطفيلي الجيارديا ثم ومعرفة بعض التغيرات المناعية والفسيولوجية المرضية والنسيجية والكيميائية الحياتية الحاصلة في تلك الفئران بعد استخدام مستخلص البذور كعلاج لتلك القئران من الجيارديا ثم مقارنتها مع الفلاجيل.بينت نتائج الدراسة المعطيات التالية : هناك انخفاض في مستوى البروتين الكلي في مصل مجموعة الفئران المصابة بطفيلي الجيارديا والمجموعة التي تم معالجتها بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2٪ و5٪ (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) في حين ارتفع مستواه في مجموعة الفئران التي تم معالجتها من قبل فلاجيل (4.35 ± 0.06) مقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة (4.10 ± 0.06).انخفض مستوى الكلكوز انخفاض طفيفا في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا (7.70 ± 0.04). في حين ارتفع مستوى الكلكوز في مصل الدم في المجموعة المعالجة بالفلاجيل وكذلك المجموعتين المصابة بالجيارديا والمعالجة بمستخلص بذور نبات ال Papaya 2% و5% (10.90 ± 0.04) (10.60 ± 0.05) (10.64 ± 0.07) على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (8.10 ± 0.06).مستوى انزيمات الكبد (GOT, GPT) ارتفعت في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة. انخفض مستوى الكوليسترول في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا وفي مجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 5% (1.50 ± 0.04) (1.64 ± 0.05) على التوالي, بينما ارتفع لدى مجموعة الفئران المعالجة بالفلاجيل (2.65 ± 0.03) ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 2% (2.65 ± 0.08) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (2.50 ± 0.00).ارتفع مستوى الكرياتين في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى البروتينات (A, C, D, E) انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري المغنيسيوم والصوديوم انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري الكالسيوم والبوتاسيوم انخفض في مجموعة الفئران المصابة بلجيارديا بينما ارتفع مستواه في مجموعة الفئران المعالجة بلفلاجيل ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2% و5% مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.اظهرت النتائج تغيرات فسلجية مرضية متنوعة في امعاء وكبد وكلية الحيوانات المصابة بطفيلي الجيارديا شملت قصر في الزغابات المعوية, ارتشاح خلوي التهابي, تنسج مع وجود التنخر واحتقان دموي مع تجمع للدهونافضل النتائج كانت بلنسبة للفلاجيل ومن ثم يليها المستخلص المائي لبذور بنات Carica papaya بتركيز 2%. | This study was conducted to determine the effect of different concentrations of seeds extract of Carica papaya plant on 100 Swedish mice aged (6 - 10) weeks and the rate of their weight (8 - 23) g infected with parasite of Giardia and then knowing some pathological physiological, histological and Biochemical changes that occurred in those mice after using the seed extract as a treatment for those mice from Giardia and then compare it with Flagyl. There is a decrease in the total protein level in serum of the group infected mice with Giardia, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) g/L respectivily while its level increased in the group which treated by Flagyl (4.35 ± 0.06 g/L) compared to the negative control group (4.10 ± 0.06 g/L). Level of glucose low slightly in serum in the group of infected mice with Giardia (7.70 ± 0.04 mmol/L), while its level high in the serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (10.90 ± 0.04, 10.60 ± 0.05, 10.64 ± 0.07) mmol/L respectively compared to the negative control group (8.10 ± 0.06 mmol/L). The level of the enzyme (GOT) and (GPT) high in all groups compared with a negative control. The cholesterol level in serum of the group infected mice with Giardia and the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 5% (1.50 ± 0.04 and 1.64 ± 0.05) mg/dl respectively, while its level high in the serum of the group that dosage with flagyl and the group that dosage with seeds extract of Carica Papaya concentration of 2% (2.65 ± 0.03, 2.65 ± 0.08) mg/dl respectively compared to the negative control group (2.50 ± 0.00 mg/dl). The level of Creatinine in the serum high in all groups compared to the negative control group. The level of vitamin A, C, D and E became low in the serum of all groups compared with negative control group. The level of Mg+2 and Na+ low in a serum of all groups compared with the negative control group. The level of Ca+2 and K+ low in a serum of the group of infected mice with Giardia while its level rise in a serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% compared to the negative control group. Results showed diverse histopathological changes in the intestines, liver and kidney of infected animals with Giardia included Palace in intestinal villi, inflammatory cellular infiltration, hyperplasia, necrosis, bloody vessels congestion and accumulation the fats. The best results were for Flagyl, and then for aqueous extract of Carica papaya in a concentration 2%.

مقارنة النشاط الانزيمي لبكتريا Escherichia coli المعزولة من مرضى التهاب المجاري البولية للمصابين وغير المصابين بالعجز الكلوي == Comparison of enzymatic activity of Escherichia coli isolated from urinary tract infection patients with renal failure and non - renal failure

Author name: مصطفى حسن زينل طلحة

Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت هذه الدراسة خلال الفترة من 1/6/2007 لغاية 1/6/2008 . تظمنت جمع 55 عينة ادرار من مستشفى الكندي العام شعبة الكلية الصناعية من المرضى الذين يعانون من التهاب المجاري البولية والمصابين بالعجز الكلوي، ومن كلا الجنسين، وبالاعمار ما بين 30 و55 سنة مقارنة بغير المصابين بالعجز الكلوي الذين تم جمع العينات منهم من المستشفى المذكور، اضافة الى مختبرات حكومية واهلية اخرى وبواقع 143 عينة من هؤلاء المصابين بالتهابات المجاري البولية ضمن الاعمار 3 و75 سنة. تم عزل 51 عزلة بكتيريا من ادرار مرضى العجز الكلوي مع التهاب المجاري البولية منها (49 عزلة للذكور واثنتان للاناث) ، بالاضافة الى عزل 80 عزلة بكتيريا من مرضى غير مصابين بالعجز الكلوي مع التهاب المجاري البولية (33 ذكور و54 انثى).وتم تشخيص الجراثيم المسببة لالتهابات المجاري البولية من كلتا مجموعتي الدراسة بالاعتماد على الصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية القياسية . وكانت نسبة الجراثيم المعزولة من مرضى العجز الكلوي كالاتي 86.2% لـEscherichia coli و5.8% Pseudomonas aeruginosa و3.7% لكل من Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis . وان نسبة الجراثيم المعزولة من التهاب المجاري البولية لغير المصابين بالعجز الكلوي كانت 48.7% Escherichia coli و11.3% لكل من Staphyllococcus aureus وProteus mirabilis, و5.0% Pseudomonas aeruginosa و6.2% Klebsiella pneumoniae و6.2% Enterobacter sp. و7.5% Streptococcus sp.. اتبعت طريقة اليود السريعة لتحديد العزلات المنتجة لانظيمات البيتالاكتاميز، ووجد ان 95.4% من هذه العزلات منتجة للانظيم في مجموعة المصابين بالعجز الكلوي, ونسبة 97.4% للمرضى غير المصابين بالعجز الكلوي، كما تم معرفة نشاط انتاج انظيمات الهيمولايسين بطريقة زرع العزلات التي اظهرت نتيجة موجبة على وسط اكار الدم، وذلك باستعمال انماط مختلفة من الدم البشري بفصائله الاربعة A ,B ,AB ,O ، ووجد ان اعلى نسبة تحلل للدم كانت للصنف AB ولكل من المصابين وغير المصابين بالعجز الكلوي، كما ان نسبة النشاط الهيمولايسيني ولجميع العزلات مرتفعة اذ كانت 84.6% لدى غير المصابين بالعجز الكلوي ووصلت النسبة الى 86.6% لدى المصابين بالعجز الكلوي.اختبرت حساسية البكتريا لمضادات الحياة التي قيست بطريقة Kirby - Bauer على وسط Mueller - Hinton agar وان مضادات الفلوروكوينيلونات, والازيثرومايسين كانت الاكثر فعالية ضد الجراثيم المعزولة من مرضى العجز الكلوي، بينما كانت مضادات النورفلوكساسين وحامض النالدكسيك والبيفلوكساسين اكثر فعالية ضد الجراثيم المعزولة من غير المصابين بالعجز الكلوي.كما وجد ان مديات المقاومة المتعددة لمضادات الحياة في مرضى العجز الكلوي اقل من غير المصابين بالعجز الكلوي، اذ كانت مديات المقاومة لاكثر من خمسة مضادات بنسبة 17.6% ولجميع المضادات بنسبة 10.7% اما غير المصابين بالعجز الكلوي فقد وصلت مديات العزلات المقاومة لخمس مضادات 18.0%، والمقاومة لجميع المضادات الموضوعة بالبحث الى 17.9%. | This study was carried out between 1st of June 2007 to the 1st of June 2008. It comprised the collection of 55 urine samples from Al - Kindy general hospital /artificial kidney department from patients who suffered from urinary tract infections with renal failure of both sexes and of ages between 30 - 55 years and was compared with people not suffering from renal failure by sample collected from them in the above mentioned hospitals, these samples were studied in government and private laboratories amounting to 143 samples from those with urinary tract infection ages between 3 - 75 years.Fifty one bacterial isolates were isolated from renal failure urines with urinary tract infections of this 49 from males and 2 from females in addition to 80 bacterial isolates from non - renal failure patients with urinary tract infections (33 males & 54 females).Bacteria causing urinary tract infections from both groups which were studied were identified by morphological characters and biochemical standard testing. The percentage of germs isolated from renal failure patients was 86.2% for Escherichia coli, 5.8% for Pseudomonas aeruginosa, 3.7% for Klebsiella pneumoniae and 3.7% for Proteus mirabilis and the percentage of germs isolated from urinary tract infection patients with non - renal failure were 48.7% for Escherichia coli, 11.3% for Staphyllococcus aureus, 11.3% for Proteus mirabilis, 5.0% for Pseudomonas aeruginosa, 6.2% for Klebsiella pneumoniae, 6.2% for Enterobacter sp. and 7.5% Streptococcus spp.Quick iodine method was used to determine the isolates which produce β - lactamase enzyme, 95.4% of these isolates were found to produce this enzyme in the group of patients with renal failure and 97.4% in patients with non - renal failure. The activity of haemolysin enzyme production was determined by culturing the isolates on blood agar by using different sorts of human blood of all four groups A, B, AB & O and the highest proportion of blood haemolysis was found in the AB group in both renal failure 85.6% and non - renal failure patients 84.6%.Antibiotics sensitivity was tested by Kirby - Bauer method and measured on Mueller - Hinton agar medium however Floroquinilones & Azithromycin antibiotics were the most efficient against the isolates from renal failure patients, while Norfloxacin, Naldixic acid and Pefloxacin were efficient against isolates from non - renal failure patients. It was found that the extents of antibiotic resistant in renal failure patients was less than in non - renal failure patients where the resistance for more than 5 antibiotics was 17.6% and for all antibiotics 10.7%, while the resistance extent to 5 antibiotics in non - renal failure patients was 18.0% and to all antibiotics was 17.9%.

Author name: ليث باسم علي الحسيني

Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تكمن اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع الامراض السرطانية وقد اكدت الدراسات المتعلقة بسرطان الثدي على دور مجموعتي ABO وMNS ، اضافة الى ان مجموعة الدم Lewis تلعب دورا اساسيا كجزيئات مرتبطة بالسرطان Cancer associated molecules جمعت 100 عينة دم من مريضات سرطان الثدي القنوي Ductal breast carcinoma ومثلها لنساء صحيحات مقاربة بالعمر للمقارنة.اهتمت الدراسة في ايجاد تردد مجاميع الدم ABOو Lewis وMNS وLutheran للمريضات والصحيحات ،اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية وتكوين المعقدات المناعية في مريضات السرطان وعلاقة ذلك بمجاميع الدم المختلفة. نمطت مجاميع الدم المختلفة باستعمال كشف التلازن الدموي Hemagglutination test كما استعمل فحص انخفاض العيارية للمصل كمعيار لتكوين المعقدات المناعية اضافة لاستعمال تثبيط تكوين المعقدات المناعية بالمستضد الحر كدليل على انفتاح المعقدات المناعية. واستعمال كشف تثبيط التلازن لدراسة نوعية الاضداد المعنية في هذه الدراسة. اظهرت نتائج العينة المدروسة عدم وجود فروق معنوية لصنفي الدم O وA في المريضات مقارنة بالصحيحات, بينما كانت نسبة صنف الدمB منخفضة في المريضات حيث بلغت 10% مقارنة بنسبة 24% للصحيحات وكانت النتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.001) ، في حين ابدت مجموعة دم Lewis في المريضات ترددا مغايرا عن تلك التي في الصحيحات, فقد بلغ تردد مجموعة دم Le( a - b+) %40 عند المريضات مقارنة بنسبة تردد %55 في الصحيحات وكان التحليل الاحصائي مشير الى معنوية هذا الفرق p<0.05)) ،اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b - )فلم تعطي فرقا معنويا فكانت %29 في المريضات مقارنة بنسبة %31 للصحيحات ، كما اظهرت مجموعة دم Le (a - b - ) نسبة بلغت %23 في المريضات مقارنة بنسبة %10عند الصحيحات اما نسبة مجموعة الدم Le (a+ b+) فكانت 8%و4% في المريضات والصحيحات على التوالي وكانت نتائج التحليل الاحصائي معنوية (p<0.005). فيما يتعلق بدور المجموعة MNS فقد اتضح من الدراسة ان المجموعة MN كانت الاكثر ازديادا اذ بلغت نسبة ترددها في المريضات %77 مقارنة مع %57 في الصحيحات(p<0.001). اما نسبة تردد النمط الوراثي Lu(a - b - )لمجموعة الدمLutheran فقد كانت عالية اذ بلغت 31% في المريضات, و7% في الصحيحات(p<0.001), بينما كانت نسبة تردد النمط الوراثي Lu (a - b+) منخفضة في المريضات اذ كانت 65% بينما كانت 82% في الصحيحات(p<0.001).اظهرت نتائج العينة المدروسة استجابة مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSوLutheran حيث كانت مجموعتي الدم AوO اكثر المجاميع اعطائا لعيارية ضادة لمستضد او مستضدات كريات دم البقر فقد بلغت 2.9 ± 8.9 و0.9 ± 7.4 للمريضات على التوالي مقارنة بعياريات بلغت 0.9 ±5.0 و0.7±6.5 لمجموعتي الدم AوO للصحيحات على التوالي .(P<0.05) اما مجموعة الدم Lewis فقد لوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Le(a - b+) كانت الاعلى اذ بلغت 8.5 ± 2.0 في المريضات و5.7 ± 0.7 في الصحيحات (P<0.05). وقد بلغ معدل عيارية النمط الوراثي MM 7.3±1.8 للمريضات مقارنة بعيارية 5.1±1.3 للصحيحات ( (P<0.05وكان الاعلى بين العيارية الموجبة للانماط الوراثية الاخرى لمجموعة الدم MNS. ولوحظ ان معدل عيارية حاملي النمط Lu(a - b+) الاعلى حيث بلغ 7.4 ± 1.2 في المريضات وكان معدل تلك العيارية 5.8 ± 0.7 في الصحيحات ( (P<0.01. سجلت نتائج العينة المدروسة تكون المعقدات المناعية Immune complexes في مصول مريضات سرطان الثدي باختلاف انماطهم الدموية ABO وLewis وMNSو Lutheran من خلال انخفاض في معايير الاضداد الضادة لكريات دم الابقار بعد تكوين المعقدات المناعية. ابدى 54 نموذجا للمريضات و37 نموذجا للصحيحات انخفاض في معايير الاضداد بعد تكوين المعقدات المناعية فقد كانت النسبة المئوية للمريضات المكونة للمعقدات 83.0% وكانت العيارية 7.1 ± 0.8 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات % 63.0بمعدل عيارية 5.5 ± 0.6 قبل تكوين المعقدات المناعية ((P<0.01، اما بعد تكوين المعقدات المناعية اصبحت النسبة المئوية للمريضات 65.1% بمعدل عيارية 2.9 ± 0.4 في حين كانت النسبة المئوية للصحيحات 58.7% بمعدل عيارية 3.0 ± 0.5 واشارت نتائج التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية بين النسبتين.تشير نتائج الدراسة الحالية الى ان هنالك ترابط بين وجود الجزيئات المسؤولة عن مجاميع الدم ووجود سرطان الثدي القنوي اذ حدد هذا الترابط اعتمادا على تلازم المرض مع المجموعة واختلافه في الصحيحات.اشارت نتائج الدراسة الحالية الى القابلية الكبيرة لمريضات سرطان الثدي القنوي على تكوين المعقدات المناعية وحددت بعض معالم نوعية الاضداد الداخلة في تلك المعقدات. سجلت هذه الدراسة ظاهرة انقلاب الصنف (من مجموعة الدم B الى AB) لاول مرة.تمت مناقشة نتائج الدراسة في ضوء النتائج المتوافرة في الابحاث العلمية ذات الصلة . | Blood groups antigens are important molecules their phenotypic expression are associated with various type of diseases as well as cancer, especially, Blood groups ABO, Lewis, MNS and Lutheran. The present study dealt with the frequency distribution of these molecules patients of ducted breast cancer and matched healthy Iraqi women. In addition the immune response toward red blood corpuscles antigen(s) and immune complexes formation were investigated.Different type of blood groups were typed by using direct hemagglutination tests, tube and Anti - human globulin test. The occurrence of immune complexes were detected using a lowered hemagglutinin titers befor and after incubating sera at room temperature and 4C. in addition, The specificity of immune complexed immunoglobulin was analyzed using free saliva antigens and hemagglutination inhibition.The results showed the followings.There no significant differences in the frequency distribution of A and O and blood groups in patient and healthy control, However Blood group B frequency was 10% in patient vs. 24% in controls (p<0,001) .On the other hand however Lea - b+ blood group approach a frequency of 40 % in patients vs 55% in controls (p<0.05).The difference of frequency of Lea+b - in patients and controls was not significant . Lea - b - Lewis blood group gave a frequency distribution of 23% in patients compared to 10% in controls (p<0.05) .In the MNSs blood group, The phenotype MN gave a highly significant frequency distribution 77% in patients vs 57% in controls (p<0.001) .In Lutheran blood group Lu a - b - showed a 31% frequency distribution in patients vs 7% in controls ( p<0.001). Various blood groups type patients demonstrated an elevated anti - bovine antibody immune response,Blood group A and O patient showed elevated mean titers .The titers in patients more 8.9±2.9 and 7.4±0.9 respectively compared to a controls mean atiters of 5±0.9 and 6.5 ±0.7 respectively . Among lewis blood groups ,the mean titer of Lea - b+ was the highest. It was8.5±2.0 in patients vs 5.7±0.7 in healthy controls (p<0.05). Likewise ,MM blood type gave a mean titer of 7.3±1.8 vs 5.1 ±1.3 in the controls (p<0.05) . The study provide the information of immune complexes (Ics) in patient and control sera . The percentage of sera giving immune complexes was 83% in patients vs 63% in controls. The respective titers after immune complexes formation were 7.1±0.8 in patients vs 5.5±0.6 in controls before (Ics) formation that rendered the titer to 2.9±0.4 in patients and 0.3±0.5 in controls after Ics formation . This study revealed a status of blood group B conversion to AB. In conclusion, the present study indicated that there were association between blood groups molecule and ductal breast cancer . The result are discussed bared on the available data on ductal breast cancer as related to blood groups molecule