عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 666

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

اسم المؤلف: نور ماجد عبد الله الدليمي
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

اسم المؤلف: نور شكيب محمد
اسم المشرف: ضمياء محمود ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

اسم المؤلف: نهاد خلاوي تكتوك
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التحري الجزيئي والتعبير الجيني لمضخات الدفق في بكتريا Pseudomonas aerugionsa متعددة المقاومة للمضادات الحيوية == The Role of Efflux Pumps in Multidrug - Resistance in Colistin - resistant Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: نبراس رضا محمد العبيدي
اسم المشرف: محمد فرج شذر المرجاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 120 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa للمدة من /15 2014/9 لغاية /11/15 2014, من مصادر سريرية مختلفة شملت : (33عزلة ) من الادرار , و(25عزلة) من الحروق , و(25عزلة ) من القشع , و(17عزلة) من الجروح , و(12عزلة ) من الدم, و( 5عزلات ) من الاذن , و(3 عزلات) من ادوات قثطرة المجاري البولية. اختبرت حساسية العزلات قيد الدراسة تجاه مضاد الكولستين باستعمال طريقة الاقراص واظهرت النتائج وجود 27) ) عزلة مقاومة للكولستين وبنسبة (%22.5) , ثم اختبرت مقاومة60 عزلة (منها 27 عزلة مقاومة للكولستين ) تجاه اثناعشر مضادا من مجاميع مختلفة وتم تحديد حساسية العزلات ومقاومتها للمضادات المايكروبية باعتماد قياس قطر منطقة التثبيط بالمليمتر حول اقراص المضادات المستعملة , واظهرت النتائج ان جميع العزلات المختبرة كانت مقاومة بشكل تام لمضادات Amoxicillin وCarbencillin بينما ابدت العزلات مقاومة لمضاداتGentamycin بنسبة (%70) و(%56.6) Tobramycin وLomefloxacin (%58.3)وكانت المقاومة اقل لمضادات Aztreonam (%18.3) وPolymyxin B بنسبة (%18.3) وتليها المقاومة لمضادNorfloxacin (%13.3)و Levofloxacin (%11.6) وتجاه Ciprofloxacin الاقل مقاومة بنسبة (%8.3) .اختبرت قابلية (60) عزلة اعلاه على انتاج انزيم البروتييز وتكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج قابلية % 88.3 من العزلات 53) عزلة )على انتاج انزيم البروتييز, وكانت جميع العزلات المقاومة للكولستين منتجة لانزيم البروتييز وبنسبة %100 , من جانب اخر كانت 43 عزلة (%71.7) منتجة طبقة لزجة قوية محددة بوساطة تكوين مستعمرات سوداء دلالة على تكوينها الغشاء الحيوي .تم الكشف عن وجود مضخات الدفق بين 60 عزلة من عزلات الدراسة ( منها 27 عزلة مقاومة لمضاد كولستين و33 عزلة حساسة له) باعتماد طريقة العجلة الخشبية Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) باعتماد صبغة الاثيديوم برومايد كمؤشر للكشف عن مضخات الدفق , واظهرت النتائج ان 46 عزلة (76.7%) من العزلات المختارة اعطت نتيجة موجبة للفحص اعلاه , ومن جانب اخر كانت جميع العزلات المقاومة للكولستين موجبة للفحص مما يدل على امتلاكها لمضخات الدفق , اما بالنسبة للعزلات الحساسة للكولستين فكانت %33.3منها تملك مضخات دفق بالكشف المظهري . اخضعت 32 عزلة (27 منها كانت مقاومة للكولستين) للكشف الجيني عن مضخات الدفق باستعمال تقنية Conventional PCRللكشف عن مضخة الدفق MexAB - OprM (بالكشف عن جينات oprMو (mexAومضخة الدفق MexXY (بالكشف عن جين mexY) اظهرت النتائج ان20 عزلة (62.5%) تمتلك الجينoprM , وان 22عزلة (68.8%) تمتلك الجين mexA , و24 عزلة (75%) تمتلك الجينmexY , وبينت النتائج ايضا بخصوص الكشف الجيني عن مضخات الدفق لعزلات الدراسة ان جميع العزلات الموجبة لاختبار امتلاك الجين mexYهي مقاومة للكولستين وقد شكلت نسبة %88.9 من العزلات الكلية المقاومة للكولستين . وتم الكشف عن التعبير الجيني لمضخة الدفق OprM - MexAB (بدراسة الجين (mexB ومضخة الدفق MexXY ( بدراسة الجين mexX) في 9 من عزلات الدراسة والتي كانت مقاومة لمضاد الكولستين باستعمال تقنية q RT - PCR من خلال استخلاص RNA البكتيري , ومن ثم تحويله الى cDNA , واظهرت نتائج الكشف عن التعبير الجيني للجين mexB والجين mexXان العزلات كانت متباينة في قيم ct , وبحسب معادلة Livak تم استخراج قيم ct ومعرفة التعبير الجيني لمضخات الدفق , ولوحظ ان التعبير الجيني لمضخة الدفق MexXY اكثر من التعبير الجيني لمضخة الدفق MexAB - OprM . | A total of (120) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were collected from different sources , During the period between 15/9/2014 till 15/11/2014 . The source of these isolates were as follows : (33) isolates from urine , (25) isolates from Burns , (25) isolates from sputum , (17) isolates from Wounds , (12) isolates from Blood , (5) isolates from ears ,and the last (3) isolates from Catheters . All isolates were identified through morphological , cultural and some biochemical tests and using Vitek2 GN . The antibiotic susceptibility test Towrd Colistin was done using the agar diffusion method ; Results showed that 27 isolates (%22.5) were resistance to Colistin ,then Sixty isolates ( Ones 27 isolates resistance to Colistin ) were tested against twelve antibiotic by measuring inhibition zone around disk antibiotic , Result showed that All isolates were complete resistance to Amoxicillin and Carbencillin , While resistance to other antibiotic were Gentamycin (70%) , Tobramycin (56.6%) , Lomefloxacin (58.3%) , and less resistance was showed for Aztreonam(18.3%) , Polymyxin B (18.3%), Norfloxacin(13.3%) , Levofloxacin(11.6%) and Ciprofloxacin (8.3%) ,The most effective antibiotic against Colistin resistance isolates were Levofloxacin and Ciprofloxacin . Sixty of isolates were choosen to detect for ability to protease production and biofilm formation , The Results showed 53 isolates (%88.3) were protease production , and results showed all Colistin resistant isolates were protease production and 43 isolates (%71.7) were able to biofilm formation . Sixity isolates (Ones 27 Colistin resistance isolates ) were choosen for detect efflux pumps by using Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) , which include ethedium bromide dye as marker to detect efflux pumps , the result showed that 46 isolates (%76.7) give positive result . Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the mexA , mexY, oprM gene , The results showed that oprM found in 20 isolates (%62.5) , mexA found in 22 isolates (%68.8) , mexY found in 24 isolates (%75) , The results also showed that 88.9 % from Colistin resistant isolates had mexY gene . Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction of Colistin resistant isolates and c DNA synthesis , The results showed that gene expression were high in efflux pumps especially to MexXY efflux pumps , and the gene expression to MexXY efflux pumps higher than MexAB - OprM efflux pums

تقييم كفاءة بعض المرشحات كبدائل في معالجة مياه الصرف الصحي واعادة استخدامها في ري نبات الذره الصفرا ء Zea mays L == Evaluation Efficiency For Some Alternatives Filters in Sewage Treatment and Reusing in Irrigation Plant Zea mays L

اسم المؤلف: منى محمد نجیب
اسم المشرف: حسين يوسف خلف الركابي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: recently Iraq where suffer from several crisis including diminished quantity and deteriorated quality of water resources, specially in southern provinces. This study was designed to show the extent of using non - traditional water resources such as sewage after its treatment with local alternative chemicals and using the resulting water in agriculture sector. Samples were collected from the terminal tank of waste water station in Al Nasiriyah ( Alhindia station) according to the criteria of United States Environment Protection Agency (USEPA, 1977) regarding the sewage properties including pH, EC, total dissolved solid(TDS), total suspended solids( TSS), CO2, Mg+2, Ca+2, Na+, CaCO3, Cl - , PO4 - , NO3 - , chemical oxygen demand ( COD), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, we easured three trace elements ( Pb, Ni, Cd) as well as sodium adsorption ratio( SAR) and biological properties and bacterial contamination with fecal coliform bacteria. Physicochemical analysis of both sewage and tab water was performed. It was found that pH values were 7.37 and 8 for sewage and tab water , respectively. While the electrical conductivity for tab water was 8.01 ds / m compared with that of sewage water which was only 1.76 ds / m . TDS, TSS and CO2 for both sewage and tab water were (3780, 723) and ( 800 , 320) and (5.41, 1.23) mg/ L respectively. Results also showed that sewage water contain high concentrations of cations and anions as compared to tab water. Magnesium concentration was 469.42mg/L in sewage water and 100.1mg/L in tab water while calcium was 581.2mg/L in tab water and 60.8 in sewage water. Sodium concentration was 662.86 mg/L in sewage water and 186.3mg/L in tab water. On the other hand, water hardness and alkalinity were (3300 , 280) mg/L for sewage water and ( 2.40, 66.49) mg/L for tab water respectively .Results of this study also showed an increase in the concentrations of some ions in crude sewage water with respect to tab water. Concentrations ofchloride,phosphate,sulphate and nitrate in sewage water sample were 2496.31 Mg/ L,1.6 Mg / L , 1976 Mg / L ,3.67 Mg / L and for tab water were 226.8,0.7,108.48,0.6 Mg/L, respectively. Fecal coliform number was 2600 cell/100 ml in sewage sample and only 6 cell/ 100 ml in tab water. BOD5 andCOD values were 18, 167 Mg/ L for sewage water and 2.0, 6.0 Mg/L for tab water respectively Heavy elements also found to be elevated in sewage with respect to tab water , where the concentrations of Pb,Ni& Cd in sewage sample were 2.8, 0.8 & 0.004 Mg / L , while they were 0.09, 0.001 &undetected in tab water, respectively. On the other hand, sodium adsorption ratio SAR in sewage samples was 7 and in tab water was only 0.48.Laboratory experiments dealt with the following : 1 - It was used sand filters as a primary processing for waste water to remove pollutants prior to pass it through used filter upon incubating it for 14 days . 2 - in this study , it was selected four types of filters to remove contaminants and improve the quality of water is (water plant Ceratophyllum demersum, wood sawyer , , coal and Cladophora glomerta ). As it was used as filters either aprimary step in processing waste water through passing these waters as aby - pass step these waters on sand filter was used in this studay .3 - chemical , physical and biological characteristics of waste waters were studied upon passing it on the under - studying filters and also estimated the efficiency of removal Removal efficiency (%) of the components. 4 - Used of Some international Standerds and Iraqi specifications to evaluate the quality of water befor and after to pass it on filters for irrigation purposes. Some of criteria Such as (Kloke, 1980; WHO, 1995; US EPA, 1996; European Society, 1996 and Awasthi, 2000. ) were used to in the evaluation of soil contamination with heavy metals.This study reached to the following results : .The study concluded accrediting wooden sawyer + sand and water plant in recycling and reforming waste water and its capacity to remove pollutants, evaluation of quality of waste water and the treated water after passing through the filters under studay results indicated that all types of water inclusive the class (C4S1 ) which means high salinity water with afew of sodium element according to the classification of Laboratory US salinity. and water to cause toxicity problem in the study, and showed It results that candidates contributed to the removal of pathogenic bacteria from the treated water, and irrigation with waters passed through ceratophyllum dermersum L and sand filter leading treatment gave the highest dry to plant maize and two shoot and root weight, Result of statistical analysis showed that soils characteristics had a significant effect on of dry weight, concentration and quantity absorbed heavy elements in sections shoot and root to plant maize, was not for irrigation with treated wastewater impact on soil pollution with heavy metals and the results showed that the soils environmentally safe after relying on the Organization standards (WHO) and the American Environmental Protection Agency (US EPA).

فصــل وتنقية وتوصيف انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي == Isolated, Purification and Characterization of Lipoxygenase from Local Chickens Meat

اسم المؤلف: منى محمد زيدان
اسم المشرف: اياد نافع يحيى
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة اختيار افضل طريقة لاستخلاص انزيم الليبوكسيجينيز من لحم الدجاج المحلي, من بين ثمان طرائق, وكان كلوريد الصوديوم (10)% هو الافضل في استخلاص الانزيم بفعالية كلية بلغت (918810) وحدة, ركز المحتوى البروتيني باستخدام كبريتات الامونيوم (60)%من بين خمس طرائق للتركيز (التنقية الجزئية), واكملت مراحل التنقية باستخدام التبادل الايوني والترشيح الهلامي بعمود DEAE - Sephadex - A50 , ومن ثم استخدام الترشيح الهلامي بعمود السيفاكريل ( Sephacryl S - 300) اذ بلغت الفعالية النوعية (17.10) وحدة / مل والفعالية الكلية (393) وحدة والحصيلة الانزيمية مقدارها (42.9)% وعدد مرات التنقية (7.50) مرة. وثم التاكد من نقاوة الانزيم باجراء عملية الترحيل الكهربائي بغياب المواد الماسخة للبروتين اذ ظهرت حزمة بروتينية واحدة في هلام متعدد اكريل امايد, ثم تم توصيف الانزيم واشارت النتائج الى ما ياتي : 1. كان الوزن الجزيئي هو (85) كيلودالتون مقدرا بطريقة الترشيح الهلامي.2. بلغت نقطة التعادل الكهربائي pI للانزيم (6.2).3. اظهرت الدراسة ان الانزيم من البروتينات السكرية وان نسبة الجزء الكربوهيدراتي تشكل (9.42)% عند تقديرها بطريقة الفينول - حامض الكبريتيك.4. وجد ان الدالة الحمضية الامثل لفعالية الانزيم (7), واظهر الانزيم ثباتا في مدى من قيم دالة الحموضة تراوحت بين (5 - 9).5. اظهرت النتائج ان درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم كانت (40) م°, عند دالة الحموضة الامثل لفعالية الانزيم, وان درجة الثبات الحراري لهذا الانزيم بين (10 - 40) م°.6. احتفظ الانزيم بكامل فعاليته الانزيمية عند حضنه بدرجة حرارة (40) م° لمدة (40) دقيقة وفقد (6)% من فعاليته في الدقيقة (50) وفقد (10)% من فعاليته بعد (60) دقيقة.7. بلغت قيمة طاقة التنشيط لتحويل المادة الاساس الى ناتج (8.836) كيلو سعرة / مول, بينما بلغت قيمة طاقة التنشيط لمسخ الانزيم (18.239) كيلو سعرة / مول.8. اظهرت دراسة الثوابت الحركية ان معدلات قيم ثابت ميكالس منتن ( Km ) لتفاعل الانزيم تجاه حامض اللينولييك كانت ( 0.296) ملغم/مل , في حين بلغت قيمة السرعة القصوى ( Vmax ) للتفاعل الانزيمي (1.50) وحدة/مل.9. اظهرت الايونات الموجبة للكالسيوم والمنغنيز والمغنيسيوم والنيكل تاثيرا منشطا, بينما اظهرت ايونات النحاس والحديد والخارصين تاثيرا مثبطا.10. وجد ان جميع المثبطات المعدنية المستخدمة في الدراسة سببت تثبيطا بدرجة واضحة مما يعطي دليلا على اشتراك المعادن في تفاعل الانزيم, اي ان هذا الانزيم من الانزيمات المعدنية. 11. وجد ان المستخلص الانزيمي النقي , له القدرة على تبييض دقيق القمح الاسمر كذلك تحسن الصفات الحسية للخبز المصنوع من الدقيق الاسمر بعد اضافة انزيم الليبوكسيجينيز المستخلص من لحم الدجاج المحلي له. | The study included the selection of the best methods to extract the enzyme among eight methods. It appeared that have given the highest activity of the crude enzyme (total activity = 918810 unit). The protein content was concentrated and precipitated by ammonium sulfate (60) %, among other five methods of concentration (partial purification). The purification stages were achieved by using ion exchange column chromatography (DEAE - Sephadex A - 50 column). Followed by gel filtration chromatography using Sephacryl S - 300. This method extract pure enzyme at a yield of (42.9) %, (7.50) times of purification and specific activity of (17.1) unit / ml. The purity of enzyme was certified by poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing condition, the enzyme was characterized by the following : - 1 - Its molecular weight was (85) KD as estimated by gel filtration.2 - Its Iso electric point was at (6.2).3 - The result showed that it was a glycoprotein with a carbohydrate content of (9.42) % as determined by phenol - sulfuric acid method.4 - Its optimum activity pH was (7). The enzyme was stable at pH range between (5 - 9).5 - The optimum temperature for enzyme activity was (40) C°at the Optimum pH. The enzyme stability temperature range between (10 - 40) C°. 6 - The enzyme keep full effectiveness when his lap (40)C° for (40) minutes, and lost (6) % of its effectiveness after (50) minutes, and lost (10)% of its effectiveness after (60) minutes.7 - The activation energy to convert the substrate to product was (8.836) kilo calorie / mole. The inactivation energy for the denatured enzyme was (18.239) kilo calorie / mole.8 - The average Michael’s constant ( Km ) for the enzyme reactions towards linoleic acid were (0.296) mg/ml. and its Vmax was (1.50) unite / minutes. 9 - The positive ions such as Ca, Mn, Mg and Ni have shown activating effect of Lipoxygenase, while the Cu, Fe and Zn have on inhibitory effect on the enzyme.10 - Metal inhibitors in habited Lipoxygenase clearly meaning that it is metallic protein enzyme.11 - Purified enzyme was clearly bleached the tan color of flour, leading to improvement of properties quality of the produced loaf.

تاثير نبات Carica papaya على طفيلي Giardia lamblia في الفئران وبعض التغيرات البايوكيميائية والنسيجية == Effect of Carica papaya on Giardia lamblia in mice, some biochemical and histological changes

اسم المؤلف: مصطفى كاظم ملاخ عزيز
اسم المشرف: شذى خضير
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لتحديد تاثير تراكيز مختلفة لمستخلص بذور نبات Carica papaya على 100 من الفئران السويدية التي تتراوح اعمارهم (6 - 10) اسابيع ومعدل اوزانهم (8 - 23) غم المصابة بطفيلي الجيارديا ثم ومعرفة بعض التغيرات المناعية والفسيولوجية المرضية والنسيجية والكيميائية الحياتية الحاصلة في تلك الفئران بعد استخدام مستخلص البذور كعلاج لتلك القئران من الجيارديا ثم مقارنتها مع الفلاجيل.بينت نتائج الدراسة المعطيات التالية : هناك انخفاض في مستوى البروتين الكلي في مصل مجموعة الفئران المصابة بطفيلي الجيارديا والمجموعة التي تم معالجتها بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2٪ و5٪ (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) في حين ارتفع مستواه في مجموعة الفئران التي تم معالجتها من قبل فلاجيل (4.35 ± 0.06) مقارنة مع مجموعة السيطرة السالبة (4.10 ± 0.06).انخفض مستوى الكلكوز انخفاض طفيفا في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا (7.70 ± 0.04). في حين ارتفع مستوى الكلكوز في مصل الدم في المجموعة المعالجة بالفلاجيل وكذلك المجموعتين المصابة بالجيارديا والمعالجة بمستخلص بذور نبات ال Papaya 2% و5% (10.90 ± 0.04) (10.60 ± 0.05) (10.64 ± 0.07) على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (8.10 ± 0.06).مستوى انزيمات الكبد (GOT, GPT) ارتفعت في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة. انخفض مستوى الكوليسترول في مصل الدم لدى مجموعة الفئران المصابة بداء الجيارديا وفي مجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 5% (1.50 ± 0.04) (1.64 ± 0.05) على التوالي, بينما ارتفع لدى مجموعة الفئران المعالجة بالفلاجيل (2.65 ± 0.03) ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات Papaya بتركيز 2% (2.65 ± 0.08) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (2.50 ± 0.00).ارتفع مستوى الكرياتين في كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى البروتينات (A, C, D, E) انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري المغنيسيوم والصوديوم انخفض في مصل دم كل المجاميع مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.مستوى عنصري الكالسيوم والبوتاسيوم انخفض في مجموعة الفئران المصابة بلجيارديا بينما ارتفع مستواه في مجموعة الفئران المعالجة بلفلاجيل ومجموعة الفئران المعالجة بمستخلص بذور نبات البابايا بتركيز 2% و5% مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة.اظهرت النتائج تغيرات فسلجية مرضية متنوعة في امعاء وكبد وكلية الحيوانات المصابة بطفيلي الجيارديا شملت قصر في الزغابات المعوية, ارتشاح خلوي التهابي, تنسج مع وجود التنخر واحتقان دموي مع تجمع للدهونافضل النتائج كانت بلنسبة للفلاجيل ومن ثم يليها المستخلص المائي لبذور بنات Carica papaya بتركيز 2%. | This study was conducted to determine the effect of different concentrations of seeds extract of Carica papaya plant on 100 Swedish mice aged (6 - 10) weeks and the rate of their weight (8 - 23) g infected with parasite of Giardia and then knowing some pathological physiological, histological and Biochemical changes that occurred in those mice after using the seed extract as a treatment for those mice from Giardia and then compare it with Flagyl. There is a decrease in the total protein level in serum of the group infected mice with Giardia, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (2.20 ± 0.04, 1.70 ± 0.04, 2.86 ± 0.04) g/L respectivily while its level increased in the group which treated by Flagyl (4.35 ± 0.06 g/L) compared to the negative control group (4.10 ± 0.06 g/L). Level of glucose low slightly in serum in the group of infected mice with Giardia (7.70 ± 0.04 mmol/L), while its level high in the serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% (10.90 ± 0.04, 10.60 ± 0.05, 10.64 ± 0.07) mmol/L respectively compared to the negative control group (8.10 ± 0.06 mmol/L). The level of the enzyme (GOT) and (GPT) high in all groups compared with a negative control. The cholesterol level in serum of the group infected mice with Giardia and the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 5% (1.50 ± 0.04 and 1.64 ± 0.05) mg/dl respectively, while its level high in the serum of the group that dosage with flagyl and the group that dosage with seeds extract of Carica Papaya concentration of 2% (2.65 ± 0.03, 2.65 ± 0.08) mg/dl respectively compared to the negative control group (2.50 ± 0.00 mg/dl). The level of Creatinine in the serum high in all groups compared to the negative control group. The level of vitamin A, C, D and E became low in the serum of all groups compared with negative control group. The level of Mg+2 and Na+ low in a serum of all groups compared with the negative control group. The level of Ca+2 and K+ low in a serum of the group of infected mice with Giardia while its level rise in a serum of each group which treated by Flagyl, the group treated with seeds extract of Carica papaya in a concentration 2% and 5% compared to the negative control group. Results showed diverse histopathological changes in the intestines, liver and kidney of infected animals with Giardia included Palace in intestinal villi, inflammatory cellular infiltration, hyperplasia, necrosis, bloody vessels congestion and accumulation the fats. The best results were for Flagyl, and then for aqueous extract of Carica papaya in a concentration 2%.

التحطم الحيوي لسم فطر Fusarium graminearum داخل جسم الكائن الحي

اسم المؤلف: مشتاق طالب كريم
اسم المشرف: شذى علي شفيق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية بيان التاثيرات النسيجية والبايوكيميائية في نسيجي الكبد والكلى لذكور الفئران البيض تحت تاثير سم الزيرالينون المستخلص من عزلة فطرية منتجة لسم الزيرالينون Fusarium graminearum وبتركيز(2)ملغم/كغم بجرعة احادية وجرعات متكررة من السم وتجريعها فمويا , تقسيم الفئران الى ثلاث مجاميع (5 فئران لكل مجموعة) مع الاخذ بنظر الاعتبار وزن الجسم الحي واوزان الكبد والكلى,مجموعة عوملت بجرعة احادية من السم وتركت لمدة يومين (T1) ومجموعة اخرى عوملت بجرعتين اسبوعيا لمدة اسبوع (T2) ومجموعة عوملت بجرعـــتين كل اسبوع لمدة اســـبوعين (T3),وقد تم اخـــذ مجموعة السيطرة لكل معاملة وعـــوملت بالمحلول الذي اذيب فيه السم الفطري (1% ثنائي مثيل الكبريت) DMSO Dimethyl Suphxide.لقد لــــوحظ في نتائج هذه الدراسة تغيــــيرات نسيجية في الكـــبد عند المعاملتين T2وT3 تمـــثلت باحتقان في الاوعية الدموية مع تنخر وتنكس في الخلايا الكـــبدية وقلة حبيـــبات الكلايكوبروتين , بينما تضمنت التغيرات النسيجية في نسيج الكلى باحـــتقان دموي في الاوعية الدموية مع وجود تنكسات في الخلايا المبطنة الدانية والقاصـــية في المعاملــتين T2وT3 ولم تــظهر المــعاملة T1 اي تغيرات نسيجية في الكبد والكلى مقارنة مع معاملة السيطرة .اما نتائج الاختبارت البايوكيــــميائية لانزيـــمات الكبد والــــكلى فقد اظــهرت نتائج التحليل الاحصائي عـــــدم وجـــــود فروقات معـــــنوية فــــي قـــيــم انزيــــمي AST Aspartate Aminotransferase) ) وALT(Alanine Aminotransferase) عند المعاملتين T1وT2 , بينما اظهرت المعاملة T3 انخفاضا معنويا فــــي قيم كلا الانزيــمين وقد انـــخفضت الى (12.33,14.00) وحــدة دولية لكل لتر مقارنة مع معاملة السيطرة (22.00,20.00) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب , اما انــزيم (Alkaline Phosphatase) ALP اظــهرت المعاملتين T2وT3 ارتفاعا معنويا بلغت (23.00,18.66) وحدة دولية لكل لتر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة(13.33)وحدة دولية لكل لتر, ولم تظهر المعاملة T1 اي اختلاف معنوي في قيم الانزيم ALP . اما تركيز اليوريا في مجانس نسيج الكلى فــــقد اظهر انخفاضا معنويا في المعاملتين T2وT3 اذ بلغت قيمته (23.66,24.83) ملغم / لتــــر على الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة (27.16) ملغم/لتر,اما المعامـــــلة T1 لم تظهر اي فروقات معنوية في قيم تركيز اليوريا، كما لم تظهر فروقات معنوية ولكافة المعاملات في تركيز الكرياتنين.تضمن الجزء الثاني من هذه الدراسة التحطيم الاحيائي لسم الزيرالينون بواسطة المعزز الحيوي العراقي بتركيز (2%) وزن/حجم وراشح خميرة Saccaromyces boulardii واللذان كان لهما الاثر الفــــعال والمعـــنوي , اذ لوحــــظ تحسن واضح في خلايا نسيج الكبد والكلى لمجموعة الفئران التي تم تغذيتـــها عــــــلى العـــليقة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح الخميرة مقارنة مع ما احــدثته السيطرة الموجبة والمتمثلة بمجموعة الفئران التي تغذت على العليقة الملوثة بفـــطر F.graminearum المنتج لسم الزيرالينون من تغيرات نسيجية في نسيجي الكبد والكلى.كما اظهرت نتائج التحليل الاحصائي لانزيمات الكبد في معاملة السيطرة الموجبة فروقات معنوية واضحة عند مستوى احتمالية (P˂0.01) بلغت قيــــم ا لانزيمات ASTو ALTوALP (25.66,14.66,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب مقارنة مع معاملة السيطرة السالبة (مجموعة الفئران التي تغذت على عليـــــقة غير ملوثة المـــلوثة بالفــــطر Fusarium graminearum المنتج لـــسم الزيرالينون ) اذ بلغت قيــــم الانزيمات الثلاثة (13.33,22.00,15.66) وحـــدة دولية لكل لــــترعلى الترتيب,و بينت نتائج تداخل تغذية ذكور الفئران لعـــليقة ملوثة بفطر F.graminearum المنتجة لسم الزيرالينون مع المعزز الحيوي وراشح خميرة S.boulardii زيادة معنوية في قيم الفـــعالية النوعية لانـــزيمات الكبد الثلاثة في مجانس نسيج الكبد وقـــــيمة تركـــيز اليــوريا في مجانس نسيج الكلى مقارنة مع معاملة السيطرة الموجبة. | The present study was conducted to evaluate the histological and biochemical toxic effects of Zearalenone on liver and kidney tissues of males white mice that extracted from fungal isolate Fusarium graminearum produced Zearalenone at concentration (2 mg / kg body weight) given single and repeated doses of toxin via oral administration. Mice were divided into three groups (five mice for each group), taking into consideration body weight, liver and kidney weights. T1 : receiving the toxin once and sacrificed after two days. T2 : given the toxin twice for one week. T3 : given the toxin twice a week for two weeks. Each treated group has its corresponding control which received 1% Dimethyl Sulphoxide (DMSO). The results showed the histological changes in liver tissue in T2 and T3 groups which represented by congestion vascular with necrosis and degeneration in hepatic cells in addition to reduction in glycoprotein granules. While, the histological changes in kidney tissue included congestion vascular and degeneration in distal and proximal tubules. No obvious histological changes were noticed in liver and kidney tissues in T1 group.The results of biochemical tests for kidney and liver enzymes AST (Aspartate Aminotransferase) , ALT (Alanine Aminotransferase) were shown no significant differences in means of the specific activity of these enzymes , AST and ALT in T1 and T2 groups .In contrast T3 group showed significant decreasing in values for both enzymes AST and ALT (14.00 , 12.33) IU/ L respectively . ALP (Alkaline Phosphatase) enzyme was increased significantly in T2 and T3 groups (23.00, 18.00) IU/L respectively compared with T1 and control groups . The results of Creatinine concentration in kidney tissue revealed no significant differences in all groups. In regard to Urea concentration in kidney tissue was decreased significantly in T2 and T3 groups (24.83,23.66) mg / L respectively compared with the rest of groups. The other part of the present study was to investigate the biological degradation of Zearalenone using by Iraqi probiotic 2% (w/v) and yeast filtrate of Saccharomyces boulardii which had an active influence . As observed a clear improvement in liver and kidney tissues for group of mice that fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate compared with positive control ( group of mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ) that caused the histological changes in liver and kidney tissues .The results of liver enzymes showed significant differences in positive group for three enzymes ALS , ALT and ALP reached ( 15.66, 14.66, 25.66 ) IU/ L respectively , compared with negative control (group of mice did not fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone ). However , the results of the interaction between mice fed contaminated diet by F. graminearum produced Zearalenone with Iraqi probiotic and yeast filtrate were shown significant increasing for ALS , ALT , ALP enzymes in addition to urea concentrations in kidney tissue compared with positive control

توصيف جرثومة Enterobacter sakazakii المعزولة من مصادر مختلفة في محافظة ذي قار == Characterization of Enterobacter sakazakii Isolated from various sources at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: مروى حسن نصير الصافي
اسم المشرف: يحيى عبد الرضا عباس | راجي طعمة ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى الكشف عن بكتريا Enterobacter sakazakii في بيئات مختلفة شملت عينات غذائية وبيئية وسريرية . اذ جمعت 310 عينة خلال الفترة من ايلول 2012 ولغاية تموز 2013.اظهرت نتائج الزرع الاولي على وسطVRBAواكار الماكونكي بعد التشخيص بالاعتماد على الصفات الزرعية والكيموحيوية وتوكيد التشخيص باستعمال العدة API 20E. ان 22 (7.09%) من اصل 310 عينة اعطت نموا لبكتريا Enterobacter كالاتي 9/80(11.2%) من بيئة المستشفيات ,12/180(6.6%) حليب اطفال,1/50(2%)من حالات الاسهال . توزعت العزلات بعد التشخيص المختبري على الانواع التالية (15/22) 68.1% Enterobacter cloacae,(4/22)18.1% Enterobacter sakazakii و3/22))13.6% للنوع Enterobacter aminogenus. اختبرت مقاومة عزلات Enterobacter sakazakii الاربع ضد 20 مضادا من اصناف مختلفة وقد اظهرت النتائج ا ن جميع العزلات كانت مقاومة على الاقل لست من المضادات قيد الاختبار.اختبرت قدرة بكتريا Enterobacter sakazakii على انتاج انزيمات البيتا لاكتيميز واسعة الطيف واظهرت العزلات عدم قدرتها على الانتاج واستخدمت طريقة القرص المصاحب لمعرفة قابلية العزلات على انتاج انزيمات الميتالو بيتا لاكتاميز.درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج ان 2/4(50%) من العزلات لها قدرة على انتاج الغشاء الحيوي.كما د رست قدرة البكتريا على مقاومة التاثير القاتل للمصل وظهرت العزلات كلها موجبة بينما درست قدرة البكتريا على تلازن كريات الدم الحمراء لوحظت تحت المجهر واظهرت النتائج ان 3/4(75%)من العزلات كانت موجبة.اختبرت قدرة البكتريا على انتاج السموم المعوية باستخدام الفئران الرضيعة وظهرت كل العزلات منتجة له وقد ظهرت على الفئران الرضيعة بالسموم المعوية اعراض سريريه حادة مثل انخفاض النشاط والحركة البطيئة وعلامات ضعف مع تغيرات في المعدة وخسارة التركيب النسيجي للغشاء المخاطي والغدد وظهور بؤر للخلايا المتحللة وزيادة في سمك الجدار مع تقرحات في النسيج اما التغيرات المرضية في الامعاء فهي تغيرات غير مخصصة تمثلت بتقطعات في النسيج الطلائي وتقرحه وفقدان لشكل النسيج والغدد. | This study was aimed for detection occurrence of Enterobacter sakazakii in stool specimens, infant formula and hospitals environments. A total of 310 samples (180 infant formula, 50 stool samples and 80 hospital environment swabs ), during the period from September 2012 to July 2013 were collected. Growth on Violet redbile agar and MacConkey agar was identified by cultural and biochemical tests and confermated by API 20 E system which revealed that : Only 22/310(7.09%)gave positive growth for Enterobacter spp. as following : 9/80 (11.2%) environmental swabs , 12/180(6.6%) infant formula and 1/50 (2%) stool samples. Diagnosis of the isolates appeared that E. cloacae was (15 ⁄ 22) while E . sakazakii (4 ⁄ 22) and E. aminogenus (3/22). Four E. sakazakii isolates were screened for their antibiotic resistance against 20 antibiotics of different classes using Kirby - Bauer disk diffusion method. The results showed that all the tested isolates were resistant to at least 6 antibiotics of which they were tested . In the present study four E. sakazakii isolates where screened for potential ESBLs production, they showed 3 (75%) isolates were potential ESBLs production ,but conformation of ESBLs production was detected by double disk synergism test and appeared that all the isolates were unproductive . Combined disk diffusion method was used for detection of metallo - β - lactamase - producing isolates, they were emplace each of imipenem and ceftazidame antibiotics with and without EDTA on Mueller - Hinton agar, because EDTA working to inhibit of metallo - β - lactamase. The results showed that the presence of EDTA does not affect the diameter of inhibition zone for the four isolates. Biofilm production was detected by spectrophotometric method .The four isolates were tested and appeared that 2(50%) were produced biofilm. The resistance of bacterial isolates to serum bactericidal activity was tested by the turbidmetric assay . All isolates were appeared able to resist to serum bactericidal activity, while Agglutination of erythrocytes was tested under the microscope and showed 3/4(75%) were positive. In the present study E. sakazakii were evaluated enterotoxin production. All the isolates showed positive for enterotoxin production. Results of treating suckling mice with enterotoxin showed acute clinical signs appeared depression, slow movement and signs of weakness. Significant macroscopic finding showed in mice treated with enterotoxin the stomach was distended and enlarged with thick corrugated mucosa but no significant changes in intestine. Pathological changes in the stomach appeared as loss of normal architecture of mucosa and glands, multiple foci of degenerative cells, reactive epithelial surface with thickening wall, pseudo - metaplasic changes and superficial epithelial injury. The intestinal changes showed nonspecific pattern of damage to surface of epithelium .Complete loss of architecture of glands and mucosal epithelial , superficial epithelial discontinuity , ulcer and non - specific reactive epithelial surface.

الممرضات الداخلية المسببة لحالات الاسهال لدى الاعمار من 1 - 15 سنة في مدينة بغداد

اسم المؤلف: مروة محمد نصري التميمي
اسم المشرف: سلوى صبر محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The diarrhea is Enteropathy characterized liquidity abnormal,because of the increases by the movement of colon in the general way, may be represent a good sign to the Enteropathy like the Entamoeba histolytica disease, viruses Enteropathogen and bacteria,The diarrhea and associated of droughts state remains the major problem to the job of medial health in the medial east especially in the age under 5 years old.This study design to study the reason of the diarrhea and diagnosis and the effect result of it in the children under 15 years old, theirs patient from (learn hospital of alemamenalkadoman) in the city of Baghdad from 25/4/2014 to 1/10/2014 period of time, the study represent 103 sample of Stool and blood from children between (>1 - 15)years wasSufferers from diarrhea state, this state diagnose with infection of parasite (E.histolytica, G.lamblia, and others), Rotaviruses and bacteria E.coli.It use the general stool examination direct (by eyes) and in direct (by microscope) to diagnose the antigen of rotaviruses in stool, Either the blood sample store in two tube one of it contain EDTA use to CBC, Pcv, Hb, w.b.c, ABO group measure, and the second one is empty from the EDTA use to ayanlsys serum to measure (CRP) and Interleukin in the patient diarrhea.From summation of 103 found that 50 (48.54%) infected by intestinal protozoa, 41 (39.80%) infected by Rotaviruses, 9 (8.73%) infected by mixed (Parasite + Rotavirus), 3 (2.91%) infected by bacteria E.coli.50 sample infected by intestinal protozoa (42 sample is infected with one Species of parasite and 8 sample of stool continue two type of the parasite), the highest ration of infection was E.histolytica 50%, G.lamblia 38.10%, Blastocystis hominis 7.14%, and the lowestBalantidium coli 4.76%, the study recode the highest ration of mixed infected (Parasite + Rotavirus) was between G.lamblia + Rotavirus 33.33%.In This study present we found highest deference between male and female in the infection of parasite and rotavirus, male record (62 - 60)% and female (38 - 40)% on series, mixed infected (parasite + Rotavirus) Reached to the female 55.56% and this is the highest ration infection from the male 44.44%, notice that there is high Significant difference in the ratio of infection between the Age groups of the groups studied at the probability of p<0.01, where recording rotavirus infection IIhigher ratio infection in the Age groups (1 - 5) year 66,67% and less ratio 11,11% where age groups less than year, but the parasite infection only was more age group infected liable (more than 5) year with ratio 56% and smallest ratio for age group (less than year) 18%. And in the result media use (L.E) to culture E.histolytica and discover from the study , this media don’t provide good environment to maintain the parasite and resolve it for a limited period without multiplication or increase in number is it, in the case of trophzoite stage culture it stay with out - increases in the number is for one day only and after bass 24 hour transfer to the cyst stage and remain bass 3 day only and despair in the fourth day, while in culture of cyst stage Found that Noway to transform to the trophzoite stage like it happen in the human body but stay in the case of cyst stage on states. With condition E.histolytica that the Stool samples continue blood and mucous only to contain a lot off mass from the trophzoite stage and this stage only can be increases causes increase in number.Noted that this culture never dedicated only to the cultivation E.histolytica but noted the trophzoite stage exist for parasite B.coli in this stage and when culture sample from Stool contain B.coli and remain this stage Governor of the trophozoite stage for a period of two days.Either for the blood type test has been shown by the study, the highest percentage recorded rotaviruses injury in people living with antigen type A 39.59%, 39% and 44.44% for parasitic and rotavirus infections and joint respectively.And gave a hemoglobin level of Hb and size precipitation of red blood cells PCV lowest level at co - infection (parasit + rotavirus), followed by rotaviral and parasitic infection compared with control group P <0.05. Showed parasitic infection and joint significant difference in the total number of white blood cells when the probability of P <0.05, either rotaviral infection did not give a significant difference with the control group.The results of the present study about differential count of white blood cells, showed no significant difference comparing with study groups, but showed significant difference within the three groups with control group that remain the value of the Moral difference p<0.05 When all of the (Neutrophil ،Basophile ،Eosenophil)However, it did not register significant difference when cells Lymphocyte.When statistical analysis when studying some immunological changes associated with injuries intestinal regarding the number of days that lasted the case of diarrhea, and by which they can determine if the injury was severe diarrhea or chronic, and that gave significant difference (1 - 2) day P <0.01 when (3 - 4) day and (more than 4) on the value of the differences P <0.05.log CRP level of rotavirus infections 31.70%, 0.52% for infections with parasite, 88.89% of the common injuries (parasitic + viral) gave at P <0.01 probability asignificant differences.The results of the study of some of the dynamics of cellular aggregates of the study and its relationship to the immune response. Observed statistically significant at the use of IL - 10 three of its study groups recorded a significant P <0.05 was higher at 1.22% viral infection compared to the control group. Parasitic infection and did not record any significant difference.And log IL - 17A highest percentage increase at the joint injury, and there is no significant difference between the incidence of parasitic and viral infection.For IL - 33 infection joint highest recorded percentage of injury followed by a parasitic infection and finally viral. and IL - 4 infection shared the highest rate, followed by injury viral recorded and finally parasitic and gave moral difference P <0.05 and finally INF - gama, which did not record any significant differences when comparing the groups study together but gave at P <0.01probability moral differences with group of control when compared recorded the highest common injury is also high.

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من نماذج الانسان باستخدام تقنية تفاعل البوليمرز المتسلسل (PCR) والنشاط المضاد لمستخلصات قشور البصل == Isolation and Identification dermatophytes from human Samples By using polymerase chain reaction (PCR) Technique and Antidermatophytic activity of onion peel extracts

اسم المؤلف: محمد عبد الكريم الخفاجي
اسم المشرف: عبد العزيز مجيد نخيلان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الفطريات الجلدية هي واحدة من مجموعة من الفطريات ذات الصلة وثيقة والتي لديها القدرة على غزو الانسجة المتقرنة (الجلد والشعر) في الانسان والحيوانات لاحداث الاصابة الجلدي دعى Dermatophytosis والمعروفة لنا على انها التهابات حلقة الدودة. لعزل وتحديد الفطريات الجلدية من العينات السريرية ودراسة النشاط المضاد للفطريات antidermatophytic للمستخلصات قشور البصل (Allim cepa) . جمعت 60 عينة من مستشفى ابو قاطع ابي غريب، 22 عينات من مستشفى اليرموك و18 عينة من تلاميذ المدارس الابتدائية في ابو غريب على التوالي. وقد اجريت الدراسة خلال الفترة الممتدة من اكتوبر 2014 الى اذار 2015. باستخدام الفحص المجهري والزرع تشخيصت وجود فطريات جلدية لدى (90) مريض من اصل (100) مريضاﱟ فقط اي بنسبة (90%) ، وقد تبين ان 59 (59%)من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري والزرع . في حين عدد الحالات السالبة في الفحص الزرعي فكان 31 اي بنسبة (31%) حيث كانت انواع مختلفة ل Candida spp، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 10 (10%) حيث كانت اجناس فطرية اخرى مثال على ذلك Penicillium sp, Aspergillus niger . اظهرت الفحوصات المختبرية تباين الانواع الفطرية الجلدية المعزولة اذ ان اكثر الانواع الفطرية الجلدية المعزولة كان الفطر Trichophyton.mentoagrophytes ظهر في 27 عينة (45.7%) ,يليه الفطر Microsporum.canis ظهرفي 18 عينة (30.6%) , والفطر Trichophyton.rubrum كان في 9 عينات (15.25%) وبينما كان الفطر Trichophyton.verrucosum اقل الانواع الفطرية المعزولة وظهر في 5 عينات فقط وبنسبة (8.4%) . واظهرت النتائج تباين في نسبة الاصابة بين الذكور والاناث ، حيث سجلت اعداد ونسب المصابين بالامراض الفطرية تبعا للجنس. اذ سجل عدد الذكور 39 اصابة اي (66.1%) اما عدد الاناث فقد بلغ 20 اصابة اي (33.9%).تبين من خلال هذه نتائج هذه الدراسة ان الاصابات بالامراض الفطرية كانت اكثر تكرارا خلال الاشهر المعتدلة درجة الحرارة حيث لوحظ زيادة نسبة الاصابة في فصل الربيع والذي سجلت فيه اعلى نسبة للاصابة خلال شهر اذار (35%) ،شهر شباط (25%) ، شهر كانون الثاني (18%) ، شهر كانون الاول (12%) ، شهر تشرين الثاني (10%) على التوالي .هرت النتائج وجود علاقة ما بين الاصابة ومناطق سكن المرضى حيث بلغت نسبتها في المناطق الريفية (84%) مقارنة مع المناطق الحضرية التي بلغت (16%) ، كما اظهرت ان الفطريات الجلدية التي تنتقل عن طريق ملامسة الحيوانات اكثر تكرارا (84.4 %) من كانت الملامسة البشرو التي كانت اقل تكرارا (15.6 %).شخصت الفطريات الجلدية المعزولة بطريقة تفاعل سلسلة انزيم البلمرة PCR ،واظهرت النتائج تماثل في الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة وحيث قورن مواقع هذه الحزم مع موقع الحزم ذات الاوزان الجزيئية المعروفة العائدة للدليل الحجمي, حيث جاءت النتائج متماثلة للحجم المتوقع وهو 500bp (زوج قاعدة) كناتج لعملية تضاعف البادىء primerالمتخصص بالفطريات الجلدية لكل M. canis , mentogrophyt T. , T. vrrucosum . وقد تمت دراسة التاثير التثبيطي لكل من المستخلص المائي والكحولي (الحار والبارد ) لقشور ثمرة البصل ، كل على حدة في النمو القطري لمستعمرات الفطريات الجلدية والاكثر تكرارا حيث شملت الفطرين M. canis ,. mentogrophyt T . واظهرت نتائج استخدام المستخلصات النباتية لقشور ثمرة البصل ان ادنى التركيز المثبط للنمو من المستخلص المائي الحار هو (0.78)ملغم/مل للفطر T.mentogrphytes اما الادنى التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل، اما الفطر M .canis فان الادنى التركيز المثبط للنمو هو (0.78)ملغم/مل اما التركيز القاتل فهو (25) ملغم / مل . وللمستخلص المائي البارد فان ادنى التركيز المثبط للنمو هو (1.56)ملغم /مل للفطرT.mentogrphytes واما ادنى التركيز القاتل فقد كان (25) ملغم/مل. واما فطر M .canis فادنى التركيز المثبط للنمو هو (3.125) ملغم /مل والتركيز القاتل فقد كان (12.5) ملغم/مل. كما تبين ان لادنى التركيز المثبط من المستخلص الكحولي الحار والكحولي البارد لقشور البصل هو (0.78) ملغم/مل على النوعين الفطريات ، اما ادنى التركيز القاتل للمستخلص الكحولي الحار والبارد فهو(50) ملغم/مل بالنسبة للفطر M. canis ,. mentogrophyt T . | Dermatophytes are one a group of closely related fungi that have the capacity to invade the keratinized tiusse (skin and hair) of human and other animals to produce cutaneus infection called Dermatophytosis commouly referred to as ring worm infections . To isolate and identify the dermatophytes from clinical samples and to study the antidermatophytic activity of onion (Allim cepa ) extracts . 60 sample from Abu Graib Hospital , 22 samples from Yarmook Hospital and 18 sample from elementany school pupils Abu Graib regian were Collected respectively . The study was conducted during the period extended from oct , 2014 to Mary ,2015 . by microscopial examination and cultivation have been diagnosed with the presence of Dermatophyte at (90) patients only at a rate (90%), has been shown that 59 (59%) of the cases were positive Result by microscopic examination and cultivation. As the number of negative cases in the examination cultivation was 31 ( 31%), where the different genus for Candida sp, either the number of negative microscopic examination and cultivation is 10 cases (10%), where anther genus of fungi for example Penicillium, Aspergillus niger. When you identify the types of fungi, laboratory tests showed fungal species isolated skin variation، The most common fungi isolated were T.mentoagrophyt where the sample was 27 (45.7%), followed by M.canis where the 18 samples (30.6%) , was T.rubrum 9 samples (15.25%), and while The T.verrucosum was less fungal species isolated where , the number of isolated samples only 5 (8.4%).There were significant differences in Infection rate between males and females, were recorded prepare ratios infected with fungal diseases Accordingly sex, and as it was recorded that the number of males 39 (66.1%) The number of females has reached to 20 (33.9%) .It has been shown through this study that fungal diseases Infection were more frequent during of moderate temperature months of year ,observed increase in Infection of the during spring, which recorded the highest rate of infection during the month of March (35%), followed by injuries recorded in the month of February (25% ) then the month of January (18%) and the month of December (12%) and then the November (10%) respectively.about the relationship between infected with Housing areas, showing High incidence was recorded in rural regions (84%) in comparison with urban regions(16%). the study demonstrated a significant shift in the skin fungus that causes the disease towards animal species (84.4% ), while the human species less frequent (15.6%). Diagnosed skin fungi by (PCR) manner enzyme polymerase chain reaction, The results showed similar in molecular weight of packages multiplying and these sites packages as compared to with site with molecular weights known as belonging to the manual volumetric packages ,where the results were similar to the size of the expected site, a 500bp (pair base) as a product of the process started it doubled primer M. canis, T. mentogrophyt, T. vrrucosum.Has been studied the inhibitory effect of each of the aqueous and alcoholic extract (hot and cold) to peel the onion, Separately in growth of the colonies skin fungi isolated from injuries skin diseases, and the most frequent during this study, which included fungi Micrsporum canis , mentoagrophyt Trichophyton.And it showed the results of the use of plant extracts to peel onions that minimum inhibitory concentration(MIC) of the growth of the aqueous extract is (0.78) mg / ml for T.mentogrphytes The minimum Focus concentration (MFC) is 25 mg / ml, either MIC for M .canis is (0.78) mg / ml The MFC 25 mg / ml . To the water cold extract, MIC is (1.56) mg / ml of T.mentogrphytes MFC is 25 mg / ml. The M .canis MIC is (3.125) mg / ml MFC is (12.5) mg / ml.And the MIC of the hot alcoholic and cold alcoholic extract of onion peel is (0.78) mg / ml and the MFC is 50 mg / ml for both M. canis, T. mentogrophyt .

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية Dermatophytes ومقاومتها ببعض المستخلصات النباتية == Isolation and Identification of some Dermatophytes and its control by the plants extracts

اسم المؤلف: محسن محمد فرج
اسم المشرف: عبد العزيز مجيد نخيلان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لغرض عزل وتشخيص الفطريات الجلدية المسببة لمرض داء السعفة التي تصيب الانسان ودراسة حساسيتها بواسطة المستخلصات النباتية للاغصان الفتية لنبات التين والحليب النباتيlatex,اذ تم جمع 100 نموذجا (قشطات جلدية ،شعر، اظافر) ماخوذة من مناطق مختلفة من الجسم ذكور واناث بفئات عمرية مختلفة من المرضى المراجعين لاستشارية الامراض الجلدية التابعة لمستشفى الامام علي() الذين شخصوا من قبل الطبيب المختص كحالات اصابة سريرية بالفطريات الجلدية للمدة ما بين تشرين الاول 2013 ولغاية حزيران 2014.تم فحص النماذج مختبريا بالفحص المجهري المباشر باستعمال هيدروكسيد البوتاسيوم KOH (%10) ثم زرعت النماذج على وسط اكار السابرويد دكستروز ، اذ اظهر الفحص المجهري المباشر والزرع 52 مريض بنسبة (52%) من المجموع الكلي للاصابات من الحالات كانت موجبة بالفحص المجهري المباشر والزرع ، في حين كان عدد الحالات الموجبة بالفحص المجهري المباشر وسالبة بالزرع هو 41 مريض بنسبة (41%) ، وكان عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر وموجبة بالزرع هو 0 اصابه بنسبة (0%) ، اما عدد الحالات السالبة بالفحص المجهري المباشر والزرع فهو 7 اصابات وبنسبة (7%).اظهرت نتائج العزل والتشخيص ستة انواع من الفطريات الجلدية اذ سجل اعلى نسبة الفطر Trichophyton rubrum 33.33% ثم يليه في نفس المرتبة كل من Trichophyton schoenleinii وMicrosporum canis بنسبة20%)) لكل منهما ويليه Trichophyton tunsouransبنسبة 13.33%وكذالك احتلت كل من Trichophyton mentagrophytesو Trichophyton vercosum 6.66% . وبلغت اصابات الذكور46.67% اما اصابات الاناث فكانت 53.33% . واكثر فئة عمرية متاثرة بالاصابات الفطرية الجلدية هي سن العشر سنين اذ بلغت نسبة الاصابة 20% . وحول موسم انتشار هذه الاصابات الجلدية اذ تبين ان الاصابة اكثر تكرارا خلال الاشهر الباردة من السنة وتزداد هذه النسبة باتجاه فصل الربيع ، اذ سجلت اعلى نسبة اصابة خلال شهر نيسان وبنسبة (27 %) ، وادنى نسبة اصابة خلال شهر تشرين الاول وبنسبة (2%) . وفيما يخص مصادر الاصابة بالفطريات الجلدية وجد ان تربية الحيوانات المنزلية والحقلية هي الغالبة وبنسبة (% 33) ، يليه استعمال ادوات الاخرين بنسبة (% 23) وباقي الاصابات لم يوجد لديهم تماس مع الحيوانات ولا لبس الملابس المستعملة .ان المستخلص المائي البارد والكحولي البارد اعطى اعلى فعالية تثبيطية مقارنة بالمستخلص الكحولي الحار والمائي الحار .كما اظهرت الفطريات الجلدية فيما بينها فروق معنوية اذ اظهر الفطر M.canis حساسية اعلى للمستخلصات المختلفة يليه الفطر T.mentagrophytes. ثم الفطر T.rubrum. وقد اظهر المستخلص المائي البارد فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وان معـــدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز75mg/ml)) اما عند تركيز50mg/ml كانت نسبة التثبيط(,18 64.16 12.5,)% على التوالي لكل من الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها 12) , 3.3 4.1 ,) % على التوالي عند التركيز5mg/ml وعند التركيز 0.5mg/ml)) نسبة تثبيط, 0.8) 27.9 , % ( 3.3 .اما المستخلص الكحولي البارد فقد اظهر فاعلية تثبيطية للفطريات T.rubrum M.canis T.mentogrophytes وبمعدلات اقطار المستعمرات الفطرية صفر وبنسبة تثبيط مقدارها (100% ) عند التركيز 75mg/ml)) وبنسبة تثبيط مقدارها(56.7,78.9,58)% على التوالي عند التركيز 30mg/ml,اما عند التركيز( 3mg/ml) فقد فكانت نسبة التثبيط (65.6,68.4,50) % على التوالي , ووصلت النسبة المئوية للتثبيط ,46.6) 52.6 , 57.4 ) % للتركيز 0.3mg/ml . اما المستخلص المائي الحار فكان اقل كفاءة ضد الفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum وبنسبة تثبيط مقدارها( 22 , 2.6 , 30.3)% على التوالي عند التركيز (75mg/ml) ,اما عند التركيز 7.5mg/ml)) فقد بلغت نسبة التثبيط مقدارها3.22,0,3.1) )% على التوالي في حين بلغت بنسبة تثبيط مقدارها (12.2 , 0 , 19.3 ) % لجميع الفطريات عند التركيز. (0.75mg/ml )اما المستخلص الكحولي الحار فقد اظهر فاعلية تثبيطية تفاوتت حسب التركيز ونوع العزلة المختبرة للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum عند التركيزmg/ml) 40) بلغت نسبة التثبيط (62.5,53,28) % على التوالي , وعند التركيز ml) (4mg/بلغت نسبة المئوية للتثبيط(24.6 , 51 , 44 )% وعند تركيز 0.4mg/ml) ) بلغت نسبة التثبيط (22.6 , 32.6 (43.4 ,%. وكذلك تم استعمال حليب التين كمستخلص للفطريات قيد الدراسة T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrum بتركيز1.5mg/ml)) واثر هذا التركيز على نمو المستعمرات الفطرية وبنسبة تثبيط بلغت (28 , 29.16 , 12.5)% .اذ درس التاثير التثبيطي لهذه المستخلصات مع عقاري الفلوكونازول وايتريكونازول في النمو القطري الشعاعي لمستعمرات الفطريات الجلدية للفطريات T.mentgrophytes,M.canis,T.rubrumوعلى التوالي وبتركيز (7.5mg/ml)للمضاد الفطري fluconazol وكانت بنسبة التثبيط (59.6 , 33.3 , 80.5)% بينما بلغت نسبة التثبيط لنفس المضاد بتركيز 15mg/ml)) (70 , 100 % (88.7, واستخدم ايضا المضاد Itraconazol بتركيز 5mg/ml)) للفطريات قيد الدراسة فبلغت بنسبة التثبيط للمستعمرات الفطرية (28.3 , 22.2 , 53)%. واستنادا الى هذه النتائج فقد اختير المستخلصين المائي والكحولي الباردين لاختبار فعاليتهما داخل الجسم الحي (In vivo) وقد اظهر المرهمين المحضرين فعالية جيدة في علاج الاصابة الجلدية التجريبية بالفطر T.mentgrophytesفي الارانب. | This study was carried out to Isolate and Identify the Dermatophytes which infect human and control plants (Ficus carica) by using the extracts of the young branches of Fig . One hundred specimens (scale ,nail and hairs) have been taken from everybody were collected from outpatient visiting the Dermatology in Al - amamm ali alyehi Alsalam , which diagnosed as dermatophycosis infection during the period extended from November 2013 through September 2014 . On direct microscopically examination the specimens were examined carefully by (10 %) KOH mount and lactophenol cotton blue smears showed the presence of fungal elements in , fifty two fungal isolates.(52%) were positive by direct microscopically examination and culture ,(41%) were positive by direct microscopically examination and negative in culture and (7%) were negative by culture and microscopical examination . The most common fungi isolated were Trichophyton rubrum(33.33 %) followed by Trichophyton schoenleini (20%)M.canis (20%) Trichophyton tunsourans 13.33% Trichophyton mentagrophytesو T.vercosum 6.66% There was recorded among male (46.67%) than female (54.43%) ,the higher percentage for fungal infection was recorded in the age ten years with percentage (20%). Concerning the season of fungal distribution the infection was more frequent during cold months of the year and the percentage of infection increases toward spring season , since the higher rate was recorded in April (27 % ) while the lowest rate was in February (2%). concerning the infection sources it was found that domestic animals are the most popular (33%) and using others instruments (23%).Young branch extract of the Fig plants ( Ficus carica ) were prepared using cold , hot water and ethanol. The inhibitory effect of aqueous extract and Fluconazol,Itraconazol were depended on extract kind , extract concentration and fungal tested species. The Fig cold water and ethanol extracts Showed the highest inhibition activity and this activity was positively related to concentration. In other hand Microsporum canis was the highest sensitive compared to the other tested fungi.Cold aqueous extract showed of different inhibitory effect according to concentration and fungal test Tricophyton.rubrum,M.canis,Tricophyton.mentgrophytes with average diameters zero and 100% inhibition at concentration (75mg/ml).while concentration(50mg/ml)the inhibitory effect (33.2,64.16,12.5)% respectively for each fungi T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes with inhibition percentage(12,3.3,4.1)% respectively at concentration (5mg/ml),while inhibitory effect at(0.5mg/ml) concentration was (0.8,27.9,3.3)% Cold alcohol extract showed inhibitory effect of fungi T.rubrum,T.mentgrophytes,M.canis,and the average diameters of fungal colonies (zero)and(100)% inhibitory at (75mg/ml) concentration ,respectively at (30mg/ml) concentration ,as well as (3mg/ml) concentration appear inhibitory effect (50,68.4,65.6)% respectively ,and the percentage of inhibitory reach (45.6,52.6,57.4)% at(0.3mg/ml) concentration .Hot aqueous extract showed lowest efficiency against T.rubrum,M.canis. T.mentgrophytes, with in hibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (75mg/ml)concentration the inhibitory effect (3.1,0.1.2)% respectively ,as well as the inhibitory effect (12.2,0,19.3)% of all fungi at (0.75mg/ml)concentration.Hot alcohol extract showed lowest efficiency against (T.rubrum,M.canis.T.mentgrophytes),with inhibitory effect(3.1,2.6,30.3)%respectively at (40mg/ml)concentration the inhibitory effect (62.5 ,53.6, 28)% respectively ,as well as the inhibitory effect (44, 51, 24.6)% of all fungi at (4mg/ml)concentration and the inhibitory effect (43.4,32.6,22.6)of all fungi at (0.4 mg/ml) According to these results the cold aqueous extracts of Fig plants have been diagnosed to examine their effectiveness (In vivo), Ointments were very effective in treating dermatophytes infection Trichophyton mentagrophytes infection in rabbets

دراسة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل sativus Raphanus ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في الارانب == A Study the Protective Effect of Alcoholic Extract of Plant Raphanus Sativus (Radish) Seeds against the Oxidative Stress Induced by Sodium Nitrite on Liver and Kidney of Rabbits

اسم المؤلف: لينا احمد عبد العزيز
اسم المشرف: عالية حسين علي | مختار خميس محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية الى معرفة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم NaNO2على كبد وكلى ذكور الارانب. باستخدام كحول 70% لاستخلاص المركبات الفعالة من البذور. استخدمت في الدراسة الحالية 25 ارنب ذكر قسمت الى 5 مجاميع تضمنت كل مجموعة 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوم. المجموعةT1 : جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم, المجموعة : T2 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 50 ملغم/كغم, المجموعة : T3 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 100 ملغم/كغم, المجموعة : T4 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل وبجرعة 200 ملغم/كغم, بالاضافة الى المجموعة : C مجموعة السيطرة جرعت فمويا بجرعة من الماء المقطر مساوية لحجم الجرعة المعطاة لمجاميع المعالجة. اوضحت نتائج الدراسة الحالية في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم حصول ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد (AST, ALT ,(ALP,مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين, ناتج اكسدة الدهون) وانخفاض في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم والمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل 200,100,50 ملغم/كغم لوحظ حصول انخفاض في مستوى انزيمات الكبد (,AST, ALT ,(ALP مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين وناتج اكسدة الدهون) وحصول ارتفاع في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم فقط. بينت نتائج الفحص النسجي لكبد المجموعة المعاملة بنتريت الصوديوم توسع الجيبانيات الدموية, احتقان الاوعية الدموية, ارتشاح الخلايا الالتهابية, تنكس دهني ومائي, تنخر, زيادة اعداد الخلايا الكبدية ثنائية النواة, واظهرت النتائج النسجية لكلى المجموعة المعاملة بمادة نتريت الصوديوم انكماش الكبيبة, احتقان, ارتشاح الخلايا الالتهابية , نزف , تنكس , وذمة, تضخم. بينت نتائج الفحص النسجي لانسجة الكبد والكلى للمجموعة المعاملة بمستخلص البذور وجود حالة اصلاح لهذه الاعضاء. اعتمادا على نتائج الدراسة الحالية نستنتج ان المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة (50 و100 و200 ملغم/كغم) يمتلك فعالية مضادة للاجهاد التاكسدي المستحدث بمادة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في ذكور الارانب. | The aim of this study is to investigate the protective effect of Radish (Raphanus sativus) seeds alcoholic extract against oxidative stress induced by sodium nitrite NaNO2 on liver and kidney in male rabbits. By using 70% alcohol to extract active compound from seeds of R.S. Twenty five adult male rabbits were divided into five groups (five rabbits in each group) and treated daily for 30 days. Group T1 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 , Group T2 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 50 mg/kg of alcoholic extract, Group T3 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 100 mg/kg of alcoholic extract, Group T4 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 200 mg/kg of alcoholic extract from Raphanus sativus seeds as well as Group C : control intubated orally distilled water. Founded in rabbits intubated with NaNO2, that there was increasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), and oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and a decrease in the level of glutathione (GSH) comparing with control . In rabbits intubated with NaNO2 + 50,100,200 mg/kg of alcoholic extract found that there was decreasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and increasing in the level of GSH in comparison with rabbits intubated with NaNO2 only. The histological sections of liver which was treated with S.N. revealed dilation of blood sinusoids, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells, fatty and hydropic degeneration, necrosis and increase number of binucleated hepatocyte. Histological sections of kidney which was treated with S.N. presence of glomerular shrinkage, congestion, infiltration of inflammatory cells, haemorrhage, degeneration, edema, hypertrophy. Histological examination of liver and kidney tissue which was treated with seeds extract, revealed healing of these organs. In conclusion according to results obtained from this study that alcoholic extract of Raphanus sativus seeds in dose (50,100,200 mg/kg) have protective effect against oxidative stress induction by sodium nitrite on liver and kidney in male rabbits.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

اسم المؤلف: لمى يوسف مهدي
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

اسم المؤلف: لمى قاسم علي الطائي
اسم المشرف: نوري محمد لعيبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة لبعض الهرمونات الجنسية لدى الاشخاص المصابين بداء المقوسات الكوندية المراجعين لبعض مستشفيات بغداد == Study of some sexual hormones in infected humans with Toxoplasmosis attenuated in some Baghdad hospitals

اسم المؤلف: فرح محمود شتيب ابراهيم الوائلي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد داء المقوسات احد الامراض الوبائية الذي ينتشر على نطاق واسع جدا في جميع انحاء العالم. سببه هو الاصابة بطفيلي التوكسوبلازما Toxoplasma gondiiويساعد في انتشاره الظروف المناخية والجغرافية والعادات الاجتماعية والثقافية والغذائية. وقد اجريت هذه الدراسة على 130 امراة (حوامل ومجهضات) مصابات بداء المقوسات واللاتي يعانين من حالات الاجهاض او بدونه. وقد وجد ان 90 مريضة من اللواتي تم احالتهن من قبل الاخصائي لمستشفى فاطمة الزهراء (عليها السلام) ومستشفى ابن البلدي في بغداد يمتلكن اجسام مضادة ضد داء المقوسات, و90 رجل مصاب بداء المقوسات من المركز الوطني لنقل الدم وقد تراوحت اعمارالاشخاص بين 15 - 45 سنة في الفترة من ديسمبر 2014 الى مارس 2015 وبالتوازي مع ذلك، تم اختيار 60 امراة و30 رجل سليمين كمجموعة سيطرة. وقداظهرت النتائج ان نسبة الاصابة بهذا الطفيلي للنساء والرجال كانت 69.23% و66.67% على التوالي باستخدام طريقة فحص التلازن test Agglutination وطريقة الاليزا ELISA . ودلت النتائج على ان مجموعة الخطر الكبيرة من النساء الحوامل المصابات بداء المقوسات تتراوح اعمارهن بين 21 - 30 سنة اذ شكلت (61.54٪) من الحالات. واظهرت النتائج ان نسبة الاجهاض وفقا لعدد مرات الاسقاطات للنساء الحوامل قيد الدراسة بلغت (61.54٪) من عدد النساء الحوامل اللاتي اجهضن مرة واحدة او اثنتين. وقد كان تركيز الضد المناعي IgG مرتفع معنويا (0.05 >P), حيث كان بمتوسط (4.02 ± 0.39) عند الرجال و(8.50 ± 0.41) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة الصحية حيث كانت عند الرجال (0.343 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.418 ± 0.03)، في حين تراكيز الضد المناعي IgM سجلت ارتفاعا غير مهم وكانت بمستوى (0.603 ± 0.07) عند الرجال و(0.540 ± 0.08 ) عند النساء مقارنة بمجموعة السيطرة حيث كان عند الرجال (0.151 ± 0.02) اما عند النساء فكان (0.325 ± 0.03). وتمت دراسة تراكيز العديد من الهرمونات في مصل مثل (testosterone, Estradiol, Progesterone, Prolactin, Follicle Stimulating Hormone and Luteinizing Hormone). وكانت نتائج هذه التجارب تكشفت عن وجود فرق معنوي (0.05 >P) في مستوى الاستراديول في النساء المصابات (المجهضات والحوامل) (43.62 ± 7.12 نانوغرام / مل) ( 682.11 ± 12.23نانو غرام/مل)، وفرق غير معنوي في الرجال المصابين (501.32 ± 82.09 نانوغرام / مل) وانخفاض معنوي (0.05 >P) في مستوى هرمون البروجسترون في النساء المصابات المجهضات والحوامل (3.12 ± 2.33 نانوغرام / مل) (7.81 ± 1.52 نانو غرام/ مل) و(5.51 ± 1.25 نانوغرام / مل) في الرجال المصابين بالمقارنة مع السيطرة للنساء (3.81± 3.22 نانو غرام/ مل) (10.72±2.23 نانو غرام/ مل) وللرجال (4.01 ± 0.02). ومع ذلك، فقد لوحظ عدم وجود فروق معنوية كبيرة في مستوى البرولاكتين حيث سجلت انخفاضا كبيرا في المرضى المصابين من النساء والرجال مقارنة بالمجموعة الضابطة. واظهرت النتائج ان مستويات هرمون تستوستيرون ليست ذات دلالة احصائية مسجلة بين مجموعتي النساء والرجال. واظهرت النتائج عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية في تركيز مستويات هرمون FSH للنساء والرجال المصابين. وكذلك في مستوى هرمون LH في النساء المصابات والرجال المصابين. | Toxoplasmosis is considered to be an epidemic disease which spreads very widely all over the world. The cause of it is the infection by the parasite Toxoplasma gondii. Its spread depends on the sociocultural and nutritional habits, climatic and geographical condition. The present study was conducted on 130 women infected with toxoplasmosis and who were suffering from abortion or without it. It was found that 90 patients who were sent by the specialist to Fatima - AL - Zahraa Hospital and Ibn - AL - Balady Hospital in Baghdad had antibodies against toxoplasmosis parasite. And 90 men infected by toxoplasmosis from National Blood Transfusion Center ranging in ages between 15 - 45 years for the period from December 2014 to March 2015. Parallel to that, 60 healthy women and 30 healthy men were chosen as a control group. The results showed that the percentage of infections by the parasite for women and men were 69.23% and 66.67% respectively using Agglutination and ELISA methods. The results indicated the great risk group of pregnant women with toxoplasmosis at the age between 21 - 30 year was (61.54%) of cases. The results showed that the rate of abortion, according to the projection of the number of times women were pregnant as a percentage (61.54%) of those who aborted once or twice. The concentrations of IgG were significantly elevated (P<0.05), the levels were (4.02 ± 0.39 IU /ml) in men and (8.50 ± 0.41 IU /ml) in woman, compared to a healthy control group where it was in men (0.343 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.418 ± 0.03 IU /ml), while the concentrations of IgM registered no significant elevated the levels were (0.603 ± 0.07 IU /ml) in men and (0.540 ± 0.08 IU /ml) in women, comparison to a healthy control group where it was in men (0.151 ± 0.02 IU /ml) and in women (0.325 ± 0.03 IU /ml). The serum concentrations of several hormones were studied such as (Testosterone, Estradiol, progesterone, Prolactin, Follicle stimulating hormone and Luteinizing hormone). The results of these trials revealed a significant (p<0.05) increase in level of Estradiol hormone in women (aborted and women) (43.62±7.12 ng/ml) (682.11±12.23 ng/ml) and non - significant for infected men (501.32 ± 82.09 ng/ml) and a significant (p< 0.05) decline in progesterone level in infected women aborted and pregnant (3.12 ± 2.33ng/ml) (7.81±1.52 ng/ml) and (5.51 ± 1.25 ng/ml) for infected men when compared with control for women (3.81± 3.22 ng/ ml) (10.72±2.23 ng/ ml) and for men (4.01± 0.02 ng/ml). However, no significant differences were noticed in the level of prolactin where it registered significant decrease in infected patients in women and men comparison to control subjects. And the results showed that testosterone levels have no statistical significance registered between the two group's women and men. The results showed the absence of significant differences in the concentration of FSH hormone level among infected women and infected men. As well as in the level of LH hormone in infected women and infected men

تاثير جسيمات ثاني اوكسيد التيتانيوم 2TiO النانوية والميكروية على انبات ونمو بذور نباتي الحنطة والرز ومركباتها == Effect of titanium dioxide TiO2 nano and bulk particles on seeds germination and growth of wheat (Triticum aestivum L.) and rice (Oryza sativa L.)

اسم المؤلف: علياء محسن يوسف
اسم المشرف: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

اسم المؤلف: عقيل محمود علي اللامي
اسم المشرف: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية في مرضى السكري النمط - 1 والاصحاء == Anti - salivary mucins antibodies in Patients of Type - 1diabetes&healthy controls

اسم المؤلف: عذراء نجم عبد محمد
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني | يعقوب عبد الواحد صالح الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: برزت اهمية مستضدات مجاميع الدم المختلفة كجزيئات ترتبط مع امراض المناعة الذاتية وعلى دور مجموعة الدم لويس في هذه الامراض . فقد ركزت الدراسة الحالية في جانبها على تنميط مجاميع الدم ومدى تكرار هذه المجاميع في مرضى داء السكري النمط - 1 مقارنة بالاصحاء , اما الجانب المناعي من الدراسة فقد تطرق الى وجود الاستجابة المناعية في مرضى داء السكري النمط 1 - وعلاقة تلك الاستجابة بمجاميع دم لويس ومستضداتها اللعابية . تمت دراسة (59) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث و(50) عينة دم ولعاب وخروج من الذكور ومقارنة ذلك للاصحاء ب(25) عينة دم ولعاب وخروج من الاناث والذكور .تم تنميط مجاميع دم لويس باستعمال طريقة الشريحة الزجاجية وملاحظة التلازن الدموي تحت تكبير 40x.ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض حيث بلغت نسبتها عند المريضات (33%) مقارنة بالسليمات (12%) (P=3.77×10 - 4**)، في حين كانت مجموعة دمLe(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفظت نسبتها الى (23%) في المريضات مقارنة بنسبة (64%) للسليمات 10 - 9)×4.98=P) ، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+)عند المريضات (17%) مقارنة بالسليمات (16%) (0.462 P=)، في حين كانت مجموعة دم(Le(a - b - في المريضات (23%) مقارنة بنسبة(%8) (10 - 3×1.20 P=) للسليمات . ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) مجموعة مقاومة للمرض اذ بلغت نسبتها في المرضى الذكور (%20) مقارنة بنسبة(24%) للاصحاء (0.239 =P)، في حين كانت مجموعة دم Le(a - b+) مجموعة مقاومة للمرض اذ انخفضت نسبتها في المرضى(32%) مقارنة بالاصحاء(40%)(0.313 P=)، في حين كانت مجموعة دم Le(a+b+) في المرضى (10%) مقارنة بنسبة(16%) للاصحاء(p=0.462) . وكانت مجموعةدم Le(a - b - ) في المرضى(28%)مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (P=0.185).وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 ذات صنفLe(a) . ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة (50%) في المريضات مقارنة بنسبة(33.3%) للسليمات (P=0.015 ) ،اما تردد مجموعة غير الفارزين حيث بلغت نسبتها(50%) مقارنة بنسبة (66.6 %) للسليمات(0.022 P=) ، وفي الذكور كان تردد الفارزين بنسبة(12.5%) في لمرضى مقارنة بنسبة(40%) للاصحاء (10 - 6×6.37 P=)، اما تردد مجموعة الغير فارزين حيث بلغت نستها (87.5%) مقارنة بنسبة(60%) .(10 - 5×1.52 P=) ، كما تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط - 1 ذات صنف Le(a - b - ) ، ففي الاناث كان تردد الفارزين بنسبة(%62.5)، اما السليمات فلم توجد نسبة لتحديدها لقله عدد النماذج .اما تردد مجموعة غير الفارزين اذ بلغت نسبتها(%37.5) للمريضات مقارنة بنسة (100%) للسليمات (10 - 22×8.80 P=) ،اما في الذكور كان تردد الفارزين بنسبة (16.6%) للمرضى مقارنة بنسة(8%) بالاصحاء (0.082 P=) ، اما مجموعة تردد الغير فارزين حيث بلغت نسبتها (83.3%) مقارنة بنسبة(20%) للاصحاء (10 - 19×4.94 p=)، اظهرت تجارب كشف الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية وباستعمال كشف الايلازا غير المباشر(مستوى الاضداد مقاس بمعدل الكثافة الضوئية ± الانحراف القياسي)، فلمجموعة Le.a للمريضات كان معدل الاضداد0.0 )±0.085) مقارنة بمعدل0.0127)±0.1495) للسليمات(10 - 8**×8.48=P)، مجموعة Le.b للمريضات كان معدل الاضداد0.011)±0.089) مقارنة بمعدل0.0127)±0.151) للسليمات (10 - 12**×P=6.37) ،مجموعة Le.a+b+ للمريضات كان معدل 0.007)±0.099) مقارنة بمعدل0.0138)±0.288) للسليمات (10 - 13***×9.09=P) ،مجموعة Le.a - b - كان للمريضات بمعدل الاضداد0.003)±0.073) مقارنة بمعدل 0.0076)±0.1207) للسليمات (10 - 13***×9.09=P). تم دراسة تثبيط الاضداد الضادة للميوسينات اللعابية بالمستضدات اللعابية OL e.a وOLe.b الحرة وكانت النتائج كالاتي : كان معدلات الكثافة الضوئية ±الانحراف القياسي للمعاملات كالاتي : مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.025±0.145) (P=0.490) ،مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.03±0.1) (P=0.142) ،مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط (0.094±0.201) ( P=0.667) ،مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.a كان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط (0.029±0.103) (10 - 4×P=4.76)، مجموعة Le.a قبل الثنبيط بالمستضد اللعابي OLe.b كان (0.01±0.160) مقارنة بعد التثبيط (0.01±0.118) (10 - 8×2.33=P)، مجموعة Le.b قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OL.b كان(0.018±0.117) مقارنة بعد التثبيط (0.016±0.088)(10 - 3×P=1.29). مجموعة Le.a+b+ قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان (0.037±0.188) مقارنة بعد التثبيط(0.077±0.189) ( P=0.971)، مجموعة Le.a - b - قبل التثبيط بالمستضد اللعابي OLe.bكان(0.066±0.2) مقارنة بعد التثبيط(0.02±0.097) (10 - 4×P=1.70)..اما في الجانب البكتيري فقد تم تشخيص عزلات بكتريا Staphylococcus aureusو Pseudomonas aeruginosa .وكالاتي : عزل بكتريا Pseudomonas aeruginosa شخصت 5 عزلات aeruginos .P من اصل ( 25) عيبة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراصي (20%) وفي حين بلغت نسبة الزرع للسليمات (0%) من اصل 25)) عينة خروج , وايضا شخصت 4))من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عز ل الاصحاء (%0).عزل بكتريا Staphylococcus aureus شخصت 5 عزلات S. aureus من اصل (25) عينة خروج للمريضات اذ بلغت نسبة الزرع الافتراضي الموجب(20%) وفي حين بلغت نسبته للسليمات 0)% )من اصل 25 عينة خروج , وايضا شخصت 4)) عزلات من الذكورمن اصل (25)وكانت نسبة العزل الافتراضي (16%) في حين بلغت نسبة عزل الاصحاء (%0).استنتج ان داء السكري النمط - 1 له علاقة بمجاميع الدم ABO ,ومجموعة دم لويس اذ دراستنا هذه اجريت سابقا بنفس الموضوع في قسم علوم الحياة . اشرت الدراسة ان هنالك اضداد ضادة لميوسين اللعاب مسجلة لاول مرة، وهي ملازمة بعيارية عالية (استعمل المصل المخفف 1 : 100) تكثر في المرضى مقارنة بالاصحاء .هنالك زيادة في تكرار عزل البكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus . فيما يدل ذلك وجود تلازم بين نوعي البكتريا والمرض الى ان ذلك يحتاج الى دراسات معمقة . ممكن ان تكون الفروقات بين الذكور والاناث في توزيع مجاميع دم لويس اساسها هرمونات ستيرويدية. من النتائج الواردة في اعلاه تبين ان هناك علاقة بين مجاميع دم لويس وقدرة الافراز والاستجابة المناعية الضادة للعابين في مرضى السكري والتي يمكن ان تستهدف هدفا لتشارك في انشاء المناعة الذاتية في هذا المرض. | Blood group antigen, are associated with autoimmune diseases . studies emphasized on lewis blood groups. The present study concentrated on finding the frequency distribution of ABO - Lewis blood groups association in type - 1 Diabetes compared to the distribution in healthy controls.The immunological part of this study investigated the immune response in the disease and its relation ship with salivary mucins Lewis molecules. Fiftynine diabetic female samples(blood، saliva،stools) as well as 50 male diabetic sample(blood، saliva،stools) were used in addition to 25sample (blood، saliva،stools )of female and males healthy controls . Typing of blood groups Lewis using the glass slide Not blood agglutination and under magnification 40x.The findings indicated that Lea+b - molecule has arole in disease susceptibility. Ites percentage approach 33% in female patients compared to 12% in healthy controls (p=7.33 x 10 - 4)، On the other hand however, Lea - b+ group gave 23% in diabetic females compared to 64% in healthy females (p= 4.98 x10 - 9). Lea+b+ groups gave 17% in diabetic females and 16% in healthy females (p=0.46).Interestingly however, Lea - b - groups was represented at 23% in diabetic females versus 8% in healthy females (p=1.2x 10 - 3) In males the results of the frequenecies could be summarized as follows : Lea + b - 20% in diabetics vs 24% in controls. p=(0.239).Lea - b+ : 33% in diabetics vs 40% in controls. P=(= 0.31).Lea+b+ : 10% in diabetics vs 16% in controls. P= (0.462).Lea - b - : 28% in diabetics vs 20% in controls. P=(0.185).The role of secretion (se gene role) in diabetes was investigated also, particularly in Lea group and the findings were as follows : secretors female : 50% in diabetics vs 33.3% in controls.(p=0.015).None secretors : 12.5% in diabetics vs 40% incontrols (p=6.37x10 - 6).In addition to that the role of secretion was seen in Lea - b - group as well. Secretor diabetics female, showed 62.5% . There was no available samples in controls.A Statistically siqnificant frequency differences was seen in non secretors diabtic, females compared to controls (37.5% in diabetics vs 100% in controls p=8.8 x 10 - 22).In Males the results of secretions reported a significant difference in non secretors83.3%. In diabetics vs 20% controls ( p= 4.94 x 10 - 3)The other part of the study experiments oriented to uncovering the presence of anti - salivary mucins antibody .Using Lewis types, salivary mucin as coating antigen، and indirect ELISA, we could demonstrate the occurrence of anti - mucin antibodies in patients sera that was from controls.In this respect the level of anti - mucin antibody measured as ELISA mean o.D±SD seen below and as following : In Lea diabetic females group was 0.085+0.02 vs 0.1495±0.0127 in control (p= 8.48 x10 - 8)،In Leb diabetic females group 0.089±0.011 vs 0.151±0.0127 in control group( p= 6.37 x10 - 12)،In lea+b+ diabetic females group 0.099+0.007 vs control groups 0.288+0.0138 in control p=( 9.09 x10 - 13) ،In Lea - b - diabetic females group 0.07+0.003 vs control group 0.1207+0.0076( p=9.09 x 10 - 13)In specificity experiment, using free olea and oleb free saliva as inhibitor for anti - mucin antibody, it was demaonstrated that in female patients group Lea : no inhibition by free Lea was seen (0.6 ± 0.01) vs 0.145±0.02 for treatments before and after inhibition respectively (p=0.49)، similarly there was no inhibitin by the free antigens، similarity there this no inhibition by the free antigens towards antibodies in group Leb.Significnt inhibition of anti - mucin antibody by free Lewis was seen in group : (0.2±0.060) vs (0.103±0.029) before and after inhibitim respectiuly(p=476 x 10 - 4) and similar results was seen in Lea - b - group.The bacteriological study on The isolation of P.aeroginosa from stool samples revealed an isolation frequency of 20% in diabetic vs 0% in control.In addition S.aureus isolation from stool gave a frequency of 20% in patients vs 0% in control.It is concluded that there is areltionship among Lewis blood groups – secretion of there molecules and anti - mucin، immune response directed to aspecific targt and initiating autoimmunity in this particular disease.

التغيرات في مستويات انترليوكين - 33 في مرضى الربو والتهاب الانف التحسسي تحت تاثير العلاج المناعي == Changes of IL - 33 Levels in Asthmatic and Allergic Rhinitis Patients under the Effect of Immunotherapy

اسم المؤلف: عذراء خلف فلحي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | سعاد الماس براخاس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتقصي التغيرات في مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 في امصال المرضى المصابين بالربو التحسسي والتهاب الانف التحسسي اضافة الى دراسة اثر العلاج المناعي على هذه المؤثرات المناعية. تم اختبار مئتين وخمسه وتسعين مريض (120ربو, 75 التهاب الانف التحسسي, 100 خاضعين للعلاج المناعي) اعمارهم تتراوح بين 20 - 60 سنة (160 ذكور , 135 اناث), من بين المراجعين للمركز التخصصي للحساسية في بغداد/ الرصافة للفترة من اكتوبر 2014 الى فبراير 2015. تم خلال الدراسة قياس مستويات الكلوبيولين المناعيE والانترليوكين - 33 بتقنية الاليزا وبالامكان تلخيص النتائج لهذه الدراسة بالاتي : 1 - تبين من خلال اجراء فحص وخز الجلد باستخدام 15 نوع من المستارجات الاكثر شيوعا ان مستويات التفاعلات الايجابية ترتب كالتالي : 8.7%D. pteronyssinus (D1) , 7.6% D. farina (D2), 7.6% Chenopodium (CH) و7.1% Bermuda grass (G2) في المرضى الذين يعانون من الربو و8.2% D. pteronyssinus (D1), 7.6% D. farina (D2), 7.6% Bermuda grass (G2) و6.6% Chenopodium (CH) في المرضى الذين يعانون من التهاب الانف التحسسي.2 - تبين من النتائج ارتفاع معنوي عالي عند مستوى معنوية (P<0.001) في مستويات الضد IgE سواء عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 33.07 ± 328.78( او التهاب الانف التحسسي (pg/ml 36.09 ± 379.76( بالمقارنة بمستوياته التي انخفضت بشكل معنوي عند مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي (pg/ml 22.75 ± 210.23(. فيما ضلت مستوياته ضمن حدودها الطبيعية عند مجموعة الاصحاء (pg/ml 8.04 ± 81.19).3 - موازيا لذلك فان مستويات انترلوكين - 33 قد سجلت ارتفاعات معنوية عند مرضى الربو التحسسي (pg/ml 13.75 ± 128.07( والتهاب الانف التحسسي ( pg/ml12.78 ± 144.62) فيما انخفضت عن ذلك في مجموعة المرضى الخاضعين للعلاج المناعي لتصل (pg/ml 11.32± 110.79( اما مجموعة السيطرة فكانت (pg/ml 9.06 ± 59.04).4 - وقد وجد ان هنالك علاقة موجبة ذات دلاله معنوية بين مستوى انتولوكين - 33 ومستويات IgE الكلية حيث ان معامل الارتباط في الربو (r = 0.42**), التهاب الانف التحسسي (r = 0.31*), والمرضى الخاضعين للعلاج المناعي (r = 0.41**) على مستوى احتمال (P <0.01**) و. (P <0.05*) | The present study was undertaken to investigate the changes in levels of total IgE and interleukin - 33 in sera of patients with allergic asthma and allergic rhinitis. In addition, the effect of immunotherapy on such immune parameters were investigated. Two hundred and ninety five of allergic patients (120 asthmatics, 75 allergic rhinitis, and 100 receiving immunotherapy) their ages ranged between 20 - 60 years (160 males and 135 females), among those who attended the allergy specialized center in Baghdad /Al - Russafa during the period from October 2014 to February 2015. The control group was included 50 apparently healthy individuals. Levels of interleukin - 33, Total IgE, were estimated using ELISA technique, the results of the study can be summarized as follow : 1 - By doing skin prick test using 15 types of most common allergens for both groups of patients, the recorded results showed to be positive respectively as so : Dermatophagoides pteronyssinus (D1) 8.7%, Dermatophagoides farinae (D2) 7.6%, Chenopodium (CH) 7.6% and Bermuda grass (G2) 7.1% in asthmatic patients and D. pteronyssinus (D1) 8.2%, D. farinae (D2) 7.6%, Bermuda grass (G2) 7.6% and Chenopodium (CH) 6.6% in allergic rhinitis patients.2 - The results showed high significant (P < 0.001) increase in the level of total serum IgE in asthmatic patients (328.78 ± 33.07 IU/ml) and in allergic rhinitis patients (379.76 ± 36.09 IU/ml) compared with its level, which were decreased (210.23 ± 22.75 IU/ml), in those patients who received immunotherapy and compared to level in healthy individuals, which were stayed within normal range (81.19 ± 8.04 IU/ml).3 - In parallel IL - 33 also recorded a significant elevation in both groups of patients (128.07 ± 13.75 pg/ml) in allergic asthma, and (144.62 ± 12.78 pg/ml) in allergic rhinitis. It decreased in group of immunotherapy patients to reach (110.79 ± 11.32 pg/ml), while it was (59.04 ±9.06 pg/ml) in the sera of healthy individuals.4 - A significant positive correlation was found between serum level of IL - 33 and the total IgE as the correlation coefficient in asthma was (r = 0.42**), rhinitis (r = 0.31*), immunotherapy (r = 0.41**) at the level of probability (P <0.01**) and (P <0.05*).

دراسة علاقة الكورتيزول ومقاومة الانسولين في رجال قصور الغدة الدرقية غير المصابين بالسكري == Study the relationship of cortisol and insulin resistance in non - diabetic hypothyroidism men

اسم المؤلف: ظلال عبد الخالق جمعة
اسم المشرف: علي شلش سلطان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية للتحري عن مستويات الكورتيزول ومقاومة الانسولين بالعلاقة مع زيادة مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية ((TSH في مرضى قصور الغدة الدرقية من الذكوروالتي اجريت على 48 شخصا من المراجعين الى المركز التخصصي للغدد الصم ومرضى السكري في بغداد للفترة من 10/10/2014 ولغاية 14/2/2015. شملت مجموعة قصورالغدة الدرقية 24 رجلا تراوحت اعمارهم بين 20 - 60 سنة ومجموعة السيطرة 24 رجل تراوحت اعمارهم بين 20 - 56 سنة. ارتفع مستوى Mu/lTSHمعنويا (P˂0.01)في مجموعة قصورالغدة الدرقية (41.74±3.61) قارنة بمجموعة السيطرة(1.97±0.264). اظهرت مستويات هرمون الثايروكسين T4nmol/Lفي مجموعة قصورالغدة الدرقية (48.59±0.98) انخفاضا معنويا P˂0.01)) مقارنة بالسيطرة .(80.12±3.09) اظهرت مستويات T3nmol/lعدم وجود فروقات معنوية (p≥0.05) بين المجموعتين (1.31±0.14)؛ (1.52±0.083) على التوالي. ارتفعت مستويات الكورتيزول ng/ml(274.08±9.3) في مجموعة المرضى معنويا(P<0.01) مقارنة بمجموعة السيطرة (174.33±13.55).ازداد مستوى الانسولين(15.13±1.14) µIU/ml في المرضى مقارنة بالسيطرة (8.28 ± 0.76) معنويا (P<0.01).لم تكن الفروقات معنوية p≥0.05)) في مستويات كلوكوز الدم(4.84±0.15) ؛ mmol/l(4.98±0.11)بين المجموعتين .لم تكن الفروقات معنويةp≥0.05)) في مستويات HbA1c%بين المجموعتين (5.50±0.18;5.50±0.18) على التوالي. ازدادت مستويات مقاومة الانسولين معنويا (P<0.01)في مجموعة المرضى (3.39±0.29) مقارنة بمجموعة السيطرة (1.81±0.16) . ارتفع معامل كتلة الجسم BMI(kg/m2)معنويا (P<0.01) في مجموعة المرضى (25.81±0.39) مقارنة بالسيطرة (23.72±0.49). لم يكن ضغط الدم الشرياني العالي (11.58 ± 0.37) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05)) عند مقارنته مع مجموعة السيطرة (11.46 0.22). لم يكن ضغط الدم الشرياني الواطئ(9.04±0.40) في مجموعة المرضى معنويا p≥0.05))عند المقارنة مع مجموعة السيطرة(8.46±0.23) .. كان معدل العمر (39.00±1.92; 35.54±2.29) بين المجموعتين. اظهر TSH وCortisolارتباطا موجبا (0.65)ومعنويا (P<0.01).اظهر الكورتيزول وT4علاقة سالبة ( - 0.32) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكورتيزول علاقة سالبة ( - 0.18) غير معنويةp≥0.05) ) مع T3. اظهر الانسولين وكلوكوزالدم علاقة موجبة (0.09) غيرمعنوية (p≥0.05). اظهراالانسولين والHbA1c% علاقة سالبة ( - 0.09) غير معنوية p≥0.05)).كانت العلاقة موجبة (0.42) ومعنوية (P<0.01) بين الانسولين والكورتيزول. اظهرالانسولين وTSHعلاقة موجبة (0.36) ومعنوية (P<0.01). اظهر الكلوكوز وTSHعلاقة سالبة ( - 0.16) وغير معنوية p≥0.05)). اظهرTSHو HbA1c%علاقة موجبة (0.05) غير معنوية ( - 0.08)كانت مقاومة الانسولين والكلوكوز علاقة موجبة (0.32) ومعنوية(p≤0.05).وجدت علاقة سالبة( - 0.08) بين مقاومة الانسولين وHbA1c%غير معنوية p≥0.05)).اظهرت مقاومة الانسولين ومعامل كتلة الجسم BMI علاقة موجبة(0.33) ومعنوية (p≤0.05). كذلك اظهرBMI وTSH علاقة موجبة (0.39)ومعنوية(P<0.01) . اظهر BMI وT4علاقة سالبة ( - 0.36) ومعنوية (P<0.01). بين BMI وT3علاقة موجبة (0.002) غير معنوية(p≥0.05) . اظهر BMIوالعمرعلاقة سالبة( - 0.001) غير معنوية p≥0.05)). استنتجنا من هذه الدراسة بان ارتفاع مستوى الTSH يؤدي الى ارتفاع مستوى الكورتيزول في مرضى قصور الغدة الدرقية مع زيادة مستويات الانسولين والمصاحبة لزيادة مقاومة الانسولين وزيادة معامل كتلة الجسم BMI. | The present study aimed to investigate the cortisol levels and insulin resistance and their relationship with increasing level of Thyroid stimulating hormone (TSH) in the hypothyroid male patients. The study was carried on 48 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Baghdad province. The study began on10/10/2014to 14/2/2015.The subjects were divided into 2groups (control and hypothyroid).Each group included 24 males, their ages ranged between 20 - 60; 20 - 56years respectively. The results showed a highly significant (P˂ 0.01) increase in the level of TSH in overt hypothyroid patients (41.74± 3.61mu/l) in comparison with control (1.97± 0.264mu/l). Levels of T4nmol/L (48.59 ± 0.98) showed a significant (p˂0.01) decrease in comparison with control (80.12±3.09). T3nmol/L levels were not significantly (p≥0.05) between two groups (1.31±0.14); (1.52±0.083) respectively. Cortisol levels (274.08±9.37) ng/ml increased significantly (P<0.01)in the patients group in comparsion with control group (174.33±13.55). Insulin (15.13±1.14)µIU/ml increased significantly (P<0.01) in the patients group in comparison with control. (8.28 ± 0.76(Glucose levels mmol/l in patients (4.84±0.15) and control group (4.98±0.11) were not significant (p≥0.05). HbA1c (%) levels in the study groups (5.50±0.18; 5.50±0.18) were not significant (p≥0.05). Insulin resistance (%) increased significantly (P<0.01) in patients group(3.39 ±0.29)when compared with control group (1.81±0.16). Body mass index (kg/m2) increased significantly (P<0.01) in patients group (25.81±0.39) in comparison with control group (23.72± 0.49). High arterial blood pressure in patients group (11.58 ± 0.37) was not significant (P≥0.05) in comparison with control group (11.46± 0.22). Low arterial blood pressure in patients group (9.04±0.40) was not significant (P≥0,05) in comparison with control group(8.46±0.23). Mean of age was (39.00±1.92;35.54±2.29) in both groups. There is a positive correlation (0.65) between cortisol and TSH at (P<0.01) level in patient group; while cortisol showed negative correlation ( - 0.32) between cortisol and T4 at (p<0.05). Cortisol showed non - significant (p≥0.05) negative correlation ( - 0.18) with T3. Insulin and glucose showed positive (0.09) non - significant correlation (p≥0.05).Insulin and HbA1C% showed ( - 0.09) non - significant correlation (0.42).TSH & Insulin in patients group showed positive (0.36) significant correlation (P<0.01). TSH & Glucose in patients group showed negative( - 0.16) non - significant (p≥0.05) correlation. TSH & HbA1C% in patients group showed positive (0.05) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and glucose correlation was positive (0.32) significantly (p≤0.05) in patients group. Insulin resistance & HbA1C% in patients group showed negative ( - 0.08) non - significant (p≥0.05) correlation. Insulin resistance and BMI showed positive (0.33) significantly (p≤0.05).BMI and TSH showed significant (P<0.01) positive (0.39) correlation. BMI & T4 showed significant (P<0.01) negative ( - 0.36) Correlation in patients groups. BMI & T3 showed positive (0.002) non - significant (p≥0.05) correlation. BMI & Age showed negative ( - 0.001) non - significant (p≥0.05). We concluded from this study that increasing levels of TSH causing an elevation of cortisol levels among hypothyroid patients with increasing insulin levels accompanied by increased insulin resistance and BMI index.

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

اسم المؤلف: علاء سالم حمزة
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة تاثير بعض المطهرات والمعقمات والمنظفات على نمو بعض الفطريات المعزولة من بعض المستشفيات في بغداد == Study the effect of some disinfectants, sterilizers and detergents on growth of some fungi isolated from Baghdad hospitals

اسم المؤلف: صادق رحيم محمد علي
اسم المشرف: منى حمودي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to detect the fungal contamination of hospitals in orderto be controlled and limited.A total of 511 environmental swaps were collected from Al - Karamateaching hospital, Al - Sader general hospital, Al - Yarmouk teachinghospital, Baghdad teaching hospital and Imam Ali general hospital inBaghdad city from the period 28,October,2013 to 31,March,2014. Thesamples were collected to isolate and identify the caused and contaminatedfungi in addition to test their sensitivity against certain antiseptic anddisinfectants that are used in hospitals; also their virulence factors forhigher frequency and occurrence genus.These isolates were collected from main sources, the hospitalsenvironment and most of the items used for hospital work in order to detectthe nosocomial pathogens persistent in the hospital ecosystem, whichincludes : sink surfaces, tools and equipments, walls, indwelling medicaldevices, premature incubators, beds, medical trashes, floors and others.Results revealed that fungal contamination in five hospitals was in thepercentage 69.89%, 64.52%, 62.40%, 51.58% and 41.90% respectively. Inaddition, the most contaminated places were the hospitals wards 80%,while it was 77.77% in endoscopy units and 76.92% in the Respiratory careunits. The lowest contaminated places were the emergency units 25.0%then burns units 33.33% and cardiac care unit which was 41.66%. Inrespect with the percentage of occurrence and frequency for the isolatedfungi, it was found out that Aspergillus flavus formed the highest ratio offrequency and occurrence 21.29% and 15.46% respectively, followed byAspergillus niger 18.33% and 13.31% then Penecillium spp. which was10.78% and 7.83%. Regarding other fungi, their frequency and occurrence were different. All fungal isolates were identified depending on themorphological and microscopic examinations as well as biochemical tests.The results on the effect of temperature and pH on fungal growthshowed that the best growth was at 25 - 30 OC, and the best growth wasfound at the pH range 5.0 - 6.0.Results of the test of fungal sensitivity against eight antiseptics andsterilizers used in the hospital showed that the ratio of inhibition of thesecompounds agnaist fungi were different according to types andconcentration of antiseptics as well as genus and species of fungi. Use ofthese compounds in 100%, 50%, 40%, 30% and 20% concentration is veryhigher effective, while more effective if they were used in 10% or 7.5%concentration than in 5% and 2.5%, but not effective in 1.25%concentration.The results showed that Setol (Chloroxylenol) has significantly the mosteffective compound on fungi, followed by Formalin (Formaldehyde), thenCarmal (Tension, active surfactants, non - ionic) and Alwazir (Sodiumhipochlorite).Testing some of virulence factors aflatoxin production, lipaseproduction , protease production and haemolysis test, it was found that A.flavus has higher lipase production and protease production than otherfungi. A. flavus and A. niger were capable of blood hemolysis in 3 daysonly, but in different diameters of lysis zone, 1.8mm and 1.6mmrespectively. Some isolates of A. flavus are capable to aflatoxin production.Depending on all results, hospitals contain different fungal species andgenus, antiseptics and disinfectants have an effect on fungal growth if theyare used in a correctly.

دراسة كيميائية وبايولوجية لمركبي Stigmasterol و? - sitosterol كمكونات فعالة متواجدة في نبات البنفسج العطري (العائلة : البنفسجية) المزروع في العراق == Phytochemical and Biological Study of Stigmasterol and ? - sitosterol as Active Constituents Present in Viola odorata L.Plant (Family : Violaceae) Cultivated in Iraq

اسم المؤلف: شيماء فخري جاسم السالم
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد هذه الدراسة مسح لبعض المكونات الفعاله لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. وعزل هذه المركبات الفعالة (Stigmasterol and β - sitosterol)، كما تم اجراء دراسه بايولوجيه لتحديد فاعليتها كمركبات مضادة للاكسدة وكمضادات بكتيرية حيث تضمنت الدراسه مايلي : - • تم استخلاص هذه المركبات كمستخلص خام من كل جزء من اجزاء النبتة الجذور،الاوراق, الازهار والبذور باستخدام الميثانول والبتروليوم ايثر واجراءالتقدير الكمي والنوعي للمركبين Stigmasterol) و( β - sitosterolفي كل جزء باستخدام تقنيات TLC, HPLC,CC• تم استخلاص وعزل وتشخيص المركبين (Stigmasterol and β - sitosterol) وذلك باستخدام طرق استخلاص وتجزئه وعزل مختلفه• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. والمركبات الستيرويدية Stigmasterol) و( β - sitosterol كمضادات للاكسدة على المركب 1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) الفعال لاحتوائه على الجذور الحرة وتحويله الى مركب 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine باستخدام التراكيز 25, 50, 100, 200 و400 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata Lو المركبات الستيرويديه( Stigmasterol و( β - sitosterol كمضادات بكتيرية فاعلة ضد بكتيريا staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa وبتراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع المضاد الحيوي Gentamicin كمعاملة قياسية• اظهرت النتائج وجود كميات كبيرة من المركبات الستيرويدية(Stigmasterol and β - sitosterol )في كل اجزاء نبتة البنفسج العطري Viola odorata L. اذ كانت تراكيز مركب Stigmasterol في الاوراق 2 ملغم/100مليلتر وللازهار 7.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 4.5 ملغم/100مليلتر وللبذور 2.4 ملغم/100مليلتر, فيما كانت تراكيز المركب β - sitosterol في الاوراق 3.2 ملغم/100مليلتر وللازهار 5.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 9.2 ملغم/100مليلتر وللبذور 3 ملغم/100مليلتر, اذ كان اعلى تركيز للمركب Stigmasterol في مستخلص الازهار 7.3 ملغم/100مليلتر واعلى تركيز للمركب β - sitosterol في الجذر 9.2 ملغم/100مليلتر.• اظهرت النتائج الفاعلية الكبيرة للمستخلص الخام لنبات Viola odorata L. بالتركيز 400 مايكروغرام/مليلتر كمضاد للاكسدة بنسبة 94% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 72, 80, 84 و92% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية, اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية P≤ 0.05 ما بين التراكيز للمستخلص الخام, فيما اظهر التركيز 400 مايكروغرام/مليلتر لخليط المركبات( stigmasterol وβ - sitosterol) كفاءة كبيرة كمضادات للاكسدة وبنسبة 74% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 59, 63, 66 و70% على التوالي مقارنة بالمعاملة القياسية وبفروق معنوية P≤0.05 ما بين التراكيز.• اظهرت تراكيز المستخلص الخام للنبتة فاعلية كمضاد للبكتيريا اذ كان مدى تثبيط بكتيريا Staphylococcus aureus على الوسط المغذي الصلب 0, 5, 15, 18, 20, 22 و25 مليمتر باستخدام التراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر على التوالي, واظهر خليط الستيرويدات مدى تثبيط 0, 0, 0, 14, 16, 19 و21 مليمتر لنفس التراكيز على التوالي ومقارنة بالمعاملة القياسية, كذلك اظهر المستخلص الخام كفاءة كمضاد بكتيري ضد بكتيريا Pseudomonas aeruginosa بمدى تثبيط 0, 5, 12, 15, 17, 19 و22 مليمتر ولخليط الستيرويدات بمدى تثبيط 0, 0, 0, 11, 13, 17 و18 مليمتر مقارنة بالمعاملة القياسية, وبينت النتائج ان التركيز الادنى المثبط للمستخلص الخام للنبتة ضد بكتيريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaهو 5 مايكروغرام/مليلتر ولخليط الستيرويدات هو 20 مايكروغرام/مليلتر. | This study is considered as a survey of the some secondary metabolits present in Viola odorata L., collected from plant nursery in Baghdad between April and July, followed by the fractionation and isolation of Stigmasterol and β - sitosterol.The biological study demonstrated the effect of the Stigmasterol and β - sitosterol found in Viola odorata L. as antioxidant and antibacterial. This study involved the following : - • Extraction of Stigmasterol and β - sitosterol as a crude extract from each part of the plant roots, leaves, flowers and seeds using (Petrolium ether and Methanol) to qualitative and quantitative estimation of Stigmasterol and β - sitosterol in each part of the plant by using TLC, HPLC and CC. • Fractionation and Isolation of sterols compounds (Stigmasterol and β - sitosterol) present in Viola odorata L., by using different methods . • Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been studies in experimental work to determination the antioxidant activity against1,1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) which is considered as stable free radical and convert it into 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine ,by using different concentrations (25,50,100,200 and 400µg/ml). Compare ascorbic acid.• Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been used to determination the antibacterial activity using different concentrations (2, 5, 10,20,30,40 and 50µg/ml) against staphylococcus aureus and pseudomonas aeruginosa by using agar well diffusion method compare with Gentamicin as a standard control. • The phytochemical results showed that all the plant parts contain high amount of sterols, the quantitative data revealed that the total content of Stigmasterol in roots(4.5mg/100g) ,in leaves(2mg/100g),in flowers(7.3mg/100g) and in seeds(2.4mg/100g).The content of β - sitosterol in roots(9.2mg/100g),in leaves(3.2mg/100g),in flowers(5.3mg/100g) and in seeds(3mg/100g), highest amount of stigmasterol founded in flowers (7.30mg/100g) ,the maximum amount of β - sitosterol in roots (9.2 mg/100g) .• The results showed that crude extract of Viola odorata in concentration of 400µg/ml have a higher antioxidant effect by 94%, and concentrations of 25, 50, 100 and 200 µg/ml by 72, 80, 84 and 92% respectively which are comparing with standard control Ascorbic acid, the results showed there are significant difference at (P≤ 0.05) between the concentrations in the same crude extract, while the stigmasterol and β - sitosterol of Viola odorata also showed higher antioxidant effect in concentration of 400µg/ml by 74% and concentrations of 25, 50, 100 and 200µg/ml by 59, 63, 66 and 70% respectively comparing with standard control Ascorbic acid with significant difference at (P≤0.05) between them ,and with significant difference at (P≤0.05)between the concentrations in the same fraction.• Antibacterial results of crude extract showed Staphylococcus aureus growth inhibition zone by 0, 5, 15, 18, 20, 22 and 25 mm with 5 µg/ml as MIC, while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 14, 16, 19 and 21 mm with 20 µg/ml as MIC comparing with Gentamicine standard control. Furthermore inhibition zone in pseudomonas aeruginosa culture when using crude extract by 0, 5, 12, 15, 17, 19 and 22 mm with 5 µg/ml as minimum inhibitory concentrations (MIC), while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 11, 13, 17 and 18 mm with 20 µg/ml as Minimum inhibitory concentration (MIC) compar with Gentamicin standard control .Stigmasterol and β - sitosterol compound showed inhibition zone by 0,0,0,11,13,17 and 18 mm with 20 µg/ml MICcompared with Gentamicine standard control.
1 ... 12 13 14 15 16 ... 27