Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 523

الكشف عن اصابات بكتريا التدرن Mycobacterium tuberculosis باستخدام تقنيات تشخيصية مختلفة في محافظة بابل == Detection of Mycobacterium tuberculosis Infections using Different diagnostic Techniques in Babylon Province

Author name: عبد الستار اسود كوكز
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | هادي محمد علي الموسوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف الدراسة الى المقارنة بين بعض التقنيات المستخدمة في التشخيص السريع لمرض التدرن في محافظة بابل باستخدام كل من Gene X - pert وAFB وReal Time PCR. وكذلك التحري عن معايير المناعية التي تتضمن التركيز المصلي لكل من IL - 2 وIgG وIgM لمصول مرضى التدرن. جمعت العينات المطلوبة لانجاز العمل من (60) شخص يشتبه اصابتهم بمرض التدرن والذين راجعو المركز التخصصي للامراض الصدرية والتنفسية بمدينه الحلة خلال الفترة من شباط الى حزيران 2015. بينت النتائج ان نسبه مرضى التدرن من الذكور هي 64% والاناث 36%, ضمن مدى الاعمار (15 - 74سنه) .اظهرت نتائج هذه الدراسة بان تشخيص مرض التدرن باستخدام كل من Gene X - pert وReal Time PCR نسبة حساسيه لكليهما بالنسبة لAFB موجب 100%. لكن Gene X - pert قد سجل 66% وReal Time PCR قد سجل 58% بالنسبة لAFB سالب. ونسبة الحساسية ل AFB 16,6%.حددت تسعة وثلاثون عينه موجبه لبكتريا التدرن من مجموع 60 مريض مشتبه اصابتهم ببكتريا التدرن قد حددت باستخدام Gene X - pert وكان منها (10 عينات عالية المقاومة و13 عينة متوسطة المقاومة و11 عينة واطئة المقاومة و9 عينات حساسة ) ل Rifampicin.اظهرت المعايير المناعية وجود زياده معنوية في معدل تركيز IL - 2 في مرضى التدرن غير المعالجين على حساب المعالجين ومجموعة السيطرة وكذلك زيادة في المعالجين على حساب مجموعة السيطرة. بين المتوسط الحسابي IL - 2 لغير المعالجين اعلى قيمة (196,429±69,139 بيكوغرام/ملي لتر) ويليه للاشخاص المعالجين (96,997±27,113 بيكوغرام/مليلتر) والاصحاء (78,997±0,909 بيكو غرام/مليلتر). عندما كانت قيمة P. value بين المرضى غير المعالجين والمعالجين (0,003) وجود زياده واضحه. وغير المعالجين ومجموعة السيطرة (0,005) وجود زياده واضحه. والمعالجين ومجموعة السيطرة (0,521) لا يوجد زياده واضحه. اظهرت المعايير المناعية وجود زياده معنوية في معدل تركيز الجسم المضاد IgG في مصول مرضى التدرن غير المعالجين على حساب المرضى المعالجين كالتالي : (22,09±1,299 غرام/لتر و17,376±2,494 غرام /لتر) على التوالي والقيمة الطبيعية في الاشخاص الاصحاء هي (6,3 - 16 غرام/لتر) عندما كانت P. value تساوي (0,01> P ) . لا توجد زياده معنويه في معدل تركيز الجسم المضاد IgM في مصول مرضى التدرن غير المعالجين والمعالجين (1,584±0,559غرام/لتر 1,143±0,492 غرام/لتر) على التوالي والقيمة الطبيعية هي (0,3 - 2,5غرام/على لتر) عندما كانت 0,05P. value > | The study aims at comprise between some techniques using for rapidly detecting tuberculosis cases among Babylon population and to limit the prevalence rate. This objective is achieved by the following : Collection of sputum and blood from study group who are suspected to have TB infection, molecular detection of Mycobacterium tuberculosis in patients samples using Real - Time PCR, Gene X - pert, and demonstration of immune response (IL - 2, IgG, and IgM) in TB patients. The samples of sputum and blood were collected from sixty patients suspected of having TB, in the Specialized Chest and Respiratory Center, Babylon, City during the period from February to June 2015. TB patients consisted of 28 (64%) males and 15 females (36%), with an age range from 15 to 74 years old. Gene X - pert MTB/RIF and Real - Time PCR techniques given sensitivity for AFB positive (100%) and AFB negative (66%, and 58%) respectively. AFB sensitivity is (16.6%), and the specificity is (100%) for all in the present study. Gene X - pert showed that forty three were TB positive from sixty suspected TB patients, and there are 10 with high resistance, 13 with medium resistance, 11 with low resistance, and 9 were sensitive to rifampicin. Serum level of Interleukin - 2 (IL - 2) in untreated TB patients, treated TB patients and control group showed significant differences. IL - 2 in untreated TB patients show high mean (169.429±69.139 pg/ml), followed by treated patients (96.997±27.113 pg/ml), and control group (78.997±0.909 pg/ml). The untreated v.s treated P. value (P<0.003) significant, untreated v.s control P. value is (0.005) significant, and treated V.s control P. value is (0.521) non - significant. Serum level means of immunoglobulin G (IgG) in untreated TB patients and treated TB patients show significant difference. The mean of IgG in untreated patients was higher than in the treated patients, there are (22.094± 1.299g/L, and 17. 376± 2.494 g/L, respectively), significantly P. value is (P<0.01) and the normal value of IgG is (6.3 - 16 g/L). Serum level means of immunoglobulin M (IgM) in untreated TB patients and treated TB patients showed non - significant difference. The IgM mean value in whole groups of the study had located in the normal value, the mean of IgM in the untreated patients is (1.584± 0.559 g/L), treated patients is (1.143± 0.492 g/L), (P. value >0.05), and normal value is (0.3 - 2.5 g/l).

دراسة تغيرات الاعصاب المحيطية لدى النساء البدينات وعلاقة توقف التنفس اثناء النوم مع اعتلال الاعصاب المحيطية == STUDY OF PERIPHERAL NERVES CHANGES IN OVERWEIGHT AND OBESE FEMALES AND THE RELATION OF SLEEP APNEA WITH NEUROPATHY

Author name: سرى عيسى الاعرجي
Supervisor name: نصير جواد حمد المختار | هديل فاضل فرهود
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: خلفية البحث : تعتبرالسمنة وباءا عالميا حيث انها تؤثرفي حوالي اكثر من 2 مليار شخص حول العالم حتى عام2013. ان ارتفاع نسبة انتشار السمنة في كل من البلدان المتقدمة والنامية كانت نتيجة لعدد من الاسباب والتي تتمثل بالبيئة، الوراثة الطبية مثل اضطراب الغدد الصماء، والعلاج مثل العقاقير المضادة للذهان، المنشطات. ان اغلب الناس البدينين يكونون عرضة للاخطار الكبيرة حيث تعرضهم للمضاعفات كداء السكري وارتفاع ضغط الدم وتصلب الشرايين، ومشاكل المفاصل، وامراض السرطان وخاصة السرطانات المحفزة بالهرمون، بالاضافة الى مشاكل في الجهاز التنفسي مثل توقف التنفس اثناء النوم، والمضاعفات العصبية مثل الاعتلال العصبي، ومتلازمة النفق الرسغي، وغيرها من المضاعفات الاخرى. ان توقف التنفس اثناء النوم (sleep apnea) هو احداضطرابات التنفس اثناء النوم والتي قد تصل نسب تكرارها حوالي 2 - 5٪ في عموم السكان والتي ينتج عنها العديد من العقابيل كالنوم اثناء النهار، وانخفاض الاداء والوظيفة المعرفية والوقت الراهن اثبت ان هناك علاقة بين توقف التنفس اثناء النوم والاعتلال العصبي.الهدف من الدراسة : هدف الدراسة الحالية هو الكشف عن تاثير السمنة على الاعصاب المحيطية ولاستبيان العلاقة بين الاعتلال العصبي المحيطي مع توقف التنفس اثناء النوم.المواد والطرائق : اشتملت الدراسة الحالية على مئة وخمسين من الاناث (اللاتي راجعن المدينة الطبية في مرجان) والتي امتدت للفترة من شهر شباط ولغاية تشرين الثاني عام 2014. وان (75) من الاناث كن غير بدينات، و(75) من الاناث كن من البدينات، حيث تم تصنيفهن بحسب مؤشر كتلة الجسم بعد قياس الوزن، الطول، ونسبة الخصر للورك، وجرى استبيان برلين لجميع المرضى البدينات لتشخيص توقف التنفس اثناء النوم ومن ثم تقييم شدتها بواسطة مؤشر ضعف التنفس توقف التنفس اثناء النوم ((Apnea - Hypopnea Index وقد تم اجراء الفحوص المختبرية والتي معدل السكر في الدم بعد الصيام، الهيموجلوبين السكري وهرمون تحفيز الغدة الدرقية ومستوى الدهون في الدم (الكولسترول في الدم، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني المرتفع الكثافة، والبروتين الدهني منخفض الكثافة، والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا)، ثم يتم اجراء فحص الكهروفسيولوجي (كهربائية) بواسطة فحص الاعصاب : المتوسط ((Median والزندي ) Ulnar) من خلال فروعها الحسية والحركية والتي تمثل الطرف العلوي بينما تم فحص عصب عظم الساق (Tibial) وعصب العظم الشضوي العام ( common peroneal) وكذلك عصب بطن الساق (sural) كعصب حسي. النتائج : بينت النتائج ان هناك تزايد معنوي كبير ((p value ≤ 0.05 بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة بالاعتبار لضوابط درجة التعلم والثقافة ، الحالة الاجتماعية، وعدد الاطفال، والاقامة، بموجب التقصي والاختبار حول تلك الاختبارات.كما اثبتت الدراسة تزايد معنوي(p value ≤ 0.05) في معدل مستوى دم الصائم للبدينيين، هرمون محفز الدرقية، الدهون ثلاثية الكليسرايد، الدهون عالية الكثافة، الدهون واطئة الكثافة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ولكنهراغم ذلك كانت تقع ضمن المدى المقبول سريريا. بينما اظهرت الدراسة فيما يخص معايير فحص توصيل الاعصاب (Nerve Conduction Study) اولا : الاعصاب الحسية : فيما يتعلق بالعصب المتوسط (Median) الايسر وعصب بطن الساق او الربلي الايمن والايسر (Sural) هناك فرق معنوي ملحوظ (زيادة) (p value ≤ 0.05) في نسب اضطراب الكمون والسعة بين المرضى من البدينات مقارنة بالاصحاء، اما فيما يخص العصب الزندي (Ulnar) الايمن والايسر والعصب المتوسط الايمن فانه لم يلحظ تغييرات معنوية (p value ˃ 0.05) في معدلات الكمون والسعة وسرعة التوصيل العصبي للمرضى بالمقارنة مع الاصحاء. ثانيا : الاعصاب الحركية : فيما يتعلق العصب المتوسط (Median) الايمن والايسر والعصب الزندي الايسر (Ulnar) فقد بينت الدراسة ان هنالك زيادة معنية ملحوظة (زيادة) (p value ≤ 0.05) في نسب اضطراب الكمون والسعة وسرعة التوصيل للمرضى بالمقارنة مع مجموعة السيطرة من الاصحاء في حين لم يظهر اي تغيير معنوي(p value ˃ 0.05) في مقاييس العصب الزندي الايمن (Ulnar). بينما بالاعتبار لعصب العظم الشظوي الايسر((common peroneal فانه لوحظ هنالك تغيرات معنوية (زيادة) ) (p value ≤ 0.05) فيما يتعلق بنسب الاضطراب المتعلقة بالسعة والكمون وسرعة التوصيل في حين لم تظهر اي تغيرات تذكر(p value ˃ 0.05) فيما يخص العصب الشظوي الايمن وعصب عظم الساق (Tibial) الايمن والايسرعند المرضى بالمقارنة مع مجموعة السيطرة من الاصحاء.الاستنتاجات : نتائج هذه الدراسة تدعم ظاهرة حث اعتلال الاعصاب المحيطية بسبب السمنة وانقطاع التنفس اثناء النوم الذي هو احد مضاعفات السمنة حيث انه يسبب ايضا اعتلال الاعصاب المحيطية. وايضا هنالك علاقه قوية تربط قياس الخصر مع حدوث توقف التنفس اثناء النوم. | Background : Obesity is representing a global epidemic that affecting more than 2 billion peoples around the world on 2013. The obesity prevalence has risen in both developed and developing countries. Many causes have been implicated for developing obesity such as : environmental, hereditary, medical disease like endocrine disorder furthermore, some medication like antipsychotic drugs and steroids. Obese people are at high risk to develop many complication such as diabetes, hypertension, atherosclerosis, joints problems, cancers especially hormone dependant, respiratory problems such as obstructive sleep apnea, neurological complication such as neuropathy, carpal tunnel syndrome, and others. Sleep apnea is one of sleep disordered breathing at frequency of 2 - 5% of general population and it has many sequele like insomnlence (day - time sleeping), decrease performance and cognitive function and nowadays there is strong correlation between sleep apnea and neuropathy. Aim of this study was : To determine the difference in nerve conduction parameters of sensory and motor nerves between obese and control groups. And to detect association between peripheral neuropathy with sleep apnea. Material and methods : One hundred fifty females were included in this study visiting Merjan medical city from February to November 2014.A 75 normal non - obese females, and 75 overweight and obese females, The overall mean age of patients and controls was (41.73±8.45) and (39.00±7.87) years old, respectively. They were classified according to body mass index after measuring their weight, height, waist - hip ratio, The Berline Questionnaire was done for all patients for diagnosis of sleep apnea then asses it's severity by Apnea - hypopnea Index. The investigation was done and include fasting blood sugar, glycosylated hemoglobin, thyroid stimulating hormone and lipid profile (serum cholesterol, serum triglyceride, high density lipoprotein, low density lipoprotein, and very low density lipoprotein), then electrophysiological testing is performed by examining the median and ulnar nerves with their both sensory and motor branches this is for the upper limb while for the lower limb we examined the tibial and common peroneal nerves as motor nerves and sural nerves as sensory nerve. Results : There is a significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between case and control groups concerning education (only primary), marital status, number of children and residence. Regarding investigation there is significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between case and control groups in parameters of fasting blood sugar, thyroid stimulating hormone, triglyceride, high density lipoprotein, and low density lipoprotein but all the investigations were within normal acceptable clinical range. Whereas, in regard to the nerve conduction parameters : - First : the sensory nerves : There is significant difference in percentage (p value ≤ 0.05) of latency, amplitude and conduction velocity of Lt. median nerve, left and right sural nerves. While no significant difference (p value ˃ 0.05) in percentage between case and control groups for Rt. median nerves, Rt. and left ulnar nerves. Second : the motor nerves : regarding the left and right median nerve and left ulnar nerve there is significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between case and controls concerning latency, amplitude and conduction velocity while there is no difference (p value ˃ 0.05) regarding latency, amplitude and conduction velocity of the right ulnar nerve between cases and control groups. Regarding the left peroneal nerve there is significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between case and controls concerning amplitude and conduction velocity while the right peroneal and left and right tibial there is no difference in percentage (p value ˃ 0.05) between case and control groups. Conclusion : The results of this study support the evidence that obesity associated with peripheral neuropathy. Furthermore obstructive sleep apnea as well as it is one of the complication of obesity also can cause peripheral neuropathy. In addition there is strong linkage between waist size and development of sleep apnea

تقييم ممارسات الامهات مع اطفالهم المصابين بمرض الناعور الوراثي المراجعات مركز امراض الدم في مستشفى بابل التعليمي للنسائية والاطفال - محافظة بابل == Assessment of Mothers' Practices Regarding their Children with Hemophilia in Blood Disease Center at Babylon Teaching Hospital for Maternity and Pediatric / Babylon Governorate

Author name: مرفت ظافر حيدر
Supervisor name: منى عبد الوهاب خليل | فخرية جبر محيبس
General topic: Medicine
Specific topic: Nursing
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: دراسة وصفية (مقطعية) اجريت في مستشفى بابل للنسائية والاطفال على الامهات الاتي لديهن اطفال مصابين بمرض الناعور الوراثي. بدات الدراسة في 24 من كانون الثاني الى 1 تموز من عام 2015. وتهدف الدراسة الى تقييم ممارسات الامهات مع اطفالهن المصابين بمرض الناعور. وتحديد العلاقة بين هذه الممارسات والخصائص الاجتماعية والديموغرافية لامهات واطفال والعينة. عينة الدراسة غير عشوائية (غرضية) مختارة من مستشفى بابل للنسائية والاطفال. اجريت على (100) ام لاطفال مصابين بالناعور الوراثي واللاتي يراجعن مركز امراض الدم في المستشفى.استبانة الدراسة تم اعتمادها وتطويرها من قبل الباحث بعد مراجعة واسعة للدراسات والمقالات المتعلقة بموضوع الدراسة, وتتكون من (5) اجزاء تشمل الخصائص الاجتماعية للامهات واطفال العينة وممارسات الامهات المتعلقة بالرعاية والتغذية والمتابعة.تم جمع البيانات من خلال المقابلة المباشرة مع امهات العينة. تم تحديد صحة وموثوقية الاستبانة من قبل مجموعة من الخبراء ومن خلال الدراسة التجريبية. وتم استخدام برنامج (SPSS) للتحليل الاحصائي, واستخدم للتحليل الوصفي (النسبة المئوية (%), المتوسط الحسابي (X) والانحراف المعياري) واستخدم للتحليل الاستنتاجي تحليل التباين (ANOVA). اظهرت نتائج الدراسة من خلال خصائص الامهات الاجتماعية ان (20%) من الامهات اعمارهن تتراوح بين(26 - 30 ) عاما, بينما الغالبية منهن (79%) ربة منزل, و(43%) هن خريجات الدراسة الابتدائية ويسكن مناطق حضرية, و(67%) من الامهات لديهن علاقة قرابة مع ازواجهن وعلاوة على ذلك اظهرت الدراسة من خلال الخصائص الديموغرافية للاطفال المصابين بمرض الناعور ان (32%) اعمارهم تتراوح بين (7 - 9) سنوات. و(41%) منهم كان تسلسلهم الثاني في اطفال العائلة ومع ذلك كانت الغالبية (70%) تم تشخيصهم بالمرض بعد 6 اشهر من الولادة ولكن (62%) يتم تلقيحهم بانتظام و(63%) من اطفال امهات العينة يذهبون الى المدرسة. واما نتائج ممارسات الامهات المتعلقة برعاية وتغدية ومتابعة الاطفال المصابين بمرض الناعور الوراثي اظهرت الدراسة ان المتوسط الحسابي للممارسات كان (1.64) والذي هو اقل من المتوسط الحسابي المرجح وهو(2) وهذه النتيجة تشير الى ضعف ممارسات الامهات في رعايتهم لاطفالهم المصابين بالناعور الوراثي. كما اظهرت الدراسة علاقة ذات دلالة احصائية بين ممارسات الامهات وبعض من الخصائص الاجتماعية المدروسة (عمر الام, التحصيل الدراسي ,بيئة منطقة السكن, علاقة القرابة بين الام والاب, والتاريخ الوراثي للعائلة) وايضا هناك علاقة ذات دلالة احصائية بين ممارسات الامهات وبعض الخصائص الاجتماعية المدروسة ( ترتيب الطفل في العائلة وانتظام التلقيح).والتوصيات المقترحة من خلال هذه الدراسة. تطوير برنامج تعليمي للابوين يتعلق بالرعاية المنزلية للاطفال المصابين بمرض الناعور الوراثي, وضع برنامج تدريب منتظم في مراكز امراض الدم للامهات الجدد اللاتي تم تشخيصهن اطفالهن حديثا بمرض الناعور الوراثي للتحسين من ممارساتهن. | A descriptive study has been conducted in Babylon Teaching Hospital for Maternity and Pediatric on mothers with hemophilic children. The study started at 24th Dec 2014 to 1st July of 2015. This study aimed to assess the practices of mothers with hemophilic children, identify the association between mother's practices with their certain demographic data, and to identify the association between mother's practices with certain demographic data of hemophilic children. A non - probability (purposive) sample selected from Babylon Teaching Hospital for Maternity and Pediatric conducted on (100) mothers with hemophilic children were visiting the Blood Disease Center in the hospital. The instrument of the study was a questionnaire which was designed and developed by the researcher after extensive literature review and the articles related to this subject which is composed of (5) parts : mother and child some certain demographic data, mother practices related to care, nutrition, visiting the clinic and follow up. The data was gathered through direct interviews with mothers. Reliability and validity of the questionnaire was determine through a pilot study and the panel of expertise. A statistical analysis was done by the use of (SPSS) the descriptive analysis, percentage (%) mean (x) standard deviation and the relative efficiency and in inferential analysis use one way (ANOVA). The study results showed that (20%) of mothers aged between (26 - 30) yrs. While, the majority of them (79%) were housewives , however, (43%) of them were primary school graduates and lived in urban areas, and (67%) of them had a relative kinship with their husbands. Moreover, the hemophilic children demographic characteristics showed that (32%) of them were (7 - 9) yrs old. The second child effected was (41%), however, the majority (70%) of them were diagnosed after the sixth month, about, (62%) of children were regularly vaccinated and (63%) of children attended school. Concerning mothers practices related to care, follow up and nutrition the arithmetic mean was (1.64) which was less than the Cutoff point (2). This indicates poor practices of mothers caring of hemophilic children. The results showed significant relationship between mothers' practices and some of their demographic data (mother's age, academic qualifications, environment of residential area, kinship between parents and genetic family history). There were significant relationships between mothers' practices and some of hemophilic children demographic data (birth order, regularly of vaccination). The suggested recommendation developed an educational program regarding home care management to parents with hemophilic children. It is important establish a regularly training program in Blood Disease Centers to new mothers with hemophilic children who were newly diagnosed to improved their practices regarding the care of their hemophilic children.

تحضير مصل تشخيصي متعدد التكافؤ لبكتيريا السالمونيلا للنمطين المصليين Typhi وTyphimurium == Preparation of Polyvalent Diagnostic Antisera for Salmonella serovares Typhi and Typhimurium

Author name: امير صادق ياسر العذاري
Supervisor name: حبيب صاحب نهر | علاء حسين حيدر
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على عزلتين مختلفتين لبكتريا Salmonella ( typhi وtyphimurium ) تم الحصول عليهما من مختبر الصحة العامة في محافظة النجف خلال شهر كانون الاول 2014. تضمنت الدراسة ثلاثة محاور رئيسية , المحور الاول بكتريولوجي وتضمن دراسة تشخيصية للعزلتين وفق انظمة تشخيصية متقدمة ومعتمدة وتضمن المحور الثاني الكشف عن بعض عوامل الضراوة التي تمتلكها البكتريا كقدرتها على الحركة, وانتاج انزيم البروتييز والقدرة على تكوين biofilm اما المحور الثالث فقد تضمن دراسة مناعية تم من خلالها تحضير المستضد الجسمي والمصل التشخيصي متعدد التكافؤPolyvalent antisera لكل من العزلتين.تم اختبار البكتريا من خلال اجراء الفحوصات المجهرية والكيموحياتية وتقنيات Api - 20 والVitek2 ومن خلال نتائج تلك الفحوصات ومقارنتها بالصفات النوعية للبكتريا تاكد بانه العزلتين قيد الدراسة هما Salmonella typhi , وSalmonella typhimurium . اظهرت النتائج قدرة بكتريا Salmonella جنس typhimurium على استهلاك السترات , وانتاجها لكميات كبيرة لكبريتيد الهيدروجين على وسط kliglar iron agar في حين كانت لها القدرة على تخمير العديد من السكريات واهما سكر Arabinose . في حين كانت العزلة للجنس typhi غير قادرة على استهلاك السترات وانتاجها لكميات قليلة لكبريتيد الهيدروجين بالاضافة لعدم قدرتها على تخمير سكر Arabinose .كشفت الدراسة عن امتلاك بكتريا السالمونيلا لبعض عوامل الضراوة متمثلة بانتاج الانزيم المحلل للبروتينات protease enzyme وقدرتها على تكوين biofilm الذي تعتبر احدى العوامل الرئيسة في تلوث الاغذية المحفوظة وانتشار المرض اضافة الى قدرة البكتريا على الحركة بنشاط مما يمكنها من اختراق الطبقة المخاطية المبطنة للامعاء. ومن النتائج التي توصلت اليها الدراسة قدرة البكتريا على مقاومة المضادات الحيوية النيومايسن والكلورامفينكول الذي كان في السابق يعتبر المضاد الحيوي الاول في علاج الاصابة ببكتريا السالمونيلا في حين اظهرت البكتريا حساسية كبيرة للمضادين السيبروفلوكساسين والسيفترياكسون اضافة الى حساسيتها للمضادات كوتريميكسازول والتيتراسايكلين والنالدكسك اسد ,كما اظهرت العزلتين تباين في نسبة الحساسية الكبيرة الى المتوسطة للمضادين الاموكسلين والامبسيلين حيث كانت Salmonella typhi حساسة لتلك المضادات في حين كانت Salmonella typhimurium متوسطة الحساسية لتلك المضادات .المصل التشخيصي متعدد التكافؤPolyvalent diagnostic antisera تم تحضيره خلال طريقة مقترحة من قبل جامعه فلوريدا. حيث تم تحضير المستضدات الجسمية لكلتا العزلتين لبكتريا السالمونيلا المقتولة بالحرارة وحقن هذه المستضدات في الحيوانات المختبرية ( ارانب ) التي قسمت الى ثلاثة مجاميع حقنت الاولى والثانية منها بمستضدات جسمية مختلفة للعزلتين المختلفتين وباربعة جرع بين حقنة واخرى ثلاثة الى اربعة ايام في حين حقنت المجموعة الثالثة بالمحلول الملحي الفسلجي واستخدمت كمجموعة سيطرة للمقارنة تم بعد الحقنة الرابعة للحيوانات سحب الدم من الحيوانات بطريقة ثقب القلب تم عزل المصول واختبار كفاءتها في الكشف عن البكتريا من خلال فحص التلازن agglutination test لكلا المستضدين مع الاضداد المتمثلة بالمصل وكانت النتيجة موجبة لكلا الفحصين . اما عند مزج المستضد للعزلة الاولى مع الضد العزلة الثانية فقد اظهرت نتيجة موجبة للتلازن لكنها كانت ضعيفة مقارنة مع النتيجة الاولى, في حين عند عمل تفاعل مع بعض انواع من البكتيريا الواقعة ضمن العائلة المعوية فكانت النتيجة غير جديرة بالذكر | The present study was executed on two different isolates of Salmonella (typhi and typhimuruim) which were obtained from Central Health Laboratory in AL - Najaf province during December 2014. The study included three main parts. The first part was to confirm diagnosis of those isolates based on reliable diagnostic procedures. The second part concerned with the study of some virulence factors of Salmonella such as motility, production of protease enzyme and ability to formation of biofilm. The last part included immunological study including preparation of somatic antigen and polyvalent diagnostic antisera for each isolates. The suspected isolates were fully identified by using bacteriological, biochemical, API 20E and Vitek2 techniques. The results of these tests which compared with specific characteristics of Salmonella indicated, it was that the isolates included in this study were Salmonella typhi and Salmonella typhmurium . The results revealed that ability of Salmonella genus typhimurium was able to utilize citrate, produce high amount of H2S in Kliglar iron agar and ferment Arabinose sugar, while Salmonella typhi was incapable to citrate utilization and produce little amount of H2S in Kliglar iron agar and has inability to ferment Arabinose sugar. The results revealed that Salmonella produced virulence factors represented by producing protease enzyme and biofilm formation which consider as the main factor in contaminating of food and transmission of disease. The results exhibited a remarkable resistance of Salmonella to Neomycin and Chloramphenicol which was consider the first choice in treatment of Salmonella, but it was sensitive to Ciprofloxacin, Ceftriaxone, Cotrimoxazole, Tetracycline and Naldixic acid, while it exhibited variable sensitive to Ampicillin and Amoxicillin . Polyvalent diagnostic antisera were prepared according to protocol being suggested by Florida State University. Preparation of heat killed somatic antigen for each isolates of Salmonella, then were injected in three groups of laboratory animals (rabbits). The first and second group was injected with different somatic antigen in four successive doses with an interval time of three to four days, while the third group was injected with normal saline which used as control. Blood was collected from animals by intracardiac injection then serum has been separated and tested for its specificity by reaction with Salmonella typhi and Salmonella typhimurium using the agglutination test. The results were highly positive and specific, but when test antigen of first isolate with serum of second isolate will exhibit positive result with weak agglutination, then when cross reaction prepared antisera with live antigens of other some species belong Enterobactrecea the results was no considerable reaction

تغاير العلاقات التطورية وتصويف عوامل الضراوة لعزلات المكورات العنقودية من المرضى في محافظة بابل == Phylogenetic diversity and characterization of virulence factor for Staphylococcus aureus isolated from patients in Babylon province

Author name: نبراس عودة كاظم عيسى
Supervisor name: لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: A total 100 samples, only nineteen isolates of S. aureus were obtained from different samples includes (urine ,vagina, stool, wound, and abscess ) from patients by standard bacteriological methods. All samples were obtained from patients or individuals who admitted to Al - Hillah Surgical Teaching Hospital and Merjan Medical City in Babylon Governorate during a period extending from (July 2017 to September 2017). Then the specimens cultured in selective media and identified by using biochemical and bacteriological tests and using specific primer(sau).Only (19)isolate of Staphylococcus aureus isolates were recovered.Some virulence factors of all S. aureus isolates were studied as sea gene , PCR was performed using specific primer on genomic DNA from S .aureus isolate . PCR amplification of sea gene indicated that two from vagina isolate 2 : 4(50%),three from urine 3 : 3(100%) and four from stool 4 : 4(100%) and one isolates from abscess 1 : 4(25%) and one isolates from wound1 : 4(25%) .Specific PCR primer was used for the detection of( tsst) gene.It was found that tsst gene was observed in 16 isolates which include urine, pus ,wound,and stool in percentage 100%.Specific primer was used for detection of eta gene .It was found that eta was observed in three from urine 3 : 3(100%), four from vagina 4 : 4(100%) and three from abscess 3 : 4(75%) and four from wound4 : 4(100%) and four from stool 4 : 4(100%).cna gene was also detected in S.aureus by using specific PCR primer .It was found that can gene was observed in two from urine 2 : 3(66.6), one from vaginaII1 : 4(25%), three from wound 3 : 4(75%) and three from abscess 3 : 4(75%) and two from stool 2 : 4(50%) .Also, ica gene was detected in S.aureus isolates by using specific primer , it was found that gene present in 2(66.6%) isolate from urine sample and 1(25%) isolate from abscess sample.However, molecular detection of pvl gene was done using specific PCR primer. It was found that pvl was observed in bacterial isolates in only 2(50%) isolate from abscess sample and 1(25%) from wound sample.Clumping factor A (clfA) gene was investigated by PCR technique using specific primer for his gene. It was found that clfA gene was observed in three from urine sample 3(100%) and one from vagina 1(25%) and four from abscess 4(100%) and four from wound 4(100%) and three from stool 3(75%).S. aureus isolates were subjected to show its ability to produce staphylokinase enzyme .It was that only 2 from 4 (50%) isolates from wound extracylallary were able to produce staphylokinase enzyme by creating clear zones around wells containing their cultures in the skim milk agar plate.Hyaluronidase activity was also investigated it was found that( 89%) of S. aureus isolates give positive result for hyaluronidase by turbidity reduction assay in the determination of hyaluronidase.The relationship between 19 S. aureus isolates using RAPD - PCR was performed. Ten primer showed polymorphism among the isolates test generatingIII88 bands, 58 of which were polymorphic with sizes ranging between 100 to 3000 bp. The mean percentage of ten primer 61.36% .The Dendogram two main cluster, the first include one isolate (st9 abscess) and the second include 18 isolates, However , the second cluster divide the 18 isolate into two subcluster. Using the ten primer isolate 11 reveled highest similarity with isolate 1 (69%) and the isolate 17 and 18 have similarity (69%) followed by isolates 7 and 16 with similarty (61%) .However , isolate 14 and 9 showed the lowest similarity (10%). All the remaining pairs showed intermediate similarity percentage with highest and lowest percentage .PCR amplification of Agr group gene from 19 isolates product different types based on size range from (323 - 659 ) bp were recognized as follows Agr I (441bP) ,Agr II(575 bp),Agr III(323 bP),Agr IV (659 bp),and. The frequencies of agr Groups III 17(89.1%) and Agr Groups I 15(78.7%) were more than those seen in other Groups flowed by agr IV 7(36.7%), while agr Group II 2(10.4%) was the least obtained in all the five isolates .DNA sequencing of cna gene from isolates of S. aureus revealed 188 mutation in four isolates and give identity in percentage (76 - 89%) with standard strand S. aureus in NCBI website ,this gene sequencing is the first described in Iraq.

تواتر الانماط المصلية من بكتريا القولون وطفيلي الحال النسيجي بين مرضى الاسهال في محافظة بابل == Frequency of Escherichia coli serotypes and Entamoeba histolytica among Patients with Diarrhea in Babylon province

Author name: محمد صباح عطيوي الزبيدي
Supervisor name: جواد كاظم الخفاجي | هادي فاضل اليساري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تعتبر Escherichia coli وEntamoeba histolytica من اكثر مسببات الامراض الشائعة التي تسبب الامراض المعوية والامعائية في جميع انحاء العالم.تم جمع 150 عينة براز من المرضى الذين يعانون من الاسهال الكبير خلال الفترة من اكتوبر 2017 حتى نهاية ديسمبر 2017 من ثلاثة مستشفيات رئيسية في مدينة الحلة ، وقد تم تشخيص 46 عزلة على انها E.coli والكشف عن 28 عينة على انها E.histolytica.شملت عزلة ال E.coli ما ياتي 29 من الذكور و17 من الاناث ، في حين شملت E.histolytica 19 من الذكور و9 من الاناث.تتراوح الفئة العمرية الاكثر شيوعا لانتشار العدوى في كل من E.histolytica وE.coli (1 - 10) سنوات . وهذا يمكن ان يكون وفقا لحقيقة ان الاطفال يلعبون على التربة مع نظافة ضئيلة او معدومة ضمن هذه الفئة العمرية او بسبب انخفاض المناعة خلال هذه الفئات العمرية.ظهر من عزلات E.coli ان اكثر انواع الاسهال شيوعا هو 14 اسهالا مائيا في حين كان في عينات E.histolytica الاسهال الدموي هو الاكثر شيوعا حيث بلغ 18 اسهالا دمويا.كان عامل الاقامة الاكثر شيوعا في كل من E.coli وE.histolytica في المناطق الريفية حيث كان حوالي 32 في E.coli و18 في E.histolytica. ويرجع ذلك الى العديد من العوامل مثل وجود الحيوانات الاليفة كمضيفين والتي تساعد على توزيع الاصابات المايكروبية ، غياب معظم المبادئ الصحية العامة ، غياب اجراءات الصرف الصحي ، تقديم الطعام والماء الملوثين .وقد درست بعض عوامل الضراوة في بكتريا القولون التي اختبرت في الدراسة الحالية لانتاج كبسولات كانت النتائج الايجابية 37 ، وكان مستضد عامل الاستعمار 18 ، وكان انتاج الهيموليزين صفرا ، وكان انتاج البكتريوسين 46.ان اكثر الانماط المصلية المنتشرة لبكتريا E.coli هو ETEC وقد كان 16 عزلة. تم اختبار تاثير بعض المضادات الحيوية على E.coli واظهرت النتائج التي تم الحصول عليها ان اعلى ارتفاع معدل مقاومة كان 43 الى ampicillin و42 الى Ceftriaxone في حين ان اعلى ارتفاع معدل انتشار الحساسية كان 43 الى Meropenem و34 الى amoxiclave.تم اختبار انتاج ESBL بواسطة E.coli في هذه الدراسة عن طريق الفحص والاختبار التاكيدي الذي كان 10 عزلات لديهم القدرة على انتاج ESBL باستخدام اختبار الفحص العادي في حين ظهرت 20 عزلة بواسطة الاختبار تاكيدي.كما تم الكشف التاكيدي ل E.histolytica بواسطة ELISA في 28 عينة التي تم الحصول عليها وجميعها اعطت نتائج موجبة | Escherichia coli and Entamoeba histolytica are among the most common pathogens that causes intestinal and extra - intestinal diseases worldwide .One hundred fifty (150) stool samples were collected from patients suffering from significant diarrhea during the period of October 2017 to the end of December 2017 from three main hospitals in Hilla city, about 46 isolates were identified as Escherichia coli and 28 Entamoeba histolytica were detected in all specimens. From 46 isolates of E.coli were included 29(63.1%) in males and 17(36.9%) in females , while from 28 E.histolytica about 19(67.9%) in males and 9(32.1) in females .The most prevalence of infection by both E.histolytica and E.coli were among age group range (1 - 10) . This could be according to the fact that children are found of playing on the soil with little or no hygiene within this age group or due to low immunity.The most common type of diarrhea in this study were 41(89.2%) watery diarrhea caused by E.coli while the 18(46.2%) bloody diarrhea were the most common in diarrhea cases by E.histolytica.Most cases of diarrhea were commonly in both E.coli and E.histolytica cases in rural that about 32(69.6%) by E.coli and 18(64.2%) by E.histolytica .These are due to many factors such as the presence of domestic animals as hosts which help in parasites distribution ,an absence of most common hygienic principles ,absent of sanitation measures , present of contaminated food and water, and the presence of insects as vectors to these pathogens .Some virulence factors of E.coli which have been tested in the present study were involve capsule production that positive results about 37(80.5%) ,colonization factor antigen were 18(39.1%), hemolysin not produced , and bacteriocin production were about 46(100%) . The high prevalence of E.coli serotypes in this study are with Enterotoxigenic E.Coli that about 16(34.8%) isolates. The enterotoxigenic E.coli pathotype is recognized as one of the main important diarrheagenic E.coli in developing countries.The effect of some antibiotics on E.coli was tested and the results that obtained show that the high prevalence of resistance 43(93.4%) to ampicillin and 42(91.4%) to Ceftriaxone while the high prevalence of sensitivity were 43(93.4%) to meropenem and 34(73.9%) to amoxiclave . The Extended Spectrum β - Lactamase production by E.coli in this study also tested by confirmatory test that was about 20 isolates were having the ability to produce ESBL by using confirmatory test.The confirmatory detection of E.histolytica by using ELISA were also applied in this study were the results give 28(100%) positive for E.histolytica .

دراسة جزيئيه وكيموحيوية لانزيم السلفوترانسفيريز 1A1 للتنبؤ بالاستجابة لعلاج المينوكسيديل لدى مرضى الصلع الوراثي == Molecular and Biochemical Study of Sulfotransferase 1A1 Enzyme Predicting the Response for Minoxidil in Patients with Androgenic Alopecia

Author name: رغد نوري عبد
Supervisor name: مؤيد عمران موسى الغزالي | وسام علي عوض
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: المقدمة : يعتبر مرض الصلع الوراثي من اكثر اسباب تساقط الشعر شيوعا لدى النساء والرجال, حيث ان نسبه المصابين بهذا المرض تصل الى حوالي 70% في بعض المجتمعات . قد يصنف المرض الى صنفين : 1 - تساقط الشعر ذو النمط الرجالي و2 - تساقط الشعر ذو النمط النسائي وذلك لان الصنفان يختلفان من ناحية الاسباب والفيزيولوجيا المرضية ونمط تساقط الشعر. يوجد سببان رئيسيان لمرض الصلع الوراثي وهما اسباب هرمونية واسباب وراثية, حيث ان الدراسات اثبتت ان الاشخاص المؤهلين وراثيا ممكن ان يظهروا حساسيه اكثر تجاه العوامل الخارجية مثل الهرمونات المؤثرة على بصيلات الشعر, مما يؤدي الى اضمحلالها وتساقطها مع الوقت. ان زيادة مستويات هرمونات الاندروجين في الدم تؤدي الى نقصان في طول فتره طور النمو في بصيلة الشعر وزيادة في طول فترة طور الاضمحلال في بصيلة الشعر. ان العلاجان الوحيدان المسموح باستعمالهما لعلاج الصلع الوراثي من قبل منظمة الغذاء والدواء الدولية هما المينوكسديل والفيناستيرايد . ان المينوكسديل يعمل على توسيع الاوعية الدموية المحيطة ببصيلة الشعر مما يزيد من تغذية ونمو الشعر. يبقى علاج المينوكسديل غير فعال لغاية اضافة مجموعة سلفونيت اليه في داخل بصيلة الشعر بواسطة انزيم السلفوترانسفيريز وقد تؤثر فعالية هذا الانزيم على فعالية العلاج, وقد وجد تغاير وراثي لنيوكليوتيده واحده (SNP) في جين انزيم السلفوترانسفيريز في الموقع 638 ذات الرقم rs9282861 , حيث تتحول فيه ال G الى A ويتغير الحامض الاميني من الارجنين الى الهستدين , ان هذا الاختلاف يؤدي الى انخفاض في مستوى فعالية الانزيم وبالتالي الى يؤدي الى انخفاض في فعالية علاج المينوكسديل. اما الفيناستيرايد فيعمل كمثبط لانزيم ال 5 - α ريديكتيز وبذلك يقلل من تحويل هرمون التستوستيرون الى هرمون الدايهايدرو تستوستيرون المسؤول عن تثبيط بصيلة الشعر.هدف الدراسه : الهدف من هذه الدراسة هو : 1 - ايجاد فحص مختبري يمكن ان يتنبا بفعالية دواء المينوكسديل قبل الشروع بالعلاج وذلك من خلال وجود تغاير وراثي في جين السلفوترانسفيريز 1A1 وهذا من شانه توفير الوقت وكلفة العلاج لمريض الصلع الوراثي.2 - ايجاد الاجابة عن سؤال فيما اذا كان الفيناستيرايد يدعم فعالية المينوكسديل من خلال تخفيض مستوى هرمون الدايهايدروتيستوستيرون مما يؤدي الى ارتفاع في مستوى انزيم السلفوترانسفيريز 1A1 في بصيلة الشعر. المرضى المشاركون وطرق العمل تم تشخيص 67 مريضا بالصلع الوراثي (30 رجل و37 امراه), تتراوح اعمارهم بين 18 سنه و49 سنة بمعدل اعمار يبلغ ..... وقد تم استبعاد اي مريض يتناول علاج من اي نوع والاشخاص المصابين باضطرابات الغدة الدرقية والمرضى المصابين بفقر الدم. من كل مريض تم الحصول على نوعين من العينات : 1 - تم نزع شعرتين كاملتين مع بصيلتهما وحفضها في انبوب ابندروف صغير وتجميدها في درجة حراره - 20م لحين اجراء فحص انزيم السلفوترانسفيريز 1A1 بواسطة تقنية ال ELISA.2 - سحب عينة دم وحفظ قسم منها في انبوب مختبري يحوي على مادة ال EDTA وهذه العينه استخدمت لاستخلاص ال DNA من خلايا الدم البيض لغرض اجراء الفحص الجيني. اما القسم الثاني من عينة الدم فقد تم استخلاص السيرم منها مباشرة بعد الجمع وحفظه في درجة حرارة - 20م لحين اجراء فحص هرمون الدايهايدروتستوستيرون بواسطة تقنية ال ELISA.النتائج لقد اوجدت هذه الدراسه وجود علاقه تناسب طردي ملحوظه بين مستوى تركيز انزيم السلفوترانسفيريز 1A1 في بصيلة شعر الراس وبين مستوى الاستجابة لدواء المينوكسديل, وبذلك يمكن الاستفاده من هذه العلاقه في التنبؤ فيما اذا كان مريض الصلع الوراثي سوف يستجيب لعلاج المينوكسديل او لا من خلال اجراء هذا الفحص قبل الشروع بالعلاج. وقد اوجدت هذه الدراسه ايضا وجود علاقه عكسيه بين تركيز انزيم السلفوترانسفيريز 1A1 في بصيلة شعر الراس وبين مستوى هرمون الدايهايدروتستوستيرون في بلازما الدم, حيث انه كلما ازداد مستوى الهرمون في الدم ادى ذلك الى انخفاض في مستوى تركيز الانزيم في بصيلة الشعر مما يؤدي الى عدم تفعيل علاج المينوكسديل وايضا الى انخفاض في مستوى الاستجابه لهذا العلاج. وبما ان هرمون الدايهايدرو تستوستيرون ممكن كبحه بواسطة علاج الفيناستيرايد مما قد يدل على ان علاج الفيناستيرايد قد يكون من المحفزات لعلاج المينوكسديل. تمت دراسة جين السلفوترانسفيريز 1A1 وذلك لاظهار مدى تاثير وجود التغاير الوراثي الذي يحمل الرقم rs9282861 على مدى الاستجابة لعلاج المينوكسديل, وقد اظهرت النتائج وجود علاقة عكسيه بينهما, حيث ان الدراسه اكدت ان الاليل من نوع G هو المسؤول عن الاستجابة للعلاج. فيما الاشخاص الذين يحملون النوع الوراثي GG هم اكثر الاشخاص استفادة من العلاج بنسبة 68.8% وقيمة P بمقدار 0.0011. وهذه النتيجه قد تكون دلاله على وجود علاقة حقيقيه يمكن الاستدلال والتنبؤ على الاشخاص المحتمل استفادتهم من علاج المينوكسديل قبل الشروع باستعماله. | Background : Androgenic Alopecia (AGA) ( also called androgenetic alopecia), is the most common type of hair loss in both sexes, affecting high percentage of population worldwide. It is also called male and female pattern hair loss as it differs in the pattern of hair loss, pathophysiology and etiology between the two sexes. There are two main reasons for AGA disposition : genetic factors and hormonal factors, as the hair follicle will respond differently to an external stimuli like hormones according to genetic variations leading to different hair characteristics. Increasing levels of androgen will affect the hair growth rate by decreasing the anagen phase length. Minoxidil and Finasteride are the only two medicines approved by the Food and Drug Adminstration to treat AA. Minoxidil is a prodrug that requires to be sulfonated by sulfotransferase 1A1 enzyme to be active, and that is why the activity of sulfotransferase1A1 enzyme is found to affect the activity of Minoxidil. One important SNP found in the sulfotransferase 1A1 gene, is located in the position 638 and numbered as rs9282861,where the G is changed to A resulting in changing the amino acid arginine to histidine and that SNP can affect the enzyme activity and then Minoxidil activity. Finasteride is a 5 - α reductase inhibitor and can reduce the transformation of testosterone to dihydrotestosterone which is responsible for the miniaturization of the hair follicle. Objective of the study : This study aims to find : 1 - A genetic test that can predict Minoxidil response before the start of the treatment and that will save time and coast for the androgenic alopecia patients.2 - If Finasteride potentiates the action of Minoxidil, through the effect of DHT on the SULT1A1 gene expression. Patients and Methods : Sixty seven subjects (30 males, 37 females) are diagnosed as androgenic alopecia patients. Subjects who suffered from any chronic diseases, subjects who were taking any medication were excluded from this study. Plucked hairs were collected from the area of the vertex where the hair is thinning, and concentration of SULT1A1 enzyme was detected inside the hair follicle using ELISA technique. Serum dihydrotestosterone hormone was also detected using ELISA technique. DNA was isolated frome white blood cells and the 638 G /A SNP in the SULT1A1 gene was detected by polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism technique.Results : present study finds a significant correlation between the level of SULT1A1 enzyme concentration and the response to Minoxidil, and that may help in predicting the response to Minoxidil. A significant correlation between the concentration of SULT1A1 enzyme in the scalp hair follicle and the serum dihydrotestosterone hormone level , also has been detected in the females group while no relation found in the males group and that may raise the question if Finasteride will potentiate the action of Minoxidil? Conclusions : Detection the GG genotype in 68.8% of the Minoxidil responders, comparing to only 31.2%of them are of GA genotype, is strongly suggests that the GG genotype is responsible for the response to Minoxidil.

التوصيف الجزيئي لبعض محددات الضراوة لبكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من عينات سريرية مختلفة في محافظة بابل == Molecular Characterization of Some Virulence Determinants of Klebsiella pneumoniae Isolated From Different Clinical Samples in Babylon

Author name: مسار عامر مرزة العماري
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | ايفاد كريم عبد الشبلي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: A total of 200 samples were collected from different sources of patients that including (sputum , tonsil, sinuses, vagina, urine) and from both sexes during a period from September 2016 to December 2016. Only twenty isolates (10%) were identified as Klebsiella pneumoniae positive according to the cultural characteristics and biochemical tests. Eight (40%) isolates from sputum, 5(25%) isolates from urine, 3(15%) isolates from tonsil, 2(10%) isolates from sinus, and also 2(10%) isolates from vagina. K. pneumoniae in males formed 12 isolates(60%) and 8 isolates(40%) in the females .The age - groups of patients who involved in the study was ranged from one year to thirty years old. The results showed that the mean age of patients was 14.9 years with standard deviation of 10.96. All isolates (100%) were able to produce capsule, siderophore, colonization factor antigen(CFA I/CFAIII) and urease, but none of these isolates were able to produce hemolysin. They have ability to form biofilm and have a strong role in stone formation. Regarding antibiotic susceptibility testing all Klebsiella pneumoniae isolates were resistant to Aztreonam, Ampicillin, Amoxicillin/ clavulanic acid) and penicillin G, whereas sensitive to Gentamycin, Ceftriaxone, and Amikacin. The molecular detection of some virulence genes ( magA gene, kfu gene, and uge gene) was done by PCR technique. And all isolates (100%)were negative mag A. Also, PCR technique displayed that 5 isolates 20(25%) were positive for Kfu gene, while only two isolates 20(10%) were positive for Uge gene. As well, the antibiotic resistance genes bla TEM and bla SHV markers were investigated, 18(90%) isolates positive to bla TEM from them(14) isolates carried on plasmid and (4) isolates carried on chromosomal DNA, while bla SHV gene was found in 17(85%) isolates positive from them (14) isolates carries on plasmid and (3) isolates carried onchromosomal DNA. Moreover, RFLP/PCR analysis explored bla TEM and bla SHV genotyping for Klebsiella pneumoniae isolates in the current study illustrating ESBL contribution in the increment of bacterial resistant to antibiotics.

انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات ESKAPE من مرضى الاطفال في محافظة بابل == Antibiotic Resistances Patterns among ESKAPE group Pathogens Isolated from Pediatric Patients in Babylon Governorate

Author name: امل محمد سعيد محمد جواد الموسوي
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | عدنان حنظل الجوذري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة للتحري عن انتشار مجموعة الممرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيويةESKAPE (الاسكيب) لدى مرضى الاطفال في محافظة بابل, العراق تم في بداية الدراسة جمع 191عينات سريرية مختلفة من مرضى الاطفال للفترة من تموز لغاية تشرين الثاني لسنة 2016. تم الحصول على النماذج من مرضى الاطفال بعمر من واحد يوم الى 14 سنة والوافدين لمستشفى التعليمي للولادة والاطفال (بصوره رئيسيه وحدة الخدج المنزلي, وحدة العناية المركزة, الردهات العامة) ومستشفى الحلة التعليمي (بصوره رئيسية وحدة الحروق). شملت النماذج المجموعة خلال الدراسة عينات الدم ,الادرار, سائل النخاع الشوكي, جروح الحروق، وغيرها تم اخذ المعلومات التالية من كل مريض تم ادراجه في الدراسة الحالية : الاسم, العمر, الجنس, العنوان , وزن الجسم, اخذ للقاح او لا, وجود او عدم وجود تشخيص سريري مؤكد, متعاطي للمضادات الحيوية او لا قبل اخذ النموذج من المرضى. بينت نتائج الدراسة انه من مجموع 191 عينة سريرية، ان 45 منها عينة بنسبة (23.5% ) اظهرت نمو بكتيري موجب على الاوساط الزرعية الاعتيادية وبالتالي الحصول على 45 عزله بكتيرية مشخصة بواسطة الاختبارات الكيميائية ,جهاز Vitek2ونظام .API تم الحصول على العزلات البكتيرية من عينات الادرار 16 (35.5%), الحروق15(33.3%), الدم13( (28.8% والسائل القصبي 1(2.2%)، فيما لم تظهر 146 عينه سريريه ( (76.4%نموا موجبا على الاوساط الزرعية وقد يعود السبب في ذلك لاحتمال وجود اصابه فطرية او فايروسية او لوجود بكتيريا شديدة التحسس fastidious bacteria والتي قد تكون فقدت اثناء نقل العينات الى المختبراو بسبب تعاطي المضادات الحيويه فبل اخذ النماذج. وجد انه من مجموع 191 عينة سريرية تم جمعها خلال الدراسة، فانه تم الحصول على 12 عزلة بكتيرية تابعة لمجموعة المرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيوية (الاسكيب) وبنسبة6.3% ،بينما كانت نسبتها26.6% من النمو البكتيري الموجب, حيث تم عزلها من العينات وبواقع 6عزلات من جروح الحروق (50%) ,5 عزلات من الدم (41.6%) وعزلة واحدة من السائل القصبي (8.3%). اظهرت نتائج الدراسة الحالية انه من بين 12 عزلة بكتيرية (6.3%) تابعة لمجموعة الاسكيب فان اعلى نسبة عزل 33.4 %)) كانت لبكتريا S. aureus ، تلتها العزلات البكتيرية التابعة لانواع P. aeruginosa, K. pneumoniae وA. baumannii بينما لم يتم الحصول على عزلات تابعة للنوع البكتيري Enterococcus faeciumفي هذه الدراسة. اظهرت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب باستخدام نظام Vitek 2 - system للعزلات البكترية الموجبة والسالبة لصبغة كرام ان اعلى نسبة مقاومة للمضادات الحيوية كانت لبكتريا P. aeruginosa تليها العزلات التابعة لكل من K. pneumoniae,, S. aureus, E. cloacae وA. baumanniiعلى التوالي. وجد في هذه الدراسة ان 75 % من جميع العزلات السالبة لصبغة كرام ومن ضمنها العزلات التابعة لمجموعة الاسكيب P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A. baumannii كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف ، كما اظهرت النتائج ان جميع العزلات السالبة لصبغه كرام ضمن مجموعة الاسكيب كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز من نوع AmpC. كما بينت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب ان هنالك اختلافات في انماط المقاومة للمضادات الحياتية بين هذه العزلات، حيث وجد ان اعلى نسبة كانت لنمط متعدد المقاومة 10(%83.3) فيما احتل نمط واسع المقاومة نسبة 2 (16.6%), بينما لم يتم الحصول على عزلات ذات نمط كلي المقاومة في هذه الدراسة. وحسب ما تم الاطلاع من المصادر المعتمدة، فان هذه الدراسة تعد الدراسة الاولى في العراق والتي تتضمن التحري عن انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات البكتيرية (الاسكيب) لمرضى الاطفال في العراق. | The present study aimed to investigate the prevalence of ESKAPE pathogens group : Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus. Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp. among pediatric patients in Babylon province, Iraq. Out of 191 different clinical samples were collected from pediatric patients during the a period of July 2016 till November 2016. Samples were obtained from aged from 1day till the age of pediatric patients 14 years old who admitted to Babylon teaching hospital for maternity and children (mainly in nursery neonatal care unit, intensive care unit, general wards) and Hilla teaching hospital (mainly in burn unit). Samples obtained included; blood, urine, cerebrospinal fluid, burns wounds and others (bronchial fluid, abscess) data like name, age, sex, residence, body weight, attending for vaccination program before or after, any clinical documented infection or not, and whether received antibiotics before or after, were taken from patients before sampling.Among 191 clinical samples, 45 (23.5%) gave positive growth on ordinary culture media, yielding 45 bacterial isolates, identified using biochemical tests,Vitek2 - system ID cards, and API system. The bacterial isolates were recovered form urine 16 (35.5%), burn wounds 15 (33.3%), blood 13(28. 8%), and bronchial fluid 1 (2.2%). Among 191 clinical samples, 146 (76.4%) gave no growth. The reason of negative culture may be attributed to fungal infection, viral infection, fastidious bacteria that might be lost during transporting or antibiotics usage before taking samples. Out of the total samples collection 191, ESKAPE pathogens group corresponded 12 isolates (6.3%) were recovered. While (26.6) from positive growth cultures. They were isolated from samples of burn wounds 6 (50%), blood 5(41.6%), and bronchial fluid 1(8.3%). Among 12 isolates of (6.3%) ESKAPE pathogens group from 191 recovered from clinical samples, S. aureus was recovered in high rate (33.4%) followed by P. aeruginosa, K. pneumoniae, and A. baumannii However, no isolate belonged to E. faecium was recovered in this study. Results of antibiotic susceptibility testing of ESKAPE pathogens group using Vitek 2 - system found that P. aeruginosa isolates showed high rate of antibiotic resistance, followed by K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae, and A. baumannii isolates respectively. Different antibiotic susceptibility patterns were recorded among ESKAPE pathoges group isolates. Multi drug resistance (MDR) was found in high rate 10 (83.3%), and extensively drug resistant (XDR) 2(16.6%) , However, no isolates belonged to pan drug resistant (PDR) were recovered in this study. In the present study found that high rate 6/8 (75%) from the all isolates of G - ve bacteria within ESKAPE pathogens group (P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A.baumannii) were ESBL - producers and all isolates were AmpC producer.According to we knowledge, this study is a first record of investigation the prevalence of pattern resistant bacteria among ESKAPE pathogen group in pediatric patients in Iraq

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Bacteroides fragilis المعزولة من النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري == Molecular and Bacteriological Study of Bacteroides fragilis Isolated from Women with Bacterial Vaginosis

Author name: زهراء قيس سلمان
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | بشرى جابر عمران
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة 150 مريضة يعانين من التهاب المهبل البكتيري ، تم جمع ما مجموعه 300 مسحة من عنق الرحم وافرازات مهبلية من هؤلاء المريضات بمعدل مسحتين اثنتين لكل مريضة و150 عينة دم جديدة تم جمعها من المريضات عند مراجعتهن الى مستشفيين في محافظة بابل هما : مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي العام، و150 عينة دم جديدة كمجموعة سيطرة ، خلال الفترة من شباط الى تشرين الاول 2016. باستخام معايير امسلز تم تشخيص النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل البكتيري. وقد خضعت المسحات لطرق مختلفة لتحديد B.fragilis باستخدام الاساليب البكتريولوجية التقليدية. وجد ان 31 عزلة موجبة (20.6٪) باستخدام الاوساط الانتقائية. فضلا عن ذلك، تم تطبيق طرق الكشف الجزيئي باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16 sRNA ، وكانت 44 عزلة (29.33٪) ايجابية وتعود لبكتريا B.fragilis وكذلك استخدم المعلم الوراثي nanH حيث كانت 39 عزلة (88.6٪) ايجابية. بالاضافة الى ذلك، تم فحص العزلات المعزولة على الاوساط الانتقائية الخاصة بالبكتريا للكشف عن قابلية البكتريا للالتصاق (adherence ability) بالخلايا المخاطية. كما تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية (Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate (TCP) test اذ كانت مكونة للاغشية بنسبة (100%). حيث اظهرت العزلات 31 الموجبة المستخرجة من الوسط الانتقائي قدرة البكترياعلى تكوين ال Biofilm وكانت نسبة تكوين البيوفيلم (83.9٪) و(16.1٪) للوضع العالي والمعتدل على التوالي، في حين لم تكن هناك عزلات غير قادرة على تشكيل بيوفيلم. اما فيما يتعلق بتاثير بوفيدون - اليود بنسبة 10٪ على تكوين البيوفيلم، فقد اظهرت نتائج هذه الدراسة ان قدرة البكتريا على تكوينه قد تقلصت لتكون نسبة التشكيل قوي (6.5٪ (ومعتدل (71٪) و(22.6٪) لم يظهر اي تشكيل للبيوفيلم . تم فحص تاثير 10% povidone - iodine المستخدمة في الطب النسائي على انتاج الاغشية الحيوية . وقيمت الدراسة قابلية B.fragilis على انتاج bacteriocin وتاثيرها على بعض العزلات البكتيرية. اظهرت النتائج ان لعزلات البكتريا قدرة تازرية لتثبيط نمو العزلات المدروسة بنسب. فضلا عن ذلك، هدفت هذه الدراسة الى التعرف على علاقة التغايرالجيني(TLR - 4 Polymorphism) باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم (PCR - RFLP) .وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية وكانت نسب انتشارها في مجموعة المرضى CC(36.0%) وThr399Ile : CT(12.0%) ,TT(52%) بينما نسب انتشارها في مجموعة السيطرة كانت TT(34.0%) , CC(60.0%) and CT(6.0%) وقد اظهرت وجود اختلاف وهو اختلافا معنويا, فيما بلغت نسبة انتشار الاليل T في المرضى (58%) بالمقارنة للسيطرة (37%) مع وجود اختلاف معنوي .وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA(46.0%) ,GG(50.0%) and GA(4.0%) في مجموعة المريضات بينما في مجموعة السيطرة كانت نسب الانتشار AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) مع عدم وجود فارق معنوي بينهما , اما نسبة انتشار الاليل G (52%) في مجموعة المريضات بالمقارنة بمجموعة السيطرة (62%) ويعد فارقا معنويا بينهما . تناولت الدراسة تحليل تسلسل جينات معينة من عزلات B.fragilis وكشفت نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin حيث تم تحديدها في 117/117 (100٪ (بمقارنة تسلسلها مع تلك التي في قاعدة البيانات في بنك الجينات وكانت نسبة الثغرات بينهما (0)٪ ، اما بالنسبة للعزلة الثانية فقد تم التعرف على نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin في 116/116 (100٪) وبثغرات 0/116 (0٪)، اما بالنسبة لجين Phospholipaseتم تحديدها في 129/129 (100٪) مع ثغرات 0/1129 (0٪) لكل من العزلتين . اخيرا تم تحليل العلاقات التطورية بين العزلات محلية من B.fragilis والعزلات العالمية من B.fragilis باستخدام تسلسل الجينات لل Enterotoxin وPhospholipaseحيث اظهر تحليل تسلسل الحمض النووي لجين Enterotoxin ان عزلات B.fragilis المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بعزلة B. fragilis المسجلة عالميا (AB026625.1) و(U67735.1) ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور (0.01%) في حين ان نتائج تحليل النشوء والتطور من تسلسل جينات Phospholipase كشفت ان نفس العزلات المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بالعزلة المسجلة عالميا (CP011073.1) ، ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور كانت (0.003 - 0.005%). | This study included 150 women with bacterial vaginosis (BV), a total of 300 swabs (as two high vaginal swabs for each woman and vaginal discharge ) were taken from each woman. In addition to fresh blood samples were collected from the same 150 women with bacterial vaginosis and 150 healthy women as control group , these women admitted to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics , in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Teaching Hospital, and Al - Hillah General Teaching Hospital during the period from February until October 2016. Women suffering from bacterial vaginosis were diagnosed according to Amsels criteria .The high vaginal swabs were subjected to different methods for identification of Bacteroides fragilis by using traditional bacteriological methods . It was found that 31(20.6%) isolates were recovered by using selective media . Furthermore , molecular detection methods was applied by using 16s rRNA gene ,where 44(29.33%) isolates were positive , and using nanH gene where 39(88.6%) isolates were positive out of the 44 isolates , these genetic markers were used for confirmation detection of B.fradilis isolates . In addition , the 31 isolates recovered from selective media were investigated to detect adherence of B.fragilis to mucosal epithelia cells .Also , biofilm formation was tested in semi quantitative microtiter plate test . The result revealed that all isolates were biofilm former , biofilm formation were accounted (83.9%) and (16.1%) for high and moderate mode respectively , while there were no isolates that do not express biofilm formation . Regarding on effect of 10% povidone - iodine on biofilm formation ,the result of this study demonstrated that internal douche effectively reduced the viability of biofilm forming to strong (6.5%) , moderate (71%) and (22.6%) shown no biofilm formation . The study was also evaluated the susceptibility of bacteriocin produced by B.fragilis on some isolates of bacteria . The result revealed that B.fragilis have synergistic ability to inhibition the growth of studied isolates with different ratios . Additionally, this study aimed to investigate the relation of Asp299Gly and Thr399Ile Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in the Toll - like receptor - 4 (TLR - 4) with the incidence of bacterial vaginosis .The result elucidated that at the site of Thr399Ile SNP, there were three genotypes for this SNP among patients ; TT,CC and TC with frequency of (52%) ,(36.0%) and (12.0%) respectively , whereas , the genotype frequency among control group were TT(34%) ,CC(60%) and TC(6.0%) with significance differences between patients and control . However, the frequency of allele T (mutant) was higher among patients (58%) than control (37%) with significant difference. The site of Asp299Gly SNP also showed three genotype among patients with frequency of AA(46.0%), GG(50.0%) and GA(4.0%) , whereas the genotype frequency among control group were AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) with no significant differences between patients and control . Additionally , the frequency of allele G(mutant) was higher among control(62%) than patients (52%) with significant differences between them . The study deal with sequence analysis of specific genes of B.fragilis isolates revealed that the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 117/117(100%) by comparing its sequence with that in the database in gene bank by Blast program with gaps 0/117(0%) and for the second isolate the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 116/116(100%) and with gaps 0/116(0%) , while for phospholipase gene was identified in 129/129(100%) with gaps 0/1129(0%) for first isolates.Finally ,the phylogenetic relationships between two local isolates of Bacteroides fragilis and Bacteroides fragilis global isolates were analyzed using the enterotoxin and phospholipase genes sequence. The DNA sequencing analysis of enterotoxin gene revealed that B. fragilis local number (No.1and No.2) isolates were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (AB026625.1) and (U67735.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis enterotoxin gene were show different out of tree at total genetic change (0.01%) , while the phylogenetic analysis results of phospholipase gene sequences revealed that B. fragilis local isolates ( No.1and No.2) were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (CP011073.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis phospholipase gene showed difference out of tree at total genetic change (0.003 - 0.005 %).

العلاقه بين الجهد التاكسدي والهرمونات الدهنيه للاطفال المصابين بالربو القصبي

Author name: افراح نزار طالب
Supervisor name: مفيد جليل عوض | سهير عيسى القيسي
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: الربو هو اكثر امراض الجهاز التنفسي السفلي المزمنة شيوعا في الطفولة في جميع انحاء العالم. الربو غالبا ما يبدا في وقت مبكر من الحياة ولها دورات متغيرة والنماذج الظاهرية غير المستقرة التي قد تقدم او تحويل مع مرور الوقت. قد ينجم عن الاطفال في سن ما قبل المدرسة عدد من الظروف المختلفة. حوالي نصف ازيز مرحلة ما قبل المدرسة تصبح غير متناظرة في سن المدرسة بغض النظر عن العلاج. ومع ذلك، قد تستمر اعراض الربو، في كثير من الاحيان للحياة، وخاصة في حالات التاتبي واكثر شدة. البدانة عامل خطر لتطور الربو. وقد ثبت جيدا ان السمنة تتميز ايضا بالتهابات نظامية منخفضة الدرجة تقلل من سلسلة من الوسطاء. اديبوكينس، التي تحفز على حالة تنشيط التهابات في اجهزة بعيدة الى الانسجة الدهنية. في لبتين السمنة واديبونيكتين، هما الهرمونات الرئيسية التي تشارك في التوازن الالتهابي والتي هي ذات الصلة المحتملة في الربو. هناك ادلة متزايدة على وجود علاقة ايجابية بين الربو والبدانة لدى الاطفال والبالغين. اديبوكينس تنظيم العديد من وظائف التمثيل الغذائي والالتهابات. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان انواع الاكسجين التفاعلية(ROS) تلعب دوررائيسيا في بدء وكذلك تضخيم الالتهابات في الشعب الهوائية الربو. انتاج روس الزائد في الربو يؤدي الى تغيير في مضادات الاكسدة الانزيمية الغير انزيمية الرئيسية مثل الكاتالاز، الجلوتاثيون ومضادات الاكسدة الكلية. هذه الدراسة هي لتسليط الضوء على اختلال اكسدة ومضادات الاكسدة فيما يتعلق بمستوى اديبونيكتين في الاطفال المصابين بالربو. اديبونيكتين، اللبتين، الكاتالاز، الجلوتاثيون، ومضادات الاكسدة الكلية ومالونديالدهيد تم قياسها في 100 طفل. تم تسجيل 60 مريضا حديثا بالربو و40 طفلا غير مصابين بالربو مع العمر والجنس المقارنين في هذه الدراسة. الاطفال الربو تنقسم الى مجموعتين 30 مريضا في كل مجموعة (البدناء وغيرالبدناء ). تراوحت اعمار المرضى والسيطرة بين (2 سنة - 12 سنة). اديبونيكتين، اللبتين ومضادات الاكسدة الكلية التي تم تقديرها من قبل تقنية الانزيم المناعي اليزا ، الجلوتاثيون بواسطة هبلك، الكاتالاز ومالونديالدهيد بواسطة الطيف. اظهرت نتائج الدراسة الحالية زيادة في الليبتين وخفض مستويات الاديبونيكتين في المجموعة البدناء مما هو عليه في المجموعة التي لاتعاني السمنة لدى مرضى الربو والسيطرة بفارق معنوي (P <0.04) و(P <0.03) على التوالي. بالاضافة الى هذه الزيادة في مالونديالدهيد وانخفاض الكاتالاز، ومضادات الاكسدة الكلية ومستويات الجلوتاثيون، مع وجود فرق كبير 0.01)>p). لوحظ وجود ارتباط معنوي ايجابي بين اللبتين ومؤشر كتلة الجسم، ارتباط معنوي ايجابي بين الجلوتاثيون ومؤشر كتلة الجسم، ارتباط معنوي سلبي بين الاديبونيكتين مع الجلوتاثيون وارتباط معنوي ايجابي بين اجمالي مضادات الاكسدة والمالونديالدهيد. ونتائج الدراسة اعلاه كشفت عن وجود اختلال اكسدة ومضادات الاكسدة بين الاطفال المصابين بالربو يعانون من السمنة المفرطة، بالمقارنة مع التغيرات في مستوى اديبوكينس. بين الاطفال المصابين بالربو الذين يعانون من السمنة المفرطة وزيادة مستويات اللبتين والاديبونيكتين على التوالي حيث تشير الى ارتباط كبير بين اديبوكينس والسمنة في الاطفال الذين يعانون من الربو. زيادة القوى المؤكسدة وتقليل القدرة المضادة للاكسدة، معا نتائج تدعم بقوة ان الاكسدة هو زيادة في الاطفال الذين يعانون من الربو ويمكن ان تلعب دورا في التسبب في الربو. | Asthma is the most common chronic lower respiratory disease in childhood throughout the world. Asthma most often starts early in life and has variable courses and unstable phenotypes which may progress or remit over time. Wheeze in preschool age children may result from a number of different these conditions; around half of preschool wheeze become asymptomatic by school age irrespective of treatment. However, asthma symptoms may persist, often for life, especially in atopic and more severe cases. Obesity is a risk factor for the development of asthma. It has been well established that obesity is also characterized by low - grade systemic inflammation that reduces a series of mediators. Adipokines, which induce an inflammatory activated state in organs distant to adipose tissue. In obesity leptin and adiponectin, are the two main hormones involved in inflammatory balance and which are potentially relevant in asthma. There is an increasing evidence of a positive correlation between asthma and obesity in children and adults. Adipokines regulate several metabolic and inflammatory functions. Several studies have shown that reactive oxygen species (ROS) play a key role in initiation as well as amplification of inflammation in asthmatic airways. Excessive ROS production in asthma leads to alteration in key enzymatic as well as nonenzymatic antioxidants such as catalase, glutathione and total antioxidant . The aim of this study to assess of the leptin and adiponectin in sera of control and asthma groups and to study the correlation between adipokines (leptin and adponectin) and oxidative stress in asthmatic children. Adiponectin , leptin, catalase, glutathione , total antioxidant and malondialdehyde were measured in 100 children; 60 newly diagnosed with asthma and 40 non asthmatic children with the comparable age and sex were enrolled in this study . Asthmatics children subdivided in two groups 30 patients in each group( obese and nonobese). Ages of patients and control ranged between (2years - 12 years). Adiponectin , leptin and total antioxidant were estimated by enzyme - linked immunoassay ELISA technique, glutathione by HPLC, catalase and malondialdeheyde (MDA) by spectrophotometer. Results in present study are shown an increase in leptin and decrease adiponectin levels in the obese group than in non - obese group in asthmatic patients and control with significant difference (P<0.04) and (P<0.03) respectively. In addition to that increase in malondialdehyde and decrease catalase, total antioxidant and glutathione levels in asthmatic children than control, with significant (p<0.01) difference. There were significant (P>0.004) positive correlation observed between leptin and BMI , significant (P>0.03) positive correlation between glutathione and BMI, while significant (p<0.032) negative correlation between adiponectin with glutathione and significant (p<0.04) positive correlation between total antioxidant and malondialdehyde. The Present study concludes that Among obese asthmatics children there is an increase and decrease levels of leptin and adiponectin respectively that indicate the significant association between adipokines and obesity in those asthmatic children. Increase of oxidant forces and decrease antioxidant capacity, together results strongly support that oxidative stress is increased in asthmatic children and may play a role in the pathogenesis of asthma. The existence of an oxidant - antioxidant imbalance among obese asthmatics children, in parallel to changes in adepokines level

الكشف الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه - النوع الاول والتعبير البروتيني ل P27, CDK6,CDK4 وBcl - 2 في سرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن == Molecular Detection of Human T Lymphotropic Virus Type - 1 (HTLV - 1) and Expressional Proteins of CDK4, CDK6, P27 and Bcl - 2 in Hodgkin?s and Non - Hodgkin?s Lymphomas

Author name: نور سامي عبود الليباوي
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | شاكر حماد محمد العلواني
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة على انها دراسة بحثية ذات اثر رجعي ,وسيطره . اذ اشتملت على120خزعة نسجية من منطقة الغدد اللمفاوية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين.جمعت هذه النماذج من ارشيفات الانسجة المرضية لمختبرات مستشفى الحلة التعليمي/ محافظة بابل , مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة كربلاء ,مستشفى الصدر التعليمي/ محافظة النجف ,مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة المثنى ومستشفى القادسية التعليمي/ محافظة القادسية وكذلك العديد من مختبرات الانسجة المرضية الخاصة الموجودة في بابل ,بغداد, كربلاء, القادسيه, المثنى اذ جمعت هذه العينات للفترة من اذار 2016 الى كانون الاول 2016. هذه النماذج تعود للمرضى المصابين بسرطان العقد اللمفاوية للسنوات من 2011 لغاية 2016 .قسمت هذه العينات حسب المجموعات التالية : - 1 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع هودجكن .2 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع اللاهودجكن .3 - اربعون قطعة نسجية لعقد لمفاوية (لايظهر عليها اي تغيرات مرضية نسيجية) ظاهريا سليمة استعملت كمجموعة سيطرة .بعد التقطيع النسيجي لخزع العقد اللمفاوبة وتصبيغها باستخدام صبغتي الايوسين والهيماتوكسلين تم اجراء الفحص التاكيدي الدقيق لغرض التشخيص النهائي من قبل اخصائي الامراض النسيجية لهذه الدراسة. تم تصميم الجانب العملي لهذه الدراسة الذي اتخذ مسارين رئيسين : - 1. التحديد الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بفحصها داخل خلايا الانسجة اللمفاوية حيث تم انجازه بوساطة استخدام تقنية التهجين الموضعي ذات الحساسية العالية .2. اجراء دراسة كيميائية - نسيجية مناعية لوصف الحالة التعبيرية ل CDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27) وفحص الجينات السرطانية للخلايا اللمفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن واللاهودجكن والعقد اللمفاوية السليمة ظاهريا (غير مصابة).ان مجمل النتائج التي تم الحصول عليها هذه الدراسة كانت كما يلي : 1 - نسبة الذكور( (57.5% المصابين بسرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن ومجموعة السيطرة كانت اعلى من نسبة الاناث (42.5%) في هذه المجاميع الثلاثة. حيث كانت نسبة الذكور/اناث هي1 : 1.35.2 - اظهر الفحص النسيجي ان النسبة العليا من مرضى الهودجكن كان من الدرجة المنخفضة (42.5%) يتبعها الدرجة المتوسطة (35%) وادنى نسبة هي الدرجة العليا (22.5%). بينما النسبة العليا من مرضى اللاهودجكن كانت من الدرجة المنخفضة والمتوسطة %37.5)) وادنى نسبة هي الدرجة العليا ( 25%).ا - نتائج الفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت ( 22.5%) 2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK4 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 57.5 % من الانسجة كانت موجبة . 5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ Bcl - 2ان47.5 % من الانسجة كانت موجبة .6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفيروس وCDK4 .7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للCDK4 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال CDK6 وBcl - 2.8 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة ل p27 وعمر المرضى. كذلك علاقة طردية بين p27 وBcl - 2.ب‌ - نتائج للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائية من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة باللاهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت (45%) بينما لم تظهر اي حالة موجبة بتفاعل التهجين الموضعي للفايروس ضمن مجموعة السيطرة .2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 42.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة للp27 بواسطة الاختبارالكيميائي النسجي المناعي ضمن مجموعة السيطرة.3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـCDK4 ان 50% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة . بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي ل Bcl - 2 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السطرة.6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد الفيروس وBcl - 2 وكذلك وجدت علاقة قوية طردية تربط بين الانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفايروس وCDK6.7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للBcl - 2 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال p27 وBcl - 2 فقط .كذلك وجدت علاقة عكسية بين عمر المريض وBcl - 2 .8 - تم تمييز علاقة طردية تربط بين كثافة CDK4 وp27 وكذلك بين CDK4 وBcl - 2

دراسة بكتيرية ووراثية لبكتريا Gardnerella vaginalis وعلاقتها بالولادة المبكرة == Bacteriological and Molecular study of Gardnerella vaginalis association with preterm labor

Author name: ازل علاء عباس الربيعي
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: In this study , one hundred fifty samples were collected from paitents with preterm labor (PTL), who have been attending to Babylon Maternity and pediatric hospital and Al - Hilla Teaching Hospital, at the period from February to October 2016. Two swabs were collected one for culturing and the other for direct extraction for isolation Gardnerella vaginalis.Out of the 150 samples only 6(4%) on culture and 30 (20%) on molecular level isolated from preterm labor caused by Bacterial vaginosis , Urinary tract infection and aborted women. The results isolation and laboratory diagnosis as well as biochemical test approved that there is only 6 isolates belong to G.vaginalis confirmed by using Vitek 2 system and molecular detection by specific primers.Preterm birth is one of the most common causes of neonatal morbidity and mortality. Associated with sub sequent preterm labor in up to 40% of cases as shown in our resultsThe isolates are varied in their ability to produce sidrophore and extracellular protease in addition to their hemolytic activity .Adherence activity were investigated and indicate that G.vaginals have pili on her surface help her to attached and initiated infection Metronidazole was effective in prevent adherence at low concentration (5%) was 100% percentage.All isolates are able to produce biofilm in different level which provided as main step in pathogenesis caused it can evade and evoke the action of immune response and antibiotics , Alum , sodium chloride and sodium bicarbonate were shown very high effectively to eradicationSummaryIIG.vaginalis biofilm which gave results (0%) whereas the thymol extract (carvacrol) were moderate in action gave (50%) effect on Biofilm .Results also preveld that increased of pH value give a chance to overgrowth of G.vaginalis .The results indicated that Lactic acid considered as a limiting factors preventing growth of G.vaginalis when its grown with lactic acid , measured by optical Density (OD) the high production level is (1.901) in 2% concentration Whereas the lowest level is (0.32) in 10% concentration.Isolates Have ability to produce wide spectrum Bacteriocin which inhibited growth of both Gram positive and Gram negative bacteria that founded in vagina environment, Staphylococcus saprophyticus were the most bacteria that inhibited .extracted Vaginolysin was have a completed hemolytic activity in different temperatures (37 - 38 - 40 - 42). The results showed that its activity as were increased in high temperature.Recent study were clarified that purified vaginolysin was active in presence of cholesterol in media, gave (1.205) growth rate measured by the optical density at (100%) concentration. vaginolysin is cholesterol - dependent cytolysin (CDCs) toxin.Antimicrobial activity were investigated to the extracted Vaginolysin to evaluation of its activity depending on inhibition zone, the results showed that candida is more affective between the other microorganism gave (1.3)mm.Some virulence factor have been detected in molecular level ( Vly - SI - LuxS - LexA - rec a - Pl - Fur - Omp - Gal - protease ). Which wereSummaryIIIvaried in production may be as a results to the un presence of this gene in bacteria , may be silent gene or due to the amount of bacteria in sample are rare.Three Antibiotics were used at a molecular level (Tet b) were varied between resistance and sensitive to this gene (10) sample are resist,(RdxA) all sample are sensitive to its gene at percentage (100%), whereas (erna)gene were resist in all samples (100%).The results show there was no sequence homology between Mycoplasma spp. and G. vaginalis in the adhesion level this were detected by P30/P32 specific primer .The outcome of RFLPS - PCR is confirmed that G.vaginalis is virulent and have a role in preterm labor by degradation of membranes with the association of variable Silidase and presence of β - Galactosidase .MBL (mannose binding lectin ) levels were have a direct role pregnancy. It is also apparent that MBL plays a role in the defense against vaginal infection. MBL is essential to successful pregnancy in regards to maternal defense against infection, recent study indicate that MBL deficiency related to pregnancy outcome disorderedthis considered the first study of mannose in Iraq .DNA sequencing were done for two main virulence factor Phospholipase gene and Quorum sensing gene which showed some variation , then recorded in NCBI - gene sequencing as first descriped in Iraq.

التاثير المايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية == The Antimicrobial Effect of Silver Nano Particles (AgNPs) Against Pseudomonas aeruginosa Isolated from Clinical Samples

Author name: سارة عقيل حسن التميمي
Supervisor name: هدى هادي الحسناوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة للكشف عن التاثيرالمايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية, تم جمع 100 عينة من مصادر سريرية مختلفة, تضمنت العينات السريرية عينات الحروق , والادرار, والدم, واصابات الاذن, والقشع تم اخذ هذه العينات من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني 2017. زرعت جميع العينات على وسط السترمايد, وسط اكار الدم, وحضنت كل الاطباق هوائيا بدرجة حرارة C°37 لمدة 18ساعة. تم تشخيص بكتريا الزوائف الزنجارية بالاعتماد على الصفات المظهرية والكيموحيوية.كان توزيع العزلات كالاتي : 22(52.4%) من عينات الحروق, 8(19%) من عينات الادرار, 14.3)6%) عينة من المرضى المصابين بالالتهاب الاذن الخارجية, 4(9.5%) من عينات الدم,2(4.7%) من عينات القشع. اظهرت نتائج اختبار الحساسية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط ان جميع العزلات(26) كانت مقاومة لكل من الببراسلين (100%), السيفوتاكسيم (100%),بينما نسبة المقاومة لكل من الاميكاسين (88%), سيفترياكسون (65%), جنتامايسن (62%), بينما وجدت نسبة مقاومة قليلة للسفتازديم (15%), وكل العزلات كانت حساسة (100) لكل من الميروبينيم, اوفلوكساسين, نورفلوكساسين والسبروفلوكساسين. تم في هذه الدراسة ايضا الكشف عن تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) وطريقة صبغة الكونكو الحمراء (CRA) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الطبق الزرعي النسيجي كانت جميع عزلات الزوائف الزنجارية والبالغ عددها (9) منتجة للاغشية الحيوية, (4) من اصل (9) (44%) من عزلات الزوائف الزنجارية انتجت مستعمرات سوداء بواسطة طريقة صبغة الكونكو الحمراء. وكذالك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير جزيئات الفضة النانوية ((AgNPs على تكوين الاغشية الحيوية باستخدام تراكيز مختلفة (µg/ml 2.5, µg/ml 5, 10 µg/ml, 20µg/ml),حيث اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التركيز (20) وبنسبة تثبيط (100%), من جهة اخرى تم اختبار التاثير البكتيري المضاد لجزيئات الفضة النانوية ضد مختلف انواع العزلات البكتيرية باستخدام طريق التخافيف في الوسط الصلب وتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (12.5 µg/ml, 25 µg/ml, 50 µg/ml, (100 µg/ml, 200 µg/ml وكانت العزلات كالتالي : ـ(S. aureus, E. coli, E. cloacae, K. pneumonia, P. aeuroginosa)اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التراكيز(100 µg/ml, 200 µg/ml).ايضا تم تعريض ظاهرة السوارمنك في عزلات الزوائف الزنجارية لتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml ), ووجد ان اعلى نشاط لجزيئات الفضة النانوية ضد ضاهرة السوارمنك وانتاج البايوسيانين كانت بتركيز ((10 µg/ml, 5 µg/ml .تم زراعة جميع عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية (26)عزلة بوجود نترات الفضة (AgNO3) بتراكيز تتراوح (100 µg/ml - 400 µg/ml ) باستخدام طريقة التخافيف في الوسط الصلب مع قدرات مختلفة لانتاج البيوسيانين. اظهرت النتائج ان جميع العزلات 26((100 المنتجة للبايوسيانين كانت مقاومة للسلفر نايتريت (AgNO3) من خلال ظهور نمو في الطبق الحاوي على التراكيز المذكورة نترات الفضة (AgNO3).في هذه الدراسة تم اختبار بكتريا الزوائف الزنجارية لانتاج البكتريوسين باستخدام عزلات بكترية مختلفة تضمنت العزلات (امعائية مذرقية,مكورات العنقودية الذهبية,اشريكية قولونية, كلبسيلة رئوية). كذلك تم العثور على مجموعة واسعة من منطقة تثبيط (24mm - 30mm) في الانواع البكتيرية اعلاه مع قطر (30mm, 28mm, 24mm, 30mm) على التوالي. عزلات (امعائية مذرقية, كلبسيلة رئوية) كانت الاكثر تاثر والتي انتجت قطر تثبيط ((30mm. في هذه الدراسة ايضا تم تقييم علاقة مقاومة الفضة مع انتاج بيوسيانين في بكتريا الزوائف الزنجارية متعددة المقاومة للمضادات الحيوية. في هذه الدراسة تم استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتاكد من وجود بعض الجينات. في هذه التقنية، تم فحص جينات bla - IMP)) التي تشفر الى انزيم ميتالو - β - لاكتاميز المسؤول عن مقاومة ايميبينيم وجينات (silS ,silE) التي تشفر لمقاومة الفضة في عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية بواسطة استخدام برايمرت خاصة. وقد وجد ان جميع العزلات ال 26 (100%) من بكتريا الزوائف الزنجارية كانت سلبية لهذه الجينات. كما تم استخدام اثنين من البرايمرات المحددة للكشف عن فينازين (بيوسيانين) (phzS, phzM). اظهرت النتائج لل (phzM) ان من اصل 26)) عزلة , 21 (80.8%) اعطت نتيجة ايجابية, , فيما يخص (phzS gene) وجد ان 14(% 53.9) عزلة كانت حامله لهذا الجين . والخاتمة ان جزيئات الفضة النانوية (AgNps) تمتلك تاثير ضد الاغشية الحيوية وايضا لها تاثير بكتيري مضاد ضد بكتريا الزوائف الزنجارية وانواع بكتيرية اخرى, والتي من الممكن استخدامها كعلاج بديل. فيما يخص انتاج البايوسيانين ومقاومة الفضة، ظاهريا كان هناك تاثير البايوسيانين على مقاومة الفضة ولم تكن مقاومة الفضة بسبب نقل وجود جينات (silS, silE). | This study was conducted to detect the antimicrobial effect of silver nanoparticles (AgNPs) against Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples, total of 100 specimens were collected from different clinical sites included urine, burns, ear, blood , and sputum. The specimens were taken from patients admitted to Al - Hilla Teaching Hospital during a period extended from November 2016 to January 2017. All specimens were cultured on selective medium (cetrimide agar), blood agar, then incubated at 37°C for 18 hr. The isolated of P. aeurginosa were diagnosed depending on morphological and biochemical characteristics.The distribution of P. aeurginosa isolates was as follows : 22(52.4%) isolates from burns, 8(19%) isolates from urine, 6(14.3%) isolates from patients with otitis externa, 4(9.5%) isolates were isolated from blood and 2(4.7%) isolates from sputum. Antibiotic susceptibility test using disc diffusion test revealed that all isolates (26) were resistant (100%) to Piperacillin, Cefotaxime. While the resistance rate for Amikacin (88%), Ceftriaxone (65%), Gentamicin (62%), but low resistance rate was found to Ceftazidime (15%) and all isolates were sensitive (100%) to Meropenem, Ofloxacin, Norfloxacin and Ciprofloxacin. The biofilm formation in P. aeurginosa isolates was investigated by two methods include, tissue culture plates method (TCP) and congo red agar method (CRA). The results showed that all isolates 9 (100%) were found to be biofilm producer when investigated by TCP assay, and 4 out of 9 (44. %) isolates of P. aeurginosa were producing black colonies when detected by CRA method.The effect of AgNps on biofilm formation was tested by using different concentrations of silver nanoparticles (2.5 μg/ml, 5 μg/ml,10 μg/ml, 20μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of 20 μg/ml, with an inhibition rate of 100%. On the other hand the antibacterial activity of AgNps was tested against different bacterial species isolates (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomnas aeurginosa) using agar dilution method with different concentrations of silver nanoparticles (12.5 μg/ml, 25 μg/ml, 50 μg/ml, 100 μg/ml, 200 μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of (100 μg/ml and 200μg/ml). On the other hand Swarming motility in P. aeruginosa isolates was detected and subjected to different concentrations of (AgNps) (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml), it was found that the highest activity of AgNps against swarming motility and pyocyanin production of P. aeurginosa was at a concentration of (5 µg/ml, and 10μg/ml).The relation of silver resistance with pyocyanin production in P. aeruginosa was assessed. Screening test for silver resistance was performed by agar dilution method, all (26 isolates) of P. aeruginosa were cultivated in the presence of AgNo3 at a concentration (100 µg/ml - 200 µg/ml, 400µg/ml) using agar dilution method with differing capacities for pyocyanin production. All isolates of P. aeurginosa 26(100%) that produce pyocyanin were found to be resistant to AgNo3.In this study P. aeruginosa isolates were tested for bacteriocin activity by the agar well diffusion method using different bacterial isolates : E. coli, K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae. Wide range of inhibition zone (24mm - 30mm) was found against above bacterial species with diameter (28mm, 30mm, 24mm, 30mm), respectively. The most affected bacteria were K. pneumoniae and E. cloacae isolates, which produce inhibition zone (30)mm.PCR technique was used in this study for investigation some genes. In this technique, blaIMP gene that encode Metallo - β - lactamase enzyme responsible for imipenem resistance and (silE and silS) genes that encoding silver resistance were investigated in P. aeuroginosa isolates by using specific primers. It was found that all 26 (100%) isolates of P. aeuroginosa were negative for these genes. Also two specific primers were used to detect phenazine (pyocyanin) modifying genes (phzM, phzS). According to phzM gene, it was found that out of 26 P. aeuroginosa isolates, 21 (80.8%) isolates gave positive results at 330 bp, in regard to phzS gene, it was found out of 26 P. aeurginosa isolates, 14 (53.9%) isolates gave positive result at 664 bp.In conclusion AgNps have an antibiofilm, antibacterial activity against P. aeruginosa and different bacterial species that could be used as an alternative therapy. In regard to pyocyanin production and silver resistance, phenotypically there was effect of pyocyanin pigment on silver resistance and the silver resistance was not due to carriage of silE, silS genes.

التشخيص والتوصيف الجزيئي لبكتريا Clostridium perfringens المعزوله من حالات مرضية سريرية في مدينة الحلة == Molecular Diagnosis and Characterization of Clostridium Perfringens from Clinical Samples in Al - Hilla city

Author name: علياء محمد حمود الشمري
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | ميساء صالح الشكري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة لمعرفة وبائية بكترياC. Perfringens في العينات المؤخوذة في محافظة بابل. تم جمع 140عينة من الجروح العميقة من المرضى الداخلين في مستشفيات مدينة الحلة الرئيسية (مستشفى الحله التعليمي ومدينة مرجان الطبيه) والذين يعانون من مرض السكري المزمن وايضا من مرضى تعرضوا الى طلق ناري فضلا عن المرضى الذين يعانون من التهاب الخلوي اللاهوائي في الجلد(anaerobic cellulitis ) للفترة من شهر شباط ولغاية شهرتشرين الاول 2016. بالاضافه الى ذلك تم تشخيص وعزل بكترياC. perfringens بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية من خلال طرق التنمية على الاوساط الزرعية الاختيارية لهذه البكتريا واظهرت النتائج الحصول على 3 (2.14%)عزلات كان عزل اثنان منها 1.42%)) من مرضى السكري المزمن اما العزله الثالثه (0.72%) فقد تم الحصول عليها من الذين تعرضوا لطلق ناري في حين لم يتم الحصول على عزلات من المرضى الذين يعانون من الالتهاب الخلوي اللاهوائي . وكذلك تم تاكيد التشخيص باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA وجين16S - 23S spacer rRNA حيث اظهرت النتائج, من اصل 140 عزلة فان 7 عزلات تعود لبكتريا C. perfringens. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا واختبار قابليتها على انتاج انزيم (phpspholipase C) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم. كما تم الكشف عن حساسية عزلات البكتريا اللاهوائية تجاه 24 مضادا حيويا. بينت نتائج الدراسة ان جميع العزلات اظهرت حساسية عالية (100%) تجاه كل من penicillins .مثل benzypencillin, ,amoxicillin فضلا عن حساسيتها تجاه  - lactamase inhibitor مثل Ampicillin - sulbactam وحساسيه عالية لكل من metronidazole وaminoglycosidesومن ناحية اخرى، اظهرت جميع العزلات مقاومة عالية لكل من مضادات tetracyclin, Linezolid, levofloxacin, erthromycin بينما اظهرت هذه العزلات تغاير في درجات المقاومة تجاه مضادات pipracillin, Clindamycin, and Impenem.تم استخدام الطرق الوراثية في الكشف عن جينات المقاومة للمضادات الحياتية كجيناتM,Q,W,B) ) tet الخاصة بالكشف عن المقاومة للتتراسايكلين وجينات erm(A,B) للكشف عن المقاومة للكلندامايسين وجين nim للكشف عن المقاومة للمترونيدازول حيث اظهرت النتائج ان الجين tet M كان ذا سيادة عالية بنسبة 71.42 %تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي لتوكسينات البكتريا (alpha,epsilon, iota) للاستدلال على وجود جينات (cpa, etx, iap)، في C. perfringens وبنسبة 100%, 28.4%, 28.4% )) على التوالي.بالاضافة الى ذلك تم استخدام جينات cpa, etx and iap لقياس تعاقب القواعد النيتروجينية للمادة الوراثية للعزلات المدروسة فضلا عن تسجيلها في بنك الجينات العالمي ( ,(Gene Bank,اذ تم خلال هذه الدراسة ولاول مرة في العراق، الحصول على خمسة ارقام انضمام الى بنك الجينات العالمي (5 accession numbers)، حيث تم نشر هذه الارقام في بنك الجينات الامريكي gene bank - NCBI وهذه الارقام هي : جينiap : KY523199, KY523200 اما فيما يخص الجينetx فكانت الارقام هي : KY523201, KY523202 وفيما يخص الجين cpaفكان رقم الانضمام هو : . KY523203تعد هذه الدراسه انها اول دراسه في العراق تضمنت تحليل , دراسه تعاقب القواعد النايتروجينية للمادة الوراثية فضلا عن التسجيل في بنك الجينات العالمي لسموم عزلات محلية من بكتريا C.perfringens معزولة من عينات سريرية. | This cross sectional and hospital - based study aimed to studying the incidenceof Clostridium perfringens in clinical samples in Babylon province. A total of 140 wound swabs were taken from patients admitted to two main hospitals in Hilla city, Iraq (Hilla Teaching Hospital and Medical Marjan City), during the period from February to October 2016. Swabs were collected from diabetic patients, anaerobic cellulitis, and bullet wounds. These wound swab samples were subjected to different methods for identification of C. perfringens according to standard method. It was found that 3 (2.14%) C. perfringens isolates were recovered, of which 2 isolates (1.42%) were obtained from diabetic patients, 1 isolates (0.72 %) from bullet wounds, No isolates are recovered from the other clinical samples (cellulitis). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA, 16S - 23S intergenic spacer rRNA genes as a genetic marker for confirmation of detection of C. perfringens isolates,7 isolates of C. perfringens out of 140 are detected by using PCR with specific primer.The study also focuses on the ability of this bacteria to produce Phospholipase C and it was found that all isolates are positive for this enzyme (100%) . The results of antibiotic susceptibility testing using Vitek 2 system and disc diffusion method (DDT) of C. perfringens isolates (No.= 3) against 24 antibiotics showed that all isolates were highly sensitive to penicillins, (benzylpenicillin, and amoxicillin), all isolates (3/3) were sensitive to  - lactamase inhibitor such as Ampicillin - sulbactum. They were more susceptible to metronidazole and aminoglycosides in (3/3). On the other hand, all isolates were highly resistant to tetracycline, Linezolid ,levofloxacin, and erythromycin However, these isolates expressed different degree of susceptibility towards other antibiotics (Clindamycin, piperacillin and Imipenem). Molecular detection of C. perfringens of antibiotic resistance genes had been investigated and it had been found that tetracycline resistance gene tet M is the most commonly observed (71.42%) among ribosomal protection genes among C. perfringens isolates. While all isolates (7) gave negative results for other tetracycline resistance genes (tet W and Q, tet B, erm(A), erm(B),nim gens).Furthermore, detection of clostridial toxin (alpha, epsilon, iota toxins was applied using specific genes (cpa, etx, iap) and the results showed that the rate of the presence of these genes are : 100%, 28.8% and 28.4% respectively. The following genes : cpa, etx and iap were used for sequencing analysis, registration in gene bank - NCBI. Five accession numbers were obtained from registration of five sequences of these three genes at gene bank - NCBI : iap gene; accession numbers are : KY523199, KY523200etx gene; accession numbers are : KY523201, KY523202cpa gene; accession number is : KY523203. This is the first study in Iraq which employed analysis sequencing and registration in gene bank - NCBI, of clostriaial toxin of local isolates of C. perfringens obtained from clinical samples

تقييم دور بروتين عامل نمو بطانة الاوعية الدموية ونسبة الصوديوم, البوتاسيوم, والكالسيوم الى الكرياتينين في الادرار كفحص تشخيصي لمرضى ما قبل تسمم الحمل == The Role of Vascular Endothelial Growth Factor and Urinary Sodium, Potassium, and Calcium to Creatinine Ratio as Diagnostic Tests in Pre - eclampsia

Author name: غيث كامل جواد
Supervisor name: حيدر هاشم الشلاه | ملال محمد الجبوري
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: Preeclampsia is defined as hypertension associated with proteinuria arising de novo after the 20th week of gestation in a previously normotensive woman and resolving completely by the 6th postpartum week.It is a major cause of morbidity and mortality during pregnancy. There are many ways to diagnose the disease, based on clinical diagnosis and conduct some tests; screening tests measurement of the amount of protein found in the urine sample that had been collected for a period of twenty - four hours. In the present study, the ratio of (Na+, K+, and Ca++) to creatinine in the urine spot sample, in addition to the protein vascular endothelial growth factor in the serum were measured as an attempt to be used as screening or diagnostic tests for patients with pre - eclampsia. This study was carried out at Babylon Teaching Hospital for Gynecology and Pediatrics, in Babylon Province, Hilla City during the period between February 2016 till August 2016. This study included 88 women, 44 were patients diagnosed with preeclampsia in the second and third trimester and the other 44 were healthy pregnant women in the same period of pregnancy taken as a control. Cases with age over 135 year, BMI > 300, previous historyd of pre - eclampsia, family history of pre - eclampsia, multipled pregnancy and hydrops fetalis, pre - existing hypertension or renal disease, pre - existing vascular disease, and antiphospholipid syndrome were excluded. Serum levels of vascular endothelial growth factor were measured by using ELISA technique, while urine were collected to estimate calcium and creatinine by spectrophotometric method. Sodium and potassium by ion selective electrode technique. The ratio of sodium to creatinine, potassium to creatinine, and calcium to creatinine were calculated.Serum vascular endothelial growth factor level was significantly lower in patients with preeclampsia compared to control group (P value < 0.01).The sensitivity of VEGF to detect preeclampsia was (75%) while, it's specificity was (90.9%).Similarly, the urinary Na+/creatinine ratio and Ca++/ creatinine ratio was significantly lower in patients with pre - eclampsia compared to control groups (P value < 0.01). The sensitivity of urinary Na+/Creatinine ratio was (93%) and it's specificity was (70%). While the sensitivity of urinary Ca++/ creatinine ratio was (34%) and specificity was (97%).On the other hand, urinary K+/creatinine ratio was significantly higher in patients with pre - eclampsia compared to control groups (P value < 0.01).The sensitivity of urinary K+/creatinine ratio to detect pre - eclampsia was (77%) while, its specificity was (68%).This study concluded that urinary Na+/creatinine ratio can be used as a screening tests because of excellent sensitivity, however because of excellent specificity of vascular endothelial growth factor and urinary Ca++/creatinine ratio (90.9% and 97% respectively), they are convienent for diagnostic purpose.

علاقة هورمونات الغرلين, اللبتين, غلوكاغون والانسولين بمقاومة الانسولين بمرضى السمنة والناس الغير مصابين بالسمنة == Relationship between Ghrelin, Leptin, Glucagon and Insulin with Insulin Resistance in Obese Patients and Non - Obese Individuals

Author name: دعاء مهدي عمران
Supervisor name: علي حسين البياتي | سعد مرزة الاعرجي
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تعتبرالسمنة وباءا عالميا حيث انها تؤثرفي حوالي اكثر من 2 مليار شخص حول العالم حتى عام2013, ان ارتفاع نسبة انتشار السمنة في كل من البلدان المتقدمة والنامية كانت نتيجة لعدد من الاسباب والتي تتمثل بالبيئة، الوراثة الطبية مثل اضطراب الغدد الصماء، والعلاج مثل العقاقير المضادة للذهان والمنشطات الستيرويدية, ان اغلب الناس البدينين يكونون عرضة للاخطار الكبيرة حيث تعرضهم للمضاعفات كداء السكري وارتفاع ضغط الدم وتصلب الشرايين، ومشاكل المفاصل، وامراض السرطان وخاصة السرطانات المحفزة بالهرمون، بالاضافة الى مشاكل في الجهاز التنفسي وغيرها من المضاعفات الاخرى, ان الهدف من هذه الدراسة هو اظهار تاثير زيادة الوزن على تمثيل تاهورمونات التالية : الغرلين, اللبتين, الانسولين والغلوكاكون في المرضى المصابين بالسمنة مع او بدون مقاومة الانسولين ومقارنتهم بالناس الغير مصابين بالسمنة مع او بدون مقاومة الانسولين, تم اخذ 100 شخصا منهم 50 شخصا مصابين بالسمنة و50 شخصا غير مصابين للفترة بين شهر كانون الثاني 2015 وشهر حزيران 2016 بمعدل اعمار بلغ (34.00±9.43) بالنسبة لمرضى السمنة و(34.50±7.40) بالنسبة للاشخاص الغير مصابين بالسمنة, تم الاعتماد على معامل كتلة الجسم لتفريق المجموعتين وتم سؤال الجميع حول ان كانوا مصابين بامراض معينة او يتناولون ادوية معينة تؤثر في وزنهم, وتم مختبريا اجراء الفحوصات التالية : فحص نسبة السكر في الدم, هورمون الانسولين, هورمون الغلوكاكون, هورمون اللبتين, هورمون الغرلين وتم قياس مقاومة الانسولين حسب المعادلة بين الانسولين والسكرو اظهرت النتائج وجود فرق معنوي بين المجموعتين (p value ≤ 0.05) فيما يخص اختلاف الجنس والتعليم وكذلك اختلافا معنويا (p value ≤ 0.05) فيما يخص الفحوصات المختبرية لنسبة السكر في الدم, نسبة هورمون الانسولين, هورمون اللبتين ومقاومة الانسولين فيما لم تظهر فرقا فيما يخص هورموني الغرلين والكلوكاكون.اعتمد الباحث في تعريب المصطلحات العلمية على : المعجم الطبي الموحد - انكليزي - عربي. رئيس التحرير د. محمود الجليلي - الطبعة الرابعه 2009 م , مطبعة المجمع العلمي العراقي. | Obesity is representing a global epidemic that affecting more than 2 billion peoples around the world on 2013. The obesity prevalence has risen in both developed and developing countries. Many causes have been implicated for developing obesity such as : environmental, hereditary, medical disease like endocrine disorders furthermore, some medication like antipsychotic drugs and steroids. Obese people are at high risk to develop much complication such as diabetes, hypertension, atherosclerosis, joints problems, cancers especially hormone dependent, respiratory problems and others. The aim of this study was to compare the impact of increase in weight on the clinical presentation of Ghrelin, Leptin, Insulin, and Glucagon in obese patients with or without Insulin resistance and compare it to that of non - obese individuals with or without Insulin resistance, one hundred people are included in this study attending Marjan medical city from December 2015 till June 2016, a fifty normal non - obese and fifty obese, the overall mean age of patients and controls were (34.00±9.43) and (34.50±7.40) years old, respectively, they are classified according to body mass index after measuring their weight, height, the mean BMI of case patients was (39.23±6.71 kg/m²) and (23.08±1.19 kg/m²) for the control individuals, a general questionnaire were done for all patients and control for diagnosis excluded disease and any treatment that effect on obesity, the investigations that were done include : fasting blood sugar with hormonal testing is performed by ELISA kits examining Serum Insulin, Glucagon, Leptin and Ghrelin and the results of this study showed a significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between study and control groups concerning education and gender. Regarding investigation there is significantly higher difference in percentage (p value ≤ 0.05) between study and control groups in parameters of fasting blood sugar, HOMA IR, Leptin and Insulin, while no significant difference (p value ˃ 0.05) in percentage between study and control for Ghrelin hormone and Glucagon hormone, so the conclusion of the results of this study support the evidence that obesity associated with Insulin Resistance, high level of Insulin and Leptin hormones and low concentrations of Ghrelin hormone, while it did not found a link with Glucagon hormone

دراسة فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية مع التهاب الاذن الوسطى القيحي في الاطفال == Study of Parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes with suppurative otitis media in children

Author name: ايام محمد صالح علي العامود
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | غانم عبود المولى
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن دور فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية Streptococcus pyogenes في الاطفال الذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي . جمعت 200 عينة (ثلاث مسحات لكل مريض تضمنت مسحة من افرازات الاذن ومسحة من افرازات الانف لدراسة الفيروس ومسحة من افرازات الاذن لدراسة البكتريا و50 عينة دم) من 50 مريض يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل للفترة من شباط (2016) لغاية ايار (2016). والذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى. وتضمنت الدراسة 32 عينة ماخوذه من اشخاص اصحاء كمجموعة سيطرة وتم تقسيمهم الى ست مجاميع عمرية بنفس طريقة تقسيم مجاميع المرضى. شملت الدراسة اربعة اجزاء رئيسية : اولا التشخيص الفيروسي اعتمد على التقنيات المتقدمة (العزل الاولي باستخدام فحص التالق المناعي المباشر لتحديد وتمييز الانواع الثلاثة لفيروس نظير الانفلونزا 1,2, and 3 والتشخيص الجزيئي بواسطة استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي لتحديد وتمييز الانواع الاربعة للفيروس1,2,3, and 4 وتم استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لمشاهدة جزيئة الفيروس . والجزء الثاني فحص البكتريا باستخدام فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 system وتم التحري ايضا عن انزيم الهيمولايسين حيث كانت جميع العزلات منتجه لهذا الانزيم . التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود الجين mga بواسطة تقنية سلسلة تفاعل انزيم البلمرة .الجزء الثالث شمل وجود الفيروس والبكتريا في عينات الاذن للمرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى . الجزء الرابع تضمن دراسة مناعية لمعرفة دور الحركيات الخلوية IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8, and CD56))عند الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم وباستخدام تقنية التالق المناعي المباشر لفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الثلاثة (hPIV 1,2,3) كانت نسبة الاصابة 64% (اي 32 طفلا من اصل من اصل50) وعند استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي ( (RT - PCR وجد ان نسبة الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الاربعة (hPIV_1,2,3 and 4) 44% ( اي 22 من 50) تضمنت الدراسة استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لرؤية جزيئة فيروس نظير الانفلونزا في افرازات الاذن . اظهرت نتائج التشخيص البكتيري ان نسبة الاصابة بالمسبحيات القيحية هي 14%(7 من 50) بعد زرعها على وسط اكار الدم وحضنت لمدة 24 ساعة بدرجة 37 وتم فحصها بواسط المجهر الضوئي بعد تصبيغها بصبغة كرام , تم التشخيص بواسطة استخدام فحص Bacitracin sensitivity وفحص انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم بواسطة فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 systemاظهر التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود mga جين ان جميع العزلات تحتوي على هذا الجين اي نسبة 100% .كما اظهرت الدراسة ان نسبة وجود الفيروس مع البكتريا في في سوائل الاذن بنسبة (16%)( . 4 وكانت نسبة وجود الفيروس (72%) 18وشملت الدراسة ايضا فحص الحركيات الخلوية بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم واظهرت النتائج ارتفاع مستوى السايتوكينات في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء وكان اعلى مستوى لانترليوكين 6 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو) 88.24 )و (100.95) 1Pg/ml على التوالي . في حين كان اعلى مستوى لعامل النخر الورمي نوع الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (99.35 ) و(109.81 ) Pg/ml على التوالي. وكان اعلى تركيز لانترفيرون الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو( 217.16) و(( 197.84 Pg/ml على التوالي . واظهرت النتائج ان تركيز الواسمين المناعيين CD8 وCD56 ان تركيزهما اعلى في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء , اظهرت النتائج ان تركيز CD8 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو ((11.46±1.49 و(14.76±1.73) ng/ml على التوالي . في حين كان تركيز CD65 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (12.82±1.62 )و (10.59±1.19) ng/ml على التوالي | This study aimed to detect the role of of parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes in children suffering from suppurative otitis media. A total of two hundred sample (three swab for each patients include ear swabs , nasopharyngeal secretion for viral study and ear swab for bacterial study and 50blood sample) , were collected from 50 patients suffering from suppurative otitis media attending to AL - Hilla Teaching Hospital in Babylon - Iraq during the period from February 2016 to May 2016. The study includes 35 samples obtained from healthy subject as control group that classified to six group according to age in similar way of patient's with parainfluenza virus infection group years old The study includes four main parts .First one is the viral diagnosis based on relied diagnostic procedure ( Primary detection of parainfluenza virus in ear discharge by direct Immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types, molecular diagnosis by Real - Time PCR technique for the qualitative detection and differentiation of Parainfluenza Virus 1, 2, 3, 4 and diagnosis of parainfluenza virus by transmission electron microscope. The second part includes the bacterial diagnostic based on relied diagnosis procedure (using conventional biochemical reaction and commercial kit (Vitek 2 system). The heamolysis on blood agar was also observed in all isolates. Molecular detection of mga virulence gene for Streptococcus pyogenes was detected using conventional PCR technique. The third part is Co - infection between GAS and HPIV in OM specimens of children with suppurative OM. The fourth part is an immunological study to investigate the role of cytokines (IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8 and CD56) in HPIV infection by ELISA assay . Direct immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types antigen was positive in 64% (32 out of 50) , when we use Real - time reverse transcription PCR(RT - PCR) the percent of children infection with HPIV1, 2, 3, and 4 was 44% (22 out of 50). The study also include the use of transmission electron microscope for visualized the parainfluenza virus particle in ear swab. Streptococcus pyogenes isolates was detected in 14%(7 from 50) the isolate were confirmed after culturing on the blood agar and incubated for 24 hour at 37ºC, then microscopically by Grams̕̕ staining. Identification was done using commercially prepared bacitracin and the type of hemolysis on blood agar by primary biochemical test and confirmatory identification by vitek2 system compact. Molecular Identification of mga gene for Streptococcus pyogene showed that all Streptococcus pyogenes positive result 100%. The occurrence of Bacterial and viral co - infection in middle ear fluids which have been observed in 16% (4 out of 50 cases). HPIV was identified as a single agent in ear swab in 72%(18 out of 50). The study include estimation of some immunological parameter include (IL - 6, TNF - α, IFN - α , CD8 and CD56 ) using ELISA and revealed elevation the concentration of cytokines in sera of otitis media patients in comparison with healthy control groups. The concentration of IL - 6 is higher in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. The high level of IL - 6 Pg/ml in otitis media patients for male and female was (88.24) and (100.91) Pg/ml respectively. Also level of TNF - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (99.3) and (109.8) Pg/ml respectively . The level of IFN - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (217.16 )and (197.84 )Pg/ml respectively. The results also show elevation concentration of CD8 and CD56 in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. For CD8 ng/ml in otitis media patients for male and female was(11.46) and (14.76)ng/ml respectively. The level of CD56 ng/ml in otitis media patients for male and female was (12.82) and (10.59)ng/ml. respectively.

الكشف عن اللولبية البوابية في خزعة المعدة ودراسة مستوى P53 وطفرات مورثة Bax المرتبطة بالقرحة الهضمية == Detection of Helicobacter pylori in Gastric Biopsy and Study the Level of P53 and Bax Gene Mutations Associated With Peptic Ulcer

Author name: اصيل هاشم راضي السعبري
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | مشتاق عبد العظيم وتوت
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اللولبية البوابية هي بكتريا سالبة لصبغة كرام, الذي تصيب غالبية سكان العالم وتسبب امراض مختلفة مثل التهاب المعدة المزمن, القرحة الهضمية وسرطان المعدة. في حين ان غالبية الناس المصابين بالبكتريا اللولبية لا تظهر عليهم اعراض مرضية. ان العوامل الرئيسية التي تحدد تطور الامراض ذات الصلة بالبكتريا اللولبية قد تكون ضراوة البكتريا, وعوامل المضيف الوراثية والبيئية.الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن اللولبية البوابية في انسجة المعدة ودراسة عوامل الضراوة الرئيسية لهذا الممرض والعوامل الوراثية للمضيف في المرضى الذين يعانون من اعراض اصابات المعدة والاثني عشري. وتشمل الطرق الجزيئية ايضا تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) للكشف عن جينات التشخيص والضراوة لبكتريا اللولبية البوابية وتقنية (SSCP) تم القيام بها للكشف عن الطفرات الجينية ل P53 وال Bax جين التي قد تترافق مع عدوى اللولبية البوابية.بلغ العدد الكلي للنماذج (الخزعات) المعوية 180 نموذج. فقط 92 خزعة معدة (51 ٪) اعطى نتيجة ايجابية لللوليبيات البوابية (Helicobacter pylori ) للتشخيص بواسطة التقنية الجزيئية, مع ذلك من بين هذه النتائج الايجابية 60% منها اعطى نتيجة ايجابية للزراع, التي تعتمد على الميزات الكيميائية الحيوية. كما تم اخذ 100 عينة مصل الدم من افراد اصحاء مع عدم وجود تاريخ عدوى بالبكتريا اللولبية كمجموعة سيطرة ونتائج اختبار الاجسام المضادة على اساس (اختبار المصلية) اعطت نتائج سلبية للبكتريا اللولبية.قد تم ملاحظة وجود تكرار عالي للولبية البوابية بالتهاب المعدة المزمن الذي يشكل 88٪ بينما التكرار القليل كان مقداره 3٫3٪ لسرطان المعدة في حين ان 8٫7٪ كان لقرحة الاثنى عشري. وقد كان التكرار العالي لعدوى اللولبية البوابية بين المصابين الذكور اكثر من الاناث, ويعود سبب ذلك لعدة عوامل مثل (متوسط العمر الاجتماعي والاقتصادي ونقص التغذية وسوء النظافة) ويعتبر التدخين احد العوامل الاضافية المرتبطة مع انتشار عدوى (اللولبية البوابية ) بسبب السلوكيات غير الصحية المرافقة للتدخين , والتي قد تشمل نقل البكتيريا من خلال اللعاب بين المدخنين. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان معدل العدوى العالي للمجموعة العمرية (31 - 50) سنة الذي تم تسجيله كان 44٫6٪. علاوة على ذلك فان الكشف عن اللولبية البوابية بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة PCR)) قد اجريت على جميع انواع خزعات المعدة وجين (ure C ) اضافة الى جين (ure A ) اللذان يستخدمان كعلامات للتشخيص التاكيدي للولبية البوابية من خلال استخدام (primers ) خاص لتقنية PCR. وضحت النتائج ان 84٫8٪ و73٫9٪ للولبية البوابية كانت ايجابية لكلا الجينين. للعينات التي اعطت نتائج ايجابية (للتضاعف الجيني amplification ) بواسطة (PCR ), كان 56 عينة ما يمثل (60٪) قد اعطت استجابة لنتائج الزرع. اضافة الى التضاعف بواسطة PCR لعلامات جين (ure C ) وجين (ure A ). اضافة الى ذلك ,المعدل الايجابي للولبية البوابية للخزعات تحت الاختبار كان 51٪ بالاعتماد على الكشف الجزيئي المباشر بواسطة (PCR) باستخدام جين (ure A) وجين (ure C ). علاوة على ذلك, تم فحص جين (cag A) لكل عينات اللولبية البوابية التي تم عزلها. اشارت النتائج الى ان65 عزلة (70٫6٪) كانت ايجابية لتضاعف (PCR ) للجين من نوع cagA) ) حيث ان عزلة 56 (60٫8٪) كانت ايجابية لتضخيم (PCR ) للجين من نوع (cag E ). من بين النتائج الايجابية التي تم عزلها 49 عزلة (53٫3٪) كانت قد اعطت نتائج ايجابية للجين من نوع (cag A ). كذلك وجد تكرار الجين (vac A ) مقداره في الدراسة الحالية 68٫5٪ (63/92). اضافة الى كل اللولبيات البوابية الايجابية لخزعة المعدة 49 (53٫3٪) اظهرت اشارة كاملة للجينات نوع (cagA, cagE وvacA (. بالنسبة للعينات المعدية المتبقية 27 عينة (30٫4٪) التي تحوي سلالات سلبية كانت سلبية للجين (cag E). وقد تم تحديد طفرات جين (p53) في الاكسونات 5 و6و 7 و8 باستخدام طريقة SSCP. ومع ذلك تم استخدام PCR لتضخيم الاكسونات 5 و6 و7 و8 للجين (p53) التي من المعروف انها بقع ساخنة طافرة .تحليل PCR - SSCP يكشف تعديلات في الجين (p53) في عدة اكسونات. حيث ان ستة عشر من التعديلات في الاكسون E5A , سبعة عشر التعديلات في الاكسون E5B6A, وكذلك سبعة عشر التعديلات في الاكسون E7 وتعديل واحد فقط في الاكسون E6B لكن لم يظهرتعديل في الاكسون E8 في الجين (p53). بنفس الاسلوب ان تحليل PCR - SSCP كشف عن تعديلات في جين bax في الاكسونات E1 وE4 وE6. ويظهر ذلك في الاشكال. فيما يخص الاكسون 1 في bax يمكن ملاحظة وجود 6 نماذج فقط تعطي طفرات موضع ايجابية للجين. قد يعزى ذلك الى اللولبية البوابية التي تحفز طفرة bax من خلال قابليتها على انتاج بروتين cag A الذي له القابلية على تغيير التسلسل الجيني والوظيفة. واستنتجنا الى ان التشخيص الجزيئي قدم دليلا توكيديا على وجود اللولبية البوابية في عينات المعدة. ايضا قد تؤثر السلالات الاكثر ضراوة على تحفيز طفرات جينية في جينات ال p53 وال bax. | Helicobacter pylori is a gram - negative bacteria which infects a majority of the world population. It causes various diseases such as chronic gastritis, peptic ulcer and gastric cancer. While majority of the people infected with H. pylori is asymptomatic. The main factors, which determine the development of H. pylori related diseases might be bacterial virulence, host genetic and environmental factors.The aim of this study is detection of H. pylori in gastric tissue and study the main virulence factors of this pathogen and host genetic factors in patients with gasteroduodenal manifestation. Molecular methods include polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis and virulence genes of H. pylori and single strand confirmation polymorphism (SSCP) technique was done to detect the p53 and bax genes mutation may be associated with H. pylori infection. In this study, 180 patient were included, only 92 gastric biopsies (51%) gave positive for the presence of H. pylori diagnosed by direct molecular technique. Among these positive result, 60% gave positive results in cultivation based on biochemical features. In addition, 100 serum samples were taken from healthy individuals, with no history of H. pylori infection as a control group and the results of antibody based test (serological test) were negative for H. pylori.In this study, the high frequencies of H. pylori were observed for chronic gastritis, which constituted 88% while low frequencies were 3.3% for gastric cancer, whereas 8.7% for duodenal ulcer.Also, the highest frequencies of H. pylori infection were found in male patients in comparison to female. On the other hand, the results showed that the high significant infection percentage 44.6%, among age group ranging from 31 - 50 years. Moreover, detection of H. pylori by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique is performed on all gastric biopsy. ure C as well as ure A genes are used as markers for confirmatory diagnosis of H. pylori through using specific primers of PCR technique. The results show that 84.8% and 73.9% of H. pylori are positive for both genes, respectively. Among samples with positive result for PCR amplification, 56 samples (60%) also had positive culture result. Besides, the PCR amplification of ureC and ureA markers. Also, the rate of positive H. pylori in the tested biopsies was 51% depending on direct molecular detection by PCR using the ureA and the ure C genes.In addition, cag A gene is investigated in all H. pylori isolates. The results show that 65 isolates (70.6%) are positive for PCR amplification of cagA gene whereas 56 isolates (60.8%) are positive for PCR amplification of cag E gene. Among of these positive isolates, 49 isolates (53.3%) give positive result for cag A gene. The frequency of the vacA gene found in the present study is 68.5% (63/92).Furthermore, among of all H. pylori positive gastric biopsy, 49 (53.3%) reveal full signals of cagA, cagE, and vacA. The remaining 27 (30.4%) gastric biopsies, harboring cagA - negative strains, are PCR negative for cagE.Mutations of the p53 gene in exons (5,6,7 and 8) are identified by PCR - SSCP method. However, PCR is used to amplify exons 5,6,7 and 8 of p53 gene which are known to be mutational hot spots. PCR - SSCP analysis has detected alterations in the p53 gene in several exons. Where sixteen alterations in exon E5A, nineteen alterations in exon E5B6A, seventeen alterations in exon E7 and only two in exon E6B but no alteration is seen in exon E8 of P53 gene.In the same way, PCR - SSCP analysis detected alterations in Bax gene where only 17% of positive samples gave alteration in the sequence of Bax gene in exons E1, E4 and E6. Regarding exon 1 of Bax gene, it was seen that only 6 samples gave positive gene locus mutation. It conclude that the molecular diagnosis gave an evidence and confirmatory guide on the existence of H. pylori in gastric samples. Also the more virulent strain may be affected on the stimulation of p53 and bax genes mutation.

دراسة بكتريولوجية وجزيئية لبكتريا Proteus mirabilis معزولة من عينات مختلفة == Bacteriological and Molecular Study of Proteus mirabilis Isolated from Different Clinical Samples

Author name: ختام فاضل عباس
Supervisor name: جواد كاظم الخفاجي | ميساء صالح الشكري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تلخصت هذه الدراسة بجمع وتشخيص P. mirabilis حيث عزلت وشخصت سبعة عشر عزلة (12.6%) عائدة الى بكتريا P. mirabilis من 135 عينة جمعت من مصادر مختلفة من المرضى المراجعين الى مستشفى الحلة الجراحي خلال الفترة من (تشرين الاول 2014 الى شباط 2015). عدد ونسبة العزلات التي تم الحصول عليها من مرضى المجاري البولية 11(64%)و التهاب الاذن 3(17%) . بالاضافة الى ذلك نسبة العزلات التي تم الحصول عليها من مرضى الاسهال والجروح والتهابات المهبل من كل حالة 1(5.9%). العزلات التي تم الحصول عليهزارعت في اوساط خاصة وشخصت بايوكيميائيا وبكتريولوجيا.من خلال التحري عن بعض عوامل الضراوة وجد ان جميع العزلات (100%) قادرة على انتاج الهيمولايسين ، اليورييز، البروتسين وظاهرة الانثيال. تم الكشف على انتاج البيتالاكتميزلجميع العزلات المقاومة لمضادات البيتا لاكتام بحسب طريقة Rapid Iodiometric وبينت نتائج الدراسة ان16(94.1%) من العزلات منتجة للبيتالاكتميز. اظهرت نتائج الدراسة قابلية جميع العزلات على مقاومة بعض المضادات الحياتية فقد بينت النتائج بان كل العزلات كانت مقاومة كليا 17(100%) الى Imipenem كما ان اغلب العزلات كانت حساسة الى Ertapenem حيث ان نسبة المقاومة فقط 3(17.6%). علاوة على ذلك مقاومة العزلات لمختلف المضادات الحياتية فحصت وظهرت ان العزلات مقاومة بنسب مختلفة 14(82.3%) منهم اعطت مقاومة الى Amoxicillin وCefotaxime , 9 (52.9%) منهم اعطت مقاومة الى Amoxiclave, 11(64.7 %) منهم اعطت مقاومة الى Ceftriaxone و4(23.5%) منهم اعطت مقاومة الى Cefepime Clavulanic acid.لجينات المشفرة عوامل الضراوة لبكتريا P. mirabilis كشفت باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR)). ظهرت النتائج ان كل عزلات البكتريا اعطت نتيجة موجبة للجين rsbA, luxS, pm1, mrpA ,ureC مع عدد ونسبة ,(53%)9 7(41%), 8(47%),,(35%)6 ,(18%)3 بالتعاقب. | This study is devoted to isolation and identification of Proteus mirabilis; 17 isolates of P. mirabilis have been isolated and identified out of one hundred thirty five clinical specimens obtained from patients attending to Hilla teaching Hospital during a period from October 2014 to February 2015. The number and percentage of isolates obtained from patients with urinary tract infections was 11(64.7%), and ear infection 3(17.6%). Other isolates obtained from patients with diarrhea, wound and vaginal infection that each case has percentage 1(5.9%). The isolates obtained have been cultured in selective media and biochemically assay. Some virulence factors of all isolates are studied, and the results showed that all bacterial isolates 17(100%) produced hemolysin, urease, Bacteriocin (proticin) and swarming. The detection of β - lactamase production is performed according to Rapid Iodometric Method and the result is shown that 16(94.1%) of isolate produced beta - lactamase. Antibiogram of P. mirabilis isolates has been studied and it has been found that all isolates were entirely resistant to Imipenem 17(100%), while most of the P. mirabilis isolates were sensitive to Ertapenem so the resistant only 3(17.6%). Furthermore, the resistance of isolates to a variety of antibiotics has been investigated and found that these isolates have been resistant to more than one antibiotic : 14(82.3%) to Amoxicillin and Cefotaxime, also 9(52.9%) of them were resistant to Amoxiclave, 11(64.7%) of them were resistant to Ceftriaxone and 4(23.5%) of them were resistant to Cefepime Clavulanic acid. Virulence factors encoding genes of P. mirabilis is detected by using polymerase chain reaction PCR. It is found that all bacterial isolates gave positive result for ureC, mrpA, pm1, luxS and rsbA with number and percentage 3(18%), 6(35%), 7(41%), 8(47%), 9(53%) respectively

دراسة النمط المناعي وقابلية الاصابة بالعدوى الميكروبية لدى ذوي السمنة البالغين == Study The Immune Profile & Susceptibility to Some Microbial Infections in Obese Adults

Author name: فؤاد قاسم جبير الزيادي
Supervisor name: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هديل فاضل فرهود
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى توضيح العلاقة بين البالغين الذين يعانون من السمنة والتعرض للعدوى الميكروبية من خلال تقدير المعايير المناعية مثل (IFN - γ & IL - 2)، عناصرcomplement system (C3, C4) , وقياس فعالية الخلايا المناعية الالتهامية من خلال الكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus. انجز هذا العمل على 50 شخصا من ذوي السمنة البالغين (11 ذكرا و39 انثى) تتراوح اعمارهم من (20 - 60) عاما قاموا بزيارة قسم التغذية في مستشفى مرجان التعليمي في محافظة بابل خلال الفترة من نوفمبر 2014 الى يناير 2015، و30 شخصا اخرين اصحاء لا يعانون من السمنة (21 ذكور و9 اناث) تتراوح اعمارهم من (22 - 42( عاما. وتم قياس مؤشر كتلة الجسم (BMI) لكل فرد من ذوي السمنة والاصحاء. تم جمع عينات الدم من كلا المجموعتين لقياس فعالية الخلايا الالتهامية، والمعايير المناعية الاخرى مثل (IFN - γ & IL - 2)، وعناصر complement system (C3, C4), والكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus بطريقة الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم. اظهرت النتائج ان تركيز (IL - 2) عند ذوي السمنة اقل بكثير وبشكل معنوي عن الذين لا يعانون من السمنة (P˂0.05) ، ولم يظهر تركيز IFN - γ)) في مجموعة ذوي السمنة انخفاضا معنويا (p>0.05) عن تركيزه عند الاصحاء. وكانت عناصر complement system (C3, C4)مرتفعة عند ذوي السمنة وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عن مجموعة الاصحاء الذين لا يعانون من السمنة، ولكن فعالية الخلايا الالتهامية اظهرت انخفاضا عالي المعنوية (p˂0.001) عند مجموعة ذوي السمنة (6.1٪) مقارنة بمجموعة الاصحاء (10.6٪)، وزيادة تراكيز كل من ASO وanti - measles virus - IgG وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عند ذوي السمنة مقارنة بالاصحاء | This study aimed to clarify the relationship between obese adults & susceptibility to microbial infections by evaluating the parameters of cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and phagocytic index using of Anti - Streptococcus pyogenes Ab and Anti - Measles virus - IgG Ab as indicators of infections. This work was applied on 50 obese adults visited to the center of nutrition in Marjan hospital in Babylon province from November 2014 to January 2015, and 30 non - obese apparently healthy as controls. Obese adults consist of (11 males and 39 females) with age range 20 - 60 years, while 30 apparently health controls consist of (21 males and 9 females) with age range 22 - 50 years. Body mass index (BMI) for all subjects obese & controls was estimated. Blood samples were collected from obese group and control group to estimate phagocytic index, and ELISA test for cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and detection of measles - IgG antibody and anti - streptolysin O antibody. IL - 2 concentration in obese adults was significantly lower than non - obese adults (p˂ 0.05), and no significant decreased (p>0.05) of IFN - γ in obese group, the complement components (C3 &C4) in obese adults were a highly significant than controls, but the phagocytic index showing there is a highly significant decreased (p˂0.001) in activity of neutrophils of obese adults (6.1%) compared to control group (10.6%), ASO and Anti - measles - IgG concentrations increased in obese adults with a highly significant (p˂0.001) as compared to controls. This findings can be concluded as that obese subjects have low levels of immune system and more susceptible to be infected with microbial infections

التشخيص الكهربائي المبكر لاعتلال الاعصاب القحفي غير السريري لدى مرضى السكري المصابين او غير المصابين باعتلال الاعصاب المحيطيه == Early Electrodiagnosis of Subclinical Cranial Neuropathy in Diabetic Patients with or without Peripheral Neuropathy

Author name: ولاء فاضل جلال الحسناوي
Supervisor name: سعد مرزة حسين الاعرجي | كريم مصحب التميمي
General topic: Medicine
Specific topic: Physiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: داء السكري من النوع الثاني هو مشكلة صحية منتشرة على نطاق واسع ويمتاز بمضاعفات عديدة تصيب الاوعية الدموية مما يؤدي الى ارتفاع معدلات الاعتلال والوفيات. الاعتلال العصبي المحيطي السكري هو اكثر المضاعفات شيوعا لداء السكري من النوع الثاني ، وفي الغالب يكون بشكل اعتلال الاعصاب القاصي المتناظر والذي يكون على هيئة قفازات وجوارب. ارتفاع السكر في الدم هو العامل المسبب الرئيسي لاعتلال الاعصاب المحيطية لدى مرضى السكري. اعتلال الاعصاب القحفية عادة تظهر مع الاعتلال العصبي المحيطي السكري اما سريريا او في شكل تحت السريري. الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو تقييم لدور منعكس الطرفة في التشخيص المبكر لاعتلال الاعصاب القحفية لدى مرضى السكري من النوع الثاني مع او بدون اعتلال الاعصاب. الطرق والاساليب : اجريت الدراسة خلال الفترة من شهر كانون الثاني الى شهر اب 2014. شملت الدراسة 83 مريضا ممن يعانون من داء السكري النوع الثاني ضمن الفئة العمرية من 35 - 69 سنة. اعتبر المرضى الذين يعانون من الاعراض السريرية لضعف الاعصاب الطرفية والذين لديهم تخطيط الاعصاب الكهربائي غير طبيعي بانهم مرضى اعتلال الاعصاب المحيطية السكري (61 مريضا)، في حين اعتبر المرضى الذين لايعانون من ضعف الاعصاب الطرفية وتخطيط الاعصاب الكهربائي لديهم كان طبيعيا بانهم لا يشكون من اعتلال الاعصاب المحيطية السكري ( 22 مريضا). شملت الدراسة ايضا اشخاص لا يعانون من اي مرض تتناغم اعمارهم وجنسهم مع المرضى المشمولين بالدراسة سميت مجموعة السيطرة(60مريضا).وقد خضع المرضى ومجموعة السيطرة المشمولين بالدراسة الى التقييم الكامل الذي شمل : التقييم السريري (التاريخ والفحص)، وتقييم الكيمياء الحيوية (قياس سكر الدم بعد الصيام، الهيموجلوبين السكري، قياس نسبة دهون الدم) وتخطيط الاعصاب الكهربائي الذي يشمل دراسات التوصيل الحسية والعصبية الحركية NCS)) مع منعكس طرفة.النتائج : وجدت الدراسة ان مرضى السكري لديهم تاريخ عائلي ايجابي، انخفاض المستوى التعليمي وارتفاع مؤشر كتلة الجسم بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. مرضى السكري مع اعتلال الاعصاب المحيطية لديهم رابطة كبيرة مع زيادة العمر (القيمة P <0.01) ، وكبيرة للغاية مع مدة المرض (0.007=P)، واهمية عالية مع الفرق في مؤشر كتلة الجسم (قيمة P <0.01) بالمقارنة مع مرضى السكري من دون اعتلال الاعصاب المحيطية . وكان مرضى السكري المصابون باعتلال الاعصاب المحيطية علاوة على ذلك لديهم ضعف السيطرة على نسبة السكر في الدم التي تعكسها نسبة عالية لقياس سكر الدم بعد الصيام ونسبة الهيموكلوبين السكري, بينما اظهرت صورة الملف الشخصي لقياس دهون الدم قيمة غير مهمه. بينت دراسة التوصيل العصبي (الحسية والحركية) فرق كبير بين الكمون، والسعة، وسرعة التوصيل بين مرضى السكري مع اعتلال الاعصاب المحيطية والذين لا يعانون من هذه الحالة. واظهرت نتائج منعكس الطرفة فرق هام للغاية (قيمة P <0.01) بين مرضى السكري ومجموعة السيطرة.مناقشة : اظهرت نتائج هذه الدراسة ان اعتلال الاعصاب المحيطية السكري يرتبط مع العديد من عوامل الخطورة مثل العمر, مدة المرض، مؤشر كتلة الجسم، وضعف السيطرة على نسبة السكر في الدم . وكشفت الدراسة ايضا ارتفاع معدل اعتلال الاعصاب المحيطية السكري في المرضى قيد الدراسة (73.5٪). اعتلال الاعصاب القحفية تحت الاكلينيكي موجود ايضا في المجموعة قيد الدراسة بغض النظر عن وجود او عدم وجود اعتلال الاعصاب المحيطية السكري. وقد تبين ذلك من خلال منعكس طرفة غير طبيعي في 44.6٪ من المرضى. كان معظم المرضى الذين يشكون من منعكس طرفة غير طبيعي يعانون ايضا من اعتلال الاعصاب المحيطية السكري (89.2٪) . ووفقا لنتائج هذه الدراسة اعتلال الاعصاب المحيطية السكري يزيد من فرصة وجود منعكس طرفة غير طبيعي بخمس مرات اكثر، وهو ينبئ باعتلال قحفي تحت الاكلينيكي لوجود نسبة غريبة بين اعتلال الاعصاب المحيطية السكري ومنعكس طرفة شاذ لا ارادي هي 5.29.اعتمد الباحث في تعريب المصطلحات العلمية على : 1 - اطلس التشريح العصبي. الاستاذ الدكتور محمد توفيق الرخاوي. جمهورية مصر العربية - الطبعة الاولى 2000 م.2 - المعجم الطبي الموحد - انكليزي - عربي. رئيس التحرير د. محمود الجليلي - الطبعة الرابعه 2009 م , مطبعة المجمع العلمي العراقي.3 - الموجز المصور لفحص الجهاز العصبي. ترجمة د. عبد الهادي الخليلي - بغداد - 1992 م , د. موريس فان الن ود. روبرت روزنسكي. | Background : Type 2 diabetes mellitus is a widely spread health problem associated with countless micro - and macro - vascular complications leading to rise morbidity . Diabetic peripheral neuropathy (DPN) is the most common complication of type 2 diabetes mellitus and it may presents as distal symmetrical polyneuropathy in which the body involved in gloves and stock pattern. Hyperglycemia is the main causative factor for peripheral neuropathy in diabetic patients. Cranial neuropathies is usually presenting as mononeuropathies coexist with DPN either presented clinically or in subclinical form. The aim of this study is to detect cranial neuropathy in diabetic patients also to evaluate the role of blink reflex for early diagnosis of cranial neuropathy in diabetic patients with or without polyneuropathy. Materials and methods : The study was conducted from January till August 2014. Eighty three patients with type 2 diabetes mellitus within age group of 30 - 69 years were included in the study. Patients who had clinical features of peripheral nerve dysfunction and recognized with abnormal electrophysiological findings of their peripheral nerves were regarded as patients with DPN (61 patients), while those who did not have complains of peripheral nerve dysfunction and with normal electrophysiological study of their peripheral nerves were considered as patients without DPN (22 patients). The study also involved normal healthy persons whose age and gender are harmonized with that of our patients that were deliberated as control group (60 persons). The patients and the controls joined in the study had undergone full evaluation that included : clinical assessment (history and examination), biochemical assessment (measurement of fasting blood sugar, glycosylated haemoglobin, lipid profile) and electrophysiological assessment that included sensory and motor nerve conduction studies (NCS) with blink reflex.Results : The study found that diabetic patients had positive family history, low educational level and high BMI when compared with control. Diabetic patients with DPN had significant (P value <0.01) difference in age(they were older), highly significant (P value =0.007)difference in the duration of the disease(they had longer disease duration), and highly significance (P value < 0.01) difference in BMI(they were obese ) when compared with diabetic patients without DPN.Furthermore diabetic patients with DPN had poor glycemic control reflected by high FBS and HbA1c, while lipid profile picture showed insignificance difference. Nerve conduction study (sensory and motor) showed a significant difference between latency, amplitude, and conduction velocity between diabetic patients with DPN and those without DPN. The results of blink reflex showed highly significant (p value < 0.01) difference between diabetic patients and controls.Discussion : The results of this study showed that diabetic peripheral neuropathy associated with many factors like age, duration of the disease, BMI, and poor glycemic control.The study also revealed a high prevalence of DPN among the studied group (73.5%). Subclinical cranial neuropathies also present in the studied group which was reflected by abnormal blink reflex found in 44.6% of the patients. Most of the patients with abnormal blink reflex had diabetic peripheral neuropathy (89.2%).According to the results of this study, DPN increases the chance of having abnormal blink reflex five times more, which means prophecy of underlying subclinical craniopathy, since the odd ratio between DPN and abnormal blink reflex is 5.29

علاقة الجهد التاكسدي مع بروتين الاوستيوبونتين عند مرضى السكري نوع الثاني الذين يعانون من متلازم الانسداد الحاد == The Relationship between Oxidative Stress and Osteopontin Levels in Patients with Type - II Diabetes Mellitus Presented with Acute Coronary Syndrome

Author name: بشرى عريبي فاضل الحسيني
Supervisor name: طارق حفظي الخياط | منعم مكي الشوك
General topic: Medicine
Specific topic: Clinical Biochemistry
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: متلازمة الشرايين التاجية الحادة ACS))تمثل مجموعة من الصفات السريرية تتراوح بين الذبحة الصدرية UA))الغير مستقرة وصولا الى احتشاء العضلة القلبية الحاد المصحوب(STEMI) بارتفاع موجة ST - والغير مصحوب بارتفاع موجة ST - (NSTEMI). احتشاء العضلة القلبية الحاد يترافق مع استجابة التهابية موقعيه وجهازية ويعتبر من التعقيدات الرئيسية لمرضى السكري. يزداد انتاج الاوستيوبونوتين في الطبقة الوسطية لشرايين مرضى السكري .يترافق مرض السكري مع ارتفاع الجهد التاكسدي والفقدان الوظيفي لطبقة الخلايا الطلائية . تم جمع العينات من مدينة مرجان التعليمية في محافظة بابل ، خلال الفترة الممتدة تشرين الثاني ٢٠١٤ وشباط ٢٠١٥ . العدد الكلي ١٠٠ شخص منهم ٦٠كمرضى و٤٠مجموعة سيطرة. تم تصنيف مرض السكري الى المجاميع التالية 1 - عشرون مريض مصاب بالسكري بدون اي مضاعفات .2 - عشرون مريض مصاب بالسكري مع وجود ارتفاع الموجه STEMI)ST - ). 3 - عشرون مريض مصاب بالسكري من دون ارتفاع الموجه - ST ( NSTEMI ) تحليل البيانات كشفت عن زيادة معنوية كبيرة في تراكيز (Osteopontin) OPN ، MDA(Malondialdehyde) ونسبة HbA1c في المصل والانخفاض في Catalase))CAT وSuperoxide dismutase))SOD في مجموعات المرضى بالمقارنة مع مجموعه السيطرة .وقد لوحظ وجود زيادة ارتباط ايجابية ذات دلالة احصائية بين OPN وMDA (0.414 = r و8.000 p<) في مجموعتي MI .اظهرت وجود ارتباط سلبي كبير مع SOD (0.461 r= - ، 0.003 p<) وOPN مع وجود ارتباط ايجابي كبير مع نسبة HbA1c (0.336 r=، 0.03 p<) في مجموعتي .MI اظهرت وجود ارتباط سلبي كبير مع SOD(0.362 r = - ،0.02p<) وCAT (0.512 r= - ، 0.01p<) في مجموعتي MI . في مجموعة مرضى السكري النمط الثاني ( Type 2 ) لوحظ ان هناك زيادة كبيرة في نسبة HbA1c ، OPN ، MDA وانخفاض SOD وCAT , هذه النتائج تشير الى وجود مخاطر عالية لامراض القلب في هؤلاء المرضى نظرا لوجود ( ACS) . وحيث ان هنالك زيادة معنوية في التراكيز لكل من OPN ، MDA ، ونسبة HbA1c مع انخفاض بنسبة تركيز SOD في الدم، وتركيز CAT هذا الاختلاف قد يؤدي الى قلة انتاج المواد المضادة للاكسدة وتعزيز انتاج المواد المؤكسدة.في الختام من نتائج الدراسة الحالية ، وجود زيادة كبيرة في تركيز Osteopontin مع وجود الصلة مع مواد الاكسدة وزيادة نسبة HbA1c قد يشير الى ان دور او اهمية ارتفاع السكري في تحفيز مؤشرات التهابية الحادة والتي يمكن اعتبارها كمؤشر لتطور المضاعفات الخطيرة للسكري خاصة على المرضى المصابين باحتشاء العضلة القلبية MI . | The acute coronary syndrome (ACS) encompasses a spectrum of clinical entities, ranging from unstable angina (UA), non - ST - segment elevation myocardial infarction (NSTEMI) to ST - elevation myocardial infarction (STEMI). The acute myocardial infarction(AMI) is associated with a local and systemic inflammatory response , it is a major complication in diabetic patients. Osteopontin (OPN) expression is increased in the media of diabetic arteries . Diabetes is highly associated with oxidative stress and endothelial dysfunction. Subjects were recruited at Merjan Teaching Hospital / Babylon Province, During the period from November, 2014 and February 2015. A total number of 100 persons were classified according to ( 60 ) patients and ( 40 ) control. Diabetes mellitus was classified into the following categories : 1 - Twenty diabetic patients with no complications.2 - Twenty diabetic patients with ST segment elevation ( STEMI).3 - Twenty diabetic patients without ST segment elevation (NSTEMI). Analysis concentration of the data revealed a significant increase of serum (osteopontin ) OPN, ( Malondialdehyde) MDA and HbA1C but decrease in(catalase) CAT and(superoxide dismutase) SOD concentration in the patient groups when compared with those of control groups . A significant positive correlation increase was observed between OPN and MDA (r=0.414, p<0.008) in MI groups . OPN exhibited a significant negative correlation with SOD (r= - 0.461, p< 0.003) and OPN a significant positive correlation with HbA1C (r= 0.336, p< 0.03) in MI groups . MDA exhibited a significant negative correlation with SOD (r= - 0.362, p<0.02) and CAT (r= - 0.512, p<0.01) in MI groups. In type 2 diabetic patients group there is a significant increase in HbA1C, OPN, MDA and low SOD and CAT indicate a high risk for heart diseases in those patients due to the ACS.Where there is an increase of serum OPN, MDA, HbA1C in comparison with decrease of serum SOD,CAT concentration may disturb the antioxidants and enhance the oxidant production. In conclusion of present study results , The significant increase of Osteopentin concentration in relevance to oxidative stress and HbA1C concentration may indicate that the role of hyperglycemia in the induction of this acute inflammatory marker which can be considered as a prognostic indicator of diabetic complications especially diabetic patients with MI.

دراسة التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمستقبلات الاستروجين الفا والبروجستيرون وعلاقتها مع الحالة السريرية المرضية لسرطان الظهارة البولية == Immunohistochemical Study of Estrogen ? and Progesterone Receptors in association with clinicopathological status of urothelial Carcinoma

Author name: احمد اسود حسين
Supervisor name: نعمه حسوني الجبوري | علي حسن التميمي
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: سرطان المثانة شائع الحدوث في جميع البلدان في انحاء العالم وانها تمثل اكثر انواع السرطان شيوعا في اوروبا وامريكا الشمالية. سرطان المثانة هو الاول من بين السرطانات شيوعا في العراق وثاني الاورام الخبيثة والاكثر شيوعا في الجهاز البولي والتناسلي في جميع انحاء العالم بعد سرطان البروستات. حالات الاصابة بسرطان المثانة اقل في اسيا مقارنة باوروبا وامريكا الشمالية. الذكور اكثر عرضه للاصابة من الاناث. سرطان الخلايا الانتقالية هو الاكثر حدوثا والتي تمثل نحو 90٪، والنسبة الباقية 10٪ تمثل سرطان الخلية الحرشفية، سرطان الخلايا الغدية، وبعض انواع اخرى نادرة. بداية هناك العديد من البروتينات وكذلك جينات تمت دراستها على سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة مثل Ki67،/neu HER - 2 ، CA19.9، CK7، PSA وغيرها. مستقبلات هرمون الاستروجين هي واحدة من فصيلة مستقبلات النووية وعامل النسخ التي تنظم مختلف الوظائف والاعضاء الطبيعي بما في ذلك التنمية، وظيفة الجهاز التناسلي، وتؤثر على انظمة اخرى مثل الهيكل العظمي والقلب والاوعية الدموية. هناك نوعان من مستقبلات هرمون الاستروجين : مستقبل الاستروجين الفا (ERα) ( 60 - 66kD) ومستقبل الاستروجين بيتا (51 - 61kD). يختلف وجود مستقبلات هرمون الاستروجين في الانسجة المختلفة مع وجود اختلافات ملحوظة في التعبير عنها. مستقبلات هرمون البروجستيرون هي واحدة من فصيلة المستقبلات النووية التي وجدت داخل الخلايا، والتي يمكن تفعيلها او تنشيطها من خلال الستيرويد هرمون البروجستيرون. ويوجد هذا المستقبل في شكلين رئيسيين، المستقبل A(kD94) والمستقبل) B (kD114 في معظم انواع الخلايا، يعمل مستقبل هرمون البروجستيرون A كاداة قامع لعمل البروجستيرون في حين ان وظيفة مستقبل هرمون البروجستيرون B هو منشط لعمل البروجستيرون من نفس الجينات. مستقبلات هرمون البروجستيرون موجودة في الجهاز التناسلي للانثى، الغدد الثدية والدماغ والغدة النخامية ويكون تنشيط المستقبل بواسطة هرمون البروجستيرون. ولمستقبلات هرمون البروجستيرون عند الاناث دور كبير في عملية الاباضة، زرع الاجنة ونمو الغدة الثدية وسير الحملالهدف من الدراسة1 - دراسة التعبير المناعي النسيجي الكيميائي لمستقبلات الاستروجين الفا والبروجستيرون في سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة بواسطة التقنية المناعية (التعبير المناعي النسيجي).2 - دراسة العلاقة بين مستقبلات الهرمونات المذكورة مع بعض المتغيرات والخصائص السريرية المرضية المتاحة للحالات المرضية. اجريت هذه الدراسة على 95 عينة من مرضى سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة (68 حالة من الذكور و27 حالة من الاناث). درست العينات بواسطة صبغة الهيماتوكسيلين وصبغة الايوسين وذلك لتاكيد التشخيص، درجة التمايز والمرحلة من المرض ودرست العينات بالطريقة المناعية (التعبير المناعي النسيجي الكيميائي) مع مستقبلات الاستروجين الفا والبروجستيرون لمعرفة ما اذا كان هناك علاقة مع بعض المتغيرات المتاحة مثل الجنس والعمر والمرحلة، ودرجة الورم. تم تقسيم المرضى حسب العمر الى اقل من 65 سنة واكبر او يساوي 65 سنة. وكان متوسط عمر جميع الحالات 64.6 وانها تراوحت بين 30سنة الى 90 سنة. الحالات التي تم جمعها من مختبرات الفحص النسيجي في مستشفى الحلة التعليمي، مدينة الامام الحسين الطبية في كربلاء، ومختبر السجاد التخصصي في كربلاء. كانت نتائج العمل تشير الى 15 عينة ايجابية لمستقبلات هرمون الاستروجين الفا، وكانت ست حالات ايجابية لمستقبلات هرمون البروجستيرون. وان من هذه العينات الايجابية من مستقبلات هرمون الاستروجين الفا، 10 عينات من الذكور وخمس عينات من الاناث وان العينات الايجابية الستة من مستقبلات هرمون البروجستيرون جميعها ذكور. بعد دراسة النتائج احصائيا كان هناك ارتباط احصائي بين مستقبلات الهرمونين سويا (ERα / PR) ومرحلة الورم (P ≤ 0.05 ).و لم يكن هناك اي ارتباط احصائي بين العوامل الاخرى بما في ذلك السن والجنس ودرجة التمايز.من النتائج اعلاه يمكن لنا ان نستنتج ان هناك فقط علاقة بين مستقبلات هرمون الاستروجين الفا والبروجسترون معا وبين مرحلة سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة ولا يوجد اي علاقة بين هذه المستقبلات واي عامل او متغير اخر ممكن ان يساعد في تقييم هذا النوع من السرطانات | Urinary bladder cancer occurs in all countries around the world. It is the first most common malignancy of the genitourinary tract in Iraq. Urinary bladder cancers present as urothelial bladder carcinoma or as transitional cell carcinoma, which account for about 90%, and the remaining 10% represent squamous cell carcinoma, adenocarcinoma, and other types. Urothelial Bladder cancer is a complex disease that have various internal and external risk factors like age, genetic factor, gender, smoking, exposure to chemical carcinogens and others. There are many tumor markers studied in urothelial bladder cancer (transitional cell carcinoma) like Estrogen and Progesterone receptors, CK20, CK18, CK8, Ki67, Her - 2/ Neu, CA19.9, Glutathione and Glatt Reductase and many others.Estrogen receptors (ER) are members of the superfamily of nuclear hormone receptors they play an important role in growth of estrogen - responsive tumors, including breast and endometrial cancers. There are two different forms of the estrogen receptor, usually referred to as α and β, each encoded by a separate gene (ESR1 and ESR2, respectively).The progesterone receptor (PR) are related to the nuclear receptor superfamily and present in two isoforms, PR - A and PR - B, which arise from different promoter usage in a single gene located on chromosome 11.Aims of study1 - To detect and assess any expression of estrogen and progesterone receptors in urothelial cell carcinoma of urinary bladder by immunohistochemical technique.2 - To study the relationship of receptor expression to some of clinicopathological features available for the present cases like age, sex, grade and stage of tumor.Patients and methodsA retrospective study was conducted on 95 Paraffin embedded blocks (68 cases male and 27 cases female) of urothelial cell carcinoma of urinary bladder specimens (biopsy and TUR). Firstly investigated by Hematoxylin and Eosine stain for histopathological study to confirm the diagnosis, grade and stage (Ta and TII). Then the cases undergo immunohistochemical staining with estrogen and progesterone monoclonal antibody to study if there were expression and correlate the expression to some of clinicopathological features available like sex, age, stage, and grade of the tumor. The age of patient classified as <65 years old and ≥ 65 years old. The cases collected from laboratories of Histopathology of AL Hilla Teaching Hospital, Imam AL Hussien Medical City in Karbala, and ALSajjad private histopathological laboratory in Karbala.ResultsFrom these 95 cases, 15 cases were positive for estrogen receptor, and six cases were positive for progesterone receptor. From these 15 positive cases of estrogen receptor, 10 cases were male and 5 cases were female. Positive low grade were 11 cases and positive high grade were 4 cases. Positive stage 0a were 7 cases and positive stage II were 8 cases. From these 6 positive cases of progesterone receptor, all cases were male. Positive low grade were 5 cases and positive high grade were1. Positive stage Ta were 3 cases and positive stage T II were 3 cases. There was a significant association between combined receptor expression (ERα/PR) and tumor’s stage (Ta and TII), p value ≤ 0.05 is significant. There were no significant association between combined receptors expression and other parameters including age, sex, and grade (p value > 0.05).Conclusions1 - There was no statistically significant association between estrogen α and progesterone receptors expression a lone in UBC and the parameters that we have studied (age, sex, stage (Ta and TII), and grade of tumor). 2 - There was a statistically significant association between combined receptors expression (ERα/PR) and tumor’s stage (Ta and TII) only, p value ≤ 0.05 is significant. There was no significant association between other parameters including age, sex, and grade with the combined hormone receptors expression (p value > 0.05). 4 - According to our finding estrogen α and progesterone receptors expression are not reliable indicators in association to clinicopathological status of UBC. 5 - Our results confirm results obtained by previous studies on the same subject

التعابير المناعية النسيجية الكيميائية لبروتين كي اي - 67 والعامل المحرض من نقص الاكسده - 1الفا في سرطان الثدي ثلاثي السلبية == Immunohistochemical Expression of Ki - 67 and Hypoxia - Inducible Factor - 1? in Triple Negative Breast Cancer

Author name: مهدي جاسم محمد علي
Supervisor name: حيدرعبد الرضا الخفاجي | عباس فاضل حسون
General topic: Medicine
Specific topic: Diseases
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: ان سرطان الثدي يمثل النوع الاكثر شيوعا من سرطان النساء في جميع انحاء العالم وله عبئا كبيرا على سلطات الصحة العالمية. ان احد اهم الانواع الجزيئية لسرطان الثدي هو سرطان الثدي ثلاثي السلبيه الذي يتميز بلتعبير السلبي لمستقبلات هرمون الاستروجين وهرمون البروجسترون وعامل النمو البشاروي وهو غير متجانس سريريا او من ناحية اخرى هو في الغالب من النوع الشرس والقاتل. هناك مؤشرات متزايدة لدعم دراسة المناعة النسيجية الكيميائية لمختلف المعلمات وتكون بطريقة او باخرى متعلقة بالمعرفة المتزايدة حول التشخيص والعلاج وتحديد سرطان الثدي او لاضافة نتائج جيدة. ان احد هذه المعلمات التي تعتبر من العوامل المحدد والمرتبطة بمعدل انتشار سرطان الثدي الثلاثي السلبية هوبروتين كي اي - ٦٧و العامل المحرض من نقص الاكسده - ١الفا. الاهداف : هدف هذه الدراسة هو العرفة على اي شراكة بين سرطان الثدي ثلاثي السلبيه وغيره من الانواع الفرعية لسرطان الثدي اواي ارتباط بينه وبين التعابير المفرطة لبروتين كي اي - ٦٧ والعامل المحرض على نقص الاكسده - ١الفا مع العديد من المتغيرات السريرية والمرضية .المواد وطرق العمل : هذه الدراسة شاملة ومستعرضة لمختلف القطاعات والفئات اجريت في قسم علم الامراض في كلية الطب - جامعة بابل تضمنت ٢٨١ امراءة ممن يعانون من سرطان الثدي الابتدائي اختيروا من البيانات التي تم الحصول عليها من المحفوظات في مختبرات مستشفى الحلة التعليمي ومستشفى الصدر التعليمي في النجف ومدينة الحسين الطبية ومختبر السجاد الخاص في كربلاء خلال الفترة من نوفمبر ٢٠١٣ الى ابريل ٢٠١٥. كما ان المرضى صنفوا استنادا الى الصبغه المناعية النسيجية الكيميائية الى مجموعتين ٥٤حاله من سرطان الثدي ثلاثي السلبية و٢٢٧حاله من الانواع الفرعية الاخرى.الانواع النسيجية والدرجة قسمت وفقا لتصنيف منظمة الصحة العالمية ودرجة بلوم - ريتشاردسون المعدلة. المتغيرات السريرية والمرضية والتي تضم العمر وحالة انقطاع الطمث وحجم وجهة الورم ونوع الجراحة وعودة الورم ونظام TNM للتدريج والدرجة. تم التعبير عن بروتين كي اي - ٦٧ والعامل المحرض من نقص الاكسده - ١الفا عند صبغه مع نظام الكشف عن الصبغه المناعية لمعقد افيدين بيوتين على ٥٤ عينة من الانسجة المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين من حالات سرطان الثدي ثلاثي السلبية. وقد تم تحليل العلاقة بين جميع متغيرات الدراسة بطريقة اختبار مربع كاي. وتعتبرالنتائج ذات دلالة احصائية اذا كانت قيمة ٠٬٠٠٥P ≤.النتائج : لقد تراوحت اعمار المرضى بين٢٣ - ٨٥ سنة , (متوسط ٥١٬٢٣± ١١٬٢٦) سنة. سرطان الثدي ثلاثي السلبية يشغل ١٩٬٢٪ فقط من مجمل الحالات وغالبا ما تكون المصابات به اصغر عمرا من غيره من الانواع الفرعية لسرطان الثدي. نسيجيا كان سرطان الاقنية الاختراقي غير المحدد الاكثر شيوعا من المجموع الكلي لحالات ) ٢٢٣/٢٨١ (.التقييم المناعي النسيجي الكيميائي لبروتين كي اي - ٦٧يرتبط بقوة مع حجم الورم(٠٬٠٢٨=P) ودرجة الورم(٠٬٠٠١ P<) وانتشارالعقدة الليمفاوية (٠٬٠٢=P) والنقائل السرطانية مكان بعيد (٠٬٠٠١ P<). في حين التقيم لبروتين العامل المحرض من نقص الاكسده - ١الفا يرتبط بقوة مع درجة الورم (٠٬٠٠١=P) وانتشار العقدة الليمفاوية (٠٬٠٠١ P<) ولتعبير بروتين كي اي - ٦٧ (٠٬٠٠٣=P).الاستنتاجات : من هذه النتائج يمكن الاستنتاج بان لتعبير بروتين كي اي - ٦٧ والعامل المحرض من نقص الاكسده - ١الفا دور هام في نشوء المرضية لسرطان الثدي ثلاثي السلبية. هذا ويمكن ان يؤيد مقترح دورهما في المقاومة للادوية، والى زيادة او الانتشار غير المنضبط للخلايا الخبيثة. حتى انه قد يكونا موصلان هامين في التنبا الاسوا للمرضى الذين يعانون سرطان الثدي ثلاثي السلبية. | Breast cancer represents the most frequent type of women cancer worldwide and it has a huge burden on the global health authorities. One of the most important molecular subtypes of breast cancer is the triple negative - breast cancer (TNBC), which is characterized by absent expression of estrogen(ER), progesterone(PR) and human epidermal growth factor - 2 receptors (HER - 2). There are mounting indications to support the study of different markers immunohistochemically(IHC) in one way or another and they related to an increased knowledge about diagnosis, treatment and prognosis of breast cancer or to adding good outcome. One of these markers regarded as a prognostic factor and closely related to the proliferation rate in triple negative - breast cancer is Kiel - 67(Ki - 67) or hypoxia inducible factor - 1 (HIF - 1α).Objectives : The aim of study is to find out that if there is any association between the triple negative breast cancer and other breast cancer subtypes or any association between it and over expression of Ki - 67 and HIF - 1α and several clinicopathological variables. Materials and methods : The cross - sectional study was conducted in the Department of Pathology in the College of Medicine - Babylon University in which 281 female patients with primary breast cancer were selected from Data obtained from archives in the laboratories in AL - Hilla Teaching Hospital, AL - Sadr Teaching Hospital in Najaf and AL - Hussein Medical City and Al - Sajad Private laboratory in Karbala during the period from November 2013 to April 2015. The patients were classified based on their immunohistochemical staining into two groups as 54 cases of triple negative breast cancer and 227 cases of other subtypes. The Clinicopathological variables comprising age, menopausal status, tumor size and site, type of surgery, recurrence, TNM Staging system, histological subtype and grade were estimated. The expression of Ki - 67 and HIF - 1α were stained with Avidin - Biotin Complex detection system of Immunostaining on 54 selected formalin fixed, paraffin embedded tissues of Triple negative breast cancer cases. The relationship between all study variables were analyzed by chi - square test. The results were considered statistically significant if the p value was ≤ 0.05. Results : The overall patients ages ranged from 23 - 85 years (mean 51.23±11.26) years old.Triple negative breast cancer presented in only 19.2% of overall cases; most frequently younger age than other breast cancer subtype. Histologically, Infiltrative ducal carcinoma was the most frequent type (223/281). Immunohistochemically, Ki - 67 expression is strongly associated with tumor size (p=0.028), grade (p<0.001), lymph node metastasis (p=0.02) and distant metastasis (p<0.001). While HIF - 1α expression is strongly associated with grade (p=0.001), lymph node metastasis (p<0.001) and Ki - 67 expression (p=0.003). Conclusions : From these results, it can be concluded that Ki - 67 and HIF - 1α expression have an important role in pathogenesis of triple negative breast cancer evolution. This may support the suggestion of their role in drug resistance, and in increased or uncontrolled proliferation of the malignant cells. So they may be an important conductor of the worst prognosis in triple negative - breast cancer patients
1 ... 8 9 10 11 12 ... 21