عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 800

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

اسم المؤلف: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
اسم المشرف: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.

دراسة حالات العقم عند الذكور والتاثيرات البكتيرية والمناعية على معالم السائل المنوي

اسم المؤلف: حياة كاظم سلمان الموسوي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | انتصار محمود جمعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 450 عينة مني ومصل دم من الذكور المصابين بالعقم (اولي _ ثانوي) من مركز العقم واطفال الانابيب (مستشفى كمال السامرائي ). قسمت عينات المني الى قسمين اجري على القسم الاول منها الفحوص العيانية والمجهرية ، فيما تم زرع القسم الاخر على اوساط زرعية مناسبة ( اكار الدم،اكار الماكونكي، اكار الجوكليت) .تم عزل 284 عزلة بكتيرية من مجموع عينات المني 450 عينة : - 173 عزلة بنسبة (38.4%) منها تعود الى Staphylococcus aureus و58 عزلة بنسبة (12.9%) تعود الى بكترياEscherichia coli و31 عزلة (6.9% ) منها تعود الى بكتريا Neisseria gonorrhoeae ،اما نتيجة الزرع للبكتريا المختلطة &S.aureus E.coliفكانت 22حالة (4.9%) وذلك باستخدام نظام API system. اختبرت حساسية البكتريا لـ(11) مضادا حيويا شملت : - الامبسلين والفانكومايسين وامبسلين/ سلبكتام وسيفترياكسون ومينوسايكلين وسيفاكلور وسيفوروكسيم وسيفوتاكسيم والاميكاسين والافلوكساسين والسبروفلوكساسين . اظهرت النتائج وجود مقاومة عالية من قبل العزلات البكتيرية للمضاد الحيوي الامبسلين 100% في حين كان المضاد الحيوي سيفترياكسون اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية والبكتريا التابعة للعائلة المعوية اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له وكان المضاد السبروفلوكساسين الاكثر تاثيرا على العزلات البكترية (N.gonorrhoea). تضمن البحث ايضا دراسة تاثير اضداد النطاف على معالم السائل المنوي اذ وجد ان 284 عينة اي بنسبة (63.1%) (من بين450 عينة ) كانت موجبة لاضداد النطاف في البلازما المنوية وان 270عينة اي بنسبة (60%) من مصل الدم كانت موجبة لاضـداد النطاف وذلك باستخدام فحص التراص بالصفيحة agglutination test Tray . كذلك تم التعرف على عيارية هذه الاضداد اذ ان اعلى عيارية للاضداد في البلازما المنوية كانت (128 : 1) في الوقت الذي بلغت اعلى عيارية للاضداد في مصل الدم (1024 : 1). استخدمت تقنية (ELISA ) Enzyme Linked Immumosorbent Assay للتحري عن اضداد النطاف واصنافها وبينت نتائج الدراسة ان اكثر الاصناف تكرارا في البلازما المنوية هو الضد IgA اذ وجد في 271 عينة بنسبة (95.4%) من بين 284 عينة موجبة لاضداد النطاف اما اصناف الاضداد في مصل الدم فالضد IgG كان اكثرها وجودا (225 ) عينة بنسبة 83.3% .من مجموع العينات الموجبة لاضداد النطاف والبالغة 270 عينة . كما تم التعرف على كيفية حدوث التراص نتيجة وجود الاضداد وتبين ان التراص بالرؤوس هو الاكثر حدوثا في (170 ) عينة بنسبة 39.9% مقارنة مع التراص ذنب بالذنب (37) عينة بنسبة 13% . بينت الدراسة وجود علاقة ذات دلالة احصائية معنوية 0.001>P بين وجود الخلايا القيحية في السائل المنوي ووجود اضداد النطاف في البلازما المنوية اذ بلغت النسبة (98.2%) من مجموع 279 عينة فيما بلغ مجموع المرضى العقيمين الذين ابدوا نتائج موجبة لاضداد النطاف بدون خمج (5)عينات 1.7 % كذلك تبين وجود علاقة معنوية 0.001>P بين الاصابة ببعض الامراض مثل القيلة الدوالية Varicoceleواصابة وضمور الخصيةTesticular trouma & atrophy والنكاف Mumps واختزاع الخصيةTesticular biopsy وبين وجود اضداد النطاف في البلازما المنوية . كذلك اظهرت الدراسة ان 393 مريضا ( 87.3%) من مجموع 450 عقيما اظهروا تركيزا سويا لهرمون (FSH) Follicle Stimulating Hormone. في مصل الدم مقابل )57) مريضا بنسبة 12.7% اظهروا تركيزا اعلى من القيمة الطبيعية العليا . كما اظهرت النتائج ان 380 مريضا بنسبة 84.4% كان لديهم تركيز سوي لهرمون (LH) Leutinizing Hormone ، مقابل 70 بنسبة (15.6%) كان لديهم تركيز اعلى من القيمة الطبيعية العليا في مصل الدم . اما بالنسبة لهرمون التيستوستيرون Testosterone فان 334 بنسبة 74.2% اظهروا تركيزا سويا مقابل 116 (25.8%) ممن كان لديهم تركيز اقل من القيمة الدنيا للتركيز السوي . | Four hundred fifteen samples of seminal fluid from infertile men (primary & secondary) from Infertility and Tube Babies Center (Kamal AL - Sammara'ee Hospital). Each semen sample was divided into two parts : The first part underwent Macroscopic& Microscopic examination, while the other part was culture on suitable culture media (Blood agar, Macconkey agar and chocolate agar). 284 bacterial isolates from 450 sample ; 173 sample of seminal fluid show to Staphylococci aureus (38.4%) and (58) from Escherichia coli (12.8%) , 31 show Nesseria gonorrhea (9.6%) while the result of mixed bacteria (E. coli & S. aureus) it was 22 sample (4.9%) by using (Api E - 20) system. Bacterial sensitivity to (11) antibiotic, included Ampcillin, Vancomycin, Ampicillin/Sulbactam, Ceftriaxone, Minocycline, Cefaclor, Cefuroxine, Cefotaxime, Amikacin, Ofloxacin, and Ciprofloxacin the results show high resistance to Ampcillin antibiotic (100%) while ''Ceftrtaxone '' show best action against (E. coli & S. aureus) . Ciprofloxacin was having the highly effect on the Nesseria gonorrhea . The research was included the study of antisperm antibody It was found that 284 sample (63.1%) from 450 sample were positive against antisperm antibody in seminal plasma and 270 sample (60%) from blood serum samples were found to be positive using '' Tray agglutinant test''. The highest molarity of seminal plasma was found to be (1 : 128) whereas the highest of blood serum was (1 : 1024).The ’ELISA’’ method was used to detect anti sperm antibody. The study showed that the most frequent in seminal plasma is Immunoglobuine ( IgA) , where 271 samples (95.4%) were found to be positive . ( IgG) was found to be the most existing one in blood serum; 225 samples ( 83.3% ) .Identification of how aggulation occurred as a result of contraries existence had been executed. It was approved that head to head is the most occurring one; 170 samples (39.9%) compared with tail to tail 37 ( 13%).There was a significant statistical correlation between the presesnce of pus cells in seminal fluid and antisperm antibodies in seminal plasma where the pus cells were found in (98.2%) 279 of the sample. While the infertile patients showed positive results or antibody without infection as being (5) specimens (1.7%) . In addition, there was a correlation between some diseases such as varicocele, Trauma & Atrophy , Mumps and testisculer biopsy and the existence of antisperm antibody (P< 0.001) in seminal plasma .The results showed that 393 patients ( 87.3% ) from 450 infertilities had normal hormone FsH (Follicle stimulating hormone) who had high level in blood serum against 57 patients (12.7%).The result also showed that 380 patients ( 84.4% ) had normal levels of (LH) in comparisn to 70 with ( 15.6%) high levels of LH in the blood serum. "Testosterone hormone" level was found to be normal in 334 patients ( 77.2%) and 116 patients ( 25.8%) showed high levels .

دراسة بكتيرية ومناعية لعوامل الضراوة المستخلصة من بكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات القناة التنفسية == Bacteriological and Immunological Study of Virulence factors extracted from Moraxella catarrhalis Isolated from Respiratory Tract Infections

اسم المؤلف: حوراء عبد الامير علي الدهان
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي | نجاح رايش هادي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 60عزلة من بكتريا Moraxella catarrhalis من 344 عينة مرضية وبنسبة 17.4% موزعة كالاتي (6.7 , 11.7 , 12.5 , 27.6 , 30) % لكل من مسحات الاذن ومسحات الانف وعينات القشع ومسحات البلعوم ومسحات اللوزتين على التوالي من المرضى المراجعين الى العيادة الاستشارية للانف والاذن والحنجرة والعيادة الاستشارية الصدرية في مستشفى الحكيم العام في محافظة النجف ومن مختلف الاعمار ولكلا الجنسين وللفترة من حزيران 2004 وحتى كانون الاول 2004م. اعتمدت الصفات الزرعية (للمستعمرات) والشكلية (للبكتريا)والاختبارات الكيماحيوية لتشخيص العزلات، فضلا عن اعتماد نظام API - NH . كانت النسبة المئوية لعزل البكتريا من الاناث (18.8%)اكثر مما هو عليه في الذكور (16.3%) فيما سادت الفئة العمرية 1ـ10 سنة حيث بلغت نسبة عزل المسبب المرضي فيها 20.4%. لغرض التحري عن طبيعة مقاومة العزلات قيد الدراسة للمضادات الحيوية المختلفة ،فقد اخضعت جميع العزلات لاختبار حساسيتها لـ 12 نوعا من المضادات الحيوية التي تستعمل في علاج الاخماج البكتيرية ،اذ اظهرت العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيويةAmpicillin وAmoxycillin وTetracyclin وبنسبة 100% لكل مضاد ، في حين اظهرت العزلات مقاومة معتدلة وبنسب (73.3 ، 71.7 ، 66.7 ، 61.7 ، 60 ، 58.3 ) % لكل من المضادات الحيوية Cefotaxime،Ciprofloxacin ،Nitrofurantoin ،Nalidixic acid ، Cephalothin وGentamycinعلى الترتيب ،لكنها كانت مقاومة وبدرجة منخفظة تجاه Chloramphenicol ,Cephalexin , Pipracillin اذ بلغت نسب المقاومة لها(30 , 36.7 , 38.3)% على الترتيب .واظهرت معظم العزلات مقاومة مشتركة لعدد من المضادات الحيوية قيد الدراسة ، كما واظهرت 91.7% من العزلات قدرتها على انتاج انظيم البيتالاكتاميز . في محاولة للتحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستعمار اظهرت العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الاول (CFA/I) والثالث (CFA/III) وبنسب (93.3 ،96.7 )% على التوالي ، في حين لم تظهر ايا من العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الثاني (CFA/II) .اظهرت 22 عزلة من بكتريا M.catarrhalis (36.7%) قدرتها على انتاج انظيم البروتيز الخارج خلوي في حين لم تظهر ايا من العزلات قابليتها على انتاج انظيم الهيمولايسين والسايدروفورات , فضلا عن عدم قدرتها على تكوين المحفظة . ولمعرفة قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الشعيرات (Fimbriae) اجري فحص تكوين الغشاء الرقيق حيث تمكنت 80 % من هذه العزلات من تكوين هذا الغشاء عند نموها في الوسط الزرعي السائل في الوقت الذي استطاعت فيه 85%من العزلات من تلزين كريات الدم الحمراء للانسان صنف O+ وذلك للتحري عن امتلاك البكتريا للواصق التي تمكنها من الالتصاق بمستقبلات خاصة مؤلفة من مواد كاربوهيدراتية تعرف باسم (Gal α1 - 4Gal ß )موجودة على سطح كريات الدم الحمراء للانسان ، كما واستخدمت العزلة (6¬MO¬)المشعرة والملزنة والعزلة (MO1)غير المشعرة والملزنة لمقارنة معدل التصاقها بالخلايا الطلائية للانسان والمرسبة من الادرار مع معدل التصاق العزلة (MPn6)غير المشعرة وغير الملزنة ,اذ بلغ معدل التصاق العزلة (6¬MO¬) 54.1 خلية بكتيرية /خلية طلائية اعلى من معدل التصاق العزلة MO1 والعزلة MPn6 التي بلغ معدل التصاقها (9.6 , 23.9 ) خلية بكتيرية / خلية طلائية على الترتيب . وفي محاولة للتعرف على انماط التلازن الدموي للعزلات البكتيرية قيد الدراسة ,اجري فحص التلازن الدموي لجميع العزلات البكتيرية (60 عزلة) باستخدام دم الانسان والابقار والدجاج وخنازير غينيا على الترتيب وقد ظهر النمط(RRRN) بكونه الاكثر سيادة حيث بلغت نسبته حوالي 33.3% من العزلات قيد الدراسة . تم اختيار احد العزلات (MO6) باعتبارها عزلة كفوءة ومشعرة لثبوتية صفاتها المستضدية واعطائها للنتائج القياسية المعروفة في التفاعلات الكيماحيوية لاستخدامها في التجارب اللاحقة المتمثلة باستخلاص مستضدات عوامل الالتصاق ( الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي وعديد السكريد الشحمي ).المحور الثاني : استخلاص وتنقية المستضدات - تم استخلاص مستضد الشعيرات (Fimbriae) للعزلة المنتجة (MO6)باستخدام تقنية النبذ المركزي فائق السرعة لفصل الشعيرات وكذلك استخدام كبريتات الامونيوم بنسب تشبع مختلفة لغرض ترسيب البروتينات المستخلصة ، ومن ثم قدرت كمية البروتين في هذا المستخلص وكانت 0.525 ملغم /مل . - تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) للعزلة MO6 باستخدام الانظيمات (RNase وDNase ) والمنظف N - Lauroyl - Sarcosinate كما وقدر تركيز البروتين في مستخلص OMPs النقي اذ بلغ 0.6 ملغم /مل ، اما متعدد السكريد الشحمي (LOS ) فقد تم استخلاصه بتكسير الخلايا بالانظيمات والاستخلاص بالفينول المائي الساخن ، وبعد فصل كل من الطورين المائي والفينولي تمت ازالة سمية LOS في كل من الطورين باستخدام مادة Hydrazine اللامائية .وكما تم تقدير كمية الكاربوهيدرات الكلية في الطورين المائي والفينولي كليهما ,حيث بلغت (300 , 190)مكغم/مل على التوالي ,فضلا عن قياس النسبة المئوية للبروتين المرتبط مع LOS في الطورين والتي بلغت (13.3 , 11.8) % على الترتيب. المحور الثالث : الدراسة المناعية شمل هذا المحور دراسة تاثير مستضد الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) المنقاة جزئيا ومتعدد السكريد الشحمي (LOS) المزالة سميته والمستخلصة من العزلة الكفوءة (MO6)لبكتريا M.catarrhalis على الاستجابة المناعية ومعرفة دور هذه المستضدات الثلاثة في تنشيط او تثبيط فعالية بعض الخلايا المناعية ,ولغرض تحقيق ذلك اجريت الاختبارات المناعية الاتية في الزجاج (In vitro )والمتمثلة بعيوشية الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية والتشكل الزهري التائي والبائي وهجرة الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى (PMNs), فضلا عن عملية البلعمة للخميرة Candida albicans المقتولة بالحرارة.ادى استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات (25 , 50 , 100 )مكغم/مل وتراكيزمن مستضد OMPs (50 , 100 , 200) مكغم/مل وتراكيز من مستضد LOS(200,100,50) مكغم /مل الى انخفاض معنوي (0.05 P <)في النسبة المئوية لعيوشية خلايا PMNs والخلايا اللمفاوية مقارنة بالسيطرة ,كما ادى استخدام التراكيز اعلاه ولكل المستضدات الثلاثة الى خفض معنوي في قطر منطقة الهجرة لخلايا PMNs . حيث كانت لجميع هذه التراكيز وللمستضدات الثلاثة تاثيرا مثبطا لهجرة خلايا PMNs وان تدرج التثبيط يزداد بصورة معنوية بزيادة تركيز المستضدات . اما فيما يخص عملية البلعمة التي استخدم فيها مستضد الشعيرات وOMPs وبالتراكيز (25 , 50 , 100 مكغم/مل) و(50 , 100 , 200 مكغم/مل) على التوالي , فقد لوحظ ازدياد معدل معامل البلعمة تدريجيا مع الزمن وبشكل معنوي (0.05 < P) حتى وصل اقصاه عند الوقت 90 دقيقة ، ثم انخفض بعد ذلك خلال الوقت 120 دقيقة ولجميع التراكيز المستعملة ولكلا المستضدين ، اما بالنسبة لمستضد LOS فقد لوحظ ان معدل معامل البلعمة يزداد وبصورة طفيفة وتدريجية واصبح بشكل معنوي عند الوقت 90 دقيقة من المعاملة ولجميع التراكيز المستعملة (200,100,50 ) مكغم /مل ,الا انه لم تظهر هنالك فروقات معنوية ( 0.05 P>) بين التركيزين (100 و200)مكغم /مل عند الاوقات (120,60,30) دقيقة ، كما وازدادت النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية المكونة للتشكل الزهري التائي الفعال والكلي وكذلك التشكل الزهري البائي وبتاثير معنوي (< 0.05 P) للمستضدات الثلاثة (الشعيرات , OMPs ,LOS)عند التراكيز نفسها مقارنة مع معامل السيطرة . اوضحت نتائج تجربة تمنيع الحيوانات المختبرية (الارانب )بمستضد الشعيرات وOMPs وLOS والمعدل المناعي (Immunoferon) امكانية الحصول على اجسام مضادة للمستضدات المستخدمة والتي استدل على وجودها باستخدام اختبار الترسيب في الانابيب ,حيث ظهرت حلقة ترسيب في الانابيب الحاوية على مصل الارنب الممنع بهذه المستضدات والمعدل المناعي عند التراكيز( 140,50,200,100) مكغم/مل على الترتيب ، في حين لم يظهر اختبار الانتشار المناعي المزدوج في هلام الاكروز (اختبارOuchterlony) اي نتيجة موجبة عند استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات وLOS وImmunoferon عدا مستضد OMPs حيث ظهر خط ترسيبي مفرد عند التركيز 200 مكغم /مل .وان هذه النتائج تشير الى امكانية استخدام هذه المستضدات كمعدلات مناعية لقابليتها على تحفيز الخلايا اللمفاوية البائية على تكوين | Sixteen isolate of Moraxella catarrhalis was diagnostic from a total of 344 pathogenic specimens , Moraxella catarrhalis was isolated and identified in a percentage of 17.4% .Isolates of M.catarrhalis were distributed amony source of the pathogenic specimens to (30,27.6,12.5,11.7,6.7) % for swabs from ear, nose, sputum specimens, pharynex, and tonsiles, respectively. Specimens were collected from male and female patients of different age groups referred to the Ear Nose & Throat and Chest consultants clinics in Al - Hakim general hospital in Najaf Governorate from the period of June, 2004 to December, 2004.Cultural, microscopical, and biochemical characteristics were considered for diagnosis of this bacteria, in addition to use of API - NH system.Higher incidence of bacteria was detected in women (18.8 %) compared to men (16.3%).Age group of (1 - 10) year was the dominant infected group (20.4%) among others .To investigate the nature of resistant to various antibiotics ,the isolates were subjected to the sensitivity test of 12 antibiotics which are routinely used in treatment of infections caused by this organism.All isolates were exhibited complete resistance (100 %) to Ampicillin, Amoxycillin, and Ttetracycline, moderatly resistant in a percentages of (73.3 ,71.7,66.7,61.7,60,58.3)% for each Cefotaxime, Ciprofloxaciy, Nitrofurantoin, Nalidixic acid, Cephalothin, Gentamycin, respectively. While, sensitive to Chloramphenicol ,Cephalexin ,Pipracillin when their resistance reached only ( 38.3 , 36.7 ,30)% ,respectively. All isolates exhibited multiple resistance for many antibiotic used in this study ,and 91.7% of isolates presented the ability to produce β - Lactamase enzyme .To investigate the pathogenicity factors for M. catarrhalis such as adhesion and colonization factors, all isolates showed the ability to produce CFA/I and CFA/III in apercentage of 93.3,96.7 %, respectively. Whereas, non of the isolates showed no ability to produce CFA/II .Twenty two (36.7 %) of M.catarrhalis isolates only were able to produce extracellular protease, but all isolates were unable to produce hemolycin, sidrophores, and capsule. To detect the ability of isolates to produce fimbriae ,pellicle formation test was done, and it was found that 80 % of isolates were formed this pellicle when it was grown in the broth culture media .At the same time ,85% of isolates were found to be able to cause agglutination of human blood type O+ “ in order to detect the precence of adhesion in the bacteria which make it able to attach into carbohydrate specific receptors named (Galα - 4Galβ)which presented on the surface of human blood erythrocyte” .The fimbriated –hemagglutinated isolate (MO6) and non fimbriated - hemagglutinated isolate(MO1) were used to compared the bacterial adherenc rate on human uroepithelial cells with non fimbriated –non hemagglutinated isolate(MPn6) .The adherence rate of (MO6) isolate was 54.1 bacterial cells / epithelial cell Morethan that of (MO1) and(MPn6) isolates which presented in 23.9 , 9.6 bacterial cells /epithelial cell,respectively . Hemagglutination patterns for all isolates were done by using human ,bovine ,chicken and guinea pig ,respectively in Hemagglutination test. RRRN patterns the highere incidence pattern presented in 33.3% from all isolates . One isolate (MO6) was selected to be used in the following experiment as it is considered efficient and fimbriated with consistent antigenic properties and its typical biochemical characteristics such as extraction of adherence factors antigens (fimbriae ,outer membrane proteins and lipooligosaccharide).Second Aspect : Extraction and Purification of Antigens. - Fimbria antigen was extracted from MO6 producted isolate by using ultracentrifugation and ammonium sulfate in a different saturation percentages for fimbriae separation and extracted protein precipitation ,respectively .The protein concentration in this antigen was estimated which was 0.525 mg/ml. - RNase ,DNase (enzymes)and N - lauroyl sarcosinate(Detergent) were used to extract OMPs ,from selected isolate (MO6).Protein concentration of the purified extracted OMPs was estimated and found to be 0.6 mg/ml. Lipooligosacchoride (LOS) was extracted after cells were broken by the above enzymes .The extraction was performed by hot - phenol .After the aqueous and phenolic phases were separated, it was detoxified for each phases by using anhydrous hydrazine, and total carbohydrate quantities were estimated for each phase which were 300,190µg/ml , respectively . Morever,LOS bounded protein quantity in each phase was also estimated. The percentages of the protein bounded to LOS for aqueous and phenolic phases were 13.3 , 11.8 %,respectively .Third Aspect : Immunological StudiesThis aspect was investigated the effect of fimbriae ,OMPs which are partially purified, and detoxified LOS antigens isolated from M. catarrhalis (MO6) on immunoresponse and showed the role of this three antigens in activation or inhibition of some immunocellular activity. The following (In vitro)immunological tests were performed; Viability of PMNs and lymphocyte, B and T rosette forming assay ,migration of PMNs, and phagocytosis of Candida albicans . The concentration of fimbriae (25,50,100) µg/ml , OMPs (50,100,200) µg/ml and LOS(50,100,200) µg/ml decreased the viability percentage of PMNs and lymphocyte with significant differences (P<0.05) in comparison to the control treatment ,while, these concentration for each antigens inhibited the migration of PMNs cells in asignificant differences and the gradual inhibition decreased significantly with increase of antigens concentration . The concentration of fimbriae ( 25 , 50 , 100) µg/ml and OMPs (50, 100 , 200 ) µg/ml increased the phagocytic index (PI) Significantly and gradually with time untile it reach the maximum at time 90 min. Then PI decrease at the time 120 minutes . For all concentration of each antigens LOS antigen increase the PI significantly at 90 min. for all concentration but its non significant (P>0.05) at times (30,60,120)minutes between (100,200) µg/ml concentration .All concentration used for these antigens (fimbriae ,OMPs ,LOS) increased the percentage of T and B rosette assay with high signfacant differences in comparison to control . The study showed that rabbit immunized by fimbriae ,OMPs,LOS, and Immunoferon produced antibodies against these antigens which were detected by Ouchterlony double diffusion test which showed no precipitin line between any antigens and serum of immunized rabbit except OMPs showed single precipitin line at concentration 200 μg/ml ,While there was clear ring of precipitin was formed in the second method (tube precipitation test) .These results showed the ability of these antigens to act as immunomodulators due to their ability to stimulate β - lymphocyte to produce antibodies similar to immunoferon

دراسة تاثير بعض العوامل الخارجية في بقاء والتصاق بكتريا Acinetobacter baumannii على السطوح غير الحية == Study the effect of some external factors on survival and adherance of Acinetobacter baumannii on abiotic surfaces

اسم المؤلف: حنين اكرم حبيب
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت عزلات من بكتريا Acinetobacter baumannii من سطوح غير حية مختلفة شملت قضبان الاسرة ومقابض الابواب والمغاسل والاغطية والوسائد وملابس العاملين , وقد تم الحصول على (149) عينة من مستشفى الكندي التعليمي , اذ زرعت العينات على اوساط زرعية صلبة (الماكونكي واكارالدم) ,وعلى ضوء التشخيص المجهري والزرعي والكيموحيوي , ومن ثم استخدم نظام Api 2o - E فقد تم الحصول على 16 عزلة من بكتريا A.baumannii وبنسب مئوية للعزل مقدارها (6.25 , 12.5 , 18.75 , 25 , 37.5) % لمسحات قضبان الاسرة , مقابض الابواب , المغاسل , الاغطية والوسائد , وملابس العاملين على التوالي . الخطوة الثانية تضمنت التحري عن العزلات البكتيرية المتحركة من بين 16 عزلة حيث كانت جميع العزلات البكتيرية متحركة حركة ارتعاشية على وسط الحركة شبه الصلب . اختبرت قابلية العزلات على الالتصاق وتكوين الغشاء الحيوي لعزلات بكتريا A.baumannii على السطوح غير الحية المصنعة من مواد مختلفة ( البلاستيك , الفولاذ والمسمى محليا ( Stainless steel) , البورسلين , الخزف , الخشب , الفورميكا , الزجاج , البوليستايرين ) وذلك بوضع كمية محددة من العالق الخلوي على تلك الاسطح ثم حضنها تحت درجات حرارية مختلفة وهي درجة حرارة الثلاجة (4)م درجة حرارة الغرفة - 20)25 (م ودرجة حرارة الحضن )37 (م ولفترات زمنية مختلفة (72,48,24) ساعة ومن ثم عمل مسحة لتلك الاسطح وزرعها على وسطBrain Heart Infusion Agar لمدة 24 ساعة تحت درجة حرارة 37 م لملاحظة مدى حيوية خلايا بكتريا A.baumannii او بعمل سلايد لسطوح الزجاج والبوليستايرين وقد اظهرت هذه النتائج ان هذه البكتريا تلتصق على السطوح غير الحية وبنسب متقاربة ما عدا الخشب فقد اظهرت البكتريا التصاقا قليلا على هذا السطح .

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

اسم المؤلف: حنان طارق صبحي
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي == Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

اسم المؤلف: حسين ظاهر عليوي التميمي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

تحديد مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين والابيشتاين بار فايروس في امصال المرضى العراقيين المصابين باللاهودجكن اللمفاوي == Detection of interleukin 10 , Adiponectin and Epstein Bar Virus in sera of Iraqi patients with Non - Hodgkin's lymphoma

اسم المؤلف: حسنين سمير الهاشمي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | زياد احمد شبيب الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد مرض اللاهودجكن اللمفاوي مجموعة من سرطانات الخلايا اللمفاوية والذي تتطورفيه الخلايا المفاوية بطريقة خاطئه مؤدية الى اضطرابات مناعية .تم خلال الدراسة الحالية تقييم بعض المؤشرات المناعية في امصال (46) عراقيا من مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ومقارنتها مع (46) فردا مضاهيا من الاصحاء ظاهريا .اجريت الدراسة في المركز الوطني لبحوث وعلاج امراض الدم وفي قسم علوم الحياة في الجامعة المستنصريه منذ كانون الثاني الى حزيران من العام 2013. هدفت الدراسة لتقييم مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين واضداد (EBV) في امصال مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ودراسة اثر هذه المتغيرات في الامراضية والتنبؤ بسير المرض وكيف يؤثر بعضها في البعض .كان 31 (67%) مريضا (≥ 50) سنة و15 (33%) منهم باعمار(<50) سنة . وكان متوسط اعمار المرضى (52.74متوسط± 2.18) اذ تراوحت اعمارهم بين (17 - 80) سنة وقد بينت نتائج الدراسة ان الذكور هم اكثر عرضه للاصابة بالمرض مقارنة بالاناث وبنسبة 1 : 1.7 . كما تبين من الدراسة هنالك فروقات معنوية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين (50≤ و50≥) فضلا عن الفروقات كانت معنويه(0.05 > p) بينهما في مستويات الاضداد (EBV IgM) في الوقت الذي لم تكن الفروق معنويه (0.05 < p) لاضداد (EBV IgG) . تبين كذلك ان هنالك فروقات في مستويات الاديبونكتين المصلية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين في ما لم تكن الفروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الانترليوكين 10 بين المجوعتين العمريتين . عند تقسيم المرضى تبعا للجنس 29 ذكر و17 انثى , بينت النتائج ان هناك فروقات معنوية في اعداد خلايا الدم البيض بين الجنسين (17.32*109/لتر ± 6.87 ذكور , 5.80*109/لتر± 0,85 اناث) (0.05 > p).وبشان مستويات اضداد EBV (IgM,IgG) لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) بين كلا الجنسين , كما لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الاديبونكتين . فيما كانت الفروقات ذات دلاله معنويه في مستويات الانترليوكين 10 (23.77 بيكو غرام / مل ±6.58ذكور , 12.06 بيكوغرام/مل ±3.77 اناث ) (0.05 > وبمقارنة المرضى بالاصحاء كانت هناك فروقات معنوية (0.05 > p) في اعداد كريات الدم البيضاء فما لم تكن الفروقات معنوية (0.05 < p) بالنسبة EBV (IgM,IgG) .اما مستويات الاديبونكتين المصلية فقد انخفضت معنويا في امصال مرضى اللاهودجكن المفاوية (وان بقيت مستوياتها ضمن الحدود الطبيعيه ) بالمقارنة مع الاحصاء (0.05 > p).سجلت النتائج ارتفاعا معنويا (0.05 > p) في مستويات الانترليوكين 10 (18.67بيكو غرام/مل ±4.12 )بالمقارنة مع مستوياته (3.4بيكوغرام /غرام ±0.73) عند مجموعة الاصحاء , كما لوحظ ان هنالك ارتفاعا معنويا (0.05 > p) اخر في امصال اللاهودجكن ذوي المراحل المتقدمة (33.1 بيكو غرام /مل ± 4.5) عند مقارنتهم بالمرضى في المراحل المبكرة (13.4 بيكو غرام /مل ± 2.7) (0.05 > p)وعلى العكس من ذلك انخفضت مستويات الاديبونكتين معنويا (0.05 > p)في المراحل المتقدمة من المرض (4.53مايكروغرام /مل ±1.4 ) مقارنة بالمراحل المبكرة (6.79مايكرو غرام /مل ±1.1). بينت نتائج التحليل الاحصائي انه ليس هنالك ثمة علاقة معنويه (0.05 < p)بين الانترليوكين 10 والاديبونكتين عند مرضى اللاهودجكن اللمفاوي في جميع مراحلة . خلصت الدراسة بالاستنتاج ان حالات اللاهودجكن المدروسة اكثر حدوثا في فئات عمرية فوق الخمسين سنة بالمقارنة مع من هم تحت ال 50 سنة وترافقهزايادة في مستويات الانترليوكين 10 مع تقدم عمر المريض وارتباطها كذلك مع شدة المرض مما قد يعكس القيمة التنبؤية لهذا السياتوكين . فيما ارتبط انخفاض مستويات الاديبونكتين مع ارتفاع خطورة الاصابة بالمرض ومع اشتداد المرض . يرتبط الانخفاض في مستويات الاديبونكتين عكسيا مع مؤشر كتلة الجسم (BMI). سجل خلال الدراسة انخفاض مستويات (EBV IgM) في المرضى باستخدام تقنية الايلايزا يعكس الحاجة لاستخدام تقنيات اخرى للكشف عن الفايروس المختبىئ . | Non hodgkin's lymphoma (NHL) is a group of cancers of the lymphocytes. In NHL, the lymphocytes develop in a wrong way led to immune disorder. The present study was carried out to evaluate some immunological parameters in the sera of (46) NHL Iraqi patients , In addition to control group involving (46) matched apparently healthy subjects. This study was done in the National center of hematology & Department of biology at AL - Mustansiyria University since January to June 2013.The aim of this study is to estimate the levels of Interleukin 10, Adiponectin and EBV infection in sera of patients with NHL and to study the impact of these parameters on the pathogenesis and predictive of the disease and how they correlated.There were 31 out of 46 (67%) patients with age group ≥50 years and 15 out of 46(33%) patients with age group <50 years. The mean age of NHL patients was (52.74) years ranging from 17 to 80 years. The patients were divided into two groups according to the age(≥50years and <50 years)patients .There was statistically significant difference (p<0.05) in White blood cells count between age groups . The mean of adiponectin serum level was significantly differ (p<0.05) between the two age groups.The mean of IL - 10 serum levels did not show a significant difference between the two age groups (p>0.05).The mean of adiponectin serum level in NHL patients wasn't significantly (P>0.50) differ between male and female while the IL - 10 level in serum was significantly different (23.77pg/ml ± 6.58 male, 12.06 pg/ml ± 3.77 female) (P<0.05).When the patients of NHL compared with control, the mean of white blood cell count was significantly different ( p<0.05) also there was non - significant differences(P>0.05) in mean of EBV - IgG & IgM among NHL patients and control group. The mean level of adiponectin serum was a statistically decreased in patients of NHL as compared with control subjects(p<0.05), but still these levels are within normal range, furthermore The levels of interleukin 10 were significantly increased in patients with NHL compared with healthy subjects (18.67 ± 4.12 pg/ml vs. 3.4 ± 0.73pg/ml) (p<0.05). Higher increasing of IL - 10 levels in the advanced stage patients of NHL was noticed compared with early stages (33.1 ± 4.5 pg/ml vs. 13.4 ± 2.7 pg/ml) (P<0.05). Otherwise the serum levels of adiponectin in aggressive stage of NHL patients was decreased compared to the early stages of that disease (4.53 ± 1.4 µg/ml vs. 6.79 ± 1.1 µg/ml ) (P<0.05). There was no significant negative correlation between IL - 10 and adiponectin in all NHL patients (p>0.05) also there was no significant correlation between IL - 10 and adiponectin in patients with advanced stage (p>0.05). In conclusion, NHL was noticed in the highest ages and it might indicates the increasing rates of NHL among older population. in addition increasing level of IL10 is associated with increasing age range and also correlated positively with aggressive NHL cases that might indicates the predictive pivotal role of this cytokine . Moreover, Lower adiponectin levels are associated with an increased risk of NHL. Adiponectin is inversely correlated with Body mass index and also it was decreased in aggressive cases compared to early stages. The low percentage of EBV IgM in NHL patients by using Elisa technique might indicates the Necessity for using other advanced technique to detect EBV infection either an action or silent form

دراسة بكتيرية ومناعية للانظيم الحال للبروتين نوع - ا - المستخلص من بكتيريا Proteus mirabilis المعزولة من خمج السبل البولية == Bacteriological and Immunological Study of IgA - Protease Enzyme Extracted from Proteus mirabilis Isolated from Urinary tract infection

اسم المؤلف: حسن علي حسين السعدي
اسم المشرف: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة اربعة محاور : 1 - العزل والتشخيص : تم عزل وتشخيص (40 ) عزلة من بكتيريا Proteus spp. من مجموع ( 200 ) عزلة بكتيرية من عينات اخماج مرضى السبل البولية في مستشفيي مدينة الطب والكندي للفترة بين 1/3/2004 لغاية 30/10/2004.اظهرت الفحوصات الكيميائية الحيوية ان 40 عزلة بكتيرية (20% ) من العزلات البكتيرية كانت تنتمي الى جنس Proteus والتي اشتملت على ( 37 ) عزلة تعود الى بكتيريا)P. mirabilis18.5%) ثلاث عزلات من بكتيريا Proteus vulgaris. عشر عزلات من بكتيريا P. mirabilis كانت منتجة للانظيم الحال للبروتين (IgA Protease)، بينما كانت عزلات بكتيريا Proteus vulgaris غير منتجة للانظيم المذكور ،واختيرت العزلة (Pm5)P.mirabilis كعزلة منتجة للانظيم.2 - تنقية وتوصيف الانظيم : اختير الوسط مرق ( Cysteine lactose electrolyte deficient ) كافضل وسط زرعي لانتاج الانظيم من بكتيريا Proteus mirabilis وتم تنمية العــــزلة البكتيريـــة( Pm5) في درجة حرارة( 37 )م باستخدام الحاضنة الهزازة وثم نقي الانظيم باستخدام الترسيب ملح كبريتات الامونيوم بتشبع(60%) وديلزته واستخدام هلام السيفادكس G - 100 Sephadex وكذلك المبادل الايوني DEAE - Cellulose، قيست الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين للانظيم في كل مرحلة من مراحل التنقية ظهر منحني تنقية الانظيم باستخدام هلام السيفادكس وجود اربعة قمم بروتينية منها قمة واحدة للانظيم الحال للبروتين بينما اظهرت طريقة استخدام المبادل الايوني قمة واحدة فقط، تم حساب الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين والفعالية النوعية والفعالية الكلية وعدد مرات التنقية والحصيلة الانظيمية فكانت على التوالي : (28.7)وحدة/مل،(0.15)ملغم/مل، (191.3)وحدة/ملغم، (258.3)، (5.5)،(9.9%) عند التنقية باستخدام المبادل الايوني وحسب الوزن الجزيئي للانظيم اذ كان (50)كيلودالتون باستخدام طريقة الترشيح الهلامي وكانت الفعالية المثلى للانظيم عند الاس الهيدروجيني 8 ودرجة الحرارة المثلى لانتاج الانظيم هي (37)م ودرجة الحرارة الملائمة لخزن الانظيم هي (4)م مقدارها وكان للايون (Ca+2) تاثير واضح في زيادة فعالية الانظيم بينما كان للـEDTA تاثير مثبط على فعالية الانظيم. 3 - الدراسة المناعية : - استعملت ثلاث مجاميع من الارانب لغرض التمنيع (ارنبين لكل مجموعة) حقنت داخل العضلة باستعمال تراكيز مختلفة من الانظيم(0.2،0.5،1)ملغم/مل فضلا عن ارنبين ضمن مجموعة السيطرة. اتبعت طريقتين (الاوكترلوني والترسيب باستعمال الانابيب) لغرض التحري عن الاضداد المتخصصة للانضيم الحال للبروتين في مصل الارنب، اظهرت النتائج عدم تكون الخط الترسيبي عند استعمال طريقة الاوكترلوني بينما تكونت حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب. تم فصل امينوكلوبيولينات الارنب باستعمال المبادل الايوني DEAE - Cellulose بعد عملية الفصل ظهرت ثلاث قمم بروتينية على الطول الموجي 280 نانوميتر تم اختبار فعالية الانظيم في كل قمة مقارنة بالقمم المؤشرة في الادبيات، اظهرت القمة الثالثة حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب بينما لم تظهر خط ترسيبي باستعمال اختبار الاوكترلوني وهذا قد يدلل على وجود تحت الانواع IgG المقاومة لفعالية الانظيم الحال للبروتين ضمن هذه القمة. تم دراسة تاثير التراكيز المختلفة للانظيم الحال للبروتين (0.2، 0.5، 1)ملغم/مل على بعض الخلايا المناعية وفق المعايير التالية : اذ ادى تركيز الانظيم(0.2)ملغم/مل الى زيادة في عيوشية الخلايا اللمفاوية وخلايا متعددة النوى (PMNs) وعلى التشكل الزهري التائي والبائي وعملية التهام الخميرة المقتولة في الزجاج واختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم (NBT) ومعامل الانقسام الخيطي في الفئران. 4 - الدراسة النسجية : - درست التغيرات النسجية المختلفة في الارانب الممنعة بالانظيم الحال للبروتين بتركيز((0.2 ملغم/مل فكان له تاثيرا واضحا على انسجة الكبد، الرئة، الكلية والطحال،اذ لوحظ وجود مناطق تنكس استسقائي شديد في هيولي خلايا الكبد مع احتقان الوريد المركزي في نسيج الكبد، كمالوحظ وجود خلايا التهابية في جدران الاسناخ وضمور تجويف الاسناخ في الرئة، بينما توسعت محفظة بومان مع ارتشاح بعض الخلايا الالتهابية وخاصة حول الكبيبات في الكلية، اما في الطحال ازداد عدد الخلايا التائية حول الشرين المركزي كذلك الخلايا البائية في باقي اللب الابيض في الطحال نتيجة لتكاثرها وفرط نموها. | This study was included four aspects : - 1 - Isolation and ldentifcation : Forty isolates of Proteus spp were isolated and identified among (200) bacterial isolates from patients samples with urinary tracts infection in two hospitals (Baghdad and Al - Kindy). Biochemical tests were showed (20 %) from bacterial isolates were belonged for genus Proteus (37) isolates replied to Proteus mirabilis with (18.5 %) and (3) isolates were for Proteus vulgaris. Ten isolates from Proteus mirabilis were producing for IgA protease while P.vulgaris isolates were non - producing for this enzyme. Proteus mirabilis (Pm5 ) was selected among isolates efficient producing isolate(Pm5). 2 - Purification and characterization of the enzyme : Cysteine lactose electrolyte deficient medium was selected as the best medium for culturing for production the enzyme by P. mirabilis. Bacterial isolate (Pm5) to produce protease, then protease was purified by application Ammonium sulfate with (60 %) saturated, dialysis, Sephadex G - 100 filtration, and Ion exchange with DEAE. Cellulose. The enzymatic activity and protein concentration were measured in every stage of purification. Four peaks were appeared one of them belong to IgA - protease activity, while by using Ionic exchange method was appeared only one peak. Enzymatic activity, protein concentration, specific activity, total activity, no. of purification, and enzymatic yield were determined in Ionic exchange technique were : ( 28.7) U/ml,(0.15)mg/ml,(191.3)U/ml,(258.3),(5.5),(9.9%) respectively, molecular weight of the enzyme was performed by using gel filtration was (50)Kd. The optimum activity was at pH (8), the optimum temperature with the enzymatic activity was at (37) ˚C, the suitable temperature for storage with enzymatic activity was at (4) ˚C, the (Ca+2) Ion has on effect on increasing the enzymatic activity, while the EDTA was suppressed activity. 3 - Immunological study : Three groups of rabbits were used for immunization (two rabbits for each group in addition to control were injected intramuscular by different enzyme concentrations (0.2, 0.5, 1) mg/ml. Two methods (Ouchterlony and tube precipitation are used for checking up specific protease antibody in rabbit serum. Results showed no precipitin line between enzyme as antigen and serum in (Ouchterlony) while there was clear ring of precipitin was formed in the second method. Rabbit immunoglobulines were separated by using DEAE - Cellulose results showed three peaks protein at (280) nm wave length absorbency, enzyme activity of each peak was tested. In comparing these peaks with standard rabbit immunoglobulines. The third peak was tested against IgA - protease by using tube precipitation test result showed precipitation ring. This result indicated that this peak may include IgG subclasses which are resist protease activity while other peaks were opsonized by the enzyme. The effects of the IgA protease concentration (0.2, 0.5,1) mg/ml on immune cells were studied according the following parameters : the effect of the enzyme on immune and (PMNs) cells, T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice, (0.2) mg/ml of the enzyme has an effect on induction activity of T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice. 4 - Histological aspect : Different pathological changes were shown on rabbit’s tissues (liver, lung, kidney and spleen) which were immunized with IgA protease (0.2)mg/ml. In liver great hydropic degeneration was noticed in the cytoplasm in addition to present an with congestion of central venule, inflammatory cells in the alveolar walls and alveolar cavity atrophy in lung, enlargement of Bouman s capsule with infiltration of phagocytes around glomerulus was shown in kidney, while in spleen T cells around central arteriole as well as B cells in other white pulp were increased as a result of proliferation .

تاثـيــر فعالية الانتيروسين المنتج من بكتريا faecium Enterococcus على بعض البكتريا المرضية المعزولة من مصادر مختلفة == Activity effect of enterocin produced from Enterococcus faecium on some pathogenic bacteria isolated from different sources

اسم المؤلف: حسام سامي عويد الشمري
اسم المشرف: خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تـتـناول هــذه الـــدراســة تاثـيـر الانتيـروســـين المنتــج بــواســطــة بكــتــريا E.faecium ضـــد بــعــض البكتــريا الــمـمـرضــة المـتـواجـــدة بكثرة في الحـليب ومشتقاته. فقد تم لهذا الغـرض جمع 382عينة من اطفال يعانون حالات اسهال والتهاب السبيل البولي والحليب الخام لعـزل بكتريا E.faecium وتم تشخيص العزلات بالفحوصات الكيموحيوية وتاكيد تشخيصها باستعمال منظومة فايتك 2 . فضلا عن ذلك فقـد تم جمع 50 عينة لعـزل بكتريا Listeria monocytogenes و66 عينة لعزل بكتريا Salmonella typhimurium من الحليب الخام ومشتقاته وتم تشخيصهما باتباع الفحوصات الكيموحيوية وتاكيد التشخيص باستعمال Api Listeria وApi - 20Eاضافة الى التنميط المصلي لبكتريا Salmonella typhimurium . تم تقصي انتاج الانتيروسين المنتج بواسطةE. faecium باستعمال طريقتي اقراص الاكار والانتشار في الحفر , ونقي الانتيروسين باستعمال الترسيب بسلفات الامونيوم والفصل بكحول البيوتانول , كما تم الكشف عن حساسية البكتريوسين المنتج لمجموعة واسعة من الانزيمات الحالة للبروتين والدهون وبعض الانزيمات الاخرى .فضلا عن ذلك فقد تمت دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني على البكتريوسين المنتج , وتم اختبار تراكيز مختلفة من المايتومايسين - سي لحث الانتيروسين .اختبرت الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات بكتريا اللستيريا والسالمونيلا والمكورات المعوية باستخدام طريقة كيربي - باور .يمكن تلخيص النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : كانت نسبة عـزل E. faecium 7.59)%) من مجموع 382 عينة , اما نسبـة عـزل Listeria monocytogenes 10)%) من مجموع 50 عينة , اما نـسبـة عـزل Salmonella typhimurium فقد كانت .06)6%) من مجموع 66 عينة . اظهـر الانتيروســين المنتـج بواســطة E. faecium طـيفا واسعا من التاثير ضـد البكتريا الاختبار المـوجبة والسالبة لصبغـة غــرام التي عددها 8 وبضمـنها Listeria monocytogenes وSalmonella typhimurium . اظهر الحث بالمايتومايسين - سي )بتركيزي 1.5 و2 مكغم/ مل( انتاجا عاليا للانتيروسين . ادت تنقية الانتيروسين جزئيا باستعمال الترسيب بنسبة 80 % الى اعطاء اعلى نتيجة عندما بلغت 2.225 وحدة / مكغم بروتين , اما الفصل بكحـول البيوتانول فقد اعطى محصولا وصــل الى 0.57 وحدة / مكغم بروتين . ادت معاملة الانتيروسين بالانزيمات وتلك الحالة للبروتين حساسية الانتيروسين تجاه هذه الانزيمات باستثناء انزيمات Lipase وCatalase وα - amylaseو Lysozyme . اظهـرت تجارب المعاملة بالحرارة مقاومة الانتيروسين للحرارة وحتى عند121ºC لمدة 20 دقيقة , في حين كان مدى الاس الهيدروجيني له 4 - 9 .اظهرت تجارب الحساسية للمضادات الحيوية ان Enterococcus faecium كانت حساسة الى 7 مضادات حيوية . وكانت بكتريا Listeria monocytogenes مقاومة الى 9 مضادات حيوية وبكتريا Salmonella typhimurium مقاومة الى 4 مضادات حيوية .امكن الحصول على النتائج وكما يلي : انتجت عزلات Enterococcus faecium الانتيروسين بكميات واطئه فيما امكن حثه باستعمال المادة الحاثة المايتومايسين - سي , وامكن تنقيتها جزئيا باستعمال مرسبات البروتين . اتصف الانتيروسين المنتج من هذه البكتريا بطيف واسع النطاق من التاثير ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام ولاسيما تلك التي تلوث الحليب ومشتقاته . | This study investigate the effect of bacteriocin by Enterococcus faecium against some pathogenic bacteria frequently found in milk and dairy product. Three hundred eighty two sample collected from patients and raw milk were used for isolation of E.faecium the isolates were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Vitek 2 system . In addition Listeria monocytogenes , Salmonella typhimurium were isolated from milk and dairy products these were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Api Listeria and Api - 20E system in addition to serotyping to bacteria Salmonella typhimurium . Enterocin produced by E.faecium detected using tow methods Cup agar and Well diffusion and partially - purified using ammonium sulfate precipitation and n - butanol partition , the sensitivity of the material was tested against diverse group of proteolytic , lipolytic and some other enzymes. In addition the effect of temperature as well as pH an the bacteriocin were tested . and used different concentration of Mitomycin - C to induce enterocin . Antibiotic sensitivity of Listeria and Salmonella and Enterococcus isolates were tested using Kirby - Bauer method. The results showed the followings : The isolation rate of E . faecium was (7.59%) from 382 sample , L. monocytogenes isolation rate approach (10%) from 50 sample , S.typhimurium isolation rate reached (6.06%) from 66 sample .Enterocin produce by E . faecium demonstrated a broad - spectrum effect against both gram positive and gram negative bacteria including Listeria monocytogenes and Salmonella typhimurium . Mitomycin - C induction was used to induce a high level production of Enterocin the concentration of optimum inducing agent was 1.5 - 2 mg /ml. The enterocin was partially purified eighty percent of Ammonium sulfate give the highest yield reaching 2.225 Unit /mg protein , n - butanol partition yield 0.57 Unit/mg protein. Enzymatic effect on enterocin demonstrated that proteolytic enzymes completely inactivated the bacteriocin , other enzymes including Lipases Catalase demonstrated no effect. α - amylase , Lysozyme ,The Enterocin was heat - resistance at even 121º C for 20 minute , the optimum pH was shown to be 4 - 9 .Enterococcus faecium was highly sensitive to 7 antibiotic used .and Listeria monocytogenes was highly resistance to 9 antibiotic and Salmonella typhimurium was resistance to 4 antibiotic . In results E . faecium produce enterocin at low level which was induced to high level yield using Mitomycin - C , the enterocin could be partially purified using precipitators protein, That enterocin product of this bacteria characterized a broad spectrum against positive and negative gram bacteria including contaminate milk and its products

تقييم العلاج التصليبي للكيس الكلوي البسيط == Diagnosis and Sclerotherapy evaluation of Simple renal cyst

اسم المؤلف: جميلة عيسى كاظم الموسوي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي | يعرب ادريس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اعتمدت معالجة الكــيس الكلـــوي البسـيـط (Simple renal cyst) سابقا على اجراء العمليات الجراحية لازالة الكيس واستخدام قثطرة البولي اثيلين (Polyethylene Catheter) في اجراء عملية الارتشاف البسيط (Simple aspiration) فقط او مع تشريب العلاج الصليبي عن طريق الجلد (Percutaneous sclerotherapeutic instillation ) .اما دراستنا والتي استغرقت عاما واحدا ابتداء من ايلول 2001 ولغاية ايلول 2002 بواقع (31) مريضا يعانون من مرض الكيس الكلوي البسيط الذي شخص لديهم اشعاعيا وسريريا, فقد اعتمدت على اختراق الكيس عن طريق الجلد باستخدام الرشف بالابرة الدقيقة(FNA) (Fine needle aspiration ) وتحت سيطرة جهاز التصوير فوق الصوتي(U/S)(Ultrasonography) في علاج هذا النوع من الاكياس باجراء عملية الارتشاف مع تشريب نوعين من العوامل التصليبية (Sclerosing agent ) اذ استخدمنا عقار التتراسايكلين بشكل اساسي ولاول مرة وفي حالتين فقط استخدمنا الكحول الاثيلي ).95%( وتلى ذلك متابعة المرضى وبشكل منتظم بعد العلاج مدة تراوحت بين الشهر الى ثلاثة اشهر .وكذلك اجريت اختبارات تفريقية للسائل المرتشف تضمنت اختبارات بايوكيميائية وخلوية للتوصل الى افضل طريقة لتشخيص انواع الاصابات التكيسية والتي شملت (الاكياس البسيطة والالتهابية والنزفية والسرطانية). واخيرا تم التوصل الى النتائج التالية اذ ظهر ان اجمالي دقة التشخيص المستخدم في هذه الدراسة كان بنسبة(100%) وقد وصلت النسبة المئوية للاستجابة السريعة للعلاج (67.7%) اما النسبة المئوية لعودة الكيس الى الظهور فلم تتجاوز (6.4%). هذا ومن الجدير بالذكر ان في هذه الدراسة لم تحصل اية مضاعفات غير محسوبة. | Traditinally the mangment of simple renal cyst has been based on the proceeding of surgical operations or by using the polyethelen catheter for simple aspiration and/lor with percataneous sclero / therapeutic instillation.Our study which was over one year period, starting from sept. 2001 to sept. 2002, (32) patients with clinical - radiological diagnosis of simple renal cyst underwent percutaneous fine needle aspiration of the kidney underultra sonic guidance and further manged using two type of sclerotherapeutic agents (like tetracycline Amp. which used mainly in most of our cases, and ethylalcohol (95%) which used only two cases) post sclerotherapy eutic in aperiod between (1 - 3) months post aspiration close regular follow up of all patient, for aperiod from (1 - 3) months post aspiration.Full physical, biochemical & cytological laboratory evaluation of the aspiration fluid has been done in all cases to diagnostic, simple, complicated, neoplastic cysts.Finally the overall aecuracy of the diagnostic procedur was (100%) and the percantage of dromatic respons to treatment was (67.7%) while the recurred percentages no more than (6.4%). So in this study no complication was encountered.

تاثير انزيمي اللايبيز والبروتيز المنتجين من بكتريا Pseudomonas fluorescens في فساد اللحم والحليب == Effect of Lipase and Protease enzymes produced from Pseudomonas fluorescens on Spoilage of Milk and Meat

اسم المؤلف: ثناء ماجد زاير النوري
اسم المشرف: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ( 75 ) عينة من المصادر المحلية شملت الحليب الخام ، واللحم البقري الطازج ، وتربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز ، عزلت منها ( 45) عزلة بكتيرية تعود الى جنس Pseudomonas ، وتم عزلها باستخدام وسطين : الاول وسط ( CVB ) الحاوي على صبغة البنفسج البلورية ، والثاني وسط MacConkey agar . اخضعت العزلات جميعها للفحوصات المجهرية والزرعية ، فضلا عن الاختبارات الكيموحيوية التي شملت انتاج انزيمات الاوكسيديز والكاتليز والجيلاتينيز واللايسثينيز، وانتاج الصبغة ، والـتالق تحت الاشعة فوق البنفسجية عند طول موجي ( 254 نانوميتر ) ، واستهلاك السترات كمصدر وحيد للكاربون، والقــدرة على الــنمو بحرارة ( 4 ) م و( 20) م و( 42) م ، وعلى الوسط الحاوي على 6.5 % ملح كلوريد الصوديوم ، وكذلك النمو في وسط ( Triple Sugar Iron - TSI ) ، وعدم انتاج غاز كبريتـــيد الهـــيدروجيـــن فيه ، فضلا عن اجـراء اختبارات عدة الفــــحص الاولـــي api20E وapi20NE . نميت العزلات على وسط اكار حليب الفرز المقشود ( Skim milk agar ) ، وتم التحري عن قابليتها على انتاج انزيم البروتييز، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج . كما نميت العزلات على وسط ران الصلب ( Rhan agar ) للتحري عن قابليتها على انتاج انزيم اللايبيز ، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج تم حساب العدد البكتيري الكلي الاولي لكل من عينات الحليب الخام واللحم الطازج غير المعقمين وعينات الحليب المعقم واللحم المعقم بالاشعة فوق البنفـــسجية بطريقة العــد بالاطباق. اختبر ايضا تاثير بكتريا Pseudomonas fluorescens على عينات الحليب واللحم المعقمين ولوحظت التغيرات في الصفات الحسية ، كما تم حساب العدد الكلي البكتيري الاولي بطريقة العد بالاطباق ومن ثم اختبر تاثير بكتريا حامض اللاكتيك Lactobacillus fermentum ضد بكتريا Pseudomonas fluorescens في عينات الحليب واللحم المعقمين ، وقدرت النسبة المئوية للتثبيط . يمكن تلخيص اهم النتائج التي امكن الحصول عليها بالاتي : اولا _ شخصت (45) عزلة تــــعود للــــنوع Pseudomonas fluorescens ، كانت (20) مــنها مصدرها لحم بقري طازج ، و(15) منها مصدرها حلــــيب بقري خام ، فيــــما كانت العزلات المتبقية (10) مصدرها تربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز. ثانيا _ انتخبت عزلتان هما : PFM6 كونها الافضل كفاءة في انتاج البروتييز، التي كان مصدرها الحليب البقري الخام وPFE4 الافضل كفاءة في انتاج اللايبيز ، والتي كان مصدرها اللحم البقري الطازج. ثالثا _ حددت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتيــــيز من العزلة المحلية PFM6 , اذ كانــــت درجة الحرارة المثلى للانتاج هي ( 20) م وافضل اس هيدروجين (7.2) , كما كان للتـــهوية تاثير فعال في زيادة انتاجية العزلة هذه من الانزيم من خلال قياس قطر منطـــقة التحلل. كما وحــددت الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايبيز من العزلة المحلية PFE4 , اذ كانت درجة الحرارة المثلى للانتاج ( 28) م ، وافضل اس هيدروجيني ( 7.2 ) وكان للتهوية ايضا تاثيرها الفعال في زيادة انتاجية العزلة من انزيم اللايبيز من خلال قياس قطر منطقة الترسب لملح الحامض. رابعا _ بلـــغ الـــعدد البكتـــيري الكــلي الاولي لعيـــنات الحلــــيب الخام واللـــحم الطازج غير المعقمين 10⁶x 1.1)) خلية / مل و(10⁶x 2.1) خلية / غم ، بعد حضانة (3) و(5) ايام على التوالي ، فيما ظلت عينات الحليب المعقم واللحم الطازج المعقم من البكتريا ( صفر خلية / غم) بعد نفس مدة الحضن . خامسا _ تغيرت الصفات الحســـــــية لعينتي الحــــــليب واللحم المعقمين ، بعد تلقيحها (10⁷ X 1 ) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens من حيث القوام واللــون والرائحة والنكهة ، وبلغ معـــدل العـــــدد الكلي البكتـــيري الاولي في العينـــتين (10⁸x 5.1) خلية / مل لعيــــنة الحلـــيب و(10⁸x 9.2) خلية / غم لعينة اللحم بعد الحضن مدة ( 3 ) و( 5 ) ايام على التوالي .سادسا _ تغيرت الصفات الحسية لعينات الحليب واللحم المعقمين بعد تلقيحها بـ (10⁷ X 1) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens و(1) مل راشح بكتريا Lactobacillus fermentum من حيــث القوام واللون والرائـــحة والنكهة ، مع انخــفاض معــدل الــــعدد الكلي البكتيري الاولي في كلتا العينتين والى (10⁶x 1.2) خلية /مل و( 10⁶x 2.7 ) خلية/غم على التوالي ، بعد الحضن لمدة (3) ايام لعينات الحليب و(5) ايام لعينات اللحم ، كما بلــــغت النسبة المئوية للــــــــتثبيط في عينات الحليب 99.764 % وعينات اللــــحم 99.706 %. | Seventy five samples were collected from the local food sources , which included contained crude milk and fresh cow meat, and from rhizosphere soil for rose flower plant . Forty five bacterial isolates were isolated , which are suspected to be belongs to the Genus Pseudomonas .Thus media were used for isolation (CVB) media which contains crystal Violet stain , and MacCkonkey agar. All isolates were subjected to the microbiological and cultural examinations for primary identification . In addition to the biochemical testes which included production of , oxidase , catalase , gelatenase , lecithenase and pigment , as well as glister under the ( UV light ) at ( 254 ) nm wave length , and citrate utilization as the unique source of carbon , ability to grow at ( 4 , 20 and 42) ℃ , and in the media which contained 6.5 % NaCl , also testing the ability to growing at Triple Sugar Iron - (TSI ) medium Producing sulfate hydrogen gas in it .However , api system was used to confirm the identification. The isolates were grown on Skim milk agar media, to test their ability for producing Protease enzyme , then choosing the most efficient isolate , and determing the typical conditions for producing . Also the isolates were grown on the ( Rhan media ) ,to investigate their ability for producing lipase enzyme , then choosing the efficient isolate and determining the typical conditions for producing. Primary total bacterial number was counted for raw milk and fresh beef meat samples . Also primary total bacterial number for the sterilized milk and fresh meat samples with ultra violet ray by using plating method . Effect of Pseudomonas fluorescens on the sterilized milk and meat samples was detected and changes in the sensory characteristics was evaluated. Inhibitory effect of Lactobacillus fermentum against Pseudomonas fluorescens in the sterilized milk and meat samples was investigated , and percentage of inhibition was estimated. Important results may be summarized as follow : 1 - Forty five isolates were identified to belong to Pseudomonas fluorescens species . Twenty of the samples were from fresh meat and fifteen from crude cow milk , while the rest (10) were from rhizosphere soil of rose flower plant . 2 - Two isolates were selected : PFM6 the most efficient in producing protease ( crude cow milk origin ) , PFE4 the most efficient in producing lipase ( fresh cow meat origin ). 3 - Optimum conditions for producing protease enzyme from the local isolate PFM6 were (20)℃, pH( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on ensuring the diameter of analysis zone Also optimum conditions for producing lipase enzyme by the local isolate PFE4 were . ( 28) ℃, pH ( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on measuring the diameter the depositing zone for acid salt. 4 - Primary total bacterial number of the crude milk samples and the fresh meat was estimated as (1.1 x 10⁶) cell / ml , (2.1 x 10⁶) cell / gm , respectively . While the primary total number of bacteria of the sterilized milk and sterilized fresh meat samples was (Zero) cell / ml upon . 5 - Changes occurred in the sensory characteristics ( taste , odor , color and texture) of sterilized milk and meat samples after inoculation with (1X 10⁷) cells / ml of Pseudomonas fluorescens Primary total bacterial number in both samples were (5.1x 10⁸) cell / ml , (9.2x 10⁸) cell / gm respectively. 6 - Changes occurred in sensory characteristics ( taste , odor , color and texture of sterilized milk and meat samples after incubation with (1X 10⁷) cell/ ml of Pseudomonas fluorescens bacteria, and with 1ml Lactobacillus fermentum. Primary total bacterial numbers of both samples were decreased to (1.2x 10⁶) cell / ml ,( 2.7x 10⁶) cell / ml respectively after incubation 3 days for milk sample , 5 days for meat samples. Percentages of inhibition were in milk sample 99.764 % and in meat sample 99.706%.

دراسة انتشار الهائمات النباتية والفطريات المائية في المياه الجارية ضمن محافظة بغداد وتاثير العوامل البيئية عليها == A Study of the Distribution of Phytoplankton and Aquatic Fungi in the Lotic Water in Baghdad District and the Effect of Environmental Factors

اسم المؤلف: تريفة كمال جلال فرخه
اسم المشرف: سجال عبد الوهاب الركابي | علي عبد الزهرة اللامي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى مقارنة تواجد الهائمات النباتية والفطريات المائية في اربعة انظمة مياه جارية ضمن مدينة بغداد وعلاقة ذلك بالظروف البيئية المختلفة ، اختيرت اربعة محطات تمثل النظم الجارية وهي : ذراع الثرثار ونهر دجلة وقناة الجيش ونهر ديالى وتم دراسة تواجد بعض الفطريات المائية Aquatic fungi والهائمات النباتية Phytoplankton والعلاقة بين تواجدهما وبين العوامل الفيزيائية والكيميائية ، وجمعت النماذج شهريا ولمدة خمسة عشر شهرا ابتداء من شهر نيسان 2004 ولغاية حزيران 2005. شملت الدراسة الخصائص الفيزيائية والكيميائية وتمثلت في درجة حرارة المياه وسرعة التيار ودرجة الاس الهيدروجيني والتوصيلية الكهربائية والاملاح الذائبة الكلية والكدرة والاوكسجين الذائب والنسبة المئوية للاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية والمغذيات النباتية (النترات والنتريت والفوسفات). تم تشخيص الهائمات النباتية ودراسة التكوين النوعي لها وكثافتها كذلك عزل وتشخيص بعض الفطريات المائية السابرولكنيسية Saprolegniaceae الموجودة في محطات الدراسة. اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه متاثرة بدرجة حرارة الهواء المحيط وتراوحت بين (10 - 29)م في ذراع الثرثار وبين (10 - 27)م في نهر دجلة و(11 - 29.5)م في قناة الجيش اما في نهر ديالى فكانت (11 - 30.6)م. تميزت المياه في المحطات الاربعة بقاعدية خفيفة حيث تراوحت قيم الاس الهيدروجيني بين (6.1 - 8.0) ، وكانت التوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والمواد الصلبة الكلية في نهر ديالى اعلى نسبة الى بقية المحطات حيث بلغت 2710 مايكروسيمنز/سم و1.73 و1.35 غم/لتر على التوالي ، وكانت المياه ذات تهوية جيدة في كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة نسبة الى قناة الجيش ونهر ديالى وسجلت قيم عالية للعسرة حيث ان اعلى قيمة للعسرة بلغت 1250 ملغم/لتر في قناة الجيش وتلتها في نهر ديالى حيث بلغت 1230 ملغم/لتر. اما بالنسبة الى تركيز النترات فتراوح بين 0.06 - 10.0 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.02 - 6.30 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 9.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.11 - 9.60 ملغم/لتر في نهر ديالى. اما النتريت فتراوحت تراكيزه بين 0.01 - 1.10 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.004 - 1.20 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 1.20 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.07 - 1.60 ملغم/لتر في نهر ديالى ، وتواجد الفسفور في ذراع الثرثار بمعدل 0.17 ملغم/لتر و0.071 ملغم/لتر في نهر دجلة و4.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و2.67 ملغم/لتر في نهر ديالى. واظهرت نتائج التحليلات الاحصائية وجود فروقات معنوية بين محطات الدراسة للعديد من الخصائص الفيزيائية والكيميائية وبالذات فيما يتعلق بالتوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والاملاح الذائبة الكلية والاوكسجين الذائب ونسبة الاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية مما يعزى الى تعرض بعض المواقع الى التلوث وانخفاض في منسوب المياه. شخصت خلال هذه الدراسة 166 وحدة تصنيفية للهائمات النباتية تضمنت 107 من الدايتومات و28 من الطحالب الخضر و22 وحدة تصنيفية تعود الى الطحالب الخضر المزرقة وتوزعت البقية بين صفوف الطحالب اليوغلينية والدوارة (البروات) والكربتات والصفر الذهبية وكان اعلى عدد للوحدات المشخصة في نهر دجلة تلاه نهر ديالى ، وظهرت عدة اجناس تمثلت باكبر عدد من الانواع ضمن الهائمات النباتية (Nitzschia وNavicula وCymbella وCyclotella وGomphonema). وتميزت الدايتومات بكثافة عالية في ذراع الثرثار ونهر دجلة ونهر ديالى والفت النسب المئوية (87.4% ، 91.4% و69.6%) على التوالي اما قناة الجيش فبلغت 16.9%. وكانت رتبة الدايتومات الريشية Pennales اكثر كثافة من رتبة الدايتومات المركزية Centrales ضمن الهائمات النباتية المشخصة. اما بالنسبة للفطريات المائية فقد تم عزل 21 نوعا 19 منها تعود الى العائلة السابرولكنيسية التي شملت الاجناس Saprolegnia وتمثلت بستة انواع والجنس Achlya وتمثل بـ 11 نوع والجنس Dictyuchus بنوعين ونوع واحد للعائلة Leptomitaceae واخر Pythiaceae ، تم تسجيل 168 عزلة في نهر دجلة و146 عزلة في ذراع الثرثار و50 عزلة في قناة الجيش و86 عزلة في نهر ديالى من المجموع الكلي للعزلات التي بلغت 450 عزلة ، ولوحظ تشابه كبير في عدد انواع الفطريات بين كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة حيث سجل (20 و19) نوع على التوالي اما في قناة الجيش فقد سجلت ثمانية انواع فقط في حين عزلت 15 نوع في نهر ديالى. ومن ضمن الفطريات المائية تميز Saprolegnia ferax باعلى نسبة تواجد حيث بلغ 16.44% وتلاه Pythium sp. ايضا بتواجد عال والفت 12.22% في جميع المحطات واقل نسبة مئوية كانت للفطر Saprolegnia litoralis والذي سجل نوعا نادر التواجد حيث ظهر في شهر واحد ولمرة واحدة فقط في ذراع الثرثار. لوحظ بان نسبة تواجد الفطريات المائية كانت مرتبطة عكسيا في معظم اوقات السنة وفي جميع المناطق بتواجد الهائمات حيث انها ازدادت بعد الانخفاض في منحنى النمو للهائمات ويعود ذلك لكونها (اي الفطريات) كائنات رمية التغذية غالبا فتنمو على البقايا العضوية للهائمات وتقوم بتحليلها وتحويلها الى مغذيات جاهزة تنمو عليها الهائمات ويزداد تواجدها ، كذلك فان الظروف البيئية الملائمة تكون متماثلة لكليهما في بعض الاوقات وتختلف في احيان اخرى. | The aim of this work was to study the occurrence of Phytoplankton and aquatic fungi (Oomycetes) in four lotic aquatic systems within Baghdad city (Tharthar Arm, Tigris River, Al - Jaish Canal and Diayla River) during 15 months, the following physico - chemical parameters were also measured : water temperature, pH, electrical conductivity, salinity, total dissolved solids, turbidity, dissolved oxygen, percentage saturation oxygen, total hardness and the nutrients. The effect of the different environmental factors on both Phytoplankton and fungi was investigated. The study included the biological aspects such as species composition and densities of Phytoplankton, isolation and identification of Oomycetes especially Saprolegniaceae for fungi. The results showed that the water temperature was affected by surrounding air temperature, it ranged from 10 - 29C in the Tharthar Arm and from 10 - 27C in Tigris River, 11 - 29.5C in Al - Jaish Canal and 11 - 30.6C in Diayla River. The water of all stations was slightly alkaline with pH values ranging from 6.1 - 8.0, the electrical conductivity, salinity and T.D.S are higher in Diayla River than the other stations. Waters were more aerated in Tharthar Arm and Tigris River than the water of Al - Jaish Canal and Diayla River, the water classified as very hard at all stations, the highest value of total hardness obtained at Al - Jaish Canal it reached 1250 mg/L followed by Diayla River 1230 mg/L. The Nitrate and Phosphate found in highest mean concentration 3.48, 4.67 mg/l respectively in Al - Jaish Canal followed by 2.09, 2.67 mg/l in Diayla River. A significant difference was found between the four stations concerning physico - chemical characters especially the electrical conductivity, salinity, TDS, dissolved oxygen, percentage of saturated oxygen and total hardness. 166 taxa of Phytoplanktons throughout the four stations were identified, diatoms was dominated (107) followed by the Chlorophyceae (28) Cyanophyceae (22) and the remaining belongs to Pyrrophyceae, Cryptophyceae and Xanthophyceae, more taxa were identified in Tigris River followed by Al - Jaish Canal. Some genera of Phytoplanktons were represented by higher numbers of the species such as Nitzschia, Navicula, Cymbella, Cyclotella and Gomphonema. Among the diatoms Pennales were dominated up on centrales, the Phytoplankton density was higher in the Tigris River 22942.6  103 ind./l followed by Al - Jaish Canal 18944.1  103 ind./l, 10106.2  103 ind./l in Diayla River and 8025.1  103 ind./l in Tharthar Arm. The diatoms comprised 91.4% in Tigris River and 87.4% in Tharthar Arm and 69.8% in Diayla River and 16.9% in Al - Jaish Canal. Out of 600 isolates of fungi carried out, 450 reached reproductive maturity so that it was possible to identify it to the level of species. 21 species belongs to 5 genera were identified in the present study, all these species have been described in detail. Most genera (isolates) were obtained through Winter which was the best season for its growth, among the 21 species 19 belongs to the family Saprolegniaceae, 5 species belonged to the genus Saprolegnia, 11 species belongs to the genus Achlya, 2 species belong to the genus Dictyuchus and 1 species to the family Leptomitaceae and the others to Pythiaceae. Out of 450 isolates, 168 isolates identified in Tigris, 146 isolates from Tharthar Arm, 50 isolates from Al - Jaish Canal and 86 isolates from Diayla River. Among the Oomycetes Saprolegnia ferax comprise 16.44% follwed by Pythium sp. 12.22% and less percentage obtained for Saprolegnia litorlis which consider as a rare species in rare occurrence. There was a reversal correlation between Phytoplankton and fungi, both were affected by the same environmental factors in some times and responsed differently at other occasitions

الكشف عن انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف المنتجة من بكتريا Klebsiella pneumoniae == Detection of extended spectrum ? - Lactmases producing Klebsiella pneumoniae

اسم المؤلف: بيداء مجبل علي حسن الخفاجي
اسم المشرف: خليل مصطفى خماس | سعد لعيبي حامد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت 46 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella pneumoniaeمن عدة مستشفيات في مدينة بغداد للفترة مابين شهري تشرين الثاني 2012 وتموز 2013. تم الحصول على العزلات من مصادر سريرية مختلفة شملت : (23) عزلة من الدم و(19) عزلة من الادرار وعزلتان من الجروح وعزلة واحدة من كل من مسحة الاذن والقشع. تم اجراء فحص حساسية العزلات تجاه 15 مضاد جرثومي باستخدام جهاز Vitek 2 , وكان نمط مقاومة العزلات تجاه المضادات الجرثومية على النحو التالي : 100٪ للاموكسيسيلين، 82.6٪ للسيفازولين، 80.43٪ للسيفوتاكسيم، 78.26٪ لكل من للالسيفتازيديم وسيفيبيم، 73٪ للكوتريموكسازول، 45.65٪ للجنتاميسين، 30٪ لل نايتروفيورانتين، 17٪ لكل من للاموكسيسيلين / كلافيولانك اسد وبيبراسيلين / تازوبكتام، وسيبروفلوكساسين، 8.69٪ للسيفوكسيتين، و4.34٪ لكل من الاميبينيم والميروبينيم والاميكاسين. فضلا عن ان بعض العزلات قد اظهرت مقاومة متوسطة ضد المضادات الجرثومية المدروسة. اظهرت نتائج فحص الحساسية ان هناك نسبة عالية من المقاومة تجاه المضادات الجرثومية المدروسة, خاصة تجاه مجموعة السيفالوسبورينات والمضاد الجرثومي كو - ترايموكزول , في حين كانت المضادات الجرثومية الاكثر فاعلية هي مجموعة الكاربابنيمات والمضاد الحياتي الاميكاسين. اظهرت نتائج قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف بان 39 عزلة (84.78%) من بين العزلات قد اعطت نتيجة موجبة لهذا الفحص. استعملت تقنيه تفاعل البلمره الببتيدي ((PCR للكشف عن مدى انتشار الجينات blaTEM وblaSHV وblaCTX - M بين العزلات المنتجه لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف المسؤولة عن التشفير لهذه الانزيمات. كشفت نتائج تقنية PCR بان نسب انتشار blaTEM ، blaSHV ، وblaCTX - M كانت : 66.66 ٪ (26 عزله) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 448 زوج قاعدة ، 69.23 ٪ (27عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 231 زوج قاعدة و82.05 ٪ (32 عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 551 زوج قاعدة على الترتيب. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان عدد العزلات الحاملة للجينات الثلاثة blaTEM وblaSHV وblaCTX - M سوية كانت 16 عزلة ( 34.78 ٪ ) ، في حين وجد ان عدد العزلات التي تحمل كلا من الجينين blaTEM وblaCTX - M, blaSHV وblaCTX - M وblaSHVو blaTEM سوية كانت 10 عزلات ( 21.73 ٪ ), 7 عزلات ( 51.21 ٪ ) وعزلتان( 4.34 ٪ ) على الترتيب . بينما كانت نسبة 10.86 ٪ من العزلات المدروسة حاوية على الجين blaSHV لوحده , و6.52٪ من العزلات كانت تمتلك فقط الجين .blaCTX - M لم تظهر النتائج وجود الجين blaTEM لوحده في اي من العزلات قيد الدراسة. اظهرت النتائج المستحصلة من بيانات نتائج تسلسل الناتج المضخم من تقنية PCR وجود نسبة مطابقة تراوحت مابين ( (100 - 99٪ مع الطراز الوراثي blaCTX - M - 15 ونسبة مطابقة تراوحت مابين ( 98 - 100 ) ٪ مع الطراز الوراثي blaSHV - 11. بينت نتائج هذا الاختبار سيادة الطرز الوراثية blaSHV - 11 وblaCTX - M - 15 بين عزلات بكتريا K. pneumoniae المنتجة لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف. | Forty - six Klebsiella pneumoniae isolates were isolated from some hospitals of Baghdad between November 2012 and July 2013. The isolates were obtained from various clinical specimens including : blood (23) isolates, urine (19) isolates, wounds (2)isolates, ear swab(1)isolates, and sputum(1) isolates. Antimicrobial susceptibility test was carried out towards 15 antimicrobials using Vitek 2 compact system, and the pattern of resistance was as follow : 100% for amoxicillin, 82.6% for cefazolin, 80.43% for cefotaxime, 78.26% for ceftazidime and cefepime, 73% for co - trimoxazole, 45.65% for gentamicin, 30% for nitrfurantoin, 17% for amoxicillin/clavulanic acid, pipracilli/tazobactam, and ciprofloxacin, (for each) 8.69% for cefoxitin, and 4.34% for imipenem, meropenem, and amikacin. In addition to some isolates were revealed intermediate resistance against some antimicrobials. Results of antimicrobials susceptibility tests has been revealed high percentage of resistance for antimicrobials studied, especially for cephalosporins and co - trimoxazole, while the most effective antimicrobials were carbapenems and amikacin. The results of capability of isolates to produce extended - spectrum β - lactamases (ESBLs) showed that thirty - nine of isolates (84.78%) were given positive result.ESBLs - producing K. pneumoniae (39) isolates were subjected to polymerase chain reaction (PCR) amplification technique to identify the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M genes that responsible for β - lactame expression. Results revealed the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M were : 26(66.66%) isolates with 448 bp amplified product, 27(69.23%) isolates with 231 bp amplified product, and 32(82.05%) isolates with 551 bp amplified product respectively.The results of present study were showed that presence of three genes - blaTEM,,blaSHV, and blaCTX - M together were in 16 isolates(34.78%), while combinations between blaTEM and blaCTX - M , blaSHV and blaCTX - M , and between blaTEM and blaSHV were found in 10 isolates(21.73%),7 isolates(15.21%), and 2 isolates(4.34%) respectively. While 10.86% of studied isolates contains only blaSHV gene, and 6.52% has only bla CTX - M none of studied isolates were carried blaTEM aloneThe data of the sequencing of PCR products were revealed (99 - 100) % homology with the blaCTX - M - 15 genotype and (98 - 100) % homology with the blaSHV - 11genotype. Results have been shown the dominance of blaSHV - 11 and blaCTX - M - 15 among ESBLs - producing strains.

دراسة بكتريولوجية عن بكتيريا Moraxella catarrhalis المعزولة من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن في محافظة بابل

اسم المؤلف: بشرى جبار حمود حمزة التميمي
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد صبري عبد الرزاق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2004
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة جمع (100) عينة من مرضى يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن(CSOM) في مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل وللفترة من ايلول 2003 ولغاية شباط 2004. تم تشخيص عزلات بكتيريا Moraxella catarrhalis ودراسة بعض عوامل ضراوتها المهمة، وكذلك دراسة وتحديد حساسية ومقاومة هذه البكتيريا للمضادات الحيوية المختلفة، وتاثير بعض العوامل الفيزيائية المؤثرة في نمو البكتيريا والمتمثلة بدرجة الحرارة وpHالوسط، وشملت الدراسة ايضا تاثير مادة الشمع التي تفرزها الاذن على نمو هذه البكتيريا.كانت نتائج الدراسة كما يلي : • تم تشخيص سبع عزلات تعود لبكتيريا Moraxella catarrhalis من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى المزمن، وبنسبة 6.48) (%، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع هو بكتيريا Pseudomonas aeruginosa وبنسبة 33.3)%(، تلتها بكتيريا Staphylococcus aureus 24.07)%(، تلتها بكتيريا Proteus mirbilis 16.6)%(، ثم بكتيريا Streptococcus pneumoniae (%13.8)و Acinetobacter وKlebsiella sp.بنسبة (2.77%) لكل منهما.• عند التحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتيريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت البكتيريا عدم امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثاني في حين امتلكت كافة العزلات عامل الاستعمار الثالث. • اظهرت اثنان فقط من العزلات قابليتها على انتاج انزيم البروتيز الخارج خلوي(Extra cellular protease)في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين والسايدروفورات وكذلك عدم قدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة امكانية نمو البكتيريا في درجات الحرارة الواقعة بين (40 - 25)م وكان افضل نمو لها في درجة حرارة (35)م في حين لم تنمو هذه البكتيريا في الدرجات الحرارية اعلى من (45)م.• اظهرت النتائج ان هذه البكتيريا تنمو في مدى اس هيدروجيني pH يتراوح من (8 - 4.5) وكان افضل نمو عند pH (4.5). في حين لم تنمو هذه البكتيريا عند قيمة pH (9).• اظهرت جميع العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيوية Penicillin Gو Ampicillin وAmoxycillinو Tetracycline. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية Chloramphenicolو Ciprofloxacinو Cephalexinو Cefotaximeو Cephalothin وGentamicin.• تم الكشف عن تاثير المادة الشمعية التي تفرزها الاذن على نمو بكتيريا M. catarrhalis ، اذ اظهرت النتائج تاثيرا مثبطا لنمو اربع عزلات فقط من بكتيريا M. catarrhalis في حين لم تتاثر باقي العزلات. | In this study, 100 ear swabs samples were obtained from patients suffering from chronic suppurative otitis media (CSOM), admitting to Hilla Teaching hospital in Babylon province during the period September 2003 to February 2004, the isolates of Moraxella catarrahlis were identified, and studied their virulence factor, their antibiotic resistance, the effect of wax substance of human ear, and some physical factors (pH, Temperature) on the bacteria M. catarrahlis growth. Results obtained in this study can be summarized as follow : • Only seven isolates of M. catarrahlis were identified (6.48%), also other isolates Pseudomonas aeuroginosa was the most common isolated (33.3%), followed by Staphylococcus aureus (24.07%) and Proteus. mirabilits (16.6%), Streptococcus pneumoniae (13.8%), Klebsiella sp. and Acinetobacter (2.77%).• Invistigation of pathogenicity factors such as Adhesion or colonization factors results showed ability all isolates of M. catarrahlis to produce (CFA/III) only.• M. catarrahlis isolated during this study possessed only colonization factor III, colonization factor I, II were not presented on this bacterium.• Two isolates only were able to produce extra cellular protease, but all isolates were unable to produce haemolycin, sidrophores, and capsules.• This bacterium were able to grow in a temperature range (25 - 40)C and the optimum temperature for growth was (35)C, no growth was detected at temperature more than (45)C.• M. catarrahlis were grown at pH ranging from (4.5 - 8), it was showed that the optimum pH was at (4.5),and there was no growth recorded at pH (9).• All isolates showed complete resistant to Penicillin G, Ampicillin, Amoxycillin and Tetracycline, and was resistant to lesser extent to Ciprofloxacin, Chloramphenicol ,Cephalothin, Cefotaxime, Cephalexin, and Gentamicin.• The effect of wax substance of human ear showed affected only four isolates by waxy substance.

دراسة بعض الفعاليات البايولوجية والتنميط لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة حالات مرضية == Study on Some Biological Activity and Biotyping of Proteus mirabilis Isolated from Clinical Samples

اسم المؤلف: برجين امين خفاف
اسم المشرف: فاروق حسن العكيدي | رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للفترة من تشرين الاول 2004 ولنهاية تشرين الاول 2005 ، تم خلالها عزل بكتريا بروتيوس من 500 عينة مرضية ومن ثلاث مستشفيات رئيسية في مدينة بغداد. تضمنت النماذج المرضية، 310 عينة ادرار و104 مسحات جروح و64 مسحات حروق و22 مسحة اذن ، والتي تم من خلال زرعها على وسطي الدم وماكونكي عزل بكتريا البروتيوس بواقع 100 عزلة من النوع Proteus mirabilis و17 عزلة من النوع Proteus vulgaris وعزلتين من النوع Proteus penneri. اخضعت عزلات النوع Proteus mirabilis (100 عزلة) والمعزولة من عينات الادرار (50 عزلة) ومسحات الجروح (30 عزلة) ومسحات الحروق (15 عزلة) ومسحات الاذن الوسطى (5 عزلة) للفحوصات الاتية : 1. فحص الحساسية لمضادات الحياة : بطريقة الاقراص اظهرت جميع العزلات مقاومة بنسبة 100% لكل من المضادات كلورامفنيكول وارثرومايسين وتتراسايكلين ، 81% لمضاد الكوتراي موكساسول و77% لحامض النالدكس، و71% للنايتروفيورانتين، و40% للريفامبسين، و39% للجنتامايسين، و32% للامكاسين ، بينما كانت 25% من العزلات مقاومة للمضاد سبروفلوكساسين.2. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لاربع مضادات هي الجنتامايسين والسبروفلوكسين والكلورامفنيكول والاميكاسين تجاه 11 عزلة مقاومة لمضادات الحياة بدرجة عالية وظهر ان التركيز المثبط الادنى لكل من المضادات سالفة الذكر هو 2 - 512، 0.5 - 16، 1 - 512، 0 - 8 مايكروغرام/مل وحسب التعاقب.3. تراوح زمن انتاج انزيم اليوريز لعزلات الدراسة من 2.5 - 6 ساعة ، عدا عزلتي ادرار استغرقتا 24 ساعة لحين ظهور النتيجة.4. ظهر ان وسط الحليب هو المفضل على وسطي الكازائين والجيلاتين في التحري عن نشاط انزيم البروتيز وبواقع 90% و78% و76% وعلى التعاقب.5. وجد ان الدم البشري من الصنف O ودم الدجاج هما الافضل استعمالا للتحري عن نشاط انزيم الهيمولايسين وبواقع 59% ، 100% لكل منهما.6. درس النشاط الهيمولايسيني بظروف بيئية مختلفة وكانت درجة الحضانة 44م ودرجة الحامضية pH - 7 واستخدام الوسط الزرعي مولير - هنتون كقاعدة للدم هي الافضل لتحديد النشاط الهيمولايسيني للعزلات.7. ضعف نشاط انزيم الهيمولايسين بعد اضافة مضادات الحياة (كلورامفنيكول وجنتامايسين والاميكاسين والسبروفلوكساسين) الى مزارع البكتريا.8. تراوحت انماط التحلل الهيمولاسيني من الاحادي الى التسعي، وكان افضل تجمع للعزلات في الانماط V وIV وVII وبواقع 33% و19% و16% على التوالي.9. ظهر ان افضل الظروف البيئية لظاهرة دنيس هي استخدام درجة حرارة حضانة 37م وpH - 7 ووسط الاكار المغذي كقاعدة للدم.10. اعطت عملية التنميط باستخدام النشاط الهيمولايسيني اعلى تجمعا للعزلات (33%) ، وكانت نتائجها مفضلة على نتائج استخدام التنميط بظاهرة دنيس (22.1%). | of October 2005, through which Proteus bacteria could be isolated from different clinical specimens (500) and from three major hospitals of Baghdad City (Al - Yarmok, Al - Kindy, Al - Karama).The specimens included 310 urine samples; 104 wound swabs; 64 burn swabs and 22 ear swabs.The specimens were cultured on blood and MacConkey’s agar it yielded a 100 isolates of Proteus mirabilis; 17 isolates of Proteus vulgaris and 2 isolates of Proteus penneri. Proteus mirabilis were isolated from urine (50 isolates); wounds (30); burns (15) and ears (5), these isolates were subjected to the following tests : 1. Antibiotics sensitivity test : all the isolates were resistant 100% towards, Chloramphenicol, Erythromycin, Tetracycline, while 81% to Co - trimoxazole, 77% to Nalidixic acid, 71% to Nitrofurantoin, 40% to Rifampicin, 39% to Gentamicin, 32% to Amikacin and 25% of the isolates were resistant to Ciprofloxacin.2. The minimum inhibition concentrations of four antibiotics (Gentamicin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, Amikacin) towards 11 isolates which were highly resistant to antibiotics revealed an MICs for the tested antibiotics ranged between 2 - 512; 0.5 - 16; 1 - 521; 0 - 8 /ml respectively.3. Except two isolates from urine that required 24 hrs for urease activity, all other isolates needed a time range between 2 - 5 to 6 hrs for the activity of this enzyme. 4. Compared to caseine and gelatin medium, milk agar medium was preferable for the detection of protease activity.5. Human blood group O and chickens blood were the most convenient to detect the haemolysin activity with the ratios 59% and 100% in accordance.6. The most favorable pH and temperature for haemolysin activity were 8 and 44C respectively, using Mueller - Hinton medium as blood agar base.7. Haemolysin activity was reduced after the addition of antibiotics (Chloranphenicol, Gentamicin, Amikacin, Ciprofloxacin) were applied in the broth culture.8. The patterns of haemolysis were ranged from type I to type IX, and the more accumulation of strains were in the types V (33%), IV (19%) and VII (16%).9. The most favorable environmental conditions for Dienese phenomena were incubation temperature at 37C, pH - 7 and using of nutrient agar as blood agar base.10. Identical strains was noticed by using haemolysin activity (33%), while using Dienese phenomena it was 22.1%.

تاثير مجموعة الفلوروكوينولونات في فاعلية انزيمي البروتييز والهيمولايسين للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية

اسم المؤلف: بثينة محمد طه عبد الحسين
اسم المشرف: رعد خليل عزيز الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • شملت هذه الدراسة عزل وتشخيص بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus من اثنين من مستشفيات بغداد خلال المدة من تشرين الثاني 2006 الى حزيران 2007 . تناولت هذه الدراسة جمع 500 عينة سريرية شملت عينات الادرار, والدم , ومسحات الجروح , والحروق , والاذن , والانف , والمهبل , والدمامل , والقشع , والعين . • زرعت العينات (المسحات وعينات الادرار والدم) مباشرة على وسط اكار الدم, لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري, حضنت الاطباق بدرجة حرارة 37م° لمدة 24 ساعة . اخضعت العينات للفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية , وشخصت على هذا الاساس 100 عزلة بكتيرية تعود للمكورات العنقودية الذهبية (S.auerus) وبنسبة عزل 20% . • اختبرت حساسية العزلات تجاه سبعة مضادات جرثومية , ستة منها تعود الى مجموعة الفلوروكوينولونات , ومضاد حياتي واحد هو الاوكساسلين الذي يعود الى مجموعة البيتا - لاكتام ,وقد بينت النتائج ان البكتريا المعزولة كانت مقاومة وبنسب عالية لكلا المجموعتين من المضادات الجرثومية قيد الدراسة , اذ كانت نسبة مقاومة Enrofloxacin 80% , 72 Ofloxacin % ,ثم Pefloxacin 71% . كما تقاربت نسب مقاومة المضادين الجرثوميين Levofloxacin وNorfloxacin , اذ كانت 57% و52% على التوالي , فيما بلغت المقاومة ضد Ciprofloxacin 33% فقط . • اظهرت91 % من العزلات قيد الدراسة مقاومة للاوكساسلين ,وهذا يشير الى مقاومة تلك العزلات للمثسلين (Methicillin - resistant Staphylococcus aureus)• اوضح اختبار التراكيز المثبطة الدنيا (Minimal inhibitory concentrations) ان Levofloxacin كان الاكفا في تثبيط هذه البكتريا , اذ بلغت قيمة MIC بين (64 - 4) مايكروغرام / مل , في حين تراوحت قيم MIC للـ (Ciprofloxacin) بين (512 - 4) مايكروغرام / مل وOfloxacin بين ((512 - 16 مايكروغرام / مل وNorfloxacin بين (1024 - 16) مايكروغرام / مل . • اختبرت قدرة العزلات المحلية على انتاج انزيم الهيمولايسين على اوساط الدم باستخدام الاصناف الاربعة لدم الانسان ( A ,B, AB,O ) , وقد كانت منتجة وبنسبة 82.75 % عند استخدام الصنف A , وبنسبة 93.10% عند استخدام الصنف AB وبنسبة 79.31% عند استخدام الصنف B , وبنسبة 79.41 % عند استخدام الصنف O , وهذا يظهر بوضوح ان صنف الدم AB هو افضل الاصناف لمعرفة نوع التحلل . • تم التحري عن قابلية البكتريا قيد الدراسة على انتاج انزيم البروتييز على وسطي اكار الحليب الفرز واكار كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز واعتماد ظهور هالات شفافة حول المستعمرات . كانت العزلات منتجة لهذا الانزيم بنسبة 79.31 % على وسط اكار الحليب الفرز , وبنسبة 82.75 % على وسط اكار كولومبيا , الذي اظهر كفاءة اعلى في الكشف عن هذا الانزيم. • حضرت التراكيز تحت المثبطة للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin وLevofloxacin واختبر تاثيرها في فعالية انزيمي الهيمولايسين والبروتييز ولوحظ ازدياد فعالية هذين الانزيمين عند التراكيز المدروسة, فقد ازداد النشاط الهيمولايسيني باستخدام صنف الدم A الى 86.20% للمضادات الجرثومية الاربعة, الصنف B الى 86.20% باستخدام Norfloxacin , و82.75% مع المضادين الجرثوميينCiprofloxacin وOfloxacin , و89.65% للمضاد Levofloxacin , الصنف AB % 100للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin , والى96.55 % للـ Levofloxacin , اما الصنف O فقد ارتفع الى 74.41% للـ Norfloxacin والى 75.86% للـ Ciprofloxacin وOfloxacin والى 93.10% للـ Levofloxacin .ارتفعت فعالية انزيم البروتييز الى 86.20 % عند التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات الجرثومية الاربعة. | This study was included the isolation and identification of Staphylococcus aureus from two of Baghdad hospitals , during the period of November 2006 to June 2007. Five hundreds clinical samples of urine and blood and the swabs of wounds , burns, ear, nose, vagina, abscesses, sputum and eye, were collected .The samples were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria , the plates were incubated at 37°C for 24 hours . The samples were objected to the microscopic examination and biochemical tests , though 100 bacterial isolates were belonged to Staphylococcus aureus (20%) .The susceptibility of the isolates was tested toward 7 antimicrobial agents , six of them belong to the Fluroquinolones group and one antibiotic (Oxacillin) belongs to the Beta - Lactam group . The results showed that these bacteria were highly resistant to both groups of the studied antimicrobial agents . The percentage of resistance to Enrofloxacin was 80% , followed by Ofloxacin 72% then Pefloxacin 71% , Levofloxacin and Norfloxacin were nearly identical 57% and 52% respectively , while the resistant to Ciprofloxacin was only 33% .Ninety - one percent of isolates were resistant to Oxacillin , Thus it was Methicillin - resistant Staphylococcus aureus (MRSA) .The test of minimal inhibitory concentrations (MICs) showed that Levofloxacin was the most active in inhibiting these bacteria , its MIC was ranging between 4 - 64 gml , while for Ciprofloxacin , the MICs values ranged from 4 - 512 gml , Ofloxacin 16 - 512 gml , Norfloxacin 16 - 1024 gml .The ability of the isolates for the production of hemolysin enzyme was studied on blood agar media by using the four human blood groups (A, AB, B, O ) . 82.75% of the isolates were producing hemolysin by human blood group A , 93.10% with group AB , 79.31% with group B , and 72.41% with group O , this clearly showed that AB blood group is the best type to detect hemolysin activities .The ability of bacteria to produce protease enzyme on skim milk agar and skim milk Columbia agar media was investigated , and depending on the appearance of clear zones around the colonies , 79.31% of isolates were able to produce this enzyme on skim milk agar media and 82.75% of isolates were able produce this enzyme on skim milk Columbia agar , which was more suitable for detecting this enzyme .The sub - inhibitory concentrations of Ciprofloxacin , Norfloxacin , Ofloxacin and Levofloxacin were prepared and its effect on the hemolysin and protease activity was tested . The activity of the two enzymes were increased by using these concentrations , hemolytic activity raised by using blood group A to 86.20% with the four antimicrobial agents , group B to 86.20% with Norfloxacin, 82.75% with Ciprofloxacin and Norfloxacin, and 89.65% with Levofloxacin , group AB 100% with Ciprofloxacin , Norfloxacin and Ofloxacin , and to 96.55% with Levofloxacin , while by using blood group O it is raised to 74.41% with Norfloxacin , 75.86% with Ciprofloxacin and Ofloxacin , 93.10% with Levofloxacin . Protease activity raised to 85.20% with the sub inhibitory concentration of the four antimicrobial agents.

تاثير مستخلصات قشور البرتقال على نشاط بكتريا Pseudomonas aeruginosa المقاومة للمضادات الحيوية والمعزولة من التهابات جروح الحروق وجروح ما بعد العمليات في مدينة بغداد == Effect of Citrus sinensis peels extracts on the viability of antibiotics resistant Pseudomonas aeruginosa isolated from burn and post - operative wound infections in Baghdad City

اسم المؤلف: بتول عبد الامير باقر الصفار
اسم المشرف: محمد فخري احمد | صفاء عبد الكريم عبد الرزاق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • تم جمع 175 مسحة من المرضى الذين يعانون من خمجات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية ,الراقدين في مستشفيات بغداد المختلفة ,والمتضمنة مستشفى الكندي التعليمي, مستشفى الكرخ العام ومستشفى بغداد التعليمي اثناء الفترة من ايلول 2008 الى كانون الثاني 2009. • زرعت المسحات على وسطي غراء الدم والماكونكي وحضنت هوائيا بحرارة 37 م لمدة 24 ساعة وشخصت العزلات منPseudomonas aeruginosa باستخدام التشخيص الكيموحيوي والفسلجي والصفات ﺍ ﻠﻤﻈهرية واكد باستخدام نظام عدة api 20E .• تشير النتائج الى 114عزلة اعطت زرع بكتيرولوجي موجب بمعدل65.14% هذه تضمنت 51 (%60 ) عزلة من 85 مسحة من اصابات جروح مابعد العمليات و63 (%70 ) عزلة من 90 مسحة من اصابات الحروق.• اجري فحص الحساسية على هذه العزلات باستعمال 10 مضادات حيوية شائعة الاستعمال من مجاميع مختلفة ,اظهرت النتائج مقاومة عالية الىCephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime وبنسبة مقاومة (100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78)% على التوالي. بينما اظهرت العزلات حساسية عالية الى المضادات Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem وبنسبة مقاومة ( 28.94, 23.68, 15.78 )% على التوالي. • اربع مستخلصات المائي الحار٬ المائي البارد ٬ الكحولي الحار والكحولي البارد طبقت لاستخلاص قشـــورالبـــرتقال. ووجدت من خلال الكشف النوعي للمستخلصات بان المستخلصات المائية الحارة والباردة لقشور البرتقال احتوت على المركبات التالية : كلايكوسيدات٬ فينولات٬ قلويدات٬ صابونيات وتانينات، بينما احتوت المستخلصات الكحولية الحارة والباردة (اضافة الى ما ذكر) على مركبات : راتنجات٬ تربينات٬ فلافونات٬ كومارينات وزيوت طيارة. • استخدمت المستخلصات لدراســـة تاثيرها على نمــو العــزلات المقاومة فقــط والمعزولة من اصابات الجروح مابعد العمليات الجراحية والحروق بطريقة الانتشار بالحفر. مستخلصات قشورالبرتقال في التراكيز) 25 ,50, 75 ,100, 200 ,300 ,400 و500 )ملغم/مل اظهرت فعالية ضد العزلات البكتيرية. • كشف التحليل الاحصائي وجود اقل فروق معنوية عند مستوى احتمالية P<0.05)) لاربع مستخلصات.• المستخلص الكحولي الحار من قشور البرتقال كان اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى ضد عزلات الجروح مابعد العمليات وجروح الحروق. المستخلص المائي البارد ياتي بالمرتبة الثانية بعد المستخلص الكحولي الحار. معدلات اقطار مناطق التثبيط لهذه المستخلصات ضد P. aeruginosa عند التركيز العالي 500 ملغم/مل كانت 22.78ملم لمستخلص الكحولي الحار، بينما كانت 71.15ملم لمستخلص المائي البارد. اما النتائج كانت متغايرة بالنسبة لتاثير مستخلصي الكحولي البارد والماء الحار وبشكل عام اظهرت تاثيرات منخفضة على العزلات البكتيرية. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل لمستخلص الكحولي الحار معدلات اقطار التثبيط تناقص الى 64.1 ملم. • اختبر تاثير التراكيز المختلفة لمستخلص الكحولي الحار على نشاط انتاج الانزيمات : اليوريز ، جيلاتينيز ، اوكسيديز والكاتاليز، اظهرت النتائج ان المستخلصات الكحولية الحارة في التراكيز (75, 100, 200) ملغم/ مل تاثيرا جدير بالملاحظة على نشاط انتاج اليوريز، يعزى ذلك الى ظهور اللون الاصفر(كنتيجة سالبة) بعد ساعتين من الاختبار. بينما عند تراكيز(25 ,50) ملغم/مل من المستخلص حصول نتيجة سالبة لانتاج اليوريز بعد الساعة الرابعة من الحضن. • المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الجيلاتينيزعند التراكيز( 50 ,75 ,100 ,200) ملغم/ مل بعد الساعة الثانية من فترة الحضن. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل اظهرت النتيجة سالبة للجيلاتينيز بعد الساعة الرابعة حضانة. المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الاوكسيديز والكاتاليز بالتراكيز(25 ,50 ,75, 100 ) ملغم/مل واظهرت نتيجة سالبة بعد الساعة الثانية من الحضن. • اظهرت نتيجة دراسات ميكانيكيات النمو بتركيز 500 ملغم \مل من المستخلص الكحولي الحار قتل كامل لعزلات اصابات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية التي يتطلب وقت حضانة بين الساعة 6 - 8 ساعة. علاوة على ذلك المستخلص بتركيز 400 ملغم/ مل تطلب القتل الكامل للعزلات 8 ساعات حضانة لكل العزلات. بينما عند التركيز( 200 ,300 ) ملغم/ مل اظهر قتل كامل على جميع الخلايا بعد مرور 24 ساعة حضانة. اما التركيز 100 ملغم/ مل اظهر معدل قتل جزئي للعزلات (حتى بعد 24 ساعة حضانة). ﺗﻡ اﯿﻀﺎ ﻤﻨﺎﻗﺷﺔ ﻮﺘﺤﻠﻴﻞ ﻤﻧﺤﺪﺮﺍﺖ اﻠﻴﺔ ﺍﻠﻧﻤﻮ ﻠﻠﺒﻜﺘﺮﻴﺎ. | Hundred and seventy five swab samples were collected from patients suffering from burns and post - operative infections who admitted to different hospitals in Baghdad for medical care, these included : Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Karkh General Hospital and Baghdad Teaching Hospital, during the periods from October 2008 to January 2009. The swabs were cultured on blood agar base and macConky's agar then incubated at 37˚C for 24hrs . Isolates of P. aeruginosa were isolated and identified using morphological, physiological and biochemical diagnosis and confirmed by api 20 E kit . The results indicated that 114 (65.14%) have given positive bacteriological cultures, this included 51(60%) isolates out of 85 swabs of post - operative wound infections, while 63(70%) isolates out of 90 swabs of burns infections. Sensitivity test was performed for these isolates using 10 commonly used antibiotics. The result indicated that a higher resistance to Cephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime whith the percentages of 100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78 % respectively , while the isolates showed a higher sensitivity to Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem with the percentages of resistance of 28.94, 23.68, 15.78 % respectively. Four extraction methods, i.e. hot water, cold water, hot alcoholic and cold alcoholic, were applied for the extraction of Citrus sinensis peels . Hot and cold watery extracts of Citrus sinensis peels contained the following compounds : Glycosides, phenols, alkaloids, saponins, and tannins. While hot and cold alcoholic extracts contained, in addition to above, resins, terpins, flavones, coumarins, and volatile oils. The extracts were used to study their effects on growth of P. aeruginosa resistant isolates of post operative wound and burn isolates by using agar diffusion method. Extracts of Citrus sinensis peels at concentrations of 500, 400, 300, 200, 100, 75, 50, 25mg/ml showed activity against bacterial isolates. The statistical analysis revealed the presence of significant differences (P<0.05) for four extracts. The hot alcoholic extract of Citrus sinensis peels were more efficient than the other extracts against post - operative wounds and burn wounds isolates. Cold water extract came next to hot alcoholic extract. The inhibition zone diameters for these extracts were 22.78mm (for hot alcoholic extract) and 15.71mm (for cold water extract). Variable results were obtained with respect to the effects of cold alcoholic extract and hot watery extract, and generally, of low effects on bacterial isolates. At a concentration of 25mg/ml of hot alcoholic extract, the rate of inhibition zone diameters decreased to 1.64mm. The effect of different concentrations of hot alcoholic extract on the activity of enzymes production of urease, gelatinase, oxidase and catalase have been tested. The results showed that hot alcoholic extracts at concentrations of 75, 100, and 200mg/ml, demonstrated an observable effect on the activity of urease production due to observation of yellow - orange color (i.e. negative result), after 2hrs . While at extract concentrations of 25 and 50mg/ml, negative urease test was obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract has inhibited gelatinase production at a concentration of 50, 75, 100, and 200mg/ml after 2hrs incubation. While at a concentration of 25mg/ml, negative gelatinase result is obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract affects the inhibition of oxidase and catalase production at concentration of 25, 50, 75, and 100mg/ml, which showed negative results after 2hrs incubation. The result of Kinetics of growth studies demonstrated that the concentration of 500mg/ml of hot alcoholic extract was enough for complete killing the isolates from burn and post - operative wound infections. Moreover, this killing required incubation time between 6 - 8 hrs . At extract concentration of 400 mg/ml a complete killing required 8hrs incubation. While for complete killing upon application of 200 and 300mg/ml of the extract required 24hrs incubation. Partial kill occurs after 24hrs when 100 mg/ml of extract was used. Analysis of the slopes of growth kinetics was also discussed.

استخدام بعض المؤثرات الفيزيائية والكيميائية في تحفيز بعض مركبات الايض الثانوي لنباتي الروجة Hypericum triquetrifolium وعنب الذيب Solanum nigrum خارج الجسم الحي == Effect of some physical and chemical elicitors on some secondary metabolite induction of Hypericum triquetrifolium and Solanum nigrum In vitro

اسم المؤلف: بان منــعـم عبد الرزاق تويــج
اسم المشرف: سعدية حسن محمود | كاظم محمد ابراهيم الصميدعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biotechnology Department, College of Science, Al - Nahrain University. It is aimed to increase the production of some secondary metabolites using physical and chemical elicitors in tissue cultures of Hypericum triquetrifolium L. and Solanum nigrum L. plants. The quality and quantity of phytochemicals were estimated using methanolic extracts of dried leaves and callus were analysed using HPLC. Callus was initiated on leaf discs cultured on Murashig and Skoog (MS) medium supplemented with 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) and Benzyl adinenine (BA) at concentrations of 0,0.1, 0.5, 2.0 or 5.0 mg/l for H.triquetrifolium callus initiation and Naphthalene acetic acid (NAA) at concentrations of 1.0, 2.0, 3.0, 4.0 or 5.0 mg/l and BA at 0.5, 1.0, 1.5, 2.0 or 2.5 mg/l for S.nigrum callus initiation. Results showed that the combination of 2,4 - D at 0.1 mg/l with BA at 0.5 mg/l was the most effective for callus induction percentage reached 90%. The highest mean fresh weight reached 64.33 mg for H.triquetrfolium, and the combination of NAA at 2.0 mg/l with 1.0 mg/l BA was the most effective for callus induction percentage reached 100% and the fresh weight reached 859.1 mg for S.nigrum. The same combination was used for callus maintenance for both plants. Results also showed an increase in the concentration of secondary metabolites in methanol extracts induced on leaves. Callus cultures induced on leaf discs were treated with some physical and chemical stimuli such as light, ultraviolet, jasmonic acid and salicylic acid, (2, 4, 6 or 8 mg/l jasmonic acid), or (50, 100, 150 or 200 mg/l salicylic acid), and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the uv exposure time was 10 or 20 minutes. Result showed that there are significant differences between the various treatmeant, the best concentration of jasmonic acid to stimulate and increase production was 6 mg/l in H.triquetrifolium callus cultures, and 8 mg/l for S.nigrum. Salicylic acid stimulated the production reached 150 mg/l in callus culture of H.triquetrifolium and 100 mg/l in callus culture of S.nigrum. The best light exposure time caused an increase in the production of secondary metabolism was 12 hrs light for calli in both plants. Both exposure time (10 or 20 mint) induced the yield of secondary metabolites in callus cultures of H.triquetrifolium equally. and 20 minutes for S.nigrum. It is concluded from studying the effect of chemical and physical treatments on callus of both plants. that uv increased callus fresh weight and secondary metabolites in callus cultures. The highest concentration of secondary metabolites induced incallus cultures of H.triquetrifolium were catchin (0.14708 mg/g), hypersoid (0.09825 mg/g), hypericin (0.84623 mg/g), pseudohypericin (0.13707 mg/g), hyperforin (0.85525 mg/g) and prenylated phlorglucin (0.11275 mg/g), the highest fresh weight for callus 61.67 mg. S.nigrum callus cultures produced ascorbic acid (0.14721 mg/g), α - solanine (0.2294 mg/g), solasodin (4.3689 mg/g), solanidin (1.4854 mg/g), β - solamargine (5.9896 mg/g), α - solamargin (1.5509 mg/g), solasonine (1.3048 mg/g) and demission (2.031 mg/g). Additionaly, it yielded the highest callus fresh weight reached 849.20 mg.

الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية عند الاناث المصابات بقصور الغدة الدرقية == Physiological Disorders in Some Liver and Kidney Functions in Females Hypothyroid Patients

اسم المؤلف: بان حسين حميدي
اسم المشرف: علي شلش سلطان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية لبيان الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية لدى النساء العراقيات المصابات بقصور الغدة الدرقية. اجريت الدراسة على 120 امراة في المركز التخصصي لامراض الغدد الصم والسكري الواقع في منطقة الرصافة بالقرب من مستشفى الكندي . للفترة من 20/10/2013 ولغاية25/1/2014. قسمت مجموعة الدراسة الى اربعة مجاميع : (مجموعة السيطرة control, مصابات سابقا بقصور الغدة ومعالجات Euthyroid, قصور تحت السريري Subclinical hypothyroidism(SCH) , قصور الغدة العلني او الواضح Overt hypothyroid(OH) )تضمنت كل مجموعة 30 امراة . اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى هرمون Thyroid stimulating hormone(TSH)في القصور تحت السريري 18.23± 2.34 mu/l)) والقصور العلني (41.37± 3.75 mu/l) مقارنة مع مجموعة السيطرة 2.09± 0.23 mu/l)) والقصور في المعالجات) 2.89± 0.20 mu/l) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون Thyroxin (T4) (46.36± 2.32nmol/L) ومستوى طبيعي لهرمون Tri - iodothyronine (T3) في مجموعة القصور العلني مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; ( 1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة القصور المعالجات (87.10 ± 2.16nmol/L); ( 1.58 ±0.05 nmol/L) على التوالي .اظهرت النتائج انخفاضا غيرمعنويا (p˃0.05) في مستوى هرمون T4 في مجموعة القصور تحت السريري (77.76 ±2.31 nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73± 2.11nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (78.10 ± 2.16nmol/L) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون T3 في مجموعة قصور تحت السريري (1.52± 0.08nmol/L) ومجموعة القصور العلني (1.30 ± 0.11nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (1.58 ± 0.05nmol/L) على التوالي. اظهرت فحوصات الكبد ارتفاعا معنويا (P<0.05) في مستويات انزيمات الـ Glutamic - oxaloacetic transaminase(SGOT) (23.05±2.67U/L) وGlutamic pyruvic transaminase(SGPT) (21.89±2.35U/L) وAlkaline phosphatase (ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مستويات الـ SGOT في مجموعة السيطرة(8.80 ± 0.88U/L) والقصور المعالجات (11.36 ± 0.85 U/L) ومستوى الـ SGPT في السيطرة (13.46 ± 0.75 U/L) والقصور المعالجات (10.93±1.03U/L)و كذلك مستويات الـ ALP في السيطرة(65.27±2.65U/L)و القصور المعالجات (65.27±2.87U/L).ازدات مستويات انزيمات الكبد SGOT(11.88±1.42U/L) وSGPT (14.08±1.87nmol/L) وALP(65.27±2.87U/L )زيادة غيرمعنوية (P˃0.05) في مجموعة قصور تحت السريري مقارنة مع مجموعة السيطرة لانزيم SGOT(8.80 ± 0.88U/L) ومجموعة قصور المعالجات (11.36 ±0.85U/L) ومستوى انزيم SGPT في مجموعة السيطرة (13.46±0.75U/L) ومجموعة قصور المعالجات (10.93±1.03U/L) وكذلك انزيم ALPفي مجموعة السيطرة (50.27 ±2.65U/L) ومجموعة قصور المعالجات (65.27 ± 2.87U/L) . ازدادت مســــتويات البروتين الكلي (7.49 ± 0.16 g/dl) والبليروبين (1.23 ± 0.11 mg/dl )بصورة معنوية (P<0.05) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مجاميـع السيطرة ((0.613 ± 0.04 mg/dl) , ( 6.82 ± 0.04 g/dl والقصـــــور المعالجات{(0.653 ± 0.04mg/dl),(6.93 ± 0.07g/dl)}على التوالي .انخفض مستوى البروتين الكلي في مجموعة القصور تحت السريري (6.91 ±0.089g/dl) انخفاضا غير معنوي p˃0.05))مع مجموعة السيطرة (6.82±0.04g/dl) ومجموعة قصور المعالجات (6.93 ±0.07g/dl) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية (p˂0.05) في مستويات البليروبين (0.883 ± 0.08mg/dl)في مجموعةالقصور تحت السريري مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (0.613±0.04mg/dl) و(0.653 ±0.04mg/dl) على التوالي. اظهرت مريضات القصور تحت السريري والقصور العلني زيادة معنوية (P<0.05) في مستويات الدهون (mg/dl) الدهون الثلاثية TG (144.27 ± 9.89mg/dl) , (165.30 ± 3.70) والكولستيرول TC (233.37 ± 12.92 mg/dl), (301.87 ± 11.05mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة LDL - C (176.57 ± 13.03 mg/dl) , (238.60 ± 10.59 mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (28.80 ± 1.96mg/dl) , (33.07 ± 0.74mg/dl) مقارنة مع مستويات السيطرة والقصور المعالج في مستويات الكولستيرول TC(154.86 ± 5.94mg/dl) , (173.93± 3.11mg/dl)و كــــــذلك الدهون الثلاثية TG(94.83± 3.53mg/dl) , ( 88.57± 4.15mg/dl) والـــــبروتينات الدهنــــــية الواطــــــئة الكثافة(97.43 ± 5.90mg/dl) , (118.47 ± 4.85mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (19.23 ± 0.73 mg/dl) , (17.73 ± 0.84mg/dl) على التوالي ,وانخفاضا معنويا (P<0.05) في البروتينات الدهنـــــية عالية الكثافة HDL - Cفي مجمـــــوعتي تحت السريري والقصور العلني (25.27 ± 0.95 mg/dl) ,(27.93 ± 0.68 mg/dl) مقارنة مع السيطرة (37.17 ± 0.77mg/dl) , والقصور المعالج (38.47 ± 0.67mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (mmHg) في مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (14.30 ± 0.24 ) و(13.36 ± 0.19 ) مقارنة مع السيطرة والقصور المعالجات (11.56 ± 0.20),(11.67 ± 0.19)على التوالي.و كذلك اظهرت الدراسة هناك زيادة معنوية (P<0.05) في ضغط الدم الانبساطي في كل من مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (7.76 ± 0.17),(6.93 ± 0.22)على التوالي مقارنة مع السيطرة والقصور في المعالجات (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22)على التوالي.و لوحظ كذلك زيادة معنوية في قياس كتلة الجسم BMI(Kg/H2) (P<0.05) في مجموعتي التحت السريري والقصور العلني او الواضح (29.30 ± 0.90),(28.90 ± 0.73) مقارنة مع مجموعة السيطرة والقصور العلني (24.10 ± 0.39),(24.73 ± 0.49) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية في مســــتوى الكــــرياتنين (P<0.05) في مجموعة تحت السريري (1.07 ± 0.07mg/dl) وفي القصور العلني (1.26 ± 0.06mg/dl) مقارنة مـــع مجموعــــــــة الســــــيطرة (0.846 ± 0.03mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (0.836 ± 0.02mg/dl). ازداد مستوى حامض البوليك( uric acid )زيادة معنوية (p<0.05) في مجموعة مرض قصور الغدة العلني (7.11 ± 0.11mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة وقصور المعالجات (3.78 ± 0.18mg/dl) , (3.66 ± 0.16mg/dl) على التوالي.و كذلك لوحظ زيادة غيرمعنوية (p˃0.05 ) في مستوى حامض البوليك في مجموعة القصور تحت السريري (4.00±0.22mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ±0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ±0.11mg/dl) . انخفض مستوى الكالسيوم بصـــــورة معنـــوية (P<0.05) في مجمــــوعة القصـــــور تحت السريري±0.09) 8.38)و العــــــلني (8.12 ± 0.10 mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة ومجمــــوعة قصــــور المـــــعالجات (8.92 ± 0.05 mg/dl) , (8.80 ± 0.06mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى الفسفور (P<0.05) في مجموعة قصور الغدة العلني (5.49 ± 0.18mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ± 0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ± 0.11mg/dl) .كما اظهرت النتائج زيادةغير معنوية (p˃0.05 ) في مستوى الفسفور في مجموعة قصور تحت السريري ( 4.00 ± 0.22 mg/dl) مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (2.89 ± 0.07mg/dl) , ( 3.26 ± 0.11 mg/dl) على التوالي. ارتفع مستوى المغنيسيوم (P˃0.05) بصورةغير معنوية (2.67 ± 0.09mg/dl - )مقارنة مع السيطرة (2.12 ± 0.02mg/dl) ومجمــــوعة قصـــور المعالجات (2.29 ± 0.05mg/dl) وازداد مستوى المغنسيوم في مجموعة قصور تحت السريري (2.14 ± 0.03 mg/dl) زيادة غير معنوية (P˃0.05)مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.12 ± 0.02 mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات ( 2.29 ± 0.05mg/dl). نستنتج من الدراسة الحالية ان قصور الغدة الدرقية العلني اثر على وظائف الكبد والكلى واوضحت القيم المدروسة اعلاه في (مرضى القصور في المعالجات) رجوعها الى الحالة الطبيعية بعد تناولهم العلاج L - levothyroxine بجرعتي (50ملغم) او (100 ملغم). | Thyroid gland is one of the largest endocrine gland ,it is shaped like abutter fly located in appropriate place slightly below the larynx .It secretes 93%of thyroxin (T4) , 7% tri - iodothyronin (T3) and the third hormone calcitonin. The present study aimed to investigate physiological disorders in some liver and kidney functions in hypothyroid Iraqi women .The study was carried on 120 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Rusafa region, near AL - Kindey Hospital . That study began on 20/10/2013 to 25/1/2014 . The subjects were divided in to 4 groups (control, euthyroid ,subclinical(SCH) and overt hypothyroid(OH)).Each group included 30 females .The results showed a significant(P˂ 0.05) increase in the level of TSH in subclinical (18.23 ± 2.34mu/l) and overt hypothyroid patients (41.37 ± 3.75 mu/l) in comparison with control (2.09 ± 0.23mu/l) and euthyroid groups (2.89 ± 0.20mu/l). The level of T4 (46.36 ± 2.32 nmol/L) showed a significant (p˂0.05) decrease with normal T3 in OH group (1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; (1.70 ± 0.07 nmol/L) euthyroid (87.10 ± 2.16 nm0l/L) ;(1.58 ± 0.05 nmol/L) respectively.The level of T4 showed no significant (p˃0.05)decrease (77.76 ± 2.31 nmol/L) in SCH group in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) and euthyroid (87.10 ± 2.16 nmol/L) groups respectively.The level of T3 showed no significant (p˃0.05) decrease in SCH (1.52 ± 0.08 nmol/L) and OH group(1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (1.70 ± 0.07 nmol/L) and euthyroid (1.58 ±0.05 nmol/L) groups respectively. The changes in liver function tests in OH group showed a significant (P˂0.05) increase in the levels of Glutamic - oxaloacetic transaminase (SGOT) (23.05 ± 2.67U/L), glutamic pyruvic transaminase (SGPT)(21.89 ± 2.35 U/L) and Alkaline Phosphatase( ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) in comparison with SGOT in control (8.80 ± 0.88 U/L) , euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) and SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L)euthyroid (10.93 ± 1.03 U/L), and in the level of ALP in control(50.27 ± 2.65 U/L),euthyroid (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.The levels of SGOT(11.88 ± 1.42 U/L) ; SGPT(14.08 ±1.87U/L) and ALP (65.27 ±2.87 U/L) non significant increase (p˃0.05) in SCH group in comparison with SGOT in control (8.80 ±0.88U/L) and euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) ,SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L) and euthyriod (10.93 ± 1.03 U/L) and ALP in control (50.27 ± 2.65 U/L) ,euthyriod (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.Total serum protein(TSP) (7.49 ± 0.16 g/dl) and bilirubin (1.23 ± 0.11 mg/dl) were increased significantly (P˂ 0.05) in OH patients in comparable with control (6.82 ± 0.04 gm/dl) ; (0.613 ± 0.04 mg/dl),euthyroid(6.93 ± 0.07gm/dl) ;(0.653 ±0.04 mg/dl) respectively. TSP level in SCH group (6.91 ± 0.08 g/dl) was no significant decrease (p˃0.05)in comparison with control (6.82 ± 0.04 g/dl) and euthyroid (6.93 ± 0.07 g/dl) groups respectively.The levels of bilirubin (0.883 ± 0.08 mg/dl) was not significantly (p˃0.05) increase in SCH group in comparable with control (0.613 ± 0.04 mg/dl ) and euthyroid (0.653 ± 0.04 mg/dl). The SCH and OH patients showed an increase (P˂ 0.05) in the level of lipid profile (mg/dl) in total cholesterol(TC) (233.37 ± 12.92) ;(301.87 ±11.05);triglyceride( TG) (144.27 ± 9.87); (165.30 ±3.70); low density lipoprotein( LDL) (176.57 ± 13.03) (238.60 ± 10.59); and very low density lipoprotein(VLDL) (28.80 ± 1.96) ; ( 33.07 ± 0.74) respectively in comparison with the control and euthyroid in the levels of TC (154.86 ± 5.94);(173.93 ± 3.11); TG (94.83 ± 3.53); (88.57 ± 4.15) : LDL (97.43 ± 5.90) ; (118.47 ± 4.85) and VLDL (19.23 ± 0.73) ; (17.73 ± 0.84) respectively. There was a significant (P˂0.05) decrease in the levels of high density lipoprotein (HDL) in SCH and OH (25.27 ± 0.95 mg/dl) ; (27.93 ± 0.68 mg/dl)in comparison with control and euthyroid groups (37.17 ± 0.77 mg/dl);( 38.47 ± 0.67mg/dl) respectively. A significant (P˂0.05) increase in the level of systolic blood pressure(BP) mm Hg in OH and SCH groups (14.30 ± 0.24 mmHg);(13.36 ± 0.31mmHg) when compared with control and euthyroid (11.56 ± 0.20);(11.67 ± 0.19) respectively , there was a significant(P˂0.05) increase in the level of diastolic blood pressure(DBP) mmHg in OH and SCH groups (7.76 ± 0.17mmHg);(7.37 ± 0.17mmHg) in comparison with control and euthyroid groups (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22) respectively. Body mass index (BMI) value (Kg/H2) increased significantly(P˂0.05) in SCH group(29.30 ± 0.90) and OH group (28.90 ± 0.73)in comparison with control (24.10 ± 0.39)and euthyroid (24.73 ± 0.49). Creatinine level increased significantly (P˂0.05) in SCH and OH groups (1.07 ± 0.07mg/dl);(1.26 ± 0.06mg/dl), in comparable with control and euthyroid groups (0.846 ± 0.03),(0.836 ± 0.02) respectively. The level of uric acid increased significantly (P˂0.05) in the OH group(7.11±0.11mg/dl) in comparable with control, euthyroid (3.78±0.18mg/dl),(3.66±0.16mg/dl) respectively.The level of uric acid non significantly increase (p˃0.05) in SCH group (4.42 ± 0.28 mg/dl) in comparison with control (0.846 ± 0.03 mg/dl ) and euthyroid ( 0.836 ± 0.02 mg/dl) respectively. The level of calcium decreased significantly (P˂0.05) in the SCH (8.38 ± 0.09mg/dl) and OH group(8.12 ± 0.10 mg/dl) in comparable with control, euthyroid (8.92 ± 0.05mg/dl),(8.80 ± 0.06mg/dl) respectively. Phosphorus increased significantly (P˂ 0.05) in the OH patients group (5.49 ± 0.18mg/dl) when compared with control,euthyroid groups (2.89 ± 0.07mg/dl),(3.26 ± 0.11mg/dl) respectively.The level of phosphorus increase non significantly (p˃0.05) in SCH group (4.0 ± 0.22 mg/dl) in comparison with control (2.89 ± 0.07 mg/dl) and euthyroid (3.26 ± 0.11 mg/dl) .In OH group magnesium(2.67 ± 0.09mg/dl) increase non significantly (P˃ 0.05) in comparison with control (2.12 ± 0.02mg/dl), euthyroid (2.29 ± 0.05) respectively.The level of Mg(2.14 ± 0.03 mg/dl) in SCH was not significant increase (p˃0.05)in comparison with control (2.12 ± 0.02 mg/dl ) and euthyroid (2.29 ± 0.05 mg/dl)groups. Euthyroid group showed normal levels for the above studied parameters which means that the levels of these parameters returned to the normal values in treated hypothyroid group (euthyroid patients)with Levothroxine - L at a dose 50mg or 100 mg orally.

دراسة فعالية البكتريوسين المنتج من قبل بكتريا Lactobacillus plantarum في عوامل الضراوة لبكتريا Acinetobacter baumannii == Study The activity of Bacteriocin produced from Lactobacillus plantarum on virulence factors of Acinetobacter baumannii

اسم المؤلف: ايناس ابراهيم جاسم المشهداني
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت 22 عزلة بكتيرية تعود لبكتريا baumannii Acinetobacter ، عزل (15) منها من عينات الدم وعزلتان من عينات الادرار و(5) عزلات من عينات الحروق ، تم التاكد من تشخيصها من خلال الصفات الزرعية والمجهرية والاختبارات الكيموحيوية ومن ثم استخدام اختبار - 20E API.• تم التحري عن حساسية العزلات اتجاه (20) مضادا حيويا ، فاظهرت جميع العزلات مقاومة لكل من مضاداتCarbenicillin ، Cefixime ، Cefotaxime ، Ceftazidime، Cetriaxone ، Ampicillin/ Sulbactam ، وكان مضاد Imipenem الاكثر فعالية ضد العزلات ، اذ بلغت نسبة المقاومة (40.90)% ، وتبين ان (68.18)% من العزلات مقاومة مابين(16 - 20) مضاداحيويا .• اظهرت النتائج ان جميع العزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتميز عدا عزلة واحدة (Ab4) لم تنتج هذه الانزيمات ، في حين امتلكت 3 عزلات فقط (13.6)% من مجموع 22 عزلة القدرة على انتاج انزيمات البيتالاكتميز واسعة الطيف .• كذلك بينت النتائج ان جميع العزلات منتجة لجميع عوامل الضراوة المدروسة والمتضمنة : الحركة الارتعاشية ، المحفظة ، الخمل ، الغشاء الحيوي ، الانزيم المحلل للدهون (Lipase) وحوامل الحديد (Siderophore) بنسبة (100) % ، في حين جاء انتاجها للانزيم المحلل للبروتين (Protease) والبكتريوسين باقل نسبة (13.6 , 31.8)% على التوالي .• درس تاثير البلانترسين المنقى جزئيا من بكتريا Lactobacillus plantarum في نمو ثلاث عزلات منتخبة تعود لبكتريا A.baumanniiاعتمادا على امتلاكها عوامل الضراوة ومقاومتها لمضادات الحيوية والتي شملت Ab20 , Ab17 , Ab2 . • اعطى بكتريوسين البلانترسين تاثير تثبيطي جيد ضد العزلات المنتخبة عند التراكيز (62.5 ،125 ،250 ، 500 ) مايكروغرام/مليلتر ، حيث بلغ التركيز المثبط الادنى (62.5) مايكروغرام/مليلتر .• استخدم التركيز تحت المثبط الادنى (31.25) مايكروغرام/مليلتر من البلانترسين المنقى جزئيا للتحري عن تاثيره في عوامل الضراوة المدروسة للعزلات المنتخبة ، فاظهر تثبيطه لالتصاق العزلات المنتخبة بالخلايا الطلائية عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة (8.2 ، 9.3 ، 7.8 ) بعد المعاملة بالبلانترسين في الوقت الذي بلغت (73.5 ،90.5 ،86.2 ) وعلى التوالي قبل المعاملة ، كما اظهر البلانترسين تاثيرا تثبيطيا لالتصاق هذه العزلات على البولستارين وانتاج الانزيم المحلل للبروتين (Protease ) وانتاج البكتريوسين ، وتسبب في فقدان تكوين الغشاء الحيوي ، كما ادى الى تثبيط نسبي في انتاج الانزيم المحلل للدهون (Lipase ) ، في حين لم يؤثر على كل من الحركة الارتعاشية ، المحفظة وانتاج حوامل الحديد .• درس تاثير التركيز تحت المثبط الادنى للبلانترسين المنقى جزئيا على حساسية العزلات لمضادات الحيوية ، اذ اظهرت النتائج تاثير متباينا في مقاومة وحساسية العزلات المنتخبة لمضادات الحيوية | • During this study a total of 22 bacterial isolates of Acinetobacter baumannii were collected , 15 isolates from blood sample , two isolates from urine sample and 5 isolates from burn samples . All isolates were then subjected to the cultural , microscopical and biochemical examination and using API 20E system for identification this bacteria .• Sensitivity of isolates was tested against 20 Antimicrobial agents, results revealed that all isolated of A. baumannii were resistant to Carbenicillin , Cefixime , Cefotaxime , Ceftazidime , Cetriaxone, Sulbactam / Ampicillin . Imipenem was found to be the most effective against the isolates , the resistance to Imipenem was 40.9% . 68.18% of isolates resistance 16 to 20 antibiotics.• The results showed also that all isolates had the ability to produce β - Lactamases enzyme except one isolate (Ab4) , Three isolates 13.6 % were able to produce Extended Spectrum β - Lactamases. • All isolates were able to produce all virulence factors such as : Twitching motility , capsule , fimbria , biofilm , lipase, siderophore with percentege 100% . While for producing protease and bacteriocin were decreasid to 13.6% and 31.8% respectivelly .• The effect of partially purified plantaricin from Lactobacillus plantarum was studied on growth of three A.baumannii isolates possessing high resistance to Antibiotics and able to produce virulence factors (Ab2 , Ab17 and Ab20) .• Plantaricin Showed a good inhibitory effect against A.baumannii isolates at concentration 65.5 , 125 , 250 , 500 Mg/ml and the minimum inhibitory concentration (MIC) was showed 62.5Mg/ml.• The effect of sub MIC of partially purified plantaricin 31.25Mg/ml on virulence factors of A.baumannii was studied , plantaricin had inhibitory effect on Adherence of isolates on epithelial cells , the adherence mean was 8.2 , 9.3 and 7.8 after treatment with plantaricin compare with before treatment 73.5 , 90.5 and 86.2 . The results showed also that plantaricin had inhibitory effect on adherence of isolates on polystyrene , protease and bacteriocin production and biofilm formation , relative inhibitory of lipase production , while plantaricin don't have any effect on twitching motility, capsule and Siderophore.• The effect of sub MIC of plantaricin on sensitivity of A.baumannii isolates to Antibiotics was studied , the results showed that different pattern of resistance to Antibiotics .

التداخل البكتيري مع عوامل ضراوة خميرة الكانديدا المسببة لحالات التهاب الفرج والمهبل == Bacterial Interference In The Virulence Factors Of The Yeast Candida Causing Vulvovaginal Candidiasis

اسم المؤلف: ايمان ناطق ناجي البياتي
اسم المشرف: احسان شفيق توفيق دميرداغ | سناء مسلم الصفار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2004
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 200 عينة من اعالي المهبل ( H.V.S ) High Vaginal Swab من نساء متزوجات توزعت بين 130 امراة غير حامل ( Non Pregnant Women ) ( NPW ) منهـن 90 كن مصابات بالتهاب الفرج والمهبل Vaginitis و( 40 ) منهن كن سليمات لغرض السيطرة (H ) Healthy Control والباقــي ( 70 ) عينة من نساءحوامل ( P.W. ) Pregnant Women ، منهـن( 40 ) امراة مصابة بالتهاب الفرج والمهبل و( 30 ) اخرى سليمـة سيطرة . استمرت فترة جمع العينات من 1/6/2002 الى 1/2/2003 تحت اشراف الكادر الطبي المتخصص في قسم النسائية والتوليد في مستشفى النعمان العام في الا عظمية / بغداد . كما تم تخصيص استمارة استبيان لكل مريضة دون فيها كل ما يخص المريضة من اعراض سريريه ونتائج التشخيص والفحص المختبري والملاحظات العامة .اعتمادا على الاعراض المرضية والفحوصات المختبرية التشخيصية تم تحديد ثلاث انواع من الالتهابات المهبلية وهي : ا - التهاب الفرج والمهبل اللانوعيBacterial Vaginosis (BV.) ..ظهرت الحالة في (23) مريضة من مجموع (70) امراة حامل [ فيهن (40) مريضة و( 30) اخرى سليمة ] بنسبة (33%) من الحوامل ، كما ظهرت في ( 25) امراة غير حامل من مجموع ( 130) امراة [فيهـن ( 90 ) مريضة ] بنسبة ( 19% ) من النساء غير الحوامل .ب - التهاب الفرج والمهبل الكانديدي Volvavagianal Candidiasis (VVC) .. ظـهرت الحالة في ( 13) مريضة من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة ( 18%) [فيهن ( 30) امراة سليمة و( 40) اخرى مريضة ] كما ظهرت في ( 43) مريضة من مجموع ( 130) امراة غير حامل بنسبة (33%) [فيهن ( 40) امراة سليمة و(90) اخرى مريضة جـ - التهاب ناتج من اصابة مختلطة Mixed Infection (MI) ظهرت الحالة في ( 4) مريضات من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة (6% ) [ فيهن ( 30) امراة سليمة و(40) اخرى مريضة] كما ظهرت في (22) مريضة من مجموع (130) امراة غير حامل بنسبة ( 17) [ فيهن (30) امراة سليمة و(40) امراة اخرى مريضة] . وقد تم عزل 74 عزلة من خميرة الكانديدا عزلت ( 38 ) عزلة منهـن( 43 ) امراة مصابة بالكانديـدا ( VVC ) عزلت ( 16 ) عزلة من (22) مريضة مصابة باصابة مختلطة (M.I ) وعـزلت ( 5 ) عزلات من مجمـوعة السيطرة من النساء غير الحبلى ومن جانب اخـر عزلت ( 11 ) عزلة من ( 13 ) امراة مصابة بالكانديدا ( VVC ) و( 3 ) عزلات من 4 نساء مصابات اصابة مختلطة ( M.I ) وعزلة واحدة من مجموعة السيطرة للنساء الحوامل. وهذه النتائج تدل على سيادة خميرة الكانديدا في التهاب الفرج والمهبل لدى مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل.و تم تشخيص الانواع التالية من خميرة الكانديدا وهي : Candida albicans ( 37 عزلة ) ، C. tropicalis ( 20 عزلة ) C. glabrata ( 7 عزلات) C.dubliniensis ( 7 عزلات ) وC.parapsilosis عزلة واحدة وC. krusei عزلتين. امكن الحصول على 588 عزلة بكتيرية من مجموع عدد الحالات الموجبة للزرع البكتيريولوجي لمجموعتي المرضى والسيطرة البالغ عددهم ( 140 ) امراة شخصت فيها سبعة اجناس من البكتيريا اللاهوائية والانواع التابعة لها وهي : Peptostreptococcus spp, Peptococcus spp, Prevotella spp , Streptococcus spp, Bacceroides spp, Propionibacterium spp, Lactobacillus spp, كما تم تشخيص انواع من البكتريا المتحملة لوجود كميات قليلة من الاوكسجين وهي : Strept . mitis , Entero , faecalis , Gardnerella vaginalis اضافة الى اربع اجناس وبعض انواعها من البكتريا الهوائية وهي Proteus spp , Staphylococcus spp , Escherichia spp, Pseudomonas spp .ولقـد كان النوعان G.vaginalis , Bacteroides fragilis من اكثر الانواع عزلا في مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل المصابات بالتهاب الفرج والمهـبل اللانوعي B.V . وفيما يخص عوامل الضراوة لخميرة الكانديدا والانواع التابعـــة لها وجد ان 28 عزلة ( 76 % ) منتجة للانزيم الحال للشحوم المفسفرة Phospholipase و6 عزلات ( 16 % ) ضعـيفة الانتاجية لهـذا الانـزيم و( 3 ) عزلات ( 8 % ) غير منتجة من اصل ( 37 ) عزلة للنوع C. albicans اماعزلات C. tropicalis فكانت 15 عزلة ( 75 % ) منتجة للانزيم و3 عزلات ( 15 % ) ضـعيفة الانتاجية وعزلتان ( 10 % ) غير منتجة من اصل 20 عزلة . اما عزلات النوع C.dubliniensis فكانت منـها ( 5 ) عزلات ( 71% ) منتجة من اصل (7) عزلات فى حين انتجت عزلة واحدة للنوع C.glabrata هذا الانزيم .وعند دراسة انتاج الانزيم الهاضم للبروتينات Proteinases كعامل اخر من عوامل الضراوة فقد تباينت قدرة الانزيمات المنتجة مـن عزلات الكانديدا على هظم البروتيــن بين ( 175 - 30 ) مكغم / مل وتفاوتت العزلات في قابليتها على انتاج الانزيم فكانت هناك 29 عزلة منتجة من اصل 74 عزلة كانديدا وكانت ( 7 ) منـها مـن النوعC.albicans و( 8 ) منها للنـوع C. tropicalis , وثلاث منها للنوع C. dubliniesis وعـزلة واحـدة للنـوع C. glabrata ولم تتمكن عزلات النوعين الاخرين من انتاج الانزيم وهما C.parapsilsosis وC. krusei . ومن حيث عامل الضراوة الثالث وهو قدرة الخميرة على الالتصاق بالخلايا الطلائية فقد تفاوتت ايضا عزلات الخميــرة فـــي اظهار هـــذه القدرة وكان النوعان C. albicansوC. dubliniensis هما الاكثر كفاءة في الالتصاق من بين الانواع الاخرى وكانت نسبة خلايا الخميرة الملتصقة بالخلايا الطلائية في درجة الحرارة 25 م اعلى من التي حصلت عند درجة 37 م للعزلة نفسها ولكن التحليل الاحصائي لم يظهر فروقا معنوية عالية .كانت جميع عزلات خميرة الكانديدا مقاومة لمادة النستاتين وبتراكيز عالية جدا بلغت 256 مكغم / مل في حين كان المستحضر Clotrimazole هـو الافضل مـن بين مشتقات الازول الاخرى اذ كانت جميع العزلات حساسة له فقـد تراوحت قيـم (MIC ) بيـن ( 2 - 125, 0) مكغم / مل للنوعين C.albicans , C.tropicalis و( 0.5 - 0,125) للنوعين C.dubliniensis وC.glabrata وكانت قيم MFC اكبر او تساوي 4 مكغم / مل . بينـما تفاوتت حساسية عزلات الخميرة اتجاه مشتقات الازول الاخرى اذا اظهرت ثلاثة انواع من الخميرة مقاومة لمضاد Ketoconazule وهي C. albicans , C.dubliniensis , C. glabrata اذ تراوحت قيم MIC ( 0.5 - 32 )،( 0.25 - 16 ) , 160.25 - - مكغم / مل على التوالي بينما كانت الانواع الثلاثة الاخرى حساسة له . وكانت قيم MFC على العموم اكبر ويساوي 32 مكغم / مل . وكانت جميع العزلات حساسـة لمضاد Miconazole اذ تراوحت قيم ( MIC ) مـن ( 4 - 8 ) مكغم / مـل ضد النوع C. albicans واقلها هـــي للنوع C.dubliniensis وهي (0.125 - 1.0) مكغم / مـل بينما كانت قيمة MFC تتراوح بين اكبر او يساوي 4 الى اكبر او تساوي 16 حسب نوع العزلة . وكانت قيم MIC للمضاد Fluconazole مرتفعة لكنها لم تتجاوز 32 مكغم / مل ولذا اعتبرت العزلات حساسة ولكن بتراكيز عالية بينما كان MFC له اكبر او يساوي 64 .كانت قيم MIC لمضاد Amphotericin B هــي الافضل اذا بلغت (0,125 - 0,5 ) مكغم / مل اما MFC فكان يساوي 1 مكغم / مل لقد اظهرت النتائج ان طريقة التخافيق باستعمال الوسط الزرعي السائل لتحديد MIC هي الافضل مقارنة باستعمال الوسط الزرعي الصلب اذ كانت قيم MIC مرتفعة مقارنة بقيم MIC بالطريقة الاولى .ولدراسة الفعالية التضادية لبعض انواع البكتريا المعزولة من اعالي المهبل على عوامل الضراوة وحيوية خميرة الكانديدا ، انتخبت 32 عزلة بكتيرية تابعة لاجناس مختلفة على اساس ما اظهرته من تاثير تضادي في التجارب الاولية على عوامل الضراوة او الحيوية او كلاهما وهذه العزلات هي ثلاث عزلات تابعة للنوع Peptostreptococcus prevotii ، ثلاث عزلات تابعة للنوع propianibacterium granulosum، وست عزلات تابعة للنوع Lactobacillus acidophilus وخمس عزلات تابعة للنوع L. gensenii وثلاث عزلات لكل من النوعين Streptococcus mitis وEnterococcus faecalis كما وانتخبت عزلات الخميرة الاكثر كفاءة في التجارب قيد الدراسة واعتمادا على نتائج الجزء السابق .بعد ان نميت العزلات البكتيرية السابقة الذكر في اوساط زرعية مناسبة لكل منها تم الحصول على رواشح مزارعها السائلة وتم تركيز الرواشح الــى نصف الحجم ( رم 1) والى ربع الحجم ( رم 2 ) مع الاحتفاظ بجزء من الراشح غير المركز . لم تظهر الرواشح غير المركزة تاثيرا على هذه العوامل ولقد بدا واضحا تاثير الراشح المركز لمرة واحدة او لمرتين وبدرجات متفاوته وذلك لاختلاف الاجناس البكتيريا والانواع التابعة لها . كانت اكـثر الـرواشح تاثيرا هـي الـرواشح المركزة م1 وم 2 لكـل مـن العزلات Sm3 , Ef3 , Lj5 , La5 , La6 على فعالية الخميرة في انتاج الانزيمات الهاضمة للبروتين والانزيمات الحالة للشحوم المفسفره وكان النوع C. albicans اكثر حساسية اتجاه المعاملة بهذه الرواشح مقارنة مع الانواع الاخرى ، كما اثرت هذه الرواشح على خفض نسبة الانبات في المصل وبفرو قات معنوية كبيـرة وصلت الى >0.001 P . واظهر ( رم1 ) ( رم2 ) للعزلة La 6 تاثيرا في خفض حيوية الخميرة مقدرة بوحدة مستعمرة لكل مل ( CFU/ml ) وتبين ان لحموضة هذه الرواشح تاثيرا في عملية التثبيط ولكن لا يعزى له التاثير الكلي. فعند مقارنة تاثير الحموضة فقط فـــي اوساط زرعيه سائلة ذات pH محدد ومماثل الى pH الرواشح مما يشير الى ان هذه الرواشح تحتوي مركبات ذات تاثير مثبط ، كما لم تظهر رواشح العزلات الاخرى تاثيرا واضحا او كان بعضها غير مؤثر . ولمحاولة فهم طبيعة تاثير خلايا العزلات البكتيرية السابقة على عملية التصاق خميرة الكانديدا بسطوح الخلايا الطلائية وجدنا ان العزلات Lj5 , La5 , Pp3 , Pg3 , Sm3 , Ef3 , La6 هي الاكثر تاثيرا في خفض نسبة الالتصاق وعلى التوالي وقد اظهرت العزلات طرقا مختلفة في طبيعة منع الالتصاق اما باحاطة خلايا الخميرة بغلاف من خلايا البكتريا او باحاطة الخلية الطلائية بغلاف من خلايا البكتريا او كلاهما مما يمنع التصاق الخميرة بسطح الخلية الطلائية وذلك من خلال غلق المستقبلات على سطوح الخلايا. | 200 high vaginal swabs were taken from 200 married women, 130 of them were non - pregnant (N.P) and 70 were pregnant (P.) women. Of the 130 N.P : 90 were suffering from vaginitis and 40 were healthy controls. Of the pregnant group 40 were suffering from vaginitis and the rest 30 were healthy controls. Thus there were a total of 130 infected and 70 healthy. Sample were taken during the period of first of June 2002 till the end of Feb. 2003, under the supervision of specialized gynecologist in the general No’man hospital in Adhamia , Baghdad . A special questionnaire was prepared for each individual. As result of cultural and microbiological examinations of the sample and depending on the clinical and microbiological features of the 130 infected pregnant (90) and non - pregnant (40) women their vaginitis were devided into three groups, namely : (a) : Bacterial vagnosis (B.V) : Appeared in (23) out of (70) pregnant women [ including (30) healthy and (40) infected i.e. 33% ]B.V. also appeared in 25 non - pregnant women out of 130 [ including (40) healthy and (90) infected i.e. 19% ](B) : Volavaginal condidiasis (V.V.C).Appeared in 13 women out of (70) pregnant women ( 18%) [including 30 healthy and (40) sick] it V.V.C also appeared in (43) infected non - pregnant women out of 130 ( 33%)[ including (40) healthy and (90) sick](C ) : Volvavaginosis due to mixed bacterial and fungal infection. I.e. mixed infection (M.I) : Appeared in (4) patient out of (70) pregnant women (6%) [including 30 healthy and (40) sick women ] . It also appeared in (22) patients out of (130) non - present women [including (40) healthy and (90) sick pregnant women] A total of (74) isolates of candida SPP were isolate from non pregnant and pregnant women of this number 38 isolates from (43) VVC non pregnant cases, (16) isolates from 22 MI non pregnant cases, 5 isolates from 40 healthy non pregnant group, 11 isolates from 13 VVC pregnant women, 3 isolates from 4 MI pregnant women, and one isolates from 30 healthy.The following species of Candida were identified : C. albicans 37 isolates , C. tropicalis 20 isolates , C. glabrata 7 isolates , C. dubliniensis 7 isolates , C. parapsilosis one isolate , and C. kursei 2 isolates .Bacteriologically 588 isolates of bacteria were obtianed form 140 women positive for bacterial cultural ; these include several species of 7 anaerobic bacterial genera ; peptostreptococcus, peptococcus , Streptococcu spp, prevotella spp, Bacteroides spp, lactobacillus spp and propionibacterium spp. Similarly the following microaerophilliic bacteria were isolated; Gardnnerella vaginalis, Enterococuus faecalis , and Streptococcus mitis . The following aerophilic were also isolated, staphyllococcus spp, proteus spp Escherichia spp and pseudomonas spp. the most frequently isolated species a mong infected women group with ( B.V) were Bacteriodes fragilis and G. vaginals . Concerned the virulence factors of the yeast candida spp like production of phospholipases and proteinasas, besides the adherence on epithelial cells ( from human mouth ) and drug tolerance. Phpspholipase was produced by 28 isolates (76 %) out of 37 of C. albicans whereas the rest 6 isolates (16 %) were weak producers and 3 isolates (8 %) did not produce this enzyme. On the other hand out of 20 isolates of C. tropicalis 15 (75 %) were weak producer and 2 isolates (10 %) were not producers of the enzyme . Of The 7 isolates of C. dubliniesis 5 (71% ) could produce the phospholipase also one ( 14 % ) of the 7 isolated of C.glabrata could produce theis enzyme . The enzyme proteinase was produced by 29 out of 74 (39 %) isolated of candida spp out these 17 were C.albicans 8 were C. tropicalis , 3 were C. dubliniesis , one was C. glabrata the other species did not produce the enzyme. Ability of the isolates for attachment onto the surface of epithelial cells varied according to the species. Both C.albicans , C. dubliniesis were more efficient than other species . The percentage of epithelial cells attached by yeast cells were higher at 25C than at 37 C for the same isolate of the yeast, though this difference was not significant. As the resistance to antifungals concerned, we found that all isolates of candida were resistant to nystatin . The measured minimum inhibitory concentration (MIC) reached 256 g/ml . On the other hand , all isolates of candida were much more susceptible to clotrimazole with MIC ranging ( 0,125 - 2 ) g/ml for C.albicans and C. tropicalis and about ( 0,5 - 0.125 ) g / ml for C.dubliniesis and C.glabrata . The minimum fungicidal concentration (MFC) was 4 ug/ml or more for these Candida spp .The (MIC) for ketocanazole against C. albicans , C.dubliniesis , C.glabrata ranges were [0.5 - 32, 0.25 - 16 and 0.25 - 16] g / ml respectively, whereas the other species of candida were more sensitive to ketaconzole , and the ( MFC ) generally was equal to or higher than 32 ug / ml .The (MFC) for Miconzole was (4 - 8) g / ml against C. albicans an (1 - 0.125) g / ml agianst C.dubliniesis , the ( MFC ) ranged between equal to or higher than 4 and 16 g / ml . Fluconzole was less effctive than the others as the (MIC) values agianst all species were 32 g / ml or les. While the (MFC) was equal to or higher than 64 g / ml. Amphoterricin B was the most effective as the (MIC) values against all isolates of candida were (0.125 - 0.5) g / ml and MFC was 1 g/ ml.For the determination of (MIC) we found that using serial dilution of liquid cultures was better than using solid agar media. The recorded (MIC) result using agar media were higher than those obtained in liquid media.We studied the antagonistic effect against virulence factors of Candida spp by (23) isolates of bacteria isolated from healthy vagina. The selection of the candida and the bacterial isolates based on preliminary tests. So three isolates of peptostreptococuus prevotii, three isolates of propionibacteriume granulosum, six isolates of lactobacillus acidophilus , five isolates of lactobacillus jensenii , three isolates of each of streptococcus mitis , and Enterococcus feacalis were used in such tests as culture filtrates and / or as bacterial cells.The cultural filtrates were concentrated to the half or to the quarter volume of the original, as the non - concentrated culture filtrates did not show any effect. Different filtrates showed different levels of effect, the more effective were the double or quadruple concentrates of the culture filtrates of L.acidophilus isolates no 5 and 6, L.jensenii isolates No. 5, Enter.faecalis isolates No. 3 and strep.mitis isolates No. 3 . These filtrates adversely affected the phospholipase and proteinase enzymes, C.albicans being more affected than other species. Also these filtrates reduced significantly (P < 0.001) the percentage of germ forming cells of C.albicans . The culture filtrate (conc. to half or to quarter volume) of isolate No. 6 of L.acidophilus greatly reduced the viability (CFU /ml) of C.albicans and other species. This effect was not totally due to the acidity (low pH) since similar pH values in control tests did not reduce viability to the same level and did not effect the yeast cells. We found that adhesion of candida cells to epithelial cells was reduced in the presence of bacterial cells. The following bacteria were effective and they are listed below starting from the most to the less effective in reducing the number of adhering yeast cells (the number refers to the isolate number L.acidophilus 6, Enter. feacalis 3, Strep. mitis 3, P.granulosum3 peptost. prevotii 3 , L.acidophilus 5 and L.jensenii 5 .Some species of bacteria prevented adhesion by surrounding the yeast cells while other species surrounded the epithelial cells some did both

The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori == The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori

اسم المؤلف: ايمان عبد الجبار محمد العاني
اسم المشرف: Nazar E. Naser | Abdul Wahab Al - Shaikhly
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتوضيح تاثير الشذوذ المناعي حول الكشف السريري لدى مرضى مصابون بقرحة المعدة والاثني عشري في بغداد, بالاضافة الى تهيئة معالم اوضح لدور الانترلوكين - 8 في الامراضية المناعية عند هؤلاء المرضى والتي سببها بكتريا Helicobacter pylori. كذلك شملت الدراسة استخدام مختلف الفحوصات المناعية والبكتريولوجية في الكشف عن وجود بكتريا H.pylori المسببة لمرض قرحة المعدة والاثنى عشري . تم شمول (48) مريضا (31 من الذكور و17 من الاناث) وباعمار تراوحت ما بين ال30 - 50 سنة مصابين بمرض قرحة المعدة والاثني عشري ومجموعة من الافراد الاصحاء كمجموعة سيطرة ملونة من 62 شخصا منهم( 26 من الذكور و36 من الاناث ) باستخدام طرائق تحري بكتريولوجية شائعة وحديثة , مناعية وتشريح انسجة مرضية للتحري عن وجود الاصابة ببكتريا Helicobacter pylori.اعتمد التشخيص النهائي على ايجابية اي من الاوساط الثلاثة او بمصاحبة فحص اليورييز الايجابي وفحص النسيج المرضي, اذ اثبتت النتائج ان من بين اوساط الزرع الثلاثة المختلفة , كان HP agar هو الوسط الاكفا في عزل البكتريا H.pylori عندما حقق على معدل عزل قياسا بكل من وسطي اكار خلاصة الدماغ / القلب واكار كولومبيا ( 79.2% , 35.4% , 25% على التوالي). اظهر تقدير اداء الاختبارات المصلية في التنبؤ بالاصابة ببكترياH.pylori لدى مرضى قرحة المعدة والاثني عشري وتمييزهم عن مجموعة الاصحاء , ان تحديد وجود H.pylori specific IgG باتباع طرائق حديثة مختلفة قد يحسن من عملية التنبوء بالاصابة بالبكتريا اكثر من علاقتها بمرض قرحة المعدة والاثني عشري نفسه.كما وتضمنت الدراسة اتباع طريقتين لتشخيص وجود مضادات H.pylori specific IgG حيث اظهرت النتائج ان طريقة الاليزا (ELISA) اعطت معدل ايجابية اعلى لدى مجموعة المرضى مقارنة بطريقة miniVidas (95.8% , 89,6% على التوالي). ومن الجدير بالملاحظة ان مجموعة السيطرة H.pylori specific IgG بلغت نسبة ( 42.2% او 46.8% عند القياس بطريقة miniVidas او ELISA على التوالي). لم تظهر فوارق معنوية لمستوى وسط H.pylori specific IgG عند قياسه بالطريقتين , اية فروق معنوية بشكل واضح بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة , في حين ظهرت فروق معنوية بين وجود من عدم وجود H.pylori في مجموعة المرضى باستخدام طريقة miniVidas فقط ) وسط الزرع =3 ng/ ملي لتر و1.15 ng / ملي لتر على التوالي). لم يكن كلا من فحص H.pylori specific IgG واختبارات ال Helicogen ذات كفاءة جيدة في التنبؤ بمرض قرحة المعدة والاثني عشر للتفريق بين مجموعتي المرضى والاصحاء , اذ كان الPPV قريبا جدا من احتمال وجود المرض دون اجراء اي اختبار. ومن جهة اخرى فان اجراء الفحص السيرولوجي في التنبؤ بالاصابة ببكتريا H.pylori لدى المرضى المصابين بقرحة المعدة والاثني عشري اظهر بان طريقة اليزا قد تعتبر فحصا حساسا جدا (درجة الحساسية 100%) في التحري عن وجود H.Pylori التي نتج عنها PPV , NPVتاما لدى 87%. كما وتم الحصول على اعلى محدودية للاختبار الايجابي ( 97.5%) باتباع طريقة miniVidas رغم ان حساسية الاختبار كانت اقل بقليل من طريقة ELISA (97.5%). واستنادا الى النتائج فان H.pylori specific IgG الذي تم تقديره بطريقةminiVidas كان افضل خيار للتميز بين H.pylori السالبة والموجبة حيث اظهر القياس نسبة حساسية عالية وPPV تتجاوز 90.7% والتي كانت مساوية لمعيار النفاذ الذي تم الحصول علية باستخدام الطريقتين. اثبتت الدراسة الحالية وجود فوارق معنوية في المستوى الكلي لمصل IgG بين المجموعات الموجبة والسالبة لدى المصابين ببكتريا H.pylori (المتوسط الحسابي 1531.2 ملي غرام/ملي لتر و917.7 ملي غرام/ملي لتر على التوالي ) في حين لم تظهر فروقات معنوية تتعلق ب IgM, IgA, C3 & C4 بين هاتين المجموعتين. ومن ناحية اخرى تميز IgG وC4 لدى المقارنة بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة (المتوسط الحسابي ل IgG كان مساويا الى 1397 ملي غرام / ملي لتر و1067.4 ملي غرام / ملي لتر والمتوسط الحسابي لC4 كان 49.8 ملي غرام / ملي لتر و29 ملي غرام / ملي لتر على التوالي). تشير البيانات المستخرجة من الدراسة الى ان مستوى IL - 8 في مرض التهاب المعدة لم يكن يعتمد على الاصابة ببكتريا H.pylori ولكن زيادة ال IL - 8 في مستوى المصل بين حالات الاصابة بقرحة المعدة والاثني عشري قد تعزى الى التهاب النسيج الذي يصاحب المرض ما دام هناك فارق معنوي بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة, في حين لم تكن تلاحظ اية فروق معنوية بين المجموعات الموجبة والسالبة لبكتريا H.pylori . وقد تكون لهذه النتائج مضامين هامة للتوصل الى تبصر اعمق في تفهم اليات البكتريا المسببة للمرض فيما يتعلق بالاستجابة المناعية ضد الاصابة ببكتريا H.pylori | This study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of peptic ulcer among Iraqi patients, in addition to provide further insights into the role of some interleukins in immunopathogenesis of patients with peptic ulcer disease induced by Helicobacter pylori. The study also included various immunological and bacteriological investigations in detecting the presence of H. pylori associated with peptic ulcer disease.Forty eight (31 males and 17 females) patients suffering from peptic ulcer, and sixty two (26 males and 36 females) apparently healthy individuals (as control) , were subjected to different recent and common bacteriological, immunological and histopathological evaluations regarding the ages of the patients and healthy individuals included between 30 - 50 years which were done for detecting Helicobacter pylori infection.Final diagnosis was completely established when any of the three culture media showed the evidence or a combination of positive urease test and histological evidence. The results documented that among different types of cultures media, Helicobacter pylori agar was the most superior medium for the recovery of H. pylori 79.2 %, which provided the highest isolation rate compared with Brain Heart Infusion agar and Colombia agar (35.4 %, and 25 % respectively).Assessing the performance of serology in predicting H. pylori infection associating with peptic ulcer patients and / or distinguishing them from healthy controls, demonstrated that determination of H. pylori specific IgG using recent different methods may improve predicting the infection of H. pylori rather than relating to peptic ulcer disease itself.In the present study, two methods were used for detecting presence of H. pylori specific IgG antibodies. The results showed that ELISA method gave a higher cases positivity rate compared to miniVidas method (95.8%, 89.6% ,respectively) .It is worth noting that a good proportion of healthy controls had positive H. pylori specific IgG (45.2 % or 46.8 % measured by miniVidas or ELISA method respectively). The medium level of H.pylori specific IgG measured by both methods did not significantly differ between patients and control groups, while the differences observed for the presence of H. pylori compared with its absence among cases were statistically significant only by using the miniVidas method (Medium = 3 ng/ml, and 1.15 ng/ml respectively). The present study showed that both H. pylori specific IgG antibodies test and Helicogen tests were not so useful in predicting peptic ulcer disease distinguishing them from healthy control since the PPV was nearly close to the prior probability of having the disease without doing any test. On the other hand, assessing the performance of serology in predicting H.pylori infection in patients with peptic ulcer disease demonstrated that ELISA method would be a very sensitive test (sensitivity = 100 %) in detecting the presence of H. pylori, that resulted in a complete NPV and PPV of 87%.The highest specificity of positive test (97.5%) was obtained by using miniVidas method. Its sensitivity, however, was slightly lower than ELISA method (97.5 %). According to the results, H. pylori specific IgG measured by miniVidas method seems to be the best choice to differentiate between positivity and negativity of H. pylori since it offered a high sensitivity and a PPV exceeding 90.7% which was equal to the validity of parameter obtained by using both methods. The present study documented a significant variation in total serum IgG level between positive and negative groups of H. pylori infection,(mean 1531.2 mg/ml and 917.7 mg/ml ,respectively), while no significant variations were reported in IgM, IgA, C3 and C4 between these two groups. On the other hand, only IgG and C4 varied significantly regarding cases and control groups (mean of IgG = 1397 mg/ml and 1067.4 mg/ml, mean of C4= 49.8 mg/ml and 29 mg/ml, respectively). Data from the study indicated that IL - 8 level in gastritis was independent of H. pylori infection, but one would attribute the increase in IL - 8 serum level among cases with peptic ulcer to the tissue inflammation related to the disease since there was a significant variation between cases and controls, while no differences were observed between positive and negative groups of H. pylori infection. These findings might be of important implications for having further insights into understanding the pathogenic mechanisms of bacteria in relation with immunologic response against H. pylori infection.

دراسة جوانب من الاستجابة المناعية لاصابات الكلية عند الاطفال == A study of some immunological aspects in children with renal disease

اسم المؤلف: ايمان عباس محسن
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | سيناء مهدي شاكر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نفذت هذه الدراسة بين 17 - 12 - 2008 و25 - 8 - 2009 وشملت 62 طفلا مريضا في المدى العمري (1 - 12) سنة ومن كلا الجنسين : 26 طفلا مصابا بالفشل الكلوي المزمن و36 طفلا مصابا بالمتلازمة الكلائية، وكان المرضى خارجيين وراقدين في وحدة غسل الكلية في كل من مستشفى المنصور التعليمي للاطفال ومستشفى الطفل التعليمي المركزي وشملت المجموعة الضابطة 26 طفلا. جمعت عينات الدم من المرضى والاصحاء واجريت الفحوص المناعية وهي قياس مستويات كلا من انترلوكين - 6 والاريثروبيوتين وفق تقنية مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم ((ELISA. اما الاختبارات الكيميائية الحيوية فقد تضمنت قياس نسبة اليوريا والكرياتنين في المصل لتقييم الوظيفة الكلوية. شملت السمات الدموية قياس حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم للتحري عن وجود فقر الدم. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى انترلوكين - 6 (0.001>P) ونقصانا معنويا في مستوى الاريثروبيوتين(0.001>P) وزيادة معنوية في يوريا وكرياتنين المصل(0.001>P) ونقصانا معنويا في كل من حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم (0.001>P)في كلتا المجموعتين المرضيتين بالمقارنة مع المجموعة الضابطة. جمعت عينات الادرار من مجاميع المرضى والاصحاء واجري لها الفحص العام (بغض النظر عن نوع المرض الكلوي) بعد زرع النماذج على وسطي اغار ماكونكي واغار الدم . اظهرت نتائج الفحص العام للادرار ان وجود القوالب في ادرار المرضى لم يكن معنويا (الاحتمالية=0.056)، بينما كان وجود بروتين الالبومين في ادرار المرضى معنويا (الاحتمالية=0.049). وجدت نتائج زرع الادرار السالبة في 64.5% من كلتا المجموعتين المرضيتين٬ كذلك كانت نتائج زرع الادرار سالبة في المجموعة الضابطة. اما نتائج زرع الادرار الموجبة في المرضى (35.3%) فكانت تشير الى وجود التهاب السبيل البولي مع علاقة معنوية بنوع المرض الكلوي (الاحتمالية= 0.042). لقد اظهر التهاب السبيل البولي علاقة معنوية مع الجنس (الاحتمالية= 0.044). تضمن النمو الجرثومي الانواع التالية : E. coli (54.55%) وPseudomonas aeruginosa (22.73%) وKlebsiella pneumoniae (9.09%) وProteus mirabilis (9.09%) وعزلة واحدة فقط من Morganella morganii (4.55%). اختلفت العزلات البكتيرية في حساسيتها للمضادات الحياتية والتي اشتملت على السفترياكزون والسفتازديم والجنتامايسين وحامض الناليدكسك والتراي ميثوبريم والنايتروفيورانتين. | This study was carried out between December 17, 2008 and August 25, 2009. It included 62 pediatric patients at the age range (1 - 12) years of both genders : 26 with chronic renal failure (CRF) and 36 with nephrotic syndrome (NS), who were outpatients and in - patients in the dialysis unit in both Al - Mansour pediatric teaching hospital and Child's central teaching hospital. The control group consisted of 26 children. Blood samples were collected from patients and controls. Immunological tests of interleukin - 6 (IL - 6) and erythropoietin (Epo) measurement were done by using ELISA technique. Biochemical tests, including blood urea and serum creatinine, were applied to evaluate renal function. Hematological aspects referred to anemia presence or not; by measuring PCV and Hb. The results explained significant increase in serum IL - 6 levels (P<0.001), significant decrease in serum Epo levels (P<0.001), significant increase in both urea and creatinine concentrations (P<0.001) in serum and significant decrease in both PCV and Hb (P<0.001) in NS and CRF patients in comparison with the control group. Urine samples were collected from children with both renal diseases and healthy controls. After culturing the samples on both MacConkey agar medium and blood agar medium, general urine examination (GUE) was applied regardless the type of the renal disease. GUE of both CRF and NS patients showed that casts presence in urine was not significant (p=0.056), while albuminuria was significant (P=0.049). The negative urine cultures were present in 64.5% of both patients' groups. The control group showed no bacteria in urine. The positive cultures in patients (35.5%) were indicating UTIs with a significant relation with the type of renal disease (P=0.042). UTIs seemed to be related with gender (P=0.044). The bacterial growth included the following isolates : E. coli (54.55%), Pseudomonas aeruginosa (22.73%), Klebsiella pneumoniae (9.09%), Proteus mirabilis (9.09%) and Morganella morganii in one case only (4.55%). The bacterial isolates were different in their sensitivity to antibiotics, which included Ceftazidime, Cefteriaxone, Gentamycin, Nalidixic acid, Nitrofurantoin and Trimethoprime).

التحليل لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من مصادر التليف الحوصلي وغير التليف الحوصلي

اسم المؤلف: ايمان ثامر جار الله
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study concerned with illustration the molecular pattern of virulence genes in P. aeruginosa isolated from cystic fibrosis (CF) and compared them with those of none CF isolates (different nosocomial infections). The study involves the following steps : · Twenty - six isolates of P. aeruginosa were obtained from patients submitted to Baghdad hospitals/Iraq during the period between July 2013 until December 2013. These isolates were distributed as 6 isolates from blood, 4 isolates from urinary tract infections andsputum (for each), 3 isolates from wounds and ear infections (for each), 2 isolates from bronchial wash of patients suffering respiratory tract infection beside 4 isolates from cystic fibrosis patients. · The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar and P. aeruginosa agar then diagnosed by performing some morphological and biochemical tests. The second diagnoses was done by api 20NE system followed by Genotypic diagnoses usingpolymerase chain reaction (PCR) depending on a housekeeping gene rpsl gene (amplified size was 201bp). The results revealed that all the 26 isolates were P. aeruginosa.· Genotypic detection of many virulence factors related to P. aeruginosa was performed using conventional PCR. They included : gene coded for exoenzyme S (exoS, 504bp), exotoxin A (toxA, 352bp), two phospholipases C encoded by (plcH, 307bp) and (plcN,466bp), alginate (algD, 1310bp), (lasB, 300bp), putative silidase (Pseudoaminidase, 1500bp) and Neuraminidase (nan1, 1316bp). · The results revealed that the most frequently gene was exoS when it was detected in 21/26 (80.7%) and distributed between 19 in different clinical source and 4 in CF samples. For toxA the rate was 19/26 (73%) and all CF isolates were positive to this gene as with exoS. The percentage of other genes were, plcH 13/26 (50%), plcN 18/26 (69.2%), algD17/26 (65.3%) {All CF isolates were positive}. For lasB gene it was detected in 8/26 (30.7%), sialidase (Pseudoaminidase) in 4/26 (15.38%) isolate, one of source was CF and the others distributed between bronchial wash and ear infections. The last gene was nan1 and only one CF isolate 1/26 (3.8%) harbored this gene.· DNA sequencing and phylogenic analysis for exoS, toxA, plcH, algD, nan1 and sialidase (Pseudoaminidase) genes were done using Pairwise alignment and Tamura - Nei genetic destine model, UPGMA (Un weighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) tree build, respectively. Results of DNA sequencing for exoS and toxA genes revealed that most isolates display different point mutation as compared with the NCBI data. Point mutation type transversion was detected in residue no. 17 base 52 in P. aeruginosa exoSBW1 isolated from bronchial wash causes alteration of Thyamine to Adenine and conversion of Leucine residue to Glutamine. Another point mutation type transition occured in exoSB1, exoSU1 and exoSCyF1 in residue no. 18 base 55 when Guanine converted to Adenine cause conversion of Serine residue to Asparagine. P. aeruginosa exoSB3 and exoS CyF2 isolated from blood and cystic fibrosis, respectively, showed high similarity made them segregate within the same group or clone, while exoSU2 and U3 were within the same clone but neither with exoS U1 nor U4. · Another point mutation was detected in P. aeruginosa toxA CyF2, when nitrogen base Guanine no. 36 residue 12 was changed to Adenine causes conversion of Arginine to Histidin. Also mutation occur in toxA - CyF1, 2, 3, 4, toxA U1, 2, 3, 4 and toxA BI, BW1 whennitrogen base Adenine no. 132 residue 44 was converted to Guanine causes the conversion of Threonine to Alanine. Such difference may explain the diversity of virulence in some isolates.· DNA analysis for plcH was performed to amplified fragment related to CyF3. The identity of Pairwise alignment with the origin gene related to NCBI was 100% and no mutation was detected. · For algD, result revealed that a point mutations were detected in many residuse but the interest finding is that all of these mutations were silent specially in CyF2, since it didn’t change amino acid sequence, while the mutation that was delectated in P. aeruginosa algD Ear1 causes alteration in amino acid sequence when nitrogen base Guanine no. 388 residue 130 was converted to Adenine thus the conversion of Glycine to serine. The percentage of Pairwise identity was 95.4% which represent the percentage of identical residues in the alignment including gap and non gap residues .· For nan1 gene, many mutations were noticed in this amplified fragment but some of them were silent while others were defective cause alteration in frame translation in many residues. · DNA sequence for silidase (Pseudoaminidase) gene related to P. aeruginosa CyF3 and Pairwise alignment for this gene was performed (forward and reverse sequences data). The data was compared with control obtained from NCBI gene bank. The identity was 82% with some gaps occur in identity due to differences in base pair sequence as a result from changing some nitrogen bases. Most of these mutation were silent mutation after translated to amino acid. Others were not.· From all above results, it could be said that some isolates displayed highly virulence pattern specially in CF isolates as compared with non - CF isolates. P. aeruginosa was unique in harboring all the detected virulence genes and most of them were mutant.
1 ... 20 21 22 23 24 ... 32