عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 11,746

التاثيرات المرضية للذيفان الخلوي المستخلص من بكتريا Campylobacter jejuni المعزولة محليا == Pathological Effects of the Cytotoxin Extracted from a Locally Isolated Campylobacter jejuni

اسم المؤلف: سيناء محمد علي السباهي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was done to investigate the presence of Campylobacter jejuni in bloody diarrheal stool collected from hospitalized children with gastroenteritis. Campylobacter was isolated from only 4 specimens of a total number of 186; upon identification three isolates were identified as C. jejuni while the fourth isolate was found to be C. coli.Isolation of campylobacters was done using a locally prepared modified, blood - free, charcoal selective medium. It was the first time in which such medium was used for cultivating Campylobacter locally. The efficacy of this medium was very clear in comparison with the ordinarily used blood containing medium for inhibiting almost all fecal flora.Biochemical and physiological tests were used to identify and differentiate C. jejuni from the other Campylobacter species. The antibiotic sensitivity test showed that all isolates were sensitive to erythromycin, chloramphenicol, amikacin and ciprofloxacin, while resistance was found for cephalothin, ceftriaxone cefotaxime, ampicillin and trimethoprim.Tissue culture technique was used to determine C. jejuni of high cytotoxin productivity using continuous cell lines (HeLa and Vero cell lines); this isolate was used for further investigations in the study.In this study, the cytotoxin of the highest cytotoxin producing C. jejuni isolate was extracted locally for the first time and purified, using gel filtration chromatography with Sephadex G100.The purified cytotoxin revealed a single band which was observed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) under the denaturing conditions. The molecular weight of the purified cytotoxin was approximately equal to 43 KDa as determined by PAGE.Using newly hatched chicks (as an animal model),the ID50 value was 3.71x10 4 cfu /ml. The ID50 decreased from 3.71x10 4 to 1.66 x 10 3 cfu/ml when 50 μg of cytotoxin was mixed with the bacterial suspension, this result reflects the role of cytotoxin on the pathogenesis of C. jejuni infection.In the present study, oral inoculation of newly hatched chicks with the C. jejuni isolate resulted in clinical and histopathological damages leading to bloody diarrhea similar to that observed in humans infected with C. jejuni.The post - mortal examination of chicks' viscera showed an accumulation of fluid in chick intestines which were distended with watery fluid; also there was obvious hepatomegaly with yellow spots, and swelling of the gall bladder. The associated infection with the C. jejuni cells and their cytotoxin induced more progressive tissue damage represented by a more severe intestinal distension and congestion.The histopathological examination of the small and large intestine of chicks infected with Campylobacter cells, showed mucosal sloughing, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells in the mucosal and submucosal layers, and accumulation of edematous fluid in the mucosal layer. The examination of chicks infected with Campylobacter cells and the cytotoxin revealed the presence of the same lesion, but more severely with the presence of hemorrhage in the lumen. These results could be important evidence of the role of cytotoxin as a virulence factor on the pathogenicity of C. jejuni

دراسة بعض الجوانب المناعية لبكتريا Listeria monocytogenes المعزولة محليا == Some Immunological study 0n Listeria monocytogenes isolated Locally

اسم المؤلف: ميادة فرحان درويش
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية التحري عن بكتريا Listeria monocytogenes في (148) عينه سريريه تضمنت( 123) عينة من مسحات مهبل عليا (High Vaginal Swab)، و25 عينة مشيمه (Placenta) من النساء المجهضات، وتم الحصول على اربعة عزلات من مسحات المهبل العليا بنسبة ( 2.70) % في حين لم تعزل من عينات المشيمه ، وتم تشخيص العزلات كيموحيويا وزرعت على الاوساط الانتقالية والتفريقية واختبرت حساسيتها للمضادات الحيوية المختلفة. اذ ظهر ان العزلات حساسه جميعها لمضادات الامبسلين والجنتاميسين ومقاومه لمضادات حامض النالدكسيك واللنكومايسين ، ودرست قدرة العزلات البكتيرية على استحثاث الجهاز المناعي في الفئران المختبرية المحقونة باحد العزلات من خلال اجراء عدد من الاختبارات المناعية ومنها الفعالية البلعمية، وقابلية التحول اللمفاوي، وفرط الحساسية الاني والاجل، اظهرت النتائج ان العزلة التي اعطيت الرمز M4 - Lis هي الاكفا بين العزلات . حضرت اللقاحات من بكترياListeria monocytogenes العزله Lis - M4 بطريقة التضعيف (Live attenuated listeria) ولاول مرة محليا ، وكذلك حضرت بطريقة القتل بالحرارة ( listeria Heat killed) . تم حساب قيمة الجرعة القاتلة النصفية للفئران المحقونة بالعالق البكتيري العزله Lis - M4 والجرعه القاتله النصفيه اللقاح الحي المضعف واللقاح المقتول بالحراره المحضرين منها على النحوالاتـي (107×2.12 , 107×3.3 , 104×2.6) وحدة مكونه للمستعمرات / 1مليلتروعلى التوالي. وتم اختيار التركيز 107و 106 , 108 لغرض تقويم التركيزالاكفا في تعزيز الاستجابة المناعية .قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في الفئران باستخدام الفحوصات الاتية فحص التحول اللمفاوي ، اختبار البلعمة ، واختبار فرط الحساسية الاني والاجل ، كما تم قياس الفعالية النوعية لانزيم الادينوسين دي امينيزAdenosin deaminase (ADA) وباستخدام تراكيز ثلاث CFU 108 , 107 , 106 في 1 مليلتر من اللقاحين والعالق البكتيري وبواقع ثلاث فئران لكل معاملة مع وجود مجموعة سيطرة حقنت بماء الملح الوظيفي . اظهرت النتائج ان اللقاح الحي المضعف هوالاكفاء وباستخدام جرعة منشطة واحدة بعد ثمان ايام من التلقيح حيث ظهر اعلى معدل لنسب الخلايا البلعمية الملتهمة واعلى نسب للخلايا اللمفاوية المتحولة واعلى معدل في تفاعل فرط الحساسية المتاخر والاني ، واعلى معدل للفعالية النوعية لانزيم ADA ، وان زيادة عدد جرع اللقاح المقتول بالحرارة ولحد الجرعة الثالثة يزيد من الاستجابة المناعية لهذا اللقاح . كذلك قيمت بعض جوانب الاستجابة المناعية في النساء المجهضات نتيجة الاصابة ببكتريا الليستريا والمجهضات لاسباب اخرى ، اظهرت النتائج وبوضوح ارتفاع معدل كلا من γINF - ( 10.97 vs 6.25) وIL - 12 ( 289.19 vs 159.54) وبفارق عالي المعنوية (p<0.00) عند المقارنة بين مجموعة السيطرة والمجهضات بسبب الاصابة بالليستريا وكذلك ارتفاع قيم IgG , IgM , IgA وارتفاع كلا من C3 , C4 نتيجة الاصابة ببكتريا Listeria monocytogenes ، اكدت النتائج قدرة الليستريا على تحفيز الجهاز المناعي بصورة جيدة من خلال تحفيزها للحركيات الخلوية ، اعطت هذه الحقيقة دعما لامكانية استخدام لقاح الليستريا في دراسات اخرى بوصفه علاجا مناعيا ضد العديد من الامراض . | The present study was achieved to investigate the Listeria monocytogenes in clinical samples such as high vaginal swabs and placenta from women with repeated abortion beside samples of blood . Listeria monocytogenes was isolated in percentage of (2.7%) from high vaginal swabs (123) samples but not isolated from placenta 25samples,and the isolates diagnosed dependent on the biochemical test and growth characteristic on selective and differential culter media. The susceptabibility of isolates to different antimicrobial agent was studied , It appeared that all isolates were totally sensitive to Gentamycine and Ampicillin but they were totally resistant to Lincomycine and Nalidaxic acid . The activity of isolates to stimulate immune response in mouse injected by one of these isolates througe number of immune testing which it : phagocytosis , lymphocyte transformation assay , immediate and delayed hypersensitivity reaction ,The result show the Lis - M4 is the best between them . The vaccine prepared from listeria monocytogenes in tow ways , live attenuated listeria is first prepared from bacterium listeria monocytogenes in our country ; also heat killed listeria was prepared . Calculated LD50 in injected mice by Lis - M4 listeria and mice injected by live attenuated vaccine and heat killed listeria vaccine ,So the result as following ( 2.6 ×104 ;3.3 ×107 ; 2.12 ×107 ) in 0.1 ml respectively , and chose the 106 ,107,108 to evalute the best concentration the in stimulate immune response. Immune response in mice evaluated by using the following assay : lymphocyte transformation assay , phagocytosis , immediate and delated hypersensitivity , also Adenosine deaminase specific activity was studied , by use three concentration 106 , 107 , 108 in 0.1ml from tow vaccines and bacterial suspention in 3 mice to each test in addition to control group injected by phosphate buffer saline . The results of this study confirmed that , live attenuated vaccine in boosting dose after 8 days from vaccination is the best efficient and gave highest mean in phagocytosis , lymphocyte transformation assay and significant increase in delayed hypersensitivity and arthus reaction , and highest mean in specific activity in adenosine deaminase enzyme , also show increase vaccine dose stimulate immune response for this vaccine. The immune response in abortion women which infected by Listeria monocytogenes compared with abortion women as aresult different causes , the result observed increase mean in INF - γ (10.97 vs 6.25) and IL - 12 (289.19 vs 159.54 ) by compared with control group , also highest mean in IgG , IgA , IgM , and C3 , C4 as a result Listeria infection . This result amphesis the ability of Listeria to premote immune response through out stimulate cytokines and demonstrate used this vaccine as immunotherapy in several disease

التعبير السايتوبلازمي للانزيمات المحللة للبروتين MMP - 2, - 9 ومثبطاتها في النسيج TIMP - 1, - 2 وتعبير مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي Fas ligand في سرطان الخلايا الانتقالية للمثانة البولية == Cytoplasmic expression of matrixmetalloproteinases (MMPs) Vs Tissue inhibitor of metalloproteinases (TIMP - 1, - 2) and expression of death receptor (Fas) , and it's specific ligand (FasL)in Transitional cell Carcinoma of the urinary bladder

اسم المؤلف: مي خليل اسماعيل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة باستخدام 36 نموذجا نسيجيا مطمورا بشمع البرافين ماخوذا من مرضى مصابين بسرطان الخلايا الانتقالية في المثانةTransitional cell carcinoma (TCC ) بالاضافة الى 10 نماذج نسيجية طبيعية ماخوذة من معهد الطب العدلي . النماذج جميعها خضعت لتقنية التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي Immunohistochemistry للتحري عن التعبير السايتوبلازمي لانزيمات MMP - 2 وMMP - 9 ومثبطاتها النسيجية TIMP - 1 وTIMP - 2 فضلا عن التحري عن التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول mRNA لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL باستخدام تقنية التهجين الموضعي In situ hybridization .اظهرت نتائج هذه الدراسة ان نسبة اصابة الذكور الى الاناث بـTCC هي 1 : 3 وان معدل اعمار المصابين كان 60 سنة . واعتمادا على نتائج التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي اظهرت النتائج وجود زيادة معنوية في التعبير السايتوبلازمي عن MMP - 2(P<0.05) يقابلها انخفاض معنوي في التعبير عن TIMP - 2 في الانسجة السرطانية مقارنة بالانسجة الطبيعية (P<0.05) . وعندما صنفت النماذج السرطانية اعتمادا على التغيرات النسيجية المرضية وجد ان كلا من انزيمي MMP - 2 وMMP - 9 يملكان علاقة ايجابية بتطور درجات الورم Tumor grades اذ يزداد التعبير السايتوبلازمي عن هذين الانزيمين كلما ازدادت درجة الورم (p<0.05) ، (p<0.05) بالتتابع . الا انه لم تظهر اية فروقات معنوية في التعبير عن هذه الانزيمات ومثبطاتها بتطور مرحلة الورم Tumor stages (p>0.05) .اما نتائج التعبير الموضعي للحامض الرايبي الرسول لكل من مستقبل الموت Fas ورابطه النوعي FasL فقد اظهرت زيادة معنوية في التعبير عنهما في الانسجة السرطانية عندما قورنت بالانسجة الطبيعية (P<0.05) و(P<0.05) بالتتابع كما لوحظ ان تعبير الخلايا السرطانية الانتقالية عن FasL يتناسب طرديا مع تقدم كل من درجة الورم ومرحلته Tumor grade and stage فهناك فرق معنوي في التعبير عن FasL بين الدرجة الاولى والثالثة (P<0.05) وبين المرحلة T1 وT2(p<0.05 ) .اما تعبير هذه الخلايا عن المستقبل Fas فقد لوحظ انه يتناسب عكسيا مع تطور درجات الورم ومراحله فهناك فرق معنوي في تعبير هذه الخلايا عن Fas بين درجة واخرى (p<0.05) وبين مرحلة واخرى (p<0.05) . في الوقت الذي لم يظهر فيه تعبير الخلايا اللمفاوية عن Fas وFasL اختلافا مع تطور درجات الورم ومراحله(P>0.05) و(P>0.05) بالتتابع .وعندما قورنت المعلمات الثمانية احصائيا مع درجات تطور الورم ومراحله ظهرت علاقة طردية معنوية بين MMP - 2 ودرجة الورم (P<0.05) وبين MMP - 9 ودرجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(p<0.05) على التوالي . كما لوحظت علاقة طردية عالية المعنوية في تعبير الخلايا السرطانية عن FasL مع تقدم درجة الورم ومرحلته (P<0.01) و(P<0.01) على التوالي .من هذه الدراسة نستنتج ان فرط التعبير عن كل من MMP - 2وMMP - 9 وFasL له علاقة بتقدم اورام TCC واجتياحها. | This study was designed by using 36 paraffin embedded tumor tissues obtained from TCC patients , and 10 normal bladder tissues obtained from forensic medicine institute . All specimens undergone to Immunohistochemistry technique to investigate the cytoplasmic expression of MMP - 2, MMP - 9 and their tissue inhibitors TIMP - 1 and TIMP - 2 ; in addition to the in situ mRNA expression of each death receptor (Fas) and its specific Ligand (FasL ) by using in situ hybridization technique. This study showed that male to female infection ratio was 3 : 1 and the mean age of patients was 60 years . Regarding immunohistochemical staining ; MMP - 2 cytoplasmic expression showed significant increase (P<0.05) with significant TIMP - 2 dicrease in tumor tissues compared with normal tissues (P<0.05).According to the histopathological criteria of malignant tissues ; MMP - 2 and MMP - 9 showed a positive relation with tumor grade progression ; so cytoplasmic expression of there enzymes was increased with tumor grade increase (p<0.05) , (p<0.05) respectively ; but there was no significant difference in there enzymes and their inhibitors expression with tumor stage progression (p>0.05).Rgarding in situ mRNA expression of Fas and Fas L ;results of this study reveled that a high significant expression in malignant tissues compaired with normal tissues (p< 0.05 ), (P > 0.05) respectively .Moreover ,FasL expression on transitional malignant cells has a linear increase with tumor grade and stage progression ; there was a significant difference in FasL expression between grade I and grade III(P < 0.05) and between stage T1 and T2 (P < 0.05) . while we found an inverse relation between Fas expression on these cells and tumor grades and stages progression ; there was a significant difference among grades and among stages (P < 0.05) , (P < 0.05) respectively. while there was no significant differences in Fas /FasL expression on lymphocytes and tumor grade and stage progression (P>0.05), (P>0.05) respectively. When we statistically compare the eight markers with tumor grades and stage ; we showed a significant linear relation between MMP - 2 and tumor grade (p<0.05) ; also between MMP - 9 and tumor grade and stage (p<0.01), (p<0.05) respectively. On the other hand , a highly significant liner relation was showed between Fas L expression on transitional malignant cells tumor grade and stage progression (p<0.01) , (p<0.01) respectively .From this study we conclude that overexpression of MMP - 2 , MMP - 9 and FasL are correlated with TCC invasion and progression

تنشيط النطف خارج الجسم باستخدام الاوكسيتوسين في مرضى العقم == In Vitro Sperm Activation by Oxytocin in the Infertile Patients

اسم المؤلف: مكارم قاسم داود اللامي
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي | فريال عبد المناف المهداوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على ١٨۰ مريضا يعانون من وهن النطف اثناء مراجعتهم لمعهد ابحاث الاجنة وعلاج العقم / جامعة النهرين. كان الهدف الرئيس لهذه الدراسة هو استقصاء تاثير اضافة الاوكسيتوسين الى السائل المنوي للمرضى لغرض التحقق من تحسين خصائص الحركة العائدة الى النطف، وكان التركيز على هذا الهرمون بوصفه مادة طبيعية ينتجها الجسم وله وظائف معروفة غير التي هدفت اليها هذه الدراسة. اما الهدف الثانوي فهو دراسة علاقة الترابط بين قيم بعض المعايير الكيمياحياتية للمني ومستوى الهرمونات التكاثرية للمصل من جهة واختبارات وظيفة النطف من جهة اخرى.تم تحليل السائل المنوي للمرضى قبل تنشيط النطف، ومن ثم تم تقسيم المرضى الى ثلاث مجاميع رئيسة متساوية. جمعت عينات الدم من مرضى المجموعة الاخيرة لغرض تعيين مستوى الهرمونات التكاثرية الاربعة في المصل وهى : التيستوستيرون، البرولاكتين، الهرمون اللوتيني، والهرمون المحفز للجريب. كذلك تم قياس مستوى بعض المعايير الكيمياحياتية للسائل المنوي لمرضى هذه المجموعة والتي تضمنت : البروتين الكلي، الكوليستيرول، الكالسيوم، انزيم الكرياتين كاينيز، والفركتوز.استخدمت طريقتان لتنشيط النطف خارج الجسم in vitro وهما : الطريقة المباشرة (باستخدام مزيج الاوكسيتوسين ووسط تحضير النطف) والطريقة غير المباشرة (باستخدام التقنية الطباقية البسيطة) وبتطبيق ثلاثة تراكيز من الاوكسيتوسين وهي : ۲،٤، و٦ وحدة دولية/مل لاختيار التركيز الاكثر تاثيرا على اختبارات وظيفة النطف. اظهرت نتائج الطريقة غير المباشرة حدوث تحسن معنوي ملحوظ (P<0.001) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف عند التركيز۲ وحدة دولية/مل مقارنة مع عينات السيطرة. وقد كان هناك ميلا الى تناقص درجة نشاط النطف مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. اما نتائج الطريقة المباشرة فقد اظهرت حدوث زيادة معنوية (P<0.05) في درجة نشاط النطف وقد كان هناك ايضا ميلا الى تناقص معيار الحركة هذا مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. بناء على هذه النتائج، تم استعمال التركيز۲ وحدة دولية/مل للاوكسيتوسين مع تطبيق الطريقتين المباشرة وغير المباشرة وذلك في حالتين هما وجود وسط تحضير النطف وعدم وجوده. اظهرت حصيلة الطريقة غير المباشرة لتنشيط النطف وعند وجود وسط تحضير النطف زيادة معنوية ملحوظة (P<0.001) في خصائص الحركة (النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف) في كلا المجموعتين (المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة) مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط. اما مقارنة المجموعتين معا فقد اظهرت بان افضل تحسن معنوي ملحوظ ((P<0.001 في خصائص الحركة كان في المجموعة المعاملة. عند غياب وسط تحضير النطف كان هنالك تحسنا معنويا (P<0.05) في خصائص الحركة في المجموعة المعاملة فقط مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط . عند تطبيق الطريقة المباشرة كانت النتائج مماثلة لما حدث عند تطبيق الطريقة غير المباشرة في حالة وجود وسط تحضير النطف. اما عند غياب وسط تحضير النطف لم يحدث اي تغيير معنوي (P>0.05) في تلك المعايير بعد فترة الحضانة. واظهرت النتائج ايضا بان هناك استجابات محفزة بالاوكسيتوسين (رغم انها غير معنوية) في تلك المعايير مقارنة مع مجموعة السيطرة. تشير جميع هذه النتائج الى التاثير المحفز للاوكسيتوسين عند التركيز۲ وحدة دولية/مل على خصائص حركة النطف، كذلك فان استعمال وسط تحضير النطف ادى الى دعم ذلك التاثير.تم تقييم علاقة الترابط بين المعايير الكيمياحياتية لبلازما المني ومعايير المني، وقد اشارت النتائج الى وجود ترابط موجب وبشكل معنوي (r = +0.29, P<0.05) بين مستوى الكوليستيرول وتركيز النطف، وبين مستوى الكالسيوم وكل من النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = +0.27, P<0.05) ودرجة نشاط النطف(r = +0.37, P<0.05) . بينما كان هناك ترابط سالب وبشكل معنوي بين مستوى الفركتوز من جهة وكل من تركيز النطف - 0.41, P<0.001) (r =، النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = - 0.28, P<0.05) ، ودرجة نشاط النطف (r = - 0.32, P<0.05) من جهة اخرى.عند مقارنة مستوى هذه المعايير الكيمياحياتية بين المجموعة المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة، كان واضحا بان الاوكسيتوسين ربما يكون سببا في فقدان الكوليستيرول من الغشاء البلازمي للنطف وبالتالي زيادة مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. كذلك فان الاوكسيتوسين ربما ادى الى تحوير نقل الكالسيوم عبر الغشاء البلازمي وبالنتيجة زيادة تركيز الكالسيوم داخل الخلية وانخفاض مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. بالاضافة الى الانخفاض المعنوي الملحوظ ((P<0.001 في مستوى الفركتوز في الوسط الخارجي والذي يشير الى استخدامه المتزايد من قبل النطف بسبب تنشيط الحركة.اظهرت نتائج فحوصات الهرمونات التكاثرية ارتفاعا معنويا ملحوظا ((P<0.001 في مستوىالبرولاكتين وانخفاضا معنويا (P<0.05)في مستوى الهرمون اللوتيني في الحالات المدروسة عند المقارنة مع القيم الطبيعية. وجدت علاقة ترابط سالبة وبشكل معنوي (r = - 0.29, P<0.05) بين مستوى برولاكتين المصل وتركيز النطف، وقد وجدت علاقة مشابهة ايضا (r = - 0.28, P<0.05) بين مستوى الهرمون المحفز للجريب في المصل وتركيز النطف.

تقييم لقاح الحصبة لدى الاطفال والبالغين باستخدام طرق مصلية مختلفة == Evaluation of Measles Vaccine in Children and Adults Using Various Serological Methods

اسم المؤلف: كريم مؤمن ليلو الساعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: بالرغم من نسبه التغطيه (العاليه ) من التلقيح في العراق الا ان وباء الحصبه مستمر في الحدوث وازدياد نسبة المعرضين للاصابه بمرورالزمن الى مستوى ينتشر فيه المرض بسهوله. ان السيطره على هذا مرض في بلدنا عمليه صعبه لسهولة انتقال الفيروس بين الملامسين بالاضافه الى عدم تطور البنيه التحتيه لانجاز عملية التلقيح ومراقبة الاصابات للحد من انتشار المرض . شمل البحث دراسة الاستجابه المناعيه ضد فايروس الحصبه لنمادج من المصل لاشخاص عراقيين من بغداد ولاطفال من زامبيا مدينة لوساكا .فيما يخص نماذج العراقيين تم اخذ 165 نموذج دم لاطفال وبالغين بواقع 95 ملقحين و70 مصابين من بينهم 34 مصاب بالحصبه على الرغم من التلقيح ضد المرض باعمار تتراوح بين ( 8 شهر - 30 سنه) وللمده ( من شباط / 2007 الى حزيران / 2007 ) , قسمت النماذج الى ستة مجاميع اعتمادا على المدى العمري . شخصت الاصابات التي وقعت عام 2007 سريريا في المراكز الصحيه ومن ثم تاكيدها مختبريا في مختبر الصحه العامه المركزي في بغداد , تم تقييم الاستجابه المناعيه المتخصصه ضد فايروس الحصبه باستخدام ثلاثة طرق مصليه مختلفه وهي : التعادل المصلي الدقيق وقياس الكلوبيولين المناعي صنف G وطريقة تثبيط التلازن الدموي اجريت هذه التجارب في مختبر تقييم اللقاحات الفايروسيه والزراعه النسيجبه في المركز الوطني للرقابه والبحوث الدوائيه . اظهرت نتائج طريقة التعادل المصلي ان جميع المشاركين بالدراسه يمتلكون الاجسام المضاده ( وهم الذين يمتلكون عياريه مساويه او اعلى من ( 128 ) المتخصصه ضد فيروس الحصبه ولكن بمستويات مختلفه , حيث كان مستوى الحمايه المصليه بنسبة 79% للملقحين و94,2% للمصابين وهذا يؤكد على بقاء الاجسام المضادة هذه لفتره طويله بعد حصول الاصابه والتلقيح . وكان معدل الانتشار المصلي لمختلف اعمار الملقحين : 923± 258 , 714± 336 , 705 ± 384 , 268 ± 289 , 278 ± 214 للاعمار (6 - 10 ),(11 - 15) , (16 - 20) ,(21 - 25) , (26 - 30) سنه بالتعاقب , اذ تبين عدم وجود مؤشر احصائي معنوي (P>0.05)عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه مع المصابين حديثا باعمار اقل من 6 سنوات, اما الملقحين بعمر (11 - 15) سنه قد اظهر وجود مؤشر احصائي مختلف (P<0.01) عند المقارنه بين الملقحين بالعمر(6 - 10 ) سنه , اما الفئات العمريه (16 - 20) , (26 - 30) سنه من الملقحين فقد اظهرت مؤشرات احصائيه مختلفه (P<0.01)بالمقارنه مع نفس الفئات العمريه من المصابين ولم تظهر الفئه العمريه (21 - 25) سنه من الملقحين مؤشر احصائي مختلف مع المقارنه لنفس الفئه من المصابين . اظهرت النتائج نسبه 97 - 100% للحمايه المصليه لفئة الملقحين في المدى العمري (6 - 10) سنه بعد ذلك تبدا بالانخفاض بتقدم العمر , وكانت نسبة الحمايه المصليه 95 - 100% للمصابين بالمرض من مختلف الفئات العمريه المشاركه في الدراسه . اجريت دراسه ايضا بقياس الحمايه المصليه بالاعتماد على عدد جرع اللقاح المعطاة باستخدام طريقة التعادل المصلي وكانت النتائج (1 : 838 ± 403) , ( (1 : 938± 244) للاشخاص الذين اعطوا 5 و6 جرع على التوالي واظهرت اختلاف احصائي(P<0.01) عن الذين اعطو (1 - 2)جرعه من لقاح الحصبه .تمت دراسة فترة بقاء الاجسام المضادة المتخصصة ضد فايروس الحصبه للملقحين والمصابين اذ وجدت بنسبة عاليه قبل مرور فترة 3 سنوات من اعطاء اخر جرعه من اللقاح حيث اظهرت مؤشر احصائي مختلف من الذين امضوا اكثر من 3 سنوات باستلامهم اخر جرعه , بينما لا توجد مؤشرات احصائيه مختلفه من اعطاء اخر جرعه لفترة (3 - 10)سنه واكثر من 10 سنوات , وهذا يعطي دليل بانخفاض مستوى الاجسام المضاده مع مرور الوقت سواء بعد التلقيح او الاصابه الطبيعيه . اظهرت نتائج قياس IgG بطريقة ELISA ان الحمايه المصليه تمثل 89% ضد الاصابه بفايروس الحصبه وتمثل نسبة 7.7% حمايه مصليه غير ثابته ونسبة 3.3% دون حمايه مصليه .وكانت اعلى نسبه من الحمايه المصليو 94,7% في الاعمار الصغيره (6 - 10) سنه من المشاركين في البحث واقل نسبه من الحمايه المصلية 75% للاعمار الكبيره (25 - 30) سنه . وبصوره عامه فان معدل عيارية الاجسام المضاده المتخصصه ضد فايروس الحصبه صنف IgG هي 2080 ±1837 لجميع الملقحين قيد الدراسة وبدون اختلاف احصائي معنوي بالمقارنه مع المصابين والتي كانت 1949 ±1838 , وان التلقيح بالجرعات التعزيزيه الاضافيه للفئات العمريه المناسبة تلعب دور كبير في تمنيع المجتمع للحد من حدوث الاوبئه وانتشارها . اما باستخدام طريقة تثبيط التلازن الدموي وجد 60 مشاركا من اعمار مختلفه يمتلك اجسام مضاده متخصصه مثبطه للتلازن الدموي , وعند الاخذ بنظر الاعتبارعيارية 1/8 كمؤشر للتعرض للاصابه وجد الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي 53,6 % , 73,6% للملقحين والمصابين بالتتابع , كما وجد انخفاض واضح لمستوى هذه الاجسام المضاده بتقدم العمر , وكما كانت النتائج التي حصل عليها هذا البحث باستخدام تقنية التعادل والاليزا يمكن الاستنتاج ايضا ان مقدارتركيز الانتشار المصلي المثبط للتلازن الدموي ذو علاقه مباشره وطرديه مع نسبة الحمايه المصليه ضد النوع البري للاعمار ما بين (6 - 15) سنه , وكانت نتائج معظم افراد الفئه العمريه (16 - 30) سنه ذو نسبه واطئه من الحمايه المصليه وهذه النتائج ربما تعود ان المشاركين في الدراسه للفئه العمريه الكبيره كانت ولادتهم قبل الشروع ببرنامج التلقيح الموسع اوكونهم عاشو خلال فترة كانت فيها نسبه واطئه من التغطيه في التلقيح مما يؤدي الى انخفاض ونقص في الانتشار المصلي . اما نتائج دراسة المقارنه باستخدام الطرق المناعيه الثلاث في قياس الاستجابه المناعيه ضد الحصبه وجد هناك علاقه جبده ومباشره بين طريقتي التعادل وتثبيط التلازن الدموي ( r =0.87 , P<0.01 كما بينت النتائج ان طريقة تثبيط التلازن الدموي اقل حساسيه من طريقة التعادل , اما المقارنه مع طريقة قياس الكلوبيولين المناعي صنف الكلوبيولين المناعي IgGتعتبرمقياس دقيق وذات علاقه جيده ومباشره مع طريقة التعادل (r = 93 , P< 0.05) واخيرا يمكن الاستنتاج ان طرق التعادل هي الطريقه المثلى في قياس الاجسام المضاده ضد فايروس الحصبه وتعتبر الطريقه المناسبه لقياس مستوى الحمايه ضد المرض . اما بخصوص نماذخ المصول العائده للاطفال من زامبيا , شملت الدراسه (50) نموذجا , يعضها كان قبل التلقيح والبعض الاخر بعد (1 - 3 اشهر ) من تلقيح الاطفال بلقاح الحصبه المنفرد بعمر 9 اشهر , تم قياس الاجسام المضادة المتخصصه ضد فايروس الحصبه بتقنية التعادل المصلي في الاكار وباستخدام النوع البري لفايروس الحصبه المعزول من حالات مصابه بالحصبه واجري الاختبار باصابة خلايا كلية القرد الاخضر الحامله للمستلم CD150 واجري الاختبار بالتزامن مع المصل القياسي العالمي لغرض المقارنه ولغرض تحويل العياريه للنتائج الى الوحدات العالميه , تم اجراء الاختبارات في مختبر الاستاذه كرفن في جامعة جون هوبكنز الامريكيه.اما نتائج هذه الاخيبارات فقد كان قياس الاجسام المضاده للاطفال الزامبيين بعمر 9 اشهر قبل اخذ اللقاح 0.079 وحده عالميه وبنفس الوقت هي تمثل ما تبقى من الاجسام المضاده المكتسبه وهي اقل من مسوى الحمايه ضد المرض التي هي 0.120 وحده عالميه عند استخدام تقنية التعادل المصلي في الاكار , اما بعد الفتراة الزمنيه شهر واحد وثلاثة اشهر من التطعيم كان قياس الاجسام المضاده 0.606 , 0.493 وحده عالميه وبمؤشر احصائي P< 0.05 ,P<0.01 , على التوالي بالمقارنه بنتائج قبل التطعيم وهو اعلى من مستوى الحمايه ضد المرض , بينما كان قياس الاجسام المضاده بعد الاصابه الطبيعيه للاطفال بعمر 76 شهر 3.303 وبمؤشر احصائي P<0.005 وحده عالميه وهذه النتيجه تؤكد النتائج السابقه بان الاستجابه المناعيه بعد الاصابه الطبيعيه اعلى من نسبتها بعد التطعيم .وهذه النتائج تتفق مع نتائج الاستجابه المناعيه للاطفال العراقيين دون سن 6 سنواة فيما يخص مستوى الحمايه ضد المرض . | In this study, the potency of the live measles vaccine ( Rouvax / Sanofi pasture production) has been determined by an in vitro microtitration assay ,the results were considered comply and meet with the WHO requirement .The estimation of the prevalence measles antibody among serum samples from Iraqi and Zambian population after measles vaccination and natural infection. Regarding the Iraqi blood samples were collected from Iraqi children and adults with documentation of vaccinated or exposure to natural infection with an average age of (8 months - 30 years) .Samples were divided into six groups based on the age of participants .The individuals were infected during 2007 outbreak identified in the health center of their area and confirmed serologically in Center Public Health Laboratory (CPHL) in Baghdad; Serological assays were performed at the National Center for Drug control and Research ( NCDCR) to detect measles antibody . All 156 participants had detectable neutralizing antibodies, while the prevalence of protective level of neutralizing antibody titer (≥ 1 : 128), was found in 79% of vaccinated group and 94.2 % for participants with a history of measles cases suggesting that the rate of antibody persist longer when expressed exposure to circulating wild virus. When groups distribution of the Geometric Mean Titer (GMT) values was determined according to the age groups, revealed that the measles neutralizing antibody titers after vaccination were 923± 44.2 , 714 ± 68.7 , 705 ± 99.2 , 268 ± 91.4 and 278 ± 87.7 for groups 6 - 10 ,11 - 15 ,16 - 20, 21 - 25 and 26 - 30 years respectively . There was no significant statistical difference (p>0.05) for age group 6 - 10 when comparing with infected children (<6 years), 11 - 15 years group showed statistical significancet when compared with infected children (>6 years) ( P < 0.01) , 16 - 20 and 26 - 30 of vaccinated groups also showed to be statistically significant when comparing with similar age of infected individuals (P< 0.01 ) ; But there is no statistical significance for age groups 21 - 25 years when comparing with similar age of infected individuals ,(p> 0.05) The percentage of neutralizing protective level was 97 - 100% for (>6 - 10) years of vaccinated group and then decreased with increasing ages, while persistent (95 - 100%) for the different age groups infected with measles. Neutralizing antibody titers after five and six vaccine doses was a (1 : 838 (SEM) 100) and (1 : 938 (SEM) 93) respectively this is showing statistically significance when compared with individuals previously had received one and two doses (p < 0.001 and p < 0.01) respectively . In the study of persistence of neutralizing antibody after vaccination and natural infection the prevalence of measles antibody was very high before 3 years of the last dose and show significant differences when compared with group of individuals who had received the last dose after more than 3 years ( P<0.05) and there was no significant statistical differences between groups with the period 3 - 10 and >10 years after the last dose. therfore, no evidence was found of neutralizing antibody against measles which decreased to nonprotective levels from neutralizing result after both vaccination and natural infection. In the second assay, sera were tested for measles specific IgG by ELISA result showed that 89% of all individuals who participated in the research were seropositive against measles, 7.7% equivocal and 3.3% had shown seronegative. The highest seroposivity was ( 94.7% ) among individuals with the lowest age group (6 - 10 years), and the lowest seroposivity (75 %) was among the oldest age group (26 - 30 years). In general all individuals participated in this study have shown IgG level 2080± 197.5 mIU/ml of the vaccinated groups. when compared with participants previously exposed to measles natural infection that was found (1949 ± 262.5mIU/ml) with no statistically significant . When individuals grouped according to the increased age , a marked decline in IgG levels were observed, resulting in different levels of protection against measles and suggested that supplementary vaccination might play a role in vaccinating population before measles outbreaks . In the third assay the prevalence of measles antibody by hemagglutination inhibition has been found that 60 participants of different age groups have detectable hemagglutination inhibition antibody titer using the titer(<1 : 8) as indicator of susceptibility .It was found that 53.6% and 73.6% of hemagglutination inhibition seroprevalence among vaccinated and those with previous to natural infection respectively . Hence again a marked decline in hemagglutination inhibition antibody titers was observed with the increasing age of participants in this study. Regarding neutralizing and IgG - ELISA antibody, the results of hemagglutination inhibition suggest that the seroconvesion after vaccination correlated with the protective levels against wild type among age group (6 - 15) years and most of the participants with (16 - 30) years age group have a low percentage of hemagglutination inhibition antibody titers, and these results may be due to the fact that individuals were born before the implementation of routine immunization against measles in 1985 and lived in the time of low vaccination coverage resulting in waning of antibody or lack of initial seroconversion. In comparison of different methods that have been used in this study to evaluate specific measles immune response, it was found that a good correlation between hemagglutination inhibition and neutralization test ( r=0.87 , P<0.01).With measles virus , hemagglutination inhibition was considered less sensitive than neutralization test . Also was found a good correlation between IgG - ELISA and neutralization assays ( r=0.93 , P<0.05). It has been concluded that the neutralization assay is considered the gold standard in measuring antibodies properly and most important in clinical protection. About the Zambian children were used in order to know the level of immunity required for measles elimination after administration with different measles virus vaccine strain .Fivity serum samples were available from Zambia children in prevaccination , 1 - 3 months after vaccination at 9 months of age ,and infected children with ages (76 ± 65 months ) . A modified plaque reduction neutralization assay was conducted to measure measles antibodies ,using wild type of Measles virus strain to infect veroSLAM cells , Plasma samples were tested in parallel with the International World Health Organization (WHO) Serum Standard and results were transformed into mIU/ml .The tests were conducted in Prof. Griffin lab. of the molecular microbiology and immunology department in John Hopkins School of public health. In the present study,Zambia infants vaccinated at 9 months of age have had passive antibody (79 mIU/ml) lower than the protective level (≥ 120 mIU/ml) and the presence of passive antibody at the time of vaccination continued to have high titers of antibody after one month ( 493 mIU/ml ) (P> 0.01) and three months (606 mIU/ml ) ( P<0.05) of measles vaccination above the protective level against measles infection ,while the antibody levels have reached to (3303 mIU/ml) ( P > 0.005) in children with natural infection, these results showed in agreement with the results of Iraqi children under 6 years of ages regarding the level of protection against the disease .

عزل وتشخيص البكتريا العصوية (Bacillus) المنتجة لانزيمات التحلل المائي (الحلمهه) (Hydrolases) المتحملة للحرارة == Isolation and identification of Bacillus producing thermotolerant hydrolases

اسم المؤلف: عدنان حنون عباس
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 97 عزلة من البكتريا العصوية ( Bacillus ) من جمع 200 عينة تربة ومياه في الفترة مابين تموز/تشرين اول 2008 من مواقع مختلفة من العراق بعد التشخيص الاولي ( صبغة كرام, تكوين السبورات, انتاج الكاتاليز ) وتلقيح العينات على وسط ال Thermus agar وتنميتها على درجة 50°C لفترة 24 ساعة. اظهــــرت نتائج الاخــــــتبارات الكيمــوحيــــويـــــة ان 56 عزلة تربـــــــة صنفت على انها B. laterosporus 35.71% , B. circulans 16.07% , B. stearoyhermophilus 14.28%, B. polymyxa 12.5% , B. macroides 7.14%, B. mycoides 7.14% , B. lentus 3.57% , B. popilliae 1.78% , B. chitinosporus 1.78 , بينـــما صنفت 41 عـــــــــزلة مياه عــــلى انها B. laterosporus 26.82% , B. circulans 26.82% , B. stearothermophilus 4.87% , B. polymyxa 4.87% , B. macroides 9.75% , B. mycoides 2.43% , B. lentus 7.31% , B. popilliae 4.87% , B. filicolonicus 4.87% , B. brevis 2.43% , B. larvae 2.43% , B. pumilus 2.43% . اظهرت عزلات ال ( Bacillus ) المعزولة من التربة والمياه ايجابيتها في انتاج الانزيمات المتحملة للحرارة بعد اختبارها على وسـط الاكار الصـلب, كالبروتييــز ( 73.17% ) ( 89.28% ) , الاميـــــــــليز ( 51.21% ) ( 55.35% ) , اللايبيــــــــــــز ( 95.12% ) ( 91.07% ) , السيليليز( 60.97% ) ( 85.71% ) , والكايتينيز( 92.68% ) ( 85.71% ) , على التوالي, في فترات حضانـــة مختلفة ودرجة حرارة 50°C . من جهة اخرى, قيست قابلية عزلات ال ( Bacillus ) والبالغة نسبتها ( 41.23% ) على انتاج انزيمات التحلل المائي كالبروتييـــز والاميليــز واللايبيـــز والسيليليـــز والكايتينيــز, باجمعها, حيث اظهرت النتائج بان سلالات ال B. polymyxa كانت الافضل في انتاج البروتييز والاميليــز والسيليليــز, بينما سلالات ال B. lentus كانت الافضل في انتاج الكايتينيـــز, اما اللايبيـــزفقد تم انتاجــــــــه من قبل سلالات ال B. circulans , B. stearothermophilus , B. polymyxa , B. mycoides وB. lentus , على اوساط زرعية وفترات حضانة مختلفة ودرجة حرارة 50°C. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج الاميليز من العزلة B. polymyxa AS 4/5 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج والمحضر مختبريا متكون من 2% نشا, 1% تربتون, 0.05% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.02% كلوريد الكالسيوم , برقم هيدروجيني 7, وبدرجة حرارة 50°C لفترة 48 ساعة. تم استخلاص الاميليــز من الوسط الزرعي وتركيزه بواسطة السكروز, وقد اظهرت النتائج الحصول على الاميليز بفاعلية نوعية 2.36U/mg protein, في المــرحلة الاولى تمت تنقية الاميليز بطريقة كروماتوغرافيا الوجبة Batch Chromatography واعقبت هذه المرحلة استخدام عمود التبادل الايوني Ion exchange chromatography باستخدام المبادل DEAE - Cellulose column . وقد اظهرت النتائج الحصـــول على الاميلــــيز بفاعلية نوعية 6.76U/mg protein وبعدد مرات تنقية بلغ 2.86 وبحصيلة نهائية 18.65% . تمت ايضا دراسة توصيف الانزيم, واظهرت النتائج بان الفعالية الانزيمية تزداد بزيادة درجة الحرارة الى 90°C بينما اظهر الاميليزثباتييتـــه في درجات الحرارة 40°C, 50°C, 60°C , في حضانة لمدة 30 دقيقـــة, اما الفاعلية المثلى للانزيم بالرقم الهيدروجيني pH 5, اما ثباتية الانزيم فتكون في الارقام الهيدروجينية مابينpH 4 - 10 في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة, وبفاعلية متبقيــة قصوى 78.57% في .pH 5 اما النتائج المتعلقة بتاثير الايونات الفلزية على الانزيم, تبين ان لكلوريد الزئبق تاثير عالي على الانزيم بفاعلية متبقية 46.47% و40.84% بتركيز 5mM و10mM , على التوالي, اما كلوريد المنغنيز له تاثير قليل على الانزيم بفاعلية متبقية 79.81% و81.69% بتركيز 5mM و10mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة. تعمل المواد الكلابية مثل EDTA والمواد المختزلة mercaptoethanol على تثبيط الفاعلية الانزيمية, حيث تؤثر المواد الكلابية ( EDTA ) على الانزيم بفاعلية متبقية 57.74% و52.58% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, اما المــــواد المختزلـــــــــة ( mercaptoethanol ) يكون تاثيرها بفاعلية متبقية 51.17% و40.37% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقـــــــــة. | Ninety - seven isolates of Bacillus were obtained from 200 soil and water samples, collected between July to October / 2008, from different local sites of Iraq, by primary identification ( gram stain, endospore - forming and catalase production ) after incubation at 50°C for 24h on thermus agar. Biochemical test showed that fifty - six soil isolates were classified as B. laterosporus 35.71%, B.circulans 16.07%, B.stearothermophilus 14.28%, B.polymyxa 12.5%, B.macroides 7.14%, B.mycoides 7.14%, B.lentus 3.57%, B. popilliae 1.78% and B.chitinosporus 1.78%, whereas forty - one water isolates were classified as B.laterosporus 26.82%, B.circulans 26.82%, B.stearothermophilus 4.87%, B.polymyxa 4.87%, B.macroides 9.75%, B.mycoides 2.43%, B.lentus 7.31%, B. popilliae 4.87%, B.filicolonicus 4.87%, B.larvae 2.43%, B.brevis 2.43% and B. pumilus 2.43%. Thermotolerant enzymes were produced from soil and water Bacillus species as, protease ( 89.28% ) ( 73.17% ), amylase ( 55.35% ) ( 51.21% ), lipase ( 91.07% ) ( 95.12% ), cellulase ( 85.71% ) ( 60.97% ) and chitinase ( 85.71% ) ( 92.68% ) , respectively, after culturing on solid agar media with different incubation period, at 50°C. So, 41.23% of soil and water Bacillus isolates were detected for hydrolases production as ( protease, amylase, lipase, cellulase and chitinase ) together, and showed that B. polymyxa strains were the best bacteria in protease, amylase and cellulase production, whereas B. lentus strains was a good chitinase producer. Lipase was produced by several Bacillus strains as B. circulans, B. stearothermophilus, B. polymyxa, B. mycoides and B. lentus, after culturing on different media and incubation period, at 50°C. Thermotolerant amylase production conditions by B. polymyxa AS 4/5 were studied, the highest amylase production was observed when the bacteriaSummary IIwas cultured in medium containing 2% starch, 1% tryptone, 0.05% MgSO4, 0.05% NaCl and 0.02% CaCl2 with pH 7 and incubated at 50°C for 48h. Amylase was extracted from production medium and concentrated with sucrose, the specific activity of amylase was 2.36U/mg protein. Purification of amylase was performed by ion exchange chromatography Cellux - Carboxymethyl ( batch chromatography ), followed by second step of purification by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose column, the results showed that the specific activity was 6.76U/mg protein with 2.86 purification folds and 18.65% yield. Thermotolerant amylase displayed a wide temperature range of activity at 40 - 90°C with highest activity at 90°C and enzyme was stable at 40 - 60°C for 30min. The optimum pH for amylase activity was pH 5, the enzyme was stable at pH 4 - 10 for 30min at 50°C with maximum remaining activity 78.57% at pH 5. Treatment of thermotolerant amylase with metal ions showed that HgCl2 reduced amylase activity, the remaining activity was 46.47% and 40.84% at concentration 5mM and 10mM of HgCl2, respectively. Whereas MnCl2 had lower effect on amylase activity, the remaining activity was 79.81% and 81.69% at concentration 5mM and 10mM of MnCl2, respectively, after 30min at 50°C. Bacillus polymyxa amylase was treated with 2mM and 5mM of EDTA and mercaptoethanol, the two compounds had inhibitory effect on the enzyme, the remaining activity of EDTA treated enzyme was 57.74% and 52.58% at 2mM and 5mM, respectively, while the remaining activity of enzyme treated with 2mM and 5mM mercaptoethanol was 51.17% and 40.37%, respectively, after 30min at 50°C.

دراسات وراثية خلوية ومناعية لمرضى التهاب القولون التقرحي == Cytogenetical and Immunological Studies of Ulcerative Colitis

اسم المؤلف: زينب محمد طاهر جعفر الملا حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحصول على عينات الدم المحيطي والخزع النسيجية الماخوذة من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن والمرضى المصابين بسرطان القولون، ومن الجنسين كليهما، ومن مختلف الاعمار. تم سحب حوالي 10 مل من دم المرضى وقسمت العينة على ثلاثة اقسام، القسم الاول استعمل لاجراء الدراسات الوراثية الخلوية. والقسم الثاني لاجراء دراسات البيولوجيا الجزيئية. والقسم الثالث لاجراء الدراسات المناعية. اجريت الدراسات الوراثية الخلوية من اجل التعرف على التغييرات التي قد تطرا على المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بقياس معامل الارومةBlastogenic index ، ومعامل الانقسام Mitotic index، ومعامل التضاعفReplicative index ، واختبار التبادل الكروماتيدي الشقيقي Sister chromatid exchange، واختبار تردد الطفرة Mutation Frequency. وقد تم ذلك من زرع خلايا الدم المحيطي في الوسط الزرعي الحاوي على المادة المعلمة (Brdu - 5) والمادة المشطرةA) PH). اوضحت النتائج وجود انخفاض في المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بمعامل الارومة، ومعامل الانقسام، ومعامل التضاعف. بينما لوحظ ارتفاع في المعدلات التلقائية في التبادل الكروماتيدي الشقيقي لمرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء. كما ولوحظ هذا الارتفاع في معدلات التبادل الكروماتيدي الشقيقي عند المعاملة بالعقار الميثوتركسيت، اذ لوحظ وجود خلايا نامية في تراكيز واطئة من عقار الميثوتركسيت.اما عن ا لجانب البايولوجي الجزيئي فقد تم قياس تراكيز الحوامض النووية المتمثلة بما يلي : الحامض النووي الرايبوزي (RNA) والحامض النووي المزدوج الشريط ) (dsDNAوالحامض النووي الاحادي الشريط (ssDNA) وذلك بتنميتها في الوسط الزرعي في اوقات حضانة مختلفة (الزمن صفر، ثم بعد24 ساعة ، ثم بعد48 ساعة ، ثم بعد 72 ساعة من الحضانة ). اوضحت النتائج وجود اضطراب في نمو الخلايا الماخوذة من مرضى التهاب القولون التقرحي عند القياس بالاصحاء . كذلك تم قياس تراكيز الحوامض النووية المذكورة اعلاه في الخلايا المنماة في تراكيز عالية من عقار الميثوتركسيت والمتمثلة بتركيز 1 مايكروغم / مليلتر و2 مايكروغم / مليلتر لكل من المرضى والاصحاء بعد تنميتها لمدة حضانة 72 ساعة. اذ لوحظ عدم وجود فروقات معنوية لهذين التركيزين بين الاصحاء والمرضى. اما فيما يتعلق بنتائج التهجين في الموقع in situ hybridiza¬tion لغرض الكشف عن التعبير الجيني للجين الكابح للورم P53 والجين المثبط للموت المبرمج Bcl - 2 ، اذ تم اخذ الخزع النسيجية من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن وسرطان القولون وقياسها بالاصحاء. اوضحت النتائج وجود علاقة بين المورثين في مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون عند قياسهما بالاصحاء، اذ اعطى الجين الكابح للورم نسبة 66 % في الانسجة المصابة بالتهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون وهذا يوضح حصول طفرات تراكمية في الجين الكابح للورم P53 والذي يعطي مؤشر على التقدم نحو التسرطن ، وكذلك الحال مع الجين Bcl - 2 الذي اوضح زيادة بالتعبير الجيني لهذا الجين في النماذج النسيجية لمرضى التهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون والاصحاء. ان التحري عن جين P53 يعطي مؤشرا عن الطفرات التراكمية او الشذوذ في فعالياته ويمكن الاستفادة منه في اعتباره قيمة تشخيصية وانذارية. اما بالنسبة للجانب المناعي فقد استخدمت فحوص مناعية عدة متمثلة بقياس الكلوبيولينات المناعية (IgG , IgA , IgM)، والعامل المتمم (C3 & C4) وفحص الاضداد الذاتية لسايتوبلازم الخلايا العدلة (ANCA) Anti neutrophile cytoplasmic antibodies والذي يشمل c - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة من مجموع العينات، وفحص p - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة، وفحص الاجسام المضادة الذاتية للمتقدرات (AMA) الذي اعطى حوالي 48% نتيجة موجبة وفحص الاضداد المناعية الذاتية للشريط المزدوج للحامض النووي منقوص الاوكسجين dsDNA)) الذي اعطى 43% نتيجة موجبة، وفحص اضداد شحم القلب (Anticardiolipin ) الذي اعطى 40% نتيجة موجبة من مجموع العينات.اوضحت نتائج الفحوصات المناعية ارتفاع نسب الكلوبيولينات المناعية والعامل المتمم في مصل مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء وعلى مستوى احتمالية (P ≤ 0.01). ان نتائج الفحوصات المناعية المستعملة في هذه الدراسة تفسر وجود اضداد ذاتية في مصل مجاميع المرضى المصابين تحت الدراسة. وهذا يوضح كون المرض يمكن ان يعزى في جانب منها الى اسباب مناعية ذاتية. | The investigation has been done on the peripheral blood and biopsy samples which drawn from patients suffered from ulcerative colitis & colon cancer , the samples were taken from female and male of different ages . The collected blood samples were about 10 ml &each sample was divided into 3 parts , the first part used for cytogenetic studies,the second part used for molecular studies & the last part used for immunological studies . The cytogenetic studies has been done in order to define the damaging effect of the disease and the effect of the drug (methotrexate ) on the peripheral blood lymphocytes . these damages were manifested through the significant reduction in the blastogenic index (BI ) , mitotic index ( MI ) , & replication index ( RI ) . This accompanied by significant increase in the sister chromatid exchange ( SCEs ) . In addition to investigate the mutation fraction in the cells cultured in selective medium containing different concentration of the drug . The results also showed presence of mutant cells that can grow in increasing concentrations of methotrexate . The molecular studies include measuring the concentrations of different types of nucleic acids ( dsDNA , ssDNA , RNA ) done by culturing the peripheral blood cells in different incubation times which include T 0 , T1 ( 24 hrs ) , T2 (48hrs ) , T3 (48 hrs ) & T4 (72 hrs ) . The results indicate disturbance in cell cycle comparing with healthy individuals . There was no significant differences in types of nucleic acids between patients & controls , when culturing the resistant cells of blood lymphocytes in high concentrations of the MTX drug ( 1 μg/ ml , 2 μg / ml ) . On the levels of in situ hybridization , the colonic biopsies which collected from patients of ulcerative colitis and colon cancer were examined for gene expression of P53 gene and Bcl - 2 gene . The results indicated accumulated mutations in P53 gene in the inflammed colonic biopsies , this result give an indication for progression of carcinogenesis .While on the level on Bcl - 2 , the results showed increasing in the activity of the gene , resulting in increase in gene expression of Bcl - 2 gene . The gene expression of Bcl - 2 in inflamed colonic tissues were approximately similar to gene expression in tissues of colon cancer . this indicate that the chronic inflammation of UC may ultimately infected with colon cancer . The detection of P53 gene and Bcl - 2 gene in chronic ulcerative colitis give early detection for diagnostic & therapeutic and monitering purposes . The immunological studies conducted to insight into immunological disturbance associated with clinical expression of ulcerative colitis of Iraqi patients and to provide a locally made easy diagnostic tests that can be used in routine work and to study the recent serological markers , that may help in the diagnosis of IBD . The immunological profiles of the patients of UC were studied using different parameters . To assess the importance of antineutrophile cytoplasmic antibodies ( ANCA ) were found in enzyme linked immunoassay ( ELISA ) , for anti - myeloperoxidase (anti - MPO ) antibodies as (P - ANCA) and anti - propteinase - 3 (anti - PR - 3 ) antibodies for ( C - ANCA ) . The C - ANCA test give 50 % positive results , while the P - ANCA test give 55% positive results . The anti - mitochondrial M - 2 antibody was estimated in sera of UC patients and gives 48% positive results . The other serological marker used was the double strand DNA antibody and give 43 % positive results . Also the anticardiolipin antibody was examined and the test give 40 % positive results and this result indicate presence IgM / IgG concentrations in the sera of patients . The levels of immunoglobulins that include ( IgG , IgM , IgA ) as well as some of complement components ( C3 , C4 ) were used in estimation in the sera of the studied groups . The results showed an increase in the levels of immunoglobulins and the complement concentrations at levels of P ≤ 0.01 . The results of immunological markers in this study explained presence of auto antibodies and emphasized by increasing levels of immunoglobulins in the sera of the patients

دور بعض المتغيرات المناعية والاصابات الفيروسية في احداث الاجهاضات العفوية المفردة والمتكررة == The role of some immunological changes and some viral infection in single and recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا سعدي عبود كاظم
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لغرض تسليط الضوء على بعض المتغيرات المناعية والهرمونية وتشخيص بعض انواع الفيروسات المرافقة لحالات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر ، تمت دراسة (90) امراة تعرضن لحدوث اجهاضات عفوية مفردة ومتكررة غير مشخصة السبب ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (10) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، (40) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، اجريت المقارنة مع (30) امراة ، (15) امراة ذات حمل طبيعي و(15) امراة غير حوامل وبالفئات العمرية نفسها ، وعدت مجموعة السيطرة.بينت الدراسة الحالية النتائج الاتية : 1 - ارتفاع مستويات الاضداد الذاتية لدى النساء ذوات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر اذ سجل لديهن : ا - ارتفاع مستويات اضداد شحم القلب Anticardiolipin antibodies (ACA) وبصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ). ب - لوحظ هنالك ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgM) β2 - GP1 - IgM عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل ومجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).ج - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgG) β2 - GP1 - IgG عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة ومجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل). ء - ارتفاع مستويات اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).هـ - ابدت (14) امراة من المجموع الكلي للنساء المجهضات (15.6)% تفاعلا موجبا للاضداد النووية (ANA) بالقياس مع نساء السيطرة اللاتي كن جميعهن سالبات لهذين الاختبارين.2 - ارتفاع مستويات كل من : (IL - 2 , IFN - γ , TNF - α) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).3 - لوحظ هنالك انخفاض معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من : (IL - 10)، و(IL - 4) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).4 - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من الغلوبيولينات المناعية (IgM,IgA,IgG) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).5 - لوحظ هنالك ارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى جزء المتمم الثالث والرابع (C4 , C3) لدى النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).6 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات Anti - Toxoplasma Ab الصنف (IgM) في 18 حالة (20)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود (32) حالة %(35.6) من المجموع الكلي للنساء المجهضات يمتلكن اضداد نوعية لداء المقوسات صنف (IgG) . 7 - بلغت نسبة انتشار اضداد فيروس مضخم الخلايا (CMV) الصنف ((IgG في (12) حالة (13.3)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل ، في حين لوحظ وجود اضداد فيروس مضخم الخلايا صنف (IgM) في (25) حالة %(27.8) من المجموع الكلي للنساء المجهضات. 8 - وجود الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس الحميراء (Rubella virus) في (10) حالات (11.1)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود اضداد فيروس الحميراء صنف (IgG) في 21 حالة %(23.3) من المجموع الكلي للنساء المجهضات.9 - بلغت نسبة انتشار الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس القوباء البسيط (HSV 1 and 2) في 4 حالات (4.4)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل .10 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في مستوى الهرمون المحفز للجسم الاصفر(LH hormone) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).11 - ارتفاع مستوى هرمون البرولاكتين (Prolactin hormone) بصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).12 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين اضداد شحم القلب (ACA) وكل من الحركيات الخلوية (IL - 2 , IL - 4 , IL - 10, IFN - γ ,TNF - α) وكذلك ما بين اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) ،والحركيات الخلوية قيد الدراسة.13 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين هرمون الـ (LH) والحركيات الخلوية قيد الدراسة ,وكذلك ما بين هرمون البرولاكتين وكل من (TNF - α وIFN - γ وIL - 2 و(IL - 10، في حين لوحظ وجود علاقة ترابطية ذات قيمة معنوية (P<0.05) ما بين هرمون البرولاكتين و(IL - 4) .14 - لوحظ وجود اصابات مشتركة ما بين اضداد شحم القلب (ACA) والاصابات الفيروسية، وكذلك وجود اصابات مشتركة ما بين الانواع المختلفة للعوامل الخمجية في هذه الدراسة.س | To shed light on some immunological ,hormonal changes and identification of some viruses that are accompanied to single and recurrent abortion . The study were done on (90) undiagnosed aborted women at different stage of pregnancy. (20) had single abortion during first trimester of pregnancy , (10) had single abortion during second trimester of pregnancy , (40) had recurrent abortion during first trimester of pregnancy , and (20) had recurrent abortion during second trimester of pregnancy . The comparisons were done with (30) women , (15) had normal pregnancy and (15) unpregnant women at the same ages and considered as control groups .The results of this study showed : 1. Increased autoantibodies levels in women that had spontaneous abortion which is : A. Highly significant increased (P<0.01) in anticardiolipin antibodies (ACA) levels in the serum of aborted women at different stages of pregnancy , compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).B. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgM) (β2 - GP 1 - IgM) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).C. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgG) (β2 - GP 1 - IgG) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).D. Highly significant increased (P<0.01) in the level of anti - double stranded DNA (anti - dsDNA) in all groups of aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).E. (14) (15.6)% from total test of aborted women showed positive reaction to antinuclear antibodies (ANA) compared with control groups which were negative to this test. 2. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of (TNF - α , INF - δ , IL - 2) in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).3. Highly significant decreased (P<0.01) in the levels of (IL - 10, IL - 4) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).4. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of immunoglobulins (IgG,IgA,IgM) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).5. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of complement component (C3,C4) in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).6. Antitoxoplasma antibodies (IgM) were found in (18) (20)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while found in (32) (35.6)% from total aborted women have antitoxoplasma antibodies (IgG). 7. Anti CMV antibodies type (IgM) were found in (12) (13.3)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while anti CMV antibodies type (IgG) were found in (25) (27.8) % from total aborted women .8. AntiRubella antibodies type (IgM) were found in (10) (11.1)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while antiRubella antibodies type (IgG) were found in (21) (23.3)% from total aborted women .9. Anti (HSV 1,2) antibodies type (IgM) found in (4) (4.4)% from total aborted women at dofferent stages of pregnancy.10. Significant increased (P<0.05) in the levels of LH hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).11. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of prolactin hormone in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).12. There was a correlation between (ACA) and each of cytokines (TNF - α , INF - δ , IL - 8 , IL - 10 , IL - 4) but this correlation was non significant (P>0.05) and also between anti - dsDNA and all cytokines tested.13. There was non significant correlation (P> 0.05) between LH hormone and all cytokines tested and also between prolactin hormone and each of (TNF - α , INF - δ , IL - 2 , IL - 10) , while there was significant correlation (P<0.05) between prolactin hormone and (IL - 4). 14. There was Co - infection between (ACA) and infectious agents and also between different types of infectious agents in this study.

دراسة مرضية وجزيئية لبكتريا Helicobacter pylori المعزولة من المرضى المصابين بالقرح المعدية والمعوية == Pathological and Molecular study on Helicobacter pylori isolated from patients with gastric and duodenal ulcers

اسم المؤلف: رباب قاسم محمد الصكر
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت80 خزعة نسيجية من المرضى المصابين بامراض القرح المعدية والمعوية، اظهرت نتائج الاختبارات النسيجية المرضية هيمنة التهاب المعدة المزمن بنسبة %35 واتت قرحة المعدة ثانية بنسبة %22.5.اظهرت الدراسة كفاءة اختبار اليوريزالسريع في التحري عن هذه الجرثومة اذ استطاع ان يثبت وجود هذه الجرثومة في 62 خزعة نسيجية واتت الاختبارات النسيجية المرضية ثانية حيث ظهرت جرثومة H.pylori في 47 خزعة نسيجية في حين تمكن الاستنبات البكتيري من الحصول على 42 عزلة بكتيرية.اثبت فحص الحساسية الدوائية تجاه عشر مضادات حيوية كفاءة المضادين الحيويين السيفوتاكسيم والريفامبسين في القضاء على هذه الجرثومة فقد كانت نسبة المقاومة لهما %10 واتى المضادان الحيويان التتراسايكلين والدوكسي سايكلين ثانية بنسبة مقاومة %20،%30 كانت نسبة المقاومة للارثرومايسين والكلارثرومايسين، فيما كانت نسبة المقاومة للاموكسيسلين %100 ونسبة المقاومة %80 لكل من المترونيدازول والسبروفلوكساسين اما الجنتامايسن فكانت نسبة المقاومة له %50.تم نمطت العزلات وراثيا باستعمال بوادىء متخصصة بالكشف عن قطعة الدنا التي تمثل المورث ure AB والمساوية الى 492زوج قاعدة لوحظ احتواء ثمان عزلات على هذا المورث فيما خلت العازلتان HP7 وHP9 من هذا المورث باستعمال تقنية الـ PCR.اظهرت نتائج النسق البلازميدي ان %50 من عزلات H.pylori تحوي بلازميدات، فقد احتوت العزلات (HP3, HP4, HP6, HP8) على بلازميدات صغيرة وامتلكت العزلتان (HP4,HP6) بلازميدا كبيرا فضلا عن بلازميدها الصغير فيما خلت العزلات الباقية من البلازميدات.اظهرت نتائج التحييد البلازميدي باستعمال صبغة بروميد الاثيديوم بوصفها مادة محيدة وبتركيز 3000 مايكوغرام/ مليليتر فقدان العزلة HP4 بلازميدها الكبير والصغير نتج عن ذلك فقدان تلك العزلة HP4صفة انتاج انزيم اليوريز وكذلك فقدانها المقاومة للمضادين الحيويين المترونيدازول Metronidazole والسروفلوكساسلين Ciprofloxacillin.اظهر التحول الوراثي Gentic transformation بين الدنا المستخلص من العزلة HP4 وبين العزلة HP1 التي عدت خلية كفوءة اكتساب الاخيرة صفة المقاومة للمترونيدازول اذ استطاعت ان تنمو على اوساط انتخابية تحوي 32 مايكوغرام/ مليلترمن هذا المضاد.اجريالتحول الوراثي ثانية بين دنا العزلة Hp4 وبكتريا تابعة لجنس اخر هي بكتريا Escherichia coli MM294 اظهرت نتائج هذه التجربة اكتساب بكتريا E.coli صفة انتاج انزيم اليوريزو المقاومة للمترونيدازول والسبروفلوكساسين من بكتريا H.pylori. | A 80 biopsies were collected from gastric & duodenal ulcers, showed dominance of chronic gastritis and gastric ulcers in aratio of %35 and %22.5, respectively.Rapid urease test, histopathological examination and cultural for detection of Helicobacter pylori, Showed the presence of this bacterium in 62 biopsies for urease test, in 47 biopsies for his topathological examination and in 42 biopsies in culture examination.Antibiotic susceptibility tests againt 10 isolates of H.pylori, Showed %10 resistance for cefotaxim & Rifampin, %20 resistance for Tetracyclin & Doxycyclin, %100 resistance for Amoxycillin, %80 resistance for Meteronidazole & ciprofloxacin and %50 resistance for Gentamicin.Genotyping by specific primer in PCR reaction for ureAB gene, Showed that 8 isolates were positive for this gene, where 2 isolates were negative.Plasmid profile for H.pylori isolatez Showed small single plasmid in each of HP3, HP4, HP6 and HP8 isolates and single small and larg plasmids for HP4 and HP6 isolates whereas other isolates were free of plasmids.Curing experiment for HP4 isolate by using ethidium bromide as acuring agent in aconcentration 3000 Mg/ ml, Showed the cured derivation lost their Urease production trait and resistance to meteronidazole & ciprofloxacin.Transformants resulted from transformation experiment between HP4 total DNA & HP1 as acompotent cell, Showed acquired ability to grow on selectve medium containing 32 Mg/ ml of metrronidazole.Another transformants, resulted from transformation experimeat between HP4 total DNA and Escherichia coli MM294 as acompetent cell, Showed acquired ability for Urease production & ciprofloxacin & Meteronidazole resistance.

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: دنيا فريد سلوم
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

في نماذج عنق (HPV) التنميط الجيني للفيروسي الحليمي البشري الرحم لنساءعراقيات باستخدام تقنيتي الوقت الحقيقي - سلسلة تفاعل البلمرة والصفوف الجينية == Genotyping of Human Papillomavirus in a sample of Iraqi women with cervical abnormalities by using Real - Time PCR and Macroarray

اسم المؤلف: حلى يونس فاضل السعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التحري عن العلاقة بين اصابة الفيروس الحليمي البشري (HPV) وحالات الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم في النساء العراقيات. تضمنت الدراسة 122امراة لديهن اعراض سريرية لاصابة عنق الرحم, 110 امراة منهن تميزت بنمو الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم او السرطانية, حيث كان 40.9 % من تلك النساء كان لديهن اصابة بالفيروس الحليمي البشري, اما 12(16.7%) امراة المتبقية تميزت بنمو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم بالرغم من وجود التهاب مزمن والتي جمعت خلال عام 2010. تضمنت مجموعة السيطرة 10 نساء والتي تميزت بغياب كل من التغيرات الخلوية, العلامات السريرية والاصابة بالفيروس الحليمي البشري. اظهرت نتائج مسحات عنق الرحم وجود نوعين من خلايا عنق الرحم غير الطبيعية هي : اصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية قليلة الخطورة (LSIL) التي شملت 70% من حالات الاصابة بالفيروس, واصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية عالية الخطورة (HSIL) التي شملت 26% من حالات الاصابة الايجابية. بينما 4% من مجموع الاصابة الكلية تمثلت بالنساء ذو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والالتهاب المزمن . هي الصفة المميزة للاصابة بالفيروس. تلك الصفة ترافقت مع 100% بوجودKoilocytosisالثاليل التناسلية الظاهرة للعيان و16.7% ترافقت مع الثاليل المستوية (غير الظاهرة). تشير دراسة الدنا الفيروسي باستعمال تجربتي سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي(PCR Real­Time) والصفوف الجينية(MacroArrays) التي طبقت لاول مرة في العراق الى وجود الفيروس الحليمي البشري بنسبة 35.6% في كل المجاميع المدروسة. تشير النتائج الى وجود 17 نمط جيني مختلف للفيروس الحليمي البشري بين 47 امراة مصابة باستعمال تقنية الصفوف الجينية, اربعة عشر من هذه الانماط الجينية كانت من الانماط عالية الخطر والتي شكلت 82.35% من مجموع الانماط والانماط الجينية المتبقية كانت من الانماط قليلة الخطر والتي شكلت 17.56% من مجموع الانماط. دى النتائج المهمة للدراسة الحالية تشير الى وجود 10 انماط جينية مختلفة ربما سجلت للمرة الاولى في النساء العراقيات ( 31 - , 45 - , 51 - , 52 - , 53 - , 58 - , 59 - , 66 - , 68 - , 44 - HPV ). لنمط الجيني 16 - HPV هو السائد على الانماط الجينية السبعة عشر, شكل هذا النمط مع الانماط الجينية (59 - , 39 - , 66 - , 6 - HPV) الانماط الخمس الاكثر شيوعا في العينات الموجبة. كما اظهرت الدراسة بان النساء ذوات الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والمصابة بالفيروس تحمل الانماط الجينية 16 - HPV و59 - HPV. كما شخصت سبعة انماط جينية مختلفة في عينات الثاليل التناسلية الظاهرة وهي (16 - , 6 - , 11 - , 39 - , 59 - , 66 - , 44 - HPV ). اشارت النتائج الى ان 32 (68.09%) من بين 47 امراة مصابة كانت لديهن الانماط عالية الخطر فقط, سواء كانت الاصابة بانماط مفردة او متعددة, بينما ثمان نساء (17.2%) كان لديهن الانماط عالية وقليلة الخطر سوية, وسبع نساء (14.89%) كان لديهن الانماط قليلة الخطر فقط. استعمل المجهر الالكتروني النافذ للتحري عن الجزيئات الفيروسية في عشر عينات موجبة للدنا الفيروسي وذو تغيرات خلوية مختلفة, حيث اظهرت النتائج وجود الجزيئات الفيروسية في ست عينات بمستويات مختلفة من المرضى واربع عينات لم تظهر جزيئات فيروسية. استخدمت تجربة التحول اللمفاوي لتقييم الحالة المناعية للمصابين. حيث وجدت نسبة التحول عالية في النساء ذوات الخلايا الطبيعية في عنق الرحم والمصابة بالفيروس (اصابة كامنة), بينما انخفضت نسبة التحول اللمفاوي في النساء ذوات الخلايا غير الطبيعية في عنق الرحم . امتلكت 40% تقريبا من حالات الثاليل التناسلية معدل عالي للتحفيز التكاثري للخلايا التائية عند مقارنتها بمجموعة السيطرة. اضافة الى ذلك كان التحفيز التكاثري للخلايا التائية مستقلا احصائية عن كل من نوع الاصابة, المحتوى الفيروسي والمجاميع العمرية. استخدمت تجربة تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي للكشف عن الفيروس وكميته لثلاثة عشر نمط جيني الاكثر ترددا بين المستويات المختلفة للنمو غير الطبيعي للخلايا الطلائية لعنق الرحم في الحالات : قبل الاورام, الاورام والسيطرة الاصحاء(132 عينة). اظهرت نتائج فحص سلسلة البلمرة بان 35 حالة موجبة من 47 حالة اصابة فيروسية التي شملت 74.5% من مجموع الاصابات الكلية. بينما الحالات المتبقية (12 حالة ) التي مثلت 25.5% من مجمو الاصابات الكلية لم يكشف عنها بهذه التقنية. لذلك قدر عدد نسخ الدنا الفيروسي لاغلب الانواع الفيروسية عالية الخطرفي 33 عينة موجبة بمستويات مختلفة من التغيرات الخلوية وعينتين موجبتين ذوات خلايا طبيعية لعنق الرحم . توزع المحتوي الفيروسي ل 33 عينة اعلاه من 1×10 الى 9.4×106 نسخة /مل بمعدل (4.17×104 نسخة /مل). اما العينتين المتبقيتين كانتا خارج قيم المنحى القياسي لذا قدرت ب 5× 107 و1×109 نسخة /مل تقريبا. صنف المحتوى الفايروسي لل35 عينة اعلاه كالاتي : 46% من العينات كمحتوى فيروسي عالي, 34% كمحتوى فيروسي منخفض و20% كمحتوي فيروسي متوسط. استخدم اختبار الصفوف الجينية لفحص 68 عينة, 36 عينة منها كانت موجبة و32 عينة كانت سالبة باختبار سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي. حيث وجدت الانماط الجينية عالية الخطر باستعمال هذه التقنية في (36/35) 97% من العينات الموجبة, بينما العينة المتبقية كانت سالبة لفحص الصفوف الجينية. كما وجدت الانماط الجينية قليلة الخطر وعالية الخطر المحتمل في تلك 35 عينة الموجبة والتي لم يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي فهي الانماط (6 - , 11 - , 53 - , 66 - HPV). اما فيما يخص العينات السالبة في فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي حيث فحصت باستعمال اختبار الصفوف الجينية ووجدت الانماط الجينية في 12 عينة منها, الانماط هي : (44 - , 66 - , 53 - , 11 - , 6 - , 58 - , 39 - HPV). تبين مما تقدم بان فحص الصفوف الجينية يتحرى عن 8 انماط جينية لا يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي, تلك الانماط شكلت 32.84% من تردد الانماط و33.33% من الحالات الموجبة التي تمتلك عدة انماط وهذا يعكس العامل المهم الذي يفضل فحص الصفوف الجينية في التحري عن الفيروس. لذا يبدو اختبار الصفوف الجينية طريقة دقيقة واكثر حساسية لكشف وتنميط اصابات الفيروس الحليمي البشري مقارنة مع فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي. | The present study was conducted to investigate the relationship between Human papillomavirus (HPV) infection and cervical cytological abnormalities in Iraqi women. One hundred twenty two women were included in this study with a cervical infection. A sample of 110 women with abnormal cytology cervical dysplasia / cancer, 45 of which 40.9% had HPV infection and 12 (16.7%) women had chronic infection with normal cytology during 2010. A control group with 10 women of normal cytology and no HPV infection was included in study for comparison. Pap smear test results showed two types of cervical cytological abnormalities, low squamous intraepithelial lesion (LSIL) which comprised of 70% of HPV positive cases, and high squamous intraepithelial lesion (HSIL) which comprised of 26% of HPV positive cases. Whereas 4 % out of the total risk group was represented in women with normal cytology. Koilocytosis is pathognonomic for HPV infection. Furthermore, Koilocytosis was accompanied with 100% with genital wart presence and 16.7% was accompanied with flat wart presence. HPV - DNA studied using Real - Time PCR and MacroArray assay (GenoArray) which applied for the first time in Iraq indicates the presence of HPV - DNA in 35.6% of all tested groups. Results indicate the presence of 17 different HPV genotypes among 47 infected women by using macroarray technique. Fourteen of these HPV genotypes which comprised of 82.35% were high risk (HR - type) and 17.56% (3/17) were low risk (LR - type).One of the important results in the present study indicates the presence of ten different genotypes which may be recorded for first time in Iraqi women (HPV - 31, - 44, - 45, - 51, - 52, - 53, - 58, - 59, - 66 and - 68 types). Out of 17 genotypes HPV - 16 was the predominant one, this genotype together with genotypes 59, 6, 39 and 66 comprised of the five most common types detected in HPV positive cases. Moreover, percentage of HPV - 16, and - 59 were extended to involve women with normal cytology. Seven different genotypes - 6, - 11, 16, 59, - 39, - 66 and - 44 have been identified in genital wart specimens. Results indicated that 32 (68.09%) out of 47 infected women had HR type alone, whether single or multiple types, while eight women (17.02%) had HR types in association with LR types and seven women (14.89%) had LR type only. Transmission electron microscope (TEM) was used for viral particles detection from ten HPV DNA positive samples with different cytological changes. Results indicated the presence of viral particles in six samples with different grades of disease and four samples showed no viral particles. To evaluate the immune status of patients lymphocyte transformation assay was applied. Results indicated that transformed lymphocyte were found to be high in women with normal cytology which may have HPV as a latent infection, while they were decreased in women with abnormal cytology. Approximately 40% of genital wart cases have higher mean of proliferative T cell response when they were compared with control group. However, proliferative T cell responses were statistically independent on HPV infection type, viral load and aging group. Real - time PCR assay was employed for HPV detection and quantitation (viral load estimation) from the range of HR - HPV DNA 13 genotypes most frequently found in different grades of cervical intraepithelial neoplasia, cervical tumors and health controls from (132 samples). Results showed that out of 47 positive cases 35 cases can be detected by real - time PCR which comprised of 74.5%. Failures in detection by this technique included 12 cases which comprised of 25.5% of the positive samples. Therefore, viral DNA copies number for the most HR - HPV types in cervical samples was determined from 35 sample with low and high - grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN I, II, III and Squamous Cell Carcinoma), and with normal cytology. However, the viral load of the 33 samples spread over a wide range from 1×10 to 9.4×106 copies/ml (mean 4.17×104 copies/ml). In addition, two samples were around the standard curve values as : approximately 5×107 and 1×109 copies/ml considered. Viral load was estimated approximately 46% constituted as high viral load, 34% as low viral load and 20% as slightly high viral load. Macroarray was applied in 68 samples, 36 of which were positive and 32 were negative by the real - time PCR test. High - risk genotypes were found in 35/36 (97%) real - time PCR positive samples, whereas remaining two samples were negative for HPV DNA (false - positive) by macroarray assay. The low - risk and probable high - risk (PHR) HPV genotypes were detected in the 35 HPV - positive samples which are not detected by real - time PCR included genotypes : HPV - 6 (in three samples), - 11, - 53 and - 66 (in two samples for each). HR, PHR and LR HPV genotypes were detected by macroarray in the 11/31 HPV - negative samples in real - time PCR which comprised of genotypes : - 39, - 58, - 66, - 11, - 6 and - 44. The GenoArray (GA) is capable of detecting 21 HPV multiple genotypes, including 8 types not detecting in real - time PCR. These types represented 32.84% of HPV types frequency and 33.33% of HPV positive cases had multiple types, this may reflect the important factor potentially favoring the GA for HPV detection. Therefore, the GA genotyping assay appears to be more accurate and sensitive technique for the detection and genotyping of HPV infections than real - time PCR one.

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

اسم المؤلف: ايمان جواد كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.

انتاج وتنقية وتوصيف البلانتريسين من سلالات محلية لبكتريا Lactobacillus plantarum == Production, Purification and Characterization of Plantaricin from Local Strains of Lactobacillus plantarum

اسم المؤلف: ولاء شوكت علي
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 118 عزلة تعود لجنس عصيات الحليب Lactobacillus من الخضر المتخمرة والعجائن الحامضية، واخضعت جميع هذه العزلات للفحوصات الزرعية والمجهرية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية بغية تشخيصها حتى النوع واظهرت النتائج ان 73 عزلة منها تعود للنوع Lactobacillus plantarum ، منها 48 عزلة من الخضر المتخمرة و25 عزلة من العجائن الحامضية، وكانت هذه البكتريا سائدة في الخضر المتخمرة اذ بلغت نسبة عزلها 73.85% بينما بلغت نسبتها في العجائن الحامضية 47.17% . تم التحري عن قابلية عزلات بكترياLb.plantarum على انتاج البلانتريسين باستخدام 3 طرائق هي : الاشرطة المتقاطعة(flip - streak method) والتنقيط (spot on the lawn method) والانتشار بالحفر(well diffusion method) ضد 12 نوعا من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام والمتضمنة : Staphylococcus aureus وStaphylococcus epidermidis وListeria monocytogenes وEnterococcus feacalis وLactobacillus acidophilusو Bacillus spp. وPseudomonas aeruginosa وPseudomonas fluorescens وSerratia marcescens وSalmonella typhi و. Klebsiella sppو Escherichia coli. واظهرت النتائج ان 8 عزلات كانت منتجة للبلانتريسين بطريقة flip - streak و7 عزلات كانت منتجة له بطريقة spot on the lawn بينما استطاعت 12 عزلة من انتاجه بطريقة الانتشار بالحفر،مما يدل على ان انتاج البلانتريسين في الاوساط السائلة كان افضل من انتاجه في الاوساط الصلبة،وعدت طريقة الانتشار بالحفر هي الافضل في التحري عن انتاج البلانتريسين. اظهرت البلانتريسينات المنتجة من عزلات Lb.plantarum فعالية عالية ضد P. aeruginosa عندما ابدت 83.3% من هذه العزلات فعاليتها التثبيطية ضد هذه البكتريا بينما اظهرت 16.7% فقط من هذه العزلات تاثيرها التثبيطي ضد بكتريا Lb. acidophilus ولم تبد اية عزلة من عزلات Lb.plantarum اية فعالية تثبيطية ضد بكتريا Bacillus spp. ، هذا وكانت العزلة Lb.plantarumVGW8 هي الافضل في انتاج البلانتريسين اذ تمكنت من انتاجه في الاوساط الصلبة والسائلة بالطرائق الثلاثة اعلاه، فضلا عن فعاليتها التثبيطية العالية تجاه 10 انواع من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج البلانتريسين من العزلة VGW8 Lb.plantarum واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان الوسط المحضر مختبريا في هذه الدراسة والذي اطلق عليه وسط الانتاج السائل ورمز له (PLM) المتكون من 2% كلوكوز و2% ببتون و1.5% مستخلص الخميرة و1.5% مستخلص اللحم و0.25% من ملح K2HPO4 و0.5% من مادة tween 80 ،برقم هيدروجيني(pH) 5 وبدرجة حرارة30 م وبحجم لقاح 2% من المزروع البكتيري الذي يحتوي على 1×109 خلية /مل ولمدة حضانة 12 ساعة في ظروف لاهوائية. تمت في هذه الدراسة ايضا تنقية البلانتريسين اذ سخن المستخلص الخام للبلانتريسين بدرجة 80 م لمدة 10 دقائق قبل البدء بالتنقية والتي تضمنت خطوتين الاولى هي الاستخلاص بالمذيب العضوي (البيوتانول) والثانية الفصل بطريقة كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود (Sepharose 6B). وقد اظهرت النتائج الحصول على البلانتريسين بفعالية نوعية 10666.67 وحدة/ملغم بروتين وبعدد مرات تنقية بلغ 13.067 وبحصيلة نهائية 12%.اطلق على البلانتريسين النقي اسم بلانتريسين VGW8 نسبة الى العزلة المنتجة Lb.plantarumVGW8 .كذلك فقد تم توصيف البلانتريسين المنقى VGW8 واظهرت النتائج ان وزنه الجزيئي كان 14400 دالتون بطريقة الترحيل الكهربائي بوجود المادة الماسخةsodium dodecyl sulfate(SDS) . واظهرت فعالية البلانتريسين النقي ثباتية عالية في قيم من الرقم الهيدروجيني(pH) تراوحت ما بين 3 الى 9 ،اذ احتفظ بكامل فعاليته عند تلك القيم لكنه فقد نصف فعاليته في pH( 2 و10) وكامل فعاليته في pH القاعدي (11 و12).كما اظهرالبلانتريسين ثباتية عالية تجاه المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 100) م لمدد زمنية مختلفة شملت (10 و30 و60) دقيقة ويلاحظ من النتائج انه في الوقت الذي تمكن فيه البلانتريسين من الاحتفاظ بكامل فعاليته عند المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 80 ) م للمدد الزمنية اعلاه، لم يتمكن من استرداد سوى نصف الفعالية عند تعرضه لدرجة حرارة 100 م لمدة 60 دقيقة او عند تعرضه لدرجة حرارة المؤصدة (121 م) لمدة 15 دقيقة. كما بينت النتائج طبيعة البلانتريسين البروتينية عندما فقد كامل فعاليته بعد معاملته بالانزيمات الحالة للبروتين ( ببسين وتربسين وبابين) في حين لم تتاثر فعاليته عند معاملته بالانزيمات (لايبيز والفا - اميليز ولايسوزايم).كذلك فقد اظهر البلانتريسين ثباتية عالية بعد معاملته بالمذيبات العضوية(كلوروفورم واسيتونايترل وداياثيل ايثر وايثانول وميثانول وايزوبروبانول وتولوين واثيل اسيتيت)، والمنظفات (توين80 وتوين20 وترايتون اكس100و EDTA ويورياو SDS) ، وبعض الايونات الفلزية (الصوديوم والبوتاسيوم والكاليسيوم والباريوم والزنك والحديد) حيث استعاد كامل فعاليته بعد معاملته بها لكن فعاليته انخفضت الى النصف بوجود ايوني المغنيسيوم والمنغنيز.تمت ايضا دراسة فعالية البلانتريسين VGW8 ضد P.aeruginosa وS.aureus واظهرت النتائج ان البلانتريسين يمتلك الفعالية القاتلة للبكتريا عندما انخفضت اعداد البكتريا مع زيادة تركيز البلانتريسين الى 320 وحدة /مل، فقد اظهرت النتائج ان هذا التركيز كان كافيا لقتل بكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين من التعرض للبلانتريسين ولقتل بكتريا S.aureus بعد اربع ساعات من التعرض له. ايضا فقد تمت دراسة الفعالية التحللية للبلانتريسين VGW8 واوضحت النتائج انه يمتلك الفعالية الحالة للغشاء الخلوي عندما انخفضت الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 600 نانوميترمن 0.59 الى 0.17 لبكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين فقط من التعرض للبلانتريسين وبتركيز 320 وحدة/مل ، ومن 0.51 الى 0.20 لبكتريا S.aureus بعد 4 ساعات من التعرض للبلانتريسين وبالتركيز نفسه(320 وحدة/مل).وتمت ايضا دراسة تاثير البلانتريسين VGW8 على نفاذية الخلية وبينت النتائج ان الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 260 نانوميتر قد سجلت زيادة من 0.5213 الى 2.9112 لبكتريا P.aeruginosa ومن0.4614 الى 2.6405 لبكتريا S.aureusدليلا على خروج الحامض النووي (DNA) من الخلايا نتيجة لتحللها.يتضح من هذه النتائج ان هدف البلانتريسين VGW8 هو الغشاء الخلوي. | A total of 118 isolates of Lactobacillus were obtained from fermented vegetables and sourdoughs. All the isolates were subjected to the cultural, microscopical and biochemical examinations for the identification of species. The results showed that 73 isolates belongs to Lactobacillus plantarum, 48 isolates from fermented vegetables and 25 isolates from sourdoughs. Lb. plantarum was dominate in fermented vegetables with 73.85% percentage of isolation while in sourdoughs the percentage of isolation was 47.17%.Three methods (flip - streak, spot on the lawn and agar well diffusion methods) were used to detect of plantaricin production by Lb. plantarum isolates against 12 species of Gram positive and Gram negative bacteria which included, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Enterococcus feacalis, Lactobacillus acidophilus, Bacillus spp., Escherichia coli, Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens and Klebsiella spp. The results showed that 8 isolates produced plantaricin by flip - streak method, 7 isolates produced it by spot on the lawn method, while by the agar well diffusion method ,12 isolates were able to produce plantaricin, suggesting that the production of plantaricin was best in the broth medium than in the solid medium. The agar well diffusion method was considered the best one for detection of plantaricin production. Plantaricins of Lb. plantarum isolates exhibited high activity against P. aeruginosa when 83.3% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against this bacterium, whereas the lowest activity was against Lb. acidophilus when 16.7% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against it. No activity against Bacillus spp. was observed.Lb. plantarum VGW8, was the best isolate for plantaricin production. It produced it in both broth and solid media by all detection methods used in this study, this plantaricin exhibited a broad spectrum of activity against 10 species of both Gram positive and Gram negative bacteria. The optimum conditions for plantaricin production by Lb. plantarum VGW8 were determined and the results showed that the best production medium was production liquid medium (PLM) that prepared in this study, it composed of 2% glucose, 2% peptone, 1.5% yeast extract, 1.5% beef extract, 0.25% K2HPO4 and 0.5% tween 80,with pH 5, temperature 30°C for 12 hours under anaerobic conditions and inoculum size of 2% of cells number 1×109cell/ml.Purification of plantaricinVGW8 was made by heating crude plantaricin at 80ºC/10min and then purified by two steps method including extraction with n - butanol followed by gel filtration chromatography on Sepharose 6B column, the results showed that the specific activity was 10666.67AU/mg protein with 13.067purification folds and 12% recovery yield. The purified plantaricin was called plantaricin VGW8 according to the producer isolate Lb. plantarum VGW8.Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of plantaricin VGW8 was 14400 Dalton by sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Plantaricin VGW8 activity was stable at pH values (3 - 9) but 50% of its activity was lost at (2 and 10) pH values, and whole activity was lost at extreme alkali pH values(11 and 12).Also, plantaricin VGW8 showed high thermostability at different temperatures (20 - 100)°C for (10,30 and 60)min, it remained active after being treated with (20 - 80)°C for the periods above, but it retained only 50% of its activity after treatment at 100°C for one hour and autoclaving treatment (121°C/ 15 min).The results showed that the activity of plantaricin VGW8 disappeared when it treated with proteolytic enzymes (pepsin, trypsin and papain), whereas it retained whole activity when treated with lipase, lysozyme and α - amylase, indicating pure proteinaceous nature of purified plantaricin.As well as, treatment of plantaricin VGW8 with organic solvents (chloroform, acetonitrile, diethyl ether, ethanol, methanol, isopropanol, toluene and ethyl acetate), surfactants (tween 80, tween 20, triton X - 100, SDS, EDTA and urea) and the metal ions : Na, K, Ca, Ba, Zn and Fe, showed no effect of these treatments on the activity of plantaricin VGW8.While treatment with Mn and Mg reduced its activity to the half.The antibacterial activity of plantaricin VGW8 was studied against P. aeruginosa and S.aureus. It was observed that plantaricin VGW8 has bactericidal effect when the numbers of cells were decreased with increasing of plantaricin VGW8 concentration to 320 AU/ml. The results showed that the complete killing of P. aeruginosa was observed after 2 hours of incubation with 320 AU/ml of plantaricin VGW8, while the same effect was observed after 4 hours on S.aureus. Also, the lytic activity of plantaricin VGW8 was studied, and the results showed that exposure P. aeruginosa and S.aureus to 320 AU/ml of plantaricin VGW8 led to decrease absorbance at 600nm from 0.59 to 0.17 for P. aeruginosa within 2 hours and from 0.51 to 0.20 for S.aureus within 4 hours. Moreover, the effect of plantaricin VGW8 on the cell permeability was studied and the results showed that absorbance at 260nm increased from 0.5213 to 2.9112 for P. aeruginosa and from 0.4614 to 2.6405 for S.aureus, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis. This means that the cell membrane is the target of plantaricin VGW8.

تاثير الذيفانات المعوية للبكتريا ETEC Escherichia coli في الخلايا السرطانية والخطوط الخلوية وفي حيونات التجارب == Effect of ETEC Escherichia coli enterotoxins on cancer cells, cell lines and laboratory animals

اسم المؤلف: الهام سعيد عبد الكريم بنو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study aimed investigating the cytotoxic effect of crude enterotoxins on normal and cancer cells both invitro and invivo. the present study included isolation and identification of Pathogenic Escherichia coli, From Children (under 3 - years for both sexes) infected with severe diarrhea, from March to June 2005, and as follows : *Sixtysix Islates (60%) were obtained from 110 samples. These Isolates were Identified according to morphological and biochemical tests, and for confirmation by Api - 20E System. *Serological identification for these Isolates( 66 isoleates )showed that only 12 (18%) isolates were belonged to Enteropathogenic group of E. coli.(EPEC).* The results of using Suckling Mouse Assay(SMA) showed that only 13 (19.6%) out of 66 Isolates were capable of producing heat - stable (ST) enterotoxin, therefore these isolates belonged to Enerotoxigenic group of E.coli ( ETEC).Whereas the EPEC isolates were all negative for this test. According to the toxin activily that was evaluated by (SMA) the Isolate No. 99 determined as the most efficient Isolate in producing the (ST). The same Isolate (99) of E. coli showed its ability to produce heat Labile enterotoxin (LT), by using Rabbit lileal Loops.The Isolate (99) revealed for sensitivity to Ampicillin, Gentamicin, Nalidixic acid and Nitrofurantoin antibiotics, but resistance to Amoxicillin , Cefixime, Cephallothin, Ciprofloxacin and trimethoprim.This Isolate also showed its ability to adhere by using the special media that contain the congo red stain, and by using hemagglutination test because it posseses the colonization factors antigen (CFA/1) and CFA /III However it failed in producing hemolysin enzyme that hemolyze red blood cells The toxin reserved Its activity at temperatures (20,40,60 and 80)c0 , but loss some of its effect at 100 c0 and kept its activity at 4 c0 for (24 - 48) hrs, It was found that the highly toxic activity reduced in the PH 5,9.5. The time ofmice response to enterotoxin was determined. At 90 minutes, as the maximum of response and 180 minutes as the optimum time of response. Enterotoxin was purified partially by using sepharose CL - 6B, and the molecular weight for (ST) was 17378 dalton. LD50 of both bacterial Suspension and crude enterotoxin in mice was 2.13 × 108 cell/ mice, and 48.75 mg/ mice respectively. The crude enterotoxin showed more severe effect than the bacterial suspension in spleen, Intestine, and Lung, while the effect of bacteria suspension was more severe in Liver.The therapeutic dose of crude enterotoxin was determined according to LD50 in mice it was revealed that the concentration of 390 mg/kg have the activity in reducing the tumor volume when injected directly in tumor, with an inhibition ratio between(83 - 89)% beginning at 8th day of the 25th injecting days. While when the toxin was injected intraperitonealy, the inhibition ratio of tumor was Less than the injection in tumor it self. The dose 97.5 mg/kg that given daily for 25 days showed more efficiectly in reducing the tumor in percent of 73.3. The Comparitive study between the relative volume of tumor in treated group and the relative volume of tumor in control group revealed that there was significant difference statistically important all over the treatment time.. The necrosis and fibrosis were the most important characteristics in treated groups after histopathological examination which appearantly with the progress of treatment associated with volume decrease of tumor, so it was found that the last stage of treatment showed the cancer cells presented like small Land Surrounded by dense fibrous tissue. The treatment by using all toxin concentration in both ways of injections on murine bone marrow cells, showed significant increase in blast Index (BI) and mitotic Index (MI) when compared with control.The toxic effect of crude extraction was studied in tumor cell lines (in vitro), Hep - 2 and AMN - 3 and the normal cell line REF, the study showed that the toxic effect depend on the type of cells, the dose and the time of exposure. This study revealed that the AMN - 3 Cells were more Susceptible from that of Hep - 2 Cells and the high concentration caused inhibition to the growth of the tumor cells, Specially the concentration of 60000 Mg/ml, Also growth and multiplication of REF cells. Whereas the concentrations of 1875and 3750 Mg/ml were found as an inhibitor to REF Cells. Partially purified enterotoxin (ST) showed that it's effect was found to in hibit Hep - 2, AMN - 3 and REF cells at 72 hrs of exposure and has an inducer effect to growth of cells at 24 hrs of exposure in all concentrations,but the effect was differ in the time of exposure at 48hrs,that the three concentrations (1.986,3.965and 7.95) Mg/ml showed inducing effect ,while the three hight concentrations(15.86,158.6 and1586) Mg/ml showed inhibition effect to AMN - 3 cells.Also the hight concentrations(30000 and 60000) Mg/ml werefound as inhibitor to REF cells at( 48,72)hrs,but they were inducer of growth at 24hrs of exposure. The toxicity effects of crude enterotoxin were studied in human Lymphocyte multiplication (in vitro) , and the higher concencentration showed decline in Mitotic index (MI), but It was induced cells to transform in present of mitogen, so there was inverse in blast index (BI) when compare with the control.

دور الببتيدو كلايكان في امراضية بكتريا Staphylococcus saprophyticus == Role of Peptidoglycan in Pathogenicity of Staphylococcus saprophyticus

اسم المؤلف: عذراء صالح فليح الهيتي
اسم المشرف: مي طالب فليح | حارث جبار فهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: من مجموع 300 عينة ادرار تم الحصول على 71 عزلة عائدة لجنس الـ Staphylococcus من مريضات مصابات بخمج المجاري البولية واظهر عائدية 16 عزلة للنوع S. saprophyticus تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية ، كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية ، استخدمت عملية التكسير الميكانيكي (Mechanical disintegration) باستخدام المازج (vortex) والحبيبات الزجاجية ، والتكسير باستخدام جهاز الذبذبات فوق الصوتية لتكسير جدار خلية العزلةS67 saprophyticus S. والحصول على خلايا متكسرة تمثل الجدار الخلوي الخام ومن ثم استخلاص وتنقية جزئية للببتيدوكلايكان بالاعتماد على الهضم الانزيمي بوساطة انزيمات الـ DNase وRNase وPronase وTrypsin فضلا عن استخدام مركب سلفات دودسيل الصوديوم (SDS) ومواد كيميائية اخرى ؛لازالة الاغشية السايتوبلازمية والمحتويات البروتينية الاخرى ؛ وبذلك تم الحصول على ببتيدوكلايكان نقي خال من الشوائب وهذا ما اكده الفحص بالمجهر الضوئي والالكتروني وقد اظهر الببتيدوكلايكان حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة مقارنة بالجدار الخلوي الخام والذي اظهر عدة حزم بروتينية ؛ مما يدل على كفاءة الطريقة المستخدمة في الاستخلاص. تضمن البحث دراسة امراضية بكترياS67 S. saprophyticus المسببة لخمج المجاري البولية في الفئران اذ حقنت مجموعة من الفئران الاناث البيض عبر الاحليل وباستخدام القثطرة بتركيز 109 خلية جرثومية / مليلتر ، وحقنت مجموعة اخرى من الفئران بتركيز 3 ملغم / 0.2 ملليتر من الببتيدوكلايكان المستخلص منS67 S. saprophyticus والمنقى جزئيا وتم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) تغييرات نسيجية ممرضة تمثلت بانكماش الكبيبة الكلوية واحتقان الاوعية الدموية للكلية وارتشاح الخلايا الالتهابية وفقدان طبقة الكيراتين في المثانة سواء اكانت محقونة بالجراثيم ام بالببتيدوكلايكان . حضر المصل المضاد للببتيدوكلايكان في الحيوانات المختبرية (الارانب البيض) وتبين ان الببتيدوكلايكان ممنع جيد عند حقنه في الارانب ، وتم اثبات وجود الاجسام المضادة للببتيدوكلايكان باستخدام اختبار الندف بالانابيب واختبار التلازن الجرثومي (Bacterial agglutination) حيث كون المصل المضاد للببتيدوكلايكان المعزول من جدار بكتريا S.saprophyticusS67 تلازنا مع جراثيم البكتريا نفسها وايضا اعطى تلازنا مع العزلة القياسية ATCC6538 S. aureusمما يشير الى وجود تفاعل تصالبي لهذه الاضداد. تم دراسة التاثيرات السريرية للببتيدوكلايكان في الارانب المحقونة، اذ لوحظ ارتفاع في مستوى اليوريا والكرياتنين وانزيمي GPT وGOT والكلوكوز في الدم وانخفاض مستوى انزيم الفوسفتيز القاعدي( Alkaline phosphatase ) مما قد يدل على وجود خلل وظيفي في عدد من الاعضاء مثل : الكلى ،و الكبد ،و البنكرياس نتيجة تاثرها بالببتيدوكلايكان | Seventy one isolates of Staphylococcus were obtained from 300 urine samples isolated from female patients with urinary tract infection. sixteen of these isolates were identified as S.saprophyticus by biochemical tests , the sensitivity of the isolates to different antibiotics were also studiedMechanical disintegration method using vortex and glass beeds in addition of Ultrasonicator were used for preparing disintegrated cell wall which represent Crude cell wall , Extraction and partial purification of the peptidoglycan were accomplished by enzymatic digestion using DNase ,RNase ,Pronase and Trypsin in addition to SDS and other chemicals to remove the cytoplasm membrane and other protein contents, so we obtained pure peptidoglycan that were confirmed by light and electron microscope, the partial purified peptidoglycan showed one protein band compared with crude cell wall which showed many protein bands when performed in poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing conditions which improved the efficacy of method that employed in extraction of peptidoglycan The pathogenicity of the S.saprophyticus in urinary tract infection of mice was studied, Female mice were injected transurethrally by using catheter with 109 germ cells concentration /ml, other group of mice were injected by 3mg concentration /0.2ml of partial purified peptidoglycan which extracted from S.saprophyticus , The histopathological changes in the organs (Kidney and Bladder) whether it was injected with germ or the peptidoglycan were observed Antiserum of the peptidoglycan was prepared in the laboratory animals (white rabbit) the results revealed that the peptidoglycan was a good immunogen, The presence of antibodies was shown by tube flocculation test and bacterial agglutination test.Thiese antibodies cause agglutination with S.saprophyticus by using microtiter plate and also give cross - reaction with ATCC5538P S.aureusThe clinical effects of the peptidoglycan in the injected rabbit were also studied, The levels of Urea,Creatinine ,GOT, GPT ,Glucose were increased in the blood where the level of Alkine phosphatase was decreased which indicate that the peptidoglycan caused dysfunction of several organs like kidney,liver and bladder

تاثير مستخلصات المركبات الثانوية لنبات الكبوسين الكبير Tropaeolum majus في بعض جوانب الاداء الحياتي للذبابة المنزلية Musca domestica (Diptera : Muscidae) ودورها في نقل الفايروس العجلي Rotavirus == Effect of secondary compounds extracts of Tropaeolum majus on some biological aspects of Musca domestica (Diptera : Muscidae) and role for transfer of The Rotavirus

اسم المؤلف: نور هادي حسن الشمري
اسم المشرف: هادي مزعل خضير الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء سلسلة من التجارب المختبرية في مختبر بيئة الحشرات / كلية العلوم للبنات / جامعة بابل من شهر تشرين الثاني لعام 2015 الى شهر ايلول من عام 2016 , وهدفت الدراسة الحالية الى اختبار فعالية المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير Tropaeolum majus (Brassicales : Tropaeolaceae) في بعض جوانب الاداء الحياتي للذبابة المنزلية Diptera : Muscidae)) Musca domestica, اضافة لدور الحشرة في نقل الفايروس العجليRotavirus , وكذلك دراسة نسجية حول تاثير مستخلص المركبات الثانوية في مبيض والقناة الهضمية للحشرة . وايضا عزل وتشخيص المركبات الفعالة الموجودة في المستخلصات باستخدام تقنية Gas - chromatography Mass Spectrometry. تفوق مستخلص المركبات الفينولية الخام على مستخلصي المركبات التربينية والقلوانية الخام , حيث بلغت معدلات نسب هلاك البيض في مستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام (90 و90 و62.3)% في تركيز (20)ملغم/مل على التوالي مقارنة مع (19.2 و18.4و 13.2)% في معاملات السيطرة . ظهر الطور اليرقي الاول اكثر حساسية للمستخلصات حيث بلغت معدلات نسب الهلاك نتيجة المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام (85.2 و77.8 و67.3)% وبتركيز (20)ملغم/مل على التوالي . اما العذارى فلم تسجل اي نسبة هلاك نتيجة المعاملة بمستخلصات المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية . بلغت معدلات نسب الهلاك التراكمي للادوار غير البالغة نتيجة المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام ( 100و 93 و81)% على التوالي عند تركيز20) )ملغم/مل بالمقارنة مع (20 و18 و15)% في معاملات السيطرة . اما مدة النمو للاطوار غير البالغة فقد بلغت (12.3) يوما عند المعاملة بمستخلص المركبات القلوانية الخام وبتركيز ((20ملغم/مل مقارنة مع ((10.2 يوما في معاملة السيطرة. انخفضت اوزان العذارى والانتاجية ونسبة الفقس البيوض عند المعاملة بمستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام من ( 0.30و 0.32 و0.35) غم و(125 و127 و129.2) بيضة/انثى و(93 و92 و(92.5 % في معاملات السيطرة على التوالي الى (0.09 و0.10 و0.13) غم و(0 و74.6 و80) بيضة/انثى و(15 و20 و(25%على التوالي وبتركيز (20)ملغم/مل . ساهمت الذبابة المنزلية في نقل الفايروس العجلي Rotavirus ميكانيكيا وذلك بعد تعرض الذبابة المنزلية الى عينة من الغائط الحاوية على الفايروس ولفترة زمنية قدرها (48) ساعة وكذلك وضعت عينة الغذاء ( معكرونية) داخل القفص ولمدة (48) ساعة ايضا , ومن خلال تقنية RT - PCR تبين وجود الفايروس في الغذاء . تاثر المبيض والقناة الهضمية للحشرة بمستخلص المركبات الفينولية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير , حيث اظهر تركيز (2.5)ملغم/مل من مستخلص المركبات الفينولية الخام تاثيرا في مبيض حشرة الذبابة المنزلية بعد ((72 ساعة من البزوغ ,حيث ظهر تحلل في انسجة الخلية البيضية والحويصلات المبيضية وزيادة في سمك الغمد المبيضي , اما تركيز (1)ملغم/مل لنفس المستخلص اثر في تركيب المعي المتوسط للحشرة وسبب تجمع في الفجوات داخل الخلايا الطلائية وتنخر في العضلات الطولية والدائرية , وكذلك سبب مستخلص المركبات القلوانية الخام عند تركيز (5)ملغم/مل تغيرات في تركيب المعي المتوسط لحشرة الذبابة المنزلية بعد (72) ساعة من البزوغ حيث ظهر في المقطع (A) زيادة في سمك جدار المعي المتوسط وتنخر في العضلات الدائرية والطولية مع وجود للفجوات داخل البطانة الطلائية , اما في المقطع (B) سبب المستخلص اختزال واضمحلال في طبقة العضلات الطولية والدائرية مع تجمع مجموعة من الفجوات داخل طبقة البطانة الطلائية . تم عزل وتشخيص المركبات الفعالة في مستخلص المركبات الفينولية والتربينية والقلوانية الخام لنبات الكبوسين الكبير باستعمال تقنية غروماتوغرافيا - المزود بطيف الكتلة (GC - MS) حيث تم عزل 12)) مركبا فعالا في مستخلص المركبات الفينولية حيث وجد ان مركب Acetic Acid الذي يمتلك زمن احتجاز (3.097) مولاري نورمالي (م ن) هو اول المركبات انفصالا بينما مركب Tri butyl acetyl citrate الذي يمتلك زمن احتجاز ( (25.710م ن كان اخر المركبات انفصالا , كما تم تحديد (30) مركبا فعالا في مستخلص المركبات التربينية الخام حيث كان مركب 2,4 Dithia pentane الذي يمتلك زمن احتجاز ((2.916 م ن اول المركبات انفصالا بينما مركب Phthalic acid, 2 - ethylhexyl phenyl ester الذي يمتلك زمن احتجاز (31.196) م ن كان اخر المركبات انفصالا , وشخص ايضا ثمانية مركبات فعالة في مستخلص المركبات القلوانية وكان مركب Acetic Acidالذي يمتلك زمن احتجاز ((3.398 م ن اول المركبات انفصالا بينما مركب 6 - Octadecenoicacide , Methyl ester,(Z) - الذي يمتلك زمن احتجاز قدره (23.887) م ن اخر المركبات انفصالا . | A series of labratory experiments were conducted in the labratory of insect ecology / college of science for women Babylon university since 2015 - 2016 , and the present study aimed to test the activity of the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds for Tropaeolum majus ( Brassicales : Tropaeolaceae ) on some biological aspects of house fly Musca domestica ( Diptera : Muscidae) . as well as the role of insect for transmission the Rota virus , and histological study about the effect of secondary compounds on ovary and digestive tract of insect . Isolation and identification of active compounds in these extracts by using Gas - chromatography Mass spectrometry . The extract of crude phenolic compounds was more effective than the extracts of terpenoid and alkaloid compounds , The mortality rates of eggs in the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds ware (90 , 90 , 62.3)% respectively at concentration (20)mg/ml compared with (19.2 , 18.4 , 13.2)% respectively at control transaction . The first larval instar was more sensitive for these extracts , the mortality rates of first larval instar at the extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds ware (85.2 , 77.8 , 67.3)% respectively of concentration (20)mg/ml . The pupal stage was not effected from treated with extracts . The mortality rates of immature stages for crude phenolic , alkaloid and terpenoid compounds ware (100, 93 , 81)% respectively of concentration (20)mg/ml , compared with (20 , 18 , 15 )% respectively at control transactions . The developmental period of immature stags was (12.3) days at the extracts of crude alkaloid compounds of concentration (20)mg/ml, compared with (10.2) days at the control transaction . The pupal weight , female productivily and percentage of aggs hatching which were treated with extracts of crude phenolic , terpenoid and alkaloid compounds more decreases from (0.35 , 0.32 , 0. 30)gm , (129.2 , 127 , 125)egg/female and (93 , 92 , 92.5)% at control transaction respectively to (0.13 , 0.10 , 0.09)gm , (80 , 74.6 , 0)egg/female and (25 , 20, 15)% respectively at concentration (20)mg/ml . The house fly contributed in transmission of Rota virus when the house fly pensions to faeces sample which was containing the virus at time (48) hours as well as the insect pensions to the food (mekrunet) at time (48) hours from RT - PCR showed that the virus was founded in food . The ovary and digestive tract of insect was effected for the extracts of crude phenolic and alkaloid compounds of Tropaeolum majus , the concentration of (2.5)mg/ml of crude phenolic compounds appeared the effect on ovary of insect after (72) hours from emergence , appeared analysis in tissue of eggs cell , ovarian follicles and increasing in the thickness of oval sheath , while the concentration (1)mg/ml for this extracts effect on the structure of midgut of insect , which caused aggregate the vacules enter epithelial lining and necrosis in longitudinal and circular muscles . also the extracts of crude alkaloid compounds at concentration (5)mg/ml caused variation in the structure of midgut for insect after (72) hours from emergence , appeared in (A) site increasing in thickness of the well of midgut and necrosis in longitudinal and circular muscles and vacules ware founded enter the epithelial lining , while in (B) site the extract caused shorthand and disappearance in layer of longitudinal and circular muscles and aggregated the vacules enter layer of epithelial lining . Isolation and identification of active compounds from crude extracts of phenolic ,terpenoid and alkaloid compounds of Tropaeolum majus by using (GC - MS) . Twelve compound were isolated from crude phenolic compounds which were (acetic acid) was first active compounds isolated at retention time (3.097)mn. while the active compound (Tri butyl acetyl citrate) was later compound isolated of retention time (25.710)mn. Thirty active compounds isolated from the crude terpenoid compounds (2,4Dithia pentane) was first compound isolated at retention time (2.916)mn. while the later active compounds (phthalic acid , 2 - ethyl hexyl phenyl ester) isolated at retention time (31.296)mn. eight active compound identified from crude alkaloid compounds the (acetic acid) was the first active compound isolated at retention time (3.398)mn. while the (6 - Octadecenoic acid , Methyl ester , (Z) - ) was later active compound isolated at retention time (23.887)mn

التنميط الوراثي لمستضدات معقدات التوافق النسيجي (HLA - DR, DQ) والتغيير الوراثي لانترلوكينات IL - 4 , IL - 18 في مرضى المفاصل == HLA - DR,DQ genotyping and IL - 4, IL - 18 gene polymorphism in arthritis patients

اسم المؤلف: علا عباس خضير
اسم المشرف: عبد النبي جويد عبد المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للتحقيق في دور بعض الجوانب المناعية والوراثية التي تتعلق بالتهاب المفاصل. وتشمل الدراسة 100عينة دم جمعت من الناس الذين راجعوا مستشفى مرجان، مع 25 عينة من الذين يبدو عليهم اصحاء وللفترة من تشرين الاول2015 الى اذار 2016. تضمنت الدراسة المناعية تقدير مستويات انترلوكين 18 وانترلوكين 4 في مرضى التهاب المفاصل باستخدام تقنية الاليزا ,لوحظ زيادة مستوى انترلوكين 18في جميع المرضى على النقيض من ذلك مع مجموعة السيطرة بمتوسط 133.93 pg/ml)) في مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي و( pg/ml ( 130.3 لمرضى هشاشه العظام مع مستوى احتمالية (.(P ≤ 0.01 اظهرت النتائج الخاصة بتقدير انترلوكين 4 زيادة في مستوى انترلوكين4 في كلا النوعين لالتهاب المفاصل وبمتوسط على النحو المبين : ( pg/ml45.06 ، pg/ml33) مع التهاب المفاصل الروماتويدي وهشاشة العظام على التوالي مقارنة مع مجموعة السيطرة (pg/ml22.48) بمستوى احتمالية(P≤ 0.01). تضمنت الدراسة الوراثية ( IL - 4 - 590 C/T & IL - 18 - 137 G/C) ذات الصلة مع مرضى التهاب المفاصل ل75 عينة متضمنة عينات مرضى وعينات سيطرة باستخدام تقنية SSP) - (PCR. اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد من( IL - 18 - 137 G/C) : 39 من متباينة الاشكال 21 ,GCمن متماثله الاشكالGGو 15 من متماثلة الاشكال CC. كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة. اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد من (IL - 4 - 590 C/T)ولوحظ انه : 50من متباينة الاشكال CT،9من متماثلة الاشكال CCو16 من متماثلة الاشكالTT.كما اظهر عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين المرضى ومجموعات السيطرة في حاله الاليلات والمورثات.كما تضمنت الدراسة الحالية دراسة علاقة مجموعة اليلات من HLA للموقعينDRB1 وكذلك DQB1 باستخدام تقنية PCR - SSP)) وبينت عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية بين مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي معالاليلات(DRB1 0301, 0701&DQB1 0201) مقارنة مع السيطرة,اما في مرضى هشاشة العظام بينت وجود اختلافات كبيرة في اليل((DQB1*0201مقارنة مع السيطرة، في حين لم تظهر اختلافات كبيرة اليلاتDRB1 وهؤلاء المرضى. | The current study was conducted to investigate the role of some aspects of immunogenetics that related with arthritis disease . The study includes 100 blood samples were collected from people who attend to Marjan hospital, with 25 samples from apparently ealth people during the period of October 2015 to March 2016 Immunological study involved estimate the levels of IL - 18 , IL - 4 in certain arthritis patients using ELISA technique , the estimation of IL - 18 revealed significantly increased in all patients by contrast with control group with mean value133.93 pg/ml in rheumatoid arthritis( RA) patients and 103 .3pg/ml for osteoarthritis (OA) patients (P <0.01) Estimation of IL - 4 and contrary results showed increasing IL - 4 levels in both types of arthritis with mean value ( 45. 06 pg/ml , 33 pg/ml ) with RA and OA respectively compared with control group (22.48 pg/ml ) with P ≤ 0.01 The genetic study involved screening of IL - 18( - 137 G/C ) and IL - 4 ( - 590 C/T ) related with arthritis patients for 75 samples including patients and control using PCR - SSP technique The SNP of IL - 18 ( - 137 G/C ) showed : GC heterozygous with (39), GG homozygous with (21) and CC homozygous with (15). The allelic and genotypes association appeared no significant differences between patients and control groups. Another SNP of IL - 4 ( - 590 C/T) showed : CT heterozygous with (50), CC homozygous with (9) and TT homozygous with (16). The allelic and genotypes association showed no significant differences between patients and control groups The possibility of detection of histocompatibility antigens HLA( DRB1& DQB1) alleles related genetically with disease by using (PCR - SSP)was performed and showed that no significant differences between RA patients with DRB1 (0301 & 0701) and DQB1 (0201) alleles compared with control , while in osteoarthritis patients showed significant differences between patients with DQB1 (0201) allele compared with control, but no significant differences with DRB1 alleles

دراسة نسيجية فسيولوجية وبايوكيميائية للمعايير ذات العلاقة بامراض الغدة الدرقية == Histophysiological And Biochemical Study of parameters related with thyroid disease

اسم المؤلف: ريم عبد الرحيم السعد
اسم المشرف: كريم حميد رشيد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد امراض الغده الدرقية من الامراض شائعة الحدوث لاسباب مختلفة وتشمل امراض الغدة الدرقية كل من فرط الدرقية (Hyperthyroidism) (وقصور الدرقية ((Hypothyroidism اذ يحدث تضخم الغده الدرقية في الحالتين . يزداد انتاج هرمونات الغدة في مرضى فرط الدرقية بالرغم من انخفاض تركيز الهرمون المحفز للدرقية ( Follicle stimulating hormone )في حين يقل انتاج هرمونات الدرقية في مرضى قصور الدرقية بالرغم من زياده انتاج الهرمون المحفز للدرقية.هنالك علاقة بين هرمونات الغدة الدرقية والايض من خلال تاثير هذه الهرمونات على ايض الكربوهيدرات , الدهون والبروتينات وبالتالي تنتج الطاقة من تحلل هذه المركبات ولقد اجريت هذه الدراسة للتعرف على التاثيرات المختلفة لمعايير الفسلجية والنسيجية والكيموحيوية والجزيئية في مرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية لمجموعتين عمريتين هما اقل من 45 سنه واكثر من 45 سنه للذكور والاناث.اظهرت نتائج الدراسة اختلافات معنوية بين كل من الهرمون المحفز للدرقية وهرمون الدرقية الثلاثي وهرمون الدرقية الثايروكسين وهرمون الايرسين ومستويات مستقبلات الانترليوكين ومستويات الكلكوز بالمصل ومستويات معدل كتلة الجسم ومستويات الكالسيوم بالمصل ومستويات قابليه مضادات الاكسدة بالمصل ومستويات الصوديوم بالمصل في مرضى قصور الدرقية ومرضى فرط الدرقية مقارنه مع مجموعه السيطرة في حين وجدت اختلافات غير معنوية بين انزيم البيروكسيدايزعند مرضى فرط الدرقية في كلا الجنسين ,مستقبل بروتين الثلاثي (FCRL3)والثايروكلوبيولين عند مرضى قصور الدرقية في كلا الجنسين ومستقبل الهرمون المحفز للدرقية في مرضى قصور الدرقية في الذكور والاناث في المرضى الاقل من 45 سنه فقط مقارنه بمجموعة السيطرة ,كما اظهرت الدراسة النسيجية وجود اختلافات في التركيب النسيجي للحويصلات الدرقية بين مرضى الغدة الدرقية بنوعيها (فرط الدرقية وقصور الدرقية) مقارنة مع السيطرة استخدم في هذه الدراسة جين MAPKinaes gene للكشف عن اورام الغدة الدرقية , وقد اظهر استخدام كيمياء المناعة النسيجية وجود ورم سرطاني من النوع الحلمي Papillary Carcinoma في احدى العينات المستحصلة لهذا الغرض .بينت نتائج الارتباط بين المعايير المختلفة لمرضى فرط الدرقية ومرضى قصور الدرقية وجود ارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين الهرمون المحفز للدرقية معدل كتلة الجسم وارتباط سلبي معنوي p˃0.05)) بين مستقبل الانترليوكين وهرمون الدرقية الثلاثي وارتباط موجبة معنوي p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون الدرقية الثلاثي وعلاقة ايجابية معنوية p˃0.05)) بين كلا من الايرسين وهرمون المحفز للدرقية | The thyroid disease is a common disease of occurrence for different causes which include thyroid hyperthyroidism and hypothyroidism . Goiter occurs in both cases and the production of thyroid hormones increases despite the decline in the concentration of the thyroid stimulating hormone (TSH), while the production of thyroid hormones decreases in hypothyroidism despite the increase in the production of thyroid stimulating hormone. In view of the relationship between thyroid hormones and metabolism and the metabolic rate through the influence of these hormones on the metabolism of carbohydrates, fats and proteins and thus energy produced from the hydrolysis of these compounds This study was conducted to investigate the different effects on different physiological ,histological biochemical and molecular criteria in 58 patients with hyperthyroidism and hypothyroidism for two age groups , they were collected from the Teaching Laboratories in Al - Hilla teaching hospital and from private laboratories (Babylon) , during the period from November 2015 to march 2016, the aim of this study was the detection of the best possible diagnostic parameter for the detection of the dysfunction of thyroid gland by using various biological markers in this study. The results of this study showed that a significant differences in thyroid stimulating hormone (TSH), irisin, thyroxin (T4), triiodothyronine (T3), triglycerides (TG), body mass index (BMI), glucose, Interlukin - 2 Receptor (CD25), total antioxidant capacity (TAC), Potassium (K), Sodium (Na), high density lipoprotein (HDL), calcium (Ca) in hypothyroidism ,hyperthyroidism patients compared with the control group, while the differences were Non - signifecant in the thyroid Peroxidase ( TPO) in patients with hyperthyroidism in both sexes Fc - receptor - like - protein3 (FCRL3), thyroglobulin (Tg) in patients with hypothyroidism in both sexes and thyroid Stimulating Hormone Receptor (TSHR) in patients with hypothyroidism in both sexes only in younger old patients as compared to the control group. Histological study revealed that there were differences in the histological structure of the thyroid vesicles in patients with hyperthyroidism and hypothyroidism compared with the control group. MAP Kinase gene was used for the detection of tumors of the thyroid gland by using immunohistochemistry technique, the result in tissue Papillary Carcinoma was identified in one of the samples obtained for this purpose. The results of the correlation between the different criteria for patients with hyperthyroidism, and hypothyroidism have shown a negative correlation between the thyroid stimulating hormone (TSH) and body mass index (BMI) and interlukin - 2receptor (CD25) and triiodothyronine (T3),while there positive correlation was a between irisin and triiodothyronine (T3) and a positive relationship between both irisin and High Density Lipoprotein (HDL), as well as positive correlation between irisin and thyroid stimulating hormone (TSH).

دراسة تصنيفية لبعض اجناس العائلة الصليبية Cruciferae في العراق == Taxonomical study of some genera in family Cruciferae in Iraq.

اسم المؤلف: سرى سليم كاظم البيرماني
اسم المشرف: عبد الكريم خضير البيرماني | هدى جاسم التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناولت الدارسة الحالية دراسة تصنيفه مقارنه لسبعة انواع عائدة لاجناس ضمن العائلة الصليبية Brassicaceae في العراق وهي Biscutella didyma L. وCapsella bursa pastoris (L.) Medik. وLobularia martima (L.) Desv. وNasturtium officinale R.Br. وNesila apiculata Fisch. وSameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. وSchimpera arabica Hochst and Steud.. واجريت الدراسة في مختبر ابحاث تصنيف النبات المتقدم/كلية العلوم للبنات/جامعة بابل للمدة من تشرين الاول/2015 الى اب/2016 . اعتمدت الدراسة على العينات الطرية والجافة التي تم الحصول عليها من السفرات الحقلية والمعاشب النباتية العراقية . اذ تناولت الدراسة العديد من الجوانب المهمة في تصنيف النبات منها الصفات المظهرية والتشريحية وحبوب اللقاح وبعض الجوانب الكيميائية والجزيئية فضلا عن التصنيف العددي. وخلصت الدراسة المظهرية في اظهار الصفات التي كان لها قيمة تشخيصية ساعدت في الفصل بين الانواع، اذ قورنت الخصائص المظهرية لصفات السيقان والاوراق والازهار والاجزاء التكاثرية والثمار والبذور وحددت اهميتها التصنيفية واتضح منها التباين في الاهمية التصنيفية لكل عضو من اعضاء النبات سواء كان على مستوى الاجناس او الانواع.وتمكنت الدراسة من تحديد العديد من الصفات التشريحية لنصل الورقة والساق والسويق وحامل النورة وطبيعة التعرق وطبيعة الكساء السطحي. ودرست مظهرية حبوب اللقاح لجميع الانواع التي هي قيد الدراسة وتبين وجود اهمية تصنيفية جيدة في عزل الانواع عن بعضها، اذ امتازت جميع الانواع بكونها ثلاثية الثقوب والاخاديد وبانها ملساء الا انها اختلفت في الحجم والشكل وسمك جدار حبة اللقاح الخارجي. وتناول البحث الحالي المحتوى الكيميائي باستخدام تقنية كروموتوغرافيا الغاز - الطيف الكتلي Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) للانواع المدروسة، ولوحظ غنى الانواع بالمركبات الكيميائية التي امكن من خلالها عزل الانواع بعضها عن بعض. كما امدت الدراسة الجزيئية بادلة ساعدت على الفصل بين الانواع المتقاربة لاختلاف الحزم الناتجة من التضخيم بين الانواع باستخدام تقانة Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) وذلك باستخدام سبع بادئات، ورسم المخطط الشجيري لمقارنة درجات التقارب والتباعد للتراكيب الوراثية للانواع قيد الدراسة. هذا وقد عوملت الانواع حسابيا استنادا الى عدد من الصفات المختارة لمعرفة مدى التشابه والاختلاف بين الانواع وتم رسم المخطط الشجيري والاشكال متعددة الاضلاع للانواع كافة وحسبت نسبة التشابه بين الانواع،ومن ثم قورنت المخططات الشجيرية الناتجة من الدراسة الجزيئية ودراسة التصنيف العددي ونتج منها مخطط يوضح درجة تقارب وتباعد الانواع بالاعتماد على جميع الصفات والجوانب المدروسة مما اكد العلاقة الوثيقة بين نتائج الدراسة المظهرية والتشريحية والكيميائية وحبوب اللقاح والجزيئية والتصنيف العددي في تحديد علاقات القربى بين الانواع محل الدراسة. | Seven species belonging to the genera within the family Brassicaceae in Iraq have been systematically studied, these are Biscutella didyma L., Capsella bursa pastoris (L.) Medik. , Lobularia martima (L.) Desv. , Nasturtium officinale R.Br. , Nesila apiculata Fisch. , Sameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. and Schimpera arabica Hochst and Steud. The study carried out in the laboratory of Advanced Plant Research / College of Science for women / the university of Babylon from October / 2015 to August / 2016. The study relied on a fresh and dry samples which obtained from field trips and National Herbarium of Iraq. The study covered many important aspects of plant taxonomy, including morphological ,anatomical traits, pollen grains, chemical and molecular aspects as well as a numerical taxonomy study. The current study concluded the characteristics that had diagnostic value helped in the separation of species, and compared to the phenotypic characteristics of the qualities of the stems, leaves, flowers, reproductive parts, fruits and seeds and their taxonomic significance were determined, including variation in important taxonomic for each member of the plant,at the level of species. The study was able to identify some of the anatomical characteristics of the lamina, stem, petiole, pedicel inflorescence , the nature of venation and the nature of the Indumentum the type of trichomes prevailing, intensity consider it as a diagnostic attribute for each species. All species of the family under study were studied Palynologically and show a good taxonomic importance in isolating the species from each other, as it was characterized by being a Tricolporate and Spineless in all species but they varied in size and shape and exaine thickness. Chemical content through the use technique of Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) in all species were studied, the study observed indispensable types of chemical compounds that could be use to isolate the species from each other. Molecular study also supplied evidence helped to separate the species converged to the different bands resulting from amplification between species using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique using seven primers, draw dendrograms to compare the degree of convergence and divergence of combinations of genetic types under study. Species treated mathematically based on a number of selected attributes to identify the similarities and differences between them, and draw the dendrogram and polygonal for all species and calculated the similarity’s ratio between species and then were compared diagrams dendritic resulting from the molecular and numerical taxonomical study and resulting in the plan that shows the degree of convergence and divergence of species depending on the qualities and all the aspects studied, which confirms the close relationship between findings of the study of morphological and anatomical, chemical and Palynological and molecular taxonomy in determining the relationships between the species under study.

تقييم تحديد عينات دم الانسان المخلوطه باستخدام تقنيه PCR == Forensic Molecular Study of Fungemia Using ITS Region

اسم المؤلف: علي حميد مجيد الاسدي
اسم المشرف: محمد جواد الجصاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمكن ان يكون لطريقه تفاعل البلمره المتسلسل دور فعال في المحكمه لابراز الادله الثبوتيه او النافيه خاصه بعد تحديد السلالات الفطريه التي تعطي معلومات عن المنطقه الجغرافيه ومصدر الاصابه سواء كان من مصادر حيوانيه او عمليه ارهابيه تستهدف المجتمع باستخدام عوامل ميكروبيه.اهداف الدراسهاهمية الدراسة الحالية هي لتقييم التحقيق الجزيئي للاصابة الفطرية بستخدام تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل باستخدام البوادئ ITS1 ,ITS4 والتي تساعد في التفريق بين دم الانسان المخلوط ودورها في دور محتمل لتورط الشخص في القضية الجنائية. تحديد مدى الاصابة الفطرية في الحيوانات التي قد يكون لها دور باعتبارها مصدر لتفشي وباء والذي يتطلب اتخاذ اجراءات سريعه للحد من انتشار المرض وطمانه المجتمع بان الوباء تحت السيطره.طريقه العملتم جمع 70 عينه دم في انابيب حاويه على ماده EDTA تتظمن 20 عينة من اشخاص اصحاء لا تظهر عليهم اعراض مرضيه و20 خروف و20 دجاجه و10 اشخاص يعانون من سرطان الدم. تم فحص العينات من ناحيه احتوائها على اصابه فطريه باستخدام الطرق المزرعيه والجزيئيه. بعض عينات الدم تم خلطها لتقييم مدى دور التحري عن الاصابه الفطريه في تحديد وجود الشخص المصاب ضمن مسرح الجريمه.النتائجلم تظهرت اي نتيجه ايجابيه عند زراعة عينات الدم المختلفة على اطباق المزرعة الغنية حتى بعد حضنها لمدة اسبوع . اظهرت نتائج تحليل تفاعل البلمره المتسلسل لمنطقه ITS باستخدام بادئات خاصه بالفطريات, ان الاصابه الفطريه الجهازيه لدى الاشخاص الذين يعانون من سرطان الدم بلغت 70% بسبب ضعف المناعه لديهم بالمقارنه مع الاشخاص الاصحاء الذين بلغت لديهم نسبه الاصابه 30% مما يدل على احتمال حدوث حاله تفشي لمرض فطري من خلال التعامل المباشر مع الحيوانات مثل الدواجن او الخراف الذين ظرت نسبه الصابه بهم 40% و20% على التوالي او من مصادر اخرى خاصه مع زياده نسبه الصابه في العينات البشريه بالمقارنه مع العينات الحيوانيه.تظهر نتائج الترحيل الكهربائي في الهلام لنواتج تفاعل البلمره المتسلسل خليط من العينات الدم الانسان التي نستطيع التفريق بين الاجابية والسلبية , تشير هذه النتائج الى احتمال تورط الشخص مع الدم الملوث في حالة الجريمة يمكن استخدامها كعلامة داعمة في تحقيقات الطب العدلي الاستنتاجان تقنية تفاعل البلمره المتسلسل تعطي نتائج قيمة في التفريق بين عينات دم بشريه مختلطه من خلال الكشف العدوى الفطرية حسب المنطقة تضخيم ITS التي قد تكون بمثابة فكرة اساسية داعمة في تحقيقات الطب الشرعي. اضف الى ذلك، انه يعطي مؤشرا على وجود عدوى حيوانية المصدر و/ او عمل ارهابي محتمل.

دراسة جزيئية ومناعية كيميائية لانسجة عنق الرحم المصابه بفايروس الورم الحليمي البشري == Molecular and Immunohistochemical Study of Uterine Cervical Tissues Infected with Human Papilloma Virus

اسم المؤلف: الهام جواد كاظم بلال
اسم المشرف: ازهار عمران لطيف الذهب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: Human papillomavirus (HPV) is a DNA virus. It is the main etiological factor for progress of cervical precancerous and cancerous lesions. In order to develop a cancer from dysplasia to invasive carcinoma, a series of cellular changes should occur. As genital HPV carries oncogenes involving in these critical changes, currently HPV has been considered the most important risk factor of cervical cancer.This study was designed as case control study. In the retrospective part of these study a total number of (56) formalin - fixed, paraffin embedded cervical tissues was involved were submitted to ISH and IHC technique 27 with Cervical Carcinoma (CC) and 16 with benign cervical tumors. Thirteen (13) apparently healthy cervical tissues were used as a control group .The age of this individuals (patients and control groups) was ranged between 23 and 73 years. Samples collected from the pathological archives of different general hospital as well as many private laboratories. Specimens belong to the period from January 2009 to September 2015. After sectioning of these cervical biopsies and staining by hematoxyline and eosin, a final definitive histopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist.In the cross - section part of this study seventy two female patients taken from different general hospitals. Cytological examinations were performed for their Pap - smeared and a final definitive cytopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist. According to their main cytological finding cervical cellular scrapes were divided into three cytological groups : cervicitis with squamous intraepithelial lesions, cervicitis without squamous intraepithelial lesions and healthy group. The DNA isolated from a representative cytological specimen was investigated by real - tim PCR analysis for the detection and genotyping of high/risk HPV DNA.The obtained results are summarized as follows : - The age range distribution mostly in age group (23 - 73 years), the most affected age group in malignant and benign cervical tumor was (52 - 67) , (36 - 51) years which constituted 55.6%(15 out of 27 cases), 50% (8 out of 16 cases) with mean age (54 ± 11.22), (38.8 ± 9.85) respectively, while (20 - 35 years) is the most affected age group in control cases were constituting 53.8% (7 out of 13 cases) with mean age (35.5 ± 8.64 ) . - The most common histopathological type among all studied archived cervical tissues was squamous cell carcinoma (66.6%), followed by the adenocarcinoma (33.3%). - The well differentiated grade of CC constituted 52%, whereas those with moderately and poorly differentiated grades CC constituted 37%and 11% respectively. - The percentage of HrHPV31/33 DNA was detected as follows : in 55.6 % of tissues from cervical cancers, 43.7% in the tissues from benign cervical tumors, while, no HrHPV31/33 positive - ISH reaction was detected in healthy cervical tissues of the control group. - The percentage of LrHPV6/11 DNA was detected as follows : in 33.3 % of tissues from cervical cancers, 31.3% in the tissues from benign cervical tumors, while, the percentage of LrHPV6/11 show negative - ISH reaction in healthy control group of cervical tissues. - The highest positive result for ISH of HPV31/33 found in squamous cell carcinoma 72.2% and in adenocarcinoma was 22.2% while the percentage of HPV6/11detection according to cancer type was 50% found in squamous cell carcinoma while 0.0% in the type of adinocarcinoma. - The highest percentage of HPV31/33 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 70% (7 out of 10 cases) show in moderately differentiated, followed by 57.1% (8 out of 14 cases ) in well differentiated , and none of poorly differentiated showpositive signal . - The highest percentage of HPV6/11 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 42,9 % (6 out of 14 cases) show in well differentiated, followed by 30% (3 out of 10 cases ) in moderately differentiated , and none of poorly differentiated show positive signal . - The highest percentage of co - infection with High risk HPV31/33 and Low risk of HPV6/11 types was (22.2%) in malignant cervical tumor group. While in benign cervical tumor and healthy control was 18.8% and 0.0% respectively. - The highest percentage of HPV DNA detection by Rt - PCR was 80% (16 out of 20 cases) within group of cervicitis with SIL, 16.7% (5 out of 30 cases) in group of cervicitis without SIL, while none of control group shoes positive result. - Phylogenetic tree analysis image, results that local HPV amplicon(S1, 3, 5, 7, 9, 12, 14, 15, 16, 17, 18, 20) show closed related to NCBI - Blast HPV type 16 (KMO58666.1), the local HPV isolates (S2, 4, 6, 11 and 19) show closed related to NCBI - Blast HPV type 18 (KC470225.1), whereas the local HPV isolates (S10 and 13) show closed related to NCBI - blast HPV type 33 (EU918766.1), the local HPV isolates (S8) show closed related to NCBI - Blast HPV type 45 (KC470260.1). - Retinoblastoma protein overexpression was detected by IHC test in 59.3% of malignant cervical tumors, 43.8% of benign cervical tumors but no signal was reported in the tissues of control group. In the malignant cervical tumors group, 43.6% has strong score (score III), whereas 37.5% and 18.8% has moderate score (score II) and low score (score I) respectively. While, in benign cervical tumor group, 57.1% were found tohave moderate score (score II) , 28.6% and 14.3% have strong score (score III) and low score (score I) respectively. - P16 protein overexpression was detected by IHC test in 63% of malignant cervical tumors, 56.3% of benign cervical tumors while none of positive result was reported in the tissues of control group. - The highest positive result for IHC of Rb and P16 according to cancer type was found in squamous cell carcinoma 61.1% and 72.2%, respectively, while there percentage in adenocarcinoma was 55.6% and 44.5%, respectively. - The highest percentage of Rb protein expression was found within poorly differentiated that have 100% (3 out of 3 cases) .Followed by 70% (7 out of 10 cases) and 42.9 % (6 out of 14 cases) within moderately and well differentiated respectively. - The highest percentage was 100 % (3 out of 3 cases), 64.3%(9 out of 14 cases), 50% (5 out of 10 cases) of cervical cancer tissues that showed IHC reaction for P16 protein have poorly, well and moderately differentiated respectively. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 100% and 77.3% have additional impact by P16 and Rb protein expression respectively. - Immunohistochemical examination of cervical tumor tissues for CD8+,CD16+ and CD20+ cell surface markers, revealed that CD8+cells the percentage of detection was 66.7% in cervical cancer group, 62.5% in benign cervical tumor group and 23.1% in control group. Also, CD16+ was detected in 29.6% of cervical cancer group, 31.3% of benign cervical tumor group and in 15.4% of control group. The CD20+ cells were detected in 44.4 % of cancer group, 43.8% of benign tumor group, and in 15.4 % of control group. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 77.3% have additional impact by CD8+ protein expression. Whereas 45.5%, 54.5% have additional impact of CD16+, CD20+ protein expression respectively

ارتباط التغايرات الوراثية لجينات نظام الدوبامين مع السلوك الاجرامي العنيف للسجناء العراقيين == Association of Dopaminergic System Genes Polymorphisms with Violent Criminal Behavior in Iraqi Prisoners

اسم المؤلف: سهاد رضا متعب الطائي
اسم المشرف: محمد عبد الله جبر جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The violent criminal behavior is emerged from the interaction between several genetics and environmental factors. The present study reflect the role of polymorphisms in dopaminergic system genes (drd2 ,comt ,dat1 ,drd4, and maoa) on violent criminal behavior in Iraqi prisoners.This research was a case - control study , blood samples were collected from 200 prisoners (case group) who convicted with terrorism (150 sample), murder (30 sample) and drug trading (20 sample) Issues selected from Al - Hilla reformist central prison for men and women in Babylon city and from position and deporting division in Karbala .This sample included (160 male and 40 female). Additionally, 100 sample were collected as control group included (54 male and 46 female).DNA was extracted and the polymorphisms analysis achieved by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP - PCR) for drd2 and comt genes ,while the dat1 ,drd4 and maoa polymorphisms was analyzed by Polymerase Chain Reaction (PCR).All polymorphisms (except drd4) were subjected to PCR - sequencing for confirming the presence of polymorphisms .The results showed that the percentage of the case group was 34.5 % with an age ranged between 20 - 39 years ,most of them were male 80% ,72.5% were married ,77.5% were from rural area ,84% were self - employed and 41.5% were illiterate .Genetic analysis of drd2 TaqIA polymorphism demonstrated that a significant increase in the genotype frequency of A1/A1 was observed in case group (p = 0.03; OR= 4.93 ; 95% CI=1.08 - 22.5) and the A1 allele frequency was significantly associated with criminal behavior (p=0.03 ;OR=1.51; 95% CI=1.04 - 2.21).The comt (Val 158 Met) polymorphism revealed that the homo - mutant genotype A/A had significant higher risk of criminal behavior (p= 0.001 ;OR= 3.98 ; 95% CI= 1.7 - 9.3) when compared with control group. and the A allele(met allele) frequency was significantly associated with case group (p=0.003; OR= 1.68; 95%CI= 1.19 - 2.37).On the other hand , the analysis of VNTR polymorphism in dat1 gene showed non - significant difference in 9/9 genotype and 9R allele frequency between the study groups (p>0.05).The VNTR polymorphism analysis for drd4 gene revealed that the criminal individual who carried 7/4 genotype was significant higher than in control group (p=0.03;OR= 2.6, 95%CI= 1.09 - 6.17), and the 7R allele frequency was significantly associated with case group (p=0.04;OR=2.06; 95%CI= 1.04 - 4.1).Finally, the maoa VNTR polymorphism was analyzed in male and female separately due to the gene location on X - chromosome .The results demonstrated that there was non - significant difference observed between all genotypes and alleles frequencies between case and control male (p> 0.05),whereas in female a significant association in 3.5/3.5 and 5.5/4.5 genotypes (p<0.01) ,additionally the 3.5 R alleles was associated with higher risk of violent criminal behavior in female (p= 0.004;OR=2.62; 95%CI=1.36 - 5.05).These results suggested that the drd2 ,comt ,drd4 and maoa in female polymorphism might increase the susceptibility of individual to engage in to crimes in the presence of certain environment risk factors.

الطريقة المثلى لاستخلاص الدنا من عينات الدم البشري == Optimization Method of DNA Extraction From Human Blood Samples

اسم المؤلف: انتصار هادي طالب اليساري
اسم المشرف: ذكرى عبد العالي الكعبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الكلمات الدلالية:
  • History of Forensic DNA
  • Sources of DNA (Evidence)
  • Bone and Teeth
  • Extraction of DNA
  • Other Method for Investigation Human DNA Profile
  • Instruments and Equipment
  • Solutions and Agarose Gel Preparation
  • Detection of β - Globin Gene by PCR Assay
  • I
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study was conducted to create an environment that mimic those samples collected from crime scenes Blood samples were collected from one hundred and twenty persons from Hila city. These samples were used to stimulate the different possible blood samples obtained for forensic medical purpose. The following simulations were created : 20 fresh blood samples, 20 frozen blood samples, 40 dried blood stain samples on carpet (20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours), and 40 samples in the form of dried blood stains on soil(20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours).Extraction of genomic DNA was attempted from the listed forms of blood samples by using four different methods : Promega purification kits, Favorgen purification kits, salting out methods, and two - step lysis assay.These methods were compared for the best extraction of DNA and were confirmed by molecular detection of β - globin gene using polymerase chain reaction (PCR) technique.After extraction of gDNA and electrophoresis by use agarose gel electrophoresis and measuring the concentration and purity of DNA by bio drop spectrophotometer. Purity was then confirmed by PCR. The results indicated that the best methods for genomic DNA isolation were from fresh, frozen ,and dried stains on carpet using Promega purification kits, whereas, from dried blood stain on soil ,none of the four methods was suitable for isolation the genomic DNA.

دراسة جزيئية ومناعية للمستقبلات TLRs المرتبطـــة بداء المــقوسات في محافظة القادسية == Molecular and immunological study of TLRs associated with Toxoplasmosis in Al - Qadisiyah province

اسم المؤلف: هديل شاكرهادي التميمي
اسم المشرف: رائد عباس كاظم | رحيم طعمة عبيس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المقوسة الكوندية طفيليات داخل خلوية تصيب نسبة كبيرة من سكان العالم. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان المستقبلات ((TLR تلعب دور مهم في الامراض الطفيلية المختلفة. وقد اجريت هذه الدراسة لتحديد الجينات TLR7 وTLR9 والسيتوكينات ذات الصلة في 125 امراة مجهضة كمجموعة بالمقارنة مع 15عينة من النساء الاصحاء (غير حوامل) و15عينة من النساء الحوامل كمجموعات سيطرة في مستشفى النسائية والاطفال في محافظة القادسية من كانون الثاني / 2015 وحتى اذار / 2016، وقد تم سحب 5 مل من عينات الدم الوريدي من النساء تحت ظروف معقمة. هناك ثلاثة جوانب في هذه الدراسة , وتضمن الجانب الاول قياس مستويات الاجسام المضادة (العدوى الكامنة والعدوى المكتسبة مؤخرا) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل . الجانب الثاني تضمن تحديد مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وproflin - 1 (PFN - 1) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل. تم الكشف عن مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وPFN - 1 في الدم باستخدام تقنية ELISA . ركز الجانب الثالث على تحديد الجينات TLR7) , (TLR9 واستخلاص الحمض النووي DNA من النساء عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). واظهرت النتائج ان معدل الانتشار المصلي IgM (العدوى الكامنة) وIgG (العدوى المكتسبة مؤخرا) الاجسام المضادة للتوكسوبلازما كانت موجبة في 55/125 حالة بنسبة ((44% و5/125 حالة بنسبة (4%) على التوالي، والانتشار المصلي للاجسام المضادة لل T.gondii في النساء المجهضات .48% ولم تسجل مصليا بشكل مختلط في هذه الدراسة، في حين كانوا النساء الاصحاء بنسبة(0%) لجميع الاجسام المضادة . وجدت علاقة ذات اهمية احصائية (P<0.05) بين الانتشار المصلي للاصابة بداء المقوسات المزمنة والعمر للنساء المجهضات ، الامراض المزمنة ، ووقت الاجهاض ، وقد اظهرت النتائج عدم وجود علاقة ذات اهمية احصائية بين الاصابة بداء المقوسات وقدرة النساء على انجاب الاطفال وتكرار الاجهاض. اكدت النتائج ان النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgG يزداد لديهم تركيز IL - 12 زيادة معنوية بالمقارنة مع مجاميع السيطرة ، في حين انه لاتوجد اي زيادة معنوية في تركيز الاجسام المضادة IgM بالمقارنة مع مجاميع السيطرة في قيمة LSD ((30.28. تركيز IFN - γ كان منخفض في النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgM ، كلا المجموعتين من النساء المجهضات لديهم انخفاض في تركيز IFN - γ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (الحوامل وغير الحوامل) . كما ان النساء المجهضات السالبات للاجسام المضادة IgM لديهم انخفاض هام في بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD (19.33).profilin - 1 البشري كان في مستوى منخفض في النساء المجهضات المصابات للاجسام المضادة IgM وIgG بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD 230.14)). ان الصورة الجينية لجينات TLRs قد اوضح ان TLR7 وTLR9 كانا بنسبة 89.7%)), 84.1%)) على التوالي .كذلك النتائج وضحت وجود بعض التباين الوراثي (TLR7 وTLR9 الجينات) في النساء المجهضات مقارنة مع السيطرة، وهذا يعني وجود طفرات في الجينات للمرضى. | Toxoplasma gondii is an intracellular parasite infected large proportion of the world population. Many of studies have shown the critical part of TLRs in different parasitic diseases. The present study were performed to detect TLRs 7 and TLRs 9 genes and related cytokines in 125 aborted women as case group and 30 healthy women (15 non pregnant and 15 pregnant women) as control groups in the Maternity and children Hospital in the Al - Qadisiyah province from December 2015 till March 2016, Five milliliter of venous blood sample were obtained from each woman under sterile condition. Three aspects were involved in this study; the first aspect included the measurement of sera antibodies (IgG& IgM) in the aborted women and control and study epidemiological aspects for T. gondii infection. The second aspect determined the levels of cytokines (IL - 12 Pg./ml , IFN - γ Pg./ml) and human proflin - 1 (PFN - 1 Pg./ml) in the sera of aborted women and control. The levels of cytokines (IL - 12 , IFN - γ) and PFN - 1 in blood were detected by using ELISA principle. The third aspect focused on detection of TLR7 gene and TLR9 gene in extraction DNA of aborted women and control (non pregnant and pregnant women) by Polymerase Chain Reaction (PCR). The outcomes demonstrated the seroprevalence of IgG (latent infection) and IgM (recently acquired infection) anti - Toxoplasma antibodies were positive in 55/125 cases (44%) and 5/125 cases (4%) respectively, however the Overall Seroprevalence of anti - T.gondii antibodies in aborted women was 48%. Mixed seropositive for IgG and IgM were not recorded in the present study, whereas the control were 0% for all antibodies. Significant relationship (P< 0.05) was found between the seroprevalence of T.gondii as ( chronic infection , age groups of the aborted women, several chronic diseases and abortion time). The results showed no statistically significant association between Toxoplasma infection and the ability of women to have children and frequency of abortions. The results confirmed that the aborted women with positive IgG antibody have significant increase in IL - 12 concentration in comparison with control , while no significant increase in IgM in comparison with control groups at LSD value ( 30.28). The concentrations of IFN - γ were lower in positive IgM aborted women than IgG , both groups of aborted women have significant decreased in comparison with pregnant control. While IgM patients have significant decreased in comparison with pregnant and healthy control group at LSD value (19.33). The human profilin - 1 levels were lowered in infected aborted women with IgG and IgM antibodies in comparison with pregnant and healthy control at LSD value ( 230.14). The genetic profils of genes TLRs have explained that TLR7 and TLR9 were (89.1 %) , (84.7 %), Respectively in aborted women. The results illustrated the presence of some genetic variation (TLR7 and TLR9 gene) in aborted women compared with the control, and this means having mutations in the patients gene.

توصيف المركبات الفعالة في نبات الشويل Cressa cretica L. وتاثيرها في الفطريات المعزولة من التهاب الاذن الخارجية == Characterization of bioactive compounds in Cressa cretica L. and their effect on fungal otomycosis

اسم المؤلف: اسيل محمد عمران الطائي
اسم المشرف: نداء عدنان ابو سراج | ابتهال معز الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to investigate the phytochemical components and antifungal activity of Cressa cretica L. using Gas chromatography - Mass spectrum (GC - MS) and Fourier transform infrared spectrophotometer (FTIR) techniques in addition to the characterization ( morphological and molecular) of fungal ear infection (otomycosis) and evaluate the antifungal activity (in vitro) of the C. cretica bioactive extracts. The secondary metabolites analysis of C.cretica extracts revealed the presence of phenols, alkaloids, terpenes, flavonoids, glycosides and tannins. The results of GC - MS reported 112 chemical compounds (30 in flowers, 34 in leaves, 23 in stems and 25 in roots). The results of the FTIR confirmed the presence of large numbers of functional groups in each part of the plant and these functional groups which varied according to the solvent type. More of these functional groups were alcohols, phenols, alkanes, alkyl halides, aldehydes, carboxylic acids, aromatics, nitro compounds and amines. The results were designed according to factorial experiments with complete randominal designed. Clinical diagnosis of otomycosis fungi revealed that there are 126 positive casesout of 185 cases included the filamentous fungi Aspergillus niger, A. flavus, A. terreuss, Penicilleum digitatium, either yeasts have included Candida parapsilosis, C. albicans, C. glabrata , C. Krusie. The percentage of Candida was 53.63% while the percentage of filamentous fungi was 46.36%, males was more infected than females, the age group 11 - 20 years old appear more affected than other age groups (19.8%), while the age group 31 - 40 years old and those who are older than 61 years were the least affected. Antifungal activity of C. cretica extracts revealed that each species of Candida had been affected by a part more than others, as well as a certain type of solvents, as follow : C. Parapsilosis largely affected by flowers extract when solvent hexane was used (the diameter of inhibition zone was 10.33 mm) at the concentration of 50%, while the C. albicans was most affected by whole plant when used ethyl acetate solvent (the diameter of inhibition zone was 10.92 mm). Stems extract by using hexane solvent was the most inhibitory growth effect on C. glabrata (the diameter of inhibition zone was 10.8 mm), while the roots extract by using methanol solvent showed largest inhibition on C. krusie growth (the diameter of inhibition zone was 8.56 mm). Minimum inhibitory concentration (MIC) reached to 25% on C. glabrata and C. krusie when using hexane stems extract and methanol roots extract respectively, while C. parapsilosis and C. albicans had reached the minimum inhibitory concentration to 30% when using hexane flowers extract and ethyl acetate whole plant extract.The results revealed that the alkaloids extract are the most effect against all species of Candida under study, the inhibition zone for C. parapsilosis was 4 mm diameters and 3.6 mm for C. albicans , 3.2 mm for C.glabrata and 5.2mm for C. krusie, followed by phenols extracts and terpens with the exception of C. albicans since terpenes extract had been more affected than phenols extracted, and this effect was increased with increasing the concentration of extract. When the C. cretica compared with the antifungal (Fluconazole) the results showed that the effect of extracts had greater inhibitory effect against otomycosis fungi, where the greatest impact of fluconazole was 8.23 mm at concentration 50% in the treatment of C. glabrata, and had the little inhibitory effect on the growth of C. krusie where the diameter of inhibition zone was 0.53 mm at the concentration 50%, and that the inhibitory effect increases with increasing concentration, while roots alkaloids gave inhibitory effect reached to 5.2 mm on C. krusie .
1 ... 309 310 311 312 313 ... 470