عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 3,675

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

اسم المؤلف: ايمان جواد كاظم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.

تقييم تحديد عينات دم الانسان المخلوطه باستخدام تقنيه PCR == Forensic Molecular Study of Fungemia Using ITS Region

اسم المؤلف: علي حميد مجيد الاسدي
اسم المشرف: محمد جواد الجصاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمكن ان يكون لطريقه تفاعل البلمره المتسلسل دور فعال في المحكمه لابراز الادله الثبوتيه او النافيه خاصه بعد تحديد السلالات الفطريه التي تعطي معلومات عن المنطقه الجغرافيه ومصدر الاصابه سواء كان من مصادر حيوانيه او عمليه ارهابيه تستهدف المجتمع باستخدام عوامل ميكروبيه.اهداف الدراسهاهمية الدراسة الحالية هي لتقييم التحقيق الجزيئي للاصابة الفطرية بستخدام تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل باستخدام البوادئ ITS1 ,ITS4 والتي تساعد في التفريق بين دم الانسان المخلوط ودورها في دور محتمل لتورط الشخص في القضية الجنائية. تحديد مدى الاصابة الفطرية في الحيوانات التي قد يكون لها دور باعتبارها مصدر لتفشي وباء والذي يتطلب اتخاذ اجراءات سريعه للحد من انتشار المرض وطمانه المجتمع بان الوباء تحت السيطره.طريقه العملتم جمع 70 عينه دم في انابيب حاويه على ماده EDTA تتظمن 20 عينة من اشخاص اصحاء لا تظهر عليهم اعراض مرضيه و20 خروف و20 دجاجه و10 اشخاص يعانون من سرطان الدم. تم فحص العينات من ناحيه احتوائها على اصابه فطريه باستخدام الطرق المزرعيه والجزيئيه. بعض عينات الدم تم خلطها لتقييم مدى دور التحري عن الاصابه الفطريه في تحديد وجود الشخص المصاب ضمن مسرح الجريمه.النتائجلم تظهرت اي نتيجه ايجابيه عند زراعة عينات الدم المختلفة على اطباق المزرعة الغنية حتى بعد حضنها لمدة اسبوع . اظهرت نتائج تحليل تفاعل البلمره المتسلسل لمنطقه ITS باستخدام بادئات خاصه بالفطريات, ان الاصابه الفطريه الجهازيه لدى الاشخاص الذين يعانون من سرطان الدم بلغت 70% بسبب ضعف المناعه لديهم بالمقارنه مع الاشخاص الاصحاء الذين بلغت لديهم نسبه الاصابه 30% مما يدل على احتمال حدوث حاله تفشي لمرض فطري من خلال التعامل المباشر مع الحيوانات مثل الدواجن او الخراف الذين ظرت نسبه الصابه بهم 40% و20% على التوالي او من مصادر اخرى خاصه مع زياده نسبه الصابه في العينات البشريه بالمقارنه مع العينات الحيوانيه.تظهر نتائج الترحيل الكهربائي في الهلام لنواتج تفاعل البلمره المتسلسل خليط من العينات الدم الانسان التي نستطيع التفريق بين الاجابية والسلبية , تشير هذه النتائج الى احتمال تورط الشخص مع الدم الملوث في حالة الجريمة يمكن استخدامها كعلامة داعمة في تحقيقات الطب العدلي الاستنتاجان تقنية تفاعل البلمره المتسلسل تعطي نتائج قيمة في التفريق بين عينات دم بشريه مختلطه من خلال الكشف العدوى الفطرية حسب المنطقة تضخيم ITS التي قد تكون بمثابة فكرة اساسية داعمة في تحقيقات الطب الشرعي. اضف الى ذلك، انه يعطي مؤشرا على وجود عدوى حيوانية المصدر و/ او عمل ارهابي محتمل.

دراسة جزيئية ومناعية كيميائية لانسجة عنق الرحم المصابه بفايروس الورم الحليمي البشري == Molecular and Immunohistochemical Study of Uterine Cervical Tissues Infected with Human Papilloma Virus

اسم المؤلف: الهام جواد كاظم بلال
اسم المشرف: ازهار عمران لطيف الذهب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: Human papillomavirus (HPV) is a DNA virus. It is the main etiological factor for progress of cervical precancerous and cancerous lesions. In order to develop a cancer from dysplasia to invasive carcinoma, a series of cellular changes should occur. As genital HPV carries oncogenes involving in these critical changes, currently HPV has been considered the most important risk factor of cervical cancer.This study was designed as case control study. In the retrospective part of these study a total number of (56) formalin - fixed, paraffin embedded cervical tissues was involved were submitted to ISH and IHC technique 27 with Cervical Carcinoma (CC) and 16 with benign cervical tumors. Thirteen (13) apparently healthy cervical tissues were used as a control group .The age of this individuals (patients and control groups) was ranged between 23 and 73 years. Samples collected from the pathological archives of different general hospital as well as many private laboratories. Specimens belong to the period from January 2009 to September 2015. After sectioning of these cervical biopsies and staining by hematoxyline and eosin, a final definitive histopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist.In the cross - section part of this study seventy two female patients taken from different general hospitals. Cytological examinations were performed for their Pap - smeared and a final definitive cytopathological diagnosis was done by a consultant histopathologist. According to their main cytological finding cervical cellular scrapes were divided into three cytological groups : cervicitis with squamous intraepithelial lesions, cervicitis without squamous intraepithelial lesions and healthy group. The DNA isolated from a representative cytological specimen was investigated by real - tim PCR analysis for the detection and genotyping of high/risk HPV DNA.The obtained results are summarized as follows : - The age range distribution mostly in age group (23 - 73 years), the most affected age group in malignant and benign cervical tumor was (52 - 67) , (36 - 51) years which constituted 55.6%(15 out of 27 cases), 50% (8 out of 16 cases) with mean age (54 ± 11.22), (38.8 ± 9.85) respectively, while (20 - 35 years) is the most affected age group in control cases were constituting 53.8% (7 out of 13 cases) with mean age (35.5 ± 8.64 ) . - The most common histopathological type among all studied archived cervical tissues was squamous cell carcinoma (66.6%), followed by the adenocarcinoma (33.3%). - The well differentiated grade of CC constituted 52%, whereas those with moderately and poorly differentiated grades CC constituted 37%and 11% respectively. - The percentage of HrHPV31/33 DNA was detected as follows : in 55.6 % of tissues from cervical cancers, 43.7% in the tissues from benign cervical tumors, while, no HrHPV31/33 positive - ISH reaction was detected in healthy cervical tissues of the control group. - The percentage of LrHPV6/11 DNA was detected as follows : in 33.3 % of tissues from cervical cancers, 31.3% in the tissues from benign cervical tumors, while, the percentage of LrHPV6/11 show negative - ISH reaction in healthy control group of cervical tissues. - The highest positive result for ISH of HPV31/33 found in squamous cell carcinoma 72.2% and in adenocarcinoma was 22.2% while the percentage of HPV6/11detection according to cancer type was 50% found in squamous cell carcinoma while 0.0% in the type of adinocarcinoma. - The highest percentage of HPV31/33 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 70% (7 out of 10 cases) show in moderately differentiated, followed by 57.1% (8 out of 14 cases ) in well differentiated , and none of poorly differentiated showpositive signal . - The highest percentage of HPV6/11 detected in relation with tumor grade depending on the differentiated of cells was 42,9 % (6 out of 14 cases) show in well differentiated, followed by 30% (3 out of 10 cases ) in moderately differentiated , and none of poorly differentiated show positive signal . - The highest percentage of co - infection with High risk HPV31/33 and Low risk of HPV6/11 types was (22.2%) in malignant cervical tumor group. While in benign cervical tumor and healthy control was 18.8% and 0.0% respectively. - The highest percentage of HPV DNA detection by Rt - PCR was 80% (16 out of 20 cases) within group of cervicitis with SIL, 16.7% (5 out of 30 cases) in group of cervicitis without SIL, while none of control group shoes positive result. - Phylogenetic tree analysis image, results that local HPV amplicon(S1, 3, 5, 7, 9, 12, 14, 15, 16, 17, 18, 20) show closed related to NCBI - Blast HPV type 16 (KMO58666.1), the local HPV isolates (S2, 4, 6, 11 and 19) show closed related to NCBI - Blast HPV type 18 (KC470225.1), whereas the local HPV isolates (S10 and 13) show closed related to NCBI - blast HPV type 33 (EU918766.1), the local HPV isolates (S8) show closed related to NCBI - Blast HPV type 45 (KC470260.1). - Retinoblastoma protein overexpression was detected by IHC test in 59.3% of malignant cervical tumors, 43.8% of benign cervical tumors but no signal was reported in the tissues of control group. In the malignant cervical tumors group, 43.6% has strong score (score III), whereas 37.5% and 18.8% has moderate score (score II) and low score (score I) respectively. While, in benign cervical tumor group, 57.1% were found tohave moderate score (score II) , 28.6% and 14.3% have strong score (score III) and low score (score I) respectively. - P16 protein overexpression was detected by IHC test in 63% of malignant cervical tumors, 56.3% of benign cervical tumors while none of positive result was reported in the tissues of control group. - The highest positive result for IHC of Rb and P16 according to cancer type was found in squamous cell carcinoma 61.1% and 72.2%, respectively, while there percentage in adenocarcinoma was 55.6% and 44.5%, respectively. - The highest percentage of Rb protein expression was found within poorly differentiated that have 100% (3 out of 3 cases) .Followed by 70% (7 out of 10 cases) and 42.9 % (6 out of 14 cases) within moderately and well differentiated respectively. - The highest percentage was 100 % (3 out of 3 cases), 64.3%(9 out of 14 cases), 50% (5 out of 10 cases) of cervical cancer tissues that showed IHC reaction for P16 protein have poorly, well and moderately differentiated respectively. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 100% and 77.3% have additional impact by P16 and Rb protein expression respectively. - Immunohistochemical examination of cervical tumor tissues for CD8+,CD16+ and CD20+ cell surface markers, revealed that CD8+cells the percentage of detection was 66.7% in cervical cancer group, 62.5% in benign cervical tumor group and 23.1% in control group. Also, CD16+ was detected in 29.6% of cervical cancer group, 31.3% of benign cervical tumor group and in 15.4% of control group. The CD20+ cells were detected in 44.4 % of cancer group, 43.8% of benign tumor group, and in 15.4 % of control group. - Among 22 cervical cancer tissues that showed infection with high oncogenic risk - HPV31/33 genotypes 77.3% have additional impact by CD8+ protein expression. Whereas 45.5%, 54.5% have additional impact of CD16+, CD20+ protein expression respectively

ارتباط التغايرات الوراثية لجينات نظام الدوبامين مع السلوك الاجرامي العنيف للسجناء العراقيين == Association of Dopaminergic System Genes Polymorphisms with Violent Criminal Behavior in Iraqi Prisoners

اسم المؤلف: سهاد رضا متعب الطائي
اسم المشرف: محمد عبد الله جبر جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The violent criminal behavior is emerged from the interaction between several genetics and environmental factors. The present study reflect the role of polymorphisms in dopaminergic system genes (drd2 ,comt ,dat1 ,drd4, and maoa) on violent criminal behavior in Iraqi prisoners.This research was a case - control study , blood samples were collected from 200 prisoners (case group) who convicted with terrorism (150 sample), murder (30 sample) and drug trading (20 sample) Issues selected from Al - Hilla reformist central prison for men and women in Babylon city and from position and deporting division in Karbala .This sample included (160 male and 40 female). Additionally, 100 sample were collected as control group included (54 male and 46 female).DNA was extracted and the polymorphisms analysis achieved by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP - PCR) for drd2 and comt genes ,while the dat1 ,drd4 and maoa polymorphisms was analyzed by Polymerase Chain Reaction (PCR).All polymorphisms (except drd4) were subjected to PCR - sequencing for confirming the presence of polymorphisms .The results showed that the percentage of the case group was 34.5 % with an age ranged between 20 - 39 years ,most of them were male 80% ,72.5% were married ,77.5% were from rural area ,84% were self - employed and 41.5% were illiterate .Genetic analysis of drd2 TaqIA polymorphism demonstrated that a significant increase in the genotype frequency of A1/A1 was observed in case group (p = 0.03; OR= 4.93 ; 95% CI=1.08 - 22.5) and the A1 allele frequency was significantly associated with criminal behavior (p=0.03 ;OR=1.51; 95% CI=1.04 - 2.21).The comt (Val 158 Met) polymorphism revealed that the homo - mutant genotype A/A had significant higher risk of criminal behavior (p= 0.001 ;OR= 3.98 ; 95% CI= 1.7 - 9.3) when compared with control group. and the A allele(met allele) frequency was significantly associated with case group (p=0.003; OR= 1.68; 95%CI= 1.19 - 2.37).On the other hand , the analysis of VNTR polymorphism in dat1 gene showed non - significant difference in 9/9 genotype and 9R allele frequency between the study groups (p>0.05).The VNTR polymorphism analysis for drd4 gene revealed that the criminal individual who carried 7/4 genotype was significant higher than in control group (p=0.03;OR= 2.6, 95%CI= 1.09 - 6.17), and the 7R allele frequency was significantly associated with case group (p=0.04;OR=2.06; 95%CI= 1.04 - 4.1).Finally, the maoa VNTR polymorphism was analyzed in male and female separately due to the gene location on X - chromosome .The results demonstrated that there was non - significant difference observed between all genotypes and alleles frequencies between case and control male (p> 0.05),whereas in female a significant association in 3.5/3.5 and 5.5/4.5 genotypes (p<0.01) ,additionally the 3.5 R alleles was associated with higher risk of violent criminal behavior in female (p= 0.004;OR=2.62; 95%CI=1.36 - 5.05).These results suggested that the drd2 ,comt ,drd4 and maoa in female polymorphism might increase the susceptibility of individual to engage in to crimes in the presence of certain environment risk factors.

الطريقة المثلى لاستخلاص الدنا من عينات الدم البشري == Optimization Method of DNA Extraction From Human Blood Samples

اسم المؤلف: انتصار هادي طالب اليساري
اسم المشرف: ذكرى عبد العالي الكعبي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الادلة الجنائية
الدرجة: دبلوم عالي
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الكلمات الدلالية:
  • History of Forensic DNA
  • Sources of DNA (Evidence)
  • Bone and Teeth
  • Extraction of DNA
  • Other Method for Investigation Human DNA Profile
  • Instruments and Equipment
  • Solutions and Agarose Gel Preparation
  • Detection of β - Globin Gene by PCR Assay
  • I
الصفحات الاولى:
المستخلص: his study was conducted to create an environment that mimic those samples collected from crime scenes Blood samples were collected from one hundred and twenty persons from Hila city. These samples were used to stimulate the different possible blood samples obtained for forensic medical purpose. The following simulations were created : 20 fresh blood samples, 20 frozen blood samples, 40 dried blood stain samples on carpet (20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours), and 40 samples in the form of dried blood stains on soil(20 samples collected after 2 hours & 20 samples collected after 3 hours).Extraction of genomic DNA was attempted from the listed forms of blood samples by using four different methods : Promega purification kits, Favorgen purification kits, salting out methods, and two - step lysis assay.These methods were compared for the best extraction of DNA and were confirmed by molecular detection of β - globin gene using polymerase chain reaction (PCR) technique.After extraction of gDNA and electrophoresis by use agarose gel electrophoresis and measuring the concentration and purity of DNA by bio drop spectrophotometer. Purity was then confirmed by PCR. The results indicated that the best methods for genomic DNA isolation were from fresh, frozen ,and dried stains on carpet using Promega purification kits, whereas, from dried blood stain on soil ,none of the four methods was suitable for isolation the genomic DNA.

دراسة جزيئية ومناعية للمستقبلات TLRs المرتبطـــة بداء المــقوسات في محافظة القادسية == Molecular and immunological study of TLRs associated with Toxoplasmosis in Al - Qadisiyah province

اسم المؤلف: هديل شاكرهادي التميمي
اسم المشرف: رائد عباس كاظم | رحيم طعمة عبيس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المقوسة الكوندية طفيليات داخل خلوية تصيب نسبة كبيرة من سكان العالم. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان المستقبلات ((TLR تلعب دور مهم في الامراض الطفيلية المختلفة. وقد اجريت هذه الدراسة لتحديد الجينات TLR7 وTLR9 والسيتوكينات ذات الصلة في 125 امراة مجهضة كمجموعة بالمقارنة مع 15عينة من النساء الاصحاء (غير حوامل) و15عينة من النساء الحوامل كمجموعات سيطرة في مستشفى النسائية والاطفال في محافظة القادسية من كانون الثاني / 2015 وحتى اذار / 2016، وقد تم سحب 5 مل من عينات الدم الوريدي من النساء تحت ظروف معقمة. هناك ثلاثة جوانب في هذه الدراسة , وتضمن الجانب الاول قياس مستويات الاجسام المضادة (العدوى الكامنة والعدوى المكتسبة مؤخرا) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل . الجانب الثاني تضمن تحديد مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وproflin - 1 (PFN - 1) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل. تم الكشف عن مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وPFN - 1 في الدم باستخدام تقنية ELISA . ركز الجانب الثالث على تحديد الجينات TLR7) , (TLR9 واستخلاص الحمض النووي DNA من النساء عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). واظهرت النتائج ان معدل الانتشار المصلي IgM (العدوى الكامنة) وIgG (العدوى المكتسبة مؤخرا) الاجسام المضادة للتوكسوبلازما كانت موجبة في 55/125 حالة بنسبة ((44% و5/125 حالة بنسبة (4%) على التوالي، والانتشار المصلي للاجسام المضادة لل T.gondii في النساء المجهضات .48% ولم تسجل مصليا بشكل مختلط في هذه الدراسة، في حين كانوا النساء الاصحاء بنسبة(0%) لجميع الاجسام المضادة . وجدت علاقة ذات اهمية احصائية (P<0.05) بين الانتشار المصلي للاصابة بداء المقوسات المزمنة والعمر للنساء المجهضات ، الامراض المزمنة ، ووقت الاجهاض ، وقد اظهرت النتائج عدم وجود علاقة ذات اهمية احصائية بين الاصابة بداء المقوسات وقدرة النساء على انجاب الاطفال وتكرار الاجهاض. اكدت النتائج ان النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgG يزداد لديهم تركيز IL - 12 زيادة معنوية بالمقارنة مع مجاميع السيطرة ، في حين انه لاتوجد اي زيادة معنوية في تركيز الاجسام المضادة IgM بالمقارنة مع مجاميع السيطرة في قيمة LSD ((30.28. تركيز IFN - γ كان منخفض في النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgM ، كلا المجموعتين من النساء المجهضات لديهم انخفاض في تركيز IFN - γ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (الحوامل وغير الحوامل) . كما ان النساء المجهضات السالبات للاجسام المضادة IgM لديهم انخفاض هام في بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD (19.33).profilin - 1 البشري كان في مستوى منخفض في النساء المجهضات المصابات للاجسام المضادة IgM وIgG بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD 230.14)). ان الصورة الجينية لجينات TLRs قد اوضح ان TLR7 وTLR9 كانا بنسبة 89.7%)), 84.1%)) على التوالي .كذلك النتائج وضحت وجود بعض التباين الوراثي (TLR7 وTLR9 الجينات) في النساء المجهضات مقارنة مع السيطرة، وهذا يعني وجود طفرات في الجينات للمرضى. | Toxoplasma gondii is an intracellular parasite infected large proportion of the world population. Many of studies have shown the critical part of TLRs in different parasitic diseases. The present study were performed to detect TLRs 7 and TLRs 9 genes and related cytokines in 125 aborted women as case group and 30 healthy women (15 non pregnant and 15 pregnant women) as control groups in the Maternity and children Hospital in the Al - Qadisiyah province from December 2015 till March 2016, Five milliliter of venous blood sample were obtained from each woman under sterile condition. Three aspects were involved in this study; the first aspect included the measurement of sera antibodies (IgG& IgM) in the aborted women and control and study epidemiological aspects for T. gondii infection. The second aspect determined the levels of cytokines (IL - 12 Pg./ml , IFN - γ Pg./ml) and human proflin - 1 (PFN - 1 Pg./ml) in the sera of aborted women and control. The levels of cytokines (IL - 12 , IFN - γ) and PFN - 1 in blood were detected by using ELISA principle. The third aspect focused on detection of TLR7 gene and TLR9 gene in extraction DNA of aborted women and control (non pregnant and pregnant women) by Polymerase Chain Reaction (PCR). The outcomes demonstrated the seroprevalence of IgG (latent infection) and IgM (recently acquired infection) anti - Toxoplasma antibodies were positive in 55/125 cases (44%) and 5/125 cases (4%) respectively, however the Overall Seroprevalence of anti - T.gondii antibodies in aborted women was 48%. Mixed seropositive for IgG and IgM were not recorded in the present study, whereas the control were 0% for all antibodies. Significant relationship (P< 0.05) was found between the seroprevalence of T.gondii as ( chronic infection , age groups of the aborted women, several chronic diseases and abortion time). The results showed no statistically significant association between Toxoplasma infection and the ability of women to have children and frequency of abortions. The results confirmed that the aborted women with positive IgG antibody have significant increase in IL - 12 concentration in comparison with control , while no significant increase in IgM in comparison with control groups at LSD value ( 30.28). The concentrations of IFN - γ were lower in positive IgM aborted women than IgG , both groups of aborted women have significant decreased in comparison with pregnant control. While IgM patients have significant decreased in comparison with pregnant and healthy control group at LSD value (19.33). The human profilin - 1 levels were lowered in infected aborted women with IgG and IgM antibodies in comparison with pregnant and healthy control at LSD value ( 230.14). The genetic profils of genes TLRs have explained that TLR7 and TLR9 were (89.1 %) , (84.7 %), Respectively in aborted women. The results illustrated the presence of some genetic variation (TLR7 and TLR9 gene) in aborted women compared with the control, and this means having mutations in the patients gene.

توصيف المركبات الفعالة في نبات الشويل Cressa cretica L. وتاثيرها في الفطريات المعزولة من التهاب الاذن الخارجية == Characterization of bioactive compounds in Cressa cretica L. and their effect on fungal otomycosis

اسم المؤلف: اسيل محمد عمران الطائي
اسم المشرف: نداء عدنان ابو سراج | ابتهال معز الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to investigate the phytochemical components and antifungal activity of Cressa cretica L. using Gas chromatography - Mass spectrum (GC - MS) and Fourier transform infrared spectrophotometer (FTIR) techniques in addition to the characterization ( morphological and molecular) of fungal ear infection (otomycosis) and evaluate the antifungal activity (in vitro) of the C. cretica bioactive extracts. The secondary metabolites analysis of C.cretica extracts revealed the presence of phenols, alkaloids, terpenes, flavonoids, glycosides and tannins. The results of GC - MS reported 112 chemical compounds (30 in flowers, 34 in leaves, 23 in stems and 25 in roots). The results of the FTIR confirmed the presence of large numbers of functional groups in each part of the plant and these functional groups which varied according to the solvent type. More of these functional groups were alcohols, phenols, alkanes, alkyl halides, aldehydes, carboxylic acids, aromatics, nitro compounds and amines. The results were designed according to factorial experiments with complete randominal designed. Clinical diagnosis of otomycosis fungi revealed that there are 126 positive casesout of 185 cases included the filamentous fungi Aspergillus niger, A. flavus, A. terreuss, Penicilleum digitatium, either yeasts have included Candida parapsilosis, C. albicans, C. glabrata , C. Krusie. The percentage of Candida was 53.63% while the percentage of filamentous fungi was 46.36%, males was more infected than females, the age group 11 - 20 years old appear more affected than other age groups (19.8%), while the age group 31 - 40 years old and those who are older than 61 years were the least affected. Antifungal activity of C. cretica extracts revealed that each species of Candida had been affected by a part more than others, as well as a certain type of solvents, as follow : C. Parapsilosis largely affected by flowers extract when solvent hexane was used (the diameter of inhibition zone was 10.33 mm) at the concentration of 50%, while the C. albicans was most affected by whole plant when used ethyl acetate solvent (the diameter of inhibition zone was 10.92 mm). Stems extract by using hexane solvent was the most inhibitory growth effect on C. glabrata (the diameter of inhibition zone was 10.8 mm), while the roots extract by using methanol solvent showed largest inhibition on C. krusie growth (the diameter of inhibition zone was 8.56 mm). Minimum inhibitory concentration (MIC) reached to 25% on C. glabrata and C. krusie when using hexane stems extract and methanol roots extract respectively, while C. parapsilosis and C. albicans had reached the minimum inhibitory concentration to 30% when using hexane flowers extract and ethyl acetate whole plant extract.The results revealed that the alkaloids extract are the most effect against all species of Candida under study, the inhibition zone for C. parapsilosis was 4 mm diameters and 3.6 mm for C. albicans , 3.2 mm for C.glabrata and 5.2mm for C. krusie, followed by phenols extracts and terpens with the exception of C. albicans since terpenes extract had been more affected than phenols extracted, and this effect was increased with increasing the concentration of extract. When the C. cretica compared with the antifungal (Fluconazole) the results showed that the effect of extracts had greater inhibitory effect against otomycosis fungi, where the greatest impact of fluconazole was 8.23 mm at concentration 50% in the treatment of C. glabrata, and had the little inhibitory effect on the growth of C. krusie where the diameter of inhibition zone was 0.53 mm at the concentration 50%, and that the inhibitory effect increases with increasing concentration, while roots alkaloids gave inhibitory effect reached to 5.2 mm on C. krusie .

التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة == Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city

اسم المؤلف: زهراء محمد وناس
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.

العزل والتشخيص الجزيئي للفطريات المعزولة من التربة المنتجة للمواد الايضية المضادة للميكروبات == Isolation and Molecular Identification of Antimicrobial Metabolites Producing Fungal Isolated from Soil

اسم المؤلف: سرى رحمن نوار المسافر
اسم المشرف: نداء شهاب حمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم للبنات / جامعة بابل للتحري عن الفطريات المنتجة للمركبات الضد ميكروبية في تربة محافظه بابل للمدة من ايلول ,2015 الى ايلول ,2016 . حيث جمعت عينات التربة من مناطق مختلف وشملت الترب الزراعية والترب الغير مزروعة كذلك الترب الملحية وترب الشاطئ والترب الصناعية ,تم تنقية 200 عزله فطرية عشوائيا واختبرت قدرتها التضادية مع عدد من الاحياء المجهرية الممرضة لتحديد قدرتها الانتاجيه .تم اختبار 200 عزلة فطرية بواسطة المسح الاولي لتحديد قابليتها على تثبيط البكتريا الممرضة السالبة والموجبة والفطريات المرضية خارج الوسط الحي .بينت نتائج التضاد ان 72 عزلة كانت قادره على تثبيط 3≤ من الكائنات الممرضة وقد اختبرت هذه العزلات لتحديد انتاجيتها للحوامض حيث وجد ان 13 فقط كانت غير منتجه و59 عزله منتجه بنسب مختلفة .استثنيت العزلات المنتجة للحوامض من الدراسة لان نسبه الحامض ادت الى قتل الاحياء المجهرية الممرضة . اما العزلات غير المنتجة فقد اختيرت منها العزلات الاكثر فعالية في التثبيط وذات مدى تثبيطي واسع . تم تشخيص العينات الفطرية مظهريا باستخدام المجهر الالكتروني واوساط زرعيه تشخيصية مختلفة ,اما التشخيص الجزيئي للعزلات فقد تم باستخدام البادئ العامITS1و ITS4 لتضخيم منطقة Internal transcribed spacer ,حيث بينت نتائج التشخيص المظهري والجزيئي للعزلات بانها تعود للجنسين Aspergillus fumigates وTrichoderma longibrachiatum. اما نتائج فحص الحساسية فقد اوضحت ان العزلتين 104وS4 هما الاقوى في الانتاج على وسط مخلفات البطاطا الصلب بالمقارنه مع الاوساط السائلة وتحت ضروف مثلى من درجة حراره واس هايدروجيني وزمن انتاج .بينت النتائج بان المركبات المعزوله كانت ذات تاثير واسع الطيف ضد مجموعة من البكتريا الموجبه والسالبة لصبغة كرام لذالك تم اختبار فعاليتها ضد مجموعة من الخمائر والاعفان الممرضه للانسان والمعزوله من مختبرات مستشفيات محافظة بابل.عند مقارنه النتائج التي تم الحصول عليها مع نتائج المضادات الصيدلانية وجد ان تاثير المضاد المنتج يفوق تاثير كل من Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, بصورة كبيرة بالاضافة الى تاثيرها على مجموعة من الاعفان الممرضة. اما اعلى قطر تثبيط تم الحصول علية يعود للعزلة S4 ضد البكتريا Bacillus seraus بقطر 43.35mm بعد تنمية الفطر على وسط مخلفات البطاطا الصلب لمدة 9 ايام بدرجه حراره 30 ◦م. وهو اعلى من قطر تثبيط المضاد Meropenem ضد البكتريا المذكوره.تضمنت الدراسة جوانب اخرى وهي استخلاص المركبات الفعالة من وسط التخمر باستخدام خلات الاثيل والماء المقطر ثم تنقيه المركب باستخدام تقنية كروماتوكرافيا الطبقة الرقيقة .كذلك تم تشخيص المركبات الفعالة باستخدام التحاليل الكيميائيه التالية(FTIR,HNMR and CHNS ) لمعرفة المجاميع الفعالة والتركيب الكيميائي للمركبات المستخلصة. | This study is conducted in the laboratories of Science College for Women’s / University of Babylon to investigate the antimicrobial producing fungi in the soil of Babylon province from September 2015 until September 2016 . Soil samples are collected from different regions included agricultural, non - agricultural, salty, sandy and carbonate soil, purified 200 fungal isolates randomly and tested the antagonism with a number of pathogenic microorganisms . The 200 fungal isolates are tested by primary screening method to determine their ability to inhibit in vitro Pathogenic gram positive and negative bacteria and pathogenic fungi. The primary screening illustrate that 72 isolate were able to inhibition 3≤ pathogenic organisms. These isolates were tested to determine the acid productivity which found that only 13 were non - acid production and 59 isolate are product in different concentration. The acids producing isolates are excluded from the study because the rate of acid led to killing of test pathogenic microorganism .The selected isolates are non - acid productive and most effective in the inhibition of test pathogenic microorganism with a wide range. The samples are morphologically identified using the electron microscope and different diagnostic agricultural media (PDA, CYA, MEA), either molecular diagnosis of isolates have been using ITS1 and, ITS4 primer to amplify the Internal transcribed spacer region, the morphological and molecular identification results of the isolates showed that it belongs to Aspergillus fumigatus and Trichoderma longibrachiatum. The sensitivity results illustrate that the isolates 104 and S4 are the strongest in the production on potatoes peals solid media in compared with liquid residues media under the optimal production condition including temperature, hydrogen power and time of production. Results show that the isolated antimicrobial compounds were broad - spectrum against both G+ve and G - ve bacteria so it has been tested its effectiveness against a group of pathogenic yeasts and molds isolated from laboratories of Babylon hospitals.When comparing the results obtained with the results of pharmaceutical antibiotics found that the effect of the product exceeds the effect of Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, in addition to significantly impact on a range of pathogenic molds. The highest inhibition zone is obtained due to the isolation of S4 against the bacteria Bacillus seraus with diameter 43.35mm after the incubation the isolates on the potato peals solid media for 9 days at a temperature of 30 ◦C. These diameter is higher than the inhibition zone of Meropenem antibiotics against the same bacteria.Other aspects of this study include an extracted of the active compounds from the fermentation media using ethyl acetate and distilled water and then purifying the compound using thin layer chromatography(TLC) technique. Also it has been diagnosed the active compounds using the following chemical analysis (FTIR, HNMR and CHNS) to illustrated the type of effective compound.

تقدير السيروتونين, عامل تغذية الدماغ, اللبتين, الكورتيزول والتيستوستيرون عند الرجال البدناء في محافظة بابل == Determination of serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, cortisol and testosterone of obese men in Babylon province

اسم المؤلف: غدير حامد عبد الحســــن
اسم المشرف: نوران جميل ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل السمنة مشكلة صحية عالمية واسعة الانتشار من خلال تاثيراتها على مختلف وظائف الجسم وهذا ما اكدته العديد من الابحاث والدراسات التي تناولت السمنة ومدى تاثيرها على صحة الجسم وتضمنت دراستنا الحالية دراسة السمنة وعلاقتها ببعض النواقل العصبية والهرمونات الايضية وقد كانت الابحاث في هذا المجال الى حد ما قليلة. اجريت الدراسة في كلية العلوم للبنات /جامعة بابل للفترة الممتدة من تشرين الثاني 2015 ولغاية نيسان 2016 حيث تم دراسة بعض النواقل العصبية (السيروتونين 5 - HT وعامل تغذية الدماغBDNF ) وبعض الهورمونات الايضية (اللبتين والكورتيزول والتيستوستيرون ) باستخدام طريقة (ELISA) وكذلك تم تقسيم مجتمع الدراسة حسب المعايير الجسمانية حيث تم حساب وزن وطول الاشخاص ومن ثم مؤشر كتلة الجسم, العمر, ونسبة الدهون في الجسم , وقياس محيط الخصر وفق معادلات خاصة وتوضيح العلاقة بين الهورمونات والمعايير الجسمانية التي بموجبها تم تقسيم مجتمع الدراسة، حيث شملت عينة البحث 98 شخص سليم ظاهريا تتراوح اعمارهم بين 20 - 49 سنة من الرجال وفي ادناه التقسيمات الجسمانية لمجتمع الدراسة : ا - مؤشر كتلة الجسم الى ثلاثة مجاميع، الفئة الاولى شملت 54 شخص بدين و24 شخص وزن زائد و20 شخص وزن مثالي كمجموعة سيطرة. ب‌ - نسبة الدهون في الجسم الى اربعة مجاميع , فئة الرياضيين5 اشخاص، فئة الاشخاص اللذين يمتلكون لياقة بدنية3 اشخاص، فئة الاشخاص بنسبة مقبولة من الدهون 14 شخص, فئة البدينين 76 شخص.ج‌ - حسب الفئات العمرية الى ثلاثة مجاميع ، الفئة الاولى شملت 31 شخص فئة الشباب و29 شخص لفئة متوسطي العمر و38 شخص كبار السن.د‌ - حسب قياس محيط الخصر وضمت مجموعتين، الاولى (84) خصر كبير(اكبر او يساوي 90 سم) والثانية(14) خصر صغير ( اصغر من 90 سم ).واظهرت النتائج ما يلي : 1. انخفاض معنوي في مستوى هرمون السيروتونين (p<0.05) عند مجموعة الاشخاص البدينين اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى. 2. اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي ( p<0.05) في مستوى عامل تغذية الدماغ BDNF)) عند مجموعة الاشخاص البدينين مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة.3. اما اعتمادا على تقسيم الفئات العمرية فنلاحظ وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في مستوى BDNF عند الفئة العمرية لكبار السن مقارنة مع فئة الشباب.4. كما واوضحت النتائج زيادة ملحوظة لمستويات هرمون اللبتين في مصول الاشخاص البدنيين في جميع التقسيمات الجسمانية(مؤشر كتلة الجسم، نسبة الدهون، ومحيط الخصر) عند مقارنتها بمجموعة السيطرة.5. فيما اظهرت نتائج هرموني الكورتيزول والشحمون الخصوي انخفاض معنوي( p<0.05) في الاشخاص البدينين لجميع التقسيمات الجسمانية مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى . 6. اما فيما يخص الفئات العمرية فقد اوضحت النتائج وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في اللبتين وهرمون الكورتيزول في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب ,بينما اظهرت النتائج حصول انخفاض معنوي (p<0.05) في هرمون الشحمون الخصوي في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب. اما قيم السيروتونين فلا توجد فروق معنويه بين الفئات العمرية . في حين اظهرت نتائج تحليل الانحدار الخطي وجود ارتباطات ايجابية وعكسية بين المعايير الجسمانية الاربعة المقاسة (كتلة الجسم ونسبة الدهون ومحيط الخصر بالاضافة الى الفئات العمرية) مع الهورمونات المتضمنة موضوع دراستنا بالاضافة الى وجود علاقات بين الهورمونات مع بعضها البعض عند الاشخاص في المجاميع المختلفة المصنفة حسب مقاييس السمنة المذكورة سابقا. | According to recent studies, obesity have been found to be of prime risk factor for many a worldwide public health problem. However, little works have been done to study the effect of obesity in showing healthy person neuropeptide and metabolic hormone level associated with it in the regulation of important system in human body. This study was carried out in College of Science for Women in Babylon University during the period from November 2015 till April 2016, it was an evaluated study for the assessment of the obesity effect on serotonin, brain derived neurotrophic factor, leptin, cortisol, and testosterone and to investigate any relationship if found between these parameters in studying population according to measures of obesity categories. The study involves following up of 98 men at 20 - 49 years who were divided according to their anthropometric (physical) characteristics : 1 - Subjects whom were obese (54 sample), overweight (24 sample) and normal weight (20 sample) as classified according to BMI categories.2 - Subjects whom were athletes (5 samples), fitness (3 samples), acceptable (14 sample) and obese (76 sample) as classified according to body fat percentage category. 3 - Subjects whom have young - age (31 sample), middle - age (29 sample), others whom have old - age (38 sample) based on age group categories.4 - Subjects whom have waist circumference (WC≥ 90 cm) defined subjects with large WC (84 sample) other subjects have (WC< 90 cm) were considered as small WC (14 sample). The parameters in the present study were included serum neurotransmitter serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, Cortisol, and Testosterone, also the parameters were done in this study included anthropometric measurements such as; body weight, height to calculated (BMI), and WC and percentage of body fat were calculated by a special formula, also subjects age were recorded. The results show in the following : 1 - A significant decrease in the serotonin level (p<0.05) in obese subjects according to categories of obesity measurements compared with other groups.2 - The results showed a significant increase in BDNF level (p<0.05) in obese group according to categories of obesity measurements as compared with other groups of obesity measurements.3 - The study showed that increase level of BDNF in old - age group compared with young - age group.4 - The results of leptin hormone show a significant increase (p<0.05) in all obese groups in regard with categories of obesity measurements.5 - The results showed a significant decrease serum testosterone level in obese subjects in all categories of obesity measurements as comparison with other groups.6 - The results showed that variation in leptin and testosterone levels were associated with age groups difference, while there were no significant differences in serotonin level as related with age - groups difference.7 - The results of cortisol level showed a significant increase (p<0.05) in both of obese groups and normal BMI group. In addition, it was noticed that a significant positive and negative correlation among investigated hormones in subjects based on categories of obesity and between that tested hormones with anthropometric measurements.

التشخيص الجزيئي, المظهري واختبار حساسية الفطريات والبكتريا المرافقة لقشرة الشعر مختبريا لعوامل التضاد الميكروبي == Molecular, Phenotyping identification and invitro susceptibility testing in Fungi and Bacteria associated with hair dandruff to antimicrobial agents

اسم المؤلف: شيماء محمد علي وتوت
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل قشرة الراس اكثر مرض جلدي شيوعا ورغم انها غير مهلكة للحياة فلم تنل قسطا من الاهتمام والبحث على مستوى العالم ولذلك هدفت الدراسة الحالية الى عزل, تشخيص والتحري عن تاثير المضادات الفطرية على الفطريات والخمائر وكذلك عزل وتشخيص البكتريا المرافقة للقشرة الموجودة في فروة الراس ومن شعر هذه الحالات المرضية. خلال مدة الدراسة ولفترة من تشرين الاول الى حزيران 2016 حيث تم جمع 280 عينة قشرة وشعر ومسح من الحالات الموصوفة انفا واشتملت على 152عينة شعر و74 عينة قشرة و54 مسحة من فروة الراس وكذلك جمعت 30 عينة سيطرة. وكل جهد لم يشار اليه بمصدر فهو من جهد الباحث.زرعت العينات على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسيمايد وبدونه وشخصت عزلات الخمائر اوليا على وسط CHROMagar للتميز بين انواع الخمائر عن طريق الوانها. كذلك تم التحري عن الفطريات الخيطية الجلدية من خلال زراعتها على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسومايد للحصول على عزلات للفطريات الجلدية وكذلك تقييم تواجد الفطريات المترممة مع العينات قيد الدراسة وتقيم عوامل الضراوة لدى الخمائر. تشخيص الفطريات المعزولة على المستوى الجزيئي من خلال تضخيم منطقة ITS باستخدام الزوج الباديئي ITS5/ITS4وITS3/ITS4 واجراء تحليل التتابع DNA sequencing لعينات ممثلة عن المجوعات المتماثلة في اوزانها الجزيئية لمنطقة التضخيم وبعد الحصول على نتائج التضخيم تم اخذ منتج بلمرة لعزلات ممثلة وارسلت الى مختبرMicrogene في امريكا للحصول على التتابع للقواعد النتروجينية ومقارنتها مع تتابع العينات المرجعية في البنك الجيني باستخدام برنامج NCBI )Blast Nucliotide Database). ومطابقة التتابعات لتقييم التماثل والاختلاف ورسم الشجرة التطورية على اساس نتائج تحليل التتابع لتقييم مدى تقارب العزلات ضمن النوع والانواع قيد الدراسة.اظهرت نتائج التشخيص التقليدية والجزيئية باستخدام الازواج البادئية ITS5/ITS4 وITS3/ITS4 كانت اوزان الحزم لكامل منطقة ITS تتراوح بين500 - 800 زوج قاعدي. بينما تراوحت الاوزان لمنطقة ITS2 بين350 - 400زوج قاعدي.واظهرت النتائج ان الطرق الجزيئية المتقدمة هي ادوات قوية لتشخيص الفطريات مقارنة مع الطرق التقليدية. تم تسجيل عزلتين من C. sake و3 عزلة Aurobasidium iranianum وعزلة Issatchenkia orientalis وعزلة من Cryptococcus fonsecae وعزلة واحدة من Cryptococcus diffluens لاول مرة في العراق.اجراء تقييم للفعالية المايكروبية لبعض المستخلصات النباتية المهمة طبيا ومقارنتها مع المضادات الفطرية وتقييم التركيز المثبط الادنى باستخدام شريط E - Test strips .كما تم مسح الانواع البكتيرية المرافقة للعينات قيد الدراسة مجهريا وبايوكيميائيا من خلال زراعتها على الاوساط التفريقية مثل وسط Manitol salt agar ووسط Blood agar base.اظهرت عزلات المبيضات البيضاء موجبة لانتاج الانبوبة الجرثومية, النمو بوجود السايكلوهكسيمايد والنمو في درجة ˚45م. قابلية C.kruzei , C.parapsilosi وC.glabrata على تكوين الغشاء الحيوي . اما اختبار الانزيمات الحالة للدهون المفسفرة فقد كانت موجبة لعزلات C.albicans ,C.parapisilosis وC.kruzei واخيرا اضهر اختبار الانزيمات الحالة للدهون نتيجة موجبة فقط لعزلات C.albicans ,C.tropicalis وC.parapsilosis. كذلك اجريت اختبارات للفطريات الجلدية والتي تضمنت قدرة ال T.rubrum على النمو على وسط SDA with 5% of NaCl وكذلك نمو الفطريات على وسط PDA وانتاج صبغة عكسية.اظهرت النتائج ان لبعض المستخلصات المائية للنباتات تاثير مثبط على نمو الفطريات الجلدية والخمائر وكان المستخلص المائي للقرنفل اكثر فعالية في تثبيط الفطريات الجلدية وبعض الخمائر وال Rhodotorulla وبفرق معنوي ≥ 0.05 يليه الشاي الاخضر والكالبتوز والدارسين والحنة وبتركيز 8 % حيث كان اكثر تاثير من بقية التراكيز.تم اجراء اختبار الحساسية الدوائية لبعض المضادات الفطرية باستخدام E - Test strips للمضادين CAS وFLU حيث اظهرت النتائج مقاومة الفطريات الجلدية والخمائر وال Rhodotorulla للمضادين.تم عزل بكتريا Staph.aurues and Staph.epidermidisوبين اختبار ال Congo red قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي Biofilms)). واستنتجت الدراسة ان قشرة الشعر هي مشكلة الشعر المهمة العديد من الخمائر مع الشعر المتساقط معها قد تقف وراءها مجموعة من الفطريات والبكتيريا المتهمة في احداث مثل هكذا اخماج وان استخدام المستخلصات النباتية كانت مؤثرة بشكل معنوي في اختزال نمو الفطريات التي تم اختبارها تحت تاثير هذه النواتج الطبيعية وبغياب الفعالية الدوائية لافضل المضادات الفطرية مثل الفلوكنزول والكاسبوفنجين. ان التشخيص المظهري للعزلات اعتمادا على شكل الخلية لانواع المبيضات والوانها على وسط الكرومواكار هو غير علمي لنجاح التميز بين انواع المبيضات. لذلك تشخيص الانواع بالاعتماد على منطقة ITS يوفر وقتا (والذي ياخذ وقت من يوم الى يومين ) وهي ملائمة وتطبيقية حتى مع العزل التي تمتلك خصائص مظهرية شاذة. | Hair dandruff is a most commercially demoralized skin disease. Although it is not deadly disease, but not have more attention and research worldwide. This study was aimed for isolation, identification and investigation of antifungal susceptibility of dermatophytes and Candida also isolation and identification of bacteria associated with hairs dandruff. During the period from September to June a total of 280 sample of scalp and hair and smear were collected from Hilla hospital private clinics and primary schools in rural areas in the Province of Babylon (n=152 hair samples, n= 74 dandruff samples, n= 54 smear from head scalp) and samples was also collected as 30 control samples. Every effort not referred to source it from researcher effort. Samples cultured on Sabouroud Dextrose Agar (SDA) medium with or without Cyclohexemide based on stander cultured methods, incubation and identification, Primary identification of Candida has been achieved on CHROMagar medium to differential between Candida spp. based on colors. Also it was investigation about dermatophytes through cultivation on Sabouroud Dextrose Agar containing Cyclohexomide to get isolates of dermatophytes, as well as assess the presence of fungus saprophytic with samples under study.Virulence factors for the yeast were detected. Fungal identification based on amplification internal transcript spacer (ITS) region by using ITS5/ITS4, ITS3/ITS4 primers and subject the PCR product to sequence analysis (DNA sequence) for representative samples groups at Micro gene laboratory in US. Sequence analysis based on alignment with data base of reference strains in the gene bank (Blast Nucliotide Database (NCBI) program). phylogeny tree was construction on the basis of the results of the sequence data.Results showed conventional and molecular diagnosis by used ITS5/ITS4 and ITS3/ITS4 primer was band weight integration to ITS region range between 500 - 800 bp. while range weight for ITS2 region between 350 - 400 bp.The results showed that advanced molecular assays were powerful tools for fungal identification compare with the conventional methods. For the first time in Iraq Two isolates from C.sake and one isolate from Issatchenkia orientalis, also three isolates Aurobasidium iranianum and one isolates from Cryptococcus fonsecae and one isolates from Cryptococcus diffluens were recorded.Evaluating the effectiveness of microbial for some medically important plant extracts and compared with the antifungal and assess the minimum inhibitory concentration by used E - Test strips. As it has been cleared bacterial species accompanying to samples under study microscopically and biochemically during cultured on differential medium like manitol salt agar and blood agar base media.C.albicans isolates positive results for germ tube, growth in the presence of Cyclohexomide and growth in temperature 45C˚. C.kruzei, C.parapsilosis, C.glabrata ability composition of biofilms, while phospholipase assay was positive to C.albicans, C.parapisilosis and C.kruzei. Lipase assay was positive to C.albicans, C.tropicalis, C.parapsilosis. As well as conducted test for dermatophytes which include ability of Trichophyton rubrum on growth on SDA with NaCl of 5 % and dermatophytes growth on PDA and produce inverse dye. The results showed that aqueous extracts were reduced the growth of dermatophytes and Candida. The aqueous extract of Cloves more effective in inhibition of dermatophytes, Candida and Rhodotorulla at ≥ 0.05 followed by green tea and Eucalyptus, Cinnomomum, Henna. Moreover 8% concentration was more effective than other concentrations.Tested antifungal sensitivity for some Fluconazole and Caspofungin antifungal using E - Test strips. Showed that dermatophytes, Candida and Rhodotorulla was reveals resistance action against antifungals.Staph.aureus and Staph.epidermidis showed Congo red test and ability for biofilms formation.The study concluded that the hair dandruff is important hair problem, many yeast with the hair loss together may be behind them groups from fungi and bacteria accused in events such as typhoid and used of plant extracts was effected in signification in fungi growth that test under effect this natural products and the absence pharmaceutical activity to best antibiotic such as Fluconazole and Caspofungin. Morphologically identified isolates based on the cell shapes of Candida spp. and their color on CHROMagar isn’t feasible to successfully differentiate between members of the Candida spp. Therefore, identification of Candida and dermatophytes base on ITS region saves time (it takes 2 to 3 days) and is accurate and applicable even to isolates with atypical morphological features.

عزل وتشخيص المضاد الحيوي المنتج بواسطة عزلة Penicillium chrysogenum من البيئات المختلفة في ترب مدينة الناصرية == Isolation and Identification of antibiotic produced by Penicillium chrysogenum isolated from different environments in Nasseriya city soi

اسم المؤلف: ميسم كريم حسن
اسم المشرف: سعد سلمان هميم | محمد حسين مشهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study includes the isolation and identification of some mycoflora from 40 soil samples in six places ( Remnants of fat - born, parks, edges of the river, animal wastes, sewage and rubbish) during October 2015 - January 2016 in Nasseriya City, Iraq. According to different environmental factors, the isolated genera were Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, Cladosporium, Sepedonium chrysospermum, Alternaria chlamydospora, Bipolaris, Chrysosporium, Candida albicans, Rhododendron flavum, Humicola, Geotrichum candidum, Fusarium and Acremonium. Three isolation methods were used. Dilution method, direct plate method, alcohol and heat treatment technique using the cultural media viz. Potato Dextrose Agar ( PDA), Sabouraud Dextrose Agar (SDA) and Potato Carrots Agar (PCA). Aspergillus represented the highest fungal isolates which represent 62 (37.12%). followed by Penicillium with 47 (28.14%), Mucor 22 (13.16%), Rhizopus 15 (8.98%), Cladosporium 6 (3.59%), Sepedonium chrysospermum and Alternaria chlamydospora, 3 (1.80%), Biopolaris, Chrysosporium and Candida albicans with 2 (1.20%), and finally Rhododendron flavum, Humicola, Acremonium, Fusarium and Geotrichum candidum recorded the lowest fungal isolation with one isolate for each (0.60%). The study was aimed to isolation of Penicillium from soil and assay its antibacterial activity. The results showed that dilution method gave a best fungal growth in comparison with direct plate method and alcohol and heat treatment technique in 25 ºC and pH = 6. PDA appeared as an optimum medium for isolation in comparison with other media such as SDA and PCA. The preliminary results showed that Penicillium sp. exerted antibacterial activity against Gram positive and Gram negative bacteria; Therefore, this fungus was used for production of antibiotic on Potato Dextrose Broth (PDB) medium. The optimum conditions were obtained at pH = 6, incubation temperature of 25 ºC and shaking rate of 180 rpm for 7 days to fermentation. Ethyl acetate was a good organic solvent to extraction of antibiotic which produced (3g/L) as white to creamy crystals. The characterization of the antibiotic product after extraction and purified by chemical methods included Thin Layer Chromatography (TLC) test, Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectra and Mass Spectra. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for clinical bacterial species was 1 - 10mg/ml.The PCR method used in this study utilized Internal transcribed spacer (ITS1 - 4) as a primer for identification of isolates. Two PCR products of the targeted gene of Penicillium chrysogenum isolates which locally named as (Penicillium chrysogenum F1 and Penicillium chrysogenum F2) were selected and subjected to partial DNA sequencing for the ITS gene to follow up the possible molecular relationship between these local isolates and what recorded globally in Genbank.

Predictability of the Expression of ER, PR Receptors, HER2 Marker by the Coloration with of IV Collagen Expression and AgNORs in Breast Carcinoma among Iraqi Women in Thi_Qar Providence : Immunohistochemical Study == Predictability of the Expression of ER

اسم المؤلف: نجم الازيرجاوي
اسم المشرف: هيفاء عبد علي الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study is adescriptive exploratory study in Thi - Qar providence for some breast cancer patients . This study aims to assess the relationship between gene expression for each type four of the collagen (IVCollagen) and gene expression positive for both estrogen receptor ER - Eestrogen - receptor and progesterone PR - Progestron receptor and fairs tumor HER2 (Human epidermal growth factor receptor) By using chemistry of dyes immunological technique and the nuclear regulatory regions Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR(. The present study addresses the identification of the type IV collagen content in the basement membrane of epithelial tissue of the breast cancer patients in Thi qar and its relationship to nuclear organization region and maintain its relationship with hormonal receptors and progesterone genetic factor and the extent of their association with the occurrence of breast cancer.Fifty tissue samples are collected from Hussein Teaching Hospital inThi Qar and some private laboratories in the providence each case where data included that the most important factor is age, where he found that the highest percentage of injuries, age (55 - 46 years) increased by 38%. And mixed samples, either partial removal of the tumor or the eradication of whole breast. After collecting samples saved each formalin concentration of 10% for 24 hours at a minimum and then buried with parafin wax and completed the work by histological methods own work.The use of special select number of collagen type IV and determine the type of hormonal receptor positive or negative and also used several positive pathological tissues of the tumor to determine the human epidermal growth factor receptor by using silver nitrate to study the nuclear organization regions. Results of the current study showed that there is a positive relationship between collagen gene expression of type IV and between fairs oncogene(HER2 human epidermal growth factor receptor), as observed the presence of collagen type IV in tissue sections of tumors with HER2 negative gene expression of genetic factor, and with the positive expression for each Estrogen receptor positive ( estrogen positive ) and progesterone receptor positive( Progstrogen positive).Results of this study also showesthe presence of collagen or lack in histological sections of the tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs as well as the non - existence of collagen in the sections taken from tumors with negative expression of estrogen and progesterone receptors. The results of the current study also showed that there is a clear positive relationship between nuclear organization regions and between Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR) Fairs oncogene HER2, as it was noted the presence of many of the nuclear regions of the dye - derived tissue sections of tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs, while nuclear chromosomal regions did not appear in the sections derived from tumors with negative expression of estrogen receptor and progesterone hormone. The results of the current study also showed that there is a lack of positive gene expression of collagen type IV, the presence of a number of chromosome regions nucleuse (Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR)).

عزل وتشخيص البكتريا المرضية مع ايلاء اهتمام خاص للبكترياStaphylococcus auerus المرافقة ل Cutaneous Leishmaniasis في محافظة ذي قار == Isolation and Identification Pathogenic Bacteri with Special Regard to Staphylococcus auerus Associate with Cutaneous leishmaniasis at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: رضاء الله مرتضى الاعظمي
اسم المشرف: قاسم حسن وداعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study is designed to isolated and identification the pathogenic bacteria associated with Cutaneous leishmaniasis. Cutaneous leishmaniasis (CL) is a parasitic disease characterized by single or numerous ulcerations. This was study performed in Iraqi in Shatra general hospital and Al - hussein teaching hospital in Thi - Qar province 2016 - 2017.Total of 370 samples of suspected patients were taken and after examining them using geimsa stain , the positive were 186 males and 126 females then sterilize the area surrounding for ulcer , all samples were taken to (swab transport media) ,culture to MacConkey agar and blood agar after 24 hr of incubation at 37C ,after diagnosed by biochemical testing then species determined by API system. The positive results on culture media 92/312 , males 62 (67.4%) , female 30 (32.6 %).The total bacteria isolated from the lesions were in males and female staph auerus 52 cases (56.5%), Escherichia coli 8 cases(8.6%) , Bacillus cereus 6 cases(6.5%) , Pseudomonas. aeruginesa 5 cases (5.4% ), Strep. Pyogenes 6 cases(6.5%) ,Strepto.agalactiae 3 cases(3.3%).While other that isolated in males only and did not appear in females were aerobic bacteria ,Listeria moncytogenes 3 cases(3.4%) , Actinobacteria .spp 2 cases(2.2%) ,Klebsiella. Pneumonia 2 cases (2.2%) , Rodococcus .equi 1 cases (1.1%) , and anaeroberia bacteria ,Peptococcus niger 2 cases (2.2%) ,Peptostreptococcus .spp 2 cases (2.2%) .Then find bacteria that more presence more with cutaneous Leishmaniasis ,were it was staph. aureus therefore it were objected study antibiotic resistant .The present study demonstrates that Staph. aureus XIV isolates were resistant to methicillin 50 (96.15%), penicillin 48 (92.30%) , Clindamycin 37 (71.15%), ciprofloxacin 30 (57.69%) , Gentamicin 30 (57.69%),Amoxicalave 29 (55.76%), Azithromycin 25 (48.07%) , Amoxicillin 22 (42.30%), Tetracycline 21 (40.38%), Rifampin 10 (19.23%) and Vancomycin all staph .auerus are sensitive to Vancomycin The all 52 Staph. aureus isolates were further examined using polymerase chain reaction (PCR) for detection of (16SrRNA ,mecA and PVI gene ). 16SrRNA gene which were responsible for diagnosis ,where all isolates were positive to was 52\52 (100%) , mecA gene which were responsible for methicillin resistance this was detected in 52\52 (100%) . of Staph. aureus isolates and a part of virulence factors PVL gene was detected in 46/52(88.46%) of Staph. aureus isolates which are responsible to kill the leukocytes of human and other animals.

تنقية جزئية وتوصيف Biosurfactant من بكتريا Bacillus subtilis وتاثيرها على نمو بعض عزلات البكتريا والفطريات

اسم المؤلف: غـفـران فـلـيـح عـبد الـحـسـن عـزيـز الجـبـوري
اسم المشرف: فاطمة عبد الحسين مجبل التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 102عزلة من العزلات البكتيرية من 40 عينة من عينات الترب الملوثة بالنفط من مختلف المناطق ورشة عمل السيارات، محطات وقود السيارات، مصافي النفط ولخمسة مناطق مختلفة في العراق . خضعت كل هذه العزلات الى الفحص المجهري والخصائص الزرعية ووجد ان 80 عزلة منها تنتمي الى جنس Bacillus ، هذه العزلات خضعت ايضا لاختبارات بايوكيميائية وشخصت بناءا على دراسة rDNA 16S من قبل مجموعتين من البرايمرات (andB16SF B16SR) و(1492R and 27 F) اذ وجد ان 51 عزلة منها تعود الى Bacillus subtilis . تم فحص جميع هذه العزلات من حيث قدرتها على انتاج biosurfactant عن طريق فحص النشاط انحلال الدم على وسط دم الاغنام حيث وجد ان جميع العزلات كانت من النوع تحلل الدم بيتا حيث تم فحصها اعتمادا على قياس الشد السطحي بعد زراعتها في Jacques medium اظهرت النتائج ان 46 عزلة من 51 عزلة كانت منتجة biosurfactant , وقد تم اختيار ثمانية منها تميزت بانتاجها لهذا المركب وهي (S1,S2,S3 S4,S5,S6,S7,S8) حيث كانت العزلة B. subtilis S4 هي الاكفا في الانتاج لذلك اختيرت في الدراسات اللاحقة . تم استخلاص Biosurfactant الخام من العزلات المختارة بواسطة وتنقيته جزئيا باستخدام طريقة Ion exchange chromatography باستخدام DEAE - Cellulose تلاها طريقة Gel filtration chromatography باستخدام Sepharose - 6B . تمت دراسة خصائص المركبات المنقاة واظهرت النتائج ان الوزن الجزيئي biosurfactant التي تنتجهاB.subtilis S4 تراوح بين (1036 - 1058دالتون) من خلال جهاز HPLC - TOF - MS . اظهرت النتائج ان الحد الاقصى لانتاج biosurfactant من العزلة تم بطريقة استخدام زيت الزيتون (3٪) وكبريتات الامونيوم (0.3٪) وKH2PO4 (1.5) غم / لتر، وبدرجة حرارة 30 مº والاس الهايدروجيني (7) وفترة الحضانة لمدة 72 ساعة. وقد تحققت اعلى نسبة للـ biosurfactant بعد مكملات الظروف المثلى الى 0.3 غرام / لتر من الوسط الزرعي . تم اختبارالنشاط البكتيري والفطري للعزلات الثمانية ضد بعض الجراثيم المسببة للامراض، وهي Staphylococcus aureus,Streptococcus pneumonia, Pseudomonas aeruginosa ,Escherichia coli ,Proteus mirabilis, Candida albicans , Candida tropicalis , Candida krusei , Rhizopus oryzae , Aspergillus niger وكانت العزلة الاكثر فعالية هي B.subtilis S4 التي اظهرت وجود نشاط ضد كل مسببات الامراض ماعدا S.pneumonia ,P.aeruginosa ,C.krusei . كما بينت النتائج ان مستخلص العزلة B.subtilis S4 اظهر اعلى تثبيط نموعند التركيز 1500 مايكروغرام / مل وصل الى 24 ملم ضد E.coli، 23 ملم ضد K.aerogenes، 21 ملم ضد S.aureus، 15 ملم ضدC.albicans، 14 ملم ضد P.mirabilis، 11 ملم ضد C.tropicalis، وتثبيط نمو الفطريات، حيث وصل معدل النمو الشعاعي الى 31.9 ملم ضد A.niger و9.7 ملم ضد R.oryzae عند التركيز 2 ملغم / مل. كذلك اظهرت النتائج ان سمية المستخلص B.subtilis خارج الجسم الحي على ذكور الجرذان البيض بلغت حوالي 922 ملغم / كغم وتشير اذ ان الاعطاء اليومي biosurfactant لم تظهراي حالة وفاة في اي جرعة ، ولم تلاحظ اي تغييرات غير عادية في السلوك اوتاثيرات سمية خلال فترة 28 يوما من العلاج. واثبت التحاليل انه ليس هناك اي تاثير سلبي على معايير الدم الفسلجية وهذا يؤكد صحة هذه المستحضرات الحيوية للاستخدام . | About 102 bacterial isolates were obtained from 40 oil contaminated soil samples from various automobile work shop ,cars fuel stations ,oil refineries of five different areas in Iraq. Microscopic examination and cultural characteristics for all isolated were investigated , 80 isolates were found to be related to the genus Bacillus , Bacillus isolates were subjected to the biochemical tests and molecular identification based on the 16S rDNA by two sets of primers (B16SF and B16SR) , (27F and 1492R) of these 80 isolates revealed that 51 of the identified isolates belonged to Bacillus subtilis.All these isolates were screened for their ability for biosurfactant production through blood haemolysis activity on sheep blood agar indicated that all isolates were β - hemolysis while screening depended on measuring the lowering surface tension of cell free supernatant after cultivation in jacques medium which referred that 46 of 51 isolates were biosurfactant producers. Eight isolates were selected for the best biosurfactant producer isolatesCrude biosurfactants produced by the selected isolates were extracted by acid precipitation followed by partially purified with dichloromethane followed by purification and characteristics, the results showed that the molecular weight of biosurfactant produced by B.subtilis S4 ranging between 1036 - 1058 Da . Optimum conditions for biosurfactants production from B. subtilis S4 were determined. Results showed that maximum biosurfactant production from this isolate was achieved by using 3% olive oil , 0.3 % ammonium sulfate and 1.5 g / l Potassium dihydrogen phosphate ,at pH7,30 ºC and incubation period for 72 hrs. Maximum biosurfactant production was achieved after the supplementation of the optimum conditions was 0.3 g/l of culture medium .All of the eight isolates were tested for antimicrobial activity against twelve pathogenic microorganisms : Staphylococcus aureus ,Streptococcus pneumonia,Pseudomonas aeruginosa ,Escherichia coli ,Proteus mirabilis Klebsiella aerogenes,Candida albicans,C.tropicalis,C. krusei , Rhizopus oryzae , Aspergillus niger and Penicillium notatum.The most effective isolates were B.subtilis S4 which showed antimicrobial activity against some tested pathogens except S.pneumonia ,P. aeruginosa ,C.krusei and P.notatum.The results indicated that S4 culture extract showed high growth inhibition zone in concentration 1500 µg /ml reached to 24 , 23, 21, 15, 14 and 11 mm against E.coli , K.aerogenes , S.aureus , C.albicans, P.mirabilis,C.tropicalis respectively and high reduction in of radial growth of the fungi reached to 31.9 and 9.7 mm in A.niger and R.oryzae respectively at 2 mg /ml concentration .Study in vivo potential toxicity of B.subtilis lipopeptide biosurfactant towards male rat was evaluated. An LD50 value was determined to be about 922 mg / kg. Results show that daily administration of biosurfactant did not show any death cases at any dose. Also, no unusual changes in behavior and no intoxication were observed during the 28 days period of treatment. Analysis proved that there were no significant adverse effect on hematological parameters and this confirms the validity of those biopharmaceuticals on body of mammals.

دراسة جزيئية ومناعية لفايروس النورو والفايروس الغدي نمط 40 و41 في الاطفال المصابين بالاسهال == Molecular and Immunological Study of Norovirus and Adenovirus types 40 and 41 in Diarrheic Children

اسم المؤلف: رمله احمد محمد حسن العميدي
اسم المشرف: مهدي حسين محيل العمار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن فايروسي النورو والفايروس الغدي نمط 40 / 41 في الاطفال المصابين بالاسهال واجراء تحليل لمعدل الاصابة وطبيعتها ودراسة الطبيعة الجزيئية للفايروسين وكذلك التحري عن قدرة الفايروسين على حث الجهاز المناعي وتحديد بعض الحركيات الخلويه عند الاطفال المصابين بالفايروسين.بالاضافة الى دراسة بعض ملامح الاصابه مثل تغاير الفصول والعمر وتحديد افضل الطرق لتشخيص الفايروسين. اجريت الدراسة الحالية في محافظة النجف الاشرف /مستشفى الزهراء التعليمي للولادة والاطفال خلال الفترة من كانون الثاني2014 الى كانون الاول 2014 والتي تضمنت 314 عينه من البراز والدم من الاطفال المصابين بالاسهال والذين تتراوح اعمارهم بين شهر الى خمسة سنوات.حيث اعتمد التحري في عينات البراز استخدام اختبار الكروماتوغرافيا المناعي السريع للكشف عن المستضدات الفايروسية للفايروسين النورو والغدي نمط 40 / 41.كما تم تاكيد العينات الموجبة بواسطة تقنية PCR Real Time لفايروس النورو تقنية PCR للفايروسالغدي نمط40 / 41،والتي اظهرت فيها النتائج بان معدل الاصابة كان 11.7% لفايروس النوروو8.9% للفايروس الغدينمط 40 / 41.كذلك تم فحص العينات الموجبة بواسطة المجهر الالكتروني والتي بينت مظهر للفايروسين في عينات البراز . وتشير الدراسة الى ان التقنيات الجزيئية المستخدمة في فحص العينات هي الاكثر كفاءة للتشخيص الروتيني للفايروسين مقارنة مع المجهر الالكتروني لتشخيص عينات الاسهال.وطبقا للفئات العمرية ،اظهرت النتائج ان الفئة العمرية 13 - 24 شهر سجلت ارتفاع عالي للاصابة بالفايروسين النورو والغدينمط 40 / 41.الحالات الايجابية كانت بين الاطفال الذين يتغذون على الحليب الجاف الاصطناعي (31 حاله) مقارنة مع الرضاعة الطبيعية من الام (14 حاله).اما نتائج الاعراض السريرية في الاطفال المصابين بالفايروسين فاظهرت ان كل الحالات تبين وجود اسهال من النوع المائي المخاطي وبنسبة 100% يليها الالم البطن بنسبة 94.5% و82.1 %،التقيؤ بنسبة 81 % و78.5 % واخيرا الحمى بنسبة 78.3% و71.1 % لكلا من النورو والغدي نمط 40 / 41 على التوالي. كما كشفت الدراسة الحالية بان معدل الاصابة المرتفع لفايروس النوروكان من شهر كانون الثاني الى اذار والتي كانت بنسبة 81%من الحالات الموجبة ، اما بالنسبة لفايروسالغدينمط 40 / 41كان معدل الاصابة المرتفع من شهر كانون الثاني الى نيسان والتي كانت بنسبة 89.2% من الحالات الموجبة. كما اظهرت النتائج وجود ارتفاع كبيرفيالحركيات الخلويه (السايتوكينات) لمصل الاطفال المصابين مقارنة مع السيطرة. وفقا للفئات العمرية ،اظهرت الفئة( 49 - 60) شهر ارتفاع عالي في مستويات الانترفيرون كاما ، الانترلوكين - 6((IL - 6 والانترلوكين - 12 (12 IL - (حيث كانت للفايروس النورو(90.8, 56.7, 84.3) جزء من الغرام /مل على التوالي،بينما كانت لفايروسالغدي(106.5, 59, 87.5)جزء من الغرام /ملعلى التوالي مقارنة مع مجموعة السيطرة. | Norovirus and adenovirus types (40 and 41) are the important causes of gastroenteritis infections in children worldwide. The present study was designed to determine the incidence and nature of infection of norovirus and adenovirus types (40 and 41) at molecular and immunological levels, as well as some features such as seasonal variation , age distributions and detected the most effective and suitable method for diagnosis of the two viruses . The study was carried out in Al - Najaf province, in AL - Zahra teaching hospital for maternity and children, during the period from January, 2014 to December, 2014. Stool and blood samples were collected from 314 children with diarrhea, their age range (from 1months to 5 years). Immunochromatographic assay for norovirus and adenovirus used to detect their antigens in stool samples, the positive results were confirmed by reverse transcriptase real time PCR technique for norovirus and polymerase chain reaction technique for adenovirus types (40 and 41), which showed incidence of 11.7% and 8.9% for norovirus and adenovirus, respectively. Transmission electron microscopy examination gave clear positive norovirus and adenovirus types (40 and 41) appearance in diarrheal stool samples .The study indicates that molecular methods are most suitable and sufficient tests for routine diagnosis of norovirus and adenovirus types (40 and 41) as compared to transmission electron microscopy analysis for diarrheal samples. According to age groups, the results showed that the majority of infections with norovirus and adenovirus were recorded among age group (13 - 24) months. The positive cases were highly among infants fed with bottle fed (31 cases) compared with infants fed with breast fed (14 cases). Regarding the clinical features of children with viral diarrheal infections , the results showed that all of the cases of both viruses complained of watery or mucosal consistence stool (100%) followed by abdominal pain (94.5%) and (82.1%), vomiting (81%) and (78.5%) , and fever (78.3%) and (71.4%) for norovirus and adenovirus positive children respectively. The present study also revealed that a higher incidence of norovirus was detected from January - March 2014, when it was found in 81% (30/37) of the positive cases, whereas the incidence of adenovirus was higher from January - April 2014, during which it was found in 89.2% (25/28) of the positive cases. The current study for cytokines profile detection showed that significant elevation in patients with norovirus and adenovirus than control. The age groups 49 - 60 months have shown a high level in cytokines Interferon gamma, Interleukin - 6 and Interleukin - 12 with concentration were (84.3, 56.7, 90.8) pg./ml , respectively for norovirus while adenovirus were (87.5, 59, 106.5) pg./ml , respectively as compared with control group . Conclusion of the study shows incidence norovirus genotypeII (GII) and adenovirus types (40 and 41) by rapid chromatographic test from infected children in Al - Najaf province. The study indicates that molecular techniques are most suitable and sufficient tests alternatively for transmission electron microscopy when there is good facility and both can replaced by rapid chromatographic test . Interferon gamma, Interleukin - 6 and Interleukin - 12 were increased in all patients with norovirus and adenovirus infections and showed high level in age group (49 - 60) months

دراسة علاقة مجاميع الدم ABO مع البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والبين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني == Studying the Association of ABO Blood Groups with IL - 18BPa & IL - 18R beta in the Iraqi Arab Females with Diabetes Mellitus Type 2

اسم المؤلف: زينب فاضل عبد الغفور
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء السكري كمرض التهابي يرتبط مع العديد من العوامل الالتهابية لذلك تهدف الدراسة الحالية لحساب تركيز العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا مع عوامل الخطورة التقليدية والتي تشمل المقاييس الفيزيائية مثل متوسط محيط الخصر ومؤشر كتله الجسم وعوامل البيو كيميائية مثل الانسولين , مقاومة الانسولين , مستوى السكر في الدم في حاله الصيام ,مستوى الهيموغلوبين السكري وملف الدهون وفي الوقت نفسه دراسة ارتباطهم مع نظام الدم ABO في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني ومن اجل معرفة تاثير ذلك مع عوامل اخرى التي تعتبر كمؤشر او مطور لمرض السكري من النوع الثاني . وشملت الدراسة الحالية 340 مريضا من النساء العراقيات العربيات المشخصات حديثا بالسكري من النوع الثاني 200 من النساء الاصحاء اختبرت للتكرار الاليلي والمظهري ,ومن هؤلاء 60 مريضة اختبرت للدراسة المناعية والكيميائية مقارنة مع 28 من النساء الاصحاء .الاختبارات المناعية بواسطة استخدام تقنية الانزيم المرتبط المناعي, اما المقاييس الكيميائية باستخدام الاساليب الانزيمية واللونية, وتم تقسيم المرضى والسيطرة حسب مجاميع الدم الى اربعة مجاميع ثانوية (A , B ,AB ,O) وفقا لنوع فصائل الدم التي كشف عنها بواسطة الاختبارات المصلية القياسية .اظهرت البيانات الحالية : 1 - زيادة معنوية في المصل العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا في المرضى الحاليين ,في حين لم تظهر اختلافات معنوية في مستوى مصل العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .2 - زيادة معنوية في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة, في حين العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتزااد في المجموعة الاقل من 40 سنة وانخفض مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة .بالاظافة الى زيادة كل عوامل الخطورةالاخرى.3 - تركيز كلا العاملين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا يزداد بشكل غير معنوي تدريجيا في كل المرضى مع زيادة مدة المرض ونفس النتيجة لمقاومة الانسولين.4 - اظهرت نسبة الهيموغلوبين السكري اقل من 7.3 % زيادة كبيرة في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وتنخفض تدريجيا مع زيادة نسبة الهيموغلوبين السكري .5 - الافراد الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , الانسولين ومقاومة الانسولين .6 - المرضى الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B والاصحاء الذين يحملون فصيلة الدم A اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .7 - يعتبر العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا كعوامل خطورة مستقلة في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني والتي تدعمها غياب العلاقة المعنوية بين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وجميع عوامل الخطورة التقليدية الاخرى .8 - هنالك علاقة ايجابية بين مستويات العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا وخطورة السكري من النوع الثاني والذي قد يعتبر كمؤشر لحدوث المرض , في حين ان مستويات العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا قد يكون مؤشر لتطور المرض .مزيد من الدراسات اللازمة لفهم العلاقة بين مجاميع الدم , عوامل الالتهابية ومخاطر السكري من النوع الثاني . | DM is considered as inflammatory disease associated with many inflammatory factors. As such the present study aims to investigate the concentration of IL - 18 binding protein alpha (IL - 18BPa) and IL - 18R beta with classical risk factors which include Anthropometric risk factors like Age, Central Obesity (CO) and body mass index (BMI), biochemical factors like Insulin , Insulin Resistance (IR), Fasting Blood Glucose ( FBG), Glycosylated Hemoglobin (HbA1c) and lipid profile. Besides, the study aims to studying their association with ABO blood system in the Iraqi Arab female patients with diabetes mellitus type 2 in order to figure out their effect with other factors as predictor or developer for diabetes mellitus type 2. The present study included 340 Iraqi Arab female patients newly diagnosed with DMT2 and 200 healthy individuals tested for phenotype and allele frequency. From those, 60 patients were tested for the immunological and chemical where compared to 28 healthy individuals. Immunological tests by using ELISA kits. While Chemical parameters using enzymatic and colorimetric methods. The study groups (patients and control) were divided into four sub groups (A, B, AB and O) according to the class of blood groups which were tested by using standard serological procedures. The present data showed : 1 - A significant increase in the serum level of IL - 18BPa in the patients of the present study, while there was no significant difference in the serum level of IL - 18R beta. 2 - A significant increased in mean of IL - 18BPa with increased age in both patients and control groups. While IL - 18R beta showed increase at group less than 40 year and decreased with increasing age in both patients and control group. Besides increased all other risk factors. 3 - The levels of both IL - 18BPa and IL - 18R beta were gradually non significantly increased the level in each patients group with an increased duration of disease and the same for IR. 4 - Patients with HbA1c less than 7.3% showed a significant increase in mean of IL - 18BPa and IL - 18R beta and decreased gradually with the increase of HbA1c. 5 - Patients and control subjects who carried blood group B had the highest mean of IL - 18BPa, Insulin and Insulin resistance. 6 - Patient subjects who carried blood group B and control subjects who carried blood group A showed the highest mean of IL - 18R beta. 7 - IL - 18BPa and IL - 18R beta act as independent risk factors in Iraqi Arab females with DMT2 which supported by the absence of significant correlation among IL - 18BPa, IL - 18R Beta and all others classical risk factors. 8 - A positive relation between levels of IL - 18BPa and risk of DMT2. This may be an indication of inflammation for newly diagnostic diabetic patients, while Serum levels of IL - 18R beta might be a predictor marker of disease progression. Further studies are needed to understanding the relationship between blood groups, inflammatory markers and risk of DMT2 in healthy population.

استخدام البكتريا المختزلة للنترات المعزولة من مياة انتاج حقول النفط في البصرة في السيطرة على الانتاج الحيوي لغاز كبريتيد الهيدروجين المنتج بفعل البكتريا المختزلة للكبريت == Using of Nitrate Reducing Bacteria Isolated From Produced Water of Oil Fields in Basra in Control of Biogenic Hydrogen Sulfide Produced by Sulfate Reducing Bacteria

اسم المؤلف: وجدان حسين عبد الصاحب التميمي
اسم المشرف: كوثر هواز مهدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية استخدام تقنية الاقصاء بالتنافس الحيوي للسيطرة على الانتاج الحيوي لغاز كبريتيد الهيدروجين H2S من قبل الجراثيم المختزلة للكبريت في مزارع الدفعة والمفاعل الحيوي, اذ ان اضافة النترات او النتريت يحفز نمو الجراثيم المختزلة للنترات التي تنافس الجراثيم المختزلة للكبريت على المصادر العضوية وتستقصيها. جمعت 40 عينة من مياه انتاج حقول نفط نهران عمر واللحيس في البصرة خلال 6 اشهر للفترة من اب 2013 الى كانون الثاني 2014, عزلت مزارع خليطه من الجراثيم المختزلة للكبريت والمختزلة للنترات من تلك العينات وحسبت اعداد الخلايا لكلا النوعين باستخدام طريقه العد الاكثر احتمالا وقد اظهرت النتائج ان اعداد الجراثيم كانت منخفضة اذ بلغت اعداد الجراثيم المختزلة للكبريت بين7 - 4 خلية/100مل في حين كانت اعداد الجراثيم المختزلة للنترات اقل من 4 - 2 خلية/ 100مل. كما تضمنت الدراسة الحالية ايضا تنقيه للجراثيم المختزلة للكبريت والمختزلة للنترات واجراء التشخيص الجيني بتقنيه التفاعل التسلسلي لانزيم البوليمريز PCR والذي من خلاله تم تضخيم الجين16S rRNA وحدد تتابعه للتشخيص الى مستوى السلالة وقد اظهرت تحاليل المجتمع الجرثومي ان عزلات الجراثيم المختزلة للنترات قد امتلكت تطابقا بنسبة 99% مع الانواع Pseudomonas stutzeri وP. putida وHerbaspirillum huttiense وBacillus licheniformis اما عزلات الجراثيم المختزلة للكبريت فقد اظهرت النتائج انها امتلكت تماثل 99% للانواعShewanella hafniensis وDesulfotomaculum acetooxidans وDesulfosporosinus orientis مع افتراض ان جميع العزلات هي سلالات جديدة عالميا. كما اظهرت نتائج المعاملة بالنترات او النتريت في مزارع الدفعة وجود تاثير مثبط قوي على الجراثيم المختزلة للكبريت اذ لم يزداد مستوى الكبريتيد في جميع التراكيز المستخدمة ( 200 و400 و600 و800 و1000) ملغم/لتر من النترات والنتريت فقد تراوح مستوى تركيز الكبريتيد بين 4.2 و21 ملغم/لتر عند المعاملة مع النترات و23 و5.2 ملغم/ لتر مع النتريت, وتطابقت هذه النتائج مع تركيز الخلايا في جميع القناني المعاملة, اذ تراوح بين 0.26 - 0.001 و0.003 - 0.17 مع النترات او النتريت على التوالي بينما كانت هناك زيادة معنوية في تركيز الكبريتيد الذي بلغ 121 ملغم/لتر وتركيز الخلايا بامتصاصية بلغت 0.84 في عينات السيطرة.كان للجراثيم المختزلة للنترات تاثير مثبط قوي على نمو الجراثيم المختزلة للكبريت وانتاج الكبريتيد عند اضافة المغذيات المشجعة لنموها بمختلف التراكيز, اذ ازدادت فعاليه الجراثيم المختزلة للنترات واستهلكت كل من النترات او النتريت المضاف خلال 3 - 2 يوم من الحضن وكان اعلى تاثير مثبط لانتاج غاز كبريتيد الهيدروجين عند التركيز 1000 ملغم/لتر من النترات اذ اظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي في مستوى الكبريتيد الى34 ملغم/لتر في حين كانت اعداد البكتريا 34.8 خلية/مل بعد عشرة ايام من المعاملة. اظهرت نتائج معالجة الحموضة طويلة الامد باستخدام المفاعل الحيوي وجود انخفاض حاد في انتاج غاز كبريتيد الهيدروجين بنسبة 94% بعد اضافة النترات والنتريت خلال فترة 60 يوما من المعاملة ,الاضافة المستمرة للنترات والنتريت بحوالي ( 333ملغم/اليوم للنترات و133ملغم/اليوم للنتريت) ادت الى تثبيط الفعالية الحيوية للجراثيم المختزلة للكبريت وانتاج غاز كبريتيد الهيدروجين, اذ انخفض مستوى الكبريتيد من 155 الى 10 ملغم/لتر واعداد الخلايا اكبرمن 1100 الى 3.5 خلية/ مل بما يعادل 99.6% , بينما ازدادت فعالية واعداد الجراثيم المختزلة للنترات من 1100 الى اكبر من 1100 خلية/مل.اظهرت نتائج معدل تاكل عينات الحديد المطاوع في المفاعل الحيوي بعد 60 يوما ان اعلى معدل للتاكل كان 70.7 ملغم/ سم2/ سنه في المفاعل غير المعامل بالنترات والنتريت بينما انخفض معدل التاكل الى 15.8 ملغم/ سم2/ سنه بعد نفس الفترة من التعرض في المفاعل المعامل وبنسبة انخفاض بلغت 55% مقارنة مع المفاعل غير المعامل. | This study includes the used of Bio Competitive Exclusion technology (BCX) to control biogenic production of hydrogen sulfide (H2S) by Sulfate Reducing Bacteria (SRB) in batch cultures and bioreactors. The injection of nitrate (NO3) and nitrite (NO2) promotes the growth of nitrate reducing bacteria (NRB) which outcompete (SRB) on carbon sources. A total of 40 samples were collected from produced water of oil production facilities in Basra including Nahran Omer and Al - Lahis oil fields in a period time of 6 months from August 2013 to January 2014. Mix cultures of (SRB) and (NRB) were isolated from these samples, the two types of bacteria were enumerated by using most probable number method, the results show that the numbers of both bacteria were generally quite low, the viable count of (SRB) was between 4 - 7cell/100 ml whereas the (NRB) was between <2 - 4 cell/100 ml. This study also includes purification of isolates for both (SRB) and (NRB) and the genetic identification by polymerase chain reaction (PCR) technique through which the universal 16S rRNA gene of 1500 bp is amplified and sequenced for identification to the level of strains. Microbial community analysis showed that isolates of (NRB) were have identity of 99% Pseudomonas stutzeri, P. putida, Herbaspirillum huttiense and Bacillus licheniformis while isolates of (SRB) were have identity of 99% Shewanella hafniensis, Desulfosporosinus orientis and Desulfotomaculum acetooxidans with supposing that all isolates new world strains. The results of the treatment with nitrate or nitrite showed a strong inhibitory effect on (SRB) growth and (H2S) production, sulfide levels do not increase at all concentrations (200, 400, 600, 800 and 1000) mg/l of nitrate or nitrite range between 4.2 - 21 mg/l in treatment with nitrate and 5.2 - 23 mg/l in treatment with nitrite. This is consistent with the concentrations of bacteria in all treatment bottles which range between 0.001 - 0.26 and 0.003 - 0.17 in treatment with nitrate or nitrite respectively, while there is a significant increase in sulfide 121 mg/l and concentration of bacteria 0.84 in control as optical density. (NRB) has a certain inhibitory effect on the growth of (SRB) and (H2S) production when the (NRB) nutrient (nitrate or nitrite 200, 400, 600, 800 and 1000) mg/l were adding , the activity of (NRB) increases after treatment, and it consumed all nitrate or nitrite during 2 - 3 days of incubation, the strong inhibition of (H2S) production is at concentration 1000 mg/l of nitrate where the results showed that there was significant decrease in sulfide level 34 mg/l and number of bacteria, 34.8 cell/ml during 10 days of incubation.Souring control at long term treatment in bioreactors show sharp decrease in production of (H2S) to 94% after injection of nitrate and nitrite during the period of 60 days, the continuous dosing of nitrate and nitrite (333 mg/l/day nitrate and 133 mg/l/day nitrite) inhibited the metabolic activity of (SRB) and (H2S) production severely, the sulfide levels decrease from 155 to 10 mg/l and number of (SRB) from >1100 to 3.5 cell/ml the percent in number decreased was to 99.6%, at the same time activity and numbers of (NRB) increase from 1100 to >1100 cell/ml over the duration of experiment. The results of corrosion rate measurement on mild steel after 60 days showed that the highest corrosion rate was 70.7 mg/cm2/year in control reactor while the lowest corrosion rate was 15.8 mg/cm2/year in treated reactor at the same period time of exposure with percent of decreasing in weight loss to 55% comparing with control reactor.

السيطرة الاحيائية واللااحيائية على نمو الفطر Aspergillus flavus والتعبير الجيني للجينين aflDو aflR وانتاج الافلاتوكسين B1 == Biotic and Abiotic Control on Aspergillus flavus Growth, aflD and aflR Expression and Aflatoxin B1 Production

اسم المؤلف: لبيد عبد الله نجم السعد
اسم المشرف: عدنان عيسى البدران | سامي عبد الرضا الجميلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة البصرة
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: Fifteen isolates of Aspergillus flavus (AFL1 - AFL15) were isolated from multiple sources included soil, compost, seeds, fruits, feed and air. The isolates were identified morphologically then confirmed by molecular techniques. Only thirteen isolates were confirmed positively (AFL1 - AFL5 and AFL8 - AFL15) while two of them were not. A phylogenetic analysis was made which revealed that the isolates grouped according to their source of isolation. The aflR profile and phenotypic AFB1 production confirmed that all thirteen isolates posses the ability to produce AFB1 with significant differences (P ≤ 0.05) among them. Growth rate profile was performed under 30ºC which showed significant differences (P ≤ 0.05) among isolates. According to the above tests, A.flavus AFL14 was selected to be the experimental isolate for the rest of experiments in this study. Comparing to A.flavus NRRL3357 type strain, the impact of temperature, water activity aw and isolate factors was examined to determine the limits and optimum ecological conditions of growth of A.flavus AFL14. The results displayed that the best growth rate was (7.217 mm/day) at 0.98 aw where the lowest was (4.069 mm/day) at 0.9 aw with no growth at 0.85 aw while the impact of temperature demonstrated by outweigh of growth rate at 35ºC (6.201 mm/day) followed by 30ºC (5.272 mm/day) which exceeded 25ºC and 40ºC (4.604 and 4.051 mm/day), respectively.Bacillus subtilis (isolates : BSS1, BSS2, BSS3, BSS4 and BSW) and Pseudomonas fluorescens (isolates : PFMst and PFDL) were elected to be used as biocontrol agents. All the isolates were passed the biochemical identification tests moreover, BSS4 and BSW isolates of B.subtilis and PFMst and PFDL isolates of P.fluorescens were confirmed molecularly which used later in all biocontrol experiments in this study. The ability ofbiocontrol agents to inhibit fungal growth was investigated and the resultsshowed significant inhibition impact represented by significant outweighof B. subtilis BSS4 (99%) on the rest of B. subtilis isolates followed by P.fluorescense PFDL and PFMst (92.29 and 86.19) %, respectively, with nosignificant differences (P ≤ 0.05) among them. The extra - cellular abilityof biocontrol agents to degrade AFB1 showed a high degradation abilityIpreformed by B. subtilis BSS4, BSW isolates and P. fluorescence PFMst,PFDL isolates (100, 100, 97.805 and 97.396%), respectively. Thedegradation residues administrated to rats to determine their effect onbiosystems, the blood parameters showed a significant reduction ofWBC, HB, RBC, and P.C.V while there was a significant increase inUrea, Glutamic pyruvate transaminase (GPT) Glutamic oxaloacetictransaminase (GOT) and MCV in AF+DMSO treatment comparing tothe negative and positive control. Water activity and biocontrol factorswere examined to control aflD and aflR expression and phenotypic AFB1production. When the experiment held using Nutrient Agar medium, asignificant inhibition of aflD and aflR expression (P=0.000 and 0.003),respectively performed by BSW at 0.94 aw comparing to 0.98 aw whileno significant inhibition was observed in the rest of the treatments. Allbiocontrol agents revealed high significant reduction of aflD and aflRexpression (P≤0.001) in each water activity level separately whichconfirmed by HPLC results. The phenotypic results showed that 0.94 awexceeded 0.98 aw in AFB1 reduction (2011 and 4280 ng/gm),respectively which agreed with gene expression results. When MaizeMeal Agar used as a medium, aflD expression presented a highsignificant increase at 0.98 aw relating to the NM level of each individualtreatment (P= 0.000 - 0.03) except PFDL+AFL14 which showed nosignificant aflD expression between both levels. aflR expression revealeda high significant reduction (P= 0. 000) caused by 0.98 PFDL+AFL14and 0.98 BSW+AFL14, respectively, while no significant differenceswere observed in the rest of the treatments or control. The HPLC resultsdisplayed a high significant reduction of AFB1 at 0.98 aw (8447 ng/gm)compared to (219000 ng/gm) at NM aw. The biocontrol agents caused ahigh significant reduction for both aflD and aflR expression (P=0. 000 - 0.043) under each individual water activity level while, HPLC resultsshowed non significant low reduction to the AFB1 performed by BSS4and BSW (25160 and 44790 ng/gm), respectively, followed by asignificant increase in AFB1 amount caused by PFMst and PFDL(267600 and 184100 ng/gm), respectively

واقع التلوث بالمركبات الهيدروكابونية في المياة والرواسب وبعض الاحياء المائية في مهر الكحلاء محافظة ميسان / العراق == The Status of Hydrocarbon Compounds Pollution of Water, Sediments and Some Aquatic Biota in Al - Kahlaa River - Missan Province /Iraq

اسم المؤلف: صالح حسن جازع
اسم المشرف: عبد الحسن يوسف العضب | حامج طالب السعد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة - التلوث البيئي
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was performed to have knowledge of hydrocarbon compounds pollution status in the water (dissolved and particulate fractions),sediments ,two species of aquatic plants (Ceratophyllum demersum and Paspalum pespaioides) ,two species of fishes(Liza abu and Carassius auratus) and one species of molluscs (Pseudodantopsis euphraticus) .The samples were collected monthly for the period November 2012 to October 2013 from four different stations ) Al - Magideh, Treatment unit, Al - Husaichi and Al - Zubair) distributed along Al - Kahlaa River in Missan province , in addition to Reference station lies on the Tigris River before entering Amara district about 25 Km .The sampling's months were divided into four typical seasons although this is incompatible with Iraq climate.As well as measures of some ecological parameters (water and air temperatures ,pH ,turbidity, electrical conductivity ,dissolved oxygen , biological oxygen demand BOD5 and total suspended solid) which ranged between 22 and 42 C˚ , 18 and 31 C˚ , 6.9 and 7.82 , 42 and 172 NTU , 12 and 118 μS/cm , 4.66 and 9.25 mg/l , 1.46 and 5.04mg/l ,33 and 108 mg/l respectively .In addition to that the Organic Matter(OM) and the texture were measured in the sediment samples. OM values ranged between 0.078 and 0.927% , whereas the percentage of the texture was ( 15 %clay, 71% silt and 14% sand),(31 %clay, 63% silt and 6% sand), (33 %clay, 57% silt and 10% sand) , (40 %clay, 47% silt and 13% sand) and (18 %clay, 55% silt and 27% sand) in Al - Magideh, Treatment unit , Al - Husaichi , Al - Zubair and Reference stations respectively .The concentrations of total petroleum hydrocarbons (TPHs)were measured by using spectrofluorometer. Concentrations of total petroleum hydrocarbons in dissolved fraction ranged between 1.36 μg/l in Reference station and 13.87 μg/l in Treatment unit station during summer and winter respectively ,and in particulate fraction between 2.69 μg/g dry weight in Reference station and 29.92 μg/g dry weight in Treatment unit station during summer and winter respectively ,while in sediments they ranged between 3.16μg/g dry weight in Reference station and 135.18 μg/g dry weight in Treatment unit station during summer and winter respectively. Concentrations of total petroleum hydrocarbons in C. demersum ranged between 5 μg/g dry weight during winter and 58.97 μg/g dry weight during summer , while in P. pespaioides between 3.18 μg/g dry weight during winter and 43.44 μg/g dry weight during summer. Concentrations of total petroleum hydrocarbons in L. abu ranged between 4.81 μg/g dry weight during spring and 37.3 μg/g dry weight during summer ,while in C. auratus between 2.51 μg/g dry weight during spring and 29.303 μg/g dry weight during autumn . Concentrations ofbtotal petroleum hydrocarbons in P. euphraticus ranged between 5.98 μg/g dry weight during spring and 119.75 μg/g dry weight during summer .The concentrations of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons(PAHs) and n - alkanes were determined in the laboratories of Nihran Omer (South Oil Company in Basrah province ) ,using Gas Chromatography.Total concentrations of n - alkanes in dissolved fraction ranged between 0.027μg/l in Reference station and 0.192 μg/l in Al - Husiachi station during winter and between 0.016 μg/l in Reference station and 0.039 μg/l in Treatment unit during summer ,and for particulate fraction between 0.108 μg/g dry weight in Reference station and 2.096 μg/g dry weight in Treatment unit station during winter and between 0.101 μg/g dry weight in Reference station and 0.160 μg/g dry weight in Treatment unit station during summer ,while in sediments they ranged between 4.491 μg/g dry weight in Reference station and 51.32 μg/g dry weight Treatment unit station during winter and between 2.31 μg/g dry weight in Reference station and 19.31 μg/g dry weight in Treatment unit station during summer.The range of carbon chain length of n - alkanes in dissolved fraction ranged from C8 to C34 and in particulate fraction from C15 to C34 distributed in two patterns ,the first pattern included compounds between C8 and C25 with the abundance of C19,C21,C23 and C25 odd carbon number of and C18,C20,C22 and C24 for even carbon number ,while the second pattern included compounds with the range from C26 to C35 predominated by C27 and C29 odd carbon number and C26,C28 and C30 even carbon number.In sediments they ranged from C14 to C35 and distributed in two patterns, the first pattern included compounds between C8 and C25 with the abundance of C17,C19 and C21 odd carbon number and C18,C20 and C22 for even carbon number ,while the second pattern included compounds with the range from C24 to C35 with predominance of C31and C33 odd carbon number and from C24 to C34 even carbon number.Total concentrations of n - alkanes in C. demersum ranged between 6.467 μg/g dry weight during spring and 59.483 μg/g dry weight during summer ,whereas in P. pespaioides between 34.7 μg/g dry weight during winter and 166.6 μg/g dry weight during summer .The distribution of n - alkanes compounds in plants chain length ranged from C15 to C35 with bimodal from C15 to C27and from C28 to C35 with predominance of C17 to C25 odd carbon number and C18 to C24 even carbon number in the first one ,whereas in the second the dominance compounds were from C29 toC33 for odd carbon number and from C26 to C32 even carbon number.cTotal concentrations of n - alkanes in muscles of L. abu ranged between 14.60 μg/g dry weight during winter and 73.15 μg/g dry weight during summer and C. auratus between 34.76 μg/g dry weight during winter and 166.61 μg/g dry weight during summer . The distribution of n - alkanes compounds in fish muscles chain length ranged from C16 to C35 with bimodal from C16 to C25 and C26 to C35 with predominance of C17 to C25 and C18 to C24 for the first one ,and from C27 to C33 and from C26 to C34 for the second. These reflected nutrition nature for these kinds of fishes which depend on algae ,phytoplankton ,zooplankton ,diatoms ,insects and crustacean . While in the mollusc (P. euphraticus) ranged between 95.16μg/g dry weight during spring and 220.36 μg/g dry weight during summer. The distribution of n - alkanes compounds in P. euphraticus chain length ranged from C14 to C35 with bimodal from C14 to C27 and from C28 to C35 with predominance of C17 to C21 and from C18 to C24 for the first one ,and from C29 to C33 and from C30 to C34 for the second.The values of Carbon Preference Index (CPI) and pristane to phytane ratio was calculated to know the hydrocarbon compounds source in water ,sediments and biota of Al - Kahlaa River ,since the CPI value ranged between 0.142 and 1.314 in dissolved fraction and between 0.045 and 2.193 in particulate fraction , 0.160 and 1.872 in sediments,1.075 and 8.638 in plants , 0.285 and 1.537 in fishes and between 0.354 and 4.457 in mollusc .Whereas the values of pristane to phytane ranged between not detected and 1.579 in dissolved fraction , not detected and 0.601 in particulate fraction , 0.447 and 3.008 in sediments, not detected and 0.821 in plants , not detected and 2.176 in fishes and between 0.822 and 1.347 in mollusc .These indicate that there are two sources of hydrocarbon compound in water ,sediments and biota ,biogenic from living organisms and anthropogenic from domestic ,industrial and petroleum pollutants except in plants .Total concentrations of PAHs in dissolved fraction varied from 0.739 ng/l in Reference station to1.974 ng/l in Treatment unit during winter ,and from 0.300 ng/l in Reference station to1.125 ng/l in Treatment unit during summer ,and in the particulate fraction they varied from 0.79 ng/g dry weight in Reference station to 24.42 ng/g dry weight in Treatment unit during winter ,and from 4.369 ng/g dry weight in Reference station to10.545 ng/g dry weight in Al - Husaich during summer ,while in sediments they varied from 4.906 ng/g dry weight in Reference station to 35.479 ng/g dry weight in Treatment unit during winter ,and from 2.391 ng/g dry weight in Reference station to 25.886 ng/g dry weight in Treatment unit during summer.It had been noticed that there were a predominance of high molecular weight PAHs on low molecular weight PAHs ,while Benzo(a)dAnthracene/(Benzo(a)Anthracene+ Chrysene) BaA/(BaA+Chr) ratio ranged from 0.218 to 0.804 in water and 0.520 to 0.66 in sediments. The Indeno (1,2,3 - cd)pyrene /(Indeno (1,2,3 - cd)pyrene + Benzo(ghi)perylene) InP/(InP+BghiP) ratio ranged between not detected and 0.578 in water and between not detected and 0.681 in sediments .The Fluoranthene/ Pyrene (Fl/Py)ratio ranged between 0.150 and 2.47 in water and between 0.10 and 8.490 in sediments ,this give an indication of the source of PAHs compounds in water and sediments which were mainly pyrogenic and few from them petrogenic .Total concentrations of PAHs in C. demersum ranged between 24.124 ng/g dry weight during winter and 87.289 ng/g dry weight during summer ,whereas in P. pespaioides between 1.616 ng/g dry weight durig winter and 16.661 ng/g dry weight during summer .The Lower Polycyclic Aromatic Hydrocarbons to Higher Polycyclic Aromatic Hydrocarbons ratio ranged between 0.006 and 0.009 in C. demersum and between 0.008 and 0.103 in P. pespaioides. TheBaA/(BaA+Chr)ratio ranged from 0.995 to 0.997 in C. demersum and 0.756 to 0.995 in P. pespaioides. The InP/(InP+BghiP) ratio ranged between 0.342 and 0.807 in C. demersum and between 0.19 and 0.645 in P. paspaloides . The Fl/Py ratio ranged between 0.096 and 0.988 in C. demersum and between 0.018 and 5.018 in P. pespaioides. These indicate that the sources of PAHs in these plants were both pyrogenic and petrogenic .Total concentrations of PAHs in muscles of L. abu ranged between 2.301 and 16.661 ng/g dry weight during winter and summer respectively and in C. auratus between 1.095 and 8.675 ng/g dry weight during winter and summer respectively ,whereas in mollusc (P. euphraticus) ranged between 1.86 and 6.88 ng/g dry weight during spring and summer respectively. According to ratios of Low Polycyclic Aromatic Hydrocarbons(LPAHs) to High Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (HPAHs), BaA/(BaA+Chr), InP/(InP+BghiP) and Fl/Py ,they certainly reflected that the PAHs sources in fishes and mollusk are pyrogenic as a main sources and petrogenic as a small part .Also results of this study revealed the presence of seasonal and spatial variations in concentrations of TPHs ,n - alkanes and PAHs in water ,sediments and aquatic biota from Al - Kahlaa River ,the highest concentrations were recorded during winter whereas the lowest during summer ,also the highest values of these compounds were recorded in Treatment unit station in comparison with other stations.

تجميع وتشخيص واستخدام الهائمات الحيوانية الدقيقة من نهر الحلة في تغذية يرقات اسماك الكارب الشائع (L., 1758) Cyprinus carpio

اسم المؤلف: ازهار عبد الحميد عبد الحسن
اسم المشرف: مؤيد جاسم ياس العماري | عدي جاسم عبد الرزاق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2018
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was carried out in AL - Hilla River near Al mahaweel district in the middle of Iraq during autumn 2016 to summer 2017. The study included a collection of high density from microzooplankton by use special device then identified and used it as live food for early feeding common carp larva (Cyprinus carpio). The environmental factors of Hilla river tested for four seasons and ranged between 6 - 44 ˚C of air temperature, 9.5 - 30 ˚C of water temperature, 7.03 - 8.58 of pH, 921 - 1090 µm/cm of conductivity, 654.33 - 772.00 mg/l of total dissolved solids and 550.00 - 636.33 of salinity, 5.43 - 13.03 mg/l of total suspended solids, 7.5 - 10.31 mg/L of dissolved oxygen, 1.96 - 6.30 mg/l of BOD5, 1.61 - 2.49 m/s of water velocity, 5.17 - 16.80 µg/L of chloropyll - a - . The taxonomic and ecological study is done to the microzooplankton specially rotifer. There are few studies of rotifer in Hilla river, The result showed that the density of rotifera was ranged between 23ind. /L in the summer season to 65.66 ind. /L in winter season, included 65 rotifer taxa (62 species +2genera +1 class) were recorded in this study, 10 taxa (9 species + 1 genus) were recorded for the first time in Iraq and 14 taxa (13 species + 1 genus) were recorded for first time in Hilla River compared with available local studies. Keratella tropica showed the highest density of the rotifera, Lecane genus showed the highest species number (10 species). Canonical correspondence analysis showed Physico - chemical parameters of water affected on the density of rotifer both positively and negatively. There was positive significant correlation between density rotifer with electrical conductivity, total dissolved solids, and salinity, while pH showed the lowest effect on the density of rotifer than other environmental factors. Different species of rotifer showed some variations of the correlation with environmental factor, such as the density of Bdelloidea class correlated positive significant correlation with water temperature, while Keratella cochlearis species negative significant correlation with water temperature. Special system (multi - filtration system) designed and made by researchers in our study for collection high density of microzooplankton with size sample range between 50 - less 200 µm, with short time, less effort and low cost. The multi - filtration system that consists of three stages : pumping stage, multi - filtration stage and sample collection stage. The density of the samples was measured seasonally by comparing the density of the microzooplankton in Hilla river and the density of the microzooplankton sample obtained by the multi - filtration system. The highest density of multi - filtration system rotifer was 1023033 ind./L and the highest density of multi - filtration system total microzooplankton was 1052000 ind/L and measured chlorophyll - a - of sample multi - filtration system that ranged between 23.54 - 1931.09 µg/L. The density of rotifer and total microzooplankton that collect by the multi - filtration system were concentration up to 20222.22, 17558.81 times than what is in the river. After collection of the high density of microzooplankton by using the multi - filtration system, this microzooplankton was used as live food for early feeding fish larvae. A special experiment was designed to feed common carp of fish larvae (Cyprinus carpio) using three types of food : first live diet collected by the multi - filtration system that microplankton most rotifer, second soybean meal and third mixed food (rotifer and soybean meal). Some growth indicators for fish larvae were studied; the results showed that the highest growth rate and best survival rate were larvae fed on live food, highest increased weight and increased length, relative growth rate, specific growth rate and lowest survival rate (33.53 mg, 3.33mm, 87.78, 30.11, and32.38 % respectively) for larvae fish feeding on rotifera, while lowest increased weight and increased length, relative growth rate, specific growth rate and lowest survival rate (27.00mg, 1.43mm, 85.23, 27.39, and 61.90 % respectively) for fish larvae feeding on soybean meal.

دراسة جزيئية للجينات البيتا - لاكتاميز في بكتريا Acinetobacter baumannii المقاومة للمضادات الكاربابينيم == Molecular Study of ? - lactamase Genes in Carbapenem Resistant Acienetobacter baumannii (CRAB)

اسم المؤلف: ربيع عبد الاله مجيد عبد علي الهنداوي
اسم المشرف: ايمان محمد جار الله
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2018
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: During the period between April 2016 and January 2017, a total of 1100 clinical specimens (burns, wounds, throat, urine, blood) were collected from two hospitals in Babylon province Al - Hillah Teaching Hospital and Medical City of Mirjan Hospital. All specimens were cultured and 17 Acinetobacter baumannii isolates were obtained from clinical specimens in a percentage of (1.5%) distributed in burn 11 (2.8%), wound 1 (0.6%), throat 1 (2%), urine 3 (0.7%) and blood 1 (0.9%).This study was conducted to determine the presence of carbapenem resistance Acinetobacter baumannii (CRAB) isolates and the prevalence of β - lactamase genes responsible for carbapenem - resistance among clinical isolates of A. baumannii collected from two hospitals in Hillah City. Isolates were identified according to VITEK2 system. Antibiotics susceptibility was assayed by using disks diffusion method according to CLSI recommendations and it’s found 8 isolates was carbapenem resistant.The eight CRAB isolates were tested for biofilm formation by using the tube adherence test and the results showed that 5 of 8 tested isolates (62.5%) were strong for biofilm formation. Two genes related to biofilm formation was investigated (bap & blaPER - 1 genes). Six isolates were positive for the bap gene (75 %) and no isolates had positive for blaPER - 1 gene. The eight CRAB isolates were tested also for the presence of two virulence factor genes include espA (K1 capsular polysaccharide) and ompA (outer membrane protein A), this detection was performed by the conventional PCR technique. The positive result for espA and ompA genes was (62.5%) and (75%) respectively.IIPhenotypic detection of carbapenemase production was performed using the imipenem - EDTA disk and modified Hodge's test (MHT). Then isolates were subjected to monoplex PCR targeting blaCTX, blaTEM, BlaSHV, blaIMP, blaVIM, blaSPM, NDM - 1, NDM - 2, AmpC, OXA - 23, OXA - 24, OXA - 48, OXA - 51, OXA - 58 and OXA - 235 genes, all CRAB isolate gave positive result with MHT and (50%) of these isolates were positive to the imipenem - EDTA disk. PCR experiments showed ; all CRAB isolates were harbored blaOXA - 51 gene, six (75%) isolates were harbored blaCTX gene, four (100%) isolates were harbored blaTEM gene, four (50%) isolates were harbored blaVIM gene, four (50%) isolates were harbored blaSPM gene, seven (87.5%) isolates were harbored NDM - 2 gene, seven (87.5%) isolates were harbored ampC gene, six (75%) isolates were harbored OXA - 23 gene, one (12.5%) isolates were harbored OXA - 24 gene, two (25%) isolates were harbored OXA - 48 gene and one (12.5%) isolates were harbored OXA - 235 gene, while none of these isolates harbored BlaSHV, blaIMP, NDM - 1, NDM - 2 genes. All isolates of A. baumannii appear as MDR, while two isolates appear to be as XDR.These results revealed that CRAB isolates constitute 47% of all A. baumannii that had been isolated from Al - Hillah Teaching Hospital and Medical City of Mirjan Hospital in Babylon province and some of carbapenemase were detected in both phenotypic and genotypic methods (PCR). This underlies the importance of their accurate identifications and reporting to prevent the emergence of complete resistance to the most potent drugs against A. baumannii in Babylon province.

انتاج وتوصيف لنقي المنتجات الايضية لعزلة Streptomyces ودراسة تاثيراتها المضاد حيوية والسرطانية == Production and Characterization of Purified Metabolites from Streptomyces Isolate and Study

اسم المؤلف: ليندا حميد تركي عطية الغزالي
اسم المشرف: رباب عمران راضي الجيلاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية جمع 100 عينة من الترب بواقع 50 عينة من ترب صحراوية جمعت من المناطق التي تبعد مسافة 3 كيلومترات من بحيرة الرزازة و50 عينة من ترب زراعية جمعت من مناطق مختلفة من محافظه كربلاء المقدسة. حيث عزلت 26 عزلة من البكتريا الخيطية من الترب الصحراوية و36 عزلة من البكتريا الخيطية من الترب الزراعية ودرست الفعالية التضادية لهذه العزلات ضد اربعة انواع من البكتريا المرضية ( بكتريا الموجبة لصبغة كرام Staphylococcus aureus and Streptococcus agalactiae وبكتريا السالبة لصبغة كرام (Escherichia coli and Pseudomonas aeru¬ginosa وبطريقة التخطيط العمودي, واظهرت النتائج ان جميع actinomycetes المعزولة من الترب الزراعية ليست لها اي فعالية مضادة للبكتريا المرضية بينما كانت لبكتريا actinomycetes المعزولة من الترب الصحراوية فعالية مضادة للبكترياالمرضية وبمديات مختلفة تبعا لنوع البكتريا المرضية المدروسة, وقد وجد ان لثمانية من عزلات actinomycetes الصحراوية فعالية مضادة للبكتريا المرضية السالبة والموجبة لصبغة كرام وتبعا لذلك المدى الواسع في التثبيط اختبرت فعاليتها المضادة بطريقة الانتشار بالحفر, واظهرت النتائج ان العزله LHR 9 actinomycetesلها فعالية مضادة للبكتريا المرضية اعلى من العزلات الاخرى المختبرة وباستخدام طريقة الانتشار بالحفر, لذلك اختيرت لاكمال محاور الدراسة المتقدمة. درست الصفات المظهرية والبايوكيمياوية والزرعية للبكتريا actinomycetes LHR 9 بعد زرعها على اوساط زرعية مختلفة من وسط استخلاص Streptomyces الدولي واعتمادا على الفحص المجهري باستخدام المجهر الضوئي المركب وتحت قوى تكبير 1000و400مره لدراسة شكل المايسليوم الهوائي والارضي, وقد تبين ان للعزلة مايسليوم هوائي متفرع له مظهر مفصص وغير مجزا وباستخدام المجهر الاليكتروني الماسح تبين ان المايسليوم يحمل ابواغا ملساء وغير متحركة, وبالاعتماد على مجمل الصفات الزرعية والفسيولوجية المدروسة تبين ان البكترياLHR 9 actinomycetes المعزولة تعود لجنس Streptomyces. درست عدد من الظروف الزرعية والغذائية المثلى لتحسين انتاج مواد الايض الثانوي من البكتريا في وسط التخمر وقد كان وسط فول الصويا الحاوي على الدكستروز كمصدر كاربوني والبيبتون كمصدر نتروجيني وK2HPO4 كمصدر فوسفاتي وبظروف تخمر : بدرجه حراره 35م0 , وحموضه 7 , وقوه اهتزاز 200دوره \ دقيقه ولمده 7 ايام كفتره حضن هو وسط الانتاج الامثل . استخدمت مذيبات عضوية مختلفة القطبيةn) - بروبانول وكلوروفورم وخلات الاثيل ووالاسيتون والميثانول والايثانول (في استخلاص مواد الايض الثانوي المنتجة من بكتريا Streptomyces sp. LHR 9 المضادة للبكترياالمرضية وقد كان المذيب العضوي خلات الاثيل افضل المذيبات العضوية في الاستخلاص اذ اعطى مستخلصه البكتيري اعلى قيم في التثبيط البكتيري . نقيت مواد الايض الثانوي بعد استخلاصها بخلات الاثيل بعمود الفصل : جيل السيليكا ذو الابعاد (1.6× 14) سم وباستخدام الميثانول والكلوروفورم بنسبه 8 : 2 حجم\حجم كمحلول الغسل لسم3 واحد من المستخلص البكتيري , وقد جمع 50 جزء من المحلول الناتج بعد الغسل واختبرت فعاليتهاالتثبيطية لنمو البكتريا المرضية , وقد اعتمدت الاجزاء الفعالة لقياس التركيز المثبط الادنى باستخدام طريقة الانتشار من القرص, وقد كانت التراكيز (4.5 , 5 , 2.5 ,3)مايكروغرام/مل هي التراكيز المثبطه الدنيا لبكتريا Escherichia coli , Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aurues , Streptococcus agalactiae على التوالي. قيمت السمية الخلوية لمواد الايض الثانوي والمنقاة جزئيا لتحديد مدى فعاليتها المضاده للسرطان وبالاعتماد على فحص MTT (3 - (4, 5 - dimethylthiazol - 2 - yl) - 2 - 5 - diphenyl tetrazolium bromide) وباستخدام خطوط خلايا الثدي السرطانية وخطوط خلايا سليمة, وقد اظهرت النتائج بان التركيز 400مايكوغرام\ مل هو التركيز الامثل لتثبيط نمو الخلايا السرطانية بنسبه 60% مع المحافظة على 80% من الخلايا السليمة. اعتمدت الكروماتوغرافيا السائلة Liquid Chromatography - Mass Spectroscopy (LC - MS) في تنقية المركب الفعال وتوصيفة اذ اظهرت نتائج المخطط اللوني ان هنالك خمسة قمم وبالمقارنة مع الاطياف الكتلية للمركبات حسب المعهد الامريكي للمعايير والتقنية National Institute of Standards and Technology ان للمركب صيغة كيمياوية C18H32O2 ووزن جزيئي 282دلتن . درست الفعالية المضادة للاكسدة والمضادة للاورام لمستخلص Streptomyces sp. LHR 9 (المنقى جزئيا) في اناث الجرذان المختبرية المحفزة للاصابة بسرطان الثدي كيمياويا باستخدام مادة 7,12 dimethyl Benz (A) anthracene (DMBA) واظهرت النتائج ان لمستخلص LHR 9 Streptomyces sp. (المنقى جزئيا) القدره على المحافظة على تركيز الانزيمات المضادة للاكسدة في مصل الحيوانات المعاملة بمادة DMBA وبقيم مقاربة لما هي موجودة في مصل الحيوانات السليمة وقد تمثلت اثار ذلك بصغر وزن وحجم الورم فيى منطقة الثدي والتغيرات النسيجية الملحوظة, وعلى مستوى جزيئ ايضا اذ لوحظ وباستخدام تقنية Polymerase Chain Reaction - Single Strand Conformation Polymorphism(PCR - SSCP) التغيرات الوراثية الحاصلة للجينين ( Bcl - 2 وCaspase - 3) بفعل مادة DMBA ودور مستخلص Streptomyces sp. LHR 9 (المنقى جزئيا) في الحفاظ على الشكل الطبيعي للجينين اذ تبين ان هناك83.66% من الحيوانات السليمة و50% من الحيوانات المعاملة بالمستخلص البكتيري تمتلك جين Caspase - 3 بشكله الطبيعي بينما 66.66% من الحيوانات التي عوملت بماده DMBA فقط تمتلك جين Caspase - 3 من النوع الطافر وكذلك بالنسبة للجين Bcl - 2 اذ تبين ان هناك 78.66% من الحيوانات السليمة و60% من الحيوانات المعالجة بالمستخلص البكتيري تمتلك جين Bcl - 2من النوع الطبيعي بينما لوحظ وجود نفس الجين ولكن من النوع الطافر بنسبة 66.67% في الحيوانات المصابة بسرطان الثدي بتاثير مادة DMBA. | The present study included the collection of 100 soil samples from desert regions away from about 3 km from Al - Razzaza lake and agricultural regions at Karbala Province, Iraq. From these samples 26 and 36 actinomycetes isolates were obtained from desert and agricultural regions respectively . All actinomycetes isolates were tested for their antibacterial activity using primary screening against pathogenic bacteria by perpendicular streaking method .The results were showed that all the actinomycetes isolates were isolated from agricultural regions hadn't any antibacterial activity while the 26 isolates isolated from desert regions were had antibacterial activity in different spectra . Eight actinomycetes isolates from all the 26 desert regions isolates were selected for secondary screening due to their antibacterial activities with wide spectrum against pathogenic bacteria namely Gram positive (Staphylococ¬cus aureus and Streptococcus agalactiae) and Gram negative (Escherichia coli and Pseudomonas aeru¬ginosa) by the agar diffusion methods and the results revealed the selection of actinomycetes LHR 9 isolate for farther studies because it gave us the highest inhibition against the tested pathogenic bacteria growth. The active actinomycetes LHR 9 isolate was identified using several morphological and biochemical methods. The morphological characterization was involved the study of aerial and substrate mycelium on many International Streptomyces Project agar medium and using light microscopy at 1000X and 400X to study the mycelium morphology, as well as using the scanning electron microscope (SEM) to examine the spore surface. The results exhibited that the isolate had the aerial mycelium which formed unfragmented, branched, looped and rectus - flexibilis hyphae type bearing non - motile spores with smooth surface. In addition to results of biochemical tests we could revealed that the isolate was belong to Streptomyces genus . The active isolate Streptomyces sp. LHR 9 was selected for optimization critical cultural and nutritional parameters for increasing the antibiotic production titer in fermentation medium (Soybean broth medium), the results showed the dextrose as carbon source , peptone as nitrogenous source and K2HPO4 as a phosphate source with fermentation cultural condition included ; temperature of 35 °C, pH 7 with agitation rate 200 rpm for 7 days as incubation period gave high values in active secondary metabolites production. The antibacterial compound from fermentation medium was extracted using liquid - liquid extraction method with various organic solvents n - propanol, chloroform, ethyl acetate, acetone, methanol and ethanol) 1 : 1 (v/v) . the results was revealed the ethyl acetate the most efficient in extraction . The Streptomyces sp. LHR 9 crude extract was purified by using silica gel column (1.6 X 14) chromatography. Chloroform and methanol (4 : 1) (v/v), was used as an eluting solvent. The active fractions ( had the antibacterial activity ) were selected for determination the minimum inhibitory concentration and evaluation the cytotoxic activity using MTT (3 - (4, 5 - dimethylthiazol - 2 - yl) - 2 - 5 - diphenyl tetrazolium bromide) assay. The results of the MIC of partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract were 4.5 µg/ml for Escherichia coli, 5 µg/ml for Pseudomonas aeruginosa, 2.5µg/ml for Staphylococcus aurues and 3µg/ml for Streptococcus agalactiae . In vitro screening for cytotoxic activity was done by MTT assay for evaluation the anticancer activity of the partially purified antibacterial compounds produced by Streptomyces sp. LHR 9. The cytotoxic activity of the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract was determined against established MCF - 7 cell line ( breast cancer cell lines ) and WRL cell as a representative of normal breast cell line, depending on their viability ratio. The viability of MCF - 7 cell line was decreased dramatically with the increasing in extract concentration in the same time the viability of WRL cell was decreased in slowly manner. The using of multiple purification methods Liquid Chromatography - Mass Spectroscopy (LC - MS) along with a sensitive measuring method and possibly isolation of these compounds should allow us to evaluate the entire potential of secondary metabolites production, the results from LC - MS chromatogram of the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract showed five peaks, on comparison of the mass spectra of the constituents with the National Institute of Standards and Technology( NIST) library the compound was had the Formula : C18H34O2 and molecular weight : 282 D. The partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract was evaluated for its in vivo antioxidant and antitumor activity depending on the ability of 7,12 dimethyl Benz (A)anthracene (DMBA) to inducing breast tumor in female rat model, the results revealed the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract had the ability to keeping the enzymatic antioxidant in approximately its natural concentrations (as the same concentrations in serum of negative group) in serum of tested rats which were induced breast cancer by DMBA and treated with partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract, so these results were more studied on histological plane and the results of that were achieved by decreasing in weight and size of the breast tumor of tested rats and other histological change in breast tissue. In addition to that partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract effect was more studied on molecular plane depending on the Bcl - 2 and Caspase - 3 genes mutation using Polymerase Chain Reaction - Single Strand Conformation Polymorphism ( PCR - SSCP) analysis. The results were two conformations polymorphism in both Caspase - 3 gene ( about 83.66 % of negative group and 50% of treated group had three bands (wild type) where's positive control had 66.66% four bands (mutant type)) and Bcl2 gene (the wild type had one band such as negative group was 78.66% and test group 60%, compared with positive group (60.67%) have two bands(mutant type)). so these results suggest the active apoptotic property of Caspase - 3 and Bcl - 2 and the role of partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract effect in keeping them in their wild type.

تاثير مستخلص نبات الكجرات Hibiscus sabdariffa على عوامل الضراوة لبكتيريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من التهابات المجاري البولية == Effect of Hibiscus sabdariffa Extract on the Virulence Factors of Staphylococcuss aureus Isolated from Urinary Tract Infection

اسم المؤلف: صمود عبد الكاظم سلمان عبد
اسم المشرف: وجدان رضا تاج الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2018
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 163 عينة ادرار من المرضى المصابين بالتهاب المجاري البولية لكلا الجنسين باعمار تتراوح من شهر واحد الى 60سنة من المراجعين في مستشفى القاسم ومستشفى الهاشمية العام خلال الفترة من اب 2016 الى كانون الاول 2016. وقد وجدت 112 (68.71%) عينة اعطت نموا بكتيريا ومن هذه النسبة وجدت36 (32.14%) عزلة موجبة لصبغة غرام و76(67.86%) سالبة لصبغة غرام . وقد تم تشخيص 23(20.5%) عزلة بكتيرية تعود للبكتريا العنقودية الذهبية Staphyllococcus aureus، تم تشخيص جميع هذه العزلات مظهريا ومجهريا وحيويا.تم اختبار حساسية المضادات الحيوية لجميع هذه العزلات. وكانت جميعها مقاومة 100% للامبسلين، يليها سيفوكسيتين 91.3 %. واظهرت هذه العزلات اعلى حساسية للمضاد الحيوي الكليندامايسين 78.2% , في حين كانت نسبة المقاومة للاميكاسين هي39.1% . وقد وجد ان نسبة المقاومة للتراسايكلين هي 47.8% . وقد اظهرت النتائج ان 20 (86.9%)عزلة مقاومة للمضاد الحيوي المثسيلين (MRSA) وقد تم الحصول على هذه النتيجة باستخدام تقنية تفاعل انزيم البلمرة التسلسلي (PCR).درست فعالية المستخلص المائي الحار والبارد لاربعة نباتات (كاس الكجرات جذور العاقول وقشور الرمان واوراق الخباز) ضد البكتريا العنقودية الذهبية ووجد من خلال التحليل الاحصائي وجود فروق معنويه 0.05 P< في حالة المستخلص المائي البارد للكجرات حيث اعطى فعالية تثبيطية تجاه هذه البكتريا لذا تم اختيار هذا المستخلص لدراسة تاثيره على عوامل الضراوة لهذه البكتريا. بعدها تم التحري عن المركبات الموجودة في هذا المستخلص وقد اظهرت النتائج ان المستخلص المائي يحتوي كلا من الفينولات , القلويدات , الفلافونات والتانينات.درست فعالية المستخلص المائي البارد الخام لكاس الكجرات المضادة للبكتريا بطريقه الانتشار بالحفر (agar well diffusion method) باستخدام التراكيز 2,5 و5و10و20و40و80 ملغم / مل. بعدها تم تحديد MIC لهذا المستخلص بطريقه الانتشار بالحفر( The modified broth macro dilution method) فكانت قيمته 25ملغم/مل.وقد اظهر المستخلص المائي البارد فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بقطر 18 ملم بتركيز 40و80 ملغم /مل .تم استخلاص المركبات الفينولية من المستخلص المائي البارد للكجرات بعدها تم استخدام تقنيه الفصل الكروموتوكرافي عالي الجودة لعزل وتشخيص المركبات الفينوليه وقد تم الحصول على عدة مركبات. بعدها تم دراسة الفعالية التثبيطية لهذه المركبات ووجد بان المركب الفينولي الكويرسيتين قد اعطى اعلى فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بتركيز 4 ملغم /مل وايضا تم تحديد MIC لهذا المركب وهي 2ملغم /مل .كما درس تاثير المستخلص الخام والكويرسيتين على عوامل الضراوة وقد اظهرت النتائج ان كلا منهم قد كان له تاثير على انتاج الهيمولايسين وعلى فعاليته وذلك بعد تنمية البكتيريا مع قيمة MIC للمستخلص الخام والكويرسيتين كلا على انفراد.كذلك تم دراسة تاثير هذه المستخلصات على تكوين البايوفيلم من قبل البكتريا وقد وجد ان 15 عزلة بكتيرية منتجة للبايوفيلم قد تحولت الى غير منتجة او الى منتجة ولكن من النوع الرقيق بعد تنميتها مع هذين المستخلصين.وقد اظهرت النتائج ايضا ان المستخلص الخام والكورسيتين للكجرات قد اثرا على فعالية كلا من الستافيلوكاينيز والبروتيز.تم التحري عن انتاج السموم المعوية من قبل البكتريا العنقودية الذهبية باستخدام تقنية الفار الرضيع وقد وجد بان جميع العزلات غير منتجة لهذه السموم.كذلك تم دراسة تاثير هذين المستخلصين على تسرب ايون البوتاسيوم من الخلايا البكتيرية خلال فترات زمنية معينة وقد وجد بان هذين المستخلصين قد عملا على زيادة تسرب هذا الايون من الخلايا البكتيرية مما يدل على ان هذين المستخلصين قد اثرا على نفاذية الغشاء الخلوي للخلية البكتيرية .كذلك وجد ان الجرعة القاتلة لنصف حيوانات التجربة قد زادت من 5,6 × 106 الى 3,9× 107 بعد معاملة البكتريا بالمستخلص المائي البارد لكاس الكجرات . ايضا تم دراسة تاثير المستخلصين الخام والكورسيتين على معايير الدم في الفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي مستخلص نباتي والفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي على الكورسيتين وقد وجد بان المستخلص الخام كان له تاثير اكبر من الكورسيتين في تحسين معايير الدم مقارنة بالبكتريا المعاملة بالعالق البكتيري بدون مستخلص نباتي ,كما تم دراسة امكانية استخدام النبات كعامل مختزل عن طريق معرفة الفعالية ضد التاكسدية وكانت قيمتها 3566,97 مايكرو مولاري بواسطة استخدام اختبار (CUPRAC). ايضا تم دراسة الفعاليه الخلويه السمية للمستخلص الخام على خلايا الكبد الطبيعية للانسان وعلى الخلايا السرطانية في الثدي وقد وجد بان هذا المستخلص ليس له فعالية سمية على خلايا الكبد الطبيعية وايضا له تاثير قاتل للخلايا السرطانية في الثدي .

دراسة مناعية ووراثية للمرضى المصابين بالتهاب المرارة في مدينة الحلة == Immunogenetic Study on Patients with Gallbladder Infection in Hilla city

اسم المؤلف: رواء عداي علي السلطاني
اسم المشرف: عبد النبي جويد عبد المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة جمع ( 100 عينة ) اخذت بشكل اعشواني ( 87 اناث , 13 ذكور ) اجريت لهم عملية استئصال المرارة بمستشفى الحلة التعليمي للفترة من ايلول 2016 الى شهر حزيران 2017. تضمنت العينات (عينات دم وحصى) لتحقق من دور بعض المعايير المناعية والوراثية المتعلقة بمرض التهاب المرارة .بينت نتائج الدراسة الحالية ظهور الاصابة بالتهاب المرارة في كلا الجنسين(الاناث والذكور) وكانت الفئة العمرية ( 31 - 40 ) سنة الفئة الاكثر عرضة للاصابة , لكن نسبة اصابة الاناث في مجتمع الدراسة اعلى من الذكور ( 87% ) بينما الذكور ( 13%) كما ان التهاب المرارة المزمن هو الاكثر شيوعا ,اذ شكل نسبة ( 84% ) ثم التهاب المرارة الحاد اذ شكل نسبة 60%)).كما كشفت الدراسة قلة تكوين الحصى المرارية عند الاطفال بعمر اقل من عشر سنوات ويزداد تكوين الحصى مع تقدم العمر وينخفض تدريجيا بعد عمر 60 سنة . اكثر انواع الحصى المرارية الشائعة والتي عزلت الحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة.اما الدراسة المناعية فتضمنت تقدير مستويات T6F - β1 , IL - 8 في مصل مرضى التهاب المرارة باستخدام تقنية الاليزا لوحظ زيادة مستوى TBF - β1 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن) على نقيض مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية. P< 0.05 P=0.007 . كما اظهرت النتائج الحالية زيادة بمستوى T6F - β1 في كلا الجنسين) للاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة بمستوى احتمالية P=0.002 . P< 0.05 للاناث وP=0.003 . P< 0.05 للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقد لوحظ زيادة في مستوى T6F - β1 في مصل المرضى المصابين بالحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة .اظهرت النتائج الخاصة بتقدير مستوى انترلوكين 8 ,زيادة في مستوى IL - 8 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن )على نقيض مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية عالي ( P=0.005 . P<0.05 ) .كما ظهرت النتائج الحالية زيادة في مستوى انترلوكين 8 في كلا الجنسين(الاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية ( P=0.01 . P< 0.05 ) للاناث و<0.05) ( P=0.2 . P للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقط لوحظ زيادة في مستوى IL - 8في جميع المرضى المصابين بالحصى المختلطة تليها الحصى الكوليسترولية ثم الحصى الصبغية .تضمنت الدراسة الوراثية ( - 869 T C ) T6F - β1 و( - 251 T A ) L - 8 ذات الصلة مع مرضى التهاب المرارة لل85 عينة متضمنة عينات للمرضى وعينات لمجموعة السيطرة باستخدام تقنية (PCR - ARM ) .اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيري المفرد 76.6%) 46 : T6F - β1 ( - 869)T⁄C ) من متباينة الاشكال (T∕C) و9 (15%) متماثلة الاشكال (TT) و(8%) 5 متماثلة الاشكال (CC) ,واظهرت النتائج ان(Tallele) الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع( C allele) . كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى ( المزمن والحاد ) كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى المرارية الاكثر صلة بالموروثات متباينة الاشكال (T⁄C) للحصى الكوليسترولية تليها المختلطة ثم الصبغية . واظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد (41.6%)25 : IL - 8( - 251) T/A من متماثلة الاشكال متباينة الاشكال من متماثلة الاشكال (TT) واظهرت النتائج ان هو الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع لمرضى التهاب الحرارة كما اظهرت الاليات والموروثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى )المزمن والحاد ( كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى الاكثر صلة مع الموروثات متماثلة الاشكال((AA للحصى الكوليسترولية تليها الصبغية ثم المختلطة . | The study included 100 patients taken randomly (87 females and 13 males) undergoing cholecystectomy at the general teaching Hilla Hospital from September 2016 to June 2017. For each patient, two samples were taken which included the blood samples and gallstone for immunogenetic tests. The infection appears in both sexes with age group (31 - 40) years 30% but the rate of infection in female was higher than males 87%, 13% respectively.Clinically, chronic cholecystitis was the most common (84 %) and acute cholecystitis (16 %). The study displayed that the formation of gallstones is less than 10 years old. The gallstones are formed by age and gradually decrease after age 60. The most common types of gallstones were cholesterol stones and pigment stone followed by mixed stone The immunological study included estimatation the level of IL - 8, TGF - β1 in patients serum by using ELISA technique. The estimation of TGF - β1level explained a significantly increased in all patients (chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference . P=0.007, p<0.05. Estimation of TGF - β1 level showed increases in both the sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference . (p=0.002. P< 0.05) for females, (p=0.003. P< 0.05 for males). As for the stone, the results of the present study revealed increased levels of TGF - β1 in serum patients had cholesterol stone with value followed the pigment stone and mixed stone. The estimation of IL - 8 level explained a significantly increased in all patients(chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference. P=0.005 , p<0.05. Estimation of IL - 8 showed increases in both sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference (p=0.01. P< 0.05) for females, (p=0.02. P< 0.05 for males). As for the stone, the results showed that IL - 8 concentration was increased in patients serum had mixed stone followed cholesterol stone and pigment stone. The genetic study involved screening of TGF - B1 ( - 869 T/C) and IL8 - ( - 251 T/A) related to gallbladder infection patients for 85 samples, including patients and the control group by using (ARM - PCR) technique. The single nucleotide polymorphism of TGF - β1 ( - 869 T/C) showed : TC heterozygous was a higher rate with 46 (76.6%), TT homozygous with 9 (15%) and CC homozygous with 5 (8%) and the result revealed that the T allele more predominant than the C allele. The genotype and allelic association of TGF - β1 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of TGF - β1 for patients appeared the genotype of T/C higher percentage in patients with who had cholesterol stone followed by mixed stone and pigment stone. An another single nucleotide polymorphismof of IL8 - (251T/A) showed : AA homozygous was a higher rate with 25 (41.6%), TA heterozygous with 23 (38%) followed by the TT homozygous just 12 (20%) and the result revealed that the A allele more predominant than the T allele. The genotype and allelic association of IL - 8 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of IL - 8 for patients showed : The genotype of AA appeared higher percentage with patients who had cholesterol stone followed by pigment stone and mixed stone
1 ... 115 116 117 118 119 ... 147