Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 3,922

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

Author name: دنيا فريد سلوم
Supervisor name: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

في نماذج عنق (HPV) التنميط الجيني للفيروسي الحليمي البشري الرحم لنساءعراقيات باستخدام تقنيتي الوقت الحقيقي - سلسلة تفاعل البلمرة والصفوف الجينية == Genotyping of Human Papillomavirus in a sample of Iraqi women with cervical abnormalities by using Real - Time PCR and Macroarray

Author name: حلى يونس فاضل السعدي
Supervisor name: ضحى سعد صالح | فيصل غازي ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التحري عن العلاقة بين اصابة الفيروس الحليمي البشري (HPV) وحالات الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم في النساء العراقيات. تضمنت الدراسة 122امراة لديهن اعراض سريرية لاصابة عنق الرحم, 110 امراة منهن تميزت بنمو الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم او السرطانية, حيث كان 40.9 % من تلك النساء كان لديهن اصابة بالفيروس الحليمي البشري, اما 12(16.7%) امراة المتبقية تميزت بنمو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم بالرغم من وجود التهاب مزمن والتي جمعت خلال عام 2010. تضمنت مجموعة السيطرة 10 نساء والتي تميزت بغياب كل من التغيرات الخلوية, العلامات السريرية والاصابة بالفيروس الحليمي البشري. اظهرت نتائج مسحات عنق الرحم وجود نوعين من خلايا عنق الرحم غير الطبيعية هي : اصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية قليلة الخطورة (LSIL) التي شملت 70% من حالات الاصابة بالفيروس, واصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية عالية الخطورة (HSIL) التي شملت 26% من حالات الاصابة الايجابية. بينما 4% من مجموع الاصابة الكلية تمثلت بالنساء ذو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والالتهاب المزمن . هي الصفة المميزة للاصابة بالفيروس. تلك الصفة ترافقت مع 100% بوجودKoilocytosisالثاليل التناسلية الظاهرة للعيان و16.7% ترافقت مع الثاليل المستوية (غير الظاهرة). تشير دراسة الدنا الفيروسي باستعمال تجربتي سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي(PCR Real­Time) والصفوف الجينية(MacroArrays) التي طبقت لاول مرة في العراق الى وجود الفيروس الحليمي البشري بنسبة 35.6% في كل المجاميع المدروسة. تشير النتائج الى وجود 17 نمط جيني مختلف للفيروس الحليمي البشري بين 47 امراة مصابة باستعمال تقنية الصفوف الجينية, اربعة عشر من هذه الانماط الجينية كانت من الانماط عالية الخطر والتي شكلت 82.35% من مجموع الانماط والانماط الجينية المتبقية كانت من الانماط قليلة الخطر والتي شكلت 17.56% من مجموع الانماط. دى النتائج المهمة للدراسة الحالية تشير الى وجود 10 انماط جينية مختلفة ربما سجلت للمرة الاولى في النساء العراقيات ( 31 - , 45 - , 51 - , 52 - , 53 - , 58 - , 59 - , 66 - , 68 - , 44 - HPV ). لنمط الجيني 16 - HPV هو السائد على الانماط الجينية السبعة عشر, شكل هذا النمط مع الانماط الجينية (59 - , 39 - , 66 - , 6 - HPV) الانماط الخمس الاكثر شيوعا في العينات الموجبة. كما اظهرت الدراسة بان النساء ذوات الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والمصابة بالفيروس تحمل الانماط الجينية 16 - HPV و59 - HPV. كما شخصت سبعة انماط جينية مختلفة في عينات الثاليل التناسلية الظاهرة وهي (16 - , 6 - , 11 - , 39 - , 59 - , 66 - , 44 - HPV ). اشارت النتائج الى ان 32 (68.09%) من بين 47 امراة مصابة كانت لديهن الانماط عالية الخطر فقط, سواء كانت الاصابة بانماط مفردة او متعددة, بينما ثمان نساء (17.2%) كان لديهن الانماط عالية وقليلة الخطر سوية, وسبع نساء (14.89%) كان لديهن الانماط قليلة الخطر فقط. استعمل المجهر الالكتروني النافذ للتحري عن الجزيئات الفيروسية في عشر عينات موجبة للدنا الفيروسي وذو تغيرات خلوية مختلفة, حيث اظهرت النتائج وجود الجزيئات الفيروسية في ست عينات بمستويات مختلفة من المرضى واربع عينات لم تظهر جزيئات فيروسية. استخدمت تجربة التحول اللمفاوي لتقييم الحالة المناعية للمصابين. حيث وجدت نسبة التحول عالية في النساء ذوات الخلايا الطبيعية في عنق الرحم والمصابة بالفيروس (اصابة كامنة), بينما انخفضت نسبة التحول اللمفاوي في النساء ذوات الخلايا غير الطبيعية في عنق الرحم . امتلكت 40% تقريبا من حالات الثاليل التناسلية معدل عالي للتحفيز التكاثري للخلايا التائية عند مقارنتها بمجموعة السيطرة. اضافة الى ذلك كان التحفيز التكاثري للخلايا التائية مستقلا احصائية عن كل من نوع الاصابة, المحتوى الفيروسي والمجاميع العمرية. استخدمت تجربة تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي للكشف عن الفيروس وكميته لثلاثة عشر نمط جيني الاكثر ترددا بين المستويات المختلفة للنمو غير الطبيعي للخلايا الطلائية لعنق الرحم في الحالات : قبل الاورام, الاورام والسيطرة الاصحاء(132 عينة). اظهرت نتائج فحص سلسلة البلمرة بان 35 حالة موجبة من 47 حالة اصابة فيروسية التي شملت 74.5% من مجموع الاصابات الكلية. بينما الحالات المتبقية (12 حالة ) التي مثلت 25.5% من مجمو الاصابات الكلية لم يكشف عنها بهذه التقنية. لذلك قدر عدد نسخ الدنا الفيروسي لاغلب الانواع الفيروسية عالية الخطرفي 33 عينة موجبة بمستويات مختلفة من التغيرات الخلوية وعينتين موجبتين ذوات خلايا طبيعية لعنق الرحم . توزع المحتوي الفيروسي ل 33 عينة اعلاه من 1×10 الى 9.4×106 نسخة /مل بمعدل (4.17×104 نسخة /مل). اما العينتين المتبقيتين كانتا خارج قيم المنحى القياسي لذا قدرت ب 5× 107 و1×109 نسخة /مل تقريبا. صنف المحتوى الفايروسي لل35 عينة اعلاه كالاتي : 46% من العينات كمحتوى فيروسي عالي, 34% كمحتوى فيروسي منخفض و20% كمحتوي فيروسي متوسط. استخدم اختبار الصفوف الجينية لفحص 68 عينة, 36 عينة منها كانت موجبة و32 عينة كانت سالبة باختبار سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي. حيث وجدت الانماط الجينية عالية الخطر باستعمال هذه التقنية في (36/35) 97% من العينات الموجبة, بينما العينة المتبقية كانت سالبة لفحص الصفوف الجينية. كما وجدت الانماط الجينية قليلة الخطر وعالية الخطر المحتمل في تلك 35 عينة الموجبة والتي لم يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي فهي الانماط (6 - , 11 - , 53 - , 66 - HPV). اما فيما يخص العينات السالبة في فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي حيث فحصت باستعمال اختبار الصفوف الجينية ووجدت الانماط الجينية في 12 عينة منها, الانماط هي : (44 - , 66 - , 53 - , 11 - , 6 - , 58 - , 39 - HPV). تبين مما تقدم بان فحص الصفوف الجينية يتحرى عن 8 انماط جينية لا يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي, تلك الانماط شكلت 32.84% من تردد الانماط و33.33% من الحالات الموجبة التي تمتلك عدة انماط وهذا يعكس العامل المهم الذي يفضل فحص الصفوف الجينية في التحري عن الفيروس. لذا يبدو اختبار الصفوف الجينية طريقة دقيقة واكثر حساسية لكشف وتنميط اصابات الفيروس الحليمي البشري مقارنة مع فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي. | The present study was conducted to investigate the relationship between Human papillomavirus (HPV) infection and cervical cytological abnormalities in Iraqi women. One hundred twenty two women were included in this study with a cervical infection. A sample of 110 women with abnormal cytology cervical dysplasia / cancer, 45 of which 40.9% had HPV infection and 12 (16.7%) women had chronic infection with normal cytology during 2010. A control group with 10 women of normal cytology and no HPV infection was included in study for comparison. Pap smear test results showed two types of cervical cytological abnormalities, low squamous intraepithelial lesion (LSIL) which comprised of 70% of HPV positive cases, and high squamous intraepithelial lesion (HSIL) which comprised of 26% of HPV positive cases. Whereas 4 % out of the total risk group was represented in women with normal cytology. Koilocytosis is pathognonomic for HPV infection. Furthermore, Koilocytosis was accompanied with 100% with genital wart presence and 16.7% was accompanied with flat wart presence. HPV - DNA studied using Real - Time PCR and MacroArray assay (GenoArray) which applied for the first time in Iraq indicates the presence of HPV - DNA in 35.6% of all tested groups. Results indicate the presence of 17 different HPV genotypes among 47 infected women by using macroarray technique. Fourteen of these HPV genotypes which comprised of 82.35% were high risk (HR - type) and 17.56% (3/17) were low risk (LR - type).One of the important results in the present study indicates the presence of ten different genotypes which may be recorded for first time in Iraqi women (HPV - 31, - 44, - 45, - 51, - 52, - 53, - 58, - 59, - 66 and - 68 types). Out of 17 genotypes HPV - 16 was the predominant one, this genotype together with genotypes 59, 6, 39 and 66 comprised of the five most common types detected in HPV positive cases. Moreover, percentage of HPV - 16, and - 59 were extended to involve women with normal cytology. Seven different genotypes - 6, - 11, 16, 59, - 39, - 66 and - 44 have been identified in genital wart specimens. Results indicated that 32 (68.09%) out of 47 infected women had HR type alone, whether single or multiple types, while eight women (17.02%) had HR types in association with LR types and seven women (14.89%) had LR type only. Transmission electron microscope (TEM) was used for viral particles detection from ten HPV DNA positive samples with different cytological changes. Results indicated the presence of viral particles in six samples with different grades of disease and four samples showed no viral particles. To evaluate the immune status of patients lymphocyte transformation assay was applied. Results indicated that transformed lymphocyte were found to be high in women with normal cytology which may have HPV as a latent infection, while they were decreased in women with abnormal cytology. Approximately 40% of genital wart cases have higher mean of proliferative T cell response when they were compared with control group. However, proliferative T cell responses were statistically independent on HPV infection type, viral load and aging group. Real - time PCR assay was employed for HPV detection and quantitation (viral load estimation) from the range of HR - HPV DNA 13 genotypes most frequently found in different grades of cervical intraepithelial neoplasia, cervical tumors and health controls from (132 samples). Results showed that out of 47 positive cases 35 cases can be detected by real - time PCR which comprised of 74.5%. Failures in detection by this technique included 12 cases which comprised of 25.5% of the positive samples. Therefore, viral DNA copies number for the most HR - HPV types in cervical samples was determined from 35 sample with low and high - grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN I, II, III and Squamous Cell Carcinoma), and with normal cytology. However, the viral load of the 33 samples spread over a wide range from 1×10 to 9.4×106 copies/ml (mean 4.17×104 copies/ml). In addition, two samples were around the standard curve values as : approximately 5×107 and 1×109 copies/ml considered. Viral load was estimated approximately 46% constituted as high viral load, 34% as low viral load and 20% as slightly high viral load. Macroarray was applied in 68 samples, 36 of which were positive and 32 were negative by the real - time PCR test. High - risk genotypes were found in 35/36 (97%) real - time PCR positive samples, whereas remaining two samples were negative for HPV DNA (false - positive) by macroarray assay. The low - risk and probable high - risk (PHR) HPV genotypes were detected in the 35 HPV - positive samples which are not detected by real - time PCR included genotypes : HPV - 6 (in three samples), - 11, - 53 and - 66 (in two samples for each). HR, PHR and LR HPV genotypes were detected by macroarray in the 11/31 HPV - negative samples in real - time PCR which comprised of genotypes : - 39, - 58, - 66, - 11, - 6 and - 44. The GenoArray (GA) is capable of detecting 21 HPV multiple genotypes, including 8 types not detecting in real - time PCR. These types represented 32.84% of HPV types frequency and 33.33% of HPV positive cases had multiple types, this may reflect the important factor potentially favoring the GA for HPV detection. Therefore, the GA genotyping assay appears to be more accurate and sensitive technique for the detection and genotyping of HPV infections than real - time PCR one.

دور الانزيمات المحللة للبروتين المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا في تقرح القرنية == Role of Proteases Produced by Pseudomonas aeruginosa in Corneal Ulcer ( Keratitis)

Author name: ايمان جواد كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة تاثيرات الاانزيمات المحللة للبروتين ( Proteases) المنتجة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهاب القرنية القيحي والجروح, حيث جمعت (200) عينة شملت (150) عينة من مسحات العيون المصابة بالتهاب القرنية و(50) عينة من مسحات الجروح المختلفة. وقد تم الحصول على 17 (%8.5) عزلة بكتيرية من هذه المسحات تعود للنوع P. aeruginosa . وقد تم تشخيص العزلات بوساطة الاختبارات الكيموحيوية. ( 13 عزلة بكتيرية (% 8.7) من التهاب القرنية, و4 عزلات بكتيرية (%8) من الجروح). اظهرت نتائج الكشف عن قابلية البكتريا على انتاج انزيمات البروتيزات, ان 13 عزلة بكتيرية (76.5) كانت منتجة لانزيم Elastase ( 10 عزلة بكتيرية (%76.9) من التهاب القرنية و3 عزلة بكتيرية (%75) من الجروح ), ولوحظ ان العزلتين البكتيريتين P7 , وP11 من التهاب القرنية, وP2من الجروح اعطت اكبر منطقة تحلل 8, 10, 10) مليمتر (على التوالي. كما بينت النتائج ان الكشف النوعي عن قابلية العزلات البكتيرية P. aeruginosa على انتاج انزيم البروتيز القاعدي باستعمال وسط اغار الحليب المقشود (Skim milk agar) اظهر ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية ومسحات الجروح لها القابلية على انتاجه, كانت العزلة البكتيرية P12 المعزولة من التهاب القرنية الافضل حيث اعطت اكبر منطقة تحلل 22) مليمترا( . في حين ان نتائج الكشف عن قابلية هذه العزلات البكتيرية على انتاج هذا الانزيم باستعمال وسط مرق الكازئين (Casein broth) , بينت ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من مرضى التهاب القرنية كانت ذات فعالية انزيمية وكانت العزلة البكتيرية P12 هي الافضل من حيث الفعالية الانزيمية اذ بلغت الفعالية النوعية للانزيم 97.469) وحدة / مليغرام( . بينما اظهرت %50 من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح فعالية انزيمية. اشارت نتائج قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasA الى ان العزلات البكتيرية المعزولة جميعها من التهاب القرنية ومن الجروح لها القابلية على انتاج الانزيم, واظهرت العزلة البكتيرية P6 المعزولة من التهاب القرنية اعلى فعالية اذ بلغت 25.94) وحدة / مليغرام (. اما نتائج الكشف عن قابلية العزلات البكتيرية على انتاج انزيم LasD فقد اظهرت ان 8 عزلات بكتيرية (% 61.5) من العزلات البكتيرية المعزولة من التهاب القرنية ذات فعالية انزيمية بلغت ذروتها في العزلة البكتيرية P11 100.465) وحدة / مليغرام ( . و3 عزلات بكتيرية (%75) من العزلات البكتيرية المعزولة من الجروح اعطت فعالية لهذا الانزيم ولكن واطئة جدا تراوحت ما بين 8.797 - 5.557) وحدة / مليغرام(.استخلص انزيمي البروتيز القاعدي ( من العزلة البكتيرية P12 ) وLasA ( من العزلة البكتيرية P6 ) بوساطة النبذ المركزي المبرد للمزروع البكتيري وتمت تنقيتهما جزئيا باستعمال الترسيب بكبريتات الامونيوم (بنسبة اشباع % 80 ) وكروماتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Cellulose , حيث ازدادت الفعالية النوعية للانزيمين وبلغت ( 1629.62 وحدة / مليغرام) لانزيم البروتيز القاعدي و( 718.651وحدة / مليغرام ) لانزيم LasA . درس تاثير هذين الانزيمين المنقيين جزئيا في قرنيات عيون الارانب (in vivu) كلا على حدة وبتراكيز مختلفة ( 10, 7, 5) وحدة / مليلتر ( للبروتيز القاعدي و5, 3, 1) وحدة / مليلتر (لانزيم LasA ) حيث اشارت النتائج الى وجود تا ثيرات واضحة لهما في قرنيات عيون الارانب حيث سبب انزيم البروتيز القاعدي عتمة من الدرجة الثالثة ) عتمة في ثلثي الى كل سطح القرنية و/ او انتفاخ متوسط (. اما انزيم LasA فقد سبب عتمة من الدرجة الثانية ) عتمة في ثلثي سطح القرنية و/او انتفاخ طفيف ( . كما درس تاثير هذين الانزيمين في مستخلص البروتينات لقرنيات عيـون الارانب (in vitro) باستعمال الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد, واظهرت النتائج حدوث تحلل وتمسخ تام لحزم بروتينات القرنية وعند الفعالية الانزيمية 10, 7, 5 ) وحدة / مليلتر( لانزيم البروتيز القاعدي وعند الفعالية الانزيمية 5, 3, 1 ) وحدة / مليلتر( لانزيم Las A. | The study is included the effects of proteases enzymes producing by Pseudomonas aeruginosa, which isolated from keratitis and wounds .two hundred samples were collected, 150 samples of them were keratitis and fifity samples were wounds.Seventeen isolates (8.5 %) were obtained and diagnosed as P. aeruginosa.13 isolates (8.7%) from keratitis and 4 isolates (8%) from wound swabs. All bacterial isolates were diagnosed by biochemical tests. The production of elastase were tested by using elastin agar.Thirteen isolates (76.5%) had the ability to producing elastase (10 isolates (76.9 %) from keratitis and 3 isolates (75%) from wounds). The isolates P7 and P11from keratitis and P2 from wounds had the larger hydrolysis Zone ( 10, 10, 8 millimetre ) respectively.The production of alkaline protease were tested by using solid cultures ( skim milk agar ), all of them (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 isolated from keratitis had the larger hydrolysis zone ( 22 millimetre). Also the production of the enzyme were tested in liquid cultures ( casein broth ), all isolates from keratitis had the ability to production of the enzyme, the isolates P12 had the specific activity 97.469 U / mg, while 50 % of the wounds isolates had the ability to producing alkaline protease. The production of LasA enzyme were tested, all isolates (keratitis and wound swabs ) had the ability to production of the enzyme, the isolates P6 isolated from keratitis had higher specific activity 25.94 U / mg.The production of LasD enzyme were tested,8 isolates (61.5 %) from keratitis isolates had the ability to producing LasD enzyme. The isolate P11 had higher specific activity 100.465 U / mg, while 3 isolates (75 %) from wounds isolates had lower ability to producing LasD enzyme including between ( 5.557 - 8.747 U / mg). The alkaline protease was extracted from P12 isolate and LasA enzyme was extracted from P6 isolate. The enzymes were extracted by cooling centrifuge and them purified partially by precipitation with ammonium sulphate ( 80 % ) and ion exchange chromatography by DEAE - Cellulose the specific activity for enzymes were increased,which reached and 1629.62 U / mg for alkaline protease enzyme and 718.651 U / mg for LasA enzyme. The results of the enjection of alkaline protease and LasA enzyme in eyes corneal rabbits (in vivu) showed that both enzymes had the obvious effect on the cornea. The alkaline protease (5, 7, 10 U / ml ) caused damage for the cornea grade III melting ( two - thirds to all of the corneal surface ) and / or moderate bulging. Also the LasA enzyme ( 1, 3, 5 U / ml ) caused damage for the cornea grade II melting ( one - thirds to two - thirds of the corneal surface) and / or mild bulging.The protein profile of extract corneal proteins treated with alkaline protease ( 5, 7, 10 unit / ml) and LasA enzyme ( 1, 3, 5 unit / ml) (in vitro) by polyacrylamide gel electrophoresis showed hydrolysis and complete denaturation of corneal proteins bands.

انتاج وتنقية وتوصيف البلانتريسين من سلالات محلية لبكتريا Lactobacillus plantarum == Production, Purification and Characterization of Plantaricin from Local Strains of Lactobacillus plantarum

Author name: ولاء شوكت علي
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 118 عزلة تعود لجنس عصيات الحليب Lactobacillus من الخضر المتخمرة والعجائن الحامضية، واخضعت جميع هذه العزلات للفحوصات الزرعية والمجهرية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية بغية تشخيصها حتى النوع واظهرت النتائج ان 73 عزلة منها تعود للنوع Lactobacillus plantarum ، منها 48 عزلة من الخضر المتخمرة و25 عزلة من العجائن الحامضية، وكانت هذه البكتريا سائدة في الخضر المتخمرة اذ بلغت نسبة عزلها 73.85% بينما بلغت نسبتها في العجائن الحامضية 47.17% . تم التحري عن قابلية عزلات بكترياLb.plantarum على انتاج البلانتريسين باستخدام 3 طرائق هي : الاشرطة المتقاطعة(flip - streak method) والتنقيط (spot on the lawn method) والانتشار بالحفر(well diffusion method) ضد 12 نوعا من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام والمتضمنة : Staphylococcus aureus وStaphylococcus epidermidis وListeria monocytogenes وEnterococcus feacalis وLactobacillus acidophilusو Bacillus spp. وPseudomonas aeruginosa وPseudomonas fluorescens وSerratia marcescens وSalmonella typhi و. Klebsiella sppو Escherichia coli. واظهرت النتائج ان 8 عزلات كانت منتجة للبلانتريسين بطريقة flip - streak و7 عزلات كانت منتجة له بطريقة spot on the lawn بينما استطاعت 12 عزلة من انتاجه بطريقة الانتشار بالحفر،مما يدل على ان انتاج البلانتريسين في الاوساط السائلة كان افضل من انتاجه في الاوساط الصلبة،وعدت طريقة الانتشار بالحفر هي الافضل في التحري عن انتاج البلانتريسين. اظهرت البلانتريسينات المنتجة من عزلات Lb.plantarum فعالية عالية ضد P. aeruginosa عندما ابدت 83.3% من هذه العزلات فعاليتها التثبيطية ضد هذه البكتريا بينما اظهرت 16.7% فقط من هذه العزلات تاثيرها التثبيطي ضد بكتريا Lb. acidophilus ولم تبد اية عزلة من عزلات Lb.plantarum اية فعالية تثبيطية ضد بكتريا Bacillus spp. ، هذا وكانت العزلة Lb.plantarumVGW8 هي الافضل في انتاج البلانتريسين اذ تمكنت من انتاجه في الاوساط الصلبة والسائلة بالطرائق الثلاثة اعلاه، فضلا عن فعاليتها التثبيطية العالية تجاه 10 انواع من البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج البلانتريسين من العزلة VGW8 Lb.plantarum واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان الوسط المحضر مختبريا في هذه الدراسة والذي اطلق عليه وسط الانتاج السائل ورمز له (PLM) المتكون من 2% كلوكوز و2% ببتون و1.5% مستخلص الخميرة و1.5% مستخلص اللحم و0.25% من ملح K2HPO4 و0.5% من مادة tween 80 ،برقم هيدروجيني(pH) 5 وبدرجة حرارة30 م وبحجم لقاح 2% من المزروع البكتيري الذي يحتوي على 1×109 خلية /مل ولمدة حضانة 12 ساعة في ظروف لاهوائية. تمت في هذه الدراسة ايضا تنقية البلانتريسين اذ سخن المستخلص الخام للبلانتريسين بدرجة 80 م لمدة 10 دقائق قبل البدء بالتنقية والتي تضمنت خطوتين الاولى هي الاستخلاص بالمذيب العضوي (البيوتانول) والثانية الفصل بطريقة كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود (Sepharose 6B). وقد اظهرت النتائج الحصول على البلانتريسين بفعالية نوعية 10666.67 وحدة/ملغم بروتين وبعدد مرات تنقية بلغ 13.067 وبحصيلة نهائية 12%.اطلق على البلانتريسين النقي اسم بلانتريسين VGW8 نسبة الى العزلة المنتجة Lb.plantarumVGW8 .كذلك فقد تم توصيف البلانتريسين المنقى VGW8 واظهرت النتائج ان وزنه الجزيئي كان 14400 دالتون بطريقة الترحيل الكهربائي بوجود المادة الماسخةsodium dodecyl sulfate(SDS) . واظهرت فعالية البلانتريسين النقي ثباتية عالية في قيم من الرقم الهيدروجيني(pH) تراوحت ما بين 3 الى 9 ،اذ احتفظ بكامل فعاليته عند تلك القيم لكنه فقد نصف فعاليته في pH( 2 و10) وكامل فعاليته في pH القاعدي (11 و12).كما اظهرالبلانتريسين ثباتية عالية تجاه المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 100) م لمدد زمنية مختلفة شملت (10 و30 و60) دقيقة ويلاحظ من النتائج انه في الوقت الذي تمكن فيه البلانتريسين من الاحتفاظ بكامل فعاليته عند المعاملات الحرارية المختلفة (20 - 80 ) م للمدد الزمنية اعلاه، لم يتمكن من استرداد سوى نصف الفعالية عند تعرضه لدرجة حرارة 100 م لمدة 60 دقيقة او عند تعرضه لدرجة حرارة المؤصدة (121 م) لمدة 15 دقيقة. كما بينت النتائج طبيعة البلانتريسين البروتينية عندما فقد كامل فعاليته بعد معاملته بالانزيمات الحالة للبروتين ( ببسين وتربسين وبابين) في حين لم تتاثر فعاليته عند معاملته بالانزيمات (لايبيز والفا - اميليز ولايسوزايم).كذلك فقد اظهر البلانتريسين ثباتية عالية بعد معاملته بالمذيبات العضوية(كلوروفورم واسيتونايترل وداياثيل ايثر وايثانول وميثانول وايزوبروبانول وتولوين واثيل اسيتيت)، والمنظفات (توين80 وتوين20 وترايتون اكس100و EDTA ويورياو SDS) ، وبعض الايونات الفلزية (الصوديوم والبوتاسيوم والكاليسيوم والباريوم والزنك والحديد) حيث استعاد كامل فعاليته بعد معاملته بها لكن فعاليته انخفضت الى النصف بوجود ايوني المغنيسيوم والمنغنيز.تمت ايضا دراسة فعالية البلانتريسين VGW8 ضد P.aeruginosa وS.aureus واظهرت النتائج ان البلانتريسين يمتلك الفعالية القاتلة للبكتريا عندما انخفضت اعداد البكتريا مع زيادة تركيز البلانتريسين الى 320 وحدة /مل، فقد اظهرت النتائج ان هذا التركيز كان كافيا لقتل بكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين من التعرض للبلانتريسين ولقتل بكتريا S.aureus بعد اربع ساعات من التعرض له. ايضا فقد تمت دراسة الفعالية التحللية للبلانتريسين VGW8 واوضحت النتائج انه يمتلك الفعالية الحالة للغشاء الخلوي عندما انخفضت الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 600 نانوميترمن 0.59 الى 0.17 لبكتريا P.aeruginosa بعد ساعتين فقط من التعرض للبلانتريسين وبتركيز 320 وحدة/مل ، ومن 0.51 الى 0.20 لبكتريا S.aureus بعد 4 ساعات من التعرض للبلانتريسين وبالتركيز نفسه(320 وحدة/مل).وتمت ايضا دراسة تاثير البلانتريسين VGW8 على نفاذية الخلية وبينت النتائج ان الامتصاصية الضوئية عند الطول الموجي 260 نانوميتر قد سجلت زيادة من 0.5213 الى 2.9112 لبكتريا P.aeruginosa ومن0.4614 الى 2.6405 لبكتريا S.aureusدليلا على خروج الحامض النووي (DNA) من الخلايا نتيجة لتحللها.يتضح من هذه النتائج ان هدف البلانتريسين VGW8 هو الغشاء الخلوي. | A total of 118 isolates of Lactobacillus were obtained from fermented vegetables and sourdoughs. All the isolates were subjected to the cultural, microscopical and biochemical examinations for the identification of species. The results showed that 73 isolates belongs to Lactobacillus plantarum, 48 isolates from fermented vegetables and 25 isolates from sourdoughs. Lb. plantarum was dominate in fermented vegetables with 73.85% percentage of isolation while in sourdoughs the percentage of isolation was 47.17%.Three methods (flip - streak, spot on the lawn and agar well diffusion methods) were used to detect of plantaricin production by Lb. plantarum isolates against 12 species of Gram positive and Gram negative bacteria which included, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Enterococcus feacalis, Lactobacillus acidophilus, Bacillus spp., Escherichia coli, Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens and Klebsiella spp. The results showed that 8 isolates produced plantaricin by flip - streak method, 7 isolates produced it by spot on the lawn method, while by the agar well diffusion method ,12 isolates were able to produce plantaricin, suggesting that the production of plantaricin was best in the broth medium than in the solid medium. The agar well diffusion method was considered the best one for detection of plantaricin production. Plantaricins of Lb. plantarum isolates exhibited high activity against P. aeruginosa when 83.3% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against this bacterium, whereas the lowest activity was against Lb. acidophilus when 16.7% of Lb. plantarum isolates showed antibacterial activity against it. No activity against Bacillus spp. was observed.Lb. plantarum VGW8, was the best isolate for plantaricin production. It produced it in both broth and solid media by all detection methods used in this study, this plantaricin exhibited a broad spectrum of activity against 10 species of both Gram positive and Gram negative bacteria. The optimum conditions for plantaricin production by Lb. plantarum VGW8 were determined and the results showed that the best production medium was production liquid medium (PLM) that prepared in this study, it composed of 2% glucose, 2% peptone, 1.5% yeast extract, 1.5% beef extract, 0.25% K2HPO4 and 0.5% tween 80,with pH 5, temperature 30°C for 12 hours under anaerobic conditions and inoculum size of 2% of cells number 1×109cell/ml.Purification of plantaricinVGW8 was made by heating crude plantaricin at 80ºC/10min and then purified by two steps method including extraction with n - butanol followed by gel filtration chromatography on Sepharose 6B column, the results showed that the specific activity was 10666.67AU/mg protein with 13.067purification folds and 12% recovery yield. The purified plantaricin was called plantaricin VGW8 according to the producer isolate Lb. plantarum VGW8.Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of plantaricin VGW8 was 14400 Dalton by sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Plantaricin VGW8 activity was stable at pH values (3 - 9) but 50% of its activity was lost at (2 and 10) pH values, and whole activity was lost at extreme alkali pH values(11 and 12).Also, plantaricin VGW8 showed high thermostability at different temperatures (20 - 100)°C for (10,30 and 60)min, it remained active after being treated with (20 - 80)°C for the periods above, but it retained only 50% of its activity after treatment at 100°C for one hour and autoclaving treatment (121°C/ 15 min).The results showed that the activity of plantaricin VGW8 disappeared when it treated with proteolytic enzymes (pepsin, trypsin and papain), whereas it retained whole activity when treated with lipase, lysozyme and α - amylase, indicating pure proteinaceous nature of purified plantaricin.As well as, treatment of plantaricin VGW8 with organic solvents (chloroform, acetonitrile, diethyl ether, ethanol, methanol, isopropanol, toluene and ethyl acetate), surfactants (tween 80, tween 20, triton X - 100, SDS, EDTA and urea) and the metal ions : Na, K, Ca, Ba, Zn and Fe, showed no effect of these treatments on the activity of plantaricin VGW8.While treatment with Mn and Mg reduced its activity to the half.The antibacterial activity of plantaricin VGW8 was studied against P. aeruginosa and S.aureus. It was observed that plantaricin VGW8 has bactericidal effect when the numbers of cells were decreased with increasing of plantaricin VGW8 concentration to 320 AU/ml. The results showed that the complete killing of P. aeruginosa was observed after 2 hours of incubation with 320 AU/ml of plantaricin VGW8, while the same effect was observed after 4 hours on S.aureus. Also, the lytic activity of plantaricin VGW8 was studied, and the results showed that exposure P. aeruginosa and S.aureus to 320 AU/ml of plantaricin VGW8 led to decrease absorbance at 600nm from 0.59 to 0.17 for P. aeruginosa within 2 hours and from 0.51 to 0.20 for S.aureus within 4 hours. Moreover, the effect of plantaricin VGW8 on the cell permeability was studied and the results showed that absorbance at 260nm increased from 0.5213 to 2.9112 for P. aeruginosa and from 0.4614 to 2.6405 for S.aureus, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis. This means that the cell membrane is the target of plantaricin VGW8.

تاثير الذيفانات المعوية للبكتريا ETEC Escherichia coli في الخلايا السرطانية والخطوط الخلوية وفي حيونات التجارب == Effect of ETEC Escherichia coli enterotoxins on cancer cells, cell lines and laboratory animals

Author name: الهام سعيد عبد الكريم بنو
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: his study aimed investigating the cytotoxic effect of crude enterotoxins on normal and cancer cells both invitro and invivo. the present study included isolation and identification of Pathogenic Escherichia coli, From Children (under 3 - years for both sexes) infected with severe diarrhea, from March to June 2005, and as follows : *Sixtysix Islates (60%) were obtained from 110 samples. These Isolates were Identified according to morphological and biochemical tests, and for confirmation by Api - 20E System. *Serological identification for these Isolates( 66 isoleates )showed that only 12 (18%) isolates were belonged to Enteropathogenic group of E. coli.(EPEC).* The results of using Suckling Mouse Assay(SMA) showed that only 13 (19.6%) out of 66 Isolates were capable of producing heat - stable (ST) enterotoxin, therefore these isolates belonged to Enerotoxigenic group of E.coli ( ETEC).Whereas the EPEC isolates were all negative for this test. According to the toxin activily that was evaluated by (SMA) the Isolate No. 99 determined as the most efficient Isolate in producing the (ST). The same Isolate (99) of E. coli showed its ability to produce heat Labile enterotoxin (LT), by using Rabbit lileal Loops.The Isolate (99) revealed for sensitivity to Ampicillin, Gentamicin, Nalidixic acid and Nitrofurantoin antibiotics, but resistance to Amoxicillin , Cefixime, Cephallothin, Ciprofloxacin and trimethoprim.This Isolate also showed its ability to adhere by using the special media that contain the congo red stain, and by using hemagglutination test because it posseses the colonization factors antigen (CFA/1) and CFA /III However it failed in producing hemolysin enzyme that hemolyze red blood cells The toxin reserved Its activity at temperatures (20,40,60 and 80)c0 , but loss some of its effect at 100 c0 and kept its activity at 4 c0 for (24 - 48) hrs, It was found that the highly toxic activity reduced in the PH 5,9.5. The time ofmice response to enterotoxin was determined. At 90 minutes, as the maximum of response and 180 minutes as the optimum time of response. Enterotoxin was purified partially by using sepharose CL - 6B, and the molecular weight for (ST) was 17378 dalton. LD50 of both bacterial Suspension and crude enterotoxin in mice was 2.13 × 108 cell/ mice, and 48.75 mg/ mice respectively. The crude enterotoxin showed more severe effect than the bacterial suspension in spleen, Intestine, and Lung, while the effect of bacteria suspension was more severe in Liver.The therapeutic dose of crude enterotoxin was determined according to LD50 in mice it was revealed that the concentration of 390 mg/kg have the activity in reducing the tumor volume when injected directly in tumor, with an inhibition ratio between(83 - 89)% beginning at 8th day of the 25th injecting days. While when the toxin was injected intraperitonealy, the inhibition ratio of tumor was Less than the injection in tumor it self. The dose 97.5 mg/kg that given daily for 25 days showed more efficiectly in reducing the tumor in percent of 73.3. The Comparitive study between the relative volume of tumor in treated group and the relative volume of tumor in control group revealed that there was significant difference statistically important all over the treatment time.. The necrosis and fibrosis were the most important characteristics in treated groups after histopathological examination which appearantly with the progress of treatment associated with volume decrease of tumor, so it was found that the last stage of treatment showed the cancer cells presented like small Land Surrounded by dense fibrous tissue. The treatment by using all toxin concentration in both ways of injections on murine bone marrow cells, showed significant increase in blast Index (BI) and mitotic Index (MI) when compared with control.The toxic effect of crude extraction was studied in tumor cell lines (in vitro), Hep - 2 and AMN - 3 and the normal cell line REF, the study showed that the toxic effect depend on the type of cells, the dose and the time of exposure. This study revealed that the AMN - 3 Cells were more Susceptible from that of Hep - 2 Cells and the high concentration caused inhibition to the growth of the tumor cells, Specially the concentration of 60000 Mg/ml, Also growth and multiplication of REF cells. Whereas the concentrations of 1875and 3750 Mg/ml were found as an inhibitor to REF Cells. Partially purified enterotoxin (ST) showed that it's effect was found to in hibit Hep - 2, AMN - 3 and REF cells at 72 hrs of exposure and has an inducer effect to growth of cells at 24 hrs of exposure in all concentrations,but the effect was differ in the time of exposure at 48hrs,that the three concentrations (1.986,3.965and 7.95) Mg/ml showed inducing effect ,while the three hight concentrations(15.86,158.6 and1586) Mg/ml showed inhibition effect to AMN - 3 cells.Also the hight concentrations(30000 and 60000) Mg/ml werefound as inhibitor to REF cells at( 48,72)hrs,but they were inducer of growth at 24hrs of exposure. The toxicity effects of crude enterotoxin were studied in human Lymphocyte multiplication (in vitro) , and the higher concencentration showed decline in Mitotic index (MI), but It was induced cells to transform in present of mitogen, so there was inverse in blast index (BI) when compare with the control.

دور الببتيدو كلايكان في امراضية بكتريا Staphylococcus saprophyticus == Role of Peptidoglycan in Pathogenicity of Staphylococcus saprophyticus

Author name: عذراء صالح فليح الهيتي
Supervisor name: مي طالب فليح | حارث جبار فهد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: من مجموع 300 عينة ادرار تم الحصول على 71 عزلة عائدة لجنس الـ Staphylococcus من مريضات مصابات بخمج المجاري البولية واظهر عائدية 16 عزلة للنوع S. saprophyticus تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية ، كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية ، استخدمت عملية التكسير الميكانيكي (Mechanical disintegration) باستخدام المازج (vortex) والحبيبات الزجاجية ، والتكسير باستخدام جهاز الذبذبات فوق الصوتية لتكسير جدار خلية العزلةS67 saprophyticus S. والحصول على خلايا متكسرة تمثل الجدار الخلوي الخام ومن ثم استخلاص وتنقية جزئية للببتيدوكلايكان بالاعتماد على الهضم الانزيمي بوساطة انزيمات الـ DNase وRNase وPronase وTrypsin فضلا عن استخدام مركب سلفات دودسيل الصوديوم (SDS) ومواد كيميائية اخرى ؛لازالة الاغشية السايتوبلازمية والمحتويات البروتينية الاخرى ؛ وبذلك تم الحصول على ببتيدوكلايكان نقي خال من الشوائب وهذا ما اكده الفحص بالمجهر الضوئي والالكتروني وقد اظهر الببتيدوكلايكان حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة مقارنة بالجدار الخلوي الخام والذي اظهر عدة حزم بروتينية ؛ مما يدل على كفاءة الطريقة المستخدمة في الاستخلاص. تضمن البحث دراسة امراضية بكترياS67 S. saprophyticus المسببة لخمج المجاري البولية في الفئران اذ حقنت مجموعة من الفئران الاناث البيض عبر الاحليل وباستخدام القثطرة بتركيز 109 خلية جرثومية / مليلتر ، وحقنت مجموعة اخرى من الفئران بتركيز 3 ملغم / 0.2 ملليتر من الببتيدوكلايكان المستخلص منS67 S. saprophyticus والمنقى جزئيا وتم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) تغييرات نسيجية ممرضة تمثلت بانكماش الكبيبة الكلوية واحتقان الاوعية الدموية للكلية وارتشاح الخلايا الالتهابية وفقدان طبقة الكيراتين في المثانة سواء اكانت محقونة بالجراثيم ام بالببتيدوكلايكان . حضر المصل المضاد للببتيدوكلايكان في الحيوانات المختبرية (الارانب البيض) وتبين ان الببتيدوكلايكان ممنع جيد عند حقنه في الارانب ، وتم اثبات وجود الاجسام المضادة للببتيدوكلايكان باستخدام اختبار الندف بالانابيب واختبار التلازن الجرثومي (Bacterial agglutination) حيث كون المصل المضاد للببتيدوكلايكان المعزول من جدار بكتريا S.saprophyticusS67 تلازنا مع جراثيم البكتريا نفسها وايضا اعطى تلازنا مع العزلة القياسية ATCC6538 S. aureusمما يشير الى وجود تفاعل تصالبي لهذه الاضداد. تم دراسة التاثيرات السريرية للببتيدوكلايكان في الارانب المحقونة، اذ لوحظ ارتفاع في مستوى اليوريا والكرياتنين وانزيمي GPT وGOT والكلوكوز في الدم وانخفاض مستوى انزيم الفوسفتيز القاعدي( Alkaline phosphatase ) مما قد يدل على وجود خلل وظيفي في عدد من الاعضاء مثل : الكلى ،و الكبد ،و البنكرياس نتيجة تاثرها بالببتيدوكلايكان | Seventy one isolates of Staphylococcus were obtained from 300 urine samples isolated from female patients with urinary tract infection. sixteen of these isolates were identified as S.saprophyticus by biochemical tests , the sensitivity of the isolates to different antibiotics were also studiedMechanical disintegration method using vortex and glass beeds in addition of Ultrasonicator were used for preparing disintegrated cell wall which represent Crude cell wall , Extraction and partial purification of the peptidoglycan were accomplished by enzymatic digestion using DNase ,RNase ,Pronase and Trypsin in addition to SDS and other chemicals to remove the cytoplasm membrane and other protein contents, so we obtained pure peptidoglycan that were confirmed by light and electron microscope, the partial purified peptidoglycan showed one protein band compared with crude cell wall which showed many protein bands when performed in poly acryl amide gel electrophoresis under non denaturing conditions which improved the efficacy of method that employed in extraction of peptidoglycan The pathogenicity of the S.saprophyticus in urinary tract infection of mice was studied, Female mice were injected transurethrally by using catheter with 109 germ cells concentration /ml, other group of mice were injected by 3mg concentration /0.2ml of partial purified peptidoglycan which extracted from S.saprophyticus , The histopathological changes in the organs (Kidney and Bladder) whether it was injected with germ or the peptidoglycan were observed Antiserum of the peptidoglycan was prepared in the laboratory animals (white rabbit) the results revealed that the peptidoglycan was a good immunogen, The presence of antibodies was shown by tube flocculation test and bacterial agglutination test.Thiese antibodies cause agglutination with S.saprophyticus by using microtiter plate and also give cross - reaction with ATCC5538P S.aureusThe clinical effects of the peptidoglycan in the injected rabbit were also studied, The levels of Urea,Creatinine ,GOT, GPT ,Glucose were increased in the blood where the level of Alkine phosphatase was decreased which indicate that the peptidoglycan caused dysfunction of several organs like kidney,liver and bladder

دراسة علاقة مجاميع الدم ABO مع البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والبين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني == Studying the Association of ABO Blood Groups with IL - 18BPa & IL - 18R beta in the Iraqi Arab Females with Diabetes Mellitus Type 2

Author name: زينب فاضل عبد الغفور
Supervisor name: اسماء محمد صالح المهيدي
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad - College Of Science For Girls
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء السكري كمرض التهابي يرتبط مع العديد من العوامل الالتهابية لذلك تهدف الدراسة الحالية لحساب تركيز العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا مع عوامل الخطورة التقليدية والتي تشمل المقاييس الفيزيائية مثل متوسط محيط الخصر ومؤشر كتله الجسم وعوامل البيو كيميائية مثل الانسولين , مقاومة الانسولين , مستوى السكر في الدم في حاله الصيام ,مستوى الهيموغلوبين السكري وملف الدهون وفي الوقت نفسه دراسة ارتباطهم مع نظام الدم ABO في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني ومن اجل معرفة تاثير ذلك مع عوامل اخرى التي تعتبر كمؤشر او مطور لمرض السكري من النوع الثاني . وشملت الدراسة الحالية 340 مريضا من النساء العراقيات العربيات المشخصات حديثا بالسكري من النوع الثاني 200 من النساء الاصحاء اختبرت للتكرار الاليلي والمظهري ,ومن هؤلاء 60 مريضة اختبرت للدراسة المناعية والكيميائية مقارنة مع 28 من النساء الاصحاء .الاختبارات المناعية بواسطة استخدام تقنية الانزيم المرتبط المناعي, اما المقاييس الكيميائية باستخدام الاساليب الانزيمية واللونية, وتم تقسيم المرضى والسيطرة حسب مجاميع الدم الى اربعة مجاميع ثانوية (A , B ,AB ,O) وفقا لنوع فصائل الدم التي كشف عنها بواسطة الاختبارات المصلية القياسية .اظهرت البيانات الحالية : 1 - زيادة معنوية في المصل العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا في المرضى الحاليين ,في حين لم تظهر اختلافات معنوية في مستوى مصل العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .2 - زيادة معنوية في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة, في حين العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتزااد في المجموعة الاقل من 40 سنة وانخفض مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة .بالاظافة الى زيادة كل عوامل الخطورةالاخرى.3 - تركيز كلا العاملين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا يزداد بشكل غير معنوي تدريجيا في كل المرضى مع زيادة مدة المرض ونفس النتيجة لمقاومة الانسولين.4 - اظهرت نسبة الهيموغلوبين السكري اقل من 7.3 % زيادة كبيرة في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وتنخفض تدريجيا مع زيادة نسبة الهيموغلوبين السكري .5 - الافراد الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , الانسولين ومقاومة الانسولين .6 - المرضى الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B والاصحاء الذين يحملون فصيلة الدم A اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .7 - يعتبر العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا كعوامل خطورة مستقلة في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني والتي تدعمها غياب العلاقة المعنوية بين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وجميع عوامل الخطورة التقليدية الاخرى .8 - هنالك علاقة ايجابية بين مستويات العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا وخطورة السكري من النوع الثاني والذي قد يعتبر كمؤشر لحدوث المرض , في حين ان مستويات العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا قد يكون مؤشر لتطور المرض .مزيد من الدراسات اللازمة لفهم العلاقة بين مجاميع الدم , عوامل الالتهابية ومخاطر السكري من النوع الثاني . | DM is considered as inflammatory disease associated with many inflammatory factors. As such the present study aims to investigate the concentration of IL - 18 binding protein alpha (IL - 18BPa) and IL - 18R beta with classical risk factors which include Anthropometric risk factors like Age, Central Obesity (CO) and body mass index (BMI), biochemical factors like Insulin , Insulin Resistance (IR), Fasting Blood Glucose ( FBG), Glycosylated Hemoglobin (HbA1c) and lipid profile. Besides, the study aims to studying their association with ABO blood system in the Iraqi Arab female patients with diabetes mellitus type 2 in order to figure out their effect with other factors as predictor or developer for diabetes mellitus type 2. The present study included 340 Iraqi Arab female patients newly diagnosed with DMT2 and 200 healthy individuals tested for phenotype and allele frequency. From those, 60 patients were tested for the immunological and chemical where compared to 28 healthy individuals. Immunological tests by using ELISA kits. While Chemical parameters using enzymatic and colorimetric methods. The study groups (patients and control) were divided into four sub groups (A, B, AB and O) according to the class of blood groups which were tested by using standard serological procedures. The present data showed : 1 - A significant increase in the serum level of IL - 18BPa in the patients of the present study, while there was no significant difference in the serum level of IL - 18R beta. 2 - A significant increased in mean of IL - 18BPa with increased age in both patients and control groups. While IL - 18R beta showed increase at group less than 40 year and decreased with increasing age in both patients and control group. Besides increased all other risk factors. 3 - The levels of both IL - 18BPa and IL - 18R beta were gradually non significantly increased the level in each patients group with an increased duration of disease and the same for IR. 4 - Patients with HbA1c less than 7.3% showed a significant increase in mean of IL - 18BPa and IL - 18R beta and decreased gradually with the increase of HbA1c. 5 - Patients and control subjects who carried blood group B had the highest mean of IL - 18BPa, Insulin and Insulin resistance. 6 - Patient subjects who carried blood group B and control subjects who carried blood group A showed the highest mean of IL - 18R beta. 7 - IL - 18BPa and IL - 18R beta act as independent risk factors in Iraqi Arab females with DMT2 which supported by the absence of significant correlation among IL - 18BPa, IL - 18R Beta and all others classical risk factors. 8 - A positive relation between levels of IL - 18BPa and risk of DMT2. This may be an indication of inflammation for newly diagnostic diabetic patients, while Serum levels of IL - 18R beta might be a predictor marker of disease progression. Further studies are needed to understanding the relationship between blood groups, inflammatory markers and risk of DMT2 in healthy population.

عزل وتشخيص بعض انواع البكتريا المكسرة للهيدروكاربونات النفطية الاليفاتية في الترسبات النفطية لمحافظة البصرة == Isolation and Identification of some species of degradable Bacteria of N - Alkanes hydrocarbons compounds in oil sludge at Basrah Governorate

Author name: استبرق عبد الحسين سلمان جدي البوغازي
Supervisor name: ميثم ايوب عبد القادر الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the oil industries, large amounts of oil sludge are generated through the refining of crude oil. The main reason for its composition that is when exporting crude oil various kinds of oils (heavy and light ones) are mixed together for the purpose of exportation. But , the mixing process between different types cannot be fully , due to the lack of homogeneity among different quality of crude oil . So, the heavy parts of oil are precipitated to the bottom of tank and with passage of time they accumulate to be sediments that’s known as oil sludge stated at the bottom of the oil storage tank in the cleaning process , oil tanks are emptied and discharged in some spaces or reservoir (pits) located near the tanks called "oil pits". Which are places of dump excess oil of various types of oil from different oil tanks or they are close places from oil / water separating unites .From these spots, samples of two kinds of oil sludge : the bottom of oil tank (during the maintenance of the tank) and oil pits (near the unities of separating water from oil) are collected. Also, samples of soil surrounding the oil pits from five oil locations in Basrah city are collected too. Those locations are : west of Gurna, Northern Rumela, Southern Rumela, Nahar Umar, Alzubeir.At the rate of redundantly for each location and for each type of the study samples.This investigation is considered as the first which conducted in Iraq which include firstly the isolation and identification different types of bacterial species from different oil sludge, and secondly use some of them in biodegradation studies for two kinds of carbon sources of oil sludge : (oil sludge of tank bottom , oil sludge of oil pits) .Oil degrading bacterial species have been isolated on a selective mineral salt medium Bushnell and Hass Mineral Salt Medium (BHMS), supplemented with a carbon source. They are also identified depending on the Morphology and biochemical characteristics; four genus of bacteria (out of 89 bacterial isolates of oil sludge from the tank bottom)Bare identified. They include : 32 Pseudomonas spp. , 27 Rhodococcus spp. 21 Bacillus spp. , 9 Arthrobacter spp. , Also four genera of bacteria (out of 101bacterial isolates of oil sludge from the oil pits) are identified. They include : 41 Pseudomonas spp. 27 Rhodococcus spp. , 22 Bacillus spp. 11 Arthrobacter spp. , , While 8 species and 3 genus of bacteria (out of 259 bacterial isolates of the soil surrounding the oil pits) are identified. They include : 41 Aeromonas spp., 39 Corynebacterium spp., 39 Pseudomonas aeruginosa, 36 Bacillus spp., 33 Micrococcus leteuc, 23 Enterobacter intermedius, 22 Pseudomonas fluorescens, 12 Micrococcus varians 7 Staphylococcus epidermidis, 4 Staphylococcus saprophyticus,3Staphylococcus aureus .The biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and two compounds of Pristane and Phytane are measured. Also, the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and the two compounds of Pristane and Phytane are measured for each four genus which were isolated from the oil sludge pits, and it is also done for one isolated genus from the soil surrounding the oil pits. The measuring process was fulfilled as a comparative study with the control flasks. Thus, the oil sludge (tank bottom ) was used as a source of carbone in the first experiment While, the oil sludge (oil pits) was used as a source of carbone in the second experiment . The incubate time of the experiment is 27 days during which a lost of the percentage of hydrocarbon compounds each 9 days are recorded by using( Capillary Gas Chromatography ). The results showed the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard toCbacteria 73.8 % Pseudomonas spp., 70.3 % Rhodococcus spp. 65.7 % Arthobacter spp., 55.6 % Aeromonas spp.,51.5 % Bacillus spp., Whereas, the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria 80 % Pseudomonas spp., 74.9 % Aeromonas spp., 70.4 % Rhodococcus spp., 64.8 % Arthobacter spp.,55 % Bacillus spp., While , The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard to bacteria 73.7 % Pseudomonas spp.,70.3 % Rhodococcus spp. 65.6 % Arthobacter spp., 55.3 % Aeromonas spp. ,51.2 % Bacillus spp., Whereas, The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria79.2 % Pseudomonas spp., 73.8 % Aeromonas spp., 69.2 % Rhodococcus spp.,63.7 % Arthobacter spp., 53.7 % Bacillus spp. It was found that there is approximately match between the biodegradation of mole percentage by using the area and those by using the concentration for each component .

دراسة للطفيليات المعوية المعزولة من الخضروات المطرية من بعض اسواق مدينة بغداد

Author name: وسن عداي مهدي المرسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: A study was carried out during the period from November 2010 to October 2011 to detect the intestinal parasites which contaminate the common fresh vegetables. A total of 303 samples were taken from three wholesale markets and three retail markets, in Baghdad province. Ten kinds common vegetables were selected. These vegetables were Celery (Apium graveolens); Parsely (Patroselinum crispum); Garden cress (Lepidium sativum); Leek (Allium porrum); Radish (Raphanus sativus); Lettuce (Lactuca sativa); Spinach (Ipomoea aquatica); Beet (Beta vulgaris); Mint(Mentha spicata) and Cabbage (Brassica oleracea).Sedimentation and floatation techniques were used for samples examination. Three different solutions (ZnSO4, saturated NaCl , saturated sucrose ) were used in floatation technique. The present study has been shown that the collected samples of vegetables were contaminated with sixteen species of intestinal parasites. It was found that the percentages of contamination with these parasites were as following : (Giardia lamblia) (29.4%), Entamoeba histolytica(24.5%), Entamoeba coli(16.9%), Balantidium coli (8%), coccidia(9.9%) and Blastocystis hominis(0.7%). For intestinal helminthes Ascaris lumbricoides (15.6%), Toxocara spp.(10.3%), Fasciola spp. (5.3%), Schistosoma haematobium (1.7%), Schistosoma masnsoni (1.4%), Taenia spp. (4.7%), Diphyllidum caninum (3.9%), Trichuris trichiura (3.3%), Enterobius vermicularis (6.9%) and Nematoda larvae (6.3%).The present study revealed that the percentage of contaminated vegetables by using sedimentation technique (72.3%) was significantly higher than that of flotation techniques (53.1%). Additionally it was found that, the different kinds of vegetables showed a significant difference in the percentages of contamination with the parasites in both techniques. Thus, the percentage of contaminated Garden cress was (93.5%), (72.4%) in both sedimentation and flotation technique respectively, while Cabbage showed (50%), (36.7%) respectively.A significant high percentage of contamination was recorded in Al - Nahrin wholesale market (89.2%) in comparison with low percentage (59.4%) in Al - Rasheed wholesale market. Additionally, it was found that the percentages of contaminated vegetables in wholesale (76.26%) were significantly higher from that of retail market (64.76%).The present study, also, showed that the percentage of detection of parasites by using ZnSo4 solution (31.2%) was more efficient than that showed by saturated sucrose (8.9%). Additionally; the soaking with normal saline (47.83%) showed a higher percentage of contamination than that by using distilled water (17.39%).The percentages of seasonal contamination were varied significantly, therefore, it was found that spring showed the highest percentage (29.7%) while summer the lowest (20.9%). The washed samples of Garden cress which obtained from the three wholesale markets, reduced the percentages of contamination with parasites but did not remove the parasites completely. Therefore, a significant difference has been noticed between washed (56.76%) and unwashed samples (76.66%).Concerning, the percentages of infections with intestinal parasites, it was found that the medical center (14 July) showed (29.4%) while Al - Ameria center (19.2%). Furthermore, the percentage of parasites infections was significantly higher in the summer (46%) than in winter (12.67%).The present study indicated that there were a positive coordination between the high percentages of contaminated vegetables and the high percentages of infection in the medical centers as in the case of G.lamblia and E.histolytica.Finally, it could be conducted that the contaminated vegetables played an important role in transmission of intestinal parasites to human, particularly, when these vegetables were eaten fresh without sterilization or good washing.

دراسة تشريحية ونسجية وكيمونسجية مقارنة للغدة الدرقية وجار الدرقية في نوعين من الفقريات العراقية (بيز ابن عرس، Herpestes javanecus والقنفذ طويل الاذن ، Hemiechinus auritus) باستعمال الواسم Anti - Calcitonin, code 140778) ) == Study of Thyroid and Parathyroid Gland in Two Iraqi Vertebrates ( Weasl , Herpestes javanicus and Long - Eared Hedgehog , Hemiechinus auritus) Using Marker (Anti - Calcitonin, code 140778)

Author name: رنا علاء عبد الحميد هايس العامري
Supervisor name: حسين عبد المنعم داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Anatomy
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التعرف على الوصف التشريحي والتركيب النسجي والكيمو نسجي - المناعي للغدتين الدرقية وجار الدرقية لنوعين من اللبائن العراقية ممثلة ب بيز ابن عرس ( ( Herpestes javanicus والقنفذ طويل الاذن ( Hemiechinus auritus ) وقد استعملت تقنيات مختلفة لانجاز الدراسة .• الغدة الدرقية Thyroid Glandاظهر الفحص التشريحي للغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H. javanicus) البالغ (ذكور, اناث) ان الغدة تتكون من فصين (ايمن, ايسر) وتاخذ موقعا في منطقة العنق اسفل الحنجرة. ويتموضع فصا الغدة على جانبي الرغامى عند الحلقات (5 - 1) من حلقات الرغامى ولم يلاحظ وجود تركيب البرزخ (Isthmus) الذي يربط بين فصا الغدة , ويتباين لون الغدة بين البني والاحمر وفي الغالب تظهر بلون بني محمر(Reddish brown) يظهر فصي الغدة في شكل بيضوي او اهليجي, اظهرت نتائج الدراسة الحالية في حيوان القنفذ ( H. auritu ) تماثلا واضحا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص الوصف التشريحي باستثناء كون فصا الغدة بيضويتي الشكل.تحاط الغدة في حيوان بيز ابن عرس بمحفظة من نسيج ضام (Connective tissue) تتكون من طبقتين, طبقة خارجية External layer)) تتالف من الياف مغراوية (Collagenous fibers) وقليل من الياف مرنة ((Elastic fibers ويتخللها ارومات ليفية Fibroblast)), وطبقة داخلية ((Internal layer تتالف من الياف مغراوية يتخللها الياف عضلية ملساء Smooth muscle fibers) ) ,كما تتضمن المحفظة اوعية دموية ((Blood vessels واعصاب (Nerves), تمتد من المحفظة الداخلية حويجزات رقيقة تقسم الغدة الى فصيصات غير مكتملة . اظهرت المحفظة في حيوان القنفذ تماثلا مع المحفظة في حيوان بيز ابن عرس.يتكون نسيج الغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس بصورة رئيسية من الجريبات (Follicles) والخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) واوعية دموية واعصاب. تتخذ الجريبات اشكالا متعددة منها بيضوي (Oval), ومنها دائري ((Rounded, واحيانا تظهر بشكل غير منتظم (Irregular shape), وتكون الجريبات باحجام مختلفة صغيرة, متوسطة وكبيرة . اظهر القنفذ تماثلا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص حجم وشكل الجريبات. تبطن الجريبات في بيز بن عرس اما بنسيج ظهاري مكعبي واطئ بسيط ( Low simple cuboidal epithelial tissue) او نسيج ظهاري مكعبي بسيط (Simple cuboidal epithelial tissue) , بينما في حيوان القنفذ يظهر نسيج ظهاري عمودي بسيط (Simple columnar epithelial tissue) فضلا عن النسيج الظهاري المكعبي الواطئ البسيط والظهاري المكعبي البسيط . تحتوي تجاويف الجريبات على مادة جيلاتينية هي الغروان Colloid)) , وتظهر الجريبات تباينا في كمية الغروان اذ ان بعض الجريبات تكون مملؤة بالغروان والبعض الاخر يحتوي على كمية قليلة والقليل منها يظهر خاليا تماما من الغروان في كلا الحيوانين موضوع الدراسة, تنتشر في نسيج الغدة خلايا تدعى بالخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) او تسمى خلايا الكالسيتونين (Calcitonin cells) او (C - cells), وتظهر هذه الخلايا باشكال متباينة يتراوح بين الدائرية (Rounded) الى مضلعة الشكل ( (Polygonal shape, وهي تظهر اما بشكل مفرد (Single) او بشكل تجمعات (Clusters) في نسيج الغدة, وتحتل هذه الخلايا موقعين اساسيين في نسيج الغدة , الاول داخل جريبي Intrafollicular position) ) وتكون بين الغشاء القاعدي والخلايا الظهارية الجريبية والثاني بين جريبي Interfollicular position)) وتكون بين جريبات الغدة الدرقية , وتكون قليلة العدد ولم تظهر اختلافا في حيوان بيز ابن عرس عن القنفذ .اظهر التفاعل الكيمونسجي المناعي في حيوان بيز ابن عرس والقنفذ استجابة واضحة للتفاعل المناعي مع الاجسام المضادة للكالسيتونين, وظهرت الخلايا متقبلة للون البني وهو دليل التفاعل المناعي .• الغدة جار الدرقية Parathyroid Gland توجد الغدة جار الدرقية بتماس مع الغدة الدرقية وتحاط بمحفظة من نسيج ضام وهي امتداد لمحفظة الغدة الدرقية والتي تتكون من الياف مغراوية والياف مرنة ((Elastic fibers والياف عضلية ملساء واوعية دموية واعصاب . توجد الغدة جار الدرقية في موقعين طرفي قمي وطرفي جانبي. تمتد من محفظة الغدة جار الدرقية حويجزات الى داخل الغدة لتفصلها الى فصيصات غير كاملة، وتنتشر داخل نسيج الغدة. اما في القنفذ ( H.auritus ) فانها تقع ضمن نسيج الغدة الدرقية وتظهر بشكل فصوص (4 - 2) فصوص دائرية او بيضوية الشكل محاطة بمحفظة رقيقة تفصلها عن جريبات الغدة الدرقية.تم تمييز ثلاثة انواع من الخلايا في نسيج الغدة جار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس اذ تمثلت الخلايا الاكثر انتشارا بالخلايا الرئيسة ((Chief cells، والخلايا الحمضة (Oxyphil cells) وخلايا الماء الشفافة ( (Water - clear cellsوهي تماثل الخلايا في نسيج القنفذ وتترتب بشكل حبال خلوية ضمن نسيج الغدة.اظهرت الغدة جار الدرقية في بيز ابن عرس استجابة للتفاعل الكيمو نسجي المناعي, اذ ظهرت خلايا الغدة متقبلة للون البني دليل التفاعل المناعي اذ تظهر الاستجابة المناعية للخلايا على مستوى السايتوبلازم والغشاء البلازمي في الخلايا الرئيسة ( (Chief cells, واظهرت الاستجابة المناعية في الغدة للقنفذ اختلافا بالنسبة لشدة استجابة الخلايا حيث كانت اقل من حيوان بيز ابن عرس .اوضحت نتائج الدراسة الحالية الخاصة بتحليل الاحماض الامينية في مستخلص الغدة الدرقية وجار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H.javanicus ) (ذكور، اناث), تشخيص (13) حامضا امينيا في الذكور و(11) حامضا امينيا في الاناث, اما في حيوان القنفذ H.auritus (الذكور، الاناث), فقد تم تشخيص (12) حامضا امينيا في كل من الذكور والاناث. | Anatomical examination of thyroid gland in adult (males &females) H. javanicus revealed that the gland consist of two lobes (right & left), situated below the layrnx in neck region. The two lobes located at the sides of trachea (1 - 5) rings of trachea. they appear without Isthemus. The colour of the gland is reddish brown. The shape of the lobes either to be oval or elliptical. On the other hand the thyroid gland in H. auritus showed a clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the oval shape of the gland. Thyroid gland of H. javanicus surrounded by capsule of connective tissue consist of external layer of collagenous and elastic fibers, fibroblast and internal layer consist of collagenous fibers with smooth muscle fibers, the capsule also contain blood vessels and nerves. Thin trabeculae extend from the capsule divided the gland into incomplete lobules. The capsule of thyroid gland in H. auritus showed clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the adipose tissue between the capsule and gland tissue in H. auritus.Histologically thyroid gland in H. javanicus consists of follicles, parafollicular cells, blood vessels and nerve. The follicles appear in different shapes (oval, rounded and irregular shapes, and have different size (small, medium and large). The thyroid gland tissue in H. auritus has the same appearance of that in H. javanicus. The follicules in H. javanicus lined by epithelial tissue either to be Lwo simple cuboidal or simple cuboidal epithelium. In H. auritus lind by Lwo simple cuboidal, simple cuboidal or even simple columnar epithelial tissue. The follicular cavities contain different quantities of colloid, and few of them lack of collid in both under investigated animals. Parafollicular cells are spreading in gland tissue; they also called calcitonin cella or c - cells. These cells have different shapes either to be rounded or polygonal shape, and found as single or clusters. They are either to be interfollicular or intrafollicular position. The immunohistochemistry reaction revealed clear positive reaction for calcitonin , and the appearance of brown colour represented evidence for the immune reaction .• Parathyroid glandResults of the present study revealed that parathyroid gland situated closely with thyroid gland in both animals under investigatin . The gland surrounded by a capsule of connective tissue represented as an extension from the capsule , which consist of collagenous fiber, elastic fibers, smooth muscles fibers and blood vessels and nerves. The parathyroid gland situated at two position (lateral terminal / apical terminal) the trabeculae wich exted from the gland capsule to the gland tissue separated the gland into incomplete. In H. auritus the parathyroid gland formed from (2 - 4) lobes with rounded or oval shapes and surrounded by thin capsule separated from the thyroid gland follicles.Three types of cells have been differentiated in the parathyroid tissue in H. javanicus represented by chief cells wich apper the most abundant in comparison with the other two types, the second type are the oxyphil cells and the third are water - clear cells, they are similar in both animals and appear as a cellular cords within the gland tissue. The immunohistochemical study in parathyroid gland of H. javanicus reveald positive reaction for calcitoninin, where ̛s the cells appear ̛s in brown color giving the evidence for the immune reaction in cytoplasm and plasma membrane of the chief cells In H. auritus there was clear immune reaction but less than H. javanicus . Result of the present study related with the amino acid analysis of the thyroid and parathyroid glands extraction in H. javanicus (mals &females) declear (13) amino acid in males and (11) in female while in H. auritus (male &females) there were (12) amino acid in both male and females.

اختبار كفاءة اوكسيد المغنيسيوم النانوي في مكافحة الفطر Rhizoctonia solani في نبات الباذنجان

Author name: رشا سعد فوزي
Supervisor name: امنة محمد علي | مهند مهدي عبد
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - Faculty Of Basic Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر السموم الفطرية / قسم وقاية النبات / كلية الزراعة / جامعة بغداد لسنة 2016 من اجل اختبار كفاءة جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوي في مكافحة الفطر Rhizoctonia solani في نبات الباذنجان صنف (اعجوبة العراق ) .تم اختبار المقدرة الامراضية لعزلة الفطر Rhizoctonia solani في الوسط الزرعي PDA على بذور الباذنجان, اظهرت النتائج ان عزلة الفطر Rhizoctonia solani اعطت نسبة اصابة عالية على بذور الباذنجان مقارنة بمعاملة المقارنة (بدون فطر ) حيث توضح النتائج ان نسبة الانبات في معاملة المقارنة بلغت 97.33 %. اما في معاملة الفطر بلغت 12 % . كما وجد ان اضافة جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوي ( MgO) بتراكيز 1 % و2 % و3 % ادت الى تثبيط الفطر مقارنة بمعاملة المقارنة (فطر ممرض ) وتراوحت نسب التثبيط (96.33 % , 100 % , 100 % ). في حين اظهرت نتائج تجربة الاصص ان معاملة البذور وخلط التربة بجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية له اثر ايجابي في رفع النسبة المئوية لانبات بذور الباذنجان وكبح نشاط الفطر Rhizoctonia.solani , وكذلك لها اثر ايجابي في معايير النمو المدروسة . اذ ادت المعاملة بجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية الى زيادة في الوزن الطري والجاف لنبات الباذنجان قياسا بمعاملة الفطر الممرض بمفرده الذي بلغ فيها الوزن الطري والجاف للمجموعين الجذري والخضري 0.18 , 0.06 , 1.60 , 0.52 غم.نبات 1ٙ على التتابع. في حين كانت اوزان المجموعين الجذري والخضري الطري والجاف لمعاملة البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي 0.81 , 0.29 , 4.74 ,1.39 غم.نبات 1ٙ على التتابع, وفي معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي 0.77 , 0.26 , 7.03 , 1.85 غم .نبات 1ٙعلى التوالي . وكانت معاملة المقارنة (بدون فطر ) 0.51 , 0.27 ,4.74 , 1.29 غم .نبات 1ٙعلى التتابع . واظهرت النتائج تاثيرجسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية في نسب العناصرالغذائية (النتروجين , الفسفور , البوتاسيوم , الكلوروفيل ) في نبات الباذنجان فقد تفوقت المعاملات التي تحتوي على جسيمات اوكسيد المغنيسيوم النانوية في نسبة النتروجين فكانت نسبة النتروجين في معاملة البذورالمعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة(بدون فطر ) 2.04 , 2.03 , 1.99 ملغم . سمٙ2على التوالي اما في معاملة الفطر فكانت نسبة النتروجين فيها 1.77ملغم . سمٙ2 .اما نسبة الفسفور في معاملات البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي والتربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة (بدون فطر ) فكانت 0.51 , 0.48, 0.49ملغم . سمٙ2 على التتابع , اما في معاملة الفطر فكانت نسبة الفسفور فيه 0.47ملغم . سمٙ2 . وكانت نسبة البوتاسيوم في معاملات البذور المعفرة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي ومعاملة المقارنة(بدون فطر) 0.37 , 0.41 , 0.36 ملغم . سمٙ2 ,اما نسبة البوتاسيوم في معاملات الفطر فكانت 0.35 ملغم . سمٙ2 ,حيث تفوقت معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم النانوي في نسبة البوتاسيوم فيها عن بقية المعاملات . وتفوقت معاملة التربة المعاملة بالنانو في نسبة صبغة الكلوروفيل فيها على بقية المعاملات مقارنة بمعاملة الفطر التي كانت نسبة الكلوروفيل A ( 1.01 , 0.54 مايكروغرام .سمٙ2) على التتابع , في حين كانت نسبة الكلوروفيل B في معاملة التربة المعاملة باوكسيد المغنيسيوم ( 1.17 , 0.71 مايكروغرام . سمٙ2) على التتابع .ان اضافة جسيمات MgO النانوية ادى الى زيادة نسبة كل العناصر الغذائية المهمة في المعاملات التي تحتوي على هذه الجسيمات . | This Study was conducted in mycotoxin laboratory / Defartment of plant protection / Agri - cuiture collage / Baghdad University in 2016 to test the efficiency of Magnesium Oxide - nano particles to combat Rhizoctonia solani fungi in eggplant type (Marvel of Iraq ). The satisfactory ability to isolating the Rhizoctonia solani fungi was tested in the agricultural sector PDA on eggplant seeds , The results showed that isolation of Rhizoctonia solani was given ahigh injury rate on eggplant seeds Compared to the comparison treatment (Without fungi ) . Where the results are shown the germination rate of comparison treatment was reached to 97.33% ,While in fungi treatment was reached to 12%. It was also found that addition of MgO nanoparticles in concentration (1%, 2% , 3%) led to inhibition the fungi compared to the comparison treatment (pathogenic fungi), the rate of inhibition varied (96.33%, 100% , 100%) .While the results of the experiments showed that the treatment of seeds and mixing the soil with MgO nanoparticles has positive effect to increase the percentage of eggplant seeds germination and curb the activity of Rhizoctonia solani fungi , Also it has positive impact on the studied growth parameters .The treatment of the MgO nanoparticles led to increase in soft and dry weight of eggplant compare with treatment of pathogenic fungi alone in which the soft and dry weight of radical and vegetative groups reached to (0.18, 0.06 , 0.52 gm) plant 1 on the relay . while the soft and dry weights of the radical and vegetative groups in the treatment of fermented seeds by MgO nanoparticles (0.81, 0.29 , 4.74 , 1.39 gm ) plant 1 on the relay . And in the soil treatment which was treated by MgO nanoparticles (0.77 , 0.26 , 7.03 , 1.85 mg) plant 1 on the relay .And the comparison treatment (without fungi ) was being ( 1.29 , 4.74 , 0.27 , 0.51 gm ) plant 1 on the relay . The results showed the effect of MgO nanoparticles in ratios of the nutrients (nitrogen , phosphour, potassium , chlorophyll )in eggplant , hence the treatment which containing MgO nanoparticles was excelled in nitrogen ratio subsequenliy the ratio nitrogen in the treatment of fermented seeds by MgO nano particles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comparison treatment (without fungi )was being (1.99, 2.03 , 2.04 )mg.cm2 respectively. while in the treatment of fungi the ratio of nitrogen was (1.77mg .cm2 ). While the ratio of phosphorus in the treatment of fermented seeds by MgO nanoparticles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comparison treatment (with out fungi ) was (0.49 , 0.48 , 0.51 mg. cm2) on the relay . while in the treatment of fungi , phosphorus ratio was (0.47 mg .cm2 ).And the ratio of potassium in treatment of farmanted seeds by MgO nanoparticles and soil treatment which treated by MgO nanoparticles and comperison treatment (without fungi ) was ( 0.37, 0.41 , 0.36 mg . cm2).While the ratio of potassium in fungi treatment was (0.35 mg.cm2) , where the soil treatment which treated by MgO nanoparticles was excelled in the potassium ratio than others treatments . The soil treatment which treated by nano was excelled in the chlorophyll dye ratio than others treatment compare with fungi treatment in which the chlorophyll A ratio was (1.01 , 0.54 mg.cm2) on the relay . whilst the chlorophyll B ratio in the soil treatment which treated by MgO was being (1.17 , 0.71 mg.cm2) on the relay . The addition of MgO nanoparticles led to increase ratio of the all nutrients which are important in the treatment containing this particles

اختبار كفاءة العسل المدعم بالمواد النانوية في مكافحة فطر Aspergillus flavus في بذور الذرة الصفراء المخزونة == Testing honey backed efficient nanomaterials in the against ( Aspergillus flavus) in Maize stored seeds

Author name: ديمة ايوب يوسف مرزوق
Supervisor name: امنة محمد علي | حليمة زغير حسين
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - Faculty Of Basic Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار كفاءة جسيمات اوكسيد الزنك النانوية( ZnO(NP) ) والعسل والعسل المدعم بجسيمات اوكسيد الزنك النانوية ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس في تثبيط الفطر Aspergillus flavus وتحطيم السم المنتج منه تحت الظروف المختبرية . اثبتت اختبارات التضاد ان اضافة كل من جسيمات اوكسيد الزنك النانوي ZnO(NP) بتراكيز 1%, 2%, 3% حققت تثبيطا لنمو الفطر A.flavusعلى الوسط الزرعي PDA بنسبة 98.55%, 100%, 100% على التوالي قياسا بمعاملة المقارنة (فطر ممرض بمفرده والتي بلغت (0.0 , واظهرت نتائج استعمال العسل بتراكيز 10%,20%,%30 الى تثبيط الفطر بنسبة %75.3 ,%78 ,78.6 % على التوالي, في حين بينت النتائج فاعلية العسل المدعم ب NP))ZnO في تثبيط الفطرعند استعماله بتراكيز %10 , %20 , %30 اذ بلغت نسبة التثبيط %85.6, %87 , 87.3 % على التوالي. كما اظهرت النتائج كفاءة مستحضر الفايلكس في تثبيط الفطر بنسبة 74.4%, 100%, 100% عندما كان التركيز المستعمل من الفايلكس 0.1%, 0.2%, %0.3على التوالي. تم اختبار كفاءة جسيمات ZnO(NP)والعسل والعسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس تحت ظروف الخزن بينت النتائج ان جميع المعاملات ادت الى خفض معنوي في نسبة الاختزال وتركيز سم الافلا B1))AFB1 في حبوب الذرة الصفراء المخزونة وبفارق معنوي عن معاملة السيطرة اذ بلغت 0.0و 1.13مايكروغرام/كغم باستعمال جهاز High performance liquid chromatography (( HPLC , باختيار افضل تركيز لكل من المواد المستخدمة لتثبيط نمو الفطر , اذ اظهرت نتائج استخدام جسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس اعطى اعلى نسبة اختزال لسم الافلاB1 بلغ% 93.80 وبتركيز 0.07 و91.15% بتركيز 0.10مايكروغرام/كغم على التوالي كما اظهرت نتائج استعمال العسل نسبة اختزال سم الافلا B1 %79.64 وبتركيز 0.23مايكروغرام/كغم , وتلاه استعمال العسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) اذ بلغت نسبة اختزال سم الافلا B1 %82.30 وبتركيز 0.20مايكروغرام/كغم . اظهرت النتائج كفاءة جسيمات ZnO(NP)والعسل والعسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) ومستحضر الفايلكس في تحطيم الفطر A.flavusومنع انتاج سم الافلا B1 في حبوب الذرة الصفراء قياسا الى معاملة السيطرة التي كانت 1.12مايكروغرام/كغم باستعمال جهاز HPLC , اذ وجد عند استعمال جسيمات ZnO(NP) نسبة اختزال سم الافلا B1 %96.42وبتركيز 0.04 مايكروغرام /كغم , في حين كانت نسبة اختزال السم %72.32وبتركيز 0.31مايكروغرام /كغم عند استعمال العسل , وبينت نتائج استخدام العسل المدعم بجسيمات ZnO(NP) نسبة اختزال سم الافلا %83.92 B1وبتركيز 0.18 مايكروغرام /كغم , اظهرت نتائج استخدام مستحضر الفايلكس نسبة اختزال سم الافلا %94.64 B1 وبتركيز 0.06 مايكروغرام/كغم . | This study was aimed at efficacy assessment of zinc oxide nanoparticles ZnO(NP), honey, honey fortified with ZnO(NP) and phylex chemical against Aspergillus flavus and its toxin at culture media . Antagonism tests revealed all ZnO(NP) treatments at 1%, 2% and 3% inhibited A. flavus growth on PDA by 98.55, 100 and 100%, respectively compared to untreated control (fungus only control) which was 0.0%. Honey treatments at 10, 20 and 30% inhibited the fungus growth by 75.3 , 78 and 78.6 %, respectively. ZnO(NP) - fortifie honey treatments inhibited fungal growth by 85.6, 87 and 87.3 % at 10, 20 and 30%, respectively. Whereas, phylex treatments could inhibit fundal growth by 74.4%, 100% and 100% at concentrations 0.1, 0.2, 0.3, respectively . ZnO(NP), honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex efficacy at storage condition were tested. All treatments inhibited A. flavus growth and reduced the aflatoxin (AFB1) production in stored corn. HPLC confirmed ZnO(NP) treatment reduced AFB1 up to 93.80 when aflatoxin concentration was 0.07 μg/kg compared to 1.13 μg/kg for control treatment. Whereas, honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex treatments reduced B1 aflatoxin up to 79.64, 82.30. and 91.15%, respectively. B1 concentration values tested for each treatment were 0.23, 0.20 and 0.10 μg/kg compared to1.13 μg/kg for control treatment. The efficacy of ZnO(NP), honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex to damage the fungus A. flavus and prevent AFB1 production in corn grains was tested by HPLC. ZnO(NP) reduced B1 aflatoxin up to %96.42 with 0.04 μg/kg concentration compared to 1.12 μg/kg for control treatment. Honey, ZnO(NP) fortified honey and phylex treatments could reduce B1 aflatoxin up to 72.32, 83.92 and 94.64%, respectively. B1 concentration values tested in corn grains were 0.31, 0.18 and 0.06 μg/kg compared to1.12 μg/kg for control treatment indicating presence of significant differences

تاثير الجبرلين والكاينتين والسماد المركب NPK في نمو وحاصل الينسون (.Pimpinella anisum L) ومحتواه من بعض المركبات الفعالة == The effect of Gibberellin , Kinetin and compound NPK fertilizer on growth and yield of anise (Pimpinella anisum L.) and some its active compounds

Author name: غفران علاء محمد رضا الخزرجي
Supervisor name: بهاء الدين مكي فيروز الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - Faculty Of Basic Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسـتان حقليتان في الحديقة النباتية التابعة لقسم العلـوم - كلية التربية الاساسية - الجامعة المستنصرية خلال موسم النمو الشتوي 2015 - 2016 تهدم الدراسة الاولى الى معرفة تاثيرتراكيز من منظم النمو الجبرلين ( (GA3 ومستويات من السماد المركب NPK والتداخل بينهما وتتضمن التجربة الثانية معرفة تاثير من منظم النمو الكاينتين ومستويات من السماد المركب NPK والتداخل بينهما التجربة الثانية في بعض صفات النمو والحاصل والمواد الفعالة للزيت الطيار في نبات الينسون (.Pimpinella anisum L) , زرعت بذور الينسون بتاريخ 1/11/2015 اذ استخدمت ثلاثة مستويات من السماد المركب NPK (0 و200و 400) كغم.ھ - 1 اضيفت الى التربة فضلا عن ثلاثة تراكيز من حامض الجبرلين هي 0) و50 و100) ملغم.لتر1 - رشت على النباتات في التجربة الاولى اما التجربة الثانية فقد تضمنت ثلاثة مستويات من السماد المركب NPK (0 و200و 400) كغم.ھ - 1 اضافة الى ثلاثة تراكيز من الكاينتين (0 و50 و100) ملغم.لتر1 - , صممت التجربة وفق تصميم القطاعات الكاملة المعشاة RCBD وبثلاثة مكررات وبذلك تضمنت كل دراسة تجربة عاملية (3×3) بواقع 27 وحدة تجريبية مساحة كل وحدة تجريبية 1.5×1.5 م2 اتبعت كافة عمليات خدمة التربة والمحصول الخاصة بمحصول الينسون من ري وازالة الادغال وتسميد. اظهرت نتائج التجربة الاولى ان اضافة المستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK ادت الى زيادة ارتفاع النبات (13.24%) ووزن الف بذرة (20.21%) وعنصر البوتاسيوم (20%) والمركبات الفعالة Dianethole وTrase - anethole وLimonene وγ - himachalene , كما ادى رش نباتات الينسون بالتركيز 100 ملغم.لتر1 - من حامض الجبرلين الى زيادة ارتفاع النبات (14.88%) ووزن الف بذرة (7.77%) وعنصر البوتاسيوم (7.81%) , وزيادة تركيز المواد الفعالة Trase - anethole وLimonene وShikmic acid, اعطى التداخل بين السماد المركب NPK وحامض الجبرلين زيادة معنوية في بعض الصفات المدروسة اذ ادى التداخل بين المستوى 400كغم.ھ - 1 من السمادNPK وتركيز 100ملغم.لتر1 - من حامض الجبرلين الى زيادة في ارتفاع النبات (29.38%) ووزن الف بذرة (29.41%) وعنصر البوتاسيوم (27.94%) والمركبات Methyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene وShikmic acid. اما في التجربة الثانية فقد ادت اضافة المستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK الى حصول زيادة في ارتفاع النبات (9.65%) والبوتاسيوم (39.20%) ووزن الف بذرة (10.96%) فضلا عن المركبات Anise - aldehyde وMethyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene . كما عمل التركيز 100 ملغم.لتر1 - من الكاينتين على زيادة عدد الاوراق (26.31 %) وعدد التفرعات (43.54%) والوزن الجاف (28.05%) وعدد النورات (26.26%) وعدد ازهار للنورة الرئيسة (26.14%) وعدد البذور في الزهرة الواحدة (26.72 %) وحاصل النبات الواحد (88.66%) وحاصل النبات الكلي (88.59%) وعنصر النتروجين (62.83%) والفسفور (62.96%) والكالسيوم (62.18%) والمغنيسيوم (60.86%) والبروتين (62.71%) والكاربوهيدرات (38.69%) والكلوروفيل (44.17%) والنسبة المئوية للزيت (37.84%) والوزن النوعي (1.07%) وكثافة الزيت(0.51%) ومعامل الانكسار (0.32%) اضافة الى المركبات Anise - aldehyde وMethyle chavicol وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene وShikmic acid , اما التداخل بين التركيز 100 ملغم.لتر1 - من الكاينتين والمستوى 400 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK اعطى زيادة في المركبات Anise - aldehyde وDianethole وTrase - anethole وγ - himachalene . يستنتج من هذه الدراسة تفوق المستوى 200 كغم.ھ - 1 من السماد المركب NPK في معظم الصفات المدروسة ولكلا التجربيتن اما الجبرلين فقد تفوق التركيز 50 ملغم.لتر1 - تفوقا في معظم التراكيز المدروسة , واعطى التركيز 100ملغم.لتر1 - من الكاينتين تفوقا في معظم الصفات المدروسة .

دراسـة لبعــض المؤشــرات المناعيــة والدمــوية لمرضى عراقيــين يعانــون من فــرط الحساسيه النــوع الاول == Study of Some Immunological and Hematological Changes in Iraqi Patients Suffering from Hypersensitivity Type - 1

Author name: سرى مسلم داود الاعــــــرجي
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad - College Of Science For Girls
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: قد تم تصميم هذه الدراسة لتسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلويه ( IL - 13, IL - 18) والكلوبيولين المناعي الكلي ((T - IgE والكلوبيولين النوعي(S IgE) ل 20 مسبب للحساسيه داخلي وخارجي واعداد خلايا الحمضات. وكان مجموع مرضى الحساسية 168، [99 مريضا بالربوالتحسسي (43 ذكرا)، (56 انثى)]، [69 مريض بالتهاب الجيوب الانفيه التحسسي (29 ذكرا)، (40 انثى)]، وجمعت اربعين عينه لاشخاص اصحاء [ (15 ذكور)، (25 اناثا )]. الفئة العمرية (5 - 60) سنة تم جمعها من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافة وخلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى شباط 2017. تمت دراسه بعض التغيرات الدمويه ومنها قياس نسبه ال (Hb) والعدد الكلي لخلايا ال (WBC) واعداد خلايا الحمضه لجميع المرضى والاصحاء عن طريق استخدام محلل الالي (Beckman Coulter) والعده الخاصه بالجهاز . تم قياس الاختبار المناعي (IL - 13, IL - 18, T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء باستخدام جهاز (ELISA ) والعدد الخاصه بالاختبارات. تم قياس الكلوبيولين النوعي (Spesific IgE) الخاص بالمحسسات المستنشقه (عث الفراش، الحيوانات الاليفه ,الصرصر، الاعفان، حبوب اللقاح الاعشاب، حبوب اللقاح الاشجار ,حبوب اللقاح الحشائش) لجميع المرضى والاصحاء باستخدام تقنيه (Western Immunobloting Electrophoresis test) والعده الخاصه بالجهاز والفحص (Euro line Inhalation Profile Kits).توصلت هذه الدراسه الى النتائج التاليه : 1 - عدم وجود فروق معنويه بين المجاميع المدروسه طبقا للجنس . 2 - عدم وجود فروق معنويه بين مرضى الربوالتحسسي الذين لهم تاريخ عائلي ايجابي وسلبي. بينما كانت هناك فروق معنويه بين مرضى التهاب الجيوب الانفيه التحسسي الذين لديهم تاريخ عائلي سلبي وايجابي .3 - احصائيا، كانت الفئة العمرية و(21 - 40) الاكثر شيوعا في مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي حيث بلغت نسبتها المئويه على التوالي[63، 63.6٪)، (47،68.1٪)].4 - زيادة معنوية في النسبه المئويه لاعداد الحمضات (٪) ومستوى الكلوبيولين المناعي الكلي ( T - IgE) ظمن مجموعتي الحساسية مقارنتا بمجموعه السيطره.5 - اظهرت النتائج وجود فروق معنويه بين اعداد المرضى الذين لديهم الكلوبيولين المناعي الخاص بالمحسسات ((Spesific IgE واعداد المرضى ذوي النتيجه السالبه لدى مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي . 6 - سجل محسس الصراصر اعلى نسبة محسس لدى مرضى الربوالتحسسي وتلتها مسببات الحساسية للحيوانات الاليفة وحساسية حبوب اللقاح. بينما في مجموعة التهاب الجيوب الانفيه التحسسي اعلى نسبة محسسات كانت للحيوانات الاليفة وتلتها حبوب لقاح الحشائش .7 - زيادة معنويه كبيرة في مستوى الحركيات الخلويه (IL - 13, IL - 18) عند مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي .8 - وجود علاقة ارتباط معنوية كبيرة بين النسبه المئويه لاعداد خلايا الحمضات والكلوبيولين المناعي الكلي( T - IgE) في مرضى الربو التحسسي والتهاب الجيوب الانفيه التحسسي r = 0.424)، (P = 0.00 | This study is designed to shed light on the role of IL - 13, IL - 18, T - IgE, Spesific IgE for 20 Indoor and outdoor inhalant allergens in some of type - 1 allergic disease and Eosinophil cells count . The Total allergic patients have been 168, 99 asthmatic patients (43 male ), (56 female ), 69 Rhinitic patients (29 male ), (40 female) and Apparently Healthy Control AHC 40 (15 male ) , (25 female ). Their age group (5 - 60) years . The groups have been collected from the Specialized Center Of Allergy in Baghdad / AL - Resafa and during the period from October 2016toFebruary2017. Some Hematological changes have been studied, including the measurement the Hb% , total count WBC, and eosinophil cells % for all subject by using automated analyzer (Beckman Coulter Analyzer). Beside some Immunological changes were studies including (IL - 13, IL - 18 and total IgE) which have been measured for all subjects by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) . The measurement of serum specific IgE for some inhalant allergens (HDM, Pits, Cockroach, Mites, Grasses pollen, Tree pollen and Weed pollen ) allergens for all subject by using Western Immunobloting test. The Study has reached the fallowing results.1 - There are no significant differences between the studied groups according to gender.2 - There are significant differences in family history between rhinitis group and control. 3 - Statistically, the age group (21 - 40) are most frequent within allergic asthma and rhinitis are (63, 63.6%), (47,68.1%) respectively. 4 - Highly significant increase in Eosinophil count (%) and total IgE within allergic groups when compared with control. 5 - Highly significant differences between positive specific IgE inhalant allergens (positive) and negative patients in asthma and rhinitis groups. 6 - The cockroach allergen records the highest percentage in asthmatic patients fallowed by pets allergens and grasses pollen allergens. While in rhinitic group the highest percentage is for pets allergens fallowed by grasses pollen , cockroach allergen. 7 - Highly significant increase in IL - 13 and IL - 18 level in asthmatic and rhinitic patients. 8 - Highly significant correlation between eosinophil cells count (%) and total IgE In asthmatic and rhinitic patients (r = 0.424 ), (P=0.00).

دراسة تصنيفية مظهرية لعائلة حشرات الخنافس الحارقة Coleoptera : Meloidae في محافظة بابل == Taxonomical and Morphological study on the Blister Beetles (Coleoptera : Meloidae) in Babilon province

Author name: اميرة ابراهيم عبد الزهرة
Supervisor name: سعدون ابراهيم اسماعيل
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - Faculty Of Basic Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study deals with morphology and taxonomy of blister Beetles (Coleoptera : Meloidae) in Babylon province.In our investigations ; there were fifteen species representing in nine genera under two subfamilies have been registered, these species are : 1 - Epicauta hirticornis (Haag - Rutenberg) Croscherichia goryi (Marseul)10 - Lydomorphus sp. MaranCerocoma graeca - 1112 - Cerocoma scovitzi Faldermann13 - Lydus mesopotamicus sp. nov.(Linnaeus) 14 - Lydus algiricus Fabricius Lytta nitidula - 2 - Nemognatha chrysomelina (Fabricius)sp. 3 - Nemognatha4 - Zonitis immaculate (Olivier)5 - Zonitis fernancastroi, Pardo Alcaide6 - Mylabris sp.klug 7 - Mylabris syriaca8 - Mylabris tenebrosa Laporte de CastelnauThe species of Lydus mesopotamicus sp. nov. has been described as a new species for science in Iraq, and has been given scientific geographical name.The genus Zonitis Fabricius and its two species; and the genus Lydomorphus Fairemaire have been recorded for the first time in Iraq.Three other species has been diagnosed and recorded for the first time in Iraq, they are : Epicauta hirticornis (Haag - Rutenberg)Fabricius Lytta nitidulaMaranCerocoma graecaThe Epicauta hirticorins (Haag - Rutenberg, 1880) was chosen as a simple type species of this family ; adults are described in details and all species body parts were drawn and pictured.Taxonomic keys for subfamilies, genera and species were desigend according to different of the important characters, especially pronotum, antennae, claws, spines of hind tibiae and pathches of elytra.

العلاقة بين المشعرات المهبلية والعوامل المرضية التناسلية الاخرى بين النساء في مدينتي كركوك وتكريت == Relationship Betwee Trichomonas Vaginalis And Other Genital Infectious Agents Among Women In Kirkuk & Tikrit Cities

Author name: برهان احمد محمد علي بيباني
Supervisor name: يحيى جرجيس سلمان | ابراهيم شعبان داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم خلال الفترة من الخامس عشر من شهر تشرين الاول 2006 ولغاية الثلاثين من شهر حزيران 2007 اجراء دراسة عن وبائية طفيلي المشعرات المهبلية وبعض مسببات الالتهابات المهبلية الافرازية المرافقة وغير المرافقة لها بين النساء المراجعات لقسم الاستشارية النسائية والتول | An epidemiological study was carried out from 15th, October 2006 to 30th, June 2007 for prevalence of Trichomonas vaginalis parasite and some causative agents of secretary vaginal inflammations associated or non - associated with the parasite among women attending the department of Obstetrics and Gynecology in two General hospitals in Kirkuk city and Tikrit teaching hospital in Tikrit city. A total of 300 samples (200 in Kirkuk, 100 in Tikrit) were colle - cted from (15 - 47) years old women. Two swabs were taken from the vaginal (high vaginal) and the lining of uterus cervix (endocervical) for each woman by Gynecologic physician. A gross examination of the swabs was done to determine the color of vaginal secretions and measurement of pH. A wet preparation was done from the (high vaginal swab) and examined microscopically for diagnosis of Trichomonas vaginalis and Candida spp. In addition a Gram stain smear was prepared from a portion of the same swab and examined by oil - immersion for diagnosis of Neisseria gonorrhoeae and Trichomonas vaginalis. A chemical test was done for the detection of Gardnerella vaginalis bacteria & Candida spores. The swabs prepared from endocervical were treated by ACON - Chlamydia Kit specific for diagnosis of Chlamydia trachomatis in vaginal swabs samples. The study concluded the following results : 1 - The infection with various sexually transmitted diseases agents were 68% , 78% in Kirkuk & Tikrit cities respectively (P>0.05).2 - The maximum infection rate for T. vaginalis was 19.5% in Kirkuk city & 16% in Tikrit city among co - infection with other agents and single infections.3 - The percentages of single infections with T. vaginalis alone for various age groups were 16.5%, 8% in Kirkuk and Tikrit cities respectively (P>0.05).4 - The rate of infections with various vaginal micro - organisms were in the following sequence : T. vaginalis (19.5%), G. vaginalis (18.5%), C. trachomatis (14%), Candida spp. (11.5%) & N. gonorrhoeae (4.5%) in Kirkuk city, whereasin Tikrit city the sequence of infection rates were as follows : G. vaginalis (43%), T. vaginalis (16%), C. trachomatis (12%), Candida spp. (6%) & N. gonorrhoeae (1%).(P>0.05).5 - The highest rates of infections with T. vaginalis only as a single infecting agents were 21.27%, 10% among a group age range (36 - 45) years in both Kirkuk & Tikrit cities respectively (P<0.05). 6 - The maximum rate of infection with the T. vaginalis were recorded among women with yellowish vaginal secretions without itching (37%), (31.25%), whereas in those with symptoms of copious secretions onlythe corresponding figures (30.17%), (18.51%) were recorded in bothcities respectively (P<0.05). 7 - The maximum infection rate with C. trachomatis in bloody swabs were (40%), (50%) in Kirkuk & Tikrit cities respectively correlated withclinical signs & symptoms. However, maximum infection rate with G. vaginalis was recorded in women with whitish vaginal discharge (60.86%) or yellowish (53.12%) then greenish (52.94%) in Tikrit city in comparison to Kirkuk city. The maximum infection with G. vaginalis were among women with bloody secretion (40%) followed by whitish secretion (30.35%). (P<0.05). 8 - The maximum infection rate with Candida spp. were recorded in women discharge milky secretions (33.33%), (25%) in Kirkuk & Tikrit cities respectively. Infection with N. gonorrhoeae showed different color vaginal discharge (P>0.05).9 - The maximum rate of infections with T. vaginalis (27.43%), (19.69%) were recorded in women whose pH of vaginal secretion range was between (5 - 6). (P> 0.05). The high vaginal swabs have been revealed to be more efficient in diagnosis of vaginal infection with T. vaginalis than endocervical swabs. The maximum rate of infections recorded by these swabs were (22.22%), (19.73%) respectively. The infection rate of pregnant women were (48%), (22.22%) from positive cases in both cities.10 - The maximum rate of infections with T. vaginalis were recorded in women using various contraceptive, women using intrauterine contraceptive device were the highly infected (33.33%), (31.57%) in both cities. P<0.05

دراسة تاثير البروبايويك في تكوين الغشاء الحيوي وانتاج البروتيز لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من اخماج الحروق والجروح == Study The Effect of Probiotic On Biofilm Formation And Production Protease Enzyme By Pseudomonas Aeruginosa Isolated From Contaminated Burns And Wound

Author name: علا عبد الكريم كاظم النعيمي
Supervisor name: منيرة جلوب اسماعيل العبادي | ضيماء محمود ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - Faculty Of Basic Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: he study includes the collection of 70 burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2013 to February 2014. 2) 31 isolates characterized as Pseudomonas aeruginosa 9 (45%) from wound and 22 (78.57%) from burn swabs, depending on the characteristics of the colonies phenotypic and microscopic when grown in differential selective media, as well as biochemical tests todiagnose isolates, Then the identification of these species were confirmed by using the system (GN I Card) using Vitek 2 device complementary step.3) The study includes sensitivity test towards 16 antibiotics for each species by using the system (AST Card) using Vitek 2 device, and the isolates ware Multi drug resistance, As results all isolates were resistant by 100 % for each of Piperacillin, Ticarcillin, Ticarcillinclavoulanic acid, Cefazolin, Ceftriaxone and Tigecycline. All strains were less resistance to Ceftazidime with percentage 50%. 4) All the isolates of Pseudomonas aeruginosa with percentage %100, have ability to produce protease enzyme.5) This study was use tow methods of biofilm formations seen in P. aeruginosa, Micro - titer plate method (MTP) and Tube method (TM), Results revealed that MTP was found to be more sensitiveand specific method for biofilm detection than TM. 6) Well diffusion method revealed the inhibitory effect of bacteria Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus rhamnosus GG and its supernatants in the growth of bacteria Staphylococcus aureus and P. aeruginosa, and was the supernatant of L. rhamnosus GG isthe largest inhibitory effect on the growth of S. aureus and P.aeruginosa with inhibition diameter 32 and 34 mm respectively, while the inhibition of growth by supernatant of L. acidophilus diameter 25 and 27 mm respectively. 7) Estimated the amount of protein in each of the biosurfactant and bacteriocine producers of L. rhamnosus GG bacteria concentration of 74, 54 Mg/mL respectively, while their concentration in bacteria L. acidophilus 44, 40 Mg / mL, respectively.8) Found that the bacteriocine product of bacteria L. rhamnosus GG and L. acidophilus GG have inhibitory effect on ability of P. aeruginosa to produce the enzyme protease, and the absence of this effect in the Biosurfactants the product of these two types.9) The biosurfactant product from L. rhamnosus GG showed inhibitory effect greater than the effect of the biosurfactant product from L. acidophilus to inhibition (production of biofilm and adhesion to epithelial cells).10) studied the suspension's effect of L. acidophilus and L. rhamnosus GG in contrived injuries wounds in mice contaminated with P. aeruginosa, Positive results have been shown to be affected by the contaminated bacteria injuries wounds.

تقييم دور الجين في دم نساء عراقيات مصابات بسرطان الثدي == Evaluation The Rule of Mammoglobin A Gene In Blood of Iraqi Women With Breast Cancer

Author name: نانسي فيصل رشيد
Supervisor name: امنة نعمة الثويني
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Mammaglobin A is a member of the superfamily of secretoglobins. Its expression is highly specific for mammary tissue and has been shown to be overexpressed in breast tumor tissue, indicating that mammaglobin A might confer a growth advantage to mammaglobin A - expressing tumor cells. The present study was undertaken to develop the mammaglobin A as a serum biomarker for the early detection of breast cancer, and breast cancer patients follow up after treatments. This study had taken ten months, it involved 84 patients with age ranged 15 - 74 years who had diagnosed with either stage I to III breast cancer or benign lesions of breast at certain Iraqi hospitals and breast cancer centers, and a total number of 10 apparently healthy individuals, with comparable age range of patients as control group.Ten ml of venous blood was collected from studied groups in order to be used for measuring estrogen and progesterone levels, Reverse transcription polymerase chain reaction (RT - PCR) test for detection of their serum m - RNA mammaglobin A existence, and serum mammaglobin A levels using Enzyme - Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) technique. Demographic study revealed that most cases enrolled in this study were women within their reproductive age 25 - 44 years old. Distribution of patients according to age group, marital status, and lactation status showed no statistically significant association (P>0.05) with any of these variables, in all comparison.The hormonal study states that elevated levels of estrogen were observed in 52 (62%) patients, also decrease in progesterone levels were observed in 50 (59%) patients out of the 84 cases studied. This indicate a highly significant SUMMARYassociation (p < 0.01) between breast cancer risk, elevated estrogen levels, and decrease in progesterone levels. Mammaglobin A protein was detectable by ELISA in 100% of breast cancer patients (65 case), and not in any benign tumor patients (19 case) nor healthycontrol women (10 females) which indicate the highly specificity of ELISA test (P<0.01) for measuring mammaglobin A levels in patients serum. With high concentration of protein in sera of women with late stage of breastcancer compared with a low protein concentration in sera of women with early stage of breast cancer. By applying a statistical analysis on the result it was found that serum mammaglobin A ELISA test is highly significant (P<0.01) for, differentiation between patients with metastatic breast cancer and patients with early diagnosed breast cancer. In this work, SCGB2A2 gene which coded for mammaglobin A was detected in 64 out of 65 breast cancer cases, but not in the benign or healthy individuals indicating its high specificity as a marker gene (SCGB2A2) for cells derived from mammary glands. A statistical analysis was made for comparison between the three groups, E - Malignant Tumors \ Early Stage, L - Malignant Tumors \ Late Stage, and B - benign, (E, L, and B) which show that the results of molecular study of mammaglobin A detected by RT - PCR is statistically high significance (P<0.001) when used for the differentiation between E group and B group, also between L group and B group. The results showed that mammaglobin A can become an important tool for detecting primary and metastatic breast cancer, and predicting disease outcome.

دراسـة بيئيــة للافقريات القاعيـة في هور الدلمج - وسط العراق == An Ecological Study of The Benthic Invertebrates In Al Dalmage Marsh - Middle of Iraq

Author name: ميسون حسن مشجل السراي
Supervisor name: هيفاء جواد جوير
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Invertebrates
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت الدراسة الحالية التنوع الاحيائي لمجتمع لافقريات القاع في هور الدلمج / وسط العراق فضلا عن بعض الخصائص الفيزياوية والكيمياوية لمياه الهور، اختيرت ست محطات لجمع العينات وذلك للمدة من بداية كانون الثاني وحتى كانون الاول 2013. استخدم تحليل التوافق CCA | Benthic invertebrate diversity on the Al - Dalmage marsh in the middle of Iraq, in addition to the some physical and chemical properties was the goal of the present study, for a period from January to the end of December 2013. Six stations along the eastern side of the marsh were chosen for monthly samples collection.The results showed water temperature ranged from(9 - 34.1)?C. The pH values were neutral but tends to near alkaline and ranged from (7.2 - 9).The Electrical conductivity values varied from (22735 - 2330) ?s/cm, according to the values of salinity (1.5 - 14.6) ‰ the marsh was classified as mesohaline (TDS) which showed high values ranged from (1820 - 17762) mg/L.This study showed that the marsh were well oxygenated due to the dissolved oxygen values which ranged from 7 - 12 mg/L, the study recorded values to BOD5 were ranging from (1.5 - 3)mg/L, and the marsh classified as very hard according to the total hardness values from (6980 - 825) CaCo3 mg/L. The high perecentage of organic matter in the sediment was 2.7 %. The results showed the station were characterized by sediment texture varied from silt clay sand sediment in the stations 1, 4, 5 , silt clay in St(2) and sand silt in St(3), sand clay silt in St(6).A total of 21286 individual benthic invertebrates was sorted, which represents which 78 taxonomic units, including 9 taxa. The Crustacea was the dominate group representing 29% of the total number of benthic invertebrates. It was noted that there were obvious differences in the total number of sorted individuals in which varied in each location and each month. The highest total number recorded in was st (2) was 4360 including 73 taxonomic units, while the highest total number recorded in April was 2624.The results of The relative abundance index showed that the species insects : Polypedilum sp Were more abundant in St(2 - 6), and dominant in St(6), while the Seinura sp were dominant in St(6), while the other taxonomy units varied from less abundant to rare abundant. Also the results of constancy index showed The which were considered "constant " However the other taxonomy units varied from "accessory " and" accidental" taxonomy units in study stations.The Shanon - Weiner index of totall benthic invertebrates varied from (1.2 - 3.8) bit/Ind, The uniformity index of benthic invertebrates varied from(0.7 - 1), these high values indicate that there is no ecological stress on benthic invertebrates in the study area.The Results of Jaccard Presence - community of similarity showed the highest degree of similarity to be 96% which recorded between St(1) and St(2).The values of the index of spcies richness varied from 1.3 - 15 with the greatest values recorded in April while lower values were in October.Six species of Turbellarian Platyhelminthes that were recorded, from which Stenostomum leucops, Stenostomum bryophilum, Stenostomum unicolor, Gyratrix hermaphrodites, Macrostomum sp, Dalyelliidae, which were considered as new records for Iraq, with Gyratrix hermaphrodites as the most abundant species and representing 25% of the total number of Turbellarian. It was noted that there were obvious differences in the total number of sorted individuals which varied in each location and each month, the highest total number recorded in St 3 was 400, while the highest total number recorded in November was (198).The present study result showed that three species of Nematoda were recorded incuding Seinura sp, Alaimus sp, Dorylaimus sp, Seinura sp as the most abundent species representing 84% of the total number of Nematoda. Spatially the highest total number of 590 individuals was recorded in St (4) , while temporally, the highest total number of 366 was recorded in October.One unidentified species of Gastrotricha was recorded for the first time in Iraq, 102 Ind were sorted these were considered "constant" recording to constancy index 63.8% which were sorted from all stations.A total of 2319 individuals of Rotifera was sorted, these were identified as 15 species that included Philodina sp, Rotaria citrinus, Dipleuchlanis sp, Euchlanis sp, Notholca sp, Ttriploeuchlainis sp, Colurella sp, Lepadella sp, Lecane sp, Proales sp, Cephalodela sp, Synchaeta sp, Hexarthra mira, and finally Brachionus sp which was recorded the highest number of individuals 540 individuals.A total of 1888 individual Annelida were sorted representing 12 species including nine species belonging to the family Naididae (three belong to the sub family Naidinae and six belonging to Tubificoid worms), two species belonged to Aleosomatidae including Aeolosoma hemprichi, Aeolosoma variegatum, and finaly one specie belong to Hirudinea which was Glossiphonia heteroclite, with three 3 ind in all study.The family Aleosomatidae recorded the highest percentage of 58% of the total number of Annelida.The sub family Naidinae including Paranais litoralis, Dero (Aulophorus) furcata, Stylaria lactustris.The highest frequency of 23.6% was recorded by P. litoralis.The Tubificoid worms represent six species which were Limnodrlius hoffmeisteri, Limnodrlius profundicola, L. claparedeianus, L udekemianus, Tubifex tubifex, Branchiura sowerbyi. This study also isolated 6238 individual Crustacea, these were identified as 15 species that included five species belonged to Cladocera, four order belong to copepod, which were recorded the highest percentage 30% of the total number of Crustacea, in addition to Macrobrachium nipponense from Decapoda, Sphaeroma annadalei anndalei from Isopoda, Ostracoda, Amphipoda, Conchostracha. It was noted that there was obvious differences in the total number of sorted individuals which varied in each location and each month, The highest total number recorded in st (2) was 1480, while the highest total number of 730 was recorded in April. The study finds 4297 individual insects groups, were sorted represent seven order includes larvae of Ephemeroptera, Trichoptera, Odonata, (Zygoptera, Anisoptera) Diptera (Culicidae, Chironomus sp, Polypedilum sp) Lepidoptera larvae Hemiptera (Corixidae, Nepa cinerea), and adult of Coleoptera (Dysitidae, Hydrophilidae Elmidae, Curculionidae, Coleoptera larvae), the Diptera larvae were recorded the highest percentage 55 % of the total number of insects groups, and Nepa cinerea was considered as new records for Iraq.This study showed two class from Mollusca, 1956 Ind were sorted, including Gastropoda and Pelecyopoda.The Gastropoda which were recorded the highest percentage 94% of the total number of Mollusca, these were identified to physa acuta, Lymnaea sp, Melonoides tuberculata, Melnopsis nodosa, Theodoxus sp, physa acuta which was the greatest percentage 41% of the total number of gastropoda. pelecyopoda which were including Pseudodontopsis euphraticus, Tigridis Unio, Corbicula fluminea, Corbicula fluminali

دراسة تصنيفية حياتية مقارنة لانواع من الجنس Euphorbia L. (Euphorbiaceae) في العراق == A Comparative Biosystematic Study of Some Species of The Genus Euphorbia L. (Euphorbiaceae) In Iraq

Author name: ازهار طاهر صليبي
Supervisor name: عذية ناهي سلمان المشهداني
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناول البحث الحالي دراسة تصنيفية مقارنة لثلاث وعشرين مرتبة تصنيفية تعود جميعها للجنس Euphorbia L. من العائلةEuphorbiaceae النامية في العراق، تضمنت الجوانب المظهرية العامة والدقيقة ودراسة حبوب اللقاح والمركبات الكيميائية والبيئة والتوزيع الجغرافي فضلا عن ا | The current research deal with twenty - three taxa belong to the genus Euphorbia L., Family Euphorbiaceae grown in Iraq. The study included the gross general morphological and micromorphological characters, the Pollen grains also studied and the chemical compounds, Ecological and geographical distribution and taxonomic treatment have done.Also botanical key was putted to separate the species. General survey for the Phytogeographical districts where the taxa spread in, and the result was a large crowds of samples, and new locations of taxa distribution were recorded. The specimens studied, and correct the mistake naming, specimens were identified and reidentified some miss identified specimens in the Iraqi herbaria. A comparative morphological study was undertaken to all plants parts of taxa appeared from habit and duration of taxa to the quantitative and qualitative attributes the members of the vegetative and floral parts included the roots, stems, leaves, stipules, flowering parts and fruiting parts and drew charts diagrams, tables and accompanying with natural images for different morphological characteristics, as well as the field images. This study showed that all species was herbs, shrubs and succulent and semisucculent annual and perinnal, the major taxonomic importance was for flowering parts includeing the specific Inflorescence, installation of a cupped and its regularity on the branches of the plant, glands forms, numbers, presence or lack of appendages, bractes and bracteoles shapes, dimensions and color fruits shape, indumentum and seeds forms, dimension and her surface sculpturing; and the presence or lack of caruncle, as well as the qualities of roots, stems and leaves, and the morphological characteristics of all plant parts mentioned above have a taxonomic importance in identification and separation of the studied taxa. The study of the micromorphological characters of hairs, leaves epidermal cells and the stomatal complex which included anomocytic, paracytic, anisocytic and tetracytic, have a taxonomic importance of supporting the morphological characters in separation and identification of the genus taxa.The pollen grains have a taxonomic importance because their different in shape, dimensions of polar and equatorial view, the wall thickness and their ornamentation. They are mostly of Tricolporate except two species were Hexacolporate, also the differences in their shape in the polar and equatorial view.They were spheroidal, ovoid and oblate - spheroidal in the polar view and oblate, spheroidal, subprolate and oblate - spheroidal in the equatorial view.The ornomentation they were reticulate, microreticulate and foveoate.The chemical study also importance in separation of the genus taxa four compounds Flavonoids diagnosed in all the studing species but different in concentrations, by using HPLC, they are Myriscetin, Quercetin, Kaempferol and Coumarin esculetin and this confirms that there are a common evolutionary link between the species in terms of their chemical properties, which suggests belonging species to the genus Euphorbia.Through field surveys and information installed on the herbarium samples, the taxa where distributed on their growth areas, and maps have been drawn for taxa distribution in the Iraqi natural geographical districts. the species of Euphorbia were distributed in all Iraqi districts especially in LCA, MSU, MRO, and DWD and some species were farmed in gardens and nurseries either to the beauty of their bractes colors or because their acceleration to the environmental changes such as succulent species, As well as wild species were spread in mountainous areas, oak, nuts forests, in orchards, cultivated fields, flat plains and desert areas in loam soils, clay, gravel, and sand. Through this study some new taxa where founded in Iraq and they are E. cyparissias Kunth ; E. maculata L. ; E. serpens L. ; E. tirucalli L., and this study suggests to recorded them for the first time in Iraq.

دراسة بيئية وسكانية للقوقع الارضي Candidula gigaxii (L.Pfeiffer, 1850) (Pulmonata : Hygromiidae) في مواقع مختارة من محافظة بغداد == Ecological And Population Study of The Land Snail Candidula Gigaxii (L.Pfeiffer, 1850) (Pulmonata : Hygromiidae) In Selected Locations From Baghdad Province

Author name: بشرى محمد كاظم ديوان البيضاني
Supervisor name: عماد الدين عبد الهادي المختار
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Few studies on terrestrial snails in general, and garden snails in particular, existin Iraq. The group being important apparently for its wide - spread distribution in various habitats. One species of this group which has been previously recorded in Baghdad, is the garden snail Candidula gigaxii, class : Pulmonata, family : Hygromiidae.Available samples of the land snail C.gigaxii were collected from four locations within Baghdad province; a Taji, the Army Canal area, the Zafaraniyah, and Al - Jadiriya district, the study period of June 2013 to May of 2014.Environmental measurements were recordedat each site. Results showed that air temperature range was 10 - 34? C, soil temperature range was 5 - 26? C, pH range of the soil was between 4 - 8.9 and the content of the soil organic matter was between 0.3 - 2.0%.Snail samples were divided into seven size - classes according to the dimension of the shell and these were <2, 2 - 4, 4 - 6, 6 - 8, 8 - 10, 10 - 12, >12 mmPercentages of each size class were calculated. Having measured shell dimensions, shell growth index (Ia) was also calculated. The range of growth index value for this snail was 1.9 - 3.86 where the highest value was recorded at the Taji site in January 2014 which was probably attributed to low temperature range and high soil moisture and organic matter content.Results also showed that C. gigaxii favored soils with moderately high pH values and rich in organic content. Soil moisture appeared to be a limiting factor for growth; and a loamy soil texture for existence of the studied species. Average highest population density of living snails and empty shells were 44 and 32 individuals / m2 respectively. The overall population density was also calculated for the purpose of obtaining realistic population density of the species.

دراسة تصنيفية لحشرات عائلة الخنافس الرواغة Staphylinidae : Coleoptera في بعض محافظات العراق

Author name: كاظم عادل هادي
Supervisor name: سعدون ابراهيم اسماعيل
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Insects
Degree: Master
University: Mustansiriyah University - College Of Science
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

دراسة نوعية مياه خزان الحبانية موقعيا والاستشعار عن بعد == Study of The Water Quality In Alhabbaniyah Reservoir In Situ And Remote Sensing

Author name: احمد عطا الله حسن الفهداوي
Supervisor name: عادل مشعان ربيع
General topic: Biology
Specific topic: Aquatic Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:

العلاقة بين مؤشر الموت الخلـوي المبرمج (ربيطة فاس الذائبة) وقلة النطاف عند الرجال == Correlation Between Apoptotic Marker (Sfas Ligand) And Oligozoospermia In Men

Author name: احمد حسين علي الزاملي
Supervisor name: صباح ناصر العلوجي | انعم رشيد الصالحي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The Fibroblast associated (Fas) system in the testes has been identified as a key regulator of apoptosis, a process that greatly influences the germ cell population of the testes. and the soluble Fas Ligand (sFasL) may be a competitive inhibitor to induce apopto¬sis of the Fas baring cells. Therefore, this study measures the level of sFasL in the semen of oligozoospermic men evaluating the association between seminal plasma sFasL and spermatogenesis.A total 58 oligozoospermic men and 29 normozoospermic volunteers were included in this study. They were attending the Infertility Clinic of the High Institute of Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technologies, AL - Nahrain University\ Baghdad. Their age mean was 31.77± 5.48 years and a median of 30 years. Semen samples were evaluated according to World Health Organization 2010 standard parameters. The Seminal plasma was separated from the cellular elements after centrifugation and the supernatant was transferred to plane tubes and frozen at - 20 ?C till using for measurement of sFasL. These patients were classified into patients with severe oligozoospermia (sperm concentration ?5 million / ml) which include 29 patients, and patients with mild and moderate oligozoospermia (sperm concentration ranging between 5 - 15 million / ml) which includes 29 patients as well. The control group comprised of 29 men with normospermic parameters according to WHO 2010 standard (Normal volunteers). The sFasL was measured using ELISA enzyme immunoassay for quantitative determination of sFasL Kit. Data were analyzed statistically using Analysis of variance (ANOVA), Least Significant Difference (LSD) and Correlation Coefficient (r).The sFasL level was found significantly higher (P< 0.01) in seminal plasma of oligozoospermic men, with weak correlation of the level of sFasL with the degree of severity of oligozoospermia. Based on the results of this study, it was concluded that sFasL is a novel marker found in the seminal plasma of oligozoospermic men. It's level was higher in cases of oligozoospermia regardless of its severity.

تكامل جرعة منخفضة من مبيد الترفلان مع مخلفات زهرة الشمس في مكافحة الادغال وتحسين نمو محصول الماش لتقليل الاعتماد على المبيدات والحد من مخاطرها == Integration of Reduced Dose of Trifluralin Herbicide With Sunflower Residues For Weed Control In Mungbean Field

Author name: اﺭﻭﻯ ﻋﺒﺪ ﺍﻟﻜﺮﻳﻢ ﺗﻮﻓﻴﻖ
Supervisor name: اﺑﺮﺍﻫﻴﻢ ﺷﻌﺒﺎﻥ ﺍﻟﺴﻌﺪﺍﻭﻱ
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Two field experiments, several greenhouse and laboratory experiments were conducted during the course of study to evaluate the allelopathic potential of two sunflower (Helianthus annuus L.) cultivars on companion weeds and weeds grown in mungbean (Vigna radiata L. R. Wilczek) field alone and in combination with reduced rate herbicide, and to determine the chemical and genetical bases of allelopathic traits in the test cultivars. The aim of the first experiment was to test whether the variation in weed growth between the sunflower cultivars (Shumoose and Sin Altheeb), which was observed in the field, was due to differences in their allelopathic potential. Results showed the ability of both cultivars to reduce weed population and biomass with the superiority of Shumoose cultivar in suppression of weed density at 60 and 120 days after sowing compared to Sin Altheeb. Weed biomass was significantly reduced up to 90 and 71% by Shumoose and Sin Altheeb cultivars, respectively. Stair case experiment indicated that root exudates of Shumoose cultivar showed more suppression to weeds than Sin Altheeb giving additional evidence for the superiority of Shumoose cultivar in its allelopathic weed suppression. Chemical analysis by High performance liquid chromatography indicated the presence of 9 compounds in root exudates of Sin Altheeb and 8 compounds in Shumoose, and all are Phenolic in nature. However, total of the isolated phenolics was doubled in Shumoose than in Sin Altheeb. Most of the isolated chemicals are reported to have inhibiting ability for germination and growth of plants, including weeds. Second field experiment was undertaken to explore the response of weeds and mungbean crop to soil incorporated with sunflower residues in combination with lower rate of a pre - plant herbicide (trifluralin). Sunflower residues of the two cultivars Shumoose and Sin Altheeb at 3.2 and 6.4 t ha - 1 were used either alone or in combination with trifluralin at 1.2 L ha - 1 (50% of label rate). Weedy check (control), trifluralin at full label rate (2.4 L ha - 1), and weed free treatments were also included for comparison. Plots treated with 50% of label rate of herbicide and amended with sunflower residues of cultivar Sin Altheeb recorded least weed density and dry biomass and this suppression was much greater than the residue treatments alone and more than cultivar Shumoose. Application of herbicide at 50% rate in plots amended with Sin Altheeb residue resulted yield 64 % more than with the label rate of herbicide treatment. Chromatographic analysis of sunflower amended field soil revealed the presence of several potent allelopathic compounds in the residues of both cultivars with greater quantity (355.5 µg/ml) in Sin Altheeb than in Shumoose (250.9 µg/ml). Dynamics of release, decomposition and degradation of allelochemicals into the soil showed that different compounds exhibited differential behavior for these processes. Overall quantity of allelochemicals started to increase after 2 weeks of decomposition and peaked at 4 week of decomposition (180.1 ppm) then declined sharply in their quantities thereafter. Periods indicating higher quantities of total phenolics as shown by chromatographic analysis was coincided with the periods in which higher suppressive activity against weeds grown under field conditions. Bioassay of sunflower residues decomposed in soil at different times on Echinochloa colonum L, one of the weeds dominated the mungbean field, revealed that residues of both cultivars suppressed growth of E. colonum weed. The phytotoxicity started after 2 weeks and persisted for 8 weeks. However, Sin Altheeb residues showed greater inhibition than Shumoose cultivar at the last three decomposition periods. Shumoose residues recorded appreciable reduction to the growth of test weed compared to Sin Altheeb. The effect of residues of both cultivars on chlorophyll content and ions uptake in Amaranthus retroflexus L. weed revealed that residues of both species reduced chlorophyll content of leaves and the reduction increased with the increased residue rate. Sin Altheeb cultivar residues were more inhibitory than Shumoose at the lower residue rate. In the same weed, ions uptake was significantly averted by the residues of both cultivars. P and K was significantly increased over control, while Ca, Mg an Fe were found to be decreased over control due to application of sunflower residues in soil at 8 g per kg soil. N was the only test element that did not significantly influence by the residue treatments. No significant differences were found in the test ion uptake between the test sunflower cultivars. Results of using RAPD technique on the sunflower genomic DNA revealed that all the 19 primers used in this study scored different amplification monomorphic and polymorphic bands in the tested genotypes with 12 primers generated polymorphic bands. These bands present in one cultivar and absent in another. They could be responsible for allelopathic trait or secondary compounds associated with this phenomenon. Further work is recommended to analyze the sequence of this band to find out whether it is related to allelopathic trait or not.
1 ... 94 95 96 97 98 ... 157