Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 2,514

تاثير الكلنبيوتيرول على بعض المعايير الفسلجية في ذكور الارانب Oryctolagus cuniculus == Effect of the Clenbuterol on some physiological parameters in male rabbits Oryctolagus cuniculus

Author name: هند ضياء هادي
Supervisor name: الية حسين علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية للتعرف على التاثيرات الفسلجية لعقار الكلنبيوتيرول في وظائف الكبد, والكلى, وتركيز الدهون, والكلوكوز ومستوى بعض هرمونات (TSH,T4,T3,T,Prolactin,LH,FSH). استخدم في هذه الدراسة 32 ذكرا بالغا من الارانب قسمت عشوائيا الى اربع مجاميع, والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوما , المجموعة الاولى جرعت فمويا بـ الماء المقطر, المجموعة الثانية جرعت فمويا بـ 2مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الثالثة جرعت فمويا بـ 4 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الرابعة جرعت فمويا بـ 6 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول. جمعت عينات الدم في مرحلتين الاولى بعد 14يوما والثانية بعد 30 يوما من بدء التجريع لغرض الدراسة الفسلجية. ادت المعاملة بعقار الكلنبيوتيرول الى انخفاض معنوي (P<0.05) في معدل وزن الجسم لكل المجاميع المجرعة بالعقار مقارنة بمجموعة السيطرة بعد 30 يوما من التجريع . واوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاع غير معنوي 0.05)<(P في كل من انزيمي الاسبارتيت الناقل للامين AST وانزيم الالنين الناقل للامينALT في المجموعتين الثانية والثالثة المجرعة بالعقار لمدة 14 , 30 يوما , بينما لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة ولمدة 14 ,30 يوما من التجريع, ولم يلاحظ وجود اي فرق معنوي 0.05)< (Pفي تركيز انزيم الفوسفاتيز القاعدي ALP لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 ,30 يوما بعد المعاملة. كما بينت الدراسة وجود انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى حامض اليوريك في كل المجاميع المجرعة لمدة 14 يوما, كذلك انخفض مستوى الحامض بصورة غير معنوية 0.05)< (Pفي المجموعة الثانية بينما انخفض بصورة معنوية(P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة بعد 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة, اوضحت النتائج ارتفاع غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى الكرياتنين لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة اذ كان هناك ارتفاع معنوي(P<0.05) لمدة 30 يوما بعد التجريع, احدث العقار انخفاض غير معنوي0.05)< (P في مستوى اليوريا لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما, بينما انخفض مستوى اليوريا بصورة معنوية (P<0.05) في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة, فضلا عن دور العقار في الانخفاض المعنوي (P<0.05) في مستوى الكولسترول لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية اذ كان هناك انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pبعد مرور 14 يوما بعد التجريع, كما اظهرت النتائج انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الكليسريدات الثلاثية في المجموعة الثانية لمدة 14 , 30 يوما بينما انخفض مستوى الكليسريدات الثلاثية معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة. احدث العقار ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (Pفي مستوى الـ HDLفي المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) بعد مرور 30 يوما من التجريع, كما بينت النتائج انخفاضا معنويا (P<0.05) في مستوى الـ LDL في المجموعة الثانية المجرعة لمدة 14 يوما بينما انخفض مستوى الـ LDL بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, وكذلك انخفض مستوى الـ LDL معنويا(P<0.05) في المجموعتين الثانية والثالثة لمدة 30 يوما من التجريع بينما انخفض بصوره غير معنوية 0.05)< (P في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, كما لوحظ انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الـ VLDL لكل المجاميع خلال 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك انخفاض معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع, اظهرت المجاميع المجرعة ارتفاع غيرمعنوي 0.05)< (P في مستوى الكلوكوز لمدة 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30يوما من التجريع. كما اوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاعا غير معنويا في مستوى الهرمونات LH, FSH وT لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع , اضافة الى انخفاض مستوى هرمون الحليبProlactin بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما من التجريع , كما اظهرت النتائج ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (P في مستوى هرمون T3في المجموعة الثانية المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما بينما ارتفع معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة, كما نلاحظ ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P في مستوى هرمون T3 في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما, وبينت النتائج ايضا ارتفاع مستوى هرمون T4معنويا (P<0.05) في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P لمدة 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة , كمالوحظ وجود ارتفاع معنوي ((P<0.05 في مستوى هرمون الـ TSH للمجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14,30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة. | This study was designed to investigate the physiological effects of Clenbuterol drug on liver, kidney function, lipidprofile ,concentration of glucose and level of some hormones (FSH,LH,T,PRL,T3,T4,TSH). Thirty two adult male rabbits were used in this study, the animals were randomly divided into four groups and treated daily for 30 days, the G1 intubated orally distilled water (control), G2 intubated orally 2 µg/kg/bw of clenbuterol drug, G3 intubated orally 4µg/kg/bw of clenbuterol drug, G4 intubated orally 6µg/kg/bw of clenbuterol drug. Blood samples were collected in two stages the first stage after 14 days, second stage after 30 days of treatment for physiological study. The treatment with Clenbuterol drug lead to a significant(P<0.05) decrease in the mean of the body weight in all the exposed groups with drug as compared with control group for 30 days. The statistical results of this study showed non significant(P>0.05) increase in both AST and ALT enzyme in the second and third groups exposed with drug for 14, 30 days, while we note significant(P<0.05) increase in the fourth group as compared with control group for 14,30 days after treatment .As for the concentration of the ALP enzyme didn,t demonstrated a significant (P>0.05) difference during 14,30 days after treatment . The results showed that there are non significant(P>0.05) decrease in the uric acid level in all the exposed groups for 14 days ,as uric acid level non significant (P>0.05)decrease in the second group, while significant(P<0.05) decrease in the third and fourth groups for 30 days after treatment compared with control group. Results explained non significant(P>0.05) increase in the creatinine level in all the treated groups with drug for 14, 30 days except fourth group there was a significant (P<0.05) increase for 30 days after treatment, drug caused non significant (P>0.05) decrease in the urea level in all the treated groups for 14 days, while urea level a significant(P<0.05) decrease in all the exposed groups with drug for 30 days as compared with control group. In addition the role of drug in significant(P<0.05) decline in the cholesterol level in all the treated animals for 14, 30 days except the second group there was non significant(P>0.05) decrease for 14 days after treatment . Results also explained non significant(P>0.05) decrease in the T.G level in second group for 14, 30 days, while T.G level a significant (P<0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group.Drug caused non significant (P>0.05) increase in the HDL level in all the exposed groups for 14, 30 days except the second group there was significant(P<0.05) increase for 30 days after treatment, the results showed a significant(P<0.05) decrease in the LDL level in the second group for 14 days, while LDL level non significant(P>0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group, as LDL level a significant decrease(P<0.05) in second and third groups for 30 days after treatment while non significant(P>0.05) decrease in fourth group as compared with control group. We also note non significant(P>0.05) decrease in VLDL level in all the exposed groups with clenbuterol for 14,30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) decrease for 30 days after treatment .Treated animals showed non significant(P>0.05) increase in the glucose level for 14, 30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) inecrease for 30 days after treatment . The statistical results of this study showed non significant (P>0.05) increase in the LH, FSH and T hormones level in all the treated animals for 14, 30 days except the fourth group there was significant (P<0.05)increase for 30 days after treatment, as well as non significant (P>0.05) decrease in the prolactin hormone level in the treated animals for 14, 30 days of treatment. Results also explained non significant (P>0.05) increase in the T3 hormone level in the second group for 14 days after treatment, while significant (P<0.05) increase in the third and fourth groups, we also note non significant(P>0.05) increase in the T3 hormone level in all the exposed groups with drug for 30 days after treatment. The results showed a significant (P<0.05) increase in the T4 hormone level in all the exposed groups for 14, 30 days except second group there was non significant(P>0.05) increase for 30 days after treatment compared with control group , we also note a significant (P<0.05) increase in the TSH hormone level in all the treated animals exposed with drug for 14, 30 days as compared with control group

التغاير الفصلي في التركيب النوعي للطحالب الملتصقة على اجزاء مختلفة من نبات القصب Phragmites australis من مواقع مختارة في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق == Seasonal Variations in Species Composition of Epiphytic Algae on Different Parts of Phragmites australis in the Tigris River - Baghdad - Iraq

Author name: هند ابراهيم احمد البياتى
Supervisor name: جنان شاوي الحساني
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسة شهرية للطحالب الملتصقة على السيقان والاوراق الحية والميتة لنبات القصب Phragmites austrlis Trin ex Stand في نهر دجلة في موقعي الاعظمية والجادرية ضمن مدينة بغداد ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 ولغاية شهر حزيران 2015 . شملت الدراسة قياس العوامل الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ، مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء) والاس الهيدروجيني (pH) والتوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰ S) والمواد الذائبة الكلية (TDS) والمواد الصلبة العالقة (TSS) والقاعدية الكلية (TA) والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD5) والعسرة الكلية (T.H) والكالسيوم والمغنسيوم والكدرة (Turbidity) ونفاذية الضوء (light penetration) وسرعة الجريان (F.W) والكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا والنتراتNO3 والنتريت NO2 والامونيا NH3و الفوسفات الفعالة (PO4) - 3و السيليكا الفعالة - 2) (SiO3 . فضلا عن ذلك تمت دراسة نوعية وكمية للطحالب الملتصقة على السيقان الحية والسيقان الميتة والاوراق الحية والاوراق الميتة لنبات القصب وقيست اربع مؤشرات للتنوع الحيوي ( دليل شانون للتنوع ودليل الغنى ودليل التكافؤ ودليل جاكارد للتشابه ) . اوضحت نتائج الدراسة ان معدل قيم درجة حرارة الهواء والماء تراوحت 18 - 39 م و12 - 31 م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني 7.6 - 8.1 واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت 130 - 191.6 ملغم.لتر - 1. بينما وصلت قابلية التوصيل الكهربائي 500 - 870 مايكروسمنز.سم - 1. في حين سجلت قيم الملوحة 0.305 - 0.538 جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية 250 - 430 ملغم .لتر - 1، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن 0.91 - 0.03 ملغم .لتر - 1، والاوكسجـين المذاب بين 8.4 - 5 ملغم.لتر - 1 ، وقيم المتطلب الحيوي بين 4.1 - 0.9 ملغم .لتر - 1 ،العسرة الكلية 465 - 120ملغم CaCO3.لتر - 1 ، الكالسيوم 97.4 - 41. ملغم . لتر - 1، المغنسيوم 17.6 - 74.9 ملغم .لتر - 1 ،الكدرة 87.1 - 28.6NTU ، نفاذية الضوء 90 - 34 سم ، سرعة الجريان 0.3 - 0.1 م . - 1ثا ، النترات الفعالة 0.98 - 0.72 ملغم .لتر - 1 ,النتريت الفعال 0.02 - 0.004 ملغم . لتر - 1 , الامونيا 0.23 - 0.09 ملغـم. لتر - 1 ، في حين تراوحت قيــم الفـوسفات الفعالة 0.73 - 0.1ملغم . لتر - 1 والسيليـكا الفعالة 4.1 - 3 ملغم . لتر - 1 . شخص 174 نوعا تعود الى 52 جنس كان منها138 نوعا 31جنس تعود الى صف الطحالب العصوية Bacillariophyceae مكونة 79.3% من العدد الكلي لانواع الطحالب الملتصقة 10انواع تعود لرتبة الدايتومات المركزيةCentrales و128 نوعا تعود لرتبة الدايتومات الريشيـــة Pennales و18 نوعا ) 10.3% ، 13 جنس) تعود الى صف الطحالب الخضر Chlorophyceae و17 نوعا (9.7% ،8 جنس ) تعود الى صف الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae ونوع واحد وجنس واحد(0.5) للطحالب البرواتية Dinophyceae.سجلت الدراسة الحالية 6 انواع من الطحالب المشخصة لاول مرة في العراق تعود لصف الطحالب العصوية تمثلت بـ Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow وNavicula exilissima Grunow وNavicula microcephalo Grunow وPleurosigma obscurum W.Smith وStauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys وStenopterobia intermedia Lewis , وقد اوضحت ابعاد النوع وصفاته الاساسية فضلا عن تصويره فوتوغرفيا بالكاميرا الرقمية .تفوقت الاجزاء الميتة من سيقان واوراق نبات القصب P . australis باعداد انواع الطحالب الملتصقة عليها مقارنة مع السيقان والاوراق الحية للنبات المضيف , سجل 96 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية ,و 95 نوع على السيقان الميتة , 50 نوع على الاوراق الحية , 61 نوع على الاوراق الميتة شكلت الطحالب العصوية 82% , 84.2 % , 80 % , 83 % نوع على التوالي , اما الطحالب الخضر فقد تراوحت بين 10.4 % , 6.3 % , 8.1 % , 4.9 % نوع, والطحالب الخضر المزرقة 8.3 % , 7.3 % , 6.5 % , 9.8 % نوع في موقع الاعظمية , اما في موقع الجادرية فقد سجل 85 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية و90 نوع على السيقان الميتة و57 نوع على الاوراق الحية و74 نوع على الاوراق الميتة , سادت فيها الدايتومات بنسبة 80.3 % ,82 % , 81 % , 82.4 % على التوالي , اما الطحالب الخضر 8.2 % , 9.4 % , 5.2 % , 6.7 % والطحالب الخضر المزرقة 9.4% , % 8.2 , 10.5%, 9.4 % نوع على التوالي تباين العدد الكلي للطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة لنبات القصب باختلاف الفصول والمواقع ، اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة 854.7×104 خلية.غم - 1 وزن رطب على السيقان الحية في الربيع واقل عدد كلي للطحالب 108.64× 104 خلية.غم - 1 على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية في حين تراوح العدد الكلي لافراد الطحالب الملتصقة في موقع الجادرية بين 114.77×909.47 - 104× 104 خلية.غم - 1 وزن رطب على الاوراق الحية والسيقان الحية لنبات القصب في الشتاء والربيع على التوالي . تراوحت قيم كلوروفيل - ا للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين 2.831 - 1.586 ملغم.سم - 2 في الخريف والربيع على التوالي في موقع الاعظمية و3.108 - 0.941 ملغم.سم - 2في الشتاء والربيع على التوالي في موقع الجادرية , بينما تراوحت قيم الفيوفايتين - ا بين 0.981 - 0.037 ملغم .سم - 2 في الخريف والصيف على التوالي في موقع الاعظمية و0.895 - 0.027 ملغم.سم - 2في الخريف والصيف في موقع الجادرية . اظهرت ادلة التنوع الحيوي اعلى قيم دليل الغنى 16.9 للطحالـــب الملتصقـة علــى السيقان الحية لنبات القصبP. australis في الربيع في موقع الجادرية وظهرت اقل قيم الدليل 7.7للطحالب الملتصقة على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية ، واعلى قيم دليل التنوع شانون بلغت 4.19 في الربيع للطحالب الملتصقة على السيقان الحية في موقع الجادرية ، في حين سجل اقل قيم دليل التنوع 3.1 على الاوراق الحية في الصيف في موقع الاعظمية ، سجلت اعلى قيمة تكافؤ 0.740 في الشتاء للطحالب الملتصقة على الاوراق الحية في موقع الجادرية واقل قيمة بلغت 0.58 على السيقان الحية في الخريف في موقع الاعظمية. كما بينت النتائج اعلى نسبة تشابه لدليل جاكارد Jaccard بين الفصول كانت بين الربيع والخريف للطحالب الملتصقة على السيقان الميتة اذ بلغت 51.7 % في موقع الاعظمية , في حين بلغت اعلى نسبة تشابه في موقع الجادرية 49.6 % بين الربيع والخريف على السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الخريف اعلى نسبة تشابه 40.2 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 37 % بين السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الربيع اعلى نسبة تشابه 48 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة وجاء الصيف بـ اعلى نسبة تشابه بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في موقع الاعظمية , اما موقع الجادرية فقد سجل اعلى نسبة تشابه 44.6 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في الخريف وسجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 40.2 % على السيقان الحية والاوراق الميتة وسجل الربيع اعلى نسية تشابه 59.5 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل فالصيف اعلى نسبة تشابه 41.4 % على السيقان الميتة والاوراق الميتة . خلصت الدراسة الى ان مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد عسرة وذات طبيعة قاعدية معتدلة وسجل تنوع عالي مع تباين ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة للنبات المائي الواحد اذ فضلت الطحالب جزء الورقة الملتف حول الساق ولم تفضل جزء الورقة الممتد افقيا على سطح الماء وازداد تنوع الطحالب الملتصقة على الاجزاء الميتة في فصول الدراسة كافة باستثناء الربيع الذي سجل زيادة في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء الحية من سيقان واوراق نبات القصب اما مواسم الذروة فكانت في فصلي الربيع والخريف وسجل الشتاء انخفاض ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة بسبب الظروف البيئية الغير الملائمة . | This work was conducted monthly to study the epiphytic algae on dead and live stems , leaves of aquatic plant Phragmites australisn Trin ex Stand on the Tigris River at Al - Jadriya and Al - Adhmia sites within Baghdad City during the period between October 2014 and June 2015. The physicochemical factors were measured in the studied area. These factors were temperature (air and water), pH (water), electrical conductivity (EC), salinity (S‰), water flow, total dissolved solids (TDS), total suspended solids (TSS), turbidity and light penetration. Also the study included total alkalinity (TA), total hardness (TH), calcium, magnesium, dissolved oxygen (DO), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, Nitrate(NO3), Nitrite(NO2), Amonia(NH3), Ractive phosphate (PO4) - 3 , Reactive Silicates (SiO3 - 2), chlorophyll - a and pheophytin - a. The quantitative and qualitative study for epiphytic algae on different part of macrophytes (Phragmites australisn Trin ex Stand ) were done. Also four biodiversity indices (Shannon - Weaver, richness, evenness and similarity) were calculated. The studied factors ranged as follows : 18 - 39 C° , 12 - 31 C° for air and water temperature, respectively. The turbidity and light penetration, water flow, EC, S‰, TDS and TSS were 28.6 - 87.1 NTU, 34 - 90 cm, 0.3 - 0.1m.Sec - 1., 500 - 870µs.cm - 1, 0.305 - 0.538 ‰, 250 - 430 mg.l - 1 and 0.03 - 0.91 mg.l - 1, respectively. While7.6 - 8.1, 130 - 191.6 mg CaCO3.l - 1 , 120 - 465 mg .l - 1 , 41.1 - 97.4 mg.l - 1 , 17.6 - 74.9mg.l - 1 for pH, TA, TH, Ca++ and Mg++, respectively. Nutrient concentrations ranged 0.98 - 0.72 µg.l - 1 , 0.02 - 0.004µg.l - 1 , 0.09 - 0.23µg.l - 1, 0.1 - 0.73 µg.l - 1 , 3 - 4.1µg.l - 1 for Ractive Nitrate, Nitrite,Amonia, Ractive phosphate and Silica. A total of 174 taxa of epiphytic algae were found in the present study. Bacillariophyceae (diatoms) was the dominate class with 138 species (128 species belonged to pinnate diatoms and 10 for centric diatoms) and represented 79.3% from the total identified algae. Other classes sequenced as follows : Chlorophyceae (18 species and 10.3%), Cyanophyceae (17species and 9.7%) and one species (0.5%) for Dinophyceae .Six of the algal taxa were recorded in the present study are new to Iraqi flora. The new record of algae belong to Bacillariophyceae are Navicula exilissima Grunow , Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow , Navicula microcephalo Grunow, Pleurosigma obscurum W.Smith, Stauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys , Stenopterobia intermedia Lewis. The results of this study include description of the basic characteristics of these taxa together with complete photographic documentation. Highest number of epiphytic algae were recorded on dead stems and leaves of aquatic plant P. australis comparison with living parts of the host plant , 96 species of epiphytic algae were recorded on living stems , 95 species on dead stems , 50 species on living leaves and 61 species on dead leaves . The proportion of Bacillariophyceae was %82, %84, %80, %83 respectively while Chlorophyceae was ranged %10.4, %6.3, %8.1, %4.9 and Cyanophyceae recorded %8.3, %7.3, %6.5, %9.8 species in Adamia site . While in Jadria site it has recorded 85 species of epiphytic algae on living stems , 90 species on dead stems , 57 species on living leaves and 74 species on dead leaves diatoms was dominant %80.3, %82, %81, %82.4 respectively Chlorophyceae recorded %8.2 , %9.4, %5.2, %6.7 species and Cyanophyceae %9.4, %8.2, %10.5, %9.4 species respectively .Numbers of epiphytic algae fluctuated among study sites, seasons and parts of aquatic plants showed that highest count was recorded 845.7 × 104 cell.gm - 1 wet weight on living stems in spring and the lowest count was recorded 108.64 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves in winter at Al - Adhmia site .While the total number of epiphytic algae on P. australis at Al - Jadria site ranged between 114.77× 104 - 909.47 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves and living stems of the host plant in winter and spring respectively .Chlorophyll - a concentration varied among Seasones , and recorded between 1.586 - 2.831 mg.cm - 2 in autumn and spring respectively at Al - Adhmia site , and ranged between 0.941 - 3.108 mg.cm - 2 in winter and spring respectively at Al - Jadria site . Pheophytin - a concentration varied and recorded between 0.037 - 0.981 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Adhmia site and 0.941 - 0.895 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Jadria site .The highest value of richness in this study was 16.9 on the living stems in spring at Al - Jadria site and the lowest value was 7.7 on dead leaves in winter at Al - Adhmia site . Shannon - Weaver index values ranged between 4.19 on the living stems in spring at Al - Jadria site and 3.1 on the living leaves in summer at Al - Adhmia site. Evenness index recorded highest value 0.740 on the live leaf in winter at Al - Jadria site While the lowest value 0.58 on live stem in autumn at Al - Adhmia site . Higher percentage for Jaccard similarity index 51.7% obtained between autumn and spring seasons on dead stems at Adhmia site While the highest percentage of similarity at Al - Jadria site was 49.6% between autumn and spring on dead stems and living stems.The water quality of Tigris River within Baghdad city is estimated as a moderate alkalinity and hardness , high diversity and marked contrast in total number of epiphytic algae was recorded on same host plant , algae prefer parts of leaves that wrapped around stem and not the leaf blade that extended horizontally on the surface of the water , diversity increased on dead parts of plant in all study seasons except spring which showed an elevated in the total algae number on living parts (stems and leaves ) for reed plant , peak seasons was Spring and Autumn while Winter record a significant decrease in algae number which attributable to environmental conditions in appropriate.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

Author name: هديل مكي حبيب المؤمن
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

تاثير حامض الجبرلين والبراسينولايد في بعض صفات النمو والحاصل لصنفين من نبات الشبنت Anethum graveolens L. == Effect of GA3 and Brassinolide on Some growth and Yield Parameters for two Cultivars of Plant Anethum graveolens L

Author name: وائل شاكر حميد الجبوري
Supervisor name: ماهر زكي فيصل الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت تجربة حقلية في الحديقة النباتية العائدة لقسم علوم الحياة، كلية التربية للعلوم الصرفة - ابن الهيثم - جامعة بغداد، في الموسم النمو 2015 - 2016 لدراسة تاثير تركيز حامض الجبرلين والبراسينولايد وتداخلهما في بعض الصفات المظهرية والكيميائية والمركبات الفعالة طبيا والحاصل ومكوناته في صنفين نبات الشبنت هما الصنف المحلي والصنف الهولندي. نفذت التجربة باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة Randomized Complete Block Design (RCBD) وبثلاثة مكررات اذ تضمنت الدراسة صنفين نبات الشبنت واضافة خمسة تراكيز من البراسينولايد هي (0 و0.5 و1 و2 و3) ملغم.لتر - 1 ورش حامض الجبرلين على المجموع الخضري بتركيز 50ملغم.لتر - 1 وبدون رشه. وبهذا تكون التجربة عاملية (2 × 2 × 5 ×3) اذ تضمنت 60 وحدة تجريبية، وسمدت الوحدات التجريبية وفق معاملاتها. ويمكن ايجاز النتائج التي تم الحصول عليها كما ياتي : 1. اختلاف صنفي نبات الشبنت (المحلي والهولندي) عن بعضهما في الصفات المدروسة، فقد تفوق الصنف المحلي على الصنف الهولندي في صفة ارتفاع النبات ووطول الحامل الزهري وتركيز الفسفور ونسبة الكاربوهيدرات في المجموع الخضري ونسبة الكاربوهيدرات في الثمار ووزن 1000ثمرة. فيما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي في صفة طول الجذر وحجم الجذر وقطر الساق والوزن الرطب والوزن الجاف ومعدل النمو المطلق واستدامة الكتلة الحيوية وعدد النورات الزهرية وحاصل الثمار في النبات الواحد وحاصل الثمار في الوحدة التجريبية الواحدة وحاصل الثمار الكلي وتركيز النتروجين في المجموع الخضري وتركيز الكالسيوم وتركيز البوتاسيوم وتركيز المغنيسيوم ونسبة البروتين في المجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي في الاوراق وتركيز النتروجين في الثمار، نسبة البروتين في الثمار ونسبة الزيت والوزن النوعي.2. اظهرت الدراسة ان المعاملة بحامض الجبرلين والبراسينولايد والتداخل بينهما ادى الى زيادة معنوية في الصفات المدروسة ، عند رش 50 ملغم.لتر - 1 من حامض الجبرلين وتركيز 2 ملغم.لتر - 1 في معظم الصفات والبعض منها عند التركيز 1 ملغم. لتر - 1 من البراسينولايد على المعاملات الاخرى. 3. اظهرت نتائج الفحص والتشخيص الكروماتوغرافي باستعمال تقنية HPLC تشخيص ستة مركبات فعالة في الزيت الطيار لبذور صنفي نبات الشبنت هي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole وP - anisaldehyde وLinalool). وقـد تـفوق الصنـف المحــلي على الصنـــف الهـولـندي باعطائــه اعــــلى تركـيــز لكل مــن المركبات الفــــعالـــة هـــما P - anisaldehyde) وLinalool)، عند رش حامض الجبرلين بتركيز 50 ملغم . لتر - 1 والبراسينولايد بتركيز1 ملغم. لتر - 1 ، بينما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي باعطائـه اعلى تركيز للمركبات الفعالة وهي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole) عند رش 50 ملغم. لتر - 1 الجبرلين و2 ملغم. لتر - 1 البراسينولايد. | A Field study was conducted at the farm of Biology Department, College of Education (Ibn AL - Haitham) for pure science, University of Baghdad during the growth season 2015 - 2016, on study the effect of Gibberellic acid concentration and brassinolide and their intraction on both morphological and chemical characteristics, the components of yield, determining the medically active compoands in two varieties of Dill plant, local and Holand varieties.The experiment was designed as Randomzied Complete Block Design (R C B D) with three replications. which two varieties of Dill plant and spray of Gibberellic acid (50) mg.liter - 1 and non spray and five concentration of brassinolide (0, 0.5 , 1,2 and 3) mg.liter - 1 The experiment was as designed factorial experiment (2x2x5x3) included sixty experimental units The plants were managed fertilized recommaded.Can be summarized the results that were obtained as follows : 1.different the variety of dill plant (local and holand) from each other in the traits, the local variety surpassed the holand variety in the plant height, the length of the pregnant syphilis, Concentration of phosphate, the percentage of carbohydrates in the shoot, the percentage of carbohydrates in the fruits, weight of a thousand fruits. As outweigh the holand variety at the local variety in the character of the root length, root size, stem diameter, wet weight, dry weight, the absolute growth rate, the sustainability of biomass, the number of inflorescences, holds fruits per plant, holds the fruits in a single experimental unit, holds overall fruits, Concentration nitrogen in the shoot, calcium Concentration, potassium Concentration, the percentage of protein in the shoot, the total chlorophyll content in the leaves, the Concentration of nitrogen in the fruits, the percentage Albroonin in fruits, oil content, specific weight.2. The study showed that treatment with acid and Gibberellin and brassinolide and overlap between them led to a significant increase in the traits, at a spray 50 mg.L - 1 Gibberellin acid and concentration of 2 mg.L - 1 in most qualities and some of them at a concentration of 1 mg.L - 1 brassinolide the rest of the transactions.3. Screening and diagnosis chromatographic results showed the use of HPLC technique diagnosed six compounds in the volatile oil fruit plant varieties Dill are : (Anethol , Limonene , Carvone , Dillapiole , P - anisaldehyde and Linalool). Local variety was higher than the holand variety by giving it the highest concentration of the two active compounds are P - anisaldehyde and Linalool), especially when the spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid and 1 mg. L - 1 of brassinolide, while the superiority of the holand breed Local product by giving it the highest concentration of other active compounds which four : (Anethol , Limonene , Carvone and Dillapiole), especially at a spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid. and 2 mg. L - 1 of brassinolide.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد
Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة الهياة الكروموسومية لنوع من اسماك المياه العذبة العراقية سمكة ابو الزمير العميق Mystus pelusius == Karyotyping Study of one Species of Iraqi Freshwater Fish ( Mystus pelusius )

Author name: هبة حسين رسن
Supervisor name: اسماء سامي ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The fish has a great economic and environmental importance, however the cytogenetic studies on them still few, especially the chromosomal studies of local fish, therefore current study aimed to identify the karyotype (Chromosomal type and number) and the sex determination system to a species of Iraqi freshwater fish, which is Mystus pelusius (Solander in Russell, 1794) fish in Iraq, as (20) fish (10) male and (10) female were hunted from Tigris river in Al - Kraat area of Bagdad city.The current study was done to investigate the karyotype, where the chromosomal preparations has been preparing from kidney cells according to (air - drying technique).The results of the males and females kidney cells metaphase chromosomes study showed that the diploid chromosome number was 2n=32, which represents less chromosomal number recorded so far in the studied Iraqi fish, also the results showed that the males chromosomal types included 2n=(6m+13sm+7st+6t) and fundamental number FN=51, the females chromosomal type was 2n=(6m+12sm+8st+6t) and FN=50, also it observed that the first sub metacentric pair was the largest within the biarmed chromosomes.The results revealed that the male (heterogamety) and the female (homogamety), accordingly it follows the sex determination system (XX/XY), as the (X) chromosome represented by medium sized submetacentric (sm) chromosome and (Y) chromosome by small sized subtelocentric (st) chromosome.The results of Giemsa - banding technique (G - banding) showed that the rich regions with Guanine (G) and Cytosine (C) nitrogen bases called (G - light) bands and the rich regions with adenine (A) and thymine (T) called (G - dark) bands, thus it determined more accurately the sister chromosomes in Mystus pelusius males and females, more over thistechnique described sex chromosomes better, it has been observed that most chromosomes in both sexes have (G - light) bands, as all (uniarmed) (telocentric, subtelocentric) autosomes pairs entirely contain (G - light) bands, while in the (biarmed) (metacentric, submetacentric) autosomes chromosomes the light bands concentrated in their telomeres, while the rest regions of these biarmed chromosomes have dark bands. Results of (G - banding) technique confirmed which was shown by the traditional pigmentation method (Giemsa staining technique) about the sex chromosomes discrimination, where this technique showed more accurately and better that the male was heterogamety through a observation of medium sized submetacentric (X) chromosome with (G - light) bands in telomric position of (short arm), while the subtelocentric (Y) chromosome was the larger within the uniarmed chromosomes and it was marked by being entirely dark and lack of (G - light) bands, while it was observed in females a medium sized submetacentric (sm) pairs with (G - light) bands in the telomeric of long and short arms which represents (XX) sex chromosomes, and according to this the females considered to be homogamety and the males heterogamety, and proved that the sex determination system in Mystus pelusius fish was a simple sex determination system of (XX/XY) type

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

Author name: نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

دراسة كيمياوية وبايولوجية لبعض مركبات الايض الثانوي المستخلص من اوراق نبات البشملة L. Eroibotrya japonica المستزرع في العراق == Chemical and Biological Study of Some Secondary Metabolism Compounds Extracted from Bashmala Eriobotrya Japonica L. leaves Cultivated in Iraq

Author name: نعم حيدر جواد سعيد الجوهري
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study containes the extraction and detection some of active compounds in the leaves of Eriobotrya japonica L. and testing the activity of crude extract as an antibacterial and food preservation. Methnol was used in crude extraction and also CC , TLC ,HPLC techniques were used in qultitive and quantative amount of some flavonoid ,terprnoid and phenolic compound .The well in agar to study the effect of crude on Staphylococcus aurus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria in 200 ,100, 50 and 25 mg /ml concentrations , In addition to study of effect of the extraction on meat at 200 mg /ml concentration . The ruselts show that Alcholic crude extract contains flavonoid ,terprnoid and phenolic compounds and the chlororform was the best solvent in separating those compounds . Through the use TLC and HPLC , it was possible to separate terpenoids (Oleanolic acid , ursolic acid , maslinic acid) , flavonoids (Qurcetin, Kaempferol ,Rutine ) and phenolic compounds (Benzoic acid ,caffeic acid ,chlorogenic acid). The results show the high activity of leaves crude extract of Eriobotrya japonica L . in 200 mg /ml concentrationthat is used as a food preservation in minced beef meat. The results also show significant differences at (P<0.05) in Thiobarbutric acid ,Total violate nitrogen measurement ,total bacterial account , and psychrotrophic bacteria account ,AS for the value of PH was governor compared with standard control. The concentrations of cruds extract showed an Antibacterial activity where Staphylococcus aureus where 15 and 26 mm by using 100 and 200 mg/ ml concetrations respectively .furthermore,The crude extractshowed an efficiency as antibacterial agains Escherichia coli with 13and 15mm inhabition zone ; and also Salmonella typhmurium with 14 and 19mm inhabition zone by using 100 and 200 mg / ml concentration , respectively compared with standard control . The ruselts show that minimum inhibitory concentration of the cruds extract agains Staphylococcus aureus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria was 100 mg / ml compared with standard control .

مستويات الرصاص في الدم لسكان بغداد والعوامل المؤثرة على ذلك == Levels of Blood Lead in Baghdad Inhabitants and Factors Affecting Them

Author name: نضال ياس يعقوب
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الرصاص عنصرا" طبيعيا" يتواجد في القشرة الارضية ويستعمل على نطاق واسع في الطلاء والكازولين والبطاريات والعلب المعدنية وبعض الاواني الخزفية. ويتعرض الناس الى الرصاص عن طريق الغبار الملوث ورقائق الطلاء والاطعمة الملوثة..شملت الدراسة 80 شخصا من العاملين في الشركة العامة للبطاريات في الوزيرية والذين يتعرضون للرصاص اضافة الى 10 اشخاص غير متعرضين ( مجموعة السيطرة). تم تحديد مستوى الرصاص في دم الاشخاص المذكورين كما درست معايير الدم لديهم اذ شملت فحوصات الدم : مستوى خضاب الدم (Hb)،حجم الدم المضغوط(pcv)،عدد كريات الدم الحمر(RBCs)،متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا(MCHC) ومتوسط حجم الخلايا(MCV). تم اختيار عينة مؤلفة من (38) شخصا من المتعرضين الذين كان مستوى الرصاص لديهم عالي حيث يبلغ (41.4 مكغم/100 مل) مع انخفاض ملحوظ في مؤشرات الدم الاخرى فكان معدل تركيز هيموكلوبين الدم (12.75 غم / 100 مل) اما مدى النسبة المئوية لحجم الدم المضغوط فقد كان (39.4 غم/100 مل) ومعدل عدد كريات الدم الحمر (5 مليون / مم3) ومعدل متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا بلغ (30.9 غم/100 مل) ومعدل متوسط حجم الخلايا بلغ (77.1 فمتولتر) . تمت دراسة تاثير الرصاص على هذه المجموعة من خلال تدوين المعلومات الخاصة في الاستمارة الاستبيانية وكانت اهم هذة التاثيرات على جهاز الخصوبة في الذكور وتاثيرات على الجهاز البولي وظهور عدد من حالات فقر الدم وحالات من السعال والصداع والاجهاض لدى السيدات والم في المفاصل .و من جانب اخر فقد تم تقسيم عينة المتعرضين الى عدة مجاميع حسب : - 1) الجنس : اذ تم تقسيم العينة الى مجموعتي الذكور والاناث اذ كان معدل تركيز الرصاص في دم الذكور اعلى اذ بلغ(35.2 مكغم/100 مل) اما الاناث فقد بلغ (32.2 مكغم/100 مل) . وظهرت معدلات اقل بالنسبة لمؤشرات الدم الاخرى .2) حالة التدخين : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتي المدخنين وعددهم (36) شخصا والثانية غير المدخنين وعددهم (44) شخصا وكان هناك تقارب في نتائج مستوى الرصاص في الدم للمجموعتين.3) للفئات العمرية : فقد تم تقسيم العينة الى اربع مجاميع فقد ظهر اعلى مستوى لتركيز الرصاص للفئة العمرية (41 - 50) سنة مع انخفاض في مؤشرات الدم الاخرى.4) حسب المهنة : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتين وهما العاملين من داخل الشركة العامة للبطاريات (بابل 1، بابل 2) في الوزيرية والعاملين في المعامل الاهلية المنتشرة في مدينة بغداد .و من الملاحظ وجود علاقة عكسية بين تراكيز الرصاص ومعايير الدم مثل مستويات خضاب الدم والنسبة المئوية لحجم الدم المضغوط وعدد كريات الدم الحمر ومتوسط تركيزهيموكلوبين الخلايا ومتوسط حجم الخلايا. | Lead is one of the natural elements exist in the crust of the earth, and widely used in the coating , gasoline, batteries, tin cans and some ceramics. Usually people are exposed to lead through the polluted dust, coating pieces and polluted food.In 1987 using lead in gasoline has been denied in developed countries but it is still used in the developing countries. One of the causes of the mental retard in children and being behind their colleagues in behave and learn is sedimentation of lead in brain tissues because the children have more ability to absorb lead than adults.Also women and pregnant face increased hazard as a result of lead exposure which negatively affect the fetus and may lead to infertility. Lead absorption also results in many diseases and effects in human body such as : sever anemia, sever and chronic lung inflammation, increase kidney failure among children and adults, and immunity system breakdown. If the lead level was over (75 μg/dl) these people would have a failure in the reproductive system as a result of having atrophy in the testis with inability to product sperms.A study have been performed to estimate the lead level in the blood of Baghdad inhabitations in order to know its effect on the workers' health who exist in polluted places, and exposure effects on the hematological indications such as : total hemoglobin, percentage of Packed Cell Volume (PCV%), Red Blood Cell count, Mean Cell Hemoglobin Concentration (MCHC), and Mean Cell Volume (MCV). 80 workers who are exposed to lead working in the General Company for Battery in Al - Wazeria in addition to other workers from private companies in Baghdad and other 10 persons who are not exposed to lead as the control group, all have been chosen as samples for the study. a sample of 38 exposed persons have been chosen who have high lead level in their blood which was about (41.4 g/100ml) with a significant decrease in the other hematological indications; the Blood Hemoglobin Concentration average was (12.75 gm/100ml), the percentage of Packed Cell Volume average was (39.4%), the Red blood cell count average was (5 million/mml3), and the mean cell hemoglobin concentration average was (30.9 gm/100ml), mean cell volume average was (77.1 FL).Lead effects on this group had been studied through recording the data in questionnaire forms, and the most important effect was on the male fertility system, effects on urinary system, anemia, coughing, headache, miscarriage, and ache in the joints. In the other hand the sample of the exposed persons had been classified into groups according to : - 1 - Gender : - the sample had been classified into 2 groups : male and female, where the lead concentration was higher in the male blood which was about (35.2 mg/100ml) and about (32.2 mg/100ml) in the female blood, in addition to less hematological indications.2 - Smoking case : - the sample had been classified into 2 groups : smokers about (36)persons and nonsmokers about (44)person, the study showed similarity in the results on lead level in the blood of both groups.3 - Age : - the sample had been classified into 4 groups, the higher lead level appeared in age group (41 - 50), with decrease in the other hematological indications of the rest. It is clear that there is a slight relation between lead concentrations and hematological indications such as blood hemoglobin, mean packed cell volume, red blood cell count, mean cell hemoglobin volume and mean cell volume.

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

Author name: ميس عماد احمد
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية == Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

Author name: نشميل علي حسن الهواسي
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض ابيضاض الدم النخاعي الحاد لمرضى عراقيين == Association of Glutathione - S - Transferas (GSTP1) gene polymorphism with Acute Myeloid leukemia in Iraqi patients

Author name: ميادة خالد ابراهيم
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was carried out to investigate the relationships between acute myeloid leukemia (AML) patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1 class (GSTP1) by using Polymerase Chain Reaction (PCR) - Restriction Fragment Length Polymorphism (REFLP) and measurement of some clinical parameters of patients and control.This study included 120 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with AML were diagnosed by the consultant of The National Center of Hematology medical City, Center for Hematology AL - Mustanseria University, hematology clinic of Baghdad Hospital and Alkadhymian medical city teaching hospital during the period from October 2014 to May 2015. Those AML cases then have been diagnosed by a specialized hematologists depending on bone marrow aspiration, biopsies reports and other diagnostic criteria for AML according to the International Staging System (ISS).Sixty individuals healthy also included as control group, their age range were between 15 - 70 years. Blood were used as samples to found the correlation between genotyping of GSTP1 and all studied parameters.Molecular studies involved DNA extraction and PCR - RFLP was carried to detect the genetic polymorphism of GSTP1 for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department / College of Sciences for women. The results showed that in the age for patients and control group were no significant difference in group less than 30 years old, while showed significant difference (P˂0.05) between other groups 30 - 50 years and 50 - 70 years, were (30%) (38.30%) (33.3%) and (23.0%) respectively.The results showed that there were significant different between patients (10.40±2.97) and controls (6.25±0.37) in the mean of white blood cells count (WBCc) (P˂0.48), the mean of hemoglobin (Hb) in patients was (8.11±0.37) and in control was (12.81±1.31) and the different was highly significant between them.The results of genetics polymorphism of the GSTP1 showed the significant difference (P˂0.05) between patients were (56.67%) and controls were (65.00%) in wild genotype AA, while the heterozygous genotype AG and homozygous mutant genotype GG were in AML patients and in controls were no significant different.Distribution of GSTP1 polymorphism and age of patients groups showed that there were significant difference between all age groups and all types of gene polymorphism, were (38.24%), (32.35%), (29.41%) in AA genotype, in AG were (26.32%), (21.05%), (52.63%) and in GG were (57.14%), (42.86%) and (0.00%) respectively.The results of relationship between the sex and AML patients showed that mutant genotype GG genotype was more in male (85.71%) than female (14.29%) with highly significant increase and the risk of male to be effect was more 1,5 than female. The mutant allele G is more frequent in male (0.38) than female (0.17). The data also showed no significant difference between the GSTP1 polymorphism and the mean value of WBC, but the mean value of Hb was shown significant different (P˂0.05), the heterozygous genotype AG showed the highest value (11.35± 0.73).Distribution of GSTP1 polymorphism between control groups according to non - smoking and smoking in the genotype AA+AG, (93.33%), (90.00%) respectively, showed significant difference (P<0.05), while in genotype AG+GG (26.67%), (43.33%) showed high significant difference (P<0.01) and the mutant allele G was more frequency in smoker control (0.27) but in non - smoker was (0.17).Results of this study suggest that GSTP1 gene polymorphisms was not associated with AML disease and GSTP1 has no active role in the pathogenesis of AML, while the age and sex may have a risk factor for progression AML

دراسة بعض المؤشرات المناعية لجروح ما بعد الحرق == Study of Some Immunological Aspects of Post Burn Injuries

Author name: مـــنى شكري محمود جواد
Supervisor name: زينب ثامر شويت الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التحري عن مستويات الحركيات الخلوية (IL - 10, IL - 17A, IFN - γ , MCP - 1,(TNF - α في مصل المصابين بجروح مابعد الحرق , كذلك تم تسليط الضوء على العلاقة بين المساحة السطحية الكلية للحرق مع تعداد خلايا Tregs ومستوى الحركيات الخلوية. شملت عينة الدراسة71 مصابا بجروح ما بعد الحرق, اذ تم سحب الدم الوريدي منهم بعد اليوم الاول واليوم الخامس من الاصابة بالحرق لغرض تقدير مستوى الحركيات الخلوية باستعمال تقنية الاليزا (ELISA) وحساب تعداد خلايا Tregs باستعمال تقنية التدفق الخلوي Flow Cytometry, كما شملت عينة الدراسة 60 شخصا من الاصحاء ليمثلوا مجموعة السيطرة. اظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي في مستويات كل من IL - 10, MCP - 1, TNF - α في مصل المصابين بالحروق مقارنة مع مستوياتها في مجموعة السيطرة , بينما كان هنالك ارتفاعا معنويا في مستوى IL - 17A في مصل المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق (28.70± 0.75, 0.86±27.28) بيكوغرام/مل مقارنة مع مستواه في مجموعة السيطرة (0.66±23.85) بيكوغرام/مل. كما بينت النتائج عدم وجود فرق معنوي في مستوى IFN - γ مابين المصابين بالحروق بعد اليوم الاول والخامس من الحرق ومجموعة السيطرة (0.21±14.31, 0.17±13.97, (0.19±13.96 بيكوغرام/مل على التوالي, كما اظهرت نتائج الدراسة وجود انخفاض معنوي بعد اليوم الاول من الحرق في مستوى γ - IFN في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق %(70 - 46) و%(100 - 71)اذ بلغت مستوياته (0.41±13.03, (0.30±13.57 بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصل انخفاض معنوي في مستوى TNF - α في مصل المصابين بمساحة سطحية للحرق100 - 71) )% مقارنة مع المساحات الاقل اذ بلغ مستواه في هذه المجموعـــة 0.57±11.61)) بيكوغرام/مل، بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي بين فئات نسب الحرق المختلفة. كما بينت النتائج وجود ارتفاع معنوي في مستوى TNF - α بعد اليوم الخامس من الحرق مع زيادة المساحة السطحية للحرق اذ بلغ مستواه في الفئات %(45 - 31), %(70 - 46), %(100 - 71) 2.51±21.51), 4.20±29.59, (1.45±23.36بيكوغرام/مل على التوالي مقارنة مع مستواه ضمن مساحة سطحية للحرق%(30 - 10) (0.87±19.54) بيكوغرام/مل بينما لم تظهر مستويات الحركيات الاخرى اي فرق معنوي مع زيادة مساحة الحرق. وقد حصل ارتفاع معنوي في مستوى كل من IL - 10, IL - 17A في مصل المصابين الذكور مقارنة بالاناث اذ بلغت مستوياتهما في الذكور (30.48±0.85, 29.36±0.83) بيكوغرام/مل على التــوالي في حين بلغت مستوياتهما في الاناث (0.65±28.38, 0.76±26.98) بيكوغرام/مل على التوالي بينما حصــل ارتفاع في مستـــوى TNF - α 0.97±18.35) ) بيكوغرام/مل في مصل الاناث المصابات بجروح مابعد الحرق مقارنة بالذكور (15.11±0.70) بيكوغرام/مل, كما حصل ارتفاع معنوي في مستوى IL - 10 (34.25±1.77) بيكوغرام/مل في مصل المصابين بجروح الحرق الناتجة من التعرض الى الانفجار مقارنة مع المصابين بالحرق بوساطة مصادر اخرى. اما نتائج تعداد خلايا Tregs فقد حصل ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في الدم المحيطي للمصابين بنسب حرق اقل من %45 واكثر من %45 مقارنة مع اعدادها في الدم المحيطي للاشخاص الاصحاء وذلك بعد اليوم الاول وكذلك بعد اليوم الخامس من الاصابة بالحرق وكان اعلى ارتفاع في النسبة المئوية لاعدادها في دم المصابين بنسبة حرق اكثر من %45 بعد اليوم الاول والخامس من الحرق حيث بلغت %(63.58) و57.95))% على التوالي. | The aim of this study was to investigate the levels of cytokines (IL - 10, IL - 17A , IFN - γ , MCP - 1,TNF - α ) in the serum of patients with post burn injuries and to evaluate the status of patients, and also to shed light on the relationship of the surface area of burn with the count of Tregs and levels of cytokines. Seventy one patients with post burn injuries were included in this research, the Venous blood was collected from the first day and fifth day after burn to evaluate cytokines levels by ELISA technique and to count Tregs by Flow Cytometry; the study also included 60 healthy persons represented control group. The results showed a significant decrease in the levels of IL - 10, MCP - 1 and TNF - α in the serum of patients comparing with control, while there is a significant increase in the level of IL - 17A in the serum of patients after first and fifth day of burn (28.70±0.75, 27.28±0.86) pg/ml comparing with control(23.85± 0.66) pg/ml; and there is no significant differences in the level of IFN - γ between patients and control (14.31±0.21, 13.97±0.17, 13.96±0.19) pg/ml respectively. moreover The results showed significant decrease in the level of IFN - γ in the first day after burn in patients with surface area of burn (46 - 70)% and (71 - 100)% and the levels were (13.03±0.41, 13.57±0.30) pg/ml respectively, while there was significant decrease in the level of TNF - α the in patients with surface area of burn (71 - 100)% comparing with less areas of burn, the levels of it in this group was (11.61±0.57) pg/ml and there is no significant differences were seen between other cytokines among different surface areas of burn. The results showed also significant increase in the level of TNF - α in the fifth day after burn in the higher surface areas of burn (31 - 45)%, (46 - 70)% and (71 - 100)% (21.51±2.51, 29.59±4.20, 23.36±1.45) pg/ml respectively comparing with its level in surface area (10 - 30)% (19.54±0.87) pg/ml and there is no significant differences between other cytokines. The results Revealed showed a significant elevation in the level of IL - 10 and IL - 17A in the serum of male patients comparing with female, and the levels in the serum of male were (30.48±0.85, 29.36±0.83) pg/ml respectively while the levels in female patients were (28.38±0.65 , 26.98±0.76) pg/ml respectively, and there was elevation in the level of TNF - α (18.35±0.97) pg/ml in the female patients comparing with male (15.11±0.70) pg/ml. There Additionally, was significant elevation in IL - 10 levels in the patients with post burn injuries by explosion comparing with another sources of burn. There was significant increase in the percentage of Tregs in the peripheral blood of patient with surface area less than 45% and more than 45% comparing with control group , in both first and fifth day after burn with the higher increase in the percentage of its count was in the patients with surface area more than 45% in the first and fifth day after burn (63.58% , 57.95%) respectively

الممرضات الداخلية المسببة لحالات الاسهال لدى الاعمار من 1 - 15 سنة في مدينة بغداد

Author name: مروة محمد نصري التميمي
Supervisor name: سلوى صبر محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The diarrhea is Enteropathy characterized liquidity abnormal,because of the increases by the movement of colon in the general way, may be represent a good sign to the Enteropathy like the Entamoeba histolytica disease, viruses Enteropathogen and bacteria,The diarrhea and associated of droughts state remains the major problem to the job of medial health in the medial east especially in the age under 5 years old.This study design to study the reason of the diarrhea and diagnosis and the effect result of it in the children under 15 years old, theirs patient from (learn hospital of alemamenalkadoman) in the city of Baghdad from 25/4/2014 to 1/10/2014 period of time, the study represent 103 sample of Stool and blood from children between (>1 - 15)years wasSufferers from diarrhea state, this state diagnose with infection of parasite (E.histolytica, G.lamblia, and others), Rotaviruses and bacteria E.coli.It use the general stool examination direct (by eyes) and in direct (by microscope) to diagnose the antigen of rotaviruses in stool, Either the blood sample store in two tube one of it contain EDTA use to CBC, Pcv, Hb, w.b.c, ABO group measure, and the second one is empty from the EDTA use to ayanlsys serum to measure (CRP) and Interleukin in the patient diarrhea.From summation of 103 found that 50 (48.54%) infected by intestinal protozoa, 41 (39.80%) infected by Rotaviruses, 9 (8.73%) infected by mixed (Parasite + Rotavirus), 3 (2.91%) infected by bacteria E.coli.50 sample infected by intestinal protozoa (42 sample is infected with one Species of parasite and 8 sample of stool continue two type of the parasite), the highest ration of infection was E.histolytica 50%, G.lamblia 38.10%, Blastocystis hominis 7.14%, and the lowestBalantidium coli 4.76%, the study recode the highest ration of mixed infected (Parasite + Rotavirus) was between G.lamblia + Rotavirus 33.33%.In This study present we found highest deference between male and female in the infection of parasite and rotavirus, male record (62 - 60)% and female (38 - 40)% on series, mixed infected (parasite + Rotavirus) Reached to the female 55.56% and this is the highest ration infection from the male 44.44%, notice that there is high Significant difference in the ratio of infection between the Age groups of the groups studied at the probability of p<0.01, where recording rotavirus infection IIhigher ratio infection in the Age groups (1 - 5) year 66,67% and less ratio 11,11% where age groups less than year, but the parasite infection only was more age group infected liable (more than 5) year with ratio 56% and smallest ratio for age group (less than year) 18%. And in the result media use (L.E) to culture E.histolytica and discover from the study , this media don’t provide good environment to maintain the parasite and resolve it for a limited period without multiplication or increase in number is it, in the case of trophzoite stage culture it stay with out - increases in the number is for one day only and after bass 24 hour transfer to the cyst stage and remain bass 3 day only and despair in the fourth day, while in culture of cyst stage Found that Noway to transform to the trophzoite stage like it happen in the human body but stay in the case of cyst stage on states. With condition E.histolytica that the Stool samples continue blood and mucous only to contain a lot off mass from the trophzoite stage and this stage only can be increases causes increase in number.Noted that this culture never dedicated only to the cultivation E.histolytica but noted the trophzoite stage exist for parasite B.coli in this stage and when culture sample from Stool contain B.coli and remain this stage Governor of the trophozoite stage for a period of two days.Either for the blood type test has been shown by the study, the highest percentage recorded rotaviruses injury in people living with antigen type A 39.59%, 39% and 44.44% for parasitic and rotavirus infections and joint respectively.And gave a hemoglobin level of Hb and size precipitation of red blood cells PCV lowest level at co - infection (parasit + rotavirus), followed by rotaviral and parasitic infection compared with control group P <0.05. Showed parasitic infection and joint significant difference in the total number of white blood cells when the probability of P <0.05, either rotaviral infection did not give a significant difference with the control group.The results of the present study about differential count of white blood cells, showed no significant difference comparing with study groups, but showed significant difference within the three groups with control group that remain the value of the Moral difference p<0.05 When all of the (Neutrophil ،Basophile ،Eosenophil)However, it did not register significant difference when cells Lymphocyte.When statistical analysis when studying some immunological changes associated with injuries intestinal regarding the number of days that lasted the case of diarrhea, and by which they can determine if the injury was severe diarrhea or chronic, and that gave significant difference (1 - 2) day P <0.01 when (3 - 4) day and (more than 4) on the value of the differences P <0.05.log CRP level of rotavirus infections 31.70%, 0.52% for infections with parasite, 88.89% of the common injuries (parasitic + viral) gave at P <0.01 probability asignificant differences.The results of the study of some of the dynamics of cellular aggregates of the study and its relationship to the immune response. Observed statistically significant at the use of IL - 10 three of its study groups recorded a significant P <0.05 was higher at 1.22% viral infection compared to the control group. Parasitic infection and did not record any significant difference.And log IL - 17A highest percentage increase at the joint injury, and there is no significant difference between the incidence of parasitic and viral infection.For IL - 33 infection joint highest recorded percentage of injury followed by a parasitic infection and finally viral. and IL - 4 infection shared the highest rate, followed by injury viral recorded and finally parasitic and gave moral difference P <0.05 and finally INF - gama, which did not record any significant differences when comparing the groups study together but gave at P <0.01probability moral differences with group of control when compared recorded the highest common injury is also high.

دراسة التنوع الاحيائي للطحالب الملتصقة على نبات القصب والطين في نهر دجلة - الدورة, ضمن مدينة بغداد/العراق == Biodiversity Study of Epiphytic on Phragmites australis and Epipelic Algae in Tigris

Author name: مروة ثامر خالد هندي
Supervisor name: جنان شاوي الحساني
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الفصلية للطحالب الملتصقة على نبات القصب Phragmites australis ولطحالب الطين في نهر دجلة ضمن منطقة الدورة / بغداد, عدت كمحطة دراسة واحدة ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 لغاية شهر حزيران 2015. تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل البيئية الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ضمن الموقع المذكور مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء)، التوصيلية الكهربائية (E.C.), الملوحة, نفاذية الضوء (L.P)، الاس الهيدروجيني (pH)، المواد الذائبة الكلية (TDS)، المواد الصلبة العالقة الكلية (TSS)، القاعدية الكلية (TA)، الاوكسجين المذاب (DO)، الكدرة (Turbidity), العسرة الكلية (TH), الكالسيوم (Ca), المغنيسيوم (Mg), سرعة الجريان (W.F), الكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا , النتروجين الكلي (TN), الفسفور الكلي (TP) والسيليكا الفعالة (SiO3). تم حساب اربعة ادلة بيولوجية (دليل الغنى ودليل التنوع ودليل جاكارد للتشابه ودليل التكافؤ). تراوحت درجة حرارة الماء والهواء بين (10.5 - 27) م و(11 - 32) م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني (7.1 - 7.9) وقيمة الاس الهيدروجيني للرواسب (7.7 - 8.1). بينما كانت قابلية التوصيل الكهربائي بين (597.0 - 821.67) مايكروسمنز/سم. في حين سجلت قيم الملوحة (0.38 - 0.50) جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية بين (298.0 - 410.0) ملغم /لتر، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن (38.87 - 15.75) ملغم /لتر، والكدرة (24.63 - 42.03)NTU ، ونفاذية الضوء (5.17 - 20.5) سم، وسرعة الجريان (0.06 - 0.67) م/ثا والاوكسجـين المذاب بين ((11.5 - 10.15 ملغم/لتر، وقيم المتطلب الحيوي بين (5.33 - 3.03) ملغم \لتر، واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت بين (133.33 - 200.53) ملغمCaCO3/لتر, العسرة الكلية (413.33 - 636.67)ملغمCaCO3/لتر، الكالسيوم (111.14 - 196.0) ملغم/لتر، المغنسيوم (33.2 - 78.5) ملغم/لتر، النتروجين الكلي (4.54 - 6.99 ) مايكروغرام /لتر، في حين تراوح الفسفور الكلي (12.88 - 15.64) مايكروغرام/لتر والسيليكا الفعالة (371.14 - 506.10) مايكروغرام/لتر. سجلت في هذه الدراسة اعلى قيمة للكلوروفيل للطحالب الملتصقة على نبات القصبPhragmites australis في الخريف (19.71) مايكروغرام/سم2واقل قيمة في الربيع (13.35) مايكروغرام/سم2, اما بالنسبة للكلوروفيل الخاص بطحالب الطين فقد سجل اعلى نسبة في الصيف (5.84) مايكروغرام/سم2, واقل نسبة في الخريف (2.17) مايكروغرام/سم2, سجلت قيم الفيوفايتين في الدراسة الحالية,ففي الطحالب الملتصقة على نبات القصب سجلت اعلى قيمة في الصيف (6.57) مايكروغرام/سم2, واقل قيمة في الربيع (1.02) مايكروغرام/سم2 وقيم الفيوفايتين الخاصة بطحالب الطين سجلت اعلى قيمة لها في الربيع (1.00) مايكروغرام/سم2 واقل قيمة كانت في فصل الخريف (0.37) مايكروغرام/سم2. تم تشخيص (253)نوعا من الطحالب الملتصقة على كلا السطحين (القصب والطين) اذ بلغ عدد الانواع المشخصة على نبات القصب Phragmites australis في الدراسة 183 نوعا( 57 جنسا), وكان منها 115 نوعا (26 جنسا) تعود الى الطحالب العصوية (الدايتومات) Bacillariophyceae 37 نوعا (11 جنسا) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae, و25 نوعا (15 جنس) تعود الى الطحالب الخضر Chlorophyceae وقد شخص نوعان من الطحالب اليوغلينية Euglenophyceae ونوع واحد للطحالب البرواتية Dinophyceae ونوع واحد من الطحالب الكارية Charyophyceae ونوع واحد من الطحالب الحمرRhodophyceae ونوع واحد من الطحالب الصفر Xanthophyceae . وبلغ عدد الطحالب المشخصة على الطين 154 نوعا 38) جنسا), كان منها 130 نوعا(24 جنسا)تعود للطحالب العصوية (الدايتومات) و15 نوعا (سبعة اجناس) تعود للطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae وثمانية انواع (ستة اجناس) تعود للطحالب الخضر ونوع واحد يعود للطحالب اليوغلينية Euglenophyceae.بينت نتائج الدراسة الحالية وجود تغايرات فصلية في العدد الكلي للطحالب الملتصقة على القصب وعلى الطين اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الشتاء اذ بلغ 772.05 x 104خلية/غم وزن رطب48.1) %) من المجموع الكلي لاعداد الطحالب المشخصة في هذه الدراسة , وقد سجل اقل عدد كلي للطحالب الملتصقة على نبات القصب في فصل الصيف x 161.13 104خلية/غم وزن رطب (10.04% ), اما في فصلي الربيع الخريف فكانت نتائج اعداد الطحالب المشخصة متقاربة فكانت x337.92 104خلية/غم وزن رطب ( 21.06% ) في الربيع وx 333.17 104 خلية/غم وزن رطب (20.07%) في الخريف. اما بالنسبة للاعداد الكلية الخاصة بطحالب الطين فبلغ اعلى تسجيل في الشتاء 104x20.07 خلية/ سم2 35.01)%) من المجموع الكلي للطحالب المشخصة, واقل عدد كلي سجل في الصيف 104 x6.53خلية/ سم(2 11.39 %) . اما في الخريف والربيع فكان العدد الكلي 104x15.53و 104x15.18 خلية/ سم2( 27.08% و26.48 %) على التوالي . اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان اعلى قيمة لدليل الغنى (8.3) في الشتاء واقل قيمة (3.09) في الصيف للطحالب الملتصقة على نبات القصب في حين سجلت اعلى قيمة لدليل الغنى (4.3) في الشتاء واقل قيمة (2.6) في الصيف لطحالب الطين . ان اعلى قيمة لدليل التنوع (4.02) في الشتاء واقل قيمة في الصيف (2.94) للطحالب الملتصقة على نبات القصب, وتراوحت قيم دليل التنوع لطحالب الطين بين ( 3.02و (4.03 في الصيف والشتاءعلى التوالي. وتراوحت قيم دليل التكافؤ للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين (0.57 - 0.6) في فصلي الصيف والربيع على التوالي, اما بالنسبة لطحالب الطين فكانت قيم دليل التكافؤ تتراوح بين (1.61 - 1.31) في فصلي الصيف والربيع على التوالي. بينت النتائج ان اعلى نسبة تشابه بين الفصول بالنسبة للطحالب الملتصقة على نبات القصب كانت بين الصيف الربيع وبلغت (0.404), اما اقل نسبة فكانت بين الخريف والربيع اذ بلغت (0.195) وكانت نسبة التشابه بين الفصول لطحالب الطين قد سجلت اعلاها بين الربيع والخريف اذ بلغت (0.369), واوطا قيمة سجلت بين فصلي الربيع والصيف اذ بلغت (0.216), اما درجة تشابه الطحالب بين سطحي الالتصاق فقد كانت 45.728%. | A seasonal study was conducted in order to cover the epiphytic Algae on Reed (Phragmites australis) and epipelic algae in Tigris River in Al - Dora site in Baghdad province from November 2014 to June 2015. Some Physiochemical parameters such as Air and water temperature, light penetration, pH, Total dissolved solids (TDS), Total Suspended Solids (TSS), Dissolved Oxygen (DO), Biological Oxygen Demand (B.O.D5), Turbidity (TU), Total hardness, Total Alkalinity (TA), Calcium (Ca), Magnesium (Mg), Water flow, Chlorophyll - a and Pheophytin - a, Total Nitrogen (TN), Total Phosphorous (TP), Active Silicate (SiO3) were collected during the study. In addition, four biological indices [Richness, Diversity (Shannon - Winer), Similarity (Jaccard), and Evenness index] were tested.The studied parameters values ranged as follows : (10.5 - 27) C°, (11 - 32) C° for water and air temperature, respectively. Water pH )7.1 - 7.9( and the sediment pH (7.7 - 8.1), EC (597.0 - 821.67) µS/cm, S‰ (0.38 - 0.50), TDS (298.0 - 410.0) mg/l ,TSS (38.87 - 15.75) mg/l, The turbidity and light penetration, water flow (24.63 - 42.03) NTU, ( 5.17 - 20.5) cm, (0.06 - 0.67) m/min, respectively. While TA (133.33 - 200.53) mg/l, TH (413.33 - 636.67) mg/l, Ca (111.14 - 196.0) mg/l, Mg (33.2 - 78.5) mg/l, DO. concentration ranged 10.15 - 11.5mg/l. B.O.D5 concentration ranged (3.03 - 5.33)mg/l, Nutrients concentration in the study sites ranged as follows : (4.54 - 6.99)µg/l, (12.88 - 15.64)µg/l, (371.14 - 506.10) µg/l for TN, TP and SiO3 - 2. Chlorophyll - a concentration recorded (13.35 - 19.71) µg/cm2 in winter and autumn for epiphytic algae, and (2.17 - 5.84) µg/ cm2 in autumn and summer for epipelic algae. Pheophytin - a concentration varied between epiphytic and epipelic algae, and recorded (1.02 - 6.57) µg/cm2 in spring and summer, (0.37 - 1.02) µg/ cm2 for autumn and spring, respectively for epiphytic and epipelic algae.Total of 183 epiphytic algal species belong to 57 genera as the following : 115 species (26 genera) of Bacillariophyceae; 37 species (11genera) of Cyanophyceae; 25 species (15 genera) of Chlorophyceae; two species of Euglenophyceae; one species to each Dinophyceae, Charyophyceae, Rhodophyceae, and Xanthophyceae were recorded. Regarding the epipelic algal species, total of 154 species (38 genera) as the following : 130 species (24 generra) of Bacillariophyceae, 15 species (seven genera) of Cyanophyceae, eight species (six genera) of Chlorophyceae, and one species of Euglenophyceae were recorded. Moreover, 90 species were shared between the identified epiphytic and epipelic algae at the study site.The seasonal variations of the epiphytic and epipelic algae were notified. According to the epiphytic, the highest count was recorded during winter 2015 and reached 772.05 x 104 cell/g. (48.1%) from the total number of the identified species. The lowest count was noticed in summer and reached 161.13 x 104 cell/g (10.4%) from the total number of the identified species. It is worth mentioning that the total count of epiphytic in autumn and spring was convergent. In autumn the count reached 333.17 x 104 cell/g. (20.07%) from the total number of the identified species; while the count reached 337.92 x 104 cell/g. (21.06%) in Spring, While for epipelic algae the highest count was recorded during winter 2015 and reached 20.07 x 104 cell/ cm² (35.01%) from the total number of the identified species. In summer, the lowest count was noticed and reached 6.53x 104 cell/ cm² (11.39%) from the total number of the identified species. In addition, the autumn count reached 15.53x 104 cell/ cm² (27.08%) from the total number of the identified species; while the spring 15.18x 104 cell/ cm² (26.48%).The biodiversity indices values for epiphytic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (2.94 - 4.02) in summer and winter; Evenness index (0.57 - 0.6) in summer and spring; Jaccard index (0.195 - 0.404) between autumn and spring and between spring and summer. The biodiversity indices values for epipelic algae ranged as follows : richness index (3.09 - 8.3) in summer and winter; Shannon - Winer index (3.02 - 4.03) in summer and winter; Evenness index) 1.31 - 1.61 (in spring and summer; Jaccard index (0.369 - 0.216) between autumn and spring and between spring and summer

التاثير الوقائي لمستخلص بذور نبات البلنكو Lallemantia royleana في حماية الكبد من سمية عقار الريفادين في ذكور الفار الابيض == Hepatoprotective Effect of Lallemantia royleana Seeds Extract Against Rifadin Toxicity in Male Albino Mice

Author name: محمد فاضل عبد الحسين
Supervisor name: زينب فاضل شويت الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study aimed to focus on the hepatoprotective effect of Lallemantia royleana seeds extract against rifadin hepatotoxicity in experimental mice.The study was conducted on swiss albino male mice (40), there age ranged from 5 - 8 weeks with weight of 25 - 30 gm that divided into four animals groups : • First group orally administered with (0.1 ml) normal saline (0.9%) for 28 days as control group. • Second group orally administered with ( 0.1 ml) rifadin (1.5 mg/kg/day) for 28 days.• Third group orally administered with (0.1 ml) alcoholic extract of Lallemantia royleana seeds (1%) for 28 days . • Forth group was also orally administered with seeds extract alone for 5 days and with (0.1 ml) seeds extract and rifadin for 28 days, so the total period of this group is 33 days. Blood samples ware collected from experimental animals to measured liver function enzymes (ALT,AST,ALP) levels, liver samples were also collected for histopathological and immunohistochemical studies.Results showed there was animals activity changes in groups especially in drug administered group compared with other groups, which represented by lethargy, introversion,the tendency to sleep, hyperventilation, in addition to change the faeces color and urine color, and these behavioral changes noted after 15 days from experiment began.The statistical analysis of the data showed significant increase (P<0.05) in AST, ALT,ALP levels in blood serum of animal group administered with rifadin (662.04±8.26, 131.575±3.45, 197.00±6.58) respectively compared withcontrol group ( 25.2 ± 21.562 , 445..2±2522, 2.543±6524 ) significant decrease (P<0.05) was also noticed in AST,ALT level in seeds extract group( 2..563±.54., 47.480±1.93) and seeds extract - drug group ( ...531±.5.1, 85.033±2.33) compared with drug group, while significant increase (P<0.05) in ALP enzyme level in animals group administered with seeds extract alone (4..5..±.533 ) compared with drug group.The histopathological changes in liver tissue of experimental grups, was represented by loss of normal architecture of liver tissue and radial organization of hepatic cords in centrilobular region and peripheral regions in animals administered with drug, vaculation and death of hepatic cells, congestion (moderate/ severe) in central veins, and few infiltration of mononuclear leukocyte in centrilobular region. In animals administered with seeds extract - drug group was preserved the hepatic cords radial organization especially surrounding the central vein, congestion (mild/ moderate) in central veins, alarge numbers of balone - shape cells with vaculated hepatic cells, and the histological structure in animals administered with seeds extract was approached to control group, that was no dissociation in liver tissue and hepatic cords radially organized around central vein, and mononuclear leukocyte infiltration in centrilobular region and the adjacent region of portal traid.The immunohistochemical test result revealed significant increase (P<0.05) in apoptotic index and in the cells with Bax protein that stimulating the process of apoptosis possitive reaction in drug administered animals group )%665.22±2542( compared with other experimental groups, also the results revealed significant decrease (P<0.05) in apoptotic index and the cells with Bax protein possitive reaction in animals administered with seeds extract and seeds extract - drug compared with drug group, ( 251.2±2521, 25422±2522) % respectively.

دراسة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل sativus Raphanus ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في الارانب == A Study the Protective Effect of Alcoholic Extract of Plant Raphanus Sativus (Radish) Seeds against the Oxidative Stress Induced by Sodium Nitrite on Liver and Kidney of Rabbits

Author name: لينا احمد عبد العزيز
Supervisor name: عالية حسين علي | مختار خميس محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى معرفة التاثير الواقي للمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل ضد الاجهاد التاكسدي المستحدث بواسطة نتريت الصوديوم NaNO2على كبد وكلى ذكور الارانب. باستخدام كحول 70% لاستخلاص المركبات الفعالة من البذور. استخدمت في الدراسة الحالية 25 ارنب ذكر قسمت الى 5 مجاميع تضمنت كل مجموعة 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوم. المجموعةT1 : جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم, المجموعة : T2 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 50 ملغم/كغم, المجموعة : T3 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة 100 ملغم/كغم, المجموعة : T4 جرعت فمويا ب 20 ملغم/كغم من مادة نتريت الصوديوم واعطيت المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل وبجرعة 200 ملغم/كغم, بالاضافة الى المجموعة : C مجموعة السيطرة جرعت فمويا بجرعة من الماء المقطر مساوية لحجم الجرعة المعطاة لمجاميع المعالجة. اوضحت نتائج الدراسة الحالية في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم حصول ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد (AST, ALT ,(ALP,مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين, ناتج اكسدة الدهون) وانخفاض في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. في الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم والمستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل 200,100,50 ملغم/كغم لوحظ حصول انخفاض في مستوى انزيمات الكبد (,AST, ALT ,(ALP مؤشرات وظيفة الكلى (حامض اليوريك, الكرياتينين) , محصلة الدهون (الكولستيرول, الدهون الثلاثية, الدهون الواطئة الكثافة , الدهون واطئة الكثافة جدا) ,مؤشرات الاجهاد التاكسدي (نسبة الميتهيموكلوبين وناتج اكسدة الدهون) وحصول ارتفاع في مستوى الكلوتاثيون بالمقارنة مع الارانب المعاملة بمادة نتريت الصوديوم فقط. بينت نتائج الفحص النسجي لكبد المجموعة المعاملة بنتريت الصوديوم توسع الجيبانيات الدموية, احتقان الاوعية الدموية, ارتشاح الخلايا الالتهابية, تنكس دهني ومائي, تنخر, زيادة اعداد الخلايا الكبدية ثنائية النواة, واظهرت النتائج النسجية لكلى المجموعة المعاملة بمادة نتريت الصوديوم انكماش الكبيبة, احتقان, ارتشاح الخلايا الالتهابية , نزف , تنكس , وذمة, تضخم. بينت نتائج الفحص النسجي لانسجة الكبد والكلى للمجموعة المعاملة بمستخلص البذور وجود حالة اصلاح لهذه الاعضاء. اعتمادا على نتائج الدراسة الحالية نستنتج ان المستخلص الكحولي لبذور نبات الفجل بجرعة (50 و100 و200 ملغم/كغم) يمتلك فعالية مضادة للاجهاد التاكسدي المستحدث بمادة نتريت الصوديوم على الكبد والكلى في ذكور الارانب. | The aim of this study is to investigate the protective effect of Radish (Raphanus sativus) seeds alcoholic extract against oxidative stress induced by sodium nitrite NaNO2 on liver and kidney in male rabbits. By using 70% alcohol to extract active compound from seeds of R.S. Twenty five adult male rabbits were divided into five groups (five rabbits in each group) and treated daily for 30 days. Group T1 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 , Group T2 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 50 mg/kg of alcoholic extract, Group T3 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 100 mg/kg of alcoholic extract, Group T4 : intubated orally 20 mg/kg NaNO2 + 200 mg/kg of alcoholic extract from Raphanus sativus seeds as well as Group C : control intubated orally distilled water. Founded in rabbits intubated with NaNO2, that there was increasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), and oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and a decrease in the level of glutathione (GSH) comparing with control . In rabbits intubated with NaNO2 + 50,100,200 mg/kg of alcoholic extract found that there was decreasing in the level of liver enzymes (AST, ALT, ALP), kidney function parameters (Uric acid, Creatinine), Lipid profile (TC, TAG, LDL - C,VLDL - C), oxidative stress parameters (MetHb % , MDA) and increasing in the level of GSH in comparison with rabbits intubated with NaNO2 only. The histological sections of liver which was treated with S.N. revealed dilation of blood sinusoids, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells, fatty and hydropic degeneration, necrosis and increase number of binucleated hepatocyte. Histological sections of kidney which was treated with S.N. presence of glomerular shrinkage, congestion, infiltration of inflammatory cells, haemorrhage, degeneration, edema, hypertrophy. Histological examination of liver and kidney tissue which was treated with seeds extract, revealed healing of these organs. In conclusion according to results obtained from this study that alcoholic extract of Raphanus sativus seeds in dose (50,100,200 mg/kg) have protective effect against oxidative stress induction by sodium nitrite on liver and kidney in male rabbits.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية == Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

Author name: لمياء علي حسين
Supervisor name: وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.

دراسة الاسهال المصاحب للمضادات الحيوية والتهاب القولون والمتسبب بجرثومة Clostridium difficile واستخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي في الوقاية والعلاج == Study of Antibiotic - Associated Diarrhea and Colitis caused by Clostridium difficile , and using Saccharomyces boulardii as a probiotic for the prevention and treatment

Author name: لمى يوسف مهدي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي | سعد صباح فخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 525 عينة براز لمرضى عراقيين مصابين بالاسهال والتهاب القولون المصاحبين للمضادات الحيوية من الراقدين في مستشفيات بغداد الذين كانوا تحت العلاج بالمضادات الحيوية واسعة الطيف ، فضلا عن اصحاء ظاهريا من اطفال(بعمر شهر فاقل الى 15 سنة) وبالغين(بعمر 16 سنة الى 61 سنة فاكثر) ، خلال الفترة من الاول من حزيران 2013 حتى نهاية ابريل 2014 . استبعدت 95 عينة اظهرت نتيجة موجبة للطفيليات والفطريات تجنبا لحدوث تداخلات في نتائج الدراسة . تم التحري عن بكتريا المطثية العسيرة Clostridium difficile (C.difficile)وذلك بعزلها وتشخيصها باستخدام وسط انتقائي، واجريت اختبارات مجهرية وكيموحيوية باستخدام نظامAPI 20 A system , كما فحصت حساسية العزلات للمضادات الحيوية. والكشف عن وجود السموم (ا وب( باستخدام تقنيةELISA وكشف جيناتهماtcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .واظهرت النتائج عزل وتشخيص75 (%17.44) عزلة من C.difficile من مجموع 430 عينة ، شملت 51 (21.3٪) عزلة من مجموع 240 عينة اطفال مرضى و12(15٪( عزلة من مجموع 80 عينة اطفال اصحاء ظاهريا ، اما من البالغين المرضى والاصحاء ظاهريا فكانت 11(15.7٪( عزلة من مجموع 70 و1(52.٪) عزلة من مجموع 40 على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الحيوية ,Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ciprofloxacin, Erythromycin, وAmpicillin ، وحساسية عالية لكل من Vancomycin وMetronidazol (100و 96(% على التوالي، مع حساسية جيدة للـ chloramphenicol.واظهرت جميع العينات الموجبة وجود سموم ( ا وب( باستخدام تقنية ELISA ، كما اظهرت جميع العزلات الموجبة احتواءها الجينات tcdA وtcdB باستخدام تقنية PCR .هدفت الدراسة ايضا استخدام خميرة Saccharomyces boulardii كمعزز حيوي خارج وداخل الجسم الحي للوقاية والعلاج من الاسهال والتـهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية والمستحث تجريبيا في فئران اصيبت بـC.difficile ، ومقارنة هذا التاثير مع التاثير العلاجي بالمضادات الحيوية. واظهرت النتائج كفاءة المعزز الحيوي في تثبيط نمو البكتريا خارج الجسم الحي والتقليل من التاثيرات النسيجية المرضية المصاحبة للاصابة بـ C.difficile من خلال الية التثبيط التنافسي داخل الجسم الحي .يستنتج من هذه الدراسة ان لخميرة S.boulardii تاثيرا ايجابيا لمنع وعلاج الاصابة بـ C.difficile من خلال احداث التوازن الميكروبي وتقليل او منع التاثيرات النسيجية المرضية الضارة للقولون ، وان هذا التاثير يكون احسن واكثر ايجابية في حالة الاستخدام المبكر والمستمر لهذه الخميرة , كما اثبتت الدراسة سلامة استخدام الخميرة كمعزز حيوي ، ومما تقدم اعلاه نوصي باستخدامها للوقاية والعلاج من الاسهال والتهاب القولون المصاحب للمضادات الحيوية . | A total of 525 stool samples were collected from patients with clinical symptoms of diarrhea and colitis with a history of antibiotics treatment from some hospitals in Baghdad .An apparently healthy children (one month to less than 15 years old) and adults (16 to 61 years and older) were involved in this study. Then investigation were carried out from June 2013 to April 2014. Ninety five samples were excluded from this study science they were contaminated by parasite and fungi . Clostridium difficile (C.difficile) were isolated and identified using selective media ,light microscope and biochemical tests using API 20 A system. All isolates were subjected to antibiotics resistance test. The presence of toxins : A and B were detected using ELISA technique ;while tcdA and tcdB genes were confirmed using PCR technique. The results showed isolate and diagnose 75 (17.44%) isolate of C.difficile out of 430 samples, including 51 (21.25%) isolate of a total 240 sample of children patients and 12 (15%) isolate of a total 80 sample of apparently healthy children, either from adult patients and apparently healthy were 11 (15.7%) isolate of a total 70 and 1 (2.5%) isolate of a total 40 respectively. Isolates showed high resistance for antibiotics : Colistin, Nalidixic acid, Cefotaxime, gentamycin Clindamycin ,ciprofloxacin, Erythromycin, and Ampicillin, and high sensitivity for Vancomycin and Metronidazol(100and 96)% respectively, with a good sensitivity to chloramphenicol . All the C.difficile positive samples showed presence of toxins (A and B) using ELISA technique, also all the positive isolates showed contain tcdA and tcdB genes by using PCR technique .The study also aimed to use the yeast Saccharomyces boulardii as probiotic in - vitro and in - vivo for the prevention and treatment of diarrhea and colitis associated with antibiotics and experimentally induced in mice that infected by C.difficile, and compared this effect with the therapeutic effect with antibiotics. The results showed efficiency of probiotic in the inhibition of bacterial growth in - vitro and reduce the pathological effects associated with C.difficile infection through competitive inhibition mechanism in - vivo.This study conclude that the S.boulardii have positive influence to prevent and treat C.difficile infection through the creation of microbial balance and reduce or prevent histopathological effects that harmful to the colon, and that this effect is better and more positive in the case of early and continued use of yeast. Besides that, this study proved the safety of S.boulardii as a probiotic and for all above it is recommended to be used for prevention and treatment of Antibiotic associated diarrhea and Colitis .

دراسة تشريحية مقارنة لمراتب من عائلة عرف الديك Amaranthaceae في العراق == Comparative Anatomical Study of Taxa From The Family Amaranthaceae in Iraq

Author name: فريال خالد خلف
Supervisor name: عذية ناهي سلمان المشهداني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Anatomy
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نبذة تاريخية عن علم تشريح النباتنبذة تاريخية عن علم تشريح النباتالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لمراتب عائلة عرف الديك قيد الد راسةالاهمية الاقتصادية والاستعمالات الطبية لكل نوعتشفيف الاوراق الخضرية والكاسية| طريقة التقطيع اليدويالمنظر السطحي لبشرة السيقان |نظام التعرق في الاوراق الكاسية

التغيرات النسجية والنسجية الشكليائية القياسية لعقار الليفيتراسيتام في بعض اعضاء الجهاز التكاثري في الفئران البيض == Histological and Histomorphological Changes of Levetiracetam Drug in Some Reproductive Organs in White Mice

Author name: فائزة جبار جودة الربيعي
Supervisor name: نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was conducted to study the effects of Levetircetam (LEV) drug at concentration of 350 mg/kg/day body weight on selected organs of male and female reproductive system in albino mice, Mus muculus (Swiss mice). The animals divided into three treated groups, the first group treated once a day for 14 days, the second group treated once a day for 30 day and the third group treated once a day for 45 days, in addition to 3 control groups one for each treated group.The results of the present study declare the following : • Selected organs of male reproductive system (testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis).The results revealed significant degrease (P<0.05) in the percentages of the weight of testes, caput (head) epididymis and cauda (tail) epididymis in treated animals for 14, 30, 45 days respectively in comparison with control group. The results also showed significant decrease (P<0.05) in percentages spermatogonia of the treated animals, when compare with control group. The percentages of the primary spermatocyte, secondary spermatocyte and spermatid increased significantly (P<0.05) in all three treated groups when compare with control groups and significant decrease (P<0.05) in percentage of spermatozoa, number of Sertoli cells, Leydig cells and diameter of Leydig cells nuclei. The mean diameter and thickness of somniferous tubules and height of epit helial cells and thickness of the tubules in the caput (head) and cauda (tail) epididymis in treated animal when compare with control group.The results of present study also showed that treatment with drug lead to histopathological changes in testes of animals treated with drug when compared with control groups such as degeneration, necrosis of spermatogenic cell and vacuolated of some seminiferous tubules, hypotrophy of interstitial and accumulation of spermatid at different stages of spermatogenic cells in lumen of tubules and degeneration of some of Leydig and separation of Sertoli cells from the basement membrane. Also results of percent study revealed some histopathological changes in caput (head) and cauda (tail) epididymis of treated animals with drug when compared with control groups, these change represented by degeneration some of epithelial cells and detachment of basement embrane and appearance of phagocytes in lumen of tubules and degeneration of epithelial cells and appearance of vacuoles between epithelial cells in addition to the damage of tubules. • Selected organs of female reproductive system significant increase (P<0.05), mean weight of ovary, oviducts and uterus of treated animals with drug for 14, 30, 45 days in comparison compared with control groups.Significant decrease (P<0.05) number of primary follicles and significant increase (P<0.05) in number of secondary follicles and significant increase (P<0.05) number of mature follicles of treated animals with drug about 14, 30, 45 days when compared with control group, significant increase (P<0.05) in number follicular cysts and corpus lutues of treated animals with drug when compared with the control groups, and significant decrease (P<0.05) diameter of growth follicles and corpus luteus and significantlyincrease (P<0.05) in diameters follicular cysts of treated animals with drug when compared with control groups. The results revealed some histopathological changes in ovary of treated animals with drug for when compared with the control groups, these changes represented by hypertrophy of cortex, degeneration of granular layer and accumulated some of cells in the middle of follicular lumen, degeneration in ovum and situated at the central position with increasing in the number of follicular cysts, separated of ovum from columns ovum, appearance of some abnormal ovum in some of follicles of ovaries.Significant decrease (P<0.05) in height and numbers of mucus folds in ampula and isthmus regions in oviduct of treated animals with drug when compared with control groups in addition to replacement of the ciliated columnar cells by cuboidal cell with the degreasing in the density of the cilia and the height of the secretory cells in addition hemorrhage, necrosis, hypoplasia and death of the columnar epithelial cells of the mucus folds, with the appearance of vacuoles, phagocytes in the center of the lumen,hypertrophy and hyperplasia in the tunica muscularis. Results also showed significant decrease (P<0.05) in numbers of endometrial glands of treated animals with drug when compared with control and significant increase (P<0.05) number of blood of treated animals with drugs when compared with control group and appearance significant increase (P<0.05) in high of epithelial cells of endometrium and thickness of lamina propria of three treated animals with drugs when compared with control group.The results revealed a histopathological changes in endometrium of treated animals with drug when compared with control such as hyperplasia and hypertrophy the epithelial layer and lamina propria and atrophy of endometrial glands and hyperplasia in epithelial of endometrial gland and detached basement membrane in some of them

انتشار ودراسة التضاد لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من فتحتي المنخرمن طلاب المدارس في محافظة ميسان == Prevalence and Study the Antagonism of Staphylococcus aureus Isolated from Nares of School Children s in Maysan Governorate

Author name: فاطمة يوسف موسى المحمداوي
Supervisor name: امال عباس محمد الفخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الدراسة الحالية تضمنت جمع 500 مسحة جمعت من انوف طلاب المدارس الابتدائية في محافظة ميسان للفترة ( من تشرين الاول لسنة 2014 الى ايار لسنة2015 للفئة للعمرية 6 - س11 سنة ) للتحري عن حاملي المكورات العنقودية الذهبية اخذت العينات من 8 مدارس ابتدائية (4 مدارس من المناطق الريفية و4 مدارس من المناطق الحضرية). شملت العينات الماخوذة 230 عينة من الذكور و270 عينة من الاناث . وكذلك تم التحري عن البكتريا والاعفان التي قد تكون موجودة في الانف والتي قد تقلل من نسبة تواجد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية في الانف. وقد استخدمت الطرق المختبرية القياسية في تشخيص هذه البكتريا وتم التاكيد باستخدام نظام API 20 .Vitick 2Compact system, وقد اظهرت النتائج ان 140 (28%) عزلة من العينات المدروسة ( 5841.43%)) عزلة اناث و82 ) (58.57عزلة ذكور) هي من النوع المكورات العنقودية الذهبية الموجبة لانزيم التجلط Coagulase Positive Staphylococcus aureus (CoPS).ولمعرفة ما اذا كانت الظروف المعيشية(الريف والمدينة) تؤثر على معدل حمل S.aureus في مناطق الريف والمدينة في محافظة ميسان تم استخدام اختبار مربع كاي حيث عكست نتائج التحليل ان هناك فروق معنوية جدا وصلت الى X2 = 34.747 تحت احتمالية (P ≤ 0.01) بين حاملين ال S.aureus ضمن مناطق الريف والمدينة مما يعكس ان الظروف المعيشة مرتبطة بنسبة حمل هذه البكتريا.كما كانت نسبة الانواع البكترية الموجبة لصبغة غرام الاخرى هي : Staphylococcus epidermidis 226 (45.2 %) Streptococcus spp 176 (35%), Staphylococcus saprophyticus 9(1.8), Aerococcus viridians 4 (0.8)% , Staphylococcus haemolyticus 2(0.4). هذا وقد خضعت العينات الموجبة لانزيم التجلط الى اختبار الحساسية الدوائية بواسطة طريقة الانتشار بالاقراص وقد استعمل 18مضاد حيوي حسب المعاييرالمختبرية العالمية لعام 2012 حيث كانت نتائج الحساسية الدوائية كالاتي : (Methicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%),Amoxyllcin(63.5%), Cefixime (61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28%), Erythromycin(30%),Azithromycin (28.57%),Ciprofloxacin (17.85%) .Clarthromycin (12.17%), Tobramycin (9.28%) , Doxycyclin (7.10%), Vancomycin (5%), Amikacin (2.85%) ,Gentamicin (1.42%), Clindamycin (1.42 %), Levoflaxacin (0.0%), وقد اظهرت النتائج ان المضاد الحيوي Levoflaxacin هوالمضاد الاكثر فعالية بين المضادات المستخدمة فقد وصلت حساسية جميع العزلات الى( 100 %) بينما اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة عالية لمضادات Beta - lactams . اجري الاختبارالتركيز المثبط الادنى Minimum Inhibitory Concentration (MIC) للعينات المعزولة بواسطة نظام الVitek 2 . بينت النتائج ان 8 ( 5.7%) عزلة هي من النوع الكورارات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin resist Staphylococcus aureus MRSA) ) حيث قاومت التركيز 0.5mg للمضادالحيوي Oxacillin . بالاظافة الى ذلك دلت نتائج فحص الحساسية بواسطة الفايتك احتواء هذه العينات المقاومة على البروتين المرتبط بالنسلين المحور 2 PBP واحتوائها على جين ال mecA . تناولت الدراسة ايضا عزل الاعفان الموجودة في الانف حيث تم دراسة 50مسحة وتم الحصول على الانواع الفطرية التالية ( Pencillium Spp, A niger. . A. terrus , Cladosporium Spp, Alternia Spp)) .كما وتم دراسة الفعل الثبيطي لرواشح هذه الاعفان على بكترياS. aureus اوضحت النتائج ان عفن ال Alternaria له القابيلة على تثبيط نمو بكتريا الS. aureus حيث بلغ معدل قطر التثبيط ( 24.67) ملم على التوالي , بالاظافة الى ذلك درس التاثير الثبيطي للبكتريا المتواجدة كنبيت طبيعي في الانف على بكتريا S.aureus حيث اختيرت بكتريا المكورات العنقودية البشرويةS.epidermidis حيث استخدمت طريقة الانتشار بواسطة الحفر well diffusion method لمعرفة تاثير الخلية البكتريا الكاملة وكراشح لهذه البكتريا ضد S.aureus لوحظ ان بكتريا S. epidermdis لم تبدي اي تاثير تثبيطي اتجاه الS.aureus سواء كخلية بكترية كاملة او كراشح لهذه البكتريا. بينما الكشف عن تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا S.aureus بواسطة epidermdis . S بواسطة استخدام جهاز Spectrophotometer اظهرت النتائج ان الامتصاصية بطول موجي 630 نانومتر فقد لوحظ انخفاض الامتصاصية من 0,022 لعالق بكتريا ال S.aureus مع سكر الكلوكوز بتركيز %0,25 المحضون لمدة 73 ساعة بدرجةحرارة 37 سيليزية الى 0,009 عند اظافة البكتريا المضادة S. epidermdis لعالق ال S aureus مع الكلوكو | The current study includes comprises 500 Nasal swab collected from the primary school students in the Maysan Governanat to investigate Staphylococcus aureus carriers for the period from (October to May 2014 - 2015 in the age group 6 - 11 years).The samples were taken from eight primary schools (4 schools from rural areas and 4 schools in urban areas),The samples taken include 230 sample from males and 270 sample from females, also to investigate for bacteria and fungi that may be present in the nose, which may reduce the percentage of the presence of the bacteria Staphylococcus aureus in the nose. The standard laboratory methods were used in the diagnosis of these bacteria and confirmed diagnosis using the API 20 system and the Viteck - 2 Compact System. The results showed that 140 (28%) isolates of the studied samples (58 isolated from females and 82 isolated from males) were Coagulase Positive Staphylococci(CoPS).To know whether that the living conditions (live in rural and urban districts) effect the rate of S. aureus carriers statistical analyses using chi square test for carriers in urban and rural districts revealed highly significant difference X2=34.747 (P≤0.01)which indicated that the living conditions and the rate of carriers are related.The proportion another gram positive bacteria were Staphylococcus epidermidis226(45.2%),Streptococcus spp176(35%),Staphylococcus saprophyticus 9(1.8%) Aerococcus viridians 4(0.8%) and Staphylococcus haemolyticus2(0.4).CoPS isolated were submitted to sensitivity test by kirpy - Bauer Disk diffusion method according to CLSI, 2012,18antibiotic has been used and the resistance rates ethicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%)Amoxycllin(63.5%),Cefixime(61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28),Erythromycin(30%),Azithromycin(28.57%),Ciprofloxacin(17.85%)Tobramycin (9.28%),Doxycyclin(7.10%),Vancomycin(5%)Amikacin(2.85%),Gentamicin 1.42%, Clindamycin (1.42 %), and Levoflaxacin (0.0%).The results showed that the antibiotic Levoflaxacin was the most effective antibiotic among them all isolates were a sensitive and reached to (100%) while most the isolates showed high resistance to Beta - lactame antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) was used by Vitek 2 system showed that 8 isolates of (5.7%) samples were Methecillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA)were they resisted to the minimum inhibitory concentration 0.5 for the antibiotic Oxacillin as well as the results of the examination sensitivity shown by Vitek 2 - System.These resistance isolates associated contain pencillin binding protein 2 PBP and contain the mecA gene.The study also included the isolation of Fungi from the nose, were the study showed 50 swabs got the following types (Pencillium spp, Aspergillus . niger, Aspergillus . terrus, Cladosporium spp, Alternaria spp).The inhibitory effect of the filtrates of these Fungi against S. aureus was studied, were results showed that the mold Alternaria spp only has the ability to inhibit the growth of S. aureus where average of inhibition zone reach to(24.67) mm in addition the present study include the control of S.aureus by the other bacteria which considered normal flora in the nose, Staphylococcus epidermidis selected for this purpose.Well diffusion method was used as Whole bacteria and filtrate for this purpose and results show that there are no inhibitory effect of S.epidermidis on S.aureus by this method. While biofilm formation of S.aureus was inhibited by S. epidermidis by detected using Spectrophotometer (360nm) results of the absorbency was decrease from 0.022 for suspension of S.aureus with glucose 0.25% incubated for 73 hour at 37 °C to 0.009 for suspension of antagonistic bacteria S. epidermidis added to the suspension of S. aureus and glucose 0.25% under the same condition and this indicate that the biofilm was inhibited by S.epidermidis

الاصابات الطفيلية في بعض اسماك نهر دجلة، منطقة الكريعات في محافظة بغداد, العراق == parasitic infections in some fishes from Tigris River, Al - Graiat location in Baghdad Province, Iraq

Author name: فاطمة خلف عطوان
Supervisor name: فاطمة خلف عطوان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت خلال الدراسة الحالية 578 سمكة من منطقة الكريعات الواقعة على نهر دجلة في محافظة بغداد اثناء المدة من شهر تموز 2015 ولغاية نهاية شهر اذار 2016. تضمنت هذه الاسماك، التي تعود الى 19 نوعا : 140 سمكة بلعوط ملوكي، 118 سمكة خشني، 66 سمكة بنيني كبير الفم، 46 سمكة حمري، 42 سمكة كارب اعتيادي، 38 سمكة بلطي احمر البطن، 21 سمكة بلطي ازرق، 14 سمكة قطان، 12 سمكة شبوط، 12 سمكة بني، 12 سمكة بنيني صغير الفم، 11 سمكة ذهبية، 11 سمكة شلك، 7 اسماك عراض، 7 اسماك سمنان، 6 اسماك ابو الزمير، 5 اسماك ابو براطم، 5 اسماك جري لاسع و5 اسماك مرمريج. فحصت الاسماك خارجيا وداخليا لتشخيص طفيلياتها. بينت النتائج وجود 77 نوعا من الطفيليات تضمنت : 14 نوعا من حاملات الاهداب، 17 نوعا من البوغيات المخاطية، 41 نوعا من الطفيليات احادية المنشا، اربعة انواع من المخرمات ونوعا واحدا من الديدان شوكية الراس. تم في هذه الدراسة تسجيل 22 نوعا من الطفيليات لاول مرة في العراق، تضمنت اربعة انواع من حاملات الاهداب هي : Trichodina centrostrigeata، T. intermedia، T. urinaria وTripartiella rhombi، عشرة انواع من البوغيات المخاطية هي : Myxobilatus baicalensis،Myxobolus bizerti ،M. branchialis ، M. chuatsi،M. dermatobius ، M. exiguus،M. kubanicum ،M. niei ، M. sphaerocapsularis وM. squamae، ثمانية انــــــواع مــــــن الطــــــفـــيـليات احادية المــــــنشا هــــي : Cichlidogyrus sclerosus، C. tilapiae، Dactylogyrus lenkoranoides،Gyrodactylus comephori، G. ibragimovi، G. macronychus، G. masu وParadiplozoon megalobramae. كما عد 50 نوعا من الاسماك مضيفات جديدة في العراق لـ 30 نوعا من الطفيليات.اظهرت انواع الطفيليات المسجلة في هذه الدراسة اختلافا في مواقع تطفلها في او على اجسام مضيفاتها، كما تباينت في نسب وشدد اصابتها للمضيفات المختلفة من الاسماك، كما بينت الدراسة الحالية وجود تباين في انواع واعداد الطفيليات التي تصيب انواع الاسماك، اذ كانت اسماك الكارب الاعتيادي والخشني مصابة باكبر عدد من انواع الطفيليات (21)، يليها كل من الشبوط والحمري (13)، وسمكة القطان (12)، وكل من البلعوط الملوكي وابو براطم والبنيني كبير الفم (11)، والبلطي احمر البطن (عشرة)، والسمكة الذهبية (خمسة)، وكل من البني والعراض (ثلاثة)، والشلك (اثنين)، وكل من البنيني صغير الفم والبلطي الازرق وابو الزمير والمرمريج والسمنان مصابة بنوع واحدا من الطفيليات، في حين لم تسجل اصابة باي نوع من الطفيليات في الجري اللاسع. | During the present investigation, a total of 578 fishes were collected from Al - Graiat location on the Tigris river at Baghdad province during the period from July 2015 until the end of March 2016. These fishes, which belonged to 19 species, included : 140 Chondrostoma regium, 118 Planiliza abu, 66 Cyprinion macrostomum, 46 Carasobarbus luteus, 42 Cyprinus carpio, 38 Coptodon zillii, 21 Oreochromis aureus, 14 Luciobarbus xanthopterus, 12 Arabibarbus grypus, 12 Mesopotamichthys sharpeyi, 12 Cyprinion kais, 11 Carassius auratus, 11 Leuciscus vorax, seven Acanthobrama marmid, seven Alburnus mossulensis, six Mystus pelusius, five Heteropneustes fossilis, five Barbus barbulus and five Mastacembelus mastacembelus. These fishes were externally and internally examined to identify their parasites. The results showed the presence of 77 species of parasites which included : 14 species of Ciliophora, 17 species of Myxozoa, 41 species of Monogenea, four species of Trematoda and one species of Acanthocephala. Among these parasites, 22 species were recorded for the first time in Iraq. These included : four species of Ciliophora (Trichodina centrostrigeata, T. intermedia, T. urinaria and Tripartiella rhombi), ten species of Myxozoa (Myxobilatus baicalensis, Myxobolus bizerti, M. branchialis, M. chuatsi, M. dermatobius, M. exiguus, M. kubanicum, M. niei, M. macrocapsularis and M. squamae), eight species of Monogenea (Cichlidogyrus sclerosus, C. tilapiae, Dactylogyrus lenkoranoides, Gyrodactylus comephori, G. ibragimovi, G. macronychus, G. masu and Paradiplozoon megalobramae). Also, 50 species of fishes were regarded as new hosts for 30 species of these studied parasites. The present study appeared a difference according to the site of infection on or in their hosts as well as in their prevalence and intensity of infections to their fish hosts, and showed verified in number and species of parasites that infected fishes. Among the infected fishes cyprinus carpio and Planiliza abu harbored the highest number of parasites species (21), followed by Arabibarbus grypus and Carasobarbus luteus (13), Luciobarbus xanthopterus (12), Chondrostoma regium and Barbus barbulus and Cyprinion macrostomum (11), Coptodon zillii (10), Carassius auratus (5), both of Acanthobrama marmid and Mesopotamichthys sharpeyi (3), Leuciscus vorax (2), both of Alburnus mossulensis and Cyprinion kais and Mastacembelus mastacembelus and Mystus pelusius and Oreochromis aureus (1), but there is no infection appeared with parasites in Heteropneustes fossilis.

دراسة الميكروبية والتداخل البكتيري للفطريات المصاحبة لالتهابات الانف والاذن لمرضى السكري وابيضاض الدم == Microbial Study and Bacterial Interaction with Mycosis Associated with Nose and Ear Inflammatory of Diabetes and Leukemia Patients

Author name: علیاء فخري خلف البیاتي
Supervisor name: امال عباس محمد الفخري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred and ten clinical samples were collected from hospitalized patients in hematology - oncology department in Baghdad Teaching Hospital and Al - Kindy Teaching Hospital, during the period from November 2014 to June 2015.The samples included 48 female and 62 male patients who are suffering from diabetes mellitus (DM) and leukemia. The ages of patients ranged between 13 - 82 years. The swab samples taken from the nose and ear of patients were (67 with diabetes mellitus and 43 with leukemia). The results of fungal culturing revealed that 50 samples of DM patients (74.63%) and 31 samples of leukemia (72.09%) were diagnosed as positive ones.From the collected clinical samples that gave positive results; it was found that Candida spp. was the most common fungi isolated from ear swabs (50%) followed by Aspergillus spp. (42.86%) and Penicillum spp. (7.14%).The results of fungal (molds) species isolated from the nose of DM patients revealed highly significant differences between fungal rates, Aspergillus spp. were isolated with highest levels (48.15%), followed by Penicillum spp. (37.04%); however, Rhizopus spp. was isolated with low levels (14.81%). On the other hand, it was found that Candida spp. and Rhodotorula spp. were the most yeasts isolated from the nose of DM patients. They were isolated with rates as (45.83%) and (41.67%) respectively. Nevertheless, the genus Cryptococcus spp. was isolated with low levels (12.50%). The results also revealed that males were more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungal are more prevalent in ages over fifty and ages between thirty one and fifty years compared with younger ages between ten and thirty years old. From the collected clinical samples of leukemia patients, highly significant differences were found between the rates of fungal infection. The level of Aspergillus spp. was (90.91%) and Rhizopus spp. (9.09%), while the levels of yeasts were (88.24%) and (11.76%) for Cryptococcus spp. and Candida spp. respectively.The frequent species of Aspergillus identified included A. niger (37.78%), followed by A. flavus (35.56%), A. fumigatus (17.77%) and A. terreus with lowest levels (8.89%). The results also revealed that males are more susceptible to fungal infection compared to females. Moreover, it was found that the fungi are more prevalent in ages 31 - 50, followed by younger ages (10 - 30) compared to old ages, over fifty years old.All fungal isolates were identified according to macroscopic and microscopic characteristics in addition to biochemical tests for yeast identification. Vitek 2 system is another confirmatory test which was carried out for further characterization for the yeast species. The results of Vitek 2 system revealed that Candida spp. were isolated with the highest level (41.67%), followed by Cryptococcus spp. (37.5%) however, Rhodotorula spp. was isolated with a low level (20.83%). A confirmatory test for the selected isolates of A. fumigatus using polymerase chain reaction (PCR) analysis technique was also conducted. This test has been done by using primers specific for hemolysin gene (aspHS). The results of the molecular method were closely related to those obtained from cultural methods with exception of one isolate which was positive by PCR method nevertheless, it was negative by culture method. The results of PCR analysis technique, revealed that 6 isolates out of total 8 (75%) were positive for the presence of aspHS gene compared to culture methods which showed 5 isolates out of total 8 (62.5%) had the ability to induce hemolysis when grown on blood agar .The inhibitory effect of Bacillus subtilis against Aspergillus spp. was also conducted, the results indicated that B. subtilis isolate has antimicrobial activity against Aspergillus spp; the diameter of inhibition fungal growth were 39.3 ± 01.5, 48.6 ± 02.2, 40.5 ± 02.8 and 43.5 ± 01.7 mm for A. fumigates, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with the diameter of controls which were 80.0 ± 05.3, 78.0 ± 03.9, 43.5 ± 01.7 and 72. ± 02.6 mm respectively. The radial inhibition growth of Aspergillus spp. treated with B. subtilis were 51%, 38%, 47% and 44% for A. fumigatus, A. flavus, A. niger and A. terreus respectively compared with treatment of control.
1 ... 45 46 47 48 49 ... 101