Author name: رفاه محمد جعفر الخطیب

Supervisor name: سالم رشید حمودي العبیدي

General topic: Medicine

Specific topic: Tissue Diseases

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

دراسة جزيئية للطفرتين NPM1 - A وFLT3 - ITD مع التعبير النسخي للمورث الجزيئي FLT3 في نموذج من المرضى العراقيين البالغين المصابين بابيضاض الدم النقياني الحاد وعلاقتهما مع المؤشرات السريرية والمختبرية == Molecular Study of NPM1 - A, FLT3 - ITD Mutations and FLT3 Transcript Expression in a Sample of Iraqi Adult Acute Myeloid Leukemia Patients : Their Correlations with Clinicopathological Parameters

Author name: شيماء محمد عبد اللطيف

Supervisor name: ختام رزاق كاظم الخفاجي | علي محمد جواد

General topic: Medicine

Specific topic: Diseases - Blood

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: Acute myeloid leukemia is a hematological malignancy of myeloid progenitor cells characterized by anomalous proliferation, inhibition of differentiation and extension of leukemic cells blocked at the early stage of hematopoiesis. It has a great variability in the pathogenesis, clinical features, and treatment outcomes. Detection of molecular markers has become a smart tool to further division of patients in acute myeloid leukemia subgroups.Nucleophosmin1 mutations are found in approximately 30% of adult acute myeloid leukemia patients and are associated with a good outcome when detected in absence of duplications in the Fms - like tyrosine kinase 3 gene. Over 50 molecular Nucleophosmin1 mutation variants have been recognized; the most common one is Nucleophosmin1 - A mutation.The Fms - like tyrosine kinase 3 receptor is expressed on the surface of hematopoietic stem cells and plays a vital role in normal hematopoiesis. Numerous studies have revealed that high levels of Fms - like tyrosine kinase 3 were expressed in patients with acute myeloid leukemia. Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutations are found in around 20 - 25% of patients with acute myeloid leukemia and are associated with increased transcript level of Fms - like tyrosine kinase 3 and with a poor scenario in adult acute myeloid leukemia patients.Aim of the Study1. Detect the frequency of Nucleophosmin1 - A; Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication along with assessment of Fms - like tyrosine kinase 3 transcript expression in a sample of newly diagnosed Iraqi adult acute myeloid leukemia patients.2. Study the relationship of Nucleophosmin1 - A, Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutations and Fms - like tyrosine kinase 3VItranscript expression with various clinicopathological parameters and French - American - British subtypes of the disease as well as the correlation among the three markers.Materials and MethodsThis is a cross - sectional study, conducted during the period extending between April 2015 and September 2016. The bone marrow aspirate samples of 53 adult acute myeloid leukemia patients were collected at the time of diagnosis and prior to treatment at the Hematology Ward of Baghdad Teaching Hospital in Medical City compared with 53 control individuals. All the control bone marrows obtained from patients with anemia and idiopathic thrombocytopenic purpura and were negative for infiltrative lesions. The related clinical and laboratory data for each patient were registered at the time of diagnosis.The study was conducted at Main Laboratory of Baghdad Teaching Hospital/ Medical City, Clinical and Communicable Diseases Research Center/College of Medicine/ University of Baghdad and Postgraduate Laboratory of Pathology and FoThe RNA was extracted and was reverse transcribed into cDNA. Real time polymerase chain reaction technique was applied on bone marrow aspirate samples of acute myeloid leukemia and control groups to detect the frequency of Nucleophosmin1 - A mutation, Fms - like tyrosine kinase 3 expression using a TaqMan probe and SYBR green assays respectively and detection of Fms - like tyrosine kinase 3 - Internal tandem duplication mutation using gel electrophoresis post polymerase chain reaction procedure

دراسة تجريبية لانزيمات البروتييز للزائفة الزنجارية المعزولة من المرضى العراقيين المصابين بتقرح القرنية ودورها في علاج تقرح القرنية المتسبب عن المكورات العنقودية == Experimental Study of Pseudomonas aeruginosa Proteases Isolated from Corneal Ulcer of Iraqi Patients and Their Role in the Treatment of Staphylococcus aureus Keratitis

Author name: عائدة حسين ابراهيم

Supervisor name: جاسم محمد كرحوت | منيرة جلوب اسماعيل

General topic: Medicine

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: One - hundred and twenty samples ( corneal scraping) were collected from patients diagnosed to have microbial keratitis (corneal ulcer) who attended Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital from the period between May 2013 and November 2013, Pseudomonas aeruginosa was reported 26 (21.6%) from the total cases. All bacterial isolates were diagnosed by conventional and biochemical tests, and confirmed by Vitek 2 Compact System.The role of proteases enzymes ( Elastase ( LasB), LasA, Alkaline protease and Protease IV ) of Pseudomonas aeruginosa in the corneal ulcer was studied by using genetic and molecular biological method by real time PCR, and the results indicated that three bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa possessed elastase gene (LasB) (11.5%), and only one bacterial isolate of Pseudomonas aeruginosa harbored LasA protease gene ( 3.8%). All bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa were harbored alkaline protease gene (100%), and twenty bacterial isolates were harbored protease IV (76.9%).The results of real - time PCR analysis indicated that four bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa (15.3%) were harbored more than one gene of different proteases enzymes ( elastase, alkaline protease, and protease IV).On the other hand our results showed that one bacterial isolates (3.8%) harbored both LasA protease and alkaline protease genes, and twenty bacterial isolates of Pseudomonas aerugenosa (76.9%) were harbored alkaline protease and protease IV genes.The LasA protease was extracted from Pseudomonas aeruginosa isolate by cooling centrifuge and precipitated supernatant by ammonium sulfate at saturation (80%). The resulted extracted crude enzyme concentration was 60 μg/ml. Then the crude enzyme was partially purified by dialysis and gel filtration chromatography by using Sephadex G - 100. The concentration of partial purified enzyme reached 40μg/ml.IIISummaryThe results of the experimental treatment of bacterial keratitis ( in vivo) of infected eyes rabbits caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was effective was as Lysostaphin in eradicating Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus from the infected corneas after approximately 15 h after giving the drug at dose 100 μl ( concentration 1μg / ml ) . While Vancomycin gave us very little potency in eradicating S. aureusfrom corneas in comparison with potency of LasA protease and Lysostaphin duringthis time but showed good potency very late approximately after 3 days of applicationof treatment.The results of the experimental treatment in vitro (in the test tube ) that is caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was similar to that of Lysostaphin drug in the killing of Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus in the bacterial broth.

تاثير الفيتامينات B1,B6 and B12) على الاعتلال العصبي المحيطي : دراسة نسيجية، نسيجية كيميائية وكيميا نسيجية مناعية == The effect of vitamins B1, B6 and B12 on peripheral neuropathy , Histological , Histochemical and Immunohistological studies

Author name: صالح مهدي علي

Supervisor name: معن حمد الخالصي

General topic: Medicine

Specific topic: Anatomy and Histology and Embryos

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: Peripheral neuropathy is a nerve injury process by disease or so on leading to damage of peripheral nervous system . Diabetes mellitus and compression are most common causes of peripheral neuropathy. Vitamins (B1,B6 and B12) commonly used for treatment of peripheral neuropathy. The objective of this study is to compare the effect of vitamins (B1,B6 and B12) on nerve regeneration and recovery after induced sciatic nerve crush injury in experimental animal model.Seventy five male Swiss albino rats were divided randomly into five groups and each group consisted of 15 animals. Group A( which considered as control positive(with crush injury) received normal saline intramuscularly for 45days. Group B received vitamin B1 , group C received vitamin B6 , group D received vitamin B12 and group E which considered as control negative(no crush injury and no treatment) . All animals were injected vitamins intramuscularly for 45days. Tail flick test time was reduced in rats treated with vitamin B12 after crush injury to the Sciatic nerve. Mid thigh circumference (MTC) was significantly increase in B12 treated group after crush injury to the Sciatic nerve. Data analysis was performed by SPSS 20 software using descriptive statistics.IVHistological examination of rats sciatic nerves stain by H&E on day 15 showing degenerative nerve fibers with Schwann cell infiltration in all groups but it is less prominent in group D. On day 45 histological examination of rats gastrocnemius muscles exhibited separation of bundles muscle fibers by connective tissue, variation of fibers in size and shape with atrophy of muscle bundles in all groups .While these were less prominent in rats treated with B12.Van Giesons staining of rat sciatic nerves on day 45 after crush injury. In all groups experimental and control (B,C,D,A) showing degenerative nerve fibers in different areas but less in group D and better organized sciatic nerve fibers in group D.Finally, Immunohistochemical study of (anti S100 protein) of rat sciatic nerves on day 45showed strong activity for those rats treated with vitamin B12 while rats treated with vitamin B1 and B6 exhibited moderate and weak activities respectively .In conclusion vitamin B12 promote peripheral nerve regeneration more than vitamin B1and vitamin B6.

العلاقة مابين بعض العلامات الحيوية القلبية الحديثة مع درجة التكلس والتصلب في الشرايين التاجية المقاسة : متابعة علاجية بالستاتين == Association of Some Novel Biochemical Markers with Coronary Artery Calcium Score and Stenosis : Follow Up treatment with Statin

Author name: نور نصير نافع

Supervisor name: باسل عويد محمد صالح | صباح موسى فاضل

General topic: Medicine

Specific topic: Clinical Biochemistry

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: يعد مفراس شرايين القلب القسطاري من احدث الطرق لتشخيص امراض الشرايين التاجية من خلال التصوير المقطعي (CCTA ) للاوعية الدمويه التاجية، والذي يعد من احدث الطرق التي تطورت بشكل ملحوظ خلال العقد الماضي من خلال تلوين الشرايين التاجية بدون تدخل جراحي لتشخيص المرض وبدقة عالية تتناسب درجة مقياس التصلب (Ca - Score) مع شدة التصلب الشرايين التاجية ويحدد درجة تطور المرض فى المراحل الاولى، ويعد الفتيون اي (Fetuin - A) من احدى العوامل السلبية الحادة المتفاعلة الذي لايزال غير معروف من الناحية الوظيفية الفسلجية، وهنالك العديد من الدلائل والدراسات التي توضح دوره المهم في عملية تكلس الاوعية الدموية الاوستيونكتين (Osteonectin) هو بروتين سكري لاصق ويعتبر عامل نضير صماوي تم تشخيصه حديثا من خلال انعكاس دوره في الحالة المرضية للانسجة الدهنية ، مثل اعادة تجدد الاوعية الدموية. ويعد الفسفاتين (Visfatin) نوع من انواع الاديبوسايتوكينات المتعدد الاوجه والذي يلعب دورا مهما في العمليات الايضية من خلال الجزء الخارجي من تركيبه وكذلك دوره في مختلف الاثار الضارة على الاوعية الدموية من خلال الالتهاب والانتشار . وقد برز حديثا دور البنتراكسين 3 (Pentraxin 3) كعلامة جديدة يعتقد انها اكثر تحديدا في التهاب الاوعية الدموية من البروتينات الاخرى في عائلة البنتراكسين مثل ارتفاع البروتين سي الحاد التفاعلي (hs - CRP).الهدفلدراسة العلاقة مابين العلامات الحيوية القلبية الحديثة الفتيون اي والاوستيونكتين والفسفاتين والبنتراكسين 3 والبروتين سي الحاد التفاعلي(hs - CRP)(Pentraxin 3)(Visfatin)(Osteonectin)(Fetuin - A) في المرضى الذين يشتبه باصابتهم بامراض شرايين القلب التاجية الذين لديهم درجه خفيفة الى متوسطة من تكلس الشرايين التاجية ، ثم مقارنة النتائج مع المرضى للذين يشتبه باصابتهم بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية وايضا لدراسة دور هذه العلامات الحيوية الحديثة مع درجة التكلس (Ca - Score) ودرجة السمنة (BMI) ومستويات الدهون في الدم المتمثلة بقياس (Cholesterol,HDL,TG) ثم دراسة تاثير علاج الدهون الـ (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) على مستوى كل من (العلامات الحيويه القلبية الحديثة ومستوى الدهون ) في المرضى المصابين بامراض تصلب شرايين القلب التاجية الذين يعانون من درجة تكلس خفيفة الى متوسطة ( Ca - Score =1 - 399 Agtaston score) .المواضيع اجريت هذه الدراسة في فرع الكيمياء الحياتية في كلية الطب - جامعة بغداد في المختبرات التخصصية لمستشفى ابن البيطار التخصصي لامراض القلب والشرايين خلال الفترة الممتدة من شباط 2013 الى كانون الاول 2013 من خلال تضمين 200 مريض مصاب بامراض تصلب شرايين القلب التاجية ثم ادراج 65 من المرضى المصابين بامراض تصلب شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية ولا يستخدمون علاج لدهون (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) تم تشخيص شدة التكلس بالشرايين التاجية من خلال قياس درجة التكلس من خلال جهاز فليبس للانظمة الطبية 64 بريليناس . ثم تقسيم المرضى الى 65 مريضا وعلى ثلاثة اقسام بحسب درجة التكلس لديهم والى ثلاثة مجاميع : المجموعة الاولى تضمنت 20 مريض لديهم درجة تكلس تساوي صفر وتتراوح اعمارهم مابين (31 - 65) سنة، والمجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى متوسطة ( Ca - Score1 - 399) تتضمن (25) مريض وتتراوح اعمارهم مابين (47 - 74)سنة، والمجموعة الثالثة ذو درجة تصلب شديدة ( Ca - Score ≥400) وتراوح اعمارهم مابين (49 - 75) سنة. تم متابع تاثير علاج الدهون (Statin, atorvastatin 10 - 40 mg ) على مستوى العلامات الحيوية القلبية الحديثة ومستوى الدهون لدى(20) مريض من اصل (25) من المجموعة الثانية تحت اشراف الطبيب الاختصاص في امراض القلب (د.صباح موسى فاضل).النتائجكشفت نتائج هذه الدراسة انخفاض كبيرذو دلالة احصائية في مستويات تركيز كل من : (الاستيونكتين والفسفاتين) مقرون بارتفاع ملحوظ ذو دلادلة احصائية في مستوى تركيز فيتيون اي فضلا عن الارتفاع غير الملحوظ احصائيا في مستوى كل من (البنتراكسين والبروتين سي الحاد التفاعلي) في المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية والثالثة ذو درجة تكلس الخفيفة الى شديدة مقارنة بالمرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية.وقد اظهرت هذه الدراسة وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية لدى المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية بين الفسفاتين والبنتراكسين3 بينما لوحظ وجود ارتباط سلبي ذولالة احصائية بين الفسفاتين والاوستيونكتين في المرضى بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس الخفيفة الى المتوسطة ولوحظ ايضا وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين البنتراكسين والمقياس درجة السمنة من جهة في المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية مع وجود ارتباط ايجابي ذولالة احصائية مابين البنتراكسين 3 والبروتين سي الحاد التفاعلي لدى المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية مقارنة بالمرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية والثالثة ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدة .وكذلك اظهرت هذه الدراسة ايضا وجود ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين الاوستيونكتين والكلوكوز لدى المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية للمجموعة الثالثة ذو درجة تكلس شديدة بينما وجد ارتباط سلبي ذو دلالة احصائية مابين الفتيون اي ومقياس درجة السمنة من جهة ومابين الفتيون اي ومستوى الكلوكوز من جهة اخرى لدى المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدة فضلا عن وجود ارتباط ايجابي ذو دلالة احصائية مابين البروتين سي الحاد التفاعلي ونسبة مستوى الكلكوز التراكمي بالدم مقارنتا بوجود ارتباط ايجابي ذو دلالة احصائية مع الكلسترول المفيد في الدم في المرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية بينما لوحظ وجود ارتفاع ملحوظ في كل من ( قيمة نسبة مستوى الكلكوز التراكمي ومستوى الدهون الثلاثية) ومستوى كل من ( (non - HDL ,AIفي المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى شديدةو المجموعة الثالثة ذو درجة تكلس شديدة مقارنة بالمرضى المصابين بامراض شرايين القلب التاجية الذين لايعانون من وجود تصلب في الشرايين التاجية. وقد ظهرت هذه الدراسة دور علاج الدهون في انخفاض مستوى كل من الفتيون اي والبنتراكسين3 وزيادة مستوى الدهون المفيد للمرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين التاجية المجموعة الثانية ذو درجة تكلس خفيفة الى المتوسطة بعد متابعتهم لمدة تتراوح مابين (6 - 8) شهور. ولوحظ وجود علاقة طردية مابين هذه العلامات القلبية الحيوية الحديثة مع( درجة التصلب وعدد الاوعية القلبية التي حدث فيها التصلب )مع وجود ارتباط مابين درجة التكلس المقاسة من خلال جهاز المفراس مع نسبة التصلب .الاستنتاجنظرا لكون درجة تكلس الشريان التاجي ذو علامة بديلة متزامنة مع امراض تصلب الشرايين التاجية لوحظ تزامن حدوثها مع ارتفاع مستوى الفتيون اي مقارنتا بانخفاض مستوى كل من الاوستيونكتين والفسفاتين مما جعلني اقترح دور هذه العلامات الحيووية القلبية الحديثة في تطور الناحية المرضية المسببة لتصلب الشرايين التاجية على الرغم من ارتفاع مستوى كل من البنتراكسين 3 والحاسة البروتين سي التفاعلي والتي تعكس الدور المهم للالتهاب كعامل اولي وسيط لتقدم المرض. ثم لوحظ دور علاج الدهون بخفض مستوى كل من الفتيون اي وتابنتراكسين 3من خلال (Pleotropic effect ) خلال فترة متابعة (20) من اصل( 25) من المرضى المصابين بامراض تصلب الشرايين القلبية التاجية ذو درجة تكلس خفيفة الى متوسطة لمدة (6 - 8) اشهر. | Coronary Computed Tomography Angiography (CCTA) is a rapidly growing, noninvasive imaging modality that developed quickly over the last decade, and its role for evaluation of Coronary Artery Disease (CAD ) becomes of great promise with high diagnostic accuracy. The presence and extent of Coronary Artery Calcification (CAC) correlates with the overall magnitude of coronary atherosclerotic plaque burden and with the development of subsequent coronary events. Human Fetuin A, is negative acute - phase reactant, its major physiologic functions are not fully understood. Several lines of evidence have suggested that it may play an important role in blood vessel calcification. Osteonectin is an adhesive glycoprotein; it is a newly identified autocrine/paracrine factor that could affect key functions in adipose tissue physiology and pathology through its implication in pathological condition of adipose tissue such as vascular remodelling. Visfatin is an multifaceted adipocytokine, It’s circulating levels are enhanced in different metabolic disease; extracellular part can exert various deleterious effects on vascular cells, including inflammation and proliferation. The Pentraxin - 3 (PTX3) has emerged as a novel marker thought to be more specific to vascular inflammation than other proteins in the PTX3 family such as high sensitive C - reactive protein (hs - CRP). Objective To study the relationship between novel cardiac biomarkers; Fetuin - A, osteonectin , visfatin, PTX3 and hs - CRP in patients with suspected CAD who have mild to severe degree of coronary artery calcification, Ca - Sore (1 - ≥400 ASU),then compare the results to patients with suspected CAD without calcification (Ca - Sore =zero ASU)and to explain the important role of these novel biomarkers in development of CAC , also to the study association of Coronary calcium score and novel biomarkers with obesity markers(BMI), and parameters of dyslipedemia(LDL - cholesterol,HDL - cholesterol).Finally, to demonstrat the effect of statin therapy (Atorvastatin 10 - 40 mg) on both novel biomarker and parameters of hyperlipidemia in patients with mild - to moderate degree of calcification with Ca - Score (1 - 399 )ASU.Subjects This study was conducted at the Department of physiol Biochemistry, College of Medicine, University of Baghdad and at the Cardiologic Clinics of Ibn - Al - Bitar Hospital, Baghdad, Iraq, during the period from February 2013 to November 2013. A total of 200 subjects with suspected Coronary Artery Disease (CAD) were encountered, 65 of them not on statin derivatives treatment were included in this study. These patients were investigated firstly for coronary artery calcium by using Multi - Slice Computed Tomography Scanner (Brilliance 64, Philips Medical Systems). The included 65 patients were classified according to their obtained values of coronary artery Ca score into three groups : Group I (GI) included 20 subjects who have coronary artery Ca score=0.0 Agatston Score unit (ASU), aged range (31 - 65 year) and considered as control group, Group II (GII) involved 25 patients with coronary artery Ca score of more than 1 - 399 ASU, aged range (47 - 74 year) and Group III (GIII) included 20 patients who have coronary artery Ca score of more than 400 ASU, aged range (49 - 75 year).Twenty patients of GII were followed after putting them on atorovastatin therapy (10 - 40 mg/day) for 6 - 8 months under supervision of the Consultant Cardiologist. Investigations included serum measurements of Fetuin A, Osteonectin, Visfatin, PTX3 and hs - CRP by using enzyme immunosorbent assay (ELISA) technique. HbA1c, fasting serum glucose and lipid profile parameters were also measured by using spectrophotometric methods. All investigations were performed in patients of the three groups (GI, GII and GIII) and also in patients post statin treatment. Results The results of this study revealed significant reduction in serum levels of visfatin (P=0.005) and osteonectin (P=0.0001) with significant increased of fetuin A in GIII compared with GI. In GII, serum level of osteonectin was significantly decreased, while Fetuin A significantly increased in comparison with those of GI(for both, P=0.0001). There was no significant differences between GII and GIII in the these three parameters.With regard to the changes in serum concentrations of pentraxin III and hs - CRP, the results found that both of these biochemical markers did not differ significantly among the three groups (GI, GII, and GIII).This study also showed that there was significant negative correlation between visfatin and pentraxin III in G I (r= - 0.495, P=0.027), while in GII, significant negative correlation was observed between visfatin and osteonectin (r= - 0.546, P=0.005). Pentraxin III also showed significant negative correlation with BMI in GI (r= - 0.528, P=0.017), significant positive correlation with BMI in GII (r=0.406, P=0.044) and significant positive correlation with with hs - CRP (r=0.482, P=0.031) in G I. In GIII, pentraxin III showed significant negative correlation with ostonectin (r= - 0.489, P=0.029). There is significant negative correlation of osteonectin with glucose in GIII (r=0.566, P=0.009) , In GII and GIII, Fetuin A showed significant negative correlation with BMI values (r= - 0.424, P=0.035)and with serum glucose (r= - .444, P=0.049) . Respectively in G I, hs - CRP concentration was found to be significantly positively correlated with HbA1c (r= - 0.509, P=0.022).The mean value of HbA1c was found to be significantly increased in GIII compared with GI (P=0.03). The serum level of TG was significantly increased in GIII and GII in comparison to G I (p= 0.019).The mean value of serum HDL - C levels of GIII was significantly decreased in comparison with that of GI (P=0.044). The serum level of VLDL is significantly decreased in both GI and GII compared to G III (P=0. 019.The mean value of non - HDL was significantly higher in GIII than in GII and that of GI (P=0. 0289), The mean values of atherogenic index of GIII and GII were significantly higher than in GI along with significant differences between that of GI and that of GII and III(P =0.0008).The present study showed the effect of complete course of statin treatment on the serum levels of novel cardiac biomarkers, the most effected one was serum PTX3 with significant decrease of its serum levels after treatment compared to that before treatment of the same patients group (P=0.0001) combined with significant decrease in serum level of Fetuin A (p=0.027) after complete course of statin treatment. In addition, there was significant increased of serum of HDL in patients after complete course of treatment compared to their concentration before starting treatment (P= 0.0001). Significant correlations were also observed between the novel studied biochemical markers and the degree and number of the major coronary arteries stenosis as well as between Ca score and stenosis.

ازدياد تعبيرالمعلمة الجزيئية miR - 21 التي تتوسط هبوط منتظم لجين PTEN في سرطان الثدي ومصاحبتها مع عوامل التنبؤ المعروفة == MicroRNA - 21 overexpression mediated phosphatase with homology to tensin (PTEN) downregulated in breast cancer in association with clinicopathological status

Author name: شروق محمد عباس التميمي

Supervisor name: سالم رشيد حمودي العبيدي | علي حسين الخفاجي

General topic: Medicine

Specific topic: Tissue Diseases

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: الخلفية : - سرطان الثدي هو الاكثر شيوعا في النساء في كل انحاء العالم . الموروث ( PTEN) هو الموروث المثبط للسرطان ,وهو منظم عكسي(اي مثبط)لاهم طريق لحدوث نمو وتكاثر الخلايا .المعلمة الجزيئية مثل ( miR - 21) هي الجزيئة الاولى التي تم اكتشافها التي تساعد على نمو وتكاثر الخلايا النامية وتمنع موت الخلايا ,اي تطيل من عمر الخلايا النامية. اذا حدث تغير في جزيئة ( miR - 21) وازداد عملها عن الحالة الطبيعية تؤدي الى حدوث نمو مستمر بدون موت الخلايا النامية مما يودي الى حدوث الخلايا السرطانية بالاضافة الى تاثيره على الموروث المثبط لنمو السرطان وهو (PTEN )الذي يعتبر موروث مستهدف له, بحيث يستطيع منع عمل هذا الموروث لذلك يؤدي الى حدوث سرطان الثدي .الهدف من الدراسة : - قياس تعبير المعلمة الجزيئية ( miR - 21) والموروث ((PTEN لمعرفة (زياده او نقصان) على اعتبارهم متغيرات حقيقية عن النسيج الطبيعي وعوامل التنبؤ لسرطان الثدي . المواد وطرائق العمل : - هذه الدراسة هي دراسة تجريبية من الشهر الاول سنة 2013 الى الشهر الاول سنه 2015.تم اخذ خمسين زوجا من العينات, وهذه العينات تؤخذ من سرطان الثدي ومن النسيج الطبيعي للثدي من النساء اللواتي تم استئصال ثديهن بسبب السرطان وهذه العينات تم اخذها في صالة العمليات وكانت العينات طازجة. تم استخلاص شريط ال RNA ثم بعد ذلك تم فحص جزيئة ال (miR - 21) وموروث(PTEN) . وتم تطبيق الواسم المناعي النسيجي الكيمياوي ((IHC لهرمون الاستروجين والبروجستين معher - 2 في العينات التي تم وضعها في بلوكات الشمع وبعد ذلك تم اختيار الحالات الموجبة ل(her - 2)وفحص تضاعف الموروث ( HER - 2) بواسطه تهجين موضعي ذي لونين .النتائج : - معظم الحالات كانت جزيئة ال( miR - 21) مرتفعة في النسيج السرطاني عن ماهو في النسيج الطبيعي وكانت احسن قيمة له (2.940 ) كدليل على ان الجزيئة تغيرت عن قيمته الطبيعية ,وكانت احسن قيمة له (4.156) في حالات انتشار السرطان في العقد اللمفاوية ,وقيمة (6.340 ) كدليل على المراحل المتقدمة من سرطان الثدي .بينما الموروث ( PTEN) كان في جميع الحالات منخفض عن النسيج الطبيعي واحسن قيمة له (0.210) كدليل لتغير تعبيرالموروث عن النسيج الطبيعي , وكانت القيمة) 0.175) دليل انتشاره الى الغدد اللمفاوية, وقيمة (0.098) تمثل المراحل المتقدمة من سرطان الثدي . هنالك علاقه عكسية بين جزيئة ال( miR - 21) والموروث ( PTEN) ولايوجد اي علاقة احصائية بين هذه المتغيرات وبين بقية عوامل التنبؤ الاخرى المعروفة في سرطان الثدي . الاستنتاجات : - التغير في التعبير كل من جزيئة ال ( miR - 21) والموروث (PTEN ) في جميع حالات سرطان الثدي وهنالك علاقة احصائية مع انتشار المرض الى العقد اللمفاوية ومع المراحل المتقدمة من سرطان الثدي . هنالك علاقة احصائية عكسية بين ازدياد التعبير للجزيئة (miR - 21) وانخفاض التعبيرللموروث (PTEN) في عينات سرطان الثدي . | Background : - Breast cancer is the most common cancer in women in worldwide. The phosphatase and tensin homolog gene is a tumor suppressor gene, and a key negatively regulator of cell signaling pathways that regulate growth and survival signaling pathways . More recently, microRNAs are small non protein coding RNAs involved in gene regulation. MicroRNA - 21 was one of the first oncogenic microRNAs and as an anti - apoptotic factor, to be characterized, being up - regulated in numerous tumors including breast cancer. The phosphatase and tensin homolog gene is one of microRNA - 21target genes Aim of the study : - To assess the validity of microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog (PTEN) gene expression as a diagnostic tool for gene alteration .Patients and Methods : - A prospective study , from January 2013 to January 2015. Fifty - pairs of fresh tissues from both breast cancer of invasive ductal carcinoma "NOS" and apparently normal adjacent tissues (from modify radical mastectomy) were by patients were recruited at the Surgical Department /Al - Diawania Teaching Hospital in Al - Diawania city . Total RNA extraction and real - time quantitative polymerize chain reaction technique were used for assessment of microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog gene expression. Tissue sample present in the paraffin embedded blocks belonging to tumor and normal adjacent tissue were used for Immunohistochemistry staining for (estrogen receptor, progesterone receptor and human epidermal growth factor receptor - 2) and dual color - chromogenic insitu hybridization technique for positive human epidermal growth factor receptor - 2 by Immunohistochemistry.Results : - Majority of cases 48(96%) ,were up regulated of microRNA - 21, indicating cancer tissue fold change of microRNA - 21 was significantly higher than that of normal adjacent breast tissue, and the best cutoff value for microRNA - 21 fold change in breast cancer tissues was (2.940)for diagnosis of gene alteration , (≥ 4.156) for positive lymph node involvement and (≥6.340) for higher stage (III,VI).All patients 50(100%) exhibit phosphatase and tensin homolog gene expression down regulation, indicating fold change of cancer tissue for phosphatase and tensin homolog gene expression was significantly lower than that of normal adjacent tissue and the best cutoff value for gene expressional alteration in breast cancer tissues was (0.210) for diagnosis of gene alteration, (≤ 0.175) for positive lymph node involvement and ( ≤ 0.098) for higher stage (III,VI) .Up - regulation of microRNA - A21 and down regulation of phosphatase and tensin homolog gene expression show no significantly correlate with other patients criteria like (age , grade ,size of tumor ,( estrogen receptor, progesterone receptor and human epidermal growth factor receptor - 2) by Immunohistochemical technique and human epidermal growth factor receptor - 2 gene amplification by dual color - chromogenic insitu hybridization technique . Identified significant negative correlation of up - regulation microRNA - 21 and down regulation of phosphatase and tensin homolog gene expression in breast cancer tissues.Conclusion : - gene expression of both microRNA - 21 and phosphatase and tensin homolog was significantly alterated in breast cancer tissues . It has been associated with positive lymph node involvement and higher tumor stage (III,VI)

تاثير التجميد بالتزجيج وطرق الاذابة المختلفة على حيوية وسلامة الحامض النووي للنطف == The Effect Of Laser Thawing After Vitrification On Sperm Motility And DNA Integrity

Author name: شذى صادق المراياتي

Supervisor name: غسان ثابت سعيد

General topic: Medicine

Specific topic: Physiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: ان التجميد بطريقة التزجيج تعتبر من طرق تجميد النطف البشرية وتعتمد على التجميد السريع للماء الى الحالة الزجاجية من خلال زيادة اللزوجة بدون تكوين بلورات داخلية (داخل الخلية). ان التجميد من الممكن ان يؤدي الى تاثيرات ضارة على تركيب ووظيفة النطف البشرية وان الاضرار الناتجة من التجميد من الممكن ان تؤثر على تركيب وسلامة الغشاء البلازمي. وان هذه الاضرار لا تقتصر على اضرار التجميد فقط بل تشمل ايضا على الاضرار الناتجة من عملية الاذابة بسبب اذابة او تبلور الثلج الناتج من التجميد. ان هذه العمليات ( التجميد والاذابة) من الممكن ان تؤثر سلامة الاحماض النووية وكذلك من الممكن ان تؤدي الى تغييرات في نواة النطف البشرية . ان التجميد قد يؤدي الى اجهاد تاكسدي للنطف البشرية كنتيجة الى انحلال الدهون التاكسدي وتقليل الية الدفاعية بواسطة الانزيمات المضادة للاكسدة. خلال عملية التجميد الخلايا والانسجة تخضع الى تغييرات كيميائية وفيزيائية . ان تاثير الليزر ومن خلال التحفيز الضوئي من الممكن ان يقاوم الاضرار الناتجة من التجميد للنطف البشرية وهذا من الممكن ان يؤدي الى تحسين نوعية النطف المجمدة وزيادة قابيلتها على الخصوبة. الهدف : دراسة تاثير الليزر كطريقة لاذابة النطف البشرية المجمدة وتاثيرها على سلامة الاحماض النووية والحركة مقابل الاذابة بدرجة حرارة الغرفة او عن طريق الحمام المائي. الموضوع والطرق : دراسة اجريت على 70 نموذج من النطف البشرية. كل نموذج قسم الى قسمين , قسم قد تم تحضيره بتقنية السباحة الى فوق والقسم الثاني بدون تحضير , وكل قسم قد قسم الى ثلاثة, جمدت, وتم اذابة كل جزء من النماذج بالليزر اوبدرجة حرارة الغرفة او بالحمام المائي بدرجة 37 درجة مئوية . تم دراسة سلامة الاحماض النووية وحركة النطف قبل وبعد التجميد , وكذلك قبل وبعد التحضير بتقنية السباحة الى فوق بطريقة الاكردين اونج (AOT) الحصول بالاعتماد على قياس المذنب (comet).النتائج : اظهرت النتائج ان الاذابة عن طريق الليزر لها تاثير معنوي (P<0.05 ) في تقليل تحطيم الاحماض النووية مع زيادة في الحركة الفعالة للنطف عند المقارنة مع الاذابة بدرجة حرارة الغرفة او بالحمام المائي.الاستنتاج : استنتجت هذه الدراسة ان تجميد الحيامن له اثار مؤذية تؤثر على سلامة الاحماض االنووية وحركة النطف البشرية. ان الاذابة بالليزر تحافظ على سلامة الاحماض النووية والحركة النشطة للنطف وان تقنية السباحة الى فوق كذلك تؤدي الى تنشيط النطف وتقليل تحطم الاحماض النووية. | Vitrification is a method of sperm freezing based on the rapid cooling of water to a glassy state through extreme elevation of viscosity without intracellular ice crystallization. Cryopreservation may lead to deleterious changes of sperm structure and function. Cryoinjury is not limited to the freezing process but may also occur during the thawing process as the ice melts or recrystallizes. It have been reported that cryopreservation/thawing significantly lead to alterations of sperm DNA integrity and could alter the quality of the spermatozoon’s nucleus. Cryopreservation induces oxidative stress in the spermatozoa due to increasing rate of lipid peroxidation and suppression of the antioxidant enzyme defense mechanism. These effects of cryopreservation lead to spermatozoa damage including nucleic acids. Subjects and methods : This prospective study carried on 70 cryopreserved semen samples. Each sample wasdivided into two parts, one part is unprepared and other part was prepared by swim - up technique and each part is divided into 3 parts, freezed and thawed by three methods of thawing by laser irradiation till melting for one part, and by room temperature and water bath at 37°C for the other two parts. The semen parameters were assessed by microscopical examination and the DNA integrity assessed by acridine orange test and comet assay before vitrification and after the three methods of thawing as well as before and after preparation. Result : The results of cryopreserved semen samples showed that laser irradiation thawing has a significant increase in sperm motility as well as a significant decreased DNA fragmentation (P < 0.05) versus room temperature and water bath thawing in addition sperm preparation by swim up method also lead to improve sperm motility and DNA integrity (P < 0.05).Conclusions : Vitrification has a deleterious effect on sperm DNA integrity and motility. Laser irradiation thawing methods of post freezing sperm improves post - thaw motility and DNA integrity. Sperm preparation by swim up technique for sperm preparation increasing motility and decrease DNA damage after thawing . The results of the acridine orange test and comet assay gave relatively similar predictive values for DNA fragmentation.

Author name: عمار احمــد ثامـــر

General topic: Medicine

Specific topic: Neurophysiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

Key words:

قسم الفسلجة السريرية

First pages:

Abstract: تصلب الاعصاب المنتشر مرض التهابي مزمن مجهول السبب، يتصف بفقدان الميالين (النخاعين) مع الميل الى اصابة محور الليف العصبي، ويصيب الاشخاص في الاعمار المتوسطة من حياتهم مع ارجحية اصابة النساء اكثر من الرجال.اشتملت الدراسة على فحوص الكهروفسلجية والكيمياء الحيوية بالاضافة الى فحوص شعاعية، لمئة واثني عشر مريضا مشخصا سريريا وفقا لمعايير مكدونالد (McDonald's criteria) وقورنت نتائجهم مع مجموعة ضابطة تضم خمسين شخصا متطوعا ومعافي.احتوت الفحوص الكهروفسلجية دراسة كامن العصب البصري المثار، في حين اشتملت الفحوص الكيميائيحيوية على قياس تراكيز النحاس ، الزنك ، المغنيسيوم ونسبة الزنك/النحاس في مصل الدم بالاضافة الى الفحوص الشعاعية بواسطة جهاز الرنين المغناطيسي.اشارت النتائج الى وجود زيادة معنوية في متوسط كمون الموجه الموجبة (P100) ولمتوسط فرق الكمون بين العينين مع نقصان معنوي لمتوسط مدى المركب (N75 - P100) لمرضى تصلب الاعصاب المنتشر، في حين لم يوجد فرق معنوي في متوسط فرق المدى للمركب (N75 - P100) بين العينين عندما قورنت بقيم المجوعة الضابطة. وكان الاكثر شذوذا في فحص كامن العصب البصري المثار لمرضى تصلب الاعصاب المنتشر هو الاطالة في كمون الموجة الموجبة (P100) ثم الاطالة في فرق الكمون بين العينين ومن ثم التغير في شكل الموجة ثم الاختزال في متوسط فرق المدى المركب (N75 - P100)، في حين كان الاختزال في متوسط مدى المركب (N75 - P100) الاقل تغيرا. وذلك يرجح التاثير الرئيسي لازالة الميالين على التوصيل والمتمثل كهروفسلجيا بزيادة الكمون.كانت هناك علاقة خطية موجبة بين نسبة العجز السريري للمرضى حسب مقياس كرتزك (Kurtzke) مع كمون الموجة الموجبة (P100) بينما كانت العلاقة الخطية سالبة مع مدى المركب (N75 - P100). وهذا يعني ان زيادة معدل العجز للمرضى يترافق بزيادة في عمليات ازالة الميالين مع الميل الى اصابة محور العصب.اظهرت دراسة الفحص الشعاعي ان جميع المرضى كانت لديهم لطخات في جهازهم العصبي المركزي حسب الفحص بالنموذج الثاني، وان توزيع اللطخات لا يتاثر مع العمر او نوع مرض تصلب الاعصاب المنتشر. بالاضافة لذلك كانت هناك علاقة خطية موجبة بين العدد الكلي للطخات مع نسبة العجز السريري، كذلك زيادة نسبة العجز السريري لدى المرضى المصابين بنوع الازدياد الاولي والثانوي عن غيرهم من الانواع، اضافة الى زيادة عدد اللطخات عند المرضى المصابين بنوع الازدياد الاولي والثاني على غيرهم من انواع المرضى.اظهرت الدراسة زيادة معنوية في تركيز النحاس ونقصان معنوي في تركيز الزنك والمغنيسيوم ونسبة الزنك/النحاس في مصل الدم عند المرضى، مما يشير لوجود عملية اجهاد تاكسدي لدى مرضى تصلب الاعصاب المنتشر.بالاضافة لذلك وجد ان هناك علاقة خطية موجبة بين نسبة العجز السريري للمرضى حسب مقياس كرتزك (Kurtzke) مع تركيز النحاس بينما كانت العلاقة الخطية سالبة مع تركيز كل من الزنك والمغنيسيوم ونسبة الزنك/النحاس في مصل الدم عند المرضى.يستنتج من هذه الدراسة ما يلي : 1. ان فحص كامن العصب البصري المثار يعكس انحدار في وظيفة المجال الكلي للنظر ويؤيد الدراسات السابقة في كشف الافات غير الظاهرة سريريا.2. امكانية جعل عجز مرضى تصلب الاعصاب ان يكون بشكل محسا وموضوعيا عن طريق هذا الفحص الكهروفسلجي.3. ان فحص الرنين المغناطيسي يستطيع ان يكشف اللطخات اكثر في نوع الازدياد الاولي والثانوي اكثر من بقية انواع مرض تصلب الاعصاب المنتشر.4. ان نسبة العجز السريري لدى مرضى تصلب الاعصاب المنتشر بنوعيه الازدياد الاولي والثانوي هي اكثر من بقية الانواع.5. كلما ازداد عدد اللطخات في الجهاز العصبي المركزي للمرضى كلمزاادت نسبة العجز السريري.6. وجود اختلال في التوازن الطبيعي بين الجذور الحرة ومضادات الاكسدة مع الميل باتجاه زيادة الاجهاد التاكسدي لدى مرضى تصلب الاعصاب المنتشر.7. امكانية الوصول الى تقييم مستوى العجز الحركي للمرضى بطرق كيميائيحيوية مثل قياس تركيز النحاس، الزنك والمغنيسيوم في مصل الدم.8. التغيرات الحاصلة نحو الاجهاد التاكسدي واختلاف االعناصر الزهيدة قد يكون السبب للمرض، او مرحلة من مراحل الامراض او نتيجة للمرض، وبكل الحالات يظهر انه يلعب دورا فعالا في هذا المرض ويحتاج الى المزيد من الدراسات المستقبلية. | Multiple sclerosis (MS) is an idiopathic chronic inflammatory disease characterized by demyelination that can be associated with axonal degeneration and is the leading cause of a non - traumatic neurological disability in young adults, with female affection more than male. This study was designated to assess the (1) changes in Visual Evoked Potential (VEP), (2) their frequency in MS patients with and without visual symptoms, (3) evaluate the oxidative status and trace elements in patients with MS, (4) correlate the results of VEP and biochemical studies with the disability of MS patients, in addition to assessing the Magnetic Resonance Imaging (MRI) findings in these patients and their changes with the disability status of patients with MS.Electrophysiological and biochemical studies in addition to imaging examination, had been carried out on 112 patients (35 males and 77 females) who were assessed clinically having definite MS, and fulfilled McDonald's Committee criteria and 50 normal control subjects (17 males and 33 females).Electrophysiological study involved visual evoked potential (VEP) of both eyes, in which P100 latency and P100 interocular (IO) latencies with amplitudes of N75 - P100 complex in addition to P100 interocular amplitude were examined, while Biochemical assay involved the evaluation of the oxidative stress by measuring the concentration of serum Copper, Zinc and Magnesium, in addition to the zinc/copper ratio measurement.This study reported statistically significant increase in the P100 latency and interocular latency difference, and a significant decrease in the N75 - P100 complex amplitude, while there was no significant difference in the IO amplitude difference between MS patients and control.The changes in the P100 latencies were more frequently recorded then the IO latency difference, while IO amplitude difference, N75 - P100 complex amplitude and the wave - form of potentials were the least, which is due to the demyelination effects on nerve conduction, and collectively, VEP abnormality was present in (79.46 %) of the examined MS patients.The changes in the VEP parameters recorded in MS patients who have clinical visual presentations, and the changes were also present in those patients without visual clinical picture, which indicates the presence of subclinical lesions in the visual pathways, this fact makes VEP test as an important diagnostic aid in MS patients.Moreover, the results of this study present a positive correlation between the P100 latencies with the patients disability (EDSS score), while with a negative correlation between the amplitudes of VEP potentials with the same score of MS disability.Regarding, neuroimaging, the distribution of MS lesions in the CNS is neither correlated with the type of MS nor the age of patients. While, the patients disability is increased with the increase of total number of MRI lesions. However, patients disability is more with the progressive forms of MS in which more number of MRI lesions in their CNS than other forms of MS disease are detected.Biochemically, the study for oxidative stress reveal a highly significant increase in the serum copper, and a significant decrease in the serum zinc, magnesium and zinc/copper ratio levels.The association between different clinical presentations and biochemical findings was not evident, however, there was a positive correlation between the clinical disability score (EDSS) with the serum concentration of Copper, and a negative correlation with that of Zinc, Magnesium and Zinc/Copper ratio.In conclusion, this study shows : 1 - VEP study can reveal a suspected deterioration of visual function and objectivate unsuspected clinically silent lesions.2 - Disability and physical deterioration of MS patients can be quantified and clarified by using this electrophysiological test. 3 - It manifests that MRI reveals CNS lesions in progressive forms more than other forms of MS.4 - Patients with the progressive forms associate with more disability.5 - The patients disability correlates with the total number of MRI lesion in MS patients.6 - It suggested the existence of a clear imbalance in oxidant - antioxidant status, towards an increasing oxidative state in MS patients.7 - Physical disability of MS patients can also be quantified by biochemical studies and serum Copper, Zinc, Magnesium and Zinc/Copper ratio levels can be used as biological markers of patients disability. 8 - The changes in the oxidative state and trace elements metabolism in MS, may be the cause behind the disease, a stage during its pathogenesis, or as a results of it, in all states they seems to have a potential role in this disease and need further studies to clarify it.

تقييم الطفرات الوراثية ل BRAF, IDH1 وفقدان 1p/19q في الاورام الدبقية للمرضى القراقيين : دراسة نسيجية مناعية كيميائية مع التهجين الموضعي المتفلور == Assessment of BRAF, IDH1 mutations and 1p/19q loss in Gliomas in Iraqi patients. Immunohistochemical and Fluorescence in Situ Hybridization study

Author name: زهراء مروان شعبان العمر

Supervisor name: سالم رشيد حمودي العبيدي

General topic: Medicine

Specific topic: Diseases - Genetics

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: Background : - Gliomas account for almost 80% of primary malignant brain tumors, so, they considered the most common primary malignant brain tumors in adults. The major types of glial tumors are astrocytomas, oligodendrogliomas, and ependymomas. Isocitrate dehydrogenases 1, BRAFV600E and 1p/19q co - deletion are important molecular markers nowadays for diagnosis and prognosis of gliomas. Isocitrate dehydrogenase mutation might be encounter in the low - grade glioma, occurs in early stages of development and directs the progression of the tumor to a higher grade. BRAFV600E is a point mutation, resulting in a valine to glutamic acid substitution at position 600 and this mutation occurs more in pediatric gliomas but less frequent in adult gliomas. Co - deletion of 1p/19q results from a non - balanced translocation t (1 : 19) (q10 : p10) with subsequent loss of one of the derivative chromosomes and highly associated with oligodendroglial tumors morphology and improved survival.Aim of the study : - To assess the frequency of Isocitrate dehydrogenases 1 and BRAF mutations in Iraqi patients with gliomas by immunohistochemical study, to correlate their immunoreactivity with some clinicopathological parameters. To validate frequency of 1p/19q loss by Fluorescence in Situ Hybridization study and correlate the deletion with the some parameters.Patients and Methods : Formalin fixed, paraffin embedded tumor tissue from 66 patients with different grades of intracranial gliomas of both gender and all age groups in Baghdad city were collected in this retrospective selective study. Ten normal brain tissue samples in form of paraffin blocks took from forensic medicine unit. New technique used, that is manual tissue microarray, in which twenty - four small cores (each measure 2mm) of represented tissue made, then cut by microtome. IHC detection of Isocitrate dehydrogenases 1 and BRAFV600E antibodies did by Dako autostainer link 48. Assessment of co - deletion of 1p/19qAbstractIII

الببتيدات النيتروجينية الدماغية الابتدائية نوع (NT - PROPBNP) ومؤشرات كيميائية حيوية اخرى في المصل كدلائل لضرر العضلة القلبية لدى مرضى المتلازمة التاجية الحادة == SerumN - Terminal Pro Brain Natriuretic Peptide and Some Other Biochemical marker as Indicators of MyoCardial Damage in patients with Acute Coronary Syndrome

Author name: وفاء منصور ميرزا

Supervisor name: احسان خليل عباس | باسل نجيب سعيد

General topic: Medicine

Specific topic: Clinical Biochemistry

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: المتلازمة التاجية الحادة تشير الى اية مجموعة من الاعراض تعزى الى اعاقة الشرايين التاجية. العلامة الاكثرشيوعا التي تحفز تشخيصACS هى الم الصدر، في اغلب الاحيانا تشع من الذراع الايسراو زاوية الفك، تشبه الضغط في النوعية، ومصحوبة بجيشان النفس والتعرق. متلازمة التاجية الحادة تحدث عادة كنتيجة لاحدى المشاكل الثلاث : الاحتشاء القلبي المرتفع ال ST ،الاحتشاء القلبي غير المرتفع الST ،اونوبة قلبيةغيرمستقرة. تسمى هذه الانواع حسب مظهر تخطيط القلب الكهربائي والمؤشرات الحيوية مثل كرياتين كاينيس، تروبونين خاص بالقلب ووالببتيدات النتروجينية الدماغية نوع BNPوبادرته (NT - proBNP) تفرز من قبل اذين وبطين العضلة القلبية للانسان. الارتفاع في مستوى الببتيدات النتروجينية نوع BNPوبادرته (NT - proBNP) بعد الاحتشاء القلبي المرتفع ال ST يربط بحجم الاحتشاء وتشوهات حركة جدار القلب.يبقى تخطيط صدى القلب الذي يستعمل بشكل متكرر وعادة الاختبارالتصويرى الاولي لتقييم كل امراض الاوعية القلبية المتعلقة بوظيفية،هيكلية اوشذوذ حركة الدم للقلب اوالشرايين الكبيرة.الهدف من الدراسة : 1 - لتحديد فائدة الببتيدات النتروجينية الدماغية ,التروبونين العالي الحساسية والبروتين التفاعلي العالي الحساسية كدلائل كيميائية في التشخيص المبكر لنقص التروية الدموية القلبية. - ربط مستوى الببتيدات النيتروجينية الدماغية الابتدائية مع معاملات تصوير صدى القلب.2في الحد من تاثير نقص التروية الدموية القلبية. تقييم كفاءة محلل الخثرة الليفية - 3 في نقص التروية الدموية القلبية. لربط العلامات الكيمياوية الحيوية المدروسة بعامل خطر - 4والطرق : المواضيع تم تضمين سبعين من المرضى الذين يعانون من انواع مختلفة من متلازمة الشريان التاجي الحادة وعشرين من الافراد الاصحاء في الدراسة. تم تقسيم المرضى الى خمس مجموعات : 1 - الاحتشاء القلبى واسعة النطاق : وشملت هذه المجموعة 26 (37.14٪) مريض. 2 - الاحتشاء القلبى في الحاجز الامامي : وشملت هذه المجموعة 10 (14.29٪) مريض. 3 - الاحتشاء القلبى الامامي : وشملت هذه المجموعة 2 (2.86٪) مريض. 4 - الاحتشاء القلبى السفلي : وشملت هذه المجموعة (25.71٪) مريض. 5 - الذبحة الصدرية غير المستقرة : وشملت هذه المجموعة 14 (20.00٪) مريض المرضى عادة عولجوا في وحدة القلب المخصصة لان هذا يوفر وسيلة مريحة لتركيز الخبرات والانعاش اللازم.تمت دراسة عوامل الخطر التي تزيد من حدوث متلازمة الشريان التاجي الحادة والتي شملت ارتفاع ضغط الدم، داء السكري، والتدخين، والسمنة، وتاريخ من امراض نقص تروية القلب. | Acute Coronary Syndrome (ACS) refers to any group of acute symptoms and sign, attributed to sever obstruction of the coronary arteries . Acute coronary syndrome usually occurs as a result of one of three problems : ST elevation myocardial infarction, non ST elevation myocardial infarction, and unstable angina. These types are named according to the results of the electrocardiogram (ECG/EKG) and cardiac biomarkers like Creatine Kinase, Cardiac - Specific Troponins and Natriuretic Peptides. B - type natriuretic peptide (BNP) and its precursor, N - terminal pro - BNP (NT - proBNP), are secreted by human atrial and ven¬tricular myocardium. The rise in BNP and NT - proBNP levels after STEMI correlates with infarct size and regional wall motion abnormalities. Echocardiography remains the most frequently used and usually the initial imaging test to evaluate all cardiovascular diseases related to a structural, functional, or hemodynamic abnormality of the heart or great vessels. The aim of the study : 1 - To determine the usefulness of NT - PRO Brain Natriuretic Peptide ,hs - troponin I and hs C - reactive protein as a biochemical indicator in early diagnosis of ischemia.2 - To correlate NT - PRO Brain Natriuretic Peptide level with echo cardio parameters.3 - To evaluate the efficiency of fibrinolytic drug (Actilyse) in reducing ischemia effect.4 - To correlate the studied biochemical markers with the risk factor of cardiac ischemia. Subjects and Methods : Seventy patients with acute coronary syndrome and twenty healthy individuals are included in the present study. Patients were classified into five groups according to their type of ischemia : I - Extensive myocardial infarction : this group included 26 (37.14%) patients.II - Anteroseptal myocardial infarction : this group included 10 (14.29%) patients.III - Anterior myocardial infarction this group included 2(2.86%) patients. IV - Inferior myocardial infarction this group included 18 (25.71%) patients. V - Unstable angina : this group included 14 (20.00%) patients. Patients are usually managed in a dedicated cardiac unit because this offers a convenient way of concentrating the necessary expertise, monitoring and resuscitation facilities.The risk factors that increased the incidence of acute coronary syndrome were studied which included hypertension, diabetes mellitus, smoking, obesity and history of ischemic heart disease.

الكشف الجزيئي عند مرضى HLA - B27 والمصلي لـ التهاب الفقار المقسط مع بعض الارتباطات السريريه == Molecular and Serologic Detection of HLA - B27 Among Ankylosing Spondylitis Patients With Some Clinical Correlations

Author name: ميادة محمد علي عبد الهادي الضايف

Supervisor name: بسام موسى صادق الموسوي

General topic: Medicine

Specific topic: Diseases - Genetics

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: مرض التهاب الفقار المقسط (AS)هو مرض التهابي مزمن يصيب المفاصل العجزية الحرقفية، العمود الفقري وليس من النادر المفاصل المحيطيه، كما يؤثر على 0.1 - 1% من عامة الناس. السبب الدقيق لـ AS غير معروف لكن تم تحديد استعداد وراثي قوي لـ AS مع ارتباط قوي بـ HLA - B27 الايجابيه، HLA - B27 يوجد في > 90% من المرضى AS البيض و50 - 80% من المرضى AS غير البيض. هناك عدة طرق للكشف عن HLA - B27 كالطرق المصلية (طريقة مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم(ELISA) وطريقة اختبار السمية للخلايا اللمفاوية الصغيرة(MLCT) والتقنيات الجزيئية (القائمة على الحمض النووي مثل PCR).كانت الطرق المصلية في البداية هي الاختبارات القياسية للكشف عن المتسضدات HLA - B27 ولكن استبدلت بالطرق الجزيئيه على اساس الحمض النووي لان الطرق المصلية لها عيوب عديدة كان تكون حساسة للتنظيم السفلي اوالتغييرات التوافقية للمستضدات، لا يمكنها اكتشاف فروق بنية البروتين الناتجة عن تعدد اشكال النوكليوتيدات الاحادي او المحدود ، لها نتائج سلبيه كاذبة او ايجابية كاذبة لعدة اسباب مثل التفاعل المتصالب للاجسام المضادة مع مستضدات فئة HLA class I المختلفة بسبب التشابه الواسع النطاق داخل الطبقه، وتغيير الحواتم المستضدي، تلوث الصفائح الدموية او كريات الدم الحمراء. تحدث هذه التغييرات في بنية البروتين (المستضد) في كثير من الاحيان استجابة للعدوى المتزامنة، والعلاج بالعقاقير والحالة الصحية للمريض.لاتتاثر التقنيات القائمة على تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) بهذه التغييرات في بنية البروتين، وبالتالي فهي اكثر تمثيلا لحالة منتج الجين (الحاضر/ الغائب)؛ بالاضافة الى انها قادرة على اكتشاف اختلاف اساسي واحد في تسلسل DNA بين الاليلين، ويمكن تطبيقه على اي مصدر من الحمض النووي الجيد بغض النظر عن قابلية الخليه. الهدف من الد راسة : 1. الكشف الجزيئي ل HLA - B27 عند المرضى المصابين بالتهاب الفقار المقسط بواسطة طريقة تفاعل البلمرة المتسلسل بالوقت الحقيقي.2. المقارنة بين التقنيات المصلية والجزيئية في التحقق من حالة HLA - B27.3. تقييم علاقة HLA - B27 مع بعض المتغيرات السريريه.المرضى والمواد وطرق العمل : اجريت دراسة مستعرضة على 83 مريضا عراقيا بالغا شخصوا في عيادة استشارات الروماتيزم والتاهيل في مدينة الطب - بغداد / العراق. واجريت تقارير بيانات المرضى والاختبارات اللاحقة بعد موافقة المريض. سجلت البيانات الديموغرافية والسريرية لجميع المرضى. حددت frequency of HLA - B27 لجميع المرضى المسجلين بطريقة تفاعل البلمرة المتسلسل بالوقت الحقيقي باستخدام HLA - B27 RealFast™ kit وكذلك بطريقة مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم (ELISA) باستخدام (human leukocyte antigen) ELISA kit.سحبت 3 - 5 مل عينات دم من المرضى الداخلين بالدراسة وقسمت الى عينتين : 1.5 - 2 مل جمعت في الانبوب العادي plane tube وتركت لتتجلط لاختبار (ELISA) والذي اجري في المختبرات التعليمية في مدينة الطب، وجمعت عينة دم اخرى بحجم 2.5 - 3 مل في انبوبK2 EDTA tube وحفظ مجمدا لتحليل الحمض النووي الذي اجري في المختبر المركزي للصحة العامه.النتائج : كان متوسط عمر المريض اعمار المرضى (±الانحراف المعياري) هو 38.4±9.8 سنة (المدى 16 - 62 سنه)، ونسبة الذكور الى الاناث هي 10.86/1، المرضى الذكور كان عددهم 76 ومرضى الاناث 7. متوسط عمر المرض من المرضى هو 9.08±32.13 سنة وكان متوسط عمر المرض للمرض هو 6.5±5.8 سنه. لوحظ التهاب الارتكاز في 44 (53%)، كان التهاب المفاصل الاطراف حاضرا في 14 (16.9%)، وكان التهاب العنبة موجودا في 12 (14.5%)، وامراض القلب والاوعية الدموية والصدفية وجدت في مريض واحد (1.2%) لكل منهما. كشف وجود HLA - B27 في 55 )66.3%) من المرضى من خلال real time PCR و28 (33.7%) خالة المتبقية كانوا حالات سلبية لـHLA - B27. كان ظهور المرض مبكرا وكانت مدة المرض اطول في المرضى الايجابيين لـHLA - B27 (قيمة p <0.05 لكل منهما). كانت هناك علاقة ذات دلالة احصائية بين HLA - B27 الايجابية مع الجنس والتهاب العنبة (p= 0.002, 0.032، على التوالي)، ولم تكن هناك ارتباطات ذات دلالة احصائية لـ HLA - B27 الايجابية مع العمر للمريض عند التشخيص ، وتاريخ العائلة، والتهاب الارتكاز ، والتهاب مفاصل الاطراف ، وESR وCRP والنتائج الاشعاعية وانواع العلاج. اظهرت حالة sHLA - B27 بواسطة ELISA لـ 83 حالة 32 حالة ايجابية (38.6%). عند مقارنة نتائج كلا الاختباريين باستخدام نتائج PCR كسيطرة، كانت 11 حالة نتائج ايجابية كاذبه و34 حالة كانت نتائج سلبية كاذبه، حساسية ELISA هي 38.18% والخصوصية 60.71%، وهذه الطريقة تكشف عن HLA - B27 القابل للذوبان، لذلك يمكن ان تتاثر بعدة عوامل بما في ذلك العلاج المستمر للمريض وصحة المريض. من بين 83 حالة، هناك 28 حالة (33.7%) لديها اختبار المصلي الاولي للكشف عن HLA - B27 باختبار microlymphocytotoxicity (MLCT)؛ اوضحت المقارنة بين نتائج ELISA وMLCT مع real time PCR (المستخدم كسيطرة) ان طريقة ELISA اظهرت 13 (46.4%) حالة هي نتائج سلبية كاذبة و3 (10.7%) حالات هي نتائج ايجابية كاذبة (حساسية = 60.6% ، خصوصية = 72.72% ، القيمة التنبؤية الايجابية (PPV)= 86.95%) في حين MLCT اظهرت 9 (32.1%) حالة كانت نتائج سلبية كاذبة و2 (7.1%) حالة هي نتائج ايجابية كاذبة (حساسية = 68.96% وخصوصية = 80% ، PPV = 90.9%). الاستنتاجات : • يتفوق كشف real time PCR لحالة HLA - B27 على التقنيات المصليةMLCT) و(ELISA. الاعتمادية والراحة والفعالية من حيث التكلفة لهذة الطريقة جعلها قابلة للتطبيق على التنميط الجيني HLA - B27 في الممارسات الروتينيه.• اعطت MLCT نتائج افضل من ELISA حيث استخدم الاخير للكشف عن sHLA - B27. كلا التقنيتين تحمل نتائج ايجابية كاذبة وسلبية كاذبة عاليه.• في المختبرات التي لاتتوفر فيها التشخيصات الجزيئيه، يمكن استخدام طريقة MLCT مع استخدام مضخمات صفيحة كبيرة (large panel antisera) لتقليل النتائج الكاذبه. • لم يؤدي الكشف عن ELISA لـsHLA - B27 في المصل الى الحساسيه او التحديد المطلوب. لتعزيز الايجابية، يوصى استخدام عينات البلازما ومحلول الاستعزاز(enhancing solution) لمنع فقدان sHLA - B27 اثناء التخثر وكذلك لمنع التفاعل المتصالب (cross - reaction) مع HLA - B7.• هناك ارتباط قوي بين HLA - B27 والتهاب الفقار المقسط بين المرضى العراقيين. • هناك ميل للمرض للتاثير على الرجال الايجابي HLA - B27 اكثر من النساء الايجابية HLA - B27.• تظهر اعراض AS في وقت اسبق في وجود جين HLA - B27 ومدة المرض كانت اطول في مرضى HLA - B27 الايجابيين من المرضى السلبيين، ولا يوجد اي ارتباطات مهمة لـ HLA - B27 مع المتغييرات المدروسة الاخرى.• هناك غلبة الذكور في الحالات AS وتبدا الاعراض عادة في الشباب | Ankylosing spondylitis (AS) is a chronic inflammatory disease affecting the sacroiliac joints, spine and not infrequently peripheral joints. AS affects 0.1 - 1% of general population. The exact cause of AS is still unknown but a strong genetic predisposition for AS was determined with a strong association with HLA - B27 positivity. HLA - B27 is present in >90% of white AS patients and 50 - 80% of non - white AS patients. There are several methods for the detection of HLA - B27 as serological methods (microlymphocytotoxicity (MLCT) and enzyme linked immunosorbent assay (ELISA)) and molecular techniques (DNA - based e.g. PCR). Serological methods were at first the standard tests for detection of HLA - B27 antigens but were replaced by DNA - based HLA typing because serologic methods have several disadvantages e.g. being sensitive to down - regulation or conformational changes of the antigens, cannot detect the protein structure differences caused by single or limited nucleotide polymorphism, have false - negative or false - positive results for several causes such as cross reactivity to other antibodies with different HLA class I antigens due to the extensive similarity within the class, altered antigenic epitopes, platelet or erythrocyte contamination. These changes to the protein (antigen) structure occur frequently in response to concurrent infection, drug therapy and health state of the patient.PCR - based techniques are not affected by these protein changes and are thus more representative to the state of the gene product (present / absent); in addition, it can detect allelic differences at the nucleotide level. It is a rapid and a selective method for the detection of HLA - B2701 to HLA - B2728 subtypes; it is capable of detecting a single base difference in DNA sequence between the two alleles and can be applied on any source of good quality DNA regardless of cell viability.Aims of the study : • To detect HLA - B27 status among patients with ankylosing spondylitis using real - time PCR technique.• To compare serologic and molecular techniques in verifying HLA - B27 status, and• To assess the correlation of HLA - B27 status with some clinical variables.Patients, Materials and Methods : A cross - sectional study was conducted on 83 adult Iraqi patients with AS diagnosed at the Rheumatology and Rehabilitation Consultation Clinic at the Medical City - Baghdad / Iraq. Patients’ data reporting and subsequent testing was performed following patients’ consents. Demographic and clinical data of all patients were reported. The frequency of HLA - B27 was determined in all enrolled patients by real - time polymerase chain reaction (PCR) using HLA - B27 RealFast™ kit as well as by ELISA method using (human leukocyte antigen) ELISA kit. Three to five ml of peripheral blood sample was aspirated from each and every enrolled patient. It was divided into two samples : 1.5 - 2 ml was collected in a plain tube and left to clot for serological (ELISA) test which was performed at The Teaching Laboratories / Medical City Campus and another 2.5 - 3 ml sample was collected in K2 EDTA tube and was kept frozen for DNA analysis which was performed at the Central Public Health Laboratory.Results : The mean age of patients (± SD) was (38.4±9.8) years (range 16 - 62 years). Male to female ratio was (9 : 1), male patients were 76 and female patients were 6. The mean age of disease onset of patients was 32.13±9.08 years and the mean age of disease duration of patients was 6.5±5.8 years. Enthesitis was observed in 44 (53%), peripheral arthritis was present in 14 (16.9%), eye involvement was present in 12 (14.5%), cardiovascular disease and psoriasis were in 1 (1.2%) each.HLA - B27 positivity was detected in 55 (66.3%) patients by real - time PCR and remaining 28 (33.7%) cases were negative HLA - B27. The disease onset was earlier and disease duration was longer in HLA - B27 - positive patients (p - value<0.05 for both). There were statistically significant correlation between HLA - B27 positivity with gender and uveitis, (p= 0.002, 0.032, respectively) and there were no statistically significant associations of HLA - B27 positivity with age at diagnosis, family history, enthesitis, peripheral arthritis, ESR, CRP, radiological findings and treatment types. The sHLA - B27 status by ELISA test for 83 cases showed 32 (38.6%) positive cases. Comparing the results of both tests using real - time PCR results as a control, 11 HLA - B27 cases were false positive and 34 patients were false negative results. Thus, the sensitivity of ELISA was 38.18% and specificity was 60.71%, this method detects soluble HLA - B27, so it can be affected by several factors including ongoing patient’s treatment and patient’s health. Out of 83 cases, 28 (33.7%) cases have initial serological test for detection of HLA - B27 by microlymphocytotoxicity (MLCT) test; the comparison of ELISA and MLCT results with real - time PCR (used as a control) revealed that ELISA method showed 13 (46.4%) false negative results and 3 (10.7%) false positive results, (sensitivity=60.6%, specificity=72.72%, positive predictive value (PPV)=86.95%) while MLCT showed 9 (32.1%) false negative results and 2 (7.1%) false positive, positive (sensitivity =68.96% and specificity =80%, PPV=90.9%).Conclusions : • Real - time PCR detection of HLA - B27 status is superior to serological techniques (ELISA and MLCT). The reliability, convenience and cost effectiveness of this method make it applicable to HLA - B27 genotyping in routine practices.• MLCT yielded better results than ELISA when the latter was used for detection of sHLA - B27. Both serologic techniques carry high false positive and negative results.• In labs where molecular diagnostics are not available, MLCT test can be used instead adding large panel antisera to reduce false results.• ELISA detection of sHLA - B27 in serum did not give the required sensitivity or specificity. To enhance positivity, the use of plasma samples and an enhancing solution are recommended to prevent the loss of sHLA - B27 during clotting and to prevent cross reaction with HLA - B7.• There is a strong association between HLA - B27 and ankylosing spondylitis among Iraqi patients.• There is a tendency of the disease to affect HLA - B27 positive men more than HLA - B27 positive women.• Symptoms of AS appear earlier in the presence of HLA - B27 gene and the duration of the disease was longer in HLA - B27 positive than negative patients. Uveitis is more likely to occur in HLA - B27 positive than negative patients, and there are no significant associations of HLA - B27 with the other studied variables. • There is a male predominance in AS cases and the symptoms start usually in young adults.

هرمون مضاد مولريان كعلامة للحمل بعد عمليات التلقيح المجهري عند النساء اللاتي يعانين من متلازمة تكييس المبايض == Anti - Mullerian Hormone as a Marker for Pregnancy following Intracytoplasmic Sperm Injection in Women with Polycystic Ovarian Syndrome

Author name: انعام عبد الواحد ذيب

Supervisor name: عفان عزت حسن | باسل عويد محمد صالح

General topic: Medicine

Specific topic: Physiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: العقم هو مرض من امراض الجهاز التناسلي يقصد به عدم قدرة الزوجين على الانجاب او تحقيق الحمل السريري بعد 12 شهرا او اكثر من الجماع الطبيعي الغير المحمي. هرمون مضاد مولريان (AMH) هو البروتين الذي يرتبط هيكليا الى اكثر من 35 الببتيدات مثل انهيبين، اكتيفين، وبروتينات العظام الشكلية وعوامل تمايز النمو، وكثير من هذه الببتيدات تشارك في الوظيفة الانجابية في كلا الجنسين. هرمون مضاد مولريان يمثل علامة بيولوجية للحجم النسبي لاحتياطي المبيض، وعدد الخلايا في الاحتياطي الجريبي الذي يساعد في التقنيات المساعدة على الانجاب ويمكن استخدامها للتنبؤ بتوقيت انقطاع الطمث. قد يكون هرمون مضاد مولريان مفيد كعلامة لضعف المبيض في متلازمة تكيس المبايض، حيث تعكس مستويات هرمون مضاد مولريان عدد الجريبات النامية من المبيض. وهومفيد ايضا في التنبؤ ببعض حالات عجز المبيض في متلازمة تكيس المبايض لكون مستويات هرمون مضاد مولريان تعكس عدد جريبات المبيض النامية. وهو مفيد ايضا في التنبؤ في حالة عدم استجابة المبيض خلال عمليات التخصيب في المختبر او اطفال الانابيب (IVF). مستويات هرمون مضاد مولريان مفيدة في اتخاذ قرار بشان بروتوكولات التحفيز في عمليات اطفال الانابيب (IVF) ويساعد في تحديد عدد الاجنة التي يتم نقلها في عمليات التقنيات المساعدة على الانجاب لزيادة معدلات نجاح الحمل وتقليل خطر متلازمة فرط المبيض. اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي لعلاج العقم واطفال الانابيب ومركز بغداد التخصصي لعلاج العقم واطفال الانابيب / بغداد - العراق، تم تقسيم مجموعات الدراسة الى مجموعتين، اللواتي لديهن متلازمة تكيس المبايض والمجموعة الثانية تتالف من الذين ليس لديهم تكيس المبايض (انثى عادية على ما يبدو مع عامل العقم ذكري)، وقد سجلت في هذه الدراسة المرتقبة ، خمسة واربعين مريضة تتراوح اعمارهن بين 18 و42 عاما يخضعن لعملية الحقن المجهري. وقد صممت الدراسة لمعرفة دور مستويات مصل الدم ومستويات السائل الجريبي( (FFمن هرمون مضاد مولريان(AMH)، الهرمون المنبه للجريب ((FSH ،الهرمون المنشط للجسم الاصفر( (LH،هرمون الاسترادايول (E₂) والانسولين في التنبؤ بالنتيجة السريرية (الحمل) بعد عمليات الحقن المجهري في النساء اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض واللواتي لديهم اباضة اعتيادية (عامل ذكري). ولاعداد قيم قطعية محددة لهرمون مضاد مولريان في مصل الدم والسائل الجريبي للاستفادة منها في التنبؤ بنتائج الحمل، وكدلك تقييم العلاقة بين النتائج التي تم الحصول عليها للهرمونات المدروسة في مصل الدم والسائل الجريبي. اظهرت نتائج هذه الدراسة وجود زيادة معنوية في مستوى هرمون مضاد مولريان في مصل الدم لدى النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض من النساء اللواتي لا يعانون من تكيس المبايض (P = 0.001)، فيما يتعلق بالهرمونات المقاسة الاخرى، اظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين مستويات الهرمونات في مصل الدم بين النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض من النساء اللواتي لا يعانين من تكيس المبايض (P = 0.034)، كما لوحظ وجود زيادة معنوية في مستوى هرمون الاسترادايول في مصل الدم في اليوم الثاني للدورة الشهرية لدى النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض من النساء اللواتي لا يعانين من تكيس المبايض (P = 0.025) فيما يتعلق بالهرمونات المقاسة الاخرى، كشفت النتائج عن عدم وجود فرق معنوي بين مستويات السائل الجريبي لهذه الهرمونات في النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض من النساء اللواتي لا يعانين من تكيس المبايض. عند اجراء المقارنة بين مستوى هرمون مضاد مولريان في مصل الدم وسائل الجريبات ومستويات الهرمونات الاخرى عند النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض والنساء اللواتي لا يعانين من تكيس المبايض من خلال قياس قيم الاختلافات المقترنة، كانت اكبر القيم في مستوى هرمون الاسترادايول ₂E بعده هرمون مضاد مولريان ، ثم هرمون المنبه للجريب (FSH) ، ثم الهرمون المنشط للجسم الاصفر (LH)،ثم الانسولين تعاقبا. عند اجراء دراسة القيم القطعية في مصل الدم والسائل الجريبي لهرمون مضاد مولريان لغرض التنبؤ بنتائج الحمل باستخدام منحنى النسب المئوية 90 و95 عند النساء اللواتي يعانين من تكيس المبايض والنساء اللواتي لا يعانين من تكيس المبايض وجميع المرضى في الدراسة، وهذا قد يساعد في التنبؤ بالنتائج السريرية (الحمل). لوحظ ارتباط مستوى هرمون مضاد مولريان مباشرة مع نتائج الحمل السريري. باستخدام غير الحوامل (الذين لديهم تكيس المبايض والذين لا يعانون من تكيس المبايض) بشكل عام لادخال مستوى قيم قطعية للتنبؤ بنتيجة الحمل. اظهرت مؤشرات حساسية وخصوصية هرمون مضاد مولريان والهرمونات الاخرى في المصل والسائل الجريبي ان مؤشر حساسية وخصوصية هرمون مضاد مولريان في المصل هي (79٪) وفي السائل الجريبي هي (70.3٪) وهما يمثلان اعلى قيمة مقارنة بالهرمونات المقاسة الاخرى، وهي هرمون الاسترادايول ₂E ، هرمون المنبه للجريب (FSH) ، الهرمون المنشط للجسم الاصفر (LH)، الانسولين ومقاومة الانسولين. ومن خلال دراسة منحنى روك للمصل والسائل الجريبي لهرمون مضاد مولريان وغيرها من الهرمونات وهي الاسترادايول ₂E ، هرمون المنبه للجريب (FSH) ، الهرمون المنشط للجسم الاصفر (LH)، الانسولين ومقاومة الانسولين ، تبين ان اكبر مساحة لما تحت المنحنى ((AUC كانت تعود لهرمون مضاد مولريان في المصل وبعدها لهرمون مضاد مولريان في السائل الجريبي. من هذه الدراسة نستنتج الاهمية السريرية لقياس هرمون مضاد مولريان في المصل وفي السائل الجريبي في تقييم النتائج السريرية (الحمل) بعد عمليات الحقن المجهري في النساء اللواتي تعانين من متلازمة تكيس المبايض ، ايضا ان قياس مستويات هرمون مضاد مولريان في المصل وفي السائل الجريبي مهمة في التنبؤ بحالات متلازمة تكيس المبايض في النساء التي تقوم بعملية الحقن المجهري، حيث ان زيادة مستويات هرمون مضاد مولريان تعكس شدة المرض. ان القيم القطعية التي تم الحصول عليها من تركيزات هرمون مضاد مولريان في المصل وفي السائل الجريبي مهمة جدا للتنبؤ بنتائج تقنية الحقن المجهري (ICSI) واستكمالها او انهاءها في (النساء اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض والنساء اللواتي لا يعانين منها ). | Infertility is a disease of the reproductive system refers to an inability of a couple to achieve a clinical pregnancy after 2 years or more of regular unprotected sexual intercourse. Anti - Müllerian hormone (AMH) is a protein that is structurally related to more than 35 peptides like inhibin , activin, bone morphogenetic proteins (BMPs) and growth differentiation factors, many of these involved in reproductive function in both sexes. AMH serves as a biomarker for the relative size of the ovarian reserve; the number of cells in the follicular reserve that helps in assisted reproduction and can be used to predict the timing of menopause. AMH may be useful as a marker of ovarian impairment in polycystic ovary syndrome, since AMH levels reflect number of the developing ovarian follicles. It is also useful in prediction of poor ovarian response during in vitro fertilization (IVF). AMH levels are useful in deciding what stimulation protocols for IVF cycles and helps in decisions about the number of embryos to transfer in assisted reproduction techniques to increase the pregnancy success rates and decreasing the risk of ovarian hyperstimulation syndrome. The study was designed to investigate the role of serum and follicular fluid levels of AMH, Follicular stimulating hormone (FSH), Luteinizing hormone (LH), Estradiol (E2) and insulin in prediction of clinical outcome (pregnancy) in women with PCOS undergoing intracytoplasmic sperm injection(ICSI) and those with normal ovulation and to set up the cutoff values of serum and follicular fluid AMH concentration for prediction of pregnancy outcome, and to evaluate the relationship between the obtained results of the studied women’s in blood serum and in follicular fluid (FF). This study was conducted in Kamal Al - Samarrai hospital for infertility treatment and IVF and in Baghdad Specialist Center for treatment of infertility and IVF/Baghdad - Iraq, the study groups were divided into two groups, those with polycystic ovarian syndrome (PCOs) and those without PCOs (normal female with male factor infertility), forty five female patients aged between 18 - 42 years undergoing IVF/ICSI treatment were enrolled in this prospective study. The results of this study showed a significant increase in serum AMH level of PCOs women’s than that of non PCOs women’s (0.001), in regard to other measured hormones, the results revealed that there was no significant difference between serum levels of these hormones in PCOs and non PCOs women’s. There was significant increase in follicular fluid (FF) AMH level of PCOs women’s than that of non PCOs women’s (P= 0.034).There was also a significant increase in FFE₂ level in non PCOs women’s than in PCOs women’s (P=0.025), in regard to other measured hormones, the results revealed that there was no significant difference between FF levels of these hormones in PCOs and non PCOs women’s. In comparison between the serum and follicular fluid ( FF) AMH level and other parameters in PCOs women’s and in non PCOs women’s by measuring the paired differences values, the greatest values was in the E₂ level after that the AMH, then the FSH, LH, Insulin consequently. By studying the cutoff values of the serum and follicular fluid AMH concentration for prediction of pregnancy outcome by using the percentiles 90 and 95 in PCOs, non PCOs and all patients in the study, this may help in prediction of clinical outcome (pregnancy). AMH was directly correlated with clinical pregnancy outcome. Using non pregnant (PCOs and non PCOs) in general to introduce a cutoff level for prediction of pregnancy outcome. The sensitivity and specificity index of serum and follicular AMH and other hormones, revealed that the sensitivity and specificity index of serum AMH (79%) and of follicular AMH (70.3%) have the highest value in comparison with other routine measured hormones, E₂, FSH, LH, Insulin and Insulin resistance. The Receiver operating characteristic (ROC) curve for serum and follicular fluid AMH and other parameters, E₂, FSH, LH, Insulin and Insulin resistance, the greater area was founded belong to serum AMH then the FF AMH. From this study concluded the clinical importance of the measurements of serum and FF levels of AMH in assessment of successful ICSI techniques in PCOS infertile women, also the measurements of serum and FF levels of AMH are important in prediction of cases of PCOS in women’s undergoing ICSI techniques. The obtained cut - off values of serum and FF AMH concentrations are very important for prediction of the outcome of the ICSI technique and its continuation or termination in (PCOs and non PCOs).

دراسة مقارنة بين الرياضيين وكثيري الجلوس من ناحية وظائف الرئة وتشبع الاوكسجين وتركيز الشوارد في الدم == Comparative Study of Pulmonary Functions, Oxygen Saturation, and Electrolytes in Athletes and Sedentary Controls at Rest

Author name: زياد طارق عبد الرزاق

Supervisor name: زيد عبد المجيد المدفعي

General topic: Medicine

Specific topic: Physiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: علم وظائف الاعضاء الرياضية هو دراسة الاثار طويلة المدى وقصيرة المدى للتدريب والظروف على الرياضيين، لمعرفة كيف يتفاعل رياضيا لانواع معينة من التمارين الرياضية.العضلات، والشوارد وتشبع الاكسجين تتاثر في الغالب في ممارسة. وفقا لنوع من الرياضة، ومدة التدريب والعضلات تتاثر في الغالب من قبل هذا التمرين، تتاثر قراءات الرئوية ايضا، وتميل الى ان تكون اعلى لدى الرياضيين من تلك التي من الناس المستقرة وبين المجموعات الرياضية انفسهم.1. هذه الدراسة وسط لتحديد احتراما في استجابة لاختبار وظائف الرئة، الشوارد وتشبع الاكسجين بين الرياضيين والمستقرة.2. التعرف على الفروق في استجابة لاختبار اداء الرئتين، وتشبع الاكسجين والشوارد بين الرياضيين من مختلف الرياضة الاكثر شعبية في العراق.اجريت قياس التنفس، ومستوى تشبع الاكسجين والدم الشوارد بما في ذلك الكالسيوم والمغنيسيوم والصوديوم والبوتاسيوم على 66 الرياضيين المستوى الوطني مختلفة تتراوح اعمارهم بين [24.36 ± 4.65 سنة]. وكان لاعب من خمس مجموعات رياضة مختلفة وكانوا جميعا من الذكور. للخروج منها، كان هناك 20 المصارعين، 15 لاعبي كرة القدم، 8 سباحين و8 عدائين و15 الكاراتيه مختلطة المقاتلين جميعهم رجال الرياضية المتخصصة، في حين كانت المستقرة 40 طلاب الطب، والذكور. وتبين هذه الدراسة ان الرياضيين لديها اعلى اختبارات وظائف الرئة من الجلوس في حين اظهر تشبع الاكسجين والشوارد في الدم في هذه الدراسة لا يوجد فرق كبير بين الرياضيين في الراحة وتلمس المستقرة | Sports physiology is the study of the long - and short - term effects of training and conditions on athletes, to learn how an athlete reacts to specific types of exercise.Muscles, electrolytes and oxygen saturation are mostly affected in exercise; and according to the type of sport, duration of training and muscles mostly affected by this workout, pulmonary readings are also affected and tend to be higher in athletes than those of sedentary people and between athletic groups themselves.1. This study is amid to Identify the deference in response of pulmonary function test, electrolytes and oxygen saturation between athletes and sedentary.2. Identify the differences in response of pulmonary function test, oxygen saturation and electrolytes between athletes of different most popular sport in Iraq.Spirometry, oxygen saturation level and serum electrolytes including calcium, magnesium, sodium and potassium were conducted on 66 different national level athletes aged [24.36 ± 4.65 years]. The athletes were from five different sport groups and were all males. Out of them, there were 20 wrestlers, 15 footballers, 8 swimmers, 8 runners and 15 karate mixed fighters all of them are specialized sports men, while sedentary were 40 medical students, males. This study shows that athletes have higher pulmonary function tests than sedentary while oxygen saturation and serum electrolytes in the present study showed

خلل الوظائف اللاارادية في مرضى الشلل الرعاشي == DYSAUTONOMIA IN PARKINSON'S DISEASE

Author name: اسماء خلف حمود

Supervisor name: اسراء فائق جعفر | فرقد بدر حمدان

General topic: Medicine

Specific topic: Physiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - Faculty Of Medicine

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: يؤثر على كبار السن بشكل اساسي، ولكن تتاثر الفئة العمرية الشابة ايضا. انه ينتج عن موت او تحلل الخلايا العصبية المنتجة للدوبامين بشكل رئيسي في المادة السوداء وقد يمتد الى اجزاء اخرى من الدماغ تحتوي على هذه الخلايا العصبية . ان السبب الرئيسي لهذا المرض لا يزال غير معروف، على الرغم من ان هناك العديد من العوامل التي تساهم في حدوثه.احد هذه العوامل هو الالتهاب، الاكسدة، واختلال عمل بيوت الطاقة (الميتوكوندريا) بالاضافة الى الاستعداد الوراثي للمريض المصاب بهذا المرض.ان الاعراض المرتبطة بمرض باركنسون هي الاعراض الحركية ، غير الحركية وغيرها من الاعراض بما في ذلك اعراض اختلال الجهاز العصبي اللاارادي.تربط هذه الدراسة بين اعتلال الجهاز العصبي اللاارادي من مرض باركنسون مع مواد استيل كولين، ومضادات الاكسدة، وعامل نخر الورم في ثلاث مجموعات دراسية التي هي مرضى باركنسون مع خلل الوظائف التلقائية (اللاارادية)، ومرضى باركنسون دون خلل الوظائف التلقائية ومجموعات الاشخاص الاصحاء.يتم ذلك من خلال دراسة الفحوصات اللاارادية بما في ذلك فحوصات القلب والاوعية الدموية اللاارادية (نسبة فالسالفا، ونسبة 30 : 15، والتغير في ضغط الدم عند الوقوف)، واستجابة الجلد السمبثاوي (SSR)، بالاضافة الى اختبار الكيمياء الحيوية من مستويات الاستيل كولين، ومضادات الاكسدة، وعامل نخر الورم.فيما يتعلق الاختبارات اللاارادية، اظهرت النتائج ان التغيرات في ضغط الدم عند الوقوف كان لها دلالة احصائية بالاضافة الى ذلك، نقص ضغط الدم الوضعي يمثل اهم اعراض خلل الوظائف التلقائية في مرض باركنسون.اما بالنسبة لمستوى الاستيل كولين فقد انخفض مع تطور مرض الشلل الرعاشي وذلك باصابة جهاز الوظائف التلقائية (اللاارادية). اضافة لذلك فان مستوى مضادات الاكسدة لم يظهر اي دلالة احصائية.من ناحية اخرى، نسبة عامل نخر الورم يزداد بتتفاقم المرض ليشمل خلل الوظائف التلقائية اللاارادية.بينت الدراسة ان عامل نخر الورم وعامل شدة الاكسدة يؤثران على تقدم مرض باركنسون ككل وخلل الوظائف الاارادية لهذا المرض بشكل خاص. | Parkinson disease is regarded as a common neurodegenerative disorder in the whole world that affects mainly elderly people, but young age group are also affected. It results from dopaminergic neuronal degeneration mainly in substantia nigra that may extend to other parts of the brain. The main cause of this disorder still unknown, although many factors that contributes in its pathogenesis. Of these factors, there are inflammation, oxidative stress, and mitochondrial dysfunction in addition to genetic predisposition.Symptoms related to Parkinson’s disease are motor, non - motor. The present study relates the autonomic dysfunction of Parkinson disease with the acetylcholine, antioxidants, and tumor necrosis factor in three study groups which are Parkinson patients with autonomic dysfunction, Parkinson patients without autonomic dysfunction and the control groups. The autonomic assessment is done by studying the autonomic tests including cardiovascular autonomic study (Valsalva ratio, 30 : 15 ratio, blood pressure change with posture), and sympathetic skin response, in addition to biochemical testing of acetylcholine, antioxidant, and Tumor necrosis factor levels. Regarding autonomic testing, the results difference that is statistically significant regarding changes of blood pressure in response to posture, in addition Parkinson disease. Acetylcholine level decrease as the disease progress from Parkinson patients without autonomic dysfunction to Parkinson patients with autonomic dysfunction. While antioxidant level was not significant difference between Parkinson patients with and without dysautonomia. On the other hand, tumor necrosis factor increases as the disease worsen to involve autonomic dysfunction. This study shows the effect of tumor necrosis factor and oxidative stress affecting the pathogenesis of Parkinson disease as a whole and autonomic dysfunction in specific