Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 691

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن == Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

Author name: محمـد فضـل سالم الميسـري
Supervisor name: حسين حسن عمر خانقاه | رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

استراتيجيات علاجية مختلفة في معالجة متلازمة تكيس المبايض == Different therapeutic strategies in the management of polycystic ovarian syndrome

Author name: لمى قاسم علي الطائي
Supervisor name: نوري محمد لعيبي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع حالات متلازمة تكيس المبيض لدى النساء العراقيات في الاونه الاخيرة وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول التغييرات الهرمونية وبعض المعايير البايوكيميائيه .تم في الدراسة الحالية استخدام طرق مختلفة للمعالجة ,كاستخدام نوعين من العقارات معا او استخدام عقار لوحده كذلك تم استخدام طريقه المعالجة الفيزيائيه والتي تمثلت بتغير نمط الحياة واتباع نظام غذائي محدد(الريجيم).ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة (95) امراة مصابه بمتلازمة تكيس المبيض قسمت الى مايلي : المجموعه (ا)تضمنت (35) امراه تعاطت عقار الميتفورمين بجرعة مقدارها( 850ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثانية (ب)شملت (32) امراه تعاطت الكولين وانيوسيتول(500/500 ملغم مرتين في اليوم ) مضافا له الميتفورمين (850 ملغم مرتين باليوم )لمده ستة اشهر والمجموعة الثالثة (ت) شملت (28) امراه اتبعت الريجيم وتغير نمط الحياة ولمده ستة اشهر . وقد اجريت هذه الدراسة في مستشفى كمال السامرائي ( بغداد) من الفترة حزيران 2013 لغاية شباط 2014 لنساء اعمارهن تتراوح بين ( 18 - 39 ) سنة .تم قياس كل من الهرمونات ( انتي ميولي رين ، اللوتيني ، المحفز الجريبي ، اللبتين ، التستوستيرون ، مقاومة الانسولين ,البروجستيرون،البرولاكتين, المعايير البايوكيميائية ، الدهون ، الكلوكوز ) .قبل وبعد العلاج بطريقة الاليزا .توصلت الدراسة الحالية الى النتائج التالية : 1 - وجود ارتباط معنوي عالي p<0.01) ) بين هرمون الانتي ميولي رين والتستوستيرون والانسولين ، ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع (اللوتيني ) المحفز الجريبي ، الاستريداول ، الكليسيريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية الواطئة الكثافة .2 - وجود ارتباط معنوي عالي ( p< 0.01 ) بين مقاومة الانسولين و( التستوستيرون ، الكولسترول ، الانسولين والكلوكوز واللبتين ) ووجود ارتباط معنوي ( p<0.05 ) مع ( اللوتيني والمحفز الجريبي والاستريداول والكلسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة والانتي ميوليرين ) .3 - انخفاض معنوي ( p< 0.05 ) في المحفز الجريبي وبين نسبةLH/FSH في مجموعة ( ا ) ( المتعاطيات للميتافورمين )وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى هرمون اللوتيني في نفس المجموعة . 4 - انخفاض معنوي ( p < 0.05 ) في مستوى هرمون اللوتيني وLH/ FSH في مجموعة ( ب ) ( المتعاطيات للكولين والنسيتول مضافا اليه الميتوفورمين ) وهناك انخفاض غير معنوي في مستوى المحفز الجريبي . 5 - مجموعة ( ت) التي اتبعت نظام غذائي ( الرجيم ) لم تظهر النتائج اي تغيرات كبيرة ، ماعدا انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في الكولسترول ، الكلسيريدات الثلاثية والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة واللبتين ) .6 - ارتفاع معنوي ( P< 0.05 ) في هرمون البروجيستيرون في مجموعة ( ب ) بينما هناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ا ) مع انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى التستستيرون في كلا المجموعتين ( ا ، ب ) .7 - تغيرات معنوية في مستوى الدهون في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) والتي تم معالجتها بمعالجات مختلفة .8 - انخفاض معنوي عالي ( P <0.01 ) في مستوى الانسولين في المجموعتين ( ا ، ب) وانخفاض معنوي في مقاومة الانسولين في كافة المجاميع ( ا ، ب ، ت ) . 9 - انخفاض معنوي عالي في دليل كتلة الجسم ( P< 0.01 ) في مجموعة ( ب ) وهناك انخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ، ت ). 10 - انخفاض معنوي ( P< 0.05 ) في مستوى اللبتين في المجموعتين ( ب ، ت ) بينما كان الانخفاض لا معنوي في مجموعة ( ا ) . 11 - انخفاض معنوي في مستوى هرمون الانتي ميوليرين في المجموعتين ( ا ، ب ) وهناك ارتفاع لا معنوي في المجموعة ( ت ) . | The cases of polycystic ovary syndrome have increased in Iraqi women lately, the current study was conducted in order to obtain some indicators about the hormone changes as well as some of the biochemical changes , In the present study , different types of management are used such as mixing between two drugs, used drug alone and using physical management by changing lifestyle and following up diet. In order to reach this purpose, the study groups(95 PCOS women) divided in to three groups , (group A) included (35) women will be treated with Metoformine for six months and (group B) included (32) women will be treated with Choline &Inositol and Metoformine for six months and (group C) included (28) women will change lifestyle and followed deit for six months This study was carried out in Kamal AL - Samaraee Hospital - Baghdad during the period from July 2013 to February 2014. women age range between (18 - 39) years . which measured hormonal profile (AMH, LEP , LH, FSH, PRL,T,PROG, E2,INS, IR) and biochemical parameter (lipid profile and FBG) ,before and after treatment by using ELISA . This study reaches to the following results : 1 - Significant decreased ( p < o.05) in FSH and LH/FSH ratio in group A (who are treated with metformen alone )while non significant decrease in LH level in the same group.2 - Significant decreased(p<o.05)in LH level and LH/FSH ratio in group B (who are treated with cholin &inositol and metformin )while non significant decrease in FSH level. 3 - Group C (which followed diet)results showed no significant changes in all parameter in the study except (cholesterol, Triglyceride , LDL ,IR, Lep )was significant decrease(p<0.05) .4 - Significant increased in progesterone level (p<0.05)in group B while non significant in group A, and significant decrease in T level (p< 0.05) in both group (A,B).5 - Significant changes in lipid profile in all groups (A,B,C)who are treated with different treatment .6 - Highly significant decrease(p<0.01) in INS level in group (A,B), and significant decrease(p<0.05) in IR in all group (A,B,C).7 - Highly significant decrease (p<0.01)in BMI in group B while non significant in group A and C.8 - Significant decrease (p<0.05)in Lep level in group( B, C) while non significant in group A.9 - Significant decrease in AMH level in group (A,B)while non significant in group C. 10 - Highly signification correlation coefficient ( p < 0.1 )between AMH and Testosterone and Insulin hormone. While significant correlation (p<0.05) with cholesterol , HDL, LDL ,and IR .11 - Highly signification correlation ( P < 0.01 ) between IR and ( testosterone ,cholesterol , INS ,FBG and LEP ) . While significant correlation ( p < 0.05 ) with ( LH , FSH , E2 , Triglyceride , LDL and AMH ) .

دراسة مناعية ومايكروبايولوجية لمرضى الربو == IMMUNOLOGICAL AND MICROBIOLOGICAL STUDY FOR ASTHMATIC PATIENTS

Author name: كريم شحل جياد الطائي
Supervisor name: كريم شحل جياد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الربو اضطرابا التهابيا مزمنا في المسالك الهوائية وانه مرض متعدد الاسباب تلعب المحفزات غير الارجية اضافة للعوامل الارجية دورا فيه . ان الدراسة الحالية تمحورت بشكل اساسي حول الربو الارجي (Allergic asthma) والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1 - من اجل البحث في العلاقة بين الابواغ الفطرية المحمولة في الهواء والمظاهر السريرية لمرضى الربو العراقيين فقد اجريت دراسة كمية ونوعية للفطريات داخل وخارج المنازل (Indoor and Outdoor) باستخدام طريقة الاطباق المفتوحة وذلك خلال الفترة من كانون الثاني 2001 لغاية كانون الاول 2002. اظهرت النتائج ان كثافة الابواغ الفطرية تتباين تبعا للمواسم والظروف المناخية وان شيوع هذه الفطريات كان داخل وخارج المنازل وفق التسلسل التالي : Aspergillus nigar , Penicillium , Aspergillus flavous , Caldosporium Alternaria . اجريت تقيما لدور هذه الفطريات في حث امراض الارجية لدى 116 من مرضى الربو 50 من الاناث و66 من الذكور تراوحت اعمارهم بين 70 - 5 سنة وكذلك 45 فردا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة وذلك باستخدام اختبار وخز الجلد (Skin prick test) ، وقد ابدى غالبية المرضى فعالية جلدية لخلاصة خليط الفطريات MM1 وMM2 وMM3 وMM4 وMM5 كما لوحظت علاقة ايجابية بين وجود هذه الفطريات داخل وخارج منازل مرضى الربو وبين مدى استجابتهم اليها . تبين من خلال قياس مستوى الضد IgE النوعي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) ان اضداد الفطريات Penicillium ، Aspergillus ، Alternaria كانت الاكثر تكرارا 2 - من اجل الغاء المزيد من الضوء حول دور الاخماج البكتيرية والتي من شانها ان تفاقم نوبات الربو ، فقد اجريت عملية زرع القشع لـ 68 مريضا من مرضى الربو تم خلالها عزل 6 انواع من البكتريا كانت Strepto pneumoniae اكثرها تكرارا (%35.2) تليها بكتريا Staph aureus بنسبة (%30.9) وبكتريا H. influenza بنسبة (%7.3) واخيرا بكتريا Strepto pyogenes وStaph epidermidis وN. cattarrhalis وبنسبة (%4.4) لكل منهما. عزلت (9) عزلات من خميرة C. albicans من اولئك المرضى والذين ابدوا تفاعلات جلدية موجبة باستخدام خلاصات هذه الخميرة . ومن خلال اجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية للعزلات ابدت غالبية تلك العزلات حساسية عالية لمضادات Ciprofloxacin وAugmentin وCefatoxime كما ابدت العديد منها مقاومة لمضادات Ampicillin وCloxacillin وTetracycline وErythromycin .3 - ولالقاء الضوء على الحالة المناعية لمرضى الربو تم تحديد مستويات الاضداد IgA وIgG وIgM واجزاء المتمم C3 وC4 في امصالهم باستخدام طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (Single Radial Immunodiffusion=SRID) ومستويات الضد IgE الكلي بتقنية ELISA تبين من خلالها ، بان متوسط مستويات الضد IgG والضد IgA قد انخفضت معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة مع مجموعة السيطرة وان متوسط مستوى جزء المتمم C3 قد ارتفع معنويا في امصال مرضى الربو مقارنة بمستواه لدى افراد السيطرة في الوقت الذي لم يحصل تغير جوهري في مستويات الضد IgM والجزء C4 من مكونات المتمم من جراء الاصابة بالربو. فيما يتعلق بتقدير مستويات الضد IgE الكلي فقد اظهرت النتائج ان هنالك ارتفاعا معنويا في مستويات هذا الضد لدى مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة وان هنالك اختلافا معنويا في مستوياته بين كلا الجنسين من مرضى الربو. اوضحت الدراسة كذلك ان هنالك فروقا في تفاعل التلازن الخاص بالبروتين الفعال - C والذي كان اكثر ايجابية لدى مرضى الربو وعلى الاخص منهم اولئك الذين يرافق اصابتهم بالربو الخمج البكتيري ومنها Strepto. pneumoniae بشكل خاص . تبين من خلال العد التفريقي لخلايا الدم البيض ان هنالك ارتفاعا معنويا في اعداد خلايا الدم الحمضة في مرضى الربو بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . ومن ناحية اخرى فقد لوحظت علاقة معنوية بين الارتفاع في اعداد هذه الخلايا ولارتفاع في مستويات الضد IgE وكذلك مع فعالية الجلد التي يبديها مرضى الربو. تم تقدير الفعالية الحجمية لانزيم (ADA) في امصال مرضى الربو باستخدام الطريقة الانزيمية ، لوحظ من خلالها ارتفاعا معنويا في فعاليته لدى هؤلاء المرضى وعلى الاخص لدى الاناث مقارنة بالذكور .4 - باستخدام تقنية الامتصاص الذري اللهبي لتحديد مستويات العناصر Fe وZn وCu وتقنية الامتصاص الذري اللالهبي لتحديد مستويات Se وMg هذا وقد لوحظت ان هنالك انخفاضا في مستويات العناصر Fe وCu وMg وSe وارتفاعا معنويا في مستوى عنصر Zn في امصال مرضى الربو بالمقارنة مع افراد السيطرة | Asthma is a chronic inflammatory disorder of the airways. Its aetiology is multifactorial , in which non - allergic triggers and allergic factors have role to play. The present study is concerned mainly with allergic asthma, and the results can be summarized as the following : 1 - To investigate the relationship between air spora and the clinical expression of asthma in Iraqi patients, a quantitative and qualitative study of indoor and outdoor airborn fungi was carried out during the period January 2001 - December 2002 . The results revealed that the spore density depends on seasonal and climatic changes. The common observed genera, arranged according to their density, were/Aspergillus nigar, Penicillium, Aspergillus flavous, Alternaria, and Cladosporium . The role of the majority of such fungi in induction of allergy was evaluated in 116 asthmatic patients (66 males and 50 females) with an age range 5 - 70 years, in addition to 45 apparently healthy individuals as a control group, by using skin prick test. The highest proportion of those patients (89.7%) showed skin reactivity to the allergen HDM , followed by MMI (75.0%), HD (63.8%), MM2 (48.3%), MM3 (19.8%) and MM5 (16.8%) . Also a positive correlation was observed between the occurrence of these fungi (inside and outside the houses of those patients) and their responsiveness . Measuring serum specific IgE using ELISA technique revealed that the most frequent specific IgE was for Penicillium , Aspergillus and Alternaria. 2 - To provide further insight about the role of bacterial infection that deteriorate asthma attack, sputum cultures were done for 68 patients with asthma . Six bacterial species were isolated, in which Strepto. pneumoniae showed the highest percentage (35.2%), followed by Staph. aureus (30.9%), H. influenza (7.3%), Strepto. pyogenes, staph. epidermidis and N. cattarnhalis (4.4%) for each. Also, nine isolates of Candida albicans were isolated from those patients, to which a skin test response was highly positive among them. Antibiotic sensitivity was done for the bacterial isolates. The majority of those isolates revealed high sensitivity to the antibiotics ciprofloxacin, augmentin and cefatoxime, while, they were resistant to ampicillin, cloxacillin, tetracycline, and erythromycin. 3 - To shed some light on the immune status of patients with asthma the total level of serum immunoglobulins (IgA, IgG, and IgM) and complement components (C3 and C4) were evaluated by using single Radial Immunodiffusion assay (SRID). Serum level of total IgE was also evaluated, but by ELISA technique. The results showed that the mean serum levels of IgG and IgA were significantly decreased in patients with asthma as compared to controls while C3 level showed a significant increase. However, the mean serum level of IgM and C4 showed no much deviation due to asthma. With ranged to the evaluation of total IgE level, the result revealed a significant elevation in the level of this immunoglobulin in sera of patients in comparison to healthy individually. Additionally a significant difference in the levels of total IgE was augmented between both sexes of patients. There was some differences in the degree of positive its of agglutination reaction for the factor C.R.P., such reaction was more positive in patients with asthma, especially those with bacterial infections with special regard to Strepto. pneumonia. Differential count of while blood cells illustrated that eosinophils were significantly higher in patients with asthma compared to the control group . On the other hand a significant correlation was noted between the elevation of eosinophil count and the elevated level of IgE antibody and skin reactivity of asthmatic patients. Volume activity of adenosine deaminase enzyme in serum of asthmatic patients revealed a significant increased activity in the patients especially the females compared to males.4 - Trace elements (Fe, Cu, and Zn) assessment was carried out by flame atomic absorption and the more sensitive flameless atomic absorption (Se and Mg) . A significant decrease in Fe, Cu, Se ad Mg, and a significant increase in Zn were clearly observed in asthmatic patients as compared with control group.

بيئة وحياتية سمكتي الكارب الكرسين Carassius carassius (L.1758) والخشني Liza abu (Heckel,1843) في ذراع الثرثار - دجلة ونهر دجلة == Ecology & Biology to Crucian Carp Carassius carassius L. and Khishni Liza abu (Heckel,1843) in Tharthar arm & Tigris River

Author name: علي عودة شاوردي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | عامر علي الشماع
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية اختيار اربع محطات اثنتين منها على ذراع الثرثار واثنتي على نهر دجلة لاجراء مقارنة عدد من العوامل البيئية مثل درجة الحرارة والاوكسجين الذائب وتركيز الاس الهيدروجيني والملوحة والشفافية واجراء مقارنة اخرى لكمية الهائمات النباتية والحيوانية واحياء القاع. فضلا عن دراسة حياتية نوعين من الاسماك هما سمكة الكارب الكرسين Carassius carassius L. والخشني Liza abu (Heckel,1843) والمتمثلة بدراسة العمر والنمو والتغذية والتكاثر في بيئتين مختلفتين هما ذراع الثرثار ونهر دجلة مع تشخيص لانواع الاسماك المتوافرة في نهر دجلة ضمن حدود مدينة بغداد.جمعت العينات ابتداء من شهر اذار 2004 وحتى كانون الثاني 2005 بالنسبة لدراسة العوامل البيئية وحياتية النوعين اعلاه وبواقع نموذج واحد لكل شهرين. تراوحت درجة حرارة المياه في منطقتي الدراسة بين 10م كادنى قيمة خلال شهر كانون الثاني و28م كاعلى قيمة لها خلال شهر تموز على الذراع واتخذت نمطا متشابها لها في الموقعين المدروسين وتراوحت قراءات قرص ساكي بين 28سم في خلال شهر ايلول في نهر دجلة و242سم خلال كانون الثاني على الذراع. كما تراوحت تراكيز الاوكسجين الذائب في الماء بين 6 ملغم/لتر خلال شهر تشرين الثاني على الذراع و10.8ملغم/لتر كحد اعلى في المحطة نفسها خلال ايار على الذراع ايضا. كما سجلت اعلى قيم الملوحة في الذراع) خلال اذار 2004 اذ بلغت قيمتها 1.422 غم /لتر. بينما سجلت ادنى مستوى لها على نهر دجلة خلال شهر تشرين الثاني اذ بلغت 0.480غم /لتر. وتراوحت قيم الاس الهيدروجيني pH بين 6.6 في المحطة (4) على نهر دجلة خلال شهر كانون الثاني، و8.4 خلال شهر تشرين الثاني على ذراع الثرثار .واوضحت الدراسة ان التواجد السنوي للهائمات النباتية في ذراع الثرثار اقل منه في نهر دجلة، وسجلت الدايتومات Bacillariophyceae تواجدا عاليا مقارنة بصنوف الهائمات النباتية الاخرى مسجلة النسب 92.56%، 92.01%، 96.35% ، 95.45% في محطات الدراسة الاربع على التوالي. جاءت بعدها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. وسجلت الهائمات الحيوانية اعلى نسب تواجد لها في نهر دجلة مقارنة بالذراع وجاءت الدولابيات في المرتبة الاولى 91.65%، 86.65% في الذراع 91.87%، 89.42% في نهر دجلة تلتها مجدافية الاقدام. وسجلت احياء القاع اعلى تواجد لها في الذراع 336 فرد/م2 ، 286 فرد/م2 بينما سجلت 126 فرد/م2 ، و178 فرد/م2 في محطتي نهر دجلة على التوالي. تراوحت الاطوال الكلية لسمكة الكارب الكرسين على الذراع بين 7.0 - 27.5 سم واوزانها بين 5 - 300غم وفي نهر دجلة بين 7.5 - 23.25سم و65 - 210.5غم للاطوال والاوزان على التوالي. كما بينت الدراسة ان نمو سمكة الكارب الكرسين ليس قياسيا. وان نموها في الذراع ونهر دجلة كان لصالح الوزن ، اذ بلغت قيمة (b) في اسماك الذراع (3.62) و(3.40) لاسماك الذراع ونهر دجلة. اما سمكة الخشني فتراوحت اطوالها بين 8.0 - 17.9سم واوزانها بين 7.0 - 95.0غم في الذراع وبين 9.0 - 15.5 سم و8.5 - 55.5غم في نهر دجلة للطول والوزن الكلي على التوالي. وبينت الدراسة زيادة في نمو الاسماك باتجاه الزيادة في مكعب الطول على حساب الوزن. وان معدل نموها النسبي في ذراع الثرثار افضل حالا منه في نهر دجلة اذ كانت قيمة (b) لاسماك الخشني المصيدة في الذراع (2.90) وفي نهر دجلة (2.80). تراوحت شدة التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 10.83 و23.33 درجة/سمكة. ولسمكة الخشني بين 9.75 و25.71 درجة /سمكة. بينما تراوح نشاط التغذي لسمكة الكارب الكرسين في موقعي الدراسة بين 33.33% و100% ولسمكة الخشني 81.81% و100%، وان سمكة الكارب الكرسين قارتةOmnivorous وتميل بشكل كبير الى الغذاء النباتي الاصل وقد شكل الفتات العضوي الجزء الاكبر من غذائها في كلا الموقعين المدروسين تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة، ولم تختلف مفردات غذائها المتناول في كلا المسطحين المدروسين. كما بينت الدراسة ان سمكة الخشني هي قارتة ايضا Omnivorous تعتمد في غذائها على المصادر ذات الاصل النباتي وان الفتات العضوي هو المكون الرئيس في غذائها الذي حل بالمرتبة الاولى تلتها الطحالب الخضر والخضر المزرقة. ولم يحصل اختلاف في نوع غذاء هذه السمكة في موقعي الدراسة. وتبين الدراسة ان كلتا السمكتين المدروستين تتناولان غذاءهما من القاع او قريبا منه. اوضحت الدراسة ان نسبة الجنس لسمكة الكارب الكرسين في ذراع الثرثار2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 1.8 : 1 وان لهذا النوع قمة اطلاق واحدة تمتد من منتصف ايار ولغاية تموز وان التبويض فيها حصصي. وان خصوبة هذا النوع عالية وان البيئتين ملائمتان لتكاثر هذا النوع اما عن تكاثر سمكة الخشني فقد بلغت نسبة الجنس في الذراع 2.1 : 1 ذكر : انثى وفي نهر دجلة 2.11 : 1 وان لهذا النوع دورة تكاثرية متتابعة تستمر عاما كاملا ولها قمة اطلاق واحدة تمتد من شهر شباط ولغاية شهر اذار وان التبويض فيها حصصي وقد تصل الى ثلاث دفعات . وتمتاز بخصوبة عالية.

بعض الجوانب المرضية للمصابين بالحمى غير معروفة الاسباب == CERTAIN PATHOLOGICAL ASPECTS ON FEVER OF UNKNOWN ORIGIN PATIENTS

Author name: علي جبار عليوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على ثلاث مجاميع مختلفة، كانت المجموعة الاولى بعدد 59 مريض بالحمى غير محددة الاسباب (FUO) والمجموعة الثانية بعدد 20 مريض بحمى مشخصة (febrile) والتي اعتبرت لمعاملات سيطرة للمجموعة الاولى، اما المجموعة الثالثة بعدد 20 شخص، كانوا اصحاء ظاهريا وتمثل مجموعة السيطرة للدراسة.تمت المتابعة واخذ العينات من المرضى والعمل عليها في مستشفى الكاظمية التعليمي، بغداد.لقد عانى مرضى FUO من اعراض مالوفة مثل الحمى المستمرة والمتقطعة، الصداع، الم الصدر، الم المفاصل، نقصان الوزن وضعف عام وفقدان الشهية وغيرها، وعلامات مرضية منها الم في الضغط على البطن، وتضخم الطحال، واليرقان، وتورم الساق وتقرحات اللسان والجلد. ان مجموعة مرضى FUO اشتركوا كون جميعهم يعانون من الحمى التي تراوحت مدتها من شهر الى ستة اشهر.تم التعرف على الاعراض السريرية من قبل الاختصاصي الموجود واجريت فحوصات المختبرية لجميع المرضى الراقدين والمشمولين بالدراسة اضافة الى فحوصات من مراكز بحثية اخرى ذات صلة بالموضوع.ان البيانات المتحصل عليها اخضعت للتحليل الاحصائي المناسب وبمختلف الطرق.اظهرت الدراسة بان مرضى FUO بسبب الاصابات المرضية المعدية يشكلون (n = 43)% 72.8) من العدد الكلي لهم (59) ثم قسموا بعد التشخيص النهائي بحسب المرض المعدي الى مرضى الحمى المعوية Enteric fever بواقع (n= 14)% 23.7 ومرضى ذات الرئة والتهاب القصبات بنسبة (n= 11) 18.6%، اما نسبة (n=6) 10.1% من المرضى فقد كانت متساوية لكل من مرضى التدرن الرئوي Tuberculosis(TB)، والتهاب المجاري البولية Urinary tract infection(UTI) ومجموعة اصابات مرضية اخرى Other infections. ومن خلال الدراسة ايضا ظهرت نسبة من المرضى (n=16) 27.12 بسبب امراض اخرى وبنسب مختلفة كما في امراض النسيج الوعائي Collagen vascular diseases (n= 4) 6.7%، ومرض التهاب بطانة القلب Endocarditis (n= 3) 5%، ومرضى الامراض الخبيثة Malignancies (n= 2) 3.3% واخيرا نسبة (n= 7) 11.8% من مرضى FUO هم المرضى غير المشخصين. ان مناقشة اربع من الثوابت الرئيسة المدروسة لها اهمية في التفريق بين مختلف حالات FUO وهذه الثوابت هي : 1 - الثوابت الدمية Haematological parameters.2 - الثوابت الكيموحيوية Biochemical parameters.3 - الثوابت المناعية Immunological parameters.4 - الثوابت الجرثومية Microbiological parameters.1 - اهمية الثوابت الدمية : كانت اعلى قيمة لنتائج فحص معدل ترسيب كريات الدم الحمراء Erythrocyte sedimentation rote (EsR) عند مرضى المناعة الذاتية، وذات معنوية قليلة لهذا الثابت عند مختلف حالات FUO الاخرى.2 - اهمية الثوابت الكيموحيوية : لقد اظهرت البيانات بان مصل مرضى FUO له اهمية كبيرة في تقسيمهم من خلال تقدير اليوريا، والكرياتينين، وانزيم الفوسفاتيز القاعدي، والبيليروبين الكلى، والالبومين، وتسبق الالبومين الى الكلوبيولين، في مصل هؤلاء المرضى.كما ان الترحيل الكهربائي لمصل مرضى FUO اظهر ارتفاعا في قيم α - 2 globulin, α - 1 globulin، مابين مصل مرضى FUO كما في مصل مجموعة الامراض الخبيثة، في حين هنالك ارتفاعا في قيمة β - globulin في مصل مرضى التهاب المجاري البولية، وارتفاعا في قيمة gammaglobulin بدليل زيادة اضداد IgM، وIgG في مصل مرضى المناعة الذاتية مقارنة مع مرضى FUO الاخرين.3 - اهمية الثوابت المناعية : اظهر فحص مصول مرضى FUO اعلى القيم لمختلف الاضداد ومنها Antistreptolysin O titer، وAntiproteinase antibodies، وAntimyeloperoxidase antibodies، وC - reactive protein، وRheumatiod factor وحسب المرض المشخص.ان مصل مرضى حمى التايفوئيد اظهر ارتفاعا في تركيز IL - 1α (72.2 pgm/ml) مقارنة مع مرضى FUO للاخرين، وكذلك ظهرت وزيادة في قيم كل من (CD25) IL - 2 receptor، وIL - 2 (153.2 pgm/ml، 8.6 pgm/ml على التوالي). في حين وجد اقل تركيزيين لـ(IL - 1α، IL - 2) في مصل مرضى الامراض الخبيثة.4 - اهمية الثوابت الجرثومية : اظهر الفحص الجرثومي تشخيص عزلات بكتريا بنسبة 40% Gram positive diplococci، وبنسبة 20% لكل من Gram negative bacilli، وGram positive cocci. ان نتائج زرع الدم لمرضى FUO اظهرت عزلات بكتريا بنسبة 33.3% لكل من Salmonella spp.، وStaphylococcus aureus، وEnterobacter spp. والمسؤولة عن امراض Salmonellosis، وEndocarditis وامراض بكتيرية اخرى.كما تم عزل كل من بكتريا Enterobacter spp.، وPseudomonas aeruginosa، وpneumoiae Streptococcus من عينات السائل الخلبي Pleural fliud وعلى ما يبدو فانهم العاملين المسببين لمرض ذات الرئة Pneumonitis ومرض التهاب الخلب Pleuritis بنسبة 33.3% من الزرع الكلى الموجب لعينات السائل الخلبي للمرض.اما بشان نتائج زرع الادرار الموجب فقد تم عزل وتشخيص كل من بكتريا Staphylococcus aureus، وE. coli، وKlebsiella spp. والتي تمثل نسبة 33.3% من الزرع الكلى لادرار المرضى والمسببة لمرض التهاب المجاري البولية (UTI).وعند زرع المسحات المختلفة (مسحات الجروح والقرح) تم تشخيص عزلات كل من بكتريا E. coli، وPseudomonas aeruginosa وهما العاملين المسببين الرئيسيين لمرض التهاب النسيج الخلوي Cellulitis.اظهرت نتائج اختبار حساسية العزلات للمضادات الحيوية بان المضاد الحيوي Amikacin يمتلك اعلى فعالية وبنسبة 88.9% ويليه المضاد الحيوي Ciprofloxacin بنسبة 58.3% تجاه العزلات المدروسة، في حين المضادين الحيويين Gentamycin، وCefotaxim كانا اقل فعالية تجاه العزلات وبنسبة 20% و12.5% على التوالي. | The importance of microbiological parameters : Bacterial isolates of sputum sample phowed that there was a 40% graw positive diplococci, gram positive cocci and gram negative bacilli showed a percentage of 20% of each.Blood culture for FUO patients demonstrated a 33.3% for each isolate of sacmorella spp., staphylococcus aurens, and Enterobacter spp., which they may be responsible for salmonellosis, endocaraditis and other bacterial infection diseases.Entarobater spp., Psendomonas aeruginosa as well as streptococcus pneumocial were isalated from a pleural fluid sample and it seems to be camsative agent for pneumonitis and pheuritis, this cause repersnet 33.3% out of the total preural fluid culture results.Urine culture results showed a positive culture result of Staphylococcus aureus, E. coli and Klebsiclla spp., and is considered as a causative agent for Urinary tract infection. This positive result represent about 33.3% of the total urine culture result wound and ulcer swabs showed a detection of E. coli and psendamamas areaginosa isolate which are the main causative agent for cellulites. Arihibiotic sensitive result showed that amikacim has the highest antibiotic activity 88.9% followed by ciprofloxacin 58.3%, while Gentamycin and cefotaxime revealed a 20% and 12.5% respectively

تاثير ملوثات معامل الطابوق على بعض العوامل الفسلجية لسكان منطقة النهروان/ بغداد/ العراق == Effect Of Bricks Factories Pollutants On Some Physiological Parameters In Population Of Al - Nahrawan district / Baghdad / IRAQ

Author name: عقيل محمود علي اللامي
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | اكرم حجازي
General topic: Biology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: التلوث اصبح اليوم مشكلة عالمية تهدد الحياة، حيث ان التلوث بلغ مستويات عالية في الهواء والماء وفي التربة، كذلك التلوث في النباتات وهذا اصبح واضح التاثير على الانسان وخطرا يهدد صحته.ان الدراسات الدقيقة التي تتناول خطر التلوث اليوم وتاثيره محدود وخصوصا في العراق حيث في مثل هذه الايام يواجه البحث العلمي في العراق صعوبات كبيرة ولاسباب تكاد تكون معروفة لدى الجميع ، وبالرغم من وجود نقاط وموانع قطعت الطريق واخرت مسيرة البحث التلوث البيئي تعتبر مدينة النهروان من المدن التابعة الى العاصمة بغداد م يسكنها قرابة المائة وخمسون الف شخص بالاضافة الى مجمعات جديدة للعوائل النازحة بسبب الحروب الى المناطق التي تكثر فيها معامل الطابوق القديمة والتي تكون غالبا مضرة للبيئة ومخالفة للتعليمات لذلك فان هذه الدراسة شملت (225) شخص فيس مدينة النهروان - (75 ) من داخل المعمل ،(75)، ويعملون في اروقة المعمل كالمخزن والنقل، (75) اخرين هم اشخاص يعيشون في داخل المدينة. وكذلك شملت الدراسة (75) شخص من منطقة شارع فلسطين باعتبارها بعيدة عن المصانع. اخذت عينات من التربة والماء وتم فحصها بعد تنقيتها ومعاملتها بمحاليل عدة لتحديد تراكيز المعادن الثقيلة فيها وباستخدام اجهزة حديثة خارج العراق لهذا الغرض ( لبنان)، كذلك سحبت عينات من الدم لاجراء فحوصات الكيموحياتية (Biochemical tests) كاليوريا والكرياتين ونسبة السكري والكوليسترول وقد اظهرت نتائج فحص العينة المدروسة ارتفاعات واضحة في نسبة الكرياتين والكولسترول واليوريا لدى العاملين في معامل الطابوق ووجود اختلافات جوهرية عند مقارنتها مع العينة القياسية - الماخوذة عشوائيا من منطقة شارع فلسطين في بغداد - واما الفحوصات الدموية الطبية (Hematological tests) وعدد كريات الدم الحمر والبيض والصفيحات الدموية اظهرت ارتفاعا معنويا في نسبة كريات الدم البيض وانخفاضها في كريات الدم الحمراء.فضلا عن بعض التحاليل الخاصة بالوراثة الخلوية اجريت في الجمهورية الاسلامية في ايران . وتم فحص نسبة المعادن الثقيلة في الجمهورية اللبنانية اضافة الى جمهورية العراق . اشارت النتائج البيئية في هذه الدراسة الى ارتفاع نسبة المعادن الثقيلة في تربة النهروان ودم الاشخاص الساكنين والعاملين فيها، اضطرابات واضحة في جهاز الدوران وعمل الكليتين، وبالتالي يمكن ان تستخلص الدراسة بان مدينة النهروان من المدن الملوثة جدا وان الاشخاص الموجودين هناك للعمل او السكن في خطر . اخيرا توصي هذه الدراسة بضرورة الاهتمام بصحة العاملين في مثل تلك المصانع او المعامل وزيادة الوعي الصحي للناس وكذلك ان تكون تلك المعامل القديمة خاضعة للقوانين وايجاد مصانع صديقة للبيئة . | Pollution has become a global problem and the results are implied in high levels of contaminations reported for soil, water, air, plants and animals. Limited studies are available concerning of the effect of heavy metals exposure human health. Nowadays the scientific research in Iraq is very difficult and dangerous because many Known reasons. Al - Nahrawan one of the most known industrial regions in Iraq , In the present study (225) adult health man in Al - Nahrawan region (inside, outside, in the region),and (75) adult health man in one of Baghdad cities - palatine street. The laboratory work of the present study was performed in many countries like Iran , Lebanon , and in addition to Iraq (my country) . Samples of soil, water & blood were taken for study. Environmentally these samples contaminated by different heavy metals like Pb, Cr, Cu, Fe ,Zn that characterized with low pH when compared with normal non industrial regions. Hematologically Blood samples taken for examination of hematology& biochemistry tests, also some cytogenetic tests like mitotic index as genetically studies also to detect the reproductive health in all samples It was found that ,in Al - Nahrawan region increasing of creatinine, urea, glucose, as compared with control. WBC value increased while RBC, platelets , MCV Decreased in Al - Nahrawan region.The present results indicate that Al - Nahrawan region affected widely by heavy metals contamination in soil, water& air because of activates of industry. The present results indicate that many persons who live in Al - Nahrawan region affected by heavy metals contamination as a result of activities of industry. Recommend to increase the health care, information in workers and also make sure that these factories subjected to governmental lows

دراسة وراثية مناعية للمصابات بداء انتباذ بطانة الرحم == Immunogenetic Study in Endometriosis Patients

Author name: ضياء جواد كاظم القاضي
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | علي حسين ادحية
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى تقييم الخلفية المناعية والوراثية - المناعبة لمرض انتباذ بطانة الرحم في عينة من المريضات العراقيات. تمثلت معايير التقييم بمايلي : مجاميع الدم ABO ومستضدات خلايا الدم البيض البشرية من الصنف الاول (A وB وC) والثاني (DR وDQ) وواسمات الخلايا اللمفية المحيطية (CD3 وCD4 وCD8 وCD56) والمستوى المصلي للحركيات الخلوية (IL - 4 وIL - 6 وIL - 10 وIFN - γ) والمستوى المصلي الكلي للغلوبيولينات المناعية (IgA وIgG وIgM) وبروتينات المتمم (C3 وC4) والبلعمة والمستوى المصلي لهرمون الحليب (Prolactin) والهرمونين الجنسيين FSH وLH.شملت الدراسة 54 امراة من المصابات بمرض انتباذ بطانة الرحم واللاتي كن مراجعات لمستشفى العلوية للنسائية والتوليد (بغداد) خلال الفترة اذار 2005 - كانون الثاني 2006. وكان معدل العمر لهن ± الخطا القياسي عند التشخيص 27.3 ± 5.4 سنة. شملت الدراسة ايضا عدد مماثل من النساء غير المريضات (عينة سيطرة) والمطابقات للمريضات من ناحية العمر (25.1 ± 6.7 سنة) والعرق (عراقيات عربيات).توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت مجموعة الدم A تكرارا مرتفع معنويا (Pc = 0.016) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (48.1 مقابل 22.2%)، في حين اظهرت مجموعة الدم O تكرارا منخفض معنويا (Pc = 4 x 10 - 4) في المريضات (5.6 مقابل 35.2%).2. اظهرت ثمانية من مستضدات خلايا الدم البيض البشرية تكرارا مرتفع معنويا في المريضات، وهي A28 (59.3 مقابل 14.8%) وB7 (66.7 مقابل 9.3%) وB12 (68.5 مقابل 16.7%) وB27 (46.3 مقابل 7.4%) وCw6 (44.4 مقابل 1.9%) وCw7 (68.5 مقابل 20.4%) وDR1 (59.3 مقابل 24.0%) وDR11 (27.8 مقابل 5.6%)، في حين اظهر مستضدان اخران تكرارا منخفض معنويا في المريضات وهما A19 (14.8 مقابل 44.5%) وB5 (5.6 مقابل 44.5%). وعند تقدير النمط الفرداني (HLA - halpotype) اتضح بان Cw7 هو اكثر المستضدات تكرارا في الانماط الفردانية المقدرة (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. اظهرت الخلايا اللمفية الموجبة للواسم CD3 (30.6 مقابل 60.5%) والواسم CD4 (13.4 مقابل 30.9%) تكرارا منخفض معنويا في المريضات، في حين لم تظهر الخلايا الموجبة للواسم CD8 فرقا معنويا ولكن كانت النسبة CD4/CD8 هي الاخرى منخفضة معنويا في المريضات (0.65 مقابل 1.6). اما الخلايا الموجبة للواسم CD56 فقد كان تكرارها في المريضات مرتفع معنويا عند المقارنة مع السيطرة (18.1 مقابل 10.6%).4. ارتفع المستوى المصلي معنويا (P ≤ 0.001) للحركي الخلوي IFN - γ في مريضات انتباذ بطانة الرحم عند المقارنة مع السيطرة (47.69 مقابل 21.26 بيكوغرام/مل)، وقد لوحظ ذلك ايضا للحركيات الخلوية IL - 4 (13.49 مقابل 10.47 بيكوغرام/مل) وIL - 6 (37.05 مقابل 22.11 بيكوغرام/مل) وIL - 10 (36.66 مقابل 20.74 بيكوغرام/مل) ولكن بمستوى اقل من المعنوية (0.05 و0.01 و0.01، على التوالي). ولمزيد من الفهم لدور الحركيات الخلوية في مرض انتباذ بطانة الرحم، فقد حسبت النسبة مابين IFN - γ وكل من IL - 4 وIL - 6و IL - 10 وكذلك مابين IL - 6 وكل من IL - 4 وIL - 10. اظهرت النسب الخمسة المحسوبة ارتفاعا في المرضى، ماعدا النسبة IL - 6/IL - 10 فقد كانت متقاربة في المريضات ونساء السيطرة,5. اظهرت الغلوبيولينات المناعي الثلاث (IgA : 172.7 مقابل 124.6 ملغم/د.لتر؛ IgG : 1437.9 مقابل 1126.3 ملغم/د.لتر؛ IgM : 159.3 مقابل 113.4 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي مرتفع معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.6. اظهر بروتيني المتمم (C3 : 72.3 مقابل 152.1 ملغم/د.لتر؛ C4 : 16.7 مقابل 32.3 ملغم/د.لتر) مستوى مصلي منخفض معنويا (P ≤ 0.01) في المريضات على ماهو عليه في السيطرة.7. اظهر معامل البلعمة انخفاضا معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات عند المقارنة مع السيطرة (17.37 مقابل 49.68%)، وكذلك الحال بالنسبة لمعامل NBT فقد انخفض هو الاخر معنويا (P ≤ 0.001) في المريضات (21.18 مقابل 65.80%).8. لم يظهر المستوى المصلي لهرمون الحليب او هرمون LH فرقا معنويا مابين المريضات والسيطرة، وعلى العكس من ذلك فقد ارتفع معنويا (P ≤ 0.05) المستوى المصلي لهرمون FSH في المريضات مقارنة بنساء السيطرة (11.85 مقابل 6.06 ملي وحدة دولية/مل). | The present study aimed to evaluate immunological and immunogenetic backgrounds of endometriosis in a sample of Iraqi patients. The parameters of evaluation were ABO blood groups, HLA - class I (A, B and C) and - class II polymorphisms, peripheral lymphocyte markers (CD3, CD4, CD8 and CD56), serum level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IFN - γ), total serum level of immunoglobulins (IgA, IgG and IgM) and complement components C3 and C4, phagocytosis and serum level of prolactin and sex hormones (FSH and LH).Fifty four female patients with endometriosis were investigated. The patients were referred to the Al - Alwayia Hospital for Gynecology and Obstetrics (Baghdad) during the period March 2005 - January 2006. Their age's main ± standard error at the time of diagnosis was 27.3 ± 5.4 year. A similar number of healthy females (control sample) was included in the study, and they matched patients for age (25.1 ± 6.7 year) and ethnicity (Iraqi Arabs).The Study reached the following results : 1. Blood group A showed a significant (Pc = 0.016) increased frequency in patients as compared to controls (48.1vs. 22.2%), while blood group O showed a significant (Pc = 4 x 10 - 4) decreased frequency (5.6 vs. 35.2%). 2. Eight HLA antigens showed a significant increased frequency in patients. They were A28 (59.3 vs. 14.8%), B7 (66.7 vs. 9.3%), B12 (68.5 vs. 16.7%), B27 (46.3 vs. 7.4%), Cw6 (44.4 vs. 1.9), Cw7 (68.5 vs. 20.4), DR1 (59.3 vs. 24.0%) and DR11 (27.8 vs. 5.6%). Two further antigens showed a significant decreased frequency in the patients, and they were A19 (14.8 vs. 44.5%) and B5 (5.6 vs. 44.5%). HLA - halpotype estimation revealed that Cw7 occurred most frequently in most of the estimated haplotypes (A28 - Cw7, B7 - Cw7, B12 - Cw7, B27 - Cw7 and Cw7 - DR1).3. Peripheral lymphocytes positive for CD3 (30.6 vs. 60.5%) and CD4 (13.4 vs. 30.9%) showed a significant decreased frequency in patients, while CD8+ lymphocytes showed no significant difference. The CD4/CD8 ratio also showed a significant decrease (0.65 vs. 1.6). The only cells that showed a significant increased frequency were CD56+ cells (18.1 vs. 10.6%). 4. Interferon - γ showed a significant (P ≤ 0.001) increased serum level in endometriosis patients as compared to controls (47.69 vs. 21.26 pg/ml). The same increase was observed for IL - 4 (13.49 vs. 10.47 pg/ml), IL - 6 (37.05 vs. 22.11 pg/ml) and IL - 10 (36.66 vs. 20.74 pg/ml), but with a lower level of significance (P ≤ 0.05, 0.01 and 0.01, respectively). For a further understanding of cytokines in endometriosis, the ratio of IFN - γ to IL - 4, IL - 6 and IL - 10, as well as, the ratio of IL - 6 to IL - 4 and IL - 10 were assessed. The five assessed ratios were increased in the patients as compared to controls, with the exception of IL - 6/IL - 10 ratio, which came approximated in patients and controls. 5. The three immunoglobulins (IgA : 172.7 vs. 124.6 mg/dL; IgG : 1437.9 vs. 1126.3 mg/dL; IgM : 159.3 vs. 113.4 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) increased serum levels in patients as compared with controls. 6. Both complement components (C3 : 72.3 vs. 152.1 mg/dL; C4 : 16.7 vs. 32.3 mg/dL) showed a significant (P ≤ 0.01) decreased serum levels in patients as compared with controls. 7. The phagocytic index was significantly (P ≤ 0.001) decreased in the patients as compared with controls (17.37 vs. 49.68 %). Similarly, the NBT index was also significantly (P ≤ 0.001) decreased (21.18 vs. 65.8 %) in the patients. 8. Serum level of prolactin and luteinizing hormone (LH) hormones showed no significant difference between patients and controls. In contrast, the follicle stimulating hormone (FSH) showed a significant (P ≤ 0.05) increased serum level in endometriosis patients as compared with controls (11.85 vs. 6.06 mIU/ml).

تاثير التطفير الفيزيائي على قابلية بكتريا Staphylococcus aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز واستنساله في بكتريا Escherichia coli == Effect of physical mutagenesis on the ability of Staphylococcus aureus in staphylokinase production and its cloning in Escherichia coli

Author name: علاء سالم حمزة
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول | حميد مجيد جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى استنسال جين الستافلوكاينيز من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة محليا في بكتريا Escherichia coli والتحري عن التعبير الجيني في المضيف الجديد فضلا عن دراسة بعض الظروف المثلى المؤثرة في ذلك التعبير . جمعت 200 عينة سريرية من اصابات المجاري البولية والاصابات الجلدية من بعض المستشفيات في محافظة بغداد . وقد تم الحصول من تلك العينات على 54 عزلة بكتيرية وشخصت على انها S.aureus وفقا لخصائصها المظهرية ونتائج الاختبارات الكيموحيوية . وقد تم تاكيد تشخيص تلك العزلات باستخدام نظام Viteck - 2 التشخيصي . تم دراسة قابلية عزلات بكتريا S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز وفعاليته التحليلية على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . وقد اشارت النتائج الى ان جميع العزلات البكتيرية كانت منتجة وبدرجات متفاوتة لانزيم الستافلوكاينيز . وقد تميزت العزلة البكتيرية S.aureus A15 المعزولة من اصابات الجلد بكفائتها العالية في انتاج الانزيم لكون رائق مزرعتها ادى الى تكوين اعلى قطر هالة تحلل مقداره 36 ملم على وسط بلازما الدم المتصلب بمادة الاكار . ولاجل تحسين قابلية العزلةA15 S.aureus في انتاج انزيم الستافلوكاينيز ، فقد تم تعريض هذه العزلة للتطفير العشوائي باستخدام الاشعة فوق البنفسجية لحث الطفرات الوراثية التي تحور ايجابيا انتاجيتها من انزيم الستافلوكاينيز . وقد اشارت النتائج الى انه قد تم الحصول على طافرتين بكتيريتين لهذه العزلة ازدادت قابليتهما على انتاج الانزيم على ضوء زيادة قطر منطقة التحلل الى 38 ملم مقارنة بالنوع البري . اجري استنسال جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli JM 109(DE3) وذلك باستخلاص الدنا الجيني اولا من الطافرة S.aureus A15 - M1 بطريقة الغليان ثم الحصول على الدنا بتركيز 50 مايكروغرام / مل وبنقاوة وصلت الى 1,8 . تم بعدها تضخيم جين الستافلوكاينيز باستخدام بادئات نيوكليوتيدية متخصصة لتضخيم اطار القراءة المفتوح (Open reading frame) للجين التركيبي . وقد اشارت نتائج التضخيم الى انه قد تم الحصول على قطعة دنا بحجم 400 زوج قاعدي . تم تحديد التعاقب النيوكليوتيدي لجين الستافلوكاينيز وقد اشارت النتائج الى وجود ثلاث طفرات نقطية (Point mutations) في الجين التركيبي للستافلوكاينز على اساس مقارنة الترتيب النيوكليوتيدي للجين مع الترتيب النيوكليوتيدي لنفس الجين للسلالة القياسية S.aureus المسجلة في قاعدة البيانات BLAST/ NCBI . وقد كانت هذه الطفرات من نوع missens mutations التي لم تؤثر على المجموعة التي ينتمي اليها الحامض الاميني المتغير ولم تؤثر على فعالية الانزيم . وقد اشارت النتائج ايضا الى عدم احتواء التعاقب النيوكليوتيدي للجين على اي موضع حساس لانزيمي التقييد BamHI وXbaI والتي استخدمت فيما بعد لكلونة الجين بالهضم المزدوج بهذين الانزيمين للحصول على قطعة تقييد ذات نهايات لاصقة من نوع BamHI وXbaIالناشئة عن مواضع التقييد الحساسة لهذين الانزمين ضمن التعاقب النيوكليوتيدي للبادئات النبوكليوتيدية المتخصصة المصممة لهذا الغرض (البادىء النيوكليوتيدي الامامي المتضمن موقع تقييد لانزيم BamHI والبادىء النيوكليوتيدي الخلفي المتضمن موضع تقييد لانزيم XbaI) ، ثم لحم قطعة تقييد جين الستافلوكاينيز مع ناقل الكلونة pSP72 المهضوم مسبقا هضما مزدوجا بانزيمي التقييد BamHI وXbaI للحصول على جزيئة ناقل ذات نهايات لاصقة متوافقة مع النهايات اللاصقة لجين الستافلوكاينيز . وبعد اللحم تم اجراء عملية الترحيل الكهربائي للناقل الهجين (جزيئة الناقل الحاوية على جين الستافلوكاينيز) على هلام الاكاروز (1%) . وقد اشارت نتائج الترحيل الكهربائي الى ظهور حزمة دنا تمثل الناقل الهجين بحجم كلي مقداره 2900 زوج قاعدي . وفي الخطوة اللاحقة من تجربة الاستنسال فقد استخدم الناقل الهجين لتحول بكتريا E.coli JM109(DE3) المؤهلة كمضيف جديد امن للجينات الغريبة القادمة من مختلف الكائنات الحية . وقد تم انتقاء المتحولات المرغوبة لبكتريا E.coli الحاوية على الناقل الهجين على وسط البلازما المتصلب بمادة الاكار الحاوي على المضاد الحيوي الامبسيلين بتركيز 50 مايكروغرام/ مل كصفة انتقائية للوسط . وقد اشارت نتائج التحول الى الحصول على خمسة متحولات بكتيرية من بكتريا E.coli JM109(DE3) القادرة على النمو بوجود الامبسيلين والمنتجة لانزيم الستافلوكاينيز المحلل لمادة البلازما في الوسط . وقد كانت درجة التعبير الجيني لجين الستافلوكاينيز في المضيف الجديد مقاربة لدرجة تعبير نفس الجين في المضيف الاصلي S.aureus . درست بعض الظروف المثلى لتعبير جين الستافلوكاينيز في بكتريا E.coli المهندسة وراثيا . وقد اشارت النتائج الى ان درجة التعبير الجيني في المضيف الجديد قد ازدادت بتنمية البكتريا في وسط لوريا - بيرتاني المتصلب بمادة الاكار الحاوي على مادة IPTG (كمحفز للتعبير الجيني) بتركيز 100 مايكروغرام / مل . كما درس تاثير درجة الحرارة على فعالية الانزيم واظهرت النتائج ان افضل درجة حرارة لفعالية الانزيم كانت °C 37 لمدة 24 ساعة . | This study was aimed for cloning staphylokinase gene from locally isolated Staphylococcus aureus in Escherichia coli and detection the gene expression in new host in addition to determine some of the optimum conditions for gene expression. A total of 200 clinical samples from urinary tract and skin infections were collected from some hospitals in Baghdad . from these samples,54 bacterial isolate were obtained and identified as S.aureus according to their cultural and morphological characteristics and results of biochemical tests . Identification of these isolates was confirmed by using VITECK - 2 identification system. Ability of S.aureus isolates in staphylokinase production and thrombolytic activity of this enzyme was screened on human plasma agar medium, and it was found that all bacterial isolates were able to produce staphylokinase with variable degrees. Among these isolates S.aureus A15 isolated from skin infection was the most efficient isolate in staphylokinase production because its culture filtrate causing highest zone of hydrolysis (36 mm) on plasma agar medium in comparison with other isolates. In order to enhance the ability of S.aureus A15 in staphylokinase production, this isolate was subjected to random mutagenesis by using UV - irradiation to induce genetic mutations altered positively staphylokinase production by this isolate. Results showed that two mutants of S.aureus A15 obtained after UV - irradiation were increased in its ability in staphylokinase production according to the increase of the diameters of hydrolysis zones to 37 mm and 38 mm in camparison with the wild - type. Cloning of staphylokinase (sak) gene in E.coli JM109 (DE3) was achieved first by extraction of S.aureus A15 - M1 genomic DNA by using boiling method with DNA purity and concentration of 1.8 and 50 μg / ml respectively . Then Sak gene was amplified by using specific primers for gene open reading frame (Structural gene) . Results showed that the amplification product was a fragment of DNA with size of about 400 bp. Amplified sak gene was then sequenced to determine the nucleotide sequence of the gene . Results of sequencing showed that there are three point mutation were occurred in the structural gene of staphylokinase according to base pair alignment with the same gene of S.aureus standard strain recorded in BLAST / NCBI. These mutations are missens mutations doesn’t affect the group of amino acid that was changed then doesn’t affect enzyme activity. Results of sequencing also showed that the complete nucleotide sequence of the gene doesn’t have a restriction site for BamHI and XbaI that were used later for gene cloning by double digestion of the gene with these two enzymes to obtain restriction fragment with sticky ends of BamHI and XbaI that were came from the restriction sites for these two enzymes within the specific primers designed for this purpose (forward primer containing restriction site for BamHI and reverse primer containing restriction site for XbaI). Then the restriction fragment of staphylokinase gene was ligated with pSP72 cloning vector previously double digested with BamHI and XbaI to get vector molecule with sticky ends compatible with the two sticky ends of Sak gene, then recombinant vector was analyzed on agarose gel (1%) . Results of electrophoresis showed that there was a single DNA band represents the recombinant vector with a total size of 2900bp. In the next step of cloning experiment , recombinant pSP72 was used to transform competent E.coli JM 109 (DE3) as a new and safe host for foreign genes came from different organisms . Then positive transformants of E.coli (containing recombinant pSP72) was selected on plasma agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin as a selectable marker. Results of transformation showed that there are five transformants of E.coli JM 109 (DE3) were able to grow in presence of ampicillin and producing staphylokinase enzyme that was able to hydrolyse human plasma in the agar medium . The degree of staphylokinase gene expression in the new host (E.coli) was asymbtotic to the degree of expression of the same gene in the original host (S.aureus) . Optimum conditions for staphylokinase gene expression in genetically engineered E.coli was studied under two growth factors . Results of optimization showed that the degree of gene expression in new host was increased when transformant E.coli JM 109 (DE3) was grown in Luria - Bertani agar containing IPTG (as inducer for gene expression) in a concentration of 100 μg / ml and incubated at 37 ⁰C for 24 hours . Effect of incubation temperature on staphylokinase activity produced by genetically engineered E.coli JM 109 (DE3) transformant was studied in range of temperature. Results showed that the optimum temperature for staphylokinase activity was 37 °C , at this temperature the diameter of zone of hydrolysis was 30mm , while the enzyme activity was decreased above and under this temperature .

دراسة عن كبسولة بكتريا Acinetobacter baumannii وتاثيرها على الاستجابة المناعية == Study on capsule of Acinetobacter baumannii and its effect on Immune Response

Author name: سيناء مهدي شاكر الخفاجي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • عزلت 34 عزلة بكتيرية تعود للنوع Acinetobacter baumannii من بين 424 عينة شملت عينات ( جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) وبنسبة 8.01% جمعت من المرضى الراقدين في مستشفى بغداد التعليمي / مدينة الطب ، وقد شخصت من خلال الصفات الزرعية (المستعمرات) والمجهرية ( البكتريا) والاختبارات الكيميائية الحياتية وباستخدام نظام Api 20 E ، وقد كانت معدلات الاصابة ببكتريا Acinetobacter baumannii في العينات المشخصة (جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) هي (15 ، 11، 6 ، 2) % على التوالي .• التحري عن عزلة كفوءة منتجة للكبسولة ، اذ امكن الحصول على عزلة كفوءة منتجة للكبسولة عند تنمية العزلات في وسط اغار نقيع القلب والدماغ المضاف اليه 5% كلوكوز وبفترة حضن 5ايام ودرجة حرارة 30 م.• التحري عن حساسية عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii تجاه 19 مضادا للحياة ، وقد اظهرت العزلات البكتيرية حساسية بنسبة 100% للمضاد Imipenem ومقاومة بنسبة 100% لمضادات الحياة (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin , Cephalothin , Tetracyclin , Aztreonam , Ciprofloxacin ) • حددت التراكيز المثبطة الدنيا لـ 8 مضادات للحياة Ciprofloxacin وGentamicin وAmikacin وTobramycin وCefotaxime وPipracillin وPiracillin +Tazobactum وCefepime واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في الـMIC لهذه المضادات ،اذ تراو حت قيم الـMIC لهذه المضادات (4 - 512 ، 8 - 1024< ،4 - 256 ، 4 - 1024< ، 16 - 1024< ، 8 - 256 ، 8 - 512) مكغم /مل على التوالي .• التحري عن قابلية عزلات Acinetobacter على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات ، اذ اظهرت العزلات البكتيرية قابليتها على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات نوع الدوز Aldose وتغييره الى لون بني .• التحري عن قابلية 18 عزلة بكتيرية منتخبة بصورة عشوائية تعود للنوع Acinetobacter baumannii على تلزين كريات الدم الحمر للانسان وباصنافه الاربعة A , B, AB, O في اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates ، وقد بينت النتائج قابلية العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للاصناف A , B AB, فيما اخفقت العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للصنف O .ثانيا - الجانب المناعي : استهدف هذا الجانب استخلاص الكبسولة من العزلة الكفوءة ودراسة تاثير تراكيز مختلـفة (25 ، 50 ، 100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على الخلايا المناعية باختيار المعايير الاتية : عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، التشكل الزهري التائي والبائي ، عملية البلعمة ، اختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم ، معامل انقسام خلايا نخاع العظم في الفئران والتحري عن الاضداد المتخصصة بمستخلص الكبسولة باجراء اختبار اخترلوني . ومنها تم الحصول على النتائج الاتية : • عدم تاثير التراكيز (25 ، 50 ، 100) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، فيما اظهرت التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل تاثيرا على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية .فقد سببت انخفاضا في عيوشية هذه الخلايا .• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التائية المكونة للتشكل الزهري الفعال والكلي نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل على الخلايا التائية.• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية البائية المكونة للتشكل الزهري نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل.• اظهرت النتائج زيادة في عملية البلعمة عند استخدام التركيز 100 مكغم /مل من مستخلص الكبسولة فيما انخفضت عملية البلعمة عند استخدام التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في النسب المئوية للخلايا المكونة للفورمازان باستخدام التراكيز (100 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في معامل الانقسام الخيطي لخلايا نخاع العظم في الفئران باستـــخدام التركيزيـــن (100 ، 250) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• تكون خطوط ترسيب بين مستخلص الكبسولة ومصول الارانب الممنعة به باستخدام المصل بدون تخفيف وعند تخفيفه بنسبة 1 : 10 ، فيما لم تظهر اي خطوط ترسيب عند استخدام التخفيفين 1 : 100 و1 : 1000 او عند استخدام المصل قبل التمنيع .ثالثا - الالتصاق البكتيري وتثبيط الالتصاق البكتيري : تضمن هذا الاختبار مقارنة التصاق عزلات مكونة للكبسولة وغير مكونة للكبسولة على البولستايرين ومقارنة التصاق عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار الانسان لمعرفة دور الكبسولة في الالتصاق ، فضلا عن تثبيط الالتصاق البكتيري باستخدام : ا - اضداد مستخلص الكبسولة Capsular antibodies ،اذ تم الحصول على مضاد الكبسولة بعد تمنيع الارانب بمستخلص الكبسولة ومفاعلة المصل المضاد للكبسولة مع عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة لبكتريا Acinetobacter baumannii ومن ثم اجراء اختبار الالتصاق البكتيري لمعرفة دور اضداد الكبسولة في تثبيط الالتصاق .ب‌ - ماتحت التركيز المثبط الادنى subMIC من خلال تنمية العزلة المكونة للكبسولة في وسط نقيع القلب والدماغ السائل BHIB الحاوي على تركيز الـ subMIC لبعض المضادات البكتيرية ، واجري اختبار الالتصاق البكتيري ومقارنة ذلك بمعدل نفس العزلة المنماة في نفس الوسط الخالي من الـ subMIC لمعرفة تاثير الـsubMIC في عملية تخليق الكبسولة وعملية الالتصاق البكتيري .• اظهرت نتائج اختبار الالتصاق على البولستايرين قابلية العزلتين المكونتين للكبسولة على البقاء ملتصقة على البولستايرين فيما اخفقت العزلتين غير المكونتين للكبسولة بالبقاء ملتصقتين على البولستايرين .• بلغ معدل التصاق البكتريا المكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية للانسان (35.62) وبذلك هو اعلى من معدل التصاق البكتريا غير المكونة للكبسولة (19.68) .• اظهرت الاضداد المتخصصة للكبسولة تاثيرا مثبطا لالتصاق العزلة المكونة للكبسولة ، فيما لم تؤثر في التصاق العزلة غير المكونة للكبسولة .• ادى ما تحت التركيز المثبط الادنــــى subMIC للمضاديــــن Ciprofloxacin 64 مكغم/مل وPiracillin + Tazobactum 16 مكغم /مل الى تثبيط الالتصاق البكتيري ، اما في حالة المضادين Cefotaxime 1024 مكغم /مل وGentamicin 4 مكغم /مل فلم يكن هنالك تاثيرا في عملية الالتصاق اذ كان الالتصاق طبيعيا اي انه لم يكن له تاثير ايضا في عملية تخليق الكبسولة .رابعا - الدراسة النسيجية : درست التغييرات النسيجية المختلفة في الفئران المحقونة بالعالق البكتيري Acinetobacter baumannii ومستخلص الكبسولة في الاعضاء ( الكبد ، الطحال ، الكلية ، الرئة ، الامعاء ) ، اذ ظهر تاثير للعالق البكتيري ومستخلص الكبسولة في كل الاعضاء وقد لوحظ تاثير العالق البكتيري في الكبد بوجود خثارات كثيرة داخل الكبد مع وجود تغير دهني ووجود قطيرات دهنية داخل نسيج الكبد ، والطحال ظهر فيه تضخم باللب الابيض في منطقة الخلايا البائية ومنطقة الخلايا التائية ، اما الرئة فقد وجد فيها احتقان مع انخماس ، وظهر في الكلية توسع بسيط في محفظة بومان مع وجود قطيرات دهنية او تغير دهني داخل الكبيبات ووجود تنكس استسقائي في بعض النبيبات ، وفي الامعاء ظهر تضخم في لطخ باير وتنكس مخاطيني . اما تاثير مستخلص الكبسولة فقد ظهر في الكبد بوجود خثرة داخل اوردة الكبد مع توسع في الجيبانيات ، وفي الرئة ظهر ارتشاح خلايا التهابية حول الاوعية الدموية ووجود خلايا التهابية حول القصبات ، اما في الكلية يلاحظ تغيير دهني في الكبيبات ، وظهر في الطحال تكوين دم خارج النخاع مع وجود فرط تنسج في اللب الابيض ، وظهر في الامعاء تضخم لطخ باير مع وجود تنكس مخاطيني . | Acinetobacter baumannii was isolated from 424 samples from wound , urine , sputum , and blood , which were collected from Baghdad hospital / Medical city, 34 isolates (8.01 %) of Acinetobacter baumannii was identified depending on the morphological , cultural ,and biochemical characteristics , by Api 20 E system. The infection rate by Acinetobacter baumannii identified samples (wound , urine , sputum , and blood ) were (15 , 11, 6, 2) % respectively .Detection the efficiency of isolate to produce a large capsular polysaccharide . Under incubation period 5 days at 30 C º and cultural media (Brain heart infusion agar + 5 % glucose) for production of a large amount of capsular polysaccharide . The susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates to 19 antibiotics were performed . All isolates were susceptible 100% to imipeneme and resistant 100% to (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin, Tetracycline , Aztreonam , Ciprofloxacin , Cephalothin Minimum inhibitory concentration ( MIC) of 8 antibiotics (Ciprofloxacin , Gentamicin , Tobramycin , Amikacin , Cefotaxime , Pipracillin , Pipracillin + Tazobactum , Cefipeme ) were determined , which they were ( 4 - 512 , 8 - >1024 , 4 - >1024 , 4 - 256 , 16 - >1024 , 8 - 256 , 8 - 512) μg /ml respectively . The ability of Acinetobacter isolates to discolored blood agar that containing sugars was detected .All isolates showed their ability to discolored blood agar that containing sugars only from type aldose. Ability of isolates that chosen randomly to agglutinate red blood cells of human A,B,AB,O blood groups in micro titration plates was done . Results showed the ability of the isolates to agglutinate red blood cells groups A,B,AB only but not blood group O . Second : Immunological aspect : Extraction of capsular polysaccharide from the efficient isolate number (26) had been done . Then the effect of different concentrations( 52, 50 ,100, 150 , 250 , 500) μg/ml of capsular extract on immune cells were studied according to following parameters : Viability of polymorph nuclear leukocytes and lymphocytes , T&B lymphocytes rosette formation , phagocytosis in vitro, reduction of nitroblutetrazolium , mitotic index test for bone marrow cells in mice , and investigation about specific capsular antibodies by ochterlony test. All these immunological tests were done , the following Results were : No effect was found of concentrations (25,50,100) μg/ml of capsule extract on viability of polymorph nuclear cells & lymphocytes , while concentrations (150, 250 , 500) μg/ml decreased it .The concentrations (100,150,250,500) μg/ml of capsular extract decreased the percentage of T&B rosette formation . Hundred μg/ml of capsular extract increase phagocytic index , while (150, 250, 500) μg/ml inhibited it . Capsular extract concentrations (100, 250, 500) μg/ml decreased number of cells producing Formosan , and (100, 250) μg/ml of capsular extract decreased mitotic index in mice. Precipitation lines were found between capsular extract and serum of immunized rabbits without dilution and with the dilution 1 : 10 .Third : Bacterial adherence and inhibition bacterial adherence : Comparison the adherence between encapsulated isolates and non encapsulated isolates on polystyrene and comparison the adherence between capsulated isolate and non encapsulated isolate on epithelial cells which took from urine to know the capsular role in adherence , and inhibit the bacterial adherence by using : 1 - capsular antibodies which were obtained after immunized the rabbits with capsular extract ,then reaction of the serum with encapsulated and non encapsulated isolates and after that the adherence test was done .2 - sub minimum inhibitory concentration (SubMIC) after growing encapsulated isolate in brain heart infusion broth containing subMIC of some antibiotics and the test of bacterial adherence was done and comparison between the same isolate growing in brain heart infusion broth with subMIC and without subMIC to find the role of subMIC in capsule production process . Results of adherence test on polystyrene showed the ability of encapsulated isolates to adhere on polystyrene while non encapsulated isolates washedout . The rate of encapsulated isolate adhere on human epithelial cells was 35.62 , and that was higher than the rate of non encapsulated isolate which was 19.68. Specific capsular antibodies inhibit adherence of encapsulated isolate, while it had no effect on non encapsulated isolate adherence . SubMIC of the antibiotics ciprofloxacin and piracillin+tazobactum had an inhibitory effect on encapsulated isolate adherence , while their was no effect when subMIC of antibiotic cefotaxime and gentamicin was used. Fourth : Histological aspect : Different histological changes in mice after injected with bacterial suspension and capsular extract were studied in organs (liver , spleen, kidney, lung, intestine) . The effect of bacterial suspension and capsular extract was noticed in all the studied organs . The effect of bacterial suspension in liver was noticed by many clotting inside the liver with fatty changes in the liver tissue , in spleen increased in white pulp size in the region of T&B cells , in lung congestion , in kidney enlargement in bowman capsule with fatty changes inside tubules with hydrobic degeneration in many tubules , in intestine enlargement in payers patches and mucosal degeneration . The effect of capsular extract was noticed in liver by the appearance of clot inside liver’s veins with enlargement in sinuses , in lung infiltration of inflammatory cells around the blood vessels with inflammatory cells around tracheas , in kidney fatty changes in glomerulus . in spleen , blood formation out of the marrow with reactive hyperplasia , in intestine enlargement in payer patches with mucosal degeneration

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

Author name: سوسن محمد كريم
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates

دراسة مقارنة لبعض انواع النحل من فوق عائلة Apoidea الملقحة لنبات الجت Alfalfa Medicago sativa في محافظة بابل == Comparative study for some insect pollinators Apoidea that pollinated Alfalfa Medicago sativa in Babylon

Author name: سهاد حميد حسن
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي شعلان معيلف الاعرجي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة اختيار 13 حقلا من حقول الجت Medicago sativa من مناطق معينة من محافظة بابل لدراسة عملية التلقيح الحيوي لهذا المحصول خلال مدة التزهير للفترة ما بين مايس الى تشرين الاول لعام 2004، حيث استخدمت خلال هذه المدة شبكة صيد الحشرات القياسية لاخذ العينات التي بلغ عددها الكلي 185 عينة ، وقد تم تشخيص (47) نوعا تعود الى(18) جنسا تحت ست عوائل تابعة الى فوق عائلة النحل Apoidea وهي Megachilidae ,Halictidae , Anthophoridae , Andernidae , Ctenoplectridae , Apidae.قورنت عوائل النحل التابعة الى فوق عائلة Apoidea تبعا لعدد الانواع والاجناس والكثافة الكلية لكل منها، وقد وجد ان عائلتي Halictidae وMegachilidae كانتا الاكثر وفرة في عدد الانواع والاجناس وكثافة الافراد مقارنة مع العوائل الاخرى وقد شكلتا نسبة 61.1 % و72.3 % و88.5 % من العدد الكلي للاجناس والانواع والنماذج المجموعة على الترتيب. كما لوحظ وجود تذبذب في عدد العوائل والاجناس والانواع والكثافات باختلاف شهور الدراسة. وقد تبين ان شهر تموز هو الشهر الاعلى كثافة (عدد الافراد/50 كنسة) اذ بلغت الكثافة فيه 22.7 فرد/50 كنسة بينما كان شهر مايس هو الاقل عددا وبلغ 4.34 فرد/50 كنسة.تم دراسة التواجد الشهري لعوائل النحل في حقول الجت من حيث الكثافة وعدد الانواع وتبين ان العوائل اختلفت في عدد الانواع التي تمثلها وكذلك كثافاتها باختلاف شهور الدراسة.اختيرت عشرة انواع من ملقحات محصول الجت التابعة الى فوق عائلة Apoidea على اساس كثافاتها ، ثباتها وتكرار تواجدها في العينات خلال مدة الدراسة بالاضافة الى سهولة تشخيصها بالعين المجردة لغرض الدراسات اللاحقة ، وهذه الانواع هي : Megachile rotundata , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus, Megachile sp.2 (near to M.latimanus) , Nomia melanderi , Apis mellifera , Megachile sp.4, (near to M. texana), Nomia sp.2(near to N. nortoni) , Homalictus sp.1 (near to H. rowlandi) , Nomioides variegata . تم مقارنة الانواع العشرة المنتخبة من حيث معدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها ، نسب حبوب لقاح الجت ضمن الحمولة ، وزن الجسم/ملغم ، طول الخرطوم/ملم، مدة البقاء على الزهرة مقاسا بالثانية وعدد الانتقالات بالدقيقة.واظهرت النتائج ان الاناث قد تفوقت على الذكور في جمع اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح وللانواع العشرة. بينت النتائج ان هنالك ستة انواع من النحل قد تفوقت في معظم نواحي الكفاءة المنتخبة وهي : Megachile rotundata وMegachile sp.2 وsp.4 Megachile تعود لعائلة Megachilidae كذلك الانواع Nomia melanderi وNomia sp.2 (Halictidae) وApis mellifera ( Apidae) وتميزت اناث النوع M. rotundata معنويا بانها الاكثر كفاءة في حمل اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح خلال الدراسة بلغ 49750 حبة لقاح تلته اناث الانواع Megachile sp.2 وsp.4 Megachile وN. melanderi بلغ عدد ما حمل كل منهم على الترتيب (34300 , 32600 , 31550).اما ذكور النحل فقد تميزت بحمل اعداد لا باس بها من حبوب اللقاح فقد حملت ذكور rotundata . M22125 حبة لقاح تلته ذكور N. melanderi فقد حملت 16725 حبة لقاح مما يدل ان لها دورا في عملية تلقيح ازهار الجت. اختلفت معدلات اعداد حبوب التي تحملها الملقحات اختلافا معنويا باختلاف شهور الدراسة،فقد كان معدل عدد حبوب اللقاح المحمولة في شهري تموز واب اعلى مقارنة مع الشهور الاخرى وكانت اعداد حبوب اللقاح المجموعة من قبل اناث النوع M. rotundata اعلى معنويا مقارنة بالانواع الاخرى بلغت 52000 و50875 حبة لقاح خلال شهري تموز واب على الترتيب.من ناحية اخرى بلغ اعلى معدل لنسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح 91.5 % بواسطة اناث النوع M. rotundata تلته اناث النوع N. melanderi اما اقل نسبة فقد بلغت 62.6 % بواسطة النوع Nomia sp.2 .تفاوتت معدلات النسب المئوية لحبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبصورة معنوية بين شهور الدراسة ،وقد تميز كل من شهري تموز واب مقارنة بالشهور الاخرى بارتفاع معدلات نسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبلغت هذه النسبة 100% في شهر تموز بواسطة النوع M. rotundata وN.melanderi ، اما في اب فقد بلغت(100،94.1%)على الترتيب للنوعين المذكورين. وعليه فانه يبدو ان الانواع الستة هي ملقحات متخصصة لمحصول الجت.تم في هذه الدراسة ايضا قياس معدل اوزان الملقحات (ملغم) ذكورا واناثا وبينت النتائج وجود فروق معنوية واضحة بين اوزان الانواع المدروسة,وبناء عليه فقد قسمت الانواع حسب الوزن الى ثلاث مجموعات كبيرة ومتوسطة وصغيرة،كما اشارت النتائج الى وجود علاقة ارتباطية موجبة بين وزن الجسم ومعدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها هذه الملقحات. اظهرت النتائج ان ازهار الجت تزار بمجموعتين من النحل حسب طول الخرطوم(اللسين) هما مجموعة النحل طويل اللسين ،بلغت النسبة المئوية لعدد الانواع التابعة لهذه المجموعة 49% اما المجموعة الثانية فهي مجموعة النحل قصير اللسين بنسبة51% من المجموع الكلي للانواع. وبلغ اكبر معدل لطول اللسين 4.34 ملم لنحل العسل mellifera A. في حين ان اقل معدل بلغ 1.55 ملم للنوع Nomia sp.2 . واوضحت النتائج ان الملقحات المنتخبة قد اختلفت اختلافا معنويا في مدد بقائها على ازهار الجت .اقل مدة بقاء سجلت للنوع M. rotundata على ازهار محصول الجت بلغت 2.22 ثانية تلاه النوع N. melanderi 3.01 ثا ونلاحظ ان عدد الانتقالات قد ارتبط عكسيا مع مدة بقائها فقد سجل النوع M. rotundata اكبر عدد لانتقالاته على محصول الجت بلغت 22.2 انتقالة/د واقل عدد للانتقالات بلغ 11 انتقالة/د للنوع Nomia sp.2 . | Thirteen fields of Alfalfa Medicago sativa were selected from certain region in Babylon governorate to study its pollination biology during flowering period , May to October 2004, the standard insect net was used to collect (185) samples.During study the period, about (47) species were collected from the Alfalfa fields belong to (18) genus under (6) families of the super family Apoidea, these families were Megachilidae, Halictidae, Anthophoridae, Andernidae, Ctenoplectridae, Apidae.The families of Apoidea that have been collected were compared according to the number of species, number of genera and density of individual of each taxonomic group.It was found that the families Halictidae and Megachilidae were the highest in the number of species , genera and density of individual compared with other families , However, these two families represented 61.1% , 72.3% , 88.5% of total number of the genera , species and their densities respectively .The monthly variations in the number of families , genera, species and density of Apoidea were discussed . It was found that the month of July was highest in the density (number of individual/ 50 beat) reached to 22.7, while the lowest number reached to 4.34 on May.The monthly occurrence of different families of Apoidea in Alfalfa fields was investigated according to the rate of densities and the rate of number of species , However, It was appeared that the families varied in number of species and densities of each month for the study period.The alfalfa pollinators species were selected according to their densities , consistence, occurrence during the study period and easily recognized by necked eye for further study. these were included : Nomia sp2.(near to N. nortoni) , Nomia melanderi , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus , Nomioides vareigata , Homalictus sp.1(near to H. rowlandi) (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2(near to M.latimanus) , Megachile sp.4 (near to M. texana)(Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae).The ten selected pollinators were compared according to the average of pollen load, the percentage of Alfalfa pollen grain in the pollen load , body size , length of proboscis, visit duration/s , visit frequency/m ,and the result showed that the females were usually collect more pollen grain than the males of same species in all the ten selected species .It was found that six species pollinators within the ten selected species of Apoidea were significantly more active in most of the efficiency factors , these were Nomia sp2. , Nomia melanderi , (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 (Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae). The females of M.rotundata was significantly more efficient in pollen grain collection , the average number of pollen grain reached to (49750) followed by females of , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 , Nomia melanderi (34300 , 32600, 31550) pollen grain respectively . While 22125 pollen grain was collected by M. rotundata males followed by males of Nomia melanderi (16725). which seems they were importance in the pollination of Alfalfa flowers .The selected pollinators varied in average number of pollen grain in various months . However, it was found that the pollen load of each species was high during July and August compared with other month, the pollen load of females M.rotundata was (52000, 50875) pollen grain in July and August respectively.On the other hand, the highest average percentage of Alfalfa pollen grains was reached to 91.5% by females of M.rotundata followed by Nomia melanderi reached to be 85.7% , while the lowest percentage was 62.6% by Nomia sp2.The average percentage of Alfalfa pollen grain within pollen load was different significantly in each month of the study period. However, it was found that the percentage of Alfalfa pollen grain was high during July and August compared with the other months . The highest percentage of Alfalfa pollen grain was reached to (100 %) in July by M.rotundata and Nomia melanderi and was reached to (100 , 94.1%) in August also by the two species respectively . thereupon, it seems clearly that these six species of Apoidea were appeared to be specialization for Alfalfa crop pollination.The average of body size of pollinators species for males and females were measured .The results illustrated that there was significant variation in body size of selected species. Thereupon , the selected species were grouped into three groups : big, medium and small. It was found that there was positive correlation relationship between the body size and pollen load of pollinators .The results showed that the flowers of Alfalfa crop were visited by two grouped of bees , which were long-tongued bees with the percentage of 49% , and short- tongued bees with the percentage of 51% of the total number of species . The highest average of proboscis length was reached to 4.34 mm for A.mellifera , while the lowest average was reached to 1.55 mm for Nomia sp2 .The results appeared that the selected pollinators were significantly differences in the visit duration to the flowers (second) , the lowest average of the visiting duration of the pollinators was reached to 2.22 second for M.rotundata followed by Nomia melanderi which was reached to 3.01second . It was found that the visiting duration of pollinators was correlated negatively with visit frequency per minute . However , the M.rotundata has highest visiting frequency reached to 22.2 visit/ minute while the lowest visiting frequency was reached to 11 visit / minute by Nomia sp2

الكشف عن البارفوفايروس B19 بوساطة التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي في مرضى اورام الدرقية == Detection of Parvovirus B19 by Immunohistochemistry in Patients with Thyroid Tumors

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | علي حسین محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Thyroid cancer is the most common neoplasm of endocrine system. In Iraq thyroid cancer ranks the eighth among ten cancers in females.Therefore, it is a growing health problem.The present study was conducted to evaluate whether or not parvovirus B19 play a role in thyroid tumors and the correlation between the existence of virus and activation of NF - κB p65. Also this study extended to determine relevant cytokines (IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α) in the microenvironment of thyroid tumors by using immunohistochemical technique.This study designed as a retrospective study. A total number of 94 formalin - fixed paraffine - embeded thyroid tumors tissue collected from archive of Histopathology Department of the Teaching Laboratories, Medical/ City, Al - Shaheed Ghazi Hospital Lab, Al - Kindy Hospital Lab, Alkarama Hospital Lab and Central Public Health Lab during the period July 2013 - November 2013. All samples are referred to the period between 2010 - 2013. Tissue blocks were divided into three groups. First group included 53 tissue block of malignant thyroid whereas second group included 41 tissue blocks of benign thyroid tumors and third group included 21 tissue blocks as control group were selected from the same benign cases which have normal tissue. From each block, seven sections of 4μm thickness were taken, one section was stained with Hematoxylin and Eosin (H&E) and the other six sections were immunohistochemically stained for human parvovirus B19, NF - κB p65, IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with malignant thyroid tumors ranged from 20 - 70 year with mean age 40±11.63 year while in benign tumors, the mean age was 37.6±11.19 year, ranged from (16 - 59) year.The papillary thyroid carcinoma was the most common type among malignant histopathological types 61%. In benign tumors the most common was follicular adenoma 29.3%.Human parvovirus B19 expression was higher in malignant tumors than in benign with no significant difference P=0.09 while it was significantly higher in malignant 66% and benign tumors 48.8% compared with their counterparts of control group 4.8%, p˂0.001.NF - κB p65 was positively expressed in all cases of malignant tumors 100% and 97.6% in cases of benign tumors compared with control group 23.8% with significant difference p˂0.001.IL - 6 expression was higher in benign than in malignant tumors with no significant difference p=0.22 while it was significantly higher in benign 90.2% and malignant tumors 81.1% compared with control group 52.4%, p=0.01 and p=0.03 respectively.Immunostaining reaction for IL - 8 was significantly higher in malignant tumors than that in benign 69.8% versus 31.7%, p˂0.001, while positive reaction was not detected in any tissue of control group.IL - 10 was expressed in 83% of malignant tumors, in 95.1% of benign tumors and 71.4% control group. The percentage of IFN - α positive was 83% in malignant tumors compared with 63% in benign tumors and normal tissue 52%. The difference was significant between malignant and benign tumors p=0.04 and between malignant and control group p=0.007.There was a significant correlation between human parvovirus B19 score category and IFN - α score r=0.296, p=0.031. But no significant correlation was noticed between B19 and the other cytokines.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة للمرضى المحبطين مناعيا ودراسة للاستجابة المناعية ضد المبيضات البيضاء == Isolation and identification of fungi associated with and study immunocompromised patients of the immune response against Candida albicans

Author name: سعاد يوسف لفتة
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: خلال فترة الدراسة التي امتدت من تشرين الثاني/2003 ولغاية نيسان/2005 فقد تم اخضاع 300 مريضا يعانون من مختلف الامراض الخبيثة الى فحص داء الفطريات واظهر 17 مريضا من المجموع الكلي ان نتائج زرع الدم كانت ايجابية وان خميرة مبيضة المبيضات Candida albicans كانت المسؤولة عن معظم الاصابات بالفطريات ومن بين الحالات السبعة عشر التي تم عزلها فان تسعة منها (53% من مجموع الحالات) كانت من نوع C. albicans وان الاصابات بفطريات اخرى سواها والتي تم عزلها بلغ عددها اربعة (23% من مجموع الحالات) كانت من Aspergillus spp التي تم عزلها من حالة فردية من حالاات Cryptococcus spp وحالة ثانية من حالات زرع Trichosporone spp . ولقد اتبع اسلوب API (API candida and API 20 C AUX) كطريقة مرجعية لتشخيص ماتم عزله. وبالمقارنة مع الاساليب التي قدمت مؤخرا وهي انظمة (ID32 C) و(VITEK YBC) فان نظام API 20 CAUX وID32 كانامطابقين لمستوى السلالتين وبدون حاجة الى مزيد من الفحوصات الاضافية لتشخيص 13 حالة من الحالات الخمسة عشر التي تم عزلها اي 86.6% وان اهم ما تم التوصل اليه ثبوت ان نظام VITEK YBC يصلح جدا للمقارنة مع API 20 CAUX. ومن بين المرضى الثلاثمائة الذين تم زراعة دمهم تم فحص 71 منهم للتاكد من وجود او عدم وجود اصابة فطرية دون اجراء فحوصات على اعضاء الجسم الاخرى غير المصابة وكانت عينات الادرار هي الاكثر شيوعا من بين العينات الاخرى ومع ذلك فان عينتين فقط من مجموع 35 عينة اتفق على انها موجبة الزرع.و من بين المرضىالسبعة عشر الذين اثبت الزرع وجود فطريات لديهم فان ثمانية منهم كونوا مستعمرات من نفس الانواع الموجودة في النماذج الاخرى وان اكثر المواقع شيوعا لتكوين المستعمرات مع نفس الاحياء المجهرية كانت المجاري التنفسية والمجاري البولية - التناسلية. وكان متوسط العدلات (Neutrophils) في عينات دم موجبة الزرع 1136 خلية/ملم3 مع انحراف معياري مقداره ±1637 خلية/ملم3 في حين كان المتوسط لحالات الزرع السالبة 2701 مع انحراف معياري مقداره ±1667 . وباستعمال فحص ELISA لمضادات الجسيمات BioRad) (المتوفر تجاريا فان 25 مريضافقط من مجموع المرضى الثلاثمئة الذين اجروا الفحص اظهروا نتائج ايجابية. وان تسعة من بين هؤلاء الخمسة والعشرين اظهروا نتائج موجبة لزرع الدم ايضا في حين اظهر الستة عشر الاخرون نتائج زرع سالبة. ولم يظهر اي من افراد فريق السيطرة الاصحاء نتائج موجبة. وكانت قراءة نماذج الدم موجبة الزرع 1.11 مع انحراف معياري مقداره 0.68 في حين ان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لحالات الزرع السالب لاعضاء فريق السطرة الاصحاء كانت 0.43 مع انحراف معياري مقداره ±23 وان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لاعضاء فريق السيطرة الاصحاء كان 0.38 مع انحراف معياري مقداره 0.123. وقد اظهرت تراكيز interleukins التي تم فحصها بهذه الطريقة اختلافات كبيرة بين مجموعات الدراسة المختلفة وكذلك اختلافات بين افراد المجموعة الواحدة وان التركيز المتوسط ل IL - 1α في نماذج زرع الدم الموجبة بلغ 30.94 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±80.33 في حين ان التركيز المضبوط لحالات الزرع السالب بلغ 16.08 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 3.26 وكان التركيز المضبوط ل IL - 8 في نماذج الدم موجبة الزرع 389.2 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±383.15 في حين ان متوسط التركيز كان 163.0 بيكوغرام \مل مع انحراف معياري مقداره ± 289.9 وكان متوسط التركيز لدى مجموعة السيطرة المؤلفة من الاصحاء 5.02 بيكوغرام \مل م مع انحراف معياري مقداره ±1.81 . وكان تركيز GM - CSF في نماذج الدم 12.90 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±31.79 في حين ان متوسط تركيز حالات الزرع الموجبة كان 2.68 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 10.19. وان متوسط تركيز افراد مجموعة السيطرة الاصحاء بلغ 0.85 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 0,45. ولم يظهر مستوى الغلوبيولين المناعي اية متغيرات ملموسة بين مجموعات الدراسة سواء اكان الفحص IgG او IgM او IgA ولقد اظهر مستوىالعنصر التكميلي ل C3 اختلافات بارزة بين مجموعات الدراسة لكونه اوطا في مجموعة الزرع الموجب. وعلى كل حال لم تلاحظ اختلافات كبيرة في المجموعات بالنسبة الى C4 . وكان مستوى C Reactive Protein في المجموعات الدراسية المختلفة قد كشف عن اختلافات بارزة p=0.001 وعلاوه على ذلك فان الاختلافات كانت واضحة بين الافراد الذين هم ضمن نفس المجموعة. وكان المتوسط التقريبي لمستوى CRP في نماذج زرع الدم الموجبة 261,9 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±384.4 وفي نماذج زرع الدم السالبة بلغ 178,8 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±364.2 وفي مجموعة السيطرة التي افراده من الاصحاء بلغ 1.7 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±7.7 . وكان مستوى CRP في 58,8 من الحالات في مجموعة الزرع الموجب قد تجاوز 96 ملغ\لتر في حين ان 37.4% فقط من مجموعة الزرع الموجب تجاوزت هذا الرقم. ولم يكن يوجد بين افراد فريق السيطرة الاصحاء من تجاوز هذا الرقم.و كانت جميع الحالات التي تم عزلها بعد الفحص تستجيب الى الامفوتيريسين B مع (MIC =<1 مايكروغرام\مل) باستثناء C. krusei المنفرد الذي تم عزله والذي كان اقل استجابة من اي نوع اخر مع MIC مقداره 2 مايكروغرام\مل وMIC 50 المزدوج. وكانت نسبة سلسلة MIC الى الامفوتيريسن B تتراوح بين 0.125 الى 2 مايكروغرام\مل وبصوره عامة فان Non - albicans Candida اظهرت MIC اعلى من C. albicans التي تم عزلها وان 84.6% من الCandida التي تم عزلها كانت تستجيب الى الامفوتريسين والباقي اي 1.4% كانت حساسيتها حسب مقدار الجرعة. وان نسبة سلسلة MICs الى الفلوكونازول تراوحت بين (0.25 - 64) مايكروغرام\مل وكان جميع ما تم عزله ذا حساسية عالية تجاه الفلوكونازول باستثناء C. krusei التي اظهرت MIC عال حيث بلغ 32 واما MIC 50 وMIC 90 فقد كانت 16 مايكروغرام\مل و32 مايكروغرام\مل على التوالي. وان جميع ال Candida التي تم عزلها ونسبتها 84.6% استجابت الى الفوكونازول في حين ان نسبة 15.4% كانت حساسيتها حسب الجرعة.ان سلسلة الMIC تجاه الاتراكونازول كانت تتراوح بين (0.015 - 1) مايكروغرام\مل وكانت جميع C. albicans التي تم عزلها حساسة تجاه الاتراكونازول واظهرت خمائر الCandida الاخرى non - albicans Candida استجابة اقل نسبيا مع الحاجة الى تراكيز دوائية اعلى من اجل التوصل الى MIC وان 96.2 % من الCandida التي تم عزلها استجابت الى الاتراكونازول وان الباقي اي 30.8% كانت تستجيب حسب الجرعة. | Through the period of this study which extended from November 2003 to April 2004, 300 patients with different types of malignancies were tested for fungemia. Out of those, 17 patients showed positive blood culture results. Candida albicans accounted for the majority of fungal infections. Out of the 17 fungal isolates, 9 (53%) were C. albicans, others non C. albicans came next in frequency constituting 4 isolates (23.5%). Two isolates of Aspergillus spp. could be detected while a single isolate of Cryptococcus spp and another of Trichosporon spp. isolate were cultured API system (API Candida and API 20C AUX) was used as a reference method for the identification of isolates. Compared with the other newly introduced techniques (ID 32C systems and VITEK YBC). ), the API 20C and the ID 32 system were in agreement with the species level, without additional tests, for the identification of 13 of the 15 (86.6%) isolates.Overall, the updated Vitek YBC compares favorably with the API 20C in the identification of common yeasts. Among the 300 patients whose blood were cultured, 71 of them were screened for fungal infection from other parts of the body. Urine was the commonest sample obtained. However, two samples only out of the total (35 samples) were accepted to be culture positive. Among the 17 patients whose blood cultures proof the existence of fungi, 8 were colonized with the same species in other specimens. The most frequent sites of colonization with the same organism were the respiratory tract and urogenital tract.The mean of neutrophils count of the blood culture positive samples was 1136/c.mm with a standard deviation (SD) of 1637, whereas the mean count of culture negative cases was 2701 with a SD of 1923. Mean count of healthy control group was 5027 with a SD of 1667. Statistical analysis showed significant differences between the study groups. Using commercially available Candida - specific antibody test (Bio - Rad), 25 patients showed positive results out of the 300 patients tested. Nine of them showed positive blood culture as well, whereas the rest (16) gave negative culture results. None of the healthy control group showed positive results. Mean OD readings of the blood culture positive samples was 1.11 with a SD of 0.68, whereas the mean OD readings of the culture negative cases was 0.43 with a SD of 0.23. Mean OD readings of healthy control group was 0.38 with a SD of 0.123. Interleukins (ILs) concentration tested in this study showed significant variations among the different groups of the study as well as within the same group. Mean concentration of IL - 1α in the blood culture positive samples was 30.94 pg/ml with a SD of 80.33, whereas the mean concentration of the culture negative cases was 16.08 pg/ml with a SD of 28.75. Mean concentration of healthy control group was 7.92 pg/ml with a SD of 3.26. Mean concentration of IL - 8 in the blood culture positive samples was 389.2 pg/ml with a SD of 383.l5, whereas the mean concentration of culture negative cases was 163.0 pg/ml with a SD of 289.9. Mean concentration of healthy control group was 5.02 pg/ml with a SD of 1.81. Mean concentration of Granulocyte Macrophage - Colony Stimulating Factor (GM - CSF) in the blood culture positive samples was 12.90 pg/ml with a SD of 31.79, whereas the mean concentration of culture negative cases was 2.68 pg/ml with a SD of 10.19. The mean concentration of healthy control group was 0.85 pg/ml with a SD of 0.45. Serum immunoglobulins level showed no significant differences among the groups of the study whether IgG, IgM or IgA were tested. Mean level of C3 complement component showed significant differences between the groups of the study, being lower in culture positive group, and followed by culture negative group. However, no significant differences were noted in the groups in regard to C4. Level of CRP in different groups of the study shows significant variations (p=0.001). Moreover, variations are clear between individuals within the group itself. Approximate mean of CRP level in blood culture positive samples was 261.9 mg/L with a SD of 384.4 and, in blood culture negative samples was 178.8 mg/L with a SD of 346.2 and in healthy control group was 1.7 mg/L with SD of 7.7. CRP level in 58.8% of cases in culture positive group exceeded 96 mg/L. while only 37.4% of cases in culture negative group exceeded this value. Non in the control group exceeded this figure. All the tested isolates were susceptible to amphotericin B, with MICs ≤ 1ug/ml with the exception of a single isolate of C. krusei which was less susceptible than any other spp with MIC of 2 ug/ml and MIC50 of 2. The range of MICs to amphotericin B was from 0.125 to 2 ug/ml. In general, non - albicans Candida showed higher MIC than C. albicans isolates. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to amphotericin while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to fluconazole was from 0.25 to 64 ug/ml. All isolates were highly sensitive to fluconazole with the exception of C. krusei which showed a high MIC (32) and MIC50 and MIC90 of 16 and 32 ug/ml respectively. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to fluconazole while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to itraconazole was from 0.015 to 1.0 ug/ml. Most C. albicans isolates were sensitive to itraconazole. Non - albicans Candida showed relatively lower susceptibility with the need for higher drug concentrations to attain the MIC. 69.2% of Candida isolates were susceptible to itraconazole while the rest (30.8%) were susceptible in a dose - dependant way.

استخلاص وتنقية جزئية للكتينات بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات مرضية

Author name: زينب نوري حامد محمد العاني
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع (50) مسحة تعود لمرضى ومراجعين لثلاث مستشفيات عامة في بغداد وذلك للتحري عن عزلات الـ Pseudomonas aeruginosa اخذت من حالات مرضية متعددة شملت الحروق والجروح والتهابات الاذن. وبعد ان اجريت على العزلات التي تم الحصول عليها الاختبارات الكيموحيوية اللازمة لتشخيصها ومنها القابلية على تحليل الدم على وسط الـ Blood agar ، امكن انتقاء (25) عزلة اظهرت قدرتها على انتاج انزيم الـ hemolysinase وتحليل وسط الدم بشكل كامل. اخضعت العزلات بعدها لاختبار القابلية على النمو على وسط السترمايد الانتقائي والقدرة على النمو في 42 م ، اذ انتخبت (18) عزلة منها. ثم تبع ذلك اختبار قابلية العزلات على انتاج اللكتينات من خلال عملية التلازن مع كريات الدم الحمر للانسان بفصائلها (O, B, A) ودم بعض الحيوانات _الماعز ، الدجاج ، الفئران والارانب) حيث تم انتقاء العزلات التي اعطت اعلى عيارية. زرعت العزلات على وسطي الانتاج (GE) Grelets mediumوالمرق المغذي (Nutrient broth) للتحري عن قابليتها على انتاج اللكتينات، ودلت النتائج على انتاجها لنوعين من اللكتينات هما PA - I والـ PA - II ، اذ يتميز الاول بتخصصه تجاه سكر الكالكتوز، فيما يتخصص الثاني بالمانوز. بعد انتهاء فترة التنمية تم استخلاص اللكتينات من اوساط الانتاج لتجري عليها عملية التنقية باستخدام كبريتات الامونيوم ثم التكسير بالموجات فوق الصوتية ، ليتم بعدها انزال الراشح باستخدام طريقة الفصل بكرموتوغرافي عمود الفصل يمكن تلخيص اهم النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : 1 - اظهرت مستخلصات اللكتينات تباينا في الفاعلية التلازنية تجاه كريات الدم الحمر للانسان والحيوان سواء اكانت معاملة بانزيم التربسين ام لم تعامل به، كما تباينت العزلات في انتاجها لانزيم الهيمولايسين وصبغة البايوسين الزرقاء. 2 - تم تحديد درجة الحرارة المثلى لنمو عزلات بكتريا الـ aeruginosa P. وانتاجها للكتينات ب37م عندما بلغ تركيز اللكتين PA - I 95 مايكروغرام / سم3 ، في حين كان تركيزه عند الحرارة 35 م مايكروغرام/ سم3. اما اللكتين PA - II فبلغ تركيزه 40 مايكروغرام / سم3 عند الحرارة 35 م . 3 - وكان لاختلاف الاس الهيدروجيني دور في التاثير على تركيز ونقاوة اللكيتنات المستخلصة. اذ لم يتجاوز تركيز اللكتين PA - II المستخلص من العزلة (Z1) الـ30 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 5.0 في حين بلغ التركيز 105 مايكروغرام / سم3 لنفس اللكتين عند الاس الهيدروجيني الامثل (7.0) . اما اللكتينPA - I فقد انخفض تركيزه من 85 مايكروغرام/ سم3 في الاس الهيدروجيني الامثل ليصل الى35 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 8.0. 4 - تمت تنقية اللكتينات المستخلصة بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام متعدد الاكريلامايد بظروف ماسخة ، من خلال تمرير اربعة نماذج مستخلصة (اضافة الى نموذج البروتينات القياسي). 5 - لدى اختبار حساسية العزلات المعزولة من التهابات الاذن لمضادات الحياة ، اظهرت تباين في مقاومتها للمضادات، وكانت جميع العزلات مقاومة لكل من الامبسلين والاموكسيسيلين، فيما كانت حساسة للمضادات توبرومايسين والجنتامايسين والارثرومايسين. 6 - لاختبار قابلية اللكتينات المستخلصة على الارتباط بالسكريات الموجودة في حليب الام وحليب البقر والحليب المصنع، دلت النتائج بانه اضافة عالق الدم صنف O الى اللكتين مع سكريات الحليب تاركا كريات الدم الحمر حرة. 7 - اثبتت تجربة استخدام المرهم الطبي المضافة له بعض السكريات البسيطة كفاءتها، بعد ان تبين قدرة هذه السكريات على تثبيط تلازن اللكتينات مع كريات الدم الحمر للانسان خارج الجسم.8 - بعد ان حقنت فئران التجارب باللكتينات (PAI,PA - II,PAII) المستخلصة من العزلات (Z4,Z1,Z1) ، كان المحتوى الكاربوهيدراتي فيها (95،48، 30) مايكروغرام/سم3 وتركيز البروتينات (1350،860، 590) مايكروغرام / سم3 على التوالي. كما ولوحظ ظهور حالات غريبة على الفئران الثلاثة في المجموعة الاولى والتي حقنت باللكتينات اعلاه وتركت بدون علاج لمدة ساعة، ما بعد قتلها فقد حدث تحلل دم كامل في الفار الاول ومتوسط في الثاني، في حين لم يحدث اي تحلل للدم في الفار الثالث. وبعد استخدام العلاج في فئران المجموعة الثانية، لم يحدث تحلل دم للفار الاول والثالث وكان التحلل ضعيفا في الثاني. اما فئران المجموعة الثالثة والتي حقنت وتركت لمدة ساعتين بدون علاج، فقد نفق الفار الاول وحدث تحلل ضعيف في دم الفار الثاني وتحلل كامل في الفار الثالث. لم يسبب اعطاء العلاج لفئران المجموعة الرابعة وتركهم لمدة ساعتين اي تحلل لدم الفار الاول والثالث فيما كان ضعيفا في الثاني. اما افراد المجموعة الثانية فقدتركت بعد الحقن ثلاث ساعات بدون علاج، وكان تحلل الدم كاملا في الفار الاول ومتوسطا في الثاني والثالث، في حين لم يحدث تحلل للدم بعد اخذ العلاج. | Fifty samples were collected from several pathogenic cases including burns, wounds and ears belonging to patients and individuals referred to three general hospitals in Baghdad. Samples were subjected to the microbiological tests for detecting Pseudomonas aeruginosa, isolales. Among those tests was the ability of blood analysis on blood agar base medium. A total of (25) isolates were selected which showed the ability to produce the hemololysins. Some suspected isolates were also subjected to grow on ctramide agar, and with stand growth at 42c. Out of (25) only (18) isolate selected due to their ability to grow at 42c. The (18) selected isolates were tested for their ability to produce lectins via the heamagglutination with the human red blood cell groups (A, B, O). Isolates showed higher titers were chosen, when ability to produce lectins, two types (PA - I and PA - II) lectins were detected. Lectin PA - ICharacterized by it’s specify toward galactose, while PA - II was specific to mannose. After lectins were extracted from the production media, they were purfeyed by using ammonium sulphate and fractioned by the ultrasonic waves, followed by descending the filtrate by separation, through the chromatographic column.Results obtained could be described briefly as : 1. Obtained lectins showed were differed in their haemagglutination activity toweras human and animals red blood cells whether they were treated by the trypsin enzyme or not. However, isolates were not similar in producing the hemolysin enzyme and pyocine pigment.2. Optimum temperature for growth of P. aeruginosa isolate, and lectins production was 37c when concentration of lectin PA - I reached 95.0 µg/ml, while at 35c was 35 µg/ml - Regarding PA - II reached 40 µg/ml at 35c.3. Variation of pH played a significant effect on the. concentration and purity of the extracted lectins. At pH5.0 lectin PA - II concentration did in exceed 30, µg/ml while at optimum pH (7.0) it reached 105 µg/ml in the optimum pH to only 35 µg/ml at pH 8.0.4. Extracted lectins purified by gel electrophoresis when four extract in addition to the standard proteins sample were passed through it. The molecular weight of the PA - I was lectin from Z1 was 14.000 Dalton, while PA_II was 12.000 Dalton from the same sample.5. When P. aeruginosa isolates of ear infection were tested for their susceptibility to some antibiotics, they differed in their pattern of resistance. However, all isolates were resistant to Ampicilin and Amoxocilin, but sensitive to Tobramycin, Erythromycin and Gentamycin.6. In order to test the ability of the extracted lectin against some sugar which present in the human milk, raw milk and powder milk, red blood cell group were added to the lectin with the milk samples. Results showed that sugars inhibited haemagglutination with the red blood cells. 7. Experiments and application of the prepared ointment containing simple sugar proved its efficiency when sugar were able to prevent lectin agglutination with human red blood cells (invitro).8. After injecting mouse with the lectins (PAI, PAII, PAII) at (Z1, Z1, Z4) isolates, concentration of CHOs were (30, 48, 95) µg/ml and protein were (135, 860, 590) µg/ml respectively. Abnormal cases were also appeared on the three mice at the first group which was injected by the lectin when they were left without treatment for one hour, after they were killed, the first one was showed complete analysis at red blood cells, while it was not complete in the second and no analysis was showed in the third one, after treatment, no analysis of red blood cells was showed in the first and the third one, but it was not complete in the second one.The third group which injected by the same lectins when they were left without treatment for two hours the first mouse was dead, and the hemolysis was not completed in the second one, but completely in the third one, after treatment no hemolysis was showed in the first and the third one, but weakly in the second one. The fourth group, which injected by the lectins when they were left without treatment for three hours, the first mouse, was showed complete hemolysis, but not complete in the second and third one, after treatment, no hemolysis of red blood cells was showed.

تقييم وبائي ومختبري لمرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط C (HCV) لحالات الثلاسيميا == Evaluation of HCV infection in Thalassemic patients Epidemiological, Virological, Immunological, Clinical and Biochemical

Author name: زينب ناصر حسين الطرفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يتميز التهاب الكبد الفايروسي بقابليته الوبائية على اصابة العديد من الافراد ويطلق مصطلح التهاب الكبد الفايروسي على عدد من الفايروسات المصيبة للكبد التي تم تسميتها حسب اكتشافها الى A,B,C,D,E,F,G ويعتبر التهاب الكبد الفايروسي C وBمشكلة كبيرة وذلك لعدم امكانية تشخيص الاصابة الفايروسية منذ البداية لكون اغلب الاصابات تكون بدون اعراض مرضية او باعراض خفيفة.المواد وطرائق العمل : شملت الدراسة الوبائية 1159عينة لمرضى الثلاسيميا الذين يراجعون مركز الثلاسيميا في الرصافة، والمجموعة الثانية 140915 عينة اخذت لمتبرعي الدم في المركز الوطني لنقل الدم اعتمدت من السجلات. وتم اجراء الفحوص الفايروسية (HCV,HBV,HIV) لهذه المجاميع، واجريت الفحوص الفايروسية التشخيصية الاخرى على مرضى الثلاسيميا، فضلا عن اجراء الفحوص المناعية، فحوص الدم، والفحوص الكيميوحيوية.النتائج : افرزت نتائج مرضى الثلاسيميا عن نسبة 24.76% (70عدد الذكور و110 عدد الاناث) موجبة لفحص anti - HCV، ونسبة 0.77% (7 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لفحص HBsAg، وبنسبة 0.34% (2 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لكلا الفحصين (علما ان جميع المرضى بدون علاج الانترفيرون) مقارنة مع متبرعي الدم بنسبة 0.4% لـanti - HCV و0.97% لـHBsAg،علما ان جميع نتائج فحص HIV كانت سالبة لمرضى الثلاسيميا ومتبرعي الدم، هذا بالنسبة للدراسة الوبائية. اظهرت الدراسة التحليلية المختبرية ان نسبة الاصابة بفايروس التهاب الكبد HCV اعلى في الذكور بنسبة 27.48% مقارنة مع الاناث بنسبة 21.35% بوجود فرق ذو دلالة احصائية معنوية لارتفاع نسبة الذكور عن الاناث، فيما لوحظ ان النسبة هي ذاتها 0.3% لذكور واناث مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ولوحظ ارتفاع الاصابة مع ازدياد العمر فاعلى نسبة للاصابة بـ HCV 41.5% هي للاعمار ما بين 21 - 30سنة وللمصابين بـHBV بنسبة 1.7% للاعمار ما بين 1 - 11سنة. ولوحظ ارتفاع نسبة الاصابة بـ HCV بين الاكراد بنسبة 85.7%. اما بالنسبة الى HBV فقد لوحظ ان النسبة هي 5.7% بين الاكراد، اما في العرق العربي فقد لوحظت نسبة HCV 22.83%، وHBV 0.63% وفي الكلدان لوحظ ان نسبة الاصابة بـHCV 20%. اجري فحصPCR على بعض مرضى الثلاسيميا واظهرت الدراسة ان 50% من النتائج موجبة، وباجراء الكشف عن النوع الجيني لفايروس HCV بطريقة RFLP تم الحصول على انماط جينية مختلفة تضمنت 3b,4,6,3a,2b,1b واجريت دراسة مناعية على المرضى الموجبين لفحص PCR، وكشفت النتائج ان 18% من اولئك المرضى قد ابدوا تفاعلات موجبة لاضداد النواة واضداد العضلات الملساء في حين لم يظهر اي نتيجة موجبة لاضداد الدنا، اضداد الميتوكوندريا واضداد الشحوم المفسفرة. اجري الترحيل الكهربائي لبروتينات المصل وتبين وجود ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لبروتين الكلوبيولين مقارنة بالالبومين، بارتفاع معدل بروتين كاما وانخفاض معدل بروتين الالبومين لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص HCV - PCR.اجري على بعض مرضى الثلاسيميا فحوصات عمل الكبد ولوحظ ارتفاع معدل TSB في مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فضلا عن ارتفاع معدل ALTفي المرضى الموجبين لفحص HBsAg عن المرضى الموجبين لفحص anti - HCV، كذلك لوحظ ارتفاع معدل AST لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فيما لوحظ ان معدل انزيم الفوسفاتيز القاعدي هو ضمن الحد الطبيعي لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg، وتم اختيار مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين بـ HCV,HBV واجريت عليهم عدد من الفحوص الكيميوحيوية لمستوى (البروتين الكلي، الالبومين، الكلوبيولين، اليوريا، الكرياتنين، حامض اليورك، البوتاسيوم، الفسفور غير العضوي، الكالسيوم، النحاس، الكلسترول والسكر) في الدم، ولم يلاحظ اي دلالة احصائية معنوية لهذه الاختبارات، عدا اختبار الكولسترول حيث لوحظ انخفاض معدل الكولسترول في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV الى 112.7mmol/L، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـHBV بمعدل mmol\L93.69 كما لوحظ وجود انخفاض ذو دلالة احصائية معنوية بين مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV,HBV مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV، كذلك لوحظ وجود دلالة احصائية معنوية لانخفاض معدل حامض اليورك لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV,HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا غير المصابين، ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى النحاس في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين مقارنة مع المصابين بـHBV. ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى السكر في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة بمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV وتبين وجود فرق معنوي لارتفاع معدل الفسفور غير العضوي لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين بـHCV,HBV مقارنة بالمصابين بـHBV. اجريت الفحوص المناعية على مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين وتضمنت الدراسة المناعية الكشف عن مستويات الكلوبيولينات المناعية في الدم ومكونات المتممة C3,C4فضلا عن الكشف عن اضداد الذات، ولوحظ ارتفاع نسب اضداد الذات لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غيرهم من مجاميعمرضى الثلاسيميا وتبين ارتفاع نسبة اضداد المايتوكوندريا (43.4%)، اضداد الهستون (40.9%)، اضداد العضلات الملساء (17%)، الاضداد النووية (17%)،اضداد شحم القلب (11.6%)، اضداد الشحوم المفسفرة (17%)، اضداد الدنا المزدوج الشريط (31.8%)، اضداد بروتينات النواة A - Jo - 1 (2.27%)، SS - B (4.5%)، A - Scl (3.4%) في حين ان اضداد الذات من نوع A - RNP/Sm,SS - A,A - Sm,AC - B لم يلاحظ اي نتيجة موجبة لها. اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد تم الحصول على نسبة (15.38%) لكل من اضداد الهستون، اضداد شحم القلب، اضداد الشحوم المفسفرة فيما كانت نسبة اضداد الميتوكوندريا (38.46%). كما لوحظ ارتفاع نسبة المصابين بالعامل الرثوي والبروتين الفعال في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بنسبة 46%، 68% على التوالي مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV بنسبة 38.4% لكل من RF,CRP. وتبين وجود فرق معنوي ذو دلالة احصائية لارتفاع الاصابة باضداد الذات ضد الهستون في الاناث مقارنة مع الذكور وارتفاع الذكور عن الاناث في اضداد المايتوكوندريا في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV. كذلك لوحظ ارتفاع بعض الكلوبيولينات المناعية في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بمستوى 1789 mg/dl للـIgG، ولوحظ مستوى 305.8 mg/dl للـ IgA فيما كان المستوى 203.3 mg/dl للـIgM، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV لوحظ ارتفاع مستوى IgG الى mg/dl1823.6، اما مستوى IgM وIgA فقد كان بمستوى 229.6 mg/dl، 278.8mg/dl بالتعاقب، وفي بروتينات المتممة C3,C4 لوحظ انخفاض مستوى C3 الى 82.6mg/dl فيما كان مستوى C4 23.7mg/dl وهو ضمن الحد الطبيعي الادنى في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV، اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد لوحظ ان مستوى بروتينات المتممة C3 اقل من المستوى الطبيعي 78.1 mg/dl فيما كان المستوى 20.3mg/dl الى C4.في اختبارات امراض الدم تم الحصول على دلالة احصائية معنوية لارتفاع معدل PT لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غير المصابين ومرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV، كما لوحظ انخفاض معدل تعداد كريات الدم العدلة لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. ولوحظ انخفاض معدل تعداد الصفائح الدموية لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. | Viral Hepatitis characterized by its epidemic ability to infect many people. Viral hepatitis called to many hepatic viral infection that had been classified into A,B,C,D,E,F,G. Hepatitis C infection considered a big problem related to the inability to diagnose the viral infection from the beginning because of mild or no symptoms. Material & Methods : - The epidemic study contains two groups, first group 1159 sample of thalassemic patients in Al - Rusafa Center For Thalassemic Patients. Second group 140915 samples taken from blood donors in the national blood bank from the records.Viral tests had been done for these groups (HCV,HBV,HIV). Diagnostic tests done on thalassemic patients like immunological, hematological, biochemical tests.Results : - For the epidemic study the result shows a 24.76% for thalassemic patients infected with HCV , 0.77% for thalassemic patients infected with HBV, & 0.34% for thalassemic patients infected with both HCV,HBV. 74.89% for non infected thalassemic patients compared with blood donors of 0.4% for HCV infection, and 0.97% for HBV infection.Studies for investigating laboratory tests done on thalassemic patients after confirming HCV,HBV infections through doing diagnostic viral tests.HCV Viral results shows higher percentage of male to female by 27.48% for male, 21.35% for female respectively and it was seen that the same rate of 0.3% for male and female infected with HBV. Higher infection rate with age increasing of 41.5% for age group 21 - 30 years of HCV thalassemic patients, and 1.7% for age group 1 - 11 years for HBV thalassemic patients. Higher HCV infection rate noticed for Kurdish people 85.7% , Christians 20%, and in Al - Sabeaa 40%.while the percentage of HBV in Kurdish people 5.7%, and no one infected with HBV infection in Christian and Al - Sabeaa people. For Arabic patients the percentage of HCV infection is 22.83% and 0.63% for HBV infection.HCV - PCR Thalassemic patient results show that 50% of results are positive and 50% are negative (11 out of 22 patients), doing genotyping of HCV by RFLP test shows different subtypes of HCV (3b, 2b, 1b, 3a, 4, 6).Immunological study done on PCR positive patients’ shows antibodies percentage of 18% to ASMA, ANA and 0% for each of AMA, ADNA, APL. Electroforeces done for protein of these patients show significant statistical increasing values of protein globulin in comparison to albumin decreasing.For liver function tests, applied on thalassemic patients it had been noticed that there is a significant statistical increasing values in the thalassemic patients infected with HCV as compared to other thalassemic patients not infected with HCV. Increasing the level of ALT in HBV patients compression with HCV patients, increasing the level of AST of HBV, HCV thalassemic patients where the level of alkaline phosphates in the upper limit of normal value of HCV, HBV thalassemic patients.No significant statistical values where noticed for the biochemical tests applied on some thalassemic patients infected with HCV, HBV infection except cholesterol where it had been noticed a decrease of level 112.7 mmol/L in thalassemic patients infected with HCV. 93.69 mmol/L in HBV infection patients, a significant statistical decrease value between HBV , HCV thalassemic patients in comparison with non infected patients.There is a decrease level of uric acid for the thalassemic patients infected with HCV compared with non infected patients, significant increase of copper level in the blood of HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients and not infected thalassemic patients.Significant statistical value increment for the random blood sugar in HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients.Regarding immunological study, it had been noticed that there is an increasing in autoantibody with significant statistical value for thalassemic patients infected with HCV compared with other thalassemic groups. It had been seen that there is an increasing in the mitochondrial antibodies (AMA - M2) 43.4%, antihiston antibodies (AHA)40.9%, antismooth muscle antibodies (ASMA)17%, antinuclear antibodies (ANA)17%, anticardiolipin antibody antibodies (ACL)11.6%, antiphosphotidel serin antibodies (APL - S)17%, antidouble stranded DNA antibodies (A - ds - DNA) 31.8%, other antinuclear proteins like A - Jo1 2.27%, SS - B 4.5%, A - ScL 3.4%, where the other auto antibodies A - RNP/Sn, SS - A, A - Sm, anticentromer B antibodies (A - C - B) show zero percent for each one of them while in the HBV thalassemic patients a 15.38% was obtained for each APL - S , ACL & AHA.. A 38.46% for AMA - M2.There is an increase in rheumatoid factor (RF), CRP in thalassemic patients infected with HCV compared with non infected thalassemic patients with a ratio of 46%, 68% respectively. In HBV thalassemic patients 38.4% for each RF and CRP. Significant statistical difference for increasing incidence with auto antibodies in the females compared with males of autoantibodies type AHA, AMA - M2 in thalassemic patients infected with HCV noticed.We noticed an increasing in the immunoglobulines IgG 1789 mg/dl, 305.8mg/dl for IgA in thalassemic patients infected with HCV while IgM in the upper normal range 302.3 mg/dl, complimentary portions C3, C4 shows a decrease level in C3 82.6 mg/dl, and the level of C4 is 23.4mg/dl, which is regard as the lower normal limit. While in the HBV thalassemic patients we obtain a level 1515.3mg/dl for IgG, 204.8 mg/dl for IgM and for IgA 233.3mg/dl.In the hematological tests of thalassemic patients infected with HCV shows significant increment in the level of PT test was obtained as compared with other groups of thalassemic patients. Percentage decrement in neutrophil of WBC cells in HCV thalassemic patients as compared with HBV and non infected thalassemic patients. There is a decrement in platelets count in HBV thalassemic patients compared with HCV and non infected thalassemic patients.

انتاج وتوصيف Protease من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من بعض الحالات السريرية وعلاقته ببعض المضادات الحيوية == Production and Characterization of Protease from Pseudomonas aeruginosa Isolated from Some Clinical Cases and its Relation with some Antibiotic Agent

Author name: رنا مجاهد عبد الله الشويخ
Supervisor name: سمير فتح الله سمعان | سعود رشيد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (170) عينة من حالات مرضية مختلفة التي تضمنت (35) مسحة من الجروح و(47) مسحة من الحروق و(25) مسحة من حالات التهابات الاذن الوسطى فضلا عن عينات الادرار التي تضمنت (63) عينة وجمعت العينات من مستشفى الكاظمية التعليمي للمدة من 1 - 5 - 2005 ولغاية 1 - 8 - 2005 .  تم تشخيص (50) عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa اذ زرعت على اوساط اغنائية وتفريقية لغرض العزل الاولي ثم اخضعت المزارع البكتيرية للفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها ، ثم استخدمت عدة الفحصapi20E للتشخيص النهائي لهذه العزلات ، اذ تضمنت (8)عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa (16%) من حالات التهاب الجروح ، (16) عزلة (32%) من التهابات الحروق ، (20) عزلة (40%) من حالات التهاب المجاري البولية و(6) عزلات (12%) من حالات التهاب الاذن الوسطى .  اختبرت حساسية بكتريا Pseudomonas aeruginosa ضد (20) مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية . اذ اظهرت بكتريا Pseudomonas aeruginosa نسبة المقاومة(100%) تجاه مضادات الامبسلين ، الاموكسسلين ، الاموكسسلين / حامض كلافيولونك ،الكلوكساسلين والسيفازولين . بينما بلغت نسبة المقاومة لمضادات السيفاكسيم ، الكاربنسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم (98%) ، (84%) ، (80%) و(78%) على التوالي. وبلغت نسبة المقاومة لمضادات الجنتاميسين ، التوبرامايسين ، الببراسيلين ، النورفلوكساسين ، الاميكاسين والسبروفلوكساسين (52%)، (26%) ، (24%) ،(14%) ،(6%) و(4% )على التوالي . في حين اظهرت جميع العزلات لبكتريا Pseudomonas aeruginosa حساسية عالية (100%) تجاه مضادات الازترونام ، امبينيم والسيفابيم البيفلوكساسين والافلوكساسين .  قدرت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs ) للمضادات الحيوية وكانت اعلى نسبة مقاومة لمضادات الاموكسسلين ، السيفاتكسيم والسفتازديم . اما نسبة المقاومة لمضادات الامينوكلايكوسايد فكانت تتراوح (4 - 128) مايكرو غرام / مل للتوبرامايسين ، (4 - 256) مايكرو غرام / مل للجنتاميسين اما لمضاد الاميكاسين فكانت (4 - 128) مايكرو غرام / مل. في حين اظهرت قيم MIC حساسية عالية (100%) لمضادي السبروفلوكساسين والسيفابيم.  اظهرت نتائج خلط مضادات السبروفلوكساسين مع كل من الجنتاميسين والسيفتازديم والببراسيلين نتائج مهمة في تخفيف التراكيز المثبطة الدنيا لكلا المضادين المستخدمين لوحدهما ضد هذه البكتريا . كذلك اظهرت نتائج خلط مضادي التوبرامايسين مع السيفتازديم فعالية عالية عند خلطهما معا واستعمالهما ضد بكتريا Pseudomonas aeruginosa . اظهرت (86%) من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa قابليتها على انتاج انزيم البروتييز . اظهرت النتائج تاثر انزيم البروتييز الخام ببعض المضادات الحيوية التي ادت الى انخفاض في فعالية الانزيم عند زيادة تركيز هذه المضادات .  كانت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتييز عند استخدام وسط لوريا عند رقم هيدروجيني(8) ولمدة(48) ساعة من الحضن بدرجة حرارة(35) م º . نقي انزيم البروتييز من العزلة Pseudomonas aeruginosa PsaW2 باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الايوني DEAE - celluloseوكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100. قدر الوزن الجزيئي للانزيم المنقى بطريقة الترشيح الهلامي بعمود هلام سيفادكس G - 100 وكان (21379 ) دالتون ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية البروتييز (35) م º والرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم كانت (8) . اوضحت نتائج تاثير بعض المثبطات والعوامل المختزلة والكلابية في فعالية الانزيم ، ان فعالية الانزيم قد ازدادت عند معاملته بايونات Ca++ وZn ++ مما يدل انها تلعب دورا في تحفيز وثبات الانزيم ، ولم تثبط فاعلية الانزيم بوجود العوامل المختزلة مثل السستين ، بينما تثبط فعالية الانزيم بوجود العوامل الكلابية EDTA .  اظهر انزيم البروتييز المنقى من بكتريا Pseudomonas aeruginosa فعالية عالية عند خلطه مع مضادي الفانكومايسين والسيفازولين في علاج التهابات العيون في الارانب والمتسبب عنها بكتريا Staphylococcus aureus . |  One - hundred and seventy swab samples were collected from different cases including (35) wound and (47) burn infection , (25) otitis media and (63) samples from urinary tract infections from Al - Kadhymia Teaching Hospital in Baghdad city . The study period was from 1 - 5 - 2005 to 1 - 8 - 2005 .  Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified using different microscopical , cultural characteristics and biochemical tests . Final identification of bacteria were performed by using api20E system. The isolates were 8(16%) from burn infections , 20(40%) isolates from urinary tract infections , 16(32%) isolates from burn infections and 6(12%) isolates from otitis media . The sensitivity of Pseudomonas aeruginosa isolates was been tested against (20) antibiotics showed isolates version resistance with different percentage against antibiotics .Pseudomonas aeruginosa exhibited (100%) resistance to Ampicillin , Amoxycillin , Amoxycillin / clavulanic acid, cloxacillin and cefazolin .While percentages of resistance to cefixime , carbencillin, cefotaxime and ceftazidime were (98%) ,(84%) ,(80%) and ( 78%) respectively .Resistance percentages to Gentamicin ,Tobramycin , Piperacillin , Norfloxacillin , Amikacin and Ciprofloxacine were (52%),(26%),(24%),(16%),(14%)and(4%) respectively. All isolates of Pseudomonas aeruginosa were highly sensitive (100%) to Aztronam , imipenem , cefepime , P - ofloxacin and ofloxacin .  Minimum inhibitory concentrations of Amoxycillin , cefotaxime , ceftazidime and piperacillin showed higher percentage of resistance . While resistance to aminoglycoside antibiotics including Tobramycin was (4 - 128) μ g / ml , Gentamicin was (4 - 256) μ g / ml and Amikacin was (4 - 128) μ g / ml . On the other hand , all bacterial isolates were susceptible (100%) to Ciprofloxacine and Cefepime .  Combinations of Ciprofloxacine with Gentamicin , ceftazidime and piperacillin gave interesting results against the local bacterial isolates in reducing their MIC values . Tobramycin and ceftazidime gave an obvious decrease in MIC values after combination of these drugs and used against Pseudomonas aeruginosa . A (86%) of the isolates of Pseudomonas aeruginosa have ability to produce protease enzyme . Enzyme activity was affected by some antibiotics . This activity was reduced with increasing the concentrations of these antibiotics . The optimum conditions for protease production were in LB medium with a pH (8) after (48) hrs of incubation at (35) C .  Purification of the protease was done using ion exchange chromatography DEAE - cellulose and gel filtration with sephadex G - 100 .  Molecular weight of the purified protease was measured by sephadex G - 100 and it was found to be around (21379 ) Dalton . The optimum temperature of enzyme activity was (35) C . However , the pH (8) was for activity and stability of this enzyme .  Zn++ and Ca++ ions may play a role in the enhancement and stability of the enzyme . Enzyme activity was not inhibited in the presence of reducing agent such as Cysteine , but it was inhibited in the presence of EDTA .  Pseudomonas aeruginosa purified enzyme shows a high activity when combined with Vancomycin and cefazoline and used for the treatment of the eye infection in rabbits caused by Staphylococcus aureus .

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

Author name: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
Supervisor name: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

Author name: زاكروس كمال احمد البرزنجي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

Author name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.
1 ... 13 14 15 16 17 ... 28