عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 16 من أصل 141

دراســة المجاميع النسليـــــه وعوامـــل الالتـــصاق لبكتريا الاشريشيا القولونيه المعزولـه من مهبل النـساء في محافظة بابل == A Study of Phylogeny Groups and some Adhesins of Esherichia coli Isolated from Women Vagina in Babylon province

اسم المؤلف: شهد سعد محمد
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | ملال محمد عبد الرضا الجبوري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمع ( 135) مسحات مهبلية من النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل المراجعات لمستشفى الامومة والاطفال في محافظة بابل للفترة تتراوح من تشرين الثاني 2016 الى نيسان 2017 , تتراوح اعمارهم من 18 الى 40 سنة . فقط 20(14.8%) من المسحات المهبلية اظهرت نتائج موجبة لبكتريا E.coli . شخصت عزلات البكتريا بواسطه الاوساط الزراعية واختبارات الكيموحيويه. الكشف الجزيئي لمجاميع النشوء بواسطه استعمال ثلاثة جينات TspE4.C2 & yjaA, chuA والنتائج اظهرت 14 (70%)عزلة من E.coli تعود لمجموعة B2 و5 (25%) عزلات تعود لمجموعة A وعزلة واحدة (5%) تعود لمجموعة B1 . ولم تظهر هذه الدراسة اي عزلة تعود لمجموعة D. صنفت اغلب عزلات E.coli التي تعود لمجموعة B2 ضمن سلالات خارج الامعاء وبقية العزلات تكون متعايشة . شملت الدراسة ايضا اختبار وجود جينات ال (pap) ل E.coli المهبلية المعزولة حيث تم تحديد بواسطه تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل (PCR) وجود جينات عوامل الالتصاق وهي papGI وpapGII وpapGIII وpapC , حيث وجدت الدراسة ان جين papGI غير موجود في جميع عزلات بكتريا E.coli و9 ( 45%) عزلات بكتيرية تحتوي على جين papGII و6 (30%)عزلات تحتوي على جين papGIII و13 (65%) عزلة بكتيرية تحتوي على جين papC . الى جانب ذلك E.coliالمهبلية فحصت لغرض وجود جينات الالتصاق معقد (sfa/foc) حيث لاحظت ان 12(60%) عزلة تحتوي على هذا الجين (sfa/foc) , وتم ايضا تشخيص وجود جين الضراوة (iucC) بواسطه علامات متخصصه حيث وجد 17 (85%) عزلة تحتوي على هذا الجين. وفقا لمجموعة النشوء، ويتم دراسة حساسية المضادات الحيوية وفقا لذلك. وقد لوحظ ان معظم العزلات تنتمي الى المجموعة 2B، كانت مقاومة لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسه، ولكنها حساسة ل Meropenemو Nitrofurantoin والى حد اقل الى Chloramphencol . وعلاوة على ذلك، وجد ان جميع العزلات المنتمية الى المجموعة A لديها مقاومة لمعظم المضادات الحيوية لكنها حساسة ل Meropenem , Chloramphencol وNitrofurantoin. وتم في هذه الدراسة ايضا اجراء اختبار انتاج الاندول من قبل العزلات البكتيرية وتاثيره على تجمع بكتريا E.coli حيث اظهرت جميع العزلات نتيجة موجبة لهذا الاختبار | A total of (135) vaginal swabs were obtained from women suffering from vaginitis who submitted to Hospital of Maternity and Children in Babylon city in a period rang from (October 2016 to April 2017), at the age ranging from 18 to 40 years. . Only 20 (14.8%) high vaginal swabs showed positive results of E.coli. The bacterial isolates were diagnosed by cultural and biochemical tests. Molecular detection of phylogeny groups by using three genetic marker chuA, yjaA & TspE4.C2,and the results showed that 14 isolates (70%) of E.coli belongs to group B2, 5 isolates (25%) belong to group A and 1 isolate (5%)belongs to group B1 whereas no isolate belongs to group D. Most E.coli belong to group B2 are classified within extra intestinal strains and the other isolates are commensal. . On the other hand, the isolated vaginal E.coli were examind for the presence of pyelonephritis associated pili (pap) type G where three subclasses (I, II, III) and type C are detected by PCR .It was found that papGI gene was not present in all isolates, papGII gene was present in 9 isolates (45%), papGIII gene was present in 6 isolates (30%) and papC gene was present in 13 isolates (65%). Besides, vaginal E.coli were examind for the presence of the adhesion genes (sfa/foc) complex. It was noticed that this gene was present in 12 isolates (60%). . Iron uptake chelate C (iucC) gene, is also investigated by using specific marker; it was found that iucC gene was present in most E.coli 17 isolates (85%). According the phylogeny group, Antibiogram profile is done accordingly. It was observed that most isolates belong to the group B2, were resistant to most antibiotics understudy, but they are sensitive to Nitrofurantion and Meropenem and to a less extent to Chloramphencol. Moreover, All isolates belonging to group A were found to have a resistant to most antibiotics but they are sensitive to Meropenem, Chloramphencol and Nitrofurantion. . Finally, the in vitro the effect of indole production on the aggregation of bacteria is also investigated. The results showed that all isolates gave positive results for this experiment

الكشف عن جينات السموم الفائقة في المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من حالات التسمم الغذائي المحلية == Detection of Superantigenic Toxin Genes in Staphylococcus aureus Isolated from Local Cases of Food Poisoning

اسم المؤلف: بارق عبد اللطيف صبر العجيلي
اسم المشرف: ميساء صالح مهدي الشكري | حسن سالم الجميلي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت في هذه الدراسة 100عينة من عينات الخروج لمرضى راجعوا مستشفى الحلة التعليمي ومدينه مرجان الطبية خلال الفترة من تموز 2016 الى ايلول 2016م. ثم زرعت العينات التي تم الحصول عليها على اوساط انتقائية واجريت عليها اختبارات بايوكيميائية وبكتريولوجية من اجل التشخيص. من مجموع (100) عينة تم الحصول على20 (20%) عزلة مكورات عنقودية الذهبيه , وشخص تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الانبوب (TM) وطريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الانبوب كانت جميع عزلات المكورات العنقودية الذهبية منتجة للاغشية الحيوية بينما في طريقة الطبق الزرعي النسيجي وجد ان (15%)من العزلات منتجة للاغشية الحيوية من النوع القوي و(50%) من نوع الغشيه الحيوية المتوسط وكذلك (35%)اظهر تضعيفه او غير مكونه للاغشيه الحيوية حسب قيم الامتصاصية عند كثافته نوعيه OD at 570nm .تم دراسة بعض عوامل الضراوه لجميع عزلات المكورات العنقودية الذهبية مثل قابلية التحلل على وسط الدم والنتائج بينت كل عزلات المكورات (20) (100%) لها قابلية لانتاج تحلل كامل (بيتا) وكذلك تم اختبار انتاج انزيم الفوسفولايبيز سي النتيجه بينت (70%)من عزلات المكورات العنقودية الذهبيه كانت منتجه للانزيم و(30%)من العزلات كانت غير منتجة لانزيم الفوسفولايبيز سي. تم التحري عن حساسية العزلات للمضادات الحياتية باستخدام طريقة انشار القرص. وقد وجد ان هذه العزلات كانت مقاومة لاكثر من نوع من المضادات الحيوية.فقد بينت النتائج ان (85%) من عزلات المكورات العنقودية الذهبية مقاومه للسفترياكسون وبينت نسبه مقاومه (75%)للاميبينيم بينما العزلات كانت مقاومه للتيترا سايكلين والاريثرومايسيين كانت (65%) كذلك مقاومه لكل من اوكساسيليين والاميكاسيين عند (25%)و(35%)على التوالي بينما بينت مقاومه لكل من جينتا ماسيين والكلورومفنيكول عند (15%) لكل منها تفاعل البلمرة المتسلسل قد استخدم للكشف عن جينات الضراوه التي تشفر للسموم المعوية وسموم الاصابات االجلديه وسموم متلازمه الصدمه وكذلك انزيم المخثر لعزلات المكورات العنقوديه الذهبيه التي بينت نتائج موجيه لكل من جينات sea,seb, agr, seg,sei,she,tst,eta,etb,coa,بنسبه وعدد كانت 8 (40%) ,7(35%) و19(95%),13(65%),20 (100%) ,1(5%) و(100%),9(45%),14(70%), 20(100%) على الترتيب.تفاعل البلمره المتسلسل لجين coa من كل العزلات انتج انواع مختلفةاعتمادا على الاحجام بمدى من 500 - 900 زوج قاعدي التي ميزت كما يلي النوع الاول coa500 زوج قاعدي والنوع الثاني 600 زوج قاعده ,النوع الثالث 700 زوج قاعده,النوع الرابع 800 زوج قاعده والنوع الخامس 900 زوج قاعده وكان النوع الثالث النوع الاكثر شيوعا في العزلات .تنويع جين coa على اساس تفاعل البلمره المتسلسل ل للتنوع الشكلي لطول القطع المتقطعة coa RFLP بواسطة استخدام الانزيم القاطعAuI I لتقطيع ناتج التضخيم لجين coa وانتجت مختلف اشكال التقطيع بواسطة انزيم التقطيع متباينة من80 - 700 زوج قاعدة مع 7 انواع من coa RFLP النوع الاول بين بنسبه (10%),النوع الثاني (5%),النوع الثالث(15%),النوع الرابع (20%),النوع الخامس(20%),النوع السادس (25%) والنوع السابع (5%).النوع السادس كان الاكثر شيوعا وكان بنسبه (25%)من كل العزلات.والنتائج قد بينت بعض العزلات بنسبه (20%)لم تقطع بواسطة الانزيم القاطع Alu I.النتائج بينت تاثير سموم المكورات العنقودية المنقى جزئيا على خلايا سرطان الجلد B6 كنموذج لخلايا سرطان جلد الانسان بالاضافه لذلك فقد بينت ان سموم المكورات العنقودية لها فعل مثبط لهذه الخلايا . | A total of 100 stool specimens were collected from patients who admitted to Al Hilla Teaching Hospital ,and Merjan medical city during a period extending from July 2016 to September 2016. The .Then the specimens cultured in selective media and identified by using biochemical and bacteriological tests.Only (20)isolate of Staphylococcus aureus isolates were recovered. Biofilm formation was detected by tube method and tissue culture plate technique, in tube method(TM)the results showed that all S. aureus isolates (100%)were biofilm producers as contrast to tissue culture plate (TCP) the results showed that (15%) Staphylococcus aureus isolates were produces strong biofilm and (50%) moderate biofilm also (35%) were weak or non biofilm forming according to the absorbance at OD 570nm. Some virulence factors of all Staphylococcus aureus isolates were studied as hemolytic activity on blood agar , and the results showed that all Staphylococcal aureus isolates have the ability for producing beta hemolysis ,and Staphylococcal Phospholipase C production were tested and the result showed that (70%) Staphylococcus aureus of isolates were able to produce Phospholipase enzyme extracellularly. Antibiotic susceptibility to a variety of antibiotics has been investigated by using disk diffusion method. It has been found that these isolates showed resistant to more than one antibiotic. It has been found that S.aureus isolates were resistant to Ceftiaxone(85%) and showed resistance (75%) to imipenem. whereas the isolates resistance to tetracycline and erythromycin was (65%),also the resistance for each, oxacillin and amikacin, at (25%), (35%), respectively. While most isolate were sensitive togentamycin and chloramphenicol was (15%) for each. Polymerase chain reaction (PCR) used for detection of virulence genes that coding to enterotoxin ,exofoliative toxin ,toxic shock syndrome toxin and coagulase enzyme of S. aureus isolates, it was found that were positive results were showed for, sea, seb , agr, seg sei ,seh ,tst, eta, etb ,coa with number and percentage,8(40%),7(35%),19(95%), 13(65%) 20(100%), 1(5%), 20(100%), 9(45%), 14(70%) and 20(100%), respectively.PCR amplification of coa gene from 20 isolates product different types based on size range from (500 - 900 ) bp were recognized as follows coa types I (500bP) ,coa type II(600 bp),coa type III(700 bP),coa types IV (800 bp),and coa type V (900bp). and were found at(500bp 5%,600bp 30%700bp50%,800bp5% , 900bp10%) The majority of the isolate exhibit coa type(III) . PCR - RFLPTyping of coagulase (coa) gene and polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism by using AulI restriction enzyme digestion of the PCR coa product generated different Aul I restriction pattern with the number of fragments varying from one to three and with size of the fragment varied from 80 - 700bp with 7 pattern of coa RFLP, pattern type I showed (10%),type II(5%),type III (15%),type IV(20%),type IX(20%),type X(25%),type XI(5%) typeX was the most common and it revered ( 25 %)of all isolate. The result in this study also rater that some strain ( 20% )were not digested by Aul I enzyme. The results show effect of partially purified of S.aureus toxin on B16 melanoma as a model for human skin cancers. It has been revealed that S.aureus entero toxin have an inhibiter effect on these cells.

دراسة التنميط الوراثي ل,HLA فيتامين دي 3 وبعض العوامل المناعية لمرض التدرن الرئوي في مدينة الحلة == Study of HLA : DRB1, Vitamin D3 and Some Immunological Factors in Pulmonary Tuberculosis in Hilla City

اسم المؤلف: اشواق مخيف سلمان الجبوري
اسم المشرف: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هادي محمد علي الموسوي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم خلال الدراسة جمع عينات الدم من 50 مريضا بالتدرن الرئوي من المراجعات الى العيادة الاستشارية للامراض الصدرية في الحلة - محافظة بابل خلال الفترة مابين شهر شباط 2016 الى شباط 2017. ومن بين مرضى التدرن الرئوي، كان هناك 27 ذكور و23 اناث، وعمر المرضى يتراوح بين 12 - 80 عاما. خمسون شخصا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة لم يكن لديهم تاريخ من مرض التدرن الرئوي. جميع المرضى الذين يعانون من مرض السكري، السرطان، الحساسية والنساء الحوامل استبعدوا من الدراسة.تم استخدام SSO)) في تحديد مورث معقد التوافق النسجيDRB1 .HLA - تم قياس السايتوكينات وفيتامين D3باستخدام تقنية الاليزا.وفقا لنتائج هذه الدراسة، كان الذكور 54٪ بينما الاناث كان 46٪ من مرضى التدرن الرئوي. وكانت الفئات العمرية بين (12 - 35) سنة الفئة العمرية الاكثر ضعفا مع السل الرئوي سجلت (50٪). كانت مدة الاصابة بين (1 - 3) اشهر هي السائدة بين مرضى السل الرئوي والمرضى الذين دون علاج كانت سائدة بين مرضى السل الرئوي. وكان التوزيع الجغرافي لمرضى التدرن الرئوي اعلى بنسبة 62 % في المناطق الريفية من 38 % في المناطق الحضرية.وقد درس التوزيع الوراثي لمستضد كريات الدم البيضاء البشرية HLA - DRB1 في 50 مريضا مصابا بالتدرن الرئوي و50 من مجموعة السيطرة. كان HLA - DRB1 * 13 زيادة معنوية في مرضى التدرن الرئوي 48٪ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة 16٪ في حين HLA - DRB1 * 15 كان زيادة معنوية في مجموعة السيطرة 24٪ بالمقارنة مع مرضى التدرن الرئوي 6٪.وجد مورث معقد التوافق النسجي HLA - DRB1alleles اكثر شيوعا في الاناث 77٪ من الذكور 23٪ من العدد الاجمالي للمرضى. ايضا، كان HLA - DRB1 * 13 اكثر شيوعا في الاناث 75٪ من الذكور 25٪ من مرضى التدرن الرئوي في حين كان HLA - DRB1 * 15 شائعا في الاناث 100٪ ولم يظهر في الذكور.اظهر متوسط تركيز مصل الدم IL - 10 ان هناك زيادة معنوية (p˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (4.024 و1.049) بغ / مل على التوالي. كما اظهر متوسط تركيز مصل الدم من IL - 12 وجود زيادة معنوية (p ˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (51.563 و13.514) بغ / مل على التوالي.في حين لم يظهر متوسط تركيز مصل IFN - γ زيادة معنوية (p˃0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (36.505 و25.019) بغ / مل. اظهر متوسط تركيز مصل الدم ل VD3 انخفاضا معنويا (p ˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (18.186 و29.321) نغ / مل.

قيمة العلامات المصلية في فحص وتشخيص التطور في فحص وتشخيص التطور لسرطان القولون == The Value of Serological Markers (CA19 - 9 and CCSA - 4) in Screening and Prognosis of Colon Cancer

اسم المؤلف: عذراء احمد محمد يعقوب
اسم المشرف: هيفاء سلمان الحديثي | عقيل شاكر محمود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Colonic cancer is a very common disease world - wide being fourth most common cancer characterized by abnormal proliferation of the epithelium of colon at beginning then taking full colon wall thickness then to surrounding lymph nodes and tissues and finally metastasis. It is one of most complicated diseases with debilitating symptoms which becomes more severe, prominent and specific with advancing stage with high percent of fatality and relatively short survival if diagnosed late or if left untreated.Therefore, finding an easy, non - invasive and readily available means (marker) of screening and diagnosing colonic cancer would be of great value particularly if the same biomarker can be used for diagnosis, screening, prognosis and monitoring the efficacy of different treatment modalities.Aims of study : - To investigate the efficacy and validity of serum Cancer Antigen 19 - 9 (CA19 - 9) and Colon Cancer Specific Antigen - 4 (CCSA - 4) levels in the screening and prognosis of colon cancer and their validity for this.Patients and methods : - This study was applied on 35 patients (17 females & 18 males) with colon cancer with ages ranged 53 - 82 years old ( 6 patients received chemotherapy and 5 of them have undergone surgical removal of the primary tumor and 4 different patients received immunotherapy) with 20 smokers and 4 alcoholic, 35 patients (19 females & 16 males) with benign polyps ages ranged 29 - 56 years old and 16 (7 females & 9 males) negative controls ages ranged 25 - 43 years age. According to DUKE's staging : 6 colon cancer patients were stage A, 12 were stage B, 12 were stage C and 5 were stage D.All individuals in this study (whom attended Baghdad Teaching Hospital and Gastroenterology and Hepatic Diseases Center) were subjected to blood sampling for measuring their serum CA19 - 9 and CCSA - 4 using Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) technique which was done at microbiology unit / university of Baghdad.Results : - The present study has shown that colonic cancer patients were presented at ages between 53 - 82 years of age (mean 68.5±6.4 years of age).Serum levels of CCSA - 4 were significantly elevated in those patients with advancing stages (C & D) compared with stages (A & B) and lower levels found in patients who had surgical removal of tumor or received chemotherapy.Also a positive relation found between CCSA - 4 with alcohol intake and smoking, however, less significant levels and relations found with CA19 - 9.Conclusion : - Serum CCSA - 4 is sensitive and specific indicator for diagnosis, prognosis and screening of colonic cancer.

قيمة العلامة المصلية اختيار مصل رباط محفز التكاثر نوع A في تشخيص سرطان القولون في المرضى العراقيين == The value of serological marker serum A proliferation Inducing Ligand test in the Diagnosis of colon cancer in Iraqi patients

اسم المؤلف: عقيل حاتم محمود
اسم المشرف: سرمد محمد حسين الزيني | عقيل شاكر محمود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Colonic cancer is a very common disease world - wide being fourth most common cancer characterized by abnormal proliferation of the epithelium of colon at beginning then taking full colon wall thickness then to surrounding lymph nodes and tissues and finally metastasis. It is one of most complicated diseases with debilitating symptoms which becomes more severe, prominent and specific with advancing stage with high percent of fatality and relatively short survival if diagnosed late or if left untreated.Therefore, finding an easy, non - invasive and readily available means (marker) of diagnosing colonic cancer would be of great value particularly if the same biomarker can be used for diagnosis, screening, prognosis and monitoring the efficacy of different treatment modalities.Study objectives : -  To investigate the efficacy and validity of serum Carcinoembryonic Antigen (CEA) and serum A Proliferation inducing Ligand (sAPRIL) levels in the diagnosis of colon cancer as individual and as combined tests. Analyze the case - control differences in serum CEA and APRIL.  Evaluate the diagnostic performance of serum CEA and APRIL and their combination in predicting colon cancer and Assess the association between the two markers.  Suggest an optimum cut - off value for these two serum markers. Evaluate the effect of age, gender, tumor stage, alcohol and smoking habits, chemotherapy, surgical excision and immunotherapy on serum CEA and APRIL in cases with colon cancer. Patients and methods : - This study was applied on 35 patients (14 females & 21 males) withcolon cancer with ages ranged 58 - 88 years old (9 patients receivedchemotherapy and all of them have undergone surgical removal of the primarytumor and 4 different patients received immunotherapy which is monoclonalantibody) with 15 smokers and 7 alcoholic, 35 patients (19 females & 16 males)with benign polyps ages ranged 30 - 56 years old and 15 (7 females & 8 males)negative controls ages ranged 25 - 37 years age, samples were collected in theperiod between October 2016 and July 2017.According to DUKE's staging which is determined according histopathology after colonoscopy and few from surgery : 4 colon cancer patients were stage A, 9 were stage B, 12 were stage C and 10 were stage D.All individuals in this study (whom attended Baghdad Teaching Hospital and Gastroenterology and Hepatology teaching hospital) were subjected to blood sampling for measuring their serum CEA and sAPRIL using Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) technique which was done at microbiology unit / university of Baghdad.Results : - The present study has shown that colonic cancer patients were presented at ages between 58 - 88 years of age ( 69 ± 8.2 years of age).Serum levels of CEA & sAPRIL were significantly elevated in those patients with advancing stages (C & D) compared with stages (A & B) and lower levels found in patients who had surgical removal of tumor or received chemotherapy.Also a positive relation found between CEA & sAPRIL from hand with alcohol intake & smoking on the other hand.

التوصيف الجزيئي لبعض محددات الضراوة لبكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من عينات سريرية مختلفة في محافظة بابل == Molecular Characterization of Some Virulence Determinants of Klebsiella pneumoniae Isolated From Different Clinical Samples in Babylon

اسم المؤلف: مسار عامر مرزة العماري
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | ايفاد كريم عبد الشبلي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: A total of 200 samples were collected from different sources of patients that including (sputum , tonsil, sinuses, vagina, urine) and from both sexes during a period from September 2016 to December 2016. Only twenty isolates (10%) were identified as Klebsiella pneumoniae positive according to the cultural characteristics and biochemical tests. Eight (40%) isolates from sputum, 5(25%) isolates from urine, 3(15%) isolates from tonsil, 2(10%) isolates from sinus, and also 2(10%) isolates from vagina. K. pneumoniae in males formed 12 isolates(60%) and 8 isolates(40%) in the females .The age - groups of patients who involved in the study was ranged from one year to thirty years old. The results showed that the mean age of patients was 14.9 years with standard deviation of 10.96. All isolates (100%) were able to produce capsule, siderophore, colonization factor antigen(CFA I/CFAIII) and urease, but none of these isolates were able to produce hemolysin. They have ability to form biofilm and have a strong role in stone formation. Regarding antibiotic susceptibility testing all Klebsiella pneumoniae isolates were resistant to Aztreonam, Ampicillin, Amoxicillin/ clavulanic acid) and penicillin G, whereas sensitive to Gentamycin, Ceftriaxone, and Amikacin. The molecular detection of some virulence genes ( magA gene, kfu gene, and uge gene) was done by PCR technique. And all isolates (100%)were negative mag A. Also, PCR technique displayed that 5 isolates 20(25%) were positive for Kfu gene, while only two isolates 20(10%) were positive for Uge gene. As well, the antibiotic resistance genes bla TEM and bla SHV markers were investigated, 18(90%) isolates positive to bla TEM from them(14) isolates carried on plasmid and (4) isolates carried on chromosomal DNA, while bla SHV gene was found in 17(85%) isolates positive from them (14) isolates carries on plasmid and (3) isolates carried onchromosomal DNA. Moreover, RFLP/PCR analysis explored bla TEM and bla SHV genotyping for Klebsiella pneumoniae isolates in the current study illustrating ESBL contribution in the increment of bacterial resistant to antibiotics.

انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات ESKAPE من مرضى الاطفال في محافظة بابل == Antibiotic Resistances Patterns among ESKAPE group Pathogens Isolated from Pediatric Patients in Babylon Governorate

اسم المؤلف: امل محمد سعيد محمد جواد الموسوي
اسم المشرف: علاء هاني الجراخ | عدنان حنظل الجوذري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة للتحري عن انتشار مجموعة الممرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيويةESKAPE (الاسكيب) لدى مرضى الاطفال في محافظة بابل, العراق تم في بداية الدراسة جمع 191عينات سريرية مختلفة من مرضى الاطفال للفترة من تموز لغاية تشرين الثاني لسنة 2016. تم الحصول على النماذج من مرضى الاطفال بعمر من واحد يوم الى 14 سنة والوافدين لمستشفى التعليمي للولادة والاطفال (بصوره رئيسيه وحدة الخدج المنزلي, وحدة العناية المركزة, الردهات العامة) ومستشفى الحلة التعليمي (بصوره رئيسية وحدة الحروق). شملت النماذج المجموعة خلال الدراسة عينات الدم ,الادرار, سائل النخاع الشوكي, جروح الحروق، وغيرها تم اخذ المعلومات التالية من كل مريض تم ادراجه في الدراسة الحالية : الاسم, العمر, الجنس, العنوان , وزن الجسم, اخذ للقاح او لا, وجود او عدم وجود تشخيص سريري مؤكد, متعاطي للمضادات الحيوية او لا قبل اخذ النموذج من المرضى. بينت نتائج الدراسة انه من مجموع 191 عينة سريرية، ان 45 منها عينة بنسبة (23.5% ) اظهرت نمو بكتيري موجب على الاوساط الزرعية الاعتيادية وبالتالي الحصول على 45 عزله بكتيرية مشخصة بواسطة الاختبارات الكيميائية ,جهاز Vitek2ونظام .API تم الحصول على العزلات البكتيرية من عينات الادرار 16 (35.5%), الحروق15(33.3%), الدم13( (28.8% والسائل القصبي 1(2.2%)، فيما لم تظهر 146 عينه سريريه ( (76.4%نموا موجبا على الاوساط الزرعية وقد يعود السبب في ذلك لاحتمال وجود اصابه فطرية او فايروسية او لوجود بكتيريا شديدة التحسس fastidious bacteria والتي قد تكون فقدت اثناء نقل العينات الى المختبراو بسبب تعاطي المضادات الحيويه فبل اخذ النماذج. وجد انه من مجموع 191 عينة سريرية تم جمعها خلال الدراسة، فانه تم الحصول على 12 عزلة بكتيرية تابعة لمجموعة المرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيوية (الاسكيب) وبنسبة6.3% ،بينما كانت نسبتها26.6% من النمو البكتيري الموجب, حيث تم عزلها من العينات وبواقع 6عزلات من جروح الحروق (50%) ,5 عزلات من الدم (41.6%) وعزلة واحدة من السائل القصبي (8.3%). اظهرت نتائج الدراسة الحالية انه من بين 12 عزلة بكتيرية (6.3%) تابعة لمجموعة الاسكيب فان اعلى نسبة عزل 33.4 %)) كانت لبكتريا S. aureus ، تلتها العزلات البكتيرية التابعة لانواع P. aeruginosa, K. pneumoniae وA. baumannii بينما لم يتم الحصول على عزلات تابعة للنوع البكتيري Enterococcus faeciumفي هذه الدراسة. اظهرت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب باستخدام نظام Vitek 2 - system للعزلات البكترية الموجبة والسالبة لصبغة كرام ان اعلى نسبة مقاومة للمضادات الحيوية كانت لبكتريا P. aeruginosa تليها العزلات التابعة لكل من K. pneumoniae,, S. aureus, E. cloacae وA. baumanniiعلى التوالي. وجد في هذه الدراسة ان 75 % من جميع العزلات السالبة لصبغة كرام ومن ضمنها العزلات التابعة لمجموعة الاسكيب P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A. baumannii كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف ، كما اظهرت النتائج ان جميع العزلات السالبة لصبغه كرام ضمن مجموعة الاسكيب كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز من نوع AmpC. كما بينت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب ان هنالك اختلافات في انماط المقاومة للمضادات الحياتية بين هذه العزلات، حيث وجد ان اعلى نسبة كانت لنمط متعدد المقاومة 10(%83.3) فيما احتل نمط واسع المقاومة نسبة 2 (16.6%), بينما لم يتم الحصول على عزلات ذات نمط كلي المقاومة في هذه الدراسة. وحسب ما تم الاطلاع من المصادر المعتمدة، فان هذه الدراسة تعد الدراسة الاولى في العراق والتي تتضمن التحري عن انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات البكتيرية (الاسكيب) لمرضى الاطفال في العراق. | The present study aimed to investigate the prevalence of ESKAPE pathogens group : Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus. Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp. among pediatric patients in Babylon province, Iraq. Out of 191 different clinical samples were collected from pediatric patients during the a period of July 2016 till November 2016. Samples were obtained from aged from 1day till the age of pediatric patients 14 years old who admitted to Babylon teaching hospital for maternity and children (mainly in nursery neonatal care unit, intensive care unit, general wards) and Hilla teaching hospital (mainly in burn unit). Samples obtained included; blood, urine, cerebrospinal fluid, burns wounds and others (bronchial fluid, abscess) data like name, age, sex, residence, body weight, attending for vaccination program before or after, any clinical documented infection or not, and whether received antibiotics before or after, were taken from patients before sampling.Among 191 clinical samples, 45 (23.5%) gave positive growth on ordinary culture media, yielding 45 bacterial isolates, identified using biochemical tests,Vitek2 - system ID cards, and API system. The bacterial isolates were recovered form urine 16 (35.5%), burn wounds 15 (33.3%), blood 13(28. 8%), and bronchial fluid 1 (2.2%). Among 191 clinical samples, 146 (76.4%) gave no growth. The reason of negative culture may be attributed to fungal infection, viral infection, fastidious bacteria that might be lost during transporting or antibiotics usage before taking samples. Out of the total samples collection 191, ESKAPE pathogens group corresponded 12 isolates (6.3%) were recovered. While (26.6) from positive growth cultures. They were isolated from samples of burn wounds 6 (50%), blood 5(41.6%), and bronchial fluid 1(8.3%). Among 12 isolates of (6.3%) ESKAPE pathogens group from 191 recovered from clinical samples, S. aureus was recovered in high rate (33.4%) followed by P. aeruginosa, K. pneumoniae, and A. baumannii However, no isolate belonged to E. faecium was recovered in this study. Results of antibiotic susceptibility testing of ESKAPE pathogens group using Vitek 2 - system found that P. aeruginosa isolates showed high rate of antibiotic resistance, followed by K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae, and A. baumannii isolates respectively. Different antibiotic susceptibility patterns were recorded among ESKAPE pathoges group isolates. Multi drug resistance (MDR) was found in high rate 10 (83.3%), and extensively drug resistant (XDR) 2(16.6%) , However, no isolates belonged to pan drug resistant (PDR) were recovered in this study. In the present study found that high rate 6/8 (75%) from the all isolates of G - ve bacteria within ESKAPE pathogens group (P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A.baumannii) were ESBL - producers and all isolates were AmpC producer.According to we knowledge, this study is a first record of investigation the prevalence of pattern resistant bacteria among ESKAPE pathogen group in pediatric patients in Iraq

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Bacteroides fragilis المعزولة من النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري == Molecular and Bacteriological Study of Bacteroides fragilis Isolated from Women with Bacterial Vaginosis

اسم المؤلف: زهراء قيس سلمان
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | بشرى جابر عمران
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت هذه الدراسة 150 مريضة يعانين من التهاب المهبل البكتيري ، تم جمع ما مجموعه 300 مسحة من عنق الرحم وافرازات مهبلية من هؤلاء المريضات بمعدل مسحتين اثنتين لكل مريضة و150 عينة دم جديدة تم جمعها من المريضات عند مراجعتهن الى مستشفيين في محافظة بابل هما : مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي العام، و150 عينة دم جديدة كمجموعة سيطرة ، خلال الفترة من شباط الى تشرين الاول 2016. باستخام معايير امسلز تم تشخيص النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل البكتيري. وقد خضعت المسحات لطرق مختلفة لتحديد B.fragilis باستخدام الاساليب البكتريولوجية التقليدية. وجد ان 31 عزلة موجبة (20.6٪) باستخدام الاوساط الانتقائية. فضلا عن ذلك، تم تطبيق طرق الكشف الجزيئي باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16 sRNA ، وكانت 44 عزلة (29.33٪) ايجابية وتعود لبكتريا B.fragilis وكذلك استخدم المعلم الوراثي nanH حيث كانت 39 عزلة (88.6٪) ايجابية. بالاضافة الى ذلك، تم فحص العزلات المعزولة على الاوساط الانتقائية الخاصة بالبكتريا للكشف عن قابلية البكتريا للالتصاق (adherence ability) بالخلايا المخاطية. كما تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية (Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate (TCP) test اذ كانت مكونة للاغشية بنسبة (100%). حيث اظهرت العزلات 31 الموجبة المستخرجة من الوسط الانتقائي قدرة البكترياعلى تكوين ال Biofilm وكانت نسبة تكوين البيوفيلم (83.9٪) و(16.1٪) للوضع العالي والمعتدل على التوالي، في حين لم تكن هناك عزلات غير قادرة على تشكيل بيوفيلم. اما فيما يتعلق بتاثير بوفيدون - اليود بنسبة 10٪ على تكوين البيوفيلم، فقد اظهرت نتائج هذه الدراسة ان قدرة البكتريا على تكوينه قد تقلصت لتكون نسبة التشكيل قوي (6.5٪ (ومعتدل (71٪) و(22.6٪) لم يظهر اي تشكيل للبيوفيلم . تم فحص تاثير 10% povidone - iodine المستخدمة في الطب النسائي على انتاج الاغشية الحيوية . وقيمت الدراسة قابلية B.fragilis على انتاج bacteriocin وتاثيرها على بعض العزلات البكتيرية. اظهرت النتائج ان لعزلات البكتريا قدرة تازرية لتثبيط نمو العزلات المدروسة بنسب. فضلا عن ذلك، هدفت هذه الدراسة الى التعرف على علاقة التغايرالجيني(TLR - 4 Polymorphism) باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم (PCR - RFLP) .وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية وكانت نسب انتشارها في مجموعة المرضى CC(36.0%) وThr399Ile : CT(12.0%) ,TT(52%) بينما نسب انتشارها في مجموعة السيطرة كانت TT(34.0%) , CC(60.0%) and CT(6.0%) وقد اظهرت وجود اختلاف وهو اختلافا معنويا, فيما بلغت نسبة انتشار الاليل T في المرضى (58%) بالمقارنة للسيطرة (37%) مع وجود اختلاف معنوي .وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA(46.0%) ,GG(50.0%) and GA(4.0%) في مجموعة المريضات بينما في مجموعة السيطرة كانت نسب الانتشار AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) مع عدم وجود فارق معنوي بينهما , اما نسبة انتشار الاليل G (52%) في مجموعة المريضات بالمقارنة بمجموعة السيطرة (62%) ويعد فارقا معنويا بينهما . تناولت الدراسة تحليل تسلسل جينات معينة من عزلات B.fragilis وكشفت نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin حيث تم تحديدها في 117/117 (100٪ (بمقارنة تسلسلها مع تلك التي في قاعدة البيانات في بنك الجينات وكانت نسبة الثغرات بينهما (0)٪ ، اما بالنسبة للعزلة الثانية فقد تم التعرف على نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin في 116/116 (100٪) وبثغرات 0/116 (0٪)، اما بالنسبة لجين Phospholipaseتم تحديدها في 129/129 (100٪) مع ثغرات 0/1129 (0٪) لكل من العزلتين . اخيرا تم تحليل العلاقات التطورية بين العزلات محلية من B.fragilis والعزلات العالمية من B.fragilis باستخدام تسلسل الجينات لل Enterotoxin وPhospholipaseحيث اظهر تحليل تسلسل الحمض النووي لجين Enterotoxin ان عزلات B.fragilis المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بعزلة B. fragilis المسجلة عالميا (AB026625.1) و(U67735.1) ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور (0.01%) في حين ان نتائج تحليل النشوء والتطور من تسلسل جينات Phospholipase كشفت ان نفس العزلات المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بالعزلة المسجلة عالميا (CP011073.1) ، ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور كانت (0.003 - 0.005%). | This study included 150 women with bacterial vaginosis (BV), a total of 300 swabs (as two high vaginal swabs for each woman and vaginal discharge ) were taken from each woman. In addition to fresh blood samples were collected from the same 150 women with bacterial vaginosis and 150 healthy women as control group , these women admitted to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics , in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Teaching Hospital, and Al - Hillah General Teaching Hospital during the period from February until October 2016. Women suffering from bacterial vaginosis were diagnosed according to Amsels criteria .The high vaginal swabs were subjected to different methods for identification of Bacteroides fragilis by using traditional bacteriological methods . It was found that 31(20.6%) isolates were recovered by using selective media . Furthermore , molecular detection methods was applied by using 16s rRNA gene ,where 44(29.33%) isolates were positive , and using nanH gene where 39(88.6%) isolates were positive out of the 44 isolates , these genetic markers were used for confirmation detection of B.fradilis isolates . In addition , the 31 isolates recovered from selective media were investigated to detect adherence of B.fragilis to mucosal epithelia cells .Also , biofilm formation was tested in semi quantitative microtiter plate test . The result revealed that all isolates were biofilm former , biofilm formation were accounted (83.9%) and (16.1%) for high and moderate mode respectively , while there were no isolates that do not express biofilm formation . Regarding on effect of 10% povidone - iodine on biofilm formation ,the result of this study demonstrated that internal douche effectively reduced the viability of biofilm forming to strong (6.5%) , moderate (71%) and (22.6%) shown no biofilm formation . The study was also evaluated the susceptibility of bacteriocin produced by B.fragilis on some isolates of bacteria . The result revealed that B.fragilis have synergistic ability to inhibition the growth of studied isolates with different ratios . Additionally, this study aimed to investigate the relation of Asp299Gly and Thr399Ile Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in the Toll - like receptor - 4 (TLR - 4) with the incidence of bacterial vaginosis .The result elucidated that at the site of Thr399Ile SNP, there were three genotypes for this SNP among patients ; TT,CC and TC with frequency of (52%) ,(36.0%) and (12.0%) respectively , whereas , the genotype frequency among control group were TT(34%) ,CC(60%) and TC(6.0%) with significance differences between patients and control . However, the frequency of allele T (mutant) was higher among patients (58%) than control (37%) with significant difference. The site of Asp299Gly SNP also showed three genotype among patients with frequency of AA(46.0%), GG(50.0%) and GA(4.0%) , whereas the genotype frequency among control group were AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) with no significant differences between patients and control . Additionally , the frequency of allele G(mutant) was higher among control(62%) than patients (52%) with significant differences between them . The study deal with sequence analysis of specific genes of B.fragilis isolates revealed that the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 117/117(100%) by comparing its sequence with that in the database in gene bank by Blast program with gaps 0/117(0%) and for the second isolate the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 116/116(100%) and with gaps 0/116(0%) , while for phospholipase gene was identified in 129/129(100%) with gaps 0/1129(0%) for first isolates.Finally ,the phylogenetic relationships between two local isolates of Bacteroides fragilis and Bacteroides fragilis global isolates were analyzed using the enterotoxin and phospholipase genes sequence. The DNA sequencing analysis of enterotoxin gene revealed that B. fragilis local number (No.1and No.2) isolates were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (AB026625.1) and (U67735.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis enterotoxin gene were show different out of tree at total genetic change (0.01%) , while the phylogenetic analysis results of phospholipase gene sequences revealed that B. fragilis local isolates ( No.1and No.2) were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (CP011073.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis phospholipase gene showed difference out of tree at total genetic change (0.003 - 0.005 %).

الكشف الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه - النوع الاول والتعبير البروتيني ل P27, CDK6,CDK4 وBcl - 2 في سرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن == Molecular Detection of Human T Lymphotropic Virus Type - 1 (HTLV - 1) and Expressional Proteins of CDK4, CDK6, P27 and Bcl - 2 in Hodgkin?s and Non - Hodgkin?s Lymphomas

اسم المؤلف: نور سامي عبود الليباوي
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | شاكر حماد محمد العلواني
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة على انها دراسة بحثية ذات اثر رجعي ,وسيطره . اذ اشتملت على120خزعة نسجية من منطقة الغدد اللمفاوية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين.جمعت هذه النماذج من ارشيفات الانسجة المرضية لمختبرات مستشفى الحلة التعليمي/ محافظة بابل , مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة كربلاء ,مستشفى الصدر التعليمي/ محافظة النجف ,مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة المثنى ومستشفى القادسية التعليمي/ محافظة القادسية وكذلك العديد من مختبرات الانسجة المرضية الخاصة الموجودة في بابل ,بغداد, كربلاء, القادسيه, المثنى اذ جمعت هذه العينات للفترة من اذار 2016 الى كانون الاول 2016. هذه النماذج تعود للمرضى المصابين بسرطان العقد اللمفاوية للسنوات من 2011 لغاية 2016 .قسمت هذه العينات حسب المجموعات التالية : - 1 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع هودجكن .2 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع اللاهودجكن .3 - اربعون قطعة نسجية لعقد لمفاوية (لايظهر عليها اي تغيرات مرضية نسيجية) ظاهريا سليمة استعملت كمجموعة سيطرة .بعد التقطيع النسيجي لخزع العقد اللمفاوبة وتصبيغها باستخدام صبغتي الايوسين والهيماتوكسلين تم اجراء الفحص التاكيدي الدقيق لغرض التشخيص النهائي من قبل اخصائي الامراض النسيجية لهذه الدراسة. تم تصميم الجانب العملي لهذه الدراسة الذي اتخذ مسارين رئيسين : - 1. التحديد الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بفحصها داخل خلايا الانسجة اللمفاوية حيث تم انجازه بوساطة استخدام تقنية التهجين الموضعي ذات الحساسية العالية .2. اجراء دراسة كيميائية - نسيجية مناعية لوصف الحالة التعبيرية ل CDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27) وفحص الجينات السرطانية للخلايا اللمفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن واللاهودجكن والعقد اللمفاوية السليمة ظاهريا (غير مصابة).ان مجمل النتائج التي تم الحصول عليها هذه الدراسة كانت كما يلي : 1 - نسبة الذكور( (57.5% المصابين بسرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن ومجموعة السيطرة كانت اعلى من نسبة الاناث (42.5%) في هذه المجاميع الثلاثة. حيث كانت نسبة الذكور/اناث هي1 : 1.35.2 - اظهر الفحص النسيجي ان النسبة العليا من مرضى الهودجكن كان من الدرجة المنخفضة (42.5%) يتبعها الدرجة المتوسطة (35%) وادنى نسبة هي الدرجة العليا (22.5%). بينما النسبة العليا من مرضى اللاهودجكن كانت من الدرجة المنخفضة والمتوسطة %37.5)) وادنى نسبة هي الدرجة العليا ( 25%).ا - نتائج الفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت ( 22.5%) 2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK4 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 57.5 % من الانسجة كانت موجبة . 5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ Bcl - 2ان47.5 % من الانسجة كانت موجبة .6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفيروس وCDK4 .7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للCDK4 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال CDK6 وBcl - 2.8 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة ل p27 وعمر المرضى. كذلك علاقة طردية بين p27 وBcl - 2.ب‌ - نتائج للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائية من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة باللاهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت (45%) بينما لم تظهر اي حالة موجبة بتفاعل التهجين الموضعي للفايروس ضمن مجموعة السيطرة .2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 42.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة للp27 بواسطة الاختبارالكيميائي النسجي المناعي ضمن مجموعة السيطرة.3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـCDK4 ان 50% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة . بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي ل Bcl - 2 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السطرة.6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد الفيروس وBcl - 2 وكذلك وجدت علاقة قوية طردية تربط بين الانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفايروس وCDK6.7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للBcl - 2 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال p27 وBcl - 2 فقط .كذلك وجدت علاقة عكسية بين عمر المريض وBcl - 2 .8 - تم تمييز علاقة طردية تربط بين كثافة CDK4 وp27 وكذلك بين CDK4 وBcl - 2

دراسة بكتيرية ووراثية لبكتريا Gardnerella vaginalis وعلاقتها بالولادة المبكرة == Bacteriological and Molecular study of Gardnerella vaginalis association with preterm labor

اسم المؤلف: ازل علاء عباس الربيعي
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: In this study , one hundred fifty samples were collected from paitents with preterm labor (PTL), who have been attending to Babylon Maternity and pediatric hospital and Al - Hilla Teaching Hospital, at the period from February to October 2016. Two swabs were collected one for culturing and the other for direct extraction for isolation Gardnerella vaginalis.Out of the 150 samples only 6(4%) on culture and 30 (20%) on molecular level isolated from preterm labor caused by Bacterial vaginosis , Urinary tract infection and aborted women. The results isolation and laboratory diagnosis as well as biochemical test approved that there is only 6 isolates belong to G.vaginalis confirmed by using Vitek 2 system and molecular detection by specific primers.Preterm birth is one of the most common causes of neonatal morbidity and mortality. Associated with sub sequent preterm labor in up to 40% of cases as shown in our resultsThe isolates are varied in their ability to produce sidrophore and extracellular protease in addition to their hemolytic activity .Adherence activity were investigated and indicate that G.vaginals have pili on her surface help her to attached and initiated infection Metronidazole was effective in prevent adherence at low concentration (5%) was 100% percentage.All isolates are able to produce biofilm in different level which provided as main step in pathogenesis caused it can evade and evoke the action of immune response and antibiotics , Alum , sodium chloride and sodium bicarbonate were shown very high effectively to eradicationSummaryIIG.vaginalis biofilm which gave results (0%) whereas the thymol extract (carvacrol) were moderate in action gave (50%) effect on Biofilm .Results also preveld that increased of pH value give a chance to overgrowth of G.vaginalis .The results indicated that Lactic acid considered as a limiting factors preventing growth of G.vaginalis when its grown with lactic acid , measured by optical Density (OD) the high production level is (1.901) in 2% concentration Whereas the lowest level is (0.32) in 10% concentration.Isolates Have ability to produce wide spectrum Bacteriocin which inhibited growth of both Gram positive and Gram negative bacteria that founded in vagina environment, Staphylococcus saprophyticus were the most bacteria that inhibited .extracted Vaginolysin was have a completed hemolytic activity in different temperatures (37 - 38 - 40 - 42). The results showed that its activity as were increased in high temperature.Recent study were clarified that purified vaginolysin was active in presence of cholesterol in media, gave (1.205) growth rate measured by the optical density at (100%) concentration. vaginolysin is cholesterol - dependent cytolysin (CDCs) toxin.Antimicrobial activity were investigated to the extracted Vaginolysin to evaluation of its activity depending on inhibition zone, the results showed that candida is more affective between the other microorganism gave (1.3)mm.Some virulence factor have been detected in molecular level ( Vly - SI - LuxS - LexA - rec a - Pl - Fur - Omp - Gal - protease ). Which wereSummaryIIIvaried in production may be as a results to the un presence of this gene in bacteria , may be silent gene or due to the amount of bacteria in sample are rare.Three Antibiotics were used at a molecular level (Tet b) were varied between resistance and sensitive to this gene (10) sample are resist,(RdxA) all sample are sensitive to its gene at percentage (100%), whereas (erna)gene were resist in all samples (100%).The results show there was no sequence homology between Mycoplasma spp. and G. vaginalis in the adhesion level this were detected by P30/P32 specific primer .The outcome of RFLPS - PCR is confirmed that G.vaginalis is virulent and have a role in preterm labor by degradation of membranes with the association of variable Silidase and presence of β - Galactosidase .MBL (mannose binding lectin ) levels were have a direct role pregnancy. It is also apparent that MBL plays a role in the defense against vaginal infection. MBL is essential to successful pregnancy in regards to maternal defense against infection, recent study indicate that MBL deficiency related to pregnancy outcome disorderedthis considered the first study of mannose in Iraq .DNA sequencing were done for two main virulence factor Phospholipase gene and Quorum sensing gene which showed some variation , then recorded in NCBI - gene sequencing as first descriped in Iraq.

التاثير المايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية == The Antimicrobial Effect of Silver Nano Particles (AgNPs) Against Pseudomonas aeruginosa Isolated from Clinical Samples

اسم المؤلف: سارة عقيل حسن التميمي
اسم المشرف: هدى هادي الحسناوي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للكشف عن التاثيرالمايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية, تم جمع 100 عينة من مصادر سريرية مختلفة, تضمنت العينات السريرية عينات الحروق , والادرار, والدم, واصابات الاذن, والقشع تم اخذ هذه العينات من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني 2017. زرعت جميع العينات على وسط السترمايد, وسط اكار الدم, وحضنت كل الاطباق هوائيا بدرجة حرارة C°37 لمدة 18ساعة. تم تشخيص بكتريا الزوائف الزنجارية بالاعتماد على الصفات المظهرية والكيموحيوية.كان توزيع العزلات كالاتي : 22(52.4%) من عينات الحروق, 8(19%) من عينات الادرار, 14.3)6%) عينة من المرضى المصابين بالالتهاب الاذن الخارجية, 4(9.5%) من عينات الدم,2(4.7%) من عينات القشع. اظهرت نتائج اختبار الحساسية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط ان جميع العزلات(26) كانت مقاومة لكل من الببراسلين (100%), السيفوتاكسيم (100%),بينما نسبة المقاومة لكل من الاميكاسين (88%), سيفترياكسون (65%), جنتامايسن (62%), بينما وجدت نسبة مقاومة قليلة للسفتازديم (15%), وكل العزلات كانت حساسة (100) لكل من الميروبينيم, اوفلوكساسين, نورفلوكساسين والسبروفلوكساسين. تم في هذه الدراسة ايضا الكشف عن تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) وطريقة صبغة الكونكو الحمراء (CRA) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الطبق الزرعي النسيجي كانت جميع عزلات الزوائف الزنجارية والبالغ عددها (9) منتجة للاغشية الحيوية, (4) من اصل (9) (44%) من عزلات الزوائف الزنجارية انتجت مستعمرات سوداء بواسطة طريقة صبغة الكونكو الحمراء. وكذالك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير جزيئات الفضة النانوية ((AgNPs على تكوين الاغشية الحيوية باستخدام تراكيز مختلفة (µg/ml 2.5, µg/ml 5, 10 µg/ml, 20µg/ml),حيث اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التركيز (20) وبنسبة تثبيط (100%), من جهة اخرى تم اختبار التاثير البكتيري المضاد لجزيئات الفضة النانوية ضد مختلف انواع العزلات البكتيرية باستخدام طريق التخافيف في الوسط الصلب وتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (12.5 µg/ml, 25 µg/ml, 50 µg/ml, (100 µg/ml, 200 µg/ml وكانت العزلات كالتالي : ـ(S. aureus, E. coli, E. cloacae, K. pneumonia, P. aeuroginosa)اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التراكيز(100 µg/ml, 200 µg/ml).ايضا تم تعريض ظاهرة السوارمنك في عزلات الزوائف الزنجارية لتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml ), ووجد ان اعلى نشاط لجزيئات الفضة النانوية ضد ضاهرة السوارمنك وانتاج البايوسيانين كانت بتركيز ((10 µg/ml, 5 µg/ml .تم زراعة جميع عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية (26)عزلة بوجود نترات الفضة (AgNO3) بتراكيز تتراوح (100 µg/ml - 400 µg/ml ) باستخدام طريقة التخافيف في الوسط الصلب مع قدرات مختلفة لانتاج البيوسيانين. اظهرت النتائج ان جميع العزلات 26((100 المنتجة للبايوسيانين كانت مقاومة للسلفر نايتريت (AgNO3) من خلال ظهور نمو في الطبق الحاوي على التراكيز المذكورة نترات الفضة (AgNO3).في هذه الدراسة تم اختبار بكتريا الزوائف الزنجارية لانتاج البكتريوسين باستخدام عزلات بكترية مختلفة تضمنت العزلات (امعائية مذرقية,مكورات العنقودية الذهبية,اشريكية قولونية, كلبسيلة رئوية). كذلك تم العثور على مجموعة واسعة من منطقة تثبيط (24mm - 30mm) في الانواع البكتيرية اعلاه مع قطر (30mm, 28mm, 24mm, 30mm) على التوالي. عزلات (امعائية مذرقية, كلبسيلة رئوية) كانت الاكثر تاثر والتي انتجت قطر تثبيط ((30mm. في هذه الدراسة ايضا تم تقييم علاقة مقاومة الفضة مع انتاج بيوسيانين في بكتريا الزوائف الزنجارية متعددة المقاومة للمضادات الحيوية. في هذه الدراسة تم استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتاكد من وجود بعض الجينات. في هذه التقنية، تم فحص جينات bla - IMP)) التي تشفر الى انزيم ميتالو - β - لاكتاميز المسؤول عن مقاومة ايميبينيم وجينات (silS ,silE) التي تشفر لمقاومة الفضة في عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية بواسطة استخدام برايمرت خاصة. وقد وجد ان جميع العزلات ال 26 (100%) من بكتريا الزوائف الزنجارية كانت سلبية لهذه الجينات. كما تم استخدام اثنين من البرايمرات المحددة للكشف عن فينازين (بيوسيانين) (phzS, phzM). اظهرت النتائج لل (phzM) ان من اصل 26)) عزلة , 21 (80.8%) اعطت نتيجة ايجابية, , فيما يخص (phzS gene) وجد ان 14(% 53.9) عزلة كانت حامله لهذا الجين . والخاتمة ان جزيئات الفضة النانوية (AgNps) تمتلك تاثير ضد الاغشية الحيوية وايضا لها تاثير بكتيري مضاد ضد بكتريا الزوائف الزنجارية وانواع بكتيرية اخرى, والتي من الممكن استخدامها كعلاج بديل. فيما يخص انتاج البايوسيانين ومقاومة الفضة، ظاهريا كان هناك تاثير البايوسيانين على مقاومة الفضة ولم تكن مقاومة الفضة بسبب نقل وجود جينات (silS, silE). | This study was conducted to detect the antimicrobial effect of silver nanoparticles (AgNPs) against Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples, total of 100 specimens were collected from different clinical sites included urine, burns, ear, blood , and sputum. The specimens were taken from patients admitted to Al - Hilla Teaching Hospital during a period extended from November 2016 to January 2017. All specimens were cultured on selective medium (cetrimide agar), blood agar, then incubated at 37°C for 18 hr. The isolated of P. aeurginosa were diagnosed depending on morphological and biochemical characteristics.The distribution of P. aeurginosa isolates was as follows : 22(52.4%) isolates from burns, 8(19%) isolates from urine, 6(14.3%) isolates from patients with otitis externa, 4(9.5%) isolates were isolated from blood and 2(4.7%) isolates from sputum. Antibiotic susceptibility test using disc diffusion test revealed that all isolates (26) were resistant (100%) to Piperacillin, Cefotaxime. While the resistance rate for Amikacin (88%), Ceftriaxone (65%), Gentamicin (62%), but low resistance rate was found to Ceftazidime (15%) and all isolates were sensitive (100%) to Meropenem, Ofloxacin, Norfloxacin and Ciprofloxacin. The biofilm formation in P. aeurginosa isolates was investigated by two methods include, tissue culture plates method (TCP) and congo red agar method (CRA). The results showed that all isolates 9 (100%) were found to be biofilm producer when investigated by TCP assay, and 4 out of 9 (44. %) isolates of P. aeurginosa were producing black colonies when detected by CRA method.The effect of AgNps on biofilm formation was tested by using different concentrations of silver nanoparticles (2.5 μg/ml, 5 μg/ml,10 μg/ml, 20μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of 20 μg/ml, with an inhibition rate of 100%. On the other hand the antibacterial activity of AgNps was tested against different bacterial species isolates (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomnas aeurginosa) using agar dilution method with different concentrations of silver nanoparticles (12.5 μg/ml, 25 μg/ml, 50 μg/ml, 100 μg/ml, 200 μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of (100 μg/ml and 200μg/ml). On the other hand Swarming motility in P. aeruginosa isolates was detected and subjected to different concentrations of (AgNps) (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml), it was found that the highest activity of AgNps against swarming motility and pyocyanin production of P. aeurginosa was at a concentration of (5 µg/ml, and 10μg/ml).The relation of silver resistance with pyocyanin production in P. aeruginosa was assessed. Screening test for silver resistance was performed by agar dilution method, all (26 isolates) of P. aeruginosa were cultivated in the presence of AgNo3 at a concentration (100 µg/ml - 200 µg/ml, 400µg/ml) using agar dilution method with differing capacities for pyocyanin production. All isolates of P. aeurginosa 26(100%) that produce pyocyanin were found to be resistant to AgNo3.In this study P. aeruginosa isolates were tested for bacteriocin activity by the agar well diffusion method using different bacterial isolates : E. coli, K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae. Wide range of inhibition zone (24mm - 30mm) was found against above bacterial species with diameter (28mm, 30mm, 24mm, 30mm), respectively. The most affected bacteria were K. pneumoniae and E. cloacae isolates, which produce inhibition zone (30)mm.PCR technique was used in this study for investigation some genes. In this technique, blaIMP gene that encode Metallo - β - lactamase enzyme responsible for imipenem resistance and (silE and silS) genes that encoding silver resistance were investigated in P. aeuroginosa isolates by using specific primers. It was found that all 26 (100%) isolates of P. aeuroginosa were negative for these genes. Also two specific primers were used to detect phenazine (pyocyanin) modifying genes (phzM, phzS). According to phzM gene, it was found that out of 26 P. aeuroginosa isolates, 21 (80.8%) isolates gave positive results at 330 bp, in regard to phzS gene, it was found out of 26 P. aeurginosa isolates, 14 (53.9%) isolates gave positive result at 664 bp.In conclusion AgNps have an antibiofilm, antibacterial activity against P. aeruginosa and different bacterial species that could be used as an alternative therapy. In regard to pyocyanin production and silver resistance, phenotypically there was effect of pyocyanin pigment on silver resistance and the silver resistance was not due to carriage of silE, silS genes.

التشخيص والتوصيف الجزيئي لبكتريا Clostridium perfringens المعزوله من حالات مرضية سريرية في مدينة الحلة == Molecular Diagnosis and Characterization of Clostridium Perfringens from Clinical Samples in Al - Hilla city

اسم المؤلف: علياء محمد حمود الشمري
اسم المشرف: علاء هاني الجراخ | ميساء صالح الشكري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة لمعرفة وبائية بكترياC. Perfringens في العينات المؤخوذة في محافظة بابل. تم جمع 140عينة من الجروح العميقة من المرضى الداخلين في مستشفيات مدينة الحلة الرئيسية (مستشفى الحله التعليمي ومدينة مرجان الطبيه) والذين يعانون من مرض السكري المزمن وايضا من مرضى تعرضوا الى طلق ناري فضلا عن المرضى الذين يعانون من التهاب الخلوي اللاهوائي في الجلد(anaerobic cellulitis ) للفترة من شهر شباط ولغاية شهرتشرين الاول 2016. بالاضافه الى ذلك تم تشخيص وعزل بكترياC. perfringens بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية من خلال طرق التنمية على الاوساط الزرعية الاختيارية لهذه البكتريا واظهرت النتائج الحصول على 3 (2.14%)عزلات كان عزل اثنان منها 1.42%)) من مرضى السكري المزمن اما العزله الثالثه (0.72%) فقد تم الحصول عليها من الذين تعرضوا لطلق ناري في حين لم يتم الحصول على عزلات من المرضى الذين يعانون من الالتهاب الخلوي اللاهوائي . وكذلك تم تاكيد التشخيص باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA وجين16S - 23S spacer rRNA حيث اظهرت النتائج, من اصل 140 عزلة فان 7 عزلات تعود لبكتريا C. perfringens. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا واختبار قابليتها على انتاج انزيم (phpspholipase C) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم. كما تم الكشف عن حساسية عزلات البكتريا اللاهوائية تجاه 24 مضادا حيويا. بينت نتائج الدراسة ان جميع العزلات اظهرت حساسية عالية (100%) تجاه كل من penicillins .مثل benzypencillin, ,amoxicillin فضلا عن حساسيتها تجاه  - lactamase inhibitor مثل Ampicillin - sulbactam وحساسيه عالية لكل من metronidazole وaminoglycosidesومن ناحية اخرى، اظهرت جميع العزلات مقاومة عالية لكل من مضادات tetracyclin, Linezolid, levofloxacin, erthromycin بينما اظهرت هذه العزلات تغاير في درجات المقاومة تجاه مضادات pipracillin, Clindamycin, and Impenem.تم استخدام الطرق الوراثية في الكشف عن جينات المقاومة للمضادات الحياتية كجيناتM,Q,W,B) ) tet الخاصة بالكشف عن المقاومة للتتراسايكلين وجينات erm(A,B) للكشف عن المقاومة للكلندامايسين وجين nim للكشف عن المقاومة للمترونيدازول حيث اظهرت النتائج ان الجين tet M كان ذا سيادة عالية بنسبة 71.42 %تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي لتوكسينات البكتريا (alpha,epsilon, iota) للاستدلال على وجود جينات (cpa, etx, iap)، في C. perfringens وبنسبة 100%, 28.4%, 28.4% )) على التوالي.بالاضافة الى ذلك تم استخدام جينات cpa, etx and iap لقياس تعاقب القواعد النيتروجينية للمادة الوراثية للعزلات المدروسة فضلا عن تسجيلها في بنك الجينات العالمي ( ,(Gene Bank,اذ تم خلال هذه الدراسة ولاول مرة في العراق، الحصول على خمسة ارقام انضمام الى بنك الجينات العالمي (5 accession numbers)، حيث تم نشر هذه الارقام في بنك الجينات الامريكي gene bank - NCBI وهذه الارقام هي : جينiap : KY523199, KY523200 اما فيما يخص الجينetx فكانت الارقام هي : KY523201, KY523202 وفيما يخص الجين cpaفكان رقم الانضمام هو : . KY523203تعد هذه الدراسه انها اول دراسه في العراق تضمنت تحليل , دراسه تعاقب القواعد النايتروجينية للمادة الوراثية فضلا عن التسجيل في بنك الجينات العالمي لسموم عزلات محلية من بكتريا C.perfringens معزولة من عينات سريرية. | This cross sectional and hospital - based study aimed to studying the incidenceof Clostridium perfringens in clinical samples in Babylon province. A total of 140 wound swabs were taken from patients admitted to two main hospitals in Hilla city, Iraq (Hilla Teaching Hospital and Medical Marjan City), during the period from February to October 2016. Swabs were collected from diabetic patients, anaerobic cellulitis, and bullet wounds. These wound swab samples were subjected to different methods for identification of C. perfringens according to standard method. It was found that 3 (2.14%) C. perfringens isolates were recovered, of which 2 isolates (1.42%) were obtained from diabetic patients, 1 isolates (0.72 %) from bullet wounds, No isolates are recovered from the other clinical samples (cellulitis). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA, 16S - 23S intergenic spacer rRNA genes as a genetic marker for confirmation of detection of C. perfringens isolates,7 isolates of C. perfringens out of 140 are detected by using PCR with specific primer.The study also focuses on the ability of this bacteria to produce Phospholipase C and it was found that all isolates are positive for this enzyme (100%) . The results of antibiotic susceptibility testing using Vitek 2 system and disc diffusion method (DDT) of C. perfringens isolates (No.= 3) against 24 antibiotics showed that all isolates were highly sensitive to penicillins, (benzylpenicillin, and amoxicillin), all isolates (3/3) were sensitive to  - lactamase inhibitor such as Ampicillin - sulbactum. They were more susceptible to metronidazole and aminoglycosides in (3/3). On the other hand, all isolates were highly resistant to tetracycline, Linezolid ,levofloxacin, and erythromycin However, these isolates expressed different degree of susceptibility towards other antibiotics (Clindamycin, piperacillin and Imipenem). Molecular detection of C. perfringens of antibiotic resistance genes had been investigated and it had been found that tetracycline resistance gene tet M is the most commonly observed (71.42%) among ribosomal protection genes among C. perfringens isolates. While all isolates (7) gave negative results for other tetracycline resistance genes (tet W and Q, tet B, erm(A), erm(B),nim gens).Furthermore, detection of clostridial toxin (alpha, epsilon, iota toxins was applied using specific genes (cpa, etx, iap) and the results showed that the rate of the presence of these genes are : 100%, 28.8% and 28.4% respectively. The following genes : cpa, etx and iap were used for sequencing analysis, registration in gene bank - NCBI. Five accession numbers were obtained from registration of five sequences of these three genes at gene bank - NCBI : iap gene; accession numbers are : KY523199, KY523200etx gene; accession numbers are : KY523201, KY523202cpa gene; accession number is : KY523203. This is the first study in Iraq which employed analysis sequencing and registration in gene bank - NCBI, of clostriaial toxin of local isolates of C. perfringens obtained from clinical samples

دراسة فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية مع التهاب الاذن الوسطى القيحي في الاطفال == Study of Parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes with suppurative otitis media in children

اسم المؤلف: ايام محمد صالح علي العامود
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | غانم عبود المولى
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن دور فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية Streptococcus pyogenes في الاطفال الذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي . جمعت 200 عينة (ثلاث مسحات لكل مريض تضمنت مسحة من افرازات الاذن ومسحة من افرازات الانف لدراسة الفيروس ومسحة من افرازات الاذن لدراسة البكتريا و50 عينة دم) من 50 مريض يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل للفترة من شباط (2016) لغاية ايار (2016). والذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى. وتضمنت الدراسة 32 عينة ماخوذه من اشخاص اصحاء كمجموعة سيطرة وتم تقسيمهم الى ست مجاميع عمرية بنفس طريقة تقسيم مجاميع المرضى. شملت الدراسة اربعة اجزاء رئيسية : اولا التشخيص الفيروسي اعتمد على التقنيات المتقدمة (العزل الاولي باستخدام فحص التالق المناعي المباشر لتحديد وتمييز الانواع الثلاثة لفيروس نظير الانفلونزا 1,2, and 3 والتشخيص الجزيئي بواسطة استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي لتحديد وتمييز الانواع الاربعة للفيروس1,2,3, and 4 وتم استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لمشاهدة جزيئة الفيروس . والجزء الثاني فحص البكتريا باستخدام فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 system وتم التحري ايضا عن انزيم الهيمولايسين حيث كانت جميع العزلات منتجه لهذا الانزيم . التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود الجين mga بواسطة تقنية سلسلة تفاعل انزيم البلمرة .الجزء الثالث شمل وجود الفيروس والبكتريا في عينات الاذن للمرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى . الجزء الرابع تضمن دراسة مناعية لمعرفة دور الحركيات الخلوية IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8, and CD56))عند الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم وباستخدام تقنية التالق المناعي المباشر لفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الثلاثة (hPIV 1,2,3) كانت نسبة الاصابة 64% (اي 32 طفلا من اصل من اصل50) وعند استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي ( (RT - PCR وجد ان نسبة الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الاربعة (hPIV_1,2,3 and 4) 44% ( اي 22 من 50) تضمنت الدراسة استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لرؤية جزيئة فيروس نظير الانفلونزا في افرازات الاذن . اظهرت نتائج التشخيص البكتيري ان نسبة الاصابة بالمسبحيات القيحية هي 14%(7 من 50) بعد زرعها على وسط اكار الدم وحضنت لمدة 24 ساعة بدرجة 37 وتم فحصها بواسط المجهر الضوئي بعد تصبيغها بصبغة كرام , تم التشخيص بواسطة استخدام فحص Bacitracin sensitivity وفحص انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم بواسطة فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 systemاظهر التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود mga جين ان جميع العزلات تحتوي على هذا الجين اي نسبة 100% .كما اظهرت الدراسة ان نسبة وجود الفيروس مع البكتريا في في سوائل الاذن بنسبة (16%)( . 4 وكانت نسبة وجود الفيروس (72%) 18وشملت الدراسة ايضا فحص الحركيات الخلوية بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم واظهرت النتائج ارتفاع مستوى السايتوكينات في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء وكان اعلى مستوى لانترليوكين 6 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو) 88.24 )و (100.95) 1Pg/ml على التوالي . في حين كان اعلى مستوى لعامل النخر الورمي نوع الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (99.35 ) و(109.81 ) Pg/ml على التوالي. وكان اعلى تركيز لانترفيرون الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو( 217.16) و(( 197.84 Pg/ml على التوالي . واظهرت النتائج ان تركيز الواسمين المناعيين CD8 وCD56 ان تركيزهما اعلى في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء , اظهرت النتائج ان تركيز CD8 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو ((11.46±1.49 و(14.76±1.73) ng/ml على التوالي . في حين كان تركيز CD65 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (12.82±1.62 )و (10.59±1.19) ng/ml على التوالي | This study aimed to detect the role of of parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes in children suffering from suppurative otitis media. A total of two hundred sample (three swab for each patients include ear swabs , nasopharyngeal secretion for viral study and ear swab for bacterial study and 50blood sample) , were collected from 50 patients suffering from suppurative otitis media attending to AL - Hilla Teaching Hospital in Babylon - Iraq during the period from February 2016 to May 2016. The study includes 35 samples obtained from healthy subject as control group that classified to six group according to age in similar way of patient's with parainfluenza virus infection group years old The study includes four main parts .First one is the viral diagnosis based on relied diagnostic procedure ( Primary detection of parainfluenza virus in ear discharge by direct Immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types, molecular diagnosis by Real - Time PCR technique for the qualitative detection and differentiation of Parainfluenza Virus 1, 2, 3, 4 and diagnosis of parainfluenza virus by transmission electron microscope. The second part includes the bacterial diagnostic based on relied diagnosis procedure (using conventional biochemical reaction and commercial kit (Vitek 2 system). The heamolysis on blood agar was also observed in all isolates. Molecular detection of mga virulence gene for Streptococcus pyogenes was detected using conventional PCR technique. The third part is Co - infection between GAS and HPIV in OM specimens of children with suppurative OM. The fourth part is an immunological study to investigate the role of cytokines (IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8 and CD56) in HPIV infection by ELISA assay . Direct immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types antigen was positive in 64% (32 out of 50) , when we use Real - time reverse transcription PCR(RT - PCR) the percent of children infection with HPIV1, 2, 3, and 4 was 44% (22 out of 50). The study also include the use of transmission electron microscope for visualized the parainfluenza virus particle in ear swab. Streptococcus pyogenes isolates was detected in 14%(7 from 50) the isolate were confirmed after culturing on the blood agar and incubated for 24 hour at 37ºC, then microscopically by Grams̕̕ staining. Identification was done using commercially prepared bacitracin and the type of hemolysis on blood agar by primary biochemical test and confirmatory identification by vitek2 system compact. Molecular Identification of mga gene for Streptococcus pyogene showed that all Streptococcus pyogenes positive result 100%. The occurrence of Bacterial and viral co - infection in middle ear fluids which have been observed in 16% (4 out of 50 cases). HPIV was identified as a single agent in ear swab in 72%(18 out of 50). The study include estimation of some immunological parameter include (IL - 6, TNF - α, IFN - α , CD8 and CD56 ) using ELISA and revealed elevation the concentration of cytokines in sera of otitis media patients in comparison with healthy control groups. The concentration of IL - 6 is higher in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. The high level of IL - 6 Pg/ml in otitis media patients for male and female was (88.24) and (100.91) Pg/ml respectively. Also level of TNF - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (99.3) and (109.8) Pg/ml respectively . The level of IFN - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (217.16 )and (197.84 )Pg/ml respectively. The results also show elevation concentration of CD8 and CD56 in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. For CD8 ng/ml in otitis media patients for male and female was(11.46) and (14.76)ng/ml respectively. The level of CD56 ng/ml in otitis media patients for male and female was (12.82) and (10.59)ng/ml. respectively.

الكشف عن اللولبية البوابية في خزعة المعدة ودراسة مستوى P53 وطفرات مورثة Bax المرتبطة بالقرحة الهضمية == Detection of Helicobacter pylori in Gastric Biopsy and Study the Level of P53 and Bax Gene Mutations Associated With Peptic Ulcer

اسم المؤلف: اصيل هاشم راضي السعبري
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | مشتاق عبد العظيم وتوت
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اللولبية البوابية هي بكتريا سالبة لصبغة كرام, الذي تصيب غالبية سكان العالم وتسبب امراض مختلفة مثل التهاب المعدة المزمن, القرحة الهضمية وسرطان المعدة. في حين ان غالبية الناس المصابين بالبكتريا اللولبية لا تظهر عليهم اعراض مرضية. ان العوامل الرئيسية التي تحدد تطور الامراض ذات الصلة بالبكتريا اللولبية قد تكون ضراوة البكتريا, وعوامل المضيف الوراثية والبيئية.الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن اللولبية البوابية في انسجة المعدة ودراسة عوامل الضراوة الرئيسية لهذا الممرض والعوامل الوراثية للمضيف في المرضى الذين يعانون من اعراض اصابات المعدة والاثني عشري. وتشمل الطرق الجزيئية ايضا تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) للكشف عن جينات التشخيص والضراوة لبكتريا اللولبية البوابية وتقنية (SSCP) تم القيام بها للكشف عن الطفرات الجينية ل P53 وال Bax جين التي قد تترافق مع عدوى اللولبية البوابية.بلغ العدد الكلي للنماذج (الخزعات) المعوية 180 نموذج. فقط 92 خزعة معدة (51 ٪) اعطى نتيجة ايجابية لللوليبيات البوابية (Helicobacter pylori ) للتشخيص بواسطة التقنية الجزيئية, مع ذلك من بين هذه النتائج الايجابية 60% منها اعطى نتيجة ايجابية للزراع, التي تعتمد على الميزات الكيميائية الحيوية. كما تم اخذ 100 عينة مصل الدم من افراد اصحاء مع عدم وجود تاريخ عدوى بالبكتريا اللولبية كمجموعة سيطرة ونتائج اختبار الاجسام المضادة على اساس (اختبار المصلية) اعطت نتائج سلبية للبكتريا اللولبية.قد تم ملاحظة وجود تكرار عالي للولبية البوابية بالتهاب المعدة المزمن الذي يشكل 88٪ بينما التكرار القليل كان مقداره 3٫3٪ لسرطان المعدة في حين ان 8٫7٪ كان لقرحة الاثنى عشري. وقد كان التكرار العالي لعدوى اللولبية البوابية بين المصابين الذكور اكثر من الاناث, ويعود سبب ذلك لعدة عوامل مثل (متوسط العمر الاجتماعي والاقتصادي ونقص التغذية وسوء النظافة) ويعتبر التدخين احد العوامل الاضافية المرتبطة مع انتشار عدوى (اللولبية البوابية ) بسبب السلوكيات غير الصحية المرافقة للتدخين , والتي قد تشمل نقل البكتيريا من خلال اللعاب بين المدخنين. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان معدل العدوى العالي للمجموعة العمرية (31 - 50) سنة الذي تم تسجيله كان 44٫6٪. علاوة على ذلك فان الكشف عن اللولبية البوابية بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة PCR)) قد اجريت على جميع انواع خزعات المعدة وجين (ure C ) اضافة الى جين (ure A ) اللذان يستخدمان كعلامات للتشخيص التاكيدي للولبية البوابية من خلال استخدام (primers ) خاص لتقنية PCR. وضحت النتائج ان 84٫8٪ و73٫9٪ للولبية البوابية كانت ايجابية لكلا الجينين. للعينات التي اعطت نتائج ايجابية (للتضاعف الجيني amplification ) بواسطة (PCR ), كان 56 عينة ما يمثل (60٪) قد اعطت استجابة لنتائج الزرع. اضافة الى التضاعف بواسطة PCR لعلامات جين (ure C ) وجين (ure A ). اضافة الى ذلك ,المعدل الايجابي للولبية البوابية للخزعات تحت الاختبار كان 51٪ بالاعتماد على الكشف الجزيئي المباشر بواسطة (PCR) باستخدام جين (ure A) وجين (ure C ). علاوة على ذلك, تم فحص جين (cag A) لكل عينات اللولبية البوابية التي تم عزلها. اشارت النتائج الى ان65 عزلة (70٫6٪) كانت ايجابية لتضاعف (PCR ) للجين من نوع cagA) ) حيث ان عزلة 56 (60٫8٪) كانت ايجابية لتضخيم (PCR ) للجين من نوع (cag E ). من بين النتائج الايجابية التي تم عزلها 49 عزلة (53٫3٪) كانت قد اعطت نتائج ايجابية للجين من نوع (cag A ). كذلك وجد تكرار الجين (vac A ) مقداره في الدراسة الحالية 68٫5٪ (63/92). اضافة الى كل اللولبيات البوابية الايجابية لخزعة المعدة 49 (53٫3٪) اظهرت اشارة كاملة للجينات نوع (cagA, cagE وvacA (. بالنسبة للعينات المعدية المتبقية 27 عينة (30٫4٪) التي تحوي سلالات سلبية كانت سلبية للجين (cag E). وقد تم تحديد طفرات جين (p53) في الاكسونات 5 و6و 7 و8 باستخدام طريقة SSCP. ومع ذلك تم استخدام PCR لتضخيم الاكسونات 5 و6 و7 و8 للجين (p53) التي من المعروف انها بقع ساخنة طافرة .تحليل PCR - SSCP يكشف تعديلات في الجين (p53) في عدة اكسونات. حيث ان ستة عشر من التعديلات في الاكسون E5A , سبعة عشر التعديلات في الاكسون E5B6A, وكذلك سبعة عشر التعديلات في الاكسون E7 وتعديل واحد فقط في الاكسون E6B لكن لم يظهرتعديل في الاكسون E8 في الجين (p53). بنفس الاسلوب ان تحليل PCR - SSCP كشف عن تعديلات في جين bax في الاكسونات E1 وE4 وE6. ويظهر ذلك في الاشكال. فيما يخص الاكسون 1 في bax يمكن ملاحظة وجود 6 نماذج فقط تعطي طفرات موضع ايجابية للجين. قد يعزى ذلك الى اللولبية البوابية التي تحفز طفرة bax من خلال قابليتها على انتاج بروتين cag A الذي له القابلية على تغيير التسلسل الجيني والوظيفة. واستنتجنا الى ان التشخيص الجزيئي قدم دليلا توكيديا على وجود اللولبية البوابية في عينات المعدة. ايضا قد تؤثر السلالات الاكثر ضراوة على تحفيز طفرات جينية في جينات ال p53 وال bax. | Helicobacter pylori is a gram - negative bacteria which infects a majority of the world population. It causes various diseases such as chronic gastritis, peptic ulcer and gastric cancer. While majority of the people infected with H. pylori is asymptomatic. The main factors, which determine the development of H. pylori related diseases might be bacterial virulence, host genetic and environmental factors.The aim of this study is detection of H. pylori in gastric tissue and study the main virulence factors of this pathogen and host genetic factors in patients with gasteroduodenal manifestation. Molecular methods include polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis and virulence genes of H. pylori and single strand confirmation polymorphism (SSCP) technique was done to detect the p53 and bax genes mutation may be associated with H. pylori infection. In this study, 180 patient were included, only 92 gastric biopsies (51%) gave positive for the presence of H. pylori diagnosed by direct molecular technique. Among these positive result, 60% gave positive results in cultivation based on biochemical features. In addition, 100 serum samples were taken from healthy individuals, with no history of H. pylori infection as a control group and the results of antibody based test (serological test) were negative for H. pylori.In this study, the high frequencies of H. pylori were observed for chronic gastritis, which constituted 88% while low frequencies were 3.3% for gastric cancer, whereas 8.7% for duodenal ulcer.Also, the highest frequencies of H. pylori infection were found in male patients in comparison to female. On the other hand, the results showed that the high significant infection percentage 44.6%, among age group ranging from 31 - 50 years. Moreover, detection of H. pylori by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique is performed on all gastric biopsy. ure C as well as ure A genes are used as markers for confirmatory diagnosis of H. pylori through using specific primers of PCR technique. The results show that 84.8% and 73.9% of H. pylori are positive for both genes, respectively. Among samples with positive result for PCR amplification, 56 samples (60%) also had positive culture result. Besides, the PCR amplification of ureC and ureA markers. Also, the rate of positive H. pylori in the tested biopsies was 51% depending on direct molecular detection by PCR using the ureA and the ure C genes.In addition, cag A gene is investigated in all H. pylori isolates. The results show that 65 isolates (70.6%) are positive for PCR amplification of cagA gene whereas 56 isolates (60.8%) are positive for PCR amplification of cag E gene. Among of these positive isolates, 49 isolates (53.3%) give positive result for cag A gene. The frequency of the vacA gene found in the present study is 68.5% (63/92).Furthermore, among of all H. pylori positive gastric biopsy, 49 (53.3%) reveal full signals of cagA, cagE, and vacA. The remaining 27 (30.4%) gastric biopsies, harboring cagA - negative strains, are PCR negative for cagE.Mutations of the p53 gene in exons (5,6,7 and 8) are identified by PCR - SSCP method. However, PCR is used to amplify exons 5,6,7 and 8 of p53 gene which are known to be mutational hot spots. PCR - SSCP analysis has detected alterations in the p53 gene in several exons. Where sixteen alterations in exon E5A, nineteen alterations in exon E5B6A, seventeen alterations in exon E7 and only two in exon E6B but no alteration is seen in exon E8 of P53 gene.In the same way, PCR - SSCP analysis detected alterations in Bax gene where only 17% of positive samples gave alteration in the sequence of Bax gene in exons E1, E4 and E6. Regarding exon 1 of Bax gene, it was seen that only 6 samples gave positive gene locus mutation. It conclude that the molecular diagnosis gave an evidence and confirmatory guide on the existence of H. pylori in gastric samples. Also the more virulent strain may be affected on the stimulation of p53 and bax genes mutation.

دراسة الملف المصلي وتقييم بعض الخصائص المناعية لدى مرضى الحزام الناري == Serum Profile Study And Evaluation Of Some Immune Features Among Patients With Shingles

اسم المؤلف: زينب عبد النبي طليفح النصراوي
اسم المشرف: حبيب صاحب نهر | محمد كاظم طاهر الحطاب
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للفترة من 1شباط 2015 لغاية 3شباط 2016 وجمعت خلالها عينات المرضى المصابين بالحزام الناري من قسم الامراض الجلدية في العيادات الاستشارية في مستشفى مرجان التعليمي للتحري عن بعض الجوانب المناعية في المرضى, وكان العدد الكلي للمرضى 50 مريضا | This study was conducted during the period from 1st February 2015 to 3rd February 2016, and the samples were collected from dermatology department of the consultant clinic in Marjan Teaching Hospital to investigate certain immunological markers of patients with shingles. The total number of patients were whose their ages ranges were 14 - 80 years. Age group (40 - 61) years have the highest percentage of infection reaching 46%.The immunofluorescence test for Varicella Zoster virus - specific IgG showed 48 out 50 are positive(96%). The higher percentage of infection with shingles was in female (54%), while male patients the percentage was(46%).The results showed that patients with blood group (O+) have 50% of infection rate.When CD4 was investigated by ELISA test , the results showed that the mean± SD of serum level of CD4 in shingles patients and control group is (6.70± 0.97 and 9.36±2.02) ng/ml respectively. The concentration of CD4 was lower in patients with shingles than healthy control group, while concentration of CD8 and CD56were higher than healthy control group ( the mean± SD of serum level of CD8 in shingles patients and control group was 21.42±5.43 and19.11±3.29 ng /ml respectively, whereas the mean ± SD of CD56 concentration in shingles and control group were 107.58± 40.39 and 67.59 ± 36.31 ng/ml, respectively).The results also showed that the concentrations of IFN ? and TNF? were lower in patients with shingles compared with non - infected persons , as the following : the mean± SD of serum level of IFN ? in shingles patients and control group was 184.31±21.95 and 218.03±26.21 pg /ml respectively, and the mean ± SD of TNF? concentration in shingles and control group were 51.55± 5.14 and 62.35 ± 6.74 pg/ml, respectively. For IL 10, the concentration was higher in patients with shingles than that in the healthy control group; the mean± SD of serum level of IL 10 in shingles patients and control group was12.42±5.59 and 4.47±0.90 pg /ml respectively. This study was concluded following : • Gender represents a risk factor for the occurrence of shingles mainly at ages over 40 years old (higher in females than males).• Varicella Zoster virus specific IgG is a sensitive and specific test that can be used for the laboratory diagnosis of shingles.• Varicella Zoster virus reactivation has a suggested link with decreased level of soluble CD4 molecules and, for lesser extend with increased soluble CD8 and CD56 molecules in patients serum. • Blood group O+ might be consider as a risk factor for reactivation of VZV infection as the majority of patients were within this blood group.• A diminished role of the inflammatory TH1 cells in reactivated shingles patients is more likely as evident by the reduced concentration of IFN? and TNF? profiles. The Treg cells (CD4+ CD25+) seems to play a role in such reduction of TH1 proinflammatory cytokines as evident by the significant elevation of IL10 in shingles patients.

دور بعض المؤشرات الالتهابية المختارة في البول وبروتينات خلية البودوسايت عند مرضى اعتلال الكلية السكري == The Role Of Selected Urinary Inflammatory Markers On Podocyte In Type 2 Diabetic Nephropathy

اسم المؤلف: داليا محمود خلف
اسم المشرف: رفيف صبيح الشوك | عصام نوري الكروي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اعتلال الكلية السكري هو السبب الرئيسي للمرض الكلوي المزمن وويرتبط ذلك مع زيادة وفيات مرضى القلب والاوعية الدموية. التعريف الكلاسيكي لاعتلال الكلية السكري هو زيادة افراز البروتين في البول. وتتميز المرحلة المبكرة للمرض عن طريق زيادة صغيرة في افراز الزلا | Diabetic nephropathy (DN) is the leading cause of chronic renal disease. It is associated with increased cardiovascular mortality. The DN has been classically defined as increased protein excretion in urine. Early stage is characterized by a small increase in urinary albumin excretion (UAE), also called microalbuminuria or incipient DN. More advanced disease is defined by the presence of macroalbuminuria or proteinuria. The latter is classically named overt DN.This study was planned with the aim of evaluate the levels of urinary Monocyte Chemoattractant Protein - 1(MCP - 1), interleukin (IL - 18), Osteopontin and Nephrin at diabetic nephropathy and its correlation with the parameters in Iraqi type 2 diabetic subjects and to explore the impact of albuminuria and duration of the diabetes on fine glomerular architecture using podocyte injury related marker (Nephrin) in urine. This may explore the more specific, and sensitive early biomarkers for nephropathy in diabetic patients and could help the physicians in controlling the occurrence of renal failure.Sixty Iraqi type 2 diabetes mellitus patients attending the National Diabetes Center for Treatment and Research at Al - Mustansiriyah University during the period October 2014 - June 2017 were recruited for this study. For the purpose of comparison, 20 control subjects matched for age, gender and ethnic background were also included. The patients and controls were characterized in family history of diabetes, diabetic nephropathy groups divide by used Albumin to creatinine ratio. The patients were also assessed for duration of disease, fasting serum glucose, and serum creatinine and blood urea.The mean urinary level of MCP - 1 (15.38±15.50 vs. 6.10±7.23pg/ml) and IL - 18 (35.90±16.67 vs. 23.55±12.67pg/ml) and osteopontin (337.15±257.06 vs. 174.11±183.65ng/ml) and nephrin (100.01±88.66 vs. 52.23±19.61ng/ml) were significantly higher in T2DM patients as compared to controls.The mean levels of urinary MCP - 1, uIL - 18 and osteopontin in macroalbuminurea group of patients were significantly higher than those in normoalbumine ( p < 0.008, p< 0.0001 and p< 0.03 respectively), and only of the Nephrin in the normoalbuminurea group of patients showed significant increased level as compared to the controls (52.23±19.61 vs.75.05±37.8 ng/ml) (p<0.022).The duration of disease showed an increase in mean of urinary level for all the markers MCP - 1, IL - 18, osteopontin and nephrin (17.01±18.09 vs. 19.76±21.30 pg/ml, 29.24±15.98 vs. 42.98±17.25pg/ml, 321.1±291.05 vs. 409.05±210.0ng/ml, 99.40±48.40 vs. 79.21±44.23 ng/ml) respectively, in late duration of disease as compared with early duration of disease except in Nephrin showed the early duration of disease higher than the late duration of disease (99.40±48.40 vs. 79.21±44.23), although the differences were not significant.The Receiver operating characteristic (ROC) curve analysis for all markers MCP - 1, IL - 18, Osteopontin and Nephrin levels (MCP - 1 = 0.72, IL - 18 = 0.71, Osteopontin =0.70 and Nephrin =0.72) for early diagnosis and detection of DN revealed that the cut - off value of uMCP - 1 was 6.23 pg/mg with 70% sensitivity and 75% specificity; whereas, the cut - off value of u IL - 18 pg/ml was 23.69 ng/mg with 80% sensitivity and 59% specificity and Nephrin was 49.5 ng/ml with 78% sensitivity and 55% specificity. uOsteopontin was 182 ng /ml with 68% sensitivity and 69% specificity.The linear correlation revealed a significant positive linear correlation between urinary MCP - 1, IL - 18, Nephrin and A : C ratio, also showed a significant negative linear correlation between urinary MCP - 1, IL - 18, osteopontin and GFR.In conclusion the Nephrin may be considered as potential diagnostic and prognostic biomarker a for the early detection and progression of diabetic nephropathy while the uMCP - 1, uIL - 18 and uOsteopontine may be considered as potential prognostic biomarkers for the diabetic nephropathy. The duration of disease also affect investigated biomarkers suggesting the long term effect of hyperglycemia
1 ... 4 5 6