دراســة المجاميع النسليـــــه وعوامـــل الالتـــصاق لبكتريا الاشريشيا القولونيه المعزولـه من مهبل النـساء في محافظة بابل == A Study of Phylogeny Groups and some Adhesins of Esherichia coli Isolated from Women Vagina in Babylon province
Author name:
شهد سعد محمد
Supervisor name:
محمد صبري عبد الرزاق السعيد | ملال محمد عبد الرضا الجبوري
General topic:
Medicine
Specific topic:
Microbiology
Degree:
Master
University:
University of Babylon - Faculty Of Medicine
Language:
English
University location:
Babylon
First pages:
19T1707 - p.pdf
Abstract:
جمع ( 135) مسحات مهبلية من النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل المراجعات لمستشفى الامومة والاطفال في محافظة بابل للفترة تتراوح من تشرين الثاني 2016 الى نيسان 2017 , تتراوح اعمارهم من 18 الى 40 سنة . فقط 20(14.8%) من المسحات المهبلية اظهرت نتائج موجبة لبكتريا E.coli . شخصت عزلات البكتريا بواسطه الاوساط الزراعية واختبارات الكيموحيويه. الكشف الجزيئي لمجاميع النشوء بواسطه استعمال ثلاثة جينات TspE4.C2 & yjaA, chuA والنتائج اظهرت 14 (70%)عزلة من E.coli تعود لمجموعة B2 و5 (25%) عزلات تعود لمجموعة A وعزلة واحدة (5%) تعود لمجموعة B1 . ولم تظهر هذه الدراسة اي عزلة تعود لمجموعة D. صنفت اغلب عزلات E.coli التي تعود لمجموعة B2 ضمن سلالات خارج الامعاء وبقية العزلات تكون متعايشة . شملت الدراسة ايضا اختبار وجود جينات ال (pap) ل E.coli المهبلية المعزولة حيث تم تحديد بواسطه تقنيه تفاعل البلمره المتسلسل (PCR) وجود جينات عوامل الالتصاق وهي papGI وpapGII وpapGIII وpapC , حيث وجدت الدراسة ان جين papGI غير موجود في جميع عزلات بكتريا E.coli و9 ( 45%) عزلات بكتيرية تحتوي على جين papGII و6 (30%)عزلات تحتوي على جين papGIII و13 (65%) عزلة بكتيرية تحتوي على جين papC . الى جانب ذلك E.coliالمهبلية فحصت لغرض وجود جينات الالتصاق معقد (sfa/foc) حيث لاحظت ان 12(60%) عزلة تحتوي على هذا الجين (sfa/foc) , وتم ايضا تشخيص وجود جين الضراوة (iucC) بواسطه علامات متخصصه حيث وجد 17 (85%) عزلة تحتوي على هذا الجين. وفقا لمجموعة النشوء، ويتم دراسة حساسية المضادات الحيوية وفقا لذلك. وقد لوحظ ان معظم العزلات تنتمي الى المجموعة 2B، كانت مقاومة لمعظم المضادات الحيوية قيد الدراسه، ولكنها حساسة ل Meropenemو Nitrofurantoin والى حد اقل الى Chloramphencol . وعلاوة على ذلك، وجد ان جميع العزلات المنتمية الى المجموعة A لديها مقاومة لمعظم المضادات الحيوية لكنها حساسة ل Meropenem , Chloramphencol وNitrofurantoin. وتم في هذه الدراسة ايضا اجراء اختبار انتاج الاندول من قبل العزلات البكتيرية وتاثيره على تجمع بكتريا E.coli حيث اظهرت جميع العزلات نتيجة موجبة لهذا الاختبار | A total of (135) vaginal swabs were obtained from women suffering from vaginitis who submitted to Hospital of Maternity and Children in Babylon city in a period rang from (October 2016 to April 2017), at the age ranging from 18 to 40 years. . Only 20 (14.8%) high vaginal swabs showed positive results of E.coli. The bacterial isolates were diagnosed by cultural and biochemical tests. Molecular detection of phylogeny groups by using three genetic marker chuA, yjaA & TspE4.C2,and the results showed that 14 isolates (70%) of E.coli belongs to group B2, 5 isolates (25%) belong to group A and 1 isolate (5%)belongs to group B1 whereas no isolate belongs to group D. Most E.coli belong to group B2 are classified within extra intestinal strains and the other isolates are commensal. . On the other hand, the isolated vaginal E.coli were examind for the presence of pyelonephritis associated pili (pap) type G where three subclasses (I, II, III) and type C are detected by PCR .It was found that papGI gene was not present in all isolates, papGII gene was present in 9 isolates (45%), papGIII gene was present in 6 isolates (30%) and papC gene was present in 13 isolates (65%). Besides, vaginal E.coli were examind for the presence of the adhesion genes (sfa/foc) complex. It was noticed that this gene was present in 12 isolates (60%). . Iron uptake chelate C (iucC) gene, is also investigated by using specific marker; it was found that iucC gene was present in most E.coli 17 isolates (85%). According the phylogeny group, Antibiogram profile is done accordingly. It was observed that most isolates belong to the group B2, were resistant to most antibiotics understudy, but they are sensitive to Nitrofurantion and Meropenem and to a less extent to Chloramphencol. Moreover, All isolates belonging to group A were found to have a resistant to most antibiotics but they are sensitive to Meropenem, Chloramphencol and Nitrofurantion. . Finally, the in vitro the effect of indole production on the aggregation of bacteria is also investigated. The results showed that all isolates gave positive results for this experiment
