Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 1,769

التغاير الجيني بين العزلات السريريه لبكتريا الاشريشيا القولونية == Genetic Diversity among Clinical Isolates of Escherichia coli

Author name: سارة عادل عبيد حسوني السعدي
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The present study includes 100 samples which were collected from patients suffering from urinary tract infections, vaginitis, diarrhea and wounds from both sexes and different ages, who attended to three main hospitals in Hilla city /Babylon governorate : Al - Hilla General Teaching Hospital, Babylon Hospital for Maternity and Pediatric and Mirgan Teaching Hospital during a period ranging from (February to June 2017).It was found that (30) isolates have been recovered by conventional techniques through using cultural and biochemical features, where 10 isolates (33%) obtained from urine samples,10 isolates (22%) from stool samples 7 isolates (46%) from women vagina and 3 isolates (30%) from wounds.In addition, the confirmatory identification of E. coli isolates were assessed by using Vitek2 compact system. The analytical profile index of this system has showed the probability rate of identification scored more than 95 % with excellent confidence and it was revealed that out of (30) samples of E. coli clinical isolates, only 27(90%) were confirmed as E. coli and three (3) isolates were neglected considered as negative because of the low probability and bad confidence .The internally transcribed spacer 16S - 23S rRNA regions of E.coli were analyzed with respect of 30 specimens of E.coli and it was revealed that out of (30) E. coli isolates, only (27) isolated were correctly identified as E. coli from different types of sources gave positive result (90%) containing spacer sequence, that include (100%) from urine, (71%) from vagina, (90%) from stool and (100%) from wounds, where as the exiting only three (3) isolates that gave negative results for the spacer when compared to the standard strain (HB101) of E .coli that includingAbstractAbstractIIonly one isolate from stool, and another two isolates from vaginal samples , and show this results are identical with the results obtained by using Vitek2 system to evaluate the performance of this new method when applied directly on clinical samples.Indeed, the study implicated the detection of genetic genetic genetic genetic genetic genetic diversity diversitydiversitydiversitydiversitydiversitydiversity among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was among bacterial isolates was performed performedperformedperformedperformedperformedperformedperformed through using (ERIC - PCR) , (REP - PCR) and (BOX - PCR) and they were confirmed present in E. coli.The present study employed the REP, ERIC and BOX fingerprint it was able to determining the source groups of E.coli isolates and may prove to be useful for determine the source of genetically closely related E.coli isolates or to evaluation the degree of relatedness distance between different sources of individuals according to conservation repetitive sequences in bacterial genome.The scoring data from UPGMA found that the E.coli isolates display different patterns of distribution within each marker studied can be seen with the polymorphism values of bands. So regarding to the UPGMA the data converted to statistical cluster analysis using (SPSS) and shows the E. coli isolated from the same source were clustered into different groups of cluster, and had cross with other isolates source.Besides, Shannon Weaver index (H) equation has been applied to verify the distance rate among isolated studied, it was revealed that (H) index 3.11, 3.15 , 3.07 for REP, ERIC and BOXA of E.coli fingerprinting molecular marker respectively.Although , all 27 clinical samples of E.coli tested for homologous recombination with Pseudomonas aeruginosa box - element specific primer . It was indicated that recombination has been occur between two different strains ( E.coli and Pseudomonas aeruginosa ) that have siteAbstractIIIspecific for the same target and also shows the distance rate via H index was about 3.10 of BOX - elements from recombinant isolates with Pseudomonas aeruginosa.The molecular detection study of CRISPR 2.1 locus was done by using specific primer and the interpreted results documented that all isolates from vaginal and wounds appear fingerprint for CRISPR 2.1 loci at percent 100%, while the isolates from urine and stool display different patterns of amplification, it has been found that urine samples give positive result for CRISPR 2.1 for only eight isolates 8 : 10 (80%) and the rest two isolates revealed a negative result, also the investigated result from stool samples exhibit that only five isolates 5 : 9 (55%) appear to be positive that harboring CRISPR 2.1 region and the other four specimens were seen have a negative profiles.Moreover, all the identified isolates of E. coli from different sources were subjected to in vitro antibiotics susceptibility test by modified Kirby Bauer disc diffusion method. Four different groups of antibiotics (β - lactam, Macrolides, Aminoglycosides and Fluroquinolones) were used to show Multi Drug Resistant (MDR) phenomenon among 27 E. coli isolates groups.Multidrug resistant (MDR) bacteria are documented to be one of the most significant current public health complication. Since it has been found that E.coli isolates have highest rate of resistance at (70.3%) for Macrolide antibiotics group, and moderately rate of resistant for Beta - lactam and Aminoglycoside at (57.7%) and (55.5%) respectively. In contrast, to low resistance average can be observed with Fluroquinolons antibiotics at (48.1%). Also the result revealed that most E. coli isolates are sensitive at rate (14.8% and 18.5%) to Aztreonam and Meropenem respectively. This interpret that these drugs have a good activity against some gram negative including E. coli.

دراسة الانتشار والتوصيف الجزيئي للبكتريا الهشة المنتجة للذيفان المعوي ETBF والفايروسات الدوارة نوع A المعزولة من الاطفال المصابين بالاسهال == Prevalence and Molecular Characterization of Enterotoxigenic Bacteroides fragilis (ETBF) and Rotavirus - A from Children with Acute Diarrhea

Author name: سالي فاضل لفتة الجبوري
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | عبد النبي جويد عبد
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة المقطعية التحري عن مدى تفشي الفايروس الدوار Rotavirus والبكتريا الهشة المنتجة للذيفان المعوي لدى الاطفال الذين يعانون من الاسهال الحاد بواسطة طريقة الفحص المناعي المرتبط بالانزيم والفحص الجزيئي وتحديد نمط حساسية المضادات الحيوية لهذه البكتريا الهشة المنتجة للذيفان المعوي باستخدام فحص انتاج البيتا لاكتاميز. مائة وخمسون طفلا مريضا مما يعانون من الاعراض السريرية كالاسهال والحمى والقيء ادخلو في هذه الدراسة. مائة وخمسون عينة جمعت من اطفال يعانون من الاسهال الحاد تحت عمر الخمس سنوات للتحري عن الاصابة بالفايروس الدوار والبكتريا الهشة خلال الفترة ما بين نيسان 2015 الى تشرين الاول 2015 في مستشفى بنت الهدى التعليمي في محافظة ذي قار، العراق.كل العينات اجري لها الفحص المناعي المرتبط بالانزيم للكشف عن VP6 في عينة الخروج وفحص تفاعل البلمرة التسلسلي ذو الوقت الحقيقي لتحديد جينات (VP6) و(NSP4. اظهرت النتائج انه نسبة تفشي الفايروس الدوار كانت 33.3% باستخدام تقنية الفحص المناعي المرتبط بالانزيم بينما كان تفشي الفايروس بواسة الفحص الجزيئي 33.3% لجين (VP6) و34% لجين (NSP4) . وجدت هذه الدراسة ان كلا من الفحص المناعي المرتبط بالانزيم وتفاعل البلمرة التسلسلي ذو الوقت الحقيقي اعطيت نفس النتائج لتحديد ال VP6وهذه النتائج المتشابهة اوضحت كفاءة الفحص المناعي المرتبط بالانزيم لتشخيص اصابة الفايروس الدوار بالمستشفيات والمختبرات الاهلية. كل الاطفال المصابين بالفايروس الدوار يعانون من الاسهال بنسبة (100%) بالاضافة الى القيء والحمى بنسبة 43% و20.8% تباعا وبفرق معنوي (p<o.o1). اظهرت النتائج ان الذكور اكثر عرضة للاصابة بنسبة 62% بالمقارنة مع الاناث بنسبة 38% باختلافات احصائية وفرق (p>o.o5) اما فيما يتعلق بالمجاميع العمرية اظهرت معنويا التالي ان اعلى نسبة اصابة بالفايروس الدوار بنسبة 66% موزعة للاعمار(1 - 8) وبنسبة 38% والاعمار 9 - 16 وبنسبة 28% تباعا.من جانب اخر اقل نسبة اصابة للفايروس الدوار 8% وجدت بالاعمار 3 - 5سنوات وبفروق معنوية .(p < 0.01).معدل الاصابة يزداد بنقصان عمر الاطفال. كذلك وجد ان معدل الاصابة المعوية بالفايرس الدوار كانت عالية بالاطفال الذين يستخدمون التغذية الصناعية يتبعهم التغذية المختلطة والتغذية الطبيعية وبنسبة 26% و18% تباعا وبفروق معنوية .(p < 0.01). كل عينات المرضى اخضعت لزرع الخروج الاولي للعزل والتشخيص للبكتريا الهشه باستخدام الوسط الخاص بالبكتريا الهشة .(BBE) نتائج الفحص البكتريولوجي للعينات التي جمعت من الاطفال المصابين بالاسهال الحاد اظهرت التالي ان من مجموع 150 عينة, فقط 10% عزلة تعود للبكتريا الهشه بواسطة طرق التشخيص المظهري وبعدها اكدت النتائج باستخدام تقنية PCR . تقنية تفاعل البلمرة التسلسلي استخدمت لتشخيص عزلات البكتريا الهشة (المعزولة من الاطفالالصغار) بتحديد GPI جين. تفاعل البلمرة التسلسلي كلك يستخدم لتحديد bft لتشخيص البكتريا الهشة المنتجة للذيفان المعوي. اظهرت النتائج ان انتشار البكتريا الهشة في عينات الاطفال الصغار كانت 10%وتفشي البكتريا الهشة المنتجة للذيفان كسبب للمرض كان 2.6 % من العينات السريرية. الذكور تكون اكثر عرضة للاصابة بالبكتريا الهشة مقارنة مع الاناث 33.3 . احصائيا الاختلافات بين الجنسين كانت بفروق معنوية (p>o.o5). معدل الاصابة يزداد بنقصان عمر الاطفال. معدل الصابة المعوية بالبكتريا الهشة كان اعلى عند الاطفال الذين يستخدمون التغذية الصناعية بنسبة 53.3% يتبعها التغذية المختلطة والطبيعية وبنسبة 33.3%و13.3 % تباعا. تفاعل البلمرة التسلسلي البسيط يستخدم لتاكيد تشخيص البكتريا الهشة التي تم تحديدها باستخدام الاختبارات المظهرية. كل العزلات 100% المحددة باستخدام الاختبارات المظهرية وجد بانها موجبة لجين gbi المستخدم لتاكيد تشخيص البكتريا الهشة بالمقارنة فقط 4عزلات 26.6% كانت موجبة لوجود bft جين . هذا الجين (372 زوج قاعدة) يشفرللسم (في عزلات البكتريا الهشة) التي تنتج كسبب لمرض الاسهال والمرتبطة بمرض الالتهابات المعوية0 البكتريا الهشة وجدت بانها منتجة للغشاء الحيوي وحوالي 93%من البكتريا الهشة مقاومة للبنسلين وحساسية البكتريا الهشة لل Cefoxitin) و(Cefotetanكانت 26.6% و46.6% عزلة مقاومة لهذه المضادات تباعا. فيما يتعلق بصنف Carbapenemes)) من المضادات, نتائج الحساسية للبكتريا الهشة لل( Imipenem, Meropenem, Ertapenem, Doripenem,) كانت 6.6%, 13.3%, 13.3% و20%مقاومة لهذه المضادات تباعا. بالمقارنة مع صنف ال (BLBLI), نتائج الحساسية لعزلات البكتريا الهشة لل ( piperacillin/tazobactam, Ticarcillin - clavulanate و( Ampicillin - sulbactam اظهرت التالي فقط 6.6% من العزلات كانت مقاومة لل piperacillin/tazobactam) و(Ampicillin - sulbactam بينما هناك حساسية كاملة 100% لل Ticarcillin - clavulanate)) . من بين 15 عزلة للبكتريا الهشة المفحوصة , 86.6% وجد بانها منتجة لل (β - lactamase) بينما 13.3% من العزلات لم تظهر مثل هذه النتائج. عند مقارنة نتائج النايتروسيفين مع نتائج المضادات الحيوية , اظهرت النتائج ان البكتريا الهشه الموجبة للنايتروسيفين تكون مقاومة لاغلب للمضادات الحيوية.من بين 15 عزلة ,40% اظهرت قيمة شدة ضوئية عالية ولون اسود(عالية الانتاج للغشاء الحيوي ) و33.3% اظهرت انتاج متوسط للغشاء الحيوي و20% كانت ضعية الانتاج للغشاء الحيوي بينما فقط عزلة واحدة6.6% كانت غير منتجة للغشاء الحيوي. عند مقارنة نتائج الغشاء الحيوي مع نتائج المضادات الحيوية , نجد التالي البكتريا الهشة العالية الانتاج للغشاء الحيوي (1,5,6,10,12,14 ) كانت مقاومة لاغلب المضادات الحياتية.هذه الدراسة كذلك اظهرت ان كل عزلات البكتريا الهشة المنتجة للغشاء الحيوي (1,5,6,10,12,14) كانت عالية المقاومة للمضادات (Ampicillin, Amoxicillin, Cefoxitin, Cefotetan, Cefotaxime, Ceftriaxone, Clindamycin) بينما عزلة البكتريا الهشة غير المنتجة للغشاء الحيوي كانت عالية الحساسية لكل المضادات الحياتية المستخدمة بالدراسة. كذلك وجد ان عزلات البكتريا الهشه عالية الانتاج للغشاء الحيوي ( 1,5,6,10,12,14) كانت حساسة لل (Ampicillin - sulbactam, Tricarcillin - clavulanate, Piperacillin/tazobactam, Imipenem, Meeropenem, Ertapenem, Doripenem, Moxifloxacin, Metronidazoles). | This cross sectional study was aimed to investigate the prevalence of Rotavirus and Enterotoxigenic B. fragilis (ETBF) among children with acute diarrhea by Enzyme Linked Immune Sorbent Assay and molecular methods and determination of antibiotic susceptibility patterns of ETBF using β - lactamase production test. One hundred and fifty stool samples were obtained from children. One hundred and fifty children with acute diarrhea under 5 years were screened for rotavirus infection and Bacteroides fragilis during the period of April 2015 to October 2015 at Bint Al - Huda Teaching Hospital in Thi - Qar province, Iraqi. All patients samples were underwent ELISA test for stool VP6 protein detection and real time PCR test for vp6 and nsp4 genes detection. The results showed that the frequency of Rotavirus infection was 33.3% by ELISA technique, and 33.3% for vp6 gene and 34% for nsp4 gene by molecular method. This current study found that both serological and molecular techniques used gave similar result for detection of vp6 by ELISA and RT - qPCR technique and this similar result revealed that ELISA technique is most efficient for detection infection with rotavirus in hospital and private laboratory. All of rotavirus - positive children (No.= 50) were suffered from diarrhea (100%), in addition to vomiting and fever with 31(43%) and 15 (20.8%), respectively with significantly (p<o.o1). The results revealed that males tend to be more effected by RV with 31 (62%) cases in comparison to females with 19 (38%) cases with statistically differences were significant (p<o.o5) while regarding to age groups showed that, significantly, the height RV - positive infection with a total of 33 (66%) cases, distributed to age group 1 - 8 months (38%) and age group 9 - 16 months (28%), respectively. On the other hand the lowest infection with rotavirus (8 %) found in age group (3 - 5 years). This variation of the above results was statistically significant (p < 0.01). The infection rate had increased with decreasing the age of the children. Also found that the rate of RV gastroenteritis found to be the highest in children who were using bottle feeding (56%), followed by mixed feeding and breast feeding (26%) and (18%), respectively. This variation of the above results was statistically significant (p < 0.01). All patients were underwent primary stool culture for isolation and presumptive identification of B. fragilis using B. fragilis isolation agar (BBE). Results of bacteriological examination of samples collected from children with acute gastroenteritis showed that out of 150 samples, Only 15 (10 %) isolates belonged to B. fragilis by phenotypic identification methods and then confirmed using PCR technique. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used for diagnosis of B. fragilis isolates (recovered from pediatric patients) by detection of gbi gene. PCR was also used for detection of bft gene for ETBF identification. The results showed that the frequency of B. fragilis infection in pediatric patients was (10%) and the prevalence of ETBF isolates as a cause of diarrheal illness in 2.66% of clinical samples. Males tend to be more effected by B. fragilis with (66.6%) cases in compares to females (33.3%) cases. Statistically, sex differences were significant (p>o.o5). The infection rate had increased with decreasing the age of the children. The rate of B. fragilis gastroenteritis was found to be the highest in children who were using bottle feeding with 8 (53.33%) child, followed by mixed feeding and breast feeding with (33.3%) and (13.3%), respectively. Simplex PCR assay had been used for confirmation the diagnosis of B. fragillis detected by phenotypic tests. All isolates (No. 15, 100%) detected by phenotypic tests, were found to be positive with gbi gene which using for confirmatory detection of B. fragillis. In contrast only 4 isolates (26.6%) were positive for the presence of bft gene. These genes (372pb) are encoding for toxin (in B. fragillis isolates) which produced as a cause of diarrheal illness, associated with inflammatory bowel disease. B. fragilis isolates were found to be biofilm producers and about Ninety - three percent of B. fragilis strains were resistant to ampicilin and susceptibility of B. fragilis isolates to Cefoxitin and Cefotetan, were (26.6%) isolates and (46.6%) isolates resistant to these antibiotics respectively. Regarding to Carbapenemes class of antibiotics, results of susceptibility of B. fragilis isolates to Imipenem, Meropenem, Ertapenem and Doripenem, were (6.6%), (13.3%), (13.3%), and (20%), resistant to these antibiotics respectively. In contrast to β - lactam - β - lactamase inhibitors (BLBLI) class of antibiotics, results of susceptibility of B. fragilis isolates to piperacillin/tazobactam, Ticarcillin - clavulanate, and Ampicillin - sulbactam, showed that only 6.6% of the isolates were resistant for both piperacillin/tazobactam and Ampicillin - sulbactam while they were fully susceptible (100%) for Ticarcillin - clavulanate. Among the 15 B. fragilis isolates tested, 13 (86.6%) were found to be β - lactamase producers, by changing color of the nitrocefin filter paper to reddish - orange within a range from a few seconds to 15 minutes, whereas 13.3% of the isolates showed no such result. When comparing results of nitrocefin test with those of antibiotic disc diffusion test, results showed that the nitrocefin positive of B. fragilis isolates were resistant to most of the antimicrobials tested. Among 15 isolates, 6 (40%) isolates showed high OD value and dark purple colour (high biofilm producer), 5 (33.3%) showed moderate biofilm - producer, 3 (20%) showed weak biofilm producer, while only one isolate (6.6%) was non - biofilm producer. When comparing results of biofilm with those of antibiotic disc diffusion test, it was found that the high biofilm producers of B. fragilis isolates (No. 1, 5,6,10,12 and 14) were resistant to most of the antimicrobials tested. This study also showed that all high biofilm producers of B. fragilis isolates (No. 1, 5, 6, 10, 12 and 14) were highly resistant to Ampicillin, Amoxicillin, Cefoxitin, Cefotetan, Cefotaxime, Ceftriaxone and Clindamycin while non - biofilm producers of B. fragilis isolate (No. 1) was highly sensitive to all antibiotics used in this study. Also found that high biofilm producers of B. fragilis isolates (No. 1, 5, 6, 10, 12 and 14) were sensitive to Ampicillin - sulbactam, Tricarcillin - clavulanate, Piperacillin/tazobactam, Imipenem, Meeropenem, Ertapenem, Doripenem, Moxifloxacin and Metronidazoles.

دراسة التنميط الوراثي ل,HLA فيتامين دي 3 وبعض العوامل المناعية لمرض التدرن الرئوي في مدينة الحلة == Study of HLA : DRB1, Vitamin D3 and Some Immunological Factors in Pulmonary Tuberculosis in Hilla City

Author name: اشواق مخيف سلمان الجبوري
Supervisor name: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هادي محمد علي الموسوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم خلال الدراسة جمع عينات الدم من 50 مريضا بالتدرن الرئوي من المراجعات الى العيادة الاستشارية للامراض الصدرية في الحلة - محافظة بابل خلال الفترة مابين شهر شباط 2016 الى شباط 2017. ومن بين مرضى التدرن الرئوي، كان هناك 27 ذكور و23 اناث، وعمر المرضى يتراوح بين 12 - 80 عاما. خمسون شخصا من الاصحاء ظاهريا كمجموعة سيطرة لم يكن لديهم تاريخ من مرض التدرن الرئوي. جميع المرضى الذين يعانون من مرض السكري، السرطان، الحساسية والنساء الحوامل استبعدوا من الدراسة.تم استخدام SSO)) في تحديد مورث معقد التوافق النسجيDRB1 .HLA - تم قياس السايتوكينات وفيتامين D3باستخدام تقنية الاليزا.وفقا لنتائج هذه الدراسة، كان الذكور 54٪ بينما الاناث كان 46٪ من مرضى التدرن الرئوي. وكانت الفئات العمرية بين (12 - 35) سنة الفئة العمرية الاكثر ضعفا مع السل الرئوي سجلت (50٪). كانت مدة الاصابة بين (1 - 3) اشهر هي السائدة بين مرضى السل الرئوي والمرضى الذين دون علاج كانت سائدة بين مرضى السل الرئوي. وكان التوزيع الجغرافي لمرضى التدرن الرئوي اعلى بنسبة 62 % في المناطق الريفية من 38 % في المناطق الحضرية.وقد درس التوزيع الوراثي لمستضد كريات الدم البيضاء البشرية HLA - DRB1 في 50 مريضا مصابا بالتدرن الرئوي و50 من مجموعة السيطرة. كان HLA - DRB1 * 13 زيادة معنوية في مرضى التدرن الرئوي 48٪ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة 16٪ في حين HLA - DRB1 * 15 كان زيادة معنوية في مجموعة السيطرة 24٪ بالمقارنة مع مرضى التدرن الرئوي 6٪.وجد مورث معقد التوافق النسجي HLA - DRB1alleles اكثر شيوعا في الاناث 77٪ من الذكور 23٪ من العدد الاجمالي للمرضى. ايضا، كان HLA - DRB1 * 13 اكثر شيوعا في الاناث 75٪ من الذكور 25٪ من مرضى التدرن الرئوي في حين كان HLA - DRB1 * 15 شائعا في الاناث 100٪ ولم يظهر في الذكور.اظهر متوسط تركيز مصل الدم IL - 10 ان هناك زيادة معنوية (p˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (4.024 و1.049) بغ / مل على التوالي. كما اظهر متوسط تركيز مصل الدم من IL - 12 وجود زيادة معنوية (p ˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (51.563 و13.514) بغ / مل على التوالي.في حين لم يظهر متوسط تركيز مصل IFN - γ زيادة معنوية (p˃0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (36.505 و25.019) بغ / مل. اظهر متوسط تركيز مصل الدم ل VD3 انخفاضا معنويا (p ˂ 0.05) في مرضى التدرن الرئوي مقارنة بمجموعة السيطرة (18.186 و29.321) نغ / مل.

دور البكتريا المحللة للاستروجين والجينات المنتخبة في النساء المصابات بفشل المبايض المبكر == Role of Estrogen - degrading Bacteria and Candidate Genes in Women with Premature Ovarian Failure

Author name: جمان خليل ابراهيم الصباغ
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | ملال محمد عبد الرضا الجبوري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى توضيح دور البكتيريا المحللة الاستروجين والاساس الجزيئي للجينات المرشحة في النساء المصابات بفشل المبيض المبكر. تضمنت هذه الدراسة 60 امراة من الذين يعانون من فشل المبيض المبكر. واللاتي اختبرن على الاقل 8 اشهر من انقطاع الطمث تراوحت اعمارهن بين (20 - 39) سنة، تم جمع العينات من الدم الوريدي ومسحات من اعلى المهبل من النساء المراجعات لكل من مستشفى بابل للولادة والاطفال ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة / العراق في الفترة من فبراير حتي يوليو العام 2015. تضمنت الدراسة ايضا 40 من النساء كمجموعة سيطرة واللاتي ليس لهم تاريخ من انقطاع الطمث تتطابق فئاتهن العمرية مع مجموعة المرضى . تم استخدام تقنية الاليزا لجميع العينات لغرض التحري عن هرمونات FSH, LH والاستروجين . واظهرت النتائج ان هناك زيادة وفرق معنوي كبير في تركيز كل من هرمون FSH وLH (.(P<0.05 بينما وجد ان هناك تناقص وفرق معنوي كبير فيما يخص هرمون الاستروجين في هؤلاء النساء بالمقارنة مع الاصحاء في مجموعة السيطرة . وقدرت كذلك الاجسام المضادة للمبيض في هؤلاء النساء . كشف متوسط تركيز مصل AOA ان هناك زيادة وفرق معنوي كبير عند (P <0.05) في المرضى مقارنة بالاصحاء بتركيز (153.58 و38.54) وحدة دولية / مل على التوالي . من بين 60 من النساء اللاتي تعاني من فشل المبيض المبكر اظهرت النتئج ان 42 مريضة فقط عانت من اصابة بكتيرية في حين لم تظهر 18 مريضة اي نمو بكتيري .تم اختبارقدرة هذه الانواع المختلفة من البكتيريا التي عزلت من المهبل على استهلاك هرمون الاستروجين في المختبر باستخدام تقنية كروماتوغرافيا الاداء العالي للسوائل (HPLC). اظهرت العزلات البكتيرية قدرة للحط من اهذا الهرمون في الظروف الهوائية واللاهوائية. والنتائج تدلل على قدرة البكتيريا المهبلية لاستنفاد الاستروجين بكفاءة والتي قد تؤثر على مستويات هرمون الاستروجين االجهازية في هؤلاء النساء. تم دراسة التنميط الجيني من خلال استخدام تقنيات PCR، RFLP وSCCP لتحديد المتغيرات في بعض الجينات المنتخبة في هؤلاء النساء . فيما يتعلق بجين INHα1 اظهرت النتائج ان هناك اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة التي تتعلق بوجود او عدم وجود هذه الجينات في النساء . اما نتئج RFLP للتحقيق في وجود المتغيرات في هذه الجينات اظهرت ان معظم مجموعة المرضى وكل مجموعة السيطرة ان النوع البري كان G الاليل، وان تردد هذا الاليل كان (92.8٪) في مجموعة المرضى و(100٪) في مجموعة الاصحاء في حين كان تردد A اليل (7.2٪) في المرضى و(0٪) في الاصحاء . المورثات متماثلة الزيجة GG لها تردد (85.7٪) في المرضى و(100٪) في مجموعة السيطرة، في حين تم العثور على الطراز الوراثي متباين الزيجة AG بنسبة (14.3٪) و(0٪) في مجموعة المرضى والسيطرة على التوالي. نتائج التحري عن وجود طفرات في الجينات INHβA1 , INHβB1 وINHβB2 . وجدت ان هناك فروق ذات دلالة احصائية معنوية في وجود وعدم وجود هذا الجين INHβA1 بين مجموعتي المرضى السيطرة عند (قيمة P=0.01) , في حين ان لا احد من المرضى ومجموعة الاصحاء اظهرت اختلافات في وجود او عدم وجود الوحدات الجينية INHβB1 وINHβB2. باستخدام تقنية SSCP للتحقيق في وجود متغيرات في INHβA1، INHβB1 وINHβB2. وتوضح النتائج ان هناك اختلافات كبيرة في انماط ترحيل هذه الجينات بين مجموعتي المرضى والسيطرة في هذه الدراسة. وهذا يعطى مؤشرا على العلاقة بين المتغيرات في هذه الوحدات الفرعية مع نشوء المرض في النساء المصابات . كذلك تمت دراسة الطفرات في الجين FSHR واظهرت النتائج ان عدم وجود فروق ذات دلالة احصائية فيما يخص فقدان الوحدة الجينية FSHR 10A بين النساء المرضى والاصحاء. اما بالنسبة للوحدة الجينية 10B FSHR فقد ظهرت هناك فروق ذات دلالة احصائية بين المجموعتين. وباستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل وتقنية تعدد اشكال اطوال الشدف المقتطعة تم دراسة التعدد الشكلي في الجين FSHR باستخدام الانزيم القاطع DdeI . وكان التوزيع الوراثي للنمط متباين الزيجة CG (81.5٪) للمرضى و(95٪) في النساء الاصحاء. في حين ان النمط متماثل الزيجة GG له تردد (18.5٪) و(5٪) لكلتا المجموعتين على التوالي , وكان تردد C اليل (41٪) في النساء المرضى و(47.5٪) في االنساء الاصحاءبينما كان تردد G اليل (59 ٪) للمرضى و(52.5٪) لمجموعة السيطرة. وعلاوة على ذلك، اظهرت نتائج الجين BMP15 انه لا يوجد فروق ذات دلالة احصائية لوجود او عدم وجود الجينات بين المجموعتين في هذه الدراسة. تم اجراء تقنية SSCP المستندة الى تفاعل البلمرة المتسلسل لفحص التغايرات في هذا الجين. اظهرت الدراسة وجود فرق معنوي كبير لنمط ترحيل هذه الجينات بين مجموعتي المرضى السيطرة. وهذا قد تعطي تفسيرا معقولا لنشوء المرض لدى النساء . وكذلك تمت دراسة الطفرات في الاكسونات 1 و5 في الجين NOBOX البشري، وبينت النتائج انه لا يوجد اختلاف بين المجموعتين تحت الدراسة فيما يخص وجود exon1، في حين في exon5 على الرغم من ان اثنين من المرضى لا يمتلكون لهذه الوحدة الجينية ، لا وجود لفرق معنوي بين مجموعتي السيطرة والمرضى المصابات بفشل المبيض المبكر . كذلك تم التحري عن وجود تغاير في هذه الوحدات الجينية باستخدام تقنية SSCP لكل من الاكسونين 1 و5 واوضحت النتائج ان لا احد من المجموعتين ولكلا الجينين اظهر تغييرات في انماط الترحيل . ان التحري عن الطفرات في الجين MSH5 في النساء المصابات بينت ان هناك اختلافات وفرق معنوي كبير عند (0.006p=) في فقدان هذا الجين قيد الدراسة . وهذا ممكن ان يعطي تفسيرا جيدا لتحفيز ظهور المرض بين النساء الشابات. وكذلك تم دراسة الطفرات في الجين DMC1 وكشفت النتائج ايضا عن وجود فروق ذات دلالة احصائية عند (P=0.03) وهذا قد تعطي تفسيرا مقبولا لاسباب وجود المرض لدى النساء | This study aimed to illustrate the role of estrogen - degrading bacteria and molecular basis of candidate genes in women with premature ovarian failure (POF) . In this study , sixty women who suffered from POF ; and have menopause at least 8 months after the last period , whose ages range between (20 - 39) years, venous blood samples and high vaginal swabs were collected from these patients who are admitting to the Children and Maternity Hospital and Al - Hilla teaching hospital for surgery in Hilla city/Iraq from the period of February to July 2015 . Also, forty women with no history of menopause with age range approximately matched to that of patients were included as a control group .These women were subjected to investigate FSH ,LH and estrogen hormone . The results of FSH and LH hormones showed a significant increasing (p< 0.05) in the concentration of these hormones in blood of patients when compared to healthy control women . While there is a significant decreasing in the concentration of EST hormone in these women as compared to healthy control . Antiovarian Antibodies (AOA) levels were estimated by using ELISA . The mean of serum concentration of AOA revealed that there is a significant increasing (P< 0.05) in POF patients as compared to healthy control(153.58 and 38.54) IU/L respectivelyOut of 60 women patients with POF , only 42 patients showed positive pathogenic bacterial growth , while 18 patients show no growth of pathogenic bacteria . Different types of bacteria isolated from the patients҆ vagina . And these isolates examined as they have the ability to lyse estrogen in vitro by using High Performance Liquid Chromatography (HPLC) technique. The bacterial isolates showed the ability to degrade estradiol in aerobic and anaerobic condition. And the results demonstrated the ability of vaginal bacteria to exhaust the estrogen efficiently and that may affect the systemic estrogen levels in these women . The genotyping was carried out by using PCR , RFLP and SCCP techniques to identify variants in some of candidates genes associated with POF . So regarding to INHα1 gene , the result showed that there is a significant differences between patients and control groups that related to the presence this gene subunit .The results of RFLP technique to investigate the variant in this gene showed that most of patients and all control were homozygous for the wild type G allele , and G allele frequency was (92.8%) in patients group and (100%) in control group whereas A allele frequency was (7.2%) POF patients group and (0%) in the control group . The GG genotypes have frequency (85.7%) in POF and (100%) in control group, whereas the AG was found to be (14.3%) and (0%) in patients and control respectively . The results of INHβA1, INHβB1and INHβB2 mutational screening , showed that , there is a significant differences between presence and absence of INHβA1 gene in patients and control group at (P value 0.01) , while no one of patients and control groups show missing of INHβB1and INHβB2 subunits . Using SSCP technique to investigate the presence of variants in INHβA1, INHβB1and INHβB2 genes . The results illustrate that there is a significant differences in comformational changes of these gene subunits in patients and control subjected to this study. And this gave an indicator to presence a relationship of the variants in these subunits with arising of POF in women in our population . Regarding to FSHR mutational screening , the results obtained showed that there were no significant differences in presence and absence of FSHR 10A subunit between the patients and control . While for 10B subunit there are a significant differences between two groups . PCR - RFLP based assay by DdeI enzyme used to show the polymorphism in exon 10 . The genotype distribution for the heterozygous CG was (81.5%) for POF patients and (95%) for control . While the homozygous GG has genotype frequency as (18.5%)for POF and (5%)for control , the allele frequencies in which C allele was(41%) in POF, and (47.5%) in control while G allele frequency was (59 %) for patients and (52.5%) for control. Moreover, the result of BMP15 gene proved that, there is no significant differences for this gene absence between two groups subjected to this study . SSCP - PCR based - technique was performed for mutational screening in this gene . A significant differences found for the variant in this gene in patients and control groups. And this may give a plausible explanation for POF. Determination of mutations in the exons 1 and 5 of human NOBOX gene were done, and the results appear that there are no one of patients and control groups show missing in exon1 , while for exon5 in spite of two patients have missing this subunit ,there is no significant differences for missing this subunits between POF women and control groups . All the patients and control samples were analyzed by SSCP technique for both exons to detection of the variant in these gene subunits . No one of patients and control groups show conformational changes for both gene subunits. After screening of MSH5 gene in POF women , the results gave a significant differences at P value (0.006) for lacking this gene between the POF women and control groups . And this show a good explanation for arising the disease among young women . As well as screening for DMC1 gene was performed And the results also detect the presence a significant differences at (P value 0.03) . This may give an acceptable explanation to outcome the POF in women

التوصيف الجزيئي لبكتريا Chlamydia trachomatis الجنسية عند النساء المخطرات للاصابة بالتهاب الحوض == Molecular Characterization of Genital Chlamydia trachomatis in Women Risky for Pelvic Inflammatory Diseases

Author name: زينب عادل غني جابك
Supervisor name: ميساء صالح مهدي الشكري | اسماء كاظم كاطع السراج
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تضمن هذا البحث (دراسة حالة - سيطرة), دراسة وتحليل جيني لبكتريا Chlamydia trachomatis المشخصة عند المريضات المصابات بالتهاب الحوض. شملت الدراسة جمع 232 عينة, نوع مسحات من داخل عنق الرحم, من النساء اللواتي يعانين من اعراض وعلامات مرض التهاب الحوض. تم تشخيص الحالات من قبل اخصائية الامراض النسوية, بالاضافة الى تعرضهم لعدد من عوامل الخطورة للمرض. وتم جمع عينات دم وريدي من هؤلاء المريضات, مع 40 عينة دم تم استخدامها كمجموعة سيطرة, وذلك في عيادة النسائية والتوليد في مستشفى بابل للولادة والاطفال ومستشفى الحلة التعليمي العام, بالاضافة للعينات التي تم جمعها في العيادات الخاصة, خلال الفترة من اذار 2015 الى تشرين اول 2015.اشتمل البحث استخلاص الحمض النووي من عينات الرحم والدم. حيث استخدم الحمض النووي المستخلص من المسحات لغرض التشخيص الجزيئي عن بكتريا الــC. trachomastis بطريقة تفاعل البلمرة المتسلسل وباستعمال المعلم الوراثي المستند على دور جين 16S rRNA وجين 16S - 23S rRNA spacer , والمقارنة بينهما في التشخيص. فكان معدل توزيع البكتريا ضمن عينة البحث للمعلمين هو 3,02% و3,45% وعلى التوالي.ايضا تم تحليل معدل التوزيع وبالعلاقة مع بعض عوامل الخطورة كالعمر واستخدام الانواع المختلفة من موانع الحمل وتاثيرها في تغيير التوزيع. فكانت اعلى نسبة 50% ضمن الفئة العمرية 20 - 40 سنة, بينما توزعت بقية الحالات الى مجموعتين وبواقع 25% للفئة العمرية اقل من 20 سنة و25% للفئة اكثر من 40 سنة. اما بالنسبة لاستخدام الموانع, اظهرت النتائج ان 50% من المريضات قد استخدمن مسبقا حبوب منع الحمل, بينما استخدم اللولب من قبل 25% منهن, 12,5% استخدمن العوازل, على عكس 12,5% منهن لم يستخدمن اي واحدة من هذه الانواع.فيما بعد تم التحري جينيا عن امتلاك هذه البكتريا لبعض جينات الضراوة, حيث اظهرت النتائج ان 75% كانت موجبة للجين omp1, بينما 75%, 87,5%, 62,5% و87,5% كانت موجبة للجينات incA, cds1, scc1, copN على التوالي.ايضا تم التقصي عن امتلاك البكتريا لجينات hsp60 وhsp70 والتي ظهرت في 75% و62,5% من الحالات, تلا ذلك البحث عن تشابه في هذه الجينات بين البكتريا والانسان, حيث لم تظهر النتائج اي تشابه في سلسلة القواعد النيتروجينية. واخيرا هدفت الدراسة الى استقصاء العلاقة بين تعدد الاشكال الجينية للطفرة النقطية في بعض الجينات مع قابلية الاصابة بالتهاب الحوض عند النساء باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم.تبين النتائج وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة mpo - 463 هي GG وGA وAA. وقد بلغت نسبة انتشارها (72,5%, 2,5%, 25%) على التوالي في مجموعة المرضى بينما كانت (82,5%, 12,5%, 5%) على التوالي في مجموعة السيطرة, مع عدم وجود اختلاف معنوي بين المجموعتين بالنسبة للنمطين GG وGA. على عكس النمط AA الذي سجل اختلاف معنوي (p=0,028) مع وجود علاقة معنوية ايجابية بين هذا النمط والمرض (OR=6,33 و=CI95%). فيما بلغت نسبة انتشار الاليل G السائد في المرضى 73,75% بالمقارنة مع السيطرة 88,75% مع عدم وجود اختلاف معنوي. بينما كان معدل التوزيع لهذه الانماط ضمن المريضات المصابات بـC. trachomatis كما يلي 62,5%, 37,5% و0,0% على التوالي للانماط GG, GA,AA .اما بالنسبة لموقع الطفرة IL - 12B +16974, فقد اظهرت النتائج وجود ثلاث انماط هي AA, AC وCC. حيث ظهر النمط AA باعلى نسبة في المرضى 90% مقارنة بمجموعة السيطرة 67,5% مع وجود اختلاف معنوي بين المجموعتين لهذا النمط (p=0,03), بالاضافة لوجود علاقة معنوية ايجابية بين النمط والمرض (OR=4,33 و=CI95%). بينما بلغت نسبة انتشار النمطين AC وCC (5% و5%) على التوالي في مجموعة المرضى بينما كانت (12,5% و20%) على التوالي في مجموعة السيطرة. وقد بلغت نسبة انتشار الاليل A السائد في المرضى 92,5% بالمقارنة مع السيطرة 73,75% مع وجود اختلاف معنوي (p=0,001), مع وجود علاقة معنوية ايجابية بين الاليل والمرض (OR=4,04 و=CI95%). بينما كان معدل التوزيع لهذه الانماط ضمن المريضات المصابات بـC. trachomatis كما يلي AA 75% و12,5% لكل من CA وCC | The present case - control work aims to study and analyze Chlamydia trachomatis genetically in patients with pelvic inflammatory disease (PID), which included 232 endocervical swab samples collected from female patients suffering from signs and/or symptoms of PID; they were diagnosed as having PID by the gynecologist and had risk factors for this infection. In addition to venous blood sample collected from those patients and 40 females as a control, to be used in the second part of this work. Patients attaineded to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics, in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Hospital, and Al - Hilla General Teaching Hospital; in addition to the samples taken from private clinics, during the period from March to October 2015.Both samples were subjected to DNA extraction. DNA extracted from swabs were utilized for molecular detection of C. trachomatis, among PID patients, carried out by using 16S rRNA and 16S - 23S rRNA spacer genes as genetic markers via conventional PCR; where both of them gave approximate results 7/232 (3.02%) versus 8/232 (3.45%) respectively.The frequency distribution was also analyzed in association with risk factors, as age revealing that the highest frequency distribution 4/8 (50%) of C. trachomatis was among the age group of 20 - 40 years, while 2/8 (25%) from both age group less than 20 years, and more than 40 years separately. While in association with the use of different types of contraceptives; 50% of chlamydial positive patients used oral contraceptive pills during their life. While those using intrauterine contraceptive devices representing 25%, and remaining cases represented 12.5% used barrier methods and 12.5% did not use any type.Later on, DNA was utilized to detect chlamydial possession of some virulence genes involve in pathogenicity, using specific primers for detection of major outer membrane protein, where omp1 appeared in 6/8 (75%) of cases. Also primers for type three secretion system genes copN, scc1, cds1 and incA that appeared as 6/8 (75%), 7/8 (87.5%), 5/8 (62.5%) and 7/8(87.5%) respectively.Moreover, chlamydial hsp60 and hsp70 were detected as 6/8 (75%) and 5/8 (62.5%) respectively. Then to identify nucleotide sequence homology between human and chlamydial heat shock proteins 60 and 70 genes, no homology was found.Finally, this study aimed to analyze genetic association between mpo - 463 G/A and IL - 12B +16974 A/C polymorphisms and PID by the use of PCR - RFLP technique.The results revealed at the site of mpo - 463 G/A SNP, there were three genotypes for this SNP among PID patients; GG, GA and AA with frequency of 72.5%, 2.5% and 25% respectively, compared with 82.5%, 12.5 and 5% respectively in control group; with no significance differences between patients and control for GG and GA, while AA had significant difference (p value 0.028); beside the risky association between this genotype and PID (OR=6.33, 95%CI). Frequency of allele G (dominant) was (73.75%) among PID group while (88.75%) in control with no significant difference. Also, this SNP was distributed among patients with chlamydia as 62.5% GG, 37.5% AA and 0% for the GA. While results of IL - 12B +16974 A/C SNP revealed that, AA was the highest in patients (90% versus 67.5%) compared with control, with significant difference between patients and controls (p value 0.03) and with risky association between AA genotype and PID (OR=4.33, 95%CI). While, CC and AC genotypes were (5% versus 20%) and (5% versus 12.5%) respectively with no significant differences.The allele A was higher (92.5% versus 73.75%) than allele C (7.5% versus 26.25%) among both patients compared with controls, with a significant difference between patients and controls (p value 0.001), and with risky association between A allele and PID (OR=4.04, 95%CI). Also, this SNP was distributed among patients with chlamydia as AA was commonest one 75%, both AC and CC were 12.5%.

استخلاص الايضيات الثانوية المنتجة من عزلات الستربتومايسيس في محافظة بابل == Extraction and Characterization of Secondary Metabolites produced by Streptomyces spp. Isolates in Babylon Province

Author name: فرقان محمد حسين الاسدي
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | محمد صبري عبد الرزاق
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى استخلاص وتوصيف مركبات الايض الثانوي ذات الفعالية ضد البكتيرية والمنتجة من عزلات محلية لبكتريا الستربتومايسيس. تم خلال الدراسة جمع 98 عينة تربة مختلفة خلال الفترة من شباط الى نيسان 2014 من مناطق مختلفة في محافظة بابل/العراق. تم عزل وتشخيص وتوصيف عزلات الستربتومايسيس باستخدام طرق قياسية مختلفة فيما تم المسح الاولي واستخلاص وتنقية المركبات الفعالة باستخدام طرق قياسية مختلفة اخرى. تم تشخيص المركبات ذات الفعالية ضد البكتيرية باستخدام تقنية الغاز الكروماتوكرافي - مطياف الكتلة (GC - MS) فيما تم تحديد التركيز المثبط الادنى للمركبات الفعالة باستخدام طريقة التخفيف بالاكار. اظهرت النتائج ان 41 عزلة ستربتومايسيس قد تم تشخيصها وتوصيفها بالاعتماد على الخصائص المظهرية والفسلجية وكذلك تحديد الوان الهايفات الهوائية والغزل الارضي substrate mycelium للمستعمرات النامية. تم انتخاب عزلتين من الستربتومايسيس لدراسة التجارب الاخرى لكونها اظهرت اعلى فعالية ضد بكتيرية وهما العزلتان SMI - 04 وSMI - .10 تضمن المسح الاولي اختبار 41 عزلة Streptomyces ، اظهرت ستة منها فعالية جيدة ضد البكتيريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام (المكورات العنقودية الذهبية وبكتريا القولون)، فيما اظهر المسح الثانوي امتلاك عزلتين من الستربتومايسيس اعلى طيف فعالية ضد بكتيرية للبكتريا الموجبة لصبغة غرام ( Staphylococcus aureus , Staphylococcus epidermidis) والسالبة لصبغة غرام (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae). تم دراسة توفير الظروف المثلى لانتاج المركبات ذات الفعالية ضد البكتيرية باستخدام عوامل مختلفة تضمنت نوع الوسط الزرعي للانتاج (وسط فول الصويراقم - 1)، دالة الحموضة 7.0، فترة الحضانة 4 ايام بدرجة حرارة 30 مئوية بالنسبة للعزلة SMI - 04 فيما كانت ظروف الانتاج للعزلة SMI - 10 هي وسط فول الصويراقم - 1 كوسط زرعي، دالة الحموضة 7.0، وفترة الحضانة 5 ايام بدرجة حرارة 30 مئوية. وجد ان مزيج الميثانول والكلوروفورم (وبنسبة 1 : 2) هو افضل مذيب ذو قدرة استخلاص فائقة لمركبات الايض الثانوي ذات الفعالية ضد البكتيرية. تضمنت خطوات التنقية الجزئية استخدام الكروماتوكرافي الورقي مع مزيج الميثانول والكلوروفورم (وبنسبة 1 : 2) حيث اظهرت النتائج وجود بقعة ذات قيمة معامل سريان Rf (0.77) للعزلة SMI - 04 وبقعة اخرى ذات معامل سريان Rf (0.71) للعزلة SMI - 10 . اظهرت نتائج عمود الكروماتوكرافي ان اعلى فعالية ضد البكتيرية كانت في الجزء fraction (11) للعزلة SMI - 04 والجزء fraction رقم (9) للعزلة .SMI - 10 اظهرت نتائج استخدام تقنية الغاز الكروماتوكرافي - مطياف الكتلة (GC - MS) وجود مركبين ذات فعالية ضد البكتيرية هما eicosane من العزلة SMI - 04 وbutylated hydroxytoluene من العزلة SMI - 10. اظهرت النتائج ان قيم التركيز المثبط الادنى لمركب eicosane كانت 32 مكغ/ مل و64 مكغ/ مل لبكتيريا Staphylococcus aureus وEscherichia coli على التوالي بينما كانت قيم التركيز المثبط الادنى لمركب butylated hydroxytoluene 16 مكغ/ مل و32 مكغ/ مل لبكتيريا Staphylococcus aureus وEscherichia coli على التوالي والذي يظهر ان المركب الاخير ذو فعالية ضد البكتيرية اقوى من المركب الاول. واستنادا للمعلومات المتوافرة فان تشخيص هذين المركبين يعد اول تسجيل في عزلات الستريبتومايسيس في العراق | This study was aimed for extraction and characterization of antibacterial metabolites produced by local isolates of Streptomyces spp. in Babylon Province, Iraq. Ninety eight different soil samples were collected during the period from February to April 2014 from different areas in Babylon province/Iraq. Streptomyces isolation, identification and characterization involved different standard methods. Screening, extraction, and Partial purification of bioactive compounds were carried out using different standard techniques. The antibacterial compound in the active fraction was identified through Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) analysis. Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) for the identified compounds were determined using two - fold agar dilution method. Results revealed that forty one Streptomyces isolates were identified and characterized depending on the morphological (cultural and microscopical), physiological characteristics, and color determination. Two isolates (Streptomyces isolate SMI - 04 and SMI - 10) were selected because of their potent antibacterial activity in the screening test. Primary screening test involved testing of 41 Streptomyces isolates. Results exhibited that only six isolates showed significant antibacterial activity toward two test bacterial isolates (Staphylococcus aureus and Escherichia coli). Secondary screening test revealed that two isolates (Streptomyces isolates SMI - 04 and SMI - 10) had broad spectrum activity against two Gram - positive (Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis) and three Gram - negative (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae). Optimization of production conditions indicated that antibacterial productivity were applied using the following parameters (soya bean broth1 medium, pH adjusted at 7.0, and incubation time for 4 days at 30°C) for Streptomyces isolates SMI - 04 and soya bean broth1 medium, pH adjusted at 7.0, and incubation for 5 days at 30°C for Streptomyces isolate SMI - 10. Methanol with chloroform in a ratio of (2 : 1) was found to be the best solvent with maximum extraction capability for antibacterial metabolites. Partial purification steps including Thin Layer Chromatography (TLC) with methanol - chloroform in a ratio of (2 : 1 v/v) was the best mobile phase, one spot was visualized for isolate SMI - 04 with Rf value of 0.77 and one spot for isolate SMI - 10 with Rf value of 0.71. Column chromatography exhibited that two active fractions, fraction No.11 of isolate SMI - 04 and fraction No.9 of isolate SMI - 10 which gave considerable antibacterial activity. Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) technique indicated the presence of two compounds with antibacterial activity; eicosane for Streptomyces isolate SMI - 04 and butylated hydroxytoluene for Streptomyces isolate SMI - 10, which possessed potent antibacterial activity. Minimum Inhibitory Concentrations (MICs) values of eicosane were 32µg/ml and 64µg/ml for Staphylococcus aureus and Escherichia coli, respectively while the MICs of butylated hydroxytoluene was 16 µg/ml for Staphylococcus aureus and 32 µg/ml for Escherichia coli which indicated the potent antibacterial activity of the latter compound. According to our knowledge, these antibacterial compounds are first recorded and identified from Streptomyces spp. in Iraq

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Bacteroides fragilis المعزولة من النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري == Molecular and Bacteriological Study of Bacteroides fragilis Isolated from Women with Bacterial Vaginosis

Author name: زهراء قيس سلمان
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | بشرى جابر عمران
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة 150 مريضة يعانين من التهاب المهبل البكتيري ، تم جمع ما مجموعه 300 مسحة من عنق الرحم وافرازات مهبلية من هؤلاء المريضات بمعدل مسحتين اثنتين لكل مريضة و150 عينة دم جديدة تم جمعها من المريضات عند مراجعتهن الى مستشفيين في محافظة بابل هما : مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي العام، و150 عينة دم جديدة كمجموعة سيطرة ، خلال الفترة من شباط الى تشرين الاول 2016. باستخام معايير امسلز تم تشخيص النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل البكتيري. وقد خضعت المسحات لطرق مختلفة لتحديد B.fragilis باستخدام الاساليب البكتريولوجية التقليدية. وجد ان 31 عزلة موجبة (20.6٪) باستخدام الاوساط الانتقائية. فضلا عن ذلك، تم تطبيق طرق الكشف الجزيئي باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16 sRNA ، وكانت 44 عزلة (29.33٪) ايجابية وتعود لبكتريا B.fragilis وكذلك استخدم المعلم الوراثي nanH حيث كانت 39 عزلة (88.6٪) ايجابية. بالاضافة الى ذلك، تم فحص العزلات المعزولة على الاوساط الانتقائية الخاصة بالبكتريا للكشف عن قابلية البكتريا للالتصاق (adherence ability) بالخلايا المخاطية. كما تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية (Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate (TCP) test اذ كانت مكونة للاغشية بنسبة (100%). حيث اظهرت العزلات 31 الموجبة المستخرجة من الوسط الانتقائي قدرة البكترياعلى تكوين ال Biofilm وكانت نسبة تكوين البيوفيلم (83.9٪) و(16.1٪) للوضع العالي والمعتدل على التوالي، في حين لم تكن هناك عزلات غير قادرة على تشكيل بيوفيلم. اما فيما يتعلق بتاثير بوفيدون - اليود بنسبة 10٪ على تكوين البيوفيلم، فقد اظهرت نتائج هذه الدراسة ان قدرة البكتريا على تكوينه قد تقلصت لتكون نسبة التشكيل قوي (6.5٪ (ومعتدل (71٪) و(22.6٪) لم يظهر اي تشكيل للبيوفيلم . تم فحص تاثير 10% povidone - iodine المستخدمة في الطب النسائي على انتاج الاغشية الحيوية . وقيمت الدراسة قابلية B.fragilis على انتاج bacteriocin وتاثيرها على بعض العزلات البكتيرية. اظهرت النتائج ان لعزلات البكتريا قدرة تازرية لتثبيط نمو العزلات المدروسة بنسب. فضلا عن ذلك، هدفت هذه الدراسة الى التعرف على علاقة التغايرالجيني(TLR - 4 Polymorphism) باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم (PCR - RFLP) .وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية وكانت نسب انتشارها في مجموعة المرضى CC(36.0%) وThr399Ile : CT(12.0%) ,TT(52%) بينما نسب انتشارها في مجموعة السيطرة كانت TT(34.0%) , CC(60.0%) and CT(6.0%) وقد اظهرت وجود اختلاف وهو اختلافا معنويا, فيما بلغت نسبة انتشار الاليل T في المرضى (58%) بالمقارنة للسيطرة (37%) مع وجود اختلاف معنوي .وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA(46.0%) ,GG(50.0%) and GA(4.0%) في مجموعة المريضات بينما في مجموعة السيطرة كانت نسب الانتشار AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) مع عدم وجود فارق معنوي بينهما , اما نسبة انتشار الاليل G (52%) في مجموعة المريضات بالمقارنة بمجموعة السيطرة (62%) ويعد فارقا معنويا بينهما . تناولت الدراسة تحليل تسلسل جينات معينة من عزلات B.fragilis وكشفت نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin حيث تم تحديدها في 117/117 (100٪ (بمقارنة تسلسلها مع تلك التي في قاعدة البيانات في بنك الجينات وكانت نسبة الثغرات بينهما (0)٪ ، اما بالنسبة للعزلة الثانية فقد تم التعرف على نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin في 116/116 (100٪) وبثغرات 0/116 (0٪)، اما بالنسبة لجين Phospholipaseتم تحديدها في 129/129 (100٪) مع ثغرات 0/1129 (0٪) لكل من العزلتين . اخيرا تم تحليل العلاقات التطورية بين العزلات محلية من B.fragilis والعزلات العالمية من B.fragilis باستخدام تسلسل الجينات لل Enterotoxin وPhospholipaseحيث اظهر تحليل تسلسل الحمض النووي لجين Enterotoxin ان عزلات B.fragilis المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بعزلة B. fragilis المسجلة عالميا (AB026625.1) و(U67735.1) ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور (0.01%) في حين ان نتائج تحليل النشوء والتطور من تسلسل جينات Phospholipase كشفت ان نفس العزلات المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بالعزلة المسجلة عالميا (CP011073.1) ، ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور كانت (0.003 - 0.005%). | This study included 150 women with bacterial vaginosis (BV), a total of 300 swabs (as two high vaginal swabs for each woman and vaginal discharge ) were taken from each woman. In addition to fresh blood samples were collected from the same 150 women with bacterial vaginosis and 150 healthy women as control group , these women admitted to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics , in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Teaching Hospital, and Al - Hillah General Teaching Hospital during the period from February until October 2016. Women suffering from bacterial vaginosis were diagnosed according to Amsels criteria .The high vaginal swabs were subjected to different methods for identification of Bacteroides fragilis by using traditional bacteriological methods . It was found that 31(20.6%) isolates were recovered by using selective media . Furthermore , molecular detection methods was applied by using 16s rRNA gene ,where 44(29.33%) isolates were positive , and using nanH gene where 39(88.6%) isolates were positive out of the 44 isolates , these genetic markers were used for confirmation detection of B.fradilis isolates . In addition , the 31 isolates recovered from selective media were investigated to detect adherence of B.fragilis to mucosal epithelia cells .Also , biofilm formation was tested in semi quantitative microtiter plate test . The result revealed that all isolates were biofilm former , biofilm formation were accounted (83.9%) and (16.1%) for high and moderate mode respectively , while there were no isolates that do not express biofilm formation . Regarding on effect of 10% povidone - iodine on biofilm formation ,the result of this study demonstrated that internal douche effectively reduced the viability of biofilm forming to strong (6.5%) , moderate (71%) and (22.6%) shown no biofilm formation . The study was also evaluated the susceptibility of bacteriocin produced by B.fragilis on some isolates of bacteria . The result revealed that B.fragilis have synergistic ability to inhibition the growth of studied isolates with different ratios . Additionally, this study aimed to investigate the relation of Asp299Gly and Thr399Ile Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in the Toll - like receptor - 4 (TLR - 4) with the incidence of bacterial vaginosis .The result elucidated that at the site of Thr399Ile SNP, there were three genotypes for this SNP among patients ; TT,CC and TC with frequency of (52%) ,(36.0%) and (12.0%) respectively , whereas , the genotype frequency among control group were TT(34%) ,CC(60%) and TC(6.0%) with significance differences between patients and control . However, the frequency of allele T (mutant) was higher among patients (58%) than control (37%) with significant difference. The site of Asp299Gly SNP also showed three genotype among patients with frequency of AA(46.0%), GG(50.0%) and GA(4.0%) , whereas the genotype frequency among control group were AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) with no significant differences between patients and control . Additionally , the frequency of allele G(mutant) was higher among control(62%) than patients (52%) with significant differences between them . The study deal with sequence analysis of specific genes of B.fragilis isolates revealed that the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 117/117(100%) by comparing its sequence with that in the database in gene bank by Blast program with gaps 0/117(0%) and for the second isolate the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 116/116(100%) and with gaps 0/116(0%) , while for phospholipase gene was identified in 129/129(100%) with gaps 0/1129(0%) for first isolates.Finally ,the phylogenetic relationships between two local isolates of Bacteroides fragilis and Bacteroides fragilis global isolates were analyzed using the enterotoxin and phospholipase genes sequence. The DNA sequencing analysis of enterotoxin gene revealed that B. fragilis local number (No.1and No.2) isolates were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (AB026625.1) and (U67735.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis enterotoxin gene were show different out of tree at total genetic change (0.01%) , while the phylogenetic analysis results of phospholipase gene sequences revealed that B. fragilis local isolates ( No.1and No.2) were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (CP011073.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis phospholipase gene showed difference out of tree at total genetic change (0.003 - 0.005 %).

الكشف الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه - النوع الاول والتعبير البروتيني ل P27, CDK6,CDK4 وBcl - 2 في سرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن == Molecular Detection of Human T Lymphotropic Virus Type - 1 (HTLV - 1) and Expressional Proteins of CDK4, CDK6, P27 and Bcl - 2 in Hodgkin?s and Non - Hodgkin?s Lymphomas

Author name: نور سامي عبود الليباوي
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | شاكر حماد محمد العلواني
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة على انها دراسة بحثية ذات اثر رجعي ,وسيطره . اذ اشتملت على120خزعة نسجية من منطقة الغدد اللمفاوية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين.جمعت هذه النماذج من ارشيفات الانسجة المرضية لمختبرات مستشفى الحلة التعليمي/ محافظة بابل , مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة كربلاء ,مستشفى الصدر التعليمي/ محافظة النجف ,مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة المثنى ومستشفى القادسية التعليمي/ محافظة القادسية وكذلك العديد من مختبرات الانسجة المرضية الخاصة الموجودة في بابل ,بغداد, كربلاء, القادسيه, المثنى اذ جمعت هذه العينات للفترة من اذار 2016 الى كانون الاول 2016. هذه النماذج تعود للمرضى المصابين بسرطان العقد اللمفاوية للسنوات من 2011 لغاية 2016 .قسمت هذه العينات حسب المجموعات التالية : - 1 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع هودجكن .2 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع اللاهودجكن .3 - اربعون قطعة نسجية لعقد لمفاوية (لايظهر عليها اي تغيرات مرضية نسيجية) ظاهريا سليمة استعملت كمجموعة سيطرة .بعد التقطيع النسيجي لخزع العقد اللمفاوبة وتصبيغها باستخدام صبغتي الايوسين والهيماتوكسلين تم اجراء الفحص التاكيدي الدقيق لغرض التشخيص النهائي من قبل اخصائي الامراض النسيجية لهذه الدراسة. تم تصميم الجانب العملي لهذه الدراسة الذي اتخذ مسارين رئيسين : - 1. التحديد الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بفحصها داخل خلايا الانسجة اللمفاوية حيث تم انجازه بوساطة استخدام تقنية التهجين الموضعي ذات الحساسية العالية .2. اجراء دراسة كيميائية - نسيجية مناعية لوصف الحالة التعبيرية ل CDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27) وفحص الجينات السرطانية للخلايا اللمفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن واللاهودجكن والعقد اللمفاوية السليمة ظاهريا (غير مصابة).ان مجمل النتائج التي تم الحصول عليها هذه الدراسة كانت كما يلي : 1 - نسبة الذكور( (57.5% المصابين بسرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن ومجموعة السيطرة كانت اعلى من نسبة الاناث (42.5%) في هذه المجاميع الثلاثة. حيث كانت نسبة الذكور/اناث هي1 : 1.35.2 - اظهر الفحص النسيجي ان النسبة العليا من مرضى الهودجكن كان من الدرجة المنخفضة (42.5%) يتبعها الدرجة المتوسطة (35%) وادنى نسبة هي الدرجة العليا (22.5%). بينما النسبة العليا من مرضى اللاهودجكن كانت من الدرجة المنخفضة والمتوسطة %37.5)) وادنى نسبة هي الدرجة العليا ( 25%).ا - نتائج الفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت ( 22.5%) 2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK4 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 57.5 % من الانسجة كانت موجبة . 5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ Bcl - 2ان47.5 % من الانسجة كانت موجبة .6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفيروس وCDK4 .7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للCDK4 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال CDK6 وBcl - 2.8 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة ل p27 وعمر المرضى. كذلك علاقة طردية بين p27 وBcl - 2.ب‌ - نتائج للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائية من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة باللاهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت (45%) بينما لم تظهر اي حالة موجبة بتفاعل التهجين الموضعي للفايروس ضمن مجموعة السيطرة .2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 42.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة للp27 بواسطة الاختبارالكيميائي النسجي المناعي ضمن مجموعة السيطرة.3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـCDK4 ان 50% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة . بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي ل Bcl - 2 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السطرة.6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد الفيروس وBcl - 2 وكذلك وجدت علاقة قوية طردية تربط بين الانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفايروس وCDK6.7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للBcl - 2 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال p27 وBcl - 2 فقط .كذلك وجدت علاقة عكسية بين عمر المريض وBcl - 2 .8 - تم تمييز علاقة طردية تربط بين كثافة CDK4 وp27 وكذلك بين CDK4 وBcl - 2

دراسة بكتيرية ووراثية لبكتريا Gardnerella vaginalis وعلاقتها بالولادة المبكرة == Bacteriological and Molecular study of Gardnerella vaginalis association with preterm labor

Author name: ازل علاء عباس الربيعي
Supervisor name: الهام عباس بنيان الساعدي | لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: In this study , one hundred fifty samples were collected from paitents with preterm labor (PTL), who have been attending to Babylon Maternity and pediatric hospital and Al - Hilla Teaching Hospital, at the period from February to October 2016. Two swabs were collected one for culturing and the other for direct extraction for isolation Gardnerella vaginalis.Out of the 150 samples only 6(4%) on culture and 30 (20%) on molecular level isolated from preterm labor caused by Bacterial vaginosis , Urinary tract infection and aborted women. The results isolation and laboratory diagnosis as well as biochemical test approved that there is only 6 isolates belong to G.vaginalis confirmed by using Vitek 2 system and molecular detection by specific primers.Preterm birth is one of the most common causes of neonatal morbidity and mortality. Associated with sub sequent preterm labor in up to 40% of cases as shown in our resultsThe isolates are varied in their ability to produce sidrophore and extracellular protease in addition to their hemolytic activity .Adherence activity were investigated and indicate that G.vaginals have pili on her surface help her to attached and initiated infection Metronidazole was effective in prevent adherence at low concentration (5%) was 100% percentage.All isolates are able to produce biofilm in different level which provided as main step in pathogenesis caused it can evade and evoke the action of immune response and antibiotics , Alum , sodium chloride and sodium bicarbonate were shown very high effectively to eradicationSummaryIIG.vaginalis biofilm which gave results (0%) whereas the thymol extract (carvacrol) were moderate in action gave (50%) effect on Biofilm .Results also preveld that increased of pH value give a chance to overgrowth of G.vaginalis .The results indicated that Lactic acid considered as a limiting factors preventing growth of G.vaginalis when its grown with lactic acid , measured by optical Density (OD) the high production level is (1.901) in 2% concentration Whereas the lowest level is (0.32) in 10% concentration.Isolates Have ability to produce wide spectrum Bacteriocin which inhibited growth of both Gram positive and Gram negative bacteria that founded in vagina environment, Staphylococcus saprophyticus were the most bacteria that inhibited .extracted Vaginolysin was have a completed hemolytic activity in different temperatures (37 - 38 - 40 - 42). The results showed that its activity as were increased in high temperature.Recent study were clarified that purified vaginolysin was active in presence of cholesterol in media, gave (1.205) growth rate measured by the optical density at (100%) concentration. vaginolysin is cholesterol - dependent cytolysin (CDCs) toxin.Antimicrobial activity were investigated to the extracted Vaginolysin to evaluation of its activity depending on inhibition zone, the results showed that candida is more affective between the other microorganism gave (1.3)mm.Some virulence factor have been detected in molecular level ( Vly - SI - LuxS - LexA - rec a - Pl - Fur - Omp - Gal - protease ). Which wereSummaryIIIvaried in production may be as a results to the un presence of this gene in bacteria , may be silent gene or due to the amount of bacteria in sample are rare.Three Antibiotics were used at a molecular level (Tet b) were varied between resistance and sensitive to this gene (10) sample are resist,(RdxA) all sample are sensitive to its gene at percentage (100%), whereas (erna)gene were resist in all samples (100%).The results show there was no sequence homology between Mycoplasma spp. and G. vaginalis in the adhesion level this were detected by P30/P32 specific primer .The outcome of RFLPS - PCR is confirmed that G.vaginalis is virulent and have a role in preterm labor by degradation of membranes with the association of variable Silidase and presence of β - Galactosidase .MBL (mannose binding lectin ) levels were have a direct role pregnancy. It is also apparent that MBL plays a role in the defense against vaginal infection. MBL is essential to successful pregnancy in regards to maternal defense against infection, recent study indicate that MBL deficiency related to pregnancy outcome disorderedthis considered the first study of mannose in Iraq .DNA sequencing were done for two main virulence factor Phospholipase gene and Quorum sensing gene which showed some variation , then recorded in NCBI - gene sequencing as first descriped in Iraq.

التاثير المايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية == The Antimicrobial Effect of Silver Nano Particles (AgNPs) Against Pseudomonas aeruginosa Isolated from Clinical Samples

Author name: سارة عقيل حسن التميمي
Supervisor name: هدى هادي الحسناوي
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة للكشف عن التاثيرالمايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية, تم جمع 100 عينة من مصادر سريرية مختلفة, تضمنت العينات السريرية عينات الحروق , والادرار, والدم, واصابات الاذن, والقشع تم اخذ هذه العينات من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني 2017. زرعت جميع العينات على وسط السترمايد, وسط اكار الدم, وحضنت كل الاطباق هوائيا بدرجة حرارة C°37 لمدة 18ساعة. تم تشخيص بكتريا الزوائف الزنجارية بالاعتماد على الصفات المظهرية والكيموحيوية.كان توزيع العزلات كالاتي : 22(52.4%) من عينات الحروق, 8(19%) من عينات الادرار, 14.3)6%) عينة من المرضى المصابين بالالتهاب الاذن الخارجية, 4(9.5%) من عينات الدم,2(4.7%) من عينات القشع. اظهرت نتائج اختبار الحساسية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط ان جميع العزلات(26) كانت مقاومة لكل من الببراسلين (100%), السيفوتاكسيم (100%),بينما نسبة المقاومة لكل من الاميكاسين (88%), سيفترياكسون (65%), جنتامايسن (62%), بينما وجدت نسبة مقاومة قليلة للسفتازديم (15%), وكل العزلات كانت حساسة (100) لكل من الميروبينيم, اوفلوكساسين, نورفلوكساسين والسبروفلوكساسين. تم في هذه الدراسة ايضا الكشف عن تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) وطريقة صبغة الكونكو الحمراء (CRA) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الطبق الزرعي النسيجي كانت جميع عزلات الزوائف الزنجارية والبالغ عددها (9) منتجة للاغشية الحيوية, (4) من اصل (9) (44%) من عزلات الزوائف الزنجارية انتجت مستعمرات سوداء بواسطة طريقة صبغة الكونكو الحمراء. وكذالك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير جزيئات الفضة النانوية ((AgNPs على تكوين الاغشية الحيوية باستخدام تراكيز مختلفة (µg/ml 2.5, µg/ml 5, 10 µg/ml, 20µg/ml),حيث اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التركيز (20) وبنسبة تثبيط (100%), من جهة اخرى تم اختبار التاثير البكتيري المضاد لجزيئات الفضة النانوية ضد مختلف انواع العزلات البكتيرية باستخدام طريق التخافيف في الوسط الصلب وتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (12.5 µg/ml, 25 µg/ml, 50 µg/ml, (100 µg/ml, 200 µg/ml وكانت العزلات كالتالي : ـ(S. aureus, E. coli, E. cloacae, K. pneumonia, P. aeuroginosa)اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التراكيز(100 µg/ml, 200 µg/ml).ايضا تم تعريض ظاهرة السوارمنك في عزلات الزوائف الزنجارية لتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml ), ووجد ان اعلى نشاط لجزيئات الفضة النانوية ضد ضاهرة السوارمنك وانتاج البايوسيانين كانت بتركيز ((10 µg/ml, 5 µg/ml .تم زراعة جميع عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية (26)عزلة بوجود نترات الفضة (AgNO3) بتراكيز تتراوح (100 µg/ml - 400 µg/ml ) باستخدام طريقة التخافيف في الوسط الصلب مع قدرات مختلفة لانتاج البيوسيانين. اظهرت النتائج ان جميع العزلات 26((100 المنتجة للبايوسيانين كانت مقاومة للسلفر نايتريت (AgNO3) من خلال ظهور نمو في الطبق الحاوي على التراكيز المذكورة نترات الفضة (AgNO3).في هذه الدراسة تم اختبار بكتريا الزوائف الزنجارية لانتاج البكتريوسين باستخدام عزلات بكترية مختلفة تضمنت العزلات (امعائية مذرقية,مكورات العنقودية الذهبية,اشريكية قولونية, كلبسيلة رئوية). كذلك تم العثور على مجموعة واسعة من منطقة تثبيط (24mm - 30mm) في الانواع البكتيرية اعلاه مع قطر (30mm, 28mm, 24mm, 30mm) على التوالي. عزلات (امعائية مذرقية, كلبسيلة رئوية) كانت الاكثر تاثر والتي انتجت قطر تثبيط ((30mm. في هذه الدراسة ايضا تم تقييم علاقة مقاومة الفضة مع انتاج بيوسيانين في بكتريا الزوائف الزنجارية متعددة المقاومة للمضادات الحيوية. في هذه الدراسة تم استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتاكد من وجود بعض الجينات. في هذه التقنية، تم فحص جينات bla - IMP)) التي تشفر الى انزيم ميتالو - β - لاكتاميز المسؤول عن مقاومة ايميبينيم وجينات (silS ,silE) التي تشفر لمقاومة الفضة في عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية بواسطة استخدام برايمرت خاصة. وقد وجد ان جميع العزلات ال 26 (100%) من بكتريا الزوائف الزنجارية كانت سلبية لهذه الجينات. كما تم استخدام اثنين من البرايمرات المحددة للكشف عن فينازين (بيوسيانين) (phzS, phzM). اظهرت النتائج لل (phzM) ان من اصل 26)) عزلة , 21 (80.8%) اعطت نتيجة ايجابية, , فيما يخص (phzS gene) وجد ان 14(% 53.9) عزلة كانت حامله لهذا الجين . والخاتمة ان جزيئات الفضة النانوية (AgNps) تمتلك تاثير ضد الاغشية الحيوية وايضا لها تاثير بكتيري مضاد ضد بكتريا الزوائف الزنجارية وانواع بكتيرية اخرى, والتي من الممكن استخدامها كعلاج بديل. فيما يخص انتاج البايوسيانين ومقاومة الفضة، ظاهريا كان هناك تاثير البايوسيانين على مقاومة الفضة ولم تكن مقاومة الفضة بسبب نقل وجود جينات (silS, silE). | This study was conducted to detect the antimicrobial effect of silver nanoparticles (AgNPs) against Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples, total of 100 specimens were collected from different clinical sites included urine, burns, ear, blood , and sputum. The specimens were taken from patients admitted to Al - Hilla Teaching Hospital during a period extended from November 2016 to January 2017. All specimens were cultured on selective medium (cetrimide agar), blood agar, then incubated at 37°C for 18 hr. The isolated of P. aeurginosa were diagnosed depending on morphological and biochemical characteristics.The distribution of P. aeurginosa isolates was as follows : 22(52.4%) isolates from burns, 8(19%) isolates from urine, 6(14.3%) isolates from patients with otitis externa, 4(9.5%) isolates were isolated from blood and 2(4.7%) isolates from sputum. Antibiotic susceptibility test using disc diffusion test revealed that all isolates (26) were resistant (100%) to Piperacillin, Cefotaxime. While the resistance rate for Amikacin (88%), Ceftriaxone (65%), Gentamicin (62%), but low resistance rate was found to Ceftazidime (15%) and all isolates were sensitive (100%) to Meropenem, Ofloxacin, Norfloxacin and Ciprofloxacin. The biofilm formation in P. aeurginosa isolates was investigated by two methods include, tissue culture plates method (TCP) and congo red agar method (CRA). The results showed that all isolates 9 (100%) were found to be biofilm producer when investigated by TCP assay, and 4 out of 9 (44. %) isolates of P. aeurginosa were producing black colonies when detected by CRA method.The effect of AgNps on biofilm formation was tested by using different concentrations of silver nanoparticles (2.5 μg/ml, 5 μg/ml,10 μg/ml, 20μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of 20 μg/ml, with an inhibition rate of 100%. On the other hand the antibacterial activity of AgNps was tested against different bacterial species isolates (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomnas aeurginosa) using agar dilution method with different concentrations of silver nanoparticles (12.5 μg/ml, 25 μg/ml, 50 μg/ml, 100 μg/ml, 200 μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of (100 μg/ml and 200μg/ml). On the other hand Swarming motility in P. aeruginosa isolates was detected and subjected to different concentrations of (AgNps) (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml), it was found that the highest activity of AgNps against swarming motility and pyocyanin production of P. aeurginosa was at a concentration of (5 µg/ml, and 10μg/ml).The relation of silver resistance with pyocyanin production in P. aeruginosa was assessed. Screening test for silver resistance was performed by agar dilution method, all (26 isolates) of P. aeruginosa were cultivated in the presence of AgNo3 at a concentration (100 µg/ml - 200 µg/ml, 400µg/ml) using agar dilution method with differing capacities for pyocyanin production. All isolates of P. aeurginosa 26(100%) that produce pyocyanin were found to be resistant to AgNo3.In this study P. aeruginosa isolates were tested for bacteriocin activity by the agar well diffusion method using different bacterial isolates : E. coli, K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae. Wide range of inhibition zone (24mm - 30mm) was found against above bacterial species with diameter (28mm, 30mm, 24mm, 30mm), respectively. The most affected bacteria were K. pneumoniae and E. cloacae isolates, which produce inhibition zone (30)mm.PCR technique was used in this study for investigation some genes. In this technique, blaIMP gene that encode Metallo - β - lactamase enzyme responsible for imipenem resistance and (silE and silS) genes that encoding silver resistance were investigated in P. aeuroginosa isolates by using specific primers. It was found that all 26 (100%) isolates of P. aeuroginosa were negative for these genes. Also two specific primers were used to detect phenazine (pyocyanin) modifying genes (phzM, phzS). According to phzM gene, it was found that out of 26 P. aeuroginosa isolates, 21 (80.8%) isolates gave positive results at 330 bp, in regard to phzS gene, it was found out of 26 P. aeurginosa isolates, 14 (53.9%) isolates gave positive result at 664 bp.In conclusion AgNps have an antibiofilm, antibacterial activity against P. aeruginosa and different bacterial species that could be used as an alternative therapy. In regard to pyocyanin production and silver resistance, phenotypically there was effect of pyocyanin pigment on silver resistance and the silver resistance was not due to carriage of silE, silS genes.

التشخيص والتوصيف الجزيئي لبكتريا Clostridium perfringens المعزوله من حالات مرضية سريرية في مدينة الحلة == Molecular Diagnosis and Characterization of Clostridium Perfringens from Clinical Samples in Al - Hilla city

Author name: علياء محمد حمود الشمري
Supervisor name: علاء هاني الجراخ | ميساء صالح الشكري
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة لمعرفة وبائية بكترياC. Perfringens في العينات المؤخوذة في محافظة بابل. تم جمع 140عينة من الجروح العميقة من المرضى الداخلين في مستشفيات مدينة الحلة الرئيسية (مستشفى الحله التعليمي ومدينة مرجان الطبيه) والذين يعانون من مرض السكري المزمن وايضا من مرضى تعرضوا الى طلق ناري فضلا عن المرضى الذين يعانون من التهاب الخلوي اللاهوائي في الجلد(anaerobic cellulitis ) للفترة من شهر شباط ولغاية شهرتشرين الاول 2016. بالاضافه الى ذلك تم تشخيص وعزل بكترياC. perfringens بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية من خلال طرق التنمية على الاوساط الزرعية الاختيارية لهذه البكتريا واظهرت النتائج الحصول على 3 (2.14%)عزلات كان عزل اثنان منها 1.42%)) من مرضى السكري المزمن اما العزله الثالثه (0.72%) فقد تم الحصول عليها من الذين تعرضوا لطلق ناري في حين لم يتم الحصول على عزلات من المرضى الذين يعانون من الالتهاب الخلوي اللاهوائي . وكذلك تم تاكيد التشخيص باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA وجين16S - 23S spacer rRNA حيث اظهرت النتائج, من اصل 140 عزلة فان 7 عزلات تعود لبكتريا C. perfringens. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا واختبار قابليتها على انتاج انزيم (phpspholipase C) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم. كما تم الكشف عن حساسية عزلات البكتريا اللاهوائية تجاه 24 مضادا حيويا. بينت نتائج الدراسة ان جميع العزلات اظهرت حساسية عالية (100%) تجاه كل من penicillins .مثل benzypencillin, ,amoxicillin فضلا عن حساسيتها تجاه  - lactamase inhibitor مثل Ampicillin - sulbactam وحساسيه عالية لكل من metronidazole وaminoglycosidesومن ناحية اخرى، اظهرت جميع العزلات مقاومة عالية لكل من مضادات tetracyclin, Linezolid, levofloxacin, erthromycin بينما اظهرت هذه العزلات تغاير في درجات المقاومة تجاه مضادات pipracillin, Clindamycin, and Impenem.تم استخدام الطرق الوراثية في الكشف عن جينات المقاومة للمضادات الحياتية كجيناتM,Q,W,B) ) tet الخاصة بالكشف عن المقاومة للتتراسايكلين وجينات erm(A,B) للكشف عن المقاومة للكلندامايسين وجين nim للكشف عن المقاومة للمترونيدازول حيث اظهرت النتائج ان الجين tet M كان ذا سيادة عالية بنسبة 71.42 %تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي لتوكسينات البكتريا (alpha,epsilon, iota) للاستدلال على وجود جينات (cpa, etx, iap)، في C. perfringens وبنسبة 100%, 28.4%, 28.4% )) على التوالي.بالاضافة الى ذلك تم استخدام جينات cpa, etx and iap لقياس تعاقب القواعد النيتروجينية للمادة الوراثية للعزلات المدروسة فضلا عن تسجيلها في بنك الجينات العالمي ( ,(Gene Bank,اذ تم خلال هذه الدراسة ولاول مرة في العراق، الحصول على خمسة ارقام انضمام الى بنك الجينات العالمي (5 accession numbers)، حيث تم نشر هذه الارقام في بنك الجينات الامريكي gene bank - NCBI وهذه الارقام هي : جينiap : KY523199, KY523200 اما فيما يخص الجينetx فكانت الارقام هي : KY523201, KY523202 وفيما يخص الجين cpaفكان رقم الانضمام هو : . KY523203تعد هذه الدراسه انها اول دراسه في العراق تضمنت تحليل , دراسه تعاقب القواعد النايتروجينية للمادة الوراثية فضلا عن التسجيل في بنك الجينات العالمي لسموم عزلات محلية من بكتريا C.perfringens معزولة من عينات سريرية. | This cross sectional and hospital - based study aimed to studying the incidenceof Clostridium perfringens in clinical samples in Babylon province. A total of 140 wound swabs were taken from patients admitted to two main hospitals in Hilla city, Iraq (Hilla Teaching Hospital and Medical Marjan City), during the period from February to October 2016. Swabs were collected from diabetic patients, anaerobic cellulitis, and bullet wounds. These wound swab samples were subjected to different methods for identification of C. perfringens according to standard method. It was found that 3 (2.14%) C. perfringens isolates were recovered, of which 2 isolates (1.42%) were obtained from diabetic patients, 1 isolates (0.72 %) from bullet wounds, No isolates are recovered from the other clinical samples (cellulitis). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA, 16S - 23S intergenic spacer rRNA genes as a genetic marker for confirmation of detection of C. perfringens isolates,7 isolates of C. perfringens out of 140 are detected by using PCR with specific primer.The study also focuses on the ability of this bacteria to produce Phospholipase C and it was found that all isolates are positive for this enzyme (100%) . The results of antibiotic susceptibility testing using Vitek 2 system and disc diffusion method (DDT) of C. perfringens isolates (No.= 3) against 24 antibiotics showed that all isolates were highly sensitive to penicillins, (benzylpenicillin, and amoxicillin), all isolates (3/3) were sensitive to  - lactamase inhibitor such as Ampicillin - sulbactum. They were more susceptible to metronidazole and aminoglycosides in (3/3). On the other hand, all isolates were highly resistant to tetracycline, Linezolid ,levofloxacin, and erythromycin However, these isolates expressed different degree of susceptibility towards other antibiotics (Clindamycin, piperacillin and Imipenem). Molecular detection of C. perfringens of antibiotic resistance genes had been investigated and it had been found that tetracycline resistance gene tet M is the most commonly observed (71.42%) among ribosomal protection genes among C. perfringens isolates. While all isolates (7) gave negative results for other tetracycline resistance genes (tet W and Q, tet B, erm(A), erm(B),nim gens).Furthermore, detection of clostridial toxin (alpha, epsilon, iota toxins was applied using specific genes (cpa, etx, iap) and the results showed that the rate of the presence of these genes are : 100%, 28.8% and 28.4% respectively. The following genes : cpa, etx and iap were used for sequencing analysis, registration in gene bank - NCBI. Five accession numbers were obtained from registration of five sequences of these three genes at gene bank - NCBI : iap gene; accession numbers are : KY523199, KY523200etx gene; accession numbers are : KY523201, KY523202cpa gene; accession number is : KY523203. This is the first study in Iraq which employed analysis sequencing and registration in gene bank - NCBI, of clostriaial toxin of local isolates of C. perfringens obtained from clinical samples

دراسة فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية مع التهاب الاذن الوسطى القيحي في الاطفال == Study of Parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes with suppurative otitis media in children

Author name: ايام محمد صالح علي العامود
Supervisor name: جواد كاظم طراد الخفاجي | غانم عبود المولى
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن دور فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية Streptococcus pyogenes في الاطفال الذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي . جمعت 200 عينة (ثلاث مسحات لكل مريض تضمنت مسحة من افرازات الاذن ومسحة من افرازات الانف لدراسة الفيروس ومسحة من افرازات الاذن لدراسة البكتريا و50 عينة دم) من 50 مريض يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل للفترة من شباط (2016) لغاية ايار (2016). والذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى. وتضمنت الدراسة 32 عينة ماخوذه من اشخاص اصحاء كمجموعة سيطرة وتم تقسيمهم الى ست مجاميع عمرية بنفس طريقة تقسيم مجاميع المرضى. شملت الدراسة اربعة اجزاء رئيسية : اولا التشخيص الفيروسي اعتمد على التقنيات المتقدمة (العزل الاولي باستخدام فحص التالق المناعي المباشر لتحديد وتمييز الانواع الثلاثة لفيروس نظير الانفلونزا 1,2, and 3 والتشخيص الجزيئي بواسطة استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي لتحديد وتمييز الانواع الاربعة للفيروس1,2,3, and 4 وتم استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لمشاهدة جزيئة الفيروس . والجزء الثاني فحص البكتريا باستخدام فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 system وتم التحري ايضا عن انزيم الهيمولايسين حيث كانت جميع العزلات منتجه لهذا الانزيم . التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود الجين mga بواسطة تقنية سلسلة تفاعل انزيم البلمرة .الجزء الثالث شمل وجود الفيروس والبكتريا في عينات الاذن للمرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى . الجزء الرابع تضمن دراسة مناعية لمعرفة دور الحركيات الخلوية IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8, and CD56))عند الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم وباستخدام تقنية التالق المناعي المباشر لفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الثلاثة (hPIV 1,2,3) كانت نسبة الاصابة 64% (اي 32 طفلا من اصل من اصل50) وعند استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي ( (RT - PCR وجد ان نسبة الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الاربعة (hPIV_1,2,3 and 4) 44% ( اي 22 من 50) تضمنت الدراسة استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لرؤية جزيئة فيروس نظير الانفلونزا في افرازات الاذن . اظهرت نتائج التشخيص البكتيري ان نسبة الاصابة بالمسبحيات القيحية هي 14%(7 من 50) بعد زرعها على وسط اكار الدم وحضنت لمدة 24 ساعة بدرجة 37 وتم فحصها بواسط المجهر الضوئي بعد تصبيغها بصبغة كرام , تم التشخيص بواسطة استخدام فحص Bacitracin sensitivity وفحص انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم بواسطة فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 systemاظهر التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود mga جين ان جميع العزلات تحتوي على هذا الجين اي نسبة 100% .كما اظهرت الدراسة ان نسبة وجود الفيروس مع البكتريا في في سوائل الاذن بنسبة (16%)( . 4 وكانت نسبة وجود الفيروس (72%) 18وشملت الدراسة ايضا فحص الحركيات الخلوية بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم واظهرت النتائج ارتفاع مستوى السايتوكينات في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء وكان اعلى مستوى لانترليوكين 6 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو) 88.24 )و (100.95) 1Pg/ml على التوالي . في حين كان اعلى مستوى لعامل النخر الورمي نوع الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (99.35 ) و(109.81 ) Pg/ml على التوالي. وكان اعلى تركيز لانترفيرون الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو( 217.16) و(( 197.84 Pg/ml على التوالي . واظهرت النتائج ان تركيز الواسمين المناعيين CD8 وCD56 ان تركيزهما اعلى في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء , اظهرت النتائج ان تركيز CD8 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو ((11.46±1.49 و(14.76±1.73) ng/ml على التوالي . في حين كان تركيز CD65 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (12.82±1.62 )و (10.59±1.19) ng/ml على التوالي | This study aimed to detect the role of of parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes in children suffering from suppurative otitis media. A total of two hundred sample (three swab for each patients include ear swabs , nasopharyngeal secretion for viral study and ear swab for bacterial study and 50blood sample) , were collected from 50 patients suffering from suppurative otitis media attending to AL - Hilla Teaching Hospital in Babylon - Iraq during the period from February 2016 to May 2016. The study includes 35 samples obtained from healthy subject as control group that classified to six group according to age in similar way of patient's with parainfluenza virus infection group years old The study includes four main parts .First one is the viral diagnosis based on relied diagnostic procedure ( Primary detection of parainfluenza virus in ear discharge by direct Immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types, molecular diagnosis by Real - Time PCR technique for the qualitative detection and differentiation of Parainfluenza Virus 1, 2, 3, 4 and diagnosis of parainfluenza virus by transmission electron microscope. The second part includes the bacterial diagnostic based on relied diagnosis procedure (using conventional biochemical reaction and commercial kit (Vitek 2 system). The heamolysis on blood agar was also observed in all isolates. Molecular detection of mga virulence gene for Streptococcus pyogenes was detected using conventional PCR technique. The third part is Co - infection between GAS and HPIV in OM specimens of children with suppurative OM. The fourth part is an immunological study to investigate the role of cytokines (IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8 and CD56) in HPIV infection by ELISA assay . Direct immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types antigen was positive in 64% (32 out of 50) , when we use Real - time reverse transcription PCR(RT - PCR) the percent of children infection with HPIV1, 2, 3, and 4 was 44% (22 out of 50). The study also include the use of transmission electron microscope for visualized the parainfluenza virus particle in ear swab. Streptococcus pyogenes isolates was detected in 14%(7 from 50) the isolate were confirmed after culturing on the blood agar and incubated for 24 hour at 37ºC, then microscopically by Grams̕̕ staining. Identification was done using commercially prepared bacitracin and the type of hemolysis on blood agar by primary biochemical test and confirmatory identification by vitek2 system compact. Molecular Identification of mga gene for Streptococcus pyogene showed that all Streptococcus pyogenes positive result 100%. The occurrence of Bacterial and viral co - infection in middle ear fluids which have been observed in 16% (4 out of 50 cases). HPIV was identified as a single agent in ear swab in 72%(18 out of 50). The study include estimation of some immunological parameter include (IL - 6, TNF - α, IFN - α , CD8 and CD56 ) using ELISA and revealed elevation the concentration of cytokines in sera of otitis media patients in comparison with healthy control groups. The concentration of IL - 6 is higher in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. The high level of IL - 6 Pg/ml in otitis media patients for male and female was (88.24) and (100.91) Pg/ml respectively. Also level of TNF - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (99.3) and (109.8) Pg/ml respectively . The level of IFN - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (217.16 )and (197.84 )Pg/ml respectively. The results also show elevation concentration of CD8 and CD56 in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. For CD8 ng/ml in otitis media patients for male and female was(11.46) and (14.76)ng/ml respectively. The level of CD56 ng/ml in otitis media patients for male and female was (12.82) and (10.59)ng/ml. respectively.

الكشف عن اللولبية البوابية في خزعة المعدة ودراسة مستوى P53 وطفرات مورثة Bax المرتبطة بالقرحة الهضمية == Detection of Helicobacter pylori in Gastric Biopsy and Study the Level of P53 and Bax Gene Mutations Associated With Peptic Ulcer

Author name: اصيل هاشم راضي السعبري
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | مشتاق عبد العظيم وتوت
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اللولبية البوابية هي بكتريا سالبة لصبغة كرام, الذي تصيب غالبية سكان العالم وتسبب امراض مختلفة مثل التهاب المعدة المزمن, القرحة الهضمية وسرطان المعدة. في حين ان غالبية الناس المصابين بالبكتريا اللولبية لا تظهر عليهم اعراض مرضية. ان العوامل الرئيسية التي تحدد تطور الامراض ذات الصلة بالبكتريا اللولبية قد تكون ضراوة البكتريا, وعوامل المضيف الوراثية والبيئية.الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن اللولبية البوابية في انسجة المعدة ودراسة عوامل الضراوة الرئيسية لهذا الممرض والعوامل الوراثية للمضيف في المرضى الذين يعانون من اعراض اصابات المعدة والاثني عشري. وتشمل الطرق الجزيئية ايضا تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) للكشف عن جينات التشخيص والضراوة لبكتريا اللولبية البوابية وتقنية (SSCP) تم القيام بها للكشف عن الطفرات الجينية ل P53 وال Bax جين التي قد تترافق مع عدوى اللولبية البوابية.بلغ العدد الكلي للنماذج (الخزعات) المعوية 180 نموذج. فقط 92 خزعة معدة (51 ٪) اعطى نتيجة ايجابية لللوليبيات البوابية (Helicobacter pylori ) للتشخيص بواسطة التقنية الجزيئية, مع ذلك من بين هذه النتائج الايجابية 60% منها اعطى نتيجة ايجابية للزراع, التي تعتمد على الميزات الكيميائية الحيوية. كما تم اخذ 100 عينة مصل الدم من افراد اصحاء مع عدم وجود تاريخ عدوى بالبكتريا اللولبية كمجموعة سيطرة ونتائج اختبار الاجسام المضادة على اساس (اختبار المصلية) اعطت نتائج سلبية للبكتريا اللولبية.قد تم ملاحظة وجود تكرار عالي للولبية البوابية بالتهاب المعدة المزمن الذي يشكل 88٪ بينما التكرار القليل كان مقداره 3٫3٪ لسرطان المعدة في حين ان 8٫7٪ كان لقرحة الاثنى عشري. وقد كان التكرار العالي لعدوى اللولبية البوابية بين المصابين الذكور اكثر من الاناث, ويعود سبب ذلك لعدة عوامل مثل (متوسط العمر الاجتماعي والاقتصادي ونقص التغذية وسوء النظافة) ويعتبر التدخين احد العوامل الاضافية المرتبطة مع انتشار عدوى (اللولبية البوابية ) بسبب السلوكيات غير الصحية المرافقة للتدخين , والتي قد تشمل نقل البكتيريا من خلال اللعاب بين المدخنين. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان معدل العدوى العالي للمجموعة العمرية (31 - 50) سنة الذي تم تسجيله كان 44٫6٪. علاوة على ذلك فان الكشف عن اللولبية البوابية بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة PCR)) قد اجريت على جميع انواع خزعات المعدة وجين (ure C ) اضافة الى جين (ure A ) اللذان يستخدمان كعلامات للتشخيص التاكيدي للولبية البوابية من خلال استخدام (primers ) خاص لتقنية PCR. وضحت النتائج ان 84٫8٪ و73٫9٪ للولبية البوابية كانت ايجابية لكلا الجينين. للعينات التي اعطت نتائج ايجابية (للتضاعف الجيني amplification ) بواسطة (PCR ), كان 56 عينة ما يمثل (60٪) قد اعطت استجابة لنتائج الزرع. اضافة الى التضاعف بواسطة PCR لعلامات جين (ure C ) وجين (ure A ). اضافة الى ذلك ,المعدل الايجابي للولبية البوابية للخزعات تحت الاختبار كان 51٪ بالاعتماد على الكشف الجزيئي المباشر بواسطة (PCR) باستخدام جين (ure A) وجين (ure C ). علاوة على ذلك, تم فحص جين (cag A) لكل عينات اللولبية البوابية التي تم عزلها. اشارت النتائج الى ان65 عزلة (70٫6٪) كانت ايجابية لتضاعف (PCR ) للجين من نوع cagA) ) حيث ان عزلة 56 (60٫8٪) كانت ايجابية لتضخيم (PCR ) للجين من نوع (cag E ). من بين النتائج الايجابية التي تم عزلها 49 عزلة (53٫3٪) كانت قد اعطت نتائج ايجابية للجين من نوع (cag A ). كذلك وجد تكرار الجين (vac A ) مقداره في الدراسة الحالية 68٫5٪ (63/92). اضافة الى كل اللولبيات البوابية الايجابية لخزعة المعدة 49 (53٫3٪) اظهرت اشارة كاملة للجينات نوع (cagA, cagE وvacA (. بالنسبة للعينات المعدية المتبقية 27 عينة (30٫4٪) التي تحوي سلالات سلبية كانت سلبية للجين (cag E). وقد تم تحديد طفرات جين (p53) في الاكسونات 5 و6و 7 و8 باستخدام طريقة SSCP. ومع ذلك تم استخدام PCR لتضخيم الاكسونات 5 و6 و7 و8 للجين (p53) التي من المعروف انها بقع ساخنة طافرة .تحليل PCR - SSCP يكشف تعديلات في الجين (p53) في عدة اكسونات. حيث ان ستة عشر من التعديلات في الاكسون E5A , سبعة عشر التعديلات في الاكسون E5B6A, وكذلك سبعة عشر التعديلات في الاكسون E7 وتعديل واحد فقط في الاكسون E6B لكن لم يظهرتعديل في الاكسون E8 في الجين (p53). بنفس الاسلوب ان تحليل PCR - SSCP كشف عن تعديلات في جين bax في الاكسونات E1 وE4 وE6. ويظهر ذلك في الاشكال. فيما يخص الاكسون 1 في bax يمكن ملاحظة وجود 6 نماذج فقط تعطي طفرات موضع ايجابية للجين. قد يعزى ذلك الى اللولبية البوابية التي تحفز طفرة bax من خلال قابليتها على انتاج بروتين cag A الذي له القابلية على تغيير التسلسل الجيني والوظيفة. واستنتجنا الى ان التشخيص الجزيئي قدم دليلا توكيديا على وجود اللولبية البوابية في عينات المعدة. ايضا قد تؤثر السلالات الاكثر ضراوة على تحفيز طفرات جينية في جينات ال p53 وال bax. | Helicobacter pylori is a gram - negative bacteria which infects a majority of the world population. It causes various diseases such as chronic gastritis, peptic ulcer and gastric cancer. While majority of the people infected with H. pylori is asymptomatic. The main factors, which determine the development of H. pylori related diseases might be bacterial virulence, host genetic and environmental factors.The aim of this study is detection of H. pylori in gastric tissue and study the main virulence factors of this pathogen and host genetic factors in patients with gasteroduodenal manifestation. Molecular methods include polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis and virulence genes of H. pylori and single strand confirmation polymorphism (SSCP) technique was done to detect the p53 and bax genes mutation may be associated with H. pylori infection. In this study, 180 patient were included, only 92 gastric biopsies (51%) gave positive for the presence of H. pylori diagnosed by direct molecular technique. Among these positive result, 60% gave positive results in cultivation based on biochemical features. In addition, 100 serum samples were taken from healthy individuals, with no history of H. pylori infection as a control group and the results of antibody based test (serological test) were negative for H. pylori.In this study, the high frequencies of H. pylori were observed for chronic gastritis, which constituted 88% while low frequencies were 3.3% for gastric cancer, whereas 8.7% for duodenal ulcer.Also, the highest frequencies of H. pylori infection were found in male patients in comparison to female. On the other hand, the results showed that the high significant infection percentage 44.6%, among age group ranging from 31 - 50 years. Moreover, detection of H. pylori by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique is performed on all gastric biopsy. ure C as well as ure A genes are used as markers for confirmatory diagnosis of H. pylori through using specific primers of PCR technique. The results show that 84.8% and 73.9% of H. pylori are positive for both genes, respectively. Among samples with positive result for PCR amplification, 56 samples (60%) also had positive culture result. Besides, the PCR amplification of ureC and ureA markers. Also, the rate of positive H. pylori in the tested biopsies was 51% depending on direct molecular detection by PCR using the ureA and the ure C genes.In addition, cag A gene is investigated in all H. pylori isolates. The results show that 65 isolates (70.6%) are positive for PCR amplification of cagA gene whereas 56 isolates (60.8%) are positive for PCR amplification of cag E gene. Among of these positive isolates, 49 isolates (53.3%) give positive result for cag A gene. The frequency of the vacA gene found in the present study is 68.5% (63/92).Furthermore, among of all H. pylori positive gastric biopsy, 49 (53.3%) reveal full signals of cagA, cagE, and vacA. The remaining 27 (30.4%) gastric biopsies, harboring cagA - negative strains, are PCR negative for cagE.Mutations of the p53 gene in exons (5,6,7 and 8) are identified by PCR - SSCP method. However, PCR is used to amplify exons 5,6,7 and 8 of p53 gene which are known to be mutational hot spots. PCR - SSCP analysis has detected alterations in the p53 gene in several exons. Where sixteen alterations in exon E5A, nineteen alterations in exon E5B6A, seventeen alterations in exon E7 and only two in exon E6B but no alteration is seen in exon E8 of P53 gene.In the same way, PCR - SSCP analysis detected alterations in Bax gene where only 17% of positive samples gave alteration in the sequence of Bax gene in exons E1, E4 and E6. Regarding exon 1 of Bax gene, it was seen that only 6 samples gave positive gene locus mutation. It conclude that the molecular diagnosis gave an evidence and confirmatory guide on the existence of H. pylori in gastric samples. Also the more virulent strain may be affected on the stimulation of p53 and bax genes mutation.

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Porphyromonas gingivalis المعزوله من المرضى المصابين بامراض اللثه == Molecular and Bacteriological Study of Porphyromonas gingivalis Isolated from Patients with Periodontitis

Author name: فاطمة مالك عبود
Supervisor name: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | الهام عباس بنيان
General topic: Medicine
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم جمع 103عينة من الصفيحة الجرثومية العميقة (subgingival dental plaque) من المرضى الذين يعانون من التهاب اللثة المزمن والمتقدم (72, 31) على التوالي لمراجي العيادة الاستشارية لامراض اللثة في كلية طب الاسنان/ جامعة بابل والمركز التخصصي لطب الاسنان في مدينة الحلة. للفترة من كانون الاول 2013 الى حزيران 2014. تم تشخيص وعزل بكتريا P. gingivalis بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية واظهرت النتائج ان 69.5%) 16) منها تم عزلها من التهاب اللثة المزمن وتم عزل 7 (30.5) من التهاب اللثة المتقدم باستخدام التنمية على الوسط الانتقائي الخاص لهذه البكتريا. وكذلك تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي باستعمال المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA حيث اظهر ان12 عزلة من اصل 23 عزلة تم تشخيصها بشكل نهائي انها تعود لبكتريا P. gingivalis. منها حوالي 8 تعود الى التهاب اللثة المزمن و4 تعود الى التهاب اللثة المتقدم. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا للالتصاق(adherence ability) بالخلايا الطلائية المبطنة للفم حيث وجد ان جميع العزلات لها القابلية على الالتصاق بهذه الخلايا وتم ايضا اختبار قابليتها على انتاج انزيم (Gingpain) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم.في هذه الدراسة تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية(Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate test (TCP) اذ كانت مكونة للاغشية الحيوية بنسبة 100% وكذلك تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على انتاج biofilm ووجد ان اعلى تثبيط سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير Clove مقارنة باقل تاثير لمادة السعد ((Cyprus rotundus. وكذلك تم الكشف عن حساسية العزلات لبعض المضادات الحيوية ووجد بان كل العزلات كانت حساسة الى Co - amoxiclave وعلى العكس اغلب العزلات تظهر مقاومة عالية لل Amoxicillin بينما سجلت مقاومة قليلة جدا لل Ampicillinو Metronidazole(16.3%, 20.3%, ) على التوالي. واخيرا تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على تثبيط نمو هذه البكتريا وتوضح النتائج ان اعلى تاثير سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير القرنفل(Clove) mm) 25,30,40) على التوالي مقارنة باقل تاثير لمادة السعدC. rotundus (10mm) .في هذه الدراسة ايضا تم التحري عن التغاير الجيني ((TLR - 4 Polymorphisms باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم ((PCR - RFLP. وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Thr399Ile : CC وCT وTT ، اذ بلغت نسبة انتشارها ((12.5%,10%,77.5% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة TT,CCوبنسبة انتشار(36.6% ,63.4%) على التوالي ، فيما بلغت نسبة انتشار الاليلC السائد في المرضى 82.5 % بالمقارنة للسيطرة 63.3% مع وجود اختلاف معنوي. وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA وAG وGG وبنسبة انتشار % 67.5 و12.5% و20% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة GG, AA وبنسبة انتشار34.4%) 66.6%,) على التوالي. حيث سجلت نسبة انتشار الاليل A السائد (73.75%) في مجموعة المرضى بالمقارنة بمجموعة السيطرة (66.6%) وبفرق معنوي. | In this study, 103 clinical samples were collected from subgingival dental plaque of patients with chronic (CP) and aggressive periodontitis (AP) (72 and 31) respectively, and (n=30) a healthy group admitted to teaching Hospital in college of Dentistry / Babylon University and specialized center of Dentistry in Hilla city, From February 2013 to June 2014). Out of which (n=40) with a chronic periodontitis group from them blood sample were collected for detection of gene polymorphisms in Toll - like receptor - 4 (TLR - 4). These dental plaque samples were subjected to different methods for identification of P. gingivalis mainly traditional bacteriological method. It was found that 23 P. gingivalis isolates were recovered by using selective media where 19 isolates (26.3%) obtained from (CP) and 4 isolates (12.5%) from (AP). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA gene as a genetic marker for confirmation of detection of P. gingivalis isolates, 12 isolates of P.gingivalis out of 23were detected by molecular method focusing on the role of 16s rRNA gene of P. gingivalis. 8 isolates were isolated from CP, and 4 isolates were isolated from AP subgingival plaques. In addition, these 12 isolates were investigated to detect Adherence of P.gingivalis to oral epithelial cells. The result showed that all isolates have ability to adhere to oral epithelial cells. The study also detected the ability of this bacteria for production of Gingipain, it was found that all isolates were positive for this enzyme at a rate 100%.Furthermore, biofilm formation was tested in the semi quantitative microtiter plate test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were accounted for (50%) while there are no isolates that express non biofilm formation.Regarding to effect of Chlorhexidine (CHX) gluconate (0.12%) on biofilm formation, the results of this study demonstrated (CHX) effectively and reduced the viability of biofilm - forming bacteria from moderate to 25%, weak to 75% and no strong. The study was also evaluating the effect of some plant extracts on biofilm formation. The results showed the highest effect for Alum potassium phosphate followed by Clove, in contrast to lowest effect of C. rotundus. And after screening the effect of Flagyl solution on production of bacterial pigment. The results showed that the metronidazole produced the highest inhibition activity range (30 - 10mm). Furthermore, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics had been investigated and it had been found that all isolates were sensitive to co - amoxiclave and, in contrast, the isolates showed high resistance to other type of beta lactam such as amoxicillin (54.3%). In addition, the result showed that the resistance of p. gingivalis was very low for ampicillin and metronidazole (16.3% and 20.3%), respectively.The screening of antimicrobial activity of (CHX) gluconate (0.12%) was carried out and the results showed that it produced the highest inhibition activity whether against p. gingivalis with inhibition zone range 40 - 15mm. Finally in vitro antibacterial activity of Alum, Clove and Cyperus rotundus plant extracts was studied and the results revealed that all tested isolates were inhibited by aqueous extracts at 50% concentration. The maximum inhibition zone was observed in Alum and Clove extracts respectively (30mm, 25mm), compared to the minimum inhibition by Cyperus rotundus (10mm). The antibacterial actions of 20% concentration of plant extract gave lower inhibition zone than 50% concentration of that extract which represented by (19mm, 16mm, and 10 mm) of the previous three mentioned extracts. This study also aimed to investigate the association of Thr399Ile and Asp299Gly single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the (TLR - 4) with the incidence of (CP).The results revealed at the site of SNPThr399Ile, there were three genotypes for this SNP among CP patients; CC, CT and TT with frequency of 77.5%, 10% and 12.5 % respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; CC and TT with frequency of 63.4% and 36.6% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele C (dominant) was higher among CP group (82.5%) than control (63.3) with significant difference. The site of SNP of Asp299Gly also showed three genotypes among CP patients; AA, AG and GG with frequency of 67.5%, 12.5% and 20% respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; AA and GG respectively with frequency of 66.6 and 34.4% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele A (dominant) was higher among CP group 73.75 % than control 66.6%.

الحقوق السياسية لمتعددي الجنسية == Political Rights For Multinationals

Author name: روافد محمد علي الطيار
Supervisor name: علي هادي حميدي الشكراوي | فراس كريم شيعان
General topic: Law
Specific topic: Private International Law
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The contribution of the individual in political life is based on a fundamental requisite to enjoy the nationality of the State which purports to exercise their political rights on its territory, but that he may enjoy the individual more than the nationali

الحماية الجنائية للاطباء : دراسة مقارنة == The Criminal Protection For Doctors A Comparative Study

Author name: نسرين محسن نعمة الحسيني
Supervisor name: علي حمزة عسل الخفاجي
General topic: Law
Specific topic: Criminal Law
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: الحماية الجنائية للاطباء تتمثل بالنصوص التي يقررها المشرع الجنائي لاحاطة الاطباء بالحماية التي يراها كفيلة برد الاعتداءات والافعال غير المشروعة التي قد تؤدي الى النيل من حياتهم او سلامتهم الجسدية او شرفهم وذلك بتجريم كل من يعتدي عليهم ومعاقبته والاقتصاص م | The Criminal Protection for Doctors (A comparative Study)Criminal protection for physicians are texts decided by the criminal legislator to inform doctors the protection seen enough to chill all kinds of attacks and illegal acts that may lead to the Nile

التوفيق بين احكام التجريم والعقاب وثوابت احكام الاسلام : دراسة مقارنة == Matching Between Rules of Criminalization And Penalization And Constants of Islamic Rules Comparison Study

Author name: حيدر حسين علي الكريطي
Supervisor name: حسون عبيد هجيج
General topic: Law
Specific topic: Criminal Law
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تعالج الاطروحة مشكلة دقيقة ومعقدة متشعبة الجوانب ومتعددة المستويات تتمثل بتعارض احكام جوهرية اساسية يضمها التشريع الجنائي العراقي مع القاعدة الدستورية المحورية التي رسخها دستور جمهورية العراق لعام 2005 وهي : ( عدم جواز سن قانون يتعارض مع ثوابت احكام الاسل | This study tackles with a minuet, complex and ramified - sides problem with multi levels are represented by conflicting of major essential laws included by Iraqi criminal legislation with the constitutional central base that was installed by the Iraqi con

اثر الحكم الصادر بعدم الدستورية : دراسة مقارنة == The Effects of The Judgment of Unconstitutionality Comparative Study

Author name: احمد علي عبود الخفاجي
Supervisor name: رافع خضر صالح شبر
General topic: Law
Specific topic: Constitutional Law
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The constitutional judiciary controls laws with a view to ensure respect for the rules in the constitutional document of the most important legal means to ensure enforcement of the law and properly implemented, they are designed to safeguard the constitut

النظام القانوني للهيئات المستقلة : دراسة مقارنة == The Legal System To Independent Bodies Comparative Study

Author name: صادق محمد علي الحسيني
Supervisor name: اسماعيل صعصاع غيدان البديري
General topic: Law
Specific topic: Constitutional Law
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The idea of independent bodies, which prevailed in many of modern legal systems, considered as modern concept. however the purpose of establish its in order to achieve most important functions deals with public freedom, economic action or transparency as

العلاقات الالمانية - الروسية (1870 - 1914) == Germany - Russian Relations 1870 - 1914

Author name: نادية جاسم كاظم علي الشمري
Supervisor name: علي هادي عباس المهداوي
General topic: History
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Summary:
References:

التفكير الدجماتي والنسق القيمي لدى طلبة الجامعة من ذوي الشيخوخة النفسية واقرانهم العاديين == The Dogmatic Thinking And Values System of The University Psychological Senility And Their Normal Peers

Author name: حليم صخيل مالك العنكوشي
Supervisor name: كاظم عبد نور عبد زيد
General topic: Psychology
Specific topic: Educational Psychology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تكمن مشكلة البحث في ان سلوك عدد من طلبة الجامعة يشبه الى حد كبير سلوكيات المسنين. وقد اطلق الباحثون على هذا النمط من السلوك مصطلح "الشيخوخة النفسية". وغالبا ما يبدى الطلبة من ذوي الشيخوخة النفسية مستويات متباينة من العجز النفسي وضعف الكفاءة الاجتماعية | The problem of this study manifests itself in the number of university students who behave in a way similar to the behaviors of the elders' people. This behavior was called psychological senility. Those kinds of behaviors lead to the emergence of various
Summary:
References:

اضطرابات اللغة اللفظية والانتماء الاجتماعي لدى تلامذة صفوف التربية الخاصة من ذوي الاسر الممتدة واقرانهم من ذوي الاسر النووية : دراسة مقارنة == Verbal Language Disorders And Social Affiliation For Students of Special Education Classes With Extended Families And Peers Nuclear Families : A Comparative Study

Author name: مدين نوري طلاك الشمري
Supervisor name: فاهم حسين الطريحي | عامر ياس خضير القيسي
General topic: Psychology
Specific topic: Educational Psychology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: يعد موضوع الاسرة الممتدة والاسرة النووية,وتطور اشكال الاسرة ووظائفها من الموضوعات التي دار حولها الكثير من الجدل، وبعدها المؤثر الاساسي في حياة الفرد والمجتمع، والتاثير الذي تتركه في تشكل اللغة اللفظية,بعدها الوسيلة التي يعبر بها الفـرد بشكل عام والطفـل ب | Considered the subject of an extended family and nuclear family and the evolution of family forms and functions of the topics that speak around a lot of controversy, and the greatest impact in the life of the individual and society, and the impact that in
Summary:
References:

اسلوبية اللغة عند نازك الملائكة

Author name: جبار اهليل زغير محمد الزيدي المياحي
Supervisor name: علي ناصر غالب
Specific topic: Language
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: This dissertation is to study stylistic opinions and poetical results of Iraqi wonderful poetess Nazik AL - Mala'ika. The study connects between the old produced and rose to come within the new ones represented by the black - verse that librated the poets from the boundaries of the unique rhythm and two parts of the old verse.The dissertation is divided into an introduction and four chapters. The introduction was just to show preliminary definition of the components of heading of the dissertation and stylistics of the language at Nazik ALMala 'ika.Chapter one concerns with the study of stylistical opinions, entitles "Nazik AL - Mala 'ika and the language of Modern Arabic Poetry", dealing with the deep and surface styles.An indicator of products unique 1 voice, binding with syntactical rule, renewal of language, renovation of utterances, humanity of verb, opposing synonyms in Arabic, refusal foreign utterances in poetry ,objection against Colloquial in poetry. Chapter two deals with linguistic consistency by which the poetess expressed her sadness and pessimism through poetry, like : (Consistency of interrogative, Format of exclamation, format of the appeal and format of repetition) Chapter three names as "Reversed in poetry ofNazik AL - Mala'ika" including sections of deletion, mention, presentation, and delay forming stylistic phenomena ,rising in her poetry like : (deletion of predicate, deletion of subject, mention predicate ,deletion of object , deletion of , preposition, deletion of articles deletion of exclamation instruments ,deletion of distinction.Whereas the sections of presentation and delay were (presenting predicate, presenting subject , presenting object , present clause, presenting adverb, presenting adjective over its noun and presenting the infinitive.).Chapter four studies the linguistic unity at Nazik AL - Mala'ika's poetry among which emerged ; Qur'anic utterances , natural utterances, patterns of irregular plural , patterns of extra verbs, the utter (each) and the verb (return).As for requirements of a stylistic research, the dissertation takes into account the effective factors on Nazik AL - Mala'ika's products particularly the poetic one like : Educational and social living, her influence by other Arab and western poets. I can not help, herein, just to present my great respect and regards to the professors of department of Arabic, in particular, the supervisor professor; Dr. ALI NASIR GHALIB who gave me most of his time, instn1ctions and his great efforts to evaluate this study.

نقض الغرض في العربية : دراسة صرفية نحوية == Refutation Of Purpose In Arabic (A Morphological And Grammatical Study)

Author name: حيدر حسين عبيس
Supervisor name: حامد عبد المحسن كاظم الجنابي
Specific topic: Language
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: معلوم ان الموانع في العربية كثيرة ومن يتتبع مواطنها لمعرفة ما يختلجها من علل او اسباب يتطلب منه ان يكون ملما بالحقائق اللغوية، مدركا بتصورات اللغويين اتجاه تلك العلل، وهذا ليس بالمطلب السهل بل يحتاج الى حسن التفكر وطول التدبر، وكان من بين هذه | It is known that there are so many ways refutation forms in Arabic and the person who wants to investigate how they work to know their limits or functions should own a wide comprehension concerning linguistics facts. He should realize the aim behind these forms. Of course, understanding that concept is not easy and it needs a high mental ability in addition to rich material from the researcher. He must know what exactly he looks for among many topics inside the linguistics which is known as ( Refutation of Purpose).The importance of studying this aspect comes from that it depends to one of the chapters of the book of (the features ) for Ibn Jiny which is ( Prevention of Refutation of Purpose) which implies lingual matters that avoid refutation forms that Arabians used to use in their common language styles what motivated me to continue studying this concept to reach its aims and the reason behind that concept according to certain principles that submit to mental logic. Through preface chapter, I have discussed the concept of (negation of purpose) and how it could be explained. Through the first chapter which is titled as (negation of Purpose in grammatical chapters). Inside the subdivision of the first chapter, I discussed negation of purpose in singular and plurol forms. In the second subdivision, I have discussed it form origin point of view. The second chapter is under the title (Refutation of Purpose in grammatical Phenomenon). In first subdivision, I have discussed refutation of purpose in brief. In the second subdivision, I discussed refutation of purpose in grammatical issues. In the third subdivision, I mentioned refutation of purpose in definite and non - definite. The fourth subdivision is about refutation of purpose from rink side. The fifth subdivision talks about refutation of purpose in deletion and finally in the sixth subdivision refutation of purpose with multiple means.The third chapter deals with (Refutation of Purpose in grammatical styles) which is listed as the first subdivision is about refutation of purpose in statement styles and it contains (speciality style) ( exception style) ( preference style) (certainty style). The second subdivision deals with refutation of purpose in request composition styles such as ( interrogative style) (warning style) and (calling style). The third subdivision implied refutation of purpose in non - request composition style such as (astonishment style) (appreciation and dis appreciation styles). With God's help to finish this research, I 've got some results. The research has put a definition to a concept of (Refutation of Purpose) as being the preventer to prevent any purpose to deform an aspect whether it has been lingual or in meaning. The research has also clarified that (Refutation of Purpose) is a clear phenomenon in existence and meaning and it forms an important notice in any linguistics job while they are discussing the general body of Arabian language as its being an essential part of Arabic that cannot be ignored. The first linguist who mentioned that concept was Abo Ali Al - Farisi who has transmitted this branch of knowledge to his student Ibn Jiny under the title of (Refutation of Purpose). Finally, I thank God for granting me luck and good will to finish this research.

الانساق الثقافية في رسائل الجاحظ (ت255هـ) == Cultural Formats In Jahez Messages (255 AH)

Author name: مثنى حسن عبود الخفاجي
Supervisor name: عباس محمد رضا حسن البياتي
Specific topic: Literature
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: Cash studies have done and did not sit in the modern and contemporary on Cultural done protruding cash and reality, and had Abu Usman among trace a few of the old intelligentsia unbroken attention counterpart on the part of the largest public vast majority of researchers and scholars Arabs, and remained read mine fertile and Mcnza thickly lesson literary and rhetorical and even cash in the Arab culture, but what draws attention really is the scarcity of cultural studies that have been the heritage of bigeye through the ages and offset to some extent lack extinction and annihilation, and this is what stimulated the researcher and encouraged him towards the foot on the approach Gahzi text, Baltae cultural exchange tools, procedures and strategies monetary mechanisms large numbers, that deal with cultural material, including linguistic texts as cultural speeches overflowing serious connotations and brimming with heavy contents and the carrier of the culture of the times, which were produced under Islamic rule, and the heir to the features and Twabah and brands negative and positive, and is involved with its institutions and overlapping with their contexts and responsive to the bets and requirements and influenced and influential Bhawwadth all the circumstances, and here the central dogma espoused by cultural criticism believes in the need to approach the texts in light generated culture him; which requires the development of texts in the womb of cultural contexts snare him from all sides, if, seeking access to the results of Ttoshh specific and respectful of accuracy, objectivity and scientific far, these are cash mental nominated by the study and adopted by the researcher Barutea grasped the most trustworthy in the bigeye read messages and relentless pursuit to discover the cultural formats mingled in the cultural discourse year, which is the fundamental objective of the study diligently in order to nail him. It was Astefaina messages bigeye, among other writings to be material anatomical these to our study, the starting point of fully represent us to the awareness of cultural criticism and responsive to him, who is trying to focus on the margins of cultural material, and struggling for the sake of all phenomena care and practices that were suffering from neglect and oppression and suffocation and repression The expulsion and absenteeism on the part of the previous monetary practice, as naive and menial and trivial and practices vile and despicable and ridiculous does not deserve attention phenomena does not require study, Vrsail bigeye not partaken so large share of the study, which won him the other writings Kalpaan and Signifying, animals and even stingy, here is worthwhile to point that we adopted in our study on three different editions investigation messages bigeye, the first achievement of Dr. Abdul Salam Mohammed Haroun, the second investigation, Dr. Ali Bou Melhem third achievement Mr. Hassan Sndoba; in order to accommodate all Almtozaah messages on the three editions written by bigeye. Material research, nature and recalled that the study is divided in three chapters : above each one entrance represents the threshold is a must to enter the Mnachath and ambiance and tourism in the internal Aoualemh, preceded by an introduction and followed by a conclusion included the most important findings of the research through the study, and download the first chapter address (assets, buildings and cultural exchange) and included four topics are : the concept of cultural criticism, and the roots of cultural criticism, and the concept of the text in cultural criticism perspective, the concept of the cultural pattern, and carry the second chapter title (format obedience to the Abbasid authority and defend), and included two topics, namely : the other dropping sectarian represented the people of modern Salafi doctrine Imami Shia religious other and suppress incarnated the Christians, carrying the third quarter and the last address (coordinated social Almadlj aligned), and included two topics is the other two : aligned chromatography (concentrated blacks and the marginalization of the egg), and sexual bias (concentrated men and the marginalization of (women
1 ... 41 42 43 44 45 ... 71