Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 8,433

عزل وتشخيص فيروس شلل الاطفال من الاطفال الملقحين بلقاح شلل الاطفال ومقارنته مع الفيروس الضاري == Isolation &Identification of Poliovirus from Vaccinated Children with Oral poliovirus vaccine and Comparison With Wild Type Virus

Author name: زهراء جعفر جميل عبد الكريم
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | عبد اللطيف محمد احمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد فيروس السنجابيةPoliovirus(PV) العامل المرضي الرئيس المسبب لشلل الاطفال Poliomyelitis . ويعتبر هذا المرض من الامراض الخطرة في العالم والتشخيص المختبري له ضروريا لغرض مراقبة وترصد حالات شلل الاطفال ومدى فعالية عملية التلقيح، وكذلك للتميز بين الشلل المتسبب من فيروس السنجابية (PV) والعوامل الاخرى ، والعناية المثالية للمريض هي تجنب الحركة والركض والركون الى الراحة والعلاج الطبيعي . تطوير علاج المرض باستعمال مضادات الفيروس لاصابات شلل الاطفال ممكن ان يضيف في المستقبل القريب حافزا اضافيا للتشخيص المختبري له . تضمنت الدراسة جمع مئة وثمانين عينة خروج من الاطفال (اعمارهم اقل من خمس سنوات) الذين اعطوا لقاح شلل الاطفال الفموي Poliovirus vaccine Oral في مركز الرعاية الاولية الصحية في بغداد لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) ، وكذلك تم اختيار خمسة عشر طفلا من المجموع الكلي للاطفال واستمرار متابعة مدى طرح فيروس السنجابية (PV) في الخروج لمدة عشرة ايام بعد التلقيح بلقاح شلل الاطفال الفموي (OPV) .لعزل فيروس السنجابية (PV) : حقنت نماذج الخروج في خطوط خلوية مختلفة (L20B, RD,Hep - 2C, CEF) ، ويتبع ذلك تشخيص نوع فيروس السنجابية (PV) من النماذج الموجبة التي اظهرت تاثيرات مرضية Cytopathic Effect بوساطة اختبار التعادل الدقيق Microneutralization Test ثم اجراء الترحيل الكهربائي SDS - PAGE Electrophoresis لبعض العينات التي شخصت وعينة اللقاح وعينات برية تم الحصول عليها من مختبر الصحة المركزي، وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : - • اظهرت الدراسة ان 114 عينة اعطت نتيجة موجبة لعزل فيروس السنجابية(PV)من اصل 180 عينة اي بنسبة (63%) .• لا توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV) من الذكور والاناث اذ ان نسبة الذكور الى الاناث في عزل (PV) هي 1 : 1 .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV ) خلال فصول السنة حيث وجد ان اعلى النسب كانت 74.6% في فصل الصيف .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) من عينات خروج اطفال باعمار مختلفة وجد ان اعلى نسبة لعزل (PV) 83.3% من عينات الاطفال بعمر 8 - 10 اشهر .• عند مقارنة معدل النتائج الموجبة على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطى افضل المعدلات (93%) يليها خلايا (RD) لمعدل (88%) ثم خلايا (Hep - 2C) بمعدل (84%) ،وعلى النقيض خلايا (CEF) لم تعط اية نتيجة موجبة .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في سرعة ظهور فيروس السنجابية (PV) على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان خلايا(L20B) اسرع الخطوط الخلوية في اعطاء النتائج، وكذلك توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) بين الخلايا (L20B) و(RD) في اليوم الثالث وكذلك توجد فروق معنوية بين (RD) و(Hep - 2C) ( P<0.05 ) في اليوم الخامس، بينما توجد فروق معنوية عالية ( P<0.05 ) في التحري عن فيروس السنجابية (PV) بين خلايا (L20B) و(Hep - 2C) وجد في اليوم الخامس .• في اختبار التعادل N.T : اظهرت النتائج ان النمط الاول (PV1) هو الشائع وقد كان بنسبة 60% ، ثم النمط الثالث (PV3) بنسبة 27% . لكن في هذه الدراسة لم يتم عزل النمط الثاني (PV2) ، وقد ظهرت فيروسات معوية (EVs) اخرى بنسبة 13% .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) مع باقي الفيروسات المعوية (EVs) خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطي افضل المعدلات (100%) لعزل فيروس السنجابية (PV)، ولم تعزل فيروسات معوية (EVs) ، اما خلايا (RD) بمعدل (90%) اما خلايا(Hep - 2C) بمعدل (71%) لعزل فيروس السنجابية (PV) ، وقد عزلت (EVs) بمعدل (29%) .• في اختبار الترحيل الكهربائي (Electrophoresis (SDS - PAGE في هذه الدراسة تم تمييز اربعة حزم للسلاسل الببتيدية لفيروس السنجابية (PV) لكن هذه النتائج : لم تظهر اي فروقات تميز بين انماط فيروس السنجابية (PV) الثلاثة ، وكذلك لا توجد فروقات تميز بين فيروس السنجابية (PV) المعزولة من عينات الخروج (المشتقة من اللقاح) والعينات البرية (تم الحصول عليها من مختبر الصحة العام المركزي)او عينات اللقاح .نستنتج من الدراسة ان تقنية الزرع النسيجي في الكشف عن فيروس السنجابية (PV) في نماذج الخروج ان الخلايا (L20B) تعد خط الخلايا الامثل والافضل لعزل فيروس السنجابية (PV) بدون عزل فيروسات معوية (EVs) اخرى من نماذج الخروج ، وهذا يوفر لناالوقت والجهد والمواد المبذولة لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) من عينات الخروج خلال وجود ومراقبة حالات الشلل الرخو الحاد (AFP )والمراقبة البيئية ضمن مبادرة استئصال شلل الاطفال وكذلك نستنتج ان النمط الاول(PV1)هو الاكثر شيوعا في هذه الدراسة . | Poliovirus (PV) is the etiologic agents of poliomyelitis , This Disease was one of the dangerous diseases in the world. Laboratory diagnosis is still required for detection of poliomyelitis cases and surveillance, to qualification of Immunization and other potentially treatable conditions; development of antiviral agent for the treatment of (PV) infection may provide added impetus for laboratory diagnosis in the near future. In this study collection one hundred and eighty stool specimens from children (less than 5 years old) who administered Oral Poliovirusvaccine (OPV) in preliminary health protection centers in Baghdad and Select fifteen children from the total children and following shedding (PV) in stool for 10 days after immunization with (OPV). Isolation of (PV) was conducted using stool specimens of the vaccination children and inoculated in (L20B) cells, human rhabdomyosarcoma (RD) , human epidermoid carcinoma (Hep - 2C) and check embryo fibroblast (CEF). Followed by identification of (PV) type from positive case which appear cytopathic effect (CFE). By microneutralization test, SDS - PAGE Electrophoresis was done to some specimens which identified as (PV1) ,(PV3),vaccine and wild type. The following results were obtained in this study : - • This study found (114) specimens were positive out of (180) specimens (63%).• No significant difference in isolation of (PV) taken from males and females ,The male to female ratio in (PV) isolation was 1 : 1 .• In comparison, the recovery rate of (PV) due to age of children was found to be the greater proportion and was 83.3%for children within age 8 - 10 month.• Significant difference in isolated (PV) due to during seasons ,the greater percentage was 74.6% during summer .• In Comparison, the recovery rate of (PV) in different cell lines revealed that L20B cell provided the best recovery rate (93%) from fecal samples , differing significantly from the other cell lines (P< 0.05) .• Significant difference in speed recovery of PV in different cell lines , recovery of L20B cell provided the faster recovery rate , significant difference (p > 0.05) of detecting PV between L20B and RD cell at day 3 and between RD and Hep - 2C cell (p > 0.05) at day 5;whereas more significant difference (p > 0.05) in the detection of PV between L20B and Hep - 2C found at day 5.• In neutralization test,it was found the poliovirus type (PV1)was more frequent (60%) than (PV3) (27%)but in this study can’t isolated (PV2), in this study found other (ENs) (13%). • In comparison, the recovered (PV) and other (EVs) in different cell lines ,showed that L20B cell was the best in the recovery rate (100%) for the isolation of (PV) while did not isolation of (EVs),RD in rate (90%) for (PV) while Hep - 2C isolation (PV) in rate (71%),and (ENs) in rate (29%).• In SDS - PAGE Electrophoresis, in this study distinguish 4 bands for polypeptide of (PV), but this result didn't show any difference between strains of (PV) which isolation from stool specimens and wild type. In conclusion the T.C. technique used for detection of ( PV) from stool specimens , the L20B cell was superior to isolation of (PV) without isolation of (EVs) and therefore established a first line of clinical diagnostic test for the detection of (PV) from stool specimens during AFP surveillance and Environmental surveillance in the initiation of eradication of Poliomyelitis. and in conclusion that the (PV1) was widespread in Environment .

تقييم صلاحية مياه نهر الغراف - جنوب العراق للاستخدامات المختلفة باستخدام دليل نوعية المياه (النموذج الكندي) == Evaluation of the validity of The AL - Gharraf - River Water Southern of Iraq for various uses by using the Water Quality Index (Canadian Model)

Author name: مها مثنى حسن التميمي
Supervisor name: حسين يوسف خلف الركابي
General topic: Biology
Specific topic: Aquatic Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية على نهر الغراف في محافظة ذي قار(جنوب العراق) فصليا ابتداء من فصل الصيف 2014 ولغاية فصل الربيع 2015 باستعمال دليل نوعية المياه (النموذج الكندي ) في هذه الدراسة بوصفه اداة فعالة في تقييم نوعية مياه نهر الغراف ولاول مرة في منطقة الدراسة لتحديد صلاحيته لاغراض مختلفة منها الشرب ومعيشة الاحياء والري للوقوف على حال المياه ونوعيتها في هذا النهر . اختيرت اربع محطات على طول النهر لجمع عينات المياه تمثلت المحطة الاولى عند مدينة الحي في محافظة واسط قبل دخول النهر محافظة ذي قار واحداثياتها 32°08'29.4"N ; 46°02'38.3"E))، اما المحطة الثانية تقع بعد خروج النهر من قضاء الرفاعي وتبعد عن المحطة الاولى بمسافة 50 كم تقريبا واحداثياتها (31°41'21.6"N ; 46°06'53.9"E) ،تقع المحطة الثالثة بعد خروج النهر من قضاء الشطرة وتبعد عن المحطة الثانية بمسافة 40 كم تقريبا واحداثياتها (31°22'50.8"N; 46°10'51.0"E)، والمحطة الرابعة والاخيرة تقع عند مدينة الاصلاح وتبعد عن المحطة الثالثة 72كم تقريبا واحداثياتها( 31°09'55.0"N; 46°36'36.6"E). جمعت عينات المياه من محطات الدراسة فصليا ابتداء من فصل الصيف2014 ولغاية فصل الربيع 2015 .اختير26 متغيرا من المتغيرات ذات التاثير الاكبر في نوعية المياه وصلاحية استخدامها لتجهيز مياه الشرب ولاغراض معيشة الاحياء ولاغراض الري في ايجاد قيم الدليل وهي درجة حرارة الهواء والماء وسرعة الجريان والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين والمتطلب الكيميائي للاوكسجين والتوصيلية الكهربائية والملوحة والعكارة والمواد الصلبة الذائبة الكلية والعسرة الكلية والكاربونات والبيكاربونات والقاعدية الكلية والكالسيوم والمغنيسيوم وايون الكلورايد وايون الصوديوم وايون البوتاسيوم ونسبة امتزاز الصوديوم والفوسفات الفعالة والنترات الفعالة والكبريتات والعناصر النزرة (الكادميوم والرصاص) وبكتيريا القولون البرازية . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ان درجة حرارة الهواء تراوحت بين(10 - 44) ○م ،اما درجة حرارة الماء فكانت بين (7.3 - 28.5) ○م ، وسرعة الجريان بين(0.07 - 0.25)م/ ثا ،اما قيم الاس الهيدروجيني سجلت بين(5.92 - 8.5)،كما سجلت الدراسة الحالية تراكيز للاوكسجين الذائب بين(1.06 - 8.4)ملغم/لتر ،اما المتطلب الحيوي للاوكسجين فكان ضمن المدى(22. 1 - 3.24)ملغم/لتر، بينما قيم المتطلب الكيميائي للاوكسجين بين (6.2 - 35.4) ملغم/لتر، في حين تراوحت قيم التوصيلية الكهربائية بين(674 - 1622) مايكروسمنز/سم، كما تراوح تركيز الملوحة بين (0.43 - 1.04) غم/لتر والعكارة بينNTU 6.7 - 3.11))،كما سجل تركيز المواد الذائبة الكلية بين(336 - 902) ملغم/لتر، والعسرة الكلية بين (367 - 833) ملغم CaCO3/لتر وكانت قيم الكاربونات غير محسوسة والبيكاربونات بين و(294 - 605) ملغم CaCO3/لتر، كما سجلت الدراسة الحالية تراكيز القاعدية الكلية بين(152 - 301) ملغم CaCO3/لتر، وكانت قيم الكالسيوم بين (52.3 - 197) ملغم/لتر والمغنسيوم بين (35.6 - 134)ملغم/لتر، والكلورايد بين (118 - 312)ملغم/لتر، كما سجلت مديات ايونات الصوديوم بين (93 - 201)ملغم/لتر والبوتاسيوم(3.2 - 13.37)ملغم/لتر ،اما نسبة امتزاز الصوديوم فكانت بين (0.63 - 3.98)ملي مكافئ/لتر،واما الفوسفات فيقع بين (0.03 - 0.44)ملغم/لتر.، بينما قيم النترات تقع بين (1.35 - 4.1)ملغم/لتر، في حين تروحت الكبريتات بين (202 - 399)ملغم/لتر. كما اظهرت الدراسة الحالية ان قيم العناصر النزرة كانت في الطور العالق ، اعلى من الطور الذائب اذ سجل عنصر الرصاص في الطور الذائب ما بين (1.72 - 47.81)مايكغم/لتر بينما في الطور العالق بين(5.78 - 135.1) مايكغم /غم وزن جاف. اما قيم عنصر الكادميوم في الطور الذائب بين (1.46 - 10.08)مايكغم وفي الطور العالق بين(2.16 - 110.72) مايكغم /غم وزن جاف. كما سجلت مياه المحطات المدروسة اعدادا لبكتريا القولون البرازية بين(50 - 333)خلية/100مل تراوحت نتائج الدراسة الحالية لقيم دليل نوعية المياه لتجهيز مياه الشرب(PWSI) بين (19.87 - 26.98) لكافة المحطات طوال مدة الدراسة وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة 44 - 0)) الفقيرة (Poor) على مقياس الدليل, اذ سجلت اعلى قيمة للدليل(26.98) (Poor) في المحطة الثانية خلال فصل الشتاء وادنى قيمة للدليل(19.87) (poor) في المحطة الرابعة لنفس الفصل. اما قيم دليل نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء (WQIAL) فكانت بين(4.37 - 12.06) وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة ايضا 44 - 0))الفقيرة(Poor) لجميع المحطات طوال مدة الدراسة ,اذ سجلت اعلى قيمة للدليل (12.6 ) (poor) في المحطة الثالثة خلال فصل الشتاء وادنى قيمة (4.37) (poor) في المحطة الرابعة خلال فصل الصيف. في حين وجدت قيم دليل نوعية مياه الري (IWQI) ما بين (16.11 - 43.32) وهي بذلك تصنف ضمن الفئة الخامسة 44 - 0))(Poor) على مقياس الدليل, لجميع المحطات طوال مدة الدراسة ,اذ سجلت اعلى القيم للدليل في المحطة الاولى ( 43.32) (poor) خلال فصل الشتاء وادنى قيمة(16.11)(poor) في المحطة الرابعة خلال فصل الصيف. اظهرت نتائج تحليل المكونات الاساسيPrincipal Component Analysis (PCA) ان الكادميوم والبوتاسيوم والنترات والفوسفات والكلورايد والمتطلب الكيميائي للاوكسجين وبكتريا القولون البرازية والمغنيسيوم اهم المتغيرات المسؤولة عن التغاير في نوعية مياه الشرب وبالتالي اكثرها تحديدا لمدى صلاحية نهر الغراف لتجهيز مياه الشرب, تلاها الصوديوم والعسرة الكلية والكبريتات والعكارة والاوكسجين المذاب والرصاص والقاعدية الكلية والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الكلية والكالسيوم والاس الهيدروجيني والمتطلب الحيوي للاوكسجين .في حين اهم المتغيرات المسؤولة عن التغاير في نوعية المياه لاغراض معيشة الاحياء ،درجة الحرارة والمتطلب الكيميائي للاوكسجين وبكتريا القولون البرازية والبوتاسيوم والفوسفات والكلورايد والكادميوم تلتها المتطلب الحيوي للاوكسجين والعكارة والاس الهيدروجيني والرصاص والمواد الصلبة الذائبة الكلية والاوكسجين المذاب والعسرة الكلية . في حين كان الاس الهيدروجيني والبيكاربونات والرصاص والتوصيلية الكهربائية هي المتغيرات الاكثر مسؤولية في التاثير على نوعية مياه الري ،تلاها الكادميوم ونسبة امتزاز الصوديوم والكلورايد. | The current study was conducted on Al - Gharraf River in Thi - Qar governorate(southern of Iraq) for the period from Summer 2014 to Spring 2015 using water quality index(Canadian model) in this study as an effective tool in the assessment of Gharraf River water for the first time in the study area to determine suitability for drinking, irrigation and aquatic organisms life. Four stations were determined along the river to collect samples AL - Hay city to the completion in the marshes .The first station was located in the district city and away from the second station of 50 kilometers (32 ° 08'29.4 "N; 46 ° 02'38.3" E), The second station was located after the departure of the river to spend AL - Rifai and its coordinates (31 ° 41'21.6 "N; 46 ° 06'53.9" E), The third station was located after the departure of the river AL - Shatra and away from the second station of approximately 40 km (31 ° 22'50.8 "N; 46 ° 10'51.0" E) The fourth station was located at the AL - Esllah city and away from the third station about 72km (31 ° 09'55.0 "N; 46 ° 36'36.6" E). Water samples were collected seasonally from a quarterly of study stations (and by four samples in the chapter) during every two months, starting from summer 2014 until spring 2015. twenty even variables were compiled the greatest impact on the water quality of the river and the validity of the Garraf which have using for the processing of drinking ,for the purposes of living requirements and irrigation purposes in the directory to find the WQI. These variables were air temperature, water temperature, the water current velocity, pH ,dissolved oxygen ,biological oxygen demand, chemical oxygen demand and electrical conductivity, salinity, turbidity ,total dissolved solids ,total hardness, carbonate ,bicarbonates ,total alkalinity, calcium ,magnesium, ion chloride ,sodium ion and potassium ion, reactive phosphate, reactive nitrate, sulfate sodium adsorption ratio ,trace elements (cadmium and lead) and fecal coliform bacteria. The current results showed that the air temperature ranged between (10 - 44) Cº, while the temperature of the water ranged between (7 - 28) Cº, the water current velocity ranged from (0.25 - 0.7) m / sec, pH between (5.92 - 8.5), The current study also recorded the concentrations of dissolved oxygen between (1.06 - 8.4 mg / L). The concentration of biological oxygen demand within the range (1.22 - 3.24) mg / L . The chemical oxygen demand of between (6.2 - 35.4)mg / L, Electrical conductivity values ranged between (674 - 1622) μs / m, .Salinity concentration ranged between (0.43 - 1.04) mg / L .Turbidity of water ranged from (3.11 - 6.7)NTU. Total dissolved solids ranged between (336 - 902) mg / L. Total hardness ranged between (367 - 833) mg CaCO3 /L. Carbonate values was non - palpable and bicarbonate and ranged between (294 - 605) mg CaCO3 /L. The total alkalinity concentration between (152 - 301) mg CaCO3 /L, Calcium ranged between (52.3 - 197 )mg / L. Magnesium ranged between (35.6 - 134) mg / L. Chloride ranged between (118 - 312) mg / L. Sodium ions were recorded between (93 - 201) mg / L. potassium (3.2 - 13.37) mg / L. The proportion of sodium adsorption ranged between (0.63 - 3.98) mequ/L. Phosphate ranged between (0.03 - 0.44) mg / L. Nitrates ranged between (1.35 - 4.1) mg / L. Sulfates ranged between (202 - 399) mg / L. The finding showed that the values of trace elements in the airborne phase was higher than the dissolved phase range the lead element of the dissolved phase between the values (1.72 - 47. 81) μg/L, while in the suspended phase ranged between(5.78 - 135.1) μg /gm dry weight. In the case cadmium of values of soluble part in the water range was (1.46 - 10.08) μg/L, either in the suspended phase of the water was (2.16 - 110.72) μg /gm dry weight. Studied water stations also recorded Numbers of fecal coliform ranged from (50 - 333) cells / 100 ml. Was also recorded in the studied stations . The values of potable water supply index (PWQI) ranged between (19.87 - 26.98) for all stations accordingly it is categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor). The highest value was (26.98) (Poor) in the second stations through the winter and the lowest value of the index (19.87) (poor) in the fourth station of the same season. Water quality index for aquatic organisms life (WQIAL) ranged between (4.37 - 12.06) for all stations there for it is evidently categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor) , As it recorded the highest value of index 12.6 (poor) in the third stations during the winter and the lowest value of index was( 4.37) (poor) in the fourth stations during the summer. The values for irrigation water quality index (IWQI)ranged between (16.11 - 43.32) for all stations accordingly it is categorized as fifth grade(0 - 44) (Poor) , As it the highest values of the index in the first station 43.32 (poor) during the winter and the lowest value of index was (16.11) (poor) in the fourth station during the summer. The results of Principal Component Analysis (PCA) showed that cadmium, potassium, reactive nitrates, phosphates, chloride ,chemical oxygen demand ,fecal coliform and magnesium were the most effective variables on the changes in water quality index for drinking water , followed by sodium, sulfates, total hardness ,turbidity ,dissolved oxygen, lead , total alkalinity ,electric conductivity ,total solids, calcium, pH and biological oxygen demand. While the most important variables responsible for the variation in water quality for quality organisms life,were water temperature ,chemical oxygen demand ,fecal coliform, potassium, phosphate, chloride , cadmium, followed by biological oxygen demand ,turbidity, pH, lead, total solids, dissolved oxygen and total hardness. While the pH ,bicarbonates, lead and electrical conductivity were the most influents effective on the determination of irrigation water quality, followed by cadmium, sodium adsorption ratio and chlorine .

دراسة بعض الجوانب الوبائية والمناعية للخمج بداء المقوسات في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار == Study of some epidemiological and immunological aspects of toxoplasmosis in Fallujah city - Al - Anbar province

Author name: محمد سليم اسماعيل ثامر العيساوي
Supervisor name: ابراهيم شعبان داوود | عبد الوهاب بديوي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع عينات دم من النساء المجهضات تراوحت اعمارهن بين (16 - 45) سنة المراجعات لمستشفى الفلوجة العام لمعرفة مدى انتشار طفيلي المقوسة الكوندية Toxoplasma gondii في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار بطريقتي تلازن اللاتكس Latex agglutination واختبار الخميرة للادمصاص المناعي (الاليزا) Enzyme linked immunosorbent assay, كذلك قياس مستوى الاضداد IgA , IgE , IgM , IgG والمتممين C4 , C3 وبعض المظاهر المناعية للخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) وبعض التاثيرات المناعية في الفئران البيض والقطط . ظهرت النتائج ان نسبة الخمج الكلية وحسب الفئات العمرية قيد الدراسة (16 - 25) , (26 - 35) , (36 - 45) سنة بطريقة تلازن اللاتكس كانت 43.75% , ( 40.90% , 46.15% , 42.11% ) وبطريقة الاليزا 32.50% (31.82% , 35.90 , 26.31% ) , ونسبة الاخماج الكلية الحادة والمزمنة بطريقة ELISA - IgG , ELISA - IgM وحسب الفئات العمرية كانت 10% (13.64% , 12.82% , 0% ) , 22.50% (18.18% , 23.08% , 26.31 ) على التوالي. قياس مستوى الاضداد IgG , IgM النوعية ضد المقوسة الكوندية وIgE الكمي بطريقة اختبار الاليزا (ELISA ) , وقياس مستوى الضد IgA الكمي والمتممين( Complements) C4 , C3 بطريقة اختبار الانتشار المناعي الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion test اظهرت ارتفاع معنوي في معدل مستوى الاضداد IgG , IgM النوعيين ضد المقوسة الكوندية وعدم وجود فروق معنوية لمعدل مستوى الاضداد IgE , IgA الكميين والمتممين C3 , C4 للنساء المخمجات مقارنة بالسيطرة. اظهر التحليل الاحصائي ان للخمج بطفيلي المقوسة الكوندية T. gondii وجود فرق معنوي على زيادة نشاط الخلايا متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) في بلعمة خميرة الكانديداCandida yeast واختزال صبغةNitroblue tetrazolium reduction وتاثيراﱟ منخفضاﱟ لمعدل عيوشية الخلايا (PMNs ) وهجرة طبيعية للخلايا PMNs)) المعزولة من النساء المخمجات ولكل الفئات العمرية مقارنة بالسيطرة. اظهرت النتائج ان حقن اكياس البيض المضعفة بالاشعة فوق البنفسجية Ultraviolet والمكسرة Ultra - Sonication اعطت تفاعلات واضحة عند اجراء اختبار فرط الحساسية المتاخرDelayed Type Hypersensitivity اذ بلغ اعلى معدل سمك القدم (2.32 , 2.79) ملم وقطر المنطقة المتهيجة (7.79 , 8.78) ملم بعد (24) ساعة في الفئران المحقونة على التوالي ، ان تمنيع الفئران بمحلول اكياس البيض المضعفة واعطائها جرعة تحدي تاثير على انخفاض معامل الكبد والطحال مقارنة بالسيطرة ، وان حقن مستضدات الطفيلي ( اكياس البيض المضعفة ) في الفئران ثم اعطائها للقطط اخر وقلل نسبة اكياس البيض المطروحة من قبل القطط وبلغت نسبة الوقاية الكلية 22.29% مقارنة بالسيطرة الموجبة. | The study included collection of blood samples from aborted women, aged between 16 - 54 years attended the general Fallujah Hospital for the prevalence of the infection with Toxoplasma gondii in Fallujah city - AL - Anbar province by two methods : latex agglutination , Enzyme linked immunosorbent assay , measurement of antibodies concentration of IgM, IgG, IgE, IgA, Complements C3, C4, and some immunological features of cells and some immunological effect in white mice and cats. The results showed that the percentage of total infection and according to age groups in the study (16 - 25), (26 - 35), (36 - 45) by LAT were 43.75% , 40.90% , 46.15% 42.11% respectively and with ELISA test 32.50% , 31.82% , 35.90% , 32.50% respectively , the percentage of total acute infection by ELISA - IgM in accordance with age groups were 10% , 13.64% , 12.82% , 0% whereas total , chronic infection by ELISA - IgG were 22.50% , 18.18% , 23.08% , 26.31% respectively. The measurement of antibodies levels of IgG, IgM, IgE by ELISA, IgA and complements C3, C4 by single radial immunodiffusion showed a significant increase in the average antibodies levels of specific IgM, IgG against T. gondii whereas no significant increase in the average antibody level of IgE, IgA and complement C3 , C4 in the infection women in comparison to control. The infection with T. gondii showed significant difference in the activity of Polymorphonuclear neutrophils (PMNs) in the phagocytosis of candida yeast and reduction of Nitroblue tetrazolium, whereas little effect on viability of PMNs and natural migration of neutrophils isolated from infection women of all age groups in comparison to control. The results of the immunological effects of inoculation of Oocysts attenuated by ultra - violet rays or ultra - sonication into white mice showed, the clear reaction in delayed type hypersensitivity test, the average of highest thickness of mice - foot were 2.79, 2.32 mm. and diameter of the inflamed regions were 8.78, 7.79 mm. 24h. after inoculation, the immunization of mice with attenuated oocysts followed by a challenge dose reshowed a decrease in the factor of liver and spleen in comparison to control. Cats fed mice that fedded by which was inoculated by Oocysts attenuated by ultra - violet rays showed a delay and a decrease in the Oocysts discharge in the feces by 22.29% in comparison to control.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ والقريص على بعض عوامل الضراوة والدنا البلازميدي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == The Effect of aqueous and alcoholic extracts of Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens (L.) in some virulence factors and plasmid DNA in local isolates of Pseudomonas aeruginosa

Author name: ديمة نزار فرج باصات
Supervisor name: لينة عبد الكريم الامير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (50) عزلة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من (110) عزلة من مصادر عزل مختلفة (الجروح ، والحروق ، والاذن ، والادرار ، والدم) لمرضى في مستشفيات اليرموك ، والكندي والعلوية للاطفال ، وقد تبين ان (44 %) من العزلات كان مصدرها الجروح و(20 %) لكل من الادرار ، والاذن و(12%) للحروق ، و(4 %) لعينات الدم.وعند التحري عن المقاومة لمضادات الحياة وجد ان (68 %) من العزلات اظهرت مقاومة متعددة لـ (6 - 9) مضادات و(26 %) من العزلات كانت مقاومة لـ (1 - 5) مضادات و(6 %) من العزلات مقاومة لـ (10 - 12) مضادا وتوزعت العزلات المقاومة ضمن (33) نمط مقاومة لمضادات الحياة.وعند التحري عن انتاج بعض عوامل الضراوة لبكتريا P. aeruginosa تبين ان (82 %) من العزلات منتجة لانزيم الهيمولايسين و(74 %) منتجة لانزيم الايلاستيز و(66 %) منتجة لانزيم اليوريز ، وكانت المجموعة السائدة هي المنتجة للعوامل الثلاثة معا ، مما يدل على اهمية هذه العوامل في ضراوة البكتريا كما تبين ان هناك ارتباطا بين انتاج انزيم الايلاستيز والهيمولايسين.اختيرت عزلتان احداهما مقاومة لاحد عشر مضادا من اصل 12 مضادا منتجة لعوامل الضراوة الهيمولايسين ، والايلاستيز ، واليورييز (PD1) والاخرى حساسة (مقاومة لاربعة مضادات من اصل 12 مضادا) ومنتجة للايلاستيز والهيمولايسين وغير منتجة لليوريز (PD2).وعند التحري عن وجود البلازميدات وجد ان العزلة المقاومة (PD1) تمتلك بلازميدا واحدا والعزلة الحساسة (PD2) لا تمتلك بلازميدا.حدد التركيز المثبط الادنى للمستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ Withania somnifera L. Dun. ، والقريص Urtica urensi L. تجاه بكتريا P. aeruginosa (للعزلتين (PD1,PD2وكان التركيز المثبط الادنى لمستخلص سم الفراخ المائي (175) ملغم / مللتر ، والكحولي (5) ملغم / مللتر ، والتركيز المثبط الادنى لمستخلص القريص الكحولي (25) ملغم / مللتر ، اما المستخلص المائي للقريص فلم يكن له اي تاثير تثبيطي في نمو البكتريا حتى التركيز (175) ملغم / مللتر.درس تاثير المستخلصات في التراكيز تحت التركيز المثبط الادنى تجاه تثبيط بعض عوامل الضراوة للبكتريا وكان مستخلص سم الفراخ المائي والمستخلص الكحولي مثبطا لانزيم الهيمولايسين ومضعفا للايلاستيز ولم يكن لهما تاثير في انتاج اليوريز عند التراكيز (100 ، 125 ، 150) ملغم / مللترللمستخلص المائي والتراكيز (2 ، 3 ، 4) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي ، اما مستخلص القريص المائي والمستخلص الكحولي فكان لهما تاثير مثبط للايلاستيز ومضعف للهيمولايسين ولم يؤثرا في انتاج اليوريز عند التراكيز (125 ، 150 ، 175) ملغم / مللتر للمستخلص المائي وعند التراكيز (10 ، 15 ، 20) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي.لم يكن لاي مستخلص نباتي من المستخلصات المستعملة تاثير في تحييد البلازميد للعزلة PD1 عند التراكيز تحت المثبطة ، لكن عند تحليل الدنا البلازميدي باستخدام الاشعة تحت الحمراء وجد ان مستخلصي سم الفراخ المائي عند التركيز (150) ملغم / مل والكحولي عند التركيز (4) ملغم / مللتر احدثا تغييرا في مواقع جذر NH+3 ولايون C=O عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 ، والحزمة 1649 سم - 1 على التوالي. اما مستخلص القريص المائي عند التركيز (175) ملغم / مللتر والكحولي عند (20) ملغم / مللتر فقد احدث تغييرا في موقع جذر NH3+ عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 وايون C=O عند 1649 سم - 1 واحدثت تغييرا في شدة الحزمة عند 1022 سم - 1 والتي تعود الى مجموعة PO2 - ويمتاز المستخلص المائي بانه احدث تغييرا في دنا البلازميد البكتيري بظهور حزمة جديدة عند 810 - 690 سم - 1 وتعود لمجموعة PO2 - ايضا. وهذا يشير ايضا الى احتمال تاثير تلك المستخلصات النباتية على الوضعية العامة لجزيئة الـ DNA من ناحية التركيب الثانوي وبالتالي على بعض ادواره الوظيفية الحيوية. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from various clinical specimens including : wound , burn , ear , urine and blood , collected from patients hospitalized in Yarmouk , Al - Kindy and Al - Elweia for children hospital,A total of (50) (out of 110) isolates were obtained of which (44 %) were isolated from wounds , (20 %) from urine and ear infections , (12 %) from burns and (4 %) from blood specimen.Antibiotic resistant tests have indicated that (68 %) of P. aeruginosa isolates were multiresistant to (6 - 9) antibiotics and (26 %) were resistant to (1 - 5) antibiotics and (6 %) were resistant to (10 - 12) antibiotics , P. aeruginosa isolates exhibited (33) antibiogram patterns.Detection of some virulence factors production by these isolates indicated that (82 %) were producers of hemolysin, (74 %) were elastase producers and (66 %) were urease producers. The group producing all three virulence factors was dominant.Two isolates were selected , the first isolate (PD1) was resistant to (11) antibiotics , and produced hemolysin , elastase and urease , the second isolate (PD2) was resistant to (4) antibiotics only (out of 12) and produced hemolysin , elastase but not urease.Screening for plasmid DNA indicated that the resistant isolate (PD1) had a single plasmid , while the sensitive isolate (PD2) had no plasmid.Minimum inhibitory concentration (MICs) of the aqueous and ethanolic extracts of both (whole) plants Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens L., were determined towards P. aeruginosa (PD1,PD2), Results obtained showed that MIC of ethanolic extract of W. somnifera was (5) mg / ml and of aqueous extract was (175) mg / ml. The MIC for the ethanolic extract of U. urens was (25) mg / ml , while the aqueous extract had no inhibitory effect towards P. aeruginosa up to (175) mg / ml.The effect of Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extracts of both plants on the production of hemolysin , elastase and urease was investigated. Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extract of W. somnifera had an inhibitory effect on hemolysin production and a suppressing effect on elastase but no effect on urease production at 100 , 125 , 150 mg / ml for the aqueous extract and 2 , 3 , 4 mg / ml for the ethanolic extract.Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extract of U. urens had an inhibitory effect on elastase production and a suppressing effect on hemolysin , but no effect on urease production at 125 , 150 , 175 for the aqueous extract and 10 , 15 , 20 mg / ml for the ethanolic extract.The electrophoresis of plasmid DNA isolated from bacterial cell treated with plant extracts indicated that neither W. somnifera nor U. urens extracts had a curing effect on the plasmid at sub - MIC concentrations for PD1.Vising infrared spectroscopy spectrum showed that the sub MICs of ethanolic and aqueous extracts of . W. somnifera (4 mg / ml , 150 mg / ml) made an alteration in NH+3 groups at wave band (2000 - 3100) cm - 1 and C=O group at 1649 cm - 1 , while the Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extracts of U. urens (20 mg / ml , 175 mg / ml) made changes in NH+3 , C=O and PO2 - groups at the wave bands (2000 - 3100) , 1649 , 690 - 810 cm - 1 respectively. These results indicate the possible effect of plant extracts on the conformation of the DNA molecules affecting some of its biological functions.

دراسة مقارنة بين الشكلين الحلزوني والمكور في بكتريا Helicobacter pylori المعزولة من مرضى مصابين بقرحة الاثنى عشر

Author name: حلا مؤيد رديف
Supervisor name: ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى عزل بكتريا Helicobacter pylori من المرضى المصابين بقرحة الاثنى عشر ودراسة ظاهرة تحول الخلايا من الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة والعوامل المؤثرة ، وقد بينت النتائج ان مكونات الوسط الزرعي والضوء والاوكسجين من اهم العوامل التي تساعد على عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة لجرثومة H. pylori . خلال مدة الحضن والخزن , فقد لوحظ عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب ، ووسط اغار الدم الاساسي المضاف اليهما دم بشري متحلل بنسبة ( %5) ، واضافات النمو يتم الحصول على الاشكال المكورة بنسبة اقل مما لو استخدمت الاوساط الزرعية ذاتها لكن بدون اضافة الدم واضافات النمو. وللمحافظة على حيوية جراثيم الهيليكوبكتر وعلى شكلها الحلزوني لمدة زمنية اطول قد تصل الى (30 - 20) يوما عند خزنها بدرجة حرارة (4)مo , يجب عدم تعريض الاوساط الزرعية الى الضوء والاوكسجين بنسبة اعلى من ( %6 ) ، كذلك مراعاة ان تكون باءهاءpH)) الوسط .( 8 - 6.9 ) سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب، ووسط المولرهنتون، ووسط مرق البروسيلا، ووسط اغار الحليب، ووسط اغار الـﭼوكليت ،ووسط اغار الماكونكي ، ووسط التربتون سوي بروث( Trypton Soy Broth ) . اذ اضيف الى قسم من الاوساط المستخدمة ( %5 ) دم بشري متحلل واضافات النمو ، كذلك سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الفئران واستخدام خنازير غينيا ( Guinea - pigs ) بشكل افضل من استخدام الاوساط الزرعية الصلبة والسائلة مع مراعاة اعطاء الحيوان جرعة لقاح بحجم ( 0.1 ) ملليلتر , ولوحظ ضرر نسيجي عند دراسة المقاطع النسيجية للمعدة ، اذ اشارت الدراسات السابقة الى عدم قدرة تحول الاشكال المكورة الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الحيوانات المختبرية. اوضحت النتائج ان المحتوى الكيميائي للاشكال المكورة في بكتريا H. pylori يختلف عن المحتوى الكيميائي للاشكال الحلزونية للبكتريا نفسها بعد معاملتها بحامض الكبريتيك المركز وهيدروكسيد البوتاسيوم ، الشيء الذي يعكس حدوث تغيرات في الجدار الخلوي خلال عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة . كما بينت النتائج ان الاشكال المكورة اقل كثافة من الاشكال الحلزونية ، بسبب قلة نسبة الببتيدوكلايكان ، واضمحلال المكونات الخلوية وفقدانها نتيجة حدوث تغيرات في الجدار الخلوي وتلف الغشاء الهيولي Cytoplasmic membrane) ) . اظهرت الدراسة ان محتوى الاشكال المكورة العائدة الى H. pylori من الحامض النووي الديوكسي رايبوز DNA ) Deoxyribo nucleic acid ) ، والحامض النووي الرايبوزي RNA ) Ribonucleic acid ) اقل مما هو موجود في الاشكال الحلزونية للجرثومة نفسها . عند دراسة انظيم اللايسوزايم Lysozyme ومادة EDTA كلا على حدة ، وكذلك انظيم اللايسوزايم ومادة EDTA معا في الاشكال الحلزونية العائدة الى جرثومة H. pylori , كان التاثير اكثر بكثير قياسا مع الاشكال المكورة للجرثومة نفسها ، وذلك لقلة نسبة الببتيدوكلايكان في جدران الاشكال المكورة ، او لفقدان مواقع في الببتيدوكلايكان حساسة الى انظيم اللايسوزايم . وقد لوحظ ان المنظفات الايونية مثل مادة SDS والمنظفات اللاايونية مثل مادة Triton X - 100 تسببان تحلل عزلة H. pylori بشكليها الحلزوني والمكور , الا ان التراكيز الواطئة من مادة SDS تكون اكثر فعالية من التراكيز العالية من مادة Triton X - 100 في تحلل الجرثومة بشكليها الحلزوني والمكور. شوهدت الاشكال الحلزونية والاشكال المكورة لجرثومة H. pylori والاشكال التي تظهر خلال تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة عند استخدام المجهر الالكتروني الناقل , وقد لوحظت اشكال مختلفة من الاشكال المكورة تملك سوطا واحدا او سوطين . وسجل لاول مرة امتلاك الاشكال المكورة العديد من الاسواط ، وذلك عند تصوير العزلات بالمجهر الالكتروني الناقل. في حين اشارت الدراسات السابقة الى امتلاك الاشكال المكورة سوطا واحدا او سوطين فقط . وقد بينت نتائج دراسة التركيب الدقيق باستخدام المجهر الالكتروني ظهور الاشكال المتعددة للجرثومة ( العصوي ، والعصوي المنحني ، والملتوي ) فضلا عن ملاحظة النهاية المستديرة للجرثومة والتوزيع المتجانس للمكونات السايتوبلازمية والصباغية ( Chromatic Contents ) في داخل الخلية الجرثومية والسطح الناعم للجرثومة ، كما تم مشاهدة السياط المميزة لهذه الجرثومة التي تميزت بكونها مغمدة ( Sheathed ) وحاوية على انتفاخ ( تثخن ) في نهاية السوط الذي يشبه الهراوة . | The study aimed to isolate the Helicobacter pylori bacteria from patients who have duodenum ulcer and study the phenomenon of cell transformation from spiral shapes to cocci shapes and the influencing factors. The results showed that the component of the agricultural environment, light, and oxygen are the most important factors that help in the process of transformation from the spiral shapes to cocci bacterial shapes of H. pylori during the incubation and the storage period. It had been noticed that when using Brain - Hart infusion agar and Blood - Base agar with the addition of decomposed human blood by a percentage of (5%) with growth supplements, we get cocci shapes with a percentage less than that when we use the same agricultural media without adding the blood and the growth supplements. To maintain the activity of the H. pylori and its spiral shape for a longer period of time which can go up to (20 - 30) days when stored at 4 Co , we must not exposure the agricultural media to light and oxygen with a percentage higher than 6% and also thepH must be (6.9 - 8). For the first time, it had been recorded that some cocci shapes can transform to spiral shapes when using Brain - Hart infusion agar, Muller - Hinton agar, Brucella agar, Milk agar, Choclate agar, Maconcky agar, and Trypton Soy Broth, if we add to some of the used media (5%) of decomposed human blood and growth supplements. While, the previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using cultural media. Also, it had been recorded for the first time that some of the cocci shapes can transform to spiral shapes when using mice and Guinea - Pigs, in a better way than using the solid and liquid cultural media taking into consideration giving the animal a dosage of vaccine of size (0.1) ml. Tissue damage had been noted when studying the tissue sections for stomach, while previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using laboratory animals. The results show that the chemical content of the cocci shapes in the H.pylori bacteria is different from the chemical content of the spiral shapes of the same type of bacteria after treating it by concentrated sulfuric acid and potassium hydroxide, which reflect that changes had took place in the cell wall during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes. The results also showed that the cocci shapes are less density from the spiral shapes due to shortage of Peptidoglycan and the vanishing of the cellular components and the loss of these cellular components due to the changes that took place in the cell wall and the damage of the Cytoplasmic membrane. The study showed that the contents of the cocci shapes of the H.pylori from the Deoxyribo Nucleic Acid (DNA) and from the RiboNucleic Acid (RNA) is less than that of the spiral shapes of the same bacteria. When the Lysozyme and EDTA had been studied separately and also the Lysozyme and the DETA together in the spiral shapes of the H. pylori bacteria, the effect was much more when compared with the cocci shapes of the same bacteria, and that is due to the shortage of Peptidoglycan in the walls of the cocci shapes or due to the loss of Peptidoglycan positions sensitive to the Lysozyme. It had been noted that the ionic detergents such as the SDS and the non - ionic detergents such as Triton X - 100 are causing the analysis of the H. pylori isolation in both the cocci and spiral shapes, but the low concentrations of SDS is more efficient than the high concentration of the Triton X - 100 in the analysis of the bacteria in both of its cocci and spiral shapes. The spiral shapes and the cocci shapes of the H. pylori bacteria and the shapes that appears during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes had been observed when using the Transmission Electronic Microscope (TEM) , also different cocci shapes had been observed that have one and two flagellum. It had been recorded for the first time that the cocci shapes have more than one flagellum and that was during the photography of the isolations by the TEM, while previous studies mentioned that the cocci shapes have one or two flagellum only. The fine composition study using electronic microscope showed that many shapes of the bacteria appears ( rods, curved rods, and the spiral ) in addition to noticing the round end of the bacteria and the homogenous distribution of the Cytoplasmic and Chromatic contents inside the bacteria cell and the smooth surface of the bacteria, and also the flagellum that distinguish this bacteria had been observed that are distinguished by being sheathed and have inflation ( thickness ) in the end of the flagellum which looks like cudgel.

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين == Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

Author name: هالة محمد حسين الحسني
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

Author name: حسام صباح اوهيم
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا == Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

Author name: جوان صباح باجلان
Supervisor name: سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة == Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

Author name: بشار قصي كاظم
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli

دراسة الاستجابة المناعية للنساء الحوامل وعلاقتها بالمسببات الجرثومية للالتهاب المجاري البولية == Study of Immune Response of Pregnant Women and it's Relation with Causative Pathogenes of Urinary Tract Infection

Author name: امال عزيز كريم السعدي
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
Abstract: تناولت هذه الدراسة التعرف على المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا لاصابة النساء الحوامل بالتهاب المجاري البولية وتقييم الاستجابة المناعية بنوعيها الخلطية (Humoral) والخلوية (Cellular).جمع 124 نموذج دم وادرار موزعة على النحو الاتي : (50) نموذجا من نساء حوامل مصابات وعينات السيطرة من (50) نموذجا من نساء حوامل غير مصابات و(10) نماذج من نساء غير حوامل مصابات، و(14) نموذجا من نساء غير حوامل وغير مصابات.وقد اظهرت النتائج ان المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا باصابتها للنساء الحوامل كانت بكتيريا Escherichia coli وبنسبة (%18.6)، تليها بالمرتبة الثانية بكتيريا Staphylococcus saprophyticus وبنسبة (%18.3).اختلفت انواع البكتيريا التي تمكن عزلها باختلاف مراحل الحمل الثلاث Trimester. وسجلت اعلى نسبة اصابة في المرحلة الثانية من الحمل تليها المرحلة الاولى ثم المرحلة الثالثة من الحمل وكانت النسبة %47) و%20 و%17) على التوالي.اظهرت نتائج الاستجابة المناعية غير المتخصصة (Non - specific) وجود زيادة بنتائج فحص النشاط البلعمي (Phagocytosis) في الدم المحيطي للنساء الحوامل المصابات وبزيادة معنوية (0.05 > P) في قابلية الخلايا البلعمية على الالتهام وفي مراحل الحمل الثلاث مقارنة مع عينات السيطرة.كما لوحظ وجود زيادة معنوية (0.05 > P) في تركيز العامل المتمم الثالث C3 في مصول النساء الحوامل المصابات.اما الاستجابة المناعية المتخصصة (Specific) فقد اظهرت انخفاضا معنويا (0.05>P) في قابلية الخلايا اللمفاوية على التحول والانقسام في الدم المحيطي وفي مراحل الحمل الثلاث وباستخدام المشطر (PHA) لتحفيز الخلايا اللمفاوية على الانقسام، مقارنة مع عينات السيطرة.اما نتائج قياس تركيز الغلوبيولينات المناعية (Immunoglobulines) في مصول مجاميع الدراسة. فقد اظهرت النتائج عدم وجود فروق معنوية في تركيز كل من الغلوبيولينات المناعية نوع A وG مع انخفاض معنوي في تركيز الغلوبيولين المناعي نوع M في مصول الحوامل المصابات مقارنة مع عينة السيطرة من النساء غير الحوامل غير المصابات | In this study, we attempted to identify the most common bacteria which causes urinary tract infection in pregnant women, and also to evaluate both cell - medicated and humoral immune responses in those women.Samples of 124 blood and urine were collected as follows : 50 blood and urine samples were taken from infected pregnant women.50 blood and urine samples were taken from non - infected pregnant women.10 blood and urine samples were taken from non - pregnant, but infected women.14 blood and urine samples were taken from non - pregnant, infected women.The results showed that E. coli was the most common causative agent of UTI in pregnant infected women (18.6%) followed by Staphylococcus saprophyticus (18.3%).In this work, different types of bacteria were isolated during the three trimesters of pregnancy. The highest percentage of infection was in the second trimester (47%), followed by the first and third trimesters (20% and 17%) respectively.Results of non - specific immune response demonstrated that there was a significant phagocytic activity increase in the peripheral blood of the pregnant, infected women during the three trimester of pregnancy when compared with the control group (P > 0.05). There was also a significant increase in the concentration of the complement component C3 in the blood of the infected pregnant women (P>0.05).While the results of specific immune response showed a significant decrease in the ability of lymphocytes to change and divide in the peripheral blood during the three trimesters of pregnancy. After using (PHA) as a stimulating agent in comparison with the control samples (P < 0.05).Results of estimation of immunoglobulin concentrations in the sera of studied groups, showed no significant differences in the concentrations of IgG and IgA, while there was a significant decrease in the concentration of IgM in the sera of infected pregnant women when compared with its concentration in the sera of the control groups i.e. non - infected and non - pregnant women

دراسة مقارنة بين العزلات المحلية لبكترياStaphylococcus epidermidis المقاومة والحساسة للمثيسلين == Comparative Study between Local Isolates of Methicillin Sensitive and Resistance of Staphylococcus epidermidis

Author name: استبرق نبيل عبد اللطيف
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 60 عزلة من المكورات العنقودية من 140 عينة سريريه (ادرار، مسحات اذن، مسحات انفية، جروح، عينات الدم). اثنان وثلاثون عزلة (53.3%) من العدد الكلي للمكورات العنقودية شخصت على انها عنقوديات غير مخثرة لذيفان مخثر بلازما الدمCONS)). تسعة عشر عزلة (59.38%) من CONS شملتStaphylococcus .epidermidis تم فحص الحساسية للعزلات المحلية من S. epidermid لمضاد المثيسلين, النتائج اظهرت 3عزلات من S. epidermidis حساسة للمثيسلين و16عزلة من S. epidermidis كانت مقاومة للمثيسلين، طبقا لهذه النتائج صنفت العزلات الى مجموعتين : - S. epidermidis مقاومة للمثيسلين MRSE)) وS. epidermidisحساسة للمثيسلين .(MSSE) اجري اختبار الحساسية لهاتين المجموعتين من S. epidermidis لاحد عشر مضادا حيويا، اظهرت النتائج مقاومة عالية ومتعددة ل MRSE لهذه المضادات بينما MSSE كانت عالية الحساسية، حيث اظهرت الMRSE حساسية 100% لمضاد vancomycinفقط. وتراوحت نسبة مقاومتها للمضادات penicillin G100% وclindamycin75% وamoxicillin 68.7% وamoxicillin clavulinic acid 68.7% وtetracyclin56.2% وrifampin 56.2% وcephalexin56.2% وerythromycin50% وciprofloxacin50% وgentamicin 43.7%. بينما اظهرتMSSE حساسية 100% لمضاد gentimicinو rifampin وclindamycin وciprofloxacin وvancomycinونسب مختلفة من المقاومة للمضادات الاخرى، اذ كانت نسبة مقاومة MSSE لمضاد amoxicillin وamoxicillin clavulinic acid وcephalexinو erythromycinو penicillin G و.%33 tetracyclin تم التحري عن انتاجية MSSEو MRSE لبعض عوامل الفوعة شملت الهيمولايسين والبروتييزواللايبيزواليورييزوالجيلاتينييزوانزيم المحلل للحامض النوويDNA اظهرت النتائج انMRSE تمتلك نسبة انتاجية لهذه عوامل الفوعة اعلى منMSSE . حيث ان نسبة انتاجية هيمولايسين، البروتييز، اللايبيز، اليورييز، الجيلاتينييز وانزيم المحلل للحامض النووي DNA فيMRSE كانت80%، 100%، 80%، 100%، 60%، و30% على التوالي، بينما كانت نسبة الانتاجية لهذه العوامل في MSSE 67%، 100%، 67%، 100%، 33% و33% على التوالي. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات penicillinو .tetracyclin اذ كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للعزلة 32S هي 60 وحدة للبنسلين و25مايكروغرام/مل للتتراسايكلين، 40 وحدة للبنسيلين للعزلة .40S تم دراسة امراضية MRSE وMSSE باختبار سميتها باستخدام ذكور الفئران البيض السويسرية، وكانت الاعداد البكتيرية المستخدمة هي (108،109، 1010 ،1011 ،1012) cfu/ml والتي تم حقنها داخل بريتون الفئران. لم تسجل اي نسبة قتل بكل التراكيز المستخدمة ل MSSE بينما بلغت نسبة القتل 33% بالتراكيز1010 و11 10 cfu/ml لMRSE. درست التغيرات النسيجية في انسجة الكبد، الطحال، الكلى، الرئة والقلب لذكور الفئران المحقونة ب MSSE و.MRSE لوحظ ان التاثيرات النسيجية التي سببتها MRSE كانت اعلى من تلك التي سببتهاMSSE . اكثر الاعضاء تاثرا نتيجة حقنMSSE وMRSE هما الرئة والكلى واللتان سبتتا نسبة عالية من النخر بهذين العضوين وكان التاثير اقل في الطحال والكبد من الرئة والكلى، ولم يظهر اي تاثير في قلب الفار المحقون بMSSE لكن هناك بعض التاثيرات في قلب الفار المحقون بMRSE. اظهرت نتائج الترحيل الكهربائي لعزلتيMSSE ( 51S و(5Sبانها لا تمتلك اي بلازميد بينما عزلتانMRSE تمتلك بلازميدات، كما لوحظ وجود بلازميدان في عزلة 40S احداهما بلازميد كبير والاخر صغير في حين ان العزلة الاخرى من MRSE 32S تمتلك 3 بلازميدات واحد منها كبير واثنان صغيران. اظهرت نتائج تحييد البلازميد باستخدام SDSو Rifampin ان بلازميدات العزلتين 32S)، (40S قد حييدت عند المعاملة ب100مايكروغرام/مل، 230مايكروغرام/مل من SDSعلى التوالي، 150مايكروغرام/مل، 200مايكروغرام/مل من Rifampinعلى التوالي. اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 40S حساسية للبنسيلين وبقاء المقاومة للمثيسلين كما اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 32S حساسبة للبنسلين وتتراسايكلين واحتفاظ البكتريا بمقاومتها للمثيسلين. | Sixty isolates of Staphylococcus were obtained from one hundred forty clinical specimens (urine, ear swabs, nasal swab, wound, and blood). Thirty two isolates (53.3%) of total number of Staphylococcus were identified as coagulase - negative staphylococci (CONS), nineteen isolates(59.38%) of CONS were included Staphylococcus epidermidis. Sensitivity of local isolates of S. epidermidis was examined against methicillin, the results showed 3 isolates from S. epidermidis were sensitive to methicillin and 16 isolates from S. epidermidis were resistance to methicillin, according to these results the isolates were splits to two groups : - methicillin resistance S. epidermidis (MRSE) and methicillin sensitive S. epiderimidis (MSSE). The sensitivity test of these two groups against 11 different antibiotics was done, the results showed MRSE were highly resistance and multi resistance patterns to these antibiotics, while MSSE showed highly sensitive. In MSSE showed 100% sensitivity to gentimicin, rifampin, clindamycin, ciprofloxacin and vancomycin, and different percentage of resistance to other antibiotics. The resistance percentage of MRSE to pencillin G 100%, clindamycin 75%, amoxicillin 68.7%, amoxicillin clavulinic acid 68.7%, cephalexin 56.2%, rifampin 56.2%, tetracyclin 56.2%, erythromycin 50%, ciprofloxacin 50%, gentamicin 43.7%. the resistance percentage of MSSE to amoxicillin, amoxicillin clavulinic acid, cephalexin, erythromycin, penicillin G and tetracyclin were 33%. While in MRSE showed 100% sensitivity to vancomycin only. Some virulence factors of MRSE and MSSE were detected including the hemolysin, protease, lipase, urease, gelatinase and DNase the results showed MRSE have higher percentage to produce these virulence factors than MSSE. The production percentage of hemolysin, protases, lipase, urease, gelatinase and DNase in MRSE was 80%, 100%, 80%, 100%, 60% and 60% respectively, while in MSSE 67%, 100%, 67%, 100%, 33% and 33% respectively. The minimum inhibitory concentration of antibiotics (penicillin and tetracyclin) to S. epidermidis isolate had been determined. they were 60U and 25µg/ml respectively for the isolate 32S, they were 40U of penicillin for the isolate 40S. The pathogenicity of MRSE and MSSE was studied by testing its lethality by using white Swiss male mice, the bacterial numbers was used that is (108,109,1010,1011,1012) cfu/ml and was injected in mice. Died of injected mice was not recorded with any used concentration in MSSE but in MRSE 33.3% of injected mice was killed in concentration 1010 and 1011 CFU/ml. Histological changes in liver, spleen, kidney, lung and heart tissues of male mice which were injected with MRSE and MSSE were studied. The histological effect were produced by MRSE was higher than those produced by MSSE. The most effective of MRSE and MSSE in lung, kidney because appeared of high necrosis in these organs but in spleen, liver of mouse were less effected from lung and kidney, in heart of mouse injected with MSSE no effect was recorded while in MRSE some effect have been seen. Results from agarose gel electrophoresis showed two isolates of MSSE 5S and 51S don't have any plasmid while other two isolates of MRSE have plasmids, two plasmids found in S. epidermidis isolate (40S), one of them was large plasmid and the other was small plasmid and in S. epidermidis isolate (32S) contained three plasmids, one from these was large plasmid and the other two plasmids were small plasmids. The results of plasmid curing by using sodium dodecyl sulphate (SDS) and rifampin showed that the plasmids of the local isolates 32S and 40S was curred by treatment with 100μg/ml, 230μg/ml respectively from SDS and 150μg/ml, 200μg/ml respectively from rifampin. Cured cells from 40S isolate (MRSE) were sensitive to penicillin and still resistance to methicillin and the cured cells from 32S isolate were sensitive to penicillin, tetracycline and still resistance to methicillin

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

Author name: حسام محمود حسن العماري
Supervisor name: هيفاء هادي حساني | عدوية عبد الله السعدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.

التغيرات النسجية لتاثير اشعة الهاتف النقال في بعض اعضاء طائر السمان الياباني (Coturnix coturnix japonica) == The histological changes to the effects of mobile phone radiation in some organs of ( Coturnix coturnix japonica )

Author name: احسان فرج عبد الصاحب الحسناوي
Supervisor name: ستار عبود فارس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية استـعمال (48) طـيـرا مـن ذكـور واناث طائر الســمان الـيابانــي Coturnix coturnix japonica، التي كانت بعمر ( 60 الى 70 ) يوما , تم الحصول على الطيور من الاسواق المحلية لمدينة سوق الشيوخ / محافظة ذي قار / العراق ، وبعد فحصها من قبل الاطباء البيطريين والتاكد من كونها سليمة وضعت الطيور معا لمدة (30 يوما) لغرض التكيف ومن ثم قسمت الطيور الى اربع مجاميع ووضعت في اقفاص خشبية بابعاد (50 × 50 سم3 ) وبواقع (12 طيرا) في كل مجموعة (6 ذكور و6 اناث) , وضعت الاقفاص في ظروف مناسبة من حيث التهوية والاضاءة ودرجة الحرارة التي بلغت من (23 - 25 مº) ، عرضت المجموعة الاولى لاشعاع الهاتف المحمول لمدة (7 ايام) , وعرضت المجموعة الثانية لمدة (30 يوم) , والمجموعة الثالثة لمدة (60 يوم) , اما المجموعة الرابعة فهي مجموعة السيطرة , وبعد انتهاء فترة التعرض شرحت الـطـيـور واسـتخـرجـت الاعـضاء الـمـراد دراسـتـها (الـخـصى ، الـمـبايـض ، الـكـبـد ، الـكـلى) . اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول انخفاض معنوي ( P≤0.05) في معدل اقطار النبيبات المنوية وكذلك حصول انخفاض معنوي في معدل سمك طبقة الخلايا الجرثومية في الخصى وكذلك حصول انخفاض معنوي في معدل وزن الخصى في ذكور المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف المحمول مقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول تغييرات نسجية في خصى ذكور المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال تمثلت هذه التغيرات بحصول نقصان في اعداد الحيوانات المنوية وقلة في اعداد الخلايا المكونة للنطف ونقص في كثافة النسيج الضام الذي يفصل بين النبيبات المنوية وكذلك تحلل degeneration في النسيج الضام بين النبيبات المنوية بالاضافة الى تحلل في جدار النبيب المنوي وكذلك حصول تنخر في الظهارة النبيبية وحصول نزف دموي بين النبيبات المنوية ، واظهرت نتائج الدراسة الحالية للمبيض حصول انخفاض معنوي في معدل وزن المبيض في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال مقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت الدراسة للمبيض في اناث المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال لمدة (30 و60 يوم) حصول تحلل في جدار المبيض وقلة في اعداد الحويصلات المبيضية وكذلك احتقان في الاوعية الدموية ونزف دموي بالاضافة الى ارتشاح الخلايا الالتهابية , كما اظهرت نتائج الدراسة للكبد في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال حصول توسع expansion في الجيبانيات الكبدية واحتقان congestion وتوسع في الوريد البابي المركزي وكذلك حصول تفجي vaculation في سايتوبلازم الخلايا الكبدية بالاضافة الى ارتشاح الخلايا الالتهابية وحصول نزف دموي ، كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان تعرض طيور السمان الياباني لاشعاع الهاتف النقال يؤدي الى حصول انخفاض معنوي في معدل قطر الكبيبة الكلوية وارتفاع معنوي في معدل الحيز بين الكبيبة ومحفظة بومان وارتفاع معنوي في معدل قطر النبيب الكلوي عند المقارنة مع مجموعة السيطرة كما اظهرت نتائج الدراسة الحالية للكلى في المجاميع المعرضة لاشعاع الهاتف النقال حصول ارتشاح infiltration للخلايا الالتهابية ونزف دموي hemorrhage وانكماش shrinkage في الكبيبات الكلوية بالاضافة الى حصول تحلل degeneration في النبيبات الكلوية . | The current study includes use (48) birds from both sexes (males , females) from Coturnix coturnix japonica . These birds were brought from the local market of Suq Al - shuyukh city / Thi - Qar province / Iraq , and then checked by veterinarians and make sure they are healthy we put them together for (30) days for adaptation and then divided the birds into four groups and put in wooden cages with dimensions 50 × 50 cm3 for 12 birds in each group (6 males and 6 females) , the cages put at organization and controlled whence ventilation , lighting and temperature ranged between (23 - 25 Cº) , the first group was exposed of mobile phone radiation for (7) days , and exposed a second group for (30) days , and the third group for (60) days , while the fourth group a control group , and after the end exposure period vivisection the birds and we extracted the organs we want study (testes , ovaries , liver , kidneys). The results of the current study showed a reduction in the rate of the seminiferous tubule diameters as well as a reduction in the rate of germ cells layer thickness in testes males mobile phone radiation - exposed aggregates compared with control group , the results of the current study also showed histological changes in testis males groups mobile phone radiation - exposed these changes were decrease in sperm counts and lack of number of cells of sperm and a decrease in density connective tissue which separates between seminiferous tubules and degenerating in connective tissue between seminiferous tubules addition to smashed in the wall of seminiferous tubule as well as epithelium necrosis and hemorrhage between seminiferous tubules , also showed the results of the current study of the ovary in females mobile phone radiation - exposed groups for (30 and 60) days smashed into the wall of the ovary and lack in numbers ovarian follicles and vascular congestion and hemorrhage in addition to infiltration of inflammatory cells , also showed the results of the current study of the liver in groups mobile phone radiation - exposed expansion in sinusoids, congestion, expansion in central vein and vaculation in hepatocytes in addition to infiltration of inflammatory cells and hemorrhage , as the results of the current study showed that exposure to radiation Japanese quail mobile phone leads to a reduction in renal glomerulus diameter rate and high rate of spread between the glomerulus and Bowman's capsule and high renal tubule diameter rate when compared to the control group and the results of the current study showed that the kidneys in mobile phone radiation - exposed aggregates infiltration of inflammatory cells, and hemorrhage shrinkage in renal glomerulus in addition to getting degenerate renal tubules .

النمط المناعي للاشخاص المعرضين للحروق والمصابين ببكتريا الزوائف الزنجارية (Pseudomonas aeruginosa) وتوصيفها الجزيئي لمقاومة المضادات الحياتية == Immunological profile of burned patients infected with Pseudomonas aeruginosa and Molecular characterization of It's Antibiotic Resistance

Author name: ضواء محمد صلاح الخطيب
Supervisor name: وفاء صادق الوزني | ياسمين خضير الغانمي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Karbala
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى بيان نسبة تردد بكتريا الزوائف الزنجارية Pseudomonas aeruginosa بين مرضى الحروق في محافظة كربلاء. مع بيان بعض التغايرات المناعية المرافقة لاصابات الحروق في جسم المصاب وبعض الصفات الوراثية لبكتريا المعزولة التي تجعلها مقاومة للعديد من المضادات الحيوية الشئ الذي يزيد من زيادة نسبة حالات الانتان الدموي والموت بين هؤلاء المرضى . قد تم في الفترة من شهر شباط2014 الى شهر اب 2014 جمع مسحات جلدية وعينات دم من 64 عزلة من مرضى الحروق الراقدين في مستشفى الحسين مع جمع 30 مسحة بيئية من ردهات الحروق نفسها في تلك المستشفى ،اذ ظهر ان 45 % من مسحات الحروق كانت تعود لبكتريا الزوائف الزنجارية في حين 26.1% فقط كانت نسبة عزل هذه البكتريا من المسحات البيئية ولبيان العلاقة بين عمر المريض ودرجة الحرق ونوعه تبين ان نسبة الحروق 60.9) %) في الاعمار دون 15 سنة كانت اعلى من نسبتها 39.11)%) في الاعمار فوق 15 سنة . في حين كانت الحروق الناتجة عن السوائل الحارة لدى المصابين دون 15سنة اعلى معدلات الحرق بينما حروق اللهب شكلت النسبة الاكبر (29.7%) في الاعمار فوق 15سنة بالاضافة الى ان الاناث كانت الاكثر عرضة للحرق ونسبته (56.3%) مقارنة بالرجال (%43.8). كانت بكتريا P.aeruginosa المعزولة عالية المقاومة لاغلب المضادات الحيوية حيث كانت مقاومة لكل من )Cefatotaxime 88.6%) , Ceftazidime (85.7%), Oxacillin (71.4)و Meropenin(85.7%) في حين وصلت مقاومتها الى (%77.1) للمضاد الحيوي Gentamycin . اذ كانت اغلب العزلات مقاومة لاكثر من مضاد حيوي واحد لبيان سبب هذه المقاومة العالية تم الكشف وراثيا عن جينات البيتالاكتميز مثل per - 1 وoxa - 10باستخدام تقنية تفاعل تضخيم الدنا (PCR) حيث اظهرت نتائج البلمرة بحجم 760bp بالنسبة لجين المسؤول عن انزيم oxa - 10 وناتج بلمرة بحجم 927bp للجين المسؤول عن انزيم per - 1 ، وكانت نسبة تواجد جين oxa - 10 بنسبة 85% من مجموع العزلات الكلي اما الجين per - 1 فقد تواجد بنسبة 50% من العزلات المحصلة عليها.اما نتائج الدراسة المناعية الخاصة لبيان تاثير الحروق بانواعها على فعالية الجهاز المناعي للمريض فقد ظهر جليا ارتفاع واضح لكريات الدم البيض عند المصابين والذي يتناسب طرديا مع شدة الحرق فقد وصلت اعداد الخلايا mm3) / 103) 10.44 , 13.222 و15.955 لكل من مجموعة مرضى الحروق البسيط والمتوسطة والشديدة على التوالي حيث كان الارتفاع بصورة خاصة لكريات الدم البيض العدلة مقارنة ببقية الانواع الخلوية .اما المناعة الخلطية المتمثلة بتراكيز كل من بروتين الطور الحاد والمتمم فقد لوحظ ارتفاع معنوي في قيم بروتيات الطور الحاد والذي يتزايد طرديا مع شدة الحرق ليصل الى 63.4 ملغم/لتر في الحروق البسيطة في حين وصل الى) 95.2 و121.8 ) ملغم/لتر لكل من الحروق المتوسطة والشديدة على التوالي .اما تراكيز بروتين المتمم C3 فقد ظهرت التحليلات الاحصائية ارتفاع غير معنوي بمستوى المتمم الثالث لكل درجات الحروق البسيطة وبنسبة 125.45 ملغم/ديسيلتر,المتوسطة137.5 ملغم/ديسيلتر والشديدة 140.15 ملغم/ديسيلتر مقارنة مع الاشخاص الاصحاء 122.32 ملغم/ديسيلتر. في حين كان الارتفاع معنويا ( p≤0.05) في قيم الحركي الخلوي IL - 6 ليصل الى 118 بيكوغرام /مل, 86 بيكوغرام /مل و33 بيكوغرام /مل كل من مرضى الحروق البسيطة والمتوسطة والشديدة على التوالي .على العكس من ذلك فقد سجلت عامل التنخر الورمي TNF اعلى ارتفاع في مرضى الحروق الشديدة اذ بلغ 600.45 بيكوغرام/مل مقارنة بالاشخاص الاصحاء 175.15 بيكوغرام/مل. | This study aimed to a statement the ratio Pseudomonas.aeruginosa between burns patients in the Al - Hussein Hosppital in Kerbala city and as well as some variations of immune system that associated with injuries or burns in the body patient in addition explain some genetic characters of isolated bacteria that make them resistant to different types of antibiotics, which increases sepsis & death among these patients. Skin swabs and blood samples were collected from 64 burn patients admitted to the hospital in period febrwary 2014 to agust 2014 in addition 30 swabs from environmental hospital also collected . Pseudomonas aeruginosa was isolated from burns swabs (45% ) while only 26.1% were isolated from environmental swabs. Relationship statement between the patient's age and the degree, type of the burn showed that the percentage of burns ( 60.9%) in the ages under 15 years higher than the rate of (39.11%) in ages over 15 years .The burns rates caused by hot liquids in patients under 15 years than flame higher burn while burns flame formed the most (29.7%) in the ages over 15 years . That females were most likely to burn rate (56.3%) compared to men (43.8%) P.aeruginosa were isolated high resistance to most antibiotics used where the resistance of each Cefatotaxime (88.6%), Ceftazidime (85.7%),Oxaciilin(71.4) and Meropenin (85.7%) while resistant to (77.1%) for Gentamycin. The cause of multidurg resistance was detected genetically by determined B - lactamase genes of per - 1and oxa - 10 using a technique amplified DNA reaction (PCR). The results showed polymerization Size 760bp for the gene responsible for oxa - 10 and the result Size polymerization 927bp gene responsible for an enzyme per - 1the presence of oxa - 10 (85%) in the total isolates either per - 1gene has presence by (50% )in the isolates collected them.The immunological results showed clearly increased white blood cells that directly proportional to the severity of the burn has reached the preparation of cells (10.44, 13.222, 15.955 ) 103/mm3 of the patients with simple and moderate to severe burns group respectively, where the rise, in particular, to neutrophil white blood cells compared to other types of cells.The immune humoral concentrations of both protein acute phase and complement were noted a significant rise in acute phase protein values and which are increasingly proportional to severity of the burn to arrives 63.4 mglL in simple burns while arrived( 95.2 and 121.8) ) mglL for each of degrees burns moderate and severe on respectively.It was found significant increase in the acute phase protein values and which increased directly according to the severity of the burn for up to 63.4mg/ml in simple burns while reached( 95.2 and 121.8)mg/ml each of the moderate and severe burns respectively.Statistical analyzes of complement protein C3 appeared insignificant rise in the levels of the complement for each degree of burns simple 125.45, medium (137.5 mgldL)and severe (140.15 mgldL) compared with healthy people (122.32 mgldL).While the rise significant at the level of probability (p ≤0.05) in the kinetic values cellular IL - 6 to reach( 118 pg / ml), (86 pg / ml), (33 pg / ml) each of the patients simple burns and moderate to severe respectively. On the opposite it values of kinetic cellular TNF were recorded the highest rise in patients with severe burns, reaching 600.45 (pg / ml) compared to control

مقارنة تاثير انواع وتراكيز المستخلصات النباتية مع عدد من المضادات الحياتية على البكتريا المسببة لالتهاب اللثة == Comparison the effect of the types and concentrations of plant extracts with some antibiotics on bacteria that cause gingivitis

Author name: اسامة غازي اسماعيل الزهيري
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في محافظة ديالى للفترة من1/10/2014 الى 1/04/ 2015 ، جمعت العينات البكتيرية باستخدام مسحات قطنية معقمة من الاشخاص الذين يعانون من مرض التهاب اللثة في المراكز التخصصية للاسنان في مدينة بعقوبة , ثم نقلت العينات الى مختبر الاحياء المجهرية/مستشفى بعقوبة التعليمي. تم تشخيص هذه العزلات البكتيرية من قبل العاملين في المختبر وهي : Staphylococcus aureusو Escherichia coliو Proteus sppو Streptococcus pyogene تضمنت الدراسة اختبار حساسية العزلات البكتيرية قيد الدراسة تجاه ستة انواع من المضادات الحيوية وهي (Tetracyclin وAmoxicillin وAugmentin وTrimethoprim وGentamicin وAmikacin). اذ بينت نتائج فحص الحساسية للعزلات البكتيريا ان بكتريا E.coli وProteus spp اظهرتا حساسيتهما تجاه المضادات الحيوية Amoxicillin وAugmentin وTrimethoprim وGentamicin وAmikacin في حين اظهرتا مقاومتهما تجاه Tetracyclin , اما بالنسبة الى بكتريا S. aureus وS. pyogens فقد اظهرتا حساسيتهما تجاه مضادات Amikacin وGentamicin وAugmentin وTrimethoprim في حين اظهرتا مقاومتهما لمضادات Tetracyclin وAmoxicillin. كما تضمنت الدراسة الكشف النوعي والتقدير الكمي للمركبات الفعالة الموجودة في نباتات القرنفل والكجرات والسواك فضلا عن دراسة تاثير المستخلص الكحولي ومستخلص الماء الحار ومستخلص الماء البارد للنبات قيد الدراسة وبثلاثة تراكيز 50 و100 و200ملغم.مل - 1. بينت نتائج الكشف النوعي ان النباتات المستعملة في الدراسة تحتوي على العديد من المركبات الفعالة وهي القلويدات والصابونينات والفلافونات والتانينات والكلايكوسيدات والزيوت الطيارة والراتنجات . اما بالنسبة الى التقدير الكمي فبينت النتائج ان المواد الفعالة ظهرت بنسب مئوية عالية في المستخلص الكحولي يليه المستخلص المائي الحار ثم المستخلص المائي البارد , وان الكجرات اكثر النباتات الذي يحتوي على نسبة عالية من المواد الفعالة يليه السواك والقرنفل . اظهرت المستخلصات النباتية فاعلية تثبيطيه تجاه العزلات البكتيرية قيد الدراسة ، اذ ان هذه العزلات كانت حساسة بالدرجة الاولى للمستخلص الكحولي ثم المستخلص المائي الحار يليه المستخلص المائي البارد. بينت الدراسة ايضا ان مستخلصات نبات الكجرات كان اكثر الانواع النباتية تثبيطا تجاه البكتريا يليه مستخلصات السواك ثم مستخلصات القرنفل , وان الفعالية التثبيطية للمستخلص النباتي ازدادت بزيادة تركيزه , اذ اعطى التركيز 200ملغم.مل - 1 اعلى فعالية تثبيطيه تجاه الانواع البكتيرية. | This study was conducted in Diyala province for the period from 01/10/2014 to 01/04/2015, bacterial samples were collected using sterile cotton swabs from people who suffer from gum inflammation disease in specialized centers of the teeth in the city of Baquba, and then the samples were transferred to biology lab microstructure / Baquba Teaching Hospital. It has been diagnosed with this bacterial isolates by those working in the laboratory which is : Staphylococcus aureus and Escherichia coli and Proteus spp and streptococcus pyogenes. The study tested the sensitivity of bacterial isolates under study toward six kinds of antibiotics which (Tetracyclin and Amoxicillin and Augmentin and Trimethoprim and Gentamicin and Amikacin). As the results of the examination of the sensitivity of the isolates of the bacteria showed that the bacteria E - coli and Proteus spp have shown resistance toward antibiotics Amoxicillin and Augmentin and Trimethoprim and Gentamicin and Amikacin while demonstrated their resistance toward Tetracyclin, As for the bacteria, S. aureus and S. pyogens has demonstrated sensitivity toward anti - Gentamicin and Amikacin and Augmentin and Trimethoprim while demonstrated their resistance to antibiotics Tetracyclin and Amoxicillin. The study also included qualitative detection and quantification of the active compounds in plants Eugenia caryophyllus Hibiscus sabdariffa and Salvadora persica as well as the study of the influence of alcoholic extract and extract hot water and cold water extract of the plant under study and three concentrations of 50, 100 and 200 mg.ml - 1. Results showed that the qualitative detection used in the study of plants contain many active compounds which alkaloids and saponins and tannins and Filavonat and Alkleikosadat and volatile oils and resins. As for the quantification of the results it stated that the active substances showed high percentages in the alcoholic extract, followed by warm water and then extracted aqueous extract cold, and Hibiscus sabdariffa more plants that contains a high concentration of active substances, followed by Salvadora persica and Eugenia caryophyllus. Plant extracts showed inhibitory effective against bacterial isolates under study, since these isolates were sensitive primarily to extract alcohol and aqueous extract hot water extract, followed by cold. The study also showed that the plant extracts Hibiscus sabdariffa was more plant species toward inhibition of bacteria, followed by Salvadora persica and then extracts Eugenia caryophyllus extracts, and that the effectiveness of inhibitory plant extract increased by increasing its focus, as it gave focus 200 mg.ml - 1. higher effective inhibitory toward bacterial species

دراسة بكتريولوجية لبعض مسببات الاسهال لدى الاطفال == Bacteriological study of the some causes of diarrhea in children

Author name: ريا خليل ابراهيم القيسي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | هادي رحمن رشيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: This study included The investigation of the existence some type of Enterobacteriaceae bacterial Causes Diarrhea in (215) samples for patients sufferers symptoms indicate that their infection Diarrhea. period from 1\10\2014 to 30\1\2015, and used MacConkey agar and blood agar for the cultivation of these samples.The results refer that 65 isolates are belonging to bacteria of Enterobacteriaceae 13 (20 %) Proteus mirabilis and 3(4.6%)Morganella morganii 2(3.1%) Salmonella spp by using diagnostic phenotypic ,biochemical tests and confirm the diagnosis by using system Vitek2.The results of the investigation of some virulence factors showed the isolates of Proteus mirabilis produce of haemolysin (92.3%) ,while Salmonella spp and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme. The results showed that all isolates of Proteus mirabilis and Salmonella spp and Morganella morganii were produced urease by (100%) (0%) (100%) respectively.The results showed that all isolates of Salmonella spp and Morganella morganii were produced protease by (100%)(50%) while Proteus mirabilis have not ability to produce this enzyme.The results showed that isolates of Proteus mirabilis were produced bacteriocin by (69.2%) while Salmonella spp by (50%) and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme The results showed a variance as far as their resistance to these antibiotics. Isolates of Proteus mirabilis showed highest resistance rate (76.9%) for Ampicillin e while isolates of Salmonella spp highest resistance rate (100%) for Cephalothin, Cefotaxime and Ampicillin , while isolates of Morganella morganii showed highest resistance rate %100 for Trimethoprime , Ampicillin , Cephalothin , Nalidixic acid , Piperacilli.The results showed (15) isolates rate (83.33%) have multiple resistance pattern for antibiotic and divided into two groups , first group included (5) isolates which were resistant to ( 2 - 5 ) antibiotics , while second group included (10) isolates were resistant to (6 - 10) antibiotics . Results indicated that the second group was dominant. The results showed that the Resistance prevailing coordinated to isolates Proteus mirabilis is (4) antibiotic (Ap - TM - CTX - NA) and to isolates Morganella morganii is (6)antibiotic (AP - TN - PRL - NA - KF - FOX) and to isolates Salmonella spp is (3) antibiotic (AP - CTX - KF).Results showed content plasmid for Proteus mirabilis and Morganella morganii they do not contain plasmids packages While shown Salmonella spp content on plasmids one package .The results of bacterial conjugation In the liquid medium The success of the process of bacterial conjugation for Salmonella spp That have one package of plasmids before and after of bacterial conjugation .The results of transmission of prescription antibiotics (TM - AP - KF - CTX)

متلازمة الابنية المريضة بين الحضر والريف : دراسة مقارنة == Sick buildings syndrome between the Urban and Rural areas : A comparative study

Author name: ســرمـد قاسـم مـحمــد الـتميمي
Supervisor name: عدنان نعمة عبد الرضا العزاوي | عامر محمد ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة الميدانية في محافظة ديالى للفترة الواقعة بين 1/تشرين الاول/2014 ولغاية 1/اذار/ 2015 وشملت مناطق حضرية ومناطق ريفية واخرى وسطية في طور التحول ،بهدف التعرف على الاثار الصحية للملوثات البيئية(الكيميائية والفيزيائية والحيوية) في الاماكن المغلقة مع بيان الفرق في نسب تلك الملوثات بين مناطق الدراسة. تضمنت الدراسة توزيع 150 استمارة استبيان تحتوي على الجنس ،مجموعة من الظروف البيئية ومجموعة من الاعراض المرضية والتي تشير الى وجود بيئة مريضة ، بواقع 50 استمارة لكل منطقة .وتم قياس تركيز الغازات اول اوكسيد الكاربون (CO)، وثاني اوكسيد الكاربون (( CO2 ،وثاني اوكسيد النتروجين(NO2) في داخل المبنى وفي خارجه باستعمال جهاز تحليل الغازات Portable Gas Analyzer وكذلك قياس درجة الحرارة والرطوبة النسبية في داخل المبنى. كما تم جمع 150 مسحة بكتيرية بواقع 50 مسحة لكل منطقة وذلك من مصادر بيئية مختلفة شملت المطابخ، الصحيات وغرف النوم وتم تشخصيها مختبريا،اضافة الى اجراء فحص الحساسية الدوائية تجاه مجموعة من مضادات الحياة للعزلات المشخصة . بينت نتائج الدراسة الحالية ان اعراض متلازمة المباني المريضة Sick Building Syndrome (SBS) مثل العصبية ،الصداع ، ضيق التنفس ، جفاف العين وجفاف الجلد كانت اكثر ظهورا لدى سكان المناطق الحضرية اذ بلغت نسبتها32.5%، 32.4%،24.4%، 20.5%، 17.1 % على التوالي، في حين كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية وكانت قليلة جدا لدى سكان المنطقة الريفية وكانت الاعراض الدوران، تشتت الانتباه ، تهيج الانف، وتهيج العين، اكثر ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية اذ بلغت نسبتها 27% ،24.8%،23.3%، 12.2% على التوالي،وايضا كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الريفية. وكانت الاعراض الصداع، جفاف العين ،تهيج العين وجفاف الجلد اكثر ظهورا على الاناث من الذكور، في حين ان الاعراض العصبية والانزعاج والدوران كانت اكثر ظهورا على الذكور. وبينت النتائج ان عوامل الخطر البيئية المساعدة على حدوث الاعراض مثل التعرض الى سوء التهوية ، الروائح الكريهة وضعف الاضاءة الطبيعية كانت متوافرة في البيئة الحضرية بصورة اكثر وبنسب 28.6%،22.4%،20.4% على التوالي ، في حين ان التعرض الى الغبار والهواء الجاف كان بنسب اعلى لدى سكان المنطقة الوسطية وبنسب27.1%،23.2% على التوالي. وكانت الظروف البيئية بنسب اقل لدى سكان المنطقة الريفية. اما نتائج قياس تركيز الغازات CO، CO2،NO2 فقد كانت اعلى تركيزا في المناطق الحضرية وبنسب 2.62 جزء بالمليون ، 0.13 جزء بالمليون ،0.20 جزء بالمليون على التوالي ، في حين كانت الاقل تركيزا في المناطق الريفية والتي بلغت 0.10 جزء بالمليون، 0.006 جزء بالمليون، 0.06 جزء بالمليون على التوالي. لم تكن هناك فروق معنوية بالنسبة لقياس درجات الحرارة والرطوبة،اذ بلغ معدل درجة الحرارة في المنطقة الوسطية 23.9م تلتها المنطقة الحضرية 21.8م ، وسجلت في المنطقة الريفية اقل درجة 21.6م .اما بالنسبة للرطوبة النسبية تفوقت المنطقة الريفية باعلى نسبة للرطوبة فبلغت 58.9%، وتلتها المنطقة الحضرية55%، وتمثلت المنطقة الوسطية باقل نسبة للرطوبة 54.8% اما بالنسبة لنتائج العزل البكتيري فقد المنطقة الريفية اعلى نسبة للنمو الايجابي اذ بلغت 46 من اصل50 عينة وبنسبة (92%)،تلتها المنطقة الوسطية 35 من اصل 50 عينة وبنسبة (70%) ، وجاءت المنطقة الحضرية باقل نسبة 24 من اصل 50 عينة وبنسبة(48%)، في المنطقة الريفية كانت البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة اذ شكلت بكتريا Staphylococcus aureus اعلى نسبة (43.4 %) وEscherichia coli (19.5%) اما الاجناس pseudomonas aeruginos وpneumoniae Streptococcus فقد بلغ كل منهما (10.8%) وبلغت pneumonia klebsiella (4.3%). وفي المنطقة الوسطية كانت ايضا البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة فقد شكلت S. aureus (42.8%) تلتها E.coli (20%) وP. aeruginosa (17.1%) وpneumoniae S . (8.5%) واحتلت K. pneumonia المرتبة الاخيرة (2.8%) . اما في المنطقة الحضرية فقد كانت البكتريا السالبة لصبغة كرام هي السائدة فبلغت نسبة P. aeruginosa وS. aureus (33.3%) وبلغت نسبة الاجناس E.coliو pneumoniaeK. ،و pneumoniae S.، (12.5%) ،(8.3%) ، (4.1%) على التوالي . وبينت نتائج فحص الحساسية تجاه المضادات اوجمنتين (Augmentin)، والامبسلين Ampicillin)) ،والتوبرومايسين Tobramycin) )،والامبينيم ( Imipenem) ان معظم الاجناس كانت متحسسة وبنسب متفاوتة،الا ان بعض الاجناس ابدت مقاومة تجاه انواع معينة منها. | This field study was conducted in Diyala province for the period between 1/10/2014 until 1/3/2015 included urban areas and rural areas and other centrist in transition, with a view to identifying the health effects of environmental contaminants (chemical, physical and biological) in enclosed spaces with the difference in the proportions of those pollutants between the study areas. It includes the distribution of 150 a questionnaire containing, sex set of environmental conditions and a set of symptoms that indicate the presence of sick environment, by 50 for each form region and concentration measurement of gases (CO, CO2, NO2) inside the building and outside by using Portable Gas Analyzer as well as temperature and relative humidity In inside the building. He also collected 150 bacterial swab 50 swab for each area,from different environmental sources included kitchens, bedrooms and Health facilities and laboratory - diagnosed, as well as a test of sensitivity to a range from antibiotic of the isolates diagnosed. The results showed that Sick Buildin Syndrome symptoms such as nervousness, headaches, shortness of breath, eyes dry and skin dryness were at ahigher rate in urban areas as the average 32.5%,32.4%, 24.4%, 20.5% 17.1% respectively, while less visible in the middle of the region and were very few the rural of the region, symptoms were Rotation, Attention Deficit, irritation of the nose, eye irritation, more common the middle of the region as the average of 27%, 24.8%, 23.3% , 12.2%, respectively, and Less amonge to the population of the rural area. symptoms as headache, eye dry, eye irritation, dryness of the skin were more amonge females than males, while the symptoms as neurological , discomfort, and the rotation was more pronounced on males. The results showed that environmental risk factors help symptoms occur, such as vulnerability to poor ventilation, odors and poor natural light available in a more urban environment as the average 28.6%, 22.4% , 20.4% respectively, whereas exposure to dust and dry air was higher among residents of the middle region as the average of 27.1%, 23.2% respectively and environmental conditions were lower in the rural area. The results concentration of measurment gases (CO, CO2, NO2) were higher in the urban areas, as average ( 2.62 ppm, 0.13 ppm, 0.20 ppm) respectively, while the less concentrated in rural areas, which reached (0.10 ppm, 0.006 ppm, 0.06 ppm) respectively, There was no significal differences for measurement of temperature and humidity, with an average temperature in the middle region ( 23.9)m followed by the urban area of (21.8) m, recorded in rural lower (21.6 )m .for relative humidity overtook the rural area with the highest percentage of humidity, reaching 58.9%, followed by urban area 55%, and middle area was the lowest 54.8%. The results of bacterial isolation region showed the highest Percentage in the rural isolation 46 sample (92%), followed by the middle region 35 sample (70%)and urban area with less than 24 sample (48%). the rural area showed the positive it for bacteria gram stain were most common , accounting Staphylococcus aureus bacteria highest percentage (43.4%) , Escherichia coli (19.5),the races, pseudomonas aeruginosa and Streptococcus pneumoniae were each (10.8%) and klebsiella pneumonia (4.3%). In the middle area the positive it for bacteria gram stain were most common accounting S. aureus might formed (42.8%) Followed by E. coli (20%) , P. aeruginosa (17.1%) , S. pneumonia (8.5%)and K. pneumonia ranked last (2.8%) In the urban area negative it for bacteria gram stain were most common accounting P. aurgenosa and S. aureus was (33.3%) and the result of species E. coli, K. pneumonia and S. pneumonia were (12.5%) (8.3%) (4.1%) respectively. the results of sensitivity to antibiotics Augmentin, Ampicillin, Tobramycin, Imipenem ,that most strain were resistance in varying percentage, some strain have expressed resistance towards certain types

دراسة مناعية وتقييم انتشار الاجسام المضادة الخاصة ضد اللولبية الشاحبة بين العراقيين المتبرعين بالدم

Author name: انس وسام مالك
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | محمد عبد الدايم صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Diyala
First pages:
Abstract: السفلس هو مرض ينتقل جنسيا بوساطة بكتريا اللولبية الشاحبة Treponema pallidum ويصنف اما مكتسب او ولادي .اجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لنقل الدم في بغداد خلال جزء عملي اشتمل على المرضى المراجعين للمركز للمدة من 1 اب الى 31 كانون الاول 2014 . تضمنت الدراسة 70 مريضا و10 اصحاء ظاهريا من كلا الجنسين بمعدل عمر من 24 الى 57 سنة.جمعت عينات المرضى من وحدة الفايروسات بوساطة متخصصين الذين شخصوا الحالات المرضية .تضمنت المعلومات الديمغرافية العمر,الجنس والعنوان. اظهرت نتائج الدراسة الحالية معدل العمر ± الانحراف المعياري7.14±41)) سنة في المرضى(من 24 - 57 سنة) كما اظهرت النتائج ان(2.9%) من المرضى كانوا ضمن الفئة العمرية (21 - 30 سنة) ,وكانت نسبة الفئة العمرية (31 - 40 سنة ) هي (40%),و نسبة الفئة العمرية (41 - 50 سنة ) هي(44.3%)والفئة العمرية (51 - 60 سنة ) هي (. (12.8%علاوة على ذلك ان ما مجموعه ((74610 من متبرعي الدم العراقيين تتراوح اعمارهم من 18 - 60 سنة عرضوا لاكتشاف الاصابة بمرض السفلس ,وان ما مجموعه(769) من المصابين بالمرضوكان عدد المصابين من الذكور( (753بنسبة(97.9%) وكان عدد الاناث هو16 بنسبة(2.1%) .من ناحية اخرى تم اختيار 70 مصاب من المجموع الكلي للمصابين (769) وتم فحصهم ضمن بعض المؤشرات المناعية واظهرت النتائج ازدياد مستوى IL - 2 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وكانت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±64.9941.92 pg/ml و39.69 ±52.94pg/ml على التواليولم يلاحظ وجود فروق معنية احصائية بين كلا المجموعتين. فضلا عن ذلك ازداد مستوى IL - 10 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وبلغت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±559.101804.20pg/ml و±377.47252.36pg/ml على التوالى.بينما كان مستوى IFN - γ اقل في المرضى وكان المعدل ± الانحراف المعياري 239.35 ±201.38pg/ml عن المستوي في مجموعة السيطرة الذي بلغ 248.51±291.49pg/ml .فضلا عن ذلك كان مستوى IgG في كلا المجموعتين (المرضى والسيطرة ) عاليا , بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمجموعة المرضى825.66±287.18pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 638.28±242.41pg/ml لذلك لا يوجد فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين = P value)0.166( كذلك بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى IgM في مجموعة المرضى 121.01±70.57pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 50.96±21.61453pg/ml مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين(P value=0.031). بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى C3 في مجموعة المرضى±112.22pg/ml 26.34 بينما كانت ±147.7617.41pg/ml لمجموعة السيطرة. وهذا يعني وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.004). اخيرا وصلت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى 4Cفيمجموعة المرضى ± 22.7622.76pg/ml بينما كانت في مجموعة السيطرة±34.412.15pg/ml .مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.005). | Syphilis is a sexually transmitted disease (STD) created by the Treponema pallidumand characterized as acquired or congenital.This study was conducted in National Blood Transfusion Center in Baghdad as crosswise over area study incorporating patients going to in the period from 1 August to 31 December 2014. The study included 70 patients and 10 apparently healthy individuals from both sex withage range from 24 to 57 years oldas control group.The specimens of patients were gathered in virology unit by virologists who conclusion the cases. The demographic data incorporates age, sex and location. The results of present study showed thatmean of age ±SD of patients was 41±7.14 years (from 24 - 57 years ) , also theresults showed (2.9%) of patients were from (21 - 30 years), (40%) of patients were from (31 - 40 years), (44.3%) of patients were from (41 - 50 years), (12.8%) of patients were from (51 - 60 years).Furthermore,a total of 74610 Iraqi blood donors, aged from 18 - 60 years were discovered to have been screened for syphilis, a total of 769 Infected syphilis there were the number of males were753 (97.9%) and females were16 (2.1%).On another hand 70 syphilis patients were selected from total infected patients ( 769) and was examined to some immunological parameters and the results showed that the level of IL - 2 higher in patients group than that of control group.Themean ±SD was 64.99±41.92pg/mland 52.94±39.69 pg/ml respectively withoutnoticing any significant statistical difference was between both groups. Additionallythe level of IL10 was higher in patients group than that of control group,the mean ±SD were559.10±1804.20 pg/ml while in control were 377.47±252.36 pg/ml.Whereas, the level of IFN - γ was lowerin patients, the mean ±SD were201.38 ±239.35pg/ml than thatin controlWhich were 291.49 ±248.51pg/ml. Furthermore, the level of IgG in both patients and controlwas almost more thanthe mean ±SDfor patients were 825.66±287.18 mg/dl and in controls they were 638.28±242.41 mg/dl. Therefore, there was no significant statistical difference between both groups (P value =0.166). Also , themean ±SD for the level of IgM in patients, were121.01±70.57mg/dl whereas in controls theywere 50.96±21.61453mg/dl.This means that there is a significant statistical difference between both groups (P value =0.031).For the level of C3 in patients ,the mean ±SDwere112.22±26.34mg/dl while in controls they were 147.76±17.41mg/dl. This indicates that there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.004).Finally, the mean ±SD the for level of C4 in patients were 22.76± 8.44mg/dl while in control they were 34.4±12.15mg/dl. Therefore there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.005).

مقارنة وراثية وبكتريولوجية بين Staphylococcus spp. وStreptococcus spp. المقاومة لمضادات الــ Macrolide والمعزولة من اصابات سريرية مختلفة == Genetic and Bacteriological Comparative between Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. resistance to Macrolide , isolated from different clinical infections

Author name: سيف علي محمد الحيالي
Supervisor name: هادي رحمن رشيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: جمعت 200 عينة من مصادرمتنوعة شملت ( الادرار، والدم ، ومسحات الاذن الوسطى ، والقشع ، والجروح ، والبلعوم ، ومسحات مهبلية ) من مستشفيات ( بعقوبة العام ، البتول للولادة ، وبلدروز العام ) بالاضافة الى بعض المراكز الصحية وذلك للفتره من 1/ 9 / 2013 لغاية 1 /1 /2014 ، حيث اظهرت 75 عينة وبنسبة (37.5%) نموا سالبا للزرع البكتيري و125 عينة (62.5%) نموا موجبا للزرع البكتيري . تم الحصول على 40 عزلة تعود للجنسين Staphylococcus spp. وStreptococcus spp . اذ شخصت العزلات باستخدام الاختبارات الزرعية , والمجهرية , والكيموحياتية فضلا عن الفحص التاكيدي للعزلات باستخدام نظام api 20 staph and strep . وصلت نسبة Staphylococcus المعزولة من الدم الى 33.3% ومن الادرار 12.6% ومن البلعوم 36% ، ومن الاذن الوسطى 13.8% ، ومن الجروح 18.7% ، اما نسبة Streptococcus المعزولة من البلعوم فكانت نسبتها 30.7% ، ومن القشع 11.7% ، ومن الجروح 6.2% . تم اختبار حساسية جميع العزلات لبعض مضادات الـــ Macrolide الشائعة الاستخدام بالاضافة الى مضاد الكلندامايسين العائد لعائلة الــ Lincosamides ، اظهرت النتائج ان مقاومة S. aureus للارثرومايسين وصلت الى نسبة 50% ، وللازيثرومايسين بنسبة 45% ، وللكلندمايسين بنسبة 25% . اما S. epidermidis فقد كانت النسب كالتالي 66.6% للارثرومايسين و44.4% للازيثرومايسين ، و11.11% للكلندامايسين . اما بالنسبة للجنس S.pyogenes فكانت نسب المقاومة كالتالي 25.5% للارثرومايسين ، و25.5% للازيثرومايسين ، و14.5% للكلندامايسين . تم تحديد التركيز المثبط الادنى لمضاد الارثرومايسين للعزلات قيد الدراسة والتي اظهرت مقاومة تجاه هذا المضاد في فحص الحساسية بطريقة الاقراص (المقاومة) حيث تراوحت قيم MIC للعزلات بين (<64 - 32) مايكروغرام / مل . تم التحري عن قابلية عزلات Staphylococcus spp . و. Streptococcus spp على انتاج بعض عوامل الضراوة وقد اظهرت النتائج ان تلك العزلات كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والذيفانات التي تسهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، واللايبيز ، واليوريز، والانزيم المحلل للدنا ، والستافيلوكاينيز ، والستربتوكاينيز وكذلك اظهرت هذه العزلات قدرتها على انتاج اربعة انواع من الهيمولايسين (الفا ، بيتا ، كاما ، ودلتا). كما وتم التحري عن قابلية العزلات على انتاج الطبقة اللزجة Slime layer باستخدام طريقة اكار احمر الكونغـو وقد بينت النتائج ان كلا الجنسين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة فقد اظهرت النتائج ان (65% ) من عزلات بكتريا S. aureus منتجة للطبقة اللزجة بينما كانت جميع عزلات S.epidermidis وبنسبة %100 منتجة للطبقة اللزجة ، بينما اظهرت 75% من عزلات S.pyogens قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة . اجريت عملية استخلاص للدنا الكلي البكتيري لـ ( 12 ) عزلة ثم اجري تفاعل البلمرة المتسلسل PCR لعزلات Staphylococcus spp. وStreptococcuss spp. المقاومة للـ Mcrolide وذات MIC اكثر من64 مايكروغرام/ مل والموجبة النمو على الوسط المعلم بالارثرومايسين من خلال استعمال البوادىء المتخصصة التي تستهدف التسلسل النوعي للجين erm A وmef A ، رحلت نواتج التضاعف على هلام الاكاروز بتركيز 1% ولوحظ ظهور حزمة واحدة في جميع المسارات في الهلام بالمستوى نفسه بالنسبة للجينين . اظهرت النتائج ان نسبة وجود الجين erm A في عزلات S. aureus وصل الى 80% وفي عزلات S.epidermidis 30% ، وفي عزلات S.pyogens وصلت النسبة الى 50% ، اما بالنسبة للجين mef A فكانت نسبة توافره في عزلات S. aureus 20% ، وفي عزلات S.epidermidis 40% ، وفي عزلات S.pyogens 50% . | Collected 200 samples from different clinical sources included (Urine , blood , middle ear , sputum, throat , wounds , and vaginal swabs) from hospitals (Baquba teaching hospital , AL - Batool hospital and Balad Ruz teaching hospital) in addition to some health centers for the period from 1 / 9 / 2013 until 01 / 01 / 2014. As demonstrated 75 samples 37.5% were negative growth for bacterial culture and 125 62.5% positive growth of bacterial culture . 40 isolates belonging were obtained to both genus Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. These isolated were diagnosed by using cultural tests , microscopic, and biochemical characteristics as well as a confirmatory test for the isolates using the api 20 staph & strep system . The percentage of Staphylococcus isolated from the blood is 33.3% the urine 12.6% the throat 36% , middle ear 13.8% , and the wounds 18.7%, while the percentage of Streptococcus isolated from the throat was represented 30.7% , the sputum 11.7% , and the wonds 6.2%. Antibiotic susceptibility testing was performed on all isolates against some of the commonly used Macrolide members in addition to the clindamycin return to the lincosamides family using the disk diffusion method , the results showed that the resistance of S. aureus to erythromycin reached to 50% , for azithromycin 45% , and for clindamycin is 25% . The S. epidermidis ratios were as follows 66.6% for erythromycin 44.4% for azithromycin , and 11.11% of the clindamycin ، while the resistant of S.pyogens were as follows 12.5% of erythromycin , 12.5% of the azithromycin , and 14.5% of the clindamycin . The minimum inhibitory concentration MIC for erythomycin of isolates under study which showed resistance to the antibiotic sensitivity test in a Disk diffusion method where ranged between <33 - 64 µg / mL . investigated the ability of Staphylococcus spp. and Streptococcus spp on the production of some of the virulence factors . The results showed that these isolates were productive for several types of enzymes and toxins that contribute usually in pathogenicity. One of these enzymes , protease enzyme , lipase enzyme , urease enzyme , Dnase enzyme , Staphylokinase enzyme , and Streptokinase enzyme and also showed these isolates ability to produce Four types of Heamolysin (alpha , beta , gamma , and Delta) . It also has been investigating the susceptibility of isolates to produce a Slime layer using the Congo red agar ( CRA) ، The results showed that both genus have the ability to produce slime layer and Biofilm formation , the results showed that 65% of the S. aureus producing Slime layer while all S.epidermidis isolates produced the slime layer , while showed 75% of the isolates S.pyogens ability to produce Slime layer. Conducted the process of total DNA extraction to 12 isolates under study that resist Macrolide members . polymerase chain reaction (PCR) was done for isolates of the bacterium Staphylococcus and S.pyogens resistance of Mcrolide and with MIC more than 64 micrograms / ml by using specialized primers targeting sequence specific gene erm A and mef A , deported outputs doubling the agarose gel concentration 1% and observed the emergence of a single package in all the tracks in the gel at the same level for the genes . The results showed that the percent of the presence of erm A gene in isolates of S. aureus arrived 80% and in isolates S.epidermidis 30% , and in isolates S.pyogens got to 50% , while for mef A gene the presence in isolates of S. aureus was 20% , in isolates S.epidermidis 40% , and in isolates S.pyogens 50% .

تقدير البعد الوراثي لبعض اصناف نخيل التمر Phoenix dactylifera L. المزروعة في العراق باستعمال تقانة RAPD == Estimation of the Genetic Distance for Some Date Palm Varieties ( Phoenix dactylifera L.) Grown in Iraq using a RAPD Technique

Author name: مهند رشيد حسين الزيدي
Supervisor name: شذى عايد يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: This study was conducted at Molecular Biology lab, Genetic Engineering Department, Agricultural Research Directorate, Ministry of Science & Technology to estimate fingerprint and genetic relationship among 9 Iraqi varieties of date palm Phoenix dactylifera L. namely Asabee AL - aroose, Zahdi, Sukari, Saada, Ashrasy, Barben, Shetwi, Khistawi and Nhair Al Saly. 20 primers were used to PCR amplify characteristic Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) marker fragments. Total genomic DNA was isolated from varieties fresh leaves, the average yields of DNA were in the range of 100 - 522.5 ng/ul with purity ranged between 1.66 to 1.92. Polymerase Chain Reaction (PCR) experiments were performed to detect DNA polymorphisms amplified fragments in each cultivar (their numbers and molecular weight sizes) on agarose gel electrophoresis stained by ethidium bromide. Results of RAPD experiments revealed differences in band numbers and molecular weight sizes, all tested primers yielded 157 polymorphic bands and the lowest polymorphic band numbers (5 bands) were with primers OPA - 01 and OPA - 20 while the largest number of polymorphic (12 bands) were with primers OPA - 08 and OPH - 09. RAPD analysis showed that many primers gave unique band in all samples made possible fingerprint identification of each cultivar, Ashrasy variety gave highest 6 unique polymorphic bands with primers OPA - 08, OPC - 04, OPF - 05 and OPF - 12, while Zahdy variety gave 1 unique polymorphic band (385 pb) with primer OPB - 05. Data was analyzed by using statistical program SPSS to find similarity and genetic relationship among cultivars, similarity index ranged between 0.291 and 0.511 and the biggest percentage of similarity was between Saada and Shetwi. Dendogram analysis has separated varieties into two main groups, the first main group consists of three sub - cluster or sub - group, the first sub - cluster contained Saada and Shetwi varieties while the second sub - cluster included Zahdi, Ashrasy and Nhair Al Saly and the third sub - cluster consisted Asabee Aroose cultivar. The second main group was divided into two sub - group, the first sub - group consisted of Berben and Khistawi while the second sub - group included Sukary.

تاثير الرش بالبرولين والارجنين في نمو وحاصل الباذنجان في الزراعة المحمية == Effect of Spraying Proline and Arginine in the Growth and Yield of Egg Plant in Protected culture

Author name: زينب نبيل ابراهيم
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:

تاثير مواعيد الزراعة والاصناف في نمو وحاصل زهرة الشمس (Helianthus annuus L.) == The effect of difference genotype and planting date in growth and production of (Helianthus annuus L .

Author name: هديل احمد مهدي الساعدي
Supervisor name: نجم عبد الله جمعة الزبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: نفذت التجربة في مشتل مديرية زراعة ديالى - بلدروز في الموسم الربيعي لعام ( 2014 ) لدراسة تاثير اربعة مواعيد زراعة 1/2 و15/2 و1/3 و15/3 على صفات النمو والحاصل ومكوناته والصفات النوعية لثلاثة اصناف من نبات زهرة الشمس الصنف فلامي , يوروفلور , زهرة العراق . تم استعمال القطع المنشقة Split Plot بتصميم القطاعات العشوائية الكاملة R.C.B.D بثلاثة مكررات حيث تضمنت مواعيد الزراعة المعاملات الرئيسية الاصناف المعاملات الثانوية ويمكن تلخيص النتائج كالاتي : - 1 - اظهرت مواعيد الزراعة تاثيرات معنوية في صفات النمو والحاصل والنوعية . اذ تفوق الموعدين الثاني والثالث في جميع صفات النمو كما تفوق الموعد الثاني في جميع مكونات الحاصل ونسبة الزيت وحاصله.2 - اظهرت الاصناف اختلافات معنوية فيما بينها في بعض صفات النمو ومكونات الحاصل والنوعية . اذ تفوق الصنف زهرة العراق فــــي المساحة الورقية وعدد الاوراق / نبات . وتفوق الصنفين زهرة العراق يوروفلور في النسبة المئوية للاخصاب ، وتفوق الصنفين يوروفلور وفلامي في قطر الساق تفوق الصنفين زهرة العراق ويوروفلور في نسبة الاخصاب المئوية وتفوق الصنفين يوروفلور وفلامي في وزن 1000 بذرة وحاصل النبات ونسبة وحاصل الزيت .3 - كان تاثير تداخل مواعيد الزراعة والاصناف معنويا في بعض صفات النمو والحاصل والنوعية ، حيث اعطى الصنف زهرة العراق في الموعد الثاني اعلى متوسط في ارتفاع النبات . واعطى اعلى متوسط في ارتفاع النبات والمساحة الورقية ودليل الكلوروفيل . واعطى الصنف يوروفلور اعلى متوسط في الوزن الرطب والجاف في القرص الزهري وقطر الساق وقطر القرص والنسبة المئوية للاخصاب وعدد البذور ووزن 1000 بذرة وحاصل النبات وحاصل البذور والنسبة المئوية للزيت وحاصل الزيت | This experiment was conducted in Baladrus plant nursery in spring (2014) to stady effect of four sowing dates ( 1/2 , 15/2 , 1/3 and 15/3 ) on plant yield and its component and the second factor was sunflower varieties ( Flamy , Eourflor , sun flower ) in a split plot desing in R.C.B.D with three repilication the sawing date have the main plots varieties in the sub - plots and the result summarized in : 1 - the sowing date show a signifieaht effects in some of growth yied and quality characters . the second and third date exceeded the others in plant height leaves number in plant but the second dates exceeded others in fertilization percentage and leaves seed number in disc .2 - varieties show significant differences in growth yield and its components and quality sun flower exceeded others in leave area . but Eourflor and Flamy gave increase in stem diameter . sunflower and Eourflor gave in higer fertilization percentage Eourflor and sunflower exceeded others in 1000 seed weight plant yield and Oil yield .3 - Interaction between sowing dates with varieties gave signnificantly result in growth yield and yield quality sunflower gave high means in the second and third dates in plant height and leave area and chrorophyll index in the second date Flamy gave the highest means in leave area in the third date Eourflor gave the highest means in stem diameret wet and dry weight for the flower disc in the second date Eouroflor and Flamy exceeded others in all of yield components yield and Oil percentage in the second date .

التاثير الاليلوباثي لنباتي الفلفل والباذنجان ومستويات الرطوبة في نمو نوعين من الحنطة == Allelopathic effect of pepper, eggplant and moisture levels on growth for two wheat species

Author name: ايمان طه ياسين سلطان السبيع
Supervisor name: صلاح محمد سعيد الطائي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Mosul
Key words:
  • الجهد الاليلوباثي,
  • مستويات الرطوبة
  • الحنطة
  • الفلفل
  • الباذنجان
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية للمجموع الخضري لنباتي الفلفل pepper(Capsicum frutescens L) والباذنجانEggplant(Solanum melongena L.) وبالتراكيز %(9,6,3,0) في انبات ونمو نوعين من الحنطة (اباء - 99) و(ام الربيع)؛ فضلا عن دراسة مستخلصات الترب تحت نباتي الفلفل والباذنجان .اظهرت النتائج المختبرية بان المستخلصات المائية للمجموع الخضري سببت اختزال معنوي في النسبة المئوية لانبات البذور, حيث كلمزااد التركيز انخفضت نسبة الانبات اذ بلغت اقل نسبة انبات بتاثير المستخلص المائي للمجموع الخضري لنبات الباذنجان 75.68)%) قياسا بمعاملة المقارنة (الماء المقطر), وتفوق النوع اباء - 99 تفوقا معنويا على النوع ام الربيع.اما في نمو البادرات المتمثل بطول الرويشة والجذير ووزنهما الجاف؛ فقد لوحظ من النتائج حصول تثبيط لتاثير المستخلصات المائية للمجموع الخضري والترب قياسا بمعاملة المقارنة مع ملاحظة انه كلمزااد التركيز للمستخلصات المائية ازداد التثبيط, وان مستخلص نبات الباذنجان كان اكثر تاثيرا في اغلب المعاملات, اذ حصلت اعلى نسبة اختزال في طول الرويشة وطول الجذير والوزن الجاف لهما عند التركيز 9% من المستخلص المائي للمجموع الخضري لنبات الباذنجان .اما تاثير مستخلصات الترب؛ فقد حصل تثبيط قياسا بمعاملة المقارنة(مستخلص التربة غير المزروعة) في اغلب الصفات المدروسة. اما تجربة البيت الزجاجي؛ فقد كانت تجربة عامليه بالتصميم العشوائي الكامل (R.C.B.D.) وبواقع (48) معاملة وفي اربعة مكررات, واستخدم المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان وبالنسب %(9,6,3,0) وزن : وزن وتحت ثلاثة مستويات من السعة الحقلية %(100,75,50) لمعرفة تاثيرها في الانبات وبعض صفات النمو والحاصل ومكوناته للنوعين من الحنطة؛ فضلا عن تاثيرها في تركيز العناصر الغذائية, واجريت تجربة اخرى لمعرفة تاثير الترب تحت نباتي الفلفل والباذنجان وبثلاث مستويات من الرطوبة%(100,75,50) وبواقع (18) معاملة وفي اربعة مكررات,وتم التوصل الى النتائج التالية : 1. صفات النمو : اظهرت النتائج انه في حالة اضافة المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان وبالتراكيز%(9,6,3) كان له تاثير تثبيطي اذ تفوقت معاملة المقارنة (تربة بدون مخلفات) في صفة نسبة الانبات, ارتفاع النبات, مساحة ورقة العلم ومحتوى الكلوروفيل الكلي للاوراق في حين تفوق المستوى الرطوبي 100% في صفة ارتفاع النبات, مساحة ورقة العلم ومحتوى الكلوروفيل الكلي قياسا الى مستوى الرطوبة %(75,50), وعن تاثير انواع الترب المزروعة؛ فقد تفوقت معاملة المقارنة على بقية المعاملات في اغلب الصفات المدروسة.2. الحاصل ومكوناته : اذ حصل اختزال في الحاصل ومكوناته (طول السنبلة, حاصل الحبوب والحاصل البايولوجي) نتيجة اضافة المجموع الخضري للنباتات قياسا بمعاملة المقارنة. اما بالنسبة لتاثير الترب المزروعة؛ فقد حصل فيها تثبيط قياسا بمعاملة المقارنة.3. تركيز العناصر : ان اضافة المجموع الخضري لنباتي الفلفل والباذنجان الى التربة وتحت الثلاث مستويات من الرطوبة كان له تاثيرا سلبيا على تركيز بعض العناصر في المجموع الخضري لنباتات الحنطة, فقد كانت اعلى نسبة تثبيط لعنصري الفسفور والبوتاسيوم عند التركيز 9%ومستوى رطوبة50%؛ اما بالنسبة لعنصر النتروجين؛ فنلاحظ حصول انخفاض مع زيادة مستويات رطوبة التربة .4. نوع الحنطة : اظهر نوع الحنطة اباء - 99 تفوقا معنويا على النوع ام الربيع في اغلب الصفات المدروسة. | The current study was conducted to investigate the effect of aqueous extract of pepper (Capsicum frutescens L.)and eggplant (Solanum melongena L.(shoots with concentration of (9,6,3,0)% on the growth of two types of wheat, (Iba - 99) and (Om Al - Rabee'), and to investigate soil extracts beneath the pepper and eggplants.Results of the current study showed that aqueous extracts of shoots caused a significant decrease in the seed percentage; where in the growth rate decreased with higher concentrations. It was shown that the lowest percentage effect by aqueous extracts of eggplants shoot amounted to (75.68%) compared with the control tretment, with Iba - 99 being significantly higher than Om Al - Rabee'.As for growth of roots and dry weight, an inhibition in the effect of the aqueous extracts of shoots and soil as compared with the control treatment was noticed. It was also shown that inhibition increased with the increase of concentration of the aqueous extracts, with eggplants having the most effect in most treatments, as well as inducing higher rate of inhibition in leaf length, root length and dry weight at concentration of 9%.Soil extract incurred an inhibition as compared with the control treatment (unplanted soil extracts)in most studied characteristics.Complete Random Design (R. C.B.D.) was used in the Glasshouse experiment, with (48) treatments and four r replications. Pepper and eggplant shoots were used with percentages of (9,6,3,0%) weight : weight under three levels of field capacity (50, 75, 100%) to determine the effect on germination, several growth characteristics and product characteristics for both wheat types. During the course of the study,and other experiment was conducted to know the effect of pepper and eggplant soil under three levels of moisture with four replications ((18) treatments combination) the following results were reached : 1 - Growth Characteristics : results show that when adding plant shoots with concentration of (9,6,3) an inhibitory effect occurred, with the control treatment (non - waste soil) being dominant in germination percentage, plant height, leaf area, and total chlorophyll content of leaves, while humidity level 100% had the most effect on plant height, leaf area, and total chlorophyll content of leaves as compared with humidity rate of (50, 75%). As for effect of planted soils, the control treatment had the dominant effect over other treatments.2 - yield components : an inhibition in the yield quantity occurred (spike length, seed yielde and biologicalyield) as a result to adding plant shoots, while inhibitory effect occurred in planted soils as compared with the control treatment.3 - Concentration of Elements : Addition of plant shoots and level of humidity significantly affected concentration of elements in the soil. Phosphorus and potassium had the highest inhibition at concentration of 9% and humidity level of 50%. Nitrogen concentration decreased with the rise of soil humidity.4 - Wheat Type : Wheat type Iba - 99 was significantly dominant over wheat type Om Al - Rabee' in most studied characters.

المستارجات الشائعة المسببة للارجية في مدينة بعقوبة ودورها في الحماية من الاصابة بالطفيليات المعوية == The common allergen causing allergy in Baquba city and its protective role against intestinal parasites infections

Author name: اميرة فاضل احمد النعيمـــي
Supervisor name: نبيل عبد القادر مولود | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية بهدف الكشف عن المستارجات الاكثر اثارة للارجية في محافظة ديالى، وعن الدور الذي قد يوفره الضد I g E الكلي وخلايا الدم الحمضة في الوقاية من الاصابات الطفيلية عند مرضى الارجية. شملت الدراسة، 106 فردا من مرضى الارجية ( 62 مريضا بالربو الارجي و44 مريضا بالتهاب الانف الارجي ) ومن كلا الجنسين ، فضلا عن 64 فردا من الاصحاء ظاهريا اعتمدوا كمجموعة سيطرة، وقد تراوحت الاعمار بين 5 - 50 سنة ± 7.24 . اظهرت نتائج اختبار وخز الجلد باستخدام 19 نوعا من الخلاصات ان اعلى النسب في تفاعلات الجلد الموجبة كانت تجاه المستارجات HDM = Hous dust mite بنسبة 33.92 % ومستارجات Bermuda وM1 ( Alternaria ) وT1 ( Fagaceae ) بنسبة 19.64 % لكل منها عند مرضى الربو، والمستارجات Bermuda وHDM بالنسب 39.39 % و30.30 % من مرضى التهاب الانف الارجي وعلى الترتيب. فيما يتعلق بالعمر والجنس لمرضى الارجية فقد ظهر ان الفئة العمرية 21 - 30 سنة هم الاكثر نسبة في حدوث المرض لكلا المجموعتين اذ سجلت نسبة 27.41% لمرضى الربو و36.36% لمرضى التهاب الانف الارجي، فيما كانت نسبة الذكور 27.77% هم الاعلى في مجموعة الربو الارجي بينما كانت الاناث 37.03% هم الاعلى في مجموعة التهاب الانف الارجي. اظهرت نتائج قياس تركيز I g E الكلي باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانظيم ( ELISA ) ان هناك فروقا معنوية ( P< 0.05 ) في مستويات هذا الضد في امصال مرضى الربو الارجي مقارنة بافراد السيطرة ، اذ بلغ المتوسط الحسابي لديهم 429.98± 279.62 وحدة عالمية / مليلتر ومرضى التهاب الانف الارجي 342.60± 242.88 وحدة عالمية / مليلتر مقارنة الاصحاء 104.02± 82.94 وحدة عالمية / مليلتر . اما بشان نسب الخلايا الحمضة فقد وجد ان هناك فروقا معنوية ( P < 0.05 ) بين متوسط نسب هذه الخلايا عند مرضى الارجية ومستوياتها في دماء الاصحاء ، اذ بلغ المتوسط الحسابي لهذه النسب في دماء مرضى الربو الارجي ومرضى التهاب الانف الارجـي 5.15 % ± 3.23 و4.97 % ± 2.73 على التوالي مقارنة بمستوياتها عند الاصحاء 1.93 % ± 1.35. ولالقاء الضوء على دور الضد I g E والخلايا الحمضة في توفير الوقاية ضد الاصابة الطفيلية عند مرضى الارجية ، فقد تم اجراء اختبار للطفيليات المعوية في مجموعتي المرضى والسيطرة، وجد من خلالها ان نسبة الذين كانت لديهم مثل هذه الاصابات من بين مرضى الارجية 1.98 % فقط مقارنة بنسبتها البالغة 25.92 % عند غير المصابين بالارجية في عينة الدراسة . وقد توزعت نسبة هذه الاصابات لدى هؤلاء المرضى على النحو الاتي 0.99 % لكل منova Enterobius vermicularis وegg Ascaris lumbricoides فيما كانت النسب عند غير المصابين بالارجية 11.11 % و5.55 % و3.70 % و1.85 % وللطفيليات trophozoite ova , Entamoeba histolytica E. vermicularisA. lumbricoides egg وAncylostoma duodenale egg , trophozoite Giardia lamblia وبالترتيب . | The current study was conducted in the Dermatology and Allergy unit in the outpatient clinic of Baquba General Hospital for the period from 2006 to 2008 . The aim of the study is to determine the most common allergens in Diyala province and to explare the protective role of total IgE antibody and eosinophile against intestinal parasitic infection .The study include 106 atopic patients; 62 patients with bronchial asthma and 44 patients with allergic rhinitis , of both sexes with mean age 5 - 50 ±7.24years. Additionally ,64 apparently individual were included as control group with mean age 5 - 50 ±7.24 years. Determination of causative allergen was carried out by skin prick test utilizing 19 type of allergen extracts . Assessment of total IgE was done using ELISA technique .Estimation of eosinophil counts and percentage was done through stained blood film . The results reveated that in asthmatic patients the highest skin positivity rate was due to HDM ( 33.9%) followed by Bermuda , Alternaria (M1) and Fagaceae (T1)(19.6%). Whereas in allergic rhinitis patients , the highest skin positivity rate was due to Bermuda and HDM(39.3% and 30.3 %) respectively . The results showed a significant increase in the total IgE concentration in asthmatic patients compared to that of control (429.9 IU/ml vs104 IU/ml); (p= 0.04).Similarly , the total IgE concentration in allergic rhinitis patients was significantly high compared to control ( 342.6 IU/ml Vs 140IU/ml) (P= 0.04 ). Estimation of blood eosinophile revealed that the percentage of these cells was significantly higher in asthmatic and allergic rhinitis patient compared to control (5.1%and 4.9% Vs 1.9%) , the P value were (P=0.03) and (P=0.04) respectively . The results also revealed that the infection rate by intestinal parasites among allergic patients was 1.98%compared to 25.9% in the control group . Among patients , Enterobius vermicularis and Ascaris lumbricoides were detected in 0.99%. However , among healthy individuals , Ascaris lumbricoides , E.vermicularis ova, Entamoeba histolytica trophozoites , Ancylostoma duodenale and Giardia lambilia were detected in 11.1%, 5.5 % , 3.7%, 1.8%respectively .

حدوث الاصابات الفطرية الجلدية بين السكان في مدينة بعقوبة وضواحيها == Occurrence of Cutaneous Mycoses Among The People In Baquba City And Vicinity

Author name: ميساء تقي عبد الحسن الخزعلي
Supervisor name: عباس عبود فرحان الدليمي | عبد الرزاق شفيق حسن الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Diyala
First pages:
Abstract: جمـعت نماذج القشطات الجلدية ، الشعر ، والاظافر من (320) مريضا كانوا يظهرون علامات يشتبه سريريا ارتباطها بالفطريات للمدة بين الاول من كانون الاول 2003 ولغاية الحادي والثلاثين من اب 2004 ، وفحصت مختبريا بوساطة الفحص المجهري المباشر باستخدام محلول هيدروكسيد البوتاسيوم (10%) وبواسطة الزرع على وسط اكار السابرويد دكستروز ، لتاكيد الاصابات الفطرية ولتحديد انواع الفطريات المسؤولة عنها.اظهر الفحص المختبري نتائج ايجابية للاصابات الفطرية لدى (248) مريضا ، واعتمادا على المسبب المرضي قسمت تلك الاصابات الفطرية الى ثلاثة مجموعات وتبين ان مجموعة الفطارات الجلدية (Dermatophytoses) هي السائدة (52.4%) وتلتها النخالية المبرقشة (Pityriasis Versicolor) بنسبة (25.8%) ، ثم الاصابات الجلدية بالمبيضات (Cutaneous Candidiasis) بنسبة (21.8%). صنفت الفطارات الجلدية سريريا الى ستة اشكال وتبين ان سعفة الجسم (44.6%) هو الشكل السائد ويليه سعفة الراس (39.2%) ، سعـفة الوجه (10.8%) ، سعفة القدم (2.3%)، ثم سعفة الفخذ (1.5%) ، وسعفة اليد (1.5%) ولـم تكن هناك فروقات معنوية في نسب الاصابات بالفطارات الجلدية بمختلف اشكالها بين الذكور والاناث ، اما بخصوص اعمار المصابين فقد لوحظت زيادة معنوية في نسب الاصابات بالفطريات الجلدية خاصة في سعفة الجسم وسعفة الراس ، لدى فئة الاعمار (1 - 11) سنة مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين من الاعمار الاكبر سنا ، وحول علاقة الاصابة مع مناطق سكن المصابين تبين ان اعـلى نسب الفطارات الجلدية خاصة في سعفة الجسم وسعفة الراس ، سجلت لدى المصابين من المناطق الريفية ( 68.5% ) مـقارنة باولئك من المناطق الحضرية ( 31.5 % ) . اظهرت الفحوص الزرعية للنماذج التي جمعت من الفطارات الجلدية ، ان النمو الفطري في وسط اكار السابرويد دكستروز كان ايجابيا في 107 (82.3%) عينة ولدى التعرف على انواع الفطريات في اوساط الزرع تبين ان الفطر Trichophyton mentagrophytes كان السائد بنسبة (33.6%) ويليه الفطر Trichophyton rubrum (21.5%) ، Trichophyton verrucosum (16.8%) ، Trichophyton tonsurans (11.2%) ، ثم Trichophyton soudanense (9.3%) ، وTrichophyton violaceum (7.5%). كما تبين ان الفطر Trichophyton soudanense قد تم عزله في الدراسة الحالية لاول مرة في العراق . كانت نسبة كبيرة من المصابين بالفطر T.mentagrophytes (22.4%) والفطر T.verrucosum (11.2%) يربون الحيوانات داخل منازلهم ، بينما سجلت اعلى نسب الفطريات الاتية : T.rubrum (14.9%) ، T.tonsurans (9.3%) ، T.soudanense (7.5%) ، وT.violaceum (7.5%) لدى المصابين الذين اعطوا تاريخا عائليا لوجود اصابات فطرية جلدية. درست النخالية المبرقشة تبعا لمواقع الاصابة في الجسم فتبين ان اصابة الرقبة كانت الاكثر شيوعا لدى (40.6%) من المصابين وقد وجد ان الاصابة البيضاء كانت اكثر الاصابات تكرارا (67.2%) مقارنة بالاصابات الغامقة اللون ، وسجلت اعلى نسب الاصابة لدى الذكور (73.4%) مقارنة بالاناث (26.5%) ، اما بخصوص اعمار المصابين فقد لوحظت زيادة معنوية في نسبة الاصابة لدى فئة الاعمار (12 - 31) سنة حيث بلغت (76.6%) مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين من الاعمار الاصغر والاكبر من هذه الفئة . وحول العلاقة بين الاصابة ومناطق سكن المصابين فلم تظهر فروقات معنوية في نسب الاصابة بين المصابين من المناطق الحضرية (48.4%) واولئك من المناطق الريفية (51.6%). بينت نتائج الفحص المجهري المباشر عن وجود الفطر Malassezia furfur في جميع حالات النخالية المبرقشة . سجلت الاصابات الجلدية بالمبيضات تبعا لمواقع الاصابة في اجسام المصابين فتبين ان اصابة الطيات الجلدية (62.9%) خاصة ما بين اصابع القدم (29.6%) وما بين اصابع اليد (20.4%) هي الاكثر شيوعا . وقد لوحظت زيادة معنوية في نسبة الاصابة لدى الاناث (72.2%) مقارنة بالذكور (27.8%) ، واما بخصوص اعمار المصابين فقد سجلت اعلى نسب الاصابة لدى فئة الاعمار (12 - 31) سنة حيث كانت (62.9%) مقارنة بنسب حدوثها لدى المصابين الاصغر والاكبر سنا من هذه الفئة . حول العلاقة بين الاصابة ومناطق سكن المصابين فلم تظهر اية فروقات معنوية في نسب الاصابة بين المصابين من المناطق الحضرية (55.5%) واولئك من المناطق الريفية (44.4%) .كشفت نتائج الفحص الزرعي للنماذج التي جمعت من حالات الاصابات الجلدية بالمبيضات عن نتائج ايجابية في جميع الحالات ولدى التعرف على انواع المبيضات المعزولة تبين وجود نوعين منها ، وكان الفطر Candida albicans هو السائد (88.9%) ويليه Candida tropicalis (11.1%). | Skin scrappings , nail, and hairs specimens were collected from 320 patients with clinically suspected to be infected with cutaneous mycoses during the peroid from 1st / December 2003 to 31th / August 2004 . These specimens were examined by direct mount with KOH(10%) and culture on Sabouraud’s - Dextrose agar plates for isolation and identification of causative fungi.The results showed that 248 (77.5%) were positive for fungi. Thereafter, according to the causative agent, the patients were divided into 3 groups; Those patients with dermatophytes were common (52.4%), followed by patients with pityriasis versicolor (25.8%) and finally those with cutaneous candidiasis (21.8%). The results also showed that these dermatophytoses were belong to the following clinical intities; Tinea corporis was the common (44.6%) followed by Tinea capitis (39.2%), Tinea facialis (10.8%), Tinea pedis (2.3%), Tinea cruris (1.5%) and Tinea palmaris (1.5%). There was insignificant difference among clinical pictures of dermatophytoses between male and female. Concerning the age groups, the results revealed a significantly higher infection rate among the age group (1 - 11) years, particulary Tinea corporis and Tinea capitis. Furthermore, higher rate of dermatophytes particulary Tinea corporis and Tinea capitis among rurals compared to urbans. Culture of specimens on Sabouraud - Dextrose agar were positive in 107 (82.3%) case. Trichophyton mentagrophytes were the predominent type of fungi isolated (33.6%), followed by T.rubrum (21.5%), T.verrucosum (16.8%), T. tonsurans (11.2%), T.soudanense (9.3%), and T.violaceum (7.5%). For the best of our knowledge, the species T. soudanense was isolated for the fiest time in Iraq in this study.Higher infection rate with T.mentagrophytes (22.4%) and T.verrucosum (11.2%) were found among patients who breed domestic animals inside their houses. However, Higher infection rate with T.rubrum (14.9%), T.tonsurans (9.3%) , T.soudanense (7.5%) , T.violaceum (7.5%) were found among patient who gave positive past family history of dermatophytoses.The most common site of clinical pityriasis versicolor was the neck (40.6%), and the white patches were the predominent (67.2%). Higher infection rate with P. versicolor was found among males (73.4%) compared to females (26.5%). The infection rate was significantly higher (76.6%) among the age group (12 - 31) years. However, there was insignificant difference between urbans (48.4%) compared to rurals (51.6%). The results of direct microscopical examination with 10% KOH revealed the presence of Malassezia furfur in all specimens of pityriasis versicolor cases. Cutaneous candidiasis was mostly affected skin folds (62.9%) especially the interdigital space (29.6%) and among the fingers (20.4%). Significantly higher infection rate was revealed among females (72.2%) compared to males (27.8%). The age group (12 - 31) years was the hardly infected (62.9%). However, there was insignificant difference concerning the residence of the patients, the infection rate among urbans was (55.5%) and that among rural was (44.4%). All culture of specimens taken from cases of cutaneous candidiasis were all positive, and the Candida albicans was the predominent isolates (88.9%) followed by C.tropicalis (11.1%).
1 ... 212 213 214 215 216 ... 338