العلم العراقي
عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 31,012

دراسة تاثير الغشاء الحيوي المنتج بواسطة Klebsiella pneumonia المعزولة سريريا على بعض جوانب الجهاز المناعي Study the Effects of Biofilm of Klebsiella pneumoniae Isolated Clinically on Some Immune System Aspects

اسم المؤلف: سرى مؤيد عباس العبيدي
اسم المشرف: علي حسين علوان العامري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد بكترياKlebsiella pneumoniae من الممرضات الخطرة التي بامكانها ان تسبب اصابات حادة, شملت الدراسة عزل 50 عزلة من البكتريا من مصادر سريرية مختلفة من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد (مستشفى ابن البلدي, مستشفى الكندي التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب) لغرض دراستها من محاور عدة بعد ان شخصت البكتريا اعتمادا على الطرق التقليدية بالتشخيص من حيث صفاتها الزرعية والكيموحيوية فضلا عن استعمل جهاز vitek2 compact system لتاكيد التشخيص, اظهرت نتائجنا ان عدد ونسبة عزلات بكترياKlebsiella pneumoniae التي تم الحصول عليها وفقا للمصادرالسريرية (الادرار,الدم ,القشع، حروق, مسحة الاذن ، القيح, الجروح والخروج) كانت 22 (44٪)، 11 (22٪)، 4 (8٪),4 (8٪), (3) (6٪)، 3 (6٪)، 2 (4٪) و1 (2٪) على التوالي. المحور الاول ركز على دراسة المقاومة للمضادات المختلفة وتحديد التركيز الادنى للمضادات الحيوية لتثبيط نمو البكتريا, استعملت المضادات الاتية (,amikicin, azteronam cefepime ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin (trimethoprim/ sulfamethoxazole and لوحظ ان المضادات amikicin, impenem meropenem and اكثر فاعلية ضد هذه البكتريا. من جهة اخرى اظهرت العزلات قدرة مختلفة على انتاج الغشاء الحيوي، حيث استخدمت في هذه الدراسة طريقتان لمعرفة قدرة العزلات لتشكيل الغشاء الحيوي، وكالتالي كانت النسبة في طريقة Congo - Red Agar (CRA) 72 % مكونة للغشاء و20 % غير منتجة و8 % غير محددة الانتاجية, في حين طريقة اطباق المعايرة الدقيقة 80 % مكونة و20 % غير قادرة على تكوين الغشاء. العزلات الاقوى لانتاج الغشاء الحيوي اختيرت لمعرفة مقاومتها للمضادين Ciprofloxacin and Meropenem لاجراء مقارنة المضادات بين الخلايا المفردة والخلايا المكونة للغشاء الحيوي, حيث اظهرت النتائج ان المقاومة للمضادات تصبح اكثر بحوالي 10 مرات بالنسبة للخلايا المكونة للغشاء الحيوي مقارنة مع الخلايا المفردة. المحور الثاني تضمن اجراء التجارب المناعية وشملت عملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة وعملية البلعمة, اجريت هذه التجارب على اكفا عزلتين من كل مصدر من ناحية تكوين الغشاء الحيوي والاكثر مقاومة للمضادات الحيوية, من ناحية اخرى عرضت هذه العزلات لمصدر الاشعة فوق البنفسجية بطول موجي 240 نانوميتر ولمدة نصف ساعة وذلك لاجراء مقارنة بين العزلات نفسها قبل وبعد التعرض وتاثير ذلك على استجابة الجهاز المناعي داخل وخارج الجسم الحي. حيث اظهرت التحليلات الاحصائية وجود فروق عند مستوى معنوية (0.001) لعملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة (داخل الجسم الحي) والبلعمة (خارج الجسم الحي) عند المقارنة مابين العزلات قبل وبعد التشعيع ومابين البكتريا في حالة كونها خلايا مفردة وفي حالة تكوينها الغشاء الحيوي, يدلل ذلك ان الجهاز المناعي اكثر فاعلية ضد الخلايا المفردة من الخلايا المكونة للغشاء الحيوي وللعزلات نفسها قبل وبعد التشعيع.اخيرا اجريت دراسة للتحري عن نسبة وجود الجينات التي يعتقد انها مسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي بواساطة جهاز تفاعل البلمرة التسلسلي وكانت النسبة للجين mrkA 92% وللجين mrkD 50% في العزلات الغير مشععة واصبحت النسبة 53% MrkA و23% MrkD للعزلات بعد التشعيع. كخلاصة هذه النتائج تؤيد ان الاستجابة المناعية ضد البكتريا المكونة للاغشية الحيوية هي اقل كفاءة والتي تضمنت في الدراسة عنها للخلايا المفردة ومما يعني نحن بحاجة لاجراء دراسات اخرى تشمل للجوانب المناعية الاخرى المتخصصة في استجابة الجهاز المناعي. | Klebsiella pneumoniae is a dangerous pathogens that can cause severe diseases. This study included the isolation of 50 isolates of bacteria from different clinical sources from different hospitals in Baghdad city (Ibn - albalady hospital, Teaching Al - Kindy hospitals and Teaching laboratory in medical city hospitals through August 2014 to December 2014) for the purpose of examination of several axes after confirmation the diagnosis of bacteria depending on traditional methods of diagnosis in terms of relying on cultural and biochemical characteristics then used vitek2 a compact system. These results showed that the number and percentage of isolate according to the sources (urine, blood, sputum, burns, ear swabs, pus, wounds and stool ) were 22(44%), 11(22%), 4(8%), 4(8%), 3(6%), 3(6%), 2(4%) and 1(2%) respectively. The first axis of this studies focused on the isolates resistance to different antibiotics and determination the minimum inhibitory concentration of antibiotics ( amikicin, azteronam, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin, trimethoprim/ sulfamethoxazole) that inhibits the growth of bacteria, the obtained results showed that the antibiotics amikicin, impenem and meropenem more effective against the isolates. On other hand the isolates showed different ability to produce biofilms, to examine this ability two methods were used (Congo - red agar methods and Tissue culture plate methods), the percentage of isolates formed biofilms in method (CRA) 72% produce biofilm and 20% non productive and 8% non - specific in CRA, while in TCP method 80% composed and 20% are not able to form the membrane. Higher production of biofilms isolates were exposed to Ciprofloxacin and Meropenem to make a comparison the antibiotic resistance between planktonic and biofilms producers isolates, the results showed that resistance to antibiotics became 10 times higher than planktonic. The second axis was the immunological experiment which included opsonization, bactericidal activity and phagosytosis. The strongest isolates that were chosen from each sources depended on biofilms formation, and antibiotic resistance, the same isolates were exposured to radiation by UV light wave length 240nm for 30min to compare between the same isolates after and before radiation to determine the immune response. Statistical analysis showed a significant differences P (0.001) to all immunogical experiments opsonization and bactericidal (preformed in vivo for wild and mutant type) activity phagocytosis (preformed in vitro for bacteria in planktonic and biofilm form). The immune system response was more effective against planktonic than biofilms formation bacteria to phagocytosis and between isolates for bactericidal assay and opsonization after and before radiation. Finally the genetic study used serial polymerase chain reaction to determine the proportion of the presence of genes that are believed to be responsible of biofilm production ratio was mrkA 92% and mrkD 50% of wild isolates that became at ratio 53.8% mrkA and 23% mrkD in isolates after radaiation, as a conclusion these findings support that immune response to bacteria vital constituent of membranes differ from the response in the case of single cells and there is need to make other immunological studies include specialized aspects of the immune system response.

تحضير الدقائق النانوية لاوكسيد واوكزالات النحاس ودراسة فعاليتها ضد بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المعزولة من اصابات الحروق والجروح Preparation of Copper Oxide and Oxalate Nanoparticles and Their Effects Against P.aeruginosa and Methicillin - Resistant S.aureus from Burn and Wound Infections

اسم المؤلف: سرمد فاروق هادي
اسم المشرف: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ست وثمانون عينة سريرية (57 من الجروح و29 من الحروق) من مرضى مصابين بانواع مختلفة من الجروح والحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد وهي : مستشفى اليرموك التعليمي ومستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الحروق في مدينة الطب خلال الفترة من ايلول الى كانون الاول 2014. العينات المجموعة فحصت باستخدام ملون كرام ثم زرعت على اوساط اكار الدم واكارالماكونكي بالاضافة الى الاوساط التفريقية الانتقائية (وسط اكار السيدوموناس لعزل Pseudomonas aeruginosa ووسط المانيتول الملحي لعزل (Staphylococcus aureusكما اجريت الاختبارات الكيموحيوية التالية : الكاتاليز والاوكسديز والكواوكيوليز واختبار API 20 NE لغرض تشخيص الـ P.aeruginosa بالاضافة الى ذلك، وبالاعتماد على نظام VITEK2 compact تم اجراء الاختبار التاكيدي لتشخيص P.aeruginosa وS.aureus كشف الزرع البكتيري لـ 86 عينة الماخوذة من الجروح والحروق، ان 75 عينة )%87.2 ( وجد فيها نمو بكتيري هوائي (عينات ايجابية)، بينما العينات السلبية كانت (11) ونسبتها 12.8 %. اظهر زرع عينات الحروق والجروح نسبة عالية %)45.3 ( ,34 عزلة من P.aeruginosa وبالتالي اقترح ان يكون هو المسبب المرضي الاكثر شيوعا، بينما S. aureus كانت نسبتها 28.0 % (21 عزلة). تم زرع جميع عزلات S. aureusعلى وسط agar CHROM حيث سجلت 66.6 %منها كانت مقاومة للمثسيلين اي Methicillin Resist Staphylococcus aureus (MRSA) و33.3 % حساسة للمثسيلين ايMethicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) ، نفس النتائج اعلاه تم الحصول عليها باستعمال طريقة Cefoxitin disc diffusion. خضعت 34عزلة عائدة لبكتيريا P.aeruginosa لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية قيد الدراسة، واظهرت النتائج ان كل العزلات %100.0كانت مقاومة للمضادات Carbenicillin وDoxycycline في حين اظهرت مقاومة عالية نسبيا للمضادات الاتية Amoxicillin /Clavulanic acid % 85.3% Cefipime , , 82.4 Netilmicin 76.5% واخيرا Azetreonam 61.8% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Gentamicin ,35.3% Tobramycin 32.4% واخيرا Ciprofloxacin ,29.4 % بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لمضاد% Imipenem 14.7 . من جهة اخرى, خضعت 21 عزلة عائدة لبكتريا S.aureus لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية واظهرت مقاومة عالية نسبيا لكل من Azithromycin ; 76.2% Cefoxitin Clathromycin; 66.7% 62.0% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Chloramphenicol ,%47.6 42.9% Ciprofloxacin Doxycycline, 38.0% بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لكل من Gentamycin , 19.0% Tobramycin Vancomycin , 14.3% 9.5% واخيرا Clindamycin . 9.5% تم تحضير دقائق نانوية لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس بنجاح بطريقة كيمياوية مرنة مستندة على التفكك الحراري لمواد اولية من حامض الاوكزاليك. تم تشخيصها باستعمال الطرق التالية : التحليل النمطي من انحراف الاشعة السينية (XRD) ، والمجهر الالكتروني الماسح (SEM) والتحويل الرباعية لامتصاص الاشعة تحت الحمراء(FT - IR) . تم قياس الفعالية المضادة للبكتيريا لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس النانوية المحضرة لكل من P.aeruginosa وMRSA باستعمال طريقة الانتشار في الحفر وطريقة تخفيف المرق. بينت النتائج بان كلا النوعين من الدقائق النانوية لها القدرة على منع نمو عزلات البكتيريا تحت الدراسة. كما تم تحديد التركيز المثبط الادنى MIC والتركيز القاتل الادنى MBC لكلا النوعين من الدقائق النانوية حيث كانت قيم MIC وMBC لاوكسيد النحاس ضد P.aeruginosa في التراكيز 1600 و3200 مايكروغرام/مل على التوالي، في حين كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/ مل على التوالي. اما بالنسبة لـ MRSA فان قيم MIC وMBC للدقائق النانوية لاوكسيد النحاس كانت في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/مل على التوالي، بينما كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس النانوية في التراكيز 200 و400 مايكروغرام/مل على التوالي. | Eighty six clinical samples (57 wounds and 29 burns swabs) were collected from patients with different types of wounds and burns from hospitals in Baghdad City : Al - Yarmuk Teaching Hospital, Baghdad Teaching Hospital and Burn Hospital in Medical City at a period between September to December 2014. The collected samples were examined by Gram stain then cultured on Blood agar and MacConkey agar media, as well as differential selective media including Pseudomonas agar for isolation of Pseudomonas aeruginosa and Mannitol salt agar for isolation of Staphylococcus aureus bacteria. The following biochemical tests were performed : catalase, oxidase, coagulase tests, and API 20 NE in order To diagnose P.aeruginosa. Additional, Confirmatory test was performed by using VITEK2 compact system in order To identify P.aeruginosa and S.aureus. The results of bacterial cultures revealed that out of 86 samples obtained from burns and wounds, 75 samples forming 87.2 % were observed to have an aerobic bacterial growth (positive samples), while negative samples, (11) represented 12.8%. The results of bacterial culture from burn and wound samples revealed high percentage of 45.3% of P.aeruginosa (34 isolates). Hence, it was suggested to be the most common pathogen, while S.aureus represent 28.0% (21 isolates). All isolates of S.aureus were cultured on CHROM agar medium which revealed that 66.6 % of them were Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and 33.3% Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), the same results were obtained by using Cefoxitin Disc Diffusion method. The Antibiotic sensitivity test on thirty four isolates of P.aeruginosa showed that all isolates 100.0% were resistant to Carbenicillin and Doxycycline; relatively high resistance to Amoxicillin/Clavulanic acid, 85.3 %; Cefipime, 82.4 %; Netilmicin, 76.5 % and Azetreonam, 61.8 %. These isolates have relatively moderate resistance to Gentamicin, 35.3%; Tobramycin, 32.4%; Ciprofloxacin, 29.4%, and relatively low resistance to Imipenem, 14.7 %. On the other hand, (21) isolates of S.aureus were tested for antibiotics sensitivity, indicating relatively high resistance to Azithromycin, 76.2%; Cefoxitin, 66.7% and Clathromycin, 62.0%. They also have relatively moderate resistance to Chloramphenicol, 47.6%; Ciprofloxacin, 42.9%, Doxycycline, 38.0% and relatively low resistance to Gentamycin, 19.0%; Tobramycin, 14.3%; Vancomycin, 9.5 % and Clindamycin, 9.5%.Copper oxide and oxalate nanoparticles were prepared successfully via soft chemistry route based on the thermal decomposition of oxalic precursors. They were obtained with a well - controlled morphology and particle size. These nanoparticles were characterized by using : X - ray diffraction (XRD) pattern analysis, Scanning Electron Microscope (SEM) and Fourier Transform Infra - Red spectroscopy (FT - IR). The antibacterial activity of the obtained copper oxide and oxalate nanoparticles against P.aeruginosa and MRSA were estimated by using Well Diffusion and Broth Dilution methods. The results showed that both types of nanoparticles have the ability to inhibit growth of the bacteria under study. The Minimal Inhibitory Concentration (MIC) and Minimal Bactericidal Concentration (MBC) of copper oxide nanoparticles against P.aeruginosa were found to be 1600 and 3200 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively. For MRSA, the MIC and MBC values of copper oxide nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 200 and 400 µg/mL respectively

التحــري عن سم الباتيولين والفطريات المنتـجــه له في بعض انـواع الفاكــهـه المجـفـفه والسـيـطره عليـه بايولوجيا Investigation for Patulin toxin producing from some fungi in dried fruits and its biological degradation

اسم المؤلف: سامي جبار اسماعيل الجدياوي
اسم المشرف: شذى علي شفيق هادي مهدي عبود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - الفطريات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسه في مختبرات دائرة البحوث الزراعية التابعة لوزارة العلوم والتكنولوجيا للتحري عن تلوث الفواكه المجففه ( المشمش - العنب) المعروضه في اسواق مدينة بغداد ومحافظة كربلاء بسم الباتيولين . اظهرت نتائج التحري عن سم الباتيولين في 21 عينه مختلفه من عينات (المشمش - العنب) المجففه اخذت من مناطق مختلفه من محافظة بغداد اضافة الى عينة من محافظة كربلاء وكانت جميع العينات المفحوصه ملوثه بسم الباتيولين وقد سجلت العينات الماخوذه من مناطق (عنب مجفف)كربلاءK و(مشمش مجفف) الشعلة D وشارع فلسطين C اعلى نسبة تلوث بلغت 30499.5) و2836.3 و1795.3 ) مايكروغرام /غم على الترتيب , في حين سجلت العينات الماخوذه من (مشمش مجفف) الحارثية I ومدينة الصدرS و(عنب مجفف) الحارثية G اقل نسبة تلوث بلغت حوالي (7.8 و11.7 (19.8 مايكروغرام /غم على الترتيب وتباينت درجة تلوث العينات بالفطريات اذ بلغت اعلى نسبة وجود على مستوى الاجناس كانت لجنس Aspergillus spp. حيث كانت نسبة وجوده 100% في عينة(عنب مجفف) الشعب H وبعدها عينات (مشمش مجفف) العطيفية N و(عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف) بغداد الجديدة U و(عنب مجفف) شارع فلسطين A والعلاوي J لنفس الجنس بنسبة (94.12 و94.44 و95.45 و95.56 و96.55)% على الترتيب . وفيما يخص لجنس Penicillium spp. فقد تراوحت نسبة وجوده في العينات من 0.0) - 46.15)% حيث سجلت اقل نسبة وجود في العينه (عنب مجفف) الشعب H 0.0% بينما كانت اعلى نسبة وجود في عينه (مشمش مجفف) كربلاء 46.15%. واظهرت نتائج التحري عن قابلية انتاج سم الباتيولين في 5 عزلات تعود الى A.flavus وA.fumigatus و3 عزلات من فطر P.expansum عزلت من عينات مختلفة هي (عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف)مدينة الصدر S و(عنب مجفف) العطيفية Z حيث ان فطر A.flavus وA.fumigatus لم ينتج سم الباتيولين نهائيا في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة مدينة الصدر والعطيفية انتج سم الباتيولين بعد مرور 5 ايام من تنيمته على الوسط المحفز لانتاج الباتيولين , في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة كربلاء انتج سم الباتيولين بعد مرور 15 يوم وسجلت العزله S اعلى قابليه على الانتاج بلغت 16.5 مايكروغرام/مل في وسط زرعي السائل GCA)) Glugose Czapek,s Apple في حين سجلت العزلة K اوطا قابليه على الانتاج بلغت (13) مايكروغرام / مل تحت نفس الظروف .اما الجانب الثاني من الدراسه فقد اظهرت نتائج ازالة السمية باستخدام المعزز الحيوي العراقي عند تركيز 0.03 ملغرام/مل في الوسط الزرعي السائل GCA الحاوي على الفطر المنتج لسم الباتيولين P.expansum K لمدة 14 يوم الى انخفاض تركيز سم الباتيولين الى 192.18مايكروغرام/مل مقارنة بمعاملة السيطرة ذات تركيز 325.01مايكروغرام/مل من سم الباتيولين , في حين لم يظهراي تركيز لسم الباتيولين عند فحصه بجهاز الـ High Performance liquid Chromatography (HPLC) عند التركيز 0.06ملغرام/مل من المعزز الحيوي العراقي تحت نفس الظروف السابقه. وفيما يخص فعالية استخدام تركيزين من خميرة Saccharomyce boulardii في ازالة سمية الباتيولين في الوسط الزرعي السائل GCA, استخدمت التراكيز( 108 و(1016خميرة/مل وفي كلا التركيزين تم ازالة السمية ولم يظهر اي تركيز لسم الباتيولين . | The results of Mycotoxin Patulin (PAT) detection in 21 samples of dried fruits (grape and apricot) collected from different locations at Baghdad city and one sample from Karbala governorate revealed that all tested samples were contaminated with PAT ,samples K , D and C which collected from Karbala ( dried grape) , Al - shoala (dried apricot) and Palestine Street (dried apricot) showed the highest contamination levels which recorded (30499.5, 2836.3 and 1795.3) µg/ml respectively , while the samples Al - Harthiya (I), Al - Sadr city (S) and Al - Harthiya (G) showed the lowest contamination levels which recorded (7.8 , 11.7 and 19.8) µg/ml respectively. The results also showed that Aspergillus spp. recorded the high percentage of occurrence 100% in sample H collected from Al - Shaab and in samples (N , K , U , A , J) collected from Al - Utaifiyya , Karbala , Baghdad al - jadeeda , Palestine Street and Al - Alawi , the percentage of occurrence is (94.12 , 94.44 , 95.45 , 95.56 , 96.55)% respectively. Also the percentage of Penicillium spp. occurrence percentage rated from 0.0 to 46.15% , samples dried grape which collected from Al - Shaab (H) recorded the lowest percentage of occurrence 0.0% , while sample apricot from Karbala (M) recorded the highest percentage 46.15% . The results of toxigenic ability of five fungal isolates include A.flavus and A.fumigatus and three isolates of P.expansum from three different samples include (K) Karbala (dried grape) , dried apricot of Al - Sadr city (S) and (Z) grape in Al - Utaifiyya . Regarding A.flavus and A.fumigatus were not produced PAT, while P.expansum isolate from S and Z recorded the ability to produce PAT after five days , while P.expansum isolated from K produced PAT after 15 days. The highest ability to produce PAT recorded in S 16.5 µg/ml, and the lowest ability in K 13 µg/ml. The second aspect of the present study was showed the ability of Iraqi probiotic at concentration 0.03 mg/ml to reduce PAT concentration in the culture medium Glucose - Czapeks Apple broth (GCA) containing of P.expansum K for 14 days which recorded 192.18 µg/ml comparing to control treatment 325.01 µg/ml while at concentration 0.06 mg/ml of Iraqi probiotic destroyed of PAT and there was no PAT appeared when examined in High Performance Liquid Chromatography (HPLC). However the results of test the ability of two concentrations of Saccharomyces boulardii (108 and 1016) yeast/ml in PAT detoxification from broth culture of (GCA) showed completely detoxification of Patulin

دراسة فسلجية وجزيئية للبكتريا Lactobacillus reuteri ATCC 23272 وتاثيرها التثبيطي على البكتريا المسببة لالتهاب المهبل Physiological and Molecular Study of Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and its Inhibitory Effect on the Bacterial Vaginosis

اسم المؤلف: سارة هيثم صديق النعيمي
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - البكتريا
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Bacterial vaginosis which is a common infection affecting the female genital tract, can be treated with different methods. One of these methods is the use of probiotic Lactic acid bacteria. The aim of this study was to evaluate the effects of two physiological factors (temperature and pH) on the growth and inhibitory action of probiotic Lactobacilli against the pathogenic Streptococcus agalactiae involved in bacterial vaginosis.A total of one hundred and six vaginal swabs were collected from Iraqi women patients affected with bacterial vaginosis, who attend Gynecological Department of Kamal Al - Samarraiy Hospital, Al - Qanat health care center, and private specialized clinics from October 2014 till March 2015, in order to obtain one hundred Streptococcus species. These swab samples were examined directly at the first. Isolated microorganisms were identified through microscopical, morphological, biochemical tests, and Vitek 2 compact system.The results showed that out of 243 bacterial isolates, 146 (60.08%) were detected as Gram - positive bacteria, whereas 97 (39.91%) were detected as Gram - negative bacteria. A hundred (68.49%) isolates of the Gram - positive bacteria were catalase - negative, while the rest 46 (31.51%) were catalase - positive.For all Gram positive, catalase negative bacteria, the results of the biochemical test and Vitek 2 compact system showed that the most frequent isolated microorganism was Streptococcus agalactiae 57 (57%), followed by Streptococcus faecalis 19(19%), Streptococcus sanguinis 13 (13%),Streptococcus salivarius 6 (6%), Streptococcus ovis 4 (4%), and Streptococcus suis 1(1%).The molecular method using the PCR technique was performed on the most prevalent species Streptococcus agalactiae to detect its virulence factors in order to prove its pathogenicity, the results revealed that, the HylB gene which is responsible for the production of hyaluronate lyase, appeared in 56 out of 57 isolates of S. agalactiae and the CylE gene which is responsible for the hemolysis of the red blood cells, appeared in 53 out of 57 isolates. These virulent isolates were involved in the physiological study.Lactobacillus reuteri ATCC 23272 was used in this study to investigate its effect as probiotic bacteria on the pathogenic bacteria (S. agalactiae). It was cultivated in MRS broth, adjusted to specific initial pH (3.5, 5, 6.5, 8), and at different temperatures of incubation (25°C, 30°C, 37°C, 44°C).The results revealed that the temperature of incubation and the initial pH of the culture medium effected significantly on both the growth rate and the antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272. The temperature 30 °C with the pH 5 were recorded as the best conditions for the antibacterial activity in which the zone of inhibition was (18.2 mm), while the temperature 25 °C with the pH 3.5 resulted in the lowest inhibition zone (0.05mm).The maximum growth rate with an O.D. 1.9297 nm of the L. reuteri ATCC 23272 was obtained at temperature. 30°C and pH 6.5, and the minimum growth rate with an O.D. 0.0002 nm were obtained at temperature 25 °C and pH 3.5.There was a positive correlation between the growth rate of the Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and the zone of inhibition.The optimal growth conditions were recorded in MRS broth, with an initial pH of 5 and a temperature of 30°C and this condition also had parallel effect on the maximum antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272 against S. agalactiae associated with bacterial vaginosis.

الكشف عن جينات البيتالاكتاميز واسعة الطيف لبكتريا الكلبسيلا المعزولة من عينات سريرية وبيئية في محافظة ذي - قار Detection of ESBLs in Klebsiella spp. Isolated from Clinical and Environmental Samples at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: زينب محمد عيدي اللامي
اسم المشرف: يحيى عبد الرضا عباس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة ذي قار - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed for isolation and identification of Klebsiella spp.from clinical and environmental samples and detection the prevalence of some extended spectrum β - lactamases (ESBLs) genes (bla CTX - M, bla CTXM1) in Klebsiella spp. Samples collected were included clinical samples ( Burns , wounds , urinary tract infections, respiratory tract infections, otitis media and vaginal infections ) and hospitals environments. A total of 554 (468 clinical and 86 environmental samples) during the period from October 2013 to March 2014 were collected. Growth on blood agar, MacConkey agar and E.M.B agar was identified by cultural, morphological and biochemical tests and confermated by API 20 E system which revealed that : 45 ∕ 554 ( 8,1%) gave positive growth for Klebsiella spp. as following : 2 ∕ 48 (4.1 %) fromburns , 7∕ 40 (17.5 %) from wounds, 29 ∕315 ( 9.2%) from urinary tract infections, 4 ∕ 25 (16%) from respiratory tract infections, 3 ∕86 (3,4%) from hospitals environments.All the 45 isolates of Klebsiella spp. were screened for their antibiotic resistance against 15 antibiotics of different classes using Kirby - Bauer disk diffusion method. The results showed that all the tested isolates were resistant to at least 6 antibiotics of which they were tested, hence the isolates were considered to be multidrug resistant.The results showed that all of the isolates were found to be resistant to β - lactam antibiotic (ampicillin and amoxicillin) Disk approximation test and not production of ESBLs by these isolates.Combined disk diffusion method was used for detection of metallo - β - lactamase - producing isolates , it was emplace each of imipenem and antibiotic with and without EDTA on Mueller - Hinton agar , because EDTA working to inhibit of metallo - β - lactamase . The results showed that there was no effect for EDTA on the diameter of inhibition zone in all isolates.All the 45 isolates were submitted to molecular detection of some ESBLs genes (bla CTX - M , bla CTX - M1) using PCR technique. The results showed that only 28 ( 62,2%) isolates were carried ) blaCTX - M or blaCTXM1) and 21 isolates were carried both genes (blaCTX - M and blaCTXM1).

تاثير حليب الابل في بعض المعايير الفسيولوجية في اناث الجرذان المختبرية Rattus norvegicus المعامله بالبنزين The Effect of Camel's Milk in Some Physiological Parameters of Female Rats (Rattus norvegicus) Treated with Benzene

اسم المؤلف: زينب محمد عباس الغزي
اسم المشرف: خالد كاطع الفرطوسي محمد عجة عودة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة ذي قار - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was conducted in Department of Biology, College of Sciences, University of Thi - Qar, Iraq to investigate the effect of camel's milk on some physiological parameters of female rats (Rattus norvegicus) treated with benzene which included (weight of body and internal organs, hematological and biochemical parameters). The study was included 48 female rats divided into 8 equal groups, 6 for each group, the control group (A) which treated orally with (5 ml /kg) of physiological solution (NaCl 0.9%) for 4 months, camel's milk group (B) which treated orally with (5ml/kg) camel's milk for 4 months, benzene group(1) (C) which injected (I.P.) with (0.2ml/kg) of benzene by two doses for each week for four months, benzene group(2) (D) which injected (I.P.) with (0.4ml/kg) of benzene by two doses for each week for four months, protection group (E) which injected with (0.2ml/kg) of benzene and treated with (5ml/kg) of raw camel's milk for four months, protection group (F) which injected with (0.4ml/kg) of benzene and treated with (5ml/kg) of raw camel's milk for four months, treatment group (G) which injected with (0.2ml/kg) of benzene and after the end of duration of injection treated with (5ml/kg) of raw camel's milk daily for 1 months, treatment group (H) which treated with (0.2ml/kg) of benzene and after the end of duration of injection treated with (5ml/kg) of raw camel's milk daily for one month, and identified the animal weights at the beginning and end of the experiment and after the end of the period experiment all rats were weight organs (heart, liver, kidneys and spleen) and took blood samples to measure the level of malondialdehyde MDA, Ceruloplasmin CP, Total Cholesterol TC, Triglyceride TG, height density lipoproteins HDL, low density lipoproteins LDL, very low density lipoproteins VLDL and the levels of ALT, AST and ALP. The current study showed significant decrease at (P≤ 0.05) in the weight of (body, heart and kidney), and the acidophil, RBCs, SUMMARY

تاثير المعززات الحيوية على الفئران المثبطة مناعيا بالبردنيزولون Effect of Probiotics on Prednisolone Immunosuppressed Mice

اسم المؤلف: زينب كاظم عبد
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لمعرفة دور FOXP3 في الفئران المثبطة مناعيا بالردنيزولون اضافة الى دور المعززات الحيوية في الجهاز المناعي للفئران البيضاء. البردنيزولون هو عقار مثبط مناعيا يستخدم لعلاج حالات الحساسية وامراض المناعة الذاتية. المعززات الحيوية هي كائنات حية تستعمل لتعديل الجهاز المناعي في الانسان والفئران. FOXP3 هو دليل للخلية التائية المنظمة وله دور في الاستجابة المناعية.لذلك استخدمنا في التجربة 30 فار مختبري ابيض ذكر قسمت الى 6 مجاميع كل مجموعة تضم 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 14 يوم : المجموعة 1 : جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالخميرة فقط. المجموعه 2 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام مجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعة 3 : جرعت فمويا ب0.4مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط. المجموعه 4 : جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالبكتريا فقط. المجموعه 5 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعه 6 : جرعت فمويا ب0.6مل من بكتريا Ss والتي تحوي (108×1) خلية\مل وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ارتفاع معنوي في العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء(10000.0 ± 275.4) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(7000 ± 145.07), واظهر العد التفريقي لها انخفاض معنوي في الخلايا اللمفية(23.0 ± 1.51) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((30.0 ± 1.65 وارتفاع معنوي في الخلايا العدلة(75.00 ± 3.59)مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (65.00 ± 2.31) وانخفاض معنوي في الخلايا الوحيدة(( 1.0 ± 0.06مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ±0.06) 3.0) وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة , حصل انخفاض معنوي في عملية البلعمه(15.0 ± 0.82) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(20.0 ± 1.4), وارتفاع غير معنوي في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة(40.0 ± 2.03) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (36.0 ± 1.1), وزيادة غير معنوية في تركيز خضاب الدم(13.3 ± 0.76) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((11.6 ± (0.54 وكذلك زيادة غير معنوية في الوزن الكلي للحيوانات المعامله بالعقار فقط (31.0 ± 1.2) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(30.0 ± 1.1) .واظهرت نتائج التجريع بالمعززات الحيوية (الخميرة والبكتريا) ارتفاع العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء ,واظهر العد التفريقي لها ارتفاع الخلايا اللمفية والوحيدة وانخفاض الخلايا العدلة وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة ,كذلك حصل ارتفاع في عملية البلعمة وارتفاع بسيط في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة . بينت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية في المجموعه المعاملة بالعقار فقط حصول فقدان بالشكل العام للعضو وعدم ظهور الحويصلات اللمفاوية وحصول تنخر في الطحال .واوضحت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجموعه المعامله بالمعززات الحيوية احتفاظ العضو بالشكل العام وحصول ارتشاح للخلايا اللمفية وتحفيز الحويصلات المفاوية داخل العضو.كما اظهرت نتائج التجريع الفموي للمعززات الحيوية بعد وقبل ومع حقن الدواء حدوث حالة تحسسن بالمؤشرات المناعية وكذلك حدوث حالة تحسن وتنشيط مناعي للحويصلات اللمفاوية للطحال والعقدة اللمفاوية. واظهرت نتائج الفحص النسيجي الكيميائي المناعي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجاميع المجرعه بالمعززات الحيوية والعقار ان لها نفس التعبير لل.FOXP3 اعتمادا على نتائج التجربة الحالية نستنتج ان المعززات الحيوية (الخميرة والبكتيريا) تمتلك قابلية على تعديل وتحسين تاثيرات العقار الجانبية على الاعظاء والمؤشرات المناعية وكذلك لها نفس التعبير لل.FOXP3 | Study have been done to see the role of FOXP3 in immunosuppressed mice using prednisolone in addition to the role of probiotic on immune system of albino mice. Prednisolone is immunosuppressive drug used to treat several allergic and autoimmune conditions. Probiotic is a live microorganisms used to modulate human and mice immune system.FOXP3 is Treg marker and have a role in immune system responses. Therefore we took 30 male albino mice were divided into 6 groups (five mice in each group) and treated daily for 14 days : Group 1 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days then injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 14 days. Group 2 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14days. Group 3 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days.Group 4 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days then injected intraperitoneally with(0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 14 days. Group 5 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days. Group 6 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days. Mice treated with prednisolone drug showed a significant increase in total leukocytes count (10000±275.4)cells\1ml.blood as compared with negative control (7000±45.07)cells\1ml.blood, and differential count of leukocytes showed non - significant decrease in lymphocytes(23.0±1.51)cells\1ml.blood as compared with negative control (30.0 ±1.65)cells\1ml.blood, a significant increase in neutrophils(75.00±3.59) as compared with negative control(65.00 ± 2.31), a significant decrease in monocytes (1.0±0.06)cells\1ml.blood as compared with negative control(3.0 ± 0.06)cells\1ml.blood and have no effect on basophils and eosinphils, a significant decreased in phagocytosis(15.0 ± 0.82) as compared with negative control (20.0 ±1.4) , no significant increased Pcv (40.0±2.03) as compared with negative control (36.0±1.1) ,no significant increased Hb (13.3±0.76) as compared with negative control(11.6 ± 0.54) , and no significant increase in total body weight (31.0 ± 1.2)g as compared with negative control (30.0 ±1.1)g. The result of group treated with probiotic show a significant increase in total leukocytes, lymphocytes count, phagocytosis and Hb & Pcv as compared with control group administrated by normal saline only. The histological sections of spleen and lymph node which was treated with prednisolone drug revealed lose the architecture, no lymphoid follicles and necrosis. While the section of spleen and lymph node treated with probiotic showed preservation architecture which contain lymphoid follicles and hyperplasia of lymphocytes. The result of groups treated with probiotic pre, post, together with prednisolone drug showed normalized the immunological and histological parameters to the normal condition as compared with group treated with prednisolone only. The immunohistochemical section for spleen and lymph node show the same expression of FOXP3 in mice treated with probiotic (yeast & bacteria) and prednisolone drug. According to the results obtained from this study it is concluded that probiotic (yeast and bacteria) have immunomodulatory effect against prednisolone in immune system of male albino mice and have the same expression of FOXP3

الكشف الجزيئي والبكتريولوجي لبكتريا Group B Streptococci (GBS) المحلية في بعض النساء العراقيات الحوامل

اسم المؤلف: زينب عدي حامد
اسم المشرف: نهاية حكمت زكي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • تم جمع مائة وتسعة وثمانين مسحة مهبلية من النساء الحوامل من مستشفى ابن البلدي ومختبر الصحة المركزي ومستشفى كمال السامرائي. حيث تم الحصول على ستة واربعين عزلة من بكتريا Streptococcus agalactiae خلال الفترة من شهر تشرين الاول 2013 الى شهر شباط 2014.• كانت الفئة العمرية للنساء المصابة ببكتريا S. agalactiae تتراوح بين (35 - 37) سنة حيث كانت نسبة الاصابة تصل الى 76.08%.• تم تشخيص جميع العينات مبدئيا بواسطة الطرق المظهرية من خلال الاوساط الزرعية blood agar وchromogenic agar واجري تاكيد التشخيص بواسطة VITEK SYSTEM 2 Identification وكذلك تم تشخيصها بالطريقة الجزيئية PCR للكشف عن جين 16S rRNA.• اجريت دراسة تحليلية مقارنة بين الطرق الثلاثة المظهرية والطريقة الجزيئية المستخدمة في الكشف عن البكتريا، وكانت طريقة التفاعل التضاعفي) (PCR افضل وسيلة للكشف عن S. agalactiae حيث تم تشخيص 46 عينة بواسطته بينما تم الكشف عن 30، 36، 37 عينة من قبل blood agar وchromogenic agar وsystem 2 VITEK على التوالي.• اجري فحص VITEK Antibiotic Sensitivity Test للكشف عن حساسية البكتريا للمضادات الحيوية المختلفة لجميع العزلات المشخصة، وكان اعلى معدل انتشار مقاومة لمضاد tetracycline بنسبة 65.2% وتليها 58.6% و45.6% لمضاداتerythromycin وclindamycin على التوالي.• تم فحص ثلاثة من الجينات التي تشفر لعوامل الفوعمة (sip، scpB، cfb) في جميع العزلات المشخصة، وكانت نسبة 97.8% من اجمالي العزلات تحتوي على الجينات الثلاثة المذكورة.• تم الكشف عن خمسة جينات لمقاومة مضادات Macrolide وكان معدل المقاومة 69.5% من اجمالي العزلات.• تم التحري عن جينات مقاومة لمثيلة الرايبوسوم (ermB، ermA\TR، ermC) في جميع العزلات المشخصة وكان جين ermB الاكثر وفرة بين العزلات بنسبة 64.04% ثم يليه جين ermA\TR بنسبة 23.09% وعلى الرغم من تغيير الظروف المستخدمة في تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز PCR)) لكن هذه الدراسة فشلت في تحديد جين مثيلة الرايبوسوم (ermC) • بينت نتائج التحري عن اثنين من الجينات المشفرة لنظام الدفق efflux pumps وهي (mefA، mreA) ان معدل انتشار الجينين بين العزلات هو 8.69% و69.5% على التوالي.• اظهرت نتائج الدراسة ان 14(% 30.4) من اجمالي العزلات لا يمتلك اي جين من جينات مقاومة الاريثرومايسين الخمسة.• بينت نتائج الدراسة ان عزلة واحدة من بكتريا S. agalactiae رقم) (V12 حاملة لاربعة انواع من جينات مقاومة الاريثرومايسين عدا الجين (ermC). | • One hundred and eighty nine vaginal swabs were collected from Ibn - Albalady Hospital, Central health Laboratory and Kammal Alsamaraie Hospital. Forty - six Streptococcus agalactiae isolates were obtained during October 2013 to February 2014.• The isolates were initially identified phenotypically by blood agar culture media and chromogenic culture media and further identification was performed by Vitek and by molecular methods by 16srRNA - based PCR. • A comparative analysis were performed between three phenotypic detection methods and molecular method by PCR were best tool for S. agalactiae detection which 46 isolates were identified while 37, 36, 30 isolates were detected by Vitek system, chromogenic agar and blood agar respectively.• Vitek Antibiotic susceptibility for different antibiotics were performed to all detected isolates, the highest prevalence of resistance was 65.2% toward tetracycline and followed by 58.6% and 45.6% for erythromycin and clindamycin respectively.• Three virulence - encoding genes (sip, scpB and cfb) were screened in all detected isolates, 97.8% of total isolates were contain the three mentioned genes.• Five macrolide resistance genes were screened and the resistant rate in total isolates was 69.5%.• Three ribosome methylation genes (ermB, ermA/TR, ermC) were screened in all examined isolates; the most prevalence gene was ermB with 63.04%, whereas 23.9% was the prevalence of ermA\TR gene and ermC not detected in any of examined isolates.• Two efflux pump genes (mefA and mreA) were screened and the prevalence rate was 8.69% and 69.5% respectively

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو بعض البكتريا المعزولة من اخماج الحروق The Effect of Watery & Alcoholic Plant Extracts of Citrullus colocynthis & Solanum nigrum On Growth of Some Bacteria Isolated from burn Infections

اسم المؤلف: زيد شاكر ناجي محمود الربيعي
اسم المشرف: ياض عبد الحسين دلول
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لثمار نباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli .تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل مستخلص ولكلا النباتين , اذ تبين نتائج الكشوفات الكيميائية لمستخلص الحنظل ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات . وان هذه المركبات لها القابلية على الذوبان في الماء , اما المستخلص الكحولي لثمار الحنظل فيحتوي ( بالاضافة الى ما ذكر ) على مركبات راتنجية وكومارينات وزيوت طيارة , وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية.و بالنسبة الى مستخلصات ثمار عنب الذيب فقد اظهرت نتائج الكشوفات الكيميائية ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , فينولات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات , واما المستخلص الكحولي فانه يحتوي على المركبات الفعالة نفسها الموجودة في المستخلص المائي بالاضافة الى الراتنجات .لدراسة تاثير المستخلصات النباتية لثمار نبات الحنظل وثمار نبات عنب الذيب في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق , تم تحضير نوعين من المستخلصات ولكلا النباتين وهما : المستخلصات المائية والمستخلصات الكحولية .بالنسبة الى مستخلصات نبات الحنظل كان المستخلص المائي اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 480 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الكحولي وللتركيز نفسه ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11 ) ملم وعلى التوالي.اما بالنسبة الى مستخلصات نبات عنب الذيب كان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي على الانواع البكتيرية بتركيز ( 480 ملغم/ مل ) وبمعدلات اقطار تثبيط ( 16.33 , 20.66 , 18 , 16.33 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , وبمعدلات تثبيط ( 16.33 , 20 , 15.33 , 15.33 ) ملم على التوالي عند التركيز نفسه .كانت البكتريا St. aureus ( الموجبة لصبغة كرام ) اكثر الانواع البكتيرية تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا Klebsilla spp. اكثر الانواع البكتيرية مقاومة لفعل المستخلصات النباتية .وبما ان المستخلص المائي هو اكفا من المستخلص الكحولي لنبات الحنظل, وان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , فقد تم المزج بين المستخلصين بنسبة 1 : 1 ودرس تاثير المزيج على البكتريا قيد الدراسة , وقد تبين ان خلط المستخلصين معا لم يعط اي تاثير ضد البكتريا . | This study was done to determine the effect of watery and alcoholic extracts of two plants : Fruits of Citrullus colocynthis and Berries of Solanum nigrum on growth of bacteria isolated from infected burns which are : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli .Evaluation of active ingredients found in each extract for both plants determined.The biochemical analysis revealed that watery extract of Citrullus colocynthis contains : Alkaloids, Glycosides, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones , while the alcoholic extract contains : (in addition to the above mentioned compounds ) Coumarines, Resins and Volatile oils.The biochemical analysis of the watery extract of Solanum nigrum showed that it contains : Alkaloids, Glycosides, Phenols, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones, while the alcoholic extract contains the same active materials in addition to Resins.The effect of watery extract of Citrullus colocynthis on the bacterial growth revealed that at a concentration of 480 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) mm for Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli respectively , when compared with alcoholic extract which were ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11) mm respectively.The study also showed that staphylococcus aureus ( gram positive ) bacteria is most sensitive to plant extract's than the gram negative bacteria , while Klebsilla spp. were most resistant to plant extracts than the others.Because water extracts of Citrullus colocynthis were more effective than the alcoholic extracts , while alcoholic extracts of Solanum nigrum were more effective than watery extracts.A mixture of both extracts was prepared in a proportion of 1 : 1 wt : wt and used to test it's effect on the studied bacteria. No effect have been detected therefore it's useless to use the above mentioned mixture in treatment.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

اسم المؤلف: رؤى عبد السادة جبار
اسم المشرف: مهند محمد نوري المفتي هادي مهدي عبود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض السكري النوع الثاني لمرضى عراقيين The Association of Glutathione - S - Transferase (GSTP1) Genetic Polymorphism in Iraqi Patients with Diabetes MellitusType2

اسم المؤلف: رغد حميد رشيد
اسم المشرف: بتول علي شهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة لمعرفة ارتباط جينات ازالة السمية لمتعدد النمط الوراثي GSTP1في ظهور مرض السكري النوع الثاني. شملت الدراسة 110 عينة دم لافراد عراقيين. 60 فرد اشخاص مصابين بداء السكري النوع الثاني مشخصين حسب المركز الامريكي للسكري وتراوحت اعمارهم بين (32 - 83 ) سنه اختيروا من مركز السكري التابع للجامعة المستنصرية المعالجين من ارتفاع سكر الدم.50 فرد اصحاء اختيروا كمجموعة سيطرة. خذت عينات من البلازما والدم. عينات البلازما شملت قياس المؤشرات السريرية للمرضى والسيطرة تضمنت مستوى الكلوكوز بالدم , الكوليسترول الكلي ,الدهون الثلاثية , مستوى اليوريا, الدهون ذات الكثافة العالية , الدهون ذات الكثافة الواطئة , الدهون ذات الكثافة الواطئة جدا ,بالاضافة الى كتلة الجسم وضغط الدم. اضافه الى تقييم ارتباط هذه العوامل مع تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1. الدراسة الجزيئيـة شملت استخلاصDNA واستخدام التضاعـــف التسلسـلي (polymerase chain reaction)و تباين اطوال قطع الدنا المقيدة (Restriction Fragment Length Polymorphism) للتحري عن التعدد الوراثي لجينات GSTP1 لجميع افراد هذه الدراسة.الدراسة الجزيئية تمت في مختبر البيولوجي الجزيئي /قسم علوم الحياة/ كلية العلوم للبنات. ظهرت النتائج ان المؤشرات السريرية (العمرAge, الجنسSex , كتلة الجسم body mass index, نسبة اليوريا في الدمblood urea , ضغط الدم الانبساطيdiastolic blood pressure والانقباضي systolic blood pressure والبروتينات الدهنية عالية الكثافة High Density Lipoproteins ) في كلا من المرضى والسيطرة لم تختلف معنويا بينما كان مستوى الكلوكوز بالدم fasting blood sugar في المرضى (184.36±7.64) mg/dl تتراوح ما بين ((341 - 100 اما في مجموعة السيطرة فقد كانت (96.06± 3.72 )mg/dl وتراوحت ما بين ((115 - 83 وكان الفرق معنويا .p< 0.00 اظهرت النتائج ان كلا من مستوى الكوليسترول الكلي((Total Cholesterol ومستوى الدهون الثلاثية (Triglyceride) في المرضى كانت ,184.56±68.66) mg/dl (161.95 ± 10.28 على التوالي واما في مجموعة السيطرة فقد كانت 98.41±9.00) mg/dl, 118.16 ± 7.11) على التوالي وكان الفرق معنويا.p<0.00 وكذلك اظهرت النتائج ان كلا من مستوى البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (Low Density Lipoproteins) ومستوى البروتينات الدهنية ذات الكثافة الواطئة جدا في المرضى كانت,106.00 ± 5.01) mg/dl, 31.58 ± 2.10 ) على التوالي واما مجموعة السيطرة فقد كانت 91. ± 4.90), (22.86 ± 1.25وكان الفرق معنويا p<0.000. نتائج التحري عن تعدد النمط الوراثي لجينات GSTP1 وتوزيعه ضمن مجموعات الدراسة اظهرت ان النمط الوراثي البري Ile/Ile والنمط الوراثي الهجين Ile/Val كانا مختلفين معنويا في مجموعة المرضى (60%, 36.67%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (68%, 32%) وكان الفرق معنوياp<0.000 . النمط الوراثي المطفرVal/Val ظهر في المرضى فقط وكان بمعدل (3.33%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0.00%) وكان الفرق معنويا p<0.000. استنادا الى النتائج المذكورة سابقا فان GSTP1 من الممكن ان يكون له دور مهم في امراضيه السكري النوع الثاني بينما لم يظهر تاثيره على مؤشرات الدهون. | This study was carried out to investigate the relationships between the T2DM patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1, and measurement of some clinical parameters of patients and controls. The study included 110 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with Type2 diabetes were diagnosed according to the American Diabetes Association criteria (American Diabetes Association, 2007); their age range were between (32 - 83) years selected from those attending the National - Diabetes Center/ AL - Mustansiriya - University for treatment with history of hyperlipidemia and hypertension. Fifty individuals healthy also included as control group. Sera and blood were used as samples. The measured parameters in serum included (biochemical testes) : Fasting Blood Sugar (FBS), Total Cholesterol (TC), Triglycerides (T.G), Blood Urea (BU), High Density Lipoprotein (HDL), Low Density Lipoprotein (LDL) and Very Low Density Lipoprotein (VLDL). Additionally, body mass index (BMI) and blood pressure (BP) were determined. Moreover, the correlation between genotyping of Glutathione S - Transferase P1 and all studied parameters was carried out. Molecular studies involved DNA extraction and PCR (Polymerase Chain Reaction) - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) was carried to detect the genetic polymorphism of glutathione - S transferase gene Pi class for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department Sciences/ College for women. The results showed that (age, sex, body mass index, blood urea diastolic blood pressure, systolic blood pressure, high density lipoproteins) for patients and control group were not significant while for the level of fasting blood sugar was (184.36±7.64) mg/dl, ranging from (100 - 341) in patients while in the control group it was (96.06±3.72) mg/dl and ranged between (83 - 115) and it was a significantly difference (P < 0.000).The results showed that total cholesterol and Triglycerides in patients (184.56±68.66 mg/dl, 161.95 ± 10.28 mg/dl) respectively were higher significantly than in controls (98.41±9.00, 118.16 ± 7.11) mg/dl (P <0.001). The data also showed that both of Low density lipoproteins and Very low density lipoproteins in patients were (106.00 ± 5.01 mg/dl, 31.58 ± 2.10 mg/dl) respectively and highly significantly difference (P < 0.001) than in controls (91.27 ± 4.90 mg/dl, 22.86 ± 1.25 mg/dl)(P <0.001) respectively. The results of genetic polymorphism of GSTP1 distribution among the studies groups showed that wild type Ile/Ile and heterozygous Ile/Val were higher significantly between patients (60 %, 36.67 %) and in controls (68 %, 32 %) respectively. The homozygous mutant Val/Val genotype was elevated in the DM patients only and it was (3.33%) compared to controls (0.00%). According to data mentioned above showed that GSTP1 genotype polymorphisms may play an important role in the pathogeneses of type2 diabetes mellitus while its effect on all lipid profile indicators did not show any significant difference.

تحضير وتوصيف الجسيمات الدهنية النانوية وربطها مع مستضد طفيلي Leishmania donovani Preparation and characterization of nanoliposome and entrapment of Leishmania donovani antigens

اسم المؤلف: روعة نجم عبد الله الخميسي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي علي عبد الرحمن الشيخلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعتبر استخدام الجزيئات النانوية التي تحمل المستضد صناعيا والقابلة للتحلل الحيوي كجزيئة مساعدة من المواضيع المهمة في تحضير اللقاح ومن الخطوات المهمة في السيطرة على تحرر المستضد لتحسين الاستجابة المناعية . تتكون الجسيمات الدهنية النانوية من مركبات طبيعية والتي تشجع بدورها الباحثين على استخدامها كمساعدات نانوية طبيعية . في هذه الدراسة , استخدمت الجسيمات الدهنية النانوية كمساعدات لقنص المستضدات الذائبة المستخلصة من طفيلي اللشمانيا الاحشائية كخطوة اولى باتجاه تحضير لقاح ضد اللشمانيا . تم تنشيط الطفيلي من خلال تنميت طور الطفيلي ) 104 promastigote / ml ) في الوسط الزرعي ( RPMI ) في درجة تحضين 23 م0 ولمدة اربعة ايام . اعتمدت اللقيحة بعمر 4 ايام وبنسبة 104 خلية في المليلترالواحد في تلقيح وسط (SNB9 ) لانتاج الكتلة الحيوية والتي تستخدم لاستخلاص المستضد . تم استخلاص المستضدات الذائبة من خلايا الطفيلي بعد اربعة تمريرات في نفس الوسط الزرعي ليتم بعدها قنصها في الجسيمات الدهنية النانوية والمحضرة انيا . حضرت الجسيمات الدهنية النانوية من ( mM Phosphatidylcholine 4 ) ) 2.2 mM Cholesterol ) و(mM Phosphatidylethanolamine 0.55) وبنسبة 1 : 2 : 7 ضمن جميع طرق التحضير المختلفة وتم دراسة توصيفها الفيزياوي والكيمياوي باستخدام (SEM ) و(AFM ) و( FTIR) و(Zeta Potential ) لتقدير حجم وشكل وشحنة الجسيمات وتحديد المجاميع الكيمياوية المتكونة .من النتائج لوحظ ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تحمل شحنة سالبة ولاتظهر تكتل بعد عملية التحضير ولا تزيد اقطار الجسيمات الناتجة عن 75 نانوميتر وتحمل مجاميع كيمياوية (PO2 ) و(CH2) و(CH3 ) . تم احتساب كفاءة قنص (EE) الجسيمات الدهنية النانوية للمستضدات الذائبة وكانت النسبة المئوية لكفاءة القنص هي 62% و50% و27.5 % للجسيمات المحضرة بطريقة الكلوروفورم والسيفادكس G25و السيفادكس G75 على التوالي . من جانب اخر , تم دراسة الثباتية للجسيمات الدهنية النانوية القانصة للمستضدات بدرجتي حرارة تخزين 4 و37 م0 واظهرت النتائج ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تمتلك درجة ثباتية كان مقدارها 32% في درجة حرارة 4 م0 و16% في درجة حرارة 37 م0 خلال فترة تخزين 12 يوم | The use of biodegradable nanoparticles as vaccine adjuvant with entrapped antigens represents an exciting approach for controlling the release of vaccine antigens and optimizing the desired immune response . Because of the natural components of nanoliposomes , we investigated the ability of prepared nanoliposomes , as a nanoadjuvant , to entrap soluble Leismania donovani antigens (SLAs) . The study was include preparation of SLA by parasite reactivation was carried out when inoculated into Rosewell park memorial institute media (RPMI) and incubated at 23 ̊ C for 4 days . Inoculum (104 promastigote / ml) of 4 days was used to inoculate modified medium of Saline - Neopeptone and Blood agar ( SNB) to produce promastigote mass . SLAs were extracted from the promastigotes ghost membrane after fourth passages of subculturing in SNB9 .The extracted SLAs then entrapped in nanoliposomes prepared freshly .Lipids mixture of 4mMPhosphatidylcholine, 2.2mM Cholesterol and 0.55mM Phosphatidylethanolamine in a ratio of 7 : 2 : 1 was depended in two nanoliposome preparation methods ; Chloroform injection and size exclusion chromatography . Physio - chemical characterizations of prepared nanoliposomes was performed by using Scanning Electron Microscope (SEM) , Atomic Force Microscope (AFM) ,Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Zeta Potential assays to determine the size , morphology , chemical active group and charge . Nanoliposomes prepared by chloroform injection method revealed non aggregate of negative nano vesicles with diameter of less than 75nm and PO2, CH2 and CH3 groups. The nanoliposomes entrapment efficiency (EE) to entrap SLAs was determined. The percentage of EE was 62, 50 and 27.5of SLAs entrapped nanoliposomes prepared by chloroform injection, Sephadex G25 and SephadexG75 , respectively .Moreover, stability of SLAs entrapped nanoliposomes was examined at 4 and 37 ̊ C storage temperature. SLAs entrapped nanoliposomes , prepared by chloroform injection method ,shown higher value of EE( 32 % ) at 4 ̊ C and(16%) at 37 ̊ C after 12 days of storage .

دراسة تشخيصية ووبائية لطفيلي المقوسة الكوندية لطلبة جامعة ذي قار باستعمال تقنيتي الاليزا Toxoplasma gondii وتفاعل سلسلة البلمرة ذو الوقت الحقيقي Diagnostic and Epidemiological Study of Toxoplasma gondii for Students of Thi - Qar University by ELISA and Real - Time PCR Techniques

اسم المؤلف: رباب علي شناوه الموسوي
اسم المشرف: بسعاد عقرب العبودي منال بادي التميمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة ذي قار - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: Toxoplasma gondii is a unique intracellular parasite, which infects a large proportion of the world, population, but clinically uncommonly causes significant disease. The present study was performed for the first time in Thi - Qar province to estimate the prevalence of toxoplasmosis among university students. Blood samples were collected from 319 (111 males and 208 females) apparently healthy students, they have ages between (18 - 42) years attended from different colleges of Thi - Qar university (students of morning and evening study), during the period from October 2013 to April 2014.Enzyme linked Immunosorbant Assay (ELISA), was used to evaluate the presence of anti - Toxoplasma IgM and IgG antibodies and detection of B1 gene of T.gondii DNA by Real - Time Polymerase Chain Reaction (RT - PCR).The results indicated that 21.94% of students were exposed to positive for anti - Toxoplasma antibodies, 5.33% of them had IgM, 11.91% had IgG, and 4.70% had both IgM and IgG. Statistically, they were significant difference between them.There were a significant difference between males and females in total rate but not significant of antibodies pattern in them, which recorded 7.52% of males and 14.42% of females were positive for anti - Toxoplasma antibodies.The study demonstrated that no significant difference in infection percentages between colleges where students studied, although the highest seropositivity students was 47.83% in education sports college whereas it did not score any infection with toxoplasmosis in College of Education for Pure Science .The current study also showed that the highest positive percentage with T.gondii of male students was 28.57% in College of Engineering while the highest percentage with T.gondii of female students was 30.43% in College of sports education.The present study revealed that the acute infection of toxoplasmosis which presented IgM and both IgM and IgG was high at small age youngstudents (18 - 22) years while the chronic infection which presented IgG was high at old students (38 - 42) years.The present study demonstrated that seroprevalence of toxoplasmosis was significantly associated with close contact with cats. Although more students in the positive sample group eating undercooked meat but not significant difference between those 36.13% and other students who did not have this habit 13.5% has been discovered.The results showed the highest positive percentage samples at middle socioeconomic level was 24.10% while the lowest percentage at good socioeconomic level was 19.60% .The results showed that the highest positive percentage samples 31.0% at Refaee district whereas the lowest percentage was 19.78% as noticed at Naserya district.The present study demonstrated that seroprevalence of toxoplasmosis was significantly associated with presence of clinical symptoms (fever, headache, malaise, influenza) that may have a relationship with toxoplasmosis of infected students when compared with not presence clinical symptoms of those (p<0.05) they recorded 18.57% and 81.43% respectively.The present study revealed an association between blood group system and Toxoplasma infection with highest prevalence among samples of blood group A+ 30.65% and lowest prevalence in samples of blood group B+ 17.44% .The current study evolutes the rate of some blood parameters, in infected and non infected students, there was no significant difference observed in mean hemoglobin level (Hb), total count of leukocytes (WBCs), neutrophilis, lymphocytes, monocytes and basophilis numbers in both student . While significant differences were observed in mean of eosinophils number of infected students was more than number of non infected students.Moreover, mean of lymphocytes number recorded significant differences between infected and non infected females only.Besides the serological diagnosis of T.gondii, Real - Time PCR (RT - PCR) technique was used to confirm the infection with T.gondii by detection B1 gene of T.gondii DNA in the blood of students. Out of 319 students only 6.26% showed positive for toxoplasmosis among those 2.50% were males and 3.76% were females. The positive result in RT - PCR analysis were distributed on the patterns of the anti - Toxoplasma antibodies by ELISA test , Any positive blood samples with IgM, IgG and both IgM and IgG respectively have not been found whereas 20 positive cases of no anti - Toxoplasma antibodies.Real - Time PCR test in student's blood has advantages in detection of recent or active toxoplasmosis

دراسة تاثير هرمون النمو على بعض المظاهر الفسيولوجية لقصار القامة في العراق

اسم المؤلف: راوية محمود يوسف السلامي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري هناء علي عبد الجبار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يمثل نقص الافراز الداخلي لهرمون النمو السبب الاكثر شيوعا في احداث قصر القامة في الاطفال ومرتبطا" بالعديد من التبعات المرضية الفسلجية. ان المفاهيم الاساسية لاثر النقص الهرموني تتاتى من الدراسات السريرية, المناعية البايوكيمياوية, والوراثية والتي تشير الى اهمية دراسة العوامل المناعية والبايوكمياوية في تفسير هذا الاثر ,اضافة الى ان نقص هرمون النمو لا يرتبط بتبعات طبية جدية فحسب وانما يؤثر نفسيا واجتماعيا في مثل هؤلاء الاطفال وعوائلهم, مما يتطلب ايضا ايضاح الدور العلاجي في الحد من الاستجابات الفسلجية المفرطة التي تلعب دورا محوريا في تراجع نمو هؤلاء الاطفال. ولندرة الدراسات العراقية في هذا المجال وبهدف تطوير استراتجيات الادارة العلاجية الناجحة والذي يسهل من خلال فهم الجوانب المناعية والايضية لنقص هذا الهرمون.لقد كانت الواسمات الورمية (مستضد المسرطن الجنيني CEA, البروتين الحميلي نوع الفا AFP, مستضد الكاربوهيدرات CA - 125), هرمون الانسولين, فايبرنوجين البلازما, اضافة" الى نسبة الدهون والكالسيوم في المصل, الطول,الوزن المرشحة لمثل هذه الدراسة علاوة على ذالك اهتمت الدراسة ايضا" بتقييم الاستجابة التحفيزية لهرمون النمو بواسطة الكلوندين. اجريت هذه الدراسة المستقبلية في المستشفيات التعليمية/ حماية الاطفال - بغداد على 49 مريضا" عراقيا" مصابا" بقصر القامة (37 ذكر, 12 انثى), قورنوا مع 20فردا"من الاطفال الاصحاء كمجموعة ضابطة, للفترة من تشرين الاول 2007 ولغاية اب 2008. اجري فحص مقايسة الماز المناعي للانزيم المرتبط ELISA لتقييم الجوانب المناعية الفسلجية(هرمون النمو, الواسمات الورمية,هرمون الانسولين, الفحص الالي اليدوي للفايبرنوجين , الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير مستويات الدهون{الكوليسترول T - C ,ال_xFFFF_لسريد الثلاثي TG ,البروتينات الشحمية (عالية الكثافة (HDL , (واطئة الكثافة (LDL, (واطئة الكثافة جدا (VLDL (اضافة لنسبة HDL T - C/} والكلسيوم في المصل) وحساب الطول نسبة" للعمر معبرا عنه بالوحدة ,Z كذالك الوزن عبر عنه بحساب معدل كتلة وزن الجسم BMIZ لجميع افراد مجموعتي الدراسة.اظهر الروز الكمي لوسيط تركيز هرمون النمو(GH) مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل ان مستوى هذا الهرمون في الاطفال قصار القامة (1.4) في السيطرة (3.7), اما بعد التحفيز فقد كان في المرضى (5.1)و في السيطرة (10.9). وكانت هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين كل من مجموعتي المرضى ومجموعة الاصحاء سواء" قبل او بعد التحفيز. اظهر الكلوندين فعالية ممتازة في التفريق بين المرضى والاصحاء من جهة وفي التقييم الاولي لنقص هرمون النمو في الاطفال قصار القامة من جهة اخرى.ظهر الوسيط الحسابي لتركيز CEA مقدر" بال مايكرو غرام لكل مل من المصل ان مستواه لدى المرضى (1.4) اعلى مما عليه في الاصحاء (0.9) هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين ومن الممكن ان تعد مؤشرا مناعيا التهابيا متعلقا بجوانب مرضية لنقص الدور الايضي للهرمون . بعد فترة 9 اشهر من العلاج بدا هذا المستوى المرتفع يميل بعض الشيء نحو الانخفاض (1.38) وان كان على نحو ضئيل لكنه معنوي مقارنة بالمرضى انفسهم قبل العلاج, على الرغم من ذالك بقت الفر وقات معنويا عالية بين المجموعتين. فيما يخص المتوسط الحسابي لتركيز CA - 125 (مقدر" وحدة لكل لتر) اعلى قليلا" لدى المرضى (10.8) من السيطرة (9.2), وبدا هذا الارتفاع البسيط يميل للانخفاض بعد العلاج (9.7), بالرغم من ذالك الاختلافات لم تكن ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين. اما المتوسط الحسابي لتركيز AFP مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل لم يؤشر اي فرق معنوي بين المرضى سواء قبل العلاج (1.4) او بعد العلاج (1.3) بالمقارنة بافراد المجموعة الضابطة (1.3) .التاثير المعاكس للانسولين تحقق من خلال التقدير الكمي لتركيز الانسولين (مايكرو وحدة دولية لكل لتر) عند الصيام حيث اظهر المتوسط الحسابي للبيانات قبل العلاج عدم وجود فرو قات معنوية بين المرضى(8.1) والمجموعة الضابطة (8.3), اثناء المتابعة لفترة العلاج ارتفع مستوى تركيز الانسولين معنويا (17.4) مقارنة بافراد المجموعة الضابطة من جهة وبين الحالة قبل العلاج من جهة اخرى.اوضحت النتائج الاحصائية لوسط تركيز الفايبرنوجين مقدرا" بوحدة الملغرام لكل لتر من البلازما بواسطة الطريقة الالية اليدوية ارتفاعا" معنويا" لدى المرضى قبل العلاج (282.9) مقارنة" بالسيطرة (265.4), ظهر ان تركيزه ازداد اكثر بعد العلاج (361.1) وبدت الفر وقات معنوية" اكثر مما كانت عليه مقارنة بالسيطرة من ناحية وبالمرضى انفسهم قبل العلاج من ناحية" اخرى.جانب اخر مهم يوضح الدور الفسلجى الايضي لهرمون النمو باستخدام الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير تركيز مستوى الدهون والكالسيوم (بوحدة الملي مول لكل لتر من المصل) وكانت البيانات موضحة لاثر النقص الهرموني لدى هؤلاء المرضى. حيث ان الفرو قات كانت معنويا" عالية بين المجموعتين في مستوى دهون المصل كما اظهر المتوسط الحسابي لعينة المرضى {T - C=4.1 , TG=1.5 ,LDL=2.5 , VLDL=0.7 , الوسيط الحسابي TC/HDL=4.22 اما HDL فقد كان معنويا منخفض = 1 { مقارنة بالسيطرة {T - C=9.3 , TG=1 ,LDL=1.8 , VLDL=0.5 , اما HDL فقد كان = 1.6, المتوسط الحسابي TC/HDL=2.35 { طرا بعد العلاج الهرموني تحسنا" معنويا" عاليا" مقارنة بما كانت عليه الحالة قبل العلاج كالاتي {T - C=3.6, TG=1.2, LDL=1.6, VLDL=0.5, اما 1.5=HDL, والمتوسط الحسابي TC/HDL=2.31}.اظهر التحليل الاحصائي ان البيانات الاولية لوسيط مستوى كالسيوم المصل تشير لانخفاض طفيف لدى المرضى(2.2) قبل العلاج, مقارنة" مع السيطرة (2.3). في حين ظهرت الفرو قات ذات اهمية معنوية اثر العلاج الهرموني حيث انخفض متوسط تركيزه الى (2). العلاج الهرموني ساهم معنويا (P<0.001) في تحسين {HAZ= - 2.9 و{BMIZ=0.7 لدى قصار القامة, مقارنة بما كانوا عليه قبل العلاج {HAZ= - 3.7 و{BMIZ= - 1.1, لكن عموما لازالت الفرو قات ذات اهمية معنوية في تفريقهم عن مجموعة السيطرة {HAZ= 0.2 . {BMIZ=0.3 بينت تحليلات الحسابات الاحصائية ان قيم القطع المثلى من الممكن ان تكون ذات اهمية في تفريق المرضى قصار القامة بسبب نقص هرمون النمو عن الاصحاء, وفي ذات السياق من الممكن ايضا" ان تساعد في توقع النقص الهرموني لديهم, ان كانت قيم القطع المثلى للمتغيرات المختبرة كالاتي {تركيز GH بعد التحفيز بالكلوندين اقل من 10.6 , CEA اعلى او مساوي ل 0.95 , وان كان مستوى الدهون في المصل اعلى من 3.04 ل TC/HDL , 2.1 LDL , 1.2 TG , 0.4 VLDL واقل من 1.4 HDL , واقل من 0.72 BMIZ }.نستنتج من هذه الدراسة ان العديد من الاستجابات المرضية والاختلال الايضيي يبدو بوضوح متعلقا" بنقص هرمون النمو وان العلاج الهرموني يساهم في تحسين الوضع المناعي والفسلجي لهؤلاء الاطفال. بشكل عام استخدام هرمون النمو امن نسبيا", بالرغم من ذالك GH يمتلك اثار جانبية محتملة قوية , لذا مثل هؤلاء المرضى لابد ان يراقبوا عن كثب وبصورة" دورية اثناء العلاج.بعض المتغيرات المدروسة مثل CEA ومستوى الدهون والفايبرنوجين اضافة الى BMIZ يمكن ان تساهم في التقييم الاولي والى حد معين من الممكن ان تساهم في دعم تشخيص نقص هرمون النمو .علاوة" على ذالك من المهم الانتباه الى الناحية الغذائية ودعم نمو مثل هؤلاء الاطفال بالكالسيوم اثناء العلاج اضافة للعناصر المغذية الاخرى الضرورية لنموهم. | Growth hormone deficiency (GHD) is the commonest endocrine disorder presenting with short stature (SS) in children, it is associated with several pathophysiological consequences, which has not yet elucidated. The important clues have come from clinical, immunobiochemical and genetic studies of GHD which have suggested an importance for the immunobiochemical factors in the etiology of this pathological consequences, and showed that GH - replacement therapy (GHRT) is recommended for the determination of the exaggerated physiological responses that play a crucial role in children growth retardation, and because of GHD not only has very serious medical consequences but also has a major psychological and social impact on children and their families, in addition to that a little is known about GHD pathological features, therefore; the development of successful therapeutical management strategies to such children are facilitated by the understanding of the GHD pathological influences.Tumor markers antigens (Carcinoembryonic antigen CEA, Alpha fetoprotein AFP, Carbohydrate antigen 125 CA - 125), insulin hormone, plasma fibrinogen, are primary candidates for this study, in addition, lipid profile, serum calcium (Ca), height and weight expressed as Z score {height for age (HAZ), body mass index (BMIZ)}, the study was also concerned with the evaluation of GH stimulation by using clonidine. This prospective study was carried out in 49 Iraqi, children, SS patient groups (37 male, 12 female) they were regularly attending the Welfare Teaching Hospital / children protective/ Baghdad were studied. The diagnosis has been well - established, based on clinical, immune - biochemical, and genetic criteria. An ethnically matched, apparently healthy control group (n=20) aged 13.5±3.3 years (mean ±SD) was also involved through Oct. 2007 to Aug 2008. ELISA tests for GH, CEA, CA - 125, AFP, insulin, and manual automated test of plasma FI and enzymatic colorimetric assay for serum lipid profile and Ca were carried out on all studied groups.Concerning the GH quantitative assay for serum median concentration (ng/ml) of baseline and after clonidine stimuli test revealed significant (p<0.001) differences between the study groups, baseline value was significantly lowered(1.4) in SS GHD cases compared to controls (3.7), after stimulation GH value was also lowered among SS GHD cases (5.1), than in controls (10.9). Clonidine test showed an excellent discriminating ability, between the two groups, and in initial assessment of GHD in SS children.A serological tumor markers quantitative immune assays, for serum median CEA concentration (µg/L), revealed that; baseline value was significantly (p<0.006) higher among GHD cases (1.4) than in controls (0.9), this elevated value tends to slightly decreased after treatment, although, still significantly higher among GHD cases (1.38) compared to controls, this result may be indicatives of the inflammatorycondition associated with GHD. CA - 125 baseline mean value (U/L) was slightly higher among GHD patients (10.8) than controls (9.2), a slight insignificant reduction occurred after treatment (9.7) compared to baseline value.AFP serum mean value (ng/ml) revealed no significant differences at baseline among GHD cases (1.4) compared to controls (1.3), after GHRT there were also no significant differences in GHD cases (1.3) compared to controls and baseline values.The contra insulin effect of GH achieved by quantitative determination of fasting serum insulin, baseline data observed in mean concentration (µIU/L) showed no significant differences among GHD cases (8.1) in comparison with controls (8.3). After treatment duration(9months) fasting serum insulin was significantly(p<0.001) elevated among GHD cases (17.4) compared to controls and to its baseline values. Manual automated quantitative assay for plasma FI mean concentrations (mg/dl) revealed that; baseline FI was significantly (p<0.049) higher among GHD patients (282.9) than in controls (265.4), this elevated value was fatherly increased after treatment (361.1) (p<0.001) in GHD patients. Another important aspect of GHD pathophysiological consequences on metabolism observed by the enzyme colorimetric method, for serum lipid profile mean value (mmol/l) , the data shown to be relevant to GHD in SS children; baseline lipid profile was significantly (p<0.001) higher among GHD cases {(T - C=4.1), (TG=1.5), (LDL - C=2.5), (VLDL - C=0.7) and median value of (T - C/HDL - C=4.22), whereas mean value of serum (HDL - C was significantly lowered =1)} than in controls {(T - C=3.9), (TG=1), (LDL - C=1.8), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.35) and (HDL - C=1.6)}. A significant (p<0.001) improvement observed through out GHRT duration in GHD cases {(T - C=3.6), (TG=1.2), (LDL - C=1.6), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.31) and (HDL - C=1.5)} compared to baseline values.Ca is an essential mineral for bones building, and several other biological functions, baseline data concentration (mmol/l) expressed as median value reveled that; baseline serum Ca was a slightly lowered in GHD cases (2.2) than controls (2.3), this slightly lowered value was further and significantly (p<0.001) decreased among GHD cases (2) compared to controls and to its baseline values.GHRT significantly (p<0.001) improved HAZ and BMIZ in GHD cases respectively {( - 2.9), ( - 0.7)} than it was pretreatment {( - 3.7), ( - 1.1)}, which were significantly (p<0.001) lowered than normal controls values {(0.2), (0.3)}, although, this improvement GHD short stature cases are still significantly different than in controls. The ROC analysis was shown newly reported, interesting evaluating roles that may - be possibly have an important assistant as discriminating and predicting tool of GHD in SS children, for probably most study parameters considering GHD as an important etiology of SS at baseline, the typical cutoff values when used to classify subjects and separator SS cases with GHD the results of this study indicated that SS patients may possibly be predicted to have GHD if they have concentrations as followed, the typical cutoff values were(< 10.6 for GH after stimulation by clonidine), while were (≥ 0.95 for CEA), {(lipid profile optimal cut off value were (≥ 3.8 for T - C), (1.2 for TG), (2.1 for LDL - C), (0.4 for VLDL - C), (3.04 for T - C/HDL - C) and was for (HDL - C < 1.4)},and for BMIZ was< 0.72). In conclusion, several pathological responses and metabolic disorders seem to be associated with GHD, and GHRT aid in improving GHD children immuno physiological state, the evaluation of immune metabolic parameters proves to be a useful indicator of GHD in The use of GH generally safe, although GH has potential side effects, children receiving GH must be monitored closely during treatment. Importantly, CEA, serum Ca, and lipid profile prove to be useful tools for the evaluation of auxological parameters during GHRT, and to some extent may aid in prediction GHD in SS children and possibly support the diagnosis.Further attention should be paid to the nutritional status of such patients, and supporting their growth by calcium and other important minerals supplements.

جينات تحسس الزحام وعلاقتها مع بعض عوامل الضراوه في بكتريا الزوائف الزنجاريه Correlation of Quorum Sensing Genes with Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: دعاء كاظم منصورالموسوي
اسم المشرف: منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 60 عزله من البكتريا السالبه لصبغه كرام مشخصه مبدئيا بانها بكتريا الزوائف الزنجاريه من عده مستشفيات في بغداد ومنها مستشفى ابن البلدي ومستشفى الحروق ومستشفى بغداد التعليمي وكذلك من المختبرات التعليميه في مدينه الطب خلال الفتره من بدايه شهر ايلول لغايه نهايه شهر كانون الاول لسنه 2013 تضمنت هذه العزلات22 عزله من خمجات الحروق و18 عزله من خمجات الجروح و9عزلات من عينات القشع لمرضى مصابين باصابات الجهاز التنفسي و6 عزلات من الدم وعزلتين من خمجات المجاري البوليه و3عزلات من مسحات الاذن. شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسط الماكونكي الصلب ووسط الدم الصلب وكذلك وسط السيدوموناس الصلب بعد ذلك تم اجراء بعض الفحوصات البايوكيميائيه مثل فحص الكاتليز والاوكسيديز تبع ذلك تشخيص العزلات جينيا باستخدام تفاعل البلمره التسلسلي باعتماد جين .rpsL اكدت النتائج ان جميع العزلات قيد الدراسه هي بكتريا الزوائف الزنجاريه . خضعت 60 عزله عائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه لاختبارفحص الحساسيه تجاه 12 مضادا حيويا بطريقه الانتشار واظهرت النتائج وجود مقاومه عاليه بين عزلات الدراسه لـــمضادات Tetracycline (100%) ,Ceftazidime (100%) ,Cefoxitin (100%) , Ceftriaxone (85 %) , Cefepeme (83.3%), Amoxillin/Clavulanic acid (81.6 %),Chloramphenicol (78.3 %) وانها كانت ذات مقاومه متوسطه لمضاد51.6%) Pipracillin ) وذات مقاومه واطئه لمضادات Tobramycin(33.3%), Norfloxacin (31.6%), Azithromycin (31.6%),Ciprofloxacin (28.3%). اختبرت قابليه العزلات على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام طريقه احمر - الكونغو وطريقه اطباق المعايره الدقيقه وتم قياس قيم الكثافه الضوئيه باستخدام قارىء منظومة الاليزا, اظهرت النتائج ان طريقه اطباق المعايره الدقيقه اكثر كفاءه وحساسيه من طريقه احمر الكونغو للكشف عن الغشاء الحيوي اذ اظهرت نتائجها ان 4 عزلات فقط غير منتجه للغشاء الحيوي اما العزلات الاخرى فقد كانت منتجه بدرجات متفاوته . اظهرت نتائج التحري عن جينات تحسس الزحام باستخدام تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي المتعدد وباستخدام بادئات خاصه بتسلسلات معينه لجينات الكوارم اظهرت النتائج ان 81,6% من هذه العزلات تمتلك واحد او اكثر من هذه الجينات بينما كانت 18.4% من هذه العزلات لا تمتلك الجينات اعلاه . تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي استخدمت في التحري عن خمس من جينات عوامل الضراوه العائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه وهي ((exoU,proteaseIV,exoS,pilB,plcH, اظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة (0% , 21.6 % ,26.6 % , 46.6% ,53.3% ) تباعا وكانت هذه العزلات تمتلك exoU وبعظها exoS وعلى اساسها صنفت العزلات على انها اما سامه او ضاريه . بينت الدراسة ان هناك بعض الطفرات قد حدثت في تسلسل القواعد النتروجينية للعزلات قيد الدراسة وكانت من نوع طفرات الاستبدال والادخال, كذلك تبين من مطابقة تسلسل القواعد النتروجينية المترجم مع تسلسل الاحماض الامينية الاصلي للجين لم يكن للطفرات تاثير على ناتج الترجمة . | A total of (60) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Pseudomonas aeruginosa were obtained from different teaching hospitals in Baghdad ; Ibn - El Balady , Baghdad teaching hospital , Burn hospital and Teaching laboratory in Medical city. During the period between July 2013 till December 2013. The source of these isolates were as follows : (22) isolates collected from burn infections ,(18) isolates from wound infections, (9) isolates from sputum taken from patients suffering from respiratory tract infection,(6) isolates from blood,(2) isolates from urinary tract infections(UTI), and the last (3) isolates from ear swab. The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar,Blood agar, Pseudomonas agar then diagnosed by performing some biochemical tests (catalase and oxidase) followed by Genotypic diagnoses by PCR Which was performed by housekeeping gene (rpsL gene). The results confirm that all the 60 isolates were P.aeruginosa. Sixty P.aeruginosa isolates were tested for 12 antibiotics by using agar diffusion method , the results showed high resistance against Tetracycline 100%, Ceftazidime100%,Cefoxitin100%,Ceftriaxone85%,Cefepime,83.3%,Amoxicillin/Clavulanic acid 81.6%, and Chloramphinicol 78.3% moderate resistance against ,Pipracillin 51.6% , and low resistance against Tobramycin 33.3% , Norfloxacin 31.6%,Azithromycin 31.6% and Ciprofloxacin 28.3%. The ability of the isolates to produce biofilm were tested using congo red plate method and Tissue culture plate method(TCP). Results showed that TCP method is a more quantitative and reliable method for the detection of biofilm this method show that 6.6% isolates were not biofilm producers while other isolates produce it in different degrees . Multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique was performed using specific primers targeting the specific sequences of Quorum sensing genes (lasR,lasI , rhlR,rhlI) .The results showed that 81.6% positive for one or more QS genes while only 18.3% were negative for all these genes. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to screened five virulence factors (exoU,proteaseIV,exoS, PilB , PlcH) results showed percentage were (53.3% , 46.6% , 26,6 % , 21,6 % , 0% ,) positive isolates respectively and these isolates contain either exoU or exoS and according to this have been classified into cytotoxic and invasive. Determination of nucleotides sequence for QS genes was revealed there was some mutations occurred which included substitution and insertion. From the other side results of identities of translated - nucleotides sequence with original sequence of amino acids revealed that there were no effect of mutations on translation product.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

اسم المؤلف: داليا سـلمان عــبد ســبع
اسم المشرف: محمد فخري احمد مروان صالح محمد النمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

اسم المؤلف: حسين ظاهر عليوي التميمي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

تحديد مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين والابيشتاين بار فايروس في امصال المرضى العراقيين المصابين باللاهودجكن اللمفاوي Detection of interleukin 10 , Adiponectin and Epstein Bar Virus in sera of Iraqi patients with Non - Hodgkin's lymphoma

اسم المؤلف: حسنين سمير الهاشمي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري زياد احمد شبيب الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد مرض اللاهودجكن اللمفاوي مجموعة من سرطانات الخلايا اللمفاوية والذي تتطورفيه الخلايا المفاوية بطريقة خاطئه مؤدية الى اضطرابات مناعية .تم خلال الدراسة الحالية تقييم بعض المؤشرات المناعية في امصال (46) عراقيا من مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ومقارنتها مع (46) فردا مضاهيا من الاصحاء ظاهريا .اجريت الدراسة في المركز الوطني لبحوث وعلاج امراض الدم وفي قسم علوم الحياة في الجامعة المستنصريه منذ كانون الثاني الى حزيران من العام 2013. هدفت الدراسة لتقييم مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين واضداد (EBV) في امصال مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ودراسة اثر هذه المتغيرات في الامراضية والتنبؤ بسير المرض وكيف يؤثر بعضها في البعض .كان 31 (67%) مريضا (≥ 50) سنة و15 (33%) منهم باعمار(<50) سنة . وكان متوسط اعمار المرضى (52.74متوسط± 2.18) اذ تراوحت اعمارهم بين (17 - 80) سنة وقد بينت نتائج الدراسة ان الذكور هم اكثر عرضه للاصابة بالمرض مقارنة بالاناث وبنسبة 1 : 1.7 . كما تبين من الدراسة هنالك فروقات معنوية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين (50≤ و50≥) فضلا عن الفروقات كانت معنويه(0.05 > p) بينهما في مستويات الاضداد (EBV IgM) في الوقت الذي لم تكن الفروق معنويه (0.05 < p) لاضداد (EBV IgG) . تبين كذلك ان هنالك فروقات في مستويات الاديبونكتين المصلية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين في ما لم تكن الفروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الانترليوكين 10 بين المجوعتين العمريتين . عند تقسيم المرضى تبعا للجنس 29 ذكر و17 انثى , بينت النتائج ان هناك فروقات معنوية في اعداد خلايا الدم البيض بين الجنسين (17.32*109/لتر ± 6.87 ذكور , 5.80*109/لتر± 0,85 اناث) (0.05 > p).وبشان مستويات اضداد EBV (IgM,IgG) لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) بين كلا الجنسين , كما لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الاديبونكتين . فيما كانت الفروقات ذات دلاله معنويه في مستويات الانترليوكين 10 (23.77 بيكو غرام / مل ±6.58ذكور , 12.06 بيكوغرام/مل ±3.77 اناث ) (0.05 > وبمقارنة المرضى بالاصحاء كانت هناك فروقات معنوية (0.05 > p) في اعداد كريات الدم البيضاء فما لم تكن الفروقات معنوية (0.05 < p) بالنسبة EBV (IgM,IgG) .اما مستويات الاديبونكتين المصلية فقد انخفضت معنويا في امصال مرضى اللاهودجكن المفاوية (وان بقيت مستوياتها ضمن الحدود الطبيعيه ) بالمقارنة مع الاحصاء (0.05 > p).سجلت النتائج ارتفاعا معنويا (0.05 > p) في مستويات الانترليوكين 10 (18.67بيكو غرام/مل ±4.12 )بالمقارنة مع مستوياته (3.4بيكوغرام /غرام ±0.73) عند مجموعة الاصحاء , كما لوحظ ان هنالك ارتفاعا معنويا (0.05 > p) اخر في امصال اللاهودجكن ذوي المراحل المتقدمة (33.1 بيكو غرام /مل ± 4.5) عند مقارنتهم بالمرضى في المراحل المبكرة (13.4 بيكو غرام /مل ± 2.7) (0.05 > p)وعلى العكس من ذلك انخفضت مستويات الاديبونكتين معنويا (0.05 > p)في المراحل المتقدمة من المرض (4.53مايكروغرام /مل ±1.4 ) مقارنة بالمراحل المبكرة (6.79مايكرو غرام /مل ±1.1). بينت نتائج التحليل الاحصائي انه ليس هنالك ثمة علاقة معنويه (0.05 < p)بين الانترليوكين 10 والاديبونكتين عند مرضى اللاهودجكن اللمفاوي في جميع مراحلة . خلصت الدراسة بالاستنتاج ان حالات اللاهودجكن المدروسة اكثر حدوثا في فئات عمرية فوق الخمسين سنة بالمقارنة مع من هم تحت ال 50 سنة وترافقهزايادة في مستويات الانترليوكين 10 مع تقدم عمر المريض وارتباطها كذلك مع شدة المرض مما قد يعكس القيمة التنبؤية لهذا السياتوكين . فيما ارتبط انخفاض مستويات الاديبونكتين مع ارتفاع خطورة الاصابة بالمرض ومع اشتداد المرض . يرتبط الانخفاض في مستويات الاديبونكتين عكسيا مع مؤشر كتلة الجسم (BMI). سجل خلال الدراسة انخفاض مستويات (EBV IgM) في المرضى باستخدام تقنية الايلايزا يعكس الحاجة لاستخدام تقنيات اخرى للكشف عن الفايروس المختبىئ . | Non hodgkin's lymphoma (NHL) is a group of cancers of the lymphocytes. In NHL, the lymphocytes develop in a wrong way led to immune disorder. The present study was carried out to evaluate some immunological parameters in the sera of (46) NHL Iraqi patients , In addition to control group involving (46) matched apparently healthy subjects. This study was done in the National center of hematology & Department of biology at AL - Mustansiyria University since January to June 2013.The aim of this study is to estimate the levels of Interleukin 10, Adiponectin and EBV infection in sera of patients with NHL and to study the impact of these parameters on the pathogenesis and predictive of the disease and how they correlated.There were 31 out of 46 (67%) patients with age group ≥50 years and 15 out of 46(33%) patients with age group <50 years. The mean age of NHL patients was (52.74) years ranging from 17 to 80 years. The patients were divided into two groups according to the age(≥50years and <50 years)patients .There was statistically significant difference (p<0.05) in White blood cells count between age groups . The mean of adiponectin serum level was significantly differ (p<0.05) between the two age groups.The mean of IL - 10 serum levels did not show a significant difference between the two age groups (p>0.05).The mean of adiponectin serum level in NHL patients wasn't significantly (P>0.50) differ between male and female while the IL - 10 level in serum was significantly different (23.77pg/ml ± 6.58 male, 12.06 pg/ml ± 3.77 female) (P<0.05).When the patients of NHL compared with control, the mean of white blood cell count was significantly different ( p<0.05) also there was non - significant differences(P>0.05) in mean of EBV - IgG & IgM among NHL patients and control group. The mean level of adiponectin serum was a statistically decreased in patients of NHL as compared with control subjects(p<0.05), but still these levels are within normal range, furthermore The levels of interleukin 10 were significantly increased in patients with NHL compared with healthy subjects (18.67 ± 4.12 pg/ml vs. 3.4 ± 0.73pg/ml) (p<0.05). Higher increasing of IL - 10 levels in the advanced stage patients of NHL was noticed compared with early stages (33.1 ± 4.5 pg/ml vs. 13.4 ± 2.7 pg/ml) (P<0.05). Otherwise the serum levels of adiponectin in aggressive stage of NHL patients was decreased compared to the early stages of that disease (4.53 ± 1.4 µg/ml vs. 6.79 ± 1.1 µg/ml ) (P<0.05). There was no significant negative correlation between IL - 10 and adiponectin in all NHL patients (p>0.05) also there was no significant correlation between IL - 10 and adiponectin in patients with advanced stage (p>0.05). In conclusion, NHL was noticed in the highest ages and it might indicates the increasing rates of NHL among older population. in addition increasing level of IL10 is associated with increasing age range and also correlated positively with aggressive NHL cases that might indicates the predictive pivotal role of this cytokine . Moreover, Lower adiponectin levels are associated with an increased risk of NHL. Adiponectin is inversely correlated with Body mass index and also it was decreased in aggressive cases compared to early stages. The low percentage of EBV IgM in NHL patients by using Elisa technique might indicates the Necessity for using other advanced technique to detect EBV infection either an action or silent form

الكشف عن انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف المنتجة من بكتريا Klebsiella pneumoniae Detection of extended spectrum ? - Lactmases producing Klebsiella pneumoniae

اسم المؤلف: بيداء مجبل علي حسن الخفاجي
اسم المشرف: خليل مصطفى خماس سعد لعيبي حامد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - انزيمات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت 46 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella pneumoniaeمن عدة مستشفيات في مدينة بغداد للفترة مابين شهري تشرين الثاني 2012 وتموز 2013. تم الحصول على العزلات من مصادر سريرية مختلفة شملت : (23) عزلة من الدم و(19) عزلة من الادرار وعزلتان من الجروح وعزلة واحدة من كل من مسحة الاذن والقشع. تم اجراء فحص حساسية العزلات تجاه 15 مضاد جرثومي باستخدام جهاز Vitek 2 , وكان نمط مقاومة العزلات تجاه المضادات الجرثومية على النحو التالي : 100٪ للاموكسيسيلين، 82.6٪ للسيفازولين، 80.43٪ للسيفوتاكسيم، 78.26٪ لكل من للالسيفتازيديم وسيفيبيم، 73٪ للكوتريموكسازول، 45.65٪ للجنتاميسين، 30٪ لل نايتروفيورانتين، 17٪ لكل من للاموكسيسيلين / كلافيولانك اسد وبيبراسيلين / تازوبكتام، وسيبروفلوكساسين، 8.69٪ للسيفوكسيتين، و4.34٪ لكل من الاميبينيم والميروبينيم والاميكاسين. فضلا عن ان بعض العزلات قد اظهرت مقاومة متوسطة ضد المضادات الجرثومية المدروسة. اظهرت نتائج فحص الحساسية ان هناك نسبة عالية من المقاومة تجاه المضادات الجرثومية المدروسة, خاصة تجاه مجموعة السيفالوسبورينات والمضاد الجرثومي كو - ترايموكزول , في حين كانت المضادات الجرثومية الاكثر فاعلية هي مجموعة الكاربابنيمات والمضاد الحياتي الاميكاسين. اظهرت نتائج قابلية العزلات على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف بان 39 عزلة (84.78%) من بين العزلات قد اعطت نتيجة موجبة لهذا الفحص. استعملت تقنيه تفاعل البلمره الببتيدي ((PCR للكشف عن مدى انتشار الجينات blaTEM وblaSHV وblaCTX - M بين العزلات المنتجه لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف المسؤولة عن التشفير لهذه الانزيمات. كشفت نتائج تقنية PCR بان نسب انتشار blaTEM ، blaSHV ، وblaCTX - M كانت : 66.66 ٪ (26 عزله) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 448 زوج قاعدة ، 69.23 ٪ (27عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 231 زوج قاعدة و82.05 ٪ (32 عزلة) وبناتج مضخم ذو حجم جزيئي 551 زوج قاعدة على الترتيب. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان عدد العزلات الحاملة للجينات الثلاثة blaTEM وblaSHV وblaCTX - M سوية كانت 16 عزلة ( 34.78 ٪ ) ، في حين وجد ان عدد العزلات التي تحمل كلا من الجينين blaTEM وblaCTX - M, blaSHV وblaCTX - M وblaSHVو blaTEM سوية كانت 10 عزلات ( 21.73 ٪ ), 7 عزلات ( 51.21 ٪ ) وعزلتان( 4.34 ٪ ) على الترتيب . بينما كانت نسبة 10.86 ٪ من العزلات المدروسة حاوية على الجين blaSHV لوحده , و6.52٪ من العزلات كانت تمتلك فقط الجين .blaCTX - M لم تظهر النتائج وجود الجين blaTEM لوحده في اي من العزلات قيد الدراسة. اظهرت النتائج المستحصلة من بيانات نتائج تسلسل الناتج المضخم من تقنية PCR وجود نسبة مطابقة تراوحت مابين ( (100 - 99٪ مع الطراز الوراثي blaCTX - M - 15 ونسبة مطابقة تراوحت مابين ( 98 - 100 ) ٪ مع الطراز الوراثي blaSHV - 11. بينت نتائج هذا الاختبار سيادة الطرز الوراثية blaSHV - 11 وblaCTX - M - 15 بين عزلات بكتريا K. pneumoniae المنتجة لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعه الطيف. | Forty - six Klebsiella pneumoniae isolates were isolated from some hospitals of Baghdad between November 2012 and July 2013. The isolates were obtained from various clinical specimens including : blood (23) isolates, urine (19) isolates, wounds (2)isolates, ear swab(1)isolates, and sputum(1) isolates. Antimicrobial susceptibility test was carried out towards 15 antimicrobials using Vitek 2 compact system, and the pattern of resistance was as follow : 100% for amoxicillin, 82.6% for cefazolin, 80.43% for cefotaxime, 78.26% for ceftazidime and cefepime, 73% for co - trimoxazole, 45.65% for gentamicin, 30% for nitrfurantoin, 17% for amoxicillin/clavulanic acid, pipracilli/tazobactam, and ciprofloxacin, (for each) 8.69% for cefoxitin, and 4.34% for imipenem, meropenem, and amikacin. In addition to some isolates were revealed intermediate resistance against some antimicrobials. Results of antimicrobials susceptibility tests has been revealed high percentage of resistance for antimicrobials studied, especially for cephalosporins and co - trimoxazole, while the most effective antimicrobials were carbapenems and amikacin. The results of capability of isolates to produce extended - spectrum β - lactamases (ESBLs) showed that thirty - nine of isolates (84.78%) were given positive result.ESBLs - producing K. pneumoniae (39) isolates were subjected to polymerase chain reaction (PCR) amplification technique to identify the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M genes that responsible for β - lactame expression. Results revealed the prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX - M were : 26(66.66%) isolates with 448 bp amplified product, 27(69.23%) isolates with 231 bp amplified product, and 32(82.05%) isolates with 551 bp amplified product respectively.The results of present study were showed that presence of three genes - blaTEM,,blaSHV, and blaCTX - M together were in 16 isolates(34.78%), while combinations between blaTEM and blaCTX - M , blaSHV and blaCTX - M , and between blaTEM and blaSHV were found in 10 isolates(21.73%),7 isolates(15.21%), and 2 isolates(4.34%) respectively. While 10.86% of studied isolates contains only blaSHV gene, and 6.52% has only bla CTX - M none of studied isolates were carried blaTEM aloneThe data of the sequencing of PCR products were revealed (99 - 100) % homology with the blaCTX - M - 15 genotype and (98 - 100) % homology with the blaSHV - 11genotype. Results have been shown the dominance of blaSHV - 11 and blaCTX - M - 15 among ESBLs - producing strains.

تاثير مستخلصات قشور البرتقال على نشاط بكتريا Pseudomonas aeruginosa المقاومة للمضادات الحيوية والمعزولة من التهابات جروح الحروق وجروح ما بعد العمليات في مدينة بغداد Effect of Citrus sinensis peels extracts on the viability of antibiotics resistant Pseudomonas aeruginosa isolated from burn and post - operative wound infections in Baghdad City

اسم المؤلف: بتول عبد الامير باقر الصفار
اسم المشرف: محمد فخري احمد صفاء عبد الكريم عبد الرزاق
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • تم جمع 175 مسحة من المرضى الذين يعانون من خمجات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية ,الراقدين في مستشفيات بغداد المختلفة ,والمتضمنة مستشفى الكندي التعليمي, مستشفى الكرخ العام ومستشفى بغداد التعليمي اثناء الفترة من ايلول 2008 الى كانون الثاني 2009. • زرعت المسحات على وسطي غراء الدم والماكونكي وحضنت هوائيا بحرارة 37 م لمدة 24 ساعة وشخصت العزلات منPseudomonas aeruginosa باستخدام التشخيص الكيموحيوي والفسلجي والصفات ﺍ ﻠﻤﻈهرية واكد باستخدام نظام عدة api 20E .• تشير النتائج الى 114عزلة اعطت زرع بكتيرولوجي موجب بمعدل65.14% هذه تضمنت 51 (%60 ) عزلة من 85 مسحة من اصابات جروح مابعد العمليات و63 (%70 ) عزلة من 90 مسحة من اصابات الحروق.• اجري فحص الحساسية على هذه العزلات باستعمال 10 مضادات حيوية شائعة الاستعمال من مجاميع مختلفة ,اظهرت النتائج مقاومة عالية الىCephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime وبنسبة مقاومة (100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78)% على التوالي. بينما اظهرت العزلات حساسية عالية الى المضادات Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem وبنسبة مقاومة ( 28.94, 23.68, 15.78 )% على التوالي. • اربع مستخلصات المائي الحار٬ المائي البارد ٬ الكحولي الحار والكحولي البارد طبقت لاستخلاص قشـــورالبـــرتقال. ووجدت من خلال الكشف النوعي للمستخلصات بان المستخلصات المائية الحارة والباردة لقشور البرتقال احتوت على المركبات التالية : كلايكوسيدات٬ فينولات٬ قلويدات٬ صابونيات وتانينات، بينما احتوت المستخلصات الكحولية الحارة والباردة (اضافة الى ما ذكر) على مركبات : راتنجات٬ تربينات٬ فلافونات٬ كومارينات وزيوت طيارة. • استخدمت المستخلصات لدراســـة تاثيرها على نمــو العــزلات المقاومة فقــط والمعزولة من اصابات الجروح مابعد العمليات الجراحية والحروق بطريقة الانتشار بالحفر. مستخلصات قشورالبرتقال في التراكيز) 25 ,50, 75 ,100, 200 ,300 ,400 و500 )ملغم/مل اظهرت فعالية ضد العزلات البكتيرية. • كشف التحليل الاحصائي وجود اقل فروق معنوية عند مستوى احتمالية P<0.05)) لاربع مستخلصات.• المستخلص الكحولي الحار من قشور البرتقال كان اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى ضد عزلات الجروح مابعد العمليات وجروح الحروق. المستخلص المائي البارد ياتي بالمرتبة الثانية بعد المستخلص الكحولي الحار. معدلات اقطار مناطق التثبيط لهذه المستخلصات ضد P. aeruginosa عند التركيز العالي 500 ملغم/مل كانت 22.78ملم لمستخلص الكحولي الحار، بينما كانت 71.15ملم لمستخلص المائي البارد. اما النتائج كانت متغايرة بالنسبة لتاثير مستخلصي الكحولي البارد والماء الحار وبشكل عام اظهرت تاثيرات منخفضة على العزلات البكتيرية. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل لمستخلص الكحولي الحار معدلات اقطار التثبيط تناقص الى 64.1 ملم. • اختبر تاثير التراكيز المختلفة لمستخلص الكحولي الحار على نشاط انتاج الانزيمات : اليوريز ، جيلاتينيز ، اوكسيديز والكاتاليز، اظهرت النتائج ان المستخلصات الكحولية الحارة في التراكيز (75, 100, 200) ملغم/ مل تاثيرا جدير بالملاحظة على نشاط انتاج اليوريز، يعزى ذلك الى ظهور اللون الاصفر(كنتيجة سالبة) بعد ساعتين من الاختبار. بينما عند تراكيز(25 ,50) ملغم/مل من المستخلص حصول نتيجة سالبة لانتاج اليوريز بعد الساعة الرابعة من الحضن. • المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الجيلاتينيزعند التراكيز( 50 ,75 ,100 ,200) ملغم/ مل بعد الساعة الثانية من فترة الحضن. بينما عند التركيز 25 ملغم/مل اظهرت النتيجة سالبة للجيلاتينيز بعد الساعة الرابعة حضانة. المستخلص الكحولي الحار اثبط انتاج الاوكسيديز والكاتاليز بالتراكيز(25 ,50 ,75, 100 ) ملغم/مل واظهرت نتيجة سالبة بعد الساعة الثانية من الحضن. • اظهرت نتيجة دراسات ميكانيكيات النمو بتركيز 500 ملغم \مل من المستخلص الكحولي الحار قتل كامل لعزلات اصابات الحروق والجروح مابعد العمليات الجراحية التي يتطلب وقت حضانة بين الساعة 6 - 8 ساعة. علاوة على ذلك المستخلص بتركيز 400 ملغم/ مل تطلب القتل الكامل للعزلات 8 ساعات حضانة لكل العزلات. بينما عند التركيز( 200 ,300 ) ملغم/ مل اظهر قتل كامل على جميع الخلايا بعد مرور 24 ساعة حضانة. اما التركيز 100 ملغم/ مل اظهر معدل قتل جزئي للعزلات (حتى بعد 24 ساعة حضانة). ﺗﻡ اﯿﻀﺎ ﻤﻨﺎﻗﺷﺔ ﻮﺘﺤﻠﻴﻞ ﻤﻧﺤﺪﺮﺍﺖ اﻠﻴﺔ ﺍﻠﻧﻤﻮ ﻠﻠﺒﻜﺘﺮﻴﺎ. | Hundred and seventy five swab samples were collected from patients suffering from burns and post - operative infections who admitted to different hospitals in Baghdad for medical care, these included : Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Karkh General Hospital and Baghdad Teaching Hospital, during the periods from October 2008 to January 2009. The swabs were cultured on blood agar base and macConky's agar then incubated at 37˚C for 24hrs . Isolates of P. aeruginosa were isolated and identified using morphological, physiological and biochemical diagnosis and confirmed by api 20 E kit . The results indicated that 114 (65.14%) have given positive bacteriological cultures, this included 51(60%) isolates out of 85 swabs of post - operative wound infections, while 63(70%) isolates out of 90 swabs of burns infections. Sensitivity test was performed for these isolates using 10 commonly used antibiotics. The result indicated that a higher resistance to Cephalothin, Carbenicillin, Tetracycline, Ceftriaxone, Chloramphenicol, Cefotaxime and Ceftazidime whith the percentages of 100, 92.98, 88.59, 78.94, 69.29, 67.54, 65.78 % respectively , while the isolates showed a higher sensitivity to Amikacin, Ciprofloxacin and Meropenem with the percentages of resistance of 28.94, 23.68, 15.78 % respectively. Four extraction methods, i.e. hot water, cold water, hot alcoholic and cold alcoholic, were applied for the extraction of Citrus sinensis peels . Hot and cold watery extracts of Citrus sinensis peels contained the following compounds : Glycosides, phenols, alkaloids, saponins, and tannins. While hot and cold alcoholic extracts contained, in addition to above, resins, terpins, flavones, coumarins, and volatile oils. The extracts were used to study their effects on growth of P. aeruginosa resistant isolates of post operative wound and burn isolates by using agar diffusion method. Extracts of Citrus sinensis peels at concentrations of 500, 400, 300, 200, 100, 75, 50, 25mg/ml showed activity against bacterial isolates. The statistical analysis revealed the presence of significant differences (P<0.05) for four extracts. The hot alcoholic extract of Citrus sinensis peels were more efficient than the other extracts against post - operative wounds and burn wounds isolates. Cold water extract came next to hot alcoholic extract. The inhibition zone diameters for these extracts were 22.78mm (for hot alcoholic extract) and 15.71mm (for cold water extract). Variable results were obtained with respect to the effects of cold alcoholic extract and hot watery extract, and generally, of low effects on bacterial isolates. At a concentration of 25mg/ml of hot alcoholic extract, the rate of inhibition zone diameters decreased to 1.64mm. The effect of different concentrations of hot alcoholic extract on the activity of enzymes production of urease, gelatinase, oxidase and catalase have been tested. The results showed that hot alcoholic extracts at concentrations of 75, 100, and 200mg/ml, demonstrated an observable effect on the activity of urease production due to observation of yellow - orange color (i.e. negative result), after 2hrs . While at extract concentrations of 25 and 50mg/ml, negative urease test was obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract has inhibited gelatinase production at a concentration of 50, 75, 100, and 200mg/ml after 2hrs incubation. While at a concentration of 25mg/ml, negative gelatinase result is obtained after 4hrs incubation. Hot alcoholic extract affects the inhibition of oxidase and catalase production at concentration of 25, 50, 75, and 100mg/ml, which showed negative results after 2hrs incubation. The result of Kinetics of growth studies demonstrated that the concentration of 500mg/ml of hot alcoholic extract was enough for complete killing the isolates from burn and post - operative wound infections. Moreover, this killing required incubation time between 6 - 8 hrs . At extract concentration of 400 mg/ml a complete killing required 8hrs incubation. While for complete killing upon application of 200 and 300mg/ml of the extract required 24hrs incubation. Partial kill occurs after 24hrs when 100 mg/ml of extract was used. Analysis of the slopes of growth kinetics was also discussed.

استخدام بعض المؤثرات الفيزيائية والكيميائية في تحفيز بعض مركبات الايض الثانوي لنباتي الروجة Hypericum triquetrifolium وعنب الذيب Solanum nigrum خارج الجسم الحي Effect of some physical and chemical elicitors on some secondary metabolite induction of Hypericum triquetrifolium and Solanum nigrum In vitro

اسم المؤلف: بان منــعـم عبد الرزاق تويــج
اسم المشرف: سعدية حسن محمود كاظم محمد ابراهيم الصميدعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biotechnology Department, College of Science, Al - Nahrain University. It is aimed to increase the production of some secondary metabolites using physical and chemical elicitors in tissue cultures of Hypericum triquetrifolium L. and Solanum nigrum L. plants. The quality and quantity of phytochemicals were estimated using methanolic extracts of dried leaves and callus were analysed using HPLC. Callus was initiated on leaf discs cultured on Murashig and Skoog (MS) medium supplemented with 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) and Benzyl adinenine (BA) at concentrations of 0,0.1, 0.5, 2.0 or 5.0 mg/l for H.triquetrifolium callus initiation and Naphthalene acetic acid (NAA) at concentrations of 1.0, 2.0, 3.0, 4.0 or 5.0 mg/l and BA at 0.5, 1.0, 1.5, 2.0 or 2.5 mg/l for S.nigrum callus initiation. Results showed that the combination of 2,4 - D at 0.1 mg/l with BA at 0.5 mg/l was the most effective for callus induction percentage reached 90%. The highest mean fresh weight reached 64.33 mg for H.triquetrfolium, and the combination of NAA at 2.0 mg/l with 1.0 mg/l BA was the most effective for callus induction percentage reached 100% and the fresh weight reached 859.1 mg for S.nigrum. The same combination was used for callus maintenance for both plants. Results also showed an increase in the concentration of secondary metabolites in methanol extracts induced on leaves. Callus cultures induced on leaf discs were treated with some physical and chemical stimuli such as light, ultraviolet, jasmonic acid and salicylic acid, (2, 4, 6 or 8 mg/l jasmonic acid), or (50, 100, 150 or 200 mg/l salicylic acid), and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the uv exposure time was 10 or 20 minutes. Result showed that there are significant differences between the various treatmeant, the best concentration of jasmonic acid to stimulate and increase production was 6 mg/l in H.triquetrifolium callus cultures, and 8 mg/l for S.nigrum. Salicylic acid stimulated the production reached 150 mg/l in callus culture of H.triquetrifolium and 100 mg/l in callus culture of S.nigrum. The best light exposure time caused an increase in the production of secondary metabolism was 12 hrs light for calli in both plants. Both exposure time (10 or 20 mint) induced the yield of secondary metabolites in callus cultures of H.triquetrifolium equally. and 20 minutes for S.nigrum. It is concluded from studying the effect of chemical and physical treatments on callus of both plants. that uv increased callus fresh weight and secondary metabolites in callus cultures. The highest concentration of secondary metabolites induced incallus cultures of H.triquetrifolium were catchin (0.14708 mg/g), hypersoid (0.09825 mg/g), hypericin (0.84623 mg/g), pseudohypericin (0.13707 mg/g), hyperforin (0.85525 mg/g) and prenylated phlorglucin (0.11275 mg/g), the highest fresh weight for callus 61.67 mg. S.nigrum callus cultures produced ascorbic acid (0.14721 mg/g), α - solanine (0.2294 mg/g), solasodin (4.3689 mg/g), solanidin (1.4854 mg/g), β - solamargine (5.9896 mg/g), α - solamargin (1.5509 mg/g), solasonine (1.3048 mg/g) and demission (2.031 mg/g). Additionaly, it yielded the highest callus fresh weight reached 849.20 mg.

The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori The Role of Interleukin - 8 Associated with Peptic Ulcer Disease Induced by Helicobacter pylori

اسم المؤلف: ايمان عبد الجبار محمد العاني
اسم المشرف: Nazar E. Naser Abdul Wahab Al - Shaikhly
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتوضيح تاثير الشذوذ المناعي حول الكشف السريري لدى مرضى مصابون بقرحة المعدة والاثني عشري في بغداد, بالاضافة الى تهيئة معالم اوضح لدور الانترلوكين - 8 في الامراضية المناعية عند هؤلاء المرضى والتي سببها بكتريا Helicobacter pylori. كذلك شملت الدراسة استخدام مختلف الفحوصات المناعية والبكتريولوجية في الكشف عن وجود بكتريا H.pylori المسببة لمرض قرحة المعدة والاثنى عشري . تم شمول (48) مريضا (31 من الذكور و17 من الاناث) وباعمار تراوحت ما بين ال30 - 50 سنة مصابين بمرض قرحة المعدة والاثني عشري ومجموعة من الافراد الاصحاء كمجموعة سيطرة ملونة من 62 شخصا منهم( 26 من الذكور و36 من الاناث ) باستخدام طرائق تحري بكتريولوجية شائعة وحديثة , مناعية وتشريح انسجة مرضية للتحري عن وجود الاصابة ببكتريا Helicobacter pylori.اعتمد التشخيص النهائي على ايجابية اي من الاوساط الثلاثة او بمصاحبة فحص اليورييز الايجابي وفحص النسيج المرضي, اذ اثبتت النتائج ان من بين اوساط الزرع الثلاثة المختلفة , كان HP agar هو الوسط الاكفا في عزل البكتريا H.pylori عندما حقق على معدل عزل قياسا بكل من وسطي اكار خلاصة الدماغ / القلب واكار كولومبيا ( 79.2% , 35.4% , 25% على التوالي). اظهر تقدير اداء الاختبارات المصلية في التنبؤ بالاصابة ببكترياH.pylori لدى مرضى قرحة المعدة والاثني عشري وتمييزهم عن مجموعة الاصحاء , ان تحديد وجود H.pylori specific IgG باتباع طرائق حديثة مختلفة قد يحسن من عملية التنبوء بالاصابة بالبكتريا اكثر من علاقتها بمرض قرحة المعدة والاثني عشري نفسه.كما وتضمنت الدراسة اتباع طريقتين لتشخيص وجود مضادات H.pylori specific IgG حيث اظهرت النتائج ان طريقة الاليزا (ELISA) اعطت معدل ايجابية اعلى لدى مجموعة المرضى مقارنة بطريقة miniVidas (95.8% , 89,6% على التوالي). ومن الجدير بالملاحظة ان مجموعة السيطرة H.pylori specific IgG بلغت نسبة ( 42.2% او 46.8% عند القياس بطريقة miniVidas او ELISA على التوالي). لم تظهر فوارق معنوية لمستوى وسط H.pylori specific IgG عند قياسه بالطريقتين , اية فروق معنوية بشكل واضح بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة , في حين ظهرت فروق معنوية بين وجود من عدم وجود H.pylori في مجموعة المرضى باستخدام طريقة miniVidas فقط ) وسط الزرع =3 ng/ ملي لتر و1.15 ng / ملي لتر على التوالي). لم يكن كلا من فحص H.pylori specific IgG واختبارات ال Helicogen ذات كفاءة جيدة في التنبؤ بمرض قرحة المعدة والاثني عشر للتفريق بين مجموعتي المرضى والاصحاء , اذ كان الPPV قريبا جدا من احتمال وجود المرض دون اجراء اي اختبار. ومن جهة اخرى فان اجراء الفحص السيرولوجي في التنبؤ بالاصابة ببكتريا H.pylori لدى المرضى المصابين بقرحة المعدة والاثني عشري اظهر بان طريقة اليزا قد تعتبر فحصا حساسا جدا (درجة الحساسية 100%) في التحري عن وجود H.Pylori التي نتج عنها PPV , NPVتاما لدى 87%. كما وتم الحصول على اعلى محدودية للاختبار الايجابي ( 97.5%) باتباع طريقة miniVidas رغم ان حساسية الاختبار كانت اقل بقليل من طريقة ELISA (97.5%). واستنادا الى النتائج فان H.pylori specific IgG الذي تم تقديره بطريقةminiVidas كان افضل خيار للتميز بين H.pylori السالبة والموجبة حيث اظهر القياس نسبة حساسية عالية وPPV تتجاوز 90.7% والتي كانت مساوية لمعيار النفاذ الذي تم الحصول علية باستخدام الطريقتين. اثبتت الدراسة الحالية وجود فوارق معنوية في المستوى الكلي لمصل IgG بين المجموعات الموجبة والسالبة لدى المصابين ببكتريا H.pylori (المتوسط الحسابي 1531.2 ملي غرام/ملي لتر و917.7 ملي غرام/ملي لتر على التوالي ) في حين لم تظهر فروقات معنوية تتعلق ب IgM, IgA, C3 & C4 بين هاتين المجموعتين. ومن ناحية اخرى تميز IgG وC4 لدى المقارنة بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة (المتوسط الحسابي ل IgG كان مساويا الى 1397 ملي غرام / ملي لتر و1067.4 ملي غرام / ملي لتر والمتوسط الحسابي لC4 كان 49.8 ملي غرام / ملي لتر و29 ملي غرام / ملي لتر على التوالي). تشير البيانات المستخرجة من الدراسة الى ان مستوى IL - 8 في مرض التهاب المعدة لم يكن يعتمد على الاصابة ببكتريا H.pylori ولكن زيادة ال IL - 8 في مستوى المصل بين حالات الاصابة بقرحة المعدة والاثني عشري قد تعزى الى التهاب النسيج الذي يصاحب المرض ما دام هناك فارق معنوي بين مجموعة المرضى ومجموعة السيطرة, في حين لم تكن تلاحظ اية فروق معنوية بين المجموعات الموجبة والسالبة لبكتريا H.pylori . وقد تكون لهذه النتائج مضامين هامة للتوصل الى تبصر اعمق في تفهم اليات البكتريا المسببة للمرض فيما يتعلق بالاستجابة المناعية ضد الاصابة ببكتريا H.pylori | This study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of peptic ulcer among Iraqi patients, in addition to provide further insights into the role of some interleukins in immunopathogenesis of patients with peptic ulcer disease induced by Helicobacter pylori. The study also included various immunological and bacteriological investigations in detecting the presence of H. pylori associated with peptic ulcer disease.Forty eight (31 males and 17 females) patients suffering from peptic ulcer, and sixty two (26 males and 36 females) apparently healthy individuals (as control) , were subjected to different recent and common bacteriological, immunological and histopathological evaluations regarding the ages of the patients and healthy individuals included between 30 - 50 years which were done for detecting Helicobacter pylori infection.Final diagnosis was completely established when any of the three culture media showed the evidence or a combination of positive urease test and histological evidence. The results documented that among different types of cultures media, Helicobacter pylori agar was the most superior medium for the recovery of H. pylori 79.2 %, which provided the highest isolation rate compared with Brain Heart Infusion agar and Colombia agar (35.4 %, and 25 % respectively).Assessing the performance of serology in predicting H. pylori infection associating with peptic ulcer patients and / or distinguishing them from healthy controls, demonstrated that determination of H. pylori specific IgG using recent different methods may improve predicting the infection of H. pylori rather than relating to peptic ulcer disease itself.In the present study, two methods were used for detecting presence of H. pylori specific IgG antibodies. The results showed that ELISA method gave a higher cases positivity rate compared to miniVidas method (95.8%, 89.6% ,respectively) .It is worth noting that a good proportion of healthy controls had positive H. pylori specific IgG (45.2 % or 46.8 % measured by miniVidas or ELISA method respectively). The medium level of H.pylori specific IgG measured by both methods did not significantly differ between patients and control groups, while the differences observed for the presence of H. pylori compared with its absence among cases were statistically significant only by using the miniVidas method (Medium = 3 ng/ml, and 1.15 ng/ml respectively). The present study showed that both H. pylori specific IgG antibodies test and Helicogen tests were not so useful in predicting peptic ulcer disease distinguishing them from healthy control since the PPV was nearly close to the prior probability of having the disease without doing any test. On the other hand, assessing the performance of serology in predicting H.pylori infection in patients with peptic ulcer disease demonstrated that ELISA method would be a very sensitive test (sensitivity = 100 %) in detecting the presence of H. pylori, that resulted in a complete NPV and PPV of 87%.The highest specificity of positive test (97.5%) was obtained by using miniVidas method. Its sensitivity, however, was slightly lower than ELISA method (97.5 %). According to the results, H. pylori specific IgG measured by miniVidas method seems to be the best choice to differentiate between positivity and negativity of H. pylori since it offered a high sensitivity and a PPV exceeding 90.7% which was equal to the validity of parameter obtained by using both methods. The present study documented a significant variation in total serum IgG level between positive and negative groups of H. pylori infection,(mean 1531.2 mg/ml and 917.7 mg/ml ,respectively), while no significant variations were reported in IgM, IgA, C3 and C4 between these two groups. On the other hand, only IgG and C4 varied significantly regarding cases and control groups (mean of IgG = 1397 mg/ml and 1067.4 mg/ml, mean of C4= 49.8 mg/ml and 29 mg/ml, respectively). Data from the study indicated that IL - 8 level in gastritis was independent of H. pylori infection, but one would attribute the increase in IL - 8 serum level among cases with peptic ulcer to the tissue inflammation related to the disease since there was a significant variation between cases and controls, while no differences were observed between positive and negative groups of H. pylori infection. These findings might be of important implications for having further insights into understanding the pathogenic mechanisms of bacteria in relation with immunologic response against H. pylori infection.

دراسة جوانب من الاستجابة المناعية لاصابات الكلية عند الاطفال A study of some immunological aspects in children with renal disease

اسم المؤلف: ايمان عباس محسن
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي سيناء مهدي شاكر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نفذت هذه الدراسة بين 17 - 12 - 2008 و25 - 8 - 2009 وشملت 62 طفلا مريضا في المدى العمري (1 - 12) سنة ومن كلا الجنسين : 26 طفلا مصابا بالفشل الكلوي المزمن و36 طفلا مصابا بالمتلازمة الكلائية، وكان المرضى خارجيين وراقدين في وحدة غسل الكلية في كل من مستشفى المنصور التعليمي للاطفال ومستشفى الطفل التعليمي المركزي وشملت المجموعة الضابطة 26 طفلا. جمعت عينات الدم من المرضى والاصحاء واجريت الفحوص المناعية وهي قياس مستويات كلا من انترلوكين - 6 والاريثروبيوتين وفق تقنية مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم ((ELISA. اما الاختبارات الكيميائية الحيوية فقد تضمنت قياس نسبة اليوريا والكرياتنين في المصل لتقييم الوظيفة الكلوية. شملت السمات الدموية قياس حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم للتحري عن وجود فقر الدم. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى انترلوكين - 6 (0.001>P) ونقصانا معنويا في مستوى الاريثروبيوتين(0.001>P) وزيادة معنوية في يوريا وكرياتنين المصل(0.001>P) ونقصانا معنويا في كل من حجم الخلايا المرصوصة ونسبة خضاب الدم (0.001>P)في كلتا المجموعتين المرضيتين بالمقارنة مع المجموعة الضابطة. جمعت عينات الادرار من مجاميع المرضى والاصحاء واجري لها الفحص العام (بغض النظر عن نوع المرض الكلوي) بعد زرع النماذج على وسطي اغار ماكونكي واغار الدم . اظهرت نتائج الفحص العام للادرار ان وجود القوالب في ادرار المرضى لم يكن معنويا (الاحتمالية=0.056)، بينما كان وجود بروتين الالبومين في ادرار المرضى معنويا (الاحتمالية=0.049). وجدت نتائج زرع الادرار السالبة في 64.5% من كلتا المجموعتين المرضيتين٬ كذلك كانت نتائج زرع الادرار سالبة في المجموعة الضابطة. اما نتائج زرع الادرار الموجبة في المرضى (35.3%) فكانت تشير الى وجود التهاب السبيل البولي مع علاقة معنوية بنوع المرض الكلوي (الاحتمالية= 0.042). لقد اظهر التهاب السبيل البولي علاقة معنوية مع الجنس (الاحتمالية= 0.044). تضمن النمو الجرثومي الانواع التالية : E. coli (54.55%) وPseudomonas aeruginosa (22.73%) وKlebsiella pneumoniae (9.09%) وProteus mirabilis (9.09%) وعزلة واحدة فقط من Morganella morganii (4.55%). اختلفت العزلات البكتيرية في حساسيتها للمضادات الحياتية والتي اشتملت على السفترياكزون والسفتازديم والجنتامايسين وحامض الناليدكسك والتراي ميثوبريم والنايتروفيورانتين. | This study was carried out between December 17, 2008 and August 25, 2009. It included 62 pediatric patients at the age range (1 - 12) years of both genders : 26 with chronic renal failure (CRF) and 36 with nephrotic syndrome (NS), who were outpatients and in - patients in the dialysis unit in both Al - Mansour pediatric teaching hospital and Child's central teaching hospital. The control group consisted of 26 children. Blood samples were collected from patients and controls. Immunological tests of interleukin - 6 (IL - 6) and erythropoietin (Epo) measurement were done by using ELISA technique. Biochemical tests, including blood urea and serum creatinine, were applied to evaluate renal function. Hematological aspects referred to anemia presence or not; by measuring PCV and Hb. The results explained significant increase in serum IL - 6 levels (P<0.001), significant decrease in serum Epo levels (P<0.001), significant increase in both urea and creatinine concentrations (P<0.001) in serum and significant decrease in both PCV and Hb (P<0.001) in NS and CRF patients in comparison with the control group. Urine samples were collected from children with both renal diseases and healthy controls. After culturing the samples on both MacConkey agar medium and blood agar medium, general urine examination (GUE) was applied regardless the type of the renal disease. GUE of both CRF and NS patients showed that casts presence in urine was not significant (p=0.056), while albuminuria was significant (P=0.049). The negative urine cultures were present in 64.5% of both patients' groups. The control group showed no bacteria in urine. The positive cultures in patients (35.5%) were indicating UTIs with a significant relation with the type of renal disease (P=0.042). UTIs seemed to be related with gender (P=0.044). The bacterial growth included the following isolates : E. coli (54.55%), Pseudomonas aeruginosa (22.73%), Klebsiella pneumoniae (9.09%), Proteus mirabilis (9.09%) and Morganella morganii in one case only (4.55%). The bacterial isolates were different in their sensitivity to antibiotics, which included Ceftazidime, Cefteriaxone, Gentamycin, Nalidixic acid, Nitrofurantoin and Trimethoprime).

التحليل لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من مصادر التليف الحوصلي وغير التليف الحوصلي

اسم المؤلف: ايمان ثامر جار الله
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - البكتريا
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study concerned with illustration the molecular pattern of virulence genes in P. aeruginosa isolated from cystic fibrosis (CF) and compared them with those of none CF isolates (different nosocomial infections). The study involves the following steps : · Twenty - six isolates of P. aeruginosa were obtained from patients submitted to Baghdad hospitals/Iraq during the period between July 2013 until December 2013. These isolates were distributed as 6 isolates from blood, 4 isolates from urinary tract infections andsputum (for each), 3 isolates from wounds and ear infections (for each), 2 isolates from bronchial wash of patients suffering respiratory tract infection beside 4 isolates from cystic fibrosis patients. · The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar and P. aeruginosa agar then diagnosed by performing some morphological and biochemical tests. The second diagnoses was done by api 20NE system followed by Genotypic diagnoses usingpolymerase chain reaction (PCR) depending on a housekeeping gene rpsl gene (amplified size was 201bp). The results revealed that all the 26 isolates were P. aeruginosa.· Genotypic detection of many virulence factors related to P. aeruginosa was performed using conventional PCR. They included : gene coded for exoenzyme S (exoS, 504bp), exotoxin A (toxA, 352bp), two phospholipases C encoded by (plcH, 307bp) and (plcN,466bp), alginate (algD, 1310bp), (lasB, 300bp), putative silidase (Pseudoaminidase, 1500bp) and Neuraminidase (nan1, 1316bp). · The results revealed that the most frequently gene was exoS when it was detected in 21/26 (80.7%) and distributed between 19 in different clinical source and 4 in CF samples. For toxA the rate was 19/26 (73%) and all CF isolates were positive to this gene as with exoS. The percentage of other genes were, plcH 13/26 (50%), plcN 18/26 (69.2%), algD17/26 (65.3%) {All CF isolates were positive}. For lasB gene it was detected in 8/26 (30.7%), sialidase (Pseudoaminidase) in 4/26 (15.38%) isolate, one of source was CF and the others distributed between bronchial wash and ear infections. The last gene was nan1 and only one CF isolate 1/26 (3.8%) harbored this gene.· DNA sequencing and phylogenic analysis for exoS, toxA, plcH, algD, nan1 and sialidase (Pseudoaminidase) genes were done using Pairwise alignment and Tamura - Nei genetic destine model, UPGMA (Un weighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) tree build, respectively. Results of DNA sequencing for exoS and toxA genes revealed that most isolates display different point mutation as compared with the NCBI data. Point mutation type transversion was detected in residue no. 17 base 52 in P. aeruginosa exoSBW1 isolated from bronchial wash causes alteration of Thyamine to Adenine and conversion of Leucine residue to Glutamine. Another point mutation type transition occured in exoSB1, exoSU1 and exoSCyF1 in residue no. 18 base 55 when Guanine converted to Adenine cause conversion of Serine residue to Asparagine. P. aeruginosa exoSB3 and exoS CyF2 isolated from blood and cystic fibrosis, respectively, showed high similarity made them segregate within the same group or clone, while exoSU2 and U3 were within the same clone but neither with exoS U1 nor U4. · Another point mutation was detected in P. aeruginosa toxA CyF2, when nitrogen base Guanine no. 36 residue 12 was changed to Adenine causes conversion of Arginine to Histidin. Also mutation occur in toxA - CyF1, 2, 3, 4, toxA U1, 2, 3, 4 and toxA BI, BW1 whennitrogen base Adenine no. 132 residue 44 was converted to Guanine causes the conversion of Threonine to Alanine. Such difference may explain the diversity of virulence in some isolates.· DNA analysis for plcH was performed to amplified fragment related to CyF3. The identity of Pairwise alignment with the origin gene related to NCBI was 100% and no mutation was detected. · For algD, result revealed that a point mutations were detected in many residuse but the interest finding is that all of these mutations were silent specially in CyF2, since it didn’t change amino acid sequence, while the mutation that was delectated in P. aeruginosa algD Ear1 causes alteration in amino acid sequence when nitrogen base Guanine no. 388 residue 130 was converted to Adenine thus the conversion of Glycine to serine. The percentage of Pairwise identity was 95.4% which represent the percentage of identical residues in the alignment including gap and non gap residues .· For nan1 gene, many mutations were noticed in this amplified fragment but some of them were silent while others were defective cause alteration in frame translation in many residues. · DNA sequence for silidase (Pseudoaminidase) gene related to P. aeruginosa CyF3 and Pairwise alignment for this gene was performed (forward and reverse sequences data). The data was compared with control obtained from NCBI gene bank. The identity was 82% with some gaps occur in identity due to differences in base pair sequence as a result from changing some nitrogen bases. Most of these mutation were silent mutation after translated to amino acid. Others were not.· From all above results, it could be said that some isolates displayed highly virulence pattern specially in CF isolates as compared with non - CF isolates. P. aeruginosa was unique in harboring all the detected virulence genes and most of them were mutant.

دراسة مقارنة بين تشظي DNA النطف والموت الخلوي المبرمج لبيوت الطاقة وعلاقتهما بعوامل العقم الذكري A comparative study between sperm DNA fragmentation and mitochondrial apoptosis correlated to male infertility factors

اسم المؤلف: الاء محمد ياسين
اسم المشرف: عبد الامير ناصر غلوب محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
الجامعة: الجامعة المستنصرية - كلية العلوم
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر بيوت الطاقة ((mitochondria والحمض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين (DNA) للنطف عوامل تنبؤ اساسية لحيوية النطفة المسؤولة عن نجاح الحمل سواء كان بالطريقة الطبيعية او عن طريق التقنيات المساعدة للانجابART) ) . لذلك هدفت هذه الدراسة لتقييم الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطفSperm mitochondrial apoptosis) SMA ) وتشظي المادة النووية للنطف SDF((Sperm DNA fragmentation. ثم تحديد العلاقة بينهما وبين عوامل العقم الذكري للسائل المنوي, وايضا ايجاد العلاقة بين نتائج فحص Acridinie orange (AO) وفحص الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطف (SMA). اجري تحليل السائل المنوي ل (85) ذكر, وكان عدد الذكور من ذوي نوع العقم الاولي (52) , ومتوسط اعمارهم (1.42± 32.13) سنة , وعدد الذكور من ذوي العقم الثانوي (33) , وبمعدل عمري قدره (1.85± 35.22) سنة , تم تقسيم الذكور الى عدة مجاميع على اساس عوامل العقم الذكري لسائلهم المنوي حسب معايير منظمة الصحة العالمية لعام (2010) عدا شكل النطف تم حسابه اعتمادا عى معايير منظمة الصحة (WHO) لسنة (1999). ايضا تم اجراء فحص الموت الخلوي المبرمج للمايتوكوندريا (SMA) لجميع الذكور بواسطة عدة تصبيغ المايتوكوندريا , وفحص تشظي المادة الوراثية بواسطة فحص (AO) وفحصت خلايا النطف المصبغة بواسطة (Fluorescent Microscope). اظهرت نتائج هذه الدراسة زيادة معنوية في الموت الخلوي المبرمج لمايتوكوندريا النطف (SMA) بطيئة الحركة التقدمية (Asthenozoospermia), وحالات النطف قليلة العدد وبطيئة الحركة التقدمية (Oligozasthenozoospermia), وحالات النطف قليلة العدد بطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل (Oligozasthenoteratozoospermia), بينما اظهر الذكور ذوي السائل المنوي طبيعي النطف والذكور ذوي النطف بطيئة الحركة التقدمية مشوهة الشكل (Asthenoteratozoospermia) والذكور ذوي حالات النطف قليلة العدد مشوهة الشكل زيادة غير معنوية (P>0.05) في نسبة (SMA) بالمقارنة مع المجاميع الاخرى. بالاضافة الى ذلك, اظهرت هذه الدراسة علاقة سلبية معنوية (P<0.05; r= - 0.94) بين الحركة التقدمية الكلية وبين نتائج فحص (SMA) في مجموعة الذكور ذوي النطف المشوهة (Teratozoospermia) , بينما كانت العلاقة سلبية غير معنوية(P>0.05) بين الصفات اعلاه مع تشظي المادة النووية (SDF) . اضافة الى ذلك اظهرت الدراسة الحالية ان الموت الخلوي المبرمج وتشظي المادة النووية كان باعلى النسب في حالات العقم الذكري التي يشترك فيها عامل عقم بطئ الحركة التقدمية. ايضا, تم ملاحظة اختلافات غير معنوية (P>0.05) في تشظي المادة النووية بين مجاميع عوامل العقم الذكري. على اية حال, كان التشظي في اعلى مستوياته عند الذكور ذوي قلة عدد النطف مع بطئ الحركة التقدمية لها, يليها نسبة اقل من (SDF) في الذكور ذوي النطف بطيئة الحركة التقدمية, بينما ظهرت اقل نسبة من (SDF) في الذكور ذوي السائل المنوي الطبيعي (Normozoospermia). استنتجنا من هذه الدراسة ان لفحص الموت الخلوي المبرمج لبيوت الطاقة لخلية النطفة دور مهم في بيان العقم الذكري . اضافة الى ذلك, ان لكلا الفحصين (SMA and SDF ) اهمية تنبا للمرضى ذوي عامل عقم بطئ الحركة التقدمية سواء كان لوحده او مرتبطا مع عوامل العقم الذكري الاخرى. | Sperm mitochondria and sperm DNA considered essential factors to prediction of sperm viability, which is responsible for successful pregnancy in natural way or in assisted reproductive techniques. Therefore, this work aimed to evaluate the sperm mitochondrial apoptosis (SMA) and DNA integrity for infertile patients, then to assess correlation between semen parameters with both SMA and sperm DNA fragmentation (SDF), also to assume the correlation between results of SMA test and acridine orange test. Seminal fluid analysis was performed for (85) male, the number of primary infertile men were (52) with average age (32.13 ± 1.42) year, and number of secondary infertile men were (33) with an average age (35.22 ± 1.85) yearAll patients were classified into several groups according to the male infertility factors according to WHO (2010) criteria with exception for the morphology that assessed according to WHO (1999). Also, the other two tests including SMA and SDF were performed for all infertile patients. SMA was assessed by mito - capture kit assay and the SDF assessed by Acridine Orange (AO) by using of fluorescent Microscope. The results of the present study showed a significant difference (P< 0.05) in SMA assay for asthenozoospermia, oligoasthenozoospermia and oligoasthenoteratozoospermia as compared with teratozoospermia, while normozoospermia, asthenoteratozoospermia, and oligoteratozoospermia had non significant differences (P > 0.05) in SMA (%) as compared with the other groups. Moreover, a significant negative correlation (P<0.05; r= - 0.94) assessed between total progressive motility (TPM) and SMA in Teratozoospermia, while it was negative non significant (P< 0.05) correlation with SDF. Also, this study showed that SMA and SDF were in the higher percentages in males who shares asthenozoospermia male infertility factor. Non significant differences (P>0.05) had been observed among groups of male infertility factors for sperm DNA fragmentation. However, SDF was in the maximum value for male with oligoasthenozoospermia, followed by asthenozoospermia. In contrast, minimum value was assessed in group normozoospermia males. A significant increment has been observed for secondary infertility as compared to primary infertility in sperm concentration, sperm progressive motility (%), sperm normal morphology (%), and total sperm motility (%). Additionally, this study showed that SMA and SDF were in higher values in cases that shares asthenozoospermia. From the results of the present study, it was concluded that the sperm mitochondrial apoptosis assay (SMA) has an important role in investigation of male infertility. Furthermore, both SMA and DFI assays have predictive value for patients with asthenozoospermia either alone or combined with other male infertility factors.
1 ... 830 831 832 833 834 ... 1241