Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 11,619

استخدام عوامل استحثاث لانتاج مؤيضات ثانوية من بعض عزلات انواع الفطر واختبار فعاليتها الضد بكتيرية والخلايا السرطانية Penicillium والكولسترول == Use of inducing agents in secondary metabolites production from some Penicillium isolates and assay their activity against bacteria , cancer cells and cholesterol

Author name: امل صالح عبد الرضا
Supervisor name: توفيق محمد محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - College Of Education For Pure Sciences
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The current study was designed to investigate active compounds from different Penicillium isolates ,that isolated from different sources , using different media . Eleven isolates related to five species : P. chrysogenum, P.paxilli , P. citrinum, P. cosmopolitanum, P. digitatum were isolated. After primary screening was performed , the best isolates that have high antibacterial activity against gram positive and gram negative bacterial was selected. The selected isolates were cultured on fermentation media according to the suitable media for each isolate, and the active compounds were extracted using ethyl acetate as a solvent. P. cosmopolitanum and P. chrysogenum were cultured on penicillin production medium (PPM) , P. paxilli was cultured on Aspergillus complete medium (ACM) and P. digitatum and P. citrinum were cultured on solid state fermentation media consist of wheat bran . The efficiency of fungal crude extracts from each isolate against the reference strains S. aureus NCTC 6571 and E. coli ATCC 25922 and against Candida albicans (pathogenic and reference strain)was examined, and the Minimum inhibitory concentration (MIC) was determinated for each extracts.The inhibition zone of fungal extracts against E. coli and S. aureus ranged between (20 - 50) mm , and they had high activity against C. albicans ( reference and pathogenic isolate) ranged between 25 - 45 mm.Induction of secondary metabolite production by the selected fungi was carried out using biological factor (Streptomyces sp.) , chemical agent (colchicine) and physical agent by UV radiation. Apparently that the biological induction by Streptomyces isolate was the best compared with the other treatments.The results revealed that the two fungal extracts ALO1 and Apax exhibit a high antioxidant activity at low concentrations and volumes of the extract compared to ascorbic acid as control. ALO1 had radical scavenging activity (RSA%) reach 99.9% at volume 3μl , and Apax had RSA 91.6% at concentration 500μg/ml. Also, the fungal extract ,ALO1, showed a significant activity as anticancer agent against RD - cell line. The IC50 of ALO1 was 8.5μl after 24h and 23.76μl after 72h. The hypercholesterolemia ability of ALO1 in vivo and in vitro was assayed . In vivo experiment designed using female albino mice and divided into three groups each one contain 8 mice : group 1 treated with 10μl , group 2 treated with 20μl of ALO1 , and group 3 treated with normal saline as control group. The results showed that total cholesterol , triglycerides, LDL and VLDL were significantly reduced when compared with control group while the HDL level was increased in comparing with control group. The chemical analysis of the crude extracts showed that Apen2 contained 259 μg/g of penicillin G when analyzed with HPLC apparatus . Also the GC mass analysis of ALO1 showed that Docasadionic acid initialize area76.18% and Palmitic acid initialize area 15.09% from the total identified compounds.Whereas the GC mass analysis of Apax showed that Hexandioic acid initialize area40% and Stearolic acid initialize area 35.57% from the total identified compounds.In addition , it was detected the presence of penicillin biosynthetic gene cluster : pcbAB, pcbC and penDE in P. cosmopolitanum and P. chrysogenum.The result showed that gene pcbC and penDE were found in the genomic DNA but the gene pcbAB was not amplified by PCR.

دراسة تصنيفية وبيئية لحشرات نصفية الاجنحة المائية وشبة المائية Heteroptera : Hemiptera في محافظة البصرة == Taxonomical And Ecological Study of Aquatic And Semiaquatic Insects(Heteroptera : Hemiptera) In Basrah Provience

Author name: اسماء عبد الزهرة سبع العيداني
Supervisor name: ضياء خليف كريم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - College Of Education For Pure Sciences
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: Present studies dealing with the taxonomical and ecological studies of the aquatic Hemiptera : Heteroptera in eight stations in Basrah provience ,which are : Al - Medina , Al - Qurna , Basrah center ,Shat Al - Arab , Al - Zubair , Abu Al - Khasib , Al - Faw and Sullein Marsh, collection was done twise monthly during the period from April 2012 to March 2013 .Results showed the presence of nine species belonging to aquatic Hemiptera , three belonging the group Gerromorpha and six the group Nepomorpha,as follows : Group : Gerromorpha(Popov,1971)Family : Gerridae ( Leach , 1815)1 - Aquarius nebularis(Schellenberg,1800)Family : Mesoveliidae(Douglast and Scott , 1867 )2 - Mesovelia vettigera( Horvath , 1895 ) ( apterous )M .vettigera( Horvath , 1895 ) ( macropterous )Family : Macroveliidae3 - Macrovelia hornii(Uhler , 1872 )Grouop : Nepomorpha(Popov,1968)Family : Nepidae ( Latreille , 1802 )4 - Nepa cinerea( Linnaeus , 1758 )Family : Corixidae ( Leach,1815 )Subfamily : Cymatianiae ( Walton , 1940 )5 - Cymatia bonsdorffii(Sahlberg , 1819 )Subfamily : Corixinae ( Leach , 1815 )6 - Sigara(Vermicorixa) latelaris ( Leach , 1815 )Family : Belostomatidae ( Leach , 1815 )7 - Lethocerus fakir(Mayr , 1852)Family : Notonectidae ( Latreille , 1802 )8 - Anisops sardeus(Herrich - Schaeffer , 1849)AbstractBFamily : Pleidae ( Fieber , 1851 )9 - Plea leachi(McGregor and Kirdaldy,1899)Among the collected species ,six were regarded as new records to the Iraqi fauna of this order,they were : A. nebularis,M. vettigera( macrpterous) , M . vettigera( apterous), Ma.hornii , N.cinerea , C.bonsdorffii andP.leachi.Study also deal with the measuring of some ecological aspects like air and water temperatures , salinity , pH and dissolved oxygen ,and their effected on the monthly distribution of the aquatic Hemiptera. Temperature was the most effective aspect in the monthly distribution of the insects ,as the lowest numbers were recorded in Summer months and the highest number were in Winter months , the ranges of the air temperatures were 9 - 43º C and water temperatures were 2 - 33º C .The highest concentrations of salinity was recorded in Al - Zubair , Abu Al - Khasib and Al - Faw reached to 35g/l in Al - Zubair in July , the pH ranges were the same in all stations and was alkalid , their ranges were 7.3 - 7.8 , about the dissolved oxygen it was low and same in all stations except in Sullein Marsh which reached to 11 mg/l in January .The concentration of some heavy metals in water also studied like Fe, Pb, Cu and Zn , the highest concentrations were to Fe and Zn in Basrah center and Al - Zubair, and the highest concentration for Fe in Al - Zubair reached to 6362.21μ/L in August, while highest concentration for Zn in Basrah center reached to 1365.92μ/L in July, while in the other stations the concentrations were lowest .The study also used the water boatmen Sigara latelaris(Leach,1817) as bioindicators of heavy metals pollution in the water of Basrah provience , and taken Sullein marsh as control , and measuring the concentrations of the heavy metals in insects tissues , water and sediments , the results showed that the insects collected from the water of the center of the city can accumulate Fe andAbstractCZn in their tissues and the highest concentrations reached to 3562.16 and 3778.12 μ /gm for Fe and Zn in July , while in the insects taken from Sullein marsh were 286.25 and 285.17 μ /gm .The concentrations of heavy metals in water and sediments of the city center were measured and the highest concentration was for Fe and Zn , and reached to 1569.91 and 1365.91 μ /L of the water of city center , while reached to 215.01 and 223.14 from the same metals in the water of Sullein marsh , the concentrations of the same metals were recorded in sediments of the city center and reached to 2865.16 and 1982.56 μ /gm for Fe and Zn , and the highest concentrations of the same metals in Sullein marsh were 418.57 and 393.74 μ /gm .

دراسة تاثيرالسمية النباتية والوراثية لتراكيز مختلفة من الاوكسينات ومضادات التلوث في استحثاث الكالس الاولي لنخيل صنف الحلاوي. (Phoenix dactylifera L.) التم == Assessment of Phytotoxicity and Genotoxicity of different Auxins concentrations and decontamination agents on initiation of date palm (Phoenix dactylifera L.) primary callus of Hillawii cv.

Author name: اسراء عبد الرزاق حميد السامر
Supervisor name: صبيح داود محمد العطبي | محمد حمزة عباس
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Tissue
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The present study was conducted to evaluate the effect of different concentrations of the growth regulators 2, 4 - D; Dicamba and NAA on the induction of date palm (Phoenix dactylifera L.) primary callus Hillawii cv., by analyzing morphological, biochemical; anatomical and molecular responses. Three concentration of 2, 4 - D (10; 50 and 100 mg/L), Dicamba (1; 5 and 10 mg/L) and 30 mg/L of NAA were examined during the course of this study. in addition, several antimicrobial agents were selected to evaluate their morphological and biochemical impacts on the primary callus of date palm including the antibiotics (Gentamycin 50 mg/L and Chloramphenicol 50 and 100 mg/L), as well as, the fungicides (Switch 1 g/L and Beltanol 1 ml/L), After induction of the primary callus from each treatments, the following results were obtained : 1. The results showed that the treatments with 2, 4 - D at 10 mg/L and Dicamba at 1 and 5 mg/L did not stimulate any callus growth over the time of incubation on MS medium.2. It was evident that the treatments of different growth regulators have a significant effect on the initial period (day) for callus initiation, the shortest period have been obtained with the low concentration of 2, 4 - D (50 mg/L) and Dicamba (10 mg/L) which were 67.57 and 66.75 days, respectively, while the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) led to increase this period significantly up to 120 days.3. Both fresh and dry weight of date palm primary callus decreased significantly at the treatment of high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) up to two folds compared to the treatment at low concentration of 2, 4 - D (50 mg/L), similar trend of results were found with browning percentage and intensity.4. Biochemical analysis of produced date palm primary callus revealed that the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) led to a significant increase in the total content of carbohydrates; Proline, Peroxidase activity and Phenolic compounds which considered as a stress indicators, and another decrease of total soluble proteins and free amino acids was accompanied with this treatment compared to the same growth regulator at low concentration and Dicamba treatments.5. Anatomical study revealed that asignificant damage was caused by the high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L) on date palm primary callus, this damage was evident from the abundant and distribution of tannins compounds across the primary callus tissues, thus, was accompanied with high percent of browning, compared with the treatments of 2, 4 - D at low concentration, Dicamba and NAA.6. The analysis of Protein profile revealed the similarity between the patterns of control treatment (juvenile leaf of Hillawii cv.) and 2, 4 - D at low concentration, as well as, Dicamba. Similarity indices results for protein profile of date palm primary callus proved the genetic similarity of 100% between control treatment and both 2, 4 - D (50 mg/L) and Dicamba ones, while, the lowest similarity percentage was observed with high concentration of 2, 4 - D (100 mg/L).7. The results of RAPD marker analysis of the extracted genomic DNA form date palm primary callus using four deca oligonucleotide primers showed the efficiency of three primers (OPAR3; OPAR8 and P.650) in their amplification of examined DNA,. RAPD profile revealed an identical matching between control treatment and 2, 4 - D at low concentration, followed by Dicamba and NAA auxins, while, the increasing in 2, 4 - D concentration up to 100 mg/L led to disappearance and the appearance of new DNA bands compared to control treatment, with a highest genetic distance among other treatments.Similarity coefficient analysis showed that the highest genetic similarities were found between control treatment and 2, 4 - D (50 mg/L) with similarity index of 96% , followed by Dicamba and NAA treatments with indices of 74 and 66%, respectively, the lowest similarity index was obtained between control and 2, 4 - D at high concentration which was 27%.8. The screening results of antimicrobial agents showed that the treatment with Switch fungicide (1 g/L) and Gentamycin antibiotic ( 50 mg/L) did not stimulate any callus growth over the time of incubation on MS medium supplemented with either 2, 4 - D or Dicamba.9. Beltanol fungicides (1 ml/L) treatment had a negative effect on the initiated primary callus either by 2, 4 - D or Dicamba, its treatment led to a high significant reduction in total solubleprotein and free amino acid content compared to control results, while an increase of total carbohydrates, Phenolic compounds, Proline and Peroxidase activity was detected with Beltanol fungicide.10. The Chloramphenicol treatment at low concentration (50 mg/L) showed positive results on the growth of primary callus at 2, 4 - D or Dicamba auxins according to morphological and biochemical analysis.

عزل وتشخيص بعض انواع البكتريا المكسرة للهيدروكاربونات النفطية الاليفاتية في الترسبات النفطية لمحافظة البصرة == Isolation and Identification of some species of degradable Bacteria of N - Alkanes hydrocarbons compounds in oil sludge at Basrah Governorate

Author name: استبرق عبد الحسين سلمان جدي البوغازي
Supervisor name: ميثم ايوب عبد القادر الحمداني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In the oil industries, large amounts of oil sludge are generated through the refining of crude oil. The main reason for its composition that is when exporting crude oil various kinds of oils (heavy and light ones) are mixed together for the purpose of exportation. But , the mixing process between different types cannot be fully , due to the lack of homogeneity among different quality of crude oil . So, the heavy parts of oil are precipitated to the bottom of tank and with passage of time they accumulate to be sediments that’s known as oil sludge stated at the bottom of the oil storage tank in the cleaning process , oil tanks are emptied and discharged in some spaces or reservoir (pits) located near the tanks called "oil pits". Which are places of dump excess oil of various types of oil from different oil tanks or they are close places from oil / water separating unites .From these spots, samples of two kinds of oil sludge : the bottom of oil tank (during the maintenance of the tank) and oil pits (near the unities of separating water from oil) are collected. Also, samples of soil surrounding the oil pits from five oil locations in Basrah city are collected too. Those locations are : west of Gurna, Northern Rumela, Southern Rumela, Nahar Umar, Alzubeir.At the rate of redundantly for each location and for each type of the study samples.This investigation is considered as the first which conducted in Iraq which include firstly the isolation and identification different types of bacterial species from different oil sludge, and secondly use some of them in biodegradation studies for two kinds of carbon sources of oil sludge : (oil sludge of tank bottom , oil sludge of oil pits) .Oil degrading bacterial species have been isolated on a selective mineral salt medium Bushnell and Hass Mineral Salt Medium (BHMS), supplemented with a carbon source. They are also identified depending on the Morphology and biochemical characteristics; four genus of bacteria (out of 89 bacterial isolates of oil sludge from the tank bottom)Bare identified. They include : 32 Pseudomonas spp. , 27 Rhodococcus spp. 21 Bacillus spp. , 9 Arthrobacter spp. , Also four genera of bacteria (out of 101bacterial isolates of oil sludge from the oil pits) are identified. They include : 41 Pseudomonas spp. 27 Rhodococcus spp. , 22 Bacillus spp. 11 Arthrobacter spp. , , While 8 species and 3 genus of bacteria (out of 259 bacterial isolates of the soil surrounding the oil pits) are identified. They include : 41 Aeromonas spp., 39 Corynebacterium spp., 39 Pseudomonas aeruginosa, 36 Bacillus spp., 33 Micrococcus leteuc, 23 Enterobacter intermedius, 22 Pseudomonas fluorescens, 12 Micrococcus varians 7 Staphylococcus epidermidis, 4 Staphylococcus saprophyticus,3Staphylococcus aureus .The biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and two compounds of Pristane and Phytane are measured. Also, the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and the two compounds of Pristane and Phytane are measured for each four genus which were isolated from the oil sludge pits, and it is also done for one isolated genus from the soil surrounding the oil pits. The measuring process was fulfilled as a comparative study with the control flasks. Thus, the oil sludge (tank bottom ) was used as a source of carbone in the first experiment While, the oil sludge (oil pits) was used as a source of carbone in the second experiment . The incubate time of the experiment is 27 days during which a lost of the percentage of hydrocarbon compounds each 9 days are recorded by using( Capillary Gas Chromatography ). The results showed the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard toCbacteria 73.8 % Pseudomonas spp., 70.3 % Rhodococcus spp. 65.7 % Arthobacter spp., 55.6 % Aeromonas spp.,51.5 % Bacillus spp., Whereas, the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria 80 % Pseudomonas spp., 74.9 % Aeromonas spp., 70.4 % Rhodococcus spp., 64.8 % Arthobacter spp.,55 % Bacillus spp., While , The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard to bacteria 73.7 % Pseudomonas spp.,70.3 % Rhodococcus spp. 65.6 % Arthobacter spp., 55.3 % Aeromonas spp. ,51.2 % Bacillus spp., Whereas, The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria79.2 % Pseudomonas spp., 73.8 % Aeromonas spp., 69.2 % Rhodococcus spp.,63.7 % Arthobacter spp., 53.7 % Bacillus spp. It was found that there is approximately match between the biodegradation of mole percentage by using the area and those by using the concentration for each component .

التحلل والمعالجة الاحيائية للمركبات الهيدروكاربونية النفطية بوساطة سلالات Streptomyces وNocardiopsis المعزولة من الترب الملوثة بالنفط في محافظة البصرة - العراق == Biodegradation and bioremediation of petroleum hydrocarbons by Streptomyces and Nocardiopsis strains isolated from oil contaminated soil of Basrah Governorate - Iraq

Author name: احمد عبد برغال الاسدي
Supervisor name: كوثر هواز مهدي | نادية عبد الامير المظفر
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
University: University Of Basrah - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: سبعة سلالات من البكتريا الخيطية تعود الى جنسي Streptomyces وNocardiopsis عزلت من ترب شركة مصافي الجنوب الملوثة بالنفط الخام في البصرة جنوب العراق، وقد تم اختبار قدرتها على النمو بوجود النفط الخام باستعمال وسط ملحي سائل مزود بالنفط الخام كمصدر وحيد للكربون. شملت السلالات على S. variabilis 7525 وS. variabilis SW75 وS. cellulosae XFB - T وS. parvus S86 وS. bacillaris S4BW2 وS. flavoviridis VITHM - 1 وN. synnemataformans ITD - 3 بنسبة تشابه من 99٪ الى 100٪. في هذه الدراسة تم العثور على سلالات جديدة من البكتريا الخيطية المعزولة من التربة الملوثة شخصت باستعمال تحديد تتابعات جين الحامض النووي الريبوزي 16S rRNA وقد اظهرت السلالات قدرات مختلفة على تحلل النفط الخام في الوسط الملحي السائل من 50.2٪ الى 72.4٪. كما تم تقييم تاثير الظروف الزرعية من درجة الحرارة والدالة الحامضية وتركيز النفط الخام والعناصر النزرة في نمو سلالات البكتريا الخيطية وتحلل النفط الخام، وقد لوحظ ان اعلى نمو للخلايا واعلى تحلل للنفط الخام كان 80٪ في ظروف زراعة مثالية ( درجة حرارة 30 ᵒم ودالة حامضية 7 بعد 10 ايام من الحضن وزادت هذه النسبة الى 85٪ من قبل السلالة S. cellulosae XFB - T بعد اضافة العناصر النزرة.في حين اظهرت نتائج اختبار التحلل الحيوي للنفط الخام في التربة من قبل سلالات البكتريا الخيطية منفردة بعد 60 يوما من الحضن تحت ظروف مختلفة ، اظهرت ان اعلى قيمة للتحلل كانت 87 ٪ من قبل النوع S. bacillaris عند درجة حرارة 30 ᵒم وحجم لقاح مضاف 10مل/ 25غم تربة ومستوى رطوبة 40٪.المعالجة الاحيائية هي ستراتيجية فعالة لتنظيف المواقع الملوثة بالهيدروكربونات. ونتيجة تاثر الكائنات الحية الدقيقة من تلك التربة يحدث لها اضطراب وبالتالي يتم انتقاء الاحياء المجهرية القادرة على استهلاك الهيدروكربونات لاستخدامها في هذه التقنية الفعالة في التعامل مع الملوثات الهيدروكربونية. الهيدروكربونات التي تتفاعل مع نسجة التربة والكائنات الحية الدقيقة هي التي تحدد مصير الملوثات وطبيعتها الكيميائية والقدرات الهادمة للميكروبات. الاثار المحتملة لنشارة الخشب، وخليط من روث الابقار والغنم وتعديل المكملات الغذائية لتحفيز الكائنات الدقيقة الاصلية وزيادة المعالجة البيولوجية للهيدروكربونات، هذه العملية تم اجراءها باستعمال طريقة المعالجة خارج الموقع بطريقتي الكومة والمفاعل الحيوي، بخلط التربة الملوثة مع نشارة الخشب والروث الحيواني ودعم التربة بالمغذيات والعناصر النزره مع توفير الرطوبة الملائمة والظروف المواتية لنمو الكائنات الحية الدقيقة كما قدمت التهوية الصناعية للتربة في الكومة والمفاعل بوساطة شبكة من الانابيب المثقبة لمحاكاة المعالجة الحيوية التي استمرت مدة 90 يوما.خلال تلك الفترة، رصدت الهيدروكربونات النفطية الكلية (TPHs) وازالة الالكانات الاعتيادية والتغيرات في المجتمعات البكتيرية. وقد اظهرت النتائج ان (TPHs) قد انخفضت من 52غم/كغم الى 10.6 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 79.6٪ ومعدل تحفيز كان 71.4٪ في تجربة الكومة ومن 52غم/كغم الى 13.5 غم / كغم بمعدل تحلل بلغ 74٪ ومعدل تحفيز كان 63.5٪ في تجربة المفاعل الحيوي. وخلال مدة 45 يوما من الاختبار بلغت اعداد الكائنات الحية الدقيقة من البكتيريا المضافة والمستوطنة التي تحلل المواد الهيدروكربونية اعلى مستوى لها 2 × 710 خلية/ غم و1.1 × 710 خلية/ غم في الكومة والمفاعل الحيوي على التوالي.بناء على هذه المعطيات، نستنتج ان المعالجة الحيوية خارج الموقع افضل ستراتيجيه غير مكلفة وفعالة وصديقة للبيئة وبالتالي قد توفر خيارا قابلا للتطبيق لمعالجة التربة من الملوثات الهيدروكربونات النفطية. | Seven actinomycetes strains from genera Streptomyces and Nocardiopsis isolated from hydrocarbon contaminated soil in Basra Governorate, Iraq were selected for their capacity to grow in the presence of crude oil. Their growth rates and biodegradation ability were investigated in mineral salt media supplemented with light Remella crude oil. These strains consist of Streptomyces variabilis 7525, Streptomyces variabilis 5W75, Streptomyces cellulosae XFB - T, Streptomyces parvus S86, Streptomyces bacillaris S4BW2, Streptomyces flavoviridis VITHM - 1 and Nocardiopsis synnemataformans ITD - 3, that the sequence identity range from 99% to 100%. Our study find a new actinomycetes strains isolated from contaminated soil. these strains appears different capacity on the degradation of crude oil in mineral salt media , the highest was found to vary from 50.2% to 72.4%.The effect of the cultivation factors (temperature, pH, and concentration of crude oil and trace elements ) on growth of the actinomycetes strains and crude oil degradation was evaluated. The highest cell growth and the amount of crude oil degraded 80% were observed in optimized cultivation conditions (30oC and initial pH 7) after 10 days, this ratio reached to 85% by addition of trace elements solution at same condition by S. cellulosae XFB - T.The biodegradation test lasted 60 days in soil by actinomycetes strains at different factors shown the highest of the crude oil was removed in experiment that inoculums with 10ml of each bacterial strain, value 87% by Streptomyces bacillaris S4BW2 at 30oC. Bioremediation is an efficient strategy for cleaning up sites contaminated by hydrocarbons. Microorganism of soil is affected by hydrocarbon disturbance thus selective enrichment of hydrocarbon utilizers occurs. The technology is very effective in dealing with petroleum hydrocarbon contamination. Hydrocarbons react with the soil matrix and microorganisms determining the fate of the contaminants relative to their chemical nature and microbial degradative capabilities. The potential effects of sawdust, and mixture of cow and sheep dung as amendment nutrient supplements to biostimulate autochthonous microflora and augmentation for hydrocarbon bioremediation were investigated in test biopile and bioreactor. The soil was ground and fluffed by admixture of 1.5% sawdust, then supplemented with the necessary minerals and watered to provide conditions favoring microorganism growth industrial aeration was provided in pile by system of a abundant perforated drainage - pip network to simulate bioremediation treatments through a 90 - day period. During this period, we monitored total petroleum hydrocarbons (TPHs) and n - alkanes degradation and changes in bacterial communities. The (TPHs) had been reduced from 52 to 10.6 g/kg (79.6 %), the rate of Biostimulants Efficiency (BE) was (71.4%) in biopile and from 52 to 13.5 g/kg (63.5 %) in bioreactor . In soil, the dominant microorganism population comprised Gram - positive bacteria from actinomycete group and autochthonous microorganisms which decompose hydrocarbons reached highest level 2 x 107 and to 1.1 x 107 CFU/g at 45 days in biopile and bioreactor respectively . Based on these data, the study conclude that is ex situ ( Biopile and bioreactor ) experiment the best strategy, inexpensive, efficient, and environmentally friendly and may thus offer a viable choice for petroleum hydrocarbons - contaminated soil remediation.

دراسة للطفيليات المعوية المعزولة من الخضروات المطرية من بعض اسواق مدينة بغداد

Author name: وسن عداي مهدي المرسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: A study was carried out during the period from November 2010 to October 2011 to detect the intestinal parasites which contaminate the common fresh vegetables. A total of 303 samples were taken from three wholesale markets and three retail markets, in Baghdad province. Ten kinds common vegetables were selected. These vegetables were Celery (Apium graveolens); Parsely (Patroselinum crispum); Garden cress (Lepidium sativum); Leek (Allium porrum); Radish (Raphanus sativus); Lettuce (Lactuca sativa); Spinach (Ipomoea aquatica); Beet (Beta vulgaris); Mint(Mentha spicata) and Cabbage (Brassica oleracea).Sedimentation and floatation techniques were used for samples examination. Three different solutions (ZnSO4, saturated NaCl , saturated sucrose ) were used in floatation technique. The present study has been shown that the collected samples of vegetables were contaminated with sixteen species of intestinal parasites. It was found that the percentages of contamination with these parasites were as following : (Giardia lamblia) (29.4%), Entamoeba histolytica(24.5%), Entamoeba coli(16.9%), Balantidium coli (8%), coccidia(9.9%) and Blastocystis hominis(0.7%). For intestinal helminthes Ascaris lumbricoides (15.6%), Toxocara spp.(10.3%), Fasciola spp. (5.3%), Schistosoma haematobium (1.7%), Schistosoma masnsoni (1.4%), Taenia spp. (4.7%), Diphyllidum caninum (3.9%), Trichuris trichiura (3.3%), Enterobius vermicularis (6.9%) and Nematoda larvae (6.3%).The present study revealed that the percentage of contaminated vegetables by using sedimentation technique (72.3%) was significantly higher than that of flotation techniques (53.1%). Additionally it was found that, the different kinds of vegetables showed a significant difference in the percentages of contamination with the parasites in both techniques. Thus, the percentage of contaminated Garden cress was (93.5%), (72.4%) in both sedimentation and flotation technique respectively, while Cabbage showed (50%), (36.7%) respectively.A significant high percentage of contamination was recorded in Al - Nahrin wholesale market (89.2%) in comparison with low percentage (59.4%) in Al - Rasheed wholesale market. Additionally, it was found that the percentages of contaminated vegetables in wholesale (76.26%) were significantly higher from that of retail market (64.76%).The present study, also, showed that the percentage of detection of parasites by using ZnSo4 solution (31.2%) was more efficient than that showed by saturated sucrose (8.9%). Additionally; the soaking with normal saline (47.83%) showed a higher percentage of contamination than that by using distilled water (17.39%).The percentages of seasonal contamination were varied significantly, therefore, it was found that spring showed the highest percentage (29.7%) while summer the lowest (20.9%). The washed samples of Garden cress which obtained from the three wholesale markets, reduced the percentages of contamination with parasites but did not remove the parasites completely. Therefore, a significant difference has been noticed between washed (56.76%) and unwashed samples (76.66%).Concerning, the percentages of infections with intestinal parasites, it was found that the medical center (14 July) showed (29.4%) while Al - Ameria center (19.2%). Furthermore, the percentage of parasites infections was significantly higher in the summer (46%) than in winter (12.67%).The present study indicated that there were a positive coordination between the high percentages of contaminated vegetables and the high percentages of infection in the medical centers as in the case of G.lamblia and E.histolytica.Finally, it could be conducted that the contaminated vegetables played an important role in transmission of intestinal parasites to human, particularly, when these vegetables were eaten fresh without sterilization or good washing.

دور بعض اجناس الساينو بكتريا في التحلل الحيوي لبعض المركبات النفطية

Author name: محمود خلف صالح الجبوري
Supervisor name: علي صالح حسين الجبوري | اياد محمد علي فاضل العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: Tikrit University - Faculty Of Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Salahaddin
First pages:
Abstract: تناولت الدراسة عزل وتشخيص ثلاثة اجناس من السيانوبكتريا من بيئات التربة والمياه العذبة في محاولة لمعرفة دور هذه الاحياء في عملية التحلل الحيوي للمركبات الهيدروكاربونية وهذه الاجناس هيNostoc sp. , Anabaena sp. ,Microcyst sp. واستخدم نوعان من المركبات الهيدروكاربونية هي نفط كركوك الخام وزيت الغاز.بينت النتائج ان لجميع عزلات السيانوبكتريا المختبرة القدرة على استحلاب واسع للمركبات الهيدروكاربونية في النسب 2%,1%,0.5% في العزلات الحاوية على الحويصلة المغايرة ، بينما كانت النسب 1%,0.5% هي اكثر استحلابا في الجنس Microcyst sp. غير الحاوي على الحويصلة . في حين لم تكن العزلات ذات قدرة عالية على الاستحلاب في التركيز5% . وقد اظهرت التحاليل المجراة باستخدام جهاز طيف الاشعة تحت الحمراء تغيرا واضحا في تركيب هذه المركبات النفطية.كما تناولت الدراسة تاثير هذه المركبات في بعض الفعاليات الفسلجية للسيانوبكتريا مثل كمية الكلوروفيل(A) وبعض التغيرات المظهرية والخلوية في السيانوبكتريا مثل تكرار الحويصلات المغايرة ، وقد بينت النتائج ان المركبات النفطية ادت الى اختزال كبير في نسبة الكلوروفيل (A) حيث كان التناسب عكسيا بين نسبة الكلوروفيل وتركيز المركب الهيدروكاربوني . كما ادت المركبات الهيدروكاربونية الى زيادة كبيرة في عدد الحويصلات المغايرة ، وان النسب 1%,0.5% من هذه المركبات كانت الاكثر تاثيرا في زيادة عدد الحويصلات .كما تناولـت الدراسة اجراء اختبار البقائية للـسيانوبكتـريا في التراكيــز 80,60,40,20 ) % ) من النفط الخام وزيت الغاز وقد لوحظ ان بقائيـة الاجناس في زيت الغاز كانت اعلى منها في النفط الخام مما يدل على ان تاثير زيت الغاز كان اقل من تاثير النفط الخام .

الخصائص البيئية لمياه الصرف في معمل دباغة بغداد - العراق

Author name: علياء سلمان مهدي
Supervisor name: ميسون مهدي صالح الطائي | مجيد حسن
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Education For Pure Sciences
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:

دراسة تشريحية ونسجية وكيمونسجية مقارنة للغدة الدرقية وجار الدرقية في نوعين من الفقريات العراقية (بيز ابن عرس، Herpestes javanecus والقنفذ طويل الاذن ، Hemiechinus auritus) باستعمال الواسم Anti - Calcitonin, code 140778) ) == Study of Thyroid and Parathyroid Gland in Two Iraqi Vertebrates ( Weasl , Herpestes javanicus and Long - Eared Hedgehog , Hemiechinus auritus) Using Marker (Anti - Calcitonin, code 140778)

Author name: رنا علاء عبد الحميد هايس العامري
Supervisor name: حسين عبد المنعم داود
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Anatomy
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التعرف على الوصف التشريحي والتركيب النسجي والكيمو نسجي - المناعي للغدتين الدرقية وجار الدرقية لنوعين من اللبائن العراقية ممثلة ب بيز ابن عرس ( ( Herpestes javanicus والقنفذ طويل الاذن ( Hemiechinus auritus ) وقد استعملت تقنيات مختلفة لانجاز الدراسة .• الغدة الدرقية Thyroid Glandاظهر الفحص التشريحي للغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H. javanicus) البالغ (ذكور, اناث) ان الغدة تتكون من فصين (ايمن, ايسر) وتاخذ موقعا في منطقة العنق اسفل الحنجرة. ويتموضع فصا الغدة على جانبي الرغامى عند الحلقات (5 - 1) من حلقات الرغامى ولم يلاحظ وجود تركيب البرزخ (Isthmus) الذي يربط بين فصا الغدة , ويتباين لون الغدة بين البني والاحمر وفي الغالب تظهر بلون بني محمر(Reddish brown) يظهر فصي الغدة في شكل بيضوي او اهليجي, اظهرت نتائج الدراسة الحالية في حيوان القنفذ ( H. auritu ) تماثلا واضحا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص الوصف التشريحي باستثناء كون فصا الغدة بيضويتي الشكل.تحاط الغدة في حيوان بيز ابن عرس بمحفظة من نسيج ضام (Connective tissue) تتكون من طبقتين, طبقة خارجية External layer)) تتالف من الياف مغراوية (Collagenous fibers) وقليل من الياف مرنة ((Elastic fibers ويتخللها ارومات ليفية Fibroblast)), وطبقة داخلية ((Internal layer تتالف من الياف مغراوية يتخللها الياف عضلية ملساء Smooth muscle fibers) ) ,كما تتضمن المحفظة اوعية دموية ((Blood vessels واعصاب (Nerves), تمتد من المحفظة الداخلية حويجزات رقيقة تقسم الغدة الى فصيصات غير مكتملة . اظهرت المحفظة في حيوان القنفذ تماثلا مع المحفظة في حيوان بيز ابن عرس.يتكون نسيج الغدة الدرقية في حيوان بيز ابن عرس بصورة رئيسية من الجريبات (Follicles) والخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) واوعية دموية واعصاب. تتخذ الجريبات اشكالا متعددة منها بيضوي (Oval), ومنها دائري ((Rounded, واحيانا تظهر بشكل غير منتظم (Irregular shape), وتكون الجريبات باحجام مختلفة صغيرة, متوسطة وكبيرة . اظهر القنفذ تماثلا مع حيوان بيز ابن عرس فيما يخص حجم وشكل الجريبات. تبطن الجريبات في بيز بن عرس اما بنسيج ظهاري مكعبي واطئ بسيط ( Low simple cuboidal epithelial tissue) او نسيج ظهاري مكعبي بسيط (Simple cuboidal epithelial tissue) , بينما في حيوان القنفذ يظهر نسيج ظهاري عمودي بسيط (Simple columnar epithelial tissue) فضلا عن النسيج الظهاري المكعبي الواطئ البسيط والظهاري المكعبي البسيط . تحتوي تجاويف الجريبات على مادة جيلاتينية هي الغروان Colloid)) , وتظهر الجريبات تباينا في كمية الغروان اذ ان بعض الجريبات تكون مملؤة بالغروان والبعض الاخر يحتوي على كمية قليلة والقليل منها يظهر خاليا تماما من الغروان في كلا الحيوانين موضوع الدراسة, تنتشر في نسيج الغدة خلايا تدعى بالخلايا الجنيب جريبية (Parafollicular cells) او تسمى خلايا الكالسيتونين (Calcitonin cells) او (C - cells), وتظهر هذه الخلايا باشكال متباينة يتراوح بين الدائرية (Rounded) الى مضلعة الشكل ( (Polygonal shape, وهي تظهر اما بشكل مفرد (Single) او بشكل تجمعات (Clusters) في نسيج الغدة, وتحتل هذه الخلايا موقعين اساسيين في نسيج الغدة , الاول داخل جريبي Intrafollicular position) ) وتكون بين الغشاء القاعدي والخلايا الظهارية الجريبية والثاني بين جريبي Interfollicular position)) وتكون بين جريبات الغدة الدرقية , وتكون قليلة العدد ولم تظهر اختلافا في حيوان بيز ابن عرس عن القنفذ .اظهر التفاعل الكيمونسجي المناعي في حيوان بيز ابن عرس والقنفذ استجابة واضحة للتفاعل المناعي مع الاجسام المضادة للكالسيتونين, وظهرت الخلايا متقبلة للون البني وهو دليل التفاعل المناعي .• الغدة جار الدرقية Parathyroid Gland توجد الغدة جار الدرقية بتماس مع الغدة الدرقية وتحاط بمحفظة من نسيج ضام وهي امتداد لمحفظة الغدة الدرقية والتي تتكون من الياف مغراوية والياف مرنة ((Elastic fibers والياف عضلية ملساء واوعية دموية واعصاب . توجد الغدة جار الدرقية في موقعين طرفي قمي وطرفي جانبي. تمتد من محفظة الغدة جار الدرقية حويجزات الى داخل الغدة لتفصلها الى فصيصات غير كاملة، وتنتشر داخل نسيج الغدة. اما في القنفذ ( H.auritus ) فانها تقع ضمن نسيج الغدة الدرقية وتظهر بشكل فصوص (4 - 2) فصوص دائرية او بيضوية الشكل محاطة بمحفظة رقيقة تفصلها عن جريبات الغدة الدرقية.تم تمييز ثلاثة انواع من الخلايا في نسيج الغدة جار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس اذ تمثلت الخلايا الاكثر انتشارا بالخلايا الرئيسة ((Chief cells، والخلايا الحمضة (Oxyphil cells) وخلايا الماء الشفافة ( (Water - clear cellsوهي تماثل الخلايا في نسيج القنفذ وتترتب بشكل حبال خلوية ضمن نسيج الغدة.اظهرت الغدة جار الدرقية في بيز ابن عرس استجابة للتفاعل الكيمو نسجي المناعي, اذ ظهرت خلايا الغدة متقبلة للون البني دليل التفاعل المناعي اذ تظهر الاستجابة المناعية للخلايا على مستوى السايتوبلازم والغشاء البلازمي في الخلايا الرئيسة ( (Chief cells, واظهرت الاستجابة المناعية في الغدة للقنفذ اختلافا بالنسبة لشدة استجابة الخلايا حيث كانت اقل من حيوان بيز ابن عرس .اوضحت نتائج الدراسة الحالية الخاصة بتحليل الاحماض الامينية في مستخلص الغدة الدرقية وجار الدرقية في حيوان بيز ابن عرس (H.javanicus ) (ذكور، اناث), تشخيص (13) حامضا امينيا في الذكور و(11) حامضا امينيا في الاناث, اما في حيوان القنفذ H.auritus (الذكور، الاناث), فقد تم تشخيص (12) حامضا امينيا في كل من الذكور والاناث. | Anatomical examination of thyroid gland in adult (males &females) H. javanicus revealed that the gland consist of two lobes (right & left), situated below the layrnx in neck region. The two lobes located at the sides of trachea (1 - 5) rings of trachea. they appear without Isthemus. The colour of the gland is reddish brown. The shape of the lobes either to be oval or elliptical. On the other hand the thyroid gland in H. auritus showed a clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the oval shape of the gland. Thyroid gland of H. javanicus surrounded by capsule of connective tissue consist of external layer of collagenous and elastic fibers, fibroblast and internal layer consist of collagenous fibers with smooth muscle fibers, the capsule also contain blood vessels and nerves. Thin trabeculae extend from the capsule divided the gland into incomplete lobules. The capsule of thyroid gland in H. auritus showed clear similarity with that of H. javanicus with the exception of the adipose tissue between the capsule and gland tissue in H. auritus.Histologically thyroid gland in H. javanicus consists of follicles, parafollicular cells, blood vessels and nerve. The follicles appear in different shapes (oval, rounded and irregular shapes, and have different size (small, medium and large). The thyroid gland tissue in H. auritus has the same appearance of that in H. javanicus. The follicules in H. javanicus lined by epithelial tissue either to be Lwo simple cuboidal or simple cuboidal epithelium. In H. auritus lind by Lwo simple cuboidal, simple cuboidal or even simple columnar epithelial tissue. The follicular cavities contain different quantities of colloid, and few of them lack of collid in both under investigated animals. Parafollicular cells are spreading in gland tissue; they also called calcitonin cella or c - cells. These cells have different shapes either to be rounded or polygonal shape, and found as single or clusters. They are either to be interfollicular or intrafollicular position. The immunohistochemistry reaction revealed clear positive reaction for calcitonin , and the appearance of brown colour represented evidence for the immune reaction .• Parathyroid glandResults of the present study revealed that parathyroid gland situated closely with thyroid gland in both animals under investigatin . The gland surrounded by a capsule of connective tissue represented as an extension from the capsule , which consist of collagenous fiber, elastic fibers, smooth muscles fibers and blood vessels and nerves. The parathyroid gland situated at two position (lateral terminal / apical terminal) the trabeculae wich exted from the gland capsule to the gland tissue separated the gland into incomplete. In H. auritus the parathyroid gland formed from (2 - 4) lobes with rounded or oval shapes and surrounded by thin capsule separated from the thyroid gland follicles.Three types of cells have been differentiated in the parathyroid tissue in H. javanicus represented by chief cells wich apper the most abundant in comparison with the other two types, the second type are the oxyphil cells and the third are water - clear cells, they are similar in both animals and appear as a cellular cords within the gland tissue. The immunohistochemical study in parathyroid gland of H. javanicus reveald positive reaction for calcitoninin, where ̛s the cells appear ̛s in brown color giving the evidence for the immune reaction in cytoplasm and plasma membrane of the chief cells In H. auritus there was clear immune reaction but less than H. javanicus . Result of the present study related with the amino acid analysis of the thyroid and parathyroid glands extraction in H. javanicus (mals &females) declear (13) amino acid in males and (11) in female while in H. auritus (male &females) there were (12) amino acid in both male and females.

دراسة نوعية للبكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من بيئة واخماج مستشفى عفك العام == Qualitative Study of Gram Negative Bacteria Isolated from Environment and Infections of Afak General Hospital

Author name: زينب عبد الكريم عليوي الفرحاني
Supervisor name: علي عبد الرحيم الناشي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Al-Qadisiyah - Faculty Of Education - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Qadisiyah
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع 400 عينة سريرية وبيئية من مستشفى عفك العام في محافظة الديوانية للفترة من 1/11/2012 ولغاية 31 /3/2013 لغرض دراسة نوعية البكتريا السالبة لصبغة كرام والملوثة لبيئة واخماج المستشفى ومدى حساسية العزلات البكتيرية ومقاومتها للمضادات الحيوية والمطهرات شائعة الاستخدام .اظهرت هذه الدراسة ان 236 عينة وبنسبة 59% قد اعطت نتيجة موجبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 31 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 56.37 % و206 عينة من مصادر بيئية وبنسبة 59.43% بينما كانت 164 عينة وبنسبة 41% سالبة للفحص البكتيري للبكتريا السالبة لصبغة كرام توزعت بين 24 عينة من مصادر سريرية وبنسبة 43.63% و140 عينة وبنسبة 40.57 % من مصادر بيئية من مستشفى عفك العام .كانت العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام المشخصة والبالغة 236 عزلة قد توزعت على اربعة اجناس وهي Pseudomonas شملت نوعين : P.aeruginosa 12.7% ، P. flourescens 8.5 % ، Klebsiella شملت K. pneumoniae 10.5% ، K.oxytoca 10.5% ، Serratia marcescens 3.4% ، Acenitobacterشملت A. baumanni 2.1% ، A.lwoffii 1.2% ، A.calcoceticus 0.8 %، Escherichia شملت E. coli 45.5% ، E.hermanni 4 % . كانت نسبة التلوث البكتيري في العينات السريرية الحروق والجروح قد بلغت 53.3 ، 60 % على التوالي ، بينما التلوث البكتيري في العينات البيئية المتمثلة بردهات دخول المرضى ، المطبخ ، صالات العمليات الجراحية ، ردهات الخدج وملابس العاملين في المستشفى قد شكلت النسب 66.6 ، 53.8 ، 60 ، 54.6 ، 40% على التوالي . كما اختبرت حساسية العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام اتجاه 13 مضادا حيويا وقد اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة وحساسية مختلفة تباينت حسب نوع العزلات البكتيرية وطبيعة المضاد الحيوي .كانت اعلى مقاومة اظهرتها بكتريا K.pneumoniae تليها K.oxytoca اتجاه مضاد Tetracycline اذ بلغت النسبة 96% و92% على التوالي . كما تميزت كل من بكتريا E.hermanni ، A.baumanni بمقاومتة عالية اتجاه ال Gentamycin اذ بلغت 80.3% ، 80% على التوالي اما P.aeruginosa فقاومت ال Tobramycin بنسبة عالية بلغت 90 %، بينما تميزت جميع البكتريا المعزولة في هذه الدراسة بحساسيتها اتجاه مضاد ال Imipenem . اما اختبار حساسية العزلات البكتيرية اتجاه المطهرات فقد ابدت مقاومة متفاوتة حسب نوع العزلات البكتيرية وتركيز وطبيعة المطهر وشملت المطهرات المستخدمة في التضاد الجرثومي كلا من الفورمالين والبوفيدين - ايودين والهبتين والديتول حيث كانت اعلى مقاومة اظهرتها E.coli اتجاه مطهر الفورمالين بتركيز 12.5% اذ بلغت 93.4% . درست بعض عوامل الضراوة المنتجة من الانواع البكتيرية ومنها انتاج المحفظة فوجد ان عزلات كل من بكتريا A. baumanni، P. aeruginosa ، K. pneumoniae وE.coli منتجة للمحفظة وبنسبة 40 ، 33.33 ، 100 ، 23.36 % على التوالي ، اما انزيم الهيمولايسين فوجد ان جميع عزلات A.baumanni غير منتجة لهذا الانزيم في حين جميع عزلات P. aeruginosa كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% ، اما انزيم البروتيز فوجد اعلى نسبة لانتاجه في P.aeruginosa بنسبة 100 % وادنى نسبة في بكتريا E.coli وبنسبة 14 % ، كانت اعلى نسبة لانتاج انزيم الجلاتينيز من قبل كل من A.baumanni وP.aeruginosa وبنسبة 100 % وتميزت عزلات K.pneumoniae بعدم القدرة على انتاجه . | The study included the collection of 400 clinical specimens and environmental from Hospital Afak General in the province of Diwaniyah for the period from 1/11/2012 until 3/31/2013 for the purpose of study quality the gram negative bacteria and contaminated environment and hospital infections and the sensitivity of the bacterial isolates and their resistance to antibiotics and antiseptics commonly used . This study showed that 236 sample and 59% gave a positive result for the examination of bacterial for bacteria gram negative distributed among the 31 sample sources of clinical and increased by 56.37% and 206 samples from environmental sources and increased by 59.43% while the 164 sample and 41% negative for screening bacterial for bacteria gram negative distributed among the 24 samples from clinical sources, and by 43.63% and 140 sample and by 40.57% from environmental sources of Afak General Hospital. The bacteria gram negative isolates diagnosed, amounting to 236 isolation has distributed over four genera Pseudomonas They included two types : P.aeruginosa 12.7%, P. flourescens 8.5%, Klebsiella included K. pneumoniae 10.5%, K.oxytoca 10.5%, Serratia marcescens 3.4% , Acenitobacter included A. baumanni 2.1%, A.lwoffii 1.2%, A.calcoceticus 0.8%, Escherichia included E. coli 45.5%, E.hermanni 4%. The percentage of bacterial contamination in clinical samples of burns and wounds had reached 53.3,0.60% respectively, while bacterial contamination in environmental samples of lobbies entry of patients, the kitchen, Eat surgeries, lobbies premature and clothes of hospital personnel had formed ratios of 66.6, 53.8 0.60 , 54.6 0.40%, respectively. The sensitivity of the bacteria gram negative isolates tested for direction 13 have shown antibiotic - resistant bacterial isolates and different sensitivity varied by type of bacterial isolates and the nature of the antibiotic. The highest resistance exhibited by the bacteria K.pneumoniae followed K.oxytoca direction Anti Tetracycline as the percentage reached 96% and 92%, respectively. It also marked by both bacteria E.hermanni, A.baumanni resisting the trend of high Gentamycin reaching 80.3%, 80%, respectively, and P.aeruginosa resisting the Tobramycin high proportion reached 90%, while all characterized bacteria isolated in this study sensitivity counter direction the Imipenem . The test of the sensitivity of the bacterial isolates direction disinfectants have shown resistance varying according to the type of bacterial isolates and the concentration and nature of the cleanser included disinfectants used in contrast bacterial both Formalin and Povidin - Iodine and Hibtin and Dettol had the highest resistance exhibited by E.coli direction antiseptic Formalin concentration of 12.5% reaching 93.4% . I studied some of the virulence factors produced by bacterial species, including the production of the wallet and found that all isolates of bacteria A. baumanni, P. aeruginosa, K. pneumoniae and E.coli producing capsule and by 40, 33.33, 100, 23.36%, respectively, while the enzyme was found haemolysin that all isolates A.baumanni unproductive for this enzyme, while all P. aeruginosa isolates were producing this enzyme by 100%, while the enzyme protease and found a higher proportion of production in P.aeruginosa 100% and the lowest percentage in the bacteria E.coli and 14%, the highest percentage for the production of an enzyme gelatinase by both A.baumanni and P.aeruginosa and 100% K.pneumonae isolates were characterized by the inability to produce it

تجميع وتشخيص واستخدام الهائمات الحيوانية الدقيقة من نهر الحلة في تغذية يرقات اسماك الكارب الشائع (L., 1758) Cyprinus carpio

Author name: ازهار عبد الحميد عبد الحسن
Supervisor name: مؤيد جاسم ياس العماري | عدي جاسم عبد الرزاق
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The present study was carried out in AL - Hilla River near Al mahaweel district in the middle of Iraq during autumn 2016 to summer 2017. The study included a collection of high density from microzooplankton by use special device then identified and used it as live food for early feeding common carp larva (Cyprinus carpio). The environmental factors of Hilla river tested for four seasons and ranged between 6 - 44 ˚C of air temperature, 9.5 - 30 ˚C of water temperature, 7.03 - 8.58 of pH, 921 - 1090 µm/cm of conductivity, 654.33 - 772.00 mg/l of total dissolved solids and 550.00 - 636.33 of salinity, 5.43 - 13.03 mg/l of total suspended solids, 7.5 - 10.31 mg/L of dissolved oxygen, 1.96 - 6.30 mg/l of BOD5, 1.61 - 2.49 m/s of water velocity, 5.17 - 16.80 µg/L of chloropyll - a - . The taxonomic and ecological study is done to the microzooplankton specially rotifer. There are few studies of rotifer in Hilla river, The result showed that the density of rotifera was ranged between 23ind. /L in the summer season to 65.66 ind. /L in winter season, included 65 rotifer taxa (62 species +2genera +1 class) were recorded in this study, 10 taxa (9 species + 1 genus) were recorded for the first time in Iraq and 14 taxa (13 species + 1 genus) were recorded for first time in Hilla River compared with available local studies. Keratella tropica showed the highest density of the rotifera, Lecane genus showed the highest species number (10 species). Canonical correspondence analysis showed Physico - chemical parameters of water affected on the density of rotifer both positively and negatively. There was positive significant correlation between density rotifer with electrical conductivity, total dissolved solids, and salinity, while pH showed the lowest effect on the density of rotifer than other environmental factors. Different species of rotifer showed some variations of the correlation with environmental factor, such as the density of Bdelloidea class correlated positive significant correlation with water temperature, while Keratella cochlearis species negative significant correlation with water temperature. Special system (multi - filtration system) designed and made by researchers in our study for collection high density of microzooplankton with size sample range between 50 - less 200 µm, with short time, less effort and low cost. The multi - filtration system that consists of three stages : pumping stage, multi - filtration stage and sample collection stage. The density of the samples was measured seasonally by comparing the density of the microzooplankton in Hilla river and the density of the microzooplankton sample obtained by the multi - filtration system. The highest density of multi - filtration system rotifer was 1023033 ind./L and the highest density of multi - filtration system total microzooplankton was 1052000 ind/L and measured chlorophyll - a - of sample multi - filtration system that ranged between 23.54 - 1931.09 µg/L. The density of rotifer and total microzooplankton that collect by the multi - filtration system were concentration up to 20222.22, 17558.81 times than what is in the river. After collection of the high density of microzooplankton by using the multi - filtration system, this microzooplankton was used as live food for early feeding fish larvae. A special experiment was designed to feed common carp of fish larvae (Cyprinus carpio) using three types of food : first live diet collected by the multi - filtration system that microplankton most rotifer, second soybean meal and third mixed food (rotifer and soybean meal). Some growth indicators for fish larvae were studied; the results showed that the highest growth rate and best survival rate were larvae fed on live food, highest increased weight and increased length, relative growth rate, specific growth rate and lowest survival rate (33.53 mg, 3.33mm, 87.78, 30.11, and32.38 % respectively) for larvae fish feeding on rotifera, while lowest increased weight and increased length, relative growth rate, specific growth rate and lowest survival rate (27.00mg, 1.43mm, 85.23, 27.39, and 61.90 % respectively) for fish larvae feeding on soybean meal.

دراسة تصنيفية لبعض اجناس العويئلة الفراشية Papilionoideae في العراق == Comparative Taxonomic study of some genera Papilionoideae subfamily in Iraq

Author name: شيماء محي حسون
Supervisor name: نداء عدنان ابو سراج
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم / جامعة بابل للفترة من شهر شباط 2016 الى شهر اب 2017 . وقد جمعت العينات من اماكن مختلفة من شمال العراق ووسطه . وقد تناول البحث الحالي دراسة تصنيفية مقارنة شملت بعض الصفات المظهرية العامة والدقيقة للبذور وكذلك دراسة صفات حبات اللقاح , ودراسة الصفات التشريحية لبعض الاجزاء النباتية , فضلا عن الدراسة الجزيئية . وشملت الدراسة تسعة عشر نوعا تعود تسعة اجناس مختارة من عشائر مختلفة من العويئلة الفراشية في العراق , وتضمنت نوعان للجنسAstragalus L. هما A.kahiricus DC. وA.rhodosemius Boiss.and Hausskn ونوع واحد لكل من الاجناس L. Coluteaالنوع Col.cilicica Boiss. ; Coronilla L. النوع Cor. scorpioides (L.)W.D.Koch. ; Glycyrrhiza L. الضرب G.glabra var. glandulifera (Waldst. et Kit) Regel et Herd. ; Hippocrepis L. ; النويع Hi.unisiliquosa L. subsp.bisiliqua (Forssk.)Bornm. ; Hymenocarpos Savi. النوع Hy.circinnatus (L.) Savi. ; Pisum L. النويع P.sativum subsp. elatius (M.Bieb.) Aschers. بالتحديد الضرب var.pumilio Meikle ; والجنس Scorpiurus L. الضرب S.muricatus var.subvilosus (L.) Lam. , فضلا عن تسعة انواع للجنس Onobrychis Mill. هي O.acaulis Bornm. , O.caput - galli (L.) Lam. , O.crista - galli (L.) Lam. , O.carduchorum Townsend , O. megatophros Boiss. , O.haussknechtii Boiss. , O. galegifolia Boiss. , O.ptolemaica subsp. macroptera Townsend. , O.ptolemaica subsp. ptolemaica (Del.) DC. , O.schahuensis Bornm.. اقتصرت الدراسة المظهرية على الصفات المظهرية العامة والدقيقة للبذرة باستعمال المجهر الضوئي Light microscope والمجهر الالكتروني الماسح Scanning electron microscope لسطح غلاف البذرة , وقد دلت النتائج على اهمية صفات البذرة من الناحية التصنيفية , اذ تم تحديد ابرز الصفات والاكثر اهمية في عزل العشائر والاجناس زيادة على عزل الانواع , لاسيما شكل البذرة ولونها وعدد البذور في البقلة , علاوة على الزخرفة السطحية لغلاف البذرة والتي لها الدور البارز في الفصل بين افراد العشيرة Coronilleae , كما كان لها الدور في فصل كل من العشائر المدروسة عن بعضها . اما صفات حبات اللقاح فقد كانت من الصفات المظهرية ذات القيمة التصنيفية العالية لعزل العشائر والاجناس , فقد دلت النتائج وجود اثنان من الطرز المختلفة هما : Colpate وColporate اذ امكن تمييز حبات لقاح الجنس Onobrychis بكونها ذات حبات لقاح من النوع Colpate , كما فصلت حبات لقاح النوع Hymenocarpos circinnatus عن باقي الاجناس بالاستناد الى عدد فتحات الانبات فقد تميز بكون حبات لقاحه سداسية وسباعية فتحات الانبات , كما كان لشكل وحجم الحبة وشكل الاخدود فضلا عن صفات الزخرفة السطحية لجدار الحبة المدروسة تحت المجهر الالكتروني الدور التصنيفي الجيد في فصل الانواع قيد الدراسة. اما جانب الدراسة التشريحية فقد شملت الدراسة صفات البشرة للوريقات والكاس الزهرية والتويج (ورقة العلم) والسيقان , فضلا عن دراسة المقاطع المستعرضة للسيقان ونصول الوريقات والسويقات وحاملات النورات والثمرة (البقلة) . كما شملت الدراسة طبيعة الكساء السطحي وانواع البلورات المنتشرة وانماط اﻠﺗﻌﱠرق Venation patterns. وقد دلت النتائج الى اهمية كل الجوانب التشريحية المدروسة في الفصل بين الاجناس المدروسة وكذلك بين الانواع. وتضمنت الدراسة ايضا التصنيف الجزيئي باستعمال تقانة البلمرة المتسلسل Polymerase chain reaction (PCR) من خلال معرفة تتابع Sequencing المنطقة النووية ITS اذ كان للدراسة الجزيئية اهمية تصنيفية لمعرفة علاقات التقارب والتباعد بين انواع الاجناس المدروسة , وتم التعرف على النوع A.rhodosemius كتسجيل جديد للجنس ضمن الانواع المنتشرة في العراق . | This study was conducted in the laboratories of the Faculty of Science / University of Babylon for the period from February 2016 to the month of August 2017. Samples were collected from various parts of northern Iraq as well as in the central regions .The present investigation deals with a comparative taxononmic study , included some gross and micromorphological characters , as well as the pollen grains characteristics and anatomical characteristics of some plant parts , as well as the molecular study . The study included nineteen species belonging to nine selected genera from different tribes of papilionoideae subfamily in Iraq , and included two species of genus Astragalus L. ( A.kahiricus DC. and A.rhodosemius Boiss.and Hausskn ) , and one species of each genera Colutea L. (Col.cilicica Boiss.) , Coronilla L. (C.scorpioides (L.) W.D.F.Koch) , Glycyrrhiza L. (G.glabra var.glandulifera (Waldst. et Kit) Regel et Herd) , Hippocrepis L. ( Hi.unisiliquosa L.subsp.bisiliqua (Forssk.)Bornm. ) , Hymenocarpos Savi. (Hy.circinnatus (L.) Savi. ) , Pisum L. (P.sativum subsp. elatius (M.Bieb.) Aschers. var.pumilio Meikle. ) and Scorpiurus L. ( S.muricatus var.subvilosus (L.) Lam. ) , in addition to nine species of genus Onobrychis , O.acaulis Bornm. ; O.caput - galli (L.) Lam. ; O.crista - galli (L.) Lam. ; O.carduchorum Townsend. ; O. megatophros Boiss. ; O.haussknechtii Boiss. ; O. galegifolia Boiss. ; O.ptolemaica subsp. macroptera Townsend. ; O.ptolemaica subsp. ptolemaica (Del.) DC. ; O.schahuensis Bornm. The morphological study was limited to gross and micromorphological characters of seed using light microscopy and a scanning electron microscopy for the surface of seed coat . the result indicated the taxonomic importance of the seed characteristics , the most important valuable in isolating the tribes and genera , also species. Especially the seed shap , colour and the number of seeds in the pod . In addition to the surface ornamentation of seed coat , Which had a important role in the separation of members of the tribe Coronilleae, and had a role in the separation of each of the studied tribes. The characteristics of pollen grains have good taxonomic value in isolation of tribes and species . the results indicated that there are two different types of pollen grains , colpate and colporate , the polle grains of Onobrychis can be distinguished from other genera by lacking germinating aperture ,pollen grains of Hymenocarpos circinnatus was separated from the other of the species based on the number of germination pores , The shape and size of the grain and the shape of the colpus as well as the characteristics of the surface ornamentation of the grain wall studied under the electronic microscope, the role of good classification in the class of species under study. pollen grains of other genera were separated based on the characteristics of germination pore , the shape , size of the grain and the shape of , in addition to the characteristics of ornamentation of studied grain wall under the electron microscope . As the anatomical study , included the characteristics of the epidermis of leaves , the calyx , corolla and stems , as well as the study of transverse sections of stems , leaflets petioles , peduncles and the pod . also the nature of indumentum , types of crystals , and venation patterens . the results showed the importance of all anatomical aspects studied in separation between the studied genera as well as between species. The study also included molecular systematic using polymerase chain reactions (PCR) through sequencing of nuclear (ITS) region . it was clear that the molecular study has taxonomical significance to know the phylogeny and relationships of convergence and divergence between species . A.rhodosemius was identified as a new species registry in Iraq.A.rhodosemius is recognized as new species for Iraq.

دراسة جزيئية للجينات البيتا - لاكتاميز في بكتريا Acinetobacter baumannii المقاومة للمضادات الكاربابينيم == Molecular Study of ? - lactamase Genes in Carbapenem Resistant Acienetobacter baumannii (CRAB)

Author name: ربيع عبد الاله مجيد عبد علي الهنداوي
Supervisor name: ايمان محمد جار الله
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: During the period between April 2016 and January 2017, a total of 1100 clinical specimens (burns, wounds, throat, urine, blood) were collected from two hospitals in Babylon province Al - Hillah Teaching Hospital and Medical City of Mirjan Hospital. All specimens were cultured and 17 Acinetobacter baumannii isolates were obtained from clinical specimens in a percentage of (1.5%) distributed in burn 11 (2.8%), wound 1 (0.6%), throat 1 (2%), urine 3 (0.7%) and blood 1 (0.9%).This study was conducted to determine the presence of carbapenem resistance Acinetobacter baumannii (CRAB) isolates and the prevalence of β - lactamase genes responsible for carbapenem - resistance among clinical isolates of A. baumannii collected from two hospitals in Hillah City. Isolates were identified according to VITEK2 system. Antibiotics susceptibility was assayed by using disks diffusion method according to CLSI recommendations and it’s found 8 isolates was carbapenem resistant.The eight CRAB isolates were tested for biofilm formation by using the tube adherence test and the results showed that 5 of 8 tested isolates (62.5%) were strong for biofilm formation. Two genes related to biofilm formation was investigated (bap & blaPER - 1 genes). Six isolates were positive for the bap gene (75 %) and no isolates had positive for blaPER - 1 gene. The eight CRAB isolates were tested also for the presence of two virulence factor genes include espA (K1 capsular polysaccharide) and ompA (outer membrane protein A), this detection was performed by the conventional PCR technique. The positive result for espA and ompA genes was (62.5%) and (75%) respectively.IIPhenotypic detection of carbapenemase production was performed using the imipenem - EDTA disk and modified Hodge's test (MHT). Then isolates were subjected to monoplex PCR targeting blaCTX, blaTEM, BlaSHV, blaIMP, blaVIM, blaSPM, NDM - 1, NDM - 2, AmpC, OXA - 23, OXA - 24, OXA - 48, OXA - 51, OXA - 58 and OXA - 235 genes, all CRAB isolate gave positive result with MHT and (50%) of these isolates were positive to the imipenem - EDTA disk. PCR experiments showed ; all CRAB isolates were harbored blaOXA - 51 gene, six (75%) isolates were harbored blaCTX gene, four (100%) isolates were harbored blaTEM gene, four (50%) isolates were harbored blaVIM gene, four (50%) isolates were harbored blaSPM gene, seven (87.5%) isolates were harbored NDM - 2 gene, seven (87.5%) isolates were harbored ampC gene, six (75%) isolates were harbored OXA - 23 gene, one (12.5%) isolates were harbored OXA - 24 gene, two (25%) isolates were harbored OXA - 48 gene and one (12.5%) isolates were harbored OXA - 235 gene, while none of these isolates harbored BlaSHV, blaIMP, NDM - 1, NDM - 2 genes. All isolates of A. baumannii appear as MDR, while two isolates appear to be as XDR.These results revealed that CRAB isolates constitute 47% of all A. baumannii that had been isolated from Al - Hillah Teaching Hospital and Medical City of Mirjan Hospital in Babylon province and some of carbapenemase were detected in both phenotypic and genotypic methods (PCR). This underlies the importance of their accurate identifications and reporting to prevent the emergence of complete resistance to the most potent drugs against A. baumannii in Babylon province.

انتاج وتوصيف لنقي المنتجات الايضية لعزلة Streptomyces ودراسة تاثيراتها المضاد حيوية والسرطانية == Production and Characterization of Purified Metabolites from Streptomyces Isolate and Study

Author name: ليندا حميد تركي عطية الغزالي
Supervisor name: رباب عمران راضي الجيلاوي
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: شملت الدراسة الحالية جمع 100 عينة من الترب بواقع 50 عينة من ترب صحراوية جمعت من المناطق التي تبعد مسافة 3 كيلومترات من بحيرة الرزازة و50 عينة من ترب زراعية جمعت من مناطق مختلفة من محافظه كربلاء المقدسة. حيث عزلت 26 عزلة من البكتريا الخيطية من الترب الصحراوية و36 عزلة من البكتريا الخيطية من الترب الزراعية ودرست الفعالية التضادية لهذه العزلات ضد اربعة انواع من البكتريا المرضية ( بكتريا الموجبة لصبغة كرام Staphylococcus aureus and Streptococcus agalactiae وبكتريا السالبة لصبغة كرام (Escherichia coli and Pseudomonas aeru¬ginosa وبطريقة التخطيط العمودي, واظهرت النتائج ان جميع actinomycetes المعزولة من الترب الزراعية ليست لها اي فعالية مضادة للبكتريا المرضية بينما كانت لبكتريا actinomycetes المعزولة من الترب الصحراوية فعالية مضادة للبكترياالمرضية وبمديات مختلفة تبعا لنوع البكتريا المرضية المدروسة, وقد وجد ان لثمانية من عزلات actinomycetes الصحراوية فعالية مضادة للبكتريا المرضية السالبة والموجبة لصبغة كرام وتبعا لذلك المدى الواسع في التثبيط اختبرت فعاليتها المضادة بطريقة الانتشار بالحفر, واظهرت النتائج ان العزله LHR 9 actinomycetesلها فعالية مضادة للبكتريا المرضية اعلى من العزلات الاخرى المختبرة وباستخدام طريقة الانتشار بالحفر, لذلك اختيرت لاكمال محاور الدراسة المتقدمة. درست الصفات المظهرية والبايوكيمياوية والزرعية للبكتريا actinomycetes LHR 9 بعد زرعها على اوساط زرعية مختلفة من وسط استخلاص Streptomyces الدولي واعتمادا على الفحص المجهري باستخدام المجهر الضوئي المركب وتحت قوى تكبير 1000و400مره لدراسة شكل المايسليوم الهوائي والارضي, وقد تبين ان للعزلة مايسليوم هوائي متفرع له مظهر مفصص وغير مجزا وباستخدام المجهر الاليكتروني الماسح تبين ان المايسليوم يحمل ابواغا ملساء وغير متحركة, وبالاعتماد على مجمل الصفات الزرعية والفسيولوجية المدروسة تبين ان البكترياLHR 9 actinomycetes المعزولة تعود لجنس Streptomyces. درست عدد من الظروف الزرعية والغذائية المثلى لتحسين انتاج مواد الايض الثانوي من البكتريا في وسط التخمر وقد كان وسط فول الصويا الحاوي على الدكستروز كمصدر كاربوني والبيبتون كمصدر نتروجيني وK2HPO4 كمصدر فوسفاتي وبظروف تخمر : بدرجه حراره 35م0 , وحموضه 7 , وقوه اهتزاز 200دوره \ دقيقه ولمده 7 ايام كفتره حضن هو وسط الانتاج الامثل . استخدمت مذيبات عضوية مختلفة القطبيةn) - بروبانول وكلوروفورم وخلات الاثيل ووالاسيتون والميثانول والايثانول (في استخلاص مواد الايض الثانوي المنتجة من بكتريا Streptomyces sp. LHR 9 المضادة للبكترياالمرضية وقد كان المذيب العضوي خلات الاثيل افضل المذيبات العضوية في الاستخلاص اذ اعطى مستخلصه البكتيري اعلى قيم في التثبيط البكتيري . نقيت مواد الايض الثانوي بعد استخلاصها بخلات الاثيل بعمود الفصل : جيل السيليكا ذو الابعاد (1.6× 14) سم وباستخدام الميثانول والكلوروفورم بنسبه 8 : 2 حجم\حجم كمحلول الغسل لسم3 واحد من المستخلص البكتيري , وقد جمع 50 جزء من المحلول الناتج بعد الغسل واختبرت فعاليتهاالتثبيطية لنمو البكتريا المرضية , وقد اعتمدت الاجزاء الفعالة لقياس التركيز المثبط الادنى باستخدام طريقة الانتشار من القرص, وقد كانت التراكيز (4.5 , 5 , 2.5 ,3)مايكروغرام/مل هي التراكيز المثبطه الدنيا لبكتريا Escherichia coli , Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aurues , Streptococcus agalactiae على التوالي. قيمت السمية الخلوية لمواد الايض الثانوي والمنقاة جزئيا لتحديد مدى فعاليتها المضاده للسرطان وبالاعتماد على فحص MTT (3 - (4, 5 - dimethylthiazol - 2 - yl) - 2 - 5 - diphenyl tetrazolium bromide) وباستخدام خطوط خلايا الثدي السرطانية وخطوط خلايا سليمة, وقد اظهرت النتائج بان التركيز 400مايكوغرام\ مل هو التركيز الامثل لتثبيط نمو الخلايا السرطانية بنسبه 60% مع المحافظة على 80% من الخلايا السليمة. اعتمدت الكروماتوغرافيا السائلة Liquid Chromatography - Mass Spectroscopy (LC - MS) في تنقية المركب الفعال وتوصيفة اذ اظهرت نتائج المخطط اللوني ان هنالك خمسة قمم وبالمقارنة مع الاطياف الكتلية للمركبات حسب المعهد الامريكي للمعايير والتقنية National Institute of Standards and Technology ان للمركب صيغة كيمياوية C18H32O2 ووزن جزيئي 282دلتن . درست الفعالية المضادة للاكسدة والمضادة للاورام لمستخلص Streptomyces sp. LHR 9 (المنقى جزئيا) في اناث الجرذان المختبرية المحفزة للاصابة بسرطان الثدي كيمياويا باستخدام مادة 7,12 dimethyl Benz (A) anthracene (DMBA) واظهرت النتائج ان لمستخلص LHR 9 Streptomyces sp. (المنقى جزئيا) القدره على المحافظة على تركيز الانزيمات المضادة للاكسدة في مصل الحيوانات المعاملة بمادة DMBA وبقيم مقاربة لما هي موجودة في مصل الحيوانات السليمة وقد تمثلت اثار ذلك بصغر وزن وحجم الورم فيى منطقة الثدي والتغيرات النسيجية الملحوظة, وعلى مستوى جزيئ ايضا اذ لوحظ وباستخدام تقنية Polymerase Chain Reaction - Single Strand Conformation Polymorphism(PCR - SSCP) التغيرات الوراثية الحاصلة للجينين ( Bcl - 2 وCaspase - 3) بفعل مادة DMBA ودور مستخلص Streptomyces sp. LHR 9 (المنقى جزئيا) في الحفاظ على الشكل الطبيعي للجينين اذ تبين ان هناك83.66% من الحيوانات السليمة و50% من الحيوانات المعاملة بالمستخلص البكتيري تمتلك جين Caspase - 3 بشكله الطبيعي بينما 66.66% من الحيوانات التي عوملت بماده DMBA فقط تمتلك جين Caspase - 3 من النوع الطافر وكذلك بالنسبة للجين Bcl - 2 اذ تبين ان هناك 78.66% من الحيوانات السليمة و60% من الحيوانات المعالجة بالمستخلص البكتيري تمتلك جين Bcl - 2من النوع الطبيعي بينما لوحظ وجود نفس الجين ولكن من النوع الطافر بنسبة 66.67% في الحيوانات المصابة بسرطان الثدي بتاثير مادة DMBA. | The present study included the collection of 100 soil samples from desert regions away from about 3 km from Al - Razzaza lake and agricultural regions at Karbala Province, Iraq. From these samples 26 and 36 actinomycetes isolates were obtained from desert and agricultural regions respectively . All actinomycetes isolates were tested for their antibacterial activity using primary screening against pathogenic bacteria by perpendicular streaking method .The results were showed that all the actinomycetes isolates were isolated from agricultural regions hadn't any antibacterial activity while the 26 isolates isolated from desert regions were had antibacterial activity in different spectra . Eight actinomycetes isolates from all the 26 desert regions isolates were selected for secondary screening due to their antibacterial activities with wide spectrum against pathogenic bacteria namely Gram positive (Staphylococ¬cus aureus and Streptococcus agalactiae) and Gram negative (Escherichia coli and Pseudomonas aeru¬ginosa) by the agar diffusion methods and the results revealed the selection of actinomycetes LHR 9 isolate for farther studies because it gave us the highest inhibition against the tested pathogenic bacteria growth. The active actinomycetes LHR 9 isolate was identified using several morphological and biochemical methods. The morphological characterization was involved the study of aerial and substrate mycelium on many International Streptomyces Project agar medium and using light microscopy at 1000X and 400X to study the mycelium morphology, as well as using the scanning electron microscope (SEM) to examine the spore surface. The results exhibited that the isolate had the aerial mycelium which formed unfragmented, branched, looped and rectus - flexibilis hyphae type bearing non - motile spores with smooth surface. In addition to results of biochemical tests we could revealed that the isolate was belong to Streptomyces genus . The active isolate Streptomyces sp. LHR 9 was selected for optimization critical cultural and nutritional parameters for increasing the antibiotic production titer in fermentation medium (Soybean broth medium), the results showed the dextrose as carbon source , peptone as nitrogenous source and K2HPO4 as a phosphate source with fermentation cultural condition included ; temperature of 35 °C, pH 7 with agitation rate 200 rpm for 7 days as incubation period gave high values in active secondary metabolites production. The antibacterial compound from fermentation medium was extracted using liquid - liquid extraction method with various organic solvents n - propanol, chloroform, ethyl acetate, acetone, methanol and ethanol) 1 : 1 (v/v) . the results was revealed the ethyl acetate the most efficient in extraction . The Streptomyces sp. LHR 9 crude extract was purified by using silica gel column (1.6 X 14) chromatography. Chloroform and methanol (4 : 1) (v/v), was used as an eluting solvent. The active fractions ( had the antibacterial activity ) were selected for determination the minimum inhibitory concentration and evaluation the cytotoxic activity using MTT (3 - (4, 5 - dimethylthiazol - 2 - yl) - 2 - 5 - diphenyl tetrazolium bromide) assay. The results of the MIC of partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract were 4.5 µg/ml for Escherichia coli, 5 µg/ml for Pseudomonas aeruginosa, 2.5µg/ml for Staphylococcus aurues and 3µg/ml for Streptococcus agalactiae . In vitro screening for cytotoxic activity was done by MTT assay for evaluation the anticancer activity of the partially purified antibacterial compounds produced by Streptomyces sp. LHR 9. The cytotoxic activity of the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract was determined against established MCF - 7 cell line ( breast cancer cell lines ) and WRL cell as a representative of normal breast cell line, depending on their viability ratio. The viability of MCF - 7 cell line was decreased dramatically with the increasing in extract concentration in the same time the viability of WRL cell was decreased in slowly manner. The using of multiple purification methods Liquid Chromatography - Mass Spectroscopy (LC - MS) along with a sensitive measuring method and possibly isolation of these compounds should allow us to evaluate the entire potential of secondary metabolites production, the results from LC - MS chromatogram of the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract showed five peaks, on comparison of the mass spectra of the constituents with the National Institute of Standards and Technology( NIST) library the compound was had the Formula : C18H34O2 and molecular weight : 282 D. The partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract was evaluated for its in vivo antioxidant and antitumor activity depending on the ability of 7,12 dimethyl Benz (A)anthracene (DMBA) to inducing breast tumor in female rat model, the results revealed the partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract had the ability to keeping the enzymatic antioxidant in approximately its natural concentrations (as the same concentrations in serum of negative group) in serum of tested rats which were induced breast cancer by DMBA and treated with partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract, so these results were more studied on histological plane and the results of that were achieved by decreasing in weight and size of the breast tumor of tested rats and other histological change in breast tissue. In addition to that partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract effect was more studied on molecular plane depending on the Bcl - 2 and Caspase - 3 genes mutation using Polymerase Chain Reaction - Single Strand Conformation Polymorphism ( PCR - SSCP) analysis. The results were two conformations polymorphism in both Caspase - 3 gene ( about 83.66 % of negative group and 50% of treated group had three bands (wild type) where's positive control had 66.66% four bands (mutant type)) and Bcl2 gene (the wild type had one band such as negative group was 78.66% and test group 60%, compared with positive group (60.67%) have two bands(mutant type)). so these results suggest the active apoptotic property of Caspase - 3 and Bcl - 2 and the role of partially purified Streptomyces sp. LHR 9 extract effect in keeping them in their wild type.

تاثير مستخلص نبات الكجرات Hibiscus sabdariffa على عوامل الضراوة لبكتيريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من التهابات المجاري البولية == Effect of Hibiscus sabdariffa Extract on the Virulence Factors of Staphylococcuss aureus Isolated from Urinary Tract Infection

Author name: صمود عبد الكاظم سلمان عبد
Supervisor name: وجدان رضا تاج الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تم جمع 163 عينة ادرار من المرضى المصابين بالتهاب المجاري البولية لكلا الجنسين باعمار تتراوح من شهر واحد الى 60سنة من المراجعين في مستشفى القاسم ومستشفى الهاشمية العام خلال الفترة من اب 2016 الى كانون الاول 2016. وقد وجدت 112 (68.71%) عينة اعطت نموا بكتيريا ومن هذه النسبة وجدت36 (32.14%) عزلة موجبة لصبغة غرام و76(67.86%) سالبة لصبغة غرام . وقد تم تشخيص 23(20.5%) عزلة بكتيرية تعود للبكتريا العنقودية الذهبية Staphyllococcus aureus، تم تشخيص جميع هذه العزلات مظهريا ومجهريا وحيويا.تم اختبار حساسية المضادات الحيوية لجميع هذه العزلات. وكانت جميعها مقاومة 100% للامبسلين، يليها سيفوكسيتين 91.3 %. واظهرت هذه العزلات اعلى حساسية للمضاد الحيوي الكليندامايسين 78.2% , في حين كانت نسبة المقاومة للاميكاسين هي39.1% . وقد وجد ان نسبة المقاومة للتراسايكلين هي 47.8% . وقد اظهرت النتائج ان 20 (86.9%)عزلة مقاومة للمضاد الحيوي المثسيلين (MRSA) وقد تم الحصول على هذه النتيجة باستخدام تقنية تفاعل انزيم البلمرة التسلسلي (PCR).درست فعالية المستخلص المائي الحار والبارد لاربعة نباتات (كاس الكجرات جذور العاقول وقشور الرمان واوراق الخباز) ضد البكتريا العنقودية الذهبية ووجد من خلال التحليل الاحصائي وجود فروق معنويه 0.05 P< في حالة المستخلص المائي البارد للكجرات حيث اعطى فعالية تثبيطية تجاه هذه البكتريا لذا تم اختيار هذا المستخلص لدراسة تاثيره على عوامل الضراوة لهذه البكتريا. بعدها تم التحري عن المركبات الموجودة في هذا المستخلص وقد اظهرت النتائج ان المستخلص المائي يحتوي كلا من الفينولات , القلويدات , الفلافونات والتانينات.درست فعالية المستخلص المائي البارد الخام لكاس الكجرات المضادة للبكتريا بطريقه الانتشار بالحفر (agar well diffusion method) باستخدام التراكيز 2,5 و5و10و20و40و80 ملغم / مل. بعدها تم تحديد MIC لهذا المستخلص بطريقه الانتشار بالحفر( The modified broth macro dilution method) فكانت قيمته 25ملغم/مل.وقد اظهر المستخلص المائي البارد فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بقطر 18 ملم بتركيز 40و80 ملغم /مل .تم استخلاص المركبات الفينولية من المستخلص المائي البارد للكجرات بعدها تم استخدام تقنيه الفصل الكروموتوكرافي عالي الجودة لعزل وتشخيص المركبات الفينوليه وقد تم الحصول على عدة مركبات. بعدها تم دراسة الفعالية التثبيطية لهذه المركبات ووجد بان المركب الفينولي الكويرسيتين قد اعطى اعلى فعالية تثبيطية تجاه البكتريا العنقودية الذهبية بتركيز 4 ملغم /مل وايضا تم تحديد MIC لهذا المركب وهي 2ملغم /مل .كما درس تاثير المستخلص الخام والكويرسيتين على عوامل الضراوة وقد اظهرت النتائج ان كلا منهم قد كان له تاثير على انتاج الهيمولايسين وعلى فعاليته وذلك بعد تنمية البكتيريا مع قيمة MIC للمستخلص الخام والكويرسيتين كلا على انفراد.كذلك تم دراسة تاثير هذه المستخلصات على تكوين البايوفيلم من قبل البكتريا وقد وجد ان 15 عزلة بكتيرية منتجة للبايوفيلم قد تحولت الى غير منتجة او الى منتجة ولكن من النوع الرقيق بعد تنميتها مع هذين المستخلصين.وقد اظهرت النتائج ايضا ان المستخلص الخام والكورسيتين للكجرات قد اثرا على فعالية كلا من الستافيلوكاينيز والبروتيز.تم التحري عن انتاج السموم المعوية من قبل البكتريا العنقودية الذهبية باستخدام تقنية الفار الرضيع وقد وجد بان جميع العزلات غير منتجة لهذه السموم.كذلك تم دراسة تاثير هذين المستخلصين على تسرب ايون البوتاسيوم من الخلايا البكتيرية خلال فترات زمنية معينة وقد وجد بان هذين المستخلصين قد عملا على زيادة تسرب هذا الايون من الخلايا البكتيرية مما يدل على ان هذين المستخلصين قد اثرا على نفاذية الغشاء الخلوي للخلية البكتيرية .كذلك وجد ان الجرعة القاتلة لنصف حيوانات التجربة قد زادت من 5,6 × 106 الى 3,9× 107 بعد معاملة البكتريا بالمستخلص المائي البارد لكاس الكجرات . ايضا تم دراسة تاثير المستخلصين الخام والكورسيتين على معايير الدم في الفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي مستخلص نباتي والفاران المعاملة بالعالق البكتيري الذي يحتوي على الكورسيتين وقد وجد بان المستخلص الخام كان له تاثير اكبر من الكورسيتين في تحسين معايير الدم مقارنة بالبكتريا المعاملة بالعالق البكتيري بدون مستخلص نباتي ,كما تم دراسة امكانية استخدام النبات كعامل مختزل عن طريق معرفة الفعالية ضد التاكسدية وكانت قيمتها 3566,97 مايكرو مولاري بواسطة استخدام اختبار (CUPRAC). ايضا تم دراسة الفعاليه الخلويه السمية للمستخلص الخام على خلايا الكبد الطبيعية للانسان وعلى الخلايا السرطانية في الثدي وقد وجد بان هذا المستخلص ليس له فعالية سمية على خلايا الكبد الطبيعية وايضا له تاثير قاتل للخلايا السرطانية في الثدي .

دراسة مناعية ووراثية للمرضى المصابين بالتهاب المرارة في مدينة الحلة == Immunogenetic Study on Patients with Gallbladder Infection in Hilla city

Author name: رواء عداي علي السلطاني
Supervisor name: عبد النبي جويد عبد المعموري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science For Girls - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع ( 100 عينة ) اخذت بشكل اعشواني ( 87 اناث , 13 ذكور ) اجريت لهم عملية استئصال المرارة بمستشفى الحلة التعليمي للفترة من ايلول 2016 الى شهر حزيران 2017. تضمنت العينات (عينات دم وحصى) لتحقق من دور بعض المعايير المناعية والوراثية المتعلقة بمرض التهاب المرارة .بينت نتائج الدراسة الحالية ظهور الاصابة بالتهاب المرارة في كلا الجنسين(الاناث والذكور) وكانت الفئة العمرية ( 31 - 40 ) سنة الفئة الاكثر عرضة للاصابة , لكن نسبة اصابة الاناث في مجتمع الدراسة اعلى من الذكور ( 87% ) بينما الذكور ( 13%) كما ان التهاب المرارة المزمن هو الاكثر شيوعا ,اذ شكل نسبة ( 84% ) ثم التهاب المرارة الحاد اذ شكل نسبة 60%)).كما كشفت الدراسة قلة تكوين الحصى المرارية عند الاطفال بعمر اقل من عشر سنوات ويزداد تكوين الحصى مع تقدم العمر وينخفض تدريجيا بعد عمر 60 سنة . اكثر انواع الحصى المرارية الشائعة والتي عزلت الحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة.اما الدراسة المناعية فتضمنت تقدير مستويات T6F - β1 , IL - 8 في مصل مرضى التهاب المرارة باستخدام تقنية الاليزا لوحظ زيادة مستوى TBF - β1 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن) على نقيض مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية. P< 0.05 P=0.007 . كما اظهرت النتائج الحالية زيادة بمستوى T6F - β1 في كلا الجنسين) للاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة بمستوى احتمالية P=0.002 . P< 0.05 للاناث وP=0.003 . P< 0.05 للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقد لوحظ زيادة في مستوى T6F - β1 في مصل المرضى المصابين بالحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة .اظهرت النتائج الخاصة بتقدير مستوى انترلوكين 8 ,زيادة في مستوى IL - 8 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن )على نقيض مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية عالي ( P=0.005 . P<0.05 ) .كما ظهرت النتائج الحالية زيادة في مستوى انترلوكين 8 في كلا الجنسين(الاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية ( P=0.01 . P< 0.05 ) للاناث و<0.05) ( P=0.2 . P للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقط لوحظ زيادة في مستوى IL - 8في جميع المرضى المصابين بالحصى المختلطة تليها الحصى الكوليسترولية ثم الحصى الصبغية .تضمنت الدراسة الوراثية ( - 869 T C ) T6F - β1 و( - 251 T A ) L - 8 ذات الصلة مع مرضى التهاب المرارة لل85 عينة متضمنة عينات للمرضى وعينات لمجموعة السيطرة باستخدام تقنية (PCR - ARM ) .اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيري المفرد 76.6%) 46 : T6F - β1 ( - 869)T⁄C ) من متباينة الاشكال (T∕C) و9 (15%) متماثلة الاشكال (TT) و(8%) 5 متماثلة الاشكال (CC) ,واظهرت النتائج ان(Tallele) الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع( C allele) . كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى ( المزمن والحاد ) كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى المرارية الاكثر صلة بالموروثات متباينة الاشكال (T⁄C) للحصى الكوليسترولية تليها المختلطة ثم الصبغية . واظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد (41.6%)25 : IL - 8( - 251) T/A من متماثلة الاشكال متباينة الاشكال من متماثلة الاشكال (TT) واظهرت النتائج ان هو الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع لمرضى التهاب الحرارة كما اظهرت الاليات والموروثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى )المزمن والحاد ( كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى الاكثر صلة مع الموروثات متماثلة الاشكال((AA للحصى الكوليسترولية تليها الصبغية ثم المختلطة . | The study included 100 patients taken randomly (87 females and 13 males) undergoing cholecystectomy at the general teaching Hilla Hospital from September 2016 to June 2017. For each patient, two samples were taken which included the blood samples and gallstone for immunogenetic tests. The infection appears in both sexes with age group (31 - 40) years 30% but the rate of infection in female was higher than males 87%, 13% respectively.Clinically, chronic cholecystitis was the most common (84 %) and acute cholecystitis (16 %). The study displayed that the formation of gallstones is less than 10 years old. The gallstones are formed by age and gradually decrease after age 60. The most common types of gallstones were cholesterol stones and pigment stone followed by mixed stone The immunological study included estimatation the level of IL - 8, TGF - β1 in patients serum by using ELISA technique. The estimation of TGF - β1level explained a significantly increased in all patients (chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference . P=0.007, p<0.05. Estimation of TGF - β1 level showed increases in both the sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference . (p=0.002. P< 0.05) for females, (p=0.003. P< 0.05 for males). As for the stone, the results of the present study revealed increased levels of TGF - β1 in serum patients had cholesterol stone with value followed the pigment stone and mixed stone. The estimation of IL - 8 level explained a significantly increased in all patients(chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference. P=0.005 , p<0.05. Estimation of IL - 8 showed increases in both sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference (p=0.01. P< 0.05) for females, (p=0.02. P< 0.05 for males). As for the stone, the results showed that IL - 8 concentration was increased in patients serum had mixed stone followed cholesterol stone and pigment stone. The genetic study involved screening of TGF - B1 ( - 869 T/C) and IL8 - ( - 251 T/A) related to gallbladder infection patients for 85 samples, including patients and the control group by using (ARM - PCR) technique. The single nucleotide polymorphism of TGF - β1 ( - 869 T/C) showed : TC heterozygous was a higher rate with 46 (76.6%), TT homozygous with 9 (15%) and CC homozygous with 5 (8%) and the result revealed that the T allele more predominant than the C allele. The genotype and allelic association of TGF - β1 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of TGF - β1 for patients appeared the genotype of T/C higher percentage in patients with who had cholesterol stone followed by mixed stone and pigment stone. An another single nucleotide polymorphismof of IL8 - (251T/A) showed : AA homozygous was a higher rate with 25 (41.6%), TA heterozygous with 23 (38%) followed by the TT homozygous just 12 (20%) and the result revealed that the A allele more predominant than the T allele. The genotype and allelic association of IL - 8 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of IL - 8 for patients showed : The genotype of AA appeared higher percentage with patients who had cholesterol stone followed by pigment stone and mixed stone

دراسة فعالية انزيمات الفوسفاتيز القاعدي, الاسبارتيت ناقل مجموعة الامين واللاكتيت منزوع الهيدروجين في البلازما المنوية للمرضى العقيمين == Study the activity of Alkaline Phosphatase, Lactate Dehydrogenase and Aspartate Aminotransferase in the Seminal Plasma of Infertile Men

Author name: كرار صالح مهدي جاسم الخفاجي
Supervisor name: فارس ناجي عبود الهادي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تعتبر بلازما السائل المنوي مهمة في العمليات الحيوية للنطف لابقائها حية وانتقالها خلال القناة التناسلية الانثوية, كما وتحتوي على العديد من المكونات المختلفة ومنها الانزيمات مثل انزيم الفوسفاتيز القاعدي (ALP) واسبارتيت ناقل مجموعة امين (AST) واللاكتيت منزوع الهيدروجين (LDH) التي تدخل في العمليات الايضية المختلفة لتجهيز الطاقة اللازمة لحركة النطف. اجريت الدراسة على مرضى عدم الخصوبة الذين راجعوا مختبر مستشفى بابل للنسائية والتوليد والمختبرات الاهلية في محافظة بابل, شملت الدراسة 122 عينة من السائل المنوي لمرضى عدم الخصوبة و10 عينات للرجال الخصبين, خلال المدة من تشرين الاول 2016 الى اذار 2017. هدفت الدراسة الى مقارنة مستويات فعالية الانزيمات المذكورة في البلازما المنوية لحالات عدم الخصوبة المشمولة بالدراسة وهي مجاميع سويي النطف ووهن النطف ووهن وتشوه النطف وقلة النطف وقلة ووهن النطف وانعدام النطف مع مجموعة الخصوبة, بالاضافة الى دراسة العلاقات بين الانزيمات مع معالم النطف وتشمل حركة النطف عند مستوى( ا+ب) وتركيز النطف والنسبة المؤية للنطف غير السوية . اظهرت النتائج فروق معنوية (P˂0.05) في مستوى فعالية انزيم الفوسفاتيز القاعدي في المجاميع المختلفة حيث لوحظ اعلى مستوى في مجموعة الخصوبة تتبعها مجموعة سويي النطف ,بينما لم يلاحظ فروق معنوية (P˃0.05) بين مجموعتي وهن النطف ووهن وتشوه النطف, كما لم تظهر النتائج فروق معنوية بين مجاميع قلة النطف وقلة ووهن النطف وانعدام النطف التي اظهرت اقل مستوى للفعالية. بينت النتائج فروق معنوية (P˂0.05) في معدل فعالية انزيم اسبارتيت ناقل مجموعة امين في مجاميع عدم الخصوبة المختلفة, حيث كان اعلى معدل للفعالية في مجموعة الخصوبة ومجموعة سويي النطف ولم يلاحظ فروق معنوية (P˃0.05)بين مجموعتي انعدام النطف ووهن وتشوه النطف, كما لم يلاحظ فروق معنوية (P˃0.05) بين مجاميع وهن النطف وقلة النطف وقلة ووهن النطف التي اظهرت اقل مستوى للفعالية. كما واظهرت النتائج فروق معنوية (P˂0.05) في معدل فعالية انزيم لاكتيت منزوع الهيدروجين بين مجاميع عدم الخصوبة مقارنة مع مجموعة الخصوبة وسويي النطف التي اظهرت اعلى مستوى للفعالية , في حين كان اقل مستوى للفعالية في مجاميع قلة النطف وقلة ووهن النطف وانعدام النطف بينما لم يظهر فرق بين مجموعتي وهن وتشوه النطف ووهن النطف. كذلك بينت النتائج العلاقات بين مستوى فعالية الانزيمات ومعالم النطف حيث لوحظت علاقة سلبية بين فعالية انزيم الفوسفاتيز القاعدي وحركة النطف مستوى ا+ب في مجاميع سويي النطف وقلة ووهن النطف مقارنة بالعلاقات الايجابية في مجاميع وهن النطف ووهن وتشوه النطف اضافة الى مجموعة الخصوبة, كما ان لذات الانزيم علاقة سلبية مع تركيز النطف في مجموعتي سويي النطف وقلة النطف بينما ظهرت العلاقات الايجابية في مجموعة الخصوبة وقلة ووهن النطف, كما تم ملاحظة العلاقات السلبية لفعالية الانزيم مع النسبة المؤوية لتشوه النطف في كل من مجموعة الخصوبة وسويي النطف اضافة الى مجموعة وهن وتشوه النطف. نلاحظ ايضا من خلال النتائج وجود علاقة سلبية معنوية (P˂0.01) في مجموعة سويي النطف وعلاقة ايجابية معنوية ((P˂0.01 في مجموعة وهن النطف بين مستوى فعالية انزيم اسبارتيت ناقل مجموعة امين وحركة النطف مستوى (ا+ب), كذلك نلاحظ وجود علاقة سلبية في مجموعة وهن وتشوه النطف بينما اظهرت مجموعة الخصوبة وقلة ووهن النطف علاقة ايجابية, كذلك بينت النتائج وجود علاقة ايجابية معنوية (P˂0.05) في مجموعة سويي النطف بين فعالية الانزيم المذكور وتركيز النطف, اما مجموعتي قلة النطف وقلة ووهن النطف اظهرت علاقة سلبية بينما كانت العلاقة الايجابية في مجموعة الخصوبة, بينت النتائج ايضا وجود علاقة سلبية معنوية (P˂0.05) في مجموعة سويي بين فعالية انزيم اسبارتيت ناقل مجموعة امين والنسبة المؤوية للنطف المشوهة, اما العلاقة الايجابية فظهرت في مجموعة وهن وتشوه النطف والعلاقة السلبية في مجموعة الخصوبة. اظهرت النتائج وجود علاقة سلبية بين فعالية انزيم لاكتيت منزوع الهيدروجين مع حركة النطف مستوى (ا+ب) في مجموعتي سويي النطف وقلة ووهن النطف بينما لوحظت العلاقات الايجابية في مجاميع الخصوبة ووهن النطف ووهن وتشوه النطف, بينت النتائج ايضا وجود علاقة سلبية معنوية (P˂0.05) بين فعالية الانزيم وتركيز النطف في البلازما المنوية لمجموعة قلة ووهن النطف بينما العلاقات السلبية كانت في مجاميع سويي النطف وقلة النطف بالمقارنة مع العلاقة الايجابية في مجموعة الخصوبة , كذلك بينت النتائج وجود علاقة سلبية بين فعالية الانزيم والنسبة المؤوية للنطف المشوهة في مجاميع وهن وتشوه النطف وسويي النطف ومجموعة الخصوبة. كذلك اظهرت النتائج العلاقات بين الانزيمات في المجاميع المختلفة فكان لفعالية انزيم الفوسفاتيز القاعدي علاقة ايجابية مع مستوى فعالية انزيم اسبارتيت ناقل مجموعة امين في البلازما المنوية لمجاميع وهن النطف ووهن وتشوه النطف وقلة النطف , كذلك العلاقة السلبية لوحظت في مجاميع سويي النطف وقلة ووهن النطف ومجموعة الخصوبة , بينما اظهرت النتائج وجود علاقة سلبية معنوية (P˂0.05) في مجموعة انعدام النطف. نلاحظ ايضا وجود علاقة ايجابية بين مستوى فعالية انزيم الفوسفاتيز القاعدي وانزيم لاكتيت منزوع الهيدروجين في مجموعة سويي النطف بالمقارنة مع مجموعة الخصوبة وباقي مجاميع قلة الخصوبة التي اظهرت علاقات سلبية بين فعالية الانزيمين. بينت النتائج ايضا وجود علاقة سلبية بين مستوى فعالية انزيم اسبارتيت ناقل مجموعة امين ولاكتيت منزوع الهيدروجين في البلازما المنوية لكل من وهن وتشوه النطف وقلة ووهن النطف عندما تقارن بالعلاقة الايجابية في مجاميع الخصوبة وسويي النطف وقلة النطف وانعدام النطف, كذلك بينت النتائج وجود علاقة ايجابية معنوية (P˂0.05) بين مستوى فعالية الانزيمين في مجموعة وهن النطف. | A wide variety of biochemical components and enzymes are presented in the seminal plasma, the enzymes such as alkaline phosphatase (ALP), aspartate amino - transaminase (AST), and lactate dehydrogenase (LDH) are proved to be important for various metabolic processes which provide energy for livability, motility, and fertility of spermatozoa. This study aimed to compare the activity levels of Alkaline phosphates, Aspartate - aminotranferase and Lactate dehydrogenase enzyme in the seminal plasma of infertility patients include : normozoospermia, asthenozoospermia, terato - asthenozoospermia, oligozoospermia, oligo - asthenozoospermia, azoospermia and fertile men, in addition to study of inter relationships between these enzymes and with sperm parameters include : sperm concentration, motility )grade A+B(, and morphologically abnormal sperm. This study was conducted in the laboratory of Babylon Maternity and children teaching hospital and private laboratories during the period from October 2016 to March 2017. The study included 122 samples from different types of infertility and 10 samples from fertile men The results showed that there was a significant difference (p˂0.05) between the different groups of alkaline phosphatase enzyme. The fertile men have the highest level, followed by normozoospermia. No significant differences were observed between the oligozoospermia, oligo - asthenozoospermia and azoospermia which have the lowest level of activity and no highly significant differences between asthenozoospermia and terato - asthenozoospermia. A significant increase (P˂0.05) in the level of aspartate - aminotransferase enzyme between the different groups, the highest level of activity was observed in the group of fertile and normozoospermia. While no significant differences (P˃0.05) between the groups of azoospermia and terato - asthenozoospermia, the results also showed no significant differences (P˃0.05) between the groups of asthenozoospermia, oligozoospermia and oligo - asthenozoospermia which owns the lowest level of activity. The results revealed significant increase (P˂0.05) in an average of the activity level of Lactate dehydrogenase enzyme between the different groups, the highest level was shown in the groups of fertile and normozoospermia and the lowest level in the azoospermia, oligozoospermia and oligo - asthenozoospermia but asthenozoospermia and terato - asthenozoospermia have the same level of activity. The results showed a significant negative correlation (P˂0.01) between AST activity and sperm motility (grade A+B) in the normozoospermic patients, and significant positive correlation (P˂0.01) in the group of asthenozoospermia, also the results revealed significant positive correlation (P˂0.05) in the normozoospermic men between AST activity and sperm concentration. The morphological abnormal sperm has significant negative correlation (P˂0.05) with AST activity in the group of normozoospermia, and it was revealed a significant negative correlation (P˂0. 05) between LDH activity and sperm concentration in the seminal plasma of oligo - asthenozoospermia. Also the results showed a significant negative correlation (P˂0.05) between the activities of ALP and AST in the azoospermia, and significant positive correlation (P˂0.05) in the seminal plasma of asthenozoospermia between AST and LDH activity. It was concluded the importance of ALP, AST and LDH levels in detecting the ability of gland secretion and normal semen components

دراسة فسلجية وجزيئية للتغاير الجيني لمستقبلات فيتامين د في النساء المصابات بمرض السكري من النوع الثاني == Physiological and Molecular Study of Vitamin D Receptor Gene Polymorphism in Type II Diabetic Women

Author name: نورا ماجد حميد ابو خمرة
Supervisor name: حيدر كامل زيدان السعدي | محمد عبد الله جبر
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى تقييم دور تعدد اشكال مستقبلات فيتامين (د) وارتباطها بتطور مرض السكري وتاثيرها في الاناث قبل وبعد سن الياس. جينات مستقبلات فيتامين (د)، تتضمن (Apa - I, Taq - I, Fok - I وCdx2) و(جين الفاEstrogen receptor - ) التي حددت بواسطة تفاعل سلسلة البوليميريز - تباين اطوال قطع التقييد وتقنية تفاعل سلسلة البوليميريز المتعدد المتخصص في الاليل, في حين ان الهرمونات والتي تتضمن (الاستراديول والانسولين) والمؤشرات الفسيولوجية (فيتامين د، الكولسترول، البروتين الدهني عالي الكثافة، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، الهيموجلوبين A1C، الجلوكوز الصيامي في الدم، مقاومة الانسولين، الحساسية للانسولين ، ضغط الدم الانقباضي وضغط الدم الانبساطي). اجريت هذه الدراسة في الفترة من اذار 2016 الى تشرين الاول 2016، حيث تم جمع العينات من مستشفى الصدر التعليمي في محافظة النجف. وقد بلغ عدد العينات (80) مريضا مصابين بداء السكري من النوع الثاني بمتوسط عمر (36 - 65 سنة ، وقسمت العينات الى مرحلة ما قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث, كذلك قسمت حسب مدة المرض وحسب التاريخ العائلي، ومؤشر كتلة الجسم، ومضاعفات المرض (ضغط الدم المرتفع). كما تضمنت الدراسة 40 شخصا اصحاء على ما يبدو بمتوسط عمر (36 - 65 سنة)، حيث ان مجموعة السيطرة تقارن مع مجموعة المرضى. قسمت الدراسة الحالية الى جزئين رئيسيين : الاجزاء الفسيولوجية والجزيئية. واظهرت النتائج ان المرضى الذين يعانون من مرض السكري من النوع الثاني، كان لديهم معنويا (p ≤ 0.05) مستوى اعلى من الكوليسترول ، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، الهيموغلوبين A1C، الانسولين، مقاومة الانسولين ونسبة السكر الصيامي في الدم مقارنة بمجموعة السيطرة، في حين ان معدلات الحساسية للانسولين تنخفض معنويا (P≥0.05) في مرضى السكري من النوع الثاني عند مقارنتهم بمجموعة السيطرة. كان معدل الاستراديول معنويا ( ≤ 0.05) اعلى في الاناث قبل انقطاع الطمث في حين انخفض في الاناث بعد سن الياس لكل من مجموعة السيطرة ومرضى السكري من النوع الثاني. واظهر الضغط الانقباضي والانبساطي فرقا معنويا بين المرضى الذين يعانون من السكري النوع 2 ومجموعة السيطرة. وفقا للمقارنة بين النساء قبل انقطاع الطمث وبعد سن الياس في كل من مرضى السكري ومجموعة السيطرة، اظهرت النتائج ارتفاع معنوي (p ≤ 0.05) في معدلات مستوى هرمون الاستراديول، ومعدلات مستوى هرمون الانسولين ومقاومة الانسولين في كلتا المجموعتين. من ناحية اخرى، اظهرت المقارنة بين المرضى قبل انقطاع الطمث الذين يعانون من السكري ومرحلة ما قبل انقطاع الطمث ارتفاع معنوي (p ≤ 0.05) في معدل مستويات الكوليسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة، هيموغلوبين A1c معدل مستويات (HBA1c)، الجلوكوز الصيامي في الدم , ومستويات هرمون الاستراديول، ومعدلات مستوى هرمون الانسولين، ومقاومة الانسولين، وحساسية الانسولين وضغط الدم الانبساطي. وفقا لمقارنة مرضى السكري بعد انقطاع الطمث ومجموعة السيطرة بعد سن الياس، كانت هناك اختلافات معنوية (p ≤ 0.05) في معدل مستويات الكوليسترول، البروتين الدهني منخفض الكثافة، معدل هيموغلوبين A1c، الجلوكوز الصيامي في الدم , هرمون الاستراديول ومعدلات مستوى هرمون الانسولين، ومقاومة الانسولين وحساسيةالانسولين. اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود ارتباط معنوي (p ≤ 0.05) بين فيتامين (د) مع الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في النوع الثاني من مرضى السكري. في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود علاقة عكسية معنويه بين فيتامين (د) مع كل من الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في حين تم العثور على علاقة ايجابية معنوية بين فيتامين (د) والبروتين الدهني عالي الكثافة في مرحلة ما بعد انقطاع الطمث في مرضى السكري. في مجموعة السيطرة بعد انقطاع الطمث تم العثور على علاقة عكسية معنويه بين فيتامين (د) ومستوى السكر الصيامي في الدم. اظهر تحليل الارتباط وجود علاقة معنوية عكسية بين معدلات مستوى الكالسيوم وضغط الدم الانقباضي في مجموعة السيطرة، وبينما في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، اظهرت نتائج تحليل الارتباط وجود علاقة ارتباط معنوية بين الكالسيوم ومؤشر كتلة الجسم، بينما وجدت علاقة معنوية عكسية بين الكالسيوم وكلا من البروتين الدهني عالي الكثافة والعمر بالاضافة الى ارتباط ايجابي معنوي مع الاستراديول في المرضى بعد سن الياس. من ناحية اخرى، في مجموعة السيطرة قبل انقطاع الطمث، تم العثور على ارتباط عكسي معنوي بين الكالسيوم وضغط الدم الانقباضي، في حين وجود علاقة طردية معنوية مع هرمون الانسولين ومقاومة الانسولين. في حين لوحظ وجود علاقة عكسية معنوية في مجموعة السيطرة بعد سن الياس بين الكالسيوم ومستوى السكر الصيامي في الدم ومؤشر كتلة الجسم. هنالك ارتباط معنوي كبير بين هرمون الانسولين مع البروتين الدهني عالي الكثافة والعمر وحساسية الانسولين، في حين كان هناك علاقة طردية معنوية بين الانسولين مع مؤشر كتلة الجسم ومقاومة الانسولين في النوع الثاني من مرضى السكري. في مجموعة السيطرة كانت هناك علاقة ارتباط معنوية طردية بين الانسولين ومقاومة الانسولين، ارتباط معنوي عكسية مع حساسية الانسولين. في كل من مرضى السكري قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث ومجموعة السيطرة كانت هناك علاقة سلبية كبيرة جدا بين الانسولين وحساسية الانسولين، في حين وجود علاقة طردية معنوية مع مقاومة الانسولين. في مرضى السكري قبل انقطاع الطمث، كانت هناك علاقة ايجابية كبيرة بين الانسولين والدهون الثلاثية , البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا ومؤشر كتلة الجسم. في مرحلة ما بعد انقطاع الطمث مرضى السكري، كانت هناك علاقة سلبية كبيرة بين الانسولين والهيموغلوبين .A1c ايضا هنالك علاقة طردية معنوية كبيرة بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم في مجموعة السكري. في مجموعة السيطرة كان هناك ارتباط طردي كبير بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم ,وعلاقة عكسية معنوية مع الكولسترول وحساسية الانسولين. وفقا لمجموعة السيطرة قبل انقطاع الطمث، كان هناك ارتباط ايجابي كبير بين الهيموغلوبين A1c والجلوكوز الصيامي في الدم، في حين وجود علاقة عكسية كبيرة مع الكولسترول، الدهون الثلاثية، البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا وحساسية الانسولين. من ناحية اخرى، في مجموعات مرضى السكري قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث وجدت علاقة طردية معنوية بين الهيموغلوبين A1c والسكر الصيامي في الدم , وارتباط ايجابي كبير مع الدهون الثلاثية والبروتين الدهني منخفض الكثافة جدا في مجموعة ما قبل انقطاع الطمث فقط. اظهرت نتائج التحليل الوراثي لتباين النوكليوتيدات المفردة، للجينات المستقبلة لفيتامين د باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البوليميريز - تباين اطوال قطع التقييد ان هناك فرقا غير معنوي في الاشكال الجينية (Apa - I, Fok - I, Taq I - ) و(Estrogen receptor - alpha ) بين المرضى ومجموعة السيطرة باستخدام نفس التقنية اعلاه. بينما وجد فرق معنوي بين المرضى ومجموعة السيطرة وفقا للتغاير الجيني في الجين (CdxII)وفقا الى الجين (Apa - I)، كان النمط الوراثي المتماثل (AA) اكثر تواترا في المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 (41٪) من مجموعة السيطرة ، في حين ان النمط الوراثي المتغاير (CA) اكثر تكرارا في مجموعة السيطرة من المرضى. نتائج الجين (Taq - I)، كان النمط الوراثي المتماثل (TT) اكثر تواترا في مجموعة السيطرة من المرضى الذين يعانون من السكري من النوع 2 ، في حين ان النمط الوراثي المتغاير (TC) كان اكثر تكرارا في المرضى من مجموعة السيطرة. وفقا الى الجين (Fok - I)، كان النمط المتماثل (CC) اكثر تواترا في مجموعة السيطرة من المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 ، في حين ان النمط المتغاير (CT) اكثر تكرارا في السيطرة من المرضى ، والنمط المتماثل (TT) كان اكثر تواترا في المرضى من مجموعة السيطرة بينما الجين (ER_alpha)، كان النمط المتماثل (AA) اكثر تواترا في المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 2 من مجموعة السيطرة ، في حين ان النمط المتغاير (AG) اكثر تواترا في السيطرة من المرضى ، والنمط المتماثل (GG) كان اكثر تكرارا في المرضى من مجموعة السيطرة | This study aimed to evaluate vitamin D receptor gene polymorphism role and its correlation with the development of diabetes disease and its effect in pre and post menopausal females. Vitamin D receptor gene including ( APA - I, FOk - I, Taq - I and CdxII) and (Estrogen receptor alpha gene) determined by Polymerase Chain Reaction (PCR) , restriction fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and Allele specific multiple (ASM - PCR), while the hormones including (Estradiol and Insulin) and the physiological parameters ( Vitamin D, Cholesterol, High density lipoprotein, Triglyceride, Low density lipoprotein, very low density lipoprotein, Hemoglobin A1c, Fasting Blood Glucose, insulin resistance, insulin sensitivity, systolic and diastolic blood pressure). This case - control study was done in a period of March 2016 to October 2016 ,where the samples collected from Al - Sadr Teaching Hospital in Najaf Province. The number of samples was (80) females with type 2 diabetes with an average age (36 - 65 year), all of them were with type 2 diabetes are divided to pre menopause and post menopause, also divided according to duration of disease and according to age groups, family history, body mass index and complications with disease (hypertensive blood pressure). Also, the study included 40 apparently healthy people with an average age ( 36 - 65 year) , as control matched with disease group. The present study divided into two main parts : physiological and molecular parts . The results showed that patients with type 2 diabetes , had significantly( p ≤ 0.05 ) higher cholesterol, Triglyceride, Low density lipoprotein, very low density lipoprotein, Hemoglobin A1c, insulin, insulin resistance and Fasting blood glucose levels rate than control group, while the levels rate of insulin sensitivity is decreased significantly (p ≤ 0.05) in type 2 diabetic patients when compared with control group . The Estradiol levels rate was significantly (p ≤ 0.05) higher in premenopausal females while it decreased in postmenopausal females of both control and type 2 diabetic patients. Systolic and diastolic pressure showed significant difference between patients with type 2 diabetic and control. According to the comparison of premenopausal and postmenopausal women in both diabetic patients and in control group, the results showed significant ( p ≤ 0.05) elevation in Estradiol hormone level rates, Insulin hormone level rates and insulin resistance in both groups. On the other , the comparison of premenopausal patients with diabetic and premenopausal control groups the statistical analysis showed significant elevation (p ≤ 0.05) in cholesterol levels rate, Low density lipoprotein (LDL), HemoglobinA1c levels rate (HBA1c), fasting blood glucose (FBG), Estradiol hormone level rates, Insulin hormone level rates, insulin resistance ,insulin sensitivity and diastolic blood pressure. The results of correlation analysis in pre menopausal diabetic patients showed there are significant negative correlation between vitamin D with both Triglyceride (TGC) and very low density lipoprotein (VLDL) while significant positive correlation has been found between vitamin D and high density lipoprotein (HDL) in post menopausal diabetic patients. In post menopausal control group a significant negative correlation has been found between vitamin D and fasting blood glucose (FBG) level.In pre menopausal diabetic patients, the results of correlation analysis showed there were significant positive correlation between calcium and BMI, while significant negative correlation has been found between calcium and both high density lipoprotein (HDL) and age in addition to significant positive correlation with Estradiol in post menopausal diabetic patients.On the other hand, In pre menopausal control group, a significant negative correlation has been found between calcium and systolic blood pressure, while a significant positive correlation with insulin hormone and insulin resistance. While, in post menopausal control group a significant negative correlation has been found between calcium and fasting blood glucose (FBG) level and body mass index. In both premenopausal and postmenopausal diabetic patients and control group there were highly significant negative correlation between Insulin and insulin sensitivity, while highly significant positive correlation with insulin resistance. In pre menopausal diabetic patients, there were significant positive correlation between insulin and Triglyceride (TGC), very low density lipoprotein (VLDL) and BMI. In post menopausal diabetic patients, there were significant negative correlation between insulin and HBA1c.On the other hand, in premenopausal and postmenopausal diabetic patients groups there were highly significant positive correlation between hemoglobinA1c (HBA1c) and fasting blood glucose (FBG), and significant positive correlation with TGC and VLDL in premenopausal group only. The genetic analysis of the Single Nucleotide Polymorphisms , for vitamin D receptor gene by using RFLP - PCR technique showed that there non - significant difference in the genotype polymorphisms of (APA - I, FOk - I and Taq - I) and (Estrogen receptor - alpha gene) between patients and control by using the same technique above, While there were significant differences according to (Cdx - II gene) by using (ASM - PCR) technique. According to (Apa - I gene), the homozygote pattern (AA) were more frequent in patients with type 2 diabetes than control group, While the heterozygote (CA) pattern more frequent in control than patients.The results of (Taq - I gene), the homozygote pattern (TT) were more frequent in control than patients with type 2 diabetes group, While the heterozygote (TC) pattern more frequent in patients than control. According to (Fok - I gene), the homozygote pattern (CC) were more frequent in control group than patients with type 2 diabetes, While the heterozygote (CT) pattern more frequent in control than patients, and the homozygote (TT) pattern was more frequent in patients than control group.While the (ER_alpha gene), the homozygote pattern (AA) were more frequent in patients with type 2 diabetes than control group, While the heterozygote (AG) pattern more frequent in control than patients, and the homozygote (GG) pattern was more frequent in patients than control group

التباين الوراثي في جينات TNF - ?, VEGF - A and IL - 10 المصاحبة لداء الصدفية == Genetic Polymorphism in TNF - ?, VEGF - A and IL - 10 genes associated with Psoriaasis

Author name: خالد عبد الكاظم هادي الطائي
Supervisor name: علي حمود السعدي | وسام علي امين عوض
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى تقصي بعض التغايرات الوراثية لكل من (TNF - α, VEFGF and IL10) لدى مرضى داء الصدفية وعلاقتها بشدة الاصابة باستخدام تقنيات تفاعل البلمرة المتسلسل وتباين اطوال قطع التقيد . بينما قدر مستوى الحركيات المناعية باستخدام تقنية الايلايزا.اجريت هذه الدراسة في الفترة من نيسان 2016 الى اذار 2017، حيث جمعت العينات مرضى داء الصدفية المراجعين لمستشفى مدينة مرجان الطبية، محافظة بابل / العراق. شملت الدراسة 64 عينة لمرضى داء الصدفية 40) ذكر و24 انثى) يبلغ متوسط اعمارهم (9 - 70 سنة)، كما شملت الدراسة 38 شخصا من الاصحاء (21 ذكر و17 انثى) يبلغ متوسط اعمارهم 15 - 65 سنة كمجموعة السيطرة جارت مجاميع المرضى.اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى كل من TNF - α وIL10 في المصل لدى مرضى داء الصدفية مقارنة بمجموعة السيطرة (P<0.01) . كما اظهرت الدراسة ارتباط معنوي بين مستوى TNF - α وشدة الاصابة ( - r=0.49, p=0.0001) بينما كان معامل الانحدار عكسي غير معنوي بين مستوى IL10 في المصل وشدة الاصابة ( - r= 0.29, P=0.0109) , وكان الانحدار عكسي معنوي بين مستوى IL10 و( - r= - 0.29) (p=0.0028) TNF - α. كما اظهرت النتائج ارتفاعا معنويا (P<0.01) في مستوى VEGF في المصل لدى مرضى داء الصدفية مقارنة بمجموعة السيطرة بينما كان الانحدارغير معنويا بين مستوى VEGF وشدة الاصابة( - r= - 0.05) .اظهرت النتائج وجود ثلاث انماط وراثية للتغايرات في موقع الجين TNF - α - 308 حيث كانت النسب AA 5 (7.81%) ,AG 24 (37.50% وGG 35 (54.69% في مجموعة السيطرة كانت 10 (26.31%) , 16 (42.11% و12 (31.58% اما توزيع الانماط الوراثية الناتجة من تحليل جين VEGF+405 كان النمط الوراثي CG هو السائد 24 (37.05) لدى مرضى الصدفية والنمط الوراثي CC هو الاقل ظهورا 1 (1.56%).. اضافة الى ذلك اظهر نتائج تحديد تتابع النيكليوتيدات للموقع الوراثي IL10 - 1082 نمطين وراثين حيث كان النمط الوراثي GG هو الاكثر تواجدا لدى مرضى داء الصدفية ( 47.5%) والنمط GA بنسبة (28.5%) مقارنة بمجموعة السيطرة التي جاءت جميعها بالنمط الوراثي GG. | Psoriasis is an immune mediated skin disease with a wide - world prevalence involves both genders and different age, it is a multifactorial disease influenced by genetic and environmental factors. The current study aims to evaluate the association of (Interleukin 10, Tumor Necrosis Factor - α and Vascular Endothelial Growth Factor) genes polymorphism in psoriasis. Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) determined by Polymerase Chain Reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (PCR - RFLP) and DNA sequencing techniques, while there serum levels determined by ELISA. This case - control study is done in a period of March 2015 to December 2017, where the samples collected from Marjan Medical City in Babylon Province. The number of samples was (64) patients psoriasis (40 males and 24 females ) with an average age ( 9 - 70 year), (50) of them were with type 1 psoriasis and (14) type 2. In addition, the study included 38 apparently healthy people who were (21 males and 17 females) with an average age (15 - 65 year), as control matched with disease group. The present study revealed a significant increasing (P<0.01) of Tumor Necrosis Factor - α (TNF - α) and Interleukin 10 (IL10) in patients compare with controls. In addition, there is a significantly regression between severity of disease and TNF - α serum level (r =0.49, p=0.0001) and non - significant invers regression with IL10 serum level (r= 0.29, P=0.0109). In addition, the results established an A significant negative correlation which has been found between IL10 and TNF - α (r= - 0.29) (p=0.0028). Physiological, the study shows significant increasing in Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) level in patient compare with control (P<0.01). There is no correlation between Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) serum level and severity or onest of disease (r= - 0.05).Genetically, analysis of the Single Nucleotide Polymorphisms PCR - RFLP genotyping for TNF - α - 308 G/A (rs1800629) SNP, Genotype distribution in patient were GG 35 (54.69%), AG 24 (37.50%) and AA 5 (7.81%) while in control were AG16 (42.11%), GG 12 (31.58%) and AA10 (26.31%).The genetic analysis of the Single Nucleotide Polymorphisms of VEGF +405 SNP, genotype distribution CC homozygous was predominant in patient 39(60.94%) and GG homozygous was 24 (37.05) While the GCwas the least 1 (1.56%). Comparing with the control group was CG 18(47.37%), CC 13(34.21%) and GG 7(18.42%).On the other hand , the statistical analysis for the role of genotyping for TNF - α - 308 SNP in the Serum levels of TNF - α were different between TNF - 308 AA (126.90 ± 14.96) patients and TNF - α GA(106.55 ± 16.42) and GG (57.94 ± 7.72) genotypes (p < 0.01). Analysis for the role of genotyping for VEGF +405 SNP non - significant difference between homozygous CC (408.30 ± 0.00), homozygous was GG (326.00 ± 34.81) and heterozygous CG (376.41 ± 58.63).This result promotes that the both of TNF - α - 308 SNP polymorphism and VEGF +405 SNP strongly implicated in the pathogenicity, severity and onest of psoriasis.PCR - sequencing for IL10 - 1082 A/G (rs1800896) locus shows a significant difference of percentage distributions of alleles and genotypes for IL10 - 1082 (rs1800896) locus between patient and control, GG homozygous was predominant in patient (71.5%) while the AG heterozygous was (28.5 %). Comparing with control group GG (100%).

تحضير وتوصيف المركبات النانوية ودراسة الفعالية المضادة للبكتريا == Synthesis, Characterization and Antibacterial Activity of Synthesized Nanoparticles

Author name: علي جبار عبد الحسين رضا الكواز
Supervisor name: فريال جميل عبد عطية | اياد فاضل محمد القيم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:

الفعالية الحياتية لبعض مستخلصات النباتات الطبية على بعض انواع البكتريا والتعبير الجيني لانزيمات الكيراتينز المنتج من قبل Trichophyton rubrum == Biological Activity of some Medicinal Plant Extracts on some Bacteria and Gene Expression of Keratinases Produced from Trichophyton rubrum

Author name: علي جليل عبيد حسن عينون
Supervisor name: جواد كاظم عبود علي الجنابي | وجدان رضا محمود محمد تاج الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The present study aimed to search for safe and effective antifungal agents through investigation of the phytochemical characterization and bioactive properties of medicinal plants (Pimpinella anisum essential oil and Moringa oleifera and Malva sylvestris leaf extracts) and their effect on gene expression of keratinases produced by T. rubrum using Real Time PCR.Phytochemical analysis of active materials of P. anisum essential oil and M. oleifera leaf extracts were carried out, through TLC accompanied autobiography, high performance liquid chromatography (HPLC) and GC - MS analyses were proceeded to relate the chemical profile with their antifungal activity. Also, the cytotoxic effects of active compound and crude extract for both plant extracts were determined using MTT (3 - (4,5 - dimethylthiazol - 2 - yl) - 2,5 - diphenyltetrazolium bromide dye) assay. Screening the antifungal activity of Pimpinella anisum essential oil, Moringa oleifera leaf extracts and four traditional antifungal agents against growth and development of two strains of T. rubrum differed in their virulence were conducted. MIC for crud extracts and antifungal agent were also determined using microdilution plate, moreover, the effects of crud extracts and active compounds on gene expression was evaluated.Qualitative TLC, HPLC analysis for the anise essential oil extract revealed the presence of anethole which was identified as a main volatile compound in this extract which was identified as anethole. GC - MS analysis also revealed that trans - anethole is the major compound (96.8%), then Himachalene (1.84%), other components were also present but less than 1% e.g. Estragole, cyclohexene and 2 - Methoxy - 5 - (1 - propenyl) phenol. On the other hand, LC - MS analysis were showed the existence of that keratinase inhibitor (extracted from Moringa oleifera leaf)IICryptochlorogenicacid (C16H18O9), Astragalin (C21H20O11), so the presences of these compounds reflected the inhibitory effects on keratinase enzyme.The results upon screening, revealed that the anise oil inhibited both strains of T. rubrum, since the growth inhibition for first strain were 21, 30 and 39 mm at 15.6, 31.2 and 62.5 μl/ml respectively, while in second strain were 24, 32 and 39 mm at 15.6, 31.2 and 62.5 μl/ml respectively. The tested strains of this fungus revealed substantial sensitivity pattern toward crude extract of essential oil and anethole as well. Results showed that there was considerable growth inhibition for both strains of T. rubrum at minimal inhibitory concentrations (MIC) between 15.6 μg/mL for crude oil and 7.5 μg/mL for anethole. The inhibition in radial growth due to the effect of anise essential oil increased from 56% at 3rd day to 86% at the 7th day. Sporulation was substantially decreased by anise oil treatment. Anise oil was significantly inhibited conidial germination for both strains. Treatment with anise oil induced morphological changes in the conidial group where the conidia were absent in treated sample. Protease inhibitor isolated from mature leaves of M. oleifera showed great ability to inhibit keratinase activity of T. rubrum.MTT assay revealed that anethole is safe as phototherapeutic agents, when it is having no effects on normal cell, but shown anticancer activity against cancer cell.Anise oil, anethole, M. oleifera crud inhibitor, Cryptochlorogenic acid and Astragalin showed high inhibitory effects on gene expression of keratinase enzyme in both strains of T. rubrum KP979791 and KP979787.

دراسة مقارنة، مجهرية ، جزيئية، بين الاميبا الحالة للنسيج E. histolytica والاميبا المتغيرة E. dispar في مرضى محافظة بابل == Comparative Study , Microscopic and Molecular , Between Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar in Babylon Patients

Author name: شمس حامد كاظم خليل السلطاني
Supervisor name: ماهر علي جتان القريشي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية في الفترة من شهر ايلول2015 ولغاية اب 2016 للتحري عن وبائية الطفيليات المعوية الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica والاميبا غير الممرضة Entamoeba dispar بطريقة الفحص المجهري وطريقة تفاعل سلسلة البلمرة PCR والمقارنة بين كلا الطفيليين في بعض جينات عوامل الضراوة السستين بروتينيز 5 وamoebapor A ، Ap - B ، Ap - C . كذلك تضمنت الدراســـــة تقدير تركـــــيز الضــــد الافرازي S - IgA ، وكذلك قياس تركيز الاضداد IgA ، IgG ، IgMفي مصول المرضى والسيطرة.بلغ عدد العينات المفحوصة 200 عينة خروج لمرضى يعانون من الاسهال لفئات عمرية مختلفة تم جمعها من المستشفيات والمراكز الصحية وبعض العيادات الخاصة في محافظة بابل، تم فحص العينات بطريقة المسحة المباشرة وطريقة تفاعل تسلسل البلمرة باستخراج الدنا الخاص بالطفيليات منها ، في مختبرات المستشفيات والمراكز الصحية ومختبر الطفيليات المتقدم في كلية العلوم/ جامعة بابل .اظهرت نتائج الفحص المجهري ان نسبة الاصابة الاجمالية بالطفيليات المعوية اميبا الزحار 20% ) 40عينة) ، بينما بلغت 73% بطريقة تفاعل تسلسل البلمرة في حين كانت نسبة الاصابة 27.5 % لطفيلي E. dispar باستخدام البرايمر الخاص بهذا الطفيلي Ed - 1. وتضمنت الدراسة الحالية ارتباط عامل العمر والجنس ومنطقة السكن واشهر السنة بنسبة انتشار كلا الطفيليين وباستخدام الفحص المجهري وPCR واوضحت نتائج التحليل الاحصائي عدم وجود فروق معنوية في عدد المصابين بين العمر والجنس الريف والمدينة وباختلاف نوع الطفيلي، بينما وجدت فروق معنوية لنسب انتشار كلا الطفيليين حسب اشهر السنة .بينت نتائج الفحص المجهري حسب الفئة العمرية ان اعلى نسبة اصابة بلغت 37.5% للفئة العمرية (1 - 10) سنة ، بينما بلغت اقل نسبة اصابة 2.5 % للفئة العمرية (31 - 40) سنة، في حين اشارت الدراسة الجزيئية الى ان اعلى نسبة اصابة36.36 و41.3 % للفئة العمرية (1 - 10) سنة واقل نسبة اصابة هي 9.09 و3.4% لكلا من طفيلي E. dispar وE. histolytica ، على التوالي.حسب الجنس بلغت اعلى نسبة اصابة لطفيلي E. histolytica للذكور67.5 % في حين كانت في الاناث32.5 %بطريقة الفحص المجهري ، اي كانت اعلى من نتائج الـــ PCR ، اذ بلغت 41% ، 59 % للاناث والذكور على التوالي ، مقارنة بطفيلي E. dispar 73% للذكور اعلى من الاناث 27%.بلغت نسبة الاصابة بطفيلي اميبا الزحار حسب منطقة السكن في الريف 75% اعل من المدينة 25% بطريقة الفحص المجهري ، مقارنة بنتائج الـــ PCR كانت نسب الاصابة في الريف 69% اعلى من المدينة 31% ، بينما لطفيلي E. dispar في المناطق الريفية 64% اعلى من المدينة 36%.وفقا للاشهر السنوية للدراسة كانت الاصابة اكثر شيوعا في يونيو ويوليو 20و 27.5% على التوالي بطريقة الفحص المجهري، واقل نسب في نوفمبر وديسمبر ويناير ومارس بنسبة 2.5% , مقارنة لنتائج الـــPCR لاميبا النسيج كان الاصابة اكثر شيوعا في يونيو ويوليو 16.6 ، 33.3 % على التوالي، وكان اقل تواترا في اكتوبر، نوفمبر، ديسمبر، ومارس 3.3% ، في حين لطفيليE. dispar كان معدل الاصابة مرتفع في مايو ويوليو 36.36% ، واقل في سبتمبر9.09٪، مع وجود فروقات معنوية بين الطفيليات لكلتا الطريقتين.اوضحت نتائج الدراسة الجزيئية ان هناك تغاير في الدنا الخاص بعوامل الضراوة في كلا الطفيليين ، اذ كانت جميع عينات طفيلي اميبا الزحار موجبة للجين البادئ سستين بروتينيز 5 CP5 وكذلك لــ amoebapor A ، Ap - B، Ap - C، في حين لطفيلي E. dispar وجدت سبعة عينات 63.6% موجبة لــ amoebapore A ، وستة عينات 54.5% لــ Ap - B ، وثلاث عينات 27.2% لــ Ap - C، مع وجود فروق معنوية لكلا الطفيليين . اظهرت نتائـــــــــــــــــج الدراسة المناعية وجود فــــــــــــــروق معنوية للمرضــــــى المصابيــــــن بطفيلي اميبا الزحار مقارنـــــــــــــــة مع مجموعــــــــــة السيطــــــــــرة ، وبلـغ مستوى تركيز الكلوبيوليــــن المناعي S - IgA (8.582 ± 0.351) مايكروغرام/ ديسيلتر لطفيلي E. histolytica و(5.213 ± 0.421) مايكروغرام/ ديسيلتر لــ E. dispar و(1.935±0.03) مايكرو غرام/ ديسيلتر لمجموعة السيطرة ، كذلك بلغ اعلى تركيز لـــــ IgA , IgG, IgM (387.9 , 707.4, 294.9) ملغ/دل لطفيلي اميبا الزحار مقارنة مع طفيلي E. dispar مع مجموعــــــــــة السيطــــــــــرة ، مع وجود فروق معنوية للمرضى المصابين باميبا الزحار . | The present study conducted in the period from September 2015 to Augusts 2016 to determination of epidemiology for Entamoeba histolytica and nonpathogenic Entamoeba dispar by microscopic examination and conventional PCR and compromise some virulence factors cysteine proteinase CP5 gene , amoebapore A , Ap - B, Ap - C, for both parasites and estimate immunoglobulin G,A,M, and S - IgA in serum of patientsAll stool samples (200) collected from patients for different ages suffering from diarrhea or bloody diarrhea and attended to some hospitals and medical centers in Babylon governorate . All samples were examined by direct wet preparation method and polymerase chain reaction by extract the parasites DNA, in hospital and medical centers laboratories and the advanced parasites laboratory in the Biology Department / College of Science / Babylon University. The microscopic examination results show out of 40 stool samples had E. histolytica with percent 20% ,in compromise to PCR product infection rate was higher 73% , and for E. dispar 27.5% by Ed - 1 primer specific for this parasite.This study includes the relation of age, gender, and residence for both parasites infection, without significant differences for both parasites, while the annual study months had significant differences for both parasites by two methods . The microscopic study results according to ages group the highest infection percentage 37.5% for ages (1 - 10) year and the lower percentage was 2.5% for ages (31 - 40) year, while by PCR technique higher percentage 41.3 , 36.36 % for ages (1 - 10) , while the lower percentage was 3.4% , 9.09 % for (21 - 30) years, for E. histolytica and E. dispar , respectively . According to the gender, the infection Percentage in male and female 67.5% , 32.5% respectively by microscopic examination ,is higher than infection rate by PCR product 59% , 41%, for E. histolytica respectively, in compromise for E. dispar in male 73 % is higher than female 27 %.E. histolytica infection according to rural regions was 75 % higher than urban regions 25 % by microscopic examination ,in compromise to PCR product ,infection rate in rural regions was 69 % higher than urban regions 31 %, while for E. dispar in rural regions was 64% higher than urban 36 %.According to annual months of the study, the most frequent infection was in June and July 20 , 27.5% respectively by microscopic examination , and lower frequent was in November , December , January and March 2.5%, in compromise to PCR product results for E. histolytica the most frequent infection was in June and July (16.6 , 33.3)% respectively , and lower frequent was in October, November , December , and March 3.3% , while for E. dispar The high infection rate was in May and July 36.36%, and lower frequent was in September 9.09 %, with significant differences between parasites for both methods. For molecular study results, out of (40) stool samples, only (29) sample showed positive for CP5 gene marker for E. histolytica and 11 (27.5%) samples showed negative for this gene, moreover (11) stool samples showed also positive for (Ed) primer which is specific for E. dispar ,all samples of E. histolytica were positive for cysteine proteinase CP5 gene , amoebapore A , Ap - B, Ap - C, while for E. dispar only seven samples 63.6% positive for amoebapore A, six samples 54.5 % for Ap - B, and three samples 27.2% for Ap - C , with significant differences between both parasites virulence factors genes. The level of secretory IgA showed significant differences in patients with E. histolytica compared with control group, The level of secretory - IgA was (8.582 ± 0.351) μg /dL for E. histolytica and (5.213 ± 0.421) μg /dL for E. dispar and (1.935±0.03) for control group.The result of the present study, revealed the concentrations of immunoglobulin IgA , IgG , IgM, (387.9 , 707.4, 294.9 mg/dl), were higher in E. histolytica patients group compared to E. Dispar patients and control group , with a significant differences at p ≤ 0.05 for E. histolytica group

تقدير الاسبارجين في مرضى سرطان الدم بوساطة الاسبارجينيز المقيد والمنقى من Portulaca oleracea L == Estimation of Asparagine in Serum Leukemia Patients by Immobilized L - asparaginase Purified from Portulaca oleracea L

Author name: هادي ساجد عبد العباس عبد الله
Supervisor name: محمد عبد الله جبر جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: جمعت عينات النباتات قيد الدراسة من منطقة الرارنجية \مدينة الحلة\العراق. وصنفت النباتات من قبل د.نداء عدنان في قسم علوم الحياة \كلية العلوم \جامعة بابل بالاعتماد على الصفات المظهرية للنباتات . تم التحري عن فعالية انزيم الاسباراجينيز والمحتوى البروتيني في المستخلص الخام لهذه النباتات , تبين ان اعلى فعالية نوعية لانزيم الاسباراجينيز في نبات البربينة Portulaca oleracea L., ثم قدرت الفعالية الانزيمية في اجزاء النبات والتي شملت (الاواق, السيقان,الجذور, نبات كامل) حيث ظهرت اعلى فعالية في النبات الكامل مقارنة بالاجزاء الاخرى ,بالاعتماد على هذه النتائج استخدم نبات البربينة Portulaca oleracea L. كمصدر لانتاج وتنقية وتوصيف والاستخدام الطبي لانزيم الاسباراجينيز.درست الظروف المثلى لفعالية انزيم الاسباراجينيز من النبات الكامل وقد اشارت النتائج الى ان اعلى فعالية للانزيم قد تحققت بحضن الانزيم الخام مع الاسبراجين بتركيز 200mM بنسبة 1 : 3 في محلول دارئ فوسفات البوتاسيوم المنظم بتركيز 0.05 مولار بدالة حامضية 8 وبدرجة حرارة 37 م مع الانخفاض التدريجي في الفعالية النوعية للانزيم الخام بعد خزنه لفترات زمنية محددة .تم تنقية انزيم الاسباراجينيز الخام المستخلص من نبات البربينة بثلاث خطوات تضمنت الاولى الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة 90% ثم التنقية بكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستحدام السيفاديكس G - 100 وبعدها التنقية بكروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام السيفاديكس G - 150 وقد ظهرت ثلاثة اشكال للانزيم حيث بلغت الفعالية النوعية للانزيم النقي 7440 وحدة\ملغم وعدد مرات التنقية 4.08 وبحصيلة انزيمية بلغت 22.7%.تم توصيف الاسباراجينيز النقي ,اذ بلغ الوزن الجزيئي52±1 كيلو دالتون باستخدام كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام السيفاديكس G - 100 بوجود البروتينات القياسية والتي هي Trypsin (23 KD), Pepsin (34.5 KD), Egg Albumin (43KD) , and Bovine serum albumin (67 KD) وكان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية وثبات الانزيم هو 8 في حين كانت درجة الحرارة المثلى لفعالية وثبات الانزيم هي 37 م وعند دراسة الثوابت الحركية للانزيم , ظهر ان معدلات قيم ثابت ميكالس (Km) والسرعة القصوى (Vmax) وعدد التحول(Kcat ) كانت 250 ملي مولار و100 ملي مولار \دقيقة و350 1\ثانية على التوالي. قيد الانزيم باستعمال الاكار,الاكاروز والجيلاتين وتم توصيف الانزيم المقيد ومقارنته مع الانزيم الحر. اظهرت نتائج الدراسة كفاءة التقييد باستعمال مادة الاكاروز والاكار والجلاتين حيث بلغت ( (70,72,78 % على التوالي وكما تبين من النتائج ان اعلى فعالية للانزيم الحر والمقيد بالاكاروز كانت عند الدالة الحامضية 8 اما الانزيم المقيد بالاكار والجيلاتين فكانت اعلى فعالية عند الدالة الحامضية 9. بالمقابل كانت درجة الحرارة 37 م هي المثلى للفعالية للانزيم المقيد بالاكار والجيلاتين والحر و40 م للانزيم المقيد بالاكاروز. واستخدم الانزيم المقيد في تقدير تركيز الاسبارجين في مصل الدم , اظهرت النتاج ارتفاع واضح في تركيز الاسباراجين لمرضى اللوكيميا (سرطان الدم) حيث بلغت〖10〗^( - 2) - 〖10〗^( - 3) مولار مقارنة مع الاشخاص الطبيعيين حيث بلغت〖10〗^( - 4) - 〖10〗^( - 7) مولار | Plants samples were collected during 2016 (August to September) from Al - Raranjia Hamlet field / Al - Hilah city / Iraq. These samples were classified by Dr. Nidaa Adnan Muhammed ,Biology Department/ Collage of Science / University of Babylon , according to their morphological characteristics. Activity of asparaginase was detected in whole plant, leaves, steems and roots extracts. Results showed that Portulaca oleracea L. was the best one from group of tested plants for research due high yield of L - asparaginase enzyme . Maximum asparaginase activity was detected in whole plant extracts which was 43.55 U/ml in comparison with 37.74,33.16 and 36.8 U/ml in extracts of leaves, steems and roots respectively. According to these results whole plant of Portulaca oleracea L. were used as a source for asparaginase production, purification , characterization, and medical application . Activity of crude asparaginase extracted from whole plant were under optimal conditions studied. Results revealed the maximum activity of asparaginase was achieved when the enzyme was incubated with asparagine 200mM at 37°C in the presence of potassium phosphate buffer 0.05 M solution/plant sample (g) (3 : 1 ratio) at pH8 , with gradually increase in activity with increase of the substrate and gradually activity decrease after particular storage period. Crude asparaginase extract was purified in three steps ( Ammonium sulfate precipitation (90%), gel filtration chromatography technique by Sephadex G - 100 and gel filtration chromatography method by Sephadex G - 150. There are three isoform of enzyme while Specific activity of the purified asparaginase was 7440 U/mg and 4.08 Purification folds, 14.5 % yield. Characterization of the purified asparaginase showed that the molecular weight of the enzyme was 52±1 Kilo Dalton by gel filtration chromatography using Sephadex G - 100 in the presence of four standard proteins which they are Trypsin (23 KD), Pepsin (34.5 KD), Egg Albumin (43KD) , and Bovine serum albumin (67 KD). pH 8 was the optimum pH for enzyme activity and stability, while 37°C was the optimum temperature for both enzyme activity and stability, with Km of 250 mM toward L - asparagine as substrate and the maximum velocity (Vmax) and Kcat of 100 mM/min, 350 sec^( - 1) respectively . The activity of immobilized enzyme was determined and compared with free enzyme ,where immobilizing Efficiency of agar , agarose and gelatin techniques was ( 72 %,78 % and 70 % ) respectively, all immobilizing technique proved that the activity of the enzyme was increased significantly compared with free enzyme, where agar and gelatin methods showed more stability of enzyme at alkaline pH (pH 9) , whereas only agarose method get the enzyme more heat stability to enzyme than other immobilizing methods. There are significant elevation level of asparagine concentration in leukemic human serum samples than normal human serum samples , where reached to 〖10〗^( - 4) - 〖10〗^( - 7) M of asparagine in normal human serum samples while it was 〖10〗^( - 2) - 〖10〗^( - 3) M of asparagine in leukemic serum blood samples.

تاثير النحاس النانوي والمستخلص حيويا في بعض المؤشرات الحيوية لنبات الفجل Raphanus sativus L. == Effect of copper nanoparticles and copper nanoparticles that extract biologically in some biochemical parameters of radish (Raphanus sativus L.)

Author name: سمية يحيى عبد عبيس
Supervisor name: رحاب عيدان كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تمت هذه الدراسة في مختبر النبات المتقدم لقسم علوم الحياة/كلية العلوم/جامعة بابل خلال السنة 2016 - 2017، وقد تضمنت هذه الدراسة بيان تاثير اربعة عشر معاملة من النحاس بالتراكيز (0.1 و3.5 و63.5) جزء بالمليون والنحاس النانوي الجاهز بالتراكيز (0.1 و0.3 و1.5 و23.5 و43.5 و63.5) جزء بالمليون والمستخلص المائي لاوراق نبات الدمس Conocarpus erectus L. (5%) والمحلول المزيج (مستخلص نباتي 5%+ كبريتات النحاس 0.1 مل مولر) وللمقارنة (الماء المقطر) على انبات ونمو بذور نبات الفجل Raphanus sativus L. في تجربتين احدهما في اطباق والثانية في اصص.وفي اوراق نبات الدمس تم انتاج النحاس حيويا وباستعمال تقنيات UVS وXRD وFTIR وSEM وEDX لتشخيص عنصر النحاس النانوي وتحديد مجاميعه الفعالة وخصائصه الاخرى وقد تم التوصل الى النتائج التالية : 1. ظهرت قمة الامتصاص بحدود 395 نانوميتر من خلال تقنية UVS، وكان معدل حجم دقائق النحاس النانوي 39 نانوميتر وفقا تقنية XRD وSEM وظهر وجود مجاميع فعالة سببت ثباتية لدقائق النحاس النانوي وفقا لما اشرته تقنية FTIR. 2. سبب المستخلص النباتي انخفاضا معنويا لمعظم المؤشرات الحيوية المدروسة في تجربتي اطباق بتري والاصص عدا المساحة الورقية ومحتوى البروتين اللذان ارتفعت قيمهما معنويا مقارنة مع عينة السيطرة.3. سبب المزيج تشجيع بعض المؤشرات الحيوية التي ثبطت بتاثير المستخلص النباتي او تاثير النحاس بالتركيز الاعلى (63.5 جزء بالمليون والمحضر من كبريتات النحاس) عند المقارنة مع كل من المستخلص النباتي لوحده او عند المقارنة مع التراكيز الاعلى للنحاس، ولكن معظمها بقيت ذات تثبيط معنوي عند المقارنة مع عينة السيطرة مثل النسبة المئوية لمعامل سرعة الانبات وطول المجموع الجذري ومحتوى الكاربوهيدرات ومحتوى السايتوكروم P450، وكانت مثبطة اكثر عند المقارنة مع التركيز الاعلى للنحاس مثل البرولين والميتالوثايونين. وثبطت بعض مؤشرات النمو بتاثير المزيج عند المقارنة مع كل من المستخلص النباتي لوحده او النحاس بالتركيز الاعلى او عند المقارنة مع السيطرة مثل الوزن الطري للمجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي. في حين ازداد بعضها عن عينة السيطرة بعد ما خفض تاثيره مقارنة مع التركيز الاعلى للنحاس مثل الوزن الجاف للمجموع الخضري والمساحة الورقية ومحتوى الكاروتينات والبرولين والكلوتاثيون. 4. اختلفت كبريتات النحاس في التاثير تبعا لتركيزها وقد ازدادت قيم بعض مؤشرات النمو مع انخفاض التركيز مثل النسبة المئوية للانبات وطول المجموع الجذري والوزن الطري للمجموع الجذري، والوزن الجاف للمجموع الخضري والمساحة الورقية ومحتوى البرولين ومحتوى السايتوكروم. وكان التركيز 3.5 جزء بالمليون للنحاس مشجعا لطول المجموع الخضري والوزن الطري للمجموع الخضري والوزن الجاف للمجموع الجذري بصورة معنوية عن عينة السيطرة. 5. اختلفت دقائق النحاس النانوية في تاثيرها باختلاف التركيز. ولوحظ ان مؤشرات النمو شجعت مع انخفاض التركيز مثل النسبة المئوية للانبات وسرعته وطول المجموعين الخضري والجذري والوزن الطري والجاف لهما والمساحة الورقية ومحتوى الكلوروفيل الكلي والكاروتينات والبرولين والكاربوهيدرات والسايتوكروم. وتبين زيادة تلك المؤشرات عند التركيزين 1.5 و0.5 جزء بالمليون لدقائق النحاس النانوي اذ اعطيا افضل نتيجة، وعند التركيزين الاخيرين (0.3 و0.1 جزء بالمليون) انخفضت قيم المؤشرات المدروسة ولكن لم يحدث فرق معنوي عند المقارنة مع عينة السيطرة لمعظمها. ازداد محتوى البرولين والكلوتاثيون ومضادات الاكسدة معنويا عند زيادة تراكيز النحاس النانوي وانخفضت بانخفاضها. | A Laboratory study, the study was conducted to study the effect of copper at concentration 0.1, 3.5, 63.5 ppm (a Copper sulphate CuSO4) and the effects of available nano - copper at concentration 0.1, 0.3, 0.5, 1.5, 23.5, 43.5 and 63.5 ppm, with study the effects of leave water extraction of Conocarpus erectus (5%) and the effect of mixture solution (plant extraction + CuSO4 0.1milimolar) and for comparison the distilled water used, experiment was carried out with fourteen treatments. At first stage of research, the nano copper was produced biologically from mixture solution and observation, the fast color changes with appearance of red residue. And with utilize UVS, XRD, FTIR, SEM, EDX technologies was detected the nanocopper elements and absorption peak was appeared at 395nm by using UVS technology. The average size of nanoparticle of copper was approximately 39 nm by using XRD and SEM, the technology of FTIR showed the present active groups due to stability of nanoparticle of copper. At the second stage of research, plant extraction was added, mixture solution , concentrations of CuSO4 and concentrations of nanocopper rather than control sample for the seed of plant Raphanus Sativus L. for two experiments, the first was cultured at petri dish and continued for 5 days, and the second was cultured in pots and continuous for 30 days, the results showed the following : 1. The plant extraction caused significantly increased for most biomarker whereas in experiment of petri dish or in pots experiment except the area of leave and protein content were significantly increased as compared with control .2. The mixture caused stimulation of some biomarkers that are inhibited by the effects of plant extraction or the effects of copper at highest concentration (63.5 ppm that are prepared from CuSO4). But non significantly for most of it as compared with plant extract or with highest concentration for copper, but most of them remained with significantly inhibited as compared with control such as indice of seed emergence speed, length of root system, carbohydrate content and cytochrome p450, or more inhibited as compared with highest concentration such as proline and metallothionien. Some indices growth were inhibited by mixture effects as compared with plant extraction alone or with the copper at highest concentration compared with control such as vegetative system of fresh weight and the total content of chlorophyll. While some of them were alleviated as compared with control after decreasing its effect as compared with highest concentration of copper such as dry weight of vegetative systems, area leave, carotenoid content, proline and glutathione. 3. The copper as Copper Sulphate was caused different effects according to its concentration. The values of some growth indices were increased, with decreased the concentration such as % of germination, length of roots systems, fresh weight of roots system, dry weight of shoots systems, leave area, proline content and cytochrome contents. While the concentration 3.5 ppm of copper was important due to increase the length of vegetative system, fresh weight of vegetative systems, dry weight of root system as significant with control. Chlorophyll a and b were significantly decreased as well as total chlorophyll content compared with the control, Carotenoid, carbohydrates, proline, glutathione, total antioxidants, metallothionien with concentration were also decreased. 4. Preparation of nanparticle copper was at different concentrations caused, different effects according to concentration, observation, the growth indices were stimulated by lower concentration such as % of seed germination, % of speed seed germination, length of both vegetative and roots systems, fresh weight of both vegetative and roots, dry weight of vegetative and roots systems, leave area, contents of each chlorophyll a and b (non significant), total chlorophyll, carotenoid, proline, carbohydrate and cytochrome p450, each of these parameters at the concentration (1.5, 0.5) ppm for nanoparticle of copper gave the best results, while they were decreased at the (0.1 , 0.3) ppm concentration , but occur significant as compared with control, it remained better than control although its value decreased. The highest concentration of nanocopper caused significantly increased of proline content, glutathione, total antioxidants metallothionien which gave the best values that similar for control at the concentration 23.5 ppm and these values were decreased with the lowest concentration

تاثير السموم الكبدية الـMicrocystin - LR على الصفات البايوكيميائية والجزيئية في الكارب الاعتيادي والجرذ == The Effects of Hepatotoxic Microcystin - LR on Biochemical and Molecular Characteristics of Cyprinus carpio and Rattus rattus

Author name: ماهر محمـــد خضـــيري الجبــــــوري
Supervisor name: مؤيد جاسم ياس العماري | اياد محمد جبر المعموري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Pollution
Degree: Doctorate
University: University of Babylon - College Of Science - Department Of Biology
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية لدراسة تاثير السموم الكبدية الـMicrocystin - LR على الصفات البايوكميائية والجزيئية في الحيوانات المختاره (الكارب الاعتيادي والجرذ) حيث كان تركيز microcystin - LR المنقى من Anabaena circinalis وOscillatoria splendida 74.832 مايكروغرام / مل61.85 مايكروغرام/ مل على التوالي الذي تم الكشف عنه وجمعه بواسطة الكروماتوكرافية السائلة فائقة الاداء التحضرية بينما كان تركيزه في Westiellopsis prolifica وStigonema sp هو 28.385 مايكروغرام/مل و23.591 مايكروغرام/مل على التوالي. استخدمت تراكيزالــmicrocystin - LR للجرذ واسماك الكارب الاعتيادي عن طريق حقنها تحت الغشاء البريتوني خلال التعرض الحاد الحادة (96 ساعة) , كانت ( 60 , 40 , 20 ) مايكروغرام /200 غرام من زون الجسم , ومن ثم تحديد الجرعة المتوسطة المميتة للجرذ واسماك الكارب الاعتيادي وكانت (52.48 و67.95) مايكروغرام / 200 غرام من وزن الجسم على التوالي . بينما في التعرض المزمن ( 30 يوم ) ،كانت التراكيز المستخدمة هي (3 و6 و9) مايكروغرام/ 200 غرام من زون الجسم. بينت نتائج الدراسة الحالية زيادة معنوية في كل المؤشرات البايوكيميائية مع زيادة الجرعة الــMicrocystin - LR في دم وكبد الجرذان واسماك الكارب الاعتيادي خلال التعرض الحادة ، لكن خلال التعرض المزمن ايضا ازدات كل المؤشرات البايوكيميائية زيادة معنوية مع زيادة تركيز الــMicrocystin - LR ، بينما قلت تركيز مضادات الاكسدة الكلية والسايتوكروم P450 والفوسفيتيز القاعدي في الدم والكبد والـGOT في دم الجرذ بشكل معنوي مع زيادة تركيز الجرعة الــmicrocystin - LR بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ، بينما في اسماك الكارب الاعتيادي ، تركيز فيتامين C والسايتوكروم P450 في الدم والكبد ، والفوسفتيز القاعدي والـGPT في الكبد حيث قل بشكل معنوي مع زيادة تركيز الـmicrocystin - LR بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. بينت ايضا نتائج الدراسة الحالية الحصول على ست انواع من التشوهات الكروموسومية هي الكروموسومات الحلقية والكروماتيد المتكسر وكروموسومات المتقطعة وكروموسومات القلة وثنائية المركز خلال الفترة المزمنة في نخاع العظم للجرذ والكبد الاسماك الكارب الاعتيادي ، فان عدد كل نوع من التشوهات الكرموسومية في الجرذ واسماك الكارب الاعتيادي ازدادت بشكل معنوي مع زيادة تركيز الــmicrocystin - LR ، اظهر التحليل الاحصائي ارتباط معنوي موجب بين التشوهات الكروموسومية والمؤشرات البايوكيميائية ومؤشرات تحطم الـDNA ، اما دليل الانقسام الخلوي ازداد بشكل معنوي مع .زيادة الجرعة في نخاع عظم الجرذ وكبد الكارب الاعتيادي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . المؤشرات الجزيئية للــDAN المتحطم كالطول المذنب Comet lengthو طول الذنب Tail length وهجرة الذنب Tail moment في دم وكبد الجرذ واسماك الكارب الاعتيادي ، والتي ازدادت بشكل معنوي مع زيادة جرعة الــmicrocystin - LR ، ايضا اظهرت النتائج ارتباط معنوي موجب مع المؤشرات البايوكيميائية والتشوهات الكرموسومية ، ايضا بينت الدراسة الحالية بان تحطم الـDNA في الكبد اكثر مما في الدم . | The presents study was designed to study the effects of hepatotoxic microcystin - LR on biochemical and molecular characteristic of selected animals (Cyprinus carpio and Rattus rattus) Whereas the concentration of microcystin - LR obtained from Anabaena circinalis and Oscillatoria splendida that purification and collection by utilizing preparative high performance liquid chromatography was 74.832 µg/ml and 61.85 µg/ml respectively. While its concentration in Westiellopsis prolifica and Stigonema sp was 28.385 µg/ml and 23.591 µg/ml respectively The concentrations of toxin that used for rats (Rattus rattus) and common carp (Cyprinus carpio) via intraperitoneally injection during acute period (96 h) was (20, 40, 60) µg/200g body weight and then determination of median lethal dose for rats and C. carpio was (52.48, 67.95) µg/200g body weight respectively, While in chronic period (30 days), the concentrations used for above animals was (3, 6, 9) µg/200g body weight . The results of presents study was showed all biochemical markers significantly increased with increasing dose of microcystin - LR in blood and liver of rats and C.carpio during acute period, but in chronic period also all biochemical markers in blood and liver of rats and C.carpio have been significantly increased with increasing concentration of microcystin - LR, Whereas the total antioxidant concentration, Cytochrome P450 and Alkaline phosphatase in blood and liver, and GOT in blood of rats were significantly decreased with increasing concentration of dose of microcystin - LR as compared with control groups, While in C. carpio, the concentration of vitamin C and Cytochrome P450 in blood and liver, and Alkaline phosphatase and GPT in liver were significantly decreased with elevated concentration of microcystin - LR as compared with control groups. The presents study was shown six type of chromosome aberration which are ring chromosomes, chromatid break, fragmented chromosomes, aneuploidy and dicentric chromosomes that are obtained during chronic exposure period in bone marrow of rats and liver of C. carpio, the number of each type of chromosome aberration in rat and C .carpio have been significantly increased with increasing microcystin - LR concentration, the statistical analysis appeared positive significant correlation between chromosome aberration, biochemical markers and marker of DNA damage. The mitotic index was significantly increased with increasing microcystin - LR concentration in bone marrow of rats and in liver of C .carpio as compared with control groups. The molecular makers of DNA damage such as comet length, tail length and tail moment in blood and liver of rats and C .carpio were significantly increased with increasing concentration of microcystin - LR, also appearance of results positive significant correlation with biochemical markers and chromosome aberration and also presents results shown the DNA damage in liver more than in blood.
1 ... 308 309 310 311 312 ... 465