عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 40,859

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

المستخلص: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
السنة: 2007
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
اسم المؤلف: نرمين نصر الدين فتحي

التشوهات الخلقية في اجنة الفئران السويسرية البيضاء من امهات معاملة بجرع مختلفة من عقار Mus masculus الديكساميثازون Developmental anomalies in swiss albino mice embryos Mus masculus from the mother treated with different doses of Dexamethasone

المستخلص: The current study was conducted for the period from September 2015 until August 2016 in college of Education for Pure Sciences - University of Thi - Qar, this study aimed to fallow the embryonic lung development and evaluate histological changes in embryos's lung development when pregnant mice treated with different doses of Dexamethasone (Dex) and evaluate Alpha - fetoprotein (AFP) levels were evaluated as an indicator for congenital malformations. Sixty pregnant mice were randomly divided into four groups and each group contain 15 pregnant mice. The members of each group were given specific dose of Dex and at different time periods, while the control group injected with a solution of Normal Saline 0.9%.All animals received doses used by tail intravenous injection until the end of the time periods specified .Blood samples were taken for the purposes of biochemical parameters account as well as the collection of samples for histological study .The treatment of animals under the same conditions were determined with a dose based on body weight, according to what was stated in the pharmaceutical constitutions where's the therapeutic dosage was 0.002 mg \2mg (0.1mg.kg from body weight ). We used another two concentrations from drug ,one less than the therapeutic dosage (0.05mg \kg from body weight) and another more than the therapeutic dosage (0.2mg \kg from body weight ).The results have showed that was a negative effects on mice embryo's body weights and the lengths increase with increasing of number and doses concentrations. The using of different doses of Dex also showed various changes in general external morphological features and congenital malformation in embryos of treated mothers included : Death of embryos ,placenta damage ,neural Tube Defect ,Trunk Torsion ,Headhemorrhage, Brain hypertrophy ,Liver Hypertrophy ,Letter C Shape Embryos, swelling ,Convoluted Tail ,Short nostril and limbs, curved head, Wrinkled skin ,Crooked pave ,Short toes ,Seal legs appearance, Oedema ,absent fingers and eyelids ,Tail congestion and Bulging eyes. Histologically microscopic examination showed histological changes with varied severity and appearing between different sub experimental group compared with the control group.Rapid elongation in lung bud, advancing in lung development, the lung asflower appearance, Loosely lung mesenchyme ,necrosis in lung tissue ,mucus hypersecretion, elongation in epithelial air ways,epithelial Hyperplasia ,mesenchyme looks as butterfly in appearance in some parts ,thinning of alveolar walls ,thinning of the interstitialmesenchymal lung tissue ,elongation of developing alveolar septa ,free alveolar septa. Alfa - fetoprotein (AFP) levels showed different concentrations value in correlation with congenital malformations .when the (AFP) value was high there were neural tube defects and advancing in the lung development while they were low in normal lung development and in brain hypertrophy.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: ذي قار
اللغة: الانكليزية
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الحيوان - الاجنة
السنة: 2016
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: علي نعيم سلمان
اسم المؤلف: صدى غالب طاهر الموسوي

دراسة التاثيرات الوراثية لمتعدد السكريد خارج خلوي لبكتريا Enterococcus faecium في الخلايا السرطانية Study of the Genetic Effects of Exopolysaccharide (EPS) from Enterococcus faecium in the Cancer Cells

المستخلص: تم الحصول على ثلاث عزلات لبكتريا Enterococcus faecium من 120 عينة منتجات الالبان المحلية والمستوردة، وقد شخصت هذه العزلات باستخدام الفحوصات البكتريولوجية والكيموحيوية، استخلص متعدد السكريد خارج خلوي Exopoly Saccharide من العزلة رقم (1) لبكتريا E. faecium وذلك لكون هذه العزلة اعطت اعلى معدل انتاجية من المستخلص وبلغ 300 ملغرام/لتر من الوزن الجاف.درس التاثير السمي الخلوي لمستخلص EPS في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما AMN - 3 وHeLa، واظهر المستخلص فعالية تثبيطية في الخلايا السرطانية اعتمادا على التركيز المستخدم ومدة التعريض خصوصا عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر حيث وصلت نسب التثبيط الى 59.3% و86.2% على التوالي في خلايا AMN - 3، ثم بدات هذه النسب بالانخفاض مع تقليل التركيز المستخدم الى 1250 مايكروغرام/مللتر لتصل الى (8.3)% بينما استمرت الخلايا بالنمو والتضاعف خلال مدد التعريض الثلاث 24 ، 48 و72 ساعة عند التركيز 625 مايكروغرام/مللتر وكانت النسبة المئوية لتضاعفها (157.1%) مقارنة بعينة السيطرة (100%).اما تاثير المستخلص في خلايا HeLa فقد اظهر تاثيرا تثبيطيا على هذه الخلايا ازدادت نسبته مع زيادة التركيز ومدة التعريض وان نسب التثبيط في خلايا HeLa كانت اقل بفارق معنوي عن نسب التثبيط في خلايا AMN - 3 حيث بلغت نسب التثبيط في خلايا HeLa عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر 28.0% و31.1% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة واستمر انخفاض الفعالية التثبيطية للمستخلص في خلايا HeLa في التراكيز الواطئة 625 و1250 مايكروغرام/ مللتر حيث بلغت 10.7% و14.4% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة مقارنة بعينة السيطرة.درس تاثير مستخلص (EPS) وراثيا في الخلايا اللمفاوية للانسان من خلال حساب معامل التحول الارومي Blast index (BI) ومعامل الانقسام الخيطي (MI) Mitotic index وفحصت التغايرات الكروموسومية والفعالية التحفيزية لانقسام الخلايا. وجد ان هذا المستخلص قد سبب انخفاضا معنويا في معدلات معامل الانقسام ومعامل التحول الارومي يتناسب مع زيادة التركيز المستعمل ومدة التعريض لكنه لم يحدث اية تاثيرات سمية وراثية في كروموسومات الخلايا اللمفاوية المعاملة. | Three isolates of Enterococcus faecium were obtained from 120 of dairy products. These isolates were identified using bacteriological and biochemical assays.Exopolysarccharide (EPS) was extracted by (TCA 10%) method from isolate E. faecium no.1 for high production. One gram of dry weight produced 300 mg/ml of EPS.Cytotoxicity effect of EPS on cancer cell lines AMN - 3 and HeLa. An inhibitory activity of EPS against cancer cells was noticed, it was depended on EPS concentration and time exposure. Both concentrations 2500 and 5000 µg/ml were inhibited cells of AMN - 3; the percentage of inhibition was 59.3 and 86.2% respectively. Whereas, the percentage of inhibition was reduced when EPS concentration was low, 1250 µg/ml of EPS was showed 8.3% of inhibition rate. Notable, the low concentration (625µg/ml) of EPS was induced proliferation of AMN - 3 cancer cells of AMN - 3 for proliferation; the viability rate of cancer cells was 157.1% in comparison with untreated cells (control). In addition, the cytotoxic activity of EPS on cancer cell line HeLa was also studied. Significantly, inhibition rate on HeLa cells was less than that against AMN - 3 cells. The inhibition rate of HeLa cells at 2500 and 5000 µg/ml of EPS after 72 hr. was 28.06 and 31.1 % respectively. While the inhibitory activity of EPS at low concentrations (625 and 1250 µg/ml) on HeLa cells were 10.7% and 14.4% respectively.Genetically, the effect of EPS on normal human lymphocytes using different parameters such as mitotic index (MI), blastogenic index (BI), rearrangement of chromosomes, and mitogenic activity was examined. The results showed that EPS was significantly reduced MI and BI. Moreover, no genotoxic effect on chromosomes of healthy human lymphocytes was noticed
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2008
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني
اسم المؤلف: هويدة كريم عبد الجنابي

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

المستخلص: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
اسم المؤلف: همسة نافع محمد علي الرحو

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

المستخلص: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: مي طالب فليح
اسم المؤلف: هبة علي هلال الجبوري

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

المستخلص: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
اسم المؤلف: ميسم محمد رشيد الشيباني

التحري الجزيئي عن جين الضراوة rmp لبكتيريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة محليا من المرضى البالغين Molecular Detection of Virulance rmp Gene in Neisseria gonorrhoeae Isolated from Adult patients

المستخلص: This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, the Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories for the time period from November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on media cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25 %) women and 63 (78.75 %) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75 %) samples were positive : 35(43.75 %) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer - Martin media; while 9 (11.25 %) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3 (3.75 %) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25 %) of the direct smears and 75 (93.75 %) of the urine samples were positive. Results of the Nitrogen bases sequence of the PCR technology of the samples in this study revealed consistency reaching up to 99 % with the Nitrogen bases sequence of the rmp gene present in the N. gonorrhoeae strain of the WHO. This study presented high specificity and sensitivity for the diagnosis of gonorrhoea using the PCR technology which is cheaper and faster than the conventional methods currently used in the hospitals and laboratories.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: التقنيات الاحيائية
السنة: 2013
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: نورية عبد الحسين علي
اسم المؤلف: مهـند كـريم عنيد الساعدي

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

المستخلص: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
اسم المؤلف: منال سلمان محمد كسار

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: سناء برهان الدين
اسم المؤلف: مريم باسم انيس

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

المستخلص: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
السنة: 2010
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
اسم المؤلف: صبا نزيه عبد الغفار الحسون

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

المستخلص: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2010
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: شذى سلمان حسن سناء برهان الدين
اسم المؤلف: شمم ناصرراضي

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

المستخلص: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
اسم المؤلف: سعاد علي احمد

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

المستخلص: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2010
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
اسم المؤلف: سحـر ظاهر عبد عسل

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

المستخلص: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: رسمية عبد ابو ريشة
اسم المؤلف: زهراء عباس جبر العيساوي

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

المستخلص: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: مي طالب فليح
اسم المؤلف: هالة محمد حسين الحسني

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
اسم المؤلف: حسام صباح اوهيم

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

المستخلص: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: سناء برهان الدين
اسم المؤلف: جوان صباح باجلان

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2010
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
اسم المؤلف: بشار قصي كاظم

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

المستخلص: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: ماجستير
السنة: 2011
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني عدوية عبد الله السعدي
اسم المؤلف: حسام محمود حسن العماري

دراسة مناعية وتقييم انتشار الاجسام المضادة الخاصة ضد اللولبية الشاحبة بين العراقيين المتبرعين بالدم

المستخلص: السفلس هو مرض ينتقل جنسيا بوساطة بكتريا اللولبية الشاحبة Treponema pallidum ويصنف اما مكتسب او ولادي .اجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لنقل الدم في بغداد خلال جزء عملي اشتمل على المرضى المراجعين للمركز للمدة من 1 اب الى 31 كانون الاول 2014 . تضمنت الدراسة 70 مريضا و10 اصحاء ظاهريا من كلا الجنسين بمعدل عمر من 24 الى 57 سنة.جمعت عينات المرضى من وحدة الفايروسات بوساطة متخصصين الذين شخصوا الحالات المرضية .تضمنت المعلومات الديمغرافية العمر,الجنس والعنوان. اظهرت نتائج الدراسة الحالية معدل العمر ± الانحراف المعياري7.14±41)) سنة في المرضى(من 24 - 57 سنة) كما اظهرت النتائج ان(2.9%) من المرضى كانوا ضمن الفئة العمرية (21 - 30 سنة) ,وكانت نسبة الفئة العمرية (31 - 40 سنة ) هي (40%),و نسبة الفئة العمرية (41 - 50 سنة ) هي(44.3%)والفئة العمرية (51 - 60 سنة ) هي (. (12.8%علاوة على ذلك ان ما مجموعه ((74610 من متبرعي الدم العراقيين تتراوح اعمارهم من 18 - 60 سنة عرضوا لاكتشاف الاصابة بمرض السفلس ,وان ما مجموعه(769) من المصابين بالمرضوكان عدد المصابين من الذكور( (753بنسبة(97.9%) وكان عدد الاناث هو16 بنسبة(2.1%) .من ناحية اخرى تم اختيار 70 مصاب من المجموع الكلي للمصابين (769) وتم فحصهم ضمن بعض المؤشرات المناعية واظهرت النتائج ازدياد مستوى IL - 2 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وكانت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±64.9941.92 pg/ml و39.69 ±52.94pg/ml على التواليولم يلاحظ وجود فروق معنية احصائية بين كلا المجموعتين. فضلا عن ذلك ازداد مستوى IL - 10 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وبلغت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±559.101804.20pg/ml و±377.47252.36pg/ml على التوالى.بينما كان مستوى IFN - γ اقل في المرضى وكان المعدل ± الانحراف المعياري 239.35 ±201.38pg/ml عن المستوي في مجموعة السيطرة الذي بلغ 248.51±291.49pg/ml .فضلا عن ذلك كان مستوى IgG في كلا المجموعتين (المرضى والسيطرة ) عاليا , بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمجموعة المرضى825.66±287.18pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 638.28±242.41pg/ml لذلك لا يوجد فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين = P value)0.166( كذلك بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى IgM في مجموعة المرضى 121.01±70.57pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 50.96±21.61453pg/ml مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين(P value=0.031). بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى C3 في مجموعة المرضى±112.22pg/ml 26.34 بينما كانت ±147.7617.41pg/ml لمجموعة السيطرة. وهذا يعني وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.004). اخيرا وصلت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى 4Cفيمجموعة المرضى ± 22.7622.76pg/ml بينما كانت في مجموعة السيطرة±34.412.15pg/ml .مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.005). | Syphilis is a sexually transmitted disease (STD) created by the Treponema pallidumand characterized as acquired or congenital.This study was conducted in National Blood Transfusion Center in Baghdad as crosswise over area study incorporating patients going to in the period from 1 August to 31 December 2014. The study included 70 patients and 10 apparently healthy individuals from both sex withage range from 24 to 57 years oldas control group.The specimens of patients were gathered in virology unit by virologists who conclusion the cases. The demographic data incorporates age, sex and location. The results of present study showed thatmean of age ±SD of patients was 41±7.14 years (from 24 - 57 years ) , also theresults showed (2.9%) of patients were from (21 - 30 years), (40%) of patients were from (31 - 40 years), (44.3%) of patients were from (41 - 50 years), (12.8%) of patients were from (51 - 60 years).Furthermore,a total of 74610 Iraqi blood donors, aged from 18 - 60 years were discovered to have been screened for syphilis, a total of 769 Infected syphilis there were the number of males were753 (97.9%) and females were16 (2.1%).On another hand 70 syphilis patients were selected from total infected patients ( 769) and was examined to some immunological parameters and the results showed that the level of IL - 2 higher in patients group than that of control group.Themean ±SD was 64.99±41.92pg/mland 52.94±39.69 pg/ml respectively withoutnoticing any significant statistical difference was between both groups. Additionallythe level of IL10 was higher in patients group than that of control group,the mean ±SD were559.10±1804.20 pg/ml while in control were 377.47±252.36 pg/ml.Whereas, the level of IFN - γ was lowerin patients, the mean ±SD were201.38 ±239.35pg/ml than thatin controlWhich were 291.49 ±248.51pg/ml. Furthermore, the level of IgG in both patients and controlwas almost more thanthe mean ±SDfor patients were 825.66±287.18 mg/dl and in controls they were 638.28±242.41 mg/dl. Therefore, there was no significant statistical difference between both groups (P value =0.166). Also , themean ±SD for the level of IgM in patients, were121.01±70.57mg/dl whereas in controls theywere 50.96±21.61453mg/dl.This means that there is a significant statistical difference between both groups (P value =0.031).For the level of C3 in patients ,the mean ±SDwere112.22±26.34mg/dl while in controls they were 147.76±17.41mg/dl. This indicates that there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.004).Finally, the mean ±SD the for level of C4 in patients were 22.76± 8.44mg/dl while in control they were 34.4±12.15mg/dl. Therefore there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.005).
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: ديالى
اللغة: الانكليزية
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
السنة: 2015
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي محمد عبد الدايم صالح
اسم المؤلف: انس وسام مالك

التاثيرات النسجية والكيمياء الحيوية في الاناث الحوامل المصابة بالشنج النفاسي : دور بروتين Leptin Histological and Biochemical Effects of Pre eclampsia on the Placenta of Pregnant Women : Role of Protein Leptin

المستخلص: تضمنت هذه الدراسة معرفة التغيرات النسجية والكيموحيوية عند فرط الضغط للنساء الحوامل ذات الشنج النفاسي. تم جمع 120 عينة مصل من النساء ذات الشنج النفاسي يصاحبها 120 عينة مصل من النساء الحوامل الطبيعيات اللاتي عدن كمجموعة سيطرة. ايضا اهتمت هذه الدراسة بمعرفة تركيز هرمون اللبتين Leptin في مراحل الحمل المختلفة، المشتملة في ثلاثة اشهر الاولى والثانية والثالثة وشملت 90 عينة مصل،30 عينة لكل مرحلة من مراحل الحمل و30 عينة عند الولادة. وتضمنت الدراسة ايضا تقديرا لبعض التغيرات الهرمونية والكيموحيوية مع الحصول على 30 سخد وحبل سرى لتوضيح التغيرات النسجية في الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الطبيعيات. اجريت هذه الدراسة في مستشفى الولادة بمحافظة اربيل. وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : 1 - بصورة عامة شوهدت في دراستنا الحالية زيادة معنوية بمستوى P<0.01 لتراكيز الهرمونات Pro, E2, LEP في الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الاصحاء مع التقدم في فترات الحمل. بينما لوحظ انخفاض معنوي P<0.01 لتراكيز الهرمونات عند الولادة.2 - سجلت قمة ارتفاع مستويات اللبتينLEP بمستوى P<0.01 في فترة الثلاثة اشهر الثانية P2 وتراجعت عند الولادة في النساء الحوامل الاصحاء لمجاميع السيطرة بينما تم تسجيل زيادة خطية في مستويات LEP مع التقدم في فترات الحمل للنساء الحوامل ذات الشنج النفاسي، وتراجعت عند الولادة.3 - وجود معامل ارتباط معنوي P<0.01 بين LEP وهرمونات التكاثر (Pro, E2) في الحوامل ذات الشنج النفاسي.4 - مستويات مصل الـ HDL تاثرت معنويا P<0.01 بالحمل والتي ترتبط سلبيا واحتوائيا مع مستويات LDL, VLDL وTG والكوليسترول، هذه المستويات عالية في مجاميع النساء ذات الشنج النفاسي مقارنة بمجاميع السيطرة بالاضافة الى تراجعها بعد الولادة.5 - وجود معامل ارتباط معنوي P<0.01 بين LEP والقياسات الدهنية في الحوامل ذات الشنج النفاسي. 6 - وجد ان التحليل الانحداري المتعدد لمصل هرمونات التكاثر ومحتويات القياسات الدهنية المتضمنة في دراستنا له علاقة معنوية قوية بمصل LEP.7 - بعض المحتويات الكيميائية الحياتية مثل اليوريا والبروتين والالبومين والكرياتين ازدادت معنويا P<0.01 في النساء الحوامل ذات الشنج النفاسي مقارنة بالحوامل الاصحاء. وهذه القياسات تقل مع التقدم في فترات الحمل ماعدا مستوى الكرياتين الذي يزداد مع التقدم في فترات الحمل ويقل عند الولادة.8 - معامل الارتباط ضعيف نسبيا P<0.01 بين LEP واليوريا والبروتين والبومين والكرياتين لدى الحوامل ذات الشنج النفاسي.9 - وجد ان معامل الارتباط قوي P<0.01 بين LEP والعمر في الحوامل ذات الشنج النفاسي.10 - الشنج النفاسي خلال الحمل يقلل معنويا P<0.01 من اوزان كل من المشيمة والحبل السري وحديثي الولادة.11 - معامل الارتباط موجب P<0.01 بين مستويات LEP الحبل السري مع اوزان المشيمة والحبل السري وحديثي الولادة.12 - التغيرات العينية المرضية النسجية في النساء ذات الشنج النفاسي : ا - اظهرت السخد التغيرات المشتملة على : * ضمور الزغابات المشيمية.* تليف مع تضييق للشرايين الامية للخلايا الخلوية الغادية المحيطة للزغابات.* نزف ونخر في الساقط.* تكلس مع ترسب لليفين في الساقط الامي.* تثخن نتيجة لتكاثر الالياف الكولاجينية في متن الزغابات الساقط الامي والشرايين الامية.* ارتشاح دهني في الزغابات.ب - الحبل السري اظهر تغيرات اشتملت على : * احتقان وتضيق في التجويف نتيجة لتثخن الجدار خاصة البطانة الداخلية (الغلالة الداخلية).* تواجد الخثرة في التجويف الشرياني فضلا عن وجود التنكس الليفين في البطانة.*وجود الفجوات الدهنية في جدار الشرياني للحبل السري. | This study was conducted the histological and biochemical changes in 120 samples of pre - eclamptic pregnant women, concomitant with 120 samples of normotensive pregnant women.Also, this study deals with estimation of leptin concentration in different periods of pregnancy, which include 120 serum samples for each state and 30 samples for different periods.Histological study conducted by obtaining 30 placenta and umbilical cord for evaluating the vascular tissues injury in PE pregnancy compare with 30 normal control, which admitted to Maternity Hospital in Erbil governorate.The following results were investigates : 1 - Generally longitudinal data significantly increased at P<0.01 means of hormones LEP, E2 and Pro in pre - eclamptic pregnant women were more than that in healthy pregnancy with advancing gestational periods. While they significantly decreased at P<0.01 means of hormones with delivery.2 - A significant increase at P<0.01 of LEP levels was recorded in 2nd trimesters (P2) and declined with delivery in healthy control, while a linear increased of LEP levels was recorded in PE Pregnancy with advancing gestational periods, where it is declined with delivery. 3 - There were significant P<0.01 correlation coefficients between LEP and productive hormones (E2 and Pro) in PE pregnancy.4 - Serum lipid profile of pre - eclamptic women revealed a significant increase at P<0.01, which was HDL levels consistently and negatively correlated with VLDL, LDL, TG and cholesterol levels; these levels were higher in group of women who had PE as compared with normal control, as well as, being declined after delivery.5 - There were positive correlation coefficients between LEP and lipid profile in PE pregnancy at P<0.01. 6 - The multiple regression analysis demonstrated that the serum reproductive hormones and lipid profile contents in our study were strongly significant depending on serum LEP.7 - Some biochemical contents of urea, protein, albumin and creatinine were raised significantly at P<0.01 in hypertensive pregnant women when compared with the normotensive pregnant women, and these parameters well be decreased with advanced gestation periods except creatinine levels which were increased and fallen down with delivery.8 - There were correlation coefficients between LEP and the biochemical contents of urea, protein, albumen and creatinine in PE pregnancy.9 - In correlation coefficient, results indicated that there were strong relationship between LEP and age in pregnancy at P<0.01. 10 - During pregnancy, PE significantly decreased P<0.01 the mean weights of placentae, umbilical cord and babies were delivered at term.11 - There were positive P<0.01 correlation coefficients between LEP cord blood levels and weights of placentae, umbilical cord and the babies delivered.12 - The cross histopathological changes includes : a - PE placentae revealed the following changes : • Atrophy villi. • Fibrosis with stenosis of maternal arteries.• Discontinuation of syncytial border of villi.• Haemorrhage and necrosis in the deciduas.• Calcification with fibrinoid deposits were present in maternal deciduas. • Thickening due to proliferation of collagen fibers surrounded the villous stroma, maternal deciduas and maternal arteries.• Fatty infiltration in placental villi. b - Umbilical cords revealed the following : • Congestion and stenosis of the lumen due to thickening of their walls which was observed mainly in tunica media. This finding is in association with PE pregnancy. • Thrombus in the lumen of arteries and areas of fibrinoid necrosis was observed in the tunica intima of the artery and vein in PE pregnancies. • Lipid vacuoles were observed in the walls of umbilical cord arteries in PE pregnancies.
الصفحات الاولى:
الكلمات الدلالية:
  • pre eclampsia
  • Leptin
  • Pregnant Women
  • Hypertenion
مكان الجامعة: الموصل
اللغة: الانكليزية
الدرجة: دكتوراه
الموضوع الدقيق: الحيوان
السنة: 2009
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: قصي عبد القادر مصطفى الجلبي حمد جنداري جمعة
اسم المؤلف: خةبات انور علي خضر

تاثيرات بعض المركبات الحلقية غير المتجانسة المصنعة على نمو وايض امامية السوط لطفيليات اللشمانيا الجلدية Leishmania tropica Effects of Some Synthesized Heterocyclic Compounds on Growth and Metabolism of Leishmania tropica Promastigotes

المستخلص: عني البحث باستخدام خمسة جالكونات مصنعة ( 1،3 - ثنائي الاريل - 2 - بروبين - 1 - ون ) كمواد بادئة لتصنيع مختلف المركبات الحلقية غير المتجانسة. اختبرت بعدها الفعالية الحيوية للمركبات المصنعةالمذكورة ضد امامية السوط promastigotes لطفيلي اللشمانيا الاستوائية Leishmania tropica. في الزجاج .in vitroكثفت الجالكونات الخمسة المصنعة مع مركبات ذات هيدروجين حامضية Acidic Hydrogen compounds مثل الهايدرازينات Hydrazines واليوريا Ureas ، والثايوريا Thioureas لانتاج خمسة من المركبات النهائية. اثنين من تلك المركبات احتوت حلقة بايرازولين وهي : 5,1 - ثنائي فنيل - 3 - (اورثوكلوروروفينيل) - 2Δ - بايرازولين (P1) و3 - (ميتانيتروفنيل) - 5,1 - (باراكلوروفنيل) - 2Δ - بايرازولين (P5), المركبات الثلاثة الاخرى احتوت حلقة بيرميدينون وهي : 4,3 - ثنائي الهيدروجين - 4 - (بارانايتروفينيل) - 6 - فينيل بيرميدين - 2(H1) - ون(P2) و4,1 - ثنائي الهيدروجين - 3 - اثيل - 4 - (2 - مستيلينيل) - 6 - (اورثوكلوروفينيل) بيرميدين - 2(H1) - ون (P4) و2،4 - ثنائي الهيدروجين - 4 - (باراميثوكسي فينيل) - 6 - (اورثوكلوروفينيل) بيرميدين - 2 - (H1) - ثايون (P3) ، والحاوي على حلقة بيرميدين ثايون . وشخصت المركبات المحضرة باستخدام الطرق الطيفية . اختبرت فعالية الحلقات الخمسة متباينة ضد امامية السوط لطفيليات اللشمانيا الاستوائية في الزجاج In vitro. تبين ان المواد الخمسة المختبرة كان لها تاثير تثبيطي على نمو امامية السوط، وازداد هذا التاثير مع زيادة تركيز المادة قيد الاختبار.عندما قورن تركيز عقار البنتوستام Pentostam المثبط لخمسين بالمئة (IC50) من امامية السوط (20مايكروغرام/ملليلتر ) مع IC50 للمواد قيد الدراسة، وجد ان كل المواد المجربة سببت تثبيطا جيدا(نسبيا) في نمو الطفيلي؛ وان اكثر المواد سمية" كان المركب P4 حيث ان IC50 له كانت (0.6 مايكروغرام/ملليتر) ,بينما امتلك المركب P3 IC50 مماثل لعقار البنتوستام (20 مايكروغرام/ملليلتر) اما المركب P5 فقد امتلك IC50 اعلى بقليل من البنتوستام ( 25مايكرو غرام/ملليلتر) . وكانت IC50 للمركب P1 (30مايكروغرام/ملليلتر). بينما كانت IC50 للمركب P2 (60مايكروغرام/ملليلتر) وهو الاقل سمية" على امامية السوط من بين المركبات الخمسة.درس تاثير المركبات الخمسة على ايض الطاقة في امامي السوط للشمانيا الاستوائية من حيث التاثير على محتوى الاحماض الدهنية وعلى بعض انزيمات السلسلة التنفسية المعلوم تواجدها في امامي السوط.حللت الاحماض الدهنية في امامي السوط للشمانيا الاستوائية بالاعتماد على تقنية كروماتوغرافيا الغاز السائل (Gas liquid chromatography) وتبين وجود ستة انواع من الاحماض الدهنية في امامي السوط وهي على التوالي : Caproic acidو Myristic acidو Palmatic acidو Stearic acidوOleic acid وLinoleic acid.اعطى IC50 للمواد الخمسة (P5 - - - P1) تاثيرات كمية ونوعية متباينة على محتوى امامية السوط من الاحماض الدهنية، فقد اعطى IC50 للمركب P3 اقوى تاثير على محتوى الاحماض الدهنية حيث سبب اختفاء اغلب انواع الاحماض الدهنية ،مع زيادة ملحوظة في نسبة تركيز Caproic acid (35%) ، كما تسبب IC50 للمركب P4 في اختفاء Oleic acid لامامية السوط المعاملة، مع نقص ملحوظ في نسبة تركيز Linoleic acid. وعند معاملة امامية السوط ب IC50 للمركب P5 حصل نقص كبير في نسبة تركيز oleic acid وLinoleic acid. على ما يبدو، فان Linoleic acid وOleic acid هما اكثر الاحماض الدهنية تاثرا، حيث انهما فقدا كليا عند معاملة امامي السوط بـ IC50 للمركبات P3و P4وP5.اختبر تاثير IC50 للمركبات (P5 - - - P1) على فعالية انزيمي فيوماريت ردكتنيز ((FRD وسكسينت ديهيدروجينيز ((SDH. وتبين ان اربعة من المركبات المصنعة وهي P2 - - - P5 امتلكت تاثيرا انتقائيا على السلسلة التنفسية لامامية السوط، حيث اثرت المواد انفة الذكر على فعالية FRD اكثر من تاثيرها على فعالية SDH. وكان تاثير المركب P2 على فعالية FRD اكثر بنسبة 34% من تاثيره على فعالية SDH، في حين كان تاثير المركب P3 على فعالية FRD اكثر ب54% من تاثيره على فعالية SDH. وكذلك الحال بالنسبة للمركب P5 الذي ثبط فعالية FRD بنسبة 43% اكثر من تثبيطه لفعالية انزيم SDH. تشير هذه البيانات الى ان انزيم FRD للطفيلي يمكن ان يكون الموقع المستهدف (الهدف الخاص) الذي يعكس فعالية المركبات الثلاثة P2و P3 وP5 المضادة لامامية السوط للشمانيا الاستوائية. بينت الدراسة الحالية ان المركبات P5 - - - P1 تسببت باختزال المحتوى الكلي للبروتينات والاحماض النووية وكذلك اثرت على فعالية بعض الانزيمات المتعلقة بايض هذه الجزيئات وهما انزيمي دايهايدروفوليت ردكتيز (DHFR) وثايميدين فوسفوريليز (TP). اظهر IC50 للمركب P5 اقصى اختزال في المحتوى البروتيني لامامية السوط (35%) وتسبب كل من IC50 للمركبات P1و P3وP4 باختزال في المحتوى البروتيني لامامية السوط بدرجات اقل : (27%، 24%، 19%على التوالي)، اما IC50 للمركب P2 فقد كان الاقل تاثيرا على محتوى البروتين حيث ادى الى اختزال 9% فقط من محتوى البروتين الكلي. اما من حيث التاثير على محتوى الاحماض النووية لامامية السوط المعاملة؛ فقد سبب P5 اقصى اختزال في كمية الاحماض النووية الكلية (42%). كما تسبب P2و P3و P4 باختزال محتوى الاحماض النووية لامامية السوط بنسب متقاربة (35%،36%،37%على التوالي )، في حين سبب P1 اقل اختزال بمحتوى الاحماض النووية(16%). بينما اعطى P5 اعلى اختزال في كمية الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين ( DNA )(50%) في حين ان P1 سبب اقل اختزال في كميةDNA (12%) . واما ما يخص محتوى امامية السوط من الحامض النووي الرايبوزي (RNA )، فقد اختزل المركب P4 41% من RNA الكلية لامامية السوط المعاملة واختزل IC50 للمركب P5 39% من RNA لامامية السوط المعاملة. وسجل اقل اختزال في محتوىRNA عند معاملة امامية السوط ب IC50 للمركب P1 (17%). تبين ان المركبات قيد الدراسة اثرت على كل من مساري البناء الحيوي de novo والانقاذ salvage لبناء dTMP. حيث ان هذه المواد (P5 - - - P1 - ) اثرت معنويا في فعالية انزيم TP . فالمركبات P2و P3و P4و P5 اختزلت الفعالية النوعية لانزيم TP في امامية السوط، من ناحية اخرى فان جميع المركبات قيد الدراسة تسببت في اختزال الفعالية النوعية لانزيم DHFR باستثناء المركب P1 الذي تسبب في زيادة الفعالية النوعية لانزيم DHFR الى 106%. وان اقصى اختزال في فعالية DHFR سببه المركب P3 (34%).يجدر بالذكر ان IC50 للمواد قيد الدراسة كان لها تاثيرا ملحوظا في شكل وابعاد الطفيلي. حيث تسبب IC50 للمركب P5 بظهور فجوات كبيرة في السايتوبلازم، اما المركب P2 فقد تسبب في ظهور تحبب في السايتوبلازم مع نواة غير منتظمة الشكل. سببت معاملة امامي السوط ب IC50 للمركب P3 ظهور تجمع من الفجوات السايتوبلازمية الصغيرة، من ناحية اخرى ظهرت فجوة منفردة كبيرة في سايتوبلازم الطفيليات المعاملة بالمركب P4، مع نواة غير منتظمة الشكل. لوحظ اقصى انتفاخ في امامية السوط المعاملة بـ IC50 للمركب P4 وبدرجات اقل لتلك المعاملة بـ اولية IC50 للمركبات P1و P2 وP5 على التوالي.بينت نتائج البحث الحالي ان موقع ونوع المجاميع التعويضية على الحلقات المصنعة في المركبات قيد الدراسة، كانت ذا تاثير حرج في الفعالية المضادة للشمانيا لهذه المركبات. | The present investigation is concerned with the use of five synthesized chalcones (1,3 - diaryl - 2 - propen - 1 - one) as a chief starting materials to synthesize different heterocyclic compounds. The produced heterocycles tested then for their biological activity against Leishmania tropica promastigotes in vitro.The five synthesized chalcones were condensed with different acidic hydrogen compounds such as hydrazines, ureas and thioureas to produce five heterocyclic compounds. Two of them contain pyrazoline ring : 1,5 - Diphenyl - 3 - (o - chlorophenyl) - ∆2 - pyrazoline (P1) and 3 - (m - Nitropheny - 5 - (p - chlorophenyl) - ∆2 - pyrazoline (P5), the other three compounds contain pyrimidinone ring : 3,4 - Dihydro - 4 - (p - nitro phenyl) - 6 - phenyl pyrimidine - 2(1H) - one (P2), 1,4 - Dihydro - 3 - ethyl - 4 - (2 - mesitylenyl) - 6 - (o - chlorophenyl) pyrimidine - 2(1H) - one(P4),and,4 - Dihydro - 4 - (p - methoxyphenyl) - 6 - (o - chlorophenyl) pyrimidine - 2 - (1H) - thione (P3), which contain pyrimidine thione ring. The resultant products were identified in the light of spectroscopic methods, as well as the melting points. The five heterocyclic compounds were tested for their antileishmanial activity against Leishmania tropica promastigotes in vitro. All tested compounds caused concentration - dependent inhibition of the in vitro growth of Leishmania promastigotes. When compared with inhibitory concentration 50 ( IC50 ) of pentostam (20μg/ml), all the tested compounds appeared to have relatively good inhibitory effects. The IC50 values of the tested compounds P1,P2,P3,P4 and P5 were 30 μg/ml, 60 μg/ml, 20 μg/ml, 0.6 μg/ml and 25 μg/ml respectively.Effects of the five synthesized compound were also tested on energy metabolism (on fatty acids content and some selective enzymes in respiratory chain) of Leishmania promastigotes. The gas liquid chromatographic analysis of untreated Leishmania tropica promastigotes revealed the presence of six types of fatty acids : caproic, myristic, palmatic, stearic, oleic, and linoleic acids respectively. The IC50 of the tested products (P1 - - - P5) showed different effects, qualitative and quantitative on the fatty acids content of promastigotes. IC50 of P3 displayed the maximum effect on promastigotes fatty acids content, in which most types of fatty acids disappeared, with considerable increase in concentration percentage of caproic acid (35%). IC50 of P4 was caused oleic acid of the treated promastigotes to disappear, with remarkable decrease in percentage concentration of linoleic acid. When promastigotes treated with IC50 of P5, there was a high decrease in percentage concentration of oleic acid and linoleic acid respectively. Oleic acid and linoleic acid seemed to be the most affected fatty acids, since they were missed in the promastigotes when treated with P3, P4. and P5. Fumarate reductase (FRD) and succinate dehydrogenase (SDH) were investigated for its sensitivity toward the five compounds under study (P1 - - - P5). IC50S of four experimented compounds (P2 - - - P5) was observed to have selective inhibitory effects on the parasite respiratory chain, since these compounds proved to have higher inhibitory effects against FRD activity than that against SDH activity. However, the inhibitory effect of P2 on the activity of FRD was approximately 34% higher than that on SDH, while the inhibitory effect of P3 on the activity of FRD was 54% higher than that on SDH, and the inhibitory effect of P5 on the activity of FRD was approximately 43% higher than that on SDH i.e. FRD is more sensitive to P2, P3 and P5 than SDH. The data indicate that the parasite FRD might be the specific target for the action of P2, P3 and P5.IC50 of P1 - - - P5 appeared to have variant inhibitory effects on the total protein, total nucleic acids content and some related enzymes (dihydrofolate reductase (DHFR) and thymidine phosphorelase (TP)). P5 caused the maximum decrease in protein content (35%); P3, P4 and P2 reduced protein total content of promastigotes for less extent (27%, 24%, and 19% respectively); P2 resulted in the less reduction in total protein content (9%). As for nucleic acids content of treated Leishmania promastigotes, the maximum reduction of nucleic acids content caused by P5 (42%), P2, P3, P4 caused approximate reduction percentage in total nucleic acids (35%, 36%, 37% respectively), while P1 resulted in the less inhibition of nucleic acids content (16%). The maximal inhibition in Deoxyribonucleic acid (DNA) content caused by P5 (50%), whereas P1 caused the minimal inhibition (12%). However, Ribonucleic acid (RNA) content was reduced 41% when Leishmania promastigotes treated with P4, and 39% when treated with P5. The less reduction in RNA content was caused by P1 (17%). The experimented compounds appeared to affect both salvage and de novo pathways of Deoxy Thymidinemonophosphate (dTMP) synthesis. However all these compounds (P1 - - - P5) resulted in significant changes in the activity of promastigotes TP. P2, P3, P4 and P5 reduced the specific activity of promastigotes Thymidine phosphorelase (TP). On the other hand, all tested products had inhibitory effects against DHFR activity, except P1, which increases the activity of promastigotes Dihydrofolate reductase (DHFR) to 106%. P3 has the highest inhibitory effect on promastigotes DHFR - activity, since it reduced DHFR activity to 34%. Inhibitory concentration 50 ( IC50 ) of the experimented compounds made remarkable changes in the morphology and dimensions of the parasite. Large vacuoles in the cytoplasm were observed in the parasites, which were treated with IC50 of P1. Cytoplasmic granulation and amorphous nuclei were observed in the parasites, which were treated with IC50 of P2. Assemblage of small vacuoles was observed in the parasites that were treated with IC50 of P3. On the other hand, parasites that were treated with IC50 of P4 appeared to contain single large vacuole that occupies large space of the cytoplasm, with amorphous nuclei. Maximum swell was observed in the promastigotes that were treated with IC50 of P4 and at lower extent with those treated with IC50 of P1, P5, and P2 respectively. The results of the present research showed that the position and type of the substituent on the synthesized rings of the tested products seemed to be critical for their antileishmanial activity.
الصفحات الاولى:
الكلمات الدلالية:
  • Heterocyclic Compounds
  • Leishmania tropica
  • Metabolism
  • Energy
  • Fatty Acid
مكان الجامعة: الموصل
اللغة: الانكليزية
الدرجة: دكتوراه
الموضوع الدقيق: الحيوان
السنة: 2006
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: قصي عبد القادر مصطفى الجلبي عبد الوهاب جعفر الحمداني
اسم المؤلف: مروة هاشم داؤد حموشي

تقييم اختبار البروكالسيتونين في التشخيص المبكر لتسمم الدم الجرثومي في الاطفال حديثي الولادة في مستشفى تكريت التعليمي Evaluation of Procalcitonin Test for Early Diagnosis of Neonatal Sepsis in Tikrit - Teaching Hospital

المستخلص: ان تشخيص الخمج ضمن فئة حديثي الولادة يعتبر بحد ذاته تحد , نظرا لكون الاختبارات التقليدية غالبا ما تؤدي الى التضليل بدل التشخيص . صممت هذه الدراسة لاجل البت بامكانية استخدام اختبار مستوى البروكالسيتونين كمعلم للتشخيص المبكر للحالات المشكوك باصابتها بتسمم الدم الجرثومي في حديثي الولادة بالمقارنه مع زرع الدم, C - reactive protein , عدم خلايا الدم البيض الكلي والتفريقي. تم جمع العينات التي اشتملت على كلا الجنسين خلال الفترة الزمنيه من شهر اب سنة 2008 ولغاية شهر اذار سنة 2009 من حديثي الولادة الوافدين الى ردهات الخدج والاطفال في مستشفى تكريت التعليمي والمشخصه سريرا من قبل طبيب الاطفال المختص على اشتباه اصابتهم بالمرض. لقد اشتملت الدراسه على 114 حاله اجري فحص زرع الدم في جميعها بينما اجريت فحوصات الدم ل 102 حاله , تم فحص CRP ل 84 حالة واختبر مستوى البروكالسيتونين في 73 حالة حيث يعزى عدم تساوي العدد الى عدم كفاية الدم لاجراء جميع الاختبارات . اظهرت نتائج زرع الدم ان 53 (46%) من العينات كانت موجبه منها, 32 (60%) ذكور و21 (40%) اناث . عدد حالات زرع الدم السالبة كانت 61 ( 54%) منها , 31 (51%) اناث و30 (49%) ذكور.اظهرت نتيجة التشخيص المختبري بان العزلات البكتيرية الاكثر شيوعيا كانت من جنس البكتريا العنقوديه السالبة لانزيم التجلط ومن Nocardia spp. لانزيم التخثر بنسبة 22% لكليهما تتبعها بكتريا Listeria monocytogenes بنسبة 17% تليها Klebsiella pneumoniae بنسبة 9% و6 % لكل منPseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus اما باقي الانواع (Citrobacter diversus, Serratia marscesens, Serratia liquifascens, Lactobacillus spp., Peptostreptococcus spp., Micrococcus spp., Streptococcus pyogenes ) فقد كانت غير شائعة واعطت نسب 2% لكل واحد . بينت هذه الدراسة ان حملة تسمم الدم الجرثومي المتاخر سجلت 67% من الحالات بينما الباقي من النسبه ( 33%) كان ل حملة تسمم الدم الجرثومي المبكر .لقد كان عدد حالات التسمم الجرثومي المؤكد بين الذكور اعلى 32 (60 ) منه في الاناث 21 (40%). تبين ان من بين جميع المظاهر السريريه , قلة الرضاعة شكل اعلى نسبة بينما اعراض تبقع الجلد والقباع اعطت اقل نسبة, كما وبينت بان 30% فقط من الاصابات كانت عند الاطفال ذوي الوزن الطبيعي بينما شكل الاطفال الذين يقل وزنهم عن الطبيعي نسبة 70% . اظهرت دراسة عوامل الخطورة في الامهات بان العامل الاكثر شيوعا كان تمزق الغشاء الامنيوني لفترة تزيد عن 18 ساعة يتبعه عامل التهاب المجاري البولية والحمى واختناق داخل الرحم بالتتابع. نسبة الوفيات كانت اعلى في الحمله المتاخره لتسمم الدم كما كانت نسبة الوفيات اعلى عند حديثي الولادة ناقصي الوزن عنه عند ذوي الوزن الطبيعي احصائيا, كان لذوي الوزن الاقل من الطبيعي اهميه من الناحيه الاحصائيه . اظهر اختبار فحص الحساسية ان عزلات البكتريا السالبة لصبغة كرام كانت ذات مقاومه عاليه للمضادات المستخدمة في الدراسة الحالية بينما كل عزلة من عزلات البكتريا الموجبة لصبغة كرام كان لها نمط مقاومه مختلف للمضادات . كما واظهرت الدراسة لعوامل الضراوة بان العزلات البكترية السالبة لصبغة كرام كانت موجبة لاختبار انتاج انزيم اليوريز واختبار انزيم الهيمولايسن واختبار انزيم اللايبيز واللسيثينيز والبروتييزبنسبة 85% , 100% , 100% , 100% و62% على التوالي بينما كانت العزلات الموجبة لصبغة كرام موجبة للاختبارات بنسبة 61% , 100%, 89%, 94% و785 عالتوالي. اظهرت فحوصات الدم الروتينيه والتي كانت ذات قيمه معنويه بان 33% من بين حالات زرع الدم الموجبة كان عدد خلايا الدم البيض فيها منخفض , 19% من الحالات كان عدد الخلايا البيض مرتفع اما باقي النسبة المؤية فقد كان نتيجة فحص عد خلايا ضمن المستوى الطبيعي فيما يتعلق بحالة تواجد الخلايا العدله غير الناضجة في الدم المحيطي فقد بينت الدراسه ان 79% من حالات زرع الدم الموجبة كانت ايضا موجبة من ناحية تواجد الخلايا العدله غير الناضجه فالدم بينما باقي النسبة ضمن حالات زرع الدم الموجب فقد كانت سالبة لتواجد هذا النوع من الخلايا.علما ان الاختلافات الاحصائيه المتعلقه بالخلايا العدله غير الناضجه كانت ذات قيمة معنويه عاليه. بالنسبة لفحص CRP كانت الفروقات الاحصائيه غير ذات قيمه معنويه مابين الحالات الموجبه لزرع الدم عن الحالات السالبه . وفيما يخص نتيجة فحص PCT الذي تم قياسه باستخدام طريقة القياس شبة الكمي الكرماتوغرافيه المناعيه فقط ظهر ان تركيز البروكالسيتونين في المصل لم يكن ذا فرق احصائي معنوي بين المرضى المصابين ببكتريا موجبه لصبغة كرام عن المصابين ببكتريا سالبة لصبغة كرام. اظهرت نتائج دراستنا ان 21% من حالات زرع الدم الموجبه اعطت مستوى بروكالسيتونين اقل من 0.5 نانوغرام لكل مل وباقي النسبة توزعت بين مستويات البروكالسيتونين الباقيه ≥0.5 ≥2 ≥10. بالنسبة لحالات زرع الدم السالبة فقد اظهرت نتيجة قياس مستوى PCT بان نسبة 49% كان ضمن مستوى البروكالسيتونين<0.5 نانوغرام لكل مل بينما 51% كانت ضمن المستويات ≥0.5 ≥2 ≥ 10 نانوغرام لكل مل بمعنى لايمكن استبعاد حصول اصابة جهازيه حتى لو كانت نتيجة الزرع الدم سلبية. كما لم تتوافق نتيجة البروكالسيتونين مع نتيجة فحص الCRP لكل الحالات فقد سجلت اعلى مستويات للبروكالسيتونين بينما كان فحص ال CRP لها سالب , ومن مقارنة نتائج عد الخلايا البيض مع نتيجة البروكالسيتونين التي اجريت لنفس الحالات ظهر بان 68 % من الحالات كانت ضمن معدل عدد الخلايا الطبيعي بالوقت الذي اعطت مستوى عالي للبروكالسيتنوين≤10 نانوغرام لكل مل و18% فقط من الحالات كان عدد الخلايا البيض مرتفع وباقي النسبة اشتملت عل حالات انخفض بها عدد الخلايا البيض عن الطبيعي . من بين كل الحالات الي اجري لها فحص مستوى البروكالسيتونين سجلت 39 حالة بنسبة 53 % ظهرت بها الخلايا البيض العدلة غير الناضجة فالدم المحيطي . عند مقارنة اختبار البروكالسيتونين مع باقي الفحوصات الروتينه المستخدمه بالدراسه اتضح بانه اكثر حساسية في تشخيص تسمم الدم الجرثومي وفقا لذلك , نستنتج بان البروكالسيتونين هو محدد اكثر حساسية من الفحوصات التقليدية( فحص زرع الدم وفحص ال CRP وفحص عد الخلايا البيض) في التشخيص المبكر لتجرثم الدم الناجم عن البكتريا عند الاطفال حديثي الولاده . | The diagnosis of neonatal infection is challenging because traditional markers of infection are often misleading instead of diagnosing. This study was conducted to determine Procalcitonin (PCT) level as an early marker for diagnosis of suspected sepsis in neonates in comparison with C - reactive protein, blood culture, total and differential white blood cell counts. From August, 2008 till March, 2009, samples were taken from neonates (males and females) admitted to the pediatrics - neonatal wards at Tikrit Teaching Hospital who were clinically suspected with sepsis as diagnosed by the physician in the hospital with any features suggestive of sepsis. The study includes a total of 114 cases. Blood cultures were done for all cases. Hematological tests were performed for 102 cases. C - reactive protein (CRP) was determined in 84 cases, while Procalcitonin level was determined in 73 cases. The differences in the number of samples involved in each test were due to the inadequate amount of blood specimens to perform all investigations. The results of blood culture showed that 53 (46%) of samples were positive, of them 32 (60%) were males and 21 (40%) were females. The number of negative cases were 61 (54%), of them 31 (51%) were females and 30 (49%)were males. The results of identification showed that the most frequent bacterial isolates were Coagulase Negative Staphylococci and Nocardia spp. (22% for each), followed by Listeria monocytogenes 17%, Klebsiella pneumoniae, 9% Pseudomonas aeruginosa 6% and Staphylococcus aureus 6%, while (Citrobacter diversus, Serratia marscesens, Serratia liquifascens, Lactobacillus spp., Peptostreptococcus spp., Micrococcus spp., Streptococcus pyogenes) were frequently less isolated recording 2% for each . This study revealed that, late - sepsis was recorded in 67% of cases while the rest (33%) were with early - sepsis and also revealed that. The number of proven sepsis were higher in males 32 (60%) than in females 21 (40%). Among all clinical manifestation, poor feeding had the highest proportion, while mottling and grunting had the smallest proportion. Only 30% of neonates were of normal birth weight, while 70% were low birth weight, very low birth weight and, extremely low birth weight respectively. Study of maternal risk factors revealed that the most frequent factor was the Prolonged Rupture of membrane followed by maternally UTI, fever and intrapartum asphyxia, respectively. The fatality rate was higher in late - sepsis cases, also it was higher in low birth weight than in normal birth weight neonates, statistically VLBW had the highest value. The antibiotics susceptibility test revealed that Gram negative isolates showed high resistance to antibiotics used in the present study. Each isolate of the Gram positive bacteria showed different pattern of resistance against the antibiotics used. Results of virulence factor showed that 85%, 100%, 100% , 100% and 62% of Gram negative isolates and 61%, 100% , 89%, 94% and 78% of Gram positive isolated produced Urease , Hemolysin, Lipase, Lecithinase and alkaline protease, respectively. Results of routine hematological tests at which the differences were statistically significant showed that 33% of culture positive cases had leucopenia, 19% of cases had leukocytosis, while the rest were in the category of normal range. Concerning the shift to left, results showed that (79%) of culture positive cases were recorded as positive and the rest were negative shift to left neutrophil the differences concerning with the shift left were statistically highly significant. For CRP, the differences were not significant among culture positive and culture neative cases. With reference to PCT test which had been measured using the immunochromatographic semi - quantitative method, that serum procalcitonin concentrations were not significantly different between the patients with Gram - positive and those with Gram negative infections. Results of our study showed that 21% of culture positive cases were <0.5 ng/ml (which were regarded as negative), while the rest which were with high level of PCT were distributed among levels of PCT≥0.5 ≥2 ≥10 ng/ml. As for culture negative cases, 49% of PCT were <0.5 ng/ml, while 51% of cases were in levels of ≥0.5 ≥2 ≥10 ng/ml which means that systemic infections cannot be excluded though they were culture negative. In addition PCT results did not fit with CRP all the time since some cases recorded higher level of PCT ≥10 ng/ml despite they were negative for CRP. The comparison between results of PCT and WBC for the same performed cases showed that 68% of cases were in the category of normal WBC range, meanwhile they had high level of PCT. Only 18% were in the category of leukocytosis, and the rest of percentage were in the category of leucopenia. Among all cases performed for PCT, 39 (53%) cases had left shift neutrophil in the peripheral blood when the differential counts were performed. when PCT was compared with other routinely measured parameters used in this study, It seemed to be significantly more sensitive in sepsis diagnosis. Accordingly, we can conclude that PCT is a more sensitive marker than other traditional tests (blood culture, CRP and WBC count) that could be used in early diagnosis of bacterial sepsis in neonates.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: صلاح الدين
اللغة: الانكليزية
الدرجة: ماجستير
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
السنة: 2009
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: وعد محمود رؤوف موسى جاسم محمد
اسم المؤلف: سهى ماهر عبد الرشيد

التاثيرات المرضية للذيفان الخلوي المستخلص من بكتريا Campylobacter jejuni المعزولة محليا Pathological Effects of the Cytotoxin Extracted from a Locally Isolated Campylobacter jejuni

المستخلص: This study was done to investigate the presence of Campylobacter jejuni in bloody diarrheal stool collected from hospitalized children with gastroenteritis. Campylobacter was isolated from only 4 specimens of a total number of 186; upon identification three isolates were identified as C. jejuni while the fourth isolate was found to be C. coli.Isolation of campylobacters was done using a locally prepared modified, blood - free, charcoal selective medium. It was the first time in which such medium was used for cultivating Campylobacter locally. The efficacy of this medium was very clear in comparison with the ordinarily used blood containing medium for inhibiting almost all fecal flora.Biochemical and physiological tests were used to identify and differentiate C. jejuni from the other Campylobacter species. The antibiotic sensitivity test showed that all isolates were sensitive to erythromycin, chloramphenicol, amikacin and ciprofloxacin, while resistance was found for cephalothin, ceftriaxone cefotaxime, ampicillin and trimethoprim.Tissue culture technique was used to determine C. jejuni of high cytotoxin productivity using continuous cell lines (HeLa and Vero cell lines); this isolate was used for further investigations in the study.In this study, the cytotoxin of the highest cytotoxin producing C. jejuni isolate was extracted locally for the first time and purified, using gel filtration chromatography with Sephadex G100.The purified cytotoxin revealed a single band which was observed by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) under the denaturing conditions. The molecular weight of the purified cytotoxin was approximately equal to 43 KDa as determined by PAGE.Using newly hatched chicks (as an animal model),the ID50 value was 3.71x10 4 cfu /ml. The ID50 decreased from 3.71x10 4 to 1.66 x 10 3 cfu/ml when 50 μg of cytotoxin was mixed with the bacterial suspension, this result reflects the role of cytotoxin on the pathogenesis of C. jejuni infection.In the present study, oral inoculation of newly hatched chicks with the C. jejuni isolate resulted in clinical and histopathological damages leading to bloody diarrhea similar to that observed in humans infected with C. jejuni.The post - mortal examination of chicks' viscera showed an accumulation of fluid in chick intestines which were distended with watery fluid; also there was obvious hepatomegaly with yellow spots, and swelling of the gall bladder. The associated infection with the C. jejuni cells and their cytotoxin induced more progressive tissue damage represented by a more severe intestinal distension and congestion.The histopathological examination of the small and large intestine of chicks infected with Campylobacter cells, showed mucosal sloughing, congestion of blood vessels, infiltration of inflammatory cells in the mucosal and submucosal layers, and accumulation of edematous fluid in the mucosal layer. The examination of chicks infected with Campylobacter cells and the cytotoxin revealed the presence of the same lesion, but more severely with the presence of hemorrhage in the lumen. These results could be important evidence of the role of cytotoxin as a virulence factor on the pathogenicity of C. jejuni
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: دكتوراه
السنة: 2010
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: ضحى سعد صالح
اسم المؤلف: سيناء محمد علي السباهي

تنشيط النطف خارج الجسم باستخدام الاوكسيتوسين في مرضى العقم In Vitro Sperm Activation by Oxytocin in the Infertile Patients

المستخلص: اجريت الدراسة على ١٨۰ مريضا يعانون من وهن النطف اثناء مراجعتهم لمعهد ابحاث الاجنة وعلاج العقم / جامعة النهرين. كان الهدف الرئيس لهذه الدراسة هو استقصاء تاثير اضافة الاوكسيتوسين الى السائل المنوي للمرضى لغرض التحقق من تحسين خصائص الحركة العائدة الى النطف، وكان التركيز على هذا الهرمون بوصفه مادة طبيعية ينتجها الجسم وله وظائف معروفة غير التي هدفت اليها هذه الدراسة. اما الهدف الثانوي فهو دراسة علاقة الترابط بين قيم بعض المعايير الكيمياحياتية للمني ومستوى الهرمونات التكاثرية للمصل من جهة واختبارات وظيفة النطف من جهة اخرى.تم تحليل السائل المنوي للمرضى قبل تنشيط النطف، ومن ثم تم تقسيم المرضى الى ثلاث مجاميع رئيسة متساوية. جمعت عينات الدم من مرضى المجموعة الاخيرة لغرض تعيين مستوى الهرمونات التكاثرية الاربعة في المصل وهى : التيستوستيرون، البرولاكتين، الهرمون اللوتيني، والهرمون المحفز للجريب. كذلك تم قياس مستوى بعض المعايير الكيمياحياتية للسائل المنوي لمرضى هذه المجموعة والتي تضمنت : البروتين الكلي، الكوليستيرول، الكالسيوم، انزيم الكرياتين كاينيز، والفركتوز.استخدمت طريقتان لتنشيط النطف خارج الجسم in vitro وهما : الطريقة المباشرة (باستخدام مزيج الاوكسيتوسين ووسط تحضير النطف) والطريقة غير المباشرة (باستخدام التقنية الطباقية البسيطة) وبتطبيق ثلاثة تراكيز من الاوكسيتوسين وهي : ۲،٤، و٦ وحدة دولية/مل لاختيار التركيز الاكثر تاثيرا على اختبارات وظيفة النطف. اظهرت نتائج الطريقة غير المباشرة حدوث تحسن معنوي ملحوظ (P<0.001) في النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف عند التركيز۲ وحدة دولية/مل مقارنة مع عينات السيطرة. وقد كان هناك ميلا الى تناقص درجة نشاط النطف مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. اما نتائج الطريقة المباشرة فقد اظهرت حدوث زيادة معنوية (P<0.05) في درجة نشاط النطف وقد كان هناك ايضا ميلا الى تناقص معيار الحركة هذا مع زيادة تركيز الاوكسيتوسين. بناء على هذه النتائج، تم استعمال التركيز۲ وحدة دولية/مل للاوكسيتوسين مع تطبيق الطريقتين المباشرة وغير المباشرة وذلك في حالتين هما وجود وسط تحضير النطف وعدم وجوده. اظهرت حصيلة الطريقة غير المباشرة لتنشيط النطف وعند وجود وسط تحضير النطف زيادة معنوية ملحوظة (P<0.001) في خصائص الحركة (النسبة المئوية للنطف المتحركة ودرجة نشاط النطف) في كلا المجموعتين (المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة) مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط. اما مقارنة المجموعتين معا فقد اظهرت بان افضل تحسن معنوي ملحوظ ((P<0.001 في خصائص الحركة كان في المجموعة المعاملة. عند غياب وسط تحضير النطف كان هنالك تحسنا معنويا (P<0.05) في خصائص الحركة في المجموعة المعاملة فقط مقارنة مع قيم ما قبل التنشيط . عند تطبيق الطريقة المباشرة كانت النتائج مماثلة لما حدث عند تطبيق الطريقة غير المباشرة في حالة وجود وسط تحضير النطف. اما عند غياب وسط تحضير النطف لم يحدث اي تغيير معنوي (P>0.05) في تلك المعايير بعد فترة الحضانة. واظهرت النتائج ايضا بان هناك استجابات محفزة بالاوكسيتوسين (رغم انها غير معنوية) في تلك المعايير مقارنة مع مجموعة السيطرة. تشير جميع هذه النتائج الى التاثير المحفز للاوكسيتوسين عند التركيز۲ وحدة دولية/مل على خصائص حركة النطف، كذلك فان استعمال وسط تحضير النطف ادى الى دعم ذلك التاثير.تم تقييم علاقة الترابط بين المعايير الكيمياحياتية لبلازما المني ومعايير المني، وقد اشارت النتائج الى وجود ترابط موجب وبشكل معنوي (r = +0.29, P<0.05) بين مستوى الكوليستيرول وتركيز النطف، وبين مستوى الكالسيوم وكل من النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = +0.27, P<0.05) ودرجة نشاط النطف(r = +0.37, P<0.05) . بينما كان هناك ترابط سالب وبشكل معنوي بين مستوى الفركتوز من جهة وكل من تركيز النطف - 0.41, P<0.001) (r =، النسبة المئوية للنطف المتحركة (r = - 0.28, P<0.05) ، ودرجة نشاط النطف (r = - 0.32, P<0.05) من جهة اخرى.عند مقارنة مستوى هذه المعايير الكيمياحياتية بين المجموعة المعاملة بالاوكسيتوسين ومجموعة السيطرة، كان واضحا بان الاوكسيتوسين ربما يكون سببا في فقدان الكوليستيرول من الغشاء البلازمي للنطف وبالتالي زيادة مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. كذلك فان الاوكسيتوسين ربما ادى الى تحوير نقل الكالسيوم عبر الغشاء البلازمي وبالنتيجة زيادة تركيز الكالسيوم داخل الخلية وانخفاض مستواه وبشكل معنوي ملحوظ ((P<0.001 في الوسط الخارجي. بالاضافة الى الانخفاض المعنوي الملحوظ ((P<0.001 في مستوى الفركتوز في الوسط الخارجي والذي يشير الى استخدامه المتزايد من قبل النطف بسبب تنشيط الحركة.اظهرت نتائج فحوصات الهرمونات التكاثرية ارتفاعا معنويا ملحوظا ((P<0.001 في مستوىالبرولاكتين وانخفاضا معنويا (P<0.05)في مستوى الهرمون اللوتيني في الحالات المدروسة عند المقارنة مع القيم الطبيعية. وجدت علاقة ترابط سالبة وبشكل معنوي (r = - 0.29, P<0.05) بين مستوى برولاكتين المصل وتركيز النطف، وقد وجدت علاقة مشابهة ايضا (r = - 0.28, P<0.05) بين مستوى الهرمون المحفز للجريب في المصل وتركيز النطف.
الصفحات الاولى:
مكان الجامعة: بغداد
اللغة: الانكليزية
الجامعة: جامعة بغداد
الدرجة: دكتوراه
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
السنة: 2006
الموضوع العام: علوم الحياة
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي فريال عبد المناف المهداوي
اسم المؤلف: مكارم قاسم داود اللامي