Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 865

تاثير موعد الزراعة والفسفور الكاينتين في بعض صفات النمو والمركبات الفعالة لنبات الحلبة

Author name: رسل طه علي البلداوي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Medicinal Plants
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تقييم اضطرابات الدهون ومقاومة الانسولين مع بعض الحركيات الدهنية في الذكور المصابين بداء السكري النوع الثاني

Author name: نجلاء جبار وسمي
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

مقارنة تشريحية ونسيجية مظهرية وهرمونية للجهاز التناسلي الانثوي في الدجاج والبط == A Comparative Study of anatomical histomorphometrical and hormonal in Genital Tract between Hens and Ducks

Author name: ياسمين عبد الامير كاظم
Supervisor name: هناء حنين منكلو | صباح عبد الحميد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في البيت الحيواني التابع لقسم علوم الحياه كليه العلوم ، في الجامعه المستنصريه ولمدة ثلاثة اشهر من 15 سبتمبر - 15 ديسمبر 2013. ووكان الهدف من هذه الدراسة هو دراسة مقارنة لثلاثة اهداف اساسيه هي التشريحية والنسيجية والهرمونية في الجهاز التناسلي الانثوي بين الدجاج والبط الناضج وغير الناضج جنسيا. تم استخدام اثني عشرمن اناث الدجاج الغير ناضج والناضج جنسيا مقابل اثني عشرمن اناث البط الغير ناضج والناضج الذي وصل مرحله النضج الجنسي ، وتم تقسيمها الى اربع مجموعات ( 6 في كل مجموعة) وفي البحث تم تحقيق ثلاثة اهداف : الهدف الاول ( تشريحي ) : ان الجهاز التناسلي الانثوي في الطيوريتكون من مبيض وقناه البيض ، المبيض : هو كتلة متعرجة فاتحه اللون خاملة نسبيا قبل سن البلوغ وبعد النضج الجنسي يتضاعف بدوره الى مايشبه العنقود وذلك لانه مؤلف من مجموعة من الحويصلات ذات اقطار مختلفة تتراوح ما بين 40 ملم الى مكروسكوبيه صغيره ،كان طول ووزن المبيض في الدجاج غير ناضج وكان (12.49±0.33 ملم ,0.37 ± 0.01 غم ) على التوالي وكان الفرق معنويا على مستوى (p ˂ 0.01) عن الدجاج الناضج ( 49.64± 0.27 ملم , 47.22 ± 0.70 غم) على التوالي وايضا كان في البط غير الناضج(17.58± 0.12 ملم ,0.37± 0.11 غم ) على التوالي ، ولكن في البط الناضج لوحظ زيادة معنويه كبيرة (p ˂ 0.01) التي كانت ( 44.0± 0.86 ملم ،16.89 ± 0.21 غم ) على التوالي . اما قناه البيض فهي انبوبه عضليه ذات جدران مطاطيه مختلفه السمك تكونت من نسيج عضلي يحرك القناة حركه دوديه مستمرة وتكونت من خمس مناطق تختلف اطوالها باختلاف وظائفها ,حيث ان الطول والوزن والعرض في المناطق الخمسة من قناة البيض كانت للدجاج والبط الناضج اعلى وبفارق معنوي عالي (p ˂ 0.01) عن غيرالناضجة في كلا من الدجاج والبط. ولكن في الدجاج الناضج كانت القياسات الثلاثه للطول والعرض والوزن اعلى وبفرق معنوي(p ˂ 0.01 ) مما في البط الناضج .الهدف الثاني ( النسيجي ) : المبيض تالف من القشرة والنخاع حيث احتوت القشرة على العديد من الحويصلات المبيضيه التي كانت في مراحل مختلفة من النمو وهي البدائية الاولية، الحويصله الثانويه والثالثيه والناضجة طبقة وطبقة من النسيج الطلائي المكعب البسيط ، واما بالنسبة الى قناة البيض اليسرى ففي مرحله قبل البلوغ كانت رقيقة ومستقيمه وغير متمايزة بشكل جيد .واما عند وصولها للنضج الجنسي فان قناة البيض اصبحت متمايزة بشكل جيد الى خمس مناطق ( القمع ، المعظم ، البرزخ ,الرحم والمهبل ) .القمع تالف من منطقتين متمايزتين احدهما قمعية الشكل رقيقة شفافه تواجه المبيض لالتقاط البويضه وتمتازباختفاء الطيات والغدد . في حين ان الجزء الاخرهو منطقه انبوبيه ضيقة ذات جدار سميك قليلاو يمتاز بوجود طبقة من الطيات تتخللها الخلايا الافرازية العمودية التي استندت على النسيج الليفي ، اما الجزء الثاني فهو المعظم (منطقه افراز الالبومين)والذي افرز باربع طبقات من الالبومين طبقتين من الزلال الخفيف وطبقتين من الزلال الكثيف والتي افرزت من نوعين من الغدد الانبوبيه وغدد وحيده الخلية على التوالي حيث هذه الاخيره توجد داخل طيات واسعه ومتشعبه والتي لوحظت في معظم كلا من الدجاج والبط الناضج وطبقة من النسيج الطلائي العمودي البسيط وكذلك طبقة العضلات الملساء للمعظم هو اكثر سمكا ومرتبه بشكل واضح في طبقات محددة مما كانت عليه في القمع واخيرا طبقه مصليه، وتلتها منطقة انتقالية بين المعظم والبرزخ وتسمى هذه المنطقة(منطقة غير الغديه) والجزء الثالث البرزخ الذي تالف من منطقتين متمايزتين على اساس مظهره الفيزيائي الطبيعي الظاهر للعين قاصيه ودانيه ويعتمد على اساس نوع الخلايا الافرازيه واما نسيجيا فانه تالف من الغشاء المخاطي ذا نسيج طلائي العمودي مع وجود الطيات الابتدائية والثانوية ، ذات الغدد الانبوبيه الكبيره الحجم والعدد ووظيفتها افراز الاغشيه الرقيقه الداخلية والخارجية التي تحيط بالصفار وتدعم الغدد هذه نسيج يتكون من طبقه ليفيه وعائيه . الجزء الرابع الذي يلي البرزخ هو الرحم وكان مؤلفا من منطقتين اولاهما تكون راسيه انبوبيه قصيره ومنطقه ذيليه شبيهه بالكاس ذات جدران عضليه سميكه حيث لوحظ في رحم البط الغير ناضج طيات مؤلفة من نسيج طلائي عمودي مخاطي افرازي ومدعم بنسيج ليفي وعائي اما في رحم البط الناضجة فقد ظهرت طيات كبيره من نسيج طلائي عمودي غير افرازي تدعمه طبقة عضلية ملساء دائرية داخلية سميكة وطبقة عضلية طولية خارجية اما الجزء الخامس والاخير من قناة البيض فهو المهبل والذي يصل قناه البيض بالمجمع فقد ظهر شكليا كانبوب عضلي سميك قصيرمكون من طيات طولية قصيرة. ونسيجيا تكون من طبقة من النسيج الطلائي العمودي الكاذب وتخللته خلايا افرازيه في الطيور البالغة وغير البالغة نظرا لان وظيفة المهبل هي للخزن وليس له دور في تكوين البيضة .اما الهدف الثالث (الهرموني) فقد اظهرت النتائج انه عندما وصلت الطيور مرحلة النضج الجنسي حدث تحفيز للمبيض لافراز هرمون الاستروجين وبالتالي ارتفع معدل الدهنيات وترسيب الدهون في صفار البيض في الحويصلات الناميه وكانت النتائج زيادة كبيرة في مستوى هرمون الاستروجين في بلازما الدم في البط مقارنة مع الدجاج على مستوى معنوي جدا ( (p ˂ 0.01في كل وقت من اوقات عملية وضع البيض ، ولكن ، على العكس من ذلك هرمون البروجسترون في بلازما الدم كان مستوى الهرمون في الدجاج اعلى على مستوى معنوية من البط (p ˂ 0.01 ) في كل وقت من اوقات وضع البيض ، وايضا تركيزات هرمون التستوستيرون في الدجاج كانت اعلى مما عليه في البط على مستوى معنوية (p ˂ 0.01).اما نتائج قياس الهرمونات في البط غيرالناضج فقد اظهرت ان مستوى هرمون الاستروجين يزيد زياده معنوية كبيرة بفارق معنوي (p ˂ 0.01)مما عليه في الدجاج غير الناضج ، ولكن كان مستوى البروجسترون في الدجاج الغير الناضج اعلى مما هو عليه في البط غير الناضج وعلى مستوى معنوية عالي (p ˂ 0.01).ومن هذا نرى انه كان للهرمونات دور هام اثناء عملية التبويض والتي تم على هذا الاساس قياسها وعلى هذا الاساس ومما اظهرته النتائج كانت هناك علاقة قوية بين النتائج التشريحية والتغيرات النسيجية ومستويات الهرمونات اثناء مرحلة النضج الجنسي مقارنة مع هذه المعايير قبل النضج الجنسي . | The present study has been carried out in the animal house of Biology Department, College of Science, Al - Mustansiriya University for three months from 15 September to 15 December 2013. The aim of this study is to make a comparative study of anatomical, histological and hormonal on genital tract between immature and mature hens and duck. Six immature and six mature female hens versus six immature and six mature female ducks ,have been housed into four groups : 1 - Anatomical : the reproductive system in fowls consist of ovary and left oviduct, ovary is a mass of light - colored herringbone inert before puberty and after sexual maturity turn into a cluster of vesicles of different diameters ranging from 40 mm microscopic small size, the differentiations between the length of immature and mature ovary in hens and ducks were 12.49 ± 0.33 mm ,17.58 ± 0.12 mm respectively . while the mature ovary of hens and ducks were 49.64 ± 0.27mm, 44.00 ± 0.86 mm respectively. The weights of immature ovary of hens and ducks were 0.37 ± 0.01 gm,0.73 ± 0.11 gm respectively while the weight of mature ovary of hens and ducks were 47.22 ± 0.7 gm ,16.89 ± 0.21 gm respectively. The left oviduct consist from five regions its parameters different according to its function . Moreover, that the length, weight and width of the parameters of five regions of oviduct were significantly differences (p˂0.01) between immature and mature hens and duck. Noticed, that increases from immature parameters to mature ages in hen and duck. But in hens showed higher significant differences (p˂0.01) in most parameters. 2 - Histological : the ovary consists from cortex which contains numerous follicles in different stages of development that are classified as primordial primary, secondary and tertiary follicles in mature hens and duck as a layer of simple cuboidal epithelium, Moreover, the left oviduct only in ages of immature hens and duck were thin and straight and not well differentiated tube. In ages of mature hens and duck the oviduct become well differentiated into five distinguishable regions ( infundibulum , magnum ,isthmus ,uterus and vagina). The infundibulum is consisting from two regions in hens the cranial region has a thin walled funnel - like shape which has elliptical opening called( fimbriae infundibulais )region, it's wall was thin transparent membrane facing the ovary, their internal surface showed disappearance of folds and glands . While the caudal region (neck region) of the infundibulum which is called (tubu infundibularis ) showed a narrow slightly thick wall tube and showed small and very short longitudinal oriented folds with tubular glands But , in infundibulum in mature duck and hen showing infolded layer of columnar secretory cells supported on fibro - vuscular tissue, the second part magnum display thick and wide lumen and their folds appeared the longer in mature hens and duck ,The mucosa of the magnum is thick wall, arranged in long, wide and branched more voluminous folds, variable in size and length than else where with narrow clefts between them lined with simple columnar epithelium and The smooth muscular layer of the magnum is thicker and clearly arranged in definite layer than in the infundibulum , magnum in mature chicken showing mucine secreting and columnar epithelium surrounded by layer of muscle fibers , The magnum wall in mature duck showing infolded layer of epithelium columnar non - secretory with its stroma surrounded by smooth muscle layer and serosa layer duck, There are a transitional zone between the magnum and the isthmus. This zone is called non - granular zone. The isthmus in mature hen showing infolded of columnar mucosa secreting epithelium with stalk of fibro - vascular and showed primary and secondary folds, but in mature duck showing ciliated pseudo stratified epithelium layer with apical surface columnar and mucine secreting cells supported by fibro - vascular stroma. The uterus the difference between immature duck and mature duck; That in immature duck showing infold large like villi lined by mucous secreting columnar epithelium supported by fibro - vascular stroma but in mature duck showing a wall of uterus in which there was infolded villi like projection into the cavity of columnar non - secretory epithelium with thick inner circular layer and thinner outer longitudinal layer of smooth muscle fibers, the final part of the oviduct is the vagina which appeared a short thick muscular tube of short longitudinal oriented folds. In immature hen showing ciliated pseudo stratified columnar lining epithelium within mucine secreting cells. But, in vagina of mature hen showing infolded layers covered by ciliated pseudo stratified columnar epithelium cells with isolated mucine secreting cells In vaginal wall of mature duck showing infolded layer of ciliated pseudo stratified columnar epithelium cells within isolated secretory cells.3 - Hormonal : From our results in mature showed,a significant increase (p˂0.01) in the level of the plasma estrogen E2 of duck compared with hen in all time from oviposition, but , on the contrary in plasma progesterone hormone the level in hens increased significantly (p˂0.01) from ducks in all time of oviposition , also Testosterone concentrations in hens increase significantly (p˂0.01) from ducks that was indicated for its important role during ovulation. In immature duck the level of estrogen E2 increase significantly (p˂0.01) from hens, but the plasma progesterone concentration increase significantly (p˂0.01) in immature hens in comparison with the ducks .These findings showed strong relationship between anatomical parameters and histological changes and hormonal levels during sexual maturity when compared with these parameters before puberty

دراسة بعض المتغيرات الحياتية عند مرضى التهاب الكبد نمطي بي وسي == Study of some biological variables in patients with hepatitis B and C

Author name: ياسر ماجد كامل
Supervisor name: عباس عراك عباس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعتبر فيروسات التهاب الكبد نمطي B وC من الفيروسات المنتقلة عن طريق تلوث الدم وذات الانتشار الواسع في انحاء العالم .تصيب هذه الفيروسات معظم السكان,متبرعي الدم ,مرضى الثلاسيميا,مرضى الغسل الكلوي وغيرهم ممن يتعرضون لعمليات سحب ونقل دم عادة,او من تجرى عليهم العمليات الجراحية او عن طريق الحقن او المخدرات.قد تتفاقم الاصابة احيانا نحو حدوث الاصابة المزمنة والتي تكون على درجة من الخطورة بحيث تؤدي الى تليف الكبد او الاصابة بسرطان الكبد.اجرينا الدراسة على 63 شخصا منهم 33 مصابون بالتهاب الكبد الفيروسي النمط B و30 اخرون مصابون بالنمط Cجمعوا من وسط مرضى الثلاسيميا (فقر الدم البحر الابيض المتوسط),مرضى غسل الكلى او متبرعي الدم والقسم الاخر مرضى عاديون لكن جميعهم مصابون واجريت عليهم فحوصات الكشف Anti - HCV وHBsAg بالاضافة الى الفحوصات اللاحقة من اختبارات ELISA وmini - VIDAS لغرض الكشف عن الاضداد. استخدمنا ايضا عينة عشوائية من 30 شخصا صحيحا لغرض المقارنة مع بعض الفحوصات المستخدمة في فحوصات الدم والدهون والغلوبيولينات المناعية.بالنسبة لمرضى التهاب الكبد نمط Bبينت الدراسة ان معدلات فحوص الدم التالية : Hb, MCH, MCHC, RBC , وplatelets قد اظهرت انخفاضا ملحوضا مقارنة مع الاشخاص السليمين, وهذه الفحوص دلائل على وجود حالة من فقر الدم.بينت الدراسة ايضا ارتفاعا في العدد الكلي لكريات الدم البيض وانخفاضا في كل من الكريات (القعدة والعدلة واللمفية),بينما اظهرت ارتفاعا في مستوى الكريات الاحادية في كلا الاصابتين (B وC) .فحوصات الدهون كشفت عن ارتفاع في مستوى الكولسترول والدهون الثلاثية والبروتينات الدهنية منخفضة الكثافة مقارنة بالاصحاء.كما كشفت الدراسة عن ارتفاع في انزيمات الكبد (ALT, AST, total and direct bilirubin, alkaline phosphatase) في كلا نمطي مرضى التهاب الكبد. اما بالنسبة لمرضى التهاب الكبد النمط Cفقد اظهروا انخفاضا في مستوى كل من ( BMI, PCV, Hb, MCH , platelets) مقارنة مع الاشخاص الاصحاء.خلايا الدم الاحادية واللمفية اظهرت ارتفاعا مقارنة بمجاميع الاصحاء مع انخفاض في مستوى الخلايا العدلة. كما اظهرت فحوصات الدهون انخفاضا ملحوظا في الكولسترول والبروتينات الدهنية قليلة الكثافة.كما بينت الدراسة الاحصائية باستخدام معامل الارتباط (سبيرمان) وجود علاقات واضحة بين بعض المؤشرات الحيوية وهي : في مرضى HBV : 1. MCH والبيليروبين الكلي وجود علاقة متوسطة ايجابية 2. MCHمع الالبومين بعلاقة قوية سالبة 3. MCH مع انزيم الفوسفاتيز القاعدي بعلاقة متوسطة سالبة 4. الخلايا العدلة مع البيليروبين الكلي بعلاقة موجبة متوسطة ومع الالبومين ايضا بعلاقة موجبة متوسطة 5. الخلايا الاحادية لكريات الدم البيض مع الالبومين بعلاقة قوية سالبة وفي مرضى HCV : 1. الهيموغلوبين مع البيليروبين الكلي بعلاقة متوسطة موجبة 2. معدل انضغاط الخلايا PCV مع انزيم AST بعلاقة قوية سالبة3. MCV مع AST بعلاقة متوسطة سالبة 4. الخلايا الحمضة لكريات الدم البيض مع الالبومين بعلاقة موجبة قوية 5.الدهون الثلاثية مع البيليروبين المباشر بعلاقة موجبة متوسطةتقترح هذه النتائج بان الاصابات بالتهاب الكبد الفايروسي نمط ب وسي تؤدي الى نوع من فقر الدم وانخفاض مستويات بعض دهون البلازما وكذلك الى اختلاف الردود المناعية بين النوعين, لذا توصي هذه الدراسة بفحص مرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط ب وسي للكشف عن مؤشرات فقر الدم ومستويات دهون البلازما تجنبا للتطورات السلبية الخطيرة مثل الفشل القلبي والكثير من امراض الاوردة والشرايين وان معالجة مثل هذه الاختلالات قد يعزز الحالة الصحية العامة للمرضى وخاصة في الطور المزمن للاصابة. | Hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) are blood born viruses which are distributed throughout the world. These viruses may infect the general population, blood donors and others such as thalassemia, hemodialysis and hemophilic patients and individuals who are exposed to blood, operations and injection of drugs. The chronic infection may lead to serious disease which promote to fibrosis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The study applied on 63 patients (33 HBV and 30 HCV) all from : thalassemia patients, hemodialysis patients and blood donors previously marked as hepatitis patients with later confirmatory process with mini - VIDAS and ELISA. The study used a random pattern of control group to compare our results of some hematological, biochemical and Immunological parameters of these HBV and HCV patients. The study used spearman rank correlation coefficient to clear the relations among liver function test parameters against : hematological, lipid profile test and immunological parameters. The study found that Hemoglobin (Hb), Mean Corpuscular Hemoglobin (MCH), Mean Corpuscular Hemoglobin Concentration (MCHC), Red Blood Cells counts (RBC counts) and platelets decreased in HBV patients comparing to control group, which refer to a type of anemia.An increase in White Blood Cells (WBCs) total count and a decrease in Deferential WBC (Basophils, neutrophils, lymphocytes), while Monocytes increased in both HBV and HCV patients. Lipid profile tests revealed a significant decrease in cholesterol, triglycerides and Low Density Lipoprotein (LDL) levels of HBV patients compared to controls. Alkaline Transaminase (ALT), Aspartate Transaminase (AST), total and direct bilirubin and alkaline phosphatase significantly increased in both HCV and HBV. Immunoglobulins classes M and A found to be significantly high in HBV.And for HCV patients we found that Body Mass Index (BMI), Packed Cell Volume (PCV), Hb, MCH and platelets are decreased comparing to control group. Monocytes and lymphocytes found to be significantly increased in HCV patients comparative with control group, with a decrease in neutrophils. Lipid profile tests showed a significant decrease in cholesterol and low density lipoprotein (LDL). The significant noted correlations among parameters according to Spearman rank coefficient were : In HBV patients : 1. Mean Corpuscular Hemoglobin and bilirubin total with a negative moderate correlation (R= - 0.49, P=0.05).2. Mean Corpuscular Hemoglobin and albumin with a high negative correlation (R= - 0.65, P>0.05) 3. Mean Corpuscular Hemoglobin and alkaline phosphatase with moderate negative correlation (R= - 0.51, P>0.05).4. Neutrophils and total bilirubin with a moderate positive correlation (R=0.54, P<0.05) and positive correlation with albumin (R=0.51, P<0.05).5. Monocytes and albumin with high negative correlation at (R= - 0.62, P>0.05). In HCV patients : 1. HB and Total Bilirubin with a moderate positive correlation at (R=0.49, P<0.05).2. PCV and AST with a high negative correlation at (R= - 0.62, P<0.05).3. MCV and AST with a moderate negative correlation at (R= - 0.55, P<0.05).4. White blood eosinophil and albumin with a high positive correlation at (R=0.6, P<0.05).5. Triglycerides and direct bilirubin with a moderate positive correlation (R=0.5, P=0.05).These results suggest that HBV and HCV infections lead to a certain type of anemia and decreased certain plasma lipids and dissimilar immunological outcomes. The study recommend testing HBV and HCV patients for anemia and plasma lipid parameters to avoid serious consequences such as heart failure and many coronary and artery diseases as well as to generally improve the health of HBV and HCV patients especially those at chronic stages

زيادة بعض مركبات الايض الثانوية لنبات الزيتون Olea europaea L باستخدام نترات الفضة النانوية والبولي اثيلين كلايكول خارج الجسم الحي == Increasing of some secondary metabolites of Olea europaea L. Using silver nitrate nano particle and polyethylene glycol elicitor In Vitro

Author name: وسن محمد موسى السويدي
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in callus induce from leave and shoot tips of Olea europaea L. in vitro.Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant.Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that ms medium containing 1 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 50 % under light conditions, the highest callus fresh and dry weight were recorded 630,43.0mg at concentrations 1,2 mg/l 2,4 - D respectively.Shoot tips and Stigma cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulatorsincluding Benzyl Adenine BA at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of shoot tips reached 80 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2534,552 mg at concentration 3mg/l BA respectively. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of Stigma reached 40 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2070,404 mg at the concentration 4mg/l BA respectively.In order to increase theproduction of secondary metabolites, some elicitors were used including Poly Ethylene Glycol (PEG) at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 %, and silver nano particles AgNO3 NPs at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l.Results showed that 1.5mg/l concentration of AgNO3NPs caused highly significant production in most of the secondary metabolites (Glycosides compound) of callus for Olea europaea L while 2mg/l concentrations of AgNO3 NPs caused highly significant production in some of the secondary metabolites (Glycosides compound) of shoot tips for Olea europaea L. Results showed that 2% concentration of PEG caused highly significant production of the secondary metabolites (Fenolic compound) of callus for Olea europaea L. while 1.5% concentrations of PEG caused highly significant production b in most of the secondary metabolites (phenolic compound) of shoot tips for Olea europaea L.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

التوزيع الزماني للفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة وبعض طرائق السيطرة عليها == Temporal Distribution of Dermatophytic Fungi the Causative of Tinea Diseases and Some Control Methods

Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي
Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

تاثير التلوث بالمواد العالقة بالهواء واثره على البيئة == THE IMPACT OF POLLUTION ON THE SUSPENDED AIR PARTICLES AND THEIR EFFECT ON ENVIROMENT

Author name: يسرى بدري نوري الحسيني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت هذه الدراسة عدة مواقع من مدينة بغداد في جانبي الكرخ والرصافة، اذ كان الاختيار على اساس الكثافتين المرورية والسكانية، والتي يتمخض عنهما مخلفات حرق الوقود المضاف اليه رابع اثيلات الرصاص وحرق القمامة الناتجة من الفعاليات البشرية المختلفة، مصدرا للتلوث. لذا اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على العناصر الملوثة (الكادميوم، النيكل، الرصاص، الحديد) كملوثات للمنظومة البيئية (تربة - نبات). من خلال تقدير هذه العناصر كما ونوعا في نباتات وترب الدراسة، مع الاخذ بالحسبان التغيرات الفصلية. جرى اعتماد النباتات المعمرة الدفلة Nerium oleander والزيتون Olea europea والنخيل Phoenix dactylifera والترب المزروعة فيها مادة لهذه الدراسة، اذ قيست تراكيز هذه العناصر في الاوراق النباتية المغسولة وغير المغسولة لفصلي الشتاء والصيف وما بعد المطر ومعرفة اي من هذه الحالات الاكثر امتصاصا، كما قيست الكميات المتجمعة من العوالق على اسطح تلك الاوراق بالمقارنة مع مساحة سطح الورقة ومعرفة اي الانواع الاكثر تجميع هذا من جانب، ومن جانب اخر قيست هذه العناصر المرتبطة بمكونات التربة ذات المساحة السطحية العالية (الطين، المادة العضوية، اكاسيد الحديد، كاربونات الكالسيوم ) بطريقة الاستخلاص المتعاقب ومقارنة قيمها بقيم التواجد البيدوكيميائي الطبيعي له في التربة. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ما ياتي : 1 - ان اوراق نباتات النخيل كانت الاكثر تجميعامن حيث كمية الدقائق العالقة على سطح الورقة، تلى ذلك اوراق نبات الدفلة والزيتون. 2 - كان تركيز عناصر الدراسة في اوراق النباتات المغسولة اقل مما في غير المغسولة اذ سجلت تراكيز العناصر في اوراق النباتات المغسولة الترتيب الاتي بعد المطر > فصل الشتاء > فصل الصيف، ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر سلوكا مختلفا عن بقية العناصر وكما في التسلسل الاتي فصل الصيف > بعد المطر > فصل الشتاء.3 - شكلت تراكيز عناصر الدراسة في اوراق الزيتون غير المغسولة اعلى قيما من بين عناصر الدراسة فيما سجلت اوراق نبات الدفلة القيم الاعلى من تراكيز هذه العناصر في الاوراق المغسولة. 4 - دلت تحريات التربة وتحاليلها على الالفة العالية لجميع عنلصر الدراسة مع مفصول الطين ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر ميلا شديدا للارتباط مع الاكاسيد الحرة ( الحديد والالمنيوم ). 5 - بينت المقارنة البيدوكيميائية لقيم عناصر الدراسة مع القيم الاصلية لها ان عنصري الكادميوم والنيكل لم يتجاوزا الحد المسموح بالتلوث فيما تجاوز ذلك كل من عنصري الرصاص والحديد. | This study deals with many sites in Baghdad, both Karh and Russafa. The choice of theses sites are according to the traffic and residential density, which result wastes from burning the fuel that contains lead Tetra ethelate and the burning of garbage that result from human activities and other pollution resources. This study is made to shed light on the polluted elements (Cadmium, Nickel, Lead and Iron) as causers of pollution to environment (soil - plant), through estimating these elements quantitively and qualitatively in the soils and plants of the study, with taking into consideration the seasonal changes.The long - lived plants are regarded in the study like Nerium Oleander, Olea europea and phoenix dactylifera and the soil of plantation.The concentrations of these elements in washed and non washed plants leaves in winter and summer seasons and after rain falling are measured to know which one is the most absorptional. The quantities of suspended particles on leaves surface are measured to be compared with the leave's area and to know which one is the most precipitated.On the other hand, these elements that are bounded with soil components of specific high surface area (clay, organic matter, Iron oxide) calcium carbonate) are estimated by sequence extraction, and comparing their values with the Bedochemical values in the soil.The study reaches the following results : 1. The leaves of palm - date is the most accumulated of the suspended particles amount on leave surface, then Nerium and olive respectively.2. The concentration of the study elements is on higher level in the washed leaves rather than the non - washed leaves. It is reported that the elements in the washed leaves are as the following sequence post - rain> winter> summer, except for Fe which has different behavior as in this sequence summer> post - rain> winter. 3. Nerium shows the higher concentrations of the elements in the washed leaves, while olive shows the higher concentrations of these elements in non - washed leaves.4. The soil investigation of the study indicates that all elements of the study have high binding with the clay except for Fe which has great tendency to be bounded with free oxides (Iron and Aluminum).5. The Petrochemical comparison of the values of cadmium and nickel do not exceed the boundary of pollution while iron and lead do

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

دراسة انتاجية البكتريوسين من بكتريا Enterococcus faecium المعزولة من مصادر سريرية == Study of the Bacteriocin production from Enterococcus faecium isolated From clinical sources

Author name: هاله عباس جاسم
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | شروق ريس كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 290 عينة سريرية من المرضى الراقدين والمراجعين لمستشفيات بغداد وتوزعت هذه العينات الى 177عينة ادرارو113 عينة خروج ، اظهرت نتائج الزرع البكتريولوجي على وسط المكورات المعوية الانتخابي Ej media ووسط المكورات المعوية التاكيدي Bile esculin azide agar والتشخيص المظهري والكيميوحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API 20 strep تشخيص 27عزلة(%9.31) من بكتريا Enterococcus faecium من عدد العينات الكلي ،وكانت 11 عزلة ( 6.21%) منهامن الادرارو16 %14.15)) عزلة من الخروج . اختبرت حساسية عزلات E.faeciumل11 نوع من المضادات الحيوية واظهرت النتائج مقاومة عالية لل Naldixic acid(81%)و (63%) TetracyclineوAmpicilin (52%)بينما كانت المقاومة لل Ciprofloxacin(48%)و(41%) Erythromycin .ومن الناحية الاخرى اظهرت العزلات مقاومة واطئة لل Penicillin (26%) وNitrofurantion (22%)و وVancomycin (18%)وكانت (19%)لل Trimethprim و(15%)Chloramphenicol. كانت (7%)فقط من العزلات مقاومةللGentamycin.اجريت تجارب التحري عن البكتريوسين من بكتريا E.faecium وكانت جميع العزلات منتجة (100%)ولمدى واسع من التاثير على البكتريا الموجبة والسالبة مع اقطار تثبيط (8 - 15 )مليمتر و(9 - 27)مليمتر على العزلات العائدة لنفس النوع . اختيرت العزلة EH(1) كعزلة كفوءة الانتاج مع فعالية نوعية 1.28 وحدة/مايكروكرام بروتين بتركيز بروتين 250 مايكروكرام /مليمتر بعد ان قيست الفعالية في العزلات(EH1,EH6,EH13) التي كانت افضل العزلات انتاجية للبكتريوسين بطريقة الاقراص. ووجد ان وسط Mann Regusa Sharp السائل والصلب هو افضل وسط لانتاج البكتريوسين من بكتريا E.faecium وان هذه البكتريا تنتج البكتريوسين في درجات حرارية بين 16 - 45 م ، واختيرت العزلة E3 والبكتريا Staphylococcus aureus, Staphylococcs epidermidis,Escherichia coli, Sallmonella كعزلات دالة ، استخلص البكتريوسين من العزلةE1 بصورته الخام بعد تنمية هذه العزلة على وسط Mann Regusa sharp السائل وتم الحصول على بكتريوسين ذي فعالية نوعية )1,28 وحدة / مايكرو كرام) بروتين وبتركيز بروتين 250 (مايكروكرام /مليلتر) وهذا البكتريوسين مقاوم للدرجات الحرارية (80,100، 121)م لمدة (15 و30 )دقيقة ، كذلك مقاوم لمدى من الرقم الهيدروجيني (8 - 2) ،ومقاوم للخزن في درجات حرارة (0،4 ،37) م لمدة (يوم ,اسبوع) . اجريت التنقية الجزئية للبكتريوسين الخام المستخلص من العزلة E1 بالترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع ( 40% و75% )واظهرت النتائج ان الترسيب بـ40%كان الافضل الذي بلغت الفعالية النوعيةفيه 44.137 وحدة/مايكروكرام بروتين وبتركيز بروتين 290 مايكروكرام/مليمتر . وكانت فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا ثابتةعند 80م لمدة 30 دقيقة و100 م لمدة (15,5)دقيقة لكن انخفضت فعاليته لتصل الى 0.8 )وحدة /مايكروكرام بروتين( في 30 دقيقة , وفقدت الفعاليةعند121م لمدة 15 دقيقة ، كانت الفاعلية ثابتة عند مدى من الرقم الهيدروجيني (8.5 - 5.5) والخزن عند صفردرجة مئوية لمدة اسبوع. | The study has involved collecting (290) clinical samples collected from admitted and refeard patients of Baghdad hospitals .The samples distributed into (177) urine sample and (113) faeces samples . Results from bacteriological culture on selective Enterococcus medium EJ medium , Enterococcus medium (bile esculin azide agar) in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20 strep system showed that only27 isolates (9.31%) were identified as Enterococcus faecium ,11 (6.21% ) isolate from urine samples and 16isolate (14.15% ) from faeces samples . The Antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecium isolates was tested towards 11 types of antimicrobial agents .The isolate showed a high resistance to Naldixic acid (81%) ,Tetracycline (63%) and ampicilin (52%) ,while (48%) of the isolate were resistant to Ciprofloxocin and (41%)resistant to Erythromycin . From the other hand Enterococcus faecium isolates showed low resistance to otherantimicrobial agent : Pencilin(26%),Nitrofurantion (22%) , Vancomycin (18%) and Trimethprim (19%) and Chloramphenicol (15%). Only(7%) of the isolates were resistant to gentamycin . Bacteriocin detection experments were carried on Enterococcus faecium and the results that all isolates were produce bacteriocin (100%) with wide range effect on gram positive and negative bacteria bacterial growth , with diameter (8 - 15)millimeter and (9 - 27)millimeter on the same isolates species ,EH1 isolate chosen as the best producer isolate bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration(250) microgram/ millimeter after the activity detected in isolates EH1,EH6,EH13 were the best bacteriocin production isolates by using disk method on the Mann Regusa Sharp agar . And founded the solid and broth Man Ragusa sharp medium was the best medium for bacteriocin production from E.faecium and this bacteria produce bacteriocin in tempreture degree between )16 - 45(C, E3isolate and the bacteria Salmonella ,Escherichia coli ,Staphylococcus aureus ,staphylococcus epidermidis chosen as indicating isolates, the bacteriocin extracted from E1in the crude form after growth this isolate on Mann Regusa Sharp broth and obtained on bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration (250) microgram /millimeter and this bacteriocin resistant for tempreture degrees 80,100,121 C for (15 ,30) minute also resistant to PH range (2 - 8) and resistant the storage in tempreture degree 0C,4 Cfor (day ,week). Then partial purification applied for this crude bacteriocin by precipitation with Ammonium sulphate of (40%,75%) saturation percentage .Results showed the precipitation in percentage 40% was the best with a specific activity reached in it to 44,137unit /migrogram protein and protein concentration 290 microgram/millimeter . The partial purified bacteriocin activity was stable at 80C for 30 minutes ,100C for( 5 ,15) minute ,but its activity decrease to reach to 0.8 unit/mg protein in 30 minute and lost activity in 121 C for 15 minute. Its activity was stable in PH (5.5 - 8.5) and storage at 0C for week

دراسة التاثير الخلطي لبعض المضادات الحيوية على فعالية المكونات الخلوية لبكتريا البروسيل == Study the effect of some antibiotics combination on the cell component activity for Brucella Spp

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل نوعين من بكتريا البروسيلا وتحديد انماطها الحيوية وهي البروسيلا المجــــــــــهضة (Brucella abortus)والبروسيلا المالطية (Brucella melitensis)المعزولة من الانسان . وتحديد حساسيتها لمضادات الحيوية وتــــــــحديد التركيز المثبط الادنىMIC))لبعض المضادات الحيوية المستخدمة في علاج داء البروسيلوسز Brucellosis)). فضلا عن التحري عن التاثير الخلطي لمضادات الحيوية وعند التراكيز تحت المثبطة الدنيا (sub - MIC)في نموها وعلى المكونات الخلوية المتمثلة بفعاليات انزيماتها, ونفاذية غشائها الخلوي ومكونات عديد السكرايد الشحمي المستخلص منها وعوامل التصاقها (Colony factor), فضلا عن تاثيرها في طور المستعمرات والتصاق خلايا البروسيلا على سطح الخلايا الطلائية . حيث اظهرت النتائج الاتي : • ان النمطين الحيويين السابع من البروسلا المجهضة والثالث من البروسيلا المالطية هما الاكثر انتشارا .• حساسية عزلات البروسيلا المجهضة والمالطية لكل من مضادات,Gentamicin,Kanamycin,Tobramycin,Naldixic acid .فيما قاومت مضادات,Lincomycin Rifampicin , Cephalaxicin ( وعلى التوالي .• بلغ التركيز المثبط الادنى لمضادات Doxycyclin ,Tetracyclin,Streptomycin ,Erythromycin ,Rifampicin (5,10,10,40,40) مكغم/مل وعلى التوالي • وجود تاثير تازري في نمو بكتريا عند خلط كل من مضاديDoxycyclin+Rifampicin,Erythromycin+Doxycyclin ,Erythromycin+Rifampicin,Tetracyclin+Rifampicin ,Tetracyclin+Erythromycin• غير مضاد Doxycyclin طور المستعمرات الملساء للبروسيلا الى طورها المتوسط فيما لم يوثر مضاد Rifampicin في طور المستعمرات فبقيت ملساء, وغير خلط مضاديDoxycyclin+Rifampicin طور المستعمرات الى الطور الخشن الفاقد للامراضية . • ثبط مضاديDoxycyclin+Rifampicin انتاج انزيمات Catalase ,Urease ,Oxidase ,Nitrate reductaseمن قبل البروسيلا المالطية والمجهضة عند استخدامها بصورة مفردة وخلطية • جاء التاثير الخلطي لمضادات Doxycyclin+Rifampicin تازريا في مكونات عديد السكرايد الشحمي عندما خفض نسبة المكونات السكرية والدهنية في مستخلص عديد السكرايد الشحمي بطوره المائي والفينولي لتبلغ المكونات السكرية للمستخلص(147,144) مكغم/مل للبروسيلا المجهضة بطورها المائي والفينولي وعلى التوالي و(145,138)مكغم/مل للبروسيلا المالطية وبطوريها المائي والفينولي . ومقارنة مع معاملة السيطرة(172,189) مكغم/مل بطوريها المائي والفينولي . اما المكونات الدهنية فبلغت لمستخلص البروسيلا المجهضة (60.6,56.5 )مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي ولمستخلص البروسيلا المالطية (44.4,36.3 )مكغم/مل وعلى التوالي لطوريها الفينولي والمائي ومقارنة بمعاملة السيطرة للبروسيلا المجهضة (82.1,77.3) مكغم/مل وللبروسيلا المالطية(92.1,64.6) مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي .• تبين قدرة كل من البروسيلا المالطية والمجهضة على تكوين عوامل الالتصاق بانواعـــــــــــها الثلاثة (CAF/I, CAF/II ,CAF/III), فضلا عن تكوينها لانواع اخرى من عوامل الالتصاق تم الكشف عنها وبطرائق محورة . كما استطاعت المضادات الحيوية المستخدمة خــــــــــلطا (Doxycyclin+Rifampicin )من منع خلايا البروسيلا عن تكوين هذه العوامل كافة.• اثر استخدام مضادي Doxycyclin+Rifampicinخلطا على خفض عدد خلايا البروسيلا الملتصقة بسطوح الخلايا الطلائية مسببا خفض اعدادها لتبغ معدل عدد الخلايا للبروسيلا المجهضة 6, وللبروسيلا المالطية 3 مقارنة بمعاملة السيطرة 51 و55 وعلى التوالي .• تسبب معاملة البروسيلا بمضاديDoxycyclin+Rifampicin خلطا خللا في نفاذية غشائها الخلوي السايتوبلازمي ونضوحا لحامضها النووي عندما بلغ طيف الامتصاص حامضها النووي(2.21,2.33) لكل من البروسيلا المجهضة والمالطية وعلى التوالي ومقارنة بمعاملة السيطرة(0.72,0.73). | Two types of Brucella isolated from human included Br. abortus and Br. melitensis were determine there biotype, Antibiotic sensitivity and MIC for some antibiotic used for brucellosis treatment were applied.mixed affect of antibiotics at concentrations of sub MIC on the growth and on cellular containt of brucella represented by enzymatic activity, cellular membrane permeability lipopolysaccharide contents,colony phase,colony adhesion factor beside adhesion on epithelial cells to brucella.the results showed that biotype 7 from Br.abortus and biotype 3 from Br. melitensis were the dominant isolated. All isolated of Br . abortus , Br. melitensis sensitive completely to gentamycin, kanamycin ,tobramycin, naldixic acid while its resistantto lincomycin ,rifampicin ,cephlothin , doxycyline The MIC to doxycycline,tetracycline,streptomycine,erythromycine,rifampicin were ( 40 , 40 , 10 , 10 ,5 ) g/ml respeactivelly.There was a synergistic effect on bacterial growth when the following antibiotics mixed as follow : ( doxycyline - rifampicin , erythromycin - rifampicin , rifampicin - tetracycline , erthromycin - tetracycline )The doxycycline had changed the colony from smooth phase to intermediate phase while the rifampicin had not affect the smooth phase . The mixed affect of doxycylin _ rifampicin have changed the smooth colonies to rough colonies .Both doxycyline , rifampicine inhibited the activity of catalase , urease , oxidase , nitrate , reductase that produced by Br. abortus and Br.melitensisThe synergistic effect of doxycycline and Rifampicin on the content of lipopolysaccharide.The mixed effect of antibiotic caused a decrase in the polysaccharides in aqueous and phenolic phases .In this case it gave a values (144,147) g/ml for Br. abortus and (138,145) g/ml for Br. melitensis in comparison with contral with read to(172,180.1) g/ml to aqueous and phenolic extraction respeactivelly. While the lipid content showed value of (60.6,56.5) g/ml for Br. abortus and (44.4,36.3) for Br. melitensis in comparison with control that gave a values (82.1,77.3) g/ml for Br. abortus and (92.1,64.6) for Br. melitensis in aqueous and phenolic phases respeactivelly .Both Br.abortus and Br. melitensis had ability to from colony adhesion factor(CAF/I,CAF/II,CAF/III) in addition to another colony factors(i.e CAF/III) that had modified due to presence of tannic acid. The mixed effect of doxycycline - Rfampicin inhibit the formation of these factor.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin causesd a decrase of brucella adhesion on the epithelial cell surface.The average of Br. abortus (6) and Br. mlitensis(3) in comparison with control 51,55 cell/filed respectively.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin caused a defeact in cytoplasmic membrane permeability hance the absorbance of Naldaxic acid a values 2.21,2.33 for Br. abortus and Br.melitensis in comparison with acontrol that showed avalues 0.72,0.73 respectivelly.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

ترافق بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض السكري النمط - 1 للانسان == Association of some human blood groups and antibodies with type - 1 diabetes

Author name: نور عبد الاله خليل حسين
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 126 نموذجا لمرضى السكري النمط ـ1 (T1D) Type - 1 Diabetes قورنت بـ 100 نموذجا لاصحاء مقاربة بالعمر والجنس مع المرضى. اهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم A وB وO وAB وLe(a+b - )وLe(a - b+) وLe(a - b - )و MMوMN وNNوSS وSsوss فضلا عن دراسة عيارية الاضداد للمرضى والاصحاء اذ استعملت طريقة تنميط مجموعة الدم ABO وLewis وMNSs واستعمل فحص تثبيط التراص لتحديد قابلية الافراز للنمط Le(a - b - ). جاءت النتائج لتشير الى زيادة ملحوظة في تردد مجموعة الدم O ، اذ كانت 39.68% في المرضى و28% في الاصحاء (مربع كاي 7.097 وباحتمالية P<0.01 ). فيما صاحب تردد مجموعة الدم A انخفاضا ملحوظا في المرضى فكان 20.63% اما في الاصحاء فكان 37% (مربع كاي 6.159 واحتمالية P<0.05) .اما مجموعة الدم B فظهرت بتردد 28.57% في المرضى و23% في الاصحاء (مربع كاي 3.615 واحتمالية P<0.05). وانخفض تردد مجموعة الدم AB انخفاضا طفيفا في المرضى عنه في الاصحاء ، اذ كان في المرضى 11.11% و12% في الاصحاء وبفرق غير معنوي (مربع كاي 0.804).ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض ، اذ بلغ ترددها في المرضى 30.95% فيما كان في الاصحاء 21% واشار التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية لهذا الفرق (مربع كاي 5.882 واحتمالية P<0.05). واظهرت المجموعة Le(a - b - ) دورا هاما في قابلية الاصابة بالمرض وبتردد بلغ 18.25% في المرضى و11% في الاصحاء (مربع كاي 4.604 واحتمالية P<0.05). في حين اظهرت المجموعة Le(a - b+) دورا مقاوما للمرض.وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 وذلك بارتفاع تردد الفارزين عن غير الفارزين ، فقد كان في المرضى 69.56% على حين كان في الاصحاء 45.45% وبمعنوية عالية (مربع كاي 11.601 واحتمالية P<0.01). اما مجموعة غير الفارزين فاظهرت مقاومة للاصابة بالمرض.لقد برز دور مجموعة الدم MNSs في المرض ، اذ بلغ تـردد المجمـوعة MN في المرضى 55.55% مقارنة بالاصحاء 41% (مربع كاي 6.377 واحتمالية P<0.05). وقد لعبت المجموعة Ss دورا في المرض وبتردد 23.80% في المرضى مقارنة بتردد 11% في الاصحاء (مربع كاي 7.067 واحتمالية P<0.01)، على حين كانت بعض مجاميع دم MNSs مقاومة للمرض. درست عيارية الاضداد للانماط الدموية تحت الدراسة وقد لوحظ من نتائج الدراسة وجود ارتباط بين بعض المجاميع الدموية وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب Anti - rabbit red blood corpuscles antibodies في مصول مرضى السكري النمط ـ1 مقارنة بالاصحاء اذ استعمل اختبار التحري عن عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب. كان النمطين A وAB اكثر الانماط اظهارا لعياريات عالية ، اذ بلغت في المجموعة A 1949.5 ± 938.7 . اما في المجموعة AB قد كانت 1940.6 ± 1331.3 مقارنة بالاصحاء والتي بلغت 1487.6 ± 1237.5 في المجموعة A و714.7 ± 510.4 في المجموعة AB وكان التحليل الاحصائي ذا شان (قيمة T 35.844 واحتمالية P<0.01) و(قيمة T 167.78 وباحتمالية P<0.01) على التوالي.ان المجموعة Le(a - b+) ارتفعت فيها عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب ، اذ بلغت 1852.9 ± 948.7 في المرضى و1387.3 ± 1192.1 في الاصحاء (قيمة T 51.802 واحتمالية P<0.01).اما عيارية النمط Le(a+b - ) اذ بلغت 1824.8 ± 979.6 في المرضى و1091.1 ± 1088.8 في الاصحاء (قيمة T 40.816 وباحتمالية P<0.01).على حين كانت العيارية للنمط Le(a - b - ) هي 1444 ± 1069.6 في المرضى و1198.6 ± 742.6 في الاصحاء (قيمة T 63.470 وباحتمالية P<0.01). درس مورث الافراز Secretory gene بالنسبة الى عيارية الاضداد، قد كان غير الفارزين ذو عيارية ضادة لكريات دم الارنب عالية مقارنة بالفارزين اذ بلغت في المرضى 2052.6 ± 1557.2 مقارنة بالاصحاء البالغة 1386.7 ± 794.9 (قيمة T 172.65 واحتمالية P<0.01).اما ما يخص مجموعة الدم MNSs ، فقد اظهر النمط MN عيارية مرتفعة والبالغة 1815.3 ± 962.9 وقد افترقت عن مثيلاتها في الاصحاء فكانت 1379.9 ± 1142.5 (قيمة T 162.09 واحتمالية P<0.01).كانت المجاميع O وLe(a - b - ) وLe(a+b - ) ومجموعة الفارزين والانماط MN وSsاكثر Relative risk للمرض اذ بلغت خطورتها النسبية 1.4 و1.7 و1.5 و1.5 و1.4 و2.2 على التوالي. | A total of 126 type - 1 diabetics and an age and sex comparable 100 healthy subjects were studied . The study dealt with finding the frequency of ABO , Lewis , MNSs blood groups in these subjects , besides the frequency of secretors and non - secretors were investigated.Further more , the anti - rabbit antibody immune response among diabetic and healthy subjects was investigated .The frequency distribution of ABO showed the followings :  A significant increase in O - blood group distribution was recorded : 39.68% in patients versus 28% in control (Chi2 7.097 , P< 0.01 ) . A significant decrease in patients A - blood group frequency was seen 20.63% in patients versus 37% in control (Chi2 6.159 , P<0.05 ) . A slight increase in B - blood group frequency in patients was observed (28.57%) compared to control (23%) (Chi2 3.615 , P< 0.05 ) . Likewise , AB - blood group showed a frequency of 11.11% in patients compared to 12% in the control .On the other hand , the frequency distribution of Lewis blood group showed : Le ( a+ b - ) Patients frequency was 30.95% versus 21% in control (Chi2 5.88 , P<0.05 ) . while Le ( a - b - ) gave a patients frequency of 18.25% versus 11% in control ( Chi2 4.6 , P<0,05 ) .Le ( a - b+ ) demonstrated a resistant distribution compared to control .The fraction of secretors among Le ( a - b - ) gave 69.56% versus 45.45% in healthy controls ( Chi2 = 11.6 , P<0.01 ) .The frequency distribution of MNSs blood group showed a role of MN , giving a frequency of 55.55% versus 41% in control (Chi2 = 6.37, P<0.05). Likewise , Ss gave a frequency of 23.80% versus 11% in control (Chi2 = 7.06 , P<0.01 ) .Nonetheless , some MNSs genetic types showed a decreased frequency in diabetics compared to controls .The immunological findings showed that there was an association between blood groups and anti - rabbit red blood cell antibody titers . A and AB were among the groups that gave an increase anti - rabbit red blood cell titers . The mean titer in A was 1949.5 ± 938.7 versus 1487.6 ± 1237.5 ( T 35.8 , P<0.01 ) , while the mean titer in AB was 1310.2 ± 646.3 in patients versus 714.7 ± 510.4 in controls (T 167.78 , P < 0.01).A statistically significant increase in anti - rabbit antibody titers was seen in Le ( a+b - ) and Le ( a - b - ) Lewis blood groups compared to controls .MNSs blood groups genetic types gave an increase in mean MN anti - rabbit antibody titers 1815.3 ± 962.9 versus 1379.9 ± 1142.5 ( T = 162.09 , P<0.01 ) .The relative risk in all blood groups was recorded O , Le ( a - b - ) , Le ( a+b - ) , secretors , MN and Ss showed a relatively increase risk giving a relative risks of 1.4 , 1.7 , 1.5 , 1.5 , 1.4 and 2.2 respectively .The novel findings were discussed based on the available data in the subject

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

Author name: نور شكيب محمد
Supervisor name: ضمياء محمود ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

دراسة مناعية عن علاقة فايروس الخلية العملاقة للمرضى المصابين بسرطان الفم == Immunological study of relation of Cytomegalovirus in patients with Oral Cancer

Author name: نور الهدى علي عبد الحسين سعيد
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعد حسن محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة كبحث باثر رجعي حيث تم اخذ (70) عينة من الانسجة الفموية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البرافين ، جمعت هذه النماذج من ارشيف الانسجة لمختبرات فرع الانسجة والامراض في كلية طب الاسنان / جامعة بغداد . حيث تعود هذه العينات للفترة بين 1998 - 2008.قسمت هذه العينات النسيجية الفموية الى مجموعتين : - مجموعة تضم (60) عينة اخذت من سرطانات الانسجة الطلائية الحرشفية للتجويف الفمي بينما ضمت المجموعة الاخرى (10) عينات نسيجية خالية من الامراض حسب الفحص النسيجي المرضي كنماذج سيطرة.تم تحليل هذه العينات، اخذين بنظر الاعتبار العمر، الجنس، موقع النسيج المصاب، والتمايز النسيجي، ثم صبغت جميعها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين للتشخيص النهائي.كما تم اجراء التشخيص الجزيئي لدنا فايروس الخلية العملاقة في الخزعات النسيجيه قد انجزت بواسطة جيل حساس ومتقدم من التقانة الاحيائية الجزيئية التي لها قابلية التحديد داخل الخلية للاحماض النووية.امتدت هذه الدراسة لتشمل دراسة نسيجية - مناعية بواسطة التصبيغ المناعي لتحديد انتشار البروتين المنتج من الجين المنشط للسرطان ( p53) ، كذلك لتحديد المستضد الموجود على سطح الخلية اللمفاوية نوع(T ) والمسمى (CD8 ) .مجمل النتائج المستحصلة من هذه الدراسة قد صنفت كالاتي : - كانت اعمار المرضى المصابين بسرطان الانسجة الحرشفية الفموية تتراوح بين (10 - 92) سنة وبمتوسط عمري (56،4) سنة . اعلى نسبة شخصت كانت بالفئة العمرية (45 - 75) سنة ، شكلت سرطانات اللسان النسبة الاعلى بين سرطانات الفم الحرشفية كما شكلت ايضا النسبة الاعلى من النتائج الموجبة لفيروس الخلية العملاقة البشري وانتشار بروتينp53 وكذلك للخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ). اكثر من 80% من حالات سرطانات الفم كانت جيدة التمايز، ضمن سرطانات الفم الحرشفية ، 26 عينة اظهرت نتائج موجبة لفايروس الخلية العملاقة البشري بواسطة التقنية الاحيائية عالية الحساسية ( التهجين بالموقع).مثلت هذه النتائج 43،3% من مجموع سرطانات الفم الحرشفية الخاضعة للتحري، في حين من بين المجموعة نفسها ، 55% (33 عينة من اصل 60) اظهرت نتائج موجبة لفحص انتشار بروتين p53 و18،3% (اي 11 عينة من اصل 60) اظهرت نتيجة موجبة لفحص الخلايا اللمفاوية التائية ( CD8).بينما لم يتم تسجيل اي نتيجة موجبة لفايروس الخلية العملاقة ، انتشار بروتينp53 والخلايا اللمفاوية التائية (CD8 ) ضمن مجموعة السيطرة. سجلت حالات ظهور مشترك لانتشار بروتينp53 الطافر مع دنا فايروس الخلية العملاقة في (18،3%) ومع الخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ) في (10%) بينما سجلت هذه الدراسة حالات ظهور مشترك للخلايا اللمفاوية التائية السامة مع فيروس الخلية العملاقة وطفرة الجينp53 في (1،7%) من سرطانات الفم الحرشفية | This study was designed as retrospective study . A total number of seventy (70) formalin - fixed paraffin - embedded oral tissues that were collected from archives of oral Histology and Histopathology department of Dentistry College/University of Baghdad, during the period from October 2008 till April 2009. All the samples are related to the period between 1998 - 2008.These oral tissue blocks were divided into two groups. A group included sixty (60) tissue blocks with histopathologic diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). And another group included ten (10) tissue specimens that were taken from histopathologically healthy oral tissues.All these tissues were analyzed according to age, sex, site and histological grading.Histopathological sections were made for those oral biopsies and stained by hematoxylin and eosin stain for definitive histologic diagnosis.Molecular detection of cytomegalovirus (CMV - DNA) in those tissue blocks were performed by using highly sensitive version of in situ hybridization (ISH) technique.This research work has further perform immunohistochemical study to demonstrate the prevalence of p53 overexpression. This study also was extended to determine the phenotype of cell surface antigen marker, namely CD8+ marker of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal anti bodies to this CD marker.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with oral SCC ranged from (10 - 92) years with mean of (56.4) years. The highest percentage was diagnosed in the age stratum of (45 - 75) years , the tongue was the most commonly affected site by OSCC. And also represents the major site for CMV infection , p53 gene mutation and CD8 positive - phenotyping results.More than 80% of the OSCC have well - differentiated grade , among oral SCC group, 26 archival tissue blocks showed positive - ISH reactions for CMV - DNA by sensitive version of ISH . This constituted 43.3% of the total screened oral SCC tissues.Thirty - three out of sixty oral SCC showed 55% positive IHC reaction indicating p53 overexpression, and 18.3% (11 out of 60) showed positive IHC reaction pointing for presence of CD8 +ve tumor infiltrating lymphocytes. While , none of those tissues in the histopathologically healthy control group showed reaction for CMV - DNA, p53, or CD8 marker.The co - occurrence of mutated - p53 overexpression with positive CMV infection was localized in (18.3%), whereas co - occurrence of p53 gene mutation and CMV infection along CD8 - positive tumor infiltrating lymphocytes in OSCC were documented in (1.7%) of these cancerous specime

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

تاثير مستخلصات اوراق العنب والخروع والبصل في بعض عوامل استعمار انواع بكتريا التهاب الاذن الوسطى في الانسان == Effect of Grape leaves, Caster bean and Onion extracts in some colonization factors of bacterial species isolated from otitis media in human

Author name: نضال عبد الامير علي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 80 مسحة من المرضى المصابين بالتهابات الاذن الوسطى( Otitis media) المراجعين للعيادة الخارجية في مستشفى الصدر العام في بغداد وللفترة من تشرين الثاني 2007 وحتى كانون الثاني 2008. زرعت المسحات على الاوساط الزرعية (اكار الدم واكار الماكونكي) لعزل البكتريا وتشخيصها باستخدام الاختبارات المجهرية ،و الزرعية واالكيموحيوية . امكن الحصول على 69 عزلة بكتيرية من المجموع الكلي (83) وشخصت بكونها تابعة الى الانواع الاتية : (33) عزلة وبنسبة (39.75 %) Pseudomonas aeruginosa ، (11)عزلة (13.2 % ) aureus Staphylococcus ، و(8) عزلات (9.6 %) epidermidis Staphylococcus و(8) عزلات (9.6 %) Proteus mirabilis و( 5 ) عزلات(6.02 % ) تعود الى Klebsiella pneumoniae و(4) عزلات ( 4.8 %) Escherichia coli، في لم تظهر ( 14) مــسحة بنسبة ( 16.86 %) اي نمو بكتيري . اظهرت النتائج ان الاصابات المفردة هي السائدة عندما بلغت نسبتها( 96.2 %) ،بينما بلغت الاصابات المختلطة ( 3 ) اصابات فقط بنسبة (3.7%). كانت نسبة الاصابات في الاناث (57.2%) اكثر منها في الذكور (42.5 %) فيما سجلت اعلى نسبة للاصابة في الفئة العمرية (اقل من سنة - 10 سنوات) .كما تبين ان الاصابة المزمنة بالتهابات الاذن الوسطى هي اكثر شيوعا من الاصابة الحادة . لدى اختبار حساسية العزلات البكتيرية الى (18) مضادا حيويا ، اظهرت نتائج وجود مقاومة تامة (100%) لبكتريا Ps.aeruginosa ضد كل من Carbenicillin ، Doxycyclin وCeftizoxime في حين كانت حساسة جدا لمضادات Amikacin وImipenem وCiprofloxacin سوى عزلة واحدة ،اما الانواع العائدة للعائلة المعوية فكانت Pr.mirabilis وبكتريا E.coli مقاومة بنسبة (100%) لمضاد Doxycyclin دون غيره وعزلات K.pneumoniae مقاومة وبنسبة (100%) لكل من Doxycyclin وGentamycinو Pipracillin ، وكانت جميع عزلات Staphylococcus spp. مقاومة كليا Methicillin وبنسبة (100%) فيما قاومت مضادات Penicillin وAmpicillin وCloxacillin بنسب اقل . انتخبت العزلات البكتيرية وحسب شدة ضراوتها ومقاومتها للمضادات الحيوية التي شملت Ps.aeruginosa وaureus S.و Pr.mirabilisو K.pneumoniaeو E.coliلدراسة تاثير المستخلصات المائية الباردة لثمار البصل واوراق كل من الخروع والعنب في نمو العزلات ،فقد اظهر مستخلص البصل فعالـية ضد Ps.aeruginosaو aureus . Sو E.coliوعند التراكيز (750 , 1000 ,1250 ,1500 ) ملغم /مل ،عندما بلغ قطر منطقة التثبيط لكل من بكتريا aureus . Sو Ps.aeruginosa وE.coli عند تركيز 750 ملغم /مل (13 , 12 , 11) ملم وعلى التوالي . واظهر مـــستخلص اوراق الــخروع فـعاليــة ضـــد Ps.aeruginosa وaureus S. وE.coli وK.pneumoniae عند التراكيز (250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل حيث بلغت اقطار مناطق التثبيط عند التركيز 1000 ملغم /مل 15.66 , 16.33 , 16.33 , 15.33 ) ) ملم وعلى التوالي . في حين اظهر مستخلص اوراق العنب فعالية ضد جميع الانواع البكتيرية المختبرة وفي التراكيز(250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل ، عندما بلغت اقطار مناطق التثبـــــيط عند التركيز 1000ملغم/مل لكل من بكتريا aureus. S وPr.mirabilisو Ps.aeruginosaو E.coli وK.pneumoniae (32 ,21.3 , 20.6 , 18.6 , 14.3) ملم وعلى التوالي . وكان المستخلص المائي البارد لاوراق العنب هو الاكفا في تاثيره مقارنة بمستخلصات البصل واوراق الخروع . تم اختبار قابلية الانواع البكتيرية المنتخبة على الالتصاق على الخلايا الطلائية قبل وبعد المعاملة بالتركيز تحت المثبط الادنى للمستخلصات النباتية، فقد اظهر التركيز تحت المثبط الادنى للبصل تاثيرا مثبطا للالتصاق الانواع Ps.aeruginosa وaureus . Sو E.coli عندما قلل عدد الخلايا البكتيرية الملتصقة من ( 56.8 , 48.9 , 24.7 ) وعلى التوالي ليصبح (11.6 , 08 21 , 15.3)على التوالي. اظهر مستخلص اوراق العنب تاثيرا مثبطا لالتصاق الانواع المختبرة Ps.aeruginosaو aureus . Sو Pr.mirabilis وK.pneumoniaeوE.coli عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة بعد المعاملة بالمستخلص ( 12.8, 14.8, 8.3 , 16 ,12.8 ) وعلى التوالي ،اما مستخلص اوراق الخروع فقد قلل عدد الخلايا الملتصقة للانواع Ps.aeruginosa وaureus S. وK.pneumoniae وE.coliمن (56.8 , 48.9 ,46.8 ,24.7) لتصبح ( 7 , 13.6 ,4.2 ,4.5) وعلى التوالي ، كان هذا المستخلص الاكفا لتثبيط التصاق الخلايا البكتيرية بالخلايا الطلائية . | Eighty swabs were collected from patients suffering from otitis media who attended Al - sader hospital in Baghdad during November 2007 to January 2008. Swabs were cultured on blood agar and MacConkey agar media to isolate bacteria and to diagnose by microscopic cultural and biochemical testes. Ninety six isolates were isolated and identified to species as follows : (33) isolates (39.75)% were Pseudomonas aeruginosa, (11) were S.aureus with a ratio of (13.2)% and (8) isolates with a ratio of (9.6)% were S.epidermidis .(8) isolates with ratio (19.6)% were Proteus mirabilis, while (5) isolates were Klebsiella pneumoniae with a ratio of ( 6.02) % and (4) isolates with ratio (4.8)% Escherichia coli, However (14) swabs with a ratio of (16.86)% with no growth. Results showed that the infections by a single pathogen were the dominant was reached 96.2%, while the mixed infection was only (3.7)%. The infection in female were 57.2% , while in male were 42.5%. However ,the high percentage of infection were observed within the age range of less than year to ten years . Morever the chronic infection with otitis media were more dominant than the acute infection. Sensitivity of the isolates towards (18) antibiotics were performed. The results showed complete resistance (100%) of Pseudomonas aeruginosa to Carbenicillin, Doxycyclin and Ceftizoxime, while they were sensitive to Amikacin, Imipenem and Ciproflaxcin , except one isolate. Proteus mirabilis and Escherichia coli isolates were (100 )% resistant to Doxycyclin, while Klebsiella pneumoniae isolates were completely resistance (100%) to Doxycyclin , Gentamycin and Pipracillin. All Staphylococcus spp. isolates completely resisted Methicillin (100%) , but resisted Penicillin , Ampicillin , Cloxacillin at less ratios. Bacterial isolates which included Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae ,E.coli were chosen according to their virulence factors and resistant to the antibiotics , to be used for studying the effect of cold - water extracts of Allium cepa (Onion) ,Ricinus communis leaves(Caster bean) and Vitis vinifera leaves(Grape) on bacterial growth ,and adherence to epithelial cells of human . Allium cepa extracts showed activity against Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli at concentration of (750, 1000, 1250, 1500)mg/ml when the diameter of inhibition zones for S.aureus , Ps.aeruginosa, E.coli at (750)mg /ml were (13 ,12 ,11)mm, respectively . The Ricinus communis leaves extracts showed activity against Ps.aeruginosa , S.aureus , E.coli and K.pneumoniae at concentration of ( 250, 500, 750, 1000)mg /ml with diameters of inhibition zones at 1000mg/ml (15.33 ,16.33 ,16.33 ,15.66) mm , respectively. While Vitis vinifera leaves extracts showed activity against all tested bacterial species in concentrations of (250 ,500 ,750 ,1000)mg/ml with inhibition zones at 1000mg/ml concentration for S.aureus, Pr.mirabilis, Ps.aeruginosa, K.pneumoniae, E.coli (32 ,21.3 ,20.6 ,18.6 ,14.3) mm , respectively . Result showed that the cold - water extract of the Vitis vinifera leaves was the most efficient in its effects on bacterial species in comparison with Allium cepa and Ricinus communis extracts . The ability of chosen bacterial isolates for adherence before and after the treatment with sub - minimum inhibition concentration of plant extracts showed the sub - MIC for Allium cepa extract reduced the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli when the adhered bacterial cells decrease from (56.8 ,48.9 ,24.7) to be (11.6 , 21.08 ,15.3) , respectively. Vitis vinifera extract showed inhibition effect on the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae and E.coli when the average of adhered cells after the treatment with the extract were (12.8 , 14.8 , 8.3 , 16 , 12.8) , respectively . Ricinus communis leaves extracts decrease numbers of the adhered cells of Ps.aeruginosa , S.aureus , K.pneumoniae , E.coli to epithelial from ( 56.8 , 48.9 , 46.8 , 24.7) to be ( 7 , 13.6 , 4.2 , 4.5) , respectively

التحري وراثيا عن انتاج بعض انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية من بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Genetics Detection of Metallic and Extended spectrum Beta - Lactamase production from Klebsiella pneumoniae Isolated from different clinical sources

Author name: نبا علي جاسم
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 1600 عينة سريرية من مرضى يعانون من التهابات مختلفة ، توزعت ما بين 1500 عينة ادرار و100 عينة قشع, ومن خلال نتائج الفحوصات الزرعية والفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية ، شخصت 53 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella spp تضمنت 44 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و6 عزلات تعود للنوع K.oxytoca و3 عزلات تعود للنوع K.planticola .اختبرت حساسية عزلات بكتريا K.pneumoniae لـ 15 مضادا حيويا شملت على : Aztreonam وAmpicillinو Amikacinو Ceftriaxoneو Cefotaxime وCeftazidime[ Amoxicillin / Clavulanic acidو Meropenemو Imipenemو Ciprofloxacin Kanamycin وPipracillinو Cefepimeو CarbenicillinوStreptomycin,] . تم التحري عن انتاج هذه العزلات لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية ، اذ استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وثلاث طرائق للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية ،وتم الحصول على خمس عزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وعزلة واحدة منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية وكانت العزلات المنتجة لهذه الانزيمات تحمل مقاومة عالية للمضادات الحياتية AztreonamوCeftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وCarbenicillin وPipracillin وAmpicillinبنسبة 100%. تم تحديد التركيز المثبط الادنى(MIC) Minimum Inhibition Concentration باستخدام طريقة تخفيف الاكار القياسية،وقد اظهرت العزلات قيمة MIC عالية اتجاه المضادات قيد الدراسة (Ceftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وImipenem) اذ تراوحت القيم للعزلات المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميزالواســعة الطــيف(K22,K26,K28,K29,K36) من g/mlµ(0.1 - 0.05) لمضاد Imipenem وg/mlµ (256 - 32) لمضاد وg/mlµ (1024 - 256) لمضاد Ceftriaxone وg/mlµ (1024 - 128) لمضاد Cefotaxime. اما العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية K8 فقد كانت قيمة MIC لهg/ml µ ( 64 ,512,1024, ( 512 للمضادات (Imipenem , Ceftazidime , Ceftriaxone , ( Cefotaxime على التوالي.تــمـــت دراســــة المــحتــوى البلازمـيـــدي للــعــزلات الســـتة المنتخبة (K8, K22, K26, K28, K29, K36) واظهرت نتائج الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز امتلاك العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية (K8) حزمة بلازميدية في حين تباينت العزلات الخمسة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ، اذ احتوت العزلتين K22 وK26 على ثلاث حزم بلازميدية ، بينما العزلة K36 على حزمتين بلازميدية في حين احتوت العزلتين K28 وK29 على حزمة واحدة فقط. اظهرت نتائج معاملات الدنا البلازميدي باستخدام مادتي Ethidum Bromide وSDS عدم قدرة مادة SDSعلى تحييد الحزم البلازميدية، في حين كان Ethidum Bromide محيدا كفوءا عند التركيز g/mlµ (512 - 1024 ).تم استخدام تقنية (PCR) Polymerase Chain Reaction للتحري عن امتلاك العزلات قيد الدراسة على الجينات التي تشفرالى انتاج انزيمات ESL وML وباستخدام طريقة الاستخلاص السريعة (الغليان) وطريقة المستعمرة المباشرة كقالب الدنا وباستخدام بادئات متخصصة لاستهداف الجين shv - bla والجين bla imp - 1. اظهرت العزلات المنتجة لانزيمات ESLجميعها امتلاكها للجين shv - bla وبنسبة %100 ولكن العزلة المنتجة لانزيمات IMP اعطت نتيجة سالبة، كما اظهرت طريقة الاستخلاص بواسطة الغليان كفاءة عالية كقالب للدنا، مقارنتا بطريقة المستعمرة المباشرة. | The study included (1600) clinical samples from Patients suffering From different infections distrubated between (1500) urine and (100) sputum. Morphological ، biochemical tests and use Api 20 E system were employed to diagnose bacterial species and the result showed they were (53) isolates of Klebsiella spp.included(44) K. pneumoniae. (6) K. oxytoca and (3) isolates of K. planticola. Antibiotic susceptibility for K. pneumoniae isolate was performed against 15 antibiotic using disk diffusion method. Disc approximation method was used to detect production of ESLs , and three methods used to detect production of MLs.Results indicated that 5 isolates produced ESLs and only one isolate produced MLs, they isolates which produced ESLs were have highly resistant to antibiotic (100)%to [Aztreonam, Ceftriaxone, Cefotaxime, Ceftazidime, Ampicillin, Pipracillin, Carbenicillin]. Agar dilution method was used for the determination of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for the ESLs and MLs producing isolates. The result showed high resistance to Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem and Ceftazidime. The value of MIC of isolates producing ESLs(K22,K26,K28,K29,K36) were (0.05 - 0.1) µg/ml to Imipenem antibiotic, Ceftazidime (32 - 265) µg/ml, Ceftriaxone (256 - 1024) µg/ml and Cefotaxime (128 - 1024) µg/ml, while the isolate producing ML(K8) showed MIC value (64, 512, 1024, 1024) µg/ml respectively. The plasmid content of six isolates (K 8, K 22, K 26, K 28, K 29, K 36) were studies، the result of revealed electrophorsis in agar gel that the isolate K8 have one plasmid, while isolates produce ESLs differs on plasmid content,in our side K22, K26 have three plasmid, K36 have two plasmid and K28, K29 have one plasmid. Curing was conducted by the use of SDS and ethidum bromide ، and the results showed that the isolates lost the plasmids at concentration (512 - 1024) g/mL of ethidum bromide. Polymerase chain reaction technique was performed for the detection ESLs and ML, DNA template that used for PCR reaction was prepared by using boiling method and the Direct colony method, by using SHV to detect ESL and IMP - 1 to detect MLs. The results showed that all isolates were 100% harboring blashv while blaIMP - 1 gave negative result.also the extraction by use boiling method showed high efficiency compare with direct colony method.

تاثير بعض العوامل الفيزيائية والكيميائية في الشكل المظهري والامراضية لخميرة Candida albicans == Effect Of Some Physical And Chemical Factors In Morphology And Pathogenicity Of Candida albicans

Author name: ميس قيس علي
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | رباب قاسم صقر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included isolation and identification Candida albicans from different sources ,We obtained (26) isolates of Candida albicans of the total (115) samples which included (60) clinical samples of children who suffer from inflammatory in the Area of diapers in the children Protection Teaching - Hospital in The Medical City hospital and Alalweia hospital in Baghdad ؛(50) soil samples from Nurseries and gardens and corrals , )5) dried milk samples in the period between January2012to April2012 . We obtained (20) isolates C. albicans from the clinical samples; (5) isolates from soil samples and only one isolate from the dried milk samples.All isolates have been cultured on a differential mediums to diagnosis and identify C. albicans from the other species . Biggy agar, Candida medium, Candida BCG ,Corn meal agar involved in the isolation and identification of the C. albicans. Candida diagnosed based on the phenotypic characteristics of the developing colonies.All isolates was involved to microscopic examinations for the purpose of examining the phenotypic characteristics of C. albicans cells as well as to examine the germination tube formation, The diagnosis also includes the use of biochemical methods such as fermentation and assimilation behavior of Candida , API20cAUX System and ability of Candida to produce Proteinase in Skim milk agar and Blood agar.The second axis of the current study included investigating about white - opaque phenotypic switching, (20) clinical isolates (5) soil isolates (1) milk isolate showed ability to transition from white to opaque ,also we found the results of phenotypic transition ratios of the colonies grown on modified Lee’s mediums by adding Glucose or N - acetyl glucosamine in different incubation conditions involved the aerobic condition and presence of CO2, at (25)°c and (37)°c during (1,2,5,and 10) days. the results of transition ratios and the overlap between the factors compared statistically. the study found that the ratio reached a maximum at physiological temperature (37 o C) in the presence of N - acetylglucoseamine and 1% CO2 . in the aerobic condition at (37o)C with presence of N - acetylglucoseamine the results show a significantdifference at the duration between the 1st and 2nd day, and no significant difference on the dried milk isolate . The results of 5th and 10th days do not show significant difference in any isolates which due to the saturation condition when cell do not affect a change in the metabolic activity, so it dispense with N - acetylglucoseamine who induce the swathing only for a short duration.Further study the morphology of C. albicans with transmission electron microscope (TEM) and the virulence of the white and opaque colony of C. albicans. The histopathological study of the liver, the spleen and the kidneys of injected mice (Balb/c) showed several changes in the tissues, two concentration of yeast suspension (1.5 x 108) cells/ml and (3x 108) cells/ml prepared by McFarland method are used, the injection with the white the phenotypic (1.5 x 108) showed necrosis in the renal tubule and mononucleosis filtration in the tissue of the kidney, also simple filtration to the inflammatory cell in liver and a replication and necrosis in the lymphatic tissue of the spleen .The white the phenotypic (3x 108) showed a necrosis in the lymphatic tissue of the spleen and a filtrationto the Megakaryocytes, acute necrosis in liver cells and a filtration to the inflammation near the hepatic portal veins and a acute renal failure combined with mononucleosis filtration in the kidney ,On the other hand the opaque cells injection (3x108) cells/ml has caused a simple necrosis in tissues of the liver, spleen and the kidneys while the opaque cells (1.5 x108) cells/ml has no effective virulence and the tissue diagnosed as a normal.
1 ... 16 17 18 19 20 ... 35