Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 1,123

انتاج وتنقية اللكتين من بكتريا Acinetobacter baumannii المعزولة من القشع وتاثيره في بعض الاحياء المجهرية خارج الجسم الحي

Author name: رونق مهدي هاشم
Supervisor name: ساهرة نصيف مسلم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to isolate Acinetobacter baumannii , 104 samples of sputum were collected from patients infected with respiratory tract infections, from Teaching Baghdad Hospital / Medical City, General Teaching Al - Kindi hospital and Al - Imam Ali Hospital . Depending on microscopic , cultural and biochemical tests ,23 isolates belonge to it were obtained.The ability of A.baumannii isolates to produce lectin was detected by using glass slide and microtiteration plates methods and the results showed that all the isolates were able to produce lectin , A.baumannii S12 was the best isolate for produce it and the blood group O was the best for detection the titration of agglutination activity.The optimum conditions for lectin production were determined and the results showed that the cultivation of A.baumannii S12 in Colonization Factor Antigen medium with pH value of 7.2 at 37 ºC for 24 hours in shaker incubator at 100 rpm / min. were the best to produce it. The lectin was extracted from cilia of A.baumannii S12 isolate by using six different breaking methods at different times , the glass beads method for 50 minutes was the best to extract it, the agglutination activity reached to 512 AU / ml with specific activity 174.14 AU / mg protein in comparison with other breaking methods. Lectin was purified by three steps, included ; precipitation by 35% saturation ammonium sulfate , ion exchange chromatography by DEAE - cellulose, then gel filtration chromatography by Sephadex G - 150. The final lectin recovery was 36.92% with 20.63 folds of purification and 3592 U / mg protein of specific activity .The purified lectin was also partially characterized and the results showed that the optimal activity of the lectin was at 30 ºC and its thermostability was between (10 and 30) ºC ,the optimum pH for lectin activity was 7.2 while the pH value for its stability was between 7 and 7.2 . Lectin retained whole activity when treated with sucrose, raffinose, maltose, mannitol, fructose, lactose, arabinose, ribose and rhamminose, while it lost whole activity when treated with glucose , mannose and galactose. Also, lectin retained whole activity when treated with EDTA - NaN3 and trypsin , whereas its agglutination activity was reduced to the half when treated with pepsin , and to 12.5% and 0.39% when treated with 2 - mercaptoethanol and formalin, respectively. In addition, the effect of some substances on lectin stability was studied and the results showed that the mixture of 2% glycerol and physiological normal saline followed by 20% ammonium sulfate were the best for its stability for 20 and 10 days, respectively. while the solutions of the rest materials(Tween - 80, mannitol, sucrose, lactose and SDS) showed inhibitory effect on lectin activity.Also, the antimicrobial activity of purified lectin against 12 bacterial and fungal isolates was studied and the results showed that the lectin had antibacterial activity against Klebsiella pneumonia , Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis with (50 , 38.88 and 36.84 )% of inhibition, respectively, and antifungal activity against Penicillium spp. , Cladosporium spp. and Fusarium spp. with (33 , 18.75 and 17.39 )% of inhibition, respectively. whereas ,it had no antimicrobial activity against the bacteria; Escherichia coli , Enterobacter cloacae ,and Staphylococcus aureus ,and the fungi ; Aspergilus niger, Aspergilus terius , and Candida albicans.

تاثير عديد سكرايد بعض الضروب المصلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa على خلايا السائل البريتوني للفار الابيض == Effect of polysaccharide of some serotypes of Pseudomonas aeruginosa on peritoneal exudates cells of white mouse

Author name: رواء عبد الامير عبد الجبار
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اظهرت تاثيرات عديد سكرايد الزائفة الزنجارية Pseudomonas aeruginosa تاثيرا متباينا على الخلايا المناعية لجوف الفار السويسري. استخلص عديد السكرايد من ضروب مصلية مختلفة للزائفة الزنجارية وتم حقنه داخل الجوف البطني للفئران بجرع مختلفة وبفترات مختلفة. فقد كان تاثير الضرب المصلي O3 واضحا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة Large Lymphocytes اعتمادا على الجرعة والوقت ، وكان هذا الضرب متميزا في تحفيزه للخلايا الرغوية Foam cell ايضا ابتداءا من اليوم الثاني للتحفيز .كان الضرب O6 غير قادرا على تحفيز الخلايا الرغوية Foam cells ، الا انه تميز في حثه للخلايا البدينة Mast cells . اما الضرب O9 فقد كان محفزا جيدا للخلايا اللمفاوية الكبيرة ومتماثلا مع الضرب O6 في عدم تحفيزه للخلايا الرغوية ، في حين كان الضرب O11 قويا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة والخلايا الرغوية ومعتمدا على الجرعة والوقت ، اذ بلغ معدل اعداد اللمفاويات الكبيرة بجرعة 50 مايكروغرام/ مل ( 41.867 ±4.277) مقارنة بالسيطرة (11.867±0.611).تميز الضرب O16 في تحفيزه الكبير للخلايا البدينة فقد كانت اعدادها النسبية في اليوم الاول وبجرعة 20مايكروغرام/ مل وبجرعة 50 مايكروغرام /مل فقد بلغت (20.067±051.4) ، (320.53±70.75) على التوالي مقارنة بالسيطرة (001.4±60.34) ، وفي اليوم الثالث بلغت الاعداد نسبة عالية اذ بلغ تحفيز الجرعة 50 مايكروغرام/ مل من عديد سكرايد هذا الضرب (23.267±1.102) مقارنة بالسيطرة (71.66±0.643). استطاعت البكتريا المقتولة من تحفيز خلايا الجوف المناعية التي تباينت ضروبها المصلية في ذلك. نوقشت النتائج في ضوء المعلومات المتوفرة التي تتعلق بتاثير عديد سكرايد هذه البكتريا على الخلايا المناعية البطنية لجوف الفار واهمية عديد السكرايد هذا كمحددة بكتيرية مهمة في الاستجابة المناعية وامراضية هذه البكتريا.

تحديد قابلية بعض النباتات المحلية على مقاومة وازالة النفط الخام من التربة == Determination the Ability some of Local Plants on Resistance and Removal the Crude Oil from S

Author name: داوود سالم عيدان عبد النبي الطائي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: زرعت خمس بذور كلا من النباتات التالية : جت Medicago sativa، شعير Hordeum vulgatis، ذرة Zea mays، ماش Vigna radiata، خيار Cucumis sativa، برسيم Trifolium astivum ولوبيا Vigna sinensis وشوفان Avena sativa وريحان Osmium basilicum في البيت الزجاجي في اصص معامــلة بتـــراكيز (0 ،22.5 ،45 , 80) غم نفط خام/ كغم تربة جافة, وبعد 34 يوم من بدء الزراعة تم اجراء عدة اختبارات : حساب نسبة الانبات, اطوال النباتات , الحجم العلوي للنبات , سرعة الانبات ومؤشر تحفيز الانبات, حيث اظهرت النتائج مقاومة النبات لتراكيز النفط ضمن درجات متفاوتة وبالترتيب من الاكثر مقاومة ( اقل حساسية) الى الاقل مقاومة (الاكثر حساسية) : الجت، الشعير, ذرة, ماش, خيار,برسيم, لوبيا واظهرت ان الشوفان والريحان على الترتيب اكثر حساسية لتراكيز النفط المستعملة, كما تم قياس كمية CO2 المتحررة من جذور الشعير وجذور الريحان بعد اسبوع من بدء التجربة للجذور الماخوذة من اصص غير ملوثة ومن اصص تركيز النفط فيها 22.5 غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف بعد 34 يوم من بدء الزراعة لكل منهما, تبين ان كميةCO2 المتحررة خلال جميع الايام السبعة وللمعاملتين لنبات الشعير اعلى من كمية CO2 المتحررة لنبات الريحان. ولمعرفة قابلية النباتات المقاومة النامية سابقا في تحسين التربة تم زراعة 5 بذور من بذور النباتين الحساسين كلا على حدا بعد 34 يوم من بدء الزراعة في اصص مزروعة سابقا بنباتات المقاومة لتراكيز النفط المختلفة , اظهرت النتائج بعد اجراء اختبارات نسبة الانبات وحجم النبات على نباتي الشوفان والريحان اظهرت ازدياد في نسبة الانبات حيث كان الانبات الاولي للشوفان وللريحان على الترتيب في المرة الاولى( اصص غير مزروعة سابقا ) ضمن تركيزي (22.5،45 ) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف ( 29%, 19% ), (25 % , 17.1% ) على الترتيب, في حين في الزراعة الثانية ( اصص مزروعة سابقا ) كانت نسب الانبات لهما على الترتيب وضمن تركيزي (22.5، 45) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف (72 %, 70 %), (74 %, 69 %) وهذا التحسن كان في حجم الجزء الخضري لهما ايضا. | Phytodegredation of crude oil in artificially contaminated soil, I used 4 concentration of crude oil in the following plants : alfalfa, barely, clover, Basil in the different concentration, after 34 days of starting the plants we measured length of plant and promoter indicator and speed of germination we showed from these tolerant plant and sensitive plant, after that we measured CO2 liberated from root soil exactly from Barely and Basil after that we planted the soil that was previously planted in the farmer plant we showed from that improvement in the growth of plant and anther criteria that was refer to improve in the soil.

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

Author name: خولة جبر خلف المحمداوي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

دراسة اولية لتقدير فعالية مواد (نباتية ، كيمياوية ، مستضدية) في خمجية طفيلي الاكياس المائية في محاولة لاستخدامها علاجيا == Primitive study to determine material efficiency) plant , chemical , antigen ( in Echinococcus granulosus infection as an a tempt to curing application

Author name: خلود ناجي رشيد التكريتي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ندى محمد طه البشير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة علاج مرض الاكياس المائية Hydatidosis المتسبب عن الطور اليرقي للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus اذ تضمنت محورين : - الاول : علاج المـــرض كـــدواء وشمـــل جانبيـــن : .1 استخــدام مســـتخلصين نباتييـــن مائييــن ( اوراق الاس Myrtus communis وبــذور الحبـــة الســـوداء Nigella sativa ) ..2 استـــخــــدام مستحضـــر كيمياوي ( عقار S2 - Complex) . فقـد درس تاثير المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في حيوية الرؤيسات الاولية Protoscolices لطفيلي E. granulosus خارج الجسم in vitro وبواقع خمسة تراكيـز لكل منهم تراوحت ما بيـن (30 ، 35 ، 40 ، 45 ، 50) ملغم/مل للمستخلصيـن النباتييـــن و(2.3 ، 3.3 ، 4.3 ، 5.3 ، 6.3) ملغم/مل للعقار ، كما درسـت فعالية وقدرة المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في السيطرة على خمجية الطفيلي داخـل الجسـم in vivo وبواقـع تركيزين لكـل منهـم تراوحت ما بيـن } (12,6) ، (25,12) ، (0.36,0.18) { ملغم/مل من مستخلص اوراق الاس وبذور الحبة السوداء والعقار S - 2 على التوالي .الثاني : علاج المـــرض كلقاح : حيث تـم استخلاص مستضدين من الطور اليرقي للطفيلي موضوع البحث ، هما مستضد سائـل الكيـس المائـي Hydatid cyst fluid antigen ومستضـد طبقات جدار الكيـس المائـي Hydatid cyst wall layers antigen فـي محاولـة لتمنيــع الفئــران المختبرية ضد الخمج بالاكياس المائية . وتم تقييم حدة الخمج بدلالة بعض المقاييس الحياتية مثـل : معـدل عـدد وقطـر الاكياس المائيـة الثانويـة والنسبـة المئويـة لاختزالها وقياس مؤشـر تضخـم الطحال والكبـد وقياس معـدل الفعاليـة الانزيميـة لانزيمي (ADA) Adenosine deaminase و(ALP) Alkaline phosphatase كمؤشرين كيميائيين حياتيين لحالة الخمج ولفترات زمنية معينة وكذلك الفحص النسيجي للكبد والطحال والكليـة والرئـة . وقـــد اظهـرت نتائج الدراسة خارج الجسـم in vitro ان المستخلص المائـي لاوراق الاس كان الاكثر فعالية في ايقاف حيوية الرؤيسات الاولية يليه المستخلص المائي لبـذور الحبـة السـوداء ثـم العقار S - 2 عنـد استخـدام التراكيـز المختلفـة لكـل منهــم مقارنــة بحالـة السيطـرة ، فــي حيـن اظهـرت نتائج الدراسة داخل الجسم in vivo قـدرة العقار S2 - Complex فـي الحـد مـن انتشار الاكياس المائية الثانوية من خلال تثبيط اعدادها واحجامها في الكبد والاحشاء الداخليـة ، يليـه المستخلص المائي لاوراق الاس ثم المستخلص المائـي لبـذور الحبـة السـوداء من حيث القدرة التثبيطية للخمج مقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة . اما نتائج استخدام المستضدين المستخلصين مــن الطـور اليرقـي فقـد اظهرت كفاءة مستضد سائل الكيس المائي HF في رفع القوة التمنيعية من خلال قدرة الفئران على توجيه مقاومة فعالة ضد الخمج فكانت النسبة المئوية لاختزال عدد الاكياس المائية (100)% اي انه اعطى مناعة تامـة ضد الخمج ، في حين ان مستضد طبقات جدار الكيس المائي HCL اعطى نسبة اختزال (94.37)% ، وقد جرى استخدام معدلين مناعيين لاغراض السيطرة : هما لقاح الســل البقــري (BCG) Bacilli Calmette Guerin ومادة النشا Starch ، فقـد اظهر لقاح BCG نسبة اختزال لاعداد الاكياس المائية الثانوية بلغت (53.83)% في حين اظهـرت مادة النشا نسبــة اختـزال بلغت (21.29)% قياسا لمجموعة السيطرة الموجبة . وبشكل عام فالنتائــج المستحصلــة تشيــر الــى القــدرة العالية للعقار S2 - Complex فـي تثبيـط تطـور الاكياس المائيـة الثانويـة ، كما تظهـر الفعالية الكبيـرة لمستضـد سائـل الكيـس المائي وكفاءته العالية في تحفيز مناعة تامـة ضد الخمج ، مما يوحي بامكانية استخدامها مستقبلا في الوقاية ضد مرض الاكياس المائية اذا ما تبعت هذه الدراسة بدراسات تطبيقيـة اخرى فـي مضائـف اخـرى . | This study aimed treat the Hydatidosis disease caused by larval stage of the Echinococcus granulosus. It included two axes : First : treatment of the disease using medicine which involved two aspects : A) Using water extracts of two plants (leaves of Myrtus communis,seeds of Nigella sativa).B) Using chemical substance (S2 - Complex drug) .The effect of those two extracts and the drug had been studied on the protoscolices viability for E. granulosus in vitro using five concentrations for each of them ranging between (30,35,40,45,50) mg/ml for the two plants extracts and (2.3,3.3,4.3,5.3,6.3) mg/ml for the substance . The effectiveness and ability of the two extracts and substance were studied in order to control the infection in vivo using two concentrations for each ranging between[(12,6),(25,12),(0.36,0.18)] mg/ml for the leave extracts of M. communis , seed extracts of N. sativa and the drug S - 2 receptively .Second : treatment of the disease using vaccine : Two antigens were extracted from the larval stage of the parasite under study. Those are hydatid cyst fluid antigen (antigen HF)and hydatid cyst wall layers antigen (antigen HCL) this was in an attempt to immunize laboratory mice against infection with Hydatidosis This study evaluated the infection intensity by using some biological standards as : The average number and diameter of hydatid cysts and its reduction percentage ratio ; measuring the indicator of liver and spleen hypertrophy ; measuring the average of the enzyme activity for Adenosine Deaminase (ADA) and Alkaline Phosphatase (ALP) as biochemical indicators for the infection state , during a period of time, in addition to tissue investigated for liver, spleen, kidney and lung .The conclusion of this study represented that the extract of M. communis was the most effective to stop the protoscolices viability ; followed by the extract of the N. sativa and finally the drug S - 2 when different concentrations were used for each of them compared with the control state. Whereas the results in vivo presented the ability of S2 - Complex drug to limit the distribution of hydatid cysts by inhibition their numbers and volumes in the liver and the visceral organs followed by water extracts of M.communis and water extracts of N. sativa according to the inhibition ability for infection compared to the positive control group. However the results of uses antigen extracted from the larval stage showed efficiency of antigen HF to increase immunization strength through mice capability having an active resistant against infection . The percentage of reducing the number of hydatid cysts was (100)% . It means that this antigen give absolute immunization against infection . However the antigen HCL gave a reduction ration (94.37)% . Then we used two immunomodulators as a control, They are BCG vaccine and Starch, The BCG vaccine present a reduction ratio for the hydatid cysts numbers reached (53.83)% while Starch represent a reduction ratio reached (21.29)% compared with the positive control group .Generally the results indicated to the S2 - Complex high capacity in frustrating the development of the hydatid cysts. Also it showed the large activity of antigen HF and its high capability for catalysis absolute immunity against infection. This can be used in prevention against the Hydatidosis disease if this study followed by another application studies in other fields .

دراسة بكتيرية ومصلية لمسببات ذات الرئة المكتسب من المجتمع لدى المصابين بالانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological and serological study for causes of community acquired pneumonia in COPD patients

Author name: خديجة شعبان المزوري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة (100) مريض من المصابين بالانسداد الرئوي المزمن والذين يعانون من التهاب ذات الرئة والمشخصين سريريا وشعاعيا في مستشفى بغداد التعليمي من قبل اطباء اختصاص بالاعتماد على العلامات والاعراض السريرية, الفحص الشعاعي وفحص وظائف الرئة. خلال المدة الزمنية 15/9/2001 - 15/4/2002.تم جمع (83) عينة قشع من هؤلاء المرضى, ثم تم قبول (76) عينة لانها كانت ضمن المواصفات المطلوبة والمتضمنة عدد الخلايا القيحية وعدد الخلايا الظهارية, ورفضت (7) عينات لانها لم تكن ضمن المواصفات المطلوبة.تم جمع عينات المصل من جميع المرضى لغرض الكشف عن الاستجابة النوعية للاجسام المضادة نوع IgM, كما شملت الدراسة (50) عينة دم سحبت من اشخاص اصحاء لا يعانون من اصابات تنفسية.تم زرع عينات القشع على اوساط زرعية مختلفة لغرض عزل وتشخيص البكتريا, في حين استخدم نظام API للتشخيص النهائي للبكتريا المعزولة وقد اظهرت نتائج التشخيص ان بكتريا Moraxella catarrhalis كانت باعلى بنسبة اذ بلغت (%13.8), ثم تلتها بكتريا Klebsiella pneumoniae (%12.1) وبكتريا Pseudomonas aeroginosae (%10.3). في حين بلغت نسبة الاصابة ببكتريا Streptococcus pneumoniae (%6.9) وبكتريا (%5.2) Haemophilus influenzae وعند اجراء التشخيص المصلي باستخدام الالايزا (ELISA), اظهرت النتائج ان بكتريا Chlamydia pneumoniae شخصت بنسبة (%31) ثم تلتها بكتريا Mycoplasma pneumoniae التي بلغت نسبتها (%17.2).وفي محاولة للتفريق بين ذات الرئة النمطي وغير النمطي تم استخدام بعض المقاييس مثل ( معدل ترسيب كريات الدم الحمر, العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, بروتين التفاعل, قياس الاستجابة المناعية الموضعية).اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود تاثير معنوي فقط عند استخدام العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, وقياس الاستجابة المناعية الموضعية. ولدراسة عوامل الخطورة الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل العمر, الجنس, وبعض الظروف الملازمة للاصابة. دلت النتائج على وجود زيادة في نسبة اصابة الذكور عما هي عليه في الاناث, اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 2.وكان للعمر تاثير مختلف على المسببات البكتيرية, فقد ارتفعت نسبة الاصابة ببكتريا C. pneumoniae وبكتريا M. catarrhalis مع الزيادة بالعمر, في حين انخفضت نسبة الاصابة ببكتريا M. pneumoniae مع تقدم المريض بالعمر.كما دلت النتائج الى وجود علاقة ذات اثر معنوي بين الاصابة ببعض المسببات البكتيرية وبعض الظروف الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل (التدخين, داء السكر, اصابات رئوية سالبة, القصور الكلوي المزمن). | This study enrolled (100) patient with clinical and radiological evidence of Pneumonia through the period extending from 15/9/2001 - 15/4/2002, who were admitted to Baghdad Teaching hospital, with chronic obstructive pulmonary disease diagnosed by a physician based on clinical, radiological and pulmonary function test.Sputum sample were collected from (83) patient, (76) were processed after fitting criteria for selection which included number of pus cells, number of epithelial cell and Gram stain for primary bacterial identification. Seven samples were rejected for not fitting criteria of selection.Serum sample for detection specific antibody response, were taken for the whole patients.More over 50 serum sample were taken as a control for immunological tests.Proper sputum samples were cultured for the isolation of bacteria, API system was used for the identification of bacteria.From the bacteria isolated M. catarrhalis was the most commonly diagnosed bacteria which is found to be (13.8%) of the total bacteria. Followed by Gram negative bacilli K. pneumoniae being (12.1%) and P. aeroginosae (10.3%) Streptococcus pneumoniae (6.9%), H. influenzae (5.2%).As for immunological diagnosis, C. pneumoniae was diagnosed for (31%) of the cases, followed by M. pneumoniae (17.2%). In an attempt to evaluate parameters that might be useful to differentiate Typical from Atypical pneumonia, ESR, CRP, total WBC count and IgA local immune response were evaluated.Significant difference was detected only in total WBC count and IgA local immune response.Finally to detect possible effect of comorbid condition on bacteria previous age, sex, and other comorbid illness were studied. Males were affected more than female, age show variable effect on different bacterial infection.Smoking, diabetes mellitus, old pulmonary diseases, chronic renal disease, were among the most common and significant factor that affect community acquired pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease

مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus المعزولة من اخماج الحروق والجروح للمضادات الحيوية وبعض المطهرات == Resistance of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus isolated from Burns & Wounds infections to Antibiotics and some Disinfecta

Author name: ختام علي عبيد الخزعلي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 235 مسحة من مرضى مصابين باخماج الجروح والحروق في مستشفيات مختلفة في بغداد للفترة من تشرين الثاني لسنة 2007 ولغاية شهر ايار لسنة 2008 .• شخصت المستعمرات النامية بالاعتماد على عدد من الاختبارات الكيموحيوية, اذ امكن تشخيص 100 عزلة سريرية ( 67 عزلة حروق و33 عزلة جروح ) من المجموع الكلي للعزلات ، توزعت بواقع 64 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ( 50 عزلة حروق 14 عزلة جروح ) و36 عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus ( 17 عزلة حروق و19 عزلة جروح ) واكد التشخيص باستخدام نظام API 20 NE وAPI Staph .• شملت الدراسة فحص الحساسية باستخدام الاقراص تجاه 18مضاداحيويا لكل منهما.• اظهرت عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa مقاومة عالية لمضادات Azetreoname وPipracillin وCarbencillin وCefepime وCefixime وCephalexin وCeftriaxone وCefotixime وCeftazidime وTrimethoprime وCo - trimoxazole اذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة لمضادات Gentamicin وTobramycin وCiprofloxacin وNorfloxacin وImipenem بلغت نسبها (89 ، 79.68 ، 60.9، 81.25، 42.1) % على التوالي ، في حين اظهرت عزلتين فقط من البكتريا المعزولة من اخماج الحروق مقاومة لمضاد Colistin ، وبنسبة 3.2% .• اظهرت عزلات بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية لمضادي Methicillin وAmpicillinاذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة للمضادات Ceftriaxone وAugmentin وErythromycin وGentamicin وTobramycin وTetracyclin وTrimethoprim وCo - trimoxazole بنسبة (72.2 ، 86.1 ، 52.77 ، 41.66 ، 36.1 ، 50 ، 33.3 ، 30.5) % على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة اقل تجاه المضادات (Imipenem ، Rifampicin ،Ciprofloxacin ،Cefotaxime) بنسبة (22.2، 27.7، 13.88، 16.66) % على التوالي . اظهرت العزلات مقاومة متكافئة لمضادات Norfloxacin وOfloxacin وEnoxacin بنسبة % 19.4 . جميع العزلات كانت حساسة لمضاد Vancomycin. • حددت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs) لبعض المضادات المستخدمة في الدراسة وشملت ، مضاد Imipenem اذ تراوحت قيم MICs ما بين (512 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Ciprofloxacin (128 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Norfloxacin (1024 - 8) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Cefotaxime (4 - 1024< ) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Gentamicin (4 - 1024<) ميكروغرام/مليلتر.• اجري اختبار الفعالية المضادة للبكتريا لخمسة من السيفالوسبورينات بعد اجراء تفاعل اعادة الترتيب من خلال تصعيدها في المحاليل المائية الحامضية القوية . انتج تفاعل اعادة الترتيب هيكل حلقة من 5,2 داي اوكسو ببرازين وهي ذات فاعلية واطئة كمضادات بكتيرية وعلى الرغم من ذلك فان هذه النواتج هي مرشحات قوية كادوية مضادة للسرطان.• تبين ان 90% من العزلات كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز.• حددت التراكيز المثبطة الدنيا Minimal Inhibitory Concentrations (MICs) لثلاثة من المطهرات الكيميائية الشائعة الاستخدام في المستشفيات لعشر عزلات بكتيرية لكل من النوعين والتي شملت مطهر الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(256 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (512 - 64) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (512 - 4) مايكروغرام/مليلتر. اذ تبين ان مطهر الهبتين بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات، في حين مطهر بيروكسيد الهيدروجين هو الاقل كفاءة.• حددت التراكيز القاتلة الدنيا Minimal Bactericidal Concentrations (MBCs) للمطهرات الثلاثة للعزلات البكتيرية الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(512 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (1024 - 128) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (1024 - 4) مايكروغرام/مليلتر.• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا (MBCs) اذ تراوح مابين 15 - 10)) دقيقة لمطهر الهبتين,و(40 - 20) دقيقة لبيروكسيد الهيدروجين,(20 - 10) دقيقة لمطهر السكنسبت. | • The study includes the collection of 235, burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2007 to May 2008 .• The isolated colonies were identified depending on biochemical tests, The identification revealed of 100 isolates (67 burns & 33 wounds) from the total number of isolates , 64 isolates of Pseugomonas aeruginosa (50 burns & 14 wounds) and 36 isolates of Staphylococcus aureus (17 burns & 19 wounds) Then the identification of these species was confirmed by using API 20 NE and API Staph. • The study includes sensitivity test by using Disk diffusion method . towards 18 antibiotics,for each species. • The Pesudomonas aeruginosa isolates showed height resistance to Azetreoname, Pipracillin, Carbencillin, Cefepime, Cefixime, Cephalexin, Ceftriaxone, Cefotixime, Ceftazidime, Trimethoprime, and Co - trimoxazole with percentage 100 %, and to Gentamicin, Tobramycin, Ciprofloxacin, Norfloxacin and Imipenem with percentage (89, 79.68, 60.9, 81.25, 42.1) % respectively . While two of burns isolates showed resistance to Colisitin with percentage 3.2 % . • The isolates of Staphylococcus aureus showed high resistance to Methicillin and Ampicillin with Percentage 100 %, and to Cefriaxone , Augmentin, Erythromycin, Gentamicin, Tobramycin, Tetracyclin, Trimethprim, Co - trimoxazole with percentage (72.2, 86.1, 52.77, 41.66, 36.1, 50, 33.3, 30.5 ) % respectively, and less resistance to Imipenem, Rifampicin, Ciprofloxacin, Cefotaxime with percentage (22.2, 27.7, 13.88, 16.66) % respectively. The isolates showed the same resistance towards Norfloxacin, Ofloxacin and Enoxacin with percentage 19.4 % . All strains were sensitive to Vancomycin . • The minimal inhibitory concentrations of some antibiotics were determined . for Imipenem, the MICs values ranged between (2 - 512) µg/mL, Ciprofloxacin, (2 - 128) µg/mL. Norfloxacin, (8 - 1024) µg/mL, Cefotaxime,( 4 - >1024) µg/mL, Gentamicin,( 4 - >1024) µg/mL• The antibacterial activity of five of cephalosporins after chemical re arrangement by reflux in strong acid solution was examined. The re arrangement reaction produce new ring skeleton of 2,5 dioxopiprazine , of lower antibacterial activity. However there product are candidates drug with expected anticancer activity. • (90 %) of the isolates have ability to produce beta lactamase enzymes.• Minimal Inhibitory Concentration, (MICs) for three of the Common Chemical disinfectants in the hospital were determined, for 10 bacterial isolates for each species. The MICs were range between (4 - 256) µg/mL for Hibitane, (64 - 512) µg/mL for Hydrogen peroxide and (4 - 512) µg/mL for skinsept . Hibitane with its low concentration was the most active comparing with the other antiseptics. while the Hydrogen peroxide was the less . • Minimal Bactericidal Concentration (MBCs) for three of the common chemical disinfectants were determined, the MBCs for Hibitane, (4 - 512) µg/mL, Hydrogen peroxide(128 - 1024) µg/mL,and Skinsept (4 - 1024) µg/mL for each species.• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal Concentrations of antiseptic was determined,it was (10 - 15)min for Hibitane, (20 - 40) min for Hydrogen peroxide and(10 - 20)min for Skinsept

دراسـة مقاومة انواع من البكتريا المعزولة من المرضى لبعض المضادات الحياتية والمركبات الكيمياوية الجديدة == STUDY THE RESISTANCE OF BACTERIAL SPECIES ISOLATED FROM PATIENTS TO THE SOME ANTIBIOTICS AND NEW CHEMICAL COMPOUNDS

Author name: خانزاد خضر جرجيس
Supervisor name: عادل كمال خضر | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 488 عينة ماخوذة من مختلف انواع الاصابات من مختبر الصحة العامة المركزي ومستشفيات محافظة اربيل . اخذت 100 عينة من اشخاص لهم التهابات المجاري البولية، وجمعت 388 مسـحة من التهاب الجروح، الحروق، الاذن، اللوزتين، ملتحمة العين، المهبل والانف . استنبتت هذه العينات على وسطي اكار الدم وماكونكي اكار للتحري عن وجود البكتريا المسـببة للاصابات المتنوعة وتشخيصها . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع البكتيري 321 (% 65.77)، فيما كان عدد العينات السالبة 167 (% 34.22)، شــخصت العزلات النامية مظهريا وزرعيا وخواصها الكيموحيوية اذ اهملت جميع انواع البكتريا النامية باســـتثناء S. aureus ، S. epidermidis ، P .aeruginosa ، E. coli . اظهرت نتائج التشخيص البايوكيميائي وجود 67 عزلة (% 20.87) منها تعود الى نوع S. aureus من خلال ايجابيتها لفحص الكاتليز وفحص انتاج انزيم مجلط البلازما، وتخمير سـكر المانيتول، اختزال التليورايت وانتاج انزيم محلل الدنا DNase المقاوم للحرارة كما واظهرت نتائج التشـــخيص وجود 59 عزلة (% 18.38) منها تعود الى E. coli اذ تميزت هذه البكتريا عند تنميتها على وسط EMB (Eosin - methylene blue agar) بمستعمراتها ذات بريق معدني اخضر وتنمو على اكار الماكونكي بشكل مستعمرات وردية لكونها مخمرة لسكر لاكتوز اضافة الى اختبار IMVC كانت موجبة لاختبار الاندول واحمر المثيل فيما كانت سالبة لفحص الفوكس بروسكاور ولم تتمكن بكتريا E. coli من اسـتهلاك السترات فقد اعطت فحصا سالبا لليوريز والاوكســيديز وكذلك وجود 50 عزلة (% 15.57) P. aeruginosa الموجبة لفحص الاوكسيديز والكاتليز واختبار استهلاك السترات وسالبة لاختبار انتاج اليوريز.واظهرت وجود 21 عزلة (% 6.54) تعود الى S. epidermidis منتجة لانزيم الكاتليز وغير منتجة لانزيم مجلط البلازما وانزيم تحلل الدنا DNase وغير مخمرة لســكر مانيتول، ، واستعمل نظام ابي API STAPH ، API 20E لدعم هذه النتائج .شملت الدراسة فحص حساسية العزلات تجاه 33 مضادا حياتيا و9 مركبات كيمياوية . اظهرت بكتريا S. aureus مقاومة عالية للمضادات Penicillin ، Ampicillin، Piperacillin ،Carbenicillin ، Augmentin ، Tetracycline اذ بلغت نسبتها (,90, 100 ,90 80 , 6050 ,) %على التوالي واظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضاد Rifampicin اذ بلغت نسبتها 5% واظهرت هذه البكتريا مقاومة منخفضة للمضادات Oxacillin ، Cloxacillin ، Imipenem , Amikacin , Ciprofloxacillin , Pefloxacillin , Sulphamethoxazole Trimethoprim اذ بلغت نســـــبتها % 15 على التوالي في حين حصلت استجابة مختلفة للمضادات الحيوية الاخرى . بينت النتائج ان جميع العزلات S. aureus كانت % 100 حساسة لمضاد Vancomycin ، Novobiocin ، Fusidic acid .اظهرت بكتريا S. epidermidis مقاومة عالية للمضادات Piperacillin, Penicillin G , Doxycycline hydrochloride, Ampicillin Carbenicillin ,Tetracycline, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (50,60,70,70,80,90, 100) .اظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضادات Imipenem Ciprofoxacillin,Rifampicin , ,Pefloxacillin, Fusidic acid , اذ بلغت نســـبتها % (5,10,10,10,10) على التوالي واظهرت جميع عزلات بكتريا S. epidermidis حساسيتها للمضادات Vancomycin , Novobiocin والتي بلغت نســـبتها % 100. اظهرت عزلات P. aeruginosa مقاومة عالية بلغت نسبتها % 100 للمضادات Penicillin G , Ampicillin , Augmentin , Oxacillin , Cloxacillin , Cephalothin , Cephalexin , Cefoxitin , Streptomycin ,Tetracyclin , Doxycycline hydrochloride , Chloramphenicol , Erythromycin , Rifampicin , Nitrofurantoin وSulphamethoxazole Trimethoprim.اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات Amikacin Ciprofloxacillin, Pefloxacillin, Imipenem, Aztreonam,, اذ بلغت نسبتها % (15,20,20,20,25) , بينما اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . اظهرت عزلات E. coli مقاومة عالية للمضادات Penicillin G , Cloxacillin,Oxacillin , Ampicillin Erythromycin, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (90,95,95, 100, 100,100) , اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات ,Gentamicin Ciprofoxacillin , Imipenem Aztreonam , , ,Amikacin,Nitrofurantoin,Pefloxacillin اذ بلغت نسبتها%(5,10,10,10,10,15,15) على التوالي في حين اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . تم دراسة مركبات مشتقة من - 5,5 ثنائي فنيل - 4,2 - ايميدازوليدين دايون (فنتيون) من خلال اجراء تفاعلات قواعد مانيخ مع البارافورمالديهايد والامينات الاولية المعروفة باستخداماتها الدوائية . واختبرت هذه المركبات الكيميائية الجديدة التســعة كمواد مضادة للبكتريا Antibacterial agent باستخدام خمسة تراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06, 0.04 ml) . بينت نتائج التحليل الاحصائي ان افضل طريقة هي طريقة التخفيف بالمرق broth dilution وتليها طريقة تخفيف بالاكار . فقد تم التوصل الى وجود فروقات معنوية (P< 0.05) ، بين طريقة التخفيف بالمرق وكل من الطريقتين انتشار القرص والحفرة .جميع المركبات الكيمياوية المحضرة لها تاثيرات قاتلة على كل من S. aureus وS. epidermidis باســـتثناء V,VII حيث وجد ان لهما تاثيرا مثبطا وليـس قاتلا في التراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06,0.04ml) في حين اظهرت المركبات I، IV، V، VIII،IX تاثيرات قاتلة على بكتريا P. aeruginosa ، كما وجد ان المركبات II،III، VI، VII لهم تاثيرات مثبطة على هذه البكتريا في التراكيز المذكورة نفسها، كانت جميع المركبات الكيمياوية لهم تاثيرات قاتلة على بكتريا E. coli وفي جميع التراكيز المستخدمة .

الخصائص الحيوية والجزيئية والفعالية ضد الميكروبية للنايسين المنتج من قبل بكتريا subsp. lactis Lactococcus lactis المعزولة من الحليب الخام == Biological, Molecular characteristics and antimicrobial activity of Nisin produced by Lactococcus lactis subsp. lactis Isolated from Raw Milk

Author name: خالد اسماعيل عزيز
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | زيرك فقى احمد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت جمع مائة وخمسة واربعون نموذجا من الحليب الخام خلال فترة ما بين تموز الى التشرين الثانى لعام 2013 فى مزارع تربية المواشي لمحافظة اربيل ودهوك .اسفرت النتائج عن الحصول على 45 عزلة من بكتريا L. lactis subsp. lactis تمت تشخيص هذه العزلات باستخدام الصفات المجهرية , المظهرية , البايوكيميائية ,API 20E SYSTEM بالاضافة الى تقنية الـ PCR . اختبرت فعالية العزلات لبكتريا L. lactis subsp. lactis تجاه ثلاثه عشر نوعا من المضادات الحيويه وتباينت العزلات فيما بينهما من حيث استجابتها لاختبار الحساسية وعدد منها مقاومة كالاتي : Cephalothin, Ampicillin, Amoxicillin/ Clavulanic acid, Sulfamethoxazole/Trimethoprim, Cefotaxime, Clindamycin, Ceftriaxone, Nitrofurantoin, Gentamycin, Vancomycin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, and Imipenem.، ونسبة المقاومة كالاتي : 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55, 24.44%, 2.22%. على التوالي.اظهرت نتائج جميع العزلات فعالية عالية ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية وهى : E. coli, B. subtilis, P. aeruginosa, C. perfringes and S. aureus باستعمال تقنية طريقة الانتشار بالحفر. اظهرت العزلة 41 و15 فعالية عظمى (16mm) (20mm) ضد بكتريا S. aureus وB. subtilis بينما اظهرت العزلة 20 فعالية كبيرة (13mm) ضد بكتريا aeruginosa P.. عموما فان البكتريوسين لجميع العزلات المذكورة كانت فعالة ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة كرام .ايضا تم استخدام النايسين النقي ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية واظهرت النتائج بان مناطق التثبيط كانت 18، 22، 14، 13 و15 ملم ضد كل من S. aureus، B. subtilis، C. perfringens، E. coli وP. aeruginosa على التوالي.درست تاثير الاس الهايدروجينى،الحرارة والاشعة الفوق بنفسجية على فعالية نايسين للعزلات 10، 26 و42. اظهرت النتائج بان مستخلص نايسين لعزلة L42 كانت اكثر فعالية عند الاس الهايدروجينى 2.5 والحرارة - 4 م ضد البكتريا المرضية. لم يظهر مستخلص النايسين اى فعالية ضد البكتريا المرضية عند تعريضه للاشعة الفوق بنفسجية مبينا التاثير السلبى لهذه الاشعة على فعالية البكتريوسين.تم اختيار العزلة اكثر مقاومة للمضادات الحيوية (L42) لاجراء عملية التحول وذلك لتحديد مواقع الجينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية باستخدام عملية التحول الوراثي باستعمال بكتريا coli DH5 - α E. الخالية من البلازميدات مع البلازميد المنقى من العزلة L42. تم اجراء عملية التحول بنجاح واظهرت النتائج بان جينات : Chloramphenicol, Nitrofurantoin, Cefotaxime, and Vancomycin كانت واقعة على البلازميد بينما البقية كانت واقعة على الكروموسوم. تم تحديد التركيز المثبط الادنى للنايسين واظهرت النتائج بان MIC للنايسين بالنسبة لبكتريا aureus S. كانت 400µg/ml بينما لبكتريا coli E. كانت 500µg/ml. استخدمت MIC للنايسين كعامل تحييد للسيطرة على جينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية لنوعين من البكتريا المرضية وهى aureus S. وcoli E.. كشفت النتائج بان الجينات منحت المقاومة لـ AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AK, CFM, تم تحييدها بنسبة 61.5% بينما فى بكتريا coli E. تم تحييد الجينات لـLEV, MEL, NOR, and SXTبنسبة 31%. تم دعم النتائج عمليتي التحول والتحييد باستخدام تقنية الترحيل الكهربائى للهلام. | In this study a total of one hundred forty five raw milk samples were collected during the period of (July to November, 2013) from different fields in Erbil and Duhok province. Screening revealed that 45 out of 145 samples of raw cow milk (31%) were L. lactis subsp. lactis. Characterization of these selected isolates were carried out using morphological, microscopical, biochemical characteristics, API 20 system and further confirmation were achieved by PCR assay.Antibiotic sensitivity test performed for L. lactis subsp. lactis against thirteen antibiotics which include Ampicillin (AMP), Amoxicillin/ Clavulanic acid (AMC), Imipenem (IMP), Gentamycin (GM), Sulfamethoxazole/Trimethoprim (SXT), Cephalothin (CEP), Clindamycin (CLIN), Nitrofurantoin (F), Ciprofloxacin (CIP), Ceftriaxone (CRO), Chloramphenicol (C), Cefotaxime (CTX), and Vancomycin (VAN). The isolates appeared to be varied in their resistance, the number and resistance percent for antibiotics used CEP, AMP, AMC, SXT, CTX, CLIN, CRO, F, GM, VAN, CIP, C, and IMP were as follow 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55%, 24.44%, and 2.22% respectively.All supernatants were isolates exhibited marked activity against five pathogenic bacteria includes S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, P. aeruginosa, and E. coli using agar well diffusion method. Isolate 15 and 41 exert maximum activity (20 mm) and (16 mm) against B. subtilis and S. aureus. Whereas isolate 20 showed highest activity (13 mm) against P. aeroginosa. Generally, all aforementioned isolates were active against gram positive and Gram negative bacteria. In addition, the effect of pH, temperature and UV light were studied on nisin activities of L10, L26 and L42 against some pathogenic bacteria. The results showed that nisin extract of L42 displayed highest activity at pH 2.5 and temperature at - 4 °C against pathogenic bacteria under study. Under UV light wavelength all nisin showed low or no activity against different pathogenic bacteria selected in this study.Also a pure nisin was used against five pathogenic bacteria and the results shows that the inhibition zones were 18, 22, 14, 13 and 15 mm against each of S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, E. coli and P. aeruginosa respectively.One highly resistance isolate was chosen (L42) for transformation test to determine the location of the antibiotic resistance genes by genetic transformation process using the laboratory strain E. coli DH5 - α with plasmid DNA purified from this isolates. The transformation process conducted successfully and the results showed that the resistance genes for F, C, CTX, and VAN were located on plasmid DNA. While for others were located on chromosomal DNA.Minimum inhibitory concentrations were tested for nisin and the results revealed the MIC of nisin for S. aureus was 400 µg/ml while for E. coli was 500 µg /ml. MIC of nisin was used as curing against to control the antibiotic resistance genes in two pathogenic bacteria represented by E. coli and S. aureus. The results showed that the genes encoding resistance to AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AM, and CFM were cured and the percentage of curing was 61.5%. Whereas for E. coli the gene of LEV, MEL, NOR, and SXT were cured with 31%. The above results of both transformation and curing process were supported with gel electrophoresis.

دور السيلينيوم والبراسينولايد في النمو والمركبات الفعالة لنبات الكزبرة (Coriandrum sativum L.) المعرض للاجهاد المائي == Role of Selenium and Brassinolide in growth and active compounds for Coriander plant (Coriandrum sativum L.) Exposed to Water Stress

Author name: حيدر ناصر حسين المنتفجي
Supervisor name: عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

Author name: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.

دراسة حالات العقم عند الذكور والتاثيرات البكتيرية والمناعية على معالم السائل المنوي

Author name: حياة كاظم سلمان الموسوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | انتصار محمود جمعة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 450 عينة مني ومصل دم من الذكور المصابين بالعقم (اولي _ ثانوي) من مركز العقم واطفال الانابيب (مستشفى كمال السامرائي ). قسمت عينات المني الى قسمين اجري على القسم الاول منها الفحوص العيانية والمجهرية ، فيما تم زرع القسم الاخر على اوساط زرعية مناسبة ( اكار الدم،اكار الماكونكي، اكار الجوكليت) .تم عزل 284 عزلة بكتيرية من مجموع عينات المني 450 عينة : - 173 عزلة بنسبة (38.4%) منها تعود الى Staphylococcus aureus و58 عزلة بنسبة (12.9%) تعود الى بكترياEscherichia coli و31 عزلة (6.9% ) منها تعود الى بكتريا Neisseria gonorrhoeae ،اما نتيجة الزرع للبكتريا المختلطة &S.aureus E.coliفكانت 22حالة (4.9%) وذلك باستخدام نظام API system. اختبرت حساسية البكتريا لـ(11) مضادا حيويا شملت : - الامبسلين والفانكومايسين وامبسلين/ سلبكتام وسيفترياكسون ومينوسايكلين وسيفاكلور وسيفوروكسيم وسيفوتاكسيم والاميكاسين والافلوكساسين والسبروفلوكساسين . اظهرت النتائج وجود مقاومة عالية من قبل العزلات البكتيرية للمضاد الحيوي الامبسلين 100% في حين كان المضاد الحيوي سيفترياكسون اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية والبكتريا التابعة للعائلة المعوية اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له وكان المضاد السبروفلوكساسين الاكثر تاثيرا على العزلات البكترية (N.gonorrhoea). تضمن البحث ايضا دراسة تاثير اضداد النطاف على معالم السائل المنوي اذ وجد ان 284 عينة اي بنسبة (63.1%) (من بين450 عينة ) كانت موجبة لاضداد النطاف في البلازما المنوية وان 270عينة اي بنسبة (60%) من مصل الدم كانت موجبة لاضـداد النطاف وذلك باستخدام فحص التراص بالصفيحة agglutination test Tray . كذلك تم التعرف على عيارية هذه الاضداد اذ ان اعلى عيارية للاضداد في البلازما المنوية كانت (128 : 1) في الوقت الذي بلغت اعلى عيارية للاضداد في مصل الدم (1024 : 1). استخدمت تقنية (ELISA ) Enzyme Linked Immumosorbent Assay للتحري عن اضداد النطاف واصنافها وبينت نتائج الدراسة ان اكثر الاصناف تكرارا في البلازما المنوية هو الضد IgA اذ وجد في 271 عينة بنسبة (95.4%) من بين 284 عينة موجبة لاضداد النطاف اما اصناف الاضداد في مصل الدم فالضد IgG كان اكثرها وجودا (225 ) عينة بنسبة 83.3% .من مجموع العينات الموجبة لاضداد النطاف والبالغة 270 عينة . كما تم التعرف على كيفية حدوث التراص نتيجة وجود الاضداد وتبين ان التراص بالرؤوس هو الاكثر حدوثا في (170 ) عينة بنسبة 39.9% مقارنة مع التراص ذنب بالذنب (37) عينة بنسبة 13% . بينت الدراسة وجود علاقة ذات دلالة احصائية معنوية 0.001>P بين وجود الخلايا القيحية في السائل المنوي ووجود اضداد النطاف في البلازما المنوية اذ بلغت النسبة (98.2%) من مجموع 279 عينة فيما بلغ مجموع المرضى العقيمين الذين ابدوا نتائج موجبة لاضداد النطاف بدون خمج (5)عينات 1.7 % كذلك تبين وجود علاقة معنوية 0.001>P بين الاصابة ببعض الامراض مثل القيلة الدوالية Varicoceleواصابة وضمور الخصيةTesticular trouma & atrophy والنكاف Mumps واختزاع الخصيةTesticular biopsy وبين وجود اضداد النطاف في البلازما المنوية . كذلك اظهرت الدراسة ان 393 مريضا ( 87.3%) من مجموع 450 عقيما اظهروا تركيزا سويا لهرمون (FSH) Follicle Stimulating Hormone. في مصل الدم مقابل )57) مريضا بنسبة 12.7% اظهروا تركيزا اعلى من القيمة الطبيعية العليا . كما اظهرت النتائج ان 380 مريضا بنسبة 84.4% كان لديهم تركيز سوي لهرمون (LH) Leutinizing Hormone ، مقابل 70 بنسبة (15.6%) كان لديهم تركيز اعلى من القيمة الطبيعية العليا في مصل الدم . اما بالنسبة لهرمون التيستوستيرون Testosterone فان 334 بنسبة 74.2% اظهروا تركيزا سويا مقابل 116 (25.8%) ممن كان لديهم تركيز اقل من القيمة الدنيا للتركيز السوي . | Four hundred fifteen samples of seminal fluid from infertile men (primary & secondary) from Infertility and Tube Babies Center (Kamal AL - Sammara'ee Hospital). Each semen sample was divided into two parts : The first part underwent Macroscopic& Microscopic examination, while the other part was culture on suitable culture media (Blood agar, Macconkey agar and chocolate agar). 284 bacterial isolates from 450 sample ; 173 sample of seminal fluid show to Staphylococci aureus (38.4%) and (58) from Escherichia coli (12.8%) , 31 show Nesseria gonorrhea (9.6%) while the result of mixed bacteria (E. coli & S. aureus) it was 22 sample (4.9%) by using (Api E - 20) system. Bacterial sensitivity to (11) antibiotic, included Ampcillin, Vancomycin, Ampicillin/Sulbactam, Ceftriaxone, Minocycline, Cefaclor, Cefuroxine, Cefotaxime, Amikacin, Ofloxacin, and Ciprofloxacin the results show high resistance to Ampcillin antibiotic (100%) while ''Ceftrtaxone '' show best action against (E. coli & S. aureus) . Ciprofloxacin was having the highly effect on the Nesseria gonorrhea . The research was included the study of antisperm antibody It was found that 284 sample (63.1%) from 450 sample were positive against antisperm antibody in seminal plasma and 270 sample (60%) from blood serum samples were found to be positive using '' Tray agglutinant test''. The highest molarity of seminal plasma was found to be (1 : 128) whereas the highest of blood serum was (1 : 1024).The ’ELISA’’ method was used to detect anti sperm antibody. The study showed that the most frequent in seminal plasma is Immunoglobuine ( IgA) , where 271 samples (95.4%) were found to be positive . ( IgG) was found to be the most existing one in blood serum; 225 samples ( 83.3% ) .Identification of how aggulation occurred as a result of contraries existence had been executed. It was approved that head to head is the most occurring one; 170 samples (39.9%) compared with tail to tail 37 ( 13%).There was a significant statistical correlation between the presesnce of pus cells in seminal fluid and antisperm antibodies in seminal plasma where the pus cells were found in (98.2%) 279 of the sample. While the infertile patients showed positive results or antibody without infection as being (5) specimens (1.7%) . In addition, there was a correlation between some diseases such as varicocele, Trauma & Atrophy , Mumps and testisculer biopsy and the existence of antisperm antibody (P< 0.001) in seminal plasma .The results showed that 393 patients ( 87.3% ) from 450 infertilities had normal hormone FsH (Follicle stimulating hormone) who had high level in blood serum against 57 patients (12.7%).The result also showed that 380 patients ( 84.4% ) had normal levels of (LH) in comparisn to 70 with ( 15.6%) high levels of LH in the blood serum. "Testosterone hormone" level was found to be normal in 334 patients ( 77.2%) and 116 patients ( 25.8%) showed high levels .

دراسة بكتيرية ومناعية لعوامل الضراوة المستخلصة من بكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات القناة التنفسية == Bacteriological and Immunological Study of Virulence factors extracted from Moraxella catarrhalis Isolated from Respiratory Tract Infections

Author name: حوراء عبد الامير علي الدهان
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | نجاح رايش هادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل وتشخيص 60عزلة من بكتريا Moraxella catarrhalis من 344 عينة مرضية وبنسبة 17.4% موزعة كالاتي (6.7 , 11.7 , 12.5 , 27.6 , 30) % لكل من مسحات الاذن ومسحات الانف وعينات القشع ومسحات البلعوم ومسحات اللوزتين على التوالي من المرضى المراجعين الى العيادة الاستشارية للانف والاذن والحنجرة والعيادة الاستشارية الصدرية في مستشفى الحكيم العام في محافظة النجف ومن مختلف الاعمار ولكلا الجنسين وللفترة من حزيران 2004 وحتى كانون الاول 2004م. اعتمدت الصفات الزرعية (للمستعمرات) والشكلية (للبكتريا)والاختبارات الكيماحيوية لتشخيص العزلات، فضلا عن اعتماد نظام API - NH . كانت النسبة المئوية لعزل البكتريا من الاناث (18.8%)اكثر مما هو عليه في الذكور (16.3%) فيما سادت الفئة العمرية 1ـ10 سنة حيث بلغت نسبة عزل المسبب المرضي فيها 20.4%. لغرض التحري عن طبيعة مقاومة العزلات قيد الدراسة للمضادات الحيوية المختلفة ،فقد اخضعت جميع العزلات لاختبار حساسيتها لـ 12 نوعا من المضادات الحيوية التي تستعمل في علاج الاخماج البكتيرية ،اذ اظهرت العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيويةAmpicillin وAmoxycillin وTetracyclin وبنسبة 100% لكل مضاد ، في حين اظهرت العزلات مقاومة معتدلة وبنسب (73.3 ، 71.7 ، 66.7 ، 61.7 ، 60 ، 58.3 ) % لكل من المضادات الحيوية Cefotaxime،Ciprofloxacin ،Nitrofurantoin ،Nalidixic acid ، Cephalothin وGentamycinعلى الترتيب ،لكنها كانت مقاومة وبدرجة منخفظة تجاه Chloramphenicol ,Cephalexin , Pipracillin اذ بلغت نسب المقاومة لها(30 , 36.7 , 38.3)% على الترتيب .واظهرت معظم العزلات مقاومة مشتركة لعدد من المضادات الحيوية قيد الدراسة ، كما واظهرت 91.7% من العزلات قدرتها على انتاج انظيم البيتالاكتاميز . في محاولة للتحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستعمار اظهرت العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الاول (CFA/I) والثالث (CFA/III) وبنسب (93.3 ،96.7 )% على التوالي ، في حين لم تظهر ايا من العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الثاني (CFA/II) .اظهرت 22 عزلة من بكتريا M.catarrhalis (36.7%) قدرتها على انتاج انظيم البروتيز الخارج خلوي في حين لم تظهر ايا من العزلات قابليتها على انتاج انظيم الهيمولايسين والسايدروفورات , فضلا عن عدم قدرتها على تكوين المحفظة . ولمعرفة قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الشعيرات (Fimbriae) اجري فحص تكوين الغشاء الرقيق حيث تمكنت 80 % من هذه العزلات من تكوين هذا الغشاء عند نموها في الوسط الزرعي السائل في الوقت الذي استطاعت فيه 85%من العزلات من تلزين كريات الدم الحمراء للانسان صنف O+ وذلك للتحري عن امتلاك البكتريا للواصق التي تمكنها من الالتصاق بمستقبلات خاصة مؤلفة من مواد كاربوهيدراتية تعرف باسم (Gal α1 - 4Gal ß )موجودة على سطح كريات الدم الحمراء للانسان ، كما واستخدمت العزلة (6¬MO¬)المشعرة والملزنة والعزلة (MO1)غير المشعرة والملزنة لمقارنة معدل التصاقها بالخلايا الطلائية للانسان والمرسبة من الادرار مع معدل التصاق العزلة (MPn6)غير المشعرة وغير الملزنة ,اذ بلغ معدل التصاق العزلة (6¬MO¬) 54.1 خلية بكتيرية /خلية طلائية اعلى من معدل التصاق العزلة MO1 والعزلة MPn6 التي بلغ معدل التصاقها (9.6 , 23.9 ) خلية بكتيرية / خلية طلائية على الترتيب . وفي محاولة للتعرف على انماط التلازن الدموي للعزلات البكتيرية قيد الدراسة ,اجري فحص التلازن الدموي لجميع العزلات البكتيرية (60 عزلة) باستخدام دم الانسان والابقار والدجاج وخنازير غينيا على الترتيب وقد ظهر النمط(RRRN) بكونه الاكثر سيادة حيث بلغت نسبته حوالي 33.3% من العزلات قيد الدراسة . تم اختيار احد العزلات (MO6) باعتبارها عزلة كفوءة ومشعرة لثبوتية صفاتها المستضدية واعطائها للنتائج القياسية المعروفة في التفاعلات الكيماحيوية لاستخدامها في التجارب اللاحقة المتمثلة باستخلاص مستضدات عوامل الالتصاق ( الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي وعديد السكريد الشحمي ).المحور الثاني : استخلاص وتنقية المستضدات - تم استخلاص مستضد الشعيرات (Fimbriae) للعزلة المنتجة (MO6)باستخدام تقنية النبذ المركزي فائق السرعة لفصل الشعيرات وكذلك استخدام كبريتات الامونيوم بنسب تشبع مختلفة لغرض ترسيب البروتينات المستخلصة ، ومن ثم قدرت كمية البروتين في هذا المستخلص وكانت 0.525 ملغم /مل . - تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) للعزلة MO6 باستخدام الانظيمات (RNase وDNase ) والمنظف N - Lauroyl - Sarcosinate كما وقدر تركيز البروتين في مستخلص OMPs النقي اذ بلغ 0.6 ملغم /مل ، اما متعدد السكريد الشحمي (LOS ) فقد تم استخلاصه بتكسير الخلايا بالانظيمات والاستخلاص بالفينول المائي الساخن ، وبعد فصل كل من الطورين المائي والفينولي تمت ازالة سمية LOS في كل من الطورين باستخدام مادة Hydrazine اللامائية .وكما تم تقدير كمية الكاربوهيدرات الكلية في الطورين المائي والفينولي كليهما ,حيث بلغت (300 , 190)مكغم/مل على التوالي ,فضلا عن قياس النسبة المئوية للبروتين المرتبط مع LOS في الطورين والتي بلغت (13.3 , 11.8) % على الترتيب. المحور الثالث : الدراسة المناعية شمل هذا المحور دراسة تاثير مستضد الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) المنقاة جزئيا ومتعدد السكريد الشحمي (LOS) المزالة سميته والمستخلصة من العزلة الكفوءة (MO6)لبكتريا M.catarrhalis على الاستجابة المناعية ومعرفة دور هذه المستضدات الثلاثة في تنشيط او تثبيط فعالية بعض الخلايا المناعية ,ولغرض تحقيق ذلك اجريت الاختبارات المناعية الاتية في الزجاج (In vitro )والمتمثلة بعيوشية الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية والتشكل الزهري التائي والبائي وهجرة الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى (PMNs), فضلا عن عملية البلعمة للخميرة Candida albicans المقتولة بالحرارة.ادى استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات (25 , 50 , 100 )مكغم/مل وتراكيزمن مستضد OMPs (50 , 100 , 200) مكغم/مل وتراكيز من مستضد LOS(200,100,50) مكغم /مل الى انخفاض معنوي (0.05 P <)في النسبة المئوية لعيوشية خلايا PMNs والخلايا اللمفاوية مقارنة بالسيطرة ,كما ادى استخدام التراكيز اعلاه ولكل المستضدات الثلاثة الى خفض معنوي في قطر منطقة الهجرة لخلايا PMNs . حيث كانت لجميع هذه التراكيز وللمستضدات الثلاثة تاثيرا مثبطا لهجرة خلايا PMNs وان تدرج التثبيط يزداد بصورة معنوية بزيادة تركيز المستضدات . اما فيما يخص عملية البلعمة التي استخدم فيها مستضد الشعيرات وOMPs وبالتراكيز (25 , 50 , 100 مكغم/مل) و(50 , 100 , 200 مكغم/مل) على التوالي , فقد لوحظ ازدياد معدل معامل البلعمة تدريجيا مع الزمن وبشكل معنوي (0.05 < P) حتى وصل اقصاه عند الوقت 90 دقيقة ، ثم انخفض بعد ذلك خلال الوقت 120 دقيقة ولجميع التراكيز المستعملة ولكلا المستضدين ، اما بالنسبة لمستضد LOS فقد لوحظ ان معدل معامل البلعمة يزداد وبصورة طفيفة وتدريجية واصبح بشكل معنوي عند الوقت 90 دقيقة من المعاملة ولجميع التراكيز المستعملة (200,100,50 ) مكغم /مل ,الا انه لم تظهر هنالك فروقات معنوية ( 0.05 P>) بين التركيزين (100 و200)مكغم /مل عند الاوقات (120,60,30) دقيقة ، كما وازدادت النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية المكونة للتشكل الزهري التائي الفعال والكلي وكذلك التشكل الزهري البائي وبتاثير معنوي (< 0.05 P) للمستضدات الثلاثة (الشعيرات , OMPs ,LOS)عند التراكيز نفسها مقارنة مع معامل السيطرة . اوضحت نتائج تجربة تمنيع الحيوانات المختبرية (الارانب )بمستضد الشعيرات وOMPs وLOS والمعدل المناعي (Immunoferon) امكانية الحصول على اجسام مضادة للمستضدات المستخدمة والتي استدل على وجودها باستخدام اختبار الترسيب في الانابيب ,حيث ظهرت حلقة ترسيب في الانابيب الحاوية على مصل الارنب الممنع بهذه المستضدات والمعدل المناعي عند التراكيز( 140,50,200,100) مكغم/مل على الترتيب ، في حين لم يظهر اختبار الانتشار المناعي المزدوج في هلام الاكروز (اختبارOuchterlony) اي نتيجة موجبة عند استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات وLOS وImmunoferon عدا مستضد OMPs حيث ظهر خط ترسيبي مفرد عند التركيز 200 مكغم /مل .وان هذه النتائج تشير الى امكانية استخدام هذه المستضدات كمعدلات مناعية لقابليتها على تحفيز الخلايا اللمفاوية البائية على تكوين | Sixteen isolate of Moraxella catarrhalis was diagnostic from a total of 344 pathogenic specimens , Moraxella catarrhalis was isolated and identified in a percentage of 17.4% .Isolates of M.catarrhalis were distributed amony source of the pathogenic specimens to (30,27.6,12.5,11.7,6.7) % for swabs from ear, nose, sputum specimens, pharynex, and tonsiles, respectively. Specimens were collected from male and female patients of different age groups referred to the Ear Nose & Throat and Chest consultants clinics in Al - Hakim general hospital in Najaf Governorate from the period of June, 2004 to December, 2004.Cultural, microscopical, and biochemical characteristics were considered for diagnosis of this bacteria, in addition to use of API - NH system.Higher incidence of bacteria was detected in women (18.8 %) compared to men (16.3%).Age group of (1 - 10) year was the dominant infected group (20.4%) among others .To investigate the nature of resistant to various antibiotics ,the isolates were subjected to the sensitivity test of 12 antibiotics which are routinely used in treatment of infections caused by this organism.All isolates were exhibited complete resistance (100 %) to Ampicillin, Amoxycillin, and Ttetracycline, moderatly resistant in a percentages of (73.3 ,71.7,66.7,61.7,60,58.3)% for each Cefotaxime, Ciprofloxaciy, Nitrofurantoin, Nalidixic acid, Cephalothin, Gentamycin, respectively. While, sensitive to Chloramphenicol ,Cephalexin ,Pipracillin when their resistance reached only ( 38.3 , 36.7 ,30)% ,respectively. All isolates exhibited multiple resistance for many antibiotic used in this study ,and 91.7% of isolates presented the ability to produce β - Lactamase enzyme .To investigate the pathogenicity factors for M. catarrhalis such as adhesion and colonization factors, all isolates showed the ability to produce CFA/I and CFA/III in apercentage of 93.3,96.7 %, respectively. Whereas, non of the isolates showed no ability to produce CFA/II .Twenty two (36.7 %) of M.catarrhalis isolates only were able to produce extracellular protease, but all isolates were unable to produce hemolycin, sidrophores, and capsule. To detect the ability of isolates to produce fimbriae ,pellicle formation test was done, and it was found that 80 % of isolates were formed this pellicle when it was grown in the broth culture media .At the same time ,85% of isolates were found to be able to cause agglutination of human blood type O+ “ in order to detect the precence of adhesion in the bacteria which make it able to attach into carbohydrate specific receptors named (Galα - 4Galβ)which presented on the surface of human blood erythrocyte” .The fimbriated –hemagglutinated isolate (MO6) and non fimbriated - hemagglutinated isolate(MO1) were used to compared the bacterial adherenc rate on human uroepithelial cells with non fimbriated –non hemagglutinated isolate(MPn6) .The adherence rate of (MO6) isolate was 54.1 bacterial cells / epithelial cell Morethan that of (MO1) and(MPn6) isolates which presented in 23.9 , 9.6 bacterial cells /epithelial cell,respectively . Hemagglutination patterns for all isolates were done by using human ,bovine ,chicken and guinea pig ,respectively in Hemagglutination test. RRRN patterns the highere incidence pattern presented in 33.3% from all isolates . One isolate (MO6) was selected to be used in the following experiment as it is considered efficient and fimbriated with consistent antigenic properties and its typical biochemical characteristics such as extraction of adherence factors antigens (fimbriae ,outer membrane proteins and lipooligosaccharide).Second Aspect : Extraction and Purification of Antigens. - Fimbria antigen was extracted from MO6 producted isolate by using ultracentrifugation and ammonium sulfate in a different saturation percentages for fimbriae separation and extracted protein precipitation ,respectively .The protein concentration in this antigen was estimated which was 0.525 mg/ml. - RNase ,DNase (enzymes)and N - lauroyl sarcosinate(Detergent) were used to extract OMPs ,from selected isolate (MO6).Protein concentration of the purified extracted OMPs was estimated and found to be 0.6 mg/ml. Lipooligosacchoride (LOS) was extracted after cells were broken by the above enzymes .The extraction was performed by hot - phenol .After the aqueous and phenolic phases were separated, it was detoxified for each phases by using anhydrous hydrazine, and total carbohydrate quantities were estimated for each phase which were 300,190µg/ml , respectively . Morever,LOS bounded protein quantity in each phase was also estimated. The percentages of the protein bounded to LOS for aqueous and phenolic phases were 13.3 , 11.8 %,respectively .Third Aspect : Immunological StudiesThis aspect was investigated the effect of fimbriae ,OMPs which are partially purified, and detoxified LOS antigens isolated from M. catarrhalis (MO6) on immunoresponse and showed the role of this three antigens in activation or inhibition of some immunocellular activity. The following (In vitro)immunological tests were performed; Viability of PMNs and lymphocyte, B and T rosette forming assay ,migration of PMNs, and phagocytosis of Candida albicans . The concentration of fimbriae (25,50,100) µg/ml , OMPs (50,100,200) µg/ml and LOS(50,100,200) µg/ml decreased the viability percentage of PMNs and lymphocyte with significant differences (P<0.05) in comparison to the control treatment ,while, these concentration for each antigens inhibited the migration of PMNs cells in asignificant differences and the gradual inhibition decreased significantly with increase of antigens concentration . The concentration of fimbriae ( 25 , 50 , 100) µg/ml and OMPs (50, 100 , 200 ) µg/ml increased the phagocytic index (PI) Significantly and gradually with time untile it reach the maximum at time 90 min. Then PI decrease at the time 120 minutes . For all concentration of each antigens LOS antigen increase the PI significantly at 90 min. for all concentration but its non significant (P>0.05) at times (30,60,120)minutes between (100,200) µg/ml concentration .All concentration used for these antigens (fimbriae ,OMPs ,LOS) increased the percentage of T and B rosette assay with high signfacant differences in comparison to control . The study showed that rabbit immunized by fimbriae ,OMPs,LOS, and Immunoferon produced antibodies against these antigens which were detected by Ouchterlony double diffusion test which showed no precipitin line between any antigens and serum of immunized rabbit except OMPs showed single precipitin line at concentration 200 μg/ml ,While there was clear ring of precipitin was formed in the second method (tube precipitation test) .These results showed the ability of these antigens to act as immunomodulators due to their ability to stimulate β - lymphocyte to produce antibodies similar to immunoferon

دراسة تاثير بعض العوامل الخارجية في بقاء والتصاق بكتريا Acinetobacter baumannii على السطوح غير الحية == Study the effect of some external factors on survival and adherance of Acinetobacter baumannii on abiotic surfaces

Author name: حنين اكرم حبيب
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت عزلات من بكتريا Acinetobacter baumannii من سطوح غير حية مختلفة شملت قضبان الاسرة ومقابض الابواب والمغاسل والاغطية والوسائد وملابس العاملين , وقد تم الحصول على (149) عينة من مستشفى الكندي التعليمي , اذ زرعت العينات على اوساط زرعية صلبة (الماكونكي واكارالدم) ,وعلى ضوء التشخيص المجهري والزرعي والكيموحيوي , ومن ثم استخدم نظام Api 2o - E فقد تم الحصول على 16 عزلة من بكتريا A.baumannii وبنسب مئوية للعزل مقدارها (6.25 , 12.5 , 18.75 , 25 , 37.5) % لمسحات قضبان الاسرة , مقابض الابواب , المغاسل , الاغطية والوسائد , وملابس العاملين على التوالي . الخطوة الثانية تضمنت التحري عن العزلات البكتيرية المتحركة من بين 16 عزلة حيث كانت جميع العزلات البكتيرية متحركة حركة ارتعاشية على وسط الحركة شبه الصلب . اختبرت قابلية العزلات على الالتصاق وتكوين الغشاء الحيوي لعزلات بكتريا A.baumannii على السطوح غير الحية المصنعة من مواد مختلفة ( البلاستيك , الفولاذ والمسمى محليا ( Stainless steel) , البورسلين , الخزف , الخشب , الفورميكا , الزجاج , البوليستايرين ) وذلك بوضع كمية محددة من العالق الخلوي على تلك الاسطح ثم حضنها تحت درجات حرارية مختلفة وهي درجة حرارة الثلاجة (4)م درجة حرارة الغرفة - 20)25 (م ودرجة حرارة الحضن )37 (م ولفترات زمنية مختلفة (72,48,24) ساعة ومن ثم عمل مسحة لتلك الاسطح وزرعها على وسطBrain Heart Infusion Agar لمدة 24 ساعة تحت درجة حرارة 37 م لملاحظة مدى حيوية خلايا بكتريا A.baumannii او بعمل سلايد لسطوح الزجاج والبوليستايرين وقد اظهرت هذه النتائج ان هذه البكتريا تلتصق على السطوح غير الحية وبنسب متقاربة ما عدا الخشب فقد اظهرت البكتريا التصاقا قليلا على هذا السطح .

دراسة بكتيرية ومناعية للانظيم الحال للبروتين نوع - ا - المستخلص من بكتيريا Proteus mirabilis المعزولة من خمج السبل البولية == Bacteriological and Immunological Study of IgA - Protease Enzyme Extracted from Proteus mirabilis Isolated from Urinary tract infection

Author name: حسن علي حسين السعدي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة اربعة محاور : 1 - العزل والتشخيص : تم عزل وتشخيص (40 ) عزلة من بكتيريا Proteus spp. من مجموع ( 200 ) عزلة بكتيرية من عينات اخماج مرضى السبل البولية في مستشفيي مدينة الطب والكندي للفترة بين 1/3/2004 لغاية 30/10/2004.اظهرت الفحوصات الكيميائية الحيوية ان 40 عزلة بكتيرية (20% ) من العزلات البكتيرية كانت تنتمي الى جنس Proteus والتي اشتملت على ( 37 ) عزلة تعود الى بكتيريا)P. mirabilis18.5%) ثلاث عزلات من بكتيريا Proteus vulgaris. عشر عزلات من بكتيريا P. mirabilis كانت منتجة للانظيم الحال للبروتين (IgA Protease)، بينما كانت عزلات بكتيريا Proteus vulgaris غير منتجة للانظيم المذكور ،واختيرت العزلة (Pm5)P.mirabilis كعزلة منتجة للانظيم.2 - تنقية وتوصيف الانظيم : اختير الوسط مرق ( Cysteine lactose electrolyte deficient ) كافضل وسط زرعي لانتاج الانظيم من بكتيريا Proteus mirabilis وتم تنمية العــــزلة البكتيريـــة( Pm5) في درجة حرارة( 37 )م باستخدام الحاضنة الهزازة وثم نقي الانظيم باستخدام الترسيب ملح كبريتات الامونيوم بتشبع(60%) وديلزته واستخدام هلام السيفادكس G - 100 Sephadex وكذلك المبادل الايوني DEAE - Cellulose، قيست الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين للانظيم في كل مرحلة من مراحل التنقية ظهر منحني تنقية الانظيم باستخدام هلام السيفادكس وجود اربعة قمم بروتينية منها قمة واحدة للانظيم الحال للبروتين بينما اظهرت طريقة استخدام المبادل الايوني قمة واحدة فقط، تم حساب الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين والفعالية النوعية والفعالية الكلية وعدد مرات التنقية والحصيلة الانظيمية فكانت على التوالي : (28.7)وحدة/مل،(0.15)ملغم/مل، (191.3)وحدة/ملغم، (258.3)، (5.5)،(9.9%) عند التنقية باستخدام المبادل الايوني وحسب الوزن الجزيئي للانظيم اذ كان (50)كيلودالتون باستخدام طريقة الترشيح الهلامي وكانت الفعالية المثلى للانظيم عند الاس الهيدروجيني 8 ودرجة الحرارة المثلى لانتاج الانظيم هي (37)م ودرجة الحرارة الملائمة لخزن الانظيم هي (4)م مقدارها وكان للايون (Ca+2) تاثير واضح في زيادة فعالية الانظيم بينما كان للـEDTA تاثير مثبط على فعالية الانظيم. 3 - الدراسة المناعية : - استعملت ثلاث مجاميع من الارانب لغرض التمنيع (ارنبين لكل مجموعة) حقنت داخل العضلة باستعمال تراكيز مختلفة من الانظيم(0.2،0.5،1)ملغم/مل فضلا عن ارنبين ضمن مجموعة السيطرة. اتبعت طريقتين (الاوكترلوني والترسيب باستعمال الانابيب) لغرض التحري عن الاضداد المتخصصة للانضيم الحال للبروتين في مصل الارنب، اظهرت النتائج عدم تكون الخط الترسيبي عند استعمال طريقة الاوكترلوني بينما تكونت حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب. تم فصل امينوكلوبيولينات الارنب باستعمال المبادل الايوني DEAE - Cellulose بعد عملية الفصل ظهرت ثلاث قمم بروتينية على الطول الموجي 280 نانوميتر تم اختبار فعالية الانظيم في كل قمة مقارنة بالقمم المؤشرة في الادبيات، اظهرت القمة الثالثة حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب بينما لم تظهر خط ترسيبي باستعمال اختبار الاوكترلوني وهذا قد يدلل على وجود تحت الانواع IgG المقاومة لفعالية الانظيم الحال للبروتين ضمن هذه القمة. تم دراسة تاثير التراكيز المختلفة للانظيم الحال للبروتين (0.2، 0.5، 1)ملغم/مل على بعض الخلايا المناعية وفق المعايير التالية : اذ ادى تركيز الانظيم(0.2)ملغم/مل الى زيادة في عيوشية الخلايا اللمفاوية وخلايا متعددة النوى (PMNs) وعلى التشكل الزهري التائي والبائي وعملية التهام الخميرة المقتولة في الزجاج واختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم (NBT) ومعامل الانقسام الخيطي في الفئران. 4 - الدراسة النسجية : - درست التغيرات النسجية المختلفة في الارانب الممنعة بالانظيم الحال للبروتين بتركيز((0.2 ملغم/مل فكان له تاثيرا واضحا على انسجة الكبد، الرئة، الكلية والطحال،اذ لوحظ وجود مناطق تنكس استسقائي شديد في هيولي خلايا الكبد مع احتقان الوريد المركزي في نسيج الكبد، كمالوحظ وجود خلايا التهابية في جدران الاسناخ وضمور تجويف الاسناخ في الرئة، بينما توسعت محفظة بومان مع ارتشاح بعض الخلايا الالتهابية وخاصة حول الكبيبات في الكلية، اما في الطحال ازداد عدد الخلايا التائية حول الشرين المركزي كذلك الخلايا البائية في باقي اللب الابيض في الطحال نتيجة لتكاثرها وفرط نموها. | This study was included four aspects : - 1 - Isolation and ldentifcation : Forty isolates of Proteus spp were isolated and identified among (200) bacterial isolates from patients samples with urinary tracts infection in two hospitals (Baghdad and Al - Kindy). Biochemical tests were showed (20 %) from bacterial isolates were belonged for genus Proteus (37) isolates replied to Proteus mirabilis with (18.5 %) and (3) isolates were for Proteus vulgaris. Ten isolates from Proteus mirabilis were producing for IgA protease while P.vulgaris isolates were non - producing for this enzyme. Proteus mirabilis (Pm5 ) was selected among isolates efficient producing isolate(Pm5). 2 - Purification and characterization of the enzyme : Cysteine lactose electrolyte deficient medium was selected as the best medium for culturing for production the enzyme by P. mirabilis. Bacterial isolate (Pm5) to produce protease, then protease was purified by application Ammonium sulfate with (60 %) saturated, dialysis, Sephadex G - 100 filtration, and Ion exchange with DEAE. Cellulose. The enzymatic activity and protein concentration were measured in every stage of purification. Four peaks were appeared one of them belong to IgA - protease activity, while by using Ionic exchange method was appeared only one peak. Enzymatic activity, protein concentration, specific activity, total activity, no. of purification, and enzymatic yield were determined in Ionic exchange technique were : ( 28.7) U/ml,(0.15)mg/ml,(191.3)U/ml,(258.3),(5.5),(9.9%) respectively, molecular weight of the enzyme was performed by using gel filtration was (50)Kd. The optimum activity was at pH (8), the optimum temperature with the enzymatic activity was at (37) ˚C, the suitable temperature for storage with enzymatic activity was at (4) ˚C, the (Ca+2) Ion has on effect on increasing the enzymatic activity, while the EDTA was suppressed activity. 3 - Immunological study : Three groups of rabbits were used for immunization (two rabbits for each group in addition to control were injected intramuscular by different enzyme concentrations (0.2, 0.5, 1) mg/ml. Two methods (Ouchterlony and tube precipitation are used for checking up specific protease antibody in rabbit serum. Results showed no precipitin line between enzyme as antigen and serum in (Ouchterlony) while there was clear ring of precipitin was formed in the second method. Rabbit immunoglobulines were separated by using DEAE - Cellulose results showed three peaks protein at (280) nm wave length absorbency, enzyme activity of each peak was tested. In comparing these peaks with standard rabbit immunoglobulines. The third peak was tested against IgA - protease by using tube precipitation test result showed precipitation ring. This result indicated that this peak may include IgG subclasses which are resist protease activity while other peaks were opsonized by the enzyme. The effects of the IgA protease concentration (0.2, 0.5,1) mg/ml on immune cells were studied according the following parameters : the effect of the enzyme on immune and (PMNs) cells, T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice, (0.2) mg/ml of the enzyme has an effect on induction activity of T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice. 4 - Histological aspect : Different pathological changes were shown on rabbit’s tissues (liver, lung, kidney and spleen) which were immunized with IgA protease (0.2)mg/ml. In liver great hydropic degeneration was noticed in the cytoplasm in addition to present an with congestion of central venule, inflammatory cells in the alveolar walls and alveolar cavity atrophy in lung, enlargement of Bouman s capsule with infiltration of phagocytes around glomerulus was shown in kidney, while in spleen T cells around central arteriole as well as B cells in other white pulp were increased as a result of proliferation .

تاثـيــر فعالية الانتيروسين المنتج من بكتريا faecium Enterococcus على بعض البكتريا المرضية المعزولة من مصادر مختلفة == Activity effect of enterocin produced from Enterococcus faecium on some pathogenic bacteria isolated from different sources

Author name: حسام سامي عويد الشمري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـتـناول هــذه الـــدراســة تاثـيـر الانتيـروســـين المنتــج بــواســطــة بكــتــريا E.faecium ضـــد بــعــض البكتــريا الــمـمـرضــة المـتـواجـــدة بكثرة في الحـليب ومشتقاته. فقد تم لهذا الغـرض جمع 382عينة من اطفال يعانون حالات اسهال والتهاب السبيل البولي والحليب الخام لعـزل بكتريا E.faecium وتم تشخيص العزلات بالفحوصات الكيموحيوية وتاكيد تشخيصها باستعمال منظومة فايتك 2 . فضلا عن ذلك فقـد تم جمع 50 عينة لعـزل بكتريا Listeria monocytogenes و66 عينة لعزل بكتريا Salmonella typhimurium من الحليب الخام ومشتقاته وتم تشخيصهما باتباع الفحوصات الكيموحيوية وتاكيد التشخيص باستعمال Api Listeria وApi - 20Eاضافة الى التنميط المصلي لبكتريا Salmonella typhimurium . تم تقصي انتاج الانتيروسين المنتج بواسطةE. faecium باستعمال طريقتي اقراص الاكار والانتشار في الحفر , ونقي الانتيروسين باستعمال الترسيب بسلفات الامونيوم والفصل بكحول البيوتانول , كما تم الكشف عن حساسية البكتريوسين المنتج لمجموعة واسعة من الانزيمات الحالة للبروتين والدهون وبعض الانزيمات الاخرى .فضلا عن ذلك فقد تمت دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني على البكتريوسين المنتج , وتم اختبار تراكيز مختلفة من المايتومايسين - سي لحث الانتيروسين .اختبرت الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات بكتريا اللستيريا والسالمونيلا والمكورات المعوية باستخدام طريقة كيربي - باور .يمكن تلخيص النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : كانت نسبة عـزل E. faecium 7.59)%) من مجموع 382 عينة , اما نسبـة عـزل Listeria monocytogenes 10)%) من مجموع 50 عينة , اما نـسبـة عـزل Salmonella typhimurium فقد كانت .06)6%) من مجموع 66 عينة . اظهـر الانتيروســين المنتـج بواســطة E. faecium طـيفا واسعا من التاثير ضـد البكتريا الاختبار المـوجبة والسالبة لصبغـة غــرام التي عددها 8 وبضمـنها Listeria monocytogenes وSalmonella typhimurium . اظهر الحث بالمايتومايسين - سي )بتركيزي 1.5 و2 مكغم/ مل( انتاجا عاليا للانتيروسين . ادت تنقية الانتيروسين جزئيا باستعمال الترسيب بنسبة 80 % الى اعطاء اعلى نتيجة عندما بلغت 2.225 وحدة / مكغم بروتين , اما الفصل بكحـول البيوتانول فقد اعطى محصولا وصــل الى 0.57 وحدة / مكغم بروتين . ادت معاملة الانتيروسين بالانزيمات وتلك الحالة للبروتين حساسية الانتيروسين تجاه هذه الانزيمات باستثناء انزيمات Lipase وCatalase وα - amylaseو Lysozyme . اظهـرت تجارب المعاملة بالحرارة مقاومة الانتيروسين للحرارة وحتى عند121ºC لمدة 20 دقيقة , في حين كان مدى الاس الهيدروجيني له 4 - 9 .اظهرت تجارب الحساسية للمضادات الحيوية ان Enterococcus faecium كانت حساسة الى 7 مضادات حيوية . وكانت بكتريا Listeria monocytogenes مقاومة الى 9 مضادات حيوية وبكتريا Salmonella typhimurium مقاومة الى 4 مضادات حيوية .امكن الحصول على النتائج وكما يلي : انتجت عزلات Enterococcus faecium الانتيروسين بكميات واطئه فيما امكن حثه باستعمال المادة الحاثة المايتومايسين - سي , وامكن تنقيتها جزئيا باستعمال مرسبات البروتين . اتصف الانتيروسين المنتج من هذه البكتريا بطيف واسع النطاق من التاثير ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام ولاسيما تلك التي تلوث الحليب ومشتقاته . | This study investigate the effect of bacteriocin by Enterococcus faecium against some pathogenic bacteria frequently found in milk and dairy product. Three hundred eighty two sample collected from patients and raw milk were used for isolation of E.faecium the isolates were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Vitek 2 system . In addition Listeria monocytogenes , Salmonella typhimurium were isolated from milk and dairy products these were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Api Listeria and Api - 20E system in addition to serotyping to bacteria Salmonella typhimurium . Enterocin produced by E.faecium detected using tow methods Cup agar and Well diffusion and partially - purified using ammonium sulfate precipitation and n - butanol partition , the sensitivity of the material was tested against diverse group of proteolytic , lipolytic and some other enzymes. In addition the effect of temperature as well as pH an the bacteriocin were tested . and used different concentration of Mitomycin - C to induce enterocin . Antibiotic sensitivity of Listeria and Salmonella and Enterococcus isolates were tested using Kirby - Bauer method. The results showed the followings : The isolation rate of E . faecium was (7.59%) from 382 sample , L. monocytogenes isolation rate approach (10%) from 50 sample , S.typhimurium isolation rate reached (6.06%) from 66 sample .Enterocin produce by E . faecium demonstrated a broad - spectrum effect against both gram positive and gram negative bacteria including Listeria monocytogenes and Salmonella typhimurium . Mitomycin - C induction was used to induce a high level production of Enterocin the concentration of optimum inducing agent was 1.5 - 2 mg /ml. The enterocin was partially purified eighty percent of Ammonium sulfate give the highest yield reaching 2.225 Unit /mg protein , n - butanol partition yield 0.57 Unit/mg protein. Enzymatic effect on enterocin demonstrated that proteolytic enzymes completely inactivated the bacteriocin , other enzymes including Lipases Catalase demonstrated no effect. α - amylase , Lysozyme ,The Enterocin was heat - resistance at even 121º C for 20 minute , the optimum pH was shown to be 4 - 9 .Enterococcus faecium was highly sensitive to 7 antibiotic used .and Listeria monocytogenes was highly resistance to 9 antibiotic and Salmonella typhimurium was resistance to 4 antibiotic . In results E . faecium produce enterocin at low level which was induced to high level yield using Mitomycin - C , the enterocin could be partially purified using precipitators protein, That enterocin product of this bacteria characterized a broad spectrum against positive and negative gram bacteria including contaminate milk and its products

تقييم العلاج التصليبي للكيس الكلوي البسيط == Diagnosis and Sclerotherapy evaluation of Simple renal cyst

Author name: جميلة عيسى كاظم الموسوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | يعرب ادريس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اعتمدت معالجة الكــيس الكلـــوي البسـيـط (Simple renal cyst) سابقا على اجراء العمليات الجراحية لازالة الكيس واستخدام قثطرة البولي اثيلين (Polyethylene Catheter) في اجراء عملية الارتشاف البسيط (Simple aspiration) فقط او مع تشريب العلاج الصليبي عن طريق الجلد (Percutaneous sclerotherapeutic instillation ) .اما دراستنا والتي استغرقت عاما واحدا ابتداء من ايلول 2001 ولغاية ايلول 2002 بواقع (31) مريضا يعانون من مرض الكيس الكلوي البسيط الذي شخص لديهم اشعاعيا وسريريا, فقد اعتمدت على اختراق الكيس عن طريق الجلد باستخدام الرشف بالابرة الدقيقة(FNA) (Fine needle aspiration ) وتحت سيطرة جهاز التصوير فوق الصوتي(U/S)(Ultrasonography) في علاج هذا النوع من الاكياس باجراء عملية الارتشاف مع تشريب نوعين من العوامل التصليبية (Sclerosing agent ) اذ استخدمنا عقار التتراسايكلين بشكل اساسي ولاول مرة وفي حالتين فقط استخدمنا الكحول الاثيلي ).95%( وتلى ذلك متابعة المرضى وبشكل منتظم بعد العلاج مدة تراوحت بين الشهر الى ثلاثة اشهر .وكذلك اجريت اختبارات تفريقية للسائل المرتشف تضمنت اختبارات بايوكيميائية وخلوية للتوصل الى افضل طريقة لتشخيص انواع الاصابات التكيسية والتي شملت (الاكياس البسيطة والالتهابية والنزفية والسرطانية). واخيرا تم التوصل الى النتائج التالية اذ ظهر ان اجمالي دقة التشخيص المستخدم في هذه الدراسة كان بنسبة(100%) وقد وصلت النسبة المئوية للاستجابة السريعة للعلاج (67.7%) اما النسبة المئوية لعودة الكيس الى الظهور فلم تتجاوز (6.4%). هذا ومن الجدير بالذكر ان في هذه الدراسة لم تحصل اية مضاعفات غير محسوبة. | Traditinally the mangment of simple renal cyst has been based on the proceeding of surgical operations or by using the polyethelen catheter for simple aspiration and/lor with percataneous sclero / therapeutic instillation.Our study which was over one year period, starting from sept. 2001 to sept. 2002, (32) patients with clinical - radiological diagnosis of simple renal cyst underwent percutaneous fine needle aspiration of the kidney underultra sonic guidance and further manged using two type of sclerotherapeutic agents (like tetracycline Amp. which used mainly in most of our cases, and ethylalcohol (95%) which used only two cases) post sclerotherapy eutic in aperiod between (1 - 3) months post aspiration close regular follow up of all patient, for aperiod from (1 - 3) months post aspiration.Full physical, biochemical & cytological laboratory evaluation of the aspiration fluid has been done in all cases to diagnostic, simple, complicated, neoplastic cysts.Finally the overall aecuracy of the diagnostic procedur was (100%) and the percantage of dromatic respons to treatment was (67.7%) while the recurred percentages no more than (6.4%). So in this study no complication was encountered.

تاثير انزيمي اللايبيز والبروتيز المنتجين من بكتريا Pseudomonas fluorescens في فساد اللحم والحليب == Effect of Lipase and Protease enzymes produced from Pseudomonas fluorescens on Spoilage of Milk and Meat

Author name: ثناء ماجد زاير النوري
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ( 75 ) عينة من المصادر المحلية شملت الحليب الخام ، واللحم البقري الطازج ، وتربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز ، عزلت منها ( 45) عزلة بكتيرية تعود الى جنس Pseudomonas ، وتم عزلها باستخدام وسطين : الاول وسط ( CVB ) الحاوي على صبغة البنفسج البلورية ، والثاني وسط MacConkey agar . اخضعت العزلات جميعها للفحوصات المجهرية والزرعية ، فضلا عن الاختبارات الكيموحيوية التي شملت انتاج انزيمات الاوكسيديز والكاتليز والجيلاتينيز واللايسثينيز، وانتاج الصبغة ، والـتالق تحت الاشعة فوق البنفسجية عند طول موجي ( 254 نانوميتر ) ، واستهلاك السترات كمصدر وحيد للكاربون، والقــدرة على الــنمو بحرارة ( 4 ) م و( 20) م و( 42) م ، وعلى الوسط الحاوي على 6.5 % ملح كلوريد الصوديوم ، وكذلك النمو في وسط ( Triple Sugar Iron - TSI ) ، وعدم انتاج غاز كبريتـــيد الهـــيدروجيـــن فيه ، فضلا عن اجـراء اختبارات عدة الفــــحص الاولـــي api20E وapi20NE . نميت العزلات على وسط اكار حليب الفرز المقشود ( Skim milk agar ) ، وتم التحري عن قابليتها على انتاج انزيم البروتييز، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج . كما نميت العزلات على وسط ران الصلب ( Rhan agar ) للتحري عن قابليتها على انتاج انزيم اللايبيز ، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج تم حساب العدد البكتيري الكلي الاولي لكل من عينات الحليب الخام واللحم الطازج غير المعقمين وعينات الحليب المعقم واللحم المعقم بالاشعة فوق البنفـــسجية بطريقة العــد بالاطباق. اختبر ايضا تاثير بكتريا Pseudomonas fluorescens على عينات الحليب واللحم المعقمين ولوحظت التغيرات في الصفات الحسية ، كما تم حساب العدد الكلي البكتيري الاولي بطريقة العد بالاطباق ومن ثم اختبر تاثير بكتريا حامض اللاكتيك Lactobacillus fermentum ضد بكتريا Pseudomonas fluorescens في عينات الحليب واللحم المعقمين ، وقدرت النسبة المئوية للتثبيط . يمكن تلخيص اهم النتائج التي امكن الحصول عليها بالاتي : اولا _ شخصت (45) عزلة تــــعود للــــنوع Pseudomonas fluorescens ، كانت (20) مــنها مصدرها لحم بقري طازج ، و(15) منها مصدرها حلــــيب بقري خام ، فيــــما كانت العزلات المتبقية (10) مصدرها تربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز. ثانيا _ انتخبت عزلتان هما : PFM6 كونها الافضل كفاءة في انتاج البروتييز، التي كان مصدرها الحليب البقري الخام وPFE4 الافضل كفاءة في انتاج اللايبيز ، والتي كان مصدرها اللحم البقري الطازج. ثالثا _ حددت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتيــــيز من العزلة المحلية PFM6 , اذ كانــــت درجة الحرارة المثلى للانتاج هي ( 20) م وافضل اس هيدروجين (7.2) , كما كان للتـــهوية تاثير فعال في زيادة انتاجية العزلة هذه من الانزيم من خلال قياس قطر منطـــقة التحلل. كما وحــددت الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايبيز من العزلة المحلية PFE4 , اذ كانت درجة الحرارة المثلى للانتاج ( 28) م ، وافضل اس هيدروجيني ( 7.2 ) وكان للتهوية ايضا تاثيرها الفعال في زيادة انتاجية العزلة من انزيم اللايبيز من خلال قياس قطر منطقة الترسب لملح الحامض. رابعا _ بلـــغ الـــعدد البكتـــيري الكــلي الاولي لعيـــنات الحلــــيب الخام واللـــحم الطازج غير المعقمين 10⁶x 1.1)) خلية / مل و(10⁶x 2.1) خلية / غم ، بعد حضانة (3) و(5) ايام على التوالي ، فيما ظلت عينات الحليب المعقم واللحم الطازج المعقم من البكتريا ( صفر خلية / غم) بعد نفس مدة الحضن . خامسا _ تغيرت الصفات الحســـــــية لعينتي الحــــــليب واللحم المعقمين ، بعد تلقيحها (10⁷ X 1 ) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens من حيث القوام واللــون والرائحة والنكهة ، وبلغ معـــدل العـــــدد الكلي البكتـــيري الاولي في العينـــتين (10⁸x 5.1) خلية / مل لعيــــنة الحلـــيب و(10⁸x 9.2) خلية / غم لعينة اللحم بعد الحضن مدة ( 3 ) و( 5 ) ايام على التوالي .سادسا _ تغيرت الصفات الحسية لعينات الحليب واللحم المعقمين بعد تلقيحها بـ (10⁷ X 1) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens و(1) مل راشح بكتريا Lactobacillus fermentum من حيــث القوام واللون والرائـــحة والنكهة ، مع انخــفاض معــدل الــــعدد الكلي البكتيري الاولي في كلتا العينتين والى (10⁶x 1.2) خلية /مل و( 10⁶x 2.7 ) خلية/غم على التوالي ، بعد الحضن لمدة (3) ايام لعينات الحليب و(5) ايام لعينات اللحم ، كما بلــــغت النسبة المئوية للــــــــتثبيط في عينات الحليب 99.764 % وعينات اللــــحم 99.706 %. | Seventy five samples were collected from the local food sources , which included contained crude milk and fresh cow meat, and from rhizosphere soil for rose flower plant . Forty five bacterial isolates were isolated , which are suspected to be belongs to the Genus Pseudomonas .Thus media were used for isolation (CVB) media which contains crystal Violet stain , and MacCkonkey agar. All isolates were subjected to the microbiological and cultural examinations for primary identification . In addition to the biochemical testes which included production of , oxidase , catalase , gelatenase , lecithenase and pigment , as well as glister under the ( UV light ) at ( 254 ) nm wave length , and citrate utilization as the unique source of carbon , ability to grow at ( 4 , 20 and 42) ℃ , and in the media which contained 6.5 % NaCl , also testing the ability to growing at Triple Sugar Iron - (TSI ) medium Producing sulfate hydrogen gas in it .However , api system was used to confirm the identification. The isolates were grown on Skim milk agar media, to test their ability for producing Protease enzyme , then choosing the most efficient isolate , and determing the typical conditions for producing . Also the isolates were grown on the ( Rhan media ) ,to investigate their ability for producing lipase enzyme , then choosing the efficient isolate and determining the typical conditions for producing. Primary total bacterial number was counted for raw milk and fresh beef meat samples . Also primary total bacterial number for the sterilized milk and fresh meat samples with ultra violet ray by using plating method . Effect of Pseudomonas fluorescens on the sterilized milk and meat samples was detected and changes in the sensory characteristics was evaluated. Inhibitory effect of Lactobacillus fermentum against Pseudomonas fluorescens in the sterilized milk and meat samples was investigated , and percentage of inhibition was estimated. Important results may be summarized as follow : 1 - Forty five isolates were identified to belong to Pseudomonas fluorescens species . Twenty of the samples were from fresh meat and fifteen from crude cow milk , while the rest (10) were from rhizosphere soil of rose flower plant . 2 - Two isolates were selected : PFM6 the most efficient in producing protease ( crude cow milk origin ) , PFE4 the most efficient in producing lipase ( fresh cow meat origin ). 3 - Optimum conditions for producing protease enzyme from the local isolate PFM6 were (20)℃, pH( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on ensuring the diameter of analysis zone Also optimum conditions for producing lipase enzyme by the local isolate PFE4 were . ( 28) ℃, pH ( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on measuring the diameter the depositing zone for acid salt. 4 - Primary total bacterial number of the crude milk samples and the fresh meat was estimated as (1.1 x 10⁶) cell / ml , (2.1 x 10⁶) cell / gm , respectively . While the primary total number of bacteria of the sterilized milk and sterilized fresh meat samples was (Zero) cell / ml upon . 5 - Changes occurred in the sensory characteristics ( taste , odor , color and texture) of sterilized milk and meat samples after inoculation with (1X 10⁷) cells / ml of Pseudomonas fluorescens Primary total bacterial number in both samples were (5.1x 10⁸) cell / ml , (9.2x 10⁸) cell / gm respectively. 6 - Changes occurred in sensory characteristics ( taste , odor , color and texture of sterilized milk and meat samples after incubation with (1X 10⁷) cell/ ml of Pseudomonas fluorescens bacteria, and with 1ml Lactobacillus fermentum. Primary total bacterial numbers of both samples were decreased to (1.2x 10⁶) cell / ml ,( 2.7x 10⁶) cell / ml respectively after incubation 3 days for milk sample , 5 days for meat samples. Percentages of inhibition were in milk sample 99.764 % and in meat sample 99.706%.

دراسة انتشار الهائمات النباتية والفطريات المائية في المياه الجارية ضمن محافظة بغداد وتاثير العوامل البيئية عليها == A Study of the Distribution of Phytoplankton and Aquatic Fungi in the Lotic Water in Baghdad District and the Effect of Environmental Factors

Author name: تريفة كمال جلال فرخه
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | علي عبد الزهرة اللامي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى مقارنة تواجد الهائمات النباتية والفطريات المائية في اربعة انظمة مياه جارية ضمن مدينة بغداد وعلاقة ذلك بالظروف البيئية المختلفة ، اختيرت اربعة محطات تمثل النظم الجارية وهي : ذراع الثرثار ونهر دجلة وقناة الجيش ونهر ديالى وتم دراسة تواجد بعض الفطريات المائية Aquatic fungi والهائمات النباتية Phytoplankton والعلاقة بين تواجدهما وبين العوامل الفيزيائية والكيميائية ، وجمعت النماذج شهريا ولمدة خمسة عشر شهرا ابتداء من شهر نيسان 2004 ولغاية حزيران 2005. شملت الدراسة الخصائص الفيزيائية والكيميائية وتمثلت في درجة حرارة المياه وسرعة التيار ودرجة الاس الهيدروجيني والتوصيلية الكهربائية والاملاح الذائبة الكلية والكدرة والاوكسجين الذائب والنسبة المئوية للاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية والمغذيات النباتية (النترات والنتريت والفوسفات). تم تشخيص الهائمات النباتية ودراسة التكوين النوعي لها وكثافتها كذلك عزل وتشخيص بعض الفطريات المائية السابرولكنيسية Saprolegniaceae الموجودة في محطات الدراسة. اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه متاثرة بدرجة حرارة الهواء المحيط وتراوحت بين (10 - 29)م في ذراع الثرثار وبين (10 - 27)م في نهر دجلة و(11 - 29.5)م في قناة الجيش اما في نهر ديالى فكانت (11 - 30.6)م. تميزت المياه في المحطات الاربعة بقاعدية خفيفة حيث تراوحت قيم الاس الهيدروجيني بين (6.1 - 8.0) ، وكانت التوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والمواد الصلبة الكلية في نهر ديالى اعلى نسبة الى بقية المحطات حيث بلغت 2710 مايكروسيمنز/سم و1.73 و1.35 غم/لتر على التوالي ، وكانت المياه ذات تهوية جيدة في كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة نسبة الى قناة الجيش ونهر ديالى وسجلت قيم عالية للعسرة حيث ان اعلى قيمة للعسرة بلغت 1250 ملغم/لتر في قناة الجيش وتلتها في نهر ديالى حيث بلغت 1230 ملغم/لتر. اما بالنسبة الى تركيز النترات فتراوح بين 0.06 - 10.0 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.02 - 6.30 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 9.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.11 - 9.60 ملغم/لتر في نهر ديالى. اما النتريت فتراوحت تراكيزه بين 0.01 - 1.10 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.004 - 1.20 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 1.20 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.07 - 1.60 ملغم/لتر في نهر ديالى ، وتواجد الفسفور في ذراع الثرثار بمعدل 0.17 ملغم/لتر و0.071 ملغم/لتر في نهر دجلة و4.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و2.67 ملغم/لتر في نهر ديالى. واظهرت نتائج التحليلات الاحصائية وجود فروقات معنوية بين محطات الدراسة للعديد من الخصائص الفيزيائية والكيميائية وبالذات فيما يتعلق بالتوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والاملاح الذائبة الكلية والاوكسجين الذائب ونسبة الاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية مما يعزى الى تعرض بعض المواقع الى التلوث وانخفاض في منسوب المياه. شخصت خلال هذه الدراسة 166 وحدة تصنيفية للهائمات النباتية تضمنت 107 من الدايتومات و28 من الطحالب الخضر و22 وحدة تصنيفية تعود الى الطحالب الخضر المزرقة وتوزعت البقية بين صفوف الطحالب اليوغلينية والدوارة (البروات) والكربتات والصفر الذهبية وكان اعلى عدد للوحدات المشخصة في نهر دجلة تلاه نهر ديالى ، وظهرت عدة اجناس تمثلت باكبر عدد من الانواع ضمن الهائمات النباتية (Nitzschia وNavicula وCymbella وCyclotella وGomphonema). وتميزت الدايتومات بكثافة عالية في ذراع الثرثار ونهر دجلة ونهر ديالى والفت النسب المئوية (87.4% ، 91.4% و69.6%) على التوالي اما قناة الجيش فبلغت 16.9%. وكانت رتبة الدايتومات الريشية Pennales اكثر كثافة من رتبة الدايتومات المركزية Centrales ضمن الهائمات النباتية المشخصة. اما بالنسبة للفطريات المائية فقد تم عزل 21 نوعا 19 منها تعود الى العائلة السابرولكنيسية التي شملت الاجناس Saprolegnia وتمثلت بستة انواع والجنس Achlya وتمثل بـ 11 نوع والجنس Dictyuchus بنوعين ونوع واحد للعائلة Leptomitaceae واخر Pythiaceae ، تم تسجيل 168 عزلة في نهر دجلة و146 عزلة في ذراع الثرثار و50 عزلة في قناة الجيش و86 عزلة في نهر ديالى من المجموع الكلي للعزلات التي بلغت 450 عزلة ، ولوحظ تشابه كبير في عدد انواع الفطريات بين كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة حيث سجل (20 و19) نوع على التوالي اما في قناة الجيش فقد سجلت ثمانية انواع فقط في حين عزلت 15 نوع في نهر ديالى. ومن ضمن الفطريات المائية تميز Saprolegnia ferax باعلى نسبة تواجد حيث بلغ 16.44% وتلاه Pythium sp. ايضا بتواجد عال والفت 12.22% في جميع المحطات واقل نسبة مئوية كانت للفطر Saprolegnia litoralis والذي سجل نوعا نادر التواجد حيث ظهر في شهر واحد ولمرة واحدة فقط في ذراع الثرثار. لوحظ بان نسبة تواجد الفطريات المائية كانت مرتبطة عكسيا في معظم اوقات السنة وفي جميع المناطق بتواجد الهائمات حيث انها ازدادت بعد الانخفاض في منحنى النمو للهائمات ويعود ذلك لكونها (اي الفطريات) كائنات رمية التغذية غالبا فتنمو على البقايا العضوية للهائمات وتقوم بتحليلها وتحويلها الى مغذيات جاهزة تنمو عليها الهائمات ويزداد تواجدها ، كذلك فان الظروف البيئية الملائمة تكون متماثلة لكليهما في بعض الاوقات وتختلف في احيان اخرى. | The aim of this work was to study the occurrence of Phytoplankton and aquatic fungi (Oomycetes) in four lotic aquatic systems within Baghdad city (Tharthar Arm, Tigris River, Al - Jaish Canal and Diayla River) during 15 months, the following physico - chemical parameters were also measured : water temperature, pH, electrical conductivity, salinity, total dissolved solids, turbidity, dissolved oxygen, percentage saturation oxygen, total hardness and the nutrients. The effect of the different environmental factors on both Phytoplankton and fungi was investigated. The study included the biological aspects such as species composition and densities of Phytoplankton, isolation and identification of Oomycetes especially Saprolegniaceae for fungi. The results showed that the water temperature was affected by surrounding air temperature, it ranged from 10 - 29C in the Tharthar Arm and from 10 - 27C in Tigris River, 11 - 29.5C in Al - Jaish Canal and 11 - 30.6C in Diayla River. The water of all stations was slightly alkaline with pH values ranging from 6.1 - 8.0, the electrical conductivity, salinity and T.D.S are higher in Diayla River than the other stations. Waters were more aerated in Tharthar Arm and Tigris River than the water of Al - Jaish Canal and Diayla River, the water classified as very hard at all stations, the highest value of total hardness obtained at Al - Jaish Canal it reached 1250 mg/L followed by Diayla River 1230 mg/L. The Nitrate and Phosphate found in highest mean concentration 3.48, 4.67 mg/l respectively in Al - Jaish Canal followed by 2.09, 2.67 mg/l in Diayla River. A significant difference was found between the four stations concerning physico - chemical characters especially the electrical conductivity, salinity, TDS, dissolved oxygen, percentage of saturated oxygen and total hardness. 166 taxa of Phytoplanktons throughout the four stations were identified, diatoms was dominated (107) followed by the Chlorophyceae (28) Cyanophyceae (22) and the remaining belongs to Pyrrophyceae, Cryptophyceae and Xanthophyceae, more taxa were identified in Tigris River followed by Al - Jaish Canal. Some genera of Phytoplanktons were represented by higher numbers of the species such as Nitzschia, Navicula, Cymbella, Cyclotella and Gomphonema. Among the diatoms Pennales were dominated up on centrales, the Phytoplankton density was higher in the Tigris River 22942.6  103 ind./l followed by Al - Jaish Canal 18944.1  103 ind./l, 10106.2  103 ind./l in Diayla River and 8025.1  103 ind./l in Tharthar Arm. The diatoms comprised 91.4% in Tigris River and 87.4% in Tharthar Arm and 69.8% in Diayla River and 16.9% in Al - Jaish Canal. Out of 600 isolates of fungi carried out, 450 reached reproductive maturity so that it was possible to identify it to the level of species. 21 species belongs to 5 genera were identified in the present study, all these species have been described in detail. Most genera (isolates) were obtained through Winter which was the best season for its growth, among the 21 species 19 belongs to the family Saprolegniaceae, 5 species belonged to the genus Saprolegnia, 11 species belongs to the genus Achlya, 2 species belong to the genus Dictyuchus and 1 species to the family Leptomitaceae and the others to Pythiaceae. Out of 450 isolates, 168 isolates identified in Tigris, 146 isolates from Tharthar Arm, 50 isolates from Al - Jaish Canal and 86 isolates from Diayla River. Among the Oomycetes Saprolegnia ferax comprise 16.44% follwed by Pythium sp. 12.22% and less percentage obtained for Saprolegnia litorlis which consider as a rare species in rare occurrence. There was a reversal correlation between Phytoplankton and fungi, both were affected by the same environmental factors in some times and responsed differently at other occasitions

دراسة بكتريولوجية عن بكتيريا Moraxella catarrhalis المعزولة من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن في محافظة بابل

Author name: بشرى جبار حمود حمزة التميمي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد صبري عبد الرزاق
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة جمع (100) عينة من مرضى يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي المزمن(CSOM) في مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل وللفترة من ايلول 2003 ولغاية شباط 2004. تم تشخيص عزلات بكتيريا Moraxella catarrhalis ودراسة بعض عوامل ضراوتها المهمة، وكذلك دراسة وتحديد حساسية ومقاومة هذه البكتيريا للمضادات الحيوية المختلفة، وتاثير بعض العوامل الفيزيائية المؤثرة في نمو البكتيريا والمتمثلة بدرجة الحرارة وpHالوسط، وشملت الدراسة ايضا تاثير مادة الشمع التي تفرزها الاذن على نمو هذه البكتيريا.كانت نتائج الدراسة كما يلي : • تم تشخيص سبع عزلات تعود لبكتيريا Moraxella catarrhalis من المرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى المزمن، وبنسبة 6.48) (%، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع هو بكتيريا Pseudomonas aeruginosa وبنسبة 33.3)%(، تلتها بكتيريا Staphylococcus aureus 24.07)%(، تلتها بكتيريا Proteus mirbilis 16.6)%(، ثم بكتيريا Streptococcus pneumoniae (%13.8)و Acinetobacter وKlebsiella sp.بنسبة (2.77%) لكل منهما.• عند التحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتيريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت البكتيريا عدم امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثاني في حين امتلكت كافة العزلات عامل الاستعمار الثالث. • اظهرت اثنان فقط من العزلات قابليتها على انتاج انزيم البروتيز الخارج خلوي(Extra cellular protease)في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين والسايدروفورات وكذلك عدم قدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة امكانية نمو البكتيريا في درجات الحرارة الواقعة بين (40 - 25)م وكان افضل نمو لها في درجة حرارة (35)م في حين لم تنمو هذه البكتيريا في الدرجات الحرارية اعلى من (45)م.• اظهرت النتائج ان هذه البكتيريا تنمو في مدى اس هيدروجيني pH يتراوح من (8 - 4.5) وكان افضل نمو عند pH (4.5). في حين لم تنمو هذه البكتيريا عند قيمة pH (9).• اظهرت جميع العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيوية Penicillin Gو Ampicillin وAmoxycillinو Tetracycline. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية Chloramphenicolو Ciprofloxacinو Cephalexinو Cefotaximeو Cephalothin وGentamicin.• تم الكشف عن تاثير المادة الشمعية التي تفرزها الاذن على نمو بكتيريا M. catarrhalis ، اذ اظهرت النتائج تاثيرا مثبطا لنمو اربع عزلات فقط من بكتيريا M. catarrhalis في حين لم تتاثر باقي العزلات. | In this study, 100 ear swabs samples were obtained from patients suffering from chronic suppurative otitis media (CSOM), admitting to Hilla Teaching hospital in Babylon province during the period September 2003 to February 2004, the isolates of Moraxella catarrahlis were identified, and studied their virulence factor, their antibiotic resistance, the effect of wax substance of human ear, and some physical factors (pH, Temperature) on the bacteria M. catarrahlis growth. Results obtained in this study can be summarized as follow : • Only seven isolates of M. catarrahlis were identified (6.48%), also other isolates Pseudomonas aeuroginosa was the most common isolated (33.3%), followed by Staphylococcus aureus (24.07%) and Proteus. mirabilits (16.6%), Streptococcus pneumoniae (13.8%), Klebsiella sp. and Acinetobacter (2.77%).• Invistigation of pathogenicity factors such as Adhesion or colonization factors results showed ability all isolates of M. catarrahlis to produce (CFA/III) only.• M. catarrahlis isolated during this study possessed only colonization factor III, colonization factor I, II were not presented on this bacterium.• Two isolates only were able to produce extra cellular protease, but all isolates were unable to produce haemolycin, sidrophores, and capsules.• This bacterium were able to grow in a temperature range (25 - 40)C and the optimum temperature for growth was (35)C, no growth was detected at temperature more than (45)C.• M. catarrahlis were grown at pH ranging from (4.5 - 8), it was showed that the optimum pH was at (4.5),and there was no growth recorded at pH (9).• All isolates showed complete resistant to Penicillin G, Ampicillin, Amoxycillin and Tetracycline, and was resistant to lesser extent to Ciprofloxacin, Chloramphenicol ,Cephalothin, Cefotaxime, Cephalexin, and Gentamicin.• The effect of wax substance of human ear showed affected only four isolates by waxy substance.

تاثير مجموعة الفلوروكوينولونات في فاعلية انزيمي البروتييز والهيمولايسين للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية

Author name: بثينة محمد طه عبد الحسين
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت هذه الدراسة عزل وتشخيص بكتريا المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus من اثنين من مستشفيات بغداد خلال المدة من تشرين الثاني 2006 الى حزيران 2007 . تناولت هذه الدراسة جمع 500 عينة سريرية شملت عينات الادرار, والدم , ومسحات الجروح , والحروق , والاذن , والانف , والمهبل , والدمامل , والقشع , والعين . • زرعت العينات (المسحات وعينات الادرار والدم) مباشرة على وسط اكار الدم, لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري, حضنت الاطباق بدرجة حرارة 37م° لمدة 24 ساعة . اخضعت العينات للفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية , وشخصت على هذا الاساس 100 عزلة بكتيرية تعود للمكورات العنقودية الذهبية (S.auerus) وبنسبة عزل 20% . • اختبرت حساسية العزلات تجاه سبعة مضادات جرثومية , ستة منها تعود الى مجموعة الفلوروكوينولونات , ومضاد حياتي واحد هو الاوكساسلين الذي يعود الى مجموعة البيتا - لاكتام ,وقد بينت النتائج ان البكتريا المعزولة كانت مقاومة وبنسب عالية لكلا المجموعتين من المضادات الجرثومية قيد الدراسة , اذ كانت نسبة مقاومة Enrofloxacin 80% , 72 Ofloxacin % ,ثم Pefloxacin 71% . كما تقاربت نسب مقاومة المضادين الجرثوميين Levofloxacin وNorfloxacin , اذ كانت 57% و52% على التوالي , فيما بلغت المقاومة ضد Ciprofloxacin 33% فقط . • اظهرت91 % من العزلات قيد الدراسة مقاومة للاوكساسلين ,وهذا يشير الى مقاومة تلك العزلات للمثسلين (Methicillin - resistant Staphylococcus aureus)• اوضح اختبار التراكيز المثبطة الدنيا (Minimal inhibitory concentrations) ان Levofloxacin كان الاكفا في تثبيط هذه البكتريا , اذ بلغت قيمة MIC بين (64 - 4) مايكروغرام / مل , في حين تراوحت قيم MIC للـ (Ciprofloxacin) بين (512 - 4) مايكروغرام / مل وOfloxacin بين ((512 - 16 مايكروغرام / مل وNorfloxacin بين (1024 - 16) مايكروغرام / مل . • اختبرت قدرة العزلات المحلية على انتاج انزيم الهيمولايسين على اوساط الدم باستخدام الاصناف الاربعة لدم الانسان ( A ,B, AB,O ) , وقد كانت منتجة وبنسبة 82.75 % عند استخدام الصنف A , وبنسبة 93.10% عند استخدام الصنف AB وبنسبة 79.31% عند استخدام الصنف B , وبنسبة 79.41 % عند استخدام الصنف O , وهذا يظهر بوضوح ان صنف الدم AB هو افضل الاصناف لمعرفة نوع التحلل . • تم التحري عن قابلية البكتريا قيد الدراسة على انتاج انزيم البروتييز على وسطي اكار الحليب الفرز واكار كولومبيا الحاوي على الحليب الفرز واعتماد ظهور هالات شفافة حول المستعمرات . كانت العزلات منتجة لهذا الانزيم بنسبة 79.31 % على وسط اكار الحليب الفرز , وبنسبة 82.75 % على وسط اكار كولومبيا , الذي اظهر كفاءة اعلى في الكشف عن هذا الانزيم. • حضرت التراكيز تحت المثبطة للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin وLevofloxacin واختبر تاثيرها في فعالية انزيمي الهيمولايسين والبروتييز ولوحظ ازدياد فعالية هذين الانزيمين عند التراكيز المدروسة, فقد ازداد النشاط الهيمولايسيني باستخدام صنف الدم A الى 86.20% للمضادات الجرثومية الاربعة, الصنف B الى 86.20% باستخدام Norfloxacin , و82.75% مع المضادين الجرثوميينCiprofloxacin وOfloxacin , و89.65% للمضاد Levofloxacin , الصنف AB % 100للمضادات الجرثومية Ciprofloxacin وNorfloxacin وOfloxacin , والى96.55 % للـ Levofloxacin , اما الصنف O فقد ارتفع الى 74.41% للـ Norfloxacin والى 75.86% للـ Ciprofloxacin وOfloxacin والى 93.10% للـ Levofloxacin .ارتفعت فعالية انزيم البروتييز الى 86.20 % عند التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات الجرثومية الاربعة. | This study was included the isolation and identification of Staphylococcus aureus from two of Baghdad hospitals , during the period of November 2006 to June 2007. Five hundreds clinical samples of urine and blood and the swabs of wounds , burns, ear, nose, vagina, abscesses, sputum and eye, were collected .The samples were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria , the plates were incubated at 37°C for 24 hours . The samples were objected to the microscopic examination and biochemical tests , though 100 bacterial isolates were belonged to Staphylococcus aureus (20%) .The susceptibility of the isolates was tested toward 7 antimicrobial agents , six of them belong to the Fluroquinolones group and one antibiotic (Oxacillin) belongs to the Beta - Lactam group . The results showed that these bacteria were highly resistant to both groups of the studied antimicrobial agents . The percentage of resistance to Enrofloxacin was 80% , followed by Ofloxacin 72% then Pefloxacin 71% , Levofloxacin and Norfloxacin were nearly identical 57% and 52% respectively , while the resistant to Ciprofloxacin was only 33% .Ninety - one percent of isolates were resistant to Oxacillin , Thus it was Methicillin - resistant Staphylococcus aureus (MRSA) .The test of minimal inhibitory concentrations (MICs) showed that Levofloxacin was the most active in inhibiting these bacteria , its MIC was ranging between 4 - 64 gml , while for Ciprofloxacin , the MICs values ranged from 4 - 512 gml , Ofloxacin 16 - 512 gml , Norfloxacin 16 - 1024 gml .The ability of the isolates for the production of hemolysin enzyme was studied on blood agar media by using the four human blood groups (A, AB, B, O ) . 82.75% of the isolates were producing hemolysin by human blood group A , 93.10% with group AB , 79.31% with group B , and 72.41% with group O , this clearly showed that AB blood group is the best type to detect hemolysin activities .The ability of bacteria to produce protease enzyme on skim milk agar and skim milk Columbia agar media was investigated , and depending on the appearance of clear zones around the colonies , 79.31% of isolates were able to produce this enzyme on skim milk agar media and 82.75% of isolates were able produce this enzyme on skim milk Columbia agar , which was more suitable for detecting this enzyme .The sub - inhibitory concentrations of Ciprofloxacin , Norfloxacin , Ofloxacin and Levofloxacin were prepared and its effect on the hemolysin and protease activity was tested . The activity of the two enzymes were increased by using these concentrations , hemolytic activity raised by using blood group A to 86.20% with the four antimicrobial agents , group B to 86.20% with Norfloxacin, 82.75% with Ciprofloxacin and Norfloxacin, and 89.65% with Levofloxacin , group AB 100% with Ciprofloxacin , Norfloxacin and Ofloxacin , and to 96.55% with Levofloxacin , while by using blood group O it is raised to 74.41% with Norfloxacin , 75.86% with Ciprofloxacin and Ofloxacin , 93.10% with Levofloxacin . Protease activity raised to 85.20% with the sub inhibitory concentration of the four antimicrobial agents.

الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية عند الاناث المصابات بقصور الغدة الدرقية == Physiological Disorders in Some Liver and Kidney Functions in Females Hypothyroid Patients

Author name: بان حسين حميدي
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية لبيان الاضطرابات الفسيولوجية في بعض وظائف الكبد والكلية لدى النساء العراقيات المصابات بقصور الغدة الدرقية. اجريت الدراسة على 120 امراة في المركز التخصصي لامراض الغدد الصم والسكري الواقع في منطقة الرصافة بالقرب من مستشفى الكندي . للفترة من 20/10/2013 ولغاية25/1/2014. قسمت مجموعة الدراسة الى اربعة مجاميع : (مجموعة السيطرة control, مصابات سابقا بقصور الغدة ومعالجات Euthyroid, قصور تحت السريري Subclinical hypothyroidism(SCH) , قصور الغدة العلني او الواضح Overt hypothyroid(OH) )تضمنت كل مجموعة 30 امراة . اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى هرمون Thyroid stimulating hormone(TSH)في القصور تحت السريري 18.23± 2.34 mu/l)) والقصور العلني (41.37± 3.75 mu/l) مقارنة مع مجموعة السيطرة 2.09± 0.23 mu/l)) والقصور في المعالجات) 2.89± 0.20 mu/l) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون Thyroxin (T4) (46.36± 2.32nmol/L) ومستوى طبيعي لهرمون Tri - iodothyronine (T3) في مجموعة القصور العلني مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; ( 1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة القصور المعالجات (87.10 ± 2.16nmol/L); ( 1.58 ±0.05 nmol/L) على التوالي .اظهرت النتائج انخفاضا غيرمعنويا (p˃0.05) في مستوى هرمون T4 في مجموعة القصور تحت السريري (77.76 ±2.31 nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (79.73± 2.11nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (78.10 ± 2.16nmol/L) .اظهرت النتائج انخفاضا معنويا (p˂0.05) في مستوى هرمون T3 في مجموعة قصور تحت السريري (1.52± 0.08nmol/L) ومجموعة القصور العلني (1.30 ± 0.11nmol/L) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.70 ± 0.07nmol/L) ومجموعة قصور المعالجات (1.58 ± 0.05nmol/L) على التوالي. اظهرت فحوصات الكبد ارتفاعا معنويا (P<0.05) في مستويات انزيمات الـ Glutamic - oxaloacetic transaminase(SGOT) (23.05±2.67U/L) وGlutamic pyruvic transaminase(SGPT) (21.89±2.35U/L) وAlkaline phosphatase (ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مستويات الـ SGOT في مجموعة السيطرة(8.80 ± 0.88U/L) والقصور المعالجات (11.36 ± 0.85 U/L) ومستوى الـ SGPT في السيطرة (13.46 ± 0.75 U/L) والقصور المعالجات (10.93±1.03U/L)و كذلك مستويات الـ ALP في السيطرة(65.27±2.65U/L)و القصور المعالجات (65.27±2.87U/L).ازدات مستويات انزيمات الكبد SGOT(11.88±1.42U/L) وSGPT (14.08±1.87nmol/L) وALP(65.27±2.87U/L )زيادة غيرمعنوية (P˃0.05) في مجموعة قصور تحت السريري مقارنة مع مجموعة السيطرة لانزيم SGOT(8.80 ± 0.88U/L) ومجموعة قصور المعالجات (11.36 ±0.85U/L) ومستوى انزيم SGPT في مجموعة السيطرة (13.46±0.75U/L) ومجموعة قصور المعالجات (10.93±1.03U/L) وكذلك انزيم ALPفي مجموعة السيطرة (50.27 ±2.65U/L) ومجموعة قصور المعالجات (65.27 ± 2.87U/L) . ازدادت مســــتويات البروتين الكلي (7.49 ± 0.16 g/dl) والبليروبين (1.23 ± 0.11 mg/dl )بصورة معنوية (P<0.05) في مجموعة مرضى القصور العلني مقارنة مع مجاميـع السيطرة ((0.613 ± 0.04 mg/dl) , ( 6.82 ± 0.04 g/dl والقصـــــور المعالجات{(0.653 ± 0.04mg/dl),(6.93 ± 0.07g/dl)}على التوالي .انخفض مستوى البروتين الكلي في مجموعة القصور تحت السريري (6.91 ±0.089g/dl) انخفاضا غير معنوي p˃0.05))مع مجموعة السيطرة (6.82±0.04g/dl) ومجموعة قصور المعالجات (6.93 ±0.07g/dl) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية (p˂0.05) في مستويات البليروبين (0.883 ± 0.08mg/dl)في مجموعةالقصور تحت السريري مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (0.613±0.04mg/dl) و(0.653 ±0.04mg/dl) على التوالي. اظهرت مريضات القصور تحت السريري والقصور العلني زيادة معنوية (P<0.05) في مستويات الدهون (mg/dl) الدهون الثلاثية TG (144.27 ± 9.89mg/dl) , (165.30 ± 3.70) والكولستيرول TC (233.37 ± 12.92 mg/dl), (301.87 ± 11.05mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة LDL - C (176.57 ± 13.03 mg/dl) , (238.60 ± 10.59 mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (28.80 ± 1.96mg/dl) , (33.07 ± 0.74mg/dl) مقارنة مع مستويات السيطرة والقصور المعالج في مستويات الكولستيرول TC(154.86 ± 5.94mg/dl) , (173.93± 3.11mg/dl)و كــــــذلك الدهون الثلاثية TG(94.83± 3.53mg/dl) , ( 88.57± 4.15mg/dl) والـــــبروتينات الدهنــــــية الواطــــــئة الكثافة(97.43 ± 5.90mg/dl) , (118.47 ± 4.85mg/dl) والبروتينات الدهنية الواطئة الكثافة جدا VLDL (19.23 ± 0.73 mg/dl) , (17.73 ± 0.84mg/dl) على التوالي ,وانخفاضا معنويا (P<0.05) في البروتينات الدهنـــــية عالية الكثافة HDL - Cفي مجمـــــوعتي تحت السريري والقصور العلني (25.27 ± 0.95 mg/dl) ,(27.93 ± 0.68 mg/dl) مقارنة مع السيطرة (37.17 ± 0.77mg/dl) , والقصور المعالج (38.47 ± 0.67mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية (P<0.05) في مستوى ضغط الدم الانقباضي (mmHg) في مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (14.30 ± 0.24 ) و(13.36 ± 0.19 ) مقارنة مع السيطرة والقصور المعالجات (11.56 ± 0.20),(11.67 ± 0.19)على التوالي.و كذلك اظهرت الدراسة هناك زيادة معنوية (P<0.05) في ضغط الدم الانبساطي في كل من مجموعتي القصور العلني وتحت السريري (7.76 ± 0.17),(6.93 ± 0.22)على التوالي مقارنة مع السيطرة والقصور في المعالجات (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22)على التوالي.و لوحظ كذلك زيادة معنوية في قياس كتلة الجسم BMI(Kg/H2) (P<0.05) في مجموعتي التحت السريري والقصور العلني او الواضح (29.30 ± 0.90),(28.90 ± 0.73) مقارنة مع مجموعة السيطرة والقصور العلني (24.10 ± 0.39),(24.73 ± 0.49) على التوالي.اظهرت النتائج زيادة معنوية في مســــتوى الكــــرياتنين (P<0.05) في مجموعة تحت السريري (1.07 ± 0.07mg/dl) وفي القصور العلني (1.26 ± 0.06mg/dl) مقارنة مـــع مجموعــــــــة الســــــيطرة (0.846 ± 0.03mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (0.836 ± 0.02mg/dl). ازداد مستوى حامض البوليك( uric acid )زيادة معنوية (p<0.05) في مجموعة مرض قصور الغدة العلني (7.11 ± 0.11mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة وقصور المعالجات (3.78 ± 0.18mg/dl) , (3.66 ± 0.16mg/dl) على التوالي.و كذلك لوحظ زيادة غيرمعنوية (p˃0.05 ) في مستوى حامض البوليك في مجموعة القصور تحت السريري (4.00±0.22mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ±0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ±0.11mg/dl) . انخفض مستوى الكالسيوم بصـــــورة معنـــوية (P<0.05) في مجمــــوعة القصـــــور تحت السريري±0.09) 8.38)و العــــــلني (8.12 ± 0.10 mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة ومجمــــوعة قصــــور المـــــعالجات (8.92 ± 0.05 mg/dl) , (8.80 ± 0.06mg/dl) على التوالي. اظهرت النتائج زيادة معنوية في مستوى الفسفور (P<0.05) في مجموعة قصور الغدة العلني (5.49 ± 0.18mg/dl) مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.89 ± 0.07mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات (3.26 ± 0.11mg/dl) .كما اظهرت النتائج زيادةغير معنوية (p˃0.05 ) في مستوى الفسفور في مجموعة قصور تحت السريري ( 4.00 ± 0.22 mg/dl) مقارنة مع مجموعتي السيطرة وقصور المعالجات (2.89 ± 0.07mg/dl) , ( 3.26 ± 0.11 mg/dl) على التوالي. ارتفع مستوى المغنيسيوم (P˃0.05) بصورةغير معنوية (2.67 ± 0.09mg/dl - )مقارنة مع السيطرة (2.12 ± 0.02mg/dl) ومجمــــوعة قصـــور المعالجات (2.29 ± 0.05mg/dl) وازداد مستوى المغنسيوم في مجموعة قصور تحت السريري (2.14 ± 0.03 mg/dl) زيادة غير معنوية (P˃0.05)مقارنة مع مجموعة السيطرة (2.12 ± 0.02 mg/dl) ومجموعة قصور المعالجات ( 2.29 ± 0.05mg/dl). نستنتج من الدراسة الحالية ان قصور الغدة الدرقية العلني اثر على وظائف الكبد والكلى واوضحت القيم المدروسة اعلاه في (مرضى القصور في المعالجات) رجوعها الى الحالة الطبيعية بعد تناولهم العلاج L - levothyroxine بجرعتي (50ملغم) او (100 ملغم). | Thyroid gland is one of the largest endocrine gland ,it is shaped like abutter fly located in appropriate place slightly below the larynx .It secretes 93%of thyroxin (T4) , 7% tri - iodothyronin (T3) and the third hormone calcitonin. The present study aimed to investigate physiological disorders in some liver and kidney functions in hypothyroid Iraqi women .The study was carried on 120 subjects in the Specialist Center of Endocrine and Diabetic Diseases at Rusafa region, near AL - Kindey Hospital . That study began on 20/10/2013 to 25/1/2014 . The subjects were divided in to 4 groups (control, euthyroid ,subclinical(SCH) and overt hypothyroid(OH)).Each group included 30 females .The results showed a significant(P˂ 0.05) increase in the level of TSH in subclinical (18.23 ± 2.34mu/l) and overt hypothyroid patients (41.37 ± 3.75 mu/l) in comparison with control (2.09 ± 0.23mu/l) and euthyroid groups (2.89 ± 0.20mu/l). The level of T4 (46.36 ± 2.32 nmol/L) showed a significant (p˂0.05) decrease with normal T3 in OH group (1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) ; (1.70 ± 0.07 nmol/L) euthyroid (87.10 ± 2.16 nm0l/L) ;(1.58 ± 0.05 nmol/L) respectively.The level of T4 showed no significant (p˃0.05)decrease (77.76 ± 2.31 nmol/L) in SCH group in comparision with control (79.73 ± 2.11 nmol/L) and euthyroid (87.10 ± 2.16 nmol/L) groups respectively.The level of T3 showed no significant (p˃0.05) decrease in SCH (1.52 ± 0.08 nmol/L) and OH group(1.30 ± 0.11 nmol/L) in comparision with control (1.70 ± 0.07 nmol/L) and euthyroid (1.58 ±0.05 nmol/L) groups respectively. The changes in liver function tests in OH group showed a significant (P˂0.05) increase in the levels of Glutamic - oxaloacetic transaminase (SGOT) (23.05 ± 2.67U/L), glutamic pyruvic transaminase (SGPT)(21.89 ± 2.35 U/L) and Alkaline Phosphatase( ALP) (99.98 ± 7.47 U/L) in comparison with SGOT in control (8.80 ± 0.88 U/L) , euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) and SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L)euthyroid (10.93 ± 1.03 U/L), and in the level of ALP in control(50.27 ± 2.65 U/L),euthyroid (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.The levels of SGOT(11.88 ± 1.42 U/L) ; SGPT(14.08 ±1.87U/L) and ALP (65.27 ±2.87 U/L) non significant increase (p˃0.05) in SCH group in comparison with SGOT in control (8.80 ±0.88U/L) and euthyroid (11.36 ± 0.85 U/L) ,SGPT in control (13.46 ± 0.75 U/L) and euthyriod (10.93 ± 1.03 U/L) and ALP in control (50.27 ± 2.65 U/L) ,euthyriod (65.27 ± 2.87 U/L) respectively.Total serum protein(TSP) (7.49 ± 0.16 g/dl) and bilirubin (1.23 ± 0.11 mg/dl) were increased significantly (P˂ 0.05) in OH patients in comparable with control (6.82 ± 0.04 gm/dl) ; (0.613 ± 0.04 mg/dl),euthyroid(6.93 ± 0.07gm/dl) ;(0.653 ±0.04 mg/dl) respectively. TSP level in SCH group (6.91 ± 0.08 g/dl) was no significant decrease (p˃0.05)in comparison with control (6.82 ± 0.04 g/dl) and euthyroid (6.93 ± 0.07 g/dl) groups respectively.The levels of bilirubin (0.883 ± 0.08 mg/dl) was not significantly (p˃0.05) increase in SCH group in comparable with control (0.613 ± 0.04 mg/dl ) and euthyroid (0.653 ± 0.04 mg/dl). The SCH and OH patients showed an increase (P˂ 0.05) in the level of lipid profile (mg/dl) in total cholesterol(TC) (233.37 ± 12.92) ;(301.87 ±11.05);triglyceride( TG) (144.27 ± 9.87); (165.30 ±3.70); low density lipoprotein( LDL) (176.57 ± 13.03) (238.60 ± 10.59); and very low density lipoprotein(VLDL) (28.80 ± 1.96) ; ( 33.07 ± 0.74) respectively in comparison with the control and euthyroid in the levels of TC (154.86 ± 5.94);(173.93 ± 3.11); TG (94.83 ± 3.53); (88.57 ± 4.15) : LDL (97.43 ± 5.90) ; (118.47 ± 4.85) and VLDL (19.23 ± 0.73) ; (17.73 ± 0.84) respectively. There was a significant (P˂0.05) decrease in the levels of high density lipoprotein (HDL) in SCH and OH (25.27 ± 0.95 mg/dl) ; (27.93 ± 0.68 mg/dl)in comparison with control and euthyroid groups (37.17 ± 0.77 mg/dl);( 38.47 ± 0.67mg/dl) respectively. A significant (P˂0.05) increase in the level of systolic blood pressure(BP) mm Hg in OH and SCH groups (14.30 ± 0.24 mmHg);(13.36 ± 0.31mmHg) when compared with control and euthyroid (11.56 ± 0.20);(11.67 ± 0.19) respectively , there was a significant(P˂0.05) increase in the level of diastolic blood pressure(DBP) mmHg in OH and SCH groups (7.76 ± 0.17mmHg);(7.37 ± 0.17mmHg) in comparison with control and euthyroid groups (6.73 ± 0.12);(6.93 ± 0.22) respectively. Body mass index (BMI) value (Kg/H2) increased significantly(P˂0.05) in SCH group(29.30 ± 0.90) and OH group (28.90 ± 0.73)in comparison with control (24.10 ± 0.39)and euthyroid (24.73 ± 0.49). Creatinine level increased significantly (P˂0.05) in SCH and OH groups (1.07 ± 0.07mg/dl);(1.26 ± 0.06mg/dl), in comparable with control and euthyroid groups (0.846 ± 0.03),(0.836 ± 0.02) respectively. The level of uric acid increased significantly (P˂0.05) in the OH group(7.11±0.11mg/dl) in comparable with control, euthyroid (3.78±0.18mg/dl),(3.66±0.16mg/dl) respectively.The level of uric acid non significantly increase (p˃0.05) in SCH group (4.42 ± 0.28 mg/dl) in comparison with control (0.846 ± 0.03 mg/dl ) and euthyroid ( 0.836 ± 0.02 mg/dl) respectively. The level of calcium decreased significantly (P˂0.05) in the SCH (8.38 ± 0.09mg/dl) and OH group(8.12 ± 0.10 mg/dl) in comparable with control, euthyroid (8.92 ± 0.05mg/dl),(8.80 ± 0.06mg/dl) respectively. Phosphorus increased significantly (P˂ 0.05) in the OH patients group (5.49 ± 0.18mg/dl) when compared with control,euthyroid groups (2.89 ± 0.07mg/dl),(3.26 ± 0.11mg/dl) respectively.The level of phosphorus increase non significantly (p˃0.05) in SCH group (4.0 ± 0.22 mg/dl) in comparison with control (2.89 ± 0.07 mg/dl) and euthyroid (3.26 ± 0.11 mg/dl) .In OH group magnesium(2.67 ± 0.09mg/dl) increase non significantly (P˃ 0.05) in comparison with control (2.12 ± 0.02mg/dl), euthyroid (2.29 ± 0.05) respectively.The level of Mg(2.14 ± 0.03 mg/dl) in SCH was not significant increase (p˃0.05)in comparison with control (2.12 ± 0.02 mg/dl ) and euthyroid (2.29 ± 0.05 mg/dl)groups. Euthyroid group showed normal levels for the above studied parameters which means that the levels of these parameters returned to the normal values in treated hypothyroid group (euthyroid patients)with Levothroxine - L at a dose 50mg or 100 mg orally.

دراسة فعالية البكتريوسين المنتج من قبل بكتريا Lactobacillus plantarum في عوامل الضراوة لبكتريا Acinetobacter baumannii == Study The activity of Bacteriocin produced from Lactobacillus plantarum on virulence factors of Acinetobacter baumannii

Author name: ايناس ابراهيم جاسم المشهداني
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 22 عزلة بكتيرية تعود لبكتريا baumannii Acinetobacter ، عزل (15) منها من عينات الدم وعزلتان من عينات الادرار و(5) عزلات من عينات الحروق ، تم التاكد من تشخيصها من خلال الصفات الزرعية والمجهرية والاختبارات الكيموحيوية ومن ثم استخدام اختبار - 20E API.• تم التحري عن حساسية العزلات اتجاه (20) مضادا حيويا ، فاظهرت جميع العزلات مقاومة لكل من مضاداتCarbenicillin ، Cefixime ، Cefotaxime ، Ceftazidime، Cetriaxone ، Ampicillin/ Sulbactam ، وكان مضاد Imipenem الاكثر فعالية ضد العزلات ، اذ بلغت نسبة المقاومة (40.90)% ، وتبين ان (68.18)% من العزلات مقاومة مابين(16 - 20) مضاداحيويا .• اظهرت النتائج ان جميع العزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتميز عدا عزلة واحدة (Ab4) لم تنتج هذه الانزيمات ، في حين امتلكت 3 عزلات فقط (13.6)% من مجموع 22 عزلة القدرة على انتاج انزيمات البيتالاكتميز واسعة الطيف .• كذلك بينت النتائج ان جميع العزلات منتجة لجميع عوامل الضراوة المدروسة والمتضمنة : الحركة الارتعاشية ، المحفظة ، الخمل ، الغشاء الحيوي ، الانزيم المحلل للدهون (Lipase) وحوامل الحديد (Siderophore) بنسبة (100) % ، في حين جاء انتاجها للانزيم المحلل للبروتين (Protease) والبكتريوسين باقل نسبة (13.6 , 31.8)% على التوالي .• درس تاثير البلانترسين المنقى جزئيا من بكتريا Lactobacillus plantarum في نمو ثلاث عزلات منتخبة تعود لبكتريا A.baumanniiاعتمادا على امتلاكها عوامل الضراوة ومقاومتها لمضادات الحيوية والتي شملت Ab20 , Ab17 , Ab2 . • اعطى بكتريوسين البلانترسين تاثير تثبيطي جيد ضد العزلات المنتخبة عند التراكيز (62.5 ،125 ،250 ، 500 ) مايكروغرام/مليلتر ، حيث بلغ التركيز المثبط الادنى (62.5) مايكروغرام/مليلتر .• استخدم التركيز تحت المثبط الادنى (31.25) مايكروغرام/مليلتر من البلانترسين المنقى جزئيا للتحري عن تاثيره في عوامل الضراوة المدروسة للعزلات المنتخبة ، فاظهر تثبيطه لالتصاق العزلات المنتخبة بالخلايا الطلائية عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة (8.2 ، 9.3 ، 7.8 ) بعد المعاملة بالبلانترسين في الوقت الذي بلغت (73.5 ،90.5 ،86.2 ) وعلى التوالي قبل المعاملة ، كما اظهر البلانترسين تاثيرا تثبيطيا لالتصاق هذه العزلات على البولستارين وانتاج الانزيم المحلل للبروتين (Protease ) وانتاج البكتريوسين ، وتسبب في فقدان تكوين الغشاء الحيوي ، كما ادى الى تثبيط نسبي في انتاج الانزيم المحلل للدهون (Lipase ) ، في حين لم يؤثر على كل من الحركة الارتعاشية ، المحفظة وانتاج حوامل الحديد .• درس تاثير التركيز تحت المثبط الادنى للبلانترسين المنقى جزئيا على حساسية العزلات لمضادات الحيوية ، اذ اظهرت النتائج تاثير متباينا في مقاومة وحساسية العزلات المنتخبة لمضادات الحيوية | • During this study a total of 22 bacterial isolates of Acinetobacter baumannii were collected , 15 isolates from blood sample , two isolates from urine sample and 5 isolates from burn samples . All isolates were then subjected to the cultural , microscopical and biochemical examination and using API 20E system for identification this bacteria .• Sensitivity of isolates was tested against 20 Antimicrobial agents, results revealed that all isolated of A. baumannii were resistant to Carbenicillin , Cefixime , Cefotaxime , Ceftazidime , Cetriaxone, Sulbactam / Ampicillin . Imipenem was found to be the most effective against the isolates , the resistance to Imipenem was 40.9% . 68.18% of isolates resistance 16 to 20 antibiotics.• The results showed also that all isolates had the ability to produce β - Lactamases enzyme except one isolate (Ab4) , Three isolates 13.6 % were able to produce Extended Spectrum β - Lactamases. • All isolates were able to produce all virulence factors such as : Twitching motility , capsule , fimbria , biofilm , lipase, siderophore with percentege 100% . While for producing protease and bacteriocin were decreasid to 13.6% and 31.8% respectivelly .• The effect of partially purified plantaricin from Lactobacillus plantarum was studied on growth of three A.baumannii isolates possessing high resistance to Antibiotics and able to produce virulence factors (Ab2 , Ab17 and Ab20) .• Plantaricin Showed a good inhibitory effect against A.baumannii isolates at concentration 65.5 , 125 , 250 , 500 Mg/ml and the minimum inhibitory concentration (MIC) was showed 62.5Mg/ml.• The effect of sub MIC of partially purified plantaricin 31.25Mg/ml on virulence factors of A.baumannii was studied , plantaricin had inhibitory effect on Adherence of isolates on epithelial cells , the adherence mean was 8.2 , 9.3 and 7.8 after treatment with plantaricin compare with before treatment 73.5 , 90.5 and 86.2 . The results showed also that plantaricin had inhibitory effect on adherence of isolates on polystyrene , protease and bacteriocin production and biofilm formation , relative inhibitory of lipase production , while plantaricin don't have any effect on twitching motility, capsule and Siderophore.• The effect of sub MIC of plantaricin on sensitivity of A.baumannii isolates to Antibiotics was studied , the results showed that different pattern of resistance to Antibiotics .

التداخل البكتيري مع عوامل ضراوة خميرة الكانديدا المسببة لحالات التهاب الفرج والمهبل == Bacterial Interference In The Virulence Factors Of The Yeast Candida Causing Vulvovaginal Candidiasis

Author name: ايمان ناطق ناجي البياتي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | سناء مسلم الصفار
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 200 عينة من اعالي المهبل ( H.V.S ) High Vaginal Swab من نساء متزوجات توزعت بين 130 امراة غير حامل ( Non Pregnant Women ) ( NPW ) منهـن 90 كن مصابات بالتهاب الفرج والمهبل Vaginitis و( 40 ) منهن كن سليمات لغرض السيطرة (H ) Healthy Control والباقــي ( 70 ) عينة من نساءحوامل ( P.W. ) Pregnant Women ، منهـن( 40 ) امراة مصابة بالتهاب الفرج والمهبل و( 30 ) اخرى سليمـة سيطرة . استمرت فترة جمع العينات من 1/6/2002 الى 1/2/2003 تحت اشراف الكادر الطبي المتخصص في قسم النسائية والتوليد في مستشفى النعمان العام في الا عظمية / بغداد . كما تم تخصيص استمارة استبيان لكل مريضة دون فيها كل ما يخص المريضة من اعراض سريريه ونتائج التشخيص والفحص المختبري والملاحظات العامة .اعتمادا على الاعراض المرضية والفحوصات المختبرية التشخيصية تم تحديد ثلاث انواع من الالتهابات المهبلية وهي : ا - التهاب الفرج والمهبل اللانوعيBacterial Vaginosis (BV.) ..ظهرت الحالة في (23) مريضة من مجموع (70) امراة حامل [ فيهن (40) مريضة و( 30) اخرى سليمة ] بنسبة (33%) من الحوامل ، كما ظهرت في ( 25) امراة غير حامل من مجموع ( 130) امراة [فيهـن ( 90 ) مريضة ] بنسبة ( 19% ) من النساء غير الحوامل .ب - التهاب الفرج والمهبل الكانديدي Volvavagianal Candidiasis (VVC) .. ظـهرت الحالة في ( 13) مريضة من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة ( 18%) [فيهن ( 30) امراة سليمة و( 40) اخرى مريضة ] كما ظهرت في ( 43) مريضة من مجموع ( 130) امراة غير حامل بنسبة (33%) [فيهن ( 40) امراة سليمة و(90) اخرى مريضة جـ - التهاب ناتج من اصابة مختلطة Mixed Infection (MI) ظهرت الحالة في ( 4) مريضات من مجموع ( 70) امراة حامل بنسبة (6% ) [ فيهن ( 30) امراة سليمة و(40) اخرى مريضة] كما ظهرت في (22) مريضة من مجموع (130) امراة غير حامل بنسبة ( 17) [ فيهن (30) امراة سليمة و(40) امراة اخرى مريضة] . وقد تم عزل 74 عزلة من خميرة الكانديدا عزلت ( 38 ) عزلة منهـن( 43 ) امراة مصابة بالكانديـدا ( VVC ) عزلت ( 16 ) عزلة من (22) مريضة مصابة باصابة مختلطة (M.I ) وعـزلت ( 5 ) عزلات من مجمـوعة السيطرة من النساء غير الحبلى ومن جانب اخـر عزلت ( 11 ) عزلة من ( 13 ) امراة مصابة بالكانديدا ( VVC ) و( 3 ) عزلات من 4 نساء مصابات اصابة مختلطة ( M.I ) وعزلة واحدة من مجموعة السيطرة للنساء الحوامل. وهذه النتائج تدل على سيادة خميرة الكانديدا في التهاب الفرج والمهبل لدى مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل.و تم تشخيص الانواع التالية من خميرة الكانديدا وهي : Candida albicans ( 37 عزلة ) ، C. tropicalis ( 20 عزلة ) C. glabrata ( 7 عزلات) C.dubliniensis ( 7 عزلات ) وC.parapsilosis عزلة واحدة وC. krusei عزلتين. امكن الحصول على 588 عزلة بكتيرية من مجموع عدد الحالات الموجبة للزرع البكتيريولوجي لمجموعتي المرضى والسيطرة البالغ عددهم ( 140 ) امراة شخصت فيها سبعة اجناس من البكتيريا اللاهوائية والانواع التابعة لها وهي : Peptostreptococcus spp, Peptococcus spp, Prevotella spp , Streptococcus spp, Bacceroides spp, Propionibacterium spp, Lactobacillus spp, كما تم تشخيص انواع من البكتريا المتحملة لوجود كميات قليلة من الاوكسجين وهي : Strept . mitis , Entero , faecalis , Gardnerella vaginalis اضافة الى اربع اجناس وبعض انواعها من البكتريا الهوائية وهي Proteus spp , Staphylococcus spp , Escherichia spp, Pseudomonas spp .ولقـد كان النوعان G.vaginalis , Bacteroides fragilis من اكثر الانواع عزلا في مجموعتي النساء الحوامل وغير الحوامل المصابات بالتهاب الفرج والمهـبل اللانوعي B.V . وفيما يخص عوامل الضراوة لخميرة الكانديدا والانواع التابعـــة لها وجد ان 28 عزلة ( 76 % ) منتجة للانزيم الحال للشحوم المفسفرة Phospholipase و6 عزلات ( 16 % ) ضعـيفة الانتاجية لهـذا الانـزيم و( 3 ) عزلات ( 8 % ) غير منتجة من اصل ( 37 ) عزلة للنوع C. albicans اماعزلات C. tropicalis فكانت 15 عزلة ( 75 % ) منتجة للانزيم و3 عزلات ( 15 % ) ضـعيفة الانتاجية وعزلتان ( 10 % ) غير منتجة من اصل 20 عزلة . اما عزلات النوع C.dubliniensis فكانت منـها ( 5 ) عزلات ( 71% ) منتجة من اصل (7) عزلات فى حين انتجت عزلة واحدة للنوع C.glabrata هذا الانزيم .وعند دراسة انتاج الانزيم الهاضم للبروتينات Proteinases كعامل اخر من عوامل الضراوة فقد تباينت قدرة الانزيمات المنتجة مـن عزلات الكانديدا على هظم البروتيــن بين ( 175 - 30 ) مكغم / مل وتفاوتت العزلات في قابليتها على انتاج الانزيم فكانت هناك 29 عزلة منتجة من اصل 74 عزلة كانديدا وكانت ( 7 ) منـها مـن النوعC.albicans و( 8 ) منها للنـوع C. tropicalis , وثلاث منها للنوع C. dubliniesis وعـزلة واحـدة للنـوع C. glabrata ولم تتمكن عزلات النوعين الاخرين من انتاج الانزيم وهما C.parapsilsosis وC. krusei . ومن حيث عامل الضراوة الثالث وهو قدرة الخميرة على الالتصاق بالخلايا الطلائية فقد تفاوتت ايضا عزلات الخميــرة فـــي اظهار هـــذه القدرة وكان النوعان C. albicansوC. dubliniensis هما الاكثر كفاءة في الالتصاق من بين الانواع الاخرى وكانت نسبة خلايا الخميرة الملتصقة بالخلايا الطلائية في درجة الحرارة 25 م اعلى من التي حصلت عند درجة 37 م للعزلة نفسها ولكن التحليل الاحصائي لم يظهر فروقا معنوية عالية .كانت جميع عزلات خميرة الكانديدا مقاومة لمادة النستاتين وبتراكيز عالية جدا بلغت 256 مكغم / مل في حين كان المستحضر Clotrimazole هـو الافضل مـن بين مشتقات الازول الاخرى اذ كانت جميع العزلات حساسة له فقـد تراوحت قيـم (MIC ) بيـن ( 2 - 125, 0) مكغم / مل للنوعين C.albicans , C.tropicalis و( 0.5 - 0,125) للنوعين C.dubliniensis وC.glabrata وكانت قيم MFC اكبر او تساوي 4 مكغم / مل . بينـما تفاوتت حساسية عزلات الخميرة اتجاه مشتقات الازول الاخرى اذا اظهرت ثلاثة انواع من الخميرة مقاومة لمضاد Ketoconazule وهي C. albicans , C.dubliniensis , C. glabrata اذ تراوحت قيم MIC ( 0.5 - 32 )،( 0.25 - 16 ) , 160.25 - - مكغم / مل على التوالي بينما كانت الانواع الثلاثة الاخرى حساسة له . وكانت قيم MFC على العموم اكبر ويساوي 32 مكغم / مل . وكانت جميع العزلات حساسـة لمضاد Miconazole اذ تراوحت قيم ( MIC ) مـن ( 4 - 8 ) مكغم / مـل ضد النوع C. albicans واقلها هـــي للنوع C.dubliniensis وهي (0.125 - 1.0) مكغم / مـل بينما كانت قيمة MFC تتراوح بين اكبر او يساوي 4 الى اكبر او تساوي 16 حسب نوع العزلة . وكانت قيم MIC للمضاد Fluconazole مرتفعة لكنها لم تتجاوز 32 مكغم / مل ولذا اعتبرت العزلات حساسة ولكن بتراكيز عالية بينما كان MFC له اكبر او يساوي 64 .كانت قيم MIC لمضاد Amphotericin B هــي الافضل اذا بلغت (0,125 - 0,5 ) مكغم / مل اما MFC فكان يساوي 1 مكغم / مل لقد اظهرت النتائج ان طريقة التخافيق باستعمال الوسط الزرعي السائل لتحديد MIC هي الافضل مقارنة باستعمال الوسط الزرعي الصلب اذ كانت قيم MIC مرتفعة مقارنة بقيم MIC بالطريقة الاولى .ولدراسة الفعالية التضادية لبعض انواع البكتريا المعزولة من اعالي المهبل على عوامل الضراوة وحيوية خميرة الكانديدا ، انتخبت 32 عزلة بكتيرية تابعة لاجناس مختلفة على اساس ما اظهرته من تاثير تضادي في التجارب الاولية على عوامل الضراوة او الحيوية او كلاهما وهذه العزلات هي ثلاث عزلات تابعة للنوع Peptostreptococcus prevotii ، ثلاث عزلات تابعة للنوع propianibacterium granulosum، وست عزلات تابعة للنوع Lactobacillus acidophilus وخمس عزلات تابعة للنوع L. gensenii وثلاث عزلات لكل من النوعين Streptococcus mitis وEnterococcus faecalis كما وانتخبت عزلات الخميرة الاكثر كفاءة في التجارب قيد الدراسة واعتمادا على نتائج الجزء السابق .بعد ان نميت العزلات البكتيرية السابقة الذكر في اوساط زرعية مناسبة لكل منها تم الحصول على رواشح مزارعها السائلة وتم تركيز الرواشح الــى نصف الحجم ( رم 1) والى ربع الحجم ( رم 2 ) مع الاحتفاظ بجزء من الراشح غير المركز . لم تظهر الرواشح غير المركزة تاثيرا على هذه العوامل ولقد بدا واضحا تاثير الراشح المركز لمرة واحدة او لمرتين وبدرجات متفاوته وذلك لاختلاف الاجناس البكتيريا والانواع التابعة لها . كانت اكـثر الـرواشح تاثيرا هـي الـرواشح المركزة م1 وم 2 لكـل مـن العزلات Sm3 , Ef3 , Lj5 , La5 , La6 على فعالية الخميرة في انتاج الانزيمات الهاضمة للبروتين والانزيمات الحالة للشحوم المفسفره وكان النوع C. albicans اكثر حساسية اتجاه المعاملة بهذه الرواشح مقارنة مع الانواع الاخرى ، كما اثرت هذه الرواشح على خفض نسبة الانبات في المصل وبفرو قات معنوية كبيـرة وصلت الى >0.001 P . واظهر ( رم1 ) ( رم2 ) للعزلة La 6 تاثيرا في خفض حيوية الخميرة مقدرة بوحدة مستعمرة لكل مل ( CFU/ml ) وتبين ان لحموضة هذه الرواشح تاثيرا في عملية التثبيط ولكن لا يعزى له التاثير الكلي. فعند مقارنة تاثير الحموضة فقط فـــي اوساط زرعيه سائلة ذات pH محدد ومماثل الى pH الرواشح مما يشير الى ان هذه الرواشح تحتوي مركبات ذات تاثير مثبط ، كما لم تظهر رواشح العزلات الاخرى تاثيرا واضحا او كان بعضها غير مؤثر . ولمحاولة فهم طبيعة تاثير خلايا العزلات البكتيرية السابقة على عملية التصاق خميرة الكانديدا بسطوح الخلايا الطلائية وجدنا ان العزلات Lj5 , La5 , Pp3 , Pg3 , Sm3 , Ef3 , La6 هي الاكثر تاثيرا في خفض نسبة الالتصاق وعلى التوالي وقد اظهرت العزلات طرقا مختلفة في طبيعة منع الالتصاق اما باحاطة خلايا الخميرة بغلاف من خلايا البكتريا او باحاطة الخلية الطلائية بغلاف من خلايا البكتريا او كلاهما مما يمنع التصاق الخميرة بسطح الخلية الطلائية وذلك من خلال غلق المستقبلات على سطوح الخلايا. | 200 high vaginal swabs were taken from 200 married women, 130 of them were non - pregnant (N.P) and 70 were pregnant (P.) women. Of the 130 N.P : 90 were suffering from vaginitis and 40 were healthy controls. Of the pregnant group 40 were suffering from vaginitis and the rest 30 were healthy controls. Thus there were a total of 130 infected and 70 healthy. Sample were taken during the period of first of June 2002 till the end of Feb. 2003, under the supervision of specialized gynecologist in the general No’man hospital in Adhamia , Baghdad . A special questionnaire was prepared for each individual. As result of cultural and microbiological examinations of the sample and depending on the clinical and microbiological features of the 130 infected pregnant (90) and non - pregnant (40) women their vaginitis were devided into three groups, namely : (a) : Bacterial vagnosis (B.V) : Appeared in (23) out of (70) pregnant women [ including (30) healthy and (40) infected i.e. 33% ]B.V. also appeared in 25 non - pregnant women out of 130 [ including (40) healthy and (90) infected i.e. 19% ](B) : Volavaginal condidiasis (V.V.C).Appeared in 13 women out of (70) pregnant women ( 18%) [including 30 healthy and (40) sick] it V.V.C also appeared in (43) infected non - pregnant women out of 130 ( 33%)[ including (40) healthy and (90) sick](C ) : Volvavaginosis due to mixed bacterial and fungal infection. I.e. mixed infection (M.I) : Appeared in (4) patient out of (70) pregnant women (6%) [including 30 healthy and (40) sick women ] . It also appeared in (22) patients out of (130) non - present women [including (40) healthy and (90) sick pregnant women] A total of (74) isolates of candida SPP were isolate from non pregnant and pregnant women of this number 38 isolates from (43) VVC non pregnant cases, (16) isolates from 22 MI non pregnant cases, 5 isolates from 40 healthy non pregnant group, 11 isolates from 13 VVC pregnant women, 3 isolates from 4 MI pregnant women, and one isolates from 30 healthy.The following species of Candida were identified : C. albicans 37 isolates , C. tropicalis 20 isolates , C. glabrata 7 isolates , C. dubliniensis 7 isolates , C. parapsilosis one isolate , and C. kursei 2 isolates .Bacteriologically 588 isolates of bacteria were obtianed form 140 women positive for bacterial cultural ; these include several species of 7 anaerobic bacterial genera ; peptostreptococcus, peptococcus , Streptococcu spp, prevotella spp, Bacteroides spp, lactobacillus spp and propionibacterium spp. Similarly the following microaerophilliic bacteria were isolated; Gardnnerella vaginalis, Enterococuus faecalis , and Streptococcus mitis . The following aerophilic were also isolated, staphyllococcus spp, proteus spp Escherichia spp and pseudomonas spp. the most frequently isolated species a mong infected women group with ( B.V) were Bacteriodes fragilis and G. vaginals . Concerned the virulence factors of the yeast candida spp like production of phospholipases and proteinasas, besides the adherence on epithelial cells ( from human mouth ) and drug tolerance. Phpspholipase was produced by 28 isolates (76 %) out of 37 of C. albicans whereas the rest 6 isolates (16 %) were weak producers and 3 isolates (8 %) did not produce this enzyme. On the other hand out of 20 isolates of C. tropicalis 15 (75 %) were weak producer and 2 isolates (10 %) were not producers of the enzyme . Of The 7 isolates of C. dubliniesis 5 (71% ) could produce the phospholipase also one ( 14 % ) of the 7 isolated of C.glabrata could produce theis enzyme . The enzyme proteinase was produced by 29 out of 74 (39 %) isolated of candida spp out these 17 were C.albicans 8 were C. tropicalis , 3 were C. dubliniesis , one was C. glabrata the other species did not produce the enzyme. Ability of the isolates for attachment onto the surface of epithelial cells varied according to the species. Both C.albicans , C. dubliniesis were more efficient than other species . The percentage of epithelial cells attached by yeast cells were higher at 25C than at 37 C for the same isolate of the yeast, though this difference was not significant. As the resistance to antifungals concerned, we found that all isolates of candida were resistant to nystatin . The measured minimum inhibitory concentration (MIC) reached 256 g/ml . On the other hand , all isolates of candida were much more susceptible to clotrimazole with MIC ranging ( 0,125 - 2 ) g/ml for C.albicans and C. tropicalis and about ( 0,5 - 0.125 ) g / ml for C.dubliniesis and C.glabrata . The minimum fungicidal concentration (MFC) was 4 ug/ml or more for these Candida spp .The (MIC) for ketocanazole against C. albicans , C.dubliniesis , C.glabrata ranges were [0.5 - 32, 0.25 - 16 and 0.25 - 16] g / ml respectively, whereas the other species of candida were more sensitive to ketaconzole , and the ( MFC ) generally was equal to or higher than 32 ug / ml .The (MFC) for Miconzole was (4 - 8) g / ml against C. albicans an (1 - 0.125) g / ml agianst C.dubliniesis , the ( MFC ) ranged between equal to or higher than 4 and 16 g / ml . Fluconzole was less effctive than the others as the (MIC) values agianst all species were 32 g / ml or les. While the (MFC) was equal to or higher than 64 g / ml. Amphoterricin B was the most effective as the (MIC) values against all isolates of candida were (0.125 - 0.5) g / ml and MFC was 1 g/ ml.For the determination of (MIC) we found that using serial dilution of liquid cultures was better than using solid agar media. The recorded (MIC) result using agar media were higher than those obtained in liquid media.We studied the antagonistic effect against virulence factors of Candida spp by (23) isolates of bacteria isolated from healthy vagina. The selection of the candida and the bacterial isolates based on preliminary tests. So three isolates of peptostreptococuus prevotii, three isolates of propionibacteriume granulosum, six isolates of lactobacillus acidophilus , five isolates of lactobacillus jensenii , three isolates of each of streptococcus mitis , and Enterococcus feacalis were used in such tests as culture filtrates and / or as bacterial cells.The cultural filtrates were concentrated to the half or to the quarter volume of the original, as the non - concentrated culture filtrates did not show any effect. Different filtrates showed different levels of effect, the more effective were the double or quadruple concentrates of the culture filtrates of L.acidophilus isolates no 5 and 6, L.jensenii isolates No. 5, Enter.faecalis isolates No. 3 and strep.mitis isolates No. 3 . These filtrates adversely affected the phospholipase and proteinase enzymes, C.albicans being more affected than other species. Also these filtrates reduced significantly (P < 0.001) the percentage of germ forming cells of C.albicans . The culture filtrate (conc. to half or to quarter volume) of isolate No. 6 of L.acidophilus greatly reduced the viability (CFU /ml) of C.albicans and other species. This effect was not totally due to the acidity (low pH) since similar pH values in control tests did not reduce viability to the same level and did not effect the yeast cells. We found that adhesion of candida cells to epithelial cells was reduced in the presence of bacterial cells. The following bacteria were effective and they are listed below starting from the most to the less effective in reducing the number of adhering yeast cells (the number refers to the isolate number L.acidophilus 6, Enter. feacalis 3, Strep. mitis 3, P.granulosum3 peptost. prevotii 3 , L.acidophilus 5 and L.jensenii 5 .Some species of bacteria prevented adhesion by surrounding the yeast cells while other species surrounded the epithelial cells some did both

المؤشرات الحيوية في اللعاب والدم في النساء المصابات بسرطان الثدي == Biomarkers in Saliva and Blood of Breast Cancer in Women

Author name: ايدن كامل محمد
Supervisor name: خالد مهدي صالح | ماهرة نوري احمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يشكل سرطان الثدي المرتبة الاولى من بين اكثر السرطانات شيوعا في العراق، وقد اصبح يشكل اكبر تهديدا لصحة النساء العراقيات. يمتاز سرطان الثدي بكونه مرض شديد التغاير بسبب تنوع خصائصه المظهرية، نتائجه السريرية، وتباين استجابته للعلاجات المختلفة. لذلك فان الدراسة الحالية تحاول ان تضع تصنيف شامل لسرطان الثدي عند النساء العراقيات من خلال تحديد قوة عوامل الخطورة الاكثر شيوعا ، ومستويات بعض الدوال الحيوية قبل وبعد عملية الازالة الجراحية وفيما اذا يمكن الكشف عنها في اللعاب كسائل جسمي تشخيصي بديلا عن الدم.تم تصميم هذه الدراسة لتشمل 181 امراة عراقية من مراكز ومستشفيات الكشف المبكر عن السرطان والامراض النسائية خلال الفترة من تموز 2013 ولغاية تشرين الثاني 2014 . كان عدد النساء السليمة من امراض الثدي 50 امراة ، و131 امراة تعاني من امراض الثدي (111 منهن لديهن سرطان الثدي الخبيث ، والـ 20 المتبقية منهن يعانين من امراض الثدي الحميدة) ، حيث تم تاكيد التشخيص السريري باستخدام تقنية الرشف بالابرة الدقيقة من قبل المتخصصين في هذه المراكز.باستخدام استمارات الاستبيان ، تم الحصول على بيانات التاريخ الطبي لكل النساء المشمولات بالدراسة لتحديد عوامل الخطورة المرافقة لسرطان الثدي كالعمر ، والتاريخ العائلي للمرض ، والعمر عند اول دورة طمثية ، والعمر عند بدا سن الياس ، واستخدام موانع الحمل الفموية ، والحالة الزوجية ، والاجهاض ، والرضاعة ، والتعرض السابق لامراض الثدي والاشعاع ، بالاضافة الى التدخين. كما تم الحصول على بعض المقاييس البدنية كالطول ووزن الجسم ومحيط الخصر والورك لتحديد حالة البدانة لدى كل النساء المشمولة بالدراسة.تم جمع عينات الدم واللعاب من كل النساء لتحديد صنف الدم حسب نظام ABO ونظام لويس وحالة الافراز وكذلك لتقدير مستويات الدوال الحيوية فيهما والتي تضمنت الاسترادايول والبروجيسترون والـCancer Antigen 15 - 3 وCarcinoemberyonic Antigen والبروتين الكلي. اما عينات الخزعة فقد استحصل عليها فقط من النساء المصابات بسرطان الثدي بعد عملية الاستئصال الجراحي واخضعت للفحص الامراضي النسجي والجزيئي لغرض تصنيف السرطان الى انواعه الرئيسية وانماطه الثانوية باستخدام تقنية الكيمياء المناعية النسجية. لقد بينت الدراسة الحالية العديد من النتائج والتي يمكن تلخيصها بما يلي : 1. هناك اربعة عوامل خطورة فقط والتي يمكن الوقاية منها (البدانة وامراض الثدي السابقة واستخدام موانع الحمل والاسقاط) هي التي رافقت بشكل معنوي سرطان الثدي ، في حين سجلت معظم عوامل الخطورة التي لا يمكن الوقاية منها كتاريخ المرض العائلي وحالة اللاافراز وطمث مبكر وسن ياس متاخر زيادة معنوية من خطورة اصابة النساء بسرطان الثدي. ان التاثير التراكمي لعوامل الخطورة هذه اوضح بان 99.1% من النساء المصابات بسرطان الثدي لديهن واحد او اكثر من عوامل الخطورة سواءا تلك التي يمكن الوقاية منها او التي لا يمكن الوقاية منها وبتوشيجات مختلفة بالمقارنة مع 68% من النساء السليمات و75% من النساء المصابات بامراض الثدي الحميدة.2. ان تراكيز جميع الدوال الحيوية المستخدمة في هذه الدراسة قد ارتفعت في دم النساء المصابات بسرطان الثدي عن الحد الاعلى لمدياتها الطبيعية وعن تلك المسجلة عند النساء الطبيعيات والمصابات بامراض الثدي الحميدة ما عدا البروجيسترون الذي بقي تركيزه ضمن الحدود الطبيعية في كل المجاميع. كما تبين بان جميع الدوال الحيوية امكن العثور عليها في عيينات اللعاب وان معامل الجزء اللعابي خاصة للدالتين CA 15 - 3 والبروتين الكلي سجل ارتفاعا معنويا لدى النساء المصابات بسرطان الثدي (14.51% و9.86% على التوالي) بالمقارنة مع (10.65% و2.08% على التوالي) عند النساء السليمات و(12.28% و2.41% على التوالي) للنساء المصابات بامراض الثدي الحميدة .3. بينت الدراسة ان اكثر انواع سرطان الثدي شيوعا عند النساء العراقيات طبقا لتصنيف الامراض النسجية هو السرطان الاجتياحي حيث شكل 92.8% من المجموع الكلي لحالات سرطان الثدي في هذه الدراسة ، والنسبة المتبقية (7.2%) تعود للسرطان الموقعي. في حين اظهر التصنيف الجزيئي بان اكثر الانماط الثانوية شيوعا من السرطانات الاجتياحية هو النمط luminal - like حيث شكل (80.6%) ، واما النسبة المتبقية فشكلت (9.7%) لكل من النمطين HER2 - enriched وbasal - like. وان معظم حالات النمط basal - like كانت من الدرجة الثالثة (90%) بالمقارنة مع 21.7% في حالات النمط luminal - like و10% في النمط HER2 - enriched.4. ان عوامل الخطورة التي لايمكن الوقاية منها هي وحدها التي سجلت ترددات عالية بين حالات النمط basal - like بحيث ان 90% من نساء هذا النمط كن في عمر ما قبل سن الياس ، و70% منهن كان لديهن دورة طمثية غير طبيعية ، و40% منهن لديهن تاريخ عائلي للمرض في اقارب الدرجة الاولى ، و100% من نساء هذا النمط لا يمتلكن صفة الافراز الوراثية. 5. بغض النظر عن البروجيسترون ، فان تراكيز جميع الدوال الحيوية انخفضت بشكل معنوي في عينات الدم واللعاب ولجميع الانماط الثانوية بعد عملية الازالة الجراحية للورم عما كانت عليه قبل الازالة الجراحية ، غير ان حالات النمط basal - like بقيت تراكيز الدوال فيها اعلى وبشكل معنوي عن تلك الموجودة في النمطين الاخرين. 6. على الرغم من ان معامل الجزء اللعابي لكل من الاسترادايول والبروجيسترون والـ CA 15 - 3 لم تتغير قيمته بعد عملية الازالة الجراحية للورم عن تلك المسجلة قبل الازالة الا ان قيمته بالنسبة للدالة CEA (قبل وبعد العملية) ولدالة البروتين الكلي (بعد العملية) قد ازدادت بشكل معنوي في حالات النمط basal - like بالمقارنة مع تلك الموجودة في النمطين الاخرين . يمكن ان نستنتج بان صفة الافراز الوراثية تعد كعامل خطورة قوي لسرطان الثدي خاصة اذراافقتها عوامل خطورة اخرى ، كما ان اللعاب يعد كسائل جسمي تشخيصي يمكن استخدامه للتحري عن العديد من الدوال الحيوية المتعلقة بسرطان الثدي على الاقل للتفريق بين سرطان الثدي وبقية امراض الثدي الحميدة وكذلك بين الانماط المختلفة لسرطان الثدي الاجتياحي. | In Iraq, breast cancer ranks the first among the commonest malignancies, which became one of the major threats to Iraqi female health. Breast cancer is a highly heterogeneous disease due to its diverse morphological features, clinical outcome and response to different therapeutic options. Therefore, the current study attempt to establish a comprehensive classification of breast cancer in Iraqi women via determining the strength of most common risk factors, levels of some biomarkers pre - and post - surgical operation, and whether they are detectable in saliva as an alternative diagnostic fluid as well as of blood. This study has been designed upon 181 Iraqi women in different sites and hospitals for early detection of breast cancer and gynecology Hospital during the period from July 2013 to October 2014. Women involved in this study include 50 healthy, and 131 breast diseased (111 from them are with malignant breast cancer and 20 with benign - breast disease), the diagnosis was confirmed according to the fine needle aspiration (FNA) technique carried out by specialists. By using questionnaire list, clinical history of all women was obtained to determine risk factors associated with breast cancer such as age, family history, age at menarche and menopause, oral contraceptive use, marital status, pregnancy, abortion, breast feeding, previous exposure to breast disease and radiation, as well as smoking. Physical measurements were obtained from all women including height, body weight, waist and hip circumference to determine their obesity status.Blood and saliva samples were collected from all women to determine ABO and Lewis blood groups, secretory status, as well as biomarkers levels including estradiol, progesterone, CA 15 - 3, CEA, and total protein. However, tumor biopsies were obtained only from breast cancer women postoperatively and subjected to histopathological and molecular investigation to classify the major types and subtypes of breast cancer by using immunohistochemistry technique.The present study revealed several results which can be summarized as follows : 1. Only four preventable risk factors (obesity, previous breast disease, oral contraceptive use, and abortion) were significantly (P < 0.05) associated with breast cancer, while most of the non - preventable risk factors including positive family history, non - secretors, early age at menarche and late age at menopause were significantly (P < 0.05) increased the risk in women for getting breast cancer. Furthermore, the accumulative effect of all these risk factors showed that 99.1% of Malignant breast cancer women have combination of one or more risk factors whether they are preventable or non - preventable which are present in different combination in comparison with 68% of normal breast and 75% of benign breast - diseased women.2. The concentrations of all biomarkers investigated in this study were elevated in the blood of malignant - breast women and become higher than those in normal and benign breast diseased women as well as higher than upper limits of their normal range except progesterone which remained within its normal range. Furthermore, all biomarkers were detectable in the saliva samples and the salivary fraction index (Sf %) particularly of CA 15 - 3 and TP were significantly higher in Malignant breast cancer women (14.51%, 9.86% respectively) than those in normal breast (10.65%, 2.08% respectively) and benign breast (12.28%, 2.41% respectively). 3. The most common type of breast cancer among Iraqi women according to histopathological classification was invasive carcinoma (92.8%), while the rest belong to in situ ductal carcinoma (7.2%). Whereas molecular classification showed that the most frequent subtypes of invasive carcinoma among Iraqi women was Luminal - like carcinoma (80.6%), while the rest (9.7%) were recorded for each HER2 - enriched and basal - like. The majority of basal - like cases were found at the 3rd grade (90%) when compared with 21.7% in luminal and 10% in HER2. 4. Non - preventable risk factors recorded high frequency among basal - like cases; 90% of them are at premenopausal status, 70% have abnormal menarche, 40% having first - related women getting breast cancer, and 100% of them are non - secretors.5. In spite of progesterone, concentrations of all other biomarkers were significantly decreased postoperatively in blood and saliva of all subtypes when compared with their concentrations preoperatively, but cases with basal - like carcinoma still have higher concentrations than those in luminal and HER2 whether pre - or postoperatively. 6. Although the salivary fraction of estradiol, progesterone, and CA 15 - 3 didn’t change after surgical removal of tumor from that of preoperatively, its values for CEA (pre - and postoperatively) and total protein (only postoperatively) were significantly increased in basal - like cases in comparison with those in luminal and HER2 subtypes.It can be concluded that secretor status should be considered as a strong risk factor for getting breast cancer particularly when combined with other risk factors, also saliva as diagnostic body fluid is a promised sample to search for several biomarkers related with breast cancer at least to differentiate between breast cancer and other benign breast diseases as well as between the different subtypes of invasive breast carcinoma.
1 ... 21 22 23 24 25 ... 45