Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 2,514

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

Author name: شمم ناصرراضي
Supervisor name: شذى سلمان حسن | سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum == Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

Author name: سعاد علي احمد
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae == A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

Author name: سحـر ظاهر عبد عسل
Supervisor name: حارث جبار فهد المذخوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه == Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

Author name: زهراء عباس جبر العيساوي
Supervisor name: رسمية عبد ابو ريشة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

عزل وتشخيص فيروس شلل الاطفال من الاطفال الملقحين بلقاح شلل الاطفال ومقارنته مع الفيروس الضاري == Isolation &Identification of Poliovirus from Vaccinated Children with Oral poliovirus vaccine and Comparison With Wild Type Virus

Author name: زهراء جعفر جميل عبد الكريم
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | عبد اللطيف محمد احمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد فيروس السنجابيةPoliovirus(PV) العامل المرضي الرئيس المسبب لشلل الاطفال Poliomyelitis . ويعتبر هذا المرض من الامراض الخطرة في العالم والتشخيص المختبري له ضروريا لغرض مراقبة وترصد حالات شلل الاطفال ومدى فعالية عملية التلقيح، وكذلك للتميز بين الشلل المتسبب من فيروس السنجابية (PV) والعوامل الاخرى ، والعناية المثالية للمريض هي تجنب الحركة والركض والركون الى الراحة والعلاج الطبيعي . تطوير علاج المرض باستعمال مضادات الفيروس لاصابات شلل الاطفال ممكن ان يضيف في المستقبل القريب حافزا اضافيا للتشخيص المختبري له . تضمنت الدراسة جمع مئة وثمانين عينة خروج من الاطفال (اعمارهم اقل من خمس سنوات) الذين اعطوا لقاح شلل الاطفال الفموي Poliovirus vaccine Oral في مركز الرعاية الاولية الصحية في بغداد لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) ، وكذلك تم اختيار خمسة عشر طفلا من المجموع الكلي للاطفال واستمرار متابعة مدى طرح فيروس السنجابية (PV) في الخروج لمدة عشرة ايام بعد التلقيح بلقاح شلل الاطفال الفموي (OPV) .لعزل فيروس السنجابية (PV) : حقنت نماذج الخروج في خطوط خلوية مختلفة (L20B, RD,Hep - 2C, CEF) ، ويتبع ذلك تشخيص نوع فيروس السنجابية (PV) من النماذج الموجبة التي اظهرت تاثيرات مرضية Cytopathic Effect بوساطة اختبار التعادل الدقيق Microneutralization Test ثم اجراء الترحيل الكهربائي SDS - PAGE Electrophoresis لبعض العينات التي شخصت وعينة اللقاح وعينات برية تم الحصول عليها من مختبر الصحة المركزي، وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : - • اظهرت الدراسة ان 114 عينة اعطت نتيجة موجبة لعزل فيروس السنجابية(PV)من اصل 180 عينة اي بنسبة (63%) .• لا توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV) من الذكور والاناث اذ ان نسبة الذكور الى الاناث في عزل (PV) هي 1 : 1 .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV ) خلال فصول السنة حيث وجد ان اعلى النسب كانت 74.6% في فصل الصيف .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) من عينات خروج اطفال باعمار مختلفة وجد ان اعلى نسبة لعزل (PV) 83.3% من عينات الاطفال بعمر 8 - 10 اشهر .• عند مقارنة معدل النتائج الموجبة على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطى افضل المعدلات (93%) يليها خلايا (RD) لمعدل (88%) ثم خلايا (Hep - 2C) بمعدل (84%) ،وعلى النقيض خلايا (CEF) لم تعط اية نتيجة موجبة .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في سرعة ظهور فيروس السنجابية (PV) على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان خلايا(L20B) اسرع الخطوط الخلوية في اعطاء النتائج، وكذلك توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) بين الخلايا (L20B) و(RD) في اليوم الثالث وكذلك توجد فروق معنوية بين (RD) و(Hep - 2C) ( P<0.05 ) في اليوم الخامس، بينما توجد فروق معنوية عالية ( P<0.05 ) في التحري عن فيروس السنجابية (PV) بين خلايا (L20B) و(Hep - 2C) وجد في اليوم الخامس .• في اختبار التعادل N.T : اظهرت النتائج ان النمط الاول (PV1) هو الشائع وقد كان بنسبة 60% ، ثم النمط الثالث (PV3) بنسبة 27% . لكن في هذه الدراسة لم يتم عزل النمط الثاني (PV2) ، وقد ظهرت فيروسات معوية (EVs) اخرى بنسبة 13% .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) مع باقي الفيروسات المعوية (EVs) خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطي افضل المعدلات (100%) لعزل فيروس السنجابية (PV)، ولم تعزل فيروسات معوية (EVs) ، اما خلايا (RD) بمعدل (90%) اما خلايا(Hep - 2C) بمعدل (71%) لعزل فيروس السنجابية (PV) ، وقد عزلت (EVs) بمعدل (29%) .• في اختبار الترحيل الكهربائي (Electrophoresis (SDS - PAGE في هذه الدراسة تم تمييز اربعة حزم للسلاسل الببتيدية لفيروس السنجابية (PV) لكن هذه النتائج : لم تظهر اي فروقات تميز بين انماط فيروس السنجابية (PV) الثلاثة ، وكذلك لا توجد فروقات تميز بين فيروس السنجابية (PV) المعزولة من عينات الخروج (المشتقة من اللقاح) والعينات البرية (تم الحصول عليها من مختبر الصحة العام المركزي)او عينات اللقاح .نستنتج من الدراسة ان تقنية الزرع النسيجي في الكشف عن فيروس السنجابية (PV) في نماذج الخروج ان الخلايا (L20B) تعد خط الخلايا الامثل والافضل لعزل فيروس السنجابية (PV) بدون عزل فيروسات معوية (EVs) اخرى من نماذج الخروج ، وهذا يوفر لناالوقت والجهد والمواد المبذولة لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) من عينات الخروج خلال وجود ومراقبة حالات الشلل الرخو الحاد (AFP )والمراقبة البيئية ضمن مبادرة استئصال شلل الاطفال وكذلك نستنتج ان النمط الاول(PV1)هو الاكثر شيوعا في هذه الدراسة . | Poliovirus (PV) is the etiologic agents of poliomyelitis , This Disease was one of the dangerous diseases in the world. Laboratory diagnosis is still required for detection of poliomyelitis cases and surveillance, to qualification of Immunization and other potentially treatable conditions; development of antiviral agent for the treatment of (PV) infection may provide added impetus for laboratory diagnosis in the near future. In this study collection one hundred and eighty stool specimens from children (less than 5 years old) who administered Oral Poliovirusvaccine (OPV) in preliminary health protection centers in Baghdad and Select fifteen children from the total children and following shedding (PV) in stool for 10 days after immunization with (OPV). Isolation of (PV) was conducted using stool specimens of the vaccination children and inoculated in (L20B) cells, human rhabdomyosarcoma (RD) , human epidermoid carcinoma (Hep - 2C) and check embryo fibroblast (CEF). Followed by identification of (PV) type from positive case which appear cytopathic effect (CFE). By microneutralization test, SDS - PAGE Electrophoresis was done to some specimens which identified as (PV1) ,(PV3),vaccine and wild type. The following results were obtained in this study : - • This study found (114) specimens were positive out of (180) specimens (63%).• No significant difference in isolation of (PV) taken from males and females ,The male to female ratio in (PV) isolation was 1 : 1 .• In comparison, the recovery rate of (PV) due to age of children was found to be the greater proportion and was 83.3%for children within age 8 - 10 month.• Significant difference in isolated (PV) due to during seasons ,the greater percentage was 74.6% during summer .• In Comparison, the recovery rate of (PV) in different cell lines revealed that L20B cell provided the best recovery rate (93%) from fecal samples , differing significantly from the other cell lines (P< 0.05) .• Significant difference in speed recovery of PV in different cell lines , recovery of L20B cell provided the faster recovery rate , significant difference (p > 0.05) of detecting PV between L20B and RD cell at day 3 and between RD and Hep - 2C cell (p > 0.05) at day 5;whereas more significant difference (p > 0.05) in the detection of PV between L20B and Hep - 2C found at day 5.• In neutralization test,it was found the poliovirus type (PV1)was more frequent (60%) than (PV3) (27%)but in this study can’t isolated (PV2), in this study found other (ENs) (13%). • In comparison, the recovered (PV) and other (EVs) in different cell lines ,showed that L20B cell was the best in the recovery rate (100%) for the isolation of (PV) while did not isolation of (EVs),RD in rate (90%) for (PV) while Hep - 2C isolation (PV) in rate (71%),and (ENs) in rate (29%).• In SDS - PAGE Electrophoresis, in this study distinguish 4 bands for polypeptide of (PV), but this result didn't show any difference between strains of (PV) which isolation from stool specimens and wild type. In conclusion the T.C. technique used for detection of ( PV) from stool specimens , the L20B cell was superior to isolation of (PV) without isolation of (EVs) and therefore established a first line of clinical diagnostic test for the detection of (PV) from stool specimens during AFP surveillance and Environmental surveillance in the initiation of eradication of Poliomyelitis. and in conclusion that the (PV1) was widespread in Environment .

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ والقريص على بعض عوامل الضراوة والدنا البلازميدي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == The Effect of aqueous and alcoholic extracts of Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens (L.) in some virulence factors and plasmid DNA in local isolates of Pseudomonas aeruginosa

Author name: ديمة نزار فرج باصات
Supervisor name: لينة عبد الكريم الامير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (50) عزلة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من (110) عزلة من مصادر عزل مختلفة (الجروح ، والحروق ، والاذن ، والادرار ، والدم) لمرضى في مستشفيات اليرموك ، والكندي والعلوية للاطفال ، وقد تبين ان (44 %) من العزلات كان مصدرها الجروح و(20 %) لكل من الادرار ، والاذن و(12%) للحروق ، و(4 %) لعينات الدم.وعند التحري عن المقاومة لمضادات الحياة وجد ان (68 %) من العزلات اظهرت مقاومة متعددة لـ (6 - 9) مضادات و(26 %) من العزلات كانت مقاومة لـ (1 - 5) مضادات و(6 %) من العزلات مقاومة لـ (10 - 12) مضادا وتوزعت العزلات المقاومة ضمن (33) نمط مقاومة لمضادات الحياة.وعند التحري عن انتاج بعض عوامل الضراوة لبكتريا P. aeruginosa تبين ان (82 %) من العزلات منتجة لانزيم الهيمولايسين و(74 %) منتجة لانزيم الايلاستيز و(66 %) منتجة لانزيم اليوريز ، وكانت المجموعة السائدة هي المنتجة للعوامل الثلاثة معا ، مما يدل على اهمية هذه العوامل في ضراوة البكتريا كما تبين ان هناك ارتباطا بين انتاج انزيم الايلاستيز والهيمولايسين.اختيرت عزلتان احداهما مقاومة لاحد عشر مضادا من اصل 12 مضادا منتجة لعوامل الضراوة الهيمولايسين ، والايلاستيز ، واليورييز (PD1) والاخرى حساسة (مقاومة لاربعة مضادات من اصل 12 مضادا) ومنتجة للايلاستيز والهيمولايسين وغير منتجة لليوريز (PD2).وعند التحري عن وجود البلازميدات وجد ان العزلة المقاومة (PD1) تمتلك بلازميدا واحدا والعزلة الحساسة (PD2) لا تمتلك بلازميدا.حدد التركيز المثبط الادنى للمستخلصات المائية والكحولية لنباتي سم الفراخ Withania somnifera L. Dun. ، والقريص Urtica urensi L. تجاه بكتريا P. aeruginosa (للعزلتين (PD1,PD2وكان التركيز المثبط الادنى لمستخلص سم الفراخ المائي (175) ملغم / مللتر ، والكحولي (5) ملغم / مللتر ، والتركيز المثبط الادنى لمستخلص القريص الكحولي (25) ملغم / مللتر ، اما المستخلص المائي للقريص فلم يكن له اي تاثير تثبيطي في نمو البكتريا حتى التركيز (175) ملغم / مللتر.درس تاثير المستخلصات في التراكيز تحت التركيز المثبط الادنى تجاه تثبيط بعض عوامل الضراوة للبكتريا وكان مستخلص سم الفراخ المائي والمستخلص الكحولي مثبطا لانزيم الهيمولايسين ومضعفا للايلاستيز ولم يكن لهما تاثير في انتاج اليوريز عند التراكيز (100 ، 125 ، 150) ملغم / مللترللمستخلص المائي والتراكيز (2 ، 3 ، 4) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي ، اما مستخلص القريص المائي والمستخلص الكحولي فكان لهما تاثير مثبط للايلاستيز ومضعف للهيمولايسين ولم يؤثرا في انتاج اليوريز عند التراكيز (125 ، 150 ، 175) ملغم / مللتر للمستخلص المائي وعند التراكيز (10 ، 15 ، 20) ملغم / مللتر للمستخلص الكحولي.لم يكن لاي مستخلص نباتي من المستخلصات المستعملة تاثير في تحييد البلازميد للعزلة PD1 عند التراكيز تحت المثبطة ، لكن عند تحليل الدنا البلازميدي باستخدام الاشعة تحت الحمراء وجد ان مستخلصي سم الفراخ المائي عند التركيز (150) ملغم / مل والكحولي عند التركيز (4) ملغم / مللتر احدثا تغييرا في مواقع جذر NH+3 ولايون C=O عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 ، والحزمة 1649 سم - 1 على التوالي. اما مستخلص القريص المائي عند التركيز (175) ملغم / مللتر والكحولي عند (20) ملغم / مللتر فقد احدث تغييرا في موقع جذر NH3+ عند الحزمة 2000 - 3100 سم - 1 وايون C=O عند 1649 سم - 1 واحدثت تغييرا في شدة الحزمة عند 1022 سم - 1 والتي تعود الى مجموعة PO2 - ويمتاز المستخلص المائي بانه احدث تغييرا في دنا البلازميد البكتيري بظهور حزمة جديدة عند 810 - 690 سم - 1 وتعود لمجموعة PO2 - ايضا. وهذا يشير ايضا الى احتمال تاثير تلك المستخلصات النباتية على الوضعية العامة لجزيئة الـ DNA من ناحية التركيب الثانوي وبالتالي على بعض ادواره الوظيفية الحيوية. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from various clinical specimens including : wound , burn , ear , urine and blood , collected from patients hospitalized in Yarmouk , Al - Kindy and Al - Elweia for children hospital,A total of (50) (out of 110) isolates were obtained of which (44 %) were isolated from wounds , (20 %) from urine and ear infections , (12 %) from burns and (4 %) from blood specimen.Antibiotic resistant tests have indicated that (68 %) of P. aeruginosa isolates were multiresistant to (6 - 9) antibiotics and (26 %) were resistant to (1 - 5) antibiotics and (6 %) were resistant to (10 - 12) antibiotics , P. aeruginosa isolates exhibited (33) antibiogram patterns.Detection of some virulence factors production by these isolates indicated that (82 %) were producers of hemolysin, (74 %) were elastase producers and (66 %) were urease producers. The group producing all three virulence factors was dominant.Two isolates were selected , the first isolate (PD1) was resistant to (11) antibiotics , and produced hemolysin , elastase and urease , the second isolate (PD2) was resistant to (4) antibiotics only (out of 12) and produced hemolysin , elastase but not urease.Screening for plasmid DNA indicated that the resistant isolate (PD1) had a single plasmid , while the sensitive isolate (PD2) had no plasmid.Minimum inhibitory concentration (MICs) of the aqueous and ethanolic extracts of both (whole) plants Withania somnifera (L.) Dun. and Urtica urens L., were determined towards P. aeruginosa (PD1,PD2), Results obtained showed that MIC of ethanolic extract of W. somnifera was (5) mg / ml and of aqueous extract was (175) mg / ml. The MIC for the ethanolic extract of U. urens was (25) mg / ml , while the aqueous extract had no inhibitory effect towards P. aeruginosa up to (175) mg / ml.The effect of Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extracts of both plants on the production of hemolysin , elastase and urease was investigated. Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extract of W. somnifera had an inhibitory effect on hemolysin production and a suppressing effect on elastase but no effect on urease production at 100 , 125 , 150 mg / ml for the aqueous extract and 2 , 3 , 4 mg / ml for the ethanolic extract.Sub - MICs of the aqueous and ethanolic extract of U. urens had an inhibitory effect on elastase production and a suppressing effect on hemolysin , but no effect on urease production at 125 , 150 , 175 for the aqueous extract and 10 , 15 , 20 mg / ml for the ethanolic extract.The electrophoresis of plasmid DNA isolated from bacterial cell treated with plant extracts indicated that neither W. somnifera nor U. urens extracts had a curing effect on the plasmid at sub - MIC concentrations for PD1.Vising infrared spectroscopy spectrum showed that the sub MICs of ethanolic and aqueous extracts of . W. somnifera (4 mg / ml , 150 mg / ml) made an alteration in NH+3 groups at wave band (2000 - 3100) cm - 1 and C=O group at 1649 cm - 1 , while the Sub - MICs of the ethanolic and aqueous extracts of U. urens (20 mg / ml , 175 mg / ml) made changes in NH+3 , C=O and PO2 - groups at the wave bands (2000 - 3100) , 1649 , 690 - 810 cm - 1 respectively. These results indicate the possible effect of plant extracts on the conformation of the DNA molecules affecting some of its biological functions.

دراسة مقارنة بين الشكلين الحلزوني والمكور في بكتريا Helicobacter pylori المعزولة من مرضى مصابين بقرحة الاثنى عشر

Author name: حلا مؤيد رديف
Supervisor name: ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى عزل بكتريا Helicobacter pylori من المرضى المصابين بقرحة الاثنى عشر ودراسة ظاهرة تحول الخلايا من الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة والعوامل المؤثرة ، وقد بينت النتائج ان مكونات الوسط الزرعي والضوء والاوكسجين من اهم العوامل التي تساعد على عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة لجرثومة H. pylori . خلال مدة الحضن والخزن , فقد لوحظ عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب ، ووسط اغار الدم الاساسي المضاف اليهما دم بشري متحلل بنسبة ( %5) ، واضافات النمو يتم الحصول على الاشكال المكورة بنسبة اقل مما لو استخدمت الاوساط الزرعية ذاتها لكن بدون اضافة الدم واضافات النمو. وللمحافظة على حيوية جراثيم الهيليكوبكتر وعلى شكلها الحلزوني لمدة زمنية اطول قد تصل الى (30 - 20) يوما عند خزنها بدرجة حرارة (4)مo , يجب عدم تعريض الاوساط الزرعية الى الضوء والاوكسجين بنسبة اعلى من ( %6 ) ، كذلك مراعاة ان تكون باءهاءpH)) الوسط .( 8 - 6.9 ) سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام وسط اغار نقيع الدماغ - القلب، ووسط المولرهنتون، ووسط مرق البروسيلا، ووسط اغار الحليب، ووسط اغار الـﭼوكليت ،ووسط اغار الماكونكي ، ووسط التربتون سوي بروث( Trypton Soy Broth ) . اذ اضيف الى قسم من الاوساط المستخدمة ( %5 ) دم بشري متحلل واضافات النمو ، كذلك سجل لاول مرة في القطر تمكن بعض الاشكال المكورة من التحول الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الفئران واستخدام خنازير غينيا ( Guinea - pigs ) بشكل افضل من استخدام الاوساط الزرعية الصلبة والسائلة مع مراعاة اعطاء الحيوان جرعة لقاح بحجم ( 0.1 ) ملليلتر , ولوحظ ضرر نسيجي عند دراسة المقاطع النسيجية للمعدة ، اذ اشارت الدراسات السابقة الى عدم قدرة تحول الاشكال المكورة الى الاشكال الحلزونية عند استخدام الحيوانات المختبرية. اوضحت النتائج ان المحتوى الكيميائي للاشكال المكورة في بكتريا H. pylori يختلف عن المحتوى الكيميائي للاشكال الحلزونية للبكتريا نفسها بعد معاملتها بحامض الكبريتيك المركز وهيدروكسيد البوتاسيوم ، الشيء الذي يعكس حدوث تغيرات في الجدار الخلوي خلال عملية تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة . كما بينت النتائج ان الاشكال المكورة اقل كثافة من الاشكال الحلزونية ، بسبب قلة نسبة الببتيدوكلايكان ، واضمحلال المكونات الخلوية وفقدانها نتيجة حدوث تغيرات في الجدار الخلوي وتلف الغشاء الهيولي Cytoplasmic membrane) ) . اظهرت الدراسة ان محتوى الاشكال المكورة العائدة الى H. pylori من الحامض النووي الديوكسي رايبوز DNA ) Deoxyribo nucleic acid ) ، والحامض النووي الرايبوزي RNA ) Ribonucleic acid ) اقل مما هو موجود في الاشكال الحلزونية للجرثومة نفسها . عند دراسة انظيم اللايسوزايم Lysozyme ومادة EDTA كلا على حدة ، وكذلك انظيم اللايسوزايم ومادة EDTA معا في الاشكال الحلزونية العائدة الى جرثومة H. pylori , كان التاثير اكثر بكثير قياسا مع الاشكال المكورة للجرثومة نفسها ، وذلك لقلة نسبة الببتيدوكلايكان في جدران الاشكال المكورة ، او لفقدان مواقع في الببتيدوكلايكان حساسة الى انظيم اللايسوزايم . وقد لوحظ ان المنظفات الايونية مثل مادة SDS والمنظفات اللاايونية مثل مادة Triton X - 100 تسببان تحلل عزلة H. pylori بشكليها الحلزوني والمكور , الا ان التراكيز الواطئة من مادة SDS تكون اكثر فعالية من التراكيز العالية من مادة Triton X - 100 في تحلل الجرثومة بشكليها الحلزوني والمكور. شوهدت الاشكال الحلزونية والاشكال المكورة لجرثومة H. pylori والاشكال التي تظهر خلال تحول الاشكال الحلزونية الى الاشكال المكورة عند استخدام المجهر الالكتروني الناقل , وقد لوحظت اشكال مختلفة من الاشكال المكورة تملك سوطا واحدا او سوطين . وسجل لاول مرة امتلاك الاشكال المكورة العديد من الاسواط ، وذلك عند تصوير العزلات بالمجهر الالكتروني الناقل. في حين اشارت الدراسات السابقة الى امتلاك الاشكال المكورة سوطا واحدا او سوطين فقط . وقد بينت نتائج دراسة التركيب الدقيق باستخدام المجهر الالكتروني ظهور الاشكال المتعددة للجرثومة ( العصوي ، والعصوي المنحني ، والملتوي ) فضلا عن ملاحظة النهاية المستديرة للجرثومة والتوزيع المتجانس للمكونات السايتوبلازمية والصباغية ( Chromatic Contents ) في داخل الخلية الجرثومية والسطح الناعم للجرثومة ، كما تم مشاهدة السياط المميزة لهذه الجرثومة التي تميزت بكونها مغمدة ( Sheathed ) وحاوية على انتفاخ ( تثخن ) في نهاية السوط الذي يشبه الهراوة . | The study aimed to isolate the Helicobacter pylori bacteria from patients who have duodenum ulcer and study the phenomenon of cell transformation from spiral shapes to cocci shapes and the influencing factors. The results showed that the component of the agricultural environment, light, and oxygen are the most important factors that help in the process of transformation from the spiral shapes to cocci bacterial shapes of H. pylori during the incubation and the storage period. It had been noticed that when using Brain - Hart infusion agar and Blood - Base agar with the addition of decomposed human blood by a percentage of (5%) with growth supplements, we get cocci shapes with a percentage less than that when we use the same agricultural media without adding the blood and the growth supplements. To maintain the activity of the H. pylori and its spiral shape for a longer period of time which can go up to (20 - 30) days when stored at 4 Co , we must not exposure the agricultural media to light and oxygen with a percentage higher than 6% and also thepH must be (6.9 - 8). For the first time, it had been recorded that some cocci shapes can transform to spiral shapes when using Brain - Hart infusion agar, Muller - Hinton agar, Brucella agar, Milk agar, Choclate agar, Maconcky agar, and Trypton Soy Broth, if we add to some of the used media (5%) of decomposed human blood and growth supplements. While, the previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using cultural media. Also, it had been recorded for the first time that some of the cocci shapes can transform to spiral shapes when using mice and Guinea - Pigs, in a better way than using the solid and liquid cultural media taking into consideration giving the animal a dosage of vaccine of size (0.1) ml. Tissue damage had been noted when studying the tissue sections for stomach, while previous studies mentioned that it is not possible for the cocci shapes to transform to spiral shapes when using laboratory animals. The results show that the chemical content of the cocci shapes in the H.pylori bacteria is different from the chemical content of the spiral shapes of the same type of bacteria after treating it by concentrated sulfuric acid and potassium hydroxide, which reflect that changes had took place in the cell wall during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes. The results also showed that the cocci shapes are less density from the spiral shapes due to shortage of Peptidoglycan and the vanishing of the cellular components and the loss of these cellular components due to the changes that took place in the cell wall and the damage of the Cytoplasmic membrane. The study showed that the contents of the cocci shapes of the H.pylori from the Deoxyribo Nucleic Acid (DNA) and from the RiboNucleic Acid (RNA) is less than that of the spiral shapes of the same bacteria. When the Lysozyme and EDTA had been studied separately and also the Lysozyme and the DETA together in the spiral shapes of the H. pylori bacteria, the effect was much more when compared with the cocci shapes of the same bacteria, and that is due to the shortage of Peptidoglycan in the walls of the cocci shapes or due to the loss of Peptidoglycan positions sensitive to the Lysozyme. It had been noted that the ionic detergents such as the SDS and the non - ionic detergents such as Triton X - 100 are causing the analysis of the H. pylori isolation in both the cocci and spiral shapes, but the low concentrations of SDS is more efficient than the high concentration of the Triton X - 100 in the analysis of the bacteria in both of its cocci and spiral shapes. The spiral shapes and the cocci shapes of the H. pylori bacteria and the shapes that appears during the process of transformation from spiral shapes to cocci shapes had been observed when using the Transmission Electronic Microscope (TEM) , also different cocci shapes had been observed that have one and two flagellum. It had been recorded for the first time that the cocci shapes have more than one flagellum and that was during the photography of the isolations by the TEM, while previous studies mentioned that the cocci shapes have one or two flagellum only. The fine composition study using electronic microscope showed that many shapes of the bacteria appears ( rods, curved rods, and the spiral ) in addition to noticing the round end of the bacteria and the homogenous distribution of the Cytoplasmic and Chromatic contents inside the bacteria cell and the smooth surface of the bacteria, and also the flagellum that distinguish this bacteria had been observed that are distinguished by being sheathed and have inflation ( thickness ) in the end of the flagellum which looks like cudgel.

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين == Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

Author name: هالة محمد حسين الحسني
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

Author name: حسام صباح اوهيم
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا == Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

Author name: جوان صباح باجلان
Supervisor name: سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة مصلية وجزيئية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من بعض الاغذية الحيوانية ومن حالات سريرية في محافظة بابل == Molecular and serological study of the bacteria Escherichia coli isolated from some animal foods and clinical cases in Babylon province

Author name: محمد حسن عبد الكاظم الكعبي
Supervisor name: الهام سعيد عبد الكريم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study isolation and Identification of Esherichia coli in Babylon province. Atotal of 206 samples were obtamel which Include 86 stool sample from patients with diarrhea for both sexy and different ages in AL - kasem and AL - Hashimia hospitals from 2 - 2 - 2015 to 30 - 3 - 2015.60 samples of ground beef meat and 60 samples of Localy raw cheeses were obtamil from Hlla , Kasem, Hashimia and Hamza states form the period from 4 - 2 - 2015 to 17 - 4 - 2015 .2. 145 Isolates characterrizd as E.coli depending on the characteristics of the colonies phenotypic and microscopic when grown in diffrerential selective media as well as biochemical test to diagnose Isolates .Then the Identification of these species were confirmal by using Api20E system . 77(89.53 %) E.coli Isolates were obtamel from stoolsamples ,33(22.75%) from ground beef meat , samples 35(24.14%) from Localy raw cheeses samples.3. Serological Identification for 145 E.coli Isolates showed that 31 Isolates (21.8%) were belonged to O157 : H7 ,also results showed 69 E.coli Isolates (47.58%)were belonged to polyvalent II (O111,O119,O26,O55,O126) ,22(15.17%) belonged to polyvalent III (O86,O114,O123,O127,O128),11(7.59%) Isolates belonged to polyvalent IV (O112,O124,O142), 2 Isolstes .belonged to O128 Monovalent serotype from stooland cheese samples and 2Isolates belonged to O159 Monovalent from stool samples .4. Results of Virulence factors of E.coli Isolates showed the ability of 66(45.51%)Producing hemolysin (α,β),E.coli Isolates showed containing tow types of adherence CFA/1 and CFA/III , and tow ratios were 104(71.72%) and 77(53.10%)Respectively ,109(75.7%) Isolates shwed ability to produce Biofilm and 122(84.15%) Isolates showed ability to produce β - Lactamase .5. The Antibiot snsceptibility to all E.coli O157 : H7 Isolate .were performed according to Kirby Bauer testing ,showed ahigh degree of resistance 100% to Ampicillin and Mmeropenem, All Isolates showed Susceptibility 0% to Impenem and Amikacin ,Norfloxcin 96.77% and Gentamycin 90.32%.while resistance to Ceftazidine, Pipracillin ,Ofloxacine and Trimethoprime 77.41%, 70.96 %70 .96%67 74% respectively .6. The molecular Investigation of the genes stx1,stx2 hlyA and flic : H7 was made by taking out the bacterial DNA of all E.coliO157 : H7.Isolates using polymerase chain reaction PCR techniques , results showed 26(83.87%)Isolates gene positive result for stx1 at (180 bp) ,9(29.03%) gave positive result for stx2 at(255bp),all Isolates 100% gave hlyA at (534bp),23(74.19%) gave positive result for flic : H7 at (625bp).

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة == Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

Author name: بشار قصي كاظم
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli

دراسة الاستجابة المناعية للنساء الحوامل وعلاقتها بالمسببات الجرثومية للالتهاب المجاري البولية == Study of Immune Response of Pregnant Women and it's Relation with Causative Pathogenes of Urinary Tract Infection

Author name: امال عزيز كريم السعدي
Supervisor name: غنيمة صادق محمد | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
Abstract: تناولت هذه الدراسة التعرف على المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا لاصابة النساء الحوامل بالتهاب المجاري البولية وتقييم الاستجابة المناعية بنوعيها الخلطية (Humoral) والخلوية (Cellular).جمع 124 نموذج دم وادرار موزعة على النحو الاتي : (50) نموذجا من نساء حوامل مصابات وعينات السيطرة من (50) نموذجا من نساء حوامل غير مصابات و(10) نماذج من نساء غير حوامل مصابات، و(14) نموذجا من نساء غير حوامل وغير مصابات.وقد اظهرت النتائج ان المسببات الجرثومية الاكثر شيوعا باصابتها للنساء الحوامل كانت بكتيريا Escherichia coli وبنسبة (%18.6)، تليها بالمرتبة الثانية بكتيريا Staphylococcus saprophyticus وبنسبة (%18.3).اختلفت انواع البكتيريا التي تمكن عزلها باختلاف مراحل الحمل الثلاث Trimester. وسجلت اعلى نسبة اصابة في المرحلة الثانية من الحمل تليها المرحلة الاولى ثم المرحلة الثالثة من الحمل وكانت النسبة %47) و%20 و%17) على التوالي.اظهرت نتائج الاستجابة المناعية غير المتخصصة (Non - specific) وجود زيادة بنتائج فحص النشاط البلعمي (Phagocytosis) في الدم المحيطي للنساء الحوامل المصابات وبزيادة معنوية (0.05 > P) في قابلية الخلايا البلعمية على الالتهام وفي مراحل الحمل الثلاث مقارنة مع عينات السيطرة.كما لوحظ وجود زيادة معنوية (0.05 > P) في تركيز العامل المتمم الثالث C3 في مصول النساء الحوامل المصابات.اما الاستجابة المناعية المتخصصة (Specific) فقد اظهرت انخفاضا معنويا (0.05>P) في قابلية الخلايا اللمفاوية على التحول والانقسام في الدم المحيطي وفي مراحل الحمل الثلاث وباستخدام المشطر (PHA) لتحفيز الخلايا اللمفاوية على الانقسام، مقارنة مع عينات السيطرة.اما نتائج قياس تركيز الغلوبيولينات المناعية (Immunoglobulines) في مصول مجاميع الدراسة. فقد اظهرت النتائج عدم وجود فروق معنوية في تركيز كل من الغلوبيولينات المناعية نوع A وG مع انخفاض معنوي في تركيز الغلوبيولين المناعي نوع M في مصول الحوامل المصابات مقارنة مع عينة السيطرة من النساء غير الحوامل غير المصابات | In this study, we attempted to identify the most common bacteria which causes urinary tract infection in pregnant women, and also to evaluate both cell - medicated and humoral immune responses in those women.Samples of 124 blood and urine were collected as follows : 50 blood and urine samples were taken from infected pregnant women.50 blood and urine samples were taken from non - infected pregnant women.10 blood and urine samples were taken from non - pregnant, but infected women.14 blood and urine samples were taken from non - pregnant, infected women.The results showed that E. coli was the most common causative agent of UTI in pregnant infected women (18.6%) followed by Staphylococcus saprophyticus (18.3%).In this work, different types of bacteria were isolated during the three trimesters of pregnancy. The highest percentage of infection was in the second trimester (47%), followed by the first and third trimesters (20% and 17%) respectively.Results of non - specific immune response demonstrated that there was a significant phagocytic activity increase in the peripheral blood of the pregnant, infected women during the three trimester of pregnancy when compared with the control group (P > 0.05). There was also a significant increase in the concentration of the complement component C3 in the blood of the infected pregnant women (P>0.05).While the results of specific immune response showed a significant decrease in the ability of lymphocytes to change and divide in the peripheral blood during the three trimesters of pregnancy. After using (PHA) as a stimulating agent in comparison with the control samples (P < 0.05).Results of estimation of immunoglobulin concentrations in the sera of studied groups, showed no significant differences in the concentrations of IgG and IgA, while there was a significant decrease in the concentration of IgM in the sera of infected pregnant women when compared with its concentration in the sera of the control groups i.e. non - infected and non - pregnant women

دراسة مقارنة بين العزلات المحلية لبكترياStaphylococcus epidermidis المقاومة والحساسة للمثيسلين == Comparative Study between Local Isolates of Methicillin Sensitive and Resistance of Staphylococcus epidermidis

Author name: استبرق نبيل عبد اللطيف
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 60 عزلة من المكورات العنقودية من 140 عينة سريريه (ادرار، مسحات اذن، مسحات انفية، جروح، عينات الدم). اثنان وثلاثون عزلة (53.3%) من العدد الكلي للمكورات العنقودية شخصت على انها عنقوديات غير مخثرة لذيفان مخثر بلازما الدمCONS)). تسعة عشر عزلة (59.38%) من CONS شملتStaphylococcus .epidermidis تم فحص الحساسية للعزلات المحلية من S. epidermid لمضاد المثيسلين, النتائج اظهرت 3عزلات من S. epidermidis حساسة للمثيسلين و16عزلة من S. epidermidis كانت مقاومة للمثيسلين، طبقا لهذه النتائج صنفت العزلات الى مجموعتين : - S. epidermidis مقاومة للمثيسلين MRSE)) وS. epidermidisحساسة للمثيسلين .(MSSE) اجري اختبار الحساسية لهاتين المجموعتين من S. epidermidis لاحد عشر مضادا حيويا، اظهرت النتائج مقاومة عالية ومتعددة ل MRSE لهذه المضادات بينما MSSE كانت عالية الحساسية، حيث اظهرت الMRSE حساسية 100% لمضاد vancomycinفقط. وتراوحت نسبة مقاومتها للمضادات penicillin G100% وclindamycin75% وamoxicillin 68.7% وamoxicillin clavulinic acid 68.7% وtetracyclin56.2% وrifampin 56.2% وcephalexin56.2% وerythromycin50% وciprofloxacin50% وgentamicin 43.7%. بينما اظهرتMSSE حساسية 100% لمضاد gentimicinو rifampin وclindamycin وciprofloxacin وvancomycinونسب مختلفة من المقاومة للمضادات الاخرى، اذ كانت نسبة مقاومة MSSE لمضاد amoxicillin وamoxicillin clavulinic acid وcephalexinو erythromycinو penicillin G و.%33 tetracyclin تم التحري عن انتاجية MSSEو MRSE لبعض عوامل الفوعة شملت الهيمولايسين والبروتييزواللايبيزواليورييزوالجيلاتينييزوانزيم المحلل للحامض النوويDNA اظهرت النتائج انMRSE تمتلك نسبة انتاجية لهذه عوامل الفوعة اعلى منMSSE . حيث ان نسبة انتاجية هيمولايسين، البروتييز، اللايبيز، اليورييز، الجيلاتينييز وانزيم المحلل للحامض النووي DNA فيMRSE كانت80%، 100%، 80%، 100%، 60%، و30% على التوالي، بينما كانت نسبة الانتاجية لهذه العوامل في MSSE 67%، 100%، 67%، 100%، 33% و33% على التوالي. تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للمضادات penicillinو .tetracyclin اذ كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للعزلة 32S هي 60 وحدة للبنسلين و25مايكروغرام/مل للتتراسايكلين، 40 وحدة للبنسيلين للعزلة .40S تم دراسة امراضية MRSE وMSSE باختبار سميتها باستخدام ذكور الفئران البيض السويسرية، وكانت الاعداد البكتيرية المستخدمة هي (108،109، 1010 ،1011 ،1012) cfu/ml والتي تم حقنها داخل بريتون الفئران. لم تسجل اي نسبة قتل بكل التراكيز المستخدمة ل MSSE بينما بلغت نسبة القتل 33% بالتراكيز1010 و11 10 cfu/ml لMRSE. درست التغيرات النسيجية في انسجة الكبد، الطحال، الكلى، الرئة والقلب لذكور الفئران المحقونة ب MSSE و.MRSE لوحظ ان التاثيرات النسيجية التي سببتها MRSE كانت اعلى من تلك التي سببتهاMSSE . اكثر الاعضاء تاثرا نتيجة حقنMSSE وMRSE هما الرئة والكلى واللتان سبتتا نسبة عالية من النخر بهذين العضوين وكان التاثير اقل في الطحال والكبد من الرئة والكلى، ولم يظهر اي تاثير في قلب الفار المحقون بMSSE لكن هناك بعض التاثيرات في قلب الفار المحقون بMRSE. اظهرت نتائج الترحيل الكهربائي لعزلتيMSSE ( 51S و(5Sبانها لا تمتلك اي بلازميد بينما عزلتانMRSE تمتلك بلازميدات، كما لوحظ وجود بلازميدان في عزلة 40S احداهما بلازميد كبير والاخر صغير في حين ان العزلة الاخرى من MRSE 32S تمتلك 3 بلازميدات واحد منها كبير واثنان صغيران. اظهرت نتائج تحييد البلازميد باستخدام SDSو Rifampin ان بلازميدات العزلتين 32S)، (40S قد حييدت عند المعاملة ب100مايكروغرام/مل، 230مايكروغرام/مل من SDSعلى التوالي، 150مايكروغرام/مل، 200مايكروغرام/مل من Rifampinعلى التوالي. اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 40S حساسية للبنسيلين وبقاء المقاومة للمثيسلين كما اظهرت الخلايا المحييدة للعزلة 32S حساسبة للبنسلين وتتراسايكلين واحتفاظ البكتريا بمقاومتها للمثيسلين. | Sixty isolates of Staphylococcus were obtained from one hundred forty clinical specimens (urine, ear swabs, nasal swab, wound, and blood). Thirty two isolates (53.3%) of total number of Staphylococcus were identified as coagulase - negative staphylococci (CONS), nineteen isolates(59.38%) of CONS were included Staphylococcus epidermidis. Sensitivity of local isolates of S. epidermidis was examined against methicillin, the results showed 3 isolates from S. epidermidis were sensitive to methicillin and 16 isolates from S. epidermidis were resistance to methicillin, according to these results the isolates were splits to two groups : - methicillin resistance S. epidermidis (MRSE) and methicillin sensitive S. epiderimidis (MSSE). The sensitivity test of these two groups against 11 different antibiotics was done, the results showed MRSE were highly resistance and multi resistance patterns to these antibiotics, while MSSE showed highly sensitive. In MSSE showed 100% sensitivity to gentimicin, rifampin, clindamycin, ciprofloxacin and vancomycin, and different percentage of resistance to other antibiotics. The resistance percentage of MRSE to pencillin G 100%, clindamycin 75%, amoxicillin 68.7%, amoxicillin clavulinic acid 68.7%, cephalexin 56.2%, rifampin 56.2%, tetracyclin 56.2%, erythromycin 50%, ciprofloxacin 50%, gentamicin 43.7%. the resistance percentage of MSSE to amoxicillin, amoxicillin clavulinic acid, cephalexin, erythromycin, penicillin G and tetracyclin were 33%. While in MRSE showed 100% sensitivity to vancomycin only. Some virulence factors of MRSE and MSSE were detected including the hemolysin, protease, lipase, urease, gelatinase and DNase the results showed MRSE have higher percentage to produce these virulence factors than MSSE. The production percentage of hemolysin, protases, lipase, urease, gelatinase and DNase in MRSE was 80%, 100%, 80%, 100%, 60% and 60% respectively, while in MSSE 67%, 100%, 67%, 100%, 33% and 33% respectively. The minimum inhibitory concentration of antibiotics (penicillin and tetracyclin) to S. epidermidis isolate had been determined. they were 60U and 25µg/ml respectively for the isolate 32S, they were 40U of penicillin for the isolate 40S. The pathogenicity of MRSE and MSSE was studied by testing its lethality by using white Swiss male mice, the bacterial numbers was used that is (108,109,1010,1011,1012) cfu/ml and was injected in mice. Died of injected mice was not recorded with any used concentration in MSSE but in MRSE 33.3% of injected mice was killed in concentration 1010 and 1011 CFU/ml. Histological changes in liver, spleen, kidney, lung and heart tissues of male mice which were injected with MRSE and MSSE were studied. The histological effect were produced by MRSE was higher than those produced by MSSE. The most effective of MRSE and MSSE in lung, kidney because appeared of high necrosis in these organs but in spleen, liver of mouse were less effected from lung and kidney, in heart of mouse injected with MSSE no effect was recorded while in MRSE some effect have been seen. Results from agarose gel electrophoresis showed two isolates of MSSE 5S and 51S don't have any plasmid while other two isolates of MRSE have plasmids, two plasmids found in S. epidermidis isolate (40S), one of them was large plasmid and the other was small plasmid and in S. epidermidis isolate (32S) contained three plasmids, one from these was large plasmid and the other two plasmids were small plasmids. The results of plasmid curing by using sodium dodecyl sulphate (SDS) and rifampin showed that the plasmids of the local isolates 32S and 40S was curred by treatment with 100μg/ml, 230μg/ml respectively from SDS and 150μg/ml, 200μg/ml respectively from rifampin. Cured cells from 40S isolate (MRSE) were sensitive to penicillin and still resistance to methicillin and the cured cells from 32S isolate were sensitive to penicillin, tetracycline and still resistance to methicillin

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

Author name: حسام محمود حسن العماري
Supervisor name: هيفاء هادي حساني | عدوية عبد الله السعدي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.

دور بروتين A المستخلص من جدران خلايا Staphylococcus aureus في امراضية البكتريا == Role of Staphylococcus aureus cell wall protein A in the pathogenesis of the bacteria

Author name: سمير عبد الامير عبد علي علـش
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح | علي عبد الرحمن طه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ا عتمد في اجراء هذه الدراسة على 20 عزلة مرضية من بكتريا Staphylococcus aureus ا خذت من مختبر الصحة المركزي مشخصة باستعمال نظام ابي للعنقوديات (API - Staph . Ident . System) . ا عيد تشخيص جميع العزلات عن طريق استخدام الاختبارات الكيموحيويه من اجل التثبت بشكل دقيق من هويتها ، وقد جاءت العزلات جميعها متوافقة مع تشخيص مختبر الصحة المركزي . ا ستخدم اختبار التلازن الدموي ( (Haemagglutination test في التحري عن وجود بروتين A في عزلات S . aureus المشخصة جميعا ، وقد اظهر هذا الاختبار تباينا ملحوظا في نسبة امتلاك هذه العزلات لبروتين A . فقد برزت العزلات ذوات الارقام 1 ، و5 ، و6 ، و7 ، و9 بوصفها عزلات ذات محتوى عال من بروتين A . اما العزلات ذوات الارقام 8 ، و10 ، و11، و12، و13، و14 ، و15، و17، و18، و19 ، و20 ظهرت انها ذات محتوى متوسط من بروتين A . فقط العزلة ذات الرقم 16 ظهرت انها فقيرة المحتوى من بروتين A . بينما كشف ووفق الاختبار المستعمل عدم امتلاك العزلات 2، و3 ، و4 اي محتوى من بروتين A . ا نتخبت العزلة رقم ( 1 ) كعزلة مثالية من اجل انجاز هذه الدراسة لكونها تميزت بمحتوى عال من بروتين A فضلا عن انها تقدمت على بقية العزلات في اعطاء النتيجة الموجبة لاختبار انتاج انزيم Coagulase ، وكذلك في اظهار تحللا كاملا وشديدا في اختبار انتاج حالة الدم Hemolysin . ا ستخلص بروتين A الخام (Crude protein A) على مرحلتين . كانت المرحلة الاولى باتباع طريقة (Lind , (1974 ( طريقة التعليق بالصوديوم ازايد ) بوصفها طريقة سهلة وغير مكلفة في الحصول على مستخلص بروتين A المرتبط بجدار الخلية العنقودية للعزلة رقم ( 1 ) (Cell - bound protein A) بشكل كامل مع الحفاظ وبدرجة عالية على وحدة التركيب البنائي لبروتين A من اية تشوهات . اما المرحلة الثانية كانت باتباع طريقة ( Seki et al .,( 1985 طريقة مكملة للطريقة الاولى وذلك بترسيب بروتين A الطافي بكبريتات الامونيوم ( 85 % اشباع ) مع بقاء بروتين A المترسب محتفظا بفعاليته . ا دخل مستخلص بروتين A الخام عملية التنقية ( Purification) وهي كذلك كانت على مرحلتين . المرحله الاولى استخدمت فيها طريقة كروماتوغرافيا التبادل الايوني (Ion - exchange chromatography) بعمود ( DEAE - Cellulose ). اما المرحلة الاخرى فقد تضمنت استخدام طريقة كروماتوغرافيا الترشيح بالهلام (Gel - filtration chromatography) بعمود Sepharose CL - 6B) ) . انتهى استخدام الطريقتين في الحصول على مستخلص بروتين A منقى ( Purified protein A ) .ومن اجل التحري عن احتفاظ مستخلص بروتين A الخام والمنقى بفعاليته استخدم اختبار الانتشار المناعي الثنائي في الهلام الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون الخطوط الترسيبية التي نتجت من تفاعل مستخلص بروتين A الخام والمنقى مع IgG لمصل دم خنزير غينيا .قدر تركيز مستخلصات بروتين A ( الخام والمنقى جزئيا والمنقى ) باتباع طريقةBradford, ( 1976 ) . حيث بلغت التراكيز 63 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A الخام ، و42 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى جزئيا ، و36 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى .تم استخدام الفئران البيض من نوع ( Balb C ) من اجل الوصول الى التاثيرات المرضية لمستخلص بروتين A المنقى . حيث حقن المستخلص بطريقة الحقن داخل البريتون Intraperitonial injection)) بعدد سبع حقنات ، وبمعدل 0.1 مليلتر لكل حقنة ( ذو التركيز 36 مايكروغرام / مليلتر ) ، يفصل بين حقنة واخرى يوم واحد . اظهرت مجموعة فئران البحث المحقونة ببروتين A المنقى على المستوى السريري خمولا عاما بدا واضحا بعد الحقنة السادسة . لم تظهر اية تغيرات مظهرية جلدية في مناطق الحقن كما لم تحدث وفيات . بعد قتل الفئران وتشريحها جميعا ا ستاصلت اعضاء القلب ، والطحال ، والكبد ، والكليتين ، والامعاء ، والمعدة ، واخيرا الرئة . وبالموازنة مع اعضاء فئران السيطرة لوحظ حدوث تضخم كبير في الطحال . كما اظهر الكبد تضخما ملحوظا وهذا سجل في الفئران المحقونة ببروتين A المنقى . لم يسجل حدوث تغيرات على المستوى المظهري في اعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة ولكن لوحظ وجود بقع سوداء اللون على السطح الخارجي لنسيج الكبد ، والكليتين ، وهو ايضا سجل في فئران الدراسة اجمع .اهم ما برز في هذه الدراسة هو حجم التاثير المرضي الذي اصاب عضو الرئة حيث ظهر بشكل غريب فقد بدا النسيج يميل الى السواد ببهوت وهو ما كان واضحا في سبعة من فئران الحقن ، اما الثلاثة الباقية شوهدت الرئة فيها خلال التشريح وهي مغطاة بعض من اجزائها بالدم .كشف الفحص النسيجي لاعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة عدم وجود اية تاثيرات مرضية ناتجة من حقن بروتين A المنقى . اما الطحال فقد شهد حدوث توسع كبير في منطقة اللب الابيض White Pulp)) مع احتقان دموي بارز وانتشار للخلايا المولدة للصفيحات الدموية (Megacaryocytes) . اما الكبد فقد برز فيه حدوث تلف بسيط (Mild degenerative change) في خلايا الكبد مع ارتشاح خلايا احادية النواة (Monocytes) خصوصا في المنطقة البوابية التي بدت متوسعة نوعا ما . كما لوحظ زيادة في خلايا كبفر ((Kupffer cells في عموم نسيج الكبد . الكليتين شهدت بروز زيادة في الخلايا المكونة للكبيبة الكلوية ( Glomeruli) والتي يطلق عليها ( Mesengial cells ) .عضو الرئة تضمن الفحص النسيجي له تاثيرات عدة وهي كما يلي : 1 - احتقانات دموية كبيرة ( Bloody congestions ) .2 - وذمة ( Oedema ) .3 - ارتشاح خلايا التهابية ( Inflammatory cells infiltration) .4 - توسع في الفسح القصبية ( Alveolar spaces) مكونا ما يسمى بظاهرة Emphysema)) اي انتفاخ حويصلات الرئة . بدت الرئة للفئران المحقونة جميعا ببروتين A المنقى اكثر الاعضاء التي اظهرت تضررا نسيجيا كبيرا موازنة بالضرر في بقية الاعضاء .تم اجراء اختبار التحري عن السمية الخلوية لبروتين A المنقى باستخدام تقنية مزرعة الخطوط الخلوية الطبيعية ( Normal cell lines - culture ) حيث اعطى الاختبار نتيجة سالبة اي عدم امتلاك بروتين A المنقى تاثيرا سميا (Toxic effect) في الخلايا النامية . | This study dealt with ( 20 ) diagnosed isolates of Staphylococcus aureus by "API - Staph . Ident . System". which were taken from the central health laboratory . The diagnosis was repeated so as to confirm the identity of those isolates by using biochemical tests whose results were the same as those of the central health laboratory .The haemagglutination test was used to investigate the presence of protein ( A ) in all S . aureus isolates . The results markedly showed differences in content concerning the ratio of this protein , thus isolates numbered 1 , 5 , 6 , 7 and 9 gave high content of protein ( A ) , but the isolates numbered 8 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 17 , 18 , 19 and 20 gave medium content of protein ( A ) . Isolate numbered 16 was the only isolate that has low content of protein ( A ) . On the other hand , isolates numbered 2 , 3 and 4 gave no content of protein ( A) .The isolate number ( 1 )has been chosen as an optimal isolate to accomplish this study , Because of its high content of protein ( A ) , furthermore it was the best isolate in getting positive result concerning the test of coagulase production , and in giving a complete and intensive result concerning the test of hemolysin production . Crude protein ( A ) was extracted by two steps : Lind method ( Lind , 1974 . ) "Suspending in sodium azide" was followed at the first step as an easy and a cheap method in getting a thorough cell - bound protein ( A ) extracted from the isolate number ( 1 ) with high preservation of the structural unit without any deformation .The Seki et al .,( 1985 ) method was followed in the second step as a completion method to the first one , by the precipitate of the supernatant protein ( A ) using ammonium sulfate ( 85 % saturation ) . The function of precipitated protein ( A ) was perfect . In order to get a purified protein ( A ) extract from crude protein A , purification was accomplished by two steps : Ion - exchange chromatography by DEAE - cellulose column was used in the first step , While Gel - filtration chromatography by Sepharose CL - 6B column was used in the second step . Double immunodiffusion in gel was used to investigate the preservation of the crude and purified protein ( A ) with its full function . This test gave a positive result by forming the precipitate lines as a result of the interaction between protein ( A ) ( Crude and Purified ) and IgG of guinea pig sera .Bradford method was used to estimate protein ( A ) extracts concentration ( Crude , Partial purified , Purified ) . The estimation was 63 microgram / ml for crude extract , 42 microgram / ml for partial purified extract and 36 microgram / ml for purified extract .white mice ( Balb C ) were used to investigate the pathogenic effects of purified protein ( A ) . Intraperitonial injection method was used to inject 0.1 ml of 36 microgram / ml of purified protein ( A ) for 7 times with a one - day separating period . The injected mice with purified protein ( A ) showed general weakness which was very clear after the sixth injection . there were no phenotypic dermal change in the injection area , and no dead mice as well .After killing and dissecting of all the mice , the organs of heart , spleen , liver , kidney , intestine , stomach and lung were eradicated . There were a great enlargement in spleen and a little in liver in all injected mice in comparison with the control mice . No phenotypic changes appeared in heart , intestine and stomach , but black spots were shown on the outer surface of kidney and liver tissue which were presented in all the injected mice . The most important results in this study is the great size of pathogenic effects in lung . The shape of its tissue seemed strange and tended to be faint black with which was obvious in seven mice . The lung of the three others ( some parts ) showed during anatomy covered by blood .The histological check for heart , intestine and stomach showed no pathogenic effects resulted from protein ( A ) injection . In the spleen , there was a huge expanding in the white pulp region , with blood congestion while the spreading of megacaryocytes has increased . The liver showed mild degenerative change in liver cells with monocytes infiltration especially in the entrance region which appeared expanded . Also there was an increase in kupffer cells in all liver tissue .Kidney showed increase in mesengial cells which are concedered the forming units of glomeruli .The histological check of lung included the following : 1 - Bloody congestions .2 - Oedema .3 - Inflammatory cells infiltration .4 - Alveolar spaces expanding forming '' Emphysema '' .The lung was the most effected organ that showed tissue injury among other all organs . The normal cell lines - culture technique was followed to investigate cellular toxicity of the purified protein ( A ) which gave a negative result , that means , there was no toxic effect of purified protein ( A ) on the growth cells .

دراسة وراثية عن الطوافر البكتيرية المفككة للمركبات الفينولية

Author name: دانية منعم حامد الجادر
Supervisor name: صبحي دواد حمزة | ميساء جاسب
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: During this study (30) bacterial isolates from (55) soil samples and (10) water samples previously contaminated with petroleum oils were isolated and then screened for their capability for degrading phenol and analine . only (5) isolates were selected which show higher growth and degradation activity on the two substrates and identified Pseudomonas aeruginosa A13 and A5 , Escherichia coli A2 and A11 ، Enterobacter cloacae A8. Adaptation of isolates (A13, A11, A8, A5, A2) in higher concentrations of phenol (500 - 3000) µg/ml and analine (5003500) µg/ml were done . As much as (70,75and 80)% of (2000 µg/ml) phenol and (70,75 and 85)% of (2500 µg/ml) analine were degraded after 3 days of incubation. Number of mutants were generated by using 500 µg/ml of Nitrosoguanidine at incubations time (0.5,1.0and 2.0) hr .It was found that period of 1hr enough to induce mutation in the bacterial isolates in this study . and increased degradation activity as much as (90,90and 97)% of (2000 µg/ml) phenol and (90,97 and 100)% of (2500 µg/ml) analine were degraded by isolates (A13M2, A11M4and A8M12)respectively . Genetic analysis by electrophoretic agarose gel show that (A13, A8 and A8M12) isolates contain three plasmid bands However isolates (A11, A11M4 and A13M2) contain only two . Curing of plasmid frome the three isolates,« A11M4, A13M2 and A8M12»,were done by using acridine orange , ethidum bromide and SDS . It was found that 2200 µg/ml SDS and200 µg/ml acridine orange were capable of curing plasmids frome A11M4, A13M2 . All attempts for curing plasmid of isolates A8M12 was failed , however transformation of plasmid DNA of isolates A11M4, A13M2 and A8M12 in to E. coli MM294 was achieved . Results of the experiments indicate that these plasmids were responsible for degradation ability in the transformed isolates.

دراسة تاثير مزيج من بعض المستخلصات لبذور الحرمل ومخاريط السرو في حيوية الرؤيسات الاولية للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus خارج وداخل الجسم الحي == Study the effect of plant extracts mixture from seeds of Peganum harmala & cones of Cupressus sempervirens on viability of protoscolices of Echinococcus granulosus in vitro and in vivo

Author name: نور نهاد باقر وزان
Supervisor name: فوزية احمد الشنوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة استخدام المستخلصات المائية لبذور الحرمل بالتراكيز 10، 20، 30 مليغرام/مليليتر، ومخاريط السرو بالتراكيز50 ،100، 200مليغرام/مليليتر. اما المستخلصات الكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السروكانت التراكيز1،2 ،3 مليغرام/مليليتر و50، 100، 200 مليغرام/مليليتر على التوالي بينما الخليط المائي لبذور الحرمل ومخاريط السروكانت التراكيز(10+50)، (20+100) و(30+200) مليغرام/مليليتر، اما تراكيز الخلط الكحولي للنباتين(1+50)،(2+100) و(3+200) مليغرام/مليليتر؛ وذلك لدراسة تاثيرها في حيوية الرؤيسات الاولية لطفيلي المشوكات الحبيبية Echinococcus granulosus في الزجاجIn vitro من اجل الوصول الى التركيزالفعال في قتل الرؤيسات خلال اقصرمدة زمنية ممكنة لحقنه داخل التجويف البريتوني للفئران البيض سلالة Balb/c في الجسم الحي In vivo انخفضت الحيوية عند استخدام المستخلص المائي لبذور الحرمل ومخاريط السرووالخلط المائي لهما فحصل القتل التام للرؤيسات الاولية عند التراكيز 30، 200 و( 30+200)مليغرام/مليليتر في الزمن 30 دقيقة على التوالي. بينما تميزت المستخلصات الكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السرو والخلط الكحولي لهما بالقتل التام للرؤيسات في الزمن صفر دقيقة عند التراكيز 3، 200 و(3+200) مليغرام/مليليتر على التوالي . وبعد اختيار التراكيز الفعالة تم تجريبها في الفئران البيض المحقونة بالرؤيسات الاولية وقياسها بالسيطرة الموجبة المحقونة بالرؤيسات وغير المعاملة بالمستخلصات النباتية والخلط والبندازول، وبالسيطرة السالبة المحقونة بالمحلول الملحي الطبيعي Normal saline من اجل بيان تاثير المستخلصات النباتية والخلط المائي والكحولي والبندازول داخل الجسم الحي عن طريق دراسة التغيرات الحاصلة في معدل اعداد واوزان واقطار الاكياس العدرية والنسب المئوية لاختزالها في الجسم ؛ اذ تبين حدوث اختزال بنسبة 100% في المجاميع اجمع قياسا بالسيطرة الموجبة غير المعاملة اذ لم يلاحظ وجود الاكياس العدرية الثانوية في المجاميع المعاملة جميعها.وتم دراسة التغيرات الحاصلة في معدلات اوزان الكبد والطحال ومعدلات تضخمهما في المجاميع المعاملة بالمستخلصات النباتية المائية والكحولية والخلط المائي والكحولي والبندازول. وقد لوحظ حدوث تباين في المعدلات اذ كانت منخفضة عن السيطرة الموجبة والافضلية كانت لمجموعة الخلط الكحولي لبذور الحرمل ومخاريط السرو اذ اقتربت من السيطرة السالبة . وشملت هذه الدراسة ايضا معرفة تاثير هذه المستخلصات والبندازول في نسيج الكبد والطحال عن طريق دراسة التغيرات النسيجية لهما اذ حصل في الكبد تغيرات عديدة منها تغيرات في شكل الخلايا الكبدية، وزيادة في اعداد خلايا كفر الدفاعية في الفئران المعاملة التي كانت اقل مما ظهر في فئران السيطرة الموجبة، اما الطحال فاظهر توسعا في اللب الابيض وظهور الخلايا المكونة للصفيحات الدموية (Megakaryocytes) في الفئران المعاملة قياسا بالسيطرة السالبة وكانت هذه التغيرات اقل حدة في الفئران المعاملة بالخلط المائي والكحولي لبذورالحرمل ومخاريط السرو؛ لذلك فان نتائج التغيرات تبين امكانية استخدام الخلط المائي والكحولي للنباتين وبالتراكيز (30+50) و(1+50) مليغرام/مليليترعلى التوالي داخل الجسم الحي بطريقة امنة عن طريق قدرتها على تحفيز الجهاز المناعي وتوهين الرؤيسات الذي ادى الى منع تطورها الى اكياس عدرية ثانوية داخل الجسم الحي دون اثار جانبية سلبية قياسا ببقية العقاقير الكيميائية مما يؤهلها للتقليل من المضاعفات الحاصلة في العمليات الجراحية . كما تم دراسة الجرعة المميتة لهذه المستخلصات والخلط للاستفادة منها عند حقن الحيوانات فكانت الجرعة المميتة لكلا الحيوانات المحقونة بالمستخلص المائي والكحولي لبذور الحرمل 2.5 غرام/كيلوغرام؛ بينما كانت الجرعة المميتة للمستخلص المائي والكحولي لمخاريط السرو 5.18، 3.63 غرام/كيلوغرام على التوالي وكانت قيمة الجرعة المميتة للخلط المائي والكحولي للنباتين 6.7، 3.3 غرام/كيلوغرام على التوالي . وباجراء التحليل الاولي للكشف عن المجاميع الفعالة في المستخلصات المائية والكحولية لبذور الحرمل ومخاريط السرو تبين احتواء المستخلص المائي والكحولي لبذور الحرمل على القلويدات والكلايكوسيدات والصابونينات والفلافونيدات، بينما احتوى المستخلص الكحولي للنبات على الراتنجات فضلا عن المواد السابقة في المستخلص المائي. اما المستخلص المائي والكحولي لمخاريط السرو احتوى على الفينولات ،والتانينات ، والصابونينات، والفلافونيدات ،والكلايكوسيدات، والزيوت الطيارة، والتربينات، والستيرويدات ولم يحتو على القلويدات، ووجدت الراتنجات في المستخلص الكحولي لمخاريط نبات السرو. | This study included the using of the aquatic extracts for the seeds of Peganum harmala and cones Cupressus sempervirens with the concentration ( 10, 20, 30 )mg/ml and (50,100,200)mg/ml respectively and the aquatic mixture for seeds P. harmala and cones C.sempervirens with concentration {(10+50),(20+100),(30+200)}mg/ml and alcoholic extracts of the seeds P. harmala and cones C.sempervirens with concentration (1,2,3)mg/ml and (50,100,200) mg/ml respectively and alcoholic mixture of them with concentration {(1+50),(2+100),(3+200)} mg/ml .To study of the influence of plant extracts and mixture in the percentage of vitality of the protoscolices of Echinococcus granulosus In vitro for the purpose of arriving to the active concentration in killing of protoscolices during the shortest period of time possible in order to inject it intraperitoneal of the white mice In vivo as the vitality of protoscolices had caused complete death at the time 30 minute when using the aquatic extracts of seeds P. harmala and cones C. sempervirens and aquatic mixture of them at the concentration {30,200,(30+200)}mg/ml respectively . the alcoholic extracts of seeds P. harmala and cones C. sempervirens and alcoholic mixture of them with concentration {3,200,(3+200)}mg/ml these had differ to be distinguished with higher inhibition on the vitality of protoscolices and shown complete killing of protoscolices at the time zero minute . After the suitable concentration selection and then experimentation the active concentration on the mice injected with protoscolices and its comparison with the mice injected with protoscolices and not processed with plant extracts ,mitxure and albendazole (as positive control group ), the mice injected with albendazole and the mice injected with normal saline(as negative control ) to investigate the effect of plant extracts and albendazole in vivo with study the changes occurred in the average of the numbers weights, diameters of the hydatid cyst and the percentage for its reduction in the body as it appeared of getting the reduction of hydatid cyst with percentage 100% in all processed group with plant extracts , mixture and albendazole compared with positive group as its absence of the hydatid cyst in processed group. Also study the change occurred in the averages of the weights of the liver and spleen and the averages of its distension ,as it appeared the occurrence of the variation in the averages of the weights of the liver and spleen and the factors of its distension ,as the lowering significantly of these average occurred in all processed groups with plant extracts, mixture and albendazole about of the positive group and the best result of alcoholic mixture group which was approach to the negative group. This study included tissular changes occurred in the liver and spleen concerning the liver it appeared the occurrence of many tissular changes it most important are the changes of the liver cell and increase in the number of the kupffer cell as a defensive in the processed rates were less than what it appeared in the rate with the positive control, but the spleen ,it appeared the dilation of the whit pulp and the appearance of the cell composing of the hemic platelets(megakaryocyte cells) in the mice processed in comparison with unprocessed negative control group. these tissular changes were of less acuity in each of the group processed with the aquatic and alcoholic mixture of the seeds P. harmala and cones C. sempervirens compared with remaining groups . Thus from the results of this study at appeared the possibility of using the aquatic and alcoholic mixture of the seeds P. harmala and cones C. sempervirens with concentration {(30+50),(3+50)}mg/ml respectively in vivo in successful and safe way in the medical understanding by it a capability of initiating the immunity system which caused to the prohibition of the development of the protoscolices to the secondary hydatid cyst in vivo without causing the side effect in comparison with remaining chemical drug and white it qualifies it to decrease the complications of occurring drug the surgical operation . Also this study included knowing the lethal dose of plants extracts and the aquatic, alcoholic mixture of seeds P. harmala and cones C. sempervirens to purpose utilization its when injected the animal, as the lethal dose of aquatic and alcoholic extract of seeds P. harmala was 2.5gm/kgm while the lethal dose of aquatic and alcoholic extract of cones C. sempervirens was 5.18gm/kgm,3.63gm/kgm respectively. and the dose of aquatic and alcoholic mixture was 6.7gm/kgm,3.3gm/kgm respectively By performing phytochemical analysis the results showed the aquatic and alcoholic extracts of seeds P. harmala contain alkaloids, flavonoids ,glycosides whereas aquatic and alcoholic extracts of cones C. sempervirens contain phenol, tannin, flavonoids ,glycosides ,terpenoids , steroids and volatile oils but only alcohol extract of seeds P. harmala and cones C. sempervirens contain resins

دراسات حياتية وبيئية لحشرة من القطن Aphis gossypii Glover (Homoptera : Aphididae) == Bio - ecology of cotton aphid, Aphis gossypii Glover (Homoptera : Aphididae

Author name: سهيلة داوود سلمان الجنابي
Supervisor name: ابراهيم قدوري قدو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسات حياتية وبيئية لحشرة من القطن Aphis gossypii Glover ( Homoptera : Aphididae ) التي تعد من الافات الاقتصادية عالمية الانتشار، والتي تصيب العديد من النباتات منها اشجارو محاصيل الخضر بانواعها فضلا عن نباتات الزينة والنباتات البرية . شملت الدراسة ما يا تي : اولا : الدراسات المختبرية ا - تناسبت مدة الاطوار الحورية عكسيا مع درجات الحرارة اذ كانت اقصر مدة للطور الحوري الاول ( 1.25 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° ، واطول مدة لهذا الطور كانت في حرارة ( 15 ) م° ( 4.4 ) يوم . تراوحت مدة الطور الحوري الثاني بين ( 4.1 - 1.2 ) يوم في درجتي الحرارة ( 15 , 30 ) م° . اما مدة الطور الحوري الثالث فكانت متدرجة بين ( 3.5 - 1.1 ) يوما في الحرارة ( 15 , 30 ) م° ، اما مدة الطور الحوري الرابع فكانت اقل مدة في حرارة ( 30 ) م° اذ بلغت ( 1.05 ) يوم واطول مدة كانت ( 3.4 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° . كانت اطول مدة للدور الحوري ( 15.4 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصرها ( 4.6 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° . بلغ اعلى انتاجية للانثى العذرية ( 54.1 ) حورية في حرارة ( 25 ) م° ، واقل انتاجية كان في ( 15 م°) . كما وجد ان طول مدة قبل التكاثر تتاثر ايضا بدرجات الحرارة اذ اطول مدة كانت ( 3.2 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصر مدة كانت ( 0.9 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° . كما ان مدة التكاثر تتاثر ايضا بدرجات الحرارة اذ وجد ان اطول مدة كانت ( 11.2 ) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقل مدة ( 6.2 ) يوما في حرارة ( 30 ) م° . بلغ معدل انتاج الانثى حورية الواحدة في اليوم الواحد اعلاه ( 6.88 ) حورية / انثى / يوم في حرارة ( 25 ) مº ، واقلها ( 1.61 )حورية / انثى / يوم في ( 15 ) مº . ان طول عمر الانثى يتناقص بارتفاع درجة الحرارة اذ كان اطول عمرا ( 41.3 ) يوم في حرارة ( 15 ) مº ، واقل عمرا ( 19.9 ) يوم في حرارة ( 30 ) مº . وجد ان مدة الجيل كانت تتناسب عكسيا مع درجات الحرارة ، وكانت اطول مدة ( 18.6) يوم في حرارة ( 15 ) م° واقصر مدة كانت ( 5.5 ) يوم في حرارة ( 30 ) م° .ازدادت النسبة المئوية للهلاك براتفاع الحرارة من 20م° الى ان وصلت اقصاها 100 % في حرارة 35م°. ب - ان لدرجة الحرارة ونوع المضيف النباتي تاثيرا واضحا في مختلف الجوانب الحياتية للحشرة فلوحظ التاثير كان كبيرا في مدة الدور الحوري والانتاجية وطول العمر ومدة الجيل والنسبة المئوية للهلاكات على المضائف النباتية المختلفة . ثانيا : الدراسات الميدانيةا ــ المضائف النباتية : وجد من المسح الميداني للمضائف النباتية التي تصيبها حشرة من القطن في حقول الجادرية انها تصيب اكثر من 40 نوعا من 11 عائلة نباتية اغلبها من العائلات : القثائية ، والمركبة ، والباذنجانية ، والخبازية . ب ــ الكثافة العددية : تختلف باختلاف المضائف النباتية اذ وجد ان اكثر النباتات اصابة هي البطيخ ،و خيارماء ثم الباميا في خريف 2005 . اما في سنة 2006 وجد ايضا ان الكثافة مختلفة باختلاف المضائف ، وان اعلى كثافة على البطيخ والخيارو القطن ثم الباميا ، كما انها تختلف من اسبوع لاخر باختلاف درجات الحرارة والرطوبة النسبية ج ــ تفضيل الحشرة لسطحي الورقة : ان اعلى كثافة لحوريات من القطن كانت على السطح السفلي ( 370.4 ، 195.2 ، 464.5 ) لورقة نبات خيار الماء ، والباذنجان ، والباميا على التوالي واقلها على السطح العلوي ( 132.7 ، 54.0 ، 60.1 ) على التوالي وان اعلى نسبة مجنحات على السطح السفلي على النباتات الثلاث . د ـ توزيع الحشرة على مستويات النبات الثلاث : وجد ان اعلى نسبة للافراد غير المجنحة على المستوى الوسطي ثم القاعدي ثم القمي على نباتات خيار ماء ، وباذنجان ، وباميا على التوالي . اما بالنسبة للمجنحات فكانت مختلفة باختلاف النباتات على السطح العلوي للورقة . اما على السطح السفلي فوجد ان اعلى معدل للافرا د غير المجنحة كان على المستوى الوسطي ثم القاعدي ثم القمي للنباتات الثلاث ، على التوالي في حين انتشار الافراد المجنحة يختلف باختلاف النباتات . هـ - ان توزيع الحوريات غير المجنحة على نصل الورقة كان اعلاه على المساحات الخضر مابين العروق ، واقلها على العرق الوسطي للسطح السفلي لورقة المضيف النباتي . | The cotton aphid , Aphis gossypii Glover ( Homoptera : Aphididae ) is an important economic cosmopolitan polyphagous pests Which attacks numerous hosts such as trees , field crops , ornamental and wild plants . The biology of this insect has not been adequately studied in Iraq .Hence ,this investigation was designed to study the local strain of the pest under controlled and field condition .These investigation covers the following aspects : First : Laboratory studies : 1 - The nymphal stadia decrease with increasing temperatures . The first stadium reneged from 1.25 days at 30 C° to 4.4 days at 15 C° . Second stadium ranged between 4.1 - 1.2 days at 15 - 30 C°, The third stadium was from 3.5 to 1.1 days at 15 - 30 C°, whereas the fourth stadium was 1.05 - 3.4 days at 30 C°, 15C°. Temperature 35 C° is considered a lethal degree of most nymphal instars .The total period of nymphal stage was 15.4 days at 15 C° and 4.6 days at 30 C°.fecundity value The highest of apterae was 54.1 nymphs at 25 C° and the lowest at 15 C° .The maximum daily reproductive rate of a viviparous female was 6.88 nymphs / female /day at 25 C° and the minimum was 1.61 nymphs / female /day at 15C° . Prereproductive and , reproductive period was also affected with temperature .Generation period from birth to birth ranged between 20.9 days at 15 C° to 7.3 days at 30 C°. The maximum longevity was 41.3 days at 15C° and the minimum was 19.9 days at 30 C° . 2 - The laboratory studies have generally revealed that the degree of temperature and host plants have significant effects on the bionomics of cotton aphid . Second : Field studies Cotton aphid has a wide range of host plants . The field survey shows that more than 40 species of host plants belong to the families : Compositae , Malvaceae , Cucurbitaceae and Solanaceae in Jadriyah fields Population density varies on different host plants . The aphid prefers melon , cucumber , okra and cotton and its population varies depending on temperature , relative humidity and natural enemies . The field studies have revealed that both alatae and apterae of cotton aphid prefer the lower surface of different host plant leaves . The highest distribution of them was on the middle leaves of plant and high percentage ratio of apterous on the green area while the lesser one was on the midrib of leaves

انتاج واستخلاص الكلوكان من خميرة Saccharomyces cerevisiae ودراسة تاثيره في تحفيز الخلايا البلعمية خارج الجسم الحي == Production and extraction of glucan from yeast Saccharomyces cerevisiae and study it's effect in stimulation of phagocytic cells in vitro

Author name: علي عبد الواحد عبد الربيعي
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على خمس عزلات من خميرة الخبز Saccharomyces cerevisiae اخذت من نماذج مختلفة من الخمائر الجافة المتوافرة في الاسواق المحلية المستوردة من عدة مناشىء ، تم تشخيصها استنادا الى الاختبارات المظهرية والزرعية والكيموحيوية التي اشارت الى انها تعود الى الخميرة المذكورة . استخدمت ست طرائق مختلفة لاستخلاص الكلوكان من الخميرة وكانت ثلاث من هذه الطرائق مستخدمة في دراسات اخرى وثلاث طرائق تم تحويرها وفق الية عمل جديدة تختلف نوعا ما عن الطرائق الثلاث الاخرى ، اظهرت النتائج ان طريقة التحلل الذاتي وطريقة الموجات الصوتية الفائقة (Ultrasonication) المحورتان كانت اكثر ملائمة في الحصول على مستخلص عالي النقاوة حيث اعطت طريقة التحلل الذاتي مستخلصا بنقاوة 94 % واعطت طريقة الموجات الصوتية الفائقة مستخلصا بنقاوة 91 % وكان وزن المستخلصين 4.8 غرام /100 غرام خلايا لطريقة التحلل الذاتي و5.5 غرام / 100 غرام خلايا لطريقة الموجات الصوتية الفائقة ، وان اعلى كمية من مستخلص الكلوكان قد تم الحصول عليها بطريقة Byron 1 والتي بلغت 6.25 غم /100 غرام خميرة بنسبة نقاوة 71 % ، وكانت هذه الطريقة هي الاقل استهلاكا للوقت وللمواد المستخدمة في الاستخلاص بين الطرائق المستخدمة.تم الكشف عن وجود الكلوكان في المستخلصات النهائية باستخدام تقنية الـFT - IR ، بينت نتائج الفحوصات احتواء جميع النماذج على بيتا (3،1) كلوكان ، ولوحظ ايضا خلو جميع النماذج من اي مركب سكري اخر مثل المانان او الكلايكوجين فضلا عن خلوها من البيتا (6،1) كلوكان ، باستثناء ما اشارت اليه الفحوصات من احتواء احد النماذج ( الانموذج G.1) الذي تم الحصول عليه بطريقة (Sakai 1) على نسبة من الكايتين دون بقية النماذج .تم غربلة عزلات الخميرة بالاعتماد على محتواها من الكلوكان ولوحظ ان العزلة S. cerevisiae Sc3 تحتوى على اعلى نسبة من الكلوكان بلغت 3.827 % (وزن /وزن ) من الوزن الجاف للخلايا ، في حين ان اعلى كتلة حيوية للخلايا تم الحصول عليها من العزلة S. cerevisiae Sc5 والتي بلغت 0.8778 غم /100 مللتر . درس تاثير بعض الظروف في انتاج الكلوكان من خلايا الخميرة ولوحظ ان نسبة الكلوكان في الخلايا تختلف باختلاف ظروف النمو ، واشارت النتائج الى ان درجة الحرارة المثلى لانتاج الكلوكان هي 35 م والرقم الهيدروجيني الامثل 6 والمصدر الكربوني الامثل هو السكروز في حين كانت مدة الحضانة المثلى هي 48 ساعة كما لوحظ ان استخدام الحاضنة الهزازة بسرعة 100 دورة / الدقيقة في حضن المزارع يعطي نسبة اعلى من الكلوكان قياسا مع استخدام الحاضنة الساكنة ، استعملت انواعا من الاوساط الخام الطبيعية في تنمية الخميرة مثل وسط مستخلص التمر ومستخلص النخالة التي يمكن ان تكون ملائمة للاستعمال بنطاق واسع وتحقيق مردود اقتصادي فضلا عن الاوساط المختبرية التقليدية المستعملة في الدراسات والبحوث مثل وسط Yeast extract peptone dextrose (YEPD) وبينت النتائج ان وسط مستخلص التمر كان الافضل في الحصول على اعلى نسبة من الكلوكان والتي بلغت 4.664 % (وزن / وزن ) من الوزن الجاف للخلايا كما ان هذا الوسط قد اعطى ايضا اعلى كتلة حيوية من الخلايا بلغت 0.9864 غم / 100 مللتر . درس تاثير ثلاث نماذج من الكلوكان في عملية التهام خميرة Candida albicans من قبل خلايا الدم البيض متعددة اشكال النوى (Polymorphonuclears) خارج الجسم الحي ، تضمنت الانموذج G.3 الذي تم الحصول عليه بطريقة (Byron 1) والانموذج G.5 الذي تم الحصول عليه بطريقة الموجات الصوتية الفائقة والانموذج G.6 الذي تم الحصول عليه بطريقة التحلل الذاتي ، بينت النتائج ان النماذج الثلاثة كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز نماذج الكلوكان باستثناء التركيز 100 مايكروغرام / مل للانموذج G.3 حيث لم يلاحظ وجود زيادة معنوية في معامل البلعمة قياسا مع معاملة السيطرة ، ولوحظ ان الانموذج G.6 الذي تم الحصول عليه بطريقة التحلل الذاتي وهو الاكثر نقاوة كان هو الافضل في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة قدرتها على الالتهام وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه عند التركيز 500 مايكروغرام / مللتر لهذا الانموذج . | Five isolates of the Saccharomyces cerevisiae were obtained from different samples of commercial dry baker yeasts that imported from different origins which purchased from local markets , they were identified depending on morphological , cultural and biochemical tests . Six different extraction methods have been used to extract glucan from the yeast , three of these methods are well documanted in previous studies and ,while the other three methods have been modified (in this study) using new technique differ from the other methods . The results showed that the autolysis and the ultrasonication methods were the best to obtain highly purified extracts , the autolysis method gave glucan extract with 94% purity and the ultrasonication method gave extract with 91% purity , the weight of extracts was 4.8 g /100 g of yeast by the autolysis method and 5.5 g / 100 g of yeast by the ultrasonication method ; The maximum quantity of glucan extract was obtained by (Byron 1) method which is reached 6.25 g/100g of yeast with 71% purity , this method was the least time and materials consumption among the extraction methods used in this study. The presence of glucan in the final extracts that obtained from these methods have been detected by the FT - IR technique , the results shown that all samples contain beta (1,3) glucan , and all samples did not contain any other carbohydrates such as mannan or glycogen as well as beta (1,6) glucan , with exception of sample (G.1) which extracted by (Sakai 1) method contained a proportion of chitin .The S. cerevisiae isolates have been screened depending on glucan content , S. cerevisiae Sc3 gave the highest glucan content reached to 3.827 % (wt / wt ) of dry weight of cells , while the highest cells biomass have been obtained from the S. cerevisiae Sc5 was 0.8778 g/100 ml.The effect of some cultural conditions on glucan content was studied and showed that glucan contents varies with different growth conditions , the result showed that the favorable conditions for glucan production are culturing the yeast in media containing sucrose (5%) with pH 6 and incubated at 35°C in a shaker incubator with 100 rpm for 48 hrs. Some natural crude materials such as date extract and wheat bran were utilized as media for growing of yeast and production of glucan to achieve the economical advantages , date extract was the favorable medium for glucan production since high content of glucan (4.664 % of dry weight of cells ) and highest cells biomass (0.9864 g/100 ml) was achieved from this medium . The effect of three glucan samples on phagocytic process of Candida albicans cells by the polymorphonuclear (PMNs) leucocytes have been studied in vitro , the samples used were G.3 which extracted by (Byron 1) method and G.5 which extracted by (Ultrasonication) method and G.6 which extracted by (autolysis) method, and the results showed that all samples had clear effect in stimulation of the phagocytic cells and increase its phagocytic activity , the stimulating effect increased with increasing of sample concentration , with exception of the concentration 100 µg / ml of sample G.3 which had no significant increasing in the phagocytic index (PI) , the sample G.6 which was obtained by the autolysis method with highest purity was the best in stimulation of the phagocytic cells , and the maximum phagocytic index was obtained at the concentration 500 µg / ml of this sample .

دراسة تشريحية مقارنة لانواع مختارة من العائلــــــــة المركبــــة Compositae الناميـــــة ضمن مجمع الجادريــــــة ـ جامعـــة بغداد == Comparative anatomical study of selected compositae species grown in Jadiriyah Campus , Baghdad University

Author name: سكينة عباس عليوي
Supervisor name: علي حسيـن عيسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناول البحث الحالي دراسة تشريحية مقارنة لانواع عشرة مختارة من العائلة المركبة Compositae النامية في مجمع الجادرية - جامعة بغداد ، والانواع هي : Aster subulatus Michx.Calendula officinalis L.Calendula Persica C. A. MayCarduus pycnocephalus L.Carthamus oxycantha M. B.Eclipta alba (L.) HaussknErigeron canadensis L.Silybum marianum (L.) GarthUrospermum picroides (L.) Schmidt .Xanthium brasilicum Vellozo .حيث ركز البحث على بعض الصفات التشريحية ودراستها بصورة مقارنة ولاول مرة لهذه الانواع في العراق. وتضمنت الدراسة مميزات البشرة مثل دراسة خلايا البشرة الاعتيادية والمعقدات الثغرية. واسفرت الدراسة عن ظهور طراز جديد ولاول مرة في هذه الانواع وهو الطراز المتوازيParacytic type للنوع Eclipta alba . كما تمت دراسة نظام التعرق للانواع المذكورة انفا ومقارنتها وكذلك الخصائص التشريحية للورقة واظهرت المقاطع العمودية لنصل الورقة لاسيما شكل الحزم وعددها وسمك الطبقتين العمادية والاسفنجية وبقية الصفات حيث اعطت خصائص تصنيفية مهمة ، وامكن تقسيم الانواع على مجاميع ، وبينت الدراسة للمقاطع المستعرضة للسيقان خاصة صفات تصنيفية مهمة. ومميزة من حيث : سمك الكيوتكل وسمك طبقة البشرة ووجود الكولنكيما او عدم وجودها ، وعدد صفوفها ونوعها . وكان لصفات الحزمة الوعائية اهمية مميزة من حيث معدل طولها واعدادها واشكالها مما امكن تقسيم الانواع على مجاميع ، كذلك درس اللحاء والخشب حيث ابديا اهمية تصنيفية من جوانب عدة ، وامكن الاستفادة من الاسطوانة الوعائية في عزل الانواع سواء اكانت مستمرة ام متقطعة على شكل حزم كذلك درس اللب واعطيت له اهمية من حيث المساحة ووجود او عدم وجود البلورات وانواعها ان وجدت . وتضمن البحث دراسة المقاطع المستعرضة للجذور ، واظهر سمك البشرة والقشرة واللحاء وشكله ومساحة منطقة الخشب اهمية كبيرة في العزل والتشخيص وكان للكساء السطحي للاوراق والسيقان فائدة وقيمة تصنيفية مهمة في عزل الانواع من حيث اشكال الشعيرات واطوالها وانواعها ومن حيث وجود او عدم وجود الحليمات . واسفرت الدراسة عن ظهور نتائج وتغايرات وصفات مهمة تعرض لاول مرة ، لقد اعطت الدراسة التشريحية صفات مهمة اعطت دعما واسنادا للصفات المظهرية وساعدت على عزل وتشخيص الانواع ضمن العائلة نفسها ، هذا واورد البحث صورا للعينات الحقلية التي جمعت من مواقع مختلفة ومتعددة ضمن مجمع الجادرية ( رقعة الدراسة ) ، وتضمن صورا عديدة للمقاطع التي تمت دراستها للاعضاء النباتية المختلفة فضلا عن العديد من الجداول . وقد نوقشت النتائج لهذه الدراسة التشريحية خصوصا ما هو متعلق ببيئة هذه الانواع . | The present study dealt with ten selected species of the family compositae grown in Jadiriyah campus , university of Baghdad , were studied anatomically in a comparative way within this work . These species are : Aster subulatus Michx.Calendula officinalis L.Calendula Persica C. A. MayCarduus pycnocephalus L.Carthamus oxycantha M. B.Eclipta alba (L.) HaussknErigeron Canadensis L.Silybum marianum (L.) GarthUrospermum picroides (L.) Schmidt .Xanthium brasilicum Vellozo .Comparative anatomical characters were used for the first time in these species grown in Iraq , such as characteristics of ordinary epidermal cells and stomatal complexes . Paralytic type was recorded as new founding in these species namely in Eclipta alba . Venation system was investigated and compared , Vertical sections of leaf blades , especially the shape and number of vascular bundles , thickness of palisade of spongy layers and other mesophyll characters . These characters were important taxonomically ,according to these species were divided into groups based on these specific characters . Cross sections of stems show important taxonomic values , like thickness of cuticle , epidermis , presence or absence of collenchyma , types and rows of this collenchyma . Characteristics of the vascular bundle were important too , therefore the species were divided according to these attributes into groups. Xyelem and phloem were also used taxonomically . The vascular cylinder was useful whether it was continuous as a complete cylinder or as a separated strands.Pith of the stem and its size , presence of crystals was of a considerable importance . Other characters of the plant organs , cross sections of root were useful taxonomically , especially the thickness of epidermis , cortex , phloem and xylem .Indumentum of leaves and stems was also of a taxonomic value , therefore the shapes , length , kinds , presence of glands were used for identification of the species . This study concluded the presences of variation in characters ; and these were presented for the first time comparatively , so that the anatomical characters were of a good supporting to the exomorphological characters in the family compositae . Graphes , field photographs of the different plants and sections of plant organs were put in addition to a numerous tables in this work . The above results were discussed scientifically regarding the invironmental factors .

دراسة كفاءة خليط من مستخلصات قشور ثمار الرمان وثمار الشفلح في تضعيف حيوية الرؤيسات الاولية للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus. Batzsh,1786 خارج الجسم الحي وداخله == The study of efficiency of mixture extracts from Pericarp of Punica granatum L. and Fruit of Capparis spinosa L. in attenuation of protoscolices of Echinococcus granulosus. Batzsh,1786In vitro and In vivo

Author name: نهى محمد موسى الدوري
Supervisor name: فوزية احمد الشنوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان هدف هذه الدراسة اختبار فعالية كل من المستخلصات المائية والكحولية لقشور الرمان Punica granantum L. وثمار الشفلحL. Capparis spinosa بتراكيز )300،200،100،50 (مليغرام /مليليتر.كما تم خلط المستخلصات المائية لقشور الرمان وبتراكيز (100،50) مليغرام /مليليتر مع (200،100) مليغرام /مليليتر من المستخلص المائي لثمار الشفلح وبالتراكيزنفسها تم خلط المستخلصات الكحولية وتقويم فعاليتها في تضعيف حيوية الرؤيسات الاولية لطفيلي المشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus .Batch,1786 الماخوذة من كيس مائي لكبد احد الاغنام خارج الجسم In vitro لمعرفة جودة وفعالية التراكيز في قتل الرؤيسات الاولية ليتم اختبارها فيما بعد داخل الجسم ,اتضح من الدراسة خارج الجسم الحي (في الزجاج ) اذ انخفضت حيوية الرؤيسات الاولية عند استعمال المستخلص المائي لقشور الرمان وبتراكيز 300,200مليغرام /مليليتر والمستخلص المائي لثمار الشفلح ووبنفس التراكيز وللخليط المائي بتركيز (200+100)مليغرام /مليليتر لهما فحصل القتل التام للرؤيسات في الزمن60 ,60, 90,45,90دقيقة لكل من التراكيز .بينما تميزت المستخلصات الكحولية لقشور الرمان وثمار الشفلح والخليط الكحولي لهما فاحدثت القتل التام للرؤيسات في الزمن30,30 60,دقيقة عند التراكيز (200+100),300مليغرام /مليليتر وقبل اجراء اختبار فعالية المستخلصات داخل الجسم تم تحديد الجرعة المميتة المتوسطة التي بلغت 11.38,8.8,10,8.1,10.7,9.41غرام / كيلوغرام بالنسبة للمستخلصات المائية للرمان والشفلح والمستخلصات الكحولية للرمان والشفلح والخليط المائي والخليط الكحولي على التوالي, لكي تعد امينة الاستعمال وقليلة السمية . كما تضمنت الدراسة اختبار التراكيز المناسبة ومعاملتها بمجاميع الفئران المحقونة بالرؤيسات الاولية اما مجموعة السيطرة السالبة فتم حقنها بمحلول الملح الفسيولوجي Normal saline من اجل بيان تاثير المستخلصات النباتية داخل الجسم كما تم دراسة التغيرات الحاصلة في معدلات اعداد واوزان واقطار الاكياس العدرية والنسب المئوية لاختزالها في الجسم اذ تبين حدوث انخفاض في معدلات اعداد واوزان واقطار الاكياس العدرية الثانوية المتطورة في الفئران المعاملة بالمستخلصات المائية لنباتي الرمان والشفلح وزيادة نسب الاختزال قياسا بمجموعة السيطرة الموجبة في بقية المجاميع حيث وصلت النسبة المئوية لاختزال اعداد الاكياس العدرية الى 100%في بقية المجاميع المعاملة .اما التغيرات الحاصلة في معدلات اوزان الكبد والطحال ومعدلات التضخم فقد لوحظ حدوث تباين في معدلات الاوزان والتضخم اذ تقاربت قيم معدلات الوزن وتضخم الكبد للمجموعة المعاملة بالمستخلص المائي للشفلح والرمان مع مجموعة السيطرة الموجبة ,بينما حدث انخفاض معنوي واضح لهذه المعدلات في بقية المجاميع وكانت الافضلية للمجموعة المعاملة بالخليط الكحولي والمجموعة المعاملة بالمستخلص الكحولي للرمان اذ اقتربت من معدلات السيطرة السالبة .هذا وشملت الدراسة تقويم تاثير هذه المستخلصات النباتية والالبندازول Albendazole من دراسة التغيرات النسيجية الحاصلة في الكبد والطحال, ففي الكبد ظهرت تغيرات نسيجية عديدة اهمها وجود احتقان في بعض اوردة الكبد مع تغيرات لحجم الخلايا الكبدية وزيادة في اعداد خلايا كوفر Kupffer cells الدفاعية التي كانت اقل مما ظهر في مجموعة فئران السيطرة الموجبة ,اما الطحال فقد اظهر توسع اللب الابيض على حساب اللب الاحمر وزيادة ارتشاح الخلايا المولدة للصفيحات الدموية (خلايا النواء Megakaryocytes). وكانت هذه التغيرات اقل حدة في الفئران المعاملة بالخلط الكحولي. كما كانت التغيرات قليلة في المجاميع المعاملة بالمستخلصات الكحولية للنباتين ,لذا تبين من هذه الدراسة امكانية استخدام الخلط الكحولي والمستخلصات الكحولية بطريقة امنة عن طريق قدرتها على تحفيز الجهاز المناعي وتضعيف الرؤيسات ومنع تطورها الى اكياس عدرية ثانوية داخل الجسم الحي دون احداث اثار جانبية سلبية قياسا ببقية العقاقير الكيميائية مما يؤهلها للتقليل من المضاعفات الحاصلة في العمليات الجراحية . وباجراء التحليل الاولي للكشف عن المجاميع الفعالة في المستخلصات المائية والكحولية لقشور الرمان وثمار الشفلح تبين احتواء المستخلص المائي والكحولي لقشور الرمان على : القلويدات Alkaloids ، والكلايكوسيدات Glycosides ، والفلافونيدات Flavonoids ،و فينولات Phenols ، وتانينات Tannins ، وتربينات Terpenoids ،و سترويدات Steroids بينما احتوى المستخلص الكحولي فضلاعن هذه المواد الراتنجات Resins ايضا. اما المستخلص المائي والكحولي لثمار الشفلح يبين احتوائه على : القلويدات Alkaloids ، والفلافونيدات Flavonoids ، والكلايكوسيدات Glycosides ، بينما احتوى | This study aims to test the efficiency of each of the aquatic and alcoholic extracts for the Pericarp of Punica granatum L. and Fruit of Capparis spinosa L. in concentrations of ( 50 , 100 , 200 , 300 ) mg/ml. Also a mixture of aquatic extract of Punica granatum Pericarp in concentration of (50,100) mg/ml, and (100, 200) mg/ml concentrate of the aquatic extract of Capparis spinosa Fruit . And a similar mixture was prepared for the alcoholic extracts in similar concentrations. A test was performed for the efficiency of each of the prepared extracts, in attenuation of protoscolices Echinococcus granulosus. Batch,1786 which were isolated from hydatid cysts of liver in sheep In vitro to determine the optimum concentration to kill the protoscolices, where the test is then to be performed by injecting the protoscolices intraperitonealy in white mice In vivo. Actually the vitality of protoscolices had dropped drastically with the application of aquatic extracts of Punica granatum Pericarp at the concentrations of (200 , 300) mg/ml, and aquatic extracts of Capparis spinosa Fruit at the concentration of (200 , 300) mg/ml, and the mixture of both the aquatic extracts at the concentration (100+200) mg/ml, where complete death was achieved at times, 90 , 45 , 90 , 60 , 60 minutes respectively. Alcoholic extracts of Punica granatum Pericarp and Capparis spinosa Fruit , and their mixture showed complete killing of Protoscolices at the time 30 , 30 , 60 minute in concentrations of {300 & (100+200)} mg/ml.Before performing the test In vivo, we determined the average lethal doses which were 9.41 , 10.7 , 8.1 , 10 , 8.8 , 11.3 g/ kg for the aquatic extract of Punica granatum, Capparis spinosa, their Alcoholic extracts, the aquatic mixture, and the alcoholic mixture respectively. Thus, the extracts in such concentrations could be considered as safe and low poisoning . The study included testing and application of the best concentration for treatment of the white mice that were injected with protoscolices, a negative group were injected with normal saline to determine the effect of extracts In vivo. The study measured, also the changes in average numbers, weights, dimensions, and percentage of reduction of hydatid cysts In vivo. Where it showed a decrease in the average number, weight, factors of its distension of the secondary hydatid cysts which developed in mice treated with the aquatic extracts of Punica granatum , Capparis spinosa, and increase of percentage of reduction compared with the positive control group, where a 100% reduction of hydatid cysts was achieved in the treated groups.Changes in liver and spleen weights, and average of hypertrophy showed some variations. Where average of weights and hypertrophy of liver of mice treated with aquatic extracts of Punica granatum , Capparis spinosa were similar to those of the positive group. A significant drop in these averages was observed in other groups. Best results were observed in groups treated with the alcoholic mixture, as well as in those treated with the alcoholic extract of Punica granatum, where the changes were close to those of the negative group. The study included observation of the effect of treatment with the above mentioned extracts and with Albendazole, on tissue changes of liver and spleen. Where liver showed significant changes, most important of which were the changes of the liver cell and increase in the number of the kupffer cell as a defensive mechanism, which were much less than their rate in the positive control group. On the other hand, spleen showed dilation of the white pulp and the appearance of cells composing of the Hemic platelet (megakaryocytic cells) in processed mice compared with unprocessed negative control group. These tissue changes were less persistent in groups processed with the alcoholic mixture of Punica granatum and Capparis spinosa and groups processed with the mixture of alcoholic extracts. By performing physiochemical analyses for the extracts to specify their effective compounds, we came to conclude that the aquatic and alcoholic extracts of Pericarp Punica granatum contain Alkaloids ,Flavonoids ,Glycosides, Phenols, Terpenoids, Tannins, and Steroids. whereas the alcoholic extracts in addition to these compounds, contain resins. whereas the aquatic extract of carp Capparis spinosa contain Alkaloids, Flavonoids, Glycosides, Terpenoids. Alcoholic extract of fruit Capparis spinosa contains in addition to these compounds ,tannin

دراسة كيموحيوية وجزيئية لانزيم Hyaluronidase المنتج من عزلات محلية لبكتريا Pseudomonas spp. == Biochemical and Molecular Study of Hyaluronidase Produced by Local Isolates of Pseudomonas spp

Author name: ابية صباح صديق الدملوجي
Supervisor name: لينة عبد الكريم الامير | غازي منعم عزيز
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 140 عينة من مصادر مختلفة تضمنت الادرار، والخمج، والجروح، والبراز، والقشع، والتهاب الاذن، والدم، وسائل من الرئة ، وللمدة من حزيران ولغاية ايلول 2005 وتم الحصول على 55 عزلة لبكتريا Pseudomonas spp. بنسبه عزل 39.3%, وكانت اعلى نسبة عزل من الخمج والجروح اذ بلغت 38.2%.2 - اختبرت حساسية العزلات المحلية لبكتريا Pseudomonas spp .اتجاه اثنا عشر مضادا للحيوية وقد ابدت العزلات مقاومة مختلفة ومتعددة للمضادات اذ كانت العزلات جميعها مقاومة لثلاثة مضادات هي : Ampicillin ، وAugmentin ، وRifampin . وكانت 82% من العزلات مقاومة ﻟ 6 - 9 مضادات ، بينما كانت 14.5% من العزلات مقاومة ﻟ 1 - 5 مضادات و3.7% من العزلات المحلية مقاومة ﻟ 10 - 12 مضادا. كما لوحظ ان اغلب العزلات كانت حساسة لمضاد Amikacin ثم Ciprofloxacin ثم Gentamycin وتباينت مقاومة العزلات ا تجاه بقية مضادات الحيوية المستعملة.3 - تم التحري عن انتاج عوامل الضراوة المختلفة للعزلات قيد الدراسة مثل : الهيمولايسين ، والايلاستيز، واليورييز ووجد ان نسبة انتاج الهيمولايسين كانت بحدود 78.1% متوزعة بشكل اساسي في نماذج الخمج والجروح ثم الادرار ، كما اتصفت العزلات المحلية بانتاجها لانزيم الايلاستيز وبنسبة 85.4% تمركزت عند عينات الخمج والجروح ثم الاذن والادرار اما نسبة انتاج اليورييز فكانت 80% للعزلات قيد الدراسة وكانت اغلبها عائدة لعينات الادرار والبراز ثم الخمج والجروح.4 - تم التحري عن انتاج انزيم الهيالورونيديز باستعمال وسط نقيع القلب والدماغ الحاوي على حامض الهيالورونك ، واتضح ان 72.7% من العزلات المحلية تمتلك القابلية على انتاج الانزيم توزعت بشكل اساسي في عينات الادرار ثم عينات الخمج والجروح والاذن.5 - درست العلاقة بين انتاج انزيم الهيالورونيديز مع عوامل الضراوة قيد الدراسة (الهيمولايسين ، والايلاستيز ، واليورييز) . واتضح ان 43.6% من العزلات الكلية كانت منتجة لهذه العوامل مع انزيم الهيالورونيديز بينما كانت 18.18% من العزلات الكلية منتجة لعاملي ضراوة وانزيم الهيالورونيديز وتميزت ست عزلات محلية بكونها منتجة لعامل ضراوة واحد مع انزيم الهيالورونيديز ، كذلك لوحظ ازدياد عدد المجموعات الخاصة بنسق توزيع عوامل الضراوة من 7 عند ربط ثلاثة عوامل فقط الى 11 عند اضافة عامل الهيالورونيديز اليها.6 - غربلت العزلات المحلية على وسط نقيع القلب والدماغ الصلب وانتخبت خمس عزلات لاعطاءها نسب تحلل عالية لحامض الهيالورونك. 7 - لوحظ عند دراسة النسق البلازميدي لخمسة عزلات محلية (P52, P2, P10, P27 ,P30) لبكتريا Pseudomonas spp. المنتجه لانزيم الهيالورونيديز باحتوائها على حزمة بلازميدية واحدة.8 - عند محاولة تحييد البلازميدات باستعمال صبغة بروميد الايثيديوم ، لوحظ اختفاء البلازمد من العزلة P2 باستعمال تركيز 2000 مايكروغرام/مليلتر من الصبغة ، وتم اختبار قدرة العزلة المحيدة في انتاج الهيالورونيديز واظهرت هذه العزلة قدرتها في انتاج الانزيم.9 - اختبرت العزلات المحلية (التي اعطت نسب تحلل عالية على الوسط الصلب) في الوسط السائل، وتم تقدير الفعالية النوعية لها بالاعتماد على طريقة Turbidimetric assay ، واختيرت العزلة المحلية P27 Pseudomonas spp. كونها الاغزر انتاجا اذ بلغت الفعالية النوعية لها 2.7 وحدة /ملغم بروتين واستعملت في التجارب اللاحقة.10 - حددت الظروف المثلى لانتاج الهيالورونيديز باستعمال وسط مرق نقيع القلب والدماغ المدعم ﺒ 0.5% مستخلص الخميرة و0.25 ملغم/مليلتر من مادة التفاعل (حامض الهيالورونك) برقم هيدروجيني 6 والملقح بعدد خلايا 1×106 خلية/مليلتر ، والحضن بالمزارع الهزازة بسرعة 50 دورة /دقيقة لمدة 18 ساعة.11 - نقي الهيالورونيديز المنتج من العزلة المنتخبة بخطوات تضمنت الترسيب باستعمال كبريتات الامونيوم بنسبة تشبع 50% ثم استخدام تقنيتي كروماتوغرافي التبادل الايوني باستخدام المبادل DEAE - Cellulose ثم الترشيح الهلامي بعمود Sephacryl S - 300 ، وتم الحصول على عدد مرات تنقية مقدارها 10.8 وبحصيلة انزيمية 20.4%.12 - درست بعض العوامل المؤثرة في فعالية وثباتية الانزيم المنقى اذ كان الرقم الهيدروجيني الامثل للفعالية 6 وثبات الانزيم 6 - 7 وظهرت اقصى فعالية للانزيم عند درجة حراره 40 م واحتفظ الانزيم بحدود 85 - 100% من فعاليته في درجات الحرارة (30 - 45) م ، واحتفظ الانزيم ﺒ 12% فقط من فعاليته عند حضنه بدرجة حراره 50 م لمدة 30 دقيقة. كما درس تاثير بعض الايونات الفلزية في فعالية الهيالورونيديز ، وجد ان لايونات الصوديوم بتركيزي 5 و10 ملي مولار فعلا تنشيطيا للانزيم اذ احتفظ الانزيم ﺒ 107% و102% من فعاليته على التوالي. بينما ثبطت فعالية الانزيم بصورة واضحة عند معاملته بايونات الحديديك Fe+3 ، اذ احتفظ الانزيم ﺒ 50% و15% من فعاليته عند معاملته ﺒ عند معاملته 5 و10 ملي مولار على التوالي ، فضلا عن ذلك لوحظ ان تاثير كل من : ايونات الحديدوز Fe+2 ، والنحاس Cu+2 ، والخارصين Zn+2 ، والزئبق Hg+2 كان اقل من الايونات السابقة، اذ احتفظ الانزيم ﺒ 60% , و53% , و74% , و66% من فعاليته عند معاملته بتركيز 10 ملي مولار لكل من الايونات على التوالي. كذلك احتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند معاملته بمادتي EDTA وازايد الصوديوم بتركيز 5 ملي مولار ، بينما احتفظ الانزيم ﺒ 95% و76% من فعاليته عند معاملته ﺒ 5 ملي مولار من المركب Phenyl methane sulphonyl fluoride والسيستايين. | 1 - A total of 140 Samples including urine infections wounds, burns, sputum, blood, stool and lung fluid samples were collected from different hospitals and medical centers in Baghdad city, during the period June _September 2005. Fifty five isolates belonged to Pseudomonas spp.(40.7%) of which 38.2% belonged to infections and wound samples.2 - Sensitivity of local Isolates was examined against 12 antibiotics, Results showed different and multi resistance patterns to antibiotics. All isolates were resistant to Ampicillin , Augmentin and Rifampin. 82% of which were resistant to 6 - 9 antibiotics, while 14.5% of the isolates were resistant to 1 - 5 antibiotics and only 3.7% were resistant to 10 - 12 antibiotics. Amikacin, Ciprofloxacin and Gentamycin were found to be the most effective agents against most of the isolates.3 - Detection of some virulence factors (hemolysin, elastase and urease) by the local isolates was studied. Results showed that 78.1% of the isolates produced hemolysin (mainly infection and wound isolates, then urine isolates). 85.4% of were mainly elastase producers (wound and infection, ear and urine). Results also showed that 80% of isolates were able to produce urease mostly belonged to urine, stool and infection and wound isolates.4 - Detection of the ability of Pseudomonas spp.local isolates to produce hyaluronidase enzyme by using Brain heart infusion (BHI) agar that contains hyaluronic acid was studied. 72.7% of the isolates were able to produce the enzyme.5 - The relation between hyaluronidase production and other virulence factors (hemolysin, elastase and urease) was studied. The results showed that 43.6% of the isolates produced the three studied virulence factors with hyaluronidase, while 18.18% of the isolates produced two of the virulence factors with hyaluronidase, and onlysix isolates produced one virulence factor and hyaloronidase. The results also showed that the groups concerning virulence factors increased from 7 to 11 when the hyaluronidase was added as a forth virulence factor.6 - Five isolates (P27, P30 , P10 , P2, P52) of Pseudomonas spp.producing hyaloronidase were selected to carry out studies on the plasmid profile. Results showed that all five isolates contained one plasmid.7 - The results of plasmid curing by using ethidium bromide showed that the plasmid of the local isolates P2 was curried by treatment with 2000μg/ml ethidium bromide, the curried isolate kept the ability to produce hyaluronidase. 8 - Five local isolates that gave large inhibition zones on (BHI) agar were chosen for specific activity determination by using submerged cultures. The local isolate P27 was chosen to be the most producing one, it’s specific activity was 2.7 unit/mg protein.9 - The optimum conditions for hyaloronidase production determined by using submerged cultures. Results showed that the optimum media for hyaluronidase production was (BHI) broth containing 0.5% yeast extract and 0.25 mg/ml hyaluronic acid with an inoculum of 1×106 cell/ml at an optimum pH 6, after 18 hours incubation in a shaker incubator 50 cycle/min.10 - Hyaloronidase was purified from selected local isolate by using several steps including concentration by ammonium sulphate in saturation percentage of 50%, this step was followed by DEAE - Cellulose ion exchange chromatography technique and gel filtration technique using sephacryl S - 300 colum. Purification fold and recovery were 10.8 and 20.4% respectively.11 - The optimum pH for enzyme activity and stability was 6 and 6 - 7 respectively. Maximum enzyme activity was obtained at 40C º and the enzyme retained 85 - 100% and 12% of it’s initial activity at (30 - 45) Cº and 50 C º respectively.12 - The effect of some metal ions on hyaluronidase activity was studied, 5 and 10 mμ of Na+2 increased enzyme activity to 107% and 102% respectively, while the enzyme kept only 50% and 15% of it’s initial activity when treated with 5 and 10 mμ of Fe+3 respectively. The enzyme also retained 60%, 53%, 74% and 66% of it’s activity when treated with 10mμ of Fe+2, Cu+2, Zn+2 and Hg+2 respectively. EDTA and sodium azide showed no effect on hyaluronidase activity, while retained only 95% and 76% of it’s initial activity when treated with 5 mμ of PMSF and cysteine respectively.

دراسة السمية الوراثية لحبوب منع الحمل على الانسان والفئران البيض == Study the genotoxicity for oral contraceptive pills on human and white mice

Author name: اسراء ايوب علوان منصور القره غولي
Supervisor name: عبد الامير ناصر الركابي | سعد محمد الندا
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الهدف من الدراسة الحالية هو تسليط الضوء على التاثيرات الوراثية الخلوية لحبوب منع الحمل الفموية المركبة على عينات دم ماخوذة من نساء اعتمدن هذا العقار كمانع حمل وفي الحيوانات المختبرية (الفار الابيض) بوصفه نظاما اختباريا ، وتم الاعتماد على بعض التحليلات الوراثية الخلوية شملت الانحرافات الكروموسومية في خلايا نقي العظم والطحال ، الانوية الصغيرة ومعامل الانقسام بالاضافة الى تشوهات الهيكل العظمي للاجنة في الفار الابيض، والانحرافات الكروموسومية ، الانوية الصغيرة ومعامل الانقسام في عينات دم الانسان . درست التاثيرات الوراثية لمجموعة من النساء بفئتين عمرية مختلفة بين )25 - 34) و(35 - 45) سنة والتي قسمت الى اربع مجاميع ، اظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي باحتمالية (P<0.05) في النسبة المئوية للانحرافات الكروموسومية الكلية لمجموعة من النساء اللواتي ياخذن حبوب منع الحمل المركبة (COCPs) ذوات الفئة العمرية )25 - 34) سنة ، بينما اظهرت وجود فرقا معنويا في النسبة المئوية للانحرافات الكروموسومية للنساء ذوات الفئة العمرية (35 - 45) سنة . كذلك لوحظ وجود فرق معنوي باحتمالية (P<0.05) في اعداد الانوية الصغيرة (MN) لمجموعة من نساء ياخذن (COCPs) في كلا الفئتين العمريتين. في التجربة الاخرى درست التحليلات الوراثية الخلوية (الانحرافات الكروموسومية) للمانع (COCPs) على الفئران، التي قسمت الى خمس مجاميع شملت مجموعة السيطرة السالبة التي تمثل الحيوانات المجرعة بدارئ (PBS) ومجموعة السيطرة الموجبة المعاملة بعقار السايكلوفوسفومايد (CP) وثلاث مجاميع معاملة بالمانع (COCPs) بالتراكيز(2.44), (1.25) (0.60) , ملغم / كغم ، اشارت النتائج ان التركيزين (2.44), (1.25) ملغم / كغم سجلا فروقا معنوية باحتمالية (P<0.05) في نسبة الانحرافات الكروموسومية بينما لم تسجل المجموعة ذات التركيز (0.60) ملغم / كغم فرقا معنويا في نسبة الانحرافات الكروموسومية لخلايا نقي العظم والطحال . واظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروقا معنوية باحتمالية (P<0.05) للجرع المختلفة للمانع (COCPs) على اعداد الانوية الصغيرة اذ كانت معدلات اعداد الانوية الصغيرة هي (1.26) , (2.50) , (3.53) للجرع ذات التراكيز (2.44) ،(1.25) ، (0.60) ملغم /كغم على التوالي. وكذلك اظهرت النتائج ان هناك فروقا معنويا باحتمالية (P<0.05) في معدل اوزان اجنة فئران المجاميع المدروسة ، فقد اظهرت مجموعة السيطرة السالبة اعلى معدل وزن للاجنة بلغ (1.55) غم، في حين سجلت معاملة السيطرة الموجبة اقل معدل وزن بلغ (0.56) غم. بينما كانت معدلات اوزان الاجنة للمجاميع المجرعة بالمانع ((COCPs ذات التراكيز (0.60) , (1.25) , (2.44) ملغم /كغم هي (1.34) , (1.32) (1.40),غم على التوالي . اما بالنسبة لحساب عدد هلاكات الاجنة فلم يوجد اي تاثير ملحوظ لحبوب منع الحمل المركبة (COCPs) على هلاكات الاجنة في حين ظهرت الهلاكات بنسبة عالية جدا في السيطرة الموجبة ، لكن عند دراسة تاثير حبوب منع الحمل المركبة على الهيكل العظمي للاجنة لم نلحظ اي تشوهات بالهياكل العظمية لجميع اجنة الفئران للمجاميع الثلاث المعاملة بحبوب منع الحمل المركبة . | Our work aimed to study the cytogenetic effects of Combined oral contraceptive pills (COCPs) on blood samples obtained from women utilized this contraceptive and lab animals (mice) treated with (COCPs). Several cytogenetic analyses (Chromosome aberrations of bone marrow and spleen , Micronuclei , Mitotic index and skeleton abnormal of embryos) in mice and (CA , MN , MI) in blood samples of human were used in this study . Studied the genetic effect for women in two age groups rang between (25 - 34) , (35 - 45) years in four groups. Result show non significant difference (P<0.05) in percentage of total chromosome aberration in women taking (COCPs) of age group rang between (25 - 34) years. While show significant differences (P<0.05) in percentage of (CA) in women of age group rang between (35 - 45) years. Also it was noticed significant differences (P<0.05) in Micronuclei (MN) of women taking oral contraceptive pills of two age groups. In other experiment studied the cytogenetic analysis for (COCPs) on mice that were divided into five groups as follows : Negative control group that animals orally treated with PBS buffer, Positive control group was treated with (CP) and three groups treated with (COCPs) with concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg and the result show was concentration (2.44) , (1.25) mg/kg recorded significant differences (P<0.05) while group with concentration (0.60) mg/kg non significant difference. also it was noticed Significant differences (P<0.05) in three groups treated with (COCPs) in Micronuclei rate and were the rates (3.53%) , (2.50%) , (1.26%) of concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg. Also result show statistically significant differences (P<0.05) in body weight of mice embryo of studied groups, Negative control group recorded rate highly in embryo body weight was (1.55) gm. While recorded Positive control group rate less in weight was (0.56) gm while were rates in embryo body weight of orally treated groups with (COCPs) with concentration (2.44) , (1.25) , (0.60) mg/kg were (1.40) , (1.32) , (1.34) gm . but non show any influences to (COCPs) in embryo number .while show died embryos in positive control group. also the results show non any abnormality in skeleton of embryos for three groups that treated with oral contraceptive pills.

العلاقة بين مرض قصور الدرقية ومقاومة الانسولين بدلالة بعض المؤشرات الالتهابية == The relationship between hypothyroidism and insulin resistance through some inflammatory markers

Author name: شيماء رزاق ابراهيم
Supervisor name: صباح ناصر العلوجي | خالد ابراهيم اللهيبي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يمتاز مرض قصور الدرقية بانخفاض مستوى هرمونات T3 وT4 الضرورية لعمليات انتاج الطاقة وحيوية الجسم ؛ لذلك ترافق هذه الحالة اضطرابات في عمليات الايض المختلفة في الجسم . اجريت الدراسة في المركز التخصصي للغدد الصم والسكري في بغداد ، وشملت 70 مريضا من مرضى قصور الدرقية ، تم تشخيص الحالة لديهم عن طريق قياس مستويات الهرمونات (TSH,T4,T3) . كما وشملت 60 شخصا اختيروا بشكل عشوائي من غير مرضى الغدة ، وقد تم التاكد من سلامة الغدة وعدم وجود قصور في وظيفتها لديهم. تضمنت الدراسة الكشف عن نسبة حدوث مقاومة الانسولين لدى مرضى الغدة ومقارنتها مع نسبة حدوثها لدى الافراد الاصحاء الغدة. وقد تم تشخيص مقاومة الانسولين باستخدام اختبارات (الببتيد الرابط C - peptide واختبار تحمل الكلوكوز الفموي Oral glucose tolerance test (OGTT) ، اذ ان ارتفاع مستوىCP والتحمل الضعيف للكلوكوز Impaired glucose tolerance (IGT) يشيران الى مقاومة مؤكدة للانسولين Definite insulin resistance (DIR) ، في حين وجود اضطراب في نتيجة احدهما يشير الى مقاومة ممكنة للانسولين Possible insulin resistance (PIR) . تشير نتائج الدراسة الحالية الى ان كلتا الحالتين المرضيتين (القصور الدرقي ومقاومة الانسولين) مترافقتان وشائعتان لدى النساء وكبار السن وكذلك لدى الافراد من فئة المفرطي الوزن (BMI=25 - 29.9 kg/m2) والبدناء(BMI>30 kg/m2) ، فقد وجد ان اغلب مرضى قصور الدرقية المؤكدي المقاومة للانسولين هم من الفئات العمرية 40 - 21 سنة و60 - 41 سنة وقد شكلوا نسبة %38.5 لكل فئة وكان اغلبهم من النساء ، وشكلوا نسبة %84.6 بالمقارنة مع نسبة %15.4 للذكور . اما المرضى الممكني المقاومة للانسولين فكان اغلبهم من الفئة العمرية 60 - 41 سنة وشكلوا نسبة %66.7 واغلبهم من النساء ايضا وشكلوا نسبة %77.8 بالمقارنة مع نسبة %22.2 للذكور . كذلك يلاحظ ان اغلب المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين هم من فئة البدناء وشكلوا نسبة %53.8 واغلب المرضى الممكني المقاومة للانسولين هم من فئة المفرطي الوزن وشكلوا نسبة %51.9 . وجد من نتائج البحث ارتفاع نسبة حدوث مقاومة الانسولين لدى مرضى قصور الدرقية ، فقد وجد ان %18.6 منهم لديه مقاومة مؤكدة للانسولين ، في حين كانت النسبة اقل بلغت %3.3 لدى الافراد الاصحاء الغدة . وبلغت نسبة المرضى الذين لديهم مقاومة ممكنة للانسولين %38.6 بالمقارنة مع نسبة %25 للافراد الاصحاء . وهي نسبة مرتفعة تؤكد دور قصور وظيفة الغدة الدرقية في نشوء مقاومة الانسولين. تضمنت الدراسة كذلك قياس مستويات بعض المؤشرات البايوكيميائية والمناعية لدى مرضى قصور الدرقية المؤكدي او الممكني المقاومة للانسولين ومقارنتها مع مستوياتها لدى افراد السيطرة الاصحاء. وشملت هذه المؤشرات قياس مستوى الكلوكوز في حالة الصيام ، وCP ، وانواع الدهون ، واختبار OGTT ، وHbA1c ، وTNF - α ، وIL - 6 ، وCRP ، والنسبة المئوية لذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي . اظهر مرضى قصور الدرقية الذين لديهم مقاومة مؤكدة للانسولين تحملا ضعيفا للكلوكوز Impaired glucose tolerance (IGT) وذلك من نتائج اختبار OGTT ، وكذلك ارتفاعا في مستوى الكلوكوز في حالة الصيام بلغ 1.24±5.77 مليمول/ لتر ، وارتفاع مستوى CP بلغ 1.71 ±5.39 نانوغرام/ مليلتر ، وارتفاع معنوي في مستوى HbA1c والبالغ 0.84± %5.86 ، وقد كان مستوى هذه المؤشرات لدى هذه المجموعة اعلى من مستوياتها لدى المجموعتين الاخريين (NIR,PIR) وبالمقارنة مع السيطرة . شملت مجموعة مرضى قصور الدرقية الممكنة المقاومة للانسولين %10 لديهم مستوى مرتفع لـ CP و%28.6 لديهم تحمل للكلوكوز ضعيف (IGT) ، وبشكل عام اظهرت هذه المجموعة ارتفاعا معنويا عاليا في مستوى الكلوكوز في حالة الصيام بلغ 1.97±5.63 مليمول/ لتر وارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى CP ، اذ بلغ 2.82±3.83 نانوغرام/ مليلتر ، وارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى HbA1c والبالغ 1.62±%6.21 . اما بالنسبة لاختبار ذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي ، فقد لوحظ ارتفاع معنوي عال في نسبتها لدى مجاميع المرضى المقاومة للانسولين مؤكدة او ممكنة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اوضحت دراسة المؤشرات المناعية وجود نمط التهابي تحت سريري لدى مرضى قصور الدرقية المؤكدي المقاومة للانسولين ، وذلك من الارتفاع المعنوي العالي(P<0.01) لمستويات كل من TNF - α وIL - 6 التي بلغت 1.02± 6.46 بيكوغرام / مليلتر و2.14 ±50.6 بيكوغرام / مليلتر على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. اما مستوى البروتين الفعال سي C - reactive protein (CRP) فقد لوحظ ارتفاع مستوياته لدى مرضى قصور الدرقية جميعا سواء كانوا من المقاومين ام غير المقاومين للانسولين ، مما يشير الى كونه عاملا التهابيا غير نوعي له ارتباط بمرض قصور الدرقية ولكن ليس له دور في التفريق بين الحالات المقاومة وغير المقاومة للانسولين . اظهرت دراسة العلاقات الترابطية بين المؤشرات البايوكيميائية والمناعية التي تم قياسها لدى مجاميع الدراسة وجود علاقة ترابطية سالبة معنوية (P<0.05) بين CP وكل من HbA1c وT.Ch وHDL - C وF.G (P<0.01) . كذلك وجدت علاقة ارتباطية ايجابية معنوية عالية (P<0.01) بين TNF - α وكل من T.Ch وLDL - C ، وعلاقة ارتباط سالبة معنوية عالية (P<0.01) بين TNF - αو TSH لدى مجموعة المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين . وفي مجموعة المرضى الممكني المقاومة للانسولين لوحظ وجود علاقة ارتباطية ايجابية معنوية (P<0.05) بين مستوى IL - 6 وBMI وF.G و(P<0.01) HbA1c . اما بالنسبة للبروتين الفعال سي فقد لوحظ وجود علاقة ارتباطية سالبة معنوية (P<0.05) بين مستواه ومستوى T.Ch وعلاقة ارتباطية ايجابية معنوية (P<0.05) بين CRP وكل من F.G وCP لدى مجموعة المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين و(P<0.01) TNF - α لدى مجموعة المرضى الممكني المقاومة للانسولين. اظهرت الدراسة ارتفاع العامل الالتهابي IL - 6 لدى المرضى المؤكدي المقاومة للانسولين ونظرا لدوره المهم في العمليات الايضية المختلفة في الجسم ؛ لذلك وجد انه من الضروري دراسة تاثيره في وظيفة الغدة الدرقية وفعاليات اخرى ومقارنته مع تاثير عقار الكاربيمازول . وقد تم ذلك عن طريق حقن ثلاث مجاميع من الجرذان ، الاولى بالانترلوكين - 6 ، والثانية بعقار الكاربيمازول ، والثالثة بالمحلول الملحي الفسيولوجي بوصفها سيطرة. بينت هذه التجربة ان كل من الانترلوكين - 6 والكاربيمازول يسببان انخفاض مستويات هرمونات الدرقية (T4,T3) عند حقنها في الحيوانات ، كما ويسببان انخفاضا معنويا في وزن الجسم في حين لم يكن لهما تاثير في وزن الكبد. لوحظ انخفاض مستوى الكلوكوز في الدم لدى الحيوانات المحقونة بعقار الكاربيمازول ، بينما لم يحدث تغير في مستواه بتاثير الانترلوكين - 6 . اما بالنسبة لانواع الدهون فقد لوحظ ارتفاع معنوي لمستوى كل من T.G وVLDL - C لدى الحيوانات المعاملة بالانترلوكين - 6 ، في حين لم تتاثر مستويات الدهون في الحيوانات المعاملة بالكاربيمازول. واخيرا ادى حقن الحيوانات بالانترلوكين - 6 والكاربيمازول الى زيادة ذوي الخلايا اللمفية في الدم المحيطي . | Hypothyroidism is a condition in which thyroid hormones levels decreased in the blood. These hormones are necessary for energy production and body viability. In many occasions this condition is accompanied or followed by different metabolic disorders. The current study is conducted in the "Specialized center for endocrinology and diabetes" and carried on 70 hypothyroid patients and 60 randomly chosen individuals with normal thyroid function .Both groups were submitted to laboratory tests to evaluate thyroid function (T3,T4.TSH). The study involved evaluation of the relationship between hypothyroidism and insulin resistance (IR) . Health problem related to many diseases , became common lately. Insulin resistance diagnosed through two important tests : C - peptide (CP) and oral glucose tolerance test (OGTT). Patients are considered to have definite insulin resistance (DIR), if they have impaired glucose tolerance (IGT) and high level of CP. If one of the tests is abnormal, the patients have possible insulin resistance (PIR). The current study show that both conditions (hypothyroidism and insulin resistance) are associated and common in women, old and overweight individuals. The results show that most hypothyroid patients with DIR are at age between 21 - 40 and 41 - 60 year, which constitute about 38.5% for each. Most of them are women constituting 84.6% compared with 15.4% for men. Most hypothyroid patients with PIR are in the ages between 41 - 60 year, constituting 66.7%. The women constitute about 77.8% compared with less percentage for men 22.2%. Also we should notice that most definite insulin resistant hypothyroid patients are obese , and constitute about 53.8% , and most possible insulin resistant hypothyroid patients are overweight, and constitute about 51.9% Insulin resistance incidence is increased in hypothyroid patients, the results show that 18.6% of hypothyroid patients have DIR compared with less percentage 3.3% in healthy individuals , and about 38.6% hypothyroid patients have PIR compared with 2.5% in healthy individuals This study also considered some biochemical and immunological parameters which include : Fasting blood glucose, (FBG), CP, Lipid profile, OGTT, HbA1c, TNF - α, IL - 6, CRP and percentage of lymphocytes apoptosis in peripheral blood. The levels of these parameters are compared between the study groups. Hypothyroid patients with DIR show impaired glucose tolerance (IGT) and high level of fasting glucose reaching 5.77±1.24 mM/l , high level of CP reaching 5.39±1.71 ng/ml and high level of HbA1c reaching 5.86% ±0.84 .The values of these parameters in this group are higher when compared with other groups and control. About 10% of hypothyroid patients with PIR have high level of CP and 28.6% have IGT. In general, PIR hypothyroid patients show a significant (P<0.01) increase in F.G reaching 5.63±1.97 mM/l , significant (P<0.01) increase in CP level reaching 3.83 ±2.82 ng/ml , and significant increase in HbA1c reaching 6.21% ±1.62. The results of peripheral lymphocytes apoptosis test show significant (P<0.01) increase in hypothyroid patients (DIR or PIR) compared to control group. The results show a significant (P<0.01) increase in levels of TNF - α reaching 6.46±1.02 pg/ml and 50.6±2.14 pg/ml respectively , in hypothyroid patients with DIR compared to control and the high levels of these parameters refer to subclinical inflammation . The non - specific inflammatory marker CRP , which refers to systemic inflammation , also increases in all hypothyroid patients (Insulin resistant or none) The current study also includes the study of correlations between. biochemical and immunological parameters in the study groups. The results show that there was a negative significant correlation between CP and each of : HbA1c, T.G, HDL - C (P<0.05) and F.G (P<0.01). There was a positive significant correlation between TNF - α and each of T.Ch, LDL - C (P<0.01) and negative significant correlation between TNF - α and TSH (P<0.01) in DIR hypothyroid patients. Patients with PIR show positive significant correlation between levels of IL - 6 and each of : BMI, F.G (P<0.05) and HbA1c (P<0.01). In DIR hypothyroid patients, the CRP correlates negatively and significantly with T.Ch (P<0.05) and correlate positively and significantly with F.G and CP (P<0.05). In PIR hypothyroid patients, the CRP correlate positively and significantly with TNF - α (P<0.01). Since the inflammatory marker (IL - 6) increased in insulin resistant cases and known by its critical role in different metabolic reactions in the body, therefore, this study involves a design for an experiment to detect the thyroid gland function and compare its effects with the effect of Carbimazole : An antithyroid drug. The experiment include three groups of rats, each injected with different material : Recombinant human interleukin - 6 (rhIL - 6), Carbimazole , Normal saline (N.S) as control . The results of the experiment show that both IL - 6 and carbimazole cause a decrease in the levels of thyroid hormones (T3,T4) in animal blood , and cause a significant decrease in animal body weight , but there is no effect on the liver weight . There was a significant decrease in glucose level in the animals injected with carbimazole, while in the IL - 6 treated animals there was no change in glucose level. There was a significant increase in the Triglyceride (T.G) and very low density lipoprotein cholesterol (VLDL - C) in the animals treated with IL - 6 , while in the animals treated with carbimazole , there was no change . Finally, injection of the animals with IL - 6 or carbimazole causes significant increase in lymphocyte apoptosis in peripheral blood.
1 ... 49 50 51 52 53 ... 101