عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 195

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

اسم المؤلف: حنان طارق صبحي
اسم المشرف: خضر حسن علي الجوراني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي == Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

اسم المؤلف: حسين ظاهر عليوي التميمي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

دراسة بيئية وامراضية على جرثومة كليبسيلا في عينات سريرية ونهر دجلة في بغداد == Environmental and Pathogenic Study on Klebsiella Spp. in Samples Collected from Patients and Tigris River at Baghdad

اسم المؤلف: افراح فهد عبد الكريم
اسم المشرف: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | كفاح احمد جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تفرعت الدراسه الحاليه خطين رئيسيين.تضمن الخط الاول تقييم نهر دجله ضمن محافظة بغداد من خلال دراسة العوامل الفيزيائيه والكيميائيه والبايولوجيه والتي لها تاثير على نوعية مياه نهر دجله بينما تضمن الخط الثاني دراسه جزيئيه لبعض عوامل الضراوه، المقاومه للمضادات الحيويه وانتاج الغشاء الحيوي لبكتريا K. pneumoniae والمعزوله من مصادر سريريه وبيئيه. محطات الدراسه تضمنت ثلاثة مواقع على نهر دجله ضمن مدينة بغداد، الموقع الاول يقع شمال مدينة بغداد والتي تقع شمال منطقة الكريعات بالقرب من جسر المثنى، والموقع الثاني يقع قرب مدينة بغداد الطبيه قرب جسر باب المعظم بينما يقع الموقع الثالث الى الجنوب بالقرب من جسر الجادريه. جمعت عينات شهريه من المواقع المذكوره انفا والواقعه على نهر دجله ابتداءا من تشرين الثاني/2013 ولغاية تشرين الاول/2014 . فضلا عن ذلك جمعت عينات سريريه من عدة مستشفيات في بغداد وباستخدام حاويات معقمه. اظهرت النتائج ان قيم درجات الحراره لمياه نهر دجله تراوحت بين (9 - 31 م◦) وهذا من صفات جو العراق والذي يتميز بتقلبات موسميه بدرجات الحراره من جهه وبتغيرات يوميه من جهه اخرى، كانت دالة الحامضيه لمياه النهر تميل للقاعديه الخفيفه وتراوحت بين (6.1 - 8.7) مع ظهور حامضيه خفيفه في الموقع الثاني وقد يعود السبب في ذلك الى مخلفات مدينة الطب والتي تدل على وجود تلوث. تراوح تركيز الاوكسجين المذاب بين (6.6 - 9.9 ملغم/لتر) وهذا يظهر ان مياه نهر دجله جيدة التهويه وكذالك اظهرت النتائج ان المتطلب الحيوي للاوكسجين كان ضمن الحدود المسموح بها دوليا ومحليا حيث تراوحت قيمته بين (0.8 - 3.5 ملغم/لتر). العكوره تظهر مدى شفافية المياه وقد تراوحت قيم العكوره لمياه النهر مابين (16 - 102 نفلوميتر) وسجلت الدراسه ارتفاع ملحوظ في قيم التوصيليه الكهربائيه (651 - 1170 ملغم/لتر). كذلك وجد ان قيم المواد الصلبه الذائبه تراوحت بين (406 - 751 ملغم/لتر) وكان لتاثير الفصول عليها اكثر من تاثير المواقع. بينما سجلت الملوحه تركيز (0.72 - 0.39ملغم/لتر). سجلت النتائج لتركيز المعادن الثقيله ما بين (0.001 - 0.6 ملغم/لتر)،(0.00 - 0.25 ملغم/لتر) لكل من الحديد والزنك على التوالي، معدل التراكيز لهذه المعادن اظهر تغايرا شهريا خلال مدة الدراسه حيث كانت معدلات الحديد متجاوزه الحدود المسموح بها دوليا بينما معدلات الزنك ضمن الحدود المسموح بها. تراوحت قيم الفوسفات لنهر دجله مابين (0.11 - 0.37). من جهه اخرى كانت نتائج الدراسه البكتريولوجيه قد سجلت معدلات مرتفعه لكل من العدد الكلي الحي للبكتريا واعداد بكتريا القولون الكليه واعداد بكتريا القولون البرازيه والتي تجاوزت الحدود المسموح بها دوليا ومحليا والتي كانت دليل على وجود تلوث احيائي وقد سجلت القيم ما بين (195 - 8200CFU/ml ) ، (3625 - 160000 cell/100ml ) ، (24000 - 142500 cell/100ml ) على التوالي. جمعت 75 عزله بكتيريه تابعه للجنس Klebsiella spp. وتوزعت مابين 40 عزله بيئيه و35 عزله مرضيه، شخصت العزلات بانها : K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7), K. ornitholytica (5) اعتمادا على الخواص الزرعيه، المجهريه والكيموحيويه وقد تم تاكيد التشخيص باستخدام نظام API - 20E وVITEC2 systemقد تم عد البكتريا باستخدام طريقة الترشيح الغشائي وباستخدام وسط انتقائي.تم تحديد حساسية العزلات تجاه (23) مضاد حيوي واظهرت النتائج بصوره عامه مقاومه العزلات لاغلب المضادات المستخدمه كما اظهر التحليل الجزيئي ان عزلات K. pneumoniae كانت حامله لجين CTX - M gene والذي له علاقه بمقاومة مضادات البيتالاكتام حيث اظهر تفاعل تضخيم السلسله PCR حزمه واضحه وبحجم (551 bp) فضلا عن ذلك تم دراسة جين aac(3) - II والذي يتعلق بمقاومة مضادات الامينوكلايكوسايد وباستخدام PCR حيث ظهرت حزمه واضحه بحجم (877 bp) . درست قدرة البكتريا على تكوين الغشاء الحيوي باستخدام ثلاثه طرق مختلفه وقد اظهرت النتائج ايجابيه الفحص وكذلك تم تضخيم جين mrkD والذي يعتبر تحت الوحدة المسؤله عن الاتصاق للنوع الثالث من الاهداب واظهر PCR حزمه بحجم (966 bp). عوامل ضراوه اخرى درست جزيئيا لهذه البكتريا وذلك باستخدام تفاعل تضخيم السلسله تضمنت rmpA , magA وkfu وهي جينات مسؤله عن تكوين الكبسوله وحوامل الحديد وكذلك تم تضخيم جين 16SrRNA وذلك باستخدام conventional and real time PCR وذلك من اجل تشخيصها جزيئيا واظهرت النتائج حزم واضحه بحجم (535 bp) لجين rmpA، (797bp) لجين kfu و(160 bp)عند استخدام برايمر متخصص لجين 16SrRNA بينما لم تظهر اي حزمه عند تضخيم جين magA. | The present work was branched into two line first line aim to study Tigris River within Baghdad City to assess Physical, chemical and biological characteristics of water river that influence water quality of the Tigris River. The second line conducted to study molecular characterization of virulence factor, antibiotic resistance genes and biofilm formation of K. pneumoniae isolated from clinical and environmental sources. The study area included three stations on Tigris River Within Baghdad city, the first was located at North of Baghdad in the northern area of Ghera'att City, and the second at middle part in the area Baghdad medical city, whereas the third station located at South part in the area near Al - Jadiriah Bridge. Monthly samples were collected from three station located on Tigris river, from November 2013 to October 2014. In addition Samples were collected from different Hospital’s Environment and patients by using sterile containers.Results obtained showed that temperature value of Tigris water has ranged between (9 - 31 Cº) the climate of Iraq recognized with seasonal fluctuation from one side and day and night fluctuation from other side. The degree of pH in Tigris River tend to be light alkalinity as it ranged between (6.1 - 8.7) with slightly acidic at station2 and this may be due to the effect of medical city discharge that indicate presences of pollution. The concentration of dissolved oxygen was ranged between (6.6 - 9.9) mg/l and it seems that the water of Tigris is ventilated well. The results showed that values of BOD5 ranged between (0.8 - 3.5 mg/l.) which is within the International allowable levels. The Turbidity reflects the transparency in water, the Turbidity's values ranged between (16 - 102) NTU. The results showed that there is a noticeable raise in value the electrical conductivity that recorded between (651 - 1170) mg/l. It is found that the total dissolved solids values were affected by its seasons more than by its locations, It was recorded higher and lower values of (TDS) (406 - 751) mg/l. whereas the salinity recorded (0.72 - 0.39 ppm) .The results showed that concentrations of heavy metals iron and zinc were varied between 0.001 - 0.6 mg/l and 0.00 - 0.25 mg/l respectively. Mean concentrations of these metals in Tigris River showed monthly variations during the study period and the Fe values exceeded the International allowable levels while Zn within permissible limit for Iraqi and WHO standards for river system maintains. Phosphate values ranged between (0.37 - 0.11). On the other side, The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (195 - 8200 C.F.U/ml), While the total coliform and faecal coliform counts exceeding acceptable limits are indicative of pollution that recorded (3625 - 160000 cell/100ml ) and (2400 - 142500 cell/100ml) respectively.A total of 75 klebsiella spp. isolates had been collected and distributed between 40 environmental isolates and 35 clinical isolates. Isolates were identified as K. pneumoniae (40), K. oxytoca (8), K. terrigena (7) and K. ornitholytica (5) depending on cultural, microscopical, biochemical characteristics, API 20E and VITEK 2 system. Enumeration of klebsiella sp from water samples had been made by using membrane filtration technique with selective media. The results of Antibiotic susceptibility of K. pneumoniae isolates against (23) antibiotic declared that, generally, the isolates were resistant to the most antibiotics used and molecular analysis showed that all isolates were carrying CTX - M gene concern β - lactam group with PCR product band of molecular size 551 bp and aac(3) - II gene which concern with aminoglycosids group resulting in PCR product with band of molecular size 877 bp.Biofilm formation assay was determined through three different methods and the results showed the ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm, also mrkD gene which is adhesive subunit of type3 fimbriae that play important role and mediated biofilm formation had been amplified and results PCR product with band of molecular size 966 bp. Another virulence factor of K. pneumoniae isolates was studied molecularly by using (PCR), magA, rmpA, kfu and for further diagnosed molecularly 16S rRNA genes were amplified using conventional and real time PCR, the results showed that the isolates of K. pneumoniae gave a clear band with a molecular size 535bp for rmpA, 797bp for kfu and160 bp when PCR was performed with the primer that target the 16S rRNA.while no bind had been obtained for magA

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية == Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

اسم المؤلف: ابرار جاسم حسن
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة بكتريولوجية لبعض مسببات الاسهال لدى الاطفال == Bacteriological study of the some causes of diarrhea in children

اسم المؤلف: ريا خليل ابراهيم القيسي
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي | هادي رحمن رشيد الطائي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included The investigation of the existence some type of Enterobacteriaceae bacterial Causes Diarrhea in (215) samples for patients sufferers symptoms indicate that their infection Diarrhea. period from 1\10\2014 to 30\1\2015, and used MacConkey agar and blood agar for the cultivation of these samples.The results refer that 65 isolates are belonging to bacteria of Enterobacteriaceae 13 (20 %) Proteus mirabilis and 3(4.6%)Morganella morganii 2(3.1%) Salmonella spp by using diagnostic phenotypic ,biochemical tests and confirm the diagnosis by using system Vitek2.The results of the investigation of some virulence factors showed the isolates of Proteus mirabilis produce of haemolysin (92.3%) ,while Salmonella spp and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme. The results showed that all isolates of Proteus mirabilis and Salmonella spp and Morganella morganii were produced urease by (100%) (0%) (100%) respectively.The results showed that all isolates of Salmonella spp and Morganella morganii were produced protease by (100%)(50%) while Proteus mirabilis have not ability to produce this enzyme.The results showed that isolates of Proteus mirabilis were produced bacteriocin by (69.2%) while Salmonella spp by (50%) and Morganella morganii have not ability to produce this enzyme The results showed a variance as far as their resistance to these antibiotics. Isolates of Proteus mirabilis showed highest resistance rate (76.9%) for Ampicillin e while isolates of Salmonella spp highest resistance rate (100%) for Cephalothin, Cefotaxime and Ampicillin , while isolates of Morganella morganii showed highest resistance rate %100 for Trimethoprime , Ampicillin , Cephalothin , Nalidixic acid , Piperacilli.The results showed (15) isolates rate (83.33%) have multiple resistance pattern for antibiotic and divided into two groups , first group included (5) isolates which were resistant to ( 2 - 5 ) antibiotics , while second group included (10) isolates were resistant to (6 - 10) antibiotics . Results indicated that the second group was dominant. The results showed that the Resistance prevailing coordinated to isolates Proteus mirabilis is (4) antibiotic (Ap - TM - CTX - NA) and to isolates Morganella morganii is (6)antibiotic (AP - TN - PRL - NA - KF - FOX) and to isolates Salmonella spp is (3) antibiotic (AP - CTX - KF).Results showed content plasmid for Proteus mirabilis and Morganella morganii they do not contain plasmids packages While shown Salmonella spp content on plasmids one package .The results of bacterial conjugation In the liquid medium The success of the process of bacterial conjugation for Salmonella spp That have one package of plasmids before and after of bacterial conjugation .The results of transmission of prescription antibiotics (TM - AP - KF - CTX)

متلازمة الابنية المريضة بين الحضر والريف : دراسة مقارنة == Sick buildings syndrome between the Urban and Rural areas : A comparative study

اسم المؤلف: ســرمـد قاسـم مـحمــد الـتميمي
اسم المشرف: عدنان نعمة عبد الرضا العزاوي | عامر محمد ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة الميدانية في محافظة ديالى للفترة الواقعة بين 1/تشرين الاول/2014 ولغاية 1/اذار/ 2015 وشملت مناطق حضرية ومناطق ريفية واخرى وسطية في طور التحول ،بهدف التعرف على الاثار الصحية للملوثات البيئية(الكيميائية والفيزيائية والحيوية) في الاماكن المغلقة مع بيان الفرق في نسب تلك الملوثات بين مناطق الدراسة. تضمنت الدراسة توزيع 150 استمارة استبيان تحتوي على الجنس ،مجموعة من الظروف البيئية ومجموعة من الاعراض المرضية والتي تشير الى وجود بيئة مريضة ، بواقع 50 استمارة لكل منطقة .وتم قياس تركيز الغازات اول اوكسيد الكاربون (CO)، وثاني اوكسيد الكاربون (( CO2 ،وثاني اوكسيد النتروجين(NO2) في داخل المبنى وفي خارجه باستعمال جهاز تحليل الغازات Portable Gas Analyzer وكذلك قياس درجة الحرارة والرطوبة النسبية في داخل المبنى. كما تم جمع 150 مسحة بكتيرية بواقع 50 مسحة لكل منطقة وذلك من مصادر بيئية مختلفة شملت المطابخ، الصحيات وغرف النوم وتم تشخصيها مختبريا،اضافة الى اجراء فحص الحساسية الدوائية تجاه مجموعة من مضادات الحياة للعزلات المشخصة . بينت نتائج الدراسة الحالية ان اعراض متلازمة المباني المريضة Sick Building Syndrome (SBS) مثل العصبية ،الصداع ، ضيق التنفس ، جفاف العين وجفاف الجلد كانت اكثر ظهورا لدى سكان المناطق الحضرية اذ بلغت نسبتها32.5%، 32.4%،24.4%، 20.5%، 17.1 % على التوالي، في حين كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية وكانت قليلة جدا لدى سكان المنطقة الريفية وكانت الاعراض الدوران، تشتت الانتباه ، تهيج الانف، وتهيج العين، اكثر ظهورا لدى سكان المنطقة الوسطية اذ بلغت نسبتها 27% ،24.8%،23.3%، 12.2% على التوالي،وايضا كانت اقل ظهورا لدى سكان المنطقة الريفية. وكانت الاعراض الصداع، جفاف العين ،تهيج العين وجفاف الجلد اكثر ظهورا على الاناث من الذكور، في حين ان الاعراض العصبية والانزعاج والدوران كانت اكثر ظهورا على الذكور. وبينت النتائج ان عوامل الخطر البيئية المساعدة على حدوث الاعراض مثل التعرض الى سوء التهوية ، الروائح الكريهة وضعف الاضاءة الطبيعية كانت متوافرة في البيئة الحضرية بصورة اكثر وبنسب 28.6%،22.4%،20.4% على التوالي ، في حين ان التعرض الى الغبار والهواء الجاف كان بنسب اعلى لدى سكان المنطقة الوسطية وبنسب27.1%،23.2% على التوالي. وكانت الظروف البيئية بنسب اقل لدى سكان المنطقة الريفية. اما نتائج قياس تركيز الغازات CO، CO2،NO2 فقد كانت اعلى تركيزا في المناطق الحضرية وبنسب 2.62 جزء بالمليون ، 0.13 جزء بالمليون ،0.20 جزء بالمليون على التوالي ، في حين كانت الاقل تركيزا في المناطق الريفية والتي بلغت 0.10 جزء بالمليون، 0.006 جزء بالمليون، 0.06 جزء بالمليون على التوالي. لم تكن هناك فروق معنوية بالنسبة لقياس درجات الحرارة والرطوبة،اذ بلغ معدل درجة الحرارة في المنطقة الوسطية 23.9م تلتها المنطقة الحضرية 21.8م ، وسجلت في المنطقة الريفية اقل درجة 21.6م .اما بالنسبة للرطوبة النسبية تفوقت المنطقة الريفية باعلى نسبة للرطوبة فبلغت 58.9%، وتلتها المنطقة الحضرية55%، وتمثلت المنطقة الوسطية باقل نسبة للرطوبة 54.8% اما بالنسبة لنتائج العزل البكتيري فقد المنطقة الريفية اعلى نسبة للنمو الايجابي اذ بلغت 46 من اصل50 عينة وبنسبة (92%)،تلتها المنطقة الوسطية 35 من اصل 50 عينة وبنسبة (70%) ، وجاءت المنطقة الحضرية باقل نسبة 24 من اصل 50 عينة وبنسبة(48%)، في المنطقة الريفية كانت البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة اذ شكلت بكتريا Staphylococcus aureus اعلى نسبة (43.4 %) وEscherichia coli (19.5%) اما الاجناس pseudomonas aeruginos وpneumoniae Streptococcus فقد بلغ كل منهما (10.8%) وبلغت pneumonia klebsiella (4.3%). وفي المنطقة الوسطية كانت ايضا البكتريا الموجبة لصبغة كرام هي السائدة فقد شكلت S. aureus (42.8%) تلتها E.coli (20%) وP. aeruginosa (17.1%) وpneumoniae S . (8.5%) واحتلت K. pneumonia المرتبة الاخيرة (2.8%) . اما في المنطقة الحضرية فقد كانت البكتريا السالبة لصبغة كرام هي السائدة فبلغت نسبة P. aeruginosa وS. aureus (33.3%) وبلغت نسبة الاجناس E.coliو pneumoniaeK. ،و pneumoniae S.، (12.5%) ،(8.3%) ، (4.1%) على التوالي . وبينت نتائج فحص الحساسية تجاه المضادات اوجمنتين (Augmentin)، والامبسلين Ampicillin)) ،والتوبرومايسين Tobramycin) )،والامبينيم ( Imipenem) ان معظم الاجناس كانت متحسسة وبنسب متفاوتة،الا ان بعض الاجناس ابدت مقاومة تجاه انواع معينة منها. | This field study was conducted in Diyala province for the period between 1/10/2014 until 1/3/2015 included urban areas and rural areas and other centrist in transition, with a view to identifying the health effects of environmental contaminants (chemical, physical and biological) in enclosed spaces with the difference in the proportions of those pollutants between the study areas. It includes the distribution of 150 a questionnaire containing, sex set of environmental conditions and a set of symptoms that indicate the presence of sick environment, by 50 for each form region and concentration measurement of gases (CO, CO2, NO2) inside the building and outside by using Portable Gas Analyzer as well as temperature and relative humidity In inside the building. He also collected 150 bacterial swab 50 swab for each area,from different environmental sources included kitchens, bedrooms and Health facilities and laboratory - diagnosed, as well as a test of sensitivity to a range from antibiotic of the isolates diagnosed. The results showed that Sick Buildin Syndrome symptoms such as nervousness, headaches, shortness of breath, eyes dry and skin dryness were at ahigher rate in urban areas as the average 32.5%,32.4%, 24.4%, 20.5% 17.1% respectively, while less visible in the middle of the region and were very few the rural of the region, symptoms were Rotation, Attention Deficit, irritation of the nose, eye irritation, more common the middle of the region as the average of 27%, 24.8%, 23.3% , 12.2%, respectively, and Less amonge to the population of the rural area. symptoms as headache, eye dry, eye irritation, dryness of the skin were more amonge females than males, while the symptoms as neurological , discomfort, and the rotation was more pronounced on males. The results showed that environmental risk factors help symptoms occur, such as vulnerability to poor ventilation, odors and poor natural light available in a more urban environment as the average 28.6%, 22.4% , 20.4% respectively, whereas exposure to dust and dry air was higher among residents of the middle region as the average of 27.1%, 23.2% respectively and environmental conditions were lower in the rural area. The results concentration of measurment gases (CO, CO2, NO2) were higher in the urban areas, as average ( 2.62 ppm, 0.13 ppm, 0.20 ppm) respectively, while the less concentrated in rural areas, which reached (0.10 ppm, 0.006 ppm, 0.06 ppm) respectively, There was no significal differences for measurement of temperature and humidity, with an average temperature in the middle region ( 23.9)m followed by the urban area of (21.8) m, recorded in rural lower (21.6 )m .for relative humidity overtook the rural area with the highest percentage of humidity, reaching 58.9%, followed by urban area 55%, and middle area was the lowest 54.8%. The results of bacterial isolation region showed the highest Percentage in the rural isolation 46 sample (92%), followed by the middle region 35 sample (70%)and urban area with less than 24 sample (48%). the rural area showed the positive it for bacteria gram stain were most common , accounting Staphylococcus aureus bacteria highest percentage (43.4%) , Escherichia coli (19.5),the races, pseudomonas aeruginosa and Streptococcus pneumoniae were each (10.8%) and klebsiella pneumonia (4.3%). In the middle area the positive it for bacteria gram stain were most common accounting S. aureus might formed (42.8%) Followed by E. coli (20%) , P. aeruginosa (17.1%) , S. pneumonia (8.5%)and K. pneumonia ranked last (2.8%) In the urban area negative it for bacteria gram stain were most common accounting P. aurgenosa and S. aureus was (33.3%) and the result of species E. coli, K. pneumonia and S. pneumonia were (12.5%) (8.3%) (4.1%) respectively. the results of sensitivity to antibiotics Augmentin, Ampicillin, Tobramycin, Imipenem ,that most strain were resistance in varying percentage, some strain have expressed resistance towards certain types

دراسة مناعية وتقييم انتشار الاجسام المضادة الخاصة ضد اللولبية الشاحبة بين العراقيين المتبرعين بالدم

اسم المؤلف: انس وسام مالك
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي | محمد عبد الدايم صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: السفلس هو مرض ينتقل جنسيا بوساطة بكتريا اللولبية الشاحبة Treponema pallidum ويصنف اما مكتسب او ولادي .اجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لنقل الدم في بغداد خلال جزء عملي اشتمل على المرضى المراجعين للمركز للمدة من 1 اب الى 31 كانون الاول 2014 . تضمنت الدراسة 70 مريضا و10 اصحاء ظاهريا من كلا الجنسين بمعدل عمر من 24 الى 57 سنة.جمعت عينات المرضى من وحدة الفايروسات بوساطة متخصصين الذين شخصوا الحالات المرضية .تضمنت المعلومات الديمغرافية العمر,الجنس والعنوان. اظهرت نتائج الدراسة الحالية معدل العمر ± الانحراف المعياري7.14±41)) سنة في المرضى(من 24 - 57 سنة) كما اظهرت النتائج ان(2.9%) من المرضى كانوا ضمن الفئة العمرية (21 - 30 سنة) ,وكانت نسبة الفئة العمرية (31 - 40 سنة ) هي (40%),و نسبة الفئة العمرية (41 - 50 سنة ) هي(44.3%)والفئة العمرية (51 - 60 سنة ) هي (. (12.8%علاوة على ذلك ان ما مجموعه ((74610 من متبرعي الدم العراقيين تتراوح اعمارهم من 18 - 60 سنة عرضوا لاكتشاف الاصابة بمرض السفلس ,وان ما مجموعه(769) من المصابين بالمرضوكان عدد المصابين من الذكور( (753بنسبة(97.9%) وكان عدد الاناث هو16 بنسبة(2.1%) .من ناحية اخرى تم اختيار 70 مصاب من المجموع الكلي للمصابين (769) وتم فحصهم ضمن بعض المؤشرات المناعية واظهرت النتائج ازدياد مستوى IL - 2 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وكانت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±64.9941.92 pg/ml و39.69 ±52.94pg/ml على التواليولم يلاحظ وجود فروق معنية احصائية بين كلا المجموعتين. فضلا عن ذلك ازداد مستوى IL - 10 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وبلغت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±559.101804.20pg/ml و±377.47252.36pg/ml على التوالى.بينما كان مستوى IFN - γ اقل في المرضى وكان المعدل ± الانحراف المعياري 239.35 ±201.38pg/ml عن المستوي في مجموعة السيطرة الذي بلغ 248.51±291.49pg/ml .فضلا عن ذلك كان مستوى IgG في كلا المجموعتين (المرضى والسيطرة ) عاليا , بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمجموعة المرضى825.66±287.18pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 638.28±242.41pg/ml لذلك لا يوجد فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين = P value)0.166( كذلك بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى IgM في مجموعة المرضى 121.01±70.57pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 50.96±21.61453pg/ml مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين(P value=0.031). بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى C3 في مجموعة المرضى±112.22pg/ml 26.34 بينما كانت ±147.7617.41pg/ml لمجموعة السيطرة. وهذا يعني وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.004). اخيرا وصلت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى 4Cفيمجموعة المرضى ± 22.7622.76pg/ml بينما كانت في مجموعة السيطرة±34.412.15pg/ml .مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.005). | Syphilis is a sexually transmitted disease (STD) created by the Treponema pallidumand characterized as acquired or congenital.This study was conducted in National Blood Transfusion Center in Baghdad as crosswise over area study incorporating patients going to in the period from 1 August to 31 December 2014. The study included 70 patients and 10 apparently healthy individuals from both sex withage range from 24 to 57 years oldas control group.The specimens of patients were gathered in virology unit by virologists who conclusion the cases. The demographic data incorporates age, sex and location. The results of present study showed thatmean of age ±SD of patients was 41±7.14 years (from 24 - 57 years ) , also theresults showed (2.9%) of patients were from (21 - 30 years), (40%) of patients were from (31 - 40 years), (44.3%) of patients were from (41 - 50 years), (12.8%) of patients were from (51 - 60 years).Furthermore,a total of 74610 Iraqi blood donors, aged from 18 - 60 years were discovered to have been screened for syphilis, a total of 769 Infected syphilis there were the number of males were753 (97.9%) and females were16 (2.1%).On another hand 70 syphilis patients were selected from total infected patients ( 769) and was examined to some immunological parameters and the results showed that the level of IL - 2 higher in patients group than that of control group.Themean ±SD was 64.99±41.92pg/mland 52.94±39.69 pg/ml respectively withoutnoticing any significant statistical difference was between both groups. Additionallythe level of IL10 was higher in patients group than that of control group,the mean ±SD were559.10±1804.20 pg/ml while in control were 377.47±252.36 pg/ml.Whereas, the level of IFN - γ was lowerin patients, the mean ±SD were201.38 ±239.35pg/ml than thatin controlWhich were 291.49 ±248.51pg/ml. Furthermore, the level of IgG in both patients and controlwas almost more thanthe mean ±SDfor patients were 825.66±287.18 mg/dl and in controls they were 638.28±242.41 mg/dl. Therefore, there was no significant statistical difference between both groups (P value =0.166). Also , themean ±SD for the level of IgM in patients, were121.01±70.57mg/dl whereas in controls theywere 50.96±21.61453mg/dl.This means that there is a significant statistical difference between both groups (P value =0.031).For the level of C3 in patients ,the mean ±SDwere112.22±26.34mg/dl while in controls they were 147.76±17.41mg/dl. This indicates that there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.004).Finally, the mean ±SD the for level of C4 in patients were 22.76± 8.44mg/dl while in control they were 34.4±12.15mg/dl. Therefore there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.005).

استخدام البكتريا المختزلة للنترات المعزولة من مياة انتاج حقول النفط في البصرة في السيطرة على الانتاج الحيوي لغاز كبريتيد الهيدروجين المنتج بفعل البكتريا المختزلة للكبريت == Using of Nitrate Reducing Bacteria Isolated From Produced Water of Oil Fields in Basra in Control of Biogenic Hydrogen Sulfide Produced by Sulfate Reducing Bacteria

اسم المؤلف: وجدان حسين عبد الصاحب التميمي
اسم المشرف: كوثر هواز مهدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية استخدام تقنية الاقصاء بالتنافس الحيوي للسيطرة على الانتاج الحيوي لغاز كبريتيد الهيدروجين H2S من قبل الجراثيم المختزلة للكبريت في مزارع الدفعة والمفاعل الحيوي, اذ ان اضافة النترات او النتريت يحفز نمو الجراثيم المختزلة للنترات التي تنافس الجراثيم المختزلة للكبريت على المصادر العضوية وتستقصيها. جمعت 40 عينة من مياه انتاج حقول نفط نهران عمر واللحيس في البصرة خلال 6 اشهر للفترة من اب 2013 الى كانون الثاني 2014, عزلت مزارع خليطه من الجراثيم المختزلة للكبريت والمختزلة للنترات من تلك العينات وحسبت اعداد الخلايا لكلا النوعين باستخدام طريقه العد الاكثر احتمالا وقد اظهرت النتائج ان اعداد الجراثيم كانت منخفضة اذ بلغت اعداد الجراثيم المختزلة للكبريت بين7 - 4 خلية/100مل في حين كانت اعداد الجراثيم المختزلة للنترات اقل من 4 - 2 خلية/ 100مل. كما تضمنت الدراسة الحالية ايضا تنقيه للجراثيم المختزلة للكبريت والمختزلة للنترات واجراء التشخيص الجيني بتقنيه التفاعل التسلسلي لانزيم البوليمريز PCR والذي من خلاله تم تضخيم الجين16S rRNA وحدد تتابعه للتشخيص الى مستوى السلالة وقد اظهرت تحاليل المجتمع الجرثومي ان عزلات الجراثيم المختزلة للنترات قد امتلكت تطابقا بنسبة 99% مع الانواع Pseudomonas stutzeri وP. putida وHerbaspirillum huttiense وBacillus licheniformis اما عزلات الجراثيم المختزلة للكبريت فقد اظهرت النتائج انها امتلكت تماثل 99% للانواعShewanella hafniensis وDesulfotomaculum acetooxidans وDesulfosporosinus orientis مع افتراض ان جميع العزلات هي سلالات جديدة عالميا. كما اظهرت نتائج المعاملة بالنترات او النتريت في مزارع الدفعة وجود تاثير مثبط قوي على الجراثيم المختزلة للكبريت اذ لم يزداد مستوى الكبريتيد في جميع التراكيز المستخدمة ( 200 و400 و600 و800 و1000) ملغم/لتر من النترات والنتريت فقد تراوح مستوى تركيز الكبريتيد بين 4.2 و21 ملغم/لتر عند المعاملة مع النترات و23 و5.2 ملغم/ لتر مع النتريت, وتطابقت هذه النتائج مع تركيز الخلايا في جميع القناني المعاملة, اذ تراوح بين 0.26 - 0.001 و0.003 - 0.17 مع النترات او النتريت على التوالي بينما كانت هناك زيادة معنوية في تركيز الكبريتيد الذي بلغ 121 ملغم/لتر وتركيز الخلايا بامتصاصية بلغت 0.84 في عينات السيطرة.كان للجراثيم المختزلة للنترات تاثير مثبط قوي على نمو الجراثيم المختزلة للكبريت وانتاج الكبريتيد عند اضافة المغذيات المشجعة لنموها بمختلف التراكيز, اذ ازدادت فعاليه الجراثيم المختزلة للنترات واستهلكت كل من النترات او النتريت المضاف خلال 3 - 2 يوم من الحضن وكان اعلى تاثير مثبط لانتاج غاز كبريتيد الهيدروجين عند التركيز 1000 ملغم/لتر من النترات اذ اظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي في مستوى الكبريتيد الى34 ملغم/لتر في حين كانت اعداد البكتريا 34.8 خلية/مل بعد عشرة ايام من المعاملة. اظهرت نتائج معالجة الحموضة طويلة الامد باستخدام المفاعل الحيوي وجود انخفاض حاد في انتاج غاز كبريتيد الهيدروجين بنسبة 94% بعد اضافة النترات والنتريت خلال فترة 60 يوما من المعاملة ,الاضافة المستمرة للنترات والنتريت بحوالي ( 333ملغم/اليوم للنترات و133ملغم/اليوم للنتريت) ادت الى تثبيط الفعالية الحيوية للجراثيم المختزلة للكبريت وانتاج غاز كبريتيد الهيدروجين, اذ انخفض مستوى الكبريتيد من 155 الى 10 ملغم/لتر واعداد الخلايا اكبرمن 1100 الى 3.5 خلية/ مل بما يعادل 99.6% , بينما ازدادت فعالية واعداد الجراثيم المختزلة للنترات من 1100 الى اكبر من 1100 خلية/مل.اظهرت نتائج معدل تاكل عينات الحديد المطاوع في المفاعل الحيوي بعد 60 يوما ان اعلى معدل للتاكل كان 70.7 ملغم/ سم2/ سنه في المفاعل غير المعامل بالنترات والنتريت بينما انخفض معدل التاكل الى 15.8 ملغم/ سم2/ سنه بعد نفس الفترة من التعرض في المفاعل المعامل وبنسبة انخفاض بلغت 55% مقارنة مع المفاعل غير المعامل. | This study includes the used of Bio Competitive Exclusion technology (BCX) to control biogenic production of hydrogen sulfide (H2S) by Sulfate Reducing Bacteria (SRB) in batch cultures and bioreactors. The injection of nitrate (NO3) and nitrite (NO2) promotes the growth of nitrate reducing bacteria (NRB) which outcompete (SRB) on carbon sources. A total of 40 samples were collected from produced water of oil production facilities in Basra including Nahran Omer and Al - Lahis oil fields in a period time of 6 months from August 2013 to January 2014. Mix cultures of (SRB) and (NRB) were isolated from these samples, the two types of bacteria were enumerated by using most probable number method, the results show that the numbers of both bacteria were generally quite low, the viable count of (SRB) was between 4 - 7cell/100 ml whereas the (NRB) was between <2 - 4 cell/100 ml. This study also includes purification of isolates for both (SRB) and (NRB) and the genetic identification by polymerase chain reaction (PCR) technique through which the universal 16S rRNA gene of 1500 bp is amplified and sequenced for identification to the level of strains. Microbial community analysis showed that isolates of (NRB) were have identity of 99% Pseudomonas stutzeri, P. putida, Herbaspirillum huttiense and Bacillus licheniformis while isolates of (SRB) were have identity of 99% Shewanella hafniensis, Desulfosporosinus orientis and Desulfotomaculum acetooxidans with supposing that all isolates new world strains. The results of the treatment with nitrate or nitrite showed a strong inhibitory effect on (SRB) growth and (H2S) production, sulfide levels do not increase at all concentrations (200, 400, 600, 800 and 1000) mg/l of nitrate or nitrite range between 4.2 - 21 mg/l in treatment with nitrate and 5.2 - 23 mg/l in treatment with nitrite. This is consistent with the concentrations of bacteria in all treatment bottles which range between 0.001 - 0.26 and 0.003 - 0.17 in treatment with nitrate or nitrite respectively, while there is a significant increase in sulfide 121 mg/l and concentration of bacteria 0.84 in control as optical density. (NRB) has a certain inhibitory effect on the growth of (SRB) and (H2S) production when the (NRB) nutrient (nitrate or nitrite 200, 400, 600, 800 and 1000) mg/l were adding , the activity of (NRB) increases after treatment, and it consumed all nitrate or nitrite during 2 - 3 days of incubation, the strong inhibition of (H2S) production is at concentration 1000 mg/l of nitrate where the results showed that there was significant decrease in sulfide level 34 mg/l and number of bacteria, 34.8 cell/ml during 10 days of incubation.Souring control at long term treatment in bioreactors show sharp decrease in production of (H2S) to 94% after injection of nitrate and nitrite during the period of 60 days, the continuous dosing of nitrate and nitrite (333 mg/l/day nitrate and 133 mg/l/day nitrite) inhibited the metabolic activity of (SRB) and (H2S) production severely, the sulfide levels decrease from 155 to 10 mg/l and number of (SRB) from >1100 to 3.5 cell/ml the percent in number decreased was to 99.6%, at the same time activity and numbers of (NRB) increase from 1100 to >1100 cell/ml over the duration of experiment. The results of corrosion rate measurement on mild steel after 60 days showed that the highest corrosion rate was 70.7 mg/cm2/year in control reactor while the lowest corrosion rate was 15.8 mg/cm2/year in treated reactor at the same period time of exposure with percent of decreasing in weight loss to 55% comparing with control reactor.

عزل وتشخيص بعض الانواع الجرثومية من مياه الانهر الداخلية في مدينة البصرة ودراسة قابليتها على المعالجة الحيوية للعناصر الثقيلة == Isolation and identification bacterial species from inner rivers in Basra governorate and study their ability to Bioremediation of heavy metals

اسم المؤلف: انوار عبد الوهاب مكي
اسم المشرف: علي عبود شريف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة البصرة
اللغة: العربية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study was conducted during November and December 2013.It included studying six inner rivers branching from Shatt al - Arab river in Basrah governorate.These rivers are Abu Al - khasseb, Al - Ribat, Al - Khandaq, Al - Ashar, Al - Khura and Al - Sarraji .The study included isolation and identification of three species of genus Bacillus which are B. licheniformis,B. megaterium and B. badius ,and two species of genus Micrococcus which are M. halobius and M. kristinae .Physical and chemical characteristics of the water samples were measured, which including pH,temperature,electric conductivity and Dissolved oxygen. The results showed that there were not correlation between physical and chemical characteristics and the concentrations of the heavy metals except for water temperature which had a negative significant correlation with the concentrations of nickel and lead.The concentrations of heavy metal dissolved in water (copper, nickel , lead and cadmium ) were measured. The concentrations of Cu+2 and Pb+2 were higher than that of Ni+2 and Cd+2 in the water .However,in general the concentrations of Cu+2, Ni+2, Pb+2 and Cd+2 were high in comparison with the local and international standards.All species of bacteria showed high resistance to the heavy metals ions starting from concentration of 1 mg/l. B. licheniformis was recorded high resistance to Pb+2, Cu+2 and Ni+2 which reached 2600 mg/l, 500mg/l and 300mg/l respectively. M. halobius was also recorded a high resistance to Pb+2 and Cd+2 with 2600mg/l and 400mg/l respectively. The highest resistance was recorded by M. kristinae to nickel with 300 mg/l . The mid resistance was by B.badius to all studied heavy metals and the lowest was by B. megaterium to all heavy metals studied in comparison with the other species of bacteria.The identified bacteria were used in the process of bioremediation of the heavy metals (Cu+2, Ni+2, Pb+2, Cd+2) with different concentrations (25, 50 and100 ) mg / l. B. licheniformis showed high ability to remove Ni+2, Cu+2 and Cd+2 than other species of bacteria, which reached (28.30%, 44.34% and 24.27%) mg/l. . respectively. B. badius showed a high capability for removing Cu+2 with 45.78% mg / l .Where as B. megaterium showed a high capability for removing Pb+2 with 23.43% mg / l.. M. halobius had the highest capability for removing Cd+2 with 25.42% mg / l. and M. kristinae had a mid capability to remove the heavy metals under studied.The study included observing the effect of the incubation period on removing the heavy metals ions.The results found that the best period was 72 hours in comparison with 24 and 48 hours.Also, the study included the effect of initial concentration in the process bioremediation.The results showed that the concentration of 25mg/l was the best for removing the heavy metals ions among the other concentrations, 50 and 100 mg/l.

عزل وتشخيص بعض انواع البكتريا المكسرة للهيدروكاربونات النفطية الاليفاتية في الترسبات النفطية لمحافظة البصرة == Isolation and Identification of some species of degradable Bacteria of N - Alkanes hydrocarbons compounds in oil sludge at Basrah Governorate

اسم المؤلف: استبرق عبد الحسين سلمان جدي البوغازي
اسم المشرف: ميثم ايوب عبد القادر الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: In the oil industries, large amounts of oil sludge are generated through the refining of crude oil. The main reason for its composition that is when exporting crude oil various kinds of oils (heavy and light ones) are mixed together for the purpose of exportation. But , the mixing process between different types cannot be fully , due to the lack of homogeneity among different quality of crude oil . So, the heavy parts of oil are precipitated to the bottom of tank and with passage of time they accumulate to be sediments that’s known as oil sludge stated at the bottom of the oil storage tank in the cleaning process , oil tanks are emptied and discharged in some spaces or reservoir (pits) located near the tanks called "oil pits". Which are places of dump excess oil of various types of oil from different oil tanks or they are close places from oil / water separating unites .From these spots, samples of two kinds of oil sludge : the bottom of oil tank (during the maintenance of the tank) and oil pits (near the unities of separating water from oil) are collected. Also, samples of soil surrounding the oil pits from five oil locations in Basrah city are collected too. Those locations are : west of Gurna, Northern Rumela, Southern Rumela, Nahar Umar, Alzubeir.At the rate of redundantly for each location and for each type of the study samples.This investigation is considered as the first which conducted in Iraq which include firstly the isolation and identification different types of bacterial species from different oil sludge, and secondly use some of them in biodegradation studies for two kinds of carbon sources of oil sludge : (oil sludge of tank bottom , oil sludge of oil pits) .Oil degrading bacterial species have been isolated on a selective mineral salt medium Bushnell and Hass Mineral Salt Medium (BHMS), supplemented with a carbon source. They are also identified depending on the Morphology and biochemical characteristics; four genus of bacteria (out of 89 bacterial isolates of oil sludge from the tank bottom)Bare identified. They include : 32 Pseudomonas spp. , 27 Rhodococcus spp. 21 Bacillus spp. , 9 Arthrobacter spp. , Also four genera of bacteria (out of 101bacterial isolates of oil sludge from the oil pits) are identified. They include : 41 Pseudomonas spp. 27 Rhodococcus spp. , 22 Bacillus spp. 11 Arthrobacter spp. , , While 8 species and 3 genus of bacteria (out of 259 bacterial isolates of the soil surrounding the oil pits) are identified. They include : 41 Aeromonas spp., 39 Corynebacterium spp., 39 Pseudomonas aeruginosa, 36 Bacillus spp., 33 Micrococcus leteuc, 23 Enterobacter intermedius, 22 Pseudomonas fluorescens, 12 Micrococcus varians 7 Staphylococcus epidermidis, 4 Staphylococcus saprophyticus,3Staphylococcus aureus .The biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and two compounds of Pristane and Phytane are measured. Also, the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes and the two compounds of Pristane and Phytane are measured for each four genus which were isolated from the oil sludge pits, and it is also done for one isolated genus from the soil surrounding the oil pits. The measuring process was fulfilled as a comparative study with the control flasks. Thus, the oil sludge (tank bottom ) was used as a source of carbone in the first experiment While, the oil sludge (oil pits) was used as a source of carbone in the second experiment . The incubate time of the experiment is 27 days during which a lost of the percentage of hydrocarbon compounds each 9 days are recorded by using( Capillary Gas Chromatography ). The results showed the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard toCbacteria 73.8 % Pseudomonas spp., 70.3 % Rhodococcus spp. 65.7 % Arthobacter spp., 55.6 % Aeromonas spp.,51.5 % Bacillus spp., Whereas, the biodegradation percentage of the lost in the concentration of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria 80 % Pseudomonas spp., 74.9 % Aeromonas spp., 70.4 % Rhodococcus spp., 64.8 % Arthobacter spp.,55 % Bacillus spp., While , The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (tank bottom ) with regard to bacteria 73.7 % Pseudomonas spp.,70.3 % Rhodococcus spp. 65.6 % Arthobacter spp., 55.3 % Aeromonas spp. ,51.2 % Bacillus spp., Whereas, The results showed of the biodegradation of mole percentage of the lost in the area of the hydrocarbon compounds of the normal alkanes of the oil sludge (oil pits) with regard to bacteria79.2 % Pseudomonas spp., 73.8 % Aeromonas spp., 69.2 % Rhodococcus spp.,63.7 % Arthobacter spp., 53.7 % Bacillus spp. It was found that there is approximately match between the biodegradation of mole percentage by using the area and those by using the concentration for each component .

الخصائص الجزيئية لبعض عوامل الضراوة لعزلات Candida albicans المعزولة من ثنيات مرضى السكري في الفرات الاوسط == Molecular characteristic of some virulence factors of Candida albicans isolates from intertrigo in diabetic patients in middle Euphrates

اسم المؤلف: ايه سامي كريم الصدام
اسم المشرف: لميس عبد الرزاق الخفاجي | كريمة امين الخفاجي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسه باخذ مسحات من 180 شخص منهم مرضى للسكري واشخاص اصحاء من المراجعين لمستشفى مرجان التعليمي من شهر تشرين الثاني 2014 الى شهر نيسان 2015 .مئه وثلاثين شخص تم فحصهم من مرضى للسكري وخمسين اخرين اصحاء . مئه شخص (76.92 % ) وجدو مصابين بالمبيضات ( 96 % ) منهم بشكل عزلات منفرده و( 4 % ) اخرين بشكل عزلات مشتركه . اما في الاشخاص الاصحاء كانت نسبه الاصابه بالمبيضات ( 32 % ) وجميعهم على شكل عزلات منفرده فقط .و كانت نسبه الاناث المصابه ( 70 % ) اما الذكور ( 30 % ) وكانت كذلك الاصابه اعلى في مجموعه الاشخاص الذين تتراوح اعمارهم بين ( 22 - 41) سنه . وكما وجدت منطقه تحت الاثداء هي الاكثر نسبه في الاصابه في النساء وتليها منطقه ما بين الافخاذ في كلا الجنسين , حيث كانت المبيضات البيض هي الاعلى نسبه في منطقه تحت الاثداء .و تم التعرف عليها بالفحص المباشر ,الزرعات المختبريه ,الاختبارات الكيموحياتيه وبالاضافه الى العده التشخيصيه الخاصه بالمبيضات , وتم ايضا بواسطه استخدام تقنيه ال (PCR).حيث تم عزل عده انواع لجنس ال Candida, كانت ال C. albicans هي الاكثر انتشارا ( 51 % ) , C. tropicalis(% 33 ) , C .parapsilosis ( 5 % ) , (C. Glabrata (5 % وC. dubliniensis ( 2 % ). الكشف الجزيئي عن ال C. albicans تم بواسطه استخدام الجين الخاص لها (calb 1 ) عن طريق تقنيه ال PCR .بالاضافه لذلك وجدت في هذه الدراسه قابليه المبيضات البيض على انتاج الفوسفولايبيز بنسبه (22.72 % ) وكذلك الانزيم المحلل للبروتين (31.81 % ) .تم الكشف عن ال (plb1 ) في عزلتين فقط وهذه العزلات لها القابليه على انتاج الفوسفولايبيز ظاهريا والتي تسبب غزو للنسيج . بالاضافه لذلك ( hwp 1 ) وجد بنسبه 90.09 % من عزلا ت ال C . albicans الذي يمكنها من النمو الخويطي والالتصاق وتكوين ال biofilm .( als 1) الموجود في كل عزلا ت ال C. albicans وهذه النتيجه وجدت ايضا في ال int 1 α, الاول مسؤل عن التصاق الفطر بالخلايا الطلائيه , اما الاخر مسؤل في الالتصاق على الاسطح وتكوين ال germ tube .Sap 1 جين اساسي في انتاج البروتنيز المحلل , هذا الجين وجد بنسبه 59.09 % في العزلات. تكوين ال biofilm لوحظ ايظا بواسطه استخدام لوحه زراعه الانسجه التي اظهرت ان 40.9 % من العزلات تعطي نتيجه قويه و59.1 % تعطي نتيجه ضعيفه ولا توجد عزلات لم تنتج ال biofilm . وقد اظهرت الدراسه ان مستخلص الثوم يقلل وبشكل فعال تكوين ال biofilm في 100 % ولا وجود للbiofilm القوي . كما وجد ايضا ان مستخلص الثوم ه القابليهعلى تثبيط النمو بواسطه تكوين حلقه بقطر 3 سم | In this study , a total 0f 180 skin swabs obtained from diabetic and non diabetic patients who were attended to Marjan medical City for detection of candidal intertrigo infection , during the period ranging from November (2014) to April (2015) , for study the infection rate in both groups and study the virulence factors of Candida albicans and also study other virulence gene .One hundred and thirty diabetic patients and fifty nondiabetic patients were tested with intertrigo infection . One hundred diabetic patients ( 76.92 % ) carried candida in their skin folded areas , which present as a single isolates ( 96 % ) and as a combination ( 4 %) . while in the healthy individuals 16 ( 32 % ) as a single isolates only . The infection rate in females was ( 70 %) and males (30 % ), the infection was more common in the age groups ( 22 - 41 ) years old . The underbreast area of the femals having the highest infection rate followed by inner thighs in both males and females , and C. albicans found more prominent in the underbreast area . Cultural characteristic and biochemical criteria revealed that ( 51 %) of isolates were C. albicans , which is more prominent followd by C . tropicalis (33 %) , C. parapsilosis and C . glabrata ( 5 % ) and C. dubliniensis ( 2 % ).This study also revealed that C. albicans is able to produce phospholipase enzyme in ( 22.72 % ) of the isolates , and also produce proteinase enzyme in ( 31.81 % ) of the isolates .Molecular detection of C. albicans was done by using specific PCR primer , and the molecular detection of phospholipase gene was done by using specific PCR primer. It was found that plb 1 was observed in only three C. albicans isolates out of twenty two ( 13.63 % ), and these positive isolates have the ability to produce phospholipase phenotypicaly and cause the invasion of the C. albicans. In addition hyphal wall protein 1 were produced from ( 90.9 % ) of C. albicans isolates which have the ability for filamentous growth , adherence and biofilm formation .Agglutinin like sequence 1 which present in all isolates and also this result as the same as that of alpha integrine like sequence 1 , the first one cause this fungi to adhere to the epithelial cells, and the other one involve in surface attachment and germ tube formation . Finally secreted aspartyl proteinase1 is essential to produce proteolytic proteinase . This gene was detected by specific PCR primer; it was observed that( 59.09 % ) of isolates gave positive result of this gene.Biofilm formation was also investigated by using tissue culture plate . It was shown that (40.9 % ) of isolates gave positive biofilm formation ,and ( 59.1 % ) negative biofilm formation.Fresh garlic extract able to inhibit candida albicans growth by forming zone of inhibition in 3 cm . Regard effect of (50 %) on biofilm formation, the result of this study demonstrated that fresh garlic extract effectively reduced the biofilm forming C. albicans in (100%) and no strong formation.

الكشف عنcag جين وجينات الضراوة الاخرى من بكتريا القولون المسببة لالتهاب المجاري البولية في مدينة بابل == Screening for cag Genes and Other Virulence Genes Among Escherichia coli Isolated From Patients With Urinary Tract Infection In Babylon City

اسم المؤلف: ياسمين رياض سعيد العزاوي
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | محمد رضا جودي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: في هذه الدراسة، تم جمع (100) عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و(25) عينة خروج من افراد اصحاء كعينة ضابطة، من كلا الجنسين في مستشفى الحلة الجراحي خلال الفترة من شباط 2015 الى ايار 2015.ثمانون عينة فقط اظهرت نمو على الاوساط الاختبارية. و40 عينة كانت حاملة ل E.coli بنسبة 10(25%) عزلة من الذكور و30(75%) عزلة من الاناث. اضافة الى ذلك تم تشخيص (7) عزلات E.coli من عينات الخروج لاشخاص اصحاء .اظهرت الدراسة ان 20(50%) من عزلاتUPEC تمتلك القابلية على انتاج الهيمولاسين خارخ الخلية على وسط اكار دم الانسان بنسبة 15(37,5%) الفا هيمولايسين و5 (12,5%) بيتا هيمولايسين . اما باقي العزلات 20 (50%) كانت غير قادرة ع انتاج الهيمولايسين.تضمنت الدراسة ايضا الكشف الجزيئي عن cag A جين لمشاهدة Sequence homology لهذا الجين في بكتريا H.pylori وE.coli بواسطة تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) حيث لوحظ ان كافة عزلات البكتريا اظهرت نتيجة سالبة لهذا الجين . وقد لوحظ ايضا نفس النتيجة ل cag E جين.اما التحري عن vir BII جين باستخدامprimer , فقد لوحظ ان 5(71,4%) عزلة بكتيرية من عينات الخروج و25(62,5 %) عزلة بكتيرية من عينات الادرار كانت ايجابية لهذا الجين , الذي لم يسبق دراسته في بكتريا E.coli . هذه النتيجة مؤشر لوجود sequence homology لهذا الجين مع جين بكتريا H.pylori .كما تم فحص عزلات UPEC )) للكشف عن وجود جينات الالتصاقpap, sfa, afaI) ) بواسطة (PCR). حيث وجد ان 26(65%) عزلة ادرار كانت تحملpap جين. و25(62%) عزلة تحمل sfaجين. بينما afaI جين يوجد في 17(42%).كذلك الكشف الجزئي عن جينات (cnf I and cnf II). ووجد ان cnf I كان ايجابيا في 21(52%) عزلة ، بينما cnf II لم يتم تحديده في اي عزلة.اظهرت الدراسة ايضا ان aer جين متواجد في 25(62,5%) من العزلات. اما hly جين فانه موجود في 18(25%) من العزلات.بالاضافة الى ذلك تم دراسة تاثير بعض المضادات الحياتية على عزلات بكتريا القولون المعوية. وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا حساسة بنسبة 100% الى Imipenem واقل حساسية 60% الى Nitrofurantoin و55% الى Amikacin . لكن بقية العزلات اظهرت نسب مختلفة من المقاومة لمضاد واحد او اكثر من المضادات الحيوية مثل Ceftazidim 80% وCeftriaxone 87,5 % , وبدرجة اقل من المقاومة لكل من Levofloxacin 62,5% وTrimethoprim - Sulfametoxazole 77,5% . | In this study, a total of (100) urine specimens obtained from patients suffering from Urinary Tract Infection and also, 25 stool samples were taken from healthy individual as control group were included, from both sexes who admitted to Al - Hilla Teaching Hospital Babylon during a period from February (2015) to May (2015). The urine and stool samples were then cultured on selective media to isolate Escherichia coli. Only 80 samples showed positive culture growth. It was found that only 40 isolate of E. coli were isolated where 10 (25%) of the isolates from male patient and 30 (75%) from female patients. Moroever, 7 isolates E.coli were isolated from stool samples of human individual.The ability of uropathogenic E.coi (UPEC) to produce extracellular hemolysin was studied, and it was found that 20 (50%) out of 40 isolates of E. coli were able to produce hemolysin on human blood agar, whereas15 (37.5%) were found α - hemolytic and 5 (12.5%) β - hemolytic. Other isolates of E. coli 20 (50%) had no ability to produce hemolysin.On the other hand, molecular detection of cytotoxic associated gene A (cagA) to show the sequence homology of this gene in Helicobacter pylori and E.coli. by PCR technique showed that all isolates of E.coli from urine and stool gave negative result for this marker, which confirm that there is no sequence homology of this gene with that present in H. pylori.The same results were seen with cytotoxic associated gene E (cagE) by using specific marker, where all isolates from urine and stool samples gave negative result to this gene. Moreover, the isolates of E. coli were subjected to show their possession of virB II gene, by using specific marker. It was observed that 25 (62.5%) of bacterial isolates from urine and 5 (71.4%) of bacterial isolates from stool gave the positive result for this gene, which is not previously detected in E. coli. This result indicate to found sequence homology of this gene with that present in H. pylori.Besides, the isolated UPEC were examind for the presence of the adhesion genes (pap, sfa, afaI) by PCR assays. It was found that pap gene was present in 26 (65%) isolates and sfa gene present in 25 (62.5%). While afaI gene present in 17 (42%) of isolates. Molecular detection of cytotoxic necrotizing factor I and II (cnf I and cnf II), was also studied by using specific markers. It was seen that cnf I gene was positive in 21 (52.5%) isolates of E. coli. While cnf II gene was not observed in any isolates of E.coli. Aerobactin (aer) and hemolysin (hly) genes, is also investigated by using specific markers; it was found that aer gene was present in 25 (62.5 %) of isolates and hly gene present only in 18(45%). Finally, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics has been investigated. It has been found that E. coli isolates were sensitive to imipenim at a rate (100%), and lesser to nitrofurantoin 60% and amikacin 55%. But most of them showed different mode of resistance to antibiotics used in this study as Trimethoprim - Sulfamethoxazole 77.5%, Ceftazidim 80%, levofloxacin 62.5%, Ceftriaxone 87.5%.

التوصيف المظهري والجزيئي لبكتريا Staphylococcus saprophyticus الممرضة البولية المعزوله من النساء المصابات بالتهاب المثانة == Molecular and Phenotypic Characterization of Uropathogenic Staphylococus Saprophyticus Isolated From Women With Cystitis

اسم المؤلف: فرح علاء عبد الحسين الوائلي
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | زينب حمود السعدي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم في هذه الدراسة جمع وزراعة (140)عينة من منتصف مجرى عينة الادرار التي جمعت من (140) مريضة مصابات بالتهاب المثانه وممن احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي العام ومن العيادة الخاصة للفئه العمريه من 16 - 55 سنة (من اكتوبر 2014 الى يناير2015) وقد تم عزل وتشخيص 14 عزلة فقط من بكتريا Staphylococcus saprophyticus. وقد تمت دراسة بعض عوامل الضراوه المسؤوله عن امراضية هذه البكتريا فقد اظهر اختبار وجود المحفظه للعزلات البكترية بان عزلة واحده فقط من بكتريا S.saprophyticus تحتوي على المحفظه في حين تخلو العزلات ال13 الاخرى منها . ايضا تضمنت هذه الدراسة التحري عن وجود عوامل الاستيطان الاول CFAI)) والثانيCFAII) ) والثالث(CFAIII). وقد اظهرت النتائج بان 13 عزلات اي 92% تمتلك عامل الاستيطان الاول (CFAI) في حين تمتلك عزلة واحده من هذه البكتريا اي 7% عامل الاستيطان الثاني CFAII)), اما بالنسبه لعامل الاستيطان الثالث (CFAIII) فقد اظهرت النتائج بان مايقارب 21% اي 3 عزلات من هذه البكتريا لديها القدره على انتاج هذا العامل . كما اظهرت النتائج ان جميع عزلات S. saprophyticus غير محلله للدم اي غير منتجة للهيمولايسين عندما تنمو على وسط اكار الدم، في حين ان جميع العزلات كانت قادرة على انتاج انزيم اليورييز. وقد تم الكشف عن وجود انزيم البروتييز الخارجي فقد وجد ان 2 (14٪) من هذه البكتيريا كانت قادرة على انتاج هذا الانزيم ، في حين 12(86٪) لم تكن تملك القدرة على انتاج هذا الانزيم .اما بالنسبه للانزيم المحلل للدهون (اللايبيز) فقد اظهرت النتائج بان 8 (57٪) من بكتريا S.saprophyticus كانت قادرة على انتاج انزيم اللايبيز. ايضا شملت الدراسه قابلية البكتريا تكوين الغشاء الحيوي في جميع العزلات البكتيرية وقد وجد ان عزلتين فقط لها القابليه على تكوين الغشاء الحيوي اما العزلات البقيه فقد اظهرت عدم قابليتها على تكوينه . ايضا اظهرت الدراسة بان الغالبية العظمى من العزلات(12) عزلة لها القابلية على انتاج عامل الالتصاق بالخلايا البولية الطلائية Addherence factor)) . كما تم الكشف عن انتاج البكتريوسين من قبل S.saprophyticus وقد اظهرت العزلات نتائج مختلفة لهذا الاختبار ضد انواع مختلفة من البكتيريا التي تشمل E.coli) P.auroginosa)،and S.epidermides, S. penumoniea، وKlebsiella) لكن لم تنتج اي من هذه العزلات مبيد جرثومي ضد E.coliاو P.auroginosa، في حين ان (28٪) منها انتجت مبيد جرثومي ضد Klebsiella و(35٪) منها ضد S.epidermides و2 (14٪) مقابل S.pneumonie اما من ناحية اختبار الحساسية للمضادات الحيوية فان جميع هذه العزلات قد خضعت لهذا الاختبار وقد وجد ان جميع عزلات هذه البكتريا حساسة بشكل تام 100% لكل من Levofloxacin , Cefoxitin, Imipenem , vancomycin .ولكنها حساسة بدرجة اقل لكل من Ciprofloxacin و. Trimethoprime - Sulfamethoxazoleكما واظهرت العزلات مقاومه100% لكل من Nalidixic acid وOxacillin .ولكن بدرجة مقاومه اقل للمضادات Methicillin وGetamycin اما من ناحية الكشف والتشخيص الجزيئي فقد تم استخدام بادئات نوعيه Primer) ) في تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR للتحري عن الجينات الخاصة بانتاج (uafA) بروتين وقد اظهرت النتائج بان جميع العزلات البكترية تمتلك هذا الجين الخاص بالبروتين المسؤول عن الالتصاق بالخلايا الطلائية للقناة البولية. ايضا بواسطة نفس التقنية تم التحري عن الجين المسؤول عن انتاج المحفظة في هذه البكتريا capD وقد اظهرت النتائج بان عزلة واحدة فقط من بكتريا S.saprophyticus تمتلك هذا الجين . وعلاوة على ذلك، تم الكشف عن الجين المسؤول عن انتاج البروتين الالتصاقي المحلل Aas من قبل هذه البكتريا وقد بينت النتائج بان جميع العزلات اظهرت نتائج ايجابيه لهذا الجين وبنسبة 100% . كما تم التحري عن الجين المنتج للبروتين المسؤول عن الارتباط بالكولاجين في هذه البكتيريا واظهرت هذه الدراسة ان عزلة واحدة فقط تمتلك هذا الجين.بالاضافة الى ذلك، في جميع العزلات البكتيرية تم الكشف عن الجين المسؤول عن تشفير وانتاج انزيم اللايبيز Ssp في بكتريا S.saprophyticus باستخدام بادئات نوعية خاصة . وقد اظهرت نتائج البحث في هذه الدراسة بان 14(100٪) من العزلات تمتلك هذا الجين. في هذه الدراسة اتضح ان جينات الضراوه (UafA, Aas , and Ssp) هي الاكثر شيوعا بين العزلات وكذلك اظهرت الدراسه قدرة هذه البكتربا على انتاج الباكتريوسين ضد البكتريا السالبه لصبغة غرام | In this study, a total of 140 mid stream urine specimen were collected from women suffering from cystitis who attended to Hilla General Teaching Hospital from November 2014 to February 2015 to detect the occurrence of Staphylococcus saprophyticus among the collected specimens. The patients age ranged from 16 to 55 years. Only 14 isolates were identified as Staphylococcus saprophyticus . Some virulence factors were studied by phenotypic method in S.saprophyticus isolates. The capsule was present in only one isolate out of 14 whereas the other 13 isolates in this study did not possess the capsule. Colonization factor antigens were also detected in all isolates. It was found that 13(92%) of isolates had CFAI , while 1(7%) of them had CFAII and 3(21%) had the ability to produce CFAIII. The results also showed that all isolates of S. saprophyticus did not produce hemolysin, while all isolates were able to produce urease enzyme. Extracellular protease were also investigated. It was found that 2(14%) of this bacterium were able to produce extracellular protease, whereas the other 12(86%) didn’t have the ability to produce this enzyme. The ability of S.saprophyticus to produce lipases was identified and the results showed that 8(57%) of S.saprophyticus were able to produce lipase enzyme. Biofilm formation was investigated in all bacterial species, and the results showed that only 2(14%) of the isolates that form biofilm ,while the result of adherence test showed that 12(85%) of this bacterium had the adherence activity to attach to the uroepithelial cells. Also the investigation of bacteriocin production in S.saprophyticus revealed that the isolates had shown different results for this test against different types of bacteria that include (E.coli or P.auroginosa, S.epidermidis , S. penumoniae , and Klebsiella) but no one of them had bacteriocin against each of E.coli and P.auroginosa , while 4( 28%) of them had produced bacteriocin against Klebsilla and 5(35%) of the isolates had bacteriocin against S.epidermidis while 2(14%) against S .pneumoniae. All the isolated S.saprophyticus bacterium from urine specimen were submitted to in vitro antibiotics sensitivity test by Kirby - Bauer disc diffusion method . It had been found that S.saprophticus isolates were sensitive (100%) to Cefoxitin , Imipenem , Levofloxacin and Vancomycin but lesser to each of Ciprofloxacin and Trimethoprime - Sulfamethoxazole . However , the isolates showed resistance to Nalidixic acid and Oxacillin , but in a lesser degree to Methicillin . Molecular detection of Ubiquitous uro - adherence factor A was made by using specific PCR primer . This marker was shown to be present in all isolates of this bacterium ,while the molecular detection of the capsular polysaccharides gene capD had shown that only one isolate 1(7%) had this gene and gave positive result for this primer. Moreover, Autolysin - adhesin surface protein Aas was also detected in S.saprophyticus . It was shown that all isolates 14(100%) gave positive result for this gene. The collagen binding protein gene sdrI was also investigated in this bacteria and this study had shown that only one isolate possess this gene.In addition to that , the surface associated protein gene of S.saprophyticus Ssp was detected in this study by using specific primer in 14(100%) of isolates, this gene is responsible for lipase encoding . In this thesis it was found that the virulence factor genes (UafA, Aas , and Ssp) are more common among isolates of S.saprophyticus and this bacteria were able to produce bacteriocin against Gram negative bacteria.

تحضير مصل تشخيصي متعدد التكافؤ لبكتيريا السالمونيلا للنمطين المصليين Typhi وTyphimurium == Preparation of Polyvalent Diagnostic Antisera for Salmonella serovares Typhi and Typhimurium

اسم المؤلف: امير صادق ياسر العذاري
اسم المشرف: حبيب صاحب نهر | علاء حسين حيدر
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة على عزلتين مختلفتين لبكتريا Salmonella ( typhi وtyphimurium ) تم الحصول عليهما من مختبر الصحة العامة في محافظة النجف خلال شهر كانون الاول 2014. تضمنت الدراسة ثلاثة محاور رئيسية , المحور الاول بكتريولوجي وتضمن دراسة تشخيصية للعزلتين وفق انظمة تشخيصية متقدمة ومعتمدة وتضمن المحور الثاني الكشف عن بعض عوامل الضراوة التي تمتلكها البكتريا كقدرتها على الحركة, وانتاج انزيم البروتييز والقدرة على تكوين biofilm اما المحور الثالث فقد تضمن دراسة مناعية تم من خلالها تحضير المستضد الجسمي والمصل التشخيصي متعدد التكافؤPolyvalent antisera لكل من العزلتين.تم اختبار البكتريا من خلال اجراء الفحوصات المجهرية والكيموحياتية وتقنيات Api - 20 والVitek2 ومن خلال نتائج تلك الفحوصات ومقارنتها بالصفات النوعية للبكتريا تاكد بانه العزلتين قيد الدراسة هما Salmonella typhi , وSalmonella typhimurium . اظهرت النتائج قدرة بكتريا Salmonella جنس typhimurium على استهلاك السترات , وانتاجها لكميات كبيرة لكبريتيد الهيدروجين على وسط kliglar iron agar في حين كانت لها القدرة على تخمير العديد من السكريات واهما سكر Arabinose . في حين كانت العزلة للجنس typhi غير قادرة على استهلاك السترات وانتاجها لكميات قليلة لكبريتيد الهيدروجين بالاضافة لعدم قدرتها على تخمير سكر Arabinose .كشفت الدراسة عن امتلاك بكتريا السالمونيلا لبعض عوامل الضراوة متمثلة بانتاج الانزيم المحلل للبروتينات protease enzyme وقدرتها على تكوين biofilm الذي تعتبر احدى العوامل الرئيسة في تلوث الاغذية المحفوظة وانتشار المرض اضافة الى قدرة البكتريا على الحركة بنشاط مما يمكنها من اختراق الطبقة المخاطية المبطنة للامعاء. ومن النتائج التي توصلت اليها الدراسة قدرة البكتريا على مقاومة المضادات الحيوية النيومايسن والكلورامفينكول الذي كان في السابق يعتبر المضاد الحيوي الاول في علاج الاصابة ببكتريا السالمونيلا في حين اظهرت البكتريا حساسية كبيرة للمضادين السيبروفلوكساسين والسيفترياكسون اضافة الى حساسيتها للمضادات كوتريميكسازول والتيتراسايكلين والنالدكسك اسد ,كما اظهرت العزلتين تباين في نسبة الحساسية الكبيرة الى المتوسطة للمضادين الاموكسلين والامبسيلين حيث كانت Salmonella typhi حساسة لتلك المضادات في حين كانت Salmonella typhimurium متوسطة الحساسية لتلك المضادات .المصل التشخيصي متعدد التكافؤPolyvalent diagnostic antisera تم تحضيره خلال طريقة مقترحة من قبل جامعه فلوريدا. حيث تم تحضير المستضدات الجسمية لكلتا العزلتين لبكتريا السالمونيلا المقتولة بالحرارة وحقن هذه المستضدات في الحيوانات المختبرية ( ارانب ) التي قسمت الى ثلاثة مجاميع حقنت الاولى والثانية منها بمستضدات جسمية مختلفة للعزلتين المختلفتين وباربعة جرع بين حقنة واخرى ثلاثة الى اربعة ايام في حين حقنت المجموعة الثالثة بالمحلول الملحي الفسلجي واستخدمت كمجموعة سيطرة للمقارنة تم بعد الحقنة الرابعة للحيوانات سحب الدم من الحيوانات بطريقة ثقب القلب تم عزل المصول واختبار كفاءتها في الكشف عن البكتريا من خلال فحص التلازن agglutination test لكلا المستضدين مع الاضداد المتمثلة بالمصل وكانت النتيجة موجبة لكلا الفحصين . اما عند مزج المستضد للعزلة الاولى مع الضد العزلة الثانية فقد اظهرت نتيجة موجبة للتلازن لكنها كانت ضعيفة مقارنة مع النتيجة الاولى, في حين عند عمل تفاعل مع بعض انواع من البكتيريا الواقعة ضمن العائلة المعوية فكانت النتيجة غير جديرة بالذكر | The present study was executed on two different isolates of Salmonella (typhi and typhimuruim) which were obtained from Central Health Laboratory in AL - Najaf province during December 2014. The study included three main parts. The first part was to confirm diagnosis of those isolates based on reliable diagnostic procedures. The second part concerned with the study of some virulence factors of Salmonella such as motility, production of protease enzyme and ability to formation of biofilm. The last part included immunological study including preparation of somatic antigen and polyvalent diagnostic antisera for each isolates. The suspected isolates were fully identified by using bacteriological, biochemical, API 20E and Vitek2 techniques. The results of these tests which compared with specific characteristics of Salmonella indicated, it was that the isolates included in this study were Salmonella typhi and Salmonella typhmurium . The results revealed that ability of Salmonella genus typhimurium was able to utilize citrate, produce high amount of H2S in Kliglar iron agar and ferment Arabinose sugar, while Salmonella typhi was incapable to citrate utilization and produce little amount of H2S in Kliglar iron agar and has inability to ferment Arabinose sugar. The results revealed that Salmonella produced virulence factors represented by producing protease enzyme and biofilm formation which consider as the main factor in contaminating of food and transmission of disease. The results exhibited a remarkable resistance of Salmonella to Neomycin and Chloramphenicol which was consider the first choice in treatment of Salmonella, but it was sensitive to Ciprofloxacin, Ceftriaxone, Cotrimoxazole, Tetracycline and Naldixic acid, while it exhibited variable sensitive to Ampicillin and Amoxicillin . Polyvalent diagnostic antisera were prepared according to protocol being suggested by Florida State University. Preparation of heat killed somatic antigen for each isolates of Salmonella, then were injected in three groups of laboratory animals (rabbits). The first and second group was injected with different somatic antigen in four successive doses with an interval time of three to four days, while the third group was injected with normal saline which used as control. Blood was collected from animals by intracardiac injection then serum has been separated and tested for its specificity by reaction with Salmonella typhi and Salmonella typhimurium using the agglutination test. The results were highly positive and specific, but when test antigen of first isolate with serum of second isolate will exhibit positive result with weak agglutination, then when cross reaction prepared antisera with live antigens of other some species belong Enterobactrecea the results was no considerable reaction

دراسة تجريبية لانزيمات البروتييز للزائفة الزنجارية المعزولة من المرضى العراقيين المصابين بتقرح القرنية ودورها في علاج تقرح القرنية المتسبب عن المكورات العنقودية == Experimental Study of Pseudomonas aeruginosa Proteases Isolated from Corneal Ulcer of Iraqi Patients and Their Role in the Treatment of Staphylococcus aureus Keratitis

اسم المؤلف: عائدة حسين ابراهيم
اسم المشرف: جاسم محمد كرحوت | منيرة جلوب اسماعيل
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One - hundred and twenty samples ( corneal scraping) were collected from patients diagnosed to have microbial keratitis (corneal ulcer) who attended Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital from the period between May 2013 and November 2013, Pseudomonas aeruginosa was reported 26 (21.6%) from the total cases. All bacterial isolates were diagnosed by conventional and biochemical tests, and confirmed by Vitek 2 Compact System.The role of proteases enzymes ( Elastase ( LasB), LasA, Alkaline protease and Protease IV ) of Pseudomonas aeruginosa in the corneal ulcer was studied by using genetic and molecular biological method by real time PCR, and the results indicated that three bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa possessed elastase gene (LasB) (11.5%), and only one bacterial isolate of Pseudomonas aeruginosa harbored LasA protease gene ( 3.8%). All bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa were harbored alkaline protease gene (100%), and twenty bacterial isolates were harbored protease IV (76.9%).The results of real - time PCR analysis indicated that four bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa (15.3%) were harbored more than one gene of different proteases enzymes ( elastase, alkaline protease, and protease IV).On the other hand our results showed that one bacterial isolates (3.8%) harbored both LasA protease and alkaline protease genes, and twenty bacterial isolates of Pseudomonas aerugenosa (76.9%) were harbored alkaline protease and protease IV genes.The LasA protease was extracted from Pseudomonas aeruginosa isolate by cooling centrifuge and precipitated supernatant by ammonium sulfate at saturation (80%). The resulted extracted crude enzyme concentration was 60 μg/ml. Then the crude enzyme was partially purified by dialysis and gel filtration chromatography by using Sephadex G - 100. The concentration of partial purified enzyme reached 40μg/ml.IIISummaryThe results of the experimental treatment of bacterial keratitis ( in vivo) of infected eyes rabbits caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was effective was as Lysostaphin in eradicating Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus from the infected corneas after approximately 15 h after giving the drug at dose 100 μl ( concentration 1μg / ml ) . While Vancomycin gave us very little potency in eradicating S. aureusfrom corneas in comparison with potency of LasA protease and Lysostaphin duringthis time but showed good potency very late approximately after 3 days of applicationof treatment.The results of the experimental treatment in vitro (in the test tube ) that is caused by Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus showed that the efficacy of LasA protease was similar to that of Lysostaphin drug in the killing of Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus in the bacterial broth.

دراسة النمط المناعي وقابلية الاصابة بالعدوى الميكروبية لدى ذوي السمنة البالغين == Study The Immune Profile & Susceptibility to Some Microbial Infections in Obese Adults

اسم المؤلف: فؤاد قاسم جبير الزيادي
اسم المشرف: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هديل فاضل فرهود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى توضيح العلاقة بين البالغين الذين يعانون من السمنة والتعرض للعدوى الميكروبية من خلال تقدير المعايير المناعية مثل (IFN - γ & IL - 2)، عناصرcomplement system (C3, C4) , وقياس فعالية الخلايا المناعية الالتهامية من خلال الكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus. انجز هذا العمل على 50 شخصا من ذوي السمنة البالغين (11 ذكرا و39 انثى) تتراوح اعمارهم من (20 - 60) عاما قاموا بزيارة قسم التغذية في مستشفى مرجان التعليمي في محافظة بابل خلال الفترة من نوفمبر 2014 الى يناير 2015، و30 شخصا اخرين اصحاء لا يعانون من السمنة (21 ذكور و9 اناث) تتراوح اعمارهم من (22 - 42( عاما. وتم قياس مؤشر كتلة الجسم (BMI) لكل فرد من ذوي السمنة والاصحاء. تم جمع عينات الدم من كلا المجموعتين لقياس فعالية الخلايا الالتهامية، والمعايير المناعية الاخرى مثل (IFN - γ & IL - 2)، وعناصر complement system (C3, C4), والكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus بطريقة الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم. اظهرت النتائج ان تركيز (IL - 2) عند ذوي السمنة اقل بكثير وبشكل معنوي عن الذين لا يعانون من السمنة (P˂0.05) ، ولم يظهر تركيز IFN - γ)) في مجموعة ذوي السمنة انخفاضا معنويا (p>0.05) عن تركيزه عند الاصحاء. وكانت عناصر complement system (C3, C4)مرتفعة عند ذوي السمنة وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عن مجموعة الاصحاء الذين لا يعانون من السمنة، ولكن فعالية الخلايا الالتهامية اظهرت انخفاضا عالي المعنوية (p˂0.001) عند مجموعة ذوي السمنة (6.1٪) مقارنة بمجموعة الاصحاء (10.6٪)، وزيادة تراكيز كل من ASO وanti - measles virus - IgG وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عند ذوي السمنة مقارنة بالاصحاء | This study aimed to clarify the relationship between obese adults & susceptibility to microbial infections by evaluating the parameters of cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and phagocytic index using of Anti - Streptococcus pyogenes Ab and Anti - Measles virus - IgG Ab as indicators of infections. This work was applied on 50 obese adults visited to the center of nutrition in Marjan hospital in Babylon province from November 2014 to January 2015, and 30 non - obese apparently healthy as controls. Obese adults consist of (11 males and 39 females) with age range 20 - 60 years, while 30 apparently health controls consist of (21 males and 9 females) with age range 22 - 50 years. Body mass index (BMI) for all subjects obese & controls was estimated. Blood samples were collected from obese group and control group to estimate phagocytic index, and ELISA test for cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and detection of measles - IgG antibody and anti - streptolysin O antibody. IL - 2 concentration in obese adults was significantly lower than non - obese adults (p˂ 0.05), and no significant decreased (p>0.05) of IFN - γ in obese group, the complement components (C3 &C4) in obese adults were a highly significant than controls, but the phagocytic index showing there is a highly significant decreased (p˂0.001) in activity of neutrophils of obese adults (6.1%) compared to control group (10.6%), ASO and Anti - measles - IgG concentrations increased in obese adults with a highly significant (p˂0.001) as compared to controls. This findings can be concluded as that obese subjects have low levels of immune system and more susceptible to be infected with microbial infections

تقييم وتعريف المكورات المسبحية الطافرة والمتحولة اللثوية في مرضى تسوس الاسنان وامراض النسيج الداعم للاسنان == Evaluation and Identification of Streptococcus mutans and Entamoeba gingivalis in Patients with Periodontal Diseases and Dental Caries

اسم المؤلف: مؤيد نعمة مصلح الخفاجي
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | هيام خالص المسعودي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present was carried out during the period of November 2014 to April 2015 in Al - Hilla City. This study included 100 samples which were collected from patients at ages ranged between 4 to 75 years old whom were suffering from dental caries and periodontal diseases ; (50) samples were taken from patients infected with dental caries (23 male and 27 female) and (50) samples taken from patients with periodontal diseases (15 male and 35 female), who have submitted to a college of Dentistry in Babylon university and special center of Dentistry. Thirty samples were taken from apparently healthy persons and considered as control.The isolation and identification of S. mutans was performed by Mitis Salivarius Bacitracin agar as a selective medium and biochemical tests as well as API 20 strep, then investigated the virulence factors and show the effect of some antibiotics on bacterial isolates, and the identification of E. gingivalis parasite was by a wet preparation method.The obtained results showed that S. mutans was with a higher existence in patients with dental caries, with lower existence in the patients with periodontal diseases and it was found in healthy persons (30%, 18%, and 0%) respectively. Entamoeba gingivalis was higher in patients with periodontal diseases than patient with dental caries and less in healthy individuals (62%, 24%, and 6%) respectively. The presence of these microorganisms was related to the type of dental disease (p=0. 009), gender (p=0. 009), age (p=0. 008) and risk factors (diabetes, smoking and hypertension) (p=0.037).The effect of some antibiotics on S.mutans was also tested, and the obtained results showed that all isolates were with high resistance to Erythromycin (70.8%) and (66.7%) were resistant to Doxycycline. Some isolates showed low level of resistance to Vancomycin (54.2%), CefatoximeII(33.4%) and Clindamycin (25%), while these isolates were with high susceptibility to Chloramphenicol (100%) and Ofloxacin (83.4%).Finally, some virulence factors of S. mutans were studied and it was seen that the (62.5%) of S. mutans isolates produced α - hemolysis and (8.3%) produced β - hemolysis but (29.2%) of isolates non - hemolysis, but (58.3%) of isolates were made capsule and (100 %) were able to synthesize glucan, (83.3%) of S. mutans isolates were able to produce mutacin and (45.83%) of isolates were found to produce dextranase enzyme, while (84%) were able to biofilm formation .In addition, all isolates in this study were able to adhere to oral epithelial cells.

دراسة على المايكرومايكروبية الشائعة المعزوله من القناة الهضمية وبعض المعايير المناعية للمرضى الذين يعانون من مرض السكري النوع الثاني == A Study on Common Microbiaes isolated from Gastrointestinal and some Immunological Parameter in Patients with Type II Diabeties Mellitus

اسم المؤلف: شذى خزعل كاظم الوائلي
اسم المشرف: هيام خالص المسعودي | علي حسين البياتي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المرضى الذين يعانون من من داء السكري النوع الثاني هم مجموعة غير متجانسة من الاضطرابات التي تتميز بمقاومة الانسولين الواسعة للانسجة ويختلف على نطاق واسع. داء السكري من النوع الثاني هي حتى الان الاكثر شيوعا. تضمنت الدراسة (100) مريض مصاب بالسكري النوع الثاني مشخص من قبل اطباء متخصصين بالسكري و(50) شخص من الناس الاصحاء وفي الفئه العمرية (25 - 65) سنة الوافدين الى مستشفيات في بابل (القاسم ومرجان) خلال الفترة من كانون الثاني 2015 حتى حزيران 2015.واظهرت النتائج ان البكتريا السالبه لصبغة كرام من مجموع العزلات هي السائدة مقارنة مع البكتريا الموجبه لصبغة كرام تشكل 26٪ وشكلت العزلات البكتيرية E.coli الاكثر شيوعا كانت يتبعها Enterobacter spp., K.Pneumoniae, Proteus spp., والبكتريا الاقل شيوعا كانتS.aureus, S.epidermidis, Citrobacter, Micrococcus Kocuria kristinae وStreptococcus spp,في حين ان الطفيليات الاكثر شيوعا كانت E.histolyticaبنسبة 55% وGiardia lambliaبنسبة 45% . تم دراسة عوامل الضراوة للبكتريا الشائعه المعزولة من مرضى السكري من النوع الثاني في هذه الدراسة. وكانت عزلات K.pneumoniae وعزلات Enterobacter وبعض عزلات E.coli تعطي الكبسول بينما بكتيريا Proteus spp. المعزوله في هذه الدراسة لم تمتلك الكبسولة. تم الكشف عن عامل الاستعمار CF - I وIII في العزلات البكتيرية فكانت ايجابيه في البكتريا الاكثر شيوعا وكانت جميع عزلات بكتيريا المكورات العنقودية الذهبية قادرة على انتاج المخثرة التي يعتبر عامل الضراوه لامراضية هذه البكتيريا. وان كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية والاشريكية القولونية اظهرت تحللا كاملا (lyses كاملة) β - الانحلالي، في حين ان جميع عزلات المكورات العقدية نمط (lyses غير مكتملة) α - الانحلالي حيث اظهرت خط مخضر حول المستعمرات البكتيرية. وكانت جميع عزلات S.epidermidis وبعض العزلات من Proteus spp. (غير الحالة للدم) γ - الحالة للدم. في هذه الدراسة تم التحري عن sidrophore بين العزلات البكتيرية واظهرت النتائج ان جميع العزلات البكتيرية (E. coli K.Pneumoniae,)، ومعظمها من عزلات E. aerogenes و.Proteus spp كانوا قادرين على صنع sidrophore. وكانت بعض العزلات من. Proteus spp وEnterobacter ايجابية لتفاعل الجيلاتيناز، في حين ان جميع العزلات من Klebseilla واكثر عزلات E.coli سالبة لهذا العامل. واظهرت نتائج اختبار انتاج ال lipase في سالبة الجرام ان معظم العزلات ايجابية لاختبار lipase. وكشفت النتائج ان جميع العزلات كانت موجبه Biofilm وضع تشكيل (50٪)، في حين لا يوجد عزلات سالبه له. وفيما يتعلق بعوامل الضراوة الشائعة للبكتيريا المعزولة من عدم وجود مرض السكري وعوامل الضراوة فكانت نادرة. وكانت نتائج المتغيرات المناعية (C3، C4، Ig A، IL4، وIL6) للمرضى السكري في الدراسة, قد انخفضت مستويات C3، IgA، IL4، وIL6 للمرضى السكري ، في حين مستوى C4 قد ارتفع. من خلال نتائج هذه الدراسة، يمكن ان نستنتج؛ ان انواع البكتيريا التي عزلت من مرض السكري من النوع الثاني هي التالية E.coli تليها K. Pneumoniae, Enterobacter spp., Proteus spp, Micrococcus, Citrobacter S.epidermidis, kocuria kristinae, S.aureus , and Streptococcus spp. والطفيليات هي الاميبا الحاله للنسيج ثم الجيارديا اللامبيليا | In this study include (100) diabetic type (II) patients as diagnosed by Diabetolegist and 50 healthy control with an age range of (25 - 65 years) who attended to the two hospitals in Babylon : (Al - Qasem and Marjan), during the period from January 2015 until June 2015. Shown that grams - negative bacteria constitutes 74% from the total isolates and were considered the predominant aetiological agent of DM compared to gram - positive bacteria which constitutes 26%. The most common bacterial isolates were E.coli followed by Klebsella Pneumoniae, Enterobacter spp, Proteus spp, and less common bacteria were Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Kocuria kristinae, Citrobacter, Micrococcus and Streptococcus spp, whereas the most common parasites were Entamoeba histolytica 55% and Giardia lamblia 45%.The virulence factors of common bacterial isolated from diabetes Mellitus type II in this study are studied. The capsule was present in all Klebsella pneumoniae isolates, Enterobacter isolates and some isolates of E.coli, whereas the other bacteria such as Proteus mirabilis isolates in this study does not possess the capsule. Colonization factor antigens were detected; The CF - I and III were detected in mostly bacterial isolates which showed positive results with these factors. All isolates of Staphylococcus aureus bacteria were able to produce coagulase which is considered as a virulence factor for pathogenicity of these bacteria. All isolates of Staphylococcus aureus and E. coli expressed β - hemolytic (complete lyses), while all isolates of Streptococcus were α - hemolytic pattern (incomplete lyses) showing a greenish line around the bacterial colonies. All isolates of Staphylococcus epidermidis and some isolates of Proteus spp. were γ - hemolytic (non hemolytic). In the present study the siderophore synthesis was investigated among bacterial isolates and the results showed that all bacterial isolates (E. coli and K. pneumonia), and mostly of isolates of Enterobacter spp. and Proteus spp. were able to synthesis siderophore. Some isolates of Proteus mirabilis and Enterobacter spp. were positive for gelatinase reaction, while all isolates of Klebseilla pneumoniae and mostely E.coli were negative for this factor. The results of lipase production test in G - ve showed that most isolates were positive to lipase production test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were account for (50%) while there is no isolates that express non - biofilm formation. Regarding the virulence factors of common bacterial isolated of non - diabetes Mellitus have rare virulence factors.The results of Immunological parameters (C3, C4, IgA, IL4, and IL6) for DM patients were studied. In this study the levels of C3, IgA, IL4, and IL6 for DM patients were decreased, whereas the level of C4 was increased. In light of the results documented in this study, we can conclude the following; the types of bacteria which isolated from diabetes mellitus type II from the most to least common are E.coli followed by K. Pneumoniae, Enterobacter spp., Proteus spp., S.aureus, S.epidermidis, kocuria kristinae, Citrobacter, Micrococcus, and Streptococcus spp. And parasite : Entamoeba histolytica and Giardia lamblia isolated from diabetes mellitus type II. Most bacterial isolates in this study have the ability to possess more than one virulence factor such as capsule, siderophors, lipase production, hemolysin, extracellular protease, adherence factors, and biofilms to produce infection in diabetes mellitus type II patients. The virulence factors of common bacterial isolated in non - diabetes mellitus have rare virulence factor. The levels of Immunological parameters of C3, IgA, IL4, and IL6 for DM patients were decreased, whereas the level of C4 was increased.

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Porphyromonas gingivalis المعزوله من المرضى المصابين بامراض اللثه == Molecular and Bacteriological Study of Porphyromonas gingivalis Isolated from Patients with Periodontitis

اسم المؤلف: فاطمة مالك عبود
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | الهام عباس بنيان
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 103عينة من الصفيحة الجرثومية العميقة (subgingival dental plaque) من المرضى الذين يعانون من التهاب اللثة المزمن والمتقدم (72, 31) على التوالي لمراجي العيادة الاستشارية لامراض اللثة في كلية طب الاسنان/ جامعة بابل والمركز التخصصي لطب الاسنان في مدينة الحلة. للفترة من كانون الاول 2013 الى حزيران 2014. تم تشخيص وعزل بكتريا P. gingivalis بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية واظهرت النتائج ان 69.5%) 16) منها تم عزلها من التهاب اللثة المزمن وتم عزل 7 (30.5) من التهاب اللثة المتقدم باستخدام التنمية على الوسط الانتقائي الخاص لهذه البكتريا. وكذلك تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي باستعمال المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA حيث اظهر ان12 عزلة من اصل 23 عزلة تم تشخيصها بشكل نهائي انها تعود لبكتريا P. gingivalis. منها حوالي 8 تعود الى التهاب اللثة المزمن و4 تعود الى التهاب اللثة المتقدم. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا للالتصاق(adherence ability) بالخلايا الطلائية المبطنة للفم حيث وجد ان جميع العزلات لها القابلية على الالتصاق بهذه الخلايا وتم ايضا اختبار قابليتها على انتاج انزيم (Gingpain) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم.في هذه الدراسة تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية(Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate test (TCP) اذ كانت مكونة للاغشية الحيوية بنسبة 100% وكذلك تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على انتاج biofilm ووجد ان اعلى تثبيط سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير Clove مقارنة باقل تاثير لمادة السعد ((Cyprus rotundus. وكذلك تم الكشف عن حساسية العزلات لبعض المضادات الحيوية ووجد بان كل العزلات كانت حساسة الى Co - amoxiclave وعلى العكس اغلب العزلات تظهر مقاومة عالية لل Amoxicillin بينما سجلت مقاومة قليلة جدا لل Ampicillinو Metronidazole(16.3%, 20.3%, ) على التوالي. واخيرا تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على تثبيط نمو هذه البكتريا وتوضح النتائج ان اعلى تاثير سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير القرنفل(Clove) mm) 25,30,40) على التوالي مقارنة باقل تاثير لمادة السعدC. rotundus (10mm) .في هذه الدراسة ايضا تم التحري عن التغاير الجيني ((TLR - 4 Polymorphisms باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم ((PCR - RFLP. وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Thr399Ile : CC وCT وTT ، اذ بلغت نسبة انتشارها ((12.5%,10%,77.5% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة TT,CCوبنسبة انتشار(36.6% ,63.4%) على التوالي ، فيما بلغت نسبة انتشار الاليلC السائد في المرضى 82.5 % بالمقارنة للسيطرة 63.3% مع وجود اختلاف معنوي. وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA وAG وGG وبنسبة انتشار % 67.5 و12.5% و20% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة GG, AA وبنسبة انتشار34.4%) 66.6%,) على التوالي. حيث سجلت نسبة انتشار الاليل A السائد (73.75%) في مجموعة المرضى بالمقارنة بمجموعة السيطرة (66.6%) وبفرق معنوي. | In this study, 103 clinical samples were collected from subgingival dental plaque of patients with chronic (CP) and aggressive periodontitis (AP) (72 and 31) respectively, and (n=30) a healthy group admitted to teaching Hospital in college of Dentistry / Babylon University and specialized center of Dentistry in Hilla city, From February 2013 to June 2014). Out of which (n=40) with a chronic periodontitis group from them blood sample were collected for detection of gene polymorphisms in Toll - like receptor - 4 (TLR - 4). These dental plaque samples were subjected to different methods for identification of P. gingivalis mainly traditional bacteriological method. It was found that 23 P. gingivalis isolates were recovered by using selective media where 19 isolates (26.3%) obtained from (CP) and 4 isolates (12.5%) from (AP). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA gene as a genetic marker for confirmation of detection of P. gingivalis isolates, 12 isolates of P.gingivalis out of 23were detected by molecular method focusing on the role of 16s rRNA gene of P. gingivalis. 8 isolates were isolated from CP, and 4 isolates were isolated from AP subgingival plaques. In addition, these 12 isolates were investigated to detect Adherence of P.gingivalis to oral epithelial cells. The result showed that all isolates have ability to adhere to oral epithelial cells. The study also detected the ability of this bacteria for production of Gingipain, it was found that all isolates were positive for this enzyme at a rate 100%.Furthermore, biofilm formation was tested in the semi quantitative microtiter plate test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were accounted for (50%) while there are no isolates that express non biofilm formation.Regarding to effect of Chlorhexidine (CHX) gluconate (0.12%) on biofilm formation, the results of this study demonstrated (CHX) effectively and reduced the viability of biofilm - forming bacteria from moderate to 25%, weak to 75% and no strong. The study was also evaluating the effect of some plant extracts on biofilm formation. The results showed the highest effect for Alum potassium phosphate followed by Clove, in contrast to lowest effect of C. rotundus. And after screening the effect of Flagyl solution on production of bacterial pigment. The results showed that the metronidazole produced the highest inhibition activity range (30 - 10mm). Furthermore, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics had been investigated and it had been found that all isolates were sensitive to co - amoxiclave and, in contrast, the isolates showed high resistance to other type of beta lactam such as amoxicillin (54.3%). In addition, the result showed that the resistance of p. gingivalis was very low for ampicillin and metronidazole (16.3% and 20.3%), respectively.The screening of antimicrobial activity of (CHX) gluconate (0.12%) was carried out and the results showed that it produced the highest inhibition activity whether against p. gingivalis with inhibition zone range 40 - 15mm. Finally in vitro antibacterial activity of Alum, Clove and Cyperus rotundus plant extracts was studied and the results revealed that all tested isolates were inhibited by aqueous extracts at 50% concentration. The maximum inhibition zone was observed in Alum and Clove extracts respectively (30mm, 25mm), compared to the minimum inhibition by Cyperus rotundus (10mm). The antibacterial actions of 20% concentration of plant extract gave lower inhibition zone than 50% concentration of that extract which represented by (19mm, 16mm, and 10 mm) of the previous three mentioned extracts. This study also aimed to investigate the association of Thr399Ile and Asp299Gly single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the (TLR - 4) with the incidence of (CP).The results revealed at the site of SNPThr399Ile, there were three genotypes for this SNP among CP patients; CC, CT and TT with frequency of 77.5%, 10% and 12.5 % respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; CC and TT with frequency of 63.4% and 36.6% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele C (dominant) was higher among CP group (82.5%) than control (63.3) with significant difference. The site of SNP of Asp299Gly also showed three genotypes among CP patients; AA, AG and GG with frequency of 67.5%, 12.5% and 20% respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; AA and GG respectively with frequency of 66.6 and 34.4% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele A (dominant) was higher among CP group 73.75 % than control 66.6%.

دور السايتوكينات المعزولة من انسجة المشيمة المغذية للجنين لدى النساء مع الاجهاض التلقائي == The role of cytokines isolated from feto - placental tissues in women with spontaneous miscarriage

اسم المؤلف: ميسلون عبد الحميد ناصر
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية (172( امراة، تتراوح اعمارهم بين 16 - 41 عاما، من المرضى الذين قدموا الى مستشفى الولادة والاطفال في البصرة بسبب الاسقاط التلقائي غير الكامل في الشهور الثلاثة الاولى من الحمل ، بالاضافة الى النساء مع الحمل الطبيعي في وقت الولادة خلال الفترة من شباط 2012 الى ايار 2014 وتم تقسيمهن الى 3 مجموعات :  المجموعة - ا : وشملت )65) من النساء مع الاجهاض التلقائي المتكرر (RSM) خلال الاشهر الثلاثة الاولى، مع متوسط العمر (25.2 ± 7.28) سنة. المجموعة - ب : وشملت (36) من النساء مع الاسقاط التلقائي غير الكامل في الاشهر الثلاثة الاولى من الحمل ولها على الاقل ثلاثة مرات حمل طبيعي سابق (الاجهاض التلقائي غير المتكرر ( non - RSM بمتوسط من العمر (26.61 ± 6.97) سنة. المجموعة - ج : السيطرة (الحمل الطبيعي) : 71 امراة بمتوسط من العمر (26.17 ± 7.01) سنة. وتم الحصول على الدم الوريدي من المجاميع قيد الدراسة من اجل البحث عن المضاد المناعي م وج الخاص بمقوس قوندي , IgM ) IgG (. والتشخيص المصلي للاصابة بمقوسات قوندي يستخدم على نطاق واسع لفحص النساء الحوامل والمجهضات. كان معدل حدوث داء المقوسات (38.4٪) التي وجدت في 101 مجموعات الاجهاض التلقائي بواسطة فحص (ELISA). اظهرت عينتين (3.08٪) نتائج ايجابية المضاد المناعي (م). بينما كانت 24 (36.92٪) عينة ايجابية للمضاد المناعي (ج) لمقوس قوندي في مجموعات المرضى , بينما لم تسجل اصابة في 71 امراة من مجموعة السيطرة . غالبية النساء المصابة (50٪) في سن (30 - 39) سنة في حالة المضاد المناعي (ج)، في حين ان (10.26٪) في سن (20 - 29) سنة في حالة من المضاد المناعي (م).والنتائج كشفت عن ان اعلى نسبة للاجهاض التلقائي لوحظت في نساء الارياف . وفي الوقت نفسه، تم جمع نسيج الارومة المغذية للجنين خلال عملية الكشط والدم الوريدي للكشف وتقييم السيتوكينات المضادة للالتهابات (IL - 4، IL - 6، IL - 10) والسيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2،عامل نخر الورم - الفا TNF - α، - γ IFN) وقياس تركيزها باستخدام فحص انزيم مرتبط البلمرة المناعي ، تبين تركيز عال (49.97 ± 8.82، 180.7 ± 15.03، 94.34 ± 7.68) للسيتوكينات في الارومة المغذية للجنين (IL - 4، IL - 6، IL - 10 على التوالي) في حالة مجموعة السيطرة بالمقارنة مع مجموعات المرضى وتم الكشف عن نتيجة عكسية في مصل الدم ، في حين ان التراكيز عالية من السيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2، TNF - α، IFN - γ) كانت (134.17 ± 24.37، 432.16 ± 51.7، 100.46 ± 9.94 على التوالي) في حالة مجموعة الاجهاض التلقائي المتكررRSM)) بدلا من مجموعة السيطرة ومجموعة الاسقاط التلقائي غير المتكرر RSM - non مع وجود اختلافات معنوية كبير.p<0.001 وقد تبين في الدراسة الحالية وجود علاقة واضحة بين مناعة الامهات نوع TH2 والحمل الطبيعي، في حين يرتبط رد فعل جهاز المناعة نوع TH1 بفقدان الحمل. والتوازن الدقيق بين السيتوكينات الناتجة عن TH1 / TH2 ممكن ان يمنع خمج مقوسات قوندي . الذي يرتبط مع الانتاج الكبير من TH1 للسيتوكينات الموالية للالتهابات.وعلاوة على ذلك نتائج حساب مستويات CD44، اظهر فرقا معنويا عاليا p<0.001 في حال مقارنة بين مجموعة السيطرة والمجموعتين من النساء المجهضات . وهكذا تم تسجيل ارتباط CD44 مع فعالية خلايا TH2 ؛ لذا فمن المرجح انه قد يكون هناك وجود علاقة بين الحمل الطبيعي وكثافة CD44 على سطح الخلية

تقويم فعالية الخميرة Candida albicans من المسح المهبلية للنساء في حيوية النطف واحداث العقم

اسم المؤلف: رقية يحيى عبد الشهيد الطفيمي
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري | فارس ناجي عبود الهادي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study aimed to identify some of the molecular dynamic qualities and the type of Candida albicans and determine its virulence factors using some of the phenotypic and molecular techniques and their impact on the semen and causing infertility.The collection of 173 swab of the vagina and the cervix was where 97 women from women with primary infertility, including 78 women with positive and 19 women with a scanning negative.kmaamlh control and 76 women with secondary infertility, including 49 with positive screening women and 27 women with a scanning negative.kmaamlh control, women who Rajan unit infertility in Babylon, a maternity hospital and children and private clinics in the province of Babylon.The use of agricultural methods to isolate and diagnose 127 isolation dating back to Candida vaginal as well as the use of CHROMO agar medium test and test tobacco Agar to distinguish between certain types of Candida, was detected on some virulence factors such as the composition of the Germ tube and spores Alclamadah and production of enzymes case of fat (Alphusfullaypez) and the formation of membrane It was vital to draw your DNA candidiasis and the use of PCR technique where the starters used by the general whiteners, especially for the purpose of diagnosis isolates of Candida albicans and genetic profiling of yeast Candida depending on the variation in the ITS region area. Showed isolate and diagnose types of eggs in women with infertility initial results of 48 women infected with C.albicans by (61.53%), while 30 women is infected Non - C.albicans by (38.46%) either in women with secondary infertility showed the 29 women infected with C.albicans by ((59.18% and 20 women is infected non - C.albican by (40.81%). the results showed the center CHROMO agar medium isolates of Candida species C.albicans was once a green color and isolates C.tropicalis with blue color and with C.krusei color pink and showed C.glabrata violet and C.parapsilosis that showed white.And C.albicans isolates showed C.albicans result is positive for the production of germ tube and spores Alclamadah as well as the center of tobacco Acar which they appear yeast C.albicans white colonies free of filamentous structures, a test of this kind without other types of Candidapositive test.. While the production of enzymes showed a case of fat test (Alphusfullaypez) as a result of the positive isolates C.albicans and C.krusei The results showed that the incidence of candidiasis in women with infertility first was more ratio than the unemployed in secondary infertility. It was the incidence of type C.albicans is the largest in all of the women with primary infertility and secondary infertility women initial rate of 61.53% and 59.18%, respectively, followed by injury type C.glabrata by 17.9% in women with infertility first and 18.36% in secondary infertility. Distributed cases of four age groups and was the highest rates (47.91% (in women with infertility and the first (55.17%) in the women's secondary infertility is located within the age group (30 - 21) years old. In the case of a period of infertility and distributed cases into three periods and was the highest rate of infection is the period (5.1), where the percentage (81.81%) in infertile women was less than the rate of infection is the period (15 - 11), where the ratio of (6.49%) in infertile women. The results showed that the rate of infection C.albicans were higher in women with and who not to say on treatment by (65.33%) of either women with and who took up treatment (53.84%). As well as the incidence is higher in women infertile is Mentzmat appeared menstrual cycle by (63.75%) The women infertile women with regular menstrual cycle and to have a lower rate (55.31%). The incidence of rural women by (67.56%) higher than the women of the city that are represented (58.49%).It was three concentrations preparation 3×107, 5× 107, 7×108cfu/ml of all isolated from C.albicans and raw leach ate Khmer and observe their effect on semen and then finding the value of MED50 effective dose)) concentrations C.albicans way to draw a dose - of responsiveness was found that the concentration curve (107× 5 cfu/ml) top influential focus on movement and Sperm Viability. It was the influence of the C.albicans test on semen Concentration 107× 5cfu/ml over time (after 30 - 60 minutes) and a leaky yeast and after the screening device Alkazh Computer aided sperm analysis (CASA) where he found the impact of the C.albicans on sperm movement, Rapid progressive (a), Slow progressive (b) and Sperm Viability (V) over time after the text of the clock and watch.The pair initiator year ITS4 - ITS5 in the diagnosis of all isolates representing the total isolates succeeded as a return to form of the genus Candida spp. Where the results of the polymerization 520 bp. The pair initiator Specialist in the diagnosis of Candida yeasts belonging to the type C.albicans and succeeded when he polymerization products 344bp, while the rest of the species is C.albicans did not show any polymerization products.Showed genetic profiling products for the ITS using a pair of initiator ITS3 - ITS4 where showed variation in the ITS region area for the pair in the public initiator profiling C.albicans under study

دراسة تاثير البروبايويك في تكوين الغشاء الحيوي وانتاج البروتيز لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من اخماج الحروق والجروح == Study The Effect of Probiotic On Biofilm Formation And Production Protease Enzyme By Pseudomonas Aeruginosa Isolated From Contaminated Burns And Wound

اسم المؤلف: علا عبد الكريم كاظم النعيمي
اسم المشرف: منيرة جلوب اسماعيل العبادي | ضيماء محمود ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: he study includes the collection of 70 burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2013 to February 2014. 2) 31 isolates characterized as Pseudomonas aeruginosa 9 (45%) from wound and 22 (78.57%) from burn swabs, depending on the characteristics of the colonies phenotypic and microscopic when grown in differential selective media, as well as biochemical tests todiagnose isolates, Then the identification of these species were confirmed by using the system (GN I Card) using Vitek 2 device complementary step.3) The study includes sensitivity test towards 16 antibiotics for each species by using the system (AST Card) using Vitek 2 device, and the isolates ware Multi drug resistance, As results all isolates were resistant by 100 % for each of Piperacillin, Ticarcillin, Ticarcillinclavoulanic acid, Cefazolin, Ceftriaxone and Tigecycline. All strains were less resistance to Ceftazidime with percentage 50%. 4) All the isolates of Pseudomonas aeruginosa with percentage %100, have ability to produce protease enzyme.5) This study was use tow methods of biofilm formations seen in P. aeruginosa, Micro - titer plate method (MTP) and Tube method (TM), Results revealed that MTP was found to be more sensitiveand specific method for biofilm detection than TM. 6) Well diffusion method revealed the inhibitory effect of bacteria Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus rhamnosus GG and its supernatants in the growth of bacteria Staphylococcus aureus and P. aeruginosa, and was the supernatant of L. rhamnosus GG isthe largest inhibitory effect on the growth of S. aureus and P.aeruginosa with inhibition diameter 32 and 34 mm respectively, while the inhibition of growth by supernatant of L. acidophilus diameter 25 and 27 mm respectively. 7) Estimated the amount of protein in each of the biosurfactant and bacteriocine producers of L. rhamnosus GG bacteria concentration of 74, 54 Mg/mL respectively, while their concentration in bacteria L. acidophilus 44, 40 Mg / mL, respectively.8) Found that the bacteriocine product of bacteria L. rhamnosus GG and L. acidophilus GG have inhibitory effect on ability of P. aeruginosa to produce the enzyme protease, and the absence of this effect in the Biosurfactants the product of these two types.9) The biosurfactant product from L. rhamnosus GG showed inhibitory effect greater than the effect of the biosurfactant product from L. acidophilus to inhibition (production of biofilm and adhesion to epithelial cells).10) studied the suspension's effect of L. acidophilus and L. rhamnosus GG in contrived injuries wounds in mice contaminated with P. aeruginosa, Positive results have been shown to be affected by the contaminated bacteria injuries wounds.

التحديد الجزيئي لبعض عوامل الضراوة في بكتريا Klebsiella spp المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Molecular Identification of Some Virulence Factors In The Bacterium Klebsiella Spp Isolated From Different Clinical Sources

اسم المؤلف: فرقد حسن فليح
اسم المشرف: بهيجة عبيس حمود الخالدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: القادسية
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (150) عينة من المرضى المراجعين والراقدين في مستشفى الديوانية التعليمي والذين يعانون من اصابات مختلفة وللفترة من 1/كانون الاول/2013 ولغاية 1/نيسان /2014 وتضمنت هذه العينات ماياتي : (50) عينة حروق وجروح، (50) عينة ادرار و(50)عينة قشع من المرضى المراجعين | One hundred fifty samples were collected from patients admitted in Al - Diwaniyah Teaching Hospital and suffering from various injuries and for the period from 1 / December / 2013 and up to 1 / April / 2014 these samples in clude : (50) sample burns and wounds, (50) urine and (50) sputum.The results showed that 90 samples (60%) of the total number gave is positive result for the growth.the bacterial isolates were distributed among 35 samples (70%) of burns and wounds, (33) the sample (66%) from urine and (22) sample (44%) from sputum After biochemical and cultural test found that 99 isolate belonging to Different Genus and species of bacteria these isolates include 40 isolate (44.44%) bound and wound isolates Staphylococcus sp was the predoniant in these samples by rate (42.5%), 36 isolate(40%) E.coli was most isolate by rate 50% in urine sample and 23 (25.5%) Klebsiella pneumonia was the most common isolate by rate (78.26%) in these putum.. Sensitivity test results of antibiotics showed that most of the isolates have high resistance against antibiotics used in the study and the most isolates possess multiple resistance (Cross resistance) as shown resistance to most of antibiotics that used in these study. All asolates (% 100) were resistant to nitrofurantin and Tetracycline while(95%)is resistant to ampiciline (90%) of isolate were resistant to thired generation of cephalosporins (ciprofloxacin and ceftazidime) and (%80) of isolate wereresistant to gentamicin and impeneme, finely (%80)of isolate were resistant to azetroname..The results of the molecular detection of genes uge and mag A gene in Klebsiella sp in the 16 (50%) of the isolates had mag A as the 8 (44.44%) of the isolates bacteria K.pneumonia carrier of mag A and 8 isolates of type K.oxytoca had of the gene above the gene uge was his appearance in the proportion of isolates (46.87%) as it appeared in 9 (50%) of the isolates K.pneumonia and 6 isolates (42.87%) of the isolates k.oxytoca..There were relationship between resistance of bacteria to antibiotics and possession of these genes

عزل وتشخيص البكتيريا Bacillus thuringiensis ودراسة تاثيرها في بعض المقاييس الحياتية لذبابة ثمار القرعيات (Diptera : Tephritidae) Dacus ciliatus == Isolation And Identification of Bacillus Thuringiensis And Studying Its Effects On Some Biological Parameters For Dacus Ciliatus (Diptera : Tephritidae)

اسم المؤلف: ادريس صالح جليل
اسم المشرف: عدنان نعمة عبد الرضا العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل البكتيريا Bacillus thuringiensis من مصادر بيئية مختلفة في محافظة ديالى وتشخيصها بالطرق الكيموحيويه والوراثية والجزئية، اذ جمعت 51 عينة من ترب مختلفة وهي(زراعية وحديقة وغير زراعية) وكذلك من الماء، من خمسة اقضية في محافظة ديالى (بعقوبة | This study included the isolation of pathogenic bacteria Bacillus thuringiensis from different environmental sources in Diyala province, diagnosis biochemical and genetic partial ways, Mar 50 samples collected from different soils, namely, (agricultural soils and garden soils and non - agricultural soils) as well as from the water, from five districts in the province of Diyala (Baquba, Khalis, Muqdadiyah, Khanaqin, Balad Ruz) for the period from 1 \ 9 \ 2014 to 20 \ 11 \ 2014. Showed the results of biochemical diagnosis and the presence of four samples and by percent 8% It was of a negative for transplantation bacterial and 46 sample growth by percent 92% It was of a growth positive for transplantation bacterial and found that 41 samples of which by percent 82% belong to the genus Bacillus and the species of Bacillus thuringiensis and the percentage of bacteria isolated of agricultural soils 94% and soils garden 93% and water 75%, and soils non - agricultural 44%. The pathogenic bacteria Bacillus thuringiensis of positive bacteria a gram dye and spore forming and The most of the natural habitat this bacterium is soil and it is capable of producing the diversified varieties of crystalline proteins with insecticide property. All isolates were tested for this bacteria that which were able growth on the media selective Acetate Sodium Selective and the production of insecticidal crystalline proteins (ICP) When staining by dye Coomassie brilliant blue (CBB) to conduct genetic partial diagnosis using several extraction (Mini gDNA Bacteria kit) processed by Bioneer company was the purity of DNA extracted ranging between (20.1 - 1.22) for all selected isolates, have been diagnosed with the bacteria at the level of genus and species Using the gene 16S rDNA with a molecular weight of 380 base pairs where the results showed polymerase chain reaction (PCR) that all isolates contain this gene and the same molecular weight which is 380 base pairs, also was diagnosed isolates containing the gene component crystalline proteins which cry a e molecular weight 200 base pairs using primer a specialist for this gene in polymerase chain reaction showed the results of gene doubled that all isolates contained the gene and the same molecular weight of 200 base pairs. After making sure of pathogenic bacteria as belonging to the genus Bacillus and species Bacillus thuringiensis according to their chemical diagnostics biochemical and diagnostic genetic partial, attended different concentrations They (1, 2, 3, 4, 5) g/L of thebio preparation for these bacteria to study their impact on the different roles of Cucurbits fruit fly Daus ciliatus. Has been tested the effect of different concentrations of bio - preparation of these bacteria isolated from soil and water on the roles of this insect which eggs and larvae and pupa and AdultsThe results of test the effect of bio - preparation of these bacteria on the eggs of age (1 - 2) Since the highest rate of hatchling (3.2) and by (89%) at a concentration of 1 g / l of bio - preparation and lowest hatchling (0.6) and by (19%) at a concentration of 5 g / L of bio - preparation comparison with control (3.2) and by (96%) for the isolated bacteria from soil Since the highest rate of hatchling (3.1) and by (92%) at a concentration 1 g / L of bio - preparation and lowest hatchling (2.1) and by (62%) at a concentration of 5, 4 g / L of bio - preparation comparison with control (3.2) and by (96%) for isolated bacteria from water, and on The last larval phase, The highest the value of the rate of highest (2.0) and by (99%) at a concentration of 5 g / L of bio - preparation and The less the value of the rate of loss (0.5) and by (26%) at 1g / L of bio - preparation concentration compared with the control treatment (0.07) and by (%3) for isolated bacteria from soil.reached its highest value the loss rate (1.2) and by (57%) at a concentration of 5 g / L of bio - preparation and less the value of the loss rate (1.0) and by (6%) at a concentration 1 g / L of bio - preparation comparison with control (0.07) and by (3%) for the bacteria isolated from water and on pupa age(6 - 7) day, reaching the highest rate of emergence of pupa (3.2) and by (92%) at a concentration of 1 g / L of bio - preparation and less the emergence of pupa rate (0.4) and (13%) at a concentration of 5 g /L of bio - preparation comparison with control (3.2) and by 96% for bacteria isolated from soil reaching the top of the emergence of pupa rate (3.1) and by (92%) at a concentration of 1 g / L of bio - preparation and less the emergence of pupa rate (2.1) and by (62%) at a concentration of 5 g / L of bio - preparation comparison with control (3.2) and by (96%) for bacteria isolated from water. and on kill adult, The highest killing rate for males (1.6) and by (32%) and females (1.5) and (30%) at a concentration of 5 g / l of bio - preparation and less killing of the male rate (0.5) and (10%) and females (0.4) and by (13%), comparison with control males (0.1) and by (2%) and females (0.1) and by (2%) for the isolated bacteria from soil. The highest kill the male rate (0.8) and by (32%) and females (0.7) and (30%) at a concentration of 5 g / L of bio - preparation, and less killing of the male rate (0.2) and (4%) and females (0.4) and by (13%) at a concentration of 1 g / L of bio - preparation comparison with control males (0.1) and by (2%) and females (0.1) and by (2%)for the isolated bacteria from water and one female productivity of egg reached its highest production rate eggs 84.5 eggs per female at a concentration of 1 g / L of bio - preparation, and less egg production rate of 54.5 eggs per female at a concentration of 5 g / L of bio - preparation comparison with control eggs productivity rate of 87.5 egg female for isolated bacteria from soil reaching its highest egg production rate (85%) eggs per female at a concentration of 1 g / L of bio - preparation, and less egg production rate (79.5%) eggs per female at a concentration of 5 g / L of bio - preparation, compared with treatment control productivity rate of whites (85.5%) eggs per female for isolated bacteria from the water

بعض المؤشرات المناعية عند مرضى الحروق في مدينة بعقوبة == Some Immunological Parameters In Burn Patients In Baquba City

اسم المؤلف: عبد الله خزعل محسن القيسي
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة في مختبرات مستشفى بعقوبة التعليمي التابعة لمحافظة ديالى خلال المدة الزمنية المحصورة من 1 /2014/10 الى 2015/ 7 /1 وتضمنت هذه الدراسة ثلاث مجاميع هي مجموعة المرضى تالفت من 70 شخصا من المرضى الراقدين في ردهة الحروق التابعة للمستشفى اعلاه بواقع | The study was conducted at Baquba teaching hospital in Diyala province during the period October 2014 - July 2015. The study included three groups, a total of 70 patients who were admitted at burn department they were 33 (47.14%) female and 37 (52.85%) male with age range from (1 - 60) year, 40 (57.14%) of 1 - 20 year, 25 (35.71%) of 21 - 40 year and 5 (7.14%) of 41 - 60 year, and three degrees of burns, 15 (21.42%) of the first degree of burn, 34 (48.57%) of the second degree of burn and 21 (30%) of the third degree of burn. The polices of the two people who did not suffer from any medical condition, the first group consisted of 30 people to 14 (46.66%) female and 16 (53.33%) male. And the second set especially cellular Dynamics consist of 10 people included 5 (50%) females and 5 (50%) male, note that sets the polices were distributed to the same age groups above. C - Reactive protein is positive measured effectively using latex examination and rely on the presence of altlasn from non existence, while conducted examinations alghlobulinat immuneglobulins IgG and IgM, and complement components C3 and C4 by single Radial Immuno diffusion and conducted tests kinematics cellular IL - 2 and IL - 6 using adsorption - linked immunosorbent assay technique. The results of the study showed significant difference when level (P < 0.05) for CRP value reaching up to his cause the immune index in patients group compared with the control group. While results of IgG concentration showed great differences at the level of (P < 0.01) in female patients with average (1103.02 mg/dl) and males average (1136.05 mg/dl) compared to the control group females average (977.90 mg/dl) and males average (1038.00 mg/dl). While results of IgM concentration showed great differences (P<0.01) in female patients with average range (242.84 mg/dl) and males average (233.50 mg/dl) compared to the control group females average (124.37 mg/dl) and males an average of (93.10 mg/dl). While results of C3 concertration showed significant differences (P<0.05) in female patients with average range (94.87 mg/dl) and males an average of (131.40 mg/dl), compared to the control group females average (98.6 mg/dl) and males average (93.10 mg/dl). While the results of C4 concentration showed significant differences (P<0.05) in female patients with average range (41.31 mg/dl) and male average (37.78 mg/dl) compared to the control group females average (24.62 mg/dl) and males an average of (25.50 mg/dl). The results of IL - 2 concentration showed great differences (P<0.05) in male patients only average (30.16 pg/ml) compared to the control group average of (29.66 pg/ml). While results of IL - 6 concentration showed significant differences (P<0.01) in female patients with average range (63.39 pg/ml) average male (66.47 pg/ml) compared to the control group females average (2.48 pg/ml) and males average (22.80 pg/ml). Moreover the results of immunological indices the significant differences between age groups and burning scores of people with burns in comparison with the control group
1 ... 4 5 6 7 8