عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 2,012

انتشار ودراسة التضاد لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من فتحتي المنخرمن طلاب المدارس في محافظة ميسان == Prevalence and Study the Antagonism of Staphylococcus aureus Isolated from Nares of School Children s in Maysan Governorate

اسم المؤلف: فاطمة يوسف موسى المحمداوي
اسم المشرف: امال عباس محمد الفخري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الدراسة الحالية تضمنت جمع 500 مسحة جمعت من انوف طلاب المدارس الابتدائية في محافظة ميسان للفترة ( من تشرين الاول لسنة 2014 الى ايار لسنة2015 للفئة للعمرية 6 - س11 سنة ) للتحري عن حاملي المكورات العنقودية الذهبية اخذت العينات من 8 مدارس ابتدائية (4 مدارس من المناطق الريفية و4 مدارس من المناطق الحضرية). شملت العينات الماخوذة 230 عينة من الذكور و270 عينة من الاناث . وكذلك تم التحري عن البكتريا والاعفان التي قد تكون موجودة في الانف والتي قد تقلل من نسبة تواجد بكتريا المكورات العنقودية الذهبية في الانف. وقد استخدمت الطرق المختبرية القياسية في تشخيص هذه البكتريا وتم التاكيد باستخدام نظام API 20 .Vitick 2Compact system, وقد اظهرت النتائج ان 140 (28%) عزلة من العينات المدروسة ( 5841.43%)) عزلة اناث و82 ) (58.57عزلة ذكور) هي من النوع المكورات العنقودية الذهبية الموجبة لانزيم التجلط Coagulase Positive Staphylococcus aureus (CoPS).ولمعرفة ما اذا كانت الظروف المعيشية(الريف والمدينة) تؤثر على معدل حمل S.aureus في مناطق الريف والمدينة في محافظة ميسان تم استخدام اختبار مربع كاي حيث عكست نتائج التحليل ان هناك فروق معنوية جدا وصلت الى X2 = 34.747 تحت احتمالية (P ≤ 0.01) بين حاملين ال S.aureus ضمن مناطق الريف والمدينة مما يعكس ان الظروف المعيشة مرتبطة بنسبة حمل هذه البكتريا.كما كانت نسبة الانواع البكترية الموجبة لصبغة غرام الاخرى هي : Staphylococcus epidermidis 226 (45.2 %) Streptococcus spp 176 (35%), Staphylococcus saprophyticus 9(1.8), Aerococcus viridians 4 (0.8)% , Staphylococcus haemolyticus 2(0.4). هذا وقد خضعت العينات الموجبة لانزيم التجلط الى اختبار الحساسية الدوائية بواسطة طريقة الانتشار بالاقراص وقد استعمل 18مضاد حيوي حسب المعاييرالمختبرية العالمية لعام 2012 حيث كانت نتائج الحساسية الدوائية كالاتي : (Methicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%),Amoxyllcin(63.5%), Cefixime (61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28%), Erythromycin(30%),Azithromycin (28.57%),Ciprofloxacin (17.85%) .Clarthromycin (12.17%), Tobramycin (9.28%) , Doxycyclin (7.10%), Vancomycin (5%), Amikacin (2.85%) ,Gentamicin (1.42%), Clindamycin (1.42 %), Levoflaxacin (0.0%), وقد اظهرت النتائج ان المضاد الحيوي Levoflaxacin هوالمضاد الاكثر فعالية بين المضادات المستخدمة فقد وصلت حساسية جميع العزلات الى( 100 %) بينما اظهرت العزلات البكتيرية مقاومة عالية لمضادات Beta - lactams . اجري الاختبارالتركيز المثبط الادنى Minimum Inhibitory Concentration (MIC) للعينات المعزولة بواسطة نظام الVitek 2 . بينت النتائج ان 8 ( 5.7%) عزلة هي من النوع الكورارات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin resist Staphylococcus aureus MRSA) ) حيث قاومت التركيز 0.5mg للمضادالحيوي Oxacillin . بالاظافة الى ذلك دلت نتائج فحص الحساسية بواسطة الفايتك احتواء هذه العينات المقاومة على البروتين المرتبط بالنسلين المحور 2 PBP واحتوائها على جين ال mecA . تناولت الدراسة ايضا عزل الاعفان الموجودة في الانف حيث تم دراسة 50مسحة وتم الحصول على الانواع الفطرية التالية ( Pencillium Spp, A niger. . A. terrus , Cladosporium Spp, Alternia Spp)) .كما وتم دراسة الفعل الثبيطي لرواشح هذه الاعفان على بكترياS. aureus اوضحت النتائج ان عفن ال Alternaria له القابيلة على تثبيط نمو بكتريا الS. aureus حيث بلغ معدل قطر التثبيط ( 24.67) ملم على التوالي , بالاظافة الى ذلك درس التاثير الثبيطي للبكتريا المتواجدة كنبيت طبيعي في الانف على بكتريا S.aureus حيث اختيرت بكتريا المكورات العنقودية البشرويةS.epidermidis حيث استخدمت طريقة الانتشار بواسطة الحفر well diffusion method لمعرفة تاثير الخلية البكتريا الكاملة وكراشح لهذه البكتريا ضد S.aureus لوحظ ان بكتريا S. epidermdis لم تبدي اي تاثير تثبيطي اتجاه الS.aureus سواء كخلية بكترية كاملة او كراشح لهذه البكتريا. بينما الكشف عن تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا S.aureus بواسطة epidermdis . S بواسطة استخدام جهاز Spectrophotometer اظهرت النتائج ان الامتصاصية بطول موجي 630 نانومتر فقد لوحظ انخفاض الامتصاصية من 0,022 لعالق بكتريا ال S.aureus مع سكر الكلوكوز بتركيز %0,25 المحضون لمدة 73 ساعة بدرجةحرارة 37 سيليزية الى 0,009 عند اظافة البكتريا المضادة S. epidermdis لعالق ال S aureus مع الكلوكو | The current study includes comprises 500 Nasal swab collected from the primary school students in the Maysan Governanat to investigate Staphylococcus aureus carriers for the period from (October to May 2014 - 2015 in the age group 6 - 11 years).The samples were taken from eight primary schools (4 schools from rural areas and 4 schools in urban areas),The samples taken include 230 sample from males and 270 sample from females, also to investigate for bacteria and fungi that may be present in the nose, which may reduce the percentage of the presence of the bacteria Staphylococcus aureus in the nose. The standard laboratory methods were used in the diagnosis of these bacteria and confirmed diagnosis using the API 20 system and the Viteck - 2 Compact System. The results showed that 140 (28%) isolates of the studied samples (58 isolated from females and 82 isolated from males) were Coagulase Positive Staphylococci(CoPS).To know whether that the living conditions (live in rural and urban districts) effect the rate of S. aureus carriers statistical analyses using chi square test for carriers in urban and rural districts revealed highly significant difference X2=34.747 (P≤0.01)which indicated that the living conditions and the rate of carriers are related.The proportion another gram positive bacteria were Staphylococcus epidermidis226(45.2%),Streptococcus spp176(35%),Staphylococcus saprophyticus 9(1.8%) Aerococcus viridians 4(0.8%) and Staphylococcus haemolyticus2(0.4).CoPS isolated were submitted to sensitivity test by kirpy - Bauer Disk diffusion method according to CLSI, 2012,18antibiotic has been used and the resistance rates ethicillin(100%),Cefoxitin(95%),PenicillinG(94.28%)Amoxycllin(63.5%),Cefixime(61.42%),Oxacillin(57.85%),Tetracycline(34.28),Erythromycin(30%),Azithromycin(28.57%),Ciprofloxacin(17.85%)Tobramycin (9.28%),Doxycyclin(7.10%),Vancomycin(5%)Amikacin(2.85%),Gentamicin 1.42%, Clindamycin (1.42 %), and Levoflaxacin (0.0%).The results showed that the antibiotic Levoflaxacin was the most effective antibiotic among them all isolates were a sensitive and reached to (100%) while most the isolates showed high resistance to Beta - lactame antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) was used by Vitek 2 system showed that 8 isolates of (5.7%) samples were Methecillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA)were they resisted to the minimum inhibitory concentration 0.5 for the antibiotic Oxacillin as well as the results of the examination sensitivity shown by Vitek 2 - System.These resistance isolates associated contain pencillin binding protein 2 PBP and contain the mecA gene.The study also included the isolation of Fungi from the nose, were the study showed 50 swabs got the following types (Pencillium spp, Aspergillus . niger, Aspergillus . terrus, Cladosporium spp, Alternaria spp).The inhibitory effect of the filtrates of these Fungi against S. aureus was studied, were results showed that the mold Alternaria spp only has the ability to inhibit the growth of S. aureus where average of inhibition zone reach to(24.67) mm in addition the present study include the control of S.aureus by the other bacteria which considered normal flora in the nose, Staphylococcus epidermidis selected for this purpose.Well diffusion method was used as Whole bacteria and filtrate for this purpose and results show that there are no inhibitory effect of S.epidermidis on S.aureus by this method. While biofilm formation of S.aureus was inhibited by S. epidermidis by detected using Spectrophotometer (360nm) results of the absorbency was decrease from 0.022 for suspension of S.aureus with glucose 0.25% incubated for 73 hour at 37 °C to 0.009 for suspension of antagonistic bacteria S. epidermidis added to the suspension of S. aureus and glucose 0.25% under the same condition and this indicate that the biofilm was inhibited by S.epidermidis

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين == Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

اسم المؤلف: شذى فارس طارق
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

انتاج الليفان من البكتريا المعزولة من تربة الجذور وتقييم العوامل المؤثرة على انتاجه == Levan Production by Bacteria Isolated from Rhizosphere Soil and Evaluation of Factors Affecting its Production

اسم المؤلف: سناء بشير كاظم
اسم المشرف: صفاء الدين احمد شنتر القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر منطقة التربة المحيطة بالجذور مصدرا مهما للعديد من الاحياء المجهرية مثل الفطريات والبكتريا والبكتريا الخيطية. في الدراسة الحالية، تم عزل البكتريا المنتجة لليفان من التربة المحيطة بالجذور. حيث تم الحصول على 15 عينة من التربة المحيطة بجذور البقوليات ( الباقلاء واللوبيا ) خلال الفترة بين تشرين الاول 2014 الى كانون الثاني 2015، من ثلاث مزارع للبقوليات في ناحية كنعان، محافظة ديالى. تم عزل 52 عزله من بكتريا الجذور (الرايزوسفير) واختبرت لمعرفة قابليتها لانتاج الليفان وذلك بالاعتماد على نمو المستعمرات المخاطية عند تنمية هذه البكتريا على وسط الاكار المغذي الحاوي على السكروز. وقد اظهرت النتائج مقدرة 36 عزلة بكتيرية جذرية على انتاج الليفان من المجموع الكلي للعزلات. شخصت العزلات الاربع الاكثر كفاءة لانتاج الليفان ووصفت بواسطة الفحوصات المظهرية والبايوكيميائية القياسية والاختبارات على المستوى الجزيئي. تم اجراء التشخيص الجزيئي لهذه العزلات الاربعة باستخدام 16S rDNA والتي اظهرت ان طول تسلسل المنطقة كان (946، 1056، 1064و1154) زوجا قاعديا للعزلات (2، 3، 23 و33) على التوالي. ان محاذات التسلسل في بنك الجينات اظهر ان العزلات الاكثر كفاءة كان لديها نسبة عالية من التشابه (98، 96، 98 و99) % على التوالي وتبعا لاقرب جار تطوري لهذه العزلات, تم التعرف عليها تبعا لتتابع جين (16S rRNA) وتبعا للفحوصات الشكلية والكيموحيوية , وشخصت على انها (Brachybacterium phenoliresistens، Elizabethkingia anophelis، Arthrobacter globiformis، Pseudomonas brassicacearum) على التوالي. تم تشخيص الليفان المنتج من هذه العزلات الاربعة باستخدام تقنية TLC والتي اظهرت تكون الليفان من نوع واحد من السكريات الا وهو الفركتوز. وقد تم تشخيص الليفان المنتج بواسطة بكتريا B. phenoliresistens باستخدام تقنيتي FTIR وتقنية الرنين المغناطيسي النووي NMR. تحليل الليفان بواسطة هاتين التقنيتين اثبتت انتاج الليفان بواسطة هذه العزلة. تم دراسة تاثير العوامل الغذائية والفيزيائية على انتاج الليفان بواسطة العزلات الاكفا. كان مصدر الكاربون الامثل لانتاج الليفان بواسطة هذه العزلات هو السكروز، حيث كان انتاج هذه العزلات هو 7.88، 7.94، 7.8 و7.77 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis، A. globiformis ، P. brassicacearum على التوالي. تم استخدام اربع مصادر مختلفة للنايتروجين لمعرفة افضل مصدر نيتروجيني لانتاج الليفان. حيث كان الكازائين هو افضل مصادر النيتروجين لانتاج الليفان حيث كان انتاج هذه العزلات 8.12، 8.2، 8.24 و8.56 غم/لتر للعينات الاربعة على التوالي. تم استخدام تراكيز مختلفة للسكروز لانتاج الليفان حيث كان اعلى انتاج لجميع العزلات عند التركيز 300غم/لتر وكان الانتاج بواسطة هذه العزلات 7.97، 7.94، 8.06 و7.95 غم/لتر على التوالي. تم استخدام قيم pH مختلفة لمعرفة افضل اس هيدروجيني لانتاج الليفان حيث كان افضل اس هيدروجيني هو 7.8 لكل العزلات، وكان الانتاج 7.88، 7.94، 7.8، 7.77 غم/لتر على التوالي. فضلا عن ذلك، تم اختبار عدة ظروف مثل فترة الحضن المثلى، درجة الحرارة، معدل الرج. كانت فترة الحضن المثلى للعزلة E. anophelis 48 ساعة حيث انتجت 8.46غم/لتر، في حين كانت 72 ساعة لباقي العزلات حيث انتجت 8.58، 8.53 و8.7 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens ، A. globiformis وP. brassicacearumعلى التوالي. درجة الحرارة المثلى لانتاج الليفان بواسطة العزلة B. phenoliresistens كانت عند 30 درجة مئوية حيث انتجت 7.87 غم/لتر، وكانت درجة الحرارة المثلى هي 33 درجة مئوية للعزلتين E. anophelis وA. globiformisحيث انتجت عندها 8.04 و8.6 غم/لتر على التوالي. في حين كانت درجة الحرارة المثلى للعزلة P. brassicacearum 40 درجة مئوية وكان انتاجها 8.24 غم/لتر. استخدمت ثلاث معدلات رج لمعرفة افضل معدل رج لانتاج الليفان. تم الحصول على اعلى انتاج لليفان عند معدل رج 150 هزه/دقيقه، حيث كان الانتاج للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis وA. globiformis هو 8.12، 8.54 و8.27 غم/لتر على التوالي. | The Rhizosphere zone is a narrow volume of soil which surrounds the plants roots and influenced by the activity and growth of the root. In the present study, Levan producing bacteria were isolated from rhizosphere soil, fifteen rhizosphere soil samples were obtained from the legumes roots cowpea and broad bean (Vinga unguiculata L. and Vicia faba) during the period from October 2014 to January 2015, which were collected from three legumes farms in Kana’an Village, Diyala Governorate. A total of 52 Rhizobacterial colonies were isolated, purified and screened for their ability to produce levan, depending on growing of mucoid colonies on sucrose nutrient agar. The results showed that thirty six isolates out of the total number of the isolates were identified as levan producers. The most efficient four isolates were identified and characterized according to standard biochemical and Molecular tests. The Molecular identification of these four isolates was carried out by using 16S rDNA, which resulted in sequenced region of 946, 1056, 1064 and 1154 base pair in length respectively. The sequence alignment in the gene bank indicated that the most efficient isolates (2, 3, 23 and 33) have high percentage of similarity (98, 96, 98 and 99 % respectively), in comparison with the retrieved consensus sequences. The closest phylogenetic neighbor for these isolates is predicted according to the 16S rRNA gene sequence, morphological and biochemical tests. These isolates were identified as (Brachybacterium phenoliresistens, Elizabethkingia anophelis, Arthrobacter globiformis and Pseudomonas brassicacearum) respectively. Levan production by these four isolates were characterized by using Thin Layer chromatography (TLC) technique, which revealed that levan is composed of only one sugar which is fructose. Levan produced by B. phenoliresistens was characterized by Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy techniques. The instrumental analysis indicated that Levan was produced by the selected isolate. The effect of some nutritional and physical factors were investigated on levan production by the highest four isolates. Sucrose was the best carbon source for levan production in all isolates that gave (7.88, 7.94, 7.8 and 7.77) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively. In addition, four nitrogen sources were used to identify the best nitrogen source for levan production. Casein was the best nitrogen source for all isolates that gave (8.12, 8.20, 8.24 and 8.56) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively,. Moreover, different sucrose concentrations were used to assess the best concentration for levan production. The highest levan yield by all isolates was at the sucrose concentration of 300 g/l, which gave (7.97, 7.94, 8.06 and 7.95) g/l respectively. Different pH values were also used to determine the best pH value for the levan production. The four isolates gave their highest levan production (7.88, 7.94, 7.80 and 7.77) g/l at pH 7.8. Further, conditions were examined like optimal incubation period, temperature and agitation rate. The optimal incubation period was 48 hs for E. anophelis that gave 8.46 g/l and 72 hs for B. phenoliresistens, A. globiformis and P. brassicacearum which gave (8.58, 8.53 and 8.7) g/l respectively. Whereas, the optimal temperature was 30ºC for B. phenoliresistens that produced 7.87 g/l , 33 ºC for E. anophelis and A. globiformis which gave (8.04 and 8.6) g/l, and 40 ºC for P. brassicacearum that gave 8.24 g/l. Three agitation rates were used to identify the best agitation rate for levan production. The highest levan production yield was obtained at 150 rpm by the isolates B. phenoliresistens, E. anophelis and A. globiformis which gave (8.12, 8.54 and 8.27) g/l respectively.

مقارنة تشخيصية جزيئية وبكتريولوجسة لبكتريا الزائفة الزنجارية المعزولة من مرضى السكري النوع الثاني وامراض اخرى == Comparison the Molecular and Conventional Identification of Pseudomonas aeruginosa isolated from Diabetes Type II and other Diseases

اسم المؤلف: سناء محمد حبيب الشمري
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Fifty clinical samples suspected as Pseudomonas aeruginosa were collected from patients with different diseases, diabetic foot ulcers, U.T.I., wounds, burns, keratitis, external otitis from September 2015, till February 2016, from hospitalized patients in four different Baghdad hospitals (Al - Kindi General Teaching Hospital, Al - Yarmuk General Teaching Hospital, Alkadhmiya General Teaching Hospital, and AL - Shiakh Zaied Hospital).The study population targeted both gender from different ages groups.The collected samples were cultured on different selective and differential media and tested biochemically in order to identify P.aeruginosa, then the identification was ensured by using two molecular methods which are conventional PCR in the detection of ecfx gene and 16SrDNA gene and real time PCR with commercial kit from sacace (qualitative detection of P.aeruginosa) and with gyrB gene using specific primers to each gene.Sensitivity for each test was measured then compared with other tests to determine the test efficiency. The results showed that the sensitivity for API20NE test was (80%), the sensitivity for molecular tests as flows : ecfx test was (92%), 16SrDNA test was (96%), the commercial kit test was (98%) and for gyrB test was (92%).The present study shows that using more than one target gene is reducing the probability of misidentification of P.aeruginosa that may be caused by variation in primer or probe targets.According to the type of infection the comparison was done. The results of P.aeruginosa detection for diabetic foot isolates were compared with other isolates. The results showed that there is a remarkabledifference in the API20NE test; as well as, with the oxidase test (according to the time that oxidase test need it to give the dark purple color as a positive result), for the mucoid strains of this bacterium. The results of detection isolates by using gyrB gene were differed too.Then a comparison in simplicity, cost, accuracy and time of P.aeruginosa identification between molecular methods and API20NE test (biochemical test) and between molecular tests themselves were performed. The results of these comparisons show that the molecular methods are better than API test in all aspects of the comparison. Real time PCR is better than conventional PCR in simplicity, accuracy and time but not in cost.All isolates were tested for antibiotic sensitivity using nine antibiotics. The results showed that most isolates were sensitive to Levofloxacin (94%), Ticarcillin - clavulanic acid (Timinim) (88%), Gentamicin (82%) and (80%) to both Pipracillin and Imipenem, while the isolates appeared resistant to another antimicrobials represented by (72%) to Augmentin, (34%) to Ceftazidime, (38%) to Colistin, and (28%) to Ciprofloxacin. In the present study, Levofloxacin represents the most effective antibiotic against P. aeruginosa isolates with the all types of infection.The present study improves the importance of the rapid and accurate detection of the bacterial types and thus giving the right antibiotics to patients to obtain rapid recovery and prevent any complications that may lead to death.

دراسة فسلجية وجزيئية للبكتريا Lactobacillus reuteri ATCC 23272 وتاثيرها التثبيطي على البكتريا المسببة لالتهاب المهبل == Physiological and Molecular Study of Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and its Inhibitory Effect on the Bacterial Vaginosis

اسم المؤلف: سارة هيثم صديق النعيمي
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Bacterial vaginosis which is a common infection affecting the female genital tract, can be treated with different methods. One of these methods is the use of probiotic Lactic acid bacteria. The aim of this study was to evaluate the effects of two physiological factors (temperature and pH) on the growth and inhibitory action of probiotic Lactobacilli against the pathogenic Streptococcus agalactiae involved in bacterial vaginosis.A total of one hundred and six vaginal swabs were collected from Iraqi women patients affected with bacterial vaginosis, who attend Gynecological Department of Kamal Al - Samarraiy Hospital, Al - Qanat health care center, and private specialized clinics from October 2014 till March 2015, in order to obtain one hundred Streptococcus species. These swab samples were examined directly at the first. Isolated microorganisms were identified through microscopical, morphological, biochemical tests, and Vitek 2 compact system.The results showed that out of 243 bacterial isolates, 146 (60.08%) were detected as Gram - positive bacteria, whereas 97 (39.91%) were detected as Gram - negative bacteria. A hundred (68.49%) isolates of the Gram - positive bacteria were catalase - negative, while the rest 46 (31.51%) were catalase - positive.For all Gram positive, catalase negative bacteria, the results of the biochemical test and Vitek 2 compact system showed that the most frequent isolated microorganism was Streptococcus agalactiae 57 (57%), followed by Streptococcus faecalis 19(19%), Streptococcus sanguinis 13 (13%),Streptococcus salivarius 6 (6%), Streptococcus ovis 4 (4%), and Streptococcus suis 1(1%).The molecular method using the PCR technique was performed on the most prevalent species Streptococcus agalactiae to detect its virulence factors in order to prove its pathogenicity, the results revealed that, the HylB gene which is responsible for the production of hyaluronate lyase, appeared in 56 out of 57 isolates of S. agalactiae and the CylE gene which is responsible for the hemolysis of the red blood cells, appeared in 53 out of 57 isolates. These virulent isolates were involved in the physiological study.Lactobacillus reuteri ATCC 23272 was used in this study to investigate its effect as probiotic bacteria on the pathogenic bacteria (S. agalactiae). It was cultivated in MRS broth, adjusted to specific initial pH (3.5, 5, 6.5, 8), and at different temperatures of incubation (25°C, 30°C, 37°C, 44°C).The results revealed that the temperature of incubation and the initial pH of the culture medium effected significantly on both the growth rate and the antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272. The temperature 30 °C with the pH 5 were recorded as the best conditions for the antibacterial activity in which the zone of inhibition was (18.2 mm), while the temperature 25 °C with the pH 3.5 resulted in the lowest inhibition zone (0.05mm).The maximum growth rate with an O.D. 1.9297 nm of the L. reuteri ATCC 23272 was obtained at temperature. 30°C and pH 6.5, and the minimum growth rate with an O.D. 0.0002 nm were obtained at temperature 25 °C and pH 3.5.There was a positive correlation between the growth rate of the Lactobacillus reuteri ATCC 23272 and the zone of inhibition.The optimal growth conditions were recorded in MRS broth, with an initial pH of 5 and a temperature of 30°C and this condition also had parallel effect on the maximum antibacterial activity of the L. reuteri ATCC 23272 against S. agalactiae associated with bacterial vaginosis.

تاثير المعززات الحيوية على الفئران المثبطة مناعيا بالبردنيزولون == Effect of Probiotics on Prednisolone Immunosuppressed Mice

اسم المؤلف: زينب كاظم عبد
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لمعرفة دور FOXP3 في الفئران المثبطة مناعيا بالردنيزولون اضافة الى دور المعززات الحيوية في الجهاز المناعي للفئران البيضاء. البردنيزولون هو عقار مثبط مناعيا يستخدم لعلاج حالات الحساسية وامراض المناعة الذاتية. المعززات الحيوية هي كائنات حية تستعمل لتعديل الجهاز المناعي في الانسان والفئران. FOXP3 هو دليل للخلية التائية المنظمة وله دور في الاستجابة المناعية.لذلك استخدمنا في التجربة 30 فار مختبري ابيض ذكر قسمت الى 6 مجاميع كل مجموعة تضم 5 حيوانات والتي جرعت يوميا لمدة 14 يوم : المجموعة 1 : جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالخميرة فقط. المجموعه 2 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.4 مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb لمدة 7 ايام مجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعة 3 : جرعت فمويا ب0.4مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من خميرة Sb وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط. المجموعه 4 : جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ثم حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة جرعت بالبكتريا فقط. المجموعه 5 : حقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone لمدة 7 ايام ثم جرعت فمويا ب0.6مل والتي تحوي (108×1) خلية\مل من بكتريا Ss لمدة 7 ايام ومجموعه السيطرة حقنت بالدواء فقط.المجموعه 6 : جرعت فمويا ب0.6مل من بكتريا Ss والتي تحوي (108×1) خلية\مل وحقنت تحت البريتون ب0.1 مل من 2.5غم\كغم عقار prednisolone معا في نفس الوقت لمدة 14 يوم ومجموعه السيطرة جرعت بالماء المقطر فقط . اوضحت نتائج الدراسة الحالية ارتفاع معنوي في العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء(10000.0 ± 275.4) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(7000 ± 145.07), واظهر العد التفريقي لها انخفاض معنوي في الخلايا اللمفية(23.0 ± 1.51) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((30.0 ± 1.65 وارتفاع معنوي في الخلايا العدلة(75.00 ± 3.59)مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (65.00 ± 2.31) وانخفاض معنوي في الخلايا الوحيدة(( 1.0 ± 0.06مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ±0.06) 3.0) وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة , حصل انخفاض معنوي في عملية البلعمه(15.0 ± 0.82) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(20.0 ± 1.4), وارتفاع غير معنوي في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة(40.0 ± 2.03) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة (36.0 ± 1.1), وزيادة غير معنوية في تركيز خضاب الدم(13.3 ± 0.76) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة ((11.6 ± (0.54 وكذلك زيادة غير معنوية في الوزن الكلي للحيوانات المعامله بالعقار فقط (31.0 ± 1.2) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة(30.0 ± 1.1) .واظهرت نتائج التجريع بالمعززات الحيوية (الخميرة والبكتريا) ارتفاع العدد الكلي لخلايا الدم البيضاء ,واظهر العد التفريقي لها ارتفاع الخلايا اللمفية والوحيدة وانخفاض الخلايا العدلة وليس لها تاثير على الخلايا العقدة والحمضة ,كذلك حصل ارتفاع في عملية البلعمة وارتفاع بسيط في نسبة خلايا الدم الحمراء المضغوطة . بينت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية في المجموعه المعاملة بالعقار فقط حصول فقدان بالشكل العام للعضو وعدم ظهور الحويصلات اللمفاوية وحصول تنخر في الطحال .واوضحت نتائج الفحص النسيجي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجموعه المعامله بالمعززات الحيوية احتفاظ العضو بالشكل العام وحصول ارتشاح للخلايا اللمفية وتحفيز الحويصلات المفاوية داخل العضو.كما اظهرت نتائج التجريع الفموي للمعززات الحيوية بعد وقبل ومع حقن الدواء حدوث حالة تحسسن بالمؤشرات المناعية وكذلك حدوث حالة تحسن وتنشيط مناعي للحويصلات اللمفاوية للطحال والعقدة اللمفاوية. واظهرت نتائج الفحص النسيجي الكيميائي المناعي للطحال والعقدة اللمفاوية للمجاميع المجرعه بالمعززات الحيوية والعقار ان لها نفس التعبير لل.FOXP3 اعتمادا على نتائج التجربة الحالية نستنتج ان المعززات الحيوية (الخميرة والبكتيريا) تمتلك قابلية على تعديل وتحسين تاثيرات العقار الجانبية على الاعظاء والمؤشرات المناعية وكذلك لها نفس التعبير لل.FOXP3 | Study have been done to see the role of FOXP3 in immunosuppressed mice using prednisolone in addition to the role of probiotic on immune system of albino mice. Prednisolone is immunosuppressive drug used to treat several allergic and autoimmune conditions. Probiotic is a live microorganisms used to modulate human and mice immune system.FOXP3 is Treg marker and have a role in immune system responses. Therefore we took 30 male albino mice were divided into 6 groups (five mice in each group) and treated daily for 14 days : Group 1 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days then injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 14 days. Group 2 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.4) ml S.boulardii for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14days. Group 3 : was administrated orally with (0.4) ml S.boulardii and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days.Group 4 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days then injected intraperitoneally with(0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days, control : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 14 days. Group 5 : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 7 days then administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days, control : was injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days. Group 6 : was administrated orally with (0.6) ml S.salivarius for 7 days and injected intraperitoneally with (0.1) ml of 2.5mg\kg prednisolone drug for 14 days, control : was administrated orally with normal saline only for 14 days. Mice treated with prednisolone drug showed a significant increase in total leukocytes count (10000±275.4)cells\1ml.blood as compared with negative control (7000±45.07)cells\1ml.blood, and differential count of leukocytes showed non - significant decrease in lymphocytes(23.0±1.51)cells\1ml.blood as compared with negative control (30.0 ±1.65)cells\1ml.blood, a significant increase in neutrophils(75.00±3.59) as compared with negative control(65.00 ± 2.31), a significant decrease in monocytes (1.0±0.06)cells\1ml.blood as compared with negative control(3.0 ± 0.06)cells\1ml.blood and have no effect on basophils and eosinphils, a significant decreased in phagocytosis(15.0 ± 0.82) as compared with negative control (20.0 ±1.4) , no significant increased Pcv (40.0±2.03) as compared with negative control (36.0±1.1) ,no significant increased Hb (13.3±0.76) as compared with negative control(11.6 ± 0.54) , and no significant increase in total body weight (31.0 ± 1.2)g as compared with negative control (30.0 ±1.1)g. The result of group treated with probiotic show a significant increase in total leukocytes, lymphocytes count, phagocytosis and Hb & Pcv as compared with control group administrated by normal saline only. The histological sections of spleen and lymph node which was treated with prednisolone drug revealed lose the architecture, no lymphoid follicles and necrosis. While the section of spleen and lymph node treated with probiotic showed preservation architecture which contain lymphoid follicles and hyperplasia of lymphocytes. The result of groups treated with probiotic pre, post, together with prednisolone drug showed normalized the immunological and histological parameters to the normal condition as compared with group treated with prednisolone only. The immunohistochemical section for spleen and lymph node show the same expression of FOXP3 in mice treated with probiotic (yeast & bacteria) and prednisolone drug. According to the results obtained from this study it is concluded that probiotic (yeast and bacteria) have immunomodulatory effect against prednisolone in immune system of male albino mice and have the same expression of FOXP3

استخلاص ، تنقية وتوصيف انزيم اللكنين بيروكسيديز المنتج من العزلة الفطرية المحلية Aspergillus terreus == Extraction, purification and characterization of lignin peroxidase enzyme produced from local fungal isolate Aspergillus terreus

اسم المؤلف: سحر غازي عمران عبد الواحد التميمي
اسم المشرف: ندى صباح رزوقي | غازي منعم عزيز
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل وتشخيص 18 عزلة فطرية محلية من 75 عينة روث خيول جمعت من نادي الجادرية ونادي العامرية للفروسية في بغداد خلال 8 اشهر للفترة من تموز 2013 الى اذار 2014 . سجلت العزلة A. niger اعلى نسبة ظهور بين العزلات واعلى تكرار % 80 %9.8, على التوالي تبعتها العزلة A.fumigatus (%9.8 , % 48) ثم العزلة A.terreus (% 8.2 , % 46.66) ، بينما سجلت العزلة Absidia cerymbifera اقل ظهور واقل تكرار(%3.28 , % 5.33) تبعتها العزلة Syncephalstrum racemosum ( % 2.67 و( %1.64 على التوالي. اختيرت العزلة A.terreus SG777 كافضل عزلة لانتاج هذه الانزيمات اذ سجلت اعلى فاعلية نوعية لانتاج الانزيمات المحللة للكنين ( لكنين بيروكسيديز 11.828 ، منغنيز بيروكسيديز1.131 واللاكيز 0.527) وحدة /ملغم . ثبتت الظروف المثلى لانتاج الانزيمات المحللة لللكنين من العزلة الفطرية A. terreus SG 777 باستخدام تخمرات الحالة الصلبة ( سيقان الموز كمادة اساس ، فترة الحضن 8 ايام ،حجم اللقاح1 × 105 بوغ / مل ، برقم هيدروجيني 4.5 وبدرجة حرارة 35م°). رسب انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع %80 ثم ازيل الملح من الانزيم المنتج من عفن777 Aspergillus terreus SG باستخدام طريقة النضح الغشائيDialysis تجاه المحلول الدارئ (Tris buffer) ونقي جزئيا بواسطة كروماتوغرافيا التبادل الايونيIon exchange chromatography باستخدام المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدد مرات للتنقية بلغ 5.4 مرة وبحصيلة انزيمية مقدارها %13.7اظهر الانزيم اعلى فغالية وثباتية عند الرقم الهيدروجيني 3.0 ,في حين اقصى فاعلية للانزيم ظهرت عند درجة حرارة 40 م° مع احتفاظ الانزيم بفاعليته عند درجات حرارة تراوحت بين 25) - 35 ) م°. درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة عدة صبغات واظهرت النتائج اعلى نسبة ازالة ( 83.61 %) للانزيم تجاه صبغة الكونغو الحمراء باستخدام 65.51 وحدة / مل منه وبفترة حضن 4 ساعات وتبعتها صبغة المثيلين الزرقاء بنسية تحطيم %58.6 ثم صبغة المثيل الحمراء بنسبة ازالة بلغت % 49.9.بينما سجلت الصبغات الملاكايت الخضراء ، الالورا الحمراء والتارترازين % 24.87 ,% 28.8 , %26 على التوالي كادنى نسبة تحطيم بوساطة الانزيم قيد الدراسة . درست قابلية انزيم اللكنين بيروكسيديز في ازالة المركبات الحلقية المتعددة التي تم الكشف عنها وذلك لمقارنة فاعلية الانزيم مع نتائج المعالجات في مصفى الدورة والتي تضمنت (المعالجة الميكانيكية، المعالجة الكيميوفيزيائية والمعالجة البايولوجية ) . اظهرت النتائج ازالة 97.54 % للمركب Di benzo (a ,h) anthrancene باستخدام 65.51 وحدة / مل من الانزيم قيد الدراسة وبفترة حضن 4 ساعات وبدرجة حرارة 40 م° في حين بلغت نسبة الازالة بوساطة معالجات المصفى % 54.37 كما بلغت نسبة الازالة لكل من Floureneو anthrancene قد بلغت % 95.98 و% 83.51 على التوالي مقارنة بنسبة الازالة %84.51 , % 46.83 بوساطة معالجات المصفى . قيد انزيم اللكنين بيروكسيديز باستخدام %2 وزن / حجم من الجينات الصوديوم و200 ملي مولار و50 من مل كلوريد الكالسيوم . بينت النتائج ان % 99 من فاعلية الانزيم الحر تم تقييدها .اجريت عملية خزن انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر لمدة اربعة اسابيع عند درجة حرارة 4 م° لمعرفة مدى احتفاظ الانزيم المقيد بفاعليته الانزيمية مقارنة بالانزيم الحر، اذ لوحظ ان الانزيم المقيد قد احتفظ % 88.29 من فاعليته الاصلية بينما احتفظ الانزيم الحر حوالي 66. 02 % من فاعليته الاصلية. استخدم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد والحر في تحطيم صبغة المثيلين الزرقاء ، اذ اظهرت النتائج ان نسبة التحطيم بالانزيم المقيد بلغت حوالي % 40.1 لفترة حضن 4 ساعات بينما بلغت نسبة تحطيم الصبغة حوالي % 25.79 باستخدام الانزيم الحر وبنفس فترة الحضن .حطم انزيم اللكنين بيروكسيديز المقيد حوالي% 57.89 من صبغة الكونغو الحمراء عند استخدامه لاول مرة ، وانخفضت قابلية الانزيم المقيد على تحطيم الصبغة الى 16.11% عند استعماله للمرة الرابعة. | Eighteen local isolates were collected from seventy five horse manure samples taken from horses in the Equestrian Club in Jadriya and Al - Amrya / Baghdad that were investigated during the 8 months; the period isolation was started from July 2013 to march 2014. Aspergillus niger was the highest occurrence and frequency (80% and 9.8 %) respectively, followed by A . fumigatus (48 % and 9.8 %) and A. terreus (46.66 % and 8.2 % ) occurrence and frequency respectively , whereas Syncephalstrum racemosum (2.67 % and 1.64%) respectively . The isolate A. terreus had the higher specific activity of ligninolytic enzymes (lignin peroxidase 11.828, manganese peroxidase 1.13 and laccase 0.53) U/mg. The optimum conditions of ligninolytic enzymes produced from A. terreus SG777 were estimated using solid state fermentation : banana stalks as a substrate, period incubation 8 days, moisture level 1 : 5 w/v inoculum size 1x105 spores /ml, pH 4.5 and temperature 35 °C. Lignin peroxidase produced from A. terreus SG777 precipitated with 80% ammonium sulfate saturation then desalting by dialysis against Tris buffer solution and partially purified by ion exchange chromatography using DEAE - cellulose. The specific activity reached 56.67U/mg with purification fold was 5.4 times and 13.7% recovery. The optimum pH for activity and stability was 3. The maximum activity was observed at 40°C and the enzyme maintained the activity when it was incubated at 25 - 35˚C. Lignin peroxidase removal the dyes during 4hr. Congo red was decolorized to the maximum extent of 83.61% in 4 hr by 65. 51 U/ml of the pure lignin peroxidase, methylene blue decolorized 58.6% and methyl red azo dye was decolorized to the extent of 49.9% ,while Malachite green triarylmethane dye, allura red and tartarazine showed minimum extent decolorized 26, 28.8 and 24.87% respectively. Degradation of poly aromatic hydrocarbons when incubated with 65.51 U/ml lignin peroxidase at 40 °C for 4 hr compared with the Refinery treatment . Results showed (97.54%) removal efficiency of Di benzo (a ,h) anthrancene by lignin peroxidase, while only 54.37% was treated by Refinery treatment. Flourene and anthrancene degradation 95.98% and 83.51% respectively, while the flourene and anthrancene degradation treated by Refinery treatment only 84.51% and 46.83% respectively. Lignin peroxidase immobilization by 2% (w/v) sodium alginate and 200 mM of calcium chloride. Results showed that 99 % from free lignin peroxidase was immobilized. The stability of immobilized and free Lip enzyme was studied during four weeks; remaining activity for immobilized Lip was 88.29 % from its original activity 76 U/ml during four weeks while free Lip remaining activity was 66. 02 % from its original activity (76.04 U/ml). Methylene blue dye degraded about 40.1% by immobilized Lip during four hr compared with free Lip which has removal only 25.79% from dye concentration. The immobilization lignin peroxidase removal 57.89 % from congo red in first use and then the immobilized lignin peroxidase ability reduced to 16.11% dye removal after four uses.

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض السكري النوع الثاني لمرضى عراقيين == The Association of Glutathione - S - Transferase (GSTP1) Genetic Polymorphism in Iraqi Patients with Diabetes MellitusType2

اسم المؤلف: رغد حميد رشيد
اسم المشرف: بتول علي شهاب
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة لمعرفة ارتباط جينات ازالة السمية لمتعدد النمط الوراثي GSTP1في ظهور مرض السكري النوع الثاني. شملت الدراسة 110 عينة دم لافراد عراقيين. 60 فرد اشخاص مصابين بداء السكري النوع الثاني مشخصين حسب المركز الامريكي للسكري وتراوحت اعمارهم بين (32 - 83 ) سنه اختيروا من مركز السكري التابع للجامعة المستنصرية المعالجين من ارتفاع سكر الدم.50 فرد اصحاء اختيروا كمجموعة سيطرة. خذت عينات من البلازما والدم. عينات البلازما شملت قياس المؤشرات السريرية للمرضى والسيطرة تضمنت مستوى الكلوكوز بالدم , الكوليسترول الكلي ,الدهون الثلاثية , مستوى اليوريا, الدهون ذات الكثافة العالية , الدهون ذات الكثافة الواطئة , الدهون ذات الكثافة الواطئة جدا ,بالاضافة الى كتلة الجسم وضغط الدم. اضافه الى تقييم ارتباط هذه العوامل مع تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1. الدراسة الجزيئيـة شملت استخلاصDNA واستخدام التضاعـــف التسلسـلي (polymerase chain reaction)و تباين اطوال قطع الدنا المقيدة (Restriction Fragment Length Polymorphism) للتحري عن التعدد الوراثي لجينات GSTP1 لجميع افراد هذه الدراسة.الدراسة الجزيئية تمت في مختبر البيولوجي الجزيئي /قسم علوم الحياة/ كلية العلوم للبنات. ظهرت النتائج ان المؤشرات السريرية (العمرAge, الجنسSex , كتلة الجسم body mass index, نسبة اليوريا في الدمblood urea , ضغط الدم الانبساطيdiastolic blood pressure والانقباضي systolic blood pressure والبروتينات الدهنية عالية الكثافة High Density Lipoproteins ) في كلا من المرضى والسيطرة لم تختلف معنويا بينما كان مستوى الكلوكوز بالدم fasting blood sugar في المرضى (184.36±7.64) mg/dl تتراوح ما بين ((341 - 100 اما في مجموعة السيطرة فقد كانت (96.06± 3.72 )mg/dl وتراوحت ما بين ((115 - 83 وكان الفرق معنويا .p< 0.00 اظهرت النتائج ان كلا من مستوى الكوليسترول الكلي((Total Cholesterol ومستوى الدهون الثلاثية (Triglyceride) في المرضى كانت ,184.56±68.66) mg/dl (161.95 ± 10.28 على التوالي واما في مجموعة السيطرة فقد كانت 98.41±9.00) mg/dl, 118.16 ± 7.11) على التوالي وكان الفرق معنويا.p<0.00 وكذلك اظهرت النتائج ان كلا من مستوى البروتينات الدهنية واطئة الكثافة (Low Density Lipoproteins) ومستوى البروتينات الدهنية ذات الكثافة الواطئة جدا في المرضى كانت,106.00 ± 5.01) mg/dl, 31.58 ± 2.10 ) على التوالي واما مجموعة السيطرة فقد كانت 91. ± 4.90), (22.86 ± 1.25وكان الفرق معنويا p<0.000. نتائج التحري عن تعدد النمط الوراثي لجينات GSTP1 وتوزيعه ضمن مجموعات الدراسة اظهرت ان النمط الوراثي البري Ile/Ile والنمط الوراثي الهجين Ile/Val كانا مختلفين معنويا في مجموعة المرضى (60%, 36.67%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (68%, 32%) وكان الفرق معنوياp<0.000 . النمط الوراثي المطفرVal/Val ظهر في المرضى فقط وكان بمعدل (3.33%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (0.00%) وكان الفرق معنويا p<0.000. استنادا الى النتائج المذكورة سابقا فان GSTP1 من الممكن ان يكون له دور مهم في امراضيه السكري النوع الثاني بينما لم يظهر تاثيره على مؤشرات الدهون. | This study was carried out to investigate the relationships between the T2DM patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1, and measurement of some clinical parameters of patients and controls. The study included 110 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with Type2 diabetes were diagnosed according to the American Diabetes Association criteria (American Diabetes Association, 2007); their age range were between (32 - 83) years selected from those attending the National - Diabetes Center/ AL - Mustansiriya - University for treatment with history of hyperlipidemia and hypertension. Fifty individuals healthy also included as control group. Sera and blood were used as samples. The measured parameters in serum included (biochemical testes) : Fasting Blood Sugar (FBS), Total Cholesterol (TC), Triglycerides (T.G), Blood Urea (BU), High Density Lipoprotein (HDL), Low Density Lipoprotein (LDL) and Very Low Density Lipoprotein (VLDL). Additionally, body mass index (BMI) and blood pressure (BP) were determined. Moreover, the correlation between genotyping of Glutathione S - Transferase P1 and all studied parameters was carried out. Molecular studies involved DNA extraction and PCR (Polymerase Chain Reaction) - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) was carried to detect the genetic polymorphism of glutathione - S transferase gene Pi class for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department Sciences/ College for women. The results showed that (age, sex, body mass index, blood urea diastolic blood pressure, systolic blood pressure, high density lipoproteins) for patients and control group were not significant while for the level of fasting blood sugar was (184.36±7.64) mg/dl, ranging from (100 - 341) in patients while in the control group it was (96.06±3.72) mg/dl and ranged between (83 - 115) and it was a significantly difference (P < 0.000).The results showed that total cholesterol and Triglycerides in patients (184.56±68.66 mg/dl, 161.95 ± 10.28 mg/dl) respectively were higher significantly than in controls (98.41±9.00, 118.16 ± 7.11) mg/dl (P <0.001). The data also showed that both of Low density lipoproteins and Very low density lipoproteins in patients were (106.00 ± 5.01 mg/dl, 31.58 ± 2.10 mg/dl) respectively and highly significantly difference (P < 0.001) than in controls (91.27 ± 4.90 mg/dl, 22.86 ± 1.25 mg/dl)(P <0.001) respectively. The results of genetic polymorphism of GSTP1 distribution among the studies groups showed that wild type Ile/Ile and heterozygous Ile/Val were higher significantly between patients (60 %, 36.67 %) and in controls (68 %, 32 %) respectively. The homozygous mutant Val/Val genotype was elevated in the DM patients only and it was (3.33%) compared to controls (0.00%). According to data mentioned above showed that GSTP1 genotype polymorphisms may play an important role in the pathogeneses of type2 diabetes mellitus while its effect on all lipid profile indicators did not show any significant difference.

جينات تحسس الزحام وعلاقتها مع بعض عوامل الضراوه في بكتريا الزوائف الزنجاريه == Correlation of Quorum Sensing Genes with Some Virulence Factors in Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: دعاء كاظم منصورالموسوي
اسم المشرف: منعم رضوان علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 60 عزله من البكتريا السالبه لصبغه كرام مشخصه مبدئيا بانها بكتريا الزوائف الزنجاريه من عده مستشفيات في بغداد ومنها مستشفى ابن البلدي ومستشفى الحروق ومستشفى بغداد التعليمي وكذلك من المختبرات التعليميه في مدينه الطب خلال الفتره من بدايه شهر ايلول لغايه نهايه شهر كانون الاول لسنه 2013 تضمنت هذه العزلات22 عزله من خمجات الحروق و18 عزله من خمجات الجروح و9عزلات من عينات القشع لمرضى مصابين باصابات الجهاز التنفسي و6 عزلات من الدم وعزلتين من خمجات المجاري البوليه و3عزلات من مسحات الاذن. شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسط الماكونكي الصلب ووسط الدم الصلب وكذلك وسط السيدوموناس الصلب بعد ذلك تم اجراء بعض الفحوصات البايوكيميائيه مثل فحص الكاتليز والاوكسيديز تبع ذلك تشخيص العزلات جينيا باستخدام تفاعل البلمره التسلسلي باعتماد جين .rpsL اكدت النتائج ان جميع العزلات قيد الدراسه هي بكتريا الزوائف الزنجاريه . خضعت 60 عزله عائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه لاختبارفحص الحساسيه تجاه 12 مضادا حيويا بطريقه الانتشار واظهرت النتائج وجود مقاومه عاليه بين عزلات الدراسه لـــمضادات Tetracycline (100%) ,Ceftazidime (100%) ,Cefoxitin (100%) , Ceftriaxone (85 %) , Cefepeme (83.3%), Amoxillin/Clavulanic acid (81.6 %),Chloramphenicol (78.3 %) وانها كانت ذات مقاومه متوسطه لمضاد51.6%) Pipracillin ) وذات مقاومه واطئه لمضادات Tobramycin(33.3%), Norfloxacin (31.6%), Azithromycin (31.6%),Ciprofloxacin (28.3%). اختبرت قابليه العزلات على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام طريقه احمر - الكونغو وطريقه اطباق المعايره الدقيقه وتم قياس قيم الكثافه الضوئيه باستخدام قارىء منظومة الاليزا, اظهرت النتائج ان طريقه اطباق المعايره الدقيقه اكثر كفاءه وحساسيه من طريقه احمر الكونغو للكشف عن الغشاء الحيوي اذ اظهرت نتائجها ان 4 عزلات فقط غير منتجه للغشاء الحيوي اما العزلات الاخرى فقد كانت منتجه بدرجات متفاوته . اظهرت نتائج التحري عن جينات تحسس الزحام باستخدام تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي المتعدد وباستخدام بادئات خاصه بتسلسلات معينه لجينات الكوارم اظهرت النتائج ان 81,6% من هذه العزلات تمتلك واحد او اكثر من هذه الجينات بينما كانت 18.4% من هذه العزلات لا تمتلك الجينات اعلاه . تقنيه تفاعل البلمره التسلسلي استخدمت في التحري عن خمس من جينات عوامل الضراوه العائده لبكتريا الزوائف الزنجاريه وهي ((exoU,proteaseIV,exoS,pilB,plcH, اظهرت النتائج وجود هذه الجينات بنسبة (0% , 21.6 % ,26.6 % , 46.6% ,53.3% ) تباعا وكانت هذه العزلات تمتلك exoU وبعظها exoS وعلى اساسها صنفت العزلات على انها اما سامه او ضاريه . بينت الدراسة ان هناك بعض الطفرات قد حدثت في تسلسل القواعد النتروجينية للعزلات قيد الدراسة وكانت من نوع طفرات الاستبدال والادخال, كذلك تبين من مطابقة تسلسل القواعد النتروجينية المترجم مع تسلسل الاحماض الامينية الاصلي للجين لم يكن للطفرات تاثير على ناتج الترجمة . | A total of (60) clinical isolates of gram negative bacteria primary identified as Pseudomonas aeruginosa were obtained from different teaching hospitals in Baghdad ; Ibn - El Balady , Baghdad teaching hospital , Burn hospital and Teaching laboratory in Medical city. During the period between July 2013 till December 2013. The source of these isolates were as follows : (22) isolates collected from burn infections ,(18) isolates from wound infections, (9) isolates from sputum taken from patients suffering from respiratory tract infection,(6) isolates from blood,(2) isolates from urinary tract infections(UTI), and the last (3) isolates from ear swab. The isolates were initially identified by culturing on MacConkey agar,Blood agar, Pseudomonas agar then diagnosed by performing some biochemical tests (catalase and oxidase) followed by Genotypic diagnoses by PCR Which was performed by housekeeping gene (rpsL gene). The results confirm that all the 60 isolates were P.aeruginosa. Sixty P.aeruginosa isolates were tested for 12 antibiotics by using agar diffusion method , the results showed high resistance against Tetracycline 100%, Ceftazidime100%,Cefoxitin100%,Ceftriaxone85%,Cefepime,83.3%,Amoxicillin/Clavulanic acid 81.6%, and Chloramphinicol 78.3% moderate resistance against ,Pipracillin 51.6% , and low resistance against Tobramycin 33.3% , Norfloxacin 31.6%,Azithromycin 31.6% and Ciprofloxacin 28.3%. The ability of the isolates to produce biofilm were tested using congo red plate method and Tissue culture plate method(TCP). Results showed that TCP method is a more quantitative and reliable method for the detection of biofilm this method show that 6.6% isolates were not biofilm producers while other isolates produce it in different degrees . Multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique was performed using specific primers targeting the specific sequences of Quorum sensing genes (lasR,lasI , rhlR,rhlI) .The results showed that 81.6% positive for one or more QS genes while only 18.3% were negative for all these genes. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to screened five virulence factors (exoU,proteaseIV,exoS, PilB , PlcH) results showed percentage were (53.3% , 46.6% , 26,6 % , 21,6 % , 0% ,) positive isolates respectively and these isolates contain either exoU or exoS and according to this have been classified into cytotoxic and invasive. Determination of nucleotides sequence for QS genes was revealed there was some mutations occurred which included substitution and insertion. From the other side results of identities of translated - nucleotides sequence with original sequence of amino acids revealed that there were no effect of mutations on translation product.

التنوع والانتشار الجغرافي لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى، العراق == Diversity and geographical distribution of freshwater Gastropods in Diyala river basin , Iraq

اسم المؤلف: خنساء سلمان فرمان
اسم المشرف: عماد الدين عبد الهادي المختار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم اجراء الدراسة الحالية للتعرف على التنوع الاحيائي والتباين المظهري لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى في العراق ولهذا الغرض تم اختيار 10 مواقع موزعة على قطاعين : القطاع الشمالي ويتمثل منطقة شمال سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة دربنديخان Dar , موقع مدينة كلار Kal , موقع رافد الوند في مدينة خانقين Wan وموقع مدينة جلولاء Jal . القطاع الجنوبي ويتمثل بجنوب سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة حمرين Him, موقع ناظم الصدور Sud , موقع جدول مهروت Mah في مدينة المقداديه , موقع مشروع الخالص الاروائيKha , موقع جدول السارية Sar وموقع مدينة بعقوبة Baq . ناولت الدراسة التعرف على العوامل الفيزيائية والكيميائية والتي شملت : درجة الحرارة , الاس الهيدروجيني , تركيز الاوكسجين المذاب , التوصيلية الكهربائية , سرعة التيار , تركيز الكالسيوم , نسبة المواد العضوية ونسجة القاع لمواقع الدراسة . جمعت عينات شهرية لبطنية القواقع المائية عن طريق اسطوانة جمع العينات من المواقع للفترة من نيسان 2013 - كانون الثاني 2014 عدا الموقعين دربنديخان وكلار حيث جمعت العينات فقط خلال شهري ايلول وتشرين الاول 2013 . وتم تشخيص العينات بالاعتماد على النماذج المحفوظة في متحف التاريخ الطبيعي البريطاني . تم حساب الكثافة والوفرة النسبية والتردد لكل نوع خلال فترة الدراسة كما شملت قياس التباين المظهري للانواع المشتركة بين القطاعين . والارتباط بين العوامل البيئية والانواع وبين الانواع بالاضافة الى قياس التماثل بين الجماعات السكانية للمواقع . تراوحت قيم درجة الحرارة للمياه المسجله للمواقع خلال فترة الدراسة ( 10 - 33 )º م واظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في حين سجلت ظهور فرق معنوي بين الاشهر كما تراوحت قيم الاس الهيدروجيني ( 6.6 - 8.1 ) مع انها تميل الى ان تكون قاعدية في اغلب المواقع كما اظهرت عدم تسجيل فرق معنوي بين القطاعين . ظهر من قيم الاوكسجين الذائب الذي تراوح بين ( 6.1 - 10.7) ملغم /لتر ان المواقع ذات تهوية جيده وبين التحليل الاحصائي عدم وجود فرق معنوي بين القطاعين في حين سجل وجود فرق معنوي بين القطاعين في قيم التوصيلية الكهربائية التي تراوحت بين ( 1530 - 450) مايكروسيمنز /سم , كما اظهرت النتائج وجود فرق معنوي في سرعة الجريان بين المواقع حيث تراوحت بين اعلى قيمة سجلت في موقع كلار 1.3 م/ثا الى اوطئ قيمة سجلت في الصدور والتي تقدر 0.08م/ثا الا انها لم تسجل فرق معنوي بين القطاعين في اغلب اشهر البحث . كما تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل مختبريا منها تركيز الكالسيوم في المياه حيث سجلت تراكيز عاليه في الموقعين الوند وبعقوبه مقارنة بالمواقع الاخرى حيث بلغت 210 ملغم /لتر في حين بلغت سجلت اقل تركيز في الصدور 41 ملغم / لتر وسجلت وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في اغلب الاشهر , كما تراوحت نسب المادة العضوية في رواسب القاع بين ( 0.6 - 4.1) % مع تسجيل فرق معنوي بين القطاعين , تباينت نسجة القاع بين مواقع الدراسة مزيجيه طينية رمليه للمواقع دربنديخان والوند وجلولاء وعرينيه طينية في كلار ومزيجيه رملية في حمرين في حين كانت طينية في الموقعين الخالص والسارية ومزيجيه في مهروت وبعقوبه . تم خلال فترة الدراسة تشخيص 12 نوع تنتمي الى 8 عوائل وشملت : عائلة Neritidae تضمنت نوعين Theodoxus jordani وNeritina mesopotamica , عائلة Valvatidae شخص Valvata saulcyi وعائلة Viviparidae تم تشخيص Bellamya bengalensis وكما تم تشخيص الانوع Melanopsis costata , M.nodosa , M. subtingitana وM. preamorsa التي تنتمي الى عائلة Melanopsidae وMelanoides tuberculata من عائلة Thiaridae وLymanaea natalensis من عائلىة Lymnaedae وPhysa acuta من عائلة Physidae وPlanorbis gibbonsi من عائلة Planorbidae . وقد بينت النتائج ظهور Physa acuta في جميع المواقع في كما سجل الموقع Dar اعلى كثافة لمجموع الافراد والموقع Jal. اقلها في حين سجلت T.jourdani هي اكثر الانواع كثافة مقارنة مع الانواع المدروسة الاخرى . كما اظهرت النتائج ان اعلى كثافة للانواع تكون في اشهر الخريف والربيع ولكنها تنخفض في اشهر الصيف والشتاء كما اظهر تحليل الارتباط بين الانواع والعوامل البيئية بان كثافة الانواع لا تتاثر بتركيز الكالسيوم في حين هناك تباين في استجابة الانواع لبقية العوامل التي تمت دراستها تم دراسة التباين المظهري للغلاف باستخدام تقنية المقياس المظهري الهندسي . حيث اجريت المقارنة بين الانواع المشتركة بين القطاعين الشمالي والجنوبي لقياس الاختلاف في الحجم لمركزي والتماثل لحجم وشكل الغلاف للانواع المشتركة Theodoxus jordani , Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis , Physa acuta وPlanorbis gibbonsi واظهرت النتائج وجود فرق معنوي في الحجم المركزي للانواع T. jordani ، P.acuta ، M.preamorsa وLymnaea natalensis كما سجلت نتائج التماثل الشكلي وجود تباين معنوي في التماثل لحجم الغلاف للنوع P. acuta. | The present work was conducted to study the biodiversity and the shell’s morphological variation of the Freshwater Gastropods in Diyala River basin northeast Iraq. For this purpose 10 sites were selected within two sectors of the River basin. A northern sector, represented the area north of Himreen’s dam and lake, including : Darbandikhan lake site (Dar); Kalar town site (Kal); Alwand tributary site in Khanaqin (Wan); Jalula city site (Jal). The Southern sector represented the area below Himreen’s dam and lake : Himreen lake site (Him); Al Sudor regulatory Dam site (Sud); Mahroot stream site at Moqdadia city (Mah); Al Khalis irrigation canal site (Kha); Al saria stream site (Sar); and Baqubah city site (Baq). Physical and chemical properties at the study sites were measured. These included : water temperature, pH, Dissolved Oxygen Concentration, Electrical Conductivity, Current Velocity, Calcium Concentration, sediment organic matter content and bottom Sediment particle size. Gastropods samples were collected monthly by a cylinder sampler from all sites for the period April 2013 through January 2014, with a small exception regarding Darbandikhan and Kalar sites. Gastropods species identification was aided by consulting preserved material at the British Natural History Museum (NHMUK). Occurrence, population density and relative abundance of each species were calculated. The morphological variation of the gastropod shells collected from different area sectors within the River basin were also determined. Correlation between gastropod species and the environmental factors were also recorded, in addition to investigating similarities between the studied sites in environmental factors and species density. Values of water temperature ranged between (10 - 33) ºC. No significant difference between sites nor between sectors, but only between months was detected. Values of the pH ranged between (6.6 - 8.1), tending to be alkaline at most sites. These values showed significant difference between the two sectors. The dissolved oxygen values ranged between (6.1 - 10.7) mg /l indicating good oxygenation with no significant difference between sites of the two sectors. However, electrical conductivity EC values ranged between(450 - 1530) µs/cm. A significant difference was revealed between the values of the two sectors, highest value of Current velocity was recorded at Kalar (1.3 m/sec.) and the lowest value was recorded at Al Sudor(0.08 m/sec.), but these records showed no significant difference between the two sectors in most months. Calcium concentration in the water showed presence of high concentrations (210 mg/l) at sites Al wand and Baqubah. While the lowest concentration (41 mg / L) was recorded at Al sudor, but no significant difference between sites or between sectors was evident in most months.Sediment content of organic matter ranged (0.6 - 4.1)% showing significant difference between the northern and southern sectors. Bottom sediment particle size and texture varied from sandy - clay - loam at sites Darbandikhan, Al wand and Jalula, to silt - clay at Kalar, sandy - loam at Himreen, clay at Khalis and Alsaria, and loamy at Mahroot and Baqubah. A total of twelve species of gastropods belonging to eight families were identified. Family Neritidae included two species Theodoxus jordani and Neritina mesopotamica; family Valvatidae included Valvata saulcyi; family Viviparidae included Bellamya bengalensis; family Melanopsidae included Melanopsis costata, M.nodosa, M. subtingitana and M .preamorsa; family Thiaridae included Melanoides tuberculata; family Lymnaedae included Lymanaea natalensis; family Physidae included Physa acuta; and family Planorbidae included Planorbis gibbonsi. Results showed that Physa acuta was present at all sites. while Theodoxus jordani was the highest density recorded. The highest density of the total individuals was recorded at Darbandikhan and the lowest was at Jalula site. The results showed that highest density of Gastropods population was recorded in Spring and Autumn months and decline in Winter and Summer months The correlation analysis between species and environmental factors showed that population density of species was not affected by the concentration of calcium while there was evident variation in the response of species to most other environmental factor. The variation in shell morphological features was investigated using Geometric Morphometric technique. Specimens from northern and southern sectors were compared to detect differences in the centroid size, symmetry of shell shape and size for shells of the most common species : Theodoxus jordani, Melanopsis preamorsa, Lymnaea natalensis, Physa acuta and Planorbis gibbonsi. Results showed variation existed in centroid size for Teodoxus jordani ,Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis and Physa acuta , but the analysis of symmetry in shell size and shape for the recorded species showed significant variance in the shell size of P.acuta only.

دراسة لمؤشرات مناعية وحيوية في مرضى تصلب الاعصاب المنتشر == Study of Certain Immuno and Biomarkers in Multiple Sclerosis Patients

اسم المؤلف: سماح خليل يحيى
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تصلب الاعصاب المنتشر مرض التهابي مزمن مجهول السبب، يتصف بفقدان الميالين (النخاعين) مع الميل الى اصابة محور الليف العصبي، ويصيب الاشخاص في الاعمار المتوسطة من حياتهم مع ارجحية اصابة النساء اكثر من الرجال.جاءت هذه الدراسة بصورة رئيسية لبحث العلاقة بين تصلب الاعصاب المتعدد وتركيز كل من البين الابيضاضي - 2 و- 10 وعامل التنخر الورمي - الفا وكذلك المؤشرات الحيوية كمستوى الدهون في الدم (الكولسترول, لشحوم الثلاثية والشحوم عالية الكثافة) , حمض اليوريك وظائف الغدة الدرقية (ثالث يود الثيرونين , الثايروكسين وهرمون تنشيط الغدة الدرقية). الى جانب ذللك , قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض. كما تناولت العلاقة بين تركيز هذة الحركيات الخلوية والمؤشرات الحيوية وعلاقتها بالجنس ومراحل تقدم المرض.اجريت هذه الدراسة على 60 مريض عراقي شخصوا بتصلب الاعصاب المتعدد وفق لمعايرMcDonald criteria وتم تصنيف المرضى المختارين الى مجموعتين : 1. المجموعة الاولى : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15اناث) تتراوحت اعمرهم من (56 - 18) سنة وهم في المرحلة الاولى من التشخيص (اي حدث لهم انتكاسة) ولم ياخذوا اي علاج.2. المجموعة الثانية : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15 اناث) تراوحت اعمرهم من (53 - 18) سنة وهم مشخصين مندو فتره ومعالجين بانترفيرون بيتا مع مثل ابردزولون الى3 ايام او 5 ايام.الى جانب ذلك‚ مجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 20 فردا (10 اناث و10 ذكور) تراوحت اعمارهم من (50 - 20) اصحاء ظاهريا والذين راجعوا الى (مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب / عيادة للكشف المبكر عن تصلب الاعصاب المتعدد) في بغداد خلال الفترة من تشرين الثاني/ 2013 الى نهاية نيسان/ 2014 للتشخيص والعلاج. تم سحب عينة (8 - 6) ملليتر من الدم الوريدي من 80 من الحالات المتضمنة في الدراسة (المرضى والسيطرة) لغرض استخدامها في الدراسة المناعية والتي تشمل قياس الحركيات الخلوية المذكورة بواسطة استعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) والمؤشرات الحيوية باستخدام جهاز ابت لقياس (مستوى الدهون في الدم وحمض اليوريك) ويستخدم جهاز توسوا لقياس (وظائف الغدة الدرقية). فضلا عن حساب العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض باستخدام جهاز روبي. توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى تصلب الاعصاب هو (34.43) سنة وان الفئة العمرية (39 - 30) سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2. اظهر معدل المستوى المصلي للبين الابيضاضي - 10 فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 بين مجموعات مرضى التصلب المتعدد (قبل وبعد المعالجة) ومجموعة السيطرة (46.64 , 44.70 و50.95) بيكو غرام/مل , على التوالي.3. اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 ما بين مرضى بعد المعالجة (17.04) بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى قبل العلاج ومجموعة السيطرة (14.81 و14.28) بيكو غرام/ مل , على التوالي .4. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من الكولسترول , الشحوم الثلاثية, الشحوم قليلة الكثافة والشحوم قليلة الكثافة جدا عند مستوى P<0.05 في المرضى غير المعالجين والمعالجين مقارنة بمجموعة السيطرة .5. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من ثالث يود الثيرونين وهرمون الثايروكسين عند مستوى P<0.05 في المرضى الغير معالجين ) 1.08) نانوغرام / مل و(7.99) ميكروغرام / ديسيلتر، على التوالي والمرضى المعالجين (1.27) نانوغرام / مل و(8.68) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة (0.898) نانوغرام / مل و(6.95) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي. 6. اظهره نقصان معنوية في معدل الخلايا الحمضة في مجاميع المرضى (قبل وبعد المعالجة) مع انترفيرون - بيتا - 1ب مقارنة مع مجموعة السيطرة.7. لم تظهر اي علاقة بين معدل كريات الدم والمستويات المصلية من كل البين الابيضاضي - 2 ,هرمون تنشيط الغدة الدرقية , حمض اليوريك والشحوم عالية الكثافة والامراضية من تصلب الاعصاب المنتشر.8. ظهر تاثير الجنس في كلا من الشحوم الثلاثية وحمض اليوريك حيث وجود زيادة وبفارق معنوي في الذكور مقارنة بالاناث, بينما كانت هنالك زيادة معنويه في الشحوم عالية الكثافة في الاناث مقارنة بالذكور. | Multiple Sclerosis (MS) is an idiopathic chronic inflammatory disease characterized by demyelination that can be associated with axonal degeneration and is the leading cause of a non - traumatic neurological disability in young adults, with female affection more than male.This study is designated mainly to investigate the relationship between the MS patients and certain cytokines serum concentrations of Interleukin - 2 (IL - 2), interleukin - 10 (IL - 10), Tumor necrosis factor - alpha (TNF - α) and biomarkers; lipid profile (TC, TG, LDL, VLDL and HDL), Uric Acid (UA) and thyroid function (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the blood. Also it is trying to find out the relation between concentrations of these cytokines and biomarkers with the gender and disease course of Iraqi MS patients. The study involved 60 Iraqi who were diagnosed as MS patients. the selected patients were classified into two groups :  Pre - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 56) years at the stage of the early diagnosis (RRMS).  Post - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 53) years with treatment Interferon - β 1b (INF - β - 1b) intravenous immunoglobulin (Ig) pulse Methyl - Prednisolone MP (in acute relapses) for 3 days or 5 days. Besides, 20 healthy volunteers 10 males and 10 females matched the patients with age and gender were used as control subjects with age range between (20 - 50) years. They have attended to (Baghdad Teaching Hospital in the Medical City / Clinic for early detection of MS) in Baghdad during the period from November / 2013 to the end of April / 2014 for the diagnosis and treatment. The blood samples (6 - 8) ml were drown from all of studied cases in order to be used for immunological study by measuring their serum level of cytokines using Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) and biomarkers; using Architect c4000 System (Abbott) for (TC, TG, LDL, VLDL, HDL and UA) and AIA - 360 system for (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the 2 ml of blood at using Cell - Dyn Ruby System.The Study has Reached the following Results : 1. The results showed that the average age in patients with MS is (34.43) years and age group (30 - 39) years are more susceptible to affected. 2. The study has showed the average serum level of IL - 10 were significant differences at the level of probability P<0.05 between the (pre - and post - treated) patients and the healthy control (35.54, 35.86 and 52.68) pg/ml, respectively. 3. The study furthermore, has showed the average serum level of TNF - α were significant differences at the level of probability P<0.05 between the post - treated patients (17.04) pg/ml and two group the pre - treated patients and the healthy control (14.81 and 14. 28) pg/ml, respectively.4. The result observed significant an increase in the concentration of serum level of TC, TG, LDL and VLDL at the level of probability P<0.05 in the pre - and post - treated patients as compared to the healthy control. 5. The result observed significant increase in the concentration of serum level of T3 and T4 at the level of probability P<0.05 in the pre - treated patients (1.08) ng/ml and (7.99) μg/dl, respectively and the post - treated patients (1.27) ng/ml and (8.68) μg/dl, respectively as compared to the healthy control (0.898) ng/ml and (6.95) μg/dl, respectively. 6. The study has showed a significant decrease in mean of the eosinophil for the pre - and post - treated patients (1.28 and 1.99) respectively as compared with the healthy controls (2.79).7. There is no relationship between the differential count of WBC and serum levels of (IL - 2, HDL, UA and TSH) and the pathogenicity of MS. 8. The research show significant increase in levels of TG and UA in male as compared with female, while level of HDL was significant increase in female as compared with male.

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية == Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

اسم المؤلف: ابرار جاسم حسن
اسم المشرف: امنة نصيف جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية == A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

اسم المؤلف: نرمين نصر الدين فتحي
اسم المشرف: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.

دراسة التاثيرات الوراثية لمتعدد السكريد خارج خلوي لبكتريا Enterococcus faecium في الخلايا السرطانية == Study of the Genetic Effects of Exopolysaccharide (EPS) from Enterococcus faecium in the Cancer Cells

اسم المؤلف: هويدة كريم عبد الجنابي
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على ثلاث عزلات لبكتريا Enterococcus faecium من 120 عينة منتجات الالبان المحلية والمستوردة، وقد شخصت هذه العزلات باستخدام الفحوصات البكتريولوجية والكيموحيوية، استخلص متعدد السكريد خارج خلوي Exopoly Saccharide من العزلة رقم (1) لبكتريا E. faecium وذلك لكون هذه العزلة اعطت اعلى معدل انتاجية من المستخلص وبلغ 300 ملغرام/لتر من الوزن الجاف.درس التاثير السمي الخلوي لمستخلص EPS في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما AMN - 3 وHeLa، واظهر المستخلص فعالية تثبيطية في الخلايا السرطانية اعتمادا على التركيز المستخدم ومدة التعريض خصوصا عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر حيث وصلت نسب التثبيط الى 59.3% و86.2% على التوالي في خلايا AMN - 3، ثم بدات هذه النسب بالانخفاض مع تقليل التركيز المستخدم الى 1250 مايكروغرام/مللتر لتصل الى (8.3)% بينما استمرت الخلايا بالنمو والتضاعف خلال مدد التعريض الثلاث 24 ، 48 و72 ساعة عند التركيز 625 مايكروغرام/مللتر وكانت النسبة المئوية لتضاعفها (157.1%) مقارنة بعينة السيطرة (100%).اما تاثير المستخلص في خلايا HeLa فقد اظهر تاثيرا تثبيطيا على هذه الخلايا ازدادت نسبته مع زيادة التركيز ومدة التعريض وان نسب التثبيط في خلايا HeLa كانت اقل بفارق معنوي عن نسب التثبيط في خلايا AMN - 3 حيث بلغت نسب التثبيط في خلايا HeLa عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر 28.0% و31.1% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة واستمر انخفاض الفعالية التثبيطية للمستخلص في خلايا HeLa في التراكيز الواطئة 625 و1250 مايكروغرام/ مللتر حيث بلغت 10.7% و14.4% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة مقارنة بعينة السيطرة.درس تاثير مستخلص (EPS) وراثيا في الخلايا اللمفاوية للانسان من خلال حساب معامل التحول الارومي Blast index (BI) ومعامل الانقسام الخيطي (MI) Mitotic index وفحصت التغايرات الكروموسومية والفعالية التحفيزية لانقسام الخلايا. وجد ان هذا المستخلص قد سبب انخفاضا معنويا في معدلات معامل الانقسام ومعامل التحول الارومي يتناسب مع زيادة التركيز المستعمل ومدة التعريض لكنه لم يحدث اية تاثيرات سمية وراثية في كروموسومات الخلايا اللمفاوية المعاملة. | Three isolates of Enterococcus faecium were obtained from 120 of dairy products. These isolates were identified using bacteriological and biochemical assays.Exopolysarccharide (EPS) was extracted by (TCA 10%) method from isolate E. faecium no.1 for high production. One gram of dry weight produced 300 mg/ml of EPS.Cytotoxicity effect of EPS on cancer cell lines AMN - 3 and HeLa. An inhibitory activity of EPS against cancer cells was noticed, it was depended on EPS concentration and time exposure. Both concentrations 2500 and 5000 µg/ml were inhibited cells of AMN - 3; the percentage of inhibition was 59.3 and 86.2% respectively. Whereas, the percentage of inhibition was reduced when EPS concentration was low, 1250 µg/ml of EPS was showed 8.3% of inhibition rate. Notable, the low concentration (625µg/ml) of EPS was induced proliferation of AMN - 3 cancer cells of AMN - 3 for proliferation; the viability rate of cancer cells was 157.1% in comparison with untreated cells (control). In addition, the cytotoxic activity of EPS on cancer cell line HeLa was also studied. Significantly, inhibition rate on HeLa cells was less than that against AMN - 3 cells. The inhibition rate of HeLa cells at 2500 and 5000 µg/ml of EPS after 72 hr. was 28.06 and 31.1 % respectively. While the inhibitory activity of EPS at low concentrations (625 and 1250 µg/ml) on HeLa cells were 10.7% and 14.4% respectively.Genetically, the effect of EPS on normal human lymphocytes using different parameters such as mitotic index (MI), blastogenic index (BI), rearrangement of chromosomes, and mitogenic activity was examined. The results showed that EPS was significantly reduced MI and BI. Moreover, no genotoxic effect on chromosomes of healthy human lymphocytes was noticed

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته == Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

اسم المؤلف: همسة نافع محمد علي الرحو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها == Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

اسم المؤلف: هبة علي هلال الجبوري
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes == A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

اسم المؤلف: ميسم محمد رشيد الشيباني
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة == Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

اسم المؤلف: منال سلمان محمد كسار
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز == Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

اسم المؤلف: مريم باسم انيس
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

اسم المؤلف: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

انتاج وتوصيف الليفان من بكتريا Paenibacillus polymyxa المعزولة محليا

اسم المؤلف: شمم ناصرراضي
اسم المشرف: شذى سلمان حسن | سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 88 عزلة تعود لجنس Bacillus من التربة والمياه من اصل 112 عزلة بكتيرية اعتمادا على الفحوصات الزرعية والمجهرية , اظهرت 25عزلة تعود لهذا الجنس مستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح الصلب الحاوي على %20 من السكروز, من ضمن هذه العزلات تم اختيار 10 منها والتي اعطت اعلى درجة من النمو اللزج لزرعها على وسط الاملاح السائل الحاوي على السكروز. كانت العزلة B2 الافضل في انتاج الليفان ((levan حيث اعطت اعلى وزن جاف من الليفان والذي بلغ 4.1غم /100مل واعلى نسبة من السكريات الكلية 91% والسكريات المختزلة 80%. الفحوصات المزرعية والكيموحيوية لهذه العزلة اظهرت انها تعود للنوع Paenibacillus polymyxa . تم استخدام ثلاثة انواع من المذيبات العضوية لغرض استخلاص الليفان وهي ايثانول, ميثانول وايزوبروبانول بنسبة (1 : 4حجم /حجم) اعطى المذيبان الايثانول والايزوبروبانول اعلى قيمة من الوزن الجاف للليفان والتي بلغت 4.1 غم /100مل بينما اعطى الميثانول 3.7 غم / 100 مل. تم تحليل الليفان نوعيا للكشف عن محتواه من السكريات المختلفة والكاربوهيدرات وذلك باستخدام اربعة كشوفات : الكشف الاول كون حلقة بنفسجية مع محلول الليفان بينما لم يعطي الليفان اي تغيير في اللون مع الكشف الثاني ممايدل على خلو الليفان من الانواع الاخرى من السكريات المتعددة ((Polysaccharide كالنشاء والكلايكوجين والدكستران. الليفان المتحلل جزئيا بفعل حامض الهيدروكلوريك المركز (HCl) كون راسب برتقالي اللون عند تفاعله مع الكاشف الثالث مما يدل على وجود سكريات مختزلة تفاعلت مع الكاشف بينما اعطى الكشف الاخير لون احمر قاني مع محلول الليفان مما يدل على وجود السكر الاحادي الفركتوز. حددت الظروف المثلى لانتاج الليفان من العزلة B2 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الاملاح الحاوي على20% من السكروز وبدون اي مصدر نايتروجيني برقم هيدروجيني (pH) 7 وبدرجة حرارة 37 ˚م وبحجم لقاح2 % من المزروع البكتيري ولمدة حضانة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 100 دورة في الدقيقة, حيث بلغت قيمة الوزن الجاف لليفان 4.8 غم/100مل وكانت النسبة المئوية للسكريات الكلية 95.8% ونسبة السكريات المختزلة 92%. ان انتاج الليفان في اوساط خام طبيعية مثل وسط عصير قصب السكر ووسط مستخلص التمر ادى الى انخفاض في انتاج الليفان مقارنة مع وسط الاملاح الحاوي على السكروز. تمت دراسة مواصفات الليفان اعتمادا على لزوجته ((viscosity عند تراكيز مختلفة حيث اظهرت النتائج ان اللزوجة تزداد بزيادة التركيز حتى تصل الى اعلى قيمة لها 3.18 سنتيبويز عند 20% , كذلك تمت ايضا دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني وتاثير املاح الصوديوم NaCl بتراكيز مختلفة على لزوجة محلول الليفان عند تركيزين هما 2% و20% حيث اظهرت النتائج بان اللزوجة عند 20% تقل بزيادة درجة الحرارة حتى تصل الى 0.67 سنتيبويزعند 100˚م ولوحظ بان هذا التاثير عكسي حيث ان الليفان يستعيد لزوجته تدريجيا بانخفاض درجة الحرارة الى 20˚م اما بالنسبة للاس الهيدروجيني pH فكان له تاثير طفيف على اللزوجة عند الرقم الهيدروجيني 4 و10. لقد لوحظ بان الزيادة في تركيز املاح الصوديوم تؤدي الى الزيادة في لزوجة الليفان عند تركيز20% حتى تصل الى 4 سنتيبويز عندما يكون تركيز املاح الصوديوم 10%. تم تحليل نموذج الليفان المستخلص من العزلة B2 وذلك باستخدام تقنية ال FT - IR وقد اظهرت النتائج وجود المجاميع الكيميائية الفعالة (CO) التي تمثل اهتزاز مط ((Stretching و,(CH) (OH) الذي يمثل اهتزاز انحناء ((Bending عند الترددات 1370,1265.2,1093,1165,813.7,945.2سم - 1 ان تحليل الليفان باستخدام تقنية Thin Layer Chromatography اظهرت الليفان كبقعة واحدة سوداء تمثل الفركتوز وكانت قيمة الجريان النسبي((Relative flow لكل من الليفان والفركتوز (0.57) عند استخدام محلول المذيبات الذي يتالف من البيوتانول : البروبانول : الماء المقطر : حامض الخليك بنسبة 7 : 5 : 4 : 2. تمت دراسة تاثير الليفان ودوره كعامل مشجع بريبيوتك ((Prebiotic لنمو البكتريا المفيدة مثل Lactobacillus acidophilus حيث وجد ان الليفان يؤدي الى زيادة عدد البكتريا وبنسبة 172% عند تركيز 2% قياسا مع معامل السيطرة46 %.درس تاثير الليفان في عملية التهام خميرة الكانديدا (Candida) من قبل خلايا الدم البيض Polymorphonuclear (PMNs) خارج الجسم الحي وقد بينت النتائج ان معاملة خلايا الدم البيض مع الليفان كان لها تاثيرا واضحا في تحفيز الخلايا البلعمية وزيادة فعاليتها في عملية الالتهام وبالتالي زيادة معامل البلعمة Phagocytic Index)) وان هذا التاثير يزداد مع زيادة تركيز الليفان مع وجود فروق معنوية كبيرة مقارنة مع معامل السيطرة عند p<0.01)) وان اعلى معامل بلعمة تم الحصول عليه هو 68% عند التركيز 100 مايكروغرام / مل.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum == Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

اسم المؤلف: سعاد علي احمد
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

دراسة التاثير التثبيطي لراشح بكتيريا Lactobacilli المعزولة من مصادر مختلفة على تكوين الغشاء الحياتي لبكتيريا Klebsiella pneumoniae == A Study On inhibitory effect of local Lactobacilli filtrate on formation of Klebsiella pneumoniae Biofilm

اسم المؤلف: سحـر ظاهر عبد عسل
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 312 عينة ادرار وجروح وقشع للمدة من اب الى ايار 2009 في اوعية معقمة من مرضى زائرين لخمسة مستشفيات في مدينة بغداد وشملت المختبرات التعليمية ,م.بغداد التعليمي,م.الشهيد غازي الحريري,م.الواسطي التعليمي للجراحة التقويمية وم.ابن النفيس التعليمي لامراض القلب.شخصت العينات باستخدام الفحوص البايوكيميائية ونظام Api 20 E ووجد ان 155 عزلة تعود لجنس . Klebsiellaحقق النوع Klebsiella pneumoniae اعلى نسبة عزل وصلت الى ما يقرب من 36,13 % في حين شكلت الانواع K. oxytoca وK. terrigena وK. mobilis وK. ornithinolytica حوالي 20,46% و18,06% و16,13% و9,03% على التوالي من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا. فيما يخص نوع العينة، عزلت K. pneumoniae من الادرار (42,16%) مقارنة مع عينات الجروح (31,25%) والقشع (28,57%) من مجموع عزلات جنس الكليبسيلا.في الدراسة الحالية، حددت الاستجابة لمضادات الحياة لعزلات K. pneumoniae جميعها وسجل مضاد الامبيسيلين اعلى نسبة مقاومة (81,5%) تلاه مضادي التتراسايكلين والتراموكسازول بنسبة 74,1% لكل منهما. هذا وكان 59,3% و51,9% و48,1% و40,7% و40,7% و33,3% و22,2% من عزلات K. pneumoniae مقاوما لمضادات النايتروفيورانتوين والسيفوتاكسيم والتوبرامايسين والناليديكسيك اسد والسيبروفلوكساسين والسيفترياكسون والجنتامايسين على التوالي. من ناحية اخرى اظهر مضاد الاميكاسين اقل نسبة مقاومة بلغت 7,41%.قدرت قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحياتي باستعمال تقنية التصبيغ بالبنفسج البلوري في طبق المعايرة الدقيقة وحددت قيمة الكثافة الضوئية عند طول موجي 540 نانوميتر التي مثلت درجة سمك الغشاء الحياتي. وجد ان (22) عزلة وبنسبة (39,29%) من العزلات عالية الانتاجية في حين كانت (34) عزلة وبنسبة (60,71%) عزلة ذات انتاجية جيدة ولم تظهر اية عزلة انتاجية ضعيفة. ومن الجدير ذكره ان العزلات K14 وK15 وK17 وK19 كانت الاكثر انتاجية من بين عزلات K. pneumoniae المفحوصة. علاوة على ذلك اظهرت العزلة K19 اسمك غشاء حياتي.قيمت فعالية مضادي الجنتامايسين والاميكاسين بتراكيزها الدنيا المثبطة (الذين حققا اعلى حساسية من بين المضادات الاخرى المدروسة) ضد تكوين الغشاء الحياتي للعزلات الاربعة K14 وK15 وK17 وK19 . فبالنسبة للعزلتين الاوليتين K14 وK15, بينت النتائج ان الكثافة الضوئية والعدد الحي قد انخفضت معنويا (P<0.05) موازنة مع القيم قبل المعاملة بهذين المضادين. وعند معاملة العزلة K17 بالمضادين نفسهما سجل الاميكاسين انخفاضا معنويا في قيمة الكثافة الضوئية مقارنة مع السيطرة في حين كان هذا الانخفاض غير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. اما على صعيد التعداد الحي فكلا المضادين اظهرا فعالية معنوية ضد الغشاء الحياتي لهذه العزلة. وفيما يتعلق بالعزلة K19 فقد لوحظ ان هناك انخفاضا معنويا في العدد الحي عند المعاملة بالاميكاسين وغير معنويا عند المعاملة بالجنتامايسين. حتى مع هذا الانخفاض في العدد الحي والكثافة الضوئية فان المعاملة بكلا المضادين قد ترك خلايا حية عندمزارع الغشاء الحياتي على اطباق التعداد الحي.اختبرت قابلية الطافي الحامضي والمتعادل لبكتريا Lactobacillus acidophilus (Lb1) وبكتريا L. fermentum (Lb2) في تثبيط الخلايا الهائمة للعزلات K14 وK15 وK17 وK19 باستعمال طريقة الحفر على اطباق مولر هنتون. لم ينجح لا الطافي المتعادل ولا وسط MRS النقي في اظهار فعالية تثبيطية على هذه العزلات. في حين بينت النتائج ان للطافي الحامضي فعالية تثبيطية.وجدت فروق معنوية(P<0.05) في الكثافة الضوئية والعدد الحي بين بيانات قبل وبعد المعاملة بالطافي الحامضي للعزلتين Lb1 وLb2 . بخلاف المعاملة بالجنتامايسين والاميكاسين لم تترك المعاملة بالطافي الحامضي اية خلايا حية خلا حالتين Lb1 ضد العزلة K17 وLb2 ضد العزلة K15 اظهرت خلايا حية. | Three hundred and twelve specimens of urine, wounds and sputum were collected for the period from August 2008 to May 2009 in sterilized containers from patients attending five hospitals in Baghdad including Educational Laboratories, Educational Baghdad Hospital, Gazi Al - Harirri Martyr Hospital, Al - wasity teaching Hospital for Reconstructive surgery and Educational Ibn Al - Nafees Hospital.All specimens were identified using biochemical tests and Api 20 E system, it was found that 155 isolate back to genus Klebsiella.Klebsiella pneumoniae achieved the highest percentages of isolation reached 36.13%; while, K. oxytoca, K. terrigena, K. mobilis and K. ornithinolytica constituted 20.64%, 18.06%, 16.13% and 9.03%, respectively from Klebsiella isolates. Concerning the specimen type, K. pneumoniae was isolated more frequently from urine (42.16%) followed by wound (31.25%) then sputum (28.57%) from Klebsiella isolates.In the present study, in vitro susceptibility of all K. pneumoniae isolates to antibiotics were identified. The highest resistance percentages were found to Ampicillin (81.5%), Tetracycline (74.1%) and Trimoxazole (74.1%). Moreover, 59.3%, 51.9%, 48.1%, 40.7%, 40.7%, 33.3% and 22.2% of the K. pneumoniae isolates were resistant to Nitrofurantoin, Cefotaxime, Tobramycin, Nalidixic acid, Ciprofloxacin, Ceftriaxon and Gentamicin, respectively. On the other hand, Amikacin was the most effective antibiotics since it recorded the lowest resistance percentage; 7.41%. The ability of K. pneumoniae isolates to produce biofilm were evaluated by using crystal violet staining technique in pre - sterilized 96 - well polystyrene microtiter plates and then O.D. was determined at 540 nm. The O.D. represented the degree of the biofilm thickness. Twenty two (39.29%) isolates were considered as high producers while 34 (60.71%) isolates were good producers and none of the testes isolates were poor producers. What's more, K. pnumoniae isolates; K14, K15, K17 and K19 produced the thickest biofilm. Clearly, K. pnumoniae K19 accomplished the highest biofilm thickness.The effect of MIC of Amikacin and Gentamicin, which achieved the highest sensitivity percentage among several antibiotics, was assessed on biofilm. On the subject of the isolates K14 and K15 and the results revealed that the absorbance and viable count for these isolates declined in comparison to pretreatment data. These isolates showed significant differences (P<0.05) after the addition of Amikacin and Gentamicn. According to O.D. parameter, K17showed significant reduction (P<0.05) in comparison to control when treated with Amikacin while in case of Gentamicin there was an insignificant reduction; however, viable count showed that Gentamicin as well as Amikacin had a significant (P<0.05) efficacy on biofilm of K. pneumoniae K17. In regard to the isolate K19 a significant differences were observed when treated with Amikacin while insignificant decrease in viable count was found when the treatment involved Gentamicin. Even with the previous results, all treated biofilms developed presence of live cells when cultured on plate count agar.The ability of acid and alkaline supernatants of Lactobacillus acidophilus (Lb1) and L. fermentum (Lb2) to inhibit planktonic K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 isolates were separately tested on Mueller Hinton agar employing agar well assay. Neither neutralized supernatant nor did sterile MRS broth have an effect on these isolates. Yet, results showed that acid supernatant developed an inhibitory effect.Significant differences (P<0.05) were found in O.D. and viable count between pre and post treatment of K. pneumoniae K14, K15, K17 and K19 biofilms with acid supernatants of Lb1 or Lb2. Unlike the Amikacin and Gentamicin treatment which left live bacterial cells, Lactobacillus supernatant left no live cells except for two cases; Lb1 with K17 and Lb2 with K15.

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه == Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

اسم المؤلف: زهراء عباس جبر العيساوي
اسم المشرف: رسمية عبد ابو ريشة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين == Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

اسم المؤلف: هالة محمد حسين الحسني
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.
1 ... 28 29 30 31 32 ... 81