Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 798

علاقة بعض المعايير الكيموحيوية في مصول مرضى الفشل الكلوي بعوامل الامراضية في عزلات لبكتريا Enterobacter وProvidencia == Study of some biomarkers in patients with kidney failure and it’s relation with virulence factors in Enterobacter and Providencia

Author name: رشا حاتم شايع العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 182 عينة من ادرار ودم المرضى المصابين بالفشل الكلوي والراقدين في ردهات الكلية الصناعية لمستشفى بعقوبة التعليمي ومستشفى مدينة الطب والبالغ عددهم 130 مريضا لمختلف الاعمار ومن كلا الجنسين للمدة من 5/11/2012 - 13/1/2013 . زرعت العينات على اوساط مناسبة لعزل البكتريا . اذ اظهرت النتائج ايجابية 74 عينة 40.7% للنمو البكتيري والذي تضمن 40 عينة دم 54.05% و34 عينة ادرار 45.95% . فيما كانت 108 عينة سالبة للنمو 59.3%.• تم تشخيص 17عزلة تعود لبكتريا (Enterobacter cloacae) وعزلتان تعودان لبكتريا (Providencia rettgeri) من المرضى المصابين بالفشل الكلوي، وبنسبة 9.34% و1.09%على التوالي ، اضافة الى عزل اجناس اخرى من البكتيريا، حيث اوضحت النتائج ان المسبب الشائع للفشل الكلوي هو بكتريا Escherechia coli وبنسبة24.3%، اضافة الى بكتيريتي Klebsiella pneumoniae وProteus mirabilis بنفس النسبة 4.1%، ثم بكتريا Pseudomonas aeruginosa 1.4%7.• عند التحري عن عوامل الامراضية لبكتريا P.rettgeriو E.cloacaeوالمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستيطان اظهرت جميع العزلات والتي تعود لكلا الجنسين امتلاكها لعامل الاستعمار الاول والثالث فيما لم تملكا عامل الاستعمار الثاني. كما اظهرت عزلات E.cloacae وP.rettgeri قدرتهما على التلازن مع مجاميع الدم للانسان بنسب متفاوتة .• اظهرت عزلة واحدة فقط تعود لكلا من E.cloacae وP.rettgeri قابليتها على انتاج الانزيم المحلل للبروتين الخارج خلوي(extracellular protease) في حين لم تظهر اي من العزلات القابلية على انتاج الهيمولايسين كما اظهرت جميع العزلات من كلا الجنسين قابليتها على انتاج السايدروفورات وقدرتها على تكوين المحفظة.• اظهرت نتائج هذه الدراسة قدرة عزلتا بكتريا P.rettgeri على انتاج انزيم اليورييز في حين لم تظهر عزلات بكتريا E.cloacae قدرتها على انتاج انزيم اليورييز.• كذلك اظهرت 12عزلة من مجموع 17من عزلات بكتريا E.cloacae وعزلتا P.rettgeri قدرتها على انتاج البكتريوسين ، وتم قياس فعالية البكتريوسين وتحديد الفعالية النوعية له لكلا من نوعي البكتريا . وبلغت فعاليته وفعاليته النوعية لبكترياE.cloacae 22.8 وحدة / مل و0.542 وحدة / مكغم وعلى التوالي ولبكتريا P.rettgeri 23وحدة / مل و0.286 وحدة / مكغم ، وعلى التوالي . من ذلك لوحظ زيادة تركيز البروتين في البكتريوسين المنتج من قبل P.rettgeri 80.4 مكغم/مل مقارنة بتركيزة في E.cloacae 42مكغم /مل ومنه زيادة فعاليتة في P.rettgeri عن E.cloacae.• اظهرت النتائج قدرة 15عزلة من E.cloacae 88.2% وعزلتا P.rettgeri 100%على انتاج انزيم β - lactamase ، كما اظهرت جميع العزلات ولكلا نوعي البكتريا القدرة على تكوين الغشاء الحيوي (Biofilm) .• اظهرت جميع عزلات E.cloacaeمقاومة تامة لمضاد amoxicillin/ clavulanic acid 100%. في حين كانت المقاومة اقل لكل من المضادات الحيوية ceftriaxone cefoxitine ،82.4 ceftazidime % ثم تليها مضادات cefotaxime ، trimethoprim 70.6% ثم تليها piperacillin،nalidixic acid ،aztreonam ، )azithromycin58.8,53,53,53)% على التوالي ، ثم يليها مضاد gentamycin 41.2 % ثم تليها باقل مقاومة مضاداتneomicin ،nitrofurantoin، ciprofloxacin (29.4, 29.4(23.5, % على التوالي .اما بكتريا P.rettgeri فقد اظهرت مقاومة تامة لكل من مضادات ceftriaxone ،cefoxitine ، ceftazidime ، amoxicillin /clavulanicacid ، gentamicin ،neomicin ، trimethoprim، Azithromycin بنسبة 100% ، في حين كانت المقاومة اقل لكل من مضادات nitrofurantoin، cefotaxime50%.• اظهرت النتائج ان الفئات العمرية الاكثر اصابة بالفشل الكلوي كانت ضمن الفئة العمرية (61 - 70) سنة . فيما تبين ان المرض يصيب الذكور والاناث ، مع ارتفاع نسبة اصابة الذكور 56.2% على الاناث 43.8% . كما اظهرت معايير مصول المرضى ارتفاع مستويات اليوريا والكرياتنين في مصل الدم ليبلغ معدل (11.6 - 50)ملي مول/لتر و(45 - 1000) مايكرومول/لتر وعلى التوالي .• تم الكشف عن وجود علاقة بين الانزيم المؤكسد لحامض اللاكتيك LDH)) ومرض الفشل الكلوي وكذلك علاقتة الانزيم بعوامل الامراضية لبكتريا E.cloacae وP.rettgeri،حيث وجد في هذه الدراسة ان انزيم LDH)) يكون مرتفع عن القيمة الطبيعية في حالة مرض الفشل الكلوي (قبل الديلزة الدموية) مقارنة بالاشخاص الطبيعين .حيث بلغ مستوى الانزيم عند وجود بكتريا E.cloacae 213.50 وحدة / لتر وبكتريا P.rettgeri 214.52وحدة / لتر . ومقارنة بالاشخاص الطبيعيين 153.63 وحدة /لتر | One hundred eighty two urine samples were isolated from patients who were resident of the industrial kidney unit of Baquba Teaching Hospital and Medical City Hospital suffering from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 5/11/2012 - 31/1/2013. The samples were cultured in a suitable culture media for isolation the bacteria. The results showed that 74 samples (40.7%) were positive for bacterial growth, It included 40 blood samples (54.05%) and 34 urine samples (45.95%).While the rest samples (i.e. 108) were negative for bacterial growth (59.3%). • The results also showed that 17 isolates have been diagnosed as E .cloacae and two have been diagnosed as P.rettgeri with a percentage of 9.34% and 1.09% respectively. Other genus were also isolated, The results showed that common cause is bacteria Escherechia coli with a percentage of 24.3% , Klebsiella pneumonia , Proteus spp. with a percentage of 4.1% and Pseudomonas aeruginosa 1.4%. • P.rettgeri and E.cloacae showed a possession of the first and third colonization factors with a percentage of 100% and both genera showed the ability to agglutinate human blood group with a variable proportions. • One isolate only of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce of extracellular protease while none of the isolates had the ability to produce hemolysin, and all of the isolates showed the ability to produce sydrophorat and capsule formation. • The results of this study showed that the genus P.rettgeri has the ability to produce the enzyme urease while the genus E.cloacae hasn’t had the ability to produce urease. • 12 out of 17 isolate of E.cloacae and the two isolate of P.rettgeri ability to produce bacteriocin. the activity of bacteriocin was measured and the qualitative activity was measured for both the two species,its activity and qualitative activity for E.cloacae were 22.8 unit/ml and 0.542 unit /µgm respectively and for P rettgeri 23 unit/ml and 0.286 unit /µgm respectively .From that we can notice that the increase in protein concentration produced by P.rettgeri 80.4 µgm/ml compared with the concentration in E. cloacae 42 µgm/ml and therefore increasing its efficiency in P.rettgeri compared with cloacae. • The results showed that 15 isolates of E.cloacae 88.2% and the two isolates of P.rettgeri 100% have the ability to produce the enzyme β - lactamase; all the isolates of P.rettgeri and E.cloacae had the ability to produce biofilm. • All E.cloacae isolates revealed a resistance to the antibiotic amoxicillin/ clavulanic acid with a percentage of 100%, ceftriaxone cefoxitine and ceftazidime 82.4, cefotaxime and trimethoprim 70.6, and piperacillin, nalidixic acid aztreonam and azithromycin with a percentage of (58.8,53,53,53)% respectively Followed by the antibiotic gentamycin 41.2 Followed by the least resistance to neomicin, nitrofurantoin and ciprofloxacin (29.4,29.4 and 23.5)% respectively.The genus P.rettgeri showed resistance against the antibiotics ceftriaxone, cefoxitine, ceftazidime, amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, neomicin, trimethoprim and azithromycin 100% while this genus showed less resistance against nitrofurantoin and cefotaxime 50%. • The results showed that the most age group infected with kidney failure is between (61 - 70) years. The disease affects women and men alike with a higher proportion of males infection 56.2% over females 43.8%. Patients sera standards showed high levels of urea and creatinine levels in blood serum to rate (11.6 - 50)m mol/L,(45 - 1000)M mol/L respectively. • It was revealed the existence of a relationship between lactic acid oxidative enzyme and kidney failure disease also the relation between the enzyme and virulence factors of P.rettgeri and E.cloacae , It was found in this study that the enzyme (LDH) have higher values in the case of natural situation of kidney failure patient (before dialyziz) compared with normal peoples where the level of the enzyme in the presence of E.cloacae (213.5)unit/L and (214.52) unit/L compared with normal peoples (153.63). • A study of the impact and effectiveness of the enzyme lysozyme in the analysis of the cell wall of the bacteria E.cloacae and P.rettgeri was done, the results showed that the highest effectiveness of the bacterial enzyme reached (0.388 and0.329) unit/L at concentrations (100,200) mg/ml respectively. The enzyme inhibited the growth of both types of bacteria to reach the highest areas of growth inhibition of both E.cloacae and P.rettgeri (25,20) mm at concentrations of the enzyme (100, 200) mg/ml respectively. The statistical analysis showed significant differences at the level (p>0.05).

عزل وتشخيص بكتريا Yersinia enterocolitica من بعض المصادر السريرية والبيئية

Author name: رعـد ناجي حسن الفلاحي الحسني
Supervisor name: هشام عطا شحاذة | ضحى سعد صالح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: لغرض دراسة تواجد وانتشار بكتريا (Yersinia enterocolitica) في مناطق مختلفة من العراق ودراسة قابليتها على احداث المرض تم ولاول مرة في القطر التحري عن هذه الجرثومة في 422 عينة مختلفة المصادر شملت عينات الاسهال الدموي الحاد(Acute Bloody Diarrhea) (150) عينة , و(37 ) عينة من حالات الاصابة بالتهاب الزائدة الدودية الحاد(Acute Appendisitis) , و(60) عينة من مياه نهري دجلة والفرات, و(15) عينة من مزارع المواشي, و(100) عينة من محلات بيع لحوم الاغنام المحلية, و(60) عينة من معلبات اللحوم (المستوردة) من السوق المحلية.جمعت العينات السريرية من عشر مستشفيات متوزعة في مناطق مختلفة من العراق فيما يخص عينات الاطفال المصابين باسهال دموي حاد وحالات التهاب الزائدة الدودية الحاد ، وشملت العينات البيئية مياه من مناطق متفرقة من نهري دجلة والفرات، كما تمت دراسة لعينات لحوم اخذت من محلات بيع اللحوم الطازجة في ثلاث محافظات هي الانبار وبغداد وديالى . واخرى من لحوم المعلبات المستوردة.شمل البحث ايضا دراسة لعدد من العينات الماخوذة من مزارع المواشي في الاسحاقي والصويرة ومزرعة الجسامية في مدينة الفلوجة . لقد تم الحصول على عزلات عائدة لبكتريا Yersinia enterocolitica من 27 عينة شخصت هذه العزلات اعتمادا على الفحوصات الخاصة بالتشخيص الاولي والتي تضمنت الاغناء البارد(Cold Enrichment ) وتنمية العزلات على وسط (CIN agar )( Cefsulodin - Irgasan - Novobiocin agar ) ثم فحص اشكال المستعرات واشكال الخلايا وتفاعلاتها مع ملون غرام(Gram Stain) وفحص انظيمي الاوكسيديز ( Oxidase ) والكاتاليز ( Catalase ) واخضاع البكتريا للفحوصات الكيموحيوية المتضمنة لتخمر السكريات المختلفة وتم ايضا تنميط العزلات مصليا بالاعتماد على الطرائق العلمية المعروفة واظهر التنميط المصلي ان غالبية العزلات السريرية وعزلات اللحوم المعلبة تعود للنمط المصلي (O : 8) اما العزلات البيئية فتعود للنمط المصلي (O : 9) وتعود عزلات اللحوم العراقية للنمط ( O : 3).درست حساسية العزلات للمضادات الحيوية (Antibiotic Sensitivity ) واظهرت النتائج حساسية العزلات لمضادات Chloramphenecole ,Ciprofloxacin, Gentamycin ,Tetracycline ,Trimethoprim ,Sulphafurazole ومقاومتها لمضادات Clavulonic acid, Carbincillin, Ampicillin Ticarcillin,Amoxicillin ، ودرست ايضا قابلية هذه العزلات على انتاج انظيم البيتالاكتميز(β - lactamase ) بينما اظهرت بعض العزلات قابليتها على انتاج هذا الانظيم، ودرست قابلية البكتريا على احداث التهاب الامعاء والاسهال باستخدام الفئران التجريبية، كما اظهرت دراسة المحتوى البلازميدي احتواء اغلب العزلات على حزم بلازميدية باعداد متفاوتة تعتمد على مصدر العينة المعزولة منه البكتريا والمرض المسببة له، كما درست قابلية البكتريا على الحركة في درجتي حرارة 22مو37م واظهرت النتائج قدرتها على الحركة في درجة 22 درجة مئوية وعدم قدرتها على الحركة في درجة 37 درجة مئوية. | Serving the purpose of studying the presence and spreading of Yersinia enterocolitica in different areas in Iraq and to study its pathogenesis. The bacteria was detected in 422 different specimen comprising acute bloody diarrhea (150 specimen) cases of Acute Appendicitis (37 specimen), specimens were taken from Tigris and Euphrates water (60 specimen), from Cattle farms (15 specimen), from local sheep shopping (100 specimen), others taken from imported canned meat and other heat specimens taken from local market (60 specimen). The Clinical Specimens were taken from 10 different hospitals in various areas in Iraq concerning specimens from children infected with acute B.d. & acute Appendicitis. Whereas water specimens were taken from Tigris & Euphrates. Fresh meat samples were taken from the local butchers stores from three different districts; Anbar, Baghdad and Dyala. Other samples were taken from imported meat. The research comprised the study of several samples from cattle farms in Al - Eshaqi , Al - Sowera and Jassamiya in Falluja City. Bacteria Yersinia enterocolitica was isolated from 27 samples, these isolates were identified according to prelimary testing using Cold Enrichment, growing isolates in (CIN agar) (Cefsslodin - Irgsan - Novobiocin agar) and examination of colony and cell shapes and their interacting with Gram Stain and Oxidase testing Catalase and submitting Bacteria for Bio - chemic at test containing various sugar fermentation. In addition, isolates were sorted Plasmatic depending on the known scientific methods. This sorting showed that most tested isolates and canned meat isolates belong to serum type (O : 8). Whilst ambiance serum belongs to type (O : 9) and Iraqi meat isolates were of type (O : 3). Antibiotic sensitivity of the isolates are determined. The results showed isolates sensitivity for Chloramphenecole, Ciprofloxacin, Gentamycin, Tetracycline, Trimethoprim and Sulphafurazole and its resistance to Ampiciline, Carbinicillin, Clavulonic acid, Ticarcillin and Amoxicillin in the meanwhile ability of these isolates to produce β - lactamase was studied. The ability of Bacteria to produce bowl inflammation and diarrhea was studied by using experimental rats. Plasmids reveals the container of different numbers of plasmadic bands depending on the source of the isolate. Besides, the movement ability of the bacteria at 22C and at 37C were studied. The results explained its movement ability at 22C and its inability of movement at 37C.

بعض المظاهر المناعية للمرضى المصابين بفايروس التهاب الكـبد C في محافظة اربيل == Some Immunological Aspects of Patients Infected with Hepatitis C virus in Erbil Province

Author name: زاكروس كمال احمد البرزنجي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ | ماجد محمد محمود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was designed to fined out the prevalence of anti - HCV in thalassemics and diabetic patients and HCV viremia in anti - HCV positive patients, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection, and to fined out a possible diabetogenic role for HCV infectionThis study was carried out in Erbil province for the period Feb 2006 to March 2007. Different diagnostic test approaches are used like 3rd generation ELISA, RT - PCR to detect HCV infection and ELISA for cytokine determination. The screened patients and control group including : (347) β - thalassemics, (786) diabetic patient, and (465) as control population were subjected to above tests for the purpose of clarifying the sensitivity and specificity of ELISA vs PCR in risk and control groups moreover, to delineate the role of TH1 cytokines in HCV infection.The results can be briefly summarized as following : Anti - HCV anti body were detected among (28.24%) (5.97%), and (0.43). of thalassemics, diabetics, and control population. RT - PCR testing revealed (88.77%), (68%) positivity among anti - HCV positive thalassemics, and diabetics cases screened by ELISA test.Cytokine levels in thalassemics for TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 were significantly higher in PCR - confirmed HCV cases than in HCV - negative thalassemics (P < 2.017E - 17), (P< 1.67E - 5), and (P< 6.048E - 8) respectively. A statistically higher significant levels of TNF - α, IFN - γ, and IL - 2 demonstrated also in thalassemic patients (PCR - confirmed HCV thalassemics and, HCV - negative thalassemics ) than in healthy controls In diabetic patients revealed only high significant association between PCR confirmed HCV infection and increased level of TNF - α (P < 1.19E - 10).Statistically significant high level of TNF - α only was detected among diabetic patients (PCR - confirmed HCV diabetics and, HCV - negative diabetics) than healthy control group (P < 1.19 E - 10).In PCR confirmed - HCV thalassemic patients (4.6%) were found to be diabetic in comparison with (0.9%) in HCV - negative thalassemic group.This study clearly demonstrates the highly prevalence of HCV - infection among thalassemic patients and to a lesser extent in diabetics.The elevation of TH1 cytokines (TNF - α, IFN - γ, and IL - 2) in thalassemics may contribute to cell mediated immunity and may be related to other infections not just HCV as a reason of frequent blood transfusion. The Study also confirm that the

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لنباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو بعض البكتريا المعزولة من اخماج الحروق == The Effect of Watery & Alcoholic Plant Extracts of Citrullus colocynthis & Solanum nigrum On Growth of Some Bacteria Isolated from burn Infections

Author name: زيد شاكر ناجي محمود الربيعي
Supervisor name: ياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة لمعرفة تاثير المستخلصات المائية والكحولية لثمار نباتي الحنظل Citrullus colocynthis وعنب الذيب Solanum nigrum في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli .تم الكشف عن المركبات الفعالة الموجودة في كل مستخلص ولكلا النباتين , اذ تبين نتائج الكشوفات الكيميائية لمستخلص الحنظل ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات . وان هذه المركبات لها القابلية على الذوبان في الماء , اما المستخلص الكحولي لثمار الحنظل فيحتوي ( بالاضافة الى ما ذكر ) على مركبات راتنجية وكومارينات وزيوت طيارة , وهذه المركبات لا تذوب بالماء , ولكنها تذوب بالمذيبات العضوية.و بالنسبة الى مستخلصات ثمار عنب الذيب فقد اظهرت نتائج الكشوفات الكيميائية ان المستخلص المائي يحتوي على كلايكوسيدات , فينولات , قلويدات , تربينات , صابونيات , تانينات وفلافونات , واما المستخلص الكحولي فانه يحتوي على المركبات الفعالة نفسها الموجودة في المستخلص المائي بالاضافة الى الراتنجات .لدراسة تاثير المستخلصات النباتية لثمار نبات الحنظل وثمار نبات عنب الذيب في نمو البكتريا المعزولة من اخماج الحروق , تم تحضير نوعين من المستخلصات ولكلا النباتين وهما : المستخلصات المائية والمستخلصات الكحولية .بالنسبة الى مستخلصات نبات الحنظل كان المستخلص المائي اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 480 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الكحولي وللتركيز نفسه ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11 ) ملم وعلى التوالي.اما بالنسبة الى مستخلصات نبات عنب الذيب كان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي على الانواع البكتيرية بتركيز ( 480 ملغم/ مل ) وبمعدلات اقطار تثبيط ( 16.33 , 20.66 , 18 , 16.33 ) ملم لكل من : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. وE. coli وعلى التوالي مقارنة مع المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , وبمعدلات تثبيط ( 16.33 , 20 , 15.33 , 15.33 ) ملم على التوالي عند التركيز نفسه .كانت البكتريا St. aureus ( الموجبة لصبغة كرام ) اكثر الانواع البكتيرية تحسسا لفعل المستخلصات النباتية مقارنة مع الانواع الاخرى السالبة لصبغة كرام , وكانت البكتريا Klebsilla spp. اكثر الانواع البكتيرية مقاومة لفعل المستخلصات النباتية .وبما ان المستخلص المائي هو اكفا من المستخلص الكحولي لنبات الحنظل, وان المستخلص الكحولي اكفا من المستخلص المائي لنبات عنب الذيب , فقد تم المزج بين المستخلصين بنسبة 1 : 1 ودرس تاثير المزيج على البكتريا قيد الدراسة , وقد تبين ان خلط المستخلصين معا لم يعط اي تاثير ضد البكتريا . | This study was done to determine the effect of watery and alcoholic extracts of two plants : Fruits of Citrullus colocynthis and Berries of Solanum nigrum on growth of bacteria isolated from infected burns which are : Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli .Evaluation of active ingredients found in each extract for both plants determined.The biochemical analysis revealed that watery extract of Citrullus colocynthis contains : Alkaloids, Glycosides, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones , while the alcoholic extract contains : (in addition to the above mentioned compounds ) Coumarines, Resins and Volatile oils.The biochemical analysis of the watery extract of Solanum nigrum showed that it contains : Alkaloids, Glycosides, Phenols, Tannins, Saponines, Terpenes and Flavones, while the alcoholic extract contains the same active materials in addition to Resins.The effect of watery extract of Citrullus colocynthis on the bacterial growth revealed that at a concentration of 480 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15.67 , 19.66 , 14 , 15 ) mm for Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Klebsilla spp. and Escherichia coli respectively , when compared with alcoholic extract which were ( 11.66 , 19.33 , 0 , 11) mm respectively.The study also showed that staphylococcus aureus ( gram positive ) bacteria is most sensitive to plant extract's than the gram negative bacteria , while Klebsilla spp. were most resistant to plant extracts than the others.Because water extracts of Citrullus colocynthis were more effective than the alcoholic extracts , while alcoholic extracts of Solanum nigrum were more effective than watery extracts.A mixture of both extracts was prepared in a proportion of 1 : 1 wt : wt and used to test it's effect on the studied bacteria. No effect have been detected therefore it's useless to use the above mentioned mixture in treatment.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية == Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

Author name: رؤى عبد السادة جبار
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

التوصيف الجزيئي لذيفاني Panton Valentine leukocidine وExfoliatine في العزلات المحلية لبكتريا المكورات العنقودية المقاومة للمثسيللين == Molecular characterization of Panton Valentine leukocidine and Exfoliatine toxins in local isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | محمد فرج المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 100 عزله تعود لبكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيللين من المرضى المصابين بالاصابات الجلديه المختلفة (52 عزله من الجروح)و(32 عزله من الخراج )و(16 عزله من الحروق) والوافدين الى مستشفيات ابن البلدي ومستشفى حماية الاطفال والجراحات التخصصيه ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بغداد التعليمي والمختبرات التعليميه في بغداد للفتره من ايلول ولغايه كانون الاول 2013. اختبرت حساسية جميع العزلات تجاه 13 مضادا حيويا مختلفا وقد اظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Cloxacillin بنسبة (100%) ، يليها المقاومة لمضاد Cefoxitin (86%) ومضاد Cephalexine ( 51% ) ، فيما كانت اقل نسبة مقاومة تجاه مضاد Teicoplanin ( %4). تم الكشف عن امتلاك العزلات لجينات pvl وeta وetb المشفرة لذيفانات Panton Valentine leukocidin وExfoliatin باستعمال تقنيه تضاعف البلمره المتسلسله PCR)) ، اظهرت النتائج امتلاك 27 عزله (27%) لجين pvl وامتلاك 13 عزلة (13%) لجين eta فيما لم تظهر اي عزلة امتلاكها لجين.etb 16 عزله منتجه لجين pvl وعزلتان منتجه لجين eta ارسلت الى NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM لتحديد تعاقب القواعد النتروجينيه لجين pvl وeta في عزلات بكتريا S. aureus وبعد تحليل النتائج وجد ان نسبة (58.44%) من الطفرات في الجين pvl الشريط R هي طفرات استبدال و(.66%37( طفرات حذف و.89%)3(طفرات ادخال بينما كان .21%)34( من الطفرات في الجين pvl الشريط F هي استبدال و.89%)57(طفرات حذف و(.89%7(طفرات ادخال. وفيما يخص الجين eta فكانت )100%) من الطفرات هي طفرات حذف لكل من eta - R وeta - F.. انتخبت العزله رقم ( 84 ) لاستخلاص وتنقيه ذيفان PVL ،وقد انتج الذيفان بعد مرور 24 ساعه من الزرع، رسب بعدها الذيفان باستعمال كبريتات الامونيوم (حد الاشباع 80%) ومن ثم التنقيه باستخدام عمود المبادل الايوني DEAE - cellulose بعدها عمود كروموتوغرافي الترشيح Sepharose 6B ومن ثم عمود كروماتوكرافي hydroxyl apatite الكاره للماء . قدر تركيز البروتين عند كل خطوه من خطوات التنقية وقد بلغ التركيزعند اخر خطوه من التنقيه.43 22 مايكروغرام /مل ،وصف الذيفانPVL وحدد الوزن الجزيئي له بواسطة هلام الترشيح sepharose 6B وباستخدام منحنى قياسي لعلاقة لوغارتم الوزن الجزيئي وخاصية Ve/Vo وبوجود محاليل البروتينات القياسيه، اذ حدد الوزن الجزيئي للذيفان فكان 35448دالتون . لوحظ النشاط السمي للذيفانPVL ضد كريات الدم البيضاء متعددة النوى بظهور الثقوب في هذه الخلايا وبعد فترات حضن مختلفه مع الذيفان عند تركيز 10 مايكروغرام /مل اذ ادى ازدياد التركيز الى تحطم الكريات متعددة النوى مما يشير الى موت الخلايا وتنخرها اعتمادا على تركيز الذيفان. حدد التاثير السمي الخلوي للذيفانPVL بتحديد الجرعة القاتله النصفيه 50% من الحيوانات المختبريه اذ ظهرت النتائج ان نسبة موت الفئران (50%)حدثت بعد مرور 24 ساعة وعند تركيز 10 مايكروغرام /مل .اظهرت الفحوصات النسجيه قدرة ذيفانPVLعلى احداث الاصابه في بعض اعضاء الفئران المصابه تجريبيا عندما حقنت الفئران البالغه في الصفاق بتراكيز الذيفان (5،10،15،20،22.43) مايكروغرام /مل .اخذت الاعضاء وعملت المقاطع النسجيه بعد ساعتين ثم بعد 24 ساعة وكذلك قتلت مجموعه من الفئران بعد 24 ساعه من التجريع الانفي بالذيفانPVL لتفحص بعدها الاعضاء نسيجيا.اثبتت نتيجه الفحص النسيجي للاعضاء ظهور تنخربانسجة الرئه وارتشاح الخلاياالالتهابيه وتنخرانسجه الكبد وتضخم بانسجة الطحال | One hundred isolates of Methicillin resistant Staphylococcus aureus were obtained from patients suffering from a variety of skin infections (52 isolates from wound ) , ( 32 isolates from abscess) and (16 isolates from burn), from patients at hospitals of Baghdad governorate included Ibn - El Balady, Martyr gazi Alhariry for specialized surgery hospital, Welfare teaching hospital, department of teaching laboratories and Baghdad teaching hospital at a period between September until November 2013 and were identified by morphological and biochemical tests , all of them were tested for their susceptibility to 13 of antibacterial agents, and all isolates were resistant to cloxacillin(100%) ,followed by cefoxitin (86%) and cephalexin (51 %), 26% to lincomycin, 24% to Azithromycine ,23% to trimethoprim and 22% to rifampicin,18% to gentamycin, 17% to vancomycin, ,13% to clindamycin and levofloxacine while the minimum resistance were seen with teicoplanin (4%).All isolates were detected for pvl,eta and etb by amplification of genes by PCR technique ,results showed that from 100 isolates ( 27%)Carry pvl gene,(13%) carry etA gene, while etB gene did not appear in any isolate.Polymerase chain reaction Product of pvl gene for sixteen isolates of S.aureus and two isolates of eta gene were sent to NICEM/USA - machine is ABI3730XLAppliedBIOSYSTEM to determine nucleotides sequencing and were achieved by using the applied biosystem (ABI) Capillary system, that mutation on pvl - R (58.44%) was subsititution mutation , (37.66%) was deletion and(3.89%) was insertion ,pvl - F (34.21%) was subsititution,( 57.89%) was deletion and(7.89%) insertion, on eta (100%) was deletion . One of pvl positive isolate (No.84) was selected for extraction and purification of Panton valentine leukocidin ,this toxin was produced after 24 hr of inoculation and it increased during the beginning of stationary phase .Panton valentine leukocidin toxin was precipitated by ammonium sulphate (80% saturation ) and purified using ion exchang byEDAE - cellulose, gel filtration chromatography by sepharose 6B, and hydro phobic interaction chromatography by hydroxyapatite. Protein concentration in each step of purification was determined ,protein concentration in the last step of purification was22.43µg/ml . PVL characterized , Mwt was determined by gel filtration sepharose 6B .The standard curve that represent the relationship between Log M.Wt and Ve/Vo for standard protein.The molecular weight of PVL toxin was determined as 35448 Da. The leukotoxic activities of PVL toxin was down by pore forming occurrence on PMNs after incubation with 10 µg/ml concentration PVL with in different incubation period ,when increase concentration lead toPMNs rupture Thus, the modes of cell death in vivo (necrosis versus apoptosis) may critically depend on the PVL concentration.Cytotoxicity of PVL was detected when determined the dose which cause death of 50% of laboratory animals. The result showed the death percentage of mice after 24hr were 10µg/ml.Histopathological investigations proved the ability of PVL toxin to cause the infections in the most organs of infected experimentally mice. Adult mice were injected intraperitonially with PVL at a different concentration (22.4, 20,10,5) g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 2hr,24hr.also living mices were killed after 24hrs after endotracheal instillation with 20 g/ml PVL toxin.Histological examination were done for organs (liver, spleen and lung) .Results showed the existence of lesions and necrosis Damage and necrosis of aleveolar tissue ,odema, emphysematous chang chronic inflammatory cell infiltration and destruction in lung with degeneration and necrosis hepatic cell and spleen enlargement of white pulp with mild necrosis of parenchymal tissue

مسح لمسببات التلوث البكتيري في وحدة الكلية الصناعية وحساسيتها للمضادات الحيوية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Survey of Bacterial contamination in Dialysis Unit and antibiotics susceptibility in some hospitals in Baghdad

Author name: زياد طارق نعمان شهاب
Supervisor name: نزار ادور ناصر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـم في هذه الدراسة جمع (204) عينة من مستشفيات مدينة بغداد ، وهي كـل مـن ( مستشفى بغداد التعليمــي/ وحدة الكلية الصناعية. ومستشـفى الكرامة التعليمـي / وحدة الكلية الصـناعية ) ، للفـترة مـن كانون الاول 2009 لغاية منتصف اذار 2010 .شملت العينات مسحات من بيئة وحدة الكلية الصناعية التي تضمنت 12 موقـعا وهي كـل من ( الاسرة والمفروشات والارضـية والجـدران والسـطح الخارجي لجـهاز الديـلـزة وجلد المرضى الراقـدين والادوات الطـبية ذات الاسـتخدام الــيدوي وملابـس الكادر الطـبـي وانابيـب دخول وخـروج الماء داخـل جـهاز الديـلزة وفتحات جـهاز الـتبريد والــتدفئـة وادوات الطـعام والاثاث الخشبي والمغاسـل فضلا عن عـينات من هـواء الصالـة وتم الحصول على النتائج الاتية : 1 - كان عدد المسحات والعينات الموجبة (95) عينة من ( 204 ) عينة وبنسبة (%46.56) واحتوت بعـض المسحات على اكثر من عزلة بكتيرية واحدة .2 - تم الحصول على (139) عزلة اجمالية من مجـموع العـينات الموجـبة كان مـنها (122) عزلة بكتيرية نقية مشخصة . شملت هذه العزلات كل من بكتريا Staphylococcus spp. وAcinetobacter spp. وPseudomonas spp. وKlebsiella spp. وCitrobacter freundii وEscherichia coli وEnterobacter spp. وAlcaligens spp. وStenotrophomonas maltophilia وBordettella spp. وOchrobacter anthropi وProteus spp. وShigella spp. وFlavomonas oryzihabitans وPasturella pneumotropica وChrysemonas lutula وBacillus spp. وNocardia spp. وEnterococcus spp. . فقد تم تشخيص هذه الـعزلات عن طريق الصـفات المظهرية والمزرعـية للمستعمرات وكـذلك عن طريـق الفحص المجهري للخلايا وباستخدام الفحوصات الكيموحياتية فضلا عن استخدام فحص API test لغرض التشخيص الدقيق للعزلات .3 - اظهرت العينات الماخوذة من هـواء الصالة والمغاسل نسبة عالية من الثلوث فقد كانت نسبة التلوث لكل منهما (%81.8) بعـدها جاءت الارضية والجـدران تلـيها الاسرة والمفروشات وبنسبة تلوث للعينات الماخوذة بلغت (%58) و(%53) على التوالي .4 - كانت بكتريا المكورات العنقودية الاكثر انتشارا في بيئة وحدة الكـلية الصناعية حيث تم الحصول على (47) عـزلة منها وبنسبة (%38.5) من اجمالي العزلات والتي كانت (122) عـزلة مشخصة . 5 - كانت بكتريا Acinetobacter spp. الاكثر انتشارا من بين العصيات السالبة لصـبغة كرام بعدد عزلات بلغ (15) عزلة من اصـل (65) عزلة سالبة لصبغة كرام وبنسـبة مئوية بلغت (%23.07) من مجموع العـزلات السالبة لصبغة كـرام ونسبة (%12.2) من مجموع العزلات الكلية، تليها كل من بكتريا Pseudomonas spp. وKlebsiella spp. وبنسب مئـوية بلغت (%10.6) و(%4.9) على التوالي من مجموع العزلات الكلية6 - تم التحري عن حساسية (70) عزلة بكتيرية مختلفة لاثني عشر مضادﴽ حيويا وهي كـل Amikacin وAmoxicillin / clavulanic acid وCiprofloxacin وCefotaxim وCefexime وChloramphenicol وGentamycin وPiperacillin وTrimethoprime وOfloxacin وVancomycin وNalidixic acid .7 - اظهرت بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية جدا تجاه المضاد الحيوي Cefexime فقد بلغت نسبة مقاومة هذا المضاد (%100) ، كما اظهرت العزلات مقاومة مرتفعة تجاه كل من المضادات الحيوية Cefotaxime وGentamycin وNalidixic acid حيث بلغت نسبة المقاومة لهذه المضادات (%60) . في حـين اظهـرت هذه العـزلات مقاومة منخفـضة تجاه كـل مـن المضادات Chloramphenicol وCiprofloxacin وOfloxacin وبنسبة مئوية بلغت (%10) لكل مضاد. 8 - اظهرت بكتريا Staphylococcus epidermidis مقاومة بنسبة (%100) للمضاد الحيوي Cefexime ، في حـين كانت نسـبة مقاومة البـكتريا للمـضاد الحـيوي Cefotaxime هـي (%58) كـما كانت نسـبة مقاومتها للمـضادات الحـيوية Nalidixic acid وTrimethoprime (%50) لكـل مـن هذه المـضادات. 9 - كانت بكتريا المكورات العنقودية جميعها حساسة بنسبة (%100) للمـضاد الحيوي Amikacin .10 - اظهرت بكتريا Pseudomonas spp. مقاومة عالية تجاه المضادين Cefotaxime وNalidixic acid وبنسبة مقاومة بلغت (%66) كما كانت نسـبة مقاومة كـل من المضادين Trimethoprim وVancomycin (%55.5) و(%44.4) على التوالـي في حين لم تظهر مقاومة للبكتريا تجاه المضاد الحيوي Amikacin وPiperacillin وOfloxacin وAmoxicillin/ Clavulanic acid .11 - كانت عزلات بكتريا Klebsiella spp. مقاومة بنسبة (%100) لكل من المضادات الحيوية Cefixime وTrimethoprim وVancomycin ، كما اظهرت البكتريا نسـبة مقاومة للمضادات الحـيوية Cefotaxime وPiperacillin وAmoxicillin/Clavulanic acid بلـغت (%66.6) ، يلـيها المضاد الحـيوي entamycin بنسبة مقاومة بلغت (%50) . وكانت بكتريا Klebsiella spp. البكتريا الوحيدة التي اظهرت نسبة مقاومة للمـضاد الحيوي Amikacin بلـغت (%16.6) .12 - تم اجراء فحص MICs لخمسة من المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وهي Amikacin وAmoxicillin / Clavulanic acid وCefotaxime وGentamycin وCiprofloxacin . على البكتريا الاكثر حساسية او الاكثر مقاومة واظهرت العزلات جميعها التي اجري لها الاختـبار نسبة MICs واطـئة تجاه المضاد الحيوي Amikacin حيث تراوحت بين (8 - 1) مايكروغرام/مليلتر حيث كانت العزلات حساسة بشكل كبير للمضاد الحيوي المذكور.13 - اظهرت العزلات قيم MICs مرتفعة للمضاد الحيوي Cefotaxime حيث تراوحت القيم ما بين (128 - 2) مايكروغـرام/ مليلتر بالنـسبة لبكـتريا S. aureus في حين تراوحت القيم مابين (512 - 8) مايكروغرام/مليلتر بالنسبة لباقي المكورات العنقودية السالبة لفحص Coagulase ، اما بالنسبة لعزلات كل من بكتريا Klebsiella spp. وAcinetobacter spp. فـقد كانت قـيم MICs لها للمضاد المذكور تتراوح مابين (512 - 2) مايكروكرام / مليلتر . في حين اظـهرت عزلات بكتريا Pseudomonas spp. قيمMICs منخفضة للمضاد نفسـه حيث تراوحت القيم بين (2.0 - 0.25) مايكروكرام / مليلتر . | In this study has collected (204) samples from the hospitals of Baghdad, these are (Baghdad teaching hospital/Dialysis unit & AL karama teaching hospital/ Dialysis unit), for the period of December 2009 to March 2010.The samples included swabs ofartificial kidney unit environment that has 12 positions these are (beds, furniture, ground, walls, external surface of dialysis, skin of asleep patients, medical instruments - use manual, clothes of medical stuff, tubes of enter and out water inside of dialysis, slots cooling and heating device, Eating utensils, wooden furniture &sinks as well as samples of hall air and it has obtained the following results : 1 - The number of swabs & positive samples was (95) sample from (204) sample in the rate of (46.56%) some of swabs contain more than one bacterial isolate.2 - It has obtained (139) total isolate from the positive samples amount (122) of that were bacterial pure diagnostic isolates all of these isolates included the following kinds of bacteria : Staphylococcus spp., Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Klebsiella spp., Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter spp., Alcaligens spp., Stenotrophomonas maltophilia, Bordettella spp., Ochrobacter anthropi, Proteus spp., Bacillus spp., Chrysemonas lutula, Pasturella pneumotropica, Nocardia spp. and Enterococcus spp. They have diagnosed these isolates by Phenotypic & farming characteristics of colonies & by Microscopic examination for cells by using bio - chemical tests as well as using API test for the purpose of accurate diagnosisfor isolates.3 - The samples taken from the hall air and sinks showed a high rate of pollution that were (81.8%) for every sample after that they were ground followed by beds, furniture, And by contamination of the samples taken at (58%) and (53%) respectively.4 - Staph bacteria were most prevalent in the environment of artificial kidney unit was obtained (47) isolate of them at (38.5%) of the total isolates, which was (122) diagnosed isolate.5 - Acinetobacter spp. were most prevalent among the negative bacilli of gram stain in the number of isolates was 15 out of 65 negative isolate of gram stain and a percentage amounted to 23.07% of the total isolate Followed by Pseudomonas spp. & Klebsiella spp. at (10.6%) & (4.9%) of the total isolates respectively.6 - It was investigated for sensitivity (70) bacterial isolates of twelve different antibiotics and are all of the : Amikacin, Amoxicillin /clavulanic acid, Ciprofloxacin, Cefotaxim, Cefexime, Chloramphenicol, Gentamycin, Piperacillin, Trimthoprime, Ofloxacin, Vancomycin and Nalidixic acid.7 - Staphylococcus aureus showed very high resistance to the antibiotic Cefaxime The ratio of this counter - resistance (100%), isolates also showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime, Gentamycin & nalidixic acid Where the percentage of resistance to these antibiotics (60%).While these isolates showed low resistance to both antibiotics Chloramphenicol, Ciprofloxacin & Ofloxacin at (10%) to both antibiotic.8 - Staphylococcus epidermidis showed resistance by (100%) to antibiotic Cefexime, while the ratio of bacteria resistance to antibiotic Cefotaxime is (58%) also it was the resistance ratio to the antibiotics Nalidixic acid & Trimethoprime (50%) to both of these antibiotics.9 - Staphylococcus bacteria were all sensitive (100%) for antibiotic Amikacin.10 - Pseudomonas spp. Showed high resistance to both antibiotics Cefotaxime & Nalidixic acid by resistance reached (66%) it was also the resistance ratio of both antibiotics Trimethoprim & Vancomycin (55.5%) & (44.4%) respectively While did not show resistance to the bacteria to the antibiotic Amikacin, piperacillin, Ofloxacin & Amoxicillin/Clavulanic acid.11 - Bacteria isolates Klebsiella spp. Were resistant to every antibiotics Cefixime, Trimethoprim & Vancomycin by (100%), bacteria also showed resistant ratio for antibiotics Cefotaxime, Piperacillin & Amoxicillin/Clavulanic reached (66.6%), followed by antibiotic Gentamycin by resistant reached (50%). Klebsiella spp. Were the only bacteria that showed resistant ratio for antibiotic Amikacin reached (16.6%).12 - It has measured MICs test for five antibiotics that used in in the study these are : Amikacin & Clavulanic acid/ Cefotaxime, Amoxicillin, Gentamycin & Ciprofloxacin. on the bacteria most sensitive or most resistant and all isolates that tested showed low MICs ratio to antibiotic Amikacin where ranged between (1 - 8) microgram/milliliter where the isolates were sensitive to mentioned antibiotic geatly.13 - The isolates showed MICs values increased to antibiotic Cefotaxime where the values ranged between (2 - 128)microgram/milliliter to S. aureus while the values ranged between (8 - 512) microgram/milliliter to the remain negative Staphylococcus bacteria of Coagulase test, as for isolates of Klebsiella spp. & Acinetobacter spp. The values of their MICs for the mentioned antibiotic ranged between (2 - 512) microgram/milliliter. While the bacteria isolates Pseudomonas spp. MICs values were low for the same antibiotic where values ranged between (0.25 - 2.0)microgram/milliliter.

تاثير المستخلصات المائية والكحولية لاوراق نباتي العفص Thuja orientalis L. واذان الصخلة Plantago lanceolata L. على بعض البكتيريا المسببة لالتهابات جروح الجلد == Effect of alcoholic extracts for leaves of Thuja orientalis L. and Plantago lanceolata L. on bacteria causes wounds skin infection

Author name: زيد رعد عباس
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة تاثير المستخلصات النباتية لاذان الصخلة Plantago lanceolata L. والعفص . Thuja orientalis Lعلى العزلات البكتيرية المتضمنة S. aureus وPse. aeruginosa وcoli, K. spp. E. . شخصت العزلات مظهريا وزرعيا وحسب الاختبارات الكيموحيوية . ابدت معظم العزلات تحسسا لمضادات Imipenean ,Aztreonam , Gentamycin وبنسبة 100% ومقاومة لمضادي Cephalothin , Carbencillin بنسبة 100% . اظهرت الدراسة ان للمستخلص المائي البارد لنبات اذان الصخلة تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم / مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli وباقطار تثبيط 9.0 ,9.66 , 6.0 ملم وعلى التوالي , فيما ازداد تاثير المستخلص بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك بينت النتائج فروقا معنوية لتاثير المستخلص الكحولي وعند التراكيز120 , 480 ملغم/ مل ضد جميع العزلات البكتيرية . اظهرت النتائج ان للمستخلص المائي البارد لنبات العفص تاثيرا معنويا عند تركيز 120 ملغم/مل ضد كل من عزلات بكتيريا S. aureus وPs. aeruginosa وE. coli, فيما ازداد تاثير المستخلص معنويا بزيادة تركيز المستخلص الى 480 ملغم/ مل . كذلك وضحت النتائج فروقا معنوية مشابهة لتاثير المستخلص الكحولي على البكتيريا المعزولة وعند التراكيز 120 , 480 ملغم/ مل . يمكن ان يعود تاثير المستخلصات النباتية على البكتيريا المعزولة الى احتواء المستخلصات المدروسة على معظم المركبات الفعالة التي تم الكشف عنها . | The study included the effect of plant extract for Plantago lanceolata L. and Thuja orientalis L. on bacterial isolates which included : S.aureus , Ps. aeruginosa , K. spp. and E.coli. The isolated bacteria were identified a ccording to cultural , morphological and biochemical testes . The majority of isolates were sensitive to Aztreonam , Gentamycin and Imipenean 100% , but they were resistant to Cephalothin and Carbencillin 100% . The study revealed asignificant effect of Plantago lanceolata L. cold water extract at the concentration 120 mg/ ml against each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli with inhibition zone 9.0 , 9.99 , 6.0 mm respectively , whil the effect increased when the concentration increased to 480 mg / ml . Also the results showed a significant effect of alcoholic extract at the concentration 120 and 480 mg /ml aganist isolated bacteria . The result revealed a significant effect of Thuja orientalis L. cold water extract at the concentration 120 mg /ml aganist each isolates of S. aureus , Ps. aeruginosa and E.coli , while the effect were increased significantly when the concentration increased to 480 mg /ml .Also the result showed a significant effect for alcoholic extract on the isolated bacteria at the concentration 120 , 480 mg /ml . The action of plant extract on bacterial isolates may be due to the presence of active compounds in the studies extract whic were explored .

تاثير السستانون وزيت السمسم على بعض الجوانب الفسلجية والنسجية المرضية في ذكور الجرذان == Effect of the sustanon and sesame oil on some physiological and histopathological aspects in male rats

Author name: رشا عبد الامير عبد اللطيف
Supervisor name: علي شلش سلطان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Physiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تقوم الدراسة الحالية الى معرفة تاثير حقن السستانون وهو من المركبات الستيرويدية البنائية وكذلك زيت السمسم على بعض الوظائف الفسيولوجية في كبد ، كلية ، خصى الجرذان والتي شملت قياس مستويات انزيمات الكبد ( SGOT , SGPT , ALP ) ، الكرياتنين , يوريا الدم والتستوستيرون والتغيرات النسجية الامراضية التي يحدثها السستانون وزيت السمسم في كل من الكبد ، الكلية ، الخصى وجلد الجرذان . تضمنت حيوانات التجربة 50 جرذا ذكرا من نوع Rattus norvegicus قسمت الى مجموعتين بالتساوي وتم تقسيم حيوانات كل مجموعة الى خمسة مجاميع فرعية ( Subgroups ) . ضمت مجاميع التجربة الاولى مجموعة السيطرة السالبة ( علفا وماء ) ، المجموعة الثانية سيطرة موجبة ( 1 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الثالثة سيطرة موجبة ( 2 مل / كغم من وزن الجسم زيت السمسم) المجموعة الرابعة سستانون ( 10 ملغم /كغم من وزن الجسم) ، المجموعة الخامسة سستانون ( 20 ملغم / كغم من وزن الجسم) .حقنت مجاميع حيوانات التجربة الاولى لمدة 6 اسابيع مرة واحدة اسبوعيا بالسستانون وزيت السمسم وتم سحب الدم منها ثم قتلت في نهاية الاسبوع السادس ، اما مجموعة حيوانات التجربة الثانية فقد عوملت لمدة 6 اسابيع ثم قتلت بعد اسبوعين من نهاية المعاملة بالسستانون وزيت السمسم اي في نهاية الاسبوع الثامن من التجربة . اظهرت نتائج حيوانات التجربة الاولى ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستويات انزيمات الكبد (SGOT , SGPT,ALP) في المجاميع المحقونة بالسستانون ( 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) .بينما اظهرت مجموعتي السيطرة الموجبة الثانية والثالثة ( زيت السمسم ) انخفاضا غير معنوي في مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT ) وانخفاضا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم ALP . ارتفعت مستويات الكرياتنين ويوريا الدم بصورة معنوية ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة بالسيطرة السالبة ، بينما انخفضت قيم هذه المعايير بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة (زيت السمسم ) .ارتفعت مستويات هرمون التستوستيرون معنويا ( P<0.05) في المجموعتين الرابعة والخامسة مقارنة مع السيطرة السالبة ومجموعتي السيطرة الموجبة بينما ارتفع مستوى التستوستيرون في مجموعتي السيطرة الموجبة بصورة غير معنوية. بينت نتائج حيوانات التجربة الثانية والمقتولة بعد اسبوعين من نهاية المعاملة ارتفاعا معنويا ( P<0.05) في مستوى انزيم الكبد ( SGOT) في المجموعتين الرابعة والخامسة ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون ) مقارنة بالمجموعتين الثانية والثالثة . كذلك ارتفع مستوى انزيم ALP وSGPT معنويا ( P<0.05 ) في المجموعة الخامسة ( 20 ملغم / كغم سستانون ) مقارنة مع بقية المجاميع .انخفضت مستويات انزيمات ( SGOT,SGPT,ALP) بصورة غير معنوية في المجموعتين الثانية والثالثة والمحقونة بزيت السمسم .بينما لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الكرياتنين في كافة مجاميع حيوانات التجربة الثانية ، ازداد مستوى يوريا الدم معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 48.2±3.16 ملغم/ 100مل من الدم ) مقارنة بالمجموعة الثانية ( 42.4±0.93 ملغم/ 100مل من الدم) الا انه لم تلاحظ فروقات معنوية في بقية المجاميع . ارتفع مستوى التستوستيرون ( 5.14±0.35 نانوغرام / مل ) في المجموعة الرابعة (سستانون ) معنويا ( P<0.05) مقارنة ببقية المجاميع . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في مستوى الهرمون في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة بالمجموعة الثالثة (زيت السمسم) ( 1.65±0.48 نانوغرام / مل) .لم تلاحظ فروقات معنوية في مستويات الهرمون في المجموعتين الثانية والثالثة مقارنة بالسيطرة السالبة . لوحظ استمرار ارتفاع مستويات انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT) معنويا ( P<0.05) في حيوانات التجربة الثانية المقتولة في نهاية الاسبوع الثامن مقارنة بتلك المقتولة بنهاية الاسبوع السادس في المجموعة المعاملة بهرمون السستانون . لوحظ انخفاض معنوي ( P<0.05) في انزيم ALP في حيوانات التجربة الثانية مقارنة بحيوانات التجربة الاولى ، اظهرت المجموعة الثانية (زيت السمسم) ارتفاعا غير معنوي في مستوى الكرياتنين ، الا انه ارتفع معنويا ( P<0.05) في المجموعة الثالثة ( زيت السمسم) وانخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة وغير معنوي في المجموعة الرابعة وكذلك لم تظهر يوريا الدم فروقات معنوية بين المجموعتين . انخفض مستوى هرمون التستوستيرون بصورة غير معنوية في مجاميع السيطرة الموجبة ( الثانية والثالثة سمسم ) وارتفع بصورة غير معنوية في المجموعة الرابعة ، الا انه انخفض معنويا ( P<0.05) في المجموعة الخامسة ( 0.51±0.09 نانوغرام / مل) مقارنة ببقية المجاميع. تميزت التغيرات النسجية المرضية في كلى ، اكباد ، خصى وجلود جرذان التجربة الاولى والثانية بما يلي : اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كلى الجرذان المعاملة بـ 10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم سستانون والمقتولة في نهاية الاسبوع السادس ( تجربة اولى ) والمقتولة في نهاية الاسبوع الثامن ( تجربة ثانية ) . احتقان دموي في الكبيبات وبين النبيبات مع تنكس وتنخر الخلايا المبطنة الكلوية . اظهرت تلك المعاملة بزيت السمسم في حيوانات التجربتين الاولى والثانية الشكل الطبيعي والمتكون من الكبيبات والنبيبات الدانية والقاصية . بينت المقاطع النسجية في كبد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بالجرعتين 10 و20 ملغم / كغم سستانون تنخر وتنكس مع تلف الخلايا الكبدية ، احتقان دموي مع ارتشاح الخلايا الالتهاية قرب المنطقة البوابية . اظهرت المقاطع النسجية المرضية في كبد الجرذان ( التجربة الاولى والثانية ) والمعاملة بالسمسم (1مل/كغم من وزن الجسم) شكل الكبد القريب الى الطبيعي المتكون من اشرطة الخلايا الكبدية والوريد الوسطي بينما بينت بعض الخلايا الكبدية في جرذان التجربة الاولى والمعاملة بالسمسم الانقسام الخيطي ( Mitosis) مما يشير الى وجود تحفيز للخلايا الكبدية على الانقسام بوساطة زيت السمسم . اظهرت خصى الجرذان المعاملة بـ10 ملغم/كغم سستانون ( التجربة الاولى ) وجود تنخر داخل النبيبات المنوية مع وجود اعداد قليلة من الحيامن وعدم وجودها في بعض تجاويف النبيبات مقارنة بالسيطرة السالبة مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن ( Spermatogonia) اظهرت جرعة 20 ملغم/كغم سستانون ( تجربة ثانية ) تثخن جدران النبيبات الخصوية مع استمرار التنكس فيها ( تنكس زجاجي ) مع تنخر الخلايا المولدة للحيامن . تميزت المقاطع النسجية والمعاملة بزيت السمسم في مجموعتي جرذان التجربة الاولى والثانية بالشكل الطبيعي لنسيج الخصى وباحتواء اكثر تجاويف النبيبات المنوية على اعداد كثيرة من الحيامن . بينت المقاطع النسجية المرضية في جلد جرذان التجربة الاولى ( 10 و20 ملغم /كغم سستانون ) زيادة في الغدد الدهنية في الادمة مع عدم وجود بصيلات الشعر ممايدل على تساقط الشعر مع زيادة في الغدد الدهنية تحت الادمة ووجود بصيلات فارغة وتساقط الشعر في جرذان التجربة الثانية ( 10 و20 ملغم/كغم سستانون مقارنة بالجلد الطبيعي ( السيطرة السالبة ) الذي تميز بوجود بصيلات الشعر والنسيج الضام . اظهرت المقاطع النسجية في جلد جرذان التجربتين الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (1مل/كغم من وزن الجسم ) بالشكل القريب الى الطبيعي مع احتوائه على بصيلات الشعر في منطقة الادمة باعداد لا باس بها . مع وجود اعداد كثيرة من بصيلات الشعر في منطقة الادمة في جرذان التجربة الاولى والثانية والمعاملة بزيت السمسم (2مل/كغم من وزن الجسم) .نستنتج من هذه الدراسة الى ان حقن السستانون بجرعتي (10 و20 ملغم / كغم من وزن الجسم ) في حيوانات التجربة الاولى قد ادى الى ارتفاع في مستوى انزيمات الكبد ( SGOT وSGPT ALP) في حين لوحظ في حيوانات التجربة الثانية ارتفاع انزيمي الـSGOT وSGPT وانخفاض في انزيمALP نتيجة جرح الكبد مع جرح الكلية والذي تميز بارتفاع الكرياتنين ويوريا مصل الدم .ارتفاع هرمون التستوستيرون بالجرعتين اعلاه في حيوانات التجربة الاولى في حين انخفض في حيوانات التجربة الثانية بجرعة 20 ملغم /كغم من وزن الجسم . تميزت الحيوانات المحقونة بزيت السمسم انخفاضا في مستوى هذه الانزيمات مع ارتفاع في مستوى التستوستيرون في كلا حيوانات التجربة . الامر الذي انعكس على انسجة الكبد والكلية والخصية والجلد الذي تميز بغياب بصيلات الشعر في الحيوانات المعاملة بالسستانون . | The present study was aimed to investigate the effect of sustanon (Anabolic Androgenic steroids )and sesame oil on some physiological functions of Liver , Kidney , Testes of rats , that included estimation of Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP (, creatinine , blood urea and testosterone levels.The histopathological study included changes caused by sustanon and sesame oil on Liver , Kidney ,testes and skin . The experimental animals included 50 males Rattus norvegicus rats divided equally into2 groups , 1st and 2nd experimental animal groups , that divided also into 5 subgroups (negative control )( ration and water ) , second group (positive control 1 ml/kg B.W Sesame oil) ; third group ( positive control 2 ml/kg B.W Sesame oil) . Fourth group ( 10 mg/kg B.W sustanon), Fifth group ( 20 mg/kg B.W sustanon) The 1stexp.groups were injected with sustanon , sesame oil weekly for six weeks and were Killed at the end of sixth week . The animals of 2ndexp.were injected the same as in first group but were Killed at eight week. Liver enzymes ( SGOT , SGPT , ALP) in the 1stexp increased significantly (P<0.05) . The 2nd and third (sesame oil ) groups showed non significant decrease in SGOT and SGPT enzymes Levels but showed significant decrease (P<0.05) in ALP enzyme level . Creatinine and blood urea increased significantly ( P<0.05) in the 4th and 5th group in comparison with negative control group .The level of creatinine and Blood urea in second and third group decreased non significantly in comparison with negative control . Testosterone level increased significantly (p<0.05) in 4th and 5th group in comparison with negative control and two groups of positive control ,while increased non significantly in both two positive control groups ( sesame oil ). SGOT increased significantly (P<0.05) in the 4th and 5th groups of 2nd exp. animals in comparison two positive sesame control groups. The SGPT and ALP increased significantly (P<0.05) in the fifth group when compared with other groups. SGPT , SGOT and ALP decreased non significantly in the 2nd and 3rd sesame group . creatinine did not show any significant differences in all groups . at 2ndexp animals . Blood urea increased significantly (P<0.05) in 5th group ( 48.2±3.16 mg/100ml blood) in comparison with 2nd sesame group (42.4±0.93 mg/100ml blood) . The other groups showed no significancy.Testosterone level increased (5.14±0.35 ng/ml) significantly (P<0.05) in 4th group (sustanon ) in comparison with other groups . Fifth group showed significant (P<0.05) decrease in the level of Testosterone ( 0.51±0.09 ng/ml) in comparison with 3rd group ( 1.65±0.48 ng/ml) .The 2nd and 3rd groups ( sesame oil ) showed non significancy in testosterone in comparison with negative control . Rats of 2ndexp (The killed at the end of the eighth week) . showed an increase ( P<0.05) of SGOT and SGPT in comparison with Rats of 1st exp( The killed at the end of the sixth week) , while ALP showed significant decrease ( P>0.05). The 2nd group (sesame ) showed non significant increase in the level of creatinine but increased significantly (P<0.05) in the 3rd group (sesame oil ). creatinine decreased significantly (P<0.05) in the 5th group and non significantly in 4th group . Blood urea showed no significant differeneces between two exp.groups. Testosterone level decreased not significantly in 2nd and 3rd groups and increased not significantly in the 4th group.But it showed a significant decreased (P<0.05) in the 5th group (0.51±0.09 ng/ml) in comparison with other groups.Histopathological changes : The histopathological changes in the Kidneys , livers , testes and skins of Rats in experimental one and two were characterized by the following : - The renal sections in rats treated with (10 and 20 mg/kg B.W sustanon), 1st group which killed at the end of six week , and the 2nd group which killed at the end of eight week showed bloody congestion in the glomeruli and btween renal tubules ; with regenerative necrosis of endothelial cells. Sections in 2nd Exp. treated with sesame oil revealed the normal architecture of the kidney composed from glomeruli , proximal and distal tubules . Hepatic sections in two experiments ( 10 and 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed necrosis with regenerative changes and damaged of hepatocytes ; bloody congestion with inflammatory infiltration near the portal area. Liver sections in 1st and 2ndexp .treated with sesame oil (1ml/kg B.w) showed normal Liver shape composed of hepatocytes cords and central vein , the sections in sesame oil (2ml/kg B.W) showed hepatocytes mitosis that refered to the role of sesame oil in cellular (hepatocytes) division stimulation .Testes sections in rats treated with 10 and 20 mg/kg B.W sustanon (1stExp ) showed necrosis intra testicular tubules with presence of few number of sperms ; and absence of others in luminal seminiferous tubules in comparison with control ., with spermatogonial necrosis . The dose 10 mg/kg B.W sustanon (2ndexp , showed testicular tubular necrosis , and azosperma inside the lumen in comparison with control . The dose 20 mg /kg B.W sustanon revealed thickening of the testicular tubules with continuously hyaline degeneration with spermatogonial necrosis ; the testicular sections in 2ndexp , sesame oil showed normal testicular tissue and most testicular tubules contained sperms in high numbers.The skin sections in 1stexp ( 10 , 20 mg/kg B.W sustanon ) revealed an increase in the sebaceous glands in dermis with abscent of hair follicles that refered to hair fallen with increasing sebaceous glands in hypodermis , presence of empty hair follicles and abscent of hair in 2ndexp . (10 and 20 mg/kg B.W sustanon) in comparison with normal control skin . In the 1st and 2ndexp . sesame oil (1ml/kg B.W) the skin sections revealed shape near normal and contained hair follicles in dermis that can't be neglected with high number of hair follicles in dermis of 1st and 2nd group treated with sesame oil (2ml/kg B.W) .We concluded from this study that the sustanon injection at two doses ( 10 and 20 mg/kg B.W) lead to an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT and ALP) in the 1st group and an increase in the liver enzymes ( SGOT , SGPT ) and decrease in the ALP in the 2nd group due to liver injury with kidney injury that characterized by increase in the level of creatinine and serum blood urea . Testosterone was increase in the 1st group at two doses while decrease in the second group at dose 20 mg/kg B.W . The injected two groups with sesame oil showed decrease in the liver enzymes levels with testosterone increase in both experimental groups ,that reflected on the liver ; kidney; testes and skin that characterized by abscense of hair follicles in the animals treated with sustanon

دراسة بعض عوامل الضراوة للبكتيريا المعزولة من ردهات الاطفال الخدج ومقاومتها لمضادات الحياة والمطهرات == Study of Some Virulence Factors of Bacteria Isolated From Instrument Used in Neonatal Intensive Care Units and It is Resistance to Antibiotics and Disinfectants

Author name: رغد عبد اللطيف عبد الرزاق العبيدي
Supervisor name: رعد خليل عزيز الحسيني | اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
Key words:
  • Staphylococcus aureus
  • Proteus mirabilis
  • Escherichia coli
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 800 مسحة مختلفة من بيئة ردهات الاطفال الخدج ومن مصادر مختلفة شملت اجهزة سحب السوائل (Suckers) وحاضنات الاطفال الخدج واجهزة انعاش الطفل والميزان وقناع الاوكسجين وادوات قص الحبل السري والارضية والجدران بالاضافة الى ايدي العاملين والكادر الطبي خلال الفترة بين ايلول 2004 الى مايس 2005 .• زرعت العينات (المسحات) مباشرة على وسطي الدم والمكونكي لغرض العزل والتشخيص الاولي للنمو البكتيري . اخضعت العينات للاختبارات الكيموحيوية والفحص باستخدام انظمة api اذ تم استخدام api 20E للعصيات السالبة وapi staph للمكورات العنقودية وشخصت على هذا الاساس 88 عينة تعود للبكتيريا الموجبة لملون كرام شملت Staphylococcus aureus وبواقع 62 عزلة وStaphylococcus epidermidis وبواقع 26 عزلة وكذلك تم عزل 170 عزلة تعود للبكتيريا السالبة لملون كرام شملت 51 عزلة للنوع Escherichia coli و35 عزلة للنوع Proteus mirabilis و20 عزلة للنوع Pseudomonas aeruginosa و15 للنوع Klebsiella sPP. و8 عزلات للنوع Citrobacter sPP. و7 عزلات للنوع Serratia sPP. و10 عزلات للنوع Enterobacter sPP. و24 عزلة للنوع Acinetobacter sPP. .• اختبرت حساسية العزلات تجاه 15 نوعا من مضادات الحياة شائعة الاستعمال . وبينت النتائج ان معظم انواع البكتيريا المعزولة مقاومة للعديد من مضادات الحياة من مجموعة مضادات البيتالاكتام اذ كانت نسبة العزلات المقاومة للمضاد Augmentin 95.9% تلاه مضاد Carbencillin (93.4%) ثم Amoxicillin (78.2%) . فيما كان مضاد Amikacin وCefotaxime وNorfloxacin اكثر فعالية تجاه العزلات قيد الدراسة وبنسبة مقاومة 4% و15.9% و18.5% على التوالي .• حددت التراكيز المثبطة الدنيا لبعض المضادات المستخدمة في العلاج وشملت المضاد Gentamicin اذ تراوحت قيم MICs ما بين 8 - 1024 مايكروغرام/مل ، والمضاد Cefotaxime 8 - 1024 مايكروغرام/مل وCiprofloxacin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وChloramphenicol 16 - 1024 مايكروغرام/مل وCephazolin 8 - >1024 مايكروغرام/مل وAmikacin 8 - 128 مايكروغرام/مل وTrimethoprim 16 - 1024 مايكروغرام/مل وClavulanic acid+ Amoxicillin 4 - 1024 مايكروغرام/مل وNorfloxacin 16 - 1024 مايكروغرام/مل وOfloxacin 4 - 512 مايكروغرام/مل وAmoxicillin 4 - >1024 مايكروغرام/مل .• درست بعض عوامل الضراوة للعزلات ومنها قابليتها على انتاج الانزيم الحال للبروتين Protenase اذ اظهرت 40 عزلة (40%) من مجموع عزلات الدراسة القدرة على انتاج هذا الانزيم تضمنت 16 عزلة تابعة لبكتيريا Staph.aureus و15 عزلة لبكتيريا E.coli و9 عزلات لبكتيريا P. mirabilis .• درست قابلية العزلات على انتاج انزيم الهيمولايسين فقد كانت منتجة وبنسبة 42% عند استخدام الدم البشري صنف A وبنسبة 37% عند استخدام الدم البشري صنف B وبنسبة 46% عند استخدام الدم البشري صنف AB وبنسبة 34% عند استخدام الدم البشري صنف O ، ومن هنا يظهر ان صنف الدم AB هو افضل الانواع لمعرفة نوع التحلل .• تم الكشف عن قابلية البكتيريا على انتاج انزيم اليوريز اذ كانت 64.2% من عزلات Staph.aureus منتجة لهذا الانزيم اما P.mirabilis فقد كانت منتجة لهذا الانزيم بنسبة 100% .• اما بخصوص انتاج انزيم البيتالاكتاميز فقد اعطت كل من Staph.aureus وE.coli وP.mirabilis نسب انتاج 57.1% و52.6% 55% على التوالي .• تم تحديد التركيز المثبط الادنى لبعض المطهرات المستخدمة في المستشفيات وتبين ان المطهر Skinsept بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات اذ تراوحت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا مابين 4 - 128 مايكروغرام/مل ، بينما كان مطهر Minudus هو الاقل كفاءة اذ بلغت قيم تراكيزه المثبطة الدنيا 512 - 4000 مايكروغرام/مل .• تم تحديد قيم التراكيز القاتلة للمطهرات المستخدمة في المستشفيات اذ تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Skinsept ما بين 2 - 256 مايكروغرام/مل وهو الافضل من باقي المطهرات . بينما تراوحت التراكيز القاتلة الدنيا لمطهر Minudus مابين 1024 - 4500 مايكروغرام/مل .• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا . اذ كان زمن القتل لمطهر Skinsept 5 دقيقة ولمطهر Hibitane ما بين 5 - 10 دقيقة ومطهر Bleach ما بين5 - 20 دقيقة ولمطهر Sekeucid - N ما بين 25 - 30 دقيقة واخيرا مطهر Minudus ما بين 20 - 30 دقيقة . | • In this study , 800 different swabs were taken from neonatal intensive care unit and from many sources , including , suckers system , neonatal incubators , baby mobilization systems , balance , Oxygen mask , imbirical cutting tools , the floor and walls , in addition to the laborers hands and the medical staff , during the period of September 2004 to may 2005.• The swabs were directly cultured on blood and MacConckey's media for the primary isolation of bacteria. The colonies were tested biochemically by using API system , the API 20E was used for the Gram negative bacteria and API staph. used for staphylococci , though , 88 sample were identificated , these samples were belonged to the G + bacteria , including 62 isolates of Staphylococcus aureus and 26 isolates of Staphylococcus epidermidis were found. Also 170 isolates were belonged to Gram negative bacteria , including 51 isolates of Escherichia coli , 35 isolates of Proteus mirabilis , 20 isolates of Pseudomonas aeruginosa , 15 isolates of Klebsiella spp. , 8 isolates of Cirtrobacter spp. , 7 isolates of Serratia spp. , 10 isolates of Enterobacter spp. and 24 isolates of Acinetobacter spp.• The susceptibility of the isolates toward 15 types of common antibiotics , was tested , the results showed that several types of isolated bacteria were resistant to many types of antibiotics that belonged to the Betalactam group . The percentage of resistance to Augmentin was 95.9% , Carbenicillin was 93% , then Amoxicillin was 78.2% while Amikacin, Cefotaxime and Norfloxacin were more active against the isolates , with percentage resistance 4% , 15.9% and 18.5% respectively .• The minimal inhibitory - concentrations of some antibiotics were determined. For Gentamicin , the MICs values ranged between 8 - 1024 mg/ml , Cefotaxime , 8 - 1024mg/ml , Ciprofloxacin 4 - 1024 mg/ml, Chloramphenicol 16 - 1024 mg/ml , Cephazolin 8 - 1024 mg/ml, Amikacin 8 - 128 mg/ml, Trimethoprim 16 - 1024 mg/ml, Amoxicillin + Clavulanic acid 4 - 1024 mg/ml , Norfloxacin 16 - 1024 mg/ml , Ofloxacin 4 - 512 mg/ml and Amoxicillin 4 - 1024 mg/ml .• Some of the virulence factors of the isolates were studied , such as the ability of protease production , 40 isolates (40%) were able to produce this enzyme, including 16 isolates of Staphylococcus aureus , 15 isolates of E.coli and 9 isolates of P.mirabilis .• The ability of the isolates for production of Haemolysin enzyme was studied too . 42% of isolates were producing Haemolysin by using Human blood group A, 37% with group B , 46% with group AB and 34% with group O , it appears that AB blood group is the best type to detect hamolysin activities . • The ability of bacteria to produce urease enzyme was detected, 64.2% of S.aureus isolates were producing this enzyme, while P.mirabilis isolates, were 100% producers.• The production of  - lactamase from each of S.aureus , E.coli and P.mirabilis was 57.1% , 52.6% and 55% respectively . • The minimum inhibiting - concentration of some antiseptics used in hospitals were determine. The results showed that the antiseptic Skinsept with its low concentrations was the most active comparing with the other antiseptics , though , the MICS values ranged between 4 - 128 mg/ml while the Minudus was the less active and its MICS values ranged between 512 - 4000 mg/ml .• The values of bactericidal concentration of antiseptics were also determined , the minimal bactericidal concentrations of Skinsept ranged between 2 - 256 mg/ml and it was the best one , while the minimal bactericidal concentrations of Minudus ranged between 1024 - 4000 mg/ml .• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal concentrations of antiseptic was determined , it was 5 minutes for Skinsept , 5 - 10 minutes for Hibitane , 5 - 20 minutes for Bleach , 25 - 30 minutes for Sekeucid - N and finally , 20 - 30 minutes for Minudus .

دراسة تاثير مستخلصات اوراق نبات الدفلة Nerium oleander الخام والنقية في الخلايا الطبيعية وخطوط الخلايا السرطانية النامية في الزجاج وفي الفئران البيضاء == Study the effect of some crud & pure Nerium oleander leaves extractions on The normal cells and cancer cell lines in vitro and in vivo

Author name: رغد ضياء عبد الجليل الشيباني
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم فصل 32 مركبا مختلفا من المستخلصات الخام المختلفة للاوراق ، و28 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للسيقان ، و36 مركبا من المستخلصات الخام المختلفة للازهار اي بحصيلة اجمالي 96 مركب . تم تمييز قسم من هذه المركبات المفصولة بمقارنتها بمركبات قياسية معروفة ، في حين بقي القسم الاخر منها مجهولا ، والمركبات المشخصة هي : Oleandrin ، Nerigoside ، Glucosylnerigoside، Odorside A ، Oleaside E ، Olaside A ، Adynerin . واختلف وجود هذه المركبات اعتمادا على نوع المستخلص وجزء النبات المستخدم في الاستخلاص .وفي تجارب تاثير المستخلصات الخام ومركب الاولندرين النقي على الوراثة الخلوية للخلايا اللمفاوية لدم الانسان فقد وجد ان التركيز غير السام خلويا من المستخلص المثيلي هو0.01µg/ml عند الحضن لمدة 1 ، 48 و72 ساعة على التوالي . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI)ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) وادت التراكيز الادنى الى زيادة معنوية في قيمة MI وBI وهذه الظاهرة تسمى الـ Hormetic effect التي ظهرت في هذا المستخلص بشكل واضح . ولمستخلص الاسيتونايترايل والمثلين كلورايد فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا 0.1µg/ml، 1µg/mlو0.01 µg/ml عند الحضن لمدة حضن 1 ، 48 ساعة . وقد ادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MIو BI . اما المستخلص المائي فقد كانت التراكيز غير السامة خلويا هي 1µg/mlو 0.1µg/ml و0.01µg/ml والتراكيز الادنى منها ولفترات الحضن ( 1، 48 ، 72 ) ساعة على التوالى ، وادت جميع التراكيز الاعلى منها الى انخفاض معنوي في قيمة MI وBI. ولوحظت ظاهرة الـ Hormetic effect ايضا عند التراكيز المختلفة من مركب الاولندرين لمدة ساعة واحدة مع الخلايا ، اذ ادت التراكيز العالية الى انخفاض معنوي في كل من MI وBIفي حين ادى التركيز الواطيء الى زيادتها ولو بشكل غير معنوي ، كانت التراكيز غير السامة هي 5ng/ml والتراكيز الادنى منها وعند زيادة فترة الحضن لمدة 48 ،72 ساعة فقد كانت جميع التراكيز المستخدمة سامة خلويا. وتم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من المادة المشطرة PHA واظهرت النتائج عدم وجود اي تحفيز لانقسام الخلايا اللمفاوية وللتراكيز المستخدمة جميعها. كما تم استخدام المستخلصات الخام والاولندرين باضافتها بدلا من مادة الكولجسين ونتج عن ذلك وجود انقسام خلوي متوقف عند الطور الاستوائي metaphase وبفارق معنوي لكل من دليل الانقسام الخلوي ومعامل التحول الارومي .وجد تاثير ايجابي للمستخلص المثيلي الخام على دورة الخلية وتقدمها ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة ولمدة ( 1 ، 48 ) ساعة . وازدادت ايضا قيم Replicative Index (RI) دون ان يؤثر ذلك على تركيب الكروموسوم اذ لم تظهر استخدام التركيزين الوسطي والعالي اي فروق معنوية في Sister Chromatid Exchange (SCE) بالمقارنة مع السيطرة ، بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض SCE وبنسبة تثبيط بلغت 6.67 % لمدتي تعريض ( 1 ، 48 ) ساعة. وظهر تاثير Hormetic effect بشكل واضح عند اطالة فترة المعاملة لمدة 72 ساعة اذ اختفت التاثيرات الايجابية على دورة توالي الخلية CCP وانخفضت قيم RI وازدادتSCE عند استخدام التركيز العالي وبشكل معنوي بالمقارنة مع السيطرة ، وحدث العكس تماما عند استخدام التركيز الواطيء فظهر تحسن في دورة توالي الخلية الخليةCell Cycle rogression (CCP). وزيادة RI وانخفاض قيمة SCEمعنويا وبنسبة تثبيط 25 % ، في حين لم يكن التركيز الوسطي مؤثرا . اما مستخلص الاسيتونايترال فقد ادت جميع التراكيز المستخدمة الى تسريع دورة الخلية وتقدمها ، كما ازدادت RI وذلك عند حضن المستخلص مع الخلايا لمدة ساعة واحدة بالمقارنة مع السيطرة. وادى ذلك في الوقت ذاته الى انخفاض في SCE بالمقارنة مع السيطرة وبنسبة تثبيط بلغت 6.25 % و6.25 % و16.67 % للتراكيز 10µg/ml و1µg/ml و0.1µg/ml على التوالي. اما عند زيادة فترة الحضن لمدة اطول ( 48 ساعة ) فقد ادى التركيزين العالي والوسطي الى تقدم دورة الخلية وزيادة RI معنويا . رافق ذلك زيادة SCE وبشكل معنوي . بينما ادى التركيز الواطيء الى انخفاض في قيمة SCE وبنسبة تثبيط 16.67 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ). وعند زيادة فترة الحضن لمدة 72 ساعة لوحظ بطيء في دورة الخلية وانخفاض RI وبشكل معنوي ، ترافق ذلك مع حدوث زيادة معنوية في SCE عند استخدام التركيزين الوسطي والعالي. وعلى العكس من ذلك ادى التركيز الواطيء الى انخفاض معنوي في SCE وبنسبة تثبيط بلغت 25 % بالمقارنة مع السيطرة (تاثير Hormetic effect ).اختلف المستخلص المائي ومركب الاولندرين في تاثيرهما الايجابي عن بقية المستخلصات اذ كانت جميع التراكيز المستخدمة منهما مؤثرة ولفترة التعريض التي امتدت من الساعة الى الـ 72 ساعة فادت الى تسريع دورة الخلية وتقدمها وازدادت قيمة RI وبشكل معنوي ولجميع التراكيز والمعاملات . شمل هذا التاثير الايجابي ايضا حدوث انخفاض في معدلات SCE معنويا وذلك عند معاملة الخلايا لمدة ساعة واحدة وبنسب تثبيط بلغت 8.33 % و16.67 % و20.83 % للتراكيز 1µg/ml و0.1µg/ml و0.01µg/ml للمستخلص المائي على التوالي و16.67 % و22.97 % و25 % للتراكيز 50 picog/ml و5 picog/ml و0.5 picog/ml لمركب الاولندرين على التوالي. وعند زيادة فترة الحضن لمدة (48 , 72) ساعة فان التركيزين الواطيء والوسطي لم يحدثت ضررا في التركيب الكروموسومي في حين ادى اما عن التاثير السمي على خطوط الخلايا التركيز العالي الى زيادة معنوية في معدل SCE بالمقارنة مع السيطرة ولنفس مدة الحضن . السرطانية فقد وصل التركيز السام للمستخلصات (المثيلي والاسيتونايترال في المثلين كلورايد والمائي) الخام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى 14 ng/ml، 5.5ng/ml ، 21.5 ng/ml لخط Hep - 2 و19.5 ng/ml و7 ng/ml و21.5 ng/ml لخط AMN - 3 عند حضنها لوحدها من دون مزج لمدة ساعة واحدة . وقد انخفضت هذه التراكيز القاتلة لنصف عدد الخلايا عند معاملتها بالمستخلصات الخام لمدة 72 ساعة . كما اظهرت اغلب المستخلصات الخام سمية اكبر على خط خلاياHep - 2 بالمقارنة مع خط AMN - 3. اما عند استخدام مركب الاولندرين لوحده لمدة ساعة واحدة فقد انخفض التركيز السام والقاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 الى0.54picog/ml و7.5 picog/ml لخط Hep - 2 وAMN - 3 على التوالي بالمقارنة مع المستخلصات الخام . وادى المزج بين المستخلصين الخام المائي والمثيلي ومزيج المستخلصين المثيلي والاسيتونايترايل في المثيلين كلورايد الى انخفاض التركيز السام القاتل لنصف عدد الخلايا السرطانية CC50 عند الحضن لمدتي تعريض (1 و72) ساعة بالمقارنة مع استخدام المستخلصات الخام لوحدها دون مزج ، ولكلا الخطين المستخدمين في التجربة . واظهر الفحص الخلوى بوساطة المجهر الضوئي ان لاستخدام التراكيز الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين قدرة حالة وسامة خلويا عند فترات الحضن الثلاث تمثلت باحداث تغيرات واضحة في نمو الخلايا السرطانية وفقدانها الشكل الخلوي المميز . بينت نتائج التحليل الكروموسومي للخط الخلوي السرطانـيHep - 2 قبل اضافة اي مستخلص الى وجود خلايا اقل من ثلاثية المجموعة الكروموسومية Hypotriploidy ( 64 كروموسوم) ولم يظهر اي انقسام خلوي عند معاملة الخلايا لساعة واحدة بالمستخلصات ولجميع التراكيز المستخدمة في التجربة .وفي التجارب البايولوجية داخل الجسم الحي in vivo فقد تم تحديد الجرعة الوسطية المميتة LD50 للفئران المختبرية وهي 168.43 mg / kg، 206.11 mg / kg و211.68 mg / kg للمستخلص المائي والمثيلي والاسيتونايترال على التوالي ولمركب الاولندرين 21.525 µg / kg . اما في التجارب العلاجية على الفئران المختبرية الحاملة لسرطان الغدة اللبنية المغروس فقد كشفت نتائج العلاج بجرعات مختلفة من المستخلص المائي الخام ان الجرعتين 16.8 mg/kgو33.6 mg/kg اظهرت ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 7 و10 جرع وبنسبة تثبيط بلغت 100% و99.9 % على التوالي . والجرعة الواطئة 8.4 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة82.54 % بعد اعطاء الحيوان معدل 5 جرعات . واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بالمستخلص المثيلي بالجرعة العالية 41.2 mg/kg ضمورا كاملا للورم وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10 جرعات وبنسبة تثبيط بلغت 100% بالمقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة التي استمر نمو الورم فيهما دون توقف حتى موت الحيوان . ووجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 20.6 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة68.612 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18 جرعة . كما اظهر استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 10.3 mg/kg اختزالا لنمو الورم بنسبة58.74 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 18.7 جرعة. واظهر حقن الفئران المصابة بالورم بمستخلص الاسيتونايترال الخام بالجرعة الوسطية 21.16 g/kg ضمورا كاملا للورم بعد اعطاء الحيوان معدل 11.2 جرعة وبنسبة تثبيط بلغت 96.2% . كما وجد ان استخدام المستخلص بالجرعة الاوطا التي مقدارها 10.58 mg/kg اظهرت اختزالا لنمو الورم بنسبة54.912 % وذلك بعد اعطاء الحيوان معدل 10.6 جرعة . اما استخدام المستخلص بجرعة مقدارها 42.32mg/kg فقد ادى ذلك الى اختزال لنمو الورم بنسبة62.303 % . وقد اظهرت جميع المجاميع العلاجية اطالة واضحة في فترة البقاء على قيد الحياة بالمقارنة مع مجاميع السيطرة . وقد تاثرت اوزان الفئران المختبرية بالعلاجات المستخدمة بالزيادة او النقصان وبشكل يعتمد على نوع المستخلص والجرع المستخدمة .وكشف فحص المقاطع النسيجية للورم المعالج بالجرعتين الوسطية والعليا من المستخلصات الخام عن وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا ورم الغدة اللبنية الخبيث مرتشح بعدد من الخلايا الالتهابية وحيدة النواة . واظهرت الجرعات الواطئة وجود تنخر واسع داخل الورم الخبيث ومحاط بنسيج ليفي حبيبي حاوﹴ على الخلايا الالتهابية وحيدة النواة فضلا عن خلايا العدلات. بين الفحص النسيجي للورم المعالج بالجرعة الواطئة والوسطية من مركب الاولندرين وجود مساحات من التنخر مع ارتشاح للخلايا الالتهابية وحيدة النواة . اما العلاج بالجرعة العالية فقد اظهر الفحص المجهري وجود مساحات اوسع من التنخر مع ارتشاح كثيف للخلايا الالتهابية وحيدة النواة وخلايا العدلات. في حين بين الفحص النسيجي لورم سرطان الغدة اللبنية المغروس في الفئران والغير المعالج عن وجود مراحل متقدمة من الورم السرطاني . اظهرت هذه الدراسة ان المستخلصات الخام لاوراق نبات الدفلة من الممكن ان يكون علاجا واعدا للسرطان وتبين ذلك من سلامة استخدامها في علاج سرطان الغدة اللبنية الفاري . ايد ذلك ما اشارت اليه نتائج دراسة تاثير الجرع الواطئة من المستخلصات الخام ومركب الاولندرين في الوراثة الخلوية لخلايا نقي عظم الفئران المختبرية . اذ لم تؤدي الجرعة الواطئة من المستخلص المائي الى تغيرات مهمة احصائيا في كل من MI وBI وC.A وSCE وRIوقد ظهر تحسن في دورة الخلية بالمقارنة مع السيطرة . اما مركب الاولندرين ومستخلص الاسيتونايترايل فقد وجدت ظاهرة الـ Hormetic effect بشكل واضح اذ ادت الجرع الواطئة (العلاجية) الى تحسين دورة الخلية وتقدمها وزيادة معنوية في BI مع عدم حدوث تغيرات مهمة في كل من MI وRI رافق ذلك انخفاضا في C.A وSCE . وحصل العكس من ذلك تماما عند استخدام الجرعة العالية من كلا المعاملتين. اما الجرع المستخدمة من المستخلص المثيلي فظهر تاثيرها الايجابي في الخلية من خلال زيادة MIوBI وCCP ولكن رافق ذلك حدوث زيادة في الـC.A وSCE. | Thirty tow active components analyzed from the different crud extractions of leaves, twenty eight from different crud stems extractions, thirty six from different crud flowers extractions were also analyzed . Some of these components are diagnosis as : Oleaside E, Odorside A, Glucosylnerigoside, Nerigoside, Oleandrin, Adynerin, Olaside A.Different results found in cytotoxic assay of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte in vitro. The non cytotoxic concentrations of methanolic extraction were : 0.01µg/mll. The concentration below it shows significance induction on mitotic index and blast index of human lymphocytes but all of higher concentration shows significance reduction on them. This biological phenomenon is called Hormetic effect or Hormesis. The non cytotoxic concentrations of acitonitrial and methelin chlorid system solvent extractions were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml. The non cytotoxic concentrations of aquatic extraction were : 1µg/ml, 0.1µg/ml and 0.01µg/ml and whole lower concentrations within (1, 48, 72 hr.) exposure time respectively. All of the higher concentration of these three crude extractions shows significance reduction on mitotic index and blast index of human lymphocytes. The results revealed the inhibitory effect of it by different concentration of oleandrin after (48, 72 hr.) exposure time. Hormesis phenomenon, also, had seen when exposed oleandrin to peripheral blood lymphocytes after one hour exposure time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of mitotic index and blast index significance. The non cytotoxic concentration was 5μg/ml.Studying the effect of crude extracts & oleandrin on human lymphocyte without mitogen (PHA) in different exposure time shows no mitosis. Using different crude extracts & oleandrin in replacement of colchicin shows some mitotic cell with high significance comparison with control.Positive effect were found in CCP by different concentration of methanolic extraction within (1, 48, hr.) exposure time and RI was arise. The higher and medium concentrations perform increased SCE significantly while the lower concentrations resulted decreased of it after (1, 48, hr.) exposure time. This Positive effect in CCP and RI was disappeared when we elongate the exposure time to 72 hr. SCE was significantly increased by the higher concentrations whereas the lower concentrations resulted decreased of it in the same exposure time. All concentrations of acetonitril show improved CCP, increased RI significantly at (48, 72 hr.) exposure time but there were different significance changes in SCE depending on concentration and exposure time. In 1 hr. exposure time, there was decreased of SCE by different concentrations while the higher and medium concentrations of extractions raise SCE within 48 hr. exposure time. The lower concentrations resulted decreased of its spontaneous level in the same exposure time. The aquatic extraction and oleandrin showed different positive effect. They were improved CCP, increased RI significantly at (1, 48, 72 hr.) exposure time by all concentrations. There was significantly decreased of SCE at the time when used different concentrations within 1 hr. exposure time. There were no significance changes in SCE when we used lowered and medium concentrations of aquatic extraction and oleandrin at (48, 72 hr.) exposure times while the high concentrations shows increased of SCE significantly.The cytotoxic assay of crude extractions & oleandrin on two cancer cell lines was studied. The result is a clear cytotoxic activity of those crude extractions & oleandrin with high significances in Hep - 2, AMN - 3 cancer cell lines during the two exposure time. CC50 of methanol, acetonitril and aqueous extraction alone was; 14 ng/ml, 5.5ng/ml and 21.5 ng/ml of Hep - 2 and : 19.5 ng/ml, 7 ng/ml, 21.5 ng/m to AMN - 3 successively within 1 hr. These CC50 was greatly decrease when arise the exposure time to 72 hr., therefore there was difference significances between them. CC50 of oleandrin was 57picog/ml and 750 picog/ml in Hep - 2 & AMN - 3 successively within 1 hr. The result suggested that Hep - 2 cell line the most sensitive cancer cell line to most of crude extracts & oleandrin.Using a mixture of methanol and aqueous crud extractions or methanol and acetonitril crud extractions show reduction of CC50 through (48, 72 hr.) exposure time comparison with extractions without mixing. Microscopic examination of cell line treated with the lower concentrations of crud extractions and oleandrin show large cytotoxic through (48, 72 hr.) exposure time, appear event different changes in morphology of cell line. The effect of crude extractions & oleandrin on chromosomal profile of human cancer cell line (Hep - 2) before treating with different concentrations exhibited a clear Hypotripolidy (64 chromosomes). There was no mitosis cell when we treated cell line (Hep - 2) with low concentrations of extractions within 1 hr. In the first in vivo experiment, LD50 of aqueous, methanol, acetonitril and oleandrin were 168.43 mg / kg, 206.11 mg / kg, 211.68 mg / kg and 21.525 µg / kg.Crud extractions and oleandrin were further used for treatment of mice bearing murine mammary adenocarcinoma system by 3 doses per extractions. Complete regression was seen in 100% of treated mice with the high and medium doses of aqueous extraction while the low doses show partial reduction with 82.54 % growth inhibition. The result indicate that there was complete regression was noted in 100 % of treated mice by high doses of methanol extraction. The low dose exhibit partial reduction with 58.74 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 68.612 %. Complete regression was noted in 96.2% of treated mice by medium doses of acitonitrial extraction. The low dose demonstrates partial reduction with 54.915 % growth inhibition. Reduction by the medium dose was 62.303 %. All treated groups in those experiments showed prolong in surviving. More over, this study showed different changes of adult mice weigh depending on doses.The histopathology examination of treated tumor by high & medium doses of extractions show fibrous connective tissue surrounding the remainder of mammary adenocarcinoma gland filtering with large amount of mononuclear cells and basophile. Lowe doses demonstrate large central necrosis inside malignant mammary adenocarcinoma surrounding by fibrous connective tissue filtering with mononuclear cells and basophile. Histopathology examination of treated tumor by low & medium doses of oleandrin shows area of necrosis while the high doses show large area of necrosis with mononuclear cells and basophile. None treated tumor shows strong condensation of malignant mammary adenocarcenoma cell so that it block off asini of mammary gland adenocarcenoma. No effect has been seen in other organs (heart, kidney and liver) of treated mice with low & high doses of crud extractions & oleandrin. While the liver tissue treated with high doses show bulkiness of liver cell which it recovered liver sinosaet and in another place it seems to be active, occurrence grades of necrosis cell that located around central liver vein, filtering with mononuclear cells around it. Kidney cortical shows hemorrhage from kidney artery with congestion of it in another place and filtering with mononuclear cells. This feature of histopathological examination was similar in almost experiments. This study showed that the crud extractions of Nerium oleander and oleandrin might be promise therapy for cancer; they are safe to use in adult mice. The therapeutic doses of aqueous crud extractions was non cytotoxic to boon marrow cells in mice because there was no significance changes in mitotic index, blast index, sister chromatid exchanges, replicative index and cell cycle regressions.Hormesis effect had seen by oleandrin & acitonitrial extractions time characterized by low dose stimulation, high dose inhibition of MI, BI, CCP, RI, significantly. In contrast, low dose inhibition, high dose stimulation of C.A, SCE. Different concentrations of methanolic extraction were stimulation MI, BI, CCP, RI, significantly but there was stimulation of C.A, SCE. Histopathology examination shows no effect in organs (heart, kidney and liver) of normal mice with therapeutic dose of crud extractions & oleandrin.

انتاج وتنقية اللكتين من بكتريا Acinetobacter baumannii المعزولة من القشع وتاثيره في بعض الاحياء المجهرية خارج الجسم الحي

Author name: رونق مهدي هاشم
Supervisor name: ساهرة نصيف مسلم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to isolate Acinetobacter baumannii , 104 samples of sputum were collected from patients infected with respiratory tract infections, from Teaching Baghdad Hospital / Medical City, General Teaching Al - Kindi hospital and Al - Imam Ali Hospital . Depending on microscopic , cultural and biochemical tests ,23 isolates belonge to it were obtained.The ability of A.baumannii isolates to produce lectin was detected by using glass slide and microtiteration plates methods and the results showed that all the isolates were able to produce lectin , A.baumannii S12 was the best isolate for produce it and the blood group O was the best for detection the titration of agglutination activity.The optimum conditions for lectin production were determined and the results showed that the cultivation of A.baumannii S12 in Colonization Factor Antigen medium with pH value of 7.2 at 37 ºC for 24 hours in shaker incubator at 100 rpm / min. were the best to produce it. The lectin was extracted from cilia of A.baumannii S12 isolate by using six different breaking methods at different times , the glass beads method for 50 minutes was the best to extract it, the agglutination activity reached to 512 AU / ml with specific activity 174.14 AU / mg protein in comparison with other breaking methods. Lectin was purified by three steps, included ; precipitation by 35% saturation ammonium sulfate , ion exchange chromatography by DEAE - cellulose, then gel filtration chromatography by Sephadex G - 150. The final lectin recovery was 36.92% with 20.63 folds of purification and 3592 U / mg protein of specific activity .The purified lectin was also partially characterized and the results showed that the optimal activity of the lectin was at 30 ºC and its thermostability was between (10 and 30) ºC ,the optimum pH for lectin activity was 7.2 while the pH value for its stability was between 7 and 7.2 . Lectin retained whole activity when treated with sucrose, raffinose, maltose, mannitol, fructose, lactose, arabinose, ribose and rhamminose, while it lost whole activity when treated with glucose , mannose and galactose. Also, lectin retained whole activity when treated with EDTA - NaN3 and trypsin , whereas its agglutination activity was reduced to the half when treated with pepsin , and to 12.5% and 0.39% when treated with 2 - mercaptoethanol and formalin, respectively. In addition, the effect of some substances on lectin stability was studied and the results showed that the mixture of 2% glycerol and physiological normal saline followed by 20% ammonium sulfate were the best for its stability for 20 and 10 days, respectively. while the solutions of the rest materials(Tween - 80, mannitol, sucrose, lactose and SDS) showed inhibitory effect on lectin activity.Also, the antimicrobial activity of purified lectin against 12 bacterial and fungal isolates was studied and the results showed that the lectin had antibacterial activity against Klebsiella pneumonia , Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis with (50 , 38.88 and 36.84 )% of inhibition, respectively, and antifungal activity against Penicillium spp. , Cladosporium spp. and Fusarium spp. with (33 , 18.75 and 17.39 )% of inhibition, respectively. whereas ,it had no antimicrobial activity against the bacteria; Escherichia coli , Enterobacter cloacae ,and Staphylococcus aureus ,and the fungi ; Aspergilus niger, Aspergilus terius , and Candida albicans.

تاثير عديد سكرايد بعض الضروب المصلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa على خلايا السائل البريتوني للفار الابيض == Effect of polysaccharide of some serotypes of Pseudomonas aeruginosa on peritoneal exudates cells of white mouse

Author name: رواء عبد الامير عبد الجبار
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اظهرت تاثيرات عديد سكرايد الزائفة الزنجارية Pseudomonas aeruginosa تاثيرا متباينا على الخلايا المناعية لجوف الفار السويسري. استخلص عديد السكرايد من ضروب مصلية مختلفة للزائفة الزنجارية وتم حقنه داخل الجوف البطني للفئران بجرع مختلفة وبفترات مختلفة. فقد كان تاثير الضرب المصلي O3 واضحا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة Large Lymphocytes اعتمادا على الجرعة والوقت ، وكان هذا الضرب متميزا في تحفيزه للخلايا الرغوية Foam cell ايضا ابتداءا من اليوم الثاني للتحفيز .كان الضرب O6 غير قادرا على تحفيز الخلايا الرغوية Foam cells ، الا انه تميز في حثه للخلايا البدينة Mast cells . اما الضرب O9 فقد كان محفزا جيدا للخلايا اللمفاوية الكبيرة ومتماثلا مع الضرب O6 في عدم تحفيزه للخلايا الرغوية ، في حين كان الضرب O11 قويا في تحفيزه للخلايا اللمفاوية الكبيرة والخلايا الرغوية ومعتمدا على الجرعة والوقت ، اذ بلغ معدل اعداد اللمفاويات الكبيرة بجرعة 50 مايكروغرام/ مل ( 41.867 ±4.277) مقارنة بالسيطرة (11.867±0.611).تميز الضرب O16 في تحفيزه الكبير للخلايا البدينة فقد كانت اعدادها النسبية في اليوم الاول وبجرعة 20مايكروغرام/ مل وبجرعة 50 مايكروغرام /مل فقد بلغت (20.067±051.4) ، (320.53±70.75) على التوالي مقارنة بالسيطرة (001.4±60.34) ، وفي اليوم الثالث بلغت الاعداد نسبة عالية اذ بلغ تحفيز الجرعة 50 مايكروغرام/ مل من عديد سكرايد هذا الضرب (23.267±1.102) مقارنة بالسيطرة (71.66±0.643). استطاعت البكتريا المقتولة من تحفيز خلايا الجوف المناعية التي تباينت ضروبها المصلية في ذلك. نوقشت النتائج في ضوء المعلومات المتوفرة التي تتعلق بتاثير عديد سكرايد هذه البكتريا على الخلايا المناعية البطنية لجوف الفار واهمية عديد السكرايد هذا كمحددة بكتيرية مهمة في الاستجابة المناعية وامراضية هذه البكتريا.

تحضير وتوصيف الجسيمات الدهنية النانوية وربطها مع مستضد طفيلي Leishmania donovani == Preparation and characterization of nanoliposome and entrapment of Leishmania donovani antigens

Author name: روعة نجم عبد الله الخميسي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي عبد الرحمن الشيخلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعتبر استخدام الجزيئات النانوية التي تحمل المستضد صناعيا والقابلة للتحلل الحيوي كجزيئة مساعدة من المواضيع المهمة في تحضير اللقاح ومن الخطوات المهمة في السيطرة على تحرر المستضد لتحسين الاستجابة المناعية . تتكون الجسيمات الدهنية النانوية من مركبات طبيعية والتي تشجع بدورها الباحثين على استخدامها كمساعدات نانوية طبيعية . في هذه الدراسة , استخدمت الجسيمات الدهنية النانوية كمساعدات لقنص المستضدات الذائبة المستخلصة من طفيلي اللشمانيا الاحشائية كخطوة اولى باتجاه تحضير لقاح ضد اللشمانيا . تم تنشيط الطفيلي من خلال تنميت طور الطفيلي ) 104 promastigote / ml ) في الوسط الزرعي ( RPMI ) في درجة تحضين 23 م0 ولمدة اربعة ايام . اعتمدت اللقيحة بعمر 4 ايام وبنسبة 104 خلية في المليلترالواحد في تلقيح وسط (SNB9 ) لانتاج الكتلة الحيوية والتي تستخدم لاستخلاص المستضد . تم استخلاص المستضدات الذائبة من خلايا الطفيلي بعد اربعة تمريرات في نفس الوسط الزرعي ليتم بعدها قنصها في الجسيمات الدهنية النانوية والمحضرة انيا . حضرت الجسيمات الدهنية النانوية من ( mM Phosphatidylcholine 4 ) ) 2.2 mM Cholesterol ) و(mM Phosphatidylethanolamine 0.55) وبنسبة 1 : 2 : 7 ضمن جميع طرق التحضير المختلفة وتم دراسة توصيفها الفيزياوي والكيمياوي باستخدام (SEM ) و(AFM ) و( FTIR) و(Zeta Potential ) لتقدير حجم وشكل وشحنة الجسيمات وتحديد المجاميع الكيمياوية المتكونة .من النتائج لوحظ ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تحمل شحنة سالبة ولاتظهر تكتل بعد عملية التحضير ولا تزيد اقطار الجسيمات الناتجة عن 75 نانوميتر وتحمل مجاميع كيمياوية (PO2 ) و(CH2) و(CH3 ) . تم احتساب كفاءة قنص (EE) الجسيمات الدهنية النانوية للمستضدات الذائبة وكانت النسبة المئوية لكفاءة القنص هي 62% و50% و27.5 % للجسيمات المحضرة بطريقة الكلوروفورم والسيفادكس G25و السيفادكس G75 على التوالي . من جانب اخر , تم دراسة الثباتية للجسيمات الدهنية النانوية القانصة للمستضدات بدرجتي حرارة تخزين 4 و37 م0 واظهرت النتائج ان الجسيمات التي تم تحضيرها بطريقة الكلوروفورم تمتلك درجة ثباتية كان مقدارها 32% في درجة حرارة 4 م0 و16% في درجة حرارة 37 م0 خلال فترة تخزين 12 يوم | The use of biodegradable nanoparticles as vaccine adjuvant with entrapped antigens represents an exciting approach for controlling the release of vaccine antigens and optimizing the desired immune response . Because of the natural components of nanoliposomes , we investigated the ability of prepared nanoliposomes , as a nanoadjuvant , to entrap soluble Leismania donovani antigens (SLAs) . The study was include preparation of SLA by parasite reactivation was carried out when inoculated into Rosewell park memorial institute media (RPMI) and incubated at 23 ̊ C for 4 days . Inoculum (104 promastigote / ml) of 4 days was used to inoculate modified medium of Saline - Neopeptone and Blood agar ( SNB) to produce promastigote mass . SLAs were extracted from the promastigotes ghost membrane after fourth passages of subculturing in SNB9 .The extracted SLAs then entrapped in nanoliposomes prepared freshly .Lipids mixture of 4mMPhosphatidylcholine, 2.2mM Cholesterol and 0.55mM Phosphatidylethanolamine in a ratio of 7 : 2 : 1 was depended in two nanoliposome preparation methods ; Chloroform injection and size exclusion chromatography . Physio - chemical characterizations of prepared nanoliposomes was performed by using Scanning Electron Microscope (SEM) , Atomic Force Microscope (AFM) ,Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Zeta Potential assays to determine the size , morphology , chemical active group and charge . Nanoliposomes prepared by chloroform injection method revealed non aggregate of negative nano vesicles with diameter of less than 75nm and PO2, CH2 and CH3 groups. The nanoliposomes entrapment efficiency (EE) to entrap SLAs was determined. The percentage of EE was 62, 50 and 27.5of SLAs entrapped nanoliposomes prepared by chloroform injection, Sephadex G25 and SephadexG75 , respectively .Moreover, stability of SLAs entrapped nanoliposomes was examined at 4 and 37 ̊ C storage temperature. SLAs entrapped nanoliposomes , prepared by chloroform injection method ,shown higher value of EE( 32 % ) at 4 ̊ C and(16%) at 37 ̊ C after 12 days of storage .

دراسة تاثير هرمون النمو على بعض المظاهر الفسيولوجية لقصار القامة في العراق

Author name: راوية محمود يوسف السلامي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء علي عبد الجبار
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يمثل نقص الافراز الداخلي لهرمون النمو السبب الاكثر شيوعا في احداث قصر القامة في الاطفال ومرتبطا" بالعديد من التبعات المرضية الفسلجية. ان المفاهيم الاساسية لاثر النقص الهرموني تتاتى من الدراسات السريرية, المناعية البايوكيمياوية, والوراثية والتي تشير الى اهمية دراسة العوامل المناعية والبايوكمياوية في تفسير هذا الاثر ,اضافة الى ان نقص هرمون النمو لا يرتبط بتبعات طبية جدية فحسب وانما يؤثر نفسيا واجتماعيا في مثل هؤلاء الاطفال وعوائلهم, مما يتطلب ايضا ايضاح الدور العلاجي في الحد من الاستجابات الفسلجية المفرطة التي تلعب دورا محوريا في تراجع نمو هؤلاء الاطفال. ولندرة الدراسات العراقية في هذا المجال وبهدف تطوير استراتجيات الادارة العلاجية الناجحة والذي يسهل من خلال فهم الجوانب المناعية والايضية لنقص هذا الهرمون.لقد كانت الواسمات الورمية (مستضد المسرطن الجنيني CEA, البروتين الحميلي نوع الفا AFP, مستضد الكاربوهيدرات CA - 125), هرمون الانسولين, فايبرنوجين البلازما, اضافة" الى نسبة الدهون والكالسيوم في المصل, الطول,الوزن المرشحة لمثل هذه الدراسة علاوة على ذالك اهتمت الدراسة ايضا" بتقييم الاستجابة التحفيزية لهرمون النمو بواسطة الكلوندين. اجريت هذه الدراسة المستقبلية في المستشفيات التعليمية/ حماية الاطفال - بغداد على 49 مريضا" عراقيا" مصابا" بقصر القامة (37 ذكر, 12 انثى), قورنوا مع 20فردا"من الاطفال الاصحاء كمجموعة ضابطة, للفترة من تشرين الاول 2007 ولغاية اب 2008. اجري فحص مقايسة الماز المناعي للانزيم المرتبط ELISA لتقييم الجوانب المناعية الفسلجية(هرمون النمو, الواسمات الورمية,هرمون الانسولين, الفحص الالي اليدوي للفايبرنوجين , الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير مستويات الدهون{الكوليسترول T - C ,ال_xFFFF_لسريد الثلاثي TG ,البروتينات الشحمية (عالية الكثافة (HDL , (واطئة الكثافة (LDL, (واطئة الكثافة جدا (VLDL (اضافة لنسبة HDL T - C/} والكلسيوم في المصل) وحساب الطول نسبة" للعمر معبرا عنه بالوحدة ,Z كذالك الوزن عبر عنه بحساب معدل كتلة وزن الجسم BMIZ لجميع افراد مجموعتي الدراسة.اظهر الروز الكمي لوسيط تركيز هرمون النمو(GH) مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل ان مستوى هذا الهرمون في الاطفال قصار القامة (1.4) في السيطرة (3.7), اما بعد التحفيز فقد كان في المرضى (5.1)و في السيطرة (10.9). وكانت هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين كل من مجموعتي المرضى ومجموعة الاصحاء سواء" قبل او بعد التحفيز. اظهر الكلوندين فعالية ممتازة في التفريق بين المرضى والاصحاء من جهة وفي التقييم الاولي لنقص هرمون النمو في الاطفال قصار القامة من جهة اخرى.ظهر الوسيط الحسابي لتركيز CEA مقدر" بال مايكرو غرام لكل مل من المصل ان مستواه لدى المرضى (1.4) اعلى مما عليه في الاصحاء (0.9) هذه الاختلافات ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين ومن الممكن ان تعد مؤشرا مناعيا التهابيا متعلقا بجوانب مرضية لنقص الدور الايضي للهرمون . بعد فترة 9 اشهر من العلاج بدا هذا المستوى المرتفع يميل بعض الشيء نحو الانخفاض (1.38) وان كان على نحو ضئيل لكنه معنوي مقارنة بالمرضى انفسهم قبل العلاج, على الرغم من ذالك بقت الفر وقات معنويا عالية بين المجموعتين. فيما يخص المتوسط الحسابي لتركيز CA - 125 (مقدر" وحدة لكل لتر) اعلى قليلا" لدى المرضى (10.8) من السيطرة (9.2), وبدا هذا الارتفاع البسيط يميل للانخفاض بعد العلاج (9.7), بالرغم من ذالك الاختلافات لم تكن ذات اهمية معنوية في التفريق بين المجموعتين. اما المتوسط الحسابي لتركيز AFP مقدرا" بالنانو غرام لكل مل من المصل لم يؤشر اي فرق معنوي بين المرضى سواء قبل العلاج (1.4) او بعد العلاج (1.3) بالمقارنة بافراد المجموعة الضابطة (1.3) .التاثير المعاكس للانسولين تحقق من خلال التقدير الكمي لتركيز الانسولين (مايكرو وحدة دولية لكل لتر) عند الصيام حيث اظهر المتوسط الحسابي للبيانات قبل العلاج عدم وجود فرو قات معنوية بين المرضى(8.1) والمجموعة الضابطة (8.3), اثناء المتابعة لفترة العلاج ارتفع مستوى تركيز الانسولين معنويا (17.4) مقارنة بافراد المجموعة الضابطة من جهة وبين الحالة قبل العلاج من جهة اخرى.اوضحت النتائج الاحصائية لوسط تركيز الفايبرنوجين مقدرا" بوحدة الملغرام لكل لتر من البلازما بواسطة الطريقة الالية اليدوية ارتفاعا" معنويا" لدى المرضى قبل العلاج (282.9) مقارنة" بالسيطرة (265.4), ظهر ان تركيزه ازداد اكثر بعد العلاج (361.1) وبدت الفر وقات معنوية" اكثر مما كانت عليه مقارنة بالسيطرة من ناحية وبالمرضى انفسهم قبل العلاج من ناحية" اخرى.جانب اخر مهم يوضح الدور الفسلجى الايضي لهرمون النمو باستخدام الطريقة الانزيمية اللونية لتقدير تركيز مستوى الدهون والكالسيوم (بوحدة الملي مول لكل لتر من المصل) وكانت البيانات موضحة لاثر النقص الهرموني لدى هؤلاء المرضى. حيث ان الفرو قات كانت معنويا" عالية بين المجموعتين في مستوى دهون المصل كما اظهر المتوسط الحسابي لعينة المرضى {T - C=4.1 , TG=1.5 ,LDL=2.5 , VLDL=0.7 , الوسيط الحسابي TC/HDL=4.22 اما HDL فقد كان معنويا منخفض = 1 { مقارنة بالسيطرة {T - C=9.3 , TG=1 ,LDL=1.8 , VLDL=0.5 , اما HDL فقد كان = 1.6, المتوسط الحسابي TC/HDL=2.35 { طرا بعد العلاج الهرموني تحسنا" معنويا" عاليا" مقارنة بما كانت عليه الحالة قبل العلاج كالاتي {T - C=3.6, TG=1.2, LDL=1.6, VLDL=0.5, اما 1.5=HDL, والمتوسط الحسابي TC/HDL=2.31}.اظهر التحليل الاحصائي ان البيانات الاولية لوسيط مستوى كالسيوم المصل تشير لانخفاض طفيف لدى المرضى(2.2) قبل العلاج, مقارنة" مع السيطرة (2.3). في حين ظهرت الفرو قات ذات اهمية معنوية اثر العلاج الهرموني حيث انخفض متوسط تركيزه الى (2). العلاج الهرموني ساهم معنويا (P<0.001) في تحسين {HAZ= - 2.9 و{BMIZ=0.7 لدى قصار القامة, مقارنة بما كانوا عليه قبل العلاج {HAZ= - 3.7 و{BMIZ= - 1.1, لكن عموما لازالت الفرو قات ذات اهمية معنوية في تفريقهم عن مجموعة السيطرة {HAZ= 0.2 . {BMIZ=0.3 بينت تحليلات الحسابات الاحصائية ان قيم القطع المثلى من الممكن ان تكون ذات اهمية في تفريق المرضى قصار القامة بسبب نقص هرمون النمو عن الاصحاء, وفي ذات السياق من الممكن ايضا" ان تساعد في توقع النقص الهرموني لديهم, ان كانت قيم القطع المثلى للمتغيرات المختبرة كالاتي {تركيز GH بعد التحفيز بالكلوندين اقل من 10.6 , CEA اعلى او مساوي ل 0.95 , وان كان مستوى الدهون في المصل اعلى من 3.04 ل TC/HDL , 2.1 LDL , 1.2 TG , 0.4 VLDL واقل من 1.4 HDL , واقل من 0.72 BMIZ }.نستنتج من هذه الدراسة ان العديد من الاستجابات المرضية والاختلال الايضيي يبدو بوضوح متعلقا" بنقص هرمون النمو وان العلاج الهرموني يساهم في تحسين الوضع المناعي والفسلجي لهؤلاء الاطفال. بشكل عام استخدام هرمون النمو امن نسبيا", بالرغم من ذالك GH يمتلك اثار جانبية محتملة قوية , لذا مثل هؤلاء المرضى لابد ان يراقبوا عن كثب وبصورة" دورية اثناء العلاج.بعض المتغيرات المدروسة مثل CEA ومستوى الدهون والفايبرنوجين اضافة الى BMIZ يمكن ان تساهم في التقييم الاولي والى حد معين من الممكن ان تساهم في دعم تشخيص نقص هرمون النمو .علاوة" على ذالك من المهم الانتباه الى الناحية الغذائية ودعم نمو مثل هؤلاء الاطفال بالكالسيوم اثناء العلاج اضافة للعناصر المغذية الاخرى الضرورية لنموهم. | Growth hormone deficiency (GHD) is the commonest endocrine disorder presenting with short stature (SS) in children, it is associated with several pathophysiological consequences, which has not yet elucidated. The important clues have come from clinical, immunobiochemical and genetic studies of GHD which have suggested an importance for the immunobiochemical factors in the etiology of this pathological consequences, and showed that GH - replacement therapy (GHRT) is recommended for the determination of the exaggerated physiological responses that play a crucial role in children growth retardation, and because of GHD not only has very serious medical consequences but also has a major psychological and social impact on children and their families, in addition to that a little is known about GHD pathological features, therefore; the development of successful therapeutical management strategies to such children are facilitated by the understanding of the GHD pathological influences.Tumor markers antigens (Carcinoembryonic antigen CEA, Alpha fetoprotein AFP, Carbohydrate antigen 125 CA - 125), insulin hormone, plasma fibrinogen, are primary candidates for this study, in addition, lipid profile, serum calcium (Ca), height and weight expressed as Z score {height for age (HAZ), body mass index (BMIZ)}, the study was also concerned with the evaluation of GH stimulation by using clonidine. This prospective study was carried out in 49 Iraqi, children, SS patient groups (37 male, 12 female) they were regularly attending the Welfare Teaching Hospital / children protective/ Baghdad were studied. The diagnosis has been well - established, based on clinical, immune - biochemical, and genetic criteria. An ethnically matched, apparently healthy control group (n=20) aged 13.5±3.3 years (mean ±SD) was also involved through Oct. 2007 to Aug 2008. ELISA tests for GH, CEA, CA - 125, AFP, insulin, and manual automated test of plasma FI and enzymatic colorimetric assay for serum lipid profile and Ca were carried out on all studied groups.Concerning the GH quantitative assay for serum median concentration (ng/ml) of baseline and after clonidine stimuli test revealed significant (p<0.001) differences between the study groups, baseline value was significantly lowered(1.4) in SS GHD cases compared to controls (3.7), after stimulation GH value was also lowered among SS GHD cases (5.1), than in controls (10.9). Clonidine test showed an excellent discriminating ability, between the two groups, and in initial assessment of GHD in SS children.A serological tumor markers quantitative immune assays, for serum median CEA concentration (µg/L), revealed that; baseline value was significantly (p<0.006) higher among GHD cases (1.4) than in controls (0.9), this elevated value tends to slightly decreased after treatment, although, still significantly higher among GHD cases (1.38) compared to controls, this result may be indicatives of the inflammatorycondition associated with GHD. CA - 125 baseline mean value (U/L) was slightly higher among GHD patients (10.8) than controls (9.2), a slight insignificant reduction occurred after treatment (9.7) compared to baseline value.AFP serum mean value (ng/ml) revealed no significant differences at baseline among GHD cases (1.4) compared to controls (1.3), after GHRT there were also no significant differences in GHD cases (1.3) compared to controls and baseline values.The contra insulin effect of GH achieved by quantitative determination of fasting serum insulin, baseline data observed in mean concentration (µIU/L) showed no significant differences among GHD cases (8.1) in comparison with controls (8.3). After treatment duration(9months) fasting serum insulin was significantly(p<0.001) elevated among GHD cases (17.4) compared to controls and to its baseline values. Manual automated quantitative assay for plasma FI mean concentrations (mg/dl) revealed that; baseline FI was significantly (p<0.049) higher among GHD patients (282.9) than in controls (265.4), this elevated value was fatherly increased after treatment (361.1) (p<0.001) in GHD patients. Another important aspect of GHD pathophysiological consequences on metabolism observed by the enzyme colorimetric method, for serum lipid profile mean value (mmol/l) , the data shown to be relevant to GHD in SS children; baseline lipid profile was significantly (p<0.001) higher among GHD cases {(T - C=4.1), (TG=1.5), (LDL - C=2.5), (VLDL - C=0.7) and median value of (T - C/HDL - C=4.22), whereas mean value of serum (HDL - C was significantly lowered =1)} than in controls {(T - C=3.9), (TG=1), (LDL - C=1.8), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.35) and (HDL - C=1.6)}. A significant (p<0.001) improvement observed through out GHRT duration in GHD cases {(T - C=3.6), (TG=1.2), (LDL - C=1.6), (VLDL - C=0.5) (T - C/HDL - C=2.31) and (HDL - C=1.5)} compared to baseline values.Ca is an essential mineral for bones building, and several other biological functions, baseline data concentration (mmol/l) expressed as median value reveled that; baseline serum Ca was a slightly lowered in GHD cases (2.2) than controls (2.3), this slightly lowered value was further and significantly (p<0.001) decreased among GHD cases (2) compared to controls and to its baseline values.GHRT significantly (p<0.001) improved HAZ and BMIZ in GHD cases respectively {( - 2.9), ( - 0.7)} than it was pretreatment {( - 3.7), ( - 1.1)}, which were significantly (p<0.001) lowered than normal controls values {(0.2), (0.3)}, although, this improvement GHD short stature cases are still significantly different than in controls. The ROC analysis was shown newly reported, interesting evaluating roles that may - be possibly have an important assistant as discriminating and predicting tool of GHD in SS children, for probably most study parameters considering GHD as an important etiology of SS at baseline, the typical cutoff values when used to classify subjects and separator SS cases with GHD the results of this study indicated that SS patients may possibly be predicted to have GHD if they have concentrations as followed, the typical cutoff values were(< 10.6 for GH after stimulation by clonidine), while were (≥ 0.95 for CEA), {(lipid profile optimal cut off value were (≥ 3.8 for T - C), (1.2 for TG), (2.1 for LDL - C), (0.4 for VLDL - C), (3.04 for T - C/HDL - C) and was for (HDL - C < 1.4)},and for BMIZ was< 0.72). In conclusion, several pathological responses and metabolic disorders seem to be associated with GHD, and GHRT aid in improving GHD children immuno physiological state, the evaluation of immune metabolic parameters proves to be a useful indicator of GHD in The use of GH generally safe, although GH has potential side effects, children receiving GH must be monitored closely during treatment. Importantly, CEA, serum Ca, and lipid profile prove to be useful tools for the evaluation of auxological parameters during GHRT, and to some extent may aid in prediction GHD in SS children and possibly support the diagnosis.Further attention should be paid to the nutritional status of such patients, and supporting their growth by calcium and other important minerals supplements.

تحديد قابلية بعض النباتات المحلية على مقاومة وازالة النفط الخام من التربة == Determination the Ability some of Local Plants on Resistance and Removal the Crude Oil from S

Author name: داوود سالم عيدان عبد النبي الطائي
Supervisor name: احسان شفيق توفيق دميرداغ
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: زرعت خمس بذور كلا من النباتات التالية : جت Medicago sativa، شعير Hordeum vulgatis، ذرة Zea mays، ماش Vigna radiata، خيار Cucumis sativa، برسيم Trifolium astivum ولوبيا Vigna sinensis وشوفان Avena sativa وريحان Osmium basilicum في البيت الزجاجي في اصص معامــلة بتـــراكيز (0 ،22.5 ،45 , 80) غم نفط خام/ كغم تربة جافة, وبعد 34 يوم من بدء الزراعة تم اجراء عدة اختبارات : حساب نسبة الانبات, اطوال النباتات , الحجم العلوي للنبات , سرعة الانبات ومؤشر تحفيز الانبات, حيث اظهرت النتائج مقاومة النبات لتراكيز النفط ضمن درجات متفاوتة وبالترتيب من الاكثر مقاومة ( اقل حساسية) الى الاقل مقاومة (الاكثر حساسية) : الجت، الشعير, ذرة, ماش, خيار,برسيم, لوبيا واظهرت ان الشوفان والريحان على الترتيب اكثر حساسية لتراكيز النفط المستعملة, كما تم قياس كمية CO2 المتحررة من جذور الشعير وجذور الريحان بعد اسبوع من بدء التجربة للجذور الماخوذة من اصص غير ملوثة ومن اصص تركيز النفط فيها 22.5 غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف بعد 34 يوم من بدء الزراعة لكل منهما, تبين ان كميةCO2 المتحررة خلال جميع الايام السبعة وللمعاملتين لنبات الشعير اعلى من كمية CO2 المتحررة لنبات الريحان. ولمعرفة قابلية النباتات المقاومة النامية سابقا في تحسين التربة تم زراعة 5 بذور من بذور النباتين الحساسين كلا على حدا بعد 34 يوم من بدء الزراعة في اصص مزروعة سابقا بنباتات المقاومة لتراكيز النفط المختلفة , اظهرت النتائج بعد اجراء اختبارات نسبة الانبات وحجم النبات على نباتي الشوفان والريحان اظهرت ازدياد في نسبة الانبات حيث كان الانبات الاولي للشوفان وللريحان على الترتيب في المرة الاولى( اصص غير مزروعة سابقا ) ضمن تركيزي (22.5،45 ) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف ( 29%, 19% ), (25 % , 17.1% ) على الترتيب, في حين في الزراعة الثانية ( اصص مزروعة سابقا ) كانت نسب الانبات لهما على الترتيب وضمن تركيزي (22.5، 45) غم نفط خام/ كغم تربة وزن جاف (72 %, 70 %), (74 %, 69 %) وهذا التحسن كان في حجم الجزء الخضري لهما ايضا. | Phytodegredation of crude oil in artificially contaminated soil, I used 4 concentration of crude oil in the following plants : alfalfa, barely, clover, Basil in the different concentration, after 34 days of starting the plants we measured length of plant and promoter indicator and speed of germination we showed from these tolerant plant and sensitive plant, after that we measured CO2 liberated from root soil exactly from Barely and Basil after that we planted the soil that was previously planted in the farmer plant we showed from that improvement in the growth of plant and anther criteria that was refer to improve in the soil.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli == Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

Author name: داليا سـلمان عــبد ســبع
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

Author name: خولة جبر خلف المحمداوي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

دراسة اولية لتقدير فعالية مواد (نباتية ، كيمياوية ، مستضدية) في خمجية طفيلي الاكياس المائية في محاولة لاستخدامها علاجيا == Primitive study to determine material efficiency) plant , chemical , antigen ( in Echinococcus granulosus infection as an a tempt to curing application

Author name: خلود ناجي رشيد التكريتي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ندى محمد طه البشير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة علاج مرض الاكياس المائية Hydatidosis المتسبب عن الطور اليرقي للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus اذ تضمنت محورين : - الاول : علاج المـــرض كـــدواء وشمـــل جانبيـــن : .1 استخــدام مســـتخلصين نباتييـــن مائييــن ( اوراق الاس Myrtus communis وبــذور الحبـــة الســـوداء Nigella sativa ) ..2 استـــخــــدام مستحضـــر كيمياوي ( عقار S2 - Complex) . فقـد درس تاثير المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في حيوية الرؤيسات الاولية Protoscolices لطفيلي E. granulosus خارج الجسم in vitro وبواقع خمسة تراكيـز لكل منهم تراوحت ما بيـن (30 ، 35 ، 40 ، 45 ، 50) ملغم/مل للمستخلصيـن النباتييـــن و(2.3 ، 3.3 ، 4.3 ، 5.3 ، 6.3) ملغم/مل للعقار ، كما درسـت فعالية وقدرة المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في السيطرة على خمجية الطفيلي داخـل الجسـم in vivo وبواقـع تركيزين لكـل منهـم تراوحت ما بيـن } (12,6) ، (25,12) ، (0.36,0.18) { ملغم/مل من مستخلص اوراق الاس وبذور الحبة السوداء والعقار S - 2 على التوالي .الثاني : علاج المـــرض كلقاح : حيث تـم استخلاص مستضدين من الطور اليرقي للطفيلي موضوع البحث ، هما مستضد سائـل الكيـس المائـي Hydatid cyst fluid antigen ومستضـد طبقات جدار الكيـس المائـي Hydatid cyst wall layers antigen فـي محاولـة لتمنيــع الفئــران المختبرية ضد الخمج بالاكياس المائية . وتم تقييم حدة الخمج بدلالة بعض المقاييس الحياتية مثـل : معـدل عـدد وقطـر الاكياس المائيـة الثانويـة والنسبـة المئويـة لاختزالها وقياس مؤشـر تضخـم الطحال والكبـد وقياس معـدل الفعاليـة الانزيميـة لانزيمي (ADA) Adenosine deaminase و(ALP) Alkaline phosphatase كمؤشرين كيميائيين حياتيين لحالة الخمج ولفترات زمنية معينة وكذلك الفحص النسيجي للكبد والطحال والكليـة والرئـة . وقـــد اظهـرت نتائج الدراسة خارج الجسـم in vitro ان المستخلص المائـي لاوراق الاس كان الاكثر فعالية في ايقاف حيوية الرؤيسات الاولية يليه المستخلص المائي لبـذور الحبـة السـوداء ثـم العقار S - 2 عنـد استخـدام التراكيـز المختلفـة لكـل منهــم مقارنــة بحالـة السيطـرة ، فــي حيـن اظهـرت نتائج الدراسة داخل الجسم in vivo قـدرة العقار S2 - Complex فـي الحـد مـن انتشار الاكياس المائية الثانوية من خلال تثبيط اعدادها واحجامها في الكبد والاحشاء الداخليـة ، يليـه المستخلص المائي لاوراق الاس ثم المستخلص المائـي لبـذور الحبـة السـوداء من حيث القدرة التثبيطية للخمج مقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة . اما نتائج استخدام المستضدين المستخلصين مــن الطـور اليرقـي فقـد اظهرت كفاءة مستضد سائل الكيس المائي HF في رفع القوة التمنيعية من خلال قدرة الفئران على توجيه مقاومة فعالة ضد الخمج فكانت النسبة المئوية لاختزال عدد الاكياس المائية (100)% اي انه اعطى مناعة تامـة ضد الخمج ، في حين ان مستضد طبقات جدار الكيس المائي HCL اعطى نسبة اختزال (94.37)% ، وقد جرى استخدام معدلين مناعيين لاغراض السيطرة : هما لقاح الســل البقــري (BCG) Bacilli Calmette Guerin ومادة النشا Starch ، فقـد اظهر لقاح BCG نسبة اختزال لاعداد الاكياس المائية الثانوية بلغت (53.83)% في حين اظهـرت مادة النشا نسبــة اختـزال بلغت (21.29)% قياسا لمجموعة السيطرة الموجبة . وبشكل عام فالنتائــج المستحصلــة تشيــر الــى القــدرة العالية للعقار S2 - Complex فـي تثبيـط تطـور الاكياس المائيـة الثانويـة ، كما تظهـر الفعالية الكبيـرة لمستضـد سائـل الكيـس المائي وكفاءته العالية في تحفيز مناعة تامـة ضد الخمج ، مما يوحي بامكانية استخدامها مستقبلا في الوقاية ضد مرض الاكياس المائية اذا ما تبعت هذه الدراسة بدراسات تطبيقيـة اخرى فـي مضائـف اخـرى . | This study aimed treat the Hydatidosis disease caused by larval stage of the Echinococcus granulosus. It included two axes : First : treatment of the disease using medicine which involved two aspects : A) Using water extracts of two plants (leaves of Myrtus communis,seeds of Nigella sativa).B) Using chemical substance (S2 - Complex drug) .The effect of those two extracts and the drug had been studied on the protoscolices viability for E. granulosus in vitro using five concentrations for each of them ranging between (30,35,40,45,50) mg/ml for the two plants extracts and (2.3,3.3,4.3,5.3,6.3) mg/ml for the substance . The effectiveness and ability of the two extracts and substance were studied in order to control the infection in vivo using two concentrations for each ranging between[(12,6),(25,12),(0.36,0.18)] mg/ml for the leave extracts of M. communis , seed extracts of N. sativa and the drug S - 2 receptively .Second : treatment of the disease using vaccine : Two antigens were extracted from the larval stage of the parasite under study. Those are hydatid cyst fluid antigen (antigen HF)and hydatid cyst wall layers antigen (antigen HCL) this was in an attempt to immunize laboratory mice against infection with Hydatidosis This study evaluated the infection intensity by using some biological standards as : The average number and diameter of hydatid cysts and its reduction percentage ratio ; measuring the indicator of liver and spleen hypertrophy ; measuring the average of the enzyme activity for Adenosine Deaminase (ADA) and Alkaline Phosphatase (ALP) as biochemical indicators for the infection state , during a period of time, in addition to tissue investigated for liver, spleen, kidney and lung .The conclusion of this study represented that the extract of M. communis was the most effective to stop the protoscolices viability ; followed by the extract of the N. sativa and finally the drug S - 2 when different concentrations were used for each of them compared with the control state. Whereas the results in vivo presented the ability of S2 - Complex drug to limit the distribution of hydatid cysts by inhibition their numbers and volumes in the liver and the visceral organs followed by water extracts of M.communis and water extracts of N. sativa according to the inhibition ability for infection compared to the positive control group. However the results of uses antigen extracted from the larval stage showed efficiency of antigen HF to increase immunization strength through mice capability having an active resistant against infection . The percentage of reducing the number of hydatid cysts was (100)% . It means that this antigen give absolute immunization against infection . However the antigen HCL gave a reduction ration (94.37)% . Then we used two immunomodulators as a control, They are BCG vaccine and Starch, The BCG vaccine present a reduction ratio for the hydatid cysts numbers reached (53.83)% while Starch represent a reduction ratio reached (21.29)% compared with the positive control group .Generally the results indicated to the S2 - Complex high capacity in frustrating the development of the hydatid cysts. Also it showed the large activity of antigen HF and its high capability for catalysis absolute immunity against infection. This can be used in prevention against the Hydatidosis disease if this study followed by another application studies in other fields .

دراسة بكتيرية ومصلية لمسببات ذات الرئة المكتسب من المجتمع لدى المصابين بالانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological and serological study for causes of community acquired pneumonia in COPD patients

Author name: خديجة شعبان المزوري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة (100) مريض من المصابين بالانسداد الرئوي المزمن والذين يعانون من التهاب ذات الرئة والمشخصين سريريا وشعاعيا في مستشفى بغداد التعليمي من قبل اطباء اختصاص بالاعتماد على العلامات والاعراض السريرية, الفحص الشعاعي وفحص وظائف الرئة. خلال المدة الزمنية 15/9/2001 - 15/4/2002.تم جمع (83) عينة قشع من هؤلاء المرضى, ثم تم قبول (76) عينة لانها كانت ضمن المواصفات المطلوبة والمتضمنة عدد الخلايا القيحية وعدد الخلايا الظهارية, ورفضت (7) عينات لانها لم تكن ضمن المواصفات المطلوبة.تم جمع عينات المصل من جميع المرضى لغرض الكشف عن الاستجابة النوعية للاجسام المضادة نوع IgM, كما شملت الدراسة (50) عينة دم سحبت من اشخاص اصحاء لا يعانون من اصابات تنفسية.تم زرع عينات القشع على اوساط زرعية مختلفة لغرض عزل وتشخيص البكتريا, في حين استخدم نظام API للتشخيص النهائي للبكتريا المعزولة وقد اظهرت نتائج التشخيص ان بكتريا Moraxella catarrhalis كانت باعلى بنسبة اذ بلغت (%13.8), ثم تلتها بكتريا Klebsiella pneumoniae (%12.1) وبكتريا Pseudomonas aeroginosae (%10.3). في حين بلغت نسبة الاصابة ببكتريا Streptococcus pneumoniae (%6.9) وبكتريا (%5.2) Haemophilus influenzae وعند اجراء التشخيص المصلي باستخدام الالايزا (ELISA), اظهرت النتائج ان بكتريا Chlamydia pneumoniae شخصت بنسبة (%31) ثم تلتها بكتريا Mycoplasma pneumoniae التي بلغت نسبتها (%17.2).وفي محاولة للتفريق بين ذات الرئة النمطي وغير النمطي تم استخدام بعض المقاييس مثل ( معدل ترسيب كريات الدم الحمر, العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, بروتين التفاعل, قياس الاستجابة المناعية الموضعية).اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود تاثير معنوي فقط عند استخدام العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, وقياس الاستجابة المناعية الموضعية. ولدراسة عوامل الخطورة الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل العمر, الجنس, وبعض الظروف الملازمة للاصابة. دلت النتائج على وجود زيادة في نسبة اصابة الذكور عما هي عليه في الاناث, اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 2.وكان للعمر تاثير مختلف على المسببات البكتيرية, فقد ارتفعت نسبة الاصابة ببكتريا C. pneumoniae وبكتريا M. catarrhalis مع الزيادة بالعمر, في حين انخفضت نسبة الاصابة ببكتريا M. pneumoniae مع تقدم المريض بالعمر.كما دلت النتائج الى وجود علاقة ذات اثر معنوي بين الاصابة ببعض المسببات البكتيرية وبعض الظروف الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل (التدخين, داء السكر, اصابات رئوية سالبة, القصور الكلوي المزمن). | This study enrolled (100) patient with clinical and radiological evidence of Pneumonia through the period extending from 15/9/2001 - 15/4/2002, who were admitted to Baghdad Teaching hospital, with chronic obstructive pulmonary disease diagnosed by a physician based on clinical, radiological and pulmonary function test.Sputum sample were collected from (83) patient, (76) were processed after fitting criteria for selection which included number of pus cells, number of epithelial cell and Gram stain for primary bacterial identification. Seven samples were rejected for not fitting criteria of selection.Serum sample for detection specific antibody response, were taken for the whole patients.More over 50 serum sample were taken as a control for immunological tests.Proper sputum samples were cultured for the isolation of bacteria, API system was used for the identification of bacteria.From the bacteria isolated M. catarrhalis was the most commonly diagnosed bacteria which is found to be (13.8%) of the total bacteria. Followed by Gram negative bacilli K. pneumoniae being (12.1%) and P. aeroginosae (10.3%) Streptococcus pneumoniae (6.9%), H. influenzae (5.2%).As for immunological diagnosis, C. pneumoniae was diagnosed for (31%) of the cases, followed by M. pneumoniae (17.2%). In an attempt to evaluate parameters that might be useful to differentiate Typical from Atypical pneumonia, ESR, CRP, total WBC count and IgA local immune response were evaluated.Significant difference was detected only in total WBC count and IgA local immune response.Finally to detect possible effect of comorbid condition on bacteria previous age, sex, and other comorbid illness were studied. Males were affected more than female, age show variable effect on different bacterial infection.Smoking, diabetes mellitus, old pulmonary diseases, chronic renal disease, were among the most common and significant factor that affect community acquired pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease

مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus المعزولة من اخماج الحروق والجروح للمضادات الحيوية وبعض المطهرات == Resistance of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus isolated from Burns & Wounds infections to Antibiotics and some Disinfecta

Author name: ختام علي عبيد الخزعلي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 235 مسحة من مرضى مصابين باخماج الجروح والحروق في مستشفيات مختلفة في بغداد للفترة من تشرين الثاني لسنة 2007 ولغاية شهر ايار لسنة 2008 .• شخصت المستعمرات النامية بالاعتماد على عدد من الاختبارات الكيموحيوية, اذ امكن تشخيص 100 عزلة سريرية ( 67 عزلة حروق و33 عزلة جروح ) من المجموع الكلي للعزلات ، توزعت بواقع 64 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ( 50 عزلة حروق 14 عزلة جروح ) و36 عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus ( 17 عزلة حروق و19 عزلة جروح ) واكد التشخيص باستخدام نظام API 20 NE وAPI Staph .• شملت الدراسة فحص الحساسية باستخدام الاقراص تجاه 18مضاداحيويا لكل منهما.• اظهرت عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa مقاومة عالية لمضادات Azetreoname وPipracillin وCarbencillin وCefepime وCefixime وCephalexin وCeftriaxone وCefotixime وCeftazidime وTrimethoprime وCo - trimoxazole اذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة لمضادات Gentamicin وTobramycin وCiprofloxacin وNorfloxacin وImipenem بلغت نسبها (89 ، 79.68 ، 60.9، 81.25، 42.1) % على التوالي ، في حين اظهرت عزلتين فقط من البكتريا المعزولة من اخماج الحروق مقاومة لمضاد Colistin ، وبنسبة 3.2% .• اظهرت عزلات بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية لمضادي Methicillin وAmpicillinاذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة للمضادات Ceftriaxone وAugmentin وErythromycin وGentamicin وTobramycin وTetracyclin وTrimethoprim وCo - trimoxazole بنسبة (72.2 ، 86.1 ، 52.77 ، 41.66 ، 36.1 ، 50 ، 33.3 ، 30.5) % على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة اقل تجاه المضادات (Imipenem ، Rifampicin ،Ciprofloxacin ،Cefotaxime) بنسبة (22.2، 27.7، 13.88، 16.66) % على التوالي . اظهرت العزلات مقاومة متكافئة لمضادات Norfloxacin وOfloxacin وEnoxacin بنسبة % 19.4 . جميع العزلات كانت حساسة لمضاد Vancomycin. • حددت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs) لبعض المضادات المستخدمة في الدراسة وشملت ، مضاد Imipenem اذ تراوحت قيم MICs ما بين (512 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Ciprofloxacin (128 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Norfloxacin (1024 - 8) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Cefotaxime (4 - 1024< ) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Gentamicin (4 - 1024<) ميكروغرام/مليلتر.• اجري اختبار الفعالية المضادة للبكتريا لخمسة من السيفالوسبورينات بعد اجراء تفاعل اعادة الترتيب من خلال تصعيدها في المحاليل المائية الحامضية القوية . انتج تفاعل اعادة الترتيب هيكل حلقة من 5,2 داي اوكسو ببرازين وهي ذات فاعلية واطئة كمضادات بكتيرية وعلى الرغم من ذلك فان هذه النواتج هي مرشحات قوية كادوية مضادة للسرطان.• تبين ان 90% من العزلات كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز.• حددت التراكيز المثبطة الدنيا Minimal Inhibitory Concentrations (MICs) لثلاثة من المطهرات الكيميائية الشائعة الاستخدام في المستشفيات لعشر عزلات بكتيرية لكل من النوعين والتي شملت مطهر الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(256 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (512 - 64) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (512 - 4) مايكروغرام/مليلتر. اذ تبين ان مطهر الهبتين بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات، في حين مطهر بيروكسيد الهيدروجين هو الاقل كفاءة.• حددت التراكيز القاتلة الدنيا Minimal Bactericidal Concentrations (MBCs) للمطهرات الثلاثة للعزلات البكتيرية الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(512 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (1024 - 128) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (1024 - 4) مايكروغرام/مليلتر.• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا (MBCs) اذ تراوح مابين 15 - 10)) دقيقة لمطهر الهبتين,و(40 - 20) دقيقة لبيروكسيد الهيدروجين,(20 - 10) دقيقة لمطهر السكنسبت. | • The study includes the collection of 235, burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2007 to May 2008 .• The isolated colonies were identified depending on biochemical tests, The identification revealed of 100 isolates (67 burns & 33 wounds) from the total number of isolates , 64 isolates of Pseugomonas aeruginosa (50 burns & 14 wounds) and 36 isolates of Staphylococcus aureus (17 burns & 19 wounds) Then the identification of these species was confirmed by using API 20 NE and API Staph. • The study includes sensitivity test by using Disk diffusion method . towards 18 antibiotics,for each species. • The Pesudomonas aeruginosa isolates showed height resistance to Azetreoname, Pipracillin, Carbencillin, Cefepime, Cefixime, Cephalexin, Ceftriaxone, Cefotixime, Ceftazidime, Trimethoprime, and Co - trimoxazole with percentage 100 %, and to Gentamicin, Tobramycin, Ciprofloxacin, Norfloxacin and Imipenem with percentage (89, 79.68, 60.9, 81.25, 42.1) % respectively . While two of burns isolates showed resistance to Colisitin with percentage 3.2 % . • The isolates of Staphylococcus aureus showed high resistance to Methicillin and Ampicillin with Percentage 100 %, and to Cefriaxone , Augmentin, Erythromycin, Gentamicin, Tobramycin, Tetracyclin, Trimethprim, Co - trimoxazole with percentage (72.2, 86.1, 52.77, 41.66, 36.1, 50, 33.3, 30.5 ) % respectively, and less resistance to Imipenem, Rifampicin, Ciprofloxacin, Cefotaxime with percentage (22.2, 27.7, 13.88, 16.66) % respectively. The isolates showed the same resistance towards Norfloxacin, Ofloxacin and Enoxacin with percentage 19.4 % . All strains were sensitive to Vancomycin . • The minimal inhibitory concentrations of some antibiotics were determined . for Imipenem, the MICs values ranged between (2 - 512) µg/mL, Ciprofloxacin, (2 - 128) µg/mL. Norfloxacin, (8 - 1024) µg/mL, Cefotaxime,( 4 - >1024) µg/mL, Gentamicin,( 4 - >1024) µg/mL• The antibacterial activity of five of cephalosporins after chemical re arrangement by reflux in strong acid solution was examined. The re arrangement reaction produce new ring skeleton of 2,5 dioxopiprazine , of lower antibacterial activity. However there product are candidates drug with expected anticancer activity. • (90 %) of the isolates have ability to produce beta lactamase enzymes.• Minimal Inhibitory Concentration, (MICs) for three of the Common Chemical disinfectants in the hospital were determined, for 10 bacterial isolates for each species. The MICs were range between (4 - 256) µg/mL for Hibitane, (64 - 512) µg/mL for Hydrogen peroxide and (4 - 512) µg/mL for skinsept . Hibitane with its low concentration was the most active comparing with the other antiseptics. while the Hydrogen peroxide was the less . • Minimal Bactericidal Concentration (MBCs) for three of the common chemical disinfectants were determined, the MBCs for Hibitane, (4 - 512) µg/mL, Hydrogen peroxide(128 - 1024) µg/mL,and Skinsept (4 - 1024) µg/mL for each species.• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal Concentrations of antiseptic was determined,it was (10 - 15)min for Hibitane, (20 - 40) min for Hydrogen peroxide and(10 - 20)min for Skinsept

دراسـة مقاومة انواع من البكتريا المعزولة من المرضى لبعض المضادات الحياتية والمركبات الكيمياوية الجديدة == STUDY THE RESISTANCE OF BACTERIAL SPECIES ISOLATED FROM PATIENTS TO THE SOME ANTIBIOTICS AND NEW CHEMICAL COMPOUNDS

Author name: خانزاد خضر جرجيس
Supervisor name: عادل كمال خضر | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 488 عينة ماخوذة من مختلف انواع الاصابات من مختبر الصحة العامة المركزي ومستشفيات محافظة اربيل . اخذت 100 عينة من اشخاص لهم التهابات المجاري البولية، وجمعت 388 مسـحة من التهاب الجروح، الحروق، الاذن، اللوزتين، ملتحمة العين، المهبل والانف . استنبتت هذه العينات على وسطي اكار الدم وماكونكي اكار للتحري عن وجود البكتريا المسـببة للاصابات المتنوعة وتشخيصها . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع البكتيري 321 (% 65.77)، فيما كان عدد العينات السالبة 167 (% 34.22)، شــخصت العزلات النامية مظهريا وزرعيا وخواصها الكيموحيوية اذ اهملت جميع انواع البكتريا النامية باســـتثناء S. aureus ، S. epidermidis ، P .aeruginosa ، E. coli . اظهرت نتائج التشخيص البايوكيميائي وجود 67 عزلة (% 20.87) منها تعود الى نوع S. aureus من خلال ايجابيتها لفحص الكاتليز وفحص انتاج انزيم مجلط البلازما، وتخمير سـكر المانيتول، اختزال التليورايت وانتاج انزيم محلل الدنا DNase المقاوم للحرارة كما واظهرت نتائج التشـــخيص وجود 59 عزلة (% 18.38) منها تعود الى E. coli اذ تميزت هذه البكتريا عند تنميتها على وسط EMB (Eosin - methylene blue agar) بمستعمراتها ذات بريق معدني اخضر وتنمو على اكار الماكونكي بشكل مستعمرات وردية لكونها مخمرة لسكر لاكتوز اضافة الى اختبار IMVC كانت موجبة لاختبار الاندول واحمر المثيل فيما كانت سالبة لفحص الفوكس بروسكاور ولم تتمكن بكتريا E. coli من اسـتهلاك السترات فقد اعطت فحصا سالبا لليوريز والاوكســيديز وكذلك وجود 50 عزلة (% 15.57) P. aeruginosa الموجبة لفحص الاوكسيديز والكاتليز واختبار استهلاك السترات وسالبة لاختبار انتاج اليوريز.واظهرت وجود 21 عزلة (% 6.54) تعود الى S. epidermidis منتجة لانزيم الكاتليز وغير منتجة لانزيم مجلط البلازما وانزيم تحلل الدنا DNase وغير مخمرة لســكر مانيتول، ، واستعمل نظام ابي API STAPH ، API 20E لدعم هذه النتائج .شملت الدراسة فحص حساسية العزلات تجاه 33 مضادا حياتيا و9 مركبات كيمياوية . اظهرت بكتريا S. aureus مقاومة عالية للمضادات Penicillin ، Ampicillin، Piperacillin ،Carbenicillin ، Augmentin ، Tetracycline اذ بلغت نسبتها (,90, 100 ,90 80 , 6050 ,) %على التوالي واظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضاد Rifampicin اذ بلغت نسبتها 5% واظهرت هذه البكتريا مقاومة منخفضة للمضادات Oxacillin ، Cloxacillin ، Imipenem , Amikacin , Ciprofloxacillin , Pefloxacillin , Sulphamethoxazole Trimethoprim اذ بلغت نســـــبتها % 15 على التوالي في حين حصلت استجابة مختلفة للمضادات الحيوية الاخرى . بينت النتائج ان جميع العزلات S. aureus كانت % 100 حساسة لمضاد Vancomycin ، Novobiocin ، Fusidic acid .اظهرت بكتريا S. epidermidis مقاومة عالية للمضادات Piperacillin, Penicillin G , Doxycycline hydrochloride, Ampicillin Carbenicillin ,Tetracycline, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (50,60,70,70,80,90, 100) .اظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضادات Imipenem Ciprofoxacillin,Rifampicin , ,Pefloxacillin, Fusidic acid , اذ بلغت نســـبتها % (5,10,10,10,10) على التوالي واظهرت جميع عزلات بكتريا S. epidermidis حساسيتها للمضادات Vancomycin , Novobiocin والتي بلغت نســـبتها % 100. اظهرت عزلات P. aeruginosa مقاومة عالية بلغت نسبتها % 100 للمضادات Penicillin G , Ampicillin , Augmentin , Oxacillin , Cloxacillin , Cephalothin , Cephalexin , Cefoxitin , Streptomycin ,Tetracyclin , Doxycycline hydrochloride , Chloramphenicol , Erythromycin , Rifampicin , Nitrofurantoin وSulphamethoxazole Trimethoprim.اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات Amikacin Ciprofloxacillin, Pefloxacillin, Imipenem, Aztreonam,, اذ بلغت نسبتها % (15,20,20,20,25) , بينما اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . اظهرت عزلات E. coli مقاومة عالية للمضادات Penicillin G , Cloxacillin,Oxacillin , Ampicillin Erythromycin, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (90,95,95, 100, 100,100) , اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات ,Gentamicin Ciprofoxacillin , Imipenem Aztreonam , , ,Amikacin,Nitrofurantoin,Pefloxacillin اذ بلغت نسبتها%(5,10,10,10,10,15,15) على التوالي في حين اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . تم دراسة مركبات مشتقة من - 5,5 ثنائي فنيل - 4,2 - ايميدازوليدين دايون (فنتيون) من خلال اجراء تفاعلات قواعد مانيخ مع البارافورمالديهايد والامينات الاولية المعروفة باستخداماتها الدوائية . واختبرت هذه المركبات الكيميائية الجديدة التســعة كمواد مضادة للبكتريا Antibacterial agent باستخدام خمسة تراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06, 0.04 ml) . بينت نتائج التحليل الاحصائي ان افضل طريقة هي طريقة التخفيف بالمرق broth dilution وتليها طريقة تخفيف بالاكار . فقد تم التوصل الى وجود فروقات معنوية (P< 0.05) ، بين طريقة التخفيف بالمرق وكل من الطريقتين انتشار القرص والحفرة .جميع المركبات الكيمياوية المحضرة لها تاثيرات قاتلة على كل من S. aureus وS. epidermidis باســـتثناء V,VII حيث وجد ان لهما تاثيرا مثبطا وليـس قاتلا في التراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06,0.04ml) في حين اظهرت المركبات I، IV، V، VIII،IX تاثيرات قاتلة على بكتريا P. aeruginosa ، كما وجد ان المركبات II،III، VI، VII لهم تاثيرات مثبطة على هذه البكتريا في التراكيز المذكورة نفسها، كانت جميع المركبات الكيمياوية لهم تاثيرات قاتلة على بكتريا E. coli وفي جميع التراكيز المستخدمة .

الخصائص الحيوية والجزيئية والفعالية ضد الميكروبية للنايسين المنتج من قبل بكتريا subsp. lactis Lactococcus lactis المعزولة من الحليب الخام == Biological, Molecular characteristics and antimicrobial activity of Nisin produced by Lactococcus lactis subsp. lactis Isolated from Raw Milk

Author name: خالد اسماعيل عزيز
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | زيرك فقى احمد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت جمع مائة وخمسة واربعون نموذجا من الحليب الخام خلال فترة ما بين تموز الى التشرين الثانى لعام 2013 فى مزارع تربية المواشي لمحافظة اربيل ودهوك .اسفرت النتائج عن الحصول على 45 عزلة من بكتريا L. lactis subsp. lactis تمت تشخيص هذه العزلات باستخدام الصفات المجهرية , المظهرية , البايوكيميائية ,API 20E SYSTEM بالاضافة الى تقنية الـ PCR . اختبرت فعالية العزلات لبكتريا L. lactis subsp. lactis تجاه ثلاثه عشر نوعا من المضادات الحيويه وتباينت العزلات فيما بينهما من حيث استجابتها لاختبار الحساسية وعدد منها مقاومة كالاتي : Cephalothin, Ampicillin, Amoxicillin/ Clavulanic acid, Sulfamethoxazole/Trimethoprim, Cefotaxime, Clindamycin, Ceftriaxone, Nitrofurantoin, Gentamycin, Vancomycin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, and Imipenem.، ونسبة المقاومة كالاتي : 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55, 24.44%, 2.22%. على التوالي.اظهرت نتائج جميع العزلات فعالية عالية ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية وهى : E. coli, B. subtilis, P. aeruginosa, C. perfringes and S. aureus باستعمال تقنية طريقة الانتشار بالحفر. اظهرت العزلة 41 و15 فعالية عظمى (16mm) (20mm) ضد بكتريا S. aureus وB. subtilis بينما اظهرت العزلة 20 فعالية كبيرة (13mm) ضد بكتريا aeruginosa P.. عموما فان البكتريوسين لجميع العزلات المذكورة كانت فعالة ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة كرام .ايضا تم استخدام النايسين النقي ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية واظهرت النتائج بان مناطق التثبيط كانت 18، 22، 14، 13 و15 ملم ضد كل من S. aureus، B. subtilis، C. perfringens، E. coli وP. aeruginosa على التوالي.درست تاثير الاس الهايدروجينى،الحرارة والاشعة الفوق بنفسجية على فعالية نايسين للعزلات 10، 26 و42. اظهرت النتائج بان مستخلص نايسين لعزلة L42 كانت اكثر فعالية عند الاس الهايدروجينى 2.5 والحرارة - 4 م ضد البكتريا المرضية. لم يظهر مستخلص النايسين اى فعالية ضد البكتريا المرضية عند تعريضه للاشعة الفوق بنفسجية مبينا التاثير السلبى لهذه الاشعة على فعالية البكتريوسين.تم اختيار العزلة اكثر مقاومة للمضادات الحيوية (L42) لاجراء عملية التحول وذلك لتحديد مواقع الجينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية باستخدام عملية التحول الوراثي باستعمال بكتريا coli DH5 - α E. الخالية من البلازميدات مع البلازميد المنقى من العزلة L42. تم اجراء عملية التحول بنجاح واظهرت النتائج بان جينات : Chloramphenicol, Nitrofurantoin, Cefotaxime, and Vancomycin كانت واقعة على البلازميد بينما البقية كانت واقعة على الكروموسوم. تم تحديد التركيز المثبط الادنى للنايسين واظهرت النتائج بان MIC للنايسين بالنسبة لبكتريا aureus S. كانت 400µg/ml بينما لبكتريا coli E. كانت 500µg/ml. استخدمت MIC للنايسين كعامل تحييد للسيطرة على جينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية لنوعين من البكتريا المرضية وهى aureus S. وcoli E.. كشفت النتائج بان الجينات منحت المقاومة لـ AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AK, CFM, تم تحييدها بنسبة 61.5% بينما فى بكتريا coli E. تم تحييد الجينات لـLEV, MEL, NOR, and SXTبنسبة 31%. تم دعم النتائج عمليتي التحول والتحييد باستخدام تقنية الترحيل الكهربائى للهلام. | In this study a total of one hundred forty five raw milk samples were collected during the period of (July to November, 2013) from different fields in Erbil and Duhok province. Screening revealed that 45 out of 145 samples of raw cow milk (31%) were L. lactis subsp. lactis. Characterization of these selected isolates were carried out using morphological, microscopical, biochemical characteristics, API 20 system and further confirmation were achieved by PCR assay.Antibiotic sensitivity test performed for L. lactis subsp. lactis against thirteen antibiotics which include Ampicillin (AMP), Amoxicillin/ Clavulanic acid (AMC), Imipenem (IMP), Gentamycin (GM), Sulfamethoxazole/Trimethoprim (SXT), Cephalothin (CEP), Clindamycin (CLIN), Nitrofurantoin (F), Ciprofloxacin (CIP), Ceftriaxone (CRO), Chloramphenicol (C), Cefotaxime (CTX), and Vancomycin (VAN). The isolates appeared to be varied in their resistance, the number and resistance percent for antibiotics used CEP, AMP, AMC, SXT, CTX, CLIN, CRO, F, GM, VAN, CIP, C, and IMP were as follow 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55%, 24.44%, and 2.22% respectively.All supernatants were isolates exhibited marked activity against five pathogenic bacteria includes S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, P. aeruginosa, and E. coli using agar well diffusion method. Isolate 15 and 41 exert maximum activity (20 mm) and (16 mm) against B. subtilis and S. aureus. Whereas isolate 20 showed highest activity (13 mm) against P. aeroginosa. Generally, all aforementioned isolates were active against gram positive and Gram negative bacteria. In addition, the effect of pH, temperature and UV light were studied on nisin activities of L10, L26 and L42 against some pathogenic bacteria. The results showed that nisin extract of L42 displayed highest activity at pH 2.5 and temperature at - 4 °C against pathogenic bacteria under study. Under UV light wavelength all nisin showed low or no activity against different pathogenic bacteria selected in this study.Also a pure nisin was used against five pathogenic bacteria and the results shows that the inhibition zones were 18, 22, 14, 13 and 15 mm against each of S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, E. coli and P. aeruginosa respectively.One highly resistance isolate was chosen (L42) for transformation test to determine the location of the antibiotic resistance genes by genetic transformation process using the laboratory strain E. coli DH5 - α with plasmid DNA purified from this isolates. The transformation process conducted successfully and the results showed that the resistance genes for F, C, CTX, and VAN were located on plasmid DNA. While for others were located on chromosomal DNA.Minimum inhibitory concentrations were tested for nisin and the results revealed the MIC of nisin for S. aureus was 400 µg/ml while for E. coli was 500 µg /ml. MIC of nisin was used as curing against to control the antibiotic resistance genes in two pathogenic bacteria represented by E. coli and S. aureus. The results showed that the genes encoding resistance to AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AM, and CFM were cured and the percentage of curing was 61.5%. Whereas for E. coli the gene of LEV, MEL, NOR, and SXT were cured with 31%. The above results of both transformation and curing process were supported with gel electrophoresis.

دور السيلينيوم والبراسينولايد في النمو والمركبات الفعالة لنبات الكزبرة (Coriandrum sativum L.) المعرض للاجهاد المائي == Role of Selenium and Brassinolide in growth and active compounds for Coriander plant (Coriandrum sativum L.) Exposed to Water Stress

Author name: حيدر ناصر حسين المنتفجي
Supervisor name: عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

Author name: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.
1 ... 19 20 21 22 23 ... 32