Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 2,514

دراسة كيمونسجية مناعية وعلاجية في الفئران الممنعة والمصابة بالاكياس العدرية == Immunohistochemical and Therapeutic Study in Immunized and Infected Mice With Hydatid Cyst

Author name: افراح عبد الامير صادق العامري
Supervisor name: وحيدة رشيد علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت الدراسة الحالية جوانب اساسية للاصابة بالاكياس العدرية الثانوية لـ 120 فارا من ذكور الفئران البيض Mus musculusسلالة Balb/c، شمل الجانب الاول تحديد دور التمنيع في الجوانب الدموية كالعد التفريقي لخلايا الدم البيض والجوانب المناعية كفرط الحساسية الاجلة ومعامل البلعمة. اوضحت نتائج العد التفريقي ارتفاعا ملحوظا في اعداد الخلايا اللمفاوية بنسبة 64.75% مع حدوث تباين في اعداد الخلايا احادية النواة والحمضة وانخفاضا في اعداد الخلايا العدلة ليصل 32% في مجموعة الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة. وفيما يتعلق بالاستجابة المناعية الخلوية المتخصصة المتمثلة بقياس فرط الحساسية الاجلة في وسادة القدم اليسرى، اظهرت نتائج الدراسة الحالية حصول ارتفاع في معدل سمك وسادة القدم في الفئران الممنعة والمجرعة بمضادات الاكسدة ، مع ارتفاع في معامل البلعمة بنسبة 74% مقارنة بفئران السيطرة السالبة، فضلا عن التغيرات العيانية لتلك المجموعة ومن ثم انعكس ايجابيا على المظهر الخارجي وحركة الفئران ووزنها وقابليتها على التغذية وعليه اصيبت تلك الفئران تجريبيا بداء الاكياس العدرية الثانوية من خلال الحقن داخل الخلب (البريتون) بـ 2000 رؤيس اولي من اكباد ورئات اغنام مصابة طبيعيا بالاكياس العدرية. اما الجانب الثاني من الدراسة تمثل بمعالجة الفئران المصابة بثلاثة عقاقير من مشتقات البنزيميدازول والايزوكوينولين هي الالبندازول ((ABZ والاوكسفيندازول (OFZ) والبرازكوينتل (PZQ) ومتابعة بعض الجوانب الدموية والمناعية في الفئران بعد الاصابة والتمنيع والمعالجة، وشملت العد التفريقي لخلايا الدم البيض، اختبار فرط الحساسية الاجلة، معدل معامل البلعمة، اختبار النوى الصغيرة واختبار الانتشار المناعي في الهلام. سجلت مجموعة الفئران المعاملة بعقارOFZ وOFZ+PZQ ارتفاع النسب المئوية للعدلات وانخفاض الخلايا اللمفاوية مقارنة مع فئران مجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة في سمك وسادة القدم اليسرى بعد 24 ساعة مقارنة بالمجاميع الاخرى ومقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة، وسجلت زيادة معنوية في معدل معامل البلعمة في مجموعة الفئران المعاملة OFZ (53.17%) ومجموعة الفئران المعاملة OFZ+PZQ (71.5%) وانخفاضا معنويا في معدل النوى الصغيرة (28% و29.1%، على التوالي) مقارنة مع الفئران المعاملة بـOFZ+ABZ وABZ+PZQ، مما يدل على كفاءة المعالجة بعقار OFZ بشكل مفرد او متحد. اما الجانب الثالث فتمثل بدراسة تاثير الاصابة بالاكياس العدرية والعلاجات الكيميائية المختلفة في وظائف الكبد اذ اظهرت الدراسة ان انزيمات الكبد وهي AST وALT وALP فضلا عن مستوى البيليروبين الكلي والمباشر في مصل الفئران المعاملة بـ OFZ وبـ OFZ+PZQ كانت نتائجها اقرب الى السيطرة السالبة مقارنة مع المجموعتين OFZ+ABZ وABZ+PZQ.اما الجانب الرابع فشمل دراسة الجوانب الحياتية المتعلقة بوزن الفئران الممنعة والمعاملة بعقار OFZ بشكل مفرد او مختلط مع البرازكوينتل OFZ+PZQحيث ظهر ارتفاعا طفيفا بمعدل وزنها بنسبة 11.13% و12.10% على التوالي مقارنة بفئران السيطرة السالبة مقارنة بالفئران المعاملة بـ OFZ+ABZ وABZ+PZQ التي سجلت زيادة معنوية ((p≤0.001 قدرها 13.50% و14.87% على التوالي. وسجلت مجموعة الفئران المعاملة انخفاضا في معدل وزن الكبد ومعدل تضخهما اذ اختلفت معنويا عن مجموعة السيطرة الموجبة عند مستوى احتمالية p≤0.001. لذا فحصت الاكياس العدرية الثانوية بعد اربعة اشهر من الاصابة وتم قياس وزن وقطروعدد الاكياس العدرية وحساب الكفاءة النسبية للعلاج, اظهرت الدراسة ان عقارOFZ+PZQ اعلى كفاءة علاجية (96.70%) لكونه تسبب باختفاء الاكياس من الطحال وتلته المعاملة بعقار OFZ) 93.75%)، وسجلت المجاميع المعاملة بعقارOFZ+ABZ وABZ+PZQ كفاءة علاجية نسبية بلغت 82.5% و77.5%, على التوالي. شملت الدراسة التغيرات النسجية المرضية في طحال وكبد الفئران بعد اربعة اشهر من الاصابة والمعاملة. بينت النتائج حصول تغيرات نسجية معتدلة مقارنة مع فئران السيطرة الموجبة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية عن طريق الكيمونسجية المناعية ( IHC) اظهرت النتائج زيادة مستوى الحركيات الخلوية المفرزة من قبل الخلايا التائية المساعدة - النوع الاول (Th1) متمثلة بانترلوكين - 2، انترفيرون - كاما وعامل تنخر الورم اظهرت النتائج ارتفاعا معنويا ((P≤0.001 في مستوى تعبير بروتينIL - 2 في مجموعة الفئران المعاملة بـ OFZ+PZQ التي بلغت في الطحال 65.1% والكبد 54.1% مقارنة بالمجاميع الاخرى ومجموعة السيطرة السالبة والموجبة، وزيادة تعبير بروتين IFN - γفي المجاميع المعاملة مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة. وبينت نتائج التحليل الاحصائي وجود فروق معنوية عالية ذات دلالة احصائيةp≤0.001 في مستوى تعبير بروتينات TNF - α مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. اما بالنسبة الى الحركيات المفرزة من قبل خلايا Th2 فقد سجلت نقصانا في انترلوكين - 10 وعامل تحويل النمو بيتا لدى الفئران المعاملة بالمجاميع العلاجية الاربعة لاسيما المجموعة المعالجة بـ OFZ+PZQ فقد اظهرIL - 10 تعبير بروتينيا واطئا في الطحال بلغ 29.7% وفي الكبد 8.2% مقارنة بالمجاميع المعاملة الاخرى ومجموعة السيطرة، كما اظهرت الفئران الممنعة والمعاملة مستوى تعبير بروتينات TGF - β فروقا معنوية عند مستوى احتماليةp≤0.001 للمجاميع مقارنة مع مجموعتي السيطرة السالبة والموجبة. بشكل عام لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الحركيات الخلوية المنتجة من قبل Th1 وTh2وبشكل متوازن لدى الفئران الممنعة والمعاملة. | The current research in deals with fundamental aspects of the infection of 120 white mice Mus musculus strain Balb/c with secondary hydatid cysts, comprising first aspect the role of immunization in the haematological aspects such as the differential count of white blood cells and the immunological aspects such as the delayed type hypersensitivity and phagocytosis. The results of differential white blood cell count showed marked increase in the numbers of lymphocyte percentage (64.75%) with a variation in the numbers of monocytes and eosinophils and a decrease in neutrophil numbers which reached 32% in mice immunized and orally administered with antioxidants. In connection with delayed type hypersensitivity in the foot pad the results showed a rise in the rate of foot pad thickness in mice immunized and orally administered with antioxidants as the highest thickness reached 0.82 mm at 24 hours after the injection of antigen and phagocytosis index in mice immunized and orally administered with antioxidants showed an increase of 74% compared with negative and positive control mice in addition to the gross changes of this group which was positively reflected on their appearance, movement, weight and feeding. So this group was experimentally infected with secondary hydatid cyst through their intra peritoneal injection with 2000 protoscolices. The second aspect of the study was to evaluate the therapeutic efficacy of three drugs which belong to Benzimedazole and Isoquinoline viz albendazole (ABZ), oxfendazole (OFZ) and praziquental (PZQ) as well as to follow - up some aspects of the haematological and immunological parameters in mice after their infection, immunization and treatment which included differential white blood cell count, delayed type hypersensitivity test, phagocytosis, micronucleus test and agar gel immune diffusion test.Regarding changes in differential white blood cell count, mice treated with OFZ and OFZ + PZQ showed an increase in neutrophils and decline in lymphocytes compared with positive control group. Also, an increase in foot pad thickness after 24hrs compared with other treated groups and positive control group. An increase in the phagocytosis was noticed in OFZ treated group (53.17%) and OFZ+PZQ treated group (71.5%) and a significant decline in the micronucleus test of 28% and 29.1%, respectively compared with mice treatment with OFZ + ABZ and ABZ+ PZQ which indicates the efficiency of OFZ drug treated alone or in a combination form.The third aspect of the study was to evaluate the effect of infection with hydatid cyst and different chemical treatments on liver functions where the study showed that liver enzymes such as AST, ALT and ALP, as well as the total and direct bilirubin serum level in mice treated with OFZ alone and OFZ + PZQ were closer to those of the negative group compared with the groups treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ.The fourth aspect of the study was to evaluate the biological aspects related to weight of the mice treated with OFZ alone or combination with praziquental OFZ+PZQ where a slight increase in the average weight of 11.13% and 12.10%, respectively was occurred in compared with the negative control due to the low number of cyst and cyst fibrosis which occurred in comparison with those existed in mice treated with OFZ+ABZ and ABZ+PZQ which showed a significant increase(p<0.001) which reached 13.50% and 14.87%, respectively.The treated group showed a reduction in liver weight and enlargement rate which was significantly different from that of the positive control group at the level of probability of P< 0.001, as OFZ+PZQ caused the disappearance of the cysts from the spleen(96.70%), followed by group treated with OFZ (93.75%) and then by group treated with OFZ+ABZ and ABZ+ PZQ which showed a treatment efficacy of 82.5% and 77.5%, respectively. The study also included the evaluation of the pathological changes of liver and spleen of mice after four months of the infection and treatment. The result showed satisfactory histopathological changes in comparison with positive control group. When investigating the role of some cellular interleukins in the immune response against Echinococcus granulosus through the immunohistochemical (IHC)test, the results showed an increase in the level of cytokines secreted byTh1 such as IFN - γ andTNF - α as well as IL - 2. The results showed higher level of protein expression IL - 2 in mice group treated with OFZ+PZQ which amounted 65.1% in spleen and 54.1% in liver compared with other treated and negative and positive control groups. Also, an increase in protein expression of IFN - γ was occurred in the treated groups compared with the negative and positive controls except in the group which was treated with OFZ+PZQ where no significant differences were appear in the negative control. The statistical analysis showed the presence of high significant differences (p<0.001) in the level of expression proteins TNF - α compared with negative and positive control groups. Reduction level of cytokines secretion from Th2 (IL - 10 and TGF - β) in mice treated with the four treated group particularly the group which was treated with OFZ+PZQ showed that IL - 10 protein expression in spleen was low and reached 29.7% and 8.2% in liver compared with the other treated and control groups. The level of expression of proteins of TGF - β in the immunized and treated mice showed significant differences at the level of the probability of p<0.001 of the group compared with negative and positive control group. Generally, a high significant level of cytokines produced byTh1andTh2 in immunized and treated mice

تاثير الرش الورقي ببيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في نمو وحاصل صنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) المزروعة في المنطقة الديمية == Effect of foliar application of hydrogen peroxide and vitamin C on growth and yield of two cultivars of(Hordeum vulgare L.) planted in the dry farming land

Author name: اسو لطيف عزيز الاركوازي
Supervisor name: وفاق امجد القيسي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت التجربة الحقلية خلال موسم النمو 2015 - 2014في احد حقول ناحية قوره تو - قضاء خانقين - محافظة ديالى بهدف تحديد التاثير المتداخل لكل من بيروكسيد الهيدروجين وفيتامين C في بعض الصفات المظهرية والفسلجية وكذلك بعض مكونات الحاصل لصنفين من نبات الشعير (Hordeum vulgare L.) هما الابيض المحلي والاسود المحلي ، نفذت التجربة وفق تصميم القطاعات كاملة التعشيةRandomized Complete Block Design RCBD وبثلاثة مكررات وتضمنت التجربة الحقلية 72 وحدة تجريبية عبارة عن التداخل بين ثلاثة تراكيزمن بيروكسيد الهيدروجين هي 10،5،0% واربعة تراكيز من فيتامين C هي 0،50،100،150 ملغم.لتر - 1 . بينت نتائج التجربة ان تاثير بيروكسيد الهيدروجين ادى الى انخفاض معنوي في جميع الصفات المدروسة ولاسيما عند التركيز 10% حيث انخفض طـول الجذرملم بنسبة 20.76% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 43.87% , الوزن الجاف للمجموع الجذري غم بنسبة 034.8% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 33.45% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 9.28% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 26.08% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 35.52% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 20.90% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 28.83% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 53.93% و53.755 و47.07% و48.82% و9.48% و42.26% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 101.70% و45.80% و47.45% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 18.23% و22.86% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من الجزء المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنـسبة 24.0% و29.53% و42.74% على التتابع، نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العلـم وفـي الحـبوب % بنسبة 32.47% و32.87% و33.71% على التتابع ، البرولين مايكروغرام.غم وزن طري - 1 بنسبة 13.41% ، فـيتامـين Cملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 40.37% ، انـزيم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.23% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 34.75% ، وطول السنبلة مع السفا سم بنسبة 12.92% , طول السنبلة سم بنسبة 19.39% , وزن السنبلة غم بنسبة 22.82% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 21.59% , عـدد السنـيـبلات لكل سنبلة سنـيبلة.سنـبلة - 1 بـنسبة 16.54% , وزن الحبـوب فـي السنابل غم بنسبة 18.03% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 23.41% , وزن1000 حبة غـم بـنسبة19.80% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 23.95% , الحاصل الاقـتـصادي كغم . هـ - 1 بنسبة 18.02% .كذلك اوضحت نتائج التجربة ان تاثير فيتامين C ادى الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المدروسة لاسيما عند التركيز 100 ملغم.لتر - 1 حيث ازداد طـول الجذرملم بنسبة 125.00% , حجـم الجـذر ملم3 بنسبة 341.88% , الوزن الجاف للمجمـوع الجذري غم بنسبة 177.77% , قـطـر الجـذر ملم بنسبة 159.43% ، ارتفاع النبات سم بنسبة 21.96% , الوزن الجاف للمجموع الخضري غم بنسبة 84.88% ، المساحة الورقية سم2 بنسبة 108.57% , الوزن الجاف لورقة العلم غم بنسبة 76.81% , المساحة الورقية لورقة العلم سم2 بنسبة 122.59% , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم ملغم.نبات - 1 بنسبة 352.38% و395.19% و251.55% و274.56% 343.37% و209.66% على التتابع , محتوى عناصر النتروجين والفسفور والبوتاسيوم في الحبوب ملغم.سنبلة - 1 بنسبة 286.77% و296.95% و107.46% على التتابع ، محتوى الكوروفيل في كل من الورقة وفي ورقة العلم مايكروغرام.سم2 بنسبة 46.91% و39.81% على التتابع , نسبة الكاربوهيدرات الذائبة في كل من المجموع الخضري وفي ورقة العلم وفي الحبوب % بنسبة 63.68% و100.00% و96.71% على التتابع , نسبة البروتين في كل من المجموع الخضري وفي ورقـة العــلـم وفـي الـحـبـوب % بنسبة 124.07% و107.50% و111.92% على التتابع ، البـروليـن مايكروغرام .غم وزن طري - 1 بنسبة 42.03% ، فـيتامـين C ملغم .100غم وزن طري - 1 بنسبة 202.06% ، انـزيـم الكاتليز وحدة.مل - 1 بنسبة 105.83% ، انـزيـم البيروكسيديز وحدة.مل - 1 بنسبة 142.70% ، طول السنبلة مع السفا سم بنسبة 41.85% , طول السنبلة سم بنسبة 61.61% , وزن السنبلة غم بنسبة 75.58% , وزن السنابل في الوحدة التجريبية غم بنسبة 77.62% , عدد السنيبلات لكل سنبلة سنيبلة.سنبلة - 1 بنسبة 59.09% , وزن الحبوب في السنابل غم بنسبة 79.41% , وزن الحبوب في السنبلة غم بنسبة 82.35% , وزن1000 حبة غـم بنسبة 95.58% , الحاصل الحيـوي كغم . هـ - 1 بنسبة 86.52%, الحاصل الاقتصادي كغم.هـ - 1 بنسبة 79.41% .بينت نتائج التجربة ماياتي : - - 1 ان زيادة تركيز بيروكسـيد الهـيدروجـين H2O2 من صفر الى 10% ادى الى حدوث انخـفاض معـنوي في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 2ادى زيادة تركيز فيتامين C من صفر الى 100 ملغم.لتر - 1 الى حدوث زيادة معنوية في جميع الصفات المظهرية والفسلجية والحاصل المذكورة اعلاه ولكلا الصنفين. - 3اظهرت النتائج ان التركيز 100 ملغم.لتر - 1 فيتامين C هو الافضل في اعطائه افضل القيم للصفات المدروسة وبغض النظر عن تركيز بيروكسيد الهيدروجين H2O2 مقارنة بالتراكيز الاخرى المرشوشة. - 4اظهرت النتائج تفوق صنف الشعير الابيض المحلي في جميع الصفات المدروسة عدا صفة طول السنبلة مقارنة مع صنف الشعير الاسود المحلي.5 - اظهرت نتائج التداخل الثنائي والثلاثي بين عوامل الدراسة تفوق صنف الشعير الابيض معنويا في اغلب الصفات مقارنة بالصنف الاسود المحلي وتحت جميع التراكيز لكل من فيتامين C وبيروكسيد الهيدروجين H2O2. نستنتج من هذه الدراسة : - الدورالمهم لفيتامين C في حماية العمليات الايضية المختلفة في النبات لكونه من مضادات الاكسده غير الانزيمية من تاثير العوامل المجهدة والمتمثلة ببيروكسيد الهيدروجين. | Field experimental was conducted during the growing season of 2014 - 2015 in one of the fields Quratu sub district/ Khanaqin/ Diala province , aiming to determine the influence of the interaction between both hydrogen peroxide and vitamin c in some morphological and physiological characteristics, also some yield components of two types of Barley (Hordeum vulgare L.) local white and local black. This experiment was carried out by randomized complete block design (RCBD) with three replications; the field experiment included 72 experimental unit of interaction between three concentrations of Hydrogen peroxide 0,5,10 % and four concentrations of vitamin C 0, 50,100,150 mg.l - 1 The results of the experiment showed that hydrogen peroxide effect pulling down significantly decreased in all studied characteristic especially in 10% concentration decreased root length 20.76%, root volume 43.87%, root dry weight 34.80%, root diameter 33.45%, Plant height 9.28%, shoot dry weight 26.08%, leaf area 35.52%, flag leaf dry weight 20.90%, leaf area of flag leaf 28.83%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 53.93%, 53.75%, 47.07%, 48.82%, 9.48%, 42.26%, 101.70%, 45.80%,47.45%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 18.23%, 22.86%, soluble carbohydrate percentage in shoot 24.0%, flag leaf 29.53% and seeds 42.74%, protein percentage in shoot 32.47%, flag leaf 32.87%, and seeds 33.71%, Proline 13.41%, vitamin c 40.37%, catalase 34.23%, peroxidase 34.75%, Spike length with awn 12.92%, spike length 24.05%, weight of spike 22.82%, weight of spike in experimental unit 21.59%, number of spikelet's 16.54%, weight of seed in spikes 18.03%, weight of seeds 23.41%, weight of 1000 seeds 19.80%, biological yield 23.95%, grain yield 18.02%.The results of the experiment showed significantly increased in all studied characteristics especially with 100 mg.l - 1 concentration of vitamin c increased root length 125.00 %, root volume 341.88%, root dry weight 177.77%, root diameter 159.43% , plant height 21.96%, shoot dry weight 84.88, leaf area 108.57%, flag leaf dry weight 76.81%, leaf area of flag leaf 122.59%, content of nitrogen, phosphorus, and potassium in shoot, flag leaf and seeds 352.38%,395.19%,251.55%, 274.56%, 343.37%, 209.66%, 286.77%, 296.95%,107.46%, chlorophyll content in leaf and flag leaf 46.91%, 39.81%, soluble carbohydrate percentage in shoot 63.68%, flag leaf 100.00% and seeds 96.71%, protein percentage in shoot 124.07%, flag leaf 107.50%, and seeds 111.92%, proline 42.03%, vitamin c 202.06%, catalase 105.83%, peroxidase 142.70%, Spike length with awn 41.85%, spike length 61.61%, weight of spike 75.58%, weight of spike in experimental unit 77.62%, number of spikelet's 59.09%, weight of seed in spikes 79.41%, weight of seeds 82.35%, weight of 1000 seeds 95.58%, biological yield 86.52%, grain yield 79.41%.The results of experiment showed : - 1 - The increased of hydrogen peroxide concentration from zero to 10% caused significantly decreased in all morphological, physiological and yield to both varieties.2 - The increased of vitamin c concentration from zero to 100 mg.l - 1 caused significantly increased in all morphological, physiological and yield to both varieties.3 - The results showed the concentrations of vitamin c 100 mg.l - 1 are the best to give the best value to all characteristic regardless of hydrogen peroxide concentration compared with other concentrations.4 - The results showed the local white barley superiority in all characteristics except the length of spike compared with local black barley. 5 - Results showed double and triple interaction between studied factors the local white barley superiority significantly in all characteristic compared with local black barley under all concentration for both vitamin c and hydrogen peroxide.We conclude of this study : - The important role of vitamin c in the metabolic various processes in the plant for being non - enzymatic antioxidants from the impact of stress full hydrogen peroxide

دور هرمون الانتي - موليرين وبعض الانزيمات التكاثريه في نوعية السائل المنوي في المرضى غير الخصبين == The Role of Anti - Mullerian hormone )AMH), and some reproductive enzymes on Semen Quality in Infertile Male Patients

Author name: اسمهان عدنان عباس النقيب
Supervisor name: صباح عبد الرضا العبيدي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يحتوي كل من مصل الدم والسائل المنوي على مجموعة متنوعة وكبيرة من الهرمونات والانزيمات والتي لم يعرف موقع انتاجها بشكل واضح. حيث تعد مستويات الانزيمات في السائل المنوي مهمة جدا لعملية التمثيل الغذائي فضلا عن دورها في وظائف الحيوانات المنويه ,نذكر منها الهرمون المضاد لقناه مولر) (Anti - Mullerian Hormone وانزيم الاروماتيز ( (Aromataseاو السايتوكروم 450 (Cytochrome450) وانزيم الكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) واخيرا الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases). لذلك كان الهدف من الدراسه هو التقصي عن مستوى ودور كل من الهرمون المضاد لقناه مولر (Anti - MullerianHormone) وانزيم الاروماتيز(Aromatase) اوالسايتوكروم 450(Cytochrome450) وبعض الانزيمات الاخرى وعلاقتها بمعايير السائل المنوي ، ومستوى بعض الهرمونات والانزيمات الجنسيه وحالة الخصوبة للرجال الخصبين وغير الخصبين. شملت الدراسة مائه رجل باعمار تتراوح بين 20 - 94 سنة , راجعوا المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة\ جامعة النهرين, خلال الفترة اذار 2014 الى كانون اول 2014 , حيث تم جمع وفحص عينات السائل المنوي وفق معايير منظمة الصحة العالمية (WHO)لسنة (2010) ,ثم تم وضع عينات السائل المنوي في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2600 دورة\ دقيقة ولمدة ربع ساعة لغرض الحصول على البلازما المنوية ثم تم وضعها بدرجة - 20 م° ليتم قياس الانزيمات لاحقا. كما تم سحب خمسة ملليلتر من الدم الوريدي المحيطي من جميع الذكور. وضعت عينات الدم في انابيب زجاجيه ، والسماح لها لتتجلط ثم وضعت في جهاز الطرد المركزي بسرعة 2500 دورة \ الدقيقة لمدة 10 دقائق . وتم تصنيف العينات الى 7 مجاميع على وفق نتائج تحليل السائل المنوي. وقد تم تحديد تراكيز الانتي مولين MullerianHormone)) والاروماتيز(Aromatase) باستخدام طريقة الELISA والكرياتين كاينيز (Creatine Kinase) والكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز(Gamma Glutamyl Transpeptidases) باستخدام الطريقة الانزيمية في كل من مصل الدم وبلازما السائل المنوي.كما تم تحليل النتائج احصائيا.اظهرت هذه الدراسة النتائج الاتية : 1 - مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر AMH)) في كل من مصل الدم والسائل المنوي. تم ملاحظة وجود انخفاض معنوي0.05)≥(P في مستوى الهرمون المضاد لقناه مولر في كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia والمجموعة التي تعاني في قلة اعداد النطف وبطء في الحركة التقدمية وتشوهات في اشكال النطف Oligoasthenoteratozoospermiaعند مقارنتها بمجاميع العقم الاخرى .كما شوهد ارتفاعا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون لمجموعة العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدميهAsthenozoospermia والمجموعة التي تعاني من تشوهات في اشكال النطفTeratozoospermia بالمقارنة مع مجماميع الذكور طبيعية النطفNormozoospermia,ومجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermiaوالمجموعة التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia وفي كل من مجموعة العقم التي تعاني من قلة في الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaومجموعة الذكور اللانطفية Azoospermia.من جانب اخر لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P للهرمون المضاد لقناه مولر في السائل المنوي في مجموعة العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف Oligozoospermia بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى .بينما اظهرت مجاميع العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaارتفاعا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل ا لمنوي عند مقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى, ايضا اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في حركة النطف التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia والمجموعة اللانطفية Azoospermia انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى الهرمون في السائل المنوي بالمقارنة بمستواه في مجاميع العقم الاخرى.2 - مستوى السايتوكروم450 (CYP450) او الاروماتيز) (Aromataseفي كل من مصل الدم واالسائل المنوي اظهرت مجموعة الذكور طبيعية االنطف Normozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الاروماتيز في مصل الدم بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى , كما شوهدت زيادة معنوية0.05)≥(P في مجموعة العقم التي تعاني منقلة في الحركة التقدميه وتشوه في الشكل Asthenoteratozoospermia في مستوى الانزيم في مصل الدم بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى. بينما لوحظت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور اللانطفيه Azoospermia بالمقارنة بمستوى هذا الانزيم في مجاميع العقم الاخرى , وانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في السائل المنوي لمجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia بالمقارنة مع مستواه في السائل المنوي في مجاميع العقم الاخرى .3 - مستوى الكرياتين كاينيز(CPK) في كل ن مصل الدم وا السائل المنوي . لوحظ وجود ارتفاعا معنويا بمستوى0.05)≥(P في مستوى انزيم الكريايتن كاينيز في مصل الدم في مجموعة الذكور طبيعيه النطف Normozoospermiaوالمجموعة اللانطفيهAzoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى كما ظهر انخفاضا معنويا0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaبمقارنة مستواه في مصل الدم مع مجاميع العقم الاخرى. اظهرت مجموعة العقم التي تعاني من قلة في العدد Oligozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من قلة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermiaزيادة معنوية0.05)≥(P في مستوى هذا الانزيم في السائل المنوي بالمقارنة مع مجاميع العقم الاخرى, كما اظهرت كل من مجموعتي العقم التي تعاني من قلة في اعداد النطف وبطيئة الحركة التقدمية ومشوهة الشكل Oligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم اللانطفيهAzoospermia انخفاظا معنويا 0.05)≥(P في مستوى انزيم الكرياتين كاينيز بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى في بلازما السائل المنوي4 - مستوى الكاما كلوتاميل ترانس ببتايديز (GGT) في كل ن مصل الدم السائل المنوي. اظهرت مجموعة الذكور طبيعية النطف Normozoospermia زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى هرمون GGTفي مصل الدم عند مقارنة مستواه بمجاميع العقم الاخرى .كما انه كانت هناك زيادة معنوية 0.05)≥ (Pفي مستوى هذا الانزيم في مصل الدم لمجموعة العقم التي تعاني من بطء في الحركة التقدميةومشوهة الشكل Asthenoteratozoospermia بالمقارنة مع مستواه في المصل لمجاميع العقم الاخرى. كما اظهرت الذكور التي تعاني من تشوهات في اشكال النطف Teratozoospermiaانخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في مصل الدم بمقارنة مستواه مع مجاميع العقم الاخرى, اما مجاميع العقم التي تعاني من قلة العدد وبطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلOligoasthenoteratozoospermia ومجموعة العقم التي تعاني من بطء الحركة التقدمية ومشوهة الشكلAsthenoteratozoospermia فقد اظهرت زيادة معنوية 0.05)≥(P في مستوى الانزيم في بلازما السائل المنوي بمقارنة مستواه في مجاميع العقم الاخرى.وقد لوحظ ايضا انخفاضا معنويا 0.05)≥(P في مستوى هذا الهرمون في في مجموعة العقم التي تعاني من قلة العددOligozoospermia بالمقارنة مع مستواه في مجاميع العقم الاخرى | A great assortment of hormones and enzymes are current in blood and seminal plasma, but in many cases the gland in charged for their production has not been well - known. The enzyme levels of seminal plasma are very important for sperm metabolism as well as sperm function; these enzymes are Anti - Mullerian Hormone (AMH), Cytochrome 450, Creatine Phospho Kinase( CPK) and Gamma - Glutamyl Transfrrase (GGT). Therefore, this study was aimed to investigate the role of AMH and aromatase activity (cytochrome 450) in relation to semen parameters, level of some reproductive hormones, enzymes and the fertility status for fertile and infertile men. This study involved one hundred men within 20 - 49 years old who attended to High Institute of Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technology / AL - Nahrain University, during the period from March, 2014 to December, 2014. Semen samples were collected and seminal fluid analysis was done in accordance with WHO (2010). Then samples of seminal fluid were centrifuged for 15 minutes at 2600 rpm. The supernatant as seminal plasma was rapidly and cautiously improved and put to freeze at - 20° C for later measurements. Also, five milliliters of peripheral venous blood was aspirated from each male. Blood samples were collected in plain tubes, allowed clotting and then centrifuged at 2500 rpm for 10 minutes. The samples were assorted into 7 groups in accordance with the results of semen analysis. For serea and seminal plasma concentrations of AMH, Cytochrome 450, CPK, GGT were determined in the stored blood serum and semen. AMH and Cytochrome 450 were determined using the ELISA sandwich method. CPK and GGT were determined by using enzymatic method. The crude data were statistically analyzed. 1 - The level of Anti - Mullerian hormone (AMH) in serum and seminal plasma. A significant decrement (P≤0.05) was observed in the serum AMH for males with oligozoospermia and oligoasthenoteratospermia as compared to the other groups of male infertility factors. There was significant elevation (P≤0.05) for males complaining from asthenozoospermiaand teratozoospermia as compared to normozoospermia, oligoasthenoteratozoospermia,oligozoospermia, asthenoteratozoospermia and azoospermia. Similarly, significant elevation (P≤0.05) in seminal AMH for males suffering from oligozoospermia as compared to other groups of male factor infertility. Meanwhile, males with teratozoospermia showed significant increment (p≤0.05) as compared to other groups infertility. Also, males with asthenoteratozoospermia and azoospermia revealed significant reduction (p≤0.05) in the level of seminal AMH as compared to other male infertility. 2 - The level of cytochrome 450 or aromatas enzyme in serum and seminal plasma. The males with normozoospermia revealed significant reduction (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to the other male infertility groups. Also, males complaining from Asthenoteratozoospermia presented significant elevation (P≤0.05) in the level of serum cytochrome as compared to other groups of infertility. While, there was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for azoospermic males as compared to the other groups of male infertility, and significant decrement (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for males complaining of normozoospermia as compared to the other groups of male infertility.3 - The level of creatine phosphokinase (cpk) in serum and seminal plasma. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of CPK for males with normozoospermia and Azoospermia when compared to other groups of male infertility in contrast, and the level of CPK showed significant reduction (P≤0.05) for teratozoospermia as compared to other groups of male infertility. There was significant elevation (P≤0.05) in the level of semen cytochrome for oligozoospermia and Aasthenoteratospermia when compared to other groups of infertility factors, also, males suffering from oligoasthenoteratospermia and azoospermia showed significant decrement (P≤0.05) when compared to other groups of infertility factors. 4 - The level of gamma - glutamyl transpeptidase (GGT) in serum and seminal plasma. Males with normozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors, and there was significant increment (P≤0.05) for males complaining from asthenoteratozoospermia as compared to the others. Males suffering from teratozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) in the level of serum GGT when compared to the other groups of infertility factors. Males with oligoasthenoteratozoospermia, and asthenozoospermia revealed significant elevation (P≤0.05) in the level of semen GGT when compared to the other groups of infertility factors, males suffering oligozoospermia revealed significant decrement (P≤0.05) when compared to the other groups of infertility facto

التكوين الجنيني والتنسج للدماغ والحبل الشوكي في طائر السلوى Quail Coturnix coturnix (Linnaeus,1758) == Embryonic Development and Histogenesis of Brain and Spinal Cord in Quail Coturinx coturinx (Linnaeus, 1758)

Author name: اسماء بشير عبد
Supervisor name: نهلة عبد الرضا البكري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Embryology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية التعرف على تكوين الدماغ والحبل الشوكي من مرحلة العصيبة حتى مرحلة الفقس لطائر السلوى Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758) ودراسة التركيب النسجي لهما في الطائر البالغ. حصل على اجنة تراوحت اعمارها ما بين (12) ساعة حضانة الى مرحلة الفقس (17) يوما وكذلك على البالغ واجريت عليها خطوات التحميل الكامل والمجهر الالكتروني الماسح وتحضير الشرائح النسجية بطريقة شمع البرافين، وتم ايضا تحليل الاحماض الامينية للادمغة للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16و 17) يوما والبالغ من طائر السلوى.اظهرت نتائج الدراسة الجنينية للدماغ والحبل الشوكي ان بداءة ظهورهما في جنين طائر السلوى عمر (18) ساعة حضانة اذ حدث تثخنا لطبقة الاديم الظاهر لتكوين الصفيحة العصبية التي تتالف من نسيج ظهاري عمودي مطبق كاذب , وظهرت الطيتان العصبيتان ملتحمتان في عمر (24) ساعة حضانة لتكوين الانبوب العصبي وبعد تمايزه الى حوصلة الدماغ والحبل الشوكي، يتمايز الدماغ على ثلاث حويصلات (الدماغ الامامي ، الدماغ المتوسط , الدماغ المؤخر) في عمر (33) ساعة حضانة، وتالف جدار الدماغ من طبقة البطانة العصبية تليها الطبقة الغطائية.تمايز الدماغ في جنين عمر (40) ساعة حضانة على خمس حويصلات هي (الدماغ الانتهائي والدماغ البيني ، والدماغ المتوسط والدماغ البعدي والدماع النخاعيني) وظهر التركيب النسجي لجداره مكون من ثلاث طبقات هي (البطانة العصبية والغطائية والحافية). وظهر التركيب النسجي لجدار الحبل الشوكي مؤلفا من طبقة البطانة العصبية تحيطها الطبقة الغطائية.وفي جنين عمر (48) ساعة حضانة اتضح الانحناء القحفي اذ يصبح الدماغ المتوسط في المقدمة وكذلك ظهرت حوصلتا الدماغ الانتهائي، واصبح جدار الحبل الشوكي مؤلفا من ثلاث طبقات (البطانة العصبية والغطائية والحافية) في هذا العمر. ظهرت الانحناءات (العنقية والظهرية والذنبية) التي تؤدي الى تقوس الجنين، في عمر (72) ساعة حضانة.تمايز الدماغ البيني في جنين عمر (96) ساعة حضانة على ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد وقد ظهرت في هذا العمر الطبقة البصرية وهي اول طبقات السقف البصري الذي يمثل سقف الدماغ المتوسط وظهر الحبل الشوكي ايضا مكونا من المادة السنجابية التي تمثل الجزء الداخلي من جداره والمادة البيضاء التي تمثل الجزء الخارجي من جداره مع تمايز المادة السنجابية الى القرون الظهرية والقرون البطنية.يتسع تجويف الدماغ الانتهائي ويزداد سمكه في جنين عمر (5) ايام حضانة مع ظهور نوى التكوين الشبكي في قاع الدماغ البعدي وفي عمر (6) ايام حضانة بدات الطبقة السنجابية الليفية السطحية بالتمايز وهي الطبقة الثانية من طبقات السقف البصري، كما تمايزت الطبقة الغطائية في الجدار الجانبي للدماغ البعدي على منطقتين ثانويتين الاولى هي الطبقة الغطائية الداخلية تكون مجاورة لطبقة البطانة العصبية اما الثانية فهي الطبقة الغطائية الخارجية ، وظهرت ايضا الحزمة الطولية الناصفة في قاع الدماغ النخاعيني. وفي جنين عمر (7) ايام لاتختلف جدران الدماغ عن المراحل السابقة ولكن تصبح اكثر سمكا.اما في جنين عمر (8) ايام حضانة وجد الدماغ والحبل الشوكي مشابها لحالة البالغ، يمثل الدماغ الانتهائي المخ الذي يتالف من نصفي كرة المخ ويسمى تجويفها البطين الجانبي (الايسر 1st، والايمن 2nd)، ويتالف نسجيا من منطقتين لحاء الدماغ وتحت لحاء الدماغ ، ويمثل البطين الثالث 3rd تجويف الدماغ البيني، ويتالف الدماغ البيني من ثلاث مناطق هي فوق المهاد والمهاد وتحت المهاد.اما الدماغ المتوسط فقد تمايز سقفه على ست طبقات (البصرية ، السنجابية الليفية السطحية ، السنجابية المركزية ، الالبومية المركزية ، السنجابية حول البطنية، والالبومية حول البطنية) اما جزاه القاعي فيتمايز الى السقيفة, وتمايز الدماغ البعدي على جزاين (المخيخ والجسر)، ويتمايز الدماغ النخاعيني ليكون النخاع المستطيل ويمثل البطين الرابع 4th تجويف الدماغ المؤخر, اما الحبل الشوكي فيكون مشابها لحالة البالغ اذ وجدت المادة البيضاء في جزئه الخارجي بينما المادة السنجابية مرتبة على شكل X تمثل جزئه الداخلي وتدعى المنطقة الظهرية منها القرون الظهرية Dorsal horns اما المنطقة البطنية فتدعى بالقرون البطنية وتمثل القناة المركزية تجويفه.وشملت الدراسة الحالية ايضا تحليل الاحماض الامينية في ادمغة اجنة طائر السلوى للاعمار (10و 11و 12و 13و 14و 15و 16) يوما حضانة ومرحلة الفقس (17) يوما والبالغ ، ووجد (16) حمضا امينيا هي الاسبارتك (13)، الكلوتامين (13)، السيرين)البالغ) ، الهستدين (13)، الثيروتين (13)، الكلايسين (16)، الارجنين )البالغ) ، الالنين (13)، التايروسين )البالغ)، السستين (13)، الفالين (13)، الميثونين (11)، الايزوليوسين (13)، اليوسين (13)، الفينلالنين)البالغ) ، اللايسين (13) على التوالي , اما اقل تركيز للاحماض الامينية في الاعمار الاسبارتك (14)، الكلوتامين (12)، السيرين)10) ، الهستدين (10)، الثيروتين (12)، الكلايسين (10)، الارجنين )10) ، الالنين (10)، التايروسين )10)، السستين (14)، الفالين (12)، الميثونين (12)، الايزوليوسين (15)، اليوسين (10)، الفينلالنين)14) ، اللايسين (10) على التوالي | The present study aimed to study the development of brain and spinal cord starting from neurula stage till hatching stage (17th day) and adult in quail Coturnix coturnix (Linnaeus, 1758), using the whole mount, scanning electron microscopeand paraffin wax method were used for preparing histological slides. Amino acids of brains were determinated during different ages (10, 11, 12, 13, 15, 15, 16 and 17 days) in addition to the adult .The embryonic study revealed the first appearance of the brain and spinal cord in Coturnix coturnix was at (18) hrs incubation. The first appearance represented as ectodermal thickening to form the neural plate, which is histologically formed from pseudostratified columnar epithelium. The neural folds fused at age of (24) hrs of incubation to form the neural tube and then differentiated to form the brain vesicle and spinal cord. The brain was differentiated into three vesicles represented by (prosencephalon, mesencephalon and rhombencephalon) at age of (33) hrs incubation. The wall of the brain consist of ependymal and mantle layers. The brain in embryo of (40) hrs incubation differentiate into five vesicles represented by telencephalon, diencephalon, mesencephalon, metencephalon and myelencephalon. The histological study of brain wall decleared that it formed from three layers which were ependymal, mantle and marginal layer. The histological structure of spinal cord wall at the same age showed that it consist of two layer represented by Ependymal layer which surrounded by mantle layer.In embryo at age of (48) hrs incubation, the cranial flexure appeared and the two vesicles of telencephalon were also became clear and the spinal cord wall consist of three layers represented by ependymal, mantle and marginal layers.The cervical, dorsal and caudal flexures appeared at (72) hrs incubation, which lead to curved the embryo.Diencephalon at age (96) differentiated into three regions age which are represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus, at this age the stratum opticum also appeared, which represented the first layer of optic tectum and represented the roof of mid - brain. The spinal cord appeared formed from the gray and white matter, at the same time the gray matter differentiated into dorsal and ventral horns.At age of (5) days incubation the telencephalon cavity enlarge and its thickness increase and reticular formation nuclei appeared at the base of metencephalon. At age of (6) days incubation, the stratum griseumfibrosum superficial which represent the 2nd layer of optic tectum started to differentiate and the mantle layer also differentiated from the lateral wall of Metencephalon into two secondary layers represented by the inner mantle layer which observed besides the epindymal layer and the outer mantle layer, The medial longitudinalfascicule appeared at the base of mylencephalon. At age of (7) days incubation the walls of brain become more thickned. At age of (8) days incubation both brain and spinal cord appeared as in the adult stage. The telencephalon appeared represent from hemispherical cerebrum and their cavity called lateral ventricles (right the 1st and left the 2nd). Histologically formed from two region represented by pallium and subpallium the 3rd ventricle represented the cavity of diencephalon which formed from three regions represented by epithalamus, thalamus and hypothalamus. The mesencephalon roof differentiated to optic tectum with six layers of opticum, griseumet fibrosum superficiale, griseum centrale, album centrale, griseum periventriculare and album periventriculare. At the same time, the base of mesencephalon differentiated to tegmentum. Metencephalon differentiated into two parts represented by cerebellum and pons, while the mylencephalon appeared differentiated to from medulla oblongata and 4th ventricle represented the cavity of rhombencephalon.On the other hand the spinal cord also appeared as in the adult in appearance, the white matter in its external part and gray matter arranged as X - shape and represented the internal part, the dorsal region of this part represented the dorsal horns while the ventral horns represented the ventral region and the central canal represented its cavity.The present study also include the amino acids analysis for the brain of the bird under investigation in different stage of development (10, 11, 12, 13, 14, 15and 16, days incubation) in addition to the hatching stage (17th day) and the adult. The results revealed that there are 16 amino acid: Aspartic acid , Glutamine , Serine , Histidine , Thronine , Glycine , Arginine , Alanine , Tyrosine , Cysteine , Valinine , Methionine , Isoleucine , Phenylalanine , Lysine , and the highest concentration of amino acid at age of (13,13, adult, 13, 13, 16, adult, 13, adult, 13, 13, 11, 13, 13, adult, 13) respectively and the low concentration at age of (14, 12, 10, 10,12,10,10,10,10, 14, 12, 12, 15, 10, 14, 10,) respectively.

دراسة شكليائية ونسجية للمرئ في نوعين من الطيور العراقية الدراج الاسود العراقي (Linnaeus,1766 (Francolinus francolinus والسماك ابيض الصدر Linnaeus,1758 (Halcyon smyrnensis == Morphological and Histological Study of the Oesophagus in Two Species of Iraqi Birds Iraqi Black Partridge Francolinus francolinus (Linnaeus,1766) and White Breasted kingfisher Halcyon smyrnensis (Linnaeus,1758)

Author name: اسراء عبد الكریم هادي امین البرزنجي
Supervisor name: ايمان سامي احمد الجميلي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study aimed to investigate the , morphological description and histological structure of oesophagus in Iraq black partridge (Francolinus francolinus ) and white breasted kingfisher (Halcyon smyrnensis) ,the results revealed the following : - Morphological Description• In both birds the oesophagus was long muscular tube, thin - walled and distensible tube , it was situated between the oropharynx cavity and Proventriculus .• The oesophagus in Iraq black partridge (Ibp) divided into the three regions represented by anterior part (Cervical), median part (Crop) and posterior part (thoracic),while in white breasted kingfisher (Wbk) divided in two regions , anterior part (Cervical) and posterior part (thoracic), because the crop was absent in this bird so that we suggested to regard the median part instead the crop which is found in Iraqi block partridge.• In both birds , the anterior part ( Cervical ) of oesophagus was located in the midline , dorsally to the larynx and trachea , which was fixed byconnective tissue . In the median part of neck , the oesophagus location was changed where it was situated at the right side of the midline , among trachea laterally and Jugular vein , the vagus nerve and thymus dorsally . In (Wbk) , the oesophagus was curved littleness on the right side of midline in contrast to the (Ibp).• In (Ibp) , immediately in the thoracic entrance , the oesophagus returns to the midline and it expanded ventrally pouch , (the crop) which located between clavicle and breast muscles . The internal and external surface of the crop presented irregular folds.• In (Ibp), the anterior part of oesophagus ( Cervical) taken an (S) shaped due to it was longer than its neck region.• In both , the posterior part of oesophagus (thoracic) entered thoracic region and then located dorsally to the trachea , syrinx and heart, ventrally to the lung. Finally, the posterior part of oesophagus(thoracic) opened in to the Proventriculus .• In both birds , the anterior part of oesophagus ( cervical) was longer than posterior part ( thoracic). The internal surface of the oesophagus demarcated longitudinal folds .Histological Study : • The results of the present study showed that the oesophagus wall in (Ibp) consisted of four tunica represented by mucosa, sub mucosa, Muscularis and adventitia or serosa while in (Wbk) composed of three tunica because due to lack the sub mucosa.• Tunica mucosa in (Ibp) oesophagus consisted of three layers represented by lining epithelium , lamina propria and Muscularis mucosa , but in the (Wbk) the layer of Muscularis mucosa was absent.• The lining epithelium of (Ibp) composed of keratinized stratified squamous epithelium , while it consisted of non keratinized stratified squamous epithelium in the (Wbk).• The lamina propria of (Ibp) consisted of loose connective tissue , while in the (Wbk) it consisted of fibrous connective tissue .• The esophageal glands of (Ibp) were situated in the lamina propria , these glands were simple branched alveolar type, while the esophageal glands of (Wbk) were observed within lining epithelium layer and these glands were simple tubular type.• The oesophageal glands in (Ibp) were less developed in the posterior part (thoracic) in comparison to anterior part ( cervical), while theseglands were absent in crop but it arranged along oesophagus in (Wbk).• Tunica Muscularis consisted of two layers thicker, inner circular and thinner outer longitudinal in (Ibp) ,these layers separated by loose connective tissue, whereas inner thin longitudinal and outer thick circular in (Wbk) ,these layers separated by fibrous connective tissue• In both birds the tunica adventitia and serosa consisted of loose connective tissue with blood vessels and nerves but in serosa surrounded by mesothelium .Statistical Study : Iraqi block partridge and Whitebreasted kingfisher : • Results showed that the mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in anterior part (cervical) oesophagus of (Ibp) as compared to (Wbk), while the mean thickness of both tunica muscularis and adventitia were significantly greater in (Wbk) as compared to (Ibp) (p<0,05).• The main thickness of tunica mucosa was significantly greater in median part ( crop) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk) (p<0.05).• The mean thickness of tunica mucosa was significantly greater in posterior part ( thoracic) of oesophagus in (Ibp) as compared to (Wbk)(p <0.05).

دراسة تصنيفية مقارنة لمراتب من العائلة السوسنية Iridaceae النامية بريا في العراق == Comparative Systematic Study For The some Taxa of the Family Iridaceae wild growing in Iraq

Author name: اريج عبد الستار فرمان الراوي
Supervisor name: مازن نواف عبود العاني
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Classification
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The current study covered 14 taxa of the family Ireidaceae wiled growth in Iraq ,as it has a comparative systematic study of all morphological characters , pollengrains , anatomy , molecular , environmental and geographical distribution in detail , as well as the taxonomical treatment have been down for all taxa with keys for all taxa was done.Survey for must districts of Iraq was done to determined the distribution of taxa , therefor many collection were obtained , new location of taxa distribution were fixed and all the specimens collected including those from herbaria were identified.The comparative study of all the morphological characters of plant parts were recorded down in tables , as well as photo for deferent purposes. Priority taxonomic important were notice to subterranean stems (bulb , rhizome and corm) such as dimension , shape and outer cover of the bulbs and corms especially in genus Iris and Gladiolus.Stems showed very important in isolation and diagnosis , however varied among them , some have normal stems (Gynandriris , Gladiolus and some Iris species) , others have flowering stems (scape) in genus Crocus and some of Iris species.Leaves showed large variation among taxa in shape , dimensions and having sheath , as well as some taxa having stem leaves (Gladiolus and some species of Iris) , others have basal leaves (Gynandriris , Crocus and some Iris species). The variation in bracts and bracteoles in type , dimension and shape were used to identify taxa especially for species belonging to the genus Iris , Gladiolus and Gynandriris .The inflorecences variation were used for isolation and diagnoses especially to Iris species , as well as the variation in floral parts for all taxa, also used for diagnosis such as color , shape and accessory parts showed very important value for taxonomic purpose specially in Iris . Also fruits variations such as dimension , shape and having beak or not showed a great value in identification to Iris sp. , but seed variation have a good taxonomic value which used to identify taxa. The study of Light microscope ( L.M.) and Scanninig electron microscope (S.E.M.) to pollen grains specially in type was shown grate value of taxonomic mattresses , inaperturate pollen grains in some Iris species and monosulcate in taxa of Gladiolus , Gynandriris , Crocus and some species of Iris , as well as the differences in pollen shape , dimensions , sculpturing and germination apertures . The anatomical study for the vertical section of leaves and cross section of stems showed many differentiations of the shapes and tissues among taxa. All taxa shown Anomocytic type of stomatal complex.Molecular study results using Random amplified polymorphic DNA( RAPDPCR) technique appeared great importance among taxa . It was revealed the genetic relationships among 12 taxa belong to genus Iris and Gladiolus , separation of these taxa depending on the presence or absence of bands , and the number of these bands in the gel after electrophoreses , so this is evidence of a genetic diversity or polymorphism among the taxa , as well as obtaining a number of unique bands that give genetic DNA fingerprint for the definition of each taxon . The taxa of the family Iridaceae distributed to their growth sites after collection from the Iraqi distracts , as well as the environmental study to the sites of the plant growth , also the taxa will be distributed on the maps to their geographical distracts , so recorded many of new spreading areas . As a result of this study two species Iris madonna Dykes. and Gladiolus anatolicus Boiss. were identified as new record for Iraq and added to flora of Iraq.

دراسة لمؤشرات مناعية وحيوية في مرضى تصلب الاعصاب المنتشر == Study of Certain Immuno and Biomarkers in Multiple Sclerosis Patients

Author name: سماح خليل يحيى
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تصلب الاعصاب المنتشر مرض التهابي مزمن مجهول السبب، يتصف بفقدان الميالين (النخاعين) مع الميل الى اصابة محور الليف العصبي، ويصيب الاشخاص في الاعمار المتوسطة من حياتهم مع ارجحية اصابة النساء اكثر من الرجال.جاءت هذه الدراسة بصورة رئيسية لبحث العلاقة بين تصلب الاعصاب المتعدد وتركيز كل من البين الابيضاضي - 2 و- 10 وعامل التنخر الورمي - الفا وكذلك المؤشرات الحيوية كمستوى الدهون في الدم (الكولسترول, لشحوم الثلاثية والشحوم عالية الكثافة) , حمض اليوريك وظائف الغدة الدرقية (ثالث يود الثيرونين , الثايروكسين وهرمون تنشيط الغدة الدرقية). الى جانب ذللك , قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض. كما تناولت العلاقة بين تركيز هذة الحركيات الخلوية والمؤشرات الحيوية وعلاقتها بالجنس ومراحل تقدم المرض.اجريت هذه الدراسة على 60 مريض عراقي شخصوا بتصلب الاعصاب المتعدد وفق لمعايرMcDonald criteria وتم تصنيف المرضى المختارين الى مجموعتين : 1. المجموعة الاولى : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15اناث) تتراوحت اعمرهم من (56 - 18) سنة وهم في المرحلة الاولى من التشخيص (اي حدث لهم انتكاسة) ولم ياخذوا اي علاج.2. المجموعة الثانية : تضمنت 30 مريض (15 ذكور و15 اناث) تراوحت اعمرهم من (53 - 18) سنة وهم مشخصين مندو فتره ومعالجين بانترفيرون بيتا مع مثل ابردزولون الى3 ايام او 5 ايام.الى جانب ذلك‚ مجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 20 فردا (10 اناث و10 ذكور) تراوحت اعمارهم من (50 - 20) اصحاء ظاهريا والذين راجعوا الى (مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب / عيادة للكشف المبكر عن تصلب الاعصاب المتعدد) في بغداد خلال الفترة من تشرين الثاني/ 2013 الى نهاية نيسان/ 2014 للتشخيص والعلاج. تم سحب عينة (8 - 6) ملليتر من الدم الوريدي من 80 من الحالات المتضمنة في الدراسة (المرضى والسيطرة) لغرض استخدامها في الدراسة المناعية والتي تشمل قياس الحركيات الخلوية المذكورة بواسطة استعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) والمؤشرات الحيوية باستخدام جهاز ابت لقياس (مستوى الدهون في الدم وحمض اليوريك) ويستخدم جهاز توسوا لقياس (وظائف الغدة الدرقية). فضلا عن حساب العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض باستخدام جهاز روبي. توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1. اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى تصلب الاعصاب هو (34.43) سنة وان الفئة العمرية (39 - 30) سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2. اظهر معدل المستوى المصلي للبين الابيضاضي - 10 فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 بين مجموعات مرضى التصلب المتعدد (قبل وبعد المعالجة) ومجموعة السيطرة (46.64 , 44.70 و50.95) بيكو غرام/مل , على التوالي.3. اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05 ما بين مرضى بعد المعالجة (17.04) بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى قبل العلاج ومجموعة السيطرة (14.81 و14.28) بيكو غرام/ مل , على التوالي .4. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من الكولسترول , الشحوم الثلاثية, الشحوم قليلة الكثافة والشحوم قليلة الكثافة جدا عند مستوى P<0.05 في المرضى غير المعالجين والمعالجين مقارنة بمجموعة السيطرة .5. لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي من ثالث يود الثيرونين وهرمون الثايروكسين عند مستوى P<0.05 في المرضى الغير معالجين ) 1.08) نانوغرام / مل و(7.99) ميكروغرام / ديسيلتر، على التوالي والمرضى المعالجين (1.27) نانوغرام / مل و(8.68) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة (0.898) نانوغرام / مل و(6.95) ميكروغرام / ديسيلتر ,على التوالي. 6. اظهره نقصان معنوية في معدل الخلايا الحمضة في مجاميع المرضى (قبل وبعد المعالجة) مع انترفيرون - بيتا - 1ب مقارنة مع مجموعة السيطرة.7. لم تظهر اي علاقة بين معدل كريات الدم والمستويات المصلية من كل البين الابيضاضي - 2 ,هرمون تنشيط الغدة الدرقية , حمض اليوريك والشحوم عالية الكثافة والامراضية من تصلب الاعصاب المنتشر.8. ظهر تاثير الجنس في كلا من الشحوم الثلاثية وحمض اليوريك حيث وجود زيادة وبفارق معنوي في الذكور مقارنة بالاناث, بينما كانت هنالك زيادة معنويه في الشحوم عالية الكثافة في الاناث مقارنة بالذكور. | Multiple Sclerosis (MS) is an idiopathic chronic inflammatory disease characterized by demyelination that can be associated with axonal degeneration and is the leading cause of a non - traumatic neurological disability in young adults, with female affection more than male.This study is designated mainly to investigate the relationship between the MS patients and certain cytokines serum concentrations of Interleukin - 2 (IL - 2), interleukin - 10 (IL - 10), Tumor necrosis factor - alpha (TNF - α) and biomarkers; lipid profile (TC, TG, LDL, VLDL and HDL), Uric Acid (UA) and thyroid function (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the blood. Also it is trying to find out the relation between concentrations of these cytokines and biomarkers with the gender and disease course of Iraqi MS patients. The study involved 60 Iraqi who were diagnosed as MS patients. the selected patients were classified into two groups :  Pre - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 56) years at the stage of the early diagnosis (RRMS).  Post - treated patients included 30 patients 15 male and 15 female whose age range between (18 - 53) years with treatment Interferon - β 1b (INF - β - 1b) intravenous immunoglobulin (Ig) pulse Methyl - Prednisolone MP (in acute relapses) for 3 days or 5 days. Besides, 20 healthy volunteers 10 males and 10 females matched the patients with age and gender were used as control subjects with age range between (20 - 50) years. They have attended to (Baghdad Teaching Hospital in the Medical City / Clinic for early detection of MS) in Baghdad during the period from November / 2013 to the end of April / 2014 for the diagnosis and treatment. The blood samples (6 - 8) ml were drown from all of studied cases in order to be used for immunological study by measuring their serum level of cytokines using Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) and biomarkers; using Architect c4000 System (Abbott) for (TC, TG, LDL, VLDL, HDL and UA) and AIA - 360 system for (T3, T4 and TSH). Besides, measured total and differential WBC of the 2 ml of blood at using Cell - Dyn Ruby System.The Study has Reached the following Results : 1. The results showed that the average age in patients with MS is (34.43) years and age group (30 - 39) years are more susceptible to affected. 2. The study has showed the average serum level of IL - 10 were significant differences at the level of probability P<0.05 between the (pre - and post - treated) patients and the healthy control (35.54, 35.86 and 52.68) pg/ml, respectively. 3. The study furthermore, has showed the average serum level of TNF - α were significant differences at the level of probability P<0.05 between the post - treated patients (17.04) pg/ml and two group the pre - treated patients and the healthy control (14.81 and 14. 28) pg/ml, respectively.4. The result observed significant an increase in the concentration of serum level of TC, TG, LDL and VLDL at the level of probability P<0.05 in the pre - and post - treated patients as compared to the healthy control. 5. The result observed significant increase in the concentration of serum level of T3 and T4 at the level of probability P<0.05 in the pre - treated patients (1.08) ng/ml and (7.99) μg/dl, respectively and the post - treated patients (1.27) ng/ml and (8.68) μg/dl, respectively as compared to the healthy control (0.898) ng/ml and (6.95) μg/dl, respectively. 6. The study has showed a significant decrease in mean of the eosinophil for the pre - and post - treated patients (1.28 and 1.99) respectively as compared with the healthy controls (2.79).7. There is no relationship between the differential count of WBC and serum levels of (IL - 2, HDL, UA and TSH) and the pathogenicity of MS. 8. The research show significant increase in levels of TG and UA in male as compared with female, while level of HDL was significant increase in female as compared with male.

مستوى البين ابيضاض 17A و33 وبروتين الصدمة الحرارية 70 في بعض امراض الحساسية == Levels of Interleukin IL - 17A, IL - 33 and Heat Shock Protein 70 in Some Allergic Diseases

Author name: ابرار جاسم حسن
Supervisor name: امنة نصيف جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على دور بعض الحركيات الخلوية IL - 33, IL - 17A)) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) والكلوبيولين المناعي الكلي T - IgE)) ومعدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في بعض امراض الحساسية النوع الاول. شملت الدراسة 210 مريض (110 انثى، 100 ذكر) تتراوح اعمارهم ما بين (10 - 70) سنة يعانون من امراض الحساسية ، جمعت من المركز التخصصي للحساسية في بغداد / الرصافه للفترة من نيسان الى ايلول 2014 .تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي الكلي (T - IgE) لجميع المرضى والاصحاء كذلك تم قياس النسبة المئوية للخلايا الحمضة للمجاميع المدروسة. قسم المرضى الى ثلاث مجاميع ، المجموعة الاولى 77 مريض ربو تحسسي (34 ذكر،43 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 60) عام ، المجموعة الثانية 48 مريض التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19 ذكر، 29 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 66) عام ، المجموعة الثالثة 85 مريض شرى ( 47 ذكر ، 38 انثى) تتراوح اعمارهم مابين (10 - 70) عام . جمعت خمسين عينه لاشخاص اصحاء (25 ذكر ، 25 انثى) تتراوح اعمارهم مابين ( 23 - 53) عام . في حين تم تقدير البين ابيضاض 17A (IL - 17A) والبين ابيضاض 33 (IL - 33) وبروتين الصدمة الحرارية 70 (HSP70) ل 73 مريض باستخدام اختبار اليزا ( المقايسة المناعية المرتبط بالانزيم) كان منهم 28 مريض ربو تحسسي ، 20 مريض التهاب جيوب انفية تحسسي ، 25 مريض شرى و15 شخص من الاصحاء. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوى IL - 17A في مصل مرضى الربو (33.61 ± 4.61 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (49.29 ± 5.76 بيكوغرام/مل) والشرى (41.93 ± 5.81 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (10.21 ± 0.82 بيكوغرام/مل).2. اظهرت الدراسة فروقا معنوية (P<0.01) في معدل مستوىIL - 33 في مصل مرضى الربو (42.01 ± 4.67 بيكوغرام/مل) ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (39.94 ± 6.07 بيكوغرام/مل) والشرى (27.49 ± 2.90 بيكوغرام/مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (18.73 ± 2.73 بيكوغرام/مل).3. لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في تركيز المستوى المصلي لبروتين الصدمة الحرارية 70(HSP70) في مرضى الربو (32.51±3.85 نانوغرام/مل) بالمقارنة مع قيم السيطرة (15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل) بينما لم يظهر اي فرقا معنويا في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي (19.51 2.19± نانوغرام/مل) والشرى ( 19.63 ± 3.76 نانوغرام/مل) عند مقارنتها مع قيم السيطرة ( 15.94 ± 4.27 نانوغرام/مل).4. ارتفعت معدلات مستويات T - IgE معنويا (5P<0.0) في مصل مرضى الربو (503.54 ± 63.49) وحدة دولية/ مل ، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (442.77 ± 95.76 وحدة دولية/ مل) والشرى (489.53 ± 69.68 وحدة دولية/ مل) مقارنة مع مجموعة السيطرة (23.67 ± 5.81 وحدة دولية/ مل). 5. ظهرت زيادة معنوية (5P<0.0) في معدل النسبة المئوية للخلايا الحمضة في مرضى الربو (4.37 ± 0.52%)، التهاب الجيوب الانفية التحسسي (4.38 ± 0.50%) والشرى (4.12 ± 0.43%) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.57 ± 0.15%).6. في مرضى حساسية الربو هناك ارتباط ايجابي وعالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات IL - 33 وT - IgE كذلك يوجد ارتباط ايجابي ومعنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 33 وHSP70 بينما هناك ارتباط سلبي معنوي (P<0.05) بين مستويات IL - 17A وHSP707. في مرضى التهاب الجيوب الانفية التحسسي كان هناك ارتباط ايجابي معنوي P<0.05)) بين مستويات T - IgE وIL - 33 كذلك بين مستويات T - IgE وIL - 17A ، بينما يوجد ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 8. في مرضى الشرى يلاحظ ان هناك ارتباط ايجابي معنوي (P<0.05) بين مستويات T - IgE وIL - 33 وايضا هناك ارتباط ايجابي عالي المعنوية (P<0.01) بين مستويات T - IgE وIL - 17A بينما نجد ان هناك ارتباط سلبي معنوي P<0.05)) بين مستويات IL - 17A وHSP70 | The present study was designed to focus on the levels of IL - 17A, IL - 33, HSP70, T - IgE and eosinophil count in some of type I allergic disease. All samples included 210 patients (110 females and 100 males), their ages between 10 - 70 years, suffering from allergic disease collected from specialized center of allergy in Baghdad / Al - Resafa, during the period from April, 2014 to September, 2014.Total IgE was measured for all patients and healthy control by using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA). Also eosinophil count was carried out for the study groups. The patient groups were divided into three groups. The first group (77) allergic asthma patients (34 males and 43 females), their age ranged between10 - 60 years. The second group (48) allergic rhinitis patients (19 males and 29 females), their age ranged between10 - 66 years, and the third group (85) urticaria patients (47 males and 38 females), their age ranged between10 - 70 years. Fifty healthy control have been collected and included in the study (25 males and 25 females), their age ranged between 23 - 52 years. Interleukin - 17A (IL - 17A), interleukin - 33(IL - 33) and Heat shock protein 70 (HSP70) have been estimated by ELISA for (73) allergic disease patients 28 allergic asthma, 20 allergic rhinitis, 25 urticaria and 15 healthy control. The study has reached the following results : 1. A highly significant (P<0.01) increase in mean serum IL - 17A in patients with allergic asthma (33.61 ± 4.61 pg/ml), allergic rhinitis (49.29 ± 5.76 pg/ml), and urticaria (41.93 ± 5.81 pg/ml) when compared with healthy controls (10.21 ± 0.82 pg/ml).2. A highly significant (P<0.01) increases in mean serum IL - 33 in patients with allergic asthma, allergic rhinitis, and urticaria (42.01 ± 4.67, 39.94 ± 6.07, 27.49 ± 2.90 pg/ml) respectively as compared with healthy control (18.73 ± 2.73 pg/ml). 3. A significant (P>0.05) increase mean levels of HSP70 (32.51± 3.85ng /ml) in patients with allergic asthma as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml). No significant difference were recorded between patient with allergic rhinitis (19.51± 2.19 ng/ml) and urticaria (19.63 ± 3.76ng /ml) as compared with healthy control (15.94 ± 4.27ng /ml).4. A highly significant (P<0.01) increases in the levels of T - IgE in the mean serum of allergic asthma (503.54 ± 63.49 IU/ml), Allergic rhinitis (442.77 ± 95.76 IU/ml) and urticaria (489.53 ± 69.68 IU/ml) as compared with healthy controls (23.67 ± 5.81 IU/ml).5. A significant(P<0.05) difference in percentage count of eosinophil in allergic asthma (4.37 ± 0.52)%, allergic rhinitis (4.38 ± 0.50)%, and urticaria 4.12± 0.43% as compared with healthy controls (1.57 ± 0.15)%. 6. In allergic asthma, there was a highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE & IL - 33 levels. A significant (p<0.05) positive correlation between IL - 33&HSP70 levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels.7. There was a significant ( p<0.05) positive correlation between T - IgE& IL - 33 levels,T - IgE&IL - 17A levels in patients with rhinitis. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels in the same patients.8. In urticaria, there was a significant (p<0.05) positive correlation between T - IgE&IL - 33 levels. A highly significant (p<0.01) positive correlation between T - IgE&IL - 17A levels. A significant (p<0.05) negative correlation between IL - 17A&HSP70 levels

دراسة لبعض عوامل الفوعة للعنقوديات السالبة لمخثر البلازما المعزولة من خمج الجلد من مستشفيات السليمانية == A study on some virulence factors of coagulase negative staphylococci isolated from skin infection in sullaimaniya hospitals

Author name: نرمين نصر الدين فتحي
Supervisor name: ﻤﻲ ﻁﺎﻟﺏ فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Out of 110 clinical samples taken from different sources of burn and wound infections, 22 isolates (20%) of coagulase negative staphylococci (CNS) were isolated. The most common isolated species among CNS was S. epidermidis which was accounted for 11 isolates (50%), S. haemolyticus was the second with 3 isolates (13.64%), followed by S. hominis and S. sciuri with two isolates for each species (9.1%) and one isolate (4.54%) for each species including S. cohnii, S. lugdunensis, S. saprophyticus, S. xylosus. Some virulence factors of CNS were detected including the hemolysins, which were determined in 10 isolates (45.4%), lipase production in 15 isolates (68.1%), 9 isolates (81.8%) of S. epidermidis were positive for lipase activity, and the proteolytic isolates of CNS were 11 isolates (50%). The production of slime layer by Congo red agar method revealed 7 isolates (31.8%) of CNS and 3 isolates (27.2%) of slime layer - producing S. epidermidis, while production of this layer by tube method was determined in 2 isolates (18.18%) of 11 isolates of S. epidermidis. The ability of S. epidermidis to adhere to abiotic materials and biofilm formation in vitro was done by using polystyrene microtitre plates which appeared in 2 isolates (18.1%). Sensitivity test of the isolates using 18 antimicrobial agents showed that the vancomycin was the more effective on CNS which was susceptible to this antibiotic and reached to (90.9%), and the incidence resistance to β - lactams antibiotics was very obvious in cefotaxim (100%), penicillin (95.5%) and in amoxycillin (72%). The effect of subinhibitory concentration of antibiotics on the adherence ability of S. epidermidis was done and the results revealed that the clindamycin was the best antibiotic, while the vancomycin was the lees affecting on the adhering of S. epidermidis.

دراسة العلاقة بين بعض المؤشرات المناعية وشدة المرض عند المصابين بالربو الارجي == Study of the relationship between some immunological markers and disease severity in allergic asthma patients

Author name: یاسر باسم عبد الوهاب
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was conducted to support the investigations of probable immunological changes in asthmatic patients and to study the relationship between some immunological markers and the clinically estimated asthma severity in order to find the more correlated immunological marker with asthma severity. This study involved 61 patients of both genders ( ٤٦ female and 15 male) of age varied between 13 to 53 years from recently diagnosed cases that arrived to the allergy institute of Baghdad or from steroids and other antiinflammatory therapy ceased patients and for a period that allow to carry out study tests without effecting the results, In addition to control group which consisted of 23 apparently healthy individuals.Skin test analysis of ten allergens showed a significant differences between asthma patients and healthy controls in rate of positive reactivity for at least one tested molds or grass allergens where they attained 43.1 % and 35.3% in patients’ group respectively, results also revealed that there was a significant differences in rate of reactivity for M4 allergen only with difference in asthma severity.Total and specific serum IgE were assessed by the Enzyme Linked Immunosorbent assay (ELISA). The geometric mean of serum total IgE was significantly higher in asthmatics than healthy controls, Another Significant elevation was revealed in asthmatics as compared to control in the rate of 100 IU/ml overlapped serum total IgE individuals, this rate also showed significant difference among the different categories of asthma severity. 83 IU/ml was suggested as a typical cut off value that differentiates asthmatic patients from healthy individuals.From other side, estimation of serum specific IgE for 10 allergens demonstrated significant differences in I203 allergen specific IgE levels in addition to specific IgE for food allergens (F25, F27, F33, F35 and F81) between asthmatics and healthy controls. Its ought to mention that specific IgE for food allergens (F25, F27 and F33) also recorded significant differences by difference in asthma severity which may refer actual effect for some food allergens in asthma pathogenesis .The results didn’t document any significant difference in levels of other immunoglobulins IgM, IgG, and IgA and complement component C4 in serum between asthmatic patients and control group, Whereas a significant elevation was documented in serum C3 level of asthmatics as compared to healthy controls which supports the studies that refered some complement component role in asthma pathogenesis. From other side, this study didn’t observe any significant differences in the levels of those immunoglobulins with difference in asthma severity. Total and differential white blood cells were estimated during the study, the results showed a significant elevation in mean of total white blood cells, eosinophils and neutrophils numbers in asthmatics’ blood as compared to control, while there were no significant differences in association with remaining white blood cells. The relationship between asthma severity and white blood cells was also assessed, the results showed a significant difference in geometric mean of total white blood cells and also lymphocytes numbers in asthmatics’ blood and asthma severity.The data demonstrated that there was a significant elevation in level of eosinophil cationic protein (ECP) in asthmatics’ serum (median = 40 ng/ml) as compared with control group (median = 15.5 ng/ml) , it was also observed that elevation in serum ECP level proportionate significantly increasing of asthma severity. This study suggested that 29 ng/ml of serum ECP as a typical cut off value of statistically significant denotation for differentiation between asthmatic patients and healthy individuals. The ratio of serum eosinophil cationic protein to blood eosinophils was calculated in this study, Despite not attaining the significance level between patients’ group and controls as regards this ratio, results showed a significant elevation in ECP/Eo associated with increasing ofasthma severity among different categories. During the study of correlation among some immunological markers that adapted in many allergy centers as preliminary diagnostic tests for asthmatic patients especially the determination of total serum IgE level and blood eosinophils number, there was no significant correlation between total serum IgE level and asthma severity, correlation between blood eosinophils and asthma severity was also not significant too (r = 0.16 and 0.01 respectively). Contrary to the previous results, Statistical analysis showed a significant positive linear correlation between ECP level and also ECP/Eo ratio and clinically estimated asthma severity (r = 0.41 and 0.43 respectively, P<0.01).According to results the ratio 0.38 Pg/Cell suggested as a typical cut off value for diagnosing severe persistent asthma and 137.5 ng/ml of serum ECP concentration also suggested as a typical cut off value for differentiating severe persistent asthma cases from other less severe categories. According to the results, Determination of serum ECP can be considered as a diagnostic tool for differentiating asthma cases from not, besides it reflects asthma severity significantly, whereas calculation of ECP/Eo ratio may be an effective marker in reflecting asthma severity which may be useful in monitoring asthma cases and in determining the recovery of disease severity during therapy stages but it has no benefit for diagnosing asthma cases where no significant differences were recorded between asthmatics and healthy controls

دراسة التاثيرات الوراثية لمتعدد السكريد خارج خلوي لبكتريا Enterococcus faecium في الخلايا السرطانية == Study of the Genetic Effects of Exopolysaccharide (EPS) from Enterococcus faecium in the Cancer Cells

Author name: هويدة كريم عبد الجنابي
Supervisor name: هيفاء هادي حساني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على ثلاث عزلات لبكتريا Enterococcus faecium من 120 عينة منتجات الالبان المحلية والمستوردة، وقد شخصت هذه العزلات باستخدام الفحوصات البكتريولوجية والكيموحيوية، استخلص متعدد السكريد خارج خلوي Exopoly Saccharide من العزلة رقم (1) لبكتريا E. faecium وذلك لكون هذه العزلة اعطت اعلى معدل انتاجية من المستخلص وبلغ 300 ملغرام/لتر من الوزن الجاف.درس التاثير السمي الخلوي لمستخلص EPS في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية هما AMN - 3 وHeLa، واظهر المستخلص فعالية تثبيطية في الخلايا السرطانية اعتمادا على التركيز المستخدم ومدة التعريض خصوصا عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر حيث وصلت نسب التثبيط الى 59.3% و86.2% على التوالي في خلايا AMN - 3، ثم بدات هذه النسب بالانخفاض مع تقليل التركيز المستخدم الى 1250 مايكروغرام/مللتر لتصل الى (8.3)% بينما استمرت الخلايا بالنمو والتضاعف خلال مدد التعريض الثلاث 24 ، 48 و72 ساعة عند التركيز 625 مايكروغرام/مللتر وكانت النسبة المئوية لتضاعفها (157.1%) مقارنة بعينة السيطرة (100%).اما تاثير المستخلص في خلايا HeLa فقد اظهر تاثيرا تثبيطيا على هذه الخلايا ازدادت نسبته مع زيادة التركيز ومدة التعريض وان نسب التثبيط في خلايا HeLa كانت اقل بفارق معنوي عن نسب التثبيط في خلايا AMN - 3 حيث بلغت نسب التثبيط في خلايا HeLa عند التركيزين 2500 و5000 مايكروغرام/مللتر 28.0% و31.1% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة واستمر انخفاض الفعالية التثبيطية للمستخلص في خلايا HeLa في التراكيز الواطئة 625 و1250 مايكروغرام/ مللتر حيث بلغت 10.7% و14.4% على التوالي ولمدة تعرض 72 ساعة مقارنة بعينة السيطرة.درس تاثير مستخلص (EPS) وراثيا في الخلايا اللمفاوية للانسان من خلال حساب معامل التحول الارومي Blast index (BI) ومعامل الانقسام الخيطي (MI) Mitotic index وفحصت التغايرات الكروموسومية والفعالية التحفيزية لانقسام الخلايا. وجد ان هذا المستخلص قد سبب انخفاضا معنويا في معدلات معامل الانقسام ومعامل التحول الارومي يتناسب مع زيادة التركيز المستعمل ومدة التعريض لكنه لم يحدث اية تاثيرات سمية وراثية في كروموسومات الخلايا اللمفاوية المعاملة. | Three isolates of Enterococcus faecium were obtained from 120 of dairy products. These isolates were identified using bacteriological and biochemical assays.Exopolysarccharide (EPS) was extracted by (TCA 10%) method from isolate E. faecium no.1 for high production. One gram of dry weight produced 300 mg/ml of EPS.Cytotoxicity effect of EPS on cancer cell lines AMN - 3 and HeLa. An inhibitory activity of EPS against cancer cells was noticed, it was depended on EPS concentration and time exposure. Both concentrations 2500 and 5000 µg/ml were inhibited cells of AMN - 3; the percentage of inhibition was 59.3 and 86.2% respectively. Whereas, the percentage of inhibition was reduced when EPS concentration was low, 1250 µg/ml of EPS was showed 8.3% of inhibition rate. Notable, the low concentration (625µg/ml) of EPS was induced proliferation of AMN - 3 cancer cells of AMN - 3 for proliferation; the viability rate of cancer cells was 157.1% in comparison with untreated cells (control). In addition, the cytotoxic activity of EPS on cancer cell line HeLa was also studied. Significantly, inhibition rate on HeLa cells was less than that against AMN - 3 cells. The inhibition rate of HeLa cells at 2500 and 5000 µg/ml of EPS after 72 hr. was 28.06 and 31.1 % respectively. While the inhibitory activity of EPS at low concentrations (625 and 1250 µg/ml) on HeLa cells were 10.7% and 14.4% respectively.Genetically, the effect of EPS on normal human lymphocytes using different parameters such as mitotic index (MI), blastogenic index (BI), rearrangement of chromosomes, and mitogenic activity was examined. The results showed that EPS was significantly reduced MI and BI. Moreover, no genotoxic effect on chromosomes of healthy human lymphocytes was noticed

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته == Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

Author name: همسة نافع محمد علي الرحو
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.

مقارنة التاثيرات المرضية للببتيدوكلايكان المستخلص من Staphylococcus xylosus وعديد السكريد الشحمي للـ E. Coli == Comparative Pathogenicity of Peptidoglycan Extracted from Staphylococcus xylosus and Lipopolysaccharide Extracted E. coli

Author name: هبة خليل توفيق
Supervisor name: مي طالب فليح | حارث جبار فهد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: من مجموع 150 عينة ادرار تم الحصول على 61 عزلة عائدة للجنس Staphylococcus , جمعت من مرضى مصابين بخمج المجاري البولية من مستشفيات الزعفرانية واليرموك للمدة من الاول من ايلول 2005 - الاول من كانون الثاني 2005 . تم التاكد من عائدية 10 عزلات للنوع S. xylosus وبنسبة عزل 16.3% من مجموع العنقوديات ، وقد تم تشخيصها بوساطة الاختبارات الكيموحيوية كما تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية وتبين ان 8 عزلات كانت مقاومة للمضاد Erythromycin ، والعزلات جميعها حساسة للمضاد Ciprofloxacin . تم استخلاص الجدار الخلوي باستخدام طريقة التكسير بالحبيبات الزجاجية (Glass beads) وتم اجراء تنقية جزئية للببتيدوكلايكان من الجدار باستعمال مواد كيميائية مثل : SDS , EDTA , LiCL2 , CaCL2 والهضم بالانزيمات DNase , RNase , Trypsin , Pronase . ولغرض التاكد من جودة طريقة التنقية تم اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخة فقد انخفض عدد الحزم البروتينية من 6 حزم في الجدار الخلوي الخام الى 4 حزم بعد التنقية . لقد اظهرت الدراسة الحالية التاثيرات الكيموحيوية السريرية للببتيدوكلايكان في مصل الارانب المحقونة عن طريق الزيادة الحاصلة في انزيمات الكبد والكلية ؛ اذ لوحظ زيادة معتدلة في كل من انزيمات : GoT وGpT وAlkaline phosphatase وكذلك Bilirubin ، والـ Urea ، والـ Creatinine ؛ مما يدل على حدوث خلل وظيفي في الكبد والكلية . تم دراسة امراضية مستخلص الببتيدوكلايكان للعزلة S.xylosus S24 (المقاومة لاكثر عدد من مضادات الحياة قيد الدراسة ) في الجهاز البولي للفئران البيض السويسرية الاناث اذ حقنت خمس مجاميع من الفئران بواقع ثلاثة مكررات لكل مجموعة عبر الاحليل باستخدام القثطرة بالتراكيز 1000000 ، 2000000 ، 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، وحقنت خمس مجاميع اخرى بمستخلص قياسي للـ LPS من بكتريا E.coli بالتراكيز 10, 25, 50, 75, 100 نانوغرام/مليليتر ، وبعد مرور يومين من الحقن تم تشريح الفئران حيث اظهرت الاعضاء (الكلية) تغييرات نسيجية تمثلت : بانكماش الكبيبة الكلوية ، واحتقان الاوعية الدموية ، وارتشاح الخلايا الالتهابية وفي المثانة فقدان طبقة الكيراتين وحدوث التنكس الاستسقائي لخلايا الطبقة الظهارية في كلا المستخلصين ومن خلال موازنة هذه التغييرات المرضية النسيجية لكل من مستخلص الببتيدوكلايكان وعديد السكريد الشحمي اتضح ان مستخلص عديد السكريد الشحمي اكثر شدة وامراضية اذ بدات التاثيرات بتراكيز (50, 75, 100) نانوغرام/مليليتر اقل من تراكيز مستخلص الببتيدوكلايكان 3000000 ، 4000000 ، 5000000 نانوغرام / 1 مليلتر ، فضلا عن وجود تغييرات نسيجية اخرى حدثت في مستخلص عديد السكريد الشحمي وغير موجودة في مستخلص الببتيدوكلايكان. | Our of 150 urine specimens collected from patients presented with urinary tract infections attending Alza’farania and Alyarmoouk hospitals in Baghdad for the period of September , 1st 2005 to December, 1st 2005 , 61 staphylococci were obtained. Ten isolates (16 , 3%) were confirmed to be Staphylococcus xylosus identified by using of biochemical tests. Antibiotic susceptibility tests . however , 8 of them were resistant to erythromycin while all of them were sensitive to ciprofloxacin.The Crude cell wall was extracted by mechanical disintegration using glass beads and a partial purification was done to the peptidoglycan by means of chemicals such as SDS , EDTA , LiCl2 and CaCl2 in addition to enzymes like DNase , RNase , trypsin and pronase.In order to prove the efficiency of the purification method , polyacrylamide gel electrophoresis was achieved under undenaturing conditions as the proteins bands number was reduced from 8 in the crude extract to 4 bands at the final stage.The present study showed clinical biochemical effects of the peptidoglycan in sera of injected rabbits through the increase resulted in liver enzymes ad renal function tests represented by GOT , GPT , alkaline phosphatase , total serum bilirubin , urea and creatinin , an indication to a malfunction of liver and kidney.The pathogenicity of peptidoglycan extracted from S. xulosus S24 (the isolate that resist highest number of studied antibiotics) was studied in urinary tract of female Swiss mice by injecting five animal groups , as triplicates catheter at concentrations reached 1000000 , 2000000 , 3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml , plus another five groups with 10 , 25 , 50 , 75 and 100 ng / ml of E. coli LPS. Two days later , animals were killed ; kidneys and urinary bladder were taken for histopathological study as they showed different pathological changes included shrinkage of glomerulus , congestion of blood vessels and infiltration of inflammatory cells in kidney , whereas dekeratinization and edematous dehydration of the epithelium were seen in urinary bladder.Passing through a comparison between these pathological changes in both extracts , LPS developed the highest severity and pathogenecity since the effects started with concentration (50 , 75 and 100 ng / ml) less than those was withpeptidoglycan (3000000 , 4000000 and 5000000 ng / 1 ml) in addition to the presence of some changes developed by LPS rather than peptidoglycan

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها == Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

Author name: هبة علي هلال الجبوري
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.

التاثيرات السمية الوراثية الخلوية للازورين المنقى جزئيا من بكتريا Pseudomonas aeruginosa في الخلايا السرطانية والطبيعية == Cytogenotoxic Effects of Partial purified Azurin from Pseudomonas aerugi

Author name: نهاد طه محمد جدوع
Supervisor name: هيفاء هادي حساني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى الكشف عن قابلية الازورين المستخلص من بكتريا Pseudomanas aeruginosa في تثبيط الخلايا السرطانية ومدى تاثيره في الخلايا الطبيعية ولذا تم جمع 66 عزلة من بكتريا P.aeruginosa من مجموع 145 عينة سريرية( ادرار، ومسحات من الجروح والحروق ، ومسحات من الاذن ، والقشع ، والبراز). وقد شخصت البكتريا بالاعتماد على الفحوصات المجهرية والزرعية والكيموحيوية ، وتم التاكد من التشخيص باستخدام عدة Api 20 E. استخلص الازورين من العزلة Ps21 المعزولة من الادرار ثم قيس تركيزه باستخدام الطريقة المطلقة Absolute method وكان 916.33 مايكروغرام / مل ، بعد ذلك نقي الازورين جزئيا بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام هلام Sephadex G - 100 اذ امتدت قمة الازورين من الجزء رقم ( 24 - 33 ) ، وبلغ تركيزه بعد التنقية 550 مايكروغرام / مل. درس التاثير الوراثي الخلوي لمستخلص الازورين المنقى جزئيا في الخلايا اللمفاوية للانسان بدلالة معامل التحول الارومي BI والانقسام الخيطي MI وفحصت كروموسومات الخلايا المعامله به ، ولوحظ ان المستخلص بتراكيزه العالية سبب انخفاضا معنويا بقيمة BI وMI بينما التراكيز الواطئة لم تحدث فروق معنوية احصائيا عند المقارنة مع معاملة السيطرة ، كما انه لم يحدث اي تغير في تركيب وعدد الكروموسومات للخلايا اللمفاوية المعامله به. كما درس التاثير التثبيطي للمستخلص المنقى جزئيا في بعض الخطوط الخلوية السرطانية مثل خط خلايا سرطان الحنجرة البشريHep - 2 وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري AMN - 3 فقد اظهر المستخلص فعالية تثبيطية عالية عند التراكيز العالية (125 ، 250 ) مايكروغرام / مل حسب هذه الدراسة ولاوقات التعريض جميعا ، في حين قل التاثير التثبيطي تدريجيا مع انخفاض التركيز المستعمل ، فقد اسهمت التراكيز الواطئة في تحفيز الخلايا على التضاعف والانقسام في هذين الخطين الخلوين وبنسب مختلفة قياسا بالسيطرة (100 % ) ، فخلايا ال Hep - 2 زادت حيويتها خلال مدة ال 24 ساعة الاولى من التعريض فقط في حين ان خلايا الAMN - 3 تمكنت من النمو والتكاثر في اوقات التعريض جميعها ( 24 ، 48 ، 72 ) ساعة. كما ونجح المستخلص في تجزئة دنا الخلايا السرطانية المستخدمة في هذه الدراسة اذ لوحظ ارتفاع معنوي في نسبة التجزئة وتناسب هذا الارتفاع طرديا مع زيادة التركيز ولكلا الخطين. | This study was amied to detection the ability of azurin, produced from Pseudomonas aeruginosa , as inihibtor of cancer cells and show the effect of azurin to the human lymphocyte. Therfore, out of 145 specimens collected from urin, burn andwound swabs, ear swab, sputum and stool. 66 isolates of P. aeruginosa were obtained. These isolates were identified according to microscopical, cultural, biochemical assays. In addition Api 20 E assay was used to confirm the diagnosis. Azurin was extacted from Ps21, isolate from urin, and concentration was measured by absolute method , it was 916.33µg/ml. Therfore, it was purified by using gel filtration,Sephadex G - 100. The peak was ranged from 24 to 33.The concentration. Azurin was performed 550µg/ml. The genetic effects of partial purified of azurin in human lymphocyte was studied by using several parameters such as Blastindex (BI), Mitotic index (MI) and Chromosomal aberration (CA). The high concentration of azurin, caused a significantreduction effect when compared with control. In addition, no chromosomal aberratios was seen. The inhibion effect of partial purified of azurin in some cancer cell lines (Hep - 2, AMN - 3) was studied. The extract at high Concentration ( 125 , 250 ) µg/ml. was exhibited apotent inhibiory for all exposure time against cancer cell lines. WhileThe inhibitory activity was gradually reduced with decreasing of Concentration;the low concentration was activated of cell to proliferation in both cell lines at different ratio in coparasion with the control ( 100 % ). The viability of Hep - 2 cells was increased only during the first 24 h from exposure while the AMN - 3 cell was able to grow and proliferate in all exposture time (24 , 48 , 72) hr. In addition the extract was succeeded to fragmentation DNA of cancer cell which used in these Studied, the azurin caused significant increas of fragmentation ratio, which increased with increase the concentration of azurin for both cell lines

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes == A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

Author name: ميسم محمد رشيد الشيباني
Supervisor name: حارث جبار فهد المذخوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA

انتاج انزيم chitinase من بكترياSerratia marcescens باستخدام حالة التخمرات السائلة والصلبة ودوره في المعالجة الحيوية

Author name: ميس عماد احمد محمود
Supervisor name: شذى سلمان حسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: درست قابلية (15)عزلة من بكتيريا Serratia marcescenase على انتاج الكايتنيز, واظهرت نتائج الغربلة الكميه وشبه الكمية ان العزلةSerratia marcescenaseA1S هي الاغزر انتاجا للانزيم . زرعت البكتيريا في اوساط تخمر صلبة وسائلة مختلفة استعملت مواد نباتية مختلفة ( مضافا اليها الكايتين وبدونه ) لتحضير الاوساط الصلبة ، اما الاوساط السائلة فقد احتوت على الكايتين مع مواد نيتروجينية مختلفة . بينت النتائج الماخوذه من قياس فعالية الانزيم على اساس تقدير السكريات المختزلة والسكر ان استيل كلوكوز امين ان البكتيريا تنتج انزيمات الكايتينيز الداخلي chitobiosidase) ) الذي يحرر سلاسل من السكريات المختزلة والكايتنيز الخارجي chitobioase ) ) التي تحرر وحدات السكر الامينيN - acetyl D - glucosamine )) ، وكانت فعالية الكايتنيز الخارجي اعلى من الداخلي عموما ، وتبين ان الاوساط السائله تعطي انتاجية اعلى من اوساط التخمر الصلبة. نميت البكتيريا في الوسط السائل بظروف مختلفة ، ووجد ان الظروف الافضل لانتاج الانزيم هي اضافة البكتريا بعدد خلايا 104 × 2.2 خلية / مل الى الوسط الحاوي على الببتون بوصفه مصدرا للنتروجين 2 % من الكايتين الغروي وحضنها بدرجة 30 م عند الرقم الهيدروجيني ( 7 ) لمدة 4 ايام في الحاضنة الهزازة بسرعة 150 دورة / دقيقة ،وبلغت الانتاجية 9.5 وحدة/ملغم بروتين. رسب الكايتنيز في وسط الانتاج بعد تنمية العزلةmarcescenas A1S Serratia باضافة كبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 75% ، وكانت الفعالية النوعية 9وحدة/ ملغم بروتين , وقد حققت هذه الخطوه تنقية جزئيه للانزيم وكان عدد مرات التنقيه5.6 بحصيله انزيميه مقدارها%80 . درست بعض العوامل المؤثره في فعالية وثبات الانزيم ، ولوحظ ان الرقم الهيدروجيني 7 هو الافضل للفعالية ، وتراوحت الارقام المفضلة لثباته بين 6 - 9 , وكانت اقصى فعالية للانزيم عند درجة 30 م . احتفظ الانزيم بنسبة 65 - 100 % عند حضنه بدرجات حرارة تراوح من 30 - 60 م لمدة 30 دقيقة ، وبقى محتفظا بـ 57 % من فعالية عند درجة 80 م. درس تاثيربعض المواد والمثبطات في فعالية الكايتنيز ولوحظ عدم تاثر الانزيم بـ EDTA وازايد الصوديوم والـPMSF بتركيز5 و10 ملي مولار . درس تاثير بعض الايونات الفلزية في فعالية الكايتنيز ولوحظت زيادة فعالية الانزيم عند حضنه مع ايونات الصوديوم Na+2 اذ وصلت الى 150 % . لم يتاثر الانزيم بايونات Mn +2 ، وFe+2 ،و Ca +2 ،و 2+ K وثبطت فعالية الانزيم عند معاملته بايونات Cu +² Zn +2, , Hg+2 بتركيز 5 ملي مولار اذ انخفضت الفعالية الى 31 , 50 , 55 % على التوالي وانخفضت الفعالية الى 25 ، 43 ، 50 % بتركيز 10 ملي مولار على التوالي عند المعاملة بهذه الايونات . قيست الفعالية المضادة للانزيم اتجاه انواع مختلفة من الكائنات الحية ، وبينت النتائج ان للانزيم فعالية مثبطة واضحة ضد خميرة الـ Candida albicans , حيث ظهرت مناطق عدم نمو واضحه للخميرة المعاملة بالانزيم ، وعند معاملةالقواقع البحرية Achatina fulica بالكايتنيز ظهرت تغيرات مظهرية عليها اذ لوحظ تنخر في اصدافها وفقدان فعاليتها. بينت النتائج ان تعريض يرقات حشرة خنفساء الطحين المتشابه Tribolium confusum للكايتنيز له تاثير قاتل للحشرة حيث فقدت حيويتها ، وظهر تحلل كامل في طبقة الكايتين التي تغلف سطح جسم اليرقة. يتضح من هذه النتائج ان الكايتنيز المنتج منmarcescenis A1S Serratia له فعالية مضادة لانواع مختلفة من الكائنات ، ويمكن استعماله بديلا للمواد الكميائية في القضاء على مثل هذه الاحياء | Fifteen Serratia isolatesd were obtained from different sources the ability of chitinase production from thes isolates was studied .Semi quantative and quantative screening appeared that Serratia marcescensA1S was the highest chitinase producer . The bacteria was cultured in different liquid and solid state fermentation media(SSF) , different plant sbstanaes were used for (SSF) with or without chitin , while liquid media containet chitin with different nitrogen source By measurements of reducing sugars and N - acetylD - glucosamine it was show this Serratia marcescensA1S produces endochitinase & exochitinase . the activity of exochitinase was higer than that of endochitinase the liquid media gaive higer chitinase production than the (SSF) Serratia marcescensA1S was grow in liquid media under tdifferent condiations and chitinase production was different favorable condtion for chitinase production were inoculation with 2.2 ×104 cell/ ml of bacteria in media containing 2 % chitin with peptone as nitrogen source , at pH 7, and incubated at 30 Cº in shakeing incubater with 150 rpm for 4 days Chitinase production reachet 9.7 unit/mg protein in these condation , Chitinase was precipitated from production media by 75 % saturation of ammonium sulphat with 9 unit/mg protein specific activity , the enzyme obtained from this step was partially purifed with 5.6 fold of purifaction and 80 % recovery . The effect of some facter on enzyme activity and stability were studied ,the optimum PH enzyme activity was 7and the favorites pH for enzyme stability ranged between 6 - 9 , the maximum activity was at 30 Cº, 100 - 65 % of enzyme activity mentained at 30 - 60 C º for 30 min and 57% at 80 Cº. EDTA ,Sodium azide and phenylmethane sulfonyl fluoride (PMSF) have no effect on chitinase activity with 5,10mM . The enzyme was treated with different metal ions , Na+2 increase enzyme activity , since it reached to150 % Mn2+ ,Fe +² ,Ca+2 , K+2, have no effect , while Cu2+, Zn+2, and Hg+2 at 5 Mm decreaced enzyme activity to 31 , 50 , 55 % respectivily and to 25 ، 43 ، 50% when it was treated with 10mM of these ions respectivily . The antibiotic activity of the chitinase against different organisms was determined , the enzyme inhibited Candida albicans growth, aclear zon appeared in the medium cultured with the yeast (treated with enzyme). Many chang appeared on sea snail Achatina fulica treated with enzyme, there was many pores on the shells , and the animal lost its viability . Flour beetle Tribolium confusum died when it was sprayed with chitinase, the chitin layer covered the Insecte body degredated after the treatment . From the above results it can be concluded that chitinase produced from Serratia marcescensA1S has antibiotic activity for different organismes , and it can be used as biocidal compound instead of chemical compounds for destroying or killing the harmful organisms

التحري الجزيئي عن جين الضراوة rmp لبكتيريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة محليا من المرضى البالغين == Molecular Detection of Virulance rmp Gene in Neisseria gonorrhoeae Isolated from Adult patients

Author name: مهـند كـريم عنيد الساعدي
Supervisor name: نورية عبد الحسين علي
General topic: Biology
Specific topic: Biotechnologies
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, the Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories for the time period from November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on media cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25 %) women and 63 (78.75 %) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75 %) samples were positive : 35(43.75 %) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer - Martin media; while 9 (11.25 %) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3 (3.75 %) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25 %) of the direct smears and 75 (93.75 %) of the urine samples were positive. Results of the Nitrogen bases sequence of the PCR technology of the samples in this study revealed consistency reaching up to 99 % with the Nitrogen bases sequence of the rmp gene present in the N. gonorrhoeae strain of the WHO. This study presented high specificity and sensitivity for the diagnosis of gonorrhoea using the PCR technology which is cheaper and faster than the conventional methods currently used in the hospitals and laboratories.

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة == Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

Author name: منال سلمان محمد كسار
Supervisor name: رشيد محجوب مصلح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز == Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

Author name: مريم باسم انيس
Supervisor name: سناء برهان الدين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

تكون الغشاء الحيوي بوساطة Klebsiella pneumoniae الملوثة للمثبتات الخارجية ومقاومته لمضادات الحياة == Biofilm Formation by The External Fixators Contaminating Klebsiella pneumoniae and Its Antibiotic Resistance

Author name: مروى حميد مطشر الخفاجي
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شخصت 98 عزلة بكتيرية منماة بظروف هوائية من مجموع 100 عينة سريرية ماخوذه من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية المستعملة في جراحة العظام والكسور. شكلت البكتريا السالبة لملون غرام اعلى نسبة 51% (50 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات، في حين شكلت البكتريا الموجبة لملون غرام 49% (48 عزلة) منها ، وكانت بكتريا Klebsiella pneumoniae هي المسبب الاكثر شيوعا لهذه الاخماج اذ عزلت بنسبة 74% (37 عزلة) من المجموع الكلي للعزلات السالبة لملون غرام . اجري اختبار حساسية عزلات K. pneumoniae لمضادات الحياة ، وتبين ان العزلات جميعها كانت حساسة لمضاد Amikacin (100%) ، ومقاومة للمضادات : Ampicillin ، وCefalexine ، وCefalothin ، وCefotaxime ، وCiprofloxacin ، وRifampin بنسبة 100% ، وقد كانت نسبة مقاومتها لمضادات Ceftazidime ، وStreptomycin ، وTobramycin ، وGentamycin ، وNeomycin ، وNitrofurantoin ، وNorfloxacin ، وTetracycline ، وNalidixic acid 94.5% و86.5% و86.5% و67.5% و59.5% و37.8% و35.1% و32.5% و24.3% وعلى التوالي . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات بكتريا K. pneumoniae لمضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin فبلغت 1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K13 ، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و64 مايكروغرام/مليليتر، و16 مايكروغرام/مليليتر، و4 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51 . كما تم تحديد التراكيز القاتلة الدنيا لهذه المضادات وتراوحت مابين اكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و1024 مايكروغرام/مليليتر، و128 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، على التوالي للعزلة K13 ، واكثر من 1024 مايكروغرام/مليليتر، و256 مايكروغرام/مليليتر، و32 مايكروغرام/مليليتر، و8 مايكروغرام/مليليتر على التوالي للعزلة K51. تم التحري عن قابلية عزلات K. pneumoniae على انتاج الطبقة اللزجة ، واظهرت نتائج طريقة الفحص بالانابيب ان 83.8% (31عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة ، في حين اظهرت طريقة احمر الكونغو ان 97.3% (36عزلة) كانت منتجة للطبقة اللزجة . تم التحري عن فوعة عزلات K. pneumoniae المعزولة من الاخماج المصاحبة للمثبتات الخارجية وذلك باختبار قابليتها لربط البنفسج البلوري وكانت العزلات جميعها فائعة (Virulent) . اختبرت قدرة عزلات K. pneumoniae على انتاج الغشاء الحيوي باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة فاظهرت النتائج ان العزلات جميعها كانت منتجة للغشاء الحيوي لكن بدرجات سمك متفاوتة ، وتراوحت قيم الامتصاصية مابين (0.111 - 2.899)، وكانت العزلة K13 هي العزلة الاكثر فعالية في انتاج الغشاء الحيوي حيث سجلت اعلى قيمة امتصاصية 2.899 . اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا من مضادات الحياة Cefotaxime ، وCeftazidime ، وNalidixic acid ، وAmikacin في الاغشية الحيوية المتكونة بفعل العزلتين K13وK51 في اطباق المعايرة الدقيقة باعمار مختلفة 24 ساعة و48 ساعة ، واظهرت النتائج ان هذه التراكيز ثبطت التصاق البكتريا على سطح البولي ستيرين مما ادى الى انفصال الغشاء الحيوي ، كما تبين ان الاغشية الحيوية الاقدم اكثر مقاومة للعوامل ضد الميكروبية . تم تحديد التراكيز المثبطة الدنيا للغشاء الحيوي واظهرت النتائج انها اكبر بثلاث او اربع مرات من التراكيز المثبطة الدنيا لعزلات K. pneumoniae العالقة في الوسط الزرعي | Out of 100 clinical samples taken from infected external fixation devices used in orthopedic surgery 98 bacterial isolates grown in aerobic conditions had been diagnosed. The higher ratio 51% (50 isolates) of the total number of the isolates occupied by gram negative bacteria while gram positive bacteria represented the rest 49% (48 isolate) , Klebsiella pneumoniae was the most common aetiological agent of these infections which accounted 74% (37 isolates) of the total number of gram negative bacterial isolates. The sensitivity test against different antibiotics was done. It was found that all K. pneumoniae isolates (100%) were sensitive to Amikacin and resistant to Ampicillin, Cefalexine, Cefalothin, Cefotaxime, Ciprofloxacin, and Rifampin . While their resistance percetage to the antibiotics Ceftazidime, Streptomycin, Tobramycin, Gentamycin, Neomycin, Nitrofurantoin, Norfloxacin, Tetracycline, and Nalidixic acid were 94.5% , 86.5% , 86.5% , 67.5% , 59.5% , 37.8% , 35.1% , 32.5% , 24.3% respectively. Minimum inhibitory concentrations to K. pneumoniae isolates had been determined for the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , they were 1024 Mcg/ml , 128 Mcg/ml , 64 Mcg/ml , and 16 Mcg/ml respectively for the isolate K13 , and they were 1024 Mcg/ml , 64 Mcg/ml, 16 Mcg/ml, and 4 Mcg/ml respectively for the isolate K51. Minimum bactericidal concentrations for the same antibiotics had been estimated and they were higher than 1024 Mcg/ml, 1024 Mcg/ml, 128 Mcg/ml, and 32 Mcg/ml respectively for K13 isolate, and higher than 1024 Mcg/ml, 256 Mcg/ml, 32 Mcg/ml, and 8 Mcg/ml respectively for the isolate K51. The ability of K.pneumoniae isolates to produce slime layer was detected , the results revealed that 83.3% (31 isolates) were slime layer producers by tube method, while 97.3% (36 isolates) were slime producers by congo red method. The virulence of K.pneumoniae isolates isolated from external fixators infections had been detected via detection the crystal violet binding ability of these isolates, all the isolates were virulent. The ability of K.pneumoniae isolates to produce the biofilm had been tested by using microtiter plates , results revealed that all the isolates were biofilm producers with different thickness degrees, absorbance values rendered between (0.111 - 2.899) , K13 was the best biofilm producer isolate, it,s absorbance value was 2.899 . The effect of subinhibitory concentrations of the antibiotics Cefotaxime, Ceftazidime, Nalidixic acid, and Amikacin , on biofilms formed by K13 and K51 isolates in microtiterplates in different ages , 24 hr and 48 hr had been tested , results revealed that these concentrations inhibited bacterial adhesion on polysteren surface and consequently causes biofilm detachment , also it was demonstrated that aged biofilms are more resistant to antimicrobial agents . Minimum inhibitory concentrations for the biofilm had been estimated, and the results revealed that these concentrations were three to four times higher than minimum inhibitory concentrations for the planktonic K.pneumoniae isolates.

دراسـة الاستجابة المناعيـة للاشخاص بعد تلقيحهم بلقاح الحصبـة الالمانية == Immune - status of Individuals after Immunization with Rubella vaccine

Author name: ليلى فؤاد علي
Supervisor name: غنيمة صادق محمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: بدا برنامج التلقيح الموسعExpanded programme on immunization(EPI) في العراق عام 1985وبتوجيه من منظمة الصحة العالمية وبضمنه لقاح الحصبة الالمانية في برنامج التلقيح الاعتيادي للاطفال وبعمر 15شهر بهدف القضاء على مرض متلازمة الحصبة الالمانية الولادية نظرا لما يسببه هذا المرض من اضرار كبيرة في الجنين حيث قد يولد الطفل المصاب مشوه وقد تؤدي الاصابة بحياته الى الموت (Laura & Susan,2002). شملت الدراسة (116) عينة دم ماخوذة من اشخاص اصحاء ،كان منها 30 عينة دم لاطفال اصحاء بعد اسبوعين من تلقيحهم بلقاح الحصبة الالمانية حسب الجدول التلقيحي المتبع في القطر وقد تراوحت اعمارهم مابين (18 - 20) شـهر ، و20 عينة دم لاناث تراوحت اعمارهن مابين(12 - 15) سنة بعد اسبوعين من تلقيحهن بلقاح الحصبة الالمانية . اما مجموعة السيطرة فتضمنت 12 عينات دم لاطفال و10 عينات لاناث بعمر (12 - 15) سنة لم يتلقوا لقاح الحصبة الالمانية . هذه العينات اجريت لها الاختبارات المناعية لتقييم الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية للقاح الحصبة الالمانية.كما تضمنت الدراسة 44 عينة دم لاشخاص ملقحين منها 22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها موجبة و22 عينة كانت نتائج فحص تثبيط التلازن الدموي لها سالبة ، تم اختبار هاتين المجموعتين باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم (ELISA) لمعرفة العلاقة بين الفحصين والحساسية والنوعية لفحص (ELISA)نسبة الى فحص تثبيط التلازن الدموي . في هذه الدراسة تم قياس الاستجابة المناعية الخلطية وذلك بقياس تركيز الاضداد النوعية للحصبة الالمانية ، بالاضافة الى تقدير التركيز الكلي للكلوبيولينات المناعية صنفA وM وG.كما تضمنت الدراسة قياس الاستجابـة لمناعية الخلوية وذلك بقياس قابلية الخلايا البلعمية على البلعمة ،وقياس قابلية الخلايا اللمفاوية التي تم تحفيزها بالملزن النباتي (PHA) على التحول والانقسام . من خلال هذه الدراسة تم الحصول على النتائج التالية : - 1 - اظهرت مصول الاطفال نسبة 96.7 % ،واظهرت مصول الاناث نسبة 95 % تراكيز فعالة من الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية اعلى من 11وحدة عالمية \مليلتر باختبار الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم ELISA بعد عملية التلقيح .2 - اظهرت مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين انخفاض في اجمالي الكلوبيولين المناعي صنف GوAوبفروق معنوية (p<0.05) ( p>0.05 ) مع ارتفاع في الكلوبيولين المناعي صنف Mوبفروق معنوية عالية(p<0.01) مقارنة بمجموعتي السيطرة .3 - وجد من خلال فحص النسبة المئوية لعملية البلعمة ان كل من الاطفال والاناث الملقحين اظهروا ارتفاعا في النشاط الالتهامي للخلايا البلعمية وبفروق معنوية (p<0.05) مقارنة بمجموعتي السيطرة .4 - اظهرت نتائج فحص التحول والانقسام اللمفاوي ان هناك انخفاض غير معنوي ( p>0.05 )في مجموعتي الاطفال والاناث الملقحين مقابلة بمجموعتي السيطرة . 5 - لا توجد فروق معنوية في الاستجابة المناعية الخلطية والخلوية بين مجموعة الاطفال الملقحين ومجموعة الاناث الملقحات ( p>0.05 ) .6 - وجد ان فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم هو اكثر حساسية من فحص تثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية ،وعليه فهو الافضل في تقييم الاستجابة المناعية للقاح الحصبة الالمانية .7 - وجد ان هناك علاقة ايجابية قوية بين فحصي الادمصاص المناعي المرتبط بالانظيم وتثبيط التلازن الدموي في قياس تركيز الاجسام المضادة النوعية للحصبة الالمانية حيث كانت قيمة ( r = 0.585 ) . | The Expanded Programme on Immunization (EPI) began in Iraq in 1985, including Rubella vaccine. MMR vaccine is represent one of combined vaccines of rubella ,measles and mumps that given for children at age of 12 - 15 months. Vaccination with rubella vaccine is the best way to eradicate Congenital Rubella Syndrome which have severe complications for women in their first trimester of pregnancy These complications include severe birth defects or death of the fetus. In this study, (116) blood samples were taken from healthy individuals after 2 - 4 weeks after vaccination with rubella vaccine .(30) from children of age (12 - 18) and (20) from females at age of (12 - 15) years old . Control group included (12) healthy children and (10) healthy females ,both did not have rubella vaccine through their life .These samples were tested to evaluate the immune - states of individuals after immunization . the study include (44) blood samples tested by HItest and ELISA test . In this study specific haemagglutination antibodies & IgM antibodies were measured ,total Immunoglobulines IgM ,IgG ,IgA also determined .Lymphocyte transformation and ability of phagocyte cell to phagocytosis were measured. The following results were obtained in this study : 1. The percentage of children whom observed levels of specific antibodies ≥ 11AU/ml was 96.7% and 95% by ELISA test for children and females groups respectively after vaccination .2. The decreasing total of IgG and IgA with the increasing of IgM in both groups of children and females with significant differences (p>0.05) (p>0.05) (p<0.01) receptively comparison with control group.3. The increasing percentage of phagocytic cell to phagocytosis in both groups of children and females in significant differences (p<0.05) comparison with control group .4. The decreasing percentage of lymphocyte transformation in both children and females groups in non significant differences (p>0.05) comparison with control group .5. The non significant differences in humoral and cellular immune Response between child and female groups .6. The higher sensitivity of ELISA test to HI test in determination of rubella specific antibodies , so it is better than HI test in measuring the immune - status of individuals vaccinated with rubella vaccine .7. A positive relationship between ELISA test and HI test (r= 0.585) .

الاستخلاص والتنقية الجزئية للخملة من بكتريا Proteus mirabilis ودراسة دورها في الالتصاق على الخلايا الطلائية البولية == Extraction and Partial Purification for Fimbriae from Proteus mirabilis and Study Their Role in Adhesion to Uroepithlial Cells

Author name: عامر سعيد علي الكعبي
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص البكتريا السالبة لملون كرام من ادرار المرضى المراجعين لمستشفى الكاظمية التعليمي ومستشفى اليرموك في بغداد واللذين شخصت اصابتهم بخمج المسالك البولية سريريا . عزلت البكتريا السالبة لملون كرام من 61 عينة ادرار وبنسبة عزل 28.9% من اصل 211 عينة ادرار , كانت نسبة عزل بكتريا Escherichia coli 70.49% , اما بكتريا Klebsiella pneumoniae , وPseudomonas aeruginosa فكانت نسبـة عزلهما 8.19% و6.55% وعلى التوالي . اظهرت بكتريا Proteus spp. نسبة عزل 14.75% وبلغت نسبة عزل P.mirabilis 11.47% اما نسبة عزل P.vulgaris فكانت 3.27% . تم التحري عن قدرة سللات بكتريا P.mirabilis للتعبير عن خمل لاصق الخلايا الطلائية البولية (Uroepithelial Cell Adhesin)(UCA) , بالاعتماد على اعلى معدل التصاق للبكتريا بالخلايا الطلائية البولية للانسان , اذ تم اختبار العزلة P.mirabilis U7 التي كان معدل التصاقها 30.2% عند تنميتها على وسط مرق اللوريا وفترة حضن 24 ساعة بدرجة حرارة 37 م , وعند تنميتها على وسط اكار اللوريا كان معدل التصاقها 20.3% مقارنة بالعزلة P.mirabilis U4 التي ابدت معدل التصاق واطيء عند تنميتها على وسط مرق اللوريا واكار اللوريا اذ بلغ معدل الالتصاق 4.7% و1.65% وعلى التوالي . اظهرت العزلة P.mirabilis U7 قدرة للتعبير عن الخمل المقاوم للمانوز شبية البروتيس (MR ∕P) والخمل المقاوم للمانوز شبية الكلبسيلا (MR ∕K) , اذ لازنت هذه العزلة كريات الدم الحمر للانسان نوع O+ وخنازير غينيا والخراف وبوجود سكر المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕P , كما لازنت كريات الدم الحمر المدبغة للابقار وبوجود المانوز دلالة على وجود خمل MR ∕K عند تنمية هذه العزلة على وسط مرق اللوريا وفترة حضانة 48 ساعة وبدرجة حرارة 37 م , كما اختزل التعبير عن الخمل MR ∕Pو MR ∕K عند تنمية P.mirabilis U7 على الاوساط الزرعية الصلبة . تم عزل خمل UCA وتنقيته جزئيا باستخدام اليوريا بتركيز 2 مولر والصدمة الحرارية وكبريتات الامونيوم وبنسبة تشبع 50% وDeoxycholate , كان تركيز بروتين UCA هو 1.65 مايكروغرام/مليلتر وبحجم نهائي 1.5 مليلتر ناتج من استخدام 3 لتر من مرق اللوريا . اظهر الترحيل الكهربائي وبوجود المادة الماسخة SDS حزمتين بروتينية لبروتين UCA المنقى جزئيا والذي بلغ وزنه الجزيئي 17.782 دالتون . تم حقن الـ UCA المنقى جزيئا في الارانب للحصول على المصل المضاد اذ وجد ان تركيز المصل المضاد هو 128 كما تم الاستدلال على وجود الاضداد النوعية لمستضد خمل UCA . ثبطت اضداد خمل UCA المحضرة في الارانب والمخففة بتراكيز 1 : 50 و1 : 100 , 1 : 200 التصاق العزلة P.mirabilis U7 بالخلايا الطلائية البولية (معدل البكتريا الملتصقة كان 5.6 و11.75 و21.05 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) , اظهرت هذه الاضداد اختلافا معنويا (P≤0.05) في معدل الالتصاق عند مقارنتها بمصل السيطرة والمستعمل بنفس التراكيز (معدل عدد البكتريا الملتصقة كان 29.8 و30 و31.6 خلية بكتيرية /خلية طلائية وعلى التوالي ) ,كما اظهرت النتائج وجود اختلاف معنوي (P≤0.05) بين تراكيز المصل المضاد المستخدمة في تثبيط الالتصاق . تم اختبار قدرة خمل UCA المنقى جزئيا على التمنيع وحماية اناث الفئران من الاصابة بخمج المسالك البولية , تم اصابة الفئران الممنعة وغير الممنعة ببكتريا P.mirabilis U7 بتركيز (5×105) وحدة مكونة لمستعمرة/ مليلتر عن طريق الاحليل وبعد مرور اسبوع على الاصابة وجد ان اعداد الخلايا البكترية الحية في كلية الفئران الممنعة انخفض الى (2.6 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر مقارنة بـ(3.7 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر لكلية الفئران غير الممنعة ,اما مثانة الفئران الممنعة فقد اختفت الاصابة وبشكل كامل مقارنة بمثانة الفئران غير الممنعة (3.3 : Log10 ) وحدة مكونة لمستعمرة /مليلتر .

التهابات المجاري البولية الناتجة عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus مقارنه بدنا الخميرة Candida albicans

Author name: صبا نزيه عبد الغفار الحسون
Supervisor name: حارث جبار فهد المذخوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ٣٠٨ عينة ادرار للفترة من تشرين الاول ٢٠٠٩ لغاية كانون الثاني ٢٠١٠ من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. اذ تم عزل وتشخيص٧٢ عزلة تابعة لجنس المكورات العنقودية وبنسبة عزل بلغت (٢٣٫٣٪) من مجموع عينات الادرار٬ وتم اثبات عائدية ٥١ عزلة الى المكورات العنقودية السالبة لاختبار الكواكيوليز٬ وكانت ٢١ عزلة منها تابعة للنوع S. aureus وبنسبة عزل (٢٩٫٢٪) من مجموع المكورات العنقودية٬ وبنسبة (٦٫٨٪) من المجموع الكلي لعينات الادرار٬ بينما ٣٦ (١١٫٦٪) عزلة قد شخصت على انها C. albicans من مجموع عينات الادرار. وقد شخصت هذه تم اختبار حساسية عزلاتS. aureus لمجموعة من المضادات الحياتية٬ وكان هناك تباينا ومقاومة متعددة تجاه تلك المضادات٬ حيث اظهرت اغلب العزلات مقاومة عالية ضد ampicillin (٩٠٫٥٪(٬ amoxicillin(٨١٪)٬cefotaxime (٧٦٫٢٪)٬ وكانت المقاومة لل oxacillin (٦٦٫٧٪) وmethicillin (٦٦٫٧٪) ٬ بينما كان المضاد vancomycin الاكثر تاثيرا على كل العزلات (٠٪). تم استخلاص دنا من بكتريا S. aureus S11 بواسطة استعمال عدةWizard genomic DNA purification٬ وحطم جدار البكتريا بانزيم اللايسوزايم بينما استخلص دنا خميرة C. albicans C3 باستعمال طريقة Harju٬ وحطم جدار الخميرة بتكرار تجميد واذابة الخلايا بالاضافة الى دور المنظفات الموجودة بدارئ التحلل .(Harju buffer) عندما تم قياس امتصاصية محاليل الدنا بواسطة المطياف وجد ان تركيز دنا S. aureus S11 كان ٠٫٨٢٥ مايكروغرام\مايكروليتر٬ والنقاوة ١٫٧٥. بينما كان تركيز دنا C. albicans C3 ٢٫٤٥٥ مايكروغرام\مايكروليتر ٬ والنقاوة ١٫٧٠. ومن كلا تركيزي دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 حضر سلسلة تراكيز (٥٠٬٤٠٬٣٠٬٢٠٬١٠ مايكروغرام\١٠٠مايكروليتر). لوحظت تفاعلات خفيفة جدا للفئران البيض المحقونة عن طريق الاحليل ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا C. albicans C3 بالمقارنة مع فئران محقونة ب١×٨١٠ وحدة مكونة للمستعمرة\مل من خلايا S. aureus S11 . فقد عكست الكلى المحقونة ب S. aureus S11 احتقان مع ارتشاح الخلايا الالتهابية وانحلال للنبيبات البولية بينما المثانة عكست وذمة مع ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية وتقرح بؤري لسطح الطبقة الطلائية المخاطية. اظهرت الكلى المحقونة ب C. albicans C3 احتقان ولم يلاحظ تغيرات نسيجية واضحة٬ بينما المثانة اظهرت ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية مع وذمة في الطبقة تحت الطلائية. لمعرفة التاثير المرضي لدنا S. aureus S11 ودنا C. albicans في الجهاز البولي للفئران البيض ٬ حقنت الفئران عن طريق الاحليل بخمسة تراكيز لكل من دنا S. aureus S11 ودنا C. albicans C3 . كان التاثير المرضي لكليهما معتمد على التركيز فقد ازدادت الشدة بزيادة تركيز الدنا وكانت اشدها عند تركيز ٥٠ مايكروغرام\مايكروليتر٬ ولكن اظهر دنا C. albicans C3 تغيرات نسيجية اقل شدة من التي لوحظت مع دنا . S. aureus S11 اظهرت الاعضاء (الكلى والمثانة) للفئران المحقونة بدنا S. aureus S11تغيرات مرضية مختلفة٬ في الكلى تراوحت من انحلال خفيف وتنخر للنبيبات البولية٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ احتقان الاوعية الدموية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما تمثلت التغيرات في المثانة بتحطم الجدار المخاطي٬ ارتشاح خفيف الى شديد للخلايا الالتهابية٬ وذمة خفيفة٬ انسلاخ سطح الطبقة الطلائية المخاطية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة.تراوحت التغيرات المرضية للكلى المحقونة بدنا C. albicans C3 من احتقان الاوعية الدموية٬ ارتشاح متوسط للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للكلى. بينما المثانة اظهرت وذمة خفيفة٬ ارتشاح خفيف للخلايا الالتهابية الى مظهر قريب للحالة الطبيعية للمثانة. | From October 2009 to January 2010, 308 mid stream urine specimens were collected from patients suffering from urinary tract infections at AL - Yarmouk Teaching Hospital and The Educational Laboratories of Madienat Al - Teb. Staphylococci were isolated from 72 (23.3%) urine specimens, 51 isolates were coagulase negative staphylococci, out of these 21 were identified as Staphylococcus aureus (29.2%) from the total count of staphylococci and (6.8%) from total urine specimens. While 36 (11.6%) specimens were identified as Candida albicans isolates. The isolates were diagnosed by biochemical tests, API Staph. and Candida system. Susceptibility of S. aureus isolates to antibiotics was examined, the results revealed different and multi resistance to these antibiotics, that S. aureus isolates were highly resistant to ampicillin (90.5%), amoxicillin (81%) and cefotaxime (76.2%), the resistant to oxacillin (66.7%), methicillin (66.7%), while vancomycin found to be the most effective agents against all of the isolates (0%). Staphylococcus aureus S11 DNA was extracted by using Wizard genomic DNA purification kit method, the cell wall of S. aureus was hydrolyzed by using lysozyme enzyme. While C. albicans C3 DNA was extracted by using a Harju method, the cell wall of C. albicans was ruptured by using repeated freeze - thawing of cells as well as the role of the detergents found in a lysis buffer (Harju buffer). When the absorbance of DNA solutions was measured by the spectrophotometer apparatus it was found the concentration of S. aureus S11 DNA was 0.825 µg/µl, the purity was 1.75. While the concentration of C. albicans C3 DNA was 2.455 µg/µl, the purity was 1.70. From the each concentrations of S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA was prepared serial of concentrations (10, 20, 30, 40 and 50 µg/100µl(. Mildest reactions were obtained from mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of C. albicans C3 compared with mice challenged with 1×108 cfu/ml viable organisms of S. aureus S11. Kidney treated with S. aureus S11 revealed congestion, inflammatory cells infiltration and degenerative changes of renal tubules, while its bladder revealed oedema with moderate inflammatory cells infiltration and focal mucosal surface epithelial ulceration. However kidney treated with C. albicans C3 showed that there was congestion and no obvious histological changes, while its bladder developed mild infiltration of inflammatory cells with oedema in subepithelial lining layer.In order to testify the pathogenicity of S. aureus DNA and C. albicans DNA in murine urinary tract system, mice were injected intraurethraly with five doses of each S. aureus S11 DNA and C. albicans C3 DNA. The histological changes for each was dose - dependent, the magnitude increased with increasing the DNA dose with the maximal at 50 µg/100µl, but C. albicans C3 DNA developed throughout less intense histological changes than observed with DNA from S. aureus S11.Organs of mice (kidneys and bladders) treated with S. aureus S11 DNA showed different pathological changes, in kidneys the changes ranged from mild degenerative and necrosis of renal tubules, mild to severe infiltration of inflammatory cells, congestion of blood vessels to near normal structure appearance of the kidney. Whereas the bladders developed damage of mucosal wall, mild to severe inflammatory cells infiltration, mild oedema, sloughing of mucosal epithelial surface to near normal structure appearance of the bladder. However kidneys treated with C. albicans C3 DNA ranged from congestion of blood vessels, moderate inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the kidney. While its bladder developed mild oedema, mild inflammatory cells infiltration to near normal structure appearance of the bladder.

دراسة بعض الخصائص الفيزيائية والكيميائية لانزيم Staphylolysin المنتج من بكتريا Pseudomonas aeruginosa == Study of Some Physical and Chemical properties of Staphylolysin produced by Pseudomonas aeruginosa

Author name: شيماء سهيل نجم
Supervisor name: مي طالب فليح
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: عزلت (50) عزلة عائدة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من 120 عينة سريرية جمعت من مصادر مختلفة تضمنت (الادرار،والقشع ،والبراز ،ومسحات الاذن ، والجروح،والحروق).تم التحري عن انتاج بعض من عوامل الضراوة للعزلات قيد الدراسة مثل : الهيمولايسين، والايلاستيز ، والبروتيز ، ووجد ان نسبة انتاج الهيمولايسين والايلاستيز كانت 76% ، فيما كانت نسبة انتاج البروتيز 72% في العزلات المحلية قيد الدراسة.اختبرت قابلية العزلات المحلية على انتاج انزيم الستافيلولايسين ، وبينت نتائج الغربلة شبه الكمية ان 18 عزلة (36%) من العزلات لها القابلية على انتاج الانزيم وبنسب متفاوتة،اذ تراوحت اقطار الهالة الشفافة من(5 - 22)ملم ، وتميزت خمس عزلات منها باعطاءها اوسع مناطق تحلل على وسط ] ترتبك صويا الصلب + 0.2% (وزن/حجم) من بكتريا Staphylococcus aureus المعزولة المقتولة بالحرارة بدرجة 100م [تراوحت من (16 - 22)ملم ، وتم انتخاب العزلة 16P لاستخلاص الستافيلولايسين A (LasA) ، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (8.59)وحدة / ملغم بروتين ، والعزلة 5P لاستخلاص الستافيلولايسين D (LasD)، اذ بلغت الفعالية النوعية لها (0.66)وحدة / ملغم بروتين ،لكونهما الاغزر انتاجا للانزيم عند اجراء الغربلة الكمية.استخلص انزيم الستافيلولايسين بالنبذ المركزي المبرد وتمت تنقيته جزئيا بترسيبه بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 80% ثم بكروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل DEAE - Cellulose ، بينت النتائج ان الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات (Staphylolytic activity) لانزيم الستافيلولايسين A ظهرت في القمة الاولى، وبلغت عدد مرات التنقية 10.74 مرة وبحصيلة انزيمية 14.2%،فيما اظهرت القمة الثانية الفعالية الانزيمية الحالة للعنقوديات لانزيم الستافيلولايسين D بعدد مرات تنقية 9.1 مرة وبحصيلة انزيمية 18.14%.درست بعض خصائص الانزيمين فكان الوزن الجزيئي 20.417 كيلو دالتون و23.988 كيلو دالتون للستافيلولايسين D,A على التوالي عند تقديرهما بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE. لوحظ ان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين A هو 8 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 150 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 7.5 - 8.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، فيما كان الرقم الهيدروجيني الامثل لفعالية الستافيلولايسين D هو 9.5 اذ اعطى اعلى فعالية بلغت 16 وحدة / مل ، ولثبات الانزيم 8.5 - 9.5 اذ احتفظ الانزيم بكامل فعاليته تقريبا ، وظهرت اقصى فعالية للانزيمين عند درجة حرارة 40م اذ بلغت الفعالية النوعية للستافيلولايسين A 140 وحدة /مل وللستافيلولايسين D 16.4 وحدة/ مل ، واحتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما تقريبا عند حضنهما بدرجة حرارة 25 - 40م لمدة ساعة.عند دراسة تاثير بعض المواد في الفعالية الانزيمية للستافيلولايسين D,A كان لكلوريد الصوديوم وكلوريد البوتاسيوم بتركيز 1 و5 ملي مولار تاثير منشط للفعالية الانزيمية قياسا بالسيطرة اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ105% و108% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد الصوديوم ، واحتفظ بـ 102% و104% من فعاليته على التوالي عند معاملته بكلوريد البوتاسيوم، في حين ثبطت الفعالية الانزيمية عند معاملتهما بكلوريدات الحديد والزئبق والخارصين وبنسب متفاوتة ،اذ احتفظ انزيم الستافيلولايسين A بـ 73% و7% من فعاليته على التوالي عند معاملته بـ5ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و9% فقط من فعاليته عند معاملته بـ 0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين ، فيما احتفظ انزيم الستافيلولايسين D بـ45% و13% من فعاليته فقط عند معاملته بـ5 ملي مولار من كلوريد الحديد والزئبق على التوالي،و23% فقط من فعاليته عند معاملته بـ0.1 ملي مولار من كلوريد الخارصين، بينما احتفظ كلا الانزيمين بكامل فعاليتهما عند المعاملة بمادة EDTA بتركيز 10 ملي مولار ،وفنيل مثيل سلفونيل فلورايد (PMSF) بتركيز 0.4 ملي مولار. | Fifty isolates of Pseudomonas aeruginosa were obtained from 120 various clinical samples included (urine, sputum, stool, ear, wound & burn swabs). Detection of the production of some virulence factors (hemolysin, elastase and protease) by the local isolates was studied. Results showed that the hemolysin and elastase production ratio were 76%, while the protease production ratio was about 72% by the local isolates.Detection of the ability of local isolates to produce staphylolysin enzyme was studied, the semi quantity screening results showed that 18 (36%) of the isolates have the ability to produce this enzyme in variable ratios , the diameters of lysis Zone ranged from(5 - 22)mm, and five isolates were characterized by giving the highest lysis zone on (Tryptic soya agar + 0.2% (wt./vol.) of heat killed Staphylococcus. aureus at temperature 100oC ) medium which were ranged from(16 - 22)mm, then the isolate P16 was chosen to extract staphylolysin A (LasA) and it's specific activity reaches 8.59 unit /mg protein, whi1e chosen the isolate P5 to extract staphylolysin D (LasD) where it's specific activity reaches 0.66 unit /mg protein since the two isolates were the most production of enzyme by quantity screening . Staphylolysin enzyme was extracted by cooling centrifugation and partially purified by ammonium sulphate precipitation in saturation percentage of 80%, this step was followed by Ion exchange chromatography technique by using DEAE - cellulose column, results showed that the enzymatic activity (Staphylolytic activity) of the staphylolysin A appeared in first peak with purification folds and recovery of 10.74 fold and 14.2% respectively, while the second peak appeared the activity for staphylolysin D with purification folds and recovery of 9.1 fold and 18.14% respectively.Some of the characters of the two enzymes were studied, so the molecular weights were 20.417 kilo dalton & 23.988 kilo dalton for staphylolysin A&D respectively were estimated by SDS - polyacryl amide gel e1ectrophoresis. The optimum pH for staphylolysin A activity was found to be 8 which gives higher activity reaches 150 unit/ml, and for enzyme stability was 7.5 - 8.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity, while there were for staphylolysin D 9.5 that gives higher activity of 16 unit/ml.& 8.5 - 9.5 in which the enzyme nearly retained it's full activity respectively, Maximum activity of two enzymes was obtained at 40 C in which the specific activity were for staphylolysin A and D 140 and 16.4 unit/ml , and the activity for two enzymes at 25 - 40 C remained approximately without change for one hour. When the effects of some materials on staphylolysin A & D activity were studied, the results showed that both sodium chloride & potassium chloride at 1 & 5 mM had the activator effect on enzymatic activity compared with its control where the staphylolysin A and D retained 105% ,108% and 102%, 104% of their activity, respectively when treated with sodium chloride, while they retained 110%, 114% and 133%, 118% of their activity, respectivity when treated with potassium chloride, while ferric, mercury & zinc chlorides inhibited the activity in variable ratios in which the staphylolysin A and D kept only 73%, 7% and 45%, 13% respectively of their initial activity when treated with 5mM of ferric and meracury chloride and 9%, 23% respectively of their initial activity when treated with 0.1mM zinc chlorid & enzymatic activity for both enzymes were not affected when treated with EDTA at 10mM & phenyl methyl sulphonyl fluoride (PMSF) at 0.4mM.
1 ... 48 49 50 51 52 ... 101