عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 19,951

السياسات المجتمعية لمواجهة مخاطر الارهاب في العراق : دراسة ميدانية في محافظة صلاح الدين

اسم المؤلف: انس ناجي حسين البلداوي
اسم المشرف: سلام عبد علي العبادي
الموضوع العام: علم الاجتماع
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علم الاجتماع
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تسعى هذه الدراسة الموسومة (السياسات المجتمعية لمواجهة مخاطر الارهاب في العراق ,دراسة ميدانية في محافظة صلاح الدين) لتوضيح واقع السياسات المجتمعية في العراق كونها من متطلبا مواجهة ظاهرة العنف والارهاب في المجتمع العراقي ،والتي تهدف للتشارك بين القطاع الرسمي وغير الرسمي في مواجهة ظاهرة الارهاب, وانطلاقا من هذا التصور فقد ركزت الدراسة على معرفة دور المؤسسات الرسمية في تقديم الخدمات بابعادها الاجتماعية والاقتصادية والثقافية والامنية في مواجهة مخاطر الارهاب ,وايضا دور المؤسسات غير الرسمية ازاء ظاهرة العنف والارهاب في المجتمع ,وعليه انطلقت هذه الدراسة من طرح تساؤلات اساسية مفادها : هل هناك سياسة مجتمعية واضحة المعالم لمكافحة ظاهرة الارهاب في العراق ؟ وما اهم التحديات التي تواجه السياسات المجتمعية لمواجهة الارهاب في العراق؟ | وللاجابة عن هذه الاستفهامات فقد تبنت هذه الدراسة في جانبها النظري عددا من المحاور التي بحثت مصادر الارهاب والعوامل المؤثرة فيه ، كما حددت الدراسة السياسات المجتمعية لمواجهة الارهاب التي كان اهمها السياسات الاقتصادية والامنية والتربوية والاجتماعية ، اما الطار المنهجي للدراسة فهي من الدراسات الوصفية الميدانية التي اعتمدت الوصف والتحليل والاطلاع على الكثير من الادبيات الخاصة بموضوع (ظاهرة الارهاب) واهم مصادره وكيفية مواجهته والوقاية منه واثاره على المجتمع ,وقد اعتمدت الدراسة مجموعة من المناهج منها المنهج التاريخي والمنهج المقارن فضلا( منهج المسح الاجتماعي) وادوات جمع البيانات ( المقابلة والاستبانه ). | اما تصميم العينة في هذه الدراسة فقد اعتمدت (400) مبحوث من افراد المؤسسات الرسمية وغير الرسمية في محافظة صلاح الدين. | اما اهم النتائج التي توصلت اليها الدراسة فهي : | 1- اكد (44.2%) من المبحوثين ان تقديم الخدمات الضرورية للمواطنين سيسهم في مواجهة الارهاب. | 2- يعتقد (45.8%) من المبحوثين ان تفعيل القوانين سيسهم في عودة الاستقرار الامني ويحد من الارهاب. | اما اهم توصيات الدراسة ومقترحاتها فهي : | 1- ان الدولة هي الجهة الاولى المسؤولة عن وضع السياسات المجتمعية ,لهذا وجب عليها ان تكون واعية لهذه المسؤولية عبر اجهزتها المختلفة لمواجهة مظاهر التطرف والارهاب والحد من مخاطرهما على الفرد والمجتمع. | 2- هناك حاجة ماسة لاحداث تغييرات تهدف الى تحسين الاوضاع العامة في المجتمع ومعالجة مشكلاته بالتخطيط والتنسيق لمعالجة بؤر ومنابع الارهاب, مثل الحرمان والبطالة ,وانعدام فرص التعليم . | == Abstract | This study (societal policies confronting terrorism risks in Iraq : a field study in Sllahaldeen) aims to explaining the reality of societal policies in Iraq. | They are considered a necessary request for confronting terrorism in the Iraqi society | It aims at taking part in both a formal and non-formal context . This study examines the role of formal institutions in presenting services in its security , cultural, economic and social form. This study also rises these questions is there a clear societal policy for confronting terrorism in Iraq? And what is the most important challenges facing the societal policies for confronting terrorism in Iraq and Sllahaldeen . | This study adopt in its theoretical back ground some aspects that examined resources of terrorism and factors affecting it. The study also pointed out the societal policies confronting terrorism such as : economic ,security, educational, and social policy . | The study adopt in its methodological framework some research methods such as historical methods, and social survey methodology . | In order to describes and analyzes the data of study and the results concerning the terrorism phenomenon .in addition to examining its sources ,ways confronting it .and its effects on the society . | The sample of the study consists of 400 researchers of individuals both formal and non-formal in Sllahaldeen governorate . | This study comes up with these findings : | 1. %44.2 of the individuals have make sure that presenting the necessary services will take part in confronting terrorism. | 2. %45.8 of the individuals think that activating laws will take part in regaining security and minimizing terrorism. | The recommendations and suggestions of the study are : | 1.The state is the direct side putting forward the societal policies it should be aware of this responsibility through its different devices for confronting radicalisms and terrorism and minimizing the effects on both individuals and society . | 2. there is an essential need for making changes aiming at improving the public condition in the society and curing its problems by putting forward plan and coordinating for curing the focuses and sources of terrorism like deprivation employment and absence of education chances. |

الجريمة في ظل التغيرات الاجتماعية والسياسية : دراسة اجتماعية تحليلية Crime Under the Political and Social Changes An Analytic Social Study

اسم المؤلف: عماد اسماعيل جميل الرواس
اسم المشرف: عبد اللطيف عبد الحميد العاني
الموضوع العام: علم الاجتماع
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علم الاجتماع
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ان المجتمع العراقي مر بظروف بالغة الصعوبة في العقدين الاخيرين من القرن العشرين، والعقد الاول من القرن الحادي والعشرين، اذ مر بحروب وحصار دولي كلفته خسائر مادية ومعنوية فادحة. | ففي اذار من عام 2003 تعرض المجتمع العراقي الى حرب استمرت تسعة عشر يوما، دخلت بعدها القوات الامريكية والقوات المتحالفة معها العاصمة بغداد لتعلن سيطرتها على البلد، فاضحى العراق صبيحة 9/4/2003، بلدا محتلا، واصدر مجلس الامن الدولي قرارا ذي الرقم (1453) يقر بان الولايات المتحدة الامريكية سلطة احتلال. | ان الاحتلال الامريكي للعراق ، وانهيار السلطة السياسية او سلطة الدولة فيه كان حدثا كبيرا في المجتمع العراقي، لان بانهيار السلطة السياسية انحلت معظم المؤسسات والنظم الاجتماعية والاقتصادية والامنية والقانونية ، مما احدث شرخا كبيرا في البنية التنظيمية لهذا المجتمع، اذ ضعفت القواعد والاسس والمعايير والضوابط التي كانت قائمة عليها البنى التنظيمية في هذا المجتمع وخاصة الرسمية منها ، مما فتح الباب على مصراعيه لكل من هب ودب من المنحرفين والمجرمين ليفعلوا افعالهم ويشبعوا حاجاتهم ورغائبهم البهيمة التي سيطرت على نفوسهم المريضة فحدثت عمليات سلب ونهب وتخريب لدوائر الدولة ومؤسساتها وممتلكاتها . | فضلا عن ذلك قامت سلطة الاحتلال او سلطة الائتلاف المؤقتة بالتشاور مع الاحزاب والكتل السياسية التي اصبحت في الساحة السياسية لبناء العملية السياسية على اساس مبدا الديمقراطية التوافقية (على اساس الدين والطائفة والعرق)، فانعكست سلبا على العملية السياسية نفسها وعلى بقية جوانب الحياة في المجتمع، فضلا عن ذلك تشكيل جيش وجهاز شرطة جديدين ولكن على اسس غير موضوعية. | فقد كان للاحتلال وتداعياته والتغيرات الناجمة عنه اثرا كبيرا في تزايد نسب الجرائم المرتكبة في هذا البلد وبكل صورها وانواعها بشكل لم يالفه المجتمع العراقي في فترة ما قبل الاحتلال وحتى في تاريخه الحديث، ففضلا عن عمليات السلب والنهب والتخريب التي حدثت في الايام الاولى للاحتلال، انتشرت وبرزت فيما بعد جرائم العنف والقتل والتهريب والفساد الاداري والمالي ، كما تفشت في المجتمع العراقي جرائم الخطف والترويع، وجرائم التزوير، ناهيك عن انتشار ظاهرة المخدرات سواء كان في تعاطيها ام في الاتجار بها وتهريبها، علاوة على ذلك فانه ظهرت في المجتمع العراقي جرائم لم تكن معهودة مثل جريمة القتل على الهوية ( الطائفية والعرقية) ، وكذلك جريمة الاعتداء على دور العبادة والتهجير القسري. | فارث الفترة السابقة من حروب وحصار ثم الحرب الاخيرة التي انتهت بانهيار سلطة الدولة ثم احتلال العراق وما تبعه من تغيرات سياسية وبناء العملية السياسية في العراق بطبيعتها والاسس التي قامت عليها، والتغيرات الاجتماعية التي تبعتها كل هذه اسهمت بشكل او باخر في احداث تغيرات كمية ونوعية للجرائم في المجتمع العراقي. | لذا جاءت دراستنا هذه للاجابة على الاسئلة الاتية : | • ما ابرز التغيرات الاجتماعية والسياسية التي حصلت في المجتمع العراقي منذ عام 2003؟ | • ما الاثار السلبية التي تركتها هذه التغيرات في المجتمع العراقي وافراده. | • ما الجرائم التي برزت وكذلك التي ظهرت في ظل هذه التغيرات؟ | ولهذا فان دراستنا تكتسب اهميتها من انها محاولة علمية للتعرف على التغييرات الاجتماعية والسياسية التي حصلت في المجتمع العراقي منذ عام 2003، والكشف عن كمية الجرائم المرتكبة في المجتمع العراقي وانواعها بسبب هذه التغييرات الاجتماعية والسياسية في المجتمع العراقي. | وتعد دراستنا هذه من الدراسات الوصفية التحليلية التي تستلزم استخدام اكثر من منهج للحصول على البيانات والمعلومات المطلوبة لانجازها، لذلك فقد استخدم الباحث في هذه الدراسة منهج الوصفي التحليلي، والمنهج المقارن، والمنهج التاريخي واستخدمنا مجموعة من الدراسات السابقة، بوصفها اطارا مرجعيا لدراستنا، فضلا عن الاعتماد على مجموعة من النظريات الاجتماعية في تفسير مشكلة الدراسة. | فقد تناولت دراستنا ايضا الجريمة في ظل التغيرات الاجتماعية والسياسية في المجتمع العراقي بالاعتماد على الاحصائيات المتوفرة ... التي اوصلتنا الى ما ياتي : | 1. بعد دخول قوات الاحتلال الامريكي للعاصمة بغداد وانهيار سلطة الدولة في 9/4/2003، حدثت عمليات سلب ونهب وتخريب لدوائر الدولة وممتلكاتها والتي احدثت اضرار مادية ومعنوية جسيمة للمجتمع وافراده. | 2. قامت سلطة الاحتلال ( سلطة الائتلاف المؤقتة) بقيادة ( بول بريمر) وبالتشاور مع القوى والاحزاب السياسية التي ظهرت في الساحة السياسية العراقية ومن اجل سد الفراغ السياسي والامني في العراق ببناء العملية السياسية على مبدا الديمقراطية التوافقية وعلى اساس التمثيل النسبي على اساس الدين والطائف والعرق ومنذ ذلك الحين ولحد الان وحتى بعد انتخاب البرلمان والحكومات اصبحت المحاصصة افة وعقدة في العملية السياسية في العراق ، وامتدت الى جميع مفاصل الدولة العراقية وانعكست على بقية جوانب الحياة في المجتمع، وكذلك تم بناء القوات الامنية ، مما ادى الى استمرار ضعف الوضع الامني . | 3. تم اقرار دستور دائم للعراق بعد ان استفتى عليه الشعب، وبدوره اقر دستور النظام الجمهوري البرلماني بدلا من النظام الجمهوري الرئاسي. | 4. اخذت الساحة السياسية العراقية تعج بمختلف الاحزاب السياسية منها الاحزاب الدينية ومنها الاحزاب القومية ومنها الاحزاب الوطنية فضلا عن احزاب الاقليات. | 5. اتصف التغير السياسي الذي حدث في المجتمع العراقي بعد 9/4/2003، بانه تغيير شامل وسريع وغير مخطط، افرز قوى وتحالفات سياسية عكست حقائق عديدة على الارض لعل ابرزها انزواء فكرة الدولة وما يرتبط بها من افكار ومبادئ كالوحدة الوطنية، والهوية الوطنية، والمواطنة، والعقلانية، والبناء وحلت محلها الهويات الصغرى وكل ما يرتبط بها من مصالح مذهبية وعرقية ومفاهيم الغلبة والمحاصصة والتهميش والتطرف ونزاعات التدمير، مع تنامي الصراع من اجل السلطة والثروة. | 6. تبعت هذه التغيرات السياسية ، تغيرات اجتماعية كبيرة ومفاجئة وسريعة وغير مخططة ، فحدثت تغيرات في المؤسسات الاجتماعية، اذ حدث ضعف في مؤسسات الضبط الرسمية وغير الرسمية، وحدث خلل في الاسرة وازدادت حالات الطلاق ، واصبح للمؤسسة الدينية دور كبير في المجتمع العراقي وفي جميع نواحي الحياة و ظهر بالمقابل نوع من التطرف الديني الذي ادى الى الفتنة الطائفية ، كما شهد المجتمع العراقي دخول سريع وكبير لوسائل الاعلام والاتصال الحديثة ، كما وحدث تغير في منظومة القيم والاعراف والعادات، وحدث نوع من ضعف المعايير ، وكذلك تاثرت العلاقات الاجتماعية سلبا بما حدث ، فكان من الاثار السلبية لكل ما حدث هو تفاقم مشكلة الجريمة كما ونوعا. | 7. ان الاحتلال والتغيرات السياسية والاجتماعية الناجمة عنه بعد 9/4/2003، احدثت تغيرا كميا ونوعيا في الجرائم المرتكبة في المجتمع العراقي، اذ وصلت جرائم قتل العمد و الفساد الاداري والمالي و الخطف، و التهريب وكذلك التزوير فضلا عن تعاطي المخدرات نسبا كبيرة جدا لم يشهدها المجتمع العراقي من قبل. | اما من ناحية النوع فانه ظهرت جرائم لم تكن معهودة في المجتمع العراقي من قبل كالقتل على الهوية الطائفية والعرقية حيث كانت نسبة كبيرة من جرائم القتل بسبب هذا الدافع، كما شهد العراق جريمة جديدة وهي جريمة الاعتداء على دور العبادة لجميع الاطياف والاديان وبشكل كبير، كما ظهرت جريمة جديدة الا وهي جريمة التهجير القسري ايضا اما بدافع ديني او مذهبي طائفي او عرقي فشهد العراق نزوح وهجرة للملايين من الاشخاص سواء في الداخل او الى الخارج. | | == The Iraqi society has passed through very difficult in the last two decades of the 20th century and in the first decade in this century. It has passed through was, and embargo cost Iraq material damages. In March 2003, the Iraqi society has exposed to war lasted for nineteen day. Since 9th April 2003 Iraq had become an occupied country. Then the Security Council issued a resolution No. (1453) endorsing the US occupation of Iraq. It was a great event in the Iraqi society. It leads to collapsing of the political authorities and the legal, economic, social, and security institutions. This caused a huge scar in the organizing structure of Iraqi society. This event destabilized the society as far as the state itself concerned. It leads to looting and plundering of the state institutions and properties. | Moreover, the occupying authorizes with the current political parties and blocs to build .The political process on the basis of ethnic and section division. This affected negatively on the political process on one hand, it also affected on the other parts of the society on the other hand. In addition to its effect on military, police …. Etc which formed on non-objective bases. | Likewise, the occupation associations caused in increasing the average of the crimes with its forms with percentage especially in pre-occupation period even in the modern history. Similarly , violence crimes, homicide , smuggling , financial corruption has also widespread in the Iraqi society in addition to kidnapping forgery crimes , drug trading and drug addicts .It also lead to committing crimes like ethnic , sectarian violence, subverting the worshipping places and displacing by force . All these events after the occupation, have led to drastic changes in the Iraqi society. | The present study tries to answer the following questions : | *What are the main political and social changed that happened in the Iraqi society since 2003? | * What are the negative associations of these changes in the Iraqi society? | * What are the crimes that appeared that resulted due to these changes This study acquires its significance as it is an attempt to be well acquainted with the social and political the new form of crimes that appeared in the society. This is an analytical, descriptive study that needs utilizing more than one means to get the required data of the study. The researcher has attempted to use the descriptive, comparative, and historical approaches. As a reference for our study, we have relied on some previous studies in addition to a group of social theories to interpret the problem under the study. After reviewing the relation between crime and social and political change. The study has come up with the following conclusions : | 1. After the US led invasion of Iraqi capital Baghdad on 9th April 2003, looting and plundering happened cause great damages for the society and its members. | 2. The coalition provincial authority led Pual Premer along with the political blocs and parties that appeared in the political arena to assume the political cases in Iraq have formed a democracy based on ethnic and sectarian representation. Since then this became a complex in the political process. It also extended to all institutions in the Iraqi government. This is highly reflected on the various aspects in the society. So this division led to build the military forces on nonobjective bases that makes the security situation very poor. | 3. A permanent constitution has been endorsed in Iraq by a referendum by the people of Iraq. In its turn, the constitution endorsed the republican parliamentary regime instead of the republican presidential one. Similarly, it endorses the federal regime. | It stresses the freedom of faith, press, expression …. Etc. In addition to providing the welfare living for all people 4. The Iraqi political arena awash with many religious, national and patriotic parties. | 5. The change that happened in the society is characterized by being comprehensive, fast and unplanned. This excreted blocs and coalitions reflected many thoughts and currents on the ground of which decentralization of the state that relates to national unity, citizenship and nationality …etc . These concepts displaced by sectarian, extremism and ethnocentrism. | 6. These political changes followed by huge social changes described as surprised, fast, and unplanned. These changes caused drastic changes in the social institutions. Likewise, the percentage of divorce rate has increased rapidly. The role of religious clerics has | become greater in various strata in the society. Against this appeared a kind of religious extremism that led to the sectarian violence. The Iraqi society also invaded the modern mean of communication and media means. The customs and tradition also affect a lot. The social relations greatly affected by these changes in the political regime. | One of which is the rate of crime aggravated both quality and quantity. | 7. The invasion and the political and social changes after 9th April 2003, have cause significant change in the rate of crime both quality and quantity in the Iraqi society. The rate of homicide, embezzlement, kidnapping, smuggling, falsification, drug addicting | has increased rapidly unprecedentedly in the Iraqi society. | Finally, quantity speaking it is worth noticing that new crimes appeared after 2003 changes unprecedentedly in the Iraqi society like sectarian acts of violence and ethnic motive crimes. Furthermore, new crimes appeared such as subverting worshipping places and | buildings of all sects and religious. Similarly, compulsive expatriation of people due to their religious, nationality…etc. is a new crime that resulted in exposing millions of people to be internally displaced whether inside Iraq or aboard

الحجاج لدى شعراء المهجر الشمالي الـرابـطـة الـقـلـمـيـة Argumentation among the Northern Diaspora Pencil Assoiation

اسم المؤلف: مـحـمـد صالـح ارخـيـص
اسم المشرف: تـغـريـد ضـياء مـشـفـي
الموضوع العام: اللغة العربية وادابها
السنة: 2018
الموضوع الدقيق: اللغة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

النعمة والانعام في الفكر الاسلامي واثرهما في السلوك الانساني

اسم المؤلف: عمر احمد ابراهيم
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الشريعة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

الاخبار عن المستقبل في الحديث النبوي الشريف ضمن الكتب الستة : دراسة تحليلية

اسم المؤلف: شهيد كريم فليح
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: اصول الدين
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

كتاب الطهارة * كتاب الصلاة (مجمع الفوائد لجم العائد) للامام محمد بن ابي بكر بن عبد القادرالرازي (ت بعد 666هـ)

اسم المؤلف: عادل فاضل عبد الطائي
اسم المشرف: عبد الستار حامد الدباغ
الموضوع العام: العلوم الاسلامية
السنة: 2006
الموضوع الدقيق: الشريعة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

المستوى المصلي وتعدد الشكل الوراثي لل IL - 10 ، IL - 2 ، IFN - في عينة للاطفال العراقيين المخمجين بالليشمانيا الاحشائية Serum level and gene polymorphism of IFN - ?, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 in a sample of Iraqi children with Visceral Leishmaniasis

اسم المؤلف: زهراء عبد الرحیم احمد عبد لله
اسم المشرف: اخلاص مشرف عیدان علي حسین ادحیة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Visceral leishmaniasis (VL) is a severe chronic systemic zoonotic disease caused by the protozoan Leishmania donovani or L. infantum, in which cytokines play an important role in its pathogenesis. These cytokines are under genetic controls, and their gene polymorphisms have been suggested to exert a functional role in regulating cytokine gene expression. Therefore, the present study determined IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels and gene polymorphisms of 11 cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, TNF, IFNG and TGFB1) in VL patients by ELISA assay and sequence specific primer - PCR method. Gene polymorphism impact on IFN - γ, IL - 2, IL - 10 and IL - 12 serum levels was also evaluated.Forty - four Iraqi Arabs VL patients (age range : 4 months to 12 years) were enrolled in the study. They were referred to hospitals in two Iraqi governorates (Baghdad and Wasit) during the period March 2013 - February 2014. A control sample of 40 apparently healthy individuals was also included and matched patients for age and ethnicity.Most of the ascertained VL cases were in winter and spring with frequencies of 43.2 and 50.3%, respectively. The results also revealed that the age group 1 - 3 years accounted for more than 50% of cases (54.5%) and the infection was more prevalent in male (65.9%) than females (34.1%).A significant increased serum level of IL - 2 (14.72 ± 1.14 vs.4.43 ± 0.49 pg/ml), IL - 10 (40.02 ± 1.26 vs.18.60 ± 1.82 pg/ml), IFN - γ (29.06 ± 1.05 vs. 12.83 ± 1.38 pg/ml) was recorded in VL patients compared to controls. While, IL - 12 serum level showed a non - significant increased level in patients (5.33 ± 3.26 vs.2.17 ± 0.36 pg/ml). Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1B - 511, IL4R+1902, IL12B - 1188, IFNG+874, TGFB1+896, TNF - 308, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6nt565/ - 597, IL6 - 174, IL10 - 1082, IL10 - 819 and IL10 - 592 genes showed a significant variation between VL patients and controls. In contrast, a positive association between IL - 1β+3962 CC genotype an C allele and IL4 - 1098 G allele and VL was observed (susceptible genotypes and alleles), while a negative association (protective genotypes and alleles) was recorded for IL1A - 889 TT genotype, IL1B+3962 T allele and IL4 - 1098 TT genotype and T allele. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, VL patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that TG genotype of IL2 - 330 was observed with the highest IL - 2 level (16.56 ± 1.69 pg/ml) compared to other genotypes. The GT genotype of IL2+166 also showed the highest level of IL - 2 (17.47 ± 2.34 pg/ml) compared to GG (13.53 ± 1.38pg/ml) or TT (15.77 ± 3.88 pg/ml) genotypes in patients. The IL10 - 1082 GG genotype showed the highest level of IL - 10 in patients (45.73 ±3.15 pg/ml) compared to AA (38.02 ± 1.48 pg/ml) genotype. For IL10 - 819 genotypes, they recorded approximated means in patients and no significant difference between them was observed. At the third position of IL10 gene (IL10 - 592), neither patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IL - 10 in their genotypes. At IL12 - 1188, CC genotype showed a significant increase level of IL - 12 (26.16 ±19.76 pg/ml) compared to CA and AA genotype(1.35 ± 0.35 pg/ml and 1.48 ± 0.23 pg/ml respectively) in patients. Finally, neither VL patients nor controls demonstrated a significant difference between the means of IFN - γ in the genotypes of IFNG+874. In conclusion, the role of cytokines in pathogenesis of VL wasascertained, but such role can be better understood in the ground of cytokine gene polymorphisms, which may also have susceptibility or protective effects.

توصيف جزيئي للخلايا الجذعية المتحفزة لتكوين خلايا عصبية Molecular Characterization of Stem Cells that Induce Neurogenesis

اسم المؤلف: مائده حسين محمد
اسم المشرف: ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The in vitro isolation, identification, differentiation, and neurogenesis characterization (with molecular studies by conventional and real time - PCR) of stem cells source were investigated to produce two type of stem cells. This two types including neural cells and neural stem cells in culture which use it as a successful sources for further treatments. And finally chosen the best medium formula for maintenance the produced neural stem cells, also to prove their stemness state in culture. The mouse bone marrow mesenchymal stem cells was used as the source of stem cells in this study. Two type of neural differentiation formula was used to induced neural cells and then neural stem cells. The first formula was butylated hydroxyanisole, and the second formula was β - mercaptoethanol reagents. Also three type of different neural stages markers were used; nestin as immaturation stage marker, neurofilament light - chain as early neural marker, and microtubule association protein as maturation marker. These markers were represented the different neurogenesis stages started from mesenchymal stem cells (as undifferentiated cells), neural stem cells production stages, and towards neuron cells (as differentiated cells).The results of immunocytochemistry and real time - PCR of butylated hydroxyanisole differentiation method showed that in contrast to mesenchymal stem cells (as control group), neural differentiated cells showed neural progenitor pattern, by showing stable increased in nestin gene expression significantly through differentiation process for different exposure time, with increased of protein expression significantly compared with control. While, neurofilament light - chain gene and protein expression started to increase significantly, but not - IIreplacedthe nestin expression completely even when its expression passed nestin levels compared with control group. In contrast to the maturation marker microtubule association protein which showed a very low expression during the duration of differentiation period in protein and gene expression (with significant effect) compared with control. This results proved that the cells were still progenitors and do not passed the maturation stage, therefore there was a difficult to define the exactly time of neural stem cells production stage from this formula and as a good formula to produce neuron cells in culture. In other side, the results of immunocytochemistry and real time - PCR of β - mercaptoethanol (as another differentiation formula) were showed that this formula was successful to produce both neural stem cells as well as neuron cells from this formula. This occur through increasing and over expressing of nestin protein and gene significantly within the early hours exposure time reaching to the highest expression levels. Compared with decreased and lower expressed in neurofilament light - chain protein and gene expression levels compared with control; therefore from this stage (exposure time) we can produce neural stem cells in culture. And then decreased and lower expressed of both protein and gene expression of nestin significantly compared with increasing the expression of neurofilament light - chain protein and gene levels throw the late exposure times compared with control, this results indicated that this stage was starting of maturation stage toward neuron cells. Also the proving of this results was lower expression levels of almost all exposure times of microtubule association protein for their protein and gene (with significant effect).The results of gene expression analysis of using four different media formulas to proved the stemness state and maintained the neural stem cells in culture showed that 6 h exposure to β - mercaptoethanol was enough to create - IIIneuralstem cells which maintained using MEM media with 5% FBS, with b - FGF, or with b - FGF &EGF. This study confirms that the molecular characterization study of stem cells in culture will assist to studying and clarifying the neurogenesis pathway through neural differentiation process, by clarified the mechanisms of neural genes through the in vitro differentiation of stem cells, and therefore ability to produced both neuron cells and neural stem cells by using the molecular studies.

امكانية تحفيز بعض الطحالب المعزولة محليا لانتاج الوقود الحيوي Possibility of stimulation of some locally isolated algae for production of biofeul

اسم المؤلف: ثائر محمد ابراهيم العكيلي
اسم المشرف: ابراهيم مهدي عزوز السلمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات - الاحياء المائية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: In the current study, samples of algae have been collecting from( Springs , Streams and Rivulets)including in northern of Iraq (the area on the Iraqi - Iranian and Turkish borders, and from the middle in the areas of (Tarmiya and Alabegi) several races of used algae in biofuels such as : Scendesmus spp , S . quadricouda , S . Dimorphus,Chroococcus sp. ,Chlorococcum humicola , Microcystsp. , Asterococcus sp. ,Chlorella sp , Oscillotoriasp. , Anabena sp , Nostoc. sp. , Ankistrodesmus falcatus.diagnosed , were isolated and prepared pure cultures of Asterococcus sp. , S dimorphus, C.humicola and were selected three culture medium (BG11, Chu13, Chu10)for culturing and development of these algae under controlling conditions (2 ± 25 ° C, intensity of illumination 3000 Lux and 8 : 16 light : darkness system).Experiments include three axes, the first representing the study of the influence of media - type and installed in curves and growth rates (K) and doubling time(G) and estimate the biomass of the tested algae, in addition to monitoring the effectiveness of the quality of the medium in the chemical content of algae and of (total of lipids, proteins, carbohydrates content and fatty acids). A second include the treatment are (remove nitrogen from the media, addition NaCl with 2 g.l - 1, addition of vitamins mixture (B1, B6, B12) in the following concentrations (0. 1, 0.1, 0. 01) mg .l - 1, respectively and change the current speed (as a mixing factor) of 400 and 850 l. h - 1). Third axis include the efficiency of the Photobioreactor system test (Tubular Photobioreactor named( I.TH.1) designed by a researchers for the purpose of comparison between culturing in bottles and the possibility of the application of expandingproduction in the reactor system of 120 liters, for testing C. humicola in Chu13media.The results showed that the highest growth rate recorded in BG11 for Asterococcus sp, was 0.343 cells . day - 1 depending on the absorbance values at of 650 nm wavelength, while the highest rate depending on the number of cells scored in Chu13 after the addition of vitamins mixture for C.humicola was 1.16 cells .day - 1, while the lowest growth rate(K) scored in Asterococcus sp, In Chu10 after the removal of nitrogen and reached 0.04 cells . day - 1, as less doubled time(G) scored when Chu13 after the addition of NaCl to Asterococcus sp, and reached 1.12 day depending on the absorbance values, while less doubling time(G) was relying on the number of cells in C.humicola in Chu13 after the addition of vitamins and amounted to 0.257day.The highest doubled time(G)13.7 and 15.05 day was scored in BG11 after removing N2 form culture medium of Asterococcus sp, depending on the absorbance values and the number of cells respectively. The highest biomass value recorded at Asterococcus sp with current speed 400 l.h - 1 and amounted to 0.724 mg .g - 1 dry weight,while the less biomass0.203 mg.g - 1 dry weight at the same algal after the addition of NaCl to Chu10 .The highest value of total lipids recorded at removing nitrogen from the Chu13 inS.dimorphus amounted 320.8 mg . g - 1 (dry weight) while it was less than at the C.humicola in control. As Chu10 recorded the highest percentage of total lipids was registered at S.dimorphus in BG11 after removing nitrogen and stood at 81.48%. The lowest percentage was registered with C.humicola in Chu10 amounted to 32.49%.The highest amount of total proteins , when Asterococcus sp developed at current speed of 400 l . h - 1 in Chu13 amounted to 299.7 mg . g - 1 (dry weight), while the least value was registered at S.dimorphus amounted to 8.9 mg . g - 1 in BG11 - free of nitrogen. While recorded the highest percentage of total proteins when Asterococcus sp, after the addition of NaCl to BG11media and amounted to 51.17%, while the lowest percentage was registered to the same alga after removing nitrogen from the BG11 and amounted to 5.7%.Results prepared that the highest amount of total carbohydrates, was recorded in the S.dimorphus when the velocity of 400 l . h - 1 and amounted to 63.09 mg . g - 1 (dry weight), and the least amount was registered in Asterococcus sp in Chu10 after the addition of vitamins. While the highest percentage recorded for carbohydrates in S.dimorphus in control BG11 reached 41.67%,and the lowest percentage was in Asterococcus sp at Chu10 after the addition of a mixture of vitamins and stood at 4.65% .When the follow - up impact of the transactions used in the experiments in quality and quantity of fatty acid (Luric, Palmetic, Stearic, Lionoleic, α - liolenic, Oleic, Archidic, DHA), we find that the the final concentrations have varied significantly, recorded acids Luric, Palmetic, Stearic higher concentrations when Asterococcus sp. In Chu13 after the addition of NaCl first and, second and was 46.7, 381.27 mg . l - 1, respectively, while the acid Stearic amounted to 117.0 mg . l - 1 after removing nitrogen from BG11. While α - linoleic, Linoleic asid recorded the highest amount it reached 188.3, 22.7mg.l - 1 when Chu10 after the addition of vitamins and at the speed of 400 l . h - 1, respectively, for Asterococcus sp, As Oleic, Archidic, DHA acids recorded the highest amount in C.humicola amounted to 125.08, 131.8,175.65 mg .l - 1 , at the current speed of 400 l . h - 1 in the first and second acides, when BG11 after removing nitrogen, DHA acid,as in terms of percentages acids, we find that the current study showed the highest percentage of Linoleic, Luric amounted to 39.69, 84.9% at the control Chu10 and Chu13 after treatment with vitamins respectively in Asterococcus sp.While DHA Oleic, α - linoleic, Stearic acids recorded highest percentage reached to 43.39, 44.25, 46.71, 46.85%, respectively, in S.dimorphus in BG11control , after treatment with vitamins to Chu10and after the addition NaCl toBG11respectively . As Archidic, Palmetic acids recorded the highest percentage in C.humicola amounted to 28.42, 62.6%, respectively, in BG11control and the speed 850 l . h - 1.the highest amount of saturated fatty acids S.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 951.7 mg . l - 1 after the addition NaCl to Chu13 .The highest percentage was registered at the same alga 92.5% in Chu13control. Current studie also recorded the highest amount of unsaturated fatty acid U.F.A recorded in Asterococcus sp. and it amounted to 488.2 mg .l - 1 when adding vitamins to Chu10, while the highest percentage recorded in S.dimorphus amounted to 91.79% when adding NaCl to BG11.I n applying the experience of the test reactor, the photobioreactor of 120 liters and choosing alga C.humicola inChu13 and 400 l .h - 1, we find that the system I.TH.1 has given the results and the differences were not significant in terms of impact on growth rates and the doubling time of replication when compared with the first and second controls(Chu13 represent first control sized 150 ml and the process to shake once a day and the second control mixing factor 400 l . h - 1 in 3 - liter size). In terms of the impact of I.TH.1 on the biomass it has increased significantly when the first control while non - significant differences were recorded for the second control at the level of probability (P≤ 0.05) either when the effect in the chemical content of the total of studied alga, we find it recorded 199.6, 200.5, 198.2 mg . g - 1 of total lipids and 218.5, 214.3, 185.9 mg . g - 1 of total proteins and 147.7, 165.1, 143.2 mg . g - 1 of total carbohydrates in the first , second control, I.TH.1respectively. These results show no significant differences between the results of I.TH.1 and education in bottles laboratory. either at the level of the quantity and quality of fatty acids, we find that there is variation in the results as recorded all the fatty acid was significantly higher for the first control except Luric acid which disappeared from the second control and I.TH.1 , while there was a significant decrease in α - Liolenic, Olice, Archidic acids. While I.TH.I recorded an increase in Palmetic, Linolic, DHA acids compared with the second control, with the advent of acidic Myrestic and Stiric in the system and the disappearance in two controls, That shows the importance of the use of these bioreactors in the biofuel production studys.

تعدد الاشكال للنيوكليوتيدة المفردة لبعض الحركيات الخلوية في مرض المعي الالتهابي لدى مرضى عراقيين Single Nucleotide Polymorphisms of some Cytokines in Inflammatory Bowel Disease of Iraqi Patients

اسم المؤلف: ابتسام بداي حسان الكناني
اسم المشرف: بتول علي شهاب علي حسين ادحية
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان - الوراثة
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Inflammatory bowel disease (IBD) is a world healthcare problem that involves two major forms : Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Immunogenetic predisposition is one of the risk factors for the disease, and cytokines are among these factors. Therefore, the association between 13 SNPs (single nucleotide polymorphisms) of cytokine and cytokine receptor genes (IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IFNG, TNF and TGFB1) and IBD was determined in samples of Iraqi Arab patients (34 CD and 66 UC). The patients were referred to the Gastrointestinal Tract Unit at Al - Kindy Teaching Hospital, Al - Yarmouk Teaching Hospital and Al - Zuafrania General Hospital in Baghdad for diagnosis and treatment during the period August 2013 - October 2014. A control sample of 43 individuals was also included.The following results were reached by the study : 1. Interleukin - 1 alpha gene (IL1A - 889) : frequencies of CC genotype and C allele were significantly increased in CD (58.8 and 73.5%, respectively) and UC (54.6 and 71.2%, respectively) patients compared to controls (25.5 and 40.7%, respectively). In contrast, TT genotype and T allele frequencies were significantly decreased in CD (11.8 and 26.5%, respectively) and UC (12.1 and 28.8%, respectively) patients compared to controls (44.2 and 59.3%, respectively).2. Interleukin - 1 beta gene (IL1B - 511) : Frequency of TC genotype was significantly increased in UC patients compared to controls (63.6 vs. 39.5%; P = 0.018), while CC genotype frequency was decreased (6.1 vs. 32.2%; P = 0.061). No variation was observed in CD patients.3. Interleukin 1 receptor type 1 gene (IL1R1pstl 1970) : Frequencies of TT genotype and T allele (47.1 and 67.7%, respectively) were significantly increased (P = 0.026 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients compared to controls (20.9 and 34.97%, respectively). In contrast, CC genotype (11.8 vs. 51.2%) and allele C (32.4 vs. 65.1%) frequencies were significantly decreased (P = 2.8*10 - 4 and 8.6*10 - 5, respectively) in CD patients. For UC, the patients demonstratedgnificant increased frequencies of TC genotype (48.5 vs. 27.9%; P = 0.045) and T allele (63.6 vs. 34.9%; P = 5.1*10 - 5) compared to controls. As in CD, UC patients also demonstrated significant decreased frequencies of CC genotype (12.1 vs. 51.2%; P = 1.7*10 - 5) and C allele (36.4 vs. 65.1%; P = 8.6*10 - 5).4. Interleukin 2 gene (IL2+166) : Among CD patients, frequencies of TT genotype (41.2 vs. 6.9%) and T allele (64.7 vs. 43.0%) were significantly increased in patients compared to controls (P = 0.001 and 0.009, respectively). In contrast, TG genotype (47.1 vs. 72.1%; P = 0.035) and G allele (35.3 vs. 56.9%; P = 0.009) frequencies were significantly decreased. Almost, similar observations were made in UC patients.5. Interleukin 4 gene (IL4 - 590) : it was observed that frequencies of TT genotype (52.9 vs. 11.6%; P = 1.2*10 - 4) and T allele (70.6 vs. 24.4%; P = 1.6*10 - 8) were significantly increased in CD patients compared to controls. In contrast, CC genotype (11.8 vs. 62.8%, P = 5.6*10 - 6) and C allele (29.4 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased. In the case of UC, frequencies of TC genotype (69.7 vs. 25.6%; P = 1.1*10 - 5) and T allele (62.1 vs. 24.4%; P = 4.6*10 - 8) were significantly increased in patients, while CC genotype (3.0 vs. 62.8%; P = 2.5*10 - 12) and C allele (37.9 vs. 75.6%; P = 1.6*10 - 8) frequencies were significantly decreased in patients.6. Interleukin 4 receptor gene (IL4R+1902) : frequencies of GG genotype (47.1 vs.11.6%) and G allele (55.9 vs. 37.2%) were significantly increased in CD patients compared to controls (P = 0.001 and 0.023, respectively). In contrast, GA genotype (17.7 vs. 51.1%; P = 0.004) and A allele (44.1 vs. 62.8%; P = 0.023) frequencies were significantly decreased. In UC patients, frequencies of GG genotype (57.6 vs. 11.6%) and G allele (75.8 vs. 37.2%) were significantly increased (P = 1.0*10 - 6 and 1.9*10 - 8, respectively); while frequencies of AA genotype (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5) and A allele (24.2 vs. 62.8%; P = 1.9*10 - 8) were significantly decreased.7. Interleukin 6 gene (IL6+565) : Comparing patients to controls revealed that GG genotype frequency was significantly increased in CD (70.6 vs. 13.9%; P = 1.5*10 - 8) and UC (69.7 vs. 13.9%; P = 4.4*10 - 7) patients, and a similar increased frequency of G allele was observed. In contrast, the GC genotype frequency was significantly decreased in CD (23.5 vs. 76.7%; P = 3.7*10 - 6) and UC (24.2 vs. 76.7%; P = 7.0*10 - 6) patients.8. Interleukin 12B gene (IL12B - 1188) : Frequency of A allele was significantly increased in CD patients compared to controls (67.7 vs. 47.7%; P = 0.015), while C allele was significantly decreased (32.4 vs. 52.3%; P = 0.015). For UC, the heterozygous genotype AC showed a significant increased frequency in patients compared to controls (66.7 vs. 30.2%; P = 3.6*10 - 4), while CC genotype frequency was significantly decreased (6.1 vs. 37.2%; P = 7.0*10 - 5). 9. Interferon gamma gene (IFNG+874) : The AT genotype showed a significant increased frequency in CD patients compared to controls (58.8 vs. 30.2; P = 0.020), while TT genotype frequency was significantly decreased (11.8 vs.39.5%; P = 0.009). For UC, AA genotype (54.6 vs. 30.2%; P = 0.018) and A allele (74.2 vs. 45.4; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly increased in patients. In contrast, TT genotype (6.1 vs. 39.5%; P = 2.8*10 - 5) and T allele (25.8 vs. 54.7%; P = 2.7*10 - 5) frequencies were significantly decreased. 10. Tumor necrosis factor alpha gene (TNF - 308) : Comparing CD patients to controls revealed no significant variation, while UC patients demonstrated a significantly (P = 0.006) increased frequency of G allele (71.2 vs. 52.3%) and a decreased frequency of A allele (28.8 vs. 47.7%). 11. Interleukin 1 receptor antagonist (IL1RNmaspl 11100), interleukin 10 gene (IL10 - 1082) and Transforming growth factor beta (TGFB1codon 25) genes : Comparing patients to controls revealed no significant variations in genotype or allele frequencies.The presented results of the 13 cytokine SNPs in CD and UC patients are the first report in Iraqi patients, and their findings highlighted the role of these SNPs in etiopathogenesis of both groups of IBD, and paved the way for further investigations to determine the role cytokine gene polymorphisms in susceptibility to IBD or their protective effects.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا صباح جواد
اسم المشرف: عبد الامير ناصر غلوب ناهي يوسف ياسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

اسم المؤلف: وســـد لطيف علوان
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري سامرة يونس يوسف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

اسم المؤلف: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
اسم المشرف: ناهي يوسف ياسين هناء حنين منكلو
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

اسم المؤلف: هونر عثمان اسماعيل
اسم المشرف: عدنان صالح الجنابي رعد خليل الحسيني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

اسم المؤلف: زينة نبيل نصيف العزاوي
اسم المشرف: صباح فرج عبد الاحد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان - اللافقريات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

اسم المؤلف: هناء كريم مايخان محمد
اسم المشرف: خالد عبد الرزاق حبيب شوان كمال رشید
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

اسم المؤلف: هديل مكي حبيب المؤمن
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش محمد عبد الهادي غالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

اسم المؤلف: هبة شاكر احمد
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين علي حسين ادحيه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: هادي حسين عباس القريشي
اسم المشرف: انتصار ناظم خلخال زهير نعمان حمد العاني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

اسم المؤلف: نهاد خلاوي تكتوك
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي سوزان سعدي حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

اسم المؤلف: ميس عماد احمد
اسم المشرف: منى تركي موسى الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

اسم المؤلف: نشميل علي حسن الهواسي
اسم المشرف: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

دراسة بكتريولوجية وراثية وبائية عــــــن بعض عصيات القولون المسببة للاسهال في الاطفال في بعض مستشفيات عدن Bacteriological,Gentetic and Epidemiological Study of Some Diarrheal Causing Coliform Bacilli Isolated from Children in Some Hospitals of Aden

اسم المؤلف: محمـد فضـل سالم الميسـري
اسم المشرف: حسين حسن عمر خانقاه رياض عبد الحسين دلول
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2002
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت (375) عينة براز غير مكررة من اطفال مصابين بالاسهال اعمارهم من ثلاث سنوات او اقل من ثلاث مستشفيات الرازي العام ، الوحدة للاطفال والمجمع الصحي في محافظة عدن - اليمن. 2. امكن الحصول على (111) عزلة (63%) من بكتريا E.coli موزعة (34) عزلة من مستشفى الرازي و(33) عزلة من مستشفى الوحدة و(44) عزلة من المجمع الصحي. 3. اظهرت الفحوصات المصلية نتيجة موجبة لـ (44) عزلة كانت موزعة (15، 13 و16) عزلة لكل من مستشفى الرازي ، الوحدة والمجمع الصحي على التوالي. 4. اعطت (37) نتيجة موجبة لقابلية العزلات للارتباط بصبغة احمر الكونغو. 5. تم استخدام (12) مضادا لفحص حساسية العزلات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد Co - trimexazole (64%) واقل مقاومة اظهرتها العزلات لمضادي Pefloxacin & ofloxacin (6.3%) اما بالنسبة لمضاد الاميكاسين فقد اظهرت العزلات جميعها حساسيتها لهذا المضاد. 6. حددت التراكيز المثبطة الدنيا لعدد من المضادات اذ اظهرت العزلات اعلى مقاومة لمضاد الامبسلين والذي قاومته العزلات بنسبة (70.6%) بينما اقل مقاومة اظهرتها العزلات كانت لمجموعة الكوينولينات وهما مضادي السبروفلوكساسين والاوفلوكساسين اللذان تراوحت مقاومتها بين(2.9 - 12.1%). 7.انخفضت قيم التراكيز المثبطة الدنيا لمضادات البيتالاكتام بوجود مثبطات البيتالاكتاميز اذ لم تنم العزلات عند معاملتها بتوليفات الببراسيلين ، السفوتاكسيم والسفتيزوكسيم بوجود مثبطات البيتالاكتاميز. 8. استخدمت طريقتا اليود القياسية وطريقة الانابيب الشعرية للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز اذ اعطت (80) عزلة نتيجة موجبة للتحري عن انزيمات البيتالاكتاميز. 9. استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف اذ اعطت (7) عزلات نتيجة موجبة للفحص بنسبة (8.8%). 10. بينت نتائج عزل الدنا البلازميدي احتواء (58) عزلة على حزم بلازميدية ، كما اظهرت نتائج الاقتران البكتيري نجاح (19) عزلة من مجموع (30) عزلة بنسبة (63.3%) وتراوح تردد الاقتران ما بين(1.2 ×3 - 10 - 4.4 × 5 - 10) واعطت العزلات نتيجة موجبة للفحص عند التحري عن انزيمات البيتالاكتاميز باستثناء العزلة (T6) التي كانت في الاساس سالبة لذلك الفحص، واظهرت دراسة ثبات البلازميدات في وظائفها الجديدة ثبات بلازميدات (16) عزلة من اصل (19) عزلة للمقاومة المتعددة لعدد من المضادات الحيوية. 11. اظهرت نتائج النسق التقطيعي باستخدام انزيمي التقييد Eco R1 وHind III اختلاف النسق التقطيعي لبلازميدات العزلات المدروسة. 12. تم تحديد نقطة التعادل الكهربائي للعزلات (R 8، C9، T13و T42) والفعالية الانزيمية وتراوحت قيم pI لها بين (5.4 - 7.5). | 1. A (375) stool samples of children (one per child) were collected from three hospitals, Al - Razi General Hospital, The Union Hospital for Children & Health Centre in Aden City Yemen. 2. A (111) isolates of E. coli were obtained and distributed as follows Al - Razi Hospital (34) , the Union Hospital for Children (33), & the Health Centre in Aden City (44) isolates. 3. The serology tests gave (44) positive results distributed as follows 15, 13, and 16 isolates for Al - Razi Hospital. The Union Hospital , and the Health Centre City, respectively. 4. A (37) isolates showed a positive result with the congo red stain. 5. Antibiotic sensitivity test was carried out using twelve antibiotics results showed that these isolates exhibited higher resistance to co - trimoxazole (64%), less resistance was towards the pefloxacin & ofloxacin (6.3%) while all isolates were sensitive to amikacin. 6. MICs for some antibiotics were determined, the isolates showed a higher resistance for Ampicillin (70.6%) while all the isolates showed low resistance to ciprofloxacin and ofloxcin (2.9 and 12.1%) sespectively. 7. The value of MIC of - lactam antibiotics has been decreased in the presence of - lactamase inhibitors. The results also showed that all the isolates were not able to grow in the presence piperacillin , cefotaxime & ceftizoxime with their inhibitors. 8. The - lactamase production test using iodometric and capillary tube methods showed that (80) out (111) isolates were producers of to this enzyme. 9. Bounded disc method was used to assess the production of wide spectrum - lactamases. Results showed that only (7) isolates were positive to this test (8.8%).10. The results of plasmid content revealed that a total of (58) isolates contained plasmid bands. The result of conjugation showed that out of (30) isolates (19) isolates gave positive results. (63.3%) with a frequency ranged (10 - 3 ×1.2 - 10 - 5 4.4×) of transfering. These isolates gave a positive result when checked - lactamase production except for the isolate no. (T6) which was negative for this test . The study showed that these plasmids were stable in their new hosts and the plasmid stability in (16) out of (19) isolates were confirmed.11.The results of the digestion with restriction endonucleases of some plasmids using ECORI and Hind III showed differences in their restriction profiles, indicating that these plassmids might be of different sources. 12. The isoelectric focusing for some isolates (R8, C9, T13, T42) and enzymatic activity were determined. The pI value was found within the range of (5.4 - 7.5), which indicated.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى داء الاكياس العدرية Study of Immunological Aspects in Patients with Hydatidosis

اسم المؤلف: لمياء علي حسين
اسم المشرف: وحيدة رشيد علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة 102 شخص منهم 52 مريضا مصابا بالاكياس العدرية (43 اناثا وتسعة ذكور) من المراجعين لوحدة الجراحة في مستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الشهيد غازي الحريري ومستشفى بعقوبة التعليمي الذين ثبتت اصابتهم جراحيا بالاكياس العدرية للمدة من الاول من ايلول 2014لغاية الاول من تموز 2015، وتم متابعة هؤلاء المرضى (52 مريضا) بعد ازالة الاكياس العدرية جراحيا، وكان اصغر عمر للاصابة خمس سنوات واكبر عمر 60 سنة, كما شملت الدراسة 50 شخصا من الاصحاء كمجموعة سيطرة منسجمين عمرا وجنسا (40 اناثا و10 ذكور), حيث سجلت لهم بعض الخواص الديموغرافية(الجنس, العمر, والمهنة), واجريت الفحوصات الدمية والبايوكيمياوية والمناعية على عينات الدم الماخوذة من مجاميع الدراسة. اظهرت النتائج ان نسبة حدوث الاصابة بمرض بالاكياس العدرية في الاناث (82.69%) اعلى منها في الذكور (17.31%)، وان النسبة الاكبر للاصابة كانت في الاعمار التي تتراوح بين 16 - 45 سنة مع ظهور فروق معنوية بين الفئات العمرية والجنس، اما عن علاقة المهنة في الاصابة بالمرض فقد وجد ان اعلى نسبة اصابة كانت في ربات البيوت (65.38%). ان نسبة حدوث الاصابة بالكبد (83.05%) اعلى من نسبتها في الاعضاء الاخرى , تليه الكلية (6.78 %)، واصابة الفص الايمن من الكبد (68.85 %) اعلى مما عليه في الفص الايسر(31.15 %), كما ان نسبة تواجد الكيس المتوسط القطر (6 - 10سم) اعلى مما عليه من الاكياس الكبيرة 15 - 11) سم) والصغيرة 5 - 1) سم). كان هناك ارتفاعا معنويا في معدل كل من الخلايا احادية النواة، الخلايا العدلة والخلايا القعدة لدى المرضى قبل الجراحة بالمقارنة بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة للمرضى, ومجموعة السيطرة، ارتفعت معنويا سرعة ترسيب خلايا الدم الحمراء (ESR) Erythrocyte Sedimentation Rate ومعدل بروتين الطور الفعال (CRP) C - Reactive Protein لدى مرضى الاكياس العدرية مقارنة بمعدلاتها لدى المرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. اما عن تاثير الاصابة بالاكياس العدرية في وظائف الكبد فقد وجد ارتفاع معنوي في مستوى انزيمات الكبد (AST) Aspartate Transaminase و(ALP) Alkaline Phosphatase في مصول المرضى قبل الجراحة مقارنة بالمرضى بعد الجراحة ومجموعة السيطرة. وعند التقصي عن دور بعض الحركيات الخلوية Cytokines والحركيات الكيميائية Chemokines وعامل النمو في الاستجابة المناعية ضد طفيلي المشوكة الحبيبية, اظهرت معدلات الحركيات الخلوية (IL - 10) Interleukine - 10, (IL - 6) Interleukin - 6 وكذلك (TNF - α) Tumor Necrosis Factor Alpha, (IL - 12) Interleukine - 12 وعامل النمو(TGF - β - 1) Transforming Growth Factor Beta - 1 والحركيات الكيميائية كلا من ,(IP - 10) Interferon Gamma Induced Protein - 10 (MCP - 1) Monocyte ,Chemotactic Protein - 1 (MIP - 1α) Macrophage Inflammatory Protein - ,1alpha (MIG) Monokine Induced Interferon Gama وجزيئات الالتصاق الداخل خلوية (ICAM - 1) Intera - cellular Adhesion Molecule ارتفاعا معنويا في مصول مرضى الاكياس العدرية قبل الجراحة مقارنة بمستواه بعد 3 - 7 ايام من الجراحة ومجموعة الاصحاء, في حين سجل الحركي الخلوي (IL - 17A) Interleukine - 17A انخفاضا معنويا. اعتمدت عدة تشخيص جديدة بتقنية فحص الادمصاص المناعي المرتبط بالانزيمEnzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) لكشف وتحديد تركيز المستضدات الدائرة (C Ag) Circulating antigens للكيس العدري في مصل مرضى الاكياس العدرية قبل وبعد التداخل الجراحي باستعمال الاضداد الناتجة من تمنيع الارانب بمستضدات السائل العدري Hydatid cyst fluid Antigens (HCF Ag) المعزولة من الاغنام المصابة طبيعيا، وتم تنقية الضد صنف(IgG) Gama Immunoglobuline الناتج من التمنيع من خلال كروماتوغرافيا التبادل الايوني Ion exchange chromatography.اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل تركيز المستضدات الدائرة في المصل قبل التداخل الجراحي (38.7 مايكروغرام /مل) مقارنة بتركيزها بعد التداخل الجراحي (25.7 مايكروغرام/ مل), وبمستوى احتمالية اقل من 0.01، وعليه شخصت الاصابة من خلال تواجد مستضدات الاكياس العدرية في 50 عينة مصل للمرضى من اصل 52 مريضا ونسبة 96.15 % قبل اجراء الجراحة، وتشخيص 48 عينة مصل من اصل 52 مريضا بنسبة 92.30% لمصل المرضى بعد 3 - 7 ايام من اجراء الجراحة, ان الكشف عن مستضدات الكيس العدري له اهمية في تقييم العلاج بعد الجراحة ونجاح استئصال الاكياس العدرية. | The present study included 102 person, 52 patients (43 females and 9 males) were surgically proven infected with hydatidosis when referred to the Surgery Units at Baghdad Teaching Hospital, Shahid Ghazi Al - Hariri hospital and Baquba General Hospital during the period from the 1st September 2014 to 1st of July 2015. The infected patients with hydatidosis (52 : 43 females and 9 males) followed during the present study post confirming the surgical diagnosis with hydatid cyst. The youngest patients were aged 5 years and the oldest were 60 years age. Fifty healthy peoples (40 females and 10 males) included the study as a control group. The demographic distribution of patients was recorded : Hematological, Biochemical and Immunological studies were performed on blood samples of studying groups (patients and control groups). The results showed a high significant increase in the incidence of infection with hydatid cyst among females (%82.29) more than males (%17.31). The highest age of hydatidosis patients was between 16 - 45 years with significant variations in infection between sex and age also the highest value recorded in house wives (65.83%). The distribution of hydatid cyst in infected patients revealed high percentage in liver (83.05%) , then kidney (6.78%), the infection in right lobe of liver (%68.85) higher than in left lobe (%31.15). The medium - sized of hydatid cyst (6 - 10cm) in diameter appeared more predominant than large cyst (11 - 15cm) and small cyst (1 - 5cm). The results of hematology were performed on blood samples of studying groups appeared a significant increase the mean values of monocyte, neutrophils, basophils, ESR (Erythrocyte sedimentation rate) and CRP ( C - Reactive protein), in hydatidosis patients before surgery compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and compared with the healthy group. The mean values of Liver enzymes (AST and ALP) exhibited a significant elevation in hydatidosis patients were seen in pre - operative patients compared to post - operative patients and healthy control. The level of the cytokines IL - 6, IL - 10, IL - 12 ,TNF - α and chemokines MIP - 1, IP - 10 ,MIG, MCP - 1, ICAM - 1 and growth factor TGF - β showed a significant increase in pre - operative patients compared to the post - operative patients after 3 - 7 days and healthy control, while significant decrease was noticed in the level of IL - 17A. The results showed increase CAg (a specific circulating antigen) concentration in pre - operative patients (38.7µg/ml) than post - operative patients (25.7µg/ml) the difference was significant at P≤0.01. In the present study, the presence CAg in sera of hydatidosis patients with new kit by indirect ELISA was detected hydatid cyst antigen in pre - operative sera in 50 out of 52 (96.15%), the test demonstrated antigen in 48 out of 52(92.30%) postoperative sera collected on 3 - 7 days. Antigen detection assay might be a useful approach for assessment of the efficacy of treatment especially after removal of the cyst.
1 ... 391 392 393 394 395 ... 799