Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 8,433

دراسة تصنيفية لبعض اجناس العائلة الصليبية Cruciferae في العراق == Taxonomical study of some genera in family Cruciferae in Iraq.

Author name: سرى سليم كاظم البيرماني
Supervisor name: عبد الكريم خضير البيرماني | هدى جاسم التميمي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تناولت الدارسة الحالية دراسة تصنيفه مقارنه لسبعة انواع عائدة لاجناس ضمن العائلة الصليبية Brassicaceae في العراق وهي Biscutella didyma L. وCapsella bursa pastoris (L.) Medik. وLobularia martima (L.) Desv. وNasturtium officinale R.Br. وNesila apiculata Fisch. وSameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. وSchimpera arabica Hochst and Steud.. واجريت الدراسة في مختبر ابحاث تصنيف النبات المتقدم/كلية العلوم للبنات/جامعة بابل للمدة من تشرين الاول/2015 الى اب/2016 . اعتمدت الدراسة على العينات الطرية والجافة التي تم الحصول عليها من السفرات الحقلية والمعاشب النباتية العراقية . اذ تناولت الدراسة العديد من الجوانب المهمة في تصنيف النبات منها الصفات المظهرية والتشريحية وحبوب اللقاح وبعض الجوانب الكيميائية والجزيئية فضلا عن التصنيف العددي. وخلصت الدراسة المظهرية في اظهار الصفات التي كان لها قيمة تشخيصية ساعدت في الفصل بين الانواع، اذ قورنت الخصائص المظهرية لصفات السيقان والاوراق والازهار والاجزاء التكاثرية والثمار والبذور وحددت اهميتها التصنيفية واتضح منها التباين في الاهمية التصنيفية لكل عضو من اعضاء النبات سواء كان على مستوى الاجناس او الانواع.وتمكنت الدراسة من تحديد العديد من الصفات التشريحية لنصل الورقة والساق والسويق وحامل النورة وطبيعة التعرق وطبيعة الكساء السطحي. ودرست مظهرية حبوب اللقاح لجميع الانواع التي هي قيد الدراسة وتبين وجود اهمية تصنيفية جيدة في عزل الانواع عن بعضها، اذ امتازت جميع الانواع بكونها ثلاثية الثقوب والاخاديد وبانها ملساء الا انها اختلفت في الحجم والشكل وسمك جدار حبة اللقاح الخارجي. وتناول البحث الحالي المحتوى الكيميائي باستخدام تقنية كروموتوغرافيا الغاز - الطيف الكتلي Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) للانواع المدروسة، ولوحظ غنى الانواع بالمركبات الكيميائية التي امكن من خلالها عزل الانواع بعضها عن بعض. كما امدت الدراسة الجزيئية بادلة ساعدت على الفصل بين الانواع المتقاربة لاختلاف الحزم الناتجة من التضخيم بين الانواع باستخدام تقانة Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) وذلك باستخدام سبع بادئات، ورسم المخطط الشجيري لمقارنة درجات التقارب والتباعد للتراكيب الوراثية للانواع قيد الدراسة. هذا وقد عوملت الانواع حسابيا استنادا الى عدد من الصفات المختارة لمعرفة مدى التشابه والاختلاف بين الانواع وتم رسم المخطط الشجيري والاشكال متعددة الاضلاع للانواع كافة وحسبت نسبة التشابه بين الانواع،ومن ثم قورنت المخططات الشجيرية الناتجة من الدراسة الجزيئية ودراسة التصنيف العددي ونتج منها مخطط يوضح درجة تقارب وتباعد الانواع بالاعتماد على جميع الصفات والجوانب المدروسة مما اكد العلاقة الوثيقة بين نتائج الدراسة المظهرية والتشريحية والكيميائية وحبوب اللقاح والجزيئية والتصنيف العددي في تحديد علاقات القربى بين الانواع محل الدراسة. | Seven species belonging to the genera within the family Brassicaceae in Iraq have been systematically studied, these are Biscutella didyma L., Capsella bursa pastoris (L.) Medik. , Lobularia martima (L.) Desv. , Nasturtium officinale R.Br. , Nesila apiculata Fisch. , Sameraria stylophosa (Jaub.et Sp.) Bioss. and Schimpera arabica Hochst and Steud. The study carried out in the laboratory of Advanced Plant Research / College of Science for women / the university of Babylon from October / 2015 to August / 2016. The study relied on a fresh and dry samples which obtained from field trips and National Herbarium of Iraq. The study covered many important aspects of plant taxonomy, including morphological ,anatomical traits, pollen grains, chemical and molecular aspects as well as a numerical taxonomy study. The current study concluded the characteristics that had diagnostic value helped in the separation of species, and compared to the phenotypic characteristics of the qualities of the stems, leaves, flowers, reproductive parts, fruits and seeds and their taxonomic significance were determined, including variation in important taxonomic for each member of the plant,at the level of species. The study was able to identify some of the anatomical characteristics of the lamina, stem, petiole, pedicel inflorescence , the nature of venation and the nature of the Indumentum the type of trichomes prevailing, intensity consider it as a diagnostic attribute for each species. All species of the family under study were studied Palynologically and show a good taxonomic importance in isolating the species from each other, as it was characterized by being a Tricolporate and Spineless in all species but they varied in size and shape and exaine thickness. Chemical content through the use technique of Gas Chromatography - Mass Spectrometry (GC - MS) in all species were studied, the study observed indispensable types of chemical compounds that could be use to isolate the species from each other. Molecular study also supplied evidence helped to separate the species converged to the different bands resulting from amplification between species using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique using seven primers, draw dendrograms to compare the degree of convergence and divergence of combinations of genetic types under study. Species treated mathematically based on a number of selected attributes to identify the similarities and differences between them, and draw the dendrogram and polygonal for all species and calculated the similarity’s ratio between species and then were compared diagrams dendritic resulting from the molecular and numerical taxonomical study and resulting in the plan that shows the degree of convergence and divergence of species depending on the qualities and all the aspects studied, which confirms the close relationship between findings of the study of morphological and anatomical, chemical and Palynological and molecular taxonomy in determining the relationships between the species under study.

دراسة جزيئية ومناعية للمستقبلات TLRs المرتبطـــة بداء المــقوسات في محافظة القادسية == Molecular and immunological study of TLRs associated with Toxoplasmosis in Al - Qadisiyah province

Author name: هديل شاكرهادي التميمي
Supervisor name: رائد عباس كاظم | رحيم طعمة عبيس
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: المقوسة الكوندية طفيليات داخل خلوية تصيب نسبة كبيرة من سكان العالم. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان المستقبلات ((TLR تلعب دور مهم في الامراض الطفيلية المختلفة. وقد اجريت هذه الدراسة لتحديد الجينات TLR7 وTLR9 والسيتوكينات ذات الصلة في 125 امراة مجهضة كمجموعة بالمقارنة مع 15عينة من النساء الاصحاء (غير حوامل) و15عينة من النساء الحوامل كمجموعات سيطرة في مستشفى النسائية والاطفال في محافظة القادسية من كانون الثاني / 2015 وحتى اذار / 2016، وقد تم سحب 5 مل من عينات الدم الوريدي من النساء تحت ظروف معقمة. هناك ثلاثة جوانب في هذه الدراسة , وتضمن الجانب الاول قياس مستويات الاجسام المضادة (العدوى الكامنة والعدوى المكتسبة مؤخرا) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل . الجانب الثاني تضمن تحديد مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وproflin - 1 (PFN - 1) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل. تم الكشف عن مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وPFN - 1 في الدم باستخدام تقنية ELISA . ركز الجانب الثالث على تحديد الجينات TLR7) , (TLR9 واستخلاص الحمض النووي DNA من النساء عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). واظهرت النتائج ان معدل الانتشار المصلي IgM (العدوى الكامنة) وIgG (العدوى المكتسبة مؤخرا) الاجسام المضادة للتوكسوبلازما كانت موجبة في 55/125 حالة بنسبة ((44% و5/125 حالة بنسبة (4%) على التوالي، والانتشار المصلي للاجسام المضادة لل T.gondii في النساء المجهضات .48% ولم تسجل مصليا بشكل مختلط في هذه الدراسة، في حين كانوا النساء الاصحاء بنسبة(0%) لجميع الاجسام المضادة . وجدت علاقة ذات اهمية احصائية (P<0.05) بين الانتشار المصلي للاصابة بداء المقوسات المزمنة والعمر للنساء المجهضات ، الامراض المزمنة ، ووقت الاجهاض ، وقد اظهرت النتائج عدم وجود علاقة ذات اهمية احصائية بين الاصابة بداء المقوسات وقدرة النساء على انجاب الاطفال وتكرار الاجهاض. اكدت النتائج ان النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgG يزداد لديهم تركيز IL - 12 زيادة معنوية بالمقارنة مع مجاميع السيطرة ، في حين انه لاتوجد اي زيادة معنوية في تركيز الاجسام المضادة IgM بالمقارنة مع مجاميع السيطرة في قيمة LSD ((30.28. تركيز IFN - γ كان منخفض في النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgM ، كلا المجموعتين من النساء المجهضات لديهم انخفاض في تركيز IFN - γ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (الحوامل وغير الحوامل) . كما ان النساء المجهضات السالبات للاجسام المضادة IgM لديهم انخفاض هام في بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD (19.33).profilin - 1 البشري كان في مستوى منخفض في النساء المجهضات المصابات للاجسام المضادة IgM وIgG بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD 230.14)). ان الصورة الجينية لجينات TLRs قد اوضح ان TLR7 وTLR9 كانا بنسبة 89.7%)), 84.1%)) على التوالي .كذلك النتائج وضحت وجود بعض التباين الوراثي (TLR7 وTLR9 الجينات) في النساء المجهضات مقارنة مع السيطرة، وهذا يعني وجود طفرات في الجينات للمرضى. | Toxoplasma gondii is an intracellular parasite infected large proportion of the world population. Many of studies have shown the critical part of TLRs in different parasitic diseases. The present study were performed to detect TLRs 7 and TLRs 9 genes and related cytokines in 125 aborted women as case group and 30 healthy women (15 non pregnant and 15 pregnant women) as control groups in the Maternity and children Hospital in the Al - Qadisiyah province from December 2015 till March 2016, Five milliliter of venous blood sample were obtained from each woman under sterile condition. Three aspects were involved in this study; the first aspect included the measurement of sera antibodies (IgG& IgM) in the aborted women and control and study epidemiological aspects for T. gondii infection. The second aspect determined the levels of cytokines (IL - 12 Pg./ml , IFN - γ Pg./ml) and human proflin - 1 (PFN - 1 Pg./ml) in the sera of aborted women and control. The levels of cytokines (IL - 12 , IFN - γ) and PFN - 1 in blood were detected by using ELISA principle. The third aspect focused on detection of TLR7 gene and TLR9 gene in extraction DNA of aborted women and control (non pregnant and pregnant women) by Polymerase Chain Reaction (PCR). The outcomes demonstrated the seroprevalence of IgG (latent infection) and IgM (recently acquired infection) anti - Toxoplasma antibodies were positive in 55/125 cases (44%) and 5/125 cases (4%) respectively, however the Overall Seroprevalence of anti - T.gondii antibodies in aborted women was 48%. Mixed seropositive for IgG and IgM were not recorded in the present study, whereas the control were 0% for all antibodies. Significant relationship (P< 0.05) was found between the seroprevalence of T.gondii as ( chronic infection , age groups of the aborted women, several chronic diseases and abortion time). The results showed no statistically significant association between Toxoplasma infection and the ability of women to have children and frequency of abortions. The results confirmed that the aborted women with positive IgG antibody have significant increase in IL - 12 concentration in comparison with control , while no significant increase in IgM in comparison with control groups at LSD value ( 30.28). The concentrations of IFN - γ were lower in positive IgM aborted women than IgG , both groups of aborted women have significant decreased in comparison with pregnant control. While IgM patients have significant decreased in comparison with pregnant and healthy control group at LSD value (19.33). The human profilin - 1 levels were lowered in infected aborted women with IgG and IgM antibodies in comparison with pregnant and healthy control at LSD value ( 230.14). The genetic profils of genes TLRs have explained that TLR7 and TLR9 were (89.1 %) , (84.7 %), Respectively in aborted women. The results illustrated the presence of some genetic variation (TLR7 and TLR9 gene) in aborted women compared with the control, and this means having mutations in the patients gene.

التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة == Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city

Author name: زهراء محمد وناس
Supervisor name: زيدان خليف عمران المعموري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.

العزل والتشخيص الجزيئي للفطريات المعزولة من التربة المنتجة للمواد الايضية المضادة للميكروبات == Isolation and Molecular Identification of Antimicrobial Metabolites Producing Fungal Isolated from Soil

Author name: سرى رحمن نوار المسافر
Supervisor name: نداء شهاب حمد
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم للبنات / جامعة بابل للتحري عن الفطريات المنتجة للمركبات الضد ميكروبية في تربة محافظه بابل للمدة من ايلول ,2015 الى ايلول ,2016 . حيث جمعت عينات التربة من مناطق مختلف وشملت الترب الزراعية والترب الغير مزروعة كذلك الترب الملحية وترب الشاطئ والترب الصناعية ,تم تنقية 200 عزله فطرية عشوائيا واختبرت قدرتها التضادية مع عدد من الاحياء المجهرية الممرضة لتحديد قدرتها الانتاجيه .تم اختبار 200 عزلة فطرية بواسطة المسح الاولي لتحديد قابليتها على تثبيط البكتريا الممرضة السالبة والموجبة والفطريات المرضية خارج الوسط الحي .بينت نتائج التضاد ان 72 عزلة كانت قادره على تثبيط 3≤ من الكائنات الممرضة وقد اختبرت هذه العزلات لتحديد انتاجيتها للحوامض حيث وجد ان 13 فقط كانت غير منتجه و59 عزله منتجه بنسب مختلفة .استثنيت العزلات المنتجة للحوامض من الدراسة لان نسبه الحامض ادت الى قتل الاحياء المجهرية الممرضة . اما العزلات غير المنتجة فقد اختيرت منها العزلات الاكثر فعالية في التثبيط وذات مدى تثبيطي واسع . تم تشخيص العينات الفطرية مظهريا باستخدام المجهر الالكتروني واوساط زرعيه تشخيصية مختلفة ,اما التشخيص الجزيئي للعزلات فقد تم باستخدام البادئ العامITS1و ITS4 لتضخيم منطقة Internal transcribed spacer ,حيث بينت نتائج التشخيص المظهري والجزيئي للعزلات بانها تعود للجنسين Aspergillus fumigates وTrichoderma longibrachiatum. اما نتائج فحص الحساسية فقد اوضحت ان العزلتين 104وS4 هما الاقوى في الانتاج على وسط مخلفات البطاطا الصلب بالمقارنه مع الاوساط السائلة وتحت ضروف مثلى من درجة حراره واس هايدروجيني وزمن انتاج .بينت النتائج بان المركبات المعزوله كانت ذات تاثير واسع الطيف ضد مجموعة من البكتريا الموجبه والسالبة لصبغة كرام لذالك تم اختبار فعاليتها ضد مجموعة من الخمائر والاعفان الممرضه للانسان والمعزوله من مختبرات مستشفيات محافظة بابل.عند مقارنه النتائج التي تم الحصول عليها مع نتائج المضادات الصيدلانية وجد ان تاثير المضاد المنتج يفوق تاثير كل من Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, بصورة كبيرة بالاضافة الى تاثيرها على مجموعة من الاعفان الممرضة. اما اعلى قطر تثبيط تم الحصول علية يعود للعزلة S4 ضد البكتريا Bacillus seraus بقطر 43.35mm بعد تنمية الفطر على وسط مخلفات البطاطا الصلب لمدة 9 ايام بدرجه حراره 30 ◦م. وهو اعلى من قطر تثبيط المضاد Meropenem ضد البكتريا المذكوره.تضمنت الدراسة جوانب اخرى وهي استخلاص المركبات الفعالة من وسط التخمر باستخدام خلات الاثيل والماء المقطر ثم تنقيه المركب باستخدام تقنية كروماتوكرافيا الطبقة الرقيقة .كذلك تم تشخيص المركبات الفعالة باستخدام التحاليل الكيميائيه التالية(FTIR,HNMR and CHNS ) لمعرفة المجاميع الفعالة والتركيب الكيميائي للمركبات المستخلصة. | This study is conducted in the laboratories of Science College for Women’s / University of Babylon to investigate the antimicrobial producing fungi in the soil of Babylon province from September 2015 until September 2016 . Soil samples are collected from different regions included agricultural, non - agricultural, salty, sandy and carbonate soil, purified 200 fungal isolates randomly and tested the antagonism with a number of pathogenic microorganisms . The 200 fungal isolates are tested by primary screening method to determine their ability to inhibit in vitro Pathogenic gram positive and negative bacteria and pathogenic fungi. The primary screening illustrate that 72 isolate were able to inhibition 3≤ pathogenic organisms. These isolates were tested to determine the acid productivity which found that only 13 were non - acid production and 59 isolate are product in different concentration. The acids producing isolates are excluded from the study because the rate of acid led to killing of test pathogenic microorganism .The selected isolates are non - acid productive and most effective in the inhibition of test pathogenic microorganism with a wide range. The samples are morphologically identified using the electron microscope and different diagnostic agricultural media (PDA, CYA, MEA), either molecular diagnosis of isolates have been using ITS1 and, ITS4 primer to amplify the Internal transcribed spacer region, the morphological and molecular identification results of the isolates showed that it belongs to Aspergillus fumigatus and Trichoderma longibrachiatum. The sensitivity results illustrate that the isolates 104 and S4 are the strongest in the production on potatoes peals solid media in compared with liquid residues media under the optimal production condition including temperature, hydrogen power and time of production. Results show that the isolated antimicrobial compounds were broad - spectrum against both G+ve and G - ve bacteria so it has been tested its effectiveness against a group of pathogenic yeasts and molds isolated from laboratories of Babylon hospitals.When comparing the results obtained with the results of pharmaceutical antibiotics found that the effect of the product exceeds the effect of Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, in addition to significantly impact on a range of pathogenic molds. The highest inhibition zone is obtained due to the isolation of S4 against the bacteria Bacillus seraus with diameter 43.35mm after the incubation the isolates on the potato peals solid media for 9 days at a temperature of 30 ◦C. These diameter is higher than the inhibition zone of Meropenem antibiotics against the same bacteria.Other aspects of this study include an extracted of the active compounds from the fermentation media using ethyl acetate and distilled water and then purifying the compound using thin layer chromatography(TLC) technique. Also it has been diagnosed the active compounds using the following chemical analysis (FTIR, HNMR and CHNS) to illustrated the type of effective compound.

تقدير السيروتونين, عامل تغذية الدماغ, اللبتين, الكورتيزول والتيستوستيرون عند الرجال البدناء في محافظة بابل == Determination of serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, cortisol and testosterone of obese men in Babylon province

Author name: غدير حامد عبد الحســــن
Supervisor name: نوران جميل ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تمثل السمنة مشكلة صحية عالمية واسعة الانتشار من خلال تاثيراتها على مختلف وظائف الجسم وهذا ما اكدته العديد من الابحاث والدراسات التي تناولت السمنة ومدى تاثيرها على صحة الجسم وتضمنت دراستنا الحالية دراسة السمنة وعلاقتها ببعض النواقل العصبية والهرمونات الايضية وقد كانت الابحاث في هذا المجال الى حد ما قليلة. اجريت الدراسة في كلية العلوم للبنات /جامعة بابل للفترة الممتدة من تشرين الثاني 2015 ولغاية نيسان 2016 حيث تم دراسة بعض النواقل العصبية (السيروتونين 5 - HT وعامل تغذية الدماغBDNF ) وبعض الهورمونات الايضية (اللبتين والكورتيزول والتيستوستيرون ) باستخدام طريقة (ELISA) وكذلك تم تقسيم مجتمع الدراسة حسب المعايير الجسمانية حيث تم حساب وزن وطول الاشخاص ومن ثم مؤشر كتلة الجسم, العمر, ونسبة الدهون في الجسم , وقياس محيط الخصر وفق معادلات خاصة وتوضيح العلاقة بين الهورمونات والمعايير الجسمانية التي بموجبها تم تقسيم مجتمع الدراسة، حيث شملت عينة البحث 98 شخص سليم ظاهريا تتراوح اعمارهم بين 20 - 49 سنة من الرجال وفي ادناه التقسيمات الجسمانية لمجتمع الدراسة : ا - مؤشر كتلة الجسم الى ثلاثة مجاميع، الفئة الاولى شملت 54 شخص بدين و24 شخص وزن زائد و20 شخص وزن مثالي كمجموعة سيطرة. ب‌ - نسبة الدهون في الجسم الى اربعة مجاميع , فئة الرياضيين5 اشخاص، فئة الاشخاص اللذين يمتلكون لياقة بدنية3 اشخاص، فئة الاشخاص بنسبة مقبولة من الدهون 14 شخص, فئة البدينين 76 شخص.ج‌ - حسب الفئات العمرية الى ثلاثة مجاميع ، الفئة الاولى شملت 31 شخص فئة الشباب و29 شخص لفئة متوسطي العمر و38 شخص كبار السن.د‌ - حسب قياس محيط الخصر وضمت مجموعتين، الاولى (84) خصر كبير(اكبر او يساوي 90 سم) والثانية(14) خصر صغير ( اصغر من 90 سم ).واظهرت النتائج ما يلي : 1. انخفاض معنوي في مستوى هرمون السيروتونين (p<0.05) عند مجموعة الاشخاص البدينين اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى. 2. اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي ( p<0.05) في مستوى عامل تغذية الدماغ BDNF)) عند مجموعة الاشخاص البدينين مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة.3. اما اعتمادا على تقسيم الفئات العمرية فنلاحظ وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في مستوى BDNF عند الفئة العمرية لكبار السن مقارنة مع فئة الشباب.4. كما واوضحت النتائج زيادة ملحوظة لمستويات هرمون اللبتين في مصول الاشخاص البدنيين في جميع التقسيمات الجسمانية(مؤشر كتلة الجسم، نسبة الدهون، ومحيط الخصر) عند مقارنتها بمجموعة السيطرة.5. فيما اظهرت نتائج هرموني الكورتيزول والشحمون الخصوي انخفاض معنوي( p<0.05) في الاشخاص البدينين لجميع التقسيمات الجسمانية مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى . 6. اما فيما يخص الفئات العمرية فقد اوضحت النتائج وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في اللبتين وهرمون الكورتيزول في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب ,بينما اظهرت النتائج حصول انخفاض معنوي (p<0.05) في هرمون الشحمون الخصوي في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب. اما قيم السيروتونين فلا توجد فروق معنويه بين الفئات العمرية . في حين اظهرت نتائج تحليل الانحدار الخطي وجود ارتباطات ايجابية وعكسية بين المعايير الجسمانية الاربعة المقاسة (كتلة الجسم ونسبة الدهون ومحيط الخصر بالاضافة الى الفئات العمرية) مع الهورمونات المتضمنة موضوع دراستنا بالاضافة الى وجود علاقات بين الهورمونات مع بعضها البعض عند الاشخاص في المجاميع المختلفة المصنفة حسب مقاييس السمنة المذكورة سابقا. | According to recent studies, obesity have been found to be of prime risk factor for many a worldwide public health problem. However, little works have been done to study the effect of obesity in showing healthy person neuropeptide and metabolic hormone level associated with it in the regulation of important system in human body. This study was carried out in College of Science for Women in Babylon University during the period from November 2015 till April 2016, it was an evaluated study for the assessment of the obesity effect on serotonin, brain derived neurotrophic factor, leptin, cortisol, and testosterone and to investigate any relationship if found between these parameters in studying population according to measures of obesity categories. The study involves following up of 98 men at 20 - 49 years who were divided according to their anthropometric (physical) characteristics : 1 - Subjects whom were obese (54 sample), overweight (24 sample) and normal weight (20 sample) as classified according to BMI categories.2 - Subjects whom were athletes (5 samples), fitness (3 samples), acceptable (14 sample) and obese (76 sample) as classified according to body fat percentage category. 3 - Subjects whom have young - age (31 sample), middle - age (29 sample), others whom have old - age (38 sample) based on age group categories.4 - Subjects whom have waist circumference (WC≥ 90 cm) defined subjects with large WC (84 sample) other subjects have (WC< 90 cm) were considered as small WC (14 sample). The parameters in the present study were included serum neurotransmitter serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, Cortisol, and Testosterone, also the parameters were done in this study included anthropometric measurements such as; body weight, height to calculated (BMI), and WC and percentage of body fat were calculated by a special formula, also subjects age were recorded. The results show in the following : 1 - A significant decrease in the serotonin level (p<0.05) in obese subjects according to categories of obesity measurements compared with other groups.2 - The results showed a significant increase in BDNF level (p<0.05) in obese group according to categories of obesity measurements as compared with other groups of obesity measurements.3 - The study showed that increase level of BDNF in old - age group compared with young - age group.4 - The results of leptin hormone show a significant increase (p<0.05) in all obese groups in regard with categories of obesity measurements.5 - The results showed a significant decrease serum testosterone level in obese subjects in all categories of obesity measurements as comparison with other groups.6 - The results showed that variation in leptin and testosterone levels were associated with age groups difference, while there were no significant differences in serotonin level as related with age - groups difference.7 - The results of cortisol level showed a significant increase (p<0.05) in both of obese groups and normal BMI group. In addition, it was noticed that a significant positive and negative correlation among investigated hormones in subjects based on categories of obesity and between that tested hormones with anthropometric measurements.

دراسة مقارنة مظهرية ونسجية للاعور وعلاقته بالبيئة الغذائية في بعض الحيوانات == Comparative study Morphological and Histological of caecum in relation to feeding ecology in some animals

Author name: عطاف طلال شاكر الكرعاوي
Supervisor name: فاضل فرهود مكي الجبوري | منار محمد حسن
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Babylon
First pages:
Abstract: The present study included four axis, the aim of which is to reveal the histological and morphological changes in the caecum of birds and mammals in relation to the effect of food on it, The result, showed the following. The 1st axis includes a laboratory study on the (Starnus vulgarus) since it is omnivorous birds and has the ability to change its natural feeding very fast, The aim of the experiment is to show the effect of food on the length of the small intestine and caecum. Thus, 25 birds were dissecting. The experiment lasted 40 days. The results showed that there was moral differences in the sum of body weight, small intestine length, caecum length and thickness, in both herbivorous and carnivorous feeding groups. The average body weight of the herbivorous feeding group was (60.04 ± 11.72)gm as compared with (70.48 ± 6.37)gm for the carnivorous feeding group .There was a moral differences in the length of the small intestine and caecum in both groups of birds. The average length of herbivorous group was (27.56 ± 3.61)cm as compared with (22.90 ± 1.50)cm in the other group. There was moral differences the length of caecum of both groups. The average length in the herbivorous group was (5.91 ± 1.38)cm . compared with(1.27 ± .22)mm in the other group. The amount of vegetable food consumption was much more 73 gm/day than that of the animal food 23 gm/day. The histological studies of the caecum of the Starnus vulgarus revealed that there was amoral differences in the thickness of the lumen of the herbivorous feeding and carnivorous feeding in herbivorous was(83.00 ±3.70) while in carnivorous was(21.5 ± 2.85) .The thickness of the muscular layer in the herbivorous feeder was(2.07 ±27.60 ) compared with(5.20 ± 1.92) in the other group. The 2nd axis includes a histological and morphological studies on the caecum of two different species of birds namely Anas platyrhynchos herbivorous bird and Falcon peregrinus carnivorous bird . It was found that there was amoral differences in small intestine length, caecum length and thickness between the two groups. The rate of small intestine length in duck was(8.14 ± 1.37) cm while that of the hawk measured(25.04 ± 1.35)cm. It was noticed that the length of caecum in the duck was (11.68 ± 1.54)cm as compared with(0.40±0.08)cm in the hawk. The thickness of the caecum in the duck was (0.67 ± 0.14)cm as compared with (0.17 ± 0.04)cm in the hawk. Histologically. There was amoral differences in the lumen thickness and muscular layer. Thus, the thickness of lumen in the duck was(467.50±33.21) while that in the hawk was(141.00±6.754) . The thicken of muscular layer in the duck was (20.20±6.37) while that in the hawk was(6.40±2.07) . The third axis includes a morphological and histological study of appendix of the rabbit to reveal the effect of food on it. It was noticed that the average weight of the body was (1100.05 ± 1.86)gm and the length of the small intestine was (36.51 ± 2.17)cm and the length of the appendix was (8.32 ± 1.27)cm and the thickness of the appendix was(0.61 ± 0.19)mm.the link among the small intestine and appendix length , appendix length and thickness was studied, too. It was that observed appositive correlation among the small intestine and appendix length , among appendix length and thickness, the correlation index among the small intestine and appendix length was(0.4) while that among the appendix length with its thickness was(0.5). Histologically, it was noticed that the appendix of the rabbit made of four layers namely, mucosa, sub mucosa , muscularis and serosa. It was also found that there was aplenty of goblet cell inside the simple columnar epithelial tissue of appendix lumen. It was also noticed that there was some kind of cells called endocrine(entero endo crino cyte), and that there was a massive spread of lymphoid follicles. The fourth axis : It includes a histological comparative study between the normal and infected appendix in human. The normal appendix of the human composed of four layers namely mucosa, sub mucosa, muscular and serosa. It was noticed that there was an intensive spread of goblet cell with in the simple columnar epithelial. It was also noticed that there was a presence of crypts of liberikuhn with in mucosa layer with widely spread to lymphocytes with in mucosa and sub mucosa layer. In the condition of inflamed appendix it was found large deformation in all layers. The information start in the internal lining of the appendix which is the mucosa layer then the information spread later to the other part.

التشخيص الجزيئي, المظهري واختبار حساسية الفطريات والبكتريا المرافقة لقشرة الشعر مختبريا لعوامل التضاد الميكروبي == Molecular, Phenotyping identification and invitro susceptibility testing in Fungi and Bacteria associated with hair dandruff to antimicrobial agents

Author name: شيماء محمد علي وتوت
Supervisor name: زيدان خليف عمران المعموري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: تمثل قشرة الراس اكثر مرض جلدي شيوعا ورغم انها غير مهلكة للحياة فلم تنل قسطا من الاهتمام والبحث على مستوى العالم ولذلك هدفت الدراسة الحالية الى عزل, تشخيص والتحري عن تاثير المضادات الفطرية على الفطريات والخمائر وكذلك عزل وتشخيص البكتريا المرافقة للقشرة الموجودة في فروة الراس ومن شعر هذه الحالات المرضية. خلال مدة الدراسة ولفترة من تشرين الاول الى حزيران 2016 حيث تم جمع 280 عينة قشرة وشعر ومسح من الحالات الموصوفة انفا واشتملت على 152عينة شعر و74 عينة قشرة و54 مسحة من فروة الراس وكذلك جمعت 30 عينة سيطرة. وكل جهد لم يشار اليه بمصدر فهو من جهد الباحث.زرعت العينات على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسيمايد وبدونه وشخصت عزلات الخمائر اوليا على وسط CHROMagar للتميز بين انواع الخمائر عن طريق الوانها. كذلك تم التحري عن الفطريات الخيطية الجلدية من خلال زراعتها على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسومايد للحصول على عزلات للفطريات الجلدية وكذلك تقييم تواجد الفطريات المترممة مع العينات قيد الدراسة وتقيم عوامل الضراوة لدى الخمائر. تشخيص الفطريات المعزولة على المستوى الجزيئي من خلال تضخيم منطقة ITS باستخدام الزوج الباديئي ITS5/ITS4وITS3/ITS4 واجراء تحليل التتابع DNA sequencing لعينات ممثلة عن المجوعات المتماثلة في اوزانها الجزيئية لمنطقة التضخيم وبعد الحصول على نتائج التضخيم تم اخذ منتج بلمرة لعزلات ممثلة وارسلت الى مختبرMicrogene في امريكا للحصول على التتابع للقواعد النتروجينية ومقارنتها مع تتابع العينات المرجعية في البنك الجيني باستخدام برنامج NCBI )Blast Nucliotide Database). ومطابقة التتابعات لتقييم التماثل والاختلاف ورسم الشجرة التطورية على اساس نتائج تحليل التتابع لتقييم مدى تقارب العزلات ضمن النوع والانواع قيد الدراسة.اظهرت نتائج التشخيص التقليدية والجزيئية باستخدام الازواج البادئية ITS5/ITS4 وITS3/ITS4 كانت اوزان الحزم لكامل منطقة ITS تتراوح بين500 - 800 زوج قاعدي. بينما تراوحت الاوزان لمنطقة ITS2 بين350 - 400زوج قاعدي.واظهرت النتائج ان الطرق الجزيئية المتقدمة هي ادوات قوية لتشخيص الفطريات مقارنة مع الطرق التقليدية. تم تسجيل عزلتين من C. sake و3 عزلة Aurobasidium iranianum وعزلة Issatchenkia orientalis وعزلة من Cryptococcus fonsecae وعزلة واحدة من Cryptococcus diffluens لاول مرة في العراق.اجراء تقييم للفعالية المايكروبية لبعض المستخلصات النباتية المهمة طبيا ومقارنتها مع المضادات الفطرية وتقييم التركيز المثبط الادنى باستخدام شريط E - Test strips .كما تم مسح الانواع البكتيرية المرافقة للعينات قيد الدراسة مجهريا وبايوكيميائيا من خلال زراعتها على الاوساط التفريقية مثل وسط Manitol salt agar ووسط Blood agar base.اظهرت عزلات المبيضات البيضاء موجبة لانتاج الانبوبة الجرثومية, النمو بوجود السايكلوهكسيمايد والنمو في درجة ˚45م. قابلية C.kruzei , C.parapsilosi وC.glabrata على تكوين الغشاء الحيوي . اما اختبار الانزيمات الحالة للدهون المفسفرة فقد كانت موجبة لعزلات C.albicans ,C.parapisilosis وC.kruzei واخيرا اضهر اختبار الانزيمات الحالة للدهون نتيجة موجبة فقط لعزلات C.albicans ,C.tropicalis وC.parapsilosis. كذلك اجريت اختبارات للفطريات الجلدية والتي تضمنت قدرة ال T.rubrum على النمو على وسط SDA with 5% of NaCl وكذلك نمو الفطريات على وسط PDA وانتاج صبغة عكسية.اظهرت النتائج ان لبعض المستخلصات المائية للنباتات تاثير مثبط على نمو الفطريات الجلدية والخمائر وكان المستخلص المائي للقرنفل اكثر فعالية في تثبيط الفطريات الجلدية وبعض الخمائر وال Rhodotorulla وبفرق معنوي ≥ 0.05 يليه الشاي الاخضر والكالبتوز والدارسين والحنة وبتركيز 8 % حيث كان اكثر تاثير من بقية التراكيز.تم اجراء اختبار الحساسية الدوائية لبعض المضادات الفطرية باستخدام E - Test strips للمضادين CAS وFLU حيث اظهرت النتائج مقاومة الفطريات الجلدية والخمائر وال Rhodotorulla للمضادين.تم عزل بكتريا Staph.aurues and Staph.epidermidisوبين اختبار ال Congo red قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي Biofilms)). واستنتجت الدراسة ان قشرة الشعر هي مشكلة الشعر المهمة العديد من الخمائر مع الشعر المتساقط معها قد تقف وراءها مجموعة من الفطريات والبكتيريا المتهمة في احداث مثل هكذا اخماج وان استخدام المستخلصات النباتية كانت مؤثرة بشكل معنوي في اختزال نمو الفطريات التي تم اختبارها تحت تاثير هذه النواتج الطبيعية وبغياب الفعالية الدوائية لافضل المضادات الفطرية مثل الفلوكنزول والكاسبوفنجين. ان التشخيص المظهري للعزلات اعتمادا على شكل الخلية لانواع المبيضات والوانها على وسط الكرومواكار هو غير علمي لنجاح التميز بين انواع المبيضات. لذلك تشخيص الانواع بالاعتماد على منطقة ITS يوفر وقتا (والذي ياخذ وقت من يوم الى يومين ) وهي ملائمة وتطبيقية حتى مع العزل التي تمتلك خصائص مظهرية شاذة. | Hair dandruff is a most commercially demoralized skin disease. Although it is not deadly disease, but not have more attention and research worldwide. This study was aimed for isolation, identification and investigation of antifungal susceptibility of dermatophytes and Candida also isolation and identification of bacteria associated with hairs dandruff. During the period from September to June a total of 280 sample of scalp and hair and smear were collected from Hilla hospital private clinics and primary schools in rural areas in the Province of Babylon (n=152 hair samples, n= 74 dandruff samples, n= 54 smear from head scalp) and samples was also collected as 30 control samples. Every effort not referred to source it from researcher effort. Samples cultured on Sabouroud Dextrose Agar (SDA) medium with or without Cyclohexemide based on stander cultured methods, incubation and identification, Primary identification of Candida has been achieved on CHROMagar medium to differential between Candida spp. based on colors. Also it was investigation about dermatophytes through cultivation on Sabouroud Dextrose Agar containing Cyclohexomide to get isolates of dermatophytes, as well as assess the presence of fungus saprophytic with samples under study.Virulence factors for the yeast were detected. Fungal identification based on amplification internal transcript spacer (ITS) region by using ITS5/ITS4, ITS3/ITS4 primers and subject the PCR product to sequence analysis (DNA sequence) for representative samples groups at Micro gene laboratory in US. Sequence analysis based on alignment with data base of reference strains in the gene bank (Blast Nucliotide Database (NCBI) program). phylogeny tree was construction on the basis of the results of the sequence data.Results showed conventional and molecular diagnosis by used ITS5/ITS4 and ITS3/ITS4 primer was band weight integration to ITS region range between 500 - 800 bp. while range weight for ITS2 region between 350 - 400 bp.The results showed that advanced molecular assays were powerful tools for fungal identification compare with the conventional methods. For the first time in Iraq Two isolates from C.sake and one isolate from Issatchenkia orientalis, also three isolates Aurobasidium iranianum and one isolates from Cryptococcus fonsecae and one isolates from Cryptococcus diffluens were recorded.Evaluating the effectiveness of microbial for some medically important plant extracts and compared with the antifungal and assess the minimum inhibitory concentration by used E - Test strips. As it has been cleared bacterial species accompanying to samples under study microscopically and biochemically during cultured on differential medium like manitol salt agar and blood agar base media.C.albicans isolates positive results for germ tube, growth in the presence of Cyclohexomide and growth in temperature 45C˚. C.kruzei, C.parapsilosis, C.glabrata ability composition of biofilms, while phospholipase assay was positive to C.albicans, C.parapisilosis and C.kruzei. Lipase assay was positive to C.albicans, C.tropicalis, C.parapsilosis. As well as conducted test for dermatophytes which include ability of Trichophyton rubrum on growth on SDA with NaCl of 5 % and dermatophytes growth on PDA and produce inverse dye. The results showed that aqueous extracts were reduced the growth of dermatophytes and Candida. The aqueous extract of Cloves more effective in inhibition of dermatophytes, Candida and Rhodotorulla at ≥ 0.05 followed by green tea and Eucalyptus, Cinnomomum, Henna. Moreover 8% concentration was more effective than other concentrations.Tested antifungal sensitivity for some Fluconazole and Caspofungin antifungal using E - Test strips. Showed that dermatophytes, Candida and Rhodotorulla was reveals resistance action against antifungals.Staph.aureus and Staph.epidermidis showed Congo red test and ability for biofilms formation.The study concluded that the hair dandruff is important hair problem, many yeast with the hair loss together may be behind them groups from fungi and bacteria accused in events such as typhoid and used of plant extracts was effected in signification in fungi growth that test under effect this natural products and the absence pharmaceutical activity to best antibiotic such as Fluconazole and Caspofungin. Morphologically identified isolates based on the cell shapes of Candida spp. and their color on CHROMagar isn’t feasible to successfully differentiate between members of the Candida spp. Therefore, identification of Candida and dermatophytes base on ITS region saves time (it takes 2 to 3 days) and is accurate and applicable even to isolates with atypical morphological features.

عزل وتشخيص المضاد الحيوي المنتج بواسطة عزلة Penicillium chrysogenum من البيئات المختلفة في ترب مدينة الناصرية == Isolation and Identification of antibiotic produced by Penicillium chrysogenum isolated from different environments in Nasseriya city soi

Author name: ميسم كريم حسن
Supervisor name: سعد سلمان هميم | محمد حسين مشهد
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: The present study includes the isolation and identification of some mycoflora from 40 soil samples in six places ( Remnants of fat - born, parks, edges of the river, animal wastes, sewage and rubbish) during October 2015 - January 2016 in Nasseriya City, Iraq. According to different environmental factors, the isolated genera were Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, Cladosporium, Sepedonium chrysospermum, Alternaria chlamydospora, Bipolaris, Chrysosporium, Candida albicans, Rhododendron flavum, Humicola, Geotrichum candidum, Fusarium and Acremonium. Three isolation methods were used. Dilution method, direct plate method, alcohol and heat treatment technique using the cultural media viz. Potato Dextrose Agar ( PDA), Sabouraud Dextrose Agar (SDA) and Potato Carrots Agar (PCA). Aspergillus represented the highest fungal isolates which represent 62 (37.12%). followed by Penicillium with 47 (28.14%), Mucor 22 (13.16%), Rhizopus 15 (8.98%), Cladosporium 6 (3.59%), Sepedonium chrysospermum and Alternaria chlamydospora, 3 (1.80%), Biopolaris, Chrysosporium and Candida albicans with 2 (1.20%), and finally Rhododendron flavum, Humicola, Acremonium, Fusarium and Geotrichum candidum recorded the lowest fungal isolation with one isolate for each (0.60%). The study was aimed to isolation of Penicillium from soil and assay its antibacterial activity. The results showed that dilution method gave a best fungal growth in comparison with direct plate method and alcohol and heat treatment technique in 25 ºC and pH = 6. PDA appeared as an optimum medium for isolation in comparison with other media such as SDA and PCA. The preliminary results showed that Penicillium sp. exerted antibacterial activity against Gram positive and Gram negative bacteria; Therefore, this fungus was used for production of antibiotic on Potato Dextrose Broth (PDB) medium. The optimum conditions were obtained at pH = 6, incubation temperature of 25 ºC and shaking rate of 180 rpm for 7 days to fermentation. Ethyl acetate was a good organic solvent to extraction of antibiotic which produced (3g/L) as white to creamy crystals. The characterization of the antibiotic product after extraction and purified by chemical methods included Thin Layer Chromatography (TLC) test, Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectra and Mass Spectra. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for clinical bacterial species was 1 - 10mg/ml.The PCR method used in this study utilized Internal transcribed spacer (ITS1 - 4) as a primer for identification of isolates. Two PCR products of the targeted gene of Penicillium chrysogenum isolates which locally named as (Penicillium chrysogenum F1 and Penicillium chrysogenum F2) were selected and subjected to partial DNA sequencing for the ITS gene to follow up the possible molecular relationship between these local isolates and what recorded globally in Genbank.

Predictability of the Expression of ER, PR Receptors, HER2 Marker by the Coloration with of IV Collagen Expression and AgNORs in Breast Carcinoma among Iraqi Women in Thi_Qar Providence : Immunohistochemical Study == Predictability of the Expression of ER

Author name: نجم الازيرجاوي
Supervisor name: هيفاء عبد علي الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: This study is adescriptive exploratory study in Thi - Qar providence for some breast cancer patients . This study aims to assess the relationship between gene expression for each type four of the collagen (IVCollagen) and gene expression positive for both estrogen receptor ER - Eestrogen - receptor and progesterone PR - Progestron receptor and fairs tumor HER2 (Human epidermal growth factor receptor) By using chemistry of dyes immunological technique and the nuclear regulatory regions Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR(. The present study addresses the identification of the type IV collagen content in the basement membrane of epithelial tissue of the breast cancer patients in Thi qar and its relationship to nuclear organization region and maintain its relationship with hormonal receptors and progesterone genetic factor and the extent of their association with the occurrence of breast cancer.Fifty tissue samples are collected from Hussein Teaching Hospital inThi Qar and some private laboratories in the providence each case where data included that the most important factor is age, where he found that the highest percentage of injuries, age (55 - 46 years) increased by 38%. And mixed samples, either partial removal of the tumor or the eradication of whole breast. After collecting samples saved each formalin concentration of 10% for 24 hours at a minimum and then buried with parafin wax and completed the work by histological methods own work.The use of special select number of collagen type IV and determine the type of hormonal receptor positive or negative and also used several positive pathological tissues of the tumor to determine the human epidermal growth factor receptor by using silver nitrate to study the nuclear organization regions. Results of the current study showed that there is a positive relationship between collagen gene expression of type IV and between fairs oncogene(HER2 human epidermal growth factor receptor), as observed the presence of collagen type IV in tissue sections of tumors with HER2 negative gene expression of genetic factor, and with the positive expression for each Estrogen receptor positive ( estrogen positive ) and progesterone receptor positive( Progstrogen positive).Results of this study also showesthe presence of collagen or lack in histological sections of the tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs as well as the non - existence of collagen in the sections taken from tumors with negative expression of estrogen and progesterone receptors. The results of the current study also showed that there is a clear positive relationship between nuclear organization regions and between Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR) Fairs oncogene HER2, as it was noted the presence of many of the nuclear regions of the dye - derived tissue sections of tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs, while nuclear chromosomal regions did not appear in the sections derived from tumors with negative expression of estrogen receptor and progesterone hormone. The results of the current study also showed that there is a lack of positive gene expression of collagen type IV, the presence of a number of chromosome regions nucleuse (Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR)).

تاثير داء السكري وعقار البنتوستام على تطور الاصابة بداء اللشمانيا الاحشائية في ذكور الفئران المختبرية == The Impact of diabetes and Pentostam on development the infected Leishmania donovani parasite in male laboratory mice

Author name: افراح علي عبد الامير العزاوي
Supervisor name: فاضل عباس منشد العبادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: This study included evaluation of the role of diabetes and Sodium Stibogluconate drug (Pentostam) against infection leishmaniasis parasite in laboratory animals experimentally infected with the parasite, Where we used in this study male white laboratory rats of the strain Mus musculus Balb /c. Aggregates were divided randomly into eight major groups of eight mice, The first group were injected with saline solution at a dosage of 0.2 ml, the group was considered as a negative control, The second group were injected with parasite (1.2 × 10 6 parasites / 0.2 ml) at a dosage of 0.2 ml, The third group was injected with the parasite and alloxan at a dosage of 0.2 ml, while the fourth group were injected only with alloxan, While the fifth group were injected with a Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg, as well as the sixth group were injected with leishmania parasite at a dosage of 0.2 ml and Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg while the seventh group were injected with the parasite and alloxan at a dosage of 0.2 ml and Pentostam drug at a dosage of 20 mg/kg while the eighth group injected with alloxan at a dosage of 0.2 ml and Sodium Stibogluconate drug at a dosage of 20 mg/kg, Where it was dissected first four groups a period of 45 days while the other groups were dissected after 75 days with recorded weights of the body before and after the experiment. Also studied the histological pathological changes and taking weights for each of the liver and spleen, blood samples were taken for the purpose of knowing the effect of which occurred in the blood parameters and the level of glucose in the blood. The results of the statistical analysis of the current study showed in the second set significantly higher (P≤0.05) total weight of the body and the weight of the liver spleen, White blood cells lymph and acidophilus, while there was a significant decrease in the total number of white blood cells, neutrophils and red blood cells there was no significant difference (P≤0.05) inthe blood glucose concentration compared with the first group. The fourth group showed a significant decrease (P≤0.05) in total body weight and red blood corpuscles with (P≤0.05) blood glucose level and neutrophil cells, the groups treated with the drug showed the sixth and seventh group height body weight and white blood cells and lymphocytes and a significant decrease (P≤0.05) red blood cells, neutrophils and acidity. There was no significant difference (P≤0.05) in the concentration of glucose in seventh group. The eighth group showed a significant decrease (P≤0.05) in the total number of white and red blood cells and significant increase (P≤0.05) in lymphocytes and acid, while there was no significant difference (P≤0.05) concentration of blood glucose. The fifth group showed the treatment of the drug loss in the radiology of hepatic cells and degeneration of clear and congestion in the central vein with the infiltration of inflammatory cells within the hepatic tissue, and showed a clear exhaustion in the white pulp and the proliferation of red pulp.we observed in the histological sections of the present study in the sixth group infected with parasite and treated with pentostam, a significant improvement of the liver tissue. The spleen showed a simple propagation of the white heart. The seventh group is experimentally infected with leishmania and the alloxan The development of diabetes and the treatment of pentostam is spread with Kupffer cells and expansion in the blood sinusoids with changes in the spleen. White and the group of nematodes around it with breeding in the red pulp as in the fifth group.

دراسة انتشار ذبابتي الرمل paptasi Phlebotomus و(Diptera : psychodidae) p.sergenti ودورهما في نقل مرض اللشمانيا في محافظة ميسان == Study the Prevalence of sand fly Phlebotomus p.sergenti (Diptera : psychodidae) paptasi and and its role in the spread of Leishmaniasis in Maysan province

Author name: عبد الحسين شلويط زغير
Supervisor name: صادق صاحب علي | بسعاد عقرب العبودي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: during field studies have been done in order to know the spread of sand flies in Maysan province during the beginning of October /2015 until the end of September 2016 through the collecting of samples from five areas that geographically different which included the areas of AL - majer AL - kabber, AL - uzair, AL - musharah , kumait and Mugharbah in the middle of the center of province .1263 insect have been collected by two types of traps light insect traps and manual insect traps. These insects included two species : papatasi and sergenti which belong to the same genus ( phlebotomus ) the number of the first species insects was more than of the second species. The number of the first species reached 85.90% while the number of the second species was 14.04% . The inset had been classified in transmitted diseases center in BaghdadThe insects have been found in the whole areas of the studying except the species sergenti which has been not found in the area of AL - majer AL - kabber . There are two peak spread times of these insects : The first is through out October and the second is the through out may . Concerning the relationship between the spread of these insects and the occurrence of Leishmaniasis positivewhere the infestation by this disease began on September November and December and the peak spread is recorded on January on the country of the inset occurrence where it begins at spring and the beginning of autumn . The spread of these insects was in flounced by the environmental factors such as temperatures and humidity . The flagellated promastigotes of leishmania parasite were not found during the anatomy of a lot of insects.Four chemical insecticides were used to control these insects where the effect of the insecticides (snake) was the strongest for killing these insects.515 infection of Leishamaniasis has been recorded in Maysan province at proportion of 506 cutaneous infestation and 9 visceral infection respectively .The rate of skin infestation was high in age groups between (1 - 10 ) year in comparison with another age groups.Concerning the types of ulcer ,the dry ulcer were dominant and the number of dry ulcers was 873 while wet ulcers were 100 concerning the diameter of the ulcer the higher infections occurred at diameter of 1 Cm which reached 873 infection . The number of patients infected by one ulcer was the highest which reached 301 infestation.The number of dry infestation in the cities was higher than in rural areas on the contrary of wet infestation . concerning the distribution of skin infestation on the body areas the higher ratio of infestation occurred in higher and lower extremities which reached 344 at proportion of 68.57%.The infestation of skin Leishmaniasis has been concentrated in the center of province which reached 334 at proportion of 66.07%.Concerning the months of the year , the majority of skin leishmaniasis was on January which reached 137 at ratio of 27.66%most of visceral leishmaniasis occurred in the patients of blood group type O proportion of 33.33% .The infection of visceral Leishmaniasis in males was higher than of females and the highest than and the highest infection of visceral Leishmaniasis was in age groups between (1 - 3) years and also the number of visceral Leishmaniasis infestation was the highest on January . Kumait areas is characterized by the presence of the highest visceral Leishmaniasis infestation.

دراسة تجريبية وجزيئية للبكتريا المصاحبة لحالات الحروق في محافظة ميسان == Experimental and Molecular Study of the Bacteria associated with burns in Maysan Governorate

Author name: حسين علي دنانه البهادلي
Supervisor name: رحمن لعيبي جلاب | حيدر خميس شنان
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Burn injuries are considered as health problems that may sometimes lead to rapid death. Bacteria are considered as the most important causes of microbial infection associated with burns. In present study, 75 clinical samples were collection from patients with burns for the period from October 2015 to June 2016 from the lobby burns in Sadr Teaching Hospital in the Maysan Governorate, these burn swabs revealed 56 bacterial isolates, 41 (73.21%) were Gram - negative bacterial, distributed of (35.71%) Pseudomonas aeruginosa, (28.57%) Klebsella Pneuomonia, (3.57%) Escherichia coli ,Enterobacter (5.35%). On the other hand 6(10.71%)were Gram - positive bacterial. out of 75 burned swabs, 84% revealed a single pathogens and 16% shown a mixed bacteria. On the other hand, Antimicrobial susceptibility for the bacterial burn isolates revealed that P. aeruginosa was resistant to routine tested antibiotics, like Amoxicillin, Gentamycin and Tobramycin in 100%, While was resistance to Ciprofloxacin 85%, while most P. aeruginosa was sensitive to Ceftizmiden in 50%. Results also showed that Staph. aureus was resistant to Gentamycin, Tobramycin, and Levofloxacin in 50% respectively.Depending on the rate of injury burns microbial and resistance to antibiotics used, p.aeruginosa and Staph.aureus isolated from the burnswere chosen and study their role in the events of infection, experimental burns, and for this purpose has been the use Albino mouse male as a model for a pilot study for pathogenesis and progress associated with the infection of the disease bacterial burns. (33) male mice were divided into tow groups, the first group(24) mice were burned (deep dermal second degree) and infection by 0.2X108 cfu kg of elected isolates, the route of infection was subcutaneously and scratching within burned area. In the second group six were infected without burn, which was considered as positive control, while in the thirdgroup three mice were burned and injected by 0.2ml of normal saline and consider as negative control .the first group was subdivided into two subgroups (12) mices for each burn dominant pathogens, then divided into subgroups each of six mices and following up (3,7, days intervals post infection process). P.aeruginosa burned mice group, shown skin infection more progressive and more severity in comporning with group infected by Staph. aureus, In addition, they were significant increases in the body temperature of all infection burned mice group(p.value)compared with those pre - infection process. Reisolation of bacteria from infection mice organs revealed, that high percentages in experimental p.aeruginosa burned model comparison with Staph. aureus.Diagnosed bacterial isolates by API 20and Vitek compact system, in addition to molecular diagnostics using PCR technique for the detection of 16S rRNA gene, All isolates showed a positive result of this gene. The amplified 16S rRNA gene seguence was compared with the seguence in NCBI seguence database.the bacterial strain identified as P.aeruginosa EPSI. This study reflects the usefulness of sequence analysis of the 16S ribosomal RNA gene in identifying bacteria and determining bacterial diversity. Various techniques that are based on utilizing the 16S rRNA gene are discussed. Of critical importance is the use of massively parallel sequencing to study bacterial diversity. Through massively parallel sequencing which is replacing traditional methods of bacterial identification; various bacterial habitats are surveyed to compile their species compositions.

عزل وتشخيص البكتريا المرضية مع ايلاء اهتمام خاص للبكترياStaphylococcus auerus المرافقة ل Cutaneous Leishmaniasis في محافظة ذي قار == Isolation and Identification Pathogenic Bacteri with Special Regard to Staphylococcus auerus Associate with Cutaneous leishmaniasis at Thi - Qar Province

Author name: رضاء الله مرتضى الاعظمي
Supervisor name: قاسم حسن وداعة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: The present study is designed to isolated and identification the pathogenic bacteria associated with Cutaneous leishmaniasis. Cutaneous leishmaniasis (CL) is a parasitic disease characterized by single or numerous ulcerations. This was study performed in Iraqi in Shatra general hospital and Al - hussein teaching hospital in Thi - Qar province 2016 - 2017.Total of 370 samples of suspected patients were taken and after examining them using geimsa stain , the positive were 186 males and 126 females then sterilize the area surrounding for ulcer , all samples were taken to (swab transport media) ,culture to MacConkey agar and blood agar after 24 hr of incubation at 37C ,after diagnosed by biochemical testing then species determined by API system. The positive results on culture media 92/312 , males 62 (67.4%) , female 30 (32.6 %).The total bacteria isolated from the lesions were in males and female staph auerus 52 cases (56.5%), Escherichia coli 8 cases(8.6%) , Bacillus cereus 6 cases(6.5%) , Pseudomonas. aeruginesa 5 cases (5.4% ), Strep. Pyogenes 6 cases(6.5%) ,Strepto.agalactiae 3 cases(3.3%).While other that isolated in males only and did not appear in females were aerobic bacteria ,Listeria moncytogenes 3 cases(3.4%) , Actinobacteria .spp 2 cases(2.2%) ,Klebsiella. Pneumonia 2 cases (2.2%) , Rodococcus .equi 1 cases (1.1%) , and anaeroberia bacteria ,Peptococcus niger 2 cases (2.2%) ,Peptostreptococcus .spp 2 cases (2.2%) .Then find bacteria that more presence more with cutaneous Leishmaniasis ,were it was staph. aureus therefore it were objected study antibiotic resistant .The present study demonstrates that Staph. aureus XIV isolates were resistant to methicillin 50 (96.15%), penicillin 48 (92.30%) , Clindamycin 37 (71.15%), ciprofloxacin 30 (57.69%) , Gentamicin 30 (57.69%),Amoxicalave 29 (55.76%), Azithromycin 25 (48.07%) , Amoxicillin 22 (42.30%), Tetracycline 21 (40.38%), Rifampin 10 (19.23%) and Vancomycin all staph .auerus are sensitive to Vancomycin The all 52 Staph. aureus isolates were further examined using polymerase chain reaction (PCR) for detection of (16SrRNA ,mecA and PVI gene ). 16SrRNA gene which were responsible for diagnosis ,where all isolates were positive to was 52\52 (100%) , mecA gene which were responsible for methicillin resistance this was detected in 52\52 (100%) . of Staph. aureus isolates and a part of virulence factors PVL gene was detected in 46/52(88.46%) of Staph. aureus isolates which are responsible to kill the leukocytes of human and other animals.

التوصيف المظهري والجزيئي للانواع البكتيرية المصاحبة لحالات الحروق في محافظة ذي قار == Phenotypic and Genotypic Charactrization of Bacterial species Assocuated with burn infections in ThiQar province

Author name: عبير هادي فرهود الحبيب
Supervisor name: رحمن لعيبي جلاب
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى تشخيص الانواع البكتيرية المصاحبة لحالات الحروق والكشف الجزيئي عن الموروثه 16SrRNA في الانواع البكتيرية المشخصة واستخدام تقنية DNA Sequencing . تناولت الدراسة الحالية فحص ومعاينة 107 مريضا تم اختيارهم بشكل عشوائي (ذكور واناث) تراوحت اعمارهم بين 1 - 45 سنة من الراقدين في مستشفى الحسين التعليمي للمدة من حزيران - 2015 تشرين الاول 2016 اذ اجري الفحص السريري من قبل الطبيب المختص وتشخيص الاصابة على انها حالة حروق مرضية ناتجة عن اسباب مختلفة. جمعت 107 عينة مسحات قطنية Cotton swabs وزرعت على وسط اكار المكونكي ((MacConkey agar واكار الدم ((Blood agar والاكار المغذي ((Nutrient agar. شخصت العزلات عن طريق الاختبارات المظهرية والبايوكيمائية وعامل التشخيص API20E ونظام الفايتك ( (Vitek 2compactفضلا عن التشخيص الجزيئي باستخدام جين.16S rRNA واظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود 117 عزلة بكتيرية تفوقت فيها العزلات السالبة لصبغة كرام ((Gram negative بنسبة 93.16% على العزلات الموجبة لصبغة كرام (Gram positive)بنسبة 6,83 وكانت نسب توزيع العزلات البكتيرية المشخصة Pseudomonas aeroginosa 32.47% , Klabseilla pneumonia 21.36% واقل نسبــة عزل كانـت لبكتريا Staphylococcus epidermidis بنسبة عزل 1.7% , في حين كانت نسب العزلات البكتيرية التالية Acinetobacter baumannii , Escherishia coli , . Enterobacter claocae ,Staphylococcus aureus , Burkholderia cepacia, Pruteus mirabillis, , Pantoea agglomerans بنسبة عزل. 12.36% , 11.1% , 5.12% , % 5.12 , 3.41% , 2.56 على التوالي.تناولت الدراسة الحالية بعض الجوانب الوبائية للحالات المصابة التي شملت معلومات عن المرضى المصابين بالحروق التي تضمنت الجنس , العمر , موقع السكن ونوع الحرق. وبينت النتائج ان عدد الحالات المشخصة كاصابات حروق للذكور كانت بنسبة 42.9% بينما كانت نسبة اصابة الاناث 57.%, تم تقسم المرضى الى عدد من المجاميع حسب الفئات العمرية. اعلى نسبة اصابة كانت في الفئة العمرية 9 - 1سنة بنسبة 54.2% وهي الفئة الخاصة بالاطفال تليها الفئة العمرية erishi29 - 20 بنسبة 20.56% واقل نسبة اصابة كانت في الفئة العمرية 49 - 40 بنسبة 4.67% وكانت نسب الفئات العمرية الاتية 19 - 10 , 39 - 30 بنسبة 11.21 , 9.34 على التوالي. اشارت النتائج الى ان حالات الاصابات المشخصة توزعت بنسب متفاوتة فيما يتعلق بنوع الحرق اذ كانت اعلى نسبة اصابة بالحروق بواسطة الماء المغلي Boiled water 38% تليها اصابة الحرق بواسطة لهيب الغاز Fire by gas flame بنسبة 28.9% واقل نسبة اصابة كانت لحروق الصدمة الكهربائية بنسبة 4.67%.اما فيما يتعلق بطبيعة ومكان السكن فقد اظهرت الدراسة ان اعلى نسبة اصابة كانت بين الافراد الذين يسكنون المناطق الريفية بنسبة 84.1% في حين كانت اصابات المركز بنسبة 15.88% . وجدت الدراسة الحالية ان نسبة الاصابة بالحوادث غير المقصودة كانت 86.9% في حين كانت الاصابات المقصودة 13% , لوحظ في الدراسة الحالية ان اعلى الاصابات بالحروق كانت تحدث في فصل الشتاء بنسبة 75.7% مقارنة باصابات الحروق في فصل الصيف 24.29% .اما بالنسبة الى اختبار فحص الحساسية فقد بينت نتائج الدراسة الحالية ان اكثر المضادات الحيوية فعالية ضد كل من البكتريا السالبة لصبغة كرامBacteria Gram negative والموجبة لصبغة كرام Gram positive هي Ceftazidin , Ciprofloxacin,Amicacin .واظهرت الدراسة ان اكثر العزلات مقاومة هي بكتريا P.aeruginosa التي اظهرت مقاومة لكل المضادات الحيوية بنسب متفاوتة. اكدت نتائج الدراسة الجزيئية لتضخيم جين 16SrRNA ان كل العزلات اعطت نتيجة موجبة لهذا الجين وان حجم الجين لكل الانواع البكتيرية كان 1500pb كذلك اكدت النتائج ان الحصول على500Pb من DNA Sequencing للجين 16SrRNA كافية لتشخيص الانواع البكتيرية كلا على حدة . ايضا تم مقارنة جميــــع نتائج DNA Sequencing للانواع البكتيرية (Pseudomonas aeruginosa ,Escherishi coli, Enterobacter cloaca , Proteus mirabillis, , Klebsiella pneumonia Staphylococcus.heamolyticus ,) التي اكدت تشابه نسب تتابع القواعد النيتروجينية مع نسب القواعد النيتروجينية المخزونة في البنك الجيني باستخدام برنامج MEGA6 Moleculas Evolutionary Genetics Analysis)) اكدت نتائج الدراسة الحالية على وجود 21 سلاله جديدة قيد التسجيل واعطيت الرمز TQU1 الى TQU12. | The present study addressed the examination and preview the 107 patients. who were randomly selected (males and females) and who ranged in age from 1 - 45 years old and have fallen asleep at the Hussein Teaching Hospital of the, period from Jon 2015 to November 2016. where he conducted clinical examination by a specialist doctor and diagnosed as a case of burns satisfactory result for different reasons. specimens were cultured on appropriated culture MacConkey agar, Blood agar and Nutrient agar, diagnosed isolates by phenotypic tests, Biochemical test, diagnosis factor API20E system Vitek 2 compact, as well as to molecular diagnostics, During this study, In total 117 bacterial isolates.109 isolates were Gram - negative bacilli and 8 were Gram - positive cocci. he distribution of bacterial isolates diagnosed Pseudomonas aeroginosa 32.47%, Klabseilla pneumonia 21.36% and the lowest rate was to isolate the bacteria by isolating Staph.epedermidis 1.7%, while the following bacterial isolates Acinetobacter baumennii, Escherishia coli, Enterobacter claocae, Staphylococcus .aueus, Burkholderia cepesa, Pruteus mirabillsi, Pantoea agglomerans by isolating : 12 : 82% , 11.1% , 5.12% 5.12% 3.41% 2.56 respectively. The present study addressed some of the epidemiological aspect of infected cases burns,which included information on patients with with burns, which included sex, age, residence location (place), burning type. The results showed that (42.9%) isolates were males and (57.%) were female.The most frequent patient were belonged to the 0 - 9 years old (54.2%) which is for children. 29 - 20 followed by isolation of 22 20.56% and less isolating rate was in the 49 - 40 age group. Created results also cases of infections diagnosed were distributed to varying degrees with respect to the type of cremation, where the highest rate of injury burns Boiled water 38%, followed by the burning by flames gas Fire 28.9%,Fire by gasoline flames (19.6%),Hot liquids (8.41%) and Electrical Shock(4.67%). As for the nature and place of residence have study found that the highest proportion of cases were among individuals who live in rural areas increased by 90 injured 84.1% while the injuries the center has reached 17 cases of burn injury by 10.88% ,Frequency of the manners of burning based on intention or accidentally was as follow : (86.95) of patients were burned accidentally and (13%) were intenion. Present results showed that the most frequent burning (75.7%)was occurred during winter. The lowest frequency (24.2%)was belonged to summer .So the most common time of burning of present was during winter. As for the screening test sensitivity was shown the results of the current study that the most effective antibiotics against both Gram - negative bacilli bacteria and Gram - positive cocci were Ceftazidin, Ciprofloxacin, Amicacin while most of isolates showed high resistance to Ticarkcillin, Gentamicin, Impenem. Where the highest proportion of resistant bacteria P.aeruginosa which showed high resistance to all antibiotics in different proportions. It showed the results of the molecular study to amplify the gene 16SrRNA that all isolates gave a positive result and it's within the range 1400pb - 1500 pb. Also it has been compared to the results of all the DNA Squencing bacterial species (P.aeruginosa, E.coli, E.cloaca, A.baumennii, P.mirabili), which confirmed its similarity ratios nitrogenous bases relay with nitrogenous bases ratios stored in the gene bank

التوصيف الجزيئي لبعض الفطريات الانتهازية المعزولة من المرضى الضعاف مناعيا واختبار حساسيتها تجاه مستخلص الثوم == Molecular Identification of Some Opportunistic Fungi Isolated from Immunocompromised Patients and Their Testing Sensitivity Against Extract of Garlic ( Allium sativum)

Author name: هند حبيب عبد الامير الفرطوسي
Supervisor name: ياس خضير عباس | ميثاق ستار عبود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية العزل والتوصيف الجزيئي والمظهري لبعض الفطريات الانتهازية من القناة التنفسية السفلى للمرضى الضعاف مناعيا المراجعين لقسم الاورام في مستشفى الحبوبي والمراجعين للعيادة الاستشارية للامراض الصدرية في محافظة ذي قار (جنوب العراق) حيث تم جمع 130عينة قشع sputum للفترة من 1/10/2015 الى 1/5/ 2016 . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع 85عينة وبنسبة 65.38% , اذ شكل عدد عينات الاناث الموجبة 21 عينة وبنسبة 46.67 % , اما عدد عينات الذكور الموجبة فقد بلغ 64 عينة وبنسبة 75.29% . ظهرت اعلى نسبة عزل عند الفئة العمرية 61 - 70 سنة وبنسبة 32.94 % بعدها الفئة العمرية 31 - 40 سنة وبنسبة 15.25 % . وتم الحصول على 106 عزلة فطرية . باستخدام طرق التشخيص المظهرية والجزيئية, بينت هذه الدراسة ان اعلى نسبة ظهور للفطريات المعزولة تمثلت بجنس spp. Candidaثم جنس Aspergillus spp.تلاه جنس Penicillium spp. بالنسب المئوية 49.41% 38.32 % 21.17 % وبالترتيب . كما ظهرت Candida albicans ثم Aspergillus flavus بالنسب المئوية 36.47 % , 12.94% بالترتيب, كما تم تسجيل 15 عزلة من الفطريات المعزولة في البنك الجيني الدولي . شملت الدراسة استخدام اربعة مذيبات عضوية وهي الايثانول, الاسيتون, الميثانول والماء بحيث كان قد استخدم من المذيبات الثلاثة غير الماء التراكيز 50%, 70% فضلا عن التركيز المطلق للحصول على مستخلص الثوم. اختبرت اربعة تراكيز من كل مذيب ضد 11 نوعا من الفطريات المعزولة, واظهر المستخلص المائي كفاءة جيدة في تثبيط جميع انواع الفطريات المدروسة بالمقارنة مع المذيبات العضوية الاخرى اذ بلغ اعلى معدل تثبيط عند التركيز400 مايكروغرام\مل بحيث ابدى الفطر Penicillium notatum تاثرا كبيرا للمستخلص المائي الذي بلغ اعلى معدل تثبيط له (60 مليمتر) عند التركيز المذكور . حددت الفعالية الحيوية لكل مذيب ضد كل الفطريات المدروسة وتم مقارنة المستخلص مع ثلاثة مضادات فطرية Miconazole وNystatin وAmphtericin B واظهر المضادان الاول والثاني تاثيرات متباينة اما المضاد الثالث فلم يظهر اي تاثير على الفطريات المختبرة . تم تحديد السمية الخلوية للمستخلص المائي الخام باستخدام كريات الدم الحمر ولم يتسبب في اي تحلل دموي. كذلك تضمنت الدراسة الكشف عن المركبات التي يحتويها المستخلص المائي للثوم باستخدام الكشوفات النوعية وتقنية كروماتوغرافيا الغاز GC فكشفت تلك الطرائق وتقنية كروماتوكرافيا الغاز بان المستخلص يحتوي على القلويدات والفينولات والفلافونويدات والتربينويدات والتانينات والكاروتينات بالاضافة الى وجود الاحماض الامينية ومركبات كبريتية اهمها الاليسين allicin واخرى اروماتية | The current study included isolation and molecular and phenotypic identification of some the opportunistic fungi from the lower respiratory tract of the immunocompromised patients in the Department of Oncology and Thoracic Consultant Clinic of Alhaboobi hospital at Thi - Qar Province ( South of Iraq). The specimens of sputum were 130 which collected during 1/ October /2015 until 1/May/2016. The study showed that 85 of the collected specimens appeared as positive results which were 65.38% of the ratio in which the females ones were 21 (46.67%) specimens while 64 (75.29%) for males. In addition that, the highest ratio of the positive results was recorded in the ages of 61 - 70 years, followed by 31 - 40 years which were 32.94% and 15.25%, respectively. Totally, 106 isolates of the isolated opportunistic fungi appeared from the positive specimens. Through using morphological methods and molecular techniques, this study showed the first rank of the isolated fungi was Candida spp followed by Aspergillus spp, and Penicillium spp which possessed ratios of 49.41%, 38.32% and 21.17, respectively. According to the species, the first ratio of the isolation was Candida albicans followed by Aspergillus falvus, as 36.47%, 12.94%, respectively. Fifteen fungal isolates of the present study were recorded in the Gene Bank of NCBI. In this study, the extracts of Allium sativum were separately obtained by using four organic solvents (ethanol, acetone, methanol and water) and three concentrations (50%, 70% and absolute) of each solvents except water. Four concentrations of each extract were tested against 11 species of the isolated fungi in which the water extract gave the best value of the bioactivity including highest inhibitory value (60 mm) against Penicillium notatum by using 400µg\ml compared with the extracts of ethanol, acetone, and methanol. The bioactivity of Allium sativum extracts of each solvent was done against the tested fungi in comparison with Amphotericin B, Nystatin and Miconazole in which two of them produced the different bioactivities while Miconazole had no effect. The blood cytotoxicity of the crude water extract was performed against red blood cells and it did not appear any hemolysis. The chemical tests and Gas Chromatography (GC) revealed that the water extract contains alkaloids, phenols, flavonoids, terpenoids, tannins and carotenes in addition to sulfur formations, such as allicin as well as aromatic compounds.

التحري الجزيئي والوبائي لطفيلي المتحولة Entamoeba Spp. في الاطفال المصابين بالاسهال في محافظة ذي قار == Molecular and Epidemiological investigation of the Parasite Entamoeba Spp. In children with diarrhea in Thi Qar Province

Author name: منار كريم كاظم السعيدي
Supervisor name: فاضل عباس منشد العبادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: شملت الدراسة الحالية فحص 3909 عينة غائط للاطفال دون سن 12 سنة الذين يعانون من الاسهال ويشكون من الام بطنية والمراجعين لمستشفى بنت الهدى التعليمي ومستشفى الشهيد محمد الموسوي والمراكز الصحية والعيادات الخارجية في محافظة ذي قار خلال المدة من شهر تشرين الاول 2015 لغاية شهر ايلول 2016 تضمنت الدراسة ثلاثة محاور رئيسة . المحور الاول هو تشخيص جنس المتحولة مجهريا باستعمال المسحة المباشرة الرطبة وطريقة التركيز وذلك للكشف عن الاطوار المتغذية والمتكيسه للطفيلي واظهرت اصابة كلية بجنس المتحولة Entamoeba spp. بنسبة 26.86% واختيرت 80 عينة من العينات الموجبة مجهريا لتاكيد التشخيص باستعمال الفحص الجزيئي PCR بواسطة الجين 18S rRNAفسجلت الدراسة اصابة كلية بطفيلي المتحولة بنسبة 35% ، اظهرت نتائج الفحص باستعمال طريقة Nested PCR لتمييز الانواع (Species Specific) اصابة بطفيلي المتحولة الحالة للنسج Entamoeba histolytica بنسبة 39.29% وبطفيلي المتحولة المتغايرة Entamoeba dispar بنسبة 39.29% . فحصت العينات الموجبة (28) للPCR باستعمال Real - Time PCR وبوجود المجسان Probes المجس Histolytica - 96 T الخاص بالمتحولة الحالة للنسج والمجس Dispar - 96 T الخاص بالمتحولة المتغايرة وذلك لتاكيد التشخيص وتمايز الانواع فثبت وجود المتحولة الحالة للنسج باعلى نسبة 53.57% والمتحولة المتغايرة بنسبة 39.29% والانواع الاخرى لجنس المتحولة بنسبة 7.14% وبفارق معنوي بين الطريقتين الجزيئيتين مع وجود تاثير معنوي لنوع الطفيلي في احداث الاصابة . اظهرت الدراسة اصابة مفرد لطفيلي E. histolytica بنسبة 45.50% ولطفيلي E.dispar بنسبة 27.20% فيما سجلت اصابة مختلطة بنسبة 27.30% كما وسجلت وجود كريات الدم الحمر في 80% من العينات الموجبة لوجود E. histolytica وبنسبة 54.55% من العينات الموجبة لوجود E.dispar . تضمن المحور الثاني دراسة انتشار الاصابة بجنس المتحولة من خلال دراسة علاقة الاصابة مع بعض العوامل الوبائية ، منها فصول السنة التي اظهرت وجود فروق معنوية P≤0.05 فكان فصل الصيف اعلى الفصول من حيث نسبة الاصابة 37.06% وادناها في فصل الشتاء بلغت 14.14% ، كذلك لم تبين النتائج وجود فروق معنوية للاصابة فيما يخص الفئات العمرية فكانت النسب اعلاها بين الاطفال دون (3) سنوات فبلغت 30.50% ادناها بين الاطفال في الفئة الاعلى من (10) سنوات بلغت 17.13% ، لم تسجل الدراسة اية فروق معنوية في نسبة الاصابة بالطفيلي بحسب الجنس فسجلت نسبة 26.87% و26.85% للاناث والذكور على التوالي، في حين اظهرت الدراسة وجود فروق معنوية ملحوظة فيما يخص المستوى المعاشي فكانت نسبة الاصابة لدى الاطفال الذين ينتمون للعائلات ذات الدخل المحدود هي الاعلى 37.98% واقلها للذين ينتمون للعائلات ذات الدخل فوق الجيد وبلغت 10.11% كما سجلت النتائج وجود فروق معنوية في نسب الاصابة حسب المستوى التعليمي للابوين فكانت نسبة الاصابة عالية لدى الاطفال الذين المستوى العلمي لذويهم دون الابتدائية مقارنة بذوي الاطفال من حملة الشهادات الجامعية وبلغت النسب 36.85% و8.55% على التوالي فيما يخص عدد افراد العائلة كانت نسبة الاصابة عالية وبفارق معنوي لدى الاطفال الذين ينتمون لعائلات تتكون اكثر من (10) افراد واقلها للذين ينتمون لعائلات التي يبلغ عددها (5 - 3) افراد بنسب بلغت 36.95% و8.54% على التوالي . تضمن المحور الثالث دراسة بعض المعايير الدمية ومعرفة التغير في نسبة هذه المعايير لدى الاطفال المصابين بالطفيلي عند مقارنتها بالمعايير الدمية للاطفال الاصحاء وتم ذلك باستعمال جهاز Coulter Counter . جمعت 150 عينة دم من الاطفال المصابين بطفيلي المتحولة و50 عينة دم من الاطفال الذين يمثلون مجموعة السيطرة الاصحاء وتبين وجود فروق معنوية واضحة في نسبة خضاب الدم 10.16%وحجم كريات الدم الحمر المضغوط 34.7% حيث لوحظ انخفاضهما في مجموعة المصابين مقارنة بالقيم في مجموعة السيطرة التي بلغت 12.34 و39.10 على التوالي. سجلت نتائج العد الكلي لخلايا الدم البيض وجود ارتفاع معنوي في الاطفال المصابين مقارنة بمجموعة الاطفال الاصحاء وبلغت 11.3، 8.37 على التوالي وفيما يخص العد التفريقي لها فقد بينت النتائج وجود ازدياد بفارق معنوي في عدد الخلايا العدلة 6.92 و4.03 والخلايا الحمضة 0.61 و0.17 والخلايا الوحيدة 1.19 و0.93 على التوالي ولوحظ كذلك وجود انخفاضا معنويا في عد الخلايا اللمفاوية في الاطفال المصابين مقارنة بقيمتها لدى اطفال مجموعة السيطرة التي بلغت 2.19 و2.76 على التوالي | The current study included examination of 3909 stool samples from under 12 years old children who visited Bint Al - Huda hospital, Martyr Mohammad Al - Mosawi hospital, medical centres and outpatient clinics in Thiqar governorate during the period from October 2015 until September 2016. All those individuals were suffering from diarrhea and abdominal pain. This study included the microscopic identification of Entamoeba Spp. using direct wet amount and concentration techniques in order to diagnose both Trophozoite and cyst stages of the parasite. The result revealed that 1050 (26.86%) of the collected samples were infected with Entamoeba Spp. Out of these infected samples, 80 were randomly selected for further confirmation by conventional PCR and 18S rRNA. Using this method, 28 (35%) was recorded to have Entamoeba Spp. Positive samples from conventional PCR were further examined by Nested PCR for species specific identification. The result of this method showed the presence of two species, E. histolytica (39.29%) and E. dispar (39.29%).Positive samples for molecular examination (28) were then examined by Real time PCR in order to verify and confirm the molecular results. Two probes were used, Histolytica - 96 Tfor E. histolytica and Dispar - 96 T for E. dispar. A significant difference was observed between two methods. E. histolytica was found to be higher percentage followed by E. dispar and then Entamoeba Spp., 53.57%, 39.29% and 7.14% respectively. The Real time PCR reported mono - infection with E. histolytica in 45.5% and with E. dispar in 27.2%, whereas reported mixed infections by both parasites in 27.3%. Red blood cells (RBCs) were detected in 80% E. histolytica positive samples and in 54.55% E. dispar positive ones.The environmental factors and their correlation with Entamoeba Spp. prevalence were also included in this study. The infection prevalence based on the seasonal variation showed significant differences P≤ 0.05. Summer recorded the highest infection prevalence whereas the lowest was in the winter, 37.06% and 14.14% respectively. Regarding the infection in age groups, the highest percentage (30.5%) was recorded in under 3 years old group and the lowest (17.13%) was found in above 10 years old one. However, no significant difference P≤ 0.05 was observed between these age groups. Furthermore, no significant differences were recorded betweenpatient’s sex. Entamoeba Spp. infection (37.98%) appeared to be higher in children who belong to families with low standard of living compared to those who are from families that earning a higher income (10.11%). A Similar pattern was found in Entamoeba Spp. prevalence based on the number of the patient’s family members. Higher prevalence and significant difference were reported (39.95%) in patients who belong high family member (above 10), compared to those from 3 - 5family member (8.54%).One hundred and fifty blood samples from infected children with Entamoeba Spp. and fifty samples from healthy children as a control were collected during the present study in order to observe the change in blood picture and parameters between two groups. Significant differences were reported in blood hemoglobin (10.16%) and volume of packed RBCs (34.7%) in the infected group compared to 12.34% and 39.10% in the control group. Total leukocyte count was found to be significantly higher in the infected group (11.3) compared to the individuals in the control group (3.37). Differential leukocyte count also showed significant differences in Neutrophils (6.92%, 4.03), eosinophils (0.61, 0.17), monocytes (1.19,0.93) and lymphocytes (2.19, 2.76) in infected and control groups respectively.

تاثير الاصابة التجريبية بطفيلي المقوسة الكوندية Toxoplasma gondii وبعض الادوية على خصوبة الجرذان المختبرية Rattus norvegicus == Effect of experimental Toxoplasma gondii infection and some drugs on fertility rats Rattus norvegicus

Author name: زهراء سعدون هادي الغزي
Supervisor name: فاضل عباس منشد العبادي | علي اسماعيل عبيد السنافي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: This study included 3 stages. In the first stage, Toxoplasma gondii was isolated from aborted women placenta who visited Bent Al - Huda hospital and Al - Shatra hospital after confirmation of the prescence of parasite by impression smear method. Then parasite uspension injected 0.3 ml which contain 100 cyst intraperitoneally (174 rat) to 87 male and 87 female rats, inaddition to control group 30 rat (15 male and 15 female). After 10 days of injection, diagnosed the acute infection by Real - Time Poplymerase Chain Reaction(Real - Time PCR) and showed 97.70% (170 infected rat and 4 noninfected rat) , in male 96.55% (84 infected rat and 3 noninfected) ,in female 98.85% (86 infected rat and 1 noninfected) . After 2months of infection 84 animals (42 males and 42 females)were sacrificed, dissected (brain, testis and ovary ) were isolated to confirm the occurance of chronic infection with the using Real - Time PCR. The incidence of infection was 100% in brain males and ovary females and recorded 71.43% in testis and 90.48% in brain females. So diagnosed infection by impression smear method, identified the amount of DNA of the parasite T. gondii by using Real - Time PCR. The use of the remaining number of animals within the following experiments.The second stage included effect of experimental Toxoplasmosis infection and some drugs on fertility 168 rat (84 male and 84 female). Animals were subdivided into 6 groups for each group included 14 rat : (First group) non infected treated by DMSO, (Second roup) non infected treated by Sulfadiazine, (Third group) non infected treated by Pyrimethamine, (Fourth group) infected treated by DMSO, (Fifth group) infected treated by Sulfadiazine and (Sixth group) infected treated by Pyrimethamine.The current study results revealed prominent effect of T. gondii infection on the hormonal level in both males and females. T. gondii infection induced significant decline in Luteinizing Hormone (LH), Follicle Stimulating Hormone (FSH) and Testosterone levels in nfected male compared with non infected males treated by DMSO. Sulf. and Pyr. treatment significantly elevated the level of these hormones (P <0.01) in infected males compared with fourth group similar to levels its in first group. Toxoplasmosis in female rats significantly decrease FSH, LH, Estrogen and Progesterone levels in compared with first group, while treating of infected females with Sulf. and Pyr. didn,t improve the declined levels of these hormones in infected and noninfected females comparedwith fourth and first group, respectively.The study showed that Toxoplasmosis in male rats induced significant decline in the sperm count in the epididymal cauda, sperm viability and relative weights of male sexual organs with an increase in sperm malformation ratio in infected male compared with first group. Treatment with Sulf. and Pyr. in infected male significanthy elevated the sperm count and viability (P<0.05), compared with fourth group. Sulf. didn,t induced further significant changes, but Pyr. induced further significant increase in sperm malformation ratio in infected (P< 0.01) and non infected (P<0.05) rats. The study also revealed that Toxoplasmosis significantly decrease the relative weight of ovary and uterus compared with first group, while treatment with Sulf. and Pyr. increased the declined relative weight of the ovary and uterus in the infected females.Testicular histological section of Toxoplasmosis infected male rats treatment with DMSO showed vacular degeneration of spermatogonia and spermatocytes. The seminiferous tubules revealed sever degeneration, shrinkal, necrosis, hemorrhage. Seminiferous tubules lumen contained little amount of sperm with appearance of gaint cell, polymorphonuclear leukocytes and exfoliated cellular debris. Metamorphosis and disintegration of the tissue between the seminiferous tubules was also observed compared to the first group that showed complex histologically intact while testes sections of infected rats treatment Pyr. and Sulf. showed improvement by removing histocompatibility damage caused by the parasite infection.The epididymal sections of T. gondii infected rats treatment with DMSO showed infiltration of mononuclear and multinucleated gaint cell. Sections also showed hyperplasia of duct lining and contained tissue cyst of T. gondii. All these changes were improved in infected males treated by Sulf. and Pyr. Ovary sections of the infected females treatment with DMSO compared with first group revealed decreased primary and secondary follicle increased follicle atresia. Histological sections of ovary females showed in the fifth and sixth group to increase the number of primary and secondary follicles and decreased number of follicle atresia compared overian sections for the fourth group. Uterine sections of the infected females treatment with DMSO showed hypertrophy, increase endometrial thickness and myometerium, increase polymorphonuclear cell infiltration, fewer glands and congestion of blood vessels compared with first group. Histological sections for ovary females of the fifth and sixth group showed changes but less severe than is present in the fourth group.In third stage from studying Toxoplasmosis on fertility parameters of male and female rats, 84 rat(42 male and 42 female) which showed the results of the current study, when paired fertilized healthy females by males is infected and infected of T.gondii treatment with Sulf. , Pyr. and DMSO, and inversion, there is the effect of the parasite and used drugs the percentage of getting pregnant and pregnancy size and rate of embryos weight and placental weight and increase the proportion of fetal resorption and the proportion of early loss of embryos in fertilized healthy females by males five groups compared to the first group.Based on that conclude from the study that the infection of parasite T. gondii had negative effects on the fertility of male and female, and that all of thePyr. and Sulf. were not honest is the other of the impact on reproductive functions.

دراسة جزيئية ومناعية لالتهاب الكبد الفيروسي نمط جـ لمرضى الثلاسيميا في محافظة النجف الاشرف - العراق == Molecular and immunological study for Hepatitis C virus in Thalassemia patients in AL - Najaf AL - Ashraf / Iraq

Author name: ناديه حبيب سرحان الشيباني
Supervisor name: موسى نعمة مزهر | جميل جري يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
First pages:
Abstract: This study was conducted to detect the infection percentage of Hepatitis C Virus (HCV) in the samples of thalassemic patients in AL - Najaf Governorate.About 130 suspected cases attending AL - Zahra'a hospital for children and delivery in Al - Najaf city during period from 1st of November (2014) to 28thof April (2015).Only 69 samples were carried out in this study .The practical side for this study followes three main paths : 1 - The Molecular identification of the presence of Ribonuclic acid of Hepatitis C virus in Thalassemic patients by using RT - PCR.2 - Using the Enzyme Linkedimmunosorbant assay (ELISA - III)technique to determinate immunological markers anti - HCV IgG and interleukine - 28B (IL - 28B).3 - Using theCYANHemato devicefor the purpose of counting blood cells which is called Coulter - Method to give a Complete blood count(CBC).The overall results obtained in this study were as follows : - Out of 69 samples,25(36%) samples of thalassemic patients were infected with Hepatitis C virus, 16 male and 9 female ,their age range from (4 - 43) years ,while 44(64%) samplesof thalassemic patients were withoutHepatitis C virus infection , 22 male and 22 female, their age range from (3 - 35) years . - The result showed that 25samples seropositive to anti - HCV IgG in all age groups where the age group (10 - 20) years old has thehighest percentage among other age groups. - The result of the examination of HCV - RNA Eleven of (25) HCV seropositive patients were positive to RT - PCR technique. - The result of this study showed that level of Interleukin - 28Bin thalassemic patients with HCV was high (mean or significant) (12733.33) pg/ml as compared with thalassemic patients without HCV (270.0463) pg/ml and control(12.1267)pg/ml. - The result also has revealed that the hematological parameters of white blood cells (WBCs),monocytespercentage (MON) and lymphocytes percentage (LYM) significantly have increased (P<0.05) in Hepatitis C patients compared to those of control group. - Granulocytes(GRA) showed a significant decrease (P<0.05) in percentage in Hepatitis C patients compared to those of control groups.

دراســـــة بعض المعايـــــير الجزيئيـــــة والمناعيـــــة لبكتيريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثيسيلين والمعزولة محليا من الاصابات الجلدية المكتسبة مجتمعيا

Author name: هدى سعد عزاوي
Supervisor name: سلمان عزيز | سميرة كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
Key words:
  • المكورات العنقودية الذهبية
  • الخراج ونضح الجروح
  • الاصابات الجلدية
First pages:
Abstract: تعد البكتيريا العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المكتسبة مجتمعيا من الكائنات المجهرية المرضية التي تسبب طيفا واسعا من الاصابات في مختلف بقاع العالم في اماكن مختلفة من جسم الانسان اذ اقترنت امراضيتها مع اصابات الجلد والانسجة الرخوة . تهدف هذه الدراسة الى التعرف على مدى انتشار هذه البكتيريا في حالات اصابة انسجة الجلد المختلفة ,واجراء تقييم جزيئي لهذه البكتيريا المعزولة من حالات مرضية مختلفة , وتقييم مستوى بعض الحركيات الخلوية في مصول المرضى . وقد اشتملت على 169 عينة اخذت من المرضى المصابين بالتهابات الجلد المختلفة كـ الدمامل والخراج الجلدي والجروح والقدم المصابة بالقرحة لدى مرضى السكري وعدوى الحروق والحصف (القوباء) واخذت من المرضى الذين يراجعون العيادات الخارجية , والمراكز الصحية , وكذلك العيادات الخاصة, لمدة امتدت اكثر من خمسة اشهر , وللفترة من تشرين الاول 2014 م وحتى اذار2015 م. تضمنت الدراسة الحالية اخذ مسحات من الجلد المصاب بالالتهابات المرضية المختلفة وعينات دم ,من بين 169 عينة ,76 عزلة فقط اثبتت عائديتها الى جنس المكورات العنقودية الذهبية وبنسبة 45% من العزلات الماخوذة من حالات مختلفة لاصابة الجلد , وكان معدل العزل العام للعنقوديات الذهبية من القدم المصابة بالقرح لدى مرضى السكري 5 عزلات بنسبة 33% نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين 20% (عزلة واحدة ),اما المصابين بخراج الجلد والدمامل والقوباء الجلدي فكان معدل عزلها كالاتي (69)18 %,(55)21% , (31)9%,نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين (55.6)10% , (61.9)13%, (11.11)1% على التوالي . ان معدل عزل هذه البكتيريا من عدوى الجروح والحروق فكانت كالاتي (32)11%, (44)12% نسبة العزلات المقاومة للمثيسيلين منها (72.7)8%% (16.6)2, على التوالي . ان العزلات البكتيرية من المكورات العنقودية الذهبية المكتسبة مجتمعيا مقاومة لجميع مضادات البيتالاكتام وغير مقاومة للمضادات الحيوية التي لا تنتمي الى هذه المجموعة. اجري الكشف الوراثي باستعمال تقنية سلسلة تفاعلات البلمرة polymerase chain reaction اذ شخصت العزلات الخمسة والثلاثين باستعمال 3 جينات وهم mec Agene وهو الجين الخاص بالمقاومة للمثيسيلين , وكان عدد العزلات الحاملة لهذا الجين 22 عزلة من اصل 35 عزلة وبنسبة 62% . واخضعت العزلات المقاومة للمثيسيلين الى عملية تعريف للقطعة الكروموسومية النوع الرابعSCCmec IV اذ يعد هذا النوع سمة تفريقية للعزلات البكتيرية من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين والمكتسبة في المجتمع ، اذ وجدت بنسبة 100 % . كذلك تم التحري عن امكانية تواجد مورثة الذيفان الخارجي Panton Valatine leukocidine ( pvl ) باستعمال تقنية تفاعلات البلمرة PCR اذ شخص في 19 عزلة بكتيرية بنسبة 54% ، اقترن وجود السم بالاخص مع حالات الاصابة بالدمامل والخراج والجروح . اجريت الفحوصات المناعية عند المصابين بالتهاب انسجة الجلد , وذلك من خلال تقييم مستوى بعض الحركيات الخلوية مثل IL - 8 وLTB - 4 باستعمال طريقة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم Enzyme linked Immune Sorbant assay وقد لوحظ زيادة معنوية في تراكيزها في مصول المرضى مقارنة بعامل السيطرة . | Community acquired methicillin resistant Staphylococcus aureus is one of the pathogenic micro - organism that cause a wide spectrum of infections in different sites of the human body where their pathogenicity is related to skin and soft tissue infection. This study is aimed to explore the role of this bacteria in different cases of skin infections.The genetic structure of these isolated strains of Staphylococcus aureus was also one of this study targets to evaluate immunological response by measurement of concentration of some cytokines as indicator of immune response. One hundred sixty nine patients with different cases of skin infection were enrolled in this study by taking one skin swab from each patient with different skin infection as Furuncle, boil, wound infection, impetigo and burns infection. All these cases were taken from out - patient clinics and private clinic along 5 months period from October 2014 to march 2015 in AL - Najaf Province , From the 169 swab samples only 76 swabs were shown to be positive Staphylococcus aureus with percent 45%.The percent of isolates of S. aureus from different cases of skin infection (5) isolates from diabetic foot with 20% of them are Methicillin resistant (one isolate) and skin abscess, boil, and impetigo were 18(69%),21(55%),9(31%)from which methicillin resistant were 10(55.6%), 13(61%) and 1(11.11%) respectively Percent of isolates from wound &burns infection were 11(32%) and 12(44%) and methicillin resistant isolates were 8 (72.7%) and 2(16.6%) respectively . The process of diagnosis of methicillin - resistant isolates was performed by using sensitivity test for cifoxitin following (CLSI,2014) instruction . Only 35 isolate showed resistant to methicillin when Cefoxitin disk was used then antibiotic sensitive test for other antibiotic disks done., Isolates of CA - MRSA showed resistant to all β - Lactam antibiotics and also to other drugs that are not belonged to this type of antibiotics. Genetic study was evaluated by using PCR technique to diagnosis the following genes in 35 isolates : mecA gene : which is considered responsible for methicillin resistant ,it was found that only 22 from 35 isolates (62%)carrying the gene. SCCmec IV gene which restricted only to Community acquired isolates of Staphylococci were explored in the isolates which considered a diagnostic character for Community acquired Staphylococci and this gene was found in 100% of isolates . Exotoxin panton - valatine toxin also diagnosed in 19 isolates with percent 54% in isolates of S. aureus using PCR technique. This exotoxin was produced in cases of Furuncle, skin abscess, and wound infection . Immunological test was introduced in this study to evaluate the innate immune response by measuring the concentration of Cytokines IL - 8&LTB4 which showed significant elevation in their concentration in comparison with healthy persons.

دراسة لاعتلال الاعصاب المحيطية عند مرضى الداء السكري من النوع الثاني == Study of peripheral neuropathy in patients with diabetes mellitus type II

Author name: اسراء ماجد نعمة عبيد العيكاشي
Supervisor name: سحر محمود جواد الجمالي | عمار جبار حمد الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
First pages:
Abstract: Diabetes mellitus is one of the most chronic diseases that is widely spread all over the world and affects all age groups. The disease has a vast potential to affect almost every body organ, especially the peripheral nerves, which causes high mortality rates from disease complications. These complications cause damage in the organs of the body including the nerves located in the limbs that generate an intense heat resulting from the destruction of nerve fibers in addition to the acute pain resulting from the effect of diabetes in those nerves. This study was designed to determine the sensitivity of those nerves by displaying the results of nerve conduction study for patients and compared it with their clinical examination to determine the severity of numbness and assess the level of pain in the upper and lower limbs.The study was conducted at the Diabetes and Endocrinology Center in Al - Sader Medical City in Al - Najaf governorate and it included following up the case of (78) patients with diabetic peripheral neuropathy by nerve conduction study. The study was began from 5/9/2014 until 7/4/2015. It included diabetic men and women, and they were divided into three age groups (35 - 68), and the study excluded the patients with peripheral neuropathy but have foot ulceration because the nerve connect system (SUDOSCAN REPORT ) was used in the current study, cannot perform nerve conduction study for patients with foot ulceration also smoking and the patients who taking treatment for diabetic peripheral neuropathy .During this study the clinical examination for patients was conducted and compared it with the nerve conduction study of them , also recording the information were related with the history of patients ,as while asmeasuring the concentrations of urea and creatinine in serum, in addition the study was recognized the effect of diabetes mellitus on the kidneys by estimating the ratio of albumin to creatinine in the urine, or named (ACR). the study compared the glycosylated hemoglobin levels and body mass index with the nerve conduction study results for all patients.The present study has shown a statistical significant difference (P <0.05) between the clinical tests of the patients who were tested by tuning fork as while as nerves test needle test and between nerve conduction study for both sexes also at all age groups included in the study. The results of the study did not show any a statistical significant (P>0.05). difference when compared the results of nerve conduction study among the different age groups for males. For females however, there was a statistical significant difference (P<0.05) amongst the different age groups.The results of the current study did not show a statistical significant difference (P>0.05) as regards the duration of injury for males, while it revealed a statistical significant difference among females (P <0.05), the results of the current study also observed the presence of a statistical significant increase (P<0.05) in the ratio of albumin to creatinine in patients with diabetic peripheral nervous for males and females.When compared the glycosylated hemoglobin (HbA1c) levels over the past three months, there are no a statistical significant differences (P>0.05) for males and females ,while the study revealed no a statistical significant increase (P> 0.05) in the concentrations of urea in males when compared to their nerve conduction study results, as well as theconcentrations of creatinine which did not show a statistical significant difference( P> 0.05) at them.The study was also revealed the presence of a statistical significant difference (P<0.05) in the concentrations of urea in females with diabetic peripheral neuropathic and did not show a statistical significant difference (P> 0.05) in the concentration of creatinine at them. The results of the current study did not show a statistical significant difference (P>0.05) between the body mass index among males and it showed a statistical significant difference among females (P <0.05)with peripheral diabetic neuropathy.The study reached that diabetes, with long periods of infection, has a crucial role in showing and the advancement of the disease for most of the patients, particularly those who lack the suitable amount of control over the percentage of the Glucose in the blood. The study also deducted that the disease is accompanied with kidney failure for most of the studied patients. It was also revealed that the nominees of some of the patients which appeared during their examination via tuning fork as while as nerves test needle was not the cause of their infection with diabetes, therefore, the study recommended the adoption of the results of the diabetic peripheral neuropathy to diagnose and asses the infection with peripheral nervous surround diabetes.

دراسة بعض العوامل البيئية المؤثرة في بعض انواع القشريات في نهر الكوفة == Study Som of Enviromental factors offecting Some Crustacea species in the Kufa river

Author name: ايمان حساني شباط السلامي
Supervisor name: جاسم حميد رحمة الخزاعي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة للتعرف على انواع القشريات وانتشارها في نهر الكوفة , وتاثير بعض العوامل البيئية على تواجدها , اذ جمعت عينات الدراسة شهريا للمدة من اب 2014 لغاية تموز 2015 من ثلاث محطات , الاولى : تقع شمال جسر الامام علي (عليه السلام) والثانية قرب مبزل ميسان والمحطة الثالثة قرب جسر الكوفة القديم ( قريبة من دار ضيافة المحافظة ) , اذ قيست العوامل البيئية الفيزياوية والكيمياوية مثل درجة الحرارة والاس الهيدروجيني والاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين والتوصيلية الكهربائية والكدرة , والعسرة الكلية وايون الكالسيوم . تراوحت الحدود الدنيا والعليا لحرارة الهواء 14.3) - 42.6 ) مo وحرارة الماء (13 - 30.4) مo والاس الهيدروجيني 6.8) - 9.6 ) والاوكسجين الذائب 2.9) - 9.1 ) ملغم / لتر والمتطلب الحيوي للاوكسجين 0.7) - 4.7 ) ملغم / لتر والتوصيلية الكهربائية 1162) - 2055 ) مايكروسيمنز/ سم والملوحة 0.7) - 1.31 ) جزء بالالف والكدرة 1.4) - 17.5) نفثالين وحدة كدرة والعسرة الكلية 210) - 930 ) ملغم / لتر وايون الكالسيوم 119 ) - 380 ) ملغم / لتر . تم خلال الدراسة الحالية تسجيل جديد لنوعين من القشريات الكبيرة لاول مرة في نهر الكوفة وهما الروبيان النهري Macrobrachium nipponense والسرطان النهري Potamon magnum اللذان يعودان الى رتبة عشارية الاقدام Decapoda , اذ سجل اعلى كثافة للروبيان النهري 63.58 ) ) فرد / م 3 في المحطة الاولى في شهر تشرين الاول واختفى في محطات الدراسة جميعها في شهر كانون الثاني وشباط , بينما سجل اعلى كثافة للسرطان النهري 32.89) ) فرد / م 3 في المحطة الاولى في شهر نيسان . وتم تشخيص 32 وحدة تصنيفية تعود الى رتبتين من القشريات الصغيرة , وهي رتبة Cladocera ورتبة Copepoda اذ وجد ان رتبة Cladocera هي الاكثر وفرة وغزارة في محطات الدراسة اذ تضم خمسة وعشرون نوعا , بينمراتبة Copepoda تضم سبعة انواع.تم تشخيص ثمانية اجناس من رتبة متفرعة اللوامس Cladocera وهي Bosmina , Daphnia , Ceriodaphnia , Simocephalus , Alona , Chydorus , Macrothrix وMonia , في جميع محطات الدراسة , ومن الاجناس التي سجلت اعلى كثافة هي جنس Bosmina وDaphnia بينما سجل الجنسين Macrothrix وMonia اقل كثافة اذ اختفت في معظم اشهر الدراسة وفي جميع محطات الدراسة. وتم تشخيص اربعة اجناس من رتبة مجذافية الاقدام Copepoda وهي Cyclops , Diaptomus , Microcyclops , Macrocyclops , ومن الاجناس التي سجلت اعلى كثافة هو جنس Cyclops ومن الاجناس التي سجلت اقل كثافة هو جنس Diaptomus . وتم تسجيل جديد لاحدى عشر نوع من القشريات الصغيرة Microcrustacea لاول مرة في نهر الكوفة تعود لرتبتين هما Cladocera وCopepoda وهذه الانواع هي umholtzil Daphnia , Daphnia galeata , Daphnia magna , Daphnia retrocurva , Simocephalus sexpinosus , Alona affinis , Chydorus gibbus , Monia micrura , Cyclops strenuous , Macrocyclops albidus , Microcyclops sp . , اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود علاقة ارتباط بين كثافة القشريات والعوامل الفيزياوية والكيمياوية المقاسة شهريا ولمدة عام , كذلك لوحظ وجود فروق معنوية بين اشهر ومحطات الدراسة بالنسبة لكثافة القشريات والعوامل الفيزياوية والكيمياوية عند مستوى P ≤ 0.05 . | This study was conducted to identify the types of Crustaceans and distribution in Al - Kufa River and the effect of some environmental factors on their presence , Study samples were collected monthly for the period from August 2014 to July 2015 of three stations, the first station is located north bridge Imam Ali , the second near the Missan trocar and the third station near old Kufa bridge . The Environmental factors, were measured ( physical and chemical) such as temperature , pH , dissolved oxygen, , electrical conductivity, salinity , turbidity ,total hardness (T . H) and calcium ion. Lower and upper limits for air temperature ranged from (14.3 - 42.6) Co and water temperature (13 - 30.4) C0 , pH (6.8 - 9.6) , dissolved oxygen (2.9 - 9.1) mg / L , the biological oxygen demand (BOD5) (0.7 - 4.7) mg / L), electrical conductivity (1162 - 2055) µs/ cm and salinity (0.7 - 1.31) ppt , turbidity (1.4 - 17.5) NTU, total hardness (210 - 930) mg / L and calcium ion ( 119 - 380) mg / L. During the current study, a new record of two species of Macrocrustaceans for the first time in AL - Kufa River Macrobrachium nipponense and river crab Potamon magnum which they return to the Order Decapoda, The highest density was recorded for the M. nipponense (63.58) individual / m 3 in the first station in October month and disappeared in the study, all stations at January and February, months , while the highest density of river crab P. magnum record (32.89) individual / m 3 in the first station in April month. in this study diagnosed 32 taxonomic unit return to Microcrustacea : Cladocera and Copepoda orders , also cladocera reverded where found that the most abundant and the abundance of plants in the study are Cladocera rank as comprising twenty - five type, while Copepoda rank of seven . Diagnosed eight genus belong to the Cladocera such as Bosmina, Daphnia, Ceriodaphnia, Simocephalus, Alona, Chydorus, Macrothrix, Monia, in all study stations, The genera Bosmina and Daphnia recorded high density while Macrothrix and Monia recorded low density which disappeared in the most study month in all study stations. Also four genera of the Copepoda were diagnose such as Cyclops, Diaptomus, Microcyclops and Macrocyclops, and genus Cyclops record high density while the genus Diaptomus recorded low density. eleven species of Microcrustacea were recorded for the first time in AL - Kufa River belonging to the Cladocera and Copepoda orders and these species are Daphnia umholtzil, Daphnia galeata, Daphnia magna, Daphnia retrocurva, Simocephalus sexpinosus, Alona affinis, Chydorus gibbus, Monia micrura , Cyclops strenuous, Macrocyclops albidus, and Microcyclops sp. Statistical analysis showed a correlation relationship between the density of Crustaceans and the physical and chemical factors measured per month for one year, also noted that there were significant differences between months and study stations for the intensity of Crustaceans and the physical and chemical factors at P ≤ 0.05

دراسة تاثـير المستخلصات المائيـة لنباتي الليمـون الحامـض والسعـد في ذكور الجرذان البيض السليمة والمصابة تجريبيا بداء السكري == Studying the Effect of Aqueous Extract of Citrus limon and Cyperus rotandus in alloxan induced in Diabetic Male Albino Rats

Author name: زهراء كريـم عبد الله حسن الميالي
Supervisor name: زينب شنيور مهـدي الطرفـي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
First pages:
Abstract: داء السكري هو اضطراب ايضي مزمن يتصف بارتفاع سكر الدم مع اضطراب في ايض الكاربوهيدرات والدهون والبروتين نتيجة لخلل في افراز الانسولين من قبل البنكرياس ، او تاثيره الحيوي اوكليهما، يشكل هذا الداء تهديد خطير ومتزايد على حياة الكثير من الناس ويعد المشكلة الرئيسية التي تودي بحياة الملايين، وما للنباتات الطبية اثر مهم في صحة الانسان كونها مصدرا مهما للعديد من الادوية والمستحضرات الطبية , وتكمن الفائدة الطبية لهذه النباتات في قابليتها على انتاج العديد من المركبات الكيميائية ذات الخصائص الصيدلانية التي تدخل كمادة اولية او عوامل مساعدة في صناعة الادوية ولكثرة استخدام الاعشاب (النباتات الطبية) في الوقت الراهن بوصفها الطب البديل جاءت هذه الدراسة . اجريت هذه الدراسة الحالية في كلية التربية للبنات / جامعة الكوفة للمدة من 2014/10/1 م ولغاية 2015/5/30 م وتضمنت الدراسة تحضير المستخلص المائي الحارلكلا النباتين (بذور الليمون الحامض Citrus limon ودرنات السعد (Cyperus rotundusوقد تضمنت الدراسة متابعة (42) حيوان من ذكور الجرذان البيض ، وتم تقسيمها الى سبعة مجاميع تضمنت كل مجموعة ستة ذكور ، اذ جرعت المجموعة الاولى فمويا بمحلول الملحي الفسيولوجي حسب وزن الجسم واعتبرت كمجموعة سيطرة (سالبة) ، اما المجموعة الثانية فقد حقنت تحت الجلد بالالوكسان (1 مل) واعتبرت كمجموعة سيطرة مصابة (موجبة)، اما المجموعة الثالثة فقد جرعت فمويا بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض بتركيز (500ملغم/كغم) بتركيز (750ملغم/كغم) وحسب وزن الجسم ، والمجموعة الرابعة جرعت فمويا بالمستخلص المائي الحار لدرنات السعد حسب وزن الجسم ، والمجوعة الخامسة فحقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم جرعت فمويا المستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض بتركيز (500ملغم/كغم) وحسب وزن الجسم، والمجموعة السادسة التي حقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم تم تجريعها فمويا المستخلص المائي الحار لدرنات السعد بتركيز (750ملغم/كغم) حسب وزن الجسم ، واخيرا المجموعة السابعة التي حقنت بالالوكسان تحت الجلد ومن ثم جرعت فمويا بعقار الاميرال (Glimepiride) بتركيز (0.1) ، علما ان التجريع قد استمر لمدة ثلاثين يوما كاملا وبواقع مرة واحدة يوميا .وقد اظهرت نتائج الدراسة ما يلي :  حصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في وزن الجسم واوزان الاعضاء (البنكرياس والكبد والكلية) لدى مجموعة السيطرة الموجبة(المحقونة بالالوكسان) عند مقارنتها بالمجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي، وعلى النقيض من ذلك فقد اظهر وزن الجسم وكذلك اوزان الاعضاء ارتفاعا معنويا (P< 0.05) لدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة.  وجود انخفاض معنوي (P< 0.05) في التعداد الكلي لخلايا الدم البيض وكريات الدم الحمر وتركيز الهيموغلوبين والصفيحات الدموية عند الحيوانات المصابة تجريبيا بداء السكري عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، على العكس من ذلك حصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في مجموعة الحيوانات السليمة لدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . حصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في مستويات الكلوكوز ، الكولسترول الكلي الكليسيريدات الثلاثية ، والبروتينات الدهنية واطئة الكثافة والواطئة الكثافة جدا وحصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وكذلك حصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في المعايير المذكورة اعلاه وارتفاع في البروتينات الدهنية عالية الكثافة في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . وحصول ارتفاع معنوي (P< 0.05) في فعالية الانزيمات الكبدية ALT, AST وALp والبلروبين لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وحصول انخفاض معنوي (P< 0.05) في فعالية الانزيمات اعلاه في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . حصول انخفاض معنوي (P< 0.05)في مستوى البروتين الكلي والالبومين والكلوبيولين لدى مجموعة السيطرة الموجبة عند مقارنتها مع المجاميع : السيطرة السالبة والمجموعتين المعاملتين بالمستخلص المائي الحار لبذور الليمون الحامض ودرنات السعد على التوالي والمجموعة المعاملة بالالوكسان وعقار الاميرال وكذلك المجموعتين المعاملتين بالالوكسان ومستخلص النباتين المذكورين على التوالي ، وحصول ارتفاع معنوي(P< 0.05) في في مجموعة الحيوانات السليمة ولدى المجموعتين المصابتين تجريبيا بداء السكري والمعاملتين بمستخلص النباتين كلا على حدا عندما تقارن بمجموعة السيطرة الموجبة . اشارت نتائج الدراسة النسجية للكبد حصول تغير نسجي للكبد في حالة ارتفاع السكر بالدم تمثل بحصول توسع بسيط بالجيبانيات ،واحتقان دموي مع حدوث تنخر للخلايا الكبدية ونزف فيها ، وظهور مناطق التهابية عدة واستسقاء مائي وبعد معاملة المجموعة المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للخلايا الكبدية . اشارت نتائج الدارسة النسجية للكلية حصول تغير نسيجي فيها في حالة ارتفاع الكلوكوز بالدم والمتمثل بخروج الانوية من الكبيبة الكلوية وتجمعها في اماكن متفرقة خارج الكبيبة وكذلك وجود نزف وتحطم في جدران الكبيبة والاوعية الدموية الموجودة ضمنها وتحطم واضح للقشرة الكلوية وعند معالجة الحيوانات المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للكلية . اشارت نتائج الدارسة النسجية للبنكرياس حصول تغير في التركيب النسيجي للبنكرياس في حالة الاصابة بالسكري نتيجة الحقن بمادة الالوكسان تتمثل بوجود النزف الحاد في جميع مناطقها وحصول توسع وتحطم في الخلايا وعدم انتظام اشكالها وانحلال الانوية وخروجها من اماكنها الصحيحة ولكن عند معالجة الحيوانات المصابة بالمستخلص المائي لكلا النباتين لوحظ رجوع الشكل الطبيعي للبنكرياس.وقد سجلت النتائج جميعا بشكل عام تاثيرا افضل للمستخلص النباتي لبذور الليمون الحامض قياسا بدرنات السعد والدرنات افضل من العقار في تخفيض سكر الدم اضافة الى تحسين الاضطرابات الايضية المتسببة عن داء السكري المستحدث بعقار الالوكسان . | Diabetes Mellitus is a metabolic disorder characterized by hyperglycemia due to a defect in Insulin secretion from the pancreas, insulin action or both, with disturbances in (carbohydrates, lipid and protein) metabolic due to a defect in Insulin secretion, Insulin action or both. This disease is a serious and growing threat to the lives of many people , it isthe main problem which cause death to millions,The medical plants have important impact on human health as an important source of many medicines and medical products. The medical advantage of these plants lies in their ability to produce many of the characteristics that the pharmaceutical intervention have as a primary material or contributing factors in the pharmaceutical industry chemical compounds. The frequent use of herbs (medical plants) at the present time as alternative medicine, as came in this study.This study was conducted at the Faculty of Education /University of Kufa during the period from2/10/ 2014 to 30/5/ 2015. The study included the preparation of aqueous extractsofCitrus lemonseeds and Cyperus rotundus tuber. Also the study includedthe use ofaqueous extractsofCitrus lemon at concentration (500) mg/kg andCyperus rotundus at concentration (750) mg/kgineach dosageaccording to the body weight of the albino rats (Ratus ratus). The study includes (42) white malerats divided into seven groups with six rat in each group and they were injected according to their weight in the following way : the first group was orally dosed with physiological saline and it was considered as a control(negative), the second group was injected with alloxan (1ml.) and were considered as infected control group (positive). The third group were also dosed orally with decocted extract of citrus lemon seeds in (500mg/kg). The fourth group was dosed orally with decocted extract of Cyperus rotundus (750mg/kg) concentration. The fifth group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with decocted extract of citrus lemon seeds in (500mg/kg) concentration. The sixth group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with decocted extract of Cyperus rotundus (750mg/kg) concentration. The seventh group was first hypodermically injected with alloxan and then orally dosed with Glimepiride with (0.1) concentration. The dosing continued for 30 days.  A significant decrease (P< 0.05) was shown in total body weight and organ weight such as pancreas, liver and kidney in uninfected control(Negative) when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds ad Cyperusrotundus tuber respectively, also,the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, we alsofound a significant increase (P< 0.05) in the above criteria in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with the positive control group.  A significant decrease (P< 0.05) was shown in the total WBC and RBC count , and the hemoglobin concentration platelets in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively, also the group was treat with Amyral and the group that were injected with alloxan and that which was treated with hot aqueous extracts of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, also a significant increase (P< 0.05) was shown in the above criteriain diabeticanimalsgroup compared with healthy control group, we also found a significant increase (P< 0.05) was shown in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with positive control group.  A significant increase (P< 0.05) was clear in the levels of glucose , total cholesterol, triglyceride, low density lipoprotein , very low density lipoprotein and a significant decrease (P< 0.05) in high density lipoprotein in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively.Also the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds ad Cyperusrotundus tuber, a significant decrease (P< 0.05) was clear in the above criteria and significant increasein high density lipoprotein in diabeticanimalsshown in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extracts when compared with the positive control group.  A significant increase (P< 0.05) the effectiveness of hepatic enzymes(ALT , AST ,ALP, Bilirubin) in uninfected control group when compared with other groups : in the two groups that were treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, respectively, also the group was treated with Amyral and the group that injected with alloxan and that treated with hot aqueous extract of Citrus lemon seeds and Cyperusrotundus tuber, also a significant decrease (P< 0.05) in the effectiveness of hepatic enzymes in diabeticanimals, a significant decrease (P< 0.05). The effectiveness of the above enzymes in the two groups that were injected by alloxan and treated by two extract when compared with the positive control group.  The presented histological study of the liver refers to the histological changes in the liver in the state of hyperglycemia that is represented by the expansion of sinusoid, blood accumulation, necrosis and bleeding in hepatocyte, presence of many inflammation areas, watery dropsically but when treating diabetic animals by aqueous extract of (Citrus lemon andCyperusrotundus), it wasnoted thatthey returned back to the normal shape of hepatocyte. The histological study of the kidneyrefers to the occurring of the histological changes in the kidney in the state of hyperglycemia that were represented by getting out the nucleus from glomerulous and aggregation in many area out theglomeruli, also, the bleeding or the destruction of glomerulous wall with blood vessels, the present distraction in kidney cortex but when treating diabetic animals with aqueous extract of (Citrus lemon and Cyperusrotundus), it was noted that it returned back to the normal shape of kidney. The histological study of the pancreasrefers to the occurring of the histological changes in infected diabetic animals by (alloxan) which represented an acute bleeding in all regions, destruction and expansion in kidney cells, abnormal shape, nucleus degenerative and leaving the true area but when treating diabetic animals with aqueous extract of (Citrus lemon and Cyperusrotundus), it was noted that it returned back to the normal shape ofpancreas.In conclusion, the results of this study indicate that the Citrus limonseeds and Cyperus rotundus tuberextracts gave good results, even better than the reference drug Amyral for loweringbloodsugar, in addition to improvingmetabolic disorderscaused byalloxan induced-diabetes

دراسة لتكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Escherichia coli وProteus mirabilis المعزلة من اصابات المسالك البولية في محافظة النجف الاشرف == Study of Biofilm formation of Escherichia coli and Proteus mirabilis isolated from urinary tract infection in AL - Najaf Al - Ashraf governorate

Author name: رسل عيدان محسن
Supervisor name: سهام جاسم محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Najaf
First pages:
Abstract: The aim of this study is to inferring the ability of biofilm production and virulence factors which has helped to form it into two types of bacteria P.mirabilis and E.coli. Two hundred and fifty samples have been collected from patients who are suffering Urinary tract infection (UTI) in Teaching Hospital at Al - Najaf Al - Ashraf during the period ( 1/10/2014 - 1/1/ 2015). The samples have has identified by diagnostic methods : culturing , microscopic , biochemical and using VITEK - 2 compact system more sensitively and specifically method.The results have been showed that the isolation ratio was 30 (37.5%) of E.coli, while P.mirabilis was 14(17.5%) also, a five isolates (6.5%) wereEnterobacter cloacae ssp cloacae and only two isolates (2.5%) were Raoultella ornithinolytica from the total number of specimens. The virulence factors and antibiotic sensitivity test of two bacteria : P.mirabilis and E.coli were determined and the more virulence and multidrug resistance were selected.The hemagglutination properties of P.mirabilis which isolated from clinical samples were determined , the reaction with red blood cells of human group O+ was explored. The ratio of Hemagglutination was reached 42.86%, 50%, 7.14% to MSHA, MRHA and NOHA respectively. However, E.coli has been a different results that was reached 30 % , 26.67% and 43.33% from type MSHA, MRHA and NOHA as well. On the other hand, the thin - film production (pellicle) has been formed by 13 isolates of bacteria P.mirabilis and 21 isolates of bacteria E.coli, when it was growth on the nutrient broth in a temperature 37˚C for 24 - 18 hours. Moreover, it has been shown that there is high affinity for adhesion with the epithelium cell in the urinary tract. In addition, the E.coli has proved the higher efficiency than P.mirabilis in adhesion. It was detected ability of bacteria to biofilm production in three methods. The bacteria E.coli have showed their ability on biofilm production where by the rate was (43.3, 52 and60)% on the different growth ways which was the Congo Red, the tube and the plate respectively.The gel electrophoresis has been done on all isolates which was to analyzed on adhesive factors genetically whereby the bacteria P.mirabilis, E.coli have shown ability to gene expression (fimH and afaB) with a rate of (42.86 and 28.57)% and (30 and 20)%, respectively.Also, it has been clarified that the antibiotics ( Ciprofloxacin, Amikacin and Ceftazidime) have an effect on the most virulent bacteria to prevent the formation of biofilm when it is taken a half of minimum inhibitory concentrations. It was found that the minimum inhibitory concentrations were the most efficient in the prevent a biofilm formation in both types of bacteria.It appears to be found that the minimum inhibitory concentrations of these antibiotics were the most efficient in the prevent the formation of biofilm in both types of bacteria. Ciprofloxacin has the high efficiency to prevent the biofilm formation in E.coli while this concentration has no effective on biofilm production from others. It has been found that there is a clear positive relationship between the presence of adhesion gene (fimH , afaB) and the ability to adhesion on the epithelial .The conjugation process was conducted successfully to transfer the adhesion genes between (E.coli and P.mirabilis) which have been considered a donor strains to transfer the genes to the standard strain E.coli HB101 which have been considered a receipt strains whereby have shown ability to adhesion and biofilm formation.

دراسة علاقة مجاميع الدم ABO مع البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والبين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني == Studying the Association of ABO Blood Groups with IL - 18BPa & IL - 18R beta in the Iraqi Arab Females with Diabetes Mellitus Type 2

Author name: زينب فاضل عبد الغفور
Supervisor name: اسماء محمد صالح المهيدي
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء السكري كمرض التهابي يرتبط مع العديد من العوامل الالتهابية لذلك تهدف الدراسة الحالية لحساب تركيز العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا مع عوامل الخطورة التقليدية والتي تشمل المقاييس الفيزيائية مثل متوسط محيط الخصر ومؤشر كتله الجسم وعوامل البيو كيميائية مثل الانسولين , مقاومة الانسولين , مستوى السكر في الدم في حاله الصيام ,مستوى الهيموغلوبين السكري وملف الدهون وفي الوقت نفسه دراسة ارتباطهم مع نظام الدم ABO في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني ومن اجل معرفة تاثير ذلك مع عوامل اخرى التي تعتبر كمؤشر او مطور لمرض السكري من النوع الثاني . وشملت الدراسة الحالية 340 مريضا من النساء العراقيات العربيات المشخصات حديثا بالسكري من النوع الثاني 200 من النساء الاصحاء اختبرت للتكرار الاليلي والمظهري ,ومن هؤلاء 60 مريضة اختبرت للدراسة المناعية والكيميائية مقارنة مع 28 من النساء الاصحاء .الاختبارات المناعية بواسطة استخدام تقنية الانزيم المرتبط المناعي, اما المقاييس الكيميائية باستخدام الاساليب الانزيمية واللونية, وتم تقسيم المرضى والسيطرة حسب مجاميع الدم الى اربعة مجاميع ثانوية (A , B ,AB ,O) وفقا لنوع فصائل الدم التي كشف عنها بواسطة الاختبارات المصلية القياسية .اظهرت البيانات الحالية : 1 - زيادة معنوية في المصل العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا في المرضى الحاليين ,في حين لم تظهر اختلافات معنوية في مستوى مصل العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .2 - زيادة معنوية في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة, في حين العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتزااد في المجموعة الاقل من 40 سنة وانخفض مع زيادة العمر في كل من المرضى ومجموعه السيطرة .بالاظافة الى زيادة كل عوامل الخطورةالاخرى.3 - تركيز كلا العاملين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا يزداد بشكل غير معنوي تدريجيا في كل المرضى مع زيادة مدة المرض ونفس النتيجة لمقاومة الانسولين.4 - اظهرت نسبة الهيموغلوبين السكري اقل من 7.3 % زيادة كبيرة في متوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وتنخفض تدريجيا مع زيادة نسبة الهيموغلوبين السكري .5 - الافراد الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا , الانسولين ومقاومة الانسولين .6 - المرضى الذين كانوا يحملون فصيلة الدم B والاصحاء الذين يحملون فصيلة الدم A اظهروا اعلى معدل لمتوسط العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا .7 - يعتبر العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا كعوامل خطورة مستقلة في النساء العراقيات العربيات المصابات بالسكري من النوع الثاني والتي تدعمها غياب العلاقة المعنوية بين العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا والعامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا وجميع عوامل الخطورة التقليدية الاخرى .8 - هنالك علاقة ايجابية بين مستويات العامل البين ابيضاضي 18 المرتبط بالبروتين الفا وخطورة السكري من النوع الثاني والذي قد يعتبر كمؤشر لحدوث المرض , في حين ان مستويات العامل البين ابيضاضي 18 مستقبل البيتا قد يكون مؤشر لتطور المرض .مزيد من الدراسات اللازمة لفهم العلاقة بين مجاميع الدم , عوامل الالتهابية ومخاطر السكري من النوع الثاني . | DM is considered as inflammatory disease associated with many inflammatory factors. As such the present study aims to investigate the concentration of IL - 18 binding protein alpha (IL - 18BPa) and IL - 18R beta with classical risk factors which include Anthropometric risk factors like Age, Central Obesity (CO) and body mass index (BMI), biochemical factors like Insulin , Insulin Resistance (IR), Fasting Blood Glucose ( FBG), Glycosylated Hemoglobin (HbA1c) and lipid profile. Besides, the study aims to studying their association with ABO blood system in the Iraqi Arab female patients with diabetes mellitus type 2 in order to figure out their effect with other factors as predictor or developer for diabetes mellitus type 2. The present study included 340 Iraqi Arab female patients newly diagnosed with DMT2 and 200 healthy individuals tested for phenotype and allele frequency. From those, 60 patients were tested for the immunological and chemical where compared to 28 healthy individuals. Immunological tests by using ELISA kits. While Chemical parameters using enzymatic and colorimetric methods. The study groups (patients and control) were divided into four sub groups (A, B, AB and O) according to the class of blood groups which were tested by using standard serological procedures. The present data showed : 1 - A significant increase in the serum level of IL - 18BPa in the patients of the present study, while there was no significant difference in the serum level of IL - 18R beta. 2 - A significant increased in mean of IL - 18BPa with increased age in both patients and control groups. While IL - 18R beta showed increase at group less than 40 year and decreased with increasing age in both patients and control group. Besides increased all other risk factors. 3 - The levels of both IL - 18BPa and IL - 18R beta were gradually non significantly increased the level in each patients group with an increased duration of disease and the same for IR. 4 - Patients with HbA1c less than 7.3% showed a significant increase in mean of IL - 18BPa and IL - 18R beta and decreased gradually with the increase of HbA1c. 5 - Patients and control subjects who carried blood group B had the highest mean of IL - 18BPa, Insulin and Insulin resistance. 6 - Patient subjects who carried blood group B and control subjects who carried blood group A showed the highest mean of IL - 18R beta. 7 - IL - 18BPa and IL - 18R beta act as independent risk factors in Iraqi Arab females with DMT2 which supported by the absence of significant correlation among IL - 18BPa, IL - 18R Beta and all others classical risk factors. 8 - A positive relation between levels of IL - 18BPa and risk of DMT2. This may be an indication of inflammation for newly diagnostic diabetic patients, while Serum levels of IL - 18R beta might be a predictor marker of disease progression. Further studies are needed to understanding the relationship between blood groups, inflammatory markers and risk of DMT2 in healthy population.

استخلاص وتنقية وتشخيص ببتيد كلايكوسيدي من الحبار Loligo sp. ودراسة تاصيرة على خط الخلايا السرطانية Hela Cell Line والطبيعية REF == Extraction , Purification, Characterization Glycosidic Peptide From Loligo sp. and Study Effect On Cancer Cell Line (Hela) and Normal (REF)

Author name: هيفاء عدنان منصور الموسوي
Supervisor name: بلسم انيس مارينا | ضمياء قاسم سكر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Basrah
First pages:
Abstract: The study was designated to investigate the capcity of pure Loligo sp extract on two cell lines : - the cancer cell line Human cervix uteri epitheloid carcinoma (Hela) and Rat Embryo Fibroblast cell line (REF) as normal cell line.The study included extraction of tissue (whole body) of Loligo sp by using 30% ammonium sulfate. and chemical group detected in the extract by using qualitative chemical test and the result showed that the crud and pure extract contained alkloides, proteins, carbohdrates, saponines, flavonoids, aldehyde &keton group and phenol group .and the extacte does not contain glycosides.The crude extraction was purified by column chromatography using sephadex G - 25. and the purity of extract detected by using polyacryl amide gel electrophoresis under non denaturated condition. The result showed that the extracted riched with amino acid and some carbohydrate by using high performance liquid chromatography (HPLC) with compared standerd amino acid and suger.Infrared Spectroscopy of purified extract shows that it contain (N - H - C - OH) to emphasize on found amino acid in the extract.The cytotoxicity effect on cell lines study by four concentraction ( 125, 250 ,500 and 1000)ϻg/ml were prepared and tested on cell line with five replicates for each concentraction, the optical density of cell growth read by the Elisa reader 550 nm and use by tetra zolium bromide (MTT). The result for in vitro study showed that all concentraction had high inhibition on tumor cell line and a highly significant inhibition in (Hela) line was recoreded 42.79% at exposure time 48hr in the concentraction 1000 ϻg/ml the effect was dose dependent. The inhibitory effect of extract on Hela cell line higher than in the REF. while it was less effect of extract on Rat Embryo Fibroblast cell line after exposure time 48hr.
1 ... 214 215 216 217 218 ... 338