عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 8,632

تقييم بعض عوامل التخثر وتضخيم جين tRNA - histidine لدى الاشخاص المصابين بداء السكري النوع الثاني == Estimation of Some Clotting Factors and PCR Amplification of tRNA histidine in Type2 - Diabetic Patients

اسم المؤلف: صفا نهاد عبد شبر
اسم المشرف: داخل غاني عمران الوطيفي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: يتميز مرض السكري Diabetes Mellitus بحصول اضطرابات في ايض سكر الكلوكوز وينتج مرض داء السكري اما بسبب انخفاض افراز الانسولين او عدم استجابة الانسجة المحيطة لهرمون الانسولين بصورة طبيعية.طبقت الدراسة الحالية لتقييم تراكيز بعض عوامل التخثر Clotting Factors الموجودة في المسارات الداخلية Intrinsic والخارجية Extrinsic والعامة Common لدى المرضى المصابين بداء السكري من النوع الثاني Type2 - diabetes ومن خلال الجنسين (رجال ونساء).شملت الدراسة الحالية فحص 180 شخصا، كان منهم 90 شخصا مصابا بداء السكري النوع الثاني ( 45 رجلا و45 امراة). اما العدد الباقي (90 شخصا) فقد كانوا اشخاص اصحاء استخدموا كمجموعة سيطرة (45 رجلا و45 امراة). وطبقا للفترة العمرية فقد قسم اشخاص الدراسة الى ثلاث مجاميع، المجموعة الاولى (40 - 49 سنة)، المجموعة الثانية (50 - 59 سنة)، المجموعة الثالثة (60 - 69 سنة).اظهر جميع المرضى في هذه الدراسة ارتفاعا معنويا (P < 0.05) في مستوى تراكيز سكر الدم Blood Sugar عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء.وبشان نتائج عوامل التخثر اظهرت قيم تركيز الفايبرنوجين (وهو المكون الرئيسي للمسار العام) انخفاضا واضحا (P > 0.05) في اغلب مجاميع المرضى المصابين بداء السكري بالمقارنة مع مجاميع الاشخاص الاصحاء.وفيما يخص نتائج العامل الثابت Stable Factor (FVII) وهو من اهم مكونات المسار الخارجي لتخثر الدم فقد اعطت ارتفاعا ملحوظا (P < 0.05) في اغلب مجاميع مرضى داء السكري عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء.بينت قيم تراكيز العامل المضاد للنزف (FVIII) Anti - hemophilic وهو المكون الرئيسي في المسار الداخلي، انخفاضا معنويا (P < 0.05) لدى اغلب المجاميع العمرية المصابة بداء السكري عندما قورنت مع الاشخاص الاصحاء.وبخصوص تقنية Poly Chain Reaction (PCR) والتي تضمنت عزل الجين المسؤول عن تشفير الحامض tRNA - histidine فقد بينت عدم وجود اختلافات بين عينات مرضى داء السكر والجين tRNA - histidine.ومن النتائج المبينة في ماسبق، يمكن الاستنتاج بان المسار الخارجي لتخثر الدم يبدو اكثر فاعلية عند مرضى السكري نسبة للمسار الداخلي Intrinsic من خلال ارتفاع مستوى تركيز العامل Stable Factor (FVII) والذي بدوره يجعل مرضى السكري اكثر عرضة لحصول الجلطات الدموية. | Diabetes mellitus is commonly defined as a metabolic disturbances of glucose metabolism resulted because of either insulin release deficiency or peripheral tissue that does not respond properly to insulin. The present study was applied to estimate specific clotting factors included in extrinsic and common pathway of patients affected with type - 2 diabetes mellitus from both sexes (men and women). The study included 180 subjects, of those, ninety (90) subjects (45 men, 45 women) were affected with type - 2 diabetes mellitus. The others remaining number (90) were used as a healthy control sample (45 men, 45 women). According to age, all subjects of the study (patients and control) were subdivided into three subgroups; (40 - 49 ) , (50 - 59) , and (60 - 69) years old. The resulted showed a significant increase of glucose level (P < 0.05) compared with the healthy group. Regarding results of clotting factors, values of fibrinogen, the final components of common pathway, explained a marked drop (P < 0.05) in most patient groups matching with the healthy groups. About results of stable factor (F VIII), the essential components of extrinsic pathway, explained a remarks heightening (P < 0.05) in most of diabetic patient groups when compared with healthy control groups. Results of anti - hemophilic factor (principal factor of intrinsic pathway) were significantly decreased (P <0.05) in most patients groups of both sexes matching with healthy groups. Concerning data of PCR technique which involved gene encoding tRNA - histidine did displayed no differences between tRNA - histidine and diabetic patients. From results which are explained above it can be concluded that extrinsic pathway of blood clotting appears more active in relative to intrinsic pathway through increased concentration of factor (VIII) which in turns can render the diabetic patients who are highly susceptible to thrombotic events.

دور عصيات حامض اللبنيك كنبيت طبيعي للتاثير على البكتيريا المرافقة المعزولة من الجهاز التناسلي الانثوي == The role of Lactobacilli as a normal microflora in preventing vaginal infection

اسم المؤلف: صبا عبد الهادي مهدي شبع
اسم المشرف: اكرام امين خاكي | خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت خمسين عزلة لعصيات حامض اللبنيك من اعالي المهبل من نساء متزوجات مصابات بطريقة المسحة High Vaginal Swab(HVS) تراوحت اعمارهن بين 16 - 45 سنة واخضعت جميع العزلات للفحوصات المجهرية والزرعية الى جانب الفحوصات الكيموحياتية.اختبرت قدرة عزلات عصيات حامض اللبنيك على اعطاء افضل فعالية تضادية على وسط MRS الصلب بطريقة الاقراص Cup Assay Methodضد بعض المجاميع المرضية ومن ثم حضرت رواشح للعزلات الفعالة ودرست قابليتها على التثبيط في وسط MRSالسائل استنادا الى طريقة الانتشار في الحفر .Well Diffusion Assay Method اختبر تاثير pH في الفعالية التثبيطية لهذه الرواشح باستخدام قيم مختلفة للاس الهيدروجيني واجري فحص اختبار الحساسية لعصيات حامض اللبنيك. لوحظ مقاومة عصيات حامض اللبنيك لمعظم المضادات الحيوية المستخدمة في الدراسة وان فاعلية الرواشح البكتيرية ضد الممرضات المهبلية كانت افضل مقارنة بفاعلية العزلات.عند اجراء التحليل الاحصائي لمقارنة نتائج تقدير الفعالية التضادية لوحظ وجود فروق معنوية بين انواع عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لخميرةCandida على الوسط الصلب وقد امتلك النوع L.jensenii اعلى فاعلية تثبيطية لها كما تباينت رواشح عصيات حامض اللبنيك في تثبيطها لعزلات الاختبار اذ اظهرت هذه الرواشح اعلى تاثيرا ضد خميرة Candida وامتازت بكتريا E.coli بامتلاكها ادنى مستوى تاثر بهذه الرواشح. اعطت رواشح عزلات عصيات حامض اللبنيك افضل فعالية تثبيطية في pH (4) مقارنة بفعاليتها التثبيطية في pH (5,6) على التوالي في حين لم تظهر اي فعالية تثبيطية للرواشح ضد عزلات الاختبار في pH (7) وقد ظهر ذلك واضحا عند اجراء التحليل الاحصائي وقد وجد ان الاس الهيدروجيني المنخفض (4)يملك تاثيرا تثبيطيا ضد البكترية والخمائر المهبلية الممرضة اكثر من الاس الهيدروجيني الاعلى. | Fifty isolates of lactobacillus ssp. were taken from infected married women vagina by high vaginal swab. The age of the women ranged between (16 - 45) years. The isolated lactobacilli were identified by microscopical, cultural and biochemical tests. The effect of these isolates against pathogenic microorganism were tested on MRS agar medium by using cup assay method where as supernatant from active isolates were tested using the well diffusion assay. The effect of pH of the medium on the inhibitory effect of lactobacilli were also tested by using different values of pH. It has been observed that lactobacillus were resistant to most commonly used antipiotics which where used in this staday and the antimicrobial activity of lactobacillus supernatant were best compore with the antimicrobial activity of lactobacillus isolates against vaginal pathogens When the statistical analysis were done to compare the results of antimicrobial activity significant differences were observed between the lactobacilli species in their antimicrobial activity on Candida on solid MRS agar medium and L.casei have the highest antimicrobial activity, also supernatants of lactobacilli species were different in their antimicrobial activity thus these supernatants had highest effect on Candida while E. coli had lower value of effect by these supernatants, also these supernatants showed best antimicrobial activity at pH (4) compard with their antimicrobial activity at pH (5,6) and did not show any antimicrobial activity at pH (7) and that was clear when the statistical analysis were done. It has been found that low pH is more effective on the inhibitory activity of lactobacilli against vaginal pathogenic bacteria and Candida than at higher pH values

دراسة بكتريولوجية وبيئية لمياه نهر دجلة وثلاث محطات تصفية في محافظة بغداد == Bacteriological and Ecological Studies on Tigris River and three Purification Stations in Baghdad province

اسم المؤلف: صبا حسين محمد النعيمي
اسم المشرف: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | خالد خورشيد كاظم البياتي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمن هذا البحث دراسة بعض العوامل الخاصة بمياه الشرب المؤثرة في صحة الانسان في مدينة بغداد . العامل الاول : هو العامل البايولوجي والفيزيائي والكيميائي الذي يؤثر في جودة مياه نهر دجلة . والعامل الثاني يتضمن دراسة كفاءة تعقيم المياه في ثلاثة محطات تصفية منشاة على طول نهر دجلة . اما العامل الثالث فقد تضمن تقييم مياه الشرب في منطقة الشعلة التي تزود بالمياه من احدى محطات التصفية ( محطة الكرامة ). فضلا عما سبق ,فقد تضمنت الدراسة مقارنة بين تلوث الماء من الناحية البكتريولوجية وحالات الاسهال في الاطفال تحت عمر السنتين, الذين قد راجعوا العيادة الخارجية لمستشفى الشهيد باقر الحكيم في منطقة الشعلة . تضمنت الدراسة ايضا تعيين جودة المياه في ثلاث محطات رئيسة للتصفية , وهي محطة شرق دجلة الواقعة شمال دجلة ومحطة الكرامة الواقعة في وسط دجلة فضلا عن محطة القادسية الواقعة جنوب نهر دجلة في مدينة بغداد , اخذت عينات الماء بواقع مكررين شهريا قبل وبعد عملية التصفية من المحطات المذكورة انفا ابتداءا من كانون الاول - 2009 ولغاية ايلول - 2010 . اما التحاليل البكتريولوجية للماء فقد تضمنت تقدير العدد الحي الكلي للبكتريا والعدد الحي الكلي للبكتريا المعوية والعدد الكلي لبكتريا E.coliوبكتريا Pseudomonas aeruginosa. فضلا عن وجود بعض البكتريا المعوية المرضية مثل Vibrio cholera وspp. Salmonella. حيث جمعت 60عينة من مياه النهر و60 من داخل مشاريع التصفية . وقد استخدمت لتشخيص هذه الانواع من البكتريا الطرائق الاعتيادية المعروفة للتشخيص فضلاعن عدة .API20E بينما تضمنت التحاليل الفيزيائية والكيميائية للماء قبل وبعد عمليات التصفية تعيين المعايير الاتية, الحرارة وتركيز ايون الهيدروجين والكدرة والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الذائبة الكلية والملوحة والاوكسجين الذائب والمتطلب الحيوي للاوكسجين , فضلا عن درجات حرارة الهواء في محطات التصفية الثلاثة. وقد اخذت العينات بواقع مكررين وجمعت 60عينة مياه لقياس الاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين و60عينة اخرى لبقية الفحوصات الفيزيائية والكيميائية . كمااخذت اربعين عينة من ماء الحنفية من المنازل في منطقة الشعلة خلال اشهر الصيف وهي حزيران وتموز واب وايلول من عام 2010. وفي الوقت نفسه, وفي الفترات نفسها السابقة , اخذت عينات مماثلة (اربعون عينة ) من براز الاطفال تحت عمرالسنتين المصابين بالاسهال واربعون عينة مماثلة من براز اطفال اصحاء بالعمرنفسه للمقارنة ولتعيين انواع واعداد البكتريا الحية الكلية المرضية في هذه العينات . ولقد اشارت نتائج هذه الدراسات الى ان درجة حرارة الهواء اثرت بدرجات حرارة البيئة المحيطة وتراوحت بين (15 - 41 م), وكانت درجة حرارة مياه دجلة ما بين ( 13 - 32 م ) , بينما كانت درجة حرارة المياه بعد عمليات التصفية في المحطات الثلاثة بين ( 15 - 33 م) . كان تركيز ايون الهيدروجين للماء ( 7. 48 - 8.08 ) وبعد التصفية كان ( 7.31 - 7.89) اما كدرة مياه دجلة فقد تراوحت بين ( NTU156 - 26 ) ولمياه المحطات الثلاثة بين ( NTU 4 - 1 )كما بينت نتائج الدراسات الحالية الى ان التوصيلية الكهربائية لمياه دجلة كانت اقل منها في مياه المشاريع الثلاثة ( 606 - 776 مايكروسيمنز/سم ) و( 608 - 793 مايكروسيمنز/ سم ) على التوالي . والمواد الصلبة الذائبة الكلية لمياه المحطات ( 425 - 555 ملغرام / لتر ) ولمياه النهر كانت ( 429 - 554 ملغرام / لتر ) . بينما لم تتجاوز الملوحة في كل من مياه النهر والمحطات عن 0.49 ملغرام / لتر. كما كان تركيز الاوكسجين الذائب في مياه نهر دجلة بحدود 7.4ملغرام / لتر بينما اعلى تركيز للاوكسجين الذائب كان 10 ملغرام / لتر. اما المتطلب الحيوي للاوكسجين لمياه النهر فقد كان بحدود ( 1.2 - 4.4 مغرام / لتر ) وهذه النسبة هي ضمن الحدود المسموح بها دوليا .و من جهة اخرى اشارت الدراسات البكتريولوجية الى وجود نسبة عالية من اعداد البكتريا الحية الكلية في مياه المحطات الثلاثة وكانت بحدود ( 1 - C.F.U 64 ), وهذه الاعداد تشير الى عدم كفاءة عمليات التصفية والتعقيم الجارية في المحطات الثلاثة . وخاصة محطة الكرامة , بينما اعداد البكتريا الحية الكلية لمياه نهر دجلة كانت بحدود ( 468 - C.F.U 9100) . اما اعداد بكتريا القولون الكلية وبكتريا E.coli فقد تراوح بين ( 1.1 - 7.1 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة وهذه الاعداد هي اكثر من الحدود المسموح بها دوليا . وقد تجاوزت اعداد بكتريا القولون الكلية في نهر دجلة عن ( 1795 - 63000 خلية / 100مل) ,بينما اعداد بكتريا E.coli فقد كانت بحدود ( 335 - 39000 خلية / 100مل ) .ا ما بالنسبة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa فقد كان عددها ( 2.2 - 23 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة واعلى تركيز في اعدادها كان قد سجل في اشهر الصيف , بينما كانت اعدادها في نهر دجلة بحدود( 580 - 160000 خلية / 100مل ) .ا ما نتائج اعداد البكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coliالمعزولة من مياه الحنفيات في منازل الشعلة فقد سجلت اعلى القيم للبكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coli 16)و9.2خلية/100مل)على التوالي, اما اقل القيم فكانت 1.1)و0.0خلية/100مل)على التوالي. كما اشارت الدراسة الى احتواء عينات البراز الماخوذة من الاطفال المصابين بالاسهال ,ا نواع البكتريا الاتية : - Citrobacter freundii 15% , Klebsiella pneumonia 21% , E.coli 45 % , Pseudomonas aeruginosa 11%,Serratia plymuthica 4% , Serratia ficaria 2% , Pseudomonas fluoresens 2%. وهذه الانواع هي في الواقع متوافقة مع الانواع نفسها من البكتريا المعزولة من ماء الحنفيات من المنازل في الشعلة وهي : - Klebsiella pneumonia 30% , E.coli 27% , Pseudomonas aeruginosa 23% Citrobacter freundii 14%, Serratia playmuthia 3% , Pseudomonas fluoresens 3% . لقد عزلت انواع من البكتريا غير السائدة مثل Sphingomonas paucimobilis, Pantoea spp. من مياه النهر ومياه المشاريع اذ تعود Pantoea spp.الى العائلة المعوية Enterobacteriaceae وتسبب بعض انواعها اعراضا مرضية خطيرة للانسان, وكثيراما تكون ملوثة للادوات الطبية اضافة الى ان بعض الاجناس ممكن ان تصيب مدى واسعا من المحاصيل الزراعية المهمة اقتصاديا ,وانواع من اشجار الغابات حول العالم كما توجد بشكل مجتمعات بكتيرية تلوث خزانات وقود الطائرات النفاثة اماالنوع Sphingomonas paucimobilisفيعود لعائلة Sphingomonasaceae الذي يوجد في البيئات المختلفة بضمنها المائية (مياه البحر والمياه العذبة) وبعض انواعها وخصوصاS.paucimobilis فقد توجد في الاجهزة الطبية في المستشفيات وانواع مختلفة من النماذج السريرية وبالرغم من ان الاصابة بها خطيرة ونادرة فقد تعالج باستخدام المضادات الحيوية . واخيرا اشارت نتائج هذه الدراسة الى ان استهلاك مياه الحنفيات من قبل عموم الناس قد يكون السبب الرئيس لحالات الاسهال التي تصيب الاطفال وغيرهم لاحتوائها على اعداد كبيرة من المسببات المرضية المختلفة. | The present work aimed to study different parameters of the drinking water that affect the health of people of Baghdad city .To perform this target three factors were studied. Firstly ,The Biological ,Physical and Chemical factors that influence water quality of the Tigris river .secondly, evaluation of the efficiency of water purification of three purification stations constructed along the river of Tigris ,and thirdly ,evaluation of drinking water of AL - Shulla region in Baghdad city that is provided with water from one of these purification stations (AL - Karama station). In addition to above ,the study also included the comparison between water pollution with respect to bacteriological point of view and diarrhea cases suffering children under two years of age ,attended the hospital of Baqir AL - Hakkem out - clinic in AL - Shula. The study included determination of the water quality from three main purification station, these stations were located to the Northern (Sharq - Diglla) ,middle (AL - Karama)and southern (AL - Qadisia)parts of Tigris river in Baghdad city.Duplicate water samples were taken on monthly basis before and after purification from December, 2009 to September 2010.Microbial analyses of the water included estimation of the number of total viable microbial counts ,total viable coliforms ,total viable E.coli and Pseudomonas aeruginosa .In addition to the presence of some pathogenic enteric microorganisms e.g. Salmonella spp. , Vibrio cholerae etc. using conventional bacteriological methods and API20E Technique for the identification of these bacteria, while Physical and chemical analyses of water before and after purification included determination of the following parameters ,temperature, pH, turbidity ,electrical conductivity ,total dissolved solids ,salinity ,dissolved oxygen and Biological oxygen demand along with the air temperatures at the three purification stations. . . On the other hand ,forty tape water samples were collected from the houses in AL - Shulla region during summer months June , July ,August and September ,2010.At the same time ,and during the same periods ,forty faecal samples from children under age of two years suffering from diarrhea and forty feacal samples from healthy children of the same age also were collected to determine the total pathogenic microorganisms in these samples .The results of these studies were indicated that the water temperature was influenced by the surrounding temperatures (15 - 41 °C)and the Tigris river temperature was between (13 - 32°C ),whereas the temperature of the water after purification in the three stations were around (15 - 33°C). . The pH of the water was (7.85 - 7.97) and after purification was around (7.31 - 7.87).The Turbidity of the river water was(156 - 26)NTU and of the stations were between (1 - 4NTU) The results of the present study also revealed that the electrical conductivity of the Tigris river water was less than that of the three stations, that is (606 - 776Ms/cm) and (608 - 793Ms /cm) respectively. and the total dissolved solids (T.D.S)were between (425 - 555mg/l)for stations water and were between (429 - 554mg/l) for river water. whereas the salinity of both river and stations water did not exceed 0.49mg/l. The dissolved oxygen concentration was 7.4mg/l in Tigris river, which indicate a good aeration condition while the highest concentration for river water recorded to be 10mg/l. The biological oxygen demand for river was between (1.2 - 4.4mg/l) which is within the International allowable levels. On the other hand ,The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (1 - 64C.F.U/ml), and these numbers indicate a non - efficient purification procedures in all station studied and was exceeding the International allowable levels especially in the AL - Krama station . while total viable bacterial counts of the Tigris river was between (468 - 9100C.F.U/ml).Total coliform counts and pathogenic E.coli counts were both between(1.1 - 7.1cell/100ml )in all the three stations studied ,again,these numbers exceeded the International allowable levels. In Tigris river water ,on the other hand ,the total coliform counts was exceeded the (1795 - 63000cell/100ml )while the pathogenic E.coli count was between (335 - 39000cell/100ml) .Pseudomonas aeruginosa counts was about (2.2 - 23cell/100ml) in the three station and the highest level recorded was in summer seasons ,whereas its counts was in between (580 - 160000cell/100ml) in Tigris river. The highest number for total coliform and pathogenic E.coli were recorded to be (16 and 9.2cell/100ml) respectively. whereas the lower range were (1.1 and 0.0 cell/100ml) respectively. . The results of the present study also revealed that the faecal samples of the diarrhea cases of children contain the following bacteria ,E.coli 45%,Klebsiella pneumonia 21%.while the numbers of other bacteria ,Citrobacter freundii, Pseudomonas aeruginosa , Serratia ficaria ,Serratia plymuthica and Pseudomonas fluorescens were 15%,11%,2%,4% and 2% respectively. . These proportions are in accordance with the same bacterial species isolated from AL - Shulla houses while were 27%for E.coli ,30%for Klebsiella pneumonia and 14%for Citrobacter freundii 23%for Pseudomonas aeruginosa ,3%for pseudomonas fluoresens and 3% for Serratia plymuthica . Finally ,these results clearly indicate that the tape water consumption by the general public might be the main causative factors for diarrhea cases affecting the people due to its high content on other hand ,will reflect the poor purification procedures employed in these different purification stations at least in Baghdad city

دراسة تاثير بعض المطهرات والمعقمات والمنظفات على نمو بعض الفطريات المعزولة من بعض المستشفيات في بغداد == Study the effect of some disinfectants, sterilizers and detergents on growth of some fungi isolated from Baghdad hospitals

اسم المؤلف: صادق رحيم محمد علي
اسم المشرف: منى حمودي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study aimed to detect the fungal contamination of hospitals in orderto be controlled and limited.A total of 511 environmental swaps were collected from Al - Karamateaching hospital, Al - Sader general hospital, Al - Yarmouk teachinghospital, Baghdad teaching hospital and Imam Ali general hospital inBaghdad city from the period 28,October,2013 to 31,March,2014. Thesamples were collected to isolate and identify the caused and contaminatedfungi in addition to test their sensitivity against certain antiseptic anddisinfectants that are used in hospitals; also their virulence factors forhigher frequency and occurrence genus.These isolates were collected from main sources, the hospitalsenvironment and most of the items used for hospital work in order to detectthe nosocomial pathogens persistent in the hospital ecosystem, whichincludes : sink surfaces, tools and equipments, walls, indwelling medicaldevices, premature incubators, beds, medical trashes, floors and others.Results revealed that fungal contamination in five hospitals was in thepercentage 69.89%, 64.52%, 62.40%, 51.58% and 41.90% respectively. Inaddition, the most contaminated places were the hospitals wards 80%,while it was 77.77% in endoscopy units and 76.92% in the Respiratory careunits. The lowest contaminated places were the emergency units 25.0%then burns units 33.33% and cardiac care unit which was 41.66%. Inrespect with the percentage of occurrence and frequency for the isolatedfungi, it was found out that Aspergillus flavus formed the highest ratio offrequency and occurrence 21.29% and 15.46% respectively, followed byAspergillus niger 18.33% and 13.31% then Penecillium spp. which was10.78% and 7.83%. Regarding other fungi, their frequency and occurrence were different. All fungal isolates were identified depending on themorphological and microscopic examinations as well as biochemical tests.The results on the effect of temperature and pH on fungal growthshowed that the best growth was at 25 - 30 OC, and the best growth wasfound at the pH range 5.0 - 6.0.Results of the test of fungal sensitivity against eight antiseptics andsterilizers used in the hospital showed that the ratio of inhibition of thesecompounds agnaist fungi were different according to types andconcentration of antiseptics as well as genus and species of fungi. Use ofthese compounds in 100%, 50%, 40%, 30% and 20% concentration is veryhigher effective, while more effective if they were used in 10% or 7.5%concentration than in 5% and 2.5%, but not effective in 1.25%concentration.The results showed that Setol (Chloroxylenol) has significantly the mosteffective compound on fungi, followed by Formalin (Formaldehyde), thenCarmal (Tension, active surfactants, non - ionic) and Alwazir (Sodiumhipochlorite).Testing some of virulence factors aflatoxin production, lipaseproduction , protease production and haemolysis test, it was found that A.flavus has higher lipase production and protease production than otherfungi. A. flavus and A. niger were capable of blood hemolysis in 3 daysonly, but in different diameters of lysis zone, 1.8mm and 1.6mmrespectively. Some isolates of A. flavus are capable to aflatoxin production.Depending on all results, hospitals contain different fungal species andgenus, antiseptics and disinfectants have an effect on fungal growth if theyare used in a correctly.

دراسة كيميائية وبايولوجية لمركبي Stigmasterol و? - sitosterol كمكونات فعالة متواجدة في نبات البنفسج العطري (العائلة : البنفسجية) المزروع في العراق == Phytochemical and Biological Study of Stigmasterol and ? - sitosterol as Active Constituents Present in Viola odorata L.Plant (Family : Violaceae) Cultivated in Iraq

اسم المؤلف: شيماء فخري جاسم السالم
اسم المشرف: بشرى محمد جابر علوش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعد هذه الدراسة مسح لبعض المكونات الفعاله لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. وعزل هذه المركبات الفعالة (Stigmasterol and β - sitosterol)، كما تم اجراء دراسه بايولوجيه لتحديد فاعليتها كمركبات مضادة للاكسدة وكمضادات بكتيرية حيث تضمنت الدراسه مايلي : - • تم استخلاص هذه المركبات كمستخلص خام من كل جزء من اجزاء النبتة الجذور،الاوراق, الازهار والبذور باستخدام الميثانول والبتروليوم ايثر واجراءالتقدير الكمي والنوعي للمركبين Stigmasterol) و( β - sitosterolفي كل جزء باستخدام تقنيات TLC, HPLC,CC• تم استخلاص وعزل وتشخيص المركبين (Stigmasterol and β - sitosterol) وذلك باستخدام طرق استخلاص وتجزئه وعزل مختلفه• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata L. والمركبات الستيرويدية Stigmasterol) و( β - sitosterol كمضادات للاكسدة على المركب 1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) الفعال لاحتوائه على الجذور الحرة وتحويله الى مركب 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine باستخدام التراكيز 25, 50, 100, 200 و400 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع حامض الاسكوربك كمعاملة قياسية• تم استخدام المستخلص الخام لنبات البنفسج العطري Viola odorata Lو المركبات الستيرويديه( Stigmasterol و( β - sitosterol كمضادات بكتيرية فاعلة ضد بكتيريا staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosa وبتراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر والمقارنة مع المضاد الحيوي Gentamicin كمعاملة قياسية• اظهرت النتائج وجود كميات كبيرة من المركبات الستيرويدية(Stigmasterol and β - sitosterol )في كل اجزاء نبتة البنفسج العطري Viola odorata L. اذ كانت تراكيز مركب Stigmasterol في الاوراق 2 ملغم/100مليلتر وللازهار 7.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 4.5 ملغم/100مليلتر وللبذور 2.4 ملغم/100مليلتر, فيما كانت تراكيز المركب β - sitosterol في الاوراق 3.2 ملغم/100مليلتر وللازهار 5.3 ملغم/100مليلتر وللجذر 9.2 ملغم/100مليلتر وللبذور 3 ملغم/100مليلتر, اذ كان اعلى تركيز للمركب Stigmasterol في مستخلص الازهار 7.3 ملغم/100مليلتر واعلى تركيز للمركب β - sitosterol في الجذر 9.2 ملغم/100مليلتر.• اظهرت النتائج الفاعلية الكبيرة للمستخلص الخام لنبات Viola odorata L. بالتركيز 400 مايكروغرام/مليلتر كمضاد للاكسدة بنسبة 94% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 72, 80, 84 و92% على التوالي بالمقارنة مع المعاملة القياسية, اذ اظهرت النتائج فروقا معنوية P≤ 0.05 ما بين التراكيز للمستخلص الخام, فيما اظهر التركيز 400 مايكروغرام/مليلتر لخليط المركبات( stigmasterol وβ - sitosterol) كفاءة كبيرة كمضادات للاكسدة وبنسبة 74% وللتراكيز 25, 50, 100 و200 مايكروغرام/مليلتر بنسبة 59, 63, 66 و70% على التوالي مقارنة بالمعاملة القياسية وبفروق معنوية P≤0.05 ما بين التراكيز.• اظهرت تراكيز المستخلص الخام للنبتة فاعلية كمضاد للبكتيريا اذ كان مدى تثبيط بكتيريا Staphylococcus aureus على الوسط المغذي الصلب 0, 5, 15, 18, 20, 22 و25 مليمتر باستخدام التراكيز 2, 5, 10, 20, 30, 40 و50 مايكروغرام/مليلتر على التوالي, واظهر خليط الستيرويدات مدى تثبيط 0, 0, 0, 14, 16, 19 و21 مليمتر لنفس التراكيز على التوالي ومقارنة بالمعاملة القياسية, كذلك اظهر المستخلص الخام كفاءة كمضاد بكتيري ضد بكتيريا Pseudomonas aeruginosa بمدى تثبيط 0, 5, 12, 15, 17, 19 و22 مليمتر ولخليط الستيرويدات بمدى تثبيط 0, 0, 0, 11, 13, 17 و18 مليمتر مقارنة بالمعاملة القياسية, وبينت النتائج ان التركيز الادنى المثبط للمستخلص الخام للنبتة ضد بكتيريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaهو 5 مايكروغرام/مليلتر ولخليط الستيرويدات هو 20 مايكروغرام/مليلتر. | This study is considered as a survey of the some secondary metabolits present in Viola odorata L., collected from plant nursery in Baghdad between April and July, followed by the fractionation and isolation of Stigmasterol and β - sitosterol.The biological study demonstrated the effect of the Stigmasterol and β - sitosterol found in Viola odorata L. as antioxidant and antibacterial. This study involved the following : - • Extraction of Stigmasterol and β - sitosterol as a crude extract from each part of the plant roots, leaves, flowers and seeds using (Petrolium ether and Methanol) to qualitative and quantitative estimation of Stigmasterol and β - sitosterol in each part of the plant by using TLC, HPLC and CC. • Fractionation and Isolation of sterols compounds (Stigmasterol and β - sitosterol) present in Viola odorata L., by using different methods . • Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been studies in experimental work to determination the antioxidant activity against1,1 - diphenyl - 2 - picrylhydrazyl (DPPH) which is considered as stable free radical and convert it into 1,1 - diphenyl - 2 - picryl - hydrazine ,by using different concentrations (25,50,100,200 and 400µg/ml). Compare ascorbic acid.• Crude extract and sterols compound (Stigmasterol and β - sitosterol) has been used to determination the antibacterial activity using different concentrations (2, 5, 10,20,30,40 and 50µg/ml) against staphylococcus aureus and pseudomonas aeruginosa by using agar well diffusion method compare with Gentamicin as a standard control. • The phytochemical results showed that all the plant parts contain high amount of sterols, the quantitative data revealed that the total content of Stigmasterol in roots(4.5mg/100g) ,in leaves(2mg/100g),in flowers(7.3mg/100g) and in seeds(2.4mg/100g).The content of β - sitosterol in roots(9.2mg/100g),in leaves(3.2mg/100g),in flowers(5.3mg/100g) and in seeds(3mg/100g), highest amount of stigmasterol founded in flowers (7.30mg/100g) ,the maximum amount of β - sitosterol in roots (9.2 mg/100g) .• The results showed that crude extract of Viola odorata in concentration of 400µg/ml have a higher antioxidant effect by 94%, and concentrations of 25, 50, 100 and 200 µg/ml by 72, 80, 84 and 92% respectively which are comparing with standard control Ascorbic acid, the results showed there are significant difference at (P≤ 0.05) between the concentrations in the same crude extract, while the stigmasterol and β - sitosterol of Viola odorata also showed higher antioxidant effect in concentration of 400µg/ml by 74% and concentrations of 25, 50, 100 and 200µg/ml by 59, 63, 66 and 70% respectively comparing with standard control Ascorbic acid with significant difference at (P≤0.05) between them ,and with significant difference at (P≤0.05)between the concentrations in the same fraction.• Antibacterial results of crude extract showed Staphylococcus aureus growth inhibition zone by 0, 5, 15, 18, 20, 22 and 25 mm with 5 µg/ml as MIC, while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 14, 16, 19 and 21 mm with 20 µg/ml as MIC comparing with Gentamicine standard control. Furthermore inhibition zone in pseudomonas aeruginosa culture when using crude extract by 0, 5, 12, 15, 17, 19 and 22 mm with 5 µg/ml as minimum inhibitory concentrations (MIC), while, sterols compound showed inhibition zone by 0, 0, 0, 11, 13, 17 and 18 mm with 20 µg/ml as Minimum inhibitory concentration (MIC) compar with Gentamicin standard control .Stigmasterol and β - sitosterol compound showed inhibition zone by 0,0,0,11,13,17 and 18 mm with 20 µg/ml MICcompared with Gentamicine standard control.

التوصيف المظهري والوراثي للانزيمات المحورة لمضادات الامينوكلايكوسيدية المنتجة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين == Phenotypic and genotypic characterization of aminoglycoside modifying enzymes produced by methecillin resistant Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: شيــماء عدنان جبر العبيــــدي
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت 150عزلة سريرية من المكورات العنقودية من مستشفيي الحبيبية والنعمان في مدينة بغداد خلال الفترة من شهر كانون الثاني وحتى شهر نيسان لعام 2011 من اصابات سريرية متنوعة. توزعت العينات ما بين 30 عزلة من الادرار, 84 من خمجات جروح و36 عزلة من مسحات الاذن . • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم, تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص الشكلية والكيموحيوية, ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة نظامي api staph وMast staph kit .لقد تم الحصول على 87 عزلة (58%) على انها Staphylococcus .aureus مقابل 63 عزلة (42%) للانواع الاخرى من هذا الجنس. • بينت نتائج الفحص المسحي المظهري الاولي لمقاومة مضاد المثسلين باستخدام طريقة الانتشاربالاكار ان هنالك 84 عزلة من اصل 87 (%96.5) قد اظهرت مقاومتها لمضاد المثسلين لتكون من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين((MRSA مقابل 3عزلات فقط (3.5%) مستجيبة للمثسلين (MSSA).• اجري اختبارفحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشارالاقراص لجميع عزلات MRSA( ,(84 واستخدم لهذا الغرض ستة مضادات حيوية تعود للمجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجوداختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري للعزلات قيد الدراسة اذا اظهرت هذه العزلات مستوى عال من المقاومة لهذه المجموعة مع نسبة وصلت الى ( 19٪ ( للستربتوميسين, 38)٪ (للاميكاسين, ( 52٪ ( للجنتاميسين ، 62٪) للكاناميسين ،و (69٪) لكل من مضادي ا لنيومايسين والتوبراميسين. • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى(MIC) لعزلات ال MRSA) (لعدد من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لعزلات ال MRSA، اذا اظهرت 16 عزلة مقاومتها للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين (16 - 1024 ميكروغرام / مل ) , و32 عزلة مقاومة للاميكاسين (64 - 128 ميكروغرام/مل ) ، و44 عزلة للجنتاميسين ( 16 - 64 ميكروغرام/مل ) و38 لو 52عزلة للكانامايسين ( 64 - 128مايكروغرام/ مل) , ، و58 للنيوميسين (16 - 1024 ميكروغرام/مل ). ان هذه النتائج تدل على انتشار صفة مقاومة مضادات المجموعة الامينوكلايكوسايدية بين عزلات المكورات العنقودية المقاومة للمثسيلين .• اعتمدت طريقتان لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهما : طريقة الغليان وطريقة المستعمرة المباشر. اظهرت النتيجة ان طريقة المستعمرة المباشرة كان افضل في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.• اختيرت خمسة وعشرون عزلة من بكتريا MRSA التي اعطت نتائج ايجابية في مجال الكشف المظهري لنمط المقاومة لمضاد المثسلين ولمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية للكشف عن الجين mecA المشفرلمقاومة المثيسلين بوساطة تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) . اظهرت نتائج احتواء جميع العزلات (100٪) على جين mecA ,وبلغ حجم القطعة المكثرة 314 زوج قاعدة بمقارنتها بدلائل الدنا الحجمية .• اجري الفحص الوراثي بتقنية ال PCR للكشف عن ثلاث جينات مشفرة للانزيمات المحورة لمضادات المجـــموعة الامــينوكلايكوسيـــدية في عــزلات ال MRSA وشـمـــلت aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa.بينت النتائج ان جين ) ′aac(6’) - Ie+aph(2’ هو الاكثر انتشارا وبنسبة 84٪ (21/25) تلاه جين ant(4’) - Iaو aph(3’) - IIIa بنسبة 76.3٪ (19/25) و44٪ (11/25) على التوالي.• بلغ معدل تواجد aac(6’) - Ie+aph(2’) مع ant(4’) - Ia, مقدار 64٪ (16 / 25) ويمثل اعلى نسبة تواجد في العزلات قيد الدراسة, فيما بلغت نسبة تواجد جيني ant(4’) - Ia وaph(3’) - IIIaمعا 40٪ (10/25) لتحل نسبة تواجد كلا من aac(6’) - Ie+aph(2’) مع aph(3’) - IIIa ثالثا وبمعدل 32٪ (8/25).اما نسبة تواجد هذه الجينات الثلاث معا فقد بلغ 28%(7/21(. • لوحظ ان هنالك ترابط بين الصفة المظهرية لمقاومة المضادرات مع الصفة الوراثية , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين aac(6’) - Ie+aph(2’) ذات مقاومة عالية لمضاد الجنتامايسين وايضا مقاومة لاغلب انواع المضادات الامينوكلايكوسيدية الاخرى.بينما كانت العزلات الحاملة للجين ant(4’) - Ia هي عزلات ذات مقاومة عالية لمضادي التوبرامايسين والنيومايسين ,ومن ناحية اخرى كانت العزلات الحاملة للجين aph(3’) - IIIa اظهرت مقاومتها العالية للمضادين الكانامايسين والاميكاسين.• في هذه الدراسة كانتالاربع وعشرين 24 عزلة الحاملة لجين mecA من اصل 25) 96%( كانت على الاقل مترابطة مع احد جينات الانزيمات المحورة AME او اثنان منها او جميعا ,ويعد هذا مؤشرا لوجود ترابط كبير بين مقاومة العزلات لمضادات الامينو كلايكوسايدية وبين مقاومتها للمثسلين في العزلات المحلية .في الوقت نفسة ظهرت ضمن النتائج عزلة MRSA واحدة اتسمت بمقاومتها المظهرية لمضادات هذه المجموعة غير انها خلت من اي جين في الفحص الوراثي مما يدل على امتلاكها نمط اخر من المقاومة تجاه هذة المجموعة . | • A total of 150 Clinical isolates of Staphylococcus species were collected from two hospitals : Al - habibia and Noaman hospitals in Baghdad city during the period from January to April 2011. Types and the numbers of these clinical samples were distributed as (30) isolates from urine, (84) isolates from wound infections and (36) isolates from ear swabs. • The isolates were initially diagnosed by culturing on MacConkey agar and blood agar followed by performing some morphological and biochemical tests . A confirmatory test as final diagnoses were done using api 20 and MAST staph kits. The results have showed that Staphylococcus aureus comprised 87(58%) isolates while other Staphylococcus species represented 63 isolates (42%) .• Results of primary screening test for methicillin resistance using disk diffusion method have revealed that 84 isolates(96.5%) were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus(MRSA), while only 3 isolates (3.5%)were methicillin sensetive Staphylococcus aureus (MSSA).• Antibiotic susceptibility test for all the 84 MRSA isolates was performed against 6 antibiotic of aminoglycosides group using disc diffusion method. The result have demonstrated clear differences in the phenotypic resistance among isolates of the current study . They showed high - level of resistance to aminoglycosides group, and the percentage of isolates reached to(19%) for streptomycin, (38% ) for amikacin ,(52% ) for gentamicin, (62%) for kanamycin and ( 69%) for each of neomycin and tobramycin . • Two fold was serial dilution agar used to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) for the MRSA isolates against aminoglycosides group. The results have showed that there were differences in the MIC values among MRSA isolates when 16 isolates were resistance streptomycin (MIC ranged 16 - 1024 µg/ ml) , 32 isolates resistance amikacin (64 - 128 µg/ ml), 44 isolates to gentamicin (16 - 64 µg/ ml) , 52 isolates to kanamycin (64 - 128µg /ml), and 58 isolates to neomycin (16 - 1024 µg/ ml). The results indicate the prevalence of aminoglycosides resistance pattern in all the MRSA isolates. • The two different methods boiling method and the direct colony method were used to prepare template DNA in order to be used in the polymerase chain reaction test. The results revealed that the direct colony methode was better in demonstrating the result as comparied with the boiling method . • Twenty five isolates which gave positive results in phenotypic detection for methicillin and aminoglycoside group resistance , were selected to detect mecA gene encoding methicillin resistance using PCR technique.The results showed that all the isolates (100%) harbored merA gene with amplified size 314 bp as compared with DAN ladder . • Genotypic detection was performed to detect three genes encoding aminoglycoside modifying enzymes in MRSA isolates. They were aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa genes.The results showed that aac(6') - Ie - aph(2") gene was the most prevalent Aminoglycoside modifying enzymes (AME) gene when the rate was 84% (21/25) of the resistant isolates followed by ant(4') - Ia and aph(3') - IIIa when the rates were 76.3% (19/25) and 44% (11/25) of these isolates respectively.• The coexistence rate of aac(6') - Ie - aph(2") with ant(4') - Ia was 68% (16/25) which it represents the most predominant rate in the isolates of the current study followed by the coexistence between of ant(4') - Ia with aph(3') - IIIa which was 40% (10/25) and the third rate for aac(6') - Ie - aph(2") with aph(3') - IIIa by 32% (8/25). The coexistence rate of the three genes in all the isolates was 28% (7/25).• The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern.The isolates harboring aac(6’) - Ie+aph(2’) gene are considered to be high resistant to gentamicin and even to all aminoglycosides ,while the isolates harboring this gene were highly resistant to tobramycin and neomycin and the isolates carrying aph(3′) - IIIa gene showed the high resistance to amikacin and kanamycin in MRSA. • In this study, the 24 isolates harboring mecA gene out of 25 ( 96%) were carried either one or more than one aminoglycoside modifying gene and this represents an indicator for high correlation between aminoglycoside and methicillin resistance in our local isolates .From the other hand the results showed that there was a MRSA isolates which confer phenotypic resistance to aminoglycoside group but it not encode for any of AME gene ,this may indicate that such isolates confer another type of resistance toward this group

دراسة مرضية نسيجية ومناعية كيميائية نسيجية للخلايا اللمفاوية المرتشحة في العقد اللمفاوية المشمولة في سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي == Histopathological and Immunohistochemical study on Lymphocytic Infiltrate in Lymph nodes involved by in Colorectal cancer and Breast carcinoma

اسم المؤلف: شيماء عبد الرضا ناجي الربيعي
اسم المشرف: ماجد محمد محمود الجواري | سالم رشيد حمودي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت الدراسة كبحث رجعي ، اذ اجريت على (85) حالة مرضية لانسجة مطمورة بشمع البارافين واخذت العينات من المرضى المصابين بالاورام الحميدة والخبيثة للقولون والمستقيم والثدي والتي تعود للفترة من 2006 - 2008 .جمعت العينات من مستشفى مدينة الطب/ المختبرات التعليمية ومستشفى امراض الجهاز الهضمي للفترة من تشرين الاول 2008 ولغاية حزيران 2009 . قسمت هذه العينات الى ثلاثة مجاميع : 1 - المجموعة الاولى تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان القولون والمستقيم والحاوية على العقد اللمفاوية.2 - المجموعة الثانية تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان الثدي والحاوية على العقد اللمفاوية.3 - المجموعة الثالثة (35) عينة من بلوك شمع البارافين منها (15) عينة تحتوي على التنسج اللمفاوي للعقد و(20) عينة طبيعية تعتبر كمجاميع سيطرة.تم تحليل هذه العينات من العقد اللمفاوية في المجاميع الثلاثة احصائيا حسب العمر , الجنس , وجود او عدم وجود السرطان المنتشر وعلاقته بارتشاح الخلايا اللمفاوية ، درجة التمايز ومرحلة الانتشار للسرطان.ولغرض التشخيص النسيجي قطعت العينات بجهاز المايكروتوم بسمك 4 مايكرومتر وصبغت بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين.امتدت الدراسة لتشمل تحديد التنميط المظهري للخلايا اللمفاوية المرتشحة والتي تشمل الواسمات CD8+, CD3+ بطريقة التصبيغ النسيجي المناعي . وقد خلصت الدراسة الى النتائج التالية : 1 - في الوقت الذي تراوح العمر لمرضى سرطان القولون والمستقيم بين (23 - 70) سنة وبمعدل (43,2) سنة ، فان النسبة الاكبر قد شخصت في عمر يتراوح بين (61 - 70) سنة.2 - اغلب حالات سرطان القولون والمستقيم كانت وسطية التمايز وكانت موجبة بنسبة (75%) للواسم CD3+ وبنسبة (25%) للواسم CD8+ للخلايا اللمفاوية المرتشحة.3 - ان النسبة من 75 - 80% من حالات سرطان القولون والمستقيم كانت في مرحلة C.4 - اظهرت الخلايا اللمفاوية الحاملة للواسم CD8+ فروقات معنوية بين سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي عند مستوى احتمالية (P<0.05). | This study was designed as retrospective study. A total number of cases were eighty five (85) formalin - fixed paraffin embedded tissue blocks of colorectal and breast cancer, in addition to benign lesions that related to the period between 2006 - 2008 . The samples were collected from Teaching Laboratories / Medical City and Gastrointestinal Teaching Hospital/ Medical City during the period extended from October 2008 till June 2009. These paraffin blocks were divided into (3) groups : 1. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of colorectal carcinoma (CRC) with their lymph node drainage.2. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of breast carcinoma with their L.N drainage.3. In addition thirty five (35) tissue blocks, including (15) blocks lymph node follicular hyperplasia and (20) blocks of normal lymph node were examined as control groups.All these tissues were analyzed according to age, gender, presence or absence of tumor metastasis with infiltration of lymphocyte, histological grading, and staging.For definitive histological diagnosis the samples were made by microtome at 4μm thickness and stained by hematoxylin and eosin stain.This study was extended to determine the phenotype of cell surface antigen markers, namely CD3+ and CD8+ markers of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal antibodies to these markers.The results of this study can be described as follows : 1 - The age of patients with CRC ranged from (23 - 70) year with mean of (43.2) year. The highest percentage was diagnosed in the age (61 - 70) year.2 - Most of the cases of the CRC were moderately differentiated grade, (75%) were CD3+ positive results, while (25%) of them were CD8+ positive results.3 - From 75 - 80% of the CRC cases were in stage C.4 - In respect to CD8+ infiltrated lymphocytes, there were significant differences (P <0.05) between CRC and breast carcinoma, 20%, 56% respectively.

تاثير Lactobacillus fermentum وLactobacillus gasseri في طفيلي الابواغ الخبيئة داخل الجسم الحي == Effect of Lactobacillus fermentum and Lactobacillus gasseri on Cryptosporidium parvum invivo

اسم المؤلف: شيماء داود سلمان
اسم المشرف: سبا طاهر محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: In order to study the effect of some bacterial probiotics on the parasite Cryptosporidium parvum invivo, 60 of feces samples were collected from fetal in calves farm belong to College of Veterinary \ Baghdad University, their aged from one to two weeks and suffer from a severe watery diarrhea. Samples were examined to detect the presence of the parasite oocysts by using Modified Cold Zeinl Neelson Stain method.Oocysts of parasite were isolated from positive feces samples by using saturated salt solution method and used to induce infection in mice .The study of laboratory animals shown that the perpant period of the parasite ranged between 3 - 4 days and did not notice any clear clinical signs neither infected mice nor treated ones.The study included nine groups; five treatment groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells,supernatant of L.fermentum,suspension of L.gasseri cells,supernatant of L.gasseri and the drug spiramycin, two preventive groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells and suspension of L.gasseri cells befor and after infected , and two groups that used as positive control (infected mice)and negative control (healthy mice).The results showed that all treatment groups suffered from a gradual decrease in rates of oocysts shedding and the groups treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day and eighth, respectively, and efficiency treatment was 81.44%, 81.72% , respectively while groups that treated with supernatant of bacteria was stopped oocysts shedding on the tenth day, and efficiency treatment 76.33%, 75.28% , respectively.On the other hand treated groups with spiramycin drug did not stop shedding of parasite oocysts to the eleventh day after treatment and recorded less efficiency treatment reaching to 65.14% compared with the positive control group, which continued shedding oocycts to the end of experiment.Also, the results showed that the preventive groups that treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day after the treatment, and for both types of bacteria,the highest treatment efficiency reached to 85.91%and 86.55%, respectively. The statistical analysis showed significant differences between the control group and the treated groups in level of probability (P≥0.05).According to the results of histological study, the changes occurred in the small intestine before and after treatment, showed that in the tissue sections of the positive control group animals the parasite adhesion clearly on brush border of the epithelial intestine tissue.The treated groups with two types of bacteria and their supernatants showed disappearance of the parasite from the intestinal tissue with simple changes included hydropic degeneration and increase in the number of goblet cells when compared to a group of spiramycin which led to the occurrence of damage in the mucous layer and the shorten in lengths of the villi , dehydration and infiltration in lymphocytes with destruction in tissue (necrosis).

دراسة جزيئية لعوامل الالتصاق في بكتريا Escherichia coli الممرضة للمسالك البولية وعلاقتها بمقاومة Fluoroquinolones == Molecular Study of Adherence Factors in Uropathogenic Escherichia coli Related to Fluoroquinolones Resistance

اسم المؤلف: شيماء خضر عباس العلاق
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 150عينة ادرار من مرضى خمج المسالك البولية ومن مختلف الاعمار للفترة من تموزالى تشرين الثاني 2011 .اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات الزرعية والمجهرية والفحوصات الكيموحيوية , والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات في وقت مبكر للكشف عن الانواع بواسطة استخدام فحص Api20E .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق وجين مقاومة الفلوروكوينولونات باستخلاص الدنا البكتيري بطريقة الغليان ومن ثم اخضع الى اختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) . تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية , فضلا عن تقدير التركيز المثبط الادنى (MIC) لاربع مضادات من الفلوروكوينولونات . اظهرت النتائج ان توزيع اصابات اخماج المسالك البولية في الاناث (99(66%) بينما بلغت في الذكور 51(34%)) وسجلت اعلى نسبة من الاصابة في النساء البالغات المتزوجات 67(44.7%) .اظهرت النتائج ان بكتريا E.coli كانت الاكثر شيوعا في مرضى خمج المسالك البولية 65 عزلة (43.3%). بينت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان (100%) , اذ اظهرت نسب مختلفة من الالتصاق تراوحت بين 8 الى 63 خلية بكتيرية / خلية طلائية .اظهرت عزلات E.coli احتوائها على ثلاثة انواع من عوامل الالتصاق (CAF) وبنسب مختلفة . النوع الاول (CAFl) ووجد في 58 عزلة (89%) , النوع الثاني (CAFΠ) ووجد في 35 عزلة (54%) والثالث (CAFШ) وجد في 36 عزلة (55%) . عند اختبار حساسية العزلات تجاه 12 مضاد جرثومي , اظهرت عزلات E.coli مقاومة تامة (100%) لمضاد Augmentin(Amoxicillin/Clavulanic acid) (99%) بينما كانت اقل مقاومة للمضادات Pefloxacin , Norfloxacin, Nitrofurantoin وبنسبة(34, 35, 22)% على التوالي .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة من المقاومة المضاعفة المشتركة (42%) كانت في العزلات التي قاومت خمسة الى ثمانية مضادات . فيما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لاربعة مضادات من الفلوروكوينولونات ,فاظهرت النتائج ان هناك اختلافا واضحا في قيمتها . تم اختيار 28 عزلة E.coli من عزلاتنا المحلية بالاعتماد على درجة مقاومتها العالية للمضادات ,اظهر كشف البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) المفرد (Uniplex PCR) والمشترك (Multiplex PCR) عن وجود جينات الالتصاق الضارية والمتضمنة P (papC), type 1 fambria fimH ,adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ) حيث تم الكشف عن(22 isolates (79%),20(71%), 6(21%),4(14%)) على التوالي . تم الكشف عن جين مقاومة الكوينولونات gyrA في كل العزلات 28 (100%). في هذه الدراسة تم اعتماد gyrAبديلا عن استخدام 16s rRNA في تشخيص السلالات البكتيرية.اذ اعطت جميع العزلات حزم عند الحجم الجزيئي (518 bp) دلالة على وجود الجين باستخدام تقنية (PCR) .واخيرا .اظهرت النتائج ان عزلات E.coli الممرضة للقناة البولية (UPEC) والمقاومة للكوينولونات تبدي انخفاضا في عوامل ضراوتها عن العزلات الحساسة للكوينولونات ,اظهرت نتائجنا اعلى نسبة لعوامل الضراوة في العزلات التي قاومت ثمانية مضادات اعطت نسبة 18% منها تمتلك عامل الالتصاق الاول (CAFl) , 14%تمتلك (CAFΠ) و12% من هذه العزلات تمتلك (CAFШ) وذلك يشير الى ارتباط مباشر لمقاومة الكوينولونات مع انخفاض وجود جينات الضراوة (تراجع جيني).و اظهرت النتائج ايضا انه جينات الضراوة اقل انتشارا (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) في العزلات التي قاومت كل مضادات الفلوروكوينولونات .هذه العلاقة ربما تتاثر بواسطة التراجع الجيني . | One hundred fifty urine samples were collected from urinary tract infection patients from different ages during the period of July 2011 to November 2011. The bacterial diagnosis on cultural and microscopical characteristics of bacterial cell and biochemical tests. The final and accurate diagnoses of the isolates as the early mentioned species were done using the API 20E system. Molecular identification for adhesion factors and fluoroquinolone resistant gene was done by DNA extraction by boiling method, then subjected to conventional PCR .The antibiotic sensitivity test was done, also the minimum inhibitory concentration (MIC) for four Fluoroquinolone antimicrobial agents was studied. The results showed that the distribution of UTI in female were 99(66%), while in male were 51 (34%). However, the high percentages of UTI were observed within the adult married women 67(44.7%). The results showed that E.coli was the most common microorganisms in UTI patients, 65 isolates (43.3%). All the isolates showeded ability of adherence to uroepithelial cells of human's urinary tract (100%) of the isolates presented adherence that mean number of bacteria adhered to uroepithelial cells ranged from 8 to 63. E.coli isolates exhibited the presence of three types of colony adhesion factors (CAF) at different rate. Type one (CAFl) observed in 58 isolates (89%), while type two (CAFΠ) in 35 isolates (54%), and (CAFШ) in 36 isolates (55%). Sensitivity of E.coli local isolates toward 12 antimicrobial agents showed complete resistance (100%) to Augmentin (Amoxicillin/Clavulanic acid), while they were less resistance to Pefloxacin, Norfloxacin, Nitrofurantoin at (34, 35, 22)% respectively. The results showed that the highest rate of multidrug resistance (42%) was observed in isolates were able to resist 5 to 8 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentrations for four Fluoroquinolone antimicrobial agents showed an obvious different between their values.The local isolates of E. coli selection 28 isolates depending upon high degree of multi antibiotic resistance. The PCR assay (Uniplex PCR and Multiplex PCR) showed prevalence of virulent adhesion genes P (papC), type 1 fambria fim H, adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ), were detected (22 isolates (79%), 20(71%), 6(21%), 4(14%)) respectively. The quinolone resistance gene gyrA detected in all isolates 28 (100%). In the present study depended upon gyrA gene (housekeeping gene) as alternative to 16s rRNA for the identification bacterial strains. All the isolates give bands at the molecular size (518 bp) an indication of a gene by using PCR technique. Finally ,the results have shown that Fluoroquinolone resistant uropathogenic E.coli (UPEC) isolates express fewer virulence factors than Fluoroquinolone susceptible isolates .The persent results showed the highest rates of virulence factors in isolates that resisted eight antibiotics which was obtained to 18% of these isolates have(CAF l ), 14% have(CAFΠ ) and 12% of the isolates have (CAFШ). This finding suggests that fluoroquinolone could be directly associated with decreased prevalence of virulent genes (genetic back) .Also the results showed that all 4 virulent genes under the study were lower prevalent (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) in the isolates resistance for all fluoroquinolone and quinolone antimicrobial agents. that the relationship may be influenced by the genetic background.

تقييم المعادن الثقيلة لنهر دجلة ضمن مدينة بغداد باستخدام دلائل التلوث == Heavy Metals Assessment of Tigris River within Baghdad City by Pollution Indices

اسم المؤلف: شهد رياض زكي الربيعي
اسم المشرف: عادل حسين طالب الزاملي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للفترة من شهر تشرين الثاني 2013 ولغاية شهر حزيران 2014, اذ تم جمع عينات الدراسة (ماء، رواسب، نباتات) خلال كل شهرين في ثلاثة مواقع في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد. تضمنت الدراسة تقدير تراكيز (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والزنك) في الماء (الذائب والكلي) وفي الرواسب (الكلي والمتوافر احيائيا) لنهر دجلة، وتم قياس نفس المعادن على انواع مختلفة من النباتات التي تم جمعها من مواقع الدراسة.اما الخصائص الفيزيائية والكيميائية لمياه النهر والمتمثلة في درجة حرارة الهواء والماء, الاس الهيدروجيني, الكدرة , الاوكسجين الذائب والتوصيلية الكهربائية فقد سجلت قيما ترواحت ما بين : ١٧٫٩ - ٤١ م°، ١١٫٧ - ٢٥٫٥ م°، ٧٫٨ - ٨٫٧، ٦٫٦ - ٣٧٫٢ NTU ، ٧٫٧ - ١١٫٣ ملغم/لتر و٨۰٦ - ١٩٤۰ مايكروسيمنز/ سم على التوالي .اظهرت نتائج الدراسة ان معدل التراكيز للمعادن الثقيلة الذائبة (الكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين) كانت ١٫٥١ ، ٣۰١٫١، ١٨٫١٨، ٢٩٫۰٣ ، ١٧١٫٤ و٤٣٫۰٣ ميكروغرام / لتر على التوالي. وكانت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار باستثناء الكروم والرصاص.بينما كان المعدل الاجمالي للمعادن الثقيلة في مياه نهر دجلة ٥٫٣۰ ،٤٦١٫٦۰، ٣٢٫۰٣، ٧٩٫٩٩ ،٢٢١٫٤٦ و١٢٦٫٦٣ميكروغرام / لتر على التوالي . والتي اعتبرت ضمن الحدود المسموح بها من قبل المحددات العراقية لنظام صيانة الانهار، باستثناء الكادميوم، الكروم والرصاص.في الرواسب ، كان معدل الاجمالي للمعادن الثقيلة ٧٫٣٨، ١٦٤٫٩٤،٣٩٫٤١، ٨٤٫٨٩ ٧١٫٥٢ و١٢٨٫٧٣ ملغم/كغم على التوالي. في حين يتراوح التوافر البيولوجي للكادميوم، الكروم، النحاس، النيكل، الرصاص والخارصين في رواسب نهر دجلة بين (قيم غير محسوسة - ۰٫٣٢) ، (۰٫٣٩ - ٣٫٤٢) ، (۰٫٨٩ - ٣٫١٩) ، (۰٫٤٢ - ٢٫٨٤) ، (۰٫٧٨ - ٥٫۰٤) و(۰٫٨٦ - ١٧٫١٨) ملغم/كغم على التوالي.تم تقييم شدة تلوث مياه النهر بالمعادن الثقيلة باستخدام مؤشر التلوث (PI) والتي اظهرت ان درجة تلوث المعادن الثقيلة في عينات المياه كانت متوسطة للمواقع حسب الترتيب التالي : ٣>٢>١.كما قيمت شدة تلوث الرواسب النهرية بالمعادن الثقيلة المدروسة بواسطة استخدام دلائل تلوث الرواسب وهي كل من مؤشر التراكم الارضي (I - geo - Index) ، مؤشر حمل التلوث (PLI - Index) ، مؤشر عامل التلوث (CF - Index) ، درجة التلوث (Cd - Index) ومؤشر عامل الاغناء EF - Index)).فيما يتعلق بتقييم تلوث الرواسب باستخدام المؤشرات البيئية فقد بينت نتائج مؤشر التراكم الارضي (I - geo) المحسوب للعناصر المدروسة ان المواقع المدروسة غير ملوثة بعنصري النحاس والزنك ولكنها قوية التلوث للغاية بعنصر الكادميوم في حين اظهرت قيم مؤشر التراكم الارضي للرصاص بانها درجة تلوث معتدلة وغير ملوثة الى متوسطة التلوث لعنصري الكروم والنيكل. كما اظهرت قيم مؤشر حمل التلوث(PLI) بان كل المواقع كانت ملوثة بمجموع المعادن المدروسة.اوضحت نتائج عامل التلوث(CF) بان المواقع جميعها سجلت تلوث عاليا جدا بعنصر الكادميوم ، ولكنها واطئة التلوث بعنصر الزنك في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل تلوث معتدلا بهذا العنصر، بينما سجل تلوث معتدلا بعنصر الكروم ،النحاس والنيكل في جميع المواقع .بينما سجلت الرواسب تلوثا عاليا بعنصر الرصاص في جميع المواقع المدروسة.وفقا لنتائج مؤشر درجة التلوث (Cd) فقد اعتبرت جميع المواقع على درجة عالية جدا من التلوث بالمعادن المدروسة.فضلا عن ذلك بينت نتائج عامل الاغناء EF - Index)) بان كل المواقع تصنف على انها عالية للغاية مع الكادميوم ومعتدلة الاغناء بعناصر الكروم، النحاس والنيكل واغناء مهم بعنصر الرصاص وحد ادنى من الاغناء بعنصر الخارصين في جميع المواقع ماعدا الموقع الثالث، والذي سجل اغناء معتدل.اظهرت نتائج قيم BCF& BSF في جميع النباتات بانها اكثر من 1 مما يشير الى ان النباتات مؤشر احيائي جيد لكافة العناصر المدروسة في منطقة الدراسة وكذلك اوضحت نتائج معامل التركيز الاحيائي((BCF لجميع المعادن المدروسة في عينات النباتات انها اعلى من قيم معامل الترسيب الاحيائي ((BSF مما يدل ان مصدر التراكم لهذه العناصر في النباتات كان من الماء. | This study was carried out from November 2013 to June 2014; the samples were collected every two months in three sites in the Tigris River within Baghdad city. It included estimate concentration of (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) in dissolved and total water and sediments (total& bio - available) of Tigris River. The same metals were measured in different types of plants collected from study sites.Physical and chemical properties of river water had values ranged between 17.9 - 41.0 C˚, 11.7 - 25.5 C˚, 7.8 - 8.7, 6.6 - 37.2 NTU, 7.7 - 11.3 mg/l and 806 - 1940 µs/cm for air and water temperature, pH, turbidity, dissolve oxygen and electrical conductivity, respectively.Study results showed that mean of heavy metals concentrations (Cadmium, Chromium, Copper, Nickel, Lead and Zinc) were 1.51 µg/L, 301.10 µg/L, 18.18 µg/L, 29.03 µg/L, 171.40 µg/L and 43.03 µg/L, respectively in dissolved water and they were within permissible limits for Iraqi standard specifications exceptions of Cr and Pb. While the total of heavy metals in Tigris River water average was 5.30 µg/L, 461.60 µg/L, 32.03 µg/L, 79.99 µg/L, 221.46 µg/L and 126.63 µg/L, respectively and they were within permissible limit for Iraqi standard specifications exceptions of Cd, Cr and Pb.In sediment samples, mean of heavy metals concentrations were 7.38 mg/kg, 164.94 mg/kg, 39.41 mg/kg, 84.89 mg/kg, 71.52 mg/kg and 128.73 mg/kg, respectively. While the ranges of bioavailability for Cd, Cr, Cu, Ni, Pb and Zn in sediments of Tigris River are (ND - 0.32), (0.39 - 3.42), (0.89 - 3.19), (0.42.2.84), (0.78 - 5.04) and (0.86 - 17.18) mg/kg, respectively.Severity of river water pollution with studied heavy metals were assessed by using Pollution Index (PI) which showed that the degree of pollution by heavy metals in the water samples moderates contamination for the sites in the following order : 3>2>1.Also, pollution of river sediments in the studied heavy metals were assessed by using sediment pollution indices such as geo - accumulation index (I - geo), pollution load index (PLI), contamination factor (CF), contamination degree (Cd) and enrichment factor (EF).Related with the assessment of sediments pollution by using the ecological indices, the results of geo - accumulation index (I - geo) for studied heavy metals cleared that the studied sites unpolluted with Cu and Zn, while strongly to extremely pollute with Cd while the Igeo values of Pb show moderately polluted degree and unpolluted to moderately polluted degree with Cr and Ni. The values of pollution load index (PLI) showed that all sites are polluted with total studied metals (PLI value of > 1).Results of contamination factor (CF) observed that all the sites recorded very high contamination with Cd , while low contamination with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate contamination with it, and recorded moderate contamination with Cr, Cu and Ni in all sites, while the sediments recorded considerable contamination with Pb in all studied sites. According to the result (Cd) indicates that all studied sites showed very high degree of pollution with studied metals. As well as, the enrichment factor results (EF) showed that all sites can be classified as extremely high enrichment with Cd, moderate enrichment with Cr, Cu and Ni, significant enrichment for Pb and minimal enrichment with Zn in all sites except the site 3 that recorded moderate enrichment.The results showed that BCF &BSF values in all plants were more than 1 and this can be considered that plants can be a good bio - indicator for all the heavy metals studied in study area, also BCF values for all elements were more than (BSF) values in all plants samples which lead to plant samples bioaccumulation source with these metals was from water.

الكشف الجزيئي عن انواع البكتريا وفايروس التهاب الكبد المرتبطين مع بيتا - ثلاسيميا == Molecular Detection of Bacterial and Hepatitis Virus Types Associated with ? - Thalassemia

اسم المؤلف: شـهـد رعـد مزعـل
اسم المشرف: اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة التحري عن انواع الاصابات البكتيرية والالتهاب الكبد الفايروسي المرتبط بمرض الثلاسيميا نوع الكبير ومقارنتها مع الاشخاص المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير.لغرض التشخيص انواع البكتيريا جمعت نوعين من عينات من مرضى الذين راجعوا مستشفى ابن بلدي.عينات الادرار تضمنت (41عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و18من المرضى غير مصابين بثلاسيميا نوع الكبير) وعينات الدم تضمنت (25عينة من المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير و25عينة من المرضى غيرمصابين بثلاسيميا نوع الكبير). اعتمادا على تحديد الصفات الزرعية للمستعمرات والصفات المورفولوجية للخلايا البكتيرية ومن ثم الصفات الكميوحيوية كما امكن تشخيص العينات باستخدام .VEKIK2systemاظهرت النتائج التشخيص في عينات الادرار في المرضى مصابين بثلاسيميا نوع الكبير ان بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 25% بينما انواع اخرى من بكتيريا ظهرت بنسبة 6% ,5% ,3% ,3% ,2% ,2% ,2% ,2%, 1.3% لبكتيريا klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia على التوالي. بينما من جانب اخر كانت نتائج التشخيص عينات الادرار لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير حيث كانت بكتيريا الاكثر تواجدا كانت Escherichia coli بنسبة 28% بينما ظهرت نتائج الانواع بكتيريا الاخرى بنسبة 12% ,7% ,5% ,3% ,4% ,4% ,4% ,4% ,4% على التوالي لبكترياklibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp ..اظهرت نتائج تشخيص عينات الدم ان بكتيريا الاكثر تواجدا في المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير والمرضى غيرمصابين بثلاسيمميا النوع الكبير كانتEscherichia coli 24% ,15% على التوالي. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 6% ,3% ,5%, 5%,5% ,3% ,2% ,2%, 2% على التوالي لبكتيريا streptococcus pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea. spp. بينما ظهرت الانواع بكتيريا الاخرى لمرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير بنسبة 7%, 5%, 3.2% ,3.2% ,3.2%3.2%, 3.2%, 3.2%,3.2% على التوالي لبكتريا sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia ,klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca,proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea.spp. اما بالنسبة لتاثير بعض المضادات الحيوية على بكتيريا Escherichia coli فقد اظهرت النتائج اختبار الحساسية لمضادات باستخدام VITKE 2 systemمقاومة هذه العزلات امبسلين (98%) وسيفاتريكسون (95%) السبروفلوكساسين (46%) السيفوتازيديم (44 (%والاموكسيسيلين (43% (والسيفوتاكزيم (40%) وليفووكساسين) 78%) والنالدكسك اسد (50%) ميثوبريم (27%) سيفابيم (40%) اكستابنيم (20%).استعملت طريقة التحليل الجزيئي PCR analysis للكشف عن عوامل الفوعة الجينية والمقاومة والتقارب الوراثي التي تمتلكها بكتيريا Escherichiacolii ، وباستخدام بادئات متخصصة لكل من الجين الخاص بالاهداب من النوع الاول (fimH) والجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII). وجين خاص بتحلل الدم (hly) وجين خاص بالالتصاق (eae) وجين خاص ب لمقاومه مضاد حيوي ((bla - cmy2 كانت النتائج ان جين (fimH) بنسبة (58%) ، فيما كانت نسبة الجين الخاص بالمحفظة (kpsMTII) (58%) بينما جين خاص بالالتصاق (eae) كانت نسبة (20%). ونسبة جين خاص بتحلل الدم (hly) (28%), ونسبة الجين خاص بمقاومة المضاد الحيوي ((bla - cmy2 كانت (83%) بينما كانت نسبة ظهور كل جينات) 5.7%), وكانت نتائج الجين الخاص بتقارب الوراثي (Box) (58%).ولغرض دراسة الاصابات الفايروسية مرتبطة بمرض ثلاسيميا النوع الكبير وباستخدام تقنية ELSLA جمعت عينات الدم (88 من المرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبير و62 من مرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير) تم جمع العينات من مركز الوطني لنقل الدم لتحري عن وجود الالتهاب الكبد الفايروسي نوع ( CوB) حيث كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (B) لدى المرضى مصابين مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (17%) بينما كانت نسبة لدى المرضى غير مصابين بثلاسيميا النوع الكبير (16%).بينما كانت نسبة الالتهاب الكبد الفايروسي نوع (C) (82.9 %) ,(8 ,83%) لدى مرضى مصابين بثلاسيميا النوع الكبيرو غير مصابين بثلاسيمياالنوع الكبير على التوالي . | This study was carried out to detect the types of bacterial and viral infections which associated with β thalassemia major comparison to non thalassemic patients group.For Bacterial types identification two different kinds of samples were collected from Ibin ALBalady hospital. Urine samples which included (41from thalassemic patients and 18 from non thalassemic patients) and blood sample which included (25 from thalassemic patients and 25 from non thalassemic patients) depending on their cultural, morphological as well as biochemical characterization. The result identification that in urine sample showed that was most prevalent kind was Escherichia coli with percentage 25%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 6%, 5%, 3%, 3%, 2%, 2%, 2%, 2%, and 1.3%. Klibseilla pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, sterptococcus pneumonia respectively. While, on other hand, in non thalassemic patients the result identification that in urine sample the most prevalent kind was Escherichiacoli with percentage 28%. In addition, other bacteria were also obtained with a percentage 12%, 7%, 5%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4%, 4% for klibseilla pneumonia, sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively. The result for blood sample identification also showed that the Escherichia coli was most common in thalassemic and non thalassemic patients it with a percentage 15%, 24% respectively, and other types bacteria were also obtain with a percentage 6%, 3%, 5%, 5%, 5.3%, 2%, 2%, 2% for , sterptococcus pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa Chlamydia pneumonia, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp, respectively from thalassemic patients and other types bacteria were obtain from non thalassemic with a percentage 7%, 5%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3%, 2.3% for sterptococcus pneumonia, Chlamydia pneumonia, klibseilla pneumonia, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter colaca, proteus. spp, Salmonella typhi, Pantoea spp receptivity, and the results confirmed by identification VITEK 2 system kit. The VITEK 2 SYSTEM Antibiotics sensitivity test kits results revealed that Escherichiacoli were resistance to following antibioses Ampcilin (98%), Cefatriaxone (95%), Ciprofloxacin (46%), Cefipime (74%) Liovfaxacin (78%), Tetracylin (70%), Cefotaxim (40%), Aomxcilin (43%), Nalidexic acid (50%), Extapenem (20%), ceftazidime (44%). Moreover, low percentage of resistance was shown to, extapenem (20%) Trimethoprim (27%). PCR Methods used of molecular diagnosis of virulence genes, resistance, genotyping genes of E. coli by using specific primers to type 1 fimbria gene (fimH) and capsule gene (kpsMTII), hemolysin (hly), intimin (eae), ceftriaxone (bla - cmy2). PCR results the presence fimH (58%) and kpsMTII (40%) while hly (28%), eae 25%, (bla - cmy2) (83%). While the prevalence of all genes together with a percentage (7.5%) The results of box - PCR genotyping was 80%. To study the viral infection which associated with β thalassemia major by used ELSLA technique sample (88 from thalassemic and 62 from non thalassemic patients) were collected from Iraq National blood bank. For detection of HBS and HCV the result showed that HBS17% in thalassemic patients while in non thalassemic patients was16% while HCV were (82.95%), (83.87%) is percentage thalassemic patients receptivity

استجابة تراكيب وراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتحمل تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم خلال مراحل مختلفة من النمو == Response of barley genotypes Hordeum vulgare L. for tolerance different concentrations of Sodium Chloride through different growth stage

اسم المؤلف: شروق محمود وسين
اسم المشرف: سعدية حسن محمود | عباس جاسم حسين الساعدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2008 - 2009 بهدف التعرف على مدى تحمل بعض التراكيب الوراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم في مراحل مختلفة من النمو . تضمنت الدراسة تجربتين : التجربة الاولى هي دراسة تاثير تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم (0 ، 50 ، 100 ، 150 و200) مليمول/لتر على ستة تراكيب وراثية من الشعير هي بركة، بيكسون، فوريست ، بركة × بيكسون، بركة × فوريست وبيكسون × فوريست في بعض المؤشرات المظهرية كنسبة وسرعة انبات البذور وطول الجذير والرويشة والمساحة الورقية . نفذت التجربة في مختبر الدراسات العليا ، قسم علوم الحياة / كلية العلوم / الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية وقد استعمل محلول مغذي nutrient solution كوسط لزراعة البذور .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في المؤشرات المدروسة كما اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية للشعير في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهر التركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح فقد اعطى القيم 93.00% عن نسبة الانبات و7.36 بذرة/يوم عن سرعة الانبات، 6.72 سم عن طول الجذير و8.30 سم عن طول الرويشة. اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع لقسم علوم الحياة ، كلية التربية / ابن الهيثم / جامعة بغداد من خلال زراعة بذور التراكيب الوراثية بركة وبيكسون وبركة × فوريست بعد معرفة تحملها للملوحة (التجربة الاولى) في اصص بلاستيكية لدراسة تاثير تراكيز كلوريد الصوديوم السابقة المذكورة اعلاه على بعض المؤشرات المظهرية والفسلجية كاطوال الجذور واحجامها واوزانها الجافة وارتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري والمساحة الورقية ومحتوى بعض العناصر الغذائية في الجزء الخضري (كالنتروجين والفسفور والبوتاسيوم والصوديوم والكلور) ونسبة البروتين ومحتوى الكلوروفيل ومحتوى البرولين ونسبة الدهون والمحتوى النسبي للرطوبة في الاوراق بالاضافة الى بعض مكونات الحاصل وهي الحاصل البايولوجي ، طول السنبلة ، وزن السنبلة/نبات ، عدد الحبوب/سنبلة، وزن الحبوب/سنبلة، وزن 1000 حبة ووزن الحبوب/اصيص . كما تمت دراسة (محتوى البوتاسيوم والصوديوم والكلور) والجهد الازموزي لتربة التجربة بعد الزراعة . وقد استخدم التصميم العشوائي الكامل CRD)) وبتجارب عاملية لتنفيذ التجربتين وبثلاثة مكررات في التجربة الاولى، واربعة مكررات في التجربة الثانية، وقد تم تحليل النتائج احصائيا وقورنت المتوسطات باستعمال اقل فرق معنوي (L.S.D.)على مستوى احتمال 0.05 .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في معظم المؤشرات المدروسة. وزيادة معنوية في محتوى الحامض الاميني البرولين ومحتوى الصوديوم والكلور في الانسجة المختلفة للتراكيب الوراثية المدروسة ، كما زاد معدل الجهد الازموزي ومحتوى الصوديوم والكلور وانخفض محتوى البوتاسيوم في ترب التراكيب الوراثية مقارنة بها قبل الزراعة . كذلك اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهرالتركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح، فقد اعطى قيما عليا في معظم المؤشرات المدروسة كالوزن الجاف للجذور 1.01 غم/نبات، وارتفاع النبات بعد مرور شهر من التعرض للملح 54.00 سم، وارتفاع النبات بعد مرور ثلاثة اشهر من التعرض للملح 63.90 سم، والوزن الجاف للجزء الخضري 0.35 غم/نبات، والمساحة الورقية 53.51 سم2، ومحتوى النتروجين 10.83 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى البوتاسيوم 8.22 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى الكلور 7.45 ملغم/غم وزن جاف، ونسبة البروتين 18.70%، ومحتوى الكلوروفيل 33.20 مايكروغرام/سم2، ومحتوى البرولين 14.01 ملغم/لتر، ونسبة الدهون 5.27%، وبعض مكونات الحاصل مثل الحاصل البايولوجي 11.01 غم/اصيص وطول السنبلة 5.84 سم، وعدد الحبوب/سنبلة 25.39 حبة/سنبلة، ووزن الحبوب/سنبلة، 0.81 غم/سنبلة، ووزن 1000 حبة 28.93 غم، ووزن الحبوب /اصيص 4.22 غم/اصيص، يليه التركيب الوراثي بيكسون ثم بركة × فوريست . كما اظهرت النتائج وجود تباين بين ترب التراكيب الوراثية للشعير في محتوى بعض العناصر، اذ اعطت تربة بركة اقل معدل لمحتوى عنصر البوتاسيوم بلغ 231.70جزء بالمليون، واعلى محتوى للكلور بلغ 2.74 ملي مكافئ/لتر . | This study has been performed during the agricultural season of 2008 - 2009 in the aim to recognize how some genotypes of barley Hordeum vulgare L. tolerate different concentrations of NaCl in different growth stages . Two sets of experiment has been done : The first was to determine the effect of different concentrations of NaCl (0,50,100,150 and 200) mM/l on some morphological parameters (% and rapidness of seeds germination, radical and plumule length and leaf area). Of six genotypes of barley cultivars Baraka, Bekson, Forest, Baraka × Bekson, Baraka × Forest and Bekson × Forest . The experiment was done in the Labrotary of higher studies, Department of Biologey, college of science, AL - Mustansiriyah University, by using petri dishes supplied with nutrient solution. The result showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to asignificant decrease in the studied parameters. Also the result revealed adifference among the genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype showed agood tolerating capacity against high saline concentration so it gave values 93% for percentage of germination, 7.36 seed/day of rapidness of germination, 6.72 cm of radical length and 8.30 cm of plumule length. The second set was carried out in the green house of the Department of Biologey, college of Education (Ibn AL - Haitham), Baghdad university via planting seeds of Baraka, Bekson and Baraka×Forest genotypes after determination of their salinity tolerance (set No.1) in plastic pots in order to study the effect of the above mentioned NaCl concentrations on some of their morphological and physiological parameters such as root length and size, shoot and root dry weights , content of some nutrient elements in the shoot (such as N, K, Na and Cl), protein %, chlorophyll content, proline content, lipid proportion and leaf relative humidity, beside some yield components : biological yield, spike length, weight of spike/plant, number of grains/spike, weight of grains/spike, weight of 1000 grains and weight of grains /pot Additionally, determination of (K, Na and Cl content)and osmotic potential in experiment soil after planting. The completely RandomiZed Design (CRD) with Factorial experiments was applied with three replicates for the first experiment and four replicates for the second experiment, Data were statistically analyzed to find out the least significant differences between treatment at 0.05 level. The results showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to a significant decrease in studied parameters and a significant increase in content of proline acid, Sodium and Chloride in the different tissue of the studied genotypes. Also increased the average of osmotic potential, content of Sodium, Chloride and decrease of potassium content in soil of the genotypes as compared with it befor planting. Moreover, the result revealed a difference among genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype exhibited a good tolerating capacity against high saline concentration so it provides higher values in most of the studied parameters as root dry weight 1.01 gm/plant, shoot length after one month of salt treated 54.00Cm,shoot length after three months of salt treated 63.90 Cm, shoot dry weight 0.35 gm/plant, leaf area 53.51Cm2, Nitrogen content 10.83 mg/gm dry weight, Potassium content 8.22 mg/gm dry weight, Chloride content 7.45 mg/gm dry weight, % protein 18.70 %, chlorophyll content 33.20 mg/cm2, proline content 14.01 mg/L, % lipid 5.27%, biological yield 11.01 gm/pot , spike length 5.84Cm, number of grains /spike 25.39 grain/spike, weight of grains /spike 0.81 gm/spike, weight of 1000 grains 28.93mg and weight of grains/ pot 4.22 gm/pot; then, Bekson genotype and Baraka × Forest. The result showed that there is a variation among soil of the genotypes of barley in content of some elements when soil Baraka gave least avarege of Potassium content as (231.70 ppm) and higher Chloride content as (2.74 m.q/L)

دراسة العلاقة بين مجاميع الدم واضداد النطف في الرجال قليلي الخصوبة == A study on relation between blood groups and Anti - sperm antibodies in infertile men

اسم المؤلف: شروق ابراهيم محمود عزيز اغا
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم استخدام 92 عينة دم وسائل منوي لذكور قليلي الخصوبة وكذلك نفس العدد من ذكور خصبين , حيث تم الحصول عليها للفترة المحصورة من تشرين الثاني 2006 ولغاية حزيران 2007 . اجري فحص الدم على جميع العينات لتحديد مجاميع الدم طبقا لنظام ABO ونظام لويس , بينما تم التحري عن اضداد النطف باستخدام فحص ELISA النوعي وكما تم تحديد عيارية هذه الاضداد في العينات الموجبة باستخدام Tray - agglutination test (TAT). اظهرت نتائج هذه الدراسة علاقة معنوية (p≤0.01) مابين نوع مجاميع دم لويس وحالة الخصوبة حيث سجل صنف دم Lea 4.4% وصنف Leb 14.1% وصنف Lea - b - 81.5% في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع 20.7 % , 15.2 % ,64.1% على التوالي في الذكور الخصبين . بينما اظهر فحص ELISA نتيجة موجبة لوجود اضداد النطف بنسبة 5.4% , 32.0% في كل من البلازما المنوية ومصل الدم على التوالي في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع الذكور الخصبين حيث لم تسجل اي نسبة وجود للاضداد في مصل الدم . من جهة اخرى فقد اظهرت النتائج علاقة معنوية ( (P≤0.01 ما بين وجود اضداد النطف في مصل دم الذكور قليلي الخصوبة ومجاميع الدم نظام ABO , حيث سجل صنف الدم O , اعلى نسبة للاضداد بلغت 55.0% بالمقارنة مع 45.0% لجميع اصناف الدم الاخرى . كما اظهرت النتائج وجود نفس العلاقة المعنوية( (≤0.05 ما بين مجاميع دم لويس ونسبة اضداد النطف حيث سجل صنف دم لويس Lea - b - اعلى نسبة اضداد بلغت 69.0% بالمقارنة مع 31.0% لكلا الصنفين Lea , Leb كذلك اظهرت النتائج عدم وجود علاقة معنوية ما بين اضداد النطف وعدد النطف في الذكور قليلي الخصوبة ذوي مجاميع الدم ABO ومجاميع دم لويس .واخيرا فقد اظهرت النتائج وجود تراكيز طبيعية لجميع الهرمونات الجنسية في عينات مصل الدم لجميع الذكور قليلي الخصوبة سواء حسب نظام ABO او نظام لويس. | Ninety two samples of blood and seminal fluid of low fertility males and equal number of the same samples from fertile males ,were obtained from November 2006 till June 2007 . The grouping was carried out according to ABO and Lewis system , While antibodies of sperms were detected by using specific ELISA test , and the titer in the positive samples was determined by Tray - agglutination test (TAT) . The results of this study revealed a significant correlation (P≤ 0.01) between the phenotype of Lewis blood groups and the fertility state , in which 4.4% Lea, 14.1% Leb and 81.5% Lea - b - phenotypes were recorded in the low fertility males , in comparison to 20.7% ,15.2% and 64.1% respectively in those fertile males . However the ELLISA screening test in low fertility males showed positive results 5.4% and 32.0% in seminal plasma and serum samples respectively , in comparison to 0% in serum of fertile males . On the other hand , the results demonstrated a significant correlation (P≤ 0.001) between the presence of anti - sperm antibodies in the serum of infertile and the ABO blood groups , Whereas ,the group O recorded a highest presence of anti - sperm antibodies 55.0% in comparison to that recorded by the remaining groups 45.0% . Also the same significant correlation (P≤ 0.05) has been obtained between the Lewis blood groups and the presence of anti - sperm antibodies, in which Lewisa - b - phenotype recorded the highest percentage 69.0% comparison to 31.0% for those of Lea and Leb together . Further more the results also showed that in low fertility males, who had ABO and Lewis blood groups, there were non significant correlation between anti - sperm antibodies and number of sperms .Finally the results showed normal concentration of all sex hormones in the serum of all infertile males in spite of their ABO and Lewis blood groups

دراسة بعض الحالات المناعية والدموية في مرضى بهاق عراقيين == Study Some Immunological and Heamatological Status of Iraqi Vitiligo (Bohak) Patients

اسم المؤلف: شذى فارس طارق
اسم المشرف: طالب عبد الله حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: البهاق هو مرض جلدي مكتسب مجهول السبب يتميز بظهور بقع ناقصة الصبغة وهذا يعزى الى فقدان الخلايا الصباغية الجلدية. تشير الدلائل الى ان المناعة الذاتية تلعب دورا في امراضية هذا المرض، لانه من الممكن الكشف عن الاجسام المضادة والخلايا التائية المتكونة ضد الخلايا الصباغية في مرضى البهاق.الدور المحتمل للخلل المناعي في مرض البهاق قد تم اقتراحه لذلك ولاختبار هذه الفرضية تم التحري عن حركيات خلوية معينة (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) ، والكلوبيولينات المناعية ( IgA , IgG , IgM وIgE)، والعد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض ولجميع المشمولين بالدراسة .شملت الدراسة : 60 مريضا (ذكور واناث ) وخلال فترة تراوحت ما بين تشرين الثاني 2014 الى نيسان 2015 وباعمار تراوحت مابين (6 - 55) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و30 معالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة مرتين في الاسبوع ولمدة ( 4 - 10 ) اسابيع ومجموعة سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 30 فرد اصحاء ظاهريا.فصل المصل وتم قياس تركيز الحركيات الخلوية (البين ابيضاض17ا وعامل التنخر الورمي الفا ) والمستوى الكلي للمضاد المناعي نوع IgEفي مصل دم المشتركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمELISA)) بينما استخدمت طريقة الانتشار المناعي الشعاعي المفرد (SRID) في قياس مستوى الكلوبيولينات المناعية (IgM, IgG and IgA ) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لخلايا الدم البيض بوساطة جهاز ( Hematology auto analyzer 5 - diff). توصلت هذه الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت الاناث ارتفاعا في نسبة الاصابة بالبهاق مقارنة بالذكور وبنسبة (اناث / ذكور) تساوي 1 : 1.6 مع ذلك لا توجد بينهم فروق معنوية عند مستوى (P > 0.05) .2 - متوسط العمر في مرضى البهاق كان (28.55) سنة وان الفئة العمرية (20 - 11) سنة هي اكثر عرضة للاصابة .كشفت نتائج هذه الدراسة بان 48 (80%) من المرضى كان لديهم ظهور مبكر للبهاق (قبل عمر 30 سنة ) في حين 12(20%) من المرضى كان لديهم ظهور متاخر للبهاق (بعد عمر 30 سنة ).3 - وفيما يتعلق بالانواع السريرية للبهاق اظهرت هذه الدراسة بان الغالبية العظمى من الحالات كانت من النوع المنتشر 40 (%66.67) ومن ثم يتبع بالنوع الموضعي 18(30%) والنوع الشامل 2(3.33%). علاوة على ذلك كان النوع الفرعي السريري الاكثر شيوعا والذي لوحظ في هذه الدراسة هو النوع الشائع 30 (50%) ومن ثم يتبع بالنوع البقعي 12(20%) , النوع الذي يصيب الوجه والاطراف 8 (13.33%) ,النوع المقطعي 4 (6.66%) , النوع المختلط 2(3.33%) والنوع المخاطي 2(3.33%).4 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية بان 23 (%38.33) من المرضى كان لديهم تاريخ عائلي بالبهاق . كان التاثير على الاقارب من الدرجة الاولى بنسبة 17(% 28.33) , الاقارب من الدرجة الثانية بنسبة 5 (%8.33) والاقارب من الدرجة الثالثة بنسبة 1 ((%1.67.5 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين ابيضاض 17ا في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة 188.62) و174.03 ) بيكو غرام/ مل ارتفاعا معنويا عند مستوى ( (p ≤ 0.05 بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ( 116.07) بيكو غرام/ مل .6 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا ارتفاعا معنويا عند مستوى (p ≤ (0.05 عند مقارنة مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (64.68 و61.94) بيكو غرام/ مل على التوالي، مع مجموعة السيطرة (50.64) بيكو غرام/ مل .7 - A/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgG وIgA في مرضى البهاق غير المعالجين (1045.24 و216.40 ±) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ،انخفاضا غير معنوي عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (1082.02 و239.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي. بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgM (121.85 ) ملغرام/ديسيلتر والكلوبيولين IgE 147.01)) وحدة دولية /مل يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى0.05) <p ( . B/ اظهر معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgMو IgG في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ( 167.69 و1228.38) ملغرام/ديسيلتر على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى ((p ≤ 0.05 مقارنة مع كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومجموعة السيطرة ،بينما وجد بان معدل المستوى المصلي للكلوبيولين IgA (233.84) ملغرام/ديسيلتر يرتفع ولكن ارتفاع غير معنوي احصائيا عند مستوى 0.05)<p ( بالمقارنة مع مرضى البهاق غير المعالجين.8 - اظهر معدل خلايا الدم البيض في كل من مرضى البهاق غير المعالجين ومرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (8.80 و8.51) 103xخلية/مل3 على التوالي ، ارتفاعا معنويا عند مستوى (P ≤ 0.05) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة ((7.25 103x خلية/مل3.9 - A / لم يظهر معدل كل من الخلايا العدلة ،اللمفية ، وحيدة النواة ,الحمضة والقعدة في مرضى البهاق غير المعالجين (58.37 , 31.57 , 6.58 , 2.64 و1.04 )% على التوالي ، فروقا معنوية وعند مستوى 0.05) < ( P بالمقارنة مع مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة (58.29 , 30.25 , 6.46 , 2.61 و1.03) % على التوالي.B / اظهر معدل كل من الخلايا العدلة, الحمضة والقعدة في مرضى البهاق المعالجين بالاشعة فوق البنفسجية نوع B ذات الحزمة الضيقة ارتفاعا قليلا ولكن غير معنوي عند مستوى (0.05 <P) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة , ولكن اظهر معدل الخلايا وحيدة النواة انخفاضا غير معنوي , بينما اظهر معدل الخلايا اللمفية انخفاضا معنويا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | Vitiligo is an acquired idiopathic skin disorder characterized by depigmented macules due to loss of cutaneous melanocytes. Evidence suggests that autoimmunity plays a role in the pathogenesis of the disease, since antibodies and T cells against melanocytes can be detected in vitiligo patients.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in vitiligo so to test this hypothesis, certain cytokines (IL - 17A and TNF - α), immunoglobulins (IgM, IgG, IgA and IgE), total and differential count of WBCs were investigated in all participants.The study included : 60 patients (males and females) during the period from November 2014 to April 2015 with age range between (6 - 55) year; 30 of them were untreated and 30 were treated with Narrow Band Ultraviolet - B twice a week for (4 - 10) weeks with confirmed diagnosis of vitiligo using standard assessment age and gender matched 30 apparently healthy control.Serum was separated and cytokines, total immunoglobulin E (IgE) were detected by using Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA); while immunoglobulins (IgM, IgG and IgA) were detected by using Single Radial Immunodiffusion (SRID) method. Total and differential counts of White Blood Cells (WBCs) were measured by using Hematology auto analyzer 5 - diff. This study has reached the following results : 1 - Females had shown higher incidence of vitiligo as compared with males with a ratio F/M equals to 1.6 : 1 however there were no significant differences (P > 0.05) between them.2 - The mean age of vitiligo patients was (28.55) year and age group (11 - 20) year was more susceptible to affected. Results of this study revealed that 48 (80%) of patients had early onset vitiligo (before 30 years of age); while 12 (20%) had late onset vitiligo (after 30 years of age).3 - Regarding the clinical types of vitiligo; this study showed that the majority of cases were generalized type 40 (66.67%) followed by localized type 18 (30%) and universal type 2 (3.33%). Furthermore the most common clinical subtype observed in this study was vulgaris vitiligo 30 (50%), followed by focal 12 (20%), acrofacial 8 (13.33%), segmental 4 (6.66%), mixed 2 (3.33%) and mucosal 2 (3.33%).4 - Results of the current study showed that 23 (38.33%) of patients had a positive family history of vitiligo. First - degree relatives were affected in 17 (28.33%), second - degree relatives in 5 (8.33%) and third - degree relatives in 1(1.67%).5 - The mean serum level of IL - 17A in both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (188.62 and 174.03) pg/ml showed a significant increase (p ≤ 0.05) as compared with healthy control (116.07) pg/ml. 6 - The mean serum level of TNF - α showed a significant increased (p ≤ 0.05) when untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (64.68 and 61.94) pg/ml respectively compared with healthy control (50.64) pg/ml.7 - A / The mean serum levels of IgG and IgA in untreated vitiligo patients (1045.24 and 216.40) mg/dl respectively showed non significantly decreased (P<0.05) as compared to healthy control (1082.02 and 239.38) mg/dl respectively, while the mean serum levels of IgM (121.85) mg/dl and IgE (147.01) IU/ml were found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05). B / The mean serum levels of IgM and IgG in NB - UVB treated vitiligo patients (167.69 and 1228.38) mg/dl respectively increased significantly (p ≤ 0.05) as compared to both untreated vitiligo patients and healthy control, while the mean serum level of IgA (233.84 ± 18.88) mg/dl was found to be increased, but the increase was statistically non significant (P<0.05) as compared to untreated vitiligo patients.8 - The mean value of total WBCs of both untreated and NB - UVB treated vitiligo patients (8.80 and 8.51) x103 cell/ml3 respectively showed a significant increased (P ≤ 0.05) as compared with healthy control (7.25) x103 cell/ml3.9 - A / The means value of neutrophil, lymphocyte, monocyte, eosinophil and basophil in untreated vitiligo patients (58.37, 31.57, 6.58, 2.64 and 1.04) % respectively showed non significant differences (P<0.05) as compared with NB - UVB treated vitiligo patients (58.29, 30.25, 6.46, 2.51 and 1.03) % respectively.B / The means value of neutrophil, eosinophil and basophil in NB - UVB treated vitiligo patients showed slightly but non significant increased as compared with healthy control, but the mean value of monocyte showed non significantly decreased ,while the mean value of lymphocyte showed a significant decreased as compared with healthy control

دراسة تاثير المحورات المناعية للمستخلص الايثانولي لبذور نبات Azadirachta indica على الاستجابة المناعية للفئران الملقحة ببكتريا Proteus vulgaris == Study the Immunomodulatory Effect of Ethanolic Azadirachta indica Seeds Extract on the Immunologic Response in Mice Vaccinated with Proteus vulgaris

اسم المؤلف: سيف مزعل عبد
اسم المشرف: طارق فعل الجنديل | تركي مفتن سعد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: المثنى
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 100 عينة من عينات الادرار من النساء الحوامل الذين اتن الى مستشفى الاطفال والولادة في مدينة السماوة، خلال فترة تمتد من نوفمبر الى يناير 2012. تضمنت الدراسة العزل والتشخيص البكتريلوجي لبكتريا Proteus vulgaris ، واختبار الحساسية للمضادات الحياتية وكذلك تضمنت الدراسة تاثير المحورات المناعية المتمثلة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم على الاستجابة المناعية للفئران الملقحة بمستضد جرثومة P. vulagris. تضمنت الدراسة ثمانية مجموعات ( 40 فار في كل مجموعة) وتمت معاملة المجاميع كما يلي (I : معاملة بالماء المقطر، II : معاملة بمستضد بكتريا p. vulagris فقط ، III : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ، IV : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ة ، V : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا البر وتيس فلكارس معا ، : VI : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا البر وتيس فلكارس ، : VII معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 600 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا . P .vulagris معا، VIII : معاملة بالمحلول الايثانولي لنبات النيم بجرعة مقدارها 400 ملغم لكل كغم ومستضد بكتريا . P .vulagris وتم حقن المجموعتين الاخيرتين بمقدار 5 ملغم لكل كغم من وزن الجسم من مادة بردنزولون (Prednisolone) المثبطة للمناعة قبل 5 ايام من اجراء المعاملة . اجريت جميع هذه المعاملات في اليوم الاول في اليوم الرابع وضحي بالحيوانات في اليوم 8 لاختبار Nitro blue tetrazolium NBT) مقاسا بجهاز الاليزا ، في اليوم 14 لاجراء معامل تفاعلات فرط الحساسية المتاخرة ومعامل تحول الخلايا اللمفاوية المقاسة بطريقة الاليزا )في اليوم 21 و28 لقيايس anti - proteus vulgaris antibody titer ولاجل اختبار serum electrophoresis لقياس بروتينات المصل ). اظهرت النتائج تاثيرات واضحة للمحورات المناعية المستخدمة في الدراسة وفي المجاميع الممنعة بمستضد البر وتيس فلكارس ومن خلال تحسن الاستجابة المناعية غير النوعية والمناعة الخلوية الخلطية مقارنة مع المجاميع غير المعاملة بالمحورات المناعية، واشارت النتائج الى ارتفاع ملحوظ في نسبة الخلايا الموجبة لفحص NBT في المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية وبفوارق احصائية معنوية بالمقارنة بمجاميع السيطرة السالبة (معاملة بالماء المقطر فقط) والسيطرة الموجبة المعاملة بالمحورات المناعية او اللقاح فقط . وقد ظهر ارتفاع في النسبة المئوية لمعامل الخلايا الموجبة لفحص NBT في كل المجاميع وسجلت المجموعةV اعلى نسبة مئوية للخلايا الموجبة لفحص NBT ( 57% ) وبفوارق احصائية معنوية (P≤ 0.01) وسجلت المجموعة IV ادنى نسبة مئوية (5%) مقارنة بمجموعة السيطرة السالبة 0 ) I% )، كما لوحظ ارتفاع واضح في النسبة المئوية لمعامل التحول للخلايا اللمفية في الدم المحيطي ، حيث اعطت جميع الحيوانات الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية نتائج اعلى من تلك الممنعة وغير معاملة بالمحورات المناعية وبفوارق احصائية معنوية وسجلت المجموعة V اعلى مستوى للنسبة المئوية لمعامل تحول الخلايا اللمفاوي في الدم (264%) ، بينما اعطت المجموعة IV ادنى نسبة وهي ( 17% ) .اما نتائج فحص الحساسية المتاخرة في الجلد فقد سجلت حيوانات المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية نتائج اعلى وبفوارق احصائية معنوية ( P≤ 0.01) عن مجاميع السيطرة الموجبة والسالبة واعطت المجموعة V. اعلى قيمة بلغت بعد 24 ساعة من حقن مستضد البر وتيس ، وكانت جميع نتائج فحص الحساسية المتاخرة المسجلة في الحيوانات بعد 24 ساعة افضل منه بعد 48 ساعة. وعند قياس عيارية اضداد anti proteus vulgaris بواسطة الوميض الاشعاعي غير المباشر، اظهرت المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية ارتفاع مستوى هذه الاضداد مقارنة بمجاميع السيطرة السالبة والموجبة وبفوارق احصائية معنوية بمستوى P≤ 0.01) ) وسجلت اعلى معيار حجمي لتلك الاضداد بمستوى 512 بعد 21 يوم التمنيع. كذلك سجلت المجاميع الممنعة والمعاملة بالمحورات المناعية ارتفاع ملحوظ في قيمة كاماكلوبيولين والفا - 1 والفا - 2 وبيتا عند تحليل البروتين بجهاز الترحيل الكهربائي وبفوارق احصائية معنوية ( P≤ 0.01) عن مجاميع السيطرة الموجبة والسالبة المعاملة بالمحورات.حيث سجلت المجموعة V (19.24 ± 0.80, 8.68 ± 0.23, 27.31 ± 0.06, 34.02 ± 0.21 ) على التولي بعد 21يوم من التمنيع وكذلك اعلى قيمة كاماكلوبيولين والفا - 1 والفا - 2 وبيتا سجلت في المجموعة 19.26 ± 0.8 )V , 8.17 ± 0.38 , 27.43 ± 0.12 , 34.10 ± 0.06 ) على التوالي بعد 28 يوم من التمنيع . من خلال النتائج اظهر المحلول الايثانولي لنبات النيم تحسنا واضحا على الاستجابة المناعية غير الخصوصية والمناعة الخصوصية بشقيها الخلطي والخلوي. | A total of 100 urine samples were collected from pregnant women who attended to Children and delivery's hospital in Samawah city, during the period extended from November to January 2012. The study is carried out for bacteriological isolation and identification of P. vulagris, antibacterial susceptibility testing and to investigate the immunomodulatory effect of the Ethanolic neem seeds extract on the immune response of mice vaccinated with Proteus vulgaris antigens. The study included eight groups; the first group (I) was treated with distilled water. group II included mice treated with Proteus vulgaris antigens only (III) : injected mice subcutaneously with a dose of (600 µg /Kg) ethanolic neem seed extract, IV group included injected subcutaneously with a dose of (400 µg /Kg) ethanolic neem seed extract only, The V, VI groups mice were treated with combination of p.vulgaris and ethanolic neem seed extract while (VII and VIII) groups mice were injected with the immunosuppressive drug prednisolone prior to the forthcoming treatment 5 days. All these treatments were carried out at day 1, and then the mice were sacrificed at day 8 to estimate phagocytic activity index by ELISA reader and on day I4 for estimation of lymphocyte transformation by MTT index by ELISA reader and for delayed - type hypersensitivity reaction test at 24 , 48 and 72 hours after proteus vulgaris antigens injection, at day 21 and 28 for (anti - proteus vulgaris antibody titer) by indirect immunoflourescent assay and for serum electrophoresis to estimate the serum fraction.In this regard, all groups of mice showed different significant increases(P≤ 0.01) in the NBT index which represent the phagocytic activity% as compared to group I (0%), which was injected with distilled water (negative control group). The best treatment efficiency was recorded in - group V (57%), while the lowest treatment efficiency was recorded in - group IV (5%). The results of lymphocyte transformation index in mice of all groups showed different significant increases by MTT assay which represent the lymphocyte transformation index as compared to group I (0%). The best treatment efficiency was recorded in - group V (264%), while the lowest treatment efficiency was recorded in - group VI (17%).Delayed type hypersensitivity (DTH) index estimated by skin test in footpad of the mice that immunized with P vulgaris antigens and treated with ethanolic neem seed extract and the high value in the group V after 24 hours. The best delayed type hypersensitivity (DTH) index was recorded in group V. The anti - Proteus antibodies assessed by indirect immunoflourescent test also showed a significant increase titer in immunomodulator - treated and - vaccinated mice in comparison with negative and positive groups. At 21, 28 days, and the best treatment efficiency was recorded in - group V after 21 days with titer of 512. In all mice a significant increase in the value of gamma globulin fraction and Alpha - 1 serum fraction and Alpha - 2 Fraction and Beta serum fraction were observed in group V (19.24 ± 0.80, 8.68 ± 0.23, 27.31 ± 0.06, 34.02 ± 0.21) respectively after 21 days of immunization, and also The highest values of gamma globulin fraction and Alpha - 1 serum fraction and Alpha - 2 Fraction and Beta serum fraction were observed in V (19.26 ± 0.8 , 8.17 ± 0.38, 27.43 ± 0.12, 34.10 ± 0.06 ) respectively after 28 days of vaccination of mice. The results demonstrated a clear immunomodulatory effect of the ethanolic neem seed extract (improvement of non - specific, and cellular immune response) of the treated mice immunized with proteus vulgaris .

الكشف عن السمية الوراثية لمستخلصات نبات الحرمل Peganum harmala L . باستعمال بعض المؤشرات الخلوية والجزيئية == Detection of genetoxic effect of Peganum harmala L. extracts by using some molecular and cytogenetic markers

اسم المؤلف: سيف محمد ابراهيم
اسم المشرف: نضال نعمة حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Evaluation of genetoxicity of the aqueous and alcoholic extracts of Peganum harmala L. seeds was assayed in onion roots Allium cepa as a biological system. Onion roots were subjected to different concentrations of aqueous and alcohol extracts (10,25,50,100,200%) V/ W for different periods( 24,48,72) hrs in order to study the effects of these extracts on onion′s root growth and some cytological properties included, (Mitotic index, phase index, proportion and types of chromosomal aberrations), as well as to assess the effect of these extracts on the DNA of onion roots using Random amplification polymorphic DNA (RAPD) technology.The results revealed that all harmala seeds extracts the aqueous and alcoholic caused a significant reduction of onion root growth, the reduction was positively proportional with the increasing concentrations of the extracts. The half maximal effective Concentration (EC50) against onion′s root growth was 50% in the case of using the aqueous extract while it reached 25% in the case of alcoholic extract. This result indicate the efficiency of the alcoholic extract over the aqueous extract on onion′s root growth.Results also showed that both harmala seeds extracts resulted in significant reduction of the mitotic index (MI) of onion′s roots tips compared with the control treatment .The reduction of the MI was also positively proportional with the increasing concentrations of the extracts .Although MI was not affected by the increase in duration of exposure .Therefore ,since the concentration 100% and 25% of the aqueous and alcoholic extracts respectively lowered the MI to nearly 50% compared to the control, they were considered sub lethal, whereas the concentration 200% of both extracts which caused a reduction of the MI to nearly 22% compared to control treatment was considered as lethal concentrations. The results showed a significant reduction prophase and significant increase of metaphase in onion′s root cells due to the treatments with both extracts. Moreover high percentages of chromosomal aberrations were alsodetected, and these aberrations were also positively associated with the increasing concentration and exposure periods. to The most frequent abnormalities were (Chromosomes stickiness, Chromosomal bridges , Chromosome disturbance and C - mitosis) .Moreover some other infrequent chromosomal abnormalities were also appeared such as ( Lagging chromosome ,Star anaphase, Shifting of poles, Polyploidy).The effect of both harmala seeds extracts was tested on DNA of onion′s roots using a random amplification polymorphic DNA (RAPD). Out of ten random primers used, seven were gave multiple bands for all studied, samples with molecular weights ranged between (90 - 1400) base pair .The results of random amplification showed that all harmala extract concentrations tested caused damage to DNA which mutations revealed as loss of a single or more band, or appearing of new bands. Additionally the total lost and gained band in samples treated with alcoholic extract reached 43 bands compared to the samples treated with the aqueous extract which revealed 35 bands , This result indicate the effectiveness of the alcoholic extract over the aqueous in it′s effect on DNA of onions roots. Furthermore, The results showed that the total number of the gained bands was more than that of the lost ones for both extracts with most primers used . The total numbers of the new bands in the samples treated with the aqueous extract were 27 bands whereas 32 bands , with alcoholic extract. However ,the total number of lost bands in samples treated with aqueous extract were 8 bands compared to 11 bands with alcoholic extract.The percentage of the genomic template stability (GTS% ) was lowered initially from the concentration 10% for both extracts ,this reduction was negatively associated with the increasing concentrations of the extracts, indicating the existence of great damage to the DNA with the increasing concentrations of the extract. The decrease of GTS in samples treated with alcoholic extract was more than that with the aqueous extract. A highest reduction 78.56% was detected at concentration 25 and 200 % in samplestreated with the aqueous extract, whereas a higher reduction 69.03% was recorded lower at concentration 50% in samples treated with alcoholic extract.Genetic dendrogram of samples treated with exposed to harmala seeds extracts in addition to the control using Jaccard coefficient of genetic variation and based on RAPD results showed segregation of onion samples treated with aqueous extract from samples treated with aqueous extract from samples treated with alcoholic extract, as well as segregation of the control treatment in a single group, this result confirms the great damages of onions root DNA when treated with harmala seed extracts..

عزل وتشخيص الفطريات الجلدية من المرضى المصابين بداء السعفة في محافظة ذي قار ودراسة تاثير بعض العوامل في نمو تلك الفطريات == Isolation and identification of dermatophytes from patients with tinea in Thi - Qar Province and studying some factors effecting on their growth

اسم المؤلف: سوزان خالد كاظم العسكري
اسم المشرف: ياس خضير عباس | محمد حسين مشهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية عزل وتشخيص بعض انواع الفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة ((Tinea من المرضى المراجعين للاستشارية الجلدية في مستشفى الامام الحسين التعليمي في محافظة ذي قار , اذ جمعت 180عينة مرضية شملت 128عينة قشور جلدية و24عينة شعر و28 عينة اظافر من مرضى يعانون من داء السعفة (( Tinea للفترة من 13/8/2014 الى 1/1/ 2015 . بلغ عدد العينات المرضية الموجبة للزرع 110 عينة وبنسبة 61.1 % , اذ شكل عدد اصابات الاناث 74 وبنسبة 67.27 % , اما اصابات الذكور فقد بلغت 36 وبنسبة 32.73 % . بينت الدراسة ان الاصابة بسعفة الجسم (Tinea corporis) احتلت المرتبة الاولى من بين الاصابات وبنسبة 57.27 % ثم سعفة الراس ((Tinea capitis 17.27 % , ثم سعفة القدم 12.73 (Tinea pedis)% وشكلت سعفة الاظافر (Tinea unguium) بنسبة 9.09% , ثم سعفة اللحية (Tinea barbae)بنسبة 3.64 % . شخصت الفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة باستخدام عدد من الاختبارات التشخيصية وقد وجد ان الفطر Microsporum canis اكثرها ظهورا وبنسبة 36.36 % يليه الفطــر Trichophyton tonsurans وT. verrucosum وM. gypseum وM. fulvum وبنسبـــة 27.27 % , 17.27 % , 12.73 % و6.36 % على التوالي . بلغت اعلى نسب للاصابة بسعفة الراس والجسم والقدم والاظافر في الاناث , في حين كانت اعلى نسبة للاصابة بسعفة اللحية في الذكور . وكان لعامل العمر تاثير في نسبة الاصابة , اذ احتلت الفئة العمرية (10≥) النسبة الاعلى في سعفة الراس , بينما كانت الفئة العمرية ( 31 - 40) النسبة الاعلى لاصابة سعفة الجسم والقدم واللحية اما سعفة الاظافر فكانت الفئة العمرية ( 21 - 30) النسبة الاعلى . بلغت نسبة الفطريات المفضلة للحيوان Zoophilic)) 53.6 % تلتها الفطريات الجلدية المفضلة للانسان (Anthropophilic) بنسبة 27.2 % , ثم الفطريات الجلدية المفضلة للتربة (Geophilic) وبنسبة 19.2 % . كما تناولت الدراسة تاثير بعض العوامل البيئية مثل نوع الوسط الغذائي ودرجة الحرارة والاس الهيدروجيني ومدة الحضن في نمو ثلاثة انواع من الفطريات الجلدية التابعة لجنس Microsporum وهي Microsporum canis وM. gypseum وM. fulvum . وقد اظهرت نتائج الدراسة ان افضل وسط غذائي لنمو الانواع الفطرية المعزولة هو Agar Sabouraud's Dextrose مقارنة مع وسطي Potato Dextrose Agar وCorn Meal Dextrose Agar , وكانت درجة الحرارة المثلى لنمو الفطريات الجلدية هي 25 م̊ . في حين كان الاس الهيدروجيني (pH = 6) للوسط الزرعي SDA هو الافضل في تنمية الفطريات الجلدية . كما اوضحت الدراسة زيادة معدلات اقطار المستعمرات الفطرية الجلدية النامية على الوسط الزرعي SDA عند pH = 6ودرجة حرارة 25 م̊ بزيادة مدة الحضن . كما تم استخــــدام تقنيــــة تفاعـــــل سلسلــــــة البلمرة ( PCR ) باستخــــدام البادئ ITS1 - 2FW - ITS1 - 2FV لتشخيص بعض انواع الجنس Microsporum . كما شملت الدراسة الكشف عن المواد الفعالة في المستخلص الكحولي لاوراق نبات اكليل الجبل ( Rosemarinus officinalis) اذ وجد ان المستخلص يحتوي على الفينولات والقلويدات والصابونينات والعفصيات والتانينات والراتنجات والكلايكوسيدات ولا يحتوي على الكومارينات. وقد تبين ان لهذا المستخلص قدرة تثبيطية ضد الفطريات الجلدية وبلغ اعلى تثبيط عند التركيز 200 ملغم / مل . وقد تباين التركيز المثبط الادنى (MIC) حسب النوع الفطري , فكان اقل تركيز مثبط ادنى للمستخلص الكحولي لاوراق نبات اكليل الجبل 25 ملغم / مل تجاه معظم الانواع الفطرية الجلدية , كما وجد ان المضاد الفطري Griseofulvin اكثر فعالية من المضاد الفطري Ketoconazole في تثبيط الفطريات الجلدية . | A study of isolation and identification of dermatophytes in Thi - Qar Province was conducted . A total of 180 clinical samples ( 128 skin scraping samples , 24 hair samples and 28 nails samples ) were collected from patients suffering Tinea and were consulting in Dermatology unit in AL - Hussein Teaching Hospital during 13/ 8/ 2014 to 1 / 1 / 2015 . 110 samples were positive for culture with a percentage of 61.1 % . Females infections were 74 cases ( 67.27 %) ,while male infections were 36 cases (32.73 %) . The study showed that Tinea corporis was the most Tinea infections with a percentage of 57.27 % . Tinea capitis , Tinea pedis , Tinea unguium and Tinea barbae had a percentage of 17.27 % , 12.73 % , 9.09 % and 3.64 % respectively . The isolated fungal species causing Tinea were Microsporum canis , Trichophyton tonsurans , T. verrucosum ,M. gypseum and M. fulvum with a percentage occurrence of 36.36 % , 27.27 % , 17.27 % , 12.73 % and 6.36 % respectively . Tinea capitis , Tinea corporis , Tinea pedis and Tinea unguium were high in females , while in males , Tinea barbae was the highest . Infection with Tinea was affected with patients age , so patients under 10 years old had tinea capitis more than others ; Tinea corporis , Tinea pedis , and Tinea barbae had the highest infection percentage in ages between 31 - 40 years . Tinea unguium had the highest infection percentage in patients with ages between 21 - 30 years . Zoophilic dermatophytes had the percentage of 53.6 % , Anthropophilic dermatophytes and Geophilic dermatophytes presented as 27.2 % and 19.2 % respectively . The effects of some environmental factors such as culture media , temperature , pH and incubation period on M. canis , M. gypseum . M. fulvum was studied .The best culture media for these dermatophytes was Sabouraud's Dextrose Agar comparing with Potato Dextrose Agar and Corn Meal Dextrose Agar. The optimum growth temperature was 25 oC , while pH = 6 was the best for culturing dermatophytes on SDA and 25 oC . Polymerase Chain Reaction (PCR ) with primer ITS1 - 2 FW - ITS1 - 2 RV was used to confirm the identification of Microsporum species . The alcoholic extract of Rosemarinus officinalis contained phenols , alkaloids , resins , tannins and glycosides , saponins . The extract had the highest inhibition activity against the isolated fungi at the concentration of 200 mg / ml . The minimal inhibitory concentration ( MIC ) of the alcoholic extract of Rosemarinus officinalis was 25 mg / ml . Griseofulvin was more active than Ketoconazole against dermatophytes

دراسة مناعية لمرضى القرحة المعدية المصابين ببكتريا Helicobacter pylori == Immunological Study of Gastric - Ulcer Patients Infected with Helicobacter pylori

اسم المؤلف: سهى طالب يحيى الجميلي
اسم المشرف: رجوة حسن عيسى الربيعي | محمد عيسى محسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت هذه الدراسة جمع خزع نسيجية (Biopsy) وعينات دم من 92 مريض يعاني من عسر الهضم، التهاب وقرحة المعدة، قرحة الاثني عشري وسرطان المعدة. وكانت اعمار المرضى تتراوح بين 17 - 76 سنة . جمعت العينات في الفترة ما بين كانون الاول 2011 ونيسان 2012 في مستشفى الكاظمية التعليمي في بغداد. وشملت الدراسة 20 شخص سليم كمجموعة سيطرة. اخضعت مجموعة المرضى فقط للتنظير المعدي العفجي لاستاصال الخزع النسيجية لاجراء الاختبارات البكتريولوجية بينما جمعت عينات الدم من مجموعة المرضى وايضا من مجموعة السيطرة لاجراء الاختبارات المناعية. للتحري عن وجود بكتريا Helicobacter pylori استخدمت عدة اختبارات شملت اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية، الزرع البكتيري، اختبار الانتشار المناعي وايضا الاختبارات المصلية التي شملت اختبار التحري عن الاجسام المضادة ((IgM IgG, IgA والمتمم (C4, C3) واختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) (ELISA)، للتحري عن مستوى الانترفيرون كاما Interferon gamma (IFN - γ) الانترلوكين - 8 Interleukin - 8 (IL - 8). تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي لبكتريا H. pyloriباستخدام طريقة Murphy وقدرت كمية البروتين باستخدام جهاز المطياف الضوئي والتي كانت (2.76028 مغم/مل) وايضا تم تقدير الوزن الجزيئي للبروتينات المستخلصة باستخدام جهاز الترحيل الكهربائي.و خلصت هذه الدراسة كالاتي : 1. انتشار بكتريا H. pylori بلغ (44.56%) بين 92 مريض.2. لا يوجد ارتباط معنوي احصائيا بين عامل العمر والاصابة ببكتريا H. Pylori. بينما وجد احصائيا تاثير عامل الجنس على الاصابة ببكنريا H. pylori.3. نتيجة الزرع البكتيري اعطت (7.31%) من (41) مصاب، بينما اعطى اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية واختبار الضد لبكتريا H. pyloriالسريع النسب (44.56% و64.13%) على التوالي من 92 مريض.4. اظهرت نتائج الترحيل وجود عشرة حزم بروتينية ذات اوزان جزيئية تتراوح بين (16.914 - 340.476) كيلو دالتون مقارنة مع حزم البروتينات القياسية.5. استخدم مستخلص بروتينات الغشاء الخارجي للبكتريا كمستضد للتحري عن وجود الاجسام المضادة للبكتريا باستخدام اختبار الانتشار المناعي الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون خطوط ترسيب بين المستخلص ومصل المريض.6. اختبار التحري عن الاجسام المضادة والمتمم اعطى عيارية عالية للمستضدين IgG, IgA والمتمم C3 بينما عيارية كل من الجسم المضاد IgM والمتمم C4 بقيت طبيعية مقارنة بمجموصة السيطرة.7. اختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم(ELISA) اعطى فروقات معنوية عند مستوى P0.05 لكل من الانترفيرون كاما (IFN - γ)و الانترلوكين - 8 (IL - 8) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | This study includes collection of biopsy and blood specimens from patients with age ranged between 17 - 76 years that suffering from dyspepsia, gastritis, duodenal ulcer, and gastric cancer during the period between December 2011 to April 2012 at AL - Kadhymia teaching hospital . This study also involved twenty healthy persons as a control group. Patients group were subjected to gastroduodenal endoscopy, gastric biopsy were taken from them for bacteriological investigations. Blood samples were also collected for immunological tests, while only blood samples were collected from control group. The Detection of Helicobacter pylori was performed using several laboratory investigations such as biopsy urease test, bacterial culture, precipitation test, and serological test which include immunoglobulins and complement quantitation and enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Interferon gamma (IFN - γ) and Interleukin - 8 (IL - 8) detection. Outer membrane proteins were extracted from these bacteria using Murphy method and the concentration of proteins were calculated by using spectrophotometer, then proteins detected and the molecular weight of proteins were evaluated by using electrophoresis.The results of this study revealed the following : 1. Prevalence of H. pylori in (44.56%) from 92 patients.2. No significant relation between age factor and distribution of H. pylori, but there is a significant relation between gender factor and distribution of H. pylori 3. The result of biopsy culture was (7.31%) from (41) infected patients, while biopsy urease test and Rapid anti H. pylori test gave (44.56% and 64.13%) respectively from 92 patients.4. Electrophoresis results revealed ten bands which renged between (16.914 - 340.476) KDa with protein concentration of (2.76028) mg/ml.5. Outer membrane proteins were extracted from H. pylori isolates and used as antigen to detect specific H. pylori antibodies using precipitation test in which the formation of precipitating line considered as a positive result.6. High titer of IgG, IgA and C3 appeared in patients group, while a normal titers of IgM and C4, as a result of immunoglobulins and complement quantitation.7. Enzyme - Linked Immunosorbent Assay technic for detection of IFN - γ and IL - 8 revealed statistically significant high level in compared with control group.

دراسة فعالية بعض المستخلصات لطحلب Cladophora glomerata == Study the activity of some extracts of alga Cladophora glomerata

اسم المؤلف: سهام نعمة لفتة
اسم المشرف: احمد ساهي دويش
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية عزل جنس من الطحالب الكبيرة من بيئة مائية وتشخيصها , اذ تم عزل طحلب Cladophora glomerata من بحر النجف من محافظة النجف الاشرف. تضمنت الدراسة ايضا قياس بعض الصفات الفيزيوكيميائية لمياه بحر النجف والمعزول منه طحلب Cladophora glomerata , اذ شملت القياسات كل من درجة حرارة الهواء والماء , الدالة الحامضية , التوصيلية الكهربائية,المواد الصلبة الذائبة ,الملوحة,وتركيز بعض الايونات السالبة والموجبة للاملاح الموجودة في ماء البحر .بينت النتائج ان درجة حرارة الهواء كانت ( 24)م˚ في حين كانت درجة حرارة الماء (18) م˚ ,فيما كانت قيمة الدالة الحامضية (7.89) وقيمه التوصيلية الكهربائية (20500) ميكروسيمنز / سم وكانت قيمة الملوحة (1.62) 0/00 . في حين كانت نتائج قياس بعض الايونات الموجبة والسالبة للاملاح هي كالاتي : الكالسيوم والمغنسيوم والصوديوم والبوتاسيوم والكلوريدات والكبريتات (3085 و1376 و3815 و6.8 و2988 و3694 ) ملغم/ مل على التوالي .استخلص طحلب Cladophora glomerata باستخدام ثلاث انواع من المذيبات وتمثلت بـ (الكحول الاثيلي وخلات الاثيل والكلوروفورم ) ومن ثم تم اختبار فعالية هذه المستخلصات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus وProteus mirabilis وEscherichia coli .كانت محصلة الاستخلاص ( الحار - البارد ) لطحلب Cladophora glomerata باستخدام المذيبات المختلفة الكحول الاثيلي %(128 - ) وخلات الاثيل %(84 - ) الكلوروفورم %(54,8 - 13,2). استعملت تراكيز مختلفة من مستخلصات الطحلب الكبيرCladophora glomerata (256,128,64,32) ملغم /مل لدراسة تاثيرها على البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق باستعمال اطباق بتري وذلك عن طريق قياس قطر منطقة التثبيط.بالنسبة الى المستخلص الاثيلي لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , وقد بلغت من معدلات اقطار مناطق التثبيط , 9 , 15, 20) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis.، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه والتي كانت (10 ,10 ,11 ,17) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص خلات الاثيل لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص البارد اكفا في تاثيره في البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ كانت معدلات اقطار مناطق التثبيط (10 , 10 , 12 , 15) ملم لكل من بكتريا : S. aureus وPs. aeruginosa وPr.mirabilis. وE.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الحار وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9.8) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 13 , 13 , 17 , 20 ) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. ، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9) ملم وعلى التوالي.كان مستخلص الكلوروفورم الحار لطحلب Cladophora glomerata معنويا اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى لجميع المذيبات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق, لذا استعمل هذا المستخلص انموذجا للتجارب اللاحقة .اظهرت نتائج الكشف عن المركبات الفعالة باستعمال التفاعلات الكيميائية احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلبCladophora glomerata على كل من التانينات والصابونينات والفلافونويدات والقلويدات والكلايكوسيدات والتربينات والفينولات والراتنجات.واظهرت نتائج التحري عن المحتوى الكيميائي من المواد الفعالة باستعمال تقنية الـGC - Mass Spectrophotometer احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata الذي اظهر كفاءة عالية في تثبيط نمو الاحياء المجهرية المعزولة من خمجات الجروح والحروق لاحتوائهما على العديد من المركبات ذات التاثيرات البايولوجية ضد المايكروبية. | The present study includes isolation and identification of Macro - alga from water body. Macro - algae was isolated ,Cladophora glomerata from Baher Al - Najaf region in Holy Najaf city . This experiment includes the measurement of some chemical and physical characteristics of Baher AL - Najef water which Cladophora glomerata was isolated from it . Temperature, electric conductivity (EC),PH, hardness and concentration of ions : Chloride, Sulphates and Carbonates. The Results were showed that the measurements of : air temperature was (24)˚C while water temperature was (18) ˚C, EC (20500) µS/cm; PH (7.8 ) ; and salinity (1.62)0/00.The concentration of positive and negative ions such as Ca, Mg, Na, K, Cl and SO4 were (3085,1376,3815,3815,6.8,2988 and 3694) mg/ml respectively Three types (Ethanol, Ethyl acetate and Chloroform) were used to extract Cladophora glomerata in order to evaluate their antibacterial activity against some bacterial isolates which isolated from wound and burn infection includes ( Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Proteus mirabilis Escherichia coli,) .The percentage yields of extracts of ( hot - cold ) for Cladophora glomerata were Ethanol ( 8 - 12 ) % , Ethyl acetate ( 4 - 8 ) % and Chloroform (13.2 - 54.8) %. Different concentrations of these algal extracts had prepared which were (32, 64, 128 and 256) mg/ml and the antagonistic activity against the isolated bacteria from wound and burn infection were evaluated by measured the diameter of inhibition zone. The effect of hot Ethanol extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 15 , 9 , 11 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with cold Ethanol extract which were ( 17 , 11 , 10 , 10) mm , respectively. The effect of cold Ethyl acetate extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15 , 12 , 10 , 10 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with hot Ethyl acetate extract which were ( 9.8 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. The effect of hot Chloroform extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 17 , 13 , 13 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli respectively , when compared with cold Chloroform extract which were ( 9 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. Because hot Chloroform extract of Cladophora glomerata was more efficiency effective than the other extracts , only the hot Chloroform extract of Cladophora glomerata will used in the next experiments. Results indicated that the active chemical compounds in hot Chloroform extract of Cladophora glomerata were Tannins, Saponins , Flavonoids, Resins , Glycosides , Terpenes, Alkaloid and Phenols. Results indicated that hot Chloroform extract of Cladophora glomerata has a lot of active chemical compounds against micro - organisms by using the GC - Mass Spectrometry technology

انتاج الليفان من البكتريا المعزولة من تربة الجذور وتقييم العوامل المؤثرة على انتاجه == Levan Production by Bacteria Isolated from Rhizosphere Soil and Evaluation of Factors Affecting its Production

اسم المؤلف: سناء بشير كاظم
اسم المشرف: صفاء الدين احمد شنتر القيسي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تعتبر منطقة التربة المحيطة بالجذور مصدرا مهما للعديد من الاحياء المجهرية مثل الفطريات والبكتريا والبكتريا الخيطية. في الدراسة الحالية، تم عزل البكتريا المنتجة لليفان من التربة المحيطة بالجذور. حيث تم الحصول على 15 عينة من التربة المحيطة بجذور البقوليات ( الباقلاء واللوبيا ) خلال الفترة بين تشرين الاول 2014 الى كانون الثاني 2015، من ثلاث مزارع للبقوليات في ناحية كنعان، محافظة ديالى. تم عزل 52 عزله من بكتريا الجذور (الرايزوسفير) واختبرت لمعرفة قابليتها لانتاج الليفان وذلك بالاعتماد على نمو المستعمرات المخاطية عند تنمية هذه البكتريا على وسط الاكار المغذي الحاوي على السكروز. وقد اظهرت النتائج مقدرة 36 عزلة بكتيرية جذرية على انتاج الليفان من المجموع الكلي للعزلات. شخصت العزلات الاربع الاكثر كفاءة لانتاج الليفان ووصفت بواسطة الفحوصات المظهرية والبايوكيميائية القياسية والاختبارات على المستوى الجزيئي. تم اجراء التشخيص الجزيئي لهذه العزلات الاربعة باستخدام 16S rDNA والتي اظهرت ان طول تسلسل المنطقة كان (946، 1056، 1064و1154) زوجا قاعديا للعزلات (2، 3، 23 و33) على التوالي. ان محاذات التسلسل في بنك الجينات اظهر ان العزلات الاكثر كفاءة كان لديها نسبة عالية من التشابه (98، 96، 98 و99) % على التوالي وتبعا لاقرب جار تطوري لهذه العزلات, تم التعرف عليها تبعا لتتابع جين (16S rRNA) وتبعا للفحوصات الشكلية والكيموحيوية , وشخصت على انها (Brachybacterium phenoliresistens، Elizabethkingia anophelis، Arthrobacter globiformis، Pseudomonas brassicacearum) على التوالي. تم تشخيص الليفان المنتج من هذه العزلات الاربعة باستخدام تقنية TLC والتي اظهرت تكون الليفان من نوع واحد من السكريات الا وهو الفركتوز. وقد تم تشخيص الليفان المنتج بواسطة بكتريا B. phenoliresistens باستخدام تقنيتي FTIR وتقنية الرنين المغناطيسي النووي NMR. تحليل الليفان بواسطة هاتين التقنيتين اثبتت انتاج الليفان بواسطة هذه العزلة. تم دراسة تاثير العوامل الغذائية والفيزيائية على انتاج الليفان بواسطة العزلات الاكفا. كان مصدر الكاربون الامثل لانتاج الليفان بواسطة هذه العزلات هو السكروز، حيث كان انتاج هذه العزلات هو 7.88، 7.94، 7.8 و7.77 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis، A. globiformis ، P. brassicacearum على التوالي. تم استخدام اربع مصادر مختلفة للنايتروجين لمعرفة افضل مصدر نيتروجيني لانتاج الليفان. حيث كان الكازائين هو افضل مصادر النيتروجين لانتاج الليفان حيث كان انتاج هذه العزلات 8.12، 8.2، 8.24 و8.56 غم/لتر للعينات الاربعة على التوالي. تم استخدام تراكيز مختلفة للسكروز لانتاج الليفان حيث كان اعلى انتاج لجميع العزلات عند التركيز 300غم/لتر وكان الانتاج بواسطة هذه العزلات 7.97، 7.94، 8.06 و7.95 غم/لتر على التوالي. تم استخدام قيم pH مختلفة لمعرفة افضل اس هيدروجيني لانتاج الليفان حيث كان افضل اس هيدروجيني هو 7.8 لكل العزلات، وكان الانتاج 7.88، 7.94، 7.8، 7.77 غم/لتر على التوالي. فضلا عن ذلك، تم اختبار عدة ظروف مثل فترة الحضن المثلى، درجة الحرارة، معدل الرج. كانت فترة الحضن المثلى للعزلة E. anophelis 48 ساعة حيث انتجت 8.46غم/لتر، في حين كانت 72 ساعة لباقي العزلات حيث انتجت 8.58، 8.53 و8.7 غم/لتر للعزلات B. phenoliresistens ، A. globiformis وP. brassicacearumعلى التوالي. درجة الحرارة المثلى لانتاج الليفان بواسطة العزلة B. phenoliresistens كانت عند 30 درجة مئوية حيث انتجت 7.87 غم/لتر، وكانت درجة الحرارة المثلى هي 33 درجة مئوية للعزلتين E. anophelis وA. globiformisحيث انتجت عندها 8.04 و8.6 غم/لتر على التوالي. في حين كانت درجة الحرارة المثلى للعزلة P. brassicacearum 40 درجة مئوية وكان انتاجها 8.24 غم/لتر. استخدمت ثلاث معدلات رج لمعرفة افضل معدل رج لانتاج الليفان. تم الحصول على اعلى انتاج لليفان عند معدل رج 150 هزه/دقيقه، حيث كان الانتاج للعزلات B. phenoliresistens، E. anophelis وA. globiformis هو 8.12، 8.54 و8.27 غم/لتر على التوالي. | The Rhizosphere zone is a narrow volume of soil which surrounds the plants roots and influenced by the activity and growth of the root. In the present study, Levan producing bacteria were isolated from rhizosphere soil, fifteen rhizosphere soil samples were obtained from the legumes roots cowpea and broad bean (Vinga unguiculata L. and Vicia faba) during the period from October 2014 to January 2015, which were collected from three legumes farms in Kana’an Village, Diyala Governorate. A total of 52 Rhizobacterial colonies were isolated, purified and screened for their ability to produce levan, depending on growing of mucoid colonies on sucrose nutrient agar. The results showed that thirty six isolates out of the total number of the isolates were identified as levan producers. The most efficient four isolates were identified and characterized according to standard biochemical and Molecular tests. The Molecular identification of these four isolates was carried out by using 16S rDNA, which resulted in sequenced region of 946, 1056, 1064 and 1154 base pair in length respectively. The sequence alignment in the gene bank indicated that the most efficient isolates (2, 3, 23 and 33) have high percentage of similarity (98, 96, 98 and 99 % respectively), in comparison with the retrieved consensus sequences. The closest phylogenetic neighbor for these isolates is predicted according to the 16S rRNA gene sequence, morphological and biochemical tests. These isolates were identified as (Brachybacterium phenoliresistens, Elizabethkingia anophelis, Arthrobacter globiformis and Pseudomonas brassicacearum) respectively. Levan production by these four isolates were characterized by using Thin Layer chromatography (TLC) technique, which revealed that levan is composed of only one sugar which is fructose. Levan produced by B. phenoliresistens was characterized by Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy techniques. The instrumental analysis indicated that Levan was produced by the selected isolate. The effect of some nutritional and physical factors were investigated on levan production by the highest four isolates. Sucrose was the best carbon source for levan production in all isolates that gave (7.88, 7.94, 7.8 and 7.77) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively. In addition, four nitrogen sources were used to identify the best nitrogen source for levan production. Casein was the best nitrogen source for all isolates that gave (8.12, 8.20, 8.24 and 8.56) g/l by B. phenoliresistens, E. anophelis, A. globiformis and P. brassicacearum respectively,. Moreover, different sucrose concentrations were used to assess the best concentration for levan production. The highest levan yield by all isolates was at the sucrose concentration of 300 g/l, which gave (7.97, 7.94, 8.06 and 7.95) g/l respectively. Different pH values were also used to determine the best pH value for the levan production. The four isolates gave their highest levan production (7.88, 7.94, 7.80 and 7.77) g/l at pH 7.8. Further, conditions were examined like optimal incubation period, temperature and agitation rate. The optimal incubation period was 48 hs for E. anophelis that gave 8.46 g/l and 72 hs for B. phenoliresistens, A. globiformis and P. brassicacearum which gave (8.58, 8.53 and 8.7) g/l respectively. Whereas, the optimal temperature was 30ºC for B. phenoliresistens that produced 7.87 g/l , 33 ºC for E. anophelis and A. globiformis which gave (8.04 and 8.6) g/l, and 40 ºC for P. brassicacearum that gave 8.24 g/l. Three agitation rates were used to identify the best agitation rate for levan production. The highest levan production yield was obtained at 150 rpm by the isolates B. phenoliresistens, E. anophelis and A. globiformis which gave (8.12, 8.54 and 8.27) g/l respectively.

مقارنة تشخيصية جزيئية وبكتريولوجسة لبكتريا الزائفة الزنجارية المعزولة من مرضى السكري النوع الثاني وامراض اخرى == Comparison the Molecular and Conventional Identification of Pseudomonas aeruginosa isolated from Diabetes Type II and other Diseases

اسم المؤلف: سناء محمد حبيب الشمري
اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Fifty clinical samples suspected as Pseudomonas aeruginosa were collected from patients with different diseases, diabetic foot ulcers, U.T.I., wounds, burns, keratitis, external otitis from September 2015, till February 2016, from hospitalized patients in four different Baghdad hospitals (Al - Kindi General Teaching Hospital, Al - Yarmuk General Teaching Hospital, Alkadhmiya General Teaching Hospital, and AL - Shiakh Zaied Hospital).The study population targeted both gender from different ages groups.The collected samples were cultured on different selective and differential media and tested biochemically in order to identify P.aeruginosa, then the identification was ensured by using two molecular methods which are conventional PCR in the detection of ecfx gene and 16SrDNA gene and real time PCR with commercial kit from sacace (qualitative detection of P.aeruginosa) and with gyrB gene using specific primers to each gene.Sensitivity for each test was measured then compared with other tests to determine the test efficiency. The results showed that the sensitivity for API20NE test was (80%), the sensitivity for molecular tests as flows : ecfx test was (92%), 16SrDNA test was (96%), the commercial kit test was (98%) and for gyrB test was (92%).The present study shows that using more than one target gene is reducing the probability of misidentification of P.aeruginosa that may be caused by variation in primer or probe targets.According to the type of infection the comparison was done. The results of P.aeruginosa detection for diabetic foot isolates were compared with other isolates. The results showed that there is a remarkabledifference in the API20NE test; as well as, with the oxidase test (according to the time that oxidase test need it to give the dark purple color as a positive result), for the mucoid strains of this bacterium. The results of detection isolates by using gyrB gene were differed too.Then a comparison in simplicity, cost, accuracy and time of P.aeruginosa identification between molecular methods and API20NE test (biochemical test) and between molecular tests themselves were performed. The results of these comparisons show that the molecular methods are better than API test in all aspects of the comparison. Real time PCR is better than conventional PCR in simplicity, accuracy and time but not in cost.All isolates were tested for antibiotic sensitivity using nine antibiotics. The results showed that most isolates were sensitive to Levofloxacin (94%), Ticarcillin - clavulanic acid (Timinim) (88%), Gentamicin (82%) and (80%) to both Pipracillin and Imipenem, while the isolates appeared resistant to another antimicrobials represented by (72%) to Augmentin, (34%) to Ceftazidime, (38%) to Colistin, and (28%) to Ciprofloxacin. In the present study, Levofloxacin represents the most effective antibiotic against P. aeruginosa isolates with the all types of infection.The present study improves the importance of the rapid and accurate detection of the bacterial types and thus giving the right antibiotics to patients to obtain rapid recovery and prevent any complications that may lead to death.

تقييم بعض العوامل المسببة للاجهاض التلقائي للنساء في محافظة بغداد : دراسة مصلية ونسيجية == Evaluation of Some Spontaneous Abortion - Causative Factors for women in Baghdad Province A Serological And Histological Study

اسم المؤلف: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
اسم المشرف: بدر محمد عباس العزاوي | سالم رشيد العبيدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد الاجهاض التلقائي احدى المشاكل السريرية المهمة التي تؤثر على النساء الحوامل خلال (20 - 22) اسبوع الاولى من الحمل مسببة خطر على الام وجنينها.وبهدف القاء الضوء على بعض مسببات الاجهاض وموت الاجنة داخل الرحم. تم اختيار (70) امراة من النساء المجهضة ، قسمت النساء الى مجموعتين ، الاولى هي المجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل (52) والثانية مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الثانية من الحمل (18) . اجريت المقارنة مع(20) من النساء ذوات حمل طبيعي انتهى حملهن بولادة طبيعية.جمعت نماذج الدم والمشايم خلال الفترة من تشرين الثاني 2008 ولغاية نيسان 2009 في مستشفيات بغداد. اجريت الفحوصات المختبرية لتحديد مستويات هرمون البروجسترون والاستراديول واضداد داء المقوسات IgM, IgG الانترلوكين - 6 وسكر الدم والبروتين الكلي والتغيرات النسجية في مشايم النساء المجهضة باستخدام صبغة الايوسين - هيماتوكسلين وصبغة الكمزا. بنيت الدراسة الحالية النتائج الاتية : - 1 - لوحظ وجود انخفاض معنوي (P< 0.01 ) في مستوى هرمون البرجسترون والاستراديول لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل المختلفة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 2 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات IgG في (%41.43) من المجموع الكلي للنساء المجهضة, بينما لوحظ وجود اضداد داء المقوسات IgM في (%5.6 ) من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل.3 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستوى 1L - 6 بين النساء المجهضات ومجموعة السيطرة. 4 - لوحظ ارتفاع معنوي (P< 0.01 ) و(P< 0.05 ) في مستوى البروتين الكلي في مصل النساء المجهضة خلال مرحلة الحمل الاولى والثانية على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 5 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستويات الكلوكوز بين مجموعة النساء المجهضة ومجموعة السيطرة . 6 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقات ترابطية في المرحلة الاولى من الاجهاض التي كانت علاقة موجبة بين ( IgM,IgG) داء المقوسات (P< 0.01 ) وعلاقة معنوية موجبة بين البروحسترون والاستراديول مع مستوى السكر بالـدم (P< 0.05 ) وعلاقة معنوية موجبة بين IgG داء المقوسات والعمر.7 - وجود علاقات ترابطية قوية بين هرمون البروجسترون و1L - 6 (P< 0.05 ) و(P< 0.01 ) المرحلة الاولى والثانيةعلى التوالي من الحمل وهرمون البروجستون والاستراديول (P< 0.05 ) في المرحلة الثانية من الاجهاض . 8 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية ظهور الحالات المرضية في المشايم المجهضة والتي شملت الاستسقاء المائي Hydropic Degeneration التليف Fibrosis وتجمع الهايلين Hyalinization وحالة الذوى Ischemia والتفاعل المناعي Immunological reaction وعدم وجود الطفيلي نسيج المشيمة باستخدام صيغة كمزا . | The spontaneous abortion is considered as one of the important clinical problems that is may effects pregnant women during the 1st 20 - 22 weeks of pregnancy causing dangers to the mother and her fetus.The present study was designed to focus on some spontaneous abortion causes and fetal death and fetal death in the uterus. (70) Women were selected to represented the samples of spontaneous aborted women.The women were classified into two groups , the first represented aborted women during the first trimester of pregnancy (52) , the second trimester of pregnancy (18) , in comparison with result of (20) normally delivered pregnancies. The samples (sera and placenta) were collected during the period from November 2008 to April 2009 in Baghdad.Laboratory tests were performed to determine serum levels of difficult parameters which include progesterone ,estradiol , Toxoplasma IgG,IgM , IL - 6 , blood sugar, total protein .Histopathological changes of aborted placenta was performed using haematoxylin - eosin , giemsa stain to differentiate nuclear and cytoplasmic morphology of parasite.Results 1 - Significant decrease (p<0.01) in the level of progesterone and estradiol hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy compared with control.2 - Anti - Toxoplasma IgG, IgM were positive in (41.43%), (5.6%) of total aborted women, respectively.3 - There was no significant difference (p>0.05) in level of IL - 6 between aborted women and control. 4 - There was a significant increase in the level of total protein in the serum of women with abortion in first and second trimester of pregnancy compared to control (p< 0.01, p< 0.05).5 - There was no significant difference in the levels of blood sugar between women with abortion and control.6 - The results of present study revealed correlations between the parameter in first trimester that was positive correlation between IgG with IgM toxoplasmosis (p<0.01), significant positive correlation between blood sugar with progesterone,estradiol hormone,(p<0.05) and significant positive correlation between age with IgG toxoplasmosis (p<0.05). 7 - There was a correlation (positive) between progesterone with IL - 6 in first and second trimester (p<0.05, p<0.01), respectively. And progesterone with estradiol (p<0.05) in second trimester. 8 - The histological study shows hydropic degeneration fibroids with hyalinization of fibrinosis changes, immunologic reaction, ischemia and negative histological parasite with Giemsa.

تحفيز انتاج الاحماض الدهنية من الطحالب المعزولة محليا والمستخدمة للوقود الحيوي == Stimulation of the Production of Important Fatty Acid from Locally Isolated Algae Used for Biodiesel

اسم المؤلف: سمارة سعد فرج حمادي
اسم المشرف: فكرت مجيد حسن | ناظم حسن حيدر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل عشرة عزلات(Chrococcus disperses, Chrococcus minor, Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) من الاحواض ومن نهر دجلة في العراق . اختبرت العزلات من حيث نموها وانتاجها للدهون. اظهرت العزلات ) C.dispersus, A,augstumalis and C.vulgaris) اعلى نمو وانتاج للدهون ، لذا تم اختيارها لغرض انتاج الدهون الحيوية . حفزت العزلات المختارة بدراسة تاثير الرقم الهيدروجيني والملوحة في النمو وانتاج الدهون. بينت النتائج بان اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.dispersus بلغ 2.68 غم / لتر عند الرقم الهيدروجيني 9 ، بالمقارنة الى تركيز واطئ للدهون ( 1.78 غم/لتر) عند الرقم الهيدروجيني 5 . في حين تم الحصول الى اعلى سرعة نمو (k) واقل فترة تضاعف (G) للعزلة عند الرقم الهيدروجيني 5 . اعلى انتاج للدهون من قبل العزلة C.vulgaris بلغ (3.45 غم/لتر) حصل عند الرقم الهيدروجيني الواطئ (pH6) ، بينما اعلى انتاج للدهون كان عند الرقم الهيدروجيني 8 . في حين اعلى نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. بالمقارنة ، حفز انتاج الدهون من قبل A.augstumalis وبلغ (2.75 غم/ لتر) عند الرقم الهيدروجيني العالي 11. اما اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة كانا عند الرقم الهيدروجيني 5. اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون من قبل العزلة C.dispersus، حفزت بخفض تركيز الملوحة وبلغ (2.94 غم/ لتر) عند التركيز 0.4 غم/ لتر من NaCl . بالمقارنة الى اعلى نمو واقل فترة تضاعف للطحلب حصلت عند التركيز العالي للملوحة (1.5 غم/ لتر). واظهرت النتائج ايضا بان العزلة C.vulgaris قادرة الى تحمل تراكيز عالية من الملوحة اكثر من(1.5 غم/لتر)، واعلى انتاج للدهون بلغ 1.72 غم/ لتر تم الحصول عليه عند تركيز الملوحة (1 غم/لتر ). في حين اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف للعزلة حصلا عند التركيز 0.8 و0.4 غم/ لتر من الملوحة على التوالي . اظهرت النتائج ايضا بان انتاج الدهون حفز من قبل A.augstumalisعند الرقم الهيدروجيني المتدني وبلغ 2.5 غم/ لتر عند التركيز 0.4 غم/ لتر من الملوحة ، بالمقارنة مع اعلى سرعة نمو واقل فترة تضاعف حصلت عند التركيز الواطئ من الملوحة (0.021غم/ لتر). درس التاثير المشترك للرقم الهيدروجيني والملوحة في انتاج الدهون والسكر والبروتين في داخل الاحواض الزجاجية ذات سعة 5 لتر. اعلى انتاج للدهون والسكر والبروتين من قبل العزلة C.dispersusتم الحصول عليها عند الرقم الهيدروجيني ( pH9، الملوحة 0.4 غم/ لتر) وبلغ 8.4 و0.525 و0.018 غم / لتر على التوالي. في حين اقل انتاج للدهون والسكر والبروتين تم الحصول عليها عند ( pH7، والملوحة 0.075 غم /لتر ). اما في حالة C.vulgaris ، اعلى انتاج للدهون والبروتين تم الحصول عليه عند (pH6، والملوحة 0.075غم/ لتر) . في حين انتاج الدهون من قبل A.augstumalisفضل الظروف القاعدية ، واعلى انتاج للدهون حصل عند (pH11، والملوحة 0.075غم/ لتر).وبلغ 4.42غم/ لتر. اظهرت النتائج ايضا ، بان اعلى محتوى للدهون(%) للعزلة C.vulgarisبلغ 33.2% ( 0.33 غم دهن /غم من الوزن الجاف للطحلب) عند (pH7، والملوحة75 0.0 غم/لتر) ، بالمقارنة مع اقل محتوى للدهون تم الحصول عليه من قبل العزلتين C.dispersus, A.augstumalis وبلغ 16 و13.8% عندما حفزت العزلتان عند (pH11، والملوحة 0.075 غم/ لتر) و(pH9، والملوحة 0.4 غم/ لتر بالتتالي). اظهرت نتائج نتائج تحليل الدهون بجهاز GC، بان مكونات الدهون للعزلة C.dispersus عند (pH7، والملوحة 0.075غم/ لتر) تحتوي حامض الستياريك (1.09غم/ لتر)، في حين لم تظهر الدهون عندما حفز الطحلب عند (pH9 ، الملوحة 0.4غم/لتر). اما في حالة C.vulgaris تم الحصول فقط الى حامض الستياريك (9.78غم/ لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075غم/ لتر)، بينما تم الحصول الى حامض الاوليك (1.15غم/ لتر) وحامض الستيارك (1.26غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.126غم/لتر) عند المعاملة (pH6 والملوحة 0.075غم/ لتر). بالمقارنة مع مكونات الدهون المنتجة من قبل A.augstumalisاحتوت حامض الاوليك (1.12غم / لتر) وحامض الستياريك (0.17 غم/ لتر) وحامض البالميتك (0.082غم/لتر) عند المعاملة (pH7 والملوحة 0.075 غم/ لتر). بينما احتوت الدهون فقط حامض الستياريك (3.96 غم/ لتر ) عندما حفز الطحلب عند المعاملة (pH11 والملوحة 0.075غم/ لتر). | Ten microalgae isolates (Chrococcus dispersus, Chrococcus minor ,Oscillatoria amoena, Anabaena augstumalis, Anabaena variabilis, Nostoc linckia, Chlorella vulgaris, Nitzchia palea, Microcyst aeruginosa, Westiellopsis prolifica) were isolated from ponds and Tigris river in Iraq. The isolates were screened for growth and lipid production, the isolates C.dispersus, A.augstumalis and C.vulgaris exhibited higher growth rate and lipid production. Therefore, these isolates were selected for the purpose of algae biodiesel production. The selected isolates were stimulated by studying the effect of different levels of pH and salinity on growth and lipid production. The results showed higher lipid production by C.dispersus which reached (2.68g/l) at pH value of 9, in comparison to lower lipid concentration of (1.78g/l) at pH5. While higher growth rate (K) and shorter doubling time (G) were observed at pH5. The lipid production by C.vulgaris reached maximum of (3.45g/l) at lower pH 6, while, minimum lipid production was observed at pH8. Also, higher growth rate and shorter doubling time were recorded at pH5. In comparison, lipid production was stimulated by A.augstumalis and reached (2.75g/l) which was obtained at pH value of 11. However, higher growth rate and shorter doubling time were observed at pH5. Results also had showed that lipid production by C.dispersus was stimulated by decreasing salinity concentration and reached maximum of (2.94g/l) at 0.4 g/l of NaCl. In comparison higher growth rate and shorter doubling time of algae were observed at higher salinity concentration of 1.5g/l. The results also showed that the isolate C.vulgaris was able to tolerate salt concentration up to 1.5 g/l, maximum lipid production was obtained (1.72 g/l) at salt concentration of 1g/l. While, higher growth rate and shorter doubling time were observed at (0.8 and 0.4 g/l) of salinity, respectively. The results also exhibited that lipid production was stimulated by A.augstumalis at lower salinity level and reached maximum of (2.5 g/l) at 0.4 g/l of salinity, in comparison to higher growth rate and shorter doubling time recorded at lower salinity concentration of 0.2g/l. The combined effect of pH and salinity together on lipid, carbohydrate and protein production were studied, the experiments were carried out in 7.5 liter glass pools. Maximum lipid, carbohydrate and protein concentration of C.dispersus were observed at (pH9 and salt 0.4g/l) and reached (8.43, 0.525 and 0.018g/l), respectively. While, minimum concentration of lipid, carbohydrate and protein production was observed at (pH7 and salt 0.075g/l).In case of C.vulgaris, higher total lipid production and protein was obtained at (pH6and salt0.075g/l).While, lipid production in microalgae A.augstumalis was favored by alkaline condition and maximum lipid production was observed at (pH11 and salt 0.075g/l) and reached 4.42 g/l. The results also reevaluated that the higher oil content was observed in A.augstumalis reached 16% (0.16 g of oil/ g of dry algal biomass) at (pH11 salt 0.075g/l), in comparison to lower oil content (%) observed with C.dispersus and C.vulgaris which reached (13.8 and 11.21%) when stimulated with (pH9 salt 0.4g/l) and (pH6 salt 0.075g/l), respectively. Analysis of lipid content by GC instrument, had shown that the lipid content of algae C.dispersus at (pH7 salt 0.075g/l), contained only stearic acid (1.09g/l) while, no lipid was detected when algae were stimulated at (pH9 salt 0.4g/l). In case of C.vulgaris only stearic acid (9.78g/l) was found at treatment (pH7 salt 0.075g/l) while, oleic acid (1.15 g/l), stearic acid (1.26 g/l) and palmitic acid (0.126 g/l) were observed. At treatment (pH6, salt 0.075g/l).In comparison, lipid content produced by A.augstumalis included, oleic acid (1.12 g/l), stearic acid (0.17 g/l) and palmitic acid (0.08 g/l) found in treatment (pH7 salt 0.075 g/l). While, lipid content was only Stearic acid (3.96g/l) when the algae were stimulated at (pH11 salt 0.075 g/l.

اكثار نبات الخلة البلدي Ammi visnaga نسيجيا وتقدير بعض مركبات الايض الثانوي فيه == Micro propagation and Estimation of some Secondary metabolite in Ammi visnaga plant A thesis

اسم المؤلف: سعدة عبد الفتاح سعيد
اسم المشرف: سعدية حسن محمود | عبد الجاسم محيسن جاسم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجري هذا البحث في مختبرات مركز بحوث التقنيات الاحيائية / جامعة النهرين بهدف زيادة انتاج الخلين في المزارع النسيجية لنبات الخلة البلدي Ammi visnaga وتقديره بالتحليل الكمي والنوعي بجهاز HPLC ثم مقارنته مع مستخلص الاوراق والبذور الجافة من النبات الكامل In vivo. تم انبات البذور في ظروف معقمة على وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 1, 0.5 ملغم / لتر على التوالي والحصول على بادرات دون الكالس .اظهرت النتائج بان وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 3.5و1 ملغم / لتر على التوالي كان فعالا في استحداث الكالس فتفوقت السويقة الجنينة السفلى باعطاء معدل نسبة مئوية 100% بالضوء على كالس الاوراق الذي كانت نسبته 83.3 % وكذلك تفوق نفس الوسط بالوزن الطري والجاف للسويقة الجنينية السفلى مقارنة مع كالس الاوراق للضوء والظلام . فقد بلغ الوزن الطري لكالس السويقة الجنينية السفلى من الضوء 1005.6 ملغم وفي الظلام 916.5 ملغم . بينما بلغ الوزن الجاف في الضوء لكل من كالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية 48.5و39.9 ملغم على التوالي وفي الظلام 45.5 و41.1ملغم .تباينت طبيعة ولون الكالس تبعا للجزء النباتي وظروف الحضن تميز كالس السويقة الجنينية السفلى بطبيعة هشة ولون اخضر في الضوء وازداد هشاشة ولون ابيض مائل للاخضرار في الظلام . بينما اختلف الكالس المستحدث من الاوراق الفتية واتصف بتماسكه ولونه الاخضر في الضوء مقارنة بالكالس المستحدث في الظلام اذ كان اقل تماسكا وذو لون ابيض .تم الحصول على كالس ذو وزن عالي وبكميات كبيرة عند اعادة زراعته Subculture على نفس وسط الاستحداث ثلاث مرات .اعطت مستخلصات الاجزاء النباتية البذور الجافة والاوراق للنبات المزروعة في الحقل In vivo منحنيات عالية لمركب الخلين مع انعدامه بمنحنيات مزارع الكالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية بخلاف مركب الكومارين اذ تميزت مستخلصات مزارع كالس بانتاجه، وارتفع منحناه بمستخلص كالس الاوراق الفتية في الضوء.لقد تم بنجاح الحصول على نبيتات كاملة لكالس نبات الخلة البلدي عند زراعته على وسط MS حيث مزود ﺒ NAA 0.5 ملغم / لتر وBA 1 ملغم / لتر تم نقلها على نفس الوسط بدون NAA . | this study was conducted in The laboratories of Biological technology center / university of Al - Nahrain, during 2007 - 2008.The aim of this study was to increase the production of Khellin from Ammi visnaga In vitro and its determination by the quantitative and qualitative Analysis by HPLC and comparing it with the extracts of plant part In vivo. Seeds have been germinated under sterilized conditions on MS medium supplied with NAA at0.5 mg/L and BA at1mg/L and It has achieved to plantlets without any production of callus .Results showed that MS medium supplied with NAA 3.5 mg/L and BA 1.0 mg/L was that most effective on callus induction. Thus, the calli of hypocotyls incubated in light were significantly superior(100% induction) in comparison with young leaves calli which gave 83.3%.Results also showed that the same medium produced more fresh and dry weights of hypocotyls callus has and young leaves ones exposed or not to light .Accordingly the fresh weight of the hypocotyls calli and young leaves achieved 1005.66, 916.5 mg in light. respectively and 800.8,702.5 in dark successively. As for the dry weight hypocotyls calli reached 48.5 mg in light and 45.5mg in dark while young leaves calli gave 41.11mg in dark and 39.9mg in light .The difference in nature and color of the calli depends on the type of explant and incubation conditions. Calli of hypocotyls was fragile nature with green color in light, the fragility increased in darkness and the color was white and greenish. Calli of young leaves were compact and green color in light while less coherent and white at dark .In order to obtain larg quantities of calli, subculture on the above mentioned medium is recommended for at least three times.The highest level of khellin was obtained in vivo by using extracts of different parts (dry seeds and leaves) in comparison with callus that production in in vitro (calli).Regeneration was successfully achieved from calli cultured firstly on MS medium supplemented with NAA0.5mg/L and BA1.0mg/L then transfersed to the same medium with out NAA.

نزعات مقاومة مكروليد في العقدية المقيحة والرئوية المعزولة من الاطفال العراقيين المصابين بامراض الحلق المعدية == Macrolide Resistance Trends in Streptococcus pyogenes and Streptococcus pneumoniae Isolated from Iraqi children with throat infections

اسم المؤلف: سعاد عبد الجبار عبد الزهرة الساعدي
اسم المشرف: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة على مرضى مراجعي العيادة الاستشارية في مستشفى ابن البلدي في مدينة بغداد (العراق) للفترة من تشرين الثاني 2007 الى شباط 2008 . تم تعين المرضى بشكل عشوائي اذ تم اختيار 108 حالة (60 انثى و48 ذكر) تراوحت اعمارهم بين 18 شهر الى 12 سنة والذين يعانون من التهاب الحنجرة والبلعوم .تم جمع مسحات البلعوم من كل مريض بهدف عزل وتشخيص البكتريا . اعتمد كل من فحص D - test وOptochin كفحص اساسي لتميز بكتريا Streptococcus pyogenes المقاومة للمضادات الميكروليدية . اظهرت النتائج ان 94 حالة ظهرت عليهم العلامات السريرية واعراض التهاب اللوزتين والبلعوم ، 7 حالات ظهرت عليهم اعراض الحمى القرمزية (Scarlet fever)، و14 مريض اعتبروا حاملين للمرض .تم تشخيص بكتريا S. pyogenes في 65 عزلة من اصل 73 وكانت 16 منها مقاومة لمضادات الحياة الميكروليدية ، وتم تشخيص 8 عزلات من Streptococcus pneumoniae .توزعت المجاميع المقاومة للمضادات الحياة الميكروليدية الى : مجموعة بكتريا مقاومة من نوع iMLSB بواقع 3 عزلات ، ومن نوع cMLSB بواقع 8 عزلات ومن نوع M - phenotype بواقع 5 عزلات ، واظهرت عزلتين من نوع معكوس D - Shape (Inverted D - Shape) .كانت التراكيز المثبطة الدنيا باستخدام تقنية التخفبف الدقيق Micro - dilution لـ17 مضاد حيوي متفاوتة بالنسبة الى العزلات (حساسة او مقاومة للمضادات الميكروليدية واشكالها المظهرية) . اظهرت بكتريا S. pyogenes الحساسة للـerythromycin والـclindamycin تركيز مثبطا ادنى عند 0.25 مايكروغرام/مليليتر لكل من الـCo - amoxicillin + clavulanic acid وceftriaxone .بكتريا S. pyogenes التي قاومت كل من erythromycin وclindamycin كانت حساسة عند التركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر للـampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وceftriaxone وciprofloxacin وgatifloxacin .كانت عزلات S. pyogenes من نوع M - phenotype حساسة للتركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر من azithromycin وlincomycin وampicillin وCo - ampicillin cloxacillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وcephalothin وcefotaxime . ادنى تركيز مثبط لعزلات S. pyogenes من نوع D - Shape موجب كان 0.25 مايكروغرام/مليليتر لمضادات ampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin . كانت عزلات S. pneumoniae حساسة لكل مضادات الحيوية التي تم دراستها وبتراكيز مثبطة ادنى تراوحت بين (1 - 0.25) مايكروغرام/مليليتر .تم تحديد 3 عزلات من S. pyogenes متحملة للبنسلين . يستنتج من ذلك ان عزلات الـS. pyogenes المقاومة لمضادات الميكروليدية كانت تحتل نسبة عالية ، واكثر الاشكال المظهرية شيوعا كان من نوع cMLSB .كل من العزلات المقاومة للـfluoroquinolone والمتحملة للبنسلين penicillin tolerant كانت متواجدة في العزلات المقاومة والحساسة لمضادات الميكروليدية .حساسية عزلات S. pyogenes لمضادات الحيوية كانت متفاوتة بالنسبة الى حساسيتها او مقاومتها لمضادات الحيوية الميكروليدية وكذلك بالنسبة الى التنويع المظهري للعزلات المقاومة . | This study was conducted on patients attending the consultant clinic at Ibn - Al - Balady Hospital in Baghdad, Iraq from November 2007 to February 2008. The patients were allocated randomly, after they examined thoroughly by pediatrician, to be admit in this study. A total number of 108 (60 girls and 48 boys), their ages ranged from 18 months to 12 years, with provisional diagnosis of tonsillo - pharyngitis were enrolled in this study. Throat swab was obtained from each patient for isolation and identification of microorganisms. Double - disk test (D - test) and optochin test, fundamental for discrimination macrolide resistant Streptococcus pyogenes were done. The results showed that 94 patients had clinical signs and symptoms of tonsillo - pharyngitis, 7 patients were diagnosed as scarlet fever and 14 patients were considered as carriers. S. pyogenes was identified in 65 out of 73 isolates; sixteen of them were macrolide - resistant strain, and (8 isolates) of Streptococcus pneumoniae were identified. The phenotypes of macrolide resistant S. pyogenes were distributed as iMLSB (3 isolates), cMLSB (8 isolates) and M phenotype (5 isolates). Two isolates showed inverted D - Shape patterns. The minimum inhibitory concentration (MIC), using microdilution technique, of seventeen antimicrobials were varied with respect to the isolates whether susceptible or resistant to macrolide in addition to their phenotypes. The lowest MIC for susceptible isolates to erythromycin and clindamycin, was 0.25 µg/mL of Co - amoxicillin + clavulanic acid and ceftriaxone. S. pyogenes which resisted to both erythromycin and clindamycin were susceptible to 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, ceftriaxone, ceftazidime, ciprofloxacin and gatifloxacin. M - phenotype of S. pyogenes isolates were susceptible to 0.25 µg/mL of azithromycin, lincomycin, ampicillin, Co - ampicillin - cloxacillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, cephalothin and cefotaxime. The lowest MIC for S. pyogenes characterized by positive D - shape test was 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid and gentamicin . S. pneumoniae isolates were susceptible to all tested antimicrobials with MIC range of 0.25 - 1 µg/mL. Penicillin - tolerant S. pyogenes was detected in 3 isolates. It concludes that Macrolide resistant S. pyogenes was found in high percent, and the commonest phenotype was cMLSB. Both fluoroquinolone resistant isolates and penicillin tolerant isolates were detected in both Macrolide resistant and susceptible isolates. The susceptibility of S. pyogenes isolates to antimicrobials was varied in respect to their susceptibility or resistance to macrolide as well as to the phenotypes of resistant isolates.
1 ... 214 215 216 217 218 ... 346