عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 851

استقرارية ليابنوف باستخدام عائلة من مصفو فات اليقين و التباديل == Lyapunov Stability Using Family of Definite and Permutation Matrices

اسم المؤلف: احمد عبد الخالق حسين الخالدي
اسم المشرف: عادل محمد حسن رزاق الرماحي
الموضوع العام: علوم الرياضيات
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الرياضيات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

تـقـويـة اداء الانظمة البــصرية باســتخدام الفتحات المركبة الدائرية المعاقة == Performance Enhancement of the Optical Systems by Using the Obscured Circular Synthetic Apertures

اسم المؤلف: بان حسين علي الرويشدي
اسم المشرف: عدنان فالح حسن الدحيدحاوي
الموضوع العام: علوم الفيزياء
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الفيزياء
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

تحضير وتشخيص بعض مونيمرات وبوليمرت جديدة محتوية على حلقات غير متجانسة ودراسة خواصها الحرارية والفعالية البايولوجية == Synthesis and Characterization of Some New Monomers and Polymers Containing Heterocyclic Rings and Study Their Thermal Properties and Biological Activity

اسم المؤلف: غادة مهدي كامل الزبيدي
اسم المشرف: هلال مسعود عبد الله | ابتسام خليفة جاسم
الموضوع العام: علوم الكيمياء
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الكيمياء
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يتضمن موضوع البحث تحضير مركبات حلقية غير متجانسة ثلاثية (الازردين و فنيل ازردين), خماسية (اوكسادايازول و ترايازول و تترازول), وخماسية ملتحمة (بنزوثايازول) والتي استخدمت لتحضير العديد من البوليمرات. | الجزء الاول : | يتضمن هذا الجزء تحضير مركب 2,3(1-ازردين)ماليك انهدريد[1] وبلمرته مع اثلين كلايكول و 1,3-بروبلين دايول و كليسيرول000الخ للحصول على رابطة استرية كما موضح بالشكل ادناه : | الجزء الثاني : | يتضمن هذا الجزء تحضير مركب 2,3(فنيل ازردين)ماليك انهدريد[12] وبلمرته مع اثلين كلايكول و 1,3-بروبلين دايول و كليسيرول000الخ للحصول على رابطة استرية كما موضح بالشكل ادناه : | الجزء الثالث : | يتضمن هذا الجزء تحضير مركب 3,2,ثنائي [2-مركبتو-5-يل-4,3,1-اوكسادايازول]1-ازردين [24] وبلمرته مع ثنائي كلوريدات الحامض للحصول على رابطة ثايواسترية كما موضح بالشكل ادناه : | الجزء الرابع : | يتضمن هذا الجزء تحضير مركب بنزوثنائي-2-امينوثايازول [29] وبلمرته مع ثنائي كلوريدات الحامض للحصول على رابطة امايدية كما موضح بالشكل ادناه : | الجزء الخامس : | يتضمن هذا الجزء تحضير مركب 4,1-ثنائي [3-مركبتو-4-(5-(بارا-فنيل)تترازولين)-5-يل-4,2,1-ترايازول] بيوتان [34] وبلمرته مع ثنائي كلوريدات الحامض للحصول على رابطة ثايواسترية كما موضح بالشكل ادناه : | * شخصت (المونمرات والبوليمرات) المحضرة باستخدام مطيافية FT.IR وUV/Vis و 1HNMR و 3CNMR وCHN كما قيست درجات انصهارها. | *درست اللزوجة و الصفات الحرارية لبعض البوليمرات المحضرة. | *كما تم تقييم الفعالية الحيوية لبعض البوليمرات المحضرة لتحديد امكانية استخدامها كمركبات ذات تطبيقات طبية. | == This work involves synthesis of different three (Aziridine, Phenyl azridine), five (Oxadiazole, Triazole, Tetrazole), and fused five (benzothiazole) member heterocyclic rings which used as a monomer for preparing many different polymers. | First part : | This part involves the synthesis of 2,3[1H-aziridine]maleic anhydride[1] and polymerized with ethylene glycol, 1,3-propylene diol, glycerol,…..etc. to get the polymers having ester linkage as shown below | This part includes the synthesis of 2,3[1-phenyl-aziridine]maleic anhydride[12] and polymerized with ethylene glycol, 1.3-propylene diol, glycerol,…..etc. to get the polymers having ester linkage as shown below This part includes the synthesis of 2,3-Bis[2-mercapto-5-yl-1,3,4-oxadiazole]1H-aziridine[24] and polymerized with diacid chlorides to get the polymers having thioester linkage as shown belowThis part contains the preparation of five member rings fused with benzene ring, its Benzobis-2-aminothiazole [29] and polymerized with diacid chlorides to get the polymers having amide linkage as shown belowIn this part, the compound 1,4- Bis[3-mercapto-4-(5-(p-substituted phenyl)tetrazolin)-5-yl-1,2,4-triazole]butane [37], [38] and polymerized with different diacid chlorides to get the polymers having thioester linkage as shown below In this part, the compound 1,4- Bis[3-mercapto-4-(5-(p-substituted phenyl)tetrazolin)-5-yl-1,2,4-triazole]butane [37], [38] and polymerized with different diacid chlorides to get the polymers having thioester linkage as shown below

مقارنة التغيرات الحيوية و الجزيئية لبعض انواع خميرة المبيضات الحساسة و المقاومة لبعض المضادات الفطرية

اسم المؤلف: رائد علي حسين
اسم المشرف: عدنان حمد الحمداني
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

دراسة اصطباغ المادة الوراثية للنطف وعلاقتها بعقم الرجال العراقيين == Study of Chromatin Staining of Sperms among Infertile Iraqi Men

اسم المؤلف: ماجد حميد جعفر الدباغ
اسم المشرف: عبد الامير ناصر غلوب | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف الدراسة الحالية الى تقييم سلامة المادة الوراثية للنطف لكل من الرجال السليمين والعقيمين وذلك من خلال استعمال الفحصين Acridine orange (AO.) وAniline blue (AB.) ، ومن ثم تقييم العلاقة بين متغيرات السائل المنوي مع كل من الفحصين السابقين اعلاه.تم فحص السائل المنوي ل (39) من الذكور السليمين ومتوسط اعمارهم (33.61± 5.23 ) سنة في حين كان عدد الذكور العقيمين الذين تم اجراء فحص السائل المنوي لهم هو(111 ) وكان متوسط اعمارهم ( 44.121 ± 6.708 ) سنة. كذلك اجري فحص (AO test ) لكل من الذكور السليمين والعقيمين من اجل معرفة سلامة المادة الوراثية للنطف. فيما بعد اجري فحص (AB test ) لكل من الرجال السليمين والعقيمين لقياس مدى تكثيف المادة الوراثية (Chromatin condensation ) التي تحصل اثناء تكوين الحيامن في الخصى والمهمة في المحافظة على سلامة المادة الوراثية. تم تقسيم المرضى العقيمين الى سبع مجاميع ، تتضمن مرضى قليلي النطف(oligozoospermia;O.) عددهم 12 ومرضى ذوي نطف قليلة العدد وشاذة(oligoteratozoospermia; OT.) عددهم 10 ومرضى يعانون من قلة عدد النطف وبطيئة الحركة وشاذة (oligoasthenoteratozoospermia; OAT.)عددهم 18 ومرضى يعانون من بطئ في حركة النطف(asthenozoospermia; A.) عددهم 6 ومرضى لديهم النطف بطيئة الحركة وشكل شاذ (asthenoteratozoospermia; AT.)عددهم 17 ومرضى نطفهم فقط شاذة الشكل(teratozoospermia; T.) عددهم 22 واخيرا مجموعة مرضى العقم غيرالمشخص وعددهم 26 . اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود فرق معنوي ( P< 0.05 ) بين الضرر في (DNA ) في نطف المرضى العقيمين مقارنة بالذكور السليمين باستعمال فحص (AO test )،في حين لم يسجل اي فرق معنوي بين مجموعتي الذكورالخصبين والعقيمين باستعمال فحص (AB test ). كذلك اظهرت نتائج الدراسة علاقة سالبة(r = - 0.575 ; P= 0.050), بين (AO test ) ومستويات الاس الهيدروجيني pH للسائل المنوي في مجموعة المرضى قليلي النطف(O) ، وكذلك ( r = - 0.500 ; P = 0.034) في مجموعة المرضى الذين يملكون نطف قليلة وبطيئة الحركة وشاذة المظهر(OAT). كذلك اظهرت مجموعة المرضى قليلي النطف علاقة سالبة ( r = - 0.634 ; P = 0.027)بين فحص (AO test) وكل من نشاط النطف (sperm activity) الصنف (A) وكذلك ظهرت علاقة سالبة ( r = - 0.684 ; P = 0.014) مع وقت التميع للسائل المنوي (semen liquefaction time). بالمقابل ظهرت علاقة سالبة قوية بين فحص ( AB test ) والنسبة المئوية لعدد النطف (r = - 0.840 ; P = 0.037) وكذلك مع النسبة المئوية للشكل المظهري الطبيعي للنطف( r = - 0.875 ; P = 0.022) في مجموعة المرضى ذوي نطف بطيئة الحركة . من ناحية اخرى النتائج اظهرت ان نسبة الضررفي المادة الوراثية لفحص (AO test ) كانت اكبر من نسبة فحص (AB test ). وبينما لوحظت علاقة موجبة بين الفحصين ( AO ,AB ) لاغلب مجاميع العقم السابقة فانه لم يسجل وجود فروق معنوية بين الفحصين (AO , AB ) لجميع مجاميع العقم. من النتائج التي ظهرت في هذه الدراسة نجد ان فحص السائل المنوي كان غير كافيا لتحديد خصوبة الرجل من عدمها بمعزل عن فحص المادة الوراثية والتي اظهرت كفاءتها في تحديد سلامة DNA النطف ، واخيرا فان الدراسة الحالية اظهرت ان فحص ( ( AO هو اكثر دقة من فحص (AB ) في التعرف على الضررالحاصل للمادة الوراثية. | The aim of this study was to evaluate the sperm DNA integrity for fertile men and infertile patients by using acridine orange (AO) test and aniline blue (AB) test, then to assess correlation between semen parameters with both AO test and AB test. Also to study the correlation between results of AO test and of AB test.Seminal fluid analysis was performed for thirty nine fertile men with average age (33.61 ± 5.23) years, and one hundred eleven infertile patients with average age (40.121 ± 6.708) years. The AO test was performed also for fertile and infertile men, then the chromatin condensation was measured by using AB test for fertile and infertile men. Infertile patients were divided into seven groups included Oligozoospermia (O.)=12, Oligoteratozoospermia (OT.)=10, Oligoasthenoteratozoospermia (OAT.)=18, Athenozoospermia (A.)=6, Asthenoteratozoospermia (AT.)=17, Teratozoospermia (T.)=22 and Unexplained infertility group=26. The results of the present study showed a significant (P< 0.05) difference in DNA fragmentation percent between fertile and infertile men by using AO test, but no significant difference (P>0.05) assessed by using AB test between both fertile and infertile men. Also a negative correlation was recorded between AO test and pH in oligozoospermia group (r = - 0.575; P= 0.050), and oligoasthenoteratozoospermia group ( r = - 0.500 ; P = 0.034). There was a good negative correlation assessed between AO test and grade (A) for sperm activity ( r = - 0.634 ; P = 0.027) , and liquefaction time ( r = - 0.684 ; P = 0.014) in oligozoospermia group. On the other hand, a strong negative correlation was noticed between AB test and sperm concentration (r = - 0.840 ; P = 0.037), and sperm morphology percentage ( r = - 0.875 ; P = 0.022) in asthenozoospermia group. Furthermore, results of DNA fragmentation percentage using AO test was higher than those using AB test with no significant difference. While there was a positive correlation between AO test and AB test in most of infertility groups, but no significant difference was assessed between the percentage of AO test and AB test in all infertility groups. From the results of this study, it was concluded that the seminal fluid analysis was not enough to obtain the fertility potential, and the sperm DNA integrity test was essential to detect DNA fragmentation in fertility clinics and laboratories. Both AO and AB test were easy and not expensive to perform for integrity test. Finally, AO test was more accurate test to detect abnormality of sperm DNA than AB test.

انتاج بروتين وحيد الخلية من بعض المخلفات الزراعية == Production of Single Cell Protien from some Agriculture byproducts

اسم المؤلف: رؤى عبد السادة جبار
اسم المشرف: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: نفذت هذه الدراسة لاجل معرفة امكانية انتاج بروتين وحيد الخلية Single Cell Protein (SCP) باستخدام ثلاثة انواع من الفطريات Agaricus bisporus, Saccharomyces cereviseae, Aspergillus niger وتحديد قدرتها على النمو على المخلفات السيللوزية(قصب بري, كوالح ذرة, خليطهما1 : 1) بعد معاملتها (كيميائيا, فيزيائيا وبايولوجيا) باستخدام تقنية تخمرات الحالة الصلبة وتقنية تخمرات الحالة السائلة وتحديد الظروف المثلى لانتاج بروتين وحيد الخلية من( مدة حضانة, درجة الحرارة, نوع المعاملة, نوع المادة السيللوزية والاس الهيدروجيني).اظهرت نتائج طرق المعاملة ان اعلى قيمة للسكريات المختزلة كانت من مادة القصب المعاملة كيميائيا والتي سجلت0.012 ,بينما سجلت مادة كوالح الذرة المعاملة فيزيائيا اقل القيم بلغت 0.002. كما اظهرت النتائج ان المعاملة الفيزيائية كانت اكفا من بقية طرق المعاملة والتي سجلت %15 لمادة كوالح الذرة بينما كانت المعاملة الكيميائية هي الاقل كفاءة والتي سجلت %3.اظهرت النتائج ان فطرA.niger كان الاكفا من بقية الفطريات في انتاج بروتين وحيد الخلية حيث سجل 0.096 غم/100 مل بينما سجل الفطرA.bisporus اقل قيمة 0.032 غم/100مل.اظهرت نتائج تحديد مدة الحضانة المثلى للفطريات المختبرة باستخدام تقنية التخمر السائل ان فترة 6 ايام كانت هي الامثل للفطريات A.niger S. cereviseae , بينما كانت فترة 9 ايام هي الامثل بالنسبة لفطر A. bisporus , اما في حالة التخمر الصلب فكانت فترة 14 يوم هي المثلى لجميع الفطريات المختبرة. اظهرت نتائج تحديد درجة الحرارة المثلى ان درجة 25°م هي الامثل للفطر A. niger , بينما كانت درجة 28°م هي الامثل لخميرة S. cerevisieae باستخدام تخمرات الحالة السائلة, بينما كانت 30°م هي الامثل للفطرA. niger في حالة التخمر الصلب.اظهرت نتائج تحديد نوع المعاملة الامثل للفطر A. niger ان المعاملة البايولوجية كانت هي الامثل باستخدام تخمرات الحالة السائلة والصلبة على حد السواء.اظهرت نتائج تحديد نوع المادة السيللوزية الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة ان خلاصة الخليط(1 : 1) كانت هي الامثل للفطر, بينما كانت خلاصة القصب هي الامثل في حالة التخمرات الصلبة.اظهرت نتائج تحديد قيمة الاس الهيدروجيني المثلى الامثل للفطر A.niger باستخدام تخمرات الحالة السائلة فقط ان 6.5 هو الاس الهيدروجيني الامثل للفطر. | The study was carried out to detecte the ability of Single Cell Protein (SCP) production using three fungi : Agaricus bisporus , Saccharomyces cerevisieae and Aspergillus niger and detecte their ability of growing on cellulytic material (Reed, corn cob, and their 1 : 1 mixture) after pretreated them (Chemically, Physically, Biologically), using liqiued state fermentation technique and solid state fermentation technique, and determine the optimum conditions for SCP production (inocubation period, tempreture, pretreatment method, kind of cellulytic material).The results of pretreatment method revealed that the highest redusing sugar value recorded by chemically reed material pretreated (0.012), while physically corn cob mateial pretreated recorded the lowest value (0.002). the results also showed that physical treatment was the more efficient than other treatments befor inoculation which recorded 15% for corn cob while chemical treatment method was the lowest efficient which recorded 3%.The resuls showed that A.niger was significantly superior than other fungi in Single cell protein production under 25°C for 5 days recording 0.096 gm/100ml dry wieght, while A.bisporus recorded the lowest value 0.032 gm/100ml.The results of the influence of four inocubation period (3,6,9,12) days revealed that 6 days was the optimum period of inocubation for A.niger and S.cerevisieae while it was 9 days for A.bisporus under 25°C and pH= (5.5, 4.5, 6.5) in liqiud state fermentation technique, and 14 days of tow period (7 , 14) days in solid state fermentation technique for the three tested fungi. The results of liqiud state fermentation technique showed that 25°C was the optimum tempreature for A.niger and 28°C for S.cerevisieae after 6 days and pH= (5.5 , 4.5) while in solid state fermentation technique the optimum tempreture was 30°C for A.niger .The results of determination the optimum pretreatment for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that Biological treatment was the optimum treatment method after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 , which is also the optimum method in solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum cellulytic material for A.niger using liqiud state fermentation technique showed that 1 : 1 mixture extract was the optimum material after 6 days of inocubation and 25°C , pH=5.5 for A.niger and it was Reed byproduct for solid state fermentation technique after 14 days and 30°C.The results of determination the optimum pH for A.niger in liqiud state fermentation technique, showed that 6.5 was the optimum pH after 6 days of inocubation and 25°C.

تاثـير الاس الهيـدروجيني على التركيز المثبط الادنى للمضادات الحيوية ضد Escherichia coli == Effect of pH on minimum inhibitory concentration of antibiotics against Escherichia coli

اسم المؤلف: داليا سـلمان عــبد ســبع
اسم المشرف: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تاثير الاس الهيدروجيني وتاثير تحمل الجهد على بكتريا الايشريشيا القولونية ( Escherichia coli ) بوجود وبغياب مجموعة من المضادات الميكروبية .امكن الحصول على ( 10) عزلات من بكتريا الايشريشيا القولونية ، من عينات الادرار والخروج لمرضى ارتادوا وحدة المايكروبايولوجي للعناية الطبية في مستشفى اليرموك التعليمي وشخصت مجهريا" وكيموحيويا" قبل زرعها في وسط نقيع الصويا الثلاثي بوجود وبغياب كل من المضادات الثمانية الاتية : ampicillin ,amoxicillin , gentamicin , amikacin ,cefotaxime , ceftriaxone , cefepime , and ciprofloxacin.تم التحري عن حساسية العزلات تجاه تلك المضادات بقيم مختلفة للاس الهيدروجيني وبوجود تراكيز مختلفة من مادتي المانيتول والبيروكسي نتريت ، اذ اظهرت النتائج مقاومة عزلات البكتيريا العالية لمعظم المضادات قيد الدراسة ، وان وسط النمو ذا الاس الهيدروجيني 5.1 ادى الى تثبيط نمو البكتريا بشكل كامل ، في حين ادى وسط النمو القاعدي الى استقرارية المضادات .اظهرت جميع العزلات مقاومتها لمضاد السبروفلوكساسين عند اسهيدروجيني ≥ 8.4 , كما وادى اي تغيير في قيمة الاس الهيدروجيني للمحلول الى فقدان هذا المضاد لفعاليته في الوقت الذي لم تفقد مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات فعاليتهما بالوسط القاعدي , ولوحظ ذلك من خلال اختبار حساسية العزلات تجاه هاتين المجموعتين في اس هيدروجيني يصل الى 9.9 , ولوحظ ايضا"ان السيفالوسبورينات كانت مستقرة عند اس هيدروجيني تراوح ما بين ( 4 - 8.8 ) .بالنسبة لتاثير المانيتول على البكتريا المعزولة ، اظهرت نتائج الدراسة ان البكتريا لا تستطيع تحمل وجوده بتركيز ≥ 2% في الوسط , كما ان مجموعتي السيفالوسبورينات والامينوكلايكوسيدات كانت مستقرة بوجود المانيتول بتركيز < 2% ، وبالنسبة لتاثير البيروكسي نتريت على نمو البكتريا المعزولة وجد انه ادى الى تثبيط نمو البكتريا بنمط يعتمد على تركيزه بالوسط كما ووجد ان هناك تازرا" بينه وبين المضادات المستخدمة عندما كان بتركيز (89.8) مايكرومول .اظهرت نتائج هذه الدراسة اهمية الاس الهيدروجيني لوسط النمو بالنسبة لمضادات ميكروبية معينة، كما وادت اضافة مواد معينة مثل المانيتول او البيروكسي نتريت الى تحفيز قابلية الكائن المجهري على المقاومة او تثبيط النمو، وبذلك يمكن ان تكون هذه المواد مؤازرة اوذات تاثير مضاد. | This study was designed to investigate the effect of pH and stress tolerance on the susceptibility of E. coli to eight antibiotics. A total of 10 isolates were recovered from urine and stool samples of patients who sake Al - Yarmouk Teaching Hospital, Unit of microbiology for a medical management. The isolated microorganisms were identified, microscopically and biochemically. The colonies of cultured microorganism were then sub - cultured in tryptic soy broth in microtitre plate in the presence or absence of each of the following antibiotics; ampicillin, amoxicillin, cefotaxime, ceftriaxone, cefepime gentamicin, amikacin, and ciprofloxacin. The susceptibility of E.coli towards these antimicrobials was examined at different pHs ; and concentrations of mannitol or peroxynitrite. The results showed that E.coli whether isolated from urine or stool, was multi - drug resistant. Growth of E.coli was completely inhibited in the tryptic soy broth at pH 5.1 in presence or absence of the antibiotics. The alkaline growth medium interferes with stability of the drugs incubated with E.coli. Ciprofloxacin lost its antibacterial activity at pH ≥ 8.4 and allowed E. coli to be a resistant . On the other hand, the cephalosporins and aminoglycosides were not degrade by the alkaline medium. This was evident through observation of the susceptibility of E. coli to these antibacterial agents at pHs up to 9.9. E.coli cannot tolerate presence of mannitol in the growth medium at concentrations of ≥2%. Cephalosporins and aminoglycosides were stable in presence of mannitol at concentrations of less than < 2%. Cephalosporins were stable at a wide range of pH (4.0 - 8.8), while ciprofloxacin had lost its stability at any changes in pH of the medium. Peroxynitrite inhibited the growth of E. coli in a concentration dependent manner rather than it induced stress and allowed the E. coli to tolerate. Furthermore, a concentration of 89.8 µM peroxynitrite produced synergism effect to all antibiotics applied in this work.Results of study explored importance of adjusting pH of growth media for specific antibiotics. Also, the addition of certain substances, like mannitol or peroxynitrite, that induced stress in microorganism may suppress the growth, rather than rendering the microorganisms, to be antimicrobial resistant. Moreover, these substances exert synergism rather than antagonism effect

استخدام بعض المؤثرات الفيزيائية والكيميائية في تحفيز بعض مركبات الايض الثانوي لنباتي الروجة Hypericum triquetrifolium وعنب الذيب Solanum nigrum خارج الجسم الحي == Effect of some physical and chemical elicitors on some secondary metabolite induction of Hypericum triquetrifolium and Solanum nigrum In vitro

اسم المؤلف: بان منــعـم عبد الرزاق تويــج
اسم المشرف: سعدية حسن محمود | كاظم محمد ابراهيم الصميدعي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This project was conducted in the plant tissue culture laboratory, Biotechnology Department, College of Science, Al - Nahrain University. It is aimed to increase the production of some secondary metabolites using physical and chemical elicitors in tissue cultures of Hypericum triquetrifolium L. and Solanum nigrum L. plants. The quality and quantity of phytochemicals were estimated using methanolic extracts of dried leaves and callus were analysed using HPLC. Callus was initiated on leaf discs cultured on Murashig and Skoog (MS) medium supplemented with 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid (2,4 - D) and Benzyl adinenine (BA) at concentrations of 0,0.1, 0.5, 2.0 or 5.0 mg/l for H.triquetrifolium callus initiation and Naphthalene acetic acid (NAA) at concentrations of 1.0, 2.0, 3.0, 4.0 or 5.0 mg/l and BA at 0.5, 1.0, 1.5, 2.0 or 2.5 mg/l for S.nigrum callus initiation. Results showed that the combination of 2,4 - D at 0.1 mg/l with BA at 0.5 mg/l was the most effective for callus induction percentage reached 90%. The highest mean fresh weight reached 64.33 mg for H.triquetrfolium, and the combination of NAA at 2.0 mg/l with 1.0 mg/l BA was the most effective for callus induction percentage reached 100% and the fresh weight reached 859.1 mg for S.nigrum. The same combination was used for callus maintenance for both plants. Results also showed an increase in the concentration of secondary metabolites in methanol extracts induced on leaves. Callus cultures induced on leaf discs were treated with some physical and chemical stimuli such as light, ultraviolet, jasmonic acid and salicylic acid, (2, 4, 6 or 8 mg/l jasmonic acid), or (50, 100, 150 or 200 mg/l salicylic acid), and different exposure to photoperiod (dark for 24 hrs, 12 hrs light, 16 hrs light or 24 hrs light), the uv exposure time was 10 or 20 minutes. Result showed that there are significant differences between the various treatmeant, the best concentration of jasmonic acid to stimulate and increase production was 6 mg/l in H.triquetrifolium callus cultures, and 8 mg/l for S.nigrum. Salicylic acid stimulated the production reached 150 mg/l in callus culture of H.triquetrifolium and 100 mg/l in callus culture of S.nigrum. The best light exposure time caused an increase in the production of secondary metabolism was 12 hrs light for calli in both plants. Both exposure time (10 or 20 mint) induced the yield of secondary metabolites in callus cultures of H.triquetrifolium equally. and 20 minutes for S.nigrum. It is concluded from studying the effect of chemical and physical treatments on callus of both plants. that uv increased callus fresh weight and secondary metabolites in callus cultures. The highest concentration of secondary metabolites induced incallus cultures of H.triquetrifolium were catchin (0.14708 mg/g), hypersoid (0.09825 mg/g), hypericin (0.84623 mg/g), pseudohypericin (0.13707 mg/g), hyperforin (0.85525 mg/g) and prenylated phlorglucin (0.11275 mg/g), the highest fresh weight for callus 61.67 mg. S.nigrum callus cultures produced ascorbic acid (0.14721 mg/g), α - solanine (0.2294 mg/g), solasodin (4.3689 mg/g), solanidin (1.4854 mg/g), β - solamargine (5.9896 mg/g), α - solamargin (1.5509 mg/g), solasonine (1.3048 mg/g) and demission (2.031 mg/g). Additionaly, it yielded the highest callus fresh weight reached 849.20 mg.

استخلاص البروتيسين من بكتريا Proteus mirabilis المعزولة سريريا ودراسة بعض صفاته == Extraction of Proticine From Clinical Strains of Proteus mirabilis and Study Some of Its Properties

اسم المؤلف: همسة نافع محمد علي الرحو
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 160 عينة خلال الفترة من تشرين الاول 2009 الى اذار 2010 من مستشفيات اليرموك التعليمي والاسكان للاطفال والكرخ العام والنعمان العام والكاظمية التعليمي والمختبرات التعليمية في مدينة الطب. شملت العينات 100 عينة ادرار من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البولية و46 عينة من اصابات الجروح و14 عينة براز من كلا الجنسين وباعمار مختلفة. تم الحصول على 29 عزلة لبكتريا Proteus من مجموع العينات الكلي اعتمادا على صفاتها الزرعية على الوسط , وكانت اعلى نسبة عزل لهذه البكتريا من عينات الجروح. تم بعد ذلك تشخيص عزلات Proteus وتمييزها الى انواع اعتمادا على صفاتها البايوكيميائية وتم تاكيد التشخيص باستخدام نظام Api 20E, فقد اظهرت النتائج ان 82,7% من العزلات تعود للنوع P. mirabilis بينما كانت نسبة النوع P. vulgaris 17,2% فقط من مجموع العزلات.اختبرت قابلية عزلات بكتريا P. mirabilis على انتاج البروتيسين في وسط نقيع القلب والدماغ الذي تم تزويده بمادة الكليسيرول بنسبة 10% واستخدمت طريقة اقراص الاكار (Cup assay) لاجراء هذا الاختبار فقد بينت النتائج ان 66,6% من عزلات P. mirabilis كانت منتجة للبروتيسين باستخدام عدد من العزلات الحساسة (proticine indicator strains) تعود الى النوع ذاته من البكتريا.تضمنت هذه الدراسة انتاج البروتيسين الخام من العزلة الاكثر كفاءة في الانتاج واستخدمت مادة المايتومايسين C لحث الخلايا على انتاج البروتيسين. وتم ايضا تحديد الفعالية النوعية للبروتيسين الخام باستخدام طريقة الانتشار بالحفرAgar well diffusion method)).بالاضافة الى ذلك, فقد اجري الترحيل الكهربائي للبروتيسين الخام مع بروتين قياسي لايجاد الوزن الجزيئي لمكونات البروتيسين الخام وذلك عن طريق مقارنة الحزم الظاهرة على طبقة الهلام مع حزم البروتين القياسي (Tris Glycin). فقد تبين من خلال الترحيل الكهربائي ظهور 3 حزم بروتينية مختلفة الاوزان الجزيئية قدرت بـ 30, 58, 81 كيلو دالتون.كما درست بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية للبروتيسين, فقد اختبرت قابلية البروتيسين على الصمود الحراري فقد وجد ان البروتيسين الخام يحتفظ بفعاليته كاملة ضمن المدى الحراري 20 - 40 ºم لكنه يبدا بفقدان فعاليته تدريجيا عند تعرضه لدرجات حرارية اعلى من 40 ºم ثم يفقدها كليا عند درجة حرارة 90ºم. كما وجد ايضا من خلال هذه الدراسة ان افضل فعالية للبروتيسين كانت عند قيمة pH تساوي 8, اعلى او اقل من هذه القيمة يبدا البروتيسين بفقدان فعاليته تدريجيا الا انه يحتفظ بجزء منها عند مدى واسع من قيم pH من 2 الى 12.اظهرت نتائج هذا الدراسة ان للبروتسين الخام تاثير تثبيطي على نمو بكترياShigella dysenteriae وP. vulgaris وSalmonella typhi وPseudomonas aeruginosa من مجموعة البكتريا الممرضة السالبة لصبغة كرام, وبكتريا Staphylococcus aureus من مجموعة البكتريا الممرضة الموجبة لصبغة كرام في حين لم يظهر اي تاثير على بكتريا Klebsiella وE. coli وLactobacillus وعلى الخميرة Candida albicans. | One hundred sixty specimens were collected during the period October 2009 to March 2010 from 6 hospitals : Al - Yarmok hospital, Central Child hospital, Al - Kadhimyia Educational hospital, Al - Karkh General hospital, Al - Nu'man General hospital and The Educational Laboratories. Specimens included UTI patients' mid stream urine, stool and wound swaps. Twenty nine Proteus isolates were obtained as total number depending on its cultural characteristics. The highest isolation percentage among specimens was obtained from wound swaps followed by urine and stool specimens. Proteus isolates were identified to species level depending on the biochemical tests and Api 20E system. P. mirabilis performed 82.7% while P. vulgaris performed only 17.2% of total Proteus isolates. P. mirabilis strains were screened for proticine production in BHI medium containing 10% glycerol by cup assay method. It was found that 66.6% of them were proticine producers against different P. mirabilis sensitive strains.This study included the production of crude proticine from the most efficient P. mirabilis producer strain which was induced by mitomycin C (2µg/ml), and determination of its specific activity by agar well diffusion method.Moreover, the molecular weights of proticine components were determined by SDS - PAGE with the ladder standard protein (Tris - Glysin). The Gel Electrophoresis resulted in a development of three protein bands with molecular weights (30, 58, and 81) x 103 Dalton.Temperature characterization of the crude proticine revealed that the crude proticine was 100% stable and active at 20 - 40˚c and it was sensitive to temperatures above 40˚c. Whole activity was lost at 90˚c. pH stability of crude proticine was also tested and revealed that the crude proticine was active at a wide range of pH values (2 - 12) but the highest activity was at pH 8. Above or below this value, proticine activity began to decrease gradually.In this study, it was demonstrated that the crude proticine had an inhibition effect on Shigella dysenteriae, P. vulgaris, Salmonella typhi, and Pseudomonas aeruginosa, as pathogenic gram - negative bacteria, and Staphylococcus aureus as a pathogenic gram - positive bacterium, but had no effect on Klebsiella, E. coli, Lactobacillus, and the yeast Candida albicans.

دراسة مقارنه بين بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة لمضاد المثيسلين والحساسة لهذا المضاد واختبار الفعالية التثبيطية لبعض المستخلصات النباتية عليها == Comparative study between Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), and detect the antimicrobial effects of some plant extracts on them

اسم المؤلف: هبة علي هلال الجبوري
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study included collection of 75 clinical different samples from teaching laboratories of Medical city in Baghdad during the period from September 2009 - February 2010, these samples differed in their sources which included 30 nasal swabs,27 inflammatory wounds swabs, 6 sputum cultures, 5 ear swabs, 4 urine cultures, and 3 skin abscesses. The results of microscopic examination, biochemical tests and API staph strip results Confirmed that 44 of this isolates were belong to the genus Staphylococcus aureus distributed in 19 isolates from nasal swabs, 10 isolates from inflammated wounds swabs, 5 isolates from both ear swabs and sputum culture, and 3 isolates from urine culture and finally 2 isolates from skin abscesses culture. Antibiotic sensitivity test showed that 90.90% of isolates were Methicillin Resistant S. aureus (MRSA), while only 6.81% of these isolates were Methicillin Sensitive S. aureus (MSSA). At the same time, the isolates showed different types of resistance towards 11 different kinds of antibiotics ,where as 100% of the isolates were resistant to PenicillinG, 65.90% of isolates were resistant to Amoxicillin, and 54.54% of isolates were resistant to Co amoxiclave, in contrast the isolates revealed different low levels of resistance against Erythromycin 34.09%, Tetracycline 31.81%, Cephalexin 25%, Gentamycin 20.45%, and 13.63% for both Ciprofloxacin and Refampine, vancomycin and clindamycin 2.27% and 0.0% respectively. The virulence factors were detected for 44 isolates, results showed the ability of both multidrug resistant (MRSA) isolates and multidrug sensitive (MSSA) isolates to produce most extracellular enzymes except for Urease enzyme, the MRSA isolates were Urease producers , while the MSSA isolates unable to produce this enzyme. MSSA isolate(S7) and MRSA isolate(S33) were chosen to detect the ability of them to produce toxic shock toxin (TSS - 1) and Exfoliative toxin (scalded skin toxin), results of these tests showed incapability of both (MRSA& MSSA) isolates to produces any of these toxins. To determine the pathoginicity of the (S33) MRSA isolate, LD50 value was detected by using BALB/c mice known in Weight and age, the LD50 value was 3.9  106. The LD50 for MSSA (S7) isolate was not detected because this isolate doesn't show any lethal activity even in (1011) concentration. To compare between the pathoginicity of (S33) MRSA& (S7) MSSA isolates, histopathological studies were performed by injecting the BALB/c mice with 106 CFU/ml for (S33) MRSA isolate and 108 for (S7) MSSA isolate concentrations of bacterial cells, four days post inoculation mice were killed. Histological sections were prepared. Results of histopathological studies showed an observable activity and virulently of multidrug resistant isolate (S33) over than the activity and virulently of multidrug sensitive isolate (S7).especially in kidney, liver and spleen, while the results were adjacent for lungs, in contrast stomach and heart appeared no effect for both (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The values of MIC were determined to three of antibiotics used in this study which were Vancomycin, Ciprofloxacin and Clindamycin, this test performed on (S7) MSSA& (S33) MRSA isolates. The results showed that the values of these three antibiotics were 1, 2, 0.250mg/ml for (S7) MSSA and 8, 4, 1 mg/ml for (S33) MRSA respectively. This study also included testing the activity of the crude juice of garlic, crude extract of pomegranate and crude oil of Eucalyptus against both multidrug sensitive MSSA (S7) and multidrug resistant MRSA (S33) isolates, garlic crude extract showed highest levels of effect against both S7& S33 isolates in two methods : well diffusion and pouring plates methods. In well diffusion method 10% concentration of crude juice appeared the highest growth inhibition effect, while in pouring plates method the concentration 10000 p.p.m appeared bactericidal effect. Also pomegranate crude extract and Eucalyptus crude oil appeared visible and strong effect against both S7&S33 isolates in both well diffusion and pouring plate method. Combination between antibiotics and garlic crude juice was performed. The MIC values of the three antibiotics after combination showed observable decreases. After combination the MIC values of Vancomycin decreased from 1mg/ml for S7 (MSSA) isolate & 8 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.250 mg/ml to both two isolates, while the MIC values for ciprofloxacin decreased from 2 mg/ml for (S7) MSSA isolate & 4 mg/ml for (S33) MRSA isolate to 0.125 mg/ml, for Clindamycin the values of MIC decreased from 1mg/ml for S33 (MRSA) isolate &0.250 mg/ml for S7 (MSSA) isolate to 0.125 mg/ml. these results means that the combination between garlic juice and antibiotics give synergistic effect against S. aureus especially the multiresistant isolate.

دراسة مقارنة تلف نسجة لجلد الفئران الناتج عن دنا بكتريا Staphylococcus aureus ودنا بكتريا Propionibacteriun acnes == A Comparative Study on Murine Skin Damage caused by Staphylococcus aureus DNA and Propionibacteriun acnes DNA

اسم المؤلف: ميسم محمد رشيد الشيباني
اسم المشرف: حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One hundred and twenty skin swabs specimens were collected from acne patients from Al - Kindey teaching hospital and medical city teachingcomplex during the period of October 26th 2009 to 18th of January 2010. Thirty eight (45.2%) specimens were identified as Staphylococcus aureus and twenty seven (32.1%) specimens were identified as Propionibacterium acnes according to the cultural, biochemical properties and API System. Obviously, indicated that S. aureus has significant higher isolation percentage in comparison to P. acnes were observed.From the results of antibiotic susceptibility test, various susceptibilities towards eight different antibiotics among isolates. Various susceptibilities to different antibiotics among isolates were observed. Most of S. aureus isolates were susceptible to methicillin and all isolates were susceptible to vancomycin. The highest resistant percentage was developed against penicillin. All P. acnes isolates were susceptible to all antibiotics used in this study.DNA was extracted and purified from the most sensitive isolates (P. acnes P7 & S. aureus S24) with A260/A280 ratio between 1.7 and 2.0 which is generally accepted as representative of a high - quality DNA sample. In order to confirm this purity both isolated bacterial DNA were submitted for electrophoresis and the result revealed a development of a single band seen by UV transillumination. Eight week old female white mice BALB/C each weight 20 to 25 g were used for histopathological study. Transcutaneous 10 mm in length wounds were performed on the shaved and sterilized backs of the mice, 2 - 3 drops of bacterial suspension(1.5×108 CFU/ml) and four concentrations (10, 20, 30 and 40 μg/ml) of isolated bacterial DNA were applied to the wound.Concerning histopathologic analysis we concluded that the effects of S. aureus whole cells were higher than the effects of P. acnes whole cells, while both isolated DNA were able to produce more severe inflammatory changes than the whole bacterial cells. Furthermore, increasing the DNA concentration caused an increase in the intensity of skin inflammation. Moreover, the effects of high GC ratio P. acnes DNA developed the highest inflammatory effect than the low GC ratio S. aureus DNA

دراسة تاثير بعض العوامل البيئية والمطهرات على التصاق بكتريا Proteus vulgaris على بعض الاسطح صلبة == Study The Effect of Certain Ecological Factors and Disinfectants on Proteus vulgaris Adherence to Certain Solid Surfaces

اسم المؤلف: منال سلمان محمد كسار
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 430عينة سريرية ونماذج بيئية للفترة من تشرين الاول 2009 لغاية اذار 2010 من عدد من مستشفيات بغداد بواسطة مسحات قطنية معقمة ومغلقة. جمعت 220 عينة سريرية شملت الادرار ومسحات الجروح ومسحات للاذن وخراج الكبد ; وجمعت 210 نموذج من بيئة المستشفيات شملت والارضيات والجدران واسرة المرضى ووحدات العناية المركزة وغرف الاطفال الخدج والهواء عن طريق فتح الاطباق المحتوية وسط اكار المكونكي لمدة دقيقة واحدة . تبعا للصفات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية تم الحصول على 32 عزلة شخصت لجنس Proteus التي تم غربلتها وحددت العزلة الاكفا انتاجا للطبقة اللزجة) (slime layer ودراسة تاثير قيم مختلفة من الحرارة والاس الهيدروجيني على نمو هذه البكتريا ودراسة عملية التصاق هذه البكتريا على الاسطح الصلبة وتاثير الحرارة والمطهرات على عملية الالتصاق وعمل دمج بين المطهرات الكيمائية وتاثيرها على الالتصاق . ونتائج هذه الدراسة يمكن ان تلخص بما يلي : - 1.اظهرت النتائج اعتمادا" على الاختبارات الكيمو حيوية و20E system - APIان نسية عزل بكتريا Proteus spp. كانت11,3% للعزلات السريرية بواقع 25 عزلة من مجموع 220 عينة سريرية واكثر عدد عزلات كان من الادرار)13عزلة ) بينما كانت نسبة العزلات البيئية 3, 3 % فقط بواقع 7 عزلات من مجموع 210 نموذج بيئي اخذ من مواقع مختلفة من بيئة المستشفيات واكثر عدد عزلات من وحدة العناية المركزة(3 عزلات). النوعين P. mirabilis وP. Vulgaris هما النوعان السائدان وp. mirabilis ذات نسبة عزل اكثر في العينات السريرية والنماذج البيئية حيث تشكل 87% بينما P. vulgaris فقط 13% من عزلات Proteus .. 2اختبرت كل العزلات عن قابليتها على انتاج الطبقة اللزجة (Slime layer) بطريقة احمر الكونكو(Congo red agar method) وطريقة كريستينس (Christensen method) واظهرت النتائج بان جميع العزلات التابعة للنوع Proteus vulgaris كانت منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين في حين كانت جميع العزلات التابعة للنوع P. mirabilis غير منتجة للطبقة اللزجة بكلا الطريقتين . 3. العزلة الاكفا في انتاجها للطبقة اللزجة والاجدر في اختيارها لاجراء باقي تجارب الدراسة من بين عزلات بكتريا P. vulgaris هي العزلة (U3) المعزولة من عينة الادرار .4. درجة حرارة المثلى لنمو بكتريا P. vulgaris (U3) كانت 37° ﻢ في حين ان الاس الهيدروجيني الامثل كان7 .5.عن طريق اجراء اختبار الفة البكتريا للزايلين تم قياس قيمة صفة الاسطح الكاره للماء لعزلات P. vulgaris وقد تراوحت القيم 42 - 50 % الذي يعنني امتلاك جميع العزلات سطوح كارهة للماء.6.عن طريق اجراء دراسة مقارنة عن قابلية بكتريا P. vulgaris (U3) في الالتصاق على ثلاثة سطوح صلبة (stainless steel, polyurethane and glass surface )المستخدمة في تصنيع العدد الطبية والجراحية فقد اظهرت نتائج الدراسة ان سطح الفولاذ المقاوم للصدا (stainless steel ) كان اكثر السطوح جذبا للبكتريا يليه سطح البولي يوريثين بينما كانت السطوح الزجاجية الاقل جذبا للبكتريا عند درجة حرارة 37° ﻢ. 7. لوحظ زيادة في قابلية البكتريا في الالتصاق على السطوح الصلبة عند درجة حرارة 4 ° ﻢ وعند 40° ﻢ مقارنة مع التصاق هذه البكتريا على نفس السطوح عند درجة حرارة 37° ﻢ.8.كانت قيم التراكيز المثبطة الدنيا للمطهرات (MIC) لبكتريا P. vulgaris (U3) كالاتي : 400 مايكروغرام ⁄مللترللمطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورات و1500 مايكروغرام ⁄مللتر للمطهر الكيميائي اليود و230 مايكرو غرام ⁄ مللتر للمطهر الكيميائي الديتول واخيرا السافلون الذي كانت قيمة التركيز المثبط الادنى له 90 مايكرو غرام ⁄ مللتر في حين اظهرت النتائج بان المطهر الكيميائي صوديوم هايبوكلورايت كان اكفا مطهر من بين المطهرات الاربع في قابليته في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة يليه اليود ثم الديتول واخيرا السافلون عند التركيز المثبط الادنى لهذه المطهرات 9. اظهرت نتائج خلط المطهرات بان جميع حالات الدمج بين المطهرات الكيميائية كانت اكفا في ازالة البكتريا لملتصقة على الاسطح الثلاثة الصلبة مقارنة بالمطهر الكيميائي الديتول والسافلون عند استخدامهما بصورة منفردة باعتبار ان هذين المطهرين الاقل كفاءة في ازالة البكتريا الملتصقة على الاسطح الصلبةوكفا حالات خلط المطهرات فكان .½ MIC of povidone - iodine +½MIC of savlon. : | From October 2009 to March 2010 ,430 specimens and samples were collected from different Baghdad s' hospitals using aseptic capped cotton swabs submerged in sterile nutrient broth. The clinical specimens were two hundred twenty included urine ,ear swabs ,wound swabs ,vaginal swabs and liver abscess, while ,the samples were two hundred ten collected from hospitals' environment included tables ,beds ,floors, walls ,infantsʹrooms and air by open the dish that contain MaCconkey agar for one min .According to morphological characteristics and biochemical tests 32 of Proteus isolates were obtained. All isolates were tested for slime layer producing . The more efficient isolate to produce slime layer was chosen to study effect of different values of temperature and pH on the growth of Proteus ,the ability of Proteus to adhere to three solid surfaces ( stainless steel , polyurethane and glass surface ) and study the effect of different values of temperature and four chemical disinfectants(separate and in combination) on adherence process. The results of this study could be summarized as follows : 1.Depending on the biochemical tests and API 20 E system results, Proteus spp. represent 11.3% of microorganisms isolated from clinical specimens and only 3.3% of microorganisms isolated from environmental samples. Proteus mirabilis and Proteus vulgaris were the dominant Proteus species, P. mirabilis was the highest Proteus spp. isolation percentage among the clinical specimens and hospitals' environment samples which was 87 %; while P. vulgaris was only 13% of Proteus spp.The urine gave the highest isolation number among clinical specimens( 13 Proteus isolates) , whereas intensive care unit (ICU) gave the highest isolation number among hospitals' environment samples(3 Proteus isolates). 2. All the Proteus isolates were tested for production of slime layer by Congo red agar and Christensen method. The results showed that all of P. vulgaris isolates gave positive results for two methods whereas all of P. mirabilis isolates showed negative result for two methods.3. P. vulgaris (U3) was the most slime layer producing among P. vulgaris isolates so it was selected for further experiments.4.The effect of different temperature values and pH values on P. vulgaris (U3) showed that optimum growth temperature was 37°C and the optimum pH for growth was 7.5. By using affinity of bacteria to xylene test ,the P. vugaris isolates were tested for measuring hydrophobicity cell surface .The results showed that the values of hydrophobicity test ranged 42 - 50% which meant that all isolates of P. vulgaris had hydrophobic cell surface.6. Comparing study of the ability of P. vulgaris(U3) to adhere on three solid surface materials used for manufacturing of medical ,surgery and health care devices,it was stated in this study that the stainless steel was the most attractive surface to the bacteria followed by polyurethane while the least ability to attract the bacteria was glass surface at 37°C.7. P. vulgaris(U3) adherence on solid surface was observed at the low temperature 4°C and high temperature 40°C better than at 37°C.8. The MIC values of chemical disinfectants for P. vulgaris were as follows bleach was 400µg/ml, iodine solution 1500µg/ml , dettol 230µg/ml and savlon was90µg/ml. and the bleach at MIC concentration was the most efficient disinfectants than other disinfectants in its ability to remove the adherent bacteria on three solid surfaces followed by iodine solution ,dettol then savlon.9 .The results of disinfectants combination showed that all the combinations were more efficient in removing of adherent bacterial cells than dettol and savlon when they were used alone and the combination between ½MICof iodine solution + ½MICof savlon was the most efficienty to remove adherent bacteria on solid surface than other combinations.

انتاج انزيم الاميليز من بكتريا Bacillus licheniformis Bs7 وتقييد الخلايا المنتجة له بالاقتناص والامتزاز == Production of amylase from Bacillus licheniformis Bs7and immobilization of the producing cells by entrapment and adsorption

اسم المؤلف: مريم باسم انيس
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة عائدة لجنس Bacillus من مصادر بيئية مختلفة شملت التربة ,الماء والغذاء. اختبرت قدرة هذه العزلات على انتاج انزيم الاميليز, وبينت نتائج الغربلة على ان العزلة Bacillus Bs7 المعزولة من التربة هي الاغرز انتاجا والتي شخصت على انها احدى سلالاتBacillus licheniformis.درست الظروف المؤثرة في انتاج الاميليز, ولوحظ ان اعلى انتاجية تكون عند زرع البكتريا في وسط S.Y.P. الحاوي على 1%نشا,0.2% مستخلص الخميرة, 0.5% ببتون, 0.4% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.015% كلوريد الكاليسيوم, برقم هيدروجيني 7 وحضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 48 ساعة في حاضنة هزازة بسرعة 150 دورة/دقيقة.رسب انزيم الاميليز بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع 70% وكانت الففعالية نوعية 540 وحدة/ملغم بروتين بعدد مرات تنقية 1.2وبحصيلة انزيمية مقدارها48%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 وانزيم الاميليز المنقى جزئيا بتقنية الاقتناص (Entrapment) داخل الجينات الكاليسيوم والاكار وعديد الاكريلامايد وتبين ان الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم احتفظت ب110% من الفعالية الانزيمية بعد مرور 5 دقائق من زمن التفاعل يليها الاكار ثم عديد الاكريلامايد بفعالية متبقية 75%و 61% على التوالي مقارنة مع الخلايا الحرة التي امتلكت فعالية انزيمية 94% بعد مرور5 دقائق من زمن التفاعل كما احتفظت الخلايا المقيدة داخل الجينات الكاليسيوم ب 50% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 60 دقيقة من زمن التفاعل في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 37% من فعاليتها بنفس الوقت. اما الانزيم المقيد داخل الجينات الكاليسيوم فقد احتفظ ب 85% من فعاليته الانزيمية بعد مرور 5 دقائق يليه الاكار 70% ثم عديد الاكريلامايد 50% مقارنة مع الانزيم الحر حيث احتفظ بفعالية انزيمية قدرها 79%.تم تقييد خلايا B. licheniformis Bs7 بطريقة الامتزاز (Adsorption) على السطوح الصلبة لمواد مختلفة شملت الفحم والقطن والنايلون ونشارة الخشب وعديد استارين والسيفاديكس G - 150, ثنائي اثيل امينو اثيل Sephadex - DEAE.احتفظت الخلايا المقيدة بنشارة الخشب باعلى فعالية انزيمية بلغت 128% عند حضنها بدرجة حرارة 50م لمدة 5 دقائق و79% عند حضنها لمدة 30 دقيقة بالمقارنة مع الخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 87% و40% على التوالي في الظروف نفسها.وجد ان درجة الحرارة 50م هي الدرجة الحرارية التي تظهر اعلى فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب حيث احتفظت ب 125% من فعاليتها الانزيمية بعد مرور 5 دقائق مقارنة بالخلايا الحرة والتي امتلكت فعالية انزيمية 88% بعد مرور 5 دقائق.وعند تعرض الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لدرجات حرارية مختلفة تراوحت بين 40 - 70 م لوحظ ان الخلايا المقيدة احتفظت ب 123% من فعاليتها بدرجة 60 م و97% بدرجة 70م في حين كانت هذه النسبة للخلايا الحرة 94% و70% على التوالي.وكان افضل رقم هيدروجيني للمحافظة على فعالية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب هو 7 حيث بقت الخلايا المقيدة محتفظة ب 129% من فعاليتها في حين احتفظت الخلايا الحرة ب 90%.جرى استخدام الخلايا المقيدة بنشارة الخشب لثمان دورات. حيث لوحظ امكانية اعادة استخدام الخلايا المقيدة للدورات الثلاثة الاولى بفعالية متبقية مقدارها 95% و49% للدورات الثلاثة الاخرى وانخفضت الفعالية الى 30% في الدورة الثامنة.اختبرت قابلية الخلايا المقيدة بنشارة الخشب على ازالة البقع من الالبسة حيث لوحظ ان استخدام الخلايا المقيدة مع المنظفات افضل في ازالة البقع عن الالبسة من المنظفات لوحدها. | Fifty isolates belong to Bacillus spp. were isolated from different sources including soil, water and food. The ability of amylase production by these isolates was screened. Bacillus Bs7 which isolated from soil was the highest amylase producer; it was identified as a strain of Bacillus licheniformis. Optimal condition for α - amylase production were studied and the highest production of amylase was obtained when the bacteria were cultured in S.Y.P medium which contained 1% starch, 0.2% yeast extract, 0.5% peptone, 0.05% Mgso4 , 0.05% Nacl and 0.015% Cacl2 at pH 7 and incubated at 50˚C in shaking incubator at 150 rpm for 48hrs. Amylase was extracted by 70% ammonium sulphate precipitation and the specific activity was 849 u/mg protein. B. licheniformis Bs7 cells and partially purified amylase were immobilized by entrapment methods in calcium alginate, agar and polyacrylamide. The immobilized cells into calcium alginate retained 110% of enzyme activity after 5 minutes followed by agar and polyacrylamide with remaining activity 75% and 61%, respectively when compared with the free cells that have enzyme activity of 94% after the same time. Immobilized cells into calcium alginate retained 50% of enzyme activity after 60 min while free cells had remaining activityof 37% after the same time. Amylase that immobilized into calcium alginate retained 85% of enzyme activity after 5 min followed by agar and polyacrylamide that retained 70% and 50% of enzyme activity respectively, compared with the free enzyme with remaining activity of 79%. B. licheniformis Bs7 cells were immobilized by adsorption method on solid surfaces of different carriers including charcoal, cotton, nylon, sawdust, polystyrene, sephadex G - 150 and DEAE - sephadex. The immobilized cells on sawdust showed maximum enzyme activity of 128% when incubated at 50˚C for 5 min and 79% after 30 min incubation compared with free cells that showed 87% and 40% enzyme activity respectively at the same times. Optimum temperature for the activity of immobilized cells on sawdust was 50˚C which had 125% of enzyme activity after 5 min compared to free cells with remaining activity of 88% after the same time. Immobilized cells on sawdust when incubated at different temperatures ranged between 40 - 70˚C for 5 min, revealed that the immobilized cells had retained 123% of activity at 60˚C and 97% at 70˚C compared to the free cells which retained 94% and 70% at the two temperatures respectively. The optimum pH that kept the activity of immobilized cells on sawdust was 7 with remaining activity of 129% while free cells kept 90% of activity at this pH value. The immobilized cells on sawdust were repeatedly used for 8 cycles. The immobilized cells showed the maximum enzyme activity during the first three cycles with remaining activity of 95%, and 49% for the second three cycles; the remaining activity was reduced to 30% in eighth cycle. The ability of immobilized cells on sawdust to remove the stains from clothes was tested. The results showed that the ability of immobilized cells with detergents for removing stains was better than detergent alone.

انتاج وتوصيف بيتا - هيدروكسي بيوتاريت (? - hydroxybutyrate) من عزلة محلية لبكتريا Azotobacter chroococcum == Production and Characterization of ? - hydroxybutyrate from Azotobacter chroococcum local isolate

اسم المؤلف: سعاد علي احمد
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 12 عزلة من بكتريا Azotobacter chroococcum من اصل 20 عينة تربة جمعت من مناطق مختلفة بالقرب من جذور النبات من حقل ذرة في كلية الزراعة في ابو غريب في الفترة الزمنية بين اب وكانون الثاني. درست قابلية العزلات على تجميع عديد هيدروكسي بيوتاريت وذلك بتصبيغ العزلات بصبغة Sudan black B . اظهرت جميع العزلات القدرة على انتاج المتعدد PHB وان العزلة A. chroococcum 9 كانت اكثرهم تجميعا للمتعدد PHB .درست تاثيرات ظروف مختلفة في انتاج المتعدد فوجد ان الظروف المثلى لانتاج PHB من العزلة A. chroococcum 9 بتنميتها في وسط Stockdale nitrogen free medium الحاوي على الكلوكوز مصدرا كربونيا والببتون مصدرا نيتروجينيا عند رقم هيدروجيني 7.5 , والملقح ب 3.8 × 104 خلية/ مل عند درجة حرارة 30 م˚ والحضن في حاضنة ساكنة لمدة 48 ساعة, حيث كانت نسبة PHB في هذه الظروف ( 40.3% ) .درست انتاجية البكتريا A. chroococcum 9 في الوسط المحتوي على مخلفات طبيعية مثل مولاس قصب السكر ومستخلص التمر(الزهدي) والشرش وكذلك الوسط المحتوي على الكليسيرول او احد انواع الزيوت ( زيت الزيتون , زيت الذرة , زيت زهرة الشمس ) حيث استخدمت بصفتها اوساط رخيصة لانتاج المتعدد PHB . كانت اعلى نسبة للعديد ( 78% ) تم الحصول عليها من تنمية البكتريا A. chroococcum 9 في وسط Stockdale nitrogen free medium المحتوي على 5% من مولاس قصب السكر . استخلص PHB من العزلة A. chroococcum 9 بعدة طرائق تضمنت الاستخلاص بمحلول هايبوكلورات الصوديوم وطريقة SDS مع هايبوكلورات الصوديوم واستعمل هيدروكسيد الصوديوم في الطريقة الثالثة . كانت طريقة الاستخلاص باستخدام محلول هايبوكلورات الصوديوم الافضل حيث بلغت نسبة المتعدد 39.5% ) ) .اظهرت نتائج توصيف PHB ان الوزن الجزيئي للمتعدد المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 كان 2.6×105 دالتون وان درجة الانصهار له كانت 180 م˚ .درست ذائبية PHB في عدة مذيبات عضوية ولوحظ ان PHB يذوب في الكلوروفورم و1 - 2 ثنائي كلوريد الايثانول الا انه غير ذائب في الميثانول , الايثانول , الاسيتون , الهكسان , ثنائي اثيل ايثر ورباعي كلوريد الكاربون .درست لزوجة PHB المستخلص من بكتريا A. chroococcum 9 في عدة ارقام هيدروجينية , حيث لوحظ اختزال في لزوجة المتعدد في الوسط الحامضي (pH 4) والقاعدي (pH 10) مما يعني اختزال في الوزن الجزيئي للمتعدد . في حين كان الرقم المتعادل (pH 7) ملائما للحفاظ على تركيبه اذ لم تتغير اللزوجة عند هذا الرقم .وجد ان PHB المستخلص من بكتريا 9 A. chroococcum يتحلل حيويا بفعل انواع مختلفة من البكتريا تضمنت P. aerugenosa , B. subtilis و. A. chroococcum | Twelve Azotobacter chroococcum isolates were obtained from 20 soil samples collected from different places in corn field in Agricultural College in Abu - Ghrabe near the plant roots in the period between August and January . The ability of polyhydroxybutyrate accumulation of the isolates was examined by staining with Sudan black B stain. All the isolates were able to produce PHB . A. chroococcum 9 was the highest PHB producer. The effect of different conditions on accumulation of PHB from A. chroococcum 9 were determined . The favorable productivity appeared when Stockdale nitrogen free medium containing 2% glucose as carbon source and 1% peptone as nitrogen source at pH 7.5 was inoculated with 3.8 × 104 Cell/ml and incubated in static incubator at 30 ˚C for 48 h , PHB productivity at these conditions was 40.3% . Media containing natural wastes including cane molasses , date extract , whey and media containing glycerol or a kind of oil ( olive oil ,sunflower oil and corn oil) were used as economic media for PHB production . High productivity was observed in Stockdale nitrogen free medium containing 5% cane molasses , PHB content was 78% . PHB was extracted from A. chroococcum 9 by different methods including sodium hypochlorite , SDS and sodium hypochlorite and by NaOH. The optimum recovery of PHB was 39.5% by using sodium hypochlorite extraction method . The molecular weight of PHB extracted from A. chroococcum 9 was 2.6×105 dalton and the melting point was 180 ˚C . The solubility of PHB in several solvents was studied . The PHB was soluble in chloroform and in 1 - 2 dichloroethanol , while it was insoluble in methanol , ethanol , acetone , hexane , diethyl ether and carbon tetrachloride . The viscosity of A. chroococcum 9 PHB was determined at different pH values , a decreasing in viscosity was at acidic pH (pH 4) and at alkaline pH (pH 10) which indicate a reducing in PHB MW , while neutral pH (pH 7) was kept the structure of PHB . PHB extracted from A. chroococcum 9 was found to biodegradable by different kinds of bacteria included P. aerugenosa , B. subtilis and A. chroococcum

استخلاص وتنقيـةlecithinase من بكتريا Proteus vulgaris ودراسة بعض تاثيراته الممرضه == Extraction and purification of Lecithinase from Proteus vulgaris and study some it is pathogenic effects

اسم المؤلف: زهراء عباس جبر العيساوي
اسم المشرف: رسمية عبد ابو ريشة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 162 عينة ادرار ومسحات جروح من المرضى المصابين بالتهابات المجاري البولية واصابات الجروح لكلا الجنسين للفترة من ايلول 2009 ولغاية شباط 2010. شخصت العزلات اعتمادا على الصفات المظهرية والفحوصات البايوكميائية ووجد ان 55 عزله تعود الى جنس Proteus وبنسبه عزل 33,9% كما وجد ان 5 عزلات تعود الى النوع Proeus vulgaris وبنسبه عزل 9,09% بعدما شخصت باستخدام نظام Api20E . حددت قابلية عزلات النوع Proeus vulgaris على انتاج انزيم lecithinase باستخدام طريقة الانتشار في الاكار. وجد ان اربع عزلات منتجة للانزيم وان العزلةProteus vulgaris (P1) هي الامثل في الانتاج. استخلص الانزيم من هذه العزلة وتم تنقيته باستخدام عملية الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبه تشبع 60% والتنقية باستخدام عمود الهلام sephacryl S - 200 حيث ظهرت قمتين بروتينية وتم قياس الفعالية النوعية للانزيم بعد التنقية حيث وجد انها تساوي 217 وحدة /ملغم وبتركيز بروتين 290,%ملغم/مل . درس تاثير عدد من المضادات الحيويه على انتاجية وفعالية الانزيم ووجد ان بعض المضادات تثبط انتاج الانزيم مثل اموكسلين / حامض كلافيولانك اسد ,ارثرومايسين وجنتمايسين وبتراكيز 60, 260 , 10 مايكروغرام/مل على التوالي بينما وجد ان البنزاثين بنسلين والريفامبين لايؤثر على الانتاجية ووجد ان الريفامبين يؤثر على فعالية الانزيم بتركيز 80مايكروغرام/ مل. حددت قابلية الانزيم السمية حيث درس التاثير القاتل للنصف للانزيم LD50)) في الحيوانات المختبرية ووجد ان نسبة الجرعة القاتلة للنصف تساوي 210 مايكرو غرام/مل كما حددت نسبة الجرعة المسببة لاصابة الكلى لنصف الحيوانات المختبرية KID50 ووجد ان النسبة تساوي 82,5 مايكروغرام/مل. كما درست التاثيرات النسجية التي يسببها الانزيم في اعضاء الحيوانات المحقونة والتي شملت اعضاء الكبد والكليه والطحال وجد ان الانزيم ياثر تاثيرا كبيرا في نسيج الكبد حيث سبب تنكس في الخلايا الكبدية مع تجمع للمواد الدهنية في الخلايا الكبدية ,تنخر , ارتشاح الخلايا الالتهابية , التهاب المنطقه البوابية , احتقان للاوعية الدموية وتكون خراجات في النسيج البرنكيمي وحدوث تليف حول هذه الخراجات. بينما التاثيرات في نسيج الكلى تمثلت بتنكس في الخلايا الكلوية , تنخر في نبيبات الكلية , ارتشاح الخلايا الالتهابية , وذمة وتجمع للسوائل ,وخراجات واحتقان الاوعية الدموية اما التاثيرات في نسيج الطحال فكانت اقل مقارنة مع الاعضاء الاخرى حيث سبب الانزيم توسع في اللب الابيض للطحال مع تنكس وتنخر بسيط في النسيج البرنكيمي | One hundred sixty two isolates of urine and wound specimens were collected from patients of both sex from September 2009 to February 2010. These isolates were identified according to morphological and biochemical tests, 55 isolates were found belong to genus Proteus with isolation percentage 33.9%. 5 isolates of P.vulgaris were obtained after using ApI 20E system which represent the isolation percentage 9.09% of total isolates. The ability of these isolates to produce lecithinase enzyme by using agar well diffusion method was determined, only 4 isolates of P. vulgaris produce this enzyme which appear as opaque zone around colonies on egg yolk agar, P. vulgaris P(1) was the best isolate for lecithiunase production.The lecithinase P. vulgaris P(1) strain was extracted and purified by precipitation with 60% saturation of ammonium sulfate, dialysis and gel filtration with Sephacryl S 200 column, two peaks of protein appeared in last step, the lecithinase activity was observed in second peak. The purified lecithinase has specific activity 217 unit/mg with protein concentration 0.29 mg/ml.P. vulgaris lecithinase was treated with different antibiotics to determine their effect on the production and activity of this enzyme, the antibiotics varied in their effect, some of them prevent production such as amoxillin/Clavulanic acid , erythromycin and gentamycin at 64, 256 and 8 µg/ml respectively, while benzathin penicillin and rifampin did not effect on the production of enzyme, but only rifampin was decreased lecithinase activity at 128 µg/ml. The LD50 and KID50 of partial pure enzyme was determined in mice and it was 210, 82.5µg/ml respectively. Histopathological effect of partial pure lecithinase was studied. It was found that the lecithinase was more effective on liver tissue than kidney tissue which caused sever degenerative changes of hepatocyte cells with accumulation of lipid materials (fatty change), necrosis, infiltration of inflammatory cell, inflammation of portal area, congestion of blood vessel, abscess formation in liver parenchyma and fibrosis around the abscess. while the effect of lecithinase on kidney showed degenerative of kidney cell, necrosis of renal tubule, with inflammatory cell infiltration, edema, abscess and congestion of blood vessel in kidney. Finally, less effect revealed by lecithinase on spleen tissue, which caused enlargement of white pulp forming germinal center with slight degenerative change and mild necrosis of parenchymal tissue

دراسة مقارنة بين انواع بكتريا Staphylococci المنتجة وغير المنتجة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين == Comparative Study between Methicillin - Resistant Coagulase Positive and Negative Staphylococci

اسم المؤلف: هالة محمد حسين الحسني
اسم المشرف: مي طالب فليح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 161 عينة من المرضى والحاملين للبكتريا (العاملين في المستشفيات والمطاعم) (carriers) كانت العينات تشمل : مسحات الانف، مسحات الجروح، الحروق، التقيحات، القشع، مسحات الاذن وكذلك شملت افرازات من الثدي وعينات من البول والدم. شخصت 49 عزلة (30.4%) على انها تعود لجنس Staphylococcus. وبعد اجراء اختبار الانزيم المخثر للبلازما .Coagulase test اظهرت 37 عزلة (75.5%) من اصل 49 قدرتها على انتاج الانزيم المخثر للبلازما ]موجبة للانزيم المخثر للبلازما Coagulase - Positive Staphylococci (COPS)[، بينما اظهرت 12 عزلة (24.5%) عدم قدرتها على انتاج هذا الانزيم واعتبرت سالبة للانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci(CONS). تم اجراء فحص الحساسية لمضادات الحياة للتحري عن وجود وانتشار بكتريا Staphylococci المقاومة للمضاد الحيوي المثسلين وكذلك تم استخدام العدة الخاصة للكشف عن هذا النوع من البكتريا (MRSA Kit) للتاكد من النتيجة، وقد كانت النتائج كالاتي : اظهرت 41 عزلة (83.7%) من اصل 49 مقاومتها لمضاد المثسلين بينما اظهرت 5 عزلات (10.2%) حساسيتها لهذا المضاد وكانت ثلاث عزلات فقط (6.1%) متوسطة المقاومة لهذا المضاد. وقد مثلت مسحات الانف (من الحاملين للبكتيريا) (carriers) اعلى نسبة (%63.4) بين العزلات المقاومة للمثسلين. ومن ناحية اخرى فقد اظهرت النتائج ان 30 عزلة (81%) من اصل 37 عزلة منتجة للانزيم المخثر للبلازما (COPS) كانت مقاومة لمضاد المثسلين بينما اظهرت 4 عزلات (10.8%) حساسيتها لهذا المضاد وثلاثة عزلات فقط (8.1%) متوسطة المقاومة للمثسلين. اما بالنسبة للعزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما (CONS) اظهرت 11 عزلة من اصل 12 عزلة (91.6%) مقاومتها للمثسلين بينما اظهرت عزلة واحدة فقط (8.3%) حساسيتها لهذا المضاد. ولم تظهر اي عزلة من العزلات السالبة للانزيم المخثر للبلازما مقاومة متوسطة لهذا المضاد. اما بالنسبة لفحص الحساسية لبقية مضادات الحياة فقد اظهرت النتائج ان كلا النوعين (الموجبة والسالبة للانزيم المخثر للبلازما) مقاومة لعدة انواع اخرى من المضادات اضافة للمثسلين (متعددة المقاومة للمضادات الحيوية). تم التحري عن قابلية بكتريا Staphylococcus aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) والبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما المقاومة للمثسلين (MR - CONS) على انتاج بعض عوامل الفوعة وقد اظهرت النتائج ان بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة لعدة انواع من الانزيمات والسموم التي تساهم عادة في امراضيتها ومن هذه الانزيمات انزيم البروتييز، اللايبيز، اليوريز، الانزيم المحلل للدنا اضافة الى انزيم الجلاتينيز، كذلك اظهر هذا النوع من البكتريا قدرته على انتاج ثلاثة انواع من الهيمولايسين (الفا، بيتا، ودلتا). اما بالنسبة للنوع الثاني، البكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت قدرتها على انتاج نوعين فقط من الانزيمات (البروتييز واليوريز) اضافة الى انتاجها للانواع الثلاثة من الهيمولايسين. ولم تظهر اي عزلة قابليتها على انتاج سم متلازمة الصدمة السمية (TSST - 1) (Toxic Shock Syndrome Toxin). كذلك فقد تم التحري عن قابلية كلا النوعين السابقي الذكر من البكتريا على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقتي الانابيب واكار احمر الكونغو، وقد بينت النتائج ان كلا النوعين لها القدرة على انتاج الطبقة اللزجة باستخدام طريقة الانابيب الا ان كمية او نسبة المادة الملتصقة على السطح الداخلي للانابيب كانت متباينة بين العزلات، اما طريقة اكار احمر الكونغو فقد اظهرت ان 60% من عزلات بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) كانت منتجة للطبقة اللزجة وبكميات كبيرة بينما اظهرت 40% من عزلات هذا النوع عدم قدرتها على انتاج الطبقة اللزجة. اما بالنسبة للبكتريا السالبة للانزيم المخثر للبلازما والمقاومة للمثسلين (MR - CONS) فقد اظهرت جميع العزلات التي تم اختبارها (100%) انتاجيتها العالية للطبقة اللزجة. اختبرت قدرة كلا من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) على انتاج او تكوين الغشاء الحيوي (biofilm) باستخدام اطباق المعايرة الدقيقة وقد بينت النتائج ان كلا النوعين له القدرة العالية على تكوين الغشاء الحيوي فقد كانت قيم الامتصاصية تتراوح بين 0.520 - 0.738 وان قيم الامتصاصية لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) كانت اكبر من قيم الامتصاصية لبكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA)، اضافة لذلك فان قيم الامتصاصية وبالتالي تكوين الغشاء الحيوي قد ازدادت وبفارق معنوي عند اضافة سكر الكلوكوز وبنسبة 1% للوسط الزرعي. اظهرت النتائج كذلك ان هناك صلة بين المقاومة للمثسلين وتكوين الغشاء الحيوي في العزلات التابعة لبكتريا S. aureus. اختبر تاثير التراكيز تحت المثبطة الدنيا لاثنين من مضادات الحياة Vancomycin وClindamycin على تثبيط تكوين الغشاء الحيوي لكل من بكتريا S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE) وقد بينت النتائج ان كلا المضادين وبكلا التركيزيين المستخدمين (تحت المثبط الادنى الاول وتحت المثبط الادنى الثاني) قد اثر او ثبط تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين هذا عند استخدام كل مضاد بمفرده على الرغم من ان تاثير مضاد الـ Vancomycin في التثبيط كان افضل من تاثير مضاد الـ Clindamycin. اضافة الى ذلك فقد اثبتت النتائج ان عملية دمج المضادين وبكلا التركيزيين تحت المثبطين الادنيين قد ثبط عملية تكوين الغشاء الحيوي وبفارق معنوي ولكلا العزلتين على السواء. وعند المقارنة بين طريقتي استخدام كل مضاد بمفرده وبين عملية الدمج بين المضادين فان النتائج قد بينت عدم وجود اي فرق معنوي بين الطريقتين بالنسبة لبكتريا S. epidermidis المقاومة للمثسلين (MRSE)، بينما بينت النتائج ان هناك فرق معنوي بين استخدام الطريقتين بالنسبة للعزلة S. aureus المقاومة للمثسلين (MRSA) وان الطريقة الاولى (استخدام كل مضاد بمفرده) كانت افضل من الطريقة الثانية (عملية الدمج بين المضادين) في التاثير التثبيطي على عملية تكوين الغشاء الحيوي. | One hundred and sixty one specimens were collected from patients and carriers (workers in the hospitals and restaurants), the specimens included nasal swab, wound swab, burn swab, abscess and pus, sputum, ear swab, breast discharge, urine and blood culture. Only 49 (30.4%) isolates identified as Staphylococcus, the coagulase test was performed and the results showed that from total 49 isolates of Staphylococci, 37 isolates (75.5%) were coagulase - positive (COPS), while only 12 isolates (24.5%) were coagulase - negative (CONS). The distribution of Methicillin resistance among Staphylococcus spp. was investigated by disc diffusion method and MRSA Kit. The results indicated that from all 49 isolates, 41 isolates (83.7%) showed resistant to the Methicillin while 5 isolates (10.2%) were sensitive and only 3 isolates (6.1%) was intermediate resistance. The highest rate of Methicillin resistance Staphylococci (63.4%) was obtained from nasal swabs (carriers). On the other hand the results showed that out of total 37 coagulase - positive isolates (COPS), 30 isolates (81%) were resistant to Methicillin and 4 isolates (10.8%) were sensitive while only 3 isolates (8.1%) were intermediate resistance to the Methicillin. The total 12 isolates that identified as coagulase - negative (CONS), 11 isolates (91.6%) showed resistance to Methicillin while only 1 isolate (8.3%) was sensitive, and there was no intermediate resistance among CONS isolates. The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that both COPS and CONS isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The ability of Methicillin - Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin - Resistant Coagulase - Negative Staphylococci (MR - CONS) isolates to produce some virulence factors were investigated and the results showed that MRSA isolates produce many enzymes and toxins that contributed in their virulence such as protease, lipase, urease, DNase and gelatinase, and also produce three types of haemolysins (alpha, beta, and delta), while MR - CONS showed the ability to produce only two enzymes (protease and urease) and three types of haemolysins. Toxic Shock Syndrome Toxin (TSST - 1) has not detected by any tested isolates. The ability to produce slime layer by MRSA and MR - CONS isolates was also investigated and the results showed that all isolates of both MRSA and MR - CONS were produced slime layer when tested by tube method but the amounts of adherent materials were different among the isolates. However, the results by Congo red agar method showed that 60% of MRSA isolates produced strong slime layer and 40% of MRSA obtained negative result, and in the case of MR - CONS all tested isolates (100%) had the ability to produce strong slime layer by this method. Similarly the ability of MRSA and Methicillin - Resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) isolates to produce biofilm by tissue culture plate (TCP) was investigated and the results indicated that both MRSA and MRSE showed highly and strong biofilm formation, and the OD value of biofilm formation ranged between 0.520 - 0.738, and the OD value obtained from MRSE isolates were higher compared to the MRSA isolates. Additionally the OD value of biofilm formation significantly increased in addition of 1% glucose to the media. The results showed that there are a possible correlation between Methicillin susceptibility and the biofilm formation in S. aureus isolates.The effect of Subinhibitory Antibiotics Concentration (sub - MIC) of two antibiotics (Vancomycin and Clindamycin) on the biofilm formation by MRSA and MRSE isolates were investigated and the results showed that both antibiotics at two subinhibitory concentration (one - half and two - half the MIC) were significantly inhibited the biofilm formation by both isolates when using of each antibiotic alone, but Vancomycin was most effective than Clindamycin. Additionally the results showed that the combination of these two antibiotics at different sub - MIC were also significantly reduced or inhibited the biofilm formation by both isolates. In comparison between the using of each antibiotics alone and the using of antibiotics combination the results showed that in the case of MRSE isolate there was no significant difference between the two treatment methods, while in the MRSA isolate there was a significant difference between the two methods. The using of each antibiotic alone (Vancomycin or Clindamycin) was most effective than the using of combination of these two antibiotics in the inhibition of biofilm formation.

انتاج الالجينت من بكتريا Azotobacter vinellandii المعزولة محليا ودراسة صفاته الفيزيوكيمياوية

اسم المؤلف: حسام صباح اوهيم
اسم المشرف: شذى سلمان حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 50 عزلة بكتيرية من 20 عينة تربة جمعت من حدائق جامعة بغداد في الجادرية ومن اماكن مختلفة من حقول الذرة في كلية الزراعة في ابو غريب, تبين ان 20 منها عائد الى جنسAzotobacter اعتمادا على الفحوصات المزرعية والمجهرية. اظهرت جميع عزلات Azotobacterمستعمرات لزجة عند زرعها على وسط الاملاح المعدنية الحاوي على السكروز. تم اختيار 10 عزلات والتي تميزت باعطاء لزوجة عالية عند نموها في الوسط لاجراء الغربلة الكمية لانتاج الالجينات وانتخبت العزلة A3 الاغزر انتاجا. وشخصت هذه العزلة باجراء الفحوصات الكيموحياتية وتبين انها احدى سلالات بلغ تركيز الالجينات المنتج من هذه العزلة 3 غم / لتر والكاربوهيدرات الكلية 3,15 غم / لتر ونسبة الالجينات في الكاربوهيدرات الكلية كانت 95,2 % . حددت الظروف المثلى لانتاج الالجينات من العزلة واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج كان وسط الحاوي على 1% سكروز وخالي من المصدرالنايتروجيني برقم هيدروجيني 6,5 وبحجم لقاح 1% وعدد خلايا ( 3 × 10 4 خلية /مل ) وعند درجة حرارة 30 م۫ ولمدة حضانة 5 ايام في حاضنة هزازة بسرعة 150 دوره في الدقيقة . درست مواصفات الالجينات المظهرية والفيزيوكيميائية المنتجة من العزلة حيث ظهر هذا المركب بعد استخلاصه وتجفيفه بلون كريمي مائل الى البني ومظهر صمغي . اما صفاته الفيزيوكيميائية فقد بينت النتائج ان المركب ذائب في الماء وغير ذائب في الايثانول والميثانول والايزوبروبانول . كانت لزوجة المركب عالية عند التركيز 1% ودرجة حرارة 35 م۫ حيث بلغت 149,94 سنتيبويز وهذه اللزوجة تقل بارتفاع درجة الحرارة وتزداد عند انخفاض الرقم الهيدروجيني حتى وصلت الى اعلى قيمة لها عند الرقم الهيدروجيني 5. كانت درجة الانصهار البدائية (onset melting point ) 190 م۫ والدرجة النهائية (clear melting point ) 205 م۫ وكان الوزن الجزيئي للالجينات 223,23 كيلودالتون. درست قابلية الالجينات على امتزاز ايونات المعادن الثقيلة ( الزنك والنحاس ) وحددت الظروف المثلى لعملية الامتزاز. اظهرت النتائج ان الالجينات لها الفه وسعة ارتباط عالية لكل من ايونات الزنك والنحاس . وان افضل امتزاز حدث بعد مرور 10 ساعات من وقت المعاملة ( اضافة 150 مل من محلول الالجينات بتركيز 1% الى 50 مل من المحلول الحاوي على ايونات الزنك او النحاس ) وكان الرقم الهيدروجيني 9 الافضل في امتزاز ايونات الزنك والنحاس من الرقم الهيدروجيني المتعادل والحامضي . | Fifty bacterial isolates were obtained from 20 soil samples collected from Baghdad University's gardens at AL - Jadiria and different places in corn field at College of Agriculture in Abu - Ghrib. Twenty of these isolates were belonged to Azotobacter depending on cultural characteristics and microscopic examination and biochemical tests .All the Azotobacter isolates revealed mucoid colonies when grown on sucrose mineral - salt agar medium. From these isolates ten isolates of higher level of mucoid growth were screened for alginate production. Azotobacter vinellandii A3 isolate revealed highest alginate production (3 gm / L ) with total carbohydrates of (3.15 gm / L ) and 95.2% alginate percent in total carbohydrate . The optimum conditions for alginate production by A. vinellandii A3 were determined; the results showed that the best production level was obtained in Emtiazis medium, containing 1% sucrose without nitrogen source, at pH 6.5, inoculum's size 1% (3.1 × 104 CFU/ml) and incubated at 30˚C for 5 days in shaking incubator at 150 rpm. , alginate concentration was 3.9(gm / L) and alginate percentage in total carbohydrate was 95.1%. Alginate of A. vinellandii A3 characterization was performed, alginate color was cream to light brown, gummy texture and soluble in water but insoluble in ethanol, methanol and isopropanol, alginate had high viscosity at a concentration of 1% solution at 35˚C which was 146.94 centipoises, the viscosity decreased with increasing temperature ,and increase with lowering pH and reached the maximum at pH 5 , the onset melting point of sodium alginate was 190 ˚C and the clear melting point was 205˚C and the molecular weight of alginate was 223.23 KD. The ability of alginate of A. vinellandii A3 to adsorb heavy metal ions(Cu+2 , Zn+2 ) was also studied, the optimum conditions for adsorption process were determined, the results showed that alginate has a high affinity and binding capacity for Cu+2 and Zn+2 ions, and the best adsorption level was occurred after 10 hrs of treatment (addition 150 ml of 1% alginate to 50 ml of solutions contain Cu +2 ions or Zn +2 ions),alkaline pH (9) was more suitable for Cu+2 and Zn+2 adsorption than neutral or acidic pH.

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا == Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

اسم المؤلف: جوان صباح باجلان
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا == A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: حسام محمود حسن العماري
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني | عدوية عبد الله السعدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: دنيا فريد سلوم
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

في نماذج عنق (HPV) التنميط الجيني للفيروسي الحليمي البشري الرحم لنساءعراقيات باستخدام تقنيتي الوقت الحقيقي - سلسلة تفاعل البلمرة والصفوف الجينية == Genotyping of Human Papillomavirus in a sample of Iraqi women with cervical abnormalities by using Real - Time PCR and Macroarray

اسم المؤلف: حلى يونس فاضل السعدي
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | فيصل غازي ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت الدراسة الحالية التحري عن العلاقة بين اصابة الفيروس الحليمي البشري (HPV) وحالات الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم في النساء العراقيات. تضمنت الدراسة 122امراة لديهن اعراض سريرية لاصابة عنق الرحم, 110 امراة منهن تميزت بنمو الخلايا غير الطبيعية لعنق الرحم او السرطانية, حيث كان 40.9 % من تلك النساء كان لديهن اصابة بالفيروس الحليمي البشري, اما 12(16.7%) امراة المتبقية تميزت بنمو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم بالرغم من وجود التهاب مزمن والتي جمعت خلال عام 2010. تضمنت مجموعة السيطرة 10 نساء والتي تميزت بغياب كل من التغيرات الخلوية, العلامات السريرية والاصابة بالفيروس الحليمي البشري. اظهرت نتائج مسحات عنق الرحم وجود نوعين من خلايا عنق الرحم غير الطبيعية هي : اصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية قليلة الخطورة (LSIL) التي شملت 70% من حالات الاصابة بالفيروس, واصابة الخلايا الطلائية الداخلية الحرشفية عالية الخطورة (HSIL) التي شملت 26% من حالات الاصابة الايجابية. بينما 4% من مجموع الاصابة الكلية تمثلت بالنساء ذو الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والالتهاب المزمن . هي الصفة المميزة للاصابة بالفيروس. تلك الصفة ترافقت مع 100% بوجودKoilocytosisالثاليل التناسلية الظاهرة للعيان و16.7% ترافقت مع الثاليل المستوية (غير الظاهرة). تشير دراسة الدنا الفيروسي باستعمال تجربتي سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي(PCR Real­Time) والصفوف الجينية(MacroArrays) التي طبقت لاول مرة في العراق الى وجود الفيروس الحليمي البشري بنسبة 35.6% في كل المجاميع المدروسة. تشير النتائج الى وجود 17 نمط جيني مختلف للفيروس الحليمي البشري بين 47 امراة مصابة باستعمال تقنية الصفوف الجينية, اربعة عشر من هذه الانماط الجينية كانت من الانماط عالية الخطر والتي شكلت 82.35% من مجموع الانماط والانماط الجينية المتبقية كانت من الانماط قليلة الخطر والتي شكلت 17.56% من مجموع الانماط. دى النتائج المهمة للدراسة الحالية تشير الى وجود 10 انماط جينية مختلفة ربما سجلت للمرة الاولى في النساء العراقيات ( 31 - , 45 - , 51 - , 52 - , 53 - , 58 - , 59 - , 66 - , 68 - , 44 - HPV ). لنمط الجيني 16 - HPV هو السائد على الانماط الجينية السبعة عشر, شكل هذا النمط مع الانماط الجينية (59 - , 39 - , 66 - , 6 - HPV) الانماط الخمس الاكثر شيوعا في العينات الموجبة. كما اظهرت الدراسة بان النساء ذوات الخلايا الطبيعية لعنق الرحم والمصابة بالفيروس تحمل الانماط الجينية 16 - HPV و59 - HPV. كما شخصت سبعة انماط جينية مختلفة في عينات الثاليل التناسلية الظاهرة وهي (16 - , 6 - , 11 - , 39 - , 59 - , 66 - , 44 - HPV ). اشارت النتائج الى ان 32 (68.09%) من بين 47 امراة مصابة كانت لديهن الانماط عالية الخطر فقط, سواء كانت الاصابة بانماط مفردة او متعددة, بينما ثمان نساء (17.2%) كان لديهن الانماط عالية وقليلة الخطر سوية, وسبع نساء (14.89%) كان لديهن الانماط قليلة الخطر فقط. استعمل المجهر الالكتروني النافذ للتحري عن الجزيئات الفيروسية في عشر عينات موجبة للدنا الفيروسي وذو تغيرات خلوية مختلفة, حيث اظهرت النتائج وجود الجزيئات الفيروسية في ست عينات بمستويات مختلفة من المرضى واربع عينات لم تظهر جزيئات فيروسية. استخدمت تجربة التحول اللمفاوي لتقييم الحالة المناعية للمصابين. حيث وجدت نسبة التحول عالية في النساء ذوات الخلايا الطبيعية في عنق الرحم والمصابة بالفيروس (اصابة كامنة), بينما انخفضت نسبة التحول اللمفاوي في النساء ذوات الخلايا غير الطبيعية في عنق الرحم . امتلكت 40% تقريبا من حالات الثاليل التناسلية معدل عالي للتحفيز التكاثري للخلايا التائية عند مقارنتها بمجموعة السيطرة. اضافة الى ذلك كان التحفيز التكاثري للخلايا التائية مستقلا احصائية عن كل من نوع الاصابة, المحتوى الفيروسي والمجاميع العمرية. استخدمت تجربة تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي للكشف عن الفيروس وكميته لثلاثة عشر نمط جيني الاكثر ترددا بين المستويات المختلفة للنمو غير الطبيعي للخلايا الطلائية لعنق الرحم في الحالات : قبل الاورام, الاورام والسيطرة الاصحاء(132 عينة). اظهرت نتائج فحص سلسلة البلمرة بان 35 حالة موجبة من 47 حالة اصابة فيروسية التي شملت 74.5% من مجموع الاصابات الكلية. بينما الحالات المتبقية (12 حالة ) التي مثلت 25.5% من مجمو الاصابات الكلية لم يكشف عنها بهذه التقنية. لذلك قدر عدد نسخ الدنا الفيروسي لاغلب الانواع الفيروسية عالية الخطرفي 33 عينة موجبة بمستويات مختلفة من التغيرات الخلوية وعينتين موجبتين ذوات خلايا طبيعية لعنق الرحم . توزع المحتوي الفيروسي ل 33 عينة اعلاه من 1×10 الى 9.4×106 نسخة /مل بمعدل (4.17×104 نسخة /مل). اما العينتين المتبقيتين كانتا خارج قيم المنحى القياسي لذا قدرت ب 5× 107 و1×109 نسخة /مل تقريبا. صنف المحتوى الفايروسي لل35 عينة اعلاه كالاتي : 46% من العينات كمحتوى فيروسي عالي, 34% كمحتوى فيروسي منخفض و20% كمحتوي فيروسي متوسط. استخدم اختبار الصفوف الجينية لفحص 68 عينة, 36 عينة منها كانت موجبة و32 عينة كانت سالبة باختبار سلسلة تفاعل البلمرة - الوقت الحقيقي. حيث وجدت الانماط الجينية عالية الخطر باستعمال هذه التقنية في (36/35) 97% من العينات الموجبة, بينما العينة المتبقية كانت سالبة لفحص الصفوف الجينية. كما وجدت الانماط الجينية قليلة الخطر وعالية الخطر المحتمل في تلك 35 عينة الموجبة والتي لم يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي فهي الانماط (6 - , 11 - , 53 - , 66 - HPV). اما فيما يخص العينات السالبة في فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي حيث فحصت باستعمال اختبار الصفوف الجينية ووجدت الانماط الجينية في 12 عينة منها, الانماط هي : (44 - , 66 - , 53 - , 11 - , 6 - , 58 - , 39 - HPV). تبين مما تقدم بان فحص الصفوف الجينية يتحرى عن 8 انماط جينية لا يكشف عنها فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي, تلك الانماط شكلت 32.84% من تردد الانماط و33.33% من الحالات الموجبة التي تمتلك عدة انماط وهذا يعكس العامل المهم الذي يفضل فحص الصفوف الجينية في التحري عن الفيروس. لذا يبدو اختبار الصفوف الجينية طريقة دقيقة واكثر حساسية لكشف وتنميط اصابات الفيروس الحليمي البشري مقارنة مع فحص تفاعل سلسلة البلمرة - الوقت الحقيقي. | The present study was conducted to investigate the relationship between Human papillomavirus (HPV) infection and cervical cytological abnormalities in Iraqi women. One hundred twenty two women were included in this study with a cervical infection. A sample of 110 women with abnormal cytology cervical dysplasia / cancer, 45 of which 40.9% had HPV infection and 12 (16.7%) women had chronic infection with normal cytology during 2010. A control group with 10 women of normal cytology and no HPV infection was included in study for comparison. Pap smear test results showed two types of cervical cytological abnormalities, low squamous intraepithelial lesion (LSIL) which comprised of 70% of HPV positive cases, and high squamous intraepithelial lesion (HSIL) which comprised of 26% of HPV positive cases. Whereas 4 % out of the total risk group was represented in women with normal cytology. Koilocytosis is pathognonomic for HPV infection. Furthermore, Koilocytosis was accompanied with 100% with genital wart presence and 16.7% was accompanied with flat wart presence. HPV - DNA studied using Real - Time PCR and MacroArray assay (GenoArray) which applied for the first time in Iraq indicates the presence of HPV - DNA in 35.6% of all tested groups. Results indicate the presence of 17 different HPV genotypes among 47 infected women by using macroarray technique. Fourteen of these HPV genotypes which comprised of 82.35% were high risk (HR - type) and 17.56% (3/17) were low risk (LR - type).One of the important results in the present study indicates the presence of ten different genotypes which may be recorded for first time in Iraqi women (HPV - 31, - 44, - 45, - 51, - 52, - 53, - 58, - 59, - 66 and - 68 types). Out of 17 genotypes HPV - 16 was the predominant one, this genotype together with genotypes 59, 6, 39 and 66 comprised of the five most common types detected in HPV positive cases. Moreover, percentage of HPV - 16, and - 59 were extended to involve women with normal cytology. Seven different genotypes - 6, - 11, 16, 59, - 39, - 66 and - 44 have been identified in genital wart specimens. Results indicated that 32 (68.09%) out of 47 infected women had HR type alone, whether single or multiple types, while eight women (17.02%) had HR types in association with LR types and seven women (14.89%) had LR type only. Transmission electron microscope (TEM) was used for viral particles detection from ten HPV DNA positive samples with different cytological changes. Results indicated the presence of viral particles in six samples with different grades of disease and four samples showed no viral particles. To evaluate the immune status of patients lymphocyte transformation assay was applied. Results indicated that transformed lymphocyte were found to be high in women with normal cytology which may have HPV as a latent infection, while they were decreased in women with abnormal cytology. Approximately 40% of genital wart cases have higher mean of proliferative T cell response when they were compared with control group. However, proliferative T cell responses were statistically independent on HPV infection type, viral load and aging group. Real - time PCR assay was employed for HPV detection and quantitation (viral load estimation) from the range of HR - HPV DNA 13 genotypes most frequently found in different grades of cervical intraepithelial neoplasia, cervical tumors and health controls from (132 samples). Results showed that out of 47 positive cases 35 cases can be detected by real - time PCR which comprised of 74.5%. Failures in detection by this technique included 12 cases which comprised of 25.5% of the positive samples. Therefore, viral DNA copies number for the most HR - HPV types in cervical samples was determined from 35 sample with low and high - grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN I, II, III and Squamous Cell Carcinoma), and with normal cytology. However, the viral load of the 33 samples spread over a wide range from 1×10 to 9.4×106 copies/ml (mean 4.17×104 copies/ml). In addition, two samples were around the standard curve values as : approximately 5×107 and 1×109 copies/ml considered. Viral load was estimated approximately 46% constituted as high viral load, 34% as low viral load and 20% as slightly high viral load. Macroarray was applied in 68 samples, 36 of which were positive and 32 were negative by the real - time PCR test. High - risk genotypes were found in 35/36 (97%) real - time PCR positive samples, whereas remaining two samples were negative for HPV DNA (false - positive) by macroarray assay. The low - risk and probable high - risk (PHR) HPV genotypes were detected in the 35 HPV - positive samples which are not detected by real - time PCR included genotypes : HPV - 6 (in three samples), - 11, - 53 and - 66 (in two samples for each). HR, PHR and LR HPV genotypes were detected by macroarray in the 11/31 HPV - negative samples in real - time PCR which comprised of genotypes : - 39, - 58, - 66, - 11, - 6 and - 44. The GenoArray (GA) is capable of detecting 21 HPV multiple genotypes, including 8 types not detecting in real - time PCR. These types represented 32.84% of HPV types frequency and 33.33% of HPV positive cases had multiple types, this may reflect the important factor potentially favoring the GA for HPV detection. Therefore, the GA genotyping assay appears to be more accurate and sensitive technique for the detection and genotyping of HPV infections than real - time PCR one.

تحضير ودراسة خواص الفصل لطور ثابت جديد لتقنية HPLC == PREPARATION AND CHARACTERIZATION OF NEW HPLC STATIONARY PHASE

اسم المؤلف: هاجر سعد نجم
اسم المشرف: شهباز احمد مكي
الموضوع العام: علوم الفيزياء
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الفيزياء
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: prepared by the reaction of congo red solution with amberlite anion exchange.SUMMaRYThe F.T.I.R elemental analyses have configured the attachment of congo red on the resin as has indicated by the physical appearance of the new resin.The resin capacities of newly prepared resin has calculated the resin capacity for the amberlite - congo red resin was found to average 7.36 meq/ gm and for the amberlite resin 3.0 meq./gm.The new stationary phase has been packed into stainless steel column. This has been done by the special technique. The chromatographic performance of the packed column was characterized the number of plate numbers, height equivalent of a theoretical plates(HETP) capacity factors, selectivity factor and peak asymmetry were measured by analyzing different analysis on the new column using different mobile phases composition and flow rates. The parameters were measured from analysis of some amino acids such as phenyl alanine, tyrosine and tryptophan. The analysis of amino acids using amberlite - congo red column has performed with an aqueous mobile phase adjusted at pH 10. The average number of plates, N was(111.09 - 284.3) . The plate height H was (0.01343) cm, capacity factor, ḱ were ranged from(3.5 - 3.76). and peak asymmetry value was1.06. The analysis of some amino acid of the some column but with a mobile phase adjusted at pH 10 with 20% aceto nitrile, the chromatographic parameters were plate’s number, N was(176.3307). plate height H was(0.128) cm, capacity factor Ќ were ranged from(2.98 - 4.65).

تخمين مسافات الاجسام باعتماد تقنية المعالجة الصورية با ستخدام المؤشرات الليزرية == Objects Distance Estimation Using Image Processing Technique Based on Laser Pointers

اسم المؤلف: هدى محمد جواد المولاوي
اسم المشرف: علي عبد داود الزكي
الموضوع العام: علوم الفيزياء
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: معالجة الصور
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ازدادت اهمية تحديد المدى وابعاد الاجسام عن بعد خلال العقود الاخيرة خصوصا" في الانظمة الروبورتية وانظمة السيطرة الصناعية. لذا توجهنا في دراستنا الحالية الى استخدام المؤشرات الليزرية مع الكاميرا الرقمية لتحديد ابعاد الاجسام ومدياتها عن بعد والعمل في هذه الدراسة ينقسم الى تحديد ابعاد الاجسام في مشهد الصورة الرقمية باستخدام مؤشرليزري، تحديد مديات الاجسام باستخدام صور البقعة الليزرية لمؤشر ليزري واحد حيث تم استخدام عمليات النمذجة لغرض استنتاج موديلات مناسبة لذلك وتحديد مديات الاجسام باستخدام صور لبقعتين ليزريتن في مشهد الصورة وذلك باستخدام عمليات نمذجة مختلفة لمعاملات مختلفة لغرض الحصول على انسب الموديلات الرياضية لتمثيل الحالات الفيزيائية لمشهد البقع الليزرية لغرض ايجاد طريقة سهلة ودقيقة لتحديد مسافات الاجسام. تم انجاز هذه الطرق من خلال بناء خمسة خوارزميات حاسوبية تعتمد على هندسية التقاط الصور للبقع الليزرية الساقطة على الاجسام البعيدة. وتم اختيار هذه الخوارزميات لمسافات الاجسام المختلفة عن الكاميرا تتراوح بين (2 7 - م). ولقد اظهرت النتائج وعمليات النمذجة التي تم تنفيذها باستخدام برنامج Table curve)) ان تقنيات تحديد ابعاد الاجسام بالاعتماد على الكاميرا ومؤشرين ليزريين المسافة بينهما معلومة ( 8سم) اعطت نتائج تمثلت في حالتين. الحالة الاولى عندما تكون قوة تكبير الكاميرا متغيرة لمسافة ثابتة عن الاجسام مقدارها (7م) حيث تم التقاط عدة صورللاجسام ومن خلال تحليل هذه الصورتم الحصول على نتائج جيدة حيث كانت الابعاد المقاسة قريبة جدا للابعاد الحقيقية. الحالة الثانية تمت بتثبيت قوة تكبير الكاميرا والمسافة عن الاجسام كانت متغيرة. اعطت الحالة الثانية نتائج افضل من الاولى.تمت عملية قياس المسافة بطريقتين، الاولى كانت باستخدام مؤشر ليزري واحد وكاميرا وهذه الطريقة تتفرع الى جزئين الجزء الاول عندما تكون قوة تكبير الكاميرا على اصغر قوة ولمسافات مختلفة ( 2 - 7م ) تتغير المسافة لكل حالة ( 1م). تم التقاط عدد من الصور ومن خلال تحليل الصور تم حساب انصاف اقطار البقعة اليزرية وعدد ( pixels) في البقعة اليزرية ومن خلالها تم الحصول على منحنيات عيارية لتخمين المسافة وقد اعطت نتائج جيدة حيث تم الحصول على معادلة قياسية لتحديد المسافة من برنامج ( table curve ) بنسبة خطا مساوية للصفر تقريبا". الجزء الثاني تمثل بحالة التكبيرللكاميرا على اكبر قوة ولمسافات مختلفة ( 2 - 7 م ) تتغير المسافة لكل حالة (1م). تم في هذا الجزء التقاط عدد من الصور ومن خلال تحليل الصور تم الحصول على نتائج جيدة وقريبة الى القياسات الحقيقية. كانت نتائج الجزء الاول افضل من الثاني لان نسبة الخطا مساوية تقريبا للصفر. الطريقة الثانية تمثلت باستخدام مؤشرين ليزريين وكاميرا وهذه الطريقة ايضا تنقسم الى قسمين الاولى عندما تكون قوة تكبير الكاميرا على اصغر قوة ولمسافات مختلفة (2 - 7م ) تتغير المسافة لكل حالة( 1م ) تم خلالها التقاط عدد من الصور وبعد تحليل الصور تم حساب انصاف اقطار البقعة اليزرية ،حساب عامل التدرج ( Scf ) ،حساب انصاف اقطار البقعة اليزرية وعدد ( pixels) في البقعة اليزرية ومن خلالها تم الحصول على منحنيات عيارية لتخمين المسافة وقد اعطت هذه الطريقة نتائج جيدة . تم الحصول على معادلة قياسية لتحديد المسافة من برنامج ( table curve ) وكانت نسبة الخطا مساوية للصفر تقريبا". الجزء الثاني تمثل بنفس الخطوات السابقة مع وضع قوة التكبير الكاميرا على اكبر قوة وهنا ابضا الجزء الاول افضل من الجزء الثاني لان نسبة الخطا تقريبا كانت صفرا" ولكن الطريقة الثانية كانت افضل من الاولى لوجود عامل التدرج فيها. | Over recent decades, the importance of determination the extent and dimensions of objects remotely has been increased especially in the regulations robot and control systems industry. So, the use of indicators laser with a digital camera have been used in the current study to determine the dimensions of objects and their distances. In this study is divided to determine the dimensions of objects in a scene of the digital image by using the laser pointer, and determine the ranges of objects using the laser photo spot for a single pointer where a modeling process for the purpose of finding the suitable models for this task has been used and finally determine the ranges of objects using the images of two laser spots in a scene of an image by using different modeling operations for different transactions for the purpose of obtaining the most suitable mathematical models to represent the physical cases of the speckle laser scene in order to find an easy and accurate way to determine the distances of objects. This has been done through the construction of five algorithms based on the engineering way to take photos of laser spots that fall on the distant object. The selected algorithms for the distances of objects from the camera are in the range (2 - 7m). Results and modeling operations that have been implemented using table curve program have shown that the techniques for the determination of objects dimensions gave the results represented in two cases depending on the camera and two laser indicators with known distance between them (8cm). The first case when the power zoom of camera is variable for a fixed distance from objects of (7m) where several photo images were taken and through the analysis of these images, good results have been obtained where the measured dimensions are very close to the real one. The second case has been performed by installing the power zoom of the camera with a variable distance from the objects. The second case gave better results than the first one.The process of measuring the distance has been done in two ways, the first is by using a single laser pointer with a camera, this method subdivided into two parts; the first part when the power zoom of the camera on a smaller power with different distances (2 - 7m) changing the distance of each case (1m). Through the analysis of images, the radii for laser spot and the number (pixels) in this spot have been calculated. So, a normative curves to guess the distance give good results where a standard equation to determine the distance from the program (table curve) with an error equal to almost zero was obtained.The second part represents the biggest power zoom of the camera with different distances (2 - 7m) changing the distance of each case (1m). In this section, number of images has been captured and through the analysis, good results were obtained which are close to the real measurements. The results of the first part are better than the second because the margin of error is nearly equal to zero. The second way represented by using two laser indicators and a camera and this way was also divided into two parts; the first when the zoom of the camera in a smaller power with different distances (2 - 7m) changing the distance of each case (1m), which capture a number of images and after the analysis process, the calculation of the radii of laser spot, the factor gradient (Scf), radii laser spot and a number (pixels) in the laser spot have been measured which were obtained standard curves to estimate the distance of this method that gives good results. A standard formula to determine the distance from the program (table curve) was obtained and the rate of error is equal to almost zero. The second part represents the same previous steps with a power zoom of the camera on its top power and the first part is better than the second one because the rate of errors was almost zero, but the second method was better than the first because of the gradient factor.
1 ... 8 9 10 11 12 ... 35