عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 155

توصيف الانزيمات الحالة للبروتينات والدهون والمنتجة من البكتريا العصوية Bacillus subtilis == Characterization of Proteases and Lipases Produced by Bacillus subtilis

اسم المؤلف: ليلى صالح عبد الحسن المعموري
اسم المشرف: عبد المجيد عبد الله السعدي | زهرة محسن علي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

التوصيف الوراثي لبعض عوامل ضراوة بكتريا E.coli المعزولة من اخماج المسالك البولية == Genotypic Characterization of someVirulence factors inE.coli isolated from UTI

اسم المؤلف: عميدة علي عطية العبيدي
اسم المشرف: وعد محمود رؤوف | كركز محمدثلج
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:

التحري وراثيا عن انتاج بعض انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية من بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Genetics Detection of Metallic and Extended spectrum Beta - Lactamase production from Klebsiella pneumoniae Isolated from different clinical sources

اسم المؤلف: نبا علي جاسم
اسم المشرف: رياض عبد الحسين دلول
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة جمع 1600 عينة سريرية من مرضى يعانون من التهابات مختلفة ، توزعت ما بين 1500 عينة ادرار و100 عينة قشع, ومن خلال نتائج الفحوصات الزرعية والفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية ، شخصت 53 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella spp تضمنت 44 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و6 عزلات تعود للنوع K.oxytoca و3 عزلات تعود للنوع K.planticola .اختبرت حساسية عزلات بكتريا K.pneumoniae لـ 15 مضادا حيويا شملت على : Aztreonam وAmpicillinو Amikacinو Ceftriaxoneو Cefotaxime وCeftazidime[ Amoxicillin / Clavulanic acidو Meropenemو Imipenemو Ciprofloxacin Kanamycin وPipracillinو Cefepimeو CarbenicillinوStreptomycin,] . تم التحري عن انتاج هذه العزلات لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية ، اذ استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وثلاث طرائق للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية ،وتم الحصول على خمس عزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وعزلة واحدة منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية وكانت العزلات المنتجة لهذه الانزيمات تحمل مقاومة عالية للمضادات الحياتية AztreonamوCeftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وCarbenicillin وPipracillin وAmpicillinبنسبة 100%. تم تحديد التركيز المثبط الادنى(MIC) Minimum Inhibition Concentration باستخدام طريقة تخفيف الاكار القياسية،وقد اظهرت العزلات قيمة MIC عالية اتجاه المضادات قيد الدراسة (Ceftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وImipenem) اذ تراوحت القيم للعزلات المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميزالواســعة الطــيف(K22,K26,K28,K29,K36) من g/mlµ(0.1 - 0.05) لمضاد Imipenem وg/mlµ (256 - 32) لمضاد وg/mlµ (1024 - 256) لمضاد Ceftriaxone وg/mlµ (1024 - 128) لمضاد Cefotaxime. اما العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية K8 فقد كانت قيمة MIC لهg/ml µ ( 64 ,512,1024, ( 512 للمضادات (Imipenem , Ceftazidime , Ceftriaxone , ( Cefotaxime على التوالي.تــمـــت دراســــة المــحتــوى البلازمـيـــدي للــعــزلات الســـتة المنتخبة (K8, K22, K26, K28, K29, K36) واظهرت نتائج الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز امتلاك العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية (K8) حزمة بلازميدية في حين تباينت العزلات الخمسة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ، اذ احتوت العزلتين K22 وK26 على ثلاث حزم بلازميدية ، بينما العزلة K36 على حزمتين بلازميدية في حين احتوت العزلتين K28 وK29 على حزمة واحدة فقط. اظهرت نتائج معاملات الدنا البلازميدي باستخدام مادتي Ethidum Bromide وSDS عدم قدرة مادة SDSعلى تحييد الحزم البلازميدية، في حين كان Ethidum Bromide محيدا كفوءا عند التركيز g/mlµ (512 - 1024 ).تم استخدام تقنية (PCR) Polymerase Chain Reaction للتحري عن امتلاك العزلات قيد الدراسة على الجينات التي تشفرالى انتاج انزيمات ESL وML وباستخدام طريقة الاستخلاص السريعة (الغليان) وطريقة المستعمرة المباشرة كقالب الدنا وباستخدام بادئات متخصصة لاستهداف الجين shv - bla والجين bla imp - 1. اظهرت العزلات المنتجة لانزيمات ESLجميعها امتلاكها للجين shv - bla وبنسبة %100 ولكن العزلة المنتجة لانزيمات IMP اعطت نتيجة سالبة، كما اظهرت طريقة الاستخلاص بواسطة الغليان كفاءة عالية كقالب للدنا، مقارنتا بطريقة المستعمرة المباشرة. | The study included (1600) clinical samples from Patients suffering From different infections distrubated between (1500) urine and (100) sputum. Morphological ، biochemical tests and use Api 20 E system were employed to diagnose bacterial species and the result showed they were (53) isolates of Klebsiella spp.included(44) K. pneumoniae. (6) K. oxytoca and (3) isolates of K. planticola. Antibiotic susceptibility for K. pneumoniae isolate was performed against 15 antibiotic using disk diffusion method. Disc approximation method was used to detect production of ESLs , and three methods used to detect production of MLs.Results indicated that 5 isolates produced ESLs and only one isolate produced MLs, they isolates which produced ESLs were have highly resistant to antibiotic (100)%to [Aztreonam, Ceftriaxone, Cefotaxime, Ceftazidime, Ampicillin, Pipracillin, Carbenicillin]. Agar dilution method was used for the determination of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for the ESLs and MLs producing isolates. The result showed high resistance to Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem and Ceftazidime. The value of MIC of isolates producing ESLs(K22,K26,K28,K29,K36) were (0.05 - 0.1) µg/ml to Imipenem antibiotic, Ceftazidime (32 - 265) µg/ml, Ceftriaxone (256 - 1024) µg/ml and Cefotaxime (128 - 1024) µg/ml, while the isolate producing ML(K8) showed MIC value (64, 512, 1024, 1024) µg/ml respectively. The plasmid content of six isolates (K 8, K 22, K 26, K 28, K 29, K 36) were studies، the result of revealed electrophorsis in agar gel that the isolate K8 have one plasmid, while isolates produce ESLs differs on plasmid content,in our side K22, K26 have three plasmid, K36 have two plasmid and K28, K29 have one plasmid. Curing was conducted by the use of SDS and ethidum bromide ، and the results showed that the isolates lost the plasmids at concentration (512 - 1024) g/mL of ethidum bromide. Polymerase chain reaction technique was performed for the detection ESLs and ML, DNA template that used for PCR reaction was prepared by using boiling method and the Direct colony method, by using SHV to detect ESL and IMP - 1 to detect MLs. The results showed that all isolates were 100% harboring blashv while blaIMP - 1 gave negative result.also the extraction by use boiling method showed high efficiency compare with direct colony method.

التوصيف المظهري والوراثي للانزيمات المحورة لمضادات الامينوكلايكوسيدية المنتجة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين == Phenotypic and genotypic characterization of aminoglycoside modifying enzymes produced by methecillin resistant Staphylococcus aureus

اسم المؤلف: شيــماء عدنان جبر العبيــــدي
اسم المشرف: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: • جمعت 150عزلة سريرية من المكورات العنقودية من مستشفيي الحبيبية والنعمان في مدينة بغداد خلال الفترة من شهر كانون الثاني وحتى شهر نيسان لعام 2011 من اصابات سريرية متنوعة. توزعت العينات ما بين 30 عزلة من الادرار, 84 من خمجات جروح و36 عزلة من مسحات الاذن . • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم, تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص الشكلية والكيموحيوية, ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة نظامي api staph وMast staph kit .لقد تم الحصول على 87 عزلة (58%) على انها Staphylococcus .aureus مقابل 63 عزلة (42%) للانواع الاخرى من هذا الجنس. • بينت نتائج الفحص المسحي المظهري الاولي لمقاومة مضاد المثسلين باستخدام طريقة الانتشاربالاكار ان هنالك 84 عزلة من اصل 87 (%96.5) قد اظهرت مقاومتها لمضاد المثسلين لتكون من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين((MRSA مقابل 3عزلات فقط (3.5%) مستجيبة للمثسلين (MSSA).• اجري اختبارفحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشارالاقراص لجميع عزلات MRSA( ,(84 واستخدم لهذا الغرض ستة مضادات حيوية تعود للمجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجوداختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري للعزلات قيد الدراسة اذا اظهرت هذه العزلات مستوى عال من المقاومة لهذه المجموعة مع نسبة وصلت الى ( 19٪ ( للستربتوميسين, 38)٪ (للاميكاسين, ( 52٪ ( للجنتاميسين ، 62٪) للكاناميسين ،و (69٪) لكل من مضادي ا لنيومايسين والتوبراميسين. • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى(MIC) لعزلات ال MRSA) (لعدد من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لعزلات ال MRSA، اذا اظهرت 16 عزلة مقاومتها للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين (16 - 1024 ميكروغرام / مل ) , و32 عزلة مقاومة للاميكاسين (64 - 128 ميكروغرام/مل ) ، و44 عزلة للجنتاميسين ( 16 - 64 ميكروغرام/مل ) و38 لو 52عزلة للكانامايسين ( 64 - 128مايكروغرام/ مل) , ، و58 للنيوميسين (16 - 1024 ميكروغرام/مل ). ان هذه النتائج تدل على انتشار صفة مقاومة مضادات المجموعة الامينوكلايكوسايدية بين عزلات المكورات العنقودية المقاومة للمثسيلين .• اعتمدت طريقتان لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهما : طريقة الغليان وطريقة المستعمرة المباشر. اظهرت النتيجة ان طريقة المستعمرة المباشرة كان افضل في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.• اختيرت خمسة وعشرون عزلة من بكتريا MRSA التي اعطت نتائج ايجابية في مجال الكشف المظهري لنمط المقاومة لمضاد المثسلين ولمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية للكشف عن الجين mecA المشفرلمقاومة المثيسلين بوساطة تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) . اظهرت نتائج احتواء جميع العزلات (100٪) على جين mecA ,وبلغ حجم القطعة المكثرة 314 زوج قاعدة بمقارنتها بدلائل الدنا الحجمية .• اجري الفحص الوراثي بتقنية ال PCR للكشف عن ثلاث جينات مشفرة للانزيمات المحورة لمضادات المجـــموعة الامــينوكلايكوسيـــدية في عــزلات ال MRSA وشـمـــلت aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa.بينت النتائج ان جين ) ′aac(6’) - Ie+aph(2’ هو الاكثر انتشارا وبنسبة 84٪ (21/25) تلاه جين ant(4’) - Iaو aph(3’) - IIIa بنسبة 76.3٪ (19/25) و44٪ (11/25) على التوالي.• بلغ معدل تواجد aac(6’) - Ie+aph(2’) مع ant(4’) - Ia, مقدار 64٪ (16 / 25) ويمثل اعلى نسبة تواجد في العزلات قيد الدراسة, فيما بلغت نسبة تواجد جيني ant(4’) - Ia وaph(3’) - IIIaمعا 40٪ (10/25) لتحل نسبة تواجد كلا من aac(6’) - Ie+aph(2’) مع aph(3’) - IIIa ثالثا وبمعدل 32٪ (8/25).اما نسبة تواجد هذه الجينات الثلاث معا فقد بلغ 28%(7/21(. • لوحظ ان هنالك ترابط بين الصفة المظهرية لمقاومة المضادرات مع الصفة الوراثية , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين aac(6’) - Ie+aph(2’) ذات مقاومة عالية لمضاد الجنتامايسين وايضا مقاومة لاغلب انواع المضادات الامينوكلايكوسيدية الاخرى.بينما كانت العزلات الحاملة للجين ant(4’) - Ia هي عزلات ذات مقاومة عالية لمضادي التوبرامايسين والنيومايسين ,ومن ناحية اخرى كانت العزلات الحاملة للجين aph(3’) - IIIa اظهرت مقاومتها العالية للمضادين الكانامايسين والاميكاسين.• في هذه الدراسة كانتالاربع وعشرين 24 عزلة الحاملة لجين mecA من اصل 25) 96%( كانت على الاقل مترابطة مع احد جينات الانزيمات المحورة AME او اثنان منها او جميعا ,ويعد هذا مؤشرا لوجود ترابط كبير بين مقاومة العزلات لمضادات الامينو كلايكوسايدية وبين مقاومتها للمثسلين في العزلات المحلية .في الوقت نفسة ظهرت ضمن النتائج عزلة MRSA واحدة اتسمت بمقاومتها المظهرية لمضادات هذه المجموعة غير انها خلت من اي جين في الفحص الوراثي مما يدل على امتلاكها نمط اخر من المقاومة تجاه هذة المجموعة . | • A total of 150 Clinical isolates of Staphylococcus species were collected from two hospitals : Al - habibia and Noaman hospitals in Baghdad city during the period from January to April 2011. Types and the numbers of these clinical samples were distributed as (30) isolates from urine, (84) isolates from wound infections and (36) isolates from ear swabs. • The isolates were initially diagnosed by culturing on MacConkey agar and blood agar followed by performing some morphological and biochemical tests . A confirmatory test as final diagnoses were done using api 20 and MAST staph kits. The results have showed that Staphylococcus aureus comprised 87(58%) isolates while other Staphylococcus species represented 63 isolates (42%) .• Results of primary screening test for methicillin resistance using disk diffusion method have revealed that 84 isolates(96.5%) were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus(MRSA), while only 3 isolates (3.5%)were methicillin sensetive Staphylococcus aureus (MSSA).• Antibiotic susceptibility test for all the 84 MRSA isolates was performed against 6 antibiotic of aminoglycosides group using disc diffusion method. The result have demonstrated clear differences in the phenotypic resistance among isolates of the current study . They showed high - level of resistance to aminoglycosides group, and the percentage of isolates reached to(19%) for streptomycin, (38% ) for amikacin ,(52% ) for gentamicin, (62%) for kanamycin and ( 69%) for each of neomycin and tobramycin . • Two fold was serial dilution agar used to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) for the MRSA isolates against aminoglycosides group. The results have showed that there were differences in the MIC values among MRSA isolates when 16 isolates were resistance streptomycin (MIC ranged 16 - 1024 µg/ ml) , 32 isolates resistance amikacin (64 - 128 µg/ ml), 44 isolates to gentamicin (16 - 64 µg/ ml) , 52 isolates to kanamycin (64 - 128µg /ml), and 58 isolates to neomycin (16 - 1024 µg/ ml). The results indicate the prevalence of aminoglycosides resistance pattern in all the MRSA isolates. • The two different methods boiling method and the direct colony method were used to prepare template DNA in order to be used in the polymerase chain reaction test. The results revealed that the direct colony methode was better in demonstrating the result as comparied with the boiling method . • Twenty five isolates which gave positive results in phenotypic detection for methicillin and aminoglycoside group resistance , were selected to detect mecA gene encoding methicillin resistance using PCR technique.The results showed that all the isolates (100%) harbored merA gene with amplified size 314 bp as compared with DAN ladder . • Genotypic detection was performed to detect three genes encoding aminoglycoside modifying enzymes in MRSA isolates. They were aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa genes.The results showed that aac(6') - Ie - aph(2") gene was the most prevalent Aminoglycoside modifying enzymes (AME) gene when the rate was 84% (21/25) of the resistant isolates followed by ant(4') - Ia and aph(3') - IIIa when the rates were 76.3% (19/25) and 44% (11/25) of these isolates respectively.• The coexistence rate of aac(6') - Ie - aph(2") with ant(4') - Ia was 68% (16/25) which it represents the most predominant rate in the isolates of the current study followed by the coexistence between of ant(4') - Ia with aph(3') - IIIa which was 40% (10/25) and the third rate for aac(6') - Ie - aph(2") with aph(3') - IIIa by 32% (8/25). The coexistence rate of the three genes in all the isolates was 28% (7/25).• The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern.The isolates harboring aac(6’) - Ie+aph(2’) gene are considered to be high resistant to gentamicin and even to all aminoglycosides ,while the isolates harboring this gene were highly resistant to tobramycin and neomycin and the isolates carrying aph(3′) - IIIa gene showed the high resistance to amikacin and kanamycin in MRSA. • In this study, the 24 isolates harboring mecA gene out of 25 ( 96%) were carried either one or more than one aminoglycoside modifying gene and this represents an indicator for high correlation between aminoglycoside and methicillin resistance in our local isolates .From the other hand the results showed that there was a MRSA isolates which confer phenotypic resistance to aminoglycoside group but it not encode for any of AME gene ,this may indicate that such isolates confer another type of resistance toward this group

دراسة جزيئية لعوامل الالتصاق في بكتريا Escherichia coli الممرضة للمسالك البولية وعلاقتها بمقاومة Fluoroquinolones == Molecular Study of Adherence Factors in Uropathogenic Escherichia coli Related to Fluoroquinolones Resistance

اسم المؤلف: شيماء خضر عباس العلاق
اسم المشرف: سوسن حسن عثمان كورجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت 150عينة ادرار من مرضى خمج المسالك البولية ومن مختلف الاعمار للفترة من تموزالى تشرين الثاني 2011 .اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات الزرعية والمجهرية والفحوصات الكيموحيوية , والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات في وقت مبكر للكشف عن الانواع بواسطة استخدام فحص Api20E .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق وجين مقاومة الفلوروكوينولونات باستخلاص الدنا البكتيري بطريقة الغليان ومن ثم اخضع الى اختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) . تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية , فضلا عن تقدير التركيز المثبط الادنى (MIC) لاربع مضادات من الفلوروكوينولونات . اظهرت النتائج ان توزيع اصابات اخماج المسالك البولية في الاناث (99(66%) بينما بلغت في الذكور 51(34%)) وسجلت اعلى نسبة من الاصابة في النساء البالغات المتزوجات 67(44.7%) .اظهرت النتائج ان بكتريا E.coli كانت الاكثر شيوعا في مرضى خمج المسالك البولية 65 عزلة (43.3%). بينت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان (100%) , اذ اظهرت نسب مختلفة من الالتصاق تراوحت بين 8 الى 63 خلية بكتيرية / خلية طلائية .اظهرت عزلات E.coli احتوائها على ثلاثة انواع من عوامل الالتصاق (CAF) وبنسب مختلفة . النوع الاول (CAFl) ووجد في 58 عزلة (89%) , النوع الثاني (CAFΠ) ووجد في 35 عزلة (54%) والثالث (CAFШ) وجد في 36 عزلة (55%) . عند اختبار حساسية العزلات تجاه 12 مضاد جرثومي , اظهرت عزلات E.coli مقاومة تامة (100%) لمضاد Augmentin(Amoxicillin/Clavulanic acid) (99%) بينما كانت اقل مقاومة للمضادات Pefloxacin , Norfloxacin, Nitrofurantoin وبنسبة(34, 35, 22)% على التوالي .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة من المقاومة المضاعفة المشتركة (42%) كانت في العزلات التي قاومت خمسة الى ثمانية مضادات . فيما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لاربعة مضادات من الفلوروكوينولونات ,فاظهرت النتائج ان هناك اختلافا واضحا في قيمتها . تم اختيار 28 عزلة E.coli من عزلاتنا المحلية بالاعتماد على درجة مقاومتها العالية للمضادات ,اظهر كشف البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) المفرد (Uniplex PCR) والمشترك (Multiplex PCR) عن وجود جينات الالتصاق الضارية والمتضمنة P (papC), type 1 fambria fimH ,adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ) حيث تم الكشف عن(22 isolates (79%),20(71%), 6(21%),4(14%)) على التوالي . تم الكشف عن جين مقاومة الكوينولونات gyrA في كل العزلات 28 (100%). في هذه الدراسة تم اعتماد gyrAبديلا عن استخدام 16s rRNA في تشخيص السلالات البكتيرية.اذ اعطت جميع العزلات حزم عند الحجم الجزيئي (518 bp) دلالة على وجود الجين باستخدام تقنية (PCR) .واخيرا .اظهرت النتائج ان عزلات E.coli الممرضة للقناة البولية (UPEC) والمقاومة للكوينولونات تبدي انخفاضا في عوامل ضراوتها عن العزلات الحساسة للكوينولونات ,اظهرت نتائجنا اعلى نسبة لعوامل الضراوة في العزلات التي قاومت ثمانية مضادات اعطت نسبة 18% منها تمتلك عامل الالتصاق الاول (CAFl) , 14%تمتلك (CAFΠ) و12% من هذه العزلات تمتلك (CAFШ) وذلك يشير الى ارتباط مباشر لمقاومة الكوينولونات مع انخفاض وجود جينات الضراوة (تراجع جيني).و اظهرت النتائج ايضا انه جينات الضراوة اقل انتشارا (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) في العزلات التي قاومت كل مضادات الفلوروكوينولونات .هذه العلاقة ربما تتاثر بواسطة التراجع الجيني . | One hundred fifty urine samples were collected from urinary tract infection patients from different ages during the period of July 2011 to November 2011. The bacterial diagnosis on cultural and microscopical characteristics of bacterial cell and biochemical tests. The final and accurate diagnoses of the isolates as the early mentioned species were done using the API 20E system. Molecular identification for adhesion factors and fluoroquinolone resistant gene was done by DNA extraction by boiling method, then subjected to conventional PCR .The antibiotic sensitivity test was done, also the minimum inhibitory concentration (MIC) for four Fluoroquinolone antimicrobial agents was studied. The results showed that the distribution of UTI in female were 99(66%), while in male were 51 (34%). However, the high percentages of UTI were observed within the adult married women 67(44.7%). The results showed that E.coli was the most common microorganisms in UTI patients, 65 isolates (43.3%). All the isolates showeded ability of adherence to uroepithelial cells of human's urinary tract (100%) of the isolates presented adherence that mean number of bacteria adhered to uroepithelial cells ranged from 8 to 63. E.coli isolates exhibited the presence of three types of colony adhesion factors (CAF) at different rate. Type one (CAFl) observed in 58 isolates (89%), while type two (CAFΠ) in 35 isolates (54%), and (CAFШ) in 36 isolates (55%). Sensitivity of E.coli local isolates toward 12 antimicrobial agents showed complete resistance (100%) to Augmentin (Amoxicillin/Clavulanic acid), while they were less resistance to Pefloxacin, Norfloxacin, Nitrofurantoin at (34, 35, 22)% respectively. The results showed that the highest rate of multidrug resistance (42%) was observed in isolates were able to resist 5 to 8 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentrations for four Fluoroquinolone antimicrobial agents showed an obvious different between their values.The local isolates of E. coli selection 28 isolates depending upon high degree of multi antibiotic resistance. The PCR assay (Uniplex PCR and Multiplex PCR) showed prevalence of virulent adhesion genes P (papC), type 1 fambria fim H, adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ), were detected (22 isolates (79%), 20(71%), 6(21%), 4(14%)) respectively. The quinolone resistance gene gyrA detected in all isolates 28 (100%). In the present study depended upon gyrA gene (housekeeping gene) as alternative to 16s rRNA for the identification bacterial strains. All the isolates give bands at the molecular size (518 bp) an indication of a gene by using PCR technique. Finally ,the results have shown that Fluoroquinolone resistant uropathogenic E.coli (UPEC) isolates express fewer virulence factors than Fluoroquinolone susceptible isolates .The persent results showed the highest rates of virulence factors in isolates that resisted eight antibiotics which was obtained to 18% of these isolates have(CAF l ), 14% have(CAFΠ ) and 12% of the isolates have (CAFШ). This finding suggests that fluoroquinolone could be directly associated with decreased prevalence of virulent genes (genetic back) .Also the results showed that all 4 virulent genes under the study were lower prevalent (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) in the isolates resistance for all fluoroquinolone and quinolone antimicrobial agents. that the relationship may be influenced by the genetic background.

تاثـيــر فعالية الانتيروسين المنتج من بكتريا faecium Enterococcus على بعض البكتريا المرضية المعزولة من مصادر مختلفة == Activity effect of enterocin produced from Enterococcus faecium on some pathogenic bacteria isolated from different sources

اسم المؤلف: حسام سامي عويد الشمري
اسم المشرف: خليل مصطفى خماس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تـتـناول هــذه الـــدراســة تاثـيـر الانتيـروســـين المنتــج بــواســطــة بكــتــريا E.faecium ضـــد بــعــض البكتــريا الــمـمـرضــة المـتـواجـــدة بكثرة في الحـليب ومشتقاته. فقد تم لهذا الغـرض جمع 382عينة من اطفال يعانون حالات اسهال والتهاب السبيل البولي والحليب الخام لعـزل بكتريا E.faecium وتم تشخيص العزلات بالفحوصات الكيموحيوية وتاكيد تشخيصها باستعمال منظومة فايتك 2 . فضلا عن ذلك فقـد تم جمع 50 عينة لعـزل بكتريا Listeria monocytogenes و66 عينة لعزل بكتريا Salmonella typhimurium من الحليب الخام ومشتقاته وتم تشخيصهما باتباع الفحوصات الكيموحيوية وتاكيد التشخيص باستعمال Api Listeria وApi - 20Eاضافة الى التنميط المصلي لبكتريا Salmonella typhimurium . تم تقصي انتاج الانتيروسين المنتج بواسطةE. faecium باستعمال طريقتي اقراص الاكار والانتشار في الحفر , ونقي الانتيروسين باستعمال الترسيب بسلفات الامونيوم والفصل بكحول البيوتانول , كما تم الكشف عن حساسية البكتريوسين المنتج لمجموعة واسعة من الانزيمات الحالة للبروتين والدهون وبعض الانزيمات الاخرى .فضلا عن ذلك فقد تمت دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني على البكتريوسين المنتج , وتم اختبار تراكيز مختلفة من المايتومايسين - سي لحث الانتيروسين .اختبرت الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات بكتريا اللستيريا والسالمونيلا والمكورات المعوية باستخدام طريقة كيربي - باور .يمكن تلخيص النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : كانت نسبة عـزل E. faecium 7.59)%) من مجموع 382 عينة , اما نسبـة عـزل Listeria monocytogenes 10)%) من مجموع 50 عينة , اما نـسبـة عـزل Salmonella typhimurium فقد كانت .06)6%) من مجموع 66 عينة . اظهـر الانتيروســين المنتـج بواســطة E. faecium طـيفا واسعا من التاثير ضـد البكتريا الاختبار المـوجبة والسالبة لصبغـة غــرام التي عددها 8 وبضمـنها Listeria monocytogenes وSalmonella typhimurium . اظهر الحث بالمايتومايسين - سي )بتركيزي 1.5 و2 مكغم/ مل( انتاجا عاليا للانتيروسين . ادت تنقية الانتيروسين جزئيا باستعمال الترسيب بنسبة 80 % الى اعطاء اعلى نتيجة عندما بلغت 2.225 وحدة / مكغم بروتين , اما الفصل بكحـول البيوتانول فقد اعطى محصولا وصــل الى 0.57 وحدة / مكغم بروتين . ادت معاملة الانتيروسين بالانزيمات وتلك الحالة للبروتين حساسية الانتيروسين تجاه هذه الانزيمات باستثناء انزيمات Lipase وCatalase وα - amylaseو Lysozyme . اظهـرت تجارب المعاملة بالحرارة مقاومة الانتيروسين للحرارة وحتى عند121ºC لمدة 20 دقيقة , في حين كان مدى الاس الهيدروجيني له 4 - 9 .اظهرت تجارب الحساسية للمضادات الحيوية ان Enterococcus faecium كانت حساسة الى 7 مضادات حيوية . وكانت بكتريا Listeria monocytogenes مقاومة الى 9 مضادات حيوية وبكتريا Salmonella typhimurium مقاومة الى 4 مضادات حيوية .امكن الحصول على النتائج وكما يلي : انتجت عزلات Enterococcus faecium الانتيروسين بكميات واطئه فيما امكن حثه باستعمال المادة الحاثة المايتومايسين - سي , وامكن تنقيتها جزئيا باستعمال مرسبات البروتين . اتصف الانتيروسين المنتج من هذه البكتريا بطيف واسع النطاق من التاثير ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام ولاسيما تلك التي تلوث الحليب ومشتقاته . | This study investigate the effect of bacteriocin by Enterococcus faecium against some pathogenic bacteria frequently found in milk and dairy product. Three hundred eighty two sample collected from patients and raw milk were used for isolation of E.faecium the isolates were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Vitek 2 system . In addition Listeria monocytogenes , Salmonella typhimurium were isolated from milk and dairy products these were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Api Listeria and Api - 20E system in addition to serotyping to bacteria Salmonella typhimurium . Enterocin produced by E.faecium detected using tow methods Cup agar and Well diffusion and partially - purified using ammonium sulfate precipitation and n - butanol partition , the sensitivity of the material was tested against diverse group of proteolytic , lipolytic and some other enzymes. In addition the effect of temperature as well as pH an the bacteriocin were tested . and used different concentration of Mitomycin - C to induce enterocin . Antibiotic sensitivity of Listeria and Salmonella and Enterococcus isolates were tested using Kirby - Bauer method. The results showed the followings : The isolation rate of E . faecium was (7.59%) from 382 sample , L. monocytogenes isolation rate approach (10%) from 50 sample , S.typhimurium isolation rate reached (6.06%) from 66 sample .Enterocin produce by E . faecium demonstrated a broad - spectrum effect against both gram positive and gram negative bacteria including Listeria monocytogenes and Salmonella typhimurium . Mitomycin - C induction was used to induce a high level production of Enterocin the concentration of optimum inducing agent was 1.5 - 2 mg /ml. The enterocin was partially purified eighty percent of Ammonium sulfate give the highest yield reaching 2.225 Unit /mg protein , n - butanol partition yield 0.57 Unit/mg protein. Enzymatic effect on enterocin demonstrated that proteolytic enzymes completely inactivated the bacteriocin , other enzymes including Lipases Catalase demonstrated no effect. α - amylase , Lysozyme ,The Enterocin was heat - resistance at even 121º C for 20 minute , the optimum pH was shown to be 4 - 9 .Enterococcus faecium was highly sensitive to 7 antibiotic used .and Listeria monocytogenes was highly resistance to 9 antibiotic and Salmonella typhimurium was resistance to 4 antibiotic . In results E . faecium produce enterocin at low level which was induced to high level yield using Mitomycin - C , the enterocin could be partially purified using precipitators protein, That enterocin product of this bacteria characterized a broad spectrum against positive and negative gram bacteria including contaminate milk and its products

دراسة بعض الجوانب الوبائية والمناعية للخمج بداء المقوسات في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار == Study of some epidemiological and immunological aspects of toxoplasmosis in Fallujah city - Al - Anbar province

اسم المؤلف: محمد سليم اسماعيل ثامر العيساوي
اسم المشرف: ابراهيم شعبان داوود | عبد الوهاب بديوي حسين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الكلمات الدلالية:
  • الاحياء المجهرية - الطفيليات
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة جمع عينات دم من النساء المجهضات تراوحت اعمارهن بين (16 - 45) سنة المراجعات لمستشفى الفلوجة العام لمعرفة مدى انتشار طفيلي المقوسة الكوندية Toxoplasma gondii في مدينة الفلوجة - محافظة الانبار بطريقتي تلازن اللاتكس Latex agglutination واختبار الخميرة للادمصاص المناعي (الاليزا) Enzyme linked immunosorbent assay, كذلك قياس مستوى الاضداد IgA , IgE , IgM , IgG والمتممين C4 , C3 وبعض المظاهر المناعية للخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) وبعض التاثيرات المناعية في الفئران البيض والقطط . ظهرت النتائج ان نسبة الخمج الكلية وحسب الفئات العمرية قيد الدراسة (16 - 25) , (26 - 35) , (36 - 45) سنة بطريقة تلازن اللاتكس كانت 43.75% , ( 40.90% , 46.15% , 42.11% ) وبطريقة الاليزا 32.50% (31.82% , 35.90 , 26.31% ) , ونسبة الاخماج الكلية الحادة والمزمنة بطريقة ELISA - IgG , ELISA - IgM وحسب الفئات العمرية كانت 10% (13.64% , 12.82% , 0% ) , 22.50% (18.18% , 23.08% , 26.31 ) على التوالي. قياس مستوى الاضداد IgG , IgM النوعية ضد المقوسة الكوندية وIgE الكمي بطريقة اختبار الاليزا (ELISA ) , وقياس مستوى الضد IgA الكمي والمتممين( Complements) C4 , C3 بطريقة اختبار الانتشار المناعي الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion test اظهرت ارتفاع معنوي في معدل مستوى الاضداد IgG , IgM النوعيين ضد المقوسة الكوندية وعدم وجود فروق معنوية لمعدل مستوى الاضداد IgE , IgA الكميين والمتممين C3 , C4 للنساء المخمجات مقارنة بالسيطرة. اظهر التحليل الاحصائي ان للخمج بطفيلي المقوسة الكوندية T. gondii وجود فرق معنوي على زيادة نشاط الخلايا متعددة اشكال النوى العدلة (PMNs) في بلعمة خميرة الكانديداCandida yeast واختزال صبغةNitroblue tetrazolium reduction وتاثيراﱟ منخفضاﱟ لمعدل عيوشية الخلايا (PMNs ) وهجرة طبيعية للخلايا PMNs)) المعزولة من النساء المخمجات ولكل الفئات العمرية مقارنة بالسيطرة. اظهرت النتائج ان حقن اكياس البيض المضعفة بالاشعة فوق البنفسجية Ultraviolet والمكسرة Ultra - Sonication اعطت تفاعلات واضحة عند اجراء اختبار فرط الحساسية المتاخرDelayed Type Hypersensitivity اذ بلغ اعلى معدل سمك القدم (2.32 , 2.79) ملم وقطر المنطقة المتهيجة (7.79 , 8.78) ملم بعد (24) ساعة في الفئران المحقونة على التوالي ، ان تمنيع الفئران بمحلول اكياس البيض المضعفة واعطائها جرعة تحدي تاثير على انخفاض معامل الكبد والطحال مقارنة بالسيطرة ، وان حقن مستضدات الطفيلي ( اكياس البيض المضعفة ) في الفئران ثم اعطائها للقطط اخر وقلل نسبة اكياس البيض المطروحة من قبل القطط وبلغت نسبة الوقاية الكلية 22.29% مقارنة بالسيطرة الموجبة. | The study included collection of blood samples from aborted women, aged between 16 - 54 years attended the general Fallujah Hospital for the prevalence of the infection with Toxoplasma gondii in Fallujah city - AL - Anbar province by two methods : latex agglutination , Enzyme linked immunosorbent assay , measurement of antibodies concentration of IgM, IgG, IgE, IgA, Complements C3, C4, and some immunological features of cells and some immunological effect in white mice and cats. The results showed that the percentage of total infection and according to age groups in the study (16 - 25), (26 - 35), (36 - 45) by LAT were 43.75% , 40.90% , 46.15% 42.11% respectively and with ELISA test 32.50% , 31.82% , 35.90% , 32.50% respectively , the percentage of total acute infection by ELISA - IgM in accordance with age groups were 10% , 13.64% , 12.82% , 0% whereas total , chronic infection by ELISA - IgG were 22.50% , 18.18% , 23.08% , 26.31% respectively. The measurement of antibodies levels of IgG, IgM, IgE by ELISA, IgA and complements C3, C4 by single radial immunodiffusion showed a significant increase in the average antibodies levels of specific IgM, IgG against T. gondii whereas no significant increase in the average antibody level of IgE, IgA and complement C3 , C4 in the infection women in comparison to control. The infection with T. gondii showed significant difference in the activity of Polymorphonuclear neutrophils (PMNs) in the phagocytosis of candida yeast and reduction of Nitroblue tetrazolium, whereas little effect on viability of PMNs and natural migration of neutrophils isolated from infection women of all age groups in comparison to control. The results of the immunological effects of inoculation of Oocysts attenuated by ultra - violet rays or ultra - sonication into white mice showed, the clear reaction in delayed type hypersensitivity test, the average of highest thickness of mice - foot were 2.79, 2.32 mm. and diameter of the inflamed regions were 8.78, 7.79 mm. 24h. after inoculation, the immunization of mice with attenuated oocysts followed by a challenge dose reshowed a decrease in the factor of liver and spleen in comparison to control. Cats fed mice that fedded by which was inoculated by Oocysts attenuated by ultra - violet rays showed a delay and a decrease in the Oocysts discharge in the feces by 22.29% in comparison to control.

عزل وتشخيص بعض انواع الجراثيم المحللة للمركبات الهيدروكاربونية من ترب محافظة نينوى == Isolation and Identification of some Hydrocarbon Degrading Bacteria from Soil in Nenavha Governorate

اسم المؤلف: ايمان محمد طاهر عزيز
اسم المشرف: اديبة يونس شريف حمو النعمان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة الموصل
اللغة: العربية
مكان الجامعة: الموصل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة جمع (100) عينة تربة من مناطق مختلفة من محافظة نينوى والاقضية التابعة لها بعضها مناطق ملوثة كمصفى الكسك وقرية العلولية وقرية البوير ومنطقة الشيخان بهدف عزل وتشخيص الانواع الجرثومية للتربة ودراسة قابلية بعض الجراثيم المعزولة على تحليل النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام. اظهرت نتائج العزل الحصول على 137 عزلة جرثومية من الانواع الموجبة والسالبة لصبغة كرام. وبنسبة 74.45% للانواع الموجبة لصبغة كرام و25.55% للانواع السالبة لصبغة كرام، شكل الجنس Bacillus نسبة 69.6% من الجراثيم الموجبة لصبغة كرام وان اكثر الانواع عزلا كان النوع B.circulans وبنسبة 26.47% من مجموع الجراثيم الموجبة وشكلت Proteus mirabilis اكثر الانواع عزلا من الجراثيم السالبة لصبغة كرام وبنسبة 28.57% من مجموع الجراثيم السالبة لصبغة كرام. وعند التحري عن قابلية عدد من انواع الجراثيم المعزولة من الترب المحلية لتحليل المركبات الهيدروكاربونية والتي شملت انواع من جنس Bacillus وهي B.cereus وB.subtilis وB.mycoides وB.megaterium وB.circulans، وانواع من جنس Micrococcus وهي M.roseus وM.luteus وM.varians وذلك باستخدام وسط الاملاح المعدنية الحاوي على المصادر الهيدروكاربونية وبنسبة 1%. اظهرت نتائج الدراسة زيادة في معدلات نمو معظم عزلات M.roseus وM.luteus وM.varians اذ كانت معدل اعدادها عند بداية التجربة 109×42 و109×31 و109×24 و107×25 و109×30.4 و109×25.3 للنوعين M.roseus وM.luteus على المصادر الهيدروكاربونية النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام على التوالي ووصلت الى 106×36 و108×36 و109×31.2 و106×30 و107×28.5 و106×22.5 لهذين النوعين من الجراثيم على التوالي وعلى المصادر الهيدروكاربونية نفسها في حين لم تتمكن احدى عزلات M.luteus من النمو في الوسط الحاوي على النفط الابيض زيت الغاز والنفط الخام واحدى عزلات M.varians وعزلتي M.roseus على النفط الابيض والنفط الخام.اما الانواع التابعة لجنس Bacillus والنامية على النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام فقد اظهر نموا جيدا وباعداد اعلى 105×30 لمعظم انواعها ما عدا B.circulans التي لم تتمكن من النمو على النفط الابيض واحدى عزلات B.megaterium وB.subtilis وB.cereus على النفط الخام وسجلت زيادة في الامتصاصية الضوئية خلال اوقات التجربة وبتناسق مع الزيادة في الاعداد الحية للبكتريا للانواع التابعة لجنس Micrococcus وBacillus النامية على النفط الابيض وزيت الغاز والنفط الخام.كما سجل انخفاض في الدالة الحامضية لجميع العزلات التي اظهرت نموا جيدا على المصادر الهيدروكاربونية المختلفة في الدراسة والتي عدت دليلا على قدرتها لتحليلها. فيما بقيت الدالة الحامضية عند 7.0 pH للعزلتين M.roseus النامية على النفط الابيض واحدى عزلات M.luteus وعزلتين لـ M.roseus واحدى عزلات M.luteus النامية على النفط الخام وكان الانخفاض في الاس الهيدروجيني قليلا اذ وصل الى 6.5 للعزلتين M.luteus وM.varians النامية على النفط الابيض والنفط الخام واحدى عزلات M.roseus النامية على زيت الغاز والنوع B.circulans النامية على النفط الابيض وB.cereus وB.subtilis وB.megaterium النامية على النفط الخام وان هذا الانخفاض ظهر في العزلات التي توقف نموها في اليوم الرابع للتجربة وعد استحلاب الوسط واختفاء الطبقة الزيتية من على سطحه دليلا على قدرة الجراثيم لاستهلاكه. اذ اظهرت معظم الانواع والعزلات المحللة استحلابا كاملا. كما تم اعتماد تقنيتي Gas - Chromatography GC وInfra - IR اذ لوحظ اختفاء اعداد كبيرة من الحزم العائدة للنفط الابيض وزيت الغاز المعامل بالعزلات الجرثومية المستخدمة في الدراسة مقارنة مع عينة النفط الابيض وزيت الغاز غير المعامل. ولوحظ كذلك اختفاء عدد من الاواصر عند استخدام تقنية IR اذ ظهرت اواصر الحامض الكاربوكسيلي والامايد والاستر في العينات المعاملة بالعزلات الجرثومية المحللة. ومن النتائج لوحظ ان الانواع المعزولة من مناطق ملوثة اظهرت قابلية جيدة لتحليل المركبات الهيدروكاربونية. | The study include the collection of 100 soil sample from Nenavah and it's vicinity, some of them were pollutant areas from Al - Kassic, Alalolia, Al - bwer Village, and Al Shikhan to isolated and identify and study the ability of some bacteria to degrade kerosene, diesel and crud oil. The results showed that the isolation of (137) bacterial isolates of both gram negative and positive bacteria, (74.45)% represent gram positive bacteria and (25.55)% were of the gram negative. Bacillus formed (69.6)% of the gram positive isolates, B.circulans was (26.47)% the most frequent isolate while Proteus mirabilis form (28.57)% of all gram negative bacteria. The ability of some isolated bacteria to degrade hydrocarbons including kerosene, diesel, crude oil was studied for Bacillus and Micrococcus which includes, B.circulans, B.cereus, B.mycoids, B.subtilis, B.megaterium, B.circulans, M.luteus, M.roseus and M.varians in mineral salts medium containing (1)% of hydrocarbon sources. The results showed an increase in the growth rates for most strain of M.roesus, M.luteus and M.varians as the mean count were 42×109, 31×109, 24×109, 25×107, 30.4×109 and 25.3×109 for M.roseus and M.luteus grown on kerosene, diesel and crude oil respectively, at the beginning and reached 36×106, 36×108, 31.2×109, 30×106, 28.5×107, 22.5×106 for mentioned species respectively on the same hydrocarbonic source at the end, whereas one strain of M.luteus didn't grow in the media containing kerosene diesel, and crude oil, and one strain of M.varians and two strain of M.roseus didn't grow in the media containing kerosene and crude oil all Bacillus species growing on kerosene, diesel and crude oil showed a good growth with colony count more than 30x105 for all strains except B.circulans which didn't grow on kerosene and of the strains of B.megaterium, B.subtilis and B. cereus which didn't grow on crude oil. An increase in photo absorption was recorded during the experimental period which were corresponding with increased viable counts of bacteria belonging to the genera of Micrococcus and Bacillus on kerosene, diesel, and crude oil. A decrease in pH was also recorded for all strain which showed a good growth on the different hydrocarbon sources used in the study which was considered as an indicator of their ability for degradation. While pH remained at (7.0) for two strains of M.roseus on kerosene one strain of M. luteus on diesel and two strains of M.roseus and one strain of M. luteus on crude oil. The decrease in pH was few as it reased (6.5) for two strains of M. luteus and M. varians growing on kerosene and crude oil one strain of M. roseus on diesel, B.circulans on kerosene and B. cereus, B. subtilis, B. megaterium on crude oil, this little decrease appeared in the strains which stopped growth at day four of the experiment Emulsification of media and disappeared of oil later of the surface was regarded as indicator for the ability of bacteria to consume hydrocarbon sources as most of hydrolytic strains showed complete emulsification.Gas chromatography (GC) and Infrared - IR techniques were used as indicators as disappearance of number of bands kerosene and diesel treated with the bacterial isolates used in the study compared with untreated sample of kerosene and diesel. And the disappearance of number of bonds was observed using IR technique, the carboxylic acid, amid and ester bonds appeared in bacterial treated sample. The bacteria isolated from polluted area have a good ability in the their hydrolytic activity.

دراسة وبائية لاميبا النسج في مدينة كركوك وعلاقته بالجذور الحرة في مصل دم المصابين == Epidemiological Study on Entamoeba Histolytica in Kirkuk City And Its Relationship With Free Radicals in Blood Serum of Infected Persons

اسم المؤلف: ليما طارق يواش لازار
اسم المشرف: شهاب احمد محمد الجبوري | محمد عبد العزيز قادر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الكلمات الدلالية:
  • الاحياء المجهرية - الطفيليات
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية فحص 600 عينة غائط للمرضى المراجعين لمستشفى الاطفال في مدينة كركوك للفترة من 1/12/2010 الى 17/7/2011 للتحري عن طفيلي Entamoeba histolytica.تم فحص عينات الغائط بطريقة المسحة المباشر باستخدام المجهر الضوئي للكشف عن الاطوار المتغذية وال | The present study includes the examination of stool sample of patients attended pediatric hospital in Kirkuk city for period from 1st of December till 17th July 2011 for detection of Entamoeba histolytica.The stool samples were examined by direct wet mount method, using light microscope for detection of trophozoites and cysts stages of parasite. The study showed that the rate of infection with E. histolytica / E. dispar was 21.67% (130 of 600). The cystic stages were dominant in infected stool samples which being 53.85% (70 of 130), while the trophozoite stage was 15.38 % (20 of 130). The epidemiological survey based on direct stool examination showed the rate of infection among females was 23.07% (60 of 260) in comparison with males 20.59% (70 of 340). The highest rate of infection was among the age group 1 - 5 years 25.5% (69 of 270). The highest rate was also in children of illiterate parents 26.1% (68 of 260). The biochemical tests were carried out to estimate serum cholesterol, triglycerides, GOT, GPT, malondialdehyde (MDA) and selenium. The study showed that the level of serum cholesterol, triglycerides, GOT, GPT, malondialdehyde increased in infected patients in comparison with healthy controls, while the study showed decreased selenium concentration in infected patients in comparison with healthy controls. The enzyme linked immunosorbent assay(ELISA) was done to estimate serum IgG level for Entamoeba histolytica, the rate of seropositivity for IgG was 21.68% (18 of 83). The rate of IgG in positive sample was 17.73% (7 of 41) while in negative sample was 26.19% (11 of 42).

دراسة بكتيريولوجية وراثية لبعض الانواع المعزولة من المصابين وغير المصابين بداء السكري == Bacteriological And Genetic Study of Some Species of Bacteria That Isolated From Patients And Healthy of Diabetes

اسم المؤلف: قناة محمود عطية سلامة الجبوري
اسم المشرف: كركز محمد ثلج الجبوري | رشيد حميد حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في مختبرات مستشفى تكريت التعليمي ومختبرات قسم علوم الحياة - كلية العلوم في جامعة تكريت للمدة من كانون الثاني 2010 لغاية كانون الثاني 2011، تضمنت جمع 534 عينة من اخماج المسالك البولية والجروح للمرضى المصابين بالنوع الاول والثاني من السكري | The study was conducted in the Laboratories of Teaching Tikrit Hospital and the laboratories of the Biology Department - College of Science - Tikrit University from January 2010 to the January 2011. In this study five hundreds thirty four samples of urine and wounds from patients with diabetes and healthy were collected from both sexes and all ages to isolation and identification of pathogenic bacteria by morphological, cultural and biochemical characteristics then determination of virulence factors and genetic variation between dominant type depending on the isolating source and the type of infection in diabetic patients. The counts of urinary tract infections and wound infection in non _diabetic patients were 118 and 52 respectively.The percentage of positive isolation of bacteria for both of them were 44, and 38.4% respectively and from the same patients with urinary tract Infections and wounds and Insulin Depended Diabetes (IDD) patients were 158 and 68 samples respectively and the percentage of bacterial isolation were at 78.5 and 67.6% respectively. The patients with Insulin Non - dependent Diabetes (INDD) were 69 and 42 samples, where positive isolates from bacteria were 75 and 71.4% respectively. The infections females from the Healthy and Diabetes Patients that (IDD) or (INDD) were larger than that of the males patients and with the same state with the wounds infections state for (IDD) patients, whereas the rate was smaller than of males for wounds infections to patients with the other diabetes infections type. The age group between 41 - 60 years was the larger percentage with all infections, except with wounds infections to (INDD) patients, while the age group between 16 - 40 years was the larger, and the infections were the largest means in the Winter and Autumn compare the other seasons.The higher rate of bacteria that isolated from patients with Urinary Tract Infections was Escherichia coli then other types like Citrobacter diversus , Proteus mirabilis, Morganella morganii, and Enterobacter aerogenes. The larger rate of bacteria in patients with diabetes and wounds Infections was Escherichia coli then Citrobacter diversus, Proteus mirabilis, Enterobacter aerogenes, Morganella morganii and Staphylococcus aureus. The rate of diabetes infections with urinary tract infections and wounds increased in winter and autumn seasons more than of summer and spring seasons, Most bacterial isolates where sensitive for chloramphenicol.Other antibiotics were highly variable in their ability to inhibit bacterial isolates.the bacterial isolates were different in their ability to produce virulence factors, the diabetes infections was the reason of increase the variation in their ability to produce that virulence factor and the bacteria that isolated from diabetes patients produced haemolysine factor and capsule.PCR technique was used to show the genetic variations for the more repeats bacterial isolates isolated from all sources infections and used the Specific Primers (KPSMT II) group II capsule, (CNF1) Cytotoxic Necrotizing factor, (CNFs) and (HLY A) haemolysine, the bands appeared after electrophoresis to represent the used Primers, one band was appeared in the sample of diabetes Patients with Urinary Tract Infections(KPSMT II) at molecular weight 270 bp, and one band appeared in the sample of diabetes with urinary tract infections for Primer (HLY A) and it is molecular weight was 177 bp. One band appeared in the sample of diabetes patients for the primer (CNF1)hg with Wound Infections and it is molecular weight 450 bp, and there is not any band in the Primer (CNFs).

عزل وتشخيص بكتريا Enterococcus faecalis من مصادر مرضية مختلفة ودراسة امراضيتها في الفئران المختبرية == Isolation And Diagnosis of Enterococcus Faecalis From Different Clinical Sources And Study of The Pathogenicity in Experimental Mice

اسم المؤلف: عباس ياسين حسن
اسم المشرف: وعد محمود رؤوف | عباس عبود فرحان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية بهدف عزل وتشخيص المكورات المعوية البرازية Enterococcus faecalis من مصادر سريرية مختلفة، وتقييم التغيرات المظهرية والافات المرضية في بعض اعضاء الفئران البيض السويسرية المصابة تجريبيا لذا تضمنت هذه الدراسة محورين رئيسين هما : الجانب ال | The present study was conducted to isolate and diagnose an Enterococcus faecalis which are isolated from different clinical sources, and evaluate the appearance changes and pathological lesions in some Swiss white mice organs which are infected experimentally, so this study deals with two main aspects : The bacteriological type : The results obtained may be summarized as follows : - The total number of (310) clinical samples were collected from Baquba Educational Hospital and Al - Batol Hospital for Maternity and Children in Baquba city from the beginning of March to the end of September (2009) with various ages and from both sexes, including (82) urine samples from patients with urinary tract infections, (46) vaginal swab from infection of female reproduction system, (45) surgical wound swabs, (38) stool sample from patients with abdominal pains and diarrhea, (32) throat swabs from tonsillitis patients, (25) middle ear swabs, (22) burn swabs, and (20) blood sample from patients with bacteremia and prosthetic valvular heart diseases. The isolates diagnose depended on the cultural and microscobial characteristics and biochemical tests, serological diagnosis according to Lancefield method and assertion diagnosis according to (API - 20 Strep) was done to find (32) isolates of Enterococcus : (28) isolates of E. faecalis (87.5%), (3) isolates of E. faecium (9.4%) and one isolate of E.gallinarum (3.1%). - The sensitivity of E. faecalis was tested against (23) different antibiotics. The isolates showed resistance of about (100%) against Aztreonam, Amikacin, Co - Trimoxazole, Cephalexin and Cefotaxime, while the isolates were sensitive about (100%) against Amoxicillin, Nitrofurantoin, Imipenem and Ampicillin, while they showed a various resistance to another antibiotics involved in this study. - The ability of the isolates for producing the Beta - lactamase enzymes was tested by the standard rapid iodometric method. The results showed the disability of these isolates for producing the Beta - lactamase enzymes. - The production ability of E. faecalis for some virulence factors was evaluated. The results showed the ability of these isolates of adherence to the uroepithelial cells of human's urinary system were (93%), and (82.1%) were bacteriocin producer, and (28.6%) were hemolysin producer, and (43%) were gelatinase producer, and (10.7%) were lipase producer, and (35.7%) were capsule producer, and (14.3%) were cytolysin producer, while none of the isolates under the study showed the ability of haemagglutination.Histopathology type : (4.6 x 106) cell / ml concentration of the bacterial suspension of E. faecalis was used orally on mice and histopathological changes were examined after (3, 5, 7, 14) days of infection, which revealed the ability of bacteria for colonization and causing pathological lesions and many histological changes in the liver, kidney, small intestine and hearts of these animals. The damage in the animal tissues of the second group (treated with Streptomycin and EFU10) was more than that in the third group (treated with Streptomycin and EFS14), and fourth group (treated with EFU10 only). Generaly, the most important histopathological changes were the necrosis in some areas, and infiltration of inflammatory cells in infected tissues. These pathological lesions cause damage and decompose of tissues with distortion of their morphologies.

دراسة وبائية تشخيصية لداء اللشمانيا مع تحديد انماط الطفيل المسبب بواسطة تقنية PCR وتمييز الانواع الناقلة من ذبابة الرمل sand fly في محافظة ديالى == Epidemio Diagnostic Study for Leishmaniasis With Determination of Parasite Strain’s By PCR Technique And Morphologically Differmates The Species of Sand Fly Vector in Diyala Governorate

اسم المؤلف: جابر عودة كاظم
اسم المشرف: توفيق ابراهيم محمد الالوسي | عبد الله حسين عبد الله الجبوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الكلمات الدلالية:
  • الاحياء المجهرية - الطفيليات
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية تسليط الضوءعلى انتشار داء اللشمانيا الجلدية والاحشائية المتسبب من قبل الطفيلي Leishmania spp في مناطق مختلفة في محافظة ديالى ودراسة الظروف البيئية المساهمة في انتشار المرض ومقارنة الفحوصات السريرية والمختبرية والمصلية المستخدمة في تش | The aims of present study to illuminate a light on visceral and cutaneous leishminiasis disease caused by leishminia Spp parasite as registered in Diyal Governorate, and study the environment condition which contributed in diffusion the disease and comparison the tests of clinical, Laboratory and serological tests which used in diagnosing with PCR technique test, the study included many steps. 1. The epidemiologically which is main to determine the rates of infection as registered in some district of Diyala province in according to the age, sex, and the month of the year so according to the environmental conditions : - 7200 samples of blood collected from many different ages persons from different districts in Diyala. (3009 males, 4011 females) are examined. The study shows a positive cases of 607 distributed among the districts including (Jalawlaa, Bani Saa'd, Baladruz, Baquba, Alodeim amd DeliAbbas) these register a highest percentage of infection in Jalawlaa sub - district about 12.8% and less percentage of infection are in Baquba about 1.3% whiel is register highest percentage of in infection were (>1 - 5) years about 13.2% and lower percentage infection (<5 - 10) years wuth rate 2.4% so the groups of ages (25 - 30) years didn't appear any infections. according to the gender the males are high from the females whom effected with this disease the number of males (432) case with rate 71, 1%. The number of infected females about 175 cases with rate 28.8%.while in the month of years were the male infection are a highest infection in January - 2012, but did not register any infection in (June and July). The environmental condition infective in prevalence the disease between the people whom resident the houses which breed the animals inside, the number of infections are 245 cases from 607 positive cases with rate 40.3%. This was the low rate 4.9% from the infected people because of rats in their hoses. which didn't kill them. 2. The comparison of diagnostic methods of clinical test, laboratory test and serological test, with the molecular methods from the direction of sensitivity and specificity, The studies results appeared the importance of clinical test subtle in case of a similar cases depend on the clinical symptoms there are a highest cases from clinical test that the children suffering from liver magle their number are 176 cases the rate 80.36%, but the lowest cases of clinical test are 59.19% whom suffered from a skin pallor and black. The laboratory tests appeared the blood picture through testing the 350cases whom suspicion in their infection with leishmaniasis, the number of whom suffering from the lower of WBC 73 with rate 34.2%, while the low cases are 6 with rate 2.82% from whom suffering from hipper ESR, but the serological test was IFAT, Dipsrtick, spotkala - azor, ELISA, KA tex LATEX. Diagnostic infection leishmaniasis a best in diagnostic disease is dipstick test it's sensitivity are 95%, but it's specificity 100% but the lowest is the test of LATEX, it's sensitivity 75% and specificity 80%.3. The Molecular methods : PCR technique test clear recently the new highest sensitivity in diagnosis when the number of the parasite are a little in the blood in the infections peoples whom choose in random way. when testing 100 samples of DNA from the infection with cutaneous and visceral leishmaniasis, the number of infected male are 73, But the number of infected females are 27 with leishmaniasis. and studying the relation between PCR diagnosis according to the sex, age, district and environment condition, so as the recognize between the species of the parasite from the sequence Nitrogen basics with number in each species, (the species are L.donovani, L.infantum, L.tropica, L.major) so recognize the vector insect sand fly Morphology by key classification (ph.alexandri, ph.papatasi Ph.sergentasi, and sqauanlpleuris).

دراسة بيئية ونوعية لمشروع تصفية ماء الكرخ في الطارمية == An Ecological And Qualitativ Study for Al - Karkh Drinking Water Plane At Al - Tarmia

اسم المؤلف: احمد توفيق احمد المشهداني
اسم المشرف: رياض عباس عبد الجبار
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: نظرا لما لمياه الشرب من اهمية كبيرة في حياة الانسان وضرورة ان تكون هذه المياه ضمن مواصفات ومعايير خاصة, فضلا عن ظهور العديد من مشاكل تلوث مياه الشرب في مختلف مدن العراق. دعت الحاجة لاجراء هذه الدراسة لبيان مدى صلاحية مياه الشرب المنتجة من مشروع تصفية ماء | Owing to the drinking water of great importance in human life and it is important to be under the specifications and standards, as well as the emergence of many of the problems of contamination of drinking water in various cities of Iraq. Needed to conduct this study to demonstrate the viability of drinking water produced from the project filter water Karkh (which is the largest project the liquidation of water in the Middle East, it is feeds many of the cities of Baghdad, on the side of Karkh) and compare the specifications of Iraq and the global standard for drinking water in order to investigate the potential weaknesses in the project and study the possibility of the development of such large projects as a first step to improving the situation of drinking water in Iraq. So were the tests, physical, chemical and biological common to drinking water in the project and divided into four main stations, namely, (station socket raw water, sedimentation basins secondary sand filters, pumps, distribution of drinking water), including nine stations secondary starting of the month of October - 2010 to July - 2011.The results showed high values of turbidity, and electrical condactivety and pH, and dissolved oxygen, and biological dimond of oxygen, and alkalinity, and total hardness, calcium hardness, magnesium hardness, chloride, phosphate, nitrite, silica, fluoride, sodium, potassium, and heavy metals, namely, (iron, copper and cadmium, nickel, lead, chromium and zinc), and the total numbers of bacteria, and total coliform bacteria, the fecal coliform bacteria and E. Coli in drinking water for most of the stations in the Alsta spring and low concentrations in summer and autumn.Values for water temperatures between (4 - 37.5) c, as recorded differences significant between the months of winter and spring, summer and autumn, and the values of brownish discharge ranged between (250 - 0.3) NTU as it showed the differences of the moral high values of turbidity in the winter and fall in the summer and fall in each stage of the treatmant with it, and the values of electrical conductivity was between (520 - 895) Micro Siemens / cm 3. The water Alnehrualcherb in the project was registered as a weak base pH values between (9.7 to 1.7), and it was well ventilated, as the oxygen values were high in the winter months registered clear monthly variation ranging between (5.14 - 2.3) mg / L, either values biologicaldimond of oxygen were values between (4.4 - ND) mg / L and found that basal total stations ranged from every stage of the liquidation potential in increasing concentrations of dissolved oxygen, between (160 - 100) mg / L, and found that drinking water hardness too, as that the values of total hardness ranged between ( - 215 335) mg / L as suited their values directly proportional to both the calcium and magnesium hardness ranging between (197 - 139) and (31.472 - 16.128) mg / L, respectively, while for the values of the chloride ranged between (69 - 25) mg / l, while the fluoride has recorded values ranged between (15 - 0.05) mg / L, with values ranging between sulfate (169.2 - 90) mg / L, free chlorine residual values ranged between (4.18 - 1.1) mg / L, and materials for suspended solids ranged values between (84 - ND) mg / L proven contribution stages of liquidation, all in the rates of removal of different, either TDS fluctuated values between (545 - 315) mg / L, with log Aluminum values ranged between (0.98 - 0.01) mg / L, but for the potassium values ranged between (3.2 - 2.15) mg / L, and sodium values ranging between (6.31 to 3.21) mg / liter.As for the concentrations of heavy metals did not detect any significant concentration of heavy metals measured except for iron ranging between concentrations (9.2 to 8.1) mg / L, so after the industrial plants that contain the droppings of these metals. The nutrient values were recorded between nitrite (0.024 - 0.001) mg / Trosgelt nitrate values between (1.7 - 0.16) mg / l, recorded between ammonia (0.54 - ND) mg / L, placed at either phosphate values ranged between (0.26 - ND) mg phosphorus atom - phosphate / L, while for the values of silica fluctuated between values (5.12 to 5.1) mg atom of silicon - silica / liter. As for the study of signs bacteriological ranged the total numbers of bacteria in air through (24) hours between (555 - 0) × 10 cells / 1 ml, and ranged in numbers for a period of (48) hours between (1186 - 0) 10 × cells / 1 ml, while for the numbers of total coliform bacteria fluctuated between (1700 - 0) cells / 100 liters, and fecal coliform bacteria, they ranged (1100 - 0) cells / 100 ml, and the E.coli bacteria, the numbers fluctuated between (1100 - 0) cells / 100 ml. For to match the drinking waterproduced from the projects liquefaction research found matching the values and concentrations of brownish, and connectivity electrical and pH, and dissolved oxygen, and the requirement is vital for oxygen, and basic college, and chloride, and ten college, and magnesium, nitrite, phosphate, and the total numbers of bacteria, and the numbers of total coliform bacteria, and fecal coliform bacteria and E Coli, and silica with the standard specifications for drinking water the Iraqi and global at all stations.While the study results show non - conformity of calcium concentrations in this study with the standard specifications for drinking water of Iraq and the world.

تقييم فعالية مستخلصات مستنبت القمح Triticum aestivum في بعض الانواع البكتيرية المسببة لاخماج مختلفة == Evaluation The Activity of Germinated Wheat Extractions Triticum Aestivum on Some Bacterial Species That Cause Different Infections

اسم المؤلف: اسماء عيسى محمود
اسم المشرف: رشيد حميد حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: The study had included isolation and diagnosis of three hundred samples for both sexes their ages were between (1 - 60) years of the inpatients and outpatients in Tikrit Teaching Hospital and General Samarraa Hospital during the period from 1/9 / 2011 to 1/3/2012. The infections were distributed among the burns infections, the wounds, urinary tract infections (UTI) and female genital tract infections (High vagina). This study clarified that (192) sample from the total samples showed bacterial growth in percentage 64%. The results of this study indicated to the proportion 58% with (UTI) by (87) bacterial isolation were produced from (150) isolation. The percentage of burns infections were 81.81% from (55) sample which distributed among the first, second and third class burns. The burns of second and third class gave bacterial growth in a proportion 100% while the first class burns gave 64.28%. Concerning the wounds infections, bacterial growth was 62.9% from (62) sample. The infections proportion of (H.V) was 63.63% from (33) sample. The results of the current study showed that the infections in females were higher that in males with respect to (UTI), while there was not considered difference between the males and females about the burns and wounds infections. Differently, the (H.V) infections were just for the females in the ages between (18 - 45). It was clear according to the results of diagnosis that Escherichia coli had the highest proportion of isolations 25.52% from the total isolates followed by Staphylococcus aureus 18.23% Pseudomonas aeruginosa 15.63%, both Klebsiella pneumoniae and Proteus miribilis 10.42% Staphylococcus epidermidis 4.69% Citrobacter freundii 4.17%, Staphylococcus saprophyticus 3.64% both Serratia marcescens and Enterococcus faecalis 2.6%, Streptococcus pyogenes 1.56% and Staphylococcus intermedius had the least percentage 0.5% by one from (192) isolate. The sensitivity of these isolates was tested by (10) antibiotic which included quinolones, aminoglycosides, beta - lactams and tetracyclines antibiotics. Among these antibiotics imipenem and ciprofloxacin were more effective, while the other antibiotics were different either active or not active at all.The wheat germinating was used in this study with the ages (36 - 48) hour and its activity was tested by using some bacterial kinds. After completing several quantitative and qualitative tests on this germinating, the carbohydrates proportion was between 67 - 70%, the protein proportion by folin method was between 10 - 8%, the lipids proportion was 1.5%.Some mineral elements in germinated wheat were estimated which include Calcium, Iron, Magnesium, Potassium, Copper, Manganese, Zinc, Selenium, and Sodium element, active materials were also estimated in the wheat germinating extracts which had inhibitory effect on the microbiology. It was clear by the tests that the germinating contains a lot of Phenolic compounds, Terpeniods, glycosides and steroids. These materials were extracted by using some extracts included the cold water extracts and hot water extracts, alcoholic extracts (ethanol and methanol) and phenolic extract. All the extracts prepared in concentrations (25, 50, 100, 200) mg/ ml. This study showed that the phenolic extract had high effect on the bacterial kinds in comparison with the methanolic and ethanolic extracts at (200) mg/ ml concentration while the cold water extract had less effect on these bacterial isolates in comparison with the above extracts, finally the hot water extract had no inhibitory effect against any isolated bacterial type with all the concentrations. The inhibitory action of these extracts was compared with some antibiotics as a control sample. These antibiotics represents different groups of antibiotics and which contained Imipenem, Ciprofloxacin, Gentamicin, Ceftazidime in addition to Augmentin.In this study the minimum inhibitory concentration (MIC) of the fenolic, alcoholic and watery extracts was determined and the concentration was different according to the extract type, the bacterial type and the isolation site.

تحديد تجمعات Giardia lamblia ومعقد Entamoeba histolytica / Entamoeba dispar بالتشخيص الجزيئي (PCR) للمصابين في تكريت == Determination of Giardia Lamblia Assemblages And Entamoeba Histolytica / Entamoeba Dispar Complex By Molecular Diagnosis (Pcr) in Patient in Tikrit

اسم المؤلف: انتصار غانم عبد الوهاب الصميدعي
اسم المشرف: شهاب احمد محمد الجبوري | عقيل حسين العاصي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الكلمات الدلالية:
  • الاحياء المجهرية - الطفيليات
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للمدة من كانون الثاني 2011 ولغاية كانون الاول 2011 للمرضى الراقدين والمراجعين لمستشفى تكريت التعليمي وبعض المختبرات الخاصة في مركز المدينة وضواحيها والذين يعانون اعراض مرضية مختلفه ولفئات عمرية مختلفة ترواحت بين اقل من سنة الى 61 سنة، ح | This study was conducted for the period started from January 2011 until December 2011 on inpatients and outpatients of Tikrit educational hospital and some private laboratories at Tikrit city and surrounded suburbs. Symptoms of different diseases among various age groups varies between less than one year to 61 years. The tests used the (ELISA & PCR) and the analysis of the PCR - RFLP to discriminate the infection by assemblage of Giardia lamblia and differentiate between pathogenic amoeba Entamoeba histolytica and nonpathogenic Entamoeba dispar compared with microscopical examination. The result of present study showed that (75) person who represent (37.5%) were infected by Giardia lamblia and (75) person who represent (37.5%) were infected by E.histolytica/E.dispare complex, out of (200) stool samples which have been tested by microscopical examination. Epidemiological study showed no significant difference among the sex for the two species parasites whereas a high percentage for infection recorded in group at age (1? - 10) year for Giardia lamblia and E.histolytica / E.dispar complex reach to (60%, 36%) respectively. Regarding the place of living Giardia lamblia in rural area showed infection rate of (19.5 %), while infection rate by E.histolytica/E.dispar complex reaches (22.5%) in urban area. Statistical analysis shows a high difference of significance according the source of water supply. Tap water showed high incidence for initiating infection which reaches to (93.3%) by G.lamblia and (90%) for E.histolytica/E.dispar complex. For the infection rates and their relationship to the educational level, the results show that the highest rates of infection recorded in non - educated (52%) and (73.3%) of Giardia lamblia and E.histolytica / E.dispar complex, respectively. Depending on the sample texture, the result show that oily diarrhea is more correlate with infection reaches to (33.3%) of Giardia lamblia and the watery diarrhea form 40% by E.histolytica / E.dispar complex, while simultaneous occurrence of both symptom (colic and loss of appetite) are the most symptom synchronized with infection records (44%) for Giardia lamblia and (36%) for E.histolytica / E.dispar complex. The percentage of infection by Giardia Lamblia in this study depends on the test results of the ELISA was (20%), while the percentage of infection E.histolytica/E.dispar complex was (6.7%). Testing has shown sensitivity compared to microscopic examination reaches to (22.6%) and (8%) for both parasite respectively, while the test showed a high specificity which reaches the rate (93.3%) and (100%) for both parasites respectively. Result of PCR showed a percentage of infection by E.dispar about (32%) (64 sample) from the total samples, whereas it does register any cases infection by E.histolytica. By counting the results of the PCR for the three genes (ssu rRNA + TPIA + GDH) they show a total infection by Giardia lamblia which was (10.5%) (21 samples). This study recorded percentage of infection Giardia lamblia depending on the result of the three Genes separately amounted to (4%), (5%), (3%) for (ssu rRNA, TPIA, GDH) respectively. According to the result of the analysis PCR - RFLP for GDH gene by using the enzyme NIaIV, it did not record any infection by Giardia lamblia (assemblage A), whereas (6 samples) recorded (100) by Giardia lamblia (assemblage B), by using the enzyme Rsal to determine the secondary assemblage shows that the total (6 samples) infected there are 5 samples carrying infection by two type of secondary assemblage returning to the assemblage B (assemblage BIII +BIV) and only one sample infected with (assemblage BIV). To determine the assemblage and secondary assemblage for the parasite result compared with amplification of TPIA gene with lysis by enzyme for the resulting amplification for GDH gene, resulting a ratio of (14.3%) for a sample infection by both assemblage (A+B) and secondary assemblage (BIII+BIV) together, and a ratio of (57.14%) infection by assemblage A only and (21.4%) infection by secondary assemblage (BIII+BIV) together and (7.14%) infection by BIV only.

دراسة بكتريولوجية لبيئة بعض كهوف شمال العراق والتحري عن الدور الجرثومي فيها == A Bacteriological Study on Some North Iraqi Caves Environment And Detection on The Bacterial Role in It

اسم المؤلف: امنة غانم عمر العاني
اسم المشرف: جهاد ذياب محل الجنابي | اميرة محمود محمد الراوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة اجراء عدد من الفحوصات البيئية والبكتريولوجية على عينات الصخور ومياه النضح البالغ عددها 100 عينة والماخوذة من بعض كهوف المنطقة الشمالية في العراق التي شملت بهيري, شرانش, خنس, بجيل وانشكي للفترة ما بين تشرين الثاني - 2010 لغاية نيسان - 2011.ت | This study was included some of ecological and bacteriological tests on rocks and dripping water samples which were included 100 samples taken from some of north region caves in Iraq including Beherii, Sharanish, Khanas, Bejeel and Inishky from the period between November - 2010 to April - 2011.The results of ecological tests which represented with cave environment temperature were ranged from (13 - 24)?C and dripping water temperature were ranged from (11 - 20)?C while the results of pH values for the same sample shows simple variation between (7 - 8) for dripping water and (6 - 9) for the rocks samples. The results of geological screening and mineralization by using X - Ray Fluorescence and X - Ray - Diffraction showed that Beherii cave was mainly composed of manganese with 102 ppm comparing with other caves. While the concentration of iron and sulfur oxides were very low for all caves. The rocks of Beherii and Khanas caves were mainly composed of Dolomite (CaMg (CO3)2), Sharanish cave was composed of Calcite (CaCO3) and Dolomite with the closed ratio, while the rocks of Bejeel and Inishky were composed mainly of Calcite. The isolated bacteria in this study were identified according to cultural and morphological characteristics and biochemical tests, while the bacillus species were identified by using Microgen Bacillus Id System. Twenty two bacterial isolates were identified from total samples. There were nine (9)identified isolates from Beherii cave with 40.9% including Arthrobacter spp., Lysobacter spp., Caulobacter spp., Bacillus freudenreichii and Bacillus subtilis in with 4.5% for each isolate, while there was 18.1% of Methanogenic bacteria with its four genuses including Methanobacterium spp., Methanobrevibacter spp. Methanospirillium spp. and Methanosata spp. In Sharanish cave there was one isolate of sulfur oxidizing bacteria with 4.5 % from the total isolates. Three isolates were identified from Khanas cave included Pseudomonas spp., Xanthobacter spp., Clostridium spp. with 4.5% for each isolate. In addition, it was obtained from a cave Bejeel on six isolates included Bacillus lichiniformis, Bacillus lentus and 2 isolates of Bacillus cereus group, Streptomyces spp. and Gallionella spp. with 4.5% for each isolate and Merismopedia spp., Myxococcus Xanthus, Clostridium spp. were Isolated from Inishky cave with 4.5%for each isolate. The relation between some of bacterial species were studied by detection of the lytic ability of Lysobacter spp. and Myxococcus xanthus for Arthrobacter spp.The microbial role in caves were studied by detection of the ability of some isolated bacteria in Calcium Carbonate (calcite) formation and estimatation of calcite production, Xanthobacter spp. was the highest productive bacteria which gives0.2073 gram during 14 days comparing with other bacterial species.In addition, the effect of temperature and pH on calcite formation by Bacillus freudenreichii were studied, the results showed variation on calcite shape in 20?C and 30?C while the highest value of calcite production in pH.8 was 0.1336 gram comparing with pH.9 with 0.0190 calcite gram. The study also detected the ability of some isolated bacteria to oxidize of iron, manganese and sulfur, where Streptomyces spp. Gallionella spp. and one isolate of bacillus cereus group have shown the ability of oxidize iron on leptothrix medium while Bacillus freudenreichii, Bacillus lichinformis, Bacillus lentus, one isolate of Bacillus cereus group and Streptomyces spp. have shown the ability to the oxidize of manganese on Krumbein and Altmann Agar Medium. In addition, sulfur oxidizing bacteria has shown ability to oxidize sulfur on M.S. Agar and produce sulfuric acid as a product of the oxidation process.

عزل وتشخيص بكتريا Streptomyces المنتجة للمضادات الميكروبية من ترب بعض اقضية محافظة صلاح الدين == Isolation And Identification of Antimicrobial Producing “Streptomyces” From Soils of Some Districts in Salahaddin Province

اسم المؤلف: هيام عزيز عباس البدري
اسم المشرف: عبد الكريم فتاح عمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الكلمات الدلالية:
  • الاحياء المجهرية - البكتريا
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة عزل وتشخيص انواع تابعة للجنس Streptomyces، اذ جمعت 50 عينة من ترب اقضية تابعة لمحافظة صلاح الدين. شخصت?11 نوع من بكتريا Streptomyces باستخدام الاختبارات الشكلية والمزرعية والكيموحيوية حيث ظهر كل من الانواع (Streptomyces antibioticus, Strep | The Study involved ; isolation and characterization of species related to Streptomyces. Fifty samples of soil has been taken from different districts of Salah aldden province. The isolates were identified by the morphological, biochemical tests and classified to nine species, The following species were found : (Streptomyces antibioticus, Streptomyces coelicolor , Streptomyces distalicus and Streptomyces fluvissimus ) in Tikrit district, ( Streptomyces cyaneus ) in Ballad and beiji districs, ( Streptomyces exofolicus) in Ballad and Aldor districts (Streptomyces lavendulea ) in Samarra and Aldor districts , (Streptomyces purpureus ) in Samarra and Beiji districts and (Streptomyces violaceus ) in Samarra and Tikrit districts. The sensitivity of these bacterial isolates were tested toward the following : (Azithromycin, Cefotaxime, Cephatexin, Doxycycline, Erythromycin , Gentamicin, Neomycin, Penicillin, Tobramycin and Vancomycin).All species showed high resistance to cefotaxime. But all species were sensitive to neomycin and doxycycline. The isolated species of Streptomyces were tested for their ability of antibiotic production. It was found that (Klebsiella) was sensitive to all the species except species Streptomyces coelicolor. Streptomyces coelicolor showed an effect against Proteus. While Staphylococcus aureus was sensitive to the following species (Streptomyces antibioticus, Streptomyces cyaneus and Streptomyces purpureus). The Scanning Electron Microscopy was used to study the surface of spores. The species of (Streptomyces antibioticus) was found to has warty surface while spores of ( Streptomyces coelicolor) has smooth surface.

عزل وتشخيص بعض انواع بكتريا السالمونيلا من بعض الاغذية المحلية في مدينة تكريت == Isolation And Identification of Some Species of Salmonella From Some Local Foods in Tikrit City

اسم المؤلف: شيماء جابر حميد البياتي
اسم المشرف: عبد الكريم فتاح عمر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم التحري عن بكتريا السالمونيلا في 520 عينة من الاغذية المحلية في مدينة تكريت, وجدت هذه البكتريا في 26 عينة (5%), كانت اعلى نسبة لتواجدها في عينات اللحوم المثرومة (2.5%) والتي تمثل 16.25% من العينات الكلية للحوم المثرومة المدروسة.عزلت السالمونيلا من عي | The presence of Salmonella spp. was investigated in 520 local food samples in Tikrit city, Salmonella was found in 26 samples (5%), with the highest presence in minced meat (2.5%) which was represented 16.25% of all minced meat samples. Salmonella was isolated from chicken's meat at a percentage of 3.75%, and same percentages for meat slices samples, egg cortex and chicken's blood represented 5% for each one, and isolated too from vegetables and cheese at a percentage of 2.5% for each one. No Salmonella has been detected from sweet, yoghurt and egg content. Six Salmonella species were isolated, S. typhimurium was to be the most frequent and represented 42.30% of positive samples, then S. enteritidis and S. anatum in 34.61% and 11.53% respectively, but S. agona, S. typhi and S. arizona existed in a percentage about 3.84% for each one. Also, all the isolated species showed their own serological formula. The selective medium Tetrathionate broth (TTB) was found to be superior for isolation of Salmonella than Selenite cystine broth (SCB), the former positivity was 96.2% and 88.5% respectively. For test of better selective medium for isolation, TTB was found to be more suitable for isolation of S. anatum, while SCB was better for isolation of S. arizona.All the six isolated Salmonella species showed high sensitivity to Ciprofloxacin (5?g) and moderately sensitive to Chloramphenicol (30?g), while they showed high resistance to three antibiotics Amoxicillin (30?g), Nalidixic acid (30?g) and Pipracillin (100?g). They showed resistance with different percentages to the other tested antibiotics : Ampicillin (10?g), Gentamicin (10?g), Streptomycin (10?g), Tetracycline (30?g) and Trimethoprim (25?g).

دور الدنا البكتيري في الموت الخلوي للعدلات == Role Of Bacterial DNA On Cell Death In Neutrophils

اسم المؤلف: نوافل سليم خلف الالوسي
اسم المشرف: هناء سليم یوسف | حارث جبار فهد المذخوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

عزل وتنقية وربط اضداد عديدة النسلية نوع Y من الدجاج الممنع ضد المشتضدات السطحية لفايروس التهاب الكبد الوبائي نوع B == Isolation ,Purification And Conjugation Of Polyclonal Antibodies Type Y From Immunized Hens Against Hepatitis B Surface Antigen

اسم المؤلف: نجاة مؤيد نافع
اسم المشرف: رغد السهيل | مجيد ارشيد سباح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

دراسة بكتريولوجية للملوثات البكتيرية في وحدة العناية المركزة في مدينه الناصرية == Bacteriological study of Bacterial contaminants in intensive care unit in Al-Nasiryia city.

اسم المؤلف: علي طاهر عباس
اسم المشرف: نزار ادور ناصر
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

التوصيف الجزيئي لبعض عوامل الضراوة لبكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات الاذن الوسطى == Molecular Characterization Of Some Virulence Factors Of Moraxella Catarrhalis Isolated From Otitis Media

اسم المؤلف: جمان خليل ابراهيم الصباغ
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق | صفاء صاحب الغزالي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:

دراسة بكتريا التدرن ذات المقاومة المتعددة للمضادات الحيوية (Multi Drug Resistant Tuberculosis) وواسعة المقاومة للمضادات الحيوية (Extensively Drug Resistant Tuberculosis) == Study of Multi-Drug Resistant and Extensively Drug Resistant Mycobacterium tuberculosis

اسم المؤلف: عفراء علي كاظم علي
اسم المشرف: محمد فرج شذر المرجاني | احمد اسمر منخي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

دراسة تشخيصية لبكتريا Helicobacter pylori المعزولة من المرضى المصابين بالقرح المعدية == Diagnostic study on Helicobacter pylori isolated from peptic ulcer patients

اسم المؤلف: نادية عامر صادق حسن النعيمي
اسم المشرف: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | سراب خاشع جميل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
1 2 3 4 5 ... 7