Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 3,922

دراسة كيموحيوية وجزيئية للبروتين A المنتج من العزلة المحلية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa == Biochemistry and Molecular Study of Exotoxin A from Local Isolate of Pseudomonas aeruginosa

Author name: خولة جبر خلف المحمداوي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة عزل بكتريا P.aeruginosa وتشخيصها من عينات المصادر المختلفة (سريرية وبيئية)، اذ اشتملت الدراسة على 200 عينة توزعت على 100 عينة سريرية تمثلت بعينات التهابات الجروح الحروق والمجاري البولية وحالات التهاب الاذن الوسطى، اما العينات البيئية فكانت 100 عينة، 50 منها جمعت من المياه و50 جمعت من التربة. اظهرت النتائج ان نسبة وجود بكتريا P.aeruginosa في العينات السريرية اعلى مقارنة بالعينات البيئية، اذ بلغت نسبة عزلها (70%) في العينات السريرية بينما كانت (62%) في العينات البيئية توزعت بين (51.6%) عينات المياه و(48.3%) لعينات التربة. كما تناولت الدراسة قابلية عزلات هذه البكتريا المعزولة من المصادر المختلفة على انتاج الذيفان الخارجي A وتبين من النتائج ان (90%) من العزلات السريرية و(60%) من عزلات المياه و(40%) من عزلات التربة لها القابلية على انتاج الذيفان الخارجي A، وتباينت هذه العزلات المنتجة للذيفان EXA في تفاعلها في جلد الارنب اذ اعطت العزلات السريرية (44.4%) افة مبكرة و(55.5%) افة متاخرة، اما عزلات المياه فكانت (33.3%) منها ذات افة مبكرة و(66.6%) ذات افة متاخرة في حين اعطت عزلات التربة (50%) افة مبكرة و(50%) افة متاخرة. اظهرت النتائج ان جميع عزلات P.aeruginosa منتجة لانزيم البروتيز ماعدا العزلة KH50 وقد كانت هذه العزلة منتجة للذيفان EXA واختيرت لغرض استخلاص وتنقية الذيفان EXA. استخلص الذيفان EXA من العزلة KH50 وتمت عملية تنقيته باستخدام كروموتوغرافيا عمود المبادل الايوني (DEAE - cellulose) وعمود هلام Sephacryl S - 200. بعدها تم تعيين الوزن الجزيئي للذيفان EXA بوساطة كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي باستخدام عمود Sephacryl S - 200 وقد بلغ 63.095 كيلو دالتون. كما وحددت الجرعة المميتة الوسطى LD50 للذيفان عند حقنه بتراكيز مختلفة في فجوة بريتون الفئران وكانت الجرعة المميتة الوسطى هي0.5 مايكروغرام/ملليتر/ فارة. واوضحت الدراسة النسيجية المرضية قدرة الذيفان EXA على احداث تغيرات نسيجية في الفئران البالغة بعد حقنها بـ 0.01 مايكروغرام/ملليتر من الذيفان ولمدة اربعة ايام من الحقن اذ لوحظ وجود افات نسيجية في كل من الكبد والكلى والطحال. اظهرت نتائج تجارب تحييد العزلة المحلية KH50 المنتجة للذيفان EXA باستخدام مواد التحييد Acridine orange وEthedium bromide بتركيز (1024، 256) مايكروغرام/ ملليتر على التوالي، ان الجينات المشفرة لهذا الذيفان هي كروموسومية الموقع. | This study includes the isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from two hundred samples collected from different sources (environmental and clinical sources). One hundred samples collected from clinical sources include patients with wounds, burn, urinary tract, and ear infections, while environmental source included one hundred samples from soil and water. Results indicate that the high percentage of isolation from clinical sources was (70%), while the percentage of isolation from environmental sources was (62%) distributed between (51.6%) from water samples and (48.3%) for soil. The ability of producing Exotoxin A by different isolates of P.aeruginosa was studied, (90%) of clinical isolates, (60%) of water and (40%) of soil isolates were toxin A produced. These isolates differ in their reaction on Rabbit’s skin, early hemorrhagic lesions were noticed in (44.4%) of clinical isolates while (55.5%) of isolates showed late band lesions. (33.3%) Water isolates showed early hemorrhagic lesions and (66.6%) for late band lesion. (50%) of soil isolates gave early hemorrhagic lesion and (50%) gave late band lesion. On the other hand, local isolate KH50 (protease negative) was selected for the study of exotoxin A (extraction and purification). Extraction and purification of P.aeruginosa exotoxin A were done using ion exchange chromatography, DEAE - cellulose and gel filtration with sephacryl S - 200. Molecular weight of the purified exotoxin A was measured by sephacryl S - 200 and it was around (63.095) killo dalton. LD50 of exotoxin A determination for local strain KH50 was about 0.5 g/ml/mouse. Histopathological investigations proved the ability of Exotoxin A to cause generalized infections in mice. Adult mice were injected with exotoxin A at a concentration of 0.01 g/ml. Histological sectioning of the organs was done after 4 days from injection. Examination of the liver, spleen and kidneys showed the existence of lesions and necrosis. Curing experiments showed that genetic markers responsible for exotoxin A production were carried on chromosome rather than plasmid, since cured isolates retain their ability to produce disease in rabbit skin.

التنوع والانتشار الجغرافي لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى، العراق == Diversity and geographical distribution of freshwater Gastropods in Diyala river basin , Iraq

Author name: خنساء سلمان فرمان
Supervisor name: عماد الدين عبد الهادي المختار
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم اجراء الدراسة الحالية للتعرف على التنوع الاحيائي والتباين المظهري لصنف بطنية القدم المائية في حوض نهر ديالى في العراق ولهذا الغرض تم اختيار 10 مواقع موزعة على قطاعين : القطاع الشمالي ويتمثل منطقة شمال سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة دربنديخان Dar , موقع مدينة كلار Kal , موقع رافد الوند في مدينة خانقين Wan وموقع مدينة جلولاء Jal . القطاع الجنوبي ويتمثل بجنوب سد وبحيرة حمرين ويشمل : موقع بحيرة حمرين Him, موقع ناظم الصدور Sud , موقع جدول مهروت Mah في مدينة المقداديه , موقع مشروع الخالص الاروائيKha , موقع جدول السارية Sar وموقع مدينة بعقوبة Baq . ناولت الدراسة التعرف على العوامل الفيزيائية والكيميائية والتي شملت : درجة الحرارة , الاس الهيدروجيني , تركيز الاوكسجين المذاب , التوصيلية الكهربائية , سرعة التيار , تركيز الكالسيوم , نسبة المواد العضوية ونسجة القاع لمواقع الدراسة . جمعت عينات شهرية لبطنية القواقع المائية عن طريق اسطوانة جمع العينات من المواقع للفترة من نيسان 2013 - كانون الثاني 2014 عدا الموقعين دربنديخان وكلار حيث جمعت العينات فقط خلال شهري ايلول وتشرين الاول 2013 . وتم تشخيص العينات بالاعتماد على النماذج المحفوظة في متحف التاريخ الطبيعي البريطاني . تم حساب الكثافة والوفرة النسبية والتردد لكل نوع خلال فترة الدراسة كما شملت قياس التباين المظهري للانواع المشتركة بين القطاعين . والارتباط بين العوامل البيئية والانواع وبين الانواع بالاضافة الى قياس التماثل بين الجماعات السكانية للمواقع . تراوحت قيم درجة الحرارة للمياه المسجله للمواقع خلال فترة الدراسة ( 10 - 33 )º م واظهرت النتائج عدم وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في حين سجلت ظهور فرق معنوي بين الاشهر كما تراوحت قيم الاس الهيدروجيني ( 6.6 - 8.1 ) مع انها تميل الى ان تكون قاعدية في اغلب المواقع كما اظهرت عدم تسجيل فرق معنوي بين القطاعين . ظهر من قيم الاوكسجين الذائب الذي تراوح بين ( 6.1 - 10.7) ملغم /لتر ان المواقع ذات تهوية جيده وبين التحليل الاحصائي عدم وجود فرق معنوي بين القطاعين في حين سجل وجود فرق معنوي بين القطاعين في قيم التوصيلية الكهربائية التي تراوحت بين ( 1530 - 450) مايكروسيمنز /سم , كما اظهرت النتائج وجود فرق معنوي في سرعة الجريان بين المواقع حيث تراوحت بين اعلى قيمة سجلت في موقع كلار 1.3 م/ثا الى اوطئ قيمة سجلت في الصدور والتي تقدر 0.08م/ثا الا انها لم تسجل فرق معنوي بين القطاعين في اغلب اشهر البحث . كما تضمنت الدراسة قياس بعض العوامل مختبريا منها تركيز الكالسيوم في المياه حيث سجلت تراكيز عاليه في الموقعين الوند وبعقوبه مقارنة بالمواقع الاخرى حيث بلغت 210 ملغم /لتر في حين بلغت سجلت اقل تركيز في الصدور 41 ملغم / لتر وسجلت وجود فرق معنوي بين المواقع وكذلك بين القطاعين في اغلب الاشهر , كما تراوحت نسب المادة العضوية في رواسب القاع بين ( 0.6 - 4.1) % مع تسجيل فرق معنوي بين القطاعين , تباينت نسجة القاع بين مواقع الدراسة مزيجيه طينية رمليه للمواقع دربنديخان والوند وجلولاء وعرينيه طينية في كلار ومزيجيه رملية في حمرين في حين كانت طينية في الموقعين الخالص والسارية ومزيجيه في مهروت وبعقوبه . تم خلال فترة الدراسة تشخيص 12 نوع تنتمي الى 8 عوائل وشملت : عائلة Neritidae تضمنت نوعين Theodoxus jordani وNeritina mesopotamica , عائلة Valvatidae شخص Valvata saulcyi وعائلة Viviparidae تم تشخيص Bellamya bengalensis وكما تم تشخيص الانوع Melanopsis costata , M.nodosa , M. subtingitana وM. preamorsa التي تنتمي الى عائلة Melanopsidae وMelanoides tuberculata من عائلة Thiaridae وLymanaea natalensis من عائلىة Lymnaedae وPhysa acuta من عائلة Physidae وPlanorbis gibbonsi من عائلة Planorbidae . وقد بينت النتائج ظهور Physa acuta في جميع المواقع في كما سجل الموقع Dar اعلى كثافة لمجموع الافراد والموقع Jal. اقلها في حين سجلت T.jourdani هي اكثر الانواع كثافة مقارنة مع الانواع المدروسة الاخرى . كما اظهرت النتائج ان اعلى كثافة للانواع تكون في اشهر الخريف والربيع ولكنها تنخفض في اشهر الصيف والشتاء كما اظهر تحليل الارتباط بين الانواع والعوامل البيئية بان كثافة الانواع لا تتاثر بتركيز الكالسيوم في حين هناك تباين في استجابة الانواع لبقية العوامل التي تمت دراستها تم دراسة التباين المظهري للغلاف باستخدام تقنية المقياس المظهري الهندسي . حيث اجريت المقارنة بين الانواع المشتركة بين القطاعين الشمالي والجنوبي لقياس الاختلاف في الحجم لمركزي والتماثل لحجم وشكل الغلاف للانواع المشتركة Theodoxus jordani , Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis , Physa acuta وPlanorbis gibbonsi واظهرت النتائج وجود فرق معنوي في الحجم المركزي للانواع T. jordani ، P.acuta ، M.preamorsa وLymnaea natalensis كما سجلت نتائج التماثل الشكلي وجود تباين معنوي في التماثل لحجم الغلاف للنوع P. acuta. | The present work was conducted to study the biodiversity and the shell’s morphological variation of the Freshwater Gastropods in Diyala River basin northeast Iraq. For this purpose 10 sites were selected within two sectors of the River basin. A northern sector, represented the area north of Himreen’s dam and lake, including : Darbandikhan lake site (Dar); Kalar town site (Kal); Alwand tributary site in Khanaqin (Wan); Jalula city site (Jal). The Southern sector represented the area below Himreen’s dam and lake : Himreen lake site (Him); Al Sudor regulatory Dam site (Sud); Mahroot stream site at Moqdadia city (Mah); Al Khalis irrigation canal site (Kha); Al saria stream site (Sar); and Baqubah city site (Baq). Physical and chemical properties at the study sites were measured. These included : water temperature, pH, Dissolved Oxygen Concentration, Electrical Conductivity, Current Velocity, Calcium Concentration, sediment organic matter content and bottom Sediment particle size. Gastropods samples were collected monthly by a cylinder sampler from all sites for the period April 2013 through January 2014, with a small exception regarding Darbandikhan and Kalar sites. Gastropods species identification was aided by consulting preserved material at the British Natural History Museum (NHMUK). Occurrence, population density and relative abundance of each species were calculated. The morphological variation of the gastropod shells collected from different area sectors within the River basin were also determined. Correlation between gastropod species and the environmental factors were also recorded, in addition to investigating similarities between the studied sites in environmental factors and species density. Values of water temperature ranged between (10 - 33) ºC. No significant difference between sites nor between sectors, but only between months was detected. Values of the pH ranged between (6.6 - 8.1), tending to be alkaline at most sites. These values showed significant difference between the two sectors. The dissolved oxygen values ranged between (6.1 - 10.7) mg /l indicating good oxygenation with no significant difference between sites of the two sectors. However, electrical conductivity EC values ranged between(450 - 1530) µs/cm. A significant difference was revealed between the values of the two sectors, highest value of Current velocity was recorded at Kalar (1.3 m/sec.) and the lowest value was recorded at Al Sudor(0.08 m/sec.), but these records showed no significant difference between the two sectors in most months. Calcium concentration in the water showed presence of high concentrations (210 mg/l) at sites Al wand and Baqubah. While the lowest concentration (41 mg / L) was recorded at Al sudor, but no significant difference between sites or between sectors was evident in most months.Sediment content of organic matter ranged (0.6 - 4.1)% showing significant difference between the northern and southern sectors. Bottom sediment particle size and texture varied from sandy - clay - loam at sites Darbandikhan, Al wand and Jalula, to silt - clay at Kalar, sandy - loam at Himreen, clay at Khalis and Alsaria, and loamy at Mahroot and Baqubah. A total of twelve species of gastropods belonging to eight families were identified. Family Neritidae included two species Theodoxus jordani and Neritina mesopotamica; family Valvatidae included Valvata saulcyi; family Viviparidae included Bellamya bengalensis; family Melanopsidae included Melanopsis costata, M.nodosa, M. subtingitana and M .preamorsa; family Thiaridae included Melanoides tuberculata; family Lymnaedae included Lymanaea natalensis; family Physidae included Physa acuta; and family Planorbidae included Planorbis gibbonsi. Results showed that Physa acuta was present at all sites. while Theodoxus jordani was the highest density recorded. The highest density of the total individuals was recorded at Darbandikhan and the lowest was at Jalula site. The results showed that highest density of Gastropods population was recorded in Spring and Autumn months and decline in Winter and Summer months The correlation analysis between species and environmental factors showed that population density of species was not affected by the concentration of calcium while there was evident variation in the response of species to most other environmental factor. The variation in shell morphological features was investigated using Geometric Morphometric technique. Specimens from northern and southern sectors were compared to detect differences in the centroid size, symmetry of shell shape and size for shells of the most common species : Theodoxus jordani, Melanopsis preamorsa, Lymnaea natalensis, Physa acuta and Planorbis gibbonsi. Results showed variation existed in centroid size for Teodoxus jordani ,Melanopsis preamorsa , Lymnaea natalensis and Physa acuta , but the analysis of symmetry in shell size and shape for the recorded species showed significant variance in the shell size of P.acuta only.

دراسة تصنيفية حياتية لانواع معينة من الجنس Astragalus L. من العائلة البقولية Leguminosae في العراق == Biosystematic study of certain species of the genus Astragalus L. from the family Leguminosae in Iraq

Author name: خنساء رشيد مجيد
Supervisor name: خليل ابراهيم الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الحالیة الى تصنیف انواع من الجنس Astragalus L. من خلال دراسة الصفات المظهریة والتشریحیة والكیمیائیة والوراثية والتوزيع الجغرافي والتصنيف العددي لستة قطاعات متكاملة والحاوية عشرة انواع جمعت من مقاطعات وسط وشمال وجنوب العراق، والقطاعات والانواع التي درست هي : Sec. Aulacolobus : A. guttatus Banks & Sol. ; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus Fisch. & Mey. and A. hamosus L.; Sec. Harpilobus : A. corrugatus Bertol. and A. hauarensis Boiss.; Sec. Hololeuce : A. alyssoides Lam.; Sec. Malacothrix : A. mollis M. Bieb. , A. pulchellus Boiss. and A. sarae Eig.; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis Stev. تضمنت الدراسة التعرف على الصفات المظهریة للجذور والسیقان والاوراق والنورات الزهریة والازهار والثمار والبذو، اما في الجانب التشریحي فتم دراسة التغايرات بین الانواع المدروسة على مستوى السیقان والاوراق والسويق) البشرة والقشرة، عددها وسمكها واعداد الحزم الوعائیة وترتیبها واشكالها ( والمعقدات الثغریة ونمط التعرق اذ كان من نوع Brochidodromous في جميع الانواع المدروسة، كم درست اشكال حبوب اللقاح وبینت نتائج الدراسة الحالیة ان هناك امكانیة للفصل بین الانواع المدروسة باستعمال بعض الصفات المظهریة الدقیقة لحبوب اللقاح اذ كانت حبوب اللقاح من الطراز ثلاثي الاخادید المثقبة Tricolporate في جمیع الانواع المدروسة، تضمنت الدراسة كذلك التعرف ولاول مرة باستعمال تقنیة كروموتوكرافيا الطور السائل عالي الاداء HPLC (High performance liquid chromatography) على محتوى الاوراق من الفلافونویدات لانواع الجنس المدروسة، اذ تم تشخیص ثمانية مركبات فلافونویدیة وهي : myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin مع تحديد تراكيزها، فضلا عن ذلك شملت الدراسة الجانب البیئي، وقد وزعت الانواع جغرافيا على مناطق انتشارها وفي بیئاتها المختلفة ورسمت خرائط توزیع الانواع على المقاطعات الجغرافية في المناطق الجنوبية والوسطى والشمالیة. | The present study aimed to consider the morphological, anatomical, chemical and genetic characters and geographical distripution of six sections and ten species belong to the genus Astragalus L. In the central, northern and south part of Iraq, the sections and species were : Sec. Aulacolobus : A. guttatus; Sec. Buceras : A. campylorrhynchus and A. hamosus; Sec. Harpilobus : A. corrugatus and A. hauarensis; Sec. Hololeuce : A. alyssoides; Sec. Malacothrix : A. mollis, A. pulchellus and A. sarae; Sec. Sewerzowia : A. oxyglottis. The research includes study of morphological characteristics of the roots, stems, leaves, flowers inflorescences, fruits and seeds, In addition anatomical study that consider variations between the species studied at the stem, leaves and petiole level (epidermis and cortx the thickness, the nature and arrangement of tissues and the number of vascular bundles, their arrangment and forms), epidermis stomatal complexes, venation patterns which they were Brochidodromous in all species in this study and the form of pollen grain which has been Tricolporate in all species in this study. The study also identified for the first time using a technique chromotochraph liquid phase HPLC on the content of the leaves of the flavonoids of the plants studied were diagnosed ten flavonoad compound in the leaves of the plants such as myrectin، quercetin، rahmnocitrin، isorhamnetin، kaempherol، formononetin، rutin، apigenin as well as the study included a study of the environmental side, has distributed species geographically "on areas of in environments different and mapped the distribution of species on geographical districts in the central and northern and south regions. Maps of geographical distribution were prepared for all species studied. The study shown that the species were distributed in the north, east and west area of Iraq.

دراسة اولية لتقدير فعالية مواد (نباتية ، كيمياوية ، مستضدية) في خمجية طفيلي الاكياس المائية في محاولة لاستخدامها علاجيا == Primitive study to determine material efficiency) plant , chemical , antigen ( in Echinococcus granulosus infection as an a tempt to curing application

Author name: خلود ناجي رشيد التكريتي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ندى محمد طه البشير
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Parasites
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: استهدفت هذه الدراسة علاج مرض الاكياس المائية Hydatidosis المتسبب عن الطور اليرقي للمشوكة الحبيبية Echinococcus granulosus اذ تضمنت محورين : - الاول : علاج المـــرض كـــدواء وشمـــل جانبيـــن : .1 استخــدام مســـتخلصين نباتييـــن مائييــن ( اوراق الاس Myrtus communis وبــذور الحبـــة الســـوداء Nigella sativa ) ..2 استـــخــــدام مستحضـــر كيمياوي ( عقار S2 - Complex) . فقـد درس تاثير المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في حيوية الرؤيسات الاولية Protoscolices لطفيلي E. granulosus خارج الجسم in vitro وبواقع خمسة تراكيـز لكل منهم تراوحت ما بيـن (30 ، 35 ، 40 ، 45 ، 50) ملغم/مل للمستخلصيـن النباتييـــن و(2.3 ، 3.3 ، 4.3 ، 5.3 ، 6.3) ملغم/مل للعقار ، كما درسـت فعالية وقدرة المستخلصين النباتيين المائيين والعقار في السيطرة على خمجية الطفيلي داخـل الجسـم in vivo وبواقـع تركيزين لكـل منهـم تراوحت ما بيـن } (12,6) ، (25,12) ، (0.36,0.18) { ملغم/مل من مستخلص اوراق الاس وبذور الحبة السوداء والعقار S - 2 على التوالي .الثاني : علاج المـــرض كلقاح : حيث تـم استخلاص مستضدين من الطور اليرقي للطفيلي موضوع البحث ، هما مستضد سائـل الكيـس المائـي Hydatid cyst fluid antigen ومستضـد طبقات جدار الكيـس المائـي Hydatid cyst wall layers antigen فـي محاولـة لتمنيــع الفئــران المختبرية ضد الخمج بالاكياس المائية . وتم تقييم حدة الخمج بدلالة بعض المقاييس الحياتية مثـل : معـدل عـدد وقطـر الاكياس المائيـة الثانويـة والنسبـة المئويـة لاختزالها وقياس مؤشـر تضخـم الطحال والكبـد وقياس معـدل الفعاليـة الانزيميـة لانزيمي (ADA) Adenosine deaminase و(ALP) Alkaline phosphatase كمؤشرين كيميائيين حياتيين لحالة الخمج ولفترات زمنية معينة وكذلك الفحص النسيجي للكبد والطحال والكليـة والرئـة . وقـــد اظهـرت نتائج الدراسة خارج الجسـم in vitro ان المستخلص المائـي لاوراق الاس كان الاكثر فعالية في ايقاف حيوية الرؤيسات الاولية يليه المستخلص المائي لبـذور الحبـة السـوداء ثـم العقار S - 2 عنـد استخـدام التراكيـز المختلفـة لكـل منهــم مقارنــة بحالـة السيطـرة ، فــي حيـن اظهـرت نتائج الدراسة داخل الجسم in vivo قـدرة العقار S2 - Complex فـي الحـد مـن انتشار الاكياس المائية الثانوية من خلال تثبيط اعدادها واحجامها في الكبد والاحشاء الداخليـة ، يليـه المستخلص المائي لاوراق الاس ثم المستخلص المائـي لبـذور الحبـة السـوداء من حيث القدرة التثبيطية للخمج مقارنة بمجموعة السيطرة الموجبة . اما نتائج استخدام المستضدين المستخلصين مــن الطـور اليرقـي فقـد اظهرت كفاءة مستضد سائل الكيس المائي HF في رفع القوة التمنيعية من خلال قدرة الفئران على توجيه مقاومة فعالة ضد الخمج فكانت النسبة المئوية لاختزال عدد الاكياس المائية (100)% اي انه اعطى مناعة تامـة ضد الخمج ، في حين ان مستضد طبقات جدار الكيس المائي HCL اعطى نسبة اختزال (94.37)% ، وقد جرى استخدام معدلين مناعيين لاغراض السيطرة : هما لقاح الســل البقــري (BCG) Bacilli Calmette Guerin ومادة النشا Starch ، فقـد اظهر لقاح BCG نسبة اختزال لاعداد الاكياس المائية الثانوية بلغت (53.83)% في حين اظهـرت مادة النشا نسبــة اختـزال بلغت (21.29)% قياسا لمجموعة السيطرة الموجبة . وبشكل عام فالنتائــج المستحصلــة تشيــر الــى القــدرة العالية للعقار S2 - Complex فـي تثبيـط تطـور الاكياس المائيـة الثانويـة ، كما تظهـر الفعالية الكبيـرة لمستضـد سائـل الكيـس المائي وكفاءته العالية في تحفيز مناعة تامـة ضد الخمج ، مما يوحي بامكانية استخدامها مستقبلا في الوقاية ضد مرض الاكياس المائية اذا ما تبعت هذه الدراسة بدراسات تطبيقيـة اخرى فـي مضائـف اخـرى . | This study aimed treat the Hydatidosis disease caused by larval stage of the Echinococcus granulosus. It included two axes : First : treatment of the disease using medicine which involved two aspects : A) Using water extracts of two plants (leaves of Myrtus communis,seeds of Nigella sativa).B) Using chemical substance (S2 - Complex drug) .The effect of those two extracts and the drug had been studied on the protoscolices viability for E. granulosus in vitro using five concentrations for each of them ranging between (30,35,40,45,50) mg/ml for the two plants extracts and (2.3,3.3,4.3,5.3,6.3) mg/ml for the substance . The effectiveness and ability of the two extracts and substance were studied in order to control the infection in vivo using two concentrations for each ranging between[(12,6),(25,12),(0.36,0.18)] mg/ml for the leave extracts of M. communis , seed extracts of N. sativa and the drug S - 2 receptively .Second : treatment of the disease using vaccine : Two antigens were extracted from the larval stage of the parasite under study. Those are hydatid cyst fluid antigen (antigen HF)and hydatid cyst wall layers antigen (antigen HCL) this was in an attempt to immunize laboratory mice against infection with Hydatidosis This study evaluated the infection intensity by using some biological standards as : The average number and diameter of hydatid cysts and its reduction percentage ratio ; measuring the indicator of liver and spleen hypertrophy ; measuring the average of the enzyme activity for Adenosine Deaminase (ADA) and Alkaline Phosphatase (ALP) as biochemical indicators for the infection state , during a period of time, in addition to tissue investigated for liver, spleen, kidney and lung .The conclusion of this study represented that the extract of M. communis was the most effective to stop the protoscolices viability ; followed by the extract of the N. sativa and finally the drug S - 2 when different concentrations were used for each of them compared with the control state. Whereas the results in vivo presented the ability of S2 - Complex drug to limit the distribution of hydatid cysts by inhibition their numbers and volumes in the liver and the visceral organs followed by water extracts of M.communis and water extracts of N. sativa according to the inhibition ability for infection compared to the positive control group. However the results of uses antigen extracted from the larval stage showed efficiency of antigen HF to increase immunization strength through mice capability having an active resistant against infection . The percentage of reducing the number of hydatid cysts was (100)% . It means that this antigen give absolute immunization against infection . However the antigen HCL gave a reduction ration (94.37)% . Then we used two immunomodulators as a control, They are BCG vaccine and Starch, The BCG vaccine present a reduction ratio for the hydatid cysts numbers reached (53.83)% while Starch represent a reduction ratio reached (21.29)% compared with the positive control group .Generally the results indicated to the S2 - Complex high capacity in frustrating the development of the hydatid cysts. Also it showed the large activity of antigen HF and its high capability for catalysis absolute immunity against infection. This can be used in prevention against the Hydatidosis disease if this study followed by another application studies in other fields .

دراسة بكتيرية ومصلية لمسببات ذات الرئة المكتسب من المجتمع لدى المصابين بالانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological and serological study for causes of community acquired pneumonia in COPD patients

Author name: خديجة شعبان المزوري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة (100) مريض من المصابين بالانسداد الرئوي المزمن والذين يعانون من التهاب ذات الرئة والمشخصين سريريا وشعاعيا في مستشفى بغداد التعليمي من قبل اطباء اختصاص بالاعتماد على العلامات والاعراض السريرية, الفحص الشعاعي وفحص وظائف الرئة. خلال المدة الزمنية 15/9/2001 - 15/4/2002.تم جمع (83) عينة قشع من هؤلاء المرضى, ثم تم قبول (76) عينة لانها كانت ضمن المواصفات المطلوبة والمتضمنة عدد الخلايا القيحية وعدد الخلايا الظهارية, ورفضت (7) عينات لانها لم تكن ضمن المواصفات المطلوبة.تم جمع عينات المصل من جميع المرضى لغرض الكشف عن الاستجابة النوعية للاجسام المضادة نوع IgM, كما شملت الدراسة (50) عينة دم سحبت من اشخاص اصحاء لا يعانون من اصابات تنفسية.تم زرع عينات القشع على اوساط زرعية مختلفة لغرض عزل وتشخيص البكتريا, في حين استخدم نظام API للتشخيص النهائي للبكتريا المعزولة وقد اظهرت نتائج التشخيص ان بكتريا Moraxella catarrhalis كانت باعلى بنسبة اذ بلغت (%13.8), ثم تلتها بكتريا Klebsiella pneumoniae (%12.1) وبكتريا Pseudomonas aeroginosae (%10.3). في حين بلغت نسبة الاصابة ببكتريا Streptococcus pneumoniae (%6.9) وبكتريا (%5.2) Haemophilus influenzae وعند اجراء التشخيص المصلي باستخدام الالايزا (ELISA), اظهرت النتائج ان بكتريا Chlamydia pneumoniae شخصت بنسبة (%31) ثم تلتها بكتريا Mycoplasma pneumoniae التي بلغت نسبتها (%17.2).وفي محاولة للتفريق بين ذات الرئة النمطي وغير النمطي تم استخدام بعض المقاييس مثل ( معدل ترسيب كريات الدم الحمر, العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, بروتين التفاعل, قياس الاستجابة المناعية الموضعية).اظهرت نتائج التحليل الاحصائي وجود تاثير معنوي فقط عند استخدام العدد الكلي لكريات الدم البيضاء, وقياس الاستجابة المناعية الموضعية. ولدراسة عوامل الخطورة الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل العمر, الجنس, وبعض الظروف الملازمة للاصابة. دلت النتائج على وجود زيادة في نسبة اصابة الذكور عما هي عليه في الاناث, اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 2.وكان للعمر تاثير مختلف على المسببات البكتيرية, فقد ارتفعت نسبة الاصابة ببكتريا C. pneumoniae وبكتريا M. catarrhalis مع الزيادة بالعمر, في حين انخفضت نسبة الاصابة ببكتريا M. pneumoniae مع تقدم المريض بالعمر.كما دلت النتائج الى وجود علاقة ذات اثر معنوي بين الاصابة ببعض المسببات البكتيرية وبعض الظروف الملازمة للاصابة بذات الرئة المكتسب من المجتمع مثل (التدخين, داء السكر, اصابات رئوية سالبة, القصور الكلوي المزمن). | This study enrolled (100) patient with clinical and radiological evidence of Pneumonia through the period extending from 15/9/2001 - 15/4/2002, who were admitted to Baghdad Teaching hospital, with chronic obstructive pulmonary disease diagnosed by a physician based on clinical, radiological and pulmonary function test.Sputum sample were collected from (83) patient, (76) were processed after fitting criteria for selection which included number of pus cells, number of epithelial cell and Gram stain for primary bacterial identification. Seven samples were rejected for not fitting criteria of selection.Serum sample for detection specific antibody response, were taken for the whole patients.More over 50 serum sample were taken as a control for immunological tests.Proper sputum samples were cultured for the isolation of bacteria, API system was used for the identification of bacteria.From the bacteria isolated M. catarrhalis was the most commonly diagnosed bacteria which is found to be (13.8%) of the total bacteria. Followed by Gram negative bacilli K. pneumoniae being (12.1%) and P. aeroginosae (10.3%) Streptococcus pneumoniae (6.9%), H. influenzae (5.2%).As for immunological diagnosis, C. pneumoniae was diagnosed for (31%) of the cases, followed by M. pneumoniae (17.2%). In an attempt to evaluate parameters that might be useful to differentiate Typical from Atypical pneumonia, ESR, CRP, total WBC count and IgA local immune response were evaluated.Significant difference was detected only in total WBC count and IgA local immune response.Finally to detect possible effect of comorbid condition on bacteria previous age, sex, and other comorbid illness were studied. Males were affected more than female, age show variable effect on different bacterial infection.Smoking, diabetes mellitus, old pulmonary diseases, chronic renal disease, were among the most common and significant factor that affect community acquired pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease

مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus المعزولة من اخماج الحروق والجروح للمضادات الحيوية وبعض المطهرات == Resistance of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus isolated from Burns & Wounds infections to Antibiotics and some Disinfecta

Author name: ختام علي عبيد الخزعلي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • شملت الدراسة جمع 235 مسحة من مرضى مصابين باخماج الجروح والحروق في مستشفيات مختلفة في بغداد للفترة من تشرين الثاني لسنة 2007 ولغاية شهر ايار لسنة 2008 .• شخصت المستعمرات النامية بالاعتماد على عدد من الاختبارات الكيموحيوية, اذ امكن تشخيص 100 عزلة سريرية ( 67 عزلة حروق و33 عزلة جروح ) من المجموع الكلي للعزلات ، توزعت بواقع 64 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ( 50 عزلة حروق 14 عزلة جروح ) و36 عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus ( 17 عزلة حروق و19 عزلة جروح ) واكد التشخيص باستخدام نظام API 20 NE وAPI Staph .• شملت الدراسة فحص الحساسية باستخدام الاقراص تجاه 18مضاداحيويا لكل منهما.• اظهرت عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa مقاومة عالية لمضادات Azetreoname وPipracillin وCarbencillin وCefepime وCefixime وCephalexin وCeftriaxone وCefotixime وCeftazidime وTrimethoprime وCo - trimoxazole اذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة لمضادات Gentamicin وTobramycin وCiprofloxacin وNorfloxacin وImipenem بلغت نسبها (89 ، 79.68 ، 60.9، 81.25، 42.1) % على التوالي ، في حين اظهرت عزلتين فقط من البكتريا المعزولة من اخماج الحروق مقاومة لمضاد Colistin ، وبنسبة 3.2% .• اظهرت عزلات بكتريا Staphylococcus aureus مقاومة عالية لمضادي Methicillin وAmpicillinاذ بلغت نسبتها 100% فيما اظهرت هذه العزلات مقاومة للمضادات Ceftriaxone وAugmentin وErythromycin وGentamicin وTobramycin وTetracyclin وTrimethoprim وCo - trimoxazole بنسبة (72.2 ، 86.1 ، 52.77 ، 41.66 ، 36.1 ، 50 ، 33.3 ، 30.5) % على التوالي. اظهرت العزلات مقاومة اقل تجاه المضادات (Imipenem ، Rifampicin ،Ciprofloxacin ،Cefotaxime) بنسبة (22.2، 27.7، 13.88، 16.66) % على التوالي . اظهرت العزلات مقاومة متكافئة لمضادات Norfloxacin وOfloxacin وEnoxacin بنسبة % 19.4 . جميع العزلات كانت حساسة لمضاد Vancomycin. • حددت التراكيز المثبطة الدنيا (MICs) لبعض المضادات المستخدمة في الدراسة وشملت ، مضاد Imipenem اذ تراوحت قيم MICs ما بين (512 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Ciprofloxacin (128 - 2) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Norfloxacin (1024 - 8) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Cefotaxime (4 - 1024< ) ميكروغرام/مليلتر، ومضاد Gentamicin (4 - 1024<) ميكروغرام/مليلتر.• اجري اختبار الفعالية المضادة للبكتريا لخمسة من السيفالوسبورينات بعد اجراء تفاعل اعادة الترتيب من خلال تصعيدها في المحاليل المائية الحامضية القوية . انتج تفاعل اعادة الترتيب هيكل حلقة من 5,2 داي اوكسو ببرازين وهي ذات فاعلية واطئة كمضادات بكتيرية وعلى الرغم من ذلك فان هذه النواتج هي مرشحات قوية كادوية مضادة للسرطان.• تبين ان 90% من العزلات كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز.• حددت التراكيز المثبطة الدنيا Minimal Inhibitory Concentrations (MICs) لثلاثة من المطهرات الكيميائية الشائعة الاستخدام في المستشفيات لعشر عزلات بكتيرية لكل من النوعين والتي شملت مطهر الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(256 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (512 - 64) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (512 - 4) مايكروغرام/مليلتر. اذ تبين ان مطهر الهبتين بتراكيزه الواطئة هو الاكثر فعالية من باقي المطهرات، في حين مطهر بيروكسيد الهيدروجين هو الاقل كفاءة.• حددت التراكيز القاتلة الدنيا Minimal Bactericidal Concentrations (MBCs) للمطهرات الثلاثة للعزلات البكتيرية الهبتين اذ تراوحت قيم MICs مابين(512 - 4) مايكروغرام/مليلتر ، وبروكسيد الهيدروجين ما بين (1024 - 128) مايكروغرام/مليلتر ، والسكنسبت ما بين (1024 - 4) مايكروغرام/مليلتر.• حدد الزمن اللازم لقتل عدد من العزلات قيد الدراسة عند تعرضها للمطهرات بتراكيزها القاتلة الدنيا (MBCs) اذ تراوح مابين 15 - 10)) دقيقة لمطهر الهبتين,و(40 - 20) دقيقة لبيروكسيد الهيدروجين,(20 - 10) دقيقة لمطهر السكنسبت. | • The study includes the collection of 235, burns and wound swabs from patients of different hospitals, in Baghdad area, for the period from November 2007 to May 2008 .• The isolated colonies were identified depending on biochemical tests, The identification revealed of 100 isolates (67 burns & 33 wounds) from the total number of isolates , 64 isolates of Pseugomonas aeruginosa (50 burns & 14 wounds) and 36 isolates of Staphylococcus aureus (17 burns & 19 wounds) Then the identification of these species was confirmed by using API 20 NE and API Staph. • The study includes sensitivity test by using Disk diffusion method . towards 18 antibiotics,for each species. • The Pesudomonas aeruginosa isolates showed height resistance to Azetreoname, Pipracillin, Carbencillin, Cefepime, Cefixime, Cephalexin, Ceftriaxone, Cefotixime, Ceftazidime, Trimethoprime, and Co - trimoxazole with percentage 100 %, and to Gentamicin, Tobramycin, Ciprofloxacin, Norfloxacin and Imipenem with percentage (89, 79.68, 60.9, 81.25, 42.1) % respectively . While two of burns isolates showed resistance to Colisitin with percentage 3.2 % . • The isolates of Staphylococcus aureus showed high resistance to Methicillin and Ampicillin with Percentage 100 %, and to Cefriaxone , Augmentin, Erythromycin, Gentamicin, Tobramycin, Tetracyclin, Trimethprim, Co - trimoxazole with percentage (72.2, 86.1, 52.77, 41.66, 36.1, 50, 33.3, 30.5 ) % respectively, and less resistance to Imipenem, Rifampicin, Ciprofloxacin, Cefotaxime with percentage (22.2, 27.7, 13.88, 16.66) % respectively. The isolates showed the same resistance towards Norfloxacin, Ofloxacin and Enoxacin with percentage 19.4 % . All strains were sensitive to Vancomycin . • The minimal inhibitory concentrations of some antibiotics were determined . for Imipenem, the MICs values ranged between (2 - 512) µg/mL, Ciprofloxacin, (2 - 128) µg/mL. Norfloxacin, (8 - 1024) µg/mL, Cefotaxime,( 4 - >1024) µg/mL, Gentamicin,( 4 - >1024) µg/mL• The antibacterial activity of five of cephalosporins after chemical re arrangement by reflux in strong acid solution was examined. The re arrangement reaction produce new ring skeleton of 2,5 dioxopiprazine , of lower antibacterial activity. However there product are candidates drug with expected anticancer activity. • (90 %) of the isolates have ability to produce beta lactamase enzymes.• Minimal Inhibitory Concentration, (MICs) for three of the Common Chemical disinfectants in the hospital were determined, for 10 bacterial isolates for each species. The MICs were range between (4 - 256) µg/mL for Hibitane, (64 - 512) µg/mL for Hydrogen peroxide and (4 - 512) µg/mL for skinsept . Hibitane with its low concentration was the most active comparing with the other antiseptics. while the Hydrogen peroxide was the less . • Minimal Bactericidal Concentration (MBCs) for three of the common chemical disinfectants were determined, the MBCs for Hibitane, (4 - 512) µg/mL, Hydrogen peroxide(128 - 1024) µg/mL,and Skinsept (4 - 1024) µg/mL for each species.• The required time for killing a number of isolates when exposed to the minimal bactericidal Concentrations of antiseptic was determined,it was (10 - 15)min for Hibitane, (20 - 40) min for Hydrogen peroxide and(10 - 20)min for Skinsept

دراسـة مقاومة انواع من البكتريا المعزولة من المرضى لبعض المضادات الحياتية والمركبات الكيمياوية الجديدة == STUDY THE RESISTANCE OF BACTERIAL SPECIES ISOLATED FROM PATIENTS TO THE SOME ANTIBIOTICS AND NEW CHEMICAL COMPOUNDS

Author name: خانزاد خضر جرجيس
Supervisor name: عادل كمال خضر | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 488 عينة ماخوذة من مختلف انواع الاصابات من مختبر الصحة العامة المركزي ومستشفيات محافظة اربيل . اخذت 100 عينة من اشخاص لهم التهابات المجاري البولية، وجمعت 388 مسـحة من التهاب الجروح، الحروق، الاذن، اللوزتين، ملتحمة العين، المهبل والانف . استنبتت هذه العينات على وسطي اكار الدم وماكونكي اكار للتحري عن وجود البكتريا المسـببة للاصابات المتنوعة وتشخيصها . بلغ عدد العينات الموجبة للزرع البكتيري 321 (% 65.77)، فيما كان عدد العينات السالبة 167 (% 34.22)، شــخصت العزلات النامية مظهريا وزرعيا وخواصها الكيموحيوية اذ اهملت جميع انواع البكتريا النامية باســـتثناء S. aureus ، S. epidermidis ، P .aeruginosa ، E. coli . اظهرت نتائج التشخيص البايوكيميائي وجود 67 عزلة (% 20.87) منها تعود الى نوع S. aureus من خلال ايجابيتها لفحص الكاتليز وفحص انتاج انزيم مجلط البلازما، وتخمير سـكر المانيتول، اختزال التليورايت وانتاج انزيم محلل الدنا DNase المقاوم للحرارة كما واظهرت نتائج التشـــخيص وجود 59 عزلة (% 18.38) منها تعود الى E. coli اذ تميزت هذه البكتريا عند تنميتها على وسط EMB (Eosin - methylene blue agar) بمستعمراتها ذات بريق معدني اخضر وتنمو على اكار الماكونكي بشكل مستعمرات وردية لكونها مخمرة لسكر لاكتوز اضافة الى اختبار IMVC كانت موجبة لاختبار الاندول واحمر المثيل فيما كانت سالبة لفحص الفوكس بروسكاور ولم تتمكن بكتريا E. coli من اسـتهلاك السترات فقد اعطت فحصا سالبا لليوريز والاوكســيديز وكذلك وجود 50 عزلة (% 15.57) P. aeruginosa الموجبة لفحص الاوكسيديز والكاتليز واختبار استهلاك السترات وسالبة لاختبار انتاج اليوريز.واظهرت وجود 21 عزلة (% 6.54) تعود الى S. epidermidis منتجة لانزيم الكاتليز وغير منتجة لانزيم مجلط البلازما وانزيم تحلل الدنا DNase وغير مخمرة لســكر مانيتول، ، واستعمل نظام ابي API STAPH ، API 20E لدعم هذه النتائج .شملت الدراسة فحص حساسية العزلات تجاه 33 مضادا حياتيا و9 مركبات كيمياوية . اظهرت بكتريا S. aureus مقاومة عالية للمضادات Penicillin ، Ampicillin، Piperacillin ،Carbenicillin ، Augmentin ، Tetracycline اذ بلغت نسبتها (,90, 100 ,90 80 , 6050 ,) %على التوالي واظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضاد Rifampicin اذ بلغت نسبتها 5% واظهرت هذه البكتريا مقاومة منخفضة للمضادات Oxacillin ، Cloxacillin ، Imipenem , Amikacin , Ciprofloxacillin , Pefloxacillin , Sulphamethoxazole Trimethoprim اذ بلغت نســـــبتها % 15 على التوالي في حين حصلت استجابة مختلفة للمضادات الحيوية الاخرى . بينت النتائج ان جميع العزلات S. aureus كانت % 100 حساسة لمضاد Vancomycin ، Novobiocin ، Fusidic acid .اظهرت بكتريا S. epidermidis مقاومة عالية للمضادات Piperacillin, Penicillin G , Doxycycline hydrochloride, Ampicillin Carbenicillin ,Tetracycline, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (50,60,70,70,80,90, 100) .اظهرت هذه العزلات مقاومة اقل للمضادات Imipenem Ciprofoxacillin,Rifampicin , ,Pefloxacillin, Fusidic acid , اذ بلغت نســـبتها % (5,10,10,10,10) على التوالي واظهرت جميع عزلات بكتريا S. epidermidis حساسيتها للمضادات Vancomycin , Novobiocin والتي بلغت نســـبتها % 100. اظهرت عزلات P. aeruginosa مقاومة عالية بلغت نسبتها % 100 للمضادات Penicillin G , Ampicillin , Augmentin , Oxacillin , Cloxacillin , Cephalothin , Cephalexin , Cefoxitin , Streptomycin ,Tetracyclin , Doxycycline hydrochloride , Chloramphenicol , Erythromycin , Rifampicin , Nitrofurantoin وSulphamethoxazole Trimethoprim.اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات Amikacin Ciprofloxacillin, Pefloxacillin, Imipenem, Aztreonam,, اذ بلغت نسبتها % (15,20,20,20,25) , بينما اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . اظهرت عزلات E. coli مقاومة عالية للمضادات Penicillin G , Cloxacillin,Oxacillin , Ampicillin Erythromycin, Augmentin, اذ بلغت نسبتها % (90,95,95, 100, 100,100) , اظهرت عزلات هذه البكتريا مقاومة اقل للمضادات ,Gentamicin Ciprofoxacillin , Imipenem Aztreonam , , ,Amikacin,Nitrofurantoin,Pefloxacillin اذ بلغت نسبتها%(5,10,10,10,10,15,15) على التوالي في حين اختلفت العزلات في نسبة مقاومتها للمضادات الحيوية الاخرى . تم دراسة مركبات مشتقة من - 5,5 ثنائي فنيل - 4,2 - ايميدازوليدين دايون (فنتيون) من خلال اجراء تفاعلات قواعد مانيخ مع البارافورمالديهايد والامينات الاولية المعروفة باستخداماتها الدوائية . واختبرت هذه المركبات الكيميائية الجديدة التســعة كمواد مضادة للبكتريا Antibacterial agent باستخدام خمسة تراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06, 0.04 ml) . بينت نتائج التحليل الاحصائي ان افضل طريقة هي طريقة التخفيف بالمرق broth dilution وتليها طريقة تخفيف بالاكار . فقد تم التوصل الى وجود فروقات معنوية (P< 0.05) ، بين طريقة التخفيف بالمرق وكل من الطريقتين انتشار القرص والحفرة .جميع المركبات الكيمياوية المحضرة لها تاثيرات قاتلة على كل من S. aureus وS. epidermidis باســـتثناء V,VII حيث وجد ان لهما تاثيرا مثبطا وليـس قاتلا في التراكيز (0.2,0.1,0.08,0.06,0.04ml) في حين اظهرت المركبات I، IV، V، VIII،IX تاثيرات قاتلة على بكتريا P. aeruginosa ، كما وجد ان المركبات II،III، VI، VII لهم تاثيرات مثبطة على هذه البكتريا في التراكيز المذكورة نفسها، كانت جميع المركبات الكيمياوية لهم تاثيرات قاتلة على بكتريا E. coli وفي جميع التراكيز المستخدمة .

الوصف التشكليائي والتركيب النسجي للبنكرياس المعثكلة في الخفاش الكحلي (Kuhl, 1817) Pipistrellus kuhlii == Morphological Description and Histological Structure of the Pancreas in Al - Kuhlii Bat Pipistrellus kuhlii (Kuhl, 1817)

Author name: خالدة محمد عليوي العوادي
Supervisor name: بيداء حسين مطلك
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Histology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study was designed to investigate the morphological description and histological structure of the pancreas gland in Bat Pipistrellus kuhlii.A total number of (20) ,10 male and 10 female bats were used in this study after taking out the pancreas gland it was fixed with fixative solutions their the sequent steps of preparing histological slides were done after that they were stained by using routine and special stains. These stains were represented by (Heamtoxylin - Eosin, Periodic acid Schiff, Chrom alum heamtoxylin, Modified aldehyde Fuchsin and Masson’s trichrome).The morphological study showed that the pancreas gland in Kuhli's bat is represented by a compact type of pancreatic tissue it is white to yellowish color divided into three divisions head, body and tail. The pancreatic tissue lies in the abdominal cavity near the mass of intestine at the mesentery network which is connected with the coiled region of the duodenum from one side and the extended mesenteries between the dorsal part of stomach and the ventral part of spleen from the other side. The pancreas gland has only one duct that originated from the pancreatic body which is opened in the upper part of the duodenum.The pancreas gland is surrounded by loose connective tissue it extend trabeculae that divides the gland into many lobules that differs in size and shape. The pancreatic tissue is characterized into two portions, the exocrine portion and endocrine portion, the exocrine portion is represented by a compound tubule - acinar gland which consists of a large number of acini and the ductal system, each acini represented by a serous secretory unit which consists of many pyramidal cells that surround a small lumen,the apics of narrow cells are headed towards the acinar lumen while their bases are wide and based on the basement membrane. The acinar sizes are variable some acini are large others are small. The acinr cells number range from (6 to 9) cells. The ductal system which eliminate the products of secretory units to the duodenum it is initiate with centroacinar cells, these cells are connected with intercalary ducts which connected with intralobular duct, these ducts lead to the interlobular duct, which their diameter is larger than the diameter of intralobular ducts. The inter lobular ducts eliminate their secretory contents in the main duct which opened in the upper part of the duodenum.The endocrine portion is represented by clusters of cells known as islets of Langerhans which appeared as masses of cells diffused among the exocrine portion units, they're separated from each other by a thin layer of connective tissue.The islets are randomly distributed within the pancreatic tissue, it is obvious that these islets are massively concentrated in the body part of pancreas inside the lobules and around the ducts as in the pancreas head. The study also revealed that there were difference in the diameters and numbers of the islets, the mean diameters of the islets was reached (1.86) micrometer with range (1 - 2.75) micrometer whereas the mean number of islets was (1.6) islet per millimeter with rang of (1 - 3) islet.Each islet consists of three types of cells arranged as irregular clusters, they are separated from each other with blood capillary network. They were differentiated by using routine and special stains, these cells are Alpha cells they have rounded shape with oval nucleus they lies at the peripheral part of the islet. Beta cells they’re oval shaped with spherical nucleus they lies at the center of the islet, while delta cells are irregular shaped, with pale color lies between Alpha and Beta cells they’re less in number and they may appear as single cell or as small clusters and mostly lies at the peripheral part of the islet.The islet stained with faint blue in routine stains (Heamtoxylin and Eosin), and they were stained with faint blue when using special stains (Chrome alum phloxine) while the nucleus of Alpha cells stained with dark red and the Beta cells nucleus stained blue whereas Delta cells nucleus appeared in pink to pale red color. When using modified aldehyde Fuchsin the islets stained with greenish blue, alpha cells stained with orang, beta cells were blueish green and delta cells stained with green

الخصائص الحيوية والجزيئية والفعالية ضد الميكروبية للنايسين المنتج من قبل بكتريا subsp. lactis Lactococcus lactis المعزولة من الحليب الخام == Biological, Molecular characteristics and antimicrobial activity of Nisin produced by Lactococcus lactis subsp. lactis Isolated from Raw Milk

Author name: خالد اسماعيل عزيز
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | زيرك فقى احمد عبد الرحمن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت جمع مائة وخمسة واربعون نموذجا من الحليب الخام خلال فترة ما بين تموز الى التشرين الثانى لعام 2013 فى مزارع تربية المواشي لمحافظة اربيل ودهوك .اسفرت النتائج عن الحصول على 45 عزلة من بكتريا L. lactis subsp. lactis تمت تشخيص هذه العزلات باستخدام الصفات المجهرية , المظهرية , البايوكيميائية ,API 20E SYSTEM بالاضافة الى تقنية الـ PCR . اختبرت فعالية العزلات لبكتريا L. lactis subsp. lactis تجاه ثلاثه عشر نوعا من المضادات الحيويه وتباينت العزلات فيما بينهما من حيث استجابتها لاختبار الحساسية وعدد منها مقاومة كالاتي : Cephalothin, Ampicillin, Amoxicillin/ Clavulanic acid, Sulfamethoxazole/Trimethoprim, Cefotaxime, Clindamycin, Ceftriaxone, Nitrofurantoin, Gentamycin, Vancomycin, Ciprofloxacin, Chloramphenicol, and Imipenem.، ونسبة المقاومة كالاتي : 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55, 24.44%, 2.22%. على التوالي.اظهرت نتائج جميع العزلات فعالية عالية ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية وهى : E. coli, B. subtilis, P. aeruginosa, C. perfringes and S. aureus باستعمال تقنية طريقة الانتشار بالحفر. اظهرت العزلة 41 و15 فعالية عظمى (16mm) (20mm) ضد بكتريا S. aureus وB. subtilis بينما اظهرت العزلة 20 فعالية كبيرة (13mm) ضد بكتريا aeruginosa P.. عموما فان البكتريوسين لجميع العزلات المذكورة كانت فعالة ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة كرام .ايضا تم استخدام النايسين النقي ضد خمسة انواع من البكتريا المرضية واظهرت النتائج بان مناطق التثبيط كانت 18، 22، 14، 13 و15 ملم ضد كل من S. aureus، B. subtilis، C. perfringens، E. coli وP. aeruginosa على التوالي.درست تاثير الاس الهايدروجينى،الحرارة والاشعة الفوق بنفسجية على فعالية نايسين للعزلات 10، 26 و42. اظهرت النتائج بان مستخلص نايسين لعزلة L42 كانت اكثر فعالية عند الاس الهايدروجينى 2.5 والحرارة - 4 م ضد البكتريا المرضية. لم يظهر مستخلص النايسين اى فعالية ضد البكتريا المرضية عند تعريضه للاشعة الفوق بنفسجية مبينا التاثير السلبى لهذه الاشعة على فعالية البكتريوسين.تم اختيار العزلة اكثر مقاومة للمضادات الحيوية (L42) لاجراء عملية التحول وذلك لتحديد مواقع الجينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية باستخدام عملية التحول الوراثي باستعمال بكتريا coli DH5 - α E. الخالية من البلازميدات مع البلازميد المنقى من العزلة L42. تم اجراء عملية التحول بنجاح واظهرت النتائج بان جينات : Chloramphenicol, Nitrofurantoin, Cefotaxime, and Vancomycin كانت واقعة على البلازميد بينما البقية كانت واقعة على الكروموسوم. تم تحديد التركيز المثبط الادنى للنايسين واظهرت النتائج بان MIC للنايسين بالنسبة لبكتريا aureus S. كانت 400µg/ml بينما لبكتريا coli E. كانت 500µg/ml. استخدمت MIC للنايسين كعامل تحييد للسيطرة على جينات مانحة المقاومة للمضادات الحيوية لنوعين من البكتريا المرضية وهى aureus S. وcoli E.. كشفت النتائج بان الجينات منحت المقاومة لـ AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AK, CFM, تم تحييدها بنسبة 61.5% بينما فى بكتريا coli E. تم تحييد الجينات لـLEV, MEL, NOR, and SXTبنسبة 31%. تم دعم النتائج عمليتي التحول والتحييد باستخدام تقنية الترحيل الكهربائى للهلام. | In this study a total of one hundred forty five raw milk samples were collected during the period of (July to November, 2013) from different fields in Erbil and Duhok province. Screening revealed that 45 out of 145 samples of raw cow milk (31%) were L. lactis subsp. lactis. Characterization of these selected isolates were carried out using morphological, microscopical, biochemical characteristics, API 20 system and further confirmation were achieved by PCR assay.Antibiotic sensitivity test performed for L. lactis subsp. lactis against thirteen antibiotics which include Ampicillin (AMP), Amoxicillin/ Clavulanic acid (AMC), Imipenem (IMP), Gentamycin (GM), Sulfamethoxazole/Trimethoprim (SXT), Cephalothin (CEP), Clindamycin (CLIN), Nitrofurantoin (F), Ciprofloxacin (CIP), Ceftriaxone (CRO), Chloramphenicol (C), Cefotaxime (CTX), and Vancomycin (VAN). The isolates appeared to be varied in their resistance, the number and resistance percent for antibiotics used CEP, AMP, AMC, SXT, CTX, CLIN, CRO, F, GM, VAN, CIP, C, and IMP were as follow 95.55%, 93.33%, 93.33%, 91.11%, 84.44%, 77.77%, 71.11%, 62.22%, 53.33%, 40%, 35.55%, 24.44%, and 2.22% respectively.All supernatants were isolates exhibited marked activity against five pathogenic bacteria includes S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, P. aeruginosa, and E. coli using agar well diffusion method. Isolate 15 and 41 exert maximum activity (20 mm) and (16 mm) against B. subtilis and S. aureus. Whereas isolate 20 showed highest activity (13 mm) against P. aeroginosa. Generally, all aforementioned isolates were active against gram positive and Gram negative bacteria. In addition, the effect of pH, temperature and UV light were studied on nisin activities of L10, L26 and L42 against some pathogenic bacteria. The results showed that nisin extract of L42 displayed highest activity at pH 2.5 and temperature at - 4 °C against pathogenic bacteria under study. Under UV light wavelength all nisin showed low or no activity against different pathogenic bacteria selected in this study.Also a pure nisin was used against five pathogenic bacteria and the results shows that the inhibition zones were 18, 22, 14, 13 and 15 mm against each of S. aureus, B. subtilis, C. perfringens, E. coli and P. aeruginosa respectively.One highly resistance isolate was chosen (L42) for transformation test to determine the location of the antibiotic resistance genes by genetic transformation process using the laboratory strain E. coli DH5 - α with plasmid DNA purified from this isolates. The transformation process conducted successfully and the results showed that the resistance genes for F, C, CTX, and VAN were located on plasmid DNA. While for others were located on chromosomal DNA.Minimum inhibitory concentrations were tested for nisin and the results revealed the MIC of nisin for S. aureus was 400 µg/ml while for E. coli was 500 µg /ml. MIC of nisin was used as curing against to control the antibiotic resistance genes in two pathogenic bacteria represented by E. coli and S. aureus. The results showed that the genes encoding resistance to AMP, OXA, TET, C, CTX, SXT, AM, and CFM were cured and the percentage of curing was 61.5%. Whereas for E. coli the gene of LEV, MEL, NOR, and SXT were cured with 31%. The above results of both transformation and curing process were supported with gel electrophoresis.

دور السيلينيوم والبراسينولايد في النمو والمركبات الفعالة لنبات الكزبرة (Coriandrum sativum L.) المعرض للاجهاد المائي == Role of Selenium and Brassinolide in growth and active compounds for Coriander plant (Coriandrum sativum L.) Exposed to Water Stress

Author name: حيدر ناصر حسين المنتفجي
Supervisor name: عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Physiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

Author name: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
Supervisor name: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Viruses
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.

التغايرات الفصلية للعوامل البيئية وتاثيرها على اصبعيات اسماك الكارب الاعتيادي Cyprinus carpio L. في بركة نصب الشهيد / بغداد == Seasonal Variation of Ecological factors and their effects on fingerlings of Cyprinus carpio L., fish In Martyr monument Pond, Baghdad

Author name: حيدر عبد الزهرة عبد علي
Supervisor name: حسين احمد شريف
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت الدراسة الحالية ابتداءا من شهر تموز 2013 ولغاية شهر نيسان 2014، اذ تم جمع النماذج لاربعة فصول موزعة على اربعة اشهر في ثلاث محطات من بركة نصب الشهيد ضمن مدينة بغداد، وقد تضمنت الدراسة قياس ثلاثون عاملا من العوامل الفيزيائية والكيميائية ، مثل درجة حرارة الهواء والماء والدالة الحامضية والتوصيلية الكهربائية والملوحة والمواد الصلبة الذائبة والمواد العالقة الكلية والكدرة والاوكسجين الذائب والمتطلب الحيوي للاوكسجين والقاعدية الكلية والكاربونات والبيكاربونات والمغنيسيوم والكالسيوم والعسرة الكلية والكلورايد والصوديوم والبوتاسيوم والنترات والنتريت والفوسفات والكبريتات .وقد تراوحت قيم تلك العوامل على التوالي ما بين 6.51 - 30م° و14 - 25 م° و7.1 - 8.8 و- 9149380مايكروسيمنز/سم و0.5 - 5.8 جزء بالالف و978 - 5526 ملغم/لتر و17 - 144 ملغم/لتر و1.2 - 11NTU و6 - 11.5 ملغم/لتر و1.2 - 5.7 ملغم/لتر و110 - 230 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر وقيم غير محسوسة - 17.6 ملغم/لتر و104 - 221 ملغم كاربونات الكالسيوم / لتر و27 - 391 ملغم/لتر و91 - 551 ملغم/لتر و500 - 2500 ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر و65 - 1458 ملغم / لتر و180 - 1430 ملغم /لتر و10 - 110 ملغم/لتر و71. - 4.8 ملغم/لتر وقيم غير محسوسة - 0.6 ملغم/لتر وقيم غير محسوسة - 0.27 ملغم/لتر و280 - 2300 ملغم/لتر.وقد تم قياس بعض العناصر الثقيلة مثل الزنك والنحاس والكادميوم والرصاص والكروم والمنغنيز والحديد. وقد تراوحت قيمها على التوالي مابين قيم غير المحسوسة - 0.031 ملغم/لتر وقيم غير محسوسة - 0.078 ملغم / لتر وقيم غير محسوسة - 0.018 ملغم / لتر وقيم غير محسوسة - 0.14 ملغم / لتر وقيم غير محسوسة - 0.19 ملغم/لتر وقيم غير محسوسة - 0.16 ملغم/لتر و0.01 - 0.15 ملغم/ لتر.اشارت نتائج الدراسة الى ان مياه البركة جيدة التهوية وعسرة وتميل للقاعدية، وكانت قيم المعادن الثقيلة متذبذبة خلال مدة الدراسة حيث لوحظ ارتفاع تراكيزها خلال شهر تموز باستثناء الزنك والحديد اذ كانت تراكيزه ضمن الحدود المسموح بها للاستخدامات كافة، وكانت المحطة الثانية والثالثة اكثر تلوثا من المحطة الاولى.وقد تم تسجيل بعض الملاحظات حول تاثير بعض العوامل المدروسة في البركة على اصبعيات اسماك الكارب ، حيث لوحظ تكيف الاصبعيات للعيش في مياه البركة من خلال ملاحظة تواجدها بكثافة في المواسم التي شهدت ارتفاعا ملحوظا في بعض القيم مثل الملوحة والتوصيلية والعسرة وبعض الايونات كالصوديوم والكلوريد والبوتاسيوم والكبريتات . تم تعريض اصبعيات اسماك الكارب الاعتيادي Cyprinus carpio L. بطول (cm3 - 2.5) وبوزن (15mg ± 200mg) الى تراكيز متساوية (0.5 و1 و1.5) ملغم/لتر من عناصر الرصاص والكادميوم والنحاس ودراسة سمية هذه العناصر، واحتساب قيم الزمن النصفي المميت والزمن الكلي المميت وملاحظة التغيرات السلوكية والمظهرية للاصبعيات، وقد تم قياس تراكيز العناصر المتراكمة في اجسام الاصبعيات واحتساب معامل التركيز الحيوي .اشارت فحوص مياه التجارب السمكية الى ان قيــم درجة الحـرارة والدالة الحامضية والتوصيلية الكهربائية والعسـرة الكليـة وتركيز الكالسيوم والمغنيسيـوم والاوكسجيـن المـذاب قد تراوحـت ما بيـن (25.5 - 24 ) م و(8.2 - 7.9 ) و(3000 - 797) مايكــروسمنز/ سم و(1010 - 265) ملغم كاربونات الكالسيوم/لتر و( 200 - 59.25) ملغم/ لتر و(121 - 28.5) ملغم/ لتر و(11 - 9) ملغم/ لتر على التوالي. اذ سجلت العناصر الثقيلة قيد الدراسة تراكيز متشابهة لماء الاسالة والبركة ،حيث سجل الرصاص قيما غير محسوسة بينما كانت تراكيزالكادميوم والنحاس0.01 ملغم/لتر في ماءالاسالة و0.02 ملغم/لتر في ماءالبركة على التوالي. واجريت تحاليل لاجسام الاصبعيات قبل وضعها في الاحواض التجريبية،وكان تركيز الرصاص والكادميوم والنحاس (µg/g99.0 وµg/g85.0 وµg/g76.0) على التوالي. بينت نتائج تعريض اصبعيات اسماك الكارب الاعتيادي Cyprinus carpio L. لعنصر الرصاص بالتراكيز التجريبية الثلاثة (0.5 و1 و1.5) ملغم/لترعدم ظهور اية هلاكات او تغيرات سلوكية ومظهرية واضحة سوى ماشوهد عند تركيز1.5)) ملغم/لترمن قلة الحركة وافرازالمادة المخاطية حول اجسامها،وسجلت اعلى مستويات التراكم ومعامل التركيز الحيوي في اجسام الاصبعيات عند التعرض للرصاص حيث سجلت قيم التراكم الحيوي عند التعرض للتراكيز (0.5 و1 و1.5) ملغم/لتر(1.53 و3.12 و4.93) مايكروغرام /غم على التوالي وكانت قيم معامل التركيز الحيوي (3.06 و3.12 و3.28) على التوالي .كما كان التراكم الحيوي في اجسام اصبعيات المجموعة الضابطةµg/g 0.77. وبعد تعريض اصبعيات الكارب الاعتيادي Cyprinus carpio الى عنصر الكادميوم، سجلت هلاكات عند التراكيز (1 و1.5) ملغم/لتر، اذ تم الوصول الى الزمن النصفي المميت خلال تسعة ايام من بدء التجربة عند تركيز1ملغم/لتر ، وتم الوصول الى الزمن النصفي المميت خلال ستة ايام بدء التجربة عند التركيز1.5ملغم/لتر.ولم يتم الوصول الى الزمن الكلي المميت عند كلا التركيزين. بينما لم تسجل هلاكات عند التركيز.5 0 ملغم/لتر. وقد لوحظت مجموعة من التغيرات السلوكية مثل حدوث حركات انفعالية تمثلت في الصعود الى اعلى واسفل الحوض بالقرب من الجدران ،واحيانا بالقرب من سطح الماء، وعدم استجابتها للمؤثرات الخارجية كالتعرض للضوء والطرق على جدران الحوض واحتقان المنطقة المحيطة بالغلاصم. وسجلت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيزالحيوي قيما اقل مما سجله الرصاص ،حيث تراوحت قيمها عند التعرض لتركيز(0.5) ملغم/لتر (0.91) مايكروغرام /غم وكانت قيمة معامل التركيز الحيوي (82.1)،وقد تم الوصول الى الزمن النصفي المميت عند تركيز (1) ملغم/لتر حيث كانت قيمة التراكم الحيوي (95.1) مايكروغرام /غم ومعامل التركيز الاحيائي (95.1) .كما سجلت قيم التراكم الحيوي (2.1) مايكروغرام / غم ومعامل التركيز الحيوي (2.1) للاسماك التبقية بعد عشرة ايام من انتهاء التجربة . وعند التعرض لتركيز (1.5) ملغم/لترسجلت قيم التراكم الحيوي (12.3 ) مايكروغرام / غم ومعامل التركيز الاحيائي (08.2 ).بينما تراوحت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيز الحيوي للاسماك التبقية (3.40) مايكروغرام / غم و( 2.26) على التوالي . وقد كان التراكم الحيوي في اجسام اصبعيات المجموعة الضابطة µg/g 0.73. وبعد تعريض اصبعيات الكارب الاعتيادي Cyprinus carpio الى عنصر النحاس، سجلت هلاكات عند التراكيز (0.5 و1 و1.5) ملغم/لتر اذ تم الوصول الى الزمن النصفي المميت عند تركيز 0.5 ملغم/لتر، والزمنين النصفي والكلي المميت عند التراكيز (1و1.5) ملغم/لتر .وقد لوحظت مجموعة من التغيرات السلوكية مثل حدوث حركات انفعالية وازدياد حركات الغلاصم، وكانت الاسماك تسبح لمدة قصيـــرة بصـورة دائـــرية حـــول محــــور واحـــــد مقلوبـــة على احـد الجانبين مع بقاء فتحــة الغطاء الغلصمي شبــه مفتوحة حتى بعد الوفاة.وسجلت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيزالحيوي قيما اقل مما سجل في الرصاص والكادميوم، وتم الوصول الى الزمن النصفي المميت خلال سبعة ايام من بدء التجربة وتراوحت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيز الحيوي (0.71) مايكروغرام/ غم و(42.1) على التوالي عند التعرض لتركيز(0.5) ملغم/لتر،وكانت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيز الحيوي (0.89) مايكروغرام/ غم و(78.1) على التوالي ،للاسماك المتبقية بعد عشرة ايام من انتهاء التجربة .وعند التركيز (1) ملغم/لتر تم الوصول الى الزمنين النصفي والكلي المميت خلال (خمسة وثمانية ايام من بدء التجربة) .اذ بلغت قيم التراكم الحيوي ومعامل التركيز الاحيائي (98.0 و1.24) مايكروغرام /غم و(98.0 و1.24) على التوالي . اماعند تركيز (1.5) ملغم/لتر فقد تم الوصول الى الزمنين النصفي والكلي خلال (ثلاثة وستة ايام من بدء التجربة) وكانت قيم التراكم الحيوي للزمنين النصفي والكلي (96.1 و33.2) مايكروغرام / غم ومعامل التركيز الاحيائي (30.1 و1.55) على التوالي. وقد كانت قيم التراكم الحيوي في اجسام اصبعيات المجموعة الضابطة µg/g 0.68 . | The present study was carred out starting from July 2013 until the April 2014. four samples were collected withen four seasons(one sample withen each season) from three sites of martyr monument pond within the city of Baghdad, The present study included a measurment of thirty physical - chemical factors, such as water and air temperature , pH, electrical conductivity, salinity, total dissolved solids, total suspended solids, turbidity, dissolved oxygen, biological oxygen demand, Alkalinity, carbonate, bicarbonates, magnesium, calcium, total hardness, chloride, sodium, potassium, nitrate, nitrite, phosphate and sulfate. The values of these factors were between16.5 - 30 °C,14 - 25 °C , 7.1 - 8.8 , 914 - 9380 μS\cm , 0.5 - 5.8 ppt , 978 - 5526 mg/L , 29 - 144 mg/L, 1.2 - 11 NTU, 6 - 11.5 mg/L , 1.2 - 5.7 mg/L, 110 - 230 mg calcium carbonate/ L , unsesnible - 17.6 mg calcium carbonate / L , 104 - 221 mg calcium carbonate/ L , 27 - 391 mg/ L , 91 - 551 mg/ L , 500 - 2500 mg calcium carbonate / L , 65 - 1458 mg/ L , 180 - 1430 mg/ L , 10 - 110 mg/ L , 1.7 - 4.8 mg/ L , unsesnible - 0.6 mg/ L , unsesnible - 0.27 mg/ L and 280 - 2300 mg/ L respectively.Some heavy metals Were measured such as zinc , copper , cadmium , lead , chromium , manganese and iron . The values ranged respectively between unsesnible - 0.031 mg/ L , unsesnible - 0.078 mg/ L , unsesnible - 0.018 mg/L, unsesnible - 0.14 mg/L, unsesnible - 0.19 mg/L, unsesnible - 0.16 mg/ L , and 0.01 - 0.15 mg/ L. The results showed that the water of the studied pond was in agood aeriation and with abad hardness, its water tend to the alkalinity, the heavy metals values were wobbling within the study period ,it had ahigh concentrations during the July summer except zinc and iron which were in a permissible limits of the uses for all uses, the second and third site were more polluted than the first site . Many observations were recorded about the effects of some studied factors upon the pond carp Fish fingerlings,the Fish fingerlings showed agood adaptipon to live inside the pond water since the were existing in a high density at the seasons that were a remarkable with a high concentrations of salinity, electrical conductivity and hardness and some ions such as sodium, chloride, potassium and sulfate. Common carp (Cyprinus carpio L.) fingerlings with the length between (2.5 - 3 cm) and The weight of (200mg ± 15mg),were exposed to the some Concentrations (0.5, 1, 1.5) mg /L of the lead, cadmium, copper, elements in order to study the poisoning effect of these heavy metals,upon the longevity and to detemine the LT50% and the LT100% and then to observe the behavioral and external morphology changes of these fingerlings.the bio accumulation of the experimental elements were measured for the fingerlings body and bioconcentration factor was recorded also.Examing of the experimental waters were pointed that the values of the temperature, pH and electrical conductivity and total hardness and concentration of calcium and magnesium, and dissolved oxygen.were between (24 - 25.5) 0C, (7.9 - 8.2) ,( 797 - 3000) μS\cm, (265 - 1010) mg/ L, (59.25 - 200) mg/ L , (28.5 - 121) mg/ L,and (9 - 11) mg/ L, respectively.the studied heavy metals were recording a similar concentrations for the Tap water and pond water since the concentrations of the lead and cadmium values were unsesnible while the concentrations of the copper was 0.01mg/L in Tap water and 0.02 mg/ L in pond water. The fingerlings body analysis was detected before putting them inside the experimental water and the concentrations of lead, cadmium and copper were recorded as (99.0 μg/g), (85.0 μg / g) and (76.0 μg / g) respectively.The results of exposing the fingerlings to the three experimental concentrations(0.5, 1 and 1.5) mg /L .had showed that no mortality or any behavioral and morphological changes were observed except what were noticed the decline of the fish movement and the secretion of the slime around the fish body.The highest values recorded fer the bioaccumulation and bioconcentration factor insid the fingerlings that they exposed to the lead element (0.5,1,1.5) mg/ L. Were (1.53, 3.12, 4.93) μg/g respectively. for the first one, and(3.06, 3.12, 3.28) respectively.For the second one.the bio - accumulation value for the control group was 0.77μg/g.After fingerlings exposing for the cadmium element there were mortalities on the concentration of (1 ,1.5) mg/ L,when it was reaching to the LT50% on the (1) mg/ L at the 9th day and reaching to the LT50% on the (1.5) mg/L concentration at the 6th day of the experments,where no mortality recorded at the(0.5) mg/ L concentrations. while it was not reaching to the LT100% on the( 1.5) concentration mg/ L.Beside that some behavioral and morpholgical changing were noticed such as some emotional movement like the rise and descent between up and down of the aquarium and near its wall or some times near the aquarium water surface ,in addition to that it showed no response for any external influence such as the light exposing or the knocking on the aquarium walls. In addition to that it showed the congestion of the area around the fish gillsThe bioaccumulation and bioconcentration factor were recorded for the cadmium less than lead where the value was (0.91μg/g) at (0.5mg/ L) concentration,while the bioconcentration factor was (1.82) at (0.5mg/ L) concentration. while the bioaccumulation was (1.95 μg/g).and then bio - concentration factor was recording the value of (1.95) on the (1) mg/ L concentration while the bioaccumulation was (2.1μg/g).and then bio - concentration factor was recording the value of (2.1) on the (1) mg/ L concetration after ten days when the experiment was finished.The value of bioaccumulation were (3.12μg/g). at (1.5mg/L) concentration. while the bioconcentration factor were (2.08). while the bioaccumulation was (3.40 μg/g) and then bio concentration factor was recording the value of (2.26) at (1.5mg/L) concentration. after ten days when the experiment was finished. The bio - accumulation inside the fish fingerlings on the control group was (0.73μg/g). After the copper exposing there was a mortality recording at the concentration of this metal with (0.5, 1, 1.5) mg / L,and then the LT50% was reached with the (0.5) mg /l concentration,while the reaching to the LT50% and LT100% were optained at the (1, 1.5) mg / L concentrations.Some behavioral and emotional changing were noticed with the active gills movement and a circular swimming around one axon and one side, then the operculum opining was noticed in opening case even after a fish death .The values bioaccumulation and bioconcentration were recording less values for copper experiments than that to lead and cadmium metals then.when it was reaching to the LT50% on the (0.5) mg/l at the 7th day. and reaching to the LT50% and LT100% on the (1) mg/l concentration at the (5th, 8th) day respectively of the experments, and reaching to the LT50% and LT100% on the (1.5) mg/L concentration at the (3th, 6th) day respectively of the experments. the bioaccumulation and bioconcentration at the time reaching of LT50% were recording the values of (0.71 μg/g and 1.42) respectively.the bioaccumulation and bioconcentration after 10 days of experiments finishing were (0.89 and 1. 78 μg/g ) respectively.At the concentration of (1)mg / L the LT50% and LT100% were recorded and the LT50% and LT100% values were recorded as (0.98 ,1.24) μg/g and (1.98 ,1.24) respectively.At the concentration of (1.5 mg / L). the values of the bioaccumulation and bioconcentration at the LT50% and LT100% were (1.96, 2.33 μg/g) and (1.30, 1.55) respectively.The bioaccumulation in side the fingerlings body for the control group (0.68 μg/g) for the copper metal .

دراسة حالات العقم عند الذكور والتاثيرات البكتيرية والمناعية على معالم السائل المنوي

Author name: حياة كاظم سلمان الموسوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | انتصار محمود جمعة
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 450 عينة مني ومصل دم من الذكور المصابين بالعقم (اولي _ ثانوي) من مركز العقم واطفال الانابيب (مستشفى كمال السامرائي ). قسمت عينات المني الى قسمين اجري على القسم الاول منها الفحوص العيانية والمجهرية ، فيما تم زرع القسم الاخر على اوساط زرعية مناسبة ( اكار الدم،اكار الماكونكي، اكار الجوكليت) .تم عزل 284 عزلة بكتيرية من مجموع عينات المني 450 عينة : - 173 عزلة بنسبة (38.4%) منها تعود الى Staphylococcus aureus و58 عزلة بنسبة (12.9%) تعود الى بكترياEscherichia coli و31 عزلة (6.9% ) منها تعود الى بكتريا Neisseria gonorrhoeae ،اما نتيجة الزرع للبكتريا المختلطة &S.aureus E.coliفكانت 22حالة (4.9%) وذلك باستخدام نظام API system. اختبرت حساسية البكتريا لـ(11) مضادا حيويا شملت : - الامبسلين والفانكومايسين وامبسلين/ سلبكتام وسيفترياكسون ومينوسايكلين وسيفاكلور وسيفوروكسيم وسيفوتاكسيم والاميكاسين والافلوكساسين والسبروفلوكساسين . اظهرت النتائج وجود مقاومة عالية من قبل العزلات البكتيرية للمضاد الحيوي الامبسلين 100% في حين كان المضاد الحيوي سيفترياكسون اكثر المضادات فاعلية ضد بكتريا المكورات العنقودية والبكتريا التابعة للعائلة المعوية اذ لم تظهر اي عزلة من العزلات مقاومة له وكان المضاد السبروفلوكساسين الاكثر تاثيرا على العزلات البكترية (N.gonorrhoea). تضمن البحث ايضا دراسة تاثير اضداد النطاف على معالم السائل المنوي اذ وجد ان 284 عينة اي بنسبة (63.1%) (من بين450 عينة ) كانت موجبة لاضداد النطاف في البلازما المنوية وان 270عينة اي بنسبة (60%) من مصل الدم كانت موجبة لاضـداد النطاف وذلك باستخدام فحص التراص بالصفيحة agglutination test Tray . كذلك تم التعرف على عيارية هذه الاضداد اذ ان اعلى عيارية للاضداد في البلازما المنوية كانت (128 : 1) في الوقت الذي بلغت اعلى عيارية للاضداد في مصل الدم (1024 : 1). استخدمت تقنية (ELISA ) Enzyme Linked Immumosorbent Assay للتحري عن اضداد النطاف واصنافها وبينت نتائج الدراسة ان اكثر الاصناف تكرارا في البلازما المنوية هو الضد IgA اذ وجد في 271 عينة بنسبة (95.4%) من بين 284 عينة موجبة لاضداد النطاف اما اصناف الاضداد في مصل الدم فالضد IgG كان اكثرها وجودا (225 ) عينة بنسبة 83.3% .من مجموع العينات الموجبة لاضداد النطاف والبالغة 270 عينة . كما تم التعرف على كيفية حدوث التراص نتيجة وجود الاضداد وتبين ان التراص بالرؤوس هو الاكثر حدوثا في (170 ) عينة بنسبة 39.9% مقارنة مع التراص ذنب بالذنب (37) عينة بنسبة 13% . بينت الدراسة وجود علاقة ذات دلالة احصائية معنوية 0.001>P بين وجود الخلايا القيحية في السائل المنوي ووجود اضداد النطاف في البلازما المنوية اذ بلغت النسبة (98.2%) من مجموع 279 عينة فيما بلغ مجموع المرضى العقيمين الذين ابدوا نتائج موجبة لاضداد النطاف بدون خمج (5)عينات 1.7 % كذلك تبين وجود علاقة معنوية 0.001>P بين الاصابة ببعض الامراض مثل القيلة الدوالية Varicoceleواصابة وضمور الخصيةTesticular trouma & atrophy والنكاف Mumps واختزاع الخصيةTesticular biopsy وبين وجود اضداد النطاف في البلازما المنوية . كذلك اظهرت الدراسة ان 393 مريضا ( 87.3%) من مجموع 450 عقيما اظهروا تركيزا سويا لهرمون (FSH) Follicle Stimulating Hormone. في مصل الدم مقابل )57) مريضا بنسبة 12.7% اظهروا تركيزا اعلى من القيمة الطبيعية العليا . كما اظهرت النتائج ان 380 مريضا بنسبة 84.4% كان لديهم تركيز سوي لهرمون (LH) Leutinizing Hormone ، مقابل 70 بنسبة (15.6%) كان لديهم تركيز اعلى من القيمة الطبيعية العليا في مصل الدم . اما بالنسبة لهرمون التيستوستيرون Testosterone فان 334 بنسبة 74.2% اظهروا تركيزا سويا مقابل 116 (25.8%) ممن كان لديهم تركيز اقل من القيمة الدنيا للتركيز السوي . | Four hundred fifteen samples of seminal fluid from infertile men (primary & secondary) from Infertility and Tube Babies Center (Kamal AL - Sammara'ee Hospital). Each semen sample was divided into two parts : The first part underwent Macroscopic& Microscopic examination, while the other part was culture on suitable culture media (Blood agar, Macconkey agar and chocolate agar). 284 bacterial isolates from 450 sample ; 173 sample of seminal fluid show to Staphylococci aureus (38.4%) and (58) from Escherichia coli (12.8%) , 31 show Nesseria gonorrhea (9.6%) while the result of mixed bacteria (E. coli & S. aureus) it was 22 sample (4.9%) by using (Api E - 20) system. Bacterial sensitivity to (11) antibiotic, included Ampcillin, Vancomycin, Ampicillin/Sulbactam, Ceftriaxone, Minocycline, Cefaclor, Cefuroxine, Cefotaxime, Amikacin, Ofloxacin, and Ciprofloxacin the results show high resistance to Ampcillin antibiotic (100%) while ''Ceftrtaxone '' show best action against (E. coli & S. aureus) . Ciprofloxacin was having the highly effect on the Nesseria gonorrhea . The research was included the study of antisperm antibody It was found that 284 sample (63.1%) from 450 sample were positive against antisperm antibody in seminal plasma and 270 sample (60%) from blood serum samples were found to be positive using '' Tray agglutinant test''. The highest molarity of seminal plasma was found to be (1 : 128) whereas the highest of blood serum was (1 : 1024).The ’ELISA’’ method was used to detect anti sperm antibody. The study showed that the most frequent in seminal plasma is Immunoglobuine ( IgA) , where 271 samples (95.4%) were found to be positive . ( IgG) was found to be the most existing one in blood serum; 225 samples ( 83.3% ) .Identification of how aggulation occurred as a result of contraries existence had been executed. It was approved that head to head is the most occurring one; 170 samples (39.9%) compared with tail to tail 37 ( 13%).There was a significant statistical correlation between the presesnce of pus cells in seminal fluid and antisperm antibodies in seminal plasma where the pus cells were found in (98.2%) 279 of the sample. While the infertile patients showed positive results or antibody without infection as being (5) specimens (1.7%) . In addition, there was a correlation between some diseases such as varicocele, Trauma & Atrophy , Mumps and testisculer biopsy and the existence of antisperm antibody (P< 0.001) in seminal plasma .The results showed that 393 patients ( 87.3% ) from 450 infertilities had normal hormone FsH (Follicle stimulating hormone) who had high level in blood serum against 57 patients (12.7%).The result also showed that 380 patients ( 84.4% ) had normal levels of (LH) in comparisn to 70 with ( 15.6%) high levels of LH in the blood serum. "Testosterone hormone" level was found to be normal in 334 patients ( 77.2%) and 116 patients ( 25.8%) showed high levels .

دراسة بكتيرية ومناعية لعوامل الضراوة المستخلصة من بكتريا Moraxella catarrhalis المعزولة من اصابات القناة التنفسية == Bacteriological and Immunological Study of Virulence factors extracted from Moraxella catarrhalis Isolated from Respiratory Tract Infections

Author name: حوراء عبد الامير علي الدهان
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي | نجاح رايش هادي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل وتشخيص 60عزلة من بكتريا Moraxella catarrhalis من 344 عينة مرضية وبنسبة 17.4% موزعة كالاتي (6.7 , 11.7 , 12.5 , 27.6 , 30) % لكل من مسحات الاذن ومسحات الانف وعينات القشع ومسحات البلعوم ومسحات اللوزتين على التوالي من المرضى المراجعين الى العيادة الاستشارية للانف والاذن والحنجرة والعيادة الاستشارية الصدرية في مستشفى الحكيم العام في محافظة النجف ومن مختلف الاعمار ولكلا الجنسين وللفترة من حزيران 2004 وحتى كانون الاول 2004م. اعتمدت الصفات الزرعية (للمستعمرات) والشكلية (للبكتريا)والاختبارات الكيماحيوية لتشخيص العزلات، فضلا عن اعتماد نظام API - NH . كانت النسبة المئوية لعزل البكتريا من الاناث (18.8%)اكثر مما هو عليه في الذكور (16.3%) فيما سادت الفئة العمرية 1ـ10 سنة حيث بلغت نسبة عزل المسبب المرضي فيها 20.4%. لغرض التحري عن طبيعة مقاومة العزلات قيد الدراسة للمضادات الحيوية المختلفة ،فقد اخضعت جميع العزلات لاختبار حساسيتها لـ 12 نوعا من المضادات الحيوية التي تستعمل في علاج الاخماج البكتيرية ،اذ اظهرت العزلات مقاومة تامة لكل من المضادات الحيويةAmpicillin وAmoxycillin وTetracyclin وبنسبة 100% لكل مضاد ، في حين اظهرت العزلات مقاومة معتدلة وبنسب (73.3 ، 71.7 ، 66.7 ، 61.7 ، 60 ، 58.3 ) % لكل من المضادات الحيوية Cefotaxime،Ciprofloxacin ،Nitrofurantoin ،Nalidixic acid ، Cephalothin وGentamycinعلى الترتيب ،لكنها كانت مقاومة وبدرجة منخفظة تجاه Chloramphenicol ,Cephalexin , Pipracillin اذ بلغت نسب المقاومة لها(30 , 36.7 , 38.3)% على الترتيب .واظهرت معظم العزلات مقاومة مشتركة لعدد من المضادات الحيوية قيد الدراسة ، كما واظهرت 91.7% من العزلات قدرتها على انتاج انظيم البيتالاكتاميز . في محاولة للتحري عن عوامل الامراضية لهذه البكتريا والمتمثلة بعوامل الالتصاق والاستعمار اظهرت العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الاول (CFA/I) والثالث (CFA/III) وبنسب (93.3 ،96.7 )% على التوالي ، في حين لم تظهر ايا من العزلات امتلاكها لعامل الاستعمار الثاني (CFA/II) .اظهرت 22 عزلة من بكتريا M.catarrhalis (36.7%) قدرتها على انتاج انظيم البروتيز الخارج خلوي في حين لم تظهر ايا من العزلات قابليتها على انتاج انظيم الهيمولايسين والسايدروفورات , فضلا عن عدم قدرتها على تكوين المحفظة . ولمعرفة قابلية العزلات البكتيرية على تكوين الشعيرات (Fimbriae) اجري فحص تكوين الغشاء الرقيق حيث تمكنت 80 % من هذه العزلات من تكوين هذا الغشاء عند نموها في الوسط الزرعي السائل في الوقت الذي استطاعت فيه 85%من العزلات من تلزين كريات الدم الحمراء للانسان صنف O+ وذلك للتحري عن امتلاك البكتريا للواصق التي تمكنها من الالتصاق بمستقبلات خاصة مؤلفة من مواد كاربوهيدراتية تعرف باسم (Gal α1 - 4Gal ß )موجودة على سطح كريات الدم الحمراء للانسان ، كما واستخدمت العزلة (6¬MO¬)المشعرة والملزنة والعزلة (MO1)غير المشعرة والملزنة لمقارنة معدل التصاقها بالخلايا الطلائية للانسان والمرسبة من الادرار مع معدل التصاق العزلة (MPn6)غير المشعرة وغير الملزنة ,اذ بلغ معدل التصاق العزلة (6¬MO¬) 54.1 خلية بكتيرية /خلية طلائية اعلى من معدل التصاق العزلة MO1 والعزلة MPn6 التي بلغ معدل التصاقها (9.6 , 23.9 ) خلية بكتيرية / خلية طلائية على الترتيب . وفي محاولة للتعرف على انماط التلازن الدموي للعزلات البكتيرية قيد الدراسة ,اجري فحص التلازن الدموي لجميع العزلات البكتيرية (60 عزلة) باستخدام دم الانسان والابقار والدجاج وخنازير غينيا على الترتيب وقد ظهر النمط(RRRN) بكونه الاكثر سيادة حيث بلغت نسبته حوالي 33.3% من العزلات قيد الدراسة . تم اختيار احد العزلات (MO6) باعتبارها عزلة كفوءة ومشعرة لثبوتية صفاتها المستضدية واعطائها للنتائج القياسية المعروفة في التفاعلات الكيماحيوية لاستخدامها في التجارب اللاحقة المتمثلة باستخلاص مستضدات عوامل الالتصاق ( الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي وعديد السكريد الشحمي ).المحور الثاني : استخلاص وتنقية المستضدات - تم استخلاص مستضد الشعيرات (Fimbriae) للعزلة المنتجة (MO6)باستخدام تقنية النبذ المركزي فائق السرعة لفصل الشعيرات وكذلك استخدام كبريتات الامونيوم بنسب تشبع مختلفة لغرض ترسيب البروتينات المستخلصة ، ومن ثم قدرت كمية البروتين في هذا المستخلص وكانت 0.525 ملغم /مل . - تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) للعزلة MO6 باستخدام الانظيمات (RNase وDNase ) والمنظف N - Lauroyl - Sarcosinate كما وقدر تركيز البروتين في مستخلص OMPs النقي اذ بلغ 0.6 ملغم /مل ، اما متعدد السكريد الشحمي (LOS ) فقد تم استخلاصه بتكسير الخلايا بالانظيمات والاستخلاص بالفينول المائي الساخن ، وبعد فصل كل من الطورين المائي والفينولي تمت ازالة سمية LOS في كل من الطورين باستخدام مادة Hydrazine اللامائية .وكما تم تقدير كمية الكاربوهيدرات الكلية في الطورين المائي والفينولي كليهما ,حيث بلغت (300 , 190)مكغم/مل على التوالي ,فضلا عن قياس النسبة المئوية للبروتين المرتبط مع LOS في الطورين والتي بلغت (13.3 , 11.8) % على الترتيب. المحور الثالث : الدراسة المناعية شمل هذا المحور دراسة تاثير مستضد الشعيرات وبروتينات الغشاء الخارجي (OMPs) المنقاة جزئيا ومتعدد السكريد الشحمي (LOS) المزالة سميته والمستخلصة من العزلة الكفوءة (MO6)لبكتريا M.catarrhalis على الاستجابة المناعية ومعرفة دور هذه المستضدات الثلاثة في تنشيط او تثبيط فعالية بعض الخلايا المناعية ,ولغرض تحقيق ذلك اجريت الاختبارات المناعية الاتية في الزجاج (In vitro )والمتمثلة بعيوشية الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية والتشكل الزهري التائي والبائي وهجرة الخلايا البلعمية متعددة اشكال النوى (PMNs), فضلا عن عملية البلعمة للخميرة Candida albicans المقتولة بالحرارة.ادى استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات (25 , 50 , 100 )مكغم/مل وتراكيزمن مستضد OMPs (50 , 100 , 200) مكغم/مل وتراكيز من مستضد LOS(200,100,50) مكغم /مل الى انخفاض معنوي (0.05 P <)في النسبة المئوية لعيوشية خلايا PMNs والخلايا اللمفاوية مقارنة بالسيطرة ,كما ادى استخدام التراكيز اعلاه ولكل المستضدات الثلاثة الى خفض معنوي في قطر منطقة الهجرة لخلايا PMNs . حيث كانت لجميع هذه التراكيز وللمستضدات الثلاثة تاثيرا مثبطا لهجرة خلايا PMNs وان تدرج التثبيط يزداد بصورة معنوية بزيادة تركيز المستضدات . اما فيما يخص عملية البلعمة التي استخدم فيها مستضد الشعيرات وOMPs وبالتراكيز (25 , 50 , 100 مكغم/مل) و(50 , 100 , 200 مكغم/مل) على التوالي , فقد لوحظ ازدياد معدل معامل البلعمة تدريجيا مع الزمن وبشكل معنوي (0.05 < P) حتى وصل اقصاه عند الوقت 90 دقيقة ، ثم انخفض بعد ذلك خلال الوقت 120 دقيقة ولجميع التراكيز المستعملة ولكلا المستضدين ، اما بالنسبة لمستضد LOS فقد لوحظ ان معدل معامل البلعمة يزداد وبصورة طفيفة وتدريجية واصبح بشكل معنوي عند الوقت 90 دقيقة من المعاملة ولجميع التراكيز المستعملة (200,100,50 ) مكغم /مل ,الا انه لم تظهر هنالك فروقات معنوية ( 0.05 P>) بين التركيزين (100 و200)مكغم /مل عند الاوقات (120,60,30) دقيقة ، كما وازدادت النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية المكونة للتشكل الزهري التائي الفعال والكلي وكذلك التشكل الزهري البائي وبتاثير معنوي (< 0.05 P) للمستضدات الثلاثة (الشعيرات , OMPs ,LOS)عند التراكيز نفسها مقارنة مع معامل السيطرة . اوضحت نتائج تجربة تمنيع الحيوانات المختبرية (الارانب )بمستضد الشعيرات وOMPs وLOS والمعدل المناعي (Immunoferon) امكانية الحصول على اجسام مضادة للمستضدات المستخدمة والتي استدل على وجودها باستخدام اختبار الترسيب في الانابيب ,حيث ظهرت حلقة ترسيب في الانابيب الحاوية على مصل الارنب الممنع بهذه المستضدات والمعدل المناعي عند التراكيز( 140,50,200,100) مكغم/مل على الترتيب ، في حين لم يظهر اختبار الانتشار المناعي المزدوج في هلام الاكروز (اختبارOuchterlony) اي نتيجة موجبة عند استخدام تراكيز من مستضد الشعيرات وLOS وImmunoferon عدا مستضد OMPs حيث ظهر خط ترسيبي مفرد عند التركيز 200 مكغم /مل .وان هذه النتائج تشير الى امكانية استخدام هذه المستضدات كمعدلات مناعية لقابليتها على تحفيز الخلايا اللمفاوية البائية على تكوين | Sixteen isolate of Moraxella catarrhalis was diagnostic from a total of 344 pathogenic specimens , Moraxella catarrhalis was isolated and identified in a percentage of 17.4% .Isolates of M.catarrhalis were distributed amony source of the pathogenic specimens to (30,27.6,12.5,11.7,6.7) % for swabs from ear, nose, sputum specimens, pharynex, and tonsiles, respectively. Specimens were collected from male and female patients of different age groups referred to the Ear Nose & Throat and Chest consultants clinics in Al - Hakim general hospital in Najaf Governorate from the period of June, 2004 to December, 2004.Cultural, microscopical, and biochemical characteristics were considered for diagnosis of this bacteria, in addition to use of API - NH system.Higher incidence of bacteria was detected in women (18.8 %) compared to men (16.3%).Age group of (1 - 10) year was the dominant infected group (20.4%) among others .To investigate the nature of resistant to various antibiotics ,the isolates were subjected to the sensitivity test of 12 antibiotics which are routinely used in treatment of infections caused by this organism.All isolates were exhibited complete resistance (100 %) to Ampicillin, Amoxycillin, and Ttetracycline, moderatly resistant in a percentages of (73.3 ,71.7,66.7,61.7,60,58.3)% for each Cefotaxime, Ciprofloxaciy, Nitrofurantoin, Nalidixic acid, Cephalothin, Gentamycin, respectively. While, sensitive to Chloramphenicol ,Cephalexin ,Pipracillin when their resistance reached only ( 38.3 , 36.7 ,30)% ,respectively. All isolates exhibited multiple resistance for many antibiotic used in this study ,and 91.7% of isolates presented the ability to produce β - Lactamase enzyme .To investigate the pathogenicity factors for M. catarrhalis such as adhesion and colonization factors, all isolates showed the ability to produce CFA/I and CFA/III in apercentage of 93.3,96.7 %, respectively. Whereas, non of the isolates showed no ability to produce CFA/II .Twenty two (36.7 %) of M.catarrhalis isolates only were able to produce extracellular protease, but all isolates were unable to produce hemolycin, sidrophores, and capsule. To detect the ability of isolates to produce fimbriae ,pellicle formation test was done, and it was found that 80 % of isolates were formed this pellicle when it was grown in the broth culture media .At the same time ,85% of isolates were found to be able to cause agglutination of human blood type O+ “ in order to detect the precence of adhesion in the bacteria which make it able to attach into carbohydrate specific receptors named (Galα - 4Galβ)which presented on the surface of human blood erythrocyte” .The fimbriated –hemagglutinated isolate (MO6) and non fimbriated - hemagglutinated isolate(MO1) were used to compared the bacterial adherenc rate on human uroepithelial cells with non fimbriated –non hemagglutinated isolate(MPn6) .The adherence rate of (MO6) isolate was 54.1 bacterial cells / epithelial cell Morethan that of (MO1) and(MPn6) isolates which presented in 23.9 , 9.6 bacterial cells /epithelial cell,respectively . Hemagglutination patterns for all isolates were done by using human ,bovine ,chicken and guinea pig ,respectively in Hemagglutination test. RRRN patterns the highere incidence pattern presented in 33.3% from all isolates . One isolate (MO6) was selected to be used in the following experiment as it is considered efficient and fimbriated with consistent antigenic properties and its typical biochemical characteristics such as extraction of adherence factors antigens (fimbriae ,outer membrane proteins and lipooligosaccharide).Second Aspect : Extraction and Purification of Antigens. - Fimbria antigen was extracted from MO6 producted isolate by using ultracentrifugation and ammonium sulfate in a different saturation percentages for fimbriae separation and extracted protein precipitation ,respectively .The protein concentration in this antigen was estimated which was 0.525 mg/ml. - RNase ,DNase (enzymes)and N - lauroyl sarcosinate(Detergent) were used to extract OMPs ,from selected isolate (MO6).Protein concentration of the purified extracted OMPs was estimated and found to be 0.6 mg/ml. Lipooligosacchoride (LOS) was extracted after cells were broken by the above enzymes .The extraction was performed by hot - phenol .After the aqueous and phenolic phases were separated, it was detoxified for each phases by using anhydrous hydrazine, and total carbohydrate quantities were estimated for each phase which were 300,190µg/ml , respectively . Morever,LOS bounded protein quantity in each phase was also estimated. The percentages of the protein bounded to LOS for aqueous and phenolic phases were 13.3 , 11.8 %,respectively .Third Aspect : Immunological StudiesThis aspect was investigated the effect of fimbriae ,OMPs which are partially purified, and detoxified LOS antigens isolated from M. catarrhalis (MO6) on immunoresponse and showed the role of this three antigens in activation or inhibition of some immunocellular activity. The following (In vitro)immunological tests were performed; Viability of PMNs and lymphocyte, B and T rosette forming assay ,migration of PMNs, and phagocytosis of Candida albicans . The concentration of fimbriae (25,50,100) µg/ml , OMPs (50,100,200) µg/ml and LOS(50,100,200) µg/ml decreased the viability percentage of PMNs and lymphocyte with significant differences (P<0.05) in comparison to the control treatment ,while, these concentration for each antigens inhibited the migration of PMNs cells in asignificant differences and the gradual inhibition decreased significantly with increase of antigens concentration . The concentration of fimbriae ( 25 , 50 , 100) µg/ml and OMPs (50, 100 , 200 ) µg/ml increased the phagocytic index (PI) Significantly and gradually with time untile it reach the maximum at time 90 min. Then PI decrease at the time 120 minutes . For all concentration of each antigens LOS antigen increase the PI significantly at 90 min. for all concentration but its non significant (P>0.05) at times (30,60,120)minutes between (100,200) µg/ml concentration .All concentration used for these antigens (fimbriae ,OMPs ,LOS) increased the percentage of T and B rosette assay with high signfacant differences in comparison to control . The study showed that rabbit immunized by fimbriae ,OMPs,LOS, and Immunoferon produced antibodies against these antigens which were detected by Ouchterlony double diffusion test which showed no precipitin line between any antigens and serum of immunized rabbit except OMPs showed single precipitin line at concentration 200 μg/ml ,While there was clear ring of precipitin was formed in the second method (tube precipitation test) .These results showed the ability of these antigens to act as immunomodulators due to their ability to stimulate β - lymphocyte to produce antibodies similar to immunoferon

دراسة تاثير بعض العوامل الخارجية في بقاء والتصاق بكتريا Acinetobacter baumannii على السطوح غير الحية == Study the effect of some external factors on survival and adherance of Acinetobacter baumannii on abiotic surfaces

Author name: حنين اكرم حبيب
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت عزلات من بكتريا Acinetobacter baumannii من سطوح غير حية مختلفة شملت قضبان الاسرة ومقابض الابواب والمغاسل والاغطية والوسائد وملابس العاملين , وقد تم الحصول على (149) عينة من مستشفى الكندي التعليمي , اذ زرعت العينات على اوساط زرعية صلبة (الماكونكي واكارالدم) ,وعلى ضوء التشخيص المجهري والزرعي والكيموحيوي , ومن ثم استخدم نظام Api 2o - E فقد تم الحصول على 16 عزلة من بكتريا A.baumannii وبنسب مئوية للعزل مقدارها (6.25 , 12.5 , 18.75 , 25 , 37.5) % لمسحات قضبان الاسرة , مقابض الابواب , المغاسل , الاغطية والوسائد , وملابس العاملين على التوالي . الخطوة الثانية تضمنت التحري عن العزلات البكتيرية المتحركة من بين 16 عزلة حيث كانت جميع العزلات البكتيرية متحركة حركة ارتعاشية على وسط الحركة شبه الصلب . اختبرت قابلية العزلات على الالتصاق وتكوين الغشاء الحيوي لعزلات بكتريا A.baumannii على السطوح غير الحية المصنعة من مواد مختلفة ( البلاستيك , الفولاذ والمسمى محليا ( Stainless steel) , البورسلين , الخزف , الخشب , الفورميكا , الزجاج , البوليستايرين ) وذلك بوضع كمية محددة من العالق الخلوي على تلك الاسطح ثم حضنها تحت درجات حرارية مختلفة وهي درجة حرارة الثلاجة (4)م درجة حرارة الغرفة - 20)25 (م ودرجة حرارة الحضن )37 (م ولفترات زمنية مختلفة (72,48,24) ساعة ومن ثم عمل مسحة لتلك الاسطح وزرعها على وسطBrain Heart Infusion Agar لمدة 24 ساعة تحت درجة حرارة 37 م لملاحظة مدى حيوية خلايا بكتريا A.baumannii او بعمل سلايد لسطوح الزجاج والبوليستايرين وقد اظهرت هذه النتائج ان هذه البكتريا تلتصق على السطوح غير الحية وبنسب متقاربة ما عدا الخشب فقد اظهرت البكتريا التصاقا قليلا على هذا السطح .

تثبيط تكوين biofilm لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من سرطان القولون والمستقيم والتهاب القولون التقرحي باستخدام جسيمات النانو لاكسيد الحديد المتراكبه

Author name: حنان طارق صبحي
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد بكتريا Pseudomoas aeruginosa ممرضة انتهازية تنتشر الاصابة بها في المرضى الذين يعانون تدهورا مناعيا ان دور هذه البكتريا في التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم لم يتم التطرق اليه.وهذا ماتتطرق اليه هذه الدراسة في جزء منها يعاني مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون - المستقيم تغير في التعبير عن مستضدات مجموعة الدم ABO ومجموعة دم لويسLewis في ميوسين الخلايا الظهارية القولونية وهذا ما يوفر بيئة لالتصاق البكتريا . تؤشر الدراسة الحالية دور الاستيطان البكتيري لهذه البكتريا لنسيج القولون في كلا المرضين وارتباط ذلك بمجموعة الدم ومجموعة دم لويس اضافة الى دور مجموعة دم لويس في المشاركة في انشاء الغشاء الحيوي البايوفيلم biofilm لهذه البكتريا .تشير نتائج عزل بكتريا Pseudomoas aeruginosa انه من بين 38 اصابة تم عزل البكتريا بنسبة 23% p=2.6×10 - 6 , من مرضى السرطان اضافة الى عزلها بنسبة p=7.35 ×10 - 5 , 25% من مرضى التهاب القولون التقرحي. اظهرت نتائج تنميط مجموعة لويس بوجود عالي لمجموعة دم لويس بي Leb (78.9%) p=3.45×10 - 12 في المرضى مقارنة بالسيطرة من جانب اخر اثر ارتفاع نسبة مجموعة الدم Aفي المرضى الا ان التحليل الاحصائي لم يظهر تغيرا معنويا .P=0.1 (×̅=45%)وفي جانب دراسة تكوين العزلات للغشاء الحيوي بارتباطها في الميوسينات اللعابية المغطية لحفر الاطباق فقد اكدت النتائج ان جميع العزلات كانت لها القدرة على تكوين البيوفلم مع زيادة كتلة بيوفيلم على لعاب مجموعة الدم لويس للافراد الاصحاء المغطية ل 96 حفرة .microtitration plate وتغاير تكوين العزل للرقيق الحيوي اعتمادا على نوع الضرب المعزول وقد اثر التركيز المثالي المغطي coating concentration للميوسينات اللعابية بان تخفيف1\16للعاب.وفي جانب اخر من الدراسة فقد تم تحضير الجسيمات النانوية وتم ربطها بنضائد واستعملت تلك في مسح قابلية تلك التحضيرات على تثبيطها للغشاء الحيوي حيث جرى تحضير الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد (IONP) باستخدام طريقة coprecipitation وفي هذا الجانب فقد تم تقدير حجم الجسيمات النانوية naked iron oxide باستعمال مجهرالقوة الذرية (Atomic Force Microscope) AFMوالتحليل الكيميائي للجسيمات النانوية باستخدام جهاز التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء FTIR) ) Fourier Transform Infrared Spectroscopy واتضح ان معدل قطرحجم الجسيمات لاكسيد الحديد النانوية 85.09 نانومتر في حين اظهرت التحضيرات النانوية - المنضدة Liganded - nanoparticles مايلي اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان (chitosan) متوسط قطر85.14 نانومتر. اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين(glucosamine) متوسط قطر 89.71 نانوميتر بينما اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري (polysaccharide) 107.20 نانومتر. تم تحديد احجام للجسيمات النانوية - الميوسين ايضا.حيث اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis a بمتوسط قطر 91.46 نانوميتر ، الجسيمات النانوية - الميوسين Lewis b 93.18 نانوميتر بينما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الفارزة كان متوسط قطرها 80.23نانوميتراما الجسيمات النانوية - الميوسين - b - Lewis a الغير فارزة كان متوسط قطرها 103.46نانوميتر.وقد اظهرت نتائج التحليل الطيفي بالاشعة تحت الحمراء (FTIR) على قابلية ارتباط النضائد بالجسيمات النانوية بين اكسيد الحديد والجتوسان، الكلوكوزامين، عديد السكرايد البكتيري والميوسين اللعابي لمجموعة الدم لويس. حيث اظهرت الجسيمات النانوية لاكسيد الحديد ارقام موجية منخفضة بين 850 و400 سم - 1 قادمة من الاهتزازات للاصرة Fe - O بينما اعطى اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجتوسان امتصاص عند 1111 سم - 1 (COC) ، اختفاء الاصرة C - N وتغير الاصرة C - H من الموقع 2839 سم - 1 الى 3196 سم - 1, تغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1614 سم - 1.اما اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين اظهرت اختفاء الاصرة C - N , تغير الاصرة C - O - C من الموقع1031سم - 1 الى1099 سم - 1 وتغير الاصرة H - N من 1616 سم - 1 الى 1541 سم - 1 وظهور مجموعة OH في الموقع 3377 سم - 1.وفي جانب اخر اظهرت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري ظهور الاصرة C - ONH2 في الموقع 1649 سم - 1 والاصرة N - H 1543 سم - 1. في حين اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين اظهرت الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a ظهور الاصرتين C= N,C= C في الموقع 1622 سم - 1, 1649 سم - 1 اما بالنسبة للجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis b ظهور الاصرتين C= N, C=C في الموقعين 1612 سم - 1 , 1649 سم - 1 بينما الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - non secretor اظهرت الاصرتين C= N, C= C في الموقعين 1670 سم - 1 , 1647 سم - 1. الجسيمات النانوية - الميوسين لويس Lewis a - b - secretor اظهرت الاصرتين C= N,C= C في الموقعين 1627 سم - 1, 1651 سم - 1. وفي نتائج التثبيط للغشاء الحيوي للبكتريا فقد اوضحت النتائج ان النضائد النانوية لها فعل مثبط لتكوين الغشاء الحيوي . ففي هذا الجانب فان تعرض البكتريا لاكسيد الحديد النانوية ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالجيتوسان ، اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالكلوكوزامين ,اكسيد الحديد النانوية المغلفة بالميوسين بتركيز 100 ملغم \سنتيمتر مكعب لمدة 24 ساعة خفض انتاج الغشاء الحيوي وكالاتي : الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد اعطت اعلى نسبة تثبيط 52% بينما الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الجتوسان اعطت اعلى نسبة تثبيط 58%(p=0.5) , الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الكلكوزامين اعطت اعلى نسبة تثبيط 39%(p=0.1). الجسيمات النانوية لاوكسيد الحديد - الميوسين الغير فارزa - b - اعطت اعلى نسبة تثبيط 74% (p=6.8×10 - 3) وفي جانب اخر اعطت اكسيد الحديد النانوية المغلفة بعديد السكرايد البكتيري اعلى نسبة تشجيع بناء 75% (p=0.3).ان النتائج الاصلية المؤثرة في هذه الدراسة والمسجلة لاول مرة اظهرت ان التطبيقات المستقبلية للجسيمات النانوية المغطاة بالنضائد المحضرة في علاج الغشاء الحيوي لبكتريا P. aeruginosa يمكن اعتمادها كطريقة للقضاء على استيطان البكتريا في مرضى التقرح القولوني وسرطان القولون - المستقيم | Pseudomoas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium. The infection with the microorganism prevail in immunocompromised patients. The role of P. aeruginosa in ulcerative colitis and colorectal cancer is not studied and this part is dealt with this study. In this regard, Ulcerative colitis (UC) and colorectal cancer (CRC) patient change the expression of ABO and Lewis blood groups antigens in colon epithelial mucin structure and might furnish an environment for bacterial attachment. The present study aimed to pinpoint a role for P. aeruginosa in colonization of colon tissue in both diseases in relation to ABO and Lewis blood groups. In addition the involvement of Lewis blood group molecule in biofilm formation was investigated. In an another part of the study a specific liganded - nanoparticles prepared were screened for inhibition of such biofilm. Isolation of the bacteria from direct biopsy samples of UC and CRC indicated that, out of 38 cases collected, 9 isolates were found to be P. aeruginosa 6 (23%) p= 2.6×10 - 5 in colorectal cancer cases and 3 (25%) p= 7.35×10 - 6 in ulcerative colitis. Patient Lewis typing revealed that Leb prevailed among patient giving a (78.9%) results and was highly significantly (p=3.45˟ 10 - 12) compared with control (29.7%). Blood group (A) seem to be highly prevalent but not significant (p=0.193) in colorectal cancer and ulcerative colitis patients. All isolates from patients were able to form biofilm with increased biofilm mass on Lewis group saliva of normal individual coated on 96 - wells microtitration plate. The results were variable depending on bacterial strain. An iron oxide nanoparticle (IONP) was prepared using the method of coprecipitation and was used as carrier of different ligands. The naked and coated iron oxide nanoparticles were characterized using Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) and Atomic Force Microscope (AFM). Particle size for naked iron oxide (IONP) was 85.09 nm and for chitosan coated iron oxide nanoparticles the average diameter was 85.14 nm while glucosamine coated iron oxide nanoparticles was in 89.71nm. Bacterial polysaccharide coated iron oxide nanoparticles gave a size of 107.20 nm. Particle sizes for mucin - IONP composite were also determined. Lea - IONP was an average diameter 91.46nm, Leb - IONP was 93.18nm, Lea - b - secretor - IONP was 80.23nm and Lea - b - nonsecretor was in 103.46nm determined by AFM. The Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) analysis indicated successful binding between iron oxide and chitosan, glucosamine, polysaccharide and mucin Lewis groups glycans. Iron oxide nanoparticle showed low wave numbers between 850 and 400 cm - 1 coming from vibrations of Fe - O bonds.Chitosan coated iron oxide gave an absorption line at 1111 cm−1 (C - O - C) bond, and N - H bond at 1614 cm - 1, 1410 cm - 1, C - H bond and 3589 cm - 1 for O - H bond. Glucosamine coated iron oxide demonstrated a characteristic bands such as OH group at 3377 cm−1, C O at 1618 cm−1 and C - O - C at 1099 cm−1 and 1031cm−1 stretching vibration of C - O - C. Polysaccharide appeared to have 1649 cm - 1 (CONH2) and 1543 cm - 1 (N - H) band. While mucin Lea coated iron oxide demonstrated 1622 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C and mucin Leb coated iron oxide gave 1612 cm - 1 1649 cm - 1 C= N, C= C on the other hand, mucin Lea - b - secretor coated iron oxide showed 1627 cm - 1 1651 cm - 1 C= N, C= C and mucin Lea - b - non secretor coated iron oxide gave1647 cm - 1 1670 cm - 1 C= N, C= C The Fourier transform infrared spectroscopy study analyses confirmed the successful attachment different ligands to the surface of magnetic nanoparticles. In experiments of P. aeruginosa biofilms inhibition by liganded nanoparticles, it was seen that exposure of cells to naked iron oxide, chitosan coated iron oxide , glucosamine coated iron oxide and mucin coated iron oxide at concentrations of 100mg/ml resulted in reduced biofilm biomass in a 24h exposure time. In contrast, polysaccharide coated iron oxide nanoparticle showed increased biofilm formation (75%). Naked nanoparticles resulted in 52% inhibition in biofilm formation, chitosan coated nanoparticles resulted in (58%) inhibition p=0.5, glucosamine coated nanoparticles resulted in (39%) inhibition p=0.1, while mucin coated nanoparticles gave (74%) inhibition p=6.8×10 - 3 especially in non secretor Lea - b - coated nanoparticles and was the best liganded nanoparticles biofilm. Polysaccharide ̶ nanoparticle gave (75%) augmentation p=0.3. The inhibition was seems to be variable between saliva Lewis group tested. The novel findings presented in this study demonstrated the futuristic application of ligands coated iron oxide nanoparticles in treating P. aeruginosa biofilm formation could be an approach to eradicate P. aeruginosa infection which may lead to ulcerative colitis and colorectal cancer patients.

دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة (Crustacea : Copepoda) Cyclopoida لمنطقة الفرات الاوسط /العراق == Taxonomic Morphological Study on Some Species of Order Cyclopoida (Crustacea : Copepoda) in Middle Euphrates Region / Iraq

Author name: حنان زوير مخلف حسين الدعمي
Supervisor name: حسن سعيد جاسم الاسدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Invertebrates
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمن البحث دراسة تصنيفية مظهرية لبعض انواع رتبة Cyclopoida جمعت من بعض مناطق محافظات منطقة الفرات الاوسط وهي : كربلاء المقدسة وبابل والنجف الاشرف والقادسية. تم وصف اثنا عشر نوعا لعائلة Cyclopidae تابعة لستة اجناس تعود لعويلتين هما : Cyclopinae وEucyclopinae. اوضحت الدراسة ان انواع عويلة Cyclopinae اكثر انتشارا ، وتميز جنس Mesocyclops بكثرة انواعه بين الاجناس الاخرى حيث تم تسجيل خمسة انواع تعود لهذا الجنس ،علما انه تم الاعتماد ووصف الذكور لبعض الانواع ولاول مرة خلال هذه الدراسة. وهذه الانواع هي : Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) اعتمد على النوع Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) كنموذج للعائلةFamily Type. صيغت مفاتيح تصنيفية لعزل العويلات والاجناس والانواع. كما تم تدوين معلومات عن مناطق الجمع وتواريخها ووقتها وعدد الانواع بالاضافة الى تدوين درجات الحرارة والاس الهيدروجيني.*تسجيل جديد اول للمجموعة الحيوانية العراقية )صنف القشريات(. | The Present study included taxonomic morphological study on some species of order Cyclopoida that collected from some regions of Euphrates governorates : (Holy Karbala, AL - Najaf ALAshraf, Babylon, AL - Qadisyah). Six genera and twelve Species were recorded belong to family Cyclopidae which including two subfamily : Cyclopinae and Eucyclopinae. Also in this study the males have been used firstly to some specieses in the taxonomic as procedure .Subfamily : CyclopinaeGenus : Mesocyclops Sars, 1914* Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906)*Mesocyclops aequatorialis Kiefer, 1929*Mesocyclops thermocyclopoides Harada, 1931*Mesocyclops granulatus Dussart & Fernando, 1988*Mesocyclops pehepiensis Hu, 1943Genus : Diacyclops Kiefer 1927*Diacyclops bisetosus (Rehberg, 1880) Diacyclops bicuspidatus (Claus, 1857) *Genus : Megacyclops Kiefer, 1927*Megacyclops cf viridis (Jurine, 1820)Genus : Microcyclops Claus,1893*Microcyclops varicans(Sars G.O., 1863)*Microcyclops pachyspina Lindberg,1937*Genus : Cryptocyclops Sars, 1927* Cryptocyclops linjanticus (Kiefer,1928)Subfamily : EucyclopinaeGenus : Macrocyclops Claus ,1893Macrocyclops albidus(Jurine,1820) Mesocyclops aspericornis (Daday, 1906) has been studied here in more details particularly in morphological characters. Taxonomic keys were formulated to isolate subfamilies, genera and species. Information about sites collection , dates and times as well as number of species, in addition information about temperatures and pH. were recorded*New First record to Iraqi Animalia Group (Class : Crustacea)

كشف عن الجينات المشفرة لانتاج البايوسين من بكتريا Pseudomonas aeruginosa ومقارنة الانتاج مع تكوين الغشاء الحيوي == Detection of Genes Encoding Pyocin Production of Pseudomonas aeruginosa and Comparison the Production with Biofilm Formation

Author name: حسين ظاهر عليوي التميمي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت50)) عزلة تابعة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa من مستشفيات مختلفة في بغداد وخلال شهر ايلول لغاية شهر الكانون الاول لسنة (2014). تم اخذ هذه العزلات من مصادر مختلفة ثم شخصت بالاعتماد على الصفات المظهرية والمجهرية عند تنميتها على الاوساط التفريقية والاختيارية فضلا عن الفحوصات الكيموحيوية ولتاكيد نتائج الفحوصات الكيموحيوية استعمل نظام VITEK2 Compact كخطوة تكميلية. كما تضمنت الدراسة التصنيف المصلي لاجناس P. aeruginosa حيث تتعدد الانماط المصلية لهذه البكتريا حيث كانت ( : 11, O : 9, O : 8 and O : 7) بعد فحص العزلات. كان النمط المصلي (O : 11) الاكثر شيوعا وانتشارا من الانماط الباقية .كانت الانماطO : 8) وO : 9) اقل انتشارا ويعد النمط المصلي (O : 7)من الانماط حديثة الظهور. استعملت في هذه الدراسة طريقة Cross Streaking Method للكشف عن قدرة البكتريا على انتاج البايوسين حيث استخدم الوسط trypticase soy agar في هذه الطريقة, كانت العزلات المنتجة للبايوسين (P) قادرة على انتاج البايوسين عندمزارعت بشكل خط مستقيم وذلك بعد ان حضنت لمدة 24 ساعة وبدرجة37 مئوية, العزلة الدالة(I) فقد زرعت بشكل خط عمودي على العزلة المنتجة (P). ان غياب النمو البكتيري في الوسط الزرعي وعند نقطة التقاء الخطين دلالة على انتاج البكتريا للبايوسين, اذ لوحظ ان (16) عزلة من اصل (50)عزلة لها القدرة على انتاج البايوسين.واستعملت في هذه الدراسة طريقتين للتحري عن تكوين الغشاء الحيوي وهي طريقة Congo Red Method (CRA) وطريقة اطباق المعايرة Micro Titration Plate Method (MTP). اظهرت النتائج ان طريقة (MTP) كانت اكثر حساسية في التحري عن تكوين الغشاء الحيوي ، اذ لوحظ ان (19) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة (38%) كانت مكونة للغشاء الحيوي وبشكل قوي ، في حين كانت (13) عزلة وبنسبة (26%) مكونة للغشاء الحيوي وبشكل ضعيف ، لكن كانت هنالك (18) عزلة وبنسبة (36%) غير مكونة للغشاء الحيوي. في حين بينت النتائج الخاصة بطريقة ال (CRA) ان (33)عزلة وبنسبة (66%) كانت قادرة على انتاج الغشاء الحيوي ، بينما كان عدد العزلات غير المكونة للغشاء الحيوي (17) عزلة وبنسبة (34%).اخضعت جميع العزلات (50 عزلة) للفحص بواسطة تقنية Polymerase Chain Reaction(PCR) لتشخيص الجينات المسؤولة عن انتاج البايوسين من نوع S باستخدام برايمرات خاصة لكل من (S1S2 pyocin) و(S3 pyocin). اظهرت نتائج تقنية الPCR بان (24) عزلة من اصل (50) عزلة وبنسبة تقدر ب (48%) تمتلك جين S1S2 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 287bp), لكن هنالك (21) عزلة وبنسبة (42%) تمتلك جين S3 (اذ كان ناتج تقنية البلمرة لهذا الجين بالحجم 451bp). | Fifty bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa have been collected from many hospitals in Baghdad include : Al - Kindy hospital, Ibn Al - baladi hospital, wound and burn hospital and Baghdad hospital in medical city during the period from Sep. to Dec. (2014). These isolates were collected from different sources. Then, they were diagnosed depending on morphological and microscopic properties when they were cultured on selective and differential culture media as well as by using biochemical tests, then in order to confirm the results of biochemical test VITEK2 compact have been used as a confirmatory step. Serotype classification of P. aeruginosa isolates showed multiple serotypes were existed (O : 11, O : 10, O : 9, O : 8, O : 7 and O : 5) for isolates which tested and (O : 11) serotype consider as more frequent serotype as (48%) whereas (O : 9, O : 5 and O : 8) are low spreading serotypes as (8%, 10% and 12%) respectively, while (O : 7) serotype as (4%) represent appearance of new serotype in comparison with local studies. In this study, pyocin production was detected by using cross streaking method, it was applied by using trypticas soy agar media. In this method producer isolates (P) which were able to produce pyocin were cultured as straight line and after incubation at 37Co for 24h., inducer isolates (I) were cultured on media as a vertical on the first line (producer isolates).Absence of bacterial growth on the media which were cultured by vertical line on producer bacteria leads to pyocin that produce by producer isolate prevent growth of inducer isolates, where it had been noted that (16) isolates out of (50) isolates have the ability to produce pyocin.Ability of bacterial isolates to produce biofilm was detected by two methods : these methods are Congo Red Agar method (CRA) and micro titration plates method (MTP). Results have been showed that (MTP) method was more sensitive to determine biofilm producers. It was noted that (19) isolates from (50) isolates as a (38%) were powerful biofilm producers while (13) isolates as a (26%) were weak biofilm formation, but there were (18) isolates as a (36%) were non - biofilm producers. On the other hand the (CRA) method appeared that (33) isolates as a (66%) were able to produce biofilm while non - biofilm formation isolates were (17) isolates as (34%).All fifty isolates were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect gene responsible for S type pyocin by using primers specific for S1S2 pyocin and S3 pyocin. Results appear that there were (24) isolates from all (50) isolates (48%) contained the S1S2 gene, but there are (21) isolates also from (50) isolates as a (42%) contained S3 gene. The total number of isolates which contain genes encoding of S - type pyocin production (both S1S2 and S3 genes) were (31) isolates as (62%).The results have shown that there were (39) isolates as (78%) have the ability to produce pyocin by both phenotypic and genotypic methods (cross - streaking and PCR technique), while there were (43) isolates as (86%) able to produce biofilm by both CRA and MTP methods. Relationship between pyocin production and biofilm production were shown that all isolates have the ability to produce pyocin at least by one method were able to produce biofilm and at least by one method too

تحديد مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين والابيشتاين بار فايروس في امصال المرضى العراقيين المصابين باللاهودجكن اللمفاوي == Detection of interleukin 10 , Adiponectin and Epstein Bar Virus in sera of Iraqi patients with Non - Hodgkin's lymphoma

Author name: حسنين سمير الهاشمي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | زياد احمد شبيب الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد مرض اللاهودجكن اللمفاوي مجموعة من سرطانات الخلايا اللمفاوية والذي تتطورفيه الخلايا المفاوية بطريقة خاطئه مؤدية الى اضطرابات مناعية .تم خلال الدراسة الحالية تقييم بعض المؤشرات المناعية في امصال (46) عراقيا من مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ومقارنتها مع (46) فردا مضاهيا من الاصحاء ظاهريا .اجريت الدراسة في المركز الوطني لبحوث وعلاج امراض الدم وفي قسم علوم الحياة في الجامعة المستنصريه منذ كانون الثاني الى حزيران من العام 2013. هدفت الدراسة لتقييم مستويات الانترليوكين 10 والاديبونكتين واضداد (EBV) في امصال مرضى اللاهودجكن اللمفاوية ودراسة اثر هذه المتغيرات في الامراضية والتنبؤ بسير المرض وكيف يؤثر بعضها في البعض .كان 31 (67%) مريضا (≥ 50) سنة و15 (33%) منهم باعمار(<50) سنة . وكان متوسط اعمار المرضى (52.74متوسط± 2.18) اذ تراوحت اعمارهم بين (17 - 80) سنة وقد بينت نتائج الدراسة ان الذكور هم اكثر عرضه للاصابة بالمرض مقارنة بالاناث وبنسبة 1 : 1.7 . كما تبين من الدراسة هنالك فروقات معنوية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين (50≤ و50≥) فضلا عن الفروقات كانت معنويه(0.05 > p) بينهما في مستويات الاضداد (EBV IgM) في الوقت الذي لم تكن الفروق معنويه (0.05 < p) لاضداد (EBV IgG) . تبين كذلك ان هنالك فروقات في مستويات الاديبونكتين المصلية (0.05 > p) بين المجموعتين العمريتين في ما لم تكن الفروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الانترليوكين 10 بين المجوعتين العمريتين . عند تقسيم المرضى تبعا للجنس 29 ذكر و17 انثى , بينت النتائج ان هناك فروقات معنوية في اعداد خلايا الدم البيض بين الجنسين (17.32*109/لتر ± 6.87 ذكور , 5.80*109/لتر± 0,85 اناث) (0.05 > p).وبشان مستويات اضداد EBV (IgM,IgG) لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) بين كلا الجنسين , كما لم تكن هنالك فروقات معنويه (0.05 < p) في مستويات الاديبونكتين . فيما كانت الفروقات ذات دلاله معنويه في مستويات الانترليوكين 10 (23.77 بيكو غرام / مل ±6.58ذكور , 12.06 بيكوغرام/مل ±3.77 اناث ) (0.05 > وبمقارنة المرضى بالاصحاء كانت هناك فروقات معنوية (0.05 > p) في اعداد كريات الدم البيضاء فما لم تكن الفروقات معنوية (0.05 < p) بالنسبة EBV (IgM,IgG) .اما مستويات الاديبونكتين المصلية فقد انخفضت معنويا في امصال مرضى اللاهودجكن المفاوية (وان بقيت مستوياتها ضمن الحدود الطبيعيه ) بالمقارنة مع الاحصاء (0.05 > p).سجلت النتائج ارتفاعا معنويا (0.05 > p) في مستويات الانترليوكين 10 (18.67بيكو غرام/مل ±4.12 )بالمقارنة مع مستوياته (3.4بيكوغرام /غرام ±0.73) عند مجموعة الاصحاء , كما لوحظ ان هنالك ارتفاعا معنويا (0.05 > p) اخر في امصال اللاهودجكن ذوي المراحل المتقدمة (33.1 بيكو غرام /مل ± 4.5) عند مقارنتهم بالمرضى في المراحل المبكرة (13.4 بيكو غرام /مل ± 2.7) (0.05 > p)وعلى العكس من ذلك انخفضت مستويات الاديبونكتين معنويا (0.05 > p)في المراحل المتقدمة من المرض (4.53مايكروغرام /مل ±1.4 ) مقارنة بالمراحل المبكرة (6.79مايكرو غرام /مل ±1.1). بينت نتائج التحليل الاحصائي انه ليس هنالك ثمة علاقة معنويه (0.05 < p)بين الانترليوكين 10 والاديبونكتين عند مرضى اللاهودجكن اللمفاوي في جميع مراحلة . خلصت الدراسة بالاستنتاج ان حالات اللاهودجكن المدروسة اكثر حدوثا في فئات عمرية فوق الخمسين سنة بالمقارنة مع من هم تحت ال 50 سنة وترافقهزايادة في مستويات الانترليوكين 10 مع تقدم عمر المريض وارتباطها كذلك مع شدة المرض مما قد يعكس القيمة التنبؤية لهذا السياتوكين . فيما ارتبط انخفاض مستويات الاديبونكتين مع ارتفاع خطورة الاصابة بالمرض ومع اشتداد المرض . يرتبط الانخفاض في مستويات الاديبونكتين عكسيا مع مؤشر كتلة الجسم (BMI). سجل خلال الدراسة انخفاض مستويات (EBV IgM) في المرضى باستخدام تقنية الايلايزا يعكس الحاجة لاستخدام تقنيات اخرى للكشف عن الفايروس المختبىئ . | Non hodgkin's lymphoma (NHL) is a group of cancers of the lymphocytes. In NHL, the lymphocytes develop in a wrong way led to immune disorder. The present study was carried out to evaluate some immunological parameters in the sera of (46) NHL Iraqi patients , In addition to control group involving (46) matched apparently healthy subjects. This study was done in the National center of hematology & Department of biology at AL - Mustansiyria University since January to June 2013.The aim of this study is to estimate the levels of Interleukin 10, Adiponectin and EBV infection in sera of patients with NHL and to study the impact of these parameters on the pathogenesis and predictive of the disease and how they correlated.There were 31 out of 46 (67%) patients with age group ≥50 years and 15 out of 46(33%) patients with age group <50 years. The mean age of NHL patients was (52.74) years ranging from 17 to 80 years. The patients were divided into two groups according to the age(≥50years and <50 years)patients .There was statistically significant difference (p<0.05) in White blood cells count between age groups . The mean of adiponectin serum level was significantly differ (p<0.05) between the two age groups.The mean of IL - 10 serum levels did not show a significant difference between the two age groups (p>0.05).The mean of adiponectin serum level in NHL patients wasn't significantly (P>0.50) differ between male and female while the IL - 10 level in serum was significantly different (23.77pg/ml ± 6.58 male, 12.06 pg/ml ± 3.77 female) (P<0.05).When the patients of NHL compared with control, the mean of white blood cell count was significantly different ( p<0.05) also there was non - significant differences(P>0.05) in mean of EBV - IgG & IgM among NHL patients and control group. The mean level of adiponectin serum was a statistically decreased in patients of NHL as compared with control subjects(p<0.05), but still these levels are within normal range, furthermore The levels of interleukin 10 were significantly increased in patients with NHL compared with healthy subjects (18.67 ± 4.12 pg/ml vs. 3.4 ± 0.73pg/ml) (p<0.05). Higher increasing of IL - 10 levels in the advanced stage patients of NHL was noticed compared with early stages (33.1 ± 4.5 pg/ml vs. 13.4 ± 2.7 pg/ml) (P<0.05). Otherwise the serum levels of adiponectin in aggressive stage of NHL patients was decreased compared to the early stages of that disease (4.53 ± 1.4 µg/ml vs. 6.79 ± 1.1 µg/ml ) (P<0.05). There was no significant negative correlation between IL - 10 and adiponectin in all NHL patients (p>0.05) also there was no significant correlation between IL - 10 and adiponectin in patients with advanced stage (p>0.05). In conclusion, NHL was noticed in the highest ages and it might indicates the increasing rates of NHL among older population. in addition increasing level of IL10 is associated with increasing age range and also correlated positively with aggressive NHL cases that might indicates the predictive pivotal role of this cytokine . Moreover, Lower adiponectin levels are associated with an increased risk of NHL. Adiponectin is inversely correlated with Body mass index and also it was decreased in aggressive cases compared to early stages. The low percentage of EBV IgM in NHL patients by using Elisa technique might indicates the Necessity for using other advanced technique to detect EBV infection either an action or silent form

دراسة بكتيرية ومناعية للانظيم الحال للبروتين نوع - ا - المستخلص من بكتيريا Proteus mirabilis المعزولة من خمج السبل البولية == Bacteriological and Immunological Study of IgA - Protease Enzyme Extracted from Proteus mirabilis Isolated from Urinary tract infection

Author name: حسن علي حسين السعدي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت هذه الدراسة اربعة محاور : 1 - العزل والتشخيص : تم عزل وتشخيص (40 ) عزلة من بكتيريا Proteus spp. من مجموع ( 200 ) عزلة بكتيرية من عينات اخماج مرضى السبل البولية في مستشفيي مدينة الطب والكندي للفترة بين 1/3/2004 لغاية 30/10/2004.اظهرت الفحوصات الكيميائية الحيوية ان 40 عزلة بكتيرية (20% ) من العزلات البكتيرية كانت تنتمي الى جنس Proteus والتي اشتملت على ( 37 ) عزلة تعود الى بكتيريا)P. mirabilis18.5%) ثلاث عزلات من بكتيريا Proteus vulgaris. عشر عزلات من بكتيريا P. mirabilis كانت منتجة للانظيم الحال للبروتين (IgA Protease)، بينما كانت عزلات بكتيريا Proteus vulgaris غير منتجة للانظيم المذكور ،واختيرت العزلة (Pm5)P.mirabilis كعزلة منتجة للانظيم.2 - تنقية وتوصيف الانظيم : اختير الوسط مرق ( Cysteine lactose electrolyte deficient ) كافضل وسط زرعي لانتاج الانظيم من بكتيريا Proteus mirabilis وتم تنمية العــــزلة البكتيريـــة( Pm5) في درجة حرارة( 37 )م باستخدام الحاضنة الهزازة وثم نقي الانظيم باستخدام الترسيب ملح كبريتات الامونيوم بتشبع(60%) وديلزته واستخدام هلام السيفادكس G - 100 Sephadex وكذلك المبادل الايوني DEAE - Cellulose، قيست الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين للانظيم في كل مرحلة من مراحل التنقية ظهر منحني تنقية الانظيم باستخدام هلام السيفادكس وجود اربعة قمم بروتينية منها قمة واحدة للانظيم الحال للبروتين بينما اظهرت طريقة استخدام المبادل الايوني قمة واحدة فقط، تم حساب الفعالية الانظيمية وتركيز البروتين والفعالية النوعية والفعالية الكلية وعدد مرات التنقية والحصيلة الانظيمية فكانت على التوالي : (28.7)وحدة/مل،(0.15)ملغم/مل، (191.3)وحدة/ملغم، (258.3)، (5.5)،(9.9%) عند التنقية باستخدام المبادل الايوني وحسب الوزن الجزيئي للانظيم اذ كان (50)كيلودالتون باستخدام طريقة الترشيح الهلامي وكانت الفعالية المثلى للانظيم عند الاس الهيدروجيني 8 ودرجة الحرارة المثلى لانتاج الانظيم هي (37)م ودرجة الحرارة الملائمة لخزن الانظيم هي (4)م مقدارها وكان للايون (Ca+2) تاثير واضح في زيادة فعالية الانظيم بينما كان للـEDTA تاثير مثبط على فعالية الانظيم. 3 - الدراسة المناعية : - استعملت ثلاث مجاميع من الارانب لغرض التمنيع (ارنبين لكل مجموعة) حقنت داخل العضلة باستعمال تراكيز مختلفة من الانظيم(0.2،0.5،1)ملغم/مل فضلا عن ارنبين ضمن مجموعة السيطرة. اتبعت طريقتين (الاوكترلوني والترسيب باستعمال الانابيب) لغرض التحري عن الاضداد المتخصصة للانضيم الحال للبروتين في مصل الارنب، اظهرت النتائج عدم تكون الخط الترسيبي عند استعمال طريقة الاوكترلوني بينما تكونت حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب. تم فصل امينوكلوبيولينات الارنب باستعمال المبادل الايوني DEAE - Cellulose بعد عملية الفصل ظهرت ثلاث قمم بروتينية على الطول الموجي 280 نانوميتر تم اختبار فعالية الانظيم في كل قمة مقارنة بالقمم المؤشرة في الادبيات، اظهرت القمة الثالثة حلقة ترسيبية واضحة باستعمال طريقة الترسيب بالانابيب بينما لم تظهر خط ترسيبي باستعمال اختبار الاوكترلوني وهذا قد يدلل على وجود تحت الانواع IgG المقاومة لفعالية الانظيم الحال للبروتين ضمن هذه القمة. تم دراسة تاثير التراكيز المختلفة للانظيم الحال للبروتين (0.2، 0.5، 1)ملغم/مل على بعض الخلايا المناعية وفق المعايير التالية : اذ ادى تركيز الانظيم(0.2)ملغم/مل الى زيادة في عيوشية الخلايا اللمفاوية وخلايا متعددة النوى (PMNs) وعلى التشكل الزهري التائي والبائي وعملية التهام الخميرة المقتولة في الزجاج واختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم (NBT) ومعامل الانقسام الخيطي في الفئران. 4 - الدراسة النسجية : - درست التغيرات النسجية المختلفة في الارانب الممنعة بالانظيم الحال للبروتين بتركيز((0.2 ملغم/مل فكان له تاثيرا واضحا على انسجة الكبد، الرئة، الكلية والطحال،اذ لوحظ وجود مناطق تنكس استسقائي شديد في هيولي خلايا الكبد مع احتقان الوريد المركزي في نسيج الكبد، كمالوحظ وجود خلايا التهابية في جدران الاسناخ وضمور تجويف الاسناخ في الرئة، بينما توسعت محفظة بومان مع ارتشاح بعض الخلايا الالتهابية وخاصة حول الكبيبات في الكلية، اما في الطحال ازداد عدد الخلايا التائية حول الشرين المركزي كذلك الخلايا البائية في باقي اللب الابيض في الطحال نتيجة لتكاثرها وفرط نموها. | This study was included four aspects : - 1 - Isolation and ldentifcation : Forty isolates of Proteus spp were isolated and identified among (200) bacterial isolates from patients samples with urinary tracts infection in two hospitals (Baghdad and Al - Kindy). Biochemical tests were showed (20 %) from bacterial isolates were belonged for genus Proteus (37) isolates replied to Proteus mirabilis with (18.5 %) and (3) isolates were for Proteus vulgaris. Ten isolates from Proteus mirabilis were producing for IgA protease while P.vulgaris isolates were non - producing for this enzyme. Proteus mirabilis (Pm5 ) was selected among isolates efficient producing isolate(Pm5). 2 - Purification and characterization of the enzyme : Cysteine lactose electrolyte deficient medium was selected as the best medium for culturing for production the enzyme by P. mirabilis. Bacterial isolate (Pm5) to produce protease, then protease was purified by application Ammonium sulfate with (60 %) saturated, dialysis, Sephadex G - 100 filtration, and Ion exchange with DEAE. Cellulose. The enzymatic activity and protein concentration were measured in every stage of purification. Four peaks were appeared one of them belong to IgA - protease activity, while by using Ionic exchange method was appeared only one peak. Enzymatic activity, protein concentration, specific activity, total activity, no. of purification, and enzymatic yield were determined in Ionic exchange technique were : ( 28.7) U/ml,(0.15)mg/ml,(191.3)U/ml,(258.3),(5.5),(9.9%) respectively, molecular weight of the enzyme was performed by using gel filtration was (50)Kd. The optimum activity was at pH (8), the optimum temperature with the enzymatic activity was at (37) ˚C, the suitable temperature for storage with enzymatic activity was at (4) ˚C, the (Ca+2) Ion has on effect on increasing the enzymatic activity, while the EDTA was suppressed activity. 3 - Immunological study : Three groups of rabbits were used for immunization (two rabbits for each group in addition to control were injected intramuscular by different enzyme concentrations (0.2, 0.5, 1) mg/ml. Two methods (Ouchterlony and tube precipitation are used for checking up specific protease antibody in rabbit serum. Results showed no precipitin line between enzyme as antigen and serum in (Ouchterlony) while there was clear ring of precipitin was formed in the second method. Rabbit immunoglobulines were separated by using DEAE - Cellulose results showed three peaks protein at (280) nm wave length absorbency, enzyme activity of each peak was tested. In comparing these peaks with standard rabbit immunoglobulines. The third peak was tested against IgA - protease by using tube precipitation test result showed precipitation ring. This result indicated that this peak may include IgG subclasses which are resist protease activity while other peaks were opsonized by the enzyme. The effects of the IgA protease concentration (0.2, 0.5,1) mg/ml on immune cells were studied according the following parameters : the effect of the enzyme on immune and (PMNs) cells, T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice, (0.2) mg/ml of the enzyme has an effect on induction activity of T, B - rosette, phagocytosis in vitro, reduction of Nitroblue tetrazolium, and Mitotic index in Mice. 4 - Histological aspect : Different pathological changes were shown on rabbit’s tissues (liver, lung, kidney and spleen) which were immunized with IgA protease (0.2)mg/ml. In liver great hydropic degeneration was noticed in the cytoplasm in addition to present an with congestion of central venule, inflammatory cells in the alveolar walls and alveolar cavity atrophy in lung, enlargement of Bouman s capsule with infiltration of phagocytes around glomerulus was shown in kidney, while in spleen T cells around central arteriole as well as B cells in other white pulp were increased as a result of proliferation .

تاثـيــر فعالية الانتيروسين المنتج من بكتريا faecium Enterococcus على بعض البكتريا المرضية المعزولة من مصادر مختلفة == Activity effect of enterocin produced from Enterococcus faecium on some pathogenic bacteria isolated from different sources

Author name: حسام سامي عويد الشمري
Supervisor name: خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تـتـناول هــذه الـــدراســة تاثـيـر الانتيـروســـين المنتــج بــواســطــة بكــتــريا E.faecium ضـــد بــعــض البكتــريا الــمـمـرضــة المـتـواجـــدة بكثرة في الحـليب ومشتقاته. فقد تم لهذا الغـرض جمع 382عينة من اطفال يعانون حالات اسهال والتهاب السبيل البولي والحليب الخام لعـزل بكتريا E.faecium وتم تشخيص العزلات بالفحوصات الكيموحيوية وتاكيد تشخيصها باستعمال منظومة فايتك 2 . فضلا عن ذلك فقـد تم جمع 50 عينة لعـزل بكتريا Listeria monocytogenes و66 عينة لعزل بكتريا Salmonella typhimurium من الحليب الخام ومشتقاته وتم تشخيصهما باتباع الفحوصات الكيموحيوية وتاكيد التشخيص باستعمال Api Listeria وApi - 20Eاضافة الى التنميط المصلي لبكتريا Salmonella typhimurium . تم تقصي انتاج الانتيروسين المنتج بواسطةE. faecium باستعمال طريقتي اقراص الاكار والانتشار في الحفر , ونقي الانتيروسين باستعمال الترسيب بسلفات الامونيوم والفصل بكحول البيوتانول , كما تم الكشف عن حساسية البكتريوسين المنتج لمجموعة واسعة من الانزيمات الحالة للبروتين والدهون وبعض الانزيمات الاخرى .فضلا عن ذلك فقد تمت دراسة تاثير الحرارة والرقم الهيدروجيني على البكتريوسين المنتج , وتم اختبار تراكيز مختلفة من المايتومايسين - سي لحث الانتيروسين .اختبرت الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات بكتريا اللستيريا والسالمونيلا والمكورات المعوية باستخدام طريقة كيربي - باور .يمكن تلخيص النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : كانت نسبة عـزل E. faecium 7.59)%) من مجموع 382 عينة , اما نسبـة عـزل Listeria monocytogenes 10)%) من مجموع 50 عينة , اما نـسبـة عـزل Salmonella typhimurium فقد كانت .06)6%) من مجموع 66 عينة . اظهـر الانتيروســين المنتـج بواســطة E. faecium طـيفا واسعا من التاثير ضـد البكتريا الاختبار المـوجبة والسالبة لصبغـة غــرام التي عددها 8 وبضمـنها Listeria monocytogenes وSalmonella typhimurium . اظهر الحث بالمايتومايسين - سي )بتركيزي 1.5 و2 مكغم/ مل( انتاجا عاليا للانتيروسين . ادت تنقية الانتيروسين جزئيا باستعمال الترسيب بنسبة 80 % الى اعطاء اعلى نتيجة عندما بلغت 2.225 وحدة / مكغم بروتين , اما الفصل بكحـول البيوتانول فقد اعطى محصولا وصــل الى 0.57 وحدة / مكغم بروتين . ادت معاملة الانتيروسين بالانزيمات وتلك الحالة للبروتين حساسية الانتيروسين تجاه هذه الانزيمات باستثناء انزيمات Lipase وCatalase وα - amylaseو Lysozyme . اظهـرت تجارب المعاملة بالحرارة مقاومة الانتيروسين للحرارة وحتى عند121ºC لمدة 20 دقيقة , في حين كان مدى الاس الهيدروجيني له 4 - 9 .اظهرت تجارب الحساسية للمضادات الحيوية ان Enterococcus faecium كانت حساسة الى 7 مضادات حيوية . وكانت بكتريا Listeria monocytogenes مقاومة الى 9 مضادات حيوية وبكتريا Salmonella typhimurium مقاومة الى 4 مضادات حيوية .امكن الحصول على النتائج وكما يلي : انتجت عزلات Enterococcus faecium الانتيروسين بكميات واطئه فيما امكن حثه باستعمال المادة الحاثة المايتومايسين - سي , وامكن تنقيتها جزئيا باستعمال مرسبات البروتين . اتصف الانتيروسين المنتج من هذه البكتريا بطيف واسع النطاق من التاثير ضد البكتريا الموجبة والسالبة لصبغة غرام ولاسيما تلك التي تلوث الحليب ومشتقاته . | This study investigate the effect of bacteriocin by Enterococcus faecium against some pathogenic bacteria frequently found in milk and dairy product. Three hundred eighty two sample collected from patients and raw milk were used for isolation of E.faecium the isolates were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Vitek 2 system . In addition Listeria monocytogenes , Salmonella typhimurium were isolated from milk and dairy products these were diagnostic by biochemical tests and confirmed using Api Listeria and Api - 20E system in addition to serotyping to bacteria Salmonella typhimurium . Enterocin produced by E.faecium detected using tow methods Cup agar and Well diffusion and partially - purified using ammonium sulfate precipitation and n - butanol partition , the sensitivity of the material was tested against diverse group of proteolytic , lipolytic and some other enzymes. In addition the effect of temperature as well as pH an the bacteriocin were tested . and used different concentration of Mitomycin - C to induce enterocin . Antibiotic sensitivity of Listeria and Salmonella and Enterococcus isolates were tested using Kirby - Bauer method. The results showed the followings : The isolation rate of E . faecium was (7.59%) from 382 sample , L. monocytogenes isolation rate approach (10%) from 50 sample , S.typhimurium isolation rate reached (6.06%) from 66 sample .Enterocin produce by E . faecium demonstrated a broad - spectrum effect against both gram positive and gram negative bacteria including Listeria monocytogenes and Salmonella typhimurium . Mitomycin - C induction was used to induce a high level production of Enterocin the concentration of optimum inducing agent was 1.5 - 2 mg /ml. The enterocin was partially purified eighty percent of Ammonium sulfate give the highest yield reaching 2.225 Unit /mg protein , n - butanol partition yield 0.57 Unit/mg protein. Enzymatic effect on enterocin demonstrated that proteolytic enzymes completely inactivated the bacteriocin , other enzymes including Lipases Catalase demonstrated no effect. α - amylase , Lysozyme ,The Enterocin was heat - resistance at even 121º C for 20 minute , the optimum pH was shown to be 4 - 9 .Enterococcus faecium was highly sensitive to 7 antibiotic used .and Listeria monocytogenes was highly resistance to 9 antibiotic and Salmonella typhimurium was resistance to 4 antibiotic . In results E . faecium produce enterocin at low level which was induced to high level yield using Mitomycin - C , the enterocin could be partially purified using precipitators protein, That enterocin product of this bacteria characterized a broad spectrum against positive and negative gram bacteria including contaminate milk and its products

تقييم العلاج التصليبي للكيس الكلوي البسيط == Diagnosis and Sclerotherapy evaluation of Simple renal cyst

Author name: جميلة عيسى كاظم الموسوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | يعرب ادريس
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اعتمدت معالجة الكــيس الكلـــوي البسـيـط (Simple renal cyst) سابقا على اجراء العمليات الجراحية لازالة الكيس واستخدام قثطرة البولي اثيلين (Polyethylene Catheter) في اجراء عملية الارتشاف البسيط (Simple aspiration) فقط او مع تشريب العلاج الصليبي عن طريق الجلد (Percutaneous sclerotherapeutic instillation ) .اما دراستنا والتي استغرقت عاما واحدا ابتداء من ايلول 2001 ولغاية ايلول 2002 بواقع (31) مريضا يعانون من مرض الكيس الكلوي البسيط الذي شخص لديهم اشعاعيا وسريريا, فقد اعتمدت على اختراق الكيس عن طريق الجلد باستخدام الرشف بالابرة الدقيقة(FNA) (Fine needle aspiration ) وتحت سيطرة جهاز التصوير فوق الصوتي(U/S)(Ultrasonography) في علاج هذا النوع من الاكياس باجراء عملية الارتشاف مع تشريب نوعين من العوامل التصليبية (Sclerosing agent ) اذ استخدمنا عقار التتراسايكلين بشكل اساسي ولاول مرة وفي حالتين فقط استخدمنا الكحول الاثيلي ).95%( وتلى ذلك متابعة المرضى وبشكل منتظم بعد العلاج مدة تراوحت بين الشهر الى ثلاثة اشهر .وكذلك اجريت اختبارات تفريقية للسائل المرتشف تضمنت اختبارات بايوكيميائية وخلوية للتوصل الى افضل طريقة لتشخيص انواع الاصابات التكيسية والتي شملت (الاكياس البسيطة والالتهابية والنزفية والسرطانية). واخيرا تم التوصل الى النتائج التالية اذ ظهر ان اجمالي دقة التشخيص المستخدم في هذه الدراسة كان بنسبة(100%) وقد وصلت النسبة المئوية للاستجابة السريعة للعلاج (67.7%) اما النسبة المئوية لعودة الكيس الى الظهور فلم تتجاوز (6.4%). هذا ومن الجدير بالذكر ان في هذه الدراسة لم تحصل اية مضاعفات غير محسوبة. | Traditinally the mangment of simple renal cyst has been based on the proceeding of surgical operations or by using the polyethelen catheter for simple aspiration and/lor with percataneous sclero / therapeutic instillation.Our study which was over one year period, starting from sept. 2001 to sept. 2002, (32) patients with clinical - radiological diagnosis of simple renal cyst underwent percutaneous fine needle aspiration of the kidney underultra sonic guidance and further manged using two type of sclerotherapeutic agents (like tetracycline Amp. which used mainly in most of our cases, and ethylalcohol (95%) which used only two cases) post sclerotherapy eutic in aperiod between (1 - 3) months post aspiration close regular follow up of all patient, for aperiod from (1 - 3) months post aspiration.Full physical, biochemical & cytological laboratory evaluation of the aspiration fluid has been done in all cases to diagnostic, simple, complicated, neoplastic cysts.Finally the overall aecuracy of the diagnostic procedur was (100%) and the percantage of dromatic respons to treatment was (67.7%) while the recurred percentages no more than (6.4%). So in this study no complication was encountered.

تاثير انزيمي اللايبيز والبروتيز المنتجين من بكتريا Pseudomonas fluorescens في فساد اللحم والحليب == Effect of Lipase and Protease enzymes produced from Pseudomonas fluorescens on Spoilage of Milk and Meat

Author name: ثناء ماجد زاير النوري
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Enzymes
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ( 75 ) عينة من المصادر المحلية شملت الحليب الخام ، واللحم البقري الطازج ، وتربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز ، عزلت منها ( 45) عزلة بكتيرية تعود الى جنس Pseudomonas ، وتم عزلها باستخدام وسطين : الاول وسط ( CVB ) الحاوي على صبغة البنفسج البلورية ، والثاني وسط MacConkey agar . اخضعت العزلات جميعها للفحوصات المجهرية والزرعية ، فضلا عن الاختبارات الكيموحيوية التي شملت انتاج انزيمات الاوكسيديز والكاتليز والجيلاتينيز واللايسثينيز، وانتاج الصبغة ، والـتالق تحت الاشعة فوق البنفسجية عند طول موجي ( 254 نانوميتر ) ، واستهلاك السترات كمصدر وحيد للكاربون، والقــدرة على الــنمو بحرارة ( 4 ) م و( 20) م و( 42) م ، وعلى الوسط الحاوي على 6.5 % ملح كلوريد الصوديوم ، وكذلك النمو في وسط ( Triple Sugar Iron - TSI ) ، وعدم انتاج غاز كبريتـــيد الهـــيدروجيـــن فيه ، فضلا عن اجـراء اختبارات عدة الفــــحص الاولـــي api20E وapi20NE . نميت العزلات على وسط اكار حليب الفرز المقشود ( Skim milk agar ) ، وتم التحري عن قابليتها على انتاج انزيم البروتييز، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج . كما نميت العزلات على وسط ران الصلب ( Rhan agar ) للتحري عن قابليتها على انتاج انزيم اللايبيز ، واختيار العزلة الاكفا ، وتحديد الظروف المثلى للانتاج تم حساب العدد البكتيري الكلي الاولي لكل من عينات الحليب الخام واللحم الطازج غير المعقمين وعينات الحليب المعقم واللحم المعقم بالاشعة فوق البنفـــسجية بطريقة العــد بالاطباق. اختبر ايضا تاثير بكتريا Pseudomonas fluorescens على عينات الحليب واللحم المعقمين ولوحظت التغيرات في الصفات الحسية ، كما تم حساب العدد الكلي البكتيري الاولي بطريقة العد بالاطباق ومن ثم اختبر تاثير بكتريا حامض اللاكتيك Lactobacillus fermentum ضد بكتريا Pseudomonas fluorescens في عينات الحليب واللحم المعقمين ، وقدرت النسبة المئوية للتثبيط . يمكن تلخيص اهم النتائج التي امكن الحصول عليها بالاتي : اولا _ شخصت (45) عزلة تــــعود للــــنوع Pseudomonas fluorescens ، كانت (20) مــنها مصدرها لحم بقري طازج ، و(15) منها مصدرها حلــــيب بقري خام ، فيــــما كانت العزلات المتبقية (10) مصدرها تربة الرايزوسفير لنبات ورد الروز. ثانيا _ انتخبت عزلتان هما : PFM6 كونها الافضل كفاءة في انتاج البروتييز، التي كان مصدرها الحليب البقري الخام وPFE4 الافضل كفاءة في انتاج اللايبيز ، والتي كان مصدرها اللحم البقري الطازج. ثالثا _ حددت الظروف المثلى لانتاج انزيم البروتيــــيز من العزلة المحلية PFM6 , اذ كانــــت درجة الحرارة المثلى للانتاج هي ( 20) م وافضل اس هيدروجين (7.2) , كما كان للتـــهوية تاثير فعال في زيادة انتاجية العزلة هذه من الانزيم من خلال قياس قطر منطـــقة التحلل. كما وحــددت الظروف المثلى لانتاج انزيم اللايبيز من العزلة المحلية PFE4 , اذ كانت درجة الحرارة المثلى للانتاج ( 28) م ، وافضل اس هيدروجيني ( 7.2 ) وكان للتهوية ايضا تاثيرها الفعال في زيادة انتاجية العزلة من انزيم اللايبيز من خلال قياس قطر منطقة الترسب لملح الحامض. رابعا _ بلـــغ الـــعدد البكتـــيري الكــلي الاولي لعيـــنات الحلــــيب الخام واللـــحم الطازج غير المعقمين 10⁶x 1.1)) خلية / مل و(10⁶x 2.1) خلية / غم ، بعد حضانة (3) و(5) ايام على التوالي ، فيما ظلت عينات الحليب المعقم واللحم الطازج المعقم من البكتريا ( صفر خلية / غم) بعد نفس مدة الحضن . خامسا _ تغيرت الصفات الحســـــــية لعينتي الحــــــليب واللحم المعقمين ، بعد تلقيحها (10⁷ X 1 ) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens من حيث القوام واللــون والرائحة والنكهة ، وبلغ معـــدل العـــــدد الكلي البكتـــيري الاولي في العينـــتين (10⁸x 5.1) خلية / مل لعيــــنة الحلـــيب و(10⁸x 9.2) خلية / غم لعينة اللحم بعد الحضن مدة ( 3 ) و( 5 ) ايام على التوالي .سادسا _ تغيرت الصفات الحسية لعينات الحليب واللحم المعقمين بعد تلقيحها بـ (10⁷ X 1) خلية / مل من بكتريا Pseudomonas fluorescens و(1) مل راشح بكتريا Lactobacillus fermentum من حيــث القوام واللون والرائـــحة والنكهة ، مع انخــفاض معــدل الــــعدد الكلي البكتيري الاولي في كلتا العينتين والى (10⁶x 1.2) خلية /مل و( 10⁶x 2.7 ) خلية/غم على التوالي ، بعد الحضن لمدة (3) ايام لعينات الحليب و(5) ايام لعينات اللحم ، كما بلــــغت النسبة المئوية للــــــــتثبيط في عينات الحليب 99.764 % وعينات اللــــحم 99.706 %. | Seventy five samples were collected from the local food sources , which included contained crude milk and fresh cow meat, and from rhizosphere soil for rose flower plant . Forty five bacterial isolates were isolated , which are suspected to be belongs to the Genus Pseudomonas .Thus media were used for isolation (CVB) media which contains crystal Violet stain , and MacCkonkey agar. All isolates were subjected to the microbiological and cultural examinations for primary identification . In addition to the biochemical testes which included production of , oxidase , catalase , gelatenase , lecithenase and pigment , as well as glister under the ( UV light ) at ( 254 ) nm wave length , and citrate utilization as the unique source of carbon , ability to grow at ( 4 , 20 and 42) ℃ , and in the media which contained 6.5 % NaCl , also testing the ability to growing at Triple Sugar Iron - (TSI ) medium Producing sulfate hydrogen gas in it .However , api system was used to confirm the identification. The isolates were grown on Skim milk agar media, to test their ability for producing Protease enzyme , then choosing the most efficient isolate , and determing the typical conditions for producing . Also the isolates were grown on the ( Rhan media ) ,to investigate their ability for producing lipase enzyme , then choosing the efficient isolate and determining the typical conditions for producing. Primary total bacterial number was counted for raw milk and fresh beef meat samples . Also primary total bacterial number for the sterilized milk and fresh meat samples with ultra violet ray by using plating method . Effect of Pseudomonas fluorescens on the sterilized milk and meat samples was detected and changes in the sensory characteristics was evaluated. Inhibitory effect of Lactobacillus fermentum against Pseudomonas fluorescens in the sterilized milk and meat samples was investigated , and percentage of inhibition was estimated. Important results may be summarized as follow : 1 - Forty five isolates were identified to belong to Pseudomonas fluorescens species . Twenty of the samples were from fresh meat and fifteen from crude cow milk , while the rest (10) were from rhizosphere soil of rose flower plant . 2 - Two isolates were selected : PFM6 the most efficient in producing protease ( crude cow milk origin ) , PFE4 the most efficient in producing lipase ( fresh cow meat origin ). 3 - Optimum conditions for producing protease enzyme from the local isolate PFM6 were (20)℃, pH( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on ensuring the diameter of analysis zone Also optimum conditions for producing lipase enzyme by the local isolate PFE4 were . ( 28) ℃, pH ( 7.2) and the aeration. The evaluation depended on measuring the diameter the depositing zone for acid salt. 4 - Primary total bacterial number of the crude milk samples and the fresh meat was estimated as (1.1 x 10⁶) cell / ml , (2.1 x 10⁶) cell / gm , respectively . While the primary total number of bacteria of the sterilized milk and sterilized fresh meat samples was (Zero) cell / ml upon . 5 - Changes occurred in the sensory characteristics ( taste , odor , color and texture) of sterilized milk and meat samples after inoculation with (1X 10⁷) cells / ml of Pseudomonas fluorescens Primary total bacterial number in both samples were (5.1x 10⁸) cell / ml , (9.2x 10⁸) cell / gm respectively. 6 - Changes occurred in sensory characteristics ( taste , odor , color and texture of sterilized milk and meat samples after incubation with (1X 10⁷) cell/ ml of Pseudomonas fluorescens bacteria, and with 1ml Lactobacillus fermentum. Primary total bacterial numbers of both samples were decreased to (1.2x 10⁶) cell / ml ,( 2.7x 10⁶) cell / ml respectively after incubation 3 days for milk sample , 5 days for meat samples. Percentages of inhibition were in milk sample 99.764 % and in meat sample 99.706%.

دراسة مقارنة للمحتوى البلازميدي للبكتريا المخمرة لسكر اللاكتوز للعائلة المعوية والمعزولة من عينات بيئية وسريرية == Comparative Study of Plasmid Content of Lactose Ferment Enterobacteriaceae Isolated From Environmental and Clinical Samples

Author name: تقي عبد الكريم حميد
Supervisor name: اسراء عبد الجبار ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: 183 bacterial isolate from clinical and environmental samples are collected during the 5 months from 1/9/2014 to 1/2/2015.Which 98 clinical bacterial isolates were isolated from patients (urine, blood, sputum and swabs) from different hospitals in Baghdad city, and also 85 environmental bacterial isolates were isolated from Tigris river water samples which are collected from Al - Shawaka area , soil samples of eastern Baghdad collected from Jadied Shat area , and poultry feces which are collected from poultry farm in Al - Sadar city.All clinical and environmental bacterial isolates were identified on the basis of morphology and biochemical tests.Further Confirmative tests were used to confirm the identification of bacterial isolates by using Vitek - 2 compact system and specific primer to detect 16S rRNA gene. Results of bacteria identification showed the following species : Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella.oxytoca Enterobacter aerogenes, Citrobacter freundii, Serratia marcescens, Raoultella planticola, Chryseomonas luteola, Burkholderia cepacia, Aeromonas, Hydrophis , Streptococcus feacalisThe antibiotic resistance patterns showed that all bacterial species were multidrug resistant.Most clinical E.coli (45isolates) revealed high levels resistance against most antibiotics : (100%) amikacin and ampicillin, (97%) cefepime and ceftazidime, (95%) cetriaxone,(86%) tobramycin, (82%) amoxicillin, (77%) gentamicin, (73%) aztreonam. Also environmental E. coli (28isolates) showed high levels resistance, (100%) ampicillin, ceftazidime, cefepime and tobramycine, (96%) nitrofurantion, (92%) Ceftriaxone, (89%) amoxicillin, (82%) amikacin, (60%) levofloxacin and impenem. All K.pneumoniae showed high levels resistance against most antibiotics, ampicillin, amoxicillin, cefepime and ceftazidime (100%).While 30% resistance in ciprofloxacinAbstractfor clinical K.pneumoniae isolates and 8% resistance was shown in each meropenem and levofloxacin.Results of molecular identification of E.coli isolates by using the specific primer for 16S rRNA gene showed that all isolates of Lactose fermenter contained this gene (100%). Also the same 16S rRNA gene was found in the bacteria Citrobacter freundii, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Raoultella planticola with the same molecular weight (544 base pair) that found in E. coli isolates. While K.pneumoniae isolates showed two bands for the same 16S rRNA gene with molecular weight of 544 and > 1500 bp.The plasmid DNA analysis by using alkaline lysis method showed that 35/48 (75%) clinical and environmental bacterial isolates contained multiple plasmids their size 1oooo bp, and 15/48 (31.25 %) isolates contained plasmids with molecular weight more than 10000 bp.The leaf extracts of medical plants, Eucalyptus incrassate, Olea eurepea, and Trigonella foenum - graecum L. used as agents to cure the plasmid via adding the plant extract to the culture media or with mixing it with the plasmid DNA. Results showed that both two methods give clear effect

دراسة انتشار الهائمات النباتية والفطريات المائية في المياه الجارية ضمن محافظة بغداد وتاثير العوامل البيئية عليها == A Study of the Distribution of Phytoplankton and Aquatic Fungi in the Lotic Water in Baghdad District and the Effect of Environmental Factors

Author name: تريفة كمال جلال فرخه
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | علي عبد الزهرة اللامي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى مقارنة تواجد الهائمات النباتية والفطريات المائية في اربعة انظمة مياه جارية ضمن مدينة بغداد وعلاقة ذلك بالظروف البيئية المختلفة ، اختيرت اربعة محطات تمثل النظم الجارية وهي : ذراع الثرثار ونهر دجلة وقناة الجيش ونهر ديالى وتم دراسة تواجد بعض الفطريات المائية Aquatic fungi والهائمات النباتية Phytoplankton والعلاقة بين تواجدهما وبين العوامل الفيزيائية والكيميائية ، وجمعت النماذج شهريا ولمدة خمسة عشر شهرا ابتداء من شهر نيسان 2004 ولغاية حزيران 2005. شملت الدراسة الخصائص الفيزيائية والكيميائية وتمثلت في درجة حرارة المياه وسرعة التيار ودرجة الاس الهيدروجيني والتوصيلية الكهربائية والاملاح الذائبة الكلية والكدرة والاوكسجين الذائب والنسبة المئوية للاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية والمغذيات النباتية (النترات والنتريت والفوسفات). تم تشخيص الهائمات النباتية ودراسة التكوين النوعي لها وكثافتها كذلك عزل وتشخيص بعض الفطريات المائية السابرولكنيسية Saprolegniaceae الموجودة في محطات الدراسة. اظهرت نتائج الدراسة البيئية بان درجة حرارة المياه متاثرة بدرجة حرارة الهواء المحيط وتراوحت بين (10 - 29)م في ذراع الثرثار وبين (10 - 27)م في نهر دجلة و(11 - 29.5)م في قناة الجيش اما في نهر ديالى فكانت (11 - 30.6)م. تميزت المياه في المحطات الاربعة بقاعدية خفيفة حيث تراوحت قيم الاس الهيدروجيني بين (6.1 - 8.0) ، وكانت التوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والمواد الصلبة الكلية في نهر ديالى اعلى نسبة الى بقية المحطات حيث بلغت 2710 مايكروسيمنز/سم و1.73 و1.35 غم/لتر على التوالي ، وكانت المياه ذات تهوية جيدة في كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة نسبة الى قناة الجيش ونهر ديالى وسجلت قيم عالية للعسرة حيث ان اعلى قيمة للعسرة بلغت 1250 ملغم/لتر في قناة الجيش وتلتها في نهر ديالى حيث بلغت 1230 ملغم/لتر. اما بالنسبة الى تركيز النترات فتراوح بين 0.06 - 10.0 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.02 - 6.30 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 9.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.11 - 9.60 ملغم/لتر في نهر ديالى. اما النتريت فتراوحت تراكيزه بين 0.01 - 1.10 ملغم/لتر في ذراع الثرثار و0.004 - 1.20 ملغم/لتر في نهر دجلة ومن غير محسوس الى 1.20 ملغم/لتر في قناة الجيش و0.07 - 1.60 ملغم/لتر في نهر ديالى ، وتواجد الفسفور في ذراع الثرثار بمعدل 0.17 ملغم/لتر و0.071 ملغم/لتر في نهر دجلة و4.60 ملغم/لتر في قناة الجيش و2.67 ملغم/لتر في نهر ديالى. واظهرت نتائج التحليلات الاحصائية وجود فروقات معنوية بين محطات الدراسة للعديد من الخصائص الفيزيائية والكيميائية وبالذات فيما يتعلق بالتوصيلية الكهربائية ونسبة الملوحة والاملاح الذائبة الكلية والاوكسجين الذائب ونسبة الاشباع بالاوكسجين والعسرة الكلية مما يعزى الى تعرض بعض المواقع الى التلوث وانخفاض في منسوب المياه. شخصت خلال هذه الدراسة 166 وحدة تصنيفية للهائمات النباتية تضمنت 107 من الدايتومات و28 من الطحالب الخضر و22 وحدة تصنيفية تعود الى الطحالب الخضر المزرقة وتوزعت البقية بين صفوف الطحالب اليوغلينية والدوارة (البروات) والكربتات والصفر الذهبية وكان اعلى عدد للوحدات المشخصة في نهر دجلة تلاه نهر ديالى ، وظهرت عدة اجناس تمثلت باكبر عدد من الانواع ضمن الهائمات النباتية (Nitzschia وNavicula وCymbella وCyclotella وGomphonema). وتميزت الدايتومات بكثافة عالية في ذراع الثرثار ونهر دجلة ونهر ديالى والفت النسب المئوية (87.4% ، 91.4% و69.6%) على التوالي اما قناة الجيش فبلغت 16.9%. وكانت رتبة الدايتومات الريشية Pennales اكثر كثافة من رتبة الدايتومات المركزية Centrales ضمن الهائمات النباتية المشخصة. اما بالنسبة للفطريات المائية فقد تم عزل 21 نوعا 19 منها تعود الى العائلة السابرولكنيسية التي شملت الاجناس Saprolegnia وتمثلت بستة انواع والجنس Achlya وتمثل بـ 11 نوع والجنس Dictyuchus بنوعين ونوع واحد للعائلة Leptomitaceae واخر Pythiaceae ، تم تسجيل 168 عزلة في نهر دجلة و146 عزلة في ذراع الثرثار و50 عزلة في قناة الجيش و86 عزلة في نهر ديالى من المجموع الكلي للعزلات التي بلغت 450 عزلة ، ولوحظ تشابه كبير في عدد انواع الفطريات بين كل من ذراع الثرثار ونهر دجلة حيث سجل (20 و19) نوع على التوالي اما في قناة الجيش فقد سجلت ثمانية انواع فقط في حين عزلت 15 نوع في نهر ديالى. ومن ضمن الفطريات المائية تميز Saprolegnia ferax باعلى نسبة تواجد حيث بلغ 16.44% وتلاه Pythium sp. ايضا بتواجد عال والفت 12.22% في جميع المحطات واقل نسبة مئوية كانت للفطر Saprolegnia litoralis والذي سجل نوعا نادر التواجد حيث ظهر في شهر واحد ولمرة واحدة فقط في ذراع الثرثار. لوحظ بان نسبة تواجد الفطريات المائية كانت مرتبطة عكسيا في معظم اوقات السنة وفي جميع المناطق بتواجد الهائمات حيث انها ازدادت بعد الانخفاض في منحنى النمو للهائمات ويعود ذلك لكونها (اي الفطريات) كائنات رمية التغذية غالبا فتنمو على البقايا العضوية للهائمات وتقوم بتحليلها وتحويلها الى مغذيات جاهزة تنمو عليها الهائمات ويزداد تواجدها ، كذلك فان الظروف البيئية الملائمة تكون متماثلة لكليهما في بعض الاوقات وتختلف في احيان اخرى. | The aim of this work was to study the occurrence of Phytoplankton and aquatic fungi (Oomycetes) in four lotic aquatic systems within Baghdad city (Tharthar Arm, Tigris River, Al - Jaish Canal and Diayla River) during 15 months, the following physico - chemical parameters were also measured : water temperature, pH, electrical conductivity, salinity, total dissolved solids, turbidity, dissolved oxygen, percentage saturation oxygen, total hardness and the nutrients. The effect of the different environmental factors on both Phytoplankton and fungi was investigated. The study included the biological aspects such as species composition and densities of Phytoplankton, isolation and identification of Oomycetes especially Saprolegniaceae for fungi. The results showed that the water temperature was affected by surrounding air temperature, it ranged from 10 - 29C in the Tharthar Arm and from 10 - 27C in Tigris River, 11 - 29.5C in Al - Jaish Canal and 11 - 30.6C in Diayla River. The water of all stations was slightly alkaline with pH values ranging from 6.1 - 8.0, the electrical conductivity, salinity and T.D.S are higher in Diayla River than the other stations. Waters were more aerated in Tharthar Arm and Tigris River than the water of Al - Jaish Canal and Diayla River, the water classified as very hard at all stations, the highest value of total hardness obtained at Al - Jaish Canal it reached 1250 mg/L followed by Diayla River 1230 mg/L. The Nitrate and Phosphate found in highest mean concentration 3.48, 4.67 mg/l respectively in Al - Jaish Canal followed by 2.09, 2.67 mg/l in Diayla River. A significant difference was found between the four stations concerning physico - chemical characters especially the electrical conductivity, salinity, TDS, dissolved oxygen, percentage of saturated oxygen and total hardness. 166 taxa of Phytoplanktons throughout the four stations were identified, diatoms was dominated (107) followed by the Chlorophyceae (28) Cyanophyceae (22) and the remaining belongs to Pyrrophyceae, Cryptophyceae and Xanthophyceae, more taxa were identified in Tigris River followed by Al - Jaish Canal. Some genera of Phytoplanktons were represented by higher numbers of the species such as Nitzschia, Navicula, Cymbella, Cyclotella and Gomphonema. Among the diatoms Pennales were dominated up on centrales, the Phytoplankton density was higher in the Tigris River 22942.6  103 ind./l followed by Al - Jaish Canal 18944.1  103 ind./l, 10106.2  103 ind./l in Diayla River and 8025.1  103 ind./l in Tharthar Arm. The diatoms comprised 91.4% in Tigris River and 87.4% in Tharthar Arm and 69.8% in Diayla River and 16.9% in Al - Jaish Canal. Out of 600 isolates of fungi carried out, 450 reached reproductive maturity so that it was possible to identify it to the level of species. 21 species belongs to 5 genera were identified in the present study, all these species have been described in detail. Most genera (isolates) were obtained through Winter which was the best season for its growth, among the 21 species 19 belongs to the family Saprolegniaceae, 5 species belonged to the genus Saprolegnia, 11 species belongs to the genus Achlya, 2 species belong to the genus Dictyuchus and 1 species to the family Leptomitaceae and the others to Pythiaceae. Out of 450 isolates, 168 isolates identified in Tigris, 146 isolates from Tharthar Arm, 50 isolates from Al - Jaish Canal and 86 isolates from Diayla River. Among the Oomycetes Saprolegnia ferax comprise 16.44% follwed by Pythium sp. 12.22% and less percentage obtained for Saprolegnia litorlis which consider as a rare species in rare occurrence. There was a reversal correlation between Phytoplankton and fungi, both were affected by the same environmental factors in some times and responsed differently at other occasitions
1 ... 89 90 91 92 93 ... 157