عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 31,012

انتاج وتوصيف الملبد الحيوي من بكتريا Bacillus coagulans المعزولة محليا Production and Characterization of Bioflocculant From Locally Isolated Bacillus coagulans

اسم المؤلف: جوان صباح باجلان
اسم المشرف: سناء برهان الدين
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم عزل 48 عزلة بكتيريه تعود الى جنس Bacillus, جمعت من عينات الماء والتربة. اعطت اثنان وعشرون عزلة صفة اللزوجة عندمزارعت على وسط الاكار المغذي, اظهرت سبعة عزلات فقط من Bacillus نموا في وسط النشاء المغذي واعطت فعالية التلبد في عالق الكاؤلين. اعطت العزلة B8 ( المعزولة من التربة ) اعلى فعالية تلبد في عالق الكاؤلين (37%). اظهرت الاختبارات الكيموحيوية والفحص المظهري لهذه العزلة انها تعود الى نوع Bacillus coagulans . استخلص الملبد الحيوي من العزلة B8 B. coagulans باستعمال المذيبات العضوية شملت : الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم , الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم /حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم . كان وزن الملبد الحيوي المستخلص من الكحول الاثيلي بنسبة 2 : 1 حجم / حجم ( 0.15 غم/100مل ) اعلى من المستخلص الناتج من الكحول الاثيلي بنسبة 4 : 1 حجم / حجم والاسيتون بنسبة 3 : 1 حجم / حجم التي كانت (0.117 غم/100مل و0.078 غم/100مل ) على التوالي . نميت العزلة B. coagulans B8 من اوساط وظروف مختلفة وبينت النتائج انه اعلى انتاجية للملبد الحيوي تكون عند زرع البكتيريا في الوسط النشاء الحاوي على 1% نشاء كمصدر كاربوني, كلوريد الامونيوم كمصدر نتروجيني, برقم هيدروجيني 8 وحضنت بدرجة 37 لمدة 48 ساعة. اشار التحليل الكيميائي للملبد الحيوي المستخلص الى انه مكون من 85% كاربوهيدرات و7% بروتين .اظهر التحليل الكروماتوغرافي للطبقة الرقيقة (TLC ) للملبد الحيوي المتحلل بواسطة حامض الهيدروكلوريك مع نظام الاذابة المكون من البيوتانول - حامض الخليك - ماء بنسبة 1 : 1 : 3 وزن /وزن والكحول الاثيلي 96% - ماء 63 : 37 وزن / وزن, انه الملبد الحيوي المنتج من B8 B. coagulans يحوي جزء كاربوهيدراتي وجزء بروتيني, حيث ظهرت بقعتان بنية اللون عند استخدام الفينول - حامض الكبريتيك لتحري عن الكاربوهيدرات(Rf = 0.41 , 0.58 ) التي ماثلت الكالكتوز والكلوكوز, وظهرت بقعة واحدة حمراء غامقة عند استخدام النينهايدرين للتحري عن الاحماض الامينية (Rf = 0.68 ) التي ماثلت الحامض الاميني الفنيل الالنيين . درست خصائص الملبد الحيوي اعتمادا على فعالية التلبد لعالق الكاؤلين : اظهرت النتائج ان الملبد الحيوي يعطي فعالية تلبد جيدة لعالق الكاؤلين ( 41.5 % ) عند حجم 0.5 مل لكل 50مل بوجود 1% من كلوريد الكالسيوم (مصدر الشحنة موجبة) لتحسين عملية التلبد. الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية التلبد هو11pH واعطت افضل فعالية عند درجة حرارة 70 مئوي وكانت ( 78% ) . درست قابلية مادة التلبد على ازالة عكورة مياه النهر ومياه المجاري المنزلية, اظهرت النتائج القدرة على ازالة العكورة ( فعالية التلبد ) فقد اختزلت في كلاهما الى 66.36 % و62.7% على التوالي. | From September 2008 to May 2009, 122 specimens were collected by sterile cotton swaps from patients suffering from eye infection at Ibn Al - Haitham Teaching Eye Hospital, 12 of them were Pseudomonas aeruginosa isolates : they were named (P(1), P(2),……..P(12)) in 9.83% isolation percentage. All the isolates were diagnosed by biochemical tests, API 20 E system and agglutination sera for the grouping of P. aeruginosa. The results showed that all the isolates belong to the P. aeruginosa strains (6, 9, 12 and 16). After the adhesion test and lipopolysaccharide extraction and after studying the prophylactic role of LPS, the results demonstrated that : 1 - P (10) isolate have a greater ability to adhesion when all P. aeruginosa isolates were tested on Congo red agar medium and adherence to smooth surfaces. 2 - The chemical analysis of crude LPS that was extracted from P (10) by using digestive enzyme and hot phenol water method showed that the percentage of carbohydrates was 7.3% and the percentage of protein was 1.3%. No nucleic acids were found.3 - The chemical analysis of partially purified LPS that was made by gel - filtration chromatography by using Sephacryl 200 S showed that the percentage of carbohydrates in the partial purified LPS was 19.5% and the percentage of binding proteins was 0.006%. No nucleic acids were found. 4 - When the molecular weight of LPS was measured by gel - filtration chromatography by using Sepharose C1 - 6B - 200 it was found to be 630957 Dalton. 5 - The prophylactic role of LPS was studied as follows : a - The sera were prepared by using two wild type rabbits (weight 2 - 2.5 kg). They were injected with five doses over 70 days of different concentrations of partially purified LPS that have been extracted from P. aeruginosa P (10) isolate. One rabbit was used as a control that has been injected with PBS. The titer of antibodies in sera was determined by passive haemagglutination and it was in the immunized rabbit’s sera (160), and the best concentration of LPS was 10µg.b - The pathological infection was done by using two groups of female mice; the first group represents the non - immunized group while the second group represents the immunized group. The left and right eyes of the two groups were scratched, then the left eyes were infected with 5µl of (1×108 cell/ml viable organism) of P. aeruginosa P (10) while the right eyes serve as a control scratched eye. In the second group that represents the immunized group, the mice were immunized intraperitoneally with 0.2 ml of 2X concentrated sera, 18 hr. before scratching and infection and 1 - 2 hr. after scratching and infection in comparison with the control mice that were not immunized or scratched or infected with P. aeruginosa. The results have shown that : - Typical pathological scores were observed in the left eyes of non - immunized mice group 72 hr. after infection with P. aeruginosa while no pathological scores were observed in the left eyes of immunized mice. This indicated that the immunization with LPS gave a protection against P.aeruginosa corneal infection. - The histological sections of mice eyes of non - immunized and immunized mice show that there was a degenerative change and necrosis of retina with inflammatory cells infiltration in the left eye and hyperplasia of inner retinal cell layer in the right eye of non - immunized mice in comparison with the right and left eyes of control mice that have shown a normal appearance of retina, choroid and vitreous chamber while there was a hemorrhage and detachment of retina with certain inflammatory cells in the left eye and accumulation of blood along inner retina of vitreous chamber and certain detachment of retinal layer of right eye of immunized mice. These results indicate that immunization with LPS reduces the corneal infection caused by P. aeruginosa

دراسة بعض الصفات الكيميائية والفيزيائية والبايولوجية للبكتريوسين المستخلص من بكتريا Bacillus spp. المعزولة من مصادر بيئية مختلفة Study of some chemical, physical and biological properties of bacteriocin extracted from Bacillus spp. isolated from different ecosources

اسم المؤلف: بشار قصي كاظم
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت هذه الدراسة عزل وتشخيص عزلات لبكتريا Bacillus من التربة والماء والغذاء .عزلت 51 عزلة من 67 عينة منها كانت عائدة لبكتريا Bacillus spp. وفقط 17 عزلة منها كانت منتجة للبكتريوسين واختبرت فعالية البكتريوسين تجاه البكتريا الدالة Listeria monocytogenes , حيث اظهرت اختبارات التشخيص بان افضل العزلات المنتجة كانت Bacillus cereus Me1 المعزولة من اللحوم. حددت الظروف المثلى لانتاج Bacteriocin Me1 من العزلة المنتقاةBacillus cereus Me1 ولوحظ بان افضل الاوساط لانتاج Me1 Bacteriocin هو مرق نقيع القلب والدماغ المدعم با لكلوكوز بتركيز 0,1% وبحجم لقاح 2% والحاوي على 1.5×810 خلية /مليلتر ورقم هيدروجيني امثل 6.5 وبدرجة حرارة مثلى 30 م° بعد 18 ساعة حظن .نقي البكتريوسين المنتج من B.cereus Me1 بعدت خطوات تضمنت الترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع (30,50,60,70,80)% واظهرت النتائج بان افضل اشباع حصل عند80% من كبريتات الامونيا المستخدمة تبعتها طريقة كروموتوكرافيا التبادل الايوني باستخدام عمود DEAE - Sephadex وطريقة الترشيح الهلامي في عمود هلام السيفاكريل - .S200 والوزن الجزيئي له حدد بطريقةالترحيل الكهربائي في هلام SDS - PAGE واظهرت حزمة بروتينية مفصولة واحدة وكان وزنها الجزيئي 9100 دالتون. وباختبار تاثير قيم ال pH على فعالية البكتريوسين اظهرت بان الفعالية لم تتاثرفي pH بينما قلت الفعالية في pH اقل من 6 واعلى من 8 . البكتريوسين كان ثابت الفعالية عند المعاملة بالتسخين حتى 70 م° حيث انخفضت فعاليته عند درجات حرارة اعلى منها وفقدت كليا عند 121 م°. البكتريوسين B.cereus Me1 كان فعالا تجاه جميع البكتريا الموجبة لصبغة كرام المختبرة (Bacillus cereus وBacillus licheniformis وBacillus subtilisو (Staphylococcus aureus والفطر Candida albicansو Erwenia caratovora بينما كان غير فعالا تجاه البكتريا السالبة لصبغة كرام Pseudomonas aeroginusa ) وEscherichia coli. ) | This study involved the isolation and identification of the Bacillus isolates from soil, water and food samples. The results showed that 51 isolates from 67 samples were belonged to Bacillus spp. All isolates were tested and only 17 of them were bacteriocin producers. Bacteriocin activity was tested against Listeria monocytogenes (Bacterial indicator). Optimization the conditions for production of bacteriocin by B.cereus Me1 revealed that the best conditions for production were Brain Heart Infusion broth medium supplemented with 0.1% glucose , inoculums size 2% (1.5 x 108 cell/ml), pH 6.5 and incubation temperature 30 °C for 18 hrs.The purification of the bacteriocin from the B.cereus Me1 was carried out by ammonium sulfate precipitation in saturated percentages of (30, 50, 60, 70,80)% and The result showed that the best saturation was obtained at 80% ammonium sulfate. Two steps of purification was performed including ion exchange Chromatography by using DEAE - Sephadex and gel filteration by using Sephacryl - S200 . The purified Bacteriocin was named Bacteriocin Me1 according to the isolate Me1 for characterization of purified bacteriocin the molecular weight was determined with gel electrophorsis SDS - PAGE and one band of separated protein appeared. It is M.W was about 9100 Dalton. Testing the effect of pH values on bacteriocin activity it was stated that this activity didn't affect at pH 6, 7, 8, while this activity decreased at pH lower than 6 and higher than 8. The bacteriocin was stable with heating up to 70°C , higher than this the activity minimized and completely lost at 121°C. The B. cereus Me1 bacteriocin was active against all tested Gram - positive bacteria (Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus) and fungus C. albicans and Erwenia caratovora while was unactive against Gram negative bacteria ( Pseudomonas. aeruginosa and Escherichia coli

دراسة مقارنة للتاثيرات ضد المايكروبية والسمية الخلوية للبايوسيانين المنتج من النوع البري وطافرة بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة محليا A comparative study on the antimicrobial and cytotoxic effects of pyocyanin produced by wild type and mutant of locally isolated Pseudomonas aeruginosa

اسم المؤلف: حسام محمود حسن العماري
اسم المشرف: هيفاء هادي حساني عدوية عبد الله السعدي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت بكتريا Pseudomonas aeruginosa من مختلف العينات (قشع, حروق, جروح, اذن, خروج, عين, ادرار) وشكلت بكتيريا P.aeruginosa نسبة 32% من العدد الكلي للبكتيريا المعزولة, تم تشخيصها على اساس الاختبارات البكتريولوجية والكيموحيوية, %92 من العزلات الكلية تميزت بانتاجها الصبغة الزرقاء المخضرة(Pyocyanin) على وسط كنج A.تميزت عزلة واحدة فقط من بين 45 عزلة من العزلات المنتجة للبايوسيانين بانتاجها للصبغة, حيث انتجت2.8ملغم/مل , هذه العزلة يرمز لها 1 - PAH هي التي استعملت لاغراض الدراسة الحالية·حددت الخصائص الكيميائية للبايوسيانين المنتج من العزلة 1 - PAH بوساطة عدة تحليلات كيميائية وهي التغير بالرقم الهيدروجيني, FTIR, وHPLC والتي اكدت ان المستخلص هو صبغة البايوسيانين; بعد ذلك عرضت العزلة البرية 1 - PAH لتراكيزمختلفة من مختلف المضادات الحياتية, فاظهر المضادان Getamycin وephataximeC افضل النتائج في الحصول على الطفرات التلقائية. خضعت عدد من هذه الطافرات لاختبار قدرتها لانتاج البايوسيانين لاختيار الاكفا, فكانت الطافرة 8 - 300S هي الاكفا بانتاجها البايوسيانين, فقد انتجت3.73 ملغم/مل. اظهر البايوسيانين المنتج من الطافرة 8 - 300S صفات مماثلة لصفات البايوسيانين المنتج من العزلة البرية٬ بعد ذلك تم اختيار مدى كفاءة البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة من Pseudomonas aeruginosa في الفعالية ضد بكتيرية ضد عدد من البكتريا السالبة والموجبة لصبغة كرام.تم فحص فعالية البايوسيانين لتقليل نمو الخطوط الخلوية السرطانية. فاظهر البايوسيانين المنتج من العزلة الطافرة بانه الاكفا في تثبيط نمو الخلايا السرطانية خط سرطان العضلات المخططة RD,و خط خلايا سرطان عنق الرحم Hela, وخط خلايا سرطان الحنجرة 2 - Hep. فضلا عن ذلك اظهر البايوسيانين المنتج من العزلة البرية والطافرة فعالية الموت الخلوي المبرمج isApoptos ضد الخط السرطاني RD. | Pseudomonas aeruginosa was isolated from different specimens (sputum, burn, wounds, ear, stool, eye, blood, and urine); these isolates formed 32% of total specimens. These bacteria were identified according to morphological, and biochemical tests. Approximately 92% of P.aeruginosa isolates were able to produce a greenish blue pigment (pyocyanin) on king A medium. One out of 45 isolates was distincted in pyocyanin production; it gave 2.8mg/ml. This isolate was designated as P.aeruginosa PAH - 1 isolate and used for further study. The chemical properties of pyocyanin produced by PAH - 1 were detected by several chemical analyses such as changing in pH, FTIR, and HPLC that was confirmed that the extracted pigment is pyocyanin. After that, the wild type isolate PAH - 1 was exposed to various concentrations of different patterns of antibiotics, Gentamycin and Cefotaxime were showed perfect results for obtaining spontaneous mutations. These mutants were submitted for production pyocyanin; the mutant P. aeruginosa S300 - 8 isolate was distincted to producing pyocyanin equal to 3.73 mg/ml. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 showed similar properties of that produced by wild type PAH - 1 isolate. Pyocyanin produced by wild type and mutant of P.aeruginosa isolates showed antibacterial activity against several Gram negative (Salmonella, Proteus, Shigella, Escherisia, Klebsiella) and Gram positive bacteria (Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus). The ability of this pigment to reduce the proliferative activity of cancer cell lines was examined. Pyocyanin produced by mutant S300 - 8 mutant was more efficient to inhibit growth of cancer cell lines, RD, Hela, and Hep - 2, moreover pyocyanin produced by wild type and mutant showed apoptotic activity against cancer cell line RD.

دراسة مناعية وتقييم انتشار الاجسام المضادة الخاصة ضد اللولبية الشاحبة بين العراقيين المتبرعين بالدم

اسم المؤلف: انس وسام مالك
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي محمد عبد الدايم صالح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: السفلس هو مرض ينتقل جنسيا بوساطة بكتريا اللولبية الشاحبة Treponema pallidum ويصنف اما مكتسب او ولادي .اجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لنقل الدم في بغداد خلال جزء عملي اشتمل على المرضى المراجعين للمركز للمدة من 1 اب الى 31 كانون الاول 2014 . تضمنت الدراسة 70 مريضا و10 اصحاء ظاهريا من كلا الجنسين بمعدل عمر من 24 الى 57 سنة.جمعت عينات المرضى من وحدة الفايروسات بوساطة متخصصين الذين شخصوا الحالات المرضية .تضمنت المعلومات الديمغرافية العمر,الجنس والعنوان. اظهرت نتائج الدراسة الحالية معدل العمر ± الانحراف المعياري7.14±41)) سنة في المرضى(من 24 - 57 سنة) كما اظهرت النتائج ان(2.9%) من المرضى كانوا ضمن الفئة العمرية (21 - 30 سنة) ,وكانت نسبة الفئة العمرية (31 - 40 سنة ) هي (40%),و نسبة الفئة العمرية (41 - 50 سنة ) هي(44.3%)والفئة العمرية (51 - 60 سنة ) هي (. (12.8%علاوة على ذلك ان ما مجموعه ((74610 من متبرعي الدم العراقيين تتراوح اعمارهم من 18 - 60 سنة عرضوا لاكتشاف الاصابة بمرض السفلس ,وان ما مجموعه(769) من المصابين بالمرضوكان عدد المصابين من الذكور( (753بنسبة(97.9%) وكان عدد الاناث هو16 بنسبة(2.1%) .من ناحية اخرى تم اختيار 70 مصاب من المجموع الكلي للمصابين (769) وتم فحصهم ضمن بعض المؤشرات المناعية واظهرت النتائج ازدياد مستوى IL - 2 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وكانت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±64.9941.92 pg/ml و39.69 ±52.94pg/ml على التواليولم يلاحظ وجود فروق معنية احصائية بين كلا المجموعتين. فضلا عن ذلك ازداد مستوى IL - 10 في مجموعة المرضى عن مستوى مجموعة السيطرة .وبلغت قيمة المعدل± الانحراف المعياري ±559.101804.20pg/ml و±377.47252.36pg/ml على التوالى.بينما كان مستوى IFN - γ اقل في المرضى وكان المعدل ± الانحراف المعياري 239.35 ±201.38pg/ml عن المستوي في مجموعة السيطرة الذي بلغ 248.51±291.49pg/ml .فضلا عن ذلك كان مستوى IgG في كلا المجموعتين (المرضى والسيطرة ) عاليا , بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمجموعة المرضى825.66±287.18pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 638.28±242.41pg/ml لذلك لا يوجد فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين = P value)0.166( كذلك بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى IgM في مجموعة المرضى 121.01±70.57pg/ml وكانت لمجموعة السيطرة 50.96±21.61453pg/ml مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلا المجموعتين(P value=0.031). بلغت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى C3 في مجموعة المرضى±112.22pg/ml 26.34 بينما كانت ±147.7617.41pg/ml لمجموعة السيطرة. وهذا يعني وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.004). اخيرا وصلت قيمة المعدل ± الانحراف المعياري لمستوى 4Cفيمجموعة المرضى ± 22.7622.76pg/ml بينما كانت في مجموعة السيطرة±34.412.15pg/ml .مما يدل على وجود فرق معنوي احصائي بين كلتا المجموعتينP value) =0.005). | Syphilis is a sexually transmitted disease (STD) created by the Treponema pallidumand characterized as acquired or congenital.This study was conducted in National Blood Transfusion Center in Baghdad as crosswise over area study incorporating patients going to in the period from 1 August to 31 December 2014. The study included 70 patients and 10 apparently healthy individuals from both sex withage range from 24 to 57 years oldas control group.The specimens of patients were gathered in virology unit by virologists who conclusion the cases. The demographic data incorporates age, sex and location. The results of present study showed thatmean of age ±SD of patients was 41±7.14 years (from 24 - 57 years ) , also theresults showed (2.9%) of patients were from (21 - 30 years), (40%) of patients were from (31 - 40 years), (44.3%) of patients were from (41 - 50 years), (12.8%) of patients were from (51 - 60 years).Furthermore,a total of 74610 Iraqi blood donors, aged from 18 - 60 years were discovered to have been screened for syphilis, a total of 769 Infected syphilis there were the number of males were753 (97.9%) and females were16 (2.1%).On another hand 70 syphilis patients were selected from total infected patients ( 769) and was examined to some immunological parameters and the results showed that the level of IL - 2 higher in patients group than that of control group.Themean ±SD was 64.99±41.92pg/mland 52.94±39.69 pg/ml respectively withoutnoticing any significant statistical difference was between both groups. Additionallythe level of IL10 was higher in patients group than that of control group,the mean ±SD were559.10±1804.20 pg/ml while in control were 377.47±252.36 pg/ml.Whereas, the level of IFN - γ was lowerin patients, the mean ±SD were201.38 ±239.35pg/ml than thatin controlWhich were 291.49 ±248.51pg/ml. Furthermore, the level of IgG in both patients and controlwas almost more thanthe mean ±SDfor patients were 825.66±287.18 mg/dl and in controls they were 638.28±242.41 mg/dl. Therefore, there was no significant statistical difference between both groups (P value =0.166). Also , themean ±SD for the level of IgM in patients, were121.01±70.57mg/dl whereas in controls theywere 50.96±21.61453mg/dl.This means that there is a significant statistical difference between both groups (P value =0.031).For the level of C3 in patients ,the mean ±SDwere112.22±26.34mg/dl while in controls they were 147.76±17.41mg/dl. This indicates that there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.004).Finally, the mean ±SD the for level of C4 in patients were 22.76± 8.44mg/dl while in control they were 34.4±12.15mg/dl. Therefore there is a significant statistical difference between both groups (P value=0.005).

تقييم اختبار البروكالسيتونين في التشخيص المبكر لتسمم الدم الجرثومي في الاطفال حديثي الولادة في مستشفى تكريت التعليمي Evaluation of Procalcitonin Test for Early Diagnosis of Neonatal Sepsis in Tikrit - Teaching Hospital

اسم المؤلف: سهى ماهر عبد الرشيد
اسم المشرف: وعد محمود رؤوف موسى جاسم محمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2009
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: صلاح الدين
الصفحات الاولى:
المستخلص: ان تشخيص الخمج ضمن فئة حديثي الولادة يعتبر بحد ذاته تحد , نظرا لكون الاختبارات التقليدية غالبا ما تؤدي الى التضليل بدل التشخيص . صممت هذه الدراسة لاجل البت بامكانية استخدام اختبار مستوى البروكالسيتونين كمعلم للتشخيص المبكر للحالات المشكوك باصابتها بتسمم الدم الجرثومي في حديثي الولادة بالمقارنه مع زرع الدم, C - reactive protein , عدم خلايا الدم البيض الكلي والتفريقي. تم جمع العينات التي اشتملت على كلا الجنسين خلال الفترة الزمنيه من شهر اب سنة 2008 ولغاية شهر اذار سنة 2009 من حديثي الولادة الوافدين الى ردهات الخدج والاطفال في مستشفى تكريت التعليمي والمشخصه سريرا من قبل طبيب الاطفال المختص على اشتباه اصابتهم بالمرض. لقد اشتملت الدراسه على 114 حاله اجري فحص زرع الدم في جميعها بينما اجريت فحوصات الدم ل 102 حاله , تم فحص CRP ل 84 حالة واختبر مستوى البروكالسيتونين في 73 حالة حيث يعزى عدم تساوي العدد الى عدم كفاية الدم لاجراء جميع الاختبارات . اظهرت نتائج زرع الدم ان 53 (46%) من العينات كانت موجبه منها, 32 (60%) ذكور و21 (40%) اناث . عدد حالات زرع الدم السالبة كانت 61 ( 54%) منها , 31 (51%) اناث و30 (49%) ذكور.اظهرت نتيجة التشخيص المختبري بان العزلات البكتيرية الاكثر شيوعيا كانت من جنس البكتريا العنقوديه السالبة لانزيم التجلط ومن Nocardia spp. لانزيم التخثر بنسبة 22% لكليهما تتبعها بكتريا Listeria monocytogenes بنسبة 17% تليها Klebsiella pneumoniae بنسبة 9% و6 % لكل منPseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus اما باقي الانواع (Citrobacter diversus, Serratia marscesens, Serratia liquifascens, Lactobacillus spp., Peptostreptococcus spp., Micrococcus spp., Streptococcus pyogenes ) فقد كانت غير شائعة واعطت نسب 2% لكل واحد . بينت هذه الدراسة ان حملة تسمم الدم الجرثومي المتاخر سجلت 67% من الحالات بينما الباقي من النسبه ( 33%) كان ل حملة تسمم الدم الجرثومي المبكر .لقد كان عدد حالات التسمم الجرثومي المؤكد بين الذكور اعلى 32 (60 ) منه في الاناث 21 (40%). تبين ان من بين جميع المظاهر السريريه , قلة الرضاعة شكل اعلى نسبة بينما اعراض تبقع الجلد والقباع اعطت اقل نسبة, كما وبينت بان 30% فقط من الاصابات كانت عند الاطفال ذوي الوزن الطبيعي بينما شكل الاطفال الذين يقل وزنهم عن الطبيعي نسبة 70% . اظهرت دراسة عوامل الخطورة في الامهات بان العامل الاكثر شيوعا كان تمزق الغشاء الامنيوني لفترة تزيد عن 18 ساعة يتبعه عامل التهاب المجاري البولية والحمى واختناق داخل الرحم بالتتابع. نسبة الوفيات كانت اعلى في الحمله المتاخره لتسمم الدم كما كانت نسبة الوفيات اعلى عند حديثي الولادة ناقصي الوزن عنه عند ذوي الوزن الطبيعي احصائيا, كان لذوي الوزن الاقل من الطبيعي اهميه من الناحيه الاحصائيه . اظهر اختبار فحص الحساسية ان عزلات البكتريا السالبة لصبغة كرام كانت ذات مقاومه عاليه للمضادات المستخدمة في الدراسة الحالية بينما كل عزلة من عزلات البكتريا الموجبة لصبغة كرام كان لها نمط مقاومه مختلف للمضادات . كما واظهرت الدراسة لعوامل الضراوة بان العزلات البكترية السالبة لصبغة كرام كانت موجبة لاختبار انتاج انزيم اليوريز واختبار انزيم الهيمولايسن واختبار انزيم اللايبيز واللسيثينيز والبروتييزبنسبة 85% , 100% , 100% , 100% و62% على التوالي بينما كانت العزلات الموجبة لصبغة كرام موجبة للاختبارات بنسبة 61% , 100%, 89%, 94% و785 عالتوالي. اظهرت فحوصات الدم الروتينيه والتي كانت ذات قيمه معنويه بان 33% من بين حالات زرع الدم الموجبة كان عدد خلايا الدم البيض فيها منخفض , 19% من الحالات كان عدد الخلايا البيض مرتفع اما باقي النسبة المؤية فقد كان نتيجة فحص عد خلايا ضمن المستوى الطبيعي فيما يتعلق بحالة تواجد الخلايا العدله غير الناضجة في الدم المحيطي فقد بينت الدراسه ان 79% من حالات زرع الدم الموجبة كانت ايضا موجبة من ناحية تواجد الخلايا العدله غير الناضجه فالدم بينما باقي النسبة ضمن حالات زرع الدم الموجب فقد كانت سالبة لتواجد هذا النوع من الخلايا.علما ان الاختلافات الاحصائيه المتعلقه بالخلايا العدله غير الناضجه كانت ذات قيمة معنويه عاليه. بالنسبة لفحص CRP كانت الفروقات الاحصائيه غير ذات قيمه معنويه مابين الحالات الموجبه لزرع الدم عن الحالات السالبه . وفيما يخص نتيجة فحص PCT الذي تم قياسه باستخدام طريقة القياس شبة الكمي الكرماتوغرافيه المناعيه فقط ظهر ان تركيز البروكالسيتونين في المصل لم يكن ذا فرق احصائي معنوي بين المرضى المصابين ببكتريا موجبه لصبغة كرام عن المصابين ببكتريا سالبة لصبغة كرام. اظهرت نتائج دراستنا ان 21% من حالات زرع الدم الموجبه اعطت مستوى بروكالسيتونين اقل من 0.5 نانوغرام لكل مل وباقي النسبة توزعت بين مستويات البروكالسيتونين الباقيه ≥0.5 ≥2 ≥10. بالنسبة لحالات زرع الدم السالبة فقد اظهرت نتيجة قياس مستوى PCT بان نسبة 49% كان ضمن مستوى البروكالسيتونين<0.5 نانوغرام لكل مل بينما 51% كانت ضمن المستويات ≥0.5 ≥2 ≥ 10 نانوغرام لكل مل بمعنى لايمكن استبعاد حصول اصابة جهازيه حتى لو كانت نتيجة الزرع الدم سلبية. كما لم تتوافق نتيجة البروكالسيتونين مع نتيجة فحص الCRP لكل الحالات فقد سجلت اعلى مستويات للبروكالسيتونين بينما كان فحص ال CRP لها سالب , ومن مقارنة نتائج عد الخلايا البيض مع نتيجة البروكالسيتونين التي اجريت لنفس الحالات ظهر بان 68 % من الحالات كانت ضمن معدل عدد الخلايا الطبيعي بالوقت الذي اعطت مستوى عالي للبروكالسيتنوين≤10 نانوغرام لكل مل و18% فقط من الحالات كان عدد الخلايا البيض مرتفع وباقي النسبة اشتملت عل حالات انخفض بها عدد الخلايا البيض عن الطبيعي . من بين كل الحالات الي اجري لها فحص مستوى البروكالسيتونين سجلت 39 حالة بنسبة 53 % ظهرت بها الخلايا البيض العدلة غير الناضجة فالدم المحيطي . عند مقارنة اختبار البروكالسيتونين مع باقي الفحوصات الروتينه المستخدمه بالدراسه اتضح بانه اكثر حساسية في تشخيص تسمم الدم الجرثومي وفقا لذلك , نستنتج بان البروكالسيتونين هو محدد اكثر حساسية من الفحوصات التقليدية( فحص زرع الدم وفحص ال CRP وفحص عد الخلايا البيض) في التشخيص المبكر لتجرثم الدم الناجم عن البكتريا عند الاطفال حديثي الولاده . | The diagnosis of neonatal infection is challenging because traditional markers of infection are often misleading instead of diagnosing. This study was conducted to determine Procalcitonin (PCT) level as an early marker for diagnosis of suspected sepsis in neonates in comparison with C - reactive protein, blood culture, total and differential white blood cell counts. From August, 2008 till March, 2009, samples were taken from neonates (males and females) admitted to the pediatrics - neonatal wards at Tikrit Teaching Hospital who were clinically suspected with sepsis as diagnosed by the physician in the hospital with any features suggestive of sepsis. The study includes a total of 114 cases. Blood cultures were done for all cases. Hematological tests were performed for 102 cases. C - reactive protein (CRP) was determined in 84 cases, while Procalcitonin level was determined in 73 cases. The differences in the number of samples involved in each test were due to the inadequate amount of blood specimens to perform all investigations. The results of blood culture showed that 53 (46%) of samples were positive, of them 32 (60%) were males and 21 (40%) were females. The number of negative cases were 61 (54%), of them 31 (51%) were females and 30 (49%)were males. The results of identification showed that the most frequent bacterial isolates were Coagulase Negative Staphylococci and Nocardia spp. (22% for each), followed by Listeria monocytogenes 17%, Klebsiella pneumoniae, 9% Pseudomonas aeruginosa 6% and Staphylococcus aureus 6%, while (Citrobacter diversus, Serratia marscesens, Serratia liquifascens, Lactobacillus spp., Peptostreptococcus spp., Micrococcus spp., Streptococcus pyogenes) were frequently less isolated recording 2% for each . This study revealed that, late - sepsis was recorded in 67% of cases while the rest (33%) were with early - sepsis and also revealed that. The number of proven sepsis were higher in males 32 (60%) than in females 21 (40%). Among all clinical manifestation, poor feeding had the highest proportion, while mottling and grunting had the smallest proportion. Only 30% of neonates were of normal birth weight, while 70% were low birth weight, very low birth weight and, extremely low birth weight respectively. Study of maternal risk factors revealed that the most frequent factor was the Prolonged Rupture of membrane followed by maternally UTI, fever and intrapartum asphyxia, respectively. The fatality rate was higher in late - sepsis cases, also it was higher in low birth weight than in normal birth weight neonates, statistically VLBW had the highest value. The antibiotics susceptibility test revealed that Gram negative isolates showed high resistance to antibiotics used in the present study. Each isolate of the Gram positive bacteria showed different pattern of resistance against the antibiotics used. Results of virulence factor showed that 85%, 100%, 100% , 100% and 62% of Gram negative isolates and 61%, 100% , 89%, 94% and 78% of Gram positive isolated produced Urease , Hemolysin, Lipase, Lecithinase and alkaline protease, respectively. Results of routine hematological tests at which the differences were statistically significant showed that 33% of culture positive cases had leucopenia, 19% of cases had leukocytosis, while the rest were in the category of normal range. Concerning the shift to left, results showed that (79%) of culture positive cases were recorded as positive and the rest were negative shift to left neutrophil the differences concerning with the shift left were statistically highly significant. For CRP, the differences were not significant among culture positive and culture neative cases. With reference to PCT test which had been measured using the immunochromatographic semi - quantitative method, that serum procalcitonin concentrations were not significantly different between the patients with Gram - positive and those with Gram negative infections. Results of our study showed that 21% of culture positive cases were <0.5 ng/ml (which were regarded as negative), while the rest which were with high level of PCT were distributed among levels of PCT≥0.5 ≥2 ≥10 ng/ml. As for culture negative cases, 49% of PCT were <0.5 ng/ml, while 51% of cases were in levels of ≥0.5 ≥2 ≥10 ng/ml which means that systemic infections cannot be excluded though they were culture negative. In addition PCT results did not fit with CRP all the time since some cases recorded higher level of PCT ≥10 ng/ml despite they were negative for CRP. The comparison between results of PCT and WBC for the same performed cases showed that 68% of cases were in the category of normal WBC range, meanwhile they had high level of PCT. Only 18% were in the category of leukocytosis, and the rest of percentage were in the category of leucopenia. Among all cases performed for PCT, 39 (53%) cases had left shift neutrophil in the peripheral blood when the differential counts were performed. when PCT was compared with other routinely measured parameters used in this study, It seemed to be significantly more sensitive in sepsis diagnosis. Accordingly, we can conclude that PCT is a more sensitive marker than other traditional tests (blood culture, CRP and WBC count) that could be used in early diagnosis of bacterial sepsis in neonates.

دراسة جزيئية ومناعية للمستقبلات TLRs المرتبطـــة بداء المــقوسات في محافظة القادسية Molecular and immunological study of TLRs associated with Toxoplasmosis in Al - Qadisiyah province

اسم المؤلف: هديل شاكرهادي التميمي
اسم المشرف: رائد عباس كاظم رحيم طعمة عبيس
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المقوسة الكوندية طفيليات داخل خلوية تصيب نسبة كبيرة من سكان العالم. وقد اظهرت العديد من الدراسات ان المستقبلات ((TLR تلعب دور مهم في الامراض الطفيلية المختلفة. وقد اجريت هذه الدراسة لتحديد الجينات TLR7 وTLR9 والسيتوكينات ذات الصلة في 125 امراة مجهضة كمجموعة بالمقارنة مع 15عينة من النساء الاصحاء (غير حوامل) و15عينة من النساء الحوامل كمجموعات سيطرة في مستشفى النسائية والاطفال في محافظة القادسية من كانون الثاني / 2015 وحتى اذار / 2016، وقد تم سحب 5 مل من عينات الدم الوريدي من النساء تحت ظروف معقمة. هناك ثلاثة جوانب في هذه الدراسة , وتضمن الجانب الاول قياس مستويات الاجسام المضادة (العدوى الكامنة والعدوى المكتسبة مؤخرا) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل . الجانب الثاني تضمن تحديد مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وproflin - 1 (PFN - 1) في مصل النساء المجهضات والحوامل وغير الحوامل. تم الكشف عن مستويات السيتوكينات (IL - 12، IFN - γ) وPFN - 1 في الدم باستخدام تقنية ELISA . ركز الجانب الثالث على تحديد الجينات TLR7) , (TLR9 واستخلاص الحمض النووي DNA من النساء عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). واظهرت النتائج ان معدل الانتشار المصلي IgM (العدوى الكامنة) وIgG (العدوى المكتسبة مؤخرا) الاجسام المضادة للتوكسوبلازما كانت موجبة في 55/125 حالة بنسبة ((44% و5/125 حالة بنسبة (4%) على التوالي، والانتشار المصلي للاجسام المضادة لل T.gondii في النساء المجهضات .48% ولم تسجل مصليا بشكل مختلط في هذه الدراسة، في حين كانوا النساء الاصحاء بنسبة(0%) لجميع الاجسام المضادة . وجدت علاقة ذات اهمية احصائية (P<0.05) بين الانتشار المصلي للاصابة بداء المقوسات المزمنة والعمر للنساء المجهضات ، الامراض المزمنة ، ووقت الاجهاض ، وقد اظهرت النتائج عدم وجود علاقة ذات اهمية احصائية بين الاصابة بداء المقوسات وقدرة النساء على انجاب الاطفال وتكرار الاجهاض. اكدت النتائج ان النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgG يزداد لديهم تركيز IL - 12 زيادة معنوية بالمقارنة مع مجاميع السيطرة ، في حين انه لاتوجد اي زيادة معنوية في تركيز الاجسام المضادة IgM بالمقارنة مع مجاميع السيطرة في قيمة LSD ((30.28. تركيز IFN - γ كان منخفض في النساء المجهضات الموجبات للاجسام المضادة IgM ، كلا المجموعتين من النساء المجهضات لديهم انخفاض في تركيز IFN - γ بالمقارنة مع مجموعة السيطرة (الحوامل وغير الحوامل) . كما ان النساء المجهضات السالبات للاجسام المضادة IgM لديهم انخفاض هام في بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD (19.33).profilin - 1 البشري كان في مستوى منخفض في النساء المجهضات المصابات للاجسام المضادة IgM وIgG بالمقارنة مع مجاميع السيطرة الاصحاء والحوامل في قيمة LSD 230.14)). ان الصورة الجينية لجينات TLRs قد اوضح ان TLR7 وTLR9 كانا بنسبة 89.7%)), 84.1%)) على التوالي .كذلك النتائج وضحت وجود بعض التباين الوراثي (TLR7 وTLR9 الجينات) في النساء المجهضات مقارنة مع السيطرة، وهذا يعني وجود طفرات في الجينات للمرضى. | Toxoplasma gondii is an intracellular parasite infected large proportion of the world population. Many of studies have shown the critical part of TLRs in different parasitic diseases. The present study were performed to detect TLRs 7 and TLRs 9 genes and related cytokines in 125 aborted women as case group and 30 healthy women (15 non pregnant and 15 pregnant women) as control groups in the Maternity and children Hospital in the Al - Qadisiyah province from December 2015 till March 2016, Five milliliter of venous blood sample were obtained from each woman under sterile condition. Three aspects were involved in this study; the first aspect included the measurement of sera antibodies (IgG& IgM) in the aborted women and control and study epidemiological aspects for T. gondii infection. The second aspect determined the levels of cytokines (IL - 12 Pg./ml , IFN - γ Pg./ml) and human proflin - 1 (PFN - 1 Pg./ml) in the sera of aborted women and control. The levels of cytokines (IL - 12 , IFN - γ) and PFN - 1 in blood were detected by using ELISA principle. The third aspect focused on detection of TLR7 gene and TLR9 gene in extraction DNA of aborted women and control (non pregnant and pregnant women) by Polymerase Chain Reaction (PCR). The outcomes demonstrated the seroprevalence of IgG (latent infection) and IgM (recently acquired infection) anti - Toxoplasma antibodies were positive in 55/125 cases (44%) and 5/125 cases (4%) respectively, however the Overall Seroprevalence of anti - T.gondii antibodies in aborted women was 48%. Mixed seropositive for IgG and IgM were not recorded in the present study, whereas the control were 0% for all antibodies. Significant relationship (P< 0.05) was found between the seroprevalence of T.gondii as ( chronic infection , age groups of the aborted women, several chronic diseases and abortion time). The results showed no statistically significant association between Toxoplasma infection and the ability of women to have children and frequency of abortions. The results confirmed that the aborted women with positive IgG antibody have significant increase in IL - 12 concentration in comparison with control , while no significant increase in IgM in comparison with control groups at LSD value ( 30.28). The concentrations of IFN - γ were lower in positive IgM aborted women than IgG , both groups of aborted women have significant decreased in comparison with pregnant control. While IgM patients have significant decreased in comparison with pregnant and healthy control group at LSD value (19.33). The human profilin - 1 levels were lowered in infected aborted women with IgG and IgM antibodies in comparison with pregnant and healthy control at LSD value ( 230.14). The genetic profils of genes TLRs have explained that TLR7 and TLR9 were (89.1 %) , (84.7 %), Respectively in aborted women. The results illustrated the presence of some genetic variation (TLR7 and TLR9 gene) in aborted women compared with the control, and this means having mutations in the patients gene.

التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city

اسم المؤلف: زهراء محمد وناس
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.

العزل والتشخيص الجزيئي للفطريات المعزولة من التربة المنتجة للمواد الايضية المضادة للميكروبات Isolation and Molecular Identification of Antimicrobial Metabolites Producing Fungal Isolated from Soil

اسم المؤلف: سرى رحمن نوار المسافر
اسم المشرف: نداء شهاب حمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة في مختبرات كلية العلوم للبنات / جامعة بابل للتحري عن الفطريات المنتجة للمركبات الضد ميكروبية في تربة محافظه بابل للمدة من ايلول ,2015 الى ايلول ,2016 . حيث جمعت عينات التربة من مناطق مختلف وشملت الترب الزراعية والترب الغير مزروعة كذلك الترب الملحية وترب الشاطئ والترب الصناعية ,تم تنقية 200 عزله فطرية عشوائيا واختبرت قدرتها التضادية مع عدد من الاحياء المجهرية الممرضة لتحديد قدرتها الانتاجيه .تم اختبار 200 عزلة فطرية بواسطة المسح الاولي لتحديد قابليتها على تثبيط البكتريا الممرضة السالبة والموجبة والفطريات المرضية خارج الوسط الحي .بينت نتائج التضاد ان 72 عزلة كانت قادره على تثبيط 3≤ من الكائنات الممرضة وقد اختبرت هذه العزلات لتحديد انتاجيتها للحوامض حيث وجد ان 13 فقط كانت غير منتجه و59 عزله منتجه بنسب مختلفة .استثنيت العزلات المنتجة للحوامض من الدراسة لان نسبه الحامض ادت الى قتل الاحياء المجهرية الممرضة . اما العزلات غير المنتجة فقد اختيرت منها العزلات الاكثر فعالية في التثبيط وذات مدى تثبيطي واسع . تم تشخيص العينات الفطرية مظهريا باستخدام المجهر الالكتروني واوساط زرعيه تشخيصية مختلفة ,اما التشخيص الجزيئي للعزلات فقد تم باستخدام البادئ العامITS1و ITS4 لتضخيم منطقة Internal transcribed spacer ,حيث بينت نتائج التشخيص المظهري والجزيئي للعزلات بانها تعود للجنسين Aspergillus fumigates وTrichoderma longibrachiatum. اما نتائج فحص الحساسية فقد اوضحت ان العزلتين 104وS4 هما الاقوى في الانتاج على وسط مخلفات البطاطا الصلب بالمقارنه مع الاوساط السائلة وتحت ضروف مثلى من درجة حراره واس هايدروجيني وزمن انتاج .بينت النتائج بان المركبات المعزوله كانت ذات تاثير واسع الطيف ضد مجموعة من البكتريا الموجبه والسالبة لصبغة كرام لذالك تم اختبار فعاليتها ضد مجموعة من الخمائر والاعفان الممرضه للانسان والمعزوله من مختبرات مستشفيات محافظة بابل.عند مقارنه النتائج التي تم الحصول عليها مع نتائج المضادات الصيدلانية وجد ان تاثير المضاد المنتج يفوق تاثير كل من Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, بصورة كبيرة بالاضافة الى تاثيرها على مجموعة من الاعفان الممرضة. اما اعلى قطر تثبيط تم الحصول علية يعود للعزلة S4 ضد البكتريا Bacillus seraus بقطر 43.35mm بعد تنمية الفطر على وسط مخلفات البطاطا الصلب لمدة 9 ايام بدرجه حراره 30 ◦م. وهو اعلى من قطر تثبيط المضاد Meropenem ضد البكتريا المذكوره.تضمنت الدراسة جوانب اخرى وهي استخلاص المركبات الفعالة من وسط التخمر باستخدام خلات الاثيل والماء المقطر ثم تنقيه المركب باستخدام تقنية كروماتوكرافيا الطبقة الرقيقة .كذلك تم تشخيص المركبات الفعالة باستخدام التحاليل الكيميائيه التالية(FTIR,HNMR and CHNS ) لمعرفة المجاميع الفعالة والتركيب الكيميائي للمركبات المستخلصة. | This study is conducted in the laboratories of Science College for Women’s / University of Babylon to investigate the antimicrobial producing fungi in the soil of Babylon province from September 2015 until September 2016 . Soil samples are collected from different regions included agricultural, non - agricultural, salty, sandy and carbonate soil, purified 200 fungal isolates randomly and tested the antagonism with a number of pathogenic microorganisms . The 200 fungal isolates are tested by primary screening method to determine their ability to inhibit in vitro Pathogenic gram positive and negative bacteria and pathogenic fungi. The primary screening illustrate that 72 isolate were able to inhibition 3≤ pathogenic organisms. These isolates were tested to determine the acid productivity which found that only 13 were non - acid production and 59 isolate are product in different concentration. The acids producing isolates are excluded from the study because the rate of acid led to killing of test pathogenic microorganism .The selected isolates are non - acid productive and most effective in the inhibition of test pathogenic microorganism with a wide range. The samples are morphologically identified using the electron microscope and different diagnostic agricultural media (PDA, CYA, MEA), either molecular diagnosis of isolates have been using ITS1 and, ITS4 primer to amplify the Internal transcribed spacer region, the morphological and molecular identification results of the isolates showed that it belongs to Aspergillus fumigatus and Trichoderma longibrachiatum. The sensitivity results illustrate that the isolates 104 and S4 are the strongest in the production on potatoes peals solid media in compared with liquid residues media under the optimal production condition including temperature, hydrogen power and time of production. Results show that the isolated antimicrobial compounds were broad - spectrum against both G+ve and G - ve bacteria so it has been tested its effectiveness against a group of pathogenic yeasts and molds isolated from laboratories of Babylon hospitals.When comparing the results obtained with the results of pharmaceutical antibiotics found that the effect of the product exceeds the effect of Tetracycline, Amikacin, Ampicillin, Gentamycin, in addition to significantly impact on a range of pathogenic molds. The highest inhibition zone is obtained due to the isolation of S4 against the bacteria Bacillus seraus with diameter 43.35mm after the incubation the isolates on the potato peals solid media for 9 days at a temperature of 30 ◦C. These diameter is higher than the inhibition zone of Meropenem antibiotics against the same bacteria.Other aspects of this study include an extracted of the active compounds from the fermentation media using ethyl acetate and distilled water and then purifying the compound using thin layer chromatography(TLC) technique. Also it has been diagnosed the active compounds using the following chemical analysis (FTIR, HNMR and CHNS) to illustrated the type of effective compound.

تقدير السيروتونين, عامل تغذية الدماغ, اللبتين, الكورتيزول والتيستوستيرون عند الرجال البدناء في محافظة بابل Determination of serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, cortisol and testosterone of obese men in Babylon province

اسم المؤلف: غدير حامد عبد الحســــن
اسم المشرف: نوران جميل ابراهيم
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الحيوان
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل السمنة مشكلة صحية عالمية واسعة الانتشار من خلال تاثيراتها على مختلف وظائف الجسم وهذا ما اكدته العديد من الابحاث والدراسات التي تناولت السمنة ومدى تاثيرها على صحة الجسم وتضمنت دراستنا الحالية دراسة السمنة وعلاقتها ببعض النواقل العصبية والهرمونات الايضية وقد كانت الابحاث في هذا المجال الى حد ما قليلة. اجريت الدراسة في كلية العلوم للبنات /جامعة بابل للفترة الممتدة من تشرين الثاني 2015 ولغاية نيسان 2016 حيث تم دراسة بعض النواقل العصبية (السيروتونين 5 - HT وعامل تغذية الدماغBDNF ) وبعض الهورمونات الايضية (اللبتين والكورتيزول والتيستوستيرون ) باستخدام طريقة (ELISA) وكذلك تم تقسيم مجتمع الدراسة حسب المعايير الجسمانية حيث تم حساب وزن وطول الاشخاص ومن ثم مؤشر كتلة الجسم, العمر, ونسبة الدهون في الجسم , وقياس محيط الخصر وفق معادلات خاصة وتوضيح العلاقة بين الهورمونات والمعايير الجسمانية التي بموجبها تم تقسيم مجتمع الدراسة، حيث شملت عينة البحث 98 شخص سليم ظاهريا تتراوح اعمارهم بين 20 - 49 سنة من الرجال وفي ادناه التقسيمات الجسمانية لمجتمع الدراسة : ا - مؤشر كتلة الجسم الى ثلاثة مجاميع، الفئة الاولى شملت 54 شخص بدين و24 شخص وزن زائد و20 شخص وزن مثالي كمجموعة سيطرة. ب‌ - نسبة الدهون في الجسم الى اربعة مجاميع , فئة الرياضيين5 اشخاص، فئة الاشخاص اللذين يمتلكون لياقة بدنية3 اشخاص، فئة الاشخاص بنسبة مقبولة من الدهون 14 شخص, فئة البدينين 76 شخص.ج‌ - حسب الفئات العمرية الى ثلاثة مجاميع ، الفئة الاولى شملت 31 شخص فئة الشباب و29 شخص لفئة متوسطي العمر و38 شخص كبار السن.د‌ - حسب قياس محيط الخصر وضمت مجموعتين، الاولى (84) خصر كبير(اكبر او يساوي 90 سم) والثانية(14) خصر صغير ( اصغر من 90 سم ).واظهرت النتائج ما يلي : 1. انخفاض معنوي في مستوى هرمون السيروتونين (p<0.05) عند مجموعة الاشخاص البدينين اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى. 2. اظهرت النتائج وجود ارتفاع معنوي ( p<0.05) في مستوى عامل تغذية الدماغ BDNF)) عند مجموعة الاشخاص البدينين مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى اعتمادا على مستويات مقاييس السمنة.3. اما اعتمادا على تقسيم الفئات العمرية فنلاحظ وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في مستوى BDNF عند الفئة العمرية لكبار السن مقارنة مع فئة الشباب.4. كما واوضحت النتائج زيادة ملحوظة لمستويات هرمون اللبتين في مصول الاشخاص البدنيين في جميع التقسيمات الجسمانية(مؤشر كتلة الجسم، نسبة الدهون، ومحيط الخصر) عند مقارنتها بمجموعة السيطرة.5. فيما اظهرت نتائج هرموني الكورتيزول والشحمون الخصوي انخفاض معنوي( p<0.05) في الاشخاص البدينين لجميع التقسيمات الجسمانية مقارنة بالاشخاص في المجاميع الاخرى . 6. اما فيما يخص الفئات العمرية فقد اوضحت النتائج وجود ارتفاع معنوي( p<0.05) في اللبتين وهرمون الكورتيزول في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب ,بينما اظهرت النتائج حصول انخفاض معنوي (p<0.05) في هرمون الشحمون الخصوي في فئة كبار السن مقارنة بفئة الشباب. اما قيم السيروتونين فلا توجد فروق معنويه بين الفئات العمرية . في حين اظهرت نتائج تحليل الانحدار الخطي وجود ارتباطات ايجابية وعكسية بين المعايير الجسمانية الاربعة المقاسة (كتلة الجسم ونسبة الدهون ومحيط الخصر بالاضافة الى الفئات العمرية) مع الهورمونات المتضمنة موضوع دراستنا بالاضافة الى وجود علاقات بين الهورمونات مع بعضها البعض عند الاشخاص في المجاميع المختلفة المصنفة حسب مقاييس السمنة المذكورة سابقا. | According to recent studies, obesity have been found to be of prime risk factor for many a worldwide public health problem. However, little works have been done to study the effect of obesity in showing healthy person neuropeptide and metabolic hormone level associated with it in the regulation of important system in human body. This study was carried out in College of Science for Women in Babylon University during the period from November 2015 till April 2016, it was an evaluated study for the assessment of the obesity effect on serotonin, brain derived neurotrophic factor, leptin, cortisol, and testosterone and to investigate any relationship if found between these parameters in studying population according to measures of obesity categories. The study involves following up of 98 men at 20 - 49 years who were divided according to their anthropometric (physical) characteristics : 1 - Subjects whom were obese (54 sample), overweight (24 sample) and normal weight (20 sample) as classified according to BMI categories.2 - Subjects whom were athletes (5 samples), fitness (3 samples), acceptable (14 sample) and obese (76 sample) as classified according to body fat percentage category. 3 - Subjects whom have young - age (31 sample), middle - age (29 sample), others whom have old - age (38 sample) based on age group categories.4 - Subjects whom have waist circumference (WC≥ 90 cm) defined subjects with large WC (84 sample) other subjects have (WC< 90 cm) were considered as small WC (14 sample). The parameters in the present study were included serum neurotransmitter serotonin, Brain - Derived Neurotrophic Factor, Leptin, Cortisol, and Testosterone, also the parameters were done in this study included anthropometric measurements such as; body weight, height to calculated (BMI), and WC and percentage of body fat were calculated by a special formula, also subjects age were recorded. The results show in the following : 1 - A significant decrease in the serotonin level (p<0.05) in obese subjects according to categories of obesity measurements compared with other groups.2 - The results showed a significant increase in BDNF level (p<0.05) in obese group according to categories of obesity measurements as compared with other groups of obesity measurements.3 - The study showed that increase level of BDNF in old - age group compared with young - age group.4 - The results of leptin hormone show a significant increase (p<0.05) in all obese groups in regard with categories of obesity measurements.5 - The results showed a significant decrease serum testosterone level in obese subjects in all categories of obesity measurements as comparison with other groups.6 - The results showed that variation in leptin and testosterone levels were associated with age groups difference, while there were no significant differences in serotonin level as related with age - groups difference.7 - The results of cortisol level showed a significant increase (p<0.05) in both of obese groups and normal BMI group. In addition, it was noticed that a significant positive and negative correlation among investigated hormones in subjects based on categories of obesity and between that tested hormones with anthropometric measurements.

التشخيص الجزيئي, المظهري واختبار حساسية الفطريات والبكتريا المرافقة لقشرة الشعر مختبريا لعوامل التضاد الميكروبي Molecular, Phenotyping identification and invitro susceptibility testing in Fungi and Bacteria associated with hair dandruff to antimicrobial agents

اسم المؤلف: شيماء محمد علي وتوت
اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تمثل قشرة الراس اكثر مرض جلدي شيوعا ورغم انها غير مهلكة للحياة فلم تنل قسطا من الاهتمام والبحث على مستوى العالم ولذلك هدفت الدراسة الحالية الى عزل, تشخيص والتحري عن تاثير المضادات الفطرية على الفطريات والخمائر وكذلك عزل وتشخيص البكتريا المرافقة للقشرة الموجودة في فروة الراس ومن شعر هذه الحالات المرضية. خلال مدة الدراسة ولفترة من تشرين الاول الى حزيران 2016 حيث تم جمع 280 عينة قشرة وشعر ومسح من الحالات الموصوفة انفا واشتملت على 152عينة شعر و74 عينة قشرة و54 مسحة من فروة الراس وكذلك جمعت 30 عينة سيطرة. وكل جهد لم يشار اليه بمصدر فهو من جهد الباحث.زرعت العينات على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسيمايد وبدونه وشخصت عزلات الخمائر اوليا على وسط CHROMagar للتميز بين انواع الخمائر عن طريق الوانها. كذلك تم التحري عن الفطريات الخيطية الجلدية من خلال زراعتها على وسط اكار السابرويد والدكستروز(SDA) الحاوي على مضاد السايكلوهكسومايد للحصول على عزلات للفطريات الجلدية وكذلك تقييم تواجد الفطريات المترممة مع العينات قيد الدراسة وتقيم عوامل الضراوة لدى الخمائر. تشخيص الفطريات المعزولة على المستوى الجزيئي من خلال تضخيم منطقة ITS باستخدام الزوج الباديئي ITS5/ITS4وITS3/ITS4 واجراء تحليل التتابع DNA sequencing لعينات ممثلة عن المجوعات المتماثلة في اوزانها الجزيئية لمنطقة التضخيم وبعد الحصول على نتائج التضخيم تم اخذ منتج بلمرة لعزلات ممثلة وارسلت الى مختبرMicrogene في امريكا للحصول على التتابع للقواعد النتروجينية ومقارنتها مع تتابع العينات المرجعية في البنك الجيني باستخدام برنامج NCBI )Blast Nucliotide Database). ومطابقة التتابعات لتقييم التماثل والاختلاف ورسم الشجرة التطورية على اساس نتائج تحليل التتابع لتقييم مدى تقارب العزلات ضمن النوع والانواع قيد الدراسة.اظهرت نتائج التشخيص التقليدية والجزيئية باستخدام الازواج البادئية ITS5/ITS4 وITS3/ITS4 كانت اوزان الحزم لكامل منطقة ITS تتراوح بين500 - 800 زوج قاعدي. بينما تراوحت الاوزان لمنطقة ITS2 بين350 - 400زوج قاعدي.واظهرت النتائج ان الطرق الجزيئية المتقدمة هي ادوات قوية لتشخيص الفطريات مقارنة مع الطرق التقليدية. تم تسجيل عزلتين من C. sake و3 عزلة Aurobasidium iranianum وعزلة Issatchenkia orientalis وعزلة من Cryptococcus fonsecae وعزلة واحدة من Cryptococcus diffluens لاول مرة في العراق.اجراء تقييم للفعالية المايكروبية لبعض المستخلصات النباتية المهمة طبيا ومقارنتها مع المضادات الفطرية وتقييم التركيز المثبط الادنى باستخدام شريط E - Test strips .كما تم مسح الانواع البكتيرية المرافقة للعينات قيد الدراسة مجهريا وبايوكيميائيا من خلال زراعتها على الاوساط التفريقية مثل وسط Manitol salt agar ووسط Blood agar base.اظهرت عزلات المبيضات البيضاء موجبة لانتاج الانبوبة الجرثومية, النمو بوجود السايكلوهكسيمايد والنمو في درجة ˚45م. قابلية C.kruzei , C.parapsilosi وC.glabrata على تكوين الغشاء الحيوي . اما اختبار الانزيمات الحالة للدهون المفسفرة فقد كانت موجبة لعزلات C.albicans ,C.parapisilosis وC.kruzei واخيرا اضهر اختبار الانزيمات الحالة للدهون نتيجة موجبة فقط لعزلات C.albicans ,C.tropicalis وC.parapsilosis. كذلك اجريت اختبارات للفطريات الجلدية والتي تضمنت قدرة ال T.rubrum على النمو على وسط SDA with 5% of NaCl وكذلك نمو الفطريات على وسط PDA وانتاج صبغة عكسية.اظهرت النتائج ان لبعض المستخلصات المائية للنباتات تاثير مثبط على نمو الفطريات الجلدية والخمائر وكان المستخلص المائي للقرنفل اكثر فعالية في تثبيط الفطريات الجلدية وبعض الخمائر وال Rhodotorulla وبفرق معنوي ≥ 0.05 يليه الشاي الاخضر والكالبتوز والدارسين والحنة وبتركيز 8 % حيث كان اكثر تاثير من بقية التراكيز.تم اجراء اختبار الحساسية الدوائية لبعض المضادات الفطرية باستخدام E - Test strips للمضادين CAS وFLU حيث اظهرت النتائج مقاومة الفطريات الجلدية والخمائر وال Rhodotorulla للمضادين.تم عزل بكتريا Staph.aurues and Staph.epidermidisوبين اختبار ال Congo red قدرتها على تكوين الغشاء الحيوي Biofilms)). واستنتجت الدراسة ان قشرة الشعر هي مشكلة الشعر المهمة العديد من الخمائر مع الشعر المتساقط معها قد تقف وراءها مجموعة من الفطريات والبكتيريا المتهمة في احداث مثل هكذا اخماج وان استخدام المستخلصات النباتية كانت مؤثرة بشكل معنوي في اختزال نمو الفطريات التي تم اختبارها تحت تاثير هذه النواتج الطبيعية وبغياب الفعالية الدوائية لافضل المضادات الفطرية مثل الفلوكنزول والكاسبوفنجين. ان التشخيص المظهري للعزلات اعتمادا على شكل الخلية لانواع المبيضات والوانها على وسط الكرومواكار هو غير علمي لنجاح التميز بين انواع المبيضات. لذلك تشخيص الانواع بالاعتماد على منطقة ITS يوفر وقتا (والذي ياخذ وقت من يوم الى يومين ) وهي ملائمة وتطبيقية حتى مع العزل التي تمتلك خصائص مظهرية شاذة. | Hair dandruff is a most commercially demoralized skin disease. Although it is not deadly disease, but not have more attention and research worldwide. This study was aimed for isolation, identification and investigation of antifungal susceptibility of dermatophytes and Candida also isolation and identification of bacteria associated with hairs dandruff. During the period from September to June a total of 280 sample of scalp and hair and smear were collected from Hilla hospital private clinics and primary schools in rural areas in the Province of Babylon (n=152 hair samples, n= 74 dandruff samples, n= 54 smear from head scalp) and samples was also collected as 30 control samples. Every effort not referred to source it from researcher effort. Samples cultured on Sabouroud Dextrose Agar (SDA) medium with or without Cyclohexemide based on stander cultured methods, incubation and identification, Primary identification of Candida has been achieved on CHROMagar medium to differential between Candida spp. based on colors. Also it was investigation about dermatophytes through cultivation on Sabouroud Dextrose Agar containing Cyclohexomide to get isolates of dermatophytes, as well as assess the presence of fungus saprophytic with samples under study.Virulence factors for the yeast were detected. Fungal identification based on amplification internal transcript spacer (ITS) region by using ITS5/ITS4, ITS3/ITS4 primers and subject the PCR product to sequence analysis (DNA sequence) for representative samples groups at Micro gene laboratory in US. Sequence analysis based on alignment with data base of reference strains in the gene bank (Blast Nucliotide Database (NCBI) program). phylogeny tree was construction on the basis of the results of the sequence data.Results showed conventional and molecular diagnosis by used ITS5/ITS4 and ITS3/ITS4 primer was band weight integration to ITS region range between 500 - 800 bp. while range weight for ITS2 region between 350 - 400 bp.The results showed that advanced molecular assays were powerful tools for fungal identification compare with the conventional methods. For the first time in Iraq Two isolates from C.sake and one isolate from Issatchenkia orientalis, also three isolates Aurobasidium iranianum and one isolates from Cryptococcus fonsecae and one isolates from Cryptococcus diffluens were recorded.Evaluating the effectiveness of microbial for some medically important plant extracts and compared with the antifungal and assess the minimum inhibitory concentration by used E - Test strips. As it has been cleared bacterial species accompanying to samples under study microscopically and biochemically during cultured on differential medium like manitol salt agar and blood agar base media.C.albicans isolates positive results for germ tube, growth in the presence of Cyclohexomide and growth in temperature 45C˚. C.kruzei, C.parapsilosis, C.glabrata ability composition of biofilms, while phospholipase assay was positive to C.albicans, C.parapisilosis and C.kruzei. Lipase assay was positive to C.albicans, C.tropicalis, C.parapsilosis. As well as conducted test for dermatophytes which include ability of Trichophyton rubrum on growth on SDA with NaCl of 5 % and dermatophytes growth on PDA and produce inverse dye. The results showed that aqueous extracts were reduced the growth of dermatophytes and Candida. The aqueous extract of Cloves more effective in inhibition of dermatophytes, Candida and Rhodotorulla at ≥ 0.05 followed by green tea and Eucalyptus, Cinnomomum, Henna. Moreover 8% concentration was more effective than other concentrations.Tested antifungal sensitivity for some Fluconazole and Caspofungin antifungal using E - Test strips. Showed that dermatophytes, Candida and Rhodotorulla was reveals resistance action against antifungals.Staph.aureus and Staph.epidermidis showed Congo red test and ability for biofilms formation.The study concluded that the hair dandruff is important hair problem, many yeast with the hair loss together may be behind them groups from fungi and bacteria accused in events such as typhoid and used of plant extracts was effected in signification in fungi growth that test under effect this natural products and the absence pharmaceutical activity to best antibiotic such as Fluconazole and Caspofungin. Morphologically identified isolates based on the cell shapes of Candida spp. and their color on CHROMagar isn’t feasible to successfully differentiate between members of the Candida spp. Therefore, identification of Candida and dermatophytes base on ITS region saves time (it takes 2 to 3 days) and is accurate and applicable even to isolates with atypical morphological features.

عزل وتشخيص المضاد الحيوي المنتج بواسطة عزلة Penicillium chrysogenum من البيئات المختلفة في ترب مدينة الناصرية Isolation and Identification of antibiotic produced by Penicillium chrysogenum isolated from different environments in Nasseriya city soi

اسم المؤلف: ميسم كريم حسن
اسم المشرف: سعد سلمان هميم محمد حسين مشهد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study includes the isolation and identification of some mycoflora from 40 soil samples in six places ( Remnants of fat - born, parks, edges of the river, animal wastes, sewage and rubbish) during October 2015 - January 2016 in Nasseriya City, Iraq. According to different environmental factors, the isolated genera were Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, Cladosporium, Sepedonium chrysospermum, Alternaria chlamydospora, Bipolaris, Chrysosporium, Candida albicans, Rhododendron flavum, Humicola, Geotrichum candidum, Fusarium and Acremonium. Three isolation methods were used. Dilution method, direct plate method, alcohol and heat treatment technique using the cultural media viz. Potato Dextrose Agar ( PDA), Sabouraud Dextrose Agar (SDA) and Potato Carrots Agar (PCA). Aspergillus represented the highest fungal isolates which represent 62 (37.12%). followed by Penicillium with 47 (28.14%), Mucor 22 (13.16%), Rhizopus 15 (8.98%), Cladosporium 6 (3.59%), Sepedonium chrysospermum and Alternaria chlamydospora, 3 (1.80%), Biopolaris, Chrysosporium and Candida albicans with 2 (1.20%), and finally Rhododendron flavum, Humicola, Acremonium, Fusarium and Geotrichum candidum recorded the lowest fungal isolation with one isolate for each (0.60%). The study was aimed to isolation of Penicillium from soil and assay its antibacterial activity. The results showed that dilution method gave a best fungal growth in comparison with direct plate method and alcohol and heat treatment technique in 25 ºC and pH = 6. PDA appeared as an optimum medium for isolation in comparison with other media such as SDA and PCA. The preliminary results showed that Penicillium sp. exerted antibacterial activity against Gram positive and Gram negative bacteria; Therefore, this fungus was used for production of antibiotic on Potato Dextrose Broth (PDB) medium. The optimum conditions were obtained at pH = 6, incubation temperature of 25 ºC and shaking rate of 180 rpm for 7 days to fermentation. Ethyl acetate was a good organic solvent to extraction of antibiotic which produced (3g/L) as white to creamy crystals. The characterization of the antibiotic product after extraction and purified by chemical methods included Thin Layer Chromatography (TLC) test, Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectra and Mass Spectra. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for clinical bacterial species was 1 - 10mg/ml.The PCR method used in this study utilized Internal transcribed spacer (ITS1 - 4) as a primer for identification of isolates. Two PCR products of the targeted gene of Penicillium chrysogenum isolates which locally named as (Penicillium chrysogenum F1 and Penicillium chrysogenum F2) were selected and subjected to partial DNA sequencing for the ITS gene to follow up the possible molecular relationship between these local isolates and what recorded globally in Genbank.

Predictability of the Expression of ER, PR Receptors, HER2 Marker by the Coloration with of IV Collagen Expression and AgNORs in Breast Carcinoma among Iraqi Women in Thi_Qar Providence : Immunohistochemical Study Predictability of the Expression of ER

اسم المؤلف: نجم الازيرجاوي
اسم المشرف: هيفاء عبد علي الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: علوم الحياة
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study is adescriptive exploratory study in Thi - Qar providence for some breast cancer patients . This study aims to assess the relationship between gene expression for each type four of the collagen (IVCollagen) and gene expression positive for both estrogen receptor ER - Eestrogen - receptor and progesterone PR - Progestron receptor and fairs tumor HER2 (Human epidermal growth factor receptor) By using chemistry of dyes immunological technique and the nuclear regulatory regions Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR(. The present study addresses the identification of the type IV collagen content in the basement membrane of epithelial tissue of the breast cancer patients in Thi qar and its relationship to nuclear organization region and maintain its relationship with hormonal receptors and progesterone genetic factor and the extent of their association with the occurrence of breast cancer.Fifty tissue samples are collected from Hussein Teaching Hospital inThi Qar and some private laboratories in the providence each case where data included that the most important factor is age, where he found that the highest percentage of injuries, age (55 - 46 years) increased by 38%. And mixed samples, either partial removal of the tumor or the eradication of whole breast. After collecting samples saved each formalin concentration of 10% for 24 hours at a minimum and then buried with parafin wax and completed the work by histological methods own work.The use of special select number of collagen type IV and determine the type of hormonal receptor positive or negative and also used several positive pathological tissues of the tumor to determine the human epidermal growth factor receptor by using silver nitrate to study the nuclear organization regions. Results of the current study showed that there is a positive relationship between collagen gene expression of type IV and between fairs oncogene(HER2 human epidermal growth factor receptor), as observed the presence of collagen type IV in tissue sections of tumors with HER2 negative gene expression of genetic factor, and with the positive expression for each Estrogen receptor positive ( estrogen positive ) and progesterone receptor positive( Progstrogen positive).Results of this study also showesthe presence of collagen or lack in histological sections of the tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs as well as the non - existence of collagen in the sections taken from tumors with negative expression of estrogen and progesterone receptors. The results of the current study also showed that there is a clear positive relationship between nuclear organization regions and between Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR) Fairs oncogene HER2, as it was noted the presence of many of the nuclear regions of the dye - derived tissue sections of tumors with positive gene expression of the HER2 oncogene fairs, while nuclear chromosomal regions did not appear in the sections derived from tumors with negative expression of estrogen receptor and progesterone hormone. The results of the current study also showed that there is a lack of positive gene expression of collagen type IV, the presence of a number of chromosome regions nucleuse (Argyrophilic nucleolar organiser region (AgNOR)).

عزل وتشخيص البكتريا المرضية مع ايلاء اهتمام خاص للبكترياStaphylococcus auerus المرافقة ل Cutaneous Leishmaniasis في محافظة ذي قار Isolation and Identification Pathogenic Bacteri with Special Regard to Staphylococcus auerus Associate with Cutaneous leishmaniasis at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: رضاء الله مرتضى الاعظمي
اسم المشرف: قاسم حسن وداعة
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study is designed to isolated and identification the pathogenic bacteria associated with Cutaneous leishmaniasis. Cutaneous leishmaniasis (CL) is a parasitic disease characterized by single or numerous ulcerations. This was study performed in Iraqi in Shatra general hospital and Al - hussein teaching hospital in Thi - Qar province 2016 - 2017.Total of 370 samples of suspected patients were taken and after examining them using geimsa stain , the positive were 186 males and 126 females then sterilize the area surrounding for ulcer , all samples were taken to (swab transport media) ,culture to MacConkey agar and blood agar after 24 hr of incubation at 37C ,after diagnosed by biochemical testing then species determined by API system. The positive results on culture media 92/312 , males 62 (67.4%) , female 30 (32.6 %).The total bacteria isolated from the lesions were in males and female staph auerus 52 cases (56.5%), Escherichia coli 8 cases(8.6%) , Bacillus cereus 6 cases(6.5%) , Pseudomonas. aeruginesa 5 cases (5.4% ), Strep. Pyogenes 6 cases(6.5%) ,Strepto.agalactiae 3 cases(3.3%).While other that isolated in males only and did not appear in females were aerobic bacteria ,Listeria moncytogenes 3 cases(3.4%) , Actinobacteria .spp 2 cases(2.2%) ,Klebsiella. Pneumonia 2 cases (2.2%) , Rodococcus .equi 1 cases (1.1%) , and anaeroberia bacteria ,Peptococcus niger 2 cases (2.2%) ,Peptostreptococcus .spp 2 cases (2.2%) .Then find bacteria that more presence more with cutaneous Leishmaniasis ,were it was staph. aureus therefore it were objected study antibiotic resistant .The present study demonstrates that Staph. aureus XIV isolates were resistant to methicillin 50 (96.15%), penicillin 48 (92.30%) , Clindamycin 37 (71.15%), ciprofloxacin 30 (57.69%) , Gentamicin 30 (57.69%),Amoxicalave 29 (55.76%), Azithromycin 25 (48.07%) , Amoxicillin 22 (42.30%), Tetracycline 21 (40.38%), Rifampin 10 (19.23%) and Vancomycin all staph .auerus are sensitive to Vancomycin The all 52 Staph. aureus isolates were further examined using polymerase chain reaction (PCR) for detection of (16SrRNA ,mecA and PVI gene ). 16SrRNA gene which were responsible for diagnosis ,where all isolates were positive to was 52\52 (100%) , mecA gene which were responsible for methicillin resistance this was detected in 52\52 (100%) . of Staph. aureus isolates and a part of virulence factors PVL gene was detected in 46/52(88.46%) of Staph. aureus isolates which are responsible to kill the leukocytes of human and other animals.

تنفيذ البوابة اكس اور بصريا بالكامل لمنظومات الاتصالات البصرية Implementation of All Optical Exclusive - OR Gate for Optical Communication Systems

اسم المؤلف: ياسمين سلمان كاظم
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: One of the most important techniques used to realize logic gates in optical networks is by all - optical signal processing.The most two important problems of electronic signal processing are high propagation loss of electronic signals and the high cost of the high speed electronics. Accordingly, these reasons led to converting to optical domain at higher frequencies (≥ 10 ????????/????) .The goal of this work is to implement all optical logic gates specifically exclusive - OR gate. Exclusive - OR gate have an important role in data encryption, parity checking, data encoding, bit pattern generation and matching, addressing, header recognition and many more applications. In this work an all - optical exclusive - OR logic function was achieved by a simulation software and implementing an experiment.In the simulation work, the exclusive - OR function was implemental by using a highly nonlinear fiber with a fiber nonlinear coefficient of 9.1 ????−1????????−1 , 0.135 km length non - degenerate with four wave mixing process and a NRZ - DPSK 10 GB/s signals.Experimentally the exclusive - OR function was implemented by using a highly non fiber with a fiber nonlinear coefficient of 10 ????−1????????−1and a 1 km length with bidirectional degenerate four wave mixing process. The optical signals that were used for the operation of the exclusive - OR function were NRZ - DPSK 40 GB/s signals. Results showed an exclusive - OR function associated with clear eye diagrams. In addition to that, exclusive - NOR function was also obtained experimentally in addition of these four maxterms (A + B, ????̅+ B, A + ???? ̅ and ????̅ +???? ̅ ).

تاثير ليزر النودميوم ياك وبيبتيدات الفوسفات الجبنية - فوسفات الكالسيوم الغير متبلرة مع الفلوريد على ازالة تمعدن مينا الاسنان في دراسة مختبرية The Effect of Nd : YAG Laser and Casein - Phosphor - Peptide - Amorphous Calcium Phosphate with Fluoride on Dental Enamel De - mineralization : In vitro study

اسم المؤلف: هبة عصام عبد الوهاب
اسم المشرف: علي شكر محمود
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: New approaches for caries prevention by using lasers effect combined remineralizing agent providing calcium and phosphate in addition to flouride for increasing the tooth mineral resistance needed. The aim of this study is to evaluate a new treatment modality to decrease dental enamel dissolution via combing the effect of pulsed Nd : YAG laser (1064 nm) and MI plus paste (CPP - ACP containing sodium fluoride ) regarding the tooth pulp chamber temperature elevation, calcium concentration dissolute from enamel surfaces and the dental enamel absorption of methylene blue stain by assessing (R,G,B)values .Eighty human permanent premolar were used in this study, sixty of them were randomly divided into six groups of 10 specimens. The negative control group A received no treatment, and the positive control group B the MI plus paste was applied without laser irradiation. For the groups C, D, E and F the pulsed Nd : YAG (1064 nm) laser was used in two energy settings. The lower laser dose setting at (0.6W, 60 mJ )without and with the MI plus paste for the groups C and D respectively and the higher laser energy setting at (1.7W, 170 mJ )with and without the MI plus paste for the groups E and F respectively.Twenty teeth were used to asses s the temperature elevation during irradiation with laser using a K - type thermocouple at 37 ± 0.5 ̊C, ten teeth exposed to the lower laser energy settings and ten for the higher laser energy settings.A circular window (4 mm radius) marked area on buccal surfaces of the 60 samples after they had been coated with three layer of nail varnish to exposed to the Nd : YAG laser irradiation, and then the samples incubated in 3ml acidic solution of acetate buffer of (0.1M/L) with a pH value of 4.5 for 48 hours . The acidly etched samples removed from the acidic solution after they had been washed from acid they immersed in a 2% solution of methylene blue dye to measure the (R,G,B) values to indicted the affinity of sample surfaces for absorbing methylene blue stain that indicate the surface demineralization . Results of temperature test +showed that the maximum temperature increases for group E (4.7 Co) was very high significant difference (p<0.05) over that of groups C (2.5 Co).The atomic absorption photometry test results showed that groups C, and D were statistically different compared to the groups A and B (p<0.001) in the reduction of calcium dissolution, with a reduction percentage for groups C and D of 25.7% and 33.34% respectively compared to group A, with 21.75% and 29.8 % for groups C and D respectively in comparison to group B. While Groups E and F shown nonsignificant reduction in calcium dissolution compared to control groups.The (R,G,B)s value test showed that groups C and D having lower affinity to absorb methylene blue stain, and they are statically significant different compared to the groups A and B .while groups E and F showing a higher affinity to absorb methylene blue stain compared to control groups. In conclusion the both laser irradiation settings energy (60mJ, 0.6 W,0.12 J/cm2),(170mJ,1.7W,0.34J/cm2) are safe for the vitality of the dental pulp, and when both settings combined with the Phosphor - Peptide - Amorphous Calcium Phosphate with Fluoride ,the results showing significant reduction of dental enamel de - mineralization and lower affinity for methylene blue absorption that although indicate increasing dental enamel resistance to demineralization for the groups of (60mJ, 0.6 W,0.12 J/cm2) laser irradiation settings.

تاثير المعلمات المختلفة لليزر الليف على تعرية الصبغ البوليمري من على سطح سبيكة الالمنيوم نوع 5005A Effect of Different Fiber Laser Parameters on Stripping of Polymer Paint from Surface of 5005A Aluminum Alloy

اسم المؤلف: هالة عبود جاسم
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study provides details of the use of laser as an alternative method to the conventional ones to remove (20) μm thickness of polyester paint from EN AW - 5005A Aluminum alloy, the laser paint stripping process performed by ytterbium fiber laser with a wavelength (1064) nm .Sets of experiments curried out in order to reach to the most suitable parameters for the process, at the first set different levels of energies used from 0.0425 mJ to 1.12 mJ, nine lines of holes accomplished by laser. The holes diameters and the depth at each energy measured in this experiment. At two different pulse repetition rates (20, 50) KHz two sets of experiments done. At the first set the effect of laser energy (0.1565, 0.73, 1.12)mJ also the overlap percent (25%, 50%, 75%) have been studied at five number of passes, the parameters of the process settled by the overlap equations, the effect of the overlap percent on the total time of machining and the material removal rate at different levels of energy also investigated, it’s found that the best energy to work with is 0.1565mJ with one and two passes.The second set of experiments done at 0.1565mJ with a wider range of overlap percent from 25% to 75% increase by five. The removal depth and the behavior of surface roughness determined by Focus Variation Microscopy (FVM) also Scanning Electron Microscope used to analyze the radiated area. It’s found that the best results obtained at 50 % overlap when the laser passes one time on the material.Laser Induced Breakdown Spectrometer (LIBS) used as a method for monitoring and controlling the paint stripping process in order to accomplish the process and ablate only the paint layer without ablating the substrate, for the paint and the substrate (LIBS) spectrum obtained and used to distinguish between the paint layer and the Aluminum substrate.

محزز الليف البصري نوع براغ لتحسس الحرارة والضغط FIBER BRAGG GRATING FOR TEMPERATURE AND PRESSURE SENSING

اسم المؤلف: فهد محمد عبد الحسين
اسم المشرف: تحرير صفاء منصور
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Nowadays, the modern trends in optical sensing are to build simultaneous measurements sensors. In this work two schemes for simultaneous measurements sensors are presented. The first one is with dual FBGs peaks. Every FBG acts as sensing head. The first peak was used for temperature sensing and the obtained sensitivity is 10 pm/˚C and the second peak was used for temperature and pressure measurements with sensitivities 9.2 pm/˚C and 67 pm/ bar for temperature and pressure respectively.The other scheme consists of two sensing heads fabricated in the lab. The first sensing head is the Fabry - Perot interferometer which was used for load and strain measurements by controlling the size of its cavity reached to minimum value in micro scale (30). The sensitivity was increased to 4.07 nm/ N and 5.11 pm/ μɛ for load and strain respectively. This sensitivity for load is the highest that was recorded by micro cavity where previous works were reached to 1.37 nm/N. The second sensing head made by inscribing Bragg gratings inside the core of All Solid Photonic Band - Gap fiber toenhance its sensitivity that reached to 13.7 pm/˚C and 0.7 pm/μɛ for temperature and strain respectively which is more sensitive than previous works of our group in the institute that reached to 10 pm/˚C and 0.66 pm/μɛ for temperature and strain respectively. The obtained temperature sensitivity for the Bragg gratings is higher than previous work for Bragg gratings inscribed on All Solid Photonic Band - Gap Fiber where it was 12.04 pm/˚C.Strain sensitivities were almost the same.

التحقق عمليا من بروتوكول البينغ بونغ

اسم المؤلف: علاء جبار جمعة
اسم المشرف: شيلان خسرو توفيق
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Quantum cryptography uses basic laws of quantum physics to guarantee secure key exchange. The key can be used with unprecedented confidence in any classic cryptographic protocol, where it increases the security to the maximum achievable value. The goal of this work is to encrypt the message directly without need to generate the secure key by using the modified Ping - Pong Protocol. A quantum cryptography system based on Modified Ping - Pong Protocol was designed and implemented for the first time. A polarization - entangled photons were generated by a source using PPKTP crystal inside a polarization Sagnac interferometer at telecom wavelength 1550 nm and a fiber length of 15 Km. In this experiment, Bob prepares entangled photons, sends one photon to Alice by optical fiber to perform one out of four operators according to the message. The modulated photon is sent back to Bob. Then the Bell’s state measurement is applied to extract the message according to the Alice’s coding. The HOM - dip of the two - photon interference was verified to guarantee perfect system performance. The final results showed the switching between the Bell’s states, |????+⟩ and |????−⟩ as the phase of the phase modulator was changed by Alice achieving an acceptable coincidence count of about 625 counts per 30s. These results proves also two photon interference needed to test Bell’s enquality.

تحسين خصائص سطح سبيكة الالمنيوم باستخدام الاكساء بالليزر بانابيب كاربون نانوية مزدوجة الجدار ونابيب كاربون نانوية متعددة الجدار Enhancement of Al 6061 - T6 Alloy Surface Properties using Laser Cladding with DWCNTs and MWCNTs

اسم المؤلف: حسنين مجيد حسين
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Industrial applications of nanomaterial in particular carbon nanotubes (CNTs) have increased from various viewpoints, such as, high performance, energy saving, cost saving, and environmental concerns. Laser cladding technique has been used successfully to modify the surface properties of materials, i.e., improving their wear and corrosion resistance. This work involves cladding aluminum alloy (Al 6061 T6) with different types of carbon nanotubes (multi - walled carbon nanotubes (MWCNTs) and double walledcarbon nanotubes (DWCNTs)) by an automated pulsed Nd : YAG laser. This was achieved by controlling selected cladding parameters whic h are laser power, pulse duration, and working frequency. The experimental investigation included microhardness, energy dispersive X - ray, corrosion resistance and microstructure topography by scanning electron microscope. At the beginning, fifteen cladded samples divided into three groups were investigated to choose the best laserparameters for the process to have almost the best homogeneous clad layer. Group one; five levels of peak power (2.7, 2.9, 3.1, 3.3, and 3.5) kW respectively where varied versus fixed pulse duration of 16 ms, working frequency of 1.5 Hz, and scanning speed of 0.5mm/s. Group two; five levels of pulse duration (12, 14, 16, 18 and 20) ms respectively where varied versus fixed peak power of 3.1 kW, working frequency of 1.5Hz, and scanning speed of 0.5mm/s. Group three; five levels of working frequency of (1.1, 1.3, 1.5, 1.7, and 1.9) Hz respectively where varied versus fixed peak power of 3.1 kW, pulse duration of 16 ms and scanning speed of 0.5 mm/s. The investigation shows that the optimum estimated laser parameters for achieving the best results at spot diameter of 3 mm were (peak power of 3.1 kW, pulse duration of 16 ms (3 ms as preheating and 13 ms as the main action time of the pulse) and working frequency of 1.5 Hz.The executed process in this work was computationally modeled using commercial multiphysics finite element analysis (FEA) software package ANSYS® Release 11 to simulating the virtual environment of laser cladding process to determine the temperature distribution in three - dimensional (3D) analysis. Results indicated that laser cladding of Al 6061 T6 using DWCNTs enhanced three of the most important of surface properties which are hardness, abrasive wear resistance and corrosion resistance more than did the MWCNTs. The distribution of the MWCNTs on the surface of Al 6061 T6 is better than that for the DWCNTs but its penetration is less. Theoretical results show that the diffusion played an important role in the cladding process.

الليف البلوري الفوتوني لاستشعار المجال المغناطيسي Photonic crystal fiber magnetic sensor

اسم المؤلف: احمد عدنان محمد
اسم المشرف: عبد الهادي مطشر الجنابي
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Photonic crystal fiber (PCF) is widely used for sensing applications. In this work, magnetic sensor based on solid core - PCFs for sensing magnetic field was presented. The general structure of the sensor applied is by splicing short lengths of PCF (LMA - 10) with conventional single mode fiber (SMF - 28) in one side and using free space connector from other side. A laser diode with different wavelengths (850, 1060 and 1300 nm) has been used as a light source, where a high sensitive optical spectrum analyzer (OSA) was used to monitor and record the transmitted/reflected spectra.The present work demonstrates the results of the infiltration of the air holes for the PCFs by fluids instead of air. For magnetic sensing, the magnetic fluids being used were prepared and standard ????????3????4 to infiltrate the air holes for the solid core PCF (LMA - 10) which leads to change in the effective refractive index of the PCF, which in turn affects the transmission of the laser inside the PCF due to the value of the refractive indices of the magnetic fluids. The experiments show that the power of transmissionspectrum of the laser had decreased after infiltration without any change in central wavelength of the laser diode the reason is that after PCF air holes infiltration, the effective refractive index has been changed but still within total internal reflectionwhich leads to loss of some fundamental modes, in turn leads to decrease the power of transmission spectrum. The decrease of the transmitted power in the case of standard has been higher than it in the case of prepared ????????3????4 because of the differencein concentration between standard and prepared magnetic fluids. The power of transmission spectrum after PCF infiltration will be increased with increasing magnetic field. Higher sensitivity has been obtained that reached 5.809 nW/mT which consideredhigher than previously published works on PCF magnetic sensors.

الكشف عن البخار الكيميائي بحساسية عالية المستند على مقياس التداخل لليف البلوري الفوتوني Chemical vapor detection with high sensitivity based on Photonic crystal fiber interferometer

اسم المؤلف: رواء كاظم زرزور
اسم المشرف: حنان جعفر طاهر
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: استخدمت مقاييس تداخلات الالياف البلورية الفوتونية في العديد من تطبيقات التحسس. في هذا البحث, تم استخدام الالياف البلورية الفوتونية ذو القلب الصلب المستندة على مقياس تداخل ماخزندر, الذي يسلك حساسية عالية لمعامل الانكسار ومختلف المركبات العضوية المتطايرة، من دون الحاجة الى اي مواد قابلة للاختراق. مقياس التداخل المدمجة ,القوية ويتكون من نهاية ليف بصري بلوري ,الليف البصري البلوري مرتبط مع الليف التقليدية ذات النمط المنفرد ((SMF - 28هذا الارتباط يكون باقل خسارة dB(0.19) في منطقة الارتباط فتحات فراغات الليف تنهار كليا, وتسمح بلتهيج واعادة التركيب للانماط القلب والغلاف .وفي منطقة الارتباط الانماط الاساسية لليف البصري التقليدي تبدا بالحيود عندما تدخل الجزء المنهار من منطقة الارتباط لليف البلوري الفوتوني . بسبب الحيود ، يوسع النمط ويسمح لاثارة نمطين رئيسيين في نهاية اليف البصري الفوتوني.الجهاز يعكس الطيف ويظهر نمط تداخل كدالة جيبية التي تظهر ازاحة بالطيف البصري بشكل مختلف عندما تتسل جزيئات المركبات العظوية المتطايرة الى فتحات الليف البصري البلوري. استخدم ليزر دايود كمصدر ضوئي وبطول موجي 1550 nm ، حيث تم استخدام محلل الطيف الضوئي (OSA) الحساس للغاية في رصد وتسجيل الطيف المنعكس. استخدم ثلاثة انواع من السوائل الكيميائية (N - الهكسين، الميثانول وبروبانول)، كل هذه السوائل الكيميائية وابخرتها لها شفافية عالية في منطقة الطيف المرئي والمنطقة تحت الحمراء القريبة. في هذه التجربة، وجدنا افضل زمن الاستجابة لهذا المتحسس هو من (30 - 35) ثانية لكميات قليلة جدا من هذه السوائل، كما تم دراسة تاثير طول المتحسس على قيمة الازاحة للطول الموجي ، تم اختبار خمسة اطوال مختلفة من PCF ذو القلب الصلب70,50,40,30and 20) nm). حدود الكشف في هذا الجهاز تم من خلالها تسجيل ازاحة في الطول الموجي لنسب من ابخرة مواد كيمياوية تصل لغاية (4.4) nm للبخار الهكسان عندما يكون طول رئس المتحسس (20)mm . في هذا العمل, الحد الاقصى للحساسية التي تم الحصول عليها للمركبات العضوية المتطايرة هي mol \15420 nm في بخار الهكسان .وقد تحققت بعض نتائج المحاكاة باستخدم برنامج COMSOL multiphysics ,تم استخدم هذا البرنامج لتصميم الليف البصري البلوري وايجاد توجيه دايود ليزر 1550 nm داخل الليف البصري البلوري عندما يتغير معامل الانكسار نتيجة لدخول ابخرة المركبات العضوية المتطايرة(هكسان, بروبان, وميثان) وملئها لفتحات الليف. نتائج mulyiphsics COMSOL عندما تسلل ابخرة السوائل الى فراغات الليف البلوري الفوتوني بدلا من الهواء. وعندما يتسلل بخار السائل الى PCF ذو النواة الصلبة (LMA - 10) الذي يؤدي الى تغيير في معامل الانكسار الفعال للPCF، والتي بدورها تؤثر على انتقال ليزر داخل PCF بسبب قيمة معاملات الانكسار للمركبات العضوية المتطايرة. ويظهر نتيجة لذلك ان طاقة طيف انتقال الليزر تخفضت بعد تسلل البخار مع التغير في الطول الموجي المركزي لليزر الدايود. | Photonic crystal fiber interferometers are used in many sensing applications. In this work, an in - reflection photonic crystal fiber (PCF) based on Mach - Zehnder (micro - holes collapsing) (MZ) interferometer, which exhibits high sensitivity to different volatile organic compounds (VOCs), without the needing of any permeable material. The interferometer is robust, compact, and consists of a stub photonic crystal fiber of large - mode area, photonic crystal fiber spliced to standard single mode fiber (SMF) (corning - 28), this splicing occurs with optimized splice loss 0.19 dB. In the splice regions the voids of the holey fiber are completely collapsed, which allows the excitation and recombination of core and cladding modes. The device reflection spectrum exhibits a sinusoidal interference pattern which shifts differently when the voids of the PCF are infiltrated with VOC molecules. Laser diode with wavelength 1550nm has been used as a pump light source, where a highly sensitive optical spectrum analyzer (OSA) was used to monitor and record the reflected spectra. Three types of chemical liquids used (N - Hexane, Methanol and Propanol), all of these chemical liquids and their vapor have a high transparency for visible and NIR spectrum. In this experiment, we found the best response time to this sensor is from (30 - 35) sec for very few quantities from these liquids which approximately measured in microliter, also it was studied the effect of the length of the head sensor on the volume of shift of the wave length, five different lengths of solid core PCF (LMA - 10) (70,50,40,30, and 20) mm were tested.The detection limits of our device associated with the maximum shifts of the wave length is 4.4nm for N - Hexane vapour when the length of the head sensor 20mm.In this work, the maximum sensitivity obtained of volatile organic compounds is 15420nm/mol at the vapor of N - Hexane.Some simulation results have been achieved by using the COMSOL mulyiphsics program. It used to design the photonic crystal fiber large - mode area and find the guiding of laser 1550 nm at this fiber when change the refractive index cladding of the photonic crystal fibers by filling the hole of cladding in vapor of (N - Hexane, propanol, methanol) at 1550 nm, The results of the COMSOL mulyiphsics when infiltration of the air holes for the PCF by vapor liquids instead of air, due the change value of the effective refractive indices of the VOCs, the power of the transmission spectrum of laser decreased after infiltration with change in the center wavelength of the laser diode

تصنيع مواد متوافقة احيائيا للعظام التعويضية باستخدام الليزر ووسائل تقليدية Fabrication of Biocompatible Material for Bone Implants Using Laser and Conventional Means

اسم المؤلف: هدیل فیاض عباس
اسم المشرف: رائد عبد الوھاب اسماعیل ولید خلف حمودي
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present work describes coating the titanium implants with biocompatible materials (ceramics or composites). Three techniques were implemented to materialize this work; these are : pulsed laser deposition, spray pyrolysis, and electrochemical deposition. In these techniques, the influence of deposition temperature, solution concentration, polymer and H2O2 addition, buffer layer sandwiching, and electrolytes combinations were tested. The obtained films’ properties were investigated by using Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR), Atomic Force Microscope (AFM), Optical Microscope, X - ray Diffraction (XRD), Scanning Electron Microscope (SEM), Vickers’ hardness instrument, and Simulated Body Fluid (SBF).Composite films prepared by pulsed laser deposition showed the formation of polycrystalline hydroxyapatite of low crystallinity due to the addition of polymeric shrimp crusts. These films had (80 - 90 nm) spherical grains and constitute only (20 - 25%) of the favorable range (80 - 200 nm), and good hardness (≈550 HV). Pure hydroxyapatite (ceramic) films had (11 - 15 nm) surface roughness and an average grain size of (48 - 65 nm) which represents (7 - 31%) of the favorable range. All these films were porous, have good adhesion, and uniform surface morphology. Best results of pulsed laser deposition technique were obtained at 125oC deposition temperature. Films prepared by spray pyrolysis showed porous polycrystalline A and B - type carbonated hydroxyapatite and single crystalline α - Ca3(PO4)2; of relatively low crystallinity and hardness increased with deposition temperature. Post annealing at 400oC and 800oC for film prepared at 350°C of (0.0325 M) solution concentration has raised the hardness from 222 HV to 488 HV and 1204.25 HV respectively. The films of (0.0325 M) solution concentration had (101 - 105 nm) average grain size and were (78 - 100%) of the favorable range, whereas the films of (0.0406 M) solution concentration had (92 - 96 nm) and made (74 - 100%) of the favorable range. Good bioactivity and adhesion strength were obtained from these films which were enhanced significantly after post annealing. Optimum results were obtained from films prepared at 350oC of (0.0325 M) solution concentration after post annealing. Films prepared by electrochemical deposition technique showed uniform and highly porous polycrystalline B - type carbonated hydroxyapatite and polycrystalline α - Ca3(PO4)2. These films had an average grain size of (66 - 93 nm) when prepared from ((NH4)2HPO4 and Ca(NO3)2) whereas the grain size was (87 - 118 nm) when prepared from (Na3PO4 and Ca(NO3)2) with low roughness values. They had (45 - 68%) and (64 - 87%) respectively of the useful grain size in the favorable range (80 - 200 nm). The films covering area increased after H2O2 addition. These films had poor adhesion but this slightly improved together with the roughness after a buffer layer was deposited.The composite films had low crystallinity, grain size, hardness, and poor adhesion. Films prepared at 70oC from both electrolytes combinations ((NH4)2HPO4 with Ca(NO3)2, and Na3PO4 with Ca(NO3)2) had the best surface morphology and crystallinity with an optimum hardness (≈475HV). All these films had very fast dissolution rate in Simulated Body Fluid. Spray pyrolysis deposition technique proved to be the most promising technique for biocompatible materials fabrication for bone implants requirement

فعالية المضاد البكتيري لاكاسيد المعادن النانوية المحضرة بواسطة الاستئصال بالليزر في سائل Antibacterial Activity of Metals Oxide Nanoparticles Induced by Laser Ablation in Liquid

اسم المؤلف: فرح عبد الكريم عبد الامير
اسم المشرف: خولة صلاح خشان غسان محمد سلمان
الموضوع العام: علوم الليزر
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: With the increasing of bacterial resistance against antibiotics, nanoparticles studies was appeared together with growing need for substituting theseantimicrobial agents. Recently, it has been demonstrated that metal oxides nanoparticles exhibits bactericidal effect against both bacteria strains.In this research, three kinds of metal oxide nanoparticles (Nickel oxide, Copper oxide and Titanium dioxide) colloidal solutions synthesized using laser ablation of nickel, copper and titanium pellet immersed in de - ionized water. Pulsed Nd : YAG laser with 1٠٦٤ nm wavelength and different laser energies (40, 80, 120, 160 and 200 mJ) was used to irradiate the targets for various ablation times : 5 (75 pulse), 10 (150 pulse), 15 (225 pulse) and 20 min (300 pulse).The UV - Visible absorption spectrum of NiO nanoparticles exhibited broad bands whose intensity decreased continuously above ~210 nm. The UV - Visible absorption spectrum of the CuO nanoparticles solution showed absorption peak around ~275 nm and another peak with low intensity around ~645 nm. While absorption spectrum of TiO2 nanoparticles exhibited strong absorption domination on the spectrum below ~360 nm. In all three metal oxide nanoparticles, absorption intensity increased with the laser energy and ablation time due to increase nanoparticles concentrations in liquid. Fourier Transform Infrared spectroscopy characterization confirmed the formation of metal oxide nanoparticles. All three metal oxides nanoparticles gave absorption bands below ~600 cm−1 arising from inter - atomic vibrations. X - ray Diffraction pattern of nanoparticles proved the presence of (111), (200) planes which belong to NiO and ( - 111), (112) planes that assigned to CuO and (101), (112), ( - 403) planes that related to TiO2. TransmissionElectron Microscopy measurement showed NiO, CuO and TiO2 nanoparticles with nearly spherical shapes and sizes at 2 - 21 nm, 3 - 40 nm and 6 - 30 nm respectively.The antibacterial activity of nanoparticles carried out against four types of bacteria : Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Proteus vulgaris (gramnegative bacteria), Staphylococcus aureus (gram - positive bacteria) firstly by liquid medium method. 1000 μg ml - 1 concentration was the best - used concentration of nanoparticles for inhibiting growth of both bacteria strains. Among the three tested types of nanoparticles (NiO, CuO and TiO2) at highest concentration (1000 μg ml - 1), TiO2 NPs showed the highest antibacterial activity against Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa. NiO NPs showed the highest antibacterial activity against Staphylococcus aureus while CuO NPs showed the highest antibacterial activity against Proteus vulgaris. Results also indicated that metal oxide nanoparticles and amoxicillin would have a synergistic effect on inhibiting of bacterial growth. Amoxicillin showed inhibitory rate about 74.8% against Escherichia coli and 76.28% against Staphylococcus aureus. In the case of NiO, CuO and TiO2 nanoparticles at concentration 1000 μg ml - 1 with Amoxicillin, antibacterial activity of Amoxicillin enhanced to about 81.5%, 90% and 81.9% against Escherichia coli and to about 86.9%, 91% and 90.7% against Staphylococcus aureus. Therefore, CuO nanoparticles and amoxicillin have the best synergic effect on inhibiting both bacteria strains. The antibacterial activity of the three metal oxides nanoparticle combined with Amoxicillin was also tested by well diffusion method against Escherichia coli and Staphylococcus aureus. In this method, CuO NPs at concentration 1000 μg ml - 1 along with Amoxicillin showed the highest inhibition zone against Escherichia coli (26.0±1.00 mm), while showed complete inhibition of bacteria against Staphylococcus aureus.