Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 25 out of 865

دراسة بكتريولوجية وبيئية لمياه نهر دجلة وثلاث محطات تصفية في محافظة بغداد == Bacteriological and Ecological Studies on Tigris River and three Purification Stations in Baghdad province

Author name: صبا حسين محمد النعيمي
Supervisor name: كاظم هاشم ياسين الاعرجي | خالد خورشيد كاظم البياتي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمن هذا البحث دراسة بعض العوامل الخاصة بمياه الشرب المؤثرة في صحة الانسان في مدينة بغداد . العامل الاول : هو العامل البايولوجي والفيزيائي والكيميائي الذي يؤثر في جودة مياه نهر دجلة . والعامل الثاني يتضمن دراسة كفاءة تعقيم المياه في ثلاثة محطات تصفية منشاة على طول نهر دجلة . اما العامل الثالث فقد تضمن تقييم مياه الشرب في منطقة الشعلة التي تزود بالمياه من احدى محطات التصفية ( محطة الكرامة ). فضلا عما سبق ,فقد تضمنت الدراسة مقارنة بين تلوث الماء من الناحية البكتريولوجية وحالات الاسهال في الاطفال تحت عمر السنتين, الذين قد راجعوا العيادة الخارجية لمستشفى الشهيد باقر الحكيم في منطقة الشعلة . تضمنت الدراسة ايضا تعيين جودة المياه في ثلاث محطات رئيسة للتصفية , وهي محطة شرق دجلة الواقعة شمال دجلة ومحطة الكرامة الواقعة في وسط دجلة فضلا عن محطة القادسية الواقعة جنوب نهر دجلة في مدينة بغداد , اخذت عينات الماء بواقع مكررين شهريا قبل وبعد عملية التصفية من المحطات المذكورة انفا ابتداءا من كانون الاول - 2009 ولغاية ايلول - 2010 . اما التحاليل البكتريولوجية للماء فقد تضمنت تقدير العدد الحي الكلي للبكتريا والعدد الحي الكلي للبكتريا المعوية والعدد الكلي لبكتريا E.coliوبكتريا Pseudomonas aeruginosa. فضلا عن وجود بعض البكتريا المعوية المرضية مثل Vibrio cholera وspp. Salmonella. حيث جمعت 60عينة من مياه النهر و60 من داخل مشاريع التصفية . وقد استخدمت لتشخيص هذه الانواع من البكتريا الطرائق الاعتيادية المعروفة للتشخيص فضلاعن عدة .API20E بينما تضمنت التحاليل الفيزيائية والكيميائية للماء قبل وبعد عمليات التصفية تعيين المعايير الاتية, الحرارة وتركيز ايون الهيدروجين والكدرة والتوصيلية الكهربائية والمواد الصلبة الذائبة الكلية والملوحة والاوكسجين الذائب والمتطلب الحيوي للاوكسجين , فضلا عن درجات حرارة الهواء في محطات التصفية الثلاثة. وقد اخذت العينات بواقع مكررين وجمعت 60عينة مياه لقياس الاوكسجين المذاب والمتطلب الحيوي للاوكسجين و60عينة اخرى لبقية الفحوصات الفيزيائية والكيميائية . كمااخذت اربعين عينة من ماء الحنفية من المنازل في منطقة الشعلة خلال اشهر الصيف وهي حزيران وتموز واب وايلول من عام 2010. وفي الوقت نفسه, وفي الفترات نفسها السابقة , اخذت عينات مماثلة (اربعون عينة ) من براز الاطفال تحت عمرالسنتين المصابين بالاسهال واربعون عينة مماثلة من براز اطفال اصحاء بالعمرنفسه للمقارنة ولتعيين انواع واعداد البكتريا الحية الكلية المرضية في هذه العينات . ولقد اشارت نتائج هذه الدراسات الى ان درجة حرارة الهواء اثرت بدرجات حرارة البيئة المحيطة وتراوحت بين (15 - 41 م), وكانت درجة حرارة مياه دجلة ما بين ( 13 - 32 م ) , بينما كانت درجة حرارة المياه بعد عمليات التصفية في المحطات الثلاثة بين ( 15 - 33 م) . كان تركيز ايون الهيدروجين للماء ( 7. 48 - 8.08 ) وبعد التصفية كان ( 7.31 - 7.89) اما كدرة مياه دجلة فقد تراوحت بين ( NTU156 - 26 ) ولمياه المحطات الثلاثة بين ( NTU 4 - 1 )كما بينت نتائج الدراسات الحالية الى ان التوصيلية الكهربائية لمياه دجلة كانت اقل منها في مياه المشاريع الثلاثة ( 606 - 776 مايكروسيمنز/سم ) و( 608 - 793 مايكروسيمنز/ سم ) على التوالي . والمواد الصلبة الذائبة الكلية لمياه المحطات ( 425 - 555 ملغرام / لتر ) ولمياه النهر كانت ( 429 - 554 ملغرام / لتر ) . بينما لم تتجاوز الملوحة في كل من مياه النهر والمحطات عن 0.49 ملغرام / لتر. كما كان تركيز الاوكسجين الذائب في مياه نهر دجلة بحدود 7.4ملغرام / لتر بينما اعلى تركيز للاوكسجين الذائب كان 10 ملغرام / لتر. اما المتطلب الحيوي للاوكسجين لمياه النهر فقد كان بحدود ( 1.2 - 4.4 مغرام / لتر ) وهذه النسبة هي ضمن الحدود المسموح بها دوليا .و من جهة اخرى اشارت الدراسات البكتريولوجية الى وجود نسبة عالية من اعداد البكتريا الحية الكلية في مياه المحطات الثلاثة وكانت بحدود ( 1 - C.F.U 64 ), وهذه الاعداد تشير الى عدم كفاءة عمليات التصفية والتعقيم الجارية في المحطات الثلاثة . وخاصة محطة الكرامة , بينما اعداد البكتريا الحية الكلية لمياه نهر دجلة كانت بحدود ( 468 - C.F.U 9100) . اما اعداد بكتريا القولون الكلية وبكتريا E.coli فقد تراوح بين ( 1.1 - 7.1 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة وهذه الاعداد هي اكثر من الحدود المسموح بها دوليا . وقد تجاوزت اعداد بكتريا القولون الكلية في نهر دجلة عن ( 1795 - 63000 خلية / 100مل) ,بينما اعداد بكتريا E.coli فقد كانت بحدود ( 335 - 39000 خلية / 100مل ) .ا ما بالنسبة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa فقد كان عددها ( 2.2 - 23 خلية / 100مل ) في المحطات الثلاثة واعلى تركيز في اعدادها كان قد سجل في اشهر الصيف , بينما كانت اعدادها في نهر دجلة بحدود( 580 - 160000 خلية / 100مل ) .ا ما نتائج اعداد البكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coliالمعزولة من مياه الحنفيات في منازل الشعلة فقد سجلت اعلى القيم للبكتريا القولونية الكلية وبكتريا E.coli 16)و9.2خلية/100مل)على التوالي, اما اقل القيم فكانت 1.1)و0.0خلية/100مل)على التوالي. كما اشارت الدراسة الى احتواء عينات البراز الماخوذة من الاطفال المصابين بالاسهال ,ا نواع البكتريا الاتية : - Citrobacter freundii 15% , Klebsiella pneumonia 21% , E.coli 45 % , Pseudomonas aeruginosa 11%,Serratia plymuthica 4% , Serratia ficaria 2% , Pseudomonas fluoresens 2%. وهذه الانواع هي في الواقع متوافقة مع الانواع نفسها من البكتريا المعزولة من ماء الحنفيات من المنازل في الشعلة وهي : - Klebsiella pneumonia 30% , E.coli 27% , Pseudomonas aeruginosa 23% Citrobacter freundii 14%, Serratia playmuthia 3% , Pseudomonas fluoresens 3% . لقد عزلت انواع من البكتريا غير السائدة مثل Sphingomonas paucimobilis, Pantoea spp. من مياه النهر ومياه المشاريع اذ تعود Pantoea spp.الى العائلة المعوية Enterobacteriaceae وتسبب بعض انواعها اعراضا مرضية خطيرة للانسان, وكثيراما تكون ملوثة للادوات الطبية اضافة الى ان بعض الاجناس ممكن ان تصيب مدى واسعا من المحاصيل الزراعية المهمة اقتصاديا ,وانواع من اشجار الغابات حول العالم كما توجد بشكل مجتمعات بكتيرية تلوث خزانات وقود الطائرات النفاثة اماالنوع Sphingomonas paucimobilisفيعود لعائلة Sphingomonasaceae الذي يوجد في البيئات المختلفة بضمنها المائية (مياه البحر والمياه العذبة) وبعض انواعها وخصوصاS.paucimobilis فقد توجد في الاجهزة الطبية في المستشفيات وانواع مختلفة من النماذج السريرية وبالرغم من ان الاصابة بها خطيرة ونادرة فقد تعالج باستخدام المضادات الحيوية . واخيرا اشارت نتائج هذه الدراسة الى ان استهلاك مياه الحنفيات من قبل عموم الناس قد يكون السبب الرئيس لحالات الاسهال التي تصيب الاطفال وغيرهم لاحتوائها على اعداد كبيرة من المسببات المرضية المختلفة. | The present work aimed to study different parameters of the drinking water that affect the health of people of Baghdad city .To perform this target three factors were studied. Firstly ,The Biological ,Physical and Chemical factors that influence water quality of the Tigris river .secondly, evaluation of the efficiency of water purification of three purification stations constructed along the river of Tigris ,and thirdly ,evaluation of drinking water of AL - Shulla region in Baghdad city that is provided with water from one of these purification stations (AL - Karama station). In addition to above ,the study also included the comparison between water pollution with respect to bacteriological point of view and diarrhea cases suffering children under two years of age ,attended the hospital of Baqir AL - Hakkem out - clinic in AL - Shula. The study included determination of the water quality from three main purification station, these stations were located to the Northern (Sharq - Diglla) ,middle (AL - Karama)and southern (AL - Qadisia)parts of Tigris river in Baghdad city.Duplicate water samples were taken on monthly basis before and after purification from December, 2009 to September 2010.Microbial analyses of the water included estimation of the number of total viable microbial counts ,total viable coliforms ,total viable E.coli and Pseudomonas aeruginosa .In addition to the presence of some pathogenic enteric microorganisms e.g. Salmonella spp. , Vibrio cholerae etc. using conventional bacteriological methods and API20E Technique for the identification of these bacteria, while Physical and chemical analyses of water before and after purification included determination of the following parameters ,temperature, pH, turbidity ,electrical conductivity ,total dissolved solids ,salinity ,dissolved oxygen and Biological oxygen demand along with the air temperatures at the three purification stations. . . On the other hand ,forty tape water samples were collected from the houses in AL - Shulla region during summer months June , July ,August and September ,2010.At the same time ,and during the same periods ,forty faecal samples from children under age of two years suffering from diarrhea and forty feacal samples from healthy children of the same age also were collected to determine the total pathogenic microorganisms in these samples .The results of these studies were indicated that the water temperature was influenced by the surrounding temperatures (15 - 41 °C)and the Tigris river temperature was between (13 - 32°C ),whereas the temperature of the water after purification in the three stations were around (15 - 33°C). . The pH of the water was (7.85 - 7.97) and after purification was around (7.31 - 7.87).The Turbidity of the river water was(156 - 26)NTU and of the stations were between (1 - 4NTU) The results of the present study also revealed that the electrical conductivity of the Tigris river water was less than that of the three stations, that is (606 - 776Ms/cm) and (608 - 793Ms /cm) respectively. and the total dissolved solids (T.D.S)were between (425 - 555mg/l)for stations water and were between (429 - 554mg/l) for river water. whereas the salinity of both river and stations water did not exceed 0.49mg/l. The dissolved oxygen concentration was 7.4mg/l in Tigris river, which indicate a good aeration condition while the highest concentration for river water recorded to be 10mg/l. The biological oxygen demand for river was between (1.2 - 4.4mg/l) which is within the International allowable levels. On the other hand ,The bacteriological studies indicated a high level of total viable bacterial counts in water of the three stations and were between (1 - 64C.F.U/ml), and these numbers indicate a non - efficient purification procedures in all station studied and was exceeding the International allowable levels especially in the AL - Krama station . while total viable bacterial counts of the Tigris river was between (468 - 9100C.F.U/ml).Total coliform counts and pathogenic E.coli counts were both between(1.1 - 7.1cell/100ml )in all the three stations studied ,again,these numbers exceeded the International allowable levels. In Tigris river water ,on the other hand ,the total coliform counts was exceeded the (1795 - 63000cell/100ml )while the pathogenic E.coli count was between (335 - 39000cell/100ml) .Pseudomonas aeruginosa counts was about (2.2 - 23cell/100ml) in the three station and the highest level recorded was in summer seasons ,whereas its counts was in between (580 - 160000cell/100ml) in Tigris river. The highest number for total coliform and pathogenic E.coli were recorded to be (16 and 9.2cell/100ml) respectively. whereas the lower range were (1.1 and 0.0 cell/100ml) respectively. . The results of the present study also revealed that the faecal samples of the diarrhea cases of children contain the following bacteria ,E.coli 45%,Klebsiella pneumonia 21%.while the numbers of other bacteria ,Citrobacter freundii, Pseudomonas aeruginosa , Serratia ficaria ,Serratia plymuthica and Pseudomonas fluorescens were 15%,11%,2%,4% and 2% respectively. . These proportions are in accordance with the same bacterial species isolated from AL - Shulla houses while were 27%for E.coli ,30%for Klebsiella pneumonia and 14%for Citrobacter freundii 23%for Pseudomonas aeruginosa ,3%for pseudomonas fluoresens and 3% for Serratia plymuthica . Finally ,these results clearly indicate that the tape water consumption by the general public might be the main causative factors for diarrhea cases affecting the people due to its high content on other hand ,will reflect the poor purification procedures employed in these different purification stations at least in Baghdad city

التوصيف المظهري والوراثي للانزيمات المحورة لمضادات الامينوكلايكوسيدية المنتجة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين == Phenotypic and genotypic characterization of aminoglycoside modifying enzymes produced by methecillin resistant Staphylococcus aureus

Author name: شيــماء عدنان جبر العبيــــدي
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت 150عزلة سريرية من المكورات العنقودية من مستشفيي الحبيبية والنعمان في مدينة بغداد خلال الفترة من شهر كانون الثاني وحتى شهر نيسان لعام 2011 من اصابات سريرية متنوعة. توزعت العينات ما بين 30 عزلة من الادرار, 84 من خمجات جروح و36 عزلة من مسحات الاذن . • شخصت العزلات مبدئيا بزراعتها على وسطي اكار الماكونكي واكار الدم, تبع ذلك اجراء عدد من الفحوص الشكلية والكيموحيوية, ثم شخصت العزلات بشكل نهائي ودقيق باستخدام اشرطة نظامي api staph وMast staph kit .لقد تم الحصول على 87 عزلة (58%) على انها Staphylococcus .aureus مقابل 63 عزلة (42%) للانواع الاخرى من هذا الجنس. • بينت نتائج الفحص المسحي المظهري الاولي لمقاومة مضاد المثسلين باستخدام طريقة الانتشاربالاكار ان هنالك 84 عزلة من اصل 87 (%96.5) قد اظهرت مقاومتها لمضاد المثسلين لتكون من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين((MRSA مقابل 3عزلات فقط (3.5%) مستجيبة للمثسلين (MSSA).• اجري اختبارفحص الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة انتشارالاقراص لجميع عزلات MRSA( ,(84 واستخدم لهذا الغرض ستة مضادات حيوية تعود للمجموعة الامينوكلايكوسيدية . اوضحت النتائج وجوداختلافات واضحة في نمط المقاومة المظهري للعزلات قيد الدراسة اذا اظهرت هذه العزلات مستوى عال من المقاومة لهذه المجموعة مع نسبة وصلت الى ( 19٪ ( للستربتوميسين, 38)٪ (للاميكاسين, ( 52٪ ( للجنتاميسين ، 62٪) للكاناميسين ،و (69٪) لكل من مضادي ا لنيومايسين والتوبراميسين. • استخدمت طريقة التراكيز المتضاعفة المتسلسلة لحساب التركيز المثبط الادنى(MIC) لعزلات ال MRSA) (لعدد من مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية . بينت النتائج وجود اختلافات في قيم MIC المحسوبة لعزلات ال MRSA، اذا اظهرت 16 عزلة مقاومتها للستربتومايسين وبقيم MIC تراوحت ما بين (16 - 1024 ميكروغرام / مل ) , و32 عزلة مقاومة للاميكاسين (64 - 128 ميكروغرام/مل ) ، و44 عزلة للجنتاميسين ( 16 - 64 ميكروغرام/مل ) و38 لو 52عزلة للكانامايسين ( 64 - 128مايكروغرام/ مل) , ، و58 للنيوميسين (16 - 1024 ميكروغرام/مل ). ان هذه النتائج تدل على انتشار صفة مقاومة مضادات المجموعة الامينوكلايكوسايدية بين عزلات المكورات العنقودية المقاومة للمثسيلين .• اعتمدت طريقتان لتحضير الدنا القالب لغرض استخدامها في التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا ( PCR) وهما : طريقة الغليان وطريقة المستعمرة المباشر. اظهرت النتيجة ان طريقة المستعمرة المباشرة كان افضل في اظهار النتائج بالمقارنة مع طريقة الغليان.• اختيرت خمسة وعشرون عزلة من بكتريا MRSA التي اعطت نتائج ايجابية في مجال الكشف المظهري لنمط المقاومة لمضاد المثسلين ولمضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية للكشف عن الجين mecA المشفرلمقاومة المثيسلين بوساطة تقنية التفاعل التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) . اظهرت نتائج احتواء جميع العزلات (100٪) على جين mecA ,وبلغ حجم القطعة المكثرة 314 زوج قاعدة بمقارنتها بدلائل الدنا الحجمية .• اجري الفحص الوراثي بتقنية ال PCR للكشف عن ثلاث جينات مشفرة للانزيمات المحورة لمضادات المجـــموعة الامــينوكلايكوسيـــدية في عــزلات ال MRSA وشـمـــلت aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa.بينت النتائج ان جين ) ′aac(6’) - Ie+aph(2’ هو الاكثر انتشارا وبنسبة 84٪ (21/25) تلاه جين ant(4’) - Iaو aph(3’) - IIIa بنسبة 76.3٪ (19/25) و44٪ (11/25) على التوالي.• بلغ معدل تواجد aac(6’) - Ie+aph(2’) مع ant(4’) - Ia, مقدار 64٪ (16 / 25) ويمثل اعلى نسبة تواجد في العزلات قيد الدراسة, فيما بلغت نسبة تواجد جيني ant(4’) - Ia وaph(3’) - IIIaمعا 40٪ (10/25) لتحل نسبة تواجد كلا من aac(6’) - Ie+aph(2’) مع aph(3’) - IIIa ثالثا وبمعدل 32٪ (8/25).اما نسبة تواجد هذه الجينات الثلاث معا فقد بلغ 28%(7/21(. • لوحظ ان هنالك ترابط بين الصفة المظهرية لمقاومة المضادرات مع الصفة الوراثية , فقد لوحظ ان العزلات الحاملة لجين aac(6’) - Ie+aph(2’) ذات مقاومة عالية لمضاد الجنتامايسين وايضا مقاومة لاغلب انواع المضادات الامينوكلايكوسيدية الاخرى.بينما كانت العزلات الحاملة للجين ant(4’) - Ia هي عزلات ذات مقاومة عالية لمضادي التوبرامايسين والنيومايسين ,ومن ناحية اخرى كانت العزلات الحاملة للجين aph(3’) - IIIa اظهرت مقاومتها العالية للمضادين الكانامايسين والاميكاسين.• في هذه الدراسة كانتالاربع وعشرين 24 عزلة الحاملة لجين mecA من اصل 25) 96%( كانت على الاقل مترابطة مع احد جينات الانزيمات المحورة AME او اثنان منها او جميعا ,ويعد هذا مؤشرا لوجود ترابط كبير بين مقاومة العزلات لمضادات الامينو كلايكوسايدية وبين مقاومتها للمثسلين في العزلات المحلية .في الوقت نفسة ظهرت ضمن النتائج عزلة MRSA واحدة اتسمت بمقاومتها المظهرية لمضادات هذه المجموعة غير انها خلت من اي جين في الفحص الوراثي مما يدل على امتلاكها نمط اخر من المقاومة تجاه هذة المجموعة . | • A total of 150 Clinical isolates of Staphylococcus species were collected from two hospitals : Al - habibia and Noaman hospitals in Baghdad city during the period from January to April 2011. Types and the numbers of these clinical samples were distributed as (30) isolates from urine, (84) isolates from wound infections and (36) isolates from ear swabs. • The isolates were initially diagnosed by culturing on MacConkey agar and blood agar followed by performing some morphological and biochemical tests . A confirmatory test as final diagnoses were done using api 20 and MAST staph kits. The results have showed that Staphylococcus aureus comprised 87(58%) isolates while other Staphylococcus species represented 63 isolates (42%) .• Results of primary screening test for methicillin resistance using disk diffusion method have revealed that 84 isolates(96.5%) were proved to be methicillin resistant Staphylococcus aureus(MRSA), while only 3 isolates (3.5%)were methicillin sensetive Staphylococcus aureus (MSSA).• Antibiotic susceptibility test for all the 84 MRSA isolates was performed against 6 antibiotic of aminoglycosides group using disc diffusion method. The result have demonstrated clear differences in the phenotypic resistance among isolates of the current study . They showed high - level of resistance to aminoglycosides group, and the percentage of isolates reached to(19%) for streptomycin, (38% ) for amikacin ,(52% ) for gentamicin, (62%) for kanamycin and ( 69%) for each of neomycin and tobramycin . • Two fold was serial dilution agar used to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) for the MRSA isolates against aminoglycosides group. The results have showed that there were differences in the MIC values among MRSA isolates when 16 isolates were resistance streptomycin (MIC ranged 16 - 1024 µg/ ml) , 32 isolates resistance amikacin (64 - 128 µg/ ml), 44 isolates to gentamicin (16 - 64 µg/ ml) , 52 isolates to kanamycin (64 - 128µg /ml), and 58 isolates to neomycin (16 - 1024 µg/ ml). The results indicate the prevalence of aminoglycosides resistance pattern in all the MRSA isolates. • The two different methods boiling method and the direct colony method were used to prepare template DNA in order to be used in the polymerase chain reaction test. The results revealed that the direct colony methode was better in demonstrating the result as comparied with the boiling method . • Twenty five isolates which gave positive results in phenotypic detection for methicillin and aminoglycoside group resistance , were selected to detect mecA gene encoding methicillin resistance using PCR technique.The results showed that all the isolates (100%) harbored merA gene with amplified size 314 bp as compared with DAN ladder . • Genotypic detection was performed to detect three genes encoding aminoglycoside modifying enzymes in MRSA isolates. They were aac(6’) - Ie+aph(2’), ant(4’) - Ia, and aph(3’) - IIIa genes.The results showed that aac(6') - Ie - aph(2") gene was the most prevalent Aminoglycoside modifying enzymes (AME) gene when the rate was 84% (21/25) of the resistant isolates followed by ant(4') - Ia and aph(3') - IIIa when the rates were 76.3% (19/25) and 44% (11/25) of these isolates respectively.• The coexistence rate of aac(6') - Ie - aph(2") with ant(4') - Ia was 68% (16/25) which it represents the most predominant rate in the isolates of the current study followed by the coexistence between of ant(4') - Ia with aph(3') - IIIa which was 40% (10/25) and the third rate for aac(6') - Ie - aph(2") with aph(3') - IIIa by 32% (8/25). The coexistence rate of the three genes in all the isolates was 28% (7/25).• The results of the current study showed that there was a correlation between phenotypic and genotypic resistance pattern.The isolates harboring aac(6’) - Ie+aph(2’) gene are considered to be high resistant to gentamicin and even to all aminoglycosides ,while the isolates harboring this gene were highly resistant to tobramycin and neomycin and the isolates carrying aph(3′) - IIIa gene showed the high resistance to amikacin and kanamycin in MRSA. • In this study, the 24 isolates harboring mecA gene out of 25 ( 96%) were carried either one or more than one aminoglycoside modifying gene and this represents an indicator for high correlation between aminoglycoside and methicillin resistance in our local isolates .From the other hand the results showed that there was a MRSA isolates which confer phenotypic resistance to aminoglycoside group but it not encode for any of AME gene ,this may indicate that such isolates confer another type of resistance toward this group

دراسة مرضية نسيجية ومناعية كيميائية نسيجية للخلايا اللمفاوية المرتشحة في العقد اللمفاوية المشمولة في سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي == Histopathological and Immunohistochemical study on Lymphocytic Infiltrate in Lymph nodes involved by in Colorectal cancer and Breast carcinoma

Author name: شيماء عبد الرضا ناجي الربيعي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سالم رشيد حمودي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة كبحث رجعي ، اذ اجريت على (85) حالة مرضية لانسجة مطمورة بشمع البارافين واخذت العينات من المرضى المصابين بالاورام الحميدة والخبيثة للقولون والمستقيم والثدي والتي تعود للفترة من 2006 - 2008 .جمعت العينات من مستشفى مدينة الطب/ المختبرات التعليمية ومستشفى امراض الجهاز الهضمي للفترة من تشرين الاول 2008 ولغاية حزيران 2009 . قسمت هذه العينات الى ثلاثة مجاميع : 1 - المجموعة الاولى تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان القولون والمستقيم والحاوية على العقد اللمفاوية.2 - المجموعة الثانية تشمل (25) عينة من بلوك شمع البارافين المشخصة بسرطان الثدي والحاوية على العقد اللمفاوية.3 - المجموعة الثالثة (35) عينة من بلوك شمع البارافين منها (15) عينة تحتوي على التنسج اللمفاوي للعقد و(20) عينة طبيعية تعتبر كمجاميع سيطرة.تم تحليل هذه العينات من العقد اللمفاوية في المجاميع الثلاثة احصائيا حسب العمر , الجنس , وجود او عدم وجود السرطان المنتشر وعلاقته بارتشاح الخلايا اللمفاوية ، درجة التمايز ومرحلة الانتشار للسرطان.ولغرض التشخيص النسيجي قطعت العينات بجهاز المايكروتوم بسمك 4 مايكرومتر وصبغت بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين.امتدت الدراسة لتشمل تحديد التنميط المظهري للخلايا اللمفاوية المرتشحة والتي تشمل الواسمات CD8+, CD3+ بطريقة التصبيغ النسيجي المناعي . وقد خلصت الدراسة الى النتائج التالية : 1 - في الوقت الذي تراوح العمر لمرضى سرطان القولون والمستقيم بين (23 - 70) سنة وبمعدل (43,2) سنة ، فان النسبة الاكبر قد شخصت في عمر يتراوح بين (61 - 70) سنة.2 - اغلب حالات سرطان القولون والمستقيم كانت وسطية التمايز وكانت موجبة بنسبة (75%) للواسم CD3+ وبنسبة (25%) للواسم CD8+ للخلايا اللمفاوية المرتشحة.3 - ان النسبة من 75 - 80% من حالات سرطان القولون والمستقيم كانت في مرحلة C.4 - اظهرت الخلايا اللمفاوية الحاملة للواسم CD8+ فروقات معنوية بين سرطان القولون والمستقيم وسرطان الثدي عند مستوى احتمالية (P<0.05). | This study was designed as retrospective study. A total number of cases were eighty five (85) formalin - fixed paraffin embedded tissue blocks of colorectal and breast cancer, in addition to benign lesions that related to the period between 2006 - 2008 . The samples were collected from Teaching Laboratories / Medical City and Gastrointestinal Teaching Hospital/ Medical City during the period extended from October 2008 till June 2009. These paraffin blocks were divided into (3) groups : 1. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of colorectal carcinoma (CRC) with their lymph node drainage.2. A group included twenty five (25) tissue blocks with histopathologic diagnosis of breast carcinoma with their L.N drainage.3. In addition thirty five (35) tissue blocks, including (15) blocks lymph node follicular hyperplasia and (20) blocks of normal lymph node were examined as control groups.All these tissues were analyzed according to age, gender, presence or absence of tumor metastasis with infiltration of lymphocyte, histological grading, and staging.For definitive histological diagnosis the samples were made by microtome at 4μm thickness and stained by hematoxylin and eosin stain.This study was extended to determine the phenotype of cell surface antigen markers, namely CD3+ and CD8+ markers of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal antibodies to these markers.The results of this study can be described as follows : 1 - The age of patients with CRC ranged from (23 - 70) year with mean of (43.2) year. The highest percentage was diagnosed in the age (61 - 70) year.2 - Most of the cases of the CRC were moderately differentiated grade, (75%) were CD3+ positive results, while (25%) of them were CD8+ positive results.3 - From 75 - 80% of the CRC cases were in stage C.4 - In respect to CD8+ infiltrated lymphocytes, there were significant differences (P <0.05) between CRC and breast carcinoma, 20%, 56% respectively.

تاثير Lactobacillus fermentum وLactobacillus gasseri في طفيلي الابواغ الخبيئة داخل الجسم الحي == Effect of Lactobacillus fermentum and Lactobacillus gasseri on Cryptosporidium parvum invivo

Author name: شيماء داود سلمان
Supervisor name: سبا طاهر محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: In order to study the effect of some bacterial probiotics on the parasite Cryptosporidium parvum invivo, 60 of feces samples were collected from fetal in calves farm belong to College of Veterinary \ Baghdad University, their aged from one to two weeks and suffer from a severe watery diarrhea. Samples were examined to detect the presence of the parasite oocysts by using Modified Cold Zeinl Neelson Stain method.Oocysts of parasite were isolated from positive feces samples by using saturated salt solution method and used to induce infection in mice .The study of laboratory animals shown that the perpant period of the parasite ranged between 3 - 4 days and did not notice any clear clinical signs neither infected mice nor treated ones.The study included nine groups; five treatment groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells,supernatant of L.fermentum,suspension of L.gasseri cells,supernatant of L.gasseri and the drug spiramycin, two preventive groups that inoculated with suspension of L.fermentum cells and suspension of L.gasseri cells befor and after infected , and two groups that used as positive control (infected mice)and negative control (healthy mice).The results showed that all treatment groups suffered from a gradual decrease in rates of oocysts shedding and the groups treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day and eighth, respectively, and efficiency treatment was 81.44%, 81.72% , respectively while groups that treated with supernatant of bacteria was stopped oocysts shedding on the tenth day, and efficiency treatment 76.33%, 75.28% , respectively.On the other hand treated groups with spiramycin drug did not stop shedding of parasite oocysts to the eleventh day after treatment and recorded less efficiency treatment reaching to 65.14% compared with the positive control group, which continued shedding oocycts to the end of experiment.Also, the results showed that the preventive groups that treated with suspension of L.fermentum and L.gasseri cells stopped shedding oocysts of parasite on the seventh day after the treatment, and for both types of bacteria,the highest treatment efficiency reached to 85.91%and 86.55%, respectively. The statistical analysis showed significant differences between the control group and the treated groups in level of probability (P≥0.05).According to the results of histological study, the changes occurred in the small intestine before and after treatment, showed that in the tissue sections of the positive control group animals the parasite adhesion clearly on brush border of the epithelial intestine tissue.The treated groups with two types of bacteria and their supernatants showed disappearance of the parasite from the intestinal tissue with simple changes included hydropic degeneration and increase in the number of goblet cells when compared to a group of spiramycin which led to the occurrence of damage in the mucous layer and the shorten in lengths of the villi , dehydration and infiltration in lymphocytes with destruction in tissue (necrosis).

دراسة جزيئية لعوامل الالتصاق في بكتريا Escherichia coli الممرضة للمسالك البولية وعلاقتها بمقاومة Fluoroquinolones == Molecular Study of Adherence Factors in Uropathogenic Escherichia coli Related to Fluoroquinolones Resistance

Author name: شيماء خضر عباس العلاق
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 150عينة ادرار من مرضى خمج المسالك البولية ومن مختلف الاعمار للفترة من تموزالى تشرين الثاني 2011 .اعتمد التشخيص البكتيري على المواصفات الزرعية والمجهرية والفحوصات الكيموحيوية , والتشخيص النهائي والدقيق للعزلات في وقت مبكر للكشف عن الانواع بواسطة استخدام فحص Api20E .تم التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الالتصاق وجين مقاومة الفلوروكوينولونات باستخلاص الدنا البكتيري بطريقة الغليان ومن ثم اخضع الى اختبار البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) . تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية , فضلا عن تقدير التركيز المثبط الادنى (MIC) لاربع مضادات من الفلوروكوينولونات . اظهرت النتائج ان توزيع اصابات اخماج المسالك البولية في الاناث (99(66%) بينما بلغت في الذكور 51(34%)) وسجلت اعلى نسبة من الاصابة في النساء البالغات المتزوجات 67(44.7%) .اظهرت النتائج ان بكتريا E.coli كانت الاكثر شيوعا في مرضى خمج المسالك البولية 65 عزلة (43.3%). بينت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية للانسان (100%) , اذ اظهرت نسب مختلفة من الالتصاق تراوحت بين 8 الى 63 خلية بكتيرية / خلية طلائية .اظهرت عزلات E.coli احتوائها على ثلاثة انواع من عوامل الالتصاق (CAF) وبنسب مختلفة . النوع الاول (CAFl) ووجد في 58 عزلة (89%) , النوع الثاني (CAFΠ) ووجد في 35 عزلة (54%) والثالث (CAFШ) وجد في 36 عزلة (55%) . عند اختبار حساسية العزلات تجاه 12 مضاد جرثومي , اظهرت عزلات E.coli مقاومة تامة (100%) لمضاد Augmentin(Amoxicillin/Clavulanic acid) (99%) بينما كانت اقل مقاومة للمضادات Pefloxacin , Norfloxacin, Nitrofurantoin وبنسبة(34, 35, 22)% على التوالي .اظهرت النتائج ان اعلى نسبة من المقاومة المضاعفة المشتركة (42%) كانت في العزلات التي قاومت خمسة الى ثمانية مضادات . فيما حددت التراكيز المثبطة الدنيا لاربعة مضادات من الفلوروكوينولونات ,فاظهرت النتائج ان هناك اختلافا واضحا في قيمتها . تم اختيار 28 عزلة E.coli من عزلاتنا المحلية بالاعتماد على درجة مقاومتها العالية للمضادات ,اظهر كشف البلمرة التضاعفي التسلسلي (PCR) المفرد (Uniplex PCR) والمشترك (Multiplex PCR) عن وجود جينات الالتصاق الضارية والمتضمنة P (papC), type 1 fambria fimH ,adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ) حيث تم الكشف عن(22 isolates (79%),20(71%), 6(21%),4(14%)) على التوالي . تم الكشف عن جين مقاومة الكوينولونات gyrA في كل العزلات 28 (100%). في هذه الدراسة تم اعتماد gyrAبديلا عن استخدام 16s rRNA في تشخيص السلالات البكتيرية.اذ اعطت جميع العزلات حزم عند الحجم الجزيئي (518 bp) دلالة على وجود الجين باستخدام تقنية (PCR) .واخيرا .اظهرت النتائج ان عزلات E.coli الممرضة للقناة البولية (UPEC) والمقاومة للكوينولونات تبدي انخفاضا في عوامل ضراوتها عن العزلات الحساسة للكوينولونات ,اظهرت نتائجنا اعلى نسبة لعوامل الضراوة في العزلات التي قاومت ثمانية مضادات اعطت نسبة 18% منها تمتلك عامل الالتصاق الاول (CAFl) , 14%تمتلك (CAFΠ) و12% من هذه العزلات تمتلك (CAFШ) وذلك يشير الى ارتباط مباشر لمقاومة الكوينولونات مع انخفاض وجود جينات الضراوة (تراجع جيني).و اظهرت النتائج ايضا انه جينات الضراوة اقل انتشارا (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) في العزلات التي قاومت كل مضادات الفلوروكوينولونات .هذه العلاقة ربما تتاثر بواسطة التراجع الجيني . | One hundred fifty urine samples were collected from urinary tract infection patients from different ages during the period of July 2011 to November 2011. The bacterial diagnosis on cultural and microscopical characteristics of bacterial cell and biochemical tests. The final and accurate diagnoses of the isolates as the early mentioned species were done using the API 20E system. Molecular identification for adhesion factors and fluoroquinolone resistant gene was done by DNA extraction by boiling method, then subjected to conventional PCR .The antibiotic sensitivity test was done, also the minimum inhibitory concentration (MIC) for four Fluoroquinolone antimicrobial agents was studied. The results showed that the distribution of UTI in female were 99(66%), while in male were 51 (34%). However, the high percentages of UTI were observed within the adult married women 67(44.7%). The results showed that E.coli was the most common microorganisms in UTI patients, 65 isolates (43.3%). All the isolates showeded ability of adherence to uroepithelial cells of human's urinary tract (100%) of the isolates presented adherence that mean number of bacteria adhered to uroepithelial cells ranged from 8 to 63. E.coli isolates exhibited the presence of three types of colony adhesion factors (CAF) at different rate. Type one (CAFl) observed in 58 isolates (89%), while type two (CAFΠ) in 35 isolates (54%), and (CAFШ) in 36 isolates (55%). Sensitivity of E.coli local isolates toward 12 antimicrobial agents showed complete resistance (100%) to Augmentin (Amoxicillin/Clavulanic acid), while they were less resistance to Pefloxacin, Norfloxacin, Nitrofurantoin at (34, 35, 22)% respectively. The results showed that the highest rate of multidrug resistance (42%) was observed in isolates were able to resist 5 to 8 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentrations for four Fluoroquinolone antimicrobial agents showed an obvious different between their values.The local isolates of E. coli selection 28 isolates depending upon high degree of multi antibiotic resistance. The PCR assay (Uniplex PCR and Multiplex PCR) showed prevalence of virulent adhesion genes P (papC), type 1 fambria fim H, adhesion S (sfaD/E) and afimbrial adhesin (afaB/CШ), were detected (22 isolates (79%), 20(71%), 6(21%), 4(14%)) respectively. The quinolone resistance gene gyrA detected in all isolates 28 (100%). In the present study depended upon gyrA gene (housekeeping gene) as alternative to 16s rRNA for the identification bacterial strains. All the isolates give bands at the molecular size (518 bp) an indication of a gene by using PCR technique. Finally ,the results have shown that Fluoroquinolone resistant uropathogenic E.coli (UPEC) isolates express fewer virulence factors than Fluoroquinolone susceptible isolates .The persent results showed the highest rates of virulence factors in isolates that resisted eight antibiotics which was obtained to 18% of these isolates have(CAF l ), 14% have(CAFΠ ) and 12% of the isolates have (CAFШ). This finding suggests that fluoroquinolone could be directly associated with decreased prevalence of virulent genes (genetic back) .Also the results showed that all 4 virulent genes under the study were lower prevalent (PapC (86.3%), fimH (68.1%), afaBCIII (13.6%), sfaDE (9%)) in the isolates resistance for all fluoroquinolone and quinolone antimicrobial agents. that the relationship may be influenced by the genetic background.

استجابة تراكيب وراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتحمل تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم خلال مراحل مختلفة من النمو == Response of barley genotypes Hordeum vulgare L. for tolerance different concentrations of Sodium Chloride through different growth stage

Author name: شروق محمود وسين
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عباس جاسم حسين الساعدي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2008 - 2009 بهدف التعرف على مدى تحمل بعض التراكيب الوراثية من الشعير Hordeum vulgare L. لتراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم في مراحل مختلفة من النمو . تضمنت الدراسة تجربتين : التجربة الاولى هي دراسة تاثير تراكيز مختلفة من كلوريد الصوديوم (0 ، 50 ، 100 ، 150 و200) مليمول/لتر على ستة تراكيب وراثية من الشعير هي بركة، بيكسون، فوريست ، بركة × بيكسون، بركة × فوريست وبيكسون × فوريست في بعض المؤشرات المظهرية كنسبة وسرعة انبات البذور وطول الجذير والرويشة والمساحة الورقية . نفذت التجربة في مختبر الدراسات العليا ، قسم علوم الحياة / كلية العلوم / الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية وقد استعمل محلول مغذي nutrient solution كوسط لزراعة البذور .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في المؤشرات المدروسة كما اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية للشعير في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهر التركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح فقد اعطى القيم 93.00% عن نسبة الانبات و7.36 بذرة/يوم عن سرعة الانبات، 6.72 سم عن طول الجذير و8.30 سم عن طول الرويشة. اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع لقسم علوم الحياة ، كلية التربية / ابن الهيثم / جامعة بغداد من خلال زراعة بذور التراكيب الوراثية بركة وبيكسون وبركة × فوريست بعد معرفة تحملها للملوحة (التجربة الاولى) في اصص بلاستيكية لدراسة تاثير تراكيز كلوريد الصوديوم السابقة المذكورة اعلاه على بعض المؤشرات المظهرية والفسلجية كاطوال الجذور واحجامها واوزانها الجافة وارتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري والمساحة الورقية ومحتوى بعض العناصر الغذائية في الجزء الخضري (كالنتروجين والفسفور والبوتاسيوم والصوديوم والكلور) ونسبة البروتين ومحتوى الكلوروفيل ومحتوى البرولين ونسبة الدهون والمحتوى النسبي للرطوبة في الاوراق بالاضافة الى بعض مكونات الحاصل وهي الحاصل البايولوجي ، طول السنبلة ، وزن السنبلة/نبات ، عدد الحبوب/سنبلة، وزن الحبوب/سنبلة، وزن 1000 حبة ووزن الحبوب/اصيص . كما تمت دراسة (محتوى البوتاسيوم والصوديوم والكلور) والجهد الازموزي لتربة التجربة بعد الزراعة . وقد استخدم التصميم العشوائي الكامل CRD)) وبتجارب عاملية لتنفيذ التجربتين وبثلاثة مكررات في التجربة الاولى، واربعة مكررات في التجربة الثانية، وقد تم تحليل النتائج احصائيا وقورنت المتوسطات باستعمال اقل فرق معنوي (L.S.D.)على مستوى احتمال 0.05 .اوضحت نتائج هذه التجربة ان زيادة تراكيز ملح كلوريد الصوديوم من 0 الى 200 مليمول/لتر ادى الى انخفاض معنوي في معظم المؤشرات المدروسة. وزيادة معنوية في محتوى الحامض الاميني البرولين ومحتوى الصوديوم والكلور في الانسجة المختلفة للتراكيب الوراثية المدروسة ، كما زاد معدل الجهد الازموزي ومحتوى الصوديوم والكلور وانخفض محتوى البوتاسيوم في ترب التراكيب الوراثية مقارنة بها قبل الزراعة . كذلك اظهرت النتائج وجود تباين معنوي بين التراكيب الوراثية في تحملها لتراكيز كلوريد الصوديوم، واظهرالتركيب الوراثي بركة قدرة تحمل جيدة للتركيز العالي من الملح، فقد اعطى قيما عليا في معظم المؤشرات المدروسة كالوزن الجاف للجذور 1.01 غم/نبات، وارتفاع النبات بعد مرور شهر من التعرض للملح 54.00 سم، وارتفاع النبات بعد مرور ثلاثة اشهر من التعرض للملح 63.90 سم، والوزن الجاف للجزء الخضري 0.35 غم/نبات، والمساحة الورقية 53.51 سم2، ومحتوى النتروجين 10.83 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى البوتاسيوم 8.22 ملغم/غم وزن جاف، ومحتوى الكلور 7.45 ملغم/غم وزن جاف، ونسبة البروتين 18.70%، ومحتوى الكلوروفيل 33.20 مايكروغرام/سم2، ومحتوى البرولين 14.01 ملغم/لتر، ونسبة الدهون 5.27%، وبعض مكونات الحاصل مثل الحاصل البايولوجي 11.01 غم/اصيص وطول السنبلة 5.84 سم، وعدد الحبوب/سنبلة 25.39 حبة/سنبلة، ووزن الحبوب/سنبلة، 0.81 غم/سنبلة، ووزن 1000 حبة 28.93 غم، ووزن الحبوب /اصيص 4.22 غم/اصيص، يليه التركيب الوراثي بيكسون ثم بركة × فوريست . كما اظهرت النتائج وجود تباين بين ترب التراكيب الوراثية للشعير في محتوى بعض العناصر، اذ اعطت تربة بركة اقل معدل لمحتوى عنصر البوتاسيوم بلغ 231.70جزء بالمليون، واعلى محتوى للكلور بلغ 2.74 ملي مكافئ/لتر . | This study has been performed during the agricultural season of 2008 - 2009 in the aim to recognize how some genotypes of barley Hordeum vulgare L. tolerate different concentrations of NaCl in different growth stages . Two sets of experiment has been done : The first was to determine the effect of different concentrations of NaCl (0,50,100,150 and 200) mM/l on some morphological parameters (% and rapidness of seeds germination, radical and plumule length and leaf area). Of six genotypes of barley cultivars Baraka, Bekson, Forest, Baraka × Bekson, Baraka × Forest and Bekson × Forest . The experiment was done in the Labrotary of higher studies, Department of Biologey, college of science, AL - Mustansiriyah University, by using petri dishes supplied with nutrient solution. The result showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to asignificant decrease in the studied parameters. Also the result revealed adifference among the genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype showed agood tolerating capacity against high saline concentration so it gave values 93% for percentage of germination, 7.36 seed/day of rapidness of germination, 6.72 cm of radical length and 8.30 cm of plumule length. The second set was carried out in the green house of the Department of Biologey, college of Education (Ibn AL - Haitham), Baghdad university via planting seeds of Baraka, Bekson and Baraka×Forest genotypes after determination of their salinity tolerance (set No.1) in plastic pots in order to study the effect of the above mentioned NaCl concentrations on some of their morphological and physiological parameters such as root length and size, shoot and root dry weights , content of some nutrient elements in the shoot (such as N, K, Na and Cl), protein %, chlorophyll content, proline content, lipid proportion and leaf relative humidity, beside some yield components : biological yield, spike length, weight of spike/plant, number of grains/spike, weight of grains/spike, weight of 1000 grains and weight of grains /pot Additionally, determination of (K, Na and Cl content)and osmotic potential in experiment soil after planting. The completely RandomiZed Design (CRD) with Factorial experiments was applied with three replicates for the first experiment and four replicates for the second experiment, Data were statistically analyzed to find out the least significant differences between treatment at 0.05 level. The results showed that an increase in Sodium Chloride salt concentration from 0 to 200 mM/L leads to a significant decrease in studied parameters and a significant increase in content of proline acid, Sodium and Chloride in the different tissue of the studied genotypes. Also increased the average of osmotic potential, content of Sodium, Chloride and decrease of potassium content in soil of the genotypes as compared with it befor planting. Moreover, the result revealed a difference among genotypes of barley in their tolerance to Sodium Chloride concentration, Baraka genotype exhibited a good tolerating capacity against high saline concentration so it provides higher values in most of the studied parameters as root dry weight 1.01 gm/plant, shoot length after one month of salt treated 54.00Cm,shoot length after three months of salt treated 63.90 Cm, shoot dry weight 0.35 gm/plant, leaf area 53.51Cm2, Nitrogen content 10.83 mg/gm dry weight, Potassium content 8.22 mg/gm dry weight, Chloride content 7.45 mg/gm dry weight, % protein 18.70 %, chlorophyll content 33.20 mg/cm2, proline content 14.01 mg/L, % lipid 5.27%, biological yield 11.01 gm/pot , spike length 5.84Cm, number of grains /spike 25.39 grain/spike, weight of grains /spike 0.81 gm/spike, weight of 1000 grains 28.93mg and weight of grains/ pot 4.22 gm/pot; then, Bekson genotype and Baraka × Forest. The result showed that there is a variation among soil of the genotypes of barley in content of some elements when soil Baraka gave least avarege of Potassium content as (231.70 ppm) and higher Chloride content as (2.74 m.q/L)

دراسة العلاقة بين مجاميع الدم واضداد النطف في الرجال قليلي الخصوبة == A study on relation between blood groups and Anti - sperm antibodies in infertile men

Author name: شروق ابراهيم محمود عزيز اغا
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم استخدام 92 عينة دم وسائل منوي لذكور قليلي الخصوبة وكذلك نفس العدد من ذكور خصبين , حيث تم الحصول عليها للفترة المحصورة من تشرين الثاني 2006 ولغاية حزيران 2007 . اجري فحص الدم على جميع العينات لتحديد مجاميع الدم طبقا لنظام ABO ونظام لويس , بينما تم التحري عن اضداد النطف باستخدام فحص ELISA النوعي وكما تم تحديد عيارية هذه الاضداد في العينات الموجبة باستخدام Tray - agglutination test (TAT). اظهرت نتائج هذه الدراسة علاقة معنوية (p≤0.01) مابين نوع مجاميع دم لويس وحالة الخصوبة حيث سجل صنف دم Lea 4.4% وصنف Leb 14.1% وصنف Lea - b - 81.5% في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع 20.7 % , 15.2 % ,64.1% على التوالي في الذكور الخصبين . بينما اظهر فحص ELISA نتيجة موجبة لوجود اضداد النطف بنسبة 5.4% , 32.0% في كل من البلازما المنوية ومصل الدم على التوالي في الذكور قليلي الخصوبة بالمقارنة مع الذكور الخصبين حيث لم تسجل اي نسبة وجود للاضداد في مصل الدم . من جهة اخرى فقد اظهرت النتائج علاقة معنوية ( (P≤0.01 ما بين وجود اضداد النطف في مصل دم الذكور قليلي الخصوبة ومجاميع الدم نظام ABO , حيث سجل صنف الدم O , اعلى نسبة للاضداد بلغت 55.0% بالمقارنة مع 45.0% لجميع اصناف الدم الاخرى . كما اظهرت النتائج وجود نفس العلاقة المعنوية( (≤0.05 ما بين مجاميع دم لويس ونسبة اضداد النطف حيث سجل صنف دم لويس Lea - b - اعلى نسبة اضداد بلغت 69.0% بالمقارنة مع 31.0% لكلا الصنفين Lea , Leb كذلك اظهرت النتائج عدم وجود علاقة معنوية ما بين اضداد النطف وعدد النطف في الذكور قليلي الخصوبة ذوي مجاميع الدم ABO ومجاميع دم لويس .واخيرا فقد اظهرت النتائج وجود تراكيز طبيعية لجميع الهرمونات الجنسية في عينات مصل الدم لجميع الذكور قليلي الخصوبة سواء حسب نظام ABO او نظام لويس. | Ninety two samples of blood and seminal fluid of low fertility males and equal number of the same samples from fertile males ,were obtained from November 2006 till June 2007 . The grouping was carried out according to ABO and Lewis system , While antibodies of sperms were detected by using specific ELISA test , and the titer in the positive samples was determined by Tray - agglutination test (TAT) . The results of this study revealed a significant correlation (P≤ 0.01) between the phenotype of Lewis blood groups and the fertility state , in which 4.4% Lea, 14.1% Leb and 81.5% Lea - b - phenotypes were recorded in the low fertility males , in comparison to 20.7% ,15.2% and 64.1% respectively in those fertile males . However the ELLISA screening test in low fertility males showed positive results 5.4% and 32.0% in seminal plasma and serum samples respectively , in comparison to 0% in serum of fertile males . On the other hand , the results demonstrated a significant correlation (P≤ 0.001) between the presence of anti - sperm antibodies in the serum of infertile and the ABO blood groups , Whereas ,the group O recorded a highest presence of anti - sperm antibodies 55.0% in comparison to that recorded by the remaining groups 45.0% . Also the same significant correlation (P≤ 0.05) has been obtained between the Lewis blood groups and the presence of anti - sperm antibodies, in which Lewisa - b - phenotype recorded the highest percentage 69.0% comparison to 31.0% for those of Lea and Leb together . Further more the results also showed that in low fertility males, who had ABO and Lewis blood groups, there were non significant correlation between anti - sperm antibodies and number of sperms .Finally the results showed normal concentration of all sex hormones in the serum of all infertile males in spite of their ABO and Lewis blood groups

دراسة عن كبسولة بكتريا Acinetobacter baumannii وتاثيرها على الاستجابة المناعية == Study on capsule of Acinetobacter baumannii and its effect on Immune Response

Author name: سيناء مهدي شاكر الخفاجي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • عزلت 34 عزلة بكتيرية تعود للنوع Acinetobacter baumannii من بين 424 عينة شملت عينات ( جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) وبنسبة 8.01% جمعت من المرضى الراقدين في مستشفى بغداد التعليمي / مدينة الطب ، وقد شخصت من خلال الصفات الزرعية (المستعمرات) والمجهرية ( البكتريا) والاختبارات الكيميائية الحياتية وباستخدام نظام Api 20 E ، وقد كانت معدلات الاصابة ببكتريا Acinetobacter baumannii في العينات المشخصة (جروح ، ادرار ، قشع ، دم ) هي (15 ، 11، 6 ، 2) % على التوالي .• التحري عن عزلة كفوءة منتجة للكبسولة ، اذ امكن الحصول على عزلة كفوءة منتجة للكبسولة عند تنمية العزلات في وسط اغار نقيع القلب والدماغ المضاف اليه 5% كلوكوز وبفترة حضن 5ايام ودرجة حرارة 30 م.• التحري عن حساسية عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii تجاه 19 مضادا للحياة ، وقد اظهرت العزلات البكتيرية حساسية بنسبة 100% للمضاد Imipenem ومقاومة بنسبة 100% لمضادات الحياة (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin , Cephalothin , Tetracyclin , Aztreonam , Ciprofloxacin ) • حددت التراكيز المثبطة الدنيا لـ 8 مضادات للحياة Ciprofloxacin وGentamicin وAmikacin وTobramycin وCefotaxime وPipracillin وPiracillin +Tazobactum وCefepime واظهرت النتائج ان هنالك اختلافا واضحا في الـMIC لهذه المضادات ،اذ تراو حت قيم الـMIC لهذه المضادات (4 - 512 ، 8 - 1024< ،4 - 256 ، 4 - 1024< ، 16 - 1024< ، 8 - 256 ، 8 - 512) مكغم /مل على التوالي .• التحري عن قابلية عزلات Acinetobacter على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات ، اذ اظهرت العزلات البكتيرية قابليتها على ازالة لون اغار الدم الحاوي على السكريات نوع الدوز Aldose وتغييره الى لون بني .• التحري عن قابلية 18 عزلة بكتيرية منتخبة بصورة عشوائية تعود للنوع Acinetobacter baumannii على تلزين كريات الدم الحمر للانسان وباصنافه الاربعة A , B, AB, O في اطباق المعايرة الدقيقة Microtitration plates ، وقد بينت النتائج قابلية العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للاصناف A , B AB, فيما اخفقت العزلات المنتخبة جميعا على تلزين كريات الدم الحمر للانسان للصنف O .ثانيا - الجانب المناعي : استهدف هذا الجانب استخلاص الكبسولة من العزلة الكفوءة ودراسة تاثير تراكيز مختلـفة (25 ، 50 ، 100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على الخلايا المناعية باختيار المعايير الاتية : عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، التشكل الزهري التائي والبائي ، عملية البلعمة ، اختزال صبغة النايتروبلوتترازوليم ، معامل انقسام خلايا نخاع العظم في الفئران والتحري عن الاضداد المتخصصة بمستخلص الكبسولة باجراء اختبار اخترلوني . ومنها تم الحصول على النتائج الاتية : • عدم تاثير التراكيز (25 ، 50 ، 100) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية ، فيما اظهرت التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل تاثيرا على عيوشية الخلايا متعددة اشكال النوى والخلايا اللمفاوية .فقد سببت انخفاضا في عيوشية هذه الخلايا .• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التائية المكونة للتشكل الزهري الفعال والكلي نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل على الخلايا التائية.• انخفاض النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية البائية المكونة للتشكل الزهري نتيجة لتاثير تراكيز مستخلص الكبسولة (100 ، 150 ، 250 ، 500) مكغم /مل.• اظهرت النتائج زيادة في عملية البلعمة عند استخدام التركيز 100 مكغم /مل من مستخلص الكبسولة فيما انخفضت عملية البلعمة عند استخدام التراكيز (150 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في النسب المئوية للخلايا المكونة للفورمازان باستخدام التراكيز (100 ، 250 ، 500) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• انخفاض في معامل الانقسام الخيطي لخلايا نخاع العظم في الفئران باستـــخدام التركيزيـــن (100 ، 250) مكغم /مل من مستخلص الكبسولة .• تكون خطوط ترسيب بين مستخلص الكبسولة ومصول الارانب الممنعة به باستخدام المصل بدون تخفيف وعند تخفيفه بنسبة 1 : 10 ، فيما لم تظهر اي خطوط ترسيب عند استخدام التخفيفين 1 : 100 و1 : 1000 او عند استخدام المصل قبل التمنيع .ثالثا - الالتصاق البكتيري وتثبيط الالتصاق البكتيري : تضمن هذا الاختبار مقارنة التصاق عزلات مكونة للكبسولة وغير مكونة للكبسولة على البولستايرين ومقارنة التصاق عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية المعزولة من ادرار الانسان لمعرفة دور الكبسولة في الالتصاق ، فضلا عن تثبيط الالتصاق البكتيري باستخدام : ا - اضداد مستخلص الكبسولة Capsular antibodies ،اذ تم الحصول على مضاد الكبسولة بعد تمنيع الارانب بمستخلص الكبسولة ومفاعلة المصل المضاد للكبسولة مع عزلة مكونة للكبسولة وعزلة غير مكونة للكبسولة لبكتريا Acinetobacter baumannii ومن ثم اجراء اختبار الالتصاق البكتيري لمعرفة دور اضداد الكبسولة في تثبيط الالتصاق .ب‌ - ماتحت التركيز المثبط الادنى subMIC من خلال تنمية العزلة المكونة للكبسولة في وسط نقيع القلب والدماغ السائل BHIB الحاوي على تركيز الـ subMIC لبعض المضادات البكتيرية ، واجري اختبار الالتصاق البكتيري ومقارنة ذلك بمعدل نفس العزلة المنماة في نفس الوسط الخالي من الـ subMIC لمعرفة تاثير الـsubMIC في عملية تخليق الكبسولة وعملية الالتصاق البكتيري .• اظهرت نتائج اختبار الالتصاق على البولستايرين قابلية العزلتين المكونتين للكبسولة على البقاء ملتصقة على البولستايرين فيما اخفقت العزلتين غير المكونتين للكبسولة بالبقاء ملتصقتين على البولستايرين .• بلغ معدل التصاق البكتريا المكونة للكبسولة بالخلايا الطلائية للانسان (35.62) وبذلك هو اعلى من معدل التصاق البكتريا غير المكونة للكبسولة (19.68) .• اظهرت الاضداد المتخصصة للكبسولة تاثيرا مثبطا لالتصاق العزلة المكونة للكبسولة ، فيما لم تؤثر في التصاق العزلة غير المكونة للكبسولة .• ادى ما تحت التركيز المثبط الادنــــى subMIC للمضاديــــن Ciprofloxacin 64 مكغم/مل وPiracillin + Tazobactum 16 مكغم /مل الى تثبيط الالتصاق البكتيري ، اما في حالة المضادين Cefotaxime 1024 مكغم /مل وGentamicin 4 مكغم /مل فلم يكن هنالك تاثيرا في عملية الالتصاق اذ كان الالتصاق طبيعيا اي انه لم يكن له تاثير ايضا في عملية تخليق الكبسولة .رابعا - الدراسة النسيجية : درست التغييرات النسيجية المختلفة في الفئران المحقونة بالعالق البكتيري Acinetobacter baumannii ومستخلص الكبسولة في الاعضاء ( الكبد ، الطحال ، الكلية ، الرئة ، الامعاء ) ، اذ ظهر تاثير للعالق البكتيري ومستخلص الكبسولة في كل الاعضاء وقد لوحظ تاثير العالق البكتيري في الكبد بوجود خثارات كثيرة داخل الكبد مع وجود تغير دهني ووجود قطيرات دهنية داخل نسيج الكبد ، والطحال ظهر فيه تضخم باللب الابيض في منطقة الخلايا البائية ومنطقة الخلايا التائية ، اما الرئة فقد وجد فيها احتقان مع انخماس ، وظهر في الكلية توسع بسيط في محفظة بومان مع وجود قطيرات دهنية او تغير دهني داخل الكبيبات ووجود تنكس استسقائي في بعض النبيبات ، وفي الامعاء ظهر تضخم في لطخ باير وتنكس مخاطيني . اما تاثير مستخلص الكبسولة فقد ظهر في الكبد بوجود خثرة داخل اوردة الكبد مع توسع في الجيبانيات ، وفي الرئة ظهر ارتشاح خلايا التهابية حول الاوعية الدموية ووجود خلايا التهابية حول القصبات ، اما في الكلية يلاحظ تغيير دهني في الكبيبات ، وظهر في الطحال تكوين دم خارج النخاع مع وجود فرط تنسج في اللب الابيض ، وظهر في الامعاء تضخم لطخ باير مع وجود تنكس مخاطيني . | Acinetobacter baumannii was isolated from 424 samples from wound , urine , sputum , and blood , which were collected from Baghdad hospital / Medical city, 34 isolates (8.01 %) of Acinetobacter baumannii was identified depending on the morphological , cultural ,and biochemical characteristics , by Api 20 E system. The infection rate by Acinetobacter baumannii identified samples (wound , urine , sputum , and blood ) were (15 , 11, 6, 2) % respectively .Detection the efficiency of isolate to produce a large capsular polysaccharide . Under incubation period 5 days at 30 C º and cultural media (Brain heart infusion agar + 5 % glucose) for production of a large amount of capsular polysaccharide . The susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates to 19 antibiotics were performed . All isolates were susceptible 100% to imipeneme and resistant 100% to (Cotrimoxazol , Nitrofurantoin , Carbenicillin, Tetracycline , Aztreonam , Ciprofloxacin , Cephalothin Minimum inhibitory concentration ( MIC) of 8 antibiotics (Ciprofloxacin , Gentamicin , Tobramycin , Amikacin , Cefotaxime , Pipracillin , Pipracillin + Tazobactum , Cefipeme ) were determined , which they were ( 4 - 512 , 8 - >1024 , 4 - >1024 , 4 - 256 , 16 - >1024 , 8 - 256 , 8 - 512) μg /ml respectively . The ability of Acinetobacter isolates to discolored blood agar that containing sugars was detected .All isolates showed their ability to discolored blood agar that containing sugars only from type aldose. Ability of isolates that chosen randomly to agglutinate red blood cells of human A,B,AB,O blood groups in micro titration plates was done . Results showed the ability of the isolates to agglutinate red blood cells groups A,B,AB only but not blood group O . Second : Immunological aspect : Extraction of capsular polysaccharide from the efficient isolate number (26) had been done . Then the effect of different concentrations( 52, 50 ,100, 150 , 250 , 500) μg/ml of capsular extract on immune cells were studied according to following parameters : Viability of polymorph nuclear leukocytes and lymphocytes , T&B lymphocytes rosette formation , phagocytosis in vitro, reduction of nitroblutetrazolium , mitotic index test for bone marrow cells in mice , and investigation about specific capsular antibodies by ochterlony test. All these immunological tests were done , the following Results were : No effect was found of concentrations (25,50,100) μg/ml of capsule extract on viability of polymorph nuclear cells & lymphocytes , while concentrations (150, 250 , 500) μg/ml decreased it .The concentrations (100,150,250,500) μg/ml of capsular extract decreased the percentage of T&B rosette formation . Hundred μg/ml of capsular extract increase phagocytic index , while (150, 250, 500) μg/ml inhibited it . Capsular extract concentrations (100, 250, 500) μg/ml decreased number of cells producing Formosan , and (100, 250) μg/ml of capsular extract decreased mitotic index in mice. Precipitation lines were found between capsular extract and serum of immunized rabbits without dilution and with the dilution 1 : 10 .Third : Bacterial adherence and inhibition bacterial adherence : Comparison the adherence between encapsulated isolates and non encapsulated isolates on polystyrene and comparison the adherence between capsulated isolate and non encapsulated isolate on epithelial cells which took from urine to know the capsular role in adherence , and inhibit the bacterial adherence by using : 1 - capsular antibodies which were obtained after immunized the rabbits with capsular extract ,then reaction of the serum with encapsulated and non encapsulated isolates and after that the adherence test was done .2 - sub minimum inhibitory concentration (SubMIC) after growing encapsulated isolate in brain heart infusion broth containing subMIC of some antibiotics and the test of bacterial adherence was done and comparison between the same isolate growing in brain heart infusion broth with subMIC and without subMIC to find the role of subMIC in capsule production process . Results of adherence test on polystyrene showed the ability of encapsulated isolates to adhere on polystyrene while non encapsulated isolates washedout . The rate of encapsulated isolate adhere on human epithelial cells was 35.62 , and that was higher than the rate of non encapsulated isolate which was 19.68. Specific capsular antibodies inhibit adherence of encapsulated isolate, while it had no effect on non encapsulated isolate adherence . SubMIC of the antibiotics ciprofloxacin and piracillin+tazobactum had an inhibitory effect on encapsulated isolate adherence , while their was no effect when subMIC of antibiotic cefotaxime and gentamicin was used. Fourth : Histological aspect : Different histological changes in mice after injected with bacterial suspension and capsular extract were studied in organs (liver , spleen, kidney, lung, intestine) . The effect of bacterial suspension and capsular extract was noticed in all the studied organs . The effect of bacterial suspension in liver was noticed by many clotting inside the liver with fatty changes in the liver tissue , in spleen increased in white pulp size in the region of T&B cells , in lung congestion , in kidney enlargement in bowman capsule with fatty changes inside tubules with hydrobic degeneration in many tubules , in intestine enlargement in payers patches and mucosal degeneration . The effect of capsular extract was noticed in liver by the appearance of clot inside liver’s veins with enlargement in sinuses , in lung infiltration of inflammatory cells around the blood vessels with inflammatory cells around tracheas , in kidney fatty changes in glomerulus . in spleen , blood formation out of the marrow with reactive hyperplasia , in intestine enlargement in payer patches with mucosal degeneration

التنميط والتحليل الجزيئي للمكورات العنقودية الذهبية المعزولة من نماذج سريرية == Molecular Analysis and Typing of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

Author name: سوسن محمد كريم
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | منعم رضوان علي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: • جمعت خلال الدراسة اربعة وثمانون عزلة من بكتريا المكورات العنقودية من عدد من مستشفيات بغداد للفترة الواقعة ما بين تموز - تشرين الثاني عام (2013) موزعة ما بين (43) عزلة من الالتهابات الجلدية , (15) عزلة من التهاب المسالك البولية , (5) عزلات لكل من الدم والتهابات الاذن , (3)عزلات من التهابات الانف ،(2)عزلتين من التهاب العيون وعزلة واحدة من لكل من القشع والسائل المنوي و(9) عزلات اخذت من مواقع بيئية مختلفة للمستشفيات .• تم العزل الاولي لبكتريا المكورات العنقودية الاوساط الزرعية واعتمادا على الصفات المظهرية على الاوساط الزرعية والفحوصات الكيموحيوية فضلا عن التشخيص بنظام (API Staph system) لتكون المحصلة النهائية (74) عزلة تعود لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية .• تم التحري عن المكورات العنقودية المقاومه للمثيسلين بعدة طرق منها الطرق المظهرية وباستخدام طريقة الانتشار بالاكار حيث اظهرت النتائج ان هنالك 55 (74.32%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية مقاومة للمثيسلين في حين بلغ عدد العزلات الحساسة 8(10.82%) وقد لوحظ وجود عدد من العزلات التي ابدت مقاومة متوسطة للمثيسيلين 11 (14.86%) كما واستخدمت طريقتين مختلفتين من الطرق الوراثية للتحري عن مقاومه البكتريا للمثيسيلين . وذلك عن طريق التحري عن المورثات المحفوظة تطوريا (femA) المورث المسؤول عن تاكيد تشخيص النوع اضافة الى التحري عن المورث (mecA) المسؤول عن صفة مقاومة البكتريا للمثسيلين وباستخدام تقنية التفاعل التسلسلي المتضاعف (Polymerase Chain Reaction). قد اعتمدت طريقتان لتحضير دنا القالب، طريقة الغليان وقد اظهرت احتواء74 (100%)عزلة من المكورات العنقودية الذهبية في حين احتوت61 / 74عزلة على المورث (mecA) وبالاعتماد على وجود مورث صفة المقاومة للمثيسلين قد بلغت نسبة المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثسيلين (82.43%) ، كما وبلغ عدد عزلات المكورات العنقودية الحساسة للمثيسلين التي لم تحتوي على مورث (mecA) 13/ 74 (17.57%) . ومن جهة اخرى استخدمت الطريقة المباشرة في تحضير دنا القالب واظهرت النتائج امتلاك فقط 17(22.97%) عزلة على مورث (femA) كما اظهرت 57/74 (77.03%)عدم امتلاكها على المورث، في حين ابدت (7) من العزلات التي ابدت اجابيتها لمورث (femA) امتلاكها على مورث (mecA) ولذلك فان نسبة بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين بلغت (41.17%) في حين المكورات الحساسة للمثيسلين قد بلغت (58.83%). وقد اثبتت طريقة تحضير دنا القالب بالغليان بانها كانت اكثر كفاءة ودقة في الكشف عن المورثات من الطرق الاخرى .• تم استخدام طريقة الانتشارالثنائي في الاكار للكشف عن صفة المظهرية لمقاومة البكتريا تجاه مجموعة الماكروليدات، اللنكوز امايد والستربتوكرامين B وقد اظهرت النتائج (18/74) عزلة تمتلك صفة مقاومة دائمية للارثرومايسين (24.32%) توزعت بين (13/61) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومه للمثيسلين (21.13%) و(5/13) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين (38.46%) ، كما واظهرت النتائج وجود (4/74) عزلة تمتلك صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين(6.55%) وكانت كل العزلات مقاومة للمثيسلين واخيرا (29/74) عزلة من العزلات المقاومة والحساسة للمثيسلين ابدت مقاومة متوسطة للاريثرومايسين .• اظهرت النتائج سيادة صفة المقاومة الدائمية للاريثرومايسن بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية الحساسة للمثيسلين بالمقارنة مع العزلات المقاومة للمثيسيلين وكذلك لوحظ وجود صفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسن بين عزلات البكتريا السريرية المعزولة من الادرار والدم والافرازات العامة.• استخدمت تقنية PCR للكشف عن وجود مورثات مقاومة الاريثرومايسين (erm A, erm B and erm C) وقد اظهرت النتائج تغلب مورث erm A (7.35%) ووجوده في (5/68) عزلة من عزلات المكورات العنقودية الذهبية والتي تمتلك مختلف اشكال الصفات المظهرية لمقاومة المثيسلين وجميع العزلات كانت مقاومة للمثيسلين. في حين تواجد مورث erm C في (4/68) ونسبة (5.88%) اثنان منها كانت عزلة من الدم والقشع وقد كانتا موجبة في فحص التحري عن مقاومة الاريثرومايسين ، كما واظهرت نتائج فحص PCR عدم امتلاك العزلات على مورث erm B . ايضا كشفت النتائج عن سيادة المورثات erm A وerm C في التشفير لصفة المقاومة المستحثة للاريثرومايسين وانه لا دور يذكر لمورث erm B في مقاومة الاريثرومايسين.• تم التحري بتقنية PCR عن انتشار ووبائية مورث pvl بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وقد اظهرت النتائج وجوده في(4/61) ونسبة (6.55%) .• تم استخدام طريقة الانتشار بالاكار للتحري عن حساسية البكتريا اتجاه المضادات الحيوية وقد اظهرت النتائج مقاومة العزلات بشكل كامل (100%) لكل من الكلوكساسيلين والاوكساسيلين والسيفيبيم ،ومقاومة عالية اتجاه كل من امبسلين/ كلافيلونك اسد (98.36%) والسيفتازديم (95.2%) . وكانت هنالك مقاومة متوسطة اتجاه التتراسايكلين (31.14%) ومقاومة قليلة اتجاه كل من الازيثرومايسين (24.6%) والفانكومايسين (16.4%) والجنتامايسين (13.11%) والسبروفلوكساسين (13.11%) واقل مقاومة اتجاة الامبنم (6.55%). • استخدمت طريقة UPGMA المتوسط الحسابي Unweighted Pair - Group Method using arithmetic Average لبناء شجرة تطور السللالات Phylogenetic treeوتحديد العلاقة التطورية dendroram واعتمد model Tamura - Nei لقياس المسافة الوراثية بين انواع المكورات العنقودية للتعبير عن مدى تطور تلك المورثات. اظهرت النتائج للتحليل الشجيري وجود 151 عقدة و76 عقدة طرفية . مما يعكس وجود تنوع عالي في نمط المقاومه لفحص الحساسية للمضادات الحيوية بين العزلات المدروسة, وكذلك تنوع واضح وعالي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة والحساسة للمثيسلين .مما يعكس الطبيعه التطورية لتلك العزلات. • تم اخضاع كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسلين والحساسة للكشف عن مورث spa بواسطة استعمال بواديء متخصصة لتضخيم المنطقة المتغايرة من المورث وبحجم القطعة المكثره (300bp) وقد اظهرت النتائج (47/74) موجبة لمورث spa حيث كانت المكورات المقاومة للمثيسلين (67.2%) في حين كانت المكورات الحساسة للمثيسلين (46.15%) .• تم اختيار (25) نموذج من نواتج PCR لمورث spa تعود لعزلات ذات مصادر عزل مختلفة وتم ارسالها لغرض تحديد تتابع القواعد النايتروجينية، تم تسجيل كل البيانات التي تم الحصول عليها من تحديد تتابع القواعد النايتروجينه في بنك المورثات العالمي (المركز الوطني لمعلومات التكنلوجيا الحيوية National center for Biotechnology Information ) وكذلك في بنك اليابان ( DNA Data Bank of Japan) وبنك المورثات الاوربي التي تبدا بالتسلسل LC038119 وتنتهي بالتسلسل LC038142 .• اظهرت النتائج ان القطع المكثرة للمناطق المتغايرة كانت مختلفة في الاحجام وتراوحت اطوالها (65 - 335bp) من اصل الجين كذلك اجري تطابق تتابع القواعد النايتروجينة وترجمة البروتين وتحديد العلاقة التطورية وشجيرات تطور السلالات باستعمال (UPGMA) وبرنامج geneious software وقد اظهرت النتائج وجود نوعين من الشجيرات واحدة للتتابعات القصيرة (65 - 190bp) وواحدة للتتابعات الطويلة (190 - 335bp) • تم هظم المورث spa بواسطة انزيمين من الانزيمات القاطعة HinfI وHindIII واظهرت النتائج تنوعا ملحوظا في الطراز الوراثي بين العزلات . | • Eighty four isolates of Staphylococcus spp. were collected from different hospitals in Baghdad province, during the period July 2013 to November 2013, distributed as : 43 isolates from skin infection ; 15 isolates from UTI; 5 isolates from each blood and ear infection; 3 from nasal swab ; two isolate from eye infection ; while one isolate obtained from each sputum and seminal fluid and 9 isolates were taken from various hospitals environments and sites.• For preliminary isolation of Staphylococcus spp. was used culture media, and depending on features on cultures, Biochemical tests and (API Staph system).The final results were (74) isolates belonged to Staphylococcus aureus.• different methods for screening to methicillin resistance S. aureus, it were used phenotypic method (disc diffusion method), the results showed 55(74.32%) MRSA isolates, 8(10.82%) MSSA and 11(14.86%) intermediate resistance to cefoxitin. While in genotypic methods were used PCR technique to detection housekeeping gene (femA) responsible to confirm species and mobile genetic element (mecA) to confirm resistance of isolates to methicillin, PCR technique was done by used two different methods to prepare template DNA.• the results of PCR technique with used template DNA prepared by boiling method have been revealed all S. aureus isolates 74(100%) contained femA gene (100%) while 61/74(82.43%) isolates contained mecA gene (MRSA) and 13/74(17.57%) isolates devoid mecA gene MSSA. On the other hands, The results of PCR technique with used template DNA prepared by direct colony have been revealed only 17(22.97%) isolates contained femA gene and 57(77.03%) isolates was devoid femA gene (77.03%), the positive isolates to femA gene have been revealed contained 7(41.17%) mecA gene while 10(58.83%) isolates devoid mecA gene. So used PCR techniques with template DNA prepared by boiling method was appeared the effective method for screening about MRSA and detection mecA gene reflected on standard methods to confirm S. aureus to be MRSA.• Double diffusion disc was used method to screening about MLSB phenotype and the results showed 18/74(24.32%) S. aureus isolates had constitutive resistance to erythromycin cMLSB phenotype (which is distributed to13/61(21.31%) MRSA and 3/13(38.46%)MSSA, 6/74(9.83%) S. aureus isolates sensitive to erythromycin, all of them was MRSA, 4/74(6.55%) S. aureus isolates had inducible resistance to erythromycin D - shape also all of them was MRSA, 9/74(14.75) S. aureus isolates showed MS phenotype was resistance to erythromycin and sensitive to clindamycin without D - shape and finally 29/74) S. aureus isolates showed intermediate resistance to erythromycin distributed between MRSA and MSSA.• Results showed a higher prevalence of the cMLSB phenotype in the MSSA isolates compared with MRSA isolates, also was observed iMLSB phenotype among clinical samples of S. aureus specially MRSA isolates more frequently in urine, blood and general secretions.• PCR technique was used for screening about ermA, ermB and ermC genes and the results were showed the percentage of ermA gene in S. aureus isolates 5/65(7.35%) with different phenotypic resistance forms to erythromycin all five isolates is MRSA while ermC gene percentage was 4/68(5.88%) S. aureus isolates, two of them showed cMLSB phenotype and harboring with ermA gene and others two isolates recovered from blood and sputum showed inducible MLSB with D - shape phenomenon, none of the S.aureus isolates harboring with ermB gene. The results were also revealed that ermA and ermC predominant erm genes found in S. aureus and the ermC gene the prevalence gene in inducible Macrolides resistant MRSA and no role was found to ermB gene in Macrolides resistant MRSA.• PCR technique was used for screening about prevalence of pvl gene among S. aureus isolates and the results showed 4/61(6.55%) harboring with pvl gene.• Disc diffusion method was used to screening about antibiotics sensitivity and the results showed completely resistance (100%) toward cloxacillin, oxacillin and cefepime while some isolates showed high resistance toward Amoxicillin /Clavulinic acid (98.36%) and Ceftazidime (95.2%). the moderate resistance toward tetracycline (31.14%), the low resistance toward azithromycin (24.6%), vancomycin (16.4%), gentamycin (13.11%), ciprofloxacin (13.11%) and the lowest resistance appeared toward imipenem (6.55%).• unweighted pair group method (UPGMA) was used to build phylogenetic tree and to find dendrogram analysis , Adoption of the Model Tamura - Nei, to measure the genetic distance between the types of Staphylococcus aureus to express the evolution of these genes, the results were showed dendogram and phylogenetic tree have (151) node and (76) tips. also reflected highly diversity resistance antibiogram among isolates and high diversity between MRSA and MSSA isolates still found some similarities in antibiogram pattern. Reflecting the evolutionary nature of these isolates.• all MRSA and MSSA isolates were subjected to screening about spa gene by used specific primers for variable region with PCR product size (300bp), and the results showed (47/74) isolates with positive results and (27/74) with negative results, (67.2%)MRSA isolates showed positive results while(46.15%)MSSA isolates showed positive to spa gene.• the 25 samples of PCR products from spa gene related to different sources of isolation were send for sequencing, then all data obtained from genes sequencing were submitted to gene bank national center for biotechnology information (NCBI), DNA data bank of Japan (DDBJ) and European Bioinformatics Institute (EMBI) under accession number started with (LC038119) and ended with (LC038142). ,The results showed the size of amplified fragments were variable and ranged from (65 - 335bp) in the original gene also pairwise sequence alignment to spa gene fragment, protein translation, Dendogram and phylogenetic tree were built by using (UPGMA) and genetic distance model Tamura - Nei with cost matrix identity (1.0 - 0.0) with geneious software, the results were showed two dendogram and phylogenetic tree first for short sequence (65 - 190bp) have 17 node and 9 tips while second for long sequence (190 - 335bp) have 31 node and 16 tips.• PCR - RFLP for spa gene was done by using two restriction enzyme HindIII and HinfI and the results showed high diversity among MRSA isolates

دراسة مناعية لمرضى القرحة المعدية المصابين ببكتريا Helicobacter pylori == Immunological Study of Gastric - Ulcer Patients Infected with Helicobacter pylori

Author name: سهى طالب يحيى الجميلي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | محمد عيسى محسن
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Bacteria
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت هذه الدراسة جمع خزع نسيجية (Biopsy) وعينات دم من 92 مريض يعاني من عسر الهضم، التهاب وقرحة المعدة، قرحة الاثني عشري وسرطان المعدة. وكانت اعمار المرضى تتراوح بين 17 - 76 سنة . جمعت العينات في الفترة ما بين كانون الاول 2011 ونيسان 2012 في مستشفى الكاظمية التعليمي في بغداد. وشملت الدراسة 20 شخص سليم كمجموعة سيطرة. اخضعت مجموعة المرضى فقط للتنظير المعدي العفجي لاستاصال الخزع النسيجية لاجراء الاختبارات البكتريولوجية بينما جمعت عينات الدم من مجموعة المرضى وايضا من مجموعة السيطرة لاجراء الاختبارات المناعية. للتحري عن وجود بكتريا Helicobacter pylori استخدمت عدة اختبارات شملت اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية، الزرع البكتيري، اختبار الانتشار المناعي وايضا الاختبارات المصلية التي شملت اختبار التحري عن الاجسام المضادة ((IgM IgG, IgA والمتمم (C4, C3) واختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم (Enzyme Linked Immunosorbent Assay) (ELISA)، للتحري عن مستوى الانترفيرون كاما Interferon gamma (IFN - γ) الانترلوكين - 8 Interleukin - 8 (IL - 8). تم استخلاص بروتينات الغشاء الخارجي لبكتريا H. pyloriباستخدام طريقة Murphy وقدرت كمية البروتين باستخدام جهاز المطياف الضوئي والتي كانت (2.76028 مغم/مل) وايضا تم تقدير الوزن الجزيئي للبروتينات المستخلصة باستخدام جهاز الترحيل الكهربائي.و خلصت هذه الدراسة كالاتي : 1. انتشار بكتريا H. pylori بلغ (44.56%) بين 92 مريض.2. لا يوجد ارتباط معنوي احصائيا بين عامل العمر والاصابة ببكتريا H. Pylori. بينما وجد احصائيا تاثير عامل الجنس على الاصابة ببكنريا H. pylori.3. نتيجة الزرع البكتيري اعطت (7.31%) من (41) مصاب، بينما اعطى اختبار انزيم اليوريز للخزع النسيجية واختبار الضد لبكتريا H. pyloriالسريع النسب (44.56% و64.13%) على التوالي من 92 مريض.4. اظهرت نتائج الترحيل وجود عشرة حزم بروتينية ذات اوزان جزيئية تتراوح بين (16.914 - 340.476) كيلو دالتون مقارنة مع حزم البروتينات القياسية.5. استخدم مستخلص بروتينات الغشاء الخارجي للبكتريا كمستضد للتحري عن وجود الاجسام المضادة للبكتريا باستخدام اختبار الانتشار المناعي الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون خطوط ترسيب بين المستخلص ومصل المريض.6. اختبار التحري عن الاجسام المضادة والمتمم اعطى عيارية عالية للمستضدين IgG, IgA والمتمم C3 بينما عيارية كل من الجسم المضاد IgM والمتمم C4 بقيت طبيعية مقارنة بمجموصة السيطرة.7. اختبار مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالانزيم(ELISA) اعطى فروقات معنوية عند مستوى P0.05 لكل من الانترفيرون كاما (IFN - γ)و الانترلوكين - 8 (IL - 8) بالمقارنة مع مجموعة السيطرة. | This study includes collection of biopsy and blood specimens from patients with age ranged between 17 - 76 years that suffering from dyspepsia, gastritis, duodenal ulcer, and gastric cancer during the period between December 2011 to April 2012 at AL - Kadhymia teaching hospital . This study also involved twenty healthy persons as a control group. Patients group were subjected to gastroduodenal endoscopy, gastric biopsy were taken from them for bacteriological investigations. Blood samples were also collected for immunological tests, while only blood samples were collected from control group. The Detection of Helicobacter pylori was performed using several laboratory investigations such as biopsy urease test, bacterial culture, precipitation test, and serological test which include immunoglobulins and complement quantitation and enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Interferon gamma (IFN - γ) and Interleukin - 8 (IL - 8) detection. Outer membrane proteins were extracted from these bacteria using Murphy method and the concentration of proteins were calculated by using spectrophotometer, then proteins detected and the molecular weight of proteins were evaluated by using electrophoresis.The results of this study revealed the following : 1. Prevalence of H. pylori in (44.56%) from 92 patients.2. No significant relation between age factor and distribution of H. pylori, but there is a significant relation between gender factor and distribution of H. pylori 3. The result of biopsy culture was (7.31%) from (41) infected patients, while biopsy urease test and Rapid anti H. pylori test gave (44.56% and 64.13%) respectively from 92 patients.4. Electrophoresis results revealed ten bands which renged between (16.914 - 340.476) KDa with protein concentration of (2.76028) mg/ml.5. Outer membrane proteins were extracted from H. pylori isolates and used as antigen to detect specific H. pylori antibodies using precipitation test in which the formation of precipitating line considered as a positive result.6. High titer of IgG, IgA and C3 appeared in patients group, while a normal titers of IgM and C4, as a result of immunoglobulins and complement quantitation.7. Enzyme - Linked Immunosorbent Assay technic for detection of IFN - γ and IL - 8 revealed statistically significant high level in compared with control group.

دراسة فعالية بعض المستخلصات لطحلب Cladophora glomerata == Study the activity of some extracts of alga Cladophora glomerata

Author name: سهام نعمة لفتة
Supervisor name: احمد ساهي دويش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية عزل جنس من الطحالب الكبيرة من بيئة مائية وتشخيصها , اذ تم عزل طحلب Cladophora glomerata من بحر النجف من محافظة النجف الاشرف. تضمنت الدراسة ايضا قياس بعض الصفات الفيزيوكيميائية لمياه بحر النجف والمعزول منه طحلب Cladophora glomerata , اذ شملت القياسات كل من درجة حرارة الهواء والماء , الدالة الحامضية , التوصيلية الكهربائية,المواد الصلبة الذائبة ,الملوحة,وتركيز بعض الايونات السالبة والموجبة للاملاح الموجودة في ماء البحر .بينت النتائج ان درجة حرارة الهواء كانت ( 24)م˚ في حين كانت درجة حرارة الماء (18) م˚ ,فيما كانت قيمة الدالة الحامضية (7.89) وقيمه التوصيلية الكهربائية (20500) ميكروسيمنز / سم وكانت قيمة الملوحة (1.62) 0/00 . في حين كانت نتائج قياس بعض الايونات الموجبة والسالبة للاملاح هي كالاتي : الكالسيوم والمغنسيوم والصوديوم والبوتاسيوم والكلوريدات والكبريتات (3085 و1376 و3815 و6.8 و2988 و3694 ) ملغم/ مل على التوالي .استخلص طحلب Cladophora glomerata باستخدام ثلاث انواع من المذيبات وتمثلت بـ (الكحول الاثيلي وخلات الاثيل والكلوروفورم ) ومن ثم تم اختبار فعالية هذه المستخلصات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق وهي : Pseudomonas aeruginosa وStaphylococcus aureus وProteus mirabilis وEscherichia coli .كانت محصلة الاستخلاص ( الحار - البارد ) لطحلب Cladophora glomerata باستخدام المذيبات المختلفة الكحول الاثيلي %(128 - ) وخلات الاثيل %(84 - ) الكلوروفورم %(54,8 - 13,2). استعملت تراكيز مختلفة من مستخلصات الطحلب الكبيرCladophora glomerata (256,128,64,32) ملغم /مل لدراسة تاثيرها على البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق باستعمال اطباق بتري وذلك عن طريق قياس قطر منطقة التثبيط.بالنسبة الى المستخلص الاثيلي لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , وقد بلغت من معدلات اقطار مناطق التثبيط , 9 , 15, 20) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis.، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه والتي كانت (10 ,10 ,11 ,17) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص خلات الاثيل لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص البارد اكفا في تاثيره في البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ كانت معدلات اقطار مناطق التثبيط (10 , 10 , 12 , 15) ملم لكل من بكتريا : S. aureus وPs. aeruginosa وPr.mirabilis. وE.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص الحار وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9.8) ملم وعلى التوالي.بالنسبة الى مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata كان المستخلص الحار اكفا في تاثيره على البكتريا بتركيز( 256 ملغم / مل ) , اذ يلاحظ من معدلات اقطار مناطق التثبيط ( 13 , 13 , 17 , 20 ) ملم لكل من : S. aureus , Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. ، E.coli وعلى التوالي مقارنة مع معدلات اقطار مناطق التثبيط للمستخلص البارد وللتركيز نفسه (0 , 0 , 0 , 9) ملم وعلى التوالي.كان مستخلص الكلوروفورم الحار لطحلب Cladophora glomerata معنويا اكثر كفاءة من المستخلصات الاخرى لجميع المذيبات في تثبيط نمو البكتريا المعزولة من اخماج الجروح والحروق, لذا استعمل هذا المستخلص انموذجا للتجارب اللاحقة .اظهرت نتائج الكشف عن المركبات الفعالة باستعمال التفاعلات الكيميائية احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلبCladophora glomerata على كل من التانينات والصابونينات والفلافونويدات والقلويدات والكلايكوسيدات والتربينات والفينولات والراتنجات.واظهرت نتائج التحري عن المحتوى الكيميائي من المواد الفعالة باستعمال تقنية الـGC - Mass Spectrophotometer احتواء مستخلص الكلوروفورم لطحلب Cladophora glomerata الذي اظهر كفاءة عالية في تثبيط نمو الاحياء المجهرية المعزولة من خمجات الجروح والحروق لاحتوائهما على العديد من المركبات ذات التاثيرات البايولوجية ضد المايكروبية. | The present study includes isolation and identification of Macro - alga from water body. Macro - algae was isolated ,Cladophora glomerata from Baher Al - Najaf region in Holy Najaf city . This experiment includes the measurement of some chemical and physical characteristics of Baher AL - Najef water which Cladophora glomerata was isolated from it . Temperature, electric conductivity (EC),PH, hardness and concentration of ions : Chloride, Sulphates and Carbonates. The Results were showed that the measurements of : air temperature was (24)˚C while water temperature was (18) ˚C, EC (20500) µS/cm; PH (7.8 ) ; and salinity (1.62)0/00.The concentration of positive and negative ions such as Ca, Mg, Na, K, Cl and SO4 were (3085,1376,3815,3815,6.8,2988 and 3694) mg/ml respectively Three types (Ethanol, Ethyl acetate and Chloroform) were used to extract Cladophora glomerata in order to evaluate their antibacterial activity against some bacterial isolates which isolated from wound and burn infection includes ( Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Proteus mirabilis Escherichia coli,) .The percentage yields of extracts of ( hot - cold ) for Cladophora glomerata were Ethanol ( 8 - 12 ) % , Ethyl acetate ( 4 - 8 ) % and Chloroform (13.2 - 54.8) %. Different concentrations of these algal extracts had prepared which were (32, 64, 128 and 256) mg/ml and the antagonistic activity against the isolated bacteria from wound and burn infection were evaluated by measured the diameter of inhibition zone. The effect of hot Ethanol extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 15 , 9 , 11 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with cold Ethanol extract which were ( 17 , 11 , 10 , 10) mm , respectively. The effect of cold Ethyl acetate extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 15 , 12 , 10 , 10 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli , respectively , when compared with hot Ethyl acetate extract which were ( 9.8 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. The effect of hot Chloroform extract of Cladophora glomerata on the bacterial growth revealed that at a concentration of 256 mg /ml the diameter of Inhibition zone were ( 20 , 17 , 13 , 13 ) mm for S. aureus Ps. aeruginosa ، Pr. mirabilis. E.coli respectively , when compared with cold Chloroform extract which were ( 9 , 0 , 0 , 0) mm , respectively. Because hot Chloroform extract of Cladophora glomerata was more efficiency effective than the other extracts , only the hot Chloroform extract of Cladophora glomerata will used in the next experiments. Results indicated that the active chemical compounds in hot Chloroform extract of Cladophora glomerata were Tannins, Saponins , Flavonoids, Resins , Glycosides , Terpenes, Alkaloid and Phenols. Results indicated that hot Chloroform extract of Cladophora glomerata has a lot of active chemical compounds against micro - organisms by using the GC - Mass Spectrometry technology

دراسة مقارنة لبعض انواع النحل من فوق عائلة Apoidea الملقحة لنبات الجت Alfalfa Medicago sativa في محافظة بابل == Comparative study for some insect pollinators Apoidea that pollinated Alfalfa Medicago sativa in Babylon

Author name: سهاد حميد حسن
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | علي شعلان معيلف الاعرجي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم في هذه الدراسة اختيار 13 حقلا من حقول الجت Medicago sativa من مناطق معينة من محافظة بابل لدراسة عملية التلقيح الحيوي لهذا المحصول خلال مدة التزهير للفترة ما بين مايس الى تشرين الاول لعام 2004، حيث استخدمت خلال هذه المدة شبكة صيد الحشرات القياسية لاخذ العينات التي بلغ عددها الكلي 185 عينة ، وقد تم تشخيص (47) نوعا تعود الى(18) جنسا تحت ست عوائل تابعة الى فوق عائلة النحل Apoidea وهي Megachilidae ,Halictidae , Anthophoridae , Andernidae , Ctenoplectridae , Apidae.قورنت عوائل النحل التابعة الى فوق عائلة Apoidea تبعا لعدد الانواع والاجناس والكثافة الكلية لكل منها، وقد وجد ان عائلتي Halictidae وMegachilidae كانتا الاكثر وفرة في عدد الانواع والاجناس وكثافة الافراد مقارنة مع العوائل الاخرى وقد شكلتا نسبة 61.1 % و72.3 % و88.5 % من العدد الكلي للاجناس والانواع والنماذج المجموعة على الترتيب. كما لوحظ وجود تذبذب في عدد العوائل والاجناس والانواع والكثافات باختلاف شهور الدراسة. وقد تبين ان شهر تموز هو الشهر الاعلى كثافة (عدد الافراد/50 كنسة) اذ بلغت الكثافة فيه 22.7 فرد/50 كنسة بينما كان شهر مايس هو الاقل عددا وبلغ 4.34 فرد/50 كنسة.تم دراسة التواجد الشهري لعوائل النحل في حقول الجت من حيث الكثافة وعدد الانواع وتبين ان العوائل اختلفت في عدد الانواع التي تمثلها وكذلك كثافاتها باختلاف شهور الدراسة.اختيرت عشرة انواع من ملقحات محصول الجت التابعة الى فوق عائلة Apoidea على اساس كثافاتها ، ثباتها وتكرار تواجدها في العينات خلال مدة الدراسة بالاضافة الى سهولة تشخيصها بالعين المجردة لغرض الدراسات اللاحقة ، وهذه الانواع هي : Megachile rotundata , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus, Megachile sp.2 (near to M.latimanus) , Nomia melanderi , Apis mellifera , Megachile sp.4, (near to M. texana), Nomia sp.2(near to N. nortoni) , Homalictus sp.1 (near to H. rowlandi) , Nomioides variegata . تم مقارنة الانواع العشرة المنتخبة من حيث معدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها ، نسب حبوب لقاح الجت ضمن الحمولة ، وزن الجسم/ملغم ، طول الخرطوم/ملم، مدة البقاء على الزهرة مقاسا بالثانية وعدد الانتقالات بالدقيقة.واظهرت النتائج ان الاناث قد تفوقت على الذكور في جمع اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح وللانواع العشرة. بينت النتائج ان هنالك ستة انواع من النحل قد تفوقت في معظم نواحي الكفاءة المنتخبة وهي : Megachile rotundata وMegachile sp.2 وsp.4 Megachile تعود لعائلة Megachilidae كذلك الانواع Nomia melanderi وNomia sp.2 (Halictidae) وApis mellifera ( Apidae) وتميزت اناث النوع M. rotundata معنويا بانها الاكثر كفاءة في حمل اكبر معدل لعدد حبوب اللقاح خلال الدراسة بلغ 49750 حبة لقاح تلته اناث الانواع Megachile sp.2 وsp.4 Megachile وN. melanderi بلغ عدد ما حمل كل منهم على الترتيب (34300 , 32600 , 31550).اما ذكور النحل فقد تميزت بحمل اعداد لا باس بها من حبوب اللقاح فقد حملت ذكور rotundata . M22125 حبة لقاح تلته ذكور N. melanderi فقد حملت 16725 حبة لقاح مما يدل ان لها دورا في عملية تلقيح ازهار الجت. اختلفت معدلات اعداد حبوب التي تحملها الملقحات اختلافا معنويا باختلاف شهور الدراسة،فقد كان معدل عدد حبوب اللقاح المحمولة في شهري تموز واب اعلى مقارنة مع الشهور الاخرى وكانت اعداد حبوب اللقاح المجموعة من قبل اناث النوع M. rotundata اعلى معنويا مقارنة بالانواع الاخرى بلغت 52000 و50875 حبة لقاح خلال شهري تموز واب على الترتيب.من ناحية اخرى بلغ اعلى معدل لنسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح 91.5 % بواسطة اناث النوع M. rotundata تلته اناث النوع N. melanderi اما اقل نسبة فقد بلغت 62.6 % بواسطة النوع Nomia sp.2 .تفاوتت معدلات النسب المئوية لحبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبصورة معنوية بين شهور الدراسة ،وقد تميز كل من شهري تموز واب مقارنة بالشهور الاخرى بارتفاع معدلات نسب حبوب لقاح الجت ضمن حمولة حبوب اللقاح وبلغت هذه النسبة 100% في شهر تموز بواسطة النوع M. rotundata وN.melanderi ، اما في اب فقد بلغت(100،94.1%)على الترتيب للنوعين المذكورين. وعليه فانه يبدو ان الانواع الستة هي ملقحات متخصصة لمحصول الجت.تم في هذه الدراسة ايضا قياس معدل اوزان الملقحات (ملغم) ذكورا واناثا وبينت النتائج وجود فروق معنوية واضحة بين اوزان الانواع المدروسة,وبناء عليه فقد قسمت الانواع حسب الوزن الى ثلاث مجموعات كبيرة ومتوسطة وصغيرة،كما اشارت النتائج الى وجود علاقة ارتباطية موجبة بين وزن الجسم ومعدل عدد حبوب اللقاح التي تحملها هذه الملقحات. اظهرت النتائج ان ازهار الجت تزار بمجموعتين من النحل حسب طول الخرطوم(اللسين) هما مجموعة النحل طويل اللسين ،بلغت النسبة المئوية لعدد الانواع التابعة لهذه المجموعة 49% اما المجموعة الثانية فهي مجموعة النحل قصير اللسين بنسبة51% من المجموع الكلي للانواع. وبلغ اكبر معدل لطول اللسين 4.34 ملم لنحل العسل mellifera A. في حين ان اقل معدل بلغ 1.55 ملم للنوع Nomia sp.2 . واوضحت النتائج ان الملقحات المنتخبة قد اختلفت اختلافا معنويا في مدد بقائها على ازهار الجت .اقل مدة بقاء سجلت للنوع M. rotundata على ازهار محصول الجت بلغت 2.22 ثانية تلاه النوع N. melanderi 3.01 ثا ونلاحظ ان عدد الانتقالات قد ارتبط عكسيا مع مدة بقائها فقد سجل النوع M. rotundata اكبر عدد لانتقالاته على محصول الجت بلغت 22.2 انتقالة/د واقل عدد للانتقالات بلغ 11 انتقالة/د للنوع Nomia sp.2 . | Thirteen fields of Alfalfa Medicago sativa were selected from certain region in Babylon governorate to study its pollination biology during flowering period , May to October 2004, the standard insect net was used to collect (185) samples.During study the period, about (47) species were collected from the Alfalfa fields belong to (18) genus under (6) families of the super family Apoidea, these families were Megachilidae, Halictidae, Anthophoridae, Andernidae, Ctenoplectridae, Apidae.The families of Apoidea that have been collected were compared according to the number of species, number of genera and density of individual of each taxonomic group.It was found that the families Halictidae and Megachilidae were the highest in the number of species , genera and density of individual compared with other families , However, these two families represented 61.1% , 72.3% , 88.5% of total number of the genera , species and their densities respectively .The monthly variations in the number of families , genera, species and density of Apoidea were discussed . It was found that the month of July was highest in the density (number of individual/ 50 beat) reached to 22.7, while the lowest number reached to 4.34 on May.The monthly occurrence of different families of Apoidea in Alfalfa fields was investigated according to the rate of densities and the rate of number of species , However, It was appeared that the families varied in number of species and densities of each month for the study period.The alfalfa pollinators species were selected according to their densities , consistence, occurrence during the study period and easily recognized by necked eye for further study. these were included : Nomia sp2.(near to N. nortoni) , Nomia melanderi , Halictus ligatus , Lasioglossum pilosus , Nomioides vareigata , Homalictus sp.1(near to H. rowlandi) (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2(near to M.latimanus) , Megachile sp.4 (near to M. texana)(Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae).The ten selected pollinators were compared according to the average of pollen load, the percentage of Alfalfa pollen grain in the pollen load , body size , length of proboscis, visit duration/s , visit frequency/m ,and the result showed that the females were usually collect more pollen grain than the males of same species in all the ten selected species .It was found that six species pollinators within the ten selected species of Apoidea were significantly more active in most of the efficiency factors , these were Nomia sp2. , Nomia melanderi , (Halictidae) , Megachile rotundata , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 (Megachilidae) , Apis mellifera (Apidae). The females of M.rotundata was significantly more efficient in pollen grain collection , the average number of pollen grain reached to (49750) followed by females of , Megachile sp.2 , Megachile sp.4 , Nomia melanderi (34300 , 32600, 31550) pollen grain respectively . While 22125 pollen grain was collected by M. rotundata males followed by males of Nomia melanderi (16725). which seems they were importance in the pollination of Alfalfa flowers .The selected pollinators varied in average number of pollen grain in various months . However, it was found that the pollen load of each species was high during July and August compared with other month, the pollen load of females M.rotundata was (52000, 50875) pollen grain in July and August respectively.On the other hand, the highest average percentage of Alfalfa pollen grains was reached to 91.5% by females of M.rotundata followed by Nomia melanderi reached to be 85.7% , while the lowest percentage was 62.6% by Nomia sp2.The average percentage of Alfalfa pollen grain within pollen load was different significantly in each month of the study period. However, it was found that the percentage of Alfalfa pollen grain was high during July and August compared with the other months . The highest percentage of Alfalfa pollen grain was reached to (100 %) in July by M.rotundata and Nomia melanderi and was reached to (100 , 94.1%) in August also by the two species respectively . thereupon, it seems clearly that these six species of Apoidea were appeared to be specialization for Alfalfa crop pollination.The average of body size of pollinators species for males and females were measured .The results illustrated that there was significant variation in body size of selected species. Thereupon , the selected species were grouped into three groups : big, medium and small. It was found that there was positive correlation relationship between the body size and pollen load of pollinators .The results showed that the flowers of Alfalfa crop were visited by two grouped of bees , which were long-tongued bees with the percentage of 49% , and short- tongued bees with the percentage of 51% of the total number of species . The highest average of proboscis length was reached to 4.34 mm for A.mellifera , while the lowest average was reached to 1.55 mm for Nomia sp2 .The results appeared that the selected pollinators were significantly differences in the visit duration to the flowers (second) , the lowest average of the visiting duration of the pollinators was reached to 2.22 second for M.rotundata followed by Nomia melanderi which was reached to 3.01second . It was found that the visiting duration of pollinators was correlated negatively with visit frequency per minute . However , the M.rotundata has highest visiting frequency reached to 22.2 visit/ minute while the lowest visiting frequency was reached to 11 visit / minute by Nomia sp2

الكشف عن البارفوفايروس B19 بوساطة التصبيغ الكيميائي النسيجي المناعي في مرضى اورام الدرقية == Detection of Parvovirus B19 by Immunohistochemistry in Patients with Thyroid Tumors

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | علي حسین محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Thyroid cancer is the most common neoplasm of endocrine system. In Iraq thyroid cancer ranks the eighth among ten cancers in females.Therefore, it is a growing health problem.The present study was conducted to evaluate whether or not parvovirus B19 play a role in thyroid tumors and the correlation between the existence of virus and activation of NF - κB p65. Also this study extended to determine relevant cytokines (IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α) in the microenvironment of thyroid tumors by using immunohistochemical technique.This study designed as a retrospective study. A total number of 94 formalin - fixed paraffine - embeded thyroid tumors tissue collected from archive of Histopathology Department of the Teaching Laboratories, Medical/ City, Al - Shaheed Ghazi Hospital Lab, Al - Kindy Hospital Lab, Alkarama Hospital Lab and Central Public Health Lab during the period July 2013 - November 2013. All samples are referred to the period between 2010 - 2013. Tissue blocks were divided into three groups. First group included 53 tissue block of malignant thyroid whereas second group included 41 tissue blocks of benign thyroid tumors and third group included 21 tissue blocks as control group were selected from the same benign cases which have normal tissue. From each block, seven sections of 4μm thickness were taken, one section was stained with Hematoxylin and Eosin (H&E) and the other six sections were immunohistochemically stained for human parvovirus B19, NF - κB p65, IL - 6, IL - 8, IL - 10 and IFN - α.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with malignant thyroid tumors ranged from 20 - 70 year with mean age 40±11.63 year while in benign tumors, the mean age was 37.6±11.19 year, ranged from (16 - 59) year.The papillary thyroid carcinoma was the most common type among malignant histopathological types 61%. In benign tumors the most common was follicular adenoma 29.3%.Human parvovirus B19 expression was higher in malignant tumors than in benign with no significant difference P=0.09 while it was significantly higher in malignant 66% and benign tumors 48.8% compared with their counterparts of control group 4.8%, p˂0.001.NF - κB p65 was positively expressed in all cases of malignant tumors 100% and 97.6% in cases of benign tumors compared with control group 23.8% with significant difference p˂0.001.IL - 6 expression was higher in benign than in malignant tumors with no significant difference p=0.22 while it was significantly higher in benign 90.2% and malignant tumors 81.1% compared with control group 52.4%, p=0.01 and p=0.03 respectively.Immunostaining reaction for IL - 8 was significantly higher in malignant tumors than that in benign 69.8% versus 31.7%, p˂0.001, while positive reaction was not detected in any tissue of control group.IL - 10 was expressed in 83% of malignant tumors, in 95.1% of benign tumors and 71.4% control group. The percentage of IFN - α positive was 83% in malignant tumors compared with 63% in benign tumors and normal tissue 52%. The difference was significant between malignant and benign tumors p=0.04 and between malignant and control group p=0.007.There was a significant correlation between human parvovirus B19 score category and IFN - α score r=0.296, p=0.031. But no significant correlation was noticed between B19 and the other cytokines.

تقييم بعض العوامل المسببة للاجهاض التلقائي للنساء في محافظة بغداد : دراسة مصلية ونسيجية == Evaluation of Some Spontaneous Abortion - Causative Factors for women in Baghdad Province A Serological And Histological Study

Author name: سمر عبد الرحيم شغاتي الغراوي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | سالم رشيد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الاجهاض التلقائي احدى المشاكل السريرية المهمة التي تؤثر على النساء الحوامل خلال (20 - 22) اسبوع الاولى من الحمل مسببة خطر على الام وجنينها.وبهدف القاء الضوء على بعض مسببات الاجهاض وموت الاجنة داخل الرحم. تم اختيار (70) امراة من النساء المجهضة ، قسمت النساء الى مجموعتين ، الاولى هي المجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل (52) والثانية مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الثانية من الحمل (18) . اجريت المقارنة مع(20) من النساء ذوات حمل طبيعي انتهى حملهن بولادة طبيعية.جمعت نماذج الدم والمشايم خلال الفترة من تشرين الثاني 2008 ولغاية نيسان 2009 في مستشفيات بغداد. اجريت الفحوصات المختبرية لتحديد مستويات هرمون البروجسترون والاستراديول واضداد داء المقوسات IgM, IgG الانترلوكين - 6 وسكر الدم والبروتين الكلي والتغيرات النسجية في مشايم النساء المجهضة باستخدام صبغة الايوسين - هيماتوكسلين وصبغة الكمزا. بنيت الدراسة الحالية النتائج الاتية : - 1 - لوحظ وجود انخفاض معنوي (P< 0.01 ) في مستوى هرمون البرجسترون والاستراديول لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل المختلفة بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 2 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات IgG في (%41.43) من المجموع الكلي للنساء المجهضة, بينما لوحظ وجود اضداد داء المقوسات IgM في (%5.6 ) من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل.3 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستوى 1L - 6 بين النساء المجهضات ومجموعة السيطرة. 4 - لوحظ ارتفاع معنوي (P< 0.01 ) و(P< 0.05 ) في مستوى البروتين الكلي في مصل النساء المجهضة خلال مرحلة الحمل الاولى والثانية على التوالي بالمقارنة مع مجموعة السيطرة . 5 - لم تكن هناك فروق معنوية (P> 0.05 ) في مستويات الكلوكوز بين مجموعة النساء المجهضة ومجموعة السيطرة . 6 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقات ترابطية في المرحلة الاولى من الاجهاض التي كانت علاقة موجبة بين ( IgM,IgG) داء المقوسات (P< 0.01 ) وعلاقة معنوية موجبة بين البروحسترون والاستراديول مع مستوى السكر بالـدم (P< 0.05 ) وعلاقة معنوية موجبة بين IgG داء المقوسات والعمر.7 - وجود علاقات ترابطية قوية بين هرمون البروجسترون و1L - 6 (P< 0.05 ) و(P< 0.01 ) المرحلة الاولى والثانيةعلى التوالي من الحمل وهرمون البروجستون والاستراديول (P< 0.05 ) في المرحلة الثانية من الاجهاض . 8 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية ظهور الحالات المرضية في المشايم المجهضة والتي شملت الاستسقاء المائي Hydropic Degeneration التليف Fibrosis وتجمع الهايلين Hyalinization وحالة الذوى Ischemia والتفاعل المناعي Immunological reaction وعدم وجود الطفيلي نسيج المشيمة باستخدام صيغة كمزا . | The spontaneous abortion is considered as one of the important clinical problems that is may effects pregnant women during the 1st 20 - 22 weeks of pregnancy causing dangers to the mother and her fetus.The present study was designed to focus on some spontaneous abortion causes and fetal death and fetal death in the uterus. (70) Women were selected to represented the samples of spontaneous aborted women.The women were classified into two groups , the first represented aborted women during the first trimester of pregnancy (52) , the second trimester of pregnancy (18) , in comparison with result of (20) normally delivered pregnancies. The samples (sera and placenta) were collected during the period from November 2008 to April 2009 in Baghdad.Laboratory tests were performed to determine serum levels of difficult parameters which include progesterone ,estradiol , Toxoplasma IgG,IgM , IL - 6 , blood sugar, total protein .Histopathological changes of aborted placenta was performed using haematoxylin - eosin , giemsa stain to differentiate nuclear and cytoplasmic morphology of parasite.Results 1 - Significant decrease (p<0.01) in the level of progesterone and estradiol hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy compared with control.2 - Anti - Toxoplasma IgG, IgM were positive in (41.43%), (5.6%) of total aborted women, respectively.3 - There was no significant difference (p>0.05) in level of IL - 6 between aborted women and control. 4 - There was a significant increase in the level of total protein in the serum of women with abortion in first and second trimester of pregnancy compared to control (p< 0.01, p< 0.05).5 - There was no significant difference in the levels of blood sugar between women with abortion and control.6 - The results of present study revealed correlations between the parameter in first trimester that was positive correlation between IgG with IgM toxoplasmosis (p<0.01), significant positive correlation between blood sugar with progesterone,estradiol hormone,(p<0.05) and significant positive correlation between age with IgG toxoplasmosis (p<0.05). 7 - There was a correlation (positive) between progesterone with IL - 6 in first and second trimester (p<0.05, p<0.01), respectively. And progesterone with estradiol (p<0.05) in second trimester. 8 - The histological study shows hydropic degeneration fibroids with hyalinization of fibrinosis changes, immunologic reaction, ischemia and negative histological parasite with Giemsa.

اكثار نبات الخلة البلدي Ammi visnaga نسيجيا وتقدير بعض مركبات الايض الثانوي فيه == Micro propagation and Estimation of some Secondary metabolite in Ammi visnaga plant A thesis

Author name: سعدة عبد الفتاح سعيد
Supervisor name: سعدية حسن محمود | عبد الجاسم محيسن جاسم
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجري هذا البحث في مختبرات مركز بحوث التقنيات الاحيائية / جامعة النهرين بهدف زيادة انتاج الخلين في المزارع النسيجية لنبات الخلة البلدي Ammi visnaga وتقديره بالتحليل الكمي والنوعي بجهاز HPLC ثم مقارنته مع مستخلص الاوراق والبذور الجافة من النبات الكامل In vivo. تم انبات البذور في ظروف معقمة على وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 1, 0.5 ملغم / لتر على التوالي والحصول على بادرات دون الكالس .اظهرت النتائج بان وسط MS مزود ﺒ NAAو BA بتراكيز 3.5و1 ملغم / لتر على التوالي كان فعالا في استحداث الكالس فتفوقت السويقة الجنينة السفلى باعطاء معدل نسبة مئوية 100% بالضوء على كالس الاوراق الذي كانت نسبته 83.3 % وكذلك تفوق نفس الوسط بالوزن الطري والجاف للسويقة الجنينية السفلى مقارنة مع كالس الاوراق للضوء والظلام . فقد بلغ الوزن الطري لكالس السويقة الجنينية السفلى من الضوء 1005.6 ملغم وفي الظلام 916.5 ملغم . بينما بلغ الوزن الجاف في الضوء لكل من كالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية 48.5و39.9 ملغم على التوالي وفي الظلام 45.5 و41.1ملغم .تباينت طبيعة ولون الكالس تبعا للجزء النباتي وظروف الحضن تميز كالس السويقة الجنينية السفلى بطبيعة هشة ولون اخضر في الضوء وازداد هشاشة ولون ابيض مائل للاخضرار في الظلام . بينما اختلف الكالس المستحدث من الاوراق الفتية واتصف بتماسكه ولونه الاخضر في الضوء مقارنة بالكالس المستحدث في الظلام اذ كان اقل تماسكا وذو لون ابيض .تم الحصول على كالس ذو وزن عالي وبكميات كبيرة عند اعادة زراعته Subculture على نفس وسط الاستحداث ثلاث مرات .اعطت مستخلصات الاجزاء النباتية البذور الجافة والاوراق للنبات المزروعة في الحقل In vivo منحنيات عالية لمركب الخلين مع انعدامه بمنحنيات مزارع الكالس السويقة الجنينية السفلى والاوراق الفتية بخلاف مركب الكومارين اذ تميزت مستخلصات مزارع كالس بانتاجه، وارتفع منحناه بمستخلص كالس الاوراق الفتية في الضوء.لقد تم بنجاح الحصول على نبيتات كاملة لكالس نبات الخلة البلدي عند زراعته على وسط MS حيث مزود ﺒ NAA 0.5 ملغم / لتر وBA 1 ملغم / لتر تم نقلها على نفس الوسط بدون NAA . | this study was conducted in The laboratories of Biological technology center / university of Al - Nahrain, during 2007 - 2008.The aim of this study was to increase the production of Khellin from Ammi visnaga In vitro and its determination by the quantitative and qualitative Analysis by HPLC and comparing it with the extracts of plant part In vivo. Seeds have been germinated under sterilized conditions on MS medium supplied with NAA at0.5 mg/L and BA at1mg/L and It has achieved to plantlets without any production of callus .Results showed that MS medium supplied with NAA 3.5 mg/L and BA 1.0 mg/L was that most effective on callus induction. Thus, the calli of hypocotyls incubated in light were significantly superior(100% induction) in comparison with young leaves calli which gave 83.3%.Results also showed that the same medium produced more fresh and dry weights of hypocotyls callus has and young leaves ones exposed or not to light .Accordingly the fresh weight of the hypocotyls calli and young leaves achieved 1005.66, 916.5 mg in light. respectively and 800.8,702.5 in dark successively. As for the dry weight hypocotyls calli reached 48.5 mg in light and 45.5mg in dark while young leaves calli gave 41.11mg in dark and 39.9mg in light .The difference in nature and color of the calli depends on the type of explant and incubation conditions. Calli of hypocotyls was fragile nature with green color in light, the fragility increased in darkness and the color was white and greenish. Calli of young leaves were compact and green color in light while less coherent and white at dark .In order to obtain larg quantities of calli, subculture on the above mentioned medium is recommended for at least three times.The highest level of khellin was obtained in vivo by using extracts of different parts (dry seeds and leaves) in comparison with callus that production in in vitro (calli).Regeneration was successfully achieved from calli cultured firstly on MS medium supplemented with NAA0.5mg/L and BA1.0mg/L then transfersed to the same medium with out NAA.

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة للمرضى المحبطين مناعيا ودراسة للاستجابة المناعية ضد المبيضات البيضاء == Isolation and identification of fungi associated with and study immunocompromised patients of the immune response against Candida albicans

Author name: سعاد يوسف لفتة
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | هيثم عزت باقر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: خلال فترة الدراسة التي امتدت من تشرين الثاني/2003 ولغاية نيسان/2005 فقد تم اخضاع 300 مريضا يعانون من مختلف الامراض الخبيثة الى فحص داء الفطريات واظهر 17 مريضا من المجموع الكلي ان نتائج زرع الدم كانت ايجابية وان خميرة مبيضة المبيضات Candida albicans كانت المسؤولة عن معظم الاصابات بالفطريات ومن بين الحالات السبعة عشر التي تم عزلها فان تسعة منها (53% من مجموع الحالات) كانت من نوع C. albicans وان الاصابات بفطريات اخرى سواها والتي تم عزلها بلغ عددها اربعة (23% من مجموع الحالات) كانت من Aspergillus spp التي تم عزلها من حالة فردية من حالاات Cryptococcus spp وحالة ثانية من حالات زرع Trichosporone spp . ولقد اتبع اسلوب API (API candida and API 20 C AUX) كطريقة مرجعية لتشخيص ماتم عزله. وبالمقارنة مع الاساليب التي قدمت مؤخرا وهي انظمة (ID32 C) و(VITEK YBC) فان نظام API 20 CAUX وID32 كانامطابقين لمستوى السلالتين وبدون حاجة الى مزيد من الفحوصات الاضافية لتشخيص 13 حالة من الحالات الخمسة عشر التي تم عزلها اي 86.6% وان اهم ما تم التوصل اليه ثبوت ان نظام VITEK YBC يصلح جدا للمقارنة مع API 20 CAUX. ومن بين المرضى الثلاثمائة الذين تم زراعة دمهم تم فحص 71 منهم للتاكد من وجود او عدم وجود اصابة فطرية دون اجراء فحوصات على اعضاء الجسم الاخرى غير المصابة وكانت عينات الادرار هي الاكثر شيوعا من بين العينات الاخرى ومع ذلك فان عينتين فقط من مجموع 35 عينة اتفق على انها موجبة الزرع.و من بين المرضىالسبعة عشر الذين اثبت الزرع وجود فطريات لديهم فان ثمانية منهم كونوا مستعمرات من نفس الانواع الموجودة في النماذج الاخرى وان اكثر المواقع شيوعا لتكوين المستعمرات مع نفس الاحياء المجهرية كانت المجاري التنفسية والمجاري البولية - التناسلية. وكان متوسط العدلات (Neutrophils) في عينات دم موجبة الزرع 1136 خلية/ملم3 مع انحراف معياري مقداره ±1637 خلية/ملم3 في حين كان المتوسط لحالات الزرع السالبة 2701 مع انحراف معياري مقداره ±1667 . وباستعمال فحص ELISA لمضادات الجسيمات BioRad) (المتوفر تجاريا فان 25 مريضافقط من مجموع المرضى الثلاثمئة الذين اجروا الفحص اظهروا نتائج ايجابية. وان تسعة من بين هؤلاء الخمسة والعشرين اظهروا نتائج موجبة لزرع الدم ايضا في حين اظهر الستة عشر الاخرون نتائج زرع سالبة. ولم يظهر اي من افراد فريق السيطرة الاصحاء نتائج موجبة. وكانت قراءة نماذج الدم موجبة الزرع 1.11 مع انحراف معياري مقداره 0.68 في حين ان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لحالات الزرع السالب لاعضاء فريق السطرة الاصحاء كانت 0.43 مع انحراف معياري مقداره ±23 وان متوسط قراءة الكثافة الضوئية لاعضاء فريق السيطرة الاصحاء كان 0.38 مع انحراف معياري مقداره 0.123. وقد اظهرت تراكيز interleukins التي تم فحصها بهذه الطريقة اختلافات كبيرة بين مجموعات الدراسة المختلفة وكذلك اختلافات بين افراد المجموعة الواحدة وان التركيز المتوسط ل IL - 1α في نماذج زرع الدم الموجبة بلغ 30.94 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±80.33 في حين ان التركيز المضبوط لحالات الزرع السالب بلغ 16.08 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 3.26 وكان التركيز المضبوط ل IL - 8 في نماذج الدم موجبة الزرع 389.2 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±383.15 في حين ان متوسط التركيز كان 163.0 بيكوغرام \مل مع انحراف معياري مقداره ± 289.9 وكان متوسط التركيز لدى مجموعة السيطرة المؤلفة من الاصحاء 5.02 بيكوغرام \مل م مع انحراف معياري مقداره ±1.81 . وكان تركيز GM - CSF في نماذج الدم 12.90 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ±31.79 في حين ان متوسط تركيز حالات الزرع الموجبة كان 2.68 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 10.19. وان متوسط تركيز افراد مجموعة السيطرة الاصحاء بلغ 0.85 بيكوغرام\مل مع انحراف معياري مقداره ± 0,45. ولم يظهر مستوى الغلوبيولين المناعي اية متغيرات ملموسة بين مجموعات الدراسة سواء اكان الفحص IgG او IgM او IgA ولقد اظهر مستوىالعنصر التكميلي ل C3 اختلافات بارزة بين مجموعات الدراسة لكونه اوطا في مجموعة الزرع الموجب. وعلى كل حال لم تلاحظ اختلافات كبيرة في المجموعات بالنسبة الى C4 . وكان مستوى C Reactive Protein في المجموعات الدراسية المختلفة قد كشف عن اختلافات بارزة p=0.001 وعلاوه على ذلك فان الاختلافات كانت واضحة بين الافراد الذين هم ضمن نفس المجموعة. وكان المتوسط التقريبي لمستوى CRP في نماذج زرع الدم الموجبة 261,9 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±384.4 وفي نماذج زرع الدم السالبة بلغ 178,8 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±364.2 وفي مجموعة السيطرة التي افراده من الاصحاء بلغ 1.7 ملغ\لتر مع انحراف معياري مقداره ±7.7 . وكان مستوى CRP في 58,8 من الحالات في مجموعة الزرع الموجب قد تجاوز 96 ملغ\لتر في حين ان 37.4% فقط من مجموعة الزرع الموجب تجاوزت هذا الرقم. ولم يكن يوجد بين افراد فريق السيطرة الاصحاء من تجاوز هذا الرقم.و كانت جميع الحالات التي تم عزلها بعد الفحص تستجيب الى الامفوتيريسين B مع (MIC =<1 مايكروغرام\مل) باستثناء C. krusei المنفرد الذي تم عزله والذي كان اقل استجابة من اي نوع اخر مع MIC مقداره 2 مايكروغرام\مل وMIC 50 المزدوج. وكانت نسبة سلسلة MIC الى الامفوتيريسن B تتراوح بين 0.125 الى 2 مايكروغرام\مل وبصوره عامة فان Non - albicans Candida اظهرت MIC اعلى من C. albicans التي تم عزلها وان 84.6% من الCandida التي تم عزلها كانت تستجيب الى الامفوتريسين والباقي اي 1.4% كانت حساسيتها حسب مقدار الجرعة. وان نسبة سلسلة MICs الى الفلوكونازول تراوحت بين (0.25 - 64) مايكروغرام\مل وكان جميع ما تم عزله ذا حساسية عالية تجاه الفلوكونازول باستثناء C. krusei التي اظهرت MIC عال حيث بلغ 32 واما MIC 50 وMIC 90 فقد كانت 16 مايكروغرام\مل و32 مايكروغرام\مل على التوالي. وان جميع ال Candida التي تم عزلها ونسبتها 84.6% استجابت الى الفوكونازول في حين ان نسبة 15.4% كانت حساسيتها حسب الجرعة.ان سلسلة الMIC تجاه الاتراكونازول كانت تتراوح بين (0.015 - 1) مايكروغرام\مل وكانت جميع C. albicans التي تم عزلها حساسة تجاه الاتراكونازول واظهرت خمائر الCandida الاخرى non - albicans Candida استجابة اقل نسبيا مع الحاجة الى تراكيز دوائية اعلى من اجل التوصل الى MIC وان 96.2 % من الCandida التي تم عزلها استجابت الى الاتراكونازول وان الباقي اي 30.8% كانت تستجيب حسب الجرعة. | Through the period of this study which extended from November 2003 to April 2004, 300 patients with different types of malignancies were tested for fungemia. Out of those, 17 patients showed positive blood culture results. Candida albicans accounted for the majority of fungal infections. Out of the 17 fungal isolates, 9 (53%) were C. albicans, others non C. albicans came next in frequency constituting 4 isolates (23.5%). Two isolates of Aspergillus spp. could be detected while a single isolate of Cryptococcus spp and another of Trichosporon spp. isolate were cultured API system (API Candida and API 20C AUX) was used as a reference method for the identification of isolates. Compared with the other newly introduced techniques (ID 32C systems and VITEK YBC). ), the API 20C and the ID 32 system were in agreement with the species level, without additional tests, for the identification of 13 of the 15 (86.6%) isolates.Overall, the updated Vitek YBC compares favorably with the API 20C in the identification of common yeasts. Among the 300 patients whose blood were cultured, 71 of them were screened for fungal infection from other parts of the body. Urine was the commonest sample obtained. However, two samples only out of the total (35 samples) were accepted to be culture positive. Among the 17 patients whose blood cultures proof the existence of fungi, 8 were colonized with the same species in other specimens. The most frequent sites of colonization with the same organism were the respiratory tract and urogenital tract.The mean of neutrophils count of the blood culture positive samples was 1136/c.mm with a standard deviation (SD) of 1637, whereas the mean count of culture negative cases was 2701 with a SD of 1923. Mean count of healthy control group was 5027 with a SD of 1667. Statistical analysis showed significant differences between the study groups. Using commercially available Candida - specific antibody test (Bio - Rad), 25 patients showed positive results out of the 300 patients tested. Nine of them showed positive blood culture as well, whereas the rest (16) gave negative culture results. None of the healthy control group showed positive results. Mean OD readings of the blood culture positive samples was 1.11 with a SD of 0.68, whereas the mean OD readings of the culture negative cases was 0.43 with a SD of 0.23. Mean OD readings of healthy control group was 0.38 with a SD of 0.123. Interleukins (ILs) concentration tested in this study showed significant variations among the different groups of the study as well as within the same group. Mean concentration of IL - 1α in the blood culture positive samples was 30.94 pg/ml with a SD of 80.33, whereas the mean concentration of the culture negative cases was 16.08 pg/ml with a SD of 28.75. Mean concentration of healthy control group was 7.92 pg/ml with a SD of 3.26. Mean concentration of IL - 8 in the blood culture positive samples was 389.2 pg/ml with a SD of 383.l5, whereas the mean concentration of culture negative cases was 163.0 pg/ml with a SD of 289.9. Mean concentration of healthy control group was 5.02 pg/ml with a SD of 1.81. Mean concentration of Granulocyte Macrophage - Colony Stimulating Factor (GM - CSF) in the blood culture positive samples was 12.90 pg/ml with a SD of 31.79, whereas the mean concentration of culture negative cases was 2.68 pg/ml with a SD of 10.19. The mean concentration of healthy control group was 0.85 pg/ml with a SD of 0.45. Serum immunoglobulins level showed no significant differences among the groups of the study whether IgG, IgM or IgA were tested. Mean level of C3 complement component showed significant differences between the groups of the study, being lower in culture positive group, and followed by culture negative group. However, no significant differences were noted in the groups in regard to C4. Level of CRP in different groups of the study shows significant variations (p=0.001). Moreover, variations are clear between individuals within the group itself. Approximate mean of CRP level in blood culture positive samples was 261.9 mg/L with a SD of 384.4 and, in blood culture negative samples was 178.8 mg/L with a SD of 346.2 and in healthy control group was 1.7 mg/L with SD of 7.7. CRP level in 58.8% of cases in culture positive group exceeded 96 mg/L. while only 37.4% of cases in culture negative group exceeded this value. Non in the control group exceeded this figure. All the tested isolates were susceptible to amphotericin B, with MICs ≤ 1ug/ml with the exception of a single isolate of C. krusei which was less susceptible than any other spp with MIC of 2 ug/ml and MIC50 of 2. The range of MICs to amphotericin B was from 0.125 to 2 ug/ml. In general, non - albicans Candida showed higher MIC than C. albicans isolates. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to amphotericin while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to fluconazole was from 0.25 to 64 ug/ml. All isolates were highly sensitive to fluconazole with the exception of C. krusei which showed a high MIC (32) and MIC50 and MIC90 of 16 and 32 ug/ml respectively. A total of 84.6% of Candida isolates were susceptible to fluconazole while 15.4% were sensitive dose - dependant. The range of MICs to itraconazole was from 0.015 to 1.0 ug/ml. Most C. albicans isolates were sensitive to itraconazole. Non - albicans Candida showed relatively lower susceptibility with the need for higher drug concentrations to attain the MIC. 69.2% of Candida isolates were susceptible to itraconazole while the rest (30.8%) were susceptible in a dose - dependant way.

نزعات مقاومة مكروليد في العقدية المقيحة والرئوية المعزولة من الاطفال العراقيين المصابين بامراض الحلق المعدية == Macrolide Resistance Trends in Streptococcus pyogenes and Streptococcus pneumoniae Isolated from Iraqi children with throat infections

Author name: سعاد عبد الجبار عبد الزهرة الساعدي
Supervisor name: محمد فخري احمد | مروان صالح محمد النمر
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة على مرضى مراجعي العيادة الاستشارية في مستشفى ابن البلدي في مدينة بغداد (العراق) للفترة من تشرين الثاني 2007 الى شباط 2008 . تم تعين المرضى بشكل عشوائي اذ تم اختيار 108 حالة (60 انثى و48 ذكر) تراوحت اعمارهم بين 18 شهر الى 12 سنة والذين يعانون من التهاب الحنجرة والبلعوم .تم جمع مسحات البلعوم من كل مريض بهدف عزل وتشخيص البكتريا . اعتمد كل من فحص D - test وOptochin كفحص اساسي لتميز بكتريا Streptococcus pyogenes المقاومة للمضادات الميكروليدية . اظهرت النتائج ان 94 حالة ظهرت عليهم العلامات السريرية واعراض التهاب اللوزتين والبلعوم ، 7 حالات ظهرت عليهم اعراض الحمى القرمزية (Scarlet fever)، و14 مريض اعتبروا حاملين للمرض .تم تشخيص بكتريا S. pyogenes في 65 عزلة من اصل 73 وكانت 16 منها مقاومة لمضادات الحياة الميكروليدية ، وتم تشخيص 8 عزلات من Streptococcus pneumoniae .توزعت المجاميع المقاومة للمضادات الحياة الميكروليدية الى : مجموعة بكتريا مقاومة من نوع iMLSB بواقع 3 عزلات ، ومن نوع cMLSB بواقع 8 عزلات ومن نوع M - phenotype بواقع 5 عزلات ، واظهرت عزلتين من نوع معكوس D - Shape (Inverted D - Shape) .كانت التراكيز المثبطة الدنيا باستخدام تقنية التخفبف الدقيق Micro - dilution لـ17 مضاد حيوي متفاوتة بالنسبة الى العزلات (حساسة او مقاومة للمضادات الميكروليدية واشكالها المظهرية) . اظهرت بكتريا S. pyogenes الحساسة للـerythromycin والـclindamycin تركيز مثبطا ادنى عند 0.25 مايكروغرام/مليليتر لكل من الـCo - amoxicillin + clavulanic acid وceftriaxone .بكتريا S. pyogenes التي قاومت كل من erythromycin وclindamycin كانت حساسة عند التركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر للـampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وceftriaxone وciprofloxacin وgatifloxacin .كانت عزلات S. pyogenes من نوع M - phenotype حساسة للتركيز 0.25 مايكروغرام/مليليتر من azithromycin وlincomycin وampicillin وCo - ampicillin cloxacillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin وcephalothin وcefotaxime . ادنى تركيز مثبط لعزلات S. pyogenes من نوع D - Shape موجب كان 0.25 مايكروغرام/مليليتر لمضادات ampicillin وamoxicillin وCo - amoxicillin - clavulanic acid وgentamicin . كانت عزلات S. pneumoniae حساسة لكل مضادات الحيوية التي تم دراستها وبتراكيز مثبطة ادنى تراوحت بين (1 - 0.25) مايكروغرام/مليليتر .تم تحديد 3 عزلات من S. pyogenes متحملة للبنسلين . يستنتج من ذلك ان عزلات الـS. pyogenes المقاومة لمضادات الميكروليدية كانت تحتل نسبة عالية ، واكثر الاشكال المظهرية شيوعا كان من نوع cMLSB .كل من العزلات المقاومة للـfluoroquinolone والمتحملة للبنسلين penicillin tolerant كانت متواجدة في العزلات المقاومة والحساسة لمضادات الميكروليدية .حساسية عزلات S. pyogenes لمضادات الحيوية كانت متفاوتة بالنسبة الى حساسيتها او مقاومتها لمضادات الحيوية الميكروليدية وكذلك بالنسبة الى التنويع المظهري للعزلات المقاومة . | This study was conducted on patients attending the consultant clinic at Ibn - Al - Balady Hospital in Baghdad, Iraq from November 2007 to February 2008. The patients were allocated randomly, after they examined thoroughly by pediatrician, to be admit in this study. A total number of 108 (60 girls and 48 boys), their ages ranged from 18 months to 12 years, with provisional diagnosis of tonsillo - pharyngitis were enrolled in this study. Throat swab was obtained from each patient for isolation and identification of microorganisms. Double - disk test (D - test) and optochin test, fundamental for discrimination macrolide resistant Streptococcus pyogenes were done. The results showed that 94 patients had clinical signs and symptoms of tonsillo - pharyngitis, 7 patients were diagnosed as scarlet fever and 14 patients were considered as carriers. S. pyogenes was identified in 65 out of 73 isolates; sixteen of them were macrolide - resistant strain, and (8 isolates) of Streptococcus pneumoniae were identified. The phenotypes of macrolide resistant S. pyogenes were distributed as iMLSB (3 isolates), cMLSB (8 isolates) and M phenotype (5 isolates). Two isolates showed inverted D - Shape patterns. The minimum inhibitory concentration (MIC), using microdilution technique, of seventeen antimicrobials were varied with respect to the isolates whether susceptible or resistant to macrolide in addition to their phenotypes. The lowest MIC for susceptible isolates to erythromycin and clindamycin, was 0.25 µg/mL of Co - amoxicillin + clavulanic acid and ceftriaxone. S. pyogenes which resisted to both erythromycin and clindamycin were susceptible to 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, ceftriaxone, ceftazidime, ciprofloxacin and gatifloxacin. M - phenotype of S. pyogenes isolates were susceptible to 0.25 µg/mL of azithromycin, lincomycin, ampicillin, Co - ampicillin - cloxacillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid, gentamicin, cephalothin and cefotaxime. The lowest MIC for S. pyogenes characterized by positive D - shape test was 0.25 µg/mL of ampicillin, amoxicillin, Co - amoxicillin - clavulanic acid and gentamicin . S. pneumoniae isolates were susceptible to all tested antimicrobials with MIC range of 0.25 - 1 µg/mL. Penicillin - tolerant S. pyogenes was detected in 3 isolates. It concludes that Macrolide resistant S. pyogenes was found in high percent, and the commonest phenotype was cMLSB. Both fluoroquinolone resistant isolates and penicillin tolerant isolates were detected in both Macrolide resistant and susceptible isolates. The susceptibility of S. pyogenes isolates to antimicrobials was varied in respect to their susceptibility or resistance to macrolide as well as to the phenotypes of resistant isolates.

بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية في تعقيدات الحـمـل == SOME IMMUNOLOGICAL AND BIOCHEMICAL CHANGES IN PREGNANCY COMPLICATIONS

Author name: سعاد الماس براخاس
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على بعض التغييرات المناعية والكيموحيوية المرافقة لتعقيدات الحمل. تم جمع (120) انموذجا من دم لنساء حوامل، قسمت على اربع مجاميع تتضمن (30) نموذج لنساء ذوات مقدمة الارتعاج و(30) نموذجا لنساء ذوات سكري الحمل و(40 ) نموذجا لنساء ذوات فقر الدم و(20) نموذجا لنساء حوامل اصحاء ظاهريا، وقد اعتمدت المجاميع الثانية والثالثة والرابعة بمثابة مجاميع السيطرة للحالة المرضية الرئيسية مقدمة الارتعاج.وقد خلصت الدراسة المناعية الى النتائج الاتية : - 1 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgM معنويا (P<0.001) في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 173.7 mg /dl ± 43.5 مقارنة بمعدل مستوياتها لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم والبالغ 118.4 mg/dl±43.5 و131.1 mg/dl±43.7 على التوالي ،في حين لم يكن هناك فرقا معنويا بالمقارنة مع ذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن 181.7 mg/dl± 55.6.2 - ارتفعت قليلا مستويات الكلوبيولين المناعي IgG في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها mg/dl 1285± 377.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى مجاميع السيطرة الثلاثة والبالغ 1145mg/dl ±374.1 و1117.2 mg/dl± 378.3 و280.4± 1233.9 mg/dl على التوالي ولم يكن هذا الارتفاع معنويا.3 - ارتفعت مستويات الكلوبيولين المناعي IgA معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فكان معدلها 279.9 mg/dl± 94.5 مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء الاصحاء والبالغ 177.1 mg/dl ±70.2 في حين لم يكن الارتفاع ذي دلالة معنوية مقارنة بمعدل مستواه عند ذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 94.37±210.4 mg/dl و261.3 mg/dl± 85.7 على التوالي.4 - ارتفاع في مستويات جزئي المتمم C3 وC4 معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغت معدلاتها 188.3 mg/dl±40.1 و47.1± 14.6 مقارنة بمعدلاتها مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم108.9 mg/dl ±44.2 و139.9 mg/dl± 40.8 و29.9 mg/dl± 12.5 و34 mg/dl± 11.8 على التوالي ، في حين لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه لدى النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 157.1 mg/dl ±55.4 و37.6 mg/dl ±11.5 .5 - ارتفعت مستويات البروتين الجنيني الالفي معنويا (P<0.001) في امصال ذوات مقدمة الارتعاج فبلغ معدلها 63.2 ng/ml ±34.6 مقارنة بمعدل مستواه عند النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 27.6 ng/ml ± 12.4و 30.4 ng/ml± 12.8و18 ng/ml ± 10.4على التوالي.6 - ارتفاع في مستويات البروتين الفعال - C في امصال 36.6% من النسوة ذوات مقدمة الارتعاج مقارنة بارتفاعه لدى 10% من ذوات فقر الدم و20% من ذوات سكري الحمل ، في حين لم تبدي اي من النساء الحوامل الاصحاء تفاعلا موجبا لهذا الفحص.فيما اشارت نتائج الفحوصات الكيموحيوية الى ماياتي : - 1 - ارتفع مستوى الكلوكوز في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.7±103.4 mg/dl مقارنة بمعدل مستواه لدى مجموعة النساء ذوات فقر الدم والبالغ g/dl 76±11.9 وكان الارتفاع ذا دلالة احصائية ( P<0.001)، بينما لم يكن الارتفاع معنويا مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 86.3 mg/dl±10.4 ، غير ان مستواه يقل وبشكل معنوي ( P<0.001) مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 163.4 mg/dl± 19.9.2 - ارتفع مستوى الكولسترول الكلي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 217.5 mg/dl 41.8 ± مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات فقر الدم والبالغ 187.2 mg/dl±30.5 وكان الارتفاع ذ ا دلالة احصائية (P<0.001) بينما لم يكن الارتفاع ذا دلالة احصائية مقارنة بمعدل مستواه مع النساء الاصحاء والبالغ 195.5 mg/dl± 19.5، في حين كان يقل وبشكل غير معنوي مقارنة بمعدل مستواه مع النساء ذوات سكري الحمل والبالغ 221.5 mg/dl ±41.3 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى اليوريا في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 13.6 ± 35.6 mg/dlمقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن22.2 mg/dl± 4.9 و23.9 mg/dl±6.4 و24 mg/dl± 5.7 على التوالي.4 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى الكرياتنين في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 1.1 mg/dl± 0.4 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 0.6 mg/dl ± 0.2 و0.6 mg/dl ± 0.2 و0.2 ± 0.7 mg/dl على التوالي.5 - سجل ارتفاعا معنويا بدلالة احصائية (P<0.001) في مستوى حامض اليوريك في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل 7.4 mg/dl± 2.5 مقارنة مع النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وبلغ المعدل لديهن 3.7 mg/dl± 1 و4.1 mg/dl± 1.2 و4.6 mg/dl±1.1 على التوالي.6 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GOT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط Median)) U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 6 U/L و7 U/L و5 U/L على التوالي.7 - لم يكن هنالك فرق معنوي في مستوى انزيم GPT في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 7 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل والبالغ 8 U/L و8 U/L و6 U/L على التوالي.8 - لم يكن هناك فرق معنوي في مستوى انزيم الفوسفاتيزالقاعدي في امصال النسوة ذوات مقدمة الارتعاج اذ بلغ الوسيط U/L 27 مقارنة بمستواه لدى النساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحــــمل والـبالغ 34 U/L و25 U/L و28 U/L على التوالي.اما نتائج الفحوصات الدمية فاشارت الى ما ياتي : - - 1ظلت مستويات الهيموكلوبين ضمن حدودها الطبيعية عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء مقارنة بمستواه لدى النساء ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 1 ± 9.2 g/dl .2 - ظلت مستويات مكداس الدم متقاربة وضمن حدودها الطبيعية لدى النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء ذوات سكري الحمل كما في الحوامل الاصحاء فيما انخفض مستوياته لدى ذوات فقر الدم واللاتي ابدين انخفاضا معنويا (P<0.001) وبمعدل قدره 2.8 ± 28.2 %.3 - ارتفعت اعداد خلايا الدم البيض معنويا (P<0.001) عند النساء ذوات مقدمة الارتعاج وبمعدل قدره 3.7 ± 12.2 ×109 /L مقارنة بالنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل اذ بلغ المعدل لديهن9.1×109/L ± 1.9 و109/L 8.8 × 2.1± و109/L 8.8 × ± 2.6 على التوالي .4 - لم تكن هناك فروقات معنوية في اعداد الصفيحات الدموية بين النساء ذوات مقدمة الارتعاج والنساء الاصحاء وذوات فقر الدم وذوات سكري الحمل وظلت ضمن حدودها الطبيعية. | The present study was designed to focus on some immunological and biochemical changes accompanied pregnancy complications. 120 pregnant women were selected to represent the samples, the women were classified into 4 groups, the first group (30 samples) represented preeclamptic women, the second group (30 samples) represented gestational diabetic women, the third group (40 samples) represented anemic women, and the fourth group (20 samples) represented healthy pregnant women. The 2nd, 3rd, and 4th groups considered as a control groups for the main group, preeclamptic women.The results of immunological study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001) in the levels of immunoglobulin IgM in the sera of preeclamptic women (43±173.7mg/dl) in comparison with healthy women and anemic women 43±118.4 mg/dl , 43.5±131.1 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.6±181.7 mg/dl.2 - There was some elevation (non - significant) in the level of immunoglobulin IgG in the serum of preeclamptic women in comparison with the three control groups.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of immunoglobulin IgA of preeclamptic women (94.5±279.9mg/dl) ,in comparison with healthy women 70.2±177.1 mg/dl , while there were no significant differences in comparison with anemic women and gestational diabetic women 4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of complement components C3 and C4 of preeclamptic women 40.1±188.3 mg/dl, 14.6±47.1mg/dl respectively comparison with healthy women and anemic women 44.2±108.9 mg/dl, 40.8±139.9 mg/dl and 12.5 ±29.9 mg/dl,11.8±34 mg/dl respectively, but not with gestational diabetic women 55.4±157.1 mg/dl and 11.5 ±37.6 mg/dl.5 - A significant increase (P<0.001) in the levels of Alpha - fetoprotein in the sera of preeclamptic women 34.6 ±63.2 ng/ml in comparison with healthy women 11.5±27.6 ng/ml , anemic women 12.4±30.4 ng/dl , and gestational diabetic women 10.4±18 ng/dl .6 - The serum levels of C - reactive protein recorded to be increased in 36.6% of preeclamptic women in comparison with 10% of anemic women and 27% of gestational diabetic women, while all the healthy women showed negative result to this test.The biochemical study showed the following features : - 1 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of glucose of preeclamptic women 13.7±103.4 mg/dl in comparison with anemic women 11.9 ±76 mg/dl, but not significant with healthy women 10.4±86.3 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 19.9±163.4 mg/dl .2 - A significant increase (P<0.001)in the serum levels of total cholesterol of preeclamptic women 41.8 ±217.5mg/dl in comparison with anemic women 30.5 ±187.2 mg/dl, but not significantly with healthy women 19.5±195.5 mg/dl , while its level decrease in comparison with gestational diabetic women 41±221.9 mg/dl.3 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of urea of preeclamptic women 13.6 ±35.6 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 4.9±22.2 mg/dl , 6.4± 23.9 mg/dl and 5.7±24 mg/dl respectively.4 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of creatinine of preeclamptic women (0.4 ±1.1 mg/dl) in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.2 ±0.6 mg/dl , 0.2 ± 0.6 mg/dl and 0.2±0.7 mg/dl respectively.5 - A significant increase (P<0.001) in the serum levels of uric acid of preeclamptic women 2.5 ±7.4 mg/dl in comparison with healthy women , anemic women , and gestational diabetic women 0.9 ±3.7mg/dl , 1.2 ± 4.1 mg/dl and 1.1±4.6 mg/dl respectively.6 - There was no significant difference in the levels of GOT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.7 - There was no significant difference in the levels of GPT enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.8 - There was no significant difference in the levels of alkaline phosphates enzyme in the sera of preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.The hematological study showed following features : - 1 - The hemoglobin's level remain within its normal range in preeclamptic women , and gestational diabetic women , as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who showed a significant decrease (P<0.001) the mean was 0.9± 9.2 g/dl. 2 - The hematocrit level remain within its normal range in preeclamptic women, and gestational diabetic women, as in healthy pregnant women in comparison with anemic women who revealed a significant decrease (P<0.001) the mean was 2.8 ± 28.2 % .3 - A significant increase (P<0.001) in the counts of white blood cells in preeclamptic women 3.7 ±12.2 × 109 /L. in comparison with healthy women , anemic women and gestational diabetic women, 1.9 ±9.1×109/ L , 2.1 ± 8.8×109 / L and 2.6 ±8.8×109 / L respectively.4 - There was no significant difference in the platelets counts in preeclamptic women in comparison with healthy women, anemic women, and gestational diabetic women.

دراسة تاثير الغشاء الحيوي المنتج بواسطة Klebsiella pneumonia المعزولة سريريا على بعض جوانب الجهاز المناعي == Study the Effects of Biofilm of Klebsiella pneumoniae Isolated Clinically on Some Immune System Aspects

Author name: سرى مؤيد عباس العبيدي
Supervisor name: علي حسين علوان العامري
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد بكترياKlebsiella pneumoniae من الممرضات الخطرة التي بامكانها ان تسبب اصابات حادة, شملت الدراسة عزل 50 عزلة من البكتريا من مصادر سريرية مختلفة من مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد (مستشفى ابن البلدي, مستشفى الكندي التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب) لغرض دراستها من محاور عدة بعد ان شخصت البكتريا اعتمادا على الطرق التقليدية بالتشخيص من حيث صفاتها الزرعية والكيموحيوية فضلا عن استعمل جهاز vitek2 compact system لتاكيد التشخيص, اظهرت نتائجنا ان عدد ونسبة عزلات بكترياKlebsiella pneumoniae التي تم الحصول عليها وفقا للمصادرالسريرية (الادرار,الدم ,القشع، حروق, مسحة الاذن ، القيح, الجروح والخروج) كانت 22 (44٪)، 11 (22٪)، 4 (8٪),4 (8٪), (3) (6٪)، 3 (6٪)، 2 (4٪) و1 (2٪) على التوالي. المحور الاول ركز على دراسة المقاومة للمضادات المختلفة وتحديد التركيز الادنى للمضادات الحيوية لتثبيط نمو البكتريا, استعملت المضادات الاتية (,amikicin, azteronam cefepime ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin (trimethoprim/ sulfamethoxazole and لوحظ ان المضادات amikicin, impenem meropenem and اكثر فاعلية ضد هذه البكتريا. من جهة اخرى اظهرت العزلات قدرة مختلفة على انتاج الغشاء الحيوي، حيث استخدمت في هذه الدراسة طريقتان لمعرفة قدرة العزلات لتشكيل الغشاء الحيوي، وكالتالي كانت النسبة في طريقة Congo - Red Agar (CRA) 72 % مكونة للغشاء و20 % غير منتجة و8 % غير محددة الانتاجية, في حين طريقة اطباق المعايرة الدقيقة 80 % مكونة و20 % غير قادرة على تكوين الغشاء. العزلات الاقوى لانتاج الغشاء الحيوي اختيرت لمعرفة مقاومتها للمضادين Ciprofloxacin and Meropenem لاجراء مقارنة المضادات بين الخلايا المفردة والخلايا المكونة للغشاء الحيوي, حيث اظهرت النتائج ان المقاومة للمضادات تصبح اكثر بحوالي 10 مرات بالنسبة للخلايا المكونة للغشاء الحيوي مقارنة مع الخلايا المفردة. المحور الثاني تضمن اجراء التجارب المناعية وشملت عملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة وعملية البلعمة, اجريت هذه التجارب على اكفا عزلتين من كل مصدر من ناحية تكوين الغشاء الحيوي والاكثر مقاومة للمضادات الحيوية, من ناحية اخرى عرضت هذه العزلات لمصدر الاشعة فوق البنفسجية بطول موجي 240 نانوميتر ولمدة نصف ساعة وذلك لاجراء مقارنة بين العزلات نفسها قبل وبعد التعرض وتاثير ذلك على استجابة الجهاز المناعي داخل وخارج الجسم الحي. حيث اظهرت التحليلات الاحصائية وجود فروق عند مستوى معنوية (0.001) لعملية الطهي وقياس الفاعلية القاتلة (داخل الجسم الحي) والبلعمة (خارج الجسم الحي) عند المقارنة مابين العزلات قبل وبعد التشعيع ومابين البكتريا في حالة كونها خلايا مفردة وفي حالة تكوينها الغشاء الحيوي, يدلل ذلك ان الجهاز المناعي اكثر فاعلية ضد الخلايا المفردة من الخلايا المكونة للغشاء الحيوي وللعزلات نفسها قبل وبعد التشعيع.اخيرا اجريت دراسة للتحري عن نسبة وجود الجينات التي يعتقد انها مسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي بواساطة جهاز تفاعل البلمرة التسلسلي وكانت النسبة للجين mrkA 92% وللجين mrkD 50% في العزلات الغير مشععة واصبحت النسبة 53% MrkA و23% MrkD للعزلات بعد التشعيع. كخلاصة هذه النتائج تؤيد ان الاستجابة المناعية ضد البكتريا المكونة للاغشية الحيوية هي اقل كفاءة والتي تضمنت في الدراسة عنها للخلايا المفردة ومما يعني نحن بحاجة لاجراء دراسات اخرى تشمل للجوانب المناعية الاخرى المتخصصة في استجابة الجهاز المناعي. | Klebsiella pneumoniae is a dangerous pathogens that can cause severe diseases. This study included the isolation of 50 isolates of bacteria from different clinical sources from different hospitals in Baghdad city (Ibn - albalady hospital, Teaching Al - Kindy hospitals and Teaching laboratory in medical city hospitals through August 2014 to December 2014) for the purpose of examination of several axes after confirmation the diagnosis of bacteria depending on traditional methods of diagnosis in terms of relying on cultural and biochemical characteristics then used vitek2 a compact system. These results showed that the number and percentage of isolate according to the sources (urine, blood, sputum, burns, ear swabs, pus, wounds and stool ) were 22(44%), 11(22%), 4(8%), 4(8%), 3(6%), 3(6%), 2(4%) and 1(2%) respectively. The first axis of this studies focused on the isolates resistance to different antibiotics and determination the minimum inhibitory concentration of antibiotics ( amikicin, azteronam, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, gentamycin, impenem, meropenem, minocycline, piperacillin, piperacillin/tazobactam, ticracillin, tobaromycin, trimethoprim/ sulfamethoxazole) that inhibits the growth of bacteria, the obtained results showed that the antibiotics amikicin, impenem and meropenem more effective against the isolates. On other hand the isolates showed different ability to produce biofilms, to examine this ability two methods were used (Congo - red agar methods and Tissue culture plate methods), the percentage of isolates formed biofilms in method (CRA) 72% produce biofilm and 20% non productive and 8% non - specific in CRA, while in TCP method 80% composed and 20% are not able to form the membrane. Higher production of biofilms isolates were exposed to Ciprofloxacin and Meropenem to make a comparison the antibiotic resistance between planktonic and biofilms producers isolates, the results showed that resistance to antibiotics became 10 times higher than planktonic. The second axis was the immunological experiment which included opsonization, bactericidal activity and phagosytosis. The strongest isolates that were chosen from each sources depended on biofilms formation, and antibiotic resistance, the same isolates were exposured to radiation by UV light wave length 240nm for 30min to compare between the same isolates after and before radiation to determine the immune response. Statistical analysis showed a significant differences P (0.001) to all immunogical experiments opsonization and bactericidal (preformed in vivo for wild and mutant type) activity phagocytosis (preformed in vitro for bacteria in planktonic and biofilm form). The immune system response was more effective against planktonic than biofilms formation bacteria to phagocytosis and between isolates for bactericidal assay and opsonization after and before radiation. Finally the genetic study used serial polymerase chain reaction to determine the proportion of the presence of genes that are believed to be responsible of biofilm production ratio was mrkA 92% and mrkD 50% of wild isolates that became at ratio 53.8% mrkA and 23% mrkD in isolates after radaiation, as a conclusion these findings support that immune response to bacteria vital constituent of membranes differ from the response in the case of single cells and there is need to make other immunological studies include specialized aspects of the immune system response.

تحضير الدقائق النانوية لاوكسيد واوكزالات النحاس ودراسة فعاليتها ضد بكتريا الزوائف الزنجارية والمكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين المعزولة من اصابات الحروق والجروح == Preparation of Copper Oxide and Oxalate Nanoparticles and Their Effects Against P.aeruginosa and Methicillin - Resistant S.aureus from Burn and Wound Infections

Author name: سرمد فاروق هادي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت ست وثمانون عينة سريرية (57 من الجروح و29 من الحروق) من مرضى مصابين بانواع مختلفة من الجروح والحروق من ثلاث مستشفيات في مدينة بغداد وهي : مستشفى اليرموك التعليمي ومستشفى بغداد التعليمي ومستشفى الحروق في مدينة الطب خلال الفترة من ايلول الى كانون الاول 2014. العينات المجموعة فحصت باستخدام ملون كرام ثم زرعت على اوساط اكار الدم واكارالماكونكي بالاضافة الى الاوساط التفريقية الانتقائية (وسط اكار السيدوموناس لعزل Pseudomonas aeruginosa ووسط المانيتول الملحي لعزل (Staphylococcus aureusكما اجريت الاختبارات الكيموحيوية التالية : الكاتاليز والاوكسديز والكواوكيوليز واختبار API 20 NE لغرض تشخيص الـ P.aeruginosa بالاضافة الى ذلك، وبالاعتماد على نظام VITEK2 compact تم اجراء الاختبار التاكيدي لتشخيص P.aeruginosa وS.aureus كشف الزرع البكتيري لـ 86 عينة الماخوذة من الجروح والحروق، ان 75 عينة )%87.2 ( وجد فيها نمو بكتيري هوائي (عينات ايجابية)، بينما العينات السلبية كانت (11) ونسبتها 12.8 %. اظهر زرع عينات الحروق والجروح نسبة عالية %)45.3 ( ,34 عزلة من P.aeruginosa وبالتالي اقترح ان يكون هو المسبب المرضي الاكثر شيوعا، بينما S. aureus كانت نسبتها 28.0 % (21 عزلة). تم زرع جميع عزلات S. aureusعلى وسط agar CHROM حيث سجلت 66.6 %منها كانت مقاومة للمثسيلين اي Methicillin Resist Staphylococcus aureus (MRSA) و33.3 % حساسة للمثسيلين ايMethicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) ، نفس النتائج اعلاه تم الحصول عليها باستعمال طريقة Cefoxitin disc diffusion. خضعت 34عزلة عائدة لبكتيريا P.aeruginosa لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية قيد الدراسة، واظهرت النتائج ان كل العزلات %100.0كانت مقاومة للمضادات Carbenicillin وDoxycycline في حين اظهرت مقاومة عالية نسبيا للمضادات الاتية Amoxicillin /Clavulanic acid % 85.3% Cefipime , , 82.4 Netilmicin 76.5% واخيرا Azetreonam 61.8% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Gentamicin ,35.3% Tobramycin 32.4% واخيرا Ciprofloxacin ,29.4 % بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لمضاد% Imipenem 14.7 . من جهة اخرى, خضعت 21 عزلة عائدة لبكتريا S.aureus لاختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية واظهرت مقاومة عالية نسبيا لكل من Azithromycin ; 76.2% Cefoxitin Clathromycin; 66.7% 62.0% في حين اظهرت مقاومة معتدلة نسبيا لكل من Chloramphenicol ,%47.6 42.9% Ciprofloxacin Doxycycline, 38.0% بينما اظهرت مقاومة منخفضة نسبيا لكل من Gentamycin , 19.0% Tobramycin Vancomycin , 14.3% 9.5% واخيرا Clindamycin . 9.5% تم تحضير دقائق نانوية لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس بنجاح بطريقة كيمياوية مرنة مستندة على التفكك الحراري لمواد اولية من حامض الاوكزاليك. تم تشخيصها باستعمال الطرق التالية : التحليل النمطي من انحراف الاشعة السينية (XRD) ، والمجهر الالكتروني الماسح (SEM) والتحويل الرباعية لامتصاص الاشعة تحت الحمراء(FT - IR) . تم قياس الفعالية المضادة للبكتيريا لاوكسيد النحاس واوكزالات النحاس النانوية المحضرة لكل من P.aeruginosa وMRSA باستعمال طريقة الانتشار في الحفر وطريقة تخفيف المرق. بينت النتائج بان كلا النوعين من الدقائق النانوية لها القدرة على منع نمو عزلات البكتيريا تحت الدراسة. كما تم تحديد التركيز المثبط الادنى MIC والتركيز القاتل الادنى MBC لكلا النوعين من الدقائق النانوية حيث كانت قيم MIC وMBC لاوكسيد النحاس ضد P.aeruginosa في التراكيز 1600 و3200 مايكروغرام/مل على التوالي، في حين كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/ مل على التوالي. اما بالنسبة لـ MRSA فان قيم MIC وMBC للدقائق النانوية لاوكسيد النحاس كانت في التراكيز 800 و1600 مايكروغرام/مل على التوالي، بينما كانت قيم MIC وMBC لاوكزالات النحاس النانوية في التراكيز 200 و400 مايكروغرام/مل على التوالي. | Eighty six clinical samples (57 wounds and 29 burns swabs) were collected from patients with different types of wounds and burns from hospitals in Baghdad City : Al - Yarmuk Teaching Hospital, Baghdad Teaching Hospital and Burn Hospital in Medical City at a period between September to December 2014. The collected samples were examined by Gram stain then cultured on Blood agar and MacConkey agar media, as well as differential selective media including Pseudomonas agar for isolation of Pseudomonas aeruginosa and Mannitol salt agar for isolation of Staphylococcus aureus bacteria. The following biochemical tests were performed : catalase, oxidase, coagulase tests, and API 20 NE in order To diagnose P.aeruginosa. Additional, Confirmatory test was performed by using VITEK2 compact system in order To identify P.aeruginosa and S.aureus. The results of bacterial cultures revealed that out of 86 samples obtained from burns and wounds, 75 samples forming 87.2 % were observed to have an aerobic bacterial growth (positive samples), while negative samples, (11) represented 12.8%. The results of bacterial culture from burn and wound samples revealed high percentage of 45.3% of P.aeruginosa (34 isolates). Hence, it was suggested to be the most common pathogen, while S.aureus represent 28.0% (21 isolates). All isolates of S.aureus were cultured on CHROM agar medium which revealed that 66.6 % of them were Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and 33.3% Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), the same results were obtained by using Cefoxitin Disc Diffusion method. The Antibiotic sensitivity test on thirty four isolates of P.aeruginosa showed that all isolates 100.0% were resistant to Carbenicillin and Doxycycline; relatively high resistance to Amoxicillin/Clavulanic acid, 85.3 %; Cefipime, 82.4 %; Netilmicin, 76.5 % and Azetreonam, 61.8 %. These isolates have relatively moderate resistance to Gentamicin, 35.3%; Tobramycin, 32.4%; Ciprofloxacin, 29.4%, and relatively low resistance to Imipenem, 14.7 %. On the other hand, (21) isolates of S.aureus were tested for antibiotics sensitivity, indicating relatively high resistance to Azithromycin, 76.2%; Cefoxitin, 66.7% and Clathromycin, 62.0%. They also have relatively moderate resistance to Chloramphenicol, 47.6%; Ciprofloxacin, 42.9%, Doxycycline, 38.0% and relatively low resistance to Gentamycin, 19.0%; Tobramycin, 14.3%; Vancomycin, 9.5 % and Clindamycin, 9.5%.Copper oxide and oxalate nanoparticles were prepared successfully via soft chemistry route based on the thermal decomposition of oxalic precursors. They were obtained with a well - controlled morphology and particle size. These nanoparticles were characterized by using : X - ray diffraction (XRD) pattern analysis, Scanning Electron Microscope (SEM) and Fourier Transform Infra - Red spectroscopy (FT - IR). The antibacterial activity of the obtained copper oxide and oxalate nanoparticles against P.aeruginosa and MRSA were estimated by using Well Diffusion and Broth Dilution methods. The results showed that both types of nanoparticles have the ability to inhibit growth of the bacteria under study. The Minimal Inhibitory Concentration (MIC) and Minimal Bactericidal Concentration (MBC) of copper oxide nanoparticles against P.aeruginosa were found to be 1600 and 3200 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively. For MRSA, the MIC and MBC values of copper oxide nanoparticles were at concentrations of 800 and 1600 µg/mL respectively, while for copper oxalate nanoparticles were at concentrations of 200 and 400 µg/mL respectively

التحــري عن سم الباتيولين والفطريات المنتـجــه له في بعض انـواع الفاكــهـه المجـفـفه والسـيـطره عليـه بايولوجيا == Investigation for Patulin toxin producing from some fungi in dried fruits and its biological degradation

Author name: سامي جبار اسماعيل الجدياوي
Supervisor name: شذى علي شفيق | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Fungi
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسه في مختبرات دائرة البحوث الزراعية التابعة لوزارة العلوم والتكنولوجيا للتحري عن تلوث الفواكه المجففه ( المشمش - العنب) المعروضه في اسواق مدينة بغداد ومحافظة كربلاء بسم الباتيولين . اظهرت نتائج التحري عن سم الباتيولين في 21 عينه مختلفه من عينات (المشمش - العنب) المجففه اخذت من مناطق مختلفه من محافظة بغداد اضافة الى عينة من محافظة كربلاء وكانت جميع العينات المفحوصه ملوثه بسم الباتيولين وقد سجلت العينات الماخوذه من مناطق (عنب مجفف)كربلاءK و(مشمش مجفف) الشعلة D وشارع فلسطين C اعلى نسبة تلوث بلغت 30499.5) و2836.3 و1795.3 ) مايكروغرام /غم على الترتيب , في حين سجلت العينات الماخوذه من (مشمش مجفف) الحارثية I ومدينة الصدرS و(عنب مجفف) الحارثية G اقل نسبة تلوث بلغت حوالي (7.8 و11.7 (19.8 مايكروغرام /غم على الترتيب وتباينت درجة تلوث العينات بالفطريات اذ بلغت اعلى نسبة وجود على مستوى الاجناس كانت لجنس Aspergillus spp. حيث كانت نسبة وجوده 100% في عينة(عنب مجفف) الشعب H وبعدها عينات (مشمش مجفف) العطيفية N و(عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف) بغداد الجديدة U و(عنب مجفف) شارع فلسطين A والعلاوي J لنفس الجنس بنسبة (94.12 و94.44 و95.45 و95.56 و96.55)% على الترتيب . وفيما يخص لجنس Penicillium spp. فقد تراوحت نسبة وجوده في العينات من 0.0) - 46.15)% حيث سجلت اقل نسبة وجود في العينه (عنب مجفف) الشعب H 0.0% بينما كانت اعلى نسبة وجود في عينه (مشمش مجفف) كربلاء 46.15%. واظهرت نتائج التحري عن قابلية انتاج سم الباتيولين في 5 عزلات تعود الى A.flavus وA.fumigatus و3 عزلات من فطر P.expansum عزلت من عينات مختلفة هي (عنب مجفف) كربلاء K و(مشمش مجفف)مدينة الصدر S و(عنب مجفف) العطيفية Z حيث ان فطر A.flavus وA.fumigatus لم ينتج سم الباتيولين نهائيا في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة مدينة الصدر والعطيفية انتج سم الباتيولين بعد مرور 5 ايام من تنيمته على الوسط المحفز لانتاج الباتيولين , في حين ان فطر P.expansum المعزول من عينة كربلاء انتج سم الباتيولين بعد مرور 15 يوم وسجلت العزله S اعلى قابليه على الانتاج بلغت 16.5 مايكروغرام/مل في وسط زرعي السائل GCA)) Glugose Czapek,s Apple في حين سجلت العزلة K اوطا قابليه على الانتاج بلغت (13) مايكروغرام / مل تحت نفس الظروف .اما الجانب الثاني من الدراسه فقد اظهرت نتائج ازالة السمية باستخدام المعزز الحيوي العراقي عند تركيز 0.03 ملغرام/مل في الوسط الزرعي السائل GCA الحاوي على الفطر المنتج لسم الباتيولين P.expansum K لمدة 14 يوم الى انخفاض تركيز سم الباتيولين الى 192.18مايكروغرام/مل مقارنة بمعاملة السيطرة ذات تركيز 325.01مايكروغرام/مل من سم الباتيولين , في حين لم يظهراي تركيز لسم الباتيولين عند فحصه بجهاز الـ High Performance liquid Chromatography (HPLC) عند التركيز 0.06ملغرام/مل من المعزز الحيوي العراقي تحت نفس الظروف السابقه. وفيما يخص فعالية استخدام تركيزين من خميرة Saccharomyce boulardii في ازالة سمية الباتيولين في الوسط الزرعي السائل GCA, استخدمت التراكيز( 108 و(1016خميرة/مل وفي كلا التركيزين تم ازالة السمية ولم يظهر اي تركيز لسم الباتيولين . | The results of Mycotoxin Patulin (PAT) detection in 21 samples of dried fruits (grape and apricot) collected from different locations at Baghdad city and one sample from Karbala governorate revealed that all tested samples were contaminated with PAT ,samples K , D and C which collected from Karbala ( dried grape) , Al - shoala (dried apricot) and Palestine Street (dried apricot) showed the highest contamination levels which recorded (30499.5, 2836.3 and 1795.3) µg/ml respectively , while the samples Al - Harthiya (I), Al - Sadr city (S) and Al - Harthiya (G) showed the lowest contamination levels which recorded (7.8 , 11.7 and 19.8) µg/ml respectively. The results also showed that Aspergillus spp. recorded the high percentage of occurrence 100% in sample H collected from Al - Shaab and in samples (N , K , U , A , J) collected from Al - Utaifiyya , Karbala , Baghdad al - jadeeda , Palestine Street and Al - Alawi , the percentage of occurrence is (94.12 , 94.44 , 95.45 , 95.56 , 96.55)% respectively. Also the percentage of Penicillium spp. occurrence percentage rated from 0.0 to 46.15% , samples dried grape which collected from Al - Shaab (H) recorded the lowest percentage of occurrence 0.0% , while sample apricot from Karbala (M) recorded the highest percentage 46.15% . The results of toxigenic ability of five fungal isolates include A.flavus and A.fumigatus and three isolates of P.expansum from three different samples include (K) Karbala (dried grape) , dried apricot of Al - Sadr city (S) and (Z) grape in Al - Utaifiyya . Regarding A.flavus and A.fumigatus were not produced PAT, while P.expansum isolate from S and Z recorded the ability to produce PAT after five days , while P.expansum isolated from K produced PAT after 15 days. The highest ability to produce PAT recorded in S 16.5 µg/ml, and the lowest ability in K 13 µg/ml. The second aspect of the present study was showed the ability of Iraqi probiotic at concentration 0.03 mg/ml to reduce PAT concentration in the culture medium Glucose - Czapeks Apple broth (GCA) containing of P.expansum K for 14 days which recorded 192.18 µg/ml comparing to control treatment 325.01 µg/ml while at concentration 0.06 mg/ml of Iraqi probiotic destroyed of PAT and there was no PAT appeared when examined in High Performance Liquid Chromatography (HPLC). However the results of test the ability of two concentrations of Saccharomyces boulardii (108 and 1016) yeast/ml in PAT detoxification from broth culture of (GCA) showed completely detoxification of Patulin

التاثير التداخلي للرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير Hordeum vulgare L. في وسط رمل == The Interference of Lead Mineral and Nitrogen on Barley Plant (Hordeum vulgare L.) Cultivated on Sandy Soil Culture

Author name: سارة يحيى المندلاوي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في الموسم الزراعي 2009 - 2010 بهدف التعرف على تاثير الرصاص والتسميد النتروجيني في نمو نبات الشعير في مرحلتي الانبات والبادرات كل على حدة فضلا عن التاثير التداخلي لهما.صممت تجارب الدراسة الحالية بتحضير اربعة تراكيز مختلفة من الرصاص (200, 150, 100, 50) جزء من المليون (ج.م.م.) اضافة لمعاملة المقارنة, فضلا عن المعاملة بثلاثة مستويات من السماد النتروجيني (اليوريا) (90, 60, 30) كغم/دونم اضافة لمعاملة المقارنة, والتحري عن تاثير كل من هذه التراكيز والمستويات بتجربة عاملية على عدد من الصفات المظهرية والفسلجية لنبات الشعير Hordeum vulgare L. في مرحلتي الانبات والبادرات فضلا عن التاثير التداخلي لكل من تراكيز الرصاص المحضرة مع مستويات السماد النتروجيني المذكورة سابقا. تم اجراء تجربتين في الدراسة الحالية, التجربة الاولى جرت في مختبر الدراسات العليا في قسم علوم الحياة بكلية العلوم - الجامعة المستنصرية باستخدام الاطباق الزجاجية (زراعة مائية) للفترة من 8 - 16/ تشرين الثاني/,2009 اما التجربة الثانية فقد نفذت في البيت الزجاجي التابع للقسم المذكور نفسه من خلال زراعة بذور نبات الشعير في اصص بلاستيكية حاوية على تربة رملية لمدة خمسة واربعون يوما للفترة من 22/ تشرين الثاني ولغاية 7/ كانون الثاني/2010.اظهرت نتائج الزراعة المائية (مرحلة الانبات) عدم تاثر الصفات المدروسة بالمعاملة بتراكيز الرصاص المحضرة, بينما سجلت المعاملة بالسماد النتروجيني وجود انخفاض في معدلات كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة الانبات بغض النظر عن المعنوية من عدمها, فقد كانت نسب الانخفاض في معدلات الصفات المدروسة معنوية على كل من النسبة المئوية للانبات 35.29%, ومعدل الانبات 43.33%, ومؤشر تحفيز الانبات 37.09% وغير معنوية على قيم سرعة الانبات 34.23%. كما اظهرت نتائج المعاملة بتراكيز الرصاص في الزراعة الرملية (مرحلة البادرات) وجود تاثير معنوي سلبي في قيم كل من الصفات النباتية المدروسة في مرحلة البادرات (عدا قيم محتوى الرصاص داخل انسجة النبات حيث كان التاثير معنوي ايجابي) فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي على كل من تركيز الكلوروفيل b والكلوروفيل الكلي.بينما اظهرت معاملة النبات بالسماد النتروجيني وبغض النظر عن تراكيز الرصاص وجود تاثير معنوي سلبي في كل الصفات المدروسة في مرحلة الانبات فضلا عن تاثير سلبي غير معنوي في محتوى النبات لصبغات الكلوروفيل a وb والكلوروفيل الكلي. في حين سجلت زيادة مستويات السماد النتروجيني ارتفاعا معنويا في معدلات محتوى الرصاص داخل النبات وبنسبة بلغت 64.82%.اظهرت نتائج التداخل بين تاثير معاملتي الرصاص والتسميد النتروجيني وجود فروق معنوية في النسبة المئوية للانبات بالنسبة لمرحلة الانبات (الزراعة المائية), فيما سجلت فروق معنوية في جميع الصفات المدروسة في مرحلة البادرات (الزراعة الرملية) عدا صفة الوزن الطري للجذور ومحتوى الصبغات الكلوروفيلية

استخلاص وتنقية جزئية للكتينات بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات مرضية

Author name: زينب نوري حامد محمد العاني
Supervisor name: عبد الواحد باقر الشيباني | خليل مصطفى خماس
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم جمع (50) مسحة تعود لمرضى ومراجعين لثلاث مستشفيات عامة في بغداد وذلك للتحري عن عزلات الـ Pseudomonas aeruginosa اخذت من حالات مرضية متعددة شملت الحروق والجروح والتهابات الاذن. وبعد ان اجريت على العزلات التي تم الحصول عليها الاختبارات الكيموحيوية اللازمة لتشخيصها ومنها القابلية على تحليل الدم على وسط الـ Blood agar ، امكن انتقاء (25) عزلة اظهرت قدرتها على انتاج انزيم الـ hemolysinase وتحليل وسط الدم بشكل كامل. اخضعت العزلات بعدها لاختبار القابلية على النمو على وسط السترمايد الانتقائي والقدرة على النمو في 42 م ، اذ انتخبت (18) عزلة منها. ثم تبع ذلك اختبار قابلية العزلات على انتاج اللكتينات من خلال عملية التلازن مع كريات الدم الحمر للانسان بفصائلها (O, B, A) ودم بعض الحيوانات _الماعز ، الدجاج ، الفئران والارانب) حيث تم انتقاء العزلات التي اعطت اعلى عيارية. زرعت العزلات على وسطي الانتاج (GE) Grelets mediumوالمرق المغذي (Nutrient broth) للتحري عن قابليتها على انتاج اللكتينات، ودلت النتائج على انتاجها لنوعين من اللكتينات هما PA - I والـ PA - II ، اذ يتميز الاول بتخصصه تجاه سكر الكالكتوز، فيما يتخصص الثاني بالمانوز. بعد انتهاء فترة التنمية تم استخلاص اللكتينات من اوساط الانتاج لتجري عليها عملية التنقية باستخدام كبريتات الامونيوم ثم التكسير بالموجات فوق الصوتية ، ليتم بعدها انزال الراشح باستخدام طريقة الفصل بكرموتوغرافي عمود الفصل يمكن تلخيص اهم النتائج التي تم الحصول عليها بالاتي : 1 - اظهرت مستخلصات اللكتينات تباينا في الفاعلية التلازنية تجاه كريات الدم الحمر للانسان والحيوان سواء اكانت معاملة بانزيم التربسين ام لم تعامل به، كما تباينت العزلات في انتاجها لانزيم الهيمولايسين وصبغة البايوسين الزرقاء. 2 - تم تحديد درجة الحرارة المثلى لنمو عزلات بكتريا الـ aeruginosa P. وانتاجها للكتينات ب37م عندما بلغ تركيز اللكتين PA - I 95 مايكروغرام / سم3 ، في حين كان تركيزه عند الحرارة 35 م مايكروغرام/ سم3. اما اللكتين PA - II فبلغ تركيزه 40 مايكروغرام / سم3 عند الحرارة 35 م . 3 - وكان لاختلاف الاس الهيدروجيني دور في التاثير على تركيز ونقاوة اللكيتنات المستخلصة. اذ لم يتجاوز تركيز اللكتين PA - II المستخلص من العزلة (Z1) الـ30 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 5.0 في حين بلغ التركيز 105 مايكروغرام / سم3 لنفس اللكتين عند الاس الهيدروجيني الامثل (7.0) . اما اللكتينPA - I فقد انخفض تركيزه من 85 مايكروغرام/ سم3 في الاس الهيدروجيني الامثل ليصل الى35 مايكروغرام / سم3 عند الاس الهيدروجيني 8.0. 4 - تمت تنقية اللكتينات المستخلصة بطريقة الترحيل الكهربائي في هلام متعدد الاكريلامايد بظروف ماسخة ، من خلال تمرير اربعة نماذج مستخلصة (اضافة الى نموذج البروتينات القياسي). 5 - لدى اختبار حساسية العزلات المعزولة من التهابات الاذن لمضادات الحياة ، اظهرت تباين في مقاومتها للمضادات، وكانت جميع العزلات مقاومة لكل من الامبسلين والاموكسيسيلين، فيما كانت حساسة للمضادات توبرومايسين والجنتامايسين والارثرومايسين. 6 - لاختبار قابلية اللكتينات المستخلصة على الارتباط بالسكريات الموجودة في حليب الام وحليب البقر والحليب المصنع، دلت النتائج بانه اضافة عالق الدم صنف O الى اللكتين مع سكريات الحليب تاركا كريات الدم الحمر حرة. 7 - اثبتت تجربة استخدام المرهم الطبي المضافة له بعض السكريات البسيطة كفاءتها، بعد ان تبين قدرة هذه السكريات على تثبيط تلازن اللكتينات مع كريات الدم الحمر للانسان خارج الجسم.8 - بعد ان حقنت فئران التجارب باللكتينات (PAI,PA - II,PAII) المستخلصة من العزلات (Z4,Z1,Z1) ، كان المحتوى الكاربوهيدراتي فيها (95،48، 30) مايكروغرام/سم3 وتركيز البروتينات (1350،860، 590) مايكروغرام / سم3 على التوالي. كما ولوحظ ظهور حالات غريبة على الفئران الثلاثة في المجموعة الاولى والتي حقنت باللكتينات اعلاه وتركت بدون علاج لمدة ساعة، ما بعد قتلها فقد حدث تحلل دم كامل في الفار الاول ومتوسط في الثاني، في حين لم يحدث اي تحلل للدم في الفار الثالث. وبعد استخدام العلاج في فئران المجموعة الثانية، لم يحدث تحلل دم للفار الاول والثالث وكان التحلل ضعيفا في الثاني. اما فئران المجموعة الثالثة والتي حقنت وتركت لمدة ساعتين بدون علاج، فقد نفق الفار الاول وحدث تحلل ضعيف في دم الفار الثاني وتحلل كامل في الفار الثالث. لم يسبب اعطاء العلاج لفئران المجموعة الرابعة وتركهم لمدة ساعتين اي تحلل لدم الفار الاول والثالث فيما كان ضعيفا في الثاني. اما افراد المجموعة الثانية فقدتركت بعد الحقن ثلاث ساعات بدون علاج، وكان تحلل الدم كاملا في الفار الاول ومتوسطا في الثاني والثالث، في حين لم يحدث تحلل للدم بعد اخذ العلاج. | Fifty samples were collected from several pathogenic cases including burns, wounds and ears belonging to patients and individuals referred to three general hospitals in Baghdad. Samples were subjected to the microbiological tests for detecting Pseudomonas aeruginosa, isolales. Among those tests was the ability of blood analysis on blood agar base medium. A total of (25) isolates were selected which showed the ability to produce the hemololysins. Some suspected isolates were also subjected to grow on ctramide agar, and with stand growth at 42c. Out of (25) only (18) isolate selected due to their ability to grow at 42c. The (18) selected isolates were tested for their ability to produce lectins via the heamagglutination with the human red blood cell groups (A, B, O). Isolates showed higher titers were chosen, when ability to produce lectins, two types (PA - I and PA - II) lectins were detected. Lectin PA - ICharacterized by it’s specify toward galactose, while PA - II was specific to mannose. After lectins were extracted from the production media, they were purfeyed by using ammonium sulphate and fractioned by the ultrasonic waves, followed by descending the filtrate by separation, through the chromatographic column.Results obtained could be described briefly as : 1. Obtained lectins showed were differed in their haemagglutination activity toweras human and animals red blood cells whether they were treated by the trypsin enzyme or not. However, isolates were not similar in producing the hemolysin enzyme and pyocine pigment.2. Optimum temperature for growth of P. aeruginosa isolate, and lectins production was 37c when concentration of lectin PA - I reached 95.0 µg/ml, while at 35c was 35 µg/ml - Regarding PA - II reached 40 µg/ml at 35c.3. Variation of pH played a significant effect on the. concentration and purity of the extracted lectins. At pH5.0 lectin PA - II concentration did in exceed 30, µg/ml while at optimum pH (7.0) it reached 105 µg/ml in the optimum pH to only 35 µg/ml at pH 8.0.4. Extracted lectins purified by gel electrophoresis when four extract in addition to the standard proteins sample were passed through it. The molecular weight of the PA - I was lectin from Z1 was 14.000 Dalton, while PA_II was 12.000 Dalton from the same sample.5. When P. aeruginosa isolates of ear infection were tested for their susceptibility to some antibiotics, they differed in their pattern of resistance. However, all isolates were resistant to Ampicilin and Amoxocilin, but sensitive to Tobramycin, Erythromycin and Gentamycin.6. In order to test the ability of the extracted lectin against some sugar which present in the human milk, raw milk and powder milk, red blood cell group were added to the lectin with the milk samples. Results showed that sugars inhibited haemagglutination with the red blood cells. 7. Experiments and application of the prepared ointment containing simple sugar proved its efficiency when sugar were able to prevent lectin agglutination with human red blood cells (invitro).8. After injecting mouse with the lectins (PAI, PAII, PAII) at (Z1, Z1, Z4) isolates, concentration of CHOs were (30, 48, 95) µg/ml and protein were (135, 860, 590) µg/ml respectively. Abnormal cases were also appeared on the three mice at the first group which was injected by the lectin when they were left without treatment for one hour, after they were killed, the first one was showed complete analysis at red blood cells, while it was not complete in the second and no analysis was showed in the third one, after treatment, no analysis of red blood cells was showed in the first and the third one, but it was not complete in the second one.The third group which injected by the same lectins when they were left without treatment for two hours the first mouse was dead, and the hemolysis was not completed in the second one, but completely in the third one, after treatment no hemolysis was showed in the first and the third one, but weakly in the second one. The fourth group, which injected by the lectins when they were left without treatment for three hours, the first mouse, was showed complete hemolysis, but not complete in the second and third one, after treatment, no hemolysis of red blood cells was showed.

تقييم وبائي ومختبري لمرضى التهاب الكبد الفايروسي نمط C (HCV) لحالات الثلاسيميا == Evaluation of HCV infection in Thalassemic patients Epidemiological, Virological, Immunological, Clinical and Biochemical

Author name: زينب ناصر حسين الطرفي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يتميز التهاب الكبد الفايروسي بقابليته الوبائية على اصابة العديد من الافراد ويطلق مصطلح التهاب الكبد الفايروسي على عدد من الفايروسات المصيبة للكبد التي تم تسميتها حسب اكتشافها الى A,B,C,D,E,F,G ويعتبر التهاب الكبد الفايروسي C وBمشكلة كبيرة وذلك لعدم امكانية تشخيص الاصابة الفايروسية منذ البداية لكون اغلب الاصابات تكون بدون اعراض مرضية او باعراض خفيفة.المواد وطرائق العمل : شملت الدراسة الوبائية 1159عينة لمرضى الثلاسيميا الذين يراجعون مركز الثلاسيميا في الرصافة، والمجموعة الثانية 140915 عينة اخذت لمتبرعي الدم في المركز الوطني لنقل الدم اعتمدت من السجلات. وتم اجراء الفحوص الفايروسية (HCV,HBV,HIV) لهذه المجاميع، واجريت الفحوص الفايروسية التشخيصية الاخرى على مرضى الثلاسيميا، فضلا عن اجراء الفحوص المناعية، فحوص الدم، والفحوص الكيميوحيوية.النتائج : افرزت نتائج مرضى الثلاسيميا عن نسبة 24.76% (70عدد الذكور و110 عدد الاناث) موجبة لفحص anti - HCV، ونسبة 0.77% (7 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لفحص HBsAg، وبنسبة 0.34% (2 من الذكور و2 من الاناث) موجبة لكلا الفحصين (علما ان جميع المرضى بدون علاج الانترفيرون) مقارنة مع متبرعي الدم بنسبة 0.4% لـanti - HCV و0.97% لـHBsAg،علما ان جميع نتائج فحص HIV كانت سالبة لمرضى الثلاسيميا ومتبرعي الدم، هذا بالنسبة للدراسة الوبائية. اظهرت الدراسة التحليلية المختبرية ان نسبة الاصابة بفايروس التهاب الكبد HCV اعلى في الذكور بنسبة 27.48% مقارنة مع الاناث بنسبة 21.35% بوجود فرق ذو دلالة احصائية معنوية لارتفاع نسبة الذكور عن الاناث، فيما لوحظ ان النسبة هي ذاتها 0.3% لذكور واناث مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ولوحظ ارتفاع الاصابة مع ازدياد العمر فاعلى نسبة للاصابة بـ HCV 41.5% هي للاعمار ما بين 21 - 30سنة وللمصابين بـHBV بنسبة 1.7% للاعمار ما بين 1 - 11سنة. ولوحظ ارتفاع نسبة الاصابة بـ HCV بين الاكراد بنسبة 85.7%. اما بالنسبة الى HBV فقد لوحظ ان النسبة هي 5.7% بين الاكراد، اما في العرق العربي فقد لوحظت نسبة HCV 22.83%، وHBV 0.63% وفي الكلدان لوحظ ان نسبة الاصابة بـHCV 20%. اجري فحصPCR على بعض مرضى الثلاسيميا واظهرت الدراسة ان 50% من النتائج موجبة، وباجراء الكشف عن النوع الجيني لفايروس HCV بطريقة RFLP تم الحصول على انماط جينية مختلفة تضمنت 3b,4,6,3a,2b,1b واجريت دراسة مناعية على المرضى الموجبين لفحص PCR، وكشفت النتائج ان 18% من اولئك المرضى قد ابدوا تفاعلات موجبة لاضداد النواة واضداد العضلات الملساء في حين لم يظهر اي نتيجة موجبة لاضداد الدنا، اضداد الميتوكوندريا واضداد الشحوم المفسفرة. اجري الترحيل الكهربائي لبروتينات المصل وتبين وجود ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لبروتين الكلوبيولين مقارنة بالالبومين، بارتفاع معدل بروتين كاما وانخفاض معدل بروتين الالبومين لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص HCV - PCR.اجري على بعض مرضى الثلاسيميا فحوصات عمل الكبد ولوحظ ارتفاع معدل TSB في مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فضلا عن ارتفاع معدل ALTفي المرضى الموجبين لفحص HBsAg عن المرضى الموجبين لفحص anti - HCV، كذلك لوحظ ارتفاع معدل AST لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg فيما لوحظ ان معدل انزيم الفوسفاتيز القاعدي هو ضمن الحد الطبيعي لمرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg، وتم اختيار مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين بـ HCV,HBV واجريت عليهم عدد من الفحوص الكيميوحيوية لمستوى (البروتين الكلي، الالبومين، الكلوبيولين، اليوريا، الكرياتنين، حامض اليورك، البوتاسيوم، الفسفور غير العضوي، الكالسيوم، النحاس، الكلسترول والسكر) في الدم، ولم يلاحظ اي دلالة احصائية معنوية لهذه الاختبارات، عدا اختبار الكولسترول حيث لوحظ انخفاض معدل الكولسترول في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV الى 112.7mmol/L، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـHBV بمعدل mmol\L93.69 كما لوحظ وجود انخفاض ذو دلالة احصائية معنوية بين مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV,HBV مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV، كذلك لوحظ وجود دلالة احصائية معنوية لانخفاض معدل حامض اليورك لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV,HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا غير المصابين، ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى النحاس في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين مقارنة مع المصابين بـHBV. ووجد ارتفاع ذو دلالة احصائية معنوية لمستوى السكر في الدم لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة بمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV وتبين وجود فرق معنوي لارتفاع معدل الفسفور غير العضوي لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV وغير المصابين بـHCV,HBV مقارنة بالمصابين بـHBV. اجريت الفحوص المناعية على مجموعة من مرضى الثلاسيميا الموجبين لفحص anti - HCV,HBsAg وغير المصابين وتضمنت الدراسة المناعية الكشف عن مستويات الكلوبيولينات المناعية في الدم ومكونات المتممة C3,C4فضلا عن الكشف عن اضداد الذات، ولوحظ ارتفاع نسب اضداد الذات لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غيرهم من مجاميعمرضى الثلاسيميا وتبين ارتفاع نسبة اضداد المايتوكوندريا (43.4%)، اضداد الهستون (40.9%)، اضداد العضلات الملساء (17%)، الاضداد النووية (17%)،اضداد شحم القلب (11.6%)، اضداد الشحوم المفسفرة (17%)، اضداد الدنا المزدوج الشريط (31.8%)، اضداد بروتينات النواة A - Jo - 1 (2.27%)، SS - B (4.5%)، A - Scl (3.4%) في حين ان اضداد الذات من نوع A - RNP/Sm,SS - A,A - Sm,AC - B لم يلاحظ اي نتيجة موجبة لها. اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد تم الحصول على نسبة (15.38%) لكل من اضداد الهستون، اضداد شحم القلب، اضداد الشحوم المفسفرة فيما كانت نسبة اضداد الميتوكوندريا (38.46%). كما لوحظ ارتفاع نسبة المصابين بالعامل الرثوي والبروتين الفعال في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بنسبة 46%، 68% على التوالي مقارنة مع غير المصابين بـHCV,HBV وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV بنسبة 38.4% لكل من RF,CRP. وتبين وجود فرق معنوي ذو دلالة احصائية لارتفاع الاصابة باضداد الذات ضد الهستون في الاناث مقارنة مع الذكور وارتفاع الذكور عن الاناث في اضداد المايتوكوندريا في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV. كذلك لوحظ ارتفاع بعض الكلوبيولينات المناعية في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV بمستوى 1789 mg/dl للـIgG، ولوحظ مستوى 305.8 mg/dl للـ IgA فيما كان المستوى 203.3 mg/dl للـIgM، وفي مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV لوحظ ارتفاع مستوى IgG الى mg/dl1823.6، اما مستوى IgM وIgA فقد كان بمستوى 229.6 mg/dl، 278.8mg/dl بالتعاقب، وفي بروتينات المتممة C3,C4 لوحظ انخفاض مستوى C3 الى 82.6mg/dl فيما كان مستوى C4 23.7mg/dl وهو ضمن الحد الطبيعي الادنى في مرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV، اما في مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV فقد لوحظ ان مستوى بروتينات المتممة C3 اقل من المستوى الطبيعي 78.1 mg/dl فيما كان المستوى 20.3mg/dl الى C4.في اختبارات امراض الدم تم الحصول على دلالة احصائية معنوية لارتفاع معدل PT لمرضى الثلاسيميا المصابين بـHCV مقارنة مع غير المصابين ومرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV، كما لوحظ انخفاض معدل تعداد كريات الدم العدلة لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. ولوحظ انخفاض معدل تعداد الصفائح الدموية لمرضى الثلاسيميا المصابين بـ HBV مقارنة مع مرضى الثلاسيميا المصابين بـ HCV ومرضى الثلاسيميا غير المصابين. | Viral Hepatitis characterized by its epidemic ability to infect many people. Viral hepatitis called to many hepatic viral infection that had been classified into A,B,C,D,E,F,G. Hepatitis C infection considered a big problem related to the inability to diagnose the viral infection from the beginning because of mild or no symptoms. Material & Methods : - The epidemic study contains two groups, first group 1159 sample of thalassemic patients in Al - Rusafa Center For Thalassemic Patients. Second group 140915 samples taken from blood donors in the national blood bank from the records.Viral tests had been done for these groups (HCV,HBV,HIV). Diagnostic tests done on thalassemic patients like immunological, hematological, biochemical tests.Results : - For the epidemic study the result shows a 24.76% for thalassemic patients infected with HCV , 0.77% for thalassemic patients infected with HBV, & 0.34% for thalassemic patients infected with both HCV,HBV. 74.89% for non infected thalassemic patients compared with blood donors of 0.4% for HCV infection, and 0.97% for HBV infection.Studies for investigating laboratory tests done on thalassemic patients after confirming HCV,HBV infections through doing diagnostic viral tests.HCV Viral results shows higher percentage of male to female by 27.48% for male, 21.35% for female respectively and it was seen that the same rate of 0.3% for male and female infected with HBV. Higher infection rate with age increasing of 41.5% for age group 21 - 30 years of HCV thalassemic patients, and 1.7% for age group 1 - 11 years for HBV thalassemic patients. Higher HCV infection rate noticed for Kurdish people 85.7% , Christians 20%, and in Al - Sabeaa 40%.while the percentage of HBV in Kurdish people 5.7%, and no one infected with HBV infection in Christian and Al - Sabeaa people. For Arabic patients the percentage of HCV infection is 22.83% and 0.63% for HBV infection.HCV - PCR Thalassemic patient results show that 50% of results are positive and 50% are negative (11 out of 22 patients), doing genotyping of HCV by RFLP test shows different subtypes of HCV (3b, 2b, 1b, 3a, 4, 6).Immunological study done on PCR positive patients’ shows antibodies percentage of 18% to ASMA, ANA and 0% for each of AMA, ADNA, APL. Electroforeces done for protein of these patients show significant statistical increasing values of protein globulin in comparison to albumin decreasing.For liver function tests, applied on thalassemic patients it had been noticed that there is a significant statistical increasing values in the thalassemic patients infected with HCV as compared to other thalassemic patients not infected with HCV. Increasing the level of ALT in HBV patients compression with HCV patients, increasing the level of AST of HBV, HCV thalassemic patients where the level of alkaline phosphates in the upper limit of normal value of HCV, HBV thalassemic patients.No significant statistical values where noticed for the biochemical tests applied on some thalassemic patients infected with HCV, HBV infection except cholesterol where it had been noticed a decrease of level 112.7 mmol/L in thalassemic patients infected with HCV. 93.69 mmol/L in HBV infection patients, a significant statistical decrease value between HBV , HCV thalassemic patients in comparison with non infected patients.There is a decrease level of uric acid for the thalassemic patients infected with HCV compared with non infected patients, significant increase of copper level in the blood of HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients and not infected thalassemic patients.Significant statistical value increment for the random blood sugar in HCV thalassemic patients compared with HBV infected thalassemic patients.Regarding immunological study, it had been noticed that there is an increasing in autoantibody with significant statistical value for thalassemic patients infected with HCV compared with other thalassemic groups. It had been seen that there is an increasing in the mitochondrial antibodies (AMA - M2) 43.4%, antihiston antibodies (AHA)40.9%, antismooth muscle antibodies (ASMA)17%, antinuclear antibodies (ANA)17%, anticardiolipin antibody antibodies (ACL)11.6%, antiphosphotidel serin antibodies (APL - S)17%, antidouble stranded DNA antibodies (A - ds - DNA) 31.8%, other antinuclear proteins like A - Jo1 2.27%, SS - B 4.5%, A - ScL 3.4%, where the other auto antibodies A - RNP/Sn, SS - A, A - Sm, anticentromer B antibodies (A - C - B) show zero percent for each one of them while in the HBV thalassemic patients a 15.38% was obtained for each APL - S , ACL & AHA.. A 38.46% for AMA - M2.There is an increase in rheumatoid factor (RF), CRP in thalassemic patients infected with HCV compared with non infected thalassemic patients with a ratio of 46%, 68% respectively. In HBV thalassemic patients 38.4% for each RF and CRP. Significant statistical difference for increasing incidence with auto antibodies in the females compared with males of autoantibodies type AHA, AMA - M2 in thalassemic patients infected with HCV noticed.We noticed an increasing in the immunoglobulines IgG 1789 mg/dl, 305.8mg/dl for IgA in thalassemic patients infected with HCV while IgM in the upper normal range 302.3 mg/dl, complimentary portions C3, C4 shows a decrease level in C3 82.6 mg/dl, and the level of C4 is 23.4mg/dl, which is regard as the lower normal limit. While in the HBV thalassemic patients we obtain a level 1515.3mg/dl for IgG, 204.8 mg/dl for IgM and for IgA 233.3mg/dl.In the hematological tests of thalassemic patients infected with HCV shows significant increment in the level of PT test was obtained as compared with other groups of thalassemic patients. Percentage decrement in neutrophil of WBC cells in HCV thalassemic patients as compared with HBV and non infected thalassemic patients. There is a decrement in platelets count in HBV thalassemic patients compared with HCV and non infected thalassemic patients.

دراسة التغيرات المرضية والكيميائية الحياتية والصورة الدموية لتاثير مبيد Thiamethoxam في الفئران == The study of Pathological changes ,Biochemical and Hematological picture for effect of “Thiamethoxam in mice

Author name: سحر عبد الهادي محمد جواد الشرقي
Supervisor name: بدر محمد عباس العزاوي | ليلـــى جبار محمد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية تقييم تاثيرات المبيد الحشري الـ Thiamethoxam في الفئران البيض ، وقـــد اعتمد فــي تحديد قـــيم الجرع علـــى قيمة الحد المسموح تناوله يوميا ( ADI ) Acceptable daily intake والذي بلغ 0.004 ملغم/ كغم من وزن الجسم . تمت دراسة التاثيرات الحادة والمزمنة بعد 28,14 يوم من التجريع بالجرع 0.12,0.08,0.04 ملغم/ كغم من وزن الجسم اضافة الى جرعة ADI من خلال المعايير الاتية : التغيرات السريرية والتغيرات في اوزان الاعضاء الكبد والكلية والطحال وعد الكريات الحمر Erythrocytes count وقياس كمية خضاب الدم Haemoglobin estimation والنسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص Percentage of Packed Cell Volume ( PCV ) والعد التفريقي للكريات البيض Differential Leukocytic count وقياس مستوى انزيمات الكبد ALP , GPT , GOT ) ) وقياس مستوى الكرياتنيين Creatinine واليوريا Urea في مصل الدم للكلية ودراسة نسيجية لكل من الكبد والكلية والطحال . وقد ادت هذه الدراسة الى النتائج الاتية : لوحظ على الحيوانات قلة في الحركة والنشاط وتناول العليقة وقلة في كمية الادرار ازدادت بزيادة الجرعة وفترة التجريع . اما معدل وزن الكبد فقد سجل اعلى ارتفاع عند P<0.05 للجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 14 يوم بعد التجريع ، وقد بلغ معدل وزن الكبد 0.16±1.72 غم ، اما لفترة 28 يوم بعد التجريع فقد سجل معدل وزن الكبد انخفاضا الاانه لم يكن معنويا عند مقارنته مع معدل وزن الكبد لحيوانات السيطرة .بينما اظهر معدل اوزان الكلى ارتفاعا لـــــم يكــــن معنويا من الناحية الاحصائية لفترة 14 يوم بعد التجريع عند مقارنته مع معدل اوزان الكلى لحيوانات السيطرة ، اما فترة 28 يوم بعد التجريع فقد اظهرت النتائج انخفاضا معنويا عند P<0.05 اذ كان اقل انخفاض عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم اذ بلغ 0.01±0.18 غم ، بينما كان معدل وزن الطحال منخفضا خلال فترتي التجريع وكان اقل انخفاض عند P<0.005 لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم الذي بلغ معدل وزن الطحال له 0.01±0.06 غم . ان التعرض الحاد والمزمن للمبيد للفترتين 28,14 يوم بعد التجريع سبب ارتفاع في معدل عدد الكريات الحمر ومعدل مستوى خضاب الدم ومعدل النسبة المئوية لحجم الخلايا المرصوص، ولوحظ ان مبيد الـ Thiamethoxam عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم قد سجل اعلى ارتفاعا معنويا P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع لتلك القياسات الدموية حيث بلغت معدلاتها ( 0.17±9.84 كرية / ملم3 ، 0.54±50.60 % ،0.87±16.58 غم / 100 مل ) على التوالي . اما معدل العد التفريقي للكريات البيض فقد سجل اعلى ارتفاع معنوي P<0.005 عند التعرض المزمن لفترة 28 يوم بعد التجريع عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لمعدل الخلايا اللمفاوية حيث بلغ 0.85±80.80 % ، بينما سجل انخفاضا معنويا لمعدل الخلايا العدلة وقد وصل اقل انخفاض P<0.005 عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم مــــن وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع اذ بلغ 0.98±10.00 % ، اما معدل عدد الخلايا وحيدة النواة فقد سجل انخفاضا معنويا P<0.05 وكان اقل معدل عند الجرعة 0.12 ملغم/ كغم من وزن الجسم لفترة 28 يوم بعد التجريع الذي بلغ 0.44±5.20 % . كانت التغيرات المرضية النسيجية قد تدرجت شدتها حسب الجرعة والفترة الزمنية ، حيث لوحظ تكفيف خلوي لمفي حول الاوعية الدموية واحتقان وتنخر الخلايا الكبدية مع وجود خلايا تعاني من الموت المبرمج فضلا عن وجود الاورام الحبيبية ، وقد لوحظ اعادة بناء الخلايا الكبدية التي تميزت بفرط تنسج تلك الخلايا وانشطار انويتها بشكل واضح مما يشير الى دور هذا المبيد في احداث الاصابة بالسرطان Cancer ، كذلك لوحظت تغيرات تنكسية في الخلايا المبطنة للنبيبات الكلوية فضلا عن تشتت اللب الابيض في الطحال في المراحل الاولى من اعطاء الجرع تحولت الى فرط تنسج اللب الابيض في مراحل لاحقة . ان النتائج السابقة الذكر ممكن ان تعطي انطباعا وافيا حول التاثير السمي للمبيد الحشري الـThiamethoxam من خلال تاثيراته الواضحة في انسجة الاعضاء وبخاصة نسيج الكبد اضافة الى التغيرات الدموية. | The present study investigates the assessments of the effects of insecticide “ Thiamethoxam “ in white mice the doses given were according to the allowable limits of Acceptable Daily Intake ( ADI ) , which amount to 0.004 mg/ kg b. w. . The acute and chronic effects have been examined after 14 , 28 days of ( 0.04 , 0.08 , 0.12 ) mg/ kg b. w. in addition to the doses of ADI through the following criteria : Behavioral changes , the changes on the weight of the liver , kidney , and spleen , erythrocytes count , haemoglobin estimation , percentages of packed cell volume ( PCV ) , differential leukocytic count , estimation of the level of liver enzymes ( GOT , GPT , ALP ) , estimation of the level of creatinine and urea in blood serum of kidney , and histological examination of the liver , kidney , and spleen .The study reached the following results : It has been observed that there was a reduction in the animals’ movement and activity and having a pellete , the reduction in the amount of urine increased by the increase of the dose and dose duration . The average of liver weight has shown the highest increase at P< 0.05 per dose was at 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days of the dosage time , the average of the liver weight was 0.16±1.72 g but after 28 days of the dosage time , the liver weight decrease though it was not significant in comparison with the average of the liver weight of the control animals’while the averages of kidney weights show an increase , though statistically insignificant , for 14 days of the dosage time in comparisn with average of kidney weight of the control animals’. After 28 days of the dosage , the results show some decrease at P< 0.05 and the least decrease at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.18 g . The average of spleen weight was decrease during the two dosage duration . The least decrease at P< 0.05 for 28 days after the dosage of 0.12 mg/ kg b. w. was 0.01±0.06 g . The acute and chronic exposure to the pesticide for 14 , 28 days of dosage was the cause for the increase of the average of the Erythrocytes count , the average of the Haemoglobin , in the average of the percentage of the Packed Cell Volume ( PCV ) . It was also observed that the “Thiamethoxam” pesticide at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. registered the highest level of P< 0.05 . When it was chronically exposed for 28 days of dosage and the blood measurements were ( 9.84±0.17 cell / mm3 , 50.60±0.54 % , and 16.58±0.87 g / 100 ml ) respectively .The differential Leukocytic count has shown the highest significant level P< 0.005 at the chornic exposure for 28 days after the dosage at 0.12 mg/ kg b. w. of Lymphocyte average of 80.80±0.85 % . Significant decrease of the Neutrophile average has shown a significant decrease and the least decrease was P< 0.005 at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after the dosage . Then showns 10.00±0.98 % . The average of Monocyte has shown a decrease of P< 0.005 and the least average at the dose of 0.12 mg/ kg b. w. for 28 days after dosage which comes to 5.20±0.44 % .The severe histopathological changes was leveled according to the dosage and the duration , it has observed lymphocytic aggregation a round blood vessels , congestion and necosis of hepatic cells with the existence of cells which suffer from apoptosis as well as the existence of granuloma and it has observed a rebuild of hepatic cells which is characterized by hyperplasia of these cells and the division of its nucleus obviously which refers to the role of this pesticide which causes cancer . In addition degeneration changes have been observed in the renal tubular epithelium besides the depletion in spleen in the first stages of giving dosage and has turned to hyperplasia of white pulp in the following stages .The previously mentioned results can give a sufficient impression about toxicity effect of the insecticide “ Thiamethoxam “ through its obvious effects in the tissue of the organs especially the liver tissue in addition to the hematological changes.
1 ... 19 20 21 22 23 ... 35