عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 34

عزل وتشخيص عاثي المكورات العنقودية الذهبية وتقييم نشاطه المضاد للبكتيريا == Isolation and Characterization of Staphylococcus aureus Bacteriophage and Evaluation of Its Antibacterial Activity

اسم المؤلف: عارف عباس غايب
اسم المشرف: ابراهيم عبد الله احمد | حامد خلف احمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2022
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الكلمات الدلالية:
  • phage Rih21
  • phage genome analysis
  • bacteriophage
  • S. aureus
  • Staphylococcus aureus phage Rih21
  • staphylococcus aureus
  • bacteriophage
  • novel bacteriophage
  • Staphylococcus phage Rih21
  • MRSA
الصفحات الاولى:
المستخلص: The antimicrobial therapy, in the long term, is expected to become ineffective against Staphylococcus aureus (S. aureus) due to its ability to produce new and more virulent strains. Bacteriophages are known to fight bacteria for a very long time and have the ability to adapt to the developing bacteria. In this study, 129 clinical specimens were collected from different places in Baghdad and from different clinical sources during the period from October 13, 2020, to January 26, 2021. Only 45 isolates showed cultural (mannitol salt and blood agar) and biochemical (catalase, coagulase and oxidase test) characteristics that were specific to S. aureus. The identity of S. aureus isolates was further confirmed by using specific primers for amplification and sequencing of the S. aureus thermonuclease (nuc) gene, and the blast result of sequences in the NCBI database was 99% to 100% identical to S. aureus species. Also, the S. aureus isolates were tested for sensitivity of different types of antibiotics, and results revealed that: all S. aureus isolates demonstrated high levels (100%) of resistance against the cefoxitin, penicillin, and ceftazidime. It also showed intermediate levels of resistance against tetracycline 55.56% (25/45 isolates), and azithromycin 46.67% (21/45 isolates), and the lowest levels of resistance was against the erythromycin 44.44% (20/45 isolates), rifampin 17.78% (8/45 isolates), trimethoprim/sulfamethoxazole 17.78% (8/45 isolates), clindamycin 15.56% (7/45 isolates), gentamicin 13.33% (6/45 isolates) and ciprofloxacin 11.11% (5/45 isolates). also found that no antibiotics tested in this study were able to kill all S. aureus isolates, therefore all isolates tested in this study were classified as Methicillin-resistant Staphylococcus aureus. From the hospital waste-water, a novel bacteriophage was isolated and characterized. The enrichment method was used for isolation of Staphylococcus aureus bacteriophage and six rounds of purification based on the plaque assay were used to purify a single type of bacteriophage against S. aureus clinical isolates. According to characterization properties, this bacteriophage belongs to the Siphoviridae family and can form a halo around the phage plaque. The maximum bacteriophage titer was recorded at 37°C and a pH of 7.2. The bacteriophage titers were decrease at 45°C, 50°C, and 55°C, until completely lost its activity at 60°C. This bacteriophage was completely inactivated at highly acidic (3, 4) and basic (10, 11) pH values and lost part of its activity at pH 5, 6, 8, and 9. This bacteriophage had a 44,789 bp linear double-strand DNA genome, and within the genome sequence, there are 61 genes, all of which are encoded into proteins. Although this bacteriophage does not have any virulence factors or antimicrobial resistance genes and had specific lytic activity against some antimicrobial resistance S. aureus clinical isolates. All the features mentioned above about this bacteriophage could make it a valuable antibacterial choice against antimicrobial-resistant S. aureus clinical isolates.
النص الكامل:
الملخص:
المصادر:

دراسة حساسية بعض الاصناف المعتمدة من قصب السكر لفايروس موزائيك قصب السكر (SCMV) في حقول سكر ميسان == A Study of The Succeptibility of Some Sugarcane Varieties to Sugarcane Mosaic Virus ( Scmv) at Misan Fields

اسم المؤلف: عدنان سالم احمد الشاوي
اسم المشرف: كاظم جاسم حمادي المنصوري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 1990
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:

الدور الكامن لفيروس الورم الحليمي البشري والتعبير الجيني للجينات ذات الصلة في سرطان عنق الرحم == Potential Role of Human Papillomavirus and Gene Expression of Related Genes in Cervical Cancer

اسم المؤلف: عقيل عبد علي عبد الصاحب العبادي
اسم المشرف: زينة وحيد عطوان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2020
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:

العلاقة بين التهاب الكبد الفايروسي نوع (C) والاعتلال الكلوي في مرضى فقر دم حوض البحر الابيض المتوسط == The Relationship Between HCV And Kidney Impairment In Beta Thalassemia Patient

اسم المؤلف: سيف ياسين حسن
اسم المشرف: سيف جبار
الموضوع العام: الطب
السنة: 2020
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الكلمات الدلالية:
  • Diagnosis.infectious blood
الصفحات الاولى:

دراسة مصلية جزيئية لفيروس التهاب الكبد نمط ب عند الاطفال بمنطقة الفرات الاوسط == Serological and Molecular Study of Hepatitis B Virus in the Chil-dren at the Middle Euphrates Area

اسم المؤلف: رؤى محمد جساب
اسم المشرف: كرار محمد عبد الساده
الموضوع العام: الطب البيطري
السنة: 2020
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الكلمات الدلالية:
  • التهاب الكبد – الفرات الوسط – نسبة انزيمي -ALT, AST
الصفحات الاولى:

دراسة حول فايروس الانفلونزا المعزول من نوبة وبائية في بغداد خلال الفترة 1988/1987 == A Study Of Influenza Virus Isolated From An Outbreak In Baghdad During 1987 - 1988

اسم المؤلف: علي سالم الدباغ
اسم المشرف: نوال الجنابي
الموضوع العام: الطب
السنة: 1988
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

Epidemiological Study Of Cryptosporidium Andersoni In Cattle In Babylon Province And Study The Pathological Changes In Mice Experimentally Infected

اسم المؤلف: Al - Tamimi Mohammed Khudair Abbas
الموضوع العام: الطب البيطري
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
مكان الجامعة: بغداد
الكلمات الدلالية:
  • veterinary virology

Immunological And Cytogenetic Aberration Study In Co Infection Human Immunodeficiency Virus And Hepatitis C Virus

اسم المؤلف: Al - Awadi . Khalid Rasheed M
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
مكان الجامعة: بغداد
الكلمات الدلالية:
  • Virus diseases

Delection Of Human Cytome Galovirus In Pregnant Women Using Quantitative Real Time Pcr

اسم المؤلف: Esraa A . Ali
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2012
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
مكان الجامعة: بغداد
الكلمات الدلالية:
  • Cytomegalovirses

Biological And Molecular Study On Parvovirus In Baghdad And Sulaimaniya

اسم المؤلف: Ahmed Faiq Ahmed
الموضوع العام: الطب البيطري
السنة: 2012
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
مكان الجامعة: بغداد
الكلمات الدلالية:
  • Veterinary virology

التحري عن فيروسي التورو والغدي عند الاطفال المصابين بالاسهال الحاد في محافظة بابل == Detection Of Torov- and Adeno Viruses in Children Infected With Acute Diarrhea In Babylon Province

اسم المؤلف: زيتون عبد الرضا اكحيوش الخفاجي
اسم المشرف: غانم عبود المولى | هاشم رحيم طارش
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:

التنميط الجيني والتحري الايضي لفيروس التهاب الكبد نوع سي لدى مرضى محافظة البصرة/العراق == Genotyping and metabolic investigations of Hepatitis C virus (HCV) among patients of Basra Province/Iraq

اسم المؤلف: نور عبد الكريم خضير
اسم المشرف: حيدر عبد الحسين مكلف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:

التشخص والشجرة التطورية لفيورس كمسبب رئيس لالتهاب المعدة والامعاءفي الاطفال في محافظة ذي قار == Detection and phylogentic Tree of Norovirus As a Main Cause for Gastroenteritis among Children at Thi - Qar Province

اسم المؤلف: دعاء كامل محمد الموسوي
اسم المشرف: رحمن لعيبي جلاب الركابي | باسم عبد الحسين جار الله
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:

دراسة مناعية لعلاقة اضطربات المناعة الذاتية للغدة الدرقية مع فيروس ابشتاين بار وفيروس التهاب الكبد الوبائي سي

اسم المؤلف: الحسنى عادل منصور الخياط
اسم المشرف: ماجدة غازي مكطوف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2019
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ذي قار
الصفحات الاولى:

انتشار الاصابة بفايروس التهاب الكبد نمط (C) بين المتبرعين بالدم في محافظة المثنى - العراق == Frequency of Hepatitis C Virus infection among blood donors in Al - Muthanna Province - Iraq

اسم المؤلف: حميد فرهود عبيد
اسم المشرف: محسن عبد نعمة الروضان | محمد عوده ملاح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: المثنى
الصفحات الاولى:

التحري الجزيئي لفيروس parainfluenza في الرضع والاطفال في محافظة المثنى == Molecular Detection of Parainfluenza virus in Infants and Young Children in AL - Muthanna Governorate

اسم المؤلف: ابرار عبد الله كاظم
اسم المشرف: محسن عبد نعمة الروضان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2016
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: المثنى
الصفحات الاولى:

معالجة اخماج الجروح والحروق بعاثيات البكتريا المعزولة منها == Treating of Wound and Burn Infections with their isolated Bacteriophages

اسم المؤلف: حيدر مهدي حمزة سلومي الشريفي
اسم المشرف: زهير نعمان حمد العاني | احسان شفيق توفيق دميرداغ الونداوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة جمع(720)عينة من مرضى اصابات الجروح والحروق(455 و265) عينة بالترتيب، من (6) مستشفيات مختلفة في مدينة بغداد للفترة من شهر حزيران2004 لغاية اب2007. زرعت المسحات على وسط اكار الدم والماكونكي وMSA، وشخصت المستعمرات النامية اعتمادا على الصفات الشكلية والزرعية، واكد التشخيص باستخدام نظام Api(Api Staph وApi20E)، اذ امكن تفريق (577) عزلة (342 عزلة جروح و235 حروق) تنتمي لـ (11) نوع من البكتريا الممرضة. بلغت النسب الكلية لعزلات اصابات الحروق (88.68%) والجروح (75.16%). بالنسبة للنسب الكلية لعزلات البكتريا بالدراسة الحالية اعطت S.aureus اعلى نسبة (21.84%)، تليها P.aeruginosa (19.76%) وE.coli (15.60%)، بينما اعطت M.morganii اوطا نسبة(0.58%). شكلت العزلات السالبة لملون كرام نسبة(68.63%)، اما الموجبة (31.37%)، اعطت الاصابة الاحادية اعلى نسبة (76.92%) والمتعددة (22.91%)(شملت اصابة ثنائية بنسبة 19.34%، ثلاثية 2.86% والرباعية 0.66%).اختبرت حساسية العزلات للمضادات الحيوية باستخدام(25) مضاد حيوي مختلف بطريقة نشرالقرص، واظهرت النتائج وجود تباين واضح بمقاومة العزلات، وانها كانت عالية المقاومة لمعظم المضادات المستخدمة بالدراسة والشائعة بالمستشفى. كانت نسب المقاومة الكلية بمجاميع المضادات الاعلى بالبنسلينات اذ بلغت (36.4%)، ولم تظهربمضاد Vancomycin، Bacetracin وNovobiocin. اعطت عزلات S.aureus ، P.aeruginosaو E.coliاعلى نسب للمقاومة بالبنسلينات بلغت(42.86%، 39.36% و26.32%) بالترتيب، ولم تظهربالمضادات السابقة كلها، كما لم تظهرمقاومة القولونية ايضا لمضاد Trimethoprim. بالنسبة لحساسية البكتريا للمضادات اعطت S.aureus اعلى نسبة مقاومة لمضاد Chloramphenicol (11.43%) والاوطا بمضاد Trimethoprim (0.95%)، P.aeruginosa الاعلى لمضاد Erythromycin (12.77%) والاوطا (1.06%) لكل من Fusidic acid وTrimethoprim، اما E.coli الاعلى لمضاد Chloram - phenicol (15.79%) والاوطا (1.32%) لكلا Cefotaxime وCeftazidime. تم عزل وتنقية مجموعة العاثيات النوعية المحللة للعزلات البكتيرية المقاومة اعلاة، واختبرت حساسيتها لخزين العاثيات النوعية لتحديد المدى المضيفي واختيارالعاثي الاوسع مدى والاكثرتحليل منها، وتحضير الخزين عالي المعيار. باختبارات الزجاج In Vitro درس مظهر(شكل)، حجم وقطرواعداد الثغرات الناتجة لكل نوع للعاثي على سطح الاكار المغذي بالطبق بطريقتي الاكساء Overlay technique والتنقيط Dropping، وايضا ترويق نمو مزرعة البكتريا بالمرق، اضافة لتحديد معيارها بالخزين Phage stock المستخدم للتجارب. اعطت طريقتي التنميط بالعاثي وكشف الثغرات السريع كفاءة عالية بتعريف عزلات البكتريا المقاومة بالدراسة. واعطت ثغرات العاثي بالزجاج اقطار ودرجات تحلل وشفافية مختلفة مهمة تشخيصيا وعلاجيا.بالنسبة لتاثيرالظروف الفيزيائية كانت درجة الحرارة (≥60 م) مثبطة للعاثيات، زمن التعرض (1 - 2ساعة) لاشعة UV بالطول الموجي (254 و600 nm) مثبط لها، وازداد معيارعاثيات الدراسة مع فترات الحضن حتى استقر عند (≥36ساعة). اما تاثير العوامل الكيميائية فقد تاثرعاثي aurephage بالفينول بنسبة (5.33%) والايثانول (18.33%)،aeruphage بالفينول قليلا(40%) وcoliphage بكل من الفينول (5.33%) ومنظف هيبوكلورات الصوديوم (18.33%). ايضا تاثرت عند pH الواطئة(4،3.5 فاقل) والعالية (8،8.5 فاكثر). اما تاثير المواد الاخرى فكان لاضافة الاملاح (NaCl وMgCl2)، والمواد الاحيائية (مصل، براز ومح البيض) تاثير ايجابي وثبطت بانزيم الببسين، وجميع عزلات العاثي بالدراسة تنجذب نحوالقطب الموجب كونها تحمل شحنة سالبة، ولم تتاثربظرفي الجفاف والرطوبة دليل على امكانية تحضيرها كمسحوق علاجي جاف لاجراء التخافيف والحفظ الطويل.باختبارات الحي In Vivo في الفئران المختبريةMice Lab. حسب نوع المعالجة للعاثي اعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%)، بينما الاوطا (5.71%) للعاثي المثبط حراريا، اما بالارانب ظهر العاثي aurephage باعلى نسبة(24.64%)،والعاثي المثبط حراريا بالاوطا(1.45%). اما حسب طريقة التقديم بالفئران اعطى تطبيق الضمادة المشبعة اعلى نسبة للشفاء بلغت (25.71%)، يليها المرهم والكريم بنسبة (22.86%) لكل منهما، والزيت باوطا نسبة(11.43%)، اما بالارانب اعطت الضمادة المشبعة اعلى نسبة (31.25%)، بينما كانت الاوطا (10.42%) بكل من المحلول المعلق والزيت.اعطت نسب الشفاء بالفئران حسب طريقة التقديم اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المعالجة بالمشكل وcoliphage بلغت (23.53%) لكل منهما، وتحسن ملحوظ بالمشكل (38.46%). واعطى المشكل اعلى نسبة (25.71%) والتي كانت الاعلى بكلا اصابات الجروح بنسبة (28.57%) والحروق (23.81%)، اما بالارانب فظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل بتطبيق المشكل (57.14%)، والتحسن الملحوظ كان الاعلى(50%) بالمشترك، وحدث تحسن قليل بنسبة(100%) بالعاثي المثبط حراريا. اما نسب الشفاء بالفئران حسب معيار العاثي المقدم بالعلاج فقد ظهرت اعلى نسبة للشفاء الكامل (26.67%) بمعيار(105 pfu/ml)، التحسن الملحوظ (28.57%) بالمعيارين (104و106) وتحسن قليل (50%) عند (102و103).ظهر ان العاثيات يمكن ان تبقى في الجسم بمعيار عالي خلال(12 - 24ساعة) ويقل معيارها بعد(36 و48ساعة)، فالعاثي المحقون بالدم كشف بمعيار اعلى مما بالتقديم الفموي، وانخفضت معاييرالعاثي المعطى فمويا للفئران بعد (36 و48ساعة) لترشيحها السريع عبراعضاء الترشيح، اذ كشفت في الكبد والطحال بمعايير اعلى مما بالدم. كانت حركيات اعداد البكتريا والعاثي بسطح الجلد وحقن الدم متماثلة، اذ تزايدت اعداد البكتريا بدون عاثي لكن نزلت مع العاثي كونة هاجمها بالاصابة، اما معيارالعاثي فنزل بدون البكتريا لكنة ارتفع معها لتضاعفة عليها. ظهرت العلاقة العكسية بين قيم MOI واعداد البكتريا وعمل التخفيف(≥1) اكثر ضدها، فكلمزااد معيار العاثي نسبة لعدد البكتريزاادت نسبة القتل والتي ظهرت اعلى بالفئران منها بالزجاج. كما ظهرت العلاقة العكسية لتاثيركمية وتكرارالجرعة وطريقة تقديمها على كفاءتها بالحي، فكلمزااد عدد الجرع انخفضت اعداد البكتريا، وكان انخفاض اعدادها على سطح الجرح اكثرمما بحقن الدم والتجريع الفموي، لكن اثبتت الدراسة ان الجرعة المفردة الصغيرة للعاثي كافية لتضاعفة اسيا طالما توفرت البكتريا. وايضا العلاقة العكسية لتاثيرتاخير تقديم المعالجة على اعداد البكتريا بالزجاج والفئران، اذ تناقصت مع تاخيرها حتى (≥18ساعة) لتضاعفة عليها مؤكدا كفاءتة رغم تاخيرتقديمة بالمعالجة.وبدراسة تاثيرفترات التحدي والمعالجة على الامراضية والوفيات(نسب البقاء) بالفئران ظهرت اعلى نسبة للامراضية (100%) بسيطرة البكتريا، والاوطا(10%) بمجموعة C فتطبيق العاثي (3 ايام) بعد التحدي خفض امراضيتها وحدثت الوفيات فقط مع سيطرة البكتريا بنسبة(50%) لتزايدها بدون العاثي، وان تقديمة خفض الامراضية ومنع تضاعفها الشديد والوفيات. بالنسبة لتاثير نقاوة تحضيرالعاثي على اعداد البكتريا بالزجاج والحي (سطح الجرح والحقن بدم الفئران) ظهرت اعدادها بالزجاج اقل منها بالحي لكل تطبيق للعاثي. ظهرت اعدادها اعلى بتطبيق تحضيرالعاثي المثبط حراريا واوطا مع العاثي المعرض للنبذ عند 12000 rpm مؤكدا كفاءة العاثي ضدها بدون تاثير محتويات الراشح الملوثة بفضلات البكتريا والسموم الداخلية بالجدر المتحللة واهمية تنقية التحضير عند تطبيقة ضدها.ظهر ان التطبيق الوقائي للعاثي كان اكفا بتقديمة قبل (≤12 - 24ساعة) من الاصابة بخفض اعداد البكتريا بالفئران مؤكدا اهميتة السريرية كمطهر وقائي لسطح الجرح ومعقم للادوات الجراحية والاجهزة الطبية، ولتصحاح الردهات والصالات وبيئة المستشفى والمجتمع لمنع خطر التلوث وتهديد السلالات المقاومة المكتسبة بالمستشفى. اعطى تقديم العاثي المثبط حراريا حماية للفئران المختبرية والارانب تعزى للمناعة ضد بكتيرية الناتجة عن حقن فضلات البكتريا والسموم الداخلية المتحللة بالراشح الخام ونشط المناعة بالحيوان وعجل الشفاء وتحسين ظروف الجرح وان توليد المناعة لايعيق المعالجة.بالمحاولات السريرية السطحية لتطبيق علاج العاثي المفرد اعطت طريقتا التنقية بالنبذ الفائق عند 12000rpm وكلوريد السيزيم اعلى تاثير بخفض اعداد البكتريا على سطح جلد المتطوعين الاصحاء. بالتطبيق الخارجي ظهر تحسس قليل للراشح الخام ماعدا بالاصحاء لعدم وجود المضيف الذي يتضاعف علية العاثي فلا يحدث تحلل اوتحررسموم شديد وبالتالي لايظهرتاثيرة لديهم. اما بتطبيقة الداخلي ظهر ارتفاع حرارة ينتهي بعد (24ساعة) وبالمرضى حدث الم كبدي ينتهي لبضع ساعات يعزى للتحرر الشديد للسموم من البكتريا المتحللة بفعل العاثي، فالتاثيرات الجانبية قليلة (نسبتها 5.31% بالفئران، 5% بالارانب و4% بالمرضى) والتي تعزى للبكتريا وترافق تطبيق الراشح الخام.اعطى تطبيق علاج العاثي السطحي اعلى نسبة شفاء كلية بالمرضى بلغت (90%)، اعلى بالحروق (100%) منها بالجروح (80%)، اذ اعطوا نسبة شفاء كامل بلغت (60%)، تحسن ملحوظ (20%)، تحسن قليل (10%) وغيرمشفي(10%)، وبهذا فهويلائم الاستخدام الخارجي السطحي لمعالجة الاصابات. وبمتابعة تطور عملية شفاء الجروح بعينات الدراسة مع فترة المعالجة(7 اسابيع) حدث تحسن قليل بجميعها في الاسبوع الثاني، بالثالث تحسن ملحوظ بالفئران والارانب، لكنة حدث بالاسبوعين الرابع والخامس لجروح وحروق المرضى بالترتيب. الشفاء الكامل حدث بالرابع للفئران، بالخامس للارانب وبالسابع للمرضى. حدثت عملية الشفاء بصورة طبيعية وكان العاثي فعال وجيد بتحسين ظروف والتام الجرح وتسريع الشفاء (ظهور النسيج الطلائي والمحبب) وخفض تدريجي واستئصال لاعداد البكتريا. | This study were conducted by collecting (720) samples from patients of wound and burn infections (455& 265) respectively, from (6) different hospitals in Baghdad City from June 2004 to August 2007. Samples were cultured on MSA, blood, and MacConkey agar, the grown colonies identified according to its morphologic and cultural properties, and confirmed by applying Api (Api Staph and Api20E) system, that differentiate (577) isolate (342& 235) respectively, belong to (11) pathogenic bacterial species. Total rate of burns was (88.68%), while wound infections (75.16%). Gram negative isolates gave (68.63%), while Gram positive isolates were (31.37%). According total percentage of bacterial isolates in study S.aureus gave the higher rate (21.84%), then P.aeruginosa (19.76%) and E.coli (15.60%), while M.morganii gave the lower (0.58%). Mono - infections showed a high rate i.e. (76.92%), whereas multiple - infections (22.91%) (which consist of Double 19.34% ,Triple 2.86% and Tetra - infections 0.66%). Antibiotic sensitivity test was conducted using (25) different types, and results showed obvious difference in isolate's resistance, which showed a high resistance against applied antibiotics and most common in hospitals. Total resistance percentages of antibiotic groups were the higher in Penicillins (36.4%), absent (0.0%) in Vancomycin, Bacitracin and Novobiocin. S.aureus, P.aeruginosa and E.coli isolates gave the higher resistance rates in Penicillins (42.86%, 39.36% & 26.32%) respectively, absent in all previous antibiotics, so E.coli resistance absent to Trimethoprim. S.aureus showed a highest rate of resistance to Chloramphenicol (11.43%), while showed a lowest (0.95%) to Trimethoprim, P.aeruginosa gave the higher rate of resistance to Erythromycin (12.77%) and the lower to Trimethoprim and Fusidic acid (1.06%) for each, while in E. coli the higher resistance to Chloramphenicol (15.79%) the lower to Cefotaxime and Ceftazidime (1.32%) for each.Specific lytic phages for resistant bacterial isolates of (S.aureus , P.aeruginosa and E.coli) in this study, were isolated, then matching with their hosts (Isolate's susceptibility to phages), to determine Specificity and Host range and to select the highly specific lytic activity phage, which then prepared in different treatment types and forms. In Vitro studies included study the Plaque morphology (Shape), size and Diameter for each phage isolated on agar by Agar Overlay and Dropping techniques and Clearing of bacterial growth in broth, So determine phage titer(pfu/ml) in stock used, results showed the high phage therapy efficiency In Vitro and In Vivo. Results of Physical conditions showed that Temperature (≥60°C) and 2hours UV light exposure times at WL (254&600nm) inhibit them, while in Chemical agents aurephage gave with Phenol the rate (5.33%) and Ethanol (18.33%), aeruphage little affect in Phenol (40%), and coliphage in Phenol (5.33%) and Sodium Hypochlorate (18.33%), so affect at low pH (≤4) and high (≥8). There was significant effects of other agents as Salts(NaCl, MgCl2), Biologicals (Serum, Stool, Egg yolk) but Pepsin inhibit them, all attracted to +ve pole,as they bear –ve charge, so they don't affect by each Dessication and Moisture conditions that we can prepare a dry therapeutic powder for dilutions and preservation. At In Vivo studies In Laboratory Mice according to type of phage treatment, Cocktail gave the higher rate(25.71%), while the lower(5.71%) for Heat - inactivated phage, in Rabbits, aurephage showed the higher rate (24.64%), while heat - inactivated phage gave the lower (1.45%). According to the form of adminstering the use of Impregnated Dressing gave the higher rate (25.71%), then Ointment and Cream (22.86%)for each, and Oil gave the lower (11.43%), In Rabbits, Imp.D. gave the higher rate (31.25%), while the lower (10.42%) for each Suspension and Oil. In Healing rates, Full - recovery were higher by using Cocktail and coliphage (23.53%) for each, Marked Improvement in Cocktail (38.46%), Cocktail gave the higher rate (25.71%), which were the highest in both wounds (28.57%) and burns (23.81%), in Rabbits, Cocktail gave the higher rate of Full - recovery (57.14%), Marked Improvment were higher (50%) in Combined, and Poor Improv.(100%) occured with Heat - inactivated phage. The Healing rates according to Phage titer that have been given in therapy, high rate of Full - recovery (26.67%) in titre (105pfu/ml), Marked Improvement (28.57%) in(104 - 106) and Poor Improv.(50%) at (102 - 103).Its obvious that phages could survive inside body in high titer through (12 - 24hr) and decrease after (36 - 48hr), an injected phage were detected in a high titer than orally, and oral phage titers in Mice decreased after(36 - 48hr) as fast clearance of RES, which detected in liver and spleen with higher titers more than that in blood. cfu and pfu kinetics in skin and injected were identical,cfu increased without phage,but decrease with it as attacking infection, while phage titer decreased without bacteria, but increased with it as they replicated on.The adverse relation between MOI and cfu (≥1moi) with increased titer on cfu the killing rate increased. That higher in Mice than In Vitro, so the adverse relation between the amount, frequency and administering route on phage efficacy In Vivo, with increasing number of dose the cfu decreased and this on wound were more than injection and orally, but study showed that the single small dose were sufficient as phage multiply exponentially on bacteria. So the adverse relation of delaying treatment on cfu In Vitro and in Mice, which decreased with delaying to(≥18hr) as multiply on it showed its efficiency.By studying challenge and treatment times effects on morbidity and mortality (Survival rates) in Mice, showed higher rate of morbidity(100%) in control of bacteria, the lower(10%) in C group were applying phage (3days) after challenge decreased its morbidity, and mortality occurred only with control of bacteria in rate(50%) as it increased without phage, and its administering decrease morbidity and prevent its access multiply and mortality. In phage preparation purity effects on cfu In Vitro and In Vivo (Wound and injection in Mice) its numbers the lower In Vitro than In Vivo for each phage application, and were higher by applying heat - inactivated phage and lower in phage preparation centrifuged at 12000 rpm which showed phage efficiency against it without effects of lysate contents that contaminated with bacterial debris and endotoxins and the importance of purity in treatment.It was Showen that phage prophylactic use were efficient when administered before (≤12 - 24hr) from infection in decreasing cfu in Mice, showing its clinical importance as protective disinfectant to wounds and sterilize Surgical tools and Medical devices, for Wards, Operation theaters, Hospital and Community environments sanitation to prevent the danger of contaminating and threatening of acquired resistant strains.Heat - inactivated phage administering gave protection to Lab. Mice and Rabbits due to antibacterial immunity result from injecting bacterial debris and endotoxins in crude lysae and activate immunity in animals, accelerate healing and improving wound conditions, and that were immunity been generated it didn't affect on therapy.In topical clinical trials of applying mono - phage therapy of ultra - centrifugation at 12000 rpm and Cesium chloride density gradient methods gave the higher effect in decreasing cfu on healthy volunteers skin. In external application showed few sense to crude lysate unless in healthy as absent of host that phage multiplied on, so the access release of toxins didn't occur then didn't show its effects on them, whereas internal showed in high temperature end after (24hr) and in patients Hepatalgia end for several hours due to access release of endotoxins, These side effects were low(5.3% in Mice, 5% Rabbits and 4% patients) which due to bacteria and associated with crude lysate only.Applying topical phage therapy gave higher total healing rate in patints (90%), higher in burns (100%) than wounds (80%), and they gave Full recovery (60%), Marked Imp. (20%), poor Imp.(10%) and non heal in (10%), so it suit with external topical use to treat infections.In following the process of wound healing In Vivo with weeks, Poor Imp. Occured in all at W2, at W3 Marked Imp. In Mice and Rabbits, but it occured in W4&W5 to patient's wound and burn respectively. Full Recovery occurred in W4 to Mice,W5 Rabbits and W7 to patients. Healing process occurred normally, so phage active and good in improving wound conditions, accelerate healing (appearance of epithelial and granulated tissue), graduate decrease then eliminate cfu.

عزل وتشخيص فيروس شلل الاطفال من الاطفال الملقحين بلقاح شلل الاطفال ومقارنته مع الفيروس الضاري == Isolation &Identification of Poliovirus from Vaccinated Children with Oral poliovirus vaccine and Comparison With Wild Type Virus

اسم المؤلف: زهراء جعفر جميل عبد الكريم
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد | عبد اللطيف محمد احمد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعد فيروس السنجابيةPoliovirus(PV) العامل المرضي الرئيس المسبب لشلل الاطفال Poliomyelitis . ويعتبر هذا المرض من الامراض الخطرة في العالم والتشخيص المختبري له ضروريا لغرض مراقبة وترصد حالات شلل الاطفال ومدى فعالية عملية التلقيح، وكذلك للتميز بين الشلل المتسبب من فيروس السنجابية (PV) والعوامل الاخرى ، والعناية المثالية للمريض هي تجنب الحركة والركض والركون الى الراحة والعلاج الطبيعي . تطوير علاج المرض باستعمال مضادات الفيروس لاصابات شلل الاطفال ممكن ان يضيف في المستقبل القريب حافزا اضافيا للتشخيص المختبري له . تضمنت الدراسة جمع مئة وثمانين عينة خروج من الاطفال (اعمارهم اقل من خمس سنوات) الذين اعطوا لقاح شلل الاطفال الفموي Poliovirus vaccine Oral في مركز الرعاية الاولية الصحية في بغداد لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) ، وكذلك تم اختيار خمسة عشر طفلا من المجموع الكلي للاطفال واستمرار متابعة مدى طرح فيروس السنجابية (PV) في الخروج لمدة عشرة ايام بعد التلقيح بلقاح شلل الاطفال الفموي (OPV) .لعزل فيروس السنجابية (PV) : حقنت نماذج الخروج في خطوط خلوية مختلفة (L20B, RD,Hep - 2C, CEF) ، ويتبع ذلك تشخيص نوع فيروس السنجابية (PV) من النماذج الموجبة التي اظهرت تاثيرات مرضية Cytopathic Effect بوساطة اختبار التعادل الدقيق Microneutralization Test ثم اجراء الترحيل الكهربائي SDS - PAGE Electrophoresis لبعض العينات التي شخصت وعينة اللقاح وعينات برية تم الحصول عليها من مختبر الصحة المركزي، وقد تم التوصل الى النتائج الاتية : - • اظهرت الدراسة ان 114 عينة اعطت نتيجة موجبة لعزل فيروس السنجابية(PV)من اصل 180 عينة اي بنسبة (63%) .• لا توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV) من الذكور والاناث اذ ان نسبة الذكور الى الاناث في عزل (PV) هي 1 : 1 .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في معدل عزل فيروس السنجابية (PV ) خلال فصول السنة حيث وجد ان اعلى النسب كانت 74.6% في فصل الصيف .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) من عينات خروج اطفال باعمار مختلفة وجد ان اعلى نسبة لعزل (PV) 83.3% من عينات الاطفال بعمر 8 - 10 اشهر .• عند مقارنة معدل النتائج الموجبة على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطى افضل المعدلات (93%) يليها خلايا (RD) لمعدل (88%) ثم خلايا (Hep - 2C) بمعدل (84%) ،وعلى النقيض خلايا (CEF) لم تعط اية نتيجة موجبة .• وجد ان هناك فروقا معنوية ( P<0.05 ) في سرعة ظهور فيروس السنجابية (PV) على خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان خلايا(L20B) اسرع الخطوط الخلوية في اعطاء النتائج، وكذلك توجد فروق معنوية ( P<0.05 ) بين الخلايا (L20B) و(RD) في اليوم الثالث وكذلك توجد فروق معنوية بين (RD) و(Hep - 2C) ( P<0.05 ) في اليوم الخامس، بينما توجد فروق معنوية عالية ( P<0.05 ) في التحري عن فيروس السنجابية (PV) بين خلايا (L20B) و(Hep - 2C) وجد في اليوم الخامس .• في اختبار التعادل N.T : اظهرت النتائج ان النمط الاول (PV1) هو الشائع وقد كان بنسبة 60% ، ثم النمط الثالث (PV3) بنسبة 27% . لكن في هذه الدراسة لم يتم عزل النمط الثاني (PV2) ، وقد ظهرت فيروسات معوية (EVs) اخرى بنسبة 13% .• عند مقارنة عزل فيروس السنجابية (PV) مع باقي الفيروسات المعوية (EVs) خطوط خلوية مختلفة : اظهرت النتائج ان (L20B) تعطي افضل المعدلات (100%) لعزل فيروس السنجابية (PV)، ولم تعزل فيروسات معوية (EVs) ، اما خلايا (RD) بمعدل (90%) اما خلايا(Hep - 2C) بمعدل (71%) لعزل فيروس السنجابية (PV) ، وقد عزلت (EVs) بمعدل (29%) .• في اختبار الترحيل الكهربائي (Electrophoresis (SDS - PAGE في هذه الدراسة تم تمييز اربعة حزم للسلاسل الببتيدية لفيروس السنجابية (PV) لكن هذه النتائج : لم تظهر اي فروقات تميز بين انماط فيروس السنجابية (PV) الثلاثة ، وكذلك لا توجد فروقات تميز بين فيروس السنجابية (PV) المعزولة من عينات الخروج (المشتقة من اللقاح) والعينات البرية (تم الحصول عليها من مختبر الصحة العام المركزي)او عينات اللقاح .نستنتج من الدراسة ان تقنية الزرع النسيجي في الكشف عن فيروس السنجابية (PV) في نماذج الخروج ان الخلايا (L20B) تعد خط الخلايا الامثل والافضل لعزل فيروس السنجابية (PV) بدون عزل فيروسات معوية (EVs) اخرى من نماذج الخروج ، وهذا يوفر لناالوقت والجهد والمواد المبذولة لعزل وتشخيص فيروس السنجابية (PV) من عينات الخروج خلال وجود ومراقبة حالات الشلل الرخو الحاد (AFP )والمراقبة البيئية ضمن مبادرة استئصال شلل الاطفال وكذلك نستنتج ان النمط الاول(PV1)هو الاكثر شيوعا في هذه الدراسة . | Poliovirus (PV) is the etiologic agents of poliomyelitis , This Disease was one of the dangerous diseases in the world. Laboratory diagnosis is still required for detection of poliomyelitis cases and surveillance, to qualification of Immunization and other potentially treatable conditions; development of antiviral agent for the treatment of (PV) infection may provide added impetus for laboratory diagnosis in the near future. In this study collection one hundred and eighty stool specimens from children (less than 5 years old) who administered Oral Poliovirusvaccine (OPV) in preliminary health protection centers in Baghdad and Select fifteen children from the total children and following shedding (PV) in stool for 10 days after immunization with (OPV). Isolation of (PV) was conducted using stool specimens of the vaccination children and inoculated in (L20B) cells, human rhabdomyosarcoma (RD) , human epidermoid carcinoma (Hep - 2C) and check embryo fibroblast (CEF). Followed by identification of (PV) type from positive case which appear cytopathic effect (CFE). By microneutralization test, SDS - PAGE Electrophoresis was done to some specimens which identified as (PV1) ,(PV3),vaccine and wild type. The following results were obtained in this study : - • This study found (114) specimens were positive out of (180) specimens (63%).• No significant difference in isolation of (PV) taken from males and females ,The male to female ratio in (PV) isolation was 1 : 1 .• In comparison, the recovery rate of (PV) due to age of children was found to be the greater proportion and was 83.3%for children within age 8 - 10 month.• Significant difference in isolated (PV) due to during seasons ,the greater percentage was 74.6% during summer .• In Comparison, the recovery rate of (PV) in different cell lines revealed that L20B cell provided the best recovery rate (93%) from fecal samples , differing significantly from the other cell lines (P< 0.05) .• Significant difference in speed recovery of PV in different cell lines , recovery of L20B cell provided the faster recovery rate , significant difference (p > 0.05) of detecting PV between L20B and RD cell at day 3 and between RD and Hep - 2C cell (p > 0.05) at day 5;whereas more significant difference (p > 0.05) in the detection of PV between L20B and Hep - 2C found at day 5.• In neutralization test,it was found the poliovirus type (PV1)was more frequent (60%) than (PV3) (27%)but in this study can’t isolated (PV2), in this study found other (ENs) (13%). • In comparison, the recovered (PV) and other (EVs) in different cell lines ,showed that L20B cell was the best in the recovery rate (100%) for the isolation of (PV) while did not isolation of (EVs),RD in rate (90%) for (PV) while Hep - 2C isolation (PV) in rate (71%),and (ENs) in rate (29%).• In SDS - PAGE Electrophoresis, in this study distinguish 4 bands for polypeptide of (PV), but this result didn't show any difference between strains of (PV) which isolation from stool specimens and wild type. In conclusion the T.C. technique used for detection of ( PV) from stool specimens , the L20B cell was superior to isolation of (PV) without isolation of (EVs) and therefore established a first line of clinical diagnostic test for the detection of (PV) from stool specimens during AFP surveillance and Environmental surveillance in the initiation of eradication of Poliomyelitis. and in conclusion that the (PV1) was widespread in Environment .

دراسة وبائية مصلية عن التهاب الكبد الفيروسي النمط (E) في محافظة ديالى == Seroepidemiological study of hepatitis E virus in Diyala province

اسم المؤلف: ولاء نجم عبود السامرائي
اسم المشرف: عباس عبود فرحان الدليمي | عبد الرزاق شفيق حسن الجميلي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2005
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: ديالى
الصفحات الاولى:
المستخلص: دراسة وبائية مصلية عن التهاب الكبد الفيروسي نمط ( E ) في محافظة ديالى)اجريت هذه الدراسة خلال الفترة من 1/ تشرين الاول / 2003 الى 30/اب/2004 في مختبر الصحة العام في بعقوبة ومختبر مستشفى بعقوبة العام. كان الهدف من الدراسة تحديد نسبة انتشار الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E)بين الاشخاص الاصحاء ظاهريا وكذلك تحديد نسبة انتشار الاضداد النوعيةIgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E) بين مرضى التهاب الكبد الفيروسي الحاد. وكذلك دراسة تاثير بعض العوامل على معدل انتشار الاضداد النوعية لفيروس التهاب الكبد نمط (E) مثل : العمر والجنس والسكن (ريف او حضر) ، التاريخ العائلي من حيث وجود اصابة بالتهاب الكبد الفيروسي في العائلة ووجود حيوانات داجنة داخل السكن، وجود اصابة سابقة باليرقان، مصدر مياه الشرب ، وحجم العائلة ( عدد الافراد ). فضلا عن ذلك استهدفت الدراسة تحديد مدى انتشار الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E) في بعض الحيوانات الداجنة.وقد تضمنت الدراسة ثلاث مجاميع ؛ مجموعة سيطرة والتي تالفت من (111) عينة مصل من اشخاص اصحاء ظاهريا، بلغ عدد الذكور 50 (45%) بمعدل عمر (الوسط الحسابي± الانحراف المعياري) (25.18 ± 5.1) سنة، وعدد الاناث 61 (55%) بمعدل عمر ( 23.23 ± 7.9) سنة . اما مجموعة المرضى فتالفت من (163) مريضا يعانون من التهاب الكبد الحاد . بلغ عدد الذكور96 (58.9 %) بمعدل عمر (27 ± 18 ) سنة وعدد الاناث 67 (41.1%) بمعدل عمر (24.3 ± 15.6) سنة. اما المجموعة الثالثة فتضمنت (77) عينة مصل من الحيوانات الداجنة وهي (20) عينة من الدجاج ، (37) عينة من الخراف ، (10) عينات من الابقار، و(10) عينات من الماعز .اجريت الاختبارات المصلية للكشف عن الاضداد النوعية IgG وIgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E) في مختبر الصحة العام في بعقوبة باستخدام تقنية ELISA. واجريت اختبارات البليروبين الكلي والمباشر واختبار انزيم الالنين امينو ترانسفيريز (ALT) في مختبر مستشفى بعقوبة العام باستخدام الطرق الكيموحيوية. وقد اظهرت النتائج الحالية ان معدل انتشار الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E) بلغ (18%) بين الاشخاص الاصحاء ظاهريا ، كما اظهرت النتائج زيادة معنوية في معدل انتشار الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E) مع تقدم عمر الشخص في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي للجنس والسكن ومصدر مياه الشرب والتاريخ العائلي ووجود حيوانات داجنة داخل السكن ووجود اصابة سابقة للشخص باليرقان وحجم العائلة على معدل انتشار الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E). اما معدل انتشار الاضداد النوعية IgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E) فبلغ (%30.1) بين مرضى التهاب الكبد الفيروسي الحاد. فضلا عن ذلك فقد اظهرت النتائج ان 5 من 163 (3.1%) مريضا كانوا يعانون من حدوث اصابة متزامنة بالتهاب الكبد الفيروسي الحاد للنمط (E) والنمط (A) وان 2 من 163 (1.2%) كانا يعانيان من حدوث اصابة متزامنة بالتهاب الكبد الفيروسي الحاد للنمط (E) والنمط (B) ومريض واحد (0.6%) وجد انه يعاني من اصابة متزامنة بالتهاب الكبد الفيروسي الحاد للنمط (E) والنمط (C). واظهرت النتائج وجود زيادة معنوية لمعدل انتشار الاضداد النوعية IgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E) مع تقدم عمر المصاب وان اعلى معدل لانتشار الاضداد النوعية IgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E) كان في الاعمار بين (10 - 49) سنة، وهذا يعني ان اليافعين والبالغين اكثر عرضة للاصابة بفيروس نمط (E). في حين لم تظهر النتائج وجود تاثير معنوي للجنس والسكن ومصدر مياه الشرب على معدل انتشار الاضداد النوعية IgM لفيروس التهاب الكبد نمط (E). وبينت النتائج ارتفاع فاعلية انزيم ALT)) بشكل معنوي في مصل الاشخاص المصابين بالتهاب الكبد الفيروسي الحاد نمط (E) في حين لم يكن هنالك تاثير معنوي لمعدل البليروبين الكلي والمباشر وغير المباشر بين الاشخاص المصابين بالتهاب الكبد الفيروسي نمط (E) مقارنة بالانماط الفيروسية الاخرى. لم تكشف الدراسة عن وجود الاضداد النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط (E) في اي من الحيوانات الداجنة المشمولة ، ربما بسبب اختلاف الضروب الانتيجينية الداخلة في العدد التشخيصية التي استخدمت في هذه الدراسة او يعود السبب الى ان العدة التشخيصية المستخدمة للكشف عن الاضداد النوعية للانسان وليس الحيوان . دلت الدراسة الحالية على ان نسب انتشار الضدات النوعية IgG لفيروس التهاب الكبد نمط) (E في محافظة ديالى مقاربة لما هي موثقة في البلدان المتوطنة بالمرض، في حين شكل التهاب الكبد الفيروسي نمط ( E ) الحاد نسبة عالية بين الحالات الحادة للاصابة بالانماط الفيروسية الاخرى. | The present study conducted in Diyala province for the period from October / 2003 to August / 2004 to explore the prevalence of Anti - HEV IgG among normal healthy population and the prevalence of Anti - HEV IgM among patients with acute viral hepatitis, and to find their relevance with certain epidemiological factors including, age, sex, residence, family past history, presence of domesticated animals in the residence, source of water supply and family size. Additionally, the prevalence of anti - HEV IgG among certain domesticated animals was detected.Three study groups were included; 111 normal healthy individuals were enrolled as a control group. 50 (45%) were males with mean age (mean±SD) (25.18±5.1) and 61(55%) were females with mean age (23.23 ±7.9). The patients group consists of 163 patients suffering from acute viral hepatitis. 96 (58.9%) were males with mean age (27 ± 18) and 67 (41.1%) were females with mean age (24.3 ±15.6). The third group was consisting of 77 samples of domesticated animals including, 20 samples from chickens, 37 samples from sheeps, 10 samples from cattle and 10 samples from goats. The anti - HEV IgG and IgM reactivity was evaluated by hepatitis E recombinant DNA antigen enzyme - linked immunosorbant assay (ELISA) technique in public health laboratory. Total serum bilirubin (TSB), direct and indirect were tested by enzymatic biochemical procedures in the Baquba general hospital laboratory.The result showed that : the prevalence of anti - HEV IgG among healthy individuals was (18%) and the prevalence of anti - HEV IgM among patients with acute viral hepatitis was (30.1%). Since there was no previous studies on the prevalence of HEV infection in Iraq, these results suggest that the prevalence of HEV infection in Diyala province was comparable to those reported in other endemic countries. The anti - HEV positivity rate was increased significantly with age (p<0.05). However, there was insignificant effect of other factors including sex, residence, family past history, presence of domesticated animals, source of water supply and family size. The results also showed that 5 patients (3.1%) had coinfection with acute hepatitis A and acute hepatitis E virus infection. 2 patients (1.2%) had coinfection with acute hepatitis B and acute hepatitis E virus infection, and one patient (0.6%) had coinfection of acute hepatitis C and acute hepatitis E virus infection, suggesting that coinfection between HEV and other hepatitis viruses such as HAV,HBV,HCV may occur. The Biochemical result revealed that there was significant rise in ALT activity in patients with acute HEV infection. However, the total serum bilirubin, direct and indirect bilirubin among patients with acute HEV was insignificantly affected. The results also revealed that all serum samples of domesticated animals were negative for anti - HEV IgG, probably because the utilized diagnostic kits prepared from antigenically different HEV strain

دراسة جزيئية ومناعية لالتهاب الكبد الفيروسي نمط جـ لمرضى الثلاسيميا في محافظة النجف الاشرف - العراق == Molecular and immunological study for Hepatitis C virus in Thalassemia patients in AL - Najaf AL - Ashraf / Iraq

اسم المؤلف: ناديه حبيب سرحان الشيباني
اسم المشرف: موسى نعمة مزهر | جميل جري يوسف
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: العربية
مكان الجامعة: النجف
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was conducted to detect the infection percentage of Hepatitis C Virus (HCV) in the samples of thalassemic patients in AL - Najaf Governorate.About 130 suspected cases attending AL - Zahra'a hospital for children and delivery in Al - Najaf city during period from 1st of November (2014) to 28thof April (2015).Only 69 samples were carried out in this study .The practical side for this study followes three main paths : 1 - The Molecular identification of the presence of Ribonuclic acid of Hepatitis C virus in Thalassemic patients by using RT - PCR.2 - Using the Enzyme Linkedimmunosorbant assay (ELISA - III)technique to determinate immunological markers anti - HCV IgG and interleukine - 28B (IL - 28B).3 - Using theCYANHemato devicefor the purpose of counting blood cells which is called Coulter - Method to give a Complete blood count(CBC).The overall results obtained in this study were as follows : - Out of 69 samples,25(36%) samples of thalassemic patients were infected with Hepatitis C virus, 16 male and 9 female ,their age range from (4 - 43) years ,while 44(64%) samplesof thalassemic patients were withoutHepatitis C virus infection , 22 male and 22 female, their age range from (3 - 35) years . - The result showed that 25samples seropositive to anti - HCV IgG in all age groups where the age group (10 - 20) years old has thehighest percentage among other age groups. - The result of the examination of HCV - RNA Eleven of (25) HCV seropositive patients were positive to RT - PCR technique. - The result of this study showed that level of Interleukin - 28Bin thalassemic patients with HCV was high (mean or significant) (12733.33) pg/ml as compared with thalassemic patients without HCV (270.0463) pg/ml and control(12.1267)pg/ml. - The result also has revealed that the hematological parameters of white blood cells (WBCs),monocytespercentage (MON) and lymphocytes percentage (LYM) significantly have increased (P<0.05) in Hepatitis C patients compared to those of control group. - Granulocytes(GRA) showed a significant decrease (P<0.05) in percentage in Hepatitis C patients compared to those of control groups.

التنميط الجيني لفايروس التهاب الكبد نوع اي لمرضى الاصابة الحادة في محافظة المثنى - العراق == Genotyping of Hepatitis E Virus Among Patients With Acute Infection In Al - Muthanna Province / Iraq

اسم المؤلف: ازهار صبري مسلم الذهبي
اسم المشرف: رغد حربي مهدي العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: ماجستير
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Hepatitis E Virus (HEV) infection is found worldwide. It is responsible for large outbreaks in East and South Asia. This study was carried out to identify the distribution of acute HEV infection in AlMuthanna province and then determine the genotypes responsible for the disease spreading. This is the first investigation about the occurrence of hepatitis E genotypes in Al - Muthanna province patients. The study included 270 jaundiced patients of both sexes From AlMuthanna province which included out patients in public health laboratory in Samawah city, for the period from October 2013 to June 2014. All these patients were tested for anti - HEV IgM antibodies by using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). In Al - Muthanna province, 72 patients (26.66 %) out of 270 patients showed positive results for anti - HEV IgM antibodies, and all those patients were tested for confirmatory test at central public health laboratories (CPHL) in Baghdad province. Those patients consist of 45 females and 27 males with age ranged between (4 - 74) years old, were all negative for routinely screened markers of Hepatitis A, Hepatitis B and Hepatitis C, Ten normal healthy individuals, used as normal control in this study. This study showed that the HEV IgM is more common among younger age group (15 - 24), with a percentage of) 41.67%(, and it was higher in females (63%) than in males (37%). Highly significant differences (p ? 0.01) appeared among age groups. The levels of liver function enzymes demonstrated significant differences (p ? 0.05) in HEV patients as compared with healthy controls. The levels of Total Serum Bilirubin (TSB) were (23.41 ± 12.38) mg/dl, Serum Aspartate transaminase (SAST) were (887.17 ± 9.87) U/l, Serum Alanine transaminase (SALT) were (859.91 ± 13.28) U/l, and the levels of Serum Alkaline phosphatase (SALP) were (206.56 ± 5.04) U/l higher than healthy controls (0.884 ± 0.05) mg/dl, (37.27 ± 4.58) U/l, (34.14 ± 7.63) U/l, (48.09 ± 15.42) U/l respectively. RNA was extracted from sera of positive anti - HEV IgM antibodies by using a QIAamp® Viral RNA Mini Kit. Nanodrop and Quantus™ Fluorometer instruments were used to determine the RNA yield and purity according to the standard kit protocol. High levels of RNA concentration were measured by Nanodrop and Quantus™ Fluorometer. Forty - six samples have high RNA concentration out of 72 samples were detected for genotypes I, III & IV by using Applied Biosystems Real time PCR 7500 machine. In this study, HEV type I and III were detected in 23 samples out of 46 samples by using Real Time PCR systems. Ten samples were positive for this test. Thirteen samples (56.52%) were negative for this test. The distribution percentage of genotypes I and III was (43.48%). The results appeared significant difference (P ? 0.05). Also by using the same technique (Real time PCR systems) the HEV type IV was detected in 23 samples out of 46 samples. Which included, 13 samples that recorded negative results by I & III genotypes kit and only 2 samples from it recorded positive results and 11 samples recorded negative result for HEV genotype IV. From other 10 samples, only 3 samples recorded positive result and 7 samples recorded negative result for HEV genotype IV. In a total, 5 samples were positive for HEV genotype IV and 18 samples (78.26%) were negative. So that the distribution percentage of genotype IV was (21.74%). In this study, the samples that showed negative results in both kits have not been tested for other genotypes. This study indicated that the acute HEV infection is highly endemic in Al - Muthanna province in Iraq. Genotypes I & III were the most distribution than genotype IV in patients from Al - Muthanna province in Iraq. These results suggest that the genotypes I & III are the main causative agents of sporadic HEV infection in Al - Muthanna province

دراسة خمج فيروس الكبد نمط جي HGV في مرضى الثلاسيميا المصابين وغير المصابين بفيروس الكبد سي (HCV) واهميته السريرية

اسم المؤلف: مريم صبري ابراهيم
اسم المشرف: اروى هادي الحمداني | اشنا جمال فائق
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: المرضى المصابين بفقر دم البحر الابيض المتوسط هم اكثر عرضة للاصابة بالالتهابات الفيروسية المنقولة دمويا. التهاب الكبد الفيروسي نمط جي (HGV)هو فيروس رنوي(RNA) مرتبط بالتهاب الكبد الفيروسي الحاد والمزمن. التهاب الكبد الفيروسي نمط سيHCV) ) والتهاب الكبد الفير | Thalassemia patients are at increased risk of infection with parentally transmitted viral agents. The hepatitis G virus (HGV) is an RNA virus, which is associated with acute or chronic hepatitis. Hepatitis G virus (HGV) and hepatitis C virus (HCV) infections may have a role in complicating the clinical outcome in patients with thalassemia. This study was designed to investigate the prevalence and clinical importance of HGV infection in thalassemia patients with or without hepatitis C virus (HCV) co - infection, furthermore to sequence and analyze phylogentic of HGV clones. One hundred fifty four thalassemia patients (56.5% male, 43.5% female) with a mean age of 22.84±6.06 years were involved in this study that was conducted in the period between Feb. to May, 2014. Anti - HCV antibody was determined by Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) and confirmed by western blot. Then, HCV - RNA was detected in 53.2% of anti - HCV positive thalassemia patients. HGV antibodies were evaluated by ELISA. Also, the HGV viremia was analyzed in patients with thalassemia by reverse transcription polymerase chain reaction (RT - PCR) protocol. Results obtained showed that the anti - E2 - HGV were found in 16 out of 154 (10.4%) thalassemia patients with significant decrease in its prevalence with increasing age, while HGV viremia was diagnosed in 28 out of 154 (18.2%) patients with thalassemia. No association of HGV infection was found with gender, age and frequency of blood transfusion.According to HCV and HGV infection status, thalassemia patients were categorized into four subgroups : subgroup I (HGV infection), subgroup II (HCV infection), subgroup III (co - infection of HCV and HGV), and subgroup IV (thalassemia patients with neither HCV nor HGV infection). Seven point one percent (7.1%) of thalassemia patients were found to be co - infected with HCV and HGV.In all thalassemia subgroups, liver transaminases; alanine transaminase (ALT) and aspartate transaminase (AST), alkaline phosphatase (ALP), and total serum bilirubin (TSB) were determined, in addition to measure serum ferritin levels by VIDAS. HCV infection shows significant increase in ALT level while in HGV is not. Co - infection with HCV and HGV decrease ALT levels when compared with infection with HCV alone, so HGV infection is suggested to have no role in increasing the severity of liver diseases in the thalassemia patients. In HGV infection, there were significant increase in ALP levels and significant decrease in ferritin levels than other subgroups in the study. However, HGV infection shows no significant differences in AST and TSB than other subgroups. The results of genotyping in 12 randomly selected patients showed presence of genotype 2 and genotype 5 with percentage of 91.7% and 8.3% respectively. The diagnosis of prevalence of HGV and HCV in patients with thalassemia in Iraq emphasized the importance of these lymphotropic viral hepatitis infections in pathogenesis and outcome of thalassemia patients.

دراسة التنميط الجيني لفيروس الSEN في متبرعي الدم الاصحاء ومرضى الثلاسيميا المصابين وغير المصابين بفيروس التهاب الكبد نمط ج واهميته السريرية == Genotypic Study Of SEN Virus In Healthy Blood Donors And Thalassemia Patients; With Or Without HCV Infection And Its Clinical Importance

اسم المؤلف: بشار منذر خزعل الزبيدي
اسم المشرف: اروى هادي الحمداني | اشنا جمال فائق
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Blood transfusion is one of the most common routes of viral hepatitis transmission among population. There are several diseases need continuous blood transfusions to manage the patient's condition; one of these diseases is ?thalassemia, so these patients are at increased risk of infection with blood transfusion transmitted agents. SEN - Virus is a DNA virus which is associated with acute post - transfusion hepatitis and the prevalence with the clinical importance and also the genetic characterization are still much unknown in Iraq; therefore, this study was designed to investigate the occurrence and the clinical importance of SEN - virus infection in healthy blood donors and thalassemia patients with or without HCV infection and then the study of the genome sequencing and the phylogenetic analysis of SEN - V clones. One hundred and fifty eight thalassemia patients (57.6% male, 42.4% female), with mean age of 16.8±8.5 year, and one hundred and fifty healthy blood donors with randomly selected persons (58.7%male, 41.3% female), with mean age of 16.7±8.6 year. All these samples involved in this study that were conducted in the period between January to June 2015. SEN - V had been identified by DNA extraction, DNA amplification by nested conventional PCR and then Agarose gel electrophoresis amplified DNA bands detection; while HCV was identified by RNA extraction, RNA reverse transcription into complementary DNA, DNA amplification by nested conventional PCR and then Agarose gel electrophoresis amplified DNA bands detection. Liver transaminases (Aspartate Transaminase and Alanine Transaminase) were determined, in addition of measure of serum ferritin levels by VIDAS. SEN - V was detected in 68 out of 158 (43%) thalassemia patients and 16 out of 150 (10.7%) blood donors. HCV prevalence was (11.4%) in thalassemia patients. There was significant increase observed in the occurrence of SEN - V or HCV infection with age but there was no significant difference observed in the occurrence of both with gender. The most important (hepatotropic) SEN - V genotypes were SEN - V - D and SEN - V - H and there were patients infected with D genotype or H genotype alone, while there were patients co - infected with D and H. According to HCV and SEN - V co - infection status, patients and controls subdivided into six subgroups : subgroup I was thalassemia HCV RNA + and SENV DNA +, subgroup II was thalassemia HCV RNA + and SEN - V - , subgroup III was thalassemia HCV RNA - and SEN - V DNA +, subgroup IV was thalassemia HCV RNA - and SEN - V - , subgroup V was control SEN - V + and finally subgroup VI was control SEN - V - . Statistical analysis revealed that there was significant increase in AST and ALT levels in subgroup I when compared with the other subgroups - that showed the increasing relationship in the case of infection with both viruses - and there were no any significant differences in ferritin levels among these subgroups. Moreover, there were no significant differences between SEN - V - D, SEN - V - H and SEN - V - D and H co - infected samples in AST, ALT and ferritin among thalassemia patients and controls. The results from the study of gene sequencing and phylogenetic analysis of samples of amplified SEN - V - D and samples of amplified SEN - V - H DNA which were selected randomly from blood donors and thalassemia patients infected with D or H genotypes alone or together (co - infection), revealed that the most transmission route of SEN - V D and H was blood transfusion that is because there was (99%) gene similarity between blood donors and thalassemia patients, furthermore SEN - V - D or SEN - V - H sequences of the co - infected persons were the same sequences of D or H genotypes alone and with the observations of similarity with neighboring countries.