عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 1,218

انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات ESKAPE من مرضى الاطفال في محافظة بابل == Antibiotic Resistances Patterns among ESKAPE group Pathogens Isolated from Pediatric Patients in Babylon Governorate

اسم المؤلف: امل محمد سعيد محمد جواد الموسوي
اسم المشرف: علاء هاني الجراخ | عدنان حنظل الجوذري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة للتحري عن انتشار مجموعة الممرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيويةESKAPE (الاسكيب) لدى مرضى الاطفال في محافظة بابل, العراق تم في بداية الدراسة جمع 191عينات سريرية مختلفة من مرضى الاطفال للفترة من تموز لغاية تشرين الثاني لسنة 2016. تم الحصول على النماذج من مرضى الاطفال بعمر من واحد يوم الى 14 سنة والوافدين لمستشفى التعليمي للولادة والاطفال (بصوره رئيسيه وحدة الخدج المنزلي, وحدة العناية المركزة, الردهات العامة) ومستشفى الحلة التعليمي (بصوره رئيسية وحدة الحروق). شملت النماذج المجموعة خلال الدراسة عينات الدم ,الادرار, سائل النخاع الشوكي, جروح الحروق، وغيرها تم اخذ المعلومات التالية من كل مريض تم ادراجه في الدراسة الحالية : الاسم, العمر, الجنس, العنوان , وزن الجسم, اخذ للقاح او لا, وجود او عدم وجود تشخيص سريري مؤكد, متعاطي للمضادات الحيوية او لا قبل اخذ النموذج من المرضى. بينت نتائج الدراسة انه من مجموع 191 عينة سريرية، ان 45 منها عينة بنسبة (23.5% ) اظهرت نمو بكتيري موجب على الاوساط الزرعية الاعتيادية وبالتالي الحصول على 45 عزله بكتيرية مشخصة بواسطة الاختبارات الكيميائية ,جهاز Vitek2ونظام .API تم الحصول على العزلات البكتيرية من عينات الادرار 16 (35.5%), الحروق15(33.3%), الدم13( (28.8% والسائل القصبي 1(2.2%)، فيما لم تظهر 146 عينه سريريه ( (76.4%نموا موجبا على الاوساط الزرعية وقد يعود السبب في ذلك لاحتمال وجود اصابه فطرية او فايروسية او لوجود بكتيريا شديدة التحسس fastidious bacteria والتي قد تكون فقدت اثناء نقل العينات الى المختبراو بسبب تعاطي المضادات الحيويه فبل اخذ النماذج. وجد انه من مجموع 191 عينة سريرية تم جمعها خلال الدراسة، فانه تم الحصول على 12 عزلة بكتيرية تابعة لمجموعة المرضات البكتيرية المقاومة للمضادات الحيوية (الاسكيب) وبنسبة6.3% ،بينما كانت نسبتها26.6% من النمو البكتيري الموجب, حيث تم عزلها من العينات وبواقع 6عزلات من جروح الحروق (50%) ,5 عزلات من الدم (41.6%) وعزلة واحدة من السائل القصبي (8.3%). اظهرت نتائج الدراسة الحالية انه من بين 12 عزلة بكتيرية (6.3%) تابعة لمجموعة الاسكيب فان اعلى نسبة عزل 33.4 %)) كانت لبكتريا S. aureus ، تلتها العزلات البكتيرية التابعة لانواع P. aeruginosa, K. pneumoniae وA. baumannii بينما لم يتم الحصول على عزلات تابعة للنوع البكتيري Enterococcus faeciumفي هذه الدراسة. اظهرت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب باستخدام نظام Vitek 2 - system للعزلات البكترية الموجبة والسالبة لصبغة كرام ان اعلى نسبة مقاومة للمضادات الحيوية كانت لبكتريا P. aeruginosa تليها العزلات التابعة لكل من K. pneumoniae,, S. aureus, E. cloacae وA. baumanniiعلى التوالي. وجد في هذه الدراسة ان 75 % من جميع العزلات السالبة لصبغة كرام ومن ضمنها العزلات التابعة لمجموعة الاسكيب P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A. baumannii كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف ، كما اظهرت النتائج ان جميع العزلات السالبة لصبغه كرام ضمن مجموعة الاسكيب كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز من نوع AmpC. كما بينت نتائج اختبار الحساسية الدوائية لمجموعة الاسكيب ان هنالك اختلافات في انماط المقاومة للمضادات الحياتية بين هذه العزلات، حيث وجد ان اعلى نسبة كانت لنمط متعدد المقاومة 10(%83.3) فيما احتل نمط واسع المقاومة نسبة 2 (16.6%), بينما لم يتم الحصول على عزلات ذات نمط كلي المقاومة في هذه الدراسة. وحسب ما تم الاطلاع من المصادر المعتمدة، فان هذه الدراسة تعد الدراسة الاولى في العراق والتي تتضمن التحري عن انماط مقاومة المضادات الحياتية لمجموعة الممرضات البكتيرية (الاسكيب) لمرضى الاطفال في العراق. | The present study aimed to investigate the prevalence of ESKAPE pathogens group : Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus. Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp. among pediatric patients in Babylon province, Iraq. Out of 191 different clinical samples were collected from pediatric patients during the a period of July 2016 till November 2016. Samples were obtained from aged from 1day till the age of pediatric patients 14 years old who admitted to Babylon teaching hospital for maternity and children (mainly in nursery neonatal care unit, intensive care unit, general wards) and Hilla teaching hospital (mainly in burn unit). Samples obtained included; blood, urine, cerebrospinal fluid, burns wounds and others (bronchial fluid, abscess) data like name, age, sex, residence, body weight, attending for vaccination program before or after, any clinical documented infection or not, and whether received antibiotics before or after, were taken from patients before sampling.Among 191 clinical samples, 45 (23.5%) gave positive growth on ordinary culture media, yielding 45 bacterial isolates, identified using biochemical tests,Vitek2 - system ID cards, and API system. The bacterial isolates were recovered form urine 16 (35.5%), burn wounds 15 (33.3%), blood 13(28. 8%), and bronchial fluid 1 (2.2%). Among 191 clinical samples, 146 (76.4%) gave no growth. The reason of negative culture may be attributed to fungal infection, viral infection, fastidious bacteria that might be lost during transporting or antibiotics usage before taking samples. Out of the total samples collection 191, ESKAPE pathogens group corresponded 12 isolates (6.3%) were recovered. While (26.6) from positive growth cultures. They were isolated from samples of burn wounds 6 (50%), blood 5(41.6%), and bronchial fluid 1(8.3%). Among 12 isolates of (6.3%) ESKAPE pathogens group from 191 recovered from clinical samples, S. aureus was recovered in high rate (33.4%) followed by P. aeruginosa, K. pneumoniae, and A. baumannii However, no isolate belonged to E. faecium was recovered in this study. Results of antibiotic susceptibility testing of ESKAPE pathogens group using Vitek 2 - system found that P. aeruginosa isolates showed high rate of antibiotic resistance, followed by K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae, and A. baumannii isolates respectively. Different antibiotic susceptibility patterns were recorded among ESKAPE pathoges group isolates. Multi drug resistance (MDR) was found in high rate 10 (83.3%), and extensively drug resistant (XDR) 2(16.6%) , However, no isolates belonged to pan drug resistant (PDR) were recovered in this study. In the present study found that high rate 6/8 (75%) from the all isolates of G - ve bacteria within ESKAPE pathogens group (P. aeruginosa, K. pneumoniae E. cloacae, A.baumannii) were ESBL - producers and all isolates were AmpC producer.According to we knowledge, this study is a first record of investigation the prevalence of pattern resistant bacteria among ESKAPE pathogen group in pediatric patients in Iraq

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Bacteroides fragilis المعزولة من النساء المصابات بالتهاب المهبل البكتيري == Molecular and Bacteriological Study of Bacteroides fragilis Isolated from Women with Bacterial Vaginosis

اسم المؤلف: زهراء قيس سلمان
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | بشرى جابر عمران
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت هذه الدراسة 150 مريضة يعانين من التهاب المهبل البكتيري ، تم جمع ما مجموعه 300 مسحة من عنق الرحم وافرازات مهبلية من هؤلاء المريضات بمعدل مسحتين اثنتين لكل مريضة و150 عينة دم جديدة تم جمعها من المريضات عند مراجعتهن الى مستشفيين في محافظة بابل هما : مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي ، ومستشفى الحلة التعليمي العام، و150 عينة دم جديدة كمجموعة سيطرة ، خلال الفترة من شباط الى تشرين الاول 2016. باستخام معايير امسلز تم تشخيص النساء اللواتي يعانين من التهاب المهبل البكتيري. وقد خضعت المسحات لطرق مختلفة لتحديد B.fragilis باستخدام الاساليب البكتريولوجية التقليدية. وجد ان 31 عزلة موجبة (20.6٪) باستخدام الاوساط الانتقائية. فضلا عن ذلك، تم تطبيق طرق الكشف الجزيئي باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16 sRNA ، وكانت 44 عزلة (29.33٪) ايجابية وتعود لبكتريا B.fragilis وكذلك استخدم المعلم الوراثي nanH حيث كانت 39 عزلة (88.6٪) ايجابية. بالاضافة الى ذلك، تم فحص العزلات المعزولة على الاوساط الانتقائية الخاصة بالبكتريا للكشف عن قابلية البكتريا للالتصاق (adherence ability) بالخلايا المخاطية. كما تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية (Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate (TCP) test اذ كانت مكونة للاغشية بنسبة (100%). حيث اظهرت العزلات 31 الموجبة المستخرجة من الوسط الانتقائي قدرة البكترياعلى تكوين ال Biofilm وكانت نسبة تكوين البيوفيلم (83.9٪) و(16.1٪) للوضع العالي والمعتدل على التوالي، في حين لم تكن هناك عزلات غير قادرة على تشكيل بيوفيلم. اما فيما يتعلق بتاثير بوفيدون - اليود بنسبة 10٪ على تكوين البيوفيلم، فقد اظهرت نتائج هذه الدراسة ان قدرة البكتريا على تكوينه قد تقلصت لتكون نسبة التشكيل قوي (6.5٪ (ومعتدل (71٪) و(22.6٪) لم يظهر اي تشكيل للبيوفيلم . تم فحص تاثير 10% povidone - iodine المستخدمة في الطب النسائي على انتاج الاغشية الحيوية . وقيمت الدراسة قابلية B.fragilis على انتاج bacteriocin وتاثيرها على بعض العزلات البكتيرية. اظهرت النتائج ان لعزلات البكتريا قدرة تازرية لتثبيط نمو العزلات المدروسة بنسب. فضلا عن ذلك، هدفت هذه الدراسة الى التعرف على علاقة التغايرالجيني(TLR - 4 Polymorphism) باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم (PCR - RFLP) .وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية وكانت نسب انتشارها في مجموعة المرضى CC(36.0%) وThr399Ile : CT(12.0%) ,TT(52%) بينما نسب انتشارها في مجموعة السيطرة كانت TT(34.0%) , CC(60.0%) and CT(6.0%) وقد اظهرت وجود اختلاف وهو اختلافا معنويا, فيما بلغت نسبة انتشار الاليل T في المرضى (58%) بالمقارنة للسيطرة (37%) مع وجود اختلاف معنوي .وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA(46.0%) ,GG(50.0%) and GA(4.0%) في مجموعة المريضات بينما في مجموعة السيطرة كانت نسب الانتشار AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) مع عدم وجود فارق معنوي بينهما , اما نسبة انتشار الاليل G (52%) في مجموعة المريضات بالمقارنة بمجموعة السيطرة (62%) ويعد فارقا معنويا بينهما . تناولت الدراسة تحليل تسلسل جينات معينة من عزلات B.fragilis وكشفت نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin حيث تم تحديدها في 117/117 (100٪ (بمقارنة تسلسلها مع تلك التي في قاعدة البيانات في بنك الجينات وكانت نسبة الثغرات بينهما (0)٪ ، اما بالنسبة للعزلة الثانية فقد تم التعرف على نتائج التحليل للاحماض الامينية لجين Enterotoxin في 116/116 (100٪) وبثغرات 0/116 (0٪)، اما بالنسبة لجين Phospholipaseتم تحديدها في 129/129 (100٪) مع ثغرات 0/1129 (0٪) لكل من العزلتين . اخيرا تم تحليل العلاقات التطورية بين العزلات محلية من B.fragilis والعزلات العالمية من B.fragilis باستخدام تسلسل الجينات لل Enterotoxin وPhospholipaseحيث اظهر تحليل تسلسل الحمض النووي لجين Enterotoxin ان عزلات B.fragilis المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بعزلة B. fragilis المسجلة عالميا (AB026625.1) و(U67735.1) ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور (0.01%) في حين ان نتائج تحليل النشوء والتطور من تسلسل جينات Phospholipase كشفت ان نفس العزلات المحلية (NO.1) و(No.2) كانت مرتبطة ارتباطا وثيقا بالعزلة المسجلة عالميا (CP011073.1) ، ونسبة التغير الجيني الكلي في شجرة التطور كانت (0.003 - 0.005%). | This study included 150 women with bacterial vaginosis (BV), a total of 300 swabs (as two high vaginal swabs for each woman and vaginal discharge ) were taken from each woman. In addition to fresh blood samples were collected from the same 150 women with bacterial vaginosis and 150 healthy women as control group , these women admitted to the out - patient clinics of Gynecology and Obstetrics , in two hospitals of Babylon Province : Babylon Maternity and Pediatrics Teaching Hospital, and Al - Hillah General Teaching Hospital during the period from February until October 2016. Women suffering from bacterial vaginosis were diagnosed according to Amsels criteria .The high vaginal swabs were subjected to different methods for identification of Bacteroides fragilis by using traditional bacteriological methods . It was found that 31(20.6%) isolates were recovered by using selective media . Furthermore , molecular detection methods was applied by using 16s rRNA gene ,where 44(29.33%) isolates were positive , and using nanH gene where 39(88.6%) isolates were positive out of the 44 isolates , these genetic markers were used for confirmation detection of B.fradilis isolates . In addition , the 31 isolates recovered from selective media were investigated to detect adherence of B.fragilis to mucosal epithelia cells .Also , biofilm formation was tested in semi quantitative microtiter plate test . The result revealed that all isolates were biofilm former , biofilm formation were accounted (83.9%) and (16.1%) for high and moderate mode respectively , while there were no isolates that do not express biofilm formation . Regarding on effect of 10% povidone - iodine on biofilm formation ,the result of this study demonstrated that internal douche effectively reduced the viability of biofilm forming to strong (6.5%) , moderate (71%) and (22.6%) shown no biofilm formation . The study was also evaluated the susceptibility of bacteriocin produced by B.fragilis on some isolates of bacteria . The result revealed that B.fragilis have synergistic ability to inhibition the growth of studied isolates with different ratios . Additionally, this study aimed to investigate the relation of Asp299Gly and Thr399Ile Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in the Toll - like receptor - 4 (TLR - 4) with the incidence of bacterial vaginosis .The result elucidated that at the site of Thr399Ile SNP, there were three genotypes for this SNP among patients ; TT,CC and TC with frequency of (52%) ,(36.0%) and (12.0%) respectively , whereas , the genotype frequency among control group were TT(34%) ,CC(60%) and TC(6.0%) with significance differences between patients and control . However, the frequency of allele T (mutant) was higher among patients (58%) than control (37%) with significant difference. The site of Asp299Gly SNP also showed three genotype among patients with frequency of AA(46.0%), GG(50.0%) and GA(4.0%) , whereas the genotype frequency among control group were AA(34.7%) , GG(59.3%) and GA(6.0%) with no significant differences between patients and control . Additionally , the frequency of allele G(mutant) was higher among control(62%) than patients (52%) with significant differences between them . The study deal with sequence analysis of specific genes of B.fragilis isolates revealed that the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 117/117(100%) by comparing its sequence with that in the database in gene bank by Blast program with gaps 0/117(0%) and for the second isolate the analysis results of amino acids for enterotoxin gene was identified in 116/116(100%) and with gaps 0/116(0%) , while for phospholipase gene was identified in 129/129(100%) with gaps 0/1129(0%) for first isolates.Finally ,the phylogenetic relationships between two local isolates of Bacteroides fragilis and Bacteroides fragilis global isolates were analyzed using the enterotoxin and phospholipase genes sequence. The DNA sequencing analysis of enterotoxin gene revealed that B. fragilis local number (No.1and No.2) isolates were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (AB026625.1) and (U67735.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis enterotoxin gene were show different out of tree at total genetic change (0.01%) , while the phylogenetic analysis results of phospholipase gene sequences revealed that B. fragilis local isolates ( No.1and No.2) were closely related to isolation B. fragilis recorded globally NCBI - BLAST B. fragilis (CP011073.1) , whereas other NCBI - Blast B.fragilis phospholipase gene showed difference out of tree at total genetic change (0.003 - 0.005 %).

الكشف الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه - النوع الاول والتعبير البروتيني ل P27, CDK6,CDK4 وBcl - 2 في سرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن == Molecular Detection of Human T Lymphotropic Virus Type - 1 (HTLV - 1) and Expressional Proteins of CDK4, CDK6, P27 and Bcl - 2 in Hodgkin?s and Non - Hodgkin?s Lymphomas

اسم المؤلف: نور سامي عبود الليباوي
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | شاكر حماد محمد العلواني
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: صممت هذه الدراسة على انها دراسة بحثية ذات اثر رجعي ,وسيطره . اذ اشتملت على120خزعة نسجية من منطقة الغدد اللمفاوية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البارافين.جمعت هذه النماذج من ارشيفات الانسجة المرضية لمختبرات مستشفى الحلة التعليمي/ محافظة بابل , مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة كربلاء ,مستشفى الصدر التعليمي/ محافظة النجف ,مستشفى الحسين التعليمي/ محافظة المثنى ومستشفى القادسية التعليمي/ محافظة القادسية وكذلك العديد من مختبرات الانسجة المرضية الخاصة الموجودة في بابل ,بغداد, كربلاء, القادسيه, المثنى اذ جمعت هذه العينات للفترة من اذار 2016 الى كانون الاول 2016. هذه النماذج تعود للمرضى المصابين بسرطان العقد اللمفاوية للسنوات من 2011 لغاية 2016 .قسمت هذه العينات حسب المجموعات التالية : - 1 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع هودجكن .2 - اربعون قطعة نسيجية لمفاوية مصابة بسرطان العقد اللمفاوية نوع اللاهودجكن .3 - اربعون قطعة نسجية لعقد لمفاوية (لايظهر عليها اي تغيرات مرضية نسيجية) ظاهريا سليمة استعملت كمجموعة سيطرة .بعد التقطيع النسيجي لخزع العقد اللمفاوبة وتصبيغها باستخدام صبغتي الايوسين والهيماتوكسلين تم اجراء الفحص التاكيدي الدقيق لغرض التشخيص النهائي من قبل اخصائي الامراض النسيجية لهذه الدراسة. تم تصميم الجانب العملي لهذه الدراسة الذي اتخذ مسارين رئيسين : - 1. التحديد الجزيئي للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بفحصها داخل خلايا الانسجة اللمفاوية حيث تم انجازه بوساطة استخدام تقنية التهجين الموضعي ذات الحساسية العالية .2. اجراء دراسة كيميائية - نسيجية مناعية لوصف الحالة التعبيرية ل CDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27) وفحص الجينات السرطانية للخلايا اللمفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن واللاهودجكن والعقد اللمفاوية السليمة ظاهريا (غير مصابة).ان مجمل النتائج التي تم الحصول عليها هذه الدراسة كانت كما يلي : 1 - نسبة الذكور( (57.5% المصابين بسرطان الغدد اللمفاوية الهودجكن واللاهودجكن ومجموعة السيطرة كانت اعلى من نسبة الاناث (42.5%) في هذه المجاميع الثلاثة. حيث كانت نسبة الذكور/اناث هي1 : 1.35.2 - اظهر الفحص النسيجي ان النسبة العليا من مرضى الهودجكن كان من الدرجة المنخفضة (42.5%) يتبعها الدرجة المتوسطة (35%) وادنى نسبة هي الدرجة العليا (22.5%). بينما النسبة العليا من مرضى اللاهودجكن كانت من الدرجة المنخفضة والمتوسطة %37.5)) وادنى نسبة هي الدرجة العليا ( 25%).ا - نتائج الفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة بالهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت ( 22.5%) 2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK4 ان 35% من الانسجة كانت موجبة .4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 57.5 % من الانسجة كانت موجبة . 5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ Bcl - 2ان47.5 % من الانسجة كانت موجبة .6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفيروس وCDK4 .7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للCDK4 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال CDK6 وBcl - 2.8 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة ل p27 وعمر المرضى. كذلك علاقة طردية بين p27 وBcl - 2.ب‌ - نتائج للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائية من النوع الاول وCDK4 وCDK6 ومثبط CDK (p27 ) وكذلك الجينات السرطانية للخلايا المفاوية B (Bcl - 2 ) في الانسجة المصابة باللاهودجكن : 1 - النتائج الموجبة لجين HBZ للفايروس البشري المتوجه للخلايا اللمفاوية التائيه من النوع الاول بتفاعل التهجين الموضعي كانت (45%) بينما لم تظهر اي حالة موجبة بتفاعل التهجين الموضعي للفايروس ضمن مجموعة السيطرة .2 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ p27 ان 42.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة للp27 بواسطة الاختبارالكيميائي النسجي المناعي ضمن مجموعة السيطرة.3 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـCDK4 ان 50% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.4 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي لـ CDK6 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة . بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السيطرة.5 - اظهرالاختبارالكيميائي النسجي المناعي ل Bcl - 2 ان 72.5% من الانسجة كانت موجبة. بينما لم تظهر اي حالة موجبة في هذا الاختبار في مجموعة السطرة.6 - تم تمييز علاقة طردية قوية تربط بين تحديد الفيروس وBcl - 2 وكذلك وجدت علاقة قوية طردية تربط بين الانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للفايروس وCDK6.7 - وجدت علاقة طردية قوية بين تحديد والانتشارالتعبيرالبروتيني والكثافة للBcl - 2 وCDK6 .وايضا وجدت علاقة بين تحديد وكثافة ال p27 وBcl - 2 فقط .كذلك وجدت علاقة عكسية بين عمر المريض وBcl - 2 .8 - تم تمييز علاقة طردية تربط بين كثافة CDK4 وp27 وكذلك بين CDK4 وBcl - 2

دراسة بكتيرية ووراثية لبكتريا Gardnerella vaginalis وعلاقتها بالولادة المبكرة == Bacteriological and Molecular study of Gardnerella vaginalis association with preterm labor

اسم المؤلف: ازل علاء عباس الربيعي
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | لميس عبد الرزاق عبد اللطيف
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: In this study , one hundred fifty samples were collected from paitents with preterm labor (PTL), who have been attending to Babylon Maternity and pediatric hospital and Al - Hilla Teaching Hospital, at the period from February to October 2016. Two swabs were collected one for culturing and the other for direct extraction for isolation Gardnerella vaginalis.Out of the 150 samples only 6(4%) on culture and 30 (20%) on molecular level isolated from preterm labor caused by Bacterial vaginosis , Urinary tract infection and aborted women. The results isolation and laboratory diagnosis as well as biochemical test approved that there is only 6 isolates belong to G.vaginalis confirmed by using Vitek 2 system and molecular detection by specific primers.Preterm birth is one of the most common causes of neonatal morbidity and mortality. Associated with sub sequent preterm labor in up to 40% of cases as shown in our resultsThe isolates are varied in their ability to produce sidrophore and extracellular protease in addition to their hemolytic activity .Adherence activity were investigated and indicate that G.vaginals have pili on her surface help her to attached and initiated infection Metronidazole was effective in prevent adherence at low concentration (5%) was 100% percentage.All isolates are able to produce biofilm in different level which provided as main step in pathogenesis caused it can evade and evoke the action of immune response and antibiotics , Alum , sodium chloride and sodium bicarbonate were shown very high effectively to eradicationSummaryIIG.vaginalis biofilm which gave results (0%) whereas the thymol extract (carvacrol) were moderate in action gave (50%) effect on Biofilm .Results also preveld that increased of pH value give a chance to overgrowth of G.vaginalis .The results indicated that Lactic acid considered as a limiting factors preventing growth of G.vaginalis when its grown with lactic acid , measured by optical Density (OD) the high production level is (1.901) in 2% concentration Whereas the lowest level is (0.32) in 10% concentration.Isolates Have ability to produce wide spectrum Bacteriocin which inhibited growth of both Gram positive and Gram negative bacteria that founded in vagina environment, Staphylococcus saprophyticus were the most bacteria that inhibited .extracted Vaginolysin was have a completed hemolytic activity in different temperatures (37 - 38 - 40 - 42). The results showed that its activity as were increased in high temperature.Recent study were clarified that purified vaginolysin was active in presence of cholesterol in media, gave (1.205) growth rate measured by the optical density at (100%) concentration. vaginolysin is cholesterol - dependent cytolysin (CDCs) toxin.Antimicrobial activity were investigated to the extracted Vaginolysin to evaluation of its activity depending on inhibition zone, the results showed that candida is more affective between the other microorganism gave (1.3)mm.Some virulence factor have been detected in molecular level ( Vly - SI - LuxS - LexA - rec a - Pl - Fur - Omp - Gal - protease ). Which wereSummaryIIIvaried in production may be as a results to the un presence of this gene in bacteria , may be silent gene or due to the amount of bacteria in sample are rare.Three Antibiotics were used at a molecular level (Tet b) were varied between resistance and sensitive to this gene (10) sample are resist,(RdxA) all sample are sensitive to its gene at percentage (100%), whereas (erna)gene were resist in all samples (100%).The results show there was no sequence homology between Mycoplasma spp. and G. vaginalis in the adhesion level this were detected by P30/P32 specific primer .The outcome of RFLPS - PCR is confirmed that G.vaginalis is virulent and have a role in preterm labor by degradation of membranes with the association of variable Silidase and presence of β - Galactosidase .MBL (mannose binding lectin ) levels were have a direct role pregnancy. It is also apparent that MBL plays a role in the defense against vaginal infection. MBL is essential to successful pregnancy in regards to maternal defense against infection, recent study indicate that MBL deficiency related to pregnancy outcome disorderedthis considered the first study of mannose in Iraq .DNA sequencing were done for two main virulence factor Phospholipase gene and Quorum sensing gene which showed some variation , then recorded in NCBI - gene sequencing as first descriped in Iraq.

التاثير المايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية == The Antimicrobial Effect of Silver Nano Particles (AgNPs) Against Pseudomonas aeruginosa Isolated from Clinical Samples

اسم المؤلف: سارة عقيل حسن التميمي
اسم المشرف: هدى هادي الحسناوي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت هذه الدراسة للكشف عن التاثيرالمايكروبي المضاد لدقائق الفضة النانوية ضد بكتريا الزوائف الزنجارية المعزولة من عينات سريرية, تم جمع 100 عينة من مصادر سريرية مختلفة, تضمنت العينات السريرية عينات الحروق , والادرار, والدم, واصابات الاذن, والقشع تم اخذ هذه العينات من المرضى الراقدين في مستشفى الحلة التعليمي خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى كانون الثاني 2017. زرعت جميع العينات على وسط السترمايد, وسط اكار الدم, وحضنت كل الاطباق هوائيا بدرجة حرارة C°37 لمدة 18ساعة. تم تشخيص بكتريا الزوائف الزنجارية بالاعتماد على الصفات المظهرية والكيموحيوية.كان توزيع العزلات كالاتي : 22(52.4%) من عينات الحروق, 8(19%) من عينات الادرار, 14.3)6%) عينة من المرضى المصابين بالالتهاب الاذن الخارجية, 4(9.5%) من عينات الدم,2(4.7%) من عينات القشع. اظهرت نتائج اختبار الحساسية باستخدام طريقة الانتشار في الوسط ان جميع العزلات(26) كانت مقاومة لكل من الببراسلين (100%), السيفوتاكسيم (100%),بينما نسبة المقاومة لكل من الاميكاسين (88%), سيفترياكسون (65%), جنتامايسن (62%), بينما وجدت نسبة مقاومة قليلة للسفتازديم (15%), وكل العزلات كانت حساسة (100) لكل من الميروبينيم, اوفلوكساسين, نورفلوكساسين والسبروفلوكساسين. تم في هذه الدراسة ايضا الكشف عن تكوين الاغشية الحيوية بواسطة طريقتين : طريقة الطبق الزرعي النسيجي (TCP) وطريقة صبغة الكونكو الحمراء (CRA) فكانت النتائج كالاتي : وجد ان في طريقة الطبق الزرعي النسيجي كانت جميع عزلات الزوائف الزنجارية والبالغ عددها (9) منتجة للاغشية الحيوية, (4) من اصل (9) (44%) من عزلات الزوائف الزنجارية انتجت مستعمرات سوداء بواسطة طريقة صبغة الكونكو الحمراء. وكذالك في هذه الدراسة تم الكشف عن تاثير جزيئات الفضة النانوية ((AgNPs على تكوين الاغشية الحيوية باستخدام تراكيز مختلفة (µg/ml 2.5, µg/ml 5, 10 µg/ml, 20µg/ml),حيث اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التركيز (20) وبنسبة تثبيط (100%), من جهة اخرى تم اختبار التاثير البكتيري المضاد لجزيئات الفضة النانوية ضد مختلف انواع العزلات البكتيرية باستخدام طريق التخافيف في الوسط الصلب وتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (12.5 µg/ml, 25 µg/ml, 50 µg/ml, (100 µg/ml, 200 µg/ml وكانت العزلات كالتالي : ـ(S. aureus, E. coli, E. cloacae, K. pneumonia, P. aeuroginosa)اظهرت النتائج ان اعلى فعالية لجزيئات الفضة النانوية كانت عند التراكيز(100 µg/ml, 200 µg/ml).ايضا تم تعريض ظاهرة السوارمنك في عزلات الزوائف الزنجارية لتراكيز مختلفة من جزيئات الفضة النانوية (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml ), ووجد ان اعلى نشاط لجزيئات الفضة النانوية ضد ضاهرة السوارمنك وانتاج البايوسيانين كانت بتركيز ((10 µg/ml, 5 µg/ml .تم زراعة جميع عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية (26)عزلة بوجود نترات الفضة (AgNO3) بتراكيز تتراوح (100 µg/ml - 400 µg/ml ) باستخدام طريقة التخافيف في الوسط الصلب مع قدرات مختلفة لانتاج البيوسيانين. اظهرت النتائج ان جميع العزلات 26((100 المنتجة للبايوسيانين كانت مقاومة للسلفر نايتريت (AgNO3) من خلال ظهور نمو في الطبق الحاوي على التراكيز المذكورة نترات الفضة (AgNO3).في هذه الدراسة تم اختبار بكتريا الزوائف الزنجارية لانتاج البكتريوسين باستخدام عزلات بكترية مختلفة تضمنت العزلات (امعائية مذرقية,مكورات العنقودية الذهبية,اشريكية قولونية, كلبسيلة رئوية). كذلك تم العثور على مجموعة واسعة من منطقة تثبيط (24mm - 30mm) في الانواع البكتيرية اعلاه مع قطر (30mm, 28mm, 24mm, 30mm) على التوالي. عزلات (امعائية مذرقية, كلبسيلة رئوية) كانت الاكثر تاثر والتي انتجت قطر تثبيط ((30mm. في هذه الدراسة ايضا تم تقييم علاقة مقاومة الفضة مع انتاج بيوسيانين في بكتريا الزوائف الزنجارية متعددة المقاومة للمضادات الحيوية. في هذه الدراسة تم استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتاكد من وجود بعض الجينات. في هذه التقنية، تم فحص جينات bla - IMP)) التي تشفر الى انزيم ميتالو - β - لاكتاميز المسؤول عن مقاومة ايميبينيم وجينات (silS ,silE) التي تشفر لمقاومة الفضة في عزلات بكتريا الزوائف الزنجارية بواسطة استخدام برايمرت خاصة. وقد وجد ان جميع العزلات ال 26 (100%) من بكتريا الزوائف الزنجارية كانت سلبية لهذه الجينات. كما تم استخدام اثنين من البرايمرات المحددة للكشف عن فينازين (بيوسيانين) (phzS, phzM). اظهرت النتائج لل (phzM) ان من اصل 26)) عزلة , 21 (80.8%) اعطت نتيجة ايجابية, , فيما يخص (phzS gene) وجد ان 14(% 53.9) عزلة كانت حامله لهذا الجين . والخاتمة ان جزيئات الفضة النانوية (AgNps) تمتلك تاثير ضد الاغشية الحيوية وايضا لها تاثير بكتيري مضاد ضد بكتريا الزوائف الزنجارية وانواع بكتيرية اخرى, والتي من الممكن استخدامها كعلاج بديل. فيما يخص انتاج البايوسيانين ومقاومة الفضة، ظاهريا كان هناك تاثير البايوسيانين على مقاومة الفضة ولم تكن مقاومة الفضة بسبب نقل وجود جينات (silS, silE). | This study was conducted to detect the antimicrobial effect of silver nanoparticles (AgNPs) against Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples, total of 100 specimens were collected from different clinical sites included urine, burns, ear, blood , and sputum. The specimens were taken from patients admitted to Al - Hilla Teaching Hospital during a period extended from November 2016 to January 2017. All specimens were cultured on selective medium (cetrimide agar), blood agar, then incubated at 37°C for 18 hr. The isolated of P. aeurginosa were diagnosed depending on morphological and biochemical characteristics.The distribution of P. aeurginosa isolates was as follows : 22(52.4%) isolates from burns, 8(19%) isolates from urine, 6(14.3%) isolates from patients with otitis externa, 4(9.5%) isolates were isolated from blood and 2(4.7%) isolates from sputum. Antibiotic susceptibility test using disc diffusion test revealed that all isolates (26) were resistant (100%) to Piperacillin, Cefotaxime. While the resistance rate for Amikacin (88%), Ceftriaxone (65%), Gentamicin (62%), but low resistance rate was found to Ceftazidime (15%) and all isolates were sensitive (100%) to Meropenem, Ofloxacin, Norfloxacin and Ciprofloxacin. The biofilm formation in P. aeurginosa isolates was investigated by two methods include, tissue culture plates method (TCP) and congo red agar method (CRA). The results showed that all isolates 9 (100%) were found to be biofilm producer when investigated by TCP assay, and 4 out of 9 (44. %) isolates of P. aeurginosa were producing black colonies when detected by CRA method.The effect of AgNps on biofilm formation was tested by using different concentrations of silver nanoparticles (2.5 μg/ml, 5 μg/ml,10 μg/ml, 20μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of 20 μg/ml, with an inhibition rate of 100%. On the other hand the antibacterial activity of AgNps was tested against different bacterial species isolates (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomnas aeurginosa) using agar dilution method with different concentrations of silver nanoparticles (12.5 μg/ml, 25 μg/ml, 50 μg/ml, 100 μg/ml, 200 μg/ml). The results showed that the highest activity was at a concentration of (100 μg/ml and 200μg/ml). On the other hand Swarming motility in P. aeruginosa isolates was detected and subjected to different concentrations of (AgNps) (2.5 µg/ml, 5 µg/ml, 10 µg/ml), it was found that the highest activity of AgNps against swarming motility and pyocyanin production of P. aeurginosa was at a concentration of (5 µg/ml, and 10μg/ml).The relation of silver resistance with pyocyanin production in P. aeruginosa was assessed. Screening test for silver resistance was performed by agar dilution method, all (26 isolates) of P. aeruginosa were cultivated in the presence of AgNo3 at a concentration (100 µg/ml - 200 µg/ml, 400µg/ml) using agar dilution method with differing capacities for pyocyanin production. All isolates of P. aeurginosa 26(100%) that produce pyocyanin were found to be resistant to AgNo3.In this study P. aeruginosa isolates were tested for bacteriocin activity by the agar well diffusion method using different bacterial isolates : E. coli, K. pneumoniae, S. aureus, E. cloacae. Wide range of inhibition zone (24mm - 30mm) was found against above bacterial species with diameter (28mm, 30mm, 24mm, 30mm), respectively. The most affected bacteria were K. pneumoniae and E. cloacae isolates, which produce inhibition zone (30)mm.PCR technique was used in this study for investigation some genes. In this technique, blaIMP gene that encode Metallo - β - lactamase enzyme responsible for imipenem resistance and (silE and silS) genes that encoding silver resistance were investigated in P. aeuroginosa isolates by using specific primers. It was found that all 26 (100%) isolates of P. aeuroginosa were negative for these genes. Also two specific primers were used to detect phenazine (pyocyanin) modifying genes (phzM, phzS). According to phzM gene, it was found that out of 26 P. aeuroginosa isolates, 21 (80.8%) isolates gave positive results at 330 bp, in regard to phzS gene, it was found out of 26 P. aeurginosa isolates, 14 (53.9%) isolates gave positive result at 664 bp.In conclusion AgNps have an antibiofilm, antibacterial activity against P. aeruginosa and different bacterial species that could be used as an alternative therapy. In regard to pyocyanin production and silver resistance, phenotypically there was effect of pyocyanin pigment on silver resistance and the silver resistance was not due to carriage of silE, silS genes.

التشخيص والتوصيف الجزيئي لبكتريا Clostridium perfringens المعزوله من حالات مرضية سريرية في مدينة الحلة == Molecular Diagnosis and Characterization of Clostridium Perfringens from Clinical Samples in Al - Hilla city

اسم المؤلف: علياء محمد حمود الشمري
اسم المشرف: علاء هاني الجراخ | ميساء صالح الشكري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة لمعرفة وبائية بكترياC. Perfringens في العينات المؤخوذة في محافظة بابل. تم جمع 140عينة من الجروح العميقة من المرضى الداخلين في مستشفيات مدينة الحلة الرئيسية (مستشفى الحله التعليمي ومدينة مرجان الطبيه) والذين يعانون من مرض السكري المزمن وايضا من مرضى تعرضوا الى طلق ناري فضلا عن المرضى الذين يعانون من التهاب الخلوي اللاهوائي في الجلد(anaerobic cellulitis ) للفترة من شهر شباط ولغاية شهرتشرين الاول 2016. بالاضافه الى ذلك تم تشخيص وعزل بكترياC. perfringens بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية من خلال طرق التنمية على الاوساط الزرعية الاختيارية لهذه البكتريا واظهرت النتائج الحصول على 3 (2.14%)عزلات كان عزل اثنان منها 1.42%)) من مرضى السكري المزمن اما العزله الثالثه (0.72%) فقد تم الحصول عليها من الذين تعرضوا لطلق ناري في حين لم يتم الحصول على عزلات من المرضى الذين يعانون من الالتهاب الخلوي اللاهوائي . وكذلك تم تاكيد التشخيص باستخدام المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA وجين16S - 23S spacer rRNA حيث اظهرت النتائج, من اصل 140 عزلة فان 7 عزلات تعود لبكتريا C. perfringens. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا واختبار قابليتها على انتاج انزيم (phpspholipase C) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم. كما تم الكشف عن حساسية عزلات البكتريا اللاهوائية تجاه 24 مضادا حيويا. بينت نتائج الدراسة ان جميع العزلات اظهرت حساسية عالية (100%) تجاه كل من penicillins .مثل benzypencillin, ,amoxicillin فضلا عن حساسيتها تجاه  - lactamase inhibitor مثل Ampicillin - sulbactam وحساسيه عالية لكل من metronidazole وaminoglycosidesومن ناحية اخرى، اظهرت جميع العزلات مقاومة عالية لكل من مضادات tetracyclin, Linezolid, levofloxacin, erthromycin بينما اظهرت هذه العزلات تغاير في درجات المقاومة تجاه مضادات pipracillin, Clindamycin, and Impenem.تم استخدام الطرق الوراثية في الكشف عن جينات المقاومة للمضادات الحياتية كجيناتM,Q,W,B) ) tet الخاصة بالكشف عن المقاومة للتتراسايكلين وجينات erm(A,B) للكشف عن المقاومة للكلندامايسين وجين nim للكشف عن المقاومة للمترونيدازول حيث اظهرت النتائج ان الجين tet M كان ذا سيادة عالية بنسبة 71.42 %تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي لتوكسينات البكتريا (alpha,epsilon, iota) للاستدلال على وجود جينات (cpa, etx, iap)، في C. perfringens وبنسبة 100%, 28.4%, 28.4% )) على التوالي.بالاضافة الى ذلك تم استخدام جينات cpa, etx and iap لقياس تعاقب القواعد النيتروجينية للمادة الوراثية للعزلات المدروسة فضلا عن تسجيلها في بنك الجينات العالمي ( ,(Gene Bank,اذ تم خلال هذه الدراسة ولاول مرة في العراق، الحصول على خمسة ارقام انضمام الى بنك الجينات العالمي (5 accession numbers)، حيث تم نشر هذه الارقام في بنك الجينات الامريكي gene bank - NCBI وهذه الارقام هي : جينiap : KY523199, KY523200 اما فيما يخص الجينetx فكانت الارقام هي : KY523201, KY523202 وفيما يخص الجين cpaفكان رقم الانضمام هو : . KY523203تعد هذه الدراسه انها اول دراسه في العراق تضمنت تحليل , دراسه تعاقب القواعد النايتروجينية للمادة الوراثية فضلا عن التسجيل في بنك الجينات العالمي لسموم عزلات محلية من بكتريا C.perfringens معزولة من عينات سريرية. | This cross sectional and hospital - based study aimed to studying the incidenceof Clostridium perfringens in clinical samples in Babylon province. A total of 140 wound swabs were taken from patients admitted to two main hospitals in Hilla city, Iraq (Hilla Teaching Hospital and Medical Marjan City), during the period from February to October 2016. Swabs were collected from diabetic patients, anaerobic cellulitis, and bullet wounds. These wound swab samples were subjected to different methods for identification of C. perfringens according to standard method. It was found that 3 (2.14%) C. perfringens isolates were recovered, of which 2 isolates (1.42%) were obtained from diabetic patients, 1 isolates (0.72 %) from bullet wounds, No isolates are recovered from the other clinical samples (cellulitis). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA, 16S - 23S intergenic spacer rRNA genes as a genetic marker for confirmation of detection of C. perfringens isolates,7 isolates of C. perfringens out of 140 are detected by using PCR with specific primer.The study also focuses on the ability of this bacteria to produce Phospholipase C and it was found that all isolates are positive for this enzyme (100%) . The results of antibiotic susceptibility testing using Vitek 2 system and disc diffusion method (DDT) of C. perfringens isolates (No.= 3) against 24 antibiotics showed that all isolates were highly sensitive to penicillins, (benzylpenicillin, and amoxicillin), all isolates (3/3) were sensitive to  - lactamase inhibitor such as Ampicillin - sulbactum. They were more susceptible to metronidazole and aminoglycosides in (3/3). On the other hand, all isolates were highly resistant to tetracycline, Linezolid ,levofloxacin, and erythromycin However, these isolates expressed different degree of susceptibility towards other antibiotics (Clindamycin, piperacillin and Imipenem). Molecular detection of C. perfringens of antibiotic resistance genes had been investigated and it had been found that tetracycline resistance gene tet M is the most commonly observed (71.42%) among ribosomal protection genes among C. perfringens isolates. While all isolates (7) gave negative results for other tetracycline resistance genes (tet W and Q, tet B, erm(A), erm(B),nim gens).Furthermore, detection of clostridial toxin (alpha, epsilon, iota toxins was applied using specific genes (cpa, etx, iap) and the results showed that the rate of the presence of these genes are : 100%, 28.8% and 28.4% respectively. The following genes : cpa, etx and iap were used for sequencing analysis, registration in gene bank - NCBI. Five accession numbers were obtained from registration of five sequences of these three genes at gene bank - NCBI : iap gene; accession numbers are : KY523199, KY523200etx gene; accession numbers are : KY523201, KY523202cpa gene; accession number is : KY523203. This is the first study in Iraq which employed analysis sequencing and registration in gene bank - NCBI, of clostriaial toxin of local isolates of C. perfringens obtained from clinical samples

دراسة فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية مع التهاب الاذن الوسطى القيحي في الاطفال == Study of Parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes with suppurative otitis media in children

اسم المؤلف: ايام محمد صالح علي العامود
اسم المشرف: جواد كاظم طراد الخفاجي | غانم عبود المولى
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى التحري عن دور فيروس نظير الانفلونزا وبكتريا المسبحيات القيحية Streptococcus pyogenes في الاطفال الذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي . جمعت 200 عينة (ثلاث مسحات لكل مريض تضمنت مسحة من افرازات الاذن ومسحة من افرازات الانف لدراسة الفيروس ومسحة من افرازات الاذن لدراسة البكتريا و50 عينة دم) من 50 مريض يعانون من التهاب الاذن الوسطى القيحي احيلوا الى مستشفى الحلة التعليمي في محافظة بابل للفترة من شباط (2016) لغاية ايار (2016). والذين يعانون من التهاب الاذن الوسطى. وتضمنت الدراسة 32 عينة ماخوذه من اشخاص اصحاء كمجموعة سيطرة وتم تقسيمهم الى ست مجاميع عمرية بنفس طريقة تقسيم مجاميع المرضى. شملت الدراسة اربعة اجزاء رئيسية : اولا التشخيص الفيروسي اعتمد على التقنيات المتقدمة (العزل الاولي باستخدام فحص التالق المناعي المباشر لتحديد وتمييز الانواع الثلاثة لفيروس نظير الانفلونزا 1,2, and 3 والتشخيص الجزيئي بواسطة استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي لتحديد وتمييز الانواع الاربعة للفيروس1,2,3, and 4 وتم استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لمشاهدة جزيئة الفيروس . والجزء الثاني فحص البكتريا باستخدام فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 system وتم التحري ايضا عن انزيم الهيمولايسين حيث كانت جميع العزلات منتجه لهذا الانزيم . التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود الجين mga بواسطة تقنية سلسلة تفاعل انزيم البلمرة .الجزء الثالث شمل وجود الفيروس والبكتريا في عينات الاذن للمرضى المصابين بالتهاب الاذن الوسطى . الجزء الرابع تضمن دراسة مناعية لمعرفة دور الحركيات الخلوية IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8, and CD56))عند الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم وباستخدام تقنية التالق المناعي المباشر لفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الثلاثة (hPIV 1,2,3) كانت نسبة الاصابة 64% (اي 32 طفلا من اصل من اصل50) وعند استخدام فحص تفاعل سلسلة انزيم البلمرة بالوقت الحقيقي ( (RT - PCR وجد ان نسبة الاصابة بفيروس نظير الانفلونزا بانواعه الاربعة (hPIV_1,2,3 and 4) 44% ( اي 22 من 50) تضمنت الدراسة استخدام المجهر الالكتروني النفاذ لرؤية جزيئة فيروس نظير الانفلونزا في افرازات الاذن . اظهرت نتائج التشخيص البكتيري ان نسبة الاصابة بالمسبحيات القيحية هي 14%(7 من 50) بعد زرعها على وسط اكار الدم وحضنت لمدة 24 ساعة بدرجة 37 وتم فحصها بواسط المجهر الضوئي بعد تصبيغها بصبغة كرام , تم التشخيص بواسطة استخدام فحص Bacitracin sensitivity وفحص انتاج انزيم الهيمولايسين على وسط الدم بواسطة فحوصات الكيموحيوية وفحص Vitek 2 systemاظهر التشخيص الجزيئي للكشف عن وجود mga جين ان جميع العزلات تحتوي على هذا الجين اي نسبة 100% .كما اظهرت الدراسة ان نسبة وجود الفيروس مع البكتريا في في سوائل الاذن بنسبة (16%)( . 4 وكانت نسبة وجود الفيروس (72%) 18وشملت الدراسة ايضا فحص الحركيات الخلوية بواسطة فحص الامتصاصية المناعي المرتبط بالانزيم واظهرت النتائج ارتفاع مستوى السايتوكينات في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء وكان اعلى مستوى لانترليوكين 6 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو) 88.24 )و (100.95) 1Pg/ml على التوالي . في حين كان اعلى مستوى لعامل النخر الورمي نوع الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (99.35 ) و(109.81 ) Pg/ml على التوالي. وكان اعلى تركيز لانترفيرون الفا في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو( 217.16) و(( 197.84 Pg/ml على التوالي . واظهرت النتائج ان تركيز الواسمين المناعيين CD8 وCD56 ان تركيزهما اعلى في مصل مرضى التهاب الاذن الوسطى مقارنة مع الاشخاص الاصحاء , اظهرت النتائج ان تركيز CD8 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو ((11.46±1.49 و(14.76±1.73) ng/ml على التوالي . في حين كان تركيز CD65 في امصال مجموعة المرضى المصابين بفيروس نظير الانفلونزا للذكور والاناث هو (12.82±1.62 )و (10.59±1.19) ng/ml على التوالي | This study aimed to detect the role of of parainfluenza virus and Streptococcus pyogenes in children suffering from suppurative otitis media. A total of two hundred sample (three swab for each patients include ear swabs , nasopharyngeal secretion for viral study and ear swab for bacterial study and 50blood sample) , were collected from 50 patients suffering from suppurative otitis media attending to AL - Hilla Teaching Hospital in Babylon - Iraq during the period from February 2016 to May 2016. The study includes 35 samples obtained from healthy subject as control group that classified to six group according to age in similar way of patient's with parainfluenza virus infection group years old The study includes four main parts .First one is the viral diagnosis based on relied diagnostic procedure ( Primary detection of parainfluenza virus in ear discharge by direct Immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types, molecular diagnosis by Real - Time PCR technique for the qualitative detection and differentiation of Parainfluenza Virus 1, 2, 3, 4 and diagnosis of parainfluenza virus by transmission electron microscope. The second part includes the bacterial diagnostic based on relied diagnosis procedure (using conventional biochemical reaction and commercial kit (Vitek 2 system). The heamolysis on blood agar was also observed in all isolates. Molecular detection of mga virulence gene for Streptococcus pyogenes was detected using conventional PCR technique. The third part is Co - infection between GAS and HPIV in OM specimens of children with suppurative OM. The fourth part is an immunological study to investigate the role of cytokines (IL - 6, TNF - α, IFN - α, CD8 and CD56) in HPIV infection by ELISA assay . Direct immunofluorescence for parainfluenza virus 1, 2 and 3 types antigen was positive in 64% (32 out of 50) , when we use Real - time reverse transcription PCR(RT - PCR) the percent of children infection with HPIV1, 2, 3, and 4 was 44% (22 out of 50). The study also include the use of transmission electron microscope for visualized the parainfluenza virus particle in ear swab. Streptococcus pyogenes isolates was detected in 14%(7 from 50) the isolate were confirmed after culturing on the blood agar and incubated for 24 hour at 37ºC, then microscopically by Grams̕̕ staining. Identification was done using commercially prepared bacitracin and the type of hemolysis on blood agar by primary biochemical test and confirmatory identification by vitek2 system compact. Molecular Identification of mga gene for Streptococcus pyogene showed that all Streptococcus pyogenes positive result 100%. The occurrence of Bacterial and viral co - infection in middle ear fluids which have been observed in 16% (4 out of 50 cases). HPIV was identified as a single agent in ear swab in 72%(18 out of 50). The study include estimation of some immunological parameter include (IL - 6, TNF - α, IFN - α , CD8 and CD56 ) using ELISA and revealed elevation the concentration of cytokines in sera of otitis media patients in comparison with healthy control groups. The concentration of IL - 6 is higher in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. The high level of IL - 6 Pg/ml in otitis media patients for male and female was (88.24) and (100.91) Pg/ml respectively. Also level of TNF - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (99.3) and (109.8) Pg/ml respectively . The level of IFN - α Pg/ml in otitis media patients for male and female was (217.16 )and (197.84 )Pg/ml respectively. The results also show elevation concentration of CD8 and CD56 in sera of otitis media patients with parainfluenza virus than healthy control group. For CD8 ng/ml in otitis media patients for male and female was(11.46) and (14.76)ng/ml respectively. The level of CD56 ng/ml in otitis media patients for male and female was (12.82) and (10.59)ng/ml. respectively.

الكشف عن اللولبية البوابية في خزعة المعدة ودراسة مستوى P53 وطفرات مورثة Bax المرتبطة بالقرحة الهضمية == Detection of Helicobacter pylori in Gastric Biopsy and Study the Level of P53 and Bax Gene Mutations Associated With Peptic Ulcer

اسم المؤلف: اصيل هاشم راضي السعبري
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | مشتاق عبد العظيم وتوت
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اللولبية البوابية هي بكتريا سالبة لصبغة كرام, الذي تصيب غالبية سكان العالم وتسبب امراض مختلفة مثل التهاب المعدة المزمن, القرحة الهضمية وسرطان المعدة. في حين ان غالبية الناس المصابين بالبكتريا اللولبية لا تظهر عليهم اعراض مرضية. ان العوامل الرئيسية التي تحدد تطور الامراض ذات الصلة بالبكتريا اللولبية قد تكون ضراوة البكتريا, وعوامل المضيف الوراثية والبيئية.الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن اللولبية البوابية في انسجة المعدة ودراسة عوامل الضراوة الرئيسية لهذا الممرض والعوامل الوراثية للمضيف في المرضى الذين يعانون من اعراض اصابات المعدة والاثني عشري. وتشمل الطرق الجزيئية ايضا تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) للكشف عن جينات التشخيص والضراوة لبكتريا اللولبية البوابية وتقنية (SSCP) تم القيام بها للكشف عن الطفرات الجينية ل P53 وال Bax جين التي قد تترافق مع عدوى اللولبية البوابية.بلغ العدد الكلي للنماذج (الخزعات) المعوية 180 نموذج. فقط 92 خزعة معدة (51 ٪) اعطى نتيجة ايجابية لللوليبيات البوابية (Helicobacter pylori ) للتشخيص بواسطة التقنية الجزيئية, مع ذلك من بين هذه النتائج الايجابية 60% منها اعطى نتيجة ايجابية للزراع, التي تعتمد على الميزات الكيميائية الحيوية. كما تم اخذ 100 عينة مصل الدم من افراد اصحاء مع عدم وجود تاريخ عدوى بالبكتريا اللولبية كمجموعة سيطرة ونتائج اختبار الاجسام المضادة على اساس (اختبار المصلية) اعطت نتائج سلبية للبكتريا اللولبية.قد تم ملاحظة وجود تكرار عالي للولبية البوابية بالتهاب المعدة المزمن الذي يشكل 88٪ بينما التكرار القليل كان مقداره 3٫3٪ لسرطان المعدة في حين ان 8٫7٪ كان لقرحة الاثنى عشري. وقد كان التكرار العالي لعدوى اللولبية البوابية بين المصابين الذكور اكثر من الاناث, ويعود سبب ذلك لعدة عوامل مثل (متوسط العمر الاجتماعي والاقتصادي ونقص التغذية وسوء النظافة) ويعتبر التدخين احد العوامل الاضافية المرتبطة مع انتشار عدوى (اللولبية البوابية ) بسبب السلوكيات غير الصحية المرافقة للتدخين , والتي قد تشمل نقل البكتيريا من خلال اللعاب بين المدخنين. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان معدل العدوى العالي للمجموعة العمرية (31 - 50) سنة الذي تم تسجيله كان 44٫6٪. علاوة على ذلك فان الكشف عن اللولبية البوابية بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة PCR)) قد اجريت على جميع انواع خزعات المعدة وجين (ure C ) اضافة الى جين (ure A ) اللذان يستخدمان كعلامات للتشخيص التاكيدي للولبية البوابية من خلال استخدام (primers ) خاص لتقنية PCR. وضحت النتائج ان 84٫8٪ و73٫9٪ للولبية البوابية كانت ايجابية لكلا الجينين. للعينات التي اعطت نتائج ايجابية (للتضاعف الجيني amplification ) بواسطة (PCR ), كان 56 عينة ما يمثل (60٪) قد اعطت استجابة لنتائج الزرع. اضافة الى التضاعف بواسطة PCR لعلامات جين (ure C ) وجين (ure A ). اضافة الى ذلك ,المعدل الايجابي للولبية البوابية للخزعات تحت الاختبار كان 51٪ بالاعتماد على الكشف الجزيئي المباشر بواسطة (PCR) باستخدام جين (ure A) وجين (ure C ). علاوة على ذلك, تم فحص جين (cag A) لكل عينات اللولبية البوابية التي تم عزلها. اشارت النتائج الى ان65 عزلة (70٫6٪) كانت ايجابية لتضاعف (PCR ) للجين من نوع cagA) ) حيث ان عزلة 56 (60٫8٪) كانت ايجابية لتضخيم (PCR ) للجين من نوع (cag E ). من بين النتائج الايجابية التي تم عزلها 49 عزلة (53٫3٪) كانت قد اعطت نتائج ايجابية للجين من نوع (cag A ). كذلك وجد تكرار الجين (vac A ) مقداره في الدراسة الحالية 68٫5٪ (63/92). اضافة الى كل اللولبيات البوابية الايجابية لخزعة المعدة 49 (53٫3٪) اظهرت اشارة كاملة للجينات نوع (cagA, cagE وvacA (. بالنسبة للعينات المعدية المتبقية 27 عينة (30٫4٪) التي تحوي سلالات سلبية كانت سلبية للجين (cag E). وقد تم تحديد طفرات جين (p53) في الاكسونات 5 و6و 7 و8 باستخدام طريقة SSCP. ومع ذلك تم استخدام PCR لتضخيم الاكسونات 5 و6 و7 و8 للجين (p53) التي من المعروف انها بقع ساخنة طافرة .تحليل PCR - SSCP يكشف تعديلات في الجين (p53) في عدة اكسونات. حيث ان ستة عشر من التعديلات في الاكسون E5A , سبعة عشر التعديلات في الاكسون E5B6A, وكذلك سبعة عشر التعديلات في الاكسون E7 وتعديل واحد فقط في الاكسون E6B لكن لم يظهرتعديل في الاكسون E8 في الجين (p53). بنفس الاسلوب ان تحليل PCR - SSCP كشف عن تعديلات في جين bax في الاكسونات E1 وE4 وE6. ويظهر ذلك في الاشكال. فيما يخص الاكسون 1 في bax يمكن ملاحظة وجود 6 نماذج فقط تعطي طفرات موضع ايجابية للجين. قد يعزى ذلك الى اللولبية البوابية التي تحفز طفرة bax من خلال قابليتها على انتاج بروتين cag A الذي له القابلية على تغيير التسلسل الجيني والوظيفة. واستنتجنا الى ان التشخيص الجزيئي قدم دليلا توكيديا على وجود اللولبية البوابية في عينات المعدة. ايضا قد تؤثر السلالات الاكثر ضراوة على تحفيز طفرات جينية في جينات ال p53 وال bax. | Helicobacter pylori is a gram - negative bacteria which infects a majority of the world population. It causes various diseases such as chronic gastritis, peptic ulcer and gastric cancer. While majority of the people infected with H. pylori is asymptomatic. The main factors, which determine the development of H. pylori related diseases might be bacterial virulence, host genetic and environmental factors.The aim of this study is detection of H. pylori in gastric tissue and study the main virulence factors of this pathogen and host genetic factors in patients with gasteroduodenal manifestation. Molecular methods include polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis and virulence genes of H. pylori and single strand confirmation polymorphism (SSCP) technique was done to detect the p53 and bax genes mutation may be associated with H. pylori infection. In this study, 180 patient were included, only 92 gastric biopsies (51%) gave positive for the presence of H. pylori diagnosed by direct molecular technique. Among these positive result, 60% gave positive results in cultivation based on biochemical features. In addition, 100 serum samples were taken from healthy individuals, with no history of H. pylori infection as a control group and the results of antibody based test (serological test) were negative for H. pylori.In this study, the high frequencies of H. pylori were observed for chronic gastritis, which constituted 88% while low frequencies were 3.3% for gastric cancer, whereas 8.7% for duodenal ulcer.Also, the highest frequencies of H. pylori infection were found in male patients in comparison to female. On the other hand, the results showed that the high significant infection percentage 44.6%, among age group ranging from 31 - 50 years. Moreover, detection of H. pylori by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique is performed on all gastric biopsy. ure C as well as ure A genes are used as markers for confirmatory diagnosis of H. pylori through using specific primers of PCR technique. The results show that 84.8% and 73.9% of H. pylori are positive for both genes, respectively. Among samples with positive result for PCR amplification, 56 samples (60%) also had positive culture result. Besides, the PCR amplification of ureC and ureA markers. Also, the rate of positive H. pylori in the tested biopsies was 51% depending on direct molecular detection by PCR using the ureA and the ure C genes.In addition, cag A gene is investigated in all H. pylori isolates. The results show that 65 isolates (70.6%) are positive for PCR amplification of cagA gene whereas 56 isolates (60.8%) are positive for PCR amplification of cag E gene. Among of these positive isolates, 49 isolates (53.3%) give positive result for cag A gene. The frequency of the vacA gene found in the present study is 68.5% (63/92).Furthermore, among of all H. pylori positive gastric biopsy, 49 (53.3%) reveal full signals of cagA, cagE, and vacA. The remaining 27 (30.4%) gastric biopsies, harboring cagA - negative strains, are PCR negative for cagE.Mutations of the p53 gene in exons (5,6,7 and 8) are identified by PCR - SSCP method. However, PCR is used to amplify exons 5,6,7 and 8 of p53 gene which are known to be mutational hot spots. PCR - SSCP analysis has detected alterations in the p53 gene in several exons. Where sixteen alterations in exon E5A, nineteen alterations in exon E5B6A, seventeen alterations in exon E7 and only two in exon E6B but no alteration is seen in exon E8 of P53 gene.In the same way, PCR - SSCP analysis detected alterations in Bax gene where only 17% of positive samples gave alteration in the sequence of Bax gene in exons E1, E4 and E6. Regarding exon 1 of Bax gene, it was seen that only 6 samples gave positive gene locus mutation. It conclude that the molecular diagnosis gave an evidence and confirmatory guide on the existence of H. pylori in gastric samples. Also the more virulent strain may be affected on the stimulation of p53 and bax genes mutation.

دراسة بكتريولوجية وجزيئية لبكتريا Proteus mirabilis معزولة من عينات مختلفة == Bacteriological and Molecular Study of Proteus mirabilis Isolated from Different Clinical Samples

اسم المؤلف: ختام فاضل عباس
اسم المشرف: جواد كاظم الخفاجي | ميساء صالح الشكري
الموضوع العام: الطب
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تلخصت هذه الدراسة بجمع وتشخيص P. mirabilis حيث عزلت وشخصت سبعة عشر عزلة (12.6%) عائدة الى بكتريا P. mirabilis من 135 عينة جمعت من مصادر مختلفة من المرضى المراجعين الى مستشفى الحلة الجراحي خلال الفترة من (تشرين الاول 2014 الى شباط 2015). عدد ونسبة العزلات التي تم الحصول عليها من مرضى المجاري البولية 11(64%)و التهاب الاذن 3(17%) . بالاضافة الى ذلك نسبة العزلات التي تم الحصول عليها من مرضى الاسهال والجروح والتهابات المهبل من كل حالة 1(5.9%). العزلات التي تم الحصول عليهزارعت في اوساط خاصة وشخصت بايوكيميائيا وبكتريولوجيا.من خلال التحري عن بعض عوامل الضراوة وجد ان جميع العزلات (100%) قادرة على انتاج الهيمولايسين ، اليورييز، البروتسين وظاهرة الانثيال. تم الكشف على انتاج البيتالاكتميزلجميع العزلات المقاومة لمضادات البيتا لاكتام بحسب طريقة Rapid Iodiometric وبينت نتائج الدراسة ان16(94.1%) من العزلات منتجة للبيتالاكتميز. اظهرت نتائج الدراسة قابلية جميع العزلات على مقاومة بعض المضادات الحياتية فقد بينت النتائج بان كل العزلات كانت مقاومة كليا 17(100%) الى Imipenem كما ان اغلب العزلات كانت حساسة الى Ertapenem حيث ان نسبة المقاومة فقط 3(17.6%). علاوة على ذلك مقاومة العزلات لمختلف المضادات الحياتية فحصت وظهرت ان العزلات مقاومة بنسب مختلفة 14(82.3%) منهم اعطت مقاومة الى Amoxicillin وCefotaxime , 9 (52.9%) منهم اعطت مقاومة الى Amoxiclave, 11(64.7 %) منهم اعطت مقاومة الى Ceftriaxone و4(23.5%) منهم اعطت مقاومة الى Cefepime Clavulanic acid.لجينات المشفرة عوامل الضراوة لبكتريا P. mirabilis كشفت باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR)). ظهرت النتائج ان كل عزلات البكتريا اعطت نتيجة موجبة للجين rsbA, luxS, pm1, mrpA ,ureC مع عدد ونسبة ,(53%)9 7(41%), 8(47%),,(35%)6 ,(18%)3 بالتعاقب. | This study is devoted to isolation and identification of Proteus mirabilis; 17 isolates of P. mirabilis have been isolated and identified out of one hundred thirty five clinical specimens obtained from patients attending to Hilla teaching Hospital during a period from October 2014 to February 2015. The number and percentage of isolates obtained from patients with urinary tract infections was 11(64.7%), and ear infection 3(17.6%). Other isolates obtained from patients with diarrhea, wound and vaginal infection that each case has percentage 1(5.9%). The isolates obtained have been cultured in selective media and biochemically assay. Some virulence factors of all isolates are studied, and the results showed that all bacterial isolates 17(100%) produced hemolysin, urease, Bacteriocin (proticin) and swarming. The detection of β - lactamase production is performed according to Rapid Iodometric Method and the result is shown that 16(94.1%) of isolate produced beta - lactamase. Antibiogram of P. mirabilis isolates has been studied and it has been found that all isolates were entirely resistant to Imipenem 17(100%), while most of the P. mirabilis isolates were sensitive to Ertapenem so the resistant only 3(17.6%). Furthermore, the resistance of isolates to a variety of antibiotics has been investigated and found that these isolates have been resistant to more than one antibiotic : 14(82.3%) to Amoxicillin and Cefotaxime, also 9(52.9%) of them were resistant to Amoxiclave, 11(64.7%) of them were resistant to Ceftriaxone and 4(23.5%) of them were resistant to Cefepime Clavulanic acid. Virulence factors encoding genes of P. mirabilis is detected by using polymerase chain reaction PCR. It is found that all bacterial isolates gave positive result for ureC, mrpA, pm1, luxS and rsbA with number and percentage 3(18%), 6(35%), 7(41%), 8(47%), 9(53%) respectively

دراسة النمط المناعي وقابلية الاصابة بالعدوى الميكروبية لدى ذوي السمنة البالغين == Study The Immune Profile & Susceptibility to Some Microbial Infections in Obese Adults

اسم المؤلف: فؤاد قاسم جبير الزيادي
اسم المشرف: محمد عبد كاظم حسن السعدي | هديل فاضل فرهود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: هدفت هذه الدراسة الى توضيح العلاقة بين البالغين الذين يعانون من السمنة والتعرض للعدوى الميكروبية من خلال تقدير المعايير المناعية مثل (IFN - γ & IL - 2)، عناصرcomplement system (C3, C4) , وقياس فعالية الخلايا المناعية الالتهامية من خلال الكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus. انجز هذا العمل على 50 شخصا من ذوي السمنة البالغين (11 ذكرا و39 انثى) تتراوح اعمارهم من (20 - 60) عاما قاموا بزيارة قسم التغذية في مستشفى مرجان التعليمي في محافظة بابل خلال الفترة من نوفمبر 2014 الى يناير 2015، و30 شخصا اخرين اصحاء لا يعانون من السمنة (21 ذكور و9 اناث) تتراوح اعمارهم من (22 - 42( عاما. وتم قياس مؤشر كتلة الجسم (BMI) لكل فرد من ذوي السمنة والاصحاء. تم جمع عينات الدم من كلا المجموعتين لقياس فعالية الخلايا الالتهامية، والمعايير المناعية الاخرى مثل (IFN - γ & IL - 2)، وعناصر complement system (C3, C4), والكشف عن الاصابة بـ Streptococcus pyogenes وMeasles virus بطريقة الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيم. اظهرت النتائج ان تركيز (IL - 2) عند ذوي السمنة اقل بكثير وبشكل معنوي عن الذين لا يعانون من السمنة (P˂0.05) ، ولم يظهر تركيز IFN - γ)) في مجموعة ذوي السمنة انخفاضا معنويا (p>0.05) عن تركيزه عند الاصحاء. وكانت عناصر complement system (C3, C4)مرتفعة عند ذوي السمنة وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عن مجموعة الاصحاء الذين لا يعانون من السمنة، ولكن فعالية الخلايا الالتهامية اظهرت انخفاضا عالي المعنوية (p˂0.001) عند مجموعة ذوي السمنة (6.1٪) مقارنة بمجموعة الاصحاء (10.6٪)، وزيادة تراكيز كل من ASO وanti - measles virus - IgG وبشكل عالي المعنوية (p˂0.001) عند ذوي السمنة مقارنة بالاصحاء | This study aimed to clarify the relationship between obese adults & susceptibility to microbial infections by evaluating the parameters of cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and phagocytic index using of Anti - Streptococcus pyogenes Ab and Anti - Measles virus - IgG Ab as indicators of infections. This work was applied on 50 obese adults visited to the center of nutrition in Marjan hospital in Babylon province from November 2014 to January 2015, and 30 non - obese apparently healthy as controls. Obese adults consist of (11 males and 39 females) with age range 20 - 60 years, while 30 apparently health controls consist of (21 males and 9 females) with age range 22 - 50 years. Body mass index (BMI) for all subjects obese & controls was estimated. Blood samples were collected from obese group and control group to estimate phagocytic index, and ELISA test for cytokines (IFN - γ & IL - 2), complement components (C3 & C4), and detection of measles - IgG antibody and anti - streptolysin O antibody. IL - 2 concentration in obese adults was significantly lower than non - obese adults (p˂ 0.05), and no significant decreased (p>0.05) of IFN - γ in obese group, the complement components (C3 &C4) in obese adults were a highly significant than controls, but the phagocytic index showing there is a highly significant decreased (p˂0.001) in activity of neutrophils of obese adults (6.1%) compared to control group (10.6%), ASO and Anti - measles - IgG concentrations increased in obese adults with a highly significant (p˂0.001) as compared to controls. This findings can be concluded as that obese subjects have low levels of immune system and more susceptible to be infected with microbial infections

تقييم وتعريف المكورات المسبحية الطافرة والمتحولة اللثوية في مرضى تسوس الاسنان وامراض النسيج الداعم للاسنان == Evaluation and Identification of Streptococcus mutans and Entamoeba gingivalis in Patients with Periodontal Diseases and Dental Caries

اسم المؤلف: مؤيد نعمة مصلح الخفاجي
اسم المشرف: الهام عباس بنيان الساعدي | هيام خالص المسعودي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present was carried out during the period of November 2014 to April 2015 in Al - Hilla City. This study included 100 samples which were collected from patients at ages ranged between 4 to 75 years old whom were suffering from dental caries and periodontal diseases ; (50) samples were taken from patients infected with dental caries (23 male and 27 female) and (50) samples taken from patients with periodontal diseases (15 male and 35 female), who have submitted to a college of Dentistry in Babylon university and special center of Dentistry. Thirty samples were taken from apparently healthy persons and considered as control.The isolation and identification of S. mutans was performed by Mitis Salivarius Bacitracin agar as a selective medium and biochemical tests as well as API 20 strep, then investigated the virulence factors and show the effect of some antibiotics on bacterial isolates, and the identification of E. gingivalis parasite was by a wet preparation method.The obtained results showed that S. mutans was with a higher existence in patients with dental caries, with lower existence in the patients with periodontal diseases and it was found in healthy persons (30%, 18%, and 0%) respectively. Entamoeba gingivalis was higher in patients with periodontal diseases than patient with dental caries and less in healthy individuals (62%, 24%, and 6%) respectively. The presence of these microorganisms was related to the type of dental disease (p=0. 009), gender (p=0. 009), age (p=0. 008) and risk factors (diabetes, smoking and hypertension) (p=0.037).The effect of some antibiotics on S.mutans was also tested, and the obtained results showed that all isolates were with high resistance to Erythromycin (70.8%) and (66.7%) were resistant to Doxycycline. Some isolates showed low level of resistance to Vancomycin (54.2%), CefatoximeII(33.4%) and Clindamycin (25%), while these isolates were with high susceptibility to Chloramphenicol (100%) and Ofloxacin (83.4%).Finally, some virulence factors of S. mutans were studied and it was seen that the (62.5%) of S. mutans isolates produced α - hemolysis and (8.3%) produced β - hemolysis but (29.2%) of isolates non - hemolysis, but (58.3%) of isolates were made capsule and (100 %) were able to synthesize glucan, (83.3%) of S. mutans isolates were able to produce mutacin and (45.83%) of isolates were found to produce dextranase enzyme, while (84%) were able to biofilm formation .In addition, all isolates in this study were able to adhere to oral epithelial cells.

دراسة على المايكرومايكروبية الشائعة المعزوله من القناة الهضمية وبعض المعايير المناعية للمرضى الذين يعانون من مرض السكري النوع الثاني == A Study on Common Microbiaes isolated from Gastrointestinal and some Immunological Parameter in Patients with Type II Diabeties Mellitus

اسم المؤلف: شذى خزعل كاظم الوائلي
اسم المشرف: هيام خالص المسعودي | علي حسين البياتي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: المرضى الذين يعانون من من داء السكري النوع الثاني هم مجموعة غير متجانسة من الاضطرابات التي تتميز بمقاومة الانسولين الواسعة للانسجة ويختلف على نطاق واسع. داء السكري من النوع الثاني هي حتى الان الاكثر شيوعا. تضمنت الدراسة (100) مريض مصاب بالسكري النوع الثاني مشخص من قبل اطباء متخصصين بالسكري و(50) شخص من الناس الاصحاء وفي الفئه العمرية (25 - 65) سنة الوافدين الى مستشفيات في بابل (القاسم ومرجان) خلال الفترة من كانون الثاني 2015 حتى حزيران 2015.واظهرت النتائج ان البكتريا السالبه لصبغة كرام من مجموع العزلات هي السائدة مقارنة مع البكتريا الموجبه لصبغة كرام تشكل 26٪ وشكلت العزلات البكتيرية E.coli الاكثر شيوعا كانت يتبعها Enterobacter spp., K.Pneumoniae, Proteus spp., والبكتريا الاقل شيوعا كانتS.aureus, S.epidermidis, Citrobacter, Micrococcus Kocuria kristinae وStreptococcus spp,في حين ان الطفيليات الاكثر شيوعا كانت E.histolyticaبنسبة 55% وGiardia lambliaبنسبة 45% . تم دراسة عوامل الضراوة للبكتريا الشائعه المعزولة من مرضى السكري من النوع الثاني في هذه الدراسة. وكانت عزلات K.pneumoniae وعزلات Enterobacter وبعض عزلات E.coli تعطي الكبسول بينما بكتيريا Proteus spp. المعزوله في هذه الدراسة لم تمتلك الكبسولة. تم الكشف عن عامل الاستعمار CF - I وIII في العزلات البكتيرية فكانت ايجابيه في البكتريا الاكثر شيوعا وكانت جميع عزلات بكتيريا المكورات العنقودية الذهبية قادرة على انتاج المخثرة التي يعتبر عامل الضراوه لامراضية هذه البكتيريا. وان كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية والاشريكية القولونية اظهرت تحللا كاملا (lyses كاملة) β - الانحلالي، في حين ان جميع عزلات المكورات العقدية نمط (lyses غير مكتملة) α - الانحلالي حيث اظهرت خط مخضر حول المستعمرات البكتيرية. وكانت جميع عزلات S.epidermidis وبعض العزلات من Proteus spp. (غير الحالة للدم) γ - الحالة للدم. في هذه الدراسة تم التحري عن sidrophore بين العزلات البكتيرية واظهرت النتائج ان جميع العزلات البكتيرية (E. coli K.Pneumoniae,)، ومعظمها من عزلات E. aerogenes و.Proteus spp كانوا قادرين على صنع sidrophore. وكانت بعض العزلات من. Proteus spp وEnterobacter ايجابية لتفاعل الجيلاتيناز، في حين ان جميع العزلات من Klebseilla واكثر عزلات E.coli سالبة لهذا العامل. واظهرت نتائج اختبار انتاج ال lipase في سالبة الجرام ان معظم العزلات ايجابية لاختبار lipase. وكشفت النتائج ان جميع العزلات كانت موجبه Biofilm وضع تشكيل (50٪)، في حين لا يوجد عزلات سالبه له. وفيما يتعلق بعوامل الضراوة الشائعة للبكتيريا المعزولة من عدم وجود مرض السكري وعوامل الضراوة فكانت نادرة. وكانت نتائج المتغيرات المناعية (C3، C4، Ig A، IL4، وIL6) للمرضى السكري في الدراسة, قد انخفضت مستويات C3، IgA، IL4، وIL6 للمرضى السكري ، في حين مستوى C4 قد ارتفع. من خلال نتائج هذه الدراسة، يمكن ان نستنتج؛ ان انواع البكتيريا التي عزلت من مرض السكري من النوع الثاني هي التالية E.coli تليها K. Pneumoniae, Enterobacter spp., Proteus spp, Micrococcus, Citrobacter S.epidermidis, kocuria kristinae, S.aureus , and Streptococcus spp. والطفيليات هي الاميبا الحاله للنسيج ثم الجيارديا اللامبيليا | In this study include (100) diabetic type (II) patients as diagnosed by Diabetolegist and 50 healthy control with an age range of (25 - 65 years) who attended to the two hospitals in Babylon : (Al - Qasem and Marjan), during the period from January 2015 until June 2015. Shown that grams - negative bacteria constitutes 74% from the total isolates and were considered the predominant aetiological agent of DM compared to gram - positive bacteria which constitutes 26%. The most common bacterial isolates were E.coli followed by Klebsella Pneumoniae, Enterobacter spp, Proteus spp, and less common bacteria were Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Kocuria kristinae, Citrobacter, Micrococcus and Streptococcus spp, whereas the most common parasites were Entamoeba histolytica 55% and Giardia lamblia 45%.The virulence factors of common bacterial isolated from diabetes Mellitus type II in this study are studied. The capsule was present in all Klebsella pneumoniae isolates, Enterobacter isolates and some isolates of E.coli, whereas the other bacteria such as Proteus mirabilis isolates in this study does not possess the capsule. Colonization factor antigens were detected; The CF - I and III were detected in mostly bacterial isolates which showed positive results with these factors. All isolates of Staphylococcus aureus bacteria were able to produce coagulase which is considered as a virulence factor for pathogenicity of these bacteria. All isolates of Staphylococcus aureus and E. coli expressed β - hemolytic (complete lyses), while all isolates of Streptococcus were α - hemolytic pattern (incomplete lyses) showing a greenish line around the bacterial colonies. All isolates of Staphylococcus epidermidis and some isolates of Proteus spp. were γ - hemolytic (non hemolytic). In the present study the siderophore synthesis was investigated among bacterial isolates and the results showed that all bacterial isolates (E. coli and K. pneumonia), and mostly of isolates of Enterobacter spp. and Proteus spp. were able to synthesis siderophore. Some isolates of Proteus mirabilis and Enterobacter spp. were positive for gelatinase reaction, while all isolates of Klebseilla pneumoniae and mostely E.coli were negative for this factor. The results of lipase production test in G - ve showed that most isolates were positive to lipase production test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were account for (50%) while there is no isolates that express non - biofilm formation. Regarding the virulence factors of common bacterial isolated of non - diabetes Mellitus have rare virulence factors.The results of Immunological parameters (C3, C4, IgA, IL4, and IL6) for DM patients were studied. In this study the levels of C3, IgA, IL4, and IL6 for DM patients were decreased, whereas the level of C4 was increased. In light of the results documented in this study, we can conclude the following; the types of bacteria which isolated from diabetes mellitus type II from the most to least common are E.coli followed by K. Pneumoniae, Enterobacter spp., Proteus spp., S.aureus, S.epidermidis, kocuria kristinae, Citrobacter, Micrococcus, and Streptococcus spp. And parasite : Entamoeba histolytica and Giardia lamblia isolated from diabetes mellitus type II. Most bacterial isolates in this study have the ability to possess more than one virulence factor such as capsule, siderophors, lipase production, hemolysin, extracellular protease, adherence factors, and biofilms to produce infection in diabetes mellitus type II patients. The virulence factors of common bacterial isolated in non - diabetes mellitus have rare virulence factor. The levels of Immunological parameters of C3, IgA, IL4, and IL6 for DM patients were decreased, whereas the level of C4 was increased.

دراسة جزيئية وبكتريولوجية لبكتريا Porphyromonas gingivalis المعزوله من المرضى المصابين بامراض اللثه == Molecular and Bacteriological Study of Porphyromonas gingivalis Isolated from Patients with Periodontitis

اسم المؤلف: فاطمة مالك عبود
اسم المشرف: محمد صبري عبد الرزاق السعيد | الهام عباس بنيان
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم جمع 103عينة من الصفيحة الجرثومية العميقة (subgingival dental plaque) من المرضى الذين يعانون من التهاب اللثة المزمن والمتقدم (72, 31) على التوالي لمراجي العيادة الاستشارية لامراض اللثة في كلية طب الاسنان/ جامعة بابل والمركز التخصصي لطب الاسنان في مدينة الحلة. للفترة من كانون الاول 2013 الى حزيران 2014. تم تشخيص وعزل بكتريا P. gingivalis بطرق مختلفة منها استخدام الطرق البكتيرية التقليدية واظهرت النتائج ان 69.5%) 16) منها تم عزلها من التهاب اللثة المزمن وتم عزل 7 (30.5) من التهاب اللثة المتقدم باستخدام التنمية على الوسط الانتقائي الخاص لهذه البكتريا. وكذلك تم استخدام طريقة التشخيص الجزيئي باستعمال المعلم الوراثي المستند على دور جين 16s rRNA حيث اظهر ان12 عزلة من اصل 23 عزلة تم تشخيصها بشكل نهائي انها تعود لبكتريا P. gingivalis. منها حوالي 8 تعود الى التهاب اللثة المزمن و4 تعود الى التهاب اللثة المتقدم. بالاضافة الى ذلك, تم التحري عن قابلية هذه البكتريا للالتصاق(adherence ability) بالخلايا الطلائية المبطنة للفم حيث وجد ان جميع العزلات لها القابلية على الالتصاق بهذه الخلايا وتم ايضا اختبار قابليتها على انتاج انزيم (Gingpain) ووجد ان جميع العزلات منتجة الى هذا الانزيم.في هذه الدراسة تم التحري المظهري عن عملية تكوين الاغشية الحيوية(Biofilm formation) للعزلات المدروسة باستخدام فحص tissue culture plate test (TCP) اذ كانت مكونة للاغشية الحيوية بنسبة 100% وكذلك تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على انتاج biofilm ووجد ان اعلى تثبيط سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير Clove مقارنة باقل تاثير لمادة السعد ((Cyprus rotundus. وكذلك تم الكشف عن حساسية العزلات لبعض المضادات الحيوية ووجد بان كل العزلات كانت حساسة الى Co - amoxiclave وعلى العكس اغلب العزلات تظهر مقاومة عالية لل Amoxicillin بينما سجلت مقاومة قليلة جدا لل Ampicillinو Metronidazole(16.3%, 20.3%, ) على التوالي. واخيرا تم فحص تاثير بعض المواد المستخدمة في طب الاسنان على تثبيط نمو هذه البكتريا وتوضح النتائج ان اعلى تاثير سجل للكلورهكسدين (غسول الفم) والشب (Alum)ويليه تاثير القرنفل(Clove) mm) 25,30,40) على التوالي مقارنة باقل تاثير لمادة السعدC. rotundus (10mm) .في هذه الدراسة ايضا تم التحري عن التغاير الجيني ((TLR - 4 Polymorphisms باستخدام تقنية البلمرة والقطع بالانزيم ((PCR - RFLP. وتبين من النتائج وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Thr399Ile : CC وCT وTT ، اذ بلغت نسبة انتشارها ((12.5%,10%,77.5% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة TT,CCوبنسبة انتشار(36.6% ,63.4%) على التوالي ، فيما بلغت نسبة انتشار الاليلC السائد في المرضى 82.5 % بالمقارنة للسيطرة 63.3% مع وجود اختلاف معنوي. وفي المقابل سجل وجود ثلاث انماط جينية في موقع طفرة Asp299Gly : AA وAG وGG وبنسبة انتشار % 67.5 و12.5% و20% في مجموعة المرضى على التوالي بينما هناك فقط نمطين في مجموعة السيطرة GG, AA وبنسبة انتشار34.4%) 66.6%,) على التوالي. حيث سجلت نسبة انتشار الاليل A السائد (73.75%) في مجموعة المرضى بالمقارنة بمجموعة السيطرة (66.6%) وبفرق معنوي. | In this study, 103 clinical samples were collected from subgingival dental plaque of patients with chronic (CP) and aggressive periodontitis (AP) (72 and 31) respectively, and (n=30) a healthy group admitted to teaching Hospital in college of Dentistry / Babylon University and specialized center of Dentistry in Hilla city, From February 2013 to June 2014). Out of which (n=40) with a chronic periodontitis group from them blood sample were collected for detection of gene polymorphisms in Toll - like receptor - 4 (TLR - 4). These dental plaque samples were subjected to different methods for identification of P. gingivalis mainly traditional bacteriological method. It was found that 23 P. gingivalis isolates were recovered by using selective media where 19 isolates (26.3%) obtained from (CP) and 4 isolates (12.5%) from (AP). Furthermore, molecular detection method was applied by using 16s rRNA gene as a genetic marker for confirmation of detection of P. gingivalis isolates, 12 isolates of P.gingivalis out of 23were detected by molecular method focusing on the role of 16s rRNA gene of P. gingivalis. 8 isolates were isolated from CP, and 4 isolates were isolated from AP subgingival plaques. In addition, these 12 isolates were investigated to detect Adherence of P.gingivalis to oral epithelial cells. The result showed that all isolates have ability to adhere to oral epithelial cells. The study also detected the ability of this bacteria for production of Gingipain, it was found that all isolates were positive for this enzyme at a rate 100%.Furthermore, biofilm formation was tested in the semi quantitative microtiter plate test. The results revealed that all isolates were biofilm former, high and moderate biofilm formation mode were accounted for (50%) while there are no isolates that express non biofilm formation.Regarding to effect of Chlorhexidine (CHX) gluconate (0.12%) on biofilm formation, the results of this study demonstrated (CHX) effectively and reduced the viability of biofilm - forming bacteria from moderate to 25%, weak to 75% and no strong. The study was also evaluating the effect of some plant extracts on biofilm formation. The results showed the highest effect for Alum potassium phosphate followed by Clove, in contrast to lowest effect of C. rotundus. And after screening the effect of Flagyl solution on production of bacterial pigment. The results showed that the metronidazole produced the highest inhibition activity range (30 - 10mm). Furthermore, the susceptibility of isolates to a variety of antibiotics had been investigated and it had been found that all isolates were sensitive to co - amoxiclave and, in contrast, the isolates showed high resistance to other type of beta lactam such as amoxicillin (54.3%). In addition, the result showed that the resistance of p. gingivalis was very low for ampicillin and metronidazole (16.3% and 20.3%), respectively.The screening of antimicrobial activity of (CHX) gluconate (0.12%) was carried out and the results showed that it produced the highest inhibition activity whether against p. gingivalis with inhibition zone range 40 - 15mm. Finally in vitro antibacterial activity of Alum, Clove and Cyperus rotundus plant extracts was studied and the results revealed that all tested isolates were inhibited by aqueous extracts at 50% concentration. The maximum inhibition zone was observed in Alum and Clove extracts respectively (30mm, 25mm), compared to the minimum inhibition by Cyperus rotundus (10mm). The antibacterial actions of 20% concentration of plant extract gave lower inhibition zone than 50% concentration of that extract which represented by (19mm, 16mm, and 10 mm) of the previous three mentioned extracts. This study also aimed to investigate the association of Thr399Ile and Asp299Gly single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the (TLR - 4) with the incidence of (CP).The results revealed at the site of SNPThr399Ile, there were three genotypes for this SNP among CP patients; CC, CT and TT with frequency of 77.5%, 10% and 12.5 % respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; CC and TT with frequency of 63.4% and 36.6% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele C (dominant) was higher among CP group (82.5%) than control (63.3) with significant difference. The site of SNP of Asp299Gly also showed three genotypes among CP patients; AA, AG and GG with frequency of 67.5%, 12.5% and 20% respectively, whereas, there were only two genotypes among control group; AA and GG respectively with frequency of 66.6 and 34.4% respectively with no significance differences between patients and control. However, the frequency of allele A (dominant) was higher among CP group 73.75 % than control 66.6%.

دور السايتوكينات المعزولة من انسجة المشيمة المغذية للجنين لدى النساء مع الاجهاض التلقائي == The role of cytokines isolated from feto - placental tissues in women with spontaneous miscarriage

اسم المؤلف: ميسلون عبد الحميد ناصر
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: البصرة
الصفحات الاولى:
المستخلص: شملت الدراسة الحالية (172( امراة، تتراوح اعمارهم بين 16 - 41 عاما، من المرضى الذين قدموا الى مستشفى الولادة والاطفال في البصرة بسبب الاسقاط التلقائي غير الكامل في الشهور الثلاثة الاولى من الحمل ، بالاضافة الى النساء مع الحمل الطبيعي في وقت الولادة خلال الفترة من شباط 2012 الى ايار 2014 وتم تقسيمهن الى 3 مجموعات :  المجموعة - ا : وشملت )65) من النساء مع الاجهاض التلقائي المتكرر (RSM) خلال الاشهر الثلاثة الاولى، مع متوسط العمر (25.2 ± 7.28) سنة. المجموعة - ب : وشملت (36) من النساء مع الاسقاط التلقائي غير الكامل في الاشهر الثلاثة الاولى من الحمل ولها على الاقل ثلاثة مرات حمل طبيعي سابق (الاجهاض التلقائي غير المتكرر ( non - RSM بمتوسط من العمر (26.61 ± 6.97) سنة. المجموعة - ج : السيطرة (الحمل الطبيعي) : 71 امراة بمتوسط من العمر (26.17 ± 7.01) سنة. وتم الحصول على الدم الوريدي من المجاميع قيد الدراسة من اجل البحث عن المضاد المناعي م وج الخاص بمقوس قوندي , IgM ) IgG (. والتشخيص المصلي للاصابة بمقوسات قوندي يستخدم على نطاق واسع لفحص النساء الحوامل والمجهضات. كان معدل حدوث داء المقوسات (38.4٪) التي وجدت في 101 مجموعات الاجهاض التلقائي بواسطة فحص (ELISA). اظهرت عينتين (3.08٪) نتائج ايجابية المضاد المناعي (م). بينما كانت 24 (36.92٪) عينة ايجابية للمضاد المناعي (ج) لمقوس قوندي في مجموعات المرضى , بينما لم تسجل اصابة في 71 امراة من مجموعة السيطرة . غالبية النساء المصابة (50٪) في سن (30 - 39) سنة في حالة المضاد المناعي (ج)، في حين ان (10.26٪) في سن (20 - 29) سنة في حالة من المضاد المناعي (م).والنتائج كشفت عن ان اعلى نسبة للاجهاض التلقائي لوحظت في نساء الارياف . وفي الوقت نفسه، تم جمع نسيج الارومة المغذية للجنين خلال عملية الكشط والدم الوريدي للكشف وتقييم السيتوكينات المضادة للالتهابات (IL - 4، IL - 6، IL - 10) والسيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2،عامل نخر الورم - الفا TNF - α، - γ IFN) وقياس تركيزها باستخدام فحص انزيم مرتبط البلمرة المناعي ، تبين تركيز عال (49.97 ± 8.82، 180.7 ± 15.03، 94.34 ± 7.68) للسيتوكينات في الارومة المغذية للجنين (IL - 4، IL - 6، IL - 10 على التوالي) في حالة مجموعة السيطرة بالمقارنة مع مجموعات المرضى وتم الكشف عن نتيجة عكسية في مصل الدم ، في حين ان التراكيز عالية من السيتوكينات الموالية للالتهابات (IL - 2، TNF - α، IFN - γ) كانت (134.17 ± 24.37، 432.16 ± 51.7، 100.46 ± 9.94 على التوالي) في حالة مجموعة الاجهاض التلقائي المتكررRSM)) بدلا من مجموعة السيطرة ومجموعة الاسقاط التلقائي غير المتكرر RSM - non مع وجود اختلافات معنوية كبير.p<0.001 وقد تبين في الدراسة الحالية وجود علاقة واضحة بين مناعة الامهات نوع TH2 والحمل الطبيعي، في حين يرتبط رد فعل جهاز المناعة نوع TH1 بفقدان الحمل. والتوازن الدقيق بين السيتوكينات الناتجة عن TH1 / TH2 ممكن ان يمنع خمج مقوسات قوندي . الذي يرتبط مع الانتاج الكبير من TH1 للسيتوكينات الموالية للالتهابات.وعلاوة على ذلك نتائج حساب مستويات CD44، اظهر فرقا معنويا عاليا p<0.001 في حال مقارنة بين مجموعة السيطرة والمجموعتين من النساء المجهضات . وهكذا تم تسجيل ارتباط CD44 مع فعالية خلايا TH2 ؛ لذا فمن المرجح انه قد يكون هناك وجود علاقة بين الحمل الطبيعي وكثافة CD44 على سطح الخلية

دراسة لبعض الخصائص الوبائية والمصلية لاصابات الـBordetella perlussis في محافظة بابل

اسم المؤلف: عمار عباس شعلان
اسم المشرف: محمد عبود القرة غولي | يحيى الطفيلي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2005
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة الى وصف بعض الخصائص الوبائية للسعال الديكي في محافظة بابل وتقييم الاضداد المتخصصة للـ Bordetella pertussis IgG وIgA باستخدام تقنية الـ ELISA للتشخيص المختبري للسعال الديكي، هذا بالاضافة الى قياس الاستجابة المناعية الخلطية للقاح الثلاثي (DPT). جمعت عينات الدم من : 68 طفل مصاب بالسعال ديكي راقد في المستشفى (36 غير ملقح و32 ملقح) ، 103 من اشخاص اسوياء (49 شخصا ملقحا، 54 شخصا غير ملقح) و20 من العاملين بالخدمة الصحية في محافظة بابل. اضداد Bordetella pertussis IgG وIgA تم قياسها بواسطة تقنية الـ ELISA لكل مجموعات الدراسة. التعداد الكلي والتفريقي للخلايا البيضاء اجري للـ68 مريض و20 من مجموعة السيطرة. اظهرت الدراسة ان اعلى مستوى حدوث للسعال الديكي لوحظ في المرضى اقل من عمر سنة (49% من مجموع الحالات). كانت نسبة الذكور للاناث 1.27 : 1. 71% من المرضى مقيمين في المناطق الريفية مقارنة بـ 29 % في المناطق الحظرية. 36 (53%) من المرضى كانوا غير ملقحين و26 (38%) كانوا ملقحين جزئيا، بينما 6 (9%) تلقوا تلقيحا كاملا (3 جرعات من اللقاح الثلاثي). لوحظت مضاعفات السعال الديكي في 88% من المرضى، والتي كانت بصورة رئيسية الاختناق (88%)، اختلاجات (26%)، ذات الرئة (29%)، والوفاة (4%). كما لوحظ ارتفاع في تعداد الخلايا البيضاء في 64% من المرضى وارتفاع في تعداد الخلايا اللمفاوية في 69% من المرضى. معظم الحالات سجلت خلال الفترة بين شهر نيسان وتموز. كانت الحساسية والتخصص التشخيصي لاضداد الـ Bordetella pertussis IgG في الاطفال غير الملقحين كانت 77% و100% على التوالي، في حين كانت الحساسية والتخصص التشخيصي لاضداد Bordetella pertussis IgG في الاطفال الملقحين 67%، 91% على التوالي. كانت الحساسية والتخصص التشخيصي لاضداد الـ Bordetella pertussis IgA في الاطفال غير الملقحين كانت 33% و100% على التوالي، في حين كانت الحساسية والتخصص التشخيصي لاضداد Bordetella pertussis IgA في الاطفال الملقحين 72%، 86% على التوالي. لوحظت افضل حساسية وتخصص تشخيصي في العيانات التي جمعت بعد اكثر من 21 يوما بعد ظهور اعراض السعال الديكي. تم الحصول على اعلى حساسية وتخصص تشخيصي (92، 82% على التوالي) باستعمال مستوى موجب لـ اضداد Bordetella pertussis IgG او IgA. اظهرت الدراسة ان متوسط مستوى اضداد Bordetella pertussis IgG في الاسوياء الملقحين كانت 56.41 U/ml (المدى 19.77 - 143.89 U/ml)، بينما بلغ متوسط اضداد Bordetella pertussis IgG في الاسوياء غير الملقحين 29.33 U/ml (المدى 1.01 - 56.9 U/ml). كان متوسط مستوى اضداد Bordetella pertussis IgA في الاسوياء الملقحين كانت 9.05 U/ml (المدى 3.6 - 29.74 U/ml)، بينما بلغ متوسط اضداد Bordetella pertussis IgA في الاسوياء غير الملقحين 4.79 U/ml (المدى 3.05 - 7 U/ml). اظهرت الدراسة ان 10.7 % (11/103) من الاسوياء يظهرون مستوى موجب لاضداد Bordetella pertussis IgG او IgA، في حين اظهر 70% (14/20) من العاملين في الخدمة الصحية في هذه الدراسة مستوى موجب لاضداد Bordetella pertussis IgG او IgA | The aims of this study is to describe some of the epidemiological features of pertussis in Babylon Province in Iraq, and to evaluate the specific anti Bordetella pertussis IgG and IgA ELISA technique in the laboratory diagnosis of pertussis, and to determine the humoral immune response to DTP vaccine. Blood samples were obtained from the following groups : 68 (36 unvaccinated and 32 vaccinated)clinically diagnosed hospitalized pertussis patients, 103 normal healthy subject of similar age groups (49 vaccinated and 54 unvaccinated) and 20 healthcare workers in Babylon Province. The anti Bordetella pertussis IgG and IgA antibodies were tested by ELIZA technique in all study groups. The study shows that the highest incidence of pertussis was noticed in patients less than 1 year (49% of the total pertussis patients). The male to female ratio was 1.27 : 1. There were 71% of pertussis cases from rural area compared with 29% from urban area. 36 (53%) of the patients were unvaccinated and 26 (38%) of the patients were partially vaccinated, while only 6 (9%) are fully vaccinated (3 doses of DTP vaccine). Complications were noticed in (88%) of the patients; they are mainly apnea (88%), seizure (26%), pneumonia (29%), and death (4%). Most cases were noticed between March and July. The anti Bordetella pertussis IgG diagnostic sensitivity and specificity in unvaccinated subjects were 77%, 100% respectively; while in vaccinated subjects they were 67%, 91% respectively. The anti Bordetella pertussis IgA diagnostic sensitivity and specificity in unvaccinated subjects were 33%, 100% respectively, while in vaccinated subjects they were 72%, 86% respectively. The best diagnostic sensitivity and specificity was observed in samples collected after > 21 days of the onset of pertussis symptoms. The higher diagnostic sensitivity and specificity were obtained by using anti Bordetella pertussis IgG or IgA positive levels. The study shows that the anti Bordetella pertussis IgG mean level in DPT vaccinated normal subjects was 56.41 U/ml (range 19.77 - 143.89 U/ml), while it was 29.33 U/ml (range 1.01 - 56.9 U/ml) in unvaccinated subjects. The anti Bordetella pertussis IgA mean level in vaccinated normal subjects was 9.05 U/ml (range 3.6 - 29.74 U/ml), while it was 4.79 U/ml (range 3.05 - 7 U/ml) in unvaccinated subjects. There is 10.7% (11/103) of the normal subjects which have a positive anti Bordetella pertussis IgG or IgA levels. In addition, 70% (14/20) of the healthcare workers in this study have a positive anti Bordetella pertussis IgG or IgA levels.

دراسة الملف المصلي وتقييم بعض الخصائص المناعية لدى مرضى الحزام الناري == Serum Profile Study And Evaluation Of Some Immune Features Among Patients With Shingles

اسم المؤلف: زينب عبد النبي طليفح النصراوي
اسم المشرف: حبيب صاحب نهر | محمد كاظم طاهر الحطاب
الموضوع العام: الطب
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بابل
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة الحالية للفترة من 1شباط 2015 لغاية 3شباط 2016 وجمعت خلالها عينات المرضى المصابين بالحزام الناري من قسم الامراض الجلدية في العيادات الاستشارية في مستشفى مرجان التعليمي للتحري عن بعض الجوانب المناعية في المرضى, وكان العدد الكلي للمرضى 50 مريضا | This study was conducted during the period from 1st February 2015 to 3rd February 2016, and the samples were collected from dermatology department of the consultant clinic in Marjan Teaching Hospital to investigate certain immunological markers of patients with shingles. The total number of patients were whose their ages ranges were 14 - 80 years. Age group (40 - 61) years have the highest percentage of infection reaching 46%.The immunofluorescence test for Varicella Zoster virus - specific IgG showed 48 out 50 are positive(96%). The higher percentage of infection with shingles was in female (54%), while male patients the percentage was(46%).The results showed that patients with blood group (O+) have 50% of infection rate.When CD4 was investigated by ELISA test , the results showed that the mean± SD of serum level of CD4 in shingles patients and control group is (6.70± 0.97 and 9.36±2.02) ng/ml respectively. The concentration of CD4 was lower in patients with shingles than healthy control group, while concentration of CD8 and CD56were higher than healthy control group ( the mean± SD of serum level of CD8 in shingles patients and control group was 21.42±5.43 and19.11±3.29 ng /ml respectively, whereas the mean ± SD of CD56 concentration in shingles and control group were 107.58± 40.39 and 67.59 ± 36.31 ng/ml, respectively).The results also showed that the concentrations of IFN ? and TNF? were lower in patients with shingles compared with non - infected persons , as the following : the mean± SD of serum level of IFN ? in shingles patients and control group was 184.31±21.95 and 218.03±26.21 pg /ml respectively, and the mean ± SD of TNF? concentration in shingles and control group were 51.55± 5.14 and 62.35 ± 6.74 pg/ml, respectively. For IL 10, the concentration was higher in patients with shingles than that in the healthy control group; the mean± SD of serum level of IL 10 in shingles patients and control group was12.42±5.59 and 4.47±0.90 pg /ml respectively. This study was concluded following : • Gender represents a risk factor for the occurrence of shingles mainly at ages over 40 years old (higher in females than males).• Varicella Zoster virus specific IgG is a sensitive and specific test that can be used for the laboratory diagnosis of shingles.• Varicella Zoster virus reactivation has a suggested link with decreased level of soluble CD4 molecules and, for lesser extend with increased soluble CD8 and CD56 molecules in patients serum. • Blood group O+ might be consider as a risk factor for reactivation of VZV infection as the majority of patients were within this blood group.• A diminished role of the inflammatory TH1 cells in reactivated shingles patients is more likely as evident by the reduced concentration of IFN? and TNF? profiles. The Treg cells (CD4+ CD25+) seems to play a role in such reduction of TH1 proinflammatory cytokines as evident by the significant elevation of IL10 in shingles patients.

عزل وتحديد هوية فيروس الحصبة في علاقته ببعض الجوانب المناعية من الاشخاص النازحين الملقحين في محافظة بابل == Isolation And Identification Of Measles Virus In Relation To Some Immunological Aspects From The Vaccinated Displaced Individuals In Babylon Governorate

اسم المؤلف: ليث احمد عمران كيف الكيف
اسم المشرف: محمد عبد كاظم حسن السعدي | يونس عبد الرضا كحيوش الخفاجي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة لتقييم مناعة المجتمع لكلا النازحين والمقيمين الملقحين بلقاح فيروس الحصبة ضد خمج الحصبة في محافظة بابل. لذا تضمنت هذه الدراسة معايرة الحالة المناعية في امصال النازحين والمقيمين محافظة بابل مع عزل وتشخيص فيروس الحصبة من الحالات المشتبه بها. ت | The study was conducted to evaluate the herd immunity for both the displaced and residents vaccinated with measles virus vaccine against measles infection in Babylon governorate. Therefore this study includes the evaluation of the immune status in sera of Babylon governorate displaced and residents with specific aspect for isolation and identification of measles virus from suspected cases. The immune response was evaluated by means of ELISA test (enzyme linked immunosorbet assay) for titration of IgM and IgG immunoglobulin level, in addition to evaluation of perforin level in the sera of 90 measles vaccinated individuals included in this study (50 displaced and 40 residents) from different areas in Babylon governorate, that were collected during the period extent from January up to April of 2016. Data about individuals were fixed according to information of formula including age, sex, geographical location, place displace of displaced and the vaccination date. Successful virus isolation from suspected cases on two types of cells culture included Vero cells line and chicken embryo fibroblast was carried. The titer of the isolated virus on Vero cell line reached (105.8 TCID50 / 0.1ml),which was higher than the titer of the virus isolated on CEF which reach (105.4 TCID50 / 0.1ml) after the third passage of the virus. The isolated virus was confirmed by indirect immunofluorescence technique.The age of subjects included in this study ranged from <1 year up to 24 years old. The results revealed that 15 (30%) have positive IgM index in sera of displaced, whereas residents sera sample shown only 6 (15%) positivity. Howover, all 90 (100%) subjects of both groups showed positive IgG index. The results of the present study showed that there were no significant difference of perforin level in sera of refugees and residents at p<0.05.Assaying of immune response against measles virus by measuring IgM immunoglobulin in sera of vaccinated displaced and resident with measles vaccine reflected a highly significant difference between two groups which reached 0.43 mIU/ml in sera of displaced in comparison with residents sera which reached 0.34 mIU/ml. The result showed also high significant differences in IgM between females and males. The females sera IgM levels of displaced and residents were higher than its level in males sera which reached 0.47 mIU/ml and 0.35 mIU/ml, respectively, in comparison with male sera level which reached 0.40 mIU/ml and 0.32 mIU/ml, respectively. According to age group, the highest IgM value was recorded in displaced and residents sera in age group 10 - 14years (0.50 mIU/ml) and 5 - 9years (0.36 mIU/ml) respec - tively. Whereas the lowest IgM serum value was detected in age group <1 year (0.34 mIU/ml) and 15 - 19years (0.31 mIU/ml) for displaced and residents subjects. According to geographical location, the highest IgM level was detected in sera of displaced from Tal Afar city (0.44 mIU/ml) followed by displaced from Ramadi (0.41 mIU/ml) and the lowest IgM value was detected in sera of displaced from Mosul city (0.33 mIU/ml). Whereas the highest IgM value in sera of residents in the subjects of Al - Mahaweel city (0.37 mIU/ml) followed by subjects of Hilla and Al - Qasem city (0.29 mIU/ml and 0.28 mIU/ml) respectively. For IgG serum immunoglobulin the results revealed that there was no difference in significant levels in both group population. But according to age groups significant difference between displaced and residents was detected at p <0.05 in which the 1 - 4 years old showed the highest IgG serum level in both group (1.98 mIU/ml and 2.18 mIU/ml) respectively. While the lowest IgG sera value was recorded in displaced age group of < 1 year old (0.60 mIU/ml) compared with residents age group of 20 - 24 years old (1.65 mIU/ml).It could be concluded that the results showed that the displaced do not have any effect on the residents of the province of Babylon for measles as a result of the good immunization by Babil Health directorate following to the Ministry of Health.

التعدد الشكلي للمستقبل الثاني لعامل الورم التنخري والجين المحفز للـ CD4 والانترلوكين 37 في تقييم التهاب المفاصل الرثوي == Tumor Necrosis Factor Receptor II, Cd4 Enhancer Gene Polymorphisms And IL - 37 In Assessment Of Rheumatoid Arthritis

اسم المؤلف: وسناء جمعة محمد
اسم المشرف: محمد شمخي جبر | باسم شهاب احمد
الموضوع العام: الطب
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: التهاب المفاصل الرثوي (Rheumatoid Arthritis) مرض جهازي التهابي مزمن يصيب المفاصل وتحديدا الاغشية الزلالية والتراكيب المفصلية، والذي يحدث للعديد من الناس وبنسبة تقارب 0.5 الى 1% من السكان في العالم. لوحظ خلال الدراسات الوبائية لمرض التهاب المفاصل الرثوي | Rheumatoid arthritis (RA) one of the most common systemic autoimmune diseases characterized by chronic joint inflammation and subsequent joint destruction. To date, it well known that RA is characteristic of the expansion of the synovium and infiltration of the inflammatory cells coupled with destruction of adjacent articular cartilage and bone. This is strongly dependent on CD4 T cell. CD4 Cells stimulate monocytes, macrophages, synovial fibroblasts, and other cells to produce cytokines such as tumor necrosis factor - ? (TNF - ?, interleukin - 1 (IL - 1), IL - 6, IL - 15, IL - 17 and metalloproteinases that produce tissue damage. TNF is a major inflammatory cytokine contributing to the pathogenesis of RA, which provides rational for development of anti - TNF biological agents in the treatment of RA.Recently have shown that IL - 37 is a key cytokine in regulating inflammatory response, mainly by inhibiting the expression, production, and function of proinflammatory cytokines. Objectives This study planned to evaluate the association of TNFRII and CD4 enhancer genes polymorphisms in development and severity of RA in Iraqi patients, evaluate IL - 37 in patients with RA and investigate the correlation between IL - 37 levels with disease activity and relation of inflammatory parameters (ESR, CRP, ACPA, and RF) with TNFRII, CD4 enhancer genes polymorphisms.Patients and methods This study was performed during the period from May to September 2015. The patients were attending the out patients' Clinic in Medical City/Baghdad Teaching hospital/rheumatology unit and the laboratory ELISA tests were done in nursing home hospital laboratory, polymerase chain reaction (RFLP) analysis was performed in the specialist private molecular laboratory (ASCO Lab) in Al - Harthia / Baghdad. Fifty patients and 50 apparently healthy control individuals, Patients received disease modifying anti rheumatic drugs (DMARDs) and newly diagnosed patients.The diagnosis of RA patients has performed under the supervision of rheumatic disease consultant physician at the consultation clinic of Baghdad teaching hospital of the medical city. Blood samples had taken from RA patients to measure (ESR), white blood cells count and hemoglobin. Also, analyze the serum levels of ACPA, RF screen CRP and estimate the levels of IL - 37 in patients and healthy individuals using ELISA test kits. TNFRII and CD4 enhancer genes polymorphisms genotyping had achieved by polymerase chain reaction restriction fragment length (PCR - RFLP).Results The results showed the estimation of RF by screening test revealed that its mean level was high among RA patients (168.87+31.62) in comparison with apparently healthy control (4.96+0.71) with highly significant difference (p<0.01). There was a higher positivity of Anti CCP in the patients sera (114.85+21.06) in comparison with apparently healthy control (1.71+0.13) (P<0.01). while the estimation of CRP showed that its level was higher among sera of RA patients (38.39+4.31) in comparison with healthy control group (16.49+2.51) (P<0.01). Furthermore, the ESR level in RA patients were higher than apparently healthy individuals (52.96+3.68) and (10.44+0.74) respectively with significance (P<0.01).The frequencies of the MM, MR, RR genotypes of TNFRII gene polymorphisms were 60%, 32%, 8% in RA patients and 52%, 42%, 6% in controls. There were no significant differences in the genotypes frequencies polymorphisms of the TNFRII 196 MR polymorphism between apparently healthy control and RA. The frequencies of AA, AG, GG genotypes of CD4 10845 A/G in patients was 36%, 42%, 22% and 8%, 44%, 48% in control group. There were significant differences in the genotypes frequencies polymorphisms of the CD4 10845A/G polymorphisms between apparently healthy control and RA patients (p<0.01). AA genotype were significantly more likely to develop RA (OR=1.355). There was significant increase in disease activity and severity in patients carries AA genotype (p<0.01).IL - 37 levels were elevated markedly in RA patients (101.31+10.41) compared with apparently healthy control (43.90+0.91) (p<0.01). More importantly, IL - 37 showed a significant correlation with disease activity (CRP) in RA patients (p<0.05). Also, IL - 37 show non - significant relationship with (MM, MR, RR) exon6 TNFRII in RA patients compared with controls, and non - significant difference between level of IL - 37 with CD4 10845 A/G genotypes compared with healthy control.Conclusion All findings suggested that TNFRII - 196R genotypes not associated with RA diagnosis. In addition, genetic polymorphisms at the CD4 enhancer gene are one of important factors that associated with susceptibility and severity of RA and can serve as a genetic marker for the risk of development of RA.

دورا محتملا لفيروس ابشتاين بار في عملية تسرطن الغدة الدرقية الحليمية == A Possible Role Of Epstein - Barrvirus In Carcinogenesis Of Papillary Thyroid Carcinoma

اسم المؤلف: هند علي خميس
اسم المشرف: عامر رشيد النجار | سعد حسن محمد علي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: This study was designed as a retrospective research. A total number of (90) formalin - fixed, paraffin embedded tissues were studied. Malignant and normal thyroid tumors tissue blocks were collected from the archives of histopathology laboratories of different general hospital including ALYarmouk Teaching Hospital (Baghdad), Baghdad Medical City Teaching Hospital as well as many private laboratories in Baghdad, during the period from May 2013 to May 2014. These cases include ? Thirty tissue specimens from patients with papillary thyroid cancer. ? Thirty tissue specimens with benign thyroid lesions as control thyroid tissues group. ? Thirty (30) thyroid specimens were obtained from the normal thyroid tissues from the same those totally - thyroidectimized patients for thyroid papillary cancer (PTC) and have served as the second control group for this study. This study was therefore a paired case - control design. The sections were stained by hemotaxyline and eosin staining so as to confirm the diagnosis and assure that the intervening sections ( that were specified for the in situ hybridization and Immunohistochemistry study have containing the questioned tissues from papillary thyroid cancers and benign thyroid tissues (control group).After histopathological sectioning of these thyroid gland tumors and staining by Hematoxylin and Eosin, a final definitive diagnosis was done by histopathologist consultant. The practical part of this study was designed in four pathways : 1. Molecular detection of Epstein - Barr virus in those tissue blocks were performed by using ultra - sensitive version of in situ hybridization (ISH) for detection of EBV - EBERs. 2. To perform immunohistochemical study to demonstrate EBV - latent gene (LMP1, EBNA - 2) in the papillary thyroid cancer compared to control group. 3. To perform immunohistochemical screening study to demonstrate the over expression state of p53 - tumor suppressor gene in those tissues with papillary thyroid cancer compared to control group. 4. To perform immunohistochemical screening study to detected the CD8 and CD56 in tissues with papillary thyroid cancers compared to control group. The obtained results are summarized as follows : 1. The mean age of patients with papillary thyroid cancer and simple nodular goiter was (39.87&41.13) years respectively, with standard deviation ±(11.773,9.243) years. 2. In this study, the percentage of the females with papillary thyroid cancer was higher (86.7%; 26 cases) than the percentage of their PTC - male counter parts (13.3%; 4 cases). The patients whom sub totally thyroidectimized for simple noduler goiters , the percentage of females was also higher (73.3%; 22 cases) than the percentage of their male counter parts with simple noduler goiters ( 26.7%; 8cases). Female / male ratios of the patients with PTC and simple noduler goiters were 6.5 and 2.75 respectively. 3. The percentage of EBV results in the total group of PTC was (50%) while the percentage in the total group of normal thyroid tissue was (26.7%) and lastly in the total simple nodular goiter group was (10.0%). 4. The positivity rate of EBV EBERs - ISH technique in the total group of PTC was (30%), where as its percentage in NTT tissues was (16.7%) and in SNG tissues was (3.3%). 5. The percentage of positive - EBNA - 2 IHC technique in the total group of PTC was (20%), where as its percentage in NTT tissues was (10.0%) and in SNG tissues was (6.7%). 6. The percentage of positive - EBV - LMP - 1 - IHC technique in the total group of PTC was (43.3%), where as its percentage in NTT tissues was (20.0%) and in SNG tissues was (6.7%). 7. Mutated P53 - protein was detected in 28 cases (70%) of the studied cases. Twelve cases (30.0 %) showed negative IHC reactions. 8. The highest total percentage of CD8 - IHC reactions (21 cases; 70%) was found in those with papillary thyroid cancer followed by normal thyroid tissues cases ( 5 cases; 16.7%) and then ( 2 cases : 6.7%) in simple nodular goiter. 9. It was found that the highest percentage of CD56 - IHC reactions was in those with normal thyroid tissues (25 cases; 83.3%) followed by an equal percentages of CD56 - IHC reactions in either thyroid papillary or simple nodular goiter (2 positive cases; 6.7%, each). 10. The importance of CD56 marker has been found to play a role or it may be better to be used as a negative - diagnostic biomarker for papillary thyroid cancer in differentiating it from other malignancies as well as benign lesions of the thyroid gland, individually as well as in combination with other markers for clinical evaluation of those patients. 11. The evident high mutated p53 - over expression, as reflected by abnormal gene product, among papillary thyroid cancer patients indicates for a pivotal role of such genetic mutation in their carcinogenesis as well as could be useful in the clinical evaluation of patients with papillary thyroid cancer, too. 12. The high coexistence of p53 - mutation with EBV in PTC could point for participation of EBV - transformation genes in the p53 activation in high proportion of PTC. 13.The high percentage of CD8 lymphocytes in EBV - positive PTC as compared to their EBV - negative counterparts could reflect the participation of specific cellular immunity against both, the papillary thyroid cancers and this EBV infection during the initiation and progression of EBV - associated papillary thyroid cancers.

تشخيص مصلي وجزيئي لفيروس الحلا البشري النوع السادس المصاحب لبعض سرطانات الدم == Serological And Molecular Detection Of Human Herpesvirus Type 6 Associated With Certain Hematologic Malignancies

اسم المؤلف: هديل محمد فياض
اسم المشرف: علاء فاضل علوان | داود سلمان داود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Human herpesvirus 6 (HHV - 6) is largely ubiquitous double stranded DNA viruses within the betaherpesvirinae subfamily and of the genus Roseolovirus.HHV - 6A and HHV - 6B infects very high percentage of population around the world, primarily during childhood through respiratory droplets. HHV - 6 has been found out in many types of cancers : lymphomas, leukemia, cervical cancer, and brain tumors.This cross - sectional case control study was carried out in Baghdad Teaching Hospital and National Center of Hematology - AL - Mustansiriyah University - Baghdad, for the period from 1 September 2013 to 1 April 2015.The aims of the study were to explore the seropositivity rate of HHV - 6 antibodies among Iraqi patients with different hematological malignancies using different laboratory assays, beside, the molecular determination of plasma viral DNA load by quantitative polymerase chain reaction (qPCR).The study included 109 patients with different hematological malignancies; 24 patients with acute lymphoblastic leukemia (ALL), 30 patients with acute myeloid leukemia (AML), 11 patients with Hodgkin lymphoma (HL), 39 patients with non hodgkin lymphoma (NHL) and 5 patients with chronic lymphocytic leukemia(CLL). All patients were newly diagnosed and enrolled before receiving chemotherapy. The age range was between 14 - 80 years. Fifty three (48.6%) and 56 (51.4%) patients were males and females, respectively. The diagnosis of their malignancies was based on either bone marrow aspirate biopsy and lymph node biopsy as well as cytochemical investigations. Additionally, 59 apparently healthy blood donors were enrolled as control group. The age range was between 18 - 59 years, twenty eight (47.4%) and 31 (52.6%) were males and females, respectively.The serum anti - HHV - 6 IgG was detected by indirect immunofluorescent technique (IFAT) as well as by enzyme linked immunosorbant assay (ELISA).While, the serum anti - HHV - 6 IgM was detected by ELISA only. The detection and quantification of plasma viral DNAemia was carried out by quantitative polymerase chain reaction. Serological as well as molecular assays were done in Central Public Health Laboratory in Baghdad. The highest IFAT positivity rate was among patients with CLL (100%), followed by patients with AML (83.3%), and the least positivity rate was among patients with NHL (64.1%) compared to that of healthy control. Generally, the total anti - HHV - 6 IgG by IFAT was insignificantly higher among patients compared to healthy controls (74.3% vs 61.0%, p=0.074). The anti - HHV - 6 IgG positivity rates by ELISA were insignificantly higher in all groups of haematological malignancies except in patients with AML in whom it was significantly higher compared to healthy controls (96.7% vs 72.9%, p= 0.007 ). A part from AML, the highest anti - HHV - 6 IgG by ELISA was among patients with ALL (87.5%) followed by patients with NHL (84.6%), and the least was among patients with CLL (80.0%) compared to healthy control. Generally, the total anti - HHV - 6 IgG positivity rate detected by ELISA was significantly higher compared to IFAT in patients (p= 0.013) as well as in healthy control (p= 0.0005).The results of anti - HHV - 6 IgM positivity rate as detected by ELISA was significantly higher in patients with AML (36.7%, p=0.0004), and patients with HL (27.7%, p= 0.038) compared to healthy controls (6.8%). Whereas, other groups of hematological malignancies showed insignificantly higher positivity rate versus control group. However, the highest positivity rate was among patients with AML (36.7%), and the least positivity rate was among patients with CLL (0%). Generally, the total ELISA anti - HHV - 6 IgM positivity rate was significantly higher in patients versus healthy controls (22.0% vs 6.8%, p= 0.011). The results of PCR showed that 5 out of 109 patients had detectable HHV - 6 DNA in the plasma. The highest detection rate was among patients with HL (27.3%), followed by patients with ALL (4.2%), and then patients with AML (3.3%), while the virus was not detected in other disease categories as well as in healthy controls. The plasma viral load (mean ± SD) among the three Hodgkin lymphoma patients was 1.4± 0.3*102 particle/milliliter.The study concluded that the seropositivity rate of HHV - 6 infection is highly prevalent among Iraqi patients with hematological malignancies compared to healthy population. However, primary or reactivation infection as determined by anti - HHV - 6 IgM in patients as well as healthy individuals is relatively low. Furthermore, the HHV - 6 DNA detection rate as well as plasma viral load among malignant patients before receiving immunosuppressive treatment were low.

دراسة Toll like receptors(TLR2& ( 4 ومؤشرات حيوية مختارة في المرضى المصابين بسرطان المثانة == Study Of Toll Like Receptors (TLR - 2 And 4) And Selected Biomarkers In Bladder Cancer Patients

اسم المؤلف: هدى سعدون البياتي
اسم المشرف: ميسون علي سليم | ناهي يوسف ياسين | عصام سلمان العزاوي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Worldwide, cancers of the urinary bladder are complex and involve genetic abnormalities and may be due to different environmental chemical carcinogens, as well as chronic infection like Schistosomiasis, all these will allow normal transitional cells to become cancerous which are typically transitional cell carcinoma(TCC).This study was conducted at AL - Yarmouk and Baghdad Teaching Hospitals in Baghdad from June 2013 to April 2014, of which urine and bladder tissue were taken from 57 bladder cancer patients and 80 controls to assess Interleukin - 8 (IL - 8), Matrix MetalloPeptidase - 9 (MMP - 9), Bladder Cancer - Associated Protein (BLCA - 4),Toll - Like Receptors (TLR - 2and TL - R4) level among them and to evaluate their roles in cancer development.One hundred thirty seven Iraqi individual were divided to 28(20.43%) newly diagnosed and 29(21.16%) recurrent bladder cancer patients (relapse), 40(29.19%) apparently healthy volunteers and 40(29.19%) autopsies (apparently normal urothelium), of whom urinesample and tissue biopsy were collected, clinical diagnosis of patients carried out by cystoscopic and histopathological examination, the mean ±SD age of bladder cancer patients were (63± 9.3) with (M : F ratio7.1 : 1).Predominant cancer type was Transitional cell carcinoma (TCC). According to risk factors of bladder cancer, out of 57 bladder cancer patients, 34(59.64%), 29(50.87%), 9(15.78%), 7(12.28%), 6(10.52%) were smoker, had UTI, history of Schistosomiasis, family history ofcancer and stones respectively. In this study 30 patients had non - muscle invasive bladder cancer, most of them (21) had newly diagnosed tumors, and only 9 had recurrent disease, as well as, 27 patients with muscle - invasive bladder tumor, just 7 had newly diagnosed tumors and 20 with recurrent disease.According to the result of ELISA technique, the mean±SD urine level IL - 8(pg/ml) for recurrent bladder cancer patients was 359.6±170.1pg/ml, for newly diagnosed was 265.95±139.09pg/ml and for healthy volunteers was 62.04±37.66pg/ml. The mean ±SD concentration of urine MMP - 9(pg/ml) was 7368.3±1730.19pg/ml for recurrent, 6176.8±2366.9 pg/ml for newly diagnosed and 1131.53±1554.80 pg/ml for healthy volunteers. Mean±SD Level of urine BLCA - 4 (ng/ml) for recurrent was 1.45± 0.26 ng/ml, for newly diagnosed was 1.30± 0.22 ng/ml and for healthy volunteers was 1.02±0.067 ng/ml. Urine level of these markers was significantly higher in recurrence group when compared with newly diagnosed and these levels decreased in normal volunteers which was statistically significance (P<0.001 for IL - 8, MMP - 9and BLCA - 4),also there was a significant increase in urine IL - 8 level according to grade(P=0.0002) and muscle invasion(P= 0.0009) as well as BLCA - 4 showed this significant increase in high grade(P=0.0001), and muscle invasion(P=0.0001),but no significant difference was found in the level of urine MMP - 9 with grade(P=0.23) and muscle invasion(P =0.069)In comparison, IL - 8 and MMP - 9 IHC staining of bladder tissue, showed low expression in cancerous tissue with no significant difference between cancer and normal urothelium(P=0.140 for IL - 8, P=0.265 for MMP - 9 ), and unrelated to grade, muscle invasion and recurrence.Significant increase in TLR - 2 and TLR - 4 expression in bladder cancer tissue than in normal urothelium (P=0.0001 for each), and according to grade and muscle invasion, TLR - 2 showed significant over expression in high grade than low grade (40.7%vs36.6%) with P=0.018, muscle invasion than non - muscle invasion (44.4%vs33.3%) with P value of 0.02, while TLR - 4 was none significantly correlated with grade andmuscle invasion. As well as, there was no correlation between these receptors with tumor recurrence.In regard to risk factors, Smoking, schistosomiasis and family history showed correlation with study marker in different manner as, IL - 8 was significantly highly expressed in smoking associated bladder cancer group, as well as patients with family history of bladder cancer showed high expression IL - 8, for Schistosoma associated TCC patients and UTI they demonstrated a statistically significant high expression of TLR - 2 p= (0.0001).From this study we conclude that urine IL - 8, MMP - 9and BLCA - 4 measured by ELISA showed specificity in diagnosis of bladder cancer, besides that, urine IL - 8, MMP - 9 and BLCA - 4 have a role in discrimination between newly diagnosed vs recurrent, with a significant association between urine IL - 8 with BLCA - 4 (P= 0.0001) and IL - 8 with MMP - 9 (P= 0.005) in patients with recurrent bladder cancer. Urine IL - 8 and BLCA - 4 concentration were statistically with significant increase in high grade than low grade and muscle invasion than non - muscle invasion, On the other hand, bladder cancer cells over express TLR - 2 and TLR - 4,while TLR - 2 showed correlation with high grade and muscle invasion,TLR4 did not show such correlation. Lastly, IL - 8 and MMP - 9 staining showed low expression in tumor tissue of different grades, stages and groups.

دراسة بكتريولوجية على التفاقم الحاد لمرضى الانسداد الرئوي المزمن == Bacteriological Study On Acute Exacerbation Of Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Patients

اسم المؤلف: هبة اسماعيل علي العزي
اسم المشرف: عروبة خالد عباس | عبد الحميد القصير
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لا يزال مرض الانسداد الرئوي المزمن مشكلة رئيسية في مجال الصحة العامة. ويرتبط التفاقم الحاد مع فقدان سريع في وظيفة الرئة وخلل في نوعية الحياة وهي من الاسباب الرئيسية للامراضية والوفيات في مرضى الانسداد الرئوي المزمن. تعتبر العدوى البكتيريا هي من الاسباب | Chronic obstructive pulmonary disease remains a main problem in public health. The acute exacerbations are related with rapid loss in lung function and defect in the quality of life and are the main causes of morbidity and mortality in COPD. This study was carried out to isolate and identify the bacteria that cause acute exacerbation in chronic obstructive pulmonary disease and sensitivity of isolated bacteria for most of the antibiotics currently in use.Eighty sputum specimens from patients were included in this study and their age was range forty and above , during the period from January 2015 to June 2015 from three places Al - Yarmouk Teaching Hospital, Medical City Hospital and Medical Al khademeain Emamaain City.Bacteria were identified in 52 (65%) while the patient is not specified any reasoned in 28 patients (35%) patients. The diagnosis of bacteria through culture and microscopic examinations and biochemical tests necessary for diagnosis and then the diagnosis has been confirmed of isolation by the Vitek method for each bacterium, the percentages were as follows : Streptococcus pneumoniae was the most frequently isolated bacteria, which recovered from 21 (26.25%) patients. Followed by Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas spp., which isolated from (7.5%, 7.5%, and 5%) of patients respectively, while (3.75%) for each of Acinetobacter baumannii & Staphylococcus aureus. The proportion of Stenotrophomonas maltophilia was (2.5%) while the proportion (1.25%) for each of Enterobacter cloacae, Leclercia adecarboxylata, Moraxella catarrhalis & Raoultella ornithinolytica.Through the search three cases were infected with Mycobacterium tuberculosis diagnosed by direct Acid Fast Stain test and their percentage was (3.75%).Sensitivity of bacterial isolates to antibiotics Carbapenems and Doxycycline and Chloramphenicol were the most effective against tested bacteria in vitro while Erythromycin, Tetracycline, and Amoxicillin were the least sensitive

دراسة جزيئية ومناعية لدى عينة من مرضى التدرن الرئوي == Molecular And Immunological Study In A Sample Of Pulmonary Tuberculosis Patients

اسم المؤلف: مي يحيى عبد الحسين
اسم المشرف: عروبة خالد عباس | احمد اسمر منخي
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: ماجستير
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: يعتبر مرض السل الرئوي tuberculosis الذي تسببه بكترياMycobacterium tuberculosis من الامراض المعدية والشائعة واحد الاسباب الرئيسية لحالات الوفاة في العالم, ولاهميته اجريت هذه الدراسة لتسليط الضوء اكثر حول التشخيص المناعي للمرض وعلاقته بالتشخيص الجزيئي.تضم | Tuberculosis (TB) is caused by Mycobacterium tuberculosis; which consider as one of the most common, infectious diseases and major causes of morbidity and mortality worldwide. A prospective study was conducted to diagnose disease by immunological methods and its association with molecular diagnosis.The study included immunological diagnosis by Quantiferon - TB Gold In Tube Test, estimation the serum levels of IFN - ?, TNF - ? and IL - 10 in TB patients and control by a sandwich ELISA test using commercially available kits, in addition to molecular diagnosis by using Gene Xpert MTB/RIF assay, conventional bacteriological tests such as smear microscopy by Ziehl - Neelsen stain for sputum samples. Furthermore, estimation of ESR and WBCs.Fifty TB patients attending the National Reference Laboratory of Tuberculosis /Baghdad from the period between April to July 2014 were recruited in this study. For the purpose of comparison, 50 control samples (respiratory disease and healthy) matched by age and gender were also included.All TB patients' samples were positive by smear microscopy. The results revealed that there were significance differences between AFB scoring and G - Xpert results (p Forty five samples of TB patients with significance difference (p?0.01) were positively detected by Quantiferon - TB Gold Test.The mean serum level of QFT among TB patient and control (3.54 IU/ml vs. 0.866 IU/ml and 0.556 IU/ml), IL - 10 (53.02 Pg/ml vs. 22.24 pg/ml and 7.51 pg/ml) and TNF - ? (74.34 Pg/ml vs. 49.12 Pg/ml and 27.81 pg/ ml) were significantly higher in TB patients as compared to controls (P?0.05).In conclusion, high levels of IFN - ?, TNF - ? and IL - 10 in TB patients serum indicate an important role of theses cytokines in the pathogenesis of tuberculosis, so they could be considered as a good biomarkers for diagnosis and considered as a target for future therapy. The present study revealed significant difference in the WBCs and ESR values between TB patients and control (P?0.05)

دور الايبشتاين بار فايرس كعامل محتمل لتقدم سرطان الدم اللمفاوي المزمن == Molecular Characterization Of Metallo ? - Lactamase (MBL) Genes

اسم المؤلف: لمى عامر ياسر
اسم المشرف: عامر رشيد النجار | داود سلمان داود
الموضوع العام: الطب
السنة: 2016
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Epstein Barr virus (EBV) is ubiquitous virus which infects the majority of the human population and is the causative agent of infectious monocleosis and a variety of B - cell tumors including Hodgkin lymphoma, Burkitt lymphoma, human immunodeficiency virus - associated lymphomas and post - transplant lymphoproliferative disorders , this virus expressed many protein and it is associated with a variety of B - cell tumors. Recently many studies have suggested a causal relationship between EBV and chronic lymphocytic leukemia (CLL). A prospective study of thirty samples of formalin - fixed, paraffin - embedded tissue of bone marrow aspirates samples and blood from newly diagnosis BCLL of 30 patients and our control included : 1) 20 bone marrow of patients who they have hematological disease other than leukemia as control. 2) Blood serum from healthy controls to study the level of IL - 10 and IL - 8. The present study conducted at Baghdad Teaching hospitals and the National Center of Hematology from September 2013 to Jun 2014. In this study we investigated the association between EBV and CLL. The detection of EBV encoded RNAs (EBER1,EBER2) by in situ hybridization and also latent membrane protein - 1 (LMP - 1) and EBV nuclear antigen - 2(EBNA2) by immunohistochemistry and detection for the level of Interleukin n (8 and 10) in the serum of CLL patients by ELISA. In situ hybridization study revealed that all the controls were negative for EBERs and 46.7% patients were found to be EBERs positive. There was a correlation between positive EBERs and tumors stage and also EBERs and IL10 and with LMP - 1 and EBNA - 2. Immuno - histochemical method was used to demonstrate the rate of (LMP - 1 and EBNA - 2) in CLL patients where a positive results of EBNA2 and LMP1were found in (43.3 % and 56.6s %), respectively in CLL patient group. All controls were negative with an exception of two patients were LMP1 positive. Enzyme linked immunosorbent assay test (ELISA) was used to detect the level of IL - 8 and IL - 10 in serum of newly diagnosed of CLL patients. Interleukin 8 was significantly higher in CLL cases group (33.1 pg/ml) compared to control group.On the other hand It was found that high increase in IL - 10 level ,in CLL patients when compared with controls. Conclusion : It can be concluded that there is a significant relationship between EBV and Chronic lymphocytic leukemia, mainly EBERs, also the association of significant increase in IL - 10 and IL - 8 with CLL.

مؤشرات جزيئية حول مقاومة الزوائف الزنجارية المرتبطة بخمج المجاري البولية للمضادات الحيوية == Molecular Markers Of Antibiotics Resistance Of Pseudomonas Aeruginosa Associated With Urinary Tract Infections

اسم المؤلف: كريم عليوي حمادي سليمان
اسم المشرف: عامر رشيد النجار
الموضوع العام: الطب
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: الزوائف الزنجارية : وهي بكتريا سالبة لصيغة الكرام والمنتشرة بشكل واسع في البيئة مثل التربة والمياه. وهذه البكتريا تتسبب في كثير من الالتهابات مثل التهاب المجاري البولية والتهاب الحروق وهي بكتريا انتهازية. وتشكل تهديد لحياة المصابين بالمجاري البولية وخاص | Pseudomonas aeruginosa is a Gram |( - ve) bacteria, widely presents in the environment such as soil, water, its incubation period (1 - 3) days, generation time 1 - 2 hrs. This bacteria causes many infections such as (UTI), and burn infections. It is an opportunistic pathogen, life threating for immune compromised patients such as diabetic patients. Pseudomonas aeruginosa is a nosocomial pathogen, and it is ranking the second among Gram ( - ve) hospitals acquiring pathogen. Its antibiotic resistance increased due to acquiring many antibiotics resistance genes. The spread of these genes among bacteria is via plasmids. Plasmid profiling of Ps. aeruginosa isolates by gel electrophoresis is a best technique for detection of plasmid content. Through this study, which was carried out in two main teaching hospitals, the diabetic center and private labs in Baghdad, during the period from January to October 2014. A total of (620) urine specimens were collected during (9) months. Urine specimens from inpatients were (420 / 620, 67.75%) and from out patients were (200 / 620, 32.25%). Urine specimens from Dialysis unit were (280 / 620, 45.1%) and from burn units were (140 / 620, 22.5%). The male represented (n = 334, 52.38%) while female were (n = 286, 46.20%). The positive cultures of urine samples obtained from hospitalized patients were (72 / 420, 17.1%) while for urine samples obtained from out patients (n = 40 / 200, 20%) were positive culture. A total of (112) positive culture out of (620) collected with (18.06%) percentage. A total of (30) bacterial isolates were tested by using disc diffusion method for susceptibility test forward to (15) antibiotics. Ps. aeruginosa isolates showed highest resistance to gentamicin (87.5%) while the lowest resistant toward meropenem, and imipenem with resistance percentage (16.7% and 8.0%) respectively.The occurrence of multi - drug resistance in (30) selected isolates were grouped as follows to (MDR) for those isolates which showed resistance to at least (3) antibiotics which was found to be (5 / 30, 6.6%). While (XDR) referred to those isolates which showed resistance to (4 - 5) antibiotics with (19 / 30, 63.3%). In related to (PDR) which referred to isolates that showed resistance to more than 5 with (6 / 30, 20%). The extracted plasmid DNA were resolved by gel electrophoresis for detection of plasmid content for (20) isolates including (10) isolates from inpatients, and (10) isolates from out patients. The selection of these isolates were grouped according to their antibiotic resistance pattern and the number of plasmids that they carried. The results showed that out of (20) there were (12 / 20, 60%) had no plasmid. While the remaining (8 / 20, 40%) had plasmids with different sizes and numbers. By using PCR technique the most common kinds of genes such as bla CTX - M, bla OXA, which encoded extended spectrum ? - lactamase (ESBLS) and those for metallo ? - lactamase such as bla IMP, were investigated with specific primers. Five isolates were selected depending on the numbers of plasmids which they carried and their resistance to antibiotics.
1 ... 34 35 36 37 38 ... 49