البحث — المستودع الرقمي العراقي

نتائج البحث: 25 من أصل 78

التوصيف المظهري والجزيئي لخميرة المبيضات المعزولة من عدوى المستشفيات في مدينة الحلة == Phenotypic and molecular characterization of Candida species isolated from hospital acquired infections in Hilla city

اسم المؤلف: زهراء محمد وناس

اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم للبنات - قسم علوم الحياة

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

المستخلص: المبيضات هي من الانواع الغير مسببة للامراض التي تعيش ك فلورا طبيعية ولكن في بعض الاحيان، بعض انواع المبيضات تسلك ك اصابات انتهازية مما تسبب في العديد من انواع داء المبيضات. هدفت هذه الدراسة الى مسح وتحديد انواع المبيضات في عينات الدم وعينات (مسحات)من تجويف الفم من المرضى وحدة العناية المركزة، ومرضى السرطان ومرضى سرطان الدم على اساس الطرق التقليدية والجزيئية. وشملت هذه الدراسة 400 العينات السريرية (264 عينات من الدم و136 مسحه من تجويف الفم) التي تم جمعها من المرضى من مدينة مرجان الطبية ومستشفى الحلة التعليمي في مدينة الحلة. الذين مصابين بالامراض المختلفة (السرطان، وحدات للجراحة الباطنية، الحروق وسرطان الدم) خلال الفترة من نوفمبر / 2015 وحتى ابريل / 2016. العينات تم زراعتها على الاوساط المناسبة والانتقائية تحت الطرق القياسية لعزل وتحديد العوامل المسببة الفطرية. بعد ذلك، والكشف عن عوامل الفوعة للانواع المبيضات مثل تشكيل انبوب الجرثومية، افراز الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم. من ناحية اخرى تركيز تثبيط الحد الادنى (MIC) باستخدام طريقة (E - test) لاثنين من مضاد (الفلوكونازول وCaspofungin) تم اختبارها. اظهرت النتائج ان 53 عينة ايجابية للدم (37 الخميرة و16 الفطريات الخيطية) من 264 عينات الدم، معظمهم ترتبط مع سرطان الدم، وحدة العناية المركزة، البطن الجراحية، مرض السرطان، والحروق بينما اظهرت مسحات تجويف الفم 71 عينة ايجابية (نمو الخميرة) من 136 عينات مسحة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت النتائج ان تم تحديد خمسة انواع من المبيضات التي شملت عينات المرضى تحت دراستنا C.albicans، C.sake، C.parapsilosis، C.krusie وC.membranifaciens على اساس الخصائص اللون على CHROMagar وتحليل تسلسل الحمض النووي . اظهرت معظم المبيضات القدرة على انتاج الليباز وفسفوليباز، تشكيل بيوفيلم بوصفها عوامل الفوعة. وبالاضافة الى ذلك، اظهرت نتائج اختبار الحساسية المضادة للفطريات على اساس اختبار E الفحص ان معظم المبيضات كانت حساسة لكلا الفلوكونازول وCaspofungen. واظهرت نتائج تسلسل multialignment التي تعتمد على برنامج Bioedit لمدة 17 الخمائر التماثل الكبير بين ستة عزلات C.sake، 4 يعزل C.membranifaciens، 4 عزلات C. parapsilosisوkudriavzevii Pichiaوبالاضافة الى ذلك، هذا الاختبار يبين متميزة من مجموعات اخرى من المبيضات من بعضها البعض. الشجرة التطورية انشات على اساس تسلسل 17 الخمائر في خمسة عناقيد. عزلتين جديدة C.sake وC.membranifaciens تم عزلها من عينات الدم تم وسجلت لاول مرة في العراق. استنتاجنا التاكيد على اهمية وجود المبيضات كما عدوى المستشفيات المكتسبة، الامر الذي يتطلب المزيد من الاهتمام لفي العراق في المستقبل. | Candida species is non - pathogenic that lives as normal flora but sometimes, some of Candida spp behaved as opportunistic causing many types of Candidiasis. This study aimed to survey and identification of Candida spp in the blood samples and from oral cavity swab samples from ICU patients, cancer patients and leukemia patients based on conventional and molecular assays. This study included 400 clinical samples (264 Blood samples and 136 Oral swabs) collected from patients of Marjan Teaching Hospital and Hilla Teaching hospital in Hilla city. Who undergo from different illness (Cancer, ICUs, Abdominal surgery, Burns and Leukemia) during the period from November / 2015 to April / 2016. Samples were cultured on appropriate and selective media under standard methods for isolation and identification the fungal causative agents. After that, detection of virulence factors for Candida spp such as germ tube formation, secretion of the lipase and phospholipase, biofilm formation. On the other hand, Minimal Inhibition concentration (MIC) using agar - based and method (E - test) for two antifungals (Fluconazole and Caspofungin) were tested. The results showed that 53 positive blood samples (37 yeast and 16 filamentous fungi) out of 264 blood samples, most of them correlated leukemia, ICU, abdominal surgical, cancer and burns while the oral cavity swabs showed 71 positive samples (yeast growth) out of 136 swab samples. In addition, the results showed that five species of Candida were identified which the patients samples under our study included C. albicans, C.sake, C.parapsilosis, C.krusie and C.membranifaciens based on color characteristics on CHROMagar and DNA sequence analysis. Most of Candida spp showed an ability to produce lipase and phospholipase, biofilm formation as virulence factors. In addition, the results of antifungal sensitivity test based on E - test assay showed that most of Candida spp were sensitive for both Fluconazole and Caspofungen. The results of multialignment sequence based on Bioedit software for 17 yeasts showed high homology between six isolates of C.sake, 4 isolates C.membranifaciens, 4 isolates of C. parapsilosis and Picha kudriavzevii. In addition, this assay shows the distinct of other groups of Candida from each other. The Phylogeny tree constructed Meg6 based on sequence of 17 yeasts occur in five cluster. Two new isolates C.sake and C.membranifaciens were isolated from the blood samples has been the recorded for the first time in Iraq. Our conclusion emphasis the importance of candidemia as hospital acquired infection, which required for more attention in Iraq in the future.

دراسة مناعية ووراثية للمرضى المصابين بالتهاب المرارة في مدينة الحلة == Immunogenetic Study on Patients with Gallbladder Infection in Hilla city

اسم المؤلف: رواء عداي علي السلطاني

اسم المشرف: عبد النبي جويد عبد المعموري

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2017

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم للبنات - قسم علوم الحياة

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

المستخلص: تضمنت الدراسة جمع ( 100 عينة ) اخذت بشكل اعشواني ( 87 اناث , 13 ذكور ) اجريت لهم عملية استئصال المرارة بمستشفى الحلة التعليمي للفترة من ايلول 2016 الى شهر حزيران 2017. تضمنت العينات (عينات دم وحصى) لتحقق من دور بعض المعايير المناعية والوراثية المتعلقة بمرض التهاب المرارة .بينت نتائج الدراسة الحالية ظهور الاصابة بالتهاب المرارة في كلا الجنسين(الاناث والذكور) وكانت الفئة العمرية ( 31 - 40 ) سنة الفئة الاكثر عرضة للاصابة , لكن نسبة اصابة الاناث في مجتمع الدراسة اعلى من الذكور ( 87% ) بينما الذكور ( 13%) كما ان التهاب المرارة المزمن هو الاكثر شيوعا ,اذ شكل نسبة ( 84% ) ثم التهاب المرارة الحاد اذ شكل نسبة 60%)).كما كشفت الدراسة قلة تكوين الحصى المرارية عند الاطفال بعمر اقل من عشر سنوات ويزداد تكوين الحصى مع تقدم العمر وينخفض تدريجيا بعد عمر 60 سنة . اكثر انواع الحصى المرارية الشائعة والتي عزلت الحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة.اما الدراسة المناعية فتضمنت تقدير مستويات T6F - β1 , IL - 8 في مصل مرضى التهاب المرارة باستخدام تقنية الاليزا لوحظ زيادة مستوى TBF - β1 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن) على نقيض مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية. P< 0.05 P=0.007 . كما اظهرت النتائج الحالية زيادة بمستوى T6F - β1 في كلا الجنسين) للاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة بمستوى احتمالية P=0.002 . P< 0.05 للاناث وP=0.003 . P< 0.05 للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقد لوحظ زيادة في مستوى T6F - β1 في مصل المرضى المصابين بالحصى الكوليسترولية تليها الحصى الصبغية ثم الحصى المختلطة .اظهرت النتائج الخاصة بتقدير مستوى انترلوكين 8 ,زيادة في مستوى IL - 8 في جميع المرضى( التهاب المرارة الحاد والمزمن )على نقيض مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية عالي ( P=0.005 . P<0.05 ) .كما ظهرت النتائج الحالية زيادة في مستوى انترلوكين 8 في كلا الجنسين(الاناث والذكور) مقارنة مع مجموعة السيطرة مع مستوى احتمالية ( P=0.01 . P< 0.05 ) للاناث و<0.05) ( P=0.2 . P للذكور. اما بالنسبة للحصى المرارية فقط لوحظ زيادة في مستوى IL - 8في جميع المرضى المصابين بالحصى المختلطة تليها الحصى الكوليسترولية ثم الحصى الصبغية .تضمنت الدراسة الوراثية ( - 869 T C ) T6F - β1 و( - 251 T A ) L - 8 ذات الصلة مع مرضى التهاب المرارة لل85 عينة متضمنة عينات للمرضى وعينات لمجموعة السيطرة باستخدام تقنية (PCR - ARM ) .اظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيري المفرد 76.6%) 46 : T6F - β1 ( - 869)T⁄C ) من متباينة الاشكال (T∕C) و9 (15%) متماثلة الاشكال (TT) و(8%) 5 متماثلة الاشكال (CC) ,واظهرت النتائج ان(Tallele) الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع( C allele) . كما اظهرت الاليلات والمورثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى ( المزمن والحاد ) كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى المرارية الاكثر صلة بالموروثات متباينة الاشكال (T⁄C) للحصى الكوليسترولية تليها المختلطة ثم الصبغية . واظهرت نتائج التنوع النيوكليوتيدي المفرد (41.6%)25 : IL - 8( - 251) T/A من متماثلة الاشكال متباينة الاشكال من متماثلة الاشكال (TT) واظهرت النتائج ان هو الاكثرعددا ونسبة مقارنة مع لمرضى التهاب الحرارة كما اظهرت الاليات والموروثات عدم وجود فروق معنوية ذات دلائل احصائية بين المرضى ومجموعة السيطرة بين نوعي المرضى )المزمن والحاد ( كما لوحظ ان المرضى المصابين بالحصى الاكثر صلة مع الموروثات متماثلة الاشكال((AA للحصى الكوليسترولية تليها الصبغية ثم المختلطة . | The study included 100 patients taken randomly (87 females and 13 males) undergoing cholecystectomy at the general teaching Hilla Hospital from September 2016 to June 2017. For each patient, two samples were taken which included the blood samples and gallstone for immunogenetic tests. The infection appears in both sexes with age group (31 - 40) years 30% but the rate of infection in female was higher than males 87%, 13% respectively.Clinically, chronic cholecystitis was the most common (84 %) and acute cholecystitis (16 %). The study displayed that the formation of gallstones is less than 10 years old. The gallstones are formed by age and gradually decrease after age 60. The most common types of gallstones were cholesterol stones and pigment stone followed by mixed stone The immunological study included estimatation the level of IL - 8, TGF - β1 in patients serum by using ELISA technique. The estimation of TGF - β1level explained a significantly increased in all patients (chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference . P=0.007, p<0.05. Estimation of TGF - β1 level showed increases in both the sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference . (p=0.002. P< 0.05) for females, (p=0.003. P< 0.05 for males). As for the stone, the results of the present study revealed increased levels of TGF - β1 in serum patients had cholesterol stone with value followed the pigment stone and mixed stone. The estimation of IL - 8 level explained a significantly increased in all patients(chronic and acute inflammation) compared with the control group with a significant difference. P=0.005 , p<0.05. Estimation of IL - 8 showed increases in both sexes (females and males) compared with the control group with a significant difference (p=0.01. P< 0.05) for females, (p=0.02. P< 0.05 for males). As for the stone, the results showed that IL - 8 concentration was increased in patients serum had mixed stone followed cholesterol stone and pigment stone. The genetic study involved screening of TGF - B1 ( - 869 T/C) and IL8 - ( - 251 T/A) related to gallbladder infection patients for 85 samples, including patients and the control group by using (ARM - PCR) technique. The single nucleotide polymorphism of TGF - β1 ( - 869 T/C) showed : TC heterozygous was a higher rate with 46 (76.6%), TT homozygous with 9 (15%) and CC homozygous with 5 (8%) and the result revealed that the T allele more predominant than the C allele. The genotype and allelic association of TGF - β1 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of TGF - β1 for patients appeared the genotype of T/C higher percentage in patients with who had cholesterol stone followed by mixed stone and pigment stone. An another single nucleotide polymorphismof of IL8 - (251T/A) showed : AA homozygous was a higher rate with 25 (41.6%), TA heterozygous with 23 (38%) followed by the TT homozygous just 12 (20%) and the result revealed that the A allele more predominant than the T allele. The genotype and allelic association of IL - 8 appeared no significant differences between the patients and the control group. The gallstone types association with genotype of IL - 8 for patients showed : The genotype of AA appeared higher percentage with patients who had cholesterol stone followed by pigment stone and mixed stone

التوصيف المظهري والجزيئي لبعض الفطريات الخيطيه والخمائر المعزولة من اخماج العين واختبار حساسيتها الدوائيه تجاه بعض المضادات الفطرية == Morphological And Molecular Identification of Some Filamentous Fungi And Yeast Isolated From Eye Infections And Theirs Susceptibilities Toward Some Antifungals

اسم المؤلف: يسر فاضل عبد الامير الاسدي

اسم المشرف: زيدان خليف عمران المعموري

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2014

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بابل - كلية العلوم للبنات - قسم علوم الحياة

اللغة: العربية

مكان الجامعة: بابل

الصفحات الاولى:

المستخلص: تمت هذه الدراسة في مختبر التقنيات الاحيائية التابع لكلية علوم البنات / جامعة بابل للفترة من اكتوبر 2012 الى اكتوبر 2013، حيث تم جمع 165 عينة سريرية من المرضى المراجعين لاستشارية العيون في مستشفى الحسين العام ومن بعض العيادات التخصصية لاطباء العيون في محاف | The study was performed in Biotechnical Laboratory in Science collage for women, Babylon University from Oct.2012 to Oct.2013. 165 clinical samples were collected from patients with eyes infections were admitted to AL - Hussein main hospital in Karbala province and private clinics of eye physician, after diagnosis of eye infection by specialize physician the clinical samples collected by using swab from Cornea, Conjunctiva, Lacrimal sac, eye allergic, contact lenses and from pull water eye after surgery, the samples included different sex & age groups.All clinical samples culturing on SDA and PDA, Yeast was identified base on their color reactions on Chromo agar Other biochemical test were performed.Antifungal sensitivity was performed against 8 antifungal (Nystatin, Econazol, Amphotericine B, Flucosytosine, Miconazole Metronidazole, Griseofulvin, Ketoconazol, Most fungi showed variable degrees in their susceptibilities to the antifungal agents. In this study we diagnostic (57) isolate from filamentous fungal species, Aspergillus spp. and Fusarium spp. showed highly frequent in ratio 20.1% and 9.6, In addition (37) yeast isolated, C.albicans and C.famata representative the highest frequent isolates.Molecular identification and genotyping, 8 isolates identified as C.albicans from 24 of selective Candida isolates were performed by specific pair primer (CABC) that give genotype with 515 base pair, genotype ITS1/ITS4 region show polymorphic PCR product help in diagnosis other (7) Candida species like C.famata, C.rugosa, C.glabrat, C.utili, C.saitoana, C.guilliermondii, C.inconpicua. The pair primer for amplified the transposable intron (CA - INT) was succeed in amplification of intron showed two genotypes : type A (450bp) and type B(850bp) and showed there was no C.dubliniensis isolates in our Candida isolate, This result was coincidence typing results between specific pair primer (CABC) and Microsatellite CAI for C.albicans.The amplified 18s region by using NS/EF3 and the result give genotype with molecular weight 1700bp.Also the study include using RFLP technique & the digested by using CfoI enzyme & the results for ITS PCR products of 24 isolates of Candida showed unique RFLP patterns.