عرض: 25 50 75 100 النتائج

نتائج البحث: 25 من أصل 153

دراسة تاثير التحمل في الازالة الحياتية لعنصر الخارصين بوساطة البكتريا == A Study on the effect of Tolerance on bioremoval of Zinc by bacteria

اسم المؤلف: صبا رياض خضير الطائي
اسم المشرف: محمد نافع علي العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

المعالجة الحياتية للرصاص والنحاس في مياه الفضلة لمعمل البطاريات == Biotreatment of lead and copper in battery factory wastewater

اسم المؤلف: زينة علي حسون
اسم المشرف: محمد نافع علي العزاوي | صديق احمد قاسم الحيالي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

تقييم مخاطر بعض المواد الكيميائية في مستحضرات تجميل الوجه المستعملة والجديدة في مدينة بغداد/ العراق == Risk assessment of some chemicals in new and used facial cosmetics in Baghdad city/ Iraq

اسم المؤلف: همسة طارق عبد الرزاق الحلفي
اسم المشرف: محمد نافع علي العزاوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2017
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

دور بروتين A المستخلص من جدران خلايا Staphylococcus aureus في امراضية البكتريا == Role of Staphylococcus aureus cell wall protein A in the pathogenesis of the bacteria

اسم المؤلف: سمير عبد الامير عبد علي علـش
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح | علي عبد الرحمن طه
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2008
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: ا عتمد في اجراء هذه الدراسة على 20 عزلة مرضية من بكتريا Staphylococcus aureus ا خذت من مختبر الصحة المركزي مشخصة باستعمال نظام ابي للعنقوديات (API - Staph . Ident . System) . ا عيد تشخيص جميع العزلات عن طريق استخدام الاختبارات الكيموحيويه من اجل التثبت بشكل دقيق من هويتها ، وقد جاءت العزلات جميعها متوافقة مع تشخيص مختبر الصحة المركزي . ا ستخدم اختبار التلازن الدموي ( (Haemagglutination test في التحري عن وجود بروتين A في عزلات S . aureus المشخصة جميعا ، وقد اظهر هذا الاختبار تباينا ملحوظا في نسبة امتلاك هذه العزلات لبروتين A . فقد برزت العزلات ذوات الارقام 1 ، و5 ، و6 ، و7 ، و9 بوصفها عزلات ذات محتوى عال من بروتين A . اما العزلات ذوات الارقام 8 ، و10 ، و11، و12، و13، و14 ، و15، و17، و18، و19 ، و20 ظهرت انها ذات محتوى متوسط من بروتين A . فقط العزلة ذات الرقم 16 ظهرت انها فقيرة المحتوى من بروتين A . بينما كشف ووفق الاختبار المستعمل عدم امتلاك العزلات 2، و3 ، و4 اي محتوى من بروتين A . ا نتخبت العزلة رقم ( 1 ) كعزلة مثالية من اجل انجاز هذه الدراسة لكونها تميزت بمحتوى عال من بروتين A فضلا عن انها تقدمت على بقية العزلات في اعطاء النتيجة الموجبة لاختبار انتاج انزيم Coagulase ، وكذلك في اظهار تحللا كاملا وشديدا في اختبار انتاج حالة الدم Hemolysin . ا ستخلص بروتين A الخام (Crude protein A) على مرحلتين . كانت المرحلة الاولى باتباع طريقة (Lind , (1974 ( طريقة التعليق بالصوديوم ازايد ) بوصفها طريقة سهلة وغير مكلفة في الحصول على مستخلص بروتين A المرتبط بجدار الخلية العنقودية للعزلة رقم ( 1 ) (Cell - bound protein A) بشكل كامل مع الحفاظ وبدرجة عالية على وحدة التركيب البنائي لبروتين A من اية تشوهات . اما المرحلة الثانية كانت باتباع طريقة ( Seki et al .,( 1985 طريقة مكملة للطريقة الاولى وذلك بترسيب بروتين A الطافي بكبريتات الامونيوم ( 85 % اشباع ) مع بقاء بروتين A المترسب محتفظا بفعاليته . ا دخل مستخلص بروتين A الخام عملية التنقية ( Purification) وهي كذلك كانت على مرحلتين . المرحله الاولى استخدمت فيها طريقة كروماتوغرافيا التبادل الايوني (Ion - exchange chromatography) بعمود ( DEAE - Cellulose ). اما المرحلة الاخرى فقد تضمنت استخدام طريقة كروماتوغرافيا الترشيح بالهلام (Gel - filtration chromatography) بعمود Sepharose CL - 6B) ) . انتهى استخدام الطريقتين في الحصول على مستخلص بروتين A منقى ( Purified protein A ) .ومن اجل التحري عن احتفاظ مستخلص بروتين A الخام والمنقى بفعاليته استخدم اختبار الانتشار المناعي الثنائي في الهلام الذي اعطى نتيجة موجبة بتكون الخطوط الترسيبية التي نتجت من تفاعل مستخلص بروتين A الخام والمنقى مع IgG لمصل دم خنزير غينيا .قدر تركيز مستخلصات بروتين A ( الخام والمنقى جزئيا والمنقى ) باتباع طريقةBradford, ( 1976 ) . حيث بلغت التراكيز 63 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A الخام ، و42 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى جزئيا ، و36 مايكروغرام / مليلتر لمستخلص بروتين A المنقى .تم استخدام الفئران البيض من نوع ( Balb C ) من اجل الوصول الى التاثيرات المرضية لمستخلص بروتين A المنقى . حيث حقن المستخلص بطريقة الحقن داخل البريتون Intraperitonial injection)) بعدد سبع حقنات ، وبمعدل 0.1 مليلتر لكل حقنة ( ذو التركيز 36 مايكروغرام / مليلتر ) ، يفصل بين حقنة واخرى يوم واحد . اظهرت مجموعة فئران البحث المحقونة ببروتين A المنقى على المستوى السريري خمولا عاما بدا واضحا بعد الحقنة السادسة . لم تظهر اية تغيرات مظهرية جلدية في مناطق الحقن كما لم تحدث وفيات . بعد قتل الفئران وتشريحها جميعا ا ستاصلت اعضاء القلب ، والطحال ، والكبد ، والكليتين ، والامعاء ، والمعدة ، واخيرا الرئة . وبالموازنة مع اعضاء فئران السيطرة لوحظ حدوث تضخم كبير في الطحال . كما اظهر الكبد تضخما ملحوظا وهذا سجل في الفئران المحقونة ببروتين A المنقى . لم يسجل حدوث تغيرات على المستوى المظهري في اعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة ولكن لوحظ وجود بقع سوداء اللون على السطح الخارجي لنسيج الكبد ، والكليتين ، وهو ايضا سجل في فئران الدراسة اجمع .اهم ما برز في هذه الدراسة هو حجم التاثير المرضي الذي اصاب عضو الرئة حيث ظهر بشكل غريب فقد بدا النسيج يميل الى السواد ببهوت وهو ما كان واضحا في سبعة من فئران الحقن ، اما الثلاثة الباقية شوهدت الرئة فيها خلال التشريح وهي مغطاة بعض من اجزائها بالدم .كشف الفحص النسيجي لاعضاء القلب ، والامعاء ، والمعدة عدم وجود اية تاثيرات مرضية ناتجة من حقن بروتين A المنقى . اما الطحال فقد شهد حدوث توسع كبير في منطقة اللب الابيض White Pulp)) مع احتقان دموي بارز وانتشار للخلايا المولدة للصفيحات الدموية (Megacaryocytes) . اما الكبد فقد برز فيه حدوث تلف بسيط (Mild degenerative change) في خلايا الكبد مع ارتشاح خلايا احادية النواة (Monocytes) خصوصا في المنطقة البوابية التي بدت متوسعة نوعا ما . كما لوحظ زيادة في خلايا كبفر ((Kupffer cells في عموم نسيج الكبد . الكليتين شهدت بروز زيادة في الخلايا المكونة للكبيبة الكلوية ( Glomeruli) والتي يطلق عليها ( Mesengial cells ) .عضو الرئة تضمن الفحص النسيجي له تاثيرات عدة وهي كما يلي : 1 - احتقانات دموية كبيرة ( Bloody congestions ) .2 - وذمة ( Oedema ) .3 - ارتشاح خلايا التهابية ( Inflammatory cells infiltration) .4 - توسع في الفسح القصبية ( Alveolar spaces) مكونا ما يسمى بظاهرة Emphysema)) اي انتفاخ حويصلات الرئة . بدت الرئة للفئران المحقونة جميعا ببروتين A المنقى اكثر الاعضاء التي اظهرت تضررا نسيجيا كبيرا موازنة بالضرر في بقية الاعضاء .تم اجراء اختبار التحري عن السمية الخلوية لبروتين A المنقى باستخدام تقنية مزرعة الخطوط الخلوية الطبيعية ( Normal cell lines - culture ) حيث اعطى الاختبار نتيجة سالبة اي عدم امتلاك بروتين A المنقى تاثيرا سميا (Toxic effect) في الخلايا النامية . | This study dealt with ( 20 ) diagnosed isolates of Staphylococcus aureus by "API - Staph . Ident . System". which were taken from the central health laboratory . The diagnosis was repeated so as to confirm the identity of those isolates by using biochemical tests whose results were the same as those of the central health laboratory .The haemagglutination test was used to investigate the presence of protein ( A ) in all S . aureus isolates . The results markedly showed differences in content concerning the ratio of this protein , thus isolates numbered 1 , 5 , 6 , 7 and 9 gave high content of protein ( A ) , but the isolates numbered 8 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 17 , 18 , 19 and 20 gave medium content of protein ( A ) . Isolate numbered 16 was the only isolate that has low content of protein ( A ) . On the other hand , isolates numbered 2 , 3 and 4 gave no content of protein ( A) .The isolate number ( 1 )has been chosen as an optimal isolate to accomplish this study , Because of its high content of protein ( A ) , furthermore it was the best isolate in getting positive result concerning the test of coagulase production , and in giving a complete and intensive result concerning the test of hemolysin production . Crude protein ( A ) was extracted by two steps : Lind method ( Lind , 1974 . ) "Suspending in sodium azide" was followed at the first step as an easy and a cheap method in getting a thorough cell - bound protein ( A ) extracted from the isolate number ( 1 ) with high preservation of the structural unit without any deformation .The Seki et al .,( 1985 ) method was followed in the second step as a completion method to the first one , by the precipitate of the supernatant protein ( A ) using ammonium sulfate ( 85 % saturation ) . The function of precipitated protein ( A ) was perfect . In order to get a purified protein ( A ) extract from crude protein A , purification was accomplished by two steps : Ion - exchange chromatography by DEAE - cellulose column was used in the first step , While Gel - filtration chromatography by Sepharose CL - 6B column was used in the second step . Double immunodiffusion in gel was used to investigate the preservation of the crude and purified protein ( A ) with its full function . This test gave a positive result by forming the precipitate lines as a result of the interaction between protein ( A ) ( Crude and Purified ) and IgG of guinea pig sera .Bradford method was used to estimate protein ( A ) extracts concentration ( Crude , Partial purified , Purified ) . The estimation was 63 microgram / ml for crude extract , 42 microgram / ml for partial purified extract and 36 microgram / ml for purified extract .white mice ( Balb C ) were used to investigate the pathogenic effects of purified protein ( A ) . Intraperitonial injection method was used to inject 0.1 ml of 36 microgram / ml of purified protein ( A ) for 7 times with a one - day separating period . The injected mice with purified protein ( A ) showed general weakness which was very clear after the sixth injection . there were no phenotypic dermal change in the injection area , and no dead mice as well .After killing and dissecting of all the mice , the organs of heart , spleen , liver , kidney , intestine , stomach and lung were eradicated . There were a great enlargement in spleen and a little in liver in all injected mice in comparison with the control mice . No phenotypic changes appeared in heart , intestine and stomach , but black spots were shown on the outer surface of kidney and liver tissue which were presented in all the injected mice . The most important results in this study is the great size of pathogenic effects in lung . The shape of its tissue seemed strange and tended to be faint black with which was obvious in seven mice . The lung of the three others ( some parts ) showed during anatomy covered by blood .The histological check for heart , intestine and stomach showed no pathogenic effects resulted from protein ( A ) injection . In the spleen , there was a huge expanding in the white pulp region , with blood congestion while the spreading of megacaryocytes has increased . The liver showed mild degenerative change in liver cells with monocytes infiltration especially in the entrance region which appeared expanded . Also there was an increase in kupffer cells in all liver tissue .Kidney showed increase in mesengial cells which are concedered the forming units of glomeruli .The histological check of lung included the following : 1 - Bloody congestions .2 - Oedema .3 - Inflammatory cells infiltration .4 - Alveolar spaces expanding forming '' Emphysema '' .The lung was the most effected organ that showed tissue injury among other all organs . The normal cell lines - culture technique was followed to investigate cellular toxicity of the purified protein ( A ) which gave a negative result , that means , there was no toxic effect of purified protein ( A ) on the growth cells .

عزل وتشخيص البكتريا العصوية (Bacillus) المنتجة لانزيمات التحلل المائي (الحلمهه) (Hydrolases) المتحملة للحرارة == Isolation and identification of Bacillus producing thermotolerant hydrolases

اسم المؤلف: عدنان حنون عباس
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تم الحصول على 97 عزلة من البكتريا العصوية ( Bacillus ) من جمع 200 عينة تربة ومياه في الفترة مابين تموز/تشرين اول 2008 من مواقع مختلفة من العراق بعد التشخيص الاولي ( صبغة كرام, تكوين السبورات, انتاج الكاتاليز ) وتلقيح العينات على وسط ال Thermus agar وتنميتها على درجة 50°C لفترة 24 ساعة. اظهــــرت نتائج الاخــــــتبارات الكيمــوحيــــويـــــة ان 56 عزلة تربـــــــة صنفت على انها B. laterosporus 35.71% , B. circulans 16.07% , B. stearoyhermophilus 14.28%, B. polymyxa 12.5% , B. macroides 7.14%, B. mycoides 7.14% , B. lentus 3.57% , B. popilliae 1.78% , B. chitinosporus 1.78 , بينـــما صنفت 41 عـــــــــزلة مياه عــــلى انها B. laterosporus 26.82% , B. circulans 26.82% , B. stearothermophilus 4.87% , B. polymyxa 4.87% , B. macroides 9.75% , B. mycoides 2.43% , B. lentus 7.31% , B. popilliae 4.87% , B. filicolonicus 4.87% , B. brevis 2.43% , B. larvae 2.43% , B. pumilus 2.43% . اظهرت عزلات ال ( Bacillus ) المعزولة من التربة والمياه ايجابيتها في انتاج الانزيمات المتحملة للحرارة بعد اختبارها على وسـط الاكار الصـلب, كالبروتييــز ( 73.17% ) ( 89.28% ) , الاميـــــــــليز ( 51.21% ) ( 55.35% ) , اللايبيــــــــــــز ( 95.12% ) ( 91.07% ) , السيليليز( 60.97% ) ( 85.71% ) , والكايتينيز( 92.68% ) ( 85.71% ) , على التوالي, في فترات حضانـــة مختلفة ودرجة حرارة 50°C . من جهة اخرى, قيست قابلية عزلات ال ( Bacillus ) والبالغة نسبتها ( 41.23% ) على انتاج انزيمات التحلل المائي كالبروتييـــز والاميليــز واللايبيـــز والسيليليـــز والكايتينيــز, باجمعها, حيث اظهرت النتائج بان سلالات ال B. polymyxa كانت الافضل في انتاج البروتييز والاميليــز والسيليليــز, بينما سلالات ال B. lentus كانت الافضل في انتاج الكايتينيـــز, اما اللايبيـــزفقد تم انتاجــــــــه من قبل سلالات ال B. circulans , B. stearothermophilus , B. polymyxa , B. mycoides وB. lentus , على اوساط زرعية وفترات حضانة مختلفة ودرجة حرارة 50°C. هذا وقد حددت الظروف المثلى لانتاج الاميليز من العزلة B. polymyxa AS 4/5 واظهرت النتائج ان الوسط الامثل للانتاج والمحضر مختبريا متكون من 2% نشا, 1% تربتون, 0.05% كبريتات المغنيسيوم, 0.05% كلوريد الصوديوم و0.02% كلوريد الكالسيوم , برقم هيدروجيني 7, وبدرجة حرارة 50°C لفترة 48 ساعة. تم استخلاص الاميليــز من الوسط الزرعي وتركيزه بواسطة السكروز, وقد اظهرت النتائج الحصول على الاميليز بفاعلية نوعية 2.36U/mg protein, في المــرحلة الاولى تمت تنقية الاميليز بطريقة كروماتوغرافيا الوجبة Batch Chromatography واعقبت هذه المرحلة استخدام عمود التبادل الايوني Ion exchange chromatography باستخدام المبادل DEAE - Cellulose column . وقد اظهرت النتائج الحصـــول على الاميلــــيز بفاعلية نوعية 6.76U/mg protein وبعدد مرات تنقية بلغ 2.86 وبحصيلة نهائية 18.65% . تمت ايضا دراسة توصيف الانزيم, واظهرت النتائج بان الفعالية الانزيمية تزداد بزيادة درجة الحرارة الى 90°C بينما اظهر الاميليزثباتييتـــه في درجات الحرارة 40°C, 50°C, 60°C , في حضانة لمدة 30 دقيقـــة, اما الفاعلية المثلى للانزيم بالرقم الهيدروجيني pH 5, اما ثباتية الانزيم فتكون في الارقام الهيدروجينية مابينpH 4 - 10 في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة, وبفاعلية متبقيــة قصوى 78.57% في .pH 5 اما النتائج المتعلقة بتاثير الايونات الفلزية على الانزيم, تبين ان لكلوريد الزئبق تاثير عالي على الانزيم بفاعلية متبقية 46.47% و40.84% بتركيز 5mM و10mM , على التوالي, اما كلوريد المنغنيز له تاثير قليل على الانزيم بفاعلية متبقية 79.81% و81.69% بتركيز 5mM و10mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقة. تعمل المواد الكلابية مثل EDTA والمواد المختزلة mercaptoethanol على تثبيط الفاعلية الانزيمية, حيث تؤثر المواد الكلابية ( EDTA ) على الانزيم بفاعلية متبقية 57.74% و52.58% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, اما المــــواد المختزلـــــــــة ( mercaptoethanol ) يكون تاثيرها بفاعلية متبقية 51.17% و40.37% بتركيز 2mM و5mM, على التوالي, في درجة 50°C لفترة 30 دقيقـــــــــة. | Ninety - seven isolates of Bacillus were obtained from 200 soil and water samples, collected between July to October / 2008, from different local sites of Iraq, by primary identification ( gram stain, endospore - forming and catalase production ) after incubation at 50°C for 24h on thermus agar. Biochemical test showed that fifty - six soil isolates were classified as B. laterosporus 35.71%, B.circulans 16.07%, B.stearothermophilus 14.28%, B.polymyxa 12.5%, B.macroides 7.14%, B.mycoides 7.14%, B.lentus 3.57%, B. popilliae 1.78% and B.chitinosporus 1.78%, whereas forty - one water isolates were classified as B.laterosporus 26.82%, B.circulans 26.82%, B.stearothermophilus 4.87%, B.polymyxa 4.87%, B.macroides 9.75%, B.mycoides 2.43%, B.lentus 7.31%, B. popilliae 4.87%, B.filicolonicus 4.87%, B.larvae 2.43%, B.brevis 2.43% and B. pumilus 2.43%. Thermotolerant enzymes were produced from soil and water Bacillus species as, protease ( 89.28% ) ( 73.17% ), amylase ( 55.35% ) ( 51.21% ), lipase ( 91.07% ) ( 95.12% ), cellulase ( 85.71% ) ( 60.97% ) and chitinase ( 85.71% ) ( 92.68% ) , respectively, after culturing on solid agar media with different incubation period, at 50°C. So, 41.23% of soil and water Bacillus isolates were detected for hydrolases production as ( protease, amylase, lipase, cellulase and chitinase ) together, and showed that B. polymyxa strains were the best bacteria in protease, amylase and cellulase production, whereas B. lentus strains was a good chitinase producer. Lipase was produced by several Bacillus strains as B. circulans, B. stearothermophilus, B. polymyxa, B. mycoides and B. lentus, after culturing on different media and incubation period, at 50°C. Thermotolerant amylase production conditions by B. polymyxa AS 4/5 were studied, the highest amylase production was observed when the bacteriaSummary IIwas cultured in medium containing 2% starch, 1% tryptone, 0.05% MgSO4, 0.05% NaCl and 0.02% CaCl2 with pH 7 and incubated at 50°C for 48h. Amylase was extracted from production medium and concentrated with sucrose, the specific activity of amylase was 2.36U/mg protein. Purification of amylase was performed by ion exchange chromatography Cellux - Carboxymethyl ( batch chromatography ), followed by second step of purification by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose column, the results showed that the specific activity was 6.76U/mg protein with 2.86 purification folds and 18.65% yield. Thermotolerant amylase displayed a wide temperature range of activity at 40 - 90°C with highest activity at 90°C and enzyme was stable at 40 - 60°C for 30min. The optimum pH for amylase activity was pH 5, the enzyme was stable at pH 4 - 10 for 30min at 50°C with maximum remaining activity 78.57% at pH 5. Treatment of thermotolerant amylase with metal ions showed that HgCl2 reduced amylase activity, the remaining activity was 46.47% and 40.84% at concentration 5mM and 10mM of HgCl2, respectively. Whereas MnCl2 had lower effect on amylase activity, the remaining activity was 79.81% and 81.69% at concentration 5mM and 10mM of MnCl2, respectively, after 30min at 50°C. Bacillus polymyxa amylase was treated with 2mM and 5mM of EDTA and mercaptoethanol, the two compounds had inhibitory effect on the enzyme, the remaining activity of EDTA treated enzyme was 57.74% and 52.58% at 2mM and 5mM, respectively, while the remaining activity of enzyme treated with 2mM and 5mM mercaptoethanol was 51.17% and 40.37%, respectively, after 30min at 50°C.

دراسات وراثية خلوية ومناعية لمرضى التهاب القولون التقرحي == Cytogenetical and Immunological Studies of Ulcerative Colitis

اسم المؤلف: زينب محمد طاهر جعفر الملا حسن
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحصول على عينات الدم المحيطي والخزع النسيجية الماخوذة من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن والمرضى المصابين بسرطان القولون، ومن الجنسين كليهما، ومن مختلف الاعمار. تم سحب حوالي 10 مل من دم المرضى وقسمت العينة على ثلاثة اقسام، القسم الاول استعمل لاجراء الدراسات الوراثية الخلوية. والقسم الثاني لاجراء دراسات البيولوجيا الجزيئية. والقسم الثالث لاجراء الدراسات المناعية. اجريت الدراسات الوراثية الخلوية من اجل التعرف على التغييرات التي قد تطرا على المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بقياس معامل الارومةBlastogenic index ، ومعامل الانقسام Mitotic index، ومعامل التضاعفReplicative index ، واختبار التبادل الكروماتيدي الشقيقي Sister chromatid exchange، واختبار تردد الطفرة Mutation Frequency. وقد تم ذلك من زرع خلايا الدم المحيطي في الوسط الزرعي الحاوي على المادة المعلمة (Brdu - 5) والمادة المشطرةA) PH). اوضحت النتائج وجود انخفاض في المقاييس الوراثية الخلوية المتمثلة بمعامل الارومة، ومعامل الانقسام، ومعامل التضاعف. بينما لوحظ ارتفاع في المعدلات التلقائية في التبادل الكروماتيدي الشقيقي لمرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء. كما ولوحظ هذا الارتفاع في معدلات التبادل الكروماتيدي الشقيقي عند المعاملة بالعقار الميثوتركسيت، اذ لوحظ وجود خلايا نامية في تراكيز واطئة من عقار الميثوتركسيت.اما عن ا لجانب البايولوجي الجزيئي فقد تم قياس تراكيز الحوامض النووية المتمثلة بما يلي : الحامض النووي الرايبوزي (RNA) والحامض النووي المزدوج الشريط ) (dsDNAوالحامض النووي الاحادي الشريط (ssDNA) وذلك بتنميتها في الوسط الزرعي في اوقات حضانة مختلفة (الزمن صفر، ثم بعد24 ساعة ، ثم بعد48 ساعة ، ثم بعد 72 ساعة من الحضانة ). اوضحت النتائج وجود اضطراب في نمو الخلايا الماخوذة من مرضى التهاب القولون التقرحي عند القياس بالاصحاء . كذلك تم قياس تراكيز الحوامض النووية المذكورة اعلاه في الخلايا المنماة في تراكيز عالية من عقار الميثوتركسيت والمتمثلة بتركيز 1 مايكروغم / مليلتر و2 مايكروغم / مليلتر لكل من المرضى والاصحاء بعد تنميتها لمدة حضانة 72 ساعة. اذ لوحظ عدم وجود فروقات معنوية لهذين التركيزين بين الاصحاء والمرضى. اما فيما يتعلق بنتائج التهجين في الموقع in situ hybridiza¬tion لغرض الكشف عن التعبير الجيني للجين الكابح للورم P53 والجين المثبط للموت المبرمج Bcl - 2 ، اذ تم اخذ الخزع النسيجية من المرضى المصابين بالتهاب القولون التقرحي المزمن وسرطان القولون وقياسها بالاصحاء. اوضحت النتائج وجود علاقة بين المورثين في مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون عند قياسهما بالاصحاء، اذ اعطى الجين الكابح للورم نسبة 66 % في الانسجة المصابة بالتهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون وهذا يوضح حصول طفرات تراكمية في الجين الكابح للورم P53 والذي يعطي مؤشر على التقدم نحو التسرطن ، وكذلك الحال مع الجين Bcl - 2 الذي اوضح زيادة بالتعبير الجيني لهذا الجين في النماذج النسيجية لمرضى التهاب القولون التقرحي قياسا بسرطان القولون والاصحاء. ان التحري عن جين P53 يعطي مؤشرا عن الطفرات التراكمية او الشذوذ في فعالياته ويمكن الاستفادة منه في اعتباره قيمة تشخيصية وانذارية. اما بالنسبة للجانب المناعي فقد استخدمت فحوص مناعية عدة متمثلة بقياس الكلوبيولينات المناعية (IgG , IgA , IgM)، والعامل المتمم (C3 & C4) وفحص الاضداد الذاتية لسايتوبلازم الخلايا العدلة (ANCA) Anti neutrophile cytoplasmic antibodies والذي يشمل c - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة من مجموع العينات، وفحص p - ANCA والذي اعطى حوالي 50% نتيجة موجبة، وفحص الاجسام المضادة الذاتية للمتقدرات (AMA) الذي اعطى حوالي 48% نتيجة موجبة وفحص الاضداد المناعية الذاتية للشريط المزدوج للحامض النووي منقوص الاوكسجين dsDNA)) الذي اعطى 43% نتيجة موجبة، وفحص اضداد شحم القلب (Anticardiolipin ) الذي اعطى 40% نتيجة موجبة من مجموع العينات.اوضحت نتائج الفحوصات المناعية ارتفاع نسب الكلوبيولينات المناعية والعامل المتمم في مصل مرضى التهاب القولون التقرحي وسرطان القولون قياسا بالاصحاء وعلى مستوى احتمالية (P ≤ 0.01). ان نتائج الفحوصات المناعية المستعملة في هذه الدراسة تفسر وجود اضداد ذاتية في مصل مجاميع المرضى المصابين تحت الدراسة. وهذا يوضح كون المرض يمكن ان يعزى في جانب منها الى اسباب مناعية ذاتية. | The investigation has been done on the peripheral blood and biopsy samples which drawn from patients suffered from ulcerative colitis & colon cancer , the samples were taken from female and male of different ages . The collected blood samples were about 10 ml &each sample was divided into 3 parts , the first part used for cytogenetic studies,the second part used for molecular studies & the last part used for immunological studies . The cytogenetic studies has been done in order to define the damaging effect of the disease and the effect of the drug (methotrexate ) on the peripheral blood lymphocytes . these damages were manifested through the significant reduction in the blastogenic index (BI ) , mitotic index ( MI ) , & replication index ( RI ) . This accompanied by significant increase in the sister chromatid exchange ( SCEs ) . In addition to investigate the mutation fraction in the cells cultured in selective medium containing different concentration of the drug . The results also showed presence of mutant cells that can grow in increasing concentrations of methotrexate . The molecular studies include measuring the concentrations of different types of nucleic acids ( dsDNA , ssDNA , RNA ) done by culturing the peripheral blood cells in different incubation times which include T 0 , T1 ( 24 hrs ) , T2 (48hrs ) , T3 (48 hrs ) & T4 (72 hrs ) . The results indicate disturbance in cell cycle comparing with healthy individuals . There was no significant differences in types of nucleic acids between patients & controls , when culturing the resistant cells of blood lymphocytes in high concentrations of the MTX drug ( 1 μg/ ml , 2 μg / ml ) . On the levels of in situ hybridization , the colonic biopsies which collected from patients of ulcerative colitis and colon cancer were examined for gene expression of P53 gene and Bcl - 2 gene . The results indicated accumulated mutations in P53 gene in the inflammed colonic biopsies , this result give an indication for progression of carcinogenesis .While on the level on Bcl - 2 , the results showed increasing in the activity of the gene , resulting in increase in gene expression of Bcl - 2 gene . The gene expression of Bcl - 2 in inflamed colonic tissues were approximately similar to gene expression in tissues of colon cancer . this indicate that the chronic inflammation of UC may ultimately infected with colon cancer . The detection of P53 gene and Bcl - 2 gene in chronic ulcerative colitis give early detection for diagnostic & therapeutic and monitering purposes . The immunological studies conducted to insight into immunological disturbance associated with clinical expression of ulcerative colitis of Iraqi patients and to provide a locally made easy diagnostic tests that can be used in routine work and to study the recent serological markers , that may help in the diagnosis of IBD . The immunological profiles of the patients of UC were studied using different parameters . To assess the importance of antineutrophile cytoplasmic antibodies ( ANCA ) were found in enzyme linked immunoassay ( ELISA ) , for anti - myeloperoxidase (anti - MPO ) antibodies as (P - ANCA) and anti - propteinase - 3 (anti - PR - 3 ) antibodies for ( C - ANCA ) . The C - ANCA test give 50 % positive results , while the P - ANCA test give 55% positive results . The anti - mitochondrial M - 2 antibody was estimated in sera of UC patients and gives 48% positive results . The other serological marker used was the double strand DNA antibody and give 43 % positive results . Also the anticardiolipin antibody was examined and the test give 40 % positive results and this result indicate presence IgM / IgG concentrations in the sera of patients . The levels of immunoglobulins that include ( IgG , IgM , IgA ) as well as some of complement components ( C3 , C4 ) were used in estimation in the sera of the studied groups . The results showed an increase in the levels of immunoglobulins and the complement concentrations at levels of P ≤ 0.01 . The results of immunological markers in this study explained presence of auto antibodies and emphasized by increasing levels of immunoglobulins in the sera of the patients

دور بعض المتغيرات المناعية والاصابات الفيروسية في احداث الاجهاضات العفوية المفردة والمتكررة == The role of some immunological changes and some viral infection in single and recurrent spontaneous abortion

اسم المؤلف: رنا سعدي عبود كاظم
اسم المشرف: غنيمة صادق محمد | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: لغرض تسليط الضوء على بعض المتغيرات المناعية والهرمونية وتشخيص بعض انواع الفيروسات المرافقة لحالات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر ، تمت دراسة (90) امراة تعرضن لحدوث اجهاضات عفوية مفردة ومتكررة غير مشخصة السبب ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (10) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المفردة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، (40) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الاولى من الحمل ، (20) منهن تعرضن للاجهاضات العفوية المتكررة خلال الاشهر الثانية من الحمل ، اجريت المقارنة مع (30) امراة ، (15) امراة ذات حمل طبيعي و(15) امراة غير حوامل وبالفئات العمرية نفسها ، وعدت مجموعة السيطرة.بينت الدراسة الحالية النتائج الاتية : 1 - ارتفاع مستويات الاضداد الذاتية لدى النساء ذوات الاجهاض العفوي المفرد والمتكرر اذ سجل لديهن : ا - ارتفاع مستويات اضداد شحم القلب Anticardiolipin antibodies (ACA) وبصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ). ب - لوحظ هنالك ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgM) β2 - GP1 - IgM عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل ومجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).ج - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات اضداد البروتينات السكرية نوع بيتا - 1 الصنف (IgG) β2 - GP1 - IgG عند الموازنة ما بين مجاميع النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة ومجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل). ء - ارتفاع مستويات اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء والنساء غير الحوامل ).هـ - ابدت (14) امراة من المجموع الكلي للنساء المجهضات (15.6)% تفاعلا موجبا للاضداد النووية (ANA) بالقياس مع نساء السيطرة اللاتي كن جميعهن سالبات لهذين الاختبارين.2 - ارتفاع مستويات كل من : (IL - 2 , IFN - γ , TNF - α) وبفوارق معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).3 - لوحظ هنالك انخفاض معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من : (IL - 10)، و(IL - 4) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).4 - لوحظ ارتفاع معنوي عالي (P<0.01) في مستويات كل من الغلوبيولينات المناعية (IgM,IgA,IgG) في مصول النساء ذوات الاجهاضات العفوية كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).5 - لوحظ هنالك ارتفاعا معنويا عاليا (P<0.01) في مستوى جزء المتمم الثالث والرابع (C4 , C3) لدى النساء المجهضات كافة عند مراحل الحمل المختلفة قياسا بمجاميع السيطرة ( النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).6 - بلغت نسبة انتشار اضداد داء المقوسات Anti - Toxoplasma Ab الصنف (IgM) في 18 حالة (20)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود (32) حالة %(35.6) من المجموع الكلي للنساء المجهضات يمتلكن اضداد نوعية لداء المقوسات صنف (IgG) . 7 - بلغت نسبة انتشار اضداد فيروس مضخم الخلايا (CMV) الصنف ((IgG في (12) حالة (13.3)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل ، في حين لوحظ وجود اضداد فيروس مضخم الخلايا صنف (IgM) في (25) حالة %(27.8) من المجموع الكلي للنساء المجهضات. 8 - وجود الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس الحميراء (Rubella virus) في (10) حالات (11.1)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل في حين لوحظ وجود اضداد فيروس الحميراء صنف (IgG) في 21 حالة %(23.3) من المجموع الكلي للنساء المجهضات.9 - بلغت نسبة انتشار الاضداد النوعية صنف (IgM) لفيروس القوباء البسيط (HSV 1 and 2) في 4 حالات (4.4)% من المجموع الكلي للنساء المجهضات عند مختلف مراحل الحمل .10 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي (P<0.05) في مستوى الهرمون المحفز للجسم الاصفر(LH hormone) لدى مجاميع النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).11 - ارتفاع مستوى هرمون البرولاكتين (Prolactin hormone) بصورة معنوية عالية (P<0.01) في مصول النساء المجهضات كافة عند مختلف مراحل الحمل قياسا بمجاميع السيطرة (النساء الحوامل الاصحاء وغير الحوامل).12 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين اضداد شحم القلب (ACA) وكل من الحركيات الخلوية (IL - 2 , IL - 4 , IL - 10, IFN - γ ,TNF - α) وكذلك ما بين اضداد الشريط المزدوج للدنا (Anti - dsDNA) ،والحركيات الخلوية قيد الدراسة.13 - وجود علاقة ترابطية ليست ذات دلالة معنوية (P>0.05) ما بين هرمون الـ (LH) والحركيات الخلوية قيد الدراسة ,وكذلك ما بين هرمون البرولاكتين وكل من (TNF - α وIFN - γ وIL - 2 و(IL - 10، في حين لوحظ وجود علاقة ترابطية ذات قيمة معنوية (P<0.05) ما بين هرمون البرولاكتين و(IL - 4) .14 - لوحظ وجود اصابات مشتركة ما بين اضداد شحم القلب (ACA) والاصابات الفيروسية، وكذلك وجود اصابات مشتركة ما بين الانواع المختلفة للعوامل الخمجية في هذه الدراسة.س | To shed light on some immunological ,hormonal changes and identification of some viruses that are accompanied to single and recurrent abortion . The study were done on (90) undiagnosed aborted women at different stage of pregnancy. (20) had single abortion during first trimester of pregnancy , (10) had single abortion during second trimester of pregnancy , (40) had recurrent abortion during first trimester of pregnancy , and (20) had recurrent abortion during second trimester of pregnancy . The comparisons were done with (30) women , (15) had normal pregnancy and (15) unpregnant women at the same ages and considered as control groups .The results of this study showed : 1. Increased autoantibodies levels in women that had spontaneous abortion which is : A. Highly significant increased (P<0.01) in anticardiolipin antibodies (ACA) levels in the serum of aborted women at different stages of pregnancy , compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).B. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgM) (β2 - GP 1 - IgM) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).C. Highly significant increased (P<0.01) in the level of β2 - glycoprotein 1 type (IgG) (β2 - GP 1 - IgG) when compared between all groups of aborted women at different stages of pregnancy and control groups (healthy pregnant and non pregnant women).D. Highly significant increased (P<0.01) in the level of anti - double stranded DNA (anti - dsDNA) in all groups of aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).E. (14) (15.6)% from total test of aborted women showed positive reaction to antinuclear antibodies (ANA) compared with control groups which were negative to this test. 2. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of (TNF - α , INF - δ , IL - 2) in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).3. Highly significant decreased (P<0.01) in the levels of (IL - 10, IL - 4) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).4. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of immunoglobulins (IgG,IgA,IgM) in serum of women that had spontaneous abortion at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).5. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of complement component (C3,C4) in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).6. Antitoxoplasma antibodies (IgM) were found in (18) (20)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while found in (32) (35.6)% from total aborted women have antitoxoplasma antibodies (IgG). 7. Anti CMV antibodies type (IgM) were found in (12) (13.3)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while anti CMV antibodies type (IgG) were found in (25) (27.8) % from total aborted women .8. AntiRubella antibodies type (IgM) were found in (10) (11.1)% from total aborted women at different stages of pregnancy ,while antiRubella antibodies type (IgG) were found in (21) (23.3)% from total aborted women .9. Anti (HSV 1,2) antibodies type (IgM) found in (4) (4.4)% from total aborted women at dofferent stages of pregnancy.10. Significant increased (P<0.05) in the levels of LH hormone was found in all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).11. Highly significant increased (P<0.01) in the levels of prolactin hormone in serum of all aborted women at different stages of pregnancy ,compared with control groups (healthy pregnant and non pregnant women).12. There was a correlation between (ACA) and each of cytokines (TNF - α , INF - δ , IL - 8 , IL - 10 , IL - 4) but this correlation was non significant (P>0.05) and also between anti - dsDNA and all cytokines tested.13. There was non significant correlation (P> 0.05) between LH hormone and all cytokines tested and also between prolactin hormone and each of (TNF - α , INF - δ , IL - 2 , IL - 10) , while there was significant correlation (P<0.05) between prolactin hormone and (IL - 4). 14. There was Co - infection between (ACA) and infectious agents and also between different types of infectious agents in this study.

دراسة مرضية وجزيئية لبكتريا Helicobacter pylori المعزولة من المرضى المصابين بالقرح المعدية والمعوية == Pathological and Molecular study on Helicobacter pylori isolated from patients with gastric and duodenal ulcers

اسم المؤلف: رباب قاسم محمد الصكر
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | اياد محمد علي فاضل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2007
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: جمعت80 خزعة نسيجية من المرضى المصابين بامراض القرح المعدية والمعوية، اظهرت نتائج الاختبارات النسيجية المرضية هيمنة التهاب المعدة المزمن بنسبة %35 واتت قرحة المعدة ثانية بنسبة %22.5.اظهرت الدراسة كفاءة اختبار اليوريزالسريع في التحري عن هذه الجرثومة اذ استطاع ان يثبت وجود هذه الجرثومة في 62 خزعة نسيجية واتت الاختبارات النسيجية المرضية ثانية حيث ظهرت جرثومة H.pylori في 47 خزعة نسيجية في حين تمكن الاستنبات البكتيري من الحصول على 42 عزلة بكتيرية.اثبت فحص الحساسية الدوائية تجاه عشر مضادات حيوية كفاءة المضادين الحيويين السيفوتاكسيم والريفامبسين في القضاء على هذه الجرثومة فقد كانت نسبة المقاومة لهما %10 واتى المضادان الحيويان التتراسايكلين والدوكسي سايكلين ثانية بنسبة مقاومة %20،%30 كانت نسبة المقاومة للارثرومايسين والكلارثرومايسين، فيما كانت نسبة المقاومة للاموكسيسلين %100 ونسبة المقاومة %80 لكل من المترونيدازول والسبروفلوكساسين اما الجنتامايسن فكانت نسبة المقاومة له %50.تم نمطت العزلات وراثيا باستعمال بوادىء متخصصة بالكشف عن قطعة الدنا التي تمثل المورث ure AB والمساوية الى 492زوج قاعدة لوحظ احتواء ثمان عزلات على هذا المورث فيما خلت العازلتان HP7 وHP9 من هذا المورث باستعمال تقنية الـ PCR.اظهرت نتائج النسق البلازميدي ان %50 من عزلات H.pylori تحوي بلازميدات، فقد احتوت العزلات (HP3, HP4, HP6, HP8) على بلازميدات صغيرة وامتلكت العزلتان (HP4,HP6) بلازميدا كبيرا فضلا عن بلازميدها الصغير فيما خلت العزلات الباقية من البلازميدات.اظهرت نتائج التحييد البلازميدي باستعمال صبغة بروميد الاثيديوم بوصفها مادة محيدة وبتركيز 3000 مايكوغرام/ مليليتر فقدان العزلة HP4 بلازميدها الكبير والصغير نتج عن ذلك فقدان تلك العزلة HP4صفة انتاج انزيم اليوريز وكذلك فقدانها المقاومة للمضادين الحيويين المترونيدازول Metronidazole والسروفلوكساسلين Ciprofloxacillin.اظهر التحول الوراثي Gentic transformation بين الدنا المستخلص من العزلة HP4 وبين العزلة HP1 التي عدت خلية كفوءة اكتساب الاخيرة صفة المقاومة للمترونيدازول اذ استطاعت ان تنمو على اوساط انتخابية تحوي 32 مايكوغرام/ مليلترمن هذا المضاد.اجريالتحول الوراثي ثانية بين دنا العزلة Hp4 وبكتريا تابعة لجنس اخر هي بكتريا Escherichia coli MM294 اظهرت نتائج هذه التجربة اكتساب بكتريا E.coli صفة انتاج انزيم اليوريزو المقاومة للمترونيدازول والسبروفلوكساسين من بكتريا H.pylori. | A 80 biopsies were collected from gastric & duodenal ulcers, showed dominance of chronic gastritis and gastric ulcers in aratio of %35 and %22.5, respectively.Rapid urease test, histopathological examination and cultural for detection of Helicobacter pylori, Showed the presence of this bacterium in 62 biopsies for urease test, in 47 biopsies for his topathological examination and in 42 biopsies in culture examination.Antibiotic susceptibility tests againt 10 isolates of H.pylori, Showed %10 resistance for cefotaxim & Rifampin, %20 resistance for Tetracyclin & Doxycyclin, %100 resistance for Amoxycillin, %80 resistance for Meteronidazole & ciprofloxacin and %50 resistance for Gentamicin.Genotyping by specific primer in PCR reaction for ureAB gene, Showed that 8 isolates were positive for this gene, where 2 isolates were negative.Plasmid profile for H.pylori isolatez Showed small single plasmid in each of HP3, HP4, HP6 and HP8 isolates and single small and larg plasmids for HP4 and HP6 isolates whereas other isolates were free of plasmids.Curing experiment for HP4 isolate by using ethidium bromide as acuring agent in aconcentration 3000 Mg/ ml, Showed the cured derivation lost their Urease production trait and resistance to meteronidazole & ciprofloxacin.Transformants resulted from transformation experiment between HP4 total DNA & HP1 as acompotent cell, Showed acquired ability to grow on selectve medium containing 32 Mg/ ml of metrronidazole.Another transformants, resulted from transformation experimeat between HP4 total DNA and Escherichia coli MM294 as acompetent cell, Showed acquired ability for Urease production & ciprofloxacin & Meteronidazole resistance.

تقييم بعض المؤشرات المناعية لمرض بهجت في عينة من المرضى العراقيين == Evaluation of some Immunological Parameters of Behcet's disease in a sample of Iraqi patients

اسم المؤلف: دنيا فريد سلوم
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | جاسم طعمة الخفاجي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: اجريت الدراسة على 70 مريض عراقي من العرب بواقع 39 مريضا من الاناث و31 مريضا من الذكور خضعوا للصفات التشخيصية العالمية لمرض بهجت وهم من المراجعين لمختبر التطابق النسيجي في المختبرات التعليمية في مدينة بغداد الطبية للفترة من نيسان 2009 - ايار 2010، كان41 مريضا ( 58.6 %) ، منهم مشمولا بالتهاب العين بينما 29 منهم لم يكن لديهم شمول للعين . شملت الدراسة على مجموعة السيطرة والمتكونة من 20 شخص ظاهريا اصحاء ومطابقين لمجموعة المرضى من ناحية العمر والجنس ، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 0.8 ومتوسط عمر المرضى (36.3 ± 1.4) سنة ومتوسط عمر حدوث المرض (32 ± 1.3) سنة وفترة المرض (4.7 ± 0.37) سنة وان معدل كتلة الجسم (24.8 ± 0.4 كغم/ملم2) وان اكثر الصفات السريرية تكرارا هي افات فموية وافات جلدية بتكرار 100 % وافات تناسلية 50 %، ، اما اختبار باثرجي فكان سالبا عند كل المرضى (لم يظهر انتفاخ جلدي التهابي ولم يحوي على قيح او يحوي على قيح بعد مرور 24 - 48 ساعة)، وكان متوسط عمر المرضى المشمولين باصابات العين (32 ± 1.6) سنة وفترة حدوثها (2.4 ± 0.32) سنة واحتلت النساء النسبة الاعلى 51.2 % مقارنة بالذكور 48.7 % .تم تقييم مستضدات HLA B51 وHLA B27لمجموعة المرضى والسيطرة ، اضداد الهربس نوع IgG ، اضداد الكلاميديا نوع IgG وIgM ، العامل البروتيني الانتكاسي ، معدل ترسيب كريات الدم الحمر ، انترليوكين 8 ، انترليوكين 10 ، بيتا - 2 - مايكروغلوبيولين ، اضداد المادة النووية ، اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة . اظهرت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية للاليل HLA B51 في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان HLA B51 (+) في 39 مريض (55.7 %) ، وان 59 % من المرضى الذين يحملون الاليل HLA B51 (+) هم من الذكور، فقد يرتبط وجود هذا الاليل مع زيادة احتمالية حدوث المرض ، وعلى النقيض فان الاليل HLA B27 ينخفض في المرضى مقارنة بالاصحاء اي ليس له دورا في المرض ولم يصل الى حد الفرق المعنوي . كما وجد ان 65.9 % من مرضى مجموعة HLA B51 (+) كان لديهم شمول العين و24.3 % من المرضى حاملين HLA B51 (+) وB27 (+) ، وان الاليل HLA B27 (+) في المرضى ربما يفيد كمرتبة تصنيفية لالتهاب العين في مرضى بهجت .وكانت نسبة الافات الفموية والجلدية في المرضى الذين يحملون HLA B51 55.7 % بينما كانت نسبة الافات التناسلية 45.9 % .اظهرت النتائج وجود اضداد IgG لفيروس HSV - 1 في مصل 24 مريض (34.2 %) كما اظهرت اضداد الكلاميديا الرئوية IgG عند 15 مريض (21.4 %) اما شمول العين لدى المرضى فظهرت متلازمة مع اضداد الجرثومتين بنسبة 41.5 % و29.2 % على التوالي هذا يشير ربما ان للفيروس او البكتيريا دورا في استحثاث المرض . بينت النتائج وجود زيادة احصائية معنوية في تركيز اللبتين وال بيتا 2 مايكروغلوبيولين في المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة الشيء الذي يؤشر الى دوره في الامراضية وعدم وجود فروق معنوية في تركيزهما في مجموعة المرضى المشمولين باصابات العين من الذين لم يكن لديهم شمول بتلك الاصابات من المرضى هذا يشير الى ان اللبتين يلعب دورا في امراضية المرض دورا طفيفا كعامل خطورة عند مجموعة المرضى الذين لديهم شمول العين . كما ان مستضدات التوافق النسيجي B51 لم يكن لها دور مع اللبتين والبيتا 2 مايكروغلوبيولينفي المرضى .ظهرت زيادة معنوية في تركيز IL - 8، IL - 10 في مصل المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة، وان تركيز هذه المؤشرات كان منخفض في مرضى من كان لديهم شمول العين من المرضى الاخرين الذين لم يكن لديهم شمول للعين، ولم يكن لمستضدات التوافق النسيجي B51 على هذه االموشرات. ان هناك علاقة موجبة بين تركيز العامل البروتيني الانتكاسي وتركيز IL - 8 كذلك بين الاخير وتركيز اللبتين. ظهرت زيادة معنوية في تركيز العامل البروتيني الانتكاسي ومعدل ترسيب كريات الدم الحمر في مرضى بهجت وان العامل البروتيني الانتكاسي لم يزداد عند مجموعة مرضى شمول العين بينما لوحظت زيادة معنوية في معدل ترسيب كريات الدم الحمر عند تلك المجموعة .اظهر اختبار التالق المناعي غير المباشر سلبية اضداد الانوية وايجابية اضداد سايتوبلازم الخلايا العدلة النمط P عند 8.5 % من المرضى . | A total of 70 Iraqi Arab patients (39 females, 31 males), who fulfilled the international study group criteria for diagnosis of Behcet's disease (BD) were enrolled in this study. Forty one patients (58.6 %) had ocular involvement, while non - ocular involvement was found in 29 patients (41.4 %). The patients attended the HLA Typing Laboratory in Teaching Laboratories of Baghdad Medical City from April 2009 - May 2010.A control group of twenty subjects were also included, and they were matched patients for gender and age.The ratio of male to female was 0.8. The mean age was 36.3 ± 1.4 years and the mean age at onset was 32 ± 1.3 years. The duration of disease was 4.7 ± 0.37 years with body mass index of 24.8 ± 0.4 Kg / m2, and the high percentage (60 %) of patients was at the age range 31 - 60 years.The overall frequency of clinical manifestation was 100 % for oral lesion, 100 % for skin lesion, 50 % for genital lesion, 58.6 % for ocular lesion and Pathergy test was negative in all patients. The mean age of ocular lesion patients was 32 ± 1.6 years with duration of 2.4 ± 0.32 years. Ocular lesion involvement in females was higher (51.2 %) than males (48.7 %).The patients and control were evaluated for HLA - B51, HLA - B27, Anti herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG, Anti Chlamydia pneumoniae IgG and IgM, Leptin, C - reactive protein (CRP), Erythrocyte Sedimentation Rate (ESR), Interleukin - 8 (IL - 8), Interleukin - 10 (IL - 10), β2 Microglobulin (β2M), Antinuclear antibody (ANA) and Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCa).There was a statistically significant increase in HLA B51 in patients as compared with controls (55.7 % vs 10 %), 59 % in of HLA B51 (+) was found in males. This marker might play crucial role in pathogenesis of BD. In contrast HLA B27 was decreased in the patients as compared two controls, it may have no role in the disease but the differences did not reach a significant level. High percentage (65.9 %) of HLA B51 positive was found in ocular BD. (24.3 %) of patients had HLA B27 positive and B 51 positive, double positive B27 and B51 patients may be the benign subgroup of BD uveitis.The percentage of patients with oral lesion and skin lesion positive for HLA B51 were 55.7 %, while it was 45.7 % in patients with genital involvement.Anti Herpes simplex virus - 1 (HSV - 1) IgG was found in 24 patients (34.2%), while anti Chlamydia pneumoniae IgG antibodies were found in 15 patients (21.4%) . Eye involvement was found in association with antimicrobes antibodies (41.5% and 29.2%, respectively). This suggests that these microbes may be the trigger factor of BD.Results indicated statistically significant increase in the concentration of leptin and β2M as compared with control group, but no significant differences in leptin concentration between ocular and non - ocular BD This suggest that leptin plays a role in pathogenesis of disease but it has a slight risk factor in ocular involvement.There was statistically significant increase in the concentration of IL - 8 and IL - 10 in sera of patients as compared with the controls, and these parameters were lower in ocular BD patients than non - ocular BD. This suggests that these parameters might play a role in immunopathogensis of BD. There was positive correlation between CRP and IL - 8 as well as, between IL - 8 and leptin concentrations.There was statistical increase in C - reactive protein concentration and ESR in BD patients as compared with the controls. The CRP showed a non - significant increase in ocular BD patients, while ESR was significantly increased.Indirect immunofluorescent technique indicated a negative anti nuclear antibody (ANA) in all cases, while the anti neutrophile cytoplasmic antibody (AN

تكامل جرعة منخفضة من مبيد الترفلان مع مخلفات زهرة الشمس في مكافحة الادغال وتحسين نمو محصول الماش لتقليل الاعتماد على المبيدات والحد من مخاطرها == Integration of Reduced Dose of Trifluralin Herbicide With Sunflower Residues For Weed Control In Mungbean Field

اسم المؤلف: اﺭﻭﻯ ﻋﺒﺪ ﺍﻟﻜﺮﻳﻢ ﺗﻮﻓﻴﻖ
اسم المشرف: اﺑﺮﺍﻫﻴﻢ ﺷﻌﺒﺎﻥ ﺍﻟﺴﻌﺪﺍﻭﻱ
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: النبات - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Two field experiments, several greenhouse and laboratory experiments were conducted during the course of study to evaluate the allelopathic potential of two sunflower (Helianthus annuus L.) cultivars on companion weeds and weeds grown in mungbean (Vigna radiata L. R. Wilczek) field alone and in combination with reduced rate herbicide, and to determine the chemical and genetical bases of allelopathic traits in the test cultivars. The aim of the first experiment was to test whether the variation in weed growth between the sunflower cultivars (Shumoose and Sin Altheeb), which was observed in the field, was due to differences in their allelopathic potential. Results showed the ability of both cultivars to reduce weed population and biomass with the superiority of Shumoose cultivar in suppression of weed density at 60 and 120 days after sowing compared to Sin Altheeb. Weed biomass was significantly reduced up to 90 and 71% by Shumoose and Sin Altheeb cultivars, respectively. Stair case experiment indicated that root exudates of Shumoose cultivar showed more suppression to weeds than Sin Altheeb giving additional evidence for the superiority of Shumoose cultivar in its allelopathic weed suppression. Chemical analysis by High performance liquid chromatography indicated the presence of 9 compounds in root exudates of Sin Altheeb and 8 compounds in Shumoose, and all are Phenolic in nature. However, total of the isolated phenolics was doubled in Shumoose than in Sin Altheeb. Most of the isolated chemicals are reported to have inhibiting ability for germination and growth of plants, including weeds. Second field experiment was undertaken to explore the response of weeds and mungbean crop to soil incorporated with sunflower residues in combination with lower rate of a pre - plant herbicide (trifluralin). Sunflower residues of the two cultivars Shumoose and Sin Altheeb at 3.2 and 6.4 t ha - 1 were used either alone or in combination with trifluralin at 1.2 L ha - 1 (50% of label rate). Weedy check (control), trifluralin at full label rate (2.4 L ha - 1), and weed free treatments were also included for comparison. Plots treated with 50% of label rate of herbicide and amended with sunflower residues of cultivar Sin Altheeb recorded least weed density and dry biomass and this suppression was much greater than the residue treatments alone and more than cultivar Shumoose. Application of herbicide at 50% rate in plots amended with Sin Altheeb residue resulted yield 64 % more than with the label rate of herbicide treatment. Chromatographic analysis of sunflower amended field soil revealed the presence of several potent allelopathic compounds in the residues of both cultivars with greater quantity (355.5 µg/ml) in Sin Altheeb than in Shumoose (250.9 µg/ml). Dynamics of release, decomposition and degradation of allelochemicals into the soil showed that different compounds exhibited differential behavior for these processes. Overall quantity of allelochemicals started to increase after 2 weeks of decomposition and peaked at 4 week of decomposition (180.1 ppm) then declined sharply in their quantities thereafter. Periods indicating higher quantities of total phenolics as shown by chromatographic analysis was coincided with the periods in which higher suppressive activity against weeds grown under field conditions. Bioassay of sunflower residues decomposed in soil at different times on Echinochloa colonum L, one of the weeds dominated the mungbean field, revealed that residues of both cultivars suppressed growth of E. colonum weed. The phytotoxicity started after 2 weeks and persisted for 8 weeks. However, Sin Altheeb residues showed greater inhibition than Shumoose cultivar at the last three decomposition periods. Shumoose residues recorded appreciable reduction to the growth of test weed compared to Sin Altheeb. The effect of residues of both cultivars on chlorophyll content and ions uptake in Amaranthus retroflexus L. weed revealed that residues of both species reduced chlorophyll content of leaves and the reduction increased with the increased residue rate. Sin Altheeb cultivar residues were more inhibitory than Shumoose at the lower residue rate. In the same weed, ions uptake was significantly averted by the residues of both cultivars. P and K was significantly increased over control, while Ca, Mg an Fe were found to be decreased over control due to application of sunflower residues in soil at 8 g per kg soil. N was the only test element that did not significantly influence by the residue treatments. No significant differences were found in the test ion uptake between the test sunflower cultivars. Results of using RAPD technique on the sunflower genomic DNA revealed that all the 19 primers used in this study scored different amplification monomorphic and polymorphic bands in the tested genotypes with 12 primers generated polymorphic bands. These bands present in one cultivar and absent in another. They could be responsible for allelopathic trait or secondary compounds associated with this phenomenon. Further work is recommended to analyze the sequence of this band to find out whether it is related to allelopathic trait or not.

دراسة تصنيفية لانواع مختارة من نباتات ذوات الفلقتين في محافظة كربلاء المقدسة, العراق == Taxanomical Study For Selected Dicot. Spp. In The Holy Karbala Province, Iraq

اسم المؤلف: زينة خليل ابراهيم البهادلي
اسم المشرف: علي حسين عيسى الموسوي | خليل ابراهيم الشمري
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناول البحث الحالي دراسة بيئية لعدة مواقع من محافظة كربلاء المقدسة بين شهري شباط وايار ولسنتي 2013 و2014 من حيث نوع الترب والمجتمعات الاحيائية لهذه المواقع جمعت خلالها انواع مختلفة من النباتات تابعة لعائلات مختلفة ضمن ذوات الفلقة الواحدة وذوات الفلقتين اذ | The present work includes ecological study for different locations of the holy Karbala province between February and May and for the years2013, 2014, investigating soil kinds and communities in these locations. Different plant species of Monocots and Dicots were collected from variable soil kinds, such as sandy saline soil, loamy saline soil and sandy gravely soil. The species of Haloxylon salicornicum, Zygophyllum coccenium were dominant in the communities of sandy saline soil, Nitraria retusa, Juncus sp. and Halocnemum strobilaceum were dominant in loamy saline soil.Comparative anatomical study has been done for (30) Dicots wild species grown in these environments of Karbala province, as follow : a.Family : Aizooaceae1) Aizoon hispanicum L. b.Family : Chenopodiaceae2) Chenopodium murale L.3) Halocnemum strobilaceum (Pall.)M.Bieb.4) Haloxylon salicornicum (Moq.)Bunge ex. Boiss.5) Salicornia herbacea L.c. Family : Compositae (Asteraceae)6) Carthamus oxycantha M.B. 7) Launaea capitata (Spreng.)Dany 8) Launaea mucronata (Forssk.)Muschl. 9) Rechardia tingitana (L.)Roth. d. Family : Convolvulaceae10) Convolvulus oxypyllus Boiss. e. Family : Cruciferae (Brassicaceae)11) Diplotaxis harra (Forssk.)Bioss. 12) Sterigosella africana (L.)Boch. 13) Sterigosella grandiflora (Bnge)Bochantsev 14) Savignya parviflora (Del.)Webb. 15) Neotorularia torulosa (Desf.) Hedge & J. Leonard 16) Zilla spinosa (Turra)Prantl. f. Family : Cucurbitaceae 17) Citrullus colocynthis (L.)Schrad. g. Family : Geraniaceae18) Erodium laciniatum (Cav.) Willd.h. Family : Malvaceae19) Malva parviflora L. i. Family : Neuradaceae 20) Neurada procumbens L. j. Family : Nitrariaceae21) Nitraria retusa (Forssk.)Aschers.22) Peganum harmala L. k. Family : Papillionaceae23) Trigonella stellata Forssk. m. Family : Polygoniaceae 24) Rumex versicarius L. n. Family : Resedaceae25) Oligomeris linifolia (Vahl)Macbr.q. Family : Solaneaceae 26) Lycium barbarum L.r. Family : Tamaricaceae 27) Tamarix florida Bge.28) Tamarix macrocarpa (Ehrenb.)Bge.u. Family : Zygophyllaceae29) Fagonia glutinosa Del. 30) Zygophyllum coccenium L. The present research focused on many anatomical characters and studies comparatively, such as epidermis types, stomatal complexes, leaf venation, cross sections of root, stem and vertical sections of leaf blades. Different cross sections were shows variability cuticle thickness and epidermis, vascular cylinder tissues, collenchyma and sclerenchyma in different species studies. Variations were noticed among these tissues in the variable species.Thickness of cuticle epidermis of leaves were variable, and unifacial and bifacial mesophylls were noticed for the first time in some species studies. Some cross sections were obtained for scale leaves in Tamarix florida, Tamarix macrocarpa, Halocnemum strobilaceum, Haloxylon salicornicum and Salicornia herbacea.The anatomical characters of these plant parts has not been studied before for these species, at least for Iraqi specimens. The following species Launaea capitata, Oligomeris linifolia and Zilla spinosa were glabrous in all vegetative and reproductive organs. In time that the other species, Haloxylon salicornicum , Salicornia herbacea, Launaea mucronata, Reichardia tingitana, Strigosella grandiflora , Peganum harmala, Lycium barbarum, Tamarix florida and Tamarix macrocarpa were glabrous just in the vegetative parts, but hairy (pubescent) in the reproductive organs. The indumentums was variable in thickness within variable plant organs and parts, even on the lower and upper leaf surfaces. Different kinds of crystals were found and verified in the stems and leaves of different species. Size and density of these crystals were variable in variable locations of stem and leaf tissues.. Geographical distribution was investigated for all the studied species using Iraqi satellite maps by GIS program. Neotorularia torulosa was the most distributed species, and Rumex versicarius was the least distributed one. Schedules, schemes, illustrations and micrographs were presented for the different species studied in this work. Lastly results were discussed depending on available references and reasons.

دراسة تصنيفية لانواع الجنس Echinops L. (Compositae) في العراق == Comparative And Systematical Study of The Genus Echinops L. (Compositae) In Iraq

اسم المؤلف: سكينة عباس عليوي
اسم المشرف: علي حسين عيسى الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: العربية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تناول البحث الحالي دراسة تصنيفية مقارنة لانواع الجنس Echinops L. في العراق حيث شملت الصفات المظهرية والتشريحية وحبوب اللقاح، وكذلك البيئة التوزيع الجغرافي فضلا عن المعاملة التصنيفية. شملت الدراسة المظهرية دراسة صفات الجذور والسيقان والاوراق والرؤوس الزهري | The present investigation dealt with comparative systematic study of the genus Echinops L. (Compositae) in Iraq.The work involved comparative morphological and anatomical characters, in addition to palynology, ecology, geographical distribution and taxonomic treatment for these species. Morphological characters of roots, leaves, involucre bracts, inflorescence, in addition to, indumentum variations were discussed and the study concluded that stems, leaves, involucres bracts, especially the inner most layer characters were useful aid in distributing species of the genus. Comparative anatomical characters were used, such as characters of leaves, epidermis stomatal complexes, variation patterns, cross sectionings of stems, leaves as well as L.S of growing points. The study revealed that the anatomical characters are important taxonomically. The present investigation observed that pollen grains of all species were tricolporate and echinate. The taxonomic important of grains characters were assessed of the species. Maps of geographical distribution were prepared for all species studied. The study shown that most species were distributed in the North area of Iraq and a few species of the genus were distributed in the East and South of Iraq. In conclusions, (11) species of the genus Echinops were recognized in Iraq. Taxonomic treatment was carried out for all Echinops species and key was designed for them

العلاقة بين انتاج الانزيم المحلل للكولاجين وتكوين الغشاء الحياتي بوساطة بكتريا Pseudomonas aeruginosae == The Relationship Between Collagenase Production And Biofilm Formation By Pseudomonas Aeuroginosa

اسم المؤلف: امال عزيز كريم السعدي
اسم المشرف: شذى سلمان الطحان
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: A total of 359 samples divided as 228 clinical and 131 non clinical specimens were collected during 2012 from four hospitals in Baghdad city including : Al - Kadhymia Teaching hospital, Baghdad Teaching hospital, The Burn Specialist Hospital and Al - Imam Ali hospital, for isolation of P.aeruginosa to study the correlation between collagenase production and biofilm formation. Eighty two Pseudomonas isolates were screened for biofilm formation, 28 isolates were classified as strong biofilm formers, 25 as moderate and 27 as weak biofilm former. The 28 isolates were identifid by VITEk - 2 Compact system which confirmed that the isolates were P.aeruginosa. Collagenase production assay was used to screen 28 isolates that were strong biofilm formers inorder to detect the ability of these isolates to produce collagenase, the substrate of collagenase (collagen) was purified localy from bovin tendon and the results showed that just 8 isolates could grow in mineral salt media with collagen after 4 days of incubation. The factors affecting biofilm formation and collagenase production were studied to determine the optimual conditions for their production, those factors included : 1 - Nitrogen sources represented higher influence on collagenase production specialy (yeast extract) in media containing collagen than other media without collagen as a substrate. The specific activity differed between the 8 isolates, biofilm formation also became more pronounced with (yeast extract), while NH4Cl and NaNO3 depressed biofilm formation at the same conditions. The statistical analysis between the two parameters (biofilm and collagenase) according to different nitrogen sources demonstrated highly significance at p?0.01 with yeast extract and casein. 2 - pH, results showed that the best pH for production was 7 for both collagenase and biofilm.The statistical analysis for determination the relationshipe between the two parameters showed highly significance at p ?0.01 for different pH. 3 - The maximum production of the two parameters was at 35?C temperature which gave highly significance at p?0.01 with defferent temperature. 4 - Long incubation periods revealed increasing in collagenase production and biofilm formation which represented highly significance detween them when incubation periods were prolonged at p?0.01. Results of this study showed that collagenase production increases when bacteria switch from a planktonic to biofilm phenotype. This indicates that biofilms and collagenase are more virulent and have a greater ability to cause tissue destruction. The REP - PCR analysis using BOX - primer, showed a clusters genetic relatedness among the isolates. The isolates were grouped according to the REP - PCR in 9 different genotypes, named cluster 1 to 3 which included C1, C2, C3 with relatedness : 8 (80%), 8 (86%), 3 (80%) respectively. A19 and A20 both of them were not included in any cluster, they have 78% similarity.The REP - PCR analysis showed that the genotypic relatedness is consistently high between the 8 producer isolates and non producer isolates (13), showed similarity reached 86

التفكك الحياتي لمبيدي الملاثيون والدورسبان باستخدام مزارع احاديه وخليطه من البكتيريا == Biodegradation of Malathion And Dursban By Mono And Mixed Bacterial Cultures

اسم المؤلف: فائزة كاظم عمران
اسم المشرف: عادل مشعان ربيع
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2015
الموضوع الدقيق: البيئة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: عزلت 45 عزلة بكتيرية محليه من مجموع 30 نموذج تربه ملوثة بالمبيدات والتي جمعت خلال فترات زمنيه مختلفة ومن مناطق مختلفه في بغداد. اختبرت قابلية العزلات البكتيريه على تفكيك مبيدي الملاثيون والدورسبان. اجريت غربلة اولية وثانوية باستخدام وسط الاملاح المعدنية ا | Forty five local bacterial isolates were isolated from thirty different soil sample contaminated with pesticide, These samples were collected from different Baghdad regions at different periods. The bacterial isolates were tested for their ability to biodegrade certain pesticides (Malathion and Dursban). Primary and secondary screenings were carried out using solid Mineral Salts Medium (MSM) and Liquid (MSM) with 100 ppm Malathion and Dursban at 37 0C, pH 7. Twenty seven isolates resistant to Malathion and Dursban were isolated. Out of 27 bacterial isolates from different locations in Baghdad. Results from primary screening showed that the 10 isolates had good growth, 5 isolates gave moderate growth, 12 showed weak growth and only 9 isolates failed to show any growth.According to current results, 10 bacterial isolates were tested for their ability to biodegradation of Malathion and Dursban in liquid medium, However, secondary screenings results by using minimal inhibition concentration(MIC) revealed that only four bacterial isolates had the highest ability to degrade Malathion and Dursban and subsequently were identified as Pseudomonas putida, Esherichia coli, Escherichia hermanii and Staphylococcus vitulinus by Vitek compact system respectively.The optimum conditions (incubation period, pH, temperature) for growth and biodegradation of Malathion and Dursban were examined. The obtained results indicated that the best incubation period was after 7 days, pH =6 and favorite temperature was 350C.Measurement physicochemical properties for soil pH, temperature (C°), electrical conductivity EC (µs/cm) for both Dursban and Malathion concentrations(ppm) collected from six different locations within Baghdad city. Biodegradation of Malathion and Dursban in soil inoculated with different bacterial mono - cultures and mixed - cultures were investigated. soil pH, temperature, electrical conductivity, cations and anions, on the population of native Malathion - Dursban tolerant bacteria in the cultivated soils of six sites. The result showed that soil physical properties like temperature and electrical conductivity affect significantly to native Malathion - Dursban tolerant bacterial density. Similarly, the soil chemical properties like pH, cations and anions had more effect on the abundance of Malathion - Dursban tolerant bacteria in the soil. However, the impact of soil organic carbon, organic nitrogen and available phosphorus was very significant. The results of the present study can be utilized for the development of effective bioremediation process for pesticide - contaminated soil. Under optimal conditions, Malathion and Dursban degradation was measured by using GC - MS analysis. The results revealed that Pseudomonas putida was the best isolate for degrading Dursban by monoculture isolate (47.18%) , while mixed culture(P.putida and S.vitulinus) was the best in degrading Malathion and Dursban that gave 90.84% and 81.055% respectively. Results also indicated that the number of byproducts produced by mono and mixed culture of Malathion and Dursban biodegradation. Whereas the results obtained from GC/Ms analysis revealed that not detected of toxic byproduct Malathion and Dursban degradation by Pseudomonas putida and Staphylococcus vitulins respectively.Moreover, under natural conditions.The study tested the ability of selected bacterial isolates (P. putida and S. vitulins) in biodegradation of Malathion and Dursban, the results showed slower biodegradation by selected bacterial isolates compared with laboratory conditions but study showed a intermediet product like phenol, diethyl phosphorothioate and oxon.The GC - MS results showed that the number of metabolic intermediates formed during the degradation of Malathion by bacterial mixed - culture were relatively higher in number than by bacterial mono - culture.The mass spectra of malathion containing samples treated with bacterial mono and mixed culture showed no any known toxic intermediates. The result indicated that the two main degradation products resulted from bacterial degradation, namely malathion monocarboxylic (MMA) and malathion dicarboxylic acid (MDA), the first one may convert into the latter over time. Some other degradation products may occur such as ethyl hydrogen fumarate (EHF) but in negligible amount.The result indicated that the main degradation products resulted from bacterial degradation of dursban is trichloropyridinol(TCP) and then de - chlorinated into 2 - pyridinol.The mass spectra results obtained in this study showed that the dursban was degraded to many metabolites.The results suggested that the bacterial isolates were not forming any toxic intermediates but no any intermediate was identified till R.T. 22 minutes. This indicated that dursban is probably completely metabolized by the isolates into smaller intermediatesThe isolate Pseudomonas putida isolated from soil contaminated with pesticides was identified genotypic tests. Molecular typing was performed by RAPD - PCR and comparison of the results to other Pseudomonas isolates. The result shows that genotyping differences between isolates and found the convergent percent biodegradation between this isolates of both selected pesticide, although from these differences, there was no more effect to biodegradation, which means that the biodegradation of Malathion and Dursban not related to genotype

تعدد الاشكال الوراثي للحركيات الخلوية وHLA - DQB1 في مرضى السل الرئوي == Genetic Polymorphisms of Cytokines And HLA - DQB1 In Pulmonary Tuberculosis Patients

اسم المؤلف: خلود كريم حسن
اسم المشرف: علي حسين ادحية
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present study aimed to understand the correlation between serum level of nine cytokines (IL - 1?, IL - 1RA, IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, IL - 12, IFN - ? and TNF - ?) and their genetic polymorphisms at 16 gene positions defined by sequence specific primer - polymerase chain reaction (SSP - PCR) in pulmonary tuberculosis (PTB) patients, and in addition HLA - DQB1 gene polymorphism was also defined by SSP - PCR to determine their role in susceptibility or resistance to M. tuberculosis. Finally, serum level of cortisol was also determined in the patients.Ninety four Iraqi Arabs PTB patients (70 males and 24 females) were enrolled in the study. They were referred to the Institute of Chest and Respiratory Diseases in Baghdad for diagnosis and treatment during the period May - October 2012. A control sample of 80 apparently healthy individuals was also included and matched patients for gender (60 males and 20 females) and ethnicity. The results are summarized in the following : 1. A significant increased serum level of IL - 1? (24.16 ± 8.82 vs. 3.20 ± 1.18 pg/ml), IL - 1RA (41.31 ± 6.64 vs. 16.85 ± 5.50 pg/ml), IL - 2 (17.63 ± 3.53 vs. 7.80 ± 1.10 pg/ml), IL - 4 (9.56 ± 2.60 vs. 3.81 ± 1.70 pg/ml), IL - 10 (34.49 ± 4.60 vs. 7.61 ± 1.70 pg/ml), IL - 12 (25.16 ± 5.85 vs. 7.70 ± 1.12 pg/ml) and TNF - ? (22.52 ± 4.41 vs. 4.97 ± 1.15 pg/ml) was recorded in PTB patients compared to controls. Also, Cortisol serum level was significantly increased in patients (215.47 ± 1.33 vs. 38.63 ± 1.74 ng/ml).2. Cytokine gene polymorphism analysis revealed that neither genotypes nor alleles of IL1A - 889, IL2 - 330, IL2+166, IL4 - 590, IL4 - 33, IL6+565, IL10 - 819, IL10 - 592, IL12B - 1188 and TNF - 238 genes showed a significant variation between PTB patients and controls. In contrast, the frequency of TT genotype of IL1RN gene at position mspal 11100 showed a significant (P = 0.004) increase in PTB patients compared to controls (65.9 vs. 43.7%). For IL4 - 1098, the frequency of TT genotype was also significantly (P = 0.048) increased inpatients (82.9 vs. 70.0%). At position - 174 of IL6 gene, a significant (P = 0.002) increased frequency of GG genotype was observed in patients (55.3 vs. 31.2%). For IL10 gene, only GG genotype at position IL10 - 1082 was observed with a significant (P = 0.045) increased frequency in patients (18.1 vs. 7.5%). At position - 308 of TNF gene, a significant (P = 6.9 x 10 - 5) decreased frequency of GG genotype was observed in patients (60.6 vs. 87.5%), while GA genotype was significantly (P = 1.3 x 10 - 4) increased (38.2 vs. 12.5%). Finally, the frequency of AA genotype of IFNG gene at position +874 demonstrated a significant (P = 0.006) increase in PTB patients (55.3%) compared to controls (33.7%).3. To determine the impact of cytokine genotypes on cytokines serum level, PTB patients and controls were distributed according to their serum level in the three genotypes of each cytokine. It was found that CC genotype of IL1RNmspal 11100 in patients was observed with the highest IL - 1RA level (52.16 ± 5.81 pg/ml) compared to TT (41.39 ± 3.23 pg/ml) or TC (38.10 ± 4.54 pg/ml) genotype. The TT genotype of IL2 at position - 330 also showed the highest level of IL - 2 (22.16 ± 4.31 pg/ml) compared to TG (17.59 ± 3.40 pg/ml) or GG (13.68 ± 3.53 pg/ml) genotype in patients. The IL4 - 1098 TT genotype showed the highest level of IL - 4 in patients (10.38 ± 2.21 pg/ml) compared to TG (6.09 ± 1.20 pg/ml) or GG (3.93 ± 0.80 pg/ml) genotype. For IL10 gene, the GG genotype of IL10 - 1082 recorded the highest level of IL - 10 (40.67 ± 2.96 pg/ml), which was significantly different from AA genotype (26.66 ± 5.65 pg/ml). At position - 308 of TNF gene, serum level of TNF - ? in GG genotype of patients demonstrated a significant increased mean compared to genotype GA (24.76 ± 1.30 vs. 19.15 ± 1.12 pg/ml). At position - 238, TNF GG genotype showed a significant increase level of TNF - ? (23.02 ± 2.91 pg/ml) in patients compared to AA genotype (17.18 ± 1.53 pg/ml) of patients. Finally, IFNG+874 AA genotype was observed with the highest IFN - ? level in patients (11.07 ± 1.12 pg/ml) compared to AT (7.97 ± 1.81 pg/ml)or TT (6.10 ± 2.20 pg/ml) genotype. In contrast, no such differences were observed in controls.4. Out of the five encountered HLA - DQB1 alleles, DQB1*03 showed a significant (P = 0.005) increased frequency in PTB patients compared to controls (71.3 vs. 50.0%). It was also observed that heterozygosity at such gene locus was significantly (P = 0.03) more frequent in patients than in controls (93.6 vs. 82.5%), while homozygosity was observed with a less percentage frequency in patients compared to controls (6.4 vs. 17.5%) and the difference was also significant (P = 0.03).Accordingly, it is possible to conclude that the cytokine profile was deviated in PTB patients, and such deviation was correlated with the genotypes of some cytokines, which might also together with HLA - DQB1polymorphism confer the individual an immunogenetic predisposition to develop M. tuberculosis infection.

التشخيس المبكر لداء السكري النوع الاول باستخدام مضاد حمض الكلوتاميك منزوع الكاربوكسيل ومضاد البيروكسيديز الدرقي == Early Detection of Type 1 Diabetes Mellitus Using Anti - Glutamic Acid Decarboxylase And Anti - Thyroid Peroxidase

اسم المؤلف: ريم محمد عبيد
اسم المشرف: منذر مصطفى فتحي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: الحيوان - الفسلجة
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: Markers have been described in type 1 diabetes mellitus (T1DM), There is a number of specific and non specific antigens have been identified. The major autoantigens involved in the destructive process of beta - cells leading to the development of type 1 diabetes are insulin hormone, glutamic acid decarboxylase (GAD), tyrosine phosphatase enzyme or Insulinoma - associated Antigen - 2(IA - 2).This study was conducted to find the relationship between antibodies for this antigens (insulin, GAD and IA - 2) and T1DM which could be used for the early detection of T1DM in normal Iraqi population. To study the importance of anti - thyroid peroxidase (anti - TPO) as a marker for autoimmune thyroid disease (ATD) in T1DM patients, and to find the relationship between T1DM and ATD.The study was carried out on 50 blood samples of men and 30 blood samples of women with age ranged from (20 - 60 years old), they were divided in to three groups : 1. Group 1 (20 men and 10 women) whom have fasting plasma glucose (FPG) above 180 mg/dL.2. Group 2 (20 men and 10 women) whom have FPG ranged from 120 - 180 mg/dL.3. Group 3 (10 men and 10 women) whom have FPG below 120 mg/dL.Blood samples were collected from all subjects, FPG and glycated haemoglobin (HbA1c) were measured. The levels of insulin, anti - insulin, anti - GAD, anti - IA - 2 and anti - TPO antibodies were measured in the serum.The statistical analysis results showed no significant difference in the presence of antibodies, HbA1c and FPG between men and women groups, inspite of some simple differences between the two groups.A significant (p<0.05) elevation in the level of FPG and HbA1c was observed in diabetic patients group compared withnon diabetic group. Significant (p<0.05) decrease in the level of insulin of T1DM patients was noticed compared to non diabetic group. Significant (p<0.05) elevation in the level of (anti - insulin, anti - TPO) in T1DM patients compared with non diabetic group. Elevation in the level of (anti - GAD, anti - IA - 2) in the T1DM patients compared with non diabetic group.The results also showed that no positive results for (anti - insulin, anti - TPO) present in the non diabetic group. One positive result for anti - GAD and one positive result for anti - IA - 2 present in the non diabetic group, which indicate the importance of anti - GAD and anti - IA - 2 antibodies ssay in normal population that could be used as early detection of T1DM.

دراسة تشريحية مقارنة لبعض الانواع البرية من ذوات الفلقتين النامية في محافظة بغداد == Comparative Anatomy of Some Wild Dicots Spp. Grown In Baghdad Province

اسم المؤلف: زبيدة عبد اللطيف اسماعيل
اسم المشرف: علي حسين الموسوي
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: The present investigation dealt with comparative anatomical characters of 29 selected wild species that belongs to different families growing in different parts of Baghdad Province. These species are : 1. Brassica deflexa Boiss.2. Brassica rapa L.3. Cardaria draba (L.) Desv.4. Sinapis arvensis L.5. Sisymbrium irio L.6. Strigosella africana (L.) Boch.7. Stellaria media (L.)Vill.8. Atriplex nitens Schkuhr.9. Chenopodium album L.10. Chrysanthemum coronarium L.11. Lactuca serriola L.12. Sonchus oleraceus L.13. Medicago polymorpha L.14. Melilotus indicus (L.) ALL.15. Vicia sativa L.16. Erodium cicutarium(L.) L'H17. Geranium rotundifolium L.18. Lamium amplexicaule L.19. Malva parviflora L.20. Plantago lanceolata L.21. Polygonum aviculare L.22. Rumex dentatus L.23. Ranunculus muricatus L.II24. Veronica polita Fries.25. Astrodaucus leptocarpus (Hoghst.) H. Riedl26. Urtica urens L.27. Verbena officinalis L.28. Lippia nodiflora (L.) Rich.29. Tribulus terrestris L.Some of these species have been anatomically investigated for the first time.Anatomical characters might be useful for plant biologist for the identification of important wild plants as an additional character at global level. Comparative anatomical characters were used; such as characteristics of ordinary epidermal cells of stems and leaves and stomatal complexes. The epidermis possesses number of important diagnostic character that offer valuable clues for identification, like size, shape, in addition to indumentum of both stems and leaves. Venation system was investigated and compared. Cross sections of root were useful taxonomically especially the thickness of epidermis, cortex, phloem and xylem. The study observed presence of sclerenchyma tissues in the root cortex of some species. Cross sectioning of stems and petioles were also studied. Epidermis, cortex, pericycle, vascular bundle shapes and numbers, pith characters, presence of crystals and tannin filled cells were useful aid in distinguishing species. Vertical sections of leaf blades, shape and number of vascular bundles, thickness of palisade and spongy layers and other mesophyll characters were important taxonomically.ccording to some of these characters, species were divided into groups. This study concluded the presence of variations in characters and these were presented for the first time comparatively, so that, the anatomical characters were a good support to the exomorphological characters in the studied species. Field photographs of the different studied plants and sections of organs were put in addition to numerous tables in this work. The above results were discussed scientifically regarding mainly the environmental factors.

فعالية مستخلصات بعض الطحالب الكبيرة للفطريات الممرضة للنبات == Activity of Some Macro - Algae Extracts Against Phytopathogenic Fungi

اسم المؤلف: دنيا يوسف محمد يوسف
اسم المشرف: عبد اللطيف محمد جواد
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2014
الموضوع الدقيق: النبات
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
المستخلص: تضمنت الدراسة الحالية عزل وتشخيص طحالب كبيرة من بيئتين مائيتين محليتين مختلفتين. تم عزل ثلاث طحالب كبيرة هي Cladophora glomerata (N) وEnteromorpha rafsii من منطقه بحر النجف في محافظة النجف, في حين عزل Cladophora glomerata (R) من احد مبازل منطقة الراشدية ش | The present study includes isolation and identification of Macro - algae from two different environmental water bodies. Three Macro - algae were isolated, Cladophora glomerata (N) and Enteromorpha ralfsii from Baher Al - Najaf region in Holy Najaf city. In addition, C. glomerata (R) was isolated from Al - Rashdiya, north of Baghdad.Phytopathogenic fungi from soil and some infected fruits were also isolated. They were identified as Pythium ultimum and Rhizoctonia solani.Water and ethanol were used to extract each algae to evaluate their antifungal activity against isolated phytopathogenic fungi. Different concentrations of these algal extracts had been prepared which are (10, 25 and 50) mg/ml and the antagonistic activity against the isolated phytopathogenic fungi were evaluated, the hot and cold water extracts did not show any antagonistic activity against fungi. However, all these extracts were ignored in the future work for this study. Furthermore, the hot ethanolic extract was more efficient than these of cold ethanolic extracts. Results have been shown that there were significant differences when macro - algal ethanolic extract were used.C. glomerata (R), which isolated from Al - Rashdiya, was more efficient against tested fungi than the same alga what isolated from Baher Al - Najaf region. However, E. ralfsii extract was more efficient against tested fungi than C. glomerata (N). Percentage of inhibition against P. ultimum when hot ethanolic extract of E. ralfsii, C. glomerata(R) and C. glomerata(N) were (88.8, 83.3 and 63.3) respectively.However, results for cold ethanolic extract of the same algae were (63.3, 52.2 and 32.2) respectively when 50 mg/ml of algal extracts were used.Percentage of inhibition against R. solani when hot ethanolic extract of E. ralfsii, C.glomerata (R) and C.glomerata(N) were (94.4, 100 and 78.8) respectively.However, results for cold ethanolic extract of the same algae were (66.6, 64.4 and 48.8) respectively when 50 mg/ml was used. According to the difference in biological activities against those phytopathogenic fungi caused by the same species of macro - algae or different genera from different environments. Due to difference in biological activity of the same macro - algae species Physiochemical parameter for each environments obtained such as air and water temperature, Turbidity (NTU), Electrical Conductivity(EC)and Salinity%, Water pH, CA+2 concentration, Mg+2 concentration, Total Hardness and Total Alkalinity. Results indicated that soaked Cucumis sativus and Capsicum annum seeds in cold and hot ethanolic macro - algae extracts of (E. ralfsii, C. glomerata (R) and C.glomerata (N) for 24 hours were able to protect seed germination that have been grown in a Petri dish contaminated with P. ultimum and R. solani comparing with control. In addition, results indicated that spraying C. sativus and C. annum seedling with these algal extracts within two weeks old again protects these seedlings from the same phytopathogenic fungi either before or after 24 hr. However, results indicated that adding the algal extracts within two months age to the C. sativus and C. annum plants again protects these plants from the same phytopathogenic fungi comparing with control and fungicide treatment. Moreover, results indicated that the active chemical compounds in E. ralfsii was Tannins, Saponins and Flavonoids. While C. glomerata was contained Tannins, Saponins, Alkaloid and Phenols. Results indicated that both hot crud methanolic extract of C. glomerata (R) and E. ralfsii have a lot of active chemical compounds against micro - organisms by using the GC - Mass Spectrometry technology.

دراسة في الوبائية والتحري بتقنية لداء (PCR) سلسلة تفاعل البلمره الابواغ الخبيئة في شمال بغداد == Study In Epidemiology And PCR Detection Of Cryptosporidiosis In North Of Baghdad

اسم المؤلف: حارث سعيد جعفر الورد
اسم المشرف: احسان مهدي الصقر | سهيلة حياوي محمود
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2010
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

التلوث الاشعاعي في مرضى السرطانات وامراض اخرى باستخدام معلمات مناعية وسريرية == Radiation Pollution In Cancer And Other Diseases Using Some Immunological And Clinical Parameters

اسم المؤلف: وئام سعد الحمداني
اسم المشرف: ضحى سعد صالح | مثنى عبد الجبار شنشل
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2011
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:

انتشاربكتريا Aeromonas spp. في المياه الخام ومياه الشرب والتحري عن قابليتها لتكوين الاغشية الحيوية == Prevalence Of Aeromonas spp. In Raw And Drinking Water ,And Detection Of Their Ability To Form Biofilm

اسم المؤلف: سناء رحمن عليوي
اسم المشرف: رشيد محجوب مصلح
الموضوع العام: علوم الحياة
السنة: 2013
الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية
الدرجة: دكتوراه
الجامعة: جامعة بغداد
اللغة: الانكليزية
مكان الجامعة: بغداد
الصفحات الاولى:
1 2 3 4 ... 7