Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي

Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان

Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي

Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي

Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي

General topic: Biology

Specific topic: Life Science

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل

Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

تاثير التلوث بالمواد العالقة بالهواء واثره على البيئة == THE IMPACT OF POLLUTION ON THE SUSPENDED AIR PARTICLES AND THEIR EFFECT ON ENVIROMENT

Author name: يسرى بدري نوري الحسيني

Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تناولت هذه الدراسة عدة مواقع من مدينة بغداد في جانبي الكرخ والرصافة، اذ كان الاختيار على اساس الكثافتين المرورية والسكانية، والتي يتمخض عنهما مخلفات حرق الوقود المضاف اليه رابع اثيلات الرصاص وحرق القمامة الناتجة من الفعاليات البشرية المختلفة، مصدرا للتلوث. لذا اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على العناصر الملوثة (الكادميوم، النيكل، الرصاص، الحديد) كملوثات للمنظومة البيئية (تربة - نبات). من خلال تقدير هذه العناصر كما ونوعا في نباتات وترب الدراسة، مع الاخذ بالحسبان التغيرات الفصلية. جرى اعتماد النباتات المعمرة الدفلة Nerium oleander والزيتون Olea europea والنخيل Phoenix dactylifera والترب المزروعة فيها مادة لهذه الدراسة، اذ قيست تراكيز هذه العناصر في الاوراق النباتية المغسولة وغير المغسولة لفصلي الشتاء والصيف وما بعد المطر ومعرفة اي من هذه الحالات الاكثر امتصاصا، كما قيست الكميات المتجمعة من العوالق على اسطح تلك الاوراق بالمقارنة مع مساحة سطح الورقة ومعرفة اي الانواع الاكثر تجميع هذا من جانب، ومن جانب اخر قيست هذه العناصر المرتبطة بمكونات التربة ذات المساحة السطحية العالية (الطين، المادة العضوية، اكاسيد الحديد، كاربونات الكالسيوم ) بطريقة الاستخلاص المتعاقب ومقارنة قيمها بقيم التواجد البيدوكيميائي الطبيعي له في التربة. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ما ياتي : 1 - ان اوراق نباتات النخيل كانت الاكثر تجميعامن حيث كمية الدقائق العالقة على سطح الورقة، تلى ذلك اوراق نبات الدفلة والزيتون. 2 - كان تركيز عناصر الدراسة في اوراق النباتات المغسولة اقل مما في غير المغسولة اذ سجلت تراكيز العناصر في اوراق النباتات المغسولة الترتيب الاتي بعد المطر > فصل الشتاء > فصل الصيف، ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر سلوكا مختلفا عن بقية العناصر وكما في التسلسل الاتي فصل الصيف > بعد المطر > فصل الشتاء.3 - شكلت تراكيز عناصر الدراسة في اوراق الزيتون غير المغسولة اعلى قيما من بين عناصر الدراسة فيما سجلت اوراق نبات الدفلة القيم الاعلى من تراكيز هذه العناصر في الاوراق المغسولة. 4 - دلت تحريات التربة وتحاليلها على الالفة العالية لجميع عنلصر الدراسة مع مفصول الطين ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر ميلا شديدا للارتباط مع الاكاسيد الحرة ( الحديد والالمنيوم ). 5 - بينت المقارنة البيدوكيميائية لقيم عناصر الدراسة مع القيم الاصلية لها ان عنصري الكادميوم والنيكل لم يتجاوزا الحد المسموح بالتلوث فيما تجاوز ذلك كل من عنصري الرصاص والحديد. | This study deals with many sites in Baghdad, both Karh and Russafa. The choice of theses sites are according to the traffic and residential density, which result wastes from burning the fuel that contains lead Tetra ethelate and the burning of garbage that result from human activities and other pollution resources. This study is made to shed light on the polluted elements (Cadmium, Nickel, Lead and Iron) as causers of pollution to environment (soil - plant), through estimating these elements quantitively and qualitatively in the soils and plants of the study, with taking into consideration the seasonal changes.The long - lived plants are regarded in the study like Nerium Oleander, Olea europea and phoenix dactylifera and the soil of plantation.The concentrations of these elements in washed and non washed plants leaves in winter and summer seasons and after rain falling are measured to know which one is the most absorptional. The quantities of suspended particles on leaves surface are measured to be compared with the leave's area and to know which one is the most precipitated.On the other hand, these elements that are bounded with soil components of specific high surface area (clay, organic matter, Iron oxide) calcium carbonate) are estimated by sequence extraction, and comparing their values with the Bedochemical values in the soil.The study reaches the following results : 1. The leaves of palm - date is the most accumulated of the suspended particles amount on leave surface, then Nerium and olive respectively.2. The concentration of the study elements is on higher level in the washed leaves rather than the non - washed leaves. It is reported that the elements in the washed leaves are as the following sequence post - rain> winter> summer, except for Fe which has different behavior as in this sequence summer> post - rain> winter. 3. Nerium shows the higher concentrations of the elements in the washed leaves, while olive shows the higher concentrations of these elements in non - washed leaves.4. The soil investigation of the study indicates that all elements of the study have high binding with the clay except for Fe which has great tendency to be bounded with free oxides (Iron and Aluminum).5. The Petrochemical comparison of the values of cadmium and nickel do not exceed the boundary of pollution while iron and lead do

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق == Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

Author name: زينة نبيل نصيف العزاوي

Supervisor name: صباح فرج عبد الاحد

General topic: Biology

Specific topic: Zoology - Invertebrates

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

Author name: هند يوسف خلف

Supervisor name: طالب عبد الله حسين

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي

Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض المعالم المناعية لمرضى التصلب المتعدد العراقيين == Study of Some Immunological Parameters in Iraqi Patients with Multiple Scler

Author name: هند قصي اسماعیل الفرضي

Supervisor name: حازمة موسى خلیل العباسي

General topic: Biology

Specific topic: Zoology - Immunology

Degree: Master

University: University of Baghdad

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory condition that affects central nervous system (CNS) causing neurological dysfunction. The current study aim was the evaluation of the role of Methylprednisolone (MP), Interferon Beta (IFN - β) as disease treatments, and to investigate their influence on CD25+ FoxP3 T regulatory cells (it was counted by flow cytometry technique), IL - 8, IL - 17 (pro - inflammatory cytokines), IL - 12 (inflammatory cytokine (T cells differentiation Factor)), IL - 10, TGF - β (anti - Inflammatory cytokines) it estimated by ELISA technique, also the total and differential WBC count, ESR, CRP (inflammatory indicators), patient characteristics, clinical manifestation and life style characteristics. Forty - five Iraqi MS patients (15 untreated as early onset patients, 15 MP treated patients and 15 IFN - β treated patients), in addition to 15 apparently healthy individuals as control. For patients treated with MP, samples collected after treatment period, while patients treated with IFN - β samples were collected in remission status.The study revealed the following results : 1. Patient general characteristics showed that according to gender distribution female : male ratio was 2 : 1 (66.67% : 33.33%), according to the age of onset, (< 30 years) group of patients were the highest frequency in study sample (37.9%), 57 years was the maximum age of onset and 13 years was the minimum, with mean (34.93), Baghdad was the highest governorate in MS onset (73.33%). 2. Total WBC count showed that patients treated with MP (10.38*103μl) increases significantly (P≤0.002), (P≤0.001) as compared with both patients treated with IFN - β (7.45*103μl) and control (7.33*103μl) respectively. Lymphocytes were decrease significantly (P≤0.013), (P≤0.030) patients treated with MP and INF - β respectively (1.82), (1.92) as compared to control (2.58) and there were a significant decrease (P≤0.03) in patients treated with MP (1.82*103μl) as compared to untreated patients (2.47*103μl).Neutrophils was increase significantly (P≤0.016) and (P≤0.000) in patients treated with MP and untreated patients respectively (7.81), (5.99) as compared to control (3.82), there were also a significant increase in patients treated with MP (P≤0.04), (P≤0.001) ascompared with untreated patients (5.99*103μl) and patients treated with IFN - β (4.73*103μl) respectively. Basophils decrease significantly (P≤0.001), (P≤0.014) in both patients treated with MP and INF - β respectively (0.05), (0.06) as compared to control (0.08).3. CD25+ FoxP3+ Tregs counting showed a significant increase (P≤0.002) in untreated patients (28.01%) as compared to control 14.06%), while there were a significant decrease (P≤0.016), (P≤0.007) in both patients treated with MP and IFN - β respectively(3.70%), (2.44%) as compared to control, also there were a significant increase (P≤0.000), (P≤0.000) in untreated patients (28.01%) as compared with patients treated with MP (3.70%) and patients treated with IFN - β (2.44%) respectively.4. Serum cytokines estimation showed that IL - 8 decreased significantly (P≤0.026) in untreated patients (0.003pg/ml) as compared to control (0.016), while IL - 10, IL - 12, IL - 17 showed no significances and TGF - β increased significantly (P≤0.028) inpatients treated with MP (700.27) as compared to control (392.13), while there were a significant increasing (P≤0.001), (P≤0.001) in patients treated with MP (700.27pg/ml) as compared with untreated patients (235pg/ml) and patients treated with IFN - β (484.67pg/ml) respectively. Saliva cytokines estimation showed that IL - 8 was increased significantly (P≤0.023) in patients treated with IFN - β (0.578) as compared to control (0.223), IL - 10 increased significantly (P≤0.017) in patients treated with MP (0.023) as compared to control(0.00), IL - 12 decreased significantly (P≤0.003) in patients treated with IFN - β (4.93) as compared to control (24.07), IL - 17 increased significantly (P≤0.018) in patients treated with MP (19.17) as compared to control (0.00).

تاثير الكلنبيوتيرول على بعض المعايير الفسلجية في ذكور الارانب Oryctolagus cuniculus == Effect of the Clenbuterol on some physiological parameters in male rabbits Oryctolagus cuniculus

Author name: هند ضياء هادي

Supervisor name: الية حسين علي

General topic: Biology

Specific topic: Zoology

Degree: Master

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: صممت الدراسة الحالية للتعرف على التاثيرات الفسلجية لعقار الكلنبيوتيرول في وظائف الكبد, والكلى, وتركيز الدهون, والكلوكوز ومستوى بعض هرمونات (TSH,T4,T3,T,Prolactin,LH,FSH). استخدم في هذه الدراسة 32 ذكرا بالغا من الارانب قسمت عشوائيا الى اربع مجاميع, والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوما , المجموعة الاولى جرعت فمويا بـ الماء المقطر, المجموعة الثانية جرعت فمويا بـ 2مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الثالثة جرعت فمويا بـ 4 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الرابعة جرعت فمويا بـ 6 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول. جمعت عينات الدم في مرحلتين الاولى بعد 14يوما والثانية بعد 30 يوما من بدء التجريع لغرض الدراسة الفسلجية. ادت المعاملة بعقار الكلنبيوتيرول الى انخفاض معنوي (P<0.05) في معدل وزن الجسم لكل المجاميع المجرعة بالعقار مقارنة بمجموعة السيطرة بعد 30 يوما من التجريع . واوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاع غير معنوي 0.05)<(P في كل من انزيمي الاسبارتيت الناقل للامين AST وانزيم الالنين الناقل للامينALT في المجموعتين الثانية والثالثة المجرعة بالعقار لمدة 14 , 30 يوما , بينما لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة ولمدة 14 ,30 يوما من التجريع, ولم يلاحظ وجود اي فرق معنوي 0.05)< (Pفي تركيز انزيم الفوسفاتيز القاعدي ALP لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 ,30 يوما بعد المعاملة. كما بينت الدراسة وجود انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى حامض اليوريك في كل المجاميع المجرعة لمدة 14 يوما, كذلك انخفض مستوى الحامض بصورة غير معنوية 0.05)< (Pفي المجموعة الثانية بينما انخفض بصورة معنوية(P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة بعد 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة, اوضحت النتائج ارتفاع غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى الكرياتنين لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة اذ كان هناك ارتفاع معنوي(P<0.05) لمدة 30 يوما بعد التجريع, احدث العقار انخفاض غير معنوي0.05)< (P في مستوى اليوريا لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما, بينما انخفض مستوى اليوريا بصورة معنوية (P<0.05) في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة, فضلا عن دور العقار في الانخفاض المعنوي (P<0.05) في مستوى الكولسترول لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية اذ كان هناك انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pبعد مرور 14 يوما بعد التجريع, كما اظهرت النتائج انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الكليسريدات الثلاثية في المجموعة الثانية لمدة 14 , 30 يوما بينما انخفض مستوى الكليسريدات الثلاثية معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة. احدث العقار ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (Pفي مستوى الـ HDLفي المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) بعد مرور 30 يوما من التجريع, كما بينت النتائج انخفاضا معنويا (P<0.05) في مستوى الـ LDL في المجموعة الثانية المجرعة لمدة 14 يوما بينما انخفض مستوى الـ LDL بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, وكذلك انخفض مستوى الـ LDL معنويا(P<0.05) في المجموعتين الثانية والثالثة لمدة 30 يوما من التجريع بينما انخفض بصوره غير معنوية 0.05)< (P في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, كما لوحظ انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الـ VLDL لكل المجاميع خلال 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك انخفاض معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع, اظهرت المجاميع المجرعة ارتفاع غيرمعنوي 0.05)< (P في مستوى الكلوكوز لمدة 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30يوما من التجريع. كما اوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاعا غير معنويا في مستوى الهرمونات LH, FSH وT لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع , اضافة الى انخفاض مستوى هرمون الحليبProlactin بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما من التجريع , كما اظهرت النتائج ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (P في مستوى هرمون T3في المجموعة الثانية المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما بينما ارتفع معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة, كما نلاحظ ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P في مستوى هرمون T3 في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما, وبينت النتائج ايضا ارتفاع مستوى هرمون T4معنويا (P<0.05) في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P لمدة 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة , كمالوحظ وجود ارتفاع معنوي ((P<0.05 في مستوى هرمون الـ TSH للمجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14,30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة. | This study was designed to investigate the physiological effects of Clenbuterol drug on liver, kidney function, lipidprofile ,concentration of glucose and level of some hormones (FSH,LH,T,PRL,T3,T4,TSH). Thirty two adult male rabbits were used in this study, the animals were randomly divided into four groups and treated daily for 30 days, the G1 intubated orally distilled water (control), G2 intubated orally 2 µg/kg/bw of clenbuterol drug, G3 intubated orally 4µg/kg/bw of clenbuterol drug, G4 intubated orally 6µg/kg/bw of clenbuterol drug. Blood samples were collected in two stages the first stage after 14 days, second stage after 30 days of treatment for physiological study. The treatment with Clenbuterol drug lead to a significant(P<0.05) decrease in the mean of the body weight in all the exposed groups with drug as compared with control group for 30 days. The statistical results of this study showed non significant(P>0.05) increase in both AST and ALT enzyme in the second and third groups exposed with drug for 14, 30 days, while we note significant(P<0.05) increase in the fourth group as compared with control group for 14,30 days after treatment .As for the concentration of the ALP enzyme didn,t demonstrated a significant (P>0.05) difference during 14,30 days after treatment . The results showed that there are non significant(P>0.05) decrease in the uric acid level in all the exposed groups for 14 days ,as uric acid level non significant (P>0.05)decrease in the second group, while significant(P<0.05) decrease in the third and fourth groups for 30 days after treatment compared with control group. Results explained non significant(P>0.05) increase in the creatinine level in all the treated groups with drug for 14, 30 days except fourth group there was a significant (P<0.05) increase for 30 days after treatment, drug caused non significant (P>0.05) decrease in the urea level in all the treated groups for 14 days, while urea level a significant(P<0.05) decrease in all the exposed groups with drug for 30 days as compared with control group. In addition the role of drug in significant(P<0.05) decline in the cholesterol level in all the treated animals for 14, 30 days except the second group there was non significant(P>0.05) decrease for 14 days after treatment . Results also explained non significant(P>0.05) decrease in the T.G level in second group for 14, 30 days, while T.G level a significant (P<0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group.Drug caused non significant (P>0.05) increase in the HDL level in all the exposed groups for 14, 30 days except the second group there was significant(P<0.05) increase for 30 days after treatment, the results showed a significant(P<0.05) decrease in the LDL level in the second group for 14 days, while LDL level non significant(P>0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group, as LDL level a significant decrease(P<0.05) in second and third groups for 30 days after treatment while non significant(P>0.05) decrease in fourth group as compared with control group. We also note non significant(P>0.05) decrease in VLDL level in all the exposed groups with clenbuterol for 14,30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) decrease for 30 days after treatment .Treated animals showed non significant(P>0.05) increase in the glucose level for 14, 30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) inecrease for 30 days after treatment . The statistical results of this study showed non significant (P>0.05) increase in the LH, FSH and T hormones level in all the treated animals for 14, 30 days except the fourth group there was significant (P<0.05)increase for 30 days after treatment, as well as non significant (P>0.05) decrease in the prolactin hormone level in the treated animals for 14, 30 days of treatment. Results also explained non significant (P>0.05) increase in the T3 hormone level in the second group for 14 days after treatment, while significant (P<0.05) increase in the third and fourth groups, we also note non significant(P>0.05) increase in the T3 hormone level in all the exposed groups with drug for 30 days after treatment. The results showed a significant (P<0.05) increase in the T4 hormone level in all the exposed groups for 14, 30 days except second group there was non significant(P>0.05) increase for 30 days after treatment compared with control group , we also note a significant (P<0.05) increase in the TSH hormone level in all the treated animals exposed with drug for 14, 30 days as compared with control group

التحري عن بعض المعايير المناعية وتعدد الطرز الوراثية لجين IL - 13 في مرضى الربو في محافظة ذي قار == Investigation of some Immunological parameters and polymorphism of IL - 13 gene in patients of asthma in Thi - Qar province

Author name: هند حسين صالح الطائي

Supervisor name: علي نعيم سلمان

General topic: Biology

Specific topic: Zoology - Immunology

Degree: Master

University: University of Thi-Qar - College Of Education For Pure Sciences

Language: English

University location: Dhi Qar

First pages:

Abstract: Asthma is a chronic inflammatory disease of the airways in which many cells and cellular elements play a role. Causes recurrent episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness, and coughing. These episodes cause airflow obstruction, often reversible either spontaneously or with treatment. The current study was conducted at the Labs of college of Education for pure science and Al - Hussein Teaching Hospital in Thi - Qar province, during the period from October 2014 to May 2015. The study aimed to investigate role of polymorphism of IL - 13 gene in patients with asthma and to evaluate their immune status by measuring the levels of some immunological parameter immunoglobulins ( IgE) by enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) and (IgG, IgM ) by single redial immune diffusion (SRID) and measure the levels of interleukins (IL - 6, IL - 17) in the serum using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), the study included test phagocytic cells on phagocytosis (coefficient of phagocytosis) and the total and differential count of white blood cells .A total of 100 patients with bronchial asthma (68 females) and (32 males) whose age lies between 17 - 62 years have enrolled in this study. DNA was extracted and RFLP - PCR was performed by using primers specific for the gene IL - 13, the results showed the presence of mutations in a48 sample out of 100 patients with asthma at site 1112C/T after using restriction enzyme BstUI. the statistical analysis showed correlation between the occurrence of the disease and the emergence of mutation (C / T) in the promoter region of IL - 13 gene when compared with the healthy control in population of Thi - Qar province .When it was compared the patient group with healthy control group there was a high significant increase (P ≤ 0.001) in serum IgE, IgG of patients with asthma compared with healthy control group. And no significant difference in serum IgM of patients with asthma compared with healthy control group. Decrease coefficientphagocytosis was significantly (P ≤ 0.001) in all patients with asthma compared with healthy control group. Levels of interleukin (IL - 6, IL - 17) measured in serum of 60 a sample of patients with asthma, and in the serum of 20 samples from healthy control group. The results showed a significant increase (P ≤ 0.001) in the levels of these interleukins in the serum of patients with asthma compared to the control group.Also there was increased in the rate of counting the total of WBCs and differential cell lymphocytes, eosinophil, neutrophil, basophil, and monocyte (P ≤ 0.001) in patients with asthma compared with the healthy people in the control group.

التغاير الفصلي في التركيب النوعي للطحالب الملتصقة على اجزاء مختلفة من نبات القصب Phragmites australis من مواقع مختارة في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق == Seasonal Variations in Species Composition of Epiphytic Algae on Different Parts of Phragmites australis in the Tigris River - Baghdad - Iraq

Author name: هند ابراهيم احمد البياتى

Supervisor name: جنان شاوي الحساني

General topic: Biology

Specific topic: Environment

Degree: Master

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت دراسة شهرية للطحالب الملتصقة على السيقان والاوراق الحية والميتة لنبات القصب Phragmites austrlis Trin ex Stand في نهر دجلة في موقعي الاعظمية والجادرية ضمن مدينة بغداد ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 ولغاية شهر حزيران 2015 . شملت الدراسة قياس العوامل الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ، مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء) والاس الهيدروجيني (pH) والتوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰ S) والمواد الذائبة الكلية (TDS) والمواد الصلبة العالقة (TSS) والقاعدية الكلية (TA) والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD5) والعسرة الكلية (T.H) والكالسيوم والمغنسيوم والكدرة (Turbidity) ونفاذية الضوء (light penetration) وسرعة الجريان (F.W) والكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا والنتراتNO3 والنتريت NO2 والامونيا NH3و الفوسفات الفعالة (PO4) - 3و السيليكا الفعالة - 2) (SiO3 . فضلا عن ذلك تمت دراسة نوعية وكمية للطحالب الملتصقة على السيقان الحية والسيقان الميتة والاوراق الحية والاوراق الميتة لنبات القصب وقيست اربع مؤشرات للتنوع الحيوي ( دليل شانون للتنوع ودليل الغنى ودليل التكافؤ ودليل جاكارد للتشابه ) . اوضحت نتائج الدراسة ان معدل قيم درجة حرارة الهواء والماء تراوحت 18 - 39 م و12 - 31 م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني 7.6 - 8.1 واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت 130 - 191.6 ملغم.لتر - 1. بينما وصلت قابلية التوصيل الكهربائي 500 - 870 مايكروسمنز.سم - 1. في حين سجلت قيم الملوحة 0.305 - 0.538 جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية 250 - 430 ملغم .لتر - 1، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن 0.91 - 0.03 ملغم .لتر - 1، والاوكسجـين المذاب بين 8.4 - 5 ملغم.لتر - 1 ، وقيم المتطلب الحيوي بين 4.1 - 0.9 ملغم .لتر - 1 ،العسرة الكلية 465 - 120ملغم CaCO3.لتر - 1 ، الكالسيوم 97.4 - 41. ملغم . لتر - 1، المغنسيوم 17.6 - 74.9 ملغم .لتر - 1 ،الكدرة 87.1 - 28.6NTU ، نفاذية الضوء 90 - 34 سم ، سرعة الجريان 0.3 - 0.1 م . - 1ثا ، النترات الفعالة 0.98 - 0.72 ملغم .لتر - 1 ,النتريت الفعال 0.02 - 0.004 ملغم . لتر - 1 , الامونيا 0.23 - 0.09 ملغـم. لتر - 1 ، في حين تراوحت قيــم الفـوسفات الفعالة 0.73 - 0.1ملغم . لتر - 1 والسيليـكا الفعالة 4.1 - 3 ملغم . لتر - 1 . شخص 174 نوعا تعود الى 52 جنس كان منها138 نوعا 31جنس تعود الى صف الطحالب العصوية Bacillariophyceae مكونة 79.3% من العدد الكلي لانواع الطحالب الملتصقة 10انواع تعود لرتبة الدايتومات المركزيةCentrales و128 نوعا تعود لرتبة الدايتومات الريشيـــة Pennales و18 نوعا ) 10.3% ، 13 جنس) تعود الى صف الطحالب الخضر Chlorophyceae و17 نوعا (9.7% ،8 جنس ) تعود الى صف الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae ونوع واحد وجنس واحد(0.5) للطحالب البرواتية Dinophyceae.سجلت الدراسة الحالية 6 انواع من الطحالب المشخصة لاول مرة في العراق تعود لصف الطحالب العصوية تمثلت بـ Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow وNavicula exilissima Grunow وNavicula microcephalo Grunow وPleurosigma obscurum W.Smith وStauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys وStenopterobia intermedia Lewis , وقد اوضحت ابعاد النوع وصفاته الاساسية فضلا عن تصويره فوتوغرفيا بالكاميرا الرقمية .تفوقت الاجزاء الميتة من سيقان واوراق نبات القصب P . australis باعداد انواع الطحالب الملتصقة عليها مقارنة مع السيقان والاوراق الحية للنبات المضيف , سجل 96 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية ,و 95 نوع على السيقان الميتة , 50 نوع على الاوراق الحية , 61 نوع على الاوراق الميتة شكلت الطحالب العصوية 82% , 84.2 % , 80 % , 83 % نوع على التوالي , اما الطحالب الخضر فقد تراوحت بين 10.4 % , 6.3 % , 8.1 % , 4.9 % نوع, والطحالب الخضر المزرقة 8.3 % , 7.3 % , 6.5 % , 9.8 % نوع في موقع الاعظمية , اما في موقع الجادرية فقد سجل 85 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية و90 نوع على السيقان الميتة و57 نوع على الاوراق الحية و74 نوع على الاوراق الميتة , سادت فيها الدايتومات بنسبة 80.3 % ,82 % , 81 % , 82.4 % على التوالي , اما الطحالب الخضر 8.2 % , 9.4 % , 5.2 % , 6.7 % والطحالب الخضر المزرقة 9.4% , % 8.2 , 10.5%, 9.4 % نوع على التوالي تباين العدد الكلي للطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة لنبات القصب باختلاف الفصول والمواقع ، اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة 854.7×104 خلية.غم - 1 وزن رطب على السيقان الحية في الربيع واقل عدد كلي للطحالب 108.64× 104 خلية.غم - 1 على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية في حين تراوح العدد الكلي لافراد الطحالب الملتصقة في موقع الجادرية بين 114.77×909.47 - 104× 104 خلية.غم - 1 وزن رطب على الاوراق الحية والسيقان الحية لنبات القصب في الشتاء والربيع على التوالي . تراوحت قيم كلوروفيل - ا للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين 2.831 - 1.586 ملغم.سم - 2 في الخريف والربيع على التوالي في موقع الاعظمية و3.108 - 0.941 ملغم.سم - 2في الشتاء والربيع على التوالي في موقع الجادرية , بينما تراوحت قيم الفيوفايتين - ا بين 0.981 - 0.037 ملغم .سم - 2 في الخريف والصيف على التوالي في موقع الاعظمية و0.895 - 0.027 ملغم.سم - 2في الخريف والصيف في موقع الجادرية . اظهرت ادلة التنوع الحيوي اعلى قيم دليل الغنى 16.9 للطحالـــب الملتصقـة علــى السيقان الحية لنبات القصبP. australis في الربيع في موقع الجادرية وظهرت اقل قيم الدليل 7.7للطحالب الملتصقة على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية ، واعلى قيم دليل التنوع شانون بلغت 4.19 في الربيع للطحالب الملتصقة على السيقان الحية في موقع الجادرية ، في حين سجل اقل قيم دليل التنوع 3.1 على الاوراق الحية في الصيف في موقع الاعظمية ، سجلت اعلى قيمة تكافؤ 0.740 في الشتاء للطحالب الملتصقة على الاوراق الحية في موقع الجادرية واقل قيمة بلغت 0.58 على السيقان الحية في الخريف في موقع الاعظمية. كما بينت النتائج اعلى نسبة تشابه لدليل جاكارد Jaccard بين الفصول كانت بين الربيع والخريف للطحالب الملتصقة على السيقان الميتة اذ بلغت 51.7 % في موقع الاعظمية , في حين بلغت اعلى نسبة تشابه في موقع الجادرية 49.6 % بين الربيع والخريف على السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الخريف اعلى نسبة تشابه 40.2 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 37 % بين السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الربيع اعلى نسبة تشابه 48 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة وجاء الصيف بـ اعلى نسبة تشابه بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في موقع الاعظمية , اما موقع الجادرية فقد سجل اعلى نسبة تشابه 44.6 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في الخريف وسجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 40.2 % على السيقان الحية والاوراق الميتة وسجل الربيع اعلى نسية تشابه 59.5 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل فالصيف اعلى نسبة تشابه 41.4 % على السيقان الميتة والاوراق الميتة . خلصت الدراسة الى ان مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد عسرة وذات طبيعة قاعدية معتدلة وسجل تنوع عالي مع تباين ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة للنبات المائي الواحد اذ فضلت الطحالب جزء الورقة الملتف حول الساق ولم تفضل جزء الورقة الممتد افقيا على سطح الماء وازداد تنوع الطحالب الملتصقة على الاجزاء الميتة في فصول الدراسة كافة باستثناء الربيع الذي سجل زيادة في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء الحية من سيقان واوراق نبات القصب اما مواسم الذروة فكانت في فصلي الربيع والخريف وسجل الشتاء انخفاض ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة بسبب الظروف البيئية الغير الملائمة . | This work was conducted monthly to study the epiphytic algae on dead and live stems , leaves of aquatic plant Phragmites australisn Trin ex Stand on the Tigris River at Al - Jadriya and Al - Adhmia sites within Baghdad City during the period between October 2014 and June 2015. The physicochemical factors were measured in the studied area. These factors were temperature (air and water), pH (water), electrical conductivity (EC), salinity (S‰), water flow, total dissolved solids (TDS), total suspended solids (TSS), turbidity and light penetration. Also the study included total alkalinity (TA), total hardness (TH), calcium, magnesium, dissolved oxygen (DO), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, Nitrate(NO3), Nitrite(NO2), Amonia(NH3), Ractive phosphate (PO4) - 3 , Reactive Silicates (SiO3 - 2), chlorophyll - a and pheophytin - a. The quantitative and qualitative study for epiphytic algae on different part of macrophytes (Phragmites australisn Trin ex Stand ) were done. Also four biodiversity indices (Shannon - Weaver, richness, evenness and similarity) were calculated. The studied factors ranged as follows : 18 - 39 C° , 12 - 31 C° for air and water temperature, respectively. The turbidity and light penetration, water flow, EC, S‰, TDS and TSS were 28.6 - 87.1 NTU, 34 - 90 cm, 0.3 - 0.1m.Sec - 1., 500 - 870µs.cm - 1, 0.305 - 0.538 ‰, 250 - 430 mg.l - 1 and 0.03 - 0.91 mg.l - 1, respectively. While7.6 - 8.1, 130 - 191.6 mg CaCO3.l - 1 , 120 - 465 mg .l - 1 , 41.1 - 97.4 mg.l - 1 , 17.6 - 74.9mg.l - 1 for pH, TA, TH, Ca++ and Mg++, respectively. Nutrient concentrations ranged 0.98 - 0.72 µg.l - 1 , 0.02 - 0.004µg.l - 1 , 0.09 - 0.23µg.l - 1, 0.1 - 0.73 µg.l - 1 , 3 - 4.1µg.l - 1 for Ractive Nitrate, Nitrite,Amonia, Ractive phosphate and Silica. A total of 174 taxa of epiphytic algae were found in the present study. Bacillariophyceae (diatoms) was the dominate class with 138 species (128 species belonged to pinnate diatoms and 10 for centric diatoms) and represented 79.3% from the total identified algae. Other classes sequenced as follows : Chlorophyceae (18 species and 10.3%), Cyanophyceae (17species and 9.7%) and one species (0.5%) for Dinophyceae .Six of the algal taxa were recorded in the present study are new to Iraqi flora. The new record of algae belong to Bacillariophyceae are Navicula exilissima Grunow , Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow , Navicula microcephalo Grunow, Pleurosigma obscurum W.Smith, Stauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys , Stenopterobia intermedia Lewis. The results of this study include description of the basic characteristics of these taxa together with complete photographic documentation. Highest number of epiphytic algae were recorded on dead stems and leaves of aquatic plant P. australis comparison with living parts of the host plant , 96 species of epiphytic algae were recorded on living stems , 95 species on dead stems , 50 species on living leaves and 61 species on dead leaves . The proportion of Bacillariophyceae was %82, %84, %80, %83 respectively while Chlorophyceae was ranged %10.4, %6.3, %8.1, %4.9 and Cyanophyceae recorded %8.3, %7.3, %6.5, %9.8 species in Adamia site . While in Jadria site it has recorded 85 species of epiphytic algae on living stems , 90 species on dead stems , 57 species on living leaves and 74 species on dead leaves diatoms was dominant %80.3, %82, %81, %82.4 respectively Chlorophyceae recorded %8.2 , %9.4, %5.2, %6.7 species and Cyanophyceae %9.4, %8.2, %10.5, %9.4 species respectively .Numbers of epiphytic algae fluctuated among study sites, seasons and parts of aquatic plants showed that highest count was recorded 845.7 × 104 cell.gm - 1 wet weight on living stems in spring and the lowest count was recorded 108.64 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves in winter at Al - Adhmia site .While the total number of epiphytic algae on P. australis at Al - Jadria site ranged between 114.77× 104 - 909.47 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves and living stems of the host plant in winter and spring respectively .Chlorophyll - a concentration varied among Seasones , and recorded between 1.586 - 2.831 mg.cm - 2 in autumn and spring respectively at Al - Adhmia site , and ranged between 0.941 - 3.108 mg.cm - 2 in winter and spring respectively at Al - Jadria site . Pheophytin - a concentration varied and recorded between 0.037 - 0.981 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Adhmia site and 0.941 - 0.895 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Jadria site .The highest value of richness in this study was 16.9 on the living stems in spring at Al - Jadria site and the lowest value was 7.7 on dead leaves in winter at Al - Adhmia site . Shannon - Weaver index values ranged between 4.19 on the living stems in spring at Al - Jadria site and 3.1 on the living leaves in summer at Al - Adhmia site. Evenness index recorded highest value 0.740 on the live leaf in winter at Al - Jadria site While the lowest value 0.58 on live stem in autumn at Al - Adhmia site . Higher percentage for Jaccard similarity index 51.7% obtained between autumn and spring seasons on dead stems at Adhmia site While the highest percentage of similarity at Al - Jadria site was 49.6% between autumn and spring on dead stems and living stems.The water quality of Tigris River within Baghdad city is estimated as a moderate alkalinity and hardness , high diversity and marked contrast in total number of epiphytic algae was recorded on same host plant , algae prefer parts of leaves that wrapped around stem and not the leaf blade that extended horizontally on the surface of the water , diversity increased on dead parts of plant in all study seasons except spring which showed an elevated in the total algae number on living parts (stems and leaves ) for reed plant , peak seasons was Spring and Autumn while Winter record a significant decrease in algae number which attributable to environmental conditions in appropriate.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد

Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

Author name: هديل مكي حبيب المؤمن

Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي

Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: Mustansiriyah University - College Of Science

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

تاثير حامض الجبرلين والبراسينولايد في بعض صفات النمو والحاصل لصنفين من نبات الشبنت Anethum graveolens L. == Effect of GA3 and Brassinolide on Some growth and Yield Parameters for two Cultivars of Plant Anethum graveolens L

Author name: وائل شاكر حميد الجبوري

Supervisor name: ماهر زكي فيصل الشمري

General topic: Biology

Specific topic: Plant

Degree: Master

University: University of Baghdad - Ibn Al-Haytham College Of Education For Pure Sciences - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: اجريت تجربة حقلية في الحديقة النباتية العائدة لقسم علوم الحياة، كلية التربية للعلوم الصرفة - ابن الهيثم - جامعة بغداد، في الموسم النمو 2015 - 2016 لدراسة تاثير تركيز حامض الجبرلين والبراسينولايد وتداخلهما في بعض الصفات المظهرية والكيميائية والمركبات الفعالة طبيا والحاصل ومكوناته في صنفين نبات الشبنت هما الصنف المحلي والصنف الهولندي. نفذت التجربة باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة Randomized Complete Block Design (RCBD) وبثلاثة مكررات اذ تضمنت الدراسة صنفين نبات الشبنت واضافة خمسة تراكيز من البراسينولايد هي (0 و0.5 و1 و2 و3) ملغم.لتر - 1 ورش حامض الجبرلين على المجموع الخضري بتركيز 50ملغم.لتر - 1 وبدون رشه. وبهذا تكون التجربة عاملية (2 × 2 × 5 ×3) اذ تضمنت 60 وحدة تجريبية، وسمدت الوحدات التجريبية وفق معاملاتها. ويمكن ايجاز النتائج التي تم الحصول عليها كما ياتي : 1. اختلاف صنفي نبات الشبنت (المحلي والهولندي) عن بعضهما في الصفات المدروسة، فقد تفوق الصنف المحلي على الصنف الهولندي في صفة ارتفاع النبات ووطول الحامل الزهري وتركيز الفسفور ونسبة الكاربوهيدرات في المجموع الخضري ونسبة الكاربوهيدرات في الثمار ووزن 1000ثمرة. فيما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي في صفة طول الجذر وحجم الجذر وقطر الساق والوزن الرطب والوزن الجاف ومعدل النمو المطلق واستدامة الكتلة الحيوية وعدد النورات الزهرية وحاصل الثمار في النبات الواحد وحاصل الثمار في الوحدة التجريبية الواحدة وحاصل الثمار الكلي وتركيز النتروجين في المجموع الخضري وتركيز الكالسيوم وتركيز البوتاسيوم وتركيز المغنيسيوم ونسبة البروتين في المجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي في الاوراق وتركيز النتروجين في الثمار، نسبة البروتين في الثمار ونسبة الزيت والوزن النوعي.2. اظهرت الدراسة ان المعاملة بحامض الجبرلين والبراسينولايد والتداخل بينهما ادى الى زيادة معنوية في الصفات المدروسة ، عند رش 50 ملغم.لتر - 1 من حامض الجبرلين وتركيز 2 ملغم.لتر - 1 في معظم الصفات والبعض منها عند التركيز 1 ملغم. لتر - 1 من البراسينولايد على المعاملات الاخرى. 3. اظهرت نتائج الفحص والتشخيص الكروماتوغرافي باستعمال تقنية HPLC تشخيص ستة مركبات فعالة في الزيت الطيار لبذور صنفي نبات الشبنت هي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole وP - anisaldehyde وLinalool). وقـد تـفوق الصنـف المحــلي على الصنـــف الهـولـندي باعطائــه اعــــلى تركـيــز لكل مــن المركبات الفــــعالـــة هـــما P - anisaldehyde) وLinalool)، عند رش حامض الجبرلين بتركيز 50 ملغم . لتر - 1 والبراسينولايد بتركيز1 ملغم. لتر - 1 ، بينما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي باعطائـه اعلى تركيز للمركبات الفعالة وهي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole) عند رش 50 ملغم. لتر - 1 الجبرلين و2 ملغم. لتر - 1 البراسينولايد. | A Field study was conducted at the farm of Biology Department, College of Education (Ibn AL - Haitham) for pure science, University of Baghdad during the growth season 2015 - 2016, on study the effect of Gibberellic acid concentration and brassinolide and their intraction on both morphological and chemical characteristics, the components of yield, determining the medically active compoands in two varieties of Dill plant, local and Holand varieties.The experiment was designed as Randomzied Complete Block Design (R C B D) with three replications. which two varieties of Dill plant and spray of Gibberellic acid (50) mg.liter - 1 and non spray and five concentration of brassinolide (0, 0.5 , 1,2 and 3) mg.liter - 1 The experiment was as designed factorial experiment (2x2x5x3) included sixty experimental units The plants were managed fertilized recommaded.Can be summarized the results that were obtained as follows : 1.different the variety of dill plant (local and holand) from each other in the traits, the local variety surpassed the holand variety in the plant height, the length of the pregnant syphilis, Concentration of phosphate, the percentage of carbohydrates in the shoot, the percentage of carbohydrates in the fruits, weight of a thousand fruits. As outweigh the holand variety at the local variety in the character of the root length, root size, stem diameter, wet weight, dry weight, the absolute growth rate, the sustainability of biomass, the number of inflorescences, holds fruits per plant, holds the fruits in a single experimental unit, holds overall fruits, Concentration nitrogen in the shoot, calcium Concentration, potassium Concentration, the percentage of protein in the shoot, the total chlorophyll content in the leaves, the Concentration of nitrogen in the fruits, the percentage Albroonin in fruits, oil content, specific weight.2. The study showed that treatment with acid and Gibberellin and brassinolide and overlap between them led to a significant increase in the traits, at a spray 50 mg.L - 1 Gibberellin acid and concentration of 2 mg.L - 1 in most qualities and some of them at a concentration of 1 mg.L - 1 brassinolide the rest of the transactions.3. Screening and diagnosis chromatographic results showed the use of HPLC technique diagnosed six compounds in the volatile oil fruit plant varieties Dill are : (Anethol , Limonene , Carvone , Dillapiole , P - anisaldehyde and Linalool). Local variety was higher than the holand variety by giving it the highest concentration of the two active compounds are P - anisaldehyde and Linalool), especially when the spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid and 1 mg. L - 1 of brassinolide, while the superiority of the holand breed Local product by giving it the highest concentration of other active compounds which four : (Anethol , Limonene , Carvone and Dillapiole), especially at a spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid. and 2 mg. L - 1 of brassinolide.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد

Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Baghdad - College Of Science For Girls

Language: English

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة جزيئية ونسيجية مناعية للنساء المصابات بمرض سرطان الثدي في محافظة ذي قار,العراق == Molecular and Immunohistochemical Study in Women with Breast Cancer in Thi - Qar Province

Author name: هبة لفتة عبد الغالبي

Supervisor name: منال بادي صالح | مها شاكر حسن

General topic: Biology

Specific topic: Life Science

Degree: Master

University: University of Thi-Qar - College Of Science

Language: English

University location: Dhi Qar

First pages:

Abstract: Breast cancer is a complex and multifactorial disease resulting in abnormal cell growth that leads to malignant tumor formation.In this study we focus on mutations of breast cancer susceptibility genes 1 and 2 (BRCA1 and BRCA2), immunohistochemical evaluation of estrogen, progesterone, HER - 2 receptors, ABO blood groups , white blood cells and clinicopathological parameter ( age, breast feeding, family history and tumor site) .Eighty five blood samples were taken from patients who attended Al - Hussain teaching hospital and oncology unit in Al - Habboby hospital during the period (from August /2014 to April /2015) , fifty blood samples were collected from healthy women as a control group who attended Al - Hussain teaching hospital and divided into groups according to age, family history, age at first brith, breast feeding. For histopathological and immunohistochemical analysis fifty tissue samples were collected from patients with breast cancer who were undergoing surgical resection (mastectomy). Blood samples were obtained by venepuncture , using a 5 ml disposable syringe , and they were divided into three aliquots, which were 1 ml, 2 ml and 2ml, for collect serum, genetic studies and hematological parameters (leucocycte count and ABO blood groups) study. The tissue samples were collected from the 50 patients with breast cancer for histopathological diagnosis and for Immunohistochemical analysis (estrogen receptor, progesterone receptor and here2/nue) The total patients were divided according to their age in to five groups (30 - 39), (40 - 49), (50 - 59), (60 - 69) and (≥70 years). results of present study revealed that a highest incidence of breast cancer (41%) occur in the age oup between 40 - 49 years, there is a significant difference among patients groups (P ≤ 0.01).The results of our study showed that (77) of patients lactating and from those according to period of lactation we found that the highest percentage of patients (37.6%) were lactating for period between (18 - 22months) and the lowest percentage (10.38%) lactating for period between (1 - 6 month). Family history of breast cancer indicates a strong association with risk of developing breast cancer. The result of the present study revealed that the family history positive in 31 cases (36.47%), and 54 cases (63.52%) had negative family history of breast cancer.The results of present study showed that (41.5%) had first birth at age (20 - 29years), (23.37%) had their first birth in age group (15 - 19 years) and (30 - 39 years), and (9.09%) had first birth at age (≥40 years).Regarding the tumor site, we found that most of patients (50.5%) the tumor mass was located in the right side and (38.8%) cases the tumor mass were located in the left side.The DNA was extracted from blood samples by using Accupower® genomic DNA extraction kit. Each concentration and purity of all DNA samples have been measured by Nanodrop. Samples with a purity ranged from 1.2 to 1.8 have been enrolled in this study for the molecular detection of BRCA1/2 gene mutation in patients and control groups. Detection of BRCA1/2 gene mutation by multiplex PCR revealed that (185 del AG mutation in BRCA1 gene) was detected in 6 patients (7.05%) out of 85 cases with breast cancer, and (5382 ins C) mutation in the same gene was detected in 2 patients (2.35%). Regarding (6174 del T) mutation in BRCA2 gene was detected in 3 patients (3.52%). While this mutation was not detected in the control groups.Histopathologically, carcinoma was divided into 44 cases (88%) ductal carcinoma {from which 42 cases (84%) were invasive ductal carcinoma, and 2 cases (4%) were comedocarcinoma}, and 6 cases (12%) cases invasive lobular carcinoma. Results revealed that 2 cases (4%) were stage I, 13 cases (26%) were stage II, 24 cases (48%) were stage III and 11 cases (22%) were stage IV, also our results showed that the 2 cases (4%) were grade I, 23 cases (46%) were grade II and 25 cases (50%) were grade III. The results of immunohistochemical analysis for breast cancer samples showed that Estrogen receptors were present in 36 cases (72%), and 14 cases (28%) were negative, while Progesterone receptors detected in 27 cases (54%), and 23 cases (46%) were negative, on the other hand the expression of HER - 2/neu showed positive results in 28 cases (56%), and 22 cases (44%) were negative.Regarding the ABO blood groups, we found that most of the cases carry blood group A (40 cases, 47.05 %), and the lowest frequency was for blood group AB (7 cases, 8.23%).The results of the present study showed that leukocytes count, lymphocytes count, monocytes count, neutrophils count and basophiles count were lower in patients than the control group, with a significant difference (p value ≤ o.o1). While the eosinophils count was significantly higher in patients than the controls (p value ≤ o.o1).

دراسة الهياة الكروموسومية لنوع من اسماك المياه العذبة العراقية سمكة ابو الزمير العميق Mystus pelusius == Karyotyping Study of one Species of Iraqi Freshwater Fish ( Mystus pelusius )

Author name: هبة حسين رسن

Supervisor name: اسماء سامي ابراهيم

General topic: Biology

Specific topic: zoology - Genetics

Degree: Master

University: University of Baghdad

Language: Arabic

University location: Baghdad

First pages:

Abstract: The fish has a great economic and environmental importance, however the cytogenetic studies on them still few, especially the chromosomal studies of local fish, therefore current study aimed to identify the karyotype (Chromosomal type and number) and the sex determination system to a species of Iraqi freshwater fish, which is Mystus pelusius (Solander in Russell, 1794) fish in Iraq, as (20) fish (10) male and (10) female were hunted from Tigris river in Al - Kraat area of Bagdad city.The current study was done to investigate the karyotype, where the chromosomal preparations has been preparing from kidney cells according to (air - drying technique).The results of the males and females kidney cells metaphase chromosomes study showed that the diploid chromosome number was 2n=32, which represents less chromosomal number recorded so far in the studied Iraqi fish, also the results showed that the males chromosomal types included 2n=(6m+13sm+7st+6t) and fundamental number FN=51, the females chromosomal type was 2n=(6m+12sm+8st+6t) and FN=50, also it observed that the first sub metacentric pair was the largest within the biarmed chromosomes.The results revealed that the male (heterogamety) and the female (homogamety), accordingly it follows the sex determination system (XX/XY), as the (X) chromosome represented by medium sized submetacentric (sm) chromosome and (Y) chromosome by small sized subtelocentric (st) chromosome.The results of Giemsa - banding technique (G - banding) showed that the rich regions with Guanine (G) and Cytosine (C) nitrogen bases called (G - light) bands and the rich regions with adenine (A) and thymine (T) called (G - dark) bands, thus it determined more accurately the sister chromosomes in Mystus pelusius males and females, more over thistechnique described sex chromosomes better, it has been observed that most chromosomes in both sexes have (G - light) bands, as all (uniarmed) (telocentric, subtelocentric) autosomes pairs entirely contain (G - light) bands, while in the (biarmed) (metacentric, submetacentric) autosomes chromosomes the light bands concentrated in their telomeres, while the rest regions of these biarmed chromosomes have dark bands. Results of (G - banding) technique confirmed which was shown by the traditional pigmentation method (Giemsa staining technique) about the sex chromosomes discrimination, where this technique showed more accurately and better that the male was heterogamety through a observation of medium sized submetacentric (X) chromosome with (G - light) bands in telomric position of (short arm), while the subtelocentric (Y) chromosome was the larger within the uniarmed chromosomes and it was marked by being entirely dark and lack of (G - light) bands, while it was observed in females a medium sized submetacentric (sm) pairs with (G - light) bands in the telomeric of long and short arms which represents (XX) sex chromosomes, and according to this the females considered to be homogamety and the males heterogamety, and proved that the sex determination system in Mystus pelusius fish was a simple sex determination system of (XX/XY) type