Show: 25 50 75 100 Results

Search results: 50 out of 11,481

دراسة تشريحية مقارنة لبعض انواع العائلة المركبة Asteraceae L == Comparative Anatomical Study of Some Species from The Family Asteraceae L

Author name: وفاء حميد مجيد محمد النعيمي
Supervisor name: اسراء كريم نصر الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant - Anatomy
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study included comparative anatomical study for 10 cultivated species of the family Compositae collected from public gardens for different region of Baghdad city, these species are : 1 - Aster amellus L. )استر(2 - Cosmos sulphureus Cav. )كوزموز(3 - Dahlia variabilis Willd. )داليا(4 - Gaillardia pulchella Foug. )عنبر كشمير(5 - Gazania splendens Hork. )ك ا زنيا(6 - Gerbera jamesonii Hook. )جربي را(7 - Helichrysum bracteatum Vent. )ورد الكاغد(8 - Tagetes erecta L.)جعفري(9 - Tagetes patula L.)قديفة(10 - Zinnia elegans Jacq. )زينيا(The study dealt with some anatomical characters and study are Compared for the first time to these species in Iraq.The study included the features of ordinary epidermal cells leaves stems, and involucre bracts, and also stomatal complexes, Actinocytic type was recorded as new founding in the species Aster amellus. The study included cross sections of the roots and also exposed the constituent tissues of it and the varies in the thickness of epidermis cortex, vascular cambium as well as the arrangement of phloem which have an important role in the studies species.studying of cross sections of stems showed important taxonomic characters like thickness of epidermis, presence or absence of collenchymatypes and rows number, characteristic of the vascular bundles in terms of forms and numbers, therefor the species were divided into groups.The vascular cylinder characters also gives prominent anatomical characters importance in terms of being continuation or intermittent.The study of vertical section of leaf showed important anatomical characteristic like thickness of upper and lower epidermis thickness of palaside and spongy layer, layers number and from of vascular bundles. The venation system of was investigated and compared between species.The study included characteristic of cross sections of petiole in terms of thickness of cuticle, epidermis and collenchyma number and forms of vascular bundles. The vertical sections of involucre bracts also studied.Indumentum of different parts of plant (leaves, stems, bracts and fruit) are also studied in details, glandular hairs and eglandular hairs where studied in terms of cells number, lengths, apexes and bases forms and other characters in addition to papillae which occur in some species. Petals venation were investigated and compare between species.The study also resulted in the presence of internal secretory structures, the study showed the locations of these structures, dimensions and the method of formation to these structures which gave an important anatomical character. The study showed the presence of crystal, which differ in the, forms and sizes which contributed to the isolation of species it was the first time note sphaerocrystals (Inulin crystal) in tuberous root cortex of Dahlia variabilis the prismatic crystals of the type styloid in root cortex of Gerbera jamesonii.The study showed results and characters and these were presented for the first time. Investigation include field photographs of studied species and plates of sections which studied in different plant parts in addition to many tables.

دراسة مقارنة لفعالية لقاح التيفوئيد من عترة محلية وقياسية مع اللقاح التجاري == Comparative Study of the Typhoid Vaccine Effectiveness from Local and Standard Strain With Commercial Vaccine

Author name: وفاء بيد الله حميدي الركابي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: حمى التيفوئيد, تسسبب بواسطة بكتريا السالمونيلا تايفي (S. Typhi) Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi, وينتقل معويا في الانسان حصرا بمدى من التهاب معوي متوسط الى امراض جهازية شديدة وينتشر عن طريق البراز - الفم من خلال تلوث الماء والطعام. هدفت الدراسة الحالية الى تحضير ثلاثة انواع من اللقاحات ضد حمى التيفوئيد من عترة محلية لبكتريا S. Typhi تضمنت لقاح متعدد السكريد Polysaccharide ومتعدد السكريد الشحمي Lipopolysaccharide وخلية كاملة مقتولة Whole cell killed. اجريت هذه الدراسة للفترة من شهر نيسان 2014 وحتى شهر حزيران 2015, تم الحصول على العترة المحلية S. Typhi من المركز الوطني للبحوث والرقابة الدوائية / وزارة الصحة العراقية. شخصت S. Typhi (العترة المحلية) بطرق التشخيص التقليدية كالفحص المجهري والفحوصات البايوكيميائية ونظام التشخيص APi20 وVitek - 2 والفحوصات المصلية, اكدت جميعها هوية البكتريا التي تنتمي الى Salmonella Typhi. تم الحصول على جودة جيدة وفعالية في اللقاحات المحضرة محليا من الناحية البيولوجية والكيميائية والفيزيائية والمناعية مقارنة مع اللقاح التجاري المستورد ، على الرغم من ان لقاحي WCK وLPS رفعا درجة حرارة الجسم في مجموعتي خنازير غينيا الملقحة بهما مقارنة مع المجموعتين المحصنة بلقاحي PSالمحلي والتجاري . ان نتيجة الاختبار الكيميائي (لمتبقيات الفينول والفورمالين) باستخدام تقنيتي Hight - Performance Liquid Chromatography (HPLC) و(Gas Chromatography (GC، قيمة الاس الهيدروجيني PH ومحتوى البروتين امن بالمقارنة مع بروتوكول منظمة الصحة العالمية للقاح التيفوئيد. ايضا في الفحوصات الفيزيائية كان حجم جزيئات لقاح PS المحلي اقل من المستورد، ان صغر حجم جزيئات اللقاح دعم الاستجابة المناعية. في الاختبار المناعي بواسطة تقنية Enzyme Linked Immunsorbent Assay ((ELISA, اظهرت جميع اللقاحات اختلافات معنوية (P<0.05) في مصل خنازير غينيا المعاملة بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعة السيطرة. كان لقاحي PS التجاري والمحلي ذا اهمية معنوية في التفاعلات المناعية reactogenicity اقل من لقاحي LPS وWCK ، ولكن كل منهم اظهر حماية (70 ، 80 ، 80 و90) ٪ على التوالي ضد جرثومة S. Typhi الضارية. اللقاحات المحلية قد تكون قادرة على تعزيز مناعة التكيفية adaptive immunity من خلال تسجيلها اختلاف معنوي (P<0.05) في حساب مجموع الكريات البيض بين الجرعتين الاولى والمعززة مقارنة مع مجموعتي اللقاح التجاري والسيطرة. واوصت الدراسة تطوير انتاج عراقي للقاح تيفوئيد PS من هذه العترة الضارية. | Typhoid fever, which is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi (S. Typhi) is an exclusively human enterically transmitted, range from mild gastroenteritis to severe systemic disease and spread by the fecal - oral route via contaminated food and water. In current study aimed to production three types of vaccines against typhoid fever from local strain S. Typhi, include polysaccharides (PS), Lipopolysaccharide (LPS) and Whole Cell Killed (WCK) vaccine. This study was carried out during the period from April 2014 until June 2015. The local strain of S. Typhi was obtained from The National Center of Drugs Control and Research (NCDCR) / Iraqi Ministry of Health. Identification of S. Typhi (local strain) by traditional methods of diagnosis as microscopic examination and biochemical tests as Api20 system diagnosis, Vitek - 2 and serological test .All confirmed the identity of the bacteria belonging to S. Typhi. Good quality and efficacy was obtained in the locally produced vaccines from the biological, chemical, physical and Immunological compared with the imported commercial vaccine, although WCK and LPS elevated body temperature in a vaccinated guinea pigs groups with them compared with local PS and Commercial Vaccinated groups. That a result of chemical test (phenol and formalin residuals) by High - Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Gas Chromatography (GC), PH value and protein content were safety side comparative with WHO protocol typhoid vaccine. Also in physical test, the particles size of local PS vaccine was less than Com. V., the smaller of particles size of vaccine supports the immune response. In Immunological test by Enzyme Linked Immunsorbent Assay ELISA was showed that the titration of all vaccines and have significantly differences (P<0.05) in the sera of treated guinea pigs between first and booster dose compared with control,. The Commercial and local Vi PS. vaccines were significantly less reactogenicity than LPS and WCK vaccines, but all of them provided (70, 80, 80 and 90) % protection respectively against virulent S. Typhi organism. The prepared vaccines may be able to enhance the adaptive immunity through its recorded significant different (P<0.05) in the total leukocytes count between first and booster dose compared with the Commercial Vaccine and control groups. The study recommends to developing production of Iraqi Vi Polysaccharide. Typhoid vaccine from this local virulent strain of S. Typhi.

العلاقة بين مستوى الكلوكوز في الدم مع بعض المعايير الكيموحيوية في متلازمة تكيس المبيض == The Relation Between Blood Glucose level and Some Biochemical Parameters in Polycystic Ovarian Syndrome

Author name: ياسمين سرمد حسن الصائغ
Supervisor name: عالية حسين علي | محمد باقر محمد رشاد فخر الدين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تعد متلازمة تكيس المبيض المتعدد ((PCOS من الاكثر شيوعا بين اضطرابات الغدد الصماء والتي تصيب النساء في عمر الانجاب. ماتزال امراضية هذه المتلازمة غير معروفة ولكن الكثير من الباحثين يعزونها الى عوامل وراثية واضطرابات ايضية والسمنة وفرط الاندروجين ومقاومة الانسولين، فضلا عن فرط الانسولين. هدفت هذه الدراسة الى ايجاد العلاقة بين مستوى الكلوكوز مع اختبارات اليوريا والكرياتنين، فضلا عن البروتين المتفاعل C في عينة من النساء العراقيات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد، اذ اجريت الدراسة الحالية على (51) امراة يعانين من متلازمة تكيس المبايض المتعدد و(10) نساء سليمات كمجموعة سيطرة في المعهد العالي لتشخيص العقم والتقنيات المساعدة على الانجاب/جامعة النهرين للفترة من شباط الى اب للعام 2014. تم تشخيص النساء الخاضعات للدراسة باستخدام جهاز الامواج فوق الصوتية (السونار) لفحص الرحم والمبيض واسندت بالاستبيان ان كن يعانين من ندرة الطمث (oligomenorrhea)، انقطاع الطمث الثانوي (secondary amenorrhea) او دورة حيضية منتظمة، فضلا عن الفحوصات الهرمونية والتي تضمنت الهرمون المحفز للحويصلات المبيضية ((FSH، الهرمون اللوتيني (LH)، هرمون الحليب (PRL)، هرمون الايستروجين (E2) وهرمون التيستوستيرون ((Testosterone. اذ جمع (5) مل من الدم الوريدي من كل امراة صائمة صباحا، واذيب 75 غرام من الكلوكوز بـ 300 - 500 مل من الماء واعطي لكل النساء الخاضعات لهذه الدراسة. تم جمع المعلومات والتي شملت العمر ومؤشر كتلة الجسم ( (BMIو فترة العقم من كل امراة خاضعة للدراسة، ثم تم اجراء اختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار فقط) واختبار اليوريا في الدم واختبار كرياتنين المصل واختبار الهوموسيستين واختبار البروتين الفعال C لكل النساء في هذه الدراسة. كما وتم اجراء اختبار اليوريا والكرياتنين فضلا عن اختبار البروتين المتفاعل C مع منتصف الاختبار لتحمل الكلوكوز الفموي لكل النساء الخاضعات في هذه الدراسة لغرض ايجاد العلاقة المحتملة بين السكر وهذه الاختبارات. قسمت المريضات الى عدة مجاميع وفقا لاختبار تحمل الكلوكوز الفموي (منتصف الاختبار) ونوع العقم وحالات الاجهاض ومؤشر كتلة الجسم وفترات العقم ووفقا للفئات العمرية. وبعد ذلك تم تحليل البيانات احصائيا. اظهرت نتائج الدراسة عدم وجود فروق معنوية(P>0.05) بين مجاميع المريضات (PCOS) مقارنة بمجموعة السيطرة فيما يخص عامل العمر،و لكن وفقا للفئات العمرية، لوحظ زيادة تكرار هذه المتلازمة للنساء ضمن الفئة العمرية التي تتراوح بين 21 - 30 سنة. كما واظهرت هذه الدراسة ان اغلب المريضات يعانين من الوزن الزائد والسمنة المفرطة، وارتفاع السكر في الدم. اما فيما يخص حالة العقم فقد قسمت المريضات لمجموعتين، مجموعة تعاني من عقم اولي 52.95%) ) والمجموعة الثانية تعاني من عقم ثانوي ((47.05% . اضافة الى ذلك، حوالي (29.42%)من المريضات يعانين من حالات الاجهاض، ولم تلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في فترات العقم بين المريضات اللواتي يعانين من الاجهاض مقارنة باللواتي لا يعانين من الاجهاض، وايضا بين المريضات اللواتي لديهن عقم اولي مقارنة باللواتي لديهن عقم ثانوي. اما بالنسبة للتحليل الهرموني، فقد لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) بهرمون الحليب لدى المريضات اللواتي يعانين من زيادة الوزن والسمنة المفرطة. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية (P>0.05)في تركيز الهرمون المحفز للحويصلات والهرمون اللوتيني وهرمون الايستروجين والهرمون الذكري التيستوستيرون بين المريضات ومجموعة السيطرة. ايضا اظهرت النتائج حصول ارتفاع معنوي(P<0.05) في تركيز الهوموسيستين في المريضات اللواتي يعانين من فترة عقم 9 سنوات فما فوق. لوحظ ايضا وجود علاقة ايجابية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز مع تركيز كل من اليوريا والكرياتنين في الدم، بينما لوحظت علاقة عكسية ضعيفة بين مستوى الكلوكوز وتركيز البروتين المتفاعل C في الدم. علاوة على ذلك، لم يلاحظ اي فروق معنوية(P>0.05) في مستويات اليوريا والكرياتنين والبروتين المتفاعل C بين مجاميع المريضات ومجموعة السيطرة الصائمات.نستنتج من نتائج الدراسة الحالية ان متلازمة تكيس المبيض مرتبطة بالسمنة، ومقاومة الانسولين، فضلا عن اضطرابات الطمث. وان ارتفاع الهوموسيستين مرتبط بمقاومة الانسولين والسمنة. المريضات اللواتي لديهن فرط الانسولين قد يتطور لديهن مرض السكري. كما وان ارتفاع هرمون الحليب مرتبط بالسمنة المفرطة والوزن الزائد في المريضات اللواتي يعانين من متلازمة تكيس المبيض المتعدد (PCOS). | Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder which affect women at reproductive age. The pathophysiology of this syndrome still unclear, but many researchers were attributed this syndrome to genetics, metabolic disorders, obesity, hyperandrogenism, insulin resistance and hyperinsulinemia. This study was aimed to identify the correlation of glucose level with blood urea, serum creatinine and C - reactive protein test in some Iraqi women suffering from polycystic ovarian syndrome. The present study was carried out for (51) PCOS women and (10) healthy women as control with age between (17 - 49) years at High Institute for Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technologies / AL - Nahrain University, from February to August, 2014. The females were diagnosed by ultrasound scan for ovarian and uterine features and supported by a questionnaire if they have oligomenorrhea, secondary amenorrhea or regular menstrual cycle, as well as reproductive hormonal assay performed for all women involved; FSH, LH , prolactin, E2 and testosterone. Blood samples (about 5 mL) were collected from each fasting woman in the morning, and 75 gm of glucose loaded in 300 - 500 ml of water and given to the subjects. The information included; age, BMI and duration of infertility were recorded for all subjects. Oral glucose tolerance test (Mid - test only), blood urea test, serum creatinine test, homocysteine test and C - reactive protein test were performed for all subjects. Blood urea, serum creatinine and C - reactive protein tests were performed with mid - test OGTT for all subjects provided the correlation between blood glucose levels and these parameters. PCOS women divided into groups according to mid - test OGTT, type of infertility, abortion cases, BMI values, duration of infertility and according to age groups. Crude data were statistically analyzed. As for the age, no significant differences (P>0.05) were observed among PCOS groups and controls. According to age group, higher prevalence of PCOS women was observed in age group with age range 21 - 30 years . The most of PCOS women were overweight and obese, and they had higher glucose levels. As for the infertility, infertile PCOS women were divided into two groups, PCOS women suffering from primary infertility (52.95%) and secondary infertility (47.05%). About 29.42% of PCOS women had abortion. Non significant differences (P>0.05) in duration of infertility between PCOS aborted vs. non aborted ones, and between primary and secondary. Higher prolactin level (P<0.05) was recorded in obese and overweight women, while non significantly differences (P>0.05) were recorded in FSH, LH, E2, and testosterone level among PCOS groups and controls. Higher homocysteine level (P<0.05) was observed in PCOS group with duration of infertility (≥9 years). Weak positive correlation was demonstrated between glucose with blood urea and glucose with serum creatinine. While negative weak correlation of glucose level with C - reactive protein level was recorded. Moreover, non significant differences (P>0.05) in urea, creatinine and C - reactive protein levels among fasting PCOS groups and control.In conclusion, the present study supported the association of PCOS cases with obesity, insulin resistance, and menstrual disturbances. Elevation of homocysteine levels related to insulin resistance and obesity in PCOS women. Hyperinsulinimic PCOS women had higher prevalence risk to develop type 2 diabetes mellitus. An elevation of prolactin level associated with obesity and overweight in PCOS patients

زيادة بعض مركبات الايض الثانوية لنبات الزيتون Olea europaea L باستخدام نترات الفضة النانوية والبولي اثيلين كلايكول خارج الجسم الحي == Increasing of some secondary metabolites of Olea europaea L. Using silver nitrate nano particle and polyethylene glycol elicitor In Vitro

Author name: وسن محمد موسى السويدي
Supervisor name: هاشم كاظم محمد
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The present study was conducted in the laboratory of plant tissue culture, Department of Biology, College of Science, University of Al - Mustansiriyah, in order to increase the production of some secondary metabolic compounds in callus induce from leave and shoot tips of Olea europaea L. in vitro.Secondary metabolites were estimated quantitatively and qualitatively using high performance liquid chromatography HPLC and compared with those in the mother plant.Callus was induced from leaf explants and cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulators including 2,4 - Dichlorophenoxy acetic acid 2,4 - D at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that ms medium containing 1 mg/l of 2, 4 - D gave the highest percentage of callus induction reached 50 % under light conditions, the highest callus fresh and dry weight were recorded 630,43.0mg at concentrations 1,2 mg/l 2,4 - D respectively.Shoot tips and Stigma cultured on MS medium containing different concentrations of growth regulatorsincluding Benzyl Adenine BA at the concentrations 0, 1, 2, 3 or 4 mg/l. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of shoot tips reached 80 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2534,552 mg at concentration 3mg/l BA respectively. Results showed that the medium containing 2 mg/l of BA gave the highest percentage of Stigma reached 40 % under light conditions, the highest fresh and dry weight were recorded 2070,404 mg at the concentration 4mg/l BA respectively.In order to increase theproduction of secondary metabolites, some elicitors were used including Poly Ethylene Glycol (PEG) at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 %, and silver nano particles AgNO3 NPs at the concentrations 0.0, 0.5, 1.0, 1.5 or 2.0 mg/l.Results showed that 1.5mg/l concentration of AgNO3NPs caused highly significant production in most of the secondary metabolites (Glycosides compound) of callus for Olea europaea L while 2mg/l concentrations of AgNO3 NPs caused highly significant production in some of the secondary metabolites (Glycosides compound) of shoot tips for Olea europaea L. Results showed that 2% concentration of PEG caused highly significant production of the secondary metabolites (Fenolic compound) of callus for Olea europaea L. while 1.5% concentrations of PEG caused highly significant production b in most of the secondary metabolites (phenolic compound) of shoot tips for Olea europaea L.

دراسة وراثية خلوية ومناعية وفسلجية للاجهاض التلقائي المتكرر == Cytogenetic, Immunological and Physiological study on recurrent spontaneous abortion

Author name: رنا صباح جواد
Supervisor name: عبد الامير ناصر غلوب | ناهي يوسف ياسين
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: الغرض الاساسي من هذه الدراسة الى التعرف على عوامل الخطر المشاركة في التسبب في RSA في النساء العراقيات. لتحقيق هذا الهدف، تم اختيار 75 امراة لتمثيل حالات RSA والسيطره. ثم صنفت النساء الى اربع مجموعاتالمجموعة الاولى : تشير الى النساء ذوات الحمل الطبيعي واللاتي انتهى حملهن بولادات طبيعي (15).المجموعه الثانيه : تشير الى النساء ذوات حمل طبيعي في الاشهر الثلاثه الاولى من الحمل (15).المجموعه الثالثه : مجموعة النساء اللاتي تعرضن للاجهاض خلال المرحلة الاولى من الحمل وكان هذا اول اجهاض لهن (15).المجموعة الرابعه : مجموعه النساء اللاتي تعرضن للاحهاض المتكرر في المرحلة الاولى من الحمل (30). تم جمع نموذج دم وعينه من المشيمه لكل امراة خلال الفترة من2012حزيران الى تموز 2013 في بغداد من مختلف مستشفيات بغداد (فاطمه الزهراء للولاده, مستشفى دجله ، مستشفى اليرموك العام). وقد اجريت الدراسات الكيميائية والمناعية على الفور بعد الحصول على المصل من عينات دم المرضى. واجريت الدراسات المناعية على عينات المشيمة التي تم الحصول عليها بعد الولادة الطبيعية او الاجهاض . واخيرا اجريت الدراسات الوراثية الخلوية باستخدام طريقة G - bandingدراسات حول تاثير العمر والاختلالات المرتبطه بالدم على الاجهاض المتكرر1. كان هناك زيادة في حالات الاجهاض مع عمر الام المتقدمة لاحظت في مجموعة الاجهاض المتكرر خلال الاشهر الثلاثة.2. اظهرت المعلمات الدموية بما في ذلك الهيموغلوبين، PCV، PLT، والكريات البيضاء اي تغير ملموس بين جميع الفئات باستثناء عدد الكريات البيضاء التي اظهرت انخفاضا طفيفا في مجموعات الاجهاض.واشارت التجارب على العوامل الهرمونية والوراثية ما يلي. 1 - كانت هناك زيادة ملحوظة في مستويات كل من LH, FSH في مجموعات الاجهاض وفقا لاعلى المستويات لاحظت في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل بالمقارنة مع مجموعات السيطره.2.انخفضت مستويات كل من β - HCG بشكل ملحوظ في مجموعات الاجهاض (P <0.001) مقارنة مع السيطرة. 3. اظهرت دراسات التعبير المناعى زيادة KISS1 في مجموعات الاجهاض 4 - كانت النتيجة النسيجية اعلى في مجموعة الاجهاض المتكرر (P <0.001) 5 - وكانت هناك زيادة في مستويات metastine في مجموعات الاجهاض (P <0 05.) مع اعلى المستويات في مجموعة الاجهاض الثلث الاول من الحمل . اجريت التحليلات الوراثيه الخلوية على عينات دم النساء المجهضات وقد كانت النتائج : ان زيادة الانحرافات الكروموسومات في الازواج مع التقدم في العمر (المجموعة الرابعة) وتشمل هذه التشوهات التبادل والحذف كما يلي : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del. | The fundamental purpose of this study was to identify the risk factors involved in the pathogenesis of RSA in Iraqi women. To accomplish that goal, 75 women were selected to represent cases of RSA and controls. Women then were classified into four groups : - Group I : refer to normal delivered pregnancy (n = 15) - Group II : refer to normal pregnant in first trimester (n = 15) - Group III : represented aborted women for the first time during the first trimester (n = 15) - Group IV : represented repeated aborted women during the first trimester (n = 30). Samples (sera and placenta) were collected during the period from July2012 to June 2013 in Baghdad. Chemical and immunological studies were performed on serum immediately obtained from patients’ blood samples. Immunohistochemical studies were performed on placental materials obtained after normal delivery. Cytogenetic studies were performed on patient’s blood samples using G - banding method.Studies on age and hematological abnormalities revealed the following1 - There was an increase in the incidence of abortion with advanced maternal age noticed in repeated abortion group during 1st trimester.2 - Hematological parameters including Hb, PCV, PLT, and WBCs showed no significant change between all groups except for the WBCs count that showed a slight decrease in abortion groups. Experiments on hormonal and genetic factors indicated the following.1 - There were a marked increase in levels of both LH and FSH in abortion groups with the highest levels noticed at 1st trimester abortion group when compared with control groups. 2 - Levels of both β - HCG and Prog were significantly decreased in abortion groups (P< 0.001) compared with the control. 3 - Immunohistochemical studies showed an increased expression of KISS1 gene in abortion groups.4 - Histological score was higher in repeated abortion group (P< 0.001) 5 - There was an increase in levels of metastine in abortion groups (P< 0. 05) with highest levels at 1st trimester abortion group.Assessment of the chromosomal abnormalities in RSA indicated that1 - An increased chromosomal abnormalities in couples with advanced age (group IV) and these abnormalities include translocation and deletion as follows : 46 XY,9qh+ ; 46 XX,21pss ; 46 XY, t(14,15) ; 46XY,14 pstk ; 46 XY ,15 pstk ; 45 XY, 3del.

التوزيع الزماني للفطريات الجلدية المسببة لداء السعفة وبعض طرائق السيطرة عليها == Temporal Distribution of Dermatophytic Fungi the Causative of Tinea Diseases and Some Control Methods

Author name: هيفاء سعدون عبد الوهاب الغراوي
Supervisor name: حمزية علي عجة الدليمي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:

تنقية وتوصيف انزيم Protease المنتج من بكتريا Burkholderia cepacia المعزولة محليا == Purification and Characterization of Protease Enzyme from Burkholderia cepacia Local Isolated

Author name: وســـد لطيف علوان
Supervisor name: سوسن ساجد محمد علي الجبوري | سامرة يونس يوسف
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت (165) عينه سريرية من مرضى مراجعين لمستشفيات في بغداد ، و(60) عينه بيئية من التربة والماء . شخص منها (3) عزلات فقط تابعة لبكتريا Burkholderia cepacia من العينات السريرية ، في حين لم تعزل البكتريا من العينات البيئية .استخدم للعزل اوساط زرعية مثل وســـــط اكار ماكونكي ، ووســـــــط اساس اكسدة تخمر المدعم بالبولي مكسين والباستراسين واللاكتـــوز فضلا عـــن الفحوصات المورفولوجية والكيموحيوية ، كما استخدمت العدد التشخيصية API 20E وAPI 20NE . اختبرت قابلية عزلات بكتريا B.cepacia لمقاومة المضادات الحيوية ، واظهرت العزلات الثلاثة مقاومة مشتركة متعددة لاغلب المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة ، سيما مضادات المجموعة الامينوكلايكوسيدية والتتراسايكلينات والكونيولينات والبيتالاكتام ، الا انها حساسة لمضاد الببراسلين . اظهرت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة ، امتلاك جميع العزلات القدرة على انتاج انزيمات الجلاتينيز والبروتييز واللايبيز والبيتالاكتاميز وعوامل السايدروفور، فيما افتقرت لقابلية تحلل الدم ، والبعض منها لانزيم اليورييز. اختبرت قابلية العزلات على انتاج انزيم البروتييز باستخدام وسط الاكار المغذي الحاوي على حليب الفرز (3%)، وتميزت العزلات الثلاث بقدرتها على انتاج الانزيم ، مع وجود اختلاف في الكفاءة ، مما ساهم في انتخاب العزلة المحلية SP1 B.cepacia المعزولة من عينة قشع بكونها الاغزر انتاجا للانزيم . حددت الظروف المثلى لانتاج الانزيم ، اذ كان وسط مرق نقيع القلب والدماغ، ذي الاس الهيدروجيني (7) ، والملقح بـ (106 ) خليه / مل مع الحضن لمدة (24) ساعة في (32) oم هي افضل الظروف لانتاج اكبر كمية من الانزيم . استخلص الانزيم بوساطة النبذ المبرد للمزروع البكتيري ، وتمت تنقيته باستخدام الترسيب بكبريتات الامونيوم بنسبة اشباع (60%) ، ثم استخدم كروموتوغرافيا التبادل الايوني باستخدام المبادل الايوني DEAE - Cellubose ، تلاها كروموتوغرافيا الترشيح الهلامي بهلام Sephadex G - 200 .اذ تم الحصول على انزيم منقى بفعالية نوعية بلغت (341.962 )وحدة/ ملغم وبعدد مرات تنقية (15.02 ) بحصيلة انزيمية (14.65 %)، وقد اظهر الانزيم حزمة بروتينية واحدة عند اجراء الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد تحت ظروف غير ماسخه . قدر الوزن الجزيئي باستخدام الرحلان الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود كبريتات دوديسيل الصوديوم وقد بلغ (300 .36)دالتن ، وكان الاس الهيدروجيني الامثل لفعالية الانزيم هو (6.5 ) ، في حين تراوح الاس الهيدروجيني الامثل لثبات الانزيم بين (6 - 8) ، وبلغت درجة الحرارة المثلى لفعالية الانزيم (45)م ، واحتفظ الانزيم بكامل فعاليته عند حضنه مدة (30) دقيقة في درجات حرارة (20 - 50 )م ، وفقد بحدود (83)% منها عند حضنه في (70) o م . اختبرت فعالية انزيم البروتييز المنقى بوجود بعض المواد الكيمياوية ، وتبين ان فعالية الانزيم تثبط كليا بوجود EDTA وSDS ،كما ان الانزيم تاثر قليلا بوجود المواد المختزلــــة مثل 2 - mercaptoethanol وCystein ، ولم يتاثر عند معاملته بمادة Phenyl Methyl Sulfonyl Fluride (PMSF)، وان فعالية الانزيم زادت بوجود ايونات الزنك والمغنسيوم ، وقلت هذه الفعالية بوجود ايونات الزئبق والنحاس مما يشير الى ان الانزيم من نوع البروتيزات المعدنية Metalloprotease . درست التغيرات النسجية لرئات ارانب حقنت عن طريق القصبة الهوائية بالانزيم ذو التركيز ( 0.1( ملغم/ مل و)0.2 ) ملغم / مل ، فكان له تاثير واضحا سيما التركيز الثاني، اذ لوحظ وجود خلايا التهابيه واحتقان دموي مع ضرر كبير للنسيج الرئوي . | Clinical samples (165 ) were collected from patients in some Baghdad hospitals , besid sixty ecological samples have been taken from soil and water. The results revealed that only three isolates from clinical samples were diagnosed as Burkholderia cepacia , while the isolation from ecological samples was not achieved . The isolation was done by using selective media ,morphological, biochemical tests and using diagnosis kits like API 20E and API 20NE. Antibiotic sensitivity test were carried out for B.cepacia .The results showed that the 3 isolates were multidrug resistant towards aminoglycosides ,Tetracyclines , Quinolones and β - lactams , but they were sensitive to pipracillin. The results for screening the virulence factors were showed that all the isolates have the ability to produce many enzymes such us gelatinase ,protease,lipase , β - lactamase and sidrophores but not haemolysin, and one isolate was urease producer. Isolates were tested for protease production using nutrient agar with 3% skim milk .The three isolates were protease producers in different efficiency and the local isolate B.cepacia SP1 (isolated from sputum )showed the highest ability of enzyme production. Optimum conditions revealed that brain heart infusion broth with initial pH(7),inoculum size(106 ) cfu/ml for (24) hours at (32)o C, were the best conditions for greatest amount production of enzyme. The enzyme was extracted by cooling centrifugation and was purified by ammonium sulfate precipitation (60% saturation) followed by ion exchange chromatography on DEAE - Cellulose ,then by gel filtration an Sephadex G - 200 .The purified enzyme had specific activity of (341.962)U/mg with (15.02)purification folds ,( 14.65% ) enzymatic yield and only a single band was observed by polyacrylamide gel electrophoresis under non denat - urating conditions. The molecular weight of the purified enzyme was estimated by using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. It was (36.300) Dalton .The optimal pH for enzyme activity was (6.5),while the optimal pH for enzyme stability was(6 - 8).The optimum temperature for enzyme activity was(45)0 C ,The enzyme was stable for (30)min. at (20 - 50)o C, and lost (83)% of it's activity at (70)oC. The purified protease activity was examined in the presence of some chemical substances .The enzyme activity was completely inhibited in the presence of EDTA and SDS, while it was little effected by 2 - mercaptoethanol and cysteine,on the other hand PMSF had no effect on enzyme activity .The enzyme activity was increased in the presence of zinc and magnesium ions ,but decreased in presence of mercury and copper ions. So the enzyme was from metallo protease type. The pathological changes, that studied for rabbits' lungs after intratracheal inoculation of purified protease, showed inflammantory cells in alveolar walls and extensive damage .

تاثير المستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus على بعض الخلايا السرطانية في الزجاج والحي == Effect of Water and Alcoholic Extracts of Mushroom Agaricus bisporus on some Tumor Cells In vitro and In vivo

Author name: وفاء فوزي ابراهيم الموسوي
Supervisor name: ناهي يوسف ياسين | هناء حنين منكلو
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صمم هذا البحث لدراسة التاثيرات السمية الخلوية للمستخلصين المائي والكحولي الخام للعرهون Agaricus bisporus في الزجاج in vitro وفي الحي in vivo في اثنين من الخطوط الخلوية السرطانية، هما خط خلايا سرطان الحنجرة البشري (Hep - 2) وخط خلايا سرطان الغدة اللبنية الفاري (AMN3) ، واظهرت النتائج ان التاثير السمي لكلا المستخلصين الخام اعتمد على التركيز المستخدم ومدة التعريض وذلك باستخدام خمسة تراكيز لكل منهما وهي 312.5) ، 625 ، 1250 ، 2500 ، (5000 مكغم/مل, كان للمستخلص المائي الخام تاثيرا معنويا باحتمالية (P≤0.01) على خط خلايا (Hep - 2) بعد 72 ساعة من تعريضها بالتراكيز المستخدمة وكانت اعلى نسبة تثبيط نمو عند التركيز (5000) مكغم/مل حيث بلغت %34.20، وبلغت نسبة تثبيط النمو الاعلى في خط خلايا (Hep - 2) للمستخلص الكحولي %60.27 ، وكانت نسبة تثبيط هذين المستخلصين الخام لخط خلايا (AMN3) ولنفس التركيز المذكور انفا %48.57 و%50 على الترتيب بعد مدة حضن 24 ساعة. في حين اوضحت نتائج تاثير المستخلصين الخام عند التركيز الاعلى (5000) مكغم/مل وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في عدد الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا لكل من خلايا (Hep - 2) بنسبة 46.44، %25.33 على التوالي و(AMN3) كانت النسبة 62.00، %46.01 على التوالي بالمقارنة مع السيطرة 18.01 ،11.45 % على التوالي.وبينت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام انخفاضا معنويا باحتمالية (P≤0.01) ولجميع التراكيز المستخدمة وهي 62.5) ، 125 ، 250 ، 1000 ، (2000 مكغم/مل في معامل الانقسام الخيطي Mitotic Index (MI) ومعامل التحول الارومي Blast Index (BI) للخلايا اللمفية للدم البشري ، في حين تبين ان كلا المستخلصين لم ينجحا بالعمل كعوامل مشطرة بديلا عن المادة المشطرة Phytohemagglutinin (PHA) , حيث انخفضت معدلات معامل (MI) و(BI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام الى (1.45،30.33) % على التوالي والمستخلص الكحولي الخام الى (0.86 ،26.79) % بالمقارنة مع السيطرة (913.،57.48) % على التوالي.وتضمنت الدراسة ايضا دراسة التاثيرات السمية للمستخلصين الخام في الحي التي شملت التاثيرات السمية الحادة والتي من خلالها حددت الجرعة المميتة الوسطية (LD50) في الفئران وهي 2842.73 ملغم/كغم و9248.33 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على الترتيب . في حين كانت نتائج التاثيرات السمية المزمنة باستخدام الجرع 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم/كغم و500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلصين المائي والكحولي الخام على التوالي داخل الخلب (IP) لمدة 30 يوما وبواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة كالاتي : اظهرت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام على خلايا نقي العظم في الفئران، التي تضمنت تاثيرها في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI)، ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في (MI) عند المعاملة بالمستخلص المائي الخام، في حين لم تظهر النتائج فرقا معنويا عند المعاملة بالمستخلص الكحولي الخام، سببت المعاملة بالمستخلصين الخام ارتفاعا معنويا واضحا في معامل التحول الارومي (BI) اعتمد على الجرعة. في حين لم تظهر النتائج اي تاثير معنوي في وزن الجسم للفئران المعاملة. وبينت النتائج ايضا وجود فروق معنوية باحتمالية (P≤0.01) في مستوى IFN -  في المصل ولجميع الجرع المستخدمة. كما اظهرت الدراسة النسيجية المرضية ان المستخلصين الخام لايمتلكان تاثيرا سميا في الكبد والكلية والطحال عند المعاملة بالجرع الثلاثة لكل منهما حيث اظهر الفحص ارتشاحا للخلايا الالتهابية في الانسجة الماخوذة. في حين لم تظهر المعاملة بالمستخلصين الخام فروقا معنوية في عملية البلعمة بالمقارنة مع السيطرة. اعطت نتائج التاثير العلاجي للمستخلصين الخام في الفئران المغروسة بسرطانة الغدة اللبنية الفاري (AM - 3) باستعمال جرع علاجية ثلاثة هي 333.3) ، 500 ، (666.6 ملغم /كغم للمستخلص المائي والجرع 500) ، 1000 ، (1500 ملغم/كغم للمستخلص الكحولي وذلك عن طريق الحقن داخل الخلب Intra - Peritoneum (IP) لمدة 30 يوما بواقع جرعة واحدة كل 48 ساعة فعالية علاجية في اختزال حجم الورم بشكل يعتمد على الجرعة المستخدمة منها. كانت الجرعة العلاجية للمستخلص المائي (666.6) ملغم/كغم هي الافضل تاثيرا من خلال تثبيطها لحجم الورم بنسبة بلغت %87.10 . اما المستخلص الكحولي فكانت الجرعة العلاجية الافضل هي (500) ملغم/كغم بنسبة تثبيط لحجم الورم بلغت %87.93. ان مقارنة حجم الورم النسبي لمختلف المجاميع العلاجية يوضح الفروق المعنوية الكبيرة بين هذه المجاميع ومجموعة السيطرة . كما اظهرت نتائج المعاملة بالمستخلصين الخام زيادة معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا في الحي in vivo كانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01).اوضحت نتائج التاثيرات السمية للمستخلصين الخام لجميع الجرع المستخدمة ارتفاعا معنويا (P≤0.01) في وزن الجسم للفئران الحاملة لسرطانة الغدة اللبنية الفاري وفي مستوى الانترفيرون كاما IFN - .بينت نتائج المعاملة بالمستخلص المائي والكحولي الخام للفئران الحاملة للورم وجود انخفاض معنوي (P ≤ 0.01) في معامل الانقسام الخيطي (MI) ومعامل التحول الارومي (BI) لخلايا نقي العظم بالمقارنة مع السيطرة.بين الفحص النسيجي لورم سرطانة الغدة اللبنية الفاري والمعالج بالمستخلصين الخام ولجميع الجرع المستخدمة وجود نسيج ليفي يحيط ببقايا الورم مرتشح بعدد هائل من الخلايا الالتهابية مع ظهور تنخر واسع داخل الورم. في حين اوضحت نتائج فحص الكيمياء النسيجية المناعية لكتلة الورم زيادة في معدل الخلايا التي عانت موتا خلويا مبرمجا وكانت هذه الزيادة معنوية باحتمالية (P≤0.01). وقد اوضح الفحص النسيجي للاعضاء (الكبد، الكلية، الطحال) للفئران المغروسة بالورم والمعاملة بالمستخلصين الخام عدم وجود خلايا منبثة لتلك الاعضاء ووجود ارتشاح للخلايا الالتهابية في الكبد والكلية، في حين اظهر الطحال تنسجا في خلاياه وتوسعا في اللب الابيض مع وجود الخلايا المولدة للصفيحات الدموية ووجود صبغة الهيموسدرين. | This research was designed to study the effect of water and alcoholic crude extracts of Agaricus bisporus in vitro and in vivo. Cytotoxic effect of different concentrations (312.5, 625, 1250, 2500, 5000) of these extracts was investigated by using tumor cell lines, murine mammary gland carcinoma (AMN3) and Human epithelial cell carcinoma of larynx (Hep - 2). The results showed high significant differences (P ≤ 0.001) cytotoxic effect in dose - dependent manner for both watery and alcoholic extracts particularly at the higher concentration 5000 µg/ ml of both extracts showed cytotoxic effect on (Hep - 2) cell line after 72 hour incubation in which the growth inhibition became 34.20% and 60.27% respectively. Similarly these extracts showed cytotoxic effect on (AMN3) cell line, but after 24 hour incubation, in which the growth inhibition was 25.54% in those treated with water extract at concentration of (5000) µg/ml, and 42.64% in those treated with alcoholic extracts at the same concentration. Water and alcoholic extracts at the highest concentration (5000) µg/ml revealed significant apoptotic effect in each of (Hep - 2) cell line (25.33, 46.44% respectively) and (AMN3) cell line (46.01, 62.00 respectively) in comparison with those of non treated (11.45, 18.01). This study also investigated significant effect (P≤0.01) of both extracts at different concentrations (62.5, 125, 250, 500, 1000, 2000) µg/ml on the mitotic index (MI) and blast index (BI) of PHA - induse human peripheral lymphocytes In vitro. The result revealed significant inhibitory effect (P≤0.01) in dose - dependent manner, in which water extracting highest dose reduced the (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (1.45, 30.33%) in treated lymphocytes respectively, while alcoholic extract reduced (MI) and (BI) from (3.91, 57.48 %) in control down to (0.86, 26.79 %) in treated lymphocytes respectively. On the other hand this study tested the toxic effect of both extracts in normal laboratory mice. The results showed that water and alcoholic extracts relatively have an acute toxic effect in mice in respect to LD50 (85.282 mg/kg, and 277.45 mg/kg respectively). However the chronic toxicity of water extract at three different concentration (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) was investigated in normal mice by (I.P) administration for 30 days alternatively. The results indicated significant effect (P ≥ 0.01) increasing in (MI) and (BI) of bone marrow cells and serum IFN -  level, but with no significant effect on body weight and histological changes in some internal organs (liver, kidney, spleen). Therapeutic effect of both extracts was studied in tumor - bearing mice after (I.P) administration of watery extract at concentrations of (333.3, 500, 666.6 mg/kg) and alcoholic extract at concentrations of (500, 1000, 1500 mg/kg) for 30 days alternatively. The results revealed significant reduction in the tumor volume weather in those treated with watery extract 87.10%, or those treated with alcoholic extract 87.98%, particularly at the concentration of 666.6 mg/kg and 500 mg/kg respectively. Also both extract caused inhibitory effect in each of (MI) and (BI), however they should significant increase (P ≥ 0.01) in the serum level of IFN -  and body weight. Histopathological study showed necrosis and infiltration of inflammatory cells encapsulated tumor mass by fibrous tissue , while the immunohistochemistry demonstrated significant (P≥0.01) apoptotic effect in the tumor cells in those treated with water or alcoholic extract. However, histopathological study of internal organs in tumor - bearing mice treated with water or alcoholic extract revealed no metastasis of cancerous cells in these organs, but inflammatory cells had detected infiltrated in both liver and kidney, while the spleen was enlarged with extractivation of the white pulp and Megakaryocytes

الفعالية الضد البكتيريه لبولي مثيل ميثاكريلات والحشوة والمواد الكيميائية الجديدة ضد Streptococcus mutans المعزولة من تسوس الاسنان == Antibacterial activity of poly methylmethacrylate, Amalgam and some new chemicals against Streptococcus mutans isolated from dental caries

Author name: هيبت ماهر عباس التميمي
Supervisor name: سوزان سعدي حسين الروزنامجي
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ان بكتريا المكورات العقدية الطافرة Streptococcus mutans هي واحدة من المجموعات البكتيرية المسببة الرئيسية لتسوس الاسنان عند البشر من خلال انتاجها وقدرتها على تحمل الحوامض. ولها القدرة على تشكيل واستخدام وتخزين السكريات اضافة الى افرازها السكريات الغير قابلة للذوبان خارج الخلية البكتيرية. في هذه الدراسة تم عزل 13 عزلة من بكتيريا المكورات العقدية الطافرة من مجموع 25 عينة من تسوس الاسنان لناس تتراوح اعمارهم من 10 الى 30 سنة. شخصت هذه البكتيريا حسب الصفات المظهرية لشكل المستعمرة في الوسط الزرعي الملائم لنموها وهو Mitis Salivarius Bacitracin (الذي يحتوي على 20 ٪ سكروز و0,2 وحدة/مل باسيتراسين)، وبعد حضن المزرعة البكتيرية في جو من النيتروجين 95 ٪ و5 ٪ ثاني اكسيد الكربون في 37 درجه مئوية لمدة يوم الى يومين باستعمال شمعة او كيس غازي. اظهرت هذه العزلات البكتيرية بانها موجبة لصبغة غرام وتكون مترتبة على شكل سلاسل قصيرة او متوسطة، غير متحركة، وسالبة لفحص الكاتاليز، وبعد تاكيد تشخيص البكتريا بجهاز VITEK سجلت النتائج الاتية : بعد دراسة فحص حساسية البكتريا للمضادات الحيوية بطريقة اانتشار القرص حيث اظهرت النتائج ان العزلات البكترية حساسة 100 % الى المضاد الحيوي الازثرومايسين . درست حساسية هذه البكتريا تجاه بعض المواد الكيميائية المختارة : Azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide, Potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate.تمت دراسة الفعالية البايولوجية لهذه المواد بطريقتي الانتشار بالحفر والتخفيف بالمرق واظهرت النتائج ان المضاد الحيوي الازثرومايسين فعال جدا ضد هذه البكتريا بكلتا الطريقتين. اما المواد الكيماوية المختارة فقد اظهرت حساسيتها تجاه البكتريا 100 % وبعض منها اظهرت عدم فعاليتها مثل : L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide.اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate اكبر منطقة تثبيط لهذه البكتيريا عند مقارنتها مع المواد الكيمياوية الاخرى بطريقة الانتشار بالحفر. وتم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة بطريقة التخفيف بالمرق وكانت بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2 ×10 - 3 M بالتعاقب .اظهرت البكتريا 100 % حساسية لجميع الحشوات بكلتا الطريقتين عند اضافة الازثرمايسين الى الحشوة بتراكيز مختلفة (من 0.8 الى 25 ملغم لكل كبسولة), في حين اظهرت مادة potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate المضاف الى الحشوة فعالية عند كمية 10 ملغم لكل كبسولة .تم قياس تراكيز الحد الادنى للتثبيط والحد الاعلى للقتل للمواد الكيميائية المختارة والمحملة في راتنج متعدد مثيل ميثا اكريلايت بطريقة التخفيف بالمرق واظهرت القيم بالشكل التالي : Zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively. | Streptococcus mutans is one of the major causative bacterial groups in human dental decay by producing acids, aciduric potential, formation and utilization of storage polysaccharides and formation of insoluble extracellular polysaccharide. In the present study 13 isolates of Streptococcus mutans were collected from 25 samples taken from volunteers within the ages of 10 - 30 years. Diagnosis of Streptococcus mutans was obtained according to the colony morphology, Gram stain, biochemical test and Vitek 2 system. That were showed the bacterium was gram positive cocci in short or medium chain, non - motile, catalase negative, facultative anaerobes and grow easily on Mitis Salivarius Bacitracin Agar (MSBA) at concentrations (20 % sucrose and 0.2units/ml bacitracin) and then incubation in an atmosphere of 95 % nitrogen and 5 % carbon dioxide at 37º C for one to two days by using candle jar or the gas pack. After diagnosing the bacterium, the following results were obtained : By studying Streptococcus mutans susceptibility's to azithromycin antibiotic by Disk diffusion method (Kirby Bauer test), the results showed that all the local bacterial isolates were sensitive 100% to azithromycin. The sensitivities of these bacteria against selected chemicals (azithromycin, zinc oxide NPs, phenytoin B.P, L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, adipic acid dihydrazide and new selected chemicals potassium L - proline dithiocarbamate, potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate were studied by well diffusion and broth dilution methods. The results showed that the azithromycin was very strong bactericidal effect by both methods, and the other selected chemicals showed the sensitivities of Streptococcus mutans were 100 %, while L - proline, oxalic acid dihydrazide, succinic acid dihydrazide, and adipic acid dihydrazide showed no significant antibacterial activity.The potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the largest inhibition zone compared to the other selected chemicals by well diffusion method. The measured MIC and MBC of the selected chemicals by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 5, 10 mg/mL; phenytoin B.P, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; potassium L - proline dithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3 M; potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 0.5×10 - 3, 1×10 - 3 M; potassium succinic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1×10 - 3, 2×10 - 3 M; and potassium adipic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 2×10 - 3, 3×10 - 3M respectively. Streptococcus mutans local isolates showed 100 % sensitivity towards azithromycin, which was loaded to the amalgam components with varying concentrations (0.8 to 25 mg per capsule) by both methods, while potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate showed the highest antibacterial effect at an amount higher than 10 mg per capsule. The measured MIC and MBC of the selected chemicals loaded on PMMA resin by broth dilution method showed the following values : zinc oxide NPs, 30, 40 mg/mL; phenytoin B.P, 2.5, 5 mg/mL and potassium oxalic acid dihydrazide bisdithiocarbamate, 1.25, 2.5 mg/mL, respectively.

دراسة بعض المؤشرات الفسلجية والمايكروبية المرافقة للعقم الذكري في مدينة اربيل == The Study of Some Physiological and Microbial Parameters Associated With Male Infertility in Erbil City

Author name: هونر عثمان اسماعيل
Supervisor name: عدنان صالح الجنابي | رعد خليل الحسيني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تشخيص بعض العوامل المرضية الخفية ذو علاقة بالعقم الذكري من رجال عقيمين يراجعون مركز علاج العقم ومركز اوات لرعاية مرضى العقم في مدينة اربيل. انجز العمل في المدة من شهر حزيران 2005 الى شهر حزيران 2008.اختير (250) رجلا عقيما من دون اعراض سريرية بصورة عشوائية لغرض تقييم بعض التغيرات المايكروبايولوجية والمناعية والهرمونية والكيموحيوية في السائل المنوي. تضمنت مجموعة السيطرة 50 رجلا خصيبا ممن لديهم طفل واحد او اكثر اوممن كانت زوجاتهم في حالة الحمل اثناء مدة الدراسة. كان معدل اعمار مجموعة العقيمين (±6.1 33.8) (معدل ± الانحراف القياسي)سنة، بينما سجلت (6.25 ±33.31) سنة لمجموعة الخصيبين وكان معدل فترة العقم (0.04 ± 48.5) سنة. وكانت كلتا المجموعتين من دون اعراض التهاب المجاري البولية - التناسلية، وقد اخذت منهم عينات من السائل المنوي وبلازما السائل المنوي ومصل الدم لغرض عمل الفحوصات عليها.فحصت عينتان للسائل المنوي ومن ثم تم الحصول على معلومات تفصيلية تخص التاريخ المرضي وحالة الجهاز التناسلي لجميع حالات الدراسة، وصنف مرضى العقم على ثمانية مجموعات استنادا للتغيرات الحاصلة في السائل المنوي. وقد اظهرت النتائج ان نسب الاصابة كانت عالية في 51 حالة لمرضى العقم غير المفسر Idiopathic بنسبة (20.4%), وتليها 44 حالة للمرضى ممن يعانون من وهن وتشوهات النطف Asthenoterato - zoospermia بنسبة (17.6%)، بينما سجلت 18حالة لانعدام النطف Azoospermia بنسبة (7.2%) كحد ادنى للاصابة. وعند تقييم الصفات الفيزيائية للسائل المنوي ظهرت اختلافات معنوية بمستوىP<0.0001) وp<0.001) بين مجموعة العقيمين مقارنة بالخصيبين.اظهرت نتائج الدراسة فروقات احصائية معنوية لمختلف العوامل النوعية للسائل المنوي (التركيز, الحركة, الاشكال السوية، نسبة التكتل للنطف، ونسبة كريات الدم البيضاء) بين مجاميع العقيمين انفسهم مقارنة معها للخصيبين. وظهرت معدلات العوامل الوظيفية للنطف (الحيوية, الغشاء الازموزي، ومستويات تركيز الفركتوز) ذات فروقات معنوية عند العقيمين مقارنة بالخصيبين ايضا, باستثناء حالات انعدام النطف اذ سجلت مستويات نسب تركيز عالية لسكر الفركتوز.تبين من نتائج زرع المني هوائيا ولاهوائيا ان 77 عينة موجبة بنسبة (30.8%) كانت للمرضى الذكور العقيمين مقارنة بــ 7(14% ) للخصيبين وبفرق معنوي (P<0.01). من بين اكثر العزلات البكتيرية الهوائية واللاهوائية الاختيارية عزلت 15 عزلة من Enterobacter sp. بنسبة (6%) ووجدت Esherichia coli في 11 (4.4%) من المرضى العقيمينProteus, vulgaris 7عزلة (2.8%) وProteus mirabilis 4عزلة (1.6%) وStaphylococcus aureus 8 عزلة (3.2%) وPseudomonas aeruoginosa 6 عزلة (2.4%) وKlebsiella pneumoniae 2عزلة (0.8%) وHaemolytic streptococci 9عزلة (3.6%) وEnterococcus faecalis 10عزلة (3.7%) وStaphylococcus albus عزلة واحدة (4%) وNeisseria gonorroheae 2عزلة (0.8%). اما بالنسبة للعزلات اللاهوائية عزلت 5عزلات من Peptostreptococcus sp. بنسبة (2%) و.Bacteroides sp 3عزلة (%1.2). سجلت الدراسة الحالية ايضا فروقات معنوية عالية (p<0.001 and P<0.0001) لمعظم العوامل النوعية للمني بين مرضى عقيمين مصابين باصابات بكتيرية والمقترنة بازدياد نسبة كريات الدم البيضاء والنسبة المئوية لتكتل النطف.اظهرت نتائج الدراسة وجود علاقة معنوية موجبة وسالبة بين العوامل النوعية للنطف مقترنة بوجود اضداد النطف(ASAs), وانواع الاوكسجين المفتعل (ROS) واضداد من الصنف IgG وIgA لجرثومة كلاميديا واضداد CMV من صنف IgG. فيما يتعلق وجود اضداد النطف وانواع الاوكسجين المفتعل, اظهرت النتائج زيادة معنوية عند المستوى (P<0.001) في نسب هذه العوامل بمرضى العقم المصابين مقارنة بغير المصابين.تبين ان عيارية عالية للاجسام المضادة لجرثومة الكلاميديا Chlamydia trachomatis من صنفIgG وIgA وبنسب(15.55%)و(9%) في مجموعة العقيمين مقارنة بنسب (6.6%)و(4.5%) في مجموعة الخصيبين وعلى التواليز سجلت عيارية مصلية موجبة للاجسام المضادة لفيروس CMV من صنف IgG في مصول 8 عقيمين وبنسبة ( 17.8% )، وسجلت نسبة 3(.5%4) نتيجة موجبة للخصيبين وبوجود فرق معنوي (P<0. 01)، بينما اعطت 2حالة بنسبة (4.8%) نتيجة موجبة لفحص تلازن الدم لجرثومة Treponema pallidum (TPHA) المطبق لكشف الاجسام المضادة لهذه البكتريا في مرضى العقيمين.كشفت هذة الدراسة ان اصابة المني بالميكروبات كانت نتيجة لاصابة الجهاز البولي - التناسلي في الذكور العقيمين والتي غالبا ما يصاحبها انخفاض في خصائص المني مع ازدياد نسب كريات الدم البيضاء لديهم مقارنة بالخصيبين بوجود فروقات معنوية. وجدت النتائج فحص حساسية المضادات الحيوية بان من بين اكثر المضادات الحيوية تاثيرا على البكتيريا المعزولة من السائل المنوى كانت ريفامبسين(RA) وسيبروفلوكاسيلين(Cft )وحمض ناليدكسيك (NA) وتترسايكلين (Ts) على التوالي ، بينما لوحظت بان المضادات الحيوية امبيسيلين (AMP) وبنيسيلين (P) كانت غير فعالة على غالبية العزلات البكتيرية. تم تنشيط النطف خارج الجسم الحي اذ وجدت فروقات معنوية في معظم العوامل النوعية للمني قبل التنشيط بالمقارنة معها بعد التنشيط ، واثمرت نتائج التنشيط والتلقيح داخل الرحم في حالتين للحمل الناجح بعون الله. ظهرت بان الاصابات البكتيرية والفيروسية مقترنة بوجود ( اضداد النطف, انواع الاوكسجين المفتعل, ازدياد كريات الدم البيضاء والحيوية الواطئة للغشاء الازموزى للنطف)و التغيرات الاخرى الحاصلة في العوامل الكيموحيوية لها تاثير ذواهمية في خصوبة الرجال. | The present study aimed to diagnose some important underlying etiological factors related to male infertility in infertile men who attended to infertility treatment centre and Awat center for infertility care in Erbil city. This work was carried out during a period from July, 2005 to July, 2008. A total of two hundred and fifty asymptomatic infertile men were randomly selected to evaluate some microbiological, immunological, hormonal and biochemical changes in their seminal fluid. The control group included 50 fertile men who have one or more children or their partners were pregnant during the investigation. The mean age of infertile was (33.86.1) (MeanStandard Error) years while the mean age of fertile group was (33.316.25).The mean duration of infertility was (8.540.04) years, the two groups were without signs and symptoms of urogenital tract infections, the semen, seminal plasma and blood serum were collected from both groups for the purpose of investigations. Average two semen analyses, a detail questionnaire on reproductive and medical history were obtained from each subjects of the study. The infertile men were classified into (8) groups based on the evaluation of seminal fluid changes, and the results showed a high percentages incidence of Idiopathic 51(20.4%) followed by Astheno - terato - zoospermia 44(17.6%) whereas Azoospermia 18(7.2%) is reported as a minimum incidence. The evaluation of physical semen characteristics (appereance, viscosity and volume) have shown highly significant differences (p<0.001 and P<0.0001) in the infertile groups compared to fertile men.The current data also showed statistical differences in percentage mean values of the various semen quality parameters (sperm concentration, motility, grade activity, sperm morphology, agglutination and leukocytes) firstly among groups of infertile men and secondly compared with the control group. Sperm function parameters (viability, Hypo - Osmotic Swelling Test (HOST) and fructose concentration) showed significant differences in mean values in infertile groups compared with controls, except in Azoospermia the concentration of fructose has recorded high percentage levels. Aerobic and anaerobic culture results of bacteria have clarified 77(30.8%) positive semen isolates among the infertile men compared with 7(14%) isolates for the fertile with significant differences between the two groups. The most frequently aerobic and facultative isolates are Enterobacter sp. 15(6%), Escherichia coli which is found in 11(4.4%) infertile men, other bacterial isolates with their percentages are Haemolytic Streptococci 9(3.6%), Staphylococcus aureus 8(3.2%), Proteus vulgaris 7(2.8%), Pseudomonas aeruginosa 6(2.4%), Proteus mirabilis 4(1.6%), Enterococcus faecalis 4(1.6%), Klebsiella pneumoniae 2(0.8%), Neisseria gonorrhoeae 2(0.8%) and Staphylococcus albus 1(0.4%) respectively. For anaerobic isolates Peptostreptococcus sp. 5(2%) and Bacteriodes sp., 3 (1.2%) were isolated.The current study reported highly significant differences (P<0.001 and P<0.0001)in most of semen quality parameters between non - infected and infected infertile men who have positive bacterial cultures and accompanied with leukocytospermia and high percentages of sperm agglutination. Data have also appeared negative and positive significant correlations between different semen quality parameters and the presence of Antisperm Antibodies (ASAs), Reactive Oxygen Species (ROS), Chlamydia class IgA and Cytomegalovirus class IgG antibodies. Regarding the presence of ASAs and ROS, data demonstrated significant increases (P<0.001) in percentages of these parameters in infected infertile men compared with non - infected groups. The positive optical densities for Chlamydia trachomatis class IgG and IgA antibodies have reported 15.55% and 9% in infertile groups compared with 6.6% and 4.5% for fertile controls respectively. Sero - positive results for Cyatomegalovirus (CMV) class IgG antibodies showed 8(17.8%) high positive titers for infertile men whereas, 3(6.66%) high positive titers are reported among fertile men with significant differences (P<0.01) between the two groups. Treponema Pallidum Haemagglutination (TPHA) test have appeared only two positive titers (4.5%) in order to detect antibodies for Treponemea pallidum in infertile patients. The results(of the study) revealed that the microbial infections of the seminal fluid is regarded as a result of urogenital tract infections are mostly associated with reduced semen parameters and leukocytospermia in infertile compared with fertile men, with significant differences (p<0.01). The results of the in vitro antibiotic sensitivity test showed that the most effective antibiotics on seminal bacterial isolates were Rifampicin (RA), Ciprofloxacillin (Cft), NalidixicAcid (NA) and Tetracycline (Ts) respectively ;whereas, the Ampicillin (AMP) and Penicillin (P) noted to be highly ineffective on most bacterial isolates. The in vitro sperm activation showed significant differences in most of semen quality parameters pre and post activation, fortunately the IUI outcome has recorded two successful pregnancies after God will. It was appeared that bacterial and viral infections associated with the presence of ASAs, ROS, Leukocytospermia, abnormal HOST and other biochemical changes have important effects on male fertility

تاثير التلوث بالمواد العالقة بالهواء واثره على البيئة == THE IMPACT OF POLLUTION ON THE SUSPENDED AIR PARTICLES AND THEIR EFFECT ON ENVIROMENT

Author name: يسرى بدري نوري الحسيني
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تناولت هذه الدراسة عدة مواقع من مدينة بغداد في جانبي الكرخ والرصافة، اذ كان الاختيار على اساس الكثافتين المرورية والسكانية، والتي يتمخض عنهما مخلفات حرق الوقود المضاف اليه رابع اثيلات الرصاص وحرق القمامة الناتجة من الفعاليات البشرية المختلفة، مصدرا للتلوث. لذا اجريت هذه الدراسة بهدف تسليط الضوء على العناصر الملوثة (الكادميوم، النيكل، الرصاص، الحديد) كملوثات للمنظومة البيئية (تربة - نبات). من خلال تقدير هذه العناصر كما ونوعا في نباتات وترب الدراسة، مع الاخذ بالحسبان التغيرات الفصلية. جرى اعتماد النباتات المعمرة الدفلة Nerium oleander والزيتون Olea europea والنخيل Phoenix dactylifera والترب المزروعة فيها مادة لهذه الدراسة، اذ قيست تراكيز هذه العناصر في الاوراق النباتية المغسولة وغير المغسولة لفصلي الشتاء والصيف وما بعد المطر ومعرفة اي من هذه الحالات الاكثر امتصاصا، كما قيست الكميات المتجمعة من العوالق على اسطح تلك الاوراق بالمقارنة مع مساحة سطح الورقة ومعرفة اي الانواع الاكثر تجميع هذا من جانب، ومن جانب اخر قيست هذه العناصر المرتبطة بمكونات التربة ذات المساحة السطحية العالية (الطين، المادة العضوية، اكاسيد الحديد، كاربونات الكالسيوم ) بطريقة الاستخلاص المتعاقب ومقارنة قيمها بقيم التواجد البيدوكيميائي الطبيعي له في التربة. اظهرت نتائج الدراسة الحالية ما ياتي : 1 - ان اوراق نباتات النخيل كانت الاكثر تجميعامن حيث كمية الدقائق العالقة على سطح الورقة، تلى ذلك اوراق نبات الدفلة والزيتون. 2 - كان تركيز عناصر الدراسة في اوراق النباتات المغسولة اقل مما في غير المغسولة اذ سجلت تراكيز العناصر في اوراق النباتات المغسولة الترتيب الاتي بعد المطر > فصل الشتاء > فصل الصيف، ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر سلوكا مختلفا عن بقية العناصر وكما في التسلسل الاتي فصل الصيف > بعد المطر > فصل الشتاء.3 - شكلت تراكيز عناصر الدراسة في اوراق الزيتون غير المغسولة اعلى قيما من بين عناصر الدراسة فيما سجلت اوراق نبات الدفلة القيم الاعلى من تراكيز هذه العناصر في الاوراق المغسولة. 4 - دلت تحريات التربة وتحاليلها على الالفة العالية لجميع عنلصر الدراسة مع مفصول الطين ما عدا عنصر الحديد الذي اظهر ميلا شديدا للارتباط مع الاكاسيد الحرة ( الحديد والالمنيوم ). 5 - بينت المقارنة البيدوكيميائية لقيم عناصر الدراسة مع القيم الاصلية لها ان عنصري الكادميوم والنيكل لم يتجاوزا الحد المسموح بالتلوث فيما تجاوز ذلك كل من عنصري الرصاص والحديد. | This study deals with many sites in Baghdad, both Karh and Russafa. The choice of theses sites are according to the traffic and residential density, which result wastes from burning the fuel that contains lead Tetra ethelate and the burning of garbage that result from human activities and other pollution resources. This study is made to shed light on the polluted elements (Cadmium, Nickel, Lead and Iron) as causers of pollution to environment (soil - plant), through estimating these elements quantitively and qualitatively in the soils and plants of the study, with taking into consideration the seasonal changes.The long - lived plants are regarded in the study like Nerium Oleander, Olea europea and phoenix dactylifera and the soil of plantation.The concentrations of these elements in washed and non washed plants leaves in winter and summer seasons and after rain falling are measured to know which one is the most absorptional. The quantities of suspended particles on leaves surface are measured to be compared with the leave's area and to know which one is the most precipitated.On the other hand, these elements that are bounded with soil components of specific high surface area (clay, organic matter, Iron oxide) calcium carbonate) are estimated by sequence extraction, and comparing their values with the Bedochemical values in the soil.The study reaches the following results : 1. The leaves of palm - date is the most accumulated of the suspended particles amount on leave surface, then Nerium and olive respectively.2. The concentration of the study elements is on higher level in the washed leaves rather than the non - washed leaves. It is reported that the elements in the washed leaves are as the following sequence post - rain> winter> summer, except for Fe which has different behavior as in this sequence summer> post - rain> winter. 3. Nerium shows the higher concentrations of the elements in the washed leaves, while olive shows the higher concentrations of these elements in non - washed leaves.4. The soil investigation of the study indicates that all elements of the study have high binding with the clay except for Fe which has great tendency to be bounded with free oxides (Iron and Aluminum).5. The Petrochemical comparison of the values of cadmium and nickel do not exceed the boundary of pollution while iron and lead do

دراسة تصنيفية وجزيئية لثمانية انواع من العقارب Scorpions Arachnida : Scorpiones في بعض مناطق العراق == Taxonomic and Molecular Study for Eight Species of the Scorpions (Arachnida : Scorpiones) in Some Areas of Iraq

Author name: زينة نبيل نصيف العزاوي
Supervisor name: صباح فرج عبد الاحد
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Invertebrates
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The study was including two sides : taxonomic description and genetic, for One hundred of scorpions were collected from different parts from central and southern provinces of Iraq (Baghdad, Diyala, Salahuddin, Karbala, Wasit, Najaf, Qadisiyah, Dhi Qar and Basra). The taxonomic side was included using eighty six samples to study the external characteristics in addition to make some specific measurements to length of the samples, while the results of the taxonomic study showed large variation in the external characteristics as well as present of differences in the measurements which were taken among members of the same species. The results showed obtaining from eight species five recorded previously in Iraq and described for first time and three species recorded and described for the first time in Iraq, as well as reordered new species discovered at first time in world . The study has been including set diagnostic key to isolation the species in addition to determinate diagnostic characterization for each type supported by illustrative photography as follows : 1 - Family : Buthidae ( 74 sample) a) - Androctonus crassicauda ,Olivier,1807,(49 sample)b) - Compsobuthus iraqensis ,sp.nov,Vachon,1949,(1 sample)c) - Hottentotta zagrosensis , Kovarik,1997(3 sample)d) - Hottentotta judaicus ,Simon,1872,(1 sample)e) - Mesobuthus eupeus ,Koch,1839,(17 sample)f) - Othochirus scrobiculosus ,Grube,1873,(3 sample) ,2 - Family Bothriuridae( 2 sample)a ) - Bothriurus nendai ,Affilastro and Mauro,2010, (2 sample)3 - Family Scorpionidae( 10 sample)a) - Scorpio maurus ,Linnaeus,1758(10 sample)* Genus and species were recorded previously in Iraq, and they were described for the first time in Iraq. Species was new recorded in Iraq, and it was described for the first time in Iraq.*** Species was new recorded in Iraq and the world, and it was described for the first time in Iraq and the world.The genetic study was included used fifteen samples of scorpions which collected from different regions at the provinces of central and southern Iraq (Baghdad, Diyala, Dhi Qar, Najaf, Qadisiyah, Basra). On this side was utilized a technology polymerase chain reaction (PCR) for the purpose of finding genetic diversity between the species and for the detection of the relevant document types with each other on gene 1 Cytochrome Oxidase (CO1) which present on the piece of DNA mitochondria (mtDNA) and extract from the pair III and IV of the legs and by present of a pair of specialized primers (ZCO1, NCO1). The results are displayed on one band for eight samples out of fifteen sample and the same level and the molecular weight of 1057 base pairs of the primer (ZCO1), but appearance just two bands for two samples of scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus which collected from provinces Baghdad and Najaf at the same level and molecular weight 793 base pairs of the primer (NCO1).The sequence sequential of nitrogen bases was conducted for two samples which they scorpions Androctonus crassicauda and Scorpio maurus when used primers ZCO1 and NCO1 after amplification of the DNA piece by using PCR reaction device that contains a gene CO1 located in mitochondria. The results of primer ZCO1 and sequence nucleotides in Iraqi samples indicated present of many variations in the gene under study compared with standard samples and registered on Gen Bank site (NCBI) where found a case of polymorphism resulting from mutations replacement of Substitution genetic for the sequences nucleotides of the primer and by up to 23.9% and 24.3% respectively as the highest proportion especially at the base of nitrogenous T→C and the lowest rate of 2.8% and 5.4% of the substitution nitrogenous base A→T and nitrogenous base G→A respectively.When using primer NCO1 and their sequence nucleotides to scorpion sample Androctonus crassicauda that belong to Buthidae family noticed lack of match in the gene with samples recorded at NCBI site. While no similarity found in scorpion sample Scorpio maurus that belong to Scorpionidae family when used anterior direction for primer NFCO1 with recorded samples in NCBI site. While used posterior direction for primer NRCO1 for same sample was observed numbers of mutations compared to the recorded sample on NCBI site including substitution genetic mutations of sequences nucleotide gene and especially at the base of nitrogenous C→T and T→C at percentage 22.9% as the highest percentage. The nitrogenous base A→T recorded lower percentage in 2.0% and the twonitrogenous bases C and A in 2.0%, which represents deletion mutation in the nucleotide sequence of Iraqi sample. This differences give a significant advantage to the Iraqi samples that represented two species Androctonus crassicauda and Scorpio maurus compared with registered samples in the world. In addition to the presence of genetic diversity in recorded Iraqi samples.

دراسة بعض المعالم المناعية لدى مرضى داء الصدفية في بعض مستشفيات مدينة بغداد == Study of Some Immunological Aspects in Patients with Psoriasis in some Baghdad City Hospitals

Author name: هند يوسف خلف
Supervisor name: طالب عبد الله حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الصدفية من الامراض الجلدية الشائعة يتميز بظهور طبقات من الخلايا القرنية المغطاة بقشور سطحية بيضاء اللون ذات بريق فضي كلون الصدفة وتتكون فيه رقع محمرة مع قشور فضية سميكة على الجلد نتيجة انقسام الخلايا المولدة للبشرة بصورة سريعة جدا وهو من الامراض المزمنة غير المعدية ولا تعرف اسباب المرض بصورة محددة ولكن يظهر ان للعوامل المناعية دورا مهما في حدوث المرض ومنها الدور المحتمل للخلل المناعي الذي تم اقتراحه في مرض الصدفية ولاختبار هذه الفرضية اجري فحص المصول لجميع المشاركين لتحري عن حركيات خلوية معينة (IL - 2,TNF - α,IL - 10) والكلوبيولين المناعي ( (IgE وعاملي المتمم ((C3,C4 والعد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيضاء (total and diffrentialWBC).شملت الدراسة 55 مريض ( ذكر وانثى ) من مدينة بغداد خلال فترة تشرين ا لثاني 2013 الى نيسان 2014 وتتراوح اعمارهم ما بين (6 - 70 ) سنة وكان 30 منهم غير معالجين و25 معالجين بعلاج بايلوجي ومجاميع سيطرة باجناس وفئات عمرية مماثلة لاغراض المقارنة مكونة من 25 فردا اصحاء ظاهريا.تم فصل المصل قياس تركيز الحركيات الخلوية (IL - 2,TNF - α, IL - 10) والمستوى الكلي للمضاد المناعي (IgE) في مصل الدم المشاركين باستعمال تقنية الامتزاز المناعي مرتبط بالانزيم ELISA)) وعوامل المتمم ((C3,C4 بطريقة الانتشار المناعي الشعاع المنفرد (SRID) وتم قياس العد الكلي والتفريقي لكريات الدم البيض (total and diffrentialWBC).بوساطة جهاز روبي.توصلت الدراسة للنتائج الاتية : 1 - اظهرت النتائج ان متوسط العمر في مرضى الصدفية هو (34.7) سنة وان الفئة العمرية (40 (30 - سنة هي اكثر عرضة للاصابة.2 - اظهر معدل المستوى المصلي للبين البيضاض IL - 10 فروقا معنوية عند مستوى (P<0.05) ما بين مرضى غير المعالجين 17.71 بيكو غرام/ مل ومجموعة السيطرة 1.701 بيكو غرام/ مل. 3 - اظهر معدل المستوى المصلي لعامل التنخر الورمي - الفا فروقا معنوية عند مستوى P<0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 18.6 بيكو غرام/ مل ومجموعة المرضى المعالجين ومجموعة السيطرة13.57 12.85, بيكو غرام/ مل على التوالي .4 - لم تظهر اي فروق معنوية في مع مستوى البين البيضاض IL - 2 عند مستوى P>0.05)) ما بين مرضى غير المعالجين 43.90 بيكو غرام/ مل والاصحاء 43.2 بيكو غرام/ مل.5 - لوحظ وجود ارتفاع معنوي في تركيز المستوى المصلي لبروتين المتمم C3 عند مستوى (P<0.05) في المرضى غير المعالجين138.61 ملغرام/ مل مقارنة بمجموعة السيطرة 37. 123ملغرام / مل . ولقد اظهر بروتين المتمم C4 تركيزا مشابها في مستوياته لكل من العدد الكلي للمرضى ولم يظهر اي فرقا معنويا عند المقارنة مع قيم السيطرة المناظرة لها.6 - اظهرت الدراسة فروقا معنوية في معدل المستوى المصلي للكلوبيولين المناعي IgE الكلي عند مستوى P>0.05)) ,عند المقارنة ما بين مرضى غير المعالجين ومجموعة السيطرة 48.77 ) و29.78 ) وحدة دولية / مل على التوالي .7 - ظهرت زيادة معنوية في معدل كريات الدم البيض ((9.02 % ومعدل الخلايا الوحيدة ((6.71 % والخلايا اللمفية ((27.25 % في المرضى المعالجين بالعلاج البايلوجي مقارنة مع المرضى غير المعالجين والاصحاء.8 - لم تظهر اي فروق معنوية في معدل كريات الدم العدلة والخلايا الحمضة والخلايا الوحيدة بين المرضى غير المعالجين والمعالجين والاصحاء9 - ظهر تاثير الجنس في كلا من العد الكلي لكريات الدم البيضاء والخلايا العدلة والبين الابيضاض 10 حيث وجود فروق زيادة معنويه في الاناث عند مقارنتها مع الذكور.10 - وجود ارتباط ايجابي ومعنوي بين المستوى المصلي للبين ابيضاض IL - 10 وعامل التنخر الورمي - الفا اذ بلغ معامل الارتباط (*r =0.19). | Psoriasis is a chronic skin disease characterized clinical features. It is characterized by sharply demarcated dull - red plaques, covered by thick whitish slivery scales due to the excessive abnormal proliferation of the germenative cells of the epidermis and its immuomediated disease. The disease affect both sexes and genetic of the disease between families. The appearance of psoriasis lesions can be provoked by an external and internal factors.A potential role of the immune dysfunction has been suggested in psoriasis to test this hypothesis, certain cytokines ( IL - 2, IL10,TNF - α), immunoglobulins (IgE),complement components C3 and C4 were investigated in serum ,the total and differential WBC of all participants.The study includes : 55 patients (males and females)from Baghdad City during November 2013 to April 2014 with age range between (6 - 60) years; 30 of them were untreated and 25 were treated with biological treatment (Infliximab) with confirmed diagnosis of psoriasis using standard assessment age and gender matched 25 confirmed healthy control .The serum was separated and cytokines , total immunoglobulinE (IgE) were detected using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) .The complement factor C3 and C4 were detected using a single radial immunodiffusion (SRID) method and the total and differential WBC was measured by a ruby devise .The study has reached the following results : 1. The age average in patients with psoriasis was (34.7) years and age group (31 - 40) years are more susceptible to affected.2. The study showed that the differences of the serum level of IL - 10 was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 17.71pg/ml and healthy control 11.70 pg/ml. 3. The study furthermore, has showed the differences of the serum level of TNF - α was significant (P<0.05) between untreated psoriasis patients 18.63pg/ml and both groups treated psoriasis patients and healthy control groups (12.85, 13.57 ,respectively).4. The Research hasn't showed significant differences (P<0.05) serum level of IL - 2 between untreated psoriasis patients 43.90 pg/ml and healthy control43.2 l pg/ml. 5. The results observed a significant increase (P<0.05) in the concentration of serum level of complement component C3 in untreated patients 138.61 mg/dl compared to the control group 37.123 mg/dl .The complement component C4 concentration showed a similar level in each of the total number of patients ,did not show any significant difference when compared with the values of the corresponding control.6. The results have showed , as well , that the rate of serum level for total immunoglobulin IgE significant differences (P<0.05) when comparing between patients 48.7 IU/ml and control group 29.78 IU/ml.7. The Study has Showed significant increase in white blood cells rate 9.02% ,monocyte 6.71% and lymphocytes 27.25% in patients treated with biological treatment (Infliximab) compared with both untreated patients and healthy controls.8. It hasn't showed the significant differences in neutrophil cells and eosinophil ,basophile between healthy controls and both untreated and treated patients .9. There was significant increase in levels of neutrophil ,WBC, IL - 10 in females as compare with males.10. Correlation positive and significant between serum level of IL - 10 and the TNF - α as the correlation coefficient (r = 0.19*).

دراســة مصليـــة لداء المقوسات بين طالبات جامعيات غير متزوجات باستخدام فحص اللاتكس, الاليزا والمنيفايدز == Serological Study of Toxoplasmosis among Unmarried Female University Students using the Agglutination Test, ELISA and MiniVidas

Author name: هند مجيد كانوص الموسوي
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المقوسات الكوندية Toxoplasma gondii طفيليات اجبارية داخل الخلايا لها القابلية على اصابة جميع انواع ذوات الدم الحار ، بما في ذلك الانسان, وهي واحدة من العوامل الممرضة الاكثر انتشارا في العراق. والاصابة في النساء في سن الانجاب غير معروفة ، خاصة في غير المتزوجات . اجريت الدراسة للتحري عن مستوى الانتشار المصلي للاضداد المناعية المضادة للمقوسات الكوندية IgG وIgMبين 200 طالبة صحيحات ظاهريا غير متزوجات في خمس جامعات (بغداد , المستنصرية , التكنولوجية , النهرين والعراقية). جمع 5 مل عينة دم وريدي من كل طالبة ، بواقع 40 طالبة من كل جامعة عند سن (18 - 26) سنة خلال المدة من شهر كانون الثاني 2013 حتى شهر اذار 2014.استخدمت الاختبارات النوعية }اختبار اللاتكس LAT, الاليزا( تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالانزيمIgM - ELISA( و{IgG - ELISA والاختبارات الكمية (ToxoIgM - Minividas ، ToxoIgG - Minividas وToxo - IgG Avidity (للكشف عن الاضداد. واستخدم اختبار الاليزا لمعرفة مستوى البين ابيضاض - (IL - 17) 17في المصل ، كما هدفت الدراسة التعرف على العلاقة بين داء المقوسات ومستوى انزيمي ناقل الامين transaminases (GPT وGOT) في المصل وعوامل الخطورة.وقد لخصت النتائج بالنقاط الاتية : - • وجود زيادة معنوية (p≤0.01) لذوات الامصال الموجبة بداء المقوسات (اكثر من ثلث مجاميع الدراسة).• بلغت نسبة ذوات الامصال الموجبة لـطفيلي T.gondii باستخدام الاختبارات النوعية 76(38%) ,3(%1.5) و58(29%) على التوالي ، بينما في الاختبارات الكمية كانت النسبة 2(1%) , 69(34.5 %) و71(35.5%) على التوالي .• سجلت اعلى نسبة للامصال الموجبة لطفيلي T.gondii حسب الجامعات باستخدام الاختبارات النوعية في } الجامعة التكنولوجية اذ بلغت (%50)20 ، بينما بلغت نسبة الاصابة في (المستنصرية , التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والتكنولوجية 13(6.5%) على التوالي{، بينما في الاختبارات الكمية سجلت في }التكنولوجية والعراقية اصابة واحدة 1(.0.5%) لكل منهما والجامعة التكنولوجية 17 (8.5%) {.• اظهر فحصي LATوMinividas حساسية (100%) ومعنوية (P≤0.05) اكثر من ELISA (89.6%), كما تم تسجيل نسبة خصوصية كلا منهما وكالاتي (94.9% و98.5% على التوالي)، عندما اعطيا عدم وجود فروق معنوية عند مقارنتهما مع ELISA (100٪).• كانت قيم فحص الرغابة المنخفضة والعالية 10 (14.91%) و61 (85.96 %) على التوالي مع وجود فروق معنوية (p≤0.01) بينهما . وينبغي ان يكون مفيدا وعلامة جيدة لتشخيص اصابات المقوسات الحادة والمزمنة على التوالي.• كانت نسبة ذوات الامصال الموجبة لداء المقوسات عالية 31(34.66%) ومعنوية(P˂0.01) للفئة العمرية من (24 - 26) سنة وخاصة في الجامعة العراقية اذ بلفت نسية الاصابة 8 (57.14%).• وجود علاقة عالية المعنوية(p≤0.01) بين نسبة الامصال الموجبة لـ T.gondii وعوامل الخطورة حيث ان اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة بتماس مع القطط 52(73.24%), العمل في الحديقة 55(%77.47) , العيش في المناطق الريفية 49(69.01%), ولكن جميع الطالبات المصابات تناولن اكل المطاعم 71(100%) وشرب مياه الاسالة 41(57.75%). وسجلت اعلى نسبة لذوات الامصال الموجبة حسب عوامل الخطورة وكما يلي : العامل الاول : التعامل مع القطط ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد 10(83.33%) , العامل الثاني : العمل في الحديقة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية 13(92.86%) ، العامل الثالث : الاقامة ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة العراقية (%78.57)11، العامل الرابع : التغذية من المطاعم ، وكانت اعلى نسبة في الجامعة التكنولوجية (%100) 18، واخيرا العامل الخامس : مصدر شرب المياه ، وكانت اعلى نسبة في جامعة بغداد (%66.67)8 . • اكثر من ثلثي ذوات الامصال الموجبة 56(78.87%) اظهرن ضعفا في الوعي الصحي اتجاه المرض ولا توجد علاقة معنوية بين انتشار المرض ومستوى التعليم .• وجود علاقة معنوية عالية(p≤0.01) بين الامصال الموجبة لـ T.gondii ومستوى البين ابيضاض - 17 (25.59±348.98) بيكو غرام / مل ومستوى ناقل الامين GPT (1.12±13.13) وحدة دولية / لتر ، ولا توجد اهمية معنوية (P≤0.05) في فاعلية انزيم (0.35±10.84) GOT وحدة دولية / لتر | Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite capable of infecting practically all warm - blooded species , including humans . It is one of the most prevalent pathogenic agents in Iraq. Therefore this study was conducted to detect the seroprevalence level (IgM and IgG ) of T.gondii infection among 200 apparently healthy unmarried females students in five Universities (Baghdad, Al - Mustansiriya, Technology, AL - Nahrin and AL - Iraqia). Five ml from venous blood samples were collected from each student , as 40 students from each university at age (18 to 26) year during the period at December 2013 till May 2014. Qualitative tests ( Latex Agglutination Test (LAT), Enzyme Linked Immunosorbent Assay IgM and IgG (ELISA - IgM and ELISA - IgG) and quantitative tests (Minividas ToxoIgM , Minividas ToxoIgG and Toxo - IgG Avidity) were using to detection Toxoplasma Immunoglobulins . ELISA was used to determine of serum Interleukin - 17A levels . Also the aim of the study was to identify the relationship between Toxoplasmosis and the level of serum transaminases (GOT and GPT) and risk factors .The results were summarized as following points : -  Significant (p≤0.01) increased seropositivity of Toxoplasmosis (more than one - third) among the study groups .  The Sero(+ve) T. gondii using qualitative tests were recorded as {76(38%) ,3(1.5%) and 58 (29%) respectively} ,While in quantitative tests were { 2(1%) , 69(34.5%) and 71(35.5%) respectively} .  The higher percentages of sero(+ve) T. gondii according universities using qualitative tests were recorded in {University of Technology 20(50%) , while Mustansyria , Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one of them and Technology 13(6.5%) respectively} , While quantitative tests were recorded in { Technology and Iraqia as 1(0.5%) of each one , and Technology 17(8.5%) respectively}. LAT and Minividas seems to be have highly sensitivity (100%) and significantly (P≤0.05) than ELISA (89.6%) , also have good specificity (94.9 % and 98.5% respectively ), when it gave no significant differences when compared with ELISA (100%).  A low and a high avidity values were 10(14.91%) and 61(85.96%) respectively with a high significant (p≤0.01) differences between them . It should be useful to confirm up and good markers for diagnosis of an acute and chronic Toxoplasma infections respectively. The seropositivity of Toxoplasmosis was the highest 31(43.66%) and significant (P˂0.01) among age (24 - 26) year , especially in Iraqia was 8(57.14%) . A highly significant (p≤0.01) relationship were found between Sero(+ve) T. gondii and risk factors that more than two - thirds of sero(+ve) contact with cats 52(73.24%) , working in the garden 55(77.47%) ,lived in urban areas 49(69.01%) , But all infected student feeding on restaurant 71(100%) and drinking tap water 41(57.75%) . The highest seropositivity according to the risk factors were recorded as following : Contact with cats in Baghdad university 10(83.33%) , Working in garden in Iraqia university 13(92.86%) , Residence in Iraqia university 11(78.57%), Feeding in restaurant in University of Technology 18 (100.0%) and Source of drinking water in Baghdad university 8(66.67%) . More than three - quarters of seropositive 56(78.87%) showed weakness in the health awareness toward the disease and no significant relationship was found between seroprevalence of T. gondii infection and health level of education. A highly significant relationship (p≤0.01) was found between sero(+ve) T. gondii and the level of serum IL - 17 (348.98 ± 25.59) bg/ml and serum transaminase GPT activity (13.13 ± 1.12) IU/L, but no significant (P≤0.05) was found in the GOT activity (10.84 ± 0.35) IU/L.

دراسة بعض المعالم المناعية لمرضى التصلب المتعدد العراقيين == Study of Some Immunological Parameters in Iraqi Patients with Multiple Scler

Author name: هند قصي اسماعیل الفرضي
Supervisor name: حازمة موسى خلیل العباسي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory condition that affects central nervous system (CNS) causing neurological dysfunction. The current study aim was the evaluation of the role of Methylprednisolone (MP), Interferon Beta (IFN - β) as disease treatments, and to investigate their influence on CD25+ FoxP3 T regulatory cells (it was counted by flow cytometry technique), IL - 8, IL - 17 (pro - inflammatory cytokines), IL - 12 (inflammatory cytokine (T cells differentiation Factor)), IL - 10, TGF - β (anti - Inflammatory cytokines) it estimated by ELISA technique, also the total and differential WBC count, ESR, CRP (inflammatory indicators), patient characteristics, clinical manifestation and life style characteristics. Forty - five Iraqi MS patients (15 untreated as early onset patients, 15 MP treated patients and 15 IFN - β treated patients), in addition to 15 apparently healthy individuals as control. For patients treated with MP, samples collected after treatment period, while patients treated with IFN - β samples were collected in remission status.The study revealed the following results : 1. Patient general characteristics showed that according to gender distribution female : male ratio was 2 : 1 (66.67% : 33.33%), according to the age of onset, (< 30 years) group of patients were the highest frequency in study sample (37.9%), 57 years was the maximum age of onset and 13 years was the minimum, with mean (34.93), Baghdad was the highest governorate in MS onset (73.33%). 2. Total WBC count showed that patients treated with MP (10.38*103μl) increases significantly (P≤0.002), (P≤0.001) as compared with both patients treated with IFN - β (7.45*103μl) and control (7.33*103μl) respectively. Lymphocytes were decrease significantly (P≤0.013), (P≤0.030) patients treated with MP and INF - β respectively (1.82), (1.92) as compared to control (2.58) and there were a significant decrease (P≤0.03) in patients treated with MP (1.82*103μl) as compared to untreated patients (2.47*103μl).Neutrophils was increase significantly (P≤0.016) and (P≤0.000) in patients treated with MP and untreated patients respectively (7.81), (5.99) as compared to control (3.82), there were also a significant increase in patients treated with MP (P≤0.04), (P≤0.001) ascompared with untreated patients (5.99*103μl) and patients treated with IFN - β (4.73*103μl) respectively. Basophils decrease significantly (P≤0.001), (P≤0.014) in both patients treated with MP and INF - β respectively (0.05), (0.06) as compared to control (0.08).3. CD25+ FoxP3+ Tregs counting showed a significant increase (P≤0.002) in untreated patients (28.01%) as compared to control 14.06%), while there were a significant decrease (P≤0.016), (P≤0.007) in both patients treated with MP and IFN - β respectively(3.70%), (2.44%) as compared to control, also there were a significant increase (P≤0.000), (P≤0.000) in untreated patients (28.01%) as compared with patients treated with MP (3.70%) and patients treated with IFN - β (2.44%) respectively.4. Serum cytokines estimation showed that IL - 8 decreased significantly (P≤0.026) in untreated patients (0.003pg/ml) as compared to control (0.016), while IL - 10, IL - 12, IL - 17 showed no significances and TGF - β increased significantly (P≤0.028) inpatients treated with MP (700.27) as compared to control (392.13), while there were a significant increasing (P≤0.001), (P≤0.001) in patients treated with MP (700.27pg/ml) as compared with untreated patients (235pg/ml) and patients treated with IFN - β (484.67pg/ml) respectively. Saliva cytokines estimation showed that IL - 8 was increased significantly (P≤0.023) in patients treated with IFN - β (0.578) as compared to control (0.223), IL - 10 increased significantly (P≤0.017) in patients treated with MP (0.023) as compared to control(0.00), IL - 12 decreased significantly (P≤0.003) in patients treated with IFN - β (4.93) as compared to control (24.07), IL - 17 increased significantly (P≤0.018) in patients treated with MP (19.17) as compared to control (0.00).

تاثير الكلنبيوتيرول على بعض المعايير الفسلجية في ذكور الارانب Oryctolagus cuniculus == Effect of the Clenbuterol on some physiological parameters in male rabbits Oryctolagus cuniculus

Author name: هند ضياء هادي
Supervisor name: الية حسين علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت الدراسة الحالية للتعرف على التاثيرات الفسلجية لعقار الكلنبيوتيرول في وظائف الكبد, والكلى, وتركيز الدهون, والكلوكوز ومستوى بعض هرمونات (TSH,T4,T3,T,Prolactin,LH,FSH). استخدم في هذه الدراسة 32 ذكرا بالغا من الارانب قسمت عشوائيا الى اربع مجاميع, والتي جرعت يوميا لمدة 30 يوما , المجموعة الاولى جرعت فمويا بـ الماء المقطر, المجموعة الثانية جرعت فمويا بـ 2مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الثالثة جرعت فمويا بـ 4 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول, المجموعة الرابعة جرعت فمويا بـ 6 مايكروغرام /كغم من وزن الجسم من عقار الكلنبيوتيرول. جمعت عينات الدم في مرحلتين الاولى بعد 14يوما والثانية بعد 30 يوما من بدء التجريع لغرض الدراسة الفسلجية. ادت المعاملة بعقار الكلنبيوتيرول الى انخفاض معنوي (P<0.05) في معدل وزن الجسم لكل المجاميع المجرعة بالعقار مقارنة بمجموعة السيطرة بعد 30 يوما من التجريع . واوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاع غير معنوي 0.05)<(P في كل من انزيمي الاسبارتيت الناقل للامين AST وانزيم الالنين الناقل للامينALT في المجموعتين الثانية والثالثة المجرعة بالعقار لمدة 14 , 30 يوما , بينما لوحظ ارتفاع معنوي (P<0.05) في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة ولمدة 14 ,30 يوما من التجريع, ولم يلاحظ وجود اي فرق معنوي 0.05)< (Pفي تركيز انزيم الفوسفاتيز القاعدي ALP لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 ,30 يوما بعد المعاملة. كما بينت الدراسة وجود انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى حامض اليوريك في كل المجاميع المجرعة لمدة 14 يوما, كذلك انخفض مستوى الحامض بصورة غير معنوية 0.05)< (Pفي المجموعة الثانية بينما انخفض بصورة معنوية(P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة بعد 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة, اوضحت النتائج ارتفاع غير معنوي 0.05)< (Pفي مستوى الكرياتنين لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة اذ كان هناك ارتفاع معنوي(P<0.05) لمدة 30 يوما بعد التجريع, احدث العقار انخفاض غير معنوي0.05)< (P في مستوى اليوريا لكل المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما, بينما انخفض مستوى اليوريا بصورة معنوية (P<0.05) في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة, فضلا عن دور العقار في الانخفاض المعنوي (P<0.05) في مستوى الكولسترول لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية اذ كان هناك انخفاض غير معنوي 0.05)< (Pبعد مرور 14 يوما بعد التجريع, كما اظهرت النتائج انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الكليسريدات الثلاثية في المجموعة الثانية لمدة 14 , 30 يوما بينما انخفض مستوى الكليسريدات الثلاثية معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة. احدث العقار ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (Pفي مستوى الـ HDLفي المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) بعد مرور 30 يوما من التجريع, كما بينت النتائج انخفاضا معنويا (P<0.05) في مستوى الـ LDL في المجموعة الثانية المجرعة لمدة 14 يوما بينما انخفض مستوى الـ LDL بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجموعتين الثالثة والرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, وكذلك انخفض مستوى الـ LDL معنويا(P<0.05) في المجموعتين الثانية والثالثة لمدة 30 يوما من التجريع بينما انخفض بصوره غير معنوية 0.05)< (P في المجموعة الرابعة مقارنة بمجموعة السيطرة, كما لوحظ انخفاض غير معنوي 0.05)< (P في مستوى الـ VLDL لكل المجاميع خلال 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك انخفاض معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع, اظهرت المجاميع المجرعة ارتفاع غيرمعنوي 0.05)< (P في مستوى الكلوكوز لمدة 14 ,30 يوما من التجريع ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30يوما من التجريع. كما اوضحت النتائج الاحصائية للدراسة حدوث ارتفاعا غير معنويا في مستوى الهرمونات LH, FSH وT لكل المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الرابعة فقد كان هناك ارتفاع معنوي (P<0.05) لمدة 30 يوما من التجريع , اضافة الى انخفاض مستوى هرمون الحليبProlactin بصورة غير معنوية 0.05)< (P في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما من التجريع , كما اظهرت النتائج ارتفاعا غير معنويا 0.05)< (P في مستوى هرمون T3في المجموعة الثانية المجرعة بالعقار لمدة 14 يوما بينما ارتفع معنويا (P<0.05) في المجموعتين الثالثة والرابعة, كما نلاحظ ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P في مستوى هرمون T3 في المجاميع المجرعة بالعقار لمدة 30 يوما, وبينت النتائج ايضا ارتفاع مستوى هرمون T4معنويا (P<0.05) في المجاميع المجرعة لمدة 14 ,30 يوما ماعدا المجموعة الثانية فقد كان هناك ارتفاع غير معنوي 0.05)< (P لمدة 30 يوما من التجريع مقارنة بمجموعة السيطرة , كمالوحظ وجود ارتفاع معنوي ((P<0.05 في مستوى هرمون الـ TSH للمجاميع المجرعة بالعقار لمدة 14,30 يوما مقارنة بمجموعة السيطرة. | This study was designed to investigate the physiological effects of Clenbuterol drug on liver, kidney function, lipidprofile ,concentration of glucose and level of some hormones (FSH,LH,T,PRL,T3,T4,TSH). Thirty two adult male rabbits were used in this study, the animals were randomly divided into four groups and treated daily for 30 days, the G1 intubated orally distilled water (control), G2 intubated orally 2 µg/kg/bw of clenbuterol drug, G3 intubated orally 4µg/kg/bw of clenbuterol drug, G4 intubated orally 6µg/kg/bw of clenbuterol drug. Blood samples were collected in two stages the first stage after 14 days, second stage after 30 days of treatment for physiological study. The treatment with Clenbuterol drug lead to a significant(P<0.05) decrease in the mean of the body weight in all the exposed groups with drug as compared with control group for 30 days. The statistical results of this study showed non significant(P>0.05) increase in both AST and ALT enzyme in the second and third groups exposed with drug for 14, 30 days, while we note significant(P<0.05) increase in the fourth group as compared with control group for 14,30 days after treatment .As for the concentration of the ALP enzyme didn,t demonstrated a significant (P>0.05) difference during 14,30 days after treatment . The results showed that there are non significant(P>0.05) decrease in the uric acid level in all the exposed groups for 14 days ,as uric acid level non significant (P>0.05)decrease in the second group, while significant(P<0.05) decrease in the third and fourth groups for 30 days after treatment compared with control group. Results explained non significant(P>0.05) increase in the creatinine level in all the treated groups with drug for 14, 30 days except fourth group there was a significant (P<0.05) increase for 30 days after treatment, drug caused non significant (P>0.05) decrease in the urea level in all the treated groups for 14 days, while urea level a significant(P<0.05) decrease in all the exposed groups with drug for 30 days as compared with control group. In addition the role of drug in significant(P<0.05) decline in the cholesterol level in all the treated animals for 14, 30 days except the second group there was non significant(P>0.05) decrease for 14 days after treatment . Results also explained non significant(P>0.05) decrease in the T.G level in second group for 14, 30 days, while T.G level a significant (P<0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group.Drug caused non significant (P>0.05) increase in the HDL level in all the exposed groups for 14, 30 days except the second group there was significant(P<0.05) increase for 30 days after treatment, the results showed a significant(P<0.05) decrease in the LDL level in the second group for 14 days, while LDL level non significant(P>0.05) decrease in the third and fourth groups as compared with control group, as LDL level a significant decrease(P<0.05) in second and third groups for 30 days after treatment while non significant(P>0.05) decrease in fourth group as compared with control group. We also note non significant(P>0.05) decrease in VLDL level in all the exposed groups with clenbuterol for 14,30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) decrease for 30 days after treatment .Treated animals showed non significant(P>0.05) increase in the glucose level for 14, 30 days after treatment except the fourth group there was significant(P<0.05) inecrease for 30 days after treatment . The statistical results of this study showed non significant (P>0.05) increase in the LH, FSH and T hormones level in all the treated animals for 14, 30 days except the fourth group there was significant (P<0.05)increase for 30 days after treatment, as well as non significant (P>0.05) decrease in the prolactin hormone level in the treated animals for 14, 30 days of treatment. Results also explained non significant (P>0.05) increase in the T3 hormone level in the second group for 14 days after treatment, while significant (P<0.05) increase in the third and fourth groups, we also note non significant(P>0.05) increase in the T3 hormone level in all the exposed groups with drug for 30 days after treatment. The results showed a significant (P<0.05) increase in the T4 hormone level in all the exposed groups for 14, 30 days except second group there was non significant(P>0.05) increase for 30 days after treatment compared with control group , we also note a significant (P<0.05) increase in the TSH hormone level in all the treated animals exposed with drug for 14, 30 days as compared with control group

التحري عن بعض المعايير المناعية وتعدد الطرز الوراثية لجين IL - 13 في مرضى الربو في محافظة ذي قار == Investigation of some Immunological parameters and polymorphism of IL - 13 gene in patients of asthma in Thi - Qar province

Author name: هند حسين صالح الطائي
Supervisor name: علي نعيم سلمان
General topic: Biology
Specific topic: Zoology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Asthma is a chronic inflammatory disease of the airways in which many cells and cellular elements play a role. Causes recurrent episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness, and coughing. These episodes cause airflow obstruction, often reversible either spontaneously or with treatment. The current study was conducted at the Labs of college of Education for pure science and Al - Hussein Teaching Hospital in Thi - Qar province, during the period from October 2014 to May 2015. The study aimed to investigate role of polymorphism of IL - 13 gene in patients with asthma and to evaluate their immune status by measuring the levels of some immunological parameter immunoglobulins ( IgE) by enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA) and (IgG, IgM ) by single redial immune diffusion (SRID) and measure the levels of interleukins (IL - 6, IL - 17) in the serum using enzyme - linked immunosorbent assay (ELISA), the study included test phagocytic cells on phagocytosis (coefficient of phagocytosis) and the total and differential count of white blood cells .A total of 100 patients with bronchial asthma (68 females) and (32 males) whose age lies between 17 - 62 years have enrolled in this study. DNA was extracted and RFLP - PCR was performed by using primers specific for the gene IL - 13, the results showed the presence of mutations in a48 sample out of 100 patients with asthma at site 1112C/T after using restriction enzyme BstUI. the statistical analysis showed correlation between the occurrence of the disease and the emergence of mutation (C / T) in the promoter region of IL - 13 gene when compared with the healthy control in population of Thi - Qar province .When it was compared the patient group with healthy control group there was a high significant increase (P ≤ 0.001) in serum IgE, IgG of patients with asthma compared with healthy control group. And no significant difference in serum IgM of patients with asthma compared with healthy control group. Decrease coefficientphagocytosis was significantly (P ≤ 0.001) in all patients with asthma compared with healthy control group. Levels of interleukin (IL - 6, IL - 17) measured in serum of 60 a sample of patients with asthma, and in the serum of 20 samples from healthy control group. The results showed a significant increase (P ≤ 0.001) in the levels of these interleukins in the serum of patients with asthma compared to the control group.Also there was increased in the rate of counting the total of WBCs and differential cell lymphocytes, eosinophil, neutrophil, basophil, and monocyte (P ≤ 0.001) in patients with asthma compared with the healthy people in the control group.

التغاير الفصلي في التركيب النوعي للطحالب الملتصقة على اجزاء مختلفة من نبات القصب Phragmites australis من مواقع مختارة في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد - العراق == Seasonal Variations in Species Composition of Epiphytic Algae on Different Parts of Phragmites australis in the Tigris River - Baghdad - Iraq

Author name: هند ابراهيم احمد البياتى
Supervisor name: جنان شاوي الحساني
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت دراسة شهرية للطحالب الملتصقة على السيقان والاوراق الحية والميتة لنبات القصب Phragmites austrlis Trin ex Stand في نهر دجلة في موقعي الاعظمية والجادرية ضمن مدينة بغداد ابتداءا من شهر تشرين الثاني 2014 ولغاية شهر حزيران 2015 . شملت الدراسة قياس العوامل الفيزيائية والكيميائية لنهر دجلة ، مثل : درجة الحرارة (الهواء والماء) والاس الهيدروجيني (pH) والتوصيل الكهربائي (EC) والملوحة (‰ S) والمواد الذائبة الكلية (TDS) والمواد الصلبة العالقة (TSS) والقاعدية الكلية (TA) والاوكسجين المذاب (DO) والمتطلب الحيوي للاوكسجين (BOD5) والعسرة الكلية (T.H) والكالسيوم والمغنسيوم والكدرة (Turbidity) ونفاذية الضوء (light penetration) وسرعة الجريان (F.W) والكلوروفيل - ا والفيوفايتين - ا والنتراتNO3 والنتريت NO2 والامونيا NH3و الفوسفات الفعالة (PO4) - 3و السيليكا الفعالة - 2) (SiO3 . فضلا عن ذلك تمت دراسة نوعية وكمية للطحالب الملتصقة على السيقان الحية والسيقان الميتة والاوراق الحية والاوراق الميتة لنبات القصب وقيست اربع مؤشرات للتنوع الحيوي ( دليل شانون للتنوع ودليل الغنى ودليل التكافؤ ودليل جاكارد للتشابه ) . اوضحت نتائج الدراسة ان معدل قيم درجة حرارة الهواء والماء تراوحت 18 - 39 م و12 - 31 م على التوالي وقيم الاس الهيدروجيني 7.6 - 8.1 واظهرت نتائج القاعدية الكلية قيما تراوحت 130 - 191.6 ملغم.لتر - 1. بينما وصلت قابلية التوصيل الكهربائي 500 - 870 مايكروسمنز.سم - 1. في حين سجلت قيم الملوحة 0.305 - 0.538 جزء بالالف وتراوحت المواد الصلبة الذائبة الكلية 250 - 430 ملغم .لتر - 1، والمواد الصلبة العالقــة بيـــن 0.91 - 0.03 ملغم .لتر - 1، والاوكسجـين المذاب بين 8.4 - 5 ملغم.لتر - 1 ، وقيم المتطلب الحيوي بين 4.1 - 0.9 ملغم .لتر - 1 ،العسرة الكلية 465 - 120ملغم CaCO3.لتر - 1 ، الكالسيوم 97.4 - 41. ملغم . لتر - 1، المغنسيوم 17.6 - 74.9 ملغم .لتر - 1 ،الكدرة 87.1 - 28.6NTU ، نفاذية الضوء 90 - 34 سم ، سرعة الجريان 0.3 - 0.1 م . - 1ثا ، النترات الفعالة 0.98 - 0.72 ملغم .لتر - 1 ,النتريت الفعال 0.02 - 0.004 ملغم . لتر - 1 , الامونيا 0.23 - 0.09 ملغـم. لتر - 1 ، في حين تراوحت قيــم الفـوسفات الفعالة 0.73 - 0.1ملغم . لتر - 1 والسيليـكا الفعالة 4.1 - 3 ملغم . لتر - 1 . شخص 174 نوعا تعود الى 52 جنس كان منها138 نوعا 31جنس تعود الى صف الطحالب العصوية Bacillariophyceae مكونة 79.3% من العدد الكلي لانواع الطحالب الملتصقة 10انواع تعود لرتبة الدايتومات المركزيةCentrales و128 نوعا تعود لرتبة الدايتومات الريشيـــة Pennales و18 نوعا ) 10.3% ، 13 جنس) تعود الى صف الطحالب الخضر Chlorophyceae و17 نوعا (9.7% ،8 جنس ) تعود الى صف الطحالب الخضر المزرقة Cyanophyceae ونوع واحد وجنس واحد(0.5) للطحالب البرواتية Dinophyceae.سجلت الدراسة الحالية 6 انواع من الطحالب المشخصة لاول مرة في العراق تعود لصف الطحالب العصوية تمثلت بـ Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow وNavicula exilissima Grunow وNavicula microcephalo Grunow وPleurosigma obscurum W.Smith وStauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys وStenopterobia intermedia Lewis , وقد اوضحت ابعاد النوع وصفاته الاساسية فضلا عن تصويره فوتوغرفيا بالكاميرا الرقمية .تفوقت الاجزاء الميتة من سيقان واوراق نبات القصب P . australis باعداد انواع الطحالب الملتصقة عليها مقارنة مع السيقان والاوراق الحية للنبات المضيف , سجل 96 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية ,و 95 نوع على السيقان الميتة , 50 نوع على الاوراق الحية , 61 نوع على الاوراق الميتة شكلت الطحالب العصوية 82% , 84.2 % , 80 % , 83 % نوع على التوالي , اما الطحالب الخضر فقد تراوحت بين 10.4 % , 6.3 % , 8.1 % , 4.9 % نوع, والطحالب الخضر المزرقة 8.3 % , 7.3 % , 6.5 % , 9.8 % نوع في موقع الاعظمية , اما في موقع الجادرية فقد سجل 85 نوع من الطحالب الملتصقة على السيقان الحية و90 نوع على السيقان الميتة و57 نوع على الاوراق الحية و74 نوع على الاوراق الميتة , سادت فيها الدايتومات بنسبة 80.3 % ,82 % , 81 % , 82.4 % على التوالي , اما الطحالب الخضر 8.2 % , 9.4 % , 5.2 % , 6.7 % والطحالب الخضر المزرقة 9.4% , % 8.2 , 10.5%, 9.4 % نوع على التوالي تباين العدد الكلي للطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة لنبات القصب باختلاف الفصول والمواقع ، اذ سجل اعلى عدد كلي للطحالب الملتصقة 854.7×104 خلية.غم - 1 وزن رطب على السيقان الحية في الربيع واقل عدد كلي للطحالب 108.64× 104 خلية.غم - 1 على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية في حين تراوح العدد الكلي لافراد الطحالب الملتصقة في موقع الجادرية بين 114.77×909.47 - 104× 104 خلية.غم - 1 وزن رطب على الاوراق الحية والسيقان الحية لنبات القصب في الشتاء والربيع على التوالي . تراوحت قيم كلوروفيل - ا للطحالب الملتصقة على نبات القصب بين 2.831 - 1.586 ملغم.سم - 2 في الخريف والربيع على التوالي في موقع الاعظمية و3.108 - 0.941 ملغم.سم - 2في الشتاء والربيع على التوالي في موقع الجادرية , بينما تراوحت قيم الفيوفايتين - ا بين 0.981 - 0.037 ملغم .سم - 2 في الخريف والصيف على التوالي في موقع الاعظمية و0.895 - 0.027 ملغم.سم - 2في الخريف والصيف في موقع الجادرية . اظهرت ادلة التنوع الحيوي اعلى قيم دليل الغنى 16.9 للطحالـــب الملتصقـة علــى السيقان الحية لنبات القصبP. australis في الربيع في موقع الجادرية وظهرت اقل قيم الدليل 7.7للطحالب الملتصقة على الاوراق الميتة في الشتاء في موقع الاعظمية ، واعلى قيم دليل التنوع شانون بلغت 4.19 في الربيع للطحالب الملتصقة على السيقان الحية في موقع الجادرية ، في حين سجل اقل قيم دليل التنوع 3.1 على الاوراق الحية في الصيف في موقع الاعظمية ، سجلت اعلى قيمة تكافؤ 0.740 في الشتاء للطحالب الملتصقة على الاوراق الحية في موقع الجادرية واقل قيمة بلغت 0.58 على السيقان الحية في الخريف في موقع الاعظمية. كما بينت النتائج اعلى نسبة تشابه لدليل جاكارد Jaccard بين الفصول كانت بين الربيع والخريف للطحالب الملتصقة على السيقان الميتة اذ بلغت 51.7 % في موقع الاعظمية , في حين بلغت اعلى نسبة تشابه في موقع الجادرية 49.6 % بين الربيع والخريف على السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الخريف اعلى نسبة تشابه 40.2 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 37 % بين السيقان الحية والسيقان الميتة , وسجل الربيع اعلى نسبة تشابه 48 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة وجاء الصيف بـ اعلى نسبة تشابه بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في موقع الاعظمية , اما موقع الجادرية فقد سجل اعلى نسبة تشابه 44.6 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في الخريف وسجل الشتاء اعلى نسبة تشابه 40.2 % على السيقان الحية والاوراق الميتة وسجل الربيع اعلى نسية تشابه 59.5 % بين السيقان الميتة والاوراق الميتة في حين سجل فالصيف اعلى نسبة تشابه 41.4 % على السيقان الميتة والاوراق الميتة . خلصت الدراسة الى ان مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد عسرة وذات طبيعة قاعدية معتدلة وسجل تنوع عالي مع تباين ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء المختلفة للنبات المائي الواحد اذ فضلت الطحالب جزء الورقة الملتف حول الساق ولم تفضل جزء الورقة الممتد افقيا على سطح الماء وازداد تنوع الطحالب الملتصقة على الاجزاء الميتة في فصول الدراسة كافة باستثناء الربيع الذي سجل زيادة في اعداد الطحالب الملتصقة على الاجزاء الحية من سيقان واوراق نبات القصب اما مواسم الذروة فكانت في فصلي الربيع والخريف وسجل الشتاء انخفاض ملحوظ في اعداد الطحالب الملتصقة بسبب الظروف البيئية الغير الملائمة . | This work was conducted monthly to study the epiphytic algae on dead and live stems , leaves of aquatic plant Phragmites australisn Trin ex Stand on the Tigris River at Al - Jadriya and Al - Adhmia sites within Baghdad City during the period between October 2014 and June 2015. The physicochemical factors were measured in the studied area. These factors were temperature (air and water), pH (water), electrical conductivity (EC), salinity (S‰), water flow, total dissolved solids (TDS), total suspended solids (TSS), turbidity and light penetration. Also the study included total alkalinity (TA), total hardness (TH), calcium, magnesium, dissolved oxygen (DO), biological oxygen demand (BOD5). Moreover, Nitrate(NO3), Nitrite(NO2), Amonia(NH3), Ractive phosphate (PO4) - 3 , Reactive Silicates (SiO3 - 2), chlorophyll - a and pheophytin - a. The quantitative and qualitative study for epiphytic algae on different part of macrophytes (Phragmites australisn Trin ex Stand ) were done. Also four biodiversity indices (Shannon - Weaver, richness, evenness and similarity) were calculated. The studied factors ranged as follows : 18 - 39 C° , 12 - 31 C° for air and water temperature, respectively. The turbidity and light penetration, water flow, EC, S‰, TDS and TSS were 28.6 - 87.1 NTU, 34 - 90 cm, 0.3 - 0.1m.Sec - 1., 500 - 870µs.cm - 1, 0.305 - 0.538 ‰, 250 - 430 mg.l - 1 and 0.03 - 0.91 mg.l - 1, respectively. While7.6 - 8.1, 130 - 191.6 mg CaCO3.l - 1 , 120 - 465 mg .l - 1 , 41.1 - 97.4 mg.l - 1 , 17.6 - 74.9mg.l - 1 for pH, TA, TH, Ca++ and Mg++, respectively. Nutrient concentrations ranged 0.98 - 0.72 µg.l - 1 , 0.02 - 0.004µg.l - 1 , 0.09 - 0.23µg.l - 1, 0.1 - 0.73 µg.l - 1 , 3 - 4.1µg.l - 1 for Ractive Nitrate, Nitrite,Amonia, Ractive phosphate and Silica. A total of 174 taxa of epiphytic algae were found in the present study. Bacillariophyceae (diatoms) was the dominate class with 138 species (128 species belonged to pinnate diatoms and 10 for centric diatoms) and represented 79.3% from the total identified algae. Other classes sequenced as follows : Chlorophyceae (18 species and 10.3%), Cyanophyceae (17species and 9.7%) and one species (0.5%) for Dinophyceae .Six of the algal taxa were recorded in the present study are new to Iraqi flora. The new record of algae belong to Bacillariophyceae are Navicula exilissima Grunow , Navicula falaisiensis var. lanceola Grunow , Navicula microcephalo Grunow, Pleurosigma obscurum W.Smith, Stauroneis amphioxys Gregory var. amphioxys , Stenopterobia intermedia Lewis. The results of this study include description of the basic characteristics of these taxa together with complete photographic documentation. Highest number of epiphytic algae were recorded on dead stems and leaves of aquatic plant P. australis comparison with living parts of the host plant , 96 species of epiphytic algae were recorded on living stems , 95 species on dead stems , 50 species on living leaves and 61 species on dead leaves . The proportion of Bacillariophyceae was %82, %84, %80, %83 respectively while Chlorophyceae was ranged %10.4, %6.3, %8.1, %4.9 and Cyanophyceae recorded %8.3, %7.3, %6.5, %9.8 species in Adamia site . While in Jadria site it has recorded 85 species of epiphytic algae on living stems , 90 species on dead stems , 57 species on living leaves and 74 species on dead leaves diatoms was dominant %80.3, %82, %81, %82.4 respectively Chlorophyceae recorded %8.2 , %9.4, %5.2, %6.7 species and Cyanophyceae %9.4, %8.2, %10.5, %9.4 species respectively .Numbers of epiphytic algae fluctuated among study sites, seasons and parts of aquatic plants showed that highest count was recorded 845.7 × 104 cell.gm - 1 wet weight on living stems in spring and the lowest count was recorded 108.64 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves in winter at Al - Adhmia site .While the total number of epiphytic algae on P. australis at Al - Jadria site ranged between 114.77× 104 - 909.47 ×104 cell.gm - 1 wet weight on living leaves and living stems of the host plant in winter and spring respectively .Chlorophyll - a concentration varied among Seasones , and recorded between 1.586 - 2.831 mg.cm - 2 in autumn and spring respectively at Al - Adhmia site , and ranged between 0.941 - 3.108 mg.cm - 2 in winter and spring respectively at Al - Jadria site . Pheophytin - a concentration varied and recorded between 0.037 - 0.981 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Adhmia site and 0.941 - 0.895 mg.cm - 2 in autumn and summer respectively at Al - Jadria site .The highest value of richness in this study was 16.9 on the living stems in spring at Al - Jadria site and the lowest value was 7.7 on dead leaves in winter at Al - Adhmia site . Shannon - Weaver index values ranged between 4.19 on the living stems in spring at Al - Jadria site and 3.1 on the living leaves in summer at Al - Adhmia site. Evenness index recorded highest value 0.740 on the live leaf in winter at Al - Jadria site While the lowest value 0.58 on live stem in autumn at Al - Adhmia site . Higher percentage for Jaccard similarity index 51.7% obtained between autumn and spring seasons on dead stems at Adhmia site While the highest percentage of similarity at Al - Jadria site was 49.6% between autumn and spring on dead stems and living stems.The water quality of Tigris River within Baghdad city is estimated as a moderate alkalinity and hardness , high diversity and marked contrast in total number of epiphytic algae was recorded on same host plant , algae prefer parts of leaves that wrapped around stem and not the leaf blade that extended horizontally on the surface of the water , diversity increased on dead parts of plant in all study seasons except spring which showed an elevated in the total algae number on living parts (stems and leaves ) for reed plant , peak seasons was Spring and Autumn while Winter record a significant decrease in algae number which attributable to environmental conditions in appropriate.

دراسة مظهرية وجزيئية للفطريات الجلدية Dermatophytes في محافـظة السليمانية من العراق وتاثـيرالبكـتريا Lactobacillus species كمعزز حيوي == Phenotypic and Molecular Study of Dermatophytes in Sulaimania Province of Iraq and the Effect of Lactobacillus spp. as Probiotics

Author name: هناء كريم مايخان محمد
Supervisor name: خالد عبد الرزاق حبيب | شوان كمال رشید
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة الحالية جمع 220 عينة من المرضى المصابين بالفطريات الجلديــــــة dermatophytes (63 ذكور و157 اناث) والذين تم تشخيصهم من قبل الكادر الطبي المتخصص في وحدة الامراض الجلدية في مستشفى كلار العام في قضاء كلار التابع لمحافظة السليمانية فی العراق خلال الفترة من منتصف تشرین الثاني 2014 ولغایة حزیران 2015. وقد شملت العینات الجلد المصاب، تقلیم الاظافر واجزاء من الشعر المصاب حيث وضعت العينات في قناني معقمة محكمة الغلق ونقلت الى مختبر الابحاث التابع لقسم علوم الحياة في كلية التربية/ جامعة كرميان تمهیدا لاجراء الفحوصات المختبریة اللازمة لتشخيص الفطريات الجلدية وقد تم التوصل الى النتائج التالية : من مجموع 220 عينة خضعت للفحص المجهري المباشر بواسطة 10% هيدروكسيد البوتاسيوم KOH ، 200 عينة ( 90.9% ) كانت موجبة لفحص هيدروكسيد البوتاسيوم في حين اظهرت نتائج الزرع المختبري نسبة اصابة كان مقدارها 80 عينة موجبة (36.4%). وبالاعتماد على موقع الاصابة بالجسم احتلت سعفة الجسم Tinea corporis اعلی نسبة اصابة بواقع 31% تلتها سعفة القدم Tinea pedis ، سعفة الاظافر، سعفة اليد، سعفة الفخذ ، سعفة الراس وسعفة اللحية حيث تكررت بواقع 26.5% ، 22.5% ، 8.5% ، 6% ، 5% و0.5% على التوالي. كشف الزرع المختبري عن نمو 80 عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى ثلاثة اجناس Trichophyton، Microsporum وEpidermophyton و13 نوع وكان الفطرTrichophyton rubrum هو الاكثر انتشارا وبنسبة 35% من بين الفطريات الجلدية التي تم عزلها وقد عزل النويع Trichophyton rubrum var.raubitschekii لاول مرة في العراق حيث تم عزله من سعفة الفخذ Tinea cruris. الفطر T.mentagrophytes سجل نسبة اصابة 17.5% من الفطريات الجلدية المعزولة تلاه الفطــر M.canis بنسبة 10% وT.tonsurans بنسبة 7.5% . اما الفطريات الجلدية الاخرى والتي شملت T. soudanese; T.interdigitale; T. terrestre فقد تكررت بنسبة 5% ، بينما T.concentricum; T. schoenleinii; T.verucosum; MicrosporumM. audouinii; M.gypsium وE.floccosum فقد تكررت وبواقع 2.5% لكل منها. اوضحت نتائج هضم الجين ITSالواقع في rDNA والتي تم مضاعفتها باستخدام تقنيةPCR عن التعدد الشكلي لطول للجين مابين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة. حيث اظهرت نتائج هضم الجين ITS لثمانين عزلة من الفطريات الجلدية والتي تعود الى 13 نوع عدد من الحزم المختلفة باستثناء الفطر M.auouiniiوالذي يفتقد الى موقع القطع الذي يعمل عليه انزيم القطع BstN1. ساعدت الدراسة الحالية على رسم العلاقة التطورية ما بين الانواع المختلفة للفطريات الجلدية المعزولة من خلال فحص التسلسل او التتابع الجينـــــــــي Gene sequencing للجين ITS,5.8S,ITS2، وقد حللت نتائج باستخدام برنامج تسلسل قاعدة البيانات Robust Phylogenetic Analysis program لرسم شجرة التقارب الجيني مابين الانواع الفطرية. تم الحصول على 12 سلالة لبكتريا Lactobacillus تعود لتسعة انواع وهيLactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus acidophilus; Lactobacillus collinoides A,B ; Lactobacillus fermentum; Lactobacillus helveticous ; Lactobacillus paracasei وLactobacillus salivarious . اظهرت دراسة الفعالية التثبيطية لانواع وسلالات بكتریا Lactobacillus على الفطرالاكثر تكراراTrichophyton rubrum باستخدام الراشح البكتيري ان النوع L.collinoides A هو الاقوى تاثيرا حيث وصل قطر منطقة التثبيط الى 14mmقبل اضافة الكليسرول ، غير ان النتائج التي تم الحصول عليها بعد اضافة الكليسرول اظهرت فرق كبير في فعالية البكتريا حيث وصل قطر منطقة التثبيط باستخدام النوع ذاته الى 33mm اما قيم MIC وMFC باستخدام طريقة التخفيف فقد بلغت 62.5) و(125 µL\ml على التوالي. اقوى الانواع البكتيرية التي اظهرت فعالية تضادية ضد الفطرT.rubrum باستخدام الخلايا الكاملة شملت L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus; L.plantarum والتي سببت تثبيط كامل لنمو الفطر كما ان قيم MIC وMFC باستخدام الخلایا الكاملة فقد بلـــــــغت (15.6 و31.3) µL\ml للانواع الـــتالية L. brevis 3; L. pentosus وL.collinoidis A على التوالي ، اما الانواع البكتيرية الطبيعية التي تم الحصول عليها من المهبل وهي L.plantarum 1 وL.acidophilus فقد اظهرت القيم التالية 31.3) وµL\ml (62.5 من MIC وMFC على التوالي. اظهرت نتائج التشخيص باستعمال جهازكروماتوغرافيا السائل عالي الكفاءة HPLC لقیاس تركیز احد مضادات الفطريات وهو Phenylacetic acid (PLA) في الراشح البكتيري لجميع السلالات البكتيرية والتي عددها 12 وتعود لتسعة انواع لبكتريا Lactobacillus بالاضافة الى الكبسولة العلاجية المستخدمة كسيطرة موجبة ان النوع L.plantarum 1 انتج اعلى تركيز من PLA الذي بلغ 19.6 ppmوالذي فاق تركيزه في السيطرة الموجبة البالغ 17.9ppm تلاه L.brevis 3 ثم L.acidophilus حيث بلغ تركيز PLA 17.2ppm و16.4 ppm على التوالي. | Two hundred and Twenty patients (157 females and 63 males) were examined and suspected to be infected with dermatophytes under the supervision of specialized physicians at the Dermatology unit of the General Hospital in Sulaimania Province\Iraq during the period from the middle of November 2014 to June 2015. Specimens were collected from patients included hair fragments, skin scraping and nail clipping which transferred to the research laboratory of Biology Department at College of Education\ University of Garmian, where they immediately examined. Out of 220 clinical specimens were subjected to the direct microscopic examination using 10% KOH, 200(90.9%) specimens were showed positive KOH test, while the laboratory culturing obtained 80(36.4%) positive cultures of dermatophytes. According to the infected sites of the body, tinea corporis was the most common type (31%) followed by tinea pedis, tinea unguium, tinea manuum, tinea cruris, tinea capitis and tinea barbae which were recorded 26.5%, 22.5%, 8.5%, 6%, 5% and 0.5% respectively. Based on the conventional laboratory methods, 80 clinical isolates of dermatophytes showed positive culture which belonging to three genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton and 13 species, Trichophyton rubrum was the most common species (35%) and Trichophyton.rubrum var.raubitschekii was isolated from tinea cruris for the first time in Iraq. Trichophyton mentagrophytes constitute 17.5% from the isolated dermatophytes followed by Microsporum canis (10%) and Trichophyton tonsurans (7.5%). Other species Trichophyton soudanese; Trichophyton interdigitale; Trichophyton terrestre represented 5% of dermatophytes while Trichophyton concentricum; Trichophyton schoenleinii; Trichophyton verucosum; Microsporum audouinii; Microsporum gypseum and Epidermophyton floccosum constitute only 2.5% of dermatophyte species.The results of PCR - RFLP showed the polymorphism of the Internal Transcript Spacer (ITS) region of the rDNA gene for different species of isolated dermatophytes. The results of the digested ITS PCR products of 80 clinical isolates belonging to 13 species revealed a number of recognition patterns with the exception of Microsporum audouinii which lacked restriction site of the used endonuclease restriction enzyme BstN1. The current study helped to drawing the phylogenetic relationship between the isolated dermatophytes by sequencing of the ITS1, 5.8S, and ITS2 gene. The ITS database sequences introduced Robust Phylogenetic Analysis program to draw the phylogenetic tree between dermatophyte species. Twelve strains belonging to nine species of Lactobacillus were identified as Lactobacillus pentosus; Lactobacillus plantarum 1; Lactobacillus plantarum 2; Lactobacillus acidophilus 1; two strains of Lactobacillus collinoides (identified as A and B); Lactobacillus fermentum 1; Lactobacillus helviticous, Lactobacillus brevis 1; Lactobacillus brevis 3; Lactobacillus paracasi and Lactobacillus salivarious. The study of antagonistic effect of Lactobacilli species and strains against the most frequent species of dermatophytres Trichophyton rubrum using the cell free supernatant (CFS) showed that L. collinoides A recorded the highest inhibition zone reached to 14 mm before addition of glycerol and increased to 33 mm after supplying glycerol into the MRS growth culture for the same species. The results of MIC and MFC values of the CFS were demonstrated by microdilution assay reached to (62.5 and 125) µL\ml respectively.The strongest species of Lactobacillus showed antifungal activity against T.rubrum by using entire cells included L. brevis 3; L. pentosus; L. acidophilus and L. plantarum were completely inhibited the fungal growth and the results of MIC and MFC of the bacterial entire cells reached to the values (15.6 and 31.3) µL\ml respectively for L. brevis 3; L. pentosus and L. collinoides A, in addition to the positive control while vaginal microbiota L. plantarum 1 and L. acidophilus exhibited (31. and 62.5) µL\ml respectively. The results of High Performance Liquid Chromotography (HPLC) analysis of antifungal compound, Phenylacetic acid (PLA) in the fermented CFS of 12 strains belonging to 9 species of Lactobacillus in addition to the probiotic capsule showed that the highest value of PLA was produced by L. plantarum 1(19.6 ppm) which is higher than the positive control (17.9 ppm) followed by L. brevis 3 and L. acidophilus reaching concentration of PLA 17.2 and 16.4 ppm respectively

استخلاص بعض المركبات الفعالة في نبات الرازقي Jasminum sambac L. المستزرع ودراسة فعاليتها في الخلايا السرطانية في الزجاج باستخدام الاجسام النانوية == Extraction of some active compounds in cultivated Jasminun sambac L. and study its activities against cancer cells in vitro by using nanoparticals

Author name: هديل مكي حبيب المؤمن
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش | محمد عبد الهادي غالي
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Doctorate
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى اختبار فاعلية المركبات الفعالة لنبات الرازقي Jasminum sambac ضد الخطوط السرطانية وزيادة كفاءة هذه المركبات باستعمال تقنيات النانوتكنولوجي. استخلصت المركبات الفعالة من جميع اجزاء النبات باستعمال اربعة مذيبات عضوية هي الكلوروفورم 99.4% والميثانول 99.8% و70% الميثانول والايثر البترولي, وقد كشف عن هذه المركبات نوعيا باستعمال الكشوفات الخاصة وتقنية TLC ، وكشف عنها كميا باستعمال تقنية HPLC. عزل مركب Jasminin iridiod glycoside ونقي وحسبت كميته في المستخلصات الاربعة باستعمال تقنية HPLC . اختبرت الفعالية السمية للمستخلص الكلوروفورمي وJasminin iridiod glycoside على الخطين الخلويين السرطانيين HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF باستعمال التراكيز 0.0 و7.81 و15.6 و20 و25 و31.25 و62.5 او 125 مايكروغرام/ مل ولمدة تعريض 24 ساعة، اذ حضرت جسيمات اللايبوسوم النانوية (liposome) بطريقة التجفيف - اعادة الترطيب (dehydration - rehydration) وباستعمال DMPC : Cholesterole بنسبة (50 : 45) ملغم/مل، وحملت بالمستخلص الكلوروفورمي او Jasminin بتركيز 50 مايكروغرام/ مل، وتم التحري عن كفاءة تحميل اللايبوسوم باستعمالHPLC وحدد حجم جسيمات اللايبوسوم باستعمال DSL ، وكشف عن وقيست شحنة اللايبوسوم باستعمال Zeta - Potential، وحدد شكل اللايبوسوم باستعمال المجهر اللالكتروني الماسح SEM، كما اختبرت سمية المستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin المحملة على الاجسام الدهنية النانوية على الخطوط الخلوية السرطانية HeLa وRD والخط الخلوي الطبيعي REF مقارنة بالمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin فقط ومجموعة السيطرة. اظهرت النتائج ان المستخلصات الاربعة (الكلوروفورمي والميثانولي99.8 و70% ميثانولي الايثر البترولي) تحتوي على القلويدات والفلافينويدات والتانينات والصابونيات والتربينات، وكانت كمية الـ Jasminin في المستخلص الكلوروفورمي والمستخلص الميثانولي وو المستخلص 70% ميثانول والمستخلص الايثر البترولي هي 111.38 ، 62.69 ، 61.50، 25.88 ومايكروغرام/ مل على التوالي من كل 100 ملغم/لتر. وكانت نتائج تحديد السمية ضد الخطوط الخلوية ان التركيز 125 مايكروغرام /مل للمستخلص الكلوروفورمي قد تسبب في اعلى نسبة تثبيط لخلايا الخطين الخلويين السرطانيين (HeLa وRD ) اذ بلغت في خلايا الخط الخلوي HeLa 72.51 وكانت في خلايا الخط الخلوي RD 64.28.في حين ادى استعمال الـ Jasminin الى نسبة تثبيط بلغت اقصاها باستعمال التركيز 125 مايكروغرام/ مل ضد خلايا الخط الخلوي HeLa 72.60 بينما كانت 67.27 ضد خلايا الخط الخلوي RD ، ولم يكن للمستخلص الكلوروفورمي والـ Jasminin تاثيرا تثبيطيا ضد خلايا REF. كانت شحنة اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي - 44.84 وحجمها 84.7. اما باستعمال الـ Jasminin فقد وصلت الى - 57.00 وبلغ حجمها 70.3 نانوميتر ، وظهرت جسيمات اللايبوسوم عند فحصها بالمجهر الالكتروني الماسح SEM كروية الشكل، اما تركيز المستخلص الكلوروفورمي فقد كان 20 مايكروغرام/مل في اللايبوسوم، وبلغت كفاءة تحميل اللايبوسوم له 40%، اما تركيز الـ Jasminin فقد كان 25.42 مايكروغرام/ مل في اللايبوسوم ووصلت كفاءة تحميله الى 50.84%. اظهرت نتائج سمية اللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي او الـ Jasminin ولثلاث مدد تعريض (24 و48 او 72 ساعة)، ان اعلى نسبة تثبيط كانت لللايبوسوم المحمل بالمستخلص الكلوروفورمي لخلايا الخط الخلوي HeLa وبلغت 84.31 مقارنة بنسبة 80.57 لخلايا الخط الخلوي RD وذلك بعد مرور 48 ساعة من التعريض. اما اللايبوسوم المحمل بالـ Jasminin فسجل اعلى تثبيط في خلايا الخط الخلوي HeLa والذي بلغ 80.90 ثم خلايا الخط الخلوي RD 87.18 وذلك بعد مرور48 ساعة من التعريض. | This study investigated the activity of natural compounds of the Jasminum sambac L. against cancer cell lines, and increased the active compounds efficiency by using nanotechnology. The active compounds were extracted by using four organic solvents (chloroform 99.4, methanol 99.8, 70% methanol and petroleum ether), detected qualitively by using special reagent and TLC technique, and quantitively by using HPLC technique. The Jasminin iridoid glycoside was isolated, purified accounted in four by using the HPLC technique. The cytotoxic activity of chloroform extract and Jasminin was tested on two cancer cell lines HeLa and RD, and the normal cell line REF by using the concentrations 0.0, 7.81, 15.6, 20, 25, 31.25, 62.5, or 125 µg/ml, for each one for 24 hours exposure time. Liposome was prepared by the dehydration - rehydration method by using DMPC : Cholesterol as (50 : 45) mg/ml ratio and loaded with 50 µg/ ml of chloroform extract or Jasminin. The liposomic encapsulated efficiency was detacted by using HPLC technique, liposome size by DSL. Detected the charged type and measure the liposome charged by zeta potential, and liposome shape were measured by using scanning electron microscope SEM, and the cytotoxic activity chloroformic extract or Jasminin on which loaded on liposome nanoparticals was tested on the cancer cell lines (HeLa and RD) and the normal cell line (REF) compared with unloaded extract and control cells. The results showed that the four extracts chloroformic, methanolic, 70% methanol and petroleum ether containing alkaloids, flavonoids, trpinoid, taninins and saponnins. The account of jasminin in chloroformic extract, methanolic extract,70% methanolic extract and petroleum ether extract was 111.38, 62.69, 61.50 and 25.88 µg/ ml respectively from 100mg/l. The results of cytotxicity against cell lines showed that the concentration 125 µg/ ml of chloroformic extract caused the highest inhibition percentage for the two cancer cell lines which reaches in HeLa cells line 72.51 and RD cells line 64.28, whereas the use of jasminin caused the maximum inhibitory percentage at the concentration 125 µg/ ml against HeLa cells line 72.60 and 67.27 for RD cells line, and there was no high inhibitory effect on REF cells line. The zeta potential of liposome loaded with chloroformic extract recorded - 44.84 and its size is 84.7 nm, whereas by useing of Jasminin it reached - 57.00 and its size was 70.3 nm. The scanning electron microscope (SEM) shows the spherical shape of liposome, whereby the concentration of chlroformic extract was 20µg/ ml in liposome, and the liposome encapsulated efficiency was 40%. The concentration of jasminin, on the other hand, was 25.42µg/ml in liposome and the encapsulated efficiency reaches 50.84%. The results of cytotxicity of liposome loaded with chloroformic extract and jasminin for three exposure times (24, 48 and 72) hours showed that the highest inhibition percentage in the liposome loaded with chloroformic extract for HeLa cells line recorded 84.31 and RD cells line was 80.57 after 48 hours from exposure. The liposome loaded with jasminin, by contrast, recorded the highest inhibition percentage in HeLa cells line 80.90 and RD cells line 87.18 after 48 hours from exposure.

دراسة بعض العوامل البكتيريولوجية والمناعية في اصابات المسالك البولية للنساء الحوامل == Study Of Some Bacteriological and Immunological Parameters In Urinary Tract Infection Of Pregnant Women

Author name: هديل كامل عباس الزبيدي
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت مئة وخمسون عينه ادرار ودم من نساء حوامل مصابات بالتهابات المسالك البوليه من مستشفى الولادة في محافظه اربيل وايضا من مستشفى العلويه للولادة في محافظه بغداد للفترة الزمنيه من كانون الاول 2012 الى اذار 2013,اخذت العينات من نساء حوامل تتراوح اعمارهم مابين 20 الى 35 سنة اذ تم عزل وتحديد البكتيريا السالبه لصبغه كرام من عينات ادرار النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البولية اضافة الى دراسة تاثير اشهر الحمل على مدى الاصابه خلال فترة الحمل , اظهرت نتائج الزرع على الاوساط الزرعية Blood agar and MacConkeys agar عزلات بكتيريه مختلفة وبنسب مختلفة. لقد تم تشخيص هذه العزلات بالفحص المجهري واستخدام الفحوصات الكيميائيه الحيويه , Api 20 E ونظام Vitek2 حيث تم تشخيص البكتربا ومعرفة حساسيتها للمضادات الحياتية اضافه الى اجناس التصنيف المصلي لبكتريا Pseudomonas aeruginosa كما تضمت الدراسة اجراء الفحوصات المناعية لمصل الحوامل وذلك بقياس مستوى الاجسام المضادة ((IgG , IgM , IgA وبعض مكونات نظام المتمم (,C3 C4 ) وذلك باستخدام طريقة الانتشار المناعي الاشعاعي (SRID ) ثم قياس مستوى عيارية C - Reactive Protein في النساء الحوامل المصابات بالتهابات المسالك البوليه . ظهرت نتائج الدراسة مايلي : 1. كانت اصابه مئة وثمانية (108) من النساء الحوامل من مجموع مئه وخمسون عينه ادرار بانواع مختلفة من بكتريا السالبة لصبغة كرام وهي عزلات E.coli (53% ) ثم عزلات بكتيريا baumannii Acinetobacter(23% ) , اما عزلات pneumoniae Klebsiella ( (14% mirabilis , Proteus ((12% بينما كانت عزلات Pseudomonas aeruginosa (%5.6 ).2. اثنان واربعون (42) من النساء الحوامل اضهرت عدم وجود اي نمو للبكتيريا.3. فحص حساسية المضادات الحياتيه للاجناس البكتيريه الخمسه المسببه لالتهاب المسالك البوليه لدى النساء الحوامل اظهرت مقاومة عالية لكل من ciprofloxacin بنسبة ( 86.5% ) وايضا Trimethoprim بنسبه (79.3%) بينما اظهرت الدراسه مقاومة قليله لكل من Tobramycin بنسبه (21.3% ) وايضا Norfloxacin بنسبه (23.7% ).4. تعدد الانماط المصليه لبكتيريا Pseudomonas aeruginosa حيث كانت (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 , O : 10) لكل من ( P1 , P2 P3 , P4 , P5 , P6) على التوالي مما يؤكد اختلاف توزيع الانماط المصليه وسعه انتشارها.5. ارتفاع معدلات للكلوبينات المناعية IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (±7.2 286 ( , IgA (503.3 ± 12.4) حيث اظهرت وجود فروق معنوية P<0.05)) بمقارنتها مع السيطرة.6. ارتفاع معدلات العامل المتمم لكل من C3 (204.3 ± 7.9) وارتفاع C4 (53 ± 2.8) حيث اظهرت وجود فروق معنوية ( P<0.05) بمقارنتها مع السيطرة .7. زيادة في عيارية المرضى الحوامل لـ C - Reactive Protein حيث اظهرت زيادة كلما تقدمت بفترة اشهر الحمل حيث ظهرت فروق معنوية عالية (P<0.01) في اشهر الحمل الثلاثة الاخيرة بينما كانت فروق معنوية اقل (P<0.05 ) لكل من الاشهر الحمل الستة الاولى. | One hundred and fifty urine and blood specimens are collected from pregnant women infected by urinary tract infections from the maternity hospital in Arbil and Al Alwaiya hospital for maternity in Baghdad for the period time from December 2012 to March 2013, the samples are taken from pregnant women with age ranging 20 to 35 years , as it has been to isolate and identify Gram - negative bacteria from urine samples of pregnant women with UTI in addition to study the effect of the third trimesters of pregnancy on the incidence of the infection during pregnancy. The results when cultured on the Blood agar and MacConkeys agar showed different bacterial isolates with different percentage. Diagnoses of these isolates by microscopic examination and by using biochemical tests, Api 20 E and Vitek2 system , knowing their sensitivity to anti - bacterial antibiotics , also serotyping classification of the bacteria Pseudomonas aeruginosa , study of some immunological parameters of serum pregnant women included measurement of level antibodies (IgG,IgM,IgA) and level of complement (C3,C4) by using single radial immune diffusion method (SRID) the study also included measurement of level of C - Reactive Protein for pregnant women with UTIs. The results of the study have showed the following : 1. One hundred and eight pregnant women are infected by different Gram - negative bacteria Characterized ( 53) isolates E.coli then followed by in second rank (23) isolates Acinetobacter baumannii, (14)isolates Klebsiella pneumoniae, (12) isolates for Proteus mirabilis and later (6) isolates for P. aeruginosa.2. Forty - two (42) of pregnant women show absence of any bacterial infections.3. Examine the sensitivity of antibiotics for each bacterial isolates causes of urinary tract infection in pregnant women showed high resistance to both ciprofloxacin (86.5%) and also Trimethoprim (79.3%), while the study showed low resistance for each of Tobramycin (21.3%) and also Norfloxacin(23.7%).4. Multiple serotypes of P. aeruginosa (O : 11 , O : 9 , O : 11 , O : 11 , O : 9 and O : 10) for each (P1 , P2 , P3 , P4 , P5 and P6) respectively , confirm different distribution and frequent spread of serotypes.5. High levels of immunoglobulines for IgG (2180.6 ± 28.4) , IgM (286 ± 7.2 (, IgA (503.3 ± 12.4) where there are significant differences at P<0.05 compared with control.6. High levels of complement factor for each of C3 (204.3 ± 7.9) and high C4 (53 ± 2.8) showed the existence of significant differences at P <0.05 when compared with the control.7. An increase in the normative pregnant patients for C - Reactive Protein showed an increase as months of pregnancy period progress and the differences appeared highly significant at P <0.01 in the last three months of pregnancy, while significant differences were lower at P <0.05 for each of the first six months of pregnancy.

تاثير حامض الجبرلين والبراسينولايد في بعض صفات النمو والحاصل لصنفين من نبات الشبنت Anethum graveolens L. == Effect of GA3 and Brassinolide on Some growth and Yield Parameters for two Cultivars of Plant Anethum graveolens L

Author name: وائل شاكر حميد الجبوري
Supervisor name: ماهر زكي فيصل الشمري
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت تجربة حقلية في الحديقة النباتية العائدة لقسم علوم الحياة، كلية التربية للعلوم الصرفة - ابن الهيثم - جامعة بغداد، في الموسم النمو 2015 - 2016 لدراسة تاثير تركيز حامض الجبرلين والبراسينولايد وتداخلهما في بعض الصفات المظهرية والكيميائية والمركبات الفعالة طبيا والحاصل ومكوناته في صنفين نبات الشبنت هما الصنف المحلي والصنف الهولندي. نفذت التجربة باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة Randomized Complete Block Design (RCBD) وبثلاثة مكررات اذ تضمنت الدراسة صنفين نبات الشبنت واضافة خمسة تراكيز من البراسينولايد هي (0 و0.5 و1 و2 و3) ملغم.لتر - 1 ورش حامض الجبرلين على المجموع الخضري بتركيز 50ملغم.لتر - 1 وبدون رشه. وبهذا تكون التجربة عاملية (2 × 2 × 5 ×3) اذ تضمنت 60 وحدة تجريبية، وسمدت الوحدات التجريبية وفق معاملاتها. ويمكن ايجاز النتائج التي تم الحصول عليها كما ياتي : 1. اختلاف صنفي نبات الشبنت (المحلي والهولندي) عن بعضهما في الصفات المدروسة، فقد تفوق الصنف المحلي على الصنف الهولندي في صفة ارتفاع النبات ووطول الحامل الزهري وتركيز الفسفور ونسبة الكاربوهيدرات في المجموع الخضري ونسبة الكاربوهيدرات في الثمار ووزن 1000ثمرة. فيما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي في صفة طول الجذر وحجم الجذر وقطر الساق والوزن الرطب والوزن الجاف ومعدل النمو المطلق واستدامة الكتلة الحيوية وعدد النورات الزهرية وحاصل الثمار في النبات الواحد وحاصل الثمار في الوحدة التجريبية الواحدة وحاصل الثمار الكلي وتركيز النتروجين في المجموع الخضري وتركيز الكالسيوم وتركيز البوتاسيوم وتركيز المغنيسيوم ونسبة البروتين في المجموع الخضري ومحتوى الكلوروفيل الكلي في الاوراق وتركيز النتروجين في الثمار، نسبة البروتين في الثمار ونسبة الزيت والوزن النوعي.2. اظهرت الدراسة ان المعاملة بحامض الجبرلين والبراسينولايد والتداخل بينهما ادى الى زيادة معنوية في الصفات المدروسة ، عند رش 50 ملغم.لتر - 1 من حامض الجبرلين وتركيز 2 ملغم.لتر - 1 في معظم الصفات والبعض منها عند التركيز 1 ملغم. لتر - 1 من البراسينولايد على المعاملات الاخرى. 3. اظهرت نتائج الفحص والتشخيص الكروماتوغرافي باستعمال تقنية HPLC تشخيص ستة مركبات فعالة في الزيت الطيار لبذور صنفي نبات الشبنت هي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole وP - anisaldehyde وLinalool). وقـد تـفوق الصنـف المحــلي على الصنـــف الهـولـندي باعطائــه اعــــلى تركـيــز لكل مــن المركبات الفــــعالـــة هـــما P - anisaldehyde) وLinalool)، عند رش حامض الجبرلين بتركيز 50 ملغم . لتر - 1 والبراسينولايد بتركيز1 ملغم. لتر - 1 ، بينما تفوق الصنف الهولندي على الصنف المحلي باعطائـه اعلى تركيز للمركبات الفعالة وهي : (Anethol وLimonene وCarvone وDillapiole) عند رش 50 ملغم. لتر - 1 الجبرلين و2 ملغم. لتر - 1 البراسينولايد. | A Field study was conducted at the farm of Biology Department, College of Education (Ibn AL - Haitham) for pure science, University of Baghdad during the growth season 2015 - 2016, on study the effect of Gibberellic acid concentration and brassinolide and their intraction on both morphological and chemical characteristics, the components of yield, determining the medically active compoands in two varieties of Dill plant, local and Holand varieties.The experiment was designed as Randomzied Complete Block Design (R C B D) with three replications. which two varieties of Dill plant and spray of Gibberellic acid (50) mg.liter - 1 and non spray and five concentration of brassinolide (0, 0.5 , 1,2 and 3) mg.liter - 1 The experiment was as designed factorial experiment (2x2x5x3) included sixty experimental units The plants were managed fertilized recommaded.Can be summarized the results that were obtained as follows : 1.different the variety of dill plant (local and holand) from each other in the traits, the local variety surpassed the holand variety in the plant height, the length of the pregnant syphilis, Concentration of phosphate, the percentage of carbohydrates in the shoot, the percentage of carbohydrates in the fruits, weight of a thousand fruits. As outweigh the holand variety at the local variety in the character of the root length, root size, stem diameter, wet weight, dry weight, the absolute growth rate, the sustainability of biomass, the number of inflorescences, holds fruits per plant, holds the fruits in a single experimental unit, holds overall fruits, Concentration nitrogen in the shoot, calcium Concentration, potassium Concentration, the percentage of protein in the shoot, the total chlorophyll content in the leaves, the Concentration of nitrogen in the fruits, the percentage Albroonin in fruits, oil content, specific weight.2. The study showed that treatment with acid and Gibberellin and brassinolide and overlap between them led to a significant increase in the traits, at a spray 50 mg.L - 1 Gibberellin acid and concentration of 2 mg.L - 1 in most qualities and some of them at a concentration of 1 mg.L - 1 brassinolide the rest of the transactions.3. Screening and diagnosis chromatographic results showed the use of HPLC technique diagnosed six compounds in the volatile oil fruit plant varieties Dill are : (Anethol , Limonene , Carvone , Dillapiole , P - anisaldehyde and Linalool). Local variety was higher than the holand variety by giving it the highest concentration of the two active compounds are P - anisaldehyde and Linalool), especially when the spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid and 1 mg. L - 1 of brassinolide, while the superiority of the holand breed Local product by giving it the highest concentration of other active compounds which four : (Anethol , Limonene , Carvone and Dillapiole), especially at a spray of 50 mg. L - 1 of gibberellic acid. and 2 mg. L - 1 of brassinolide.

تعدد الاشكال الوراثية للحركيات الخلوية ?،4، 6، 10 و12وخطر الاصابة بداء الذئب الاحمراري لدى المريضات العراقيات == Cytokine Genetic Polymorphism of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10, and IL - 12 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus among Iraqi female Patients

Author name: هبة شاكر احمد
Supervisor name: طالب عبد الله حسين | علي حسين ادحيه
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: داء الذئب الاحمراري هو احد امراض المناعة الذاتية ولم يتم معرفة المسببات جيدا على وجه الدقة، ولكن تم اقتراح الاستعداد الوراثي والعوامل البيئية، فضلا عن العوامل الهرمونية لما لها من دور مؤثر في امراضية داء الذئب الاحمراري. حددت هذه الدراسة العلاقة الوظيفية بين مستوى مصل خمسة من السايتوكينات (IL - 2، IL - 4 وIL - 6، IL - 10 وIL - 12) وتعدد الاشكال الخلوية النيوكليوتيدية المنفردة بها؛ تعدد الاشكال في 11 موقع (IL2 - 330، IL2 + 160، IL4 - 1098، IL4 - 590، IL4 - 330، IL6 - 174، IL6 + 565، IL10 - 1082، IL10 - 819، IL10 - 592 وIL12B - 1188) في عينة من 45 من النساء العراقيات العربيات المصابات بداء الذئب الاحمراري من اللواتي يراجعن العيادة الاستشارية/ قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي خلال الفترة من حزيران ولغاية تشرين الاول 2013. فضلا عن، شملت الدراسة 43 من النساء الاصحاء كمجموعة سيطرة. وتم الحصول على النتائج التالية : كان هنالك انخفاض كبير في المكونات المتممة C3 وC4 (P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري (0.57 ± 0.04 و0.06 ± 0.01 غم/ لتر على التوالي) مقارنة مع مجموعة السيطرة (1.12 ± 0.04 و0.22 ± 0.01، غم/ لتر، على التوالي). وكان معظم المرضى ايجابيين للمضاد النووي والاجسام المضادة لشريط الحامض النووي منقوص الاوكسجين المزدوج المضاد (91.1 و88.9٪ على التوالي)، في حين كانت هنالك نسبة 9.3٪ فقط من مجموعة السيطرة الايجابيين لهذه الاجسام المضادة وكان هذا الفرق كبير (P ≤ 0.001) في كلتا الحالتين. واظهرت عمليات تقييم مستويات السايتوكينات في المصل ان IL - 2 ينخفض انخفاض معنوي كبير(P ≤ 0.001) لدى مرضى داء الذئب الاحمراري مقارنة بمجموعة السيطرة (25.6 ± 1.2 مقابل 35.1 ± 2.1 بيكوغرام/ مل)، وكان هنالك انخفاض في الانترلوكين - 4 ايضا لدى المرضى ( 17.9 ± 2.7 مقابل 22.2 ± 1.9 بيكوغرام / مل)، ولكن هذا الانخفاض لم يكن معنويا (P > 0.05). مقابل16.7 ± 1.0 بيكوغرام/ مل) 26.0 ± 4.3) وعلى العكس فان الانترلوكين - 6 والانترلوكين - 10 36.4 ± 1.8) مقابل 29.5 ± 0.8 بيكوغرام/ مل)، والانترلوكين - 12 24.4 ± 2.3) مقابل 19.2 ± 0.9 بيكوغرام/ مل) اظهرت زيادة كبيرة لدى مرضى داء الذئب الاحمراري.تم تشخيص 11 من السايتوكينات المتعددة الاشكال الخلوية المنفردة واظهر فقط الموقع 590 في الانترلوكين - 4 والموقع 188 في الانترلوكين - 12 اختلافات كبيرة بين المرضى ومجموعة السيطرة. وقد لوحظ ان هناك زيادة معنوية في تردد الطراز الجيني TTفي الموقع 590 للانترلوكين - 4 (66.6 مقابل 41.9٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.78؛ P = 0.03) والتي تم ملاحظتها في المرضى. في المقابل، انخفض تردد الاليل C بشكل ملحوظ لدى المرضى (24.4 مقابل 41.9٪، PF = 0.23؛ P = 0.02) والاليل T (P = 0.02 75.6 مقابل 58.1٪، ونسبة الخطا النسبي = 2.23). وبالنسبة للموقع B - 1188في الانترلوكين - 12، اظهر الطراز الوراثي CC زيادة معنوية في التردد لدى المرضى مقارنة مع مجموعة السيطرة (73.4 مقابل 46.5٪، ونسبة الخطا النسبي في = 3.16؛ P = 0.016)، ولوحظت زيادة مماثلة في التردد في الاليل C (80.0 مقابل 62.8٪ ؛ RR = 2.37؛ P = 0.013). وعلى العكس، فان الطراز الوراثي AC (13.3 مقابل 32.6٪، PF = 0.22؛ P = 0.042) والليل A (20.0 vs.37.2٪، PF = 0.22؛ P = 0.013) انخفضت تردداتها بشكل ملحوظ لدى المرضى. وجرى تقييم اثر تشخيص الطراز الوراثي للاشكال الخلوية المتعددة المنفردة للسايتوكينات على مستوى المصل لكل من الانترلوكين - 2، الانترلوكين - 4 والانترلوكين - 6 ، الانترلوكين - 10 والانترلوكين - 12 لدى مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. وتم الحصول على ملاحظات مختلفة، وارتبطت بعض الانماط الجينية مع زيادة مستوى السايتوكينات، في حين ارتبطت الاخرى مع انخفاض المستوى. في كلتا الحالتين لوحظت اختلافات بين مرضى داء الذئب الاحمراري ومجموعة السيطرة. | Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease and its precise etiology is not well - defined, but genetic predisposition and environmental factors, as well as hormonal factors have been suggested to play important roles in SLE pathogenesis. The present study determined the functional correlation between serum level of five cytokines (IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12) and their single nucleotide polymorphisms; SNPs at 11 positions (IL2 - 330, IL2+160, IL4 - 1098, IL4 - 590, IL4 - 330, IL6 - 174, IL6+565, IL10 - 1082, IL10 - 819, IL10 - 592 and IL12B - 1188) in a sample of 45 Iraqi Arab female SLE patients, who were referred to the Consultant Clinic at the Department of Rheumatology, Baghdad Teaching Hospital during the period June - October 2013. In addition, 43 apparently healthy women were further included in the study as a control group. The following results were obtained : Complement components C3 and C4 were significantly (P ≤ 0.001) decreased in SLE patients (0.57 ± 0.04 and 0.06 ± 0.01 g/L, respectively) compared to controls (1.12 ± 0.04 and 0.22 ± 0.01, g/L, respectively).Most of the patients were positive for anti - nuclear and anti - double strand DNA antibodies (91.1 and 88.9%, respectively), while only 9.3% of controls were positive for these autoantibodies. Such difference was significant (P ≤ 0.001) in both cases.Assessments of cytokine serum levels revealed that IL - 2 showed a significant (P ≤ 0.001) decreased level in SLE patients compared to controls (25.6 ± 1.2 vs. 35.1 ± 2.1 pg/ml), and IL - 4 was also decreased in patients (17.9 ± 2.7 vs. 22.2 ± 1.9 pg/ml), but the difference was not significant (P > 0.05). In contrast, IL - 6 (26.0 ± 4.3 vs. 16.7 ± 1.0 pg/ml), IL - 10 (36.4 ± 1.8 vs. 29.5 ± 0.8 pg/ml) and IL - 12 (24.4 ± 2.3 vs. 19.2 ± 0.9 pg/ml) were significantly increased in SLE patients.Out of the 11 investigated cytokine SNPs, only IL4 - 590 and IL12B - 1188 showed significant variations between patients and controls. A significant increased frequency of IL4 - 590 TT genotype (66.6 vs. 41.9%; Odd’s ratio = 2.78; P = 0.03) and T allele (75.6 vs. 58.1%; Odd’s ratio = 2.23; P = 0.02) was observed in patients. In contrast, C allele frequency was significantly decreased in patients (24.4 vs. 41.9%; PF = 0.23; P = 0.02). For IL12B - 1188, CC genotype showed a significant increased frequency in patients compared to controls (73.4 vs. 46.5%; Odd’s ratio = 3.16; P = 0.016), and a similar increased frequency was observed in C allele (80.0 vs. 62.8%; RR = 2.37; P = 0.013). In contrast, AC genotype (13.3 vs. 32.6%; PF = 0.22; P = 0.042) and A allele (20.0 vs.37.2%; PF = 0.22; P = 0.013) frequencies were significantly decreased in patients.The impact of investigated cytokine SNP genotypes on serum level of IL - 2, IL - 4, IL - 6, IL - 10 and IL - 12 was also assessed in SLE patients and controls. Different observations were made and some genotypes were associated with increased level of cytokines, while others were presented with a decreased level. In both cases differences between SLE patients and controls were observed.

دراسة جزيئية ونسيجية مناعية للنساء المصابات بمرض سرطان الثدي في محافظة ذي قار,العراق == Molecular and Immunohistochemical Study in Women with Breast Cancer in Thi - Qar Province

Author name: هبة لفتة عبد الغالبي
Supervisor name: منال بادي صالح | مها شاكر حسن
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: English
University location: Dhi Qar
First pages:
Abstract: Breast cancer is a complex and multifactorial disease resulting in abnormal cell growth that leads to malignant tumor formation.In this study we focus on mutations of breast cancer susceptibility genes 1 and 2 (BRCA1 and BRCA2), immunohistochemical evaluation of estrogen, progesterone, HER - 2 receptors, ABO blood groups , white blood cells and clinicopathological parameter ( age, breast feeding, family history and tumor site) .Eighty five blood samples were taken from patients who attended Al - Hussain teaching hospital and oncology unit in Al - Habboby hospital during the period (from August /2014 to April /2015) , fifty blood samples were collected from healthy women as a control group who attended Al - Hussain teaching hospital and divided into groups according to age, family history, age at first brith, breast feeding. For histopathological and immunohistochemical analysis fifty tissue samples were collected from patients with breast cancer who were undergoing surgical resection (mastectomy). Blood samples were obtained by venepuncture , using a 5 ml disposable syringe , and they were divided into three aliquots, which were 1 ml, 2 ml and 2ml, for collect serum, genetic studies and hematological parameters (leucocycte count and ABO blood groups) study. The tissue samples were collected from the 50 patients with breast cancer for histopathological diagnosis and for Immunohistochemical analysis (estrogen receptor, progesterone receptor and here2/nue) The total patients were divided according to their age in to five groups (30 - 39), (40 - 49), (50 - 59), (60 - 69) and (≥70 years). results of present study revealed that a highest incidence of breast cancer (41%) occur in the age oup between 40 - 49 years, there is a significant difference among patients groups (P ≤ 0.01).The results of our study showed that (77) of patients lactating and from those according to period of lactation we found that the highest percentage of patients (37.6%) were lactating for period between (18 - 22months) and the lowest percentage (10.38%) lactating for period between (1 - 6 month). Family history of breast cancer indicates a strong association with risk of developing breast cancer. The result of the present study revealed that the family history positive in 31 cases (36.47%), and 54 cases (63.52%) had negative family history of breast cancer.The results of present study showed that (41.5%) had first birth at age (20 - 29years), (23.37%) had their first birth in age group (15 - 19 years) and (30 - 39 years), and (9.09%) had first birth at age (≥40 years).Regarding the tumor site, we found that most of patients (50.5%) the tumor mass was located in the right side and (38.8%) cases the tumor mass were located in the left side.The DNA was extracted from blood samples by using Accupower® genomic DNA extraction kit. Each concentration and purity of all DNA samples have been measured by Nanodrop. Samples with a purity ranged from 1.2 to 1.8 have been enrolled in this study for the molecular detection of BRCA1/2 gene mutation in patients and control groups. Detection of BRCA1/2 gene mutation by multiplex PCR revealed that (185 del AG mutation in BRCA1 gene) was detected in 6 patients (7.05%) out of 85 cases with breast cancer, and (5382 ins C) mutation in the same gene was detected in 2 patients (2.35%). Regarding (6174 del T) mutation in BRCA2 gene was detected in 3 patients (3.52%). While this mutation was not detected in the control groups.Histopathologically, carcinoma was divided into 44 cases (88%) ductal carcinoma {from which 42 cases (84%) were invasive ductal carcinoma, and 2 cases (4%) were comedocarcinoma}, and 6 cases (12%) cases invasive lobular carcinoma. Results revealed that 2 cases (4%) were stage I, 13 cases (26%) were stage II, 24 cases (48%) were stage III and 11 cases (22%) were stage IV, also our results showed that the 2 cases (4%) were grade I, 23 cases (46%) were grade II and 25 cases (50%) were grade III. The results of immunohistochemical analysis for breast cancer samples showed that Estrogen receptors were present in 36 cases (72%), and 14 cases (28%) were negative, while Progesterone receptors detected in 27 cases (54%), and 23 cases (46%) were negative, on the other hand the expression of HER - 2/neu showed positive results in 28 cases (56%), and 22 cases (44%) were negative.Regarding the ABO blood groups, we found that most of the cases carry blood group A (40 cases, 47.05 %), and the lowest frequency was for blood group AB (7 cases, 8.23%).The results of the present study showed that leukocytes count, lymphocytes count, monocytes count, neutrophils count and basophiles count were lower in patients than the control group, with a significant difference (p value ≤ o.o1). While the eosinophils count was significantly higher in patients than the controls (p value ≤ o.o1).

دراسة الهياة الكروموسومية لنوع من اسماك المياه العذبة العراقية سمكة ابو الزمير العميق Mystus pelusius == Karyotyping Study of one Species of Iraqi Freshwater Fish ( Mystus pelusius )

Author name: هبة حسين رسن
Supervisor name: اسماء سامي ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: The fish has a great economic and environmental importance, however the cytogenetic studies on them still few, especially the chromosomal studies of local fish, therefore current study aimed to identify the karyotype (Chromosomal type and number) and the sex determination system to a species of Iraqi freshwater fish, which is Mystus pelusius (Solander in Russell, 1794) fish in Iraq, as (20) fish (10) male and (10) female were hunted from Tigris river in Al - Kraat area of Bagdad city.The current study was done to investigate the karyotype, where the chromosomal preparations has been preparing from kidney cells according to (air - drying technique).The results of the males and females kidney cells metaphase chromosomes study showed that the diploid chromosome number was 2n=32, which represents less chromosomal number recorded so far in the studied Iraqi fish, also the results showed that the males chromosomal types included 2n=(6m+13sm+7st+6t) and fundamental number FN=51, the females chromosomal type was 2n=(6m+12sm+8st+6t) and FN=50, also it observed that the first sub metacentric pair was the largest within the biarmed chromosomes.The results revealed that the male (heterogamety) and the female (homogamety), accordingly it follows the sex determination system (XX/XY), as the (X) chromosome represented by medium sized submetacentric (sm) chromosome and (Y) chromosome by small sized subtelocentric (st) chromosome.The results of Giemsa - banding technique (G - banding) showed that the rich regions with Guanine (G) and Cytosine (C) nitrogen bases called (G - light) bands and the rich regions with adenine (A) and thymine (T) called (G - dark) bands, thus it determined more accurately the sister chromosomes in Mystus pelusius males and females, more over thistechnique described sex chromosomes better, it has been observed that most chromosomes in both sexes have (G - light) bands, as all (uniarmed) (telocentric, subtelocentric) autosomes pairs entirely contain (G - light) bands, while in the (biarmed) (metacentric, submetacentric) autosomes chromosomes the light bands concentrated in their telomeres, while the rest regions of these biarmed chromosomes have dark bands. Results of (G - banding) technique confirmed which was shown by the traditional pigmentation method (Giemsa staining technique) about the sex chromosomes discrimination, where this technique showed more accurately and better that the male was heterogamety through a observation of medium sized submetacentric (X) chromosome with (G - light) bands in telomric position of (short arm), while the subtelocentric (Y) chromosome was the larger within the uniarmed chromosomes and it was marked by being entirely dark and lack of (G - light) bands, while it was observed in females a medium sized submetacentric (sm) pairs with (G - light) bands in the telomeric of long and short arms which represents (XX) sex chromosomes, and according to this the females considered to be homogamety and the males heterogamety, and proved that the sex determination system in Mystus pelusius fish was a simple sex determination system of (XX/XY) type

دراسة انتاجية البكتريوسين من بكتريا Enterococcus faecium المعزولة من مصادر سريرية == Study of the Bacteriocin production from Enterococcus faecium isolated From clinical sources

Author name: هاله عباس جاسم
Supervisor name: خليل مصطفى خماس | شروق ريس كاظم
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 290 عينة سريرية من المرضى الراقدين والمراجعين لمستشفيات بغداد وتوزعت هذه العينات الى 177عينة ادرارو113 عينة خروج ، اظهرت نتائج الزرع البكتريولوجي على وسط المكورات المعوية الانتخابي Ej media ووسط المكورات المعوية التاكيدي Bile esculin azide agar والتشخيص المظهري والكيميوحيوي وتاكيد التشخيص باستخدام نظام API 20 strep تشخيص 27عزلة(%9.31) من بكتريا Enterococcus faecium من عدد العينات الكلي ،وكانت 11 عزلة ( 6.21%) منهامن الادرارو16 %14.15)) عزلة من الخروج . اختبرت حساسية عزلات E.faeciumل11 نوع من المضادات الحيوية واظهرت النتائج مقاومة عالية لل Naldixic acid(81%)و (63%) TetracyclineوAmpicilin (52%)بينما كانت المقاومة لل Ciprofloxacin(48%)و(41%) Erythromycin .ومن الناحية الاخرى اظهرت العزلات مقاومة واطئة لل Penicillin (26%) وNitrofurantion (22%)و وVancomycin (18%)وكانت (19%)لل Trimethprim و(15%)Chloramphenicol. كانت (7%)فقط من العزلات مقاومةللGentamycin.اجريت تجارب التحري عن البكتريوسين من بكتريا E.faecium وكانت جميع العزلات منتجة (100%)ولمدى واسع من التاثير على البكتريا الموجبة والسالبة مع اقطار تثبيط (8 - 15 )مليمتر و(9 - 27)مليمتر على العزلات العائدة لنفس النوع . اختيرت العزلة EH(1) كعزلة كفوءة الانتاج مع فعالية نوعية 1.28 وحدة/مايكروكرام بروتين بتركيز بروتين 250 مايكروكرام /مليمتر بعد ان قيست الفعالية في العزلات(EH1,EH6,EH13) التي كانت افضل العزلات انتاجية للبكتريوسين بطريقة الاقراص. ووجد ان وسط Mann Regusa Sharp السائل والصلب هو افضل وسط لانتاج البكتريوسين من بكتريا E.faecium وان هذه البكتريا تنتج البكتريوسين في درجات حرارية بين 16 - 45 م ، واختيرت العزلة E3 والبكتريا Staphylococcus aureus, Staphylococcs epidermidis,Escherichia coli, Sallmonella كعزلات دالة ، استخلص البكتريوسين من العزلةE1 بصورته الخام بعد تنمية هذه العزلة على وسط Mann Regusa sharp السائل وتم الحصول على بكتريوسين ذي فعالية نوعية )1,28 وحدة / مايكرو كرام) بروتين وبتركيز بروتين 250 (مايكروكرام /مليلتر) وهذا البكتريوسين مقاوم للدرجات الحرارية (80,100، 121)م لمدة (15 و30 )دقيقة ، كذلك مقاوم لمدى من الرقم الهيدروجيني (8 - 2) ،ومقاوم للخزن في درجات حرارة (0،4 ،37) م لمدة (يوم ,اسبوع) . اجريت التنقية الجزئية للبكتريوسين الخام المستخلص من العزلة E1 بالترسيب بكبريتات الامونيوم وبنسب اشباع ( 40% و75% )واظهرت النتائج ان الترسيب بـ40%كان الافضل الذي بلغت الفعالية النوعيةفيه 44.137 وحدة/مايكروكرام بروتين وبتركيز بروتين 290 مايكروكرام/مليمتر . وكانت فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا ثابتةعند 80م لمدة 30 دقيقة و100 م لمدة (15,5)دقيقة لكن انخفضت فعاليته لتصل الى 0.8 )وحدة /مايكروكرام بروتين( في 30 دقيقة , وفقدت الفعاليةعند121م لمدة 15 دقيقة ، كانت الفاعلية ثابتة عند مدى من الرقم الهيدروجيني (8.5 - 5.5) والخزن عند صفردرجة مئوية لمدة اسبوع. | The study has involved collecting (290) clinical samples collected from admitted and refeard patients of Baghdad hospitals .The samples distributed into (177) urine sample and (113) faeces samples . Results from bacteriological culture on selective Enterococcus medium EJ medium , Enterococcus medium (bile esculin azide agar) in addition to morphological and biochemical identification and confirmation of the identification by using of API 20 strep system showed that only27 isolates (9.31%) were identified as Enterococcus faecium ,11 (6.21% ) isolate from urine samples and 16isolate (14.15% ) from faeces samples . The Antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecium isolates was tested towards 11 types of antimicrobial agents .The isolate showed a high resistance to Naldixic acid (81%) ,Tetracycline (63%) and ampicilin (52%) ,while (48%) of the isolate were resistant to Ciprofloxocin and (41%)resistant to Erythromycin . From the other hand Enterococcus faecium isolates showed low resistance to otherantimicrobial agent : Pencilin(26%),Nitrofurantion (22%) , Vancomycin (18%) and Trimethprim (19%) and Chloramphenicol (15%). Only(7%) of the isolates were resistant to gentamycin . Bacteriocin detection experments were carried on Enterococcus faecium and the results that all isolates were produce bacteriocin (100%) with wide range effect on gram positive and negative bacteria bacterial growth , with diameter (8 - 15)millimeter and (9 - 27)millimeter on the same isolates species ,EH1 isolate chosen as the best producer isolate bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration(250) microgram/ millimeter after the activity detected in isolates EH1,EH6,EH13 were the best bacteriocin production isolates by using disk method on the Mann Regusa Sharp agar . And founded the solid and broth Man Ragusa sharp medium was the best medium for bacteriocin production from E.faecium and this bacteria produce bacteriocin in tempreture degree between )16 - 45(C, E3isolate and the bacteria Salmonella ,Escherichia coli ,Staphylococcus aureus ,staphylococcus epidermidis chosen as indicating isolates, the bacteriocin extracted from E1in the crude form after growth this isolate on Mann Regusa Sharp broth and obtained on bacteriocin with specific activity (1.28)unit/microgram of protein with protein concentration (250) microgram /millimeter and this bacteriocin resistant for tempreture degrees 80,100,121 C for (15 ,30) minute also resistant to PH range (2 - 8) and resistant the storage in tempreture degree 0C,4 Cfor (day ,week). Then partial purification applied for this crude bacteriocin by precipitation with Ammonium sulphate of (40%,75%) saturation percentage .Results showed the precipitation in percentage 40% was the best with a specific activity reached in it to 44,137unit /migrogram protein and protein concentration 290 microgram/millimeter . The partial purified bacteriocin activity was stable at 80C for 30 minutes ,100C for( 5 ,15) minute ,but its activity decrease to reach to 0.8 unit/mg protein in 30 minute and lost activity in 121 C for 15 minute. Its activity was stable in PH (5.5 - 8.5) and storage at 0C for week

دراسة التاثير الخلطي لبعض المضادات الحيوية على فعالية المكونات الخلوية لبكتريا البروسيل == Study the effect of some antibiotics combination on the cell component activity for Brucella Spp

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تم عزل نوعين من بكتريا البروسيلا وتحديد انماطها الحيوية وهي البروسيلا المجــــــــــهضة (Brucella abortus)والبروسيلا المالطية (Brucella melitensis)المعزولة من الانسان . وتحديد حساسيتها لمضادات الحيوية وتــــــــحديد التركيز المثبط الادنىMIC))لبعض المضادات الحيوية المستخدمة في علاج داء البروسيلوسز Brucellosis)). فضلا عن التحري عن التاثير الخلطي لمضادات الحيوية وعند التراكيز تحت المثبطة الدنيا (sub - MIC)في نموها وعلى المكونات الخلوية المتمثلة بفعاليات انزيماتها, ونفاذية غشائها الخلوي ومكونات عديد السكرايد الشحمي المستخلص منها وعوامل التصاقها (Colony factor), فضلا عن تاثيرها في طور المستعمرات والتصاق خلايا البروسيلا على سطح الخلايا الطلائية . حيث اظهرت النتائج الاتي : • ان النمطين الحيويين السابع من البروسلا المجهضة والثالث من البروسيلا المالطية هما الاكثر انتشارا .• حساسية عزلات البروسيلا المجهضة والمالطية لكل من مضادات,Gentamicin,Kanamycin,Tobramycin,Naldixic acid .فيما قاومت مضادات,Lincomycin Rifampicin , Cephalaxicin ( وعلى التوالي .• بلغ التركيز المثبط الادنى لمضادات Doxycyclin ,Tetracyclin,Streptomycin ,Erythromycin ,Rifampicin (5,10,10,40,40) مكغم/مل وعلى التوالي • وجود تاثير تازري في نمو بكتريا عند خلط كل من مضاديDoxycyclin+Rifampicin,Erythromycin+Doxycyclin ,Erythromycin+Rifampicin,Tetracyclin+Rifampicin ,Tetracyclin+Erythromycin• غير مضاد Doxycyclin طور المستعمرات الملساء للبروسيلا الى طورها المتوسط فيما لم يوثر مضاد Rifampicin في طور المستعمرات فبقيت ملساء, وغير خلط مضاديDoxycyclin+Rifampicin طور المستعمرات الى الطور الخشن الفاقد للامراضية . • ثبط مضاديDoxycyclin+Rifampicin انتاج انزيمات Catalase ,Urease ,Oxidase ,Nitrate reductaseمن قبل البروسيلا المالطية والمجهضة عند استخدامها بصورة مفردة وخلطية • جاء التاثير الخلطي لمضادات Doxycyclin+Rifampicin تازريا في مكونات عديد السكرايد الشحمي عندما خفض نسبة المكونات السكرية والدهنية في مستخلص عديد السكرايد الشحمي بطوره المائي والفينولي لتبلغ المكونات السكرية للمستخلص(147,144) مكغم/مل للبروسيلا المجهضة بطورها المائي والفينولي وعلى التوالي و(145,138)مكغم/مل للبروسيلا المالطية وبطوريها المائي والفينولي . ومقارنة مع معاملة السيطرة(172,189) مكغم/مل بطوريها المائي والفينولي . اما المكونات الدهنية فبلغت لمستخلص البروسيلا المجهضة (60.6,56.5 )مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي ولمستخلص البروسيلا المالطية (44.4,36.3 )مكغم/مل وعلى التوالي لطوريها الفينولي والمائي ومقارنة بمعاملة السيطرة للبروسيلا المجهضة (82.1,77.3) مكغم/مل وللبروسيلا المالطية(92.1,64.6) مكغم/مل بطوريها الفينولي والمائي وعلى التوالي .• تبين قدرة كل من البروسيلا المالطية والمجهضة على تكوين عوامل الالتصاق بانواعـــــــــــها الثلاثة (CAF/I, CAF/II ,CAF/III), فضلا عن تكوينها لانواع اخرى من عوامل الالتصاق تم الكشف عنها وبطرائق محورة . كما استطاعت المضادات الحيوية المستخدمة خــــــــــلطا (Doxycyclin+Rifampicin )من منع خلايا البروسيلا عن تكوين هذه العوامل كافة.• اثر استخدام مضادي Doxycyclin+Rifampicinخلطا على خفض عدد خلايا البروسيلا الملتصقة بسطوح الخلايا الطلائية مسببا خفض اعدادها لتبغ معدل عدد الخلايا للبروسيلا المجهضة 6, وللبروسيلا المالطية 3 مقارنة بمعاملة السيطرة 51 و55 وعلى التوالي .• تسبب معاملة البروسيلا بمضاديDoxycyclin+Rifampicin خلطا خللا في نفاذية غشائها الخلوي السايتوبلازمي ونضوحا لحامضها النووي عندما بلغ طيف الامتصاص حامضها النووي(2.21,2.33) لكل من البروسيلا المجهضة والمالطية وعلى التوالي ومقارنة بمعاملة السيطرة(0.72,0.73). | Two types of Brucella isolated from human included Br. abortus and Br. melitensis were determine there biotype, Antibiotic sensitivity and MIC for some antibiotic used for brucellosis treatment were applied.mixed affect of antibiotics at concentrations of sub MIC on the growth and on cellular containt of brucella represented by enzymatic activity, cellular membrane permeability lipopolysaccharide contents,colony phase,colony adhesion factor beside adhesion on epithelial cells to brucella.the results showed that biotype 7 from Br.abortus and biotype 3 from Br. melitensis were the dominant isolated. All isolated of Br . abortus , Br. melitensis sensitive completely to gentamycin, kanamycin ,tobramycin, naldixic acid while its resistantto lincomycin ,rifampicin ,cephlothin , doxycyline The MIC to doxycycline,tetracycline,streptomycine,erythromycine,rifampicin were ( 40 , 40 , 10 , 10 ,5 ) g/ml respeactivelly.There was a synergistic effect on bacterial growth when the following antibiotics mixed as follow : ( doxycyline - rifampicin , erythromycin - rifampicin , rifampicin - tetracycline , erthromycin - tetracycline )The doxycycline had changed the colony from smooth phase to intermediate phase while the rifampicin had not affect the smooth phase . The mixed affect of doxycylin _ rifampicin have changed the smooth colonies to rough colonies .Both doxycyline , rifampicine inhibited the activity of catalase , urease , oxidase , nitrate , reductase that produced by Br. abortus and Br.melitensisThe synergistic effect of doxycycline and Rifampicin on the content of lipopolysaccharide.The mixed effect of antibiotic caused a decrase in the polysaccharides in aqueous and phenolic phases .In this case it gave a values (144,147) g/ml for Br. abortus and (138,145) g/ml for Br. melitensis in comparison with contral with read to(172,180.1) g/ml to aqueous and phenolic extraction respeactivelly. While the lipid content showed value of (60.6,56.5) g/ml for Br. abortus and (44.4,36.3) for Br. melitensis in comparison with control that gave a values (82.1,77.3) g/ml for Br. abortus and (92.1,64.6) for Br. melitensis in aqueous and phenolic phases respeactivelly .Both Br.abortus and Br. melitensis had ability to from colony adhesion factor(CAF/I,CAF/II,CAF/III) in addition to another colony factors(i.e CAF/III) that had modified due to presence of tannic acid. The mixed effect of doxycycline - Rfampicin inhibit the formation of these factor.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin causesd a decrase of brucella adhesion on the epithelial cell surface.The average of Br. abortus (6) and Br. mlitensis(3) in comparison with control 51,55 cell/filed respectively.The mixed effect of Doxycycline - Rifampicin caused a defeact in cytoplasmic membrane permeability hance the absorbance of Naldaxic acid a values 2.21,2.33 for Br. abortus and Br.melitensis in comparison with acontrol that showed avalues 0.72,0.73 respectivelly.

التحديد الجزيئي لجين مقاومة مضاد الفنكومايسين في انواع جنس الانتيروكوكس والعنقوديات الذهبية == Molecular Detection of Vancomycin Resistance Gene in Enterococcus Spp. and Staphylococcus aureus

Author name: هادي حسين عباس القريشي
Supervisor name: انتصار ناظم خلخال | زهير نعمان حمد العاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تشكل البكتريا التابعة لجنس Enterococcus جزءا مهما من النبيت الطبيعي للقناة الهضميه ،تجويف الفم والمهبل ، وقد برزت في الوقت الحاضر كممرضات مكتسبة من المستشفيات ،وعدت E.faecalis & E.faeciumالانواع العوامل الرئيسه لاصابات المستشفى الحادة ضمن جنسEnterococcus ذات الصلة بالالتهابات الخطرة ويحدث فشل علاج هذه الالتهابات بسبب المقاومة الداخلية (المتاصلة) والاخرى المنتقلة للادوية والعقارات المستخدمة .لذا فقد صممت الدراسة الحالية للكشف عن حركة وانتقال جينات المقاومة ضمن الانواع التابعة لجنس Enterococcus وS.aureus كمكورات موجبة لصبغة غرام(Gram positive) مسببة لاصابات المستشفيات.امكن تقسيم هذه الدراسة الى جزئين رئيسين : الاول : الجانب البكتريولوجي : جمعت (705) عينة ادرار من مصابين بالتهابات المسالك البولية(UTI) من ثلاثة مستشفيات(الكندي التعليمي،ابن البلدي والشهيد الصدر) في مدينة بغداد خلال اربعة اشهر للفترة من(شباط - ايار2014). وقد بينت النتائج ان (105) عزلة منها تعود للجنس Enterococcus.كما تم الحصول على (299) عزلة لبكتريا S.aureus من مجموع (413 )مسحة جروح وحروق .شملت الدراسة مرضى من كافة الفئات العمرية ومن كلا الجنسين.شخصت العزلات العائدة لجنس Enterococcus باجراء اختبارات تمهيدية من خلال زرع العزلات على اوساط تفريقية (Azide blood agar) وملونة (chromo agar UTI orientation ) واخرى محورة(modified media) .كما اجريت اختبارات تاكيدية لتشخيص العزلات الى مستوى النوع وهي : vetik 2 system فضلا عن استخدام بوادئ متخصصة لجينات(primers) ddl للنوعين E.faecalis E.faecium and .لذا امكن تمييز(55)عزلة تعود للنوع E.faecalis(% 7.8) و(50)عزلةشخصت كونها تعود للنوع E.faecium(% 7.1).اما عزلات S.aureus فقد زرعت على وسط اكار المانيتول الملحي (mannitole salt agar)كاختبار تمهيدي لتشخيص العزلات بانها تعود للنوع aureus، ولتاكيد التشخيص فقد تم تنمية العزلات على اوساط اختيارية عالية الدقة والخصوصية شملت(chromoagar S. aureus and chromoagar MRSA) اذ تعتمد نتيجة التشخيص هنا على طبيعة التفاعل الملون بين انزيمات الكائن المجهري المراد التحري عنه وبعض المتفاعلات (reagents) على مثل هكذا اوساط زرعية فضلا عن استخدام (femA gene) البادئ المتخصص بهذا الجين، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات(299) كانت تعود للنوع ستاف اوريس (162) من عزلات الحروق و(137) من عزلات الجروح.كما اظهرت النتائج ان (135) عزله (100%) كانت مقاومة للمثيسيلين (82) من عزلات الحروق اي مايعادل(60.7%) و(53) من عزلات الجروح اي مانسبته (39.3%).تم التحري عن حساسية جميع عزلاتE.faecium and E.faecalis تجاه المضاد الحيوي فانكومايسين بطريقة Disc diffusion method فضلا عن تحديد التركيز المثبط الادنى (MIC) وقد بينت النتائج ان (20) عزلة من النوع E.faecalis و(20) اخرى من النوع E.faecium كانت بين مقاومة ومتوسطة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وقد تم تاكيد النتائج بعد زرع هذه العزلات على الوسط الخاص ببكتريا Enterococcus المقاومة لمضاد الفانكومايسن ((VRE medium،اذ ظهرت المستعمرات بلون وردي مقارنة بالعزلات الحساسة لهذا المضاد والتي تظهر مستعمراتها بلون ازرق .واظهرت (13) عزلة لبكيريا ستاف اوريس مقاومة واضحة تجاه مضاد الفانكومايسين وحددت قيم (MIC) . عزلت بلازميدات المقاومة للفانكومايسين من عزلاتEnterococcusوS. aureusالمقاومة لهذا المضاد بطريقة (plasmid profile) method plasmid extraction وبينت النتائج ان جميع هذه العزلات تحتوي بلازميدات مختلفة الحجام من حيث عدد ازواج القواعد النتروجينية ( Kbp ). ثانيا : الجانب الجزيئي : شخصت عزلاتE.faecalis and E.faecium باستخدام بوادئ متخصصة للجين (ddl) لكلا النوعين كذلك بادئ متخصص للجين fem A لعزلات S. aureus كما استخدمت بوادئ متخصصة للجينات (VanS,R,A and B) ل(40) عزلة لكلا نوعي جنسEnterococcus المقاومة للفانكومايسين واستخدمت نفس البوادئ مع ( 13 ) عزلة S. aureus كانت مقاومة لهذا المضاد . ولتحديد تعاقبات جينات( van R,S and A) للعزلات قيد الدراسة فقد ارسلت نواتج عمليةPCR الى(NCBI) في الولايات المتحدة الامريكة، وقد اظهرت النتائج ان جميع العزلات التابعة للنوعين(E.faecalis and E. faecium) كانت تمتلك جينات (Van R,S,and A) المسؤولة عن صفة المقاومة لمضاد الفانكومايسين وكانت حجوم هذه الجينات1094,733 bp)،650) بالتعاقب ،ولم يتم الكشف عن الجين B في عزلات Enterococcus لكلا النوعين. امكن استنتاج النقاط الاتية من الدراسة الحالية : 1 - اكتسبت عزلات S. aureusالمقاومة نوعA تجاه مضاد الفانكومايسين ، كما ظهر انها تمتلك جينات Van S and R.2 - كانت المقاومة للفانكومايسن في جميع العزلات قيد الدراسة والمقاومة للفانكومايسين هي صفة بلازميدية بسبب فقدانها بعد عمل Curing .3 - اظهرت عملية اجراء التعاقبات للجينات Van S,R and A لعزلات Enterococcusاظهرت تطابقا بم يقارب (99%) مع الجين المرجع من جهة ومع بعضها الاخر من جهة اخرى.4 - بينت تعاقبات جيناتS. aureus (99%) تطابقا مع مثيلاتها في عزلات Enterococcus.5 - كان مصدر المقاومة لمضاد الفانكومايسين هو من عزلات Enterococcusومنها انتقلت صفة المقاومة لعزلات S. aureu | Enterococci form a part of the normal flora of the intestinal tract, oral cavity and the vagina. In recent time; they have become emerged as a nosocomial pathogens. Among Enterococcus genus; Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis are the main causative agents for serious relevant nosocomial infections. The therapeutic failure of enterococcal infections are mainly due to the intrinsic as well as transferable drug resistance,so the current study have been performed to detect the movement or transfer of resistance genes among Enterococcus sp.and Staphylococcus aureus (S.aureus) as a nosocomial Gram - positive cocci. This study could be divided into two aspect : I : Bacteriological aspect : During the period from February / 2014 to May / 2014, one hundred and five enterococcal isolates were isolated from a total of (705) urine samples collected from patients with urinary tract infections (UTI) who attended to three hospitals ( Al - Kindy teaching hospital, Ibn - Al - Balady and Al - Shaheed - Al - Sader ) at Baghdad city .Also 299 isolates of S. aureus were obtained from 413 wound and burn swabs . Patients included in this study were from all age groups and of both genders .The Enterococcus isolates were diagnosed by using the preliminary tests (azide blood agar,chromogenic that included chromoagar UTI orientation , VRE chromagar and modified media). As well as confirmative tests have been conducted for identification of Enterococcus to species level; these tests included vitek 2 System and ddl E.faecalis and ddl E.faecium gene primers ,therefore (55)7.8% isolates were identified as; E.faecalis while (50) 7.1% isolates were detected as E.faecium from 705 urine sample .S.aureus have been diagnosed by preliminary test by culturing the suspected isolates on mannitol salt agar then confirmative test were carried out ; by employing high specialized and accurate chromogenic S. aureus media ( chromagar S. aureus ) , also some of S. aureus isolated identified by vitek 2 system, and other isolates identified by house keeping gene primer special to S. aureus (Fem A gene) ,the results have been shown that;(299)isolates were identified as S. aureus from 413sample was included 232 burn and 181 wound samples . Also from 299 of S. aureus that included 162 isolates from burn and 137 isolates from wound, 135(100%) isolates was methicillin resistance after inoculcated on chromagar MRSA was included 82(60.7%) burn isolates and 53(39.3%) wound isolates. E. faecalis and E. faecium isolates were screened for their antibiotic resistance against vancomycin by disc diffusion test (Kirby - Bauer) method and determination MIC,the results have revealed that (20) isolates of E. faecium and (20) isolates of E.faecium were between resistant and intermediate resistance to vancomycin antibiotic and these results were ensured by culturing of VRE isolates on VRE medium and the colonies showed pink color compared with vancomycin sensitive isolates which appeared blue. As well as the results were showed that (13) isolates of S. aureus were resistant to vancomycin when tested for vancomycin sensitivity and MIC value. Plasmid have been extracted and isolated from those (40) isolates of E.faecalis , E.faecium and 13(8.5%) isolates of S. aureus that were resistant to vancomycin included 8 ( 4.9%)isolates from burn and 5(3.6%) isolates from wound . the results have been showed that all of VRE and S. aureus were contained plasmids with multiple size of Kbp.II; Molecular aspect : E.faecalis and E.faecium have been identified by using the ddl gene primers of both E.faecalis and E.faecium , as well as fem A gene primer of S. aureus . Van S,R, Aand B primer genes special to 40 isolates of Enterococcus that resistant to vancomycin were detected by MIC determination,as well as we used the same primers genes that special to Enterococcus to S. aureus which were resistant to vancomycin and the PCR product were sequencing to comprised each of Van S,R,and A genes in both of bacterial species shown that the results were ,all isolates of E.faecium and E. faecalis should have Van R/S and A genes which were responsible for vancomycin resistance and the size of these genes 650 bp,1094bp and 733bp respectively, no van B gene resistance had been detected among all isolates of Enterococcus of both species . and the conclusion from this study was : - S. aureus gained resistance toward antibiotic vancomycin type A, S. aureus was also harboring van R and VanS genes . - Vancomycin resistance in all isolates of Enterococcus and S. aureus. was a plasmid born character since it has been lost and upon curing of the plasmid - Sequencing of Van R,S and A genes in Enterococcus have shown 99% of alignment with reference gene on one hand with each other on other hand - Sequencing of resistance genes in S. aureus have show 99% alignment with those of Enterococcus . - Members of genus Enterococcus are the source of Vancomycin resistance and from which it transfer to S. aureus. - Vancomycin resistance is a plasmid born characters since it was lostduring curing process using acridine orange.

تاثير بعض الاحياء الدقيقة والمركبات الكيميائيه ومستخلص زيت بذور نبات الحنظل في نمو وتكوين الغشاء الحيوي لخميره المبيضات (Candida albicans) == Effect of some Microorganisms,Chemical Compounds and Citrullus colocynthis Seed Extract on the Growth and Composition of the Biofilm of (Candida albicans)

Author name: نـور ناجي حسن
Supervisor name: عبد العزيز مجيد الكبيسي | فياض شريف
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدف البحث دراسة تكوين الغشاء الاحيائي من قبل عزلات سريرية محلية لخميره المبيضات Candida albicans ، تاثيرات مستخلص زيت بذورنبات الحنظل والمعروف باسم التفاح المر Citrullus colocynthis وتضاد الخميرة Saccharomyces cerevisiae والبكتريا Lactobacillus spp. في نمو وتكوين الغشاء الحيوي من قبل الخميره C. albicans بالمقارنة مع المضادات الحيوية الفطرية Amphotericin B وNystatin وFluconazole. من بين 50 عزلة جمعت من مرضى يعانون انواع مختلفة من اصابات محتملة بداء المبيضات من مستشفى ابن البلدي للاطفال والامومة ومستشفى بغداد التعليمي التابع لمدينه الطب في بغداد ، تبين وجود 35 عزلة موجبة لخميره Candida. عشرون عزلة (57.14%) كانت للفطر C. albicans ، 6 عزلات (17.14%) C. glabrata ، 4 عزلات (11.42%) C. tropicalis ، 3 عزلات (8.57) C. lusitariae ، عزلتان (5.71) للفطر C. lipolytica . التراكيز الدنيا المثبطة لنمو 5 عزلات من الفطر C. albicans من المضادات الحيوية Amphotericin B وNystatin وFluconazoleكانت 16 - 8 مكغم/مل ، 64 - 32 مكغم/مل و1024 - 256مكغم/مل على التوالي. نمو جميع العزلات الخمسة للخميره C. albicans كانت حساسة لـتركيز 0.1 ،6 ،10 و100 ملغم/مل من مستخلص بذور نبات الحنظل بمناطق تثبيط نمو باقطار 13 - 14،15 - 17،17 - 19 و19 - 22 ملم على التوالي. كما ثبط راسب خلايا خميره S. cerevisiae نمو بعض عزلات الفطر C. albicans بينما لم يثبط راسب ولرااشح مزرعة خلايا البكتريا Lactobacillus spp. نمو الفطر. تم تقدير كميات الغشاء الحيوي للفطر C. albicans بطريقتي Congo - Red Agar وTissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining والتان اظهرتا توافقا عاليا وبينتا قدرة 17 عزلة من الفطر C. albicans على تكوين الغشاء الحيوي سميت 5 منها انها موجبة و12 متوسطة و3 سالبة مقارنة بمعاملتي المقارنة الموجبة والسالبة. خفض المضاد الحيوي Flucanozol (250 - 1000 مكغم/مل) ومستخلص بذور نبات الحنظل (6 و10 ملغم/مل) تكوين الغشاء الحيوي للفطر الى مستوى المقارنة السالبة. كما خفض الراشح (OD 0.141) والراسب (OD 0.160) لخميرة S. cerevisiae والراشح (OD 0.161) لبكتريا الاكتو تكوين الغشاء الحيوي للفطر بنسبة حوالي 50% من المقارنة الموجبة (OD 0.370) و50% من تاثير المقارنة السالبة (OD 0.070). | The current study aimed to studying biofilm formation by local clinical isolates of Candida albicans ,the effect of the medicinal plant Citrullus colocynthis seed extract commonly known as (Bitter apple) and antagonistic activity of the yeast Saccharomyces cerevisiae and the bacteria Lactobacillus spp. on growth and biofilm formation by C. albicans compared to the antifungal antibiotics Amphotericin B, Nystatin and Fluconazole. Out of 50 clinical samples were collected from patients suffering from variety of suspected Candida infections in Ibn - Balady children and maternity hospital and Baghdad teaching hospital(Medical City) in Baghdad, 35 were positive for Candida species. Twenty isolates (57.14%) were identified as C. albicans ,6 isolates (17.14%) C. glabrata,4 isolates (11.42%) C. tropicalis,3 isolates (8.57) C. lusitariae,and 2 isolates (5.71) C. lipolytica. The minimum inhibitory concentration ( MICs) of Amphotericin B tested on five isolates of C. albicans ranged between 8 - 16 µg/ml, Nystatin 32 - 64 µg/ml and Fluconazole 256 - 1024 µg/ml. The growth of all five isolates of C. albicans were shown to be sensitive to Citrullus colocynthis seed extract with inhibition zone of 13 - 14,15 - 17,17 - 19 and 19 - 22 mm at concentrations 0.1,6,10 and 100 mg/ml respectively. The cellular lysis of S. cerevisiae inhibited growth of some isolates of C. albicans ;however, neither cellular lysis nor cell - free supernatant of Lactobacillus spp. showed inhibitory activity. Biofilm of C. albicans was quantified by Congo - Red Agar Method and Tissue Culture Plate method - Crystal Violet Staining which were shown to be highly correlated and revealed presence of 17 biofilm - forming isolates,5 termed positive and 12 moderate while 3 were negative compared to positive and negative controls. Flucanozol (250 - 1000 µg/ml) and Citrullus colocynthis seed extract (6 and 10 mg/ml) reduced biofilm formation down to the negative control level. Both cell - free supernatant (OD 0.141) and cellular lysis (OD 0.160) of S. cerevisiae and cell - free supernatant (OD 0.161) of Lactobacillus sp. reduced Candida biofilm formation about 50% of the positive control (OD 0.370) and about 50% of the effect of the negative control (OD 0.070).

التعرف على بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثيسيلين من العينات السريرية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتحري عن حساسيتها للسفتارولاين ولمضادات حيوية اخرى == Identification of Methicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) from Clinical Samples Using PCR Techinque and Detection of Its Susceptibility to Ceftaroline and other Antibiotics

Author name: نور ماجد عبد الله الدليمي
Supervisor name: امنة نصيف جاسم | عباس عبد المعيد مصطفى
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ﺷﻤﻠﺖ ﻫﺬﻩ ﺍﻟﺪﺭﺍﺳﺔ جمع ( ٢٢۰ ) عينة من Hospitalized Patients في مستشفى بغداد التعليمي في مدينة الطب (العراق/ بغداد)، خلال الفترة من شهر تشرين الثاني /٢۰۱٣ الى شهرنيسان/ ٢۰١٤. تضمنت العينات )۷۰) مسحة من الحروق ، (٥٦) عينة دم،(٥٤) مسحة من الاذن، (٤۰) عينة ادرار. ﺍﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﺩﺭﺍﺳﺔ ﺍﻥ۱۰۸) ٤۹٫۰٣٪ (من العزلات تعود الى جنس Staphylococcus aureus حيث اعطت نتيجة موجبة لفحص الانزيم المخثر للبلازما (Coagulase - Positive Staphylococci) COPS،في حين اعطت ۱۱٢ )٥۰٫۹٪(من العزلات نتيجة سالبة لفحص الانزيم المخثر للبلازماCoagulase - Negative Staphylococci )CONS .من بين ۱۰۸ عزلة بكتيرية من COPS شخصت۸٥ )۷۸٫۷٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين MRSA ) ( methicillin resistance Staphylococcus aureus طبقا لاختبار الحساسية للمضادات الحياتية وجهاز الفايتكvitek system،بينما شخصت ٢٣ )٢۱٫۹٪( عزلة بكتيرية على انها بكتريا العنقوديات الذهبية الحساسة للميثسيلين methicillin sensitive Staphylococcus aureus) MSSA . تم تحديد اختبار الحساسية لعزلات المكورات العنقودية لعشرة من مضادات الحياة باستخدام طريقة الانتشار بالاقراص،وكانت نسبة مقاومة بكتريا المكورات العنقودية للمضادات كالاتي : جنتامايسين ٦۰ )٥٥٫٥٦٪( ,ارثرومايسين ۷۰)٦٤٫۸١٪(،كلندامايسين ۸١)۷٥٪( ,سيفوكستين ۸۹)۸٢٫٤١٪( ,كلورامفينيكول وبنسيلين جي ۹۰)۸٣٫٣٣٪( ,اوكزاسلين ۸٦)۷۹٫٦٣٪(،فانكومايسين ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(،واخيرا الميثسيلين ۸٥)۷۸٫۷۰٪(.ﻭﻟﻘﺪ اﻅﻬﺮﺕ ﺍﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺍﻟﺘﻲ ﺗﻢ ﺍﻟﺤﺼﻮﻝ ﻋﻠﻴﻬﺎ ﻣﻦ ﺍﺧﺘﺒﺎﺭ ﺍﻟﺤﺴﺎﺳﻴﺔ ﻟﻠﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ انها ﻛﺎﻧﺖ ﻣﻘﺎﻭﻣﺔ ﻟﻠﻌﺪﻳﺪ ﻣﻦ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩﺍﺕ ﺍﻟﺤﻴﻮﻳﺔ ﺍﻷﺧﺮﻯ ﺑﺎﻹﺿﺎﻓﺔ اﻟﻰ للميثسيلين. نتائج جهاز الفايتك كانت متقاربة مع نتائج اختبار الحساسية للمضادات الحياتية لنفس المضادات التي استخدمت في كلا الاختبارين ،ماعدا نتيجة مضاد الفانكومايسين حيث كان الفرق بالنتيجة كبير ،كانت نسبة الحساسية للمضاد بواسطة الانتشار بالاقراص ٢٤ )٢٢٫٢٢٪(، بينما بواسطة جهاز الفايتك كانت النتيجة )۸٫٣٣٪(.السبب وراء الاختلاف بالنتيجة قد يعزى الى ظروف الاختبار ونوعية التقنية المستخدمة. اعلى نسبة من المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثسيلين عزلت من عينات الجروح ،حيث بلغت هذه النسبة (۹٣٫۸۷٪)،في حين اقل نسبة من هذه االبكتريا عزلت من عينات الادرار ،حيث بلغت النسبة (٥۰٪). اجري تشخيص تاكيدي للعزلات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة لمعرفة عائديتها الى نفس النوع من البكتريا عن طريق تضخيم جينmecA ،واظهرت ۸٥ عزلة بكتيرية نتيجة موجبة تفيد باحتوائها على هذا الجين. في الدراسة الحالية، مضاد السفتارولاين هو المضاد المثالي للعلاج، بسبب فعاليته القاتلة ضد بكتريا العنقوديات الذهبية المقاومة للميثسيلين .حيث اختبرت فعاليتة وتاثيره عللى ۸٥ عزلة من البكتريا المقاومة للميثسيلين،كل العزلات التي اختبرت كانت حساسة لهذا المضاد.تم تحديد اختبار التركيز المثبط الادنى MIC لعزلات المكورات العنقودية الذهبية لمضاد السفتارولاين,۸١( ۹٥٫٢۹٪) عزلة كانت قيمة ال MIC لها ۰٫٥مايكروغرام/مل ، ٣ (٣٫٥٢٪) ثلاث عزلات كانت قيمة ال MIC لها (۰٫٢٥مايكروغرام/مل) , و۱(۱٫۱۷٪) عزلة واحدة كانت قيمة ال MIC لها (۰٫١٢ مايكروغرام/مل) . اظهرت النتائج ان قيم تركيز المثبط الادنى للمضاد قد تراوحت بين (۰٫٥ - ۰٫١٢ مايكروغرام/مل). | Two hundred and twenty clinical samples were collected from hospitalized patients in Baghdad Teaching Hospitals in Medical City (Baghdad /Iraq), during the period From November/ 2013 to April /2014. The samples included : (70) burn swab, (56) blood, (54) ear swab, and (40) urine sample. It was found that (49.03%) of the 108 isolates, which belong to Staphylococcus aureus, were diagnosed as coagulase - positive staphylococci (COPS); while 112 (50.9%) of clinical samples were coagulase negative (CONS). From the collected clinical samples that gave positive result in coagulase (108) there 85(78.7%) of it was (MRSA) methicillin resistance S. aureus according to sensitivity test and vitek 2 system. The rest were (MSSA) methicillin susceptible S. aureus 23(21.9%). The pattern of antibiotic susceptibility of S. aureus isolates included 10 antibotics (Gentamycin, Erythromycin Clindamycin, Cefoxitin, Chloramphenicol, Penicillin G, Oxacillin, Vancomycin, Tetracycline, and Methicillin), which determined using disc diffusion method. There were a variable resistance percentage for the rest of antibiotics : Gentamycin 60 (55.56%), Erythromycin 70(64.81%), Clindamycin 81 (75.00%), Cefoxitin 89 (82.41%), Chloramphenicol and Penicillin G, 90 (83.33%), Oxacillin 86 (79.63%), Vancomycin 24 (22.22%), and Methicillin 85 (78.70%) . The results obtained from antimicrobial sensitivity test showed that MRSA isolates were resistant to many other antimicrobial agents in addition to the Methicillin (Multi - drug Resistant). The results of vitak - 2 were closely with those obtained from sensitivity test for all antibiotics that used in both tests, except vancomycin; the percentage of vancomycin in disk diffusion was 24 (22.22%), while the percentage in vitek system was 9 (8.33%).The reason behind the difference in results is attributed to the conditions of tests used and type of techniques. The highest percentage of MRSA isolate was from burn samples; it was 93.87%, while the lower percentage of MRSA isolate was from urine samples (50%). A confirmatory test was carried out for the selected isolates using PCR technique for further characterization up to the species level by the amplification of mecA gene (Staphylococcus aureus specific gene) and all the isolates are found to be positive for the presence of mecA gene. In the present study, ceftaroline is a drug of choice, because of its bactericidal activity against Methicillin - resistant S. aureus .The effectiveness of the ceftaroline antibiotic is being tested on 85 isolates of Methicillin - resistant S. aureus (MRSA); all isolates were sensitive to ceftaroline. The pattern of minimum inhibitory concentration of MRSA isolates to ceftaroline, was determined using MIC method. For 81 (95.29%) MRSA isolates the MIC (0.5 µg/ml), 3 (3.52%) MRSA isolates the MIC (0.25 µg/ml), and 1(1.17%) MRSA isolate the MIC (0.12 µg/ml). The results revealed that MIC range from (0.5 µg/ml - 0.12 µg/ml) respectively.

ترافق بعض مجاميع الدم البشرية واضدادها مع مرض السكري النمط - 1 للانسان == Association of some human blood groups and antibodies with type - 1 diabetes

Author name: نور عبد الاله خليل حسين
Supervisor name: خضر حسن علي الجوراني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: شملت الدراسة 126 نموذجا لمرضى السكري النمط ـ1 (T1D) Type - 1 Diabetes قورنت بـ 100 نموذجا لاصحاء مقاربة بالعمر والجنس مع المرضى. اهتمت الدراسة في ايجاد ترددات مجاميع الدم A وB وO وAB وLe(a+b - )وLe(a - b+) وLe(a - b - )و MMوMN وNNوSS وSsوss فضلا عن دراسة عيارية الاضداد للمرضى والاصحاء اذ استعملت طريقة تنميط مجموعة الدم ABO وLewis وMNSs واستعمل فحص تثبيط التراص لتحديد قابلية الافراز للنمط Le(a - b - ). جاءت النتائج لتشير الى زيادة ملحوظة في تردد مجموعة الدم O ، اذ كانت 39.68% في المرضى و28% في الاصحاء (مربع كاي 7.097 وباحتمالية P<0.01 ). فيما صاحب تردد مجموعة الدم A انخفاضا ملحوظا في المرضى فكان 20.63% اما في الاصحاء فكان 37% (مربع كاي 6.159 واحتمالية P<0.05) .اما مجموعة الدم B فظهرت بتردد 28.57% في المرضى و23% في الاصحاء (مربع كاي 3.615 واحتمالية P<0.05). وانخفض تردد مجموعة الدم AB انخفاضا طفيفا في المرضى عنه في الاصحاء ، اذ كان في المرضى 11.11% و12% في الاصحاء وبفرق غير معنوي (مربع كاي 0.804).ولوحظ دور المجموعة Le(a+b - ) في القابلية لاحداث المرض ، اذ بلغ ترددها في المرضى 30.95% فيما كان في الاصحاء 21% واشار التحليل الاحصائي الى وجود فروق معنوية لهذا الفرق (مربع كاي 5.882 واحتمالية P<0.05). واظهرت المجموعة Le(a - b - ) دورا هاما في قابلية الاصابة بالمرض وبتردد بلغ 18.25% في المرضى و11% في الاصحاء (مربع كاي 4.604 واحتمالية P<0.05). في حين اظهرت المجموعة Le(a - b+) دورا مقاوما للمرض.وقد تبين دور الافراز في احتمالية الاصابة بالسكري النمط ـ1 وذلك بارتفاع تردد الفارزين عن غير الفارزين ، فقد كان في المرضى 69.56% على حين كان في الاصحاء 45.45% وبمعنوية عالية (مربع كاي 11.601 واحتمالية P<0.01). اما مجموعة غير الفارزين فاظهرت مقاومة للاصابة بالمرض.لقد برز دور مجموعة الدم MNSs في المرض ، اذ بلغ تـردد المجمـوعة MN في المرضى 55.55% مقارنة بالاصحاء 41% (مربع كاي 6.377 واحتمالية P<0.05). وقد لعبت المجموعة Ss دورا في المرض وبتردد 23.80% في المرضى مقارنة بتردد 11% في الاصحاء (مربع كاي 7.067 واحتمالية P<0.01)، على حين كانت بعض مجاميع دم MNSs مقاومة للمرض. درست عيارية الاضداد للانماط الدموية تحت الدراسة وقد لوحظ من نتائج الدراسة وجود ارتباط بين بعض المجاميع الدموية وعيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب Anti - rabbit red blood corpuscles antibodies في مصول مرضى السكري النمط ـ1 مقارنة بالاصحاء اذ استعمل اختبار التحري عن عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب. كان النمطين A وAB اكثر الانماط اظهارا لعياريات عالية ، اذ بلغت في المجموعة A 1949.5 ± 938.7 . اما في المجموعة AB قد كانت 1940.6 ± 1331.3 مقارنة بالاصحاء والتي بلغت 1487.6 ± 1237.5 في المجموعة A و714.7 ± 510.4 في المجموعة AB وكان التحليل الاحصائي ذا شان (قيمة T 35.844 واحتمالية P<0.01) و(قيمة T 167.78 وباحتمالية P<0.01) على التوالي.ان المجموعة Le(a - b+) ارتفعت فيها عيارية الاضداد الضادة لكريات دم الارنب ، اذ بلغت 1852.9 ± 948.7 في المرضى و1387.3 ± 1192.1 في الاصحاء (قيمة T 51.802 واحتمالية P<0.01).اما عيارية النمط Le(a+b - ) اذ بلغت 1824.8 ± 979.6 في المرضى و1091.1 ± 1088.8 في الاصحاء (قيمة T 40.816 وباحتمالية P<0.01).على حين كانت العيارية للنمط Le(a - b - ) هي 1444 ± 1069.6 في المرضى و1198.6 ± 742.6 في الاصحاء (قيمة T 63.470 وباحتمالية P<0.01). درس مورث الافراز Secretory gene بالنسبة الى عيارية الاضداد، قد كان غير الفارزين ذو عيارية ضادة لكريات دم الارنب عالية مقارنة بالفارزين اذ بلغت في المرضى 2052.6 ± 1557.2 مقارنة بالاصحاء البالغة 1386.7 ± 794.9 (قيمة T 172.65 واحتمالية P<0.01).اما ما يخص مجموعة الدم MNSs ، فقد اظهر النمط MN عيارية مرتفعة والبالغة 1815.3 ± 962.9 وقد افترقت عن مثيلاتها في الاصحاء فكانت 1379.9 ± 1142.5 (قيمة T 162.09 واحتمالية P<0.01).كانت المجاميع O وLe(a - b - ) وLe(a+b - ) ومجموعة الفارزين والانماط MN وSsاكثر Relative risk للمرض اذ بلغت خطورتها النسبية 1.4 و1.7 و1.5 و1.5 و1.4 و2.2 على التوالي. | A total of 126 type - 1 diabetics and an age and sex comparable 100 healthy subjects were studied . The study dealt with finding the frequency of ABO , Lewis , MNSs blood groups in these subjects , besides the frequency of secretors and non - secretors were investigated.Further more , the anti - rabbit antibody immune response among diabetic and healthy subjects was investigated .The frequency distribution of ABO showed the followings :  A significant increase in O - blood group distribution was recorded : 39.68% in patients versus 28% in control (Chi2 7.097 , P< 0.01 ) . A significant decrease in patients A - blood group frequency was seen 20.63% in patients versus 37% in control (Chi2 6.159 , P<0.05 ) . A slight increase in B - blood group frequency in patients was observed (28.57%) compared to control (23%) (Chi2 3.615 , P< 0.05 ) . Likewise , AB - blood group showed a frequency of 11.11% in patients compared to 12% in the control .On the other hand , the frequency distribution of Lewis blood group showed : Le ( a+ b - ) Patients frequency was 30.95% versus 21% in control (Chi2 5.88 , P<0.05 ) . while Le ( a - b - ) gave a patients frequency of 18.25% versus 11% in control ( Chi2 4.6 , P<0,05 ) .Le ( a - b+ ) demonstrated a resistant distribution compared to control .The fraction of secretors among Le ( a - b - ) gave 69.56% versus 45.45% in healthy controls ( Chi2 = 11.6 , P<0.01 ) .The frequency distribution of MNSs blood group showed a role of MN , giving a frequency of 55.55% versus 41% in control (Chi2 = 6.37, P<0.05). Likewise , Ss gave a frequency of 23.80% versus 11% in control (Chi2 = 7.06 , P<0.01 ) .Nonetheless , some MNSs genetic types showed a decreased frequency in diabetics compared to controls .The immunological findings showed that there was an association between blood groups and anti - rabbit red blood cell antibody titers . A and AB were among the groups that gave an increase anti - rabbit red blood cell titers . The mean titer in A was 1949.5 ± 938.7 versus 1487.6 ± 1237.5 ( T 35.8 , P<0.01 ) , while the mean titer in AB was 1310.2 ± 646.3 in patients versus 714.7 ± 510.4 in controls (T 167.78 , P < 0.01).A statistically significant increase in anti - rabbit antibody titers was seen in Le ( a+b - ) and Le ( a - b - ) Lewis blood groups compared to controls .MNSs blood groups genetic types gave an increase in mean MN anti - rabbit antibody titers 1815.3 ± 962.9 versus 1379.9 ± 1142.5 ( T = 162.09 , P<0.01 ) .The relative risk in all blood groups was recorded O , Le ( a - b - ) , Le ( a+b - ) , secretors , MN and Ss showed a relatively increase risk giving a relative risks of 1.4 , 1.7 , 1.5 , 1.5 , 1.4 and 2.2 respectively .The novel findings were discussed based on the available data in the subject

تاثير مستخلص نبات ورق الغار واللاكتوفيرين على تكوين الغشاء الحيوي لبكتريا Proteus mirabilis المعزولة من المرضى حاملي انابيب القثطرة == The effects of Laurus nobilis leaf extract and lactoferrin on the formation of Proteus mirabilis biofilm in patients with urinary catheters

Author name: نور شكيب محمد
Supervisor name: ضمياء محمود ابراهيم
General topic: Biology
Specific topic: Life Science
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بكتريا Proteus mirabilis من قثاطـر المجاري البولية، وتم التحري عن بعض عوامل الضراوة (الغشاء الحيوي، الحركة المتموجة، ومقاومة المضادات الحيوية)، وكذلك دراسة تاثير بعض المنتجات (المستخلص الكحولي لورق الغار، واللاكتوفيرين) على عوامل الضراوة، ومن ثم دراسة جزيئية - وراثية لعامل الضراوة Fimbriae.جمعت (110) عينة ادرار من قثاطر المجاري البوليةCatheter من المرضى الراقدين في وحدة العناية المركزة في مستشفيات بغداد (مستشفى الجراحات البولية المتعددة/ مدينة الطب)،(مستشفى ابن القف لاصابات الحبل الشوكي ومستشفى الكندي التعليمي) للفترة من تشرين الاول/2013 ولغاية اذار/2014.زرعت عينات الادرار على وسط اكار الدم والماكونكي ووسطCLED agar Cysteine Lactose Electrolyte Deficient ، ثم اخضعت المزارع البكتيرية النامية الى الفحوصات المجهرية والكيموحيوية لغرض تشخيص بكترياProteus mirabilis ، وتم تاكيد التشخيص باستعمال عدة التشخيص الخاصة بالعائلة المعوية Vitek2 ، شخصت (14) عزلة باستعمال البطاقات GNI - Cards Gram Negative Identifecation الخاصة بجهازVitek2 والعزلات الستة شخصت بـ Analytic Profile Index API.اوضحت نتائج العزل والتشخيص ان هناك (82) عينة موجبة للزرع البكتيري بنسبة(74.5%) اما العينات السالبة للزرع البكتيري فكانت (28) عينة بنسبة (25.5%) ، تواجدت بكترياProteus spp في (20) عينة ادرار بنسبة (24.4%) وكانت بكترياProteus mirabilis تمثل (20) عزلة بنسبة (100%).تم التحري عن تاثير المضادات الحيوية في العزلات البكتيرية باستعمال بطاقةAST - Cards Antibiotics Sensitivity Tests اذ بينت النتائج تباين في مقاومة العزلات للمضادات الحيوية العشرين المختارة. فكانت جميع العزلات قيد الدراسة مقاومة بنسبة (80 - 90%) لكل من المضادات(Ampicillin - Piperacillin - Ticarcillin) ومقاومة بنسبة (70%) للمضادCeftazidime ونسبة(65%) للمضادCeftriaxone و(50%) للمضادCefepime ، ونسبة(35.7%) لكل من Ciprofloxacin وAztreonam ، اما بالنسبة للمضادات (Minocycline - Tigecycline - Nitrofurantoine) فكانت نسبة المقاومة (100%)، اما المضاد Trimethoprim فكانت نسبة المقاومة (85.7%) يليه مضادGentamycin بنسبة (78.5%)،ومضادTobramycin بنسبة(71.4%)، وAmikacin بنسبة(28.5%) ومن ثم مضادLevofloxacin بنسبة(14.2%)، فيما كانت العزلات جميعها حساسة بنسبة (100%) لمضاد Imipeneam، كما اظهرت العزلات مقاومة متعددة للمضادات الحيوية عندما قاومت (7 - 14) مضاد حيوي بنسبة (64.3%).اظهرت (20) عزلة من بكترياProteus mirabilis قابليتها على تكوين الغشاء الحيوي بنسبة ( (%100ولكن بدرجات متفاوتة، اذ اظهرت(10) عزلات وبنسبة(50%) انتاجية عالية للغشاء الحيوي، في حين كانت العزلات الاخرى ذات انتاجية واطئة للغشاء الحيوي.تم التحري عن قابلية العزلات ذات الانتاجية العالية للغشاء الحيوي للمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية. وتبين من خلال النتائج ان العزلة P11 قد ابدت مقاومة الى (13) مضاد حيوي لتشكل اعلى نسبة مقاومة متعددة للمضادات (65%) في حين كانت اقل نسبة مقاومة (20%) وهي للعزلة P20 التي قاومت (4) مضادات.حضرت تراكيز متعددة من المستخلص الكحولي لورق الغار اذ تم اختبار تاثيره على العزلات البكتيرية (20) قيد الدراسة، لوحظ ان التركيز(200 ملغم/ مللتر) اعطى اعلى منطقة تثبيط (20ملم) بينما التركيز(6.25 ملغم/ مللتر) اعطى اقل منطقة تثبيط (10ملم). تم اختبار تاثير اللاكتوفيرين على عشرين عزلة من بكترياProteus mirabilis اذ بينت النتائج ان التركيز (200ملغم/ مللتر) اعطى منطقة تثبيط (7ملم) وكان هذا قبل عملية التنافذ الغشائي ، اما بعد عملية التنافذ الغشائي وتركيز حجمه الى النصف اعطى منطقة تثبيط (15ملم).تم تحديد التراكيز المثبطة الدنياMIC والتراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين، اظهرت النتائج ان التركيز المثبط الادنى للمستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين كان (6.25, 100 ملغم/مللتر) على التوالي، اما التركيز المثبط لتكوين الغشاء الحيوي للمستخلص الكحولي واللاكتوفيرين كان (100,200 ملغم/ مللتر) على التوالي.تم اختبار تاثير تركيزBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين لتثبيط التصاق الغشاء الحيوي لبكترياProteus mirabilis بطريقة اطباق المعايرة الدقيقة، تراوحت نسبة التثبيط بين (8 - 43%) بالنسبة للمستخلص الكحولي لورق الغار، اما بالنسبة للاكتوفيرين فتراوحت نسبة التثبيط بين (18 - 59%).اعتمدت التراكيز المثبطة لتكوين الغشاء الحيويBIC لكل من المستخلص الكحولي لورق الغار واللاكتوفيرين في اختبار تثبيط التصاق الغشاء الحيوي في انابيب القثطرة لبكترياProteus mirabilis وكذلك لعدة انواع من البكتريا السالبة لصبغة كرام المعزولة من قثاطر المجاري البولية، حيث اظهرت النتائج ازالة واضحة للغشاء الحيوي من على انابيب القثطرة عند النظر اليها بالعين المجردة والمقارنة بالسيطرة.اختيرت خمس عزلات لبكترياProteus mirabilis والتي اعطت انتاجية عالية للغشاء الحيوي لغرض دراسة جزيئية وراثية للكشف عن عوامل الضراوة المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوي، حيث اعتمدت تقنيةPCR كوسيلة لايضاح احد اهم عوامل الضراوة وهي الاهلاب Fimbriae المسؤولة عن التصاق البكتريا على سطوح الاغشية الطلائية للمجاري البولية وعلى سطوح انابيب القثطرة التي تؤدي الى تكوين الغشاء الحيوي، اظهرت النتائج ان العزلات الخمسة التي تم اختيارها كانت جميعها تمتلك جينPMF (pmf A) المسؤول عن التشفير للاهلابFimbriae ، حيث ان حجم البادئ كان 618 للعزلات الخمسة حيث تم ترحيلها بنفس مسار الدليل الحجمي للقطعة600 واعطت نتيجة موجبة بنسبة (100%). | The aim of this study is to isolate and diagnose Proteus mirabilis bacteria from urethral catheters; some virulence factors were investigated such as : - biofilm, swarming movement and resistance to antibiotics. The effect of Lactoferrin solution and the alcoholic extract of Laurus nobilis on these virulence factors was investigated, then a molecular genetic study was performed to the some factors(fimbriae).110 urinary sample were collected from urethral catheters of patients who had admitted to the intensive care units in 3 hospitals in Baghdad(Surgical subspecialities hospital/ Medical city, Al - Kindy teaching hospital & Ibn Al - Kuff hospital) during the period between October 2013 & March 2014.Those urine samples were cultured using Blood agar media, MaCconkey agar media& CLED agar media, the colonies of the growing bacteria underwent microscopial & chemobiological examination to diagnose Proteus mirabilis , the diagnosis was confirmed using the diagnostic kit specific for enterobacteriacae Vitek 2; 14 strains were diagnosed using GNI cards and 6 others were diagnosed using API.The results of isolation &diagnosis revealed 82 positive samples in bacterial culture (74.5%) while negative samples were 28(25.5%). Proteus spp. Was present in 20 urinary samples (24.4%) and Proteus mirabilis represented 20 strains (100%).The effect of antibiotics on bacterial strains was investigated using AST - card and the results revealed differences in the resistance of strains to the 20 chosen antibiotics.All studied strains were resistant in 80 - 90% to Ampicillin, Piperacillin & Ticarcillin, 70% to Ceftazidime , 65% to Ceftriaxone, 50% to Cefipime,and 35.7% to Ciprofloxacin & Aztreonam, whereas the resistance to minocycline, tigecycline & Nitrofuratoin was 100% .The resistance to trimethoprim was 85.7%, to gentamycin was 78.5%, to amikacin was 28.5% and 14.2% to Levofloxacin.At the same time , all strains were sensitive to imipineam , while some strains have shown multidrug resistance to 7 - 14 antibiotics (64.3%).The 20 strains of Proteus mirabilis have shown an ability to form biofilm in a rate of 100% but with variable degrees. The Biofilm was highly produced by 10 strains (50%), the other 10 strains have shown low ability to produce the biofilm.The 10 strains with high rate of biofilm production were selected & compared according to the number of resisted antibiotics, the results have shown a highest rate of resistance (65%) in P11 strain as it was resistance to 13 antibiotics , whereas the P20 strain has shown the lowest rate of resistance (20%) as it was resistant to 4 antibiotic only.Multiple concentrations of alcoholic extract of Laurus nobilis were prepared & their effect on the studied dacteria strains was investigated. It was noticed that the concentration of 200 mg/ml had given the highest area of inhibition (20 mm) , while the concentration of 6.25 mg/ml had given the lowest area of inhibition (10 mm).The effect of lactoferrin solutio on the 20 strains of Proteus mirabilis was investigated and the results revealed that the concentration of 200 mg/ml had given an area of inhibition of 7 mm before performing solution dialysis whereas after dialysis and decreasing volume to the half, the area of inhibition increased to 15 mm.The minimal inhibitory concentration (MIC) , & the biofilm inhibitory concentration for both of alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were quantified , and the results have shown that MIC of alcoholic exract of Laurus nobilis & lactoferrin was 6.25 & 100mg/ml respectively whereas BIC of alcoholic extract & lactoferrin was 100 & 200 mg/ml respectively.The effect of BIC of both alcoholic exract & lactoferrin on the inhibition of adhesion of biofilm of Proteus mirabilis was investigated using microtiter plate method , the rate of 18 - 59% for lactoferrin solution. The BIC of both alcoholic extract of Laurus nobilis & lactoferrin solution were adopted in investigating the inhibition of adhesion into catheter tubes of Proteus mirabilis and other types of gram negative bacteria isolated from urethral catheters.Five strains of Proteus mirabilis were selected according to their high rate of production of biofilm , for molecular & genetic study to discover the virulence factors responsible for biofilm production. PCR technology was used to demonstrate one of the most important virulence factors which is (fimbriae) responsible for bacterial adhesion on the surfaces of lining epithelium of urinary tract and catheter tnbes which leads to biofilm production . The results have shown that all the selected five strains had PMF gene which is responsible for fimbriae encoding , were the volume of primer was (618 bp) for all the five strains ; the five strains have given a positive results (100%) in the same path of ladder of band (600bp) when examined by electrophoresis

دراسة مناعية عن علاقة فايروس الخلية العملاقة للمرضى المصابين بسرطان الفم == Immunological study of relation of Cytomegalovirus in patients with Oral Cancer

Author name: نور الهدى علي عبد الحسين سعيد
Supervisor name: ماجد محمد محمود الجواري | سعد حسن محمد علي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: صممت هذه الدراسة كبحث باثر رجعي حيث تم اخذ (70) عينة من الانسجة الفموية المحفوظة بالفورمالين والمطمورة بشمع البرافين ، جمعت هذه النماذج من ارشيف الانسجة لمختبرات فرع الانسجة والامراض في كلية طب الاسنان / جامعة بغداد . حيث تعود هذه العينات للفترة بين 1998 - 2008.قسمت هذه العينات النسيجية الفموية الى مجموعتين : - مجموعة تضم (60) عينة اخذت من سرطانات الانسجة الطلائية الحرشفية للتجويف الفمي بينما ضمت المجموعة الاخرى (10) عينات نسيجية خالية من الامراض حسب الفحص النسيجي المرضي كنماذج سيطرة.تم تحليل هذه العينات، اخذين بنظر الاعتبار العمر، الجنس، موقع النسيج المصاب، والتمايز النسيجي، ثم صبغت جميعها بصبغة الهيماتوكسلين والايوسين للتشخيص النهائي.كما تم اجراء التشخيص الجزيئي لدنا فايروس الخلية العملاقة في الخزعات النسيجيه قد انجزت بواسطة جيل حساس ومتقدم من التقانة الاحيائية الجزيئية التي لها قابلية التحديد داخل الخلية للاحماض النووية.امتدت هذه الدراسة لتشمل دراسة نسيجية - مناعية بواسطة التصبيغ المناعي لتحديد انتشار البروتين المنتج من الجين المنشط للسرطان ( p53) ، كذلك لتحديد المستضد الموجود على سطح الخلية اللمفاوية نوع(T ) والمسمى (CD8 ) .مجمل النتائج المستحصلة من هذه الدراسة قد صنفت كالاتي : - كانت اعمار المرضى المصابين بسرطان الانسجة الحرشفية الفموية تتراوح بين (10 - 92) سنة وبمتوسط عمري (56،4) سنة . اعلى نسبة شخصت كانت بالفئة العمرية (45 - 75) سنة ، شكلت سرطانات اللسان النسبة الاعلى بين سرطانات الفم الحرشفية كما شكلت ايضا النسبة الاعلى من النتائج الموجبة لفيروس الخلية العملاقة البشري وانتشار بروتينp53 وكذلك للخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ). اكثر من 80% من حالات سرطانات الفم كانت جيدة التمايز، ضمن سرطانات الفم الحرشفية ، 26 عينة اظهرت نتائج موجبة لفايروس الخلية العملاقة البشري بواسطة التقنية الاحيائية عالية الحساسية ( التهجين بالموقع).مثلت هذه النتائج 43،3% من مجموع سرطانات الفم الحرشفية الخاضعة للتحري، في حين من بين المجموعة نفسها ، 55% (33 عينة من اصل 60) اظهرت نتائج موجبة لفحص انتشار بروتين p53 و18،3% (اي 11 عينة من اصل 60) اظهرت نتيجة موجبة لفحص الخلايا اللمفاوية التائية ( CD8).بينما لم يتم تسجيل اي نتيجة موجبة لفايروس الخلية العملاقة ، انتشار بروتينp53 والخلايا اللمفاوية التائية (CD8 ) ضمن مجموعة السيطرة. سجلت حالات ظهور مشترك لانتشار بروتينp53 الطافر مع دنا فايروس الخلية العملاقة في (18،3%) ومع الخلايا اللمفاوية التائية السامة (CD8 ) في (10%) بينما سجلت هذه الدراسة حالات ظهور مشترك للخلايا اللمفاوية التائية السامة مع فيروس الخلية العملاقة وطفرة الجينp53 في (1،7%) من سرطانات الفم الحرشفية | This study was designed as retrospective study . A total number of seventy (70) formalin - fixed paraffin - embedded oral tissues that were collected from archives of oral Histology and Histopathology department of Dentistry College/University of Baghdad, during the period from October 2008 till April 2009. All the samples are related to the period between 1998 - 2008.These oral tissue blocks were divided into two groups. A group included sixty (60) tissue blocks with histopathologic diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). And another group included ten (10) tissue specimens that were taken from histopathologically healthy oral tissues.All these tissues were analyzed according to age, sex, site and histological grading.Histopathological sections were made for those oral biopsies and stained by hematoxylin and eosin stain for definitive histologic diagnosis.Molecular detection of cytomegalovirus (CMV - DNA) in those tissue blocks were performed by using highly sensitive version of in situ hybridization (ISH) technique.This research work has further perform immunohistochemical study to demonstrate the prevalence of p53 overexpression. This study also was extended to determine the phenotype of cell surface antigen marker, namely CD8+ marker of tumor infiltrating lymphocytes by using immunohistochemical specific monoclonal anti bodies to this CD marker.The overall results of this study are described as follows : - The age of patients presented with oral SCC ranged from (10 - 92) years with mean of (56.4) years. The highest percentage was diagnosed in the age stratum of (45 - 75) years , the tongue was the most commonly affected site by OSCC. And also represents the major site for CMV infection , p53 gene mutation and CD8 positive - phenotyping results.More than 80% of the OSCC have well - differentiated grade , among oral SCC group, 26 archival tissue blocks showed positive - ISH reactions for CMV - DNA by sensitive version of ISH . This constituted 43.3% of the total screened oral SCC tissues.Thirty - three out of sixty oral SCC showed 55% positive IHC reaction indicating p53 overexpression, and 18.3% (11 out of 60) showed positive IHC reaction pointing for presence of CD8 +ve tumor infiltrating lymphocytes. While , none of those tissues in the histopathologically healthy control group showed reaction for CMV - DNA, p53, or CD8 marker.The co - occurrence of mutated - p53 overexpression with positive CMV infection was localized in (18.3%), whereas co - occurrence of p53 gene mutation and CMV infection along CD8 - positive tumor infiltrating lymphocytes in OSCC were documented in (1.7%) of these cancerous specime

التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن انتاج الغشاء الحيوي لبكتريا Staphylococcus epidermidis المعزولة من عينات سريريه مختلفة == Investigation of some genes responsible for Biofilm Formation in Staphylococcus epidermidis Isolated From clinical samples

Author name: نهاد خلاوي تكتوك
Supervisor name: رجوة حسن عيسى الربيعي | سوزان سعدي حسين
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: المكورات البشرويه (Staphylococcus.epidermidis) احدى اهم انواع المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز والتي تعتبر الممرض الرئيسي المصاحب للاصابات . تم جمع 645 عينه سريريه اخذت من مصادر مختلفه تضمنت عينات الدم , عينات ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الجلد والانف من كادر المستشفى,وقد تم زرع وعزل وتحديد العزلات النقيه من مختلف الاجناس البكتيريه وكالتالي : بكتريا الـ pseudomonas .spp. احتلت المركز الاول وبنسبة 19.9% تتبعها مجموعة الـمكورات السالبه لفحص الكواكيوليز 17% تضمنتها : , S.Lentus, S. saprophyticus , S. epidermidis ) S. haemolyticus وS.hominis)وبنسبة ( 68.5 , 13.7, 6.85 , 6.85 و4.1) %على التوالي, تتبعها كلا الـ S. aureus وE. coli وبنسبه (4 16. %)ثم (%16) Klebsiella sp. وProteus (12.9%) ثم بكتريا الـ Serratia marcescens (%1.4) عزله من عينات الدراسه. كل عزلات بكتريا المكورات السالبه لفحص الكواكيوليز كانت موجبه لصبغة كرام , منتجة صبغه بيضاء عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي انتجت صبغه صفراء وقد اضهرت كل العزلات نتائج سالبة لفحوصات : الاوكسيديز والكواكيوليز لكنها منتجه لانزيم الكتيليز والتي من خلالة تفرق المكورات عن المسبحيات , اضافه لذلك كانت النتائج ايجابيه في اختزال النترات الى نتريت ومقاومه لمضاد الفانكومايسين عدا بكتريا الـ S.saprophyticus والتي كانت مقاومه للمضاد, وقد عرفت كل العزلات بواسطة نظام الـ API staph ونظام الفايتك خلال 6 ساعات. ان كل عزلات المكورات البشرويه كانت غير مخمرة لسكر الزايلوز والسوربيتول والمليببوز بينما مخمرة لسكر الكلوكوز , الفركتوز , السكروز , المالتوز , اللاكتوز والمانوز اضافه الى انتاجها لليوريز , اللايبيز لكنها سالبه لفخصي الدنيز واللسيذنيز. وقد احتلت عينات الدم المرتبة الاولى في عزلات المكورات البشروية وبنسبة 60% يتبعها عينات ادرار القسطرة بالمرتبة الثانيه20%. اغلب المكورات البشرويه عزلت من الذكور 58% مقارنه بالاناث 42% وقد كانت الفئه العمريه الثالثه ( 46 - 65 ) سنه اكثر انتشارا للمكورات البشرويه تتبعها الفئه العمريه الرابعه (>65)وبنسبة 32% وايضا فان نسبة عزل البكتريا من مجاميع الدراسة ( 50, 25 ,15 ,10) على التوالي من عينات ( الدم,ادرارالقسطرة, مسحات الجروح والحروق بالاضافة الى مسحات الجلد والانف من كادرالمستشفى )على التوالي واكثرها في الذكور عدا الفئة العمرية الثالثة حيث كانت النسبة في الاناث 65% عما عليه في الذكور 35% اما انتاجية البكتريا للغشاء الحيوي مظهريا فقد تبين ان 16 % من العزلات كانت منتجة للغشاء الحيوي على وسط الكونكو الاحمر بالرغم من اختلاف المستويات الانتاجية حيث كانت انتاجيتها قوية للغشاء الحيوي (الكونكو الاحمر, الكونكو الاحمر المحور, الكونكو الاحمر المحور الجديد) وبنسبة (2,4,6) % على التوالي بينما كانت متوسطة (4,10,10) % وضعيفة (84,86,94) % على التوالي لهذه الاوساط الثلاثة . وقد بينت نتائج هذه الدراسة عدم وجود فروقات بين هذه الاوساط الثلاثة حيث كانت الانتاجية قوية للغشاءالحيوي على وسط الكونكو الاحمر6% مقارنة بــ (2,4) % على وسطي الكونكو الاحمر المحور والجديد على التوالي بينما كانت متوسطة الانتاجية وبنسبة 10% للكونكو الاحمر و4% لكلا الوسطيين للكونكو الاحمر المحور والجديد . ان انتاجية الغشاء الحيوي المشخصة بالطرق المظهرية الثلاث كانت 60% ايجابية بطريقة الاطباق الماكروية بينما (16,38) % على التوالي لكلا الطريقتين (الانابيب ووسط الكونكو الاحمر) وبنفس الوقت كانت (40,62,84) % على التوالي سالبة للطرق المظهرية الثلاث . فيما بينت المقارنةالمظهرية بين الطرق الثلاث وجود ارتباط قليل بين طريقتي الكونكو الاحمر والاطباق المايكرويه وان انتاجية الغشاء الحيوي قويه وبنسبة18% بطريقة الاطباق المايكرويه مقارنة بطريقتي الانابيب والكونكو الاحمر وبنسبة ( 12, 16) % على التوالي, كذلك منتجه للغشاء الحيوي ( 33.3,83.3,54.5,60) % على التوالي للعزلات المعزوله من عينات الدم ,ادرار القسطره , مسحات الجروح والحروق بالاضافه الى مسحات الانف والجلد من كادر المستشفى وغير منتجه للغشاء ( 40, 16.7,45.5 ,66.7)% على التوالي من مجاميع عينات الدراسه. بالاضافه لذلك فان ( 44)% من عزلات المكورات البشرويه كانت منتجه لجيني الـ PIA بينما)56%) غير منتجه , و10,8 عزله من 30 عزله من البكتريا المعزوله من الدم كانت موجبه لكلا الجينين ICaA وICaD وقد كانت العزلات المنتجه للغشاء الحيوي وجيني الـ PIA بنسبة 77.3 % ( 17 عزله) كانت موجبة للجينين بينما سالبه لانتاجية الغشاء الحيوي والجينين وبنسبة 53.6% . وقد بينت نتائج الدراسة ان 17% من العزلات تحوي الجينين ومنتجه للغشاء الحيوي و16 عزله كانت منتجه للغشاء الحيوي لكنها فاقدة للجينين كذلك 53.6% من العزلات غير منتجه للغشاء الحيوي وفاقده للجينين بالاضافه الى انتشار الجينين (44 , 38)% على التوالي حيث ظهر ان وجود الجين (Ica A) بالبكتريا المعزوله من الدم 33.3% اعلى مما هو عليه من عينات ادرار القسطرة 45.4% يتبعه الجين IcaD بعزلات عينات زرع الدم 26.7% مما هو عليه في عينات قسطرة الادرار 36.3% . وقد اثبتت الدراسه في نتائجها ان كل عزلات المكورات البشرويه المنتجه للغشاء الحيوي لا ترتبط معنويا بوجود جينات الـ PIA ولا علاقه بين وجود الجين IcaD وانتاجيه الغشاء الحيوي , كذلك ظهرت سبعة عزلات منتجه للغشاء الحيوي وحاويه على الجينين (IcaA وIcaD) بطريقة وسط الكونكوالاحمر بينما 15 , 17 عزله كانت ايجابيه للجينين ومنتجه للغشاء الحيوي بطريقة الاطباق المايكرويه , اضافه لذلك فقد وجد ان التلازن الدموي للمكورات البشرويه تلعب دوررائيسيا بالتصاق هذه البكتريا على الاطباق المايكرويه. وقد ظهر من خلال الدراسه وجود علاقه بين كميه الغشاء الحيوي والتلازن الدموي بالاضافه الى ان 13 و18 عزله من 30 عزله كانت على علاقه بالتلازن الدموي ( الفحص العيني والمجهري ) وتكوين الغشاء الحيوي , ووجد ان متوسط الوزن الجاف للغشاء الحيوي المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من عينات الدم كانت 2.7 ملغم لـ 6 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص العيني بينما 8 عزلات كانت ايجابيه للتلازن الدموي بالفحص المجهري لكن ظهرت بالدراسه( 5 ,6 و2 ,3 )عزلات موجبه عينيا ومجهريا للتلازن الدموي على التوالي مع معدل الوزن الجاف للغشاء الحيوي لها 2.8 ملغم المتكون بواسطة المكورات البشرويه المعزوله من ادرار القسطره ومسحات الجروح والحروق على التوالي بينما عزله واحده فقط من مسحات الانف والجلد لكادر المستشفى كانت ايجابيه لفحص التلازن الدموي مجهريا لكنها سالبه عينيا وبمعدل وزن 2.7 ملغم للغشاء الحيوي , هذه النتائج تؤكد عدم وجود علاقه ارتباطيه بين كميه الغشاء الحيوي المتكون وقابليه تكوينه لكنها تزداد بزيادة عمر الغشاء الحيوي . اما في تفاعل بروتينات مصول المرضى الذين يعانون من التهابات المكورات البشرويه مع المستضدات المكورات البشرويه (خلايا باكملها) فقد كانت النتايج ايجابيه وعلى النحو التالي : ستة من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار 1 : 2، 1 : 4، 1 : 32 و1 : 128 من امصال المرضى , في حين 5، 9، 11 من مستضدات المكورات البشرويه اعطت نتائج ايجابيه في عيار (1 : 16، 1 : 64، 1 : 256) على التوالي,كما اعطى تاثير تركيز بروتين (5.032) ميكروغرام / مل في المصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه القادرة على تشكيل الغشاء الحيوي تثييطا عاليا وبنسبة 90٪ بينما كان التثبيط 30% في تركيز بروتين المصل (1.394) ميكروغرام / مل.وقد ظهرت نتائج الدراسة مستوى طبيبعي لكل من الاجسام المناعية M وA (90.23±44.23, , 124.4±41.20) و(220.8±90.209, 200.10±79.004) mg/dI على التوالي ولكن سجلت زيادة ملحوظه في المستوي الاجسام المناعيه G (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg/dl على التوالي في مصل المرضى المصابين ببكتريا المكورات البشرويه المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي، وقد كانت مستويات طبيعية للمتمم C3وبنسبة (120±36.5, 120±36.49) mg/dl على التوالي في مصل المرضى الذين يعانون من اصابات البكنريا المنتجه وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي ، بينما مستويات مرتفعة من المكمل C4() (41.9 ± 1.9 1.8 ± 42) mg/dl على التوالي لكلا المجموعتين (المنتجة وغير المنتجة الغشاء الحيوي)، وفي نفس الوقت كان هناك فرقا معنويا بمستويات الانترلوكبن 6 في المصل طبيعية وبتركيز (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml على التوالي في الامصال من المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (15.88±6.8) pg/ml (P< 0.001) ، في حين ظهر فرق معنوي في مستويات الانترلوكبن 8 في المصل (38±9.52,37±7.13) pg/ml على التوالي في مصل المرضى المصابين بالمكورات البشرويه (المنتجة وغيرالمنتجه للغشاء الحيوي) على التوالي مقارنة بجموعة السيطرة (20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001). | Staphylococcus.epidermidis is one of coagulase negative staphylococci (CONS) are now well established as major nosocomial pathogens associated with infections of indwelling medical devices. A total of 645 clinical samples, taken from different sources include blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs and swabs of skin and nasal hospital staff, these sample had been cultured then isolated and identified pure isolates of different genus of bacteria, results show 85 (19.9%) were Pseudomonas spp isolates, 73 (17%) belong to Coagulase Negative Staphylococci (CONS) (S. epidermidis ,S. saprophyticus , S.Lentus , S. haemolyticus and S.hominis constituted 68.5%, 13.7%, 6.85%, 6.85%, and 4.1% Respectively), followed by both S. aureus and E. coli (n = 70 ,16.4%), followed by Klebsiella sp. (n = 68 , 16%), Proteus sp. (n = 55 ,12.9%), Serratia marcescens (n = 6 , 1.4%) isolated from study clinical samples. Most predominant pathogen was Pseudomonas spp (n = 85 ,19.9%), Also, the second most important microorganism which isolated were Coagulase negative Staphylococci (n = 73 , 17%) ,Staphylococcus epidermidis was mainly isolated from study patients group (68.5%) All isolates of CONS species are positive gram stain , produce white pigment except S.saprophyticus which produced yellow pigment, and all isolates gave negative result of oxidase test , coagulase and catalase test was performed for all the isolates and all of them produced catalase enzyme that differentiates Staphylococcus from the genus Streptococcus , so Staphylococcus spp. reduce nitrate to nitrite , and all isolates were identified by using epi staph and VITEK - 2 system within 6 h., CONS are novobiocin resistance except S.saprophyticus. staph.epidermidis isolated were none fermented xylose , sorbitol , melibiose while fermented many sugar as positive results for glucose, fructose, sucrose , maltose, lactose and mannose, in addition to produce urease, lipase and alkaline phosphatase while it cannot produce DNase and lecithinase. Blood samples occupied the first place in isolation S.epidermidis from it a percentage of 60%, followed by catheter urine in the second place 22% . Most of the Staphylococcus epidermidis was isolated from male patients (58 %) compare to female (42%), prevalence of Staphylococcus epidermidis with age were peaked in the third group (46 - 65) years, followed (32%) in fourth age group (> 65) so the most bacterial isolated from four study group (blood, catheter urine specimen, wound and burn swabs , as well as swabs of skin and nasal hospital staff) were (50, 25, 15, 10) % respectively, there was male preponderance in all years age group, excepted in third group, the proportion of females (65%) appeared higher than it is in males (35%). Results of phenotype were shown 16 % of the isolates were biofilm producers with Congo red agar method (CRA), although production level varied. In the biofilm positive S. epidermidis strains on CRA , modified CRA and new modified CRA were 6, 4, 2 ,% respectively of isolates were strong producers, while 10 ,10 ,4% and 84, 86 , 94 % respectively were moderate and weak . In this study results show no differences between CRA and modified CRA and new modified CRA strong biofilm formation was 6% in CRA compare to (4, 2) % to modified CRA and new modified CRA respectively; also moderate produced biofilm was 10% in CRA and modified CRA with 4% in new modified CRA, slime producing which detected by three phenotyping methods 60% of bacterial isolate were positive biofilm produced by microtiter plate , while ( 38, 16%) respectively were positive for both tube and CRA methods, in the same time table 3.10 showed negative result as ( 84 , 62 , 40%) respectively for CRA, tube and microtiter plate method. When compare three phenotype methods congo red agar method showed little correlation with TCP(MTP ) assay and high biofilm formation in TCP 18% compare to both methods ( tube and Congo red agar) as 12 , 16 % respectively, S. epidermidis isolates, which gained from blood , urine catheters, wound and burn swab as well as from swab of skin and nasal hospital staff by (60 , 54.5 , 83.3,33.3) % respectively of the isolates produced biofilm phenotypically while (24, 10, 2,4)% respectively no biofilm phenotypically. Twenty two (44) % of S. epidermidis has PIA gens while 28(56)% negatively for PIA gens, so 10, 8 of 30 S. epidermidis which isolated from blood culture were found to be positive for both IcaA and IcaD , most positive both PIA gene (Ica A, Ica D) and biofilm produced were 17 (77.3%) while negative for both of them and negative biofilm were 15(53.6%)Whilst 5(22.7%) were positive for PIA gene and negative for phenotype (biofilm produce). So prevalence of IcaA, IcaD genes were 44%, 38% respectively , the results indicated that the IcaA gene had the highest rate in blood culture (33.3 %) and catheter urine specimen (45.4%) followed by IcaD gene which was detected in 26.7 % of blood culture while 36.3% of catheter urine specimen. All S. epidermidis slime positive isolates did not reveal any correlation between both PIA genes (icaA and icaD); nonetheless, a correlation was noticed between icaD alone and slime layer production, also seven isolates were potential biofilm producers and positive for both ica genes (A and D) whilst 15, 12 isolate of S.epidermidis were positive for both PIA genes (Ica A and Ica D) and produced biofilm by tube method while 17, 15 strain were positive to both IcaA and IcaD by Mtp methods. So results of this study indicated that presence of PIA genes did not always correlate with biofilm production and hemagglutinin of S.epidermidis may play a major role in the adherence of this organism to microtiter plate. Thus, the hemagglutinin of S.epidermidis may be a virulence factor in the pathogenesis of infection, However, no statistically significant differences were found between the amounts of biofilm formed among the isolates, so founded a good correlation between amount of biofilm formed and the haemagglutination, as well as 13, 18 of the 30 isolate, were the relationship between positive both (Macroscopically and microscopically) hemagglutination assay respectively and biofilm formation So Mean of Dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from blood was equal to 2.7 mg, and 6 out of 18 isolates have positive macroscopically hemaglutination assay and 8 isolates have positive microscopically hemaglutination assay ,whilst ( 5, 6 and 2,3) isolates have positive macroscopically and microscopically hemaglutination assay respectively with 2.8 mg were the mean of dry weights of biofilm which formed by S.epidermidis which isolated from both catheter urine and wound and burn swabs while only one isolate isolated from swab of skin and nasal hospital staff has positive microscopically hemaglutination assay but negative macroscopically with mean of dry weights biofilm were equal to 2.7 mg, these results indicate no relationship was founded between the amount of biofilm formed and form of biofilm but increasing when increased age of biofilm. Sera from patients with S. epidermidis infections showed reactivity with S. epidermidis antigens (whole cells ) as : six of S. epidermidis antigens agglutinated in titer 1 : 2 , 1 : 4 , 1 : 32 and 1 : 128 of patients sera ( antibodies ) while 5, 9 , 11 of S. epidermidis antigens agglutinated in the patients sera in titer ( 1 : 16 , 1 : 64 , 1 : 256) respectively . Also concentration of sera protein (5.032) µg/ ml gave 90% inhibition but concentration of sera protein (1.394) µg/ ml gave 30% inhibition ,and normal level both for immunoglobulin M and A (90.23±44.23, 124.4±41.20 and 220.8±90.209, 200.10±79.004) mg / dl respectively(p>0.001), but IgG increased level is highly elevated (1535±812.333, 1521.3±475.440) mg / dl respectively(p< 0.001) in sera of patients with produced and non - produced biofilm, and normal levels of (C3) (120±36.5, 120±36.49) mg/dl respectively (P> 0.001), in sera of patients with produced biofilm compare to non - produced biofilm whilst elevated levels of (C4) (41.9±14.09, 42±14.28) mg/dl respectively (p>0.001)to each two groups (produced and non - produced biofilm), so level of cytokines (IL - 6, IL - 8) appear variations between patients and controls, levels of IL - 6 (24.8 ±18.20 , 24.5 ±19.09) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control (15.88±6.8) pg/ml(P< 0.001), while serum level of IL - 8 (38±9.52,37±7.13) pg/ml respectively in sera of infected patients by S.epidermidis (produced and non - produced biofilm) respectively compare to the control(20.3±7.07) pg/ml (P< 0.001

دراسة كيمياوية وبايولوجية لبعض مركبات الايض الثانوي المستخلص من اوراق نبات البشملة L. Eroibotrya japonica المستزرع في العراق == Chemical and Biological Study of Some Secondary Metabolism Compounds Extracted from Bashmala Eriobotrya Japonica L. leaves Cultivated in Iraq

Author name: نعم حيدر جواد سعيد الجوهري
Supervisor name: بشرى محمد جابر علوش
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study containes the extraction and detection some of active compounds in the leaves of Eriobotrya japonica L. and testing the activity of crude extract as an antibacterial and food preservation. Methnol was used in crude extraction and also CC , TLC ,HPLC techniques were used in qultitive and quantative amount of some flavonoid ,terprnoid and phenolic compound .The well in agar to study the effect of crude on Staphylococcus aurus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria in 200 ,100, 50 and 25 mg /ml concentrations , In addition to study of effect of the extraction on meat at 200 mg /ml concentration . The ruselts show that Alcholic crude extract contains flavonoid ,terprnoid and phenolic compounds and the chlororform was the best solvent in separating those compounds . Through the use TLC and HPLC , it was possible to separate terpenoids (Oleanolic acid , ursolic acid , maslinic acid) , flavonoids (Qurcetin, Kaempferol ,Rutine ) and phenolic compounds (Benzoic acid ,caffeic acid ,chlorogenic acid). The results show the high activity of leaves crude extract of Eriobotrya japonica L . in 200 mg /ml concentrationthat is used as a food preservation in minced beef meat. The results also show significant differences at (P<0.05) in Thiobarbutric acid ,Total violate nitrogen measurement ,total bacterial account , and psychrotrophic bacteria account ,AS for the value of PH was governor compared with standard control. The concentrations of cruds extract showed an Antibacterial activity where Staphylococcus aureus where 15 and 26 mm by using 100 and 200 mg/ ml concetrations respectively .furthermore,The crude extractshowed an efficiency as antibacterial agains Escherichia coli with 13and 15mm inhabition zone ; and also Salmonella typhmurium with 14 and 19mm inhabition zone by using 100 and 200 mg / ml concentration , respectively compared with standard control . The ruselts show that minimum inhibitory concentration of the cruds extract agains Staphylococcus aureus , Escherichia coli , Salmonella typhmurium bacteria was 100 mg / ml compared with standard control .

مستويات الرصاص في الدم لسكان بغداد والعوامل المؤثرة على ذلك == Levels of Blood Lead in Baghdad Inhabitants and Factors Affecting Them

Author name: نضال ياس يعقوب
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد الرصاص عنصرا" طبيعيا" يتواجد في القشرة الارضية ويستعمل على نطاق واسع في الطلاء والكازولين والبطاريات والعلب المعدنية وبعض الاواني الخزفية. ويتعرض الناس الى الرصاص عن طريق الغبار الملوث ورقائق الطلاء والاطعمة الملوثة..شملت الدراسة 80 شخصا من العاملين في الشركة العامة للبطاريات في الوزيرية والذين يتعرضون للرصاص اضافة الى 10 اشخاص غير متعرضين ( مجموعة السيطرة). تم تحديد مستوى الرصاص في دم الاشخاص المذكورين كما درست معايير الدم لديهم اذ شملت فحوصات الدم : مستوى خضاب الدم (Hb)،حجم الدم المضغوط(pcv)،عدد كريات الدم الحمر(RBCs)،متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا(MCHC) ومتوسط حجم الخلايا(MCV). تم اختيار عينة مؤلفة من (38) شخصا من المتعرضين الذين كان مستوى الرصاص لديهم عالي حيث يبلغ (41.4 مكغم/100 مل) مع انخفاض ملحوظ في مؤشرات الدم الاخرى فكان معدل تركيز هيموكلوبين الدم (12.75 غم / 100 مل) اما مدى النسبة المئوية لحجم الدم المضغوط فقد كان (39.4 غم/100 مل) ومعدل عدد كريات الدم الحمر (5 مليون / مم3) ومعدل متوسط تركيز هيموكلوبين الخلايا بلغ (30.9 غم/100 مل) ومعدل متوسط حجم الخلايا بلغ (77.1 فمتولتر) . تمت دراسة تاثير الرصاص على هذه المجموعة من خلال تدوين المعلومات الخاصة في الاستمارة الاستبيانية وكانت اهم هذة التاثيرات على جهاز الخصوبة في الذكور وتاثيرات على الجهاز البولي وظهور عدد من حالات فقر الدم وحالات من السعال والصداع والاجهاض لدى السيدات والم في المفاصل .و من جانب اخر فقد تم تقسيم عينة المتعرضين الى عدة مجاميع حسب : - 1) الجنس : اذ تم تقسيم العينة الى مجموعتي الذكور والاناث اذ كان معدل تركيز الرصاص في دم الذكور اعلى اذ بلغ(35.2 مكغم/100 مل) اما الاناث فقد بلغ (32.2 مكغم/100 مل) . وظهرت معدلات اقل بالنسبة لمؤشرات الدم الاخرى .2) حالة التدخين : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتي المدخنين وعددهم (36) شخصا والثانية غير المدخنين وعددهم (44) شخصا وكان هناك تقارب في نتائج مستوى الرصاص في الدم للمجموعتين.3) للفئات العمرية : فقد تم تقسيم العينة الى اربع مجاميع فقد ظهر اعلى مستوى لتركيز الرصاص للفئة العمرية (41 - 50) سنة مع انخفاض في مؤشرات الدم الاخرى.4) حسب المهنة : فقد تم تقسيم العينة الى مجموعتين وهما العاملين من داخل الشركة العامة للبطاريات (بابل 1، بابل 2) في الوزيرية والعاملين في المعامل الاهلية المنتشرة في مدينة بغداد .و من الملاحظ وجود علاقة عكسية بين تراكيز الرصاص ومعايير الدم مثل مستويات خضاب الدم والنسبة المئوية لحجم الدم المضغوط وعدد كريات الدم الحمر ومتوسط تركيزهيموكلوبين الخلايا ومتوسط حجم الخلايا. | Lead is one of the natural elements exist in the crust of the earth, and widely used in the coating , gasoline, batteries, tin cans and some ceramics. Usually people are exposed to lead through the polluted dust, coating pieces and polluted food.In 1987 using lead in gasoline has been denied in developed countries but it is still used in the developing countries. One of the causes of the mental retard in children and being behind their colleagues in behave and learn is sedimentation of lead in brain tissues because the children have more ability to absorb lead than adults.Also women and pregnant face increased hazard as a result of lead exposure which negatively affect the fetus and may lead to infertility. Lead absorption also results in many diseases and effects in human body such as : sever anemia, sever and chronic lung inflammation, increase kidney failure among children and adults, and immunity system breakdown. If the lead level was over (75 μg/dl) these people would have a failure in the reproductive system as a result of having atrophy in the testis with inability to product sperms.A study have been performed to estimate the lead level in the blood of Baghdad inhabitations in order to know its effect on the workers' health who exist in polluted places, and exposure effects on the hematological indications such as : total hemoglobin, percentage of Packed Cell Volume (PCV%), Red Blood Cell count, Mean Cell Hemoglobin Concentration (MCHC), and Mean Cell Volume (MCV). 80 workers who are exposed to lead working in the General Company for Battery in Al - Wazeria in addition to other workers from private companies in Baghdad and other 10 persons who are not exposed to lead as the control group, all have been chosen as samples for the study. a sample of 38 exposed persons have been chosen who have high lead level in their blood which was about (41.4 g/100ml) with a significant decrease in the other hematological indications; the Blood Hemoglobin Concentration average was (12.75 gm/100ml), the percentage of Packed Cell Volume average was (39.4%), the Red blood cell count average was (5 million/mml3), and the mean cell hemoglobin concentration average was (30.9 gm/100ml), mean cell volume average was (77.1 FL).Lead effects on this group had been studied through recording the data in questionnaire forms, and the most important effect was on the male fertility system, effects on urinary system, anemia, coughing, headache, miscarriage, and ache in the joints. In the other hand the sample of the exposed persons had been classified into groups according to : - 1 - Gender : - the sample had been classified into 2 groups : male and female, where the lead concentration was higher in the male blood which was about (35.2 mg/100ml) and about (32.2 mg/100ml) in the female blood, in addition to less hematological indications.2 - Smoking case : - the sample had been classified into 2 groups : smokers about (36)persons and nonsmokers about (44)person, the study showed similarity in the results on lead level in the blood of both groups.3 - Age : - the sample had been classified into 4 groups, the higher lead level appeared in age group (41 - 50), with decrease in the other hematological indications of the rest. It is clear that there is a slight relation between lead concentrations and hematological indications such as blood hemoglobin, mean packed cell volume, red blood cell count, mean cell hemoglobin volume and mean cell volume.

تاثير مستخلصات اوراق العنب والخروع والبصل في بعض عوامل استعمار انواع بكتريا التهاب الاذن الوسطى في الانسان == Effect of Grape leaves, Caster bean and Onion extracts in some colonization factors of bacterial species isolated from otitis media in human

Author name: نضال عبد الامير علي
Supervisor name: سوسن حسن عثمان كورجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 80 مسحة من المرضى المصابين بالتهابات الاذن الوسطى( Otitis media) المراجعين للعيادة الخارجية في مستشفى الصدر العام في بغداد وللفترة من تشرين الثاني 2007 وحتى كانون الثاني 2008. زرعت المسحات على الاوساط الزرعية (اكار الدم واكار الماكونكي) لعزل البكتريا وتشخيصها باستخدام الاختبارات المجهرية ،و الزرعية واالكيموحيوية . امكن الحصول على 69 عزلة بكتيرية من المجموع الكلي (83) وشخصت بكونها تابعة الى الانواع الاتية : (33) عزلة وبنسبة (39.75 %) Pseudomonas aeruginosa ، (11)عزلة (13.2 % ) aureus Staphylococcus ، و(8) عزلات (9.6 %) epidermidis Staphylococcus و(8) عزلات (9.6 %) Proteus mirabilis و( 5 ) عزلات(6.02 % ) تعود الى Klebsiella pneumoniae و(4) عزلات ( 4.8 %) Escherichia coli، في لم تظهر ( 14) مــسحة بنسبة ( 16.86 %) اي نمو بكتيري . اظهرت النتائج ان الاصابات المفردة هي السائدة عندما بلغت نسبتها( 96.2 %) ،بينما بلغت الاصابات المختلطة ( 3 ) اصابات فقط بنسبة (3.7%). كانت نسبة الاصابات في الاناث (57.2%) اكثر منها في الذكور (42.5 %) فيما سجلت اعلى نسبة للاصابة في الفئة العمرية (اقل من سنة - 10 سنوات) .كما تبين ان الاصابة المزمنة بالتهابات الاذن الوسطى هي اكثر شيوعا من الاصابة الحادة . لدى اختبار حساسية العزلات البكتيرية الى (18) مضادا حيويا ، اظهرت نتائج وجود مقاومة تامة (100%) لبكتريا Ps.aeruginosa ضد كل من Carbenicillin ، Doxycyclin وCeftizoxime في حين كانت حساسة جدا لمضادات Amikacin وImipenem وCiprofloxacin سوى عزلة واحدة ،اما الانواع العائدة للعائلة المعوية فكانت Pr.mirabilis وبكتريا E.coli مقاومة بنسبة (100%) لمضاد Doxycyclin دون غيره وعزلات K.pneumoniae مقاومة وبنسبة (100%) لكل من Doxycyclin وGentamycinو Pipracillin ، وكانت جميع عزلات Staphylococcus spp. مقاومة كليا Methicillin وبنسبة (100%) فيما قاومت مضادات Penicillin وAmpicillin وCloxacillin بنسب اقل . انتخبت العزلات البكتيرية وحسب شدة ضراوتها ومقاومتها للمضادات الحيوية التي شملت Ps.aeruginosa وaureus S.و Pr.mirabilisو K.pneumoniaeو E.coliلدراسة تاثير المستخلصات المائية الباردة لثمار البصل واوراق كل من الخروع والعنب في نمو العزلات ،فقد اظهر مستخلص البصل فعالـية ضد Ps.aeruginosaو aureus . Sو E.coliوعند التراكيز (750 , 1000 ,1250 ,1500 ) ملغم /مل ،عندما بلغ قطر منطقة التثبيط لكل من بكتريا aureus . Sو Ps.aeruginosa وE.coli عند تركيز 750 ملغم /مل (13 , 12 , 11) ملم وعلى التوالي . واظهر مـــستخلص اوراق الــخروع فـعاليــة ضـــد Ps.aeruginosa وaureus S. وE.coli وK.pneumoniae عند التراكيز (250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل حيث بلغت اقطار مناطق التثبيط عند التركيز 1000 ملغم /مل 15.66 , 16.33 , 16.33 , 15.33 ) ) ملم وعلى التوالي . في حين اظهر مستخلص اوراق العنب فعالية ضد جميع الانواع البكتيرية المختبرة وفي التراكيز(250 , 500 , 750 , 1000) ملغم /مل ، عندما بلغت اقطار مناطق التثبـــــيط عند التركيز 1000ملغم/مل لكل من بكتريا aureus. S وPr.mirabilisو Ps.aeruginosaو E.coli وK.pneumoniae (32 ,21.3 , 20.6 , 18.6 , 14.3) ملم وعلى التوالي . وكان المستخلص المائي البارد لاوراق العنب هو الاكفا في تاثيره مقارنة بمستخلصات البصل واوراق الخروع . تم اختبار قابلية الانواع البكتيرية المنتخبة على الالتصاق على الخلايا الطلائية قبل وبعد المعاملة بالتركيز تحت المثبط الادنى للمستخلصات النباتية، فقد اظهر التركيز تحت المثبط الادنى للبصل تاثيرا مثبطا للالتصاق الانواع Ps.aeruginosa وaureus . Sو E.coli عندما قلل عدد الخلايا البكتيرية الملتصقة من ( 56.8 , 48.9 , 24.7 ) وعلى التوالي ليصبح (11.6 , 08 21 , 15.3)على التوالي. اظهر مستخلص اوراق العنب تاثيرا مثبطا لالتصاق الانواع المختبرة Ps.aeruginosaو aureus . Sو Pr.mirabilis وK.pneumoniaeوE.coli عندما بلغ معدل الخلايا الملتصقة بعد المعاملة بالمستخلص ( 12.8, 14.8, 8.3 , 16 ,12.8 ) وعلى التوالي ،اما مستخلص اوراق الخروع فقد قلل عدد الخلايا الملتصقة للانواع Ps.aeruginosa وaureus S. وK.pneumoniae وE.coliمن (56.8 , 48.9 ,46.8 ,24.7) لتصبح ( 7 , 13.6 ,4.2 ,4.5) وعلى التوالي ، كان هذا المستخلص الاكفا لتثبيط التصاق الخلايا البكتيرية بالخلايا الطلائية . | Eighty swabs were collected from patients suffering from otitis media who attended Al - sader hospital in Baghdad during November 2007 to January 2008. Swabs were cultured on blood agar and MacConkey agar media to isolate bacteria and to diagnose by microscopic cultural and biochemical testes. Ninety six isolates were isolated and identified to species as follows : (33) isolates (39.75)% were Pseudomonas aeruginosa, (11) were S.aureus with a ratio of (13.2)% and (8) isolates with a ratio of (9.6)% were S.epidermidis .(8) isolates with ratio (19.6)% were Proteus mirabilis, while (5) isolates were Klebsiella pneumoniae with a ratio of ( 6.02) % and (4) isolates with ratio (4.8)% Escherichia coli, However (14) swabs with a ratio of (16.86)% with no growth. Results showed that the infections by a single pathogen were the dominant was reached 96.2%, while the mixed infection was only (3.7)%. The infection in female were 57.2% , while in male were 42.5%. However ,the high percentage of infection were observed within the age range of less than year to ten years . Morever the chronic infection with otitis media were more dominant than the acute infection. Sensitivity of the isolates towards (18) antibiotics were performed. The results showed complete resistance (100%) of Pseudomonas aeruginosa to Carbenicillin, Doxycyclin and Ceftizoxime, while they were sensitive to Amikacin, Imipenem and Ciproflaxcin , except one isolate. Proteus mirabilis and Escherichia coli isolates were (100 )% resistant to Doxycyclin, while Klebsiella pneumoniae isolates were completely resistance (100%) to Doxycyclin , Gentamycin and Pipracillin. All Staphylococcus spp. isolates completely resisted Methicillin (100%) , but resisted Penicillin , Ampicillin , Cloxacillin at less ratios. Bacterial isolates which included Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae ,E.coli were chosen according to their virulence factors and resistant to the antibiotics , to be used for studying the effect of cold - water extracts of Allium cepa (Onion) ,Ricinus communis leaves(Caster bean) and Vitis vinifera leaves(Grape) on bacterial growth ,and adherence to epithelial cells of human . Allium cepa extracts showed activity against Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli at concentration of (750, 1000, 1250, 1500)mg/ml when the diameter of inhibition zones for S.aureus , Ps.aeruginosa, E.coli at (750)mg /ml were (13 ,12 ,11)mm, respectively . The Ricinus communis leaves extracts showed activity against Ps.aeruginosa , S.aureus , E.coli and K.pneumoniae at concentration of ( 250, 500, 750, 1000)mg /ml with diameters of inhibition zones at 1000mg/ml (15.33 ,16.33 ,16.33 ,15.66) mm , respectively. While Vitis vinifera leaves extracts showed activity against all tested bacterial species in concentrations of (250 ,500 ,750 ,1000)mg/ml with inhibition zones at 1000mg/ml concentration for S.aureus, Pr.mirabilis, Ps.aeruginosa, K.pneumoniae, E.coli (32 ,21.3 ,20.6 ,18.6 ,14.3) mm , respectively . Result showed that the cold - water extract of the Vitis vinifera leaves was the most efficient in its effects on bacterial species in comparison with Allium cepa and Ricinus communis extracts . The ability of chosen bacterial isolates for adherence before and after the treatment with sub - minimum inhibition concentration of plant extracts showed the sub - MIC for Allium cepa extract reduced the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus , E.coli when the adhered bacterial cells decrease from (56.8 ,48.9 ,24.7) to be (11.6 , 21.08 ,15.3) , respectively. Vitis vinifera extract showed inhibition effect on the adherence of Ps.aeruginosa ,S.aureus ,Pr.mirabilis ,K.pneumoniae and E.coli when the average of adhered cells after the treatment with the extract were (12.8 , 14.8 , 8.3 , 16 , 12.8) , respectively . Ricinus communis leaves extracts decrease numbers of the adhered cells of Ps.aeruginosa , S.aureus , K.pneumoniae , E.coli to epithelial from ( 56.8 , 48.9 , 46.8 , 24.7) to be ( 7 , 13.6 , 4.2 , 4.5) , respectively

التحري وراثيا عن انتاج بعض انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية من بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة من مصادر سريرية مختلفة == Genetics Detection of Metallic and Extended spectrum Beta - Lactamase production from Klebsiella pneumoniae Isolated from different clinical sources

Author name: نبا علي جاسم
Supervisor name: رياض عبد الحسين دلول
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تضمنت الدراسة جمع 1600 عينة سريرية من مرضى يعانون من التهابات مختلفة ، توزعت ما بين 1500 عينة ادرار و100 عينة قشع, ومن خلال نتائج الفحوصات الزرعية والفحص المجهري والاختبارات الكيموحيوية ، شخصت 53 عزلة تعود لبكتريا Klebsiella spp تضمنت 44 عزلة تعود للنوع K.pneumoniae و6 عزلات تعود للنوع K.oxytoca و3 عزلات تعود للنوع K.planticola .اختبرت حساسية عزلات بكتريا K.pneumoniae لـ 15 مضادا حيويا شملت على : Aztreonam وAmpicillinو Amikacinو Ceftriaxoneو Cefotaxime وCeftazidime[ Amoxicillin / Clavulanic acidو Meropenemو Imipenemو Ciprofloxacin Kanamycin وPipracillinو Cefepimeو CarbenicillinوStreptomycin,] . تم التحري عن انتاج هذه العزلات لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف والمعدنية ، اذ استخدمت طريقة الاقراص المتاخمة للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وثلاث طرائق للتحري عن انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية ،وتم الحصول على خمس عزلات منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وعزلة واحدة منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية وكانت العزلات المنتجة لهذه الانزيمات تحمل مقاومة عالية للمضادات الحياتية AztreonamوCeftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وCarbenicillin وPipracillin وAmpicillinبنسبة 100%. تم تحديد التركيز المثبط الادنى(MIC) Minimum Inhibition Concentration باستخدام طريقة تخفيف الاكار القياسية،وقد اظهرت العزلات قيمة MIC عالية اتجاه المضادات قيد الدراسة (Ceftriaxone وCefotaxime وCeftazidime وImipenem) اذ تراوحت القيم للعزلات المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميزالواســعة الطــيف(K22,K26,K28,K29,K36) من g/mlµ(0.1 - 0.05) لمضاد Imipenem وg/mlµ (256 - 32) لمضاد وg/mlµ (1024 - 256) لمضاد Ceftriaxone وg/mlµ (1024 - 128) لمضاد Cefotaxime. اما العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية K8 فقد كانت قيمة MIC لهg/ml µ ( 64 ,512,1024, ( 512 للمضادات (Imipenem , Ceftazidime , Ceftriaxone , ( Cefotaxime على التوالي.تــمـــت دراســــة المــحتــوى البلازمـيـــدي للــعــزلات الســـتة المنتخبة (K8, K22, K26, K28, K29, K36) واظهرت نتائج الترحيل الكهربائي في هلام الاكاروز امتلاك العزلة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز المعدنية (K8) حزمة بلازميدية في حين تباينت العزلات الخمسة المنتجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ، اذ احتوت العزلتين K22 وK26 على ثلاث حزم بلازميدية ، بينما العزلة K36 على حزمتين بلازميدية في حين احتوت العزلتين K28 وK29 على حزمة واحدة فقط. اظهرت نتائج معاملات الدنا البلازميدي باستخدام مادتي Ethidum Bromide وSDS عدم قدرة مادة SDSعلى تحييد الحزم البلازميدية، في حين كان Ethidum Bromide محيدا كفوءا عند التركيز g/mlµ (512 - 1024 ).تم استخدام تقنية (PCR) Polymerase Chain Reaction للتحري عن امتلاك العزلات قيد الدراسة على الجينات التي تشفرالى انتاج انزيمات ESL وML وباستخدام طريقة الاستخلاص السريعة (الغليان) وطريقة المستعمرة المباشرة كقالب الدنا وباستخدام بادئات متخصصة لاستهداف الجين shv - bla والجين bla imp - 1. اظهرت العزلات المنتجة لانزيمات ESLجميعها امتلاكها للجين shv - bla وبنسبة %100 ولكن العزلة المنتجة لانزيمات IMP اعطت نتيجة سالبة، كما اظهرت طريقة الاستخلاص بواسطة الغليان كفاءة عالية كقالب للدنا، مقارنتا بطريقة المستعمرة المباشرة. | The study included (1600) clinical samples from Patients suffering From different infections distrubated between (1500) urine and (100) sputum. Morphological ، biochemical tests and use Api 20 E system were employed to diagnose bacterial species and the result showed they were (53) isolates of Klebsiella spp.included(44) K. pneumoniae. (6) K. oxytoca and (3) isolates of K. planticola. Antibiotic susceptibility for K. pneumoniae isolate was performed against 15 antibiotic using disk diffusion method. Disc approximation method was used to detect production of ESLs , and three methods used to detect production of MLs.Results indicated that 5 isolates produced ESLs and only one isolate produced MLs, they isolates which produced ESLs were have highly resistant to antibiotic (100)%to [Aztreonam, Ceftriaxone, Cefotaxime, Ceftazidime, Ampicillin, Pipracillin, Carbenicillin]. Agar dilution method was used for the determination of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for the ESLs and MLs producing isolates. The result showed high resistance to Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem and Ceftazidime. The value of MIC of isolates producing ESLs(K22,K26,K28,K29,K36) were (0.05 - 0.1) µg/ml to Imipenem antibiotic, Ceftazidime (32 - 265) µg/ml, Ceftriaxone (256 - 1024) µg/ml and Cefotaxime (128 - 1024) µg/ml, while the isolate producing ML(K8) showed MIC value (64, 512, 1024, 1024) µg/ml respectively. The plasmid content of six isolates (K 8, K 22, K 26, K 28, K 29, K 36) were studies، the result of revealed electrophorsis in agar gel that the isolate K8 have one plasmid, while isolates produce ESLs differs on plasmid content,in our side K22, K26 have three plasmid, K36 have two plasmid and K28, K29 have one plasmid. Curing was conducted by the use of SDS and ethidum bromide ، and the results showed that the isolates lost the plasmids at concentration (512 - 1024) g/mL of ethidum bromide. Polymerase chain reaction technique was performed for the detection ESLs and ML, DNA template that used for PCR reaction was prepared by using boiling method and the Direct colony method, by using SHV to detect ESL and IMP - 1 to detect MLs. The results showed that all isolates were 100% harboring blashv while blaIMP - 1 gave negative result.also the extraction by use boiling method showed high efficiency compare with direct colony method.

تاثير بعض العوامل الفيزيائية والكيميائية في الشكل المظهري والامراضية لخميرة Candida albicans == Effect Of Some Physical And Chemical Factors In Morphology And Pathogenicity Of Candida albicans

Author name: ميس قيس علي
Supervisor name: سجال عبد الوهاب الركابي | رباب قاسم صقر
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study included isolation and identification Candida albicans from different sources ,We obtained (26) isolates of Candida albicans of the total (115) samples which included (60) clinical samples of children who suffer from inflammatory in the Area of diapers in the children Protection Teaching - Hospital in The Medical City hospital and Alalweia hospital in Baghdad ؛(50) soil samples from Nurseries and gardens and corrals , )5) dried milk samples in the period between January2012to April2012 . We obtained (20) isolates C. albicans from the clinical samples; (5) isolates from soil samples and only one isolate from the dried milk samples.All isolates have been cultured on a differential mediums to diagnosis and identify C. albicans from the other species . Biggy agar, Candida medium, Candida BCG ,Corn meal agar involved in the isolation and identification of the C. albicans. Candida diagnosed based on the phenotypic characteristics of the developing colonies.All isolates was involved to microscopic examinations for the purpose of examining the phenotypic characteristics of C. albicans cells as well as to examine the germination tube formation, The diagnosis also includes the use of biochemical methods such as fermentation and assimilation behavior of Candida , API20cAUX System and ability of Candida to produce Proteinase in Skim milk agar and Blood agar.The second axis of the current study included investigating about white - opaque phenotypic switching, (20) clinical isolates (5) soil isolates (1) milk isolate showed ability to transition from white to opaque ,also we found the results of phenotypic transition ratios of the colonies grown on modified Lee’s mediums by adding Glucose or N - acetyl glucosamine in different incubation conditions involved the aerobic condition and presence of CO2, at (25)°c and (37)°c during (1,2,5,and 10) days. the results of transition ratios and the overlap between the factors compared statistically. the study found that the ratio reached a maximum at physiological temperature (37 o C) in the presence of N - acetylglucoseamine and 1% CO2 . in the aerobic condition at (37o)C with presence of N - acetylglucoseamine the results show a significantdifference at the duration between the 1st and 2nd day, and no significant difference on the dried milk isolate . The results of 5th and 10th days do not show significant difference in any isolates which due to the saturation condition when cell do not affect a change in the metabolic activity, so it dispense with N - acetylglucoseamine who induce the swathing only for a short duration.Further study the morphology of C. albicans with transmission electron microscope (TEM) and the virulence of the white and opaque colony of C. albicans. The histopathological study of the liver, the spleen and the kidneys of injected mice (Balb/c) showed several changes in the tissues, two concentration of yeast suspension (1.5 x 108) cells/ml and (3x 108) cells/ml prepared by McFarland method are used, the injection with the white the phenotypic (1.5 x 108) showed necrosis in the renal tubule and mononucleosis filtration in the tissue of the kidney, also simple filtration to the inflammatory cell in liver and a replication and necrosis in the lymphatic tissue of the spleen .The white the phenotypic (3x 108) showed a necrosis in the lymphatic tissue of the spleen and a filtrationto the Megakaryocytes, acute necrosis in liver cells and a filtration to the inflammation near the hepatic portal veins and a acute renal failure combined with mononucleosis filtration in the kidney ,On the other hand the opaque cells injection (3x108) cells/ml has caused a simple necrosis in tissues of the liver, spleen and the kidneys while the opaque cells (1.5 x108) cells/ml has no effective virulence and the tissue diagnosed as a normal.

التاثيراث ضد المايكروبية والالتهابية للبكتروسينات المنتجة والمنقاة من بكتريا Staphylococcus aureus وPseudomonas aeruginosaالمعزولة معه العيناث سريرية == Antimicrobial and inflammatory effects of bacteriocins produced and purified from multidrug resistance Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples

Author name: ميس عماد احمد
Supervisor name: منى تركي موسى الموسوي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: One hundred fifty clinical samples (burns, wounds, urine, nasal and ear swabs) were collected from patients of Al - Yarmouk Hospital and Teaching Baghdad Hospital during the period from November / 2015 to January / 2016.Multi drug resistant strains are serious problems in public health worldwide. So, the continueous development of new classes of antimicrobial agents has become of increasing importance for medicine. Therefore was aimed to produce of Crude and purified bacteriocins from antibiotic resistant bacteria (G - ve MRSA and G+ve P. aeruginosa) isolated from clinical samples and determine the optimization conditions for production of bacteriocin and their purification and characterization. In addition to characterize their inhibitory activity in - vitro and in - vivo .Cultural and morphological characteristice examination ,biochemical tests were conducted and confirmed the diagnosis by API20E and Staph API and antibiotics sensitivity test confirmed by Vitek - 2 system.The results showed 102(68%) isolates of S.aureus, all of which were Methicillin Resistace S.aureus (MRSA), constituted 50% from the ratio in the burns and wounds samples, while the lowest 13(12.7%) isolates were from ear samples. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. The isolates showed multi - resistant to Methicillin, Penicillin G , Cefoxitin, Erythromycin, Oxacillin, Chloramphenicol and Tetracyclin, while sensitive to vancomycin.Also 77(51.3%) isolates were P.aeruginosa, 62(80.5%) from which were multi - resistant to antibiotics that constituted more than half (59.8% and 51.6%) from the ratio in burn and wound samples respectively, while the lowest 8(12.9%) isolates were from ear samples too. Highly significant differences (P˂0.01) recorded in both isolates among clinical samples. There were about completely resist to Cefoxitin 75(97.40 %) and also show a higher resist to Ceftazidime, Tetracycline and Cefepime, While less resistance to Azithromycin.Vitek 2 system gave confirmation of positive results for MRSA and resistant P.aeruginosa and as a selected organism with a probability 98 - 99%."II "The MRSA isolate S12 and P.aeruginosa isolate (P26) were chosen among five bacterial isolates as a good producer for crude MRSAcin and MAR - pyocin according to their widest inhibition zone .Five methods were used to detect of MRSAcin and MAR - pyocin production by (well diffusion assay WDA , flip - streak , spot on the lawn , Cup disc and paper disc method) against indicator pathogens (G+ve , G - ve bacteria and yeast) which included, Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans .Well diffusion assay was the best method for identify of bacteriocin production and antibacterial activity against indicator pathogens.The crude and purified MRSAcin and MAR - pyocin recorded non - significant differences in activity whether as alone or synergistic against pathogenic bacteria (G - ve and G+ve) and yeast compared with higher sensitive antibiotics.The optimum conditions for bacteriocins production were in trypticase soya broth and brain heart infusion broth supplemented with )Carbon ,nitrogen, Salts, surfactants and Vitamins) with pH 7, at temperature 37°C for 48 hrs. and inoculum size of 2% from bacterial culture 6×108 cell/ml."Purification of bacteriocin was made by two steps method including extraction by ammonium sulphate 70% followed by ion - exchange chromatography DEAE - cellulose that the specific activity for these fractions was 1.375and1.000 (AU/mg) with 6 and 5 purification folds and 78 and 29 % yield and gel filtration chromatography on using Sephadex G - 50 column. The resulted fractions were 1.646 and 1.160 (AU/mg) protein with 8 and 6 purification folds and 38 and 28% yield respectively."Physical characteristics were also studied and the results showed that the molecular weight of MRSAcin and MAR - pyocin was )15and 35) KDa respectively by Sodium Dodecyl Sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis (SDS - PAGE). Purified bacteriocins were stable at wide range of pH values 1 - 8, and remained active (50%) at pH 9 .The whole activity was lost at the pH value 10 and thermostabile at 100°C for 30 min.A strong stability of bacteriocins were recorded against organic solvents 10% and surfactants (0.5% EDTA), mineral salts 0.5% of each (CuSo4 and FeSo4), (10%) proteolytic enzymes lipase recorded significantly different (P≤0.05) compared with other enzyme (trypsin, pepsin and papain) which show complete inactivation of antibacterial activity.Also crud bacteriocins are still active for at least 3 months of freezing storage, while in purified after 2 months of freezing storage. Showed that the minimum inhibition zone against E. coli was 62.5 μg/ml for both MRSAcin and R - pyocin in vitro. The effect of MRSAcin and MAR - pyocin on the cell permeability was studied and the results showed that the absorbance at 260nm increased, indicating that DNA leaked from cells due to the cell lysis.Experimental infection induced by therapeutic effectiveness of the bacteriocin invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa which was marked at the beginning of her appearance inflammation of skin, swelling and redness of the affected area with the appearance of festering spots and abscesses in the surface layer of the skin and with the progress of the abscess spotted Purple happens .The antibacterial action of synergistic affected of (MRSAcin and MAR - pyocin) extracts .The results confirmed that the treated invivo skin injury bacteria MRSA and resistance P. aeruginosa was damaged . MRSAcin , MAR - pyocin and synergistic were giving good healing process with limited tissue damage in vivo (mice) against superficial skin infection by MRSA and resistance P. aeruginosa isolates at 1,2,3 day after infection.

دراسة بعض التاثيرات البيئية لملوثات الهواء في بغداد

Author name: نادية كامل بشار القريشي
Supervisor name: حسوني جدوع عبد الله
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: تمت دراسة تلوث الهواء بدقائق الغبار ( العواصف الغبارية dust storm والغبار العالق في الهواء Suspended dust والغبار المتصاعد rising dust والغبار المترسب على اوراق نبات الدودونيا Dodonaea viscose L. جمع الغبار على الاوراق في كل شهر من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009 لثلاث مناطق : الكاظمية ، والمنصور ، وشارع فلسطين ، في مدينة بغداد/ العراق، واخذت معلومات عن عدد المرضى الشهري الذين زاروا مستشفى ابن النفيس خلال فترة الدراسة من كانون الثاني الى شهر حزيران 2009. ربطت العلاقة بين عدد المرضى والظواهر اعلاه .وبينت النتائج ان العواصف الغبارية لم يكن فيها فرق معنوي بين معدلات الفترات الزمنية 1970 - 1980 و1980 - 1990 و1990 - 2000للاشهر الستة اعلاه . بينما يوجد فرق معنوي على مستوى 5% ( P - value = 0.022 ) لشهر اذار بين الفترات الزمنية الثلاث اعلاه . بالنسبة للغبار المتصاعد .المعدل الشهري لمجموع الغبار المترسب على اوراق نبات الدودونياكان معنويا لشهر اذار ( 0.70 غم / سم ²) ومايس (0.38 غم / سم ² ) وحزيران (0.38 غم / سم ²) للمناطق الثلاث تحت الدراسة .معدل عدد المرضى كان 8848.0 ، واقل قيمة هي 6902.00 وكانت في شهر كانون الثاني ، واعلى قيمة12940.0 في شهر حزيران .ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والغبار المترسب (r =0.9679) ، والمعادلة الاتية توضح العلاقة : Y=12684.505e - 86.3442X العلاقة بين عدد المرضى الشهري (Y) والغبار الجوي المتصاعد(X)Rising dust Y=11841.62 - 2211.404+220.69X2 ….. r = 0.8033ولوحظت علاقة عالية المعنوية بين عدد المرضى والعواصف الغبارية (r = 0.6763) Y=480.00+20168.42X - 9993.53X2 ….. r=0.6763ولاتوجد علاقة معنوية بين عدد المرضى والغبار المعلق Y=11749.138 - 785.34X+39.21X2 ….. r=0.3772 وقد تبين من نتائج التحاليل الكيمياوية للغبار المترسب ان هناك فرقا معنويا في نسبة الكاربون العضوي للمناطق الثلاثة ونسبة المادة العضوية والكالسيوم والمغنيسيوم وملوحة التربة وتفاعلها ، بينما لا يوجد فرق معنوي بالنسبة لمحتوى الرصاص والكاربونات والبيكاربونات والكلورات .

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لاعلاف الدواجن والتحري عن مستوى التلوث بالافلاتوكسين == Isolation and identification of fungi associated with poultry feeds and detection of aflatoxin contamination level

Author name: هـبـة فـرحان دلــــي
Supervisor name: مهند محمد نوري المفتي | هادي مهدي عبـود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: هدفت الدراسة الى تحديد مدى تلوث بعض اعلاف الدواجن(خليط من بذور بعض المحاصيل) المعروضة في بعض الاسواق المحلية لبعض محافظات العراق بالفطريات ، وتحديد قابلية عزلات الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسينات فضلا عن تقييم كفاءة اربعة ممد صات كيميائية في ٳمدصاص سم الافلاتوكسين B1 من الاوساط السائلة . اظهرت نتائج عزل وتشخيص الفطريات المعزولة من 52 عينة من اعلاف الدواجن من محافظات بغداد ،ديالى ،بابل ،السماوة ،كربلاء ،القادسية وميسان تواجد الانواع الفطرية الاتية في الاعلاف : Alternaria alternaria وAspergillus candidus وAsp.clavatus وAsp.flavipesوAsp.flavus وAsp.fumigatus وAsp.niger وCephalosporium spp. وCladosporium cladosporioids وFusarium graminearum وF.moniliforme وF.oxysporum وGonatosbotrys simplex وMucor sp. وPenicillium citrinum وP.chrysogenum وP.cyclopium وP.expansumوP.griesofulvum وP.oxalicum وUlocladium sp. ومجموعة Mycelia sterila fungi. وفيما يخص نسبة التواجد فقد كان الجنس Aspergillus sp. هو الاعلى في معظم العينات المفحوصة اذ بلغت نسب تواجده 99.15 ،100 ،100 ،94.55 ،100 ،98.58 ،100 و95.24% في العينات B4 ،B11 ،B13 ،B16 ،B17 ،Kh6 ،M1 وM3. وسجل النوع Aspergillus flavus اعلى نسبة مئوية للتواجد بالنسبة لبقية انواع الجنسAspergillus sp. اذ بلغت نسب تواجده 88.03 ،85.71 ،71.43 و% 87.5 في العينات B4 ،B17 ،C2 وC3. في حين ظهر الفطر Cladosporium cladosporioids بشكل متوسط وبنسب مئوية 41.67 ،56.25 ،72.22 ،71.43 و50 % في العينات B¬1 ،B2 ،B6 ،B7 وC1 . اما الفطر Gonatobotrys simplex فقد سجل اقل نسبة مئوية للتواجد بلغت 0.5 % في العينة Di1. وفيما يـخـص تـكـرار العـزل قـد اظهر الجـنـس Aspergillus sp. اعـلـى تكرارات بـلـغت 19 : 18 ،7 : 7 ،3 : 3 ،3 : 3 ،6 : 5 ،6 : 6 و8 : 8 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل،السماوة ، كـربلاء ، القادسيـة ومـيـسان ومـن بـيـن انـواع الجـنـس Aspergillus sp. سجـل النـوع Aspergillus flavus اعـلـى تكرارات عـزل بـلـغت 19 : 15 ،7 : 5 ،3 : 3 و3 : 3 % فـي عـيـنات مـحافـظات بـغـداد ، ديالـى ، بابـل ، الســماوة على التوالي . اظهر الفـطـر Cladosporium cladosporioids تـكـرار عــزل بلغت متوسطاته 19 : 8 ،7 : 3،6 : 2 و8 : 4 % في عينات محفظات بـغـداد ، ديالـى ، كربلاء وميسان . اما اقل تكرار عزل فسجله الفطر Gonatobotrys simplex اذ بلغ 7 : 1 % في عينات محافظة ديالى . وبالنسبة لبقية الفطريات فقد اظهرت نسب تواجد وتكرارات عزل متباينة حسب مصدر العينات ومكوناتها . وفيما يخص الحمل الفطري فقد سجلت محافظة كربلاء اعلى معدل للحمل الفطري بلغ 253×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، وسجلت محافظة القادسية معدل حمل فطري متوسط بلغ 140×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف ، في حين كان اقل معدل حمل فطري لمحافظة السماوة اذ بلغ 3.4×106 وحدة مكونة للمستعمرة /غم علف جاف . اظهرت نتائج قابلية 37 عزلة من الفطر Aspergillus flavus على انتاج الافلاتوكسين ان 13 عزلة فقط اظهرت قابلية على انتاج الافلاتوكسين B1، وتفوقت العزلة 6B من محافظة بغداد على بقية العزلات في القابلية على الانتاج اذ سجلت قابلية فائقة في الانتاج (++++) . اظهرت نتائج الكشف بتقانة TLC كفاءة كل من قشور الرمان والفحم المنشط والكايتوسان كعوامل ممدصة ، وكانت قشور الرمان اكفا هذه العوامل اذ اظهرت اكبر مساحة بقعة واشد تالق مقارنة ببقية المعاملات الاخرى، في حين اظهر الفحم المنشط كفاءة جيدة في الامدصاص ولكن بمستوى اقل من الدباغ. اما فيما يخص الكايتوسان قد اظهر كفاءة قليلة كعامل مدمص بينما اظهر الطين عدم كفاءته كعامل مدمص الا انه اظهر كفاءة عالية في التحطيم حيث ادى الى اختفاء السم من الراشح والراسب. | This study was aimed to determine the fungal contamination levels of poultry feeds(grains mixture of agricultural crops) exhibited in local markets of some Iraqi governorates, the aflatoxin toxigenic activity of Aspergillus flavus isolated isolates and evaluation of four materials as detoxification agents. The results of fungal isolation and identification of 52 poultry feed samples collected from Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan governorates revealed presence of the following fungal species : Alternaria alternaria,Aspergillus candidus, Asp.clavatus, Asp.flavipes, Asp.flavus, Asp.fumigatus, Asp.niger, Cephalosporium ssp., Cladosporium cladosporioids, Fusarium graminearum, F.monilforme, F.oxysporum, Gonatobotrys simplex, Mucor sp., Penicillium citrinum, P.chrysogenum, P.cyclopium, P.expansum, P.griesofulvum, P.oxalicum , Ulocladium sp. and Mycelia sterile fungi group. Genus Aspergillus showed the highest percentage of occurence in most tested samples which recorded 99.15 ,100 ,100 ,94.55 ,100 ,98.58 ,100 and 95.24 % in samples B4 ,B11 ,B13 ,B16 ,B17 ,Kh6 ,M1 and M3, respectively. Species Asp.flavus recorded the highest percentage of occurence among other Aspergillus species which recorded 88.03 ,85.71 ,71.43 and 87.5% in samples B4 ,B17 ,C2 and C3, respectively, while the fungus Cladosporium cladosporioids appeared in moderate percentage when recorded 41.67 ,56.25 ,72.22 ,71.43 and 50 % in samples B1 ,B2 ,B6 ,B7 and C1, respectively. Fungus Gonatobotrys simplex showed the lowest percentage of occurence (5.0% in Di1). The genus Aspergillus also recorded highest isolation frequencies (18 : 19 ,7 : 7 ,3 : 3 ,3 : 3 ,5 : 6 ,6 : 6 and 8 : 8 %) in (samples Baghdad, Deila, Babil, Seemawa, Karbala, Kadisia and Maysan).However, among isolated species, Asp.flavus recorded highest frequencies 15 : 19 ,5 : 7 ,3 : 3 and 3 : 3 % in samples Baghdad, Deila, Babil and Seemawa respectively, while Cladosporium cladosporioids showed moderate isolation frequencies 8 : 19 ,3 : 7 ,2 : 6 and 4 : 8 % in samples Baghdad, Deila, Karbala and Maysan respectively and the Gonatobotrys simplex the lowest (1 : 7 %) in Deila samples. Other fungal isolates showed different percentages of occurence and isolation frequencies according to the source and components of the collected Samples. Karbala governorate recorded highest rate of fungal load (253×106 CFU / gm feed), moderate rate (140×106 CFU / gm feed) recorded by Kadisia samples, while the lowest (3.3×106 CFU / gm feed) by Seemawa samples. The results of toxigenic activity of 37 isolates of Asp.flavus showed that only 13 of them have toxigenic activity, and isolate B6 was the most toxigenic than other isolates. The results of TLC showed the efficiency of Pomegranate pericarp , activated carbon and chitosan as absorption agents. Pomegranate pericarp was the most efficient as manifested by area and severe fluorescence of it's sopt followed by activated carbon and chitosan which recorded the lowest efficiency, while clay had no efficiency as absorption agents but it showed high efficiency in toxin degradation as manifested by the disappearance of the toxin in both filterate and precipitate.

علاقة الحركيات الخلوية بالتهاب المعدة المزمن لدى عينة من المرضى العراقيين == Association of Cytokines with Chronic Gastritis in A sample of Iraqi Patients

Author name: نرجس عبد الرحمن عودة اللامي
Supervisor name: اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: يعد التهاب المعدة المزمن من المشاكل الصحية الكبرى الواسعة الانتشار في العالم وتعتمد الاصابة به على نوع المسبب المرضي ومدى فعاليته اضافة الى قوة الاستجابة الالتهابية والمناعية (الخلوية والخلطية) للمضيف، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف تقييم بعض المعايير المصلية والنسيجية التي يمكن من خلالها تشخيص نوع المرض والاصابة ببكتريا H.pylori، ولتوضيح تاثير بعض العوامل المناعية والالتهابية على الحالة المرضية لدى مرضى التهاب المعدة المزمن. شملت الدراسة (100) مريض عراقي يعانون من اعراض عسر الهضم خضعوا للتنظير المعدي واستئصال الخزعات النسيجية (61 ذكر، 39انثى) تراوحت اعمارهم بين 10 الى 79 سنة، وقسمت مجموعة المرضى وفقا للتشخيص النسيجي الى ثلاثة مجاميع، الاولى تضم 66 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن الفعال Active Chronic Gastritis ، والثانية 21 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن السطحي Superficial Chronic Gastritis، اما الثالثة فشملت 13 مريضا مصابا بالتهاب المعدة المزمن غير الفعال Inactive Chronic Gastritis، فضلا عن ثلاثين متطوع من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة. اجريت الدراسة في المركز التعليمي لامراض الجهاز الهضمي والكبد في دائرة مدينة الطب في بغداد ومختبرات الصحة المركزية، واستمرت للمدة من تشرين الثاني 2007م الى نيسان 2008م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : 1 - ان الاصابة بالتهاب المعدة المزمن في الذكور اعلى منها في الاناث؛ اذ بلغت نسبة الذكور الى الاناث 1 : 1.56 ومتوسط اعمارهم (40.03) سنة، لكن لم يشكل هذا الفرق دلالة معنوية (P> 0.05).2 - اظهرت الفحوصات النسيجية للمعده وجود بكتريا H.pylori بنسبة (66%) من المجموع الكلي لمرضى التهاب المعدة المزمن. 3 - تبين من خلال الفحوصات السيرولوجية للتحري عن اضداد IgG ضد H.pylori اصابة (70%) من مرضى التهاب المعدة المزمن ببكتريا H.pylori مقارنة بالمرضى غير المصابين بالبكتريا (30%) وقد اكتسب هذا الفرق دلالة معنوية جدا(P < 0.01)،كما ارتفع مستوى اضداد IgG ضد بكترياH.pylori لدى مجاميع المرضى الثلاثه ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P < 0.05).4 - اظهرت الاختبارات السيرولوجية لتقييم حالة الطبقة الظهارية لمخاطية المعدة - ارتفاع مستوى الكاسترين - 17 لدى مجاميع المرضى الثلاثة ICG وSCG وACG على التوالي بدلالة معنوية (P < 0.05) مقارنة مع مجموعة السيطرة. - وجد هناك فرق معنوي (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين I لدى مرضى ACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة لكن لا يعد ذلك ارتفاعا في مستوى PGI لكون قيمته كانت ضمن النسب الطبيعية لمستوى PGI في مصل الدم. - لوحظ وجود علاقة معنوية (P < 0.05) في مستوى الببسينوجين II لدى مرضى ACG فقط مقارنة بمجموعة السيطرة، بينما لم تلاحظ اي فروقات معنوية (P > 0.05) في مستوى نسب PGI/II لدى مجاميع المرضى مقارنة بمجموعة السيطرة. 5 - الحركيات الخلوية Cytokines - ارتفاع مستوى IL - 4 في مصل مجاميع المرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بمجموعة السيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - اظهرت مجاميع المرضى ICG وSCG وACG على التوالي ارتفاع مستوى IL - 8 في المصل مقارنة بالسيطرة وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك ارتفاع في مستوى IL - 10 في مصل مجاميع المرضى ACG وICG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا لدى مرضى ACG فقط (P < 0.01). - ارتفع مستوى IFN - γ في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل الارتفاع فرقا معنويا (P < 0.05). - اظهرت مجاميع مرضىACG وSCG وICG على التوالي ارتفاع مستوى GM - CSF في المصل مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا ( P < 0.05). 6 - الكلوبيولينات المناعية Immunoglobulines - ارتفع مستوى IgG في مصل مجاميع مرضى ICG وACG وSCG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - لوحظ ارتفاع مستوى IgA في مصل مجاميع مرضى ACG وSCG وICG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). - وجد هناك اختلاف في مستوى IgM بين مجاميع المرضى والسيطرة وكان الاختلاف معنويا لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة. 7 - مكوني المتمم C3، C4 - ظهر فرق معنوي (P<0.05) في مستوى C3 لدى مرضى ACG فقط مقارنة بالسيطرة، فيما كان مستواه لدى مرضى التهاب المعدة المزمن عامة ومرضى SCG وICG مقاربا لمجموعة السيطرة ومن دون فروقات معنوية. - ارتفع مستوى C4 في مصل مجاميع مرضى ICG وSCG وACG على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P < 0.01). 8 - اظهر التحليل الاحصائي وجود فروقات معنوية بين المرضى والحالة الاقتصادية والاجتماعية (P < 0.01) وكانت اعلى نسبة للتكرارات لدى المرضى ذوي الحالة الاقتصادية والاجتماعية الواطئة. فيما لوحظ انخفاض المستوى التعليمي لدى مرضى التهاب المعدة المزمن وقد شكل هذا الانخفاض دلالة معنوية (P<0.01). وعند المقارنة الاحصائية بين المرضى والاعراض السريرية وجد ارتفاع تكرارات المرضى لمجموعة من اعراض عسر الهضم واكتسب الارتفاع دلالة معنوية (P<0.01). 9 - اظهرت نتائج الدراسة الحالية وجود علاقة طردية بين IL - 4 وكل من PGII وIL - 10 وIgG وكانت العلاقة طردية ايضا بين IL - 8 مع IgG وC4 وIgA وG - 17، فيما ارتبط مستوى IL - 10 بعلاقة طردية مع IFN - γ وPGII وC4، وظهر ايضا وجود علاقة طردية بين IFN - γ وكل من IL - 8 وIgA وC4 وIgG، وقد اكتسبت هذه العلاقات دلالة معنوية (P < 0.05). | The chronic gastritis is considered as one of the greatest health problem that is widely distributed throughout the world, and the disease depends on the type and the activity of the causes, furthermore the strength of immune & inflammatory response (cellular & humeral) of the host, The present study was conducted to estimate some of serological & histological parameters in order to diagnose both the type of disease, and infection with H.pylori, in addition to shed light on influence of some immunoinflammatory factors on pathogensis of thechronic gastritis. The study included (100)Iraqi patients (61 male & 39 female) are suffering from dyspepsia , and submitted for gastroendoscopy and biopsy. their age varied between 10 to 80 years. All patient groups were divided according to histological diagnosis into three groups , 66 with Active Chronic Gastritis (ACG), 21 with Superficial Chronic Gastritis (SCG) and 13 with Inactive Chronic Gastritis (ICG), with apparently health 30 individuals volunteers as control group, the study was carried out in the Gastroenterology and Hepatology Teaching Center in Medical City and Health Central Laboratories from November 2007 to April 2008. The study revealed the following results : 1 - The present study showed the frequency of chronic gastritis is higher among males than females; with ratio was 1.56 : 1 respectively; The mean age was (40.03) years, with non significant difference (P<0.05). 2 - Histological examinations revealed the incidence of H.pylori is (66%) among all patients. 3 - Serological examinations showed significance, that increasing number of patients with chronic gastritis infected with H.pylori (70%) compared with non infected (30%) Also highly significant increased (P<0.01) was observed in serum level of IgG antibody anti - H.pylori in the three patient groups : ACG, SCG, ICG respectively as compared with control group. 4 - Estimation of mucas epithelial layer state : - Significant increase (P<0.05) in serum level of Gastrin - 17 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively as compared with control group. - Significant difference (P<0.05) was found in serum level of pepsinogen I in patients groups : ACG, SCG respectively as compared with control group but that is not consider increase in the level of PGI because the values lies among the normal ratio of PGI level in serum. - There is significant relationship (P<0.05) was observed in serum level of pepsinogen II only in patients of ACG compared with control group, wherease non significant differences (P<0.05) was observed in the ratios of PGI / II in the patients groups compared with control group. 5 - Cytokines : - Significant increase (P<0.05) in the serum level of IL - 4 in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - All patients groups ICG, SCG, ACG respectively revealed highly significant increased (P< 0.01) in the serum level of IL - 8 compared with control group. - Highly significant increased (P<0.01) was observed of IL - 10 in all patients groups : ACG, ICG, SCG respectively compared with control group. - Highly level of IFN - γ in serum of all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively, This increament formed significant difference (P<0.05). - All patients groups ACG, SCG, ICG consequently revealed significant increased (P<0.05) in the concentration of GM - SCF as compared with control group. 6 - Immunoglobulines : - Highly significant increased (P<0.01) in the level of serum IgG in all patients groups : ICG, ACG, SCG respectively compared with control group. - Highly significant increase was observed in the level of serum IgA in all patients groups : ACG, SCG, ICG consequently compared with control group (P<0.01). - Patients groups revealed difference in the level of serum IgM compared with control group, but this difference was significant only in ACG patients (P<0.05). 7 - Complement components C3 and C4 : - Appearing significant difference (P<0.05) in the serum level of C3 only in ACG patients compared with the control group, but non significant difference when compared general patients of chronic gastritis and SCG, ICG patients with control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the serum level of C4 in all patients groups : ICG, SCG, ACG respectively compared with control group. 8 - Statistical analysis appeared significant difference (P<0.01) between patients with low socioeconomic state & educational level and inassociation with severity of clinical diagnosis & increased frequency of patient that’s are suffering from dyspepsia. 9 - The result of present study revealed direct correlation between IL - 4 with (PGII, IL - 10 & IgG), IL - 8 with (IgG, C4, IgA & G - 17), IL - 10 with (IFN - γ, PGII & C4) and IFN - γ with (IL - 8, IgA, C4 & IgG). This correlations request significant evidence (P<0.05).

التحري الجزيئي والتعبير الجيني لمضخات الدفق في بكتريا Pseudomonas aerugionsa متعددة المقاومة للمضادات الحيوية == The Role of Efflux Pumps in Multidrug - Resistance in Colistin - resistant Pseudomonas aeruginosa

Author name: نبراس رضا محمد العبيدي
Supervisor name: محمد فرج شذر المرجاني
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: جمعت 120 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa للمدة من /15 2014/9 لغاية /11/15 2014, من مصادر سريرية مختلفة شملت : (33عزلة ) من الادرار , و(25عزلة) من الحروق , و(25عزلة ) من القشع , و(17عزلة) من الجروح , و(12عزلة ) من الدم, و( 5عزلات ) من الاذن , و(3 عزلات) من ادوات قثطرة المجاري البولية. اختبرت حساسية العزلات قيد الدراسة تجاه مضاد الكولستين باستعمال طريقة الاقراص واظهرت النتائج وجود 27) ) عزلة مقاومة للكولستين وبنسبة (%22.5) , ثم اختبرت مقاومة60 عزلة (منها 27 عزلة مقاومة للكولستين ) تجاه اثناعشر مضادا من مجاميع مختلفة وتم تحديد حساسية العزلات ومقاومتها للمضادات المايكروبية باعتماد قياس قطر منطقة التثبيط بالمليمتر حول اقراص المضادات المستعملة , واظهرت النتائج ان جميع العزلات المختبرة كانت مقاومة بشكل تام لمضادات Amoxicillin وCarbencillin بينما ابدت العزلات مقاومة لمضاداتGentamycin بنسبة (%70) و(%56.6) Tobramycin وLomefloxacin (%58.3)وكانت المقاومة اقل لمضادات Aztreonam (%18.3) وPolymyxin B بنسبة (%18.3) وتليها المقاومة لمضادNorfloxacin (%13.3)و Levofloxacin (%11.6) وتجاه Ciprofloxacin الاقل مقاومة بنسبة (%8.3) .اختبرت قابلية (60) عزلة اعلاه على انتاج انزيم البروتييز وتكوين الغشاء الحيوي واظهرت النتائج قابلية % 88.3 من العزلات 53) عزلة )على انتاج انزيم البروتييز, وكانت جميع العزلات المقاومة للكولستين منتجة لانزيم البروتييز وبنسبة %100 , من جانب اخر كانت 43 عزلة (%71.7) منتجة طبقة لزجة قوية محددة بوساطة تكوين مستعمرات سوداء دلالة على تكوينها الغشاء الحيوي .تم الكشف عن وجود مضخات الدفق بين 60 عزلة من عزلات الدراسة ( منها 27 عزلة مقاومة لمضاد كولستين و33 عزلة حساسة له) باعتماد طريقة العجلة الخشبية Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) باعتماد صبغة الاثيديوم برومايد كمؤشر للكشف عن مضخات الدفق , واظهرت النتائج ان 46 عزلة (76.7%) من العزلات المختارة اعطت نتيجة موجبة للفحص اعلاه , ومن جانب اخر كانت جميع العزلات المقاومة للكولستين موجبة للفحص مما يدل على امتلاكها لمضخات الدفق , اما بالنسبة للعزلات الحساسة للكولستين فكانت %33.3منها تملك مضخات دفق بالكشف المظهري . اخضعت 32 عزلة (27 منها كانت مقاومة للكولستين) للكشف الجيني عن مضخات الدفق باستعمال تقنية Conventional PCRللكشف عن مضخة الدفق MexAB - OprM (بالكشف عن جينات oprMو (mexAومضخة الدفق MexXY (بالكشف عن جين mexY) اظهرت النتائج ان20 عزلة (62.5%) تمتلك الجينoprM , وان 22عزلة (68.8%) تمتلك الجين mexA , و24 عزلة (75%) تمتلك الجينmexY , وبينت النتائج ايضا بخصوص الكشف الجيني عن مضخات الدفق لعزلات الدراسة ان جميع العزلات الموجبة لاختبار امتلاك الجين mexYهي مقاومة للكولستين وقد شكلت نسبة %88.9 من العزلات الكلية المقاومة للكولستين . وتم الكشف عن التعبير الجيني لمضخة الدفق OprM - MexAB (بدراسة الجين (mexB ومضخة الدفق MexXY ( بدراسة الجين mexX) في 9 من عزلات الدراسة والتي كانت مقاومة لمضاد الكولستين باستعمال تقنية q RT - PCR من خلال استخلاص RNA البكتيري , ومن ثم تحويله الى cDNA , واظهرت نتائج الكشف عن التعبير الجيني للجين mexB والجين mexXان العزلات كانت متباينة في قيم ct , وبحسب معادلة Livak تم استخراج قيم ct ومعرفة التعبير الجيني لمضخات الدفق , ولوحظ ان التعبير الجيني لمضخة الدفق MexXY اكثر من التعبير الجيني لمضخة الدفق MexAB - OprM . | A total of (120) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were collected from different sources , During the period between 15/9/2014 till 15/11/2014 . The source of these isolates were as follows : (33) isolates from urine , (25) isolates from Burns , (25) isolates from sputum , (17) isolates from Wounds , (12) isolates from Blood , (5) isolates from ears ,and the last (3) isolates from Catheters . All isolates were identified through morphological , cultural and some biochemical tests and using Vitek2 GN . The antibiotic susceptibility test Towrd Colistin was done using the agar diffusion method ; Results showed that 27 isolates (%22.5) were resistance to Colistin ,then Sixty isolates ( Ones 27 isolates resistance to Colistin ) were tested against twelve antibiotic by measuring inhibition zone around disk antibiotic , Result showed that All isolates were complete resistance to Amoxicillin and Carbencillin , While resistance to other antibiotic were Gentamycin (70%) , Tobramycin (56.6%) , Lomefloxacin (58.3%) , and less resistance was showed for Aztreonam(18.3%) , Polymyxin B (18.3%), Norfloxacin(13.3%) , Levofloxacin(11.6%) and Ciprofloxacin (8.3%) ,The most effective antibiotic against Colistin resistance isolates were Levofloxacin and Ciprofloxacin . Sixty of isolates were choosen to detect for ability to protease production and biofilm formation , The Results showed 53 isolates (%88.3) were protease production , and results showed all Colistin resistant isolates were protease production and 43 isolates (%71.7) were able to biofilm formation . Sixity isolates (Ones 27 Colistin resistance isolates ) were choosen for detect efflux pumps by using Ethedium Bromide - Agar Cartwheel Method (EtBr CW) , which include ethedium bromide dye as marker to detect efflux pumps , the result showed that 46 isolates (%76.7) give positive result . Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was performed done using specific primer targeting the specific sequences of the mexA , mexY, oprM gene , The results showed that oprM found in 20 isolates (%62.5) , mexA found in 22 isolates (%68.8) , mexY found in 24 isolates (%75) , The results also showed that 88.9 % from Colistin resistant isolates had mexY gene . Detection of gene expression was performed done by using q RT - PCR technique after RNA extraction of Colistin resistant isolates and c DNA synthesis , The results showed that gene expression were high in efflux pumps especially to MexXY efflux pumps , and the gene expression to MexXY efflux pumps higher than MexAB - OprM efflux pums

المعالجة الاحيائية للرصاص من مياه الصرف الصحي باستخدام ثلاث انواع من النباتات المائية == Bioremediation of lead from municipal wastewater by three aquatic plant species

Author name: نشميل علي حسن الهواسي
Supervisor name: عبد الرحمن عبد الجبار الكبيسي | عبد الحميد محمد جواد العبيدي
General topic: Biology
Specific topic: Environment
Degree: Doctorate
University: University of Baghdad
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة مختبريا" للتعرف على قدرة ثلاث انواع من النباتات تم حمعها من نهر دجلة وهي نبات الشمبلانCeratophyllum demersumL. والكطل Hydrilla verticellata ونبات عشبة النيل Echhornia crassipes على ازالة عنصر الرصاص من مياه الصرف الصحي اولا تم تعريض الانواع الثلاثة كل على حدة الى تخافيف مختلفة من مياه الصرف الصحي بصورة منفردة وهي (25 , 50)% ppmوالتركيز100% من مياه الصرف الصحي، ولمدة ثلاثين يوما لكل تركيز، وقيست كفاءة النبات في ازالة الرصاص من المياه كنسب مئوية للازالة في النبات .تم اخذ عينات من ماء الاحواض وكذلك اخذ وزن 2 غرام من النبات بدءا″من اليوم الاول وبعد 5 ،10 ،15 ، 30 يوما وذلك لتقدير كمية العنصر المتبقي في الماء وايضا كمية العنصر المتراكم في النبات ، كما تم حساب معامل التركيز الحيوي في النباتات الثلاثة, اظهرت النتائج مقدرة النباتات الثلاثة على ازالة الرصاص وبصورة متفاوتة اذ كان لنبات عشبة النيل قدرة اعلى من بقية النباتات في عملية الازالة وبلغت ( 0.397, 0.802 ,1.369) ppm على التوالي في اليوم الثلاثين بينما نبات الكطل استطاع ان يعالج مياه الصرف الصحي ليوم واحد فقط عند التركيز100% وكانت النتيجة (0.448) ppm وبقي لمدة خمسة ايام عند التخفيف 50% وكان (0.745) ppm بينما ظل النبات لمدة خمسة عشر يوما عند التخفيف 25% وبلغ التراكم ( 0.343) ppm , اما بالنسبة لنبات الشمبلان فقد كان (0,544,0.239) عند التخفيفين50,25% على التوالي في اليوم الخامس عشر لان النبات هلك بعد هذا اليوم بينما عند التركيز 100% من مياه الصرف الصحي ظل النبات حيا ليوم واحد وكان التراكم (0.362) .ppm ثم استخدمت النباتات ذاتها لمعرفة قابليتها على ازالة الرصاص من المياه الملوثة باستخدام تراكيز مختلفة وهي (30,20,10)ppm ولمدة ثلاثين يوما لكل نبات على حدة ثم المقارنة بين النباتات الثلاثة ,اذ بلغ تراكم الرصاص في اليوم الثلاثين للتراكيز( 30,20,10) عند نبات عشبة النيل (22.28,17.42,8.64) ppm ونبات الكطل ( 19.90,16.21,8.06) ppm ونبات الشمبلان (18.70,13.14,11.11) ppm . | This study was conducted laboratory "to identify the three types of the plant's capacity was collected from the Tigris River, a A Ceratophyllum demersum L. And Hydrilla verticellata and plant Echhornia crassipes to remove the lead element of the muncipal wastewater was first exposed three types separately to different dilutions of munncipal water, a individually (25, 50)% ppm and focus 100% of the wastewater, and for a period of thirty days for each concentration, and measured the efficiency of the plant to remove lead from water as a percentage of the removal of the plant. Sampling of water basins, as well as taking a weight of 2 grams of plant starting "from the first day and after 5.10, 15.30 days in order to estimate the amount of the remaining element in the water and also the amount of accumulated element in the plant, has also been vital concentration factor in the three plants account the results showed the ability of the three plants to remove lead and disproportionately as it was to E. crassipes plant higher than the rest of the plant's capacity in the removal process amounted to (0.397, 0.802, 1.369) ppm, respectively, on the thirtieth day while the H. verticellata plant able to handle sewage for just one day when you focus 100% and the result (0.448) ppm and stayed for five days at the dilution of 50% and was (0.745) ppm while the plant for a period of fifteen days when dilution of 25% and amounted to accumulation (0.343) ppm, as for the plant C.demersum was (0,544,0.239 ) when dilutions 50.25%, respectively, in the fifteenth day because the plant died after this day, while at the focus 100% of the sewage plant remained alive for one day and it was the accumulation (0.362) .ppm Then they used the plants themselves to see their ability to remove lead from contaminated water by using different concentrations of a (10,20,30) ppm for a period of thirty days each plant separately and then compare the three plants, as it was the accumulation of lead in the thirtieth day of concentrations (10,20.30) when aplant E. crassipes (22.28,17.42,8.64) ppm and H.verticellata (19.90, 16.21, 8.06) ppm and C. demersum(18.70,13.14,11.11) ppm.

دراسة بعض الجوانب المناعية لمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين == Study of some immunological aspects of Iraqi patients with ATOPIC DERMATITIS

Author name: ميادة نوري اقبال الدوسكي
Supervisor name: رجوه حسن عيسى الربيعي | جاسم طعمه حسين الخفاجي
General topic: Biology
Specific topic: Microbiology - Immunology
Degree: Master
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة بهدف الحصول على المزيد من الايضاحات حول تاثير الاضطرابات المناعية على الحالة المرضية عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل من العراقيين ،لقد تم خلال هذه الدراسة اخضاع 124 مريضا من كلا الجنسين (55مريضاﹰمن الذكور و69من الاناث ) تتراوح اعمارهم ما بين(6 - 55 ) سنة من الذين شخصوا كمرضى التهاب جلدي متماحل ،حيث كان بينهم 48 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل البسيط و76 مريضاﹰ من المصابين بالتهاب الجلدي المتماحل الشديد ، اضافةﹰالى(50) شخصاﹰمن الاصحاء ظاهرياﹰ كمجموعة سيطرة ، تم اخضاعهم الى مختلف الاختبارات بضمنها الفحوصات المختبرية المالوفة للحساسيةوقياس المعلمات المناعية حديثة الاكتشاف بالاضافة الى عزل وتشخيص بكتريا الـ Staphylococcus spp. .اظهرت النتائج اختلاف انتشار مرض التهاب الجلدي المتماحل بين مختلف الفئات العمرية وكذلك بين الجنسين حيث كان نسبة انتشار المرض عند الاناث اكثرمن الذكور. من خلال فحص الجلد وباستخدام (13) نوع من المستارجات، تم التوصل الى انه المستارجات داخل المباني indoor allergens اعلى نسبة للتفاعل الموجب لفحص الجلد ضمن كل مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ،ومن بينها كان حلم الغبار المنزل HDM هو اكثر الانواع تكرارا فى الظهور بنسبة =5‚68 في حين كان لثيل البرمودا Bermuda grass وخليط انواع المختلفة النسبة الاعلى بين حبوب اللقاح =7‚ 13 % و1‚ 12 % على التوالي ، وكذلك لخليط الفطريات نوع MMI النسبة الاعلى بين الفطريات =9‚12%. باستخدام اختبار الامتزاز المناعي للانظيم المرتبط ELISA تم قياس مستوى الكلوبيولين المناعي(E) الكلي والنوعي في مصل الدم ، وكانت قيمة المتوسط الحسابي للكلوبيولين المناعي(E) الكلي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد اعلى وذات فرق احصائي معنوي عنها في كل من مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط ومجموعة السيطرة الاصحاء.وكذلك تم احتساب مستوى الكلوبيولين المناعي (E)النوعي في مصل الدم وذلك لـ 19 نوع المستارجات اظهرت نتائج الدراسة ان الكلوبيولين المناعي (E)النوعي الاكثر تكرارا في كل مجاميع الدراسة من المرضى كان للمستارج D2 بنسبة =7‚ 63 % يتبعه للمستارج H2بنسبة = 7‚ 59 % ،ثم للعشب G2 وبنسبة = 9‚ 58 % تبعهم الكلوبيولين النوعي للفطر M1 = 5‚ 57 % ، F29 =8‚ 54 % ، = F23‚ 54 %، W6 =6‚ 51 % ، M4 = 50 % ، G1 = 50 % ، G15 =2‚ 49 % ، W1 =5‚ 43 % ، M6 =8‚ 46 % ، D1 =46 % ، M2 =5‚ 43 % ، بينما كانت نسبة الكلوبيولين (E ) النوعي للـ F73 مساوي لـ T9 = 1‚ 37 % ،و 9‚ 33 % للمستارج W9 . في حين كانت اقل نسب للكلوبيولين النوعي ضد كل من T3 ، T5 وكانت تساوي 4‚ 23 % ،1، 16 % على التوالي .ان نسبة التطابق الاجمالية بين فحص الجلد ومستوى الكلوبيولينات المناعية النوعية لـخمسة من المستارجات كانت بمقدار9‚ 83 % كما كانت حساسية الاختبار بنسبة 100% لاشجار Mediterranean و19% لاعشاب Mugwort في حين كانت نسبة خصوصية الاختبار 98 % مساوية لكل من Plantain ,Betula واعقبتها المستارجات Fagac ,Bermuda =5‚97% ، 7‚96% على التوالي .اما المستارج HD اظهر اقل نسبة خصوصية وكانت2‚74% لم يلاحظ اي اختلاف معنوي في مستوى الكلوبيولينات المناعية (M , A ) واحدى مكونات المتمم C3 في المصل بين المجاميع الثلاثة قيد الدراسة بينما لوحظ ارتفاع معنوي في مستوى الكلوبيولين المناعي G واحدى مكونات المتمم C4 عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاء. وجد ان عدد خلايا اليفة الايوسين في الدم اعلى معنويا عند كل من مجموعتي المرضى بالمقارنة مع الاصحاء. لم تظهر النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي CD3 اي فروقات معنوية ضمن مجاميع الدراسة ،بينما النسبة المئوية للخلايا اللمفاوية التي تعبر المعلم السطحي .CDميادة نوري اقبال الدوسكيكانت اعلى معنويا عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عما هو عليه في كل من مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء. المعلم المناعي الـ CD8 اظهر انخفاض معنوي عند مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل مقارنة بمجموعة السيطرة الاصحاءولوحظ فروقات معنوية في نسبة الخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 ضمن مجاميع الدراسة مما ادى الى ارتفاع نسبة ((CD4/CD8 ارتفاعا ملحوظا ضمن مجموعتي مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومقارنة بالاصحاء وخاصة عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.كذلك لوحظت اضطرابات في الاستجابة المناعية الخلوية تجاه المشطر اللانوعي PHA ومستخلص البروتيني عند مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد.احد النتائج المهمة في هذه الدراسة هي ان متوسط مستوى الانترلوكين نوع IL - 4 يزداد بشكل معنوي لدى مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل عن الاصحاء ،ان مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط اظهرت زيادة معنوية مقارنة بمرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد والاصحاء (1‚84، 9‚58،4 ‚15 بيكوغرام/مل ) في حين ان مستوى الانترلوكين نوع IL - 5 في المصل كان اعلى في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد عن مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل البسيط والاصحاء(5‚95، 9‚75، 2 ‚23 بيكوغرام/مل ) ، بالاضافة الى ذلك ظهرت علاقة خطية موجبة بين IL - 5 واعداد خلايا اليفة الايوسين في مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اما فيما يتعلق بمجاميع الدم فلم تظهر اية علاقة معنوية موجبة بين مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل ومجاميع فصائل الدم بالرغم من انتشار مرض الالتهاب الجلدي المتماحل ضمن الاشخاص ذوي فصائل الدم A, B .الجزء الاخير من الدراسة تضمن اخذ مسحات للجلد لكل من المرضى والاصحاء ، تم زرعها بشكل مناسب لعزل وتشخيص بكتريا المتواجدة فيه . لقد اوضحت النتائج ان بكتريا Staphylococcus aureus كانت الاكثر تكرارا لدى مرضى الالتهاب الجلد المتماحل بنسبة 7‚ 76 % وبالاخص مجموعة مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل الشديد بينما Staphylococcus epidermidis كانت نسبتها3‚ 23 % .فيما يخص علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مع مختلف المعلمات المناعية ،فقد لوحظ وجود علاقة خطية موجبة معنوية مع عدد من الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) النوعي ،الى جانب ذلك فقد بينت النتائج وجود علاقة الكلوبيولين المناعي (E) الكلي مع عدد خلايا اليفة الايوسين عند كل مرضى الالتهاب الجلد المتماحل النسب المئوية للخلايا اللمفاوية الموجبة للـ CD4 وCD19ونسبة CD4/CD8 وIL - 4 ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل اظهرت علاقة موجبة معنوية مع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي ،في حين علاقة الانترلوكين IL - 5 مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي هي علاقة سلبية واظهرت النتائج ايضا وجود الـ Staphylococcus aureus ضمن مجاميع مرضى الالتهاب الجلدي المتماحل هو مقترن مع زيادة او ارتفاع مستوى الكلوبيولين المناعي (E) الكلي في المصل مما ادى الى علاقة موجبة .فيما لم تظهر الكلوبيولينات المناعية ( M , A ) علاقة موجبة مع الكلوبيولين المناعي (E) الكلي عدا الكلوبيولين المناعي G حيث اظهر علاقة ضعيفة ،كذلك الحال بالنسبة لعلاقة شدة المرض مع مختلف المعلمات المناعية حيث اظهرت النتائج وجود علاقة موجبة ذات قيمة معنوية احصائيا مع كل من عدد الفحوصات الموجبة للجلد والكلوبيولين المناعي (E) وعدد خلايا اليفة الايوسين ،ونسبة CD4/CD8 ، مستوى الانترلوكين IL - 5 في المصل ، اضافة الى ذلك كانت نسبة انتشار بكتريا Staphylococcus aureus مقترنة مع شدة المرض. | The favor of this work, is first at all, and above all, is all Allah's. I would like to express my profound thanks and sincere gratitude to my supervisor Dr. Rajwa H.AL - Rubai’e for her valuable scientific guidance, encouragement and support that made it possible for me to accomplish this study. I extend my deep gratitude also to my supervisor Dr. Jassem T. AL - Khafaji for his scientific advice, clinical instructions, in addition to his provision of laboratory materials and equipment. I should express my gratitude to the head and all the employees of the Department of Biology in the College of Science, AL - Mustansiriya University.Deepest gratitude goes to consultant center for Allergy and Asthma especially, Dr. Arij AL - Ani and Dr. Omar AL - Janabi for preparing the diagnostic cases and the chemist Mrs. Aysar F.AL - Aumari and Alaa’s father, Hamssa’s mother for their generous help and their kind assistance in presenting the possible facilities in the lab work.Thanks are also dedicated for Fransois Tron for his cooperation in help me to complete our research in laboratories of Rouen University France. My sincere gratitude presented to Dr. Abdul Alkhaliq AL - Naqeb for their efforts and help in statistical analysis.From my deep hearts, I would express my thanks and respect to my colleagues for their encouragement during my study. Finally, I would like to express my deepest and warmest gratitude and indebtedness to my family, for their kind, love and help in one way or another, and to all those who have contributed to the completion and success of this project. Mayada N. AL - DoskiResearcher SummaryA Prospective study was conducted to obtain more clarification about the impact of immunological abnormalities on the clinical expression of atopic dermatitis (AD) among Iraqi patients. One hundred twenty four cases of AD (55 males and 69 females), ranging in age between (6 to 55) years, Patients were grouped as mild AD (48) and severe AD (76), according to severity, and (50) apparently healthy individuals used as a control group (24 males and 26 females). They were studied using different allergic, immunological and hematological tests; in addition to that Staphylococcus species were isolated and diagnosed, Atopic Dermatitis occurred in different ages and most frequently in females than males.Skin test analysis of 13 allergens revealed that AD patients had higher proportions of positive skin reactivity to indoor allergens, among them House dust mites HDM was the most frequent = 68.5%, Bermuda grass and grasses mixture had the highest frequency = 13.7%, and 12.1% respectively among pollens, whereas mould mixture I were the most frequent moulds = 12.9%. Enzyme linked immunosorbent assay ELISA was used to measure serum IgE levels. The mean total IgE was significantly higher in severe than in mild AD and healthy control groups. The quantitative of serum specific IgE was carried out for 19 allergens. Among all AD cases, the most frequent specific IgE was found to D2 = 63.7% followed by H2 = 59.7%, G2 = 58 .9%, M1=56.5%, F29= 54.8%, F2= 54.03%, W6= 51.6%, M4= 50%, G1=50%, G15= 49.2%, W1= 43.5%, M6 = 46.8%, D1 = 46%, M2 = 43.5% and F73 and T9 are equal = 37.1% and 33.9 % for W9. However the least rates were to T3 and T5=23.4% and 16.1% respectively, in contrast to that of healthy controls which showed negative results for most allergens with the exception of M1= 24% = followed by W9 = 16% . The relationship of skin test with serum specific IgE level for seven compatible allergens showed an overall agreement of (83.9%) sensitivity for Mediterranean trees=100%, Mugwort=99%, specificity for Plantain equal to Betula = 98%, followed by specificity for Bermuda and Fagac = 97.5%, 96.7% respectively while the least were to HD = 74.2%. No significant differences between all AD patients and healthy controls as well as between two types of AD patients could be detected in IgM, IgA and C3 serum levels, while serum IgG and C4 levels were significantly increased in both types of illness compared to healthy controls. Blood eosinophil counts were significantly higher in all AD patients than healthy controls. No significant differences between all AD patients and healthy subjects in CD3+ lymphocyte percentage while CD19+ lymphocyte percentage was significantly higher in severe AD group than mild and healthy control groups. CD8+ lymphocyte percentage was significantly lower in all AD patients than healthy control group . Statistically significant differences were observed between the study groups in CD4+ lymphocyte percentage, the mean CD4+ / CD8+ ratio was higher in severe AD group compared to mild AD and healthy control. On the other hand a disorder observed in cellular immunity response to PHA and proteins extract among patients with severe AD. One of the important findings of this study, was that the mean serum IL - 4 was significantly increasing among AD patients as compared to healthy controls, also it was significantly higher in mild AD than severe AD and healthy control groups = 84.1, 58.9 and 15.4 pg/ml respectively, whereas serum level of IL - 5 was obviously higher in cases with severe AD group than mild AD and healthy control groups= 95.5, 75.9 and 23.2 pg/ml respectively. More over a significant positive linear correlation was found between IL - 5 and peripheral eosinophil counts in atopic dermatitis. The relationship between AD and ABO system has shown no significant correlation in spite of the highest frequency of A and B blood groups among atopic dermatitis patients. The last part of this study included skin swabs which were taken from AD patients. Samples were cultured on suitable media for isolation then identification bacteria. The results showed that Staphylococcus aureus was the most common organism isolated from AD patients =76.7% while Staphylococcus epidermidis was =23.3%. In severe AD group; the incidence of Staphylococcus aureus was higher than in mild AD group =70 %, 60% respectively. Regarding the association between total serum IgE and different immunological markers, the mean serum total IgE concentration was significantly increased with number of positive skin tests as well as serum specific IgE scored by subjects with AD. Also, the eosinophil counts revealed a statistically significant positive linear correlation with total serum IgE level in all AD group.CD4+ and CD19+ lymphocyte percentage and CD4+/CD8+ ratio among all AD groups showed significant positive linear correlation with total serum IgE concentration.The relationship between total serum IgE levels and IL - 4 concentration gave positive linear correlation; whereas, between IL - 5 and total IgE levels the results showed negative correlation. The results revealed that persistence of Staphylococcus aureus colonization in AD patients was associated with higher levels of total serum IgE leading to positive correlations between serum total IgE and Staphylococcus aureus persistence. There were no significant differences in level concentration of IgM, IgA with the exception of the IgG which showed a weak correlation. In conclusion, the association between AD severity and different immunological markers were assessed. The severity of AD group was associated with higher total serum IgE levels and number of specific IgE scored by subjects, as well as, eosinophil counts, CD4+/CD8+ ratio, level of cytokine in serum (IL - 5), in addition, the persistence of Staphylococcus aureus were associated with severity of AD disease.

تقيم بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة وجين Mitochondrial Cytochrome C - 1 oxidase لدى الرجال المدخنين والمصابين بفرط الكريات الحمر الثانوي == Evaluation of Some Oxidant - Antioxidant Parameter and Mitochondrial Cytochrome C - 1 Oxidase Gene in Smokers' Secondary Polycythemic Men

Author name: ميادة عبود محمود فرحان
Supervisor name: داخل غاني عمران الوطيفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: English
University location: Babylon
First pages:
Abstract: ان الدراسة الجارية تضمنت بحث بعض معايير الاكسدة ومضادات الاكسدة oxidant - antioxidant parameters)) وعزل mt - DNA لغرض تعيين الجين المشفر للانزيم cytochrome - oxidase - C لدى الرجال المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمر polycythemia)). كان العدد الكلي لا شخاص الدراسة120 رجلا , كان منهم 60 رجلا مدخنا مصابا بفرط الكريات الحمر اما العدد الباقي 60) رجلا( فقد كانوا اصحاء وغير مدخنين وقد استخدموا كمجموعة سيطرة (control). تراوحت جميع اعمار اشخاص الدراسة بين30 سنه الى 60 سنه تم تقسيم جميع اشخاص الدراسة(اصحاء ومرضى) الى ثلاثة مجاميع عمرية وكالاتي؛ المجموع الاولى (30 - 39 سنه) ؛المجموعة الثانية (40 - 49سنه) المجموعة الثالثة(50 - 59سنه). تميز جميع المرضى في هده الدراسة بارتفاع معنوي (p<0.05 ) في قيم حجم الخلايا المضغوط pcv)) عند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء وقد لوحظ حصول ارتباط ايجابي (r=0.8) بين قيم pcv ومعدل العمر. اما بخصوص بروكسيدات الدهون lipid peroxidation)) فقد سجل مركب malondialdehyde ( وهو دليل واضح لا كسدة الدهون) ارتفاع واضح (p<0.05 ) لدى كل مجاميع المرضى عند مطابقتهم مع الاشخاص الاصحاء . وقد سجلت قيمه ارتباطا ايجابيا مع كل من العمر (r=0.4) ومستوى ال .(r=0.4) PCV وبشان معايير مضادات الاكسدة(Anti - oxidants) فقد اشرت قيم الكلوتاثيون المختزل (GSH) وهو مضاد اكسده غير انزيمي ) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى المجاميع الثلاثة للاشخاص المدخنين عندما قورنوا مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيمة ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2 )و قيم ال PCV (r= - 0.9).اعطت قيم فعالية الكاتليز (catalase activity) انخفاضا معنويا p<0.05) ) لدى جميع الفئات العمرية للاشخاص المدخنين بالمقارنة مع الاشخاص الاصحاء. كدلك سجلت قيم فعالياته ارتباطا عكسيا مع كل من العمر (r= - 0.2)و قيم ال PCV (r= - 0.9).وبشان قيم فعاليات انزيم superoxide dismutase فقد تبين كدلك حصول انخفاضا ملحوظ p<0.05) ) لكل الفئات العمرية للاشخاص المدخنين المصابين بفرط الكريات الحمراء عندما مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء. وتبين حصول ارتباط عكسي بين فعاليات SOD وكل من العمر (r= - 0.5)و PCV (r= - 0.5).نتائج الدراسة الحالية اثبتت بان التدخين وفرط كريات الدم الحمراء ليس لها تاثيرات على الجين المشفر ل cytochrome oxidase c1و الموجودة على DNA المايتوكوندريا باستخدام تقنية الPCR ومن النتائج الموضحة في اعلاه؛ فان الايضاح المدون لهده التغيرات يمكن اعزاءه الى العدد الهائل من الكريات الدم الحمراء ونواتج التدخين السامة والتي يمكن ان تسبب انخفاض جميع فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون وعلاوة على دلك؛ يلعب العمر دورا كبيرا في خفض فعاليات مضادات الاكسدة وزيادة بيروكسيد الدهون. | The current study was involved to investigate some oxidant - antioxidants parameters and isolation of mt - DNA for cytochrome c - 1 oxidase gene of smoker men affected with polycythemia . One hundered twenty (120) men were recruited in this study ,of them, sixty (60) smoker men affected with polycythemia and the remaining number (60) men were healthy men and serves as control group in this study . all ages of the enrolled subjects were limited between 30 - 60 years old .According to their ages, they were classified into three groups, first group(30 - 39 years old),second group(40 - 49 years old), and third group(50 - 59 years old). All patients included in this study have packed cell volume (PCV) higher than of their healthy counter parts and showed significant increase (p<0.05) when compared with healthy control men. Moreover, levels of PCV have a positive correlation (r=0.8) with advanced ages. concerning lipid peroxidation, malondialdehyde (MDA)as markers of lipid peroxidation was used, an its results revealed a significant increase (p<0.05) in all groups of smokers' polycythemic men and also showed a positive correlation with age (r=0.4) and PCV(r=0.4) Regarding markers of antioxidants, results of reduced glutathione (GSH) non - enzymatic antioxidants, were significantly decreased (p<0.05) in all tested groups in compared with those control group. it was found that results of GSH proportionate inversely with age (r= - 0.2) and PCV(r= - 0.9). About catalase activity , results of its activity indicated a marked decrease (p<0.05) in three age groups of smokers' polycythemic men in a comparison with control groups . the activity of catalase pointed out a negative correlation with both age and PCV(r= - 0.3 ,r = - 0.6 respectively) Serum superoxide dismutase (SOD)activity were also significantly decrease (p<0.05) in all age groups of smokers' polycythemic men when compared with those control group .The SOD activities were inversely proportionated with age and PCV(r= - 0.5, r= - 0.5, respectively). results of the present study confirmed that the smoking and polycythemia have not effects on cytochrome oxidase C1 gene of mt - DNA by using PCR technique. Finally, according to correct study that mentioned above the possible explanation to these findings can be showed that high PCV and toxic materials produced by smoking can be implicated with drop of antioxidant activities with increase lipid peroxidation. Moreover, aging can be exert negative action on these anti - oxidants that associated with increase lipid peroxidation marker (MDA

العلاقة بين تعدد النمط الوراثي للجين GSTP1 ومرض ابيضاض الدم النخاعي الحاد لمرضى عراقيين == Association of Glutathione - S - Transferas (GSTP1) gene polymorphism with Acute Myeloid leukemia in Iraqi patients

Author name: ميادة خالد ابراهيم
Supervisor name: بتول علي شهاب
General topic: Biology
Specific topic: zoology - Genetics
Degree: Master
University: University of Baghdad
Language: English
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: This study was carried out to investigate the relationships between acute myeloid leukemia (AML) patients and the genotyping of Glutathione S - Transferase P1 class (GSTP1) by using Polymerase Chain Reaction (PCR) - Restriction Fragment Length Polymorphism (REFLP) and measurement of some clinical parameters of patients and control.This study included 120 blood samples for Iraqi individuals. Sixty individuals with AML were diagnosed by the consultant of The National Center of Hematology medical City, Center for Hematology AL - Mustanseria University, hematology clinic of Baghdad Hospital and Alkadhymian medical city teaching hospital during the period from October 2014 to May 2015. Those AML cases then have been diagnosed by a specialized hematologists depending on bone marrow aspiration, biopsies reports and other diagnostic criteria for AML according to the International Staging System (ISS).Sixty individuals healthy also included as control group, their age range were between 15 - 70 years. Blood were used as samples to found the correlation between genotyping of GSTP1 and all studied parameters.Molecular studies involved DNA extraction and PCR - RFLP was carried to detect the genetic polymorphism of GSTP1 for all individuals of this study. Molecular study was conducted in the laboratory of the Biology Department / College of Sciences for women. The results showed that in the age for patients and control group were no significant difference in group less than 30 years old, while showed significant difference (P˂0.05) between other groups 30 - 50 years and 50 - 70 years, were (30%) (38.30%) (33.3%) and (23.0%) respectively.The results showed that there were significant different between patients (10.40±2.97) and controls (6.25±0.37) in the mean of white blood cells count (WBCc) (P˂0.48), the mean of hemoglobin (Hb) in patients was (8.11±0.37) and in control was (12.81±1.31) and the different was highly significant between them.The results of genetics polymorphism of the GSTP1 showed the significant difference (P˂0.05) between patients were (56.67%) and controls were (65.00%) in wild genotype AA, while the heterozygous genotype AG and homozygous mutant genotype GG were in AML patients and in controls were no significant different.Distribution of GSTP1 polymorphism and age of patients groups showed that there were significant difference between all age groups and all types of gene polymorphism, were (38.24%), (32.35%), (29.41%) in AA genotype, in AG were (26.32%), (21.05%), (52.63%) and in GG were (57.14%), (42.86%) and (0.00%) respectively.The results of relationship between the sex and AML patients showed that mutant genotype GG genotype was more in male (85.71%) than female (14.29%) with highly significant increase and the risk of male to be effect was more 1,5 than female. The mutant allele G is more frequent in male (0.38) than female (0.17). The data also showed no significant difference between the GSTP1 polymorphism and the mean value of WBC, but the mean value of Hb was shown significant different (P˂0.05), the heterozygous genotype AG showed the highest value (11.35± 0.73).Distribution of GSTP1 polymorphism between control groups according to non - smoking and smoking in the genotype AA+AG, (93.33%), (90.00%) respectively, showed significant difference (P<0.05), while in genotype AG+GG (26.67%), (43.33%) showed high significant difference (P<0.01) and the mutant allele G was more frequency in smoker control (0.27) but in non - smoker was (0.17).Results of this study suggest that GSTP1 gene polymorphisms was not associated with AML disease and GSTP1 has no active role in the pathogenesis of AML, while the age and sex may have a risk factor for progression AML

عزل وتشخيص الفطريات المرافقة لتعفن الفواكه المستوردة وطرق مكافحتها == Isolation and Identification of fungi associated for rotting of imported fruits and methods of their control

Author name: مؤيد صالح حسين
Supervisor name: عبد العزيز مجيد نخيلان | هادي مهدي عبود
General topic: Biology
Specific topic: Plant
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: اجريت هذه الدراسة في مختبر الفطريات، قسم علوم الحياة، كلية العلوم - الجامعة المستنصرية ٬ ومختبرات دائرة البحوث الزراعية - وزارة العلوم والتكنولوجيا ؛ للكشف عن الفطريات المرافقة لثلاثة انواع من الفاكهة المستوردة (الليمون حامض ، التفاح والخوخ) . تم جمع (60) عينة عشـوائية (20 لكل نـوع) من اربع اسـواق محلية (باب المعظم ، الكاظمية ، علاوي الحلة، العطيفية ) في مدينة بغداد. للفترة من 15 - 5 ولغاية 15 - 8 لعام 2013 . وبعد تحديد نسبة حدوث المرض،عزلت الفطريات من الفواكه المتعفنة على الوسط الزرعي PDA المدعم ب 100 جزء بالمليون من الكلورامفينيكول. تمت تنقية الفطريات المعزولة٬ وتم حساب تردد كل عزلة لكل الفطريات. اظهرت النتائج عزل 141 عزلة فطرية تنتمي الى اربعة اجناس : Penicillium, Aspergillus ,Rhizopus Alternaria , توزعت على ستة انواع من الفطريات. اكثر الانواع ترددا Aspergillus niger بتردد 37.6% يليه Penicillium expansum بتردد 24.8% ثم Penicillum digitatum ٬ Aspergillusflavus ٬Rhizopus Stolonifer وAlternaria.citri التي سجلت 14.9% ٬ 9.2%٬ 7.8% و5.7% . اظهرت النتائج ايضا ان الفطريات الاكثر عزلا كانت من سوق باب المعظم وبنسبة 49.6% يليه سوق الكاظمية 24.8% ثم سوق العلاوي والعطيفية التي سجلت كل منهما 12.8% . استنادا الى تردد العزلات تم اختيار 36 عزلة لاختبار القدرة الٳمراضية باستخدام ثمار التفاح كعائل نباتي . انتخبت عشر عزلات عالية الضراوة : ٳثنان تعود الى جنس البنسليوم P.expansum, واحدة تعود الى P.digitatum , اربعة تعود الى A.niger عزلة واحدة تعود الى R. stolonifer , وعزلة واحدة تابعة ٳلى Alternaria citri وكذلك عزلة واحدة تنتمي الى A.flavus التي اعطيت الرموز الاتية (1 - 2) (1 - 6)، (1 - 7)، (2 - 1) (2 - 3)، (2 - 4) (2 - 5)، (3 - 1)، (4 - 1)، (5 - 1) على التوالي ٬ والتي استخدمت طوال مدة الدراسة. اظهرت نتائج التاثير السمي لحامض الساليسيلك (SA) في الفطريات ٬ ان (SA) في 400 جزء بالمليون ثبط بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلات (1 - 7) P.digitatum و(3 - 1) R. stolonifer ، في حين ان التركيز نفسه في الوسط السائل ثبط بالكامل الوزن الطري والجاف للكتلة الحية للعزلة (1 - 6) expansum P.. كذلك اظهرت النتائج ان الكايتوسان في 1.6 ملغم / مل ثبطʹ بالكامل النمو القطري والتبوغ للعزلة (3 - 1) R. stolonifer في حين ان التركيز نفسه احدث انخفاضا عاليا في الوزن الطري والجاف من الكتلة الحيوية الفطرية للعزلة (1 - 7) P.digitatum التي سجلت 0.15 غرام و0.01 غرام على التوالي. اظهرت النتائج ان توليفات من حامض السالسيلك والكايتوسان اثرت على النمو القطري، التبوغ والوزن الطري والجاف للعزلات (1 - 2) P.expansum و(2 - 5) A.niger وان التوليفة 75 - 25 % كانت الاكثر فعالية. كما اظهرت نتائج الاختبارات التطبيقية في رش كل من حامض السالسيلك بتركيز 400 جزء بالمليون والكايتوسان بتركيز 1.6 ملغم/مل والتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان بالتركيز 75 - 25 جزء بالمليون - ملغم/مل على ثمار التفاح الملقحة بالعزلة (1 - 2) التي تعود للفطر P.expansum ٬ ان الثمار كانت اكثر مقاومة لظهور العفن في جميع المعاملات قبل 24 ساعة من التلقيح وحتى نهاية اليوم الخامس للاختبار بالمقارنة مع الثمار المعاملة بعد 24 ساعة من التلقيح ٬ حيث وصل النمو ٳلى 2.33 سم2 في الثمار المعاملة بحامض السالسيلك ٬ في حين وصل النمو في الثمار المعاملة بالكايتوسان ٳلى 2.65 سم2 ٬اما الثمار المعاملة بالتوليف بين حامض السالسيلك والكايتوسان فقد وصل النمو الى 3.57 سم2 ٬ في حين وصل معدل النمو لثمار السيطرة في اليوم الخامس ايضا الى 10.88 سم2 . واظهرت نتائج قدرة اربع عزلات فطرية هي (1 - 2) Penicillium expansum ٬ (1 - 11) P. digitatum ٬ (2 - 1) A. niger ٬ (2 - 19) A. niger في انتاج انزيمي البكتنيز Pectinase والسليليز Cellulase ان العزلات جميعها لها القابلية على ٳنتاج الانزيمين . وارتبطت الفعالية الانزيمية مباشرة بالقابلية الٳمراضية للعزلات ٬ فوجد ان العزلتين العاليتي الضراوة (1 - 2) (2 - 1) اظهرت فعالية انزيمية عالية بلغت 23.59 ٬ 22.55 و64.83 ٬ 62.36 وحدة/ مل . في حين اظهرت العزلات الواطئة الضراوة (1 - 11) (2 - 19) فعالية انزيمية بلغت 9.44 ٬ 15.87 و43.44 ٬ 47.89 وحدة/مل لانزيم Cellulase وPectinase على التوالي . | This study was conducted in laboratory of fungi , Biology Department , College of Sciences - University of El - Mustansiriya and laboratories of Directorate of agricultural research , Ministry of Science and Technology to detect the fungi associated with three kinds of imported fruit ( lemon , apple , peach). Sixty random samples (20 for each kind ) were collected from four local markets (Bab El muadium, Kadhmia, Alawi alhilla, Eletaphia) at Baghdad city After determination of the percentage of disease incidence , the rotted fruits subjected for fungal isolation on PDA medium supplemented with 100 ppm Chloramphenicol . Isolated fungi were purified then the frequency of each isolate was calculated for all fungi. The results showed the isolation of 141 fungal isolate belonged to four genera : Penicillium, Aspergillus, Rhizopus, Alternaria and distributed among six fungal species . The most frequent isolated species Aspergillus niger 37.6 %, followed by Penicillium expansum 24.8 % and P. digitatum, A.flavus, R. Stolonifer and A.citri which recorded 14.9 % , 9.2% , 7.8% and 5.7 % respectively. The results also showed that the most isolated fungi were from Bab El muadium 49.6 %, followed by Kadhmia 24.8 %, then Alawi alhilla and Eletaphia which each of them recorded 12.8 % . Based on the frequency of isolation 36 isolates were selected for pathogenicity test using apple fruits as host Plant . The high virulent ten isolates were selected : two belonged to Penicillium expansum , one belonged to Penicillium digitatum , four belonged to Aspergillus niger one isolate belonged to Rhizopus stolonifer , one isolate belonging to Alternaria citri and one isolate belonged to Aspergillus flavus which given the following codes (1 - 2) (1 - 6) , ( 1 - 7 ) , (2 - 1 ) (2 3) , ( 2 - 4 ) (2 - 5 ) , (3 - 1 ) , (4 - 1 ) , ( 5 - 1 ), respectively were used throughout the study . The results of Fungitoxic effect of Salicylic acid(SA) revealed that (SA) at 400 ppm completely inhibited the radial growth and sporulation of ( 1 - 7 ) P. digitatum and (3 - 1 ) R. stolonifer isolates , while the same concentration in broth medium completely inhibited fresh and dry weight of biomass for (1 - 6) P. expansum . The results showed that Chitosan at 1.6 mg / ml completely inhibited the radial growth and sporulation of isolate (3 - 1 ) R. stolonifer while the same concentration induced the high reduction in fresh and dry weight of fungal biomass for isolate ( 1 - 7 ) P. digitatum which recorded 0.15 g and 0.01 g respectively. The results of the combination effect of Salicylic acid and Chitosan mixture on radial growth , sporulation , fresh and dry weight of isolate (1 - 2 ) P.expansum and (2 - 5 ) A.niger showed that the 75 - 25 % mixture was the most effective one. The results of the tests applications in spraying of Salicylic acid concentration of 400 ppm and Chitosan concentration of 1.6 ml / mg and combination between Salicylic acid and Chitosan concentration 75 - 25 ppm - ml / mg on the apples vaccinated with isolate (1 - 2) P.expansum showed that fruits were more resistant to the appearance of mold in all Treatments befor 24 hours of vaccination until the end of the fifth day of the test, compared with fruits treatment after 24 hours of vaccination, Reached growth to 2.33 cm 2 in fruits treated with Salicylic acid ٬ while growth reached in fruits treated with Chitosan to 2.65 cm 2 , and the fruits which treated with combination between Salicylic acid and Chitosan the growth has reached to 3.57 cm 2 , while the growth rate of the fruits of control on the fifth day to 10.88 cm 2 . The results of the ability of four isolates (1 - 2) P. expansum, (1 - 11) P. digitatum, (2 - 1) A. niger and (2 - 19) A. niger in production of Cellulase and Pectinase enzymes showed that all tested isolates are capable of production both enzymes , but the ability was positively correlated with the isolate virulence . The virulent isolate (1 - 2 ) , (2 - 1) showed the highest enzymaric activity 23.59 , 22.55 , 64.83 and 62.36 Enzymatic units / ml . While the A virulent isolates ( 1 - 11) (2 - 19 ) showed the lowest enzymatic activity 9.44 , 15.87 and 43.44 , 47.89 unit / ml respectively.

دور بعض العوامل المناعية الالتهابية كعوامل خطورة لدى مرضى القلب == The Role of Some Immunoinflammatory Elements as Risk Factors in Patients with Heart Diseases

Author name: مهدي حيدر حمادي الناجي
Supervisor name: اقبال خضر الجوفي
General topic: Biology
Specific topic: Zoology
Degree: Master
Language: Arabic
University location: Baghdad
First pages:
Abstract: ازداد شيوع امراض القلب خلال القرن الحادي والعشرين كمرض مزمن ومهيمن في العديد من انحاء العالم، ويتوقع ان يصبح السبب الرئيس للعجز والوفاة في العالم، وقد اجريت الدراسة الحالية بهدف الحصول على مزيد من الايضاحات حول تاثير العوامل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory Factors والكيموحيوية في الحالة المرضية لدى مرضى القلب العراقيين، وتوجيه المزيد من الفهم نحو عوامل الخطورة التقليدية والمزيد من العوامل الجديدة التي قد تعد عوامل خطورة يمكن استخدامها كعوامل تكهنية وتشخيصية للمرض. ولغرض بلوغ هذه الغاية شملت الدراسة 100 مريض عراقي من المصابين بامراض القلب (80 ذكر، 20 انثى) وقسمت مجموعة المرضى الى اربعة مجاميع، الاولى 17 مريضا مصابا بفشل القلب Heart Failure (H.F)، والثانية 26 مريضا مصابا باحتشاء عضلة القلب Myocardial Infarction (M.I)، والثالثة 12 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية المستقرة Stable Angina Pectoris (SAP)، والرابعة 45 مريضا مصابا بالذبحة الصدرية غيرالمستقرة Unstable Angina Pectoris (UAP)، فضلا عن الى عشرين متطوعا من الاصحاء يمثلون مجموعة السيطرة ، وتراوحت اعمار المرضى بين 20 الى 80 سنة. وقد شخصت مجاميع المرضى من اختصاصي امراض القلب في المركز العراقي لامراض القلب، ومستشفى بغداد التعليمي للمدة من كانون الاول 2006م والى اذار 2007م. توصلت الدراسة الى النتائج الاتية : * المظاهر الديموغرافية Demographic featuresبالنسبة للتوزيع الجغرافي كان 77% من بغداد، وكانت نسبة الذكور الى الاناث 4/1، ومتوسط اعمارهم 36.30 سنة. وكانت نسبة الاصابة في الذكور اعلى معنويا (P<0.05) عما عليه في الاناث. * عوامل الخطورة Risk factors - ارتفاع تكرارات مرضى القلب الذين يمتلكون تاريخا عائليا موجبا لامراض القلب (54.5%) مقارنة مع مرضى القلب الذين لا يمتلكون تاريخا عائليا موجبا (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - اظهرت المجاميع الاربعة للمرضى انخفاضا في تكرارات المرضى المتناولين للمشروبات الكحولية هذا الانخفاض لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المدخنين (54.5%) مقارنة بغير المدخنين (45.5%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوية (P>0.05). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب المصابين ببكتريا Helicobacter pylori (90%)، مقارنة مع مرضى القلب غير المصابين (10%). وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). كما ارتفع مستوى الكلوبيولين المناعي IgG ضد بكتريا H.pylori لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وUA وSA وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع تكرارات مرضى القلب غير المتبعين لنظام غذائي (59.6%) مقارنة مع مرضى القلب المتبعين لنظام غذائي (40.4%) ولكن هذا الفرق لم يشكل دلالة معنوي (P>0.05). - انخفاض دليل كتلة الجسم لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة (اعلى من 25 كغم/ملم2) عموما مقارنة بالسيطرة، ولكن هذا الانخفاض لم يشكل فرق معنوية (P>0.05). - ان مجموعة الدم O اكثر تكرارا لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة HF وMI وUA وSA على التوالي، فيما كانت مجموعة الدم B اكثر تكرارا لدى مرضى SA وUA فقط مقارنة بالسيطرة وبشكل معنوي جدا (P<0.01)، وعكس ذلك بالنسبة لمجاميع الدم A وAB اذ كانت اقل تكرارا. * الدلائل المناعية الالتهابية Immuno - inflammatory markersتم استخدام ثلاث تقنيات للتحري عن العناصر المناعية الالتهابية، اولا تقنية الـ (EASIA) Enzyme Amplified Sensitivity Immunoassay للتحري عن مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IL - 4 وIL - 6 وIL - 8 وIFN - γ)، وتقنية الـ Enzyme Linked Immunosorbant Assay(ELISA) للتحري عن مستوى البروتين الفعال - C، والبحث عن وجود الاجسام المضادة نوع IgG ضد بكتريا Helicobactor pylori، وتقنية الانتشار الشعاعي المفرد Single radial immunodiffusion لتقدير مستوى مكوني المتمم C3 وC4. - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 4 في مصل مجاميع مرضى القلب HF وUA وMI وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وHF وUA وSA على التوالي ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 6 في المصل مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى الحريك الخلوي IL - 8 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وقد شكل هذا الارتفاع فرقا معنويا (P<0.05). - اظهرت مجاميع مرضى القلب الاربعة UA وHF وMI وSA على التوالي ارتفاع مستوى الانترفيرون - كاما (IFN - γ) في المصل، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر (ESR) لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وMI وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - ارتفاع مستوى البروتين الفعال - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وHF وMI وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C3 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة MI وUA وHF وSA على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). - ارتفاع مستوى مكون المتمم C4 في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة SA وUA وHF وMI على التوالي مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا (P<0.05). * الشحوم والبروتينات الشحمية Lipid & Lipoproteins - ارتفاع مستوى الكوليسترول لدى مرضى فشل القلب ومرضى احتشاء عضلة القلب ومرضى الذبحة الصدرية غير المستقرة، مقارنة بالسيطرة وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01) فيما انخفض لدى مرضى الذبحة الصدرية المستقرة مقارنة بالسيطرة. - ارتفاع مستوى الكليسيريد الثلاثي لدى مجاميع مرضى القلب الاربعة S.A وM.I وUA وHF على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الارتفاع معنويا جدا (P<0.01). - انخفاض مستوى البروتين الشحمي عالي الكثافة المرتبط بالكوليسترول HDL - C لدى مرضى HF وSA وUA على التوالي مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05)، بينما كان مرتفعا قليلا لدى مرضى MI ولكن بدون فروقات معنوية. - ارتفاع مستوى البروتين الشحمي واطئ الكثافة المرتبط بالكوليسترول LDL - C في مصل مجاميع مرضى القلب الاربعة مقارنة بالسيطرة ولكن هذا الارتفاع البسيط لم يشكل فرقا معنويا (P>0.05).* فحص خضاب الدم Haemoglobin test - انخفض معدل تركيز خضاب الدم (Hb) لدى مرضى U.A فقط مقارنة بالسيطرة، وكان الانخفاض معنويا (P<0.05) فيما كان معدل تركيزه لدى مرضى HF وMI وSA مقاربا لمجموعة السيطرة وبدون فروقات معنوية.اكدت نتائج الدراسة الحالية ان العناصر المناعية الالتهابية تمثل دورا حيويا كعامل خطورة للاصابة بامراض القلب، وانعكس ذلك بارتفاع واضح في مستوى الحركيات الخلوية Cytokines (IFN - γ,IL - 8, IL - 6, IL - 4) بصورة عامة لدى مرضى القلب جميعهم فضلا عن ارتفاع معدل ترسب خلايا الدم الحمر ESR ومستوى البروتين الفعال C - الذي يؤشر درجة الحالة الالتهابية لمرضى القلب، كما بينت ان نظام المتمم بمكونيه C3 وC4 يمثل دورا مهما في العمليات الالتهابية لامراض القلب من خلال المسلكين التقليدي والبديل، واكدت النتائج ان الاصابة ببكتريا H.pylori تعد عامل خطورة مهما في حدوث امراض القلب وقد تجلى بوضوح الدور الذي تمثله الشحوم والبروتينات الشحمية كعوامل خطورة للاصابة بامراض القلب، فضلا عن ذلك اكدت الدراسة ان مستضدات مجاميع الدم بامكانها ان تمثل دورا مهما في الاصابة بامراض القلب. | Heart Diseases become more common during 21st century as the dominant chronic diseases in many parts of the world and it is predicted to become the main causes of disability and death worldwide.Present study was conducted to obtain more clarification about the impact of immuno - inflammatory and biochemical factors on the clinical expression of heart disease among Iraqi patients, and proved further insights into the classical risk factors, and several new factors that could be consider as risk factors that could be used as predictive and diagnostic factors.In order to reach this purpose the study included 100 Iraqi patients with heart diseases (80male and 20 Female) patients are divided into four groups. 17 with Heart Failure (H.F); 26 with Myocardial Infarction (M.I); 12 with stable Angina Pectoris (SAP) and 45 with unstable Angina Pectoris (UAP), with apparently health 20 individuals are used as control group, the age varied between 20 to 80 years. All patients groups were diagnosed by consultant of heart diseases in Iraqi center for heart diseases and Baghdad Hospital from December 2006 to March 2007. The study revealed the following results : * Demographic featuresAbout the geographical distribution, 77% of patients were from Baghdad; male to female ratio was 4/1; Age mean was 36.30 years, with significant difference in male than female (P<0.05).* Risk Factors - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients with positive family history for heart diseases (54%) compared with patients with negative family history (45.5%). - Non significant decreased (P>0.05) was observed in the frequency of alcohol drinking patients in the four patients groups. - Higher frequency of smokers patients (54.5%) compared with non smokers (45.5%) but this difference is not significant (P>0.05). - High significant increased (P<0.01) in the frequency of infected patients with H.pylori (90%) compared with non infected patients (10%). Also clearly significant (P>0.01) elevated was observed in serum level of anti H.pyolri antibody in the four patients groups : H.F, U.A, S.A, M.I respectively as compared with control group. - Non significant increased (P>0.05) was observed in the frequency of patients undergo dietary system (59.6%) as compared with patients who were not undergo dietary system. - Non significant reduction (P>0.05) in the means of body mass index (BMI) in all patients groups (over 25 Kg/m2) compared with control group. - Blood group O was significantly (P<0.01) more frequent in all patients groups : H.F,M.I,U.A,S.A respectively, also highly significant increased in frequency of blood group B was observed only in the patients groups of S.A and U.A heart diseases (P<0.01), on contrast blood groups A & AB had the less frequency.* Immuno - inflammatory markers in this study three techniques were used to measure immuno - inflammatory elements, the first enzyme amplified sensitivity immunoassay (EASIA) technique to measure the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8, IFN - γ) and enzyme linked immunosorbant assay (ELISA) technique to measure the levels of C - RP and anti H.pylori antibody, moreover single radial immunodiffusion technique to measure the level of complement component C3 and C4. - Significant increase in the serum level of IL - 4 in all patients groups : HF, UA, MI, SA respectively compared with control group (P<0.05). - The present study revealed significant increased in the serum level of IL - 6 in all patients groups : MI, HF, UA, SA respectively compared with control group (P<0.05). - Significant increased (P<0.05) in the serum level of IL - 8 in all patients groups : SA,HF,MI,UA respectively compared with control group. - All patients groups UA, HF, MI, SA consequently revealed highly significant increased (P<0.01) in the concentration of IFN - γ compared wit control group. - Highly significant increased (P<0.01) in the erythrocyte sedimentation rate (E.S.R) in all patients groups : SA, UA, MI, HF consequently compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the mean of C - reactive protein concentration in the serum of all patients groups : SA, HF, MI, UA respectively compared with control group. - Significant increased (P<0.05) in the concentration of serum C3 in all patients groups : MI, UA, HF, SA respectively compared with control group. - Significant increased in the concentration of serum C4 in all patients groups : SA, UA, HF, MI consequently compared with control group (P<0.05). * Lipids and lipoproteins - Significant increased (P<0.05) in the mean of cholesterol level in HF, MI and UA patients groups compared with the control group, on the other hand, decreased in the cholesterol level in SA patient group was observed compared with the control group. - Highly significant elevated (P<0.01) in the means of serum triglyceride level in all patient group; SA, MI, UA, HF respectively compared with control group. - Significant decreased (P<0.05) in the serum HDL - C level in the HF, SA, UA patents groups respectively compared with control group on the other hand, increased in the level of HDL - C in the MI patients group. - The means of serum LDL - C level illustrated no significant differences recorded among patients groups and control group (P>0.05).* Haemoglobin test - Significant decreased (P<0.05) in the mean of haemoglobin concentration in the UA patients group compared with healthy control group, with non significant increased in Hb. Level was observed in HF, MI, SA patients groups compared with healthy control group (P>0.05). Results of the present study showed that immuno - inflammatory elements play a crucial role in the susceptibility of heart diseases this reflected by markedly elevated in the level of cytokines (IL - 4, IL - 6, IL - 8 IFN - γ) in all patients of heart diseases in addition elevation of erythrocyte sedimentation rate and the level of C - RP this reflect the degree of the inflammatory status of heart diseases patients, also this revealed that complement component C3 & C4 play important role in inflammatory process of heart diseases through both pathway classical & Alternative, on the other hand, the results proved that infected by H.pylori consider as important microbial risk factor in heart diseases, furthermore, the results revealed that lipid & lipoproteins play important role as risk factor in the occurrency of heart disease, in addition, this study showed that blood groups antigens could play crucial role in the aetiopathogensis of heart diseases.
1 ... 141 142 143 144 145 ... 230