Search — Iraqi Digital Repository

Search results: 25 out of 40

التوصيف الجزيئي للمجموعات الوراثية وعوامل الضراوة في السلالات الممرضة والمتعايشة لجرثومة الاشريكية القولونية في محافظة النجف الاشرف == Mullecular Charactrization of Phylogenetic groups and Virulence factors in Pathogenic and Commensal strains of Escherichia coli in Governorate Najaf Al.ashraf

Author name: رسل نجم عبد جابر الرماحي

Supervisor name: جنان محمد حسين

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى التحري عن الانماط الوراثية وعوامل الضراوة في البكتريا القولونية الممرضة ومقارنتها مع البكتريا القولونية المتعايشة وعلاقتها بجين مقاومة مضادات البيتالاكتام blaCTX-M. تم الحصول على 125 عزلة من الاشريكية القولونية ) 100 ممرضة و25 متعايشة( من اصل 380 عينة من اصابات المجاري البولية والجروح والحروق و25 عزلة من براز Stool الاشخاص الاصحاء لكلا الجنسين ولمختلف الاعمار من مستشفيات مختلفة في محافظة النجف الاشرف وللفترة من السابع والعشرون من تموز 2022 ولغاية الحادي عشر من كانون الثاني 2023 وبعد تشخيص العينات مختبريا عن طريق زراعتها على الاوساط الانتقائية )الماكونكي والايوسين مثيلين الازرق( اضافة الى ذلك للتاكيد التشخيص باستخدام جهاز الفايتك VITEK-2 compact system توزعت العزلات الجرثومية الممرضة على 71 عزلة من الاناث و20 عزلة من الذكور المصابين بااصابات المجاري البولية ، اما الجروح بلغت 7 عزلات ، والحروق فقد بلغت 2 من الذكور، وبلغت نسبة الاصابة في كل من الذكور حوالي 25% اما الاناث بلغت 75% ، اما بالنسبة الى العزلات البرازية جمعت 25 عزلة متعايشة تضمنت الاناث 4 ( 16% ( اما الذكور بلغت حوالي 21 84%) ( ، وتم اجراء اختبار الحساسية لبكتريا الاشريكية القولونية لعدد من المضادات الحياتية لكل من العزلات الممرضة والمتعايشة . بينت نتائج الدراسة الحالية نسبة المقاومة للعزلات الممرضة اذ بلغت نسبة المقاومة لمضاد Piperacillin كانت 64%) 64 ( ومضاد Amoxicillin – Clavulanate بلغت 63 (63%) اما لمضاد Ceftriaxone كانت نسبة المقاومة 43 (43%) ولمضاد Ciprofloxacin بلغت نسبة المقاومة 34 (34%) ولمضاد Ceftazidime بلغت نسبة المقاومة 33 33%) ( ولمضاد Trimethoprim- Sulfamethoxazole كانت المقاومة 29 29%) ( وبلغت نسبة المقاومة لمضاد Levofloxacin (25%) 25 ولمضاد Doxycycline كانت نسبة المقاومة حوالي (20%) 20 ولمضاد Aztreonam بلغت حوالي 19 (19%) ولمضاد Cefoxitin كانت 15 (15%) ثم المضاد Gentamicin كانت نسبة المقاومة حوالي (5%) 5 واظهرت مقاومة ضعيفة جدا لمضاد Imipenem وAmikacin اذ بلغت حوالي 1 (1%) اما بالنسبة الى العزلات المتعايشة بلغت نسبة المقاومة Amoxicillin – Clavulanate حوالي (88%) 22 ولمضاد Piperacillin حوالي 17 (68%) ولمضاد Ceftriaxone (64%)16 ولمضاد Ceftazidime (56%)14 ولمضاد Cefoxitin كانت (24%)6 ولمضاد Aztreonam بلغت (24%)6 واخيرا لمضاد Imipenem كانت نسبة المقاومة 0%)0 . وتم الكشف عن المجاميع الوراثية للعزلات الممرضة والمتعايشة باستخدام تقنية تفاعل انزيم البلمرة المتسلسل Multiplex اذ اظهرت النسب المجاميع الوراثية للعزلات الممرضة اذ وجدت اعلى نسبة تعود للمجموعة B1 حيث بلغت (44%) 44 وتليها المجموعة B2 حيث كانت 43 43%) ) ومن ثم D 12 ( 12% ( واخيرا A 1 ( 1% (. اما العزلات المتعايشة كانت اعلى نسبة تعود الى المجموعة B1 اذ بلغت حوالي (72%)18 تليها B2 6 ( 24% ( ثم المجموعة D 1 ( 4% ( ولا توجد نسبة تمثل المجموعة A . تم التحري عن جينات الضراوة لكل من العزلات الممرضة والمتعايشة ، حيث بلغت نسبة الجين fimH حوالي ) 32 62.7% (، وللجين aer 45.0%)23 (، وhlyA (11.7%)6 ، اما بالنسبة الى العزلات المتعايشة بلغت نسبة الجين fimH حوالي 40%)6 ،) (86.6%)12 aer ، hlyA 2 ( 13.3% . ومن ثم تم ربط المجاميع الوراثية بجينات الضراوة ولكل من العزلات الممرضة والمتعايشة اذ ظهرت في العزلات الممرضة ، ارتباط الجين fimH بالمجموعة B2 بنسبة 29.4%)15 (، وتليها المجموعة B1 19.6%)10 (، وD 11.7%)6 (، واخير A 1 ( 1.9% (. اما الجين aer اعلى نسبة تعود الى المجموعة B2 27.4%)14 (، وتليها B1 13.7%)7 ،) D بلغت 3.9%)2 (. اما الجين hlyA B2 6 ( 11.7% (. اما بالنسبة الى العزلات المتعايشة للجين fimH وجدت اعلى نسبة للمجموعة B2 26.6%)4 (، وتليها B1 13.3%)2 (، اما للجين aer B2 40%)6 ،) B1 33%)5 ،) D 1 ( 6.6% (، وللجين hlyA B2 13.3%)2 . وتم التحري عن جين blaCTX-M في كلا العزلات اذ وجد نسبة الجين في العزلات الممرضة 57.5%)23 (، وللعزلات المتعايشة بلغت (12.5%)2 وجد ان هناك علاقة ما بين المجاميع الوراثية وجينات الضراوة وانتاج CTX-M اذ كانت المجموعتين الوراثية B2 وB1 هي الاعلى من حيث احتوائها على انواع مختلفة من جينات الضراوة وانتاج انزيم CTX-M تلتها D اما بالنسبة الى العزلات المتعايشة اذ كانت المجموعة B2 هي الاكثر احتواء على جينات الضراوة وكانت فقط عزلة واحدة منتجة CTX-M تلتها B1 احتوت على جينات fimH, aer وعزلة واحدة انتجت CTX-M ومن ثم المجموعة D ولم تنتج CTX-M

Summary:

References:

وبائية ومناعية لطفيلي الاميبا الحالة للنسيج والبكتريا العصوية المسببة لمرض الزحار في محافظة النجف الاشرف

Author name: ذكرى غالي يوسف

Supervisor name: هيثم محمد عوادي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

علاقة تعدد الاشكال الجيني للحركي الخلوي IL-17 والحركي الكيميائي CXCL10 والاصابة بفايروس نظير الانفلونزا النمط الثالثHPIV3

Author name: نور حميد صالح الخرسان

Supervisor name: سهام جاسم محسن الكعبي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

دراسة مناعية وكيموحيوية للمصابين بالاكياس العدرية وفايروس التهاب الكبد الوبائي نمط ب في محافظة النجف

Author name: ايمان حساني شباط السلامي

Supervisor name: جاسم حميد رحمة

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: English

University location: Najaf

دراسة فعالية المستخلص الكحولي لتمر العجوة في اختزال التاثيرات السميه لسم الاوكرا A في النظم الحيوية لحيوانات الجرذ الابيض

Author name: سجى عباس مزهر

Supervisor name: الاء عبد علي حسن | سحر محمود جواد

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

دراسة جزيئية للعائلة المعوية المتعلقة بسرطان القولون

Author name: سحر محمد جواد عبد العظيم

Supervisor name: احلام كاظم نعيم

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: English

University location: Najaf

دراسة بكتيرية ومناعية للمرضى المصابين بخمج دواعم السن في مدينة النجف

Author name: نجلاء ناجي جفات الخزاعي

Supervisor name: سهام جاسم محسن الكعبي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: English

University location: Najaf

تقييم بعض الحركيات الخلوية والتعبير الجيني لجيني FoxP3 وNFAT لدى المرضى المصابين بفايروس الحمى الغدي Epstein - Barr virus

Author name: رواق حيدر عبد النبي

Supervisor name: سهام جاسم محسن الكعبي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: English

University location: Najaf

تحديد بعض عوامل الضراوة للفطريات المعزولة من حالات سريرية لمرضى التهاب الاذن Otomycosis

Author name: جنان كريم عيسى

Supervisor name: سميرة كاظم حميد

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

العلاقة بين الاصابة بطفيلي الاكياس العدرية والتغايرات في مستوى مضادات الاكسدة الانزيمية ومستقبلات TLR2 وTLR4

Author name: شيماء رحيم حسين السعبري

Supervisor name: جميل جري يوسف

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Doctorate

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

التوصيف المظهري والجزيئي لبعض عوامل الضراوة في بكتريا Porohyromonas gingivalis المعزولة من مرضى خمج اللثة في محافظة النجف الاشرف

Author name: هبة رضا حسين الموسوي

Supervisor name: احلام كاظم نعيم الياسين

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

التحري المناعي والجزيئي لطفيلي اللشمانيا الجلدية في محافظة الديوانية /العراق

Author name: مروة حسين دخيل

Supervisor name: جميل جري يوسف

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

The Effect of Some Plant extracts on biofilm Formation of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus and Staphylococcus haemolyticus

Author name: علياء حسين جميل الموسوي

Supervisor name: سهام جاسم محسن الكعبي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: English

University location: Najaf

Author name: وفاق احمد محمود

Supervisor name: سميرة كاظم حميد | ياسر لفتة حسون

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

First pages:

Abstract: جمعت (113) عينه سريريه (مسحة اذن Ear swab) لمرضى التهاب قناة الاذن الخارجيه الفطري Otomycosis من كلا الجنسين والذين راجعوا استشارية الانف والاذن والحنجره في مستشفى الصدر التعليمي والعيادات الخاصه للاطباء الاختصاص / محافظة النجف الاشرف للمده من تشرين الثان | This study included 113 ear swabs from patients with otomycosis, males and females, visited the otolaryngology consultation room at Al - Sader Medical City in An - Najaf / Iraq in addition to the private otolaryngology clinics of some of ear, nose and throat specialists, during the period from October 2012 to March 2013, the study aimed to isolate and diagnose the causative opportunistic mycotic infections of the ear and to test sensitivity of these organisms towards antimycotic agents in addition to identifying some enzymes of the most fungal reluctant type phenotypically and molecularly. (103) positive swabs were obtained from total samples including "Cephalosporium, Candida spp, Aspergillus spp, Neurospora and Trichosporium beigelii.The Precentage of isolated fungi was (85.43)% for Aspergillus, (10.67)% for Candida, while other species constituted totally (3.88)%. The study show that the highest percentage of isolated fungi was from males as it was(51.4)% while in females was (48.6)%. Patients' ages were found to be between (11 - 80) years and the age group (21 - 30) years was the most frequent Category in (30.3)% and the Category (71 - 80) years was affected only in (0.8)%. The highest percentage of insulation fungi during the period of sample collection was in February which constitute (30.9)% and the lowest percentage was in March reaching only (14.1)%.The highest ratios to isolate the fungus was recorded among housewives and unemployed males and it was (44.2%), while the lowest rates of insulation when the students reached (15.9%).The cases of otitis media excelled on the rest of the pathological cases accompaniments of Otomycosis as the proportion of insulation was (19.4%), followed by disease of blood pressure which their percentage was (5.3%), while the rest of the pathological cases did not have significant influence in insulation, for more ear side affected the left ear was affected in(51.8)% and the right was affected in (48.2) %. The study showed that there is inhibitory effect of (flucanazole, Nystatin, Clotrimazole, Miconazole, Itraconazole and Ketoconozole) against Aspergillus spp (A.niger, A.flavus and A.terreus). All antifungals were effective and their inhibitory ratio was (100) %, except for the antifungal (Fluconazole ) which found to have a lower inhibitory effect (10) % against the species A.flavus only. Testing the phospholipase activity for aspergillus species, A.flavus and A.niger showed phospholipase activity in two degrees (++, +++), but A.terreus shoed only (++). Searching the gene alp " which is encoded for the production of alkaline protease " showed that all the Aspegillus species produces the gene with amplification results of (100)% for the band supposed to appear at the molecular weight of (747) pb

انتشار المقاومة للمضادات الحيوية وبعض عوامل الضراوة في بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من مستشفيات في النجف المعزولة من مستشفيات في النجف == Molecular Study To Some of Pseudomonas Aeruginosa Virulence Factors Isolated From Clinical And Environmental Isolates

Author name: ذو الفقار حيدر حسن

Supervisor name: ماجدة مالك متعب

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

First pages:

Abstract: اجريت الدراسة الحالية لغرض التحري عن وجود الجينات الكروموسومية المسؤولة عن بعض عوامل الضراوة المهمة لجنس Pseudomonas aeruginosa كانتاجها للسم الخارجي A والالجنيت اضافة الى الجينات الكروموسومية المسببة لمقاومة الكوينولونات في العزلات السريرية والبيئية لبكت | This study include investigate the presence of chromosomal quinolone resistance genes and virulence genes(toxA and algD) in clinical and environmental isolates from Al - Sadr Medical city.A total of 110 samples were collected from different clinical sources(burns, wounds, and urine), and 50 from the hospital environment.the samples were collected during 10, Oct, 2012 to 2, Feb, 2013. A total number of Pseudomonas aeruginosa isolates accounted for 89 of 160 samples.The distribution of these isolates were 28 from Burns, 14 wounds, 15 urine, and 32 from hospital environments. Identification of isolates has been accomplished depending on phenotypic diagnostic methods and PCR technique.our study proved that PCR technique depending on oprI and oprL genes was a rapid method for identification of non - pigmented isolates. A total of 20 antibiotics resistant isolates were chosen for Molecular studies. The result reveling that 100% of isolates had a chromosomal mutation in the QRDRs of genes (gyrA, gyrB, parC, and parE). High percentage of isolates(45%) carried mutated genes gyrA and parC, followed by 15% of isolates were carried either mutated gene gyrA alone or three mutated genes gyrA, parC, and parE and and 10%of isolates were carried three muted genes gyrA, gyrB, and parC, while gene that encoding to parC mutation were detected in 5% of isolates. Our study is the first study about detection of Quinolone Resistance Determining Regions in P.aeruginosa in Iraq. The results showed the the presence of mexAB - oprM multidrugs efflux system expression in 100%(20) isolates. while the phenotypic test depending on MIC values for ciprofloxacin alone in the presence of efflux inhibitor showed that only 15%(3) isolates had the active efflux pump.

تقييم مستوى بعض الحركيات الخلوية لدى المرضــى المصابين بفايروس الحلا البسيط النمط الاول Herpes simplex virus - 1 == Evaluation of The Level of Some Cytokines In Patients With Herpes Simplex Virus Type I (HSV - 1)

Author name: حسين علي كاظم

Supervisor name: سهام جاسم الكعبي

General topic: Biology

Specific topic: Microbiology

Degree: Master

University: University of Kufa - College Of Education For Girls - Department Of Biology

Language: Arabic

University location: Najaf

First pages:

Abstract: هدفت الدراسة الحالية الى تسليط الضوء على مجموعة من المرضى المصابين بفايروس الحلا البسيط النمط الاول Herpes simplex virus - 1(HSV - 1) من خلال تقييم مستوى نوعين من الحركيات الخلوية الموجودة في مصولهم. شملت هذه الحركيات الخلوية الانترلوكين Interleukin - 6(I | The present study aimed to highlight a group of patients infected with herpes simplex virus type I (HSV - 1) by evaluating levels of two types cytokines in sera. These included cytokines interleukin - 6 (IL - 6) and tumor necrosis factor - alpha (TNF - ?) has been evaluated using the technique of Enzyme - linked immunosorbent Assay (ELISA), has also been investigating the relationship between these cytokines and the stages of infection compared to the control group. Before that rapid cytologic method has been used to diagnose the virus by detecting the presence of multinucleated giant cells, and then was diagnosed serologically by specific IgM and IgG monoclonal antibodies against Herpes simplex virus - 1. It was also used Radial immunodiffusion method to evaluate levels of total IgM and IgG in patients sera.Sixty four sera samples were collected from patients who are attending to the consultants clinics of Al - Hakeem general hospital and AL - Sader teaching hospital in AL - Najaf AL - Ashraf governorate for the period from October 21/2012 until March 13/2013. These Samples were divided into two groups : (32) sample during primary and recurrent infection, (32) after recovery from infection (latent stage), as well as (16) sample were collected from healthy individuals, who were regarded as acontrol groups.The study reached to the following results : • A significant increment (p<0.05) in sera concentrations of IL - 6 in patients during infection as compared with control groups, but the increment was not significant in sera of patients during latent stage.• TNF - ? levels increased in sera of patient, but this increment was not significant as compared with controls group.• There was no significant increase of Total IgM levels in sera of patients.• Total IgG levels increased significantly in sera of patients during infection and latent stage as compared with control group.• A highly significant positive correlation (r= 0.7, p= 0.00) between TNF - ? and IL - 6 concentration in sera of patients.• There was no significant correlation (p>0.05) between Total IgM levels and (IL - 6 and TNF - ?) in sera of patients with correlation coefficient (r= 0.1, r=0.2) respectively.• Positive significant correlation (r= 0.4, p= 0.02) was found between total IgG levels and IL - 6 in patients during infection, but was no correlation between them in latent stage.• There was no association between age and IL - 6 and TNF - ? levels in sera of patients with HSV - 1.Finally, the elevation of TNF - ? and IL - 6 levels in sera of infected patients with HSV - 1 may be play an important role in pathogenicity of virus, as well as it may limits the viral infection.Furthermore, there are positive correlation between levels of TNF - ? and IL - 6 in sera of patients