البحث — المستودع الرقمي العراقي

نتائج البحث: 5 من أصل 5

النمط الجيني لمستضد كريات الدم البيض نوع DQ وعلاقته ببعض العوامل المناعية والميكروبية لمرضى حساسية الحنطة في محافظة النجف الاشرف == HLA-DQ genotyping and its relationship to some immunological and microbial factors in patients with celiac disease in Najef province

اسم المؤلف: رعد جاسم عبد المهدي

اسم المشرف: وسن سامي حميد | هاشم رحيم طارش

الموضوع العام: الطب

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة الكوفة - كلية الطب

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: النجف

الصفحات الاولى:

مقارنة تشخيصية جزيئية وبكتريولوجسة لبكتريا الزائفة الزنجارية المعزولة من مرضى السكري النوع الثاني وامراض اخرى == Comparison the Molecular and Conventional Identification of Pseudomonas aeruginosa isolated from Diabetes Type II and other Diseases

اسم المؤلف: سناء محمد حبيب الشمري

اسم المشرف: اسماء محمد صالح المهيدي

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بغداد

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: Fifty clinical samples suspected as Pseudomonas aeruginosa were collected from patients with different diseases, diabetic foot ulcers, U.T.I., wounds, burns, keratitis, external otitis from September 2015, till February 2016, from hospitalized patients in four different Baghdad hospitals (Al - Kindi General Teaching Hospital, Al - Yarmuk General Teaching Hospital, Alkadhmiya General Teaching Hospital, and AL - Shiakh Zaied Hospital).The study population targeted both gender from different ages groups.The collected samples were cultured on different selective and differential media and tested biochemically in order to identify P.aeruginosa, then the identification was ensured by using two molecular methods which are conventional PCR in the detection of ecfx gene and 16SrDNA gene and real time PCR with commercial kit from sacace (qualitative detection of P.aeruginosa) and with gyrB gene using specific primers to each gene.Sensitivity for each test was measured then compared with other tests to determine the test efficiency. The results showed that the sensitivity for API20NE test was (80%), the sensitivity for molecular tests as flows : ecfx test was (92%), 16SrDNA test was (96%), the commercial kit test was (98%) and for gyrB test was (92%).The present study shows that using more than one target gene is reducing the probability of misidentification of P.aeruginosa that may be caused by variation in primer or probe targets.According to the type of infection the comparison was done. The results of P.aeruginosa detection for diabetic foot isolates were compared with other isolates. The results showed that there is a remarkabledifference in the API20NE test; as well as, with the oxidase test (according to the time that oxidase test need it to give the dark purple color as a positive result), for the mucoid strains of this bacterium. The results of detection isolates by using gyrB gene were differed too.Then a comparison in simplicity, cost, accuracy and time of P.aeruginosa identification between molecular methods and API20NE test (biochemical test) and between molecular tests themselves were performed. The results of these comparisons show that the molecular methods are better than API test in all aspects of the comparison. Real time PCR is better than conventional PCR in simplicity, accuracy and time but not in cost.All isolates were tested for antibiotic sensitivity using nine antibiotics. The results showed that most isolates were sensitive to Levofloxacin (94%), Ticarcillin - clavulanic acid (Timinim) (88%), Gentamicin (82%) and (80%) to both Pipracillin and Imipenem, while the isolates appeared resistant to another antimicrobials represented by (72%) to Augmentin, (34%) to Ceftazidime, (38%) to Colistin, and (28%) to Ciprofloxacin. In the present study, Levofloxacin represents the most effective antibiotic against P. aeruginosa isolates with the all types of infection.The present study improves the importance of the rapid and accurate detection of the bacterial types and thus giving the right antibiotics to patients to obtain rapid recovery and prevent any complications that may lead to death.

الكشف عن بعض الحركيات الخموية والاخماج البكتيرية في مرضى الفشل الكموي == Detection of some cytokines and bacterial infections in patients with renal failure

اسم المؤلف: رغد ناجي شهاب احمد

اسم المشرف: صدام حسين جبر الحيدري

الموضوع العام: علوم الحياة

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة

الدرجة: ماجستير

الجامعة: جامعة بغداد

اللغة: العربية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: Urine and blood samples was Collected 245 from patients who were resident of the industrial renal unit of Al - kadhamyiah (p) Teaching Hospital and Al - kindy Teaching Hospital from kidney failure seeking medical care for all ages and both sexes for a period between 05/11/2014 - 13/1/2015 .The samples were cultured in a suitable culture media for isolation bacteria. Diagnosed bacteria isolation on agar medium accuracy and privacy (Chromagar Orientation medium) as dependent as a result of the diagnosis on the color interaction between the enzymes of different bacterial isolates and the components of the center, specialist this confirmed diagnosis using API 20E and API Staph system results showed that the percentages of the bacterial isolates were as follows The results showed that 140 samples were positive for bacterial growth, It included 66 urine samples, has been negative bacterial 61/66 (92.42%) the isolation of prevailing compared bacterial positive grams for gram - stain and number 5/66 isolates, which accounted for (7.58%) of urine, while the number of bacterial isolates negative for tinted grams 26/74 (43.51%) compared to the isolation positive for gram - stain and number of 48/74 (64.86%) bacterial isolates . results show that the bacteria E .coli was the most sought after the generation of patients with kidney failure as it was isolated 57.57 percent, and by 18.92% isolated from the blood of patients with kidney failure. K.pneumoniae bacteria, followed by 25.75%, then the bacteria S.aureus by 7.57% and were S. aureus bacteria are prevalent in the blood as isolated 45.59%, then all of P. mirabilis and P. aeruginosa bacteria 4.54% P.aeruginosa isolates ratio was one of the blood 13.51%. Isolated the bacteria E.cloacae and Enterococcus spp 2.70% - 18.92% of the blood samples .The results showed that the age groups most affected renal failure were in the age group (50 - 70 years) as showing that the disease affects males and females, the study showed that there is an increase significantly in some measures of patients, male and female , and these standards is protein acute phase, the low increase significantly in the level of IGg and molecules complement C3,C4 in the serum of patients. results showed significant decrease in response to IL - 4 in patients level average of 297.4 pg \ ml compared with the levels in the control group, which recorded 410.1 rate pg \ ml and was a significant decrease in the level P< 0.05. Results show the high level of IL - 17A ,but not significant in patients with Group 79.2 pg \ ml compared with the levels in the control group, average of 76.6 pg \ ml.Results showed a high level of IP - 10 concentration in patients, amounting to an average of 0.318 pg \ ml compared with a total of 0.282 pg control \ ml at the level P< 0.05. results recorded a high level of response for MCP - 1 in patients, amounting to an average of 186.1 pg \ ml compared with normal levels in 116.2 when the total control pg \ ml moral worth at the level P< 0.05. The results of the study slight rises in cytokine rate significant difference was not a statistically significant in all cytokine between males and females have the current study signals are consistent with another study that sex is not at the level of cytokine in the serum of patient.

تاثير الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب وعلاقتها مع مستضدات الكريات البيض البشرية - النوع الثاني - DRB1 في المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي == Influence of Anti - infliximab Antibodies and its Association with HLA - class II - DRB1 alleles in Iraqi patients with Rheumatoid arthritis

اسم المؤلف: محمد احمد الكرخي

الموضوع العام: الطب

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة بغداد - كلية الطب

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: التهاب المفاصل الرثوي هو مرض مزمن ذاتي المناعة يصيب عدة اعضاء من الجسم ومن ضمنها المفاصل ويمكن ان يؤدي الى تدمير المفاصل والعجز الشديد اذا لم يعالج في وقت مبكر. المضادات لعامل نخر الورم عامل الفا (TNFα) مثل اينفلياكسيمب (INF) وهو من الاجسام المضادة وحيدة النسيلة خيالية ادخلت في عام 2010 من قبل وزارة الصحة كعوامل فعالة للغاية لعلاج المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي الحاد متوسط الشدة او الشديد الذي لا يستجيب للعلاج التقليدي.اينفلياكسيمب يمكن ان يحفز على تكوين الاجسام المضادة لعقار اينفلياكسيمب (ATIS)، ولكن هذه الاجسام المضادة من الممكن ان تؤدي الى نقص فعالية الاينفلياكسيمب او تاثيرات جانبية سلبية.وفقا لمعلوماتنا المتاحة انه لا توجد اية معلومات عن هذه الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب وارتباطها مع النتائج السريرية، العلامات المصلية ومستضدات HLA - classІІ - DRB1 في المرضى العراقيين المصابين بالتهاب المفاصل الرثوي.وقد اجريت هذه الدراسة لاعطاء فكرة واضحة عن تكون ودور هذه الاجسام المضادة في الاستجابة السريرية للمرضى لعقار الاينفلياكسيمب وكذلك توضيح تاثير مستضداتHLA - classІІ - DRB1 على القابلية المناعية لعقار الانفلياكسيمب في تكوين هذه المضادات.المرضى والطرق : شملت الدراسة 100 شخص. حيث تضمنت ما مجموعه 50 مريضا الذين توافقوا مع المعايير المنقحة لمرض التهاب المفاصل الرثوي (الكلية الامريكية لامراض الروماتيزم 1987 و2010) في المواءمة مع 50 مجموعة السيطرة (25 اشخاص اصحاء و25 مرضى مصابين بالتهاب المفاصل الرثوي لم يعالجوا بعقار اينفلياكسيمب). وقد اجريت هذه الدراسة خلال الفترة من بداية شهراذار 2014 حتى نهاية شهر ايلول 2014 في وحدة العلاج البيولوجي لقسم امراض الروماتيزم / مستشفى بغداد التعليمي، مختبر الدراسات العليا / فرع الاحياء المجهرية / كلية الطب - جامعة بغداد، المختبرات التعليمية / مدينة الطب، وحدة زرع الكلى / مستشفى الكرامة التعليمي ومركز التطابق النسيجي البحثي / كلية طب الكندي / جامعة بغداد. تم جمع عينات الدم من مجموعة السيطرة والمرضى الذين يعانون من التهاب المفاصل الرثوي في والذين تمت معالجتهم بعقار الانفلياكسيمب لاكثر من ثلاثة اشهر لغرض تقييم الاجسام المضادة لعقار الاينفلياكسيمب،مضادات - CCP، بروتين سي التفاعلي والتنميط الجيني HLA - DRB1.المرضى الذين لم تتكون لديهم الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب فتمت متابعتهم لمدة 6 اشهر واعادة فحصهم للتحقق من وجود الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب,anti - CCP وبروتين سي التفاعلي.تم الكشف عن الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب والاجسام المضادة لل CCP بواسطة جهاز فحص الانزيم الرابط المناعي (ELISA) ,اما بروتين سي التفاعلي(CRP) فتمت قياسته بواسطة جهازNephelometer في حين تم اجراء تحليل التنميط الجيني النوع الثاني DRB1 بواسطة بادئات محددة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR - SSO) لكل من المرضى ومجموعة السيطرة الاصحاء.النتائج : من اصل 50 مريض في الدراسة الحالية، كان متوسط العمر (45.24 ± 9.15سنة) وكانت الاناث اكثر من الذكور (اناث : ذكور 3 : 1).تم اكتشاف الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب في خمسة وثلاثون مريض(70٪) من مرضى التهاب المفاصل الرثوي بعد فترة ثلاثة اشهر من العلاج بهذا الدواء, بينما لم تتكون هذه المضادات للعقار في 15 (30٪) منهم.في حين لم يتم الكشف عن اية اجسام مضادة في مجموعة السيطرة (الاصحاء ووالسيطرة المرضية)، كان الفرق على درجة عالية وذات دلالة احصائية (قيمةp = 0.000001)، ومع حساسية وخصوصية (70٪، 100٪) على التوالي. في نفس المدة من العلاج تم الكشف عن الاجسام المضادة لل - CCP في 47 (94٪) من المرضى بينما لم يتم اكتشاف هذه الاجسام المضادة في في 3 (6.0٪)منهم، في حين تم الكشف عن هذه الاجسام المضادة في 22 (88٪) من مجموعة السيطرة ولم يتم اكتشافها في 3 (12٪) منهم.بينما لم يتم اكتشاف اية اجسام مضادة لل - CCPفي مجموعة الاصحاء ,وكان الفرق معتد للغاية وذات دلالة احصائية (قيمة p=0.0005) مع حساسية وخصوصية (94٪، 100٪) على التوالي.تم توثيق علاقة قوية بين نشوء الاجسام المضادة للانفلياكسيمب والاجسام المضادة لل - CCP (قيمة p = 0.006).وفيما يتعلق بفحص بروتين سي التفاعلي، تم الكشف عنه في 26 (52٪) من مجموعةالمرضى بينما لم يتم الكشف عنه في 24 (48٪) منهم، كما انه كان ايجابيا في كل مجموعة السيطرة المرضية, بينما في مجموعة السيطرة للاصحاء، كان ايجابيا في 10 (40٪) وسلبيا في 15 (60٪) وكان الفرق ذات دلالة احصائية عالية (قيمة p= 0.000014) مع تدني في الحساسية والخصوصية (52٪، 60٪) على التوالي.ولم تسجل الدراسة الحالية اي ارتباط ذو قيمة بين نتيجة بروتين سي التفاعلي وتكون اضداد اينفلياكسيمب (قيمةp = 0.084).بالنسبة لمجموع المرضى الذين لم يتم اكتشاف اضداد ال انفلياكسيمب لديهم والبالغ عددهم 15 مريض فتمت متابعتهم بعد 6 اشهر من فترة العلاج بال انفلياكسيمب لغرض التحقق من احتمالية تكون الاجسام المضادة لل انفلياكسيمب ,اضافة الى اعادة فحص اضداد - CCPو بروتين سي التفاعلي ,اظهرت النتائج عن عدم وجود فرق احصائي بين نتائج الفحص بعد 3 اشهر وونتائج الفحص بعد 6 اشهر وكانت قيمة - p((0.067، 0.067 و1.0) على التوالي.وعلاوة على ذلك، كشفت الدراسة وجود علاقة ايجابية بين HLA - DRB1 * 04 (DR4) اليل مع 35 مريض مصاب بالتهاب المفاصل الرثوي تمت علاجهم بال اينفلياكسيمب حيث تمت مقارنتهم مع 25شخص من مجموعة السيطرة للاصحاء وكان الفرق ذات دلالة احصائية (قيمة p = 0.001).واخيرا كشفت الدراسة الحالية عن عدم وجود اي ارتباط بين HLA - DRB1 وتكون الاجسام المضادة لل اينفلياكسيمب في المرضى الذين يعانون من التهاب المفاصل الرثوي (قيمة p = 0.0914).الاستنتاجات : اظهرت الدراسة الحالية على ان ما يقرب من ثلاثة ارباع المرضى العراقيين المصابين بمرض التهاب المفاصل الرثوي تتكون لديهم الاجسام المضادة لل ااينفلياكسيمب بعد ثلاثة اشهر من العلاج مع هذا العامل البيولوجي مع عدم وجود اي ارتباط للعامل الوراثي (اليل DRB1 - HLAالنوع الثاني) مع تكونها، كما اثبتت الدراسة وجود ارتباط وثيق بين العامل الجيني الاليل( HLA - DRB1 * 04 (DR4مع نشوء مرض التهاب المفاصل الرثوي في المرضى العراقيين. | Rheumatoid arthritis is a systemic chronic autoimmune inflammatory polyarthritis leads to joints destruction and severe disability if not treated early. Tumor necrosis factor alpha antagonists such as infliximabwhich is a chimeric monoclonal antibody have been introduced and approved in 2010 by Ministry of Health as highly effective agents for the treatment of Iraqi patients with moderate to severe Rheumatoid arthritis that not responds to conventional treatment.Infliximab can induce formation of anti - infliximab antibodies, however, these antibodies may lead to lack of efficacy to Infliximab or adverse reactions.According to our knowlege no information is available about these antibodies to infliximab and their association with clinical findings , serological markers and HLA - class ІІ - DRB1 antigens in iraqi patients with Rheumatoid arthritis.The present study was conducted to give a clear idea about the development and the role of these antibodies in clinical response of patients to infliximab and demonstration the effect of HLA - class ІІ - DRB1 antigens on the immungenicity of infliximab. Patients and Methods : The study covered 100 subjects. It included a total of 50 patients who met the revised criteria for RA (the American College of Rheumatology 1987 and 2010) in aligment with the 50 control group(25 healthy individuals and 25 RA patients not treated by infliximab). This study was carried out during the beginning of March 2014 till the end of September 2014 in the Biological Therapy Unit of the Deparment of Rheumatology/Baghdad Teaching Hospital, the laboratory for Higher Studies/Microbiology Deparment/Baghdad College of Medicine, the Teaching Laboratories/Medical City, the Kidney Transplant Unit/ Al - Karama Teaching Hospital and HLA Research Center /Al - kindy College of Medicine/Baghdad University. Blood samples were collected from control group and patients with RA on infliximab therapy for more than three months duration for assesment of antibodies to infliximab , anti - Cyclic Citrullinated Peptide(anti - CCP) ,C - reactive Protein(CRP) and for Human Leukocyte Antigen - DRB1(HLA - DRB1) genotyping.The patients with negative anti - infliximab antibodies were follow up and reinvestigated after 6 month of infliximab therapy for anti - infliximab antibodies, anti - cyclic citrullinated peptide and C - reactive Protein.Anti - bodies to infliximab and anti - Cyclic Citrullinated Peptide antibodies were detected by Enzyme Link Immunosorbent Assay (ELISA), the C - reactive protien (CRP) was measured by Nephlometer . whereas the genotyping analysis for HLA - class ІІ - DRB1 had been done by polymerase chain reaction - sequence specific primers (PCR - SSO) for both patients and healthy control group.Results : Out of 50 case study group included in the current study, their mean age was (45.24± 9.15) the females were predminance than males in a ratio (F : M 3 : 1).Thirty five (70%) of RA patients developed antibodies against infliximab after three months of treatment with this drug ,15 (30%) of them were negative for these antibodies, while no anti - inflixmab antibodies were detected in control groups( (healthy and case control) ,the difference was a highly statistically significant(P - value=0.000001), and with sensitivity and specificity (70 %,100%) respectively.At the same duration of treatment the anti - CCP was detected in 47 (94%) patients and negative in 3 (6.0%), while in case control was postive in 22 ( 88%) and negative in 3(12%), and was not detected in all healthy control group,the difference was highly satistically siginficant ( p - value =0.0005) with sensitivity and specificity (94%,100%) repectively.A strong correlation was reported between the development of anti - infliximab and anti - CCP antibodies (p - value=0.006).Regarding the CRP test ,it was positive in 26 (52%) patients and negative in 24 (48%), also it was positive in all case control group while in healthy control group ,it was reported positive in 10(40%) and negative in 15(60%) with highly statistically significance(p - value=0.000014) with low sensitivity and specificity (52%, 60%) respectively.No significant correlation was reported between CRP and development of anti - infliximab antibodies (p - value=.084).Fifteen patients group with negative anti - infliximab antibodies were follow up and re - investigated after six months of treatment with infliximab for anti - infliximab ,anti - CCP antibodies and CRP, the results showed no statistical difference of these test after three and six month of infliximab treatment with p - value (0.067, 0.067 and 1.0) respectively.The study revealed a positive association of HLA - DRB1*04(DR4) allele with 35 patients with RA on infliximab therapy whom compared with 25 healthy control and the difference was statistically significant (p - value=0.001).There was no association found between the HLA - DRB1 and development of antibodies to infliximab in patients with RA (p - value=0.0914).Conclusions : The current thesis showed that approximately three quarter of Iraqi patients with RA developed antibodies against infliximab after three months of treatment with this biological agent and without association of genetic factor( HLA - class ІІ - DRB1 alleles) with their development ,also the study suggested an association of susceptibility of RA in Iraqi patients with HLA - DRB1*04(DR4).

دور Foxp جين والاحماض النووية الرايبوية متناهية الصغر ,145 ,146a ,20aفي عينة من المرضى العراقيين المصابين بمرض تصلب الاعصاب المنتشر == The Role of Foxp3 and MicroRNAs (20a, 146a, 145, and 155) in a Sample of Iraqi patients with Multiple sclerosis

اسم المؤلف: زينب عبد الاله عبد الجواد الجوادي

اسم المشرف: عائدة رشيد منصور الدرزي | بان عباس عبد المجيد

الموضوع العام: الطب

السنة: 2016

الموضوع الدقيق: الاحياء المجهرية - المناعة

الدرجة: دكتوراه

الجامعة: جامعة بغداد - كلية الطب

اللغة: الانكليزية

مكان الجامعة: بغداد

الصفحات الاولى:

المستخلص: Multiple sclerosis is a devastating central nervous system autoimmune disorder that is characterized by a series of inflammations, demyelinations, and neurodegenerations that affect the brain and spinal cord. The epigenetic studies specially micro Ribonucleic acid expression represent an important field of researches that probably uncover the obscurities behind the multiple sclerosis pathogenesis. The aims of the present work were to study the expression of micro Ribonucleic acids (20a, 146a, 155, and 145) and forkhead box P3 genes by real time polymerase chain reaction relative quantification technique, to correlate their expression according to different clinical parameters, and to perform chromosomal analysis on the multiple sclerosis patients peripheral blood lymphocytes. A case - control study was performed on 25 newly diagnosed untreated multiple sclerosis patients during their attendance to Multiple Sclerosis clinic, or during their admission to the Neuromedical ward (10th floor) in Baghdad Teaching Hospital, and Special Nursing Home (5th floor) in Baghdad Medical City as well as from the Neuromedical Consultancy Unit in Al - Yarmouk Teaching Hospital in Baghdad city, in addition to 25 apparently healthy controls which were medical staff with no history of having any autoimmune disease or receiving any steroid or immunomodulatory therapy. Furthermore, chromosomal analysis was performed for multiple sclerosis patients. This work was conducted during the period from 1st of April 2015 to 31st of March 2016.From a total of 25 multiple sclerosis patients, 23 of them were females and 2 were males with a female to male ratio (F : M) of 11.5 : 1. The ages of these patients ranged between 18 - 55 years; mean age was 33.32 + 9.45 years. Studying of micro Ribonucleic acids expression revealed a significant down - regulation in micro Ribonucleic acid - 20a and forkhead box P3 gene while up - regulation of micro Ribonucleic acid - 155 expression in multiple sclerosis patients in comparison to controls. Micro Ribonucleic acid - 146a was directly associated with inflammation, and multiple sclerosis disease activity. On the other hand, micro Ribonucleic acid - 145 was not associated with significant changes in its expression in relation to multiple sclerosis disease. Chromosomal analysis was done for multiple sclerosis patients and it was normal.In conclusion, multiple sclerosis is associated with significant changes in micro Ribonucleic acids expression including micro Ribonucleic acid - 20a, micro Ribonucleic acid - 146a, and micro Ribonucleic acid - 155 but not micro Ribonucleic acid - 145 as well as to a significant change in forkhead box P3 gene expression that can be measured by real time polymerase chain reaction technique. Furthermore, multiple sclerosis is not associated withgross chromosomal abnormalities.